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lowQualScore                  :      . .     .  ...  .      ......   . . .  .    .....          . .   .  ...     . . ..   ..................     ....   ..    . ........................................    ..  ... .    .. ..        .........    ....     ....... ....  .   ...  .        ...   .. .  .    . ......  ..  .  .    .   . .. ..  ....     . ..    . . ..     
lowQualScore                  :      0 0     7  000  7      222222   9 9 7  7    33333          0 5   1  111     4 4 66   222222222222222222     7777   11    2 2222222222222222222222222222222222222222    55  777 1    55 00        333333333    2222     4444444 1111  5   999  5        666   00 5  5    5 333333  55  5  5    5   5 00 00  2222     5 44    8 7 22     
consensus                     :    ATCGCACTTTAGA---GT-CCTATA------TTT-G-A-CA-CTTT----CACTTGATGCCTT-CAAAGA---TTCTG-T-T--ATT-----A-------CCAN-GCACG----AAA--GTTC-AAA-T-AATAC-ATA---TTAC--T-TACTA--TTAT-A-TAAAAC-AA---A-AATCT-GA-TTCATTAAA--------GTAT---TTACTA-C--A--C----TT-CTTC--AA-TTTCTTAT---TAA--T-TA-GCAG-A------TA--TG-GC-GCTA-GCA-T--T--CT----AATCT-T--TTTT-A-A--AAGAT
Reference ( gi|2 )            :    ATTGTACTTTGGA---GT-CCTATA------TTT-G-A-CA-CTTT----AACTTGATGCCGT-CAACGA---TTCTG-T-T--ATT-----A-------CCAA-GCACG----AAA--GTTC-AGA-T-AATAC-ATA---TTACA-TGTACTA--TTAT-A-TAAAAC-AA---A-AATCA-GA-TTCATTAAATT--ACGCGTAT---CTACTA-A--A--C----TT-CTTT--AA-TTTCTTAT---TAA--T-TA-GCAG-A------TA--TG-GC-GCTA-GCA-T--T--CT----AATCT-T--TTTT-A-A--AAGAT
gi|3                          :    ATCGCACTTTGGA---GT-CCTATA------TTT-G-A-CA-CTTA----CACTTGATGCCTT-CAAAAA---TTCTG-T-C--ATT-----A-------CCAA-GCACG----AAA--GTTA-AAA-T-A--------------------------TTAT-A-TAAAAC-AA---A-AGTTT-GA-TTCATTAAA--------GTAC---TTACTA-C--G--C----TT-CTTC--AA-TTTTTTAT---AAA--T-TAAGCAG-A------TA--TG-AC-GCTA-GCA-T--T--CT----AATCT-T--TTTA-A-A--AAGAT
gi|1                          :  ccATCGCACCTTCGAAAAG--CCTATA------TTTCG-A-CA-CTCT----CATTTGACGCCTT-CAAAGA---TTCTG-T-TCAGTT-----A-------CCAA-GCACG----CAACCGTTC-AAA-T-AATAC-ATA---TATTA-T-TACTA--TAAT-AATAAAAC-AA---A-TCTCGCAA-TTCATTAAA--------GTAT---TTACTC-A--A--C----T--CTTCCCAA-TTTCTTAT---TAA--T-TA-GCAG-A------TA--TG-GC-GCTA-GCA-T--T--TT----AATCT-TC-TTTT-A-A--AAGATaatt
gi|11                         :   cATCGCACTTTAGA---GT-CCTATA------TTT-C-A-CA-CTTT----CACTTGATGCCCT-CAAAGG---TTCTG-T-T--ATT-----G-------C-------CG----AAA--GTTC-AAA--------------------------TA--TTGT-T-TAAAAC-AA---A-AATCT-GA-TTCATGAAA--------GTAT---TTACTA-C--A--C----TT-C---------------------A--T-TA-GCAG-A------TA--TG-AC-GCTA-GTA-T--T--CT----AATTT-T--TTTT-aagc
gi|12                         :  ccATCGCACTTTAGA---GT-CCTATACATGTATTT-G-A-CA-CTTT----TACTTGATGCCTT-CAA-GA---TTCTG-T-T--ATT-----A-------TAAA-ACAtctaaa
gi|4                          :  ccATCGCACTTTAGA---GTGCCTATA------TTT-GCA-CAGCTTT----A-CTTGGTGCCTT-CAAAGA---TTTTG-T-T--ATT-----G-------CC------TG----AAA--GTTCAAGA-T-TATTC-GTA---TTA-A-T-----------------AAGC-AA---T-AATCT-GA-TTGATGAAA------G-GTAT---TTA----------------G-CTCT--AA-CTTC--AT---TAG--T-----CAG-A------TA--TGAACGGCTATGCA-T--TG-CT----AATCT-TTCTTTC-A-AATAAGATaaaatctgattcattaaagtatttgctacaccctcttcttaaattattagcagatatggcgctagcattctaatttttttaaagata
gi|26                         : cccATCGCACTTTAGA---GT-CCTATACATGTATTT-G-A-CA-CTTT----TACTTGATGCCTT-CAA-GA---TTCTGTT-T--ATT-----A-------TAAA-ACAaa
gi|32                         :          cccTGTA---GT-CCTATA------TTT-G-A-TA-CTTT----CACTTGATGCaaaatctgattcattaaa
gi|10                         :      ccatcccactttataaataTATT------TTT-G-A-CG-CTTT----CATTTCATGCCTT-CAAAGA---TTCTG-TAT--ATT-----A-------CTAT-GCACG----AAA--GTTC-AAA-T-AATGC-ATA---TTACT-T--------TTGT-A--AAAAC-AA---A-AATCT-GA-TTCATTAAA--------GTAT---TTACAA-C--A--C----TT-CTT---AA-TTTCTTAT---TGA--T-TA-TCAG-A------TA--TG-GC-GCTA-GCA-T--T--CT----AATCT-T--T
gi|21                         :                        aTATA------TT--G-A-CA-CCTTTTCTCACTTGATGCCTTTCAAAGA---TTCTG-T-TT-ATT-----A-------CCAT-GTACG----AAA--GTTC-A-A-T-AATTA-ATA---TT---------CA--CTAT-A-TAAAACAAA---A-AATCT-GA-TTCATTA
gi|7                          :                          tTA------TTT-G-A-CA-CTTT----CACTTGATGCCTT-CAAAGA---TTCTG-T-T--ATT-----ATACTGTACCAA-GCACGCCCGAAA--GTTC-AAA-T-A-----------------TG---------AT-A-TAAAAC-AA---A-AATCT-GA-TTCATTAAA--------GTAT---TTACTA-C--A--C----TT-CTTC--AT-TTTCTTAT---TAA--T-TA-GCAG-A------TA--TG-GC-GCTA-GCA-T--T--CTAAA-AAGAT-T--TTTT-A-A--AAGtagtaattctac
gi|8                          :                           gA------TTT-G-AACA-CTTT----CGCACAATGCTTC-CAAAGA---TTCTA-T-T--GTTCATGTA-------CAAT-GCACG----AAA--GTTC-AAA-TTAATGC-ATA---TT------T-CTA--TTAT---CAAAATTAA---A-AATCT-GA-TTCATTAAA--------ATAT----TACTA-T--A--C----GT-CT--------------T---GAA--T-TA-GCAGAA------TAT-TG-GC-GCTA-GCATT--T--CT----AATTTAT--TTTT-A-A--AAGAT
gi|5                          :                             ------TTT-G-A-CA-CTTT----CACTTGATGCCTT-CAAAGA---TTCTG-T-T--ATT-----A-------CCAT-GCACG----AAA--GGTC-AAA-T-AATAC-AAA---TTAC--TATA----------A-TAAAAC-AA---A-AATCT-GT-TTCATT-AATTAAAAAAGTAT---TTAGTA-C--A--C----TT-CTTC--AA-TTTCTTAT---TAA--T-TA-GCAG-A------TA--TG-GT-GCTA-GCA-T--C--CA----AATTT-T--TTTTAA-A--AAGATaa
gi|6                          :                                     T-G-A-CA-CTTT----CACTTGATGTCTT-TAAAGA---TTCTG-T-T--ATT-----A-------CCAC-CCACG----GAT--GTTC-ATA-T-AATGC-ACA---T-------TACTA--TTAC-G--AA----AA---A-AATCT-GA-TTCATTAA---------GTATTTACTACTA-AACA--C----TT-CTTC--AC-TTTCTTGT---TGA--T-TA-GTAT-A------TA--TG-GC-GCCA-TCA-T--T--CT----AATTT-TG-TTTT-T-A--AAGATaa
gi|9                          :                                attgcT-G-A-CA-CTTT----CGCT----GCCTT-CAAAAAATATTTTG-T-T--ATT-----A-------CCAT-CCACA----AAT--GTTC-AAA-T-AATAC-TTA---TTGAA-T-TATTAAATTAT-T-TAAAA--AA---T-ACTTA----TTCATTAA---------GTAT---TTACTA-C--A--C----TT-CTTC--AA-TTACTTAT---TAA--T-TA-GTGT-A------TA--TG-GC-GCTA-GCA-T--T--CA----AATCT-T--TTTT-
gi|13                         :                                     attgg-CA-ATTT----CACTTGATTACCT-CAAAGA---TT-TC-T-T--AT------A-------CC---GTACG----AAA--GTTC-AAA-T-AATAC-ATA---TTACT-T----TA--TTAT-A---AAAT-AA---A-AATCT-GA-TTAATTAAG------GCATAT-----ATTG-C--A--C----TT-CTTC--AG-TTTCTTAT---TAA--T-TA-GCAG-A------TA--TG-GC-GCTA-GCA-T--T--CT----GATt
gi|16                         :                                                          tGATGCCTT-CCAAAA---TTCTG-T-T--ATT-------------TCAATGCACG----AAA--GTTC-A-----------------------------A--TTAT-A---AAAC-AA---A-AGTCC-GA-TTCATTAAA--------GTAT---TTACTA-G--A--A----TT-CTTC--AA-TTTCTTAT---TAA--T-TA-GCTG-A------TA--TG-GC-TCTA-GCA-T--T--CT----AATCT-T--TTTT-A-A--AAGAT
gi|17                         :                                                          gGATGCCTT-CCAAAA---TTCTG-T-T--ATT-------------TCAATGC-CG----AAA--GTTC-A-----------------------------A--TTAT-A---AAAC-AA---A-AGTCC-GA-TTCATTAAA--------GTAT---TTACTAGA--A--T----TT-CTTC--AA-TTTCTTAT---TAA--T-TA-GCTG-A------TA--TG-GC-TCTA-GCA-T--T--CT----AATCT-T--TTTT-A-A--AAGAT
gi|19                         :                                                                        GA---CTTTG-T-A--ATT-----A-------TCAT-CGACA----AAT--GTTC-AAA-T-AATAC-ATA---TCA-A-TAT------TTAT-A---------A---A-AATC------TGATTAA---------GTAT---TTACTA-C--T--C----TT-CTTC--AA-TTTCTTAT---TAA--T-TA-TTAG-A------TA--TG-GT-GCTA-CCA-T--T--CT----AATCT-T--Ta
gi|14                         :                                                                                       aaTC-----A-------CCAAAGCAGA----AAA--GTTC-AAA----ATAC-ATAGATTTAT----TACTA--TTG--G-TTAAAC-AA---A-AATT--GA-TTCATTAAA--------GCAT---TTATTA-T--G--C----TT-CTTT--AAATTTCTTAT---TAA--T-TA-GC-T-A------TA--TG-GC-GCTA-GCA-T--T--CTCCGGAATAT-T--TTTT-ccc
gi|15                         :                                                                                                           A-ACACG----AAC--GTTC-AAAAT-AATACCATA---TTACA-TATAACA--TAAT-A----AAC-AA---A-ATT---GACTTCATTAAA--------GTAT---TTACTA-A-----C----GT-CTTT--AC-TTTCTTATGTCTAAAAT-TA-GCAG-A------TACATG-GC-GCT--GCA-T--TT-CT----AATC--T--TTTT-A-A--AATATtacacagata
gi|18                         :                                                                                                            -GCACG----AAA--GTTT-AAA-T-AATAC-ATA---TTAT----TACT---TT-T-A-TAAAAC-AA---A-ACTAT-GA-ATTATTAAA--------GTAT---TTACTA-C--A--C----TT-C--------------------AA--T-CA-GCAG-A------TA--TG-GC-GCTA-GCA-T--T--CT----AATTT-T--GTTT-aagc
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gi|29                         :                                                                                                                                            aTA---CTACAATGTATTA--T-------AAAA--AA---A-AAT-------------AATT--G------T---CCACTA---------------CTTT--AA-TTTCTTAT---CAA--T-TA-GTAC-A------TA--TG-GC-GCTA-CCA-T--T--TT----AATCT-aga
gi|22                         :                                                                                                                                                          TACCA--TT-T-A-TAAAG--AA---A-ATTCT-GA-TTCATTAT-TT--AAA-GTAT---TTACTG-T--C--C----TT-CTTC--AA-TTTCTTAT---TAA--T-CA-GCAG-A------TA--TG-CC-GCTA-GCA-T--T--CT----A-----T--TTTT-ATA--AAGAT
gi|12                         :                                                                                                                                                         tatCTG--TTATTA-TAAAAC-AA---A-AATCT-GA-TTCATTAAA--------GTAT---TTGCTA-C--A--CCCTCTT-CTTA--AA-TT-----------A--T-TA-GCAG-A------TA--TG-GC-GCTA-GCA-T--T--CT----AATTT-T--TTT----A--AAGATatgc
gi|24                         :                                                                                                ccatcgcactttagagtcctatacatgtatttgacacttttacttgatgccttcaagattCCA--TT-T-A-TAAAG---A---A-AATTC-GA-TTCATTAT-TT--AAA-GTAT---TTACTG-T--C--C----TT-CTTC--AA-TTTCTTAT---TAA--T-CA-GCAG-A------TA--TG-CC-GCTA-GCA-T--T--C-----------T--TTTT-ATA--AAGAa
gi|25                         :                                                                                                                                                              tattTGT-A-TAGAAC-AA---A-AATCT-TA-TTCATCAAA--------GTAT---TTACTA-C--A--C----GT-CTTC--AT-TTTCTTTT---TTA--T-TA-GCAG-A------TT--TT-GC-GCTA-GCA-T--T--CT----AATCT-T--TTTT-T-A--
gi|27                         :                                                                                                                                                                       -TAAAAC-AATAAATAATCA-A---TCATTA---T--AAAAGTGT---TTACTA-C--A--C----CT-CTTC--AA-TTTCTTAT--------------------------A--TG-GC-GCTA-GCA-T--T--CT----AATCT-T--TTTT-
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1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|30 ): TTTCACTTTGGAATTGCCTCAAAGATGTCTGTGTATACCGTAGCAAGGAAGTTCGAATACTAACAACTTACTTTTATTATAA






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consensus                     :                      ATCGCACTTT---A-------G-AGT-CCTATA------TTT-G-A-CACTTT----CACTT--GA--TGCCTT-CAAAGA---T-TCTG-T-T--ATT-----A-------CCAT-GCACG----AAA--GTTCAAA-T-AATAC-ATA---T--T-A--T-TACTA--TTA-T-A-TAAAAC-AA-A-AAT-CT---GA-T---TCATT-------A----AA------GTATTTACT-----A--CA-CTT-CTTC--AA-TTTCTT--AT-T----AAT-T-AGCAG-A------T--A-TG-GC-GCTA-GCA-T--T--CT----AATCT-T--TTTT-A-A--AAGAT
Reference ( family-6035 )     :                      ATCGCACTTT---A-------G-AGT-CCTATA------TTT-G-A-CACTTT----CACTT--GA--TGCCTT-CAAAGA---T-TCTG-T-T--ATT-----A-------CCAN-GCACG----AAA--GTTCAAA-T-AATAC-ATA---T--T-AC-T-TACTA--TTA-T-A-TAAAAC-AA-A-AAT-CT---GA-T---TCATT-------A----AA------GTATTTACT-----A--CA-CTT-CTTC--AA-TTTCTT--AT-T----AAT-T-AGCAG-A------T--A-TG-GC-GCTA-GCA-T--T--CT----AATCT-T--TTTT-A-A--AAGAT
gi|1                          :                      ATCGCACCTTCGAA-------A-AG--CCTATA------TTTCG-A-CACTCT----CATTT--GA--CGCCTT-CAAAGA---T-TCTG-T-TCAGTT-----A-------CCAA-GCACG----CAACCGTTCAAA-T-AATAC-ATA---TATT-A--T-TACTA--TAA-T-AATAAAAC-AA-A---T-CTCGCAA-T---TCATT-------A----AA------GTATTTACT--------CA-ACT-CTTCCCAA-TTTCTT--AT-T----AAT-T-AGCAG-A------T--A-TG-GC-GCTA-GCA-T--T--TT----AATCT-TC-TTTT-A-A--AAGAT
gi|10                         :                                                  cTATT------TTT-G-A-CGCTTT----CATTT--CA--TGCCTT-CAAAGA---T-TCTG-TAT--ATT-----A-------CTAT-GCACG----AAA--GTTCAAA-T-AATGC-ATA---T--T-AC-T-T------TTG-T-A--AAAAC-AA-A-AAT-CT---GA-T---TCATT-------A----AA------GTATTTACA-----A--CA-CTT-CTT---AA-TTTCTT--AT-T----GAT-T-ATCAG-A------T--A-TG-GC-GCTA-GCA-T--T--CT----AATCT-T--Taagc
gi|11                         :                     aATCGCACTTT---A-------G-AGT-CCTATA------TTT-C-A-CACTTT----CACTT--GA--TGCCCT-CAAAGG---T-TCTG-T-T--ATT-----G-------C-------CG----AAA--GTTCAAA----------------------------TA--TTG-T-T-TAAAAC-AA-A-AAT-CT---GA-T---TCATG-------A----AA------GTATTTACT-----A--CA-CTT-C-------------------------AT-T-AGCAG-A------T--A-TG-AC-GCTA-GTA-T--T--CT----AATTT-T--TTTT-
gi|12                         :                    ccATCGCACTTT---A-------G-AGT-CCTATACATGTATTT-G-A-CACTTT----TACTT--GA--TGCCTT-C-AAGA---T-TCTG-T-T--ATT-----A-------tctaaa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                         ccCTG--TTA-TTA-TAAAAC-AA-A-AAT-CT---GA-T---TCATT-------A----AA------GTATTTGCT-----A--CA-C---CCTC------TTCTTAAAT-T-----AT-T-AGCAG-A------T--A-TG-GC-GCTA-GCA-T--T--CT----AATTT-T--TTT----A--AAGATtaaaacaaaaatctgattcattaaagtatttgctacaccctcttcttaaattattagcagatatggcgctagcattctaatttttttaaagata
gi|13                         :        ccatcgcactttagagtcctatacatgtatttgacacttttacttgatgccttcaagatt-CAATTT----CACTT--GA--TTACCT-CAAAGA---T-T-TC-T-T--AT------A-------CC---GTACG----AAA--GTTCAAA-T-AATAC-ATA---T--T-AC-T-T--TA--TTA-T-A---AAAT-AA-A-AAT-CT---GA-T---TAATT-------A----AG------GCATATATT-----G--CA-CTT-CTTC--AG-TTTCTT--AT-T----AAT-T-AGCAG-A------T--A-TG-GC-GCTA-GCA-T--T--CT----GATa
gi|14                         :                                                                                                                      tTC-----A-------CCAAAGCAGA----AAA--GTTCAAA----ATAC-ATAGATT--T-A--T-TACTA--TTG---G-TTAAAC-AA-A-AAT--T---GA-T---TCATT-------A----AA------GCATTTATT-----A--TG-CTT-CTTT--AAATTTCTT--AT-T----AAT-T-AGC-T-A------T--A-TG-GC-GCTA-GCA-T--T--CTCCGGAATAT-T--TTTT-
gi|15                         :                                                                                                                                            CACG----AAC--GTTCAAAAT-AATACCATA---T--T-AC-A-TA-TA--ACA-T-A-ATAAAC-AA-A-A---TT---GACT---TCATT-------A----AA------GTATTTACT-----A---A-CGT-CTTT--AC-TTTCTT--ATGTCTAAAAT-T-AGCAG-A------TACA-TG-GC-GCT--GCATT--T--CT----AATC--T--TTTT-A-A--AATATtacacagata
gi|16                         :                                                                                  aa--GA--TGCCTT-CCAAAA---T-TCTG-T-T--ATT-----T-------CAAT-GCACG----AAA--GTTCAA----------------------------------T--T-A-TAAAAC-AA-A-AGT-CC---GA-T---TCATT-------A----AA------GTATTTACT-----A--GA-ATT-CTTC--AA-TTTCTT--AT-T----AAT-T-AGCTG-A------T--A-TG-GC-TCTA-GCA-T--T--CT----AATCT-T--TTTT-A-A--AAGATaagc
gi|17                         :                                                                                   g--GA--TGCCTT-CCAAAA---T-TCTG-T-T--ATT-----T-------CAAT-GC-CG----AAA--GTTCAA----------------------------------T--T-A-TAAAAC-AA-A-AGT-CC---GA-T---TCATT-------A----AA------GTATTTACT-----A--GAATTT-CTTC--AA-TTTCTT--AT-T----AAT-T-AGCTG-A------T--A-TG-GC-TCTA-GCA-T--T--CT----AATCT-T--TTTT-A-A--AAGAT
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gi|19                         :                                                                                                   AAGA---C-TTTG-T-A--ATT-----A-------TCAT-CGACA----AAT--GTTCAAA-T-AATAC-ATA---T--C-A-----A-TA--TT--T-A-TAAAA--------AT-CT---GA-T---T----------------AA------GTATTTACT-----A--CT-CTT-CTTC--AA-TTTCTT--AT-T----AAT-T-ATTAG-A------T--A-TG-GT-GCTA-CCA-T--T--CT----AATCT-T--Ttttttttttttaaagataagc
gi|2                          :                      ATTGTACTTT---G-------G-AGT-CCTATA------TTT-G-A-CACTTT----AACTT--GA--TGCCGT-CAACGA---T-TCTG-T-T--ATT-----A-------CCAA-GCACG----AAA--GTTCAGA-T-AATAC-ATA---T--T-ACATGTACTA--TTA-T-A-TAAAAC-AA-A-AAT-CA---GA-T---TCATT-------A----AATTACGCGTATCTACT-----A--AA-CTT-CTTT--AA-TTTCTT--AT-T----AAT-T-AGCAG-A------T--A-TG-GC-GCTA-GCA-T--T--CT----AATCT-T--TTTT-A-A--AAGATccc
gi|20                         :                                                                                                                                                              AA-T-AATAC-ATA-----------T-TACTA--T---T-A-TAAAAC-TA-G-AA--------A-G---T-ATT-------T----AC------ATGTGTACT-----A--CA-CTT-CTTC--AA-TTTTTT--AT-T----AAT-T-AGCAG-ATACTAGT--A-TG-GC-GCTA-GCA-TGCTCACT----GATCT-T--TTTT-A-A--AA
gi|21                         :                                                   TATA------TT--G-A-CACCTTTTCTCACTT--GA--TGCCTTTCAAAGA---T-TCTG-T-TT-ATT-----A-------CCAT-GTACG----AAA--GTTC-AA-T-AAT----TA---A--T-AT-T-CAC-----TA-T-A-TAAAACAAA-A-AAT-CT---GA-T---TCATT-------A----TA------GTAATT-CT-----A--Caga
gi|22                         :                                                                                                                                                                                     t-T-TACCA--TT--T-A-TAAAG--AA-A-ATT-CT---GA-T---TCATT-------ATTTAAA------GTATTTACT-----G--TC-CTT-CTTC--AA-TTTCTT--AT-T----AAT-C-AGCAG-A------T--A-TG-CC-GCTA-GCA-T--T--CT----A-----T--TTTT-ATA--AAGAT
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                             taATTCACC-----AAATA-CTTGTTTT--AA-CCTCT---AC-T----TGTAT-AGTAG-A------T--A-TG-GC-GCTG-GCA-T--T--CTA---AATCT-T--TTCT-G-A--AAatgc
gi|24                         :                                                                                                                                                          tttaatttaaattactatgaaagatattttataCCA--TT--T-A-TAAAG---A-A-AAT-TC---GA-T---TCATT-------ATTTAAA------GTATTTACT-----G--TC-CTT-CTTC--AA-TTTCTT--AT-T----AAT-C-AGCAG-A------T--A-TG-CC-GCTA-GCA-T--T--C-----------T--TTTT-ATA--AAGAa
gi|25                         :                                                                                                                                                                                             tattTG-T-A-TAGAAC-AA-A-AAT-CT---TA-T---TCATC-------A----AA------GTATTTACT-----A--CA-CGT-CTTC--AT-TTTCTT--TT-T----TAT-T-AGCAG-A------T--T-TT-GC-GCTA-GCA-T--T--CT----AATCT-T--TTTT-T-A--
gi|26                         :                      ATCGCACTTT---A-------G-AGT-CCTATACATGTATTT-G-A-CACTTT----TACTT--GA--TGCCTT-C-AAGA---T-TCTGTT-T--ATT-----A-------
gi|26                         :                                                                                                                                                                                           ccc--TTA-TTA-TAAAAC-AA-A-AAT-CT---GA-T---TCATT-------A----AA------taaaacaaaaatctgattcattaaa
gi|27                         :                                                                                                                                      cccatcgcactttagagtcctatacatgtatttgacacttttacttgatgccttcaagattctgt-TAAAAC-AATA-AAT------AA-TCAATCATT-------ATAA-AA------GTGTTTACT-----A--CA-CCT-CTTC--AA-TTTCTT----------------------A------T--A-TG-GC-GCTA-GCA-T--T--CT----AATCT-T--TTTT-
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                          gAAT-AA-ATAAT-C-----A-A---TCATT-------ATAA-AA------GTGTTTACT-----A--CA-CCT-CTTC--AA-TTTCTT----------------------A------T--A-TG-GC-GCTA-GCA-T--T--CT----AATCT-T--TTTT-T-A--ttaaa
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                      aac-------A----AA------ATAATTG-T-----C--CA-CTA-CTTT--AA-TTTCTT--AT-C----AAT-T-AGTAC-A------T--A-TG-GC-GCTA-CCA-T--T--TT----AATCT-
gi|3                          : tactacaatgtattataaaaaATCGCACTTT---G-------G-AGT-CCTATA------TTT-G-A-CACTTA----CACTT--GA--TGCCTT-CAAAAA---T-TCTG-T-C--ATT-----A-------CCAA-GCACG----AAA--GTTAAAA-T-A----------------------------TTA-T-A-TAAAAC-AA-A-AGT-TT---GA-T---TCATT-------A----AA------GTACTTACT-----A--CG-CTT-CTTC--AA-TTTTTT--AT-A----AAT-TAAGCAG-A------T--A-TG-AC-GCTA-GCA-T--T--CT----AATCT-T--TTTA-A-A--AAGAT
gi|30                         :                                                                      ccTTT----CACTTTGGAATTGCCT--CAAAGA---TGTCTG-TGT--AT------A-------CCGTAGCAAG----GAA--GTTCGAA-T-ACTA--ACA--------AC-T-TACTT--TTATT-A-TAAaatt
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                       ------GTATTTACT-----A--CA-CTT-CTTC--AA-TTTCTT--AT-T----AAT-T-AGTGG-A------T--A-TG-GC-GCCA-GCA-T--T--CT----AATCT-T--TTT
gi|32                         :                      ATCCCACTTT---ATAAATATGTAGT-CCTATA------TTT-G-A-TACTTT----CACTT--GA--TGCa
gi|4                          :                    ccATCGCACTTT---A-------G-AGTGCCTATA------TTT-GCA-CAGCTT----TACTT--GG--TGCCTT-CAAAGA---T-TTTG-T-T--ATT-----G-------CC------TG----AAA--GTTCAAG-----------A---T--T-AT-T-CG-TA--TTA---A-T-AAGC-AA-T-AAT-CT---GA-T---TGATG-------A----AAG-----GTATTTA---------------G-CTCT--AA-CTTC----AT-T----AGT-----CAG-A------T--A-TGAACGGCTATGCA-T--TG-CT----AATCT-TTCTTTC-A-AATAAGAT
gi|5                          :                                                    ccc------TTT-G-A-CACTTT----CACTT--GA--TGCCTT-CAAAGA---T-TCTG-T-T--ATT-----A-------CCAT-GCACG----AAA--GGTCAAA-T-AATAC-A----------AA-T-TACTA---TA---A-TAAAAC-AA-A-AAT-CT---GT-T---TCATTAATTAAAA----AA------GTATTTAGT-----A--CA-CTT-CTTC--AA-TTTCTT--AT-T----AAT-T-AGCAG-A------T--A-TG-GT-GCTA-GCA-T--C--CA----AATTT-T--TTTTAA-A--AAGATaa
gi|6                          :                                                               T-G-A-CACTTT----CACTT--GA--TGTCTT-TAAAGA---T-TCTG-T-T--ATT-----A-------CCAC-CCACG----GAT--GTTCATA-T-AATGC-ACA-----------T-TACTA--TTA-C-G--AA----AA-A-AAT-CT---GA-T---TCATT------------AA------GTATTTACTACTAAA--CA-CTT-CTTC--AC-TTTCTT--GT-T----GAT-T-AGTAT-A------T--A-TG-GC-GCCA-TCA-T--T--CT----AATTT-TG-TTTT-T-A--AAGATaa
gi|7                          :                                                attgcTA------TTT-G-A-CACTTT----CACTT--GA--TGCCTT-CAAAGA---T-TCTG-T-T--ATT-----ATACTGTACCAA-GCACGCCCGAAA--GTTCAAA-T-A----------------------------TGA-T-A-TAAAAC-AA-A-AAT-CT---GA-T---TCATT-------A----AA------GTATTTACT-----A--CA-CTT-CTTC--AT-TTTCTT--AT-T----AAT-T-AGCAG-A------T--A-TG-GC-GCTA-GCA-T--T--CTAAA-AAGAT-T--TTTT-A-A--AAG
gi|8                          :                                                     gA------TTT-G-AACACTTT----CGCAC--AA--TGCTTC-CAAAGA---T-TCTA-T-T--GTTCATGTA-------CAAT-GCACG----AAA--GTTCAAA-TTAATGC-ATA---T--T------T-CTA--TTA-T---CAAAATTAA-A-AAT-CT---GA-T---TCATT-------A----AA------ATA-TTACT-----A--TA-CGT-CT----------------T-G----AAT-T-AGCAGAA------T--ATTG-GC-GCTA-GCATT--T--CT----AATTTAT--TTTT-A-A--AAGAT
gi|9                          :                                                               T-G-A-CACTTT----CGCT--------GCCTT-CAAAAAATAT-TTTG-T-T--ATT-----A-------CCAT-CCACA----AAT--GTTCAAA-T-AATAC-TTA---T--TGAA-T-TATTAAATTA-T-T-TAAAA-------AATACT---TA-T---TCATT-------A----A-------GTATTTACT-----A--CA-CTT-CTTC--AA-TTACTT--AT-T----AAT-T-AGTGT-A------T--A-TG-GC-GCTA-GCA-T--T--CA----AATCT-T--TTTT-aa





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consensus                     :                      ATCGCACTTT---A-------G-AGT-CCTATA------TTT-G-A-CACTTT----CACTT--GA--TGCCTT-CAAAGA---T-TCTG-T-T--ATT-----A-------CCAT-GCACG----AAA--GTTCAAA-T-AAT-ACATA---T--T--AT---TAC-T--ATTAT-A-TAA--AAC-AA-A-AAT-CT---GA-T---TCATT-------A----AA------GTATTTACT-----A--CA-CTT-CTTC--AATTTCTT--AT-T----AAT-T-AGCAG-A------T--A-TG-GC-GCTA-GCA-T--T--CT----AATCT-T--TTTT-A-A--AAGAT
Reference ( family-6035 )     :                      ATCGCACTTT---A-------G-AGT-CCTATA------TTT-G-A-CACTTT----CACTT--GA--TGCCTT-CAAAGA---T-TCTG-T-T--ATT-----A-------CCAT-GCACG----AAA--GTTCAAA-T-AAT-ACATA---T--T--AT---TAC-T--ATTAT-A-TAA--AAC-AA-A-AAT-CT---GA-T---TCATT-------A----AA------GTATTTACT-----A--CA-CTT-CTTC--AATTTCTT--AT-T----AAT-T-AGCAG-A------T--A-TG-GC-GCTA-GCA-T--T--CT----AATCT-T--TTTT-A-A--AAGAT
gi|1                          :                      ATCGCACCTTCGAA-------A-AG--CCTATA------TTTCG-A-CACTCT----CATTT--GA--CGCCTT-CAAAGA---T-TCTG-T-TCAGTT-----A-------CCAA-GCACG----CAACCGTTCAAA-T-AAT-ACATA---TATT--AT---TAC-T--ATAAT-AATAA--AAC-AA-A---T-CTCGCAA-T---TCATT-------A----AA------GTATTTACT--------CA-ACT-CTTCCCAATTTCTT--AT-T----AAT-T-AGCAG-A------T--A-TG-GC-GCTA-GCA-T--T--TT----AATCT-TC-TTTT-A-A--AAGAT
gi|10                         :                                                  cTATT------TTT-G-A-CGCTTT----CATTT--CA--TGCCTT-CAAAGA---T-TCTG-TAT--ATT-----A-------CTAT-GCACG----AAA--GTTCAAA-T-AAT-GCATA---T--T--A------C-T--TTTGT-A--AA--AAC-AA-A-AAT-CT---GA-T---TCATT-------A----AA------GTATTTACA-----A--CA-CTT-CTT---AATTTCTT--AT-T----GAT-T-ATCAG-A------T--A-TG-GC-GCTA-GCA-T--T--CT----AATCT-T--Taagc
gi|11                         :                     aATCGCACTTT---A-------G-AGT-CCTATA------TTT-C-A-CACTTT----CACTT--GA--TGCCCT-CAAAGG---T-TCTG-T-T--ATT-----G-------C-------CG----AAA--GTTCAA----------ATA---T--T--GT---T--------------TAA--AAC-AA-A-AAT-CT---GA-T---TCATG-------A----AA------GTATTTACT-----A--CA-CTT-C------------------------AT-T-AGCAG-A------T--A-TG-AC-GCTA-GTA-T--T--CT----AATTT-T--TTTT-
gi|12                         :                    ccATCGCACTTT---A-------G-AGT-CCTATACATGTATTT-G-A-CACTTT----TACTT--GA--TGCCTT-C-AAGA---T-TCTG-T-T--ATT-----A-------tctaaa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                 cc--AT---T-C-T--GTTATTA-TAA--AAC-AA-A-AAT-CT---GA-T---TCATT-------A----AA------GTATTTGCT-----A--CA-C---CCTC-----TTCTTAAAT-T-----AT-T-AGCAG-A------T--A-TG-GC-GCTA-GCA-T--T--CT----AATTT-T--TTT----A--AAGATtaaaacaaaaatctgattcattaaagtatttgctacaccctcttcttaaattattagcagatatggcgctagcattctaatttttttaaagata
gi|13                         :           ccatcgcactttagagtcctatacatgtatttgacacttttacttgatgccttcaag-CAATTT----CACTT--GA--TTACCT-CAAAGA---T-T-TC-T-T--AT------A-------CC---GTACG----AAA--GTTCAAA-T-AAT-ACATA---T--T--AC---T-T-T--ATTAT-A---A--AAT-AA-A-AAT-CT---GA-T---TAATT-------A----AG------GCATATATT-----G--CA-CTT-CTTC--AGTTTCTT--AT-T----AAT-T-AGCAG-A------T--A-TG-GC-GCTA-GCA-T--T--CT----GATa
gi|14                         :                                                                                                                                         t-GCAGA----AAA--GTTCAAA----AT-ACATAGATT--T--AT---TAC-T--ATTG--G-TTA--AAC-AA-A-AAT--T---GA-T---TCATT-------A----AA------GCATTTATT-----A--TG-CTT-CTTTA-AATTTCTT--AT-T----AAT-T-AGC-T-A------T--A-TG-GC-GCTA-GCA-T--T--CTCCGGAATAT-T--TTTT-
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gi|16                         :                                                                                  aa--GA--TGCCTT-CCAAAA---T-TCTG-T-T--ATT-----T-------CAAT-GCACG----AAA--GTTCAA------------------------------------T-T-A-TAA--AAC-AA-A-AGT-CC---GA-T---TCATT-------A----AA------GTATTTACT-----A--GA-ATT-CTTC--AATTTCTT--AT-T----AAT-T-AGCTG-A------T--A-TG-GC-TCTA-GCA-T--T--CT----AATCT-T--TTTT-A-A--AAGATaagc
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gi|18                         :                                                                                                                                          -GCACG----AAA--GTTTAAA-T-AAT-ACATA---T--T--AT---TAC-T---TT-T-A-TAA--AAC-AA-A-ACT-AT---GA-A---TTATT-------A----AA------GTATTTACT-----A--CA-CTT-C-----------------------AAT-C-AGCAG-A------T--A-TG-GC-GCTA-GCA-T--T--CT----AATTT-T--GTTT-a
gi|19                         :                                                                                                   AAGA---C-TTTG-T-A--ATT-----A-------TCAT-CGACA----AAT--GTTCAAA-T-AAT-ACATA---T--C--A-----A--T--ATT-T-A-TAA--AA--------AT-CT---GA-T---T----------------AA------GTATTTACT-----A--CT-CTT-CTTC--AATTTCTT--AT-T----AAT-T-ATTAG-A------T--A-TG-GT-GCTA-CCA-T--T--CT----AATCT-T--Ttttttttttttaaagataagc
gi|2                          :                      ATTGTACTTT---G-------G-AGT-CCTATA------TTT-G-A-CACTTT----AACTT--GA--TGCCGT-CAACGA---T-TCTG-T-T--ATT-----A-------CCAA-GCACG----AAA--GTTCAGA-T-AAT-ACATA---T--T--ACATGTAC-T--ATTAT-A-TAA--AAC-AA-A-AAT-CA---GA-T---TCATT-------A----AATTACGCGTATCTACT-----A--AA-CTT-CTTT--AATTTCTT--AT-T----AAT-T-AGCAG-A------T--A-TG-GC-GCTA-GCA-T--T--CT----AATCT-T--TTTT-A-A--AAGATccc
gi|20                         :                                                                                                                                                              AA-T-AAT-ACA--------T--AT---TAC-T--AT--T-A-TAA--AAC-TA-G-AA--------A-G---T-ATT-------T----AC------ATGTGTACT-----A--CA-CTT-CTTC--AATTTTTT--AT-T----AAT-T-AGCAG-ATACTAGT--A-TG-GC-GCTA-GCA-TGCTCACT----GATCT-T--TTTT-A-A--AA
gi|21                         :                                                   TATA------TT--G-A-CACCTTTTCTCACTT--GA--TGCCTTTCAAAGA---T-TCTG-T-TT-ATT-----A-------CCAT-GTACG----AAA--GTTC-AA-T-AAT----TA---A--T--AT---T---C--ACTAT-A-TAA--AACAAA-A-AAT-CT---GA-T---TCATT-------A----TA------GTAATT-CT-----A--Caga
gi|22                         :                                                                                                                                                                               t--T--AT---TAC-C--ATT-T-A-TAA--AG--AA-A-ATT-CT---GA-T---TCATT-------ATTTAAA------GTATTTACT-----G--TC-CTT-CTTC--AATTTCTT--AT-T----AAT-C-AGCAG-A------T--A-TG-CC-GCTA-GCA-T--T--CT----A-----T--TTTT-ATA--AAGAT
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                  ATTCACC-----AAATA-CTTGTTTT--AACCTCT---AC-T----TGTAT-AGTAG-A------T--A-TG-GC-GCTG-GCA-T--T--CTA---AATCT-T--TTCT-G-A--AAatgc
gi|24                         :                                                                                                                                               tttaatttaaattactatgaaagatattttata--T--AT---T-C-C--ATT-T-A-TAA--AG---A-A-AAT-TC---GA-T---TCATT-------ATTTAAA------GTATTTACT-----G--TC-CTT-CTTC--AATTTCTT--AT-T----AAT-C-AGCAG-A------T--A-TG-CC-GCTA-GCA-T--T--C-----------T--TTTT-ATA--AAGAa
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gi|26                         :                      ATCGCACTTT---A-------G-AGT-CCTATACATGTATTT-G-A-CACTTT----TACTT--GA--TGCCTT-C-AAGA---T-TCTGTT-T--ATT-----A-------
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                  cccT-A-TAA--AAC-AA-A-AAT-CT---GA-T---TCATT-------A----AA------taaaacaaaaatctgattcattaaa
gi|27                         :                                                                                                                                   cccatcgcactttagagtcctatacatgtatttgacacttttacttgatgccttcaagattctgtttat-TAA--AAC-AATA-AAT------AA-TCAATCATT-------ATAA-AA------GTGTTTACT-----A--CA-CCT-CTTC--AATTTCTT----------------------A------T--A-TG-GC-GCTA-GCA-T--T--CT----AATCT-T--TTTT-
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                           g--AAT-AA-ATAAT-C-----A-A---TCATT-------ATAA-AA------GTGTTTACT-----A--CA-CCT-CTTC--AATTTCTT----------------------A------T--A-TG-GC-GCTA-GCA-T--T--CT----AATCT-T--TTTT-T-A--ttaaa
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                         aac-------A----AA------ATAATTG-T-----C--CA-CTA-CTTT--AATTTCTT--AT-C----AAT-T-AGTAC-A------T--A-TG-GC-GCTA-CCA-T--T--TT----AATCT-
gi|3                          : tactacaatgtattataaaaaATCGCACTTT---G-------G-AGT-CCTATA------TTT-G-A-CACTTA----CACTT--GA--TGCCTT-CAAAAA---T-TCTG-T-C--ATT-----A-------CCAA-GCACG----AAA--GTTAAAA-T-A------------------------------TTAT-A-TAA--AAC-AA-A-AGT-TT---GA-T---TCATT-------A----AA------GTACTTACT-----A--CG-CTT-CTTC--AATTTTTT--AT-A----AAT-TAAGCAG-A------T--A-TG-AC-GCTA-GCA-T--T--CT----AATCT-T--TTTA-A-A--AAGAT
gi|30                         :                                                                      ccTTT----CACTTTGGAATTGCCT--CAAAGA---TGTCTG-TGT--A-T-----A-------CCGTAGCAAG----GAA--GTTCGAA-T-ACTAACAAC---T--T--AC---TTT-T--ATTAT-A-aatt
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                          ------GTATTTACT-----A--CA-CTT-CTTC--AATTTCTT--AT-T----AAT-T-AGTGG-A------T--A-TG-GC-GCCA-GCA-T--T--CT----AATCT-T--TTTa
gi|32                         :                      ATCCCACTTT---ATAAATATGTAGT-CCTATA------TTT-G-A-TACTTT----CACTT--GA--TGCa
gi|4                          :                    ccATCGCACTTT---A-------G-AGTGCCTATA------TTT-GCA-CAGCTT----TACTT--GG--TGCCTT-CAAAGA---T-TTTG-T-T--ATT-----G-------CC------TG----AAA--GTTCAAG-----------A---T--T--AT---TCG-T--ATTA--A-T-A--AGC-AA-T-AAT-CT---GA-T---TGATG-------A----AAG-----GTATTTA---------------G-CTCT--AACTTC----AT-T----AGT-----CAG-A------T--A-TGAACGGCTATGCA-T--TG-CT----AATCT-TTCTTTC-A-AATAAGAT
gi|5                          :                                                    ccc------TTT-G-A-CACTTT----CACTT--GA--TGCCTT-CAAAGA---T-TCTG-T-T--ATT-----A-------CCAT-GCACG----AAA--GGTCAAA-T-AAT-ACA-A---------AT---TAC-T--A-TA--A-TAA--AAC-AA-A-AAT-CT---GT-T---TCATTAATTAAAA----AA------GTATTTAGT-----A--CA-CTT-CTTC--AATTTCTT--AT-T----AAT-T-AGCAG-A------T--A-TG-GT-GCTA-GCA-T--C--CA----AATTT-T--TTTTAA-A--AAGATaa
gi|6                          :                                                               T-G-A-CACTTT----CACTT--GA--TGTCTT-TAAAGA---T-TCTG-T-T--ATT-----A-------CCAC-CCACG----GAT--GTTCATA-T-AAT-GCA--------C--AT---TAC-T--ATTAC-G--AA------AA-A-AAT-CT---GA-T---TCATT------------AA------GTATTTACTACTAAA--CA-CTT-CTTC--ACTTTCTT--GT-T----GAT-T-AGTAT-A------T--A-TG-GC-GCCA-TCA-T--T--CT----AATTT-TG-TTTT-T-A--AAGATaa
gi|7                          :                                                attgcTA------TTT-G-A-CACTTT----CACTT--GA--TGCCTT-CAAAGA---T-TCTG-T-T--ATT-----ATACTGTACCAA-GCACGCCCGAAA--GTTCAAA-T-A------------------------------TGAT-A-TAA--AAC-AA-A-AAT-CT---GA-T---TCATT-------A----AA------GTATTTACT-----A--CA-CTT-CTTC--ATTTTCTT--AT-T----AAT-T-AGCAG-A------T--A-TG-GC-GCTA-GCA-T--T--CTAAA-AAGAT-T--TTTT-A-A--AAG
gi|8                          :                                                     gA------TTT-G-AACACTTT----CGCAC--AA--TGCTTC-CAAAGA---T-TCTA-T-T--GTTCATGTA-------CAAT-GCACG----AAA--GTTCAAA-TTAAT-GCATA---T--T-------T-C-T--ATTAT---CAA--AATTAA-A-AAT-CT---GA-T---TCATT-------A----AA------ATA-TTACT-----A--TA-CGT-CT---------------T-G----AAT-T-AGCAGAA------T--ATTG-GC-GCTA-GCATT--T--CT----AATTTAT--TTTT-A-A--AAGAT
gi|9                          :                                                               T-G-A-CACTTT----CGCT--------GCCTT-CAAAAAATAT-TTTG-T-T--ATT-----A-------CCAT-CCACA----AAT--GTTCAAA-T-AAT-ACTTA---T--TGAAT---TAT-TAAATTAT-T-TA-------AA-A-AATACT---TA-T---TCATT------------AA------GTATTTACT-----A--CA-CTT-CTTC--AATTACTT--AT-T----AAT-T-AGTGT-A------T--A-TG-GC-GCTA-GCA-T--T--CA----AATCT-T--TTTT-aa





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consensus                     :                      ATCGCACTTT---A-------G-AGT-CCTATA------TTT-G-A-CACTTT----CACTT--GA--TGCCTT-CAAAGA---T-TCTG-T-T--ATT-----A-------CCAT-GCACG----AAA--GTTCAAA-T-AAT-ACATA---T--T--AT---TAC-T--ATTAT-A-TAA--AAC-AA-A-AAT-CT---GA-T---TCATT-------A----AA------GTATTTACT-----A--CA-CTT-CTTC--AATTTCTT--AT-T----AAT-T-AGCAG-A------T--A-TG-GC-GCTA-GCA-T--T--CT----AATCT-T--TTTT-A-A--AAGAT
Reference ( family-6035 )     :                      ATCGCACTTT---A-------G-AGT-CCTATA------TTT-G-A-CACTTT----CACTT--GA--TGCCTT-CAAAGA---T-TCTG-T-T--ATT-----A-------CCAT-GCACG----AAA--GTTCAAA-T-AAT-ACATA---T--T--AT---TAC-T--ATTAT-A-TAA--AAC-AA-A-AAT-CT---GA-T---TCATT-------A----AA------GTATTTACT-----A--CA-CTT-CTTC--AATTTCTT--AT-T----AAT-T-AGCAG-A------T--A-TG-GC-GCTA-GCA-T--T--CT----AATCT-T--TTTT-A-A--AAGAT
gi|1                          :                      ATCGCACCTTCGAA-------A-AG--CCTATA------TTTCG-A-CACTCT----CATTT--GA--CGCCTT-CAAAGA---T-TCTG-T-TCAGTT-----A-------CCAA-GCACG----CAACCGTTCAAA-T-AAT-ACATA---TATT--AT---TAC-T--ATAAT-AATAA--AAC-AA-A---T-CTCGCAA-T---TCATT-------A----AA------GTATTTACT--------CA-ACT-CTTCCCAATTTCTT--AT-T----AAT-T-AGCAG-A------T--A-TG-GC-GCTA-GCA-T--T--TT----AATCT-TC-TTTT-A-A--AAGAT
gi|10                         :                                                  cTATT------TTT-G-A-CGCTTT----CATTT--CA--TGCCTT-CAAAGA---T-TCTG-TAT--ATT-----A-------CTAT-GCACG----AAA--GTTCAAA-T-AAT-GCATA---T--T--A------C-T--TTTGT-A--AA--AAC-AA-A-AAT-CT---GA-T---TCATT-------A----AA------GTATTTACA-----A--CA-CTT-CTT---AATTTCTT--AT-T----GAT-T-ATCAG-A------T--A-TG-GC-GCTA-GCA-T--T--CT----AATCT-T--Taagc
gi|11                         :                     aATCGCACTTT---A-------G-AGT-CCTATA------TTT-C-A-CACTTT----CACTT--GA--TGCCCT-CAAAGG---T-TCTG-T-T--ATT-----G-------C-------CG----AAA--GTTCAA----------ATA---T--T--GT---T--------------TAA--AAC-AA-A-AAT-CT---GA-T---TCATG-------A----AA------GTATTTACT-----A--CA-CTT-C------------------------AT-T-AGCAG-A------T--A-TG-AC-GCTA-GTA-T--T--CT----AATTT-T--TTTT-
gi|12                         :                    ccATCGCACTTT---A-------G-AGT-CCTATACATGTATTT-G-A-CACTTT----TACTT--GA--TGCCTT-C-AAGA---T-TCTG-T-T--ATT-----A-------tctaaa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                 cc--AT---T-C-T--GTTATTA-TAA--AAC-AA-A-AAT-CT---GA-T---TCATT-------A----AA------GTATTTGCT-----A--CA-C---CCTC-----TTCTTAAAT-T-----AT-T-AGCAG-A------T--A-TG-GC-GCTA-GCA-T--T--CT----AATTT-T--TTT----A--AAGATtaaaacaaaaatctgattcattaaagtatttgctacaccctcttcttaaattattagcagatatggcgctagcattctaatttttttaaagata
gi|13                         :           ccatcgcactttagagtcctatacatgtatttgacacttttacttgatgccttcaag-CAATTT----CACTT--GA--TTACCT-CAAAGA---T-T-TC-T-T--AT------A-------CC---GTACG----AAA--GTTCAAA-T-AAT-ACATA---T--T--AC---T-T-T--ATTAT-A---A--AAT-AA-A-AAT-CT---GA-T---TAATT-------A----AG------GCATATATT-----G--CA-CTT-CTTC--AGTTTCTT--AT-T----AAT-T-AGCAG-A------T--A-TG-GC-GCTA-GCA-T--T--CT----GATa
gi|14                         :                                                                                                                                         t-GCAGA----AAA--GTTCAAA----AT-ACATAGATT--T--AT---TAC-T--ATTG--G-TTA--AAC-AA-A-AAT--T---GA-T---TCATT-------A----AA------GCATTTATT-----A--TG-CTT-CTTTA-AATTTCTT--AT-T----AAT-T-AGC-T-A------T--A-TG-GC-GCTA-GCA-T--T--CTCCGGAATAT-T--TTTT-
gi|15                         :                                                                                                                                    tcaccaaaCACG----AAC--GTTCAAAAT-AAT-AC-CA---T-----AT---TACAT--ATAAC-A-TAATAAAC-AA-A-A---TT---GACT---TCATT-------A----AA------GTATTTACT-----A---A-CGT-CTTT--ACTTTCTT--ATGTCTAAAAT-T-AGCAG-A------TACA-TG-GC-GCT--GCATT--T--CT----AATC--T--TTTT-A-A--AATATtacacagata
gi|16                         :                                                                                  aa--GA--TGCCTT-CCAAAA---T-TCTG-T-T--ATT-----T-------CAAT-GCACG----AAA--GTTCAA------------------------------------T-T-A-TAA--AAC-AA-A-AGT-CC---GA-T---TCATT-------A----AA------GTATTTACT-----A--GA-ATT-CTTC--AATTTCTT--AT-T----AAT-T-AGCTG-A------T--A-TG-GC-TCTA-GCA-T--T--CT----AATCT-T--TTTT-A-A--AAGATaagc
gi|17                         :                                                                                   g--GA--TGCCTT-CCAAAA---T-TCTG-T-T--ATT-----T-------CAAT-GC-CG----AAA--GTTCAA------------------------------------T-T-A-TAA--AAC-AA-A-AGT-CC---GA-T---TCATT-------A----AA------GTATTTACT-----A--GAATTT-CTTC--AATTTCTT--AT-T----AAT-T-AGCTG-A------T--A-TG-GC-TCTA-GCA-T--T--CT----AATCT-T--TTTT-A-A--AAGAT
gi|18                         :                                                                                                                                          -GCACG----AAA--GTTTAAA-T-AAT-ACATA---T--T--AT---TAC-T---TT-T-A-TAA--AAC-AA-A-ACT-AT---GA-A---TTATT-------A----AA------GTATTTACT-----A--CA-CTT-C-----------------------AAT-C-AGCAG-A------T--A-TG-GC-GCTA-GCA-T--T--CT----AATTT-T--GTTT-a
gi|19                         :                                                                                                   AAGA---C-TTTG-T-A--ATT-----A-------TCAT-CGACA----AAT--GTTCAAA-T-AAT-ACATA---T--C--A-----A--T--ATT-T-A-TAA--AA--------AT-CT---GA-T---T----------------AA------GTATTTACT-----A--CT-CTT-CTTC--AATTTCTT--AT-T----AAT-T-ATTAG-A------T--A-TG-GT-GCTA-CCA-T--T--CT----AATCT-T--Ttttttttttttaaagataagc
gi|2                          :                      ATTGTACTTT---G-------G-AGT-CCTATA------TTT-G-A-CACTTT----AACTT--GA--TGCCGT-CAACGA---T-TCTG-T-T--ATT-----A-------CCAA-GCACG----AAA--GTTCAGA-T-AAT-ACATA---T--T--ACATGTAC-T--ATTAT-A-TAA--AAC-AA-A-AAT-CA---GA-T---TCATT-------A----AATTACGCGTATCTACT-----A--AA-CTT-CTTT--AATTTCTT--AT-T----AAT-T-AGCAG-A------T--A-TG-GC-GCTA-GCA-T--T--CT----AATCT-T--TTTT-A-A--AAGATccc
gi|20                         :                                                                                                                                                              AA-T-AAT-ACA--------T--AT---TAC-T--AT--T-A-TAA--AAC-TA-G-AA--------A-G---T-ATT-------T----AC------ATGTGTACT-----A--CA-CTT-CTTC--AATTTTTT--AT-T----AAT-T-AGCAG-ATACTAGT--A-TG-GC-GCTA-GCA-TGCTCACT----GATCT-T--TTTT-A-A--AA
gi|21                         :                                                   TATA------TT--G-A-CACCTTTTCTCACTT--GA--TGCCTTTCAAAGA---T-TCTG-T-TT-ATT-----A-------CCAT-GTACG----AAA--GTTC-AA-T-AAT----TA---A--T--AT---T---C--ACTAT-A-TAA--AACAAA-A-AAT-CT---GA-T---TCATT-------A----TA------GTAATT-CT-----A--Caga
gi|22                         :                                                                                                                                                                               t--T--AT---TAC-C--ATT-T-A-TAA--AG--AA-A-ATT-CT---GA-T---TCATT-------ATTTAAA------GTATTTACT-----G--TC-CTT-CTTC--AATTTCTT--AT-T----AAT-C-AGCAG-A------T--A-TG-CC-GCTA-GCA-T--T--CT----A-----T--TTTT-ATA--AAGAT
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                  ATTCACC-----AAATA-CTTGTTTT--AACCTCT---AC-T----TGTAT-AGTAG-A------T--A-TG-GC-GCTG-GCA-T--T--CTA---AATCT-T--TTCT-G-A--AAatgc
gi|24                         :                                                                                                                                               tttaatttaaattactatgaaagatattttata--T--AT---T-C-C--ATT-T-A-TAA--AG---A-A-AAT-TC---GA-T---TCATT-------ATTTAAA------GTATTTACT-----G--TC-CTT-CTTC--AATTTCTT--AT-T----AAT-C-AGCAG-A------T--A-TG-CC-GCTA-GCA-T--T--C-----------T--TTTT-ATA--AAGAa
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                   TGT-A-TAG--AAC-AA-A-AAT-CT---TA-T---TCATC-------A----AA------GTATTTACT-----A--CA-CGT-CTTC--ATTTTCTT--TT-T----TAT-T-AGCAG-A------T--T-TT-GC-GCTA-GCA-T--T--CT----AATCT-T--TTTT-T-A--
gi|26                         :                      ATCGCACTTT---A-------G-AGT-CCTATACATGTATTT-G-A-CACTTT----TACTT--GA--TGCCTT-C-AAGA---T-TCTGTT-T--ATT-----A-------
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                  cccT-A-TAA--AAC-AA-A-AAT-CT---GA-T---TCATT-------A----AA------taaaacaaaaatctgattcattaaa
gi|27                         :                                                                                                                                   cccatcgcactttagagtcctatacatgtatttgacacttttacttgatgccttcaagattctgtttat-TAA--AAC-AATA-AAT------AA-TCAATCATT-------ATAA-AA------GTGTTTACT-----A--CA-CCT-CTTC--AATTTCTT----------------------A------T--A-TG-GC-GCTA-GCA-T--T--CT----AATCT-T--TTTT-
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                           g--AAT-AA-ATAAT-C-----A-A---TCATT-------ATAA-AA------GTGTTTACT-----A--CA-CCT-CTTC--AATTTCTT----------------------A------T--A-TG-GC-GCTA-GCA-T--T--CT----AATCT-T--TTTT-T-A--ttaaa
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                         aac-------A----AA------ATAATTG-T-----C--CA-CTA-CTTT--AATTTCTT--AT-C----AAT-T-AGTAC-A------T--A-TG-GC-GCTA-CCA-T--T--TT----AATCT-
gi|3                          : tactacaatgtattataaaaaATCGCACTTT---G-------G-AGT-CCTATA------TTT-G-A-CACTTA----CACTT--GA--TGCCTT-CAAAAA---T-TCTG-T-C--ATT-----A-------CCAA-GCACG----AAA--GTTAAAA-T-A------------------------------TTAT-A-TAA--AAC-AA-A-AGT-TT---GA-T---TCATT-------A----AA------GTACTTACT-----A--CG-CTT-CTTC--AATTTTTT--AT-A----AAT-TAAGCAG-A------T--A-TG-AC-GCTA-GCA-T--T--CT----AATCT-T--TTTA-A-A--AAGAT
gi|30                         :                                                                      ccTTT----CACTTTGGAATTGCCT--CAAAGA---TGTCTG-TGT--A-T-----A-------CCGTAGCAAG----GAA--GTTCGAA-T-ACTAACAAC---T--T--AC---TTT-T--ATTAT-A-aatt
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                          ------GTATTTACT-----A--CA-CTT-CTTC--AATTTCTT--AT-T----AAT-T-AGTGG-A------T--A-TG-GC-GCCA-GCA-T--T--CT----AATCT-T--TTTa
gi|32                         :                      ATCCCACTTT---ATAAATATGTAGT-CCTATA------TTT-G-A-TACTTT----CACTT--GA--TGCa
gi|4                          :                    ccATCGCACTTT---A-------G-AGTGCCTATA------TTT-GCA-CAGCTT----TACTT--GG--TGCCTT-CAAAGA---T-TTTG-T-T--ATT-----G-------CC------TG----AAA--GTTCAAG-----------A---T--T--AT---TCG-T--ATTA--A-T-A--AGC-AA-T-AAT-CT---GA-T---TGATG-------A----AAG-----GTATTTA---------------G-CTCT--AACTTC----AT-T----AGT-----CAG-A------T--A-TGAACGGCTATGCA-T--TG-CT----AATCT-TTCTTTC-A-AATAAGAT
gi|5                          :                                                    ccc------TTT-G-A-CACTTT----CACTT--GA--TGCCTT-CAAAGA---T-TCTG-T-T--ATT-----A-------CCAT-GCACG----AAA--GGTCAAA-T-AAT-ACA-A---------AT---TAC-T--A-TA--A-TAA--AAC-AA-A-AAT-CT---GT-T---TCATTAATTAAAA----AA------GTATTTAGT-----A--CA-CTT-CTTC--AATTTCTT--AT-T----AAT-T-AGCAG-A------T--A-TG-GT-GCTA-GCA-T--C--CA----AATTT-T--TTTTAA-A--AAGATaa
gi|6                          :                                                               T-G-A-CACTTT----CACTT--GA--TGTCTT-TAAAGA---T-TCTG-T-T--ATT-----A-------CCAC-CCACG----GAT--GTTCATA-T-AAT-GCA--------C--AT---TAC-T--ATTAC-G--AA------AA-A-AAT-CT---GA-T---TCATT------------AA------GTATTTACTACTAAA--CA-CTT-CTTC--ACTTTCTT--GT-T----GAT-T-AGTAT-A------T--A-TG-GC-GCCA-TCA-T--T--CT----AATTT-TG-TTTT-T-A--AAGATaa
gi|7                          :                                                attgcTA------TTT-G-A-CACTTT----CACTT--GA--TGCCTT-CAAAGA---T-TCTG-T-T--ATT-----ATACTGTACCAA-GCACGCCCGAAA--GTTCAAA-T-A------------------------------TGAT-A-TAA--AAC-AA-A-AAT-CT---GA-T---TCATT-------A----AA------GTATTTACT-----A--CA-CTT-CTTC--ATTTTCTT--AT-T----AAT-T-AGCAG-A------T--A-TG-GC-GCTA-GCA-T--T--CTAAA-AAGAT-T--TTTT-A-A--AAG
gi|8                          :                                                     gA------TTT-G-AACACTTT----CGCAC--AA--TGCTTC-CAAAGA---T-TCTA-T-T--GTTCATGTA-------CAAT-GCACG----AAA--GTTCAAA-TTAAT-GCATA---T--T-------T-C-T--ATTAT---CAA--AATTAA-A-AAT-CT---GA-T---TCATT-------A----AA------ATA-TTACT-----A--TA-CGT-CT---------------T-G----AAT-T-AGCAGAA------T--ATTG-GC-GCTA-GCATT--T--CT----AATTTAT--TTTT-A-A--AAGAT
gi|9                          :                                                               T-G-A-CACTTT----CGCT--------GCCTT-CAAAAAATAT-TTTG-T-T--ATT-----A-------CCAT-CCACA----AAT--GTTCAAA-T-AAT-ACTTA---T--TGAAT---TAT-TAAATTAT-T-TA-------AA-A-AATACT---TA-T---TCATT------------AA------GTATTTACT-----A--CA-CTT-CTTC--AATTACTT--AT-T----AAT-T-AGTGT-A------T--A-TG-GC-GCTA-GCA-T--T--CA----AATCT-T--TTTT-aa


blockSeqs                     :                                ATAAATAT    T   G      CATGTA   . C A      TTCT     TG  AT      T      ATA G    T A T    ATACTGTA        TA     CCCG   .        AT  A ACTTATTGAATTATTAAATTAT            .   TA   A  T T   A  .    C CAA     AATTAAAA      TTACGC         ACTAA AA  A   G    A         AA  G CTAA   A A     A TACTAG AC T  A  G    T   T GC CA  CCGG     A TC    A T AT
blockSeqs                     :                                A           .   .      CATGTA   . . .      .        .   .       .      .   .    . G .    CATGTA          T      .      .        TT  A ACATATTACATGTACTATTAT             .   .    T  . .   .  .    . .       ATTTA         G              .     .   .   .    .         .   . .      . .     . .      .  .  .  .    .   T .  G   AAA      . G     . T . 
blockSeqs                     :                                A           .   .      .        . . .      .        .   .       .      .   .    . . .    A               T      .      .        T   A ACATAGATTTATTACTATTG              .   .    .  . .   .  .    . .       ATTTA         .              .     .   .   .    .         .   . .      . .     . .      .  .  .  .    .   . .  .   A        . .     . . . 
blockSeqs                     :                                G           .   .      .        . . .      .        .   .       .      .   .    . . .    G               T      .      .        T   A AACAACTTACTTTTATTAT               .   .    .  . .   .  .    . .       ATAA          .              .     .   .   .    .         .   . .      . .     . .      .  .  .  .    .   . .  .   .        . .     . . . 
blockSeqs                     :                                A           .   .      .        . . .      .        .   .       .      .   .    . . .    A               T      .      .        T   A ACATATTACTTTATTAT                 .   .    .  . .   .  .    . .       ATAA          .              .     .   .   .    .         .   . .      . .     . .      .  .  .  .    .   . .  .   .        . .     . . . 
blockSeqs                     :                                G           .   .      .        . . .      .        .   .       .      .   .    . . .    A               A      .      .        T   A ACCATATTACATATAAC                 .   .    .  . .   .  .    . .       A             .              .     .   .   .    .         .   . .      . .     . .      .  .  .  .    .   . .  .   .        . .     . . . 
blockSeqs                     :                                A           .   .      .        . . .      .        .   .       .      .   .    . . .    T               T      .      .        T   A ACATATTATTACTTTT                  .   .    .  . .   .  .    . .       A             .              .     .   .   .    .         .   . .      . .     . .      .  .  .  .    .   . .  .   .        . .     . . . 
blockSeqs                     :                                                       .        . . .      .        .   .       .      .   .    . . .    T               A      .      .        T   A GCATATTACTTTTGT                   .   .    .  . .   .  .    . .       A             .              .     .   .   .    .         .   . .      . .     . .      .  .  .  .    .   . .  .   .        . .     . . . 
blockSeqs                     :                                                       .        . . .      .        .   .       .      .   .    . . .    A               T      .      .        T   A GCACATTACTATTAC                   .   .    .  . .   .  .    . .       A             .              .     .   .   .    .         .   . .      . .     . .      .  .  .  .    .   . .  .   .        . .     . . . 
blockSeqs                     :                                                       .        . . .      .        .   .       .      .   .    . . .    A               C      .      .        T   C GCATATTTCTATTAT                   .   .    .  . .   .  .    . .       A             .              .     .   .   .    .         .   . .      . .     . .      .  .  .  .    .   . .  .   .        . .     . . . 
blockSeqs                     :                                                       .        . . .      .        .   .       .      .   .    . . .    A               A      .      .        T   A ACATATCAATATTT                    .   .    .  . .   .  .    . .       A             .              .     .   .   .    .         .   . .      . .     . .      .  .  .  .    .   . .  .   .        . .     . . . 
blockSeqs                     :                                                       .        . . .      .        .   .       .      .   .    . . .    A               T      .      .        T   A ACATATTACTATT                     .   .    .  . .   .  .    . .       A             .              .     .   .   .    .         .   . .      . .     . .      .  .  .  .    .   . .  .   .        . .     . . . 
blockSeqs                     :                                                                . . .      .        .   .       .      .   .    . . .    A               T      .      .        T   A TAATATTCACTAT                     .   .    .  . .   .  .    . .       A             .              .     .   .   .    .         .   . .      . .     . .      .  .  .  .    .   . .  .   .        . .     . . . 
blockSeqs                     :                                                                . . .      .        .   .       .      .   .    . . .    A               .      .      .        T   A ATTATTCGTATTA                     .   .    .  . .   .  .    . .       A             .              .     .   .   .    .         .   . .      . .     . .      .  .  .  .    .   . .  .   .        . .     . . . 
blockSeqs                     :                                                                    .      .        .   .       .      .   .    . . .    G               .      .      .        T   . ACAAATTACTATA                     .   .    .  . .   .  .    . .       A             .              .     .   .   .    .         .   . .      . .     . .      .  .  .  .    .   . .  .   .        . .     . . . 
blockSeqs                     :                                                                           .        .   .       .      .   .    . . .    A               .      .      .        .   . ATATTGTT                          .   .    .  . .   .  .    . .       T             .              .     .   .   .    .         .   . .      . .     . .      .  .  .  .    .   . .  .   .        . .     . . . 
blockSeqs                     :                                                                                    .   .       .      .   .    . . .    A                      .      .        .   . TTAT                              .   .    .  . .   .  .    . .       A             .              .     .   .   .    .         .   . .      . .     . .      .  .  .  .    .   . .  .   .        . .     . . . 
blockSeqs                     :                                                                                    .   .              .   .    . . .    A                      .      .        .   . TGAT                              .   .    .  . .   .  .    . .       A             .              .     .   .   .    .         .   . .      . .     . .      .  .  .  .    .   . .  .   .        . .     .     
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                .   . TT                                .   .    .  . .   .  .    . .       A             .              .     .   .   .    .         .   . .      . .     . .      .  .  .  .    .   . .  .   .        . .     .     
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Reference ( family-6035 )     :                      ATCGCACTTT---A-------G-AGT-CCTATA------TTT-G-A-CACTTT----CACTT--GA--TGCCTT-CAAAGA---T-TCTG-T-T--ATT-----A-------CCAT-GCACG----AAA--GTTCAAA-T-AATA-C-ATA---TTACT-T----T-A-TTAT--A----TAA---AAC-AA-A-AAT-CT---GA-T---TCATT-------A----AA------GTATTTACT-----A--CA-CTT-CTTC--AA-TTTCTT--AT---TAA--T-T-AGCAG-A------TA--TG-GC-GCTA-GCA-T--T--CT----AATCT-T--TTTT-A-A--AAGAT
gi|1                          :                      ATCGCACCTTCGAA-------A-AG--CCTATA------TTTCG-A-CACTCT----CATTT--GA--CGCCTT-CAAAGA---T-TCTG-T-TCAGTT-----A-------CCAA-GCACG----CAACCGTTCAAA-T-AATA-C-ATA---T-ATTAT----T-A-CTAT--AATAATAA---AAC-AA-A---T-CTCGCAA-T---TCATT-------A----AA------GTATTTACT--------CA-ACT-CTTCCCAA-TTTCTT--AT---TAA--T-T-AGCAG-A------TA--TG-GC-GCTA-GCA-T--T--TT----AATCT-TC-TTTT-A-A--AAGAT
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gi|11                         :                     aATCGCACTTT---A-------G-AGT-CCTATA------TTT-C-A-CACTTT----CACTT--GA--TGCCCT-CAAAGG---T-TCTG-T-T--ATT-----G-------C-------CG----AAA--GTTCAAA-T-A------------------T----T-G-TT---------TAA---AAC-AA-A-AAT-CT---GA-T---TCATG-------A----AA------GTATTTACT-----A--CA-CTT-C-----------------------A--T-T-AGCAG-A------TA--TG-AC-GCTA-GTA-T--T--CT----AATTT-T--TTTT-
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gi|13                         :                                                                  cc-CAATTT----CACTT--GA--TTACCT-CAAAGA---T-T-TC-T-T--AT------A-------CC---GTACG----AAA--GTTCAAA-T-AATA-C-ATA---TTACT-T----T-A-TTAT--A------A---AAT-AA-A-AAT-CT---GA-T---TAATT-------A----AG------GCATATATT-----G--CA-CTT-CTTC--AG-TTTCTT--AT---TAA--T-T-AGCAG-A------TA--TG-GC-GCTA-GCA-T--T--CT----GATa
gi|14                         :                                                                                                                                         t-GCAGA----AAA--GTTCAAA----ATA-C-ATAGATTTA---T----T-A-CTATTGG----TTA---AAC-AA-A-AAT--T---GA-T---TCATT-------A----AA------GCATTTATT-----A--TG-CTT-CTTT--AAATTTCTT--AT---TAA--T-T-AGC-T-A------TA--TG-GC-GCTA-GCA-T--T--CTCCGGAATAT-T--TTTT-
gi|15                         :                                                                                                                                    tcaccaaaCACG----AAC--GTTCAAAAT-AATA-CCATA---TTACA-T------A-TAAC--A----TAATA-AAC-AA-A-A---TT---GACT---TCATT-------A----AA------GTATTTACT-----A---A-CGT-CTTT--AC-TTTCTT--ATGTCTAAAAT-T-AGCAG-A------TACATG-GC-GCT--GCA-T--TT-CT----AATC--T--TTTT-A-A--AATATtacacagata
gi|16                         :                                                                                  aa--GA--TGCCTT-CCAAAA---T-TCTG-T-T--ATT-----T-------CAAT-GCACG----AAA--GTTCAA---------------------------------T-T--A----TAA---AAC-AA-A-AGT-CC---GA-T---TCATT-------A----AA------GTATTTACT-----A--GA-ATT-CTTC--AA-TTTCTT--AT---TAA--T-T-AGCTG-A------TA--TG-GC-TCTA-GCA-T--T--CT----AATCT-T--TTTT-A-A--AAGATaagc
gi|17                         :                                                                                   g--GA--TGCCTT-CCAAAA---T-TCTG-T-T--ATT-----T-------CAAT-GC-CG----AAA--GTTCAA---------------------------------T-T--A----TAA---AAC-AA-A-AGT-CC---GA-T---TCATT-------A----AA------GTATTTACT-----A--GAATTT-CTTC--AA-TTTCTT--AT---TAA--T-T-AGCTG-A------TA--TG-GC-TCTA-GCA-T--T--CT----AATCT-T--TTTT-A-A--AAGAT
gi|18                         :                                                                                                                                          -GCACG----AAA--GTTTAAA-T-AATA-C-ATA---TTA---T----T-ACTTTT--A----TAA---AAC-AA-A-ACT-AT---GA-A---TTATT-------A----AA------GTATTTACT-----A--CA-CTT-C----------------------AA--T-C-AGCAG-A------TA--TG-GC-GCTA-GCA-T--T--CT----AATTT-T--GTTT-a
gi|19                         :                                                                                                   AAGA---C-TTTG-T-A--ATT-----A-------TCAT-CGACA----AAT--GTTCAAA-T-AATA-C-ATA---TCAAT--------A-TT-T--A----TAA---AA--------AT-CT---GA-T---T----------------AA------GTATTTACT-----A--CT-CTT-CTTC--AA-TTTCTT--AT---TAA--T-T-ATTAG-A------TA--TG-GT-GCTA-CCA-T--T--CT----AATCT-T--Ttttttttttttaaagataagc
gi|2                          :                      ATTGTACTTT---G-------G-AGT-CCTATA------TTT-G-A-CACTTT----AACTT--GA--TGCCGT-CAACGA---T-TCTG-T-T--ATT-----A-------CCAA-GCACG----AAA--GTTCAGA-T-AATA-C-ATA---TTACA-TGTACT-A-TTAT--A----TAA---AAC-AA-A-AAT-CA---GA-T---TCATT-------A----AATTACGCGTATCTACT-----A--AA-CTT-CTTT--AA-TTTCTT--AT---TAA--T-T-AGCAG-A------TA--TG-GC-GCTA-GCA-T--T--CT----AATCT-T--TTTT-A-A--AAGATccc
gi|20                         :                                                                                                                                                              AA-T-AATA-C-ATA---TTAC-------T-A-T--T--A----TAA---AAC-TA-G-AA--------A-G---T-ATT-------T----AC------ATGTGTACT-----A--CA-CTT-CTTC--AA-TTTTTT--AT---TAA--T-T-AGCAG-ATACTAGTA--TG-GC-GCTA-GCA-TGCTCACT----GATCT-T--TTTT-A-A--AA
gi|21                         :                                                   TATA------TT--G-A-CACCTTTTCTCACTT--GA--TGCCTTTCAAAGA---T-TCTG-T-TT-ATT-----A-------CCAT-GTACG----AAA--GTTC-AA-T-AAT-----TA---ATA-T-T----C-A-CTAT--A----TAA---AACAAA-A-AAT-CT---GA-T---TCATT-------A----TA------GTAATT-CT-----A--Caga
gi|22                         :                                                                                                                                                                          tTA---TTACC--------A-TT-T--A----TAA---AG--AA-A-ATT-CT---GA-T---TCATT-------ATTTAAA------GTATTTACT-----G--TC-CTT-CTTC--AA-TTTCTT--AT---TAA--T-C-AGCAG-A------TA--TG-CC-GCTA-GCA-T--T--CT----A-----T--TTTT-ATA--AAGAT
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                    ATTCACC-----AAATA-CTTGTTTT--AA-CCTCT---AC---TTG--TAT-AGTAG-A------TA--TG-GC-GCTG-GCA-T--T--CTA---AATCT-T--TTCT-G-A--AAatgc
gi|24                         :                                                                                                                                                tttaatttaaattactatgaaagatattttataTATT-C----C-A-TT-T--A----TAA---AG---A-A-AAT-TC---GA-T---TCATT-------ATTTAAA------GTATTTACT-----G--TC-CTT-CTTC--AA-TTTCTT--AT---TAA--T-C-AGCAG-A------TA--TG-CC-GCTA-GCA-T--T--C-----------T--TTTT-ATA--AAGAa
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                TGT--A----TAG---AAC-AA-A-AAT-CT---TA-T---TCATC-------A----AA------GTATTTACT-----A--CA-CGT-CTTC--AT-TTTCTT--TT---TTA--T-T-AGCAG-A------TT--TT-GC-GCTA-GCA-T--T--CT----AATCT-T--TTTT-T-A--
gi|26                         :                      ATCGCACTTT---A-------G-AGT-CCTATACATGTATTT-G-A-CACTTT----TACTT--GA--TGCCTT-C-AAGA---T-TCTGTT-T--ATT-----A-------
gi|26                         :                                                                                                                                                                                 cccT-T----T-A-TTAT--A------A---AAC-AA-A-AAT-CT---GA-T---TCATT-------A----AA------taaaacaaaaatctgattcattaaa
gi|27                         :                                                                                                                                      cccatcgcactttagagtcctatacatgtatttgacacttttacttgatgccttcaagattctg----TAA---AAC-AATA-AAT------AA-TCAATCATT-------ATAA-AA------GTGTTTACT-----A--CA-CCT-CTTC--AA-TTTCTT----------------------A------TA--TG-GC-GCTA-GCA-T--T--CT----AATCT-T--TTTT-
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                            g---AAT-AA-ATAAT-C-----A-A---TCATT-------ATAA-AA------GTGTTTACT-----A--CA-CCT-CTTC--AA-TTTCTT----------------------A------TA--TG-GC-GCTA-GCA-T--T--CT----AATCT-T--TTTT-T-A--ttaaa
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                           aac-------A----AA------ATAATTG-T-----C--CA-CTA-CTTT--AA-TTTCTT--AT---CAA--T-T-AGTAC-A------TA--TG-GC-GCTA-CCA-T--T--TT----AATCT-
gi|3                          : tactacaatgtattataaaaaATCGCACTTT---G-------G-AGT-CCTATA------TTT-G-A-CACTTA----CACTT--GA--TGCCTT-CAAAAA---T-TCTG-T-C--ATT-----A-------CCAA-GCACG----AAA--GTTAAAA-T-A---------------------------TTAT--A----TAA---AAC-AA-A-AGT-TT---GA-T---TCATT-------A----AA------GTACTTACT-----A--CG-CTT-CTTC--AA-TTTTTT--AT---AAA--T-TAAGCAG-A------TA--TG-AC-GCTA-GCA-T--T--CT----AATCT-T--TTTA-A-A--AAGAT
gi|30                         :                                                                      ccTTT----CACTTTGGAATTGCCT--CAAAGA---TGTCTG-TGT--AT------A-------CCGTAGCAAG----GAA--GTTCGAA-T-ACTAAC-AAC---TTACT-T----TTA-TTAT--A----aatt
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                            ------GTATTTACT-----A--CA-CTT-CTTC--AA-TTTCTT--AT---TAA--T-T-AGTGG-A------TA--TG-GC-GCCA-GCA-T--T--CT----AATCT-T--TTTa
gi|32                         :                      ATCCCACTTT---ATAAATATGTAGT-CCTATA------TTT-G-A-TACTTT----CACTT--GA--TGCa
gi|4                          :                    ccATCGCACTTT---A-------G-AGTGCCTATA------TTT-GCA-CAGCTT----TACTT--GG--TGCCTT-CAAAGA---T-TTTG-T-T--ATT-----G-------CC------TG----AAA--GTTCAAG------------A---TTATT-CG---T-A-TTA---A----T-A---AGC-AA-T-AAT-CT---GA-T---TGATG-------A----AAG-----GTATTTA---------------G-CTCT--AA-CTTC----AT---TAG--T-----CAG-A------TA--TGAACGGCTATGCA-T--TG-CT----AATCT-TTCTTTC-A-AATAAGAT
gi|5                          :                                                    ccc------TTT-G-A-CACTTT----CACTT--GA--TGCCTT-CAAAGA---T-TCTG-T-T--ATT-----A-------CCAT-GCACG----AAA--GGTCAAA-T-AATA-C-AAA---TTACT-A----T-A-------A----TAA---AAC-AA-A-AAT-CT---GT-T---TCATTAATTAAAA----AA------GTATTTAGT-----A--CA-CTT-CTTC--AA-TTTCTT--AT---TAA--T-T-AGCAG-A------TA--TG-GT-GCTA-GCA-T--C--CA----AATTT-T--TTTTAA-A--AAGATaa
gi|6                          :                                                               T-G-A-CACTTT----CACTT--GA--TGTCTT-TAAAGA---T-TCTG-T-T--ATT-----A-------CCAC-CCACG----GAT--GTTCATA-T-AATG-C-ACA---TTAC-------T-A-TTAC--G-----AA-------AA-A-AAT-CT---GA-T---TCATT------------AA------GTATTTACTACTAAA--CA-CTT-CTTC--AC-TTTCTT--GT---TGA--T-T-AGTAT-A------TA--TG-GC-GCCA-TCA-T--T--CT----AATTT-TG-TTTT-T-A--AAGATaa
gi|7                          :                                                attgcTA------TTT-G-A-CACTTT----CACTT--GA--TGCCTT-CAAAGA---T-TCTG-T-T--ATT-----ATACTGTACCAA-GCACGCCCGAAA--GTTCAAA-T-A---------------------------TGAT--A----TAA---AAC-AA-A-AAT-CT---GA-T---TCATT-------A----AA------GTATTTACT-----A--CA-CTT-CTTC--AT-TTTCTT--AT---TAA--T-T-AGCAG-A------TA--TG-GC-GCTA-GCA-T--T--CTAAA-AAGAT-T--TTTT-A-A--AAG
gi|8                          :                                                     gA------TTT-G-AACACTTT----CGCAC--AA--TGCTTC-CAAAGA---T-TCTA-T-T--GTTCATGTA-------CAAT-GCACG----AAA--GTTCAAA-TTAATG-C-ATA---TT--T-C----T-A-TTAT-------CAA---AATTAA-A-AAT-CT---GA-T---TCATT-------A----AA------ATA-TTACT-----A--TA-CGT-CT----------------T---GAA--T-T-AGCAGAA------TAT-TG-GC-GCTA-GCATT--T--CT----AATTTAT--TTTT-A-A--AAGAT
gi|9                          :                                                               T-G-A-CACTTT----CGCT--------GCCTT-CAAAAAATAT-TTTG-T-T--ATT-----A-------CCAT-CCACA----AAT--GTTCAAA-T-AATA-C-TTA---TTGAA-T----T-A-TTAA--A----TTATTTAA---A-A-AATACT---TA-T---TCATT-------A----A-------GTATTTACT-----A--CA-CTT-CTTC--AA-TTACTT--AT---TAA--T-T-AGTGT-A------TA--TG-GC-GCTA-GCA-T--T--CA----AATCT-T--TTTT-aa