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lowQualScore                  :                 ...   ..    . .  .   .  ..  .  .   ...       . .. .  . ........ . .... ...    ...    .    .   
lowQualScore                  :                 000   33    7 7  7   7  88  0  7   888       7 00 3  7 55555555 8 2222 555    777    2    6   
consensus                     :     AATATGCCCTCA---AGG--GTCA-C-AG-ATA-AA-CTTTGC-TGCC--GGCGGGG-G--C-AT-TCG------T-G---GC---GTAC-C-GACA-CATCTAGT
Reference ( gi|13 )           :     AATATGCCCTCA---AGG--GTCA-C-AG-ATA-AA-TTTCGC-TGCT--GGCGGGG-G--C-AT-TTG------T-G---AC---GTAC-C-GACA-CATTGAGT
gi|14                         :     AATATGCCCCCA---ATG--GTCA-C-AG-ATA-AA-CTTTGC-TGCC--GGTGGGG-G--C-AT-TTG------T-G---GC---GTAC-C-GACA-CAT
gi|21                         :     AATATG---TCA---AGG--GTCA-C-AA-ATA-AA-CTTTGC-TGCC--GGCAGGA-G--C-AT-TCA------T-G---GC---GTAC-T-GACA-CATatagt
gi|11                         :     AATATGCCCTCATTAAGG--GCCA-C-AG-GTA-AA-CTTTGT-TGAT--GACCGAC-A--CGAT-TTG------T-G---AT---GTAC-C-GACA-CATT
gi|1                          :     AATATGCCCTC----AGG--GTCA-A-GA-ATA-AC-TTT-GC-TGCC--AGTTTGG-G--TAAT-TCA------T-G---GC---ATAC-TGGACA-CTTTt
gi|15                         :     tATGTGTCCTCA---AGG--GTCA-C-AG-ATA-AA-CTTTGC-TGCA--GGCAGGG-G--C-AT-TTA------T-G---GG---GTAC-C-AACA-TATaccatgattttt
gi|22                         :    atATATGCCCTCA---AGG--ATCA-C-GG-ATA-AA-TTTTGC-TGCT--GGCGAGG-G--C-AT-TCG------T-cta
gi|4                          :   aatATATGCCCTCA---GGG--GTCA-C-AG-ATA-AT-CTTTGC-TGCC--AGCGGGG-G--T-AT-TCGCCACGTT-G----C---GTAC-T-GACA-CATCTAGTagca
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gi|16                         :    atATATGCCCTCA---AAG--GTCA-C-AG-ATA-AATTTTTGA-TGCT--GGCAGGG-G--C-AT-TCA------T-G---cat
gi|6                          :    atATATGCCCTCA---GGG--GTCA-C-AG-ATA-AA-CTTTAC-TGTC--AGCAGGGTG--C-AT-CC-------T-G---GC---ATAC-T-AACA-CATCTAGTcattacaatacccatc
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gi|10                         :    atACATGACATCA---AGG--GCCA-C-A--ATA-AA-CTTTGC-TACC--AGCGGGG-G--T-AA-TCG------T-G---GC---GTAC-C-AACA-CATCTAGTaggg
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gi|26                         :    atATATGCC-TCA---AGG---TCA-C-AG-ATA-AC-TTT-GC-TGCC--GGCGGGA-G--C-Attgtgtagtt
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gi|7                          :      gTATACCATCA---AGG--GTCA-C-AG-AAA-AT-TTTCAC-TACC--CGCAGAG-G--C-AA-TCA------T-G---GC---GTAC-C-GATA-CATTTAGT
gi|2                          :  caatgTATGCCCTCA---AGA--ATC--C-AG-AAA-AA-CTTTGC-TGCT--GGCGGTG-GCTC-AT-TCG------A-G----C---GTAC-G-GACA-CAATG
gi|18                         :     atTATGCCCTCA---AGG-----------------A-TTT-GC-TGTC--GGTGGGG-G--C-AT-TTG------T-G---GC---GTAC-T-Gtatctagttt
gi|5                          : atacatgATGCCCTCA---AGG--GTCA-C-AG-ATA-AA-CTTTGC-TTCC--GGCGGGG-GA-C-AT-TCA------T-G---GC---ATAC-C-AACA-CATccccgtctagttt
gi|19                         :    ataaATGCCCTCA---AGG--GTCA---AG-ATA-AA-CTTTGC-TGCC--GGCTGGG-G--C-AT-TCG------T-G---GG---GTAC-C-TACA-CATctaggtat
gi|24                         :        ATTCCCTAA---AGG--GT---C-AG-ATA-AA----------------CGGGG-G--C-AT-TCA------T-G---GT---GTAC-T-GACA-CATCGAGTcta
gi|12                         :          aaCCTCA---AGGTTGTCAAC-AG-ATACAA-CTTTGCCTGCCTCGGTGGGG----C-AT-TCG------T-G---GC---GTAC-C-AACAGCATt
gi|23                         :             CTCA---ATG--ACCA-C-AG-ATA-GA-CTTTGC-TACC--GGAGGGG-G--G-AT-TCA------T-G---GC---GT------ACA-CATTGcatagt
gi|3                          :                      G--GTCA-C-AA-ATA-AA-CTGTGC-TGCC--GGCAGAG-C--A-ATATTG------CAG---GC---GTACGT-GACA-CATTt
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|20 ): AAATATGTGCTCAAAGGCCACATATCAACTTCATTGCTGGTAATCTAGTGGCATTCGTGGCATACC






Alignments
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lowQualScore                  :                          ...   ..    .   .   .  .    .  .  ....  ..    .....   . .. .  . .....   .   ...    ...    . ..... .  .    
lowQualScore                  :                          888   11    1   5   5  1    5  5  3333  11    88888   5 77 5  6 00000   7   000    000    0 33333 2  5    
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Reference ( family-6185 )     :              AATATGCCCTCA---AGG--GTCA-CAG-ATA-AA-CTTT-GC-TG----CC--GGCG-----GGG-G--C-AT-T-----CGT-GGC---GTAC-C-GACA-C-----A-TC-TAGT
gi|1                          :              AATATGCCCTC----AGG--GTCA--AG-AAT-AA-CTTT-GC-TG----CC--AGTT-----TGG-G--TAAT-T-----CAT-GGC---ATAC-TGGACA-C-----
gi|10                         :              tACATGACATCA---AGG--GCCA-CA--ATA-AA-CTTT-GC-TA----CC--AGCG-----GGG-G--T-AA-T-----CGT-GGC---GTAC-C-AACA-C-----A-TC-TAGTtttaccatgattttt
gi|11                         :            acAATATGCCCTCATTAAGG--GCCA-CAG-GTA-AA-CTTT-GT-TGATGACC--GACA-----CG-------AT-T-----TGT-GAT---GTAC-C-GACA-C-----A-TT-tt
gi|12                         :                     CCTCA---AGGTTGTCAACAG-ATACAA-CTTT-GCCTG----CCTCGGTG-----GGG----C-AT-T-----CGT-GGC---GTAC-C-AACAGC-----A-TCATAGT
gi|13                         :              AATATGCCCTCA---AGG--GTCA-CAG-ATA-AA-TTTC-GC-TG----CT--GGCG-----GGG-G--C-AT-T-----TGT-GAC---GTAC-C-GACA-C-----A-TT-GAGT
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gi|17                         :             atATATGCCCTCA---AAG--GTCA-CAG-ATA-AATTTTT-GA-TG----CT--GGCA-----GGG-G--C-AT-T-----CAT--GC---ATAC-A-TACC-C-----A-Tcattacaatacccatc
gi|18                         :              atTATGCCCTCA---AGG--AT----------------TT-GC-TG----TC--GGTG-----GGG-G--C-AT-T-----TGT-GGC---GTAC-T-GCCC-C-----G-TC-TAGT
gi|19                         :          atacatgATGCCCTCA---AGG--GTCA--AG-ATA-AA-CTTT-GC-TG----CC--GGCT-----GGG-G--C-AT-T-----CGT-GGG---GTAC-C-TACA-C-----A-TC-TAtt
gi|2                          :                TATGCCCTCA---AGA--ATC--CAG-AAA-AA-CTTT-GC-TG----CT--GGCG-----GTG-GCTC-AT-T-----CG--AGC---GTAC-G-GACA-CAATGTA-TC-TAGT
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gi|22                         :               ATATGCCCTCA---AGG--ATCA-CGG-ATA-AA-TTTT-GC-TG----CT--GGCG-----AGG-G--C-AT-T-----CGT-AGC---
gi|23                         :                   aatCTCA---ATG--ACCA-CAG-ATA-GA-CTTT-GC-TA----CC--GGAG-----GGG-G--G-AT-T-----CAT-GGC---GTAC-a
gi|24                         :                 ATTCCCTAA---AGG--GT---CAG-ATA-AA---------------------CG-----GGG-G--C-AT-T-----CAT-GGT---GTAC-T-GACA-C-----A-TC-GAGTacattgt
gi|25                         :             aaATATGCCTTCA---AGA--GTCA-CAG-ATA-AA-CCTT-GC-TG----TT--GGCG-----GGA-G--C-AT-T-----t
gi|26                         :             atATATGCC-TCA---AGG---TCA-CAG-ATA-A--CTTT-GC-TG----CC--GGCG-----GGA-G--C-Ataggg
gi|3                          :                            aatG--GTCA-CAA-ATA-AA-CTGT-GC-TG----CC--GGCA-----GAG-C--A-ATAT-----TGCAGGC---GTACGT-GACA-C-----ATTC-TAGT
gi|4                          : caaattgtaattcaATATGCCCTCA---GGG--GTCA-CAG-ATA-AT-CTTT-GC-TG----CC--AGCG-----GGG-G--T-AT-TCGCCACGT-TGC---GTAC-T-GACA-C-----A-TC-TAGTttc
gi|5                          :               atATGCCCTCA---AGG--GTCA-CAG-ATA-AA-CTTT-GC-TT----CC--GGCG-----GGG-GA-C-AT-T-----CAT-GGC---ATAC-C-AACA-C-----A-TC-TAG
gi|6                          :           ataaATATGCCCTCA---GGG--GTCA-CAG-ATA-AA-CTTT-AC-TG----TC--AGCA-----GGGTG--C-AT-C-----C-T-GGC---ATAC-T-AACA-C-----A-TC-TAGTgtat
gi|7                          :            caatTATACCATCA---AGG--GTCA-CAG-A-A-AA-TTTTCAC-TA----CC--CGCA-----GAG-G--C-AA-T-----CAT-GGC---GTAC-C-GATA-C-----A-TT-TAGTt
gi|8                          :           caatgTATGCCCTCA---AGG--ATCA-CAG-ATA-AA-CTTT-GC-TG----CC--AACA-----GGA-G--C-AT-T-----TGT-GGCTTTCTAC-T-GACA-C-----A-TC-TAGT
gi|9                          :              gATATGCCTTCA---AGG--GTCACCAGTATA-A----TT-GC-CG----CT--GGCG-----GGA-G--T-AT-T-----CGT-AGC---GTAC-T-GACA-





Alignments
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lowQualScore                  :                          ...   ..    .   .   .  .    .  .  ....  ..    .....   . .. .  . .....   .   ...    ...    . ..... .  .    
lowQualScore                  :                          888   11    1   5   5  1    5  5  3333  11    88888   5 77 5  6 00000   7   000    000    0 33333 2  5    
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Reference ( family-6185 )     :              AATATGCCCTCA---AGG--GTCA-CAG-ATA-AA-CTTT-GC-TG----CC--GGCG-----GGG-G--C-AT-T-----CGT-GGC---GTAC-C-GACA-C-----A-TC-TAGT
gi|1                          :              AATATGCCCTC----AGG--GTCA--AG-AAT-AA-CTTT-GC-TG----CC--AGTT-----TGG-G--TAAT-T-----CAT-GGC---ATAC-TGGACA-C-----
gi|10                         :              tACATGACATCA---AGG--GCCA-CA--ATA-AA-CTTT-GC-TA----CC--AGCG-----GGG-G--T-AA-T-----CGT-GGC---GTAC-C-AACA-C-----A-TC-TAGTtttaccatgattttt
gi|11                         :            acAATATGCCCTCATTAAGG--GCCA-CAG-GTA-AA-CTTT-GT-TGATGACC--GACA-----CG-------AT-T-----TGT-GAT---GTAC-C-GACA-C-----A-TT-tt
gi|12                         :                     CCTCA---AGGTTGTCAACAG-ATACAA-CTTT-GCCTG----CCTCGGTG-----GGG----C-AT-T-----CGT-GGC---GTAC-C-AACAGC-----A-TCATAGT
gi|13                         :              AATATGCCCTCA---AGG--GTCA-CAG-ATA-AA-TTTC-GC-TG----CT--GGCG-----GGG-G--C-AT-T-----TGT-GAC---GTAC-C-GACA-C-----A-TT-GAGT
gi|14                         :              AATATGCCCCCA---ATG--GTCA-CAG-ATA-AA-CTTT-GC-TG----CC--GGTG-----GGG-G--C-AT-T-----TGT-GGC---GTAC-C-GACA-C-----A-TA-TAGT
gi|15                         :               ATGTGTCCTCA---AGG--GTCA-CAG-ATA-AA-CTTT-GC-TG----CA--GGCA-----GGG-G--C-AT-T-----TAT-GGG---GTAC-C-AACA-T-----A-TC-TA
gi|16                         :             atATATGCCCTCA---AAG--GTCA-CAG-ATA-AATTTTT-GA-TG----CT--GGCA-----GGG-G--C-AT-T-----CAT-G
gi|17                         :             atATATGCCCTCA---AAG--GTCA-CAG-ATA-AATTTTT-GA-TG----CT--GGCA-----GGG-G--C-AT-T-----CAT--GC---ATAC-A-TACC-C-----A-Tcattacaatacccatc
gi|18                         :              atTATGCCCTCA---AGG--AT----------------TT-GC-TG----TC--GGTG-----GGG-G--C-AT-T-----TGT-GGC---GTAC-T-GCCC-C-----G-TC-TAGT
gi|19                         :          atacatgATGCCCTCA---AGG--GTCA--AG-ATA-AA-CTTT-GC-TG----CC--GGCT-----GGG-G--C-AT-T-----CGT-GGG---GTAC-C-TACA-C-----A-TC-TAtt
gi|2                          :                TATGCCCTCA---AGA--ATC--CAG-AAA-AA-CTTT-GC-TG----CT--GGCG-----GTG-GCTC-AT-T-----CG--AGC---GTAC-G-GACA-CAATGTA-TC-TAGT
gi|20                         :            atAATATGTGCTCA---AAG--GCCA-CAT-ATC-AA-CTTC-AT-TG----CT--GGTAATCTAGTG-G--C-AT-T-----CGT-GGC---ATAC-C-tt
gi|21                         :             aAATATG---TCA---AGG--GTCA-CAA-ATA-AA-CTTT-GC-TG----CC--GGCA-----GGA-G--C-AT-T-----CAT-GGC---GTAC-T-GACA-C-----A-T
gi|22                         :               ATATGCCCTCA---AGG--ATCA-CGG-ATA-AA-TTTT-GC-TG----CT--GGCG-----AGG-G--C-AT-T-----CGT-AGC---
gi|23                         :                   aatCTCA---ATG--ACCA-CAG-ATA-GA-CTTT-GC-TA----CC--GGAG-----GGG-G--G-AT-T-----CAT-GGC---GTAC-a
gi|24                         :                 ATTCCCTAA---AGG--GT---CAG-ATA-AA---------------------CG-----GGG-G--C-AT-T-----CAT-GGT---GTAC-T-GACA-C-----A-TC-GAGTacattgt
gi|25                         :             aaATATGCCTTCA---AGA--GTCA-CAG-ATA-AA-CCTT-GC-TG----TT--GGCG-----GGA-G--C-AT-T-----t
gi|26                         :             atATATGCC-TCA---AGG---TCA-CAG-ATA-A--CTTT-GC-TG----CC--GGCG-----GGA-G--C-Ataggg
gi|3                          :                            aatG--GTCA-CAA-ATA-AA-CTGT-GC-TG----CC--GGCA-----GAG-C--A-ATAT-----TGCAGGC---GTACGT-GACA-C-----ATTC-TAGT
gi|4                          : caaattgtaattcaATATGCCCTCA---GGG--GTCA-CAG-ATA-AT-CTTT-GC-TG----CC--AGCG-----GGG-G--T-AT-TCGCCACGT-TGC---GTAC-T-GACA-C-----A-TC-TAGTttc
gi|5                          :               atATGCCCTCA---AGG--GTCA-CAG-ATA-AA-CTTT-GC-TT----CC--GGCG-----GGG-GA-C-AT-T-----CAT-GGC---ATAC-C-AACA-C-----A-TC-TAG
gi|6                          :           ataaATATGCCCTCA---GGG--GTCA-CAG-ATA-AA-CTTT-AC-TG----TC--AGCA-----GGGTG--C-AT-C-----C-T-GGC---ATAC-T-AACA-C-----A-TC-TAGTgtat
gi|7                          :            caatTATACCATCA---AGG--GTCA-CAG-A-A-AA-TTTTCAC-TA----CC--CGCA-----GAG-G--C-AA-T-----CAT-GGC---GTAC-C-GATA-C-----A-TT-TAGTt
gi|8                          :           caatgTATGCCCTCA---AGG--ATCA-CAG-ATA-AA-CTTT-GC-TG----CC--AACA-----GGA-G--C-AT-T-----TGT-GGCTTTCTAC-T-GACA-C-----A-TC-TAGT
gi|9                          :              gATATGCCTTCA---AGG--GTCACCAGTATA-A----TT-GC-CG----CT--GGCG-----GGA-G--T-AT-T-----CGT-AGC---GTAC-T-GACA-


blockSeqs                     :                          TTA   TT    A   T   C  T    C  C  ATGA  TC    ATCTA   T CT .  A CGCCA   A   TTT    GT     G AATGT T  A
blockSeqs                     :                          .     .     C   .   .  T    .  .  .     .     .       . A  .  . .       .   .      C      . .     .  .
blockSeqs                     :                          .     .     .   .   .  .    .  .  .     .     .       . .  .  . .       .   .      C      . .     .  .
blockSeqs                     :                          .     .     .   .   .  .    .  .  .     .     .       . .  .  . .       .   .      C      . .     .  .
blockSeqs                     :                          .     .     .   .   .  .    .  .  .     .     .       . .  .  . .       .   .      C      . .     .  .
blockSeqs                     :                          .     .     .   .   .  .    .  .  .     .     .       . .  .  . .       .   .      C      . .     .  .
blockSeqs                     :                          .     .     .   .   .  .    .  .  .     .     .       . .  .  . .       .   .      C      . .     .  .
blockSeqs                     :                          .     .     .   .   .  .    .  .  .     .     .       . .  .  . .       .   .      A      . .     .  .
blockSeqs                     :                          .     .     .   .   .  .    .  .  .     .     .       . .  .  . .       .   .      T      . .     .  .
blockSeqs                     :                          .     .     .   .   .  .    .  .  .     .     .       . .  .  . .       .   .      C      . .     .  .
blockSeqs                     :                          .     .     .   .   .  .    .  .  .     .     .       . .  .  . .       .   .      G      . .     .  .
blockSeqs                     :                          .     .     .   .   .  .    .  .  .     .     .       . .  .  . .       .   .      C      . .     .  .
blockSeqs                     :                          .     .     .   .   .  .    .  .  .     .     .       . .  .  . .       .   .      T      . .     .  .
blockSeqs                     :                          .     .     .   .   .  .    .  .  .     .     .       . .  .  . .       .   .      T      . .     .  .
blockSeqs                     :                          .     .     .   .   .  .    .  .  .     .     .       . .  .  . .       .   .      T      . .     .  .
blockSeqs                     :                          .     .     .   .   .  .    .  .  .     .     .       . .  .  . .       .   .      C      . .     .   
blockSeqs                     :                          .     .     .   .   .  .    .  .  .     .     .       . .  .  . .       .   .      T      . .     .   
blockSeqs                     :                          .     .     .   .   .  .    .  .  .     .     .       . .  .  . .       .   .      C      . .         
blockSeqs                     :                          .     .     .   .   .  .    .  .  .     .     .       . .  .  . .       .   .      T      .           
blockSeqs                     :                          .     .     .   .   .  .    .  .  .     .     .       . .  .  . .       .   .      T                  
blockSeqs                     :                          .     .     .   .   .  .    .  .  .     .     .       . .  .  . .       .   .                         
blockSeqs                     :                          .     .     .   .   .  .    .  .  .     .     .       . .  .  . .       .   .                         
blockSeqs                     :                          .     .     .   .   .  .    .  .  .     .     .       . .  .  . .       .                             
blockSeqs                     :                          .     .     .   .   .  .    .  .  .     .     .       . .  .  . .                                     
blockSeqs                     :                                .     .   .   .  .    .  .  .     .     .       . .  .                                          


blockSeqCons                  :                                                                                                             C**
originalCons                  :              AATATGCCCTCA---AGG--GTCA-CAG-ATA-AA-CTTT-GC-TG----CC--GGCG-----GGG-G--C-AT-T-----CGT-GGC---GTAC-C-GACA-C-----A-TC-TAGT
finalCons                     :              AATATGCCCTCA---AGG--GTCA-CAG-ATA-AA-CTTT-GC-TG----CC--GGCG-----GGG-G--C-AT-T-----CGT-GGC---GTACC--GACA-C-----A-TC-TAGT





Alignments
lowQualScore                  :                          222   22    3   1   1  3    1  1  3333  22    33333   1 33 1  1 44444   1   333    333    2 55555 2  2    
lowQualScore                  :                          ...   ..    .   .   .  .    .  .  ....  ..    .....   . .. .  . .....   .   ...    ...    . ..... .  .    
lowQualScore                  :                          888   11    1   5   5  1    5  5  3333  11    88888   5 77 5  6 00000   7   000    000    0 33333 2  5    
consensus                     :              AATATGCCCTCA---AGG--GTCA-CAG-ATA-AA-CTTT-GC-TG----CC--GGCG-----GGG-G--C-AT-T-----CGT-GGC---GTAC-C-GACA-C-----A-TC-TAGT
Reference ( family-6185 )     :              AATATGCCCTCA---AGG--GTCA-CAG-ATA-AA-CTTT-GC-TG----CC--GGCG-----GGG-G--C-AT-T-----CGT-GGC---GTAC-C-GACA-C-----A-TC-TAGT
gi|1                          :              AATATGCCCTC----AGG--GTCA--AG-AAT-AA-CTTT-GC-TG----CC--AGTT-----TGG-G--TAAT-T-----CAT-GGC---ATAC-TGGACA-C-----
gi|10                         :              tACATGACATCA---AGG--GCCA-CA--ATA-AA-CTTT-GC-TA----CC--AGCG-----GGG-G--T-AA-T-----CGT-GGC---GTAC-C-AACA-C-----A-TC-TAGTtttaccatgattttt
gi|11                         :            acAATATGCCCTCATTAAGG--GCCA-CAG-GTA-AA-CTTT-GT-TGATGACC--GACA-----CG-------AT-T-----TGT-GAT---GTAC-C-GACA-C-----A-TT-tt
gi|12                         :                     CCTCA---AGGTTGTCAACAG-ATACAA-CTTT-GCCTG----CCTCGGTG-----GGG----C-AT-T-----CGT-GGC---GTAC-C-AACAGC-----A-TCATAGT
gi|13                         :              AATATGCCCTCA---AGG--GTCA-CAG-ATA-AA-TTTC-GC-TG----CT--GGCG-----GGG-G--C-AT-T-----TGT-GAC---GTAC-C-GACA-C-----A-TT-GAGT
gi|14                         :              AATATGCCCCCA---ATG--GTCA-CAG-ATA-AA-CTTT-GC-TG----CC--GGTG-----GGG-G--C-AT-T-----TGT-GGC---GTAC-C-GACA-C-----A-TA-TAGT
gi|15                         :               ATGTGTCCTCA---AGG--GTCA-CAG-ATA-AA-CTTT-GC-TG----CA--GGCA-----GGG-G--C-AT-T-----TAT-GGG---GTAC-C-AACA-T-----A-TC-TA
gi|16                         :             atATATGCCCTCA---AAG--GTCA-CAG-ATA-AATTTTT-GA-TG----CT--GGCA-----GGG-G--C-AT-T-----CAT-G
gi|17                         :             atATATGCCCTCA---AAG--GTCA-CAG-ATA-AATTTTT-GA-TG----CT--GGCA-----GGG-G--C-AT-T-----CAT--GC---ATAC-A-TACC-C-----A-Tcattacaatacccatc
gi|18                         :              atTATGCCCTCA---AGG--AT----------------TT-GC-TG----TC--GGTG-----GGG-G--C-AT-T-----TGT-GGC---GTAC-T-GCCC-C-----G-TC-TAGT
gi|19                         :          atacatgATGCCCTCA---AGG--GTCA--AG-ATA-AA-CTTT-GC-TG----CC--GGCT-----GGG-G--C-AT-T-----CGT-GGG---GTAC-C-TACA-C-----A-TC-TAtt
gi|2                          :                TATGCCCTCA---AGA--ATC--CAG-AAA-AA-CTTT-GC-TG----CT--GGCG-----GTG-GCTC-AT-T-----CG--AGC---GTAC-G-GACA-CAATGTA-TC-TAGT
gi|20                         :            atAATATGTGCTCA---AAG--GCCA-CAT-ATC-AA-CTTC-AT-TG----CT--GGTAATCTAGTG-G--C-AT-T-----CGT-GGC---ATAC-C-tt
gi|21                         :             aAATATG---TCA---AGG--GTCA-CAA-ATA-AA-CTTT-GC-TG----CC--GGCA-----GGA-G--C-AT-T-----CAT-GGC---GTAC-T-GACA-C-----A-T
gi|22                         :               ATATGCCCTCA---AGG--ATCA-CGG-ATA-AA-TTTT-GC-TG----CT--GGCG-----AGG-G--C-AT-T-----CGT-AGC---
gi|23                         :                   aatCTCA---ATG--ACCA-CAG-ATA-GA-CTTT-GC-TA----CC--GGAG-----GGG-G--G-AT-T-----CAT-GGC---GTAC-a
gi|24                         :                 ATTCCCTAA---AGG--GT---CAG-ATA-AA---------------------CG-----GGG-G--C-AT-T-----CAT-GGT---GTAC-T-GACA-C-----A-TC-GAGTacattgt
gi|25                         :             aaATATGCCTTCA---AGA--GTCA-CAG-ATA-AA-CCTT-GC-TG----TT--GGCG-----GGA-G--C-AT-T-----t
gi|26                         :             atATATGCC-TCA---AGG---TCA-CAG-ATA-A--CTTT-GC-TG----CC--GGCG-----GGA-G--C-Ataggg
gi|3                          :                            aatG--GTCA-CAA-ATA-AA-CTGT-GC-TG----CC--GGCA-----GAG-C--A-ATAT-----TGCAGGC---GTACGT-GACA-C-----ATTC-TAGT
gi|4                          : caaattgtaattcaATATGCCCTCA---GGG--GTCA-CAG-ATA-AT-CTTT-GC-TG----CC--AGCG-----GGG-G--T-AT-TCGCCACGT-TGC---GTAC-T-GACA-C-----A-TC-TAGTttc
gi|5                          :               atATGCCCTCA---AGG--GTCA-CAG-ATA-AA-CTTT-GC-TT----CC--GGCG-----GGG-GA-C-AT-T-----CAT-GGC---ATAC-C-AACA-C-----A-TC-TAG
gi|6                          :           ataaATATGCCCTCA---GGG--GTCA-CAG-ATA-AA-CTTT-AC-TG----TC--AGCA-----GGGTG--C-AT-C-----C-T-GGC---ATAC-T-AACA-C-----A-TC-TAGTgtat
gi|7                          :            caatTATACCATCA---AGG--GTCA-CAG-A-A-AA-TTTTCAC-TA----CC--CGCA-----GAG-G--C-AA-T-----CAT-GGC---GTAC-C-GATA-C-----A-TT-TAGTt
gi|8                          :           caatgTATGCCCTCA---AGG--ATCA-CAG-ATA-AA-CTTT-GC-TG----CC--AACA-----GGA-G--C-AT-T-----TGT-GGCTTTCTAC-T-GACA-C-----A-TC-TAGT
gi|9                          :              gATATGCCTTCA---AGG--GTCACCAGTATA-A----TT-GC-CG----CT--GGCG-----GGA-G--T-AT-T-----CGT-AGC---GTAC-T-GACA-