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gi|12 : taacatggtcttacaatctctccgttcatTA---TCTCAAGGAG--CTTATCA-AG-----CAGTACAAA-CCTGCGAGATC-CTTGCGCTCGGAATCA-GCATA---TCTTCTTCAA-GTA-CCATCGACCCGT--AC-AAAAACAT---------ATGGA-GTACGTCGGTT-CGA-CA-A-CG-TTGCAGC-CT--C--GCT-TTGGA-----A--TTC-GCT
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Alignments
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Reference ( family-6173 ) : TTGT-AC--GTC-TTCA-AGGCG--C-TAAACAACGTTGGGCA-CC---TGTATA---T-TCAAGGAGG-CTTATCACAG-GCC-CCGTACAAAACCTGCGAGATC-CTTGCGCTCGGAATCA-G-CATCTCTTCTTCAAAGTAC-CATCGACCCGT-T-AC-AAAA-CAT---------ATGGAG-AACGTCGGTT-CGA-CA-AGG-TTGCAGC-CT--C--GCT-TTGGAA--T-----TC-GCTGC--C-AGTACAT-CTGC-GCG-TAGC-CAGGTCAATTGACATTTT-CAA-----A-AA---GGCTTGAAA-AC--ACATCTT-TTT-AGA--C-TAG-CC-T----T------CA----------A----CACTA---AA--T--TTATT-T--TTT-AT-A-TT-G--AT-ATTTAA-G-CTGTA-------CTT--T--------TATTCAAC-AT-AGGTCTT--AATTT-ATGTT-CAT-AT------------A--CGT----A-T---G-CGC-A-TTGC-ATA-G-----T-C-ATCAT--T-A----T-CA---ATG-TTTG-TTT-T-A-TA-CTG------GTTTT----A--TGTT--------AA--------GCGC-TTT-AGAG---TTAGA-T-T-TT-T-AA-AA-TA-GGGCGC-T-A-T-----AC---AAAACTT----CTCATT-GTATTGT
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Reference ( family-6173 ) : TTGT-AC--GTC-TTCA-AGGCG--C-TAAACAACGTTGGGCA-CC---TGTATA---T-TCAAGGAGG-CTTATCACAG-GCC-CCGTACAAAACCTGCGAGATC-CTTGCGCTCGGAATCA-G-CATCTCTTCTTCAAAGTAC-CATCGACCCGT-T-AC-AAAA-CAT---------ATGGAG-AACGTCGGTT-CGA-CA-AGG-TTGCAGC-CT--C--GCT-TTGGAA--T-----TC-GCTGC--C-AGTACAT-CTGC-GCG-TAGC-CAGGTCAATTGACATTTT-CAA-----A-AA---GGCTTGAAA-AC--ACATCTT-TTT-AGA--C-TAG-CC-T----T------CA----------A----CACTA---AA--T--TTATT-T--TTT-AT-A-TT-G--AT-ATTTAA-G-CTGTA-------CTT--T--------TATTCAAC-AT-AGGTCTT--AATTT-ATGTT-CAT-AT------------A--CGT----A-T---G-CGC-A-TTGC-ATA-G-----T-C-ATCAT--T-A----T-CA---ATG-TTTG-TTT-T-A-TA-CTG------GTTTT----A--TGTT--------AA--------GCGC-TTT-AGAG---TTAGA-T-T-TT-T-AA-AA-TA-GGGCGC-T-A-T-----AC---AAAACTT----CTCATT-GTATTGT
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gi|6 : ctttatttagggacccttacccaatgccagggtagttgcaacacgggacgaaatctaacacaactcaatccttgcgctcggaatcagcatctcttctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacacccGTCG-TT-CGA-CA-AGG-TTGCAGC-CT--CCCGCT-TTGGAA--T-----TCAGCTGC--CCAG-ACATTCTGC-GCG-TAGC--AGGTCA-TTGACATTTT-CAA-----A-AAAAGGACTTGAAACAC---CATTCT-TTT-AGA----TAG-CC-T----TT-----CA----------A----CACTA---AA--T--T-ATT-T--TTT-AT-AATT-G---T-ATTTAA-GGCTGTA-------CTT--T--------TAT-CAAC-AT-TGGTCTTTAAAATT-AAGTTTCAT-AT------------A--CGTGG--A-T---G-CGC-A-TTGCCATAAG-----T-C-ATCCTCGT-AG---T-CA---ATG-TT-G-TTT-T-A-TT-CTG--------TTT----A--TGTTTAAAAAAAAA--------GCGCCTTT-AGAG---TTAGA-T-T-TT-T-GA-AT-TA-GGGCGC-T-A-T-----AC---AAAATTA----CTC-TT-a
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Reference ( family-6173 ) : TTGT-AC--GTC-TTCA-AGGCG--C-TAAACAACGTTGGGCA-CC---TGTATA---T-TCAAGGAGG-CTTATCACAG-GCC-CCGTACAAAACCTGCGAGATC-CTTGCGCTCGGAATCA-G-CATCTCTTCTTCAAAGTAC-CATCGACCCGT-T-AC-AAAA-CAT---------ATGGAG-AACGTCGGTT-CGA-CA-A-GG-TTGCAGC-CT--C--GCT-TTGGAA--T-----TC-GCTGC--C-AGTACAT-CTGC-GCG-TAGC-CAGGTCAATTGACA-TTTT-CAA-----A-AA---GGCTTGAAA-AC--ACATCTT-TTT-AGA--C-TA-G-CC--TT-----TC-A----------A-C---ACTA---AA--T--TTATT-T--TTT-AT-A-TT-G--AT-ATTTAA-G-CTGTA-------CTT--T--------TATTCAAC-AT-AGGTCTT--AATTT-ATGTT-CAT-AT------------A--CGT----A-T---G-CGC-A-TTGC-ATA-G-----T-C-ATCAT--T-A----T-CA---ATG-TTTG-TTT-T-A-TA-CTG------GTTTT----A--TGTT--------AA--------GCGC-TTT-AGAG---TTAGA-T-T-TT-T-AA-AA-TA-GGGCGC-T-A-T-----AC---AAAACTT----CTCATT-GTATTGT
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gi|6 : ctttatttagggacccttacccaatgccagggtagttgcaacacgggacgaaatctaacacaactcaatccttgcgctcggaatcagcatctcttctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaacacccGTCG-TT-CGA-CA-A-GG-TTGCAGC-CT--CCCGCT-TTGGAA--T-----TCAGCTGC--CCAG-ACATTCTGC-GCG-TAGC--AGGTCA-TTGACA-TTTT-CAA-----A-AAAAGGACTTGAAACAC---CATTCT-TTT-AGA----TA-G-CC--TT-----TC-A----------A-C---ACTA---AA--T--T-ATT-T--TTT-AT-AATT-G---T-ATTTAA-GGCTGTA-------CTT--T--------TAT-CAAC-AT-TGGTCTTTAAAATT-AAGTTTCAT-AT------------A--CGTGG--A-T---G-CGC-A-TTGCCATAAG-----T-C-ATCCTCGT-AG---T-CA---ATG-TT-G-TTT-T-A-TT-CTG--------TTT----A--TGTTTAAAAAAAAA--------GCGCCTTT-AGAG---TTAGA-T-T-TT-T-GA-AT-TA-GGGCGC-T-A-T-----AC---AAAATTA----CTC-TT-a
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