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gi|8                          :    GACCTTGA-G--CT-G-C-C-AATAACCCCACCCCT-G-T----TCCCCCCC-------------AG-----G-GG-----AA--T-TT-TGAA-GG-G--TAT-G-----A--TT-----T-CTG-A-A---A-G-------CT--T-A-T----AA-C--AAA---TGCTAACAAA---N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNN--NNNNN--N----N-N---TCTTAAG--AA---TTT-T-TATCA--AAA--ATCGCT-GAA--A-TTTGG--A--A---AAC--------CTG-----TA-T---AAAT-C-T-TAAA--TA--T----CTT-TA--TTTTT--TG----TT-TGTCT---T--A-ACA-T-A-T-GGC-T-G-T----A-T-CAT--AA-A-TG---TCATAA-A-CTATCA-GA-ACAGACAC----C--T-----CA--AA--CAC-A-CAAT--T------T----TT---A-T--TTT-C-TTGGCT--ATT-TTT--------G-------GGGGAA--------AA----AATA--C-C--G-A--------TTTTT-----G-TG----AAA-A-TCAA-T-G-A--AA-AC-CT---C--AT-ATATT--T-T-T-CT----A-A-T-----AT-T-GCAA-TT--T--TT-GT-GAT---TC-AA-----AACG-A---AT-TGT-C---A-TGT-TTT----------GG-TA-TG-GCTTT-T--GA-G-TAA-TG--AAT------T-C-C-A-T-C-AT-TT-T--C-AA-----TT-----T-AA-TA-T----T--T-GCA-T-GT-TA---AA---CAT-AT--T-------TG----G----T-----AAA---A------------------A-A-GAAATAA--------T-----TCT--CA-A---A-GTGG--AAACA-CTC-A--TT-AC-A---A-CAC---A-TC---A------TTAA-A-TTA---ATGCTT-C----TT---T-A--C-A-TC--------A-TTG--CAT------------T---AAT-A-T------------C-A-----CA-CA-A-TTT--T--ATT--TCA-G--G-T--T--A-ATTT--T---A-A--TAAA--TTAGA--AA-GACAAAAA--A-TCAG--AAT--AAAA-----T------AAC--A---A-A-------TT-A---TT---CTTATT-AATTA----ATTG-ATTA---ATT-A--AAT-----T-A--A--TTATTAT-T--AT-T---A-T-CT----A-------AGA-GACA--A-T----T-T-AT-ACAT-GT------------TACAAAT----C----TGTA-CTTATATT-GG-TATG
gi|7                          :    GACCTTGA-G--CCCA-C-C-AATAACTCC-----A-A-C----CCACCCCC---CCCCC---CGGGTGTGTGTGG-----AA--T-TT-TGAA-GG-G--TAT-G-----G--TT-----TTCTG-A-C---A-G-------CT--T-A-T----GA----AAA---TGCTA-NNNN---N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNN--NNNNN--N----N-N---NNNNNNN--NN---NTT-A-T--CA--AAAA-ATCGCT-GAC--A-TT-GG--A--A---AAA--------CTG-----TA-C---AAAT-C-T-TTAA--TA--T----TTT-TA--TTTTTGTTGGTTTTT-TGTCT---T--ACACA-T-A-T-GGC-T-G-T----AT--CAT--AA-A-TG---TCATAA---CTATCAGGA--CAGAAC-----C--T-----CA--AA--CAT-A-CAA---T------T----TT---AAT--TTT-T-GGGGCT--ATT-TG---------G-------GGGGGG--------GG----GAT-----C--G-A--------TTTTT-----G-TG----AAT---TCAA-T-G-A--AA-AC--T---C--AC-AATTT--T-T-T-TT----A-A-T-----AT-C-GCAG-TT--T--TT-GT-GAT---TCAAA-----CA-G-A---AT-TAT-A---A-T-T-TTTT---------GG-TA-TG-GC-TT-T---T-G-T-A-TG--AAT---A-AT-C-C-A-T-C-A--TT-T--C-AA-----TT-----T-AA-TA-T----T--T-GCA-T-GT-TA---AA---CAT-AT--C-------TG----G----T-----AAA---A------------------A-A-AAAATAA--------T-----TGT--CA-A---A-GT-G--AAACA-CTC-A--TT-ATAA---A-CGC---A-TC---A------TTGA-A-TTA---ATGC-T-T----CT---TAA--C-A-TC--------A-TTG--CAT------------T---AAT-A-T------------C-A-----CA-CA-A-TTT--T--ATT--TCA-G--GTT--T--A-ATTT--T---A-A--TGAA--TT-GA--AA--AC-AAAA--A-TCAG--AAT-GAAAA-----T------ACT--AAATA-AA----C--T-A---TT---C-TAGT-AATAA----T-TG-ATTAATTATT-A--GAT-----T----A--TTA--TT-T--AT-T---A-ATTT----A-------AGA-GACA--A-T----TATGAT-ACA--------------TGTACATGT----CTGT-TTTA-CTTATATT-GG-TATGcagggttctcaataggat
gi|3                          :  taGACCTTGA-GTTCT-G-C---AATAACCC------T-G-T----TTCCAACC---CCC------AGG-----GTGG-----AA--T-TT-TGAAAGG-G--TAT-G-----A--TT-----CTTTG-A-A---A-G--------T--T-A-T----A--C--AAA---TGCTATCAAAC--A-TGAGCCATGTTGCCTCTTGGTCCAGTTGGGGCGTTAAGGAGT---TTT--GGGGT--ACACAA-A---TCTTAAG--AA---ATT-T-TA-TA--CAAA-ATCGCT-GAAGGA-TTTGG--A--A---AAA--------C-G-----TA-T---AAAT-CGT-TAAA--TAA-T----CTT-TG--TTTTT--TG----TT-TGTCT------A-ACA-T-A-T-GG--T-G-TT---AAT-CATTAAA-A-TG---TCATAATA-ATATCAG-A-ACAGACAGCC--C--T-----CGG-AA--CAC-A-TA----TATTTTGT----TT---A-T--TTTTC-TTGGCT--CCT-TTT--------T-------GGGGGG--------AA----AATGACC-C--G-A--------TTTTTT----G-TG----TAA-A-TTCA-T-G-A--AAGAC-CTC--A--AT-A---T--T-T-T-TTTCTAA-A-T-----AA-T-GCCA-TT--T--TT-TT-GTG--ATCAAG-----AACG-A---AT-TGT-C---A-TGT-TTT----------GG-TAATGTGC-TT-T--TG-G-T-A-TG--AAT---A-TC-T-C-A-T-C-A--TT-T--CCAA-----TT-----TTAA-TA-T----TGTT-ACA-T-GT-T----AAA--CAT-AT--T-------TG---------T-----AAA---A------------------A-A-AAGAC-T--------T-----CTT--TT-A---A-GTGG--AAACA-CTC-A--TT-AC-A---A-CGCGAAA-TCAT--------CGAA-A-TTA---ATGC-T-T----ATGTAT-A--C-A-TC--------A-TTG--CAT------------T---AAT-A-T------------C-AAATGGAA-CA-A-TTT--T--ATT--TCATG--G-T--TA-A-ATTT--TTA-A-T--A-AA--TT-GAGGAA-GAC-AAAATCA--CAG--AATGAAAAA-----T------AAT--A---A-A-------TT-A---TT---C-TATT-A-------------ATTA---ATT-A--AAT-----T-A--A--TTA--ATAT--AT-C---AGA-TT----AGTAACGTAAA-GACA--A-TTAAGTATAAT-ACAT-G----------TTAGACAAGT----CTGTGTGCA-CTTATATT-GG-TATGcaggttctcactagga
gi|5                          :  taGACCT--G-G--CT-TTC-C-AAT---CCC-----T--------TCCCCCCC---CGCCC---GGGG-----G-GGGGGGGAA--T-TT-TGAA-GG-G--TAT-G-----A--TTG----TTCTG-A-A---A-GA------CT--T-A-T----AA-C--AAT---TGC-A-CCA-------CATGAGCCATGTTATGCACTCTGGCGTTGGGGCGTAAGAGT---TTT--GGGGT--A----A-AA--TCTTAAG--A----TTT-A-T--CA--ATAA-ATCGCT-GAA--AATTTGGT-A--A---AAA--------CTG-----TA-T---AAAT-C-T-TAAA---A--TA---TTT-TG--TTTTT--TG----TT--GTTT--------AC--T-A-T-GGC-T---C----GTT-CAT--AATA-TG---TC-TAA-A-CT--CAGGA--CAGACAA----C--T-----CA--AAATCAC-A-CA----T------T----TTT--A-TGCTTT-C-TTGGCT--ATT-TTT--------T-------GGGGGA--------AA----A-TA--C-C--GGA--------TTTTT-----GCTG----AAA-T-TCAAAT-G-A--CA-AC-CTC--A--AT-A---T--T-T-T-TT----CCA-T-----A--T-TGAA-TT--T--TT-GTTGAT---TCAAA-----G-CG-A---AT-TGT-CGCCA-T-G-TTT----------GG-T--TG-GC-TT-T--GG-G-T-A-TC--GAT---A-AT-C-C-AAT-C-A--TT-T--CCAA-----TT-----T-AA-TAAT----G--T-TCACT-GT-T----AA---CA--AT--T--------G----G----T-----AAA---A------------------C-A-AA--T-AC-------T-----TCT--CA-A---A-A-GG--AAACA-CTC-A--TT-AC-A---G-AGC---A-TCAT---------TAA-A-TTA---ATGC-TTC----AT---T----C-A-CC--------A-CT----AT------------T---GATTA-T------------CTA-----TA-CACA-TCT--T--AT----CA-G--G-T--T--A-AATT--TTA-A----T-AAATTT-GATAAA-GAC-AAAA----TCAG--A---------------------AT--G---A-AA----------------------------------A-TA-ATAA---ATT-A----T-----T-------CTA--AT-T--AT-T---A-A-TT----A-------ATA-ATTA--A-T----TATcagggttctcatagga
gi|12                         : ataGGCCTTGA-G--CT-G-C-C-AATAACCC------T-G-T----TCCCC--------------CAGG-----G-GG-----AA--T-TT-TGAA--G-G--TGT-A-----A--TT-----TTCTG-A-A---A-T-------CT--TGA-T----AA-C--AAA---TGCTA-CAAA---A-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNN--NNNNN--N----N-N---TCTTAAG--AA---TTT-TAT--C----AAA-ATCGCT-GAA--A-TTTGG--A--AAC-AAA--------CTG-----TC-T---AAAT-C-T-TAAA--TA--T----CTT-TA---TTTT--TG----TT-TGTTT---T--A-ACA-T-A-T-GGC-T-G-T----A-T-CAT--AG-A-TG---TCATAA-A-CTATCAGG--ACAGACAC----C--T-----CA--AA--CAC-A-CAGTTTT------T----TT---A-T--TTT-C-TTGG-T--ATT-TTTTTTTTTGGA-------GGGGGG--------GG----GGTA--C-C--G-A--------TTTTT-----G-TG----AAA-A-TCAA-T-G-A--AA-AC-CTC--A--ACAA---T--T-T-T-CT----A-A-T-----AT-C-GCAA-TT--T--TT-GT-GAT---TC-AA-----AATG-A---AT-TGT-C---A-TGT-TTT----------AG-TA-TG-GCTTT-T--GG-G-T-A-TG--AAT---AGAT-C-C-A-T-C-A--TT-T--G-AA-----TT-----T-AA-TA-T----T--T-Gtttaaattaaaaaaaaaaaaaaaacaaaaaaaaaaaaaaaaataagcgaccattatgatacatgtacacagtctgttgtactttattggtatgcaggggcttctcccatgggatt
gi|39                         :    GACCTTGA-G--CT-G-C-C-AATAACTCC-----T-G-T----CTCTCCCC---CCCCC---CCCG-----G-GG-----AA--T-TT-TGAA-GG-G--TA
gi|18                         :   taATCTTCA-G--CT-G-C-C-AATATCGCC-----T-G-T----T--CCCAA---CCCTT---CAGG-----G-TA-----AG--T-TT-TGGA-GGCT--TAT-GA----A--TT-----TTCTG-A-A---A-G-------CT--T-A-T----AA-A--AAA---TGTAA-CAAA---A---TGAGCTTGGTTGCACTGTGATTGTGAGCGTTTAACTTCAT---TTT--G------------------CTTAAT--AA---CT--------A--AAAA-ATCGCT-GAAG-A---TGG--G--A---AAA--------CTG-----T
gi|2                          :      CCTTGA-G--CT-G-C-C-AA-AACCC------T-G-C----TCTCCCTT---CCCCC---CAGG-----G-AT------A--T-TT-TAA-----G--TAT-GA----A--TT-----TTCTGAA-A---A-G-------CTACT-A-T-----A-C--AAA---TGCTA-CAAA---AGGACCATATGTTCCTACTCTGCCTGTATGGGCGTCAGGATGTT---TTT--GGGGT--A----A-ATTTTCTTAAGT-AAT--TTT-T-T--TATCAAAA-GCCGCT-GAA--G-TGGTG--A--ATATAAA--------CGGCGCTTTA-T---TAAC-C-T-GAAA-----------TTT-TAGCGTTTT--GG----TT-TG--G---T--A-ACAGTGA-T-GGCTT-G-G----ATTCCAT--AA-A-TGGAATTAAAA-A-CGATTCGAC-ACA-ACA-----C--C-----CA--AAG-CACAA-CA----A------TGTGATT-----T--TTT-C-TTGGCT--ATCGGGT--------G-------GGGGGgtttgtgagtcactctatgttattgaaatttatatcacaatagtgtaaattttacaattctagtagt
gi|40                         :      CTTTGA-G--CT---C-C-AATAACCC------T-G-CCAACTCGCCCCC---CTTCC---C-TT-----G-GG-----AA----TT-TGAA-GG-G--TAT-G-----ggggggcgcataataacctgaagttggggaacattttaatgtgctatttagtactattctctacttcctatcgcctcatctcttctcgatatcttttcaatgaaaaccttcaatatgtttctatgagcaactttttgtgatatcaaaacgtaatatgtctaattttggtggcttggtagaattaaccgatttttcaattaatattacttgttaaaacatatgtaaaaaaaaaaaccctctcaaagtgaaaacacctcaattacaacgcatcattaaataatgttcattacatccatgcattatatcacccaatttcattcgtatagatttaattaaattgaaaacaaaaatctaaatgaaaataagaattatctattaagtaattaaatttaatcaatattaatttttttaagaggacaattatatacatgtataagtctcggtcactttaggatataaatgattggtatgcaatttctcaataa
gi|26                         :      tCTTGA-G--CT-G-C-C-AGCAACCTC-----T-G-------------C---CCCTC---T-----------G-----A-----TT-TGAA-GG-G--TAT-G-----G--TT-----TTCCG-A-A---A-G-------CT--T-A-T----AA-A--AAA---TGCTG-CAAA---A--TGAGCCATGTAGGTACCCTGACCGTTGGGGCGTTAAGAAGT---TTA--GGGGT--A----ATA---TTTTAAG--AA---ATT-T-
gi|24                         :      aCTTGATG--CT-G-CTC-AGCAACCTC-----T---------------------CCC---CTG----------------A--T-TT-GAAA-GG-G--TAT-G-----GG-TT-----TTCCG-A-A---A-G-------CT--T-A-T----AA-A--AAA---TGCTG-CAAA---A----TGAGCCATGTAGTACCCTGAAGTTGGGAGCGTTAAGAAG---TTTAGGGGGT--A----ATA---T-TTAGA--AA---TTT-
gi|11                         :    ctaaTTGA-G--CT-G-C-CTAAAAACC-------T-A-A----CCCCCCCC---CTCCC---C----------GA-----AA--TGTT-TGAA-GG-G--TAT-G-----GATTT-----TTCTG-A-AGGGA-G-------CT--T-A-T----AAAC--AAAAATTGC-A-CAAA---A-TGAGTCCTGTTTTTACTTTCTGGCCGTTGTGGCGTTGAGAGGAGTTTT--GGGGT--A----A-A---TCTTGAG--AA---TTT-TAT--CC--AAAA-ATCGAT-GAA--A-TTGGGTGG--A---AAA--------CTG-----TA-T---CAATAC-T-TAAAAATG--T----TTT-TA--TTTTT--T------T-TGTCT------A-ACA-T-AAT-GCT-T-G-T----AGT-CAT--AA---TG---TCATAA-A-ACATCAAGG-ACAGATG-----CC-T-----CA--AA--CAC-AACAAA--T------T----TT---AAT--TTT-C-TTTGCTGGATT-TT------------------GAGGG--------AA----AACA--CGC--G-AA-------TCTTT-----G-TG----AAA-A-TCAA-T-G-----A-AC-CTC--A--AA-AT--T--T-T-T-CT----A-A-T-----ATTC-GCAATTT--T--TT-GT-GAT--TTC-AA-----AACG-A---AT-TGT-C---A-TGTGTTT----------GG-TA-TG-GC-TT-T--GG-G-T-A-TG--AAT---A-AA-T-A-G-T-C-A--TT-TCAC-AA-----TT-----TAAA-TA------T--T-GCA-T-GT-T----AA---CAT-GT--T-------TA----G----T-----AAA---A------------------ATA-AAAAT-A--------CTA---TCT--CATA---A-GTGG--AAACAGCTC-A--TTAAC-A---A-CGC---A-TAATCA------TTAa
gi|6                          :                 T-G-C-C-AATAACCCC-----TAG-T----TCCCGC--------------AGG-----G-GG-----AAG-T-TT-TGAA-GG-G--TAT-G-----A--TT-----TTCTG-A-A---A-GG------CT--T-A-T----A--CGAAAA---TGCTA-CAAA--------TGGCCATTGTTTGCACTCTGCCGTTGGGGCGTTAAGAGT---TTT--GG-GTTAA----A-A---TCTTAAG--AA---TTTAG-T--CA--AAAA--TCGCTTGAA--G-ATTGG--A--A---AA---------CTA-----TA-T---AAAT-C-T-TAA---TA--T----TTT-TA--ATGTT--TG----TT-TAAATA--T--A-ACA-T-A-T-GG--T-G-T----AT---AT--AA-A-TG---TCATAA---CTATCGG---ACAGA-A-----C--TT----CA--AA--CAC-A-CT----A------T----TT---A-T--TTT-CATTGGCT--AGT-TTT--------G-------GGGCGA--------AA------T---C-C--G-A--------TTTT------G-TT----AAACA-TCAA-T-G-G--AA-AC-CTCA-G--AC-G---T--T-A-T-TT----A-AAT-----A--CCGCAT--T--T--TT-GT-GAT--TTCAAA-------CG-A---AT-TTG-T---A-TGT-TTT----------GGATA-TG-GC-TT-T--GG-A-T-A-TC--GAT---A-AT-C-C-A-T-C-A--TT-T--T-AA-----TT-----C-AA-TA------T--T-GCA-T-GT-T----AA---CAT-AT--T-------TG----G----T-----AAA---AAAACGAAACAAAAACAACA-A-AAAAA-A--------C-----TAT-----A---A-ATGATTAAACC-CTT-A--T---C-A---A--GC---AGTCGT-AACCAGGCTAA-A-CTATACACGA-T-CATGAGT---T-ATGC-T-TC--------G-TTA--CATTCATTGCATTAAT---AAT-A--------------C-ACCTG-CA-CA-A-TTT--T--A-T--TCA-G--G-G--T--T-ATTT--TTA-A-T--A-AA--TT-GA--AC-GAC-AAAAC-ACTCA---AAT-AAAAC-----T------AAT--A---A-ACTTCTC-AT-A---T------TATT-GA-TA----A----ATTA---ATT-A--AAT----------A--TTA--AT-A--AG-T---A-ATTT----A-------AGAGGACA--A-T------TGAT-ACAT-GTACAT-----CTG------------TGT-TGTA-CTTATG-T-TG-TGTG
gi|23                         :                   agctg-AACAACCCG-----T-A-G----TTCCCCCC---AGATC---CAAG-----G-GG-----AG--T-TT-TGAA-GG-GTTTATGG-----A--TT-----TTCTG-ACA---A-GACTCACTCC--T-A-T----AA-C--caggggttctcaaatagg
gi|1                          :                              CCCC-----T-C-T----CCCCCCCCTTTCCCCT---CGGGTTTTTG-GG-----AACAT-TTATGAA-------TAT-GGTGATA--TTGCTTATTCTG-G-A---A-CATC----CT--T-A-T----AAAC--AAA---TGCTA-CAAA---A-TGGCAATGTCTGCACTTCTGGGCGTTTGGGGCGGGTGAAG------TT--GAAG---A----A-A---TC--AAG--AA---TTT-TAT--CA--AAAT--TCGCG-GAA--A-ATTGG--AGAA---AAA--------CTG-----TA-ATATAAAT-CGC-TAAA--TC--T----TTTAGA--TTTTT--TG----TTATGTCTATAC--A-GCA-TGA-T-GGC-C-G-TTCGTATT-CAT--AA-A-T----TCATAA-AACTATCAGAA-ACAGACA-----C--T-----CTCTAA--CAC-A-CA----A------A----AT---A-T--TTT-C-TTGGCT--ATT-TTTTTTTTTTGG-------GGGGGGTGGAAGGCAG----GATA--C-CTGG-A--------AGTT---------G----AAATA-TCAA-T-G-ACAGA-AC-CTTCAA--GC-A---TATTAT-T-CTG---A-A-TTTATGA--C-ACAA-ATTTT--TT-CT-GAT---TCAAACCCGGAAGG-AGGTAA-TGTCC---A-C-T-ATTAG--------AG-TA-TG----CT-T--GTGG-T-A-TGAAAAT---A-AA-C-CAA-TAC-AAGTTGT--C-AAAATTGTC-----T-AA-TA------C--T-G-A-T-GT-TATCAAA---AAT-ATGATGAGACCATGAAGAA----T-----AAA---A------------------A-ATAGAAT-A--------CGAAGAGCTA-CA-A---ATGT-C--AAACA-CCA-G--TT-AC-A---A-CGC---A-TC---A------TTAATA-TTA---TGGCTT-C----TT---T-A--C-AGTC--------GATTGCACAT------------TATGAAT-AGT------------C-A-----CACCA-ATTTT--T--ATT--TCA-G--G-T--TTCA-ATTT--TTATA-AATT-AA--TT-GA--AA-GAC-ATAC--A-TCAGAAAAT-TAAAT-----T------AAT--A---A-AA----T--T-ACTTTT---C-GACC-AATTA----ATTC-ATTG---ATT-ATTAAT-----A-A--A--TTA--AT-TTAATAT---A-A-TT----A-------AGA-GACA--A-G----TATGAT-ACA--------------TGTACATGT----CTGT-C----CTTGTA-T-cggaagaaccacccaccggctccatgctggcttacaaagatgaagcccatgttttgccactctggcgggttcgggcgttcaa
gi|4                          :           gcaatttatacaccctgtccCCC-----T-GCT----TTCCCCTC---CCCCCACGCAGG-----G-GG-----AA--T-TT-TGAA-GG-G--TTTTG-----A--TT-----TT-TG-A-A---A-GG------CT--T---T----AT-C--AAA---T-CTAACAAATAGA-GCCATGTTTGAACCACTTGGCCTGAGCCGGGGGTCGTTAAGGAGTTTT--GGGGT--A----T-A---ACTTAAG--AA---TTT-TAT--CA--AAAATGCTGCT-GAA----TTTGG--A--A---AAAAAAAAAAACTGG----TA-T---AAAT-C-T-TAA---TA--T----CTT-TG--TTTTT--TG----TT-TGTTC---TTGA-ACA-T-A-TTGGC-T-G-T----AT--CAT--AA-AATG---TCATAA-A-CTAC---GA-ACAGACA-----CC-T-----CA--AA--CAC-A-CAA---T------T----TT---A-T--TTT-C-TTGGCT--ATT-ATT--------G-------GGGGGG--------GGGGGGAATA--C----G-A--------TTTTT-----G-TGGTGAAAA-A-TCAA-T-GGA--AA-AC-CT---C--AT-A---T--T-T-TTCT----ATA-T-----G--T-GCAA-TT--T--TT-AT-GAT---TCAAA-------CGGA---AT-TGT-T---C-TGT-TTT----------GG-TA-TG-GC-TT-TTGGG-G-T-A-TG--CATT--A-AT-C-C-A-T-C-A--TT-T--C-AA-----TT-----T-AAATA-T----T--TTGCA-T--T-T----AA---AATTAT--T-------TG----G----TTAAAAAAA---A------------------A-A-AAAAT-A--------C-----TCTTCCA-A---A-GTGG--AAACA-CTC-A--TT-AC-A---AGCGC---A-T-GC-A------TTAG-A-TTA---ATGC-T-C----AT---T-A--C-A-TC--------A-TTG--CAT------------T---AAT-A-T------------C-AC----CC-CA-A-TTT--T--ATT--T-A-GGAG-T--T--A-AATT--TTA-A-T--A-AA--TT-GA--AAGGACAAAAA--A-TCAG--AAT-AAAAAG----T------AAG--G---A-AA----T--T-A---TT---C-TACT-AATTA---------ATTA---ATT-A--AAT-----T-A--A---TA--AT-T--AT-TTTGA-T-TT----A-------AGA-GACA--ATT----TATGAT-ACATGGTACAA-----------AAGT----CTGT-TGTA-CTTATATT-GGTTATGaaacttatatttgtggtttgctaacgagtcaggttatctcctatataggattt
gi|10                         :                                                            agcgttgctcaagtaca-GG-----AA--T-TT-TGAA-GG-G--TAT-G-----A--TT-----TTCTG-A-A---AAG-------CT--T-A-TTTTAAA-A--AAA---TGCTA-CAAA---A-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNN--NNNNN--N----N-N---TCTTAAG--AA---ATT-TAT--CA--GAAA--TTGCT-GAA--A-TTTGG--G--A---AAA--------CTG-----TA-T---ACAT-C-T-TAG------------TTT-TA--TTTTT--TG----TT-TGTCT---T--A-ACA-T-A-T-GGC-T-G-T----AT--CAT--AA-A-TG---TCATAA-A-CTATCAGGA--CAGACA-----C--CTAGGCCA--AA--CAC-A--A----T------T----TTTTTA-T--TTT-C-TTGGCT--ATT-TGG--------GAGGGGGCGGGGGG--------GG----GATA--C-C--G-A--------TTTTTTTTTAG-TG----AAA-A-TCAA-T-G-A--AA-AC-CTTA-A--AA-A---T--T-T-T-CT----A-A-T-----AT-C-GCAG-TT--T--TT-GT-GAT---TCAAA-----A-CG-A---AT-TGT-C---AAT-T-TTT----------AG-TA-TG-GC-TT-T---T-GAT-A-TG--AAT---A-AT-C-C-A-T-C-A--TT-T--C-AA-----TT-----T-GA-TA-TAAATT--T-GCA-T-GT-T----AAA--CAT-AT--T-------CG----A----T-----AAA---A------------------T-A-AAATT-AC-------T-----TCT--CA-A---A-GTGG--AAACA-CTC-A--TT-AC-A---A-CGC---A-TCAT--------TTAA-A-TTA---ATGC-T-------T---C-A--CTA-TCAAATTAATG-CTT--CGT------------T----AC-A-T------------C-A-----CA-CT-A--TT--T--A-T--TCA-G--GTT--T--A-ATTC--TTT-A-A--T-AA--TT-GA--AA-GAC-AAAA--A-TTAG--AAT-AAAAAAATACT------AAT--A---A-AC----T-GT-T---TTNNNN-NNNN-NNNNN----N-NN-NNNN---NNN-N--NNN-----N-N--N--NNN--NN-C--AT-T---T-A-GT----A-------AGA-GACA--A-T----TATGAT-ACAT-TTACAA-------------GT----CTGT-TGTA-TTT-TATT-GG-TATGcagggttttcaatagtat
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gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                ccttgagctgccaaaaccctgctctcccttccccccagggatattttaagtatgaattttctgaaaagctactatacaaatgctacaaaaggaccatatgttcctactctgcctgtatgggcgtcaggatgtttttggggtaaattttcttaagtaatttttttatcaaaagccgctgaagtggtgaatataaacggcgctttattaacctgaaattttagcgttttggtttggtaacagtgatggcttggattccataaatggaattaaaaacgattcgacacaacacccaaagcacaacaatgtgattttttcttggctatcgggtggggggggggggcgcataataacctgaagttggggaacattttaatgtgctatttagtactattctctacttcctatcgcctcatctcttctcgatatcttt--TT-GT-GAT---TCAGA-----A-CG-A---AT-TGT-C---A-T-T-TTTTTTTTTTTTTGG-TA-TG-AC-TT-T--TG-G-T-A-TG--AAT---A-AT-----------A----------AA-----TT-----T-AA-TA-T----T--T-GCA-T-GT-T----AAACATAT-AT--T-------TG----G----T-----AAA---A------------------T-A-AATTT-C--------T-----TCT--CA-A---AAGTGG--AAACA-CTC-A--TT-AC-A---A-TGC---A-TCAT-gtctcggtcactttaggatataaatgattggtatgcaatttctcaataa
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -T-TTT----------GG-TA-TG-GC-TT-T--TG-G-T-A-TG--AAG---A-AA-C-C-G-T-T-A--TT-C--C-AT-----TT-----G-AA-TA-T----C--T-GCA-T-AC-T----AA---
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ggc-TA-TG-GC-TT-T---T-G-G-GATG--ACT---A-AT-C-C-A-T-C-A--TT-T--C--C-----TT-----A-AA-TA-T----T--T-GCA-T-GT-T----AA---CA--A---T-------TG----G----T-----AAA---A------------------A-A-AAAAC-T--------T-----TC------A---C-GTGG---AACA-CTC-CCTTT-AC-----A-C-C---A-TC---A------TTAA-A-TTA---ATGCTT-C----GT---T-A--C-A-TC--------A-TGA-----------------T---AAT-A-T--------------A-----CA-CA-A-TTT--T--Aa
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ---A-AT-C-C-A-T-C-AA-TT-T--C-AA-----TTAAACAT-AA--A-T----TA-T-GCA-TAGTAT----AA---CATTAT--CC------TG----GAAAAT-----AAAGAAA------------------A-A-AAAAT-ACC------T-----TCT--AA-A---A-GTGG--AAG-A-CT--A--TT-AT-ACAAA-CGC---A-TCA--A------TAAA-AATTA---ATGC-TTC----GT---T-A--C-A-TC--------A-TTA--GAT------------TGA-AAT-A-TAAAC--------C-A-----AA-CA-A-TCTATT--ATTAATCC-G--G-TATT--A-ATATA-TTA-ATA--A-AA--TT-GA--AA-GAG-CAAA--A-TCAG--AAT-AAAAAATAC-T------AATAAA---A-AA----C-AT-A---TA---C-TATTAAATTAACATA-TG-ATTG---ATTAA--AATAAATAT-A--A--TTA--AT-C--AT-T---A-A-TTATAAA-------AGA-GCCA--A-TA---TATGATAACAT-GTACAAAATGTTTGTATATGTAAAACTAT-TGTA----ATA-TAGG-TATAAatgagtccaacataagactgagtcctaattataaactgtaggtacacaaatcatggtaacacagtaag
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           atgacacc----T--T-GCA-T-GT-T----AAA--CAT-AT--T-------TG----G----C-----CAA---A------------------A-A-AAAAA-C--------T-----TCT--CA-ATTTA-GTGG--AAACA-TTC-A--TT-AC-A---A-CGC---A-TCAT-agacacagggttcatcactagaatt
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 T-AT--T-------TG----G----C-----CAA---A------------------A-ACAAAAC-AAACACAACT-----TCT--CA-A---A-GTGG--AAACA-TTC-A--TT-AC-A---A-CGC---A-TCAC---------TAA-A-TTA---ATGC-TTC----GT---T-A--C-A-TC--------A-TTG--CAT------------T---AAT-A-T------------C-A-----CA-CA-A-TTT--TAAATT--TCA-G--T-T--T--A-A-TT--TTA-A-A--T-AA--AT-GA--AA-GAC-AAAA--A-TCAG--AAT-AAAGA-----T-------AT------A-AA----C--T-A---TT---C-TATT-A-------------ATTA---ATT-A--AAT-----T-A--A--TT---------AT-T---A-ATTT----A-------AGA-GAAA--A-T----TATGAT-ACAT-GTACt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                t--TT-AC-A---A-TCT---A-TCAT----------------TA---ATGT-T-TT---AT---T-A--C-A-TC--------A-CTG--CATAT----------T---AAT-A-TACATATATTAATC-A-----CA-CA-A-TTT--T--ATT--TCA-G--G-T--T----------TTG-A-T--G-AA--TT-AA--AA-GAC-AAAA--A-TCAT--AAT-AAAAA-----T------ACT--A-------------AT-A---AG---C-TATC-G--CA----A-TA-TTTC---GTT-A--AAT-----T-G--A--TTA--GT-T--AT-C---A-A-TC----A-------AGA-GACA--ttc
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tattgtgcattttacaacatatataagttaattagataccaaatgcgtttccagagagcaaaatagcatatagaataaatgtataatTAA-A-TTA---TTGC-TTC----GT---T-A--C-A-TC--------A-TTG--CAT------------T---AAT-A-T------------C-A-----CA-CA-A--TT--T--ATT--TCA-G--GTT--T--A-ATTT--T---A-A--TAAA--TT-GA--AA-GGC-AAA-----------AAT-AAAAA-----T------AAT--A---A-AA----C-AA-A---TT---C-TA---AA------------ATTA---ATT-A--AAT-----T-A--AAGTAA--AT-T--AT-T-----T-TT----A-------AGA-GAAA--A-T----TATG-----AT-GTACA-------CGTGTATGT----CCGT-TGTA-CTTGTATT-GGTTATG
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gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TT--TTA-A-T--A-AA--CT-GA--AA-GAC-AAAT--A-TCAG--AAT-AAAAA-----T------ACT--AGT-A-AA----CTATAA---TT---C-TATT-AATCA---------ATTG---A-T-G--AAT-----T-A--A--TTA--AT-C--AT-T---A-ATTT----A-------AGA-GACA--A-T----ttgcagagttctcactaagaa
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             gtgtga--TCA-A-A--T-GA--T------AA-GA----AA--T-TCAG--ATT-AAAAA-----T------ACT--A---ATAA----T-CT-G---AT---G-CATC-AATTA----A-T---TTA---ATT-A--A-T-----T-G--A--TTA--AT-C--AA-T---C-A-------A-------AGA-GACT--A-T----TATGAT-AGAT-GTACA-------TA-ATATGT----CTGT-TGTA-CTTGTA-
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -ATTA---AAT-G--AAT-----A-A--A--TTA--AT-C--AT-T---A-A-TCA---A-------AGA-TACAATA-T----TATGAT-ACGT-GTA---------TATATATGT----ATGT-TATA-CTTGTATT-TG-TATGcatgtatttact
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tttgtcattt---A-A-AT----A-------AGC-GACC--A-T----TATGAT-ACAT-GTAC-----------ACA-GT----CTGT-TGTA-CTT-TATT-GG-TATGcagggttcttactagga
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|41 ): TATTTATAACCCTTTTGGAATTAATTCATAAAACAATTCTAAAAGTTTCTAAGCTAAATTT






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Reference ( family-606 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GACCTTGA-G--CT-G-C-C-AATAACCCC-----T-G-T----TCCCCCCC---CCCCC---CAGG-----G-GG-----A-A--T-TT-TGAA----G-G-G--TAT-G-A--TT-TTCTG-A-A---A-G-------CT--T-A-T----AA-C--AAA---TGCTA-CAAAA-NNNNNCCNN---T--GTNN--C-NCNNC---G---C--GNNT-NG--GG-GGNNN---AA--G-A-G-TTTTGGGGTA----A-A---TCTTAAG--AA---T-TTTATCAAAAA-ATCGCT-G-AA--ATTTG--G-A--A---A--AA--------CTG-----TA---TA-AAT-C-TT--AAATA--T----TTT-TA--TTTTT--TG----TT-TGT-CT---T-A-ACA-T-AT-GGC-TG-T----AT-T-CAT--AA-A-TG---TCAT-AA-ACTATCAGGAACAGAC-A-----C--T-----CA-AA--CAC-AC--A----T------T-TT---A---T--TTT-C-TTGGCT--A-------TT-TTT--------G-------GGGGGGG---------G-G----ATA--C-C--G-A--------TTTTT-----G-TG----AAA-A-T-C-AAT-G--AAA-AC-C-T-CA---AC-A-T-T-T-TCT----AA---TA-T--CGCAA--TT-TTT--G-TGAT---T-CAAA-----AACG-A---AT-T-GT---C-AT-T-TTT----------GG-TA-TG-GC-TTT--GGGT-ATG--AAT---A-AT-C-C-AT-C-A--TT-T--C-AA-----TT-----T-AA-T----AT-T--T-GCA-T-GT-T----AA---CAT-AT--T-------TG----G----T-----AAA---A------------------A-A-AAAAT-A--------T-----TCT--CA-A---A-GTG-G--AAACA-CTC-A--TT-AC-A---A-CGC---A-TCA-T-A------TTAA-ATTA---ATGC-T-C----GT---T-A--C---A-TC-ATTG--CAT---------T---AA-TA-T------------C-A-----CA------CA-A-TTT--T--ATT--T---CA-G--G-T--T--AATTT-TTA-A-A--NAATT-G--A--AA-GAC-AAAA-A--T--CAG--AAT-AAAAA-----T------AAT--A---A-AA----C-AT-A---TTC-TATT-AATTAAT--A-T-TA---ATT-----A--AAT-----T-A--A--TTA--AT-T----AT-T---A-A-TT----A-------AGA-GACA--A-T----TATGAT-ACATGTACA-------TGTAC--ATGT----CTGT-TGT----A-CTTATATTGG-TATGA
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ---A-AT-C-C-AT-C-AA-TT-T--C-AA-----TTAAACAT-AA------AT-TA-T-GCA-TAGTAT----AA---CATTAT--CC------TG----GAAAAT-----AAAGAAA------------------A-A-AAAAT-ACC------T-----TCT--AA-A---A-GTG-G--AAG-A-CT--A--TT-AT-ACAAA-CGC---A-TCAAT-A------A-AA-ATTA---ATGC-TTC----GT---T-A--C---A-TC-ATTA--GAT---------TGA-AA-TA-TAAAC--------C-A-----AA------CA-A-TCTATT--ATTAAT---CC-G--G-TATT--AATATATTA-ATA--AAATT-G--A--AA-GAG-CAAA-A--T--CAG--AAT-AAAAAATAC-T------AATAAA---A-AA----C-AT-A---TAC-TATTAAATTAAC--A-TATG---ATTGATTAA--AATAAATAT-A--A--TTA--AT-C----AT-T---A-A-TTATAAA-------AGA-GCCA--A-TA---TATGATAACATGTACAAAATGTTTGTAT--ATGTAAAACTAT-TGT----A----ATATAGG-TATAA
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            atgacacc-A---A-G-------CT--T-A-T----AA-A--ACT---TGATA-CAAA---TGAGCCA----T--GTTT----GCACC---G---T--GCCC-CGTTGG-GGATT---AA--G---G-ATTTGGGAGA----A-A---T--TAAG--AAA--TGTTTATCAAAA--ATCGCT-G-AAG-ATTT---G-A--A---A--AA--------CT------TA---TATAAT-C-TA--AACTA--T----TTT-TT--ATTTT--TG----TT-TGT-CT---T-C-ACA-T-AT-TGC-T--C----ATAT-CAT--AA-A-TA---TCAT-AA-ACTATCAGAA--AGAC-A-----CCTT-----C--AA--CAC-AC--A------------------A---T-------------T--A-------TT-TTT--------G-------GGAAGAA---------ACA----ATA--C-G--G-A---------TTTT-----G-TG----AAA-ATT-C-AAT-G---AA-AC-C-T-CA---AA-A-T-T-T-CCT----AA----A-T--CGCAG--TTGTTT--G-TAATTGGT-CAAACG---AATG-A---AT-T-GTG--T-AT-T-TTT----------agacacagggttcatcactagaatt
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gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             --TT-AC-A---A-TCT---A-TCA-T---------------TA---ATGT-T-TT---AT---T-A--C---A-TC-ACTG--CATAT-------T---AA-TA-TACATATATTAATC-A-----CA------CA-A-TTT--T--ATT--T---CA-G--G-T--T--------TTG-A-T--GAATT-A--A--AA-GAC-AAAA-A--T--CAT--AAT-AAAAA-----T------ACT--A-------------AT-A---AGC-TATC-G--CAAT--ATT-TC---GTT-----A--AAT-----T-G--A--TTA--GT-T----AT-C---A-A-TC----A-------AGA-GACA--ca
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tattgtgcattttacaacatatataagttaattagataccaaatgcgtttccagagagcaaaatagcatatagaataaatgtataatATCTTCA-G--CT-G-C-C-AATATCGCC-----T-G-T----T--CCCAA---CCCTT---CAGG-----G-TA-----A-G--T-TT-TGGA----G-GCT--TAT-GAA--TT-TTCTG-A-A---A-G-------CT--T-A-T----AA-A--AAA---TGTAA-CAAAA-TGAG--CTT---G--GTTG--C-ACT-----G---T--GATTGTG--AG-CGTTT---AACTT-C-A-TTTTG----------------CTTAAT--AA---C-T-----AAAAA-ATCGCT-G-AAG-A--TG--G-G--A---A--AA--------CTG-----TG---T
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gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -T-C-AAT-G--AAA-AC-C-TTCA---AT-A-TGT-T-TCT----AT---GA-----GCAAC-TT-TTT--G-TGATA--T-CAAA-----A-CGTA---ATAT-GT---CTAA-T-TTT----------GG-T---G-GC-TT----GGT-A-G--AATT--A-AC-C-G-AT-T----TT-T--C-AA-----TT-------AA-T----AT-T----ACT-T-GT-T----AA---AAC-AT--A-------TG----T----A-----AAA---A------------------A-A-AAAAC-C--------C-----TCT--CA-A---A-GTG-A--AAACACCTCAA--TT-AC-A---A-CGC---A-TC----A------TTAA-A-TA---ATGT-T-C----AT---T-A--C---A-TC-CATG--CAT---------T----A-TA-T------------C-A-----CC------CA-A-TTT--C--ATT--CGTATA-G--ATT--T--AATT-----------AAATT-G--A--AA--AC-AAAA-A--T--CTA--AAT-GAAAA-----T------AAG--A---A---------TT-A----TC-TATT-AAGTAAT----T-AA---ATT-----T--AAT-----C-AATA--TTA--AT-T----TT-T-------TT----A-------AGAGGACA--A-T----TAT-AT-ACATGTATA-------AGTggcgcataataacctgaagttggggaacattttaatgtgctatttagtactattctctacttcctatcgcctcatctcttctcgatatcttttcaatgaaaaccttcaatatgtttctatgagcaactttttgtgatatcaaaacgtaatatgtctaattttggtggcttggtagaattaaccgatttttcaattaatattacttgttaaaacatatgtaaaaaaaaaaaccctctcaaagtgaaaacacctcaattacaacgcatcattaaataatgttcattacatccatgcattatatcacccaatttcattcgtatagatttaattaaattgaaaacaaaaatctaaatgaaaataagaattatctattaagtaattaaatttaatcaatattaatttttttaagaggacaattatatacatgtataagtctcggtcactttaggatataaatgattggtatgcaatttctcaataa
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ccttgagctgccaaaaccctgctctcccttccccccagggatattttaagtatgaattttctgaaaagctactatacaaatgctacaaaaggaccatatgttcctactctgcctgtatgggcgtcaggatgtttttggggtaaattttcttaagtaatttttttatcaaaagccgctgaagtggtgaatataaacggcgctttattaacctgaaattttagcgttttggtttggtaacagtgatggcttggattccataaatggaattaaaaacgattcgacacaacacccaaagcacaacaatgtgattttttcttggctatcgggtggggggggggggcgcataataacctgaagttggggaacattttaatgtgctatttagtactattctctacttcctatcgcctcatctcttctcgatatcttt-TA-TG-GC-TTT--TGGG-ATG--ACT---A-AT-C-C-AT-C-A--TT-T--C--C-----TT-----A-AA-T----AT-T--T-GCA-T-GT-T----AA---CA--A---T-------TG----G----T-----AAA---A------------------A-A-AAAAC-T--------T-----TC------A---C-GTG-G---AACA-CTC-CCTTT-AC-----A-C-C---A-TC----A------TTAA-ATTA---ATGCTT-C----GT---T-A--C---A-TC-ATGA--------------T---AA-TA-T--------------A-----CA------CA-A-TTT--T--Actcggtcactttaggatataaatgattggtatgcaatttctcaataa
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TAA-ATTA---TTGC-TTC----GT---T-A--C---A-TC-ATTG--CAT---------T---AA-TA-T------------C-A-----CA------CA-A--TT--T--ATT--T---CA-G--G-T--T--TAATT-TTA-A-T--AAATT-G--A--AA-GGC-AAA-------------AAT-AAAAA-----T------AAT--A---A-AA----C-AA-A---TTC-TA---AA-------A-T-TA---ATT-----A--AAT-----T-A--AAGTAA--AT-T----AT-T-----T-TT----A-------AGA-GAAA--A-T----TATG-----ATGTACA-------CGTGT--ATGT----CCGT-TGT----A-CTTGTATTGGTTATGatgagtccaacataagactgagtcctaattataaactgtaggtacacaaatcatggtaacacagtaag
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     A-T------------C-AA----CA------CA-A-TTT--T--ATT--T---CA-G--T-A--T--AATTT-T---A-A--AAATT--------A-G----AAA-A--T---------T-AAAAA-----TTCACTCAAT--T---A-AA------AT-A---TTC--ATC-AATAACTGAA-T-TA---ATT-----A--ATT-----TAA--A--TTC--AT-T----ATCC---A-ATTT----A-------AGA-GACA--A-T----TATTTT-A-----ACA-------TCTAT--ATGTC---CTGT-TGA----ACCTTATATAGG-TATcagggttctcactaagat
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           -AACAACCCG-----T-A-G----TTCCCCCC---AGATC---CAAG-----G-GG-----A-G--T-TT-TGAA----G-G-GTTTATGG-A--TT-TTCTG-ACA---A-GACTCACTCC--T-A-T----AA-C--ttgcagagttctcactaagaa
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CTTGATG--CT-G-CTC-AGCAACCTC-----T---------------------CCC---CTG-----------------A--T-TT-GAAA----G-G-G--TAT-G-GG-TT-TTCCG-A-A---A-G-------CT--T-A-T----AA-A--AAA---TGCTG-CAAAA-TGAG--CCA---T--GTAG--T-ACCCT---G---A--AGTT-GG--GA-GCGTT---AA--GAA-G-TTTAGGGGGT----A-A---TATTTAG--AA---A-TTTAcggaagaaccacccaccggctccatgctggcttacaaagatgaagcccatgttttgccactctggcgggttcgggcgttcaa
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ctaaTT--G-TGAT---T-CAGA-----A-CG-A---AT-T-GT---C-AT-T-TTTTTTTTTTTTTGG-TA-TG-AC-TTT--TGGT-ATG--AAT---A-AT----------A----------AA-----TT-----T-AA-T----AT-T--T-GCA-T-GT-T----AAACATAT-AT--T-------TG----G----T-----AAA---A------------------T-A-AATTT-C--------T-----TCT--CA-A---AAGTG-G--AAACA-CTC-A--TT-AC-A---A-TGC---A-TCA-T-
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gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    A--T----TTT-TA--TTTTT--TG----TT-TGT-CT---T-A-ACA-T-GT-GAC-TG-T----A--T-CAT--AA-A-TG---TCAT-GG-ACTATCAGG-ATATAC-AC----C--T-----CA-AA--CAC-A---A----T------TCTT---A---A--TTT-C-TTGGCT--A-------c
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gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ----A-A---TCTTAAGCTAA---T-T--ATCAAAA--ATCGCT-G-AA--ATTTG--G-G--A---A--AA--------CTG-----AA---TT-AAT-C-TT--t
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -T-TTT----------GG-TA-TG-GC-TTT--TGGT-ATG--AAG---A-AA-C-C-GT-T-A--TT-C--C-AT-----TT-----G-AA-T----AT-C--T-GCA-T-AC-T----AA---tttttctcagttt
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ggcGACCTTGA-G--CT-G-C-C-AATAACTCC-----T-G-T----CTCTCCCC---CCCCC---CCCG-----G-GG-----A-A--T-TT-TGAA----G-G-G--TAa
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                taCCC-----T-GCT----TTCCCCTC---CCCCCACGCAGG-----G-GG-----A-A--T-TT-TGAA----G-G-G--TTTTG-A--TT-TT-TG-A-A---A-GG------CT--T---T----AT-C--AAA---T-CTA-ACAAA-TAGAGCCATGTTT--GAAC--C-ACTTG---G---CCTGAGC-CG--GG-GGTCGTTAAG--G-A-G-TTTTGGGGTA----T-A---ACTTAAG--AA---T-TTTATCAAAAATGCTGCT-G-AA---TTTG--G-A--A---A--AAAAAAAAAACTGG----TA---TA-AAT-C-TT--AA-TA--T----CTT-TG--TTTTT--TG----TT-TGTTCT---TGA-ACA-T-ATTGGC-TG-T----AT---CAT--AA-AATG---TCAT-AA-ACTAC---GAACAGAC-A-----CC-T-----CA-AA--CAC-AC--AA---T------T-TT---A---T--TTT-C-TTGGCT--A-------TT-ATT--------G-------GGGGGGG---------G-GGGGAATA--C----G-A--------TTTTT-----G-TGGTGAAAA-A-T-C-AAT-GG-AAA-AC-C-T-CA----T-A-T-T-T-TTC----TA---TA-TG-TGCAA--TT-TTT--A-TGAT---T-CAAA-------CGGA---AT-T-GT---T-CTGT-TTT----------GG-TA-TG-GC-TTTTGGGGT-ATG--CATT--A-AT-C-C-AT-C-A--TT-T--C-AA-----TT-----T-AAAT----AT-T--TTGCA-T--T-T----AA---AATTAT--T-------TG----G----TTAAAAAAA---A------------------A-A-AAAAT-A--------C-----TCTTCCA-A---A-GTG-G--AAACA-CTC-A--TT-AC-A---AGCGC---A-T-G-C-A------TTAG-ATTA---ATGC-T-C----AT---T-A--C---A-TC-ATTG--CAT---------T---AA-TA-T------------C-AC----CC------CA-A-TTT--T--ATT--T----A-GGAG-T--T--AAATT-TTA-A-T--AAATT-G--A--AAGGACAAAAA-A--T--CAG--AAT-AAAAAG----T------AAG--G---A-AA----T--T-A---TTC-TACT-AATTA----A-T-TA---ATT-----A--AAT-----T-A--A---TA--AT-T----AT-TTTGA-T-TT----A-------AGA-GACA--ATT----TATGAT-ACATG------------GTACAAAAGT----CTGT-TGT----A-CTTATATTGGTTATG
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        agcgttgctcaagtacaCTTTGA-G--CT---C-C-AATAACCC------T-G-CCAACTCGCCCCC---CTTCC---C-TT-----G-GG-----A-A----TT-TGAA----G-G-G--TAT-G-cagggttttcaatagtat
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             t-TT-TGAC----G-G-G--TAT-G-A--TT-TTCTG-A-A---A---------CT--T-ATT----GA-A--AAA---TGCTA-CAAAA-
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GACCT--G-G--CT-TTC-C-AAT---CCC-----T--------TCCCCCCC---CGCCC---GGGG-----G-GGGGGGGA-A--T-TT-TGAA----G-G-G--TAT-G-A--TTGTTCTG-A-A---A-GA------CT--T-A-T----AA-C--AAT---TGC-A-CCACA-TGAGCC--A---T--GTTATGC-ACTCT---G------GCGT-TG--GG-G-CGT---AA--G-A-G-TTTTGGGGTA----A-AA--TCTTAAG--A------TTTATCAATAA-ATCGCT-GAAA--ATTTG--GTA--A---A--AA--------CTG-----TA---TA-AAT-C-TT--AAA-A--TA---TTT-TG--TTTTT--TG-----T-TGT-TT-------AC--T-AT-GGC-T--C----GT-T-CAT--AATA-TG---TC-T-AA-AC--TCAGG-ACAGACAA-----C--T-----CA-AAATCAC-AC--AT---T------T-TT---A---TGCTTT-C-TTGGCT--A-------TT-TTT----------------TGGGGGA---------A-A----ATA--C-CG-G-A--------TTTTT-----GCTG----AAA-T-T-CAAAT-G--ACA-AC-C-T-CA---AT-A-T-T-T-TTTC---CA---TA-T--TG-AA--TT-TTT--GTTGAT---T-C-AA-----AGCG-A---AT-T-GTCGCC-AT-G-TTT----------GG-T--TG-GC-TTT--GGGT-ATC--GAT---A-AT-C-CAAT-C-A--TT-TC-C-AA-----TT-----T-AA-TA---AT-G--T-TCACT-GT-T----AA---CA--A---T-------TG----G----T-------A---A------------------A-A-CAAAT-AC-------T-----TCT--CA-A---A-A-G-G--AAACA-CTC-A--TT-AC-A---G-AGC---A-TC----A------TTAA-ATTA---ATGCTT-C----AT---T----C---A-CC-ACT----AT---------T---GATTA-T------------CTA-----TA------CACA-TCT--T--A----T---CA-G--G-T--T--AAATT-TTA-ATA--AATTT-GATA--AA-GAC--AAA-A--T--CAG--AAT-GAAAA-----T------AAT--A---A-A-------TT-A---TTC----T-AAT---T--A-T-TA---ATT-----A--A-------T-A--A--TTA--AT-T----AT-TTTAA-A-TT----A-------AAA-AAAA--A-tgag
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Reference ( family-606 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GACCTTGA-G--CT-G-C-C-AATAACCCC-----T-G-T----TCCCCCCC---CCCCC---CAGG-----G-GG-----A-A--T-TT-TGAA----G-G-G--TAT-G-A--TT-TTCTG-A-A---A-G-------CT--T-A-T----AA-C---AA------------------A---TGC-----TA-CAAA-A-TGGGNCC-NNTG-T-T---N----C-ACT--CC---G-C--GNNT-NG--GG-GGN--TTAA--G-A-G---TTTTGGGGT-A----A-A---TCTTAAG--AA---T-TTTATCAAAAA-ATCGC-TG-AA--ATTTG--G-A--A---A--AA--------CTG-----TA---TA-AAT-C-TT--AAATA--T----TTT-TA--TTTTT--TG----TT-TGT-CT---T-A-ACA-T-AT-GGC-TG-T----AT-T-CAT--AA-A-TG---TCAT-AA-ACTATCAGGAACAGAC-A-----C--T-----CA-AA--CAC-AC--A----T------T-TT---A---T--TTT-C-TTGGCT--A-------TT-TTT--------G-------GGGGGGG---------G-G----ATA--C-C--G-A--------TTTTT-----G-TG----AAA-A-T-C-AAT-G--AAA-AC-C-T-CA---A-NA-T--T-T-TCT----A-A---TA-T--CGCAA--TT-TTT--G-TGA-T---TCAAA-----AACG-A---A-T-TGT---C-AT-T-TTT----------GG-TA-TG-GC-TTTNG-G--T-ATG--AAT---A-AT-C-C-AT-C-A--TT-T--C-AA-----TT-----T-AA-T----AT-T--T-GCA-T-GT-T----AA---CAT-AT--T-------TG----G----T-----AAA---A------------------A-A-AAAAT-A--------T-----TCT--CA-A---A-GTG-G--AAACA-CTC-A--TT-AC-A---A-CGC---A-TCA-T-A------TTAA-ATTA---ATGC-T-C----GT---T-A--C---A-TC-ATTG--CAT---------T---AA-TA-T------------C-A-----CA------CA-A-TTT--T--ATT--TCA-G--G-T--T--AATT-T-TTA-ANA--AA-TT-G--A--AA-GAC-AAAA-A--T--CAG--AAT-AAAAA-----T------AAT--A--A--A---AC-NT-ATTC-TATT-AATTAAT--A-T-TA---ATT-----A--AAT-----T-A--A--TTA--AT-T----AT-T---A-A-TT----A-------AGA-GACA--A-T----TATGAT-ACATGTACA-------TGTAC--ATGT----CTGT-TGT----A-CTTATATTGG-TATGA
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ---A-AT-C-C-AT-C-AA-TT-T--C-AA-----TTAAACAT-AA------AT-TA-T-GCA-TAGTAT----AA---CATTAT--CC------TG----GAAAAT-----AAAGAAA------------------A-A-AAAAT-ACC------T-----TCT--AA-A---A-GTG-G--AAG-A-CT--A--TT-AT-ACAAA-CGC---A-TCAAT-A------A-AA-ATTA---ATGC-TTC----GT---T-A--C---A-TC-ATTA--GAT---------TGA-AA-TA-TAAAC--------C-A-----AA------CA-A-TCTATT--ATTAATCC-G--G-TATT--AATA-TATTA-ATA--AAATT-G--A--AA-GAG-CAAA-A--T--CAG--AAT-AAAAAATAC-T------AATAAA--A--A---AC-AT-ATAC-TATTAAATTAAC--A-TATG---ATTGATTAA--AATAAATAT-A--A--TTA--AT-C----AT-T---A-A-TTATAAA-------AGA-GCCA--A-TA---TATGATAACATGTACAAAATGTTTGTAT--ATGTAAAACTAT-TGT----A----ATATAGG-TATAA
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gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          --TT-AC-A---A-TCT---A-TCA-T---------------TA---ATGT-T-TT---AT---T-A--C---A-TC-ACTG--CATAT-------T---AA-TA-TACATATATTAATC-A-----CA------CA-A-TTT--T--ATT--TCA-G--G-T--T---------TTG-ATG--AA-TT-A--A--AA-GAC-AAAA-A--T--CAT--AAT-AAAAA-----T------ACT--A--A----------T-AAGC-TATC-G--CAAT--ATT-TC---GTT-----A--AAT-----T-G--A--TTA--GT-T----AT-C---A-A-TC----A-------AGA-GACA--ca
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tattgtgcattttacaacatatataagttaattagataccaaatgcgtttccagagagcaaaatagcatatagaataaatgtataatATCTTCA-G--CT-G-C-C-AATATCGCC-----T-G-T----T--CCCAA---CCCTT---CAGG-----G-TA-----A-G--T-TT-TGGA----G-GCT--TAT-GAA--TT-TTCTG-A-A---A-G-------CT--T-A-T----AA-A---AA------------------A---TGT-----AA-CAAA-A-TGAG--C-TTGG-T-T---G----C-ACT-------G-T--GATTGTG--AG-CGT--TTAACTT-C-A---TTTTG-----------------CTTAAT--AA---C-T-----AAAAA-ATCGC-TG-AAG-A--TG--G-G--A---A--AA--------CTG-----TG---T
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         T-AT--T-------TG----G----C-----CAA---A------------------A-ACAAAAC-AAACACAACT-----TCT--CA-A---A-GTG-G--AAACA-TTC-A--TT-AC-A---A-CGC---A-TCA-C---------TAA-ATTA---ATGC-TTC----GT---T-A--C---A-TC-ATTG--CAT---------T---AA-TA-T------------C-A-----CA------CA-A-TTT--TAAATT--TCA-G--T-T--T--AATT-T-TAA-ATA--AA--T-G--A--AA-GAC-AAAA-A--T--CAG--AAT-AAAGA-----T-------AT--A--A--A------CT-ATTC-TATT-AATTA----A-T-TA------------------------A--A--TTA--AT-T----AT-T---A-ATTT----A-------AGA-GAAA--A-T----TATGAT-ACATGTACttgtgagtcactctatgttattgaaatttatatcacaatagtgtaaattttacaattctagtagt
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gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    -T-C-AAT-G--AAA-AC-C-TTCA---A-TA-TG-T-T-TCT----A-T---GA-----GCAAC-TT-TTT--G-TGA-TA--TCAAA-----A-CGTA---A-TATGT---CTAA-T-TTT----------GG-T---G-GC-TT--G-G--T-A-G--AATT--A-AC-C-G-AT-T----TT-T--C-AA-----TT-------AA-T----AT-T----ACT-T-GT-T----AA---AAC-AT--A-------TG----T----A-----AAA---A------------------A-A-AAAAC-C--------C-----TCT--CA-A---A-GTG-A--AAACACCTCAA--TT-AC-A---A-CGC---A-TC----A------TTAA-A-TA---ATGT-T-C----AT---T-A--C---A-TC-CATG--CAT---------T----A-TA-T------------C-A-----CC------CA-A-TTT--C--ATT--C------G-TA-T--AGAT-T-TAA-TTA--AA-TT-G--A--AA--AC-AAAA-A--T--CTA--AAT-GAAAA-----T------AAG--A--A---------TT-A-TC-TATT-AAGTAAT----T-AA---ATT-----T--AAT-----C-AATA--TTA--AT-T----TT-T-------TT----A-------AGAGGACA--A-T----TAT-AT-ACATGTATA-------AGTggcgcataataacctgaagttggggaacattttaatgtgctatttagtactattctctacttcctatcgcctcatctcttctcgatatcttttcaatgaaaaccttcaatatgtttctatgagcaactttttgtgatatcaaaacgtaatatgtctaattttggtggcttggtagaattaaccgatttttcaattaatattacttgttaaaacatatgtaaaaaaaaaaaccctctcaaagtgaaaacacctcaattacaacgcatcattaaataatgttcattacatccatgcattatatcacccaatttcattcgtatagatttaattaaattgaaaacaaaaatctaaatgaaaataagaattatctattaagtaattaaatttaatcaatattaatttttttaagaggacaattatatacatgtataagtctcggtcactttaggatataaatgattggtatgcaatttctcaataa
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gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TAA-ATTA---TTGC-TTC----GT---T-A--C---A-TC-ATTG--CAT---------T---AA-TA-T------------C-A-----CA------CA-A--TT--T--ATT--TCA-G--G-T--T--TAAT-T-TTA-ATA--AA-TT-G--A--AA-GGC-AAA-------------AAT-AAAAA-----T------AAT--A--A--A---AC-AA-ATTC-TA---AA-------A-T-TA---ATT-----A--AAT-----T-A--AAGTAA--AT-T----AT-T-----T-TT----A-------AGA-GAAA--A-T----TATG-----ATGTACA-------CGTGT--ATGT----CCGT-TGT----A-CTTGTATTGGTTATGatgagtccaacataagactgagtcctaattataaactgtaggtacacaaatcatggtaacacagtaag
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  A-T------------C-AA----CA------CA-A-TTT--T--ATT--TCA-G--T-A--T--AATT-T-T---AAA--AA-TT--------A-G----AAA-A--T---------T-AAAAA-----TTCACTCAAT--T--A--A---A--AT-ATTC--ATC-AATAACTGAA-T-TA---ATT-----A--ATT-----TAA--A--TTC--AT-T----ATCC---A-ATTT----A-------AGA-GACA--A-T----TATTTT-A-----ACA-------TCTAT--ATGTC---CTGT-TGA----ACCTTATATAGG-TATcagggttctcactaagat
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -AACAACCCG-----T-A-G----TTCCCCCC---AGATC---CAAG-----G-GG-----A-G--T-TT-TGAA----G-G-GTTTATGG-A--TT-TTCTG-ACA---A-GACTCACTCC--T-A-T----AA-CCGGAAGAACCACCCACCGGCTCCA---TGCTGGCTTA-CAAAGA-TGAAGCC-CATG-T-TTTGC----C-ACT--CTG--G-CG-GGTT-CG--GG-CGT--TCAA--ttgcagagttctcactaagaa
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Reference ( family-606 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GACCTTGA-G--CT-G-C-C-AATAACCCC-----T-G-T----TCCCCCCC---CCCCC---CAGG-----G-GG-----A-A--T-TT-TGAA----G-G-G--TAT-G-A--TT-TTCTG-A-A---A-G-------CT--T-A-T----AA-C---AA------------------A---TGC-----TA-CAAA-A-TGAGNCCNATG--T--T-G---C-ACT--CT--G-C--GN-GTC-GGG-G--CG--TTAAG---A-G---TTTTGGGGT-A----A-A---TCTTAAG--AA---T-TTTATCAAAAA-ATCGC-TG-AA--ATTTG--G-A--A---A--AA--------CTG-----TA---TA-AAT-C-TT--AAATA--T----TTT-TA--TTTTT--TG----TT-TGT-CT---T-A-ACA-T-AT-GGC-TG-T----AT-T-CAT--AA-A-TG---TCAT-AA-ACTATCAGGAACAGAC-A-----C--T-----CA-AA--CAC-AC--A----T------T-TT---A---T--TTT-C-TTGGCT--A-------TT-TTT--------G-------GGGGGGG---------G-G----ATA--C-C--G-A--------TTTTT-----G-TG----AAA-A-T-C-AAT-G--AAA-AC-C-T-CA---A-NA-T--T-T-TCT----A-A---TA-T--CGCAA--TT-TTT--G-TGA-T---TCAAA-----AACG-A---A-T-TGT---C-AT-T-TTT----------GG-TA-TG-GCTTTT-G-G--T-ATG--AAT---A-AT-C-C-AT-C-A--TT-T--C-AA-----TT-----T-AA-T----AT-T--T-GCA-T-GT-T----AA---CAT-AT--T-------TG----G----T-----AAA---A------------------A-A-AAAAT-A--------T-----TCT--CA-A---A-GTG-G--AAACA-CTC-A--TT-AC-A---A-CGC---A-TCA-T-A------TTAA-ATTA---ATGC-T-C----GT---T-A--C---A-TC-ATTG--CAT---------T---AA-TA-T------------C-A-----CA------CA-A-TTT--T--ATT---TC-------A-G--G-T--T--AATT-T-TT---A---ATAAA-TT-G--A--AA-G-AC-AAAA-A--T--CAG--AAT-AAAAA-----T------AAT--A--A--A---AC-NT-ATTC-TATT-AATTAAT--A-T-TA---ATT-----A--AAT-----T-A--A--TTA--AT-T----AT-T---A-A-TT----A-------AGA-GACA--A-T----TATGAT-ACATGTACA-------TGTAC--ATGT----CTGT-TGT----A-CTTATATTGG-TATGA
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gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tattgtgcattttacaacatatataagttaattagataccaaatgcgtttccagagagcaaaatagcatatagaataaatgtataatATCTTCA-G--CT-G-C-C-AATATCGCC-----T-G-T----T--CCCAA---CCCTT---CAGG-----G-TA-----A-G--T-TT-TGGA----G-GCT--TAT-GAA--TT-TTCTG-A-A---A-G-------CT--T-A-T----AA-A---AA------------------A---TGT-----AA-CAAA-A-TGAGCTTG--G--T--T-G---C-ACT--GT--G-A--TT-GT---GA-G--CG--TTTAACTTC-A---TTTTG-----------------CTTAAT--AA---C-T-----AAAAA-ATCGC-TG-AAG-A--TG--G-G--A---A--AA--------CTG-----TG---T
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           T-AT--T-------TG----G----C-----CAA---A------------------A-ACAAAAC-AAACACAACT-----TCT--CA-A---A-GTG-G--AAACA-TTC-A--TT-AC-A---A-CGC---A-TCA-C---------TAA-ATTA---ATGC-TTC----GT---T-A--C---A-TC-ATTG--CAT---------T---AA-TA-T------------C-A-----CA------CA-A-TTT--TAAATT---TC-------A-G--T-T--T--AATT-T-TA---A---ATAAA--T-G--A--AA-G-AC-AAAA-A--T--CAG--AAT-AAAGA-----T-------AT--A--A--A------CT-ATTC-TATT-AATTA----A-T-TA------------------------A--A--TTA--AT-T----AT-T---A-ATTT----A-------AGA-GAAA--A-T----TATGAT-ACATGTACttgtgagtcactctatgttattgaaatttatatcacaatagtgtaaattttacaattctagtagt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tCCTTGA-G--CT-G-C-C-AA-AACCC------T-G-C----TCTCCCTT---CCCCC---CA-------G-GG-----ATA--T-TT-TAA---------G--TAT-GAA--TT-TTCTGAA-A---A-G-------CTACT-A-T-----A-C---AA------------------A---TGC-----TA-CAAA-A-GGA-CCATATG--T--T-C---CTACT--CT--G-C--CT-GTA-TGG-G--CG--TCAGG---ATGT--TTTTGGGGT-A----A-ATTTTCTTAAGT-AATTTT-TTTATC-AAAA-GCCGC-TG-AA--GTGGT--G-A--ATATA--AA--------CGGCGCTTTA---TT-AAC-C-TG--AAA---------TTT-TAGCGTTTT--GG----TT-TG---G---T-A-ACAGTGAT-GGCTTG-G----AT-TCCAT--AA-A-TGGAATTAA-AA-ACGATTCGACACA-AC-A-----C--C-----CA-AAG-CACAAC--A----A------T-GT---GATTT--TTT-C-TTGGCT--A-------TCGGGT--------G-------GGGGGGG---------G-G----ttc
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -T-C-AAT-G--AAA-AC-C-TTCA---A-TA-TG-T-T-TCT----A-T---GA-----GCAAC-TT-TTT--G-TGA-TA--TCAAA-----A-CGTA---A-TATGT---CTAA-T-TTT----------GG-T---G-GCTT---G-G--T-A-G--AATT--A-AC-C-G-AT-T----TT-T--C-AA-----TT-------AA-T----AT-T----ACT-T-GT-T----AA---AAC-AT--A-------TG----T----A-----AAA---A------------------A-A-AAAAC-C--------C-----TCT--CA-A---A-GTG-A--AAACACCTCAA--TT-AC-A---A-CGC---A-TC----A------TTAA-A-TA---ATGT-T-C----AT---T-A--C---A-TC-CATG--CAT---------T----A-TA-T------------C-A-----CC------CA-A-TTT--C--ATT---C-------------G-TA-T--AGAT-T-TA---A---TTAAA-TT-G--A--AA---AC-AAAA-A--T--CTA--AAT-GAAAA-----T------AAG--A--A---------TT-A-TC-TATT-AAGTAAT----T-AA---ATT-----T--AAT-----C-AATA--TTA--AT-T----TT-T-------TT----A-------AGAGGACA--A-T----TAT-AT-ACATGTATA-------AGTggcgcataataacctgaagttggggaacattttaatgtgctatttagtactattctctacttcctatcgcctcatctcttctcgatatcttttcaatgaaaaccttcaatatgtttctatgagcaactttttgtgatatcaaaacgtaatatgtctaattttggtggcttggtagaattaaccgatttttcaattaatattacttgttaaaacatatgtaaaaaaaaaaaccctctcaaagtgaaaacacctcaattacaacgcatcattaaataatgttcattacatccatgcattatatcacccaatttcattcgtatagatttaattaaattgaaaacaaaaatctaaatgaaaataagaattatctattaagtaattaaatttaatcaatattaatttttttaagaggacaattatatacatgtataagtctcggtcactttaggatataaatgattggtatgcaatttctcaataa
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gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                A--T----TTT-TA--TTTTT--TG----TT-TGT-CT---T-A-ACA-T-GT-GAC-TG-T----A--T-CAT--AA-A-TG---TCAT-GG-ACTATCAGG-ATATAC-AC----C--T-----CA-AA--CAC-A---A----T------TCTT---A---A--TTT-C-TTGGCT--A-------c
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gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ----A-A---TCTTAAGCTAA---T-T--ATCAAAA--ATCGC-TG-AA--ATTTG--G-G--A---A--AA--------CTG-----AA---TT-AAT-C-TT--t
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gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ggcGACCTTGA-G--CT-G-C-C-AATAACTCC-----T-G-T----CTCTCCCC---CCCCC---CCCG-----G-GG-----A-A--T-TT-TGAA----G-G-G--TAa
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gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        agcgttgctcaagtacaCTTTGA-G--CT---C-C-AATAACCC------T-G-CCAACTCGCCCCC---CTTCC---C-TT-----G-GG-----A-A----TT-TGAA----G-G-G--TAT-G-cagggttttcaatagtat
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             t-TT-TGAC----G-G-G--TAT-G-A--TT-TTCTG-A-A---A---------CT--T-ATT----GA-A---AA------------------A---TGC-----TA-CAAA-A-TGAG
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GACCT--G-G--CT-TTC-C-AAT---CCC-----T--------TCCCCCCC---CGCCC---GGGG-----G-GGGGGGGA-A--T-TT-TGAA----G-G-G--TAT-G-A--TTGTTCTG-A-A---A-GA------CT--T-A-T----AA-C---AA------------------T---TGC------A-CCAC-A-TGAG--CCATG--TTAT-G---C-ACT--CT--G----GC-GTT-GGG-G--CG---TAAG---A-G---TTTTGGGGTAA----A-A---TCTTAAG--A------TTTATCAATAA-ATCGC-TGAAA--ATTTG--GTA--A---A--AA--------CTG-----TA---TA-AAT-C-TT--AAA-A--TA---TTT-TG--TTTTT--TG-----T-TGT-TT-------AC--T-AT-GGC-T--C----GT-T-CAT--AATA-TG---TC-T-AA-AC--TCAGG-ACAGACAA-----C--T-----CA-AAATCAC-AC--AT---T------T-TT---A---TGCTTT-C-TTGGCT--A-------TT-TTT----------------TGGGGGA---------A-A----ATA--C-CG-G-A--------TTTTT-----GCTG----AAA-T-T-CAAAT-G--ACA-AC-C-T-CA---A-TA-T--T-T-TTTC---C-A---TA-T--TG-AA--TT-TTT--GTTGA-T---TC-AA-----AGCG-A---A-T-TGTCGCC-AT-G-TTT----------GG-T--TG-GCTTTG-G-G--T-ATC--GAT---A-AT-C-CAAT-C-A--TT-TC-C-AA-----TT-----T-AA-TA---AT-G--T-TCACT-GT-T----AA---CA--A---T-------TG----G----T-------A---A------------------A-A-CAAAT-AC-------T-----TCT--CA-A---A-A-G-G--AAACA-CTC-A--TT-AC-A---G-AGC---A-TC----A------TTAA-ATTA---ATGCTT-C----AT---T----C---A-CC-ACT----AT---------T---GATTA-T------------CTA-----TA------CACA-TCT--T--A-----TC-------A-G--G-T--T--AAAT-T-TT---A---ATAAATTT-GATA--AA-G-AC--AAA-A--T--CAG--AAT-GAAAA-----T------AAT--A--A--A------TT-ATTC----T-AAT---T--A-T-TA---ATT-----A--A-------T-A--A--TTA--AT-T----AT-TTTAA-A-TT----A-------AAA-AAAA--A-
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ata---A-A-AT----A-------AGC-GACC--A-T----TATGAT-ACATGTAC-----------AC--A-GT----CTGT-TGT----A-CTT-TATTGG-TATGaaaaaaacaaaaaaaaaaaaaaaaataagcgaccattatgatacatgtacacagtctgttgtactttattggtatgcaggggcttctcccatgggatt
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Reference ( family-606 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GACCTTGA-G--CT-G-C-C-AATAACCCC-----T-G-T----TCCCCCCC---CCCCC---CAGG-----G-GG-----A-A--T-TT-TGAA----G-G-G--TAT-G-A--TT-TTCTG-A-A---A-G-------CT--T-A-T----AA-C---AA------------------A---TGC-----TA-CAAA-A-T-GAGCCCCAT-G--T-T--G---C-ACT--CT--GCNC-G--TT-GGG-G--CG--TTAAG---A-G---TTTTGGGGT-A----A-A---TCTTAAG--AA---T-TTTATCAAAAA-ATCGC-TG-AA--ATTTG--G-A--A---A--AA--------CTG-----TA---TA-AAT-C-TT--AAATA--T----TTT-TA--TTTTT--TG----TT-TGT-CT---T-A-ACA-T-AT-GGC-TG-T----AT-T-CAT--AA-A-TG---TCAT-AA-ACTATCAGGAACAGAC-A-----C--T-----CA-AA--CAC-AC--A----T------T-TT---A---T--TTT-C-TTGGCT--A-------TT-TTT--------G-------GGGGGGG---------G-G----ATA--C-C--G-A--------TTTTT-----G-TG----AAA-A-T-C-AAT-G--AAA-AC-C-T-CA---A-NA-T--T-T-TCT----A-A---TA-T--CGCAA--TT-TTT--G-TGA-T---TCAAA-----AACG-A---A-T-TGT---C-AT-T-TTT----------GG-TA-TG-GCTTTT-G-G--T-ATG--AAT---A-AT-C-C-AT-C-A--TT-T--C-AA-----TT-----T-AA-T----AT-T--T-GCA-T-GT-T----AA---CAT-AT--T-------TG----G----T-----AAA---A------------------A-A-AAAAT-A--------T-----TCT--CA-A---A-GTG-G--AAACA-CTC-A--TT-AC-A---A-CGC---A-TCA-T-A------TTAA-ATTA---ATGC-T-C----GT---T-A--C---A-TC-ATTG--CAT---------T---AA-TA-T------------C-A-----CA------CA-A-TTT--T--ATT---TC-------A-G--G-T--T--A-ANT-T-TT---A---ATAAA-TT-G--A--AA-G-AC-AAAA-A--T--CAG--AAT-AAAAA-----T------AAT--A--A--A---AC-NT-ATTC-TATT-AATTAAT--A-T-TA---ATT-----A--AAT-----T-A--A--TTA--AT-T----AT-T---A-A-TT----A-------AGA-GACA--A-T----TATGAT-ACATGTACA-------TGTAC--ATGT----CTGT-TGT----A-CTTATATTGG-TATGA
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ---A-AT-C-C-AT-C-AA-TT-T--C-AA-----TTAAACAT-AA------AT-TA-T-GCA-TAGTAT----AA---CATTAT--CC------TG----GAAAAT-----AAAGAAA------------------A-A-AAAAT-ACC------T-----TCT--AA-A---A-GTG-G--AAG-A-CT--A--TT-AT-ACAAA-CGC---A-TCAAT-A------A-AA-ATTA---ATGC-TTC----GT---T-A--C---A-TC-ATTA--GAT---------TGA-AA-TA-TAAAC--------C-A-----AA------CA-A-TCTATT--ATTAA-TC-------C-G--G-TATT--A-ATA-TATT---A---ATAAAATT-G--A--AA-G-AG-CAAA-A--T--CAG--AAT-AAAAAATAC-T------AATAAA--A--A---AC-AT-ATAC-TATTAAATTAAC--A-TATG---ATTGATTAA--AATAAATAT-A--A--TTA--AT-C----AT-T---A-A-TTATAAA-------AGA-GCCA--A-TA---TATGATAACATGTACAAAATGTTTGTAT--ATGTAAAACTAT-TGT----A----ATATAGG-TATAA
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gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tattgtgcattttacaacatatataagttaattagataccaaatgcgtttccagagagcaaaatagcatatagaataaatgtataatATCTTCA-G--CT-G-C-C-AATATCGCC-----T-G-T----T--CCCAA---CCCTT---CAGG-----G-TA-----A-G--T-TT-TGGA----G-GCT--TAT-GAA--TT-TTCTG-A-A---A-G-------CT--T-A-T----AA-A---AA------------------A---TGT-----AA-CAAA-A-T-GAGCTT--G-G--T-T--G---C-ACT--GT--GATT-G--T---GA-G--CG--TTTAACTTC-A---TTTTG-----------------CTTAAT--AA---C-T-----AAAAA-ATCGC-TG-AAG-A--TG--G-G--A---A--AA--------CTG-----TG---T
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            T-AT--T-------TG----G----C-----CAA---A------------------A-ACAAAAC-AAACACAACT-----TCT--CA-A---A-GTG-G--AAACA-TTC-A--TT-AC-A---A-CGC---A-TCA-C---------TAA-ATTA---ATGC-TTC----GT---T-A--C---A-TC-ATTG--CAT---------T---AA-TA-T------------C-A-----CA------CA-A-TTT--TAAATT---TC-------A-G--T-T--T--A-ATT-T-TA---A---ATAAA--T-G--A--AA-G-AC-AAAA-A--T--CAG--AAT-AAAGA-----T-------AT--A--A--A------CT-ATTC-TATT-AATTA----A-T-TA------------------------A--A--TTA--AT-T----AT-T---A-ATTT----A-------AGA-GAAA--A-T----TATGAT-ACATGTACttgtgagtcactctatgttattgaaatttatatcacaatagtgtaaattttacaattctagtagt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tCCTTGA-G--CT-G-C-C-AA-AACCC------T-G-C----TCTCCCTT---CCCCC---CA-------G-GG-----ATA--T-TT-TAA---------G--TAT-GAA--TT-TTCTGAA-A---A-G-------CTACT-A-T-----A-C---AA------------------A---TGC-----TA-CAAA-A-G-GA-CCATAT-G--T-T--C---CTACT--CT--GCCT-G--TA-TGG-G--CG--TCAGG---ATGT--TTTTGGGGT-A----A-ATTTTCTTAAGT-AATTTT-TTTATC-AAAA-GCCGC-TG-AA--GTGGT--G-A--ATATA--AA--------CGGCGCTTTA---TT-AAC-C-TG--AAA---------TTT-TAGCGTTTT--GG----TT-TG---G---T-A-ACAGTGAT-GGCTTG-G----AT-TCCAT--AA-A-TGGAATTAA-AA-ACGATTCGACACA-AC-A-----C--C-----CA-AAG-CACAAC--A----A------T-GT---GATTT--TTT-C-TTGGCT--A-------TCGGGT--------G-------GGGGGGG---------G-G----ttc
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -T-C-AAT-G--AAA-AC-C-TTCA---A-TA-TG-T-T-TCT----A-T---GA-----GCAAC-TT-TTT--G-TGA-TA--TCAAA-----A-CGTA---A-TATGT---CTAA-T-TTT----------GG-T---G-GCTT---G-G--T-A-G--AATT--A-AC-C-G-AT-T----TT-T--C-AA-----TT-------AA-T----AT-T----ACT-T-GT-T----AA---AAC-AT--A-------TG----T----A-----AAA---A------------------A-A-AAAAC-C--------C-----TCT--CA-A---A-GTG-A--AAACACCTCAA--TT-AC-A---A-CGC---A-TC----A------TTAA-A-TA---ATGT-T-C----AT---T-A--C---A-TC-CATG--CAT---------T----A-TA-T------------C-A-----CC------CA-A-TTT--C--ATT---C-------------G-TA-T--A-GAT-T-TA---A---TTAAA-TT-G--A--AA---AC-AAAA-A--T--CTA--AAT-GAAAA-----T------AAG--A--A---------TT-A-TC-TATT-AAGTAAT----T-AA---ATT-----T--AAT-----C-AATA--TTA--AT-T----TT-T-------TT----A-------AGAGGACA--A-T----TAT-AT-ACATGTATA-------AGTggcgcataataacctgaagttggggaacattttaatgtgctatttagtactattctctacttcctatcgcctcatctcttctcgatatcttttcaatgaaaaccttcaatatgtttctatgagcaactttttgtgatatcaaaacgtaatatgtctaattttggtggcttggtagaattaaccgatttttcaattaatattacttgttaaaacatatgtaaaaaaaaaaaccctctcaaagtgaaaacacctcaattacaacgcatcattaaataatgttcattacatccatgcattatatcacccaatttcattcgtatagatttaattaaattgaaaacaaaaatctaaatgaaaataagaattatctattaagtaattaaatttaatcaatattaatttttttaagaggacaattatatacatgtataagtctcggtcactttaggatataaatgattggtatgcaatttctcaataa
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gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tttgtcattGCT--A-------TT-TTTTTT-----G-------GGGGGGG---------G-G----ATA--C-C--A-A--------TTTTTT----A-TG----AAA-A-T-C-AAT-G--AAA-AC-C-T-CA---A-AA-TG-T-T-TCT----A-A---TA-T--CGC------------------T---TC-AA-----AACG-A---A---TGT---C-AT-T-TTT----------GG-TA-TG-ACTTTT-G-cagggttcttactagga
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gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 A--T----TTT-TA--TTTTT--TG----TT-TGT-CT---T-A-ACA-T-GT-GAC-TG-T----A--T-CAT--AA-A-TG---TCAT-GG-ACTATCAGG-ATATAC-AC----C--T-----CA-AA--CAC-A---A----T------TCTT---A---A--TTT-C-TTGGCT--A-------c
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gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ggcGACCTTGA-G--CT-G-C-C-AATAACTCC-----T-G-T----CTCTCCCC---CCCCC---CCCG-----G-GG-----A-A--T-TT-TGAA----G-G-G--TAa
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gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        agcgttgctcaagtacaCTTTGA-G--CT---C-C-AATAACCC------T-G-CCAACTCGCCCCC---CTTCC---C-TT-----G-GG-----A-A----TT-TGAA----G-G-G--TAT-G-cagggttttcaatagtat
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             t-TT-TGAC----G-G-G--TAT-G-A--TT-TTCTG-A-A---A---------CT--T-ATT----GA-A---AA------------------A---TGC-----TA-CAAA-A-T-GAG
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GACCT--G-G--CT-TTC-C-AAT---CCC-----T--------TCCCCCCC---CGCCC---GGGG-----G-GGGGGGGA-A--T-TT-TGAA----G-G-G--TAT-G-A--TTGTTCTG-A-A---A-GA------CT--T-A-T----AA-C---AA------------------T---TGC------A-CCAC-A-T-GAGCC--AT-G--T-TATG---C-ACT--CT--G-GC-G--TT-GGG-G--CG---TAAG---A-G---TTTTGGGGTAA----A-A---TCTTAAG--A------TTTATCAATAA-ATCGC-TGAAA--ATTTG--GTA--A---A--AA--------CTG-----TA---TA-AAT-C-TT--AAA-A--TA---TTT-TG--TTTTT--TG-----T-TGT-TT-------AC--T-AT-GGC-T--C----GT-T-CAT--AATA-TG---TC-T-AA-AC--TCAGG-ACAGACAA-----C--T-----CA-AAATCAC-AC--AT---T------T-TT---A---TGCTTT-C-TTGGCT--A-------TT-TTT----------------TGGGGGA---------A-A----ATA--C-CG-G-A--------TTTTT-----GCTG----AAA-T-T-CAAAT-G--ACA-AC-C-T-CA---A-TA-T--T-T-TTTC---C-A---TA-T--TG-AA--TT-TTT--GTTGA-T---TC-AA-----AGCG-A---A-T-TGTCGCC-AT-G-TTT----------GG-T--TG-GCTTTG-G-G--T-ATC--GAT---A-AT-C-CAAT-C-A--TT-TC-C-AA-----TT-----T-AA-TA---AT-G--T-TCACT-GT-T----AA---CA--A---T-------TG----G----T-------A---A------------------A-A-CAAAT-AC-------T-----TCT--CA-A---A-A-G-G--AAACA-CTC-A--TT-AC-A---G-AGC---A-TC----A------TTAA-ATTA---ATGCTT-C----AT---T----C---A-CC-ACT----AT---------T---GATTA-T------------CTA-----TA------CACA-TCT--T--A-----TC-------A-G--G-T--T--A-AAT-T-TT---A---ATAAATTT-GATA--AA-G-AC--AAA-A--T--CAG--AAT-GAAAA-----T------AAT--A--A--A------TT-ATTC----T-AAT---T--A-T-TA---ATT-----A--A-------T-A--A--TTA--AT-T----AT-TTTAA-A-TT----A-------AAA-AAAA--A-
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Reference ( family-606 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GACCTTGA-G--CT-G-C-C-AATAACCCC-----T-G-T----TCCCCCCC---CCCCC---CAGG-----G-GG-----A-A--T-TT-TGAA----G-G-G--TAT-G-A--TT-TTCTG-A-A---A-G-------CT--T-A-T----AA-C---AA------------------A---TGC-----TA-CAAA-A-T-GAGCCCCAT-G--T-T--G---C-ACT--CT--GCCC-G--TT-G-GG-G--CG--TTAAG---A-G---TTTTGGGGT-A----A-A---TCTTAAG--AA---T-TTTATCAAAAA-ATCGC-TG-AA--ATTTG--G-A--A---A--AA--------CTG-----TA---TA-AAT-C-TT--AAATA--T----TTT-TA--TTTTT--TG----TT-TGT-CT---T-A-ACA-T-AT-GGC-TG-T----AT-T-CAT--AA-A-TG---TCAT-AA-ACTATCAGGAACAGAC-A-----C--T-----CA-AA--CAC-AC--A----T------T-TT---A---T--TTT-C-TTGGCT--A-------TT-TTT--------G-------GGGGGGG---------G-G----ATA--C-C--G-A--------TTTTT-----G-TG----AAA-A-T-C-AAT-G--AAA-AC-C-T-CA---A-NA-T--T-T-TCT----A-A---TA-T--CGCAA--TT-TTT--G-TGA-T---TCAAA-----AACG-A---A-T-TGT---C-AT-T-TTT----------GG-TA-TG-GCTTTT-G-G--T-ATG--AAT---A-AT-C-C-AT-C-A--TT-T--C-AA-----TT-----T-AA-T----AT-T--T-GCA-T-GT-T----AA---CAT-AT--T-------TG----G----T-----AAA---A------------------A-A-AAAAT-A--------T-----TCT--CA-A---A-GTG-G--AAACA-CTC-A--TT-AC-A---A-CGC---A-TCA-T-A------TTAA-ATTA---ATGC-T-C----GT---T-A--C---A-TC-ATTG--CAT---------T---AA-TA-T------------C-A-----CA------CA-A-TTT--T--ATT---TC-------A-G--G-T--T--A-ANT-T-TT---A---ATAAA-TT-G--A--AA-G-AC-AAAA-A--T--CAG--AAT-AAAAA-----T------AAT--A--A--A---AC-NT-ATTC-TATT-AATTAAT--A-T-TA---ATT-----A--AAT-----T-A--A--TTA--AT-T----AT-T---A-A-TT----A-------AGA-GACA--A-T----TATGAT-ACATGTACA-------TGTAC--ATGT----CTGT-TGT----A-CTTATATTGG-TATGA
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ---A-AT-C-C-AT-C-AA-TT-T--C-AA-----TTAAACAT-AA------AT-TA-T-GCA-TAGTAT----AA---CATTAT--CC------TG----GAAAAT-----AAAGAAA------------------A-A-AAAAT-ACC------T-----TCT--AA-A---A-GTG-G--AAG-A-CT--A--TT-AT-ACAAA-CGC---A-TCAAT-A------A-AA-ATTA---ATGC-TTC----GT---T-A--C---A-TC-ATTA--GAT---------TGA-AA-TA-TAAAC--------C-A-----AA------CA-A-TCTATT--ATTAA-TC-------C-G--G-TATT--A-ATA-TATT---A---ATAAAATT-G--A--AA-G-AG-CAAA-A--T--CAG--AAT-AAAAAATAC-T------AATAAA--A--A---AC-AT-ATAC-TATTAAATTAAC--A-TATG---ATTGATTAA--AATAAATAT-A--A--TTA--AT-C----AT-T---A-A-TTATAAA-------AGA-GCCA--A-TA---TATGATAACATGTACAAAATGTTTGTAT--ATGTAAAACTAT-TGT----A----ATATAGG-TATAA
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gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tattgtgcattttacaacatatataagttaattagataccaaatgcgtttccagagagcaaaatagcatatagaataaatgtataatATCTTCA-G--CT-G-C-C-AATATCGCC-----T-G-T----T--CCCAA---CCCTT---CAGG-----G-TA-----A-G--T-TT-TGGA----G-GCT--TAT-GAA--TT-TTCTG-A-A---A-G-------CT--T-A-T----AA-A---AA------------------A---TGT-----AA-CAAA-A-T-GAGCTT--G-G--T-T--G---C-ACT--GT--G----A--TT-GTGA-G--CG--TTTAACTTC-A---TTTTG-----------------CTTAAT--AA---C-T-----AAAAA-ATCGC-TG-AAG-A--TG--G-G--A---A--AA--------CTG-----TG---T
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             T-AT--T-------TG----G----C-----CAA---A------------------A-ACAAAAC-AAACACAACT-----TCT--CA-A---A-GTG-G--AAACA-TTC-A--TT-AC-A---A-CGC---A-TCA-C---------TAA-ATTA---ATGC-TTC----GT---T-A--C---A-TC-ATTG--CAT---------T---AA-TA-T------------C-A-----CA------CA-A-TTT--TAAATT---TC-------A-G--T-T--T--A-ATT-T-TA---A---ATAAA--T-G--A--AA-G-AC-AAAA-A--T--CAG--AAT-AAAGA-----T-------AT--A--A--A------CT-ATTC-TATT-AATTA----A-T-TA------------------------A--A--TTA--AT-T----AT-T---A-ATTT----A-------AGA-GAAA--A-T----TATGAT-ACATGTACttgtgagtcactctatgttattgaaatttatatcacaatagtgtaaattttacaattctagtagt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tCCTTGA-G--CT-G-C-C-AA-AACCC------T-G-C----TCTCCCTT---CCCCC---CA-------G-GG-----ATA--T-TT-TAA---------G--TAT-GAA--TT-TTCTGAA-A---A-G-------CTACT-A-T-----A-C---AA------------------A---TGC-----TA-CAAA-A-G-GA-CCATAT-G--T-T--C---CTACT--CT--GCCT-G--TA-T-GG-G--CG--TCAGG---ATGT--TTTTGGGGT-A----A-ATTTTCTTAAGT-AATTTT-TTTATC-AAAA-GCCGC-TG-AA--GTGGT--G-A--ATATA--AA--------CGGCGCTTTA---TT-AAC-C-TG--AAA---------TTT-TAGCGTTTT--GG----TT-TG---G---T-A-ACAGTGAT-GGCTTG-G----AT-TCCAT--AA-A-TGGAATTAA-AA-ACGATTCGACACA-AC-A-----C--C-----CA-AAG-CACAAC--A----A------T-GT---GATTT--TTT-C-TTGGCT--A-------TCGGGT--------G-------GGGGGGG---------G-G----ttc
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -T-C-AAT-G--AAA-AC-C-TTCA---A-TA-TG-T-T-TCT----A-T---GA-----GCAAC-TT-TTT--G-TGA-TA--TCAAA-----A-CGTA---A-TATGT---CTAA-T-TTT----------GG-T---G-GCTT---G-G--T-A-G--AATT--A-AC-C-G-AT-T----TT-T--C-AA-----TT-------AA-T----AT-T----ACT-T-GT-T----AA---AAC-AT--A-------TG----T----A-----AAA---A------------------A-A-AAAAC-C--------C-----TCT--CA-A---A-GTG-A--AAACACCTCAA--TT-AC-A---A-CGC---A-TC----A------TTAA-A-TA---ATGT-T-C----AT---T-A--C---A-TC-CATG--CAT---------T----A-TA-T------------C-A-----CC------CA-A-TTT--C--ATT---C-------------G-TA-T--A-GAT-T-TA---A---TTAAA-TT-G--A--AA---AC-AAAA-A--T--CTA--AAT-GAAAA-----T------AAG--A--A---------TT-A-TC-TATT-AAGTAAT----T-AA---ATT-----T--AAT-----C-AATA--TTA--AT-T----TT-T-------TT----A-------AGAGGACA--A-T----TAT-AT-ACATGTATA-------AGTggcgcataataacctgaagttggggaacattttaatgtgctatttagtactattctctacttcctatcgcctcatctcttctcgatatcttttcaatgaaaaccttcaatatgtttctatgagcaactttttgtgatatcaaaacgtaatatgtctaattttggtggcttggtagaattaaccgatttttcaattaatattacttgttaaaacatatgtaaaaaaaaaaaccctctcaaagtgaaaacacctcaattacaacgcatcattaaataatgttcattacatccatgcattatatcacccaatttcattcgtatagatttaattaaattgaaaacaaaaatctaaatgaaaataagaattatctattaagtaattaaatttaatcaatattaatttttttaagaggacaattatatacatgtataagtctcggtcactttaggatataaatgattggtatgcaatttctcaataa
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gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  T-T-TT---A---ATAAA-CT-G--A--AA-G-AC-AAAT-A--T--CAG--AAT-AAAAA-----T------ACT--AGTA--A---ACTATAATTC-TATT-AATCA----A-T-TG---A-T-----G--AAT-----T-A--A--TTA--AT-C----AT-T---A-ATTT----A-------AGA-GACA--A-T----
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gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -------GGGGGGG---------G-GTAA-ATA--C-C--G-A--------TTTTT-----G-TG----AAA-A-AAC-AAT-G--AAA-AC-C-T-CA---A-TA-T--T-TCTTT----A-A---TA-T--TGCAA--CT-TTT--G-TGA-T---TC-AA-----AACG-A---A-T-TGT---C-AT-G-TTT----------
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gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  A--T----TTT-TA--TTTTT--TG----TT-TGT-CT---T-A-ACA-T-GT-GAC-TG-T----A--T-CAT--AA-A-TG---TCAT-GG-ACTATCAGG-ATATAC-AC----C--T-----CA-AA--CAC-A---A----T------TCTT---A---A--TTT-C-TTGGCT--A-------c
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gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ggcGACCTTGA-G--CT-G-C-C-AATAACTCC-----T-G-T----CTCTCCCC---CCCCC---CCCG-----G-GG-----A-A--T-TT-TGAA----G-G-G--TAa
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gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             t-TT-TGAC----G-G-G--TAT-G-A--TT-TTCTG-A-A---A---------CT--T-ATT----GA-A---AA------------------A---TGC-----TA-CAAA-A-T-GAG
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GACCT--G-G--CT-TTC-C-AAT---CCC-----T--------TCCCCCCC---CGCCC---GGGG-----G-GGGGGGGA-A--T-TT-TGAA----G-G-G--TAT-G-A--TTGTTCTG-A-A---A-GA------CT--T-A-T----AA-C---AA------------------T---TGC------A-CCAC-A-T-GAGCC--AT-G--T-TATG---C-ACT--CT--GGC--G--TT-G-GG-G--CG---TAAG---A-G---TTTTGGGGTAA----A-A---TCTTAAG--A------TTTATCAATAA-ATCGC-TGAAA--ATTTG--GTA--A---A--AA--------CTG-----TA---TA-AAT-C-TT--AAA-A--TA---TTT-TG--TTTTT--TG-----T-TGT-TT-------AC--T-AT-GGC-T--C----GT-T-CAT--AATA-TG---TC-T-AA-AC--TCAGG-ACAGACAA-----C--T-----CA-AAATCAC-AC--AT---T------T-TT---A---TGCTTT-C-TTGGCT--A-------TT-TTT----------------TGGGGGA---------A-A----ATA--C-CG-G-A--------TTTTT-----GCTG----AAA-T-T-CAAAT-G--ACA-AC-C-T-CA---A-TA-T--T-T-TTTC---C-A---TA-T--TG-AA--TT-TTT--GTTGA-T---TC-AA-----AGCG-A---A-T-TGTCGCC-AT-G-TTT----------GG-T--TG-GCTTTG-G-G--T-ATC--GAT---A-AT-C-CAAT-C-A--TT-TC-C-AA-----TT-----T-AA-TA---AT-G--T-TCACT-GT-T----AA---CA--A---T-------TG----G----T-------A---A------------------A-A-CAAAT-AC-------T-----TCT--CA-A---A-A-G-G--AAACA-CTC-A--TT-AC-A---G-AGC---A-TC----A------TTAA-ATTA---ATGCTT-C----AT---T----C---A-CC-ACT----AT---------T---GATTA-T------------CTA-----TA------CACA-TCT--T--A-----TC-------A-G--G-T--T--A-AAT-T-TT---A---ATAAATTT-GATA--AA-G-AC--AAA-A--T--CAG--AAT-GAAAA-----T------AAT--A--A--A------TT-ATTC----T-AAT---T--A-T-TA---ATT-----A--A-------T-A--A--TTA--AT-T----AT-TTTAA-A-TT----A-------AAA-AAAA--A-
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Reference ( family-606 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GACCTTGA-G--CT-G-C-C-AATAACCCC-----T-G-T----TCCCCCCC---CCCCC---CAGG-----G-GG-----A-A--T-TT-TGAA----G-G-G--TAT-G-A--TT-TTCTG-A-A---A-G-------CT--T-A-T----AA-C---AA------------------A---TGC-----TA-CAAA-A-T-GAGCCCCAT-G--T-T--G---C-ACT--CT--GCCC-G--TT-G-GG-G--CG--TTAAG---A-G---TTTTGGGGT-A----A-A---TCTTAAG--AA---T-TTTATCAAAAA-ATCGC-TG-AA--ATTTG--G-A--A---A--AA--------CTG-----TA---TA-AAT-C-TT--AAATA--T----TTT-TA--TTTTT--TG----TT-TGT-CT---T-A-ACA-T-AT-GGC-TG-T----AT-T-CAT--AA-A-TG---TCAT-AA-ACTATCAGGAACAGAC-A-----C--T-----CA-AA--CAC-AC--A----T------T-TT---A---T--TTT-C-TTGGCT--A-------TT-TTT--------G-------GGGGGGG---------G-G----ATA--C-C--G-A--------TTTTT-----G-TG----AAA-A-T-C-AAT-G--AAA-AC-C-T-CA---A-NA-T--T-T-TCT----A-A---TA-T--CGCAA--TT-TTT--G-TGA-T---TCAAA-----AACG-A---A-T-TGT---C-AT-T-TTT----------GG-TA-TG-GCTTTT-G-G--T-ATG--AAT---A-AT-C-C-AT-C-A--TT-T--C-AA-----TT-----T-AA-T----AT-T--T-GCA-T-GT-T----AA---CAT-AT--T-------TG----G----T-----AAA---A------------------A-A-AAAAT-A--------T-----TCT--CA-A---A-GTG-G--AAACA-CTC-A--TT-AC-A---A-CGC---A-TCA-T-A------TTAA-ATTA---ATGC-T-C----GT---T-A--C---A-TC-ATTG--CAT---------T---AA-TA-T------------C-A-----CA------CA-A-TTT--T--ATT---TC-------A-G--G-T--T--A-ANT-T-TT---A---ATAAA-TT-G--A--AA-G-AC-AAAA-A--T--CAG--AAT-AAAAA-----T------AAT--A--A--A---AC-NT-ATTC-TATT-AATTAAT--A-T-TA---ATT-----A--AAT-----T-A--A--TTA--AT-T----AT-T---A-A-TT----A-------AGA-GACA--A-T----TATGAT-ACATGTACA-------TGTAC--ATGT----CTGT-TGT----A-CTTATATTGG-TATGA
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ---A-AT-C-C-AT-C-AA-TT-T--C-AA-----TTAAACAT-AA------AT-TA-T-GCA-TAGTAT----AA---CATTAT--CC------TG----GAAAAT-----AAAGAAA------------------A-A-AAAAT-ACC------T-----TCT--AA-A---A-GTG-G--AAG-A-CT--A--TT-AT-ACAAA-CGC---A-TCAAT-A------A-AA-ATTA---ATGC-TTC----GT---T-A--C---A-TC-ATTA--GAT---------TGA-AA-TA-TAAAC--------C-A-----AA------CA-A-TCTATT--ATTAA-TC-------C-G--G-TATT--A-ATA-TATT---A---ATAAAATT-G--A--AA-G-AG-CAAA-A--T--CAG--AAT-AAAAAATAC-T------AATAAA--A--A---AC-AT-ATAC-TATTAAATTAAC--A-TATG---ATTGATTAA--AATAAATAT-A--A--TTA--AT-C----AT-T---A-A-TTATAAA-------AGA-GCCA--A-TA---TATGATAACATGTACAAAATGTTTGTAT--ATGTAAAACTAT-TGT----A----ATATAGG-TATAA
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gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tattgtgcattttacaacatatataagttaattagataccaaatgcgtttccagagagcaaaatagcatatagaataaatgtataatATCTTCA-G--CT-G-C-C-AATATCGCC-----T-G-T----T--CCCAA---CCCTT---CAGG-----G-TA-----A-G--T-TT-TGGA----G-GCT--TAT-GAA--TT-TTCTG-A-A---A-G-------CT--T-A-T----AA-A---AA------------------A---TGT-----AA-CAAA-A-T-GAGCTT--G-G--T-T--G---C-ACT--GT--G----A--TT-GTGA-G--CG--TTTAACTTC-A---TTTTG-----------------CTTAAT--AA---C-T-----AAAAA-ATCGC-TG-AAG-A--TG--G-G--A---A--AA--------CTG-----TG---T
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             T-AT--T-------TG----G----C-----CAA---A------------------A-ACAAAAC-AAACACAACT-----TCT--CA-A---A-GTG-G--AAACA-TTC-A--TT-AC-A---A-CGC---A-TCA-C---------TAA-ATTA---ATGC-TTC----GT---T-A--C---A-TC-ATTG--CAT---------T---AA-TA-T------------C-A-----CA------CA-A-TTT--TAAATT---TC-------A-G--T-T--T--A-ATT-T-TA---A---ATAAA--T-G--A--AA-G-AC-AAAA-A--T--CAG--AAT-AAAGA-----T-------AT--A--A--A------CT-ATTC-TATT-AATTA----A-T-TA------------------------A--A--TTA--AT-T----AT-T---A-ATTT----A-------AGA-GAAA--A-T----TATGAT-ACATGTACttgtgagtcactctatgttattgaaatttatatcacaatagtgtaaattttacaattctagtagt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tCCTTGA-G--CT-G-C-C-AA-AACCC------T-G-C----TCTCCCTT---CCCCC---CA-------G-GG-----ATA--T-TT-TAA---------G--TAT-GAA--TT-TTCTGAA-A---A-G-------CTACT-A-T-----A-C---AA------------------A---TGC-----TA-CAAA-A-G-GA-CCATAT-G--T-T--C---CTACT--CT--GCCT-G--TA-T-GG-G--CG--TCAGG---ATGT--TTTTGGGGT-A----A-ATTTTCTTAAGT-AATTTT-TTTATC-AAAA-GCCGC-TG-AA--GTGGT--G-A--ATATA--AA--------CGGCGCTTTA---TT-AAC-C-TG--AAA---------TTT-TAGCGTTTT--GG----TT-TG---G---T-A-ACAGTGAT-GGCTTG-G----AT-TCCAT--AA-A-TGGAATTAA-AA-ACGATTCGACACA-AC-A-----C--C-----CA-AAG-CACAAC--A----A------T-GT---GATTT--TTT-C-TTGGCT--A-------TCGGGT--------G-------GGGGGGG---------G-G----ttc
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -T-C-AAT-G--AAA-AC-C-TTCA---A-TA-TG-T-T-TCT----A-T---GA-----GCAAC-TT-TTT--G-TGA-TA--TCAAA-----A-CGTA---A-TATGT---CTAA-T-TTT----------GG-T---G-GCTT---G-G--T-A-G--AATT--A-AC-C-G-AT-T----TT-T--C-AA-----TT-------AA-T----AT-T----ACT-T-GT-T----AA---AAC-AT--A-------TG----T----A-----AAA---A------------------A-A-AAAAC-C--------C-----TCT--CA-A---A-GTG-A--AAACACCTCAA--TT-AC-A---A-CGC---A-TC----A------TTAA-A-TA---ATGT-T-C----AT---T-A--C---A-TC-CATG--CAT---------T----A-TA-T------------C-A-----CC------CA-A-TTT--C--ATT---C-------------G-TA-T--A-GAT-T-TA---A---TTAAA-TT-G--A--AA---AC-AAAA-A--T--CTA--AAT-GAAAA-----T------AAG--A--A---------TT-A-TC-TATT-AAGTAAT----T-AA---ATT-----T--AAT-----C-AATA--TTA--AT-T----TT-T-------TT----A-------AGAGGACA--A-T----TAT-AT-ACATGTATA-------AGTggcgcataataacctgaagttggggaacattttaatgtgctatttagtactattctctacttcctatcgcctcatctcttctcgatatcttttcaatgaaaaccttcaatatgtttctatgagcaactttttgtgatatcaaaacgtaatatgtctaattttggtggcttggtagaattaaccgatttttcaattaatattacttgttaaaacatatgtaaaaaaaaaaaccctctcaaagtgaaaacacctcaattacaacgcatcattaaataatgttcattacatccatgcattatatcacccaatttcattcgtatagatttaattaaattgaaaacaaaaatctaaatgaaaataagaattatctattaagtaattaaatttaatcaatattaatttttttaagaggacaattatatacatgtataagtctcggtcactttaggatataaatgattggtatgcaatttctcaataa
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gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  T-T-TT---A---ATAAA-CT-G--A--AA-G-AC-AAAT-A--T--CAG--AAT-AAAAA-----T------ACT--AGTA--A---ACTATAATTC-TATT-AATCA----A-T-TG---A-T-----G--AAT-----T-A--A--TTA--AT-C----AT-T---A-ATTT----A-------AGA-GACA--A-T----
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gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -------GGGGGGG---------G-GTAA-ATA--C-C--G-A--------TTTTT-----G-TG----AAA-A-AAC-AAT-G--AAA-AC-C-T-CA---A-TA-T--T-TCTTT----A-A---TA-T--TGCAA--CT-TTT--G-TGA-T---TC-AA-----AACG-A---A-T-TGT---C-AT-G-TTT----------
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gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  A--T----TTT-TA--TTTTT--TG----TT-TGT-CT---T-A-ACA-T-GT-GAC-TG-T----A--T-CAT--AA-A-TG---TCAT-GG-ACTATCAGG-ATATAC-AC----C--T-----CA-AA--CAC-A---A----T------TCTT---A---A--TTT-C-TTGGCT--A-------c
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gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ggcGACCTTGA-G--CT-G-C-C-AATAACTCC-----T-G-T----CTCTCCCC---CCCCC---CCCG-----G-GG-----A-A--T-TT-TGAA----G-G-G--TAa
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gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             t-TT-TGAC----G-G-G--TAT-G-A--TT-TTCTG-A-A---A---------CT--T-ATT----GA-A---AA------------------A---TGC-----TA-CAAA-A-T-GAG
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GACCT--G-G--CT-TTC-C-AAT---CCC-----T--------TCCCCCCC---CGCCC---GGGG-----G-GGGGGGGA-A--T-TT-TGAA----G-G-G--TAT-G-A--TTGTTCTG-A-A---A-GA------CT--T-A-T----AA-C---AA------------------T---TGC------A-CCAC-A-T-GAGCC--AT-G--T-TATG---C-ACT--CT--GGC--G--TT-G-GG-G--CG---TAAG---A-G---TTTTGGGGTAA----A-A---TCTTAAG--A------TTTATCAATAA-ATCGC-TGAAA--ATTTG--GTA--A---A--AA--------CTG-----TA---TA-AAT-C-TT--AAA-A--TA---TTT-TG--TTTTT--TG-----T-TGT-TT-------AC--T-AT-GGC-T--C----GT-T-CAT--AATA-TG---TC-T-AA-AC--TCAGG-ACAGACAA-----C--T-----CA-AAATCAC-AC--AT---T------T-TT---A---TGCTTT-C-TTGGCT--A-------TT-TTT----------------TGGGGGA---------A-A----ATA--C-CG-G-A--------TTTTT-----GCTG----AAA-T-T-CAAAT-G--ACA-AC-C-T-CA---A-TA-T--T-T-TTTC---C-A---TA-T--TG-AA--TT-TTT--GTTGA-T---TC-AA-----AGCG-A---A-T-TGTCGCC-AT-G-TTT----------GG-T--TG-GCTTTG-G-G--T-ATC--GAT---A-AT-C-CAAT-C-A--TT-TC-C-AA-----TT-----T-AA-TA---AT-G--T-TCACT-GT-T----AA---CA--A---T-------TG----G----T-------A---A------------------A-A-CAAAT-AC-------T-----TCT--CA-A---A-A-G-G--AAACA-CTC-A--TT-AC-A---G-AGC---A-TC----A------TTAA-ATTA---ATGCTT-C----AT---T----C---A-CC-ACT----AT---------T---GATTA-T------------CTA-----TA------CACA-TCT--T--A-----TC-------A-G--G-T--T--A-AAT-T-TT---A---ATAAATTT-GATA--AA-G-AC--AAA-A--T--CAG--AAT-GAAAA-----T------AAT--A--A--A------TT-ATTC----T-AAT---T--A-T-TA---ATT-----A--A-------T-A--A--TTA--AT-T----AT-TTTAA-A-TT----A-------AAA-AAAA--A-
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               . .   . . . .        CTGT                 C .       CCCG         .  .     . .  .  .    .    . . .    . A     .     . . .   . .        .  . . .     C      .                  .     .      .    . . .  GCCATGTTATG          .   .   .  NNN  .   . .  . .   .      AAG              TAATA               .   A          A   AA     .  .  .      .  . .  .   .   .          .      .    .   . .  A   CTAT         .  .      .   .     .   .  .   . .   . .  .   .  . .    TT     .   . .  .      A  .          A     . CCTT            .  .    .  .  TG          .  .   T        . .      .  .        .   AAG                    AA                A   . .  . .            .     .  .      . . . .   . .    .  . . .  .   T  . .  . .   .    . .    T        .   .   .  .   . .    A  .        . .   T     C      G .   .           .  .  .      . . .  .   .    .   .  . . .  . . .   . .  .  .      .     .  . .     . .  .   . .  . .     .     .  .  .        GC                .   .                  . .     ACT                .   . .   .   . .      .   . .   .  . .   .   .   .  ATA            .    .      TTCG      .   . .  .   .  .    .    .         .    .  . .            . .      .       . .   .  .  A .    .       . .  . .  A    G . .  .   .       .  . .  .   . .  .    . .  .    .    .     .     .        .  .  AACA       .    .    .  TA ATG  . .  .     .     .    TG         .    .   . .     . AGA      .    .         .    .  . .         .      A  TCTATAT           .       .   .    .   G      .
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|41 ): TATTTATAACCCTTTTGGAATTAATTCATAAAACAATTCTAAAAGTTTCTAAGCTAAATTT






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Reference ( family-606 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GACCTTGA-G--CT-G-C-C-AATAACCCC-----T-G-T----TCCCCCCC---CCCCC---CAGG-----G-GG-----A-A--T-TT-TGAA----G-G-G--TAT-G-A--TT-TTCTG-A-A---A-G-------CT--T-A-T----AA-C---AA------------------A---TGC-----TA-CAAA-AT-GAG--CC--A-TG-TT-TG---CACT--CT--GCCC-G--TT-G-GG-G--CG--TTAAG---A-G---T--TTT--GGGGTA---AA--A-TCTTAAG--AA---T-TTTATCAAAAA-ATCGC-TG-AA--ATTTG--G-A--A---A--AA--------CTG-----TA---TA-AAT-C-TT--AAATA--T----TTT-TA--TTTTT--TG----TT-TGT-CT---T-A-ACA-T-AT-GGC-T-G-T----A-T--CAT--AA-A-TG---TCATAA-A-CTATCAGGAACAGACA----C-CT----CA-AA--CAC-AC--A----T------T-TT---A---T--TTT-C-TTGGCT--A-------TT-TTT--------G-------GGGGGGG---------G-G----ATA--C-C--G-A--------TTTTT-----G-TG----AAA-A-T-C-AAT-G--AAA-AC-C-T-CA---A-NA-T--T-T-TCT----A-A---TA-T--CGCAA--TT-TTT--G-TGA-T---TCAAA-----AACG-A---A-T-TGT---C-AT-T-TTT----------GG-TA-TG-GCTTTT-G-G--T-ATG--AAT---A-AT-C-C-AT-C-A--TT-T--C-AA-----TT-----T-AA-T----AT-T--T-GCA-T-GT-T----AA---CAT-AT--T-------TG----G----T-----AAA---A------------------A-A-AAAAT-N--------T-----TCT--CA-A---A-GTG-G--AAACA-CTC-A--TT-AC-A---A-CGC---A-TCA-T-A------TTAA-ATTA---ATGC-T-C----GT---T-A--C---A-TC-ATTG--CAT--T---------AA-TA-T------------C-A-----CA-C------A-A-TTT--T--ATT---TC-------A-G--G-T--T--A-ANT-T-TT---A---ATAAA-TT-G--A--AA-G-AC-AAAA-A--T--CAG--AAT-AAAAA----T------AA-T--A-----A-A---A-C-----T-T-ATTC-TATT-AATTAAT--A-T-TA---ATT-----A--AAT-----T-A--A--TTA--AT-T--AT-T---A-A-TT----A-------AGA-GACA--A-T----TATGAT-ACATGTACA-------TGTAC--ATGT----CTGT-TGT----A-CTTATATTGG-TATGA
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ---A-AT-C-C-AT-C-AA-TT-T--C-AA-----TTAAACAT-AA------AT-TA-T-GCA-TAGTAT----AA---CATTAT--CC------TG----GAAAAT-----AAAGAAA------------------A-A-AAAAT-ACC------T-----TCT--AA-A---A-GTG-G--AAG-A-CT--A--TT-AT-ACAAA-CGC---A-TCAAT-A------A-AA-ATTA---ATGC-TTC----GT---T-A--C---A-TC-ATTA--GAT--TGA-------AA-TA-TAAAC--------C-A-----AA-C------A-A-TCTATT--ATTAA-TC-------C-G--G-TATT--A-ATA-TATT---A---ATAAAATT-G--A--AA-G-AG-CAAA-A--T--CAG--AAT-AAAAAATACT------AA-TAAA-----A-A---A-C-----A-T-ATAC-TATTAAATTAAC--A-TATG---ATTGATTAA--AATAAATAT-A--A--TTA--AT-C--AT-T---A-A-TTATAAA-------AGA-GCCA--A-TA---TATGATAACATGTACAAAATGTTTGTAT--ATGTAAAACTAT-TGT----A----ATATAGG-TATAA
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gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            --TT-AC-A---A-TCT---A-TCA-T---------------TA---ATGT-T-TT---AT---T-A--C---A-TC-ACTG--CATATT---------AA-TA-TACATATATTAATC-A-----CA-C------A-A-TTT--T--ATT---TC-------A-G--G-T--T----------TT---G---ATGAA-TT-A--A--AA-G-AC-AAAA-A--T--CAT--AAT-AAAAA----T------AC-T--A-----A---------------T-AAGC-TATC-G--CAAT--ATT-TC---GTT-----A--AAT-----T-G--A--TTA--GT-T--AT-C---A-A-TC----A-------AGA-GACA--ca
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tattgtgcattttacaacatatataagttaattagataccaaatgcgtttccagagagcaaaatagcatatagaataaatgtataatATCTTCA-G--CT-G-C-C-AATATCGCC-----T-G-T----T--CCCAA---CCCTT---CAGG-----G-TA-----A-G--T-TT-TGGA----G-GCT--TAT-GAA--TT-TTCTG-A-A---A-G-------CT--T-A-T----AA-A---AA------------------A---TGT-----AA-CAAA-AT-GAG--CT----TG-GT-TG---CACT--GT--G----A--TT-GTGA-G--CG--TTTAACTTC-A---T--TTT--G---------------CTTAAT--AA---C-T-----AAAAA-ATCGC-TG-AAG-A--TG--G-G--A---A--AA--------CTG-----TG---T
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           T-AT--T-------TG----G----C-----CAA---A------------------A-ACAAAAC-AAACACAACT-----TCT--CA-A---A-GTG-G--AAACA-TTC-A--TT-AC-A---A-CGC---A-TCA-C---------TAA-ATTA---ATGC-TTC----GT---T-A--C---A-TC-ATTG--CAT--T---------AA-TA-T------------C-A-----CA-C------A-A-TTT--TAAATT---TC-------A-G--T-T--T--A-ATT-T-TA---A---ATAAA--T-G--A--AA-G-AC-AAAA-A--T--CAG--AAT-AAAGA----T-------A-T--A-----A-A-----------C-T-ATTC-TATT-AATTA----A-T-TA------------------------A--A--TTA--AT-T--AT-T---A-ATTT----A-------AGA-GAAA--A-T----TATGAT-ACATGTACttgtgagtcactctatgttattgaaatttatatcacaatagtgtaaattttacaattctagtagt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tCCTTGA-G--CT-G-C-C-AA-AACCC------T-G-C----TCTCCCTT---CCCCC---CA-------G-GG-----ATA--T-TT-TAA---------G--TAT-GAA--TT-TTCTGAA-A---A-G-------CTACT-A-T-----A-C---AA------------------A---TGC-----TA-CAAA-AG-GA---CCATA-TG-TT-CC---TACT--CT--GCCT-G--TA-T-GG-G--CG--TCAGG---ATGT--T--TTT--GGGGTA---AATTT-TCTTAAGT-AATTTT-TTTATC-AAAA-GCCGC-TG-AA--GTGGT--G-A--ATATA--AA--------CGGCGCTTTA---TT-AAC-C-TG--AAA---------TTT-TAGCGTTTT--GG----TT-TG---G---T-A-ACAGTGAT-GGCTT-G-G----A-TTCCAT--AA-A-TGGAATTAAAA-A-CGATTCGACACA-ACA----C-CC----AA-AG--CACAAC--A----A------T-GT---GATTT--TTT-C-TTGGCT--A-------TCGGGT--------G-------GGGGGGG---------G-G----ttc
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -T-C-AAT-G--AAA-AC-C-TTCA---A-TA-TG-T-T-TCT----A-T---GA-----GCAAC-TT-TTT--G-TGA-TA--TCAAA-----A-CGTA---A-TATGT---CTAA-T-TTT----------GG-T---G-GCTT---G-G--T-A-G--AATT--A-AC-C-G-AT-T----TT-T--C-AA-----TT-------AA-T----AT-T----ACT-T-GT-T----AA---AAC-AT--A-------TG----T----A-----AAA---A------------------A-A-AAAAC-C--------C-----TCT--CA-A---A-GTG-A--AAACACCTCAA--TT-AC-A---A-CGC---A-TC----A------TTAA-A-TA---ATGT-T-C----AT---T-A--C---A-TC-CATG--CAT--T----------A-TA-T------------C-A-----CC-C------A-A-TTT--C--ATT---C-------------G-TA-T--A-GAT-T-TA---A---TTAAA-TT-G--A--AA---AC-AAAA-A--T--CTA--AAT-GAAAA----T------AA-G--A-----A-------------T-T-A-TC-TATT-AAGTAAT----T-AA---ATT-----T--AAT-----C-AATA--TTA--AT-T--TT-T-------TT----A-------AGAGGACA--A-T----TAT-AT-ACATGTATA-------AGTggcgcataataacctgaagttggggaacattttaatgtgctatttagtactattctctacttcctatcgcctcatctcttctcgatatcttttcaatgaaaaccttcaatatgtttctatgagcaactttttgtgatatcaaaacgtaatatgtctaattttggtggcttggtagaattaaccgatttttcaattaatattacttgttaaaacatatgtaaaaaaaaaaaccctctcaaagtgaaaacacctcaattacaacgcatcattaaataatgttcattacatccatgcattatatcacccaatttcattcgtatagatttaattaaattgaaaacaaaaatctaaatgaaaataagaattatctattaagtaattaaatttaatcaatattaatttttttaagaggacaattatatacatgtataagtctcggtcactttaggatataaatgattggtatgcaatttctcaataa
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gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        agcgttgctcaagtacaCTTTGA-G--CT---C-C-AATAACCC------T-G-CCAACTCGCCCCC---CTTCC---C-TT-----G-GG-----A-A----TT-TGAA----G-G-G--TAT-G-cagggttttcaatagtat
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             t-TT-TGAC----G-G-G--TAT-G-A--TT-TTCTG-A-A---A---------CT--T-ATT----GA-A---AA------------------A---TGC-----TA-CAAA-AT-GAG--
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GACCT--G-G--CT-TTC-C-AAT---CCC-----T--------TCCCCCCC---CGCCC---GGGG-----G-GGGGGGGA-A--T-TT-TGAA----G-G-G--TAT-G-A--TTGTTCTG-A-A---A-GA------CT--T-A-T----AA-C---AA------------------T---TGC------A-CCAC-AT-GAG--CC--A-TG-TTATG---CACT--CT--GGC--G--TT-G-GG-G--CG--T-AAG---A-G---T--TTT--GGGGTA---AA--A-TCTTAAG--A------TTTATCAATAA-ATCGC-TGAAA--ATTTG--GTA--A---A--AA--------CTG-----TA---TA-AAT-C-TT--AAA-A--TA---TTT-TG--TTTTT--TG-----T-TGT-TT-------AC--T-AT-GGC-TCG-T------T--CAT--AATA-TG---TC-TAA-A-C--TCAGG-ACAGACA----A-CT----CA-AAATCAC-AC--AT---T------T-TT---A---TGCTTT-C-TTGGCT--A-------TT-TTT----------------TGGGGGA---------A-A----ATA--C-CG-G-A--------TTTTT-----GCTG----AAA-T-T-CAAAT-G--ACA-AC-C-T-CA---A-TA-T--T-T-TTTC---C-A---TA-T--TG-AA--TT-TTT--GTTGA-T---TC-AA-----AGCG-A---A-T-TGTCGCC-AT-G-TTT----------GG-T--TG-GCTTTG-G-G--T-ATC--GAT---A-AT-C-CAAT-C-A--TT-TC-C-AA-----TT-----T-AA-TA---AT-G--T-TCACT-GT-T----AA---CA--A---T-------TG----G----T-----AAA---A------------------C-A-AATA--C--------T-----TCT--CA-A---A-A-G-G--AAACA-CTC-A--TT-AC-A---G-AGC---A-TC----A------TTAA-ATTA---ATGCTT-C----AT---T----C---A-CC-ACT----AT--T---------GATTA-T------------CTA-----TA-C------ACA-TCT--T--A-----TC-------A-G--G-T--T--A-AAT-T-TT---A---ATAAATTT-GATA--AA-G-AC--AAA-A--T--CAG--AAT-GAAAA----T------AA-T--A-----A-A-----------T-T-ATTC----T-AAT---T--A-T-TA---ATT-----A--A-------T-A--A--TTA--AT-T--AT-TTTAA-A-TT----A-------AAA-AAAA--A-
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ata---A-A-AT----A-------AGC-GACC--A-T----TATGAT-ACATGTAC-----------AC--A-GT----CTGT-TGT----A-CTT-TATTGG-TATGaaaaaaacaaaaaaaaaaaaaaaaataagcgaccattatgatacatgtacacagtctgttgtactttattggtatgcaggggcttctcccatgggatt
gi|6                          : atagacctggctttccaatcccttccccccccgcccggggggggggggaattttgaagggtatgattgttctgaaagacttataacaattgcaccacatgagccatgttatgcactctggcgttggggcgtaagagttttggggtaaaatcttaagatttatcaataaatcgctgaaaatttggtaaaaactgtataaatcttaaaatattttgttttttgttgtttactatggctcgttcataatatgtctaaactcaggacagacaactcaaaatcacacatttttatgctttcttggctattttttgggggaaaataccggatttttgctgaaattcaaatgacaacctcaatattttttccatattgaatttttgttgattcaaagcgaattgtcgccatgtttggttggctttgggtatcgataatccaatcatttccaatttaataatgttcactgttaacaattggtaaaacaaatacttctcaaaaggaaacactcattacagagcatcattaaattaatgcttcattcaccactattgattatctatacacatcttatcaggttaaattttaataaatttgataaagacaaaatcagaatgaaaataataaattattctaattattaattaataattaattattttaaattaaaaaaaaaaaaaaaacaaaaaaaaaaaaaaT-G-C-C-AATAACCCC-----TAG-T----TCCCGC--------------AGG-----G-GG-----A-AG-T-TT-TGAA----G-G-G--TAT-G-A--TT-TTCTG-A-A---AGG-------CT--T-A-T-----A-CGA-AA------------------A---TGC-----TA-C-AA-AT-G-G--CC--ATTG-TT-TG---CACT--CT--G-CC-G--TT-G-GG-G--CG--TTAAG---A-G---T--TTT--GGGTTA---AA--A-TCTTAAG--AA---T-TTAGTC-AAAA-ATCGCTTG-AA--GATTG--G----A---A--AA--------CTA-----TA---TA-AAT-C-TT---AATA--T----TTT-TA--ATGTT--TG----TT-TAA-ATA--T-A-ACA-T-AT-GG--T-G-T----A-T---AT--AA-A-TG---TCAT-A-A-CTATC--GGACAGA-A----C-TT----CA-AA--CAC-AC--T----A------T-TT---A---T--TTT-CATTGGCT--A-------GT-TTT-----------------GGGGCG---------A-A----AT---C-C--G-A---------TTTT-----G-TT----AAACA-T-C-AAT-G--GAA-AC-C-T-CAG--A-CG-T--TAT-TTA----A-A---TA-C--CGC-A--TT-TTT--G-TGATT---TC--A-----AACG-A---ATT-TGT-----ATGT-TTT----------GGATA-TG-GCTTTG-G-A--T-ATC--GAT---A-AT-C-C-AT-C-A--TT-T--T-AA-----TT-----C-AA-T----A--T--T-GCA-T-GT-T----AA---CAT-AT--T-------TG----G----T-----AAA---AAAACGAAACAAAAACAACA-A-AAAAA-A--------C-----TAT-----A---A-ATG-ATTAAACC-CTT-A--T---C-A---A--GC---AGTCG-T-AACCAGGCTAA-ACTATACACGA-T-CATGAGT---T-ATGC---T-TC-GTTA--CAT--TCATTGCATTAA-TA-A------------T-A-----CA-CCTGCACA-A-TTT--T--A-T---TC-------A-G--G-G--T--T-ATT-T-TT---A---ATAAA-TT-G--A--AC-G-AC-AAAACAC-T--CA---AAT-AAAAC----T------AA-T--------A-A---A-C-----T-T-CTCA-TATT--ATTGATAAA-T-TA---ATT-----A--AAT----------A--TTA--AT-A--AG-T---A-ATTT----A-------AGAGGACA--A-T------TGAT-ACATGTACA-------T---C---TG------TGT-TGT----A-CTTATGTTGcaggggcttctcccatgggatt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  agctgGACCTTGA-G--CCCA-C-C-AATAACTCC-----A-A-C----CCACCCCC---CCCCC---CGGGTGTGTGTGG-----A-A--T-TT-TGAA----G-G-G--TAT-G-G--TT-TTCTG-A-C---A-G-------CT--T-A-T----GA-----AA------------------A---TGC-----TA-NNNN-NN-NNN--NN--N-NN-NN-NN---NNNN--NN--NNNN-N--NN-N-NN-N--NN--NNNNN---N-N---N--NNN--NNNNNN---NN--N-NNNNNNN--NN---N-NTTATCAAAAA-ATCGC-TG-AC--ATT-G--G-A--A---A--AA--------CTG-----TA---CA-AAT-C-TT--TAATA--T----TTT-TA--TTTTTGTTGGTTTTT-TGT-CT---T-ACACA-T-AT-GGC-T-G-T----A-T--CAT--AA-A-TG---TCATAA---CTATCAGGA-CAGA-A----C-CT----CA-AA--CAT-AC--AA---T------T-TT---AA--T--TTT-T-GGGGCT--A-------TT-TG---------G-------GGGGGGG---------G-G----AT-----C--G-A--------TTTTT-----G-TG----AAT---T-C-AAT-G--AAA-ACTC-A-CA---A-TT-T--T-T-TTT----A-A---TA-T--CGCAG--TT-TTT--G-TGA-T---TCAAA-----CA-G-A---A-T-TAT---A-AT-T-TTTT---------GG-TA-TG-GCTTTT---G--T-ATG--AAT---A-AT-C-C-AT-C-A--TT-T--C-AA-----TT-----T-AA-T----AT-T--T-GCA-T-GT-TA---AA---CAT-AT--C-------TG----G----T-----AAA---A------------------A-A-AAAATAA--------T-----TGT--CA-A---A-GT--G--AAACA-CTC-A--TT-ATAA---A-CGC---A-TC----A------TTGA-ATTA---ATGC-T-T----CT---TAA--C---A-TC-ATTG--CAT--T---------AA-TA-T------------C-A-----CA-C------A-A-TTT--T--ATT---TC-------A-G--G-T--T--T-AAT-T-TT---A---ATGAA-TT-G--A--AA---AC-AAAA-A--T--CAG--AAT-GAAAA----T------AC-T--AAAT--A-A---A-C-------T-ATTC-TAGT-AA-TAATTGA-T-TAATTATT-----A--GAT-----T----A--TTA--TT-T--AT-T---A-ATTT----A-------AGA-GACA--A-T----TATGA-------TACA-------TGTAC--ATGT----CTGT-TTT----A-CTTATATTGG-TATGtgtgcaggggttctcaaatagg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     taGACCTTGA-G--CT-G-C-C-AATAACCCCACCCCT-G-T----TCCCCCCC-------------AG-----G-GG-----A-A--T-TT-TGAA----G-G-G--TAT-G-A--TT-T-CTG-A-A---A-G-------CT--T-A-T----AA-C---AA------------------A---TGC-----TAACAAA-NN-NNN--NN--N-NN-NN-NN---NNNN--NN--NNNN-N--NN-N-NN-N--NN--NNNNN---N-N---N--NNN--NNNNNN---NN--NNTCTTAAG--AAT--T-TTTATC-AAAA-ATCGC-TG-AA--ATTTG--G-A--A---A--AC--------CTG-----TA---TA-AAT-C-TT--AAATA--T----CTT-TA--TTTTT--TG----TT-TGT-CT---T-A-ACA-T-AT-GGC-T-G-T----A-T--CAT--AA-A-TG---TCATAA-A-CTATCA-GAACAGACA----C-CT----CA-AA--CAC-AC--AAT--T------T-TT---A---T--TTT-C-TTGGCT--A-------TT-TTT--------G-------GGGGAAA---------A-A----ATA--C-C--G-A--------TTTTT-----G-TG----AAA-A-T-C-AAT-G--AAA-AC-C-T-CAT--A-TATT--T-T-TCT----A-A---TA-T--TGCAA--TT-TTT--G-TGA-T---TC-AA-----AACG-A---A-T-TGT---C-ATGT-TTT----------GG-TA-TG-GCTTTT-GAG--TAATG--AAT------T-C-C-AT-C-AT-TT-T--C-AA-----TT-----T-AA-T----AT-T--T-GCA-T-GT-TA---AA---CAT-AT--T-------TG----G----T-----AAA---A------------------A-A-GAAATAA--------T-----TCT--CA-A---A-GTG-G--AAACA-CTC-A--TT-AC-A---A-CAC---A-TC----A------TTAA-ATTA---ATGCTT-C----TT---T-A--C---A-TC-ATTG--CAT--T---------AA-TA-T------------C-A-----CA-C------A-A-TTT--T--ATT---TC-------A-G--G-T--T--A-A-T-T-TT---A---ATAAA-TTAG--A--AA-G-ACAAAAA-A--T--CAG--AAT--AAAA----T------AA-C--A-----A-A-----------T-T-ATTCTTATT-AATTAATTGA-T-TA---ATT-----A--AAT-----T-A--A--TTATTAT-T--AT-T---A-T-CT----A-------AGA-GACA--A-T----T-T-AT-ACATGT------------TAC--AAAT----C----TGT----A-CTTATATTGG-TATGcaggttctcactagga
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Unaligned ( gi|41 ): TATTTATAACCCTTTTGGAATTAATTCATAAAACAATTCTAAAAGTTTCTAAGCTAAATTT