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Reference ( gi|1 ) : GGTGGCACCCGGACTAATAACAAATTGTT--ACATAC--AGCG-CG--GGG-ACTGC-A--CCTTTT-T-GAGTAATT--------TTT---GG--GG--GTGT-------------TACATGTAAA-ATATT-GT---A------------GAT-----ACC--------------GTTT-GTTAGTG--------AG----TT-TATA-G-GTGT---G--TAGTTT-----T-CAA-------TAT--GTGTCTTATTCGTA-TCTTA--TTT----AGG-GTATA-T----CATAAAA--GTA-TATTTTAAATTCAAGTATTGCCCGACGCATGAATTAAAAAAAT-ATTTTTGTG-TTTTACATGCCACCATGAAATAAAGCAAGAA-TA--AAACAAATGTTGACTGTAGGATTACTTGAAAA-TCGC-ACGCATACCGGTATAC--ACGCACTAACA--CAC---TGATGAAA--ATGA-ATC-TAC-AA-----GACTT-TAT-T-------T--TCCC-CTA----------AA--------AA-TACTCAAAAA-GG--T----GTAGTCCCCGC-ACAC--TATGT--AAC----AA-----TTTGTT--ACATA---C--CG-T-------A--------------GC--------------------C---A--T--------------G-------TA-A-C------A--------A--------T----T--T-----GTTA-CA-AA-----G---C--G-T----A--GC-------------T---T-G----A-A-TG----GCGA--CG---C--TA--TGTT-A--CAAA-----G-AAA-----------A-T-TG----T---T---GTTA-C-A--TA--G---C-G--TCGC----CA-T--T--------------C----G-TG---CT----A----C--GT-----T-T--------------TG-TAAC-AAA-T---TG-TTACA-T-ACCGTC-TCG-T-T-----GTTACAT------ACCGTG-GTCCA-----T-C-ACA-----GC-TGTTATG-AACACGTT----GAA-GATGTGCACGTGCCTTTTTGAAAGTGATTCGATATTTTGCGA-AAAATATACAATC-TCATGTTGAACATTGTCATTTTCTAAGCATGTGTTTAGTAGATGGTACTTATTTTGTGCAATCAACTTCTCCCACGCCTCTATTTAGACATTCCTCAAATTCTGAACAGTTGTAATGGACTCATCCAAGATGTGCTTGAAATGAAAATATGTGA
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gi|7 : ggacAA--ATCATATC-TAC-AATACTGGACTT-TGC-C-------CCCTCCC-CGG----------AA--------AT-TTCTCAAAAA-AG--TT---GAAGTTCCTGC-ACGA--TATGT--AAC----AA-----GTTGTT--ACATA---C--TG-T-------T--------------GT--------------------C---ACTT--------------A-------TA-A-CAT----A--------G--------T----A--T-----GCAC-CA-AT-----A---T--G-T--------C-------------A---T------A-A-TG----GCGT--TG---C--TA--TGCA-A--CACA-----G-AA----------------TG----G---T---GTCA-C-A--TA--GAGTC-GA-TCGC----CA-T--T--------------C-----------------A----C--G-----------------------------C-AA------------------CCGTC-TCG-T-T-----GTTCCAT------GACGTG-cattat
gi|5 : C-CTA----------CA--------AT-TACTCAAAAA-GG--TAGGAGTAG--CCCGC-AC----TGAGT--AAC----AA-----TGTGTTGTACATG---C--CG-TCATCTGCA--------------GC------------------------A--T--------------GAGTGTTGCA-A-C------A-----------------T----T--T-----GT-A-CA-AA-----T---C--G-T----A--GC-------------T---C-A----G-A-TG----GCGA--CG---C---A--TGTA-A--CAAA-----G-AAA-----------A-T--G----T---T---GTAA-C-A--TA--A---C----TCGC----CA-T--T--------------C----G-TG---CT----A----CAGGA-----T-C--------------TGATAAC-AAAAT---TG-TTACA-T-ACCGTC-TCG-T-TTGAACATTACAT------ACCGTG-GTCCtgttat
gi|9 : agaaagtattggaaaaccaccacaccctatgaaattgctcactaacaaacacaaacttgaaaagcatatgacaataacccccccccgaaattaAAAA-GG--T----GCAGTCCCCGC-ACGG--TATATACAAC----AA------TCGTT--ACATG---C--CG-T-------T--------------GC--------------------C---A--TCC------------G-------CA-G-G------A--------A--------A----T--T-----GTTA-CG-CA-----G---C--G-T----A--GC-------------A---C-A----A-A-TG----GCTA--TA---C--TA--TGT----------------AAA-----------A------------------------A--TA--G---C-G--TCGT----CA-T--T--------------C----G-TG---CT----A----C--GG-----T-A--------------TG-TATC-AAA-T---GA-TTGCA-T-ACAGTC-TCC-T-T-----GTTACATGTACAAACCGTG-
gi|10 : atcacacagA-GG--T----GCAGTCCCCGC-ACGG--TATGC--ATC----AA-----TTAGTT--ACGTA---C--CG-T-------A--------------GC--------------------ccct
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gi|4 : GC-ACAG--TATAT--AAC----AA-----C--G------ATA---C--CA----------------------------------------------C---A--T--------------G-------TA-A-C------A--------A--------T----T--T-----GTAA-CA--------G---TT-A-T----A--GT-------------A---C-G----A-A-TG----GCGA--CG---C--TT--TGTA-A--CAAT---------A-----------A-T-TGCATTT---T---GTTA-C-A--TA--G---C-G--TCGC----CA-T--T--------------T----G-TG---CT----A----C--GC-----T-T--------------TG-TAAC-AAA-T---TG-TTACT-T-AACGTa
gi|13 : ggaccaaatattgtcggtggatttacatgaaagtcacatatatatacctactcacaaatacaatggttaaaaggaatttacaaagttttgccccccccccccccccccccggatcactcaataaagtaccgtcctgcatgacacattacgattgttacatacctttgccatccacagcGC-ACAA--TATGT--AAC----A---------GCG--AAATG-------G-T-------A-------------------------------------------T--------------G-------TA-A-C------A--------G--------T------------------CA-AA--------------T----A--AC-------------A---C-G----A-G-TA----GCAA--CG---C--TACATGT-------AA-----C-AAC-----------A-T-TT----T---T---GTTA-C-A--TA--G---C-G--TCGC----CA-T--T--------------T----G-TG---CT----A----C--GC-----T-T--------------TC-TAAC-AAA-T---TG-Tattat
gi|7 : tgcacactgttgtcatccgctacGC-ATAC--TATGT--TAT----AA--------GTG--ACA-A---C--AG-T-------A-------------------------------------------T--------------G-------TA-A-C------A--------A--------C----T--T-----GTTA-CA-TA-----T---C--G-T----c
gi|2 : aaatcatatctacaatactggactttgccccctccccggaaatttctcaaaaaagttgaagttcctgcC-ACGG--TATGT--AAC----AA-----C--G------AGA---C--GG-T-------A-------------------------------------------T--------------G-------TA-A-T------A--------A--------T----T--T-----GTTA-CA-AA-----C---C--G-T----A--GC-------------A---C-G----A-A-CG----GCGA--CG---T--TA--TTTA-A--CAAC---------A-----------A-T-TT----TCTTT---ATTA-C-A--TT--G---C-G--TCGC----CA-T--T--------------T----G-AG---CT----A----C--GC-----T-T--------------TG-TAAC-AAA-T---TATTTACA-C-AACGTaccaatatgtcataatggcgttgctatgcaacacagaatggtgtcacatagagtcgatcgccattcacgcaaccgtctcgttgttccatgacgtgtgttat
gi|12 : tctttaggggaaatataacgtcttgtagattccttttcatcagtgtgtaagagagtgtatacctttcaagtaattcgacaatcaatatttgaattcttcttgctttatttcatgatgggatataaaacacgaaagtaatttttttgattcatgcgtcgggcagtacttgaatttcaaagatacttttatgatttttctctaaataagacaaatatttgaaaaccatacacctttaaactccactaacaaacacaattattgcaaaggcatctacaatatattaccacccccccccccccaccccccccccaatactcaaaaaaggtgcagtccccgccacagtatgtaacaatttgttacataccgttgccatctgcagcC-ACGG--TATGT--AAC----AA-----T--G------AGA---C--GG-T-------A-------------------------------------------T--------------G-------TA-A-C------A--------A--------T----T--T-----GTTA-CA-AA-----C---C--G-TTCAAA--GT-------------TGCAC-G----A-A-TG----GCGA--CG---C--TA--TGTA-A--CAA------------------------T-TT----TCTTT---GTTA-C-A--TA--G---C-G--TCGC----CA-T--T--------------T----G-AG---CT----A----C--GG-----T-T--------------TG-TAAC-AAA-T---TG-TTAgacc
gi|5 : acactttgtaacC-ACGG--TATGT--AA--------------TGTT---CA-A---A--CG---------A--------------GA--------------------CGGTA--T--------------G-------TA-A-C------A--------A--------T----T--TT----GTTATCA-GA-----T---CCTG-T----A--GC-------------A---C-G----A-A-TG----GCGA---G---T--TA--TGTT-A--CAAC---------------------A-T-TT----TCTTT---GTTA-C-A--T---G---C-G--TCGC----CA-T--C--------------T----G-AG---CT----A----C--GA-----T-T--------------TG-T-AC-AAA-----TG-TTGCA-g
gi|11 : agaaagtattggaaaaccaccacaccctatgaaattgctcactaacaaacacaaacttgaaaagcatatgacaataacccccccccgaaattacctacaattactcaaaaaggtaggagtagcccgcactgagtaacaatgtgttgtacatgccgtcatctgcagcatgagtgtC-ACGG--TATGT--AGC----AA-----C--G------AGA---C--CG-T-------A-------------------------------------------T--------------G-------TA-G-C------A--------A--------T----T--T-----GTTA-CA-AA-----G---C--G-T----A--GC-------------A---C-G----A-A-TT----GTGA--AT---C--TA--TGTA-A--CCAA-----A-GAA-----------A-T-TG----T---T---G----C-A--TA--A---C-G--TCGC----CA-T--T--------------C----G-TG---CT----A----C--GC-----T-T--------------TG-TATC-AAA-T---TT-TTACA-T-ACCGCA-TCG-T-T-----GCTACAT------ACCGgtcc
gi|16 : C-ACGG--TATGT--AAC----AA------------------------CG-G-------G--------------GCAG------------------T---A--T--------------G-------TA-A-C------A--------A--------T----T--T-----GTTA-CA-AA-----C---C--G-T----A--AC-------------A---C-G----A-A-TG----GCGA--TA---C--TA--TGTA-A--C-AA-----C-AAT-----------C-T-TAT---T---T---GTTA-T-A--TA--G---C-T--TCCC----CA-T--T--------------T----G-AG---CT----A----gtcc
gi|20 : aC-ACGG--TATGT--AAC----AA-----C--G------AGA---C--GG-T-------A-------------------------------------------T--------------G-------TA-A-C------A--------A--------T----T--T-----GTTA-CA-GA-----C---C--G-T----A--GC-------------A---C-G----A-A-TG----GCGA--C----T--TA---GTT------AA-----C-AAA-----------A-T-Tgt
gi|12 : aa-ACAC--TTTGT--AACTAACAA-----TTTGTT--ACAAA---C--CG-T-------AGCTCAAATGGCGACGC--------------------T---A--T--------------G-------TA-A-CAAAGA-A--------A--------A----T--T-----GTTA-CA-TA-----G---C--G-T----C--GCCATTCGTGCAACTT---T-G----A-A-CG----G-------------TT--TGTA-A--CAAA-------------------------------T---T---GTTA-C-A--TA--C---C-G--TC-T----CA-T--T--------------
gi|10 : -ACACGATATGT--AAC----AA-----C--G------AGA---C--AG-T-------A-------------------------------------------T--------------G-------TA-G-C------A--------A--------T----T--T-----GTTA-CA-GA-----C---C--G-T----A--GC-------------A---T-G----A-A-TA----GCGA--CG---T--TA--TGTTAA--CA---------ACA-----------A-T-TT----T---TTTGGTTA-C-A--TA--G---C-G--TCGC----CA-T--T--------------C----A-AG---CT----A----C--GG-----T-A--------------CG-TAAC-TAA-T---TG-ATGCA-T-ACCGTgttacataccgtgg
gi|15 : aggtgcagtccccgc-ACGC--TATAT--AAC----AATTCCTTTTGTT--ACATA---TAGCG-T-------C--------------GC--------------------C---A--TTCGC----------G-------CT-A-C------G--------C--------T----T--T-----GTTA-CA-AA-----tc
gi|15 : catcagcaacacggtatgtaacta-ACACGGTATGT--AAC----TA-----TTTGTA--ACAAA---G--CG-T-------A--------------GCGCGAATGGCGACGCTA----T---A--T--------------G-------TA-A-C------AAAAGG---A--------A----T--T-----GTTA-TA-TA-----G---C--G-T----C--GC-------------cgccatgcattcgtgctacggtttcattgttatatattcgca
gi|7 : catcagca-ACAG--TATGT--AAC----AA-----CTTGTT--ACATA---T--CG-T-------catgcattcgtgctacggtttcattgttatatattcgca
gi|14 : aaatcatatctacaatactggactttgccccctccccggaaatttctcaaaaaagttgaagttcctgc--TATGT--AAC----AT-----TTTGTT--ACAAA---C--CT-T-------A--------------GCACGAATGGCGACGC------T---A--T--------------G-------TA-A-C------A--------GCAATTTTCT----T--T-----GTTA-CA-TA-----G---C--G-T----C--GCCAT----------T---T-G----A---------GCTA--CG---G--TT--TGTA-A--CAAA-------------------------------T---T---GTTA-C-A--TA--tgtcacttataacatagtatgcaccaatatgtcataatggcgttgctatgcaacacagaatggtgtcacatagagtcgatcgccattcacgcaaccgtctcgttgttccatgacgtgtgttat
gi|14 : tgtta--TATGT--AAC----AA-----TTTGTT--ACAAA---C--CG-T-------AGCTCAAATGGCGACGC--------------------T---A--T--------------G-------TA-A-CAAAGAAA--------A--------T----TGCT-----GTTA-CA-TA-----G---C--G-T----C--GCCAT----------T---C-GTGCTA-A-GGTTT-GTAA--CA---A--AA--TGTT-A--CATA-----T-CAT-----------C-T-CG----T---T---GTTA-C-A--TG--C---C-G--Ttcatctcgttgttacatgccgtg
gi|11 : tgtta--TATGT--AAA----AA-----TTTGAT--ACAAA---G--CG-T-------A--------------GCACGAATGGCGACGT------T---A--T--------------G-------CA-A-C------A--------A--------T----T--TCTTTGGTTA-CA-TA-----GATTC--A-C----A--AT-------------T---C-G--------T-----GCTA--CG---C--TT--TGTA-A--CAAA-------------------------------T---T---GCTA-C-A--TA--C---G-G--TC------------T--------------C----GTTG---CT----A----C--AT-----g
gi|9 : cggtatgtagcaacgatgcgg--TATGC--AAT----CA-----TTTGAT--ACATA---C--CG-T-------A--------------G---------------------C---A--C--------------GAA-----TG-A-C------G--------A--------CGCTAT--T-----TTTA-CA-TA-----G---T--A-T----A--GCCAT----------T---T-G--------T-----GCTA--CG---C--TG--CGTA-A--CAAaccgtggtcc
gi|16 : atcacacagaaaaggtgcagtccccgcacggtatatacaacaatcgttacatgccgttgccatccgcaggaaaTGT--AAC----AA-----ATTGTT--ACATA---C--T-------------------------GC--------------------C---C--C--------------G------------------------------------------T--T-----GTTA-CA-TA-----C---C--G-T----G--Gcagtctccttgttacatgtacaaaccgtgccct
gi|20 : atagctcaaatggggaagctatataacaaataagattgttgttacatagtatcgccattcgtgttacggttTGT--AAC----AA-----ATTGTT--ACATA---C--CG-T-------t
gi|8 : aaaattttgttaactaagtcgccattcgtgctacggtcTGT--AAC----AA-----TTTGTT--ACATA---C--AG-T-------A--------------GCACTATGAAATGACGACGCCTT---A--T--------------G-------TA-A-T------G--------A--------T----T--T-----TTT-------------------G-T----C--GC--------------------------A-TA----GCGC--CG---T--CA--TTTT-GTGCTAATCTTTG-AAA-----------A-A-CG----T-------GTTA-C-A--TA--A---TTA--TCGT----GA-TGCT--------------C----A-TG---GT----AACGGC--GT-----T-A--------------TA-CAAC-AAA-T---CG-TTACA-A-ACCGTctcgttgttacataccgtg
gi|24 : cgcAC----AA-----TTTGTT--ACATA---A--TG-T-------A------------------------------------C---A--T--------------G-------TA-G-C------A--------ccactgtctcgtctcttacatacca
gi|13 : aacaaaaaattttattacaagtatcaccattcgT--GCACA---C--TG-T-------T--------------GT--------------------C---A--TCC------------GC------TACA-C------A--------A--------T----T--T-----GTTA-GA-AA-----G---C--G-T----A--GC-------------A---C-A----A-A-TG----GCGA--CG---C--TA--TGTA-A--CAAA-----A-A-----------------TG----T---T---GTTA-C-ATGTA--G---C-G--TTGC----TA-C--T--------------C----G-TG---TT----A--------------T-T--------------TG--------A-C---TG-TTACA-T-ACCATT-TCG-C-T-----GTTACAT------ATTGTG-
gi|7 : --ACACA---C----------------------------GT--------------------C---A--T--------------G-------GA-A-C------A--------A---------------------------CG-AG-----A---C--GGT----T--GC-------------G---T-G----A-A-TG----GCGAT-CGACTC--TA--TGTG-A--CACC---------------------A-T-TC----TG--T---GTTG-C-A--TA--G---C-A--ACGC----CA-T--TATGACATATTGGTGC----A-TA---CT----A----T--GT-----TATAAGTGACAACAGTATG-TAAC-AAC-T---TG-TTACA-T-ATCGTcc
gi|14 : aaatcatatctacaatactggactttgccccctccccggaaatttctcaaaaaagttgaagttcctgc---A--T--------------G-------TA-A-C------A--------A--------T----T--T-----GTTA-CA-AA-----C---C--G-T----A--GC-------------T---C-A----A-A-TG----GCGA--CG---C--TA--TGTA-A--CAAA-----G-AAA-----------A-T-TG----C---T---GTTA-C-A--TA--G---C-G--TCGC----CA-T--T--------------C----G-TG---CT----A----A--GG-----T-T--------------TG-TAAC-AAA-A---TG-TTACA-T-ATCATC-TCG-T-T-----GTTACAT------GCCGTG-tat
gi|14 : tgttat---A--T--------------G-------TA-A-C------A--------T--------T----T--T-----GTTA-CA-AA-----C---C--T-T----A--GC-------------A---C-G----A-A-TG----GCGA--CG---C--TA--TGTA-A--CA-------G-CAA-----------T-T-TTCT--T---T---GTTA-C-A--TA--G---C-G--TCGC----CA-T--T--------------T----G-AG---CT----A----C--GG-----T-T--------------TG-TAAC-AAA-T---TG-TTACA-T-A
gi|10 : tgtta---A--T--------------G-------CA-T-C------A--------A--------T----T--A-----GTTA-CG-TA-----C---C--G-T----A--GC-------------T---T-G----A-A-TG----GCGA--CG---C--TA--TGTA-A--CCAA-----A-AAA-----------A-T-TG----T---T---GTTAAC-A--TA--A---C-G--TCGC----TA-T--T--------------C----A-TG---CT----A----C--GG-----T-C--------------TG-TAAC-AAA-T---TG-CTACA-T-ACTGTC-TCG-T-T-----GTTACAT------ATCGTG-TTCatcatctcgttgttacatgccgtg
gi|11 : aggtgcagtccccgcacggt---A--T--------------G-------TA-A-A------A--------A--------T----T--T-----GATA-CA-AA-----G---C--G-T----A--GC-------------A---C-G----A-A-TG----GCGA--CG---T--TA--TGCA-A--CAAT-----------------------T-TC----T---TTG-GTTA-C-A--TA--G---A-T--TCAC----AA-T--T--------------C----G-TG---CT----A----C--GC-----T-T--------------TG-TAAC-AAA-T---TG-CTACA-T-ACGGTC-TCG-T-T-----GCTACAT------ACCGTG-GTCC
gi|9 : cggtatgtagcaacgatgcggt---A--T--------------G-------CA-A-T------C--------A--------T----T--T-----GATA-CA-TA-----C---C--G-T----A--GC-------------A---C-G----A-A-TG----ACGA--CG---C--TA--T------------------------------------------T---T----TTA-C-A--TA--G---T-A--TAGC----CA-T--T--------------T----G-TG---CT----A----C--GC-----T-G--------------CG-TAAC-AAT-T---T
gi|15 : atcacacagaaaaggtgcagtccccgcacggtatatacaacaatcgttacatgccgttgccatccgcagg---A--T--------------G-------TA-A-C------T--------A--------T----T--T-----GTAA-CA-AA-----G---C--G-T----A--GC-------------G---C-G----A-A-TG----GCGA--CG---CTATA--TGTA-A--CAAA-----A-GGA-----------A---------T---T---GTTA-T-A--TA--G---C-G--TCGCCATGCA-T--T--------------C----G-TG---CT----A----C--GG-----T-T--------------T-----C---A-T---TG-TTATA-T-Aacagtctccttgttacatgtacaaaccgtgccct
gi|15 : catcagcaacacggt---A--T--------------A-------TA-A-C------A--------A--------T-------------G-----A-AA-----C---C--G-T----A--GC-------------A---C-G----A-A-TGCATGGCGA--CG---C--TA--TATA-A--CAA------------------------T-TCCTT-T---T---GTTA-C-A--TATAG---C-G--TCGC----CA-T--T--------------C----G-CG---CT----A----C--GC-----T-T--------------TG-TTAC-AAA-T---AG-TTACA-T-ACCGTG-TTG-C-T-----Gttcgca
gi|19 : cat---A--T--------------T-------TA-A-C------A--------A--------T----T--T-----GATA-CA-AT-----C---C--A-T----A--GC-------------A---C-G----A-A-TG----ATGAAGCT---C--TA--TGTA-A--CAAattcgca
gi|26 : attgacagctggcgatacgttaattg---A--T--------------G-------TA-A-C------G--------A--------T----T--T-----TTCA-CA-AC-----A---C--G-T----A--GC-------------A---C-G----A-G-TG----GCGA--Cactgtttttgtt
gi|6 : atagttattgtt--T--------------G-------AA-A-C------A--------A--------T----T--G-----AT-------A-----A---C--G-T----A--GC-------------A---C-A----ATG-TG----GCGA--CA---C---A---GTA-A--CTAA-------ACA-----------A-T-TT----T---C---TTTG-T-A--CA--T---C-A--TCGC----CA-T--T--------------T----GAGG---CT----A-------GA-----T-T--------------TG-TAAC-ATA-T---TG-TTAC--T-ACTG
gi|8 : aattaagtacgaaattagacaatatttaatctgaatttgttgaaaaatagccacgtatacaaaatcactcacaaaccagttattaaaggaaaaatgtaccaataaatttatatatccccaaaaaactactcaaaagggattgcattcccagcacggt--T--------------G-------TA-A-C------A--------A--------T----T--T-----GTTA-CA-TA-----C---A--G-T----A--GCACTA---------T---G-A----A-A-TG----ACGA--CG---CCTTA--TGT------AAT-----G---A-----------T-T-TT----T---T---GTCG-C-A--TA--G---C-G--CCGT----CATT--T--------------T----G-TG---CT----A----A--TC-----T-T--------------TG--AAA-AAC-G---TG-TTACA-T-Acaccgtctcgttgtcaccaaccgtggtca
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gi|24 : acactttgtaac-A-C------A--------A--------T----T--T-----GTTA-CATAATGTACA---T--G-T----A--GC-------------A---C-G----A-A-TG----GTGA--TA---C--T---TGT-------AA-----T-AAA-----------ATT-TT----T---T---GTT
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gi|19 : a-TG----GCGA----------TA--CGTT-A---------------------------A-T-TG----T---T---GTTA-C-A--TA--G---A-GCTTCAT----CA-T--T--------------C----G-TG---CT----A----T--GG-----A-T--------------TG-TATC-AAA-T---TG-TTAAA-T-ACTGTT-T---T-T-----GTT
gi|24 : attgacagc-A--CAAA--------AA-----------A-T-T-----T---T---ATTA-C-A---A--G---T-A--TCAC----CA-T--T--------------C----G-TG---CT----A----C--ATGTACAT-TA-------------TG-TAAC-AAA-T---TG-T
gi|21 : a-A--CAAA-----A-AA----------------TG----T---T----TTG-C-A--TA--G---T-G--TCCT----CAAT--T--------------C----T-T-----T----A----G--GC-----T-T--------------TG-TAAT-AA--T---TG-T-ACA-T-ACCGTT-T
gi|20 : -AAA-----------A-T-T-----T---T---GTTA-A-C--TA--A-----G--TCGC----CA-T--T--------------C----G-TG---CT----A----C--GG-----T-C--------------TG-TAAC-AAA-T---TG-TTACA-T-ACCGTC-TCG-T-T-----GTTACAT------ACCGTG-taacaactatgg
gi|26 : A-----------G-T-TA----T---T---GTT-----------------G--TCGC----CA-C--T--------------C----G-TG---CT----A----C--GT-----G-T--------------TG-TGAA-AAA-T---CG-TTACA-T-
gi|7 : at-T--T--------------C----C-TG---C-----A----C--GA-----T-A--------------TG-TAAC-AAG-T---TG-TTACA-T-ACTGTTGTCACT-T-----ATAACAT------AGTATG-CACCAATATGT-C-ATAATGGCGT-TGCTATGCAACACA------GAATGGTGT-CACAT
gi|12 : aaatcatatctacaatactggactttgccccctccccggaaatttctcaaaaaagttgaag----A----C--GG-----T-A--------------TG-TAAC-AAT-T---TG-TTACA-A-ACCGTagagtcgatcgccattcacgcaaccgtctcgttgttccatgacgtgtgttat
gi|20 : acactttgtaactaacaatttgttacaaaccgtagctcaaatggcgacgctatgtaacaaagaaaattgttacatagcgtcgccattcgtgcaactttga----A----C--GG-----T-A--------------TG-TAAC-AAT-T---TG-TTACA-G-ACCGTctcattgttacataccgtgg
gi|8 : aaaattttgttaactaagtcgccattcgtgct----A----C--GG-----T-T--------------TG-TAAC-GAT-T---TG-TTGTA-T-AACG---CCG-T-------------T------ACCATGAG--CA-----T-C-ACG-----AT-AATTATGTAACACGTTTTTCAAA-GATTAGCAC-----------AAAATGA--CGGCGCTATGCGACAAAA-----AATCATTACATAAGGCGTCGTCATTTctcgttgttacataccgtg
gi|23 : cgc----A----C--GC-----T-TA-------------TA-AAAC-ATG-T---GG-TTACA-CCACCGGT-TTT-T-T-----GTTACAT------ACTGTG-GTCTA-----T-C-ATA-----GC---TTATG-catagtgctactgtatgtaacaaattgttacaccactgtctcgtctcttacatacca
gi|25 : cg----A----C--GC-----T-A--------------TA-TACC-AAA-CATGTG-TTACA-C-ACGGTT-TCT-T-T-----GTTACAT------ACTGTG-GTCTA-----
gi|16 : cg--------------TG-TAAC-AAT-T---TG-TTACA-A-ACCGT
gi|18 : atagctcaaatggggaagctatataacaaataagattgttgttacatagtatcgccattcgtgtt--------------TA-TAACCAAA-CATGTG-TTACA-C-ACGGTT-TCT-T-T-----GTTACAT------ACTGTG-GTCTA-----T-C-ATA-----GC-T-TTATG-CTCAAGTC----GAtactgccccgttgttacataccgtggt
gi|27 : tccataatacgaatggcgacgc--------------TG-CAAC-AAA-T---GG-TTGCC-T-ACCGTC-TCG-T-T-----GTTACGT------ATCGT
gi|2 : -T-T-----GTTACAT------ACCGTT-G-CCA-----T-CTGCA-----GCACGTTGTG-
gi|4 : tctttaggggaaatataacgtcttgtagattccttttcatcagtgtgtaagagagtgtatacctttcaagtaattcgacaatcaatatttgaattcttcttgctttatttcatgatgggatataaaacacgaaagtaatttttttgattcatgcgtcgggcagtacttgaatttcaaagatacttttatgatttttctctaaataagacaaatatttgaaaaccatacacctttaaactccactaacaaacacaattattgcaaaggcatctacaatatattaccacccccccccccccaccccccccccaatactcaaaaaaggtgcagtccccgccacagtatgtaacaat-T-T-----GTTACAT------ACCTTT-G-CCA-----TCC-ACA-----GCACGTTAAGTAACAtaaataatttgttacaaagcgtagctcaaatggcgacgcaatgtaataaagaaaattgttgttaaataacgtcgccgttcgtgctacggtttgtaacaaattattacataccgtctcgttgttacataccgtggacc
4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|23 : AAC-ATGT---GGTTACA-CCACCGGTTTTT-T-----GTTACAT------ACTGTGGTCTATCATAGC--TTATG-taacaactatgg
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4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|18 : a--TATGTAAC-AAA-G--AAACCGTGT--GTAA-C-ACATGTTTGGTTATA--G---CG--TCGC----CA-T-TC----GTAT-----T--AT--G-----G
gi|18 : t-TA-TAACCAAACATGTGTTACA-C-ACGGTTTCTT-T-----GTTACAT------ACTGTGGTCTATCATAGCT-TTATGCT--CAAGTCGActgtggtctatcatagctttatgctcaagtcga
gi|19 : tccataatacgaatggcgacgcAATTGT-T--GTTA-C-A------------TA--G---AGCTTCAT----CA-T-TC----GTGC-----T--AT--G-----GAT-TG-TATC-AAAT---TGTTAAA-T-ACTGTTT--T-T-----GTT
gi|2 : attgacagctggcgatacgttTCTTTAGGGG----AAATATAACGTCTTGTAGATTCCTTTTCATCAGTGTGTAAGAGAGTGTATACCTTTCAAGTAATTCGACAATCAATAT-TTGAAT--TCTTCTTGCTTTATTTCATGATGGGATATAAAACACGAAAGTAATTTTTTTGATTCATGCGTCGGGCAGTACTTGAATTTCAAAGATAC--TTTTATGATTTT-----TCTC-------TA-------AA-TA--AGACAAATAT--------------------TTGAAAA----CCAT-ACAC-C-TT----TA-AACTCCACTAAC-AAACACA-ATTAT--TGCAAAGGC-A--TC-TAC-AATA------TAT-TA--CCACCCCCCCCCCCCCACCCC--CC--CCCCA----------A------------TACTCAA-AAAAGG--T-GCAGT-CCCCGCCACAGTATGT--AACAATTTGT--TACATA---CCGT----T-GC--CA-------TCTGCAGCAC-----G----TTGTGTAA-AT---A--------ATT-TGTTACA---------AAGC--GTAGCT-CAAA-TGGCGACGC--AATGTAAT-AAAGA--AAATTGT-T--GTTA-A-A------------TA--A---CG--TCGC----CG-T-TC----GTGC-----T--AC--G-----GTT-TG-TAAC-AAAT---TATTACA-T-ACCGTCTCGT-T-----GTTACAT------ACCGTGGACC
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gi|21 : AC-AAA-A--AA--TGT-T---TTG-C-A------------TA--G---TG--TCCT----CAAT-TC----TT-------T--AG--G-----CTT-TG-TAAT-AA-T---TGT-ACA-T-ACCGTTT
gi|23 : AAC-ATGT---GGTTACA-CCACCGGTTTTT-T-----GTTACAT------ACTGTGGTCTATCATAGC--TTATG-taacaactatgg
gi|24 : cgacgcttataaAAC-AAA-A--AA-TT-T-T--ATTA-C-A-------------A--G---TA--TCAC----CA-T-TC----GTGC-----T--AC--ATGTACATTATG-TAAC-AAAT---TGT
gi|25 : --AC--G-----CTA-TA-TACC-AAACATGTGTTACA-C-ACGGTTTCTT-T-----GTTACAT------ACTGTGGTCTA
gi|26 : cgAGTTAT-T--GTT--------------------------G--TCGC----CA-C-TC----GTGC-----T--AC--G-----TGT-TG-TGAA-AAAT---CGTTACA-T-
gi|26 : atA-------T--------------G----T------A-AC---G--------ATT-TTTCACA---------ACAC--GTAGCA-CGAG-TGGCGAC
gi|27 : atagttattgtt-TG-CAAC-AAAT---GGTTGCC-T-ACCGTCTCGT-T-----GTTACGT------ATCGT
gi|3 : TGAACATAAGAGATAAAGTTTCATGATTTT-----C-ACC-TAGAAT----TAAGAA-TATGAGAAAAATATTG---A---T-GAAATT-ACTTGAAAA----TCAC-ACACAT-TA----TGTAA-------CACATAA-AAA-ATGA---TGAAAGG------TCGTAC--ATA----ACT-TATAATTT------------------C--CC--GCTAA----------AA---------ATTACTC-G-AAAAGG--T-GCA---CCTTG-CATGGTATGT--AA-AATTTAT--TACATA---CCGT----TGGC--CATC-----T--------------G----C------AGAC---AGTGTGTACATT-GGTTAC----------AGGCAAGGAG-T-TGAA-TGG-GATGC--T-TTTAAT-AAA-G--AAAATGT-T--GTTG-CAA------------TA--G---CG--CGG------A-T-TT----CT-C-----T--AC--G-----G-C-TG-TACA-AAAT---TG-TA-----ATCGCTCCGT-T-----GTTAC-T------ACTG-GATCCAT
gi|4 : ggtaaatttttaaagtatatacataaaattggaacatcatacttatatgaCAAATATTGTCGG---T-GGA-TTTACATGAAAG----TCAC-ATA----TA----TATACCT--ACTCAC-AAATACA-ATGG---TTAAAAGGA-A--TT-TAC-AA-A----GTT-T-TG--CC------------------C--CC--CCCCCCCCCCCCCCCGG---------ATCACTC-A-ATAAAG--T-ACCGT-CCT-G-CATGACACAT--TACGATT-GT--TACATA---CCTT----T-GC--CA-------TCCACAGCACGTTAAG----T------A-AC---A--------ATT-TGTTACA---------AAGC--GTAGCA-CAAA-TGGCGACGC--TATGTAAC-AAA-ATGCAATTAT-T--GTTA-C-A------------AA--G---CG--TCGC----CA-T-TC----GTAC-----T--AT--A-----A-C-TG-TTAC-AAAT---TGTTACA-T-GTGGTATCGT-T-----GTTATAT------ACTGTG---CATTAT
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gi|6 : agaAATTAA-GTACGAAATT--AGACAA-TATTT---AATCT-GAA-TT-TGTTGAAAAATAGCCAC-GTA----TA----CAAAATC--ACTCAC-AAAC-CA-GTTA---TTAAAGGAA-AAATG-TACCAATA----AAT-T-TA--TA------------------TATCC--CCAAA----------AA---------ACTACTC-A-AAAGGGATT-GCATT-CCCAG-CACGGTCAGT--A----------------------------------------------------------G----T------A-AC---A--------ATA-TGTTACA---------AATC---TAGCCTCAAA-TGGCGATG----ATGTA-C-AAAGA--AAATTGT-TTAGTTA-C--------------T---G---TG--TCGC----CA-CATT----GTGC-----T--AC--G-------T-TA-T--C-AA-T---TGTTTCA-C-ACCGTCTCGT-T-----GTCACCA------ACCGTGGTC
gi|7 : -A--TC-TAC-AATACTGGACT-T-TG--CC------------------C--CCTCCCCGG----------AA---------ATTTCTC-A-AAAAAG--TTGAAGT-TCCTG-CACGATATGT--AACAAGTTGT--TACATA---CTGT----T-GT--CACT-----T--------------A----T------A-ACAT-A--------GTA-TGCACCA---------ATAT--GT--CA-T-AA-TGGCGTTGC--TATGCAAC-ACA-G--AA--TGG-T--GTCA-C-A------------TA--GAGTCGA-TCGC----CA-T-TC----------------AC--G---------------C-A----------------ACCGTCTCGT-T-----GTTCCAT------GACGTGa
gi|8 : aaatcatCG-CACGGTTTGT--AACGATTTGT--TGTATAACGCCGT----T-AC--CA-------T--------------GAGCAT------C-ACGATA--------ATTATGTAACACGTTTTTCAAAGA--TTAGCA-CAAAATGACGGCGC--TATGCGAC-AAA-A--AA----T-C--ATTA-C-A------------TAAGG---CG--TCGT----CA-T-TTCATAGTGC-----T--AC--T-----GTA-TG-TAAC-AAAT---TGTTACACC-ACTGTCTCGTCT-----CTTACAT------ACCtgttat
gi|9 : ---------ATCACAC-AGAAAAGG--T-GCAGT-CCCCG-CACGGTATATACAACAA-TCGT--TACATG---CCGT----T-GC--CA-------TCC------------G----C------A-GG---A--------AAT-TGTTACG---------CAGC--GTAGCA-CAAA-TGGCTATAC--TATGTAA--AA-----------------------A------------TA--G---CG--TCGT----CA-T-TC----GTGC-----T--AC--G-----GTA-TG-TATC-AAAT---GATTGCA-T-ACAGTCTCCT-T-----GTTACATGTACAAACCGTGa
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|22 ): AAGATGTCGCGTGTTATTAATTTAAGTCAATATTTCAAATTTGTTAAAGAGAGTACCTCTAAACTATCAGAGAAA
Unaligned ( gi|28 ): AACTTGCTTTTATTTATTAAAAGAAAGTGTATTCGGTTTT
Unaligned ( gi|29 ): CAAGGCATCATTGTACATAAGACGTCCTATACAA