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Reference ( gi|8 )            :                                           TAACTTAT---TTTT----TG--T--A---AA--C---GTTT-GCTAG--AGA-A---CT---CC---------GCAAA----------A-GAGTT--C--T--C--T-AAC---A---A--------AC------G------------TT-----T-----AAAA--A---TAAGTTA------CAAGCCAAAAGT
gi|1                          :                                           TAACTTAT---TTTT----T------A---AA--C---ATTT-GTTAG--AGA-A---CT---CC---------GCAAA----------A-TAGTT--CGAG--C--T-AAC---A---C--------AT------GTTTTTTTGTTTTTT-----T-----TTAA--A---TAAGTTA------TAAGCCAAA
gi|15                         :                 ataacttgtttgttattattggcttaTAACTTAT---TTTT----T----------AA--C---GTTT-GTTAG--AG--A---CT---TC---------GCAAA----------A-TAGTT--C--CAGC--T-AAC---A---A--------AC-------------------TT-----T-----AAAA--A---tataacaaataaa
gi|14                         :                                         taTAATTTAT---TTTT----T---T--A---AA--C---GTTT--TTAG--AGA-A---CT---CC---------GCAAA----------A-TAGCT--C--T---------C---A---A--------AC--------------------T-----T-----AAAA--A---aa
gi|10                         :                                   ttggcttgTAATTTAT---TTTT----T---T--A---AA--C---GTTT--TTAG--AGA-A---CT---CC---------GCAAA----------A-TAGCT--C--T---------C---A---A--------AC--------------------------T-----AAAA--A---aat
gi|5                          :                        atttgttatttttggcttgTAACTTAT---TTTT----T---T--A---AA------GTGT-GTTA----------------CC---------TCGAACCCTTTTTTCA-GAATT--C--T--C--T-AAC---A---A--------AC------C------------CT-----T-----AAAA--A---CAAGTa
gi|6                          :                                         ttTAA-TTAT---TTTT----T------A---AA--C---ATTT-GTTAG--AGA-----CT---CC---------GCAAA----------A-TAGTT--CGAG--C--T-AAC----------------ACTTTTTTGTTT---------TT-----T-----TTAA--A---TAAGTTA------TAAGCtgagccaaaaataacaaataagt
gi|5                          :                               ttatttattggcttACTTGT---TTTT-----------A---AG--G---GTTT-GTTAG--AGA-A---TT---CT---------GAAAA----------AAGGGTT--C--G--AGGT-AAC---A---C--------AC-------------------TT-----T-----AAAAAAA---TAAGTTA------TGAGCCAAAAA
gi|16                         :                                            ttCTTAG---TTTT----TT--T--A---AAACC---GTTT-CTTAG--AGA-A---CT---CC---------ACAAA----------A-TAGTT--C--C--C--T-AAC---A---T--------AC------G------------GT-----T-----AAAA--aacaaataagt
gi|13                         :                                              CTTATAACTTTT----T---T--A---AA--C---GTTT-GTTAG--AGA-A---CG---CC---------ACAAA----------A-TAGTT--C--C--C--TAAAC---ATATA--------AG------G------------TT-----A-----AAAA--A---
gi|17                         :                                              CTTATAACTTTT----T---T--A---AA--C---GTTTAGTTAG--AGA-A---CT---a
gi|12                         :                                             ggTTAT---TTTT----TT--TTAA---AA--C---ATAT-GTTAG--GGA-A---CTATTTT---------GCGAA--------------GTT--C--T--C--T-AAC---A---A--------AC------C------------TT-----T-----GAAA--A---ttt
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gi|12                         :                                       aacttatttgAT---TTTT----T---C--A---AA--G---GTTT-GTTAG--AGA-A---CT---TC---------GCAAA----------A-TAGTT--C--C--C--T-AAC---A---T--------AT------G------------TT-----TTAAAAAAAA--A---TAA
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gi|15                         :                                                   ---TTTT----TT--T--A---AA------GTTT-GTTAGCTGGA-A---CTATTTT---------GCGAA----------G-----T--C--T--C--T-AAC---A---A--------AC------G------------TT-----A-----AAAA--A---TAAGTTA------TA
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gi|11                         :                                                        TT----TT--T--A---AA--C---TTTT-GTTAG--AAA-A---CT---CC---------GCAAA----------A-TAGTTGGA--G--C--T-AAC---A---A--------AC------G------------Tcgttggtaaaaa
gi|16                         :                                                   tataacT----TT--T--A---AC--C---GTAT-GTTAG--GGA-A---CTATTTT---------GTG--------------GAGTT--C--T--C--T-AAG---A---A--------AC------GGT----------TT-----T-----AAAA--AAACTAAGaacaaaacgttggtaaaaa
gi|2                          :                                                                   --A---AA--C---GTTT-GTTAG--AGA-A---CT---
gi|9                          : aattacttggttgtaagaccactgggctatcacaggatttcaaaaccaatattgaaaattagtcacaattacatgtaatgtTTT-GTTAG--AGA-A---CT---CC---------GCAAA----------A-TATTT--C--T--C--T-AAC---A---A--------AC--------------------T-----T-----AGA------------TA------TAAGCCAAAAAttttgtttttttttaaatgagttataagcc
gi|4                          :                                                                                   TT-GTTAG--AGA-A---CT---CC---------GCAAA----------A-TAGTT--CGAG--T--T-AAC---A---AACACGTGTAC------G------------TT-----TAAAAAAAAA--A---AAAGTTATAGGACTAAGCCAAAAAaacaagtaagttacatgtattttattatt
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gi|1                          :                                                                                                                                     -GAGTT--C--T--C--T-AAC---A---A--------AT------G------------TT-----TA----AAAA--A---TAAGTTA------TAAGCCAA
gi|10                         :                                                                                                                   ataacttgtttgttatta-GAGTT--C--T--C--T-AA----A---A--------AC------G------------TT-----T-----AAAA--AAA-TAAATTA------CAAGCCAAAAAcgcaaaatagttcgagctaacacatgtttttttgtttttttttaaataagttataagccaaatataacaaataaa
gi|6                          :                                                                                                                              atttgtt-GAGT---C--T--C--T-AAC---A---A--------AT------G------------TT-----TA----AAAA--A---TAA-TTA-------AAGCCAAcgcaaaatagctctcaaactaaaaaa
gi|2                          :                                                                                                                                ttatttaAGTT--C--T--C--T-AAC---A---A--------AC------GTTTTTTTGTTTTTT-----T-----TTAA--A---TGAGTTA------TAAGCCcgcaaaatagttcgagctaacacttttttgttttttttaaataagttataagc
gi|13                         :                                                       aattacttggttgtaagaccactgggctatcacaggatttcaaaaccaatattgaaaattagtcacaattacatgtaatgtGTT--C--T--C--T-AAC---A---A--------AC------G------------TT-----T-----AAAA-------AAGTTA------TAAG





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Reference ( family-6811 )     :                                                                             TAACTTA-T---TTTT---T-TA-AA--C---GTTTGTTAGAGAACTCCGCGAAATAGTT--C--T--C----T-AAC---A---A--------AC------G------------TT-----T-----AAAA--ATAAGTTA------TAAGCCAA-AAAT
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gi|16                         :                                                                              taCTTAGT---TTTT---T-TA-AAACC---GTTTCTTAGAGAACTCCACAAAATAGTT--C--C--C----T-AAC---A---T--------AC------G------------GT-----T-----AAAA--aa
gi|17                         :                                                                                                                                 AAA-AGTT--C--T--C----T-AACT--A---A--------AC------G------------TT-----T-----AAAA--A--AGTTA------TAAGCC
gi|2                          :                                                                                                                                    TAGTT--C--T--C----T-AAC---A---A--------AC------GTTTTTTTGTTTTTT-----T-----TTAA--ATGAGTTA------TAAGCC
gi|3                          : aattacttggttgtaagaccactgggctatcacaggatttcaaaaccaatattgaaaattagtcacaattacatgtaatgTTA-T---TTTTGGCT-TATAA--CTTAGTATGGCAGAAAACTCCGCAAAATAGTC--CGAG--C----T-AACAAGA---A--------AC------GTTTTTTT-----TT-----T-----AAA-----AAGTTA------TAAGC
gi|4                          :                                                                                                     aacttatttgTTGTTAGAGAACTCCGCAAAATAGTT--CGAG--T----T-AAC---A---AACACGTGTAC------G------------TT-----TAAAAAAAAA--AAAAGTTATAGGACTAAGCCAA-AAAT
gi|5                          :                                                                               ACTTG-T---TTTT------A-AG--G---GTTTGTTAGAGAATTCTGAAAAA-AGGG--T--T--CGAGGT-AAC---A---C--------AC-------------------TT-----T-----AAAAAAATAAGTTA------TGAGCCAA-AAATaacaaatgagtt
gi|6                          :                                                                                                                                      ttT--C--T--C----T-AAC---A---A--------AT------G------------TT-----TA----AAAA--ATAA-TTA-------AAGCCAATAAATaacaaataagt
gi|6                          :                                                                           ttTAA-TTA-T---TTTT---T--A-AA--C---ATTTGTTAGAG-ACTCCGCAAAATAGTT--CGAG--C----T-AAC----------------ACTTTTTTGTTT---------TT-----T-----TTAA--ATAAGTTA------TAAGCctccgcaaaatagttcgagctaacacttttttgttttttttaaataagttataagc
gi|7                          :                                                                                                    ttatttattggcttTTAAACAATTCCGCAAAATAGTT--C--T--C----T-AAC---A---A--------AC------G------------TTAGAAAA-----AAGA--AAAAGATA------GAAGCCAA-AAAT
gi|8                          :                                                                          tctTAACTTA-T---TTTT---TGTA-AA--C---GTTTGCTAGAGAACTCCGCAAAAGAGTT--C--T--C----T-AAC---A---A--------AC------G------------TT-----T-----AAAA--ATAAGTTA------CAAGCCAA-AAGTaacaaataagctatttgattac
gi|9                          :                                                                                                              TTTGTTAGAGAACTCCGCAAAATATTT--C--T--C----T-AAC---A---A--------AC--------------------T-----T-----AGA---------TA------TAAGCCAA-AAAT





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Reference ( family-6811 )     :                                                                             TAACTTA-T---TTTT---T-TA-AA--C---GTTTGTTAGAGAACTCCGCAAAATAGTT--C--T--C----T-AAC---A---A--------AC------G------------TT-----T-----AAAA--ATAAGTTA------TAAGCCAA-AAAT
gi|1                          :                                                                             TAACTTA-T---TTTT---T--A-AA--C---ATTTGTTAGAGAACTCCGCAAAATAGTT--CGAG--C----T-AAC---A---C--------AT------GTTTTTTTGTTTTTT-----T-----TTAA--ATAAGTTA------TAAGCCAA-ATAT
gi|10                         :                                                   ataacttgtttgttattattggcttaTAATTTA-T---TTTT---T-TA-AA--C---GTTT-TTAGAGAACTCCGCAAAATAGCT--C--T-----------C---A---A--------AC--------------------------T-----AAAA--Aaacaaataaa
gi|11                         :                                                                       atttgttatttttggcttgTTT---T-TA-AA--C---TTTTGTTAGAAAACTCCGCAAAATAGTTGGA--G--C----T-AAC---A---A--------AC------G------------Ta
gi|12                         :                                                                             tataacA-T---TTTT---T-CA-AA--G---GTTTGTTAGAGAACTTCGCAAAATAGTT--C--C--C----T-AAC---A---T--------AT------G------------TT-----TTAAAAAAAA--ATAAaacaaaacgttggtaaaaa
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gi|14                         :                                                                             TAATTTA-T---TTTT---T-TA-AA--C---GTTT-TTAGAGAACTCCGCAAAATAGCT--C--T-----------C---A---A--------AC--------------------T-----T-----AAAA--Aa
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gi|16                         :                                                                              taCTTAGT---TTTT---T-TA-AAACC---GTTTCTTAGAGAACTCCACAAAATAGTT--C--C--C----T-AAC---A---T--------AC------G------------GT-----T-----AAAA--aa
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gi|2                          :                                                                                                                                    TAGTT--C--T--C----T-AAC---A---A--------AC------GTTTTTTTGTTTTTT-----T-----TTAA--ATGAGTTA------TAAGCC
gi|3                          : aattacttggttgtaagaccactgggctatcacaggatttcaaaaccaatattgaaaattagtcacaattacatgtaatgTTA-T---TTTTGGCT-TATAA--CTTAGTATGGCAGAAAACTCCGCAAAATAGTC--CGAG--C----T-AACAAGA---A--------AC------GTTTTTTT-----TT-----T-----AAA-----AAGTTA------TAAGC
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gi|5                          :                                                                               ACTTG-T---TTTT------A-AG--G---GTTTGTTAGAGAATTCTGAAAAA-AGGG--T--T--CGAGGT-AAC---A---C--------AC-------------------TT-----T-----AAAAAAATAAGTTA------TGAGCCAA-AAATaacaaatgagtt
gi|6                          :                                                                                                                                      ttT--C--T--C----T-AAC---A---A--------AT------G------------TT-----TA----AAAA--ATAA-TTA-------AAGCCAATAAATaacaaataagt
gi|6                          :                                                                           ttTAA-TTA-T---TTTT---T--A-AA--C---ATTTGTTAGAG-ACTCCGCAAAATAGTT--CGAG--C----T-AAC----------------ACTTTTTTGTTT---------TT-----T-----TTAA--ATAAGTTA------TAAGCctccgcaaaatagttcgagctaacacttttttgttttttttaaataagttataagc
gi|7                          :                                                                                                    ttatttattggcttTTAAACAATTCCGCAAAATAGTT--C--T--C----T-AAC---A---A--------AC------G------------TTAGAAAA-----AAGA--AAAAGATA------GAAGCCAA-AAAT
gi|8                          :                                                                          tctTAACTTA-T---TTTT---TGTA-AA--C---GTTTGCTAGAGAACTCCGCAAAAGAGTT--C--T--C----T-AAC---A---A--------AC------G------------TT-----T-----AAAA--ATAAGTTA------CAAGCCAA-AAGTaacaaataagctatttgattac
gi|9                          :                                                                                                              TTTGTTAGAGAACTCCGCAAAATATTT--C--T--C----T-AAC---A---A--------AC--------------------T-----T-----AGA---------TA------TAAGCCAA-AAAT


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blockSeqs                     :                                                                                    . .      TT     .  .  .                              .  CC         .   .   T             GTTA                                .  T      .              
blockSeqs                     :                                                                                    . .      T      .  .  .                              .  CC         .   .   A             GGTT                                .  .      .              
blockSeqs                     :                                                                                    . .      T      .  .  .                              .  TC         .   .   A             GTTT                                .  .      .              
blockSeqs                     :                                                                                             .      .  .  .                              .  TC         .   .   A             GTTT                                .  .                     
blockSeqs                     :                                                                                                                                         .  TC         .   .   C             TTT                                 .                        
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blockSeqs                     :                                                                                                                                         .  TC         .   .   A             TT                                  .                        
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blockSeqs                     :                                                                                                                                         .  T          .   .   .                                                                          


blockSeqCons                  :                                                                                             TT****                                         TC********                       GTTT****************************
originalCons                  :                                                                             TAACTTA-T---TTTT---T-TA-AA--C---GTTTGTTAGAGAACTCCGCAAAATAGTT--C--T--C----T-AAC---A---A--------AC------G------------TT-----T-----AAAA--ATAAGTTA------TAAGCCAA-AAAT
finalCons                     :                                                                             TAACTTA-T---TTTTTT----A-AA--C---GTTTGTTAGAGAACTCCGCAAAATAGTT--CTC--------T-AAC---A---A--------ACGTTT----------------------------AAAA--ATAAGTTA------TAAGCCAA-AAAT





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consensus                     :                                                                             TAACTTA-T---TTTT---T-TA-AA--C---GTTTGTTAGAGAACTCCGCAAAATAGTT--C--T--C----T-AAC---A---A--------AC------G------------TT-----T-----AAAA--ATAAGTTA------TAAGCCAA-AAAT
Reference ( family-6811 )     :                                                                             TAACTTA-T---TTTT---T-TA-AA--C---GTTTGTTAGAGAACTCCGCAAAATAGTT--C--T--C----T-AAC---A---A--------AC------G------------TT-----T-----AAAA--ATAAGTTA------TAAGCCAA-AAAT
gi|1                          :                                                                             TAACTTA-T---TTTT---T--A-AA--C---ATTTGTTAGAGAACTCCGCAAAATAGTT--CGAG--C----T-AAC---A---C--------AT------GTTTTTTTGTTTTTT-----T-----TTAA--ATAAGTTA------TAAGCCAA-ATAT
gi|10                         :                                                   ataacttgtttgttattattggcttaTAATTTA-T---TTTT---T-TA-AA--C---GTTT-TTAGAGAACTCCGCAAAATAGCT--C--T-----------C---A---A--------AC--------------------------T-----AAAA--Aaacaaataaa
gi|11                         :                                                                       atttgttatttttggcttgTTT---T-TA-AA--C---TTTTGTTAGAAAACTCCGCAAAATAGTTGGA--G--C----T-AAC---A---A--------AC------G------------Ta
gi|12                         :                                                                             tataacA-T---TTTT---T-CA-AA--G---GTTTGTTAGAGAACTTCGCAAAATAGTT--C--C--C----T-AAC---A---T--------AT------G------------TT-----TTAAAAAAAA--ATAAaacaaaacgttggtaaaaa
gi|13                         :                                                                               aCTTA-TAACTTTT---T-TA-AA--C---GTTTGTTAGAGAACGCCACAAAATAGTT--C--C--C----TAAAC---ATATA--------AG------G------------TT-----A-----AAAA--Att
gi|14                         :                                                                             TAATTTA-T---TTTT---T-TA-AA--C---GTTT-TTAGAGAACTCCGCAAAATAGCT--C--T-----------C---A---A--------AC--------------------T-----T-----AAAA--Aa
gi|15                         :                                                                     ttggcttgTAACTTA-T---TTTT---T----AA--C---GTTTGTTAGAG-ACTTCGCAAAATAGTT--C--CAGC----T-AAC---A---A--------AC-------------------TT-----T-----AAAA--Aaat
gi|16                         :                                                                              taCTTAGT---TTTT---T-TA-AAACC---GTTTCTTAGAGAACTCCACAAAATAGTT--C--C--C----T-AAC---A---T--------AC------G------------GT-----T-----AAAA--aa
gi|17                         :                                                                                                                                 AAA-AGTT--C--T--C----T-AACT--A---A--------AC------G------------TT-----T-----AAAA--A--AGTTA------TAAGCC
gi|2                          :                                                                                                                                    TAGTT--C--T--C----T-AAC---A---A--------AC------GTTTTTTTGTTTTTT-----T-----TTAA--ATGAGTTA------TAAGCC
gi|3                          : aattacttggttgtaagaccactgggctatcacaggatttcaaaaccaatattgaaaattagtcacaattacatgtaatgTTA-T---TTTTGGCT-TATAA--CTTAGTATGGCAGAAAACTCCGCAAAATAGTC--CGAG--C----T-AACAAGA---A--------AC------GTTTTTTT-----TT-----T-----AAA-----AAGTTA------TAAGC
gi|4                          :                                                                                                     aacttatttgTTGTTAGAGAACTCCGCAAAATAGTT--CGAG--T----T-AAC---A---AACACGTGTAC------G------------TT-----TAAAAAAAAA--AAAAGTTATAGGACTAAGCCAA-AAAT
gi|5                          :                                                                               ACTTG-T---TTTT------A-AG--G---GTTTGTTAGAGAATTCTGAAAAA-AGGG--T--T--CGAGGT-AAC---A---C--------AC-------------------TT-----T-----AAAAAAATAAGTTA------TGAGCCAA-AAATaacaaatgagtt
gi|6                          :                                                                                                                                      ttT--C--T--C----T-AAC---A---A--------AT------G------------TT-----TA----AAAA--ATAA-TTA-------AAGCCAATAAATaacaaataagt
gi|6                          :                                                                           ttTAA-TTA-T---TTTT---T--A-AA--C---ATTTGTTAGAG-ACTCCGCAAAATAGTT--CGAG--C----T-AAC----------------ACTTTTTTGTTT---------TT-----T-----TTAA--ATAAGTTA------TAAGCctccgcaaaatagttcgagctaacacttttttgttttttttaaataagttataagc
gi|7                          :                                                                                                    ttatttattggcttTTAAACAATTCCGCAAAATAGTT--C--T--C----T-AAC---A---A--------AC------G------------TTAGAAAA-----AAGA--AAAAGATA------GAAGCCAA-AAAT
gi|8                          :                                                                          tctTAACTTA-T---TTTT---TGTA-AA--C---GTTTGCTAGAGAACTCCGCAAAAGAGTT--C--T--C----T-AAC---A---A--------AC------G------------TT-----T-----AAAA--ATAAGTTA------CAAGCCAA-AAGTaacaaataagctatttgattac
gi|9                          :                                                                                                              TTTGTTAGAGAACTCCGCAAAATATTT--C--T--C----T-AAC---A---A--------AC--------------------T-----T-----AGA---------TA------TAAGCCAA-AAAT