lowQualScore : 1111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 4444444444444444444444 1 22222222222 7777777777777777777777777777777 222222222222 11111111111 1111 111111111 333333333333333333333333 1 5555555555 111 222222222 6666666666666666666666666666666666666 1111111 44444444444 222222222222222222 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1
lowQualScore : 2 3 333 6666666666666666666666 1 333 22 1 2 22222222222 3 1 1111111111111111111111111111111 1 3333 44444 444444444444 44 44 3333 7777777777 22 3333 444444 5 22222222222 5555 44 999999999999999999 44 3 1 44444 7 22 1 333333333 22 5 4444 22 888888888888888888888888 88 3 666666 2 33 7777777777 2 333 7 7 33 999 66 99 2 222222222 333 333 5 55555 2 5555555555555555555555555555555555555 1111111 4444 3 2 333 2 333 66666666666 4444 333333333333333333 2 2 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 0 2 4
lowQualScore : . . ... ...................... . ... .. . . ........... . . ............................... . .... ..... ............ .. .. .... .......... .. .... ...... . ........... .... .. .................. .. . . ..... . .. . ......... .. . .... .. ........................ .. . ...... . .. .......... . ... . . .. ... .. .. . ......... ... ... . ..... . ..................................... ....... .... . . ... . ... ........... .... .................. . . ............................................................................................................................................................................ . . .
lowQualScore : 2 8 555 8888888888888888888888 9 333 66 4 2 99999999999 6 0 4444444444444444444444444444444 7 6666 33333 777777777777 00 66 5555 3333333333 22 4444 666666 1 77777777777 2222 55 555555555555555555 66 5 8 55555 1 66 9 222222222 66 4 5555 99 888888888888888888888888 55 6 444444 2 00 1111111111 1 777 7 4 44 999 55 66 2 333333333 777 777 8 99999 4 2222222222222222222222222222222222222 3333333 7777 7 2 999 2 999 66666666666 7777 222222222222222222 0 7 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 2 1 2
consensus : TGGTTTACA-TTTATTTCATCACTCA---T------CTC----AT--AAAACTCATTAATATATTT-CATT---AAGA--AACGGAAAATAAAGGACAG---GATAT--CATGT-TATATAGT-C-T-TTAA-----------A-------ATCGG-G---CG-----T-------G----GT--A--CC----GTA----------CAA--T----A------CGT-----------CCCTGAGCAACG--G-CGG--------C--CG----TGT--TG-TTCTGATTTCCC-GAT-----TAATCG--GC-T------G--TATA--ACGGTAG----C--TGTACC--ATNT--AT---CT---------TTTCAA-TTTTA------CTTTT-A-AAACCATTTA----T--ATGAACCATT-C---TGATATGAATTCCGGGGTT--TTGGTCA-T-TCAGTGAAAGAACC--AGCAAAC-TTGCATAAA---ATT-TTTGGAGAATA---A---TAAACCTTCTG-----ATAAA-TGTGCT--------------A---T-------------AAT-GTAA-----CGTG----TAGCGG-TCA---TCCA-TC---CAGGTTG--C---NAAAGTTT----CCTCT------------------TATACTGTCCGCTAC-ACTTTTC----CCCGCACAGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCACTGTCT----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNANNGCCAAACACCAGAGTCACTACGCT-GCC-ACCAAA
Reference ( gi|2 ) : TGGTTTACA-TTTATTTCCTCACTCA---T------CTC----AT--AGAATTCATTAATATATTT-CATT---AAGA--AACGGAAACTAAAGGACAG---CAAAT--CATGT-TATATAGT-CAT-TTAAAAATAT-ATAAA-------ATCGG-G---TG-----T-------G----GT--A--CC----GTA----------CAA--T----A------CAT-----------CCCTGAGCAACA--G-TGG--------C--CA----TGT--TG-TTCTGATTTCCC-GAT-----TAATTG--GC-T------A--TATA--ACAGTAG----C--TGTACC--CTAT--AT---AT---------TTTCAG-TTGTA------CTTTT-A-AAACCATTTAA---T--ATGAACCATT-C---TGATATGAATTCCAGAGTT--TTGGTCA-A-TCAGTGAAAGAACC--AGCAAAC-CTGCATAAA---AGT-TTTGGAGAATA---A---TAAAACTTCTG-----ATAAA-TGTGCT--------------AAT-T-------------AAT-GTAA-----TGTG----TAGTGG-TCA---TCCA-TC---CAGGTTG--C---AAATGTTT----CCTCT------------------TATACTGTCCACTAC-ACTTTTC--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACCACTGTCT----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCCAAACACCAGAGTCACTAAGCT-GCC-ACCAAA
gi|9 : TGGTTTACA-TTTATTACATCACTCA---TTTC---CTC----AT--AAAACTCATTAATATATTT-CATT---AAGA--A-------TTAACGGAAAG---TAAAG--GACA---AGATA-T-CATGTTAAA-------------------------------------------------T--A--------GTA----------CAA--T----A------CGT-----------CCCTGAGCAATG--G-CGG--------T--CG----AGT--TG-CTCTGATTTCCT-GATCACGTTAATCG--GC-T------G--TATA--ACGGTAA----C--TGTACC--ATTT--AT---CT---------TTTTAAATTTTA------CTTTT-A-A---CATTTA--------TGGATCATT-C---TGATAAGAATTCTGGGGCT--TTGGCCA-T-TCAGTGAAAGAACC--AGCAAAA-TTACATAAA---ATT-TTTGGAGAATA---A---TAAACATTCTG-----ATAAA-TGTGCT--------------AAT-G-------------A-----AA-----CCTG----TAGCAG-CCA---CCCA-TC---CACGTTG--CTT-AAA--TTT----CCTCTAAGGC-------------TA-ATTGTCCGCTAC-ACTT
gi|45 : TGGTTTACA-TTTATTTCATCACTCACTTT------CTC----AT--AAAACTC
gi|44 : aTGGTTTACA-TTTATTTCATCACTCA---TTATTTCCTT----AT--AAAACTt
gi|1 : ttaGGTTTACA-CTCATTTCCCCA----------------------T--AAAACTCATCAATACATTT-CATT---ACGA--AACGGAACATAAAGGACAG---GATAT--TATGG-TACATATG-CAT-GT---AGTCT-TT--A-------ATCAG-G---CG-----T-------G----GT--A--CC----GTA----------CCA--T----A------CGT-----------CCCTGCGCAATG--G-CGG--------T--TG----TGT--TG-TTCT
gi|21 : GGTTTACA-TTTATTTCATCACTTA---TTTC---CTC----AT--A-AACTCATTGATATATTT-CTTT---TAG------------TAAAGGACAG---GATCT--CAAGT-TATATAGT-C-T-T-------------AA-------ATCGG-G---CG-----A-------G----AT--A--CC----GTA----------CAA--T----A------CATGTACATGCAAGTCCTGAGCAA------TGG-----------CA-----GC--TG-TTCTGATTTCCT-GAT-----TAATCG--G--------------TA--ACA-----------------------------------------TTTTAA-TTTCA------CTTTT-ATAACCCATTT-A---T-------CCATT-C---TGATATGAATCCCGGGGaccgtaccatacgtccctgcgcaatggcgttgtgttgattctgatttccgattaaatagcggtaactgtgccatttatcttttcaatttttcttttattaccatttatgaactattctgatatgaattctggggttttggtcattcaatgaaagaaacagcaaaggtatgtaaaaattctggagaataataaacattctgataaataagctaatgtaacgtataccagtcatccatccaggttgctcaagtttccttttatactgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntccactgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngccaaacaccagagtcactacgctgccaccaaa
gi|29 : GGTTTATA-TTTATTTCATCACTCA---T---------------------TTC----------CT-CAT------AA--AACAGGAACTCATGGTCAG---TATA---CATGT----ATTGT-C-T-TTAA--------------------TCGG-G---CG-----T-------G----GTGTA--CC----GTA----------CAA--T----ATATGTACGT-----------CCCTGAACAATG--G-CGA--------C--CGACCGTGT--TG-TTCTGATTTCCC-GAT-----T
gi|31 : GGTTTATA-TTTA-TTCATCACTCA---T------TTC------------CTCAT--------------------AA--AACAGGAACTCATGGTCAG---TATA---CATG----TATTGT-C-T-TT-------------A-------ATCGG-G---CG-----T-------GGT--GT--A--TC----GTA----------CAA--T----A------TATGTACGC-----CCCTGAACAATG--G-CGA--------C--CG----TGT--TG-TTCTGATTTCCC-
gi|41 : GGTTTACA-TTCATATCATCAATCA---T------TTCCTT-AT--AGGATTTATTAATACATTT-TATT---AAGA--AACGGAAAATAAAGGACA
gi|33 : GGTTCACA-TTTATTTCACCACTCA---T------GTT----TT------TTCATAAATATATTT-CATT---TAGG--AACAAAATGTAAAGGACAG---TATCT--CATGA-TATATG----AT-TT-------------A-------ATCTG-G---CG-----T-------GGT--GT--A--CC----GTA----------CAG--T----A------Ctgttatcatatc
gi|4 : GTTTACG-TTTATTTCATCACTAA---TTTC---CTC----AT--AAAACCCATTAATATATTT-CATT---ACGA--AACGGAAAGTAAAGGATAG---GATAT--TATGT-TATATAGT-C-T-TT-------------A-------ATCGG-G---TG-----TGTATGAAG----GTA-A--CT----GTA----------CTA--T----T------CAT-----------Cg
gi|20 : tGTTTACA-TTTATTTAATCACTCA---T------TTC----CT--CGA--TCATTAACATATTT-CATT---AAGA--AACGGAACATAAAGGACAGTCTCA-----CATGT-TATATA---CAC-GT---AGTCT-TT--A-------ATTGG-G---CG-----T-------GGT--GT--A--CC----GTA----------CAATTT----A------TAT-----------ACGT---CA---------G--------C--CG----TGT--TG-TTCTGATTTCCC-ACT-----TCATAG--GC-T------G--TATA--GCGGTAAAGTTC--TGTACC-------------AT---------TT--------TA------CTTT----------------------TGAACCATT-C---TGATATAAATTCCtgttcaattttactttaacaaccatttatggactattctgatatgaattcctggattttggtcatttagaaagagccagcaaacttacattttggagaataataaatcttctggcaaaacaaatgtgcttttaacatgtagtggtcatccatccattttgctcaagtttcctcttatactgtccaatacactctccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcactgtcttccttagacgtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccaaacacctgagtcctacgctgccac
gi|23 : GTTTACG-TTTATTTCATCATTCA---T------CTCCCC-AT--TAACCTGATTAGTACATTT-CATT---AAGA--AAC--AAAATGAAGGACA-----AAGTA-TATGT-TACATAAT-C---TT-------T-AT-----------TCGG-T---TG-----T-------A----GT--GTTCC----GTA----------CAA--T----A------CGT-----------CCTTGAGCAATG--G-TG-------------A----TAG--TG-TTTTGATTTCCC-GAT-----CATTCG--GC-C------A--TATA--AC-GTAG----C--TATTTCTGCTAC--AC---AT---------TTCCg
gi|3 : TTTACA-TTTAATTCACTACTGA---TTTC---CTC----AT---GAACTCATTAATATTTTT-CTTT---AAGA--AACGAAAAATAAAGGACAG---GATAT--CATGT-TATATAGT-C-T-TTAA--------------------TCGG-G---CG-----T-------G----GT--A--CG----GTA----------CAA--T----A------C-T-----------TCCTTAGGGACT--GATGG--------C--CG----TGT--TG-TGTTGATTTCCC-GAT-----TAATCG--GC-T------AGATATA--ACGGTAA----C--CGTACC--ATTT--GT---CT---------TTTCAG-TTTTA------CTTTT-G-TACCCATCTA--------TGCACCATT-C---TTATTTGAATTCTGG-GTT--TTGGTCA-T-TCATTGAAAGAACC--AGCAAAC-TTGGATAAT---TAT-TTTGGAGAATA---A---TAAACCTTCTG-----ATAAA-TTTGCT--------------AATGT-------------AAT----A-----TTTG----TAGCAG-TCA---TCCA-TC---CAGATTG--C---TCGAGTTT----CCTCT------------------CATAATGTCTGCTAC-ACTTCTC--ccgttccggga
gi|14 : TTTACAGTTTATTTAATCA-TCA---T------TTCCTCCATTAAAAATTCATTATTATATTTTCATT---AAGA--AACGAAAGATAAAGCACAG----GATT--CATAT-TATA-AGT-C-T-TTAA--------------------TCGG-G---CG-----T-------G----GT--AATCT----ATA----------CAA--T----A------CGT-----------CTCTGAGCAACG--G-CGG--------G--C------GG--TG-TTCTGATTTCCC-GAT-----T-ATCG--GCTT------G--TGTA--ACGGT-G----C--TG-----------------------------TTGAG-TC-TA------CCTTT-A-AAACCAT-------T--ATTAACCATT-C---TGATATGAATTCTTGCGGT--TT-GTCATT-TCAGTGAAAGGGCCAAAGCAAACGCCGCATGAA---G---TTTGAAGAACA---A---TAAACCTTCccagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacgactgtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacaaacaccagagtcactacactgccaccaaa
gi|12 : tTTACA-GTTATTTCATCACCCA---TTTC---CTC----AT--AAAGTTCATTAAT----TT-CATTTAAAAAA--AACGAAAAA-AAAGGACAA---GATAT--CATAT-TATATAGT-C-T-TTAA--------------------TCTG-G---TG-----T-------G----GT--A--CC----ATA----------CAA--A----A------CGT-----------TCCTGAGCAACG--G-CGG--------C--CG----TGT--T----------------------------------T------G--TATA--ACGGTAG----T--TGTACC--ATTT--TT---CT---------TTTCAA-TTTTA------CTTTT-A-AA--------------------CCATT-T---T--TATGAATTCCGGGGTT--TTGGTCA-T-TCATTGAAAGAACC--AGCAAAC-GTGAATAGA---ATT-TTTAAAGAATA---A---TTAAATTTCTG-----ATA-----------------------------------------AAT-GTAA-----GATG----TAATGG-TCT---TCAA-TCCAGCAGGTTG--CT--CAAT-TTT----CGTAT------------------TATACTGTCC
gi|24 : TTACA-TTTATTTCAGCACTCA---T------TTCTTC-AT--AAAACTCATTAATATATTT-CATG---AAGA--GACTGAAAATAAAGGACAG---GATAT--CATGTATATATACC-C----TGGTAGTCT-TTAA---------TCGG-G---TG-----TT------GT---GT--A--AC----GTA----------CGA--T----A------CGT-----------CCCTGAGCAATG--G-CGG--------T--CA----TGT--TG-TTCTGATTTCCC-GGT-----TAATCA--GC-T------G--TATA--ATGGTAG----C--TGTACC--gttgact
gi|19 : gtttgTTACA-TTCATTTTATCCCTTA---A------TTC-------------TCATTGATATATTC-CATA---AAGAGAAATCGAAAGTAAAGGAC---------------GT-TAT------CAT-ATAGACATATTCTTTA-------ATCCG-G---CG-----T-------TAT--GT--A--CC----GTA----------CAA--T----A------CGC-----------CCCTGAGCAATG--G-CGG--------A--TG----TGT--TA-TTCTGGTTTCCT-GTT-----TAAGCG--GC-T------G--TATA--GCGGTAA----C--TGTACC--GATT--AT---CT---------TTTCAA-TTTTA------CTTTT-C-TCACCATT------T--ATGATCCATT-C---TGATATCAATTattc
gi|5 : TACA-TATATTTTATCAT--A---T------TTC----CTTAAAAAATCATTAATATATTT-CATT---AAGA--AACGG
gi|15 : aTTCTTTCATCACTCA---TTTC---CTC----AT--AAAACTC-------TATTT-CATT---AAGA--AACGGAAAATAAAGGATA--------T--CATGT-TATA---------------ATAT-AT-----------TCGG-G---CAGGTACT-------A----GT--A--CCTACTGTA----------AAA--T----T------CAT-----------CCCTGAGCAATG--G-CGG--------T--CC----CGT--TG-TTC-------CC-GAT-----TAATCG--GC-T------G--TATA--ACATAAA----C--TGTACT--ATTT--AT---CT---------TTTTAA-TTTTG------ATTTT-A-TAACCATT------T--ATGAATCATT-C---TGATATAAATTCC-GGGTT--TTGGTCA-T-TCAGTGAAAGAACC--AGCAAAC-----------------TTTGGTGAATA---A---TAAAcgttgtgtaccgtaacaggtgagacgatactcttgaggagcaaggtggcgaggccgtgttctgatttcctgattaatcgcggctgcgttcatataacagtaaccttggatcgaatttgtcactgggtttttcatgaatccgaccttttataaccaattagtgtatgcatctttgcatatgatatcaactggcttagttggtcattcagtgaaatgacccaagaaaacattacatcaaattcccttgagaataaatagccttctgataaattttgctaattatggtaacgtgtcgtgtagcggttcattgtccatttcagattgcgtaagtttataccctcttatactccgcgctacaat
gi|27 : aTTCTTTCATCACTCA---T------TTC------------CTCATAAATATATTT-CATT---AAGA--AACGGAAAATAAACGACAG---GATAT--CATGT-TATGTAGT-C-T-TTAA--------------------TCGG-G---CT-----T-------G----GT--A--CC----ATA----------CAA--T----A------CGT-----------CCCCGAGCAATG--G-CAG--------C--CA----TGT--TG-TTATGATTTCCT-GAG-----TAATCG--GC-T------G--TATA--catat
gi|28 : TC----AT--AATATTCATTAATATACAT-CATC---AAGA--ACCAGAAAGGAAAGGACAT---GATAT--CATAT-TATATA---CGT-TT-----T-------A-------GTCGG-G---TG-----T-------G----GA--A--CC----ATA----------CAA--C----A------CGT-----------TCCTGAGCAATG--G-CGG--------C--CG----TGT--TG-TTATGATTTTGC-GAT-----TAATTG--GC-T------C--TACA--ACGGTAG----A--TGTACtcgga
gi|25 : CATTAATATATTT-CATT---AAGA--AACGGGAAATAAAGGGCAG---GATAT--CATGT-TACA--GT-----------GTGT-ATATATTCTTTCATCGG-G---CG-----TT------GT---GT--A--CC----GTA----------CAA--T----A------CAC-----------CCCCAAACAATG--A-CGG--------T--CG----TGT--TG-TTCCGATTTCCC-GAT-----TTATCG--GT-T------G--TATA--ACGGTAA----C--TGTACC--ATTT--AT---
gi|38 : T-CATT---AAGA------GAAAATAAAGGACA-----AAATTTCACAT-TATA--GT-C-T-TTAA--------------------TTGG-GCCTTG-----T-------G-----T--A--CC----AAA----------CAA--TTAATA------CGC-----------CCCTGAGCAAAT--G-TGG--------C--CG----TGT--
gi|40 : AAATAAAGGACAG---GATAT--CATGTATATATAGT-C-T-TTAA--------------------TCGG-G---TG-----TT------GT---GT--A--CC----GTC----------CGA--T----A------CGT-----------CCCTGAGCAATG--G-CGG--------T--CA---------TG-TTCTGATTTC
gi|34 : TAAAGGACAG---CATAT--CATGT-TATATAGT-C-T-TTAA--------------------TCGG-G---CG-----T-------G----GT--A--CC----GTT----------CAA--T----A------CGT-----------CCCTGAGCAACG--A-CGG--------C--CA---------TA-TTCTGTTTTCCC-AAT-----TAATCG--GT-T------G--TACA--ACGGT
gi|5 : AAAT--CAT-T-AATATATTTCAT-TAAGAAA------------------CGGCG---T------T-------GT---GT--A--CC----GTAACAGGTGAGACGA--T----A------C-------------TCTTGAGGAGCAAGG-TGG--------C--GA----GGCCGTG-TTCTGATTTCCT-GAT-----TAATCGCGGC-TGCGTTCA--TATA--ACAGTAA----CCTTGGATC--GAAT--TT---GTCACTGGGTTTTTCA---TGAATCCGACCTTTT-A-TAACCAATTAG---TGTATGCATCTTTGCATATGATATCAACT---GGCTTAGTTGGTCA-T-TCAGTGAAATGACCCAAGAAAACATTACATCAA---ATTCCCTTGAGAATA---A---ATAGCCTTCTG-----ATAAATTTTGCT--------------AAT-T-------------ATG-GTAACGTGTCGTG----TAGCGGTTCATTGTCCATTT---CAGATTG--C---GTAAGTTTATACCCTCT------------------TATACTCCGCGCTAC-A
gi|26 : atacatatattttatcatatttccttaaa-G---TG-----T-------GTTGTGT--A--CC----GTA----------CAA--T----A------CGT-----------CCCTG-GC----------G--------C--CG----TGT--TGGTTCTGATT--------------AATCA--GC-T------G--TATA--ACGGTAG----C--TGTGCC--ATTT--AT---CT---------TTTCAA-TTTTA------CTTTT-A-AGACCATT--A---T-----AACCATT-C---TGAGATAAATTCCAGGGTT--TTGTTCA-ATTCAGTGat
gi|1 : T--A--CC----GTA----------CCA--T----A------CGT-----------CCCTGCGCAA------TGG--------CGTTG----TGT--TGATTCTGATTTCC--GAT-----TAA-------------------ATA--GCGGTAA----C--TGTGCC--ATTT--AT---CT---------TTTCAA-TTTTT------CTTTT-A-TTACCATTTA--------TGAACTATT-C---TGATATGAATTCTGGGGTT--TTGGTCA-T-TCAATGAAAGAAAC--AGCAAAG-GTATGTAAA---AAT-TCTGGAGAATA---A---TAAACATTCTG-----ATAAA-TAAGC-------------------T-------------AAT-GTAA-----CGTA----TACCAG-TCA---TCCA-TC---CAGGTTG--C---TCAAGTTT----CCTTT------------------TATACTGTgggtccaatgcataatttt
gi|36 : ggtttacactcatttccccataaaactcatcaatacatttcattacgaaacggaacataaaggacaggatattatggtacatatgcatgtagtctttaatcaggcgtggtaccgtaccatacgtccctgcgcaatggcggttgtgttgttc--T----A------CGC-----------CCCTGAAAAAAA--G-AGGACGGGATAT--CA----TGTGATG-TTCTGATTTCCCGGAT-----CAATCG--GC-T------G--TATA--ACGGTAG----C--TTTACC--ATGT--ATTTCAT---------TTT-AA-TTTTA------CTTTT-A-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntccactgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngccaaacaccagagtcactacgctgccaccaaa
gi|18 : AGCAACA--G-TGG--------C--CG----TGT--TG-TTCTGATTTCCC-GAT-----TAATGG--GC-T------G--TATA--ACGGTAG----C--TGTACC--ATAT--AT---CT---------TTTCAT-TTTTA------CTTTT-A-AAACCATT------T--ATGAGTCAAT-C---TAATATACATTCCGGGGTT--ATGGTCA-T-TCAGTGAAAGAACC--AGCAAAC-CTGGATATA---TTT-TATGGAGGACA---A---TAAACCTTTTG-----ATATA-TGT-------------------------------------------------------------G-TCA---TCTA-TC---CAGGTTG--C---TAAAATTT----CCTCT------------------TGTACTGTCCGCTGC-ACTTT
gi|22 : TGATTTCCC-AAT-----TAATCA--TT-T------G--TATA--ACGGTTG----C--TGTACC--AT-T--AT---CT---------TTTCAA-TTGTA------CCTAT-A-AAACCATTTA--------TGAACAATT-C---TGATATGAATTC-AGAGTT--T-GATCA-T-TCAGTTAAAGAACC--AGCAAAC-CTGTATA-------T-TTTGGAGAAAA---A---TAAAACCTCTG-----ATAAA-AGTGC-------------------T-------------AAT-GTAA-----TATG----TAACGG-TCA---TCCA-TC---CATGTTG--CT--CAAC-TTT----CCT
gi|4 : T-----TAATCG--GG-T------G--TGTATGAAGGTAA----C--TGTAC----TATTCAT---CT---------GTTCAA-TTTTA------CTTTA-A-CAACCATTTA--------TGGACTATT-C---TGATATGAATTCCTGGATT--TTGGTCA-T-TTAG--AAAGAGCC--AGCAAAC-TTACAT----------TTTGGAGAATA---A---TAAATCTTCTGGCAAAACAAA-TGTGCT----------------T-T------------------TAA-----CATG----TAGTGG-TCA---TCCA-TC---CATTTTG--C---TCAAGTTT----CCTCT------------------TATACTGTCCAATAC-ACTCTCC--
gi|8 : tgtttacgtttatttcatcactaatttcctcataaaacccattaatatatttcattacgaaacggaaagtaaaggataggatattatgttatatagtctAT--TT---ATC--------TTTCAG-TTTTA------CCTTT-A-AAACCATT---------ATGAACCATT-C---TGATTTGAATTCCCGGGTT--TTGGTCA-C-TCAGTGAAA----------AAAA-TTG-------------TTTGGAGAATA---A---TAAACCTTCTG-----ATAAA-TGTGC-------------------T-------------AAT-GTAA-----CGTGTACATAACGG-TCA---TCCA-TC---CAGGTTG--C---TCAAGTTT----CCTCT------------------TATACTGTCCGCCAC-ACTTTCC----CCCGCACAGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCACTGTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCCAAACACCAGAGTCACTAAGCT-GCC-ACCAAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcactgtcttccttagacgtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccaaacacctgagtcctacgctgccac
gi|6 : gttatcT---------TTTCAA-TTTTA------CTTTT-A-AAACCATT---------ATGAGCCCTT-G---TTATATGAATTTCGGTGTT--TTAGTCA-T-TCAGTGAAAGAATC--AGCCGAC-CAGCATAAA---TTT-TTGGGAGAATA---A---CAACACTTCTG-----ATAAA-TGTGC-------------------T-------------AAT-GTAA-----CGTG----TAGCGA-TCA---TTCA-TC---TAGGTTG--CT--CAAC-TTT----CCTCT------------------GATACTGCCCGCTATAACTCTTC--
gi|7 : -TTTTA------CTTTTTA-AAACCATTTA--------TGAACCATT-C---TGATATAAATTTCGGGCTT--TGGGTCA-T-TCAGTGATTGAACC--AGCAAAC-TTACA-AAA---AG---ATGGAGAATA---GCCCTAAACGCTCTG-----ATAAA-TGTGC---------------A-----------------------AA-----TGTA----TAGCGG-TTA---TCCA-TC---CAGGTTGCTC---AAA--TTT----CCTCT------------------TATACTGCCCGCTAC-ACTTTTC--gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccactgtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngccaaacaccagtcacctagctgctacc
gi|10 : -AGACCATCTATCTTT--CTAAATCATT-C---TGATATAAATTCCGGGATT--TTGGTCA-T-TCAGTGAAAGAACC--AGCAAAC-CTGCATACA---ATT-TTTGAAGAATAATTA---TAAAACTTCTG-----GTAAA-TGTGCT--------------AA----------------NNN-NNNN-----NNNN----NNNNNN-NNN---NNNN-NN---NNNNNNN--C---AA--GTTT------GCT------------------TATACTGTCCATTAC-ACTTTTC--nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccactgtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntccaaacaccagagtcactaagctggcaccaa
gi|11 : TT-C---TGATGTGAATTCCAGAGTT--TTGGTCA-T-TCAGTGAAAGAACC--AGCAAAC-ATACATAAA---ATT-TTTGGAGAATA---A----AAAAC--CTA-----ATAAA-TGTGC-------------------T-------------AAT-GTAA-----CGTG----CAGCGG-TCA---TCCA-TC---CAGGTTGT-T---TAAC-TTT----CCTCT------------------AATACTGTCCGTTAC-ACTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngccaaacatcagagtcattaagctgccaccaaa
gi|30 : TGGTCA-T-TCAGTGAAAGAACC--AGCAAAC-TTGCATAATTTTATT-TTTTGAGAATA---A---TAAACCTTCTG-----ATAAA-TGTG------------------T-C-------------ATT-GTTC-----TGTG----TAGCGG-TCA---CCCA-TC---CAGGTTG--C---TCAAGTTT----CCTTT------------------TATACTATTCACTAC-ACTTccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccattgtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccaaacattagagtcagtacgctgccaccaa
gi|42 : TGGCCA-T-TCAATGAAAGAACC--AACGAAA-TTGAATATA----GT-TTTTTAGAATG---A---TAAAACTCCTG-----ATAAA-TATGCT--------------
gi|13 : AAA---ATT-TTTGGAGAATA---A---TTAAACTTCTG-----ATAAA-TGTAC-------------------T-------------AAT-GTAA-------CG----TAGCGG-TCA---TCCA-TC---CAGGTTA--CTCAAAA---TT----CCTCTTATATATAAAATGGCATATATACTGTCCGCTAC-TTTTTTC-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCACTGTCT-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCCAAACACCAGAGTCACTACGCT-GCC-ACCA
gi|32 : gtgattcattatttgaataatgGT-TTTGGAGAATA---A---TGAACCTTCTG-----ATAAA-TGTGCTTATTTGAATTGACGAAT-TCAACATTGCATTAAAC-GTAA-----TGTG----TAACGG-TCA---TCCA-TC---CAAGTTGTTC---AA--GTTT----CCTCT------------------TATACTGTCCGCTAT-AC
gi|16 : CT--------------AAC-T-------------AACCGTAA--------------ACTGG-TCA---TTCA---------GTGA--A---AGAAGTTT----CCTCT------------------TATACTGTCCGCTAC-ACcc
gi|17 : caccgaaatgagagaaccagtcaaAA-----TGTG----TAGCGG-TCA---TCCA-TC---CAGGTTGATC---AA--GTAT----CCTCT------------------TATACTGTCCACTAC-ACTTTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCACTGTCT----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA---CCAAACACC--AGTCGCTATGAT-GCC-ACCAAcccccctcccgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacttgtgtcgtccaaggacgagaccacgcccatacatgaccacaaagtccaaggtttcccgccaaacaccagagtaactatgctgccaccaaa
gi|1 : aacaGCCAAACACCAGAGTCACTACGCT-GCC-ACCAAA
gi|10 : ggtttacactcatttccccataaaactcatcaatacatttcattacgaaacggaacataaaggacaggatattatggtacatatgcatgtagtctttaatcaggcgtggtaccgtaccatacgtccctgcgcaatggcggttgtgttgttctaccgtaccatacgtccctgcgcaatggcgttgtgttgattctgatttccgattaaatagcggtaactgtgccatttatcttttcaatttttcttttattaccatttatgaactattctgatatgaattctggggttttggtcattcaatgaaagaaacagcaaaggtatgtaaaaattctggagaataataaacattctgataaataagctaatgtaacgtataccagtcatccatccaggttgctcaagtttccttttatactgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntccactgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGCCAAACATCAGAGTCATTAAGCT-GCC-ACCAAA
gi|16 : agaccatctatctttctaaatcattctgatataaattccgggattttggtcattcagtgaaagaaccagcaaacctgcatacaatttttgaagaataattataaaacttctggtaaatgtgctaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaagtttgcttatactgtccattacacttttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGCCAAACACCAGAGTAACTATGCT-GCC-ACCAAA
gi|48 : caccgaaatgagagaaccagtcaactaactaaccgtaaactggtcattcagtgaaagaagtttcctcttatactgtccgctacaccccccctcccgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacttgtgtcgtccaaggacgagaccacgcccatacatgaccacaaagtccaaggtttcccGCCAAACACCAGAATCACTACGCT-GCC-ACCAAA
gi|47 : cGCCAAACACCAGAGTCACTACGCT-GCCAACCAA
gi|11 : CCAAACATTAGAGTCAGTACGCT-GCC-ACCAAtt
gi|4 : ttctgatgtgaattccagagttttggtcattcagtgaaagaaccagcaaacatacataaaatttttggagaataaaaaacctaataaatgtgctaatgtaacgtgcagcggtcatccatccaggttgtttaactttcctctaatactgtccgttacacttccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccattgtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaCCAAACACCTGAGTC-CTACGCT-GCC-AC
gi|7 : tgtttacgtttatttcatcactaatttcctcataaaacccattaatatatttcattacgaaacggaaagtaaaggataggatattatgttatatagtctttaatcgggtgtgtatgaaggtaactgtactattcatctgttcaattttactttaacaaccatttatggactattctgatatgaattcctggattttggtcatttagaaagagccagcaaacttacattttggagaataataaatcttctggcaaaacaaatgtgcttttaacatgtagtggtcatccatccattttgctcaagtttcctcttatactgtccaatacactctccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcactgtcttccttagacgtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaCCAAACACCAGAGTCACTAAGCT-GGC-ACCAA
gi|55 : ttttactttttaaaaccatttatgaaccattctgatataaatttcgggctttgggtcattcagtgattgaaccagcaaacttacaaaaagatggagaatagccctaaacgctctgataaatgtgcaaatgtatagcggttatccatccaggttgctcaaatttcctcttatactgcccgctacacttttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccactgtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntCCAAACACCAGAGTCACTACGCT-GCC-ACCAA
gi|52 : CCAAACACCAGAGTCACTACGCT-GCC-ACCAA
gi|51 : CCAAACACCAGAGTCACTAACCT-GTC-ACCAAAt
gi|53 : CCAAACACCAGAGTCACTGCGCT-GCC-ACCAAt
gi|54 : CCAATCACCAGAGTCACTACGCT-GCC-ACCAAt
gi|50 : CCAAA-ACCAGAGTCACTACGCT-GCC-ACCAAt
gi|46 : CCAAACACCAGAGTCACTACGCTGGCCAACCAAAttt
gi|3 : CAAACACCAGAGTCACTACACT-GCC-ACCAAAtt
5 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|35 ): TGTAGGGTTATGGCTACTTTATTTTGGGCTTTGTGGTATATAACGAGTTTTGTGCACTTTTCTAACATCGGAATGAGAGAGGCAGTCATCTAACCTTAAACTTGTCATTCAGTG
Unaligned ( gi|37 ): TTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAACCACTGTC
Unaligned ( gi|39 ): TTGTCTCGCGGCGTTGAGTTTTGGCTACTTTATTTTGAGCTTAGTGATGTTTCTCGAGTTTGGTGCATTTTCCTAGAAACCACTCATTTAACCTTAAA
Unaligned ( gi|43 ): ATGGTTTACATTAATTCCAACACTCATTTCCTCATAAAGGATGAAGTGCAGTCTCCATACATGTA
Unaligned ( gi|49 ): GTATAAAGCGTATATTTCATAAGTTTTGAACGTG
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 222222 11111 1111111111111111111111 111111 3333333333333333 11 3333333333333 555555555555555555555555555 111 222222222222222222 1111 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 2 333 777777 44444 44 5 1 333 22 333 0000000000000000000000 000000 1 1 1 6666666666666666 333 66666 5 33 44 44 3333 1 3333 22 3333 999999 1 99999999999 3333 555 22 999999999 22 3 1 44444 22 1 777777 22 4444 22 22 5 7777777 33 333 2 2 2 22 2222222222222 2 333 2 0 33 2 2 55 88 1 88888 3 333 333 55555 2 555555555555555555555555555 7777777 444 55555 4444 2 333 2 333 444 4444 111111111111111111 2 9999 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 2 4
lowQualScore : . ... ...... ..... .. . . ... .. ... ...................... ...... . . . ................ ... ..... . .. .. .. .... . .... .. .... ...... . ........... .... ... .. ......... .. . . ..... .. . ...... .. .... .. .. . ....... .. ... . . . .. ............. . ... . . .. . . .. .. . ..... . ... ... ..... . ........................... ....... ... ..... .... . ... . ... ... .... .................. . .... ................................................................. ................................................................................... . .
lowQualScore : 0 222 555555 55555 88 0 8 222 55 222 0000000000000000000000 000000 7 7 7 0000000000000000 000 11111 2 55 66 66 5555 7 5555 22 4444 222222 6 66666666666 5555 444 22 333333333 22 3 8 33333 55 8 777777 55 2222 88 99 5 2222222 11 999 1 1 1 44 9999999999999 0 555 1 1 22 0 0 88 99 6 88888 8 555 555 66666 2 444444444444444444444444444 2222222 222 66666 7777 2 999 1 777 666 5555 999999999999999999 5 5555 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0 0
consensus : TGGTTTACA-TTTATTTCATCACTCA---T------CTC----AT--AAAACTCATTAATATATTT-CATT---AAGA--A---ACGGAAAATAAAGGACAGGATATCATGT---T--------A---------TA------TA-GT-C-TT----------TAA-AATCGGGC---G-----T-G--GT--A--CC----GTA-CA----A--T----A------CG-T-----------CCCT----GAGCAA--CGGCG--GCCG--------TGT--TG-TTCTGATTTCCCG-AT-----TAAT--CGGC-TG------TATA--ACGGTAG----C--TGTACC--ATTTATC-------T--TTTC---AA-TTTTA-CTTTT-A-AAACCATTT-A---TAT----GAACCATT-C---TGATATGAATTC-CGGGGTT--TTGGTC-A-TTCAGTGAAAGAACC--AGCAAAC-CTGCATAAA---ATT-TTTGGAGAATA---A---TAAACCTTCTG-----ATAAA-TGTGC-TA-------T----------------AATGT-------AACG--T-----GTA----GCGG-TCA---TCCA-TC---CAGGTTGCTC-AAGTTT----CCTCT------------------TATACTGTCCGCTAC-ACTTTTC----CCCGCACAGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACCACTGTCT----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNANNGCCAAACACCAGAGTCACTACGCT-GCC-ACCAAA
Reference ( family-593 ) : TGGTTTACA-TTTATTTCATCACTCA---T------CTC----AT--AAAACTCATTAATATATTT-CATT---AAGA--A---ACGGAAAATAAAGGACAGGATATCATGT---T--------A---------TA------TA-GT-C-TT----------TAA-AATCGGGC---G-----T-G--GT--A--CC----GTA-CA----A--T----A------CG-T-----------CCCT----GAGCAA--CGGCG--GCCG--------TGT--TG-TTCTGATTTCCCG-AT-----TAAT--CGGC-TG------TATA--ACGGTAG----C--TGTACC--ATNTATC-------T--TTTC---AA-TTTTA-CTTTT-A-AAACCATTT-A---TAT----GAACCATT-C---TGATATGAATTC-CGGGGTT--TTGGTC-A-TTCAGTGAAAGAACC--AGCAAAC-TTGCATAAA---ATT-TTTGGAGAATA---A---TAAACCTTCTG-----ATAAA-TGTGC-TA-------T----------------AATGT-------AACG--T-----GTA----GCGG-TCA---TCCA-TC---CAGGTTGCNA-AAGTTT----CCTCT------------------TATACTGTCCGCTAC-ACTTTTC----CCCGCACAGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCACTGTCT----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNANNGCCAAACACCAGAGTCACTACGCT-GCC-ACCAAA
gi|1 : GGTTTACA-CTCATTTC------------------CCC----AT--AAAACTCATCAATACATTT-CATT---ACGA--A---ACGGAACATAAAGGACAGGATATTATGG---TACATATGCA---------TG------TA-GT-C-TT----------T---AATCAGGC---G-----T-G--GT--A--CC----GTA-CC----A--T----A------CG-T-----------CCCT----GCGCAA--TGGCG--GTTG--------TGT--TG-TTCT
gi|1 : T--A--CC----GTA-CC----A--T----A------CG-T-----------CCCT----GCGCAA--TGGCG---TTG--------TGT--TGATTCTGATTTCC-G-AT-----TAA-----------------ATA--GCGGTAA----C--TGTGCC--ATTTATC-------T--TTTC---AA-TTTTT-CTTTT-A-TTACCATTT-A---T------GAACTATT-C---TGATATGAATTC-TGGGGTT--TTGGTC-A-TTCAATGAAAGAAAC--AGCAAAG-GTATGTAAA---AAT-TCTGGAGAATA---A---TAAACATTCTG-----ATAAA-TAAGC----------T----------------AATGT-------AACG--T-----ATA----CCAG-TCA---TCCA-TC---CAGGTTGCTC-AAGTTT----CCTTT------------------TATACTGTaccgtaccatacgtccctgcgcaatggcgttgtgttgattctgatttccgattaaatagcggtaactgtgccatttatcttttcaatttttcttttattaccatttatgaactattctgatatgaattctggggttttggtcattcaatgaaagaaacagcaaaggtatgtaaaaattctggagaataataaacattctgataaataagctaatgtaacgtataccagtcatccatccaggttgctcaagtttccttttatactgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntccactgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngccaaacaccagagtcactacgctgccaccaaa
gi|1 : ggtttacactcatttccccataaaactcatcaatacatttcattacgaaacggaacataaaggacaggatattatggtacatatgcatgtagtctttaatcaggcgtggtaccgtaccatacgtccctgcgcaatggcggttgtgttgttcGCCAAACACCAGAGTCACTACGCT-GCC-ACCAAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntccactgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngccaaacaccagagtcactacgctgccaccaaa
gi|10 : ggtttacactcatttccccataaaactcatcaatacatttcattacgaaacggaacataaaggacaggatattatggtacatatgcatgtagtctttaatcaggcgtggtaccgtaccatacgtccctgcgcaatggcggttgtgttgttctaccgtaccatacgtccctgcgcaatggcgttgtgttgattctgatttccgattaaatagcggtaactgtgccatttatcttttcaatttttcttttattaccatttatgaactattctgatatgaattctggggttttggtcattcaatgaaagaaacagcaaaggtatgtaaaaattctggagaataataaacattctgataaataagctaatgtaacgtataccagtcatccatccaggttgctcaagtttccttttatactgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntccactgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-AGACCATCT-A---TCTTTCTAAATCATT-C---TGATATAAATTC-CGGGATT--TTGGTC-A-TTCAGTGAAAGAACC--AGCAAAC-CTGCATACA---ATT-TTTGAAGAATAATTA---TAAAACTTCTG-----GTAAA-TGTGC----------T----------------AANNN-------NNNN--N-----NNN----NNNN-NNN---NNNN-NN---NNNNNNNNNC-AAGTTT------GCT------------------TATACTGTCCATTAC-ACTTTTC----
gi|10 : GCCAAACATCAGAGTCATTAAGCT-GCC-ACCAAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngccaaacatcagagtcattaagctgccaccaaa
gi|11 : agaccatctatctttctaaatcattctgatataaattccgggattttggtcattcagtgaaagaaccagcaaacctgcatacaatttttgaagaataattataaaacttctggtaaatgtgctaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaagtttgcttatactgtccattacacttttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTT-C---TGATGTGAATTC-CAGAGTT--TTGGTC-A-TTCAGTGAAAGAACC--AGCAAAC-ATACATAAA---ATT-TTTGGAGAATA---A---AAAAC---CTA-----ATAAA-TGTGC----------T----------------AATGT-------AACG--T-----GCA----GCGG-TCA---TCCA-TC---CAGGTTGTTT-AACTTT----CCTCT------------------AATACTGTCCGTTAC-ACTT
gi|11 : CCAAACATTAGAGTCAGTACGCT-GCC-ACCAAccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccattgtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccaaacattagagtcagtacgctgccaccaa
gi|12 : ttctgatgtgaattccagagttttggtcattcagtgaaagaaccagcaaacatacataaaatttttggagaataaaaaacctaataaatgtgctaatgtaacgtgcagcggtcatccatccaggttgtttaactttcctctaatactgtccgttacacttccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccattgtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaTTACA-GTTATTTCATCACCCA---TTTC---CTC----AT--AAAGTTCATTAAT----TT-CATTTAAAAAA--A---ACGAAAAA-AAAGGACAAGATATCATAT---T--------A---------TA------TA-GT-C-TT----------TAA---TCTGGT---G-----T-G--GT--A--CC----ATA-CA----A--A----A------CG-T-----------TCCT----GAGCAA--CGGCG--GCCG--------TGT--T----------------------------------TG------TATA--ACGGTAG----T--TGTACC--ATTTTTC-------T--TTTC---AA-TTTTA-CTTTT-A-AA----------------------CCATT-T---T--TATGAATTC-CGGGGTT--TTGGTC-A-TTCATTGAAAGAACC--AGCAAAC-GTGAATAGA---ATT-TTTAAAGAATA---A---TTAAATTTCTG-----ATA-----------------------------------AATGT-------AAGA--T-----GTA----ATGG-TCT---TCAA-TCCAGCAGGTTGCTC-AATTTT----CGTAT------------------TATACTGTCCGTT
gi|13 : AAA---ATT-TTTGGAGAATA---A---TTAAACTTCTG-----ATAAA-TGTAC----------T----------------AATGT-------AAC---------GTA----GCGG-TCA---TCCA-TC---CAGGTTACTC-AAAATT----CCTCTTATATATAAAATGGCATATATACTGTCCGCTAC--TTTTTT----CNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCACTGTCT-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCCAAACACCAGAGTCACTACGCT-GCC-ACCAgact
gi|14 : gtgattcattatttgaataatgTTTACAGTTTATTTAATCA-TCA---T------TTCCTCCATTAAAAATTCATTATTATATTTTCATT---AAGA--A---ACGAAAGATAAAGCACAGGAT-TCATAT---T--------A---------TA-------A-GT-C-TT----------T---AATCGGGC---G-----T-G--GT--AATCT----ATA-CA----A--T----A------CG-T-----------CTCT----GAGCAA--CGGCG--G--G--------CGG--TG-TTCTGATTTCCCG-AT-----T-AT--CGGCTTG------TGTA--ACGGT-G----C--TG-------------------------TT---GA-GTCTA-CCTTT-A-AAACCAT-------TAT----TAACCATT-C---TGATATGAATTCTTGCGGTT--T--GTC-ATTTCAGTGAAAGGGCCAAAGCAAACGCCGCATGAA---G---TTTGAAGAACA---A---TAAACCTTC
gi|15 : tTTCTTTCATCACTCA---TTTC---CTC----AT--AAAACTC-------TATTT-CATT---AAGA--A---ACGGAAAATAAAGGA-----TATCATGT---T--------A---------TA-------A------------------TAT-ATTCGGGC---AGGTACT-A--GT--A--CCTACTGTA-AA----A--T----T------CA-T-----------CCCT----GAGCAA--TGGCG--GTCC--------CGT--TG-TTC-------CCG-AT-----TAAT--CGGC-TG------TATA--ACATAAA----C--TGTACT--ATTTATC-------T--TTTT---AA-TTTTG-ATTTT-A-TAACCATT------TAT----GAATCATT-C---TGATATAAATTC-C-GGGTT--TTGGTC-A-TTCAGTGAAAGAACC--AGCAAAC-----------------TTTGGTGAATA---A---TAAAC
gi|16 : aTGGTC-A-TTCAGTGAAAGAAatat
gi|16 : caccgaaatgagagaaccagtcaactaactaaccgtaaacCA-TT---CAG--TGAAAGAAGTTT----CCTCT------------------TATACTGTCCGCTAC-ACCCCCCCT--CCCGCgtttcctcttatactgtccgctacaccccccctcccgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacttgtgtcgtccaaggacgagaccacgcccatacatgaccacaaagtccaaggtttcccgccaaacaccagagtaactatgctgccaccaaa
gi|16 : caccgaaatgagagaaccagtcaactaactaaccgtaaactggtGCCAAACACCAGAGTAACTATGCT-GCC-ACCAAAtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacttgtgtcgtccaaggacgagaccacgcccatacatgaccacaaagtccaaggtttcccgccaaacaccagagtaactatgctgccaccaaa
gi|17 : caccgaaatgagagaaccagtcaactaactaaccgtaaactggtcattcagtgaaagaagtttcctcttatactgtccgctacaccccccctcccgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacttgtgtcgtccaaggacgagaccacgcccatacatgaccacaaagtccaaggtttccc-------AATG--T-----GTA----GCGG-TCA---TCCA-TC---CAGGTTGATC-AAGTAT----CCTCT------------------TATACTGTCCACTAC-ACTTTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCACTGTCT----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA---CCAAACACC--AGTCGCTATGAT-GCC-ACCAA
gi|18 : aacaAGCAA--CAGTG--GCCG--------TGT--TG-TTCTGATTTCCCG-AT-----TAAT--GGGC-TG------TATA--ACGGTAG----C--TGTACC--ATATATC-------T--TTTC---AT-TTTTA-CTTTT-A-AAACCATT------TAT----GAGTCAAT-C---TAATATACATTC-CGGGGTT--ATGGTC-A-TTCAGTGAAAGAACC--AGCAAAC-CTGGATATA---TTT-TATGGAGGACA---A---TAAACCTTTTG-----ATATA-TGT---------------------------------------------------------------G-TCA---TCTA-TC---CAGGTTGCTA-AAATTT----CCTCT------------------TGTACTGTCCGCTGC-ACTTT
gi|19 : TTACA-TTCATTTTATCCCT--------------------T--AATTCTCATTGATATATTC-CATA---AAGAGAA---ATCGAAAGTAAAGGAC--GTTATCATATA--G--------A---------CA------TA-TT-C-TT----------TAA---TCCGGC---G-----T-TATGT--A--CC----GTA-CA----A--T----A------CG-C-----------CCCT----GAGCAA--TGGCG--GATG--------TGT--TA-TTCTGGTTTCCTG-TT-----TAAG--CGGC-TG------TATA--GCGGTAA----C--TGTACC--GATTATC-------T--TTTC---AA-TTTTA-CTTTT-C-TCACCATT------TAT----GATCCATT-C---TGATATCAATT
gi|2 : TGGTTTACA-TTTATTTCCTCACTCA---T------CTC----AT--AGAATTCATTAATATATTT-CATT---AAGA--A---ACGGAAACTAAAGGACAGCAAATCATGT---T--------A---------TA------TA-GT-CATTTAAAAATATATAA-AATCGGGT---G-----T-G--GT--A--CC----GTA-CA----A--T----A------CA-T-----------CCCT----GAGCAA--CAGTG--GCCA--------TGT--TG-TTCTGATTTCCCG-AT-----TAAT--TGGC-TA------TATA--ACAGTAG----C--TGTACC--CTATATA-------T--TTTC---AG-TTGTA-CTTTT-A-AAACCATTTAA---TAT----GAACCATT-C---TGATATGAATTC-CAGAGTT--TTGGTC-A-ATCAGTGAAAGAACC--AGCAAAC-CTGCATAAA---AGT-TTTGGAGAATA---A---TAAAACTTCTG-----ATAAA-TGTGC-TAAT-----T----------------AATGT-------AATG--T-----GTA----GTGG-TCA---TCCA-TC---CAGGTTGCAA-ATGTTT----CCTCT------------------TATACTGTCCACTAC-ACTTTTCNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACCACTGTCT----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCCAAACACCAGAGTCACTAAGCT-GCC-ACCAAA
gi|20 : GTTTACA-TTTATTTAATCACTCA---T------TTC----CT--CGA--TCATTAACATATTT-CATT---AAGA--A---ACGGAACATAAAGGACAGTCTCACATGT---T--------A---------TATACACGTA-GT-C-TT----------T---AATTGGGC---G-----T-GGTGT--A--CC----GTA-CA----ATTT----A------TA-T------------------------A--CGTCA--GCCG--------TGT--TG-TTCTGATTTCCCA-CT-----TCAT--AGGC-TG------TATA--GCGGTAAAGTTC--TGTACC---------------------------A-TTTTA-CTTT--------------------T----GAACCATT-C---TGATATAAATTC-CG
gi|21 : GGTTTACA-TTTATTTCATCACTTA---TTTC---CTC----AT--AAA-CTCATTGATATATTT-CTTT---TAG---------------TAAAGGACAGGATCTCAAGT---T--------A---------TA------TA-GT-C-TT------------A-AATCGGGC---G-----A-G--AT--A--CC----GTA-CA----A--T----A------CA-TGTACATGCAAGTCCT----GAGCAA--TGGCA--GC---------------TG-TTCTGATTTCCTG-AT-----TAAT--CGG------------TA--ACA------------------------------------TTTT---AA-TTTCA-CTTTT-ATAACCCATTT-A---T---------CCATT-C---TGATATGAATCC-CGGGG
gi|22 : TGATTTCCCA-AT-----TAAT--CATT-TG------TATA--ACGGTTG----C--TGTACC--AT-TATC-------T--TTTC---AA-TTGTA-CCTAT-A-AAACCATTT-A---T------GAACAATT-C---TGATATGAATTC-AGAG--T--TTGATC-A-TTCAGTTAAAGAACC--AGCAAAC-CTGTATA-------T-TTTGGAGAAAA---A---TAAAACCTCTG-----ATAAA-AGTGC-TA-------------------------ATGT-------AATA--T-----GTA----ACGG-TCA---TCCA-TC---CATGTTGCTC-AACTTT----CCT
gi|23 : GTTTACG-TTTATTTCATCATTCA---T------CTCCCC-AT--TAACCTGATTAGTACATTT-CATT---AAGA--A---AC--AAAATGAAGGACAAAGTAT-ATGT---T--------A---------CA------TA-AT-C-TT----------TAT---TCGGTT---G-----T-A--GT--GTTCC----GTA-CA----A--T----A------CG-T-----------CCTT----GAGCAA--TGGTG--ATAG-------------TG-TTTTGATTTCCCG-AT-----CATT--CGGC-CA------TATA--AC-GTAG----C--TAT
gi|24 : TTACA-TTTATTTCAGCACTCA---T------TTCTTC-AT--AAAACTCATTAATATATTT-CATG---AAGA--G---ACTGAAAATAAAGGACAGGATATCATGTATAT--------A---------TACCCTGGTA-GT-C-TT----------TAA---TCGGGT---G-----TTGT-GT--A--AC----GTA-CG----A--T----A------CG-T-----------CCCT----GAGCAA--TGGCG--GTCA--------TGT--TG-TTCTGATTTCCCG-GT-----TAAT--CAGC-TG------TATA--ATGGTAG----C--TGTACC--ATttctgctacacatttccccgttccggga
gi|25 : gtttgCATTAATATATTT-CATT---AAGA--A---ACGGGAAATAAAGGGCAGGATATCATGT---T--------ACAGTGTGTATA------TA-TT-C-TT----------TCA---TCGGGC---G-----TTGT-GT--A--CC----GTA-CA----A--T----A------CA-C-----------CCCC----AAACAA--TGACG--GTCG--------TGT--TG-TTCCGATTTCCCG-AT-----TTAT--CGGT-TG------TATA--ACGGTAA----C--TGTACC--ATTTATtc
gi|26 : --GT--A--CC----GTA-CA----A--T----A------CG-T-----------CCCT----G---------GCG---CCG--------TGT--TGGTTCTGATT--------------AAT--CAGC-TG------TATA--ACGGTAG----C--TGTGCC--ATTTATC-------T--TTTC---AA-TTTTA-CTTTT-A-AGACCA-TT-A---T-------AACCATT-C---TGAGATAAATTC-CAGGGTT--TTGTTCAA-TTCAGTG---GGGTC----CAA----TGCAT--A---ATT-TT
gi|27 : gtgtgttgtTTCTTTCATCACTCA---T------TTC------------CTCATAAATATATTT-CATT---AAGA--A---ACGGAAAATAAACGACAGGATATCATGT---T--------A---------TG------TA-GT-C-TT----------TAA---TCGGGC---T-----T-G--GT--A--CC----ATA-CA----A--T----A------CG-T-----------CCCC----GAGCAA--TGGCA--GCCA--------TGT--TG-TTATGATTTCCTG-AG-----TAAT--CGGC-TG------TATA--TCGG
gi|28 : TC----AT--AATATTCATTAATATACAT-CATC---AAGA--A---CCAGAAAGGAAAGGACATGATATCATAT---T--------A---------TA------TACGT-T-TT--------------AGTCGGGT---G-----T-G--GA--A--CC----ATA-CA----A--C----A------CG-T-----------TCCT----GAGCAA--TGGCG--GCCG--------TGT--TG-TTATGATTTTGCG-AT-----TAAT--TGGC-TC------TACA--ACGGTAG----A--TGTACa
gi|29 : GGTTTATA-TTTATTTCATCACTCA---T------TTC------------CTCAT--------------------AA--A---ACAGGAACTCATGGTCAGTATA-CATGT-----------------------A------TT-GT-C-TT----------TAA---TCGGGC---G-----T-G--GTGTA--CC----GTA-CA----A--T----ATATGTACG-T-----------CCCT----GAACAA--TGGCG--ACCGACCG----TGT--TG-TTCTGATTTCCCG-AT-----T
gi|3 : TTTACA-TTTAATTCACTACTGA---TTTC---CTC----AT--GAA-CTCATTAATATTTTT-CTTT---AAGA--A---ACGAAAAATAAAGGACAGGATATCATGT---T--------A---------TA------TA-GT-C-TT----------TAA---TCGGGC---G-----T-G--GT--A--CG----GTA-CA----A--T----A------CT-T-----------CCTT----AGGGAC--TGATG--GCCG--------TGT--TG-TGTTGATTTCCCG-AT-----TAAT--CGGC-TAGA----TATA--ACGGTAA----C--CGTACC--ATTTGTC-------T--TTTC---AG-TTTTA-CTTTT-G-TACCCATCT-A---T------GCACCATT-C---TTATTTGAATTC-TGGG-TT--TTGGTC-A-TTCATTGAAAGAACC--AGCAAAC-TTGGATAAT---TAT-TTTGGAGAATA---A---TAAACCTTCTG-----ATAAA-TTTGC----------T----------------AATGT-------AATATTT-----GTA----GCAG-TCA---TCCA-TC---CAGATTGCTC-GAGTTT----CCTCT------------------CATAATGTCTGCTAC-ACTTCTC----CC
gi|3 : CAAACACCAGAGTCACTACACT-GCC-ACCAAAagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacgactgtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacaaacaccagagtcactacactgccaccaaa
gi|30 : tttacatttaattcactactgatttcctcatgaactcattaatatttttctttaagaaacgaaaaataaaggacaggatatcatgttatatagtctttaatcgggcgtggtacggtacaatacttccttagggactgatggccgtgttgtgttgatttcccgattaatcggctagatataacggtaaccgtaccatttgtcttttcagttttacttttgtacccatctatgcaccattcttatttgaattctgggttttggtcattcattgaaagaaccagcaaacttggataattattttggagaataataaaccttctgataaatttgctaatgtaatatttgtagcagtcatccatccagattgctcgagtttcctctcataatgtctgctacacttctcccagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacgactgtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaTGGTC-A-TTCAGTGAAAGAACC--AGCAAAC-TTGCATAATTTTATT-TTTTGAGAATA---A---TAAACCTTCTG-----ATAAA-TGTGT-CA-------T------------------TGT-------TCTG--T-----GTA----GCGG-TCA---CCCA-TC---CAGGTTGCTC-AAGTTT----CCTTT------------------TATACTATTCACTAC-ACTT
gi|31 : GGTTTATA-TTTATT-CATCACTCA---T------TTC------------CTCAT--------------------AA--A---ACAGGAACTCATGGTCAGTATA-CATGT-----------------------A------TT-GT-C-TT----------TAA---TCGGGC---G-----T-G--GTGTA--TC----GTA-CA----A--T----ATATGTACG-C-----------CCCT----GAACAA--TGGCG--ACCG--------TGT--TG-TTCTGATTTCCC
gi|32 : T-TTTGGAGAATA---A---TGAACCTTCTG-----ATAAA-TGTGCTTA-------TTTGAATTGACGAATTCAACATTGCATTAAACG--TAATGTGTA----ACGG-TCA---TCCA-TC---CAAGTTGTTC-AAGTTT----CCTCT------------------TATACTGTCCGCTAT-AC
gi|33 : gGGTTCACA-TTTATTTCACCACTCA---T------GTT----TT------TTCATAAATATATTT-CATT---TAGG--A---ACAAAATGTAAAGGACAGTATCTCATGA---T--------A---------TA------TG-AT-T-T---------------AATCTGGC---G-----T-GGTGT--A--CC----GTA-CA----G--T----A------CG-cc
gi|34 : TAAAGGACAGCATATCATGT---T--------A---------TA------TA-GT-C-TT----------TAA---TCGGGC---G-----T-G--GT--A--CC----GTT-CA----A--T----A------CG-T-----------CCCT----GAGCAA--CGACG--GCCA-------------TA-TTCTGTTTTCCCA-AT-----TAAT--CGGT-TG------TACA--ACGGT
gi|36 : --T----A------CG-C-----------CCCT----GAAAAA--AAGAG--GACGGGATATCATGTGATG-TTCTGATTTCCCGGAT-----CAAT--CGGC-TG------TATA--ACGGTAG----C--TTTACC--ATGTATT-------TCATTTT---AA-TTTTA-CTTTT-A-
gi|38 : T-CATT---AAGA---------GAAAATAAAGGACAAAATTTCACAT---T--------A---------TA---------GT-C-TT----------TAA---TTGGGCCTTG-----T-G---T--A--CC----AAA-CA----A--TTAATA------CG-C-----------CCCT----GAGCAA--ATGTG--GCCG--------TGT--
gi|4 : GTTTACG-TTTATTTCATCACTAA---TTTC---CTC----AT--AAAACCCATTAATATATTT-CATT---ACGA--A---ACGGAAAGTAAAGGATAGGATATTATGT---T--------A---------TA------TA-GT-C-TT----------T---AATCGGGT---G-----T-G--
gi|4 : tT-----TAAT--CGGG-TG------TGTATGAAGGTAA----C--TGTACT--ATTCATC-------T--GTTC---AA-TTTTA-CTTTA-A-CAACCATTT-A---T------GGACTATT-C---TGATATGAATTC-CTGGATT--TTGGTC-A-TTTAG--AAAGAGCC--AGCAAAC-TTACAT----------TTTGGAGAATA---A---TAAATCTTCTGGCAAAACAAA-TGTGC-T---------------------------TTT-------AACA--T-----GTA----GTGG-TCA---TCCA-TC---CATTTTGCTC-AAGTTT----CCTCT------------------TATACTGTCCAATAC-ACTCTCC----tatgaaggtaactgtactattcatctgttcaattttactttaacaaccatttatggactattctgatatgaattcctggattttggtcatttagaaagagccagcaaacttacattttggagaataataaatcttctggcaaaacaaatgtgcttttaacatgtagtggtcatccatccattttgctcaagtttcctcttatactgtccaatacactctccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcactgtcttccttagacgtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccaaacacctgagtcctacgctgccac
gi|4 : tgtttacgtttatttcatcactaatttcctcataaaacccattaatatatttcattacgaaacggaaagtaaaggataggatattatgttatatagtctCCAAACACCTGAGTC-CTACGCT-GCC-ACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcactgtcttccttagacgtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccaaacacctgagtcctacgctgccac
gi|40 : tgtttacgtttatttcatcactaatttcctcataaaacccattaatatatttcattacgaaacggaaagtaaaggataggatattatgttatatagtctttaatcgggtgtgtatgaaggtaactgtactattcatctgttcaattttactttaacaaccatttatggactattctgatatgaattcctggattttggtcatttagaaagagccagcaaacttacattttggagaataataaatcttctggcaaaacaaatgtgcttttaacatgtagtggtcatccatccattttgctcaagtttcctcttatactgtccaatacactctccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcactgtcttccttagacgtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaAAATAAAGGACAGGATATCATGTA--T--------A---------TA------TA-GT-C-TT----------T---AATCGGGT---GT----T-GT-GT--A--CC----GTC-CG----A--T----A------CG-T-----------CCCT----GAGCAA--TGGCG--GTCA-------------TG-TTCTGATTTC
gi|41 : GGTTTACA-TTCATATCATCAATCA---T------TTCCTT-AT--AGGATTTATTAATACATTT-TATT---AAGA--A---ACGGAAAATAAAGGACATGTTATCATAT---
gi|42 : TGGCC-A-TTCAATGAAAGAACC--AACGAAA-TTGAATATA---GTT-TTT-TAGAATG---A---TAAAACTCCTG-----ATAAA-TATGC-Tc
gi|43 : TGGTTTACA-TTAATTCCAACACTCA---TTTC---CTC----AT--AAA
gi|44 : aTGGTTTACA-TTTATTTCATCACTCA---TTATTTCCTT----AT--AAAACTggatgaagtgcagtctccatacatgta
gi|45 : ttaTGGTTTACA-TTTATTTCATCACTCACTTT------CTC----AT--AAAACTC
gi|46 : aCCAAACACCAGAGTCACTACGCTGGCCAACCAAAt
gi|47 : GCCAAACACCAGAGTCACTACGCT-GCCAACCAAtt
gi|48 : GCCAAACACCAGAATCACTACGCT-GCC-ACCAAAtt
gi|5 : cTACA-TATATTTTATCAT--A---T------TTC----CTTAAAAAATCATTAATATATTT-CATT---AAGA--A---ACGG
gi|5 : aATCAT-T---A--------A---------TA------TA-TTTC-AT----------TAAGAAACGG-C---G-----TTGT-GT--A--CC----GTAACAGGTGA--G----A------CGATA----------CTCTTGAGGAGCAAGGTGGCGAGGCCG--------TGT--T----CTGATTTCCTG-AT-----TAATCGCGGC-TGCGTTCATATA--ACAGTAA----CCTTGGATCGAATTTGTCACTGGGTT--TTTCATGAA-TCCGACCTTTT-A-TAACCAATT-AGTGTAT----GCATCTTTGCATATGATATCAACT----GGCTTAGTTGGTC-A-TTCAGTGAAATGACCCAAGAAAACATTACATCAA---ATTCCCTTGAGAATA---A---ATAGCCTTCTG-----ATAAATTTTGC-TAATTATGGT----------------AACGT-------GTCG--T-----GTA----GCGGTTCATTGTCCATTT---CAGATTGCGT-AAGTTTATACCCTCT------------------TATACTCCGCGCTAC-Acgttgtgtaccgtaacaggtgagacgatactcttgaggagcaaggtggcgaggccgtgttctgatttcctgattaatcgcggctgcgttcatataacagtaaccttggatcgaatttgtcactgggtttttcatgaatccgaccttttataaccaattagtgtatgcatctttgcatatgatatcaactggcttagttggtcattcagtgaaatgacccaagaaaacattacatcaaattcccttgagaataaatagccttctgataaattttgctaattatggtaacgtgtcgtgtagcggttcattgtccatttcagattgcgtaagtttataccctcttatactccgcgctacaat
gi|50 : atacatatattttatcatatttccttaaaaaCCAAA-ACCAGAGTCACTACGCT-GCC-ACCAAat
gi|51 : CCAAACACCAGAGTCACTAACCT-GTC-ACCAAAttt
gi|52 : CCAAACACCAGAGTCACTACGCT-GCC-ACCAAt
gi|53 : CCAAACACCAGAGTCACTGCGCT-GCC-ACCAAt
gi|54 : CCAATCACCAGAGTCACTACGCT-GCC-ACCAAt
gi|55 : CCAAACACCAGAGTCACTACGCT-GCC-ACCAAt
gi|6 : -------T--TTTC---AA-TTTTA-CTTTT-A-AAACCATT-------AT----GAGCCCTT-G---TTATATGAATTT-CGGTGTT--TTAGTC-A-TTCAGTGAAAGAATC--AGCCGAC-CAGCATAAA---TTT-TTGGGAGAATA---A---CAACACTTCTG-----ATAAA-TGTGC----------T----------------AATGT-------AACG--T-----GTA----GCGA-TCA---TTCA-TC---TAGGTTGCTC-AACTTT----CCTCT------------------GATACTGCCCGCTATAACTCTTC----
gi|7 : -TTTTA-CTTTTTA-AAACCATTT-A---T------GAACCATT-C---TGATATAAATTT-CGGGCTT--TGGGTC-A-TTCAGTGATTGAACC--AGCAAAC-TTACAAAAAG--A-----TGGAGAATA---GCCCTAAACGCTCTG-----ATAAA-TGTGC--A------------------------AATGT-------A------------TA----GCGG-TTA---TCCA-TC---CAGGTTGCTC-AAATTT----CCTCT------------------TATACTGCCCGCTAC-ACTTTTC----gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccactgtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngccaaacaccagtcacctagctgctacc
gi|7 : CCAAACACCAGAGTCACTAAGCT-GGC-ACCAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccactgtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntccaaacaccagagtcactaagctggcaccaa
gi|8 : ttttactttttaaaaccatttatgaaccattctgatataaatttcgggctttgggtcattcagtgattgaaccagcaaacttacaaaaagatggagaatagccctaaacgctctgataaatgtgcaaatgtatagcggttatccatccaggttgctcaaatttcctcttatactgcccgctacacttttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccactgtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntTATC--ATTTATC-------T--TT-C---AG-TTTTA-CCTTT-A-AAACCATT-------AT----GAACCATT-C---TGATTTGAATTC-CCGGGTT--TTGGTC-A-CTCAGTGAAA---------------------AAA---ATTGTTTGGAGAATA---A---TAAACCTTCTG-----ATAAA-TGTGC-TA-------------------------ATGT-------AACG--T-----GTACATAACGG-TCA---TCCA-TC---CAGGTTGCTC-AAGTTT----CCTCT------------------TATACTGTCCGCCAC-ACTTTCC----CCCGCACAGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCACTGTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCCAAACACCAGAGTCACTAAGCT-GCC-ACCAAA
gi|9 : gtTGGTTTACA-TTTATTACATCACTCA---TTTC---CTC----AT--AAAACTCATTAATATATTT-CATT---AAGA--ATTAACGGAAAGTAAAGGACAAGATATCATGT---T--------A---------AA------TA-GT--------------------------------------------------------A-CA----A--T----A------CG-T-----------CCCT----GAGCAA--TGGCG--GTCG--------AGT--TG-CTCTGATTTCCTG-ATCACGTTAAT--CGGC-TG------TATA--ACGGTAA----C--TGTACC--ATTTATC-------T--TTTT---AAATTTTA-CTTTT-A-A---CATTT-A---T------GGATCATT-C---TGATAAGAATTC-TGGGGCT--TTGGCC-A-TTCAGTGAAAGAACC--AGCAAAA-TTACATAAA---ATT-TTTGGAGAATA---A---TAAACATTCTG-----ATAAA-TGTGC----------T----------------AATGA-------AACC--T-----GTA----GCAG-CCA---CCCA-TC---CACGTTGCTT-AAATTT----CCTCTAAGGC-------------TA-ATTGTCCGCTAC-ACTT
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|35 ): TGTAGGGTTATGGCTACTTTATTTTGGGCTTTGTGGTATATAACGAGTTTTGTGCACTTTTCTAACATCGGAATGAGAGAGGCAGTCATCTAACCTTAAACTTGTCATTCAGTG
Unaligned ( gi|37 ): TTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAACCACTGTC
Unaligned ( gi|39 ): TTGTCTCGCGGCGTTGAGTTTTGGCTACTTTATTTTGAGCTTAGTGATGTTTCTCGAGTTTGGTGCATTTTCCTAGAAACCACTCATTTAACCTTAAA
Unaligned ( gi|49 ): GTATAAAGCGTATATTTCATAAGTTTTGAACGTG
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 222222 11111 1111111111111111111111 111111 3333333333333333 11 3333333333333 5555555555555555555555555555 222222222222222222 1111 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 2 333 777777 44444 44 5 1 333 22 333 0000000000000000000000 000000 1 1 1 6666666666666666 333 66666 5 33 44 44 3333 1 3333 22 3333 999999 1 99999999999 3333 555 22 999999999 22 3 1 44444 22 1 777777 22 4444 22 22 7777777 33 333 2 2 2 22 2222222222222 2 333 2 0 33 2 2 55 99 1 6666666 333 333 55555 2 5555555555555555555555555555 7777777 33 55555 4444 2 333 2 333 4444 111111111111111111 2 9999 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 2 4
lowQualScore : . ... ...... ..... .. . . ... .. ... ...................... ...... . . . ................ ... ..... . .. .. .. .... . .... .. .... ...... . ........... .... ... .. ......... .. . . ..... .. . ...... .. .... .. .. ....... .. ... . . . .. ............. . ... . . .. . . .. .. . ....... ... ... ..... . ............................ ....... .. ..... .... . ... . ... .... .................. . .... ................................................................ ................................................................................... . .
lowQualScore : 0 222 555555 55555 88 0 8 222 55 222 0000000000000000000000 000000 7 7 7 0000000000000000 000 11111 2 55 66 66 5555 7 5555 22 4444 222222 6 66666666666 5555 444 22 333333333 22 3 8 33333 55 8 777777 55 2222 88 99 2222222 11 999 1 1 1 44 9999999999999 0 555 1 1 22 0 0 88 33 6 9999999 555 555 66666 2 1111111111111111111111111111 2222222 11 66666 7777 2 999 2 999 5555 999999999999999999 5 5555 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0 0
consensus : TGGTTTACA-TTTATTTCATCACTCA---T------CTC----AT--AAAACTCATTAATATATTT-CATT---AAGA--A---ACGGAAAATAAAGGACAGGATATCATGT---T--------A---------TA------TA-GT-C-TT----------TAA-AATCGGGC---G-----T-G--GT--A--CC----GTA-CA----A--T----A------CG-T-----------CCCT----GAGCAA--CGGCG--GCCG--------TGT--TG-TTCTGATTTCCCG-AT-----TAAT--CGGC-TG------TATA--ACGGTAG----C--TGTACC--ATTTATC-------T--TTTC---AA-TTTTA-CTTTT-A-AAACCATTT-A---TAT----GAACCATT-C---TGATATGAATTC-CGGGGTT--TTGGTC-A-TTCAGTGAAAGAACC--AGCAAAC-CTGCATAAA---ATT-TTTGGAGAATA---A---TAAACCTTCTG-----ATAAA-TGTGC-TA-------T----------------AATGT-------AACG--T-----GTA----GCGG-TCA---TCCA-TC---CAGGTTGCTCAAGTTT----CCTCT------------------TATACTGTCCGCTAC-ACTTTTC----CCCGCACAGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACCACTGTCT----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNANNGCCAAACACCAGAGTCACTACGCT-GCC-ACCAAA
Reference ( family-593 ) : TGGTTTACA-TTTATTTCATCACTCA---T------CTC----AT--AAAACTCATTAATATATTT-CATT---AAGA--A---ACGGAAAATAAAGGACAGGATATCATGT---T--------A---------TA------TA-GT-C-TT----------TAA-AATCGGGC---G-----T-G--GT--A--CC----GTA-CA----A--T----A------CG-T-----------CCCT----GAGCAA--CGGCG--GCCG--------TGT--TG-TTCTGATTTCCCG-AT-----TAAT--CGGC-TG------TATA--ACGGTAG----C--TGTACC--ATTTATC-------T--TTTC---AA-TTTTA-CTTTT-A-AAACCATTT-A---TAT----GAACCATT-C---TGATATGAATTC-CGGGGTT--TTGGTC-A-TTCAGTGAAAGAACC--AGCAAAC-CTGCATAAA---ATT-TTTGGAGAATA---A---TAAACCTTCTG-----ATAAA-TGTGC-TA-------T----------------AATGT-------AACG--T-----GTA----GCGG-TCA---TCCA-TC---CAGGTTGCTCAAGTTT----CCTCT------------------TATACTGTCCGCTAC-ACTTTTC----CCCGCACAGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACCACTGTCT----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNANNGCCAAACACCAGAGTCACTACGCT-GCC-ACCAAA
gi|1 : GGTTTACA-CTCATTTC------------------CCC----AT--AAAACTCATCAATACATTT-CATT---ACGA--A---ACGGAACATAAAGGACAGGATATTATGG---TACATATGCA---------TG------TA-GT-C-TT----------T---AATCAGGC---G-----T-G--GT--A--CC----GTA-CC----A--T----A------CG-T-----------CCCT----GCGCAA--TGGCG--GTTG--------TGT--TG-TTCT
gi|1 : T--A--CC----GTA-CC----A--T----A------CG-T-----------CCCT----GCGCAA--TGGCG---TTG--------TGT--TGATTCTGATTTCC-G-AT-----TAA-----------------ATA--GCGGTAA----C--TGTGCC--ATTTATC-------T--TTTC---AA-TTTTT-CTTTT-A-TTACCATTT-A---T------GAACTATT-C---TGATATGAATTC-TGGGGTT--TTGGTC-A-TTCAATGAAAGAAAC--AGCAAAG-GTATGTAAA---AAT-TCTGGAGAATA---A---TAAACATTCTG-----ATAAA-TAAGC----------T----------------AATGT-------AACG--T-----ATA----CCAG-TCA---TCCA-TC---CAGGTTGCTCAAGTTT----CCTTT------------------TATACTGTaccgtaccatacgtccctgcgcaatggcgttgtgttgattctgatttccgattaaatagcggtaactgtgccatttatcttttcaatttttcttttattaccatttatgaactattctgatatgaattctggggttttggtcattcaatgaaagaaacagcaaaggtatgtaaaaattctggagaataataaacattctgataaataagctaatgtaacgtataccagtcatccatccaggttgctcaagtttccttttatactgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntccactgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngccaaacaccagagtcactacgctgccaccaaa
gi|1 : ggtttacactcatttccccataaaactcatcaatacatttcattacgaaacggaacataaaggacaggatattatggtacatatgcatgtagtctttaatcaggcgtggtaccgtaccatacgtccctgcgcaatggcggttgtgttgttcGCCAAACACCAGAGTCACTACGCT-GCC-ACCAAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntccactgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngccaaacaccagagtcactacgctgccaccaaa
gi|10 : ggtttacactcatttccccataaaactcatcaatacatttcattacgaaacggaacataaaggacaggatattatggtacatatgcatgtagtctttaatcaggcgtggtaccgtaccatacgtccctgcgcaatggcggttgtgttgttctaccgtaccatacgtccctgcgcaatggcgttgtgttgattctgatttccgattaaatagcggtaactgtgccatttatcttttcaatttttcttttattaccatttatgaactattctgatatgaattctggggttttggtcattcaatgaaagaaacagcaaaggtatgtaaaaattctggagaataataaacattctgataaataagctaatgtaacgtataccagtcatccatccaggttgctcaagtttccttttatactgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntccactgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-AGACCATCT-A---TCTTTCTAAATCATT-C---TGATATAAATTC-CGGGATT--TTGGTC-A-TTCAGTGAAAGAACC--AGCAAAC-CTGCATACA---ATT-TTTGAAGAATAATTA---TAAAACTTCTG-----GTAAA-TGTGC----------T----------------AANNN-------NNNN--N-----NNN----NNNN-NNN---NNNN-NN---NNNNNNNNNCAAGTTT------GCT------------------TATACTGTCCATTAC-ACTTTTC----
gi|10 : GCCAAACATCAGAGTCATTAAGCT-GCC-ACCAAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngccaaacatcagagtcattaagctgccaccaaa
gi|11 : agaccatctatctttctaaatcattctgatataaattccgggattttggtcattcagtgaaagaaccagcaaacctgcatacaatttttgaagaataattataaaacttctggtaaatgtgctaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaagtttgcttatactgtccattacacttttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTT-C---TGATGTGAATTC-CAGAGTT--TTGGTC-A-TTCAGTGAAAGAACC--AGCAAAC-ATACATAAA---ATT-TTTGGAGAATA---A---AAAAC---CTA-----ATAAA-TGTGC----------T----------------AATGT-------AACG--T-----GCA----GCGG-TCA---TCCA-TC---CAGGTTGTTTAACTTT----CCTCT------------------AATACTGTCCGTTAC-ACTT
gi|11 : CCAAACATTAGAGTCAGTACGCT-GCC-ACCAAccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccattgtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccaaacattagagtcagtacgctgccaccaa
gi|12 : ttctgatgtgaattccagagttttggtcattcagtgaaagaaccagcaaacatacataaaatttttggagaataaaaaacctaataaatgtgctaatgtaacgtgcagcggtcatccatccaggttgtttaactttcctctaatactgtccgttacacttccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccattgtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaTTACA-GTTATTTCATCACCCA---TTTC---CTC----AT--AAAGTTCATTAAT----TT-CATTTAAAAAA--A---ACGAAAAA-AAAGGACAAGATATCATAT---T--------A---------TA------TA-GT-C-TT----------TAA---TCTGGT---G-----T-G--GT--A--CC----ATA-CA----A--A----A------CG-T-----------TCCT----GAGCAA--CGGCG--GCCG--------TGT--T----------------------------------TG------TATA--ACGGTAG----T--TGTACC--ATTTTTC-------T--TTTC---AA-TTTTA-CTTTT-A-AA----------------------CCATT-T---T--TATGAATTC-CGGGGTT--TTGGTC-A-TTCATTGAAAGAACC--AGCAAAC-GTGAATAGA---ATT-TTTAAAGAATA---A---TTAAATTTCTG-----ATA-----------------------------------AATGT-------AAGA--T-----GTA----ATGG-TCT---TCAA-TCCAGCAGGTTGCTCAATTTT----CGTAT------------------TATACTGTCCGTT
gi|13 : AAA---ATT-TTTGGAGAATA---A---TTAAACTTCTG-----ATAAA-TGTAC-TA-------------------------ATGT-------AACG--T-------A----GCGG-TCA---TCCA-TC---CAGGTTACTCAAAATT----CCTCTTATATATAAAATGGCATATATACTGTCCGCTAC--TTTTTT----CNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCACTGTCT-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCCAAACACCAGAGTCACTACGCT-GCC-ACCAgact
gi|14 : gtgattcattatttgaataatgTTTACAGTTTATTTAATCA-TCA---T------TTCCTCCATTAAAAATTCATTATTATATTTTCATT---AAGA--A---ACGAAAGATAAAGCACAGGAT-TCATAT---T--------A---------TA-------A-GT-C-TT----------T---AATCGGGC---G-----T-G--GT--AATCT----ATA-CA----A--T----A------CG-T-----------CTCT----GAGCAA--CGGCG--G--G--------CGG--TG-TTCTGATTTCCCG-AT-----T-AT--CGGCTTG------TGTA--ACGGT-G----C--TG-------------------------TT---GA-GTCTA-CCTTT-A-AAACCAT-------TAT----TAACCATT-C---TGATATGAATTCTTGCGGTT--T--GTC-ATTTCAGTGAAAGGGCCAAAGCAAACGCCGCATGAA---G---TTTGAAGAACA---A---TAAACCTTC
gi|15 : tTTCTTTCATCACTCA---TTTC---CTC----AT--AAAACTC-------TATTT-CATT---AAGA--A---ACGGAAAATAAAGGA-----TATCATGT---T--------A---------TA-------A------------------TAT-ATTCGGGC---AGGTACT-A--GT--A--CCTACTGTA-AA----A--T----T------CA-T-----------CCCT----GAGCAA--TGGCG--GTCC--------CGT--TG-TTC-------CCG-AT-----TAAT--CGGC-TG------TATA--ACATAAA----C--TGTACT--ATTTATC-------T--TTTT---AA-TTTTG-ATTTT-A-TAACCATT------TAT----GAATCATT-C---TGATATAAATTC-C-GGGTT--TTGGTC-A-TTCAGTGAAAGAACC--AGCAAAC-----------------TTTGGTGAATA---A---TAAAC
gi|16 : aTGGTC-A-TTCAGTGAAAGAAatat
gi|16 : caccgaaatgagagaaccagtcaactaactaaccgtaaacAAGTTT----CCTCT------------------TATACTGTCCGCTAC-ACCCCCCCT--CCCGCgtttcctcttatactgtccgctacaccccccctcccgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacttgtgtcgtccaaggacgagaccacgcccatacatgaccacaaagtccaaggtttcccgccaaacaccagagtaactatgctgccaccaaa
gi|16 : caccgaaatgagagaaccagtcaactaactaaccgtaaactggtcattcagtgaaagGCCAAACACCAGAGTAACTATGCT-GCC-ACCAAAtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacttgtgtcgtccaaggacgagaccacgcccatacatgaccacaaagtccaaggtttcccgccaaacaccagagtaactatgctgccaccaaa
gi|17 : caccgaaatgagagaaccagtcaactaactaaccgtaaactggtcattcagtgaaagaagtttcctcttatactgtccgctacaccccccctcccgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacttgtgtcgtccaaggacgagaccacgcccatacatgaccacaaagtccaaggtttccc-------AATG--T-----GTA----GCGG-TCA---TCCA-TC---CAGGTTGATCAAGTAT----CCTCT------------------TATACTGTCCACTAC-ACTTTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCACTGTCT----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA---CCAAACACC--AGTCGCTATGAT-GCC-ACCAA
gi|18 : aacaAGCAA--CAGTG--GCCG--------TGT--TG-TTCTGATTTCCCG-AT-----TAAT--GGGC-TG------TATA--ACGGTAG----C--TGTACC--ATATATC-------T--TTTC---AT-TTTTA-CTTTT-A-AAACCATT------TAT----GAGTCAAT-C---TAATATACATTC-CGGGGTT--ATGGTC-A-TTCAGTGAAAGAACC--AGCAAAC-CTGGATATA---TTT-TATGGAGGACA---A---TAAACCTTTTG-----ATATA-TGT---------------------------------------------------------------G-TCA---TCTA-TC---CAGGTTGCTAAAATTT----CCTCT------------------TGTACTGTCCGCTGC-ACTTT
gi|19 : TTACA-TTCATTTTATCCCT--------------------T--AATTCTCATTGATATATTC-CATA---AAGAGAA---ATCGAAAGTAAAGGAC--GTTATCATATA--G--------A---------CA------TA-TT-C-TT----------TAA---TCCGGC---G-----T-TATGT--A--CC----GTA-CA----A--T----A------CG-C-----------CCCT----GAGCAA--TGGCG--GATG--------TGT--TA-TTCTGGTTTCCTG-TT-----TAAG--CGGC-TG------TATA--GCGGTAA----C--TGTACC--GATTATC-------T--TTTC---AA-TTTTA-CTTTT-C-TCACCATT------TAT----GATCCATT-C---TGATATCAATT
gi|2 : TGGTTTACA-TTTATTTCCTCACTCA---T------CTC----AT--AGAATTCATTAATATATTT-CATT---AAGA--A---ACGGAAACTAAAGGACAGCAAATCATGT---T--------A---------TA------TA-GT-CATTTAAAAATATATAA-AATCGGGT---G-----T-G--GT--A--CC----GTA-CA----A--T----A------CA-T-----------CCCT----GAGCAA--CAGTG--GCCA--------TGT--TG-TTCTGATTTCCCG-AT-----TAAT--TGGC-TA------TATA--ACAGTAG----C--TGTACC--CTATATA-------T--TTTC---AG-TTGTA-CTTTT-A-AAACCATTTAA---TAT----GAACCATT-C---TGATATGAATTC-CAGAGTT--TTGGTC-A-ATCAGTGAAAGAACC--AGCAAAC-CTGCATAAA---AGT-TTTGGAGAATA---A---TAAAACTTCTG-----ATAAA-TGTGC-TAAT-----T----------------AATGT-------AATG--T-----GTA----GTGG-TCA---TCCA-TC---CAGGTTGCAAATGTTT----CCTCT------------------TATACTGTCCACTAC-ACTTTTCNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACCACTGTCT----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCCAAACACCAGAGTCACTAAGCT-GCC-ACCAAA
gi|20 : GTTTACA-TTTATTTAATCACTCA---T------TTC----CT--CGA--TCATTAACATATTT-CATT---AAGA--A---ACGGAACATAAAGGACAGTCTCACATGT---T--------A---------TATACACGTA-GT-C-TT----------T---AATTGGGC---G-----T-GGTGT--A--CC----GTA-CA----ATTT----A------TA-T------------------------A--CGTCA--GCCG--------TGT--TG-TTCTGATTTCCCA-CT-----TCAT--AGGC-TG------TATA--GCGGTAAAGTTC--TGTACC---------------------------A-TTTTA-CTTT--------------------T----GAACCATT-C---TGATATAAATTC-CG
gi|21 : GGTTTACA-TTTATTTCATCACTTA---TTTC---CTC----AT--AAA-CTCATTGATATATTT-CTTT---TAG---------------TAAAGGACAGGATCTCAAGT---T--------A---------TA------TA-GT-C-TT------------A-AATCGGGC---G-----A-G--AT--A--CC----GTA-CA----A--T----A------CA-TGTACATGCAAGTCCT----GAGCAA--TGGCA--GC---------------TG-TTCTGATTTCCTG-AT-----TAAT--CGG------------TA--ACA------------------------------------TTTT---AA-TTTCA-CTTTT-ATAACCCATTT-A---T---------CCATT-C---TGATATGAATCC-CGGGG
gi|22 : TGATTTCCCA-AT-----TAAT--CATT-TG------TATA--ACGGTTG----C--TGTACC--ATT-ATC-------T--TTTC---AA-TTGTA-CCTAT-A-AAACCATTT-A---T------GAACAATT-C---TGATATGAATTC-AGAG--T--TTGATC-A-TTCAGTTAAAGAACC--AGCAAAC-CTGTATA-------T-TTTGGAGAAAA---A---TAAAACCTCTG-----ATAAA-AGTGC-TA-------------------------ATGT-------AATA--T-----GTA----ACGG-TCA---TCCA-TC---CATGTTGCTCAACTTT----CCT
gi|23 : GTTTACG-TTTATTTCATCATTCA---T------CTCCCC-AT--TAACCTGATTAGTACATTT-CATT---AAGA--A---AC--AAAATGAAGGACAAAGTAT-ATGT---T--------A---------CA------TA-AT-C-TT----------TAT---TCGGTT---G-----T-A--GT--GTTCC----GTA-CA----A--T----A------CG-T-----------CCTT----GAGCAA--TGGTG--ATAG-------------TG-TTTTGATTTCCCG-AT-----CATT--CGGC-CA------TATA--AC-GTAG----C--TAT
gi|24 : TTACA-TTTATTTCAGCACTCA---T------TTCTTC-AT--AAAACTCATTAATATATTT-CATG---AAGA--G---ACTGAAAATAAAGGACAGGATATCATGTATAT--------A---------TACCCTGGTA-GT-C-TT----------TAA---TCGGGT---G-----TTGT-GT--A--AC----GTA-CG----A--T----A------CG-T-----------CCCT----GAGCAA--TGGCG--GTCA--------TGT--TG-TTCTGATTTCCCG-GT-----TAAT--CAGC-TG------TATA--ATGGTAG----C--TGTACC--ATTttctgctacacatttccccgttccggga
gi|25 : gtttgCATTAATATATTT-CATT---AAGA--A---ACGGGAAATAAAGGGCAGGATATCATGT---T--------ACAGTGTGTATA------TA-TT-C-TT----------TCA---TCGGGC---G-----TTGT-GT--A--CC----GTA-CA----A--T----A------CA-C-----------CCCC----AAACAA--TGACG--GTCG--------TGT--TG-TTCCGATTTCCCG-AT-----TTAT--CGGT-TG------TATA--ACGGTAA----C--TGTACC--ATTTATc
gi|26 : --GT--A--CC----GTA-CA----A--T----A------CG-T-----------CCCT----G---------GCG---CCG--------TGT--TGGTTCTGATT--------------AAT--CAGC-TG------TATA--ACGGTAG----C--TGTGCC--ATTTATC-------T--TTTC---AA-TTTTA-CTTTT-A-AGACCA-TT-A---T-------AACCATT-C---TGAGATAAATTC-CAGGGTT--TTGTTCAA-TTCAGTG---GGGTC----CAA----TGCAT--A---ATT-TT
gi|27 : gtgtgttgtTTCTTTCATCACTCA---T------TTC------------CTCATAAATATATTT-CATT---AAGA--A---ACGGAAAATAAACGACAGGATATCATGT---T--------A---------TG------TA-GT-C-TT----------TAA---TCGGGC---T-----T-G--GT--A--CC----ATA-CA----A--T----A------CG-T-----------CCCC----GAGCAA--TGGCA--GCCA--------TGT--TG-TTATGATTTCCTG-AG-----TAAT--CGGC-TG------TATA--TCGG
gi|28 : TC----AT--AATATTCATTAATATACAT-CATC---AAGA--A---CCAGAAAGGAAAGGACATGATATCATAT---T--------A---------TA------TACGT-T-TT--------------AGTCGGGT---G-----T-G--GA--A--CC----ATA-CA----A--C----A------CG-T-----------TCCT----GAGCAA--TGGCG--GCCG--------TGT--TG-TTATGATTTTGCG-AT-----TAAT--TGGC-TC------TACA--ACGGTAG----A--TGTACa
gi|29 : GGTTTATA-TTTATTTCATCACTCA---T------TTC------------CTCAT--------------------AA--A---ACAGGAACTCATGGTCAGTATA-CATGT-----------------------A------TT-GT-C-TT----------TAA---TCGGGC---G-----T-G--GTGTA--CC----GTA-CA----A--T----ATATGTACG-T-----------CCCT----GAACAA--TGGCG--ACCGACCG----TGT--TG-TTCTGATTTCCCG-AT-----T
gi|3 : TTTACA-TTTAATTCACTACTGA---TTTC---CTC----AT--GAA-CTCATTAATATTTTT-CTTT---AAGA--A---ACGAAAAATAAAGGACAGGATATCATGT---T--------A---------TA------TA-GT-C-TT----------TAA---TCGGGC---G-----T-G--GT--A--CG----GTA-CA----A--T----A------CT-T-----------CCTT----AGGGAC--TGATG--GCCG--------TGT--TG-TGTTGATTTCCCG-AT-----TAAT--CGGC-TAGA----TATA--ACGGTAA----C--CGTACC--ATTTGTC-------T--TTTC---AG-TTTTA-CTTTT-G-TACCCATCT-A---T------GCACCATT-C---TTATTTGAATTC-TGGG-TT--TTGGTC-A-TTCATTGAAAGAACC--AGCAAAC-TTGGATAAT---TAT-TTTGGAGAATA---A---TAAACCTTCTG-----ATAAA-TTTGC----------T----------------AATGT-------AATATTT-----GTA----GCAG-TCA---TCCA-TC---CAGATTGCTCGAGTTT----CCTCT------------------CATAATGTCTGCTAC-ACTTCTC----CC
gi|3 : CAAACACCAGAGTCACTACACT-GCC-ACCAAAagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacgactgtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacaaacaccagagtcactacactgccaccaaa
gi|30 : tttacatttaattcactactgatttcctcatgaactcattaatatttttctttaagaaacgaaaaataaaggacaggatatcatgttatatagtctttaatcgggcgtggtacggtacaatacttccttagggactgatggccgtgttgtgttgatttcccgattaatcggctagatataacggtaaccgtaccatttgtcttttcagttttacttttgtacccatctatgcaccattcttatttgaattctgggttttggtcattcattgaaagaaccagcaaacttggataattattttggagaataataaaccttctgataaatttgctaatgtaatatttgtagcagtcatccatccagattgctcgagtttcctctcataatgtctgctacacttctcccagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacgactgtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaTGGTC-A-TTCAGTGAAAGAACC--AGCAAAC-TTGCATAATTTTATT-TTTTGAGAATA---A---TAAACCTTCTG-----ATAAA-TGTGT-CA-------T------------------TGT-------TCTG--T-----GTA----GCGG-TCA---CCCA-TC---CAGGTTGCTCAAGTTT----CCTTT------------------TATACTATTCACTAC-ACTT
gi|31 : GGTTTATA-TTTATT-CATCACTCA---T------TTC------------CTCAT--------------------AA--A---ACAGGAACTCATGGTCAGTATA-CATGT-----------------------A------TT-GT-C-TT----------TAA---TCGGGC---G-----T-G--GTGTA--TC----GTA-CA----A--T----ATATGTACG-C-----------CCCT----GAACAA--TGGCG--ACCG--------TGT--TG-TTCTGATTTCCC
gi|32 : T-TTTGGAGAATA---A---TGAACCTTCTG-----ATAAA-TGTGCTTA-------TTTGAATTGACGAATTCAACATTGCATTAAACG--TAATGTGTA----ACGG-TCA---TCCA-TC---CAAGTTGTTCAAGTTT----CCTCT------------------TATACTGTCCGCTAT-AC
gi|33 : gGGTTCACA-TTTATTTCACCACTCA---T------GTT----TT------TTCATAAATATATTT-CATT---TAGG--A---ACAAAATGTAAAGGACAGTATCTCATGA---T--------A---------TA------TG-AT-T-T---------------AATCTGGC---G-----T-GGTGT--A--CC----GTA-CA----G--T----A------CG-cc
gi|34 : TAAAGGACAGCATATCATGT---T--------A---------TA------TA-GT-C-TT----------TAA---TCGGGC---G-----T-G--GT--A--CC----GTT-CA----A--T----A------CG-T-----------CCCT----GAGCAA--CGACG--GCCA-------------TA-TTCTGTTTTCCCA-AT-----TAAT--CGGT-TG------TACA--ACGGT
gi|36 : --T----A------CG-C-----------CCCT----GAAAAA--AAGAG--GACGGGATATCATGTGATG-TTCTGATTTCCCGGAT-----CAAT--CGGC-TG------TATA--ACGGTAG----C--TTTACC--ATGTATT-------TCATTTT---AA-TTTTA-CTTTT-A-
gi|38 : T-CATT---AAGA---------GAAAATAAAGGACAAAATTTCACAT---T--------A---------TA---------GT-C-TT----------TAA---TTGGGCCTTG-----T-G---T--A--CC----AAA-CA----A--TTAATA------CG-C-----------CCCT----GAGCAA--ATGTG--GCCG--------TGT--
gi|4 : GTTTACG-TTTATTTCATCACTAA---TTTC---CTC----AT--AAAACCCATTAATATATTT-CATT---ACGA--A---ACGGAAAGTAAAGGATAGGATATTATGT---T--------A---------TA------TA-GT-C-TT----------T---AATCGGGT---G-----T-G--
gi|4 : tT-----TAAT--CGGG-TG------TGTATGAAGGTAA----C--TGTACT--ATTCATC-------T--GTTC---AA-TTTTA-CTTTA-A-CAACCATTT-A---T------GGACTATT-C---TGATATGAATTC-CTGGATT--TTGGTC-A-TTTAG--AAAGAGCC--AGCAAAC-TTACAT----------TTTGGAGAATA---A---TAAATCTTCTGGCAAAACAAA-TGTGC-T---------------------------TTT-------AACA--T-----GTA----GTGG-TCA---TCCA-TC---CATTTTGCTCAAGTTT----CCTCT------------------TATACTGTCCAATAC-ACTCTCC----tatgaaggtaactgtactattcatctgttcaattttactttaacaaccatttatggactattctgatatgaattcctggattttggtcatttagaaagagccagcaaacttacattttggagaataataaatcttctggcaaaacaaatgtgcttttaacatgtagtggtcatccatccattttgctcaagtttcctcttatactgtccaatacactctccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcactgtcttccttagacgtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccaaacacctgagtcctacgctgccac
gi|4 : tgtttacgtttatttcatcactaatttcctcataaaacccattaatatatttcattacgaaacggaaagtaaaggataggatattatgttatatagtctCCAAACACCTGAGTC-CTACGCT-GCC-ACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcactgtcttccttagacgtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccaaacacctgagtcctacgctgccac
gi|40 : tgtttacgtttatttcatcactaatttcctcataaaacccattaatatatttcattacgaaacggaaagtaaaggataggatattatgttatatagtctttaatcgggtgtgtatgaaggtaactgtactattcatctgttcaattttactttaacaaccatttatggactattctgatatgaattcctggattttggtcatttagaaagagccagcaaacttacattttggagaataataaatcttctggcaaaacaaatgtgcttttaacatgtagtggtcatccatccattttgctcaagtttcctcttatactgtccaatacactctccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcactgtcttccttagacgtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaAAATAAAGGACAGGATATCATGTA--T--------A---------TA------TA-GT-C-TT----------T---AATCGGGT---GT----T-GT-GT--A--CC----GTC-CG----A--T----A------CG-T-----------CCCT----GAGCAA--TGGCG--GTCA-------------TG-TTCTGATTTC
gi|41 : GGTTTACA-TTCATATCATCAATCA---T------TTCCTT-AT--AGGATTTATTAATACATTT-TATT---AAGA--A---ACGGAAAATAAAGGACATGTTATCATAT---
gi|42 : TGGCC-A-TTCAATGAAAGAACC--AACGAAA-TTGAATATA---GTT-TTT-TAGAATG---A---TAAAACTCCTG-----ATAAA-TATGC-Tc
gi|43 : TGGTTTACA-TTAATTCCAACACTCA---TTTC---CTC----AT--AAA
gi|44 : aTGGTTTACA-TTTATTTCATCACTCA---TTATTTCCTT----AT--AAAACTggatgaagtgcagtctccatacatgta
gi|45 : ttaTGGTTTACA-TTTATTTCATCACTCACTTT------CTC----AT--AAAACTC
gi|46 : aCCAAACACCAGAGTCACTACGCTGGCCAACCAAAt
gi|47 : GCCAAACACCAGAGTCACTACGCT-GCCAACCAAtt
gi|48 : GCCAAACACCAGAATCACTACGCT-GCC-ACCAAAtt
gi|5 : cTACA-TATATTTTATCAT--A---T------TTC----CTTAAAAAATCATTAATATATTT-CATT---AAGA--A---ACGG
gi|5 : aATCAT-T---A--------A---------TA------TA-TTTC-AT----------TAAGAAACGG-C---G-----TTGT-GT--A--CC----GTAACAGGTGA--G----A------CGATA----------CTCTTGAGGAGCAAGGTGGCGAGGCCG--------TGT--T----CTGATTTCCTG-AT-----TAATCGCGGC-TGCGTTCATATA--ACAGTAA----CCTTGGATCGAATTTGTCACTGGGTT--TTTCATGAA-TCCGACCTTTT-A-TAACCAATT-AGTGTAT----GCATCTTTGCATATGATATCAACT----GGCTTAGTTGGTC-A-TTCAGTGAAATGACCCAAGAAAACATTACATCAA---ATTCCCTTGAGAATA---A---ATAGCCTTCTG-----ATAAATTTTGC-TAATTATGGT----------------AACGT-------GTCG--T-----GTA----GCGGTTCATTGTCCATTT---CAGATTGCGTAAGTTTATACCCTCT------------------TATACTCCGCGCTAC-Acgttgtgtaccgtaacaggtgagacgatactcttgaggagcaaggtggcgaggccgtgttctgatttcctgattaatcgcggctgcgttcatataacagtaaccttggatcgaatttgtcactgggtttttcatgaatccgaccttttataaccaattagtgtatgcatctttgcatatgatatcaactggcttagttggtcattcagtgaaatgacccaagaaaacattacatcaaattcccttgagaataaatagccttctgataaattttgctaattatggtaacgtgtcgtgtagcggttcattgtccatttcagattgcgtaagtttataccctcttatactccgcgctacaat
gi|50 : atacatatattttatcatatttccttaaaaaCCAAA-ACCAGAGTCACTACGCT-GCC-ACCAAat
gi|51 : CCAAACACCAGAGTCACTAACCT-GTC-ACCAAAttt
gi|52 : CCAAACACCAGAGTCACTACGCT-GCC-ACCAAt
gi|53 : CCAAACACCAGAGTCACTGCGCT-GCC-ACCAAt
gi|54 : CCAATCACCAGAGTCACTACGCT-GCC-ACCAAt
gi|55 : CCAAACACCAGAGTCACTACGCT-GCC-ACCAAt
gi|6 : -------T--TTTC---AA-TTTTA-CTTTT-A-AAACCATT-------AT----GAGCCCTT-G---TTATATGAATTT-CGGTGTT--TTAGTC-A-TTCAGTGAAAGAATC--AGCCGAC-CAGCATAAA---TTT-TTGGGAGAATA---A---CAACACTTCTG-----ATAAA-TGTGC----------T----------------AATGT-------AACG--T-----GTA----GCGA-TCA---TTCA-TC---TAGGTTGCTCAACTTT----CCTCT------------------GATACTGCCCGCTATAACTCTTC----
gi|7 : -TTTTA-CTTTTTA-AAACCATTT-A---T------GAACCATT-C---TGATATAAATTT-CGGGCTT--TGGGTC-A-TTCAGTGATTGAACC--AGCAAAC-TTACAAAAAG--AT-----GGAGAATA---GCCCTAAACGCTCTG-----ATAAA-TGTGC--A------------------------AATGT-------A------------TA----GCGG-TTA---TCCA-TC---CAGGTTGCTCAAATTT----CCTCT------------------TATACTGCCCGCTAC-ACTTTTC----gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccactgtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngccaaacaccagtcacctagctgctacc
gi|7 : CCAAACACCAGAGTCACTAAGCT-GGC-ACCAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccactgtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntccaaacaccagagtcactaagctggcaccaa
gi|8 : ttttactttttaaaaccatttatgaaccattctgatataaatttcgggctttgggtcattcagtgattgaaccagcaaacttacaaaaagatggagaatagccctaaacgctctgataaatgtgcaaatgtatagcggttatccatccaggttgctcaaatttcctcttatactgcccgctacacttttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccactgtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntTATC--ATTTATC-------T--TT-C---AG-TTTTA-CCTTT-A-AAACCATT-------AT----GAACCATT-C---TGATTTGAATTC-CCGGGTT--TTGGTC-A-CTCAGTGAAA---------------------AAA---ATTGTTTGGAGAATA---A---TAAACCTTCTG-----ATAAA-TGTGC-TA-------------------------ATGT-------AACG--T-----GTACATAACGG-TCA---TCCA-TC---CAGGTTGCTCAAGTTT----CCTCT------------------TATACTGTCCGCCAC-ACTTTCC----CCCGCACAGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCACTGTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCCAAACACCAGAGTCACTAAGCT-GCC-ACCAAA
gi|9 : gtTGGTTTACA-TTTATTACATCACTCA---TTTC---CTC----AT--AAAACTCATTAATATATTT-CATT---AAGA--ATTAACGGAAAGTAAAGGACAAGATATCATGT---T--------A---------AA------TA-GT--------------------------------------------------------A-CA----A--T----A------CG-T-----------CCCT----GAGCAA--TGGCG--GTCG--------AGT--TG-CTCTGATTTCCTG-ATCACGTTAAT--CGGC-TG------TATA--ACGGTAA----C--TGTACC--ATTTATC-------T--TTTT---AAATTTTA-CTTTT-A-A---CATTT-A---T------GGATCATT-C---TGATAAGAATTC-TGGGGCT--TTGGCC-A-TTCAGTGAAAGAACC--AGCAAAA-TTACATAAA---ATT-TTTGGAGAATA---A---TAAACATTCTG-----ATAAA-TGTGC----------T----------------AATGA-------AACC--T-----GTA----GCAG-CCA---CCCA-TC---CACGTTGCTTAAATTT----CCTCTAAGGC-------------TA-ATTGTCCGCTAC-ACTT
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|35 ): TGTAGGGTTATGGCTACTTTATTTTGGGCTTTGTGGTATATAACGAGTTTTGTGCACTTTTCTAACATCGGAATGAGAGAGGCAGTCATCTAACCTTAAACTTGTCATTCAGTG
Unaligned ( gi|37 ): TTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAACCACTGTC
Unaligned ( gi|39 ): TTGTCTCGCGGCGTTGAGTTTTGGCTACTTTATTTTGAGCTTAGTGATGTTTCTCGAGTTTGGTGCATTTTCCTAGAAACCACTCATTTAACCTTAAA
Unaligned ( gi|49 ): GTATAAAGCGTATATTTCATAAGTTTTGAACGTG
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 222222 11111 1111111111111111111111 111111 3333333333333333 11 3333333333333 5555555555555555555555555555 222222222222222222 1111 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 2 333 777777 44444 44 5 1 333 22 333 0000000000000000000000 000000 1 1 1 6666666666666666 333 66666 5 33 44 44 3333 1 3333 22 3333 999999 1 99999999999 3333 555 22 999999999 22 3 1 44444 22 1 777777 22 4444 22 22 7777777 33 333 2 2 2 22 2222222222222 2 333 2 0 33 2 2 55 99 1 6666666 333 333 55555 2 5555555555555555555555555555 7777777 33 55555 4444 2 333 2 333 4444 111111111111111111 2 9999 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 2 4
lowQualScore : . ... ...... ..... .. . . ... .. ... ...................... ...... . . . ................ ... ..... . .. .. .. .... . .... .. .... ...... . ........... .... ... .. ......... .. . . ..... .. . ...... .. .... .. .. ....... .. ... . . . .. ............. . ... . . .. . . .. .. . ....... ... ... ..... . ............................ ....... .. ..... .... . ... . ... .... .................. . .... ................................................................ ................................................................................... . .
lowQualScore : 0 222 555555 55555 88 0 8 222 55 222 0000000000000000000000 000000 7 7 7 0000000000000000 000 11111 2 55 66 66 5555 7 5555 22 4444 222222 6 66666666666 5555 444 22 333333333 22 3 8 33333 55 8 777777 55 2222 88 99 2222222 11 999 1 1 1 44 9999999999999 0 555 1 1 22 0 0 88 33 6 9999999 555 555 66666 2 1111111111111111111111111111 2222222 11 66666 7777 2 999 2 999 5555 999999999999999999 5 5555 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0 0
consensus : TGGTTTACA-TTTATTTCATCACTCA---T------CTC----AT--AAAACTCATTAATATATTT-CATT---AAGA--A---ACGGAAAATAAAGGACAGGATATCATGT---T--------A---------TA------TA-GT-C-TT----------TAA-AATCGGGC---G-----T-G--GT--A--CC----GTA-CA----A--T----A------CG-T-----------CCCT----GAGCAA--CGGCG--GCCG--------TGT--TG-TTCTGATTTCCCG-AT-----TAAT--CGGC-TG------TATA--ACGGTAG----C--TGTACC--ATTTATC-------T--TTTC---AA-TTTTA-CTTTT-A-AAACCATTT-A---TAT----GAACCATT-C---TGATATGAATTC-CGGGGTT--TTGGTC-A-TTCAGTGAAAGAACC--AGCAAAC-CTGCATAAA---ATT-TTTGGAGAATA---A---TAAACCTTCTG-----ATAAA-TGTGC-TA-------T----------------AATGT-------AACG--T-----GTA----GCGG-TCA---TCCA-TC---CAGGTTGCTCAAGTTT----CCTCT------------------TATACTGTCCGCTAC-ACTTTTC----CCCGCACAGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACCACTGTCT----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNANNGCCAAACACCAGAGTCACTACGCT-GCC-ACCAAA
Reference ( family-593 ) : TGGTTTACA-TTTATTTCATCACTCA---T------CTC----AT--AAAACTCATTAATATATTT-CATT---AAGA--A---ACGGAAAATAAAGGACAGGATATCATGT---T--------A---------TA------TA-GT-C-TT----------TAA-AATCGGGC---G-----T-G--GT--A--CC----GTA-CA----A--T----A------CG-T-----------CCCT----GAGCAA--CGGCG--GCCG--------TGT--TG-TTCTGATTTCCCG-AT-----TAAT--CGGC-TG------TATA--ACGGTAG----C--TGTACC--ATTTATC-------T--TTTC---AA-TTTTA-CTTTT-A-AAACCATTT-A---TAT----GAACCATT-C---TGATATGAATTC-CGGGGTT--TTGGTC-A-TTCAGTGAAAGAACC--AGCAAAC-CTGCATAAA---ATT-TTTGGAGAATA---A---TAAACCTTCTG-----ATAAA-TGTGC-TA-------T----------------AATGT-------AACG--T-----GTA----GCGG-TCA---TCCA-TC---CAGGTTGCTCAAGTTT----CCTCT------------------TATACTGTCCGCTAC-ACTTTTC----CCCGCACAGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACCACTGTCT----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNANNGCCAAACACCAGAGTCACTACGCT-GCC-ACCAAA
gi|1 : GGTTTACA-CTCATTTC------------------CCC----AT--AAAACTCATCAATACATTT-CATT---ACGA--A---ACGGAACATAAAGGACAGGATATTATGG---TACATATGCA---------TG------TA-GT-C-TT----------T---AATCAGGC---G-----T-G--GT--A--CC----GTA-CC----A--T----A------CG-T-----------CCCT----GCGCAA--TGGCG--GTTG--------TGT--TG-TTCT
gi|1 : T--A--CC----GTA-CC----A--T----A------CG-T-----------CCCT----GCGCAA--TGGCG---TTG--------TGT--TGATTCTGATTTCC-G-AT-----TAA-----------------ATA--GCGGTAA----C--TGTGCC--ATTTATC-------T--TTTC---AA-TTTTT-CTTTT-A-TTACCATTT-A---T------GAACTATT-C---TGATATGAATTC-TGGGGTT--TTGGTC-A-TTCAATGAAAGAAAC--AGCAAAG-GTATGTAAA---AAT-TCTGGAGAATA---A---TAAACATTCTG-----ATAAA-TAAGC----------T----------------AATGT-------AACG--T-----ATA----CCAG-TCA---TCCA-TC---CAGGTTGCTCAAGTTT----CCTTT------------------TATACTGTaccgtaccatacgtccctgcgcaatggcgttgtgttgattctgatttccgattaaatagcggtaactgtgccatttatcttttcaatttttcttttattaccatttatgaactattctgatatgaattctggggttttggtcattcaatgaaagaaacagcaaaggtatgtaaaaattctggagaataataaacattctgataaataagctaatgtaacgtataccagtcatccatccaggttgctcaagtttccttttatactgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntccactgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngccaaacaccagagtcactacgctgccaccaaa
gi|1 : ggtttacactcatttccccataaaactcatcaatacatttcattacgaaacggaacataaaggacaggatattatggtacatatgcatgtagtctttaatcaggcgtggtaccgtaccatacgtccctgcgcaatggcggttgtgttgttcGCCAAACACCAGAGTCACTACGCT-GCC-ACCAAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntccactgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngccaaacaccagagtcactacgctgccaccaaa
gi|10 : ggtttacactcatttccccataaaactcatcaatacatttcattacgaaacggaacataaaggacaggatattatggtacatatgcatgtagtctttaatcaggcgtggtaccgtaccatacgtccctgcgcaatggcggttgtgttgttctaccgtaccatacgtccctgcgcaatggcgttgtgttgattctgatttccgattaaatagcggtaactgtgccatttatcttttcaatttttcttttattaccatttatgaactattctgatatgaattctggggttttggtcattcaatgaaagaaacagcaaaggtatgtaaaaattctggagaataataaacattctgataaataagctaatgtaacgtataccagtcatccatccaggttgctcaagtttccttttatactgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntccactgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-AGACCATCT-A---TCTTTCTAAATCATT-C---TGATATAAATTC-CGGGATT--TTGGTC-A-TTCAGTGAAAGAACC--AGCAAAC-CTGCATACA---ATT-TTTGAAGAATAATTA---TAAAACTTCTG-----GTAAA-TGTGC----------T----------------AANNN-------NNNN--N-----NNN----NNNN-NNN---NNNN-NN---NNNNNNNNNCAAGTTT------GCT------------------TATACTGTCCATTAC-ACTTTTC----
gi|10 : GCCAAACATCAGAGTCATTAAGCT-GCC-ACCAAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngccaaacatcagagtcattaagctgccaccaaa
gi|11 : agaccatctatctttctaaatcattctgatataaattccgggattttggtcattcagtgaaagaaccagcaaacctgcatacaatttttgaagaataattataaaacttctggtaaatgtgctaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaagtttgcttatactgtccattacacttttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTT-C---TGATGTGAATTC-CAGAGTT--TTGGTC-A-TTCAGTGAAAGAACC--AGCAAAC-ATACATAAA---ATT-TTTGGAGAATA---A---AAAAC---CTA-----ATAAA-TGTGC----------T----------------AATGT-------AACG--T-----GCA----GCGG-TCA---TCCA-TC---CAGGTTGTTTAACTTT----CCTCT------------------AATACTGTCCGTTAC-ACTT
gi|11 : CCAAACATTAGAGTCAGTACGCT-GCC-ACCAAccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccattgtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccaaacattagagtcagtacgctgccaccaa
gi|12 : ttctgatgtgaattccagagttttggtcattcagtgaaagaaccagcaaacatacataaaatttttggagaataaaaaacctaataaatgtgctaatgtaacgtgcagcggtcatccatccaggttgtttaactttcctctaatactgtccgttacacttccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccattgtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaTTACA-GTTATTTCATCACCCA---TTTC---CTC----AT--AAAGTTCATTAAT----TT-CATTTAAAAAA--A---ACGAAAAA-AAAGGACAAGATATCATAT---T--------A---------TA------TA-GT-C-TT----------TAA---TCTGGT---G-----T-G--GT--A--CC----ATA-CA----A--A----A------CG-T-----------TCCT----GAGCAA--CGGCG--GCCG--------TGT--T----------------------------------TG------TATA--ACGGTAG----T--TGTACC--ATTTTTC-------T--TTTC---AA-TTTTA-CTTTT-A-AA----------------------CCATT-T---T--TATGAATTC-CGGGGTT--TTGGTC-A-TTCATTGAAAGAACC--AGCAAAC-GTGAATAGA---ATT-TTTAAAGAATA---A---TTAAATTTCTG-----ATA-----------------------------------AATGT-------AAGA--T-----GTA----ATGG-TCT---TCAA-TCCAGCAGGTTGCTCAATTTT----CGTAT------------------TATACTGTCCGTT
gi|13 : AAA---ATT-TTTGGAGAATA---A---TTAAACTTCTG-----ATAAA-TGTAC-TA-------------------------ATGT-------AACG--T-------A----GCGG-TCA---TCCA-TC---CAGGTTACTCAAAATT----CCTCTTATATATAAAATGGCATATATACTGTCCGCTAC--TTTTTT----CNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCACTGTCT-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCCAAACACCAGAGTCACTACGCT-GCC-ACCAgact
gi|14 : gtgattcattatttgaataatgTTTACAGTTTATTTAATCA-TCA---T------TTCCTCCATTAAAAATTCATTATTATATTTTCATT---AAGA--A---ACGAAAGATAAAGCACAGGAT-TCATAT---T--------A---------TA-------A-GT-C-TT----------T---AATCGGGC---G-----T-G--GT--AATCT----ATA-CA----A--T----A------CG-T-----------CTCT----GAGCAA--CGGCG--G--G--------CGG--TG-TTCTGATTTCCCG-AT-----T-AT--CGGCTTG------TGTA--ACGGT-G----C--TG-------------------------TT---GA-GTCTA-CCTTT-A-AAACCAT-------TAT----TAACCATT-C---TGATATGAATTCTTGCGGTT--T--GTC-ATTTCAGTGAAAGGGCCAAAGCAAACGCCGCATGAA---G---TTTGAAGAACA---A---TAAACCTTC
gi|15 : tTTCTTTCATCACTCA---TTTC---CTC----AT--AAAACTC-------TATTT-CATT---AAGA--A---ACGGAAAATAAAGGA-----TATCATGT---T--------A---------TA-------A------------------TAT-ATTCGGGC---AGGTACT-A--GT--A--CCTACTGTA-AA----A--T----T------CA-T-----------CCCT----GAGCAA--TGGCG--GTCC--------CGT--TG-TTC-------CCG-AT-----TAAT--CGGC-TG------TATA--ACATAAA----C--TGTACT--ATTTATC-------T--TTTT---AA-TTTTG-ATTTT-A-TAACCATT------TAT----GAATCATT-C---TGATATAAATTC-C-GGGTT--TTGGTC-A-TTCAGTGAAAGAACC--AGCAAAC-----------------TTTGGTGAATA---A---TAAAC
gi|16 : aTGGTC-A-TTCAGTGAAAGAAatat
gi|16 : caccgaaatgagagaaccagtcaactaactaaccgtaaacAAGTTT----CCTCT------------------TATACTGTCCGCTAC-ACCCCCCCT--CCCGCgtttcctcttatactgtccgctacaccccccctcccgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacttgtgtcgtccaaggacgagaccacgcccatacatgaccacaaagtccaaggtttcccgccaaacaccagagtaactatgctgccaccaaa
gi|16 : caccgaaatgagagaaccagtcaactaactaaccgtaaactggtcattcagtgaaagGCCAAACACCAGAGTAACTATGCT-GCC-ACCAAAtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacttgtgtcgtccaaggacgagaccacgcccatacatgaccacaaagtccaaggtttcccgccaaacaccagagtaactatgctgccaccaaa
gi|17 : caccgaaatgagagaaccagtcaactaactaaccgtaaactggtcattcagtgaaagaagtttcctcttatactgtccgctacaccccccctcccgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacttgtgtcgtccaaggacgagaccacgcccatacatgaccacaaagtccaaggtttccc-------AATG--T-----GTA----GCGG-TCA---TCCA-TC---CAGGTTGATCAAGTAT----CCTCT------------------TATACTGTCCACTAC-ACTTTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCACTGTCT----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA---CCAAACACC--AGTCGCTATGAT-GCC-ACCAA
gi|18 : aacaAGCAA--CAGTG--GCCG--------TGT--TG-TTCTGATTTCCCG-AT-----TAAT--GGGC-TG------TATA--ACGGTAG----C--TGTACC--ATATATC-------T--TTTC---AT-TTTTA-CTTTT-A-AAACCATT------TAT----GAGTCAAT-C---TAATATACATTC-CGGGGTT--ATGGTC-A-TTCAGTGAAAGAACC--AGCAAAC-CTGGATATA---TTT-TATGGAGGACA---A---TAAACCTTTTG-----ATATA-TGT---------------------------------------------------------------G-TCA---TCTA-TC---CAGGTTGCTAAAATTT----CCTCT------------------TGTACTGTCCGCTGC-ACTTT
gi|19 : TTACA-TTCATTTTATCCCT--------------------T--AATTCTCATTGATATATTC-CATA---AAGAGAA---ATCGAAAGTAAAGGAC--GTTATCATATA--G--------A---------CA------TA-TT-C-TT----------TAA---TCCGGC---G-----T-TATGT--A--CC----GTA-CA----A--T----A------CG-C-----------CCCT----GAGCAA--TGGCG--GATG--------TGT--TA-TTCTGGTTTCCTG-TT-----TAAG--CGGC-TG------TATA--GCGGTAA----C--TGTACC--GATTATC-------T--TTTC---AA-TTTTA-CTTTT-C-TCACCATT------TAT----GATCCATT-C---TGATATCAATT
gi|2 : TGGTTTACA-TTTATTTCCTCACTCA---T------CTC----AT--AGAATTCATTAATATATTT-CATT---AAGA--A---ACGGAAACTAAAGGACAGCAAATCATGT---T--------A---------TA------TA-GT-CATTTAAAAATATATAA-AATCGGGT---G-----T-G--GT--A--CC----GTA-CA----A--T----A------CA-T-----------CCCT----GAGCAA--CAGTG--GCCA--------TGT--TG-TTCTGATTTCCCG-AT-----TAAT--TGGC-TA------TATA--ACAGTAG----C--TGTACC--CTATATA-------T--TTTC---AG-TTGTA-CTTTT-A-AAACCATTTAA---TAT----GAACCATT-C---TGATATGAATTC-CAGAGTT--TTGGTC-A-ATCAGTGAAAGAACC--AGCAAAC-CTGCATAAA---AGT-TTTGGAGAATA---A---TAAAACTTCTG-----ATAAA-TGTGC-TAAT-----T----------------AATGT-------AATG--T-----GTA----GTGG-TCA---TCCA-TC---CAGGTTGCAAATGTTT----CCTCT------------------TATACTGTCCACTAC-ACTTTTCNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACCACTGTCT----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCCAAACACCAGAGTCACTAAGCT-GCC-ACCAAA
gi|20 : GTTTACA-TTTATTTAATCACTCA---T------TTC----CT--CGA--TCATTAACATATTT-CATT---AAGA--A---ACGGAACATAAAGGACAGTCTCACATGT---T--------A---------TATACACGTA-GT-C-TT----------T---AATTGGGC---G-----T-GGTGT--A--CC----GTA-CA----ATTT----A------TA-T------------------------A--CGTCA--GCCG--------TGT--TG-TTCTGATTTCCCA-CT-----TCAT--AGGC-TG------TATA--GCGGTAAAGTTC--TGTACC---------------------------A-TTTTA-CTTT--------------------T----GAACCATT-C---TGATATAAATTC-CG
gi|21 : GGTTTACA-TTTATTTCATCACTTA---TTTC---CTC----AT--AAA-CTCATTGATATATTT-CTTT---TAG---------------TAAAGGACAGGATCTCAAGT---T--------A---------TA------TA-GT-C-TT------------A-AATCGGGC---G-----A-G--AT--A--CC----GTA-CA----A--T----A------CA-TGTACATGCAAGTCCT----GAGCAA--TGGCA--GC---------------TG-TTCTGATTTCCTG-AT-----TAAT--CGG------------TA--ACA------------------------------------TTTT---AA-TTTCA-CTTTT-ATAACCCATTT-A---T---------CCATT-C---TGATATGAATCC-CGGGG
gi|22 : TGATTTCCCA-AT-----TAAT--CATT-TG------TATA--ACGGTTG----C--TGTACC--ATT-ATC-------T--TTTC---AA-TTGTA-CCTAT-A-AAACCATTT-A---T------GAACAATT-C---TGATATGAATTC-AGAG--T--TTGATC-A-TTCAGTTAAAGAACC--AGCAAAC-CTGTATA-------T-TTTGGAGAAAA---A---TAAAACCTCTG-----ATAAA-AGTGC-TA-------------------------ATGT-------AATA--T-----GTA----ACGG-TCA---TCCA-TC---CATGTTGCTCAACTTT----CCT
gi|23 : GTTTACG-TTTATTTCATCATTCA---T------CTCCCC-AT--TAACCTGATTAGTACATTT-CATT---AAGA--A---AC--AAAATGAAGGACAAAGTAT-ATGT---T--------A---------CA------TA-AT-C-TT----------TAT---TCGGTT---G-----T-A--GT--GTTCC----GTA-CA----A--T----A------CG-T-----------CCTT----GAGCAA--TGGTG--ATAG-------------TG-TTTTGATTTCCCG-AT-----CATT--CGGC-CA------TATA--AC-GTAG----C--TAT
gi|24 : TTACA-TTTATTTCAGCACTCA---T------TTCTTC-AT--AAAACTCATTAATATATTT-CATG---AAGA--G---ACTGAAAATAAAGGACAGGATATCATGTATAT--------A---------TACCCTGGTA-GT-C-TT----------TAA---TCGGGT---G-----TTGT-GT--A--AC----GTA-CG----A--T----A------CG-T-----------CCCT----GAGCAA--TGGCG--GTCA--------TGT--TG-TTCTGATTTCCCG-GT-----TAAT--CAGC-TG------TATA--ATGGTAG----C--TGTACC--ATTttctgctacacatttccccgttccggga
gi|25 : gtttgCATTAATATATTT-CATT---AAGA--A---ACGGGAAATAAAGGGCAGGATATCATGT---T--------ACAGTGTGTATA------TA-TT-C-TT----------TCA---TCGGGC---G-----TTGT-GT--A--CC----GTA-CA----A--T----A------CA-C-----------CCCC----AAACAA--TGACG--GTCG--------TGT--TG-TTCCGATTTCCCG-AT-----TTAT--CGGT-TG------TATA--ACGGTAA----C--TGTACC--ATTTATc
gi|26 : --GT--A--CC----GTA-CA----A--T----A------CG-T-----------CCCT----G---------GCG---CCG--------TGT--TGGTTCTGATT--------------AAT--CAGC-TG------TATA--ACGGTAG----C--TGTGCC--ATTTATC-------T--TTTC---AA-TTTTA-CTTTT-A-AGACCA-TT-A---T-------AACCATT-C---TGAGATAAATTC-CAGGGTT--TTGTTCAA-TTCAGTG---GGGTC----CAA----TGCAT--A---ATT-TT
gi|27 : gtgtgttgtTTCTTTCATCACTCA---T------TTC------------CTCATAAATATATTT-CATT---AAGA--A---ACGGAAAATAAACGACAGGATATCATGT---T--------A---------TG------TA-GT-C-TT----------TAA---TCGGGC---T-----T-G--GT--A--CC----ATA-CA----A--T----A------CG-T-----------CCCC----GAGCAA--TGGCA--GCCA--------TGT--TG-TTATGATTTCCTG-AG-----TAAT--CGGC-TG------TATA--TCGG
gi|28 : TC----AT--AATATTCATTAATATACAT-CATC---AAGA--A---CCAGAAAGGAAAGGACATGATATCATAT---T--------A---------TA------TACGT-T-TT--------------AGTCGGGT---G-----T-G--GA--A--CC----ATA-CA----A--C----A------CG-T-----------TCCT----GAGCAA--TGGCG--GCCG--------TGT--TG-TTATGATTTTGCG-AT-----TAAT--TGGC-TC------TACA--ACGGTAG----A--TGTACa
gi|29 : GGTTTATA-TTTATTTCATCACTCA---T------TTC------------CTCAT--------------------AA--A---ACAGGAACTCATGGTCAGTATA-CATGT-----------------------A------TT-GT-C-TT----------TAA---TCGGGC---G-----T-G--GTGTA--CC----GTA-CA----A--T----ATATGTACG-T-----------CCCT----GAACAA--TGGCG--ACCGACCG----TGT--TG-TTCTGATTTCCCG-AT-----T
gi|3 : TTTACA-TTTAATTCACTACTGA---TTTC---CTC----AT--GAA-CTCATTAATATTTTT-CTTT---AAGA--A---ACGAAAAATAAAGGACAGGATATCATGT---T--------A---------TA------TA-GT-C-TT----------TAA---TCGGGC---G-----T-G--GT--A--CG----GTA-CA----A--T----A------CT-T-----------CCTT----AGGGAC--TGATG--GCCG--------TGT--TG-TGTTGATTTCCCG-AT-----TAAT--CGGC-TAGA----TATA--ACGGTAA----C--CGTACC--ATTTGTC-------T--TTTC---AG-TTTTA-CTTTT-G-TACCCATCT-A---T------GCACCATT-C---TTATTTGAATTC-TGGG-TT--TTGGTC-A-TTCATTGAAAGAACC--AGCAAAC-TTGGATAAT---TAT-TTTGGAGAATA---A---TAAACCTTCTG-----ATAAA-TTTGC----------T----------------AATGT-------AATATTT-----GTA----GCAG-TCA---TCCA-TC---CAGATTGCTCGAGTTT----CCTCT------------------CATAATGTCTGCTAC-ACTTCTC----CC
gi|3 : CAAACACCAGAGTCACTACACT-GCC-ACCAAAagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacgactgtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacaaacaccagagtcactacactgccaccaaa
gi|30 : tttacatttaattcactactgatttcctcatgaactcattaatatttttctttaagaaacgaaaaataaaggacaggatatcatgttatatagtctttaatcgggcgtggtacggtacaatacttccttagggactgatggccgtgttgtgttgatttcccgattaatcggctagatataacggtaaccgtaccatttgtcttttcagttttacttttgtacccatctatgcaccattcttatttgaattctgggttttggtcattcattgaaagaaccagcaaacttggataattattttggagaataataaaccttctgataaatttgctaatgtaatatttgtagcagtcatccatccagattgctcgagtttcctctcataatgtctgctacacttctcccagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacgactgtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaTGGTC-A-TTCAGTGAAAGAACC--AGCAAAC-TTGCATAATTTTATT-TTTTGAGAATA---A---TAAACCTTCTG-----ATAAA-TGTGT-CA-------T------------------TGT-------TCTG--T-----GTA----GCGG-TCA---CCCA-TC---CAGGTTGCTCAAGTTT----CCTTT------------------TATACTATTCACTAC-ACTT
gi|31 : GGTTTATA-TTTATT-CATCACTCA---T------TTC------------CTCAT--------------------AA--A---ACAGGAACTCATGGTCAGTATA-CATGT-----------------------A------TT-GT-C-TT----------TAA---TCGGGC---G-----T-G--GTGTA--TC----GTA-CA----A--T----ATATGTACG-C-----------CCCT----GAACAA--TGGCG--ACCG--------TGT--TG-TTCTGATTTCCC
gi|32 : T-TTTGGAGAATA---A---TGAACCTTCTG-----ATAAA-TGTGCTTA-------TTTGAATTGACGAATTCAACATTGCATTAAACG--TAATGTGTA----ACGG-TCA---TCCA-TC---CAAGTTGTTCAAGTTT----CCTCT------------------TATACTGTCCGCTAT-AC
gi|33 : gGGTTCACA-TTTATTTCACCACTCA---T------GTT----TT------TTCATAAATATATTT-CATT---TAGG--A---ACAAAATGTAAAGGACAGTATCTCATGA---T--------A---------TA------TG-AT-T-T---------------AATCTGGC---G-----T-GGTGT--A--CC----GTA-CA----G--T----A------CG-cc
gi|34 : TAAAGGACAGCATATCATGT---T--------A---------TA------TA-GT-C-TT----------TAA---TCGGGC---G-----T-G--GT--A--CC----GTT-CA----A--T----A------CG-T-----------CCCT----GAGCAA--CGACG--GCCA-------------TA-TTCTGTTTTCCCA-AT-----TAAT--CGGT-TG------TACA--ACGGT
gi|36 : --T----A------CG-C-----------CCCT----GAAAAA--AAGAG--GACGGGATATCATGTGATG-TTCTGATTTCCCGGAT-----CAAT--CGGC-TG------TATA--ACGGTAG----C--TTTACC--ATGTATT-------TCATTTT---AA-TTTTA-CTTTT-A-
gi|38 : T-CATT---AAGA---------GAAAATAAAGGACAAAATTTCACAT---T--------A---------TA---------GT-C-TT----------TAA---TTGGGCCTTG-----T-G---T--A--CC----AAA-CA----A--TTAATA------CG-C-----------CCCT----GAGCAA--ATGTG--GCCG--------TGT--
gi|4 : GTTTACG-TTTATTTCATCACTAA---TTTC---CTC----AT--AAAACCCATTAATATATTT-CATT---ACGA--A---ACGGAAAGTAAAGGATAGGATATTATGT---T--------A---------TA------TA-GT-C-TT----------T---AATCGGGT---G-----T-G--
gi|4 : tT-----TAAT--CGGG-TG------TGTATGAAGGTAA----C--TGTACT--ATTCATC-------T--GTTC---AA-TTTTA-CTTTA-A-CAACCATTT-A---T------GGACTATT-C---TGATATGAATTC-CTGGATT--TTGGTC-A-TTTAG--AAAGAGCC--AGCAAAC-TTACAT----------TTTGGAGAATA---A---TAAATCTTCTGGCAAAACAAA-TGTGC-T---------------------------TTT-------AACA--T-----GTA----GTGG-TCA---TCCA-TC---CATTTTGCTCAAGTTT----CCTCT------------------TATACTGTCCAATAC-ACTCTCC----tatgaaggtaactgtactattcatctgttcaattttactttaacaaccatttatggactattctgatatgaattcctggattttggtcatttagaaagagccagcaaacttacattttggagaataataaatcttctggcaaaacaaatgtgcttttaacatgtagtggtcatccatccattttgctcaagtttcctcttatactgtccaatacactctccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcactgtcttccttagacgtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccaaacacctgagtcctacgctgccac
gi|4 : tgtttacgtttatttcatcactaatttcctcataaaacccattaatatatttcattacgaaacggaaagtaaaggataggatattatgttatatagtctCCAAACACCTGAGTC-CTACGCT-GCC-ACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcactgtcttccttagacgtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccaaacacctgagtcctacgctgccac
gi|40 : tgtttacgtttatttcatcactaatttcctcataaaacccattaatatatttcattacgaaacggaaagtaaaggataggatattatgttatatagtctttaatcgggtgtgtatgaaggtaactgtactattcatctgttcaattttactttaacaaccatttatggactattctgatatgaattcctggattttggtcatttagaaagagccagcaaacttacattttggagaataataaatcttctggcaaaacaaatgtgcttttaacatgtagtggtcatccatccattttgctcaagtttcctcttatactgtccaatacactctccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcactgtcttccttagacgtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaAAATAAAGGACAGGATATCATGTA--T--------A---------TA------TA-GT-C-TT----------T---AATCGGGT---GT----T-GT-GT--A--CC----GTC-CG----A--T----A------CG-T-----------CCCT----GAGCAA--TGGCG--GTCA-------------TG-TTCTGATTTC
gi|41 : GGTTTACA-TTCATATCATCAATCA---T------TTCCTT-AT--AGGATTTATTAATACATTT-TATT---AAGA--A---ACGGAAAATAAAGGACATGTTATCATAT---
gi|42 : TGGCC-A-TTCAATGAAAGAACC--AACGAAA-TTGAATATA---GTT-TTT-TAGAATG---A---TAAAACTCCTG-----ATAAA-TATGC-Tc
gi|43 : TGGTTTACA-TTAATTCCAACACTCA---TTTC---CTC----AT--AAA
gi|44 : aTGGTTTACA-TTTATTTCATCACTCA---TTATTTCCTT----AT--AAAACTggatgaagtgcagtctccatacatgta
gi|45 : ttaTGGTTTACA-TTTATTTCATCACTCACTTT------CTC----AT--AAAACTC
gi|46 : aCCAAACACCAGAGTCACTACGCTGGCCAACCAAAt
gi|47 : GCCAAACACCAGAGTCACTACGCT-GCCAACCAAtt
gi|48 : GCCAAACACCAGAATCACTACGCT-GCC-ACCAAAtt
gi|5 : cTACA-TATATTTTATCAT--A---T------TTC----CTTAAAAAATCATTAATATATTT-CATT---AAGA--A---ACGG
gi|5 : aATCAT-T---A--------A---------TA------TA-TTTC-AT----------TAAGAAACGG-C---G-----TTGT-GT--A--CC----GTAACAGGTGA--G----A------CGATA----------CTCTTGAGGAGCAAGGTGGCGAGGCCG--------TGT--T----CTGATTTCCTG-AT-----TAATCGCGGC-TGCGTTCATATA--ACAGTAA----CCTTGGATCGAATTTGTCACTGGGTT--TTTCATGAA-TCCGACCTTTT-A-TAACCAATT-AGTGTAT----GCATCTTTGCATATGATATCAACT----GGCTTAGTTGGTC-A-TTCAGTGAAATGACCCAAGAAAACATTACATCAA---ATTCCCTTGAGAATA---A---ATAGCCTTCTG-----ATAAATTTTGC-TAATTATGGT----------------AACGT-------GTCG--T-----GTA----GCGGTTCATTGTCCATTT---CAGATTGCGTAAGTTTATACCCTCT------------------TATACTCCGCGCTAC-Acgttgtgtaccgtaacaggtgagacgatactcttgaggagcaaggtggcgaggccgtgttctgatttcctgattaatcgcggctgcgttcatataacagtaaccttggatcgaatttgtcactgggtttttcatgaatccgaccttttataaccaattagtgtatgcatctttgcatatgatatcaactggcttagttggtcattcagtgaaatgacccaagaaaacattacatcaaattcccttgagaataaatagccttctgataaattttgctaattatggtaacgtgtcgtgtagcggttcattgtccatttcagattgcgtaagtttataccctcttatactccgcgctacaat
gi|50 : atacatatattttatcatatttccttaaaaaCCAAA-ACCAGAGTCACTACGCT-GCC-ACCAAat
gi|51 : CCAAACACCAGAGTCACTAACCT-GTC-ACCAAAttt
gi|52 : CCAAACACCAGAGTCACTACGCT-GCC-ACCAAt
gi|53 : CCAAACACCAGAGTCACTGCGCT-GCC-ACCAAt
gi|54 : CCAATCACCAGAGTCACTACGCT-GCC-ACCAAt
gi|55 : CCAAACACCAGAGTCACTACGCT-GCC-ACCAAt
gi|6 : -------T--TTTC---AA-TTTTA-CTTTT-A-AAACCATT-------AT----GAGCCCTT-G---TTATATGAATTT-CGGTGTT--TTAGTC-A-TTCAGTGAAAGAATC--AGCCGAC-CAGCATAAA---TTT-TTGGGAGAATA---A---CAACACTTCTG-----ATAAA-TGTGC----------T----------------AATGT-------AACG--T-----GTA----GCGA-TCA---TTCA-TC---TAGGTTGCTCAACTTT----CCTCT------------------GATACTGCCCGCTATAACTCTTC----
gi|7 : -TTTTA-CTTTTTA-AAACCATTT-A---T------GAACCATT-C---TGATATAAATTT-CGGGCTT--TGGGTC-A-TTCAGTGATTGAACC--AGCAAAC-TTACAAAAAG--AT-----GGAGAATA---GCCCTAAACGCTCTG-----ATAAA-TGTGC--A------------------------AATGT-------A------------TA----GCGG-TTA---TCCA-TC---CAGGTTGCTCAAATTT----CCTCT------------------TATACTGCCCGCTAC-ACTTTTC----gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccactgtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngccaaacaccagtcacctagctgctacc
gi|7 : CCAAACACCAGAGTCACTAAGCT-GGC-ACCAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccactgtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntccaaacaccagagtcactaagctggcaccaa
gi|8 : ttttactttttaaaaccatttatgaaccattctgatataaatttcgggctttgggtcattcagtgattgaaccagcaaacttacaaaaagatggagaatagccctaaacgctctgataaatgtgcaaatgtatagcggttatccatccaggttgctcaaatttcctcttatactgcccgctacacttttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccactgtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntTATC--ATTTATC-------T--TT-C---AG-TTTTA-CCTTT-A-AAACCATT-------AT----GAACCATT-C---TGATTTGAATTC-CCGGGTT--TTGGTC-A-CTCAGTGAAA---------------------AAA---ATTGTTTGGAGAATA---A---TAAACCTTCTG-----ATAAA-TGTGC-TA-------------------------ATGT-------AACG--T-----GTACATAACGG-TCA---TCCA-TC---CAGGTTGCTCAAGTTT----CCTCT------------------TATACTGTCCGCCAC-ACTTTCC----CCCGCACAGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCACTGTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCCAAACACCAGAGTCACTAAGCT-GCC-ACCAAA
gi|9 : gtTGGTTTACA-TTTATTACATCACTCA---TTTC---CTC----AT--AAAACTCATTAATATATTT-CATT---AAGA--ATTAACGGAAAGTAAAGGACAAGATATCATGT---T--------A---------AA------TA-GT--------------------------------------------------------A-CA----A--T----A------CG-T-----------CCCT----GAGCAA--TGGCG--GTCG--------AGT--TG-CTCTGATTTCCTG-ATCACGTTAAT--CGGC-TG------TATA--ACGGTAA----C--TGTACC--ATTTATC-------T--TTTT---AAATTTTA-CTTTT-A-A---CATTT-A---T------GGATCATT-C---TGATAAGAATTC-TGGGGCT--TTGGCC-A-TTCAGTGAAAGAACC--AGCAAAA-TTACATAAA---ATT-TTTGGAGAATA---A---TAAACATTCTG-----ATAAA-TGTGC----------T----------------AATGA-------AACC--T-----GTA----GCAG-CCA---CCCA-TC---CACGTTGCTTAAATTT----CCTCTAAGGC-------------TA-ATTGTCCGCTAC-ACTT
blockSeqs : G CTT TATTTC CTCCA TA G T TAA GA TTA TACAGTGTGTA TACACG C T A TAAAAATATATAAAA CTT GGTAC T AT GT AT TACT A GGTG TT TAAT TATGTA A GTACATGCAAG TGAG GGT AG GGATATCAT GA A G CACGT CG T CGTTCA TG AGTT CT GA ACTGGGT CA ATG A C T TA TATCTTTCT G ATA T AG A T AA GC C TTTATT ATT CCC GCAAA T TTATTTGAATTGACGAATTCA TGCATTA TT AATGT CATA T TTG T CAG ATAC TATATATAAAATGGCATA A NNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN G A
blockSeqs : . . TTC CCCA TA A . . . . ATATA CCCTGG . . . TAAGAA . T T GT GT TT . . . . . TATGTA . A . T . ACCGT . G . . . . GA . . . . . . . . . . A TAGTGTAT . . . . . . CA AT A ATTC . . . . TAATTATGGTA . . . . . . . . . AAGGC . CT NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN . A
blockSeqs : . . TTC TTCA . A . . . . AGA . . . . TATAT . . T GT . . . . . . . . . . . C . T . . . . . . . . . . . . . . . . . A TAATAT . . . . . . . C G ATTG . . . . TAATTA . . . . . . . . . . . NN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA . .
blockSeqs : . . TTC CTTA . T . . . . ATA . . . . TAA . . . T . . . . . . . . . . . C . T . . . . . . . . . . . . . . . . . A TAT . . . . . . . A A ATT . . . . CAT . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . TTC A . A . . . . TA . . . . TAA . . . T . . . . . . . . . . . T . C . . . . . . . . . . . . . . . . . T TAT . . . . . . . G A ATT . . . . TA . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . TTC A . C . . . . TA . . . . TAA . . . T . . . . . . . . . . . C . C . . . . . . . . . . . . . . . . . A TAT . . . . . . . C T ATT . . . . TA . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . TTC A . A . . . . TA . . . . TAA . . . T . . . . . . . . . . . T . T . . . . . . . . . . . . . . . . . T TAT . . . . . . . C A ATT . . . . TA . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . TTC C . A . . . . TA . . . . AAA . . . . . . . . . . . . . . . C . T . . . . . . . . . . . . . . . . . A TAT . . . . . . . C A TTT . . . . TA . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . A . A . . . . TA . . . . TAT . . . . . . . . . . . . . . . C . T . . . . . . . . . . . . . . . . . A TAT . . . . . . . T A AGT . . . . TA . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . A . A . . . . TA . . . . TAA . . . . . . . . . . . . . . . T . T . . . . . . . . . . . . . . . . . A TAT . . . . . . . T T ATT . . . . TA . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . A . A . . . . TA . . . . TCA . . . . . . . . . . . . . . . T . T . . . . . . . . . . . . . . . . . T TAT . . . . . . . T A TAT . . . . AA . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . T . A . . . . TA . . . . TAA . . . . . . . . . . . . . . . T . T . . . . . . . . . . . . . . . . . C TAT . . . . . . . T A GTT . . . . TA . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . A . A . . . . TA . . . . TAA . . . . . . . . . . . . . . . T . T . . . . . . . . . . . . . . . . . T TAT . . . . . . . C A TTT . . . . TA . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . A . A . . . . TA . . . . TAA . . . . . . . . . . . . . . . T . T . . . . . . . . . . . . . . . . . A TAT . . . . . . . T A GAT . . . . A . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . A . . . . . . TA . . . . TAA . . . . . . . . . . . . . . . T . T . . . . . . . . . . . . . . . . . A AT . . . . . . . T A ATT . . . . T . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . A . . . . . . TA . . . . TAA . . . . . . . . . . . . . . . T . T . . . . . . . . . . . . . . . . . A AT . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . C . . . . . . TA . . . . TAA . . . . . . . . . . . . . . . T . T . . . . . . . . . . . . . . . . . A T . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . A . . . . . . TA . . . . TAA . . . . . . . . . . . . . . . T . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . AA . . . . TAA . . . . . . . . . . . . . . . C . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . TA . . . . AG . . . . . . . . . . . . . . . A . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqCons : TA********************
originalCons : TGGTTTACA-TTTATTTCATCACTCA---T------CTC----AT--AAAACTCATTAATATATTT-CATT---AAGA--A---ACGGAAAATAAAGGACAGGATATCATGT---T--------A---------TA------TA-GT-C-TT----------TAA-AATCGGGC---G-----T-G--GT--A--CC----GTA-CA----A--T----A------CG-T-----------CCCT----GAGCAA--CGGCG--GCCG--------TGT--TG-TTCTGATTTCCCG-AT-----TAAT--CGGC-TG------TATA--ACGGTAG----C--TGTACC--ATTTATC-------T--TTTC---AA-TTTTA-CTTTT-A-AAACCATTT-A---TAT----GAACCATT-C---TGATATGAATTC-CGGGGTT--TTGGTC-A-TTCAGTGAAAGAACC--AGCAAAC-CTGCATAAA---ATT-TTTGGAGAATA---A---TAAACCTTCTG-----ATAAA-TGTGC-TA-------T----------------AATGT-------AACG--T-----GTA----GCGG-TCA---TCCA-TC---CAGGTTGCTCAAGTTT----CCTCT------------------TATACTGTCCGCTAC-ACTTTTC----CCCGCACAGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACCACTGTCT----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNANNGCCAAACACCAGAGTCACTACGCT-GCC-ACCAAA
finalCons : TGGTTTACA-TTTATTTCATCACTCA---T------CTC----AT--AAAACTCATTAATATATTT-CATT---AAGA--A---ACGGAAAATAAAGGACAGGATATCATGTTA--------------------TA------TA-GT-C-TT----------TAA-AATCGGGC---G-----T-G--GT--A--CC----GTA-CA----A--T----A------CG-T-----------CCCT----GAGCAA--CGGCG--GCCG--------TGT--TG-TTCTGATTTCCCG-AT-----TAAT--CGGC-TG------TATA--ACGGTAG----C--TGTACC--ATTTATC-------T--TTTC---AA-TTTTA-CTTTT-A-AAACCATTT-A---TAT----GAACCATT-C---TGATATGAATTC-CGGGGTT--TTGGTC-A-TTCAGTGAAAGAACC--AGCAAAC-CTGCATAAA---ATT-TTTGGAGAATA---A---TAAACCTTCTG-----ATAAA-TGTGC-TA-------T----------------AATGT-------AACG--T-----GTA----GCGG-TCA---TCCA-TC---CAGGTTGCTCAAGTTT----CCTCT------------------TATACTGTCCGCTAC-ACTTTTC----CCCGCACAGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACCACTGTCT----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNANNGCCAAACACCAGAGTCACTACGCT-GCC-ACCAAA
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|35 ): TGTAGGGTTATGGCTACTTTATTTTGGGCTTTGTGGTATATAACGAGTTTTGTGCACTTTTCTAACATCGGAATGAGAGAGGCAGTCATCTAACCTTAAACTTGTCATTCAGTG
Unaligned ( gi|37 ): TTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAACCACTGTC
Unaligned ( gi|39 ): TTGTCTCGCGGCGTTGAGTTTTGGCTACTTTATTTTGAGCTTAGTGATGTTTCTCGAGTTTGGTGCATTTTCCTAGAAACCACTCATTTAACCTTAAA
Unaligned ( gi|49 ): GTATAAAGCGTATATTTCATAAGTTTTGAACGTG
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 222222 11111 1111111111111111111111 111111 3333333333333333 11 3333333333333 5555555555555555555555555555 222222222222222222 1111 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 2 333 777777 44444 44 5 1 333 22 333 0000000000000000000000 000000 1 1 1 6666666666666666 333 66666 5 33 44 44 3333 1 3333 22 3333 999999 1 99999999999 3333 555 22 999999999 22 3 1 44444 22 1 777777 22 4444 22 22 7777777 33 333 2 2 2 22 2222222222222 2 333 2 0 33 2 2 55 99 1 6666666 333 333 55555 2 5555555555555555555555555555 7777777 33 55555 4444 2 333 2 333 4444 111111111111111111 2 9999 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 2 4
lowQualScore : . ... ...... ..... .. . . ... .. ... ...................... ...... . . . ................ ... ..... . .. .. .. .... . .... .. .... ...... . ........... .... ... .. ......... .. . . ..... .. . ...... .. .... .. .. ....... .. ... . . . .. ............. . ... . . .. . . .. .. . ....... ... ... ..... . ............................ ....... .. ..... .... . ... . ... .... .................. . .... ................................................................ ................................................................................... . .
lowQualScore : 0 222 555555 55555 88 0 8 222 55 222 0000000000000000000000 000000 7 7 7 0000000000000000 000 11111 2 55 66 66 5555 7 5555 22 4444 222222 6 66666666666 5555 444 22 333333333 22 3 8 33333 55 8 777777 55 2222 88 99 2222222 11 999 1 1 1 44 9999999999999 0 555 1 1 22 0 0 88 33 6 9999999 555 555 66666 2 1111111111111111111111111111 2222222 11 66666 7777 2 999 2 999 5555 999999999999999999 5 5555 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0 0
consensus : TGGTTTACA-TTTATTTCATCACTCA---T------CTC----AT--AAAACTCATTAATATATTT-CATT---AAGA--A---ACGGAAAATAAAGGACAGGATATCATGT---T--------A---------TA------TA-GT-C-TT----------TAA-AATCGGGC---G-----T-G--GT--A--CC----GTA-CA----A--T----A------CG-T-----------CCCT----GAGCAA--CGGCG--GCCG--------TGT--TG-TTCTGATTTCCCG-AT-----TAAT--CGGC-TG------TATA--ACGGTAG----C--TGTACC--ATTTATC-------T--TTTC---AA-TTTTA-CTTTT-A-AAACCATTT-A---TAT----GAACCATT-C---TGATATGAATTC-CGGGGTT--TTGGTC-A-TTCAGTGAAAGAACC--AGCAAAC-CTGCATAAA---ATT-TTTGGAGAATA---A---TAAACCTTCTG-----ATAAA-TGTGC-TA-------T----------------AATGT-------AACG--T-----GTA----GCGG-TCA---TCCA-TC---CAGGTTGCTCAAGTTT----CCTCT------------------TATACTGTCCGCTAC-ACTTTTC----CCCGCACAGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACCACTGTCT----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNANNGCCAAACACCAGAGTCACTACGCT-GCC-ACCAAA
Reference ( family-593 ) : TGGTTTACA-TTTATTTCATCACTCA---T------CTC----AT--AAAACTCATTAATATATTT-CATT---AAGA--A---ACGGAAAATAAAGGACAGGATATCATGT---T--------A---------TA------TA-GT-C-TT----------TAA-AATCGGGC---G-----T-G--GT--A--CC----GTA-CA----A--T----A------CG-T-----------CCCT----GAGCAA--CGGCG--GCCG--------TGT--TG-TTCTGATTTCCCG-AT-----TAAT--CGGC-TG------TATA--ACGGTAG----C--TGTACC--ATTTATC-------T--TTTC---AA-TTTTA-CTTTT-A-AAACCATTT-A---TAT----GAACCATT-C---TGATATGAATTC-CGGGGTT--TTGGTC-A-TTCAGTGAAAGAACC--AGCAAAC-CTGCATAAA---ATT-TTTGGAGAATA---A---TAAACCTTCTG-----ATAAA-TGTGC-TA-------T----------------AATGT-------AACG--T-----GTA----GCGG-TCA---TCCA-TC---CAGGTTGCTCAAGTTT----CCTCT------------------TATACTGTCCGCTAC-ACTTTTC----CCCGCACAGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACCACTGTCT----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNANNGCCAAACACCAGAGTCACTACGCT-GCC-ACCAAA
gi|1 : GGTTTACA-CTCATTTC------------------CCC----AT--AAAACTCATCAATACATTT-CATT---ACGA--A---ACGGAACATAAAGGACAGGATATTATGG---TACATATGCA---------TG------TA-GT-C-TT----------T---AATCAGGC---G-----T-G--GT--A--CC----GTA-CC----A--T----A------CG-T-----------CCCT----GCGCAA--TGGCG--GTTG--------TGT--TG-TTCT
gi|1 : T--A--CC----GTA-CC----A--T----A------CG-T-----------CCCT----GCGCAA--TGGCG---TTG--------TGT--TGATTCTGATTTCC-G-AT-----TAA-----------------ATA--GCGGTAA----C--TGTGCC--ATTTATC-------T--TTTC---AA-TTTTT-CTTTT-A-TTACCATTT-A---T------GAACTATT-C---TGATATGAATTC-TGGGGTT--TTGGTC-A-TTCAATGAAAGAAAC--AGCAAAG-GTATGTAAA---AAT-TCTGGAGAATA---A---TAAACATTCTG-----ATAAA-TAAGC----------T----------------AATGT-------AACG--T-----ATA----CCAG-TCA---TCCA-TC---CAGGTTGCTCAAGTTT----CCTTT------------------TATACTGTaccgtaccatacgtccctgcgcaatggcgttgtgttgattctgatttccgattaaatagcggtaactgtgccatttatcttttcaatttttcttttattaccatttatgaactattctgatatgaattctggggttttggtcattcaatgaaagaaacagcaaaggtatgtaaaaattctggagaataataaacattctgataaataagctaatgtaacgtataccagtcatccatccaggttgctcaagtttccttttatactgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntccactgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngccaaacaccagagtcactacgctgccaccaaa
gi|1 : ggtttacactcatttccccataaaactcatcaatacatttcattacgaaacggaacataaaggacaggatattatggtacatatgcatgtagtctttaatcaggcgtggtaccgtaccatacgtccctgcgcaatggcggttgtgttgttcGCCAAACACCAGAGTCACTACGCT-GCC-ACCAAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntccactgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngccaaacaccagagtcactacgctgccaccaaa
gi|10 : ggtttacactcatttccccataaaactcatcaatacatttcattacgaaacggaacataaaggacaggatattatggtacatatgcatgtagtctttaatcaggcgtggtaccgtaccatacgtccctgcgcaatggcggttgtgttgttctaccgtaccatacgtccctgcgcaatggcgttgtgttgattctgatttccgattaaatagcggtaactgtgccatttatcttttcaatttttcttttattaccatttatgaactattctgatatgaattctggggttttggtcattcaatgaaagaaacagcaaaggtatgtaaaaattctggagaataataaacattctgataaataagctaatgtaacgtataccagtcatccatccaggttgctcaagtttccttttatactgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntccactgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-AGACCATCT-A---TCTTTCTAAATCATT-C---TGATATAAATTC-CGGGATT--TTGGTC-A-TTCAGTGAAAGAACC--AGCAAAC-CTGCATACA---ATT-TTTGAAGAATAATTA---TAAAACTTCTG-----GTAAA-TGTGC----------T----------------AANNN-------NNNN--N-----NNN----NNNN-NNN---NNNN-NN---NNNNNNNNNCAAGTTT------GCT------------------TATACTGTCCATTAC-ACTTTTC----
gi|10 : GCCAAACATCAGAGTCATTAAGCT-GCC-ACCAAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngccaaacatcagagtcattaagctgccaccaaa
gi|11 : agaccatctatctttctaaatcattctgatataaattccgggattttggtcattcagtgaaagaaccagcaaacctgcatacaatttttgaagaataattataaaacttctggtaaatgtgctaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaagtttgcttatactgtccattacacttttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTT-C---TGATGTGAATTC-CAGAGTT--TTGGTC-A-TTCAGTGAAAGAACC--AGCAAAC-ATACATAAA---ATT-TTTGGAGAATA---A---AAAAC---CTA-----ATAAA-TGTGC----------T----------------AATGT-------AACG--T-----GCA----GCGG-TCA---TCCA-TC---CAGGTTGTTTAACTTT----CCTCT------------------AATACTGTCCGTTAC-ACTT
gi|11 : CCAAACATTAGAGTCAGTACGCT-GCC-ACCAAccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccattgtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccaaacattagagtcagtacgctgccaccaa
gi|12 : ttctgatgtgaattccagagttttggtcattcagtgaaagaaccagcaaacatacataaaatttttggagaataaaaaacctaataaatgtgctaatgtaacgtgcagcggtcatccatccaggttgtttaactttcctctaatactgtccgttacacttccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccattgtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaTTACA-GTTATTTCATCACCCA---TTTC---CTC----AT--AAAGTTCATTAAT----TT-CATTTAAAAAA--A---ACGAAAAA-AAAGGACAAGATATCATAT---T--------A---------TA------TA-GT-C-TT----------TAA---TCTGGT---G-----T-G--GT--A--CC----ATA-CA----A--A----A------CG-T-----------TCCT----GAGCAA--CGGCG--GCCG--------TGT--T----------------------------------TG------TATA--ACGGTAG----T--TGTACC--ATTTTTC-------T--TTTC---AA-TTTTA-CTTTT-A-AA----------------------CCATT-T---T--TATGAATTC-CGGGGTT--TTGGTC-A-TTCATTGAAAGAACC--AGCAAAC-GTGAATAGA---ATT-TTTAAAGAATA---A---TTAAATTTCTG-----ATA-----------------------------------AATGT-------AAGA--T-----GTA----ATGG-TCT---TCAA-TCCAGCAGGTTGCTCAATTTT----CGTAT------------------TATACTGTCCGTT
gi|13 : AAA---ATT-TTTGGAGAATA---A---TTAAACTTCTG-----ATAAA-TGTAC-TA-------------------------ATGT-------AACG--T-------A----GCGG-TCA---TCCA-TC---CAGGTTACTCAAAATT----CCTCTTATATATAAAATGGCATATATACTGTCCGCTAC--TTTTTT----CNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCACTGTCT-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCCAAACACCAGAGTCACTACGCT-GCC-ACCAgact
gi|14 : gtgattcattatttgaataatgTTTACAGTTTATTTAATCA-TCA---T------TTCCTCCATTAAAAATTCATTATTATATTTTCATT---AAGA--A---ACGAAAGATAAAGCACAGGAT-TCATAT---T--------A---------TA-------A-GT-C-TT----------T---AATCGGGC---G-----T-G--GT--AATCT----ATA-CA----A--T----A------CG-T-----------CTCT----GAGCAA--CGGCG--G--G--------CGG--TG-TTCTGATTTCCCG-AT-----T-AT--CGGCTTG------TGTA--ACGGT-G----C--TG-------------------------TT---GA-GTCTA-CCTTT-A-AAACCAT-------TAT----TAACCATT-C---TGATATGAATTCTTGCGGTT--T--GTC-ATTTCAGTGAAAGGGCCAAAGCAAACGCCGCATGAA---G---TTTGAAGAACA---A---TAAACCTTC
gi|15 : tTTCTTTCATCACTCA---TTTC---CTC----AT--AAAACTC-------TATTT-CATT---AAGA--A---ACGGAAAATAAAGGA-----TATCATGT---T--------A---------TA-------A------------------TAT-ATTCGGGC---AGGTACT-A--GT--A--CCTACTGTA-AA----A--T----T------CA-T-----------CCCT----GAGCAA--TGGCG--GTCC--------CGT--TG-TTC-------CCG-AT-----TAAT--CGGC-TG------TATA--ACATAAA----C--TGTACT--ATTTATC-------T--TTTT---AA-TTTTG-ATTTT-A-TAACCATT------TAT----GAATCATT-C---TGATATAAATTC-C-GGGTT--TTGGTC-A-TTCAGTGAAAGAACC--AGCAAAC-----------------TTTGGTGAATA---A---TAAAC
gi|16 : aTGGTC-A-TTCAGTGAAAGAAatat
gi|16 : caccgaaatgagagaaccagtcaactaactaaccgtaaacAAGTTT----CCTCT------------------TATACTGTCCGCTAC-ACCCCCCCT--CCCGCgtttcctcttatactgtccgctacaccccccctcccgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacttgtgtcgtccaaggacgagaccacgcccatacatgaccacaaagtccaaggtttcccgccaaacaccagagtaactatgctgccaccaaa
gi|16 : caccgaaatgagagaaccagtcaactaactaaccgtaaactggtcattcagtgaaagGCCAAACACCAGAGTAACTATGCT-GCC-ACCAAAtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacttgtgtcgtccaaggacgagaccacgcccatacatgaccacaaagtccaaggtttcccgccaaacaccagagtaactatgctgccaccaaa
gi|17 : caccgaaatgagagaaccagtcaactaactaaccgtaaactggtcattcagtgaaagaagtttcctcttatactgtccgctacaccccccctcccgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacttgtgtcgtccaaggacgagaccacgcccatacatgaccacaaagtccaaggtttccc-------AATG--T-----GTA----GCGG-TCA---TCCA-TC---CAGGTTGATCAAGTAT----CCTCT------------------TATACTGTCCACTAC-ACTTTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCACTGTCT----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA---CCAAACACC--AGTCGCTATGAT-GCC-ACCAA
gi|18 : aacaAGCAA--CAGTG--GCCG--------TGT--TG-TTCTGATTTCCCG-AT-----TAAT--GGGC-TG------TATA--ACGGTAG----C--TGTACC--ATATATC-------T--TTTC---AT-TTTTA-CTTTT-A-AAACCATT------TAT----GAGTCAAT-C---TAATATACATTC-CGGGGTT--ATGGTC-A-TTCAGTGAAAGAACC--AGCAAAC-CTGGATATA---TTT-TATGGAGGACA---A---TAAACCTTTTG-----ATATA-TGT---------------------------------------------------------------G-TCA---TCTA-TC---CAGGTTGCTAAAATTT----CCTCT------------------TGTACTGTCCGCTGC-ACTTT
gi|19 : TTACA-TTCATTTTATCCCT--------------------T--AATTCTCATTGATATATTC-CATA---AAGAGAA---ATCGAAAGTAAAGGAC--GTTATCATATA--G--------A---------CA------TA-TT-C-TT----------TAA---TCCGGC---G-----T-TATGT--A--CC----GTA-CA----A--T----A------CG-C-----------CCCT----GAGCAA--TGGCG--GATG--------TGT--TA-TTCTGGTTTCCTG-TT-----TAAG--CGGC-TG------TATA--GCGGTAA----C--TGTACC--GATTATC-------T--TTTC---AA-TTTTA-CTTTT-C-TCACCATT------TAT----GATCCATT-C---TGATATCAATT
gi|2 : TGGTTTACA-TTTATTTCCTCACTCA---T------CTC----AT--AGAATTCATTAATATATTT-CATT---AAGA--A---ACGGAAACTAAAGGACAGCAAATCATGT---T--------A---------TA------TA-GT-CATTTAAAAATATATAA-AATCGGGT---G-----T-G--GT--A--CC----GTA-CA----A--T----A------CA-T-----------CCCT----GAGCAA--CAGTG--GCCA--------TGT--TG-TTCTGATTTCCCG-AT-----TAAT--TGGC-TA------TATA--ACAGTAG----C--TGTACC--CTATATA-------T--TTTC---AG-TTGTA-CTTTT-A-AAACCATTTAA---TAT----GAACCATT-C---TGATATGAATTC-CAGAGTT--TTGGTC-A-ATCAGTGAAAGAACC--AGCAAAC-CTGCATAAA---AGT-TTTGGAGAATA---A---TAAAACTTCTG-----ATAAA-TGTGC-TAAT-----T----------------AATGT-------AATG--T-----GTA----GTGG-TCA---TCCA-TC---CAGGTTGCAAATGTTT----CCTCT------------------TATACTGTCCACTAC-ACTTTTCNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACCACTGTCT----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCCAAACACCAGAGTCACTAAGCT-GCC-ACCAAA
gi|20 : GTTTACA-TTTATTTAATCACTCA---T------TTC----CT--CGA--TCATTAACATATTT-CATT---AAGA--A---ACGGAACATAAAGGACAGTCTCACATGT---T--------A---------TATACACGTA-GT-C-TT----------T---AATTGGGC---G-----T-GGTGT--A--CC----GTA-CA----ATTT----A------TA-T------------------------A--CGTCA--GCCG--------TGT--TG-TTCTGATTTCCCA-CT-----TCAT--AGGC-TG------TATA--GCGGTAAAGTTC--TGTACC---------------------------A-TTTTA-CTTT--------------------T----GAACCATT-C---TGATATAAATTC-CG
gi|21 : GGTTTACA-TTTATTTCATCACTTA---TTTC---CTC----AT--AAA-CTCATTGATATATTT-CTTT---TAG---------------TAAAGGACAGGATCTCAAGT---T--------A---------TA------TA-GT-C-TT------------A-AATCGGGC---G-----A-G--AT--A--CC----GTA-CA----A--T----A------CA-TGTACATGCAAGTCCT----GAGCAA--TGGCA--GC---------------TG-TTCTGATTTCCTG-AT-----TAAT--CGG------------TA--ACA------------------------------------TTTT---AA-TTTCA-CTTTT-ATAACCCATTT-A---T---------CCATT-C---TGATATGAATCC-CGGGG
gi|22 : TGATTTCCCA-AT-----TAAT--CATT-TG------TATA--ACGGTTG----C--TGTACC--ATT-ATC-------T--TTTC---AA-TTGTA-CCTAT-A-AAACCATTT-A---T------GAACAATT-C---TGATATGAATTC-AGAG--T--TTGATC-A-TTCAGTTAAAGAACC--AGCAAAC-CTGTATA-------T-TTTGGAGAAAA---A---TAAAACCTCTG-----ATAAA-AGTGC-TA-------------------------ATGT-------AATA--T-----GTA----ACGG-TCA---TCCA-TC---CATGTTGCTCAACTTT----CCT
gi|23 : GTTTACG-TTTATTTCATCATTCA---T------CTCCCC-AT--TAACCTGATTAGTACATTT-CATT---AAGA--A---AC--AAAATGAAGGACAAAGTAT-ATGT---T--------A---------CA------TA-AT-C-TT----------TAT---TCGGTT---G-----T-A--GT--GTTCC----GTA-CA----A--T----A------CG-T-----------CCTT----GAGCAA--TGGTG--ATAG-------------TG-TTTTGATTTCCCG-AT-----CATT--CGGC-CA------TATA--AC-GTAG----C--TAT
gi|24 : TTACA-TTTATTTCAGCACTCA---T------TTCTTC-AT--AAAACTCATTAATATATTT-CATG---AAGA--G---ACTGAAAATAAAGGACAGGATATCATGTATAT--------A---------TACCCTGGTA-GT-C-TT----------TAA---TCGGGT---G-----TTGT-GT--A--AC----GTA-CG----A--T----A------CG-T-----------CCCT----GAGCAA--TGGCG--GTCA--------TGT--TG-TTCTGATTTCCCG-GT-----TAAT--CAGC-TG------TATA--ATGGTAG----C--TGTACC--ATTttctgctacacatttccccgttccggga
gi|25 : gtttgCATTAATATATTT-CATT---AAGA--A---ACGGGAAATAAAGGGCAGGATATCATGT---T--------ACAGTGTGTATA------TA-TT-C-TT----------TCA---TCGGGC---G-----TTGT-GT--A--CC----GTA-CA----A--T----A------CA-C-----------CCCC----AAACAA--TGACG--GTCG--------TGT--TG-TTCCGATTTCCCG-AT-----TTAT--CGGT-TG------TATA--ACGGTAA----C--TGTACC--ATTTATc
gi|26 : --GT--A--CC----GTA-CA----A--T----A------CG-T-----------CCCT----G---------GCG---CCG--------TGT--TGGTTCTGATT--------------AAT--CAGC-TG------TATA--ACGGTAG----C--TGTGCC--ATTTATC-------T--TTTC---AA-TTTTA-CTTTT-A-AGACCA-TT-A---T-------AACCATT-C---TGAGATAAATTC-CAGGGTT--TTGTTCAA-TTCAGTG---GGGTC----CAA----TGCAT--A---ATT-TT
gi|27 : gtgtgttgtTTCTTTCATCACTCA---T------TTC------------CTCATAAATATATTT-CATT---AAGA--A---ACGGAAAATAAACGACAGGATATCATGT---T--------A---------TG------TA-GT-C-TT----------TAA---TCGGGC---T-----T-G--GT--A--CC----ATA-CA----A--T----A------CG-T-----------CCCC----GAGCAA--TGGCA--GCCA--------TGT--TG-TTATGATTTCCTG-AG-----TAAT--CGGC-TG------TATA--TCGG
gi|28 : TC----AT--AATATTCATTAATATACAT-CATC---AAGA--A---CCAGAAAGGAAAGGACATGATATCATAT---T--------A---------TA------TACGT-T-TT--------------AGTCGGGT---G-----T-G--GA--A--CC----ATA-CA----A--C----A------CG-T-----------TCCT----GAGCAA--TGGCG--GCCG--------TGT--TG-TTATGATTTTGCG-AT-----TAAT--TGGC-TC------TACA--ACGGTAG----A--TGTACa
gi|29 : GGTTTATA-TTTATTTCATCACTCA---T------TTC------------CTCAT--------------------AA--A---ACAGGAACTCATGGTCAGTATA-CATGT-----------------------A------TT-GT-C-TT----------TAA---TCGGGC---G-----T-G--GTGTA--CC----GTA-CA----A--T----ATATGTACG-T-----------CCCT----GAACAA--TGGCG--ACCGACCG----TGT--TG-TTCTGATTTCCCG-AT-----T
gi|3 : TTTACA-TTTAATTCACTACTGA---TTTC---CTC----AT--GAA-CTCATTAATATTTTT-CTTT---AAGA--A---ACGAAAAATAAAGGACAGGATATCATGT---T--------A---------TA------TA-GT-C-TT----------TAA---TCGGGC---G-----T-G--GT--A--CG----GTA-CA----A--T----A------CT-T-----------CCTT----AGGGAC--TGATG--GCCG--------TGT--TG-TGTTGATTTCCCG-AT-----TAAT--CGGC-TAGA----TATA--ACGGTAA----C--CGTACC--ATTTGTC-------T--TTTC---AG-TTTTA-CTTTT-G-TACCCATCT-A---T------GCACCATT-C---TTATTTGAATTC-TGGG-TT--TTGGTC-A-TTCATTGAAAGAACC--AGCAAAC-TTGGATAAT---TAT-TTTGGAGAATA---A---TAAACCTTCTG-----ATAAA-TTTGC----------T----------------AATGT-------AATATTT-----GTA----GCAG-TCA---TCCA-TC---CAGATTGCTCGAGTTT----CCTCT------------------CATAATGTCTGCTAC-ACTTCTC----CC
gi|3 : CAAACACCAGAGTCACTACACT-GCC-ACCAAAagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacgactgtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacaaacaccagagtcactacactgccaccaaa
gi|30 : tttacatttaattcactactgatttcctcatgaactcattaatatttttctttaagaaacgaaaaataaaggacaggatatcatgttatatagtctttaatcgggcgtggtacggtacaatacttccttagggactgatggccgtgttgtgttgatttcccgattaatcggctagatataacggtaaccgtaccatttgtcttttcagttttacttttgtacccatctatgcaccattcttatttgaattctgggttttggtcattcattgaaagaaccagcaaacttggataattattttggagaataataaaccttctgataaatttgctaatgtaatatttgtagcagtcatccatccagattgctcgagtttcctctcataatgtctgctacacttctcccagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacgactgtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaTGGTC-A-TTCAGTGAAAGAACC--AGCAAAC-TTGCATAATTTTATT-TTTTGAGAATA---A---TAAACCTTCTG-----ATAAA-TGTGT-CA-------T------------------TGT-------TCTG--T-----GTA----GCGG-TCA---CCCA-TC---CAGGTTGCTCAAGTTT----CCTTT------------------TATACTATTCACTAC-ACTT
gi|31 : GGTTTATA-TTTATT-CATCACTCA---T------TTC------------CTCAT--------------------AA--A---ACAGGAACTCATGGTCAGTATA-CATGT-----------------------A------TT-GT-C-TT----------TAA---TCGGGC---G-----T-G--GTGTA--TC----GTA-CA----A--T----ATATGTACG-C-----------CCCT----GAACAA--TGGCG--ACCG--------TGT--TG-TTCTGATTTCCC
gi|32 : T-TTTGGAGAATA---A---TGAACCTTCTG-----ATAAA-TGTGCTTA-------TTTGAATTGACGAATTCAACATTGCATTAAACG--TAATGTGTA----ACGG-TCA---TCCA-TC---CAAGTTGTTCAAGTTT----CCTCT------------------TATACTGTCCGCTAT-AC
gi|33 : gGGTTCACA-TTTATTTCACCACTCA---T------GTT----TT------TTCATAAATATATTT-CATT---TAGG--A---ACAAAATGTAAAGGACAGTATCTCATGA---T--------A---------TA------TG-AT-T-T---------------AATCTGGC---G-----T-GGTGT--A--CC----GTA-CA----G--T----A------CG-cc
gi|34 : TAAAGGACAGCATATCATGT---T--------A---------TA------TA-GT-C-TT----------TAA---TCGGGC---G-----T-G--GT--A--CC----GTT-CA----A--T----A------CG-T-----------CCCT----GAGCAA--CGACG--GCCA-------------TA-TTCTGTTTTCCCA-AT-----TAAT--CGGT-TG------TACA--ACGGT
gi|36 : --T----A------CG-C-----------CCCT----GAAAAA--AAGAG--GACGGGATATCATGTGATG-TTCTGATTTCCCGGAT-----CAAT--CGGC-TG------TATA--ACGGTAG----C--TTTACC--ATGTATT-------TCATTTT---AA-TTTTA-CTTTT-A-
gi|38 : T-CATT---AAGA---------GAAAATAAAGGACAAAATTTCACAT---T--------A---------TA---------GT-C-TT----------TAA---TTGGGCCTTG-----T-G---T--A--CC----AAA-CA----A--TTAATA------CG-C-----------CCCT----GAGCAA--ATGTG--GCCG--------TGT--
gi|4 : GTTTACG-TTTATTTCATCACTAA---TTTC---CTC----AT--AAAACCCATTAATATATTT-CATT---ACGA--A---ACGGAAAGTAAAGGATAGGATATTATGT---T--------A---------TA------TA-GT-C-TT----------T---AATCGGGT---G-----T-G--
gi|4 : tT-----TAAT--CGGG-TG------TGTATGAAGGTAA----C--TGTACT--ATTCATC-------T--GTTC---AA-TTTTA-CTTTA-A-CAACCATTT-A---T------GGACTATT-C---TGATATGAATTC-CTGGATT--TTGGTC-A-TTTAG--AAAGAGCC--AGCAAAC-TTACAT----------TTTGGAGAATA---A---TAAATCTTCTGGCAAAACAAA-TGTGC-T---------------------------TTT-------AACA--T-----GTA----GTGG-TCA---TCCA-TC---CATTTTGCTCAAGTTT----CCTCT------------------TATACTGTCCAATAC-ACTCTCC----tatgaaggtaactgtactattcatctgttcaattttactttaacaaccatttatggactattctgatatgaattcctggattttggtcatttagaaagagccagcaaacttacattttggagaataataaatcttctggcaaaacaaatgtgcttttaacatgtagtggtcatccatccattttgctcaagtttcctcttatactgtccaatacactctccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcactgtcttccttagacgtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccaaacacctgagtcctacgctgccac
gi|4 : tgtttacgtttatttcatcactaatttcctcataaaacccattaatatatttcattacgaaacggaaagtaaaggataggatattatgttatatagtctCCAAACACCTGAGTC-CTACGCT-GCC-ACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcactgtcttccttagacgtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccaaacacctgagtcctacgctgccac
gi|40 : tgtttacgtttatttcatcactaatttcctcataaaacccattaatatatttcattacgaaacggaaagtaaaggataggatattatgttatatagtctttaatcgggtgtgtatgaaggtaactgtactattcatctgttcaattttactttaacaaccatttatggactattctgatatgaattcctggattttggtcatttagaaagagccagcaaacttacattttggagaataataaatcttctggcaaaacaaatgtgcttttaacatgtagtggtcatccatccattttgctcaagtttcctcttatactgtccaatacactctccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcactgtcttccttagacgtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaAAATAAAGGACAGGATATCATGTA--T--------A---------TA------TA-GT-C-TT----------T---AATCGGGT---GT----T-GT-GT--A--CC----GTC-CG----A--T----A------CG-T-----------CCCT----GAGCAA--TGGCG--GTCA-------------TG-TTCTGATTTC
gi|41 : GGTTTACA-TTCATATCATCAATCA---T------TTCCTT-AT--AGGATTTATTAATACATTT-TATT---AAGA--A---ACGGAAAATAAAGGACATGTTATCATAT---
gi|42 : TGGCC-A-TTCAATGAAAGAACC--AACGAAA-TTGAATATA---GTT-TTT-TAGAATG---A---TAAAACTCCTG-----ATAAA-TATGC-Tc
gi|43 : TGGTTTACA-TTAATTCCAACACTCA---TTTC---CTC----AT--AAA
gi|44 : aTGGTTTACA-TTTATTTCATCACTCA---TTATTTCCTT----AT--AAAACTggatgaagtgcagtctccatacatgta
gi|45 : ttaTGGTTTACA-TTTATTTCATCACTCACTTT------CTC----AT--AAAACTC
gi|46 : aCCAAACACCAGAGTCACTACGCTGGCCAACCAAAt
gi|47 : GCCAAACACCAGAGTCACTACGCT-GCCAACCAAtt
gi|48 : GCCAAACACCAGAATCACTACGCT-GCC-ACCAAAtt
gi|5 : cTACA-TATATTTTATCAT--A---T------TTC----CTTAAAAAATCATTAATATATTT-CATT---AAGA--A---ACGG
gi|5 : aATCAT-T---A--------A---------TA------TA-TTTC-AT----------TAAGAAACGG-C---G-----TTGT-GT--A--CC----GTAACAGGTGA--G----A------CGATA----------CTCTTGAGGAGCAAGGTGGCGAGGCCG--------TGT--T----CTGATTTCCTG-AT-----TAATCGCGGC-TGCGTTCATATA--ACAGTAA----CCTTGGATCGAATTTGTCACTGGGTT--TTTCATGAA-TCCGACCTTTT-A-TAACCAATT-AGTGTAT----GCATCTTTGCATATGATATCAACT----GGCTTAGTTGGTC-A-TTCAGTGAAATGACCCAAGAAAACATTACATCAA---ATTCCCTTGAGAATA---A---ATAGCCTTCTG-----ATAAATTTTGC-TAATTATGGT----------------AACGT-------GTCG--T-----GTA----GCGGTTCATTGTCCATTT---CAGATTGCGTAAGTTTATACCCTCT------------------TATACTCCGCGCTAC-Acgttgtgtaccgtaacaggtgagacgatactcttgaggagcaaggtggcgaggccgtgttctgatttcctgattaatcgcggctgcgttcatataacagtaaccttggatcgaatttgtcactgggtttttcatgaatccgaccttttataaccaattagtgtatgcatctttgcatatgatatcaactggcttagttggtcattcagtgaaatgacccaagaaaacattacatcaaattcccttgagaataaatagccttctgataaattttgctaattatggtaacgtgtcgtgtagcggttcattgtccatttcagattgcgtaagtttataccctcttatactccgcgctacaat
gi|50 : atacatatattttatcatatttccttaaaaaCCAAA-ACCAGAGTCACTACGCT-GCC-ACCAAat
gi|51 : CCAAACACCAGAGTCACTAACCT-GTC-ACCAAAttt
gi|52 : CCAAACACCAGAGTCACTACGCT-GCC-ACCAAt
gi|53 : CCAAACACCAGAGTCACTGCGCT-GCC-ACCAAt
gi|54 : CCAATCACCAGAGTCACTACGCT-GCC-ACCAAt
gi|55 : CCAAACACCAGAGTCACTACGCT-GCC-ACCAAt
gi|6 : -------T--TTTC---AA-TTTTA-CTTTT-A-AAACCATT-------AT----GAGCCCTT-G---TTATATGAATTT-CGGTGTT--TTAGTC-A-TTCAGTGAAAGAATC--AGCCGAC-CAGCATAAA---TTT-TTGGGAGAATA---A---CAACACTTCTG-----ATAAA-TGTGC----------T----------------AATGT-------AACG--T-----GTA----GCGA-TCA---TTCA-TC---TAGGTTGCTCAACTTT----CCTCT------------------GATACTGCCCGCTATAACTCTTC----
gi|7 : -TTTTA-CTTTTTA-AAACCATTT-A---T------GAACCATT-C---TGATATAAATTT-CGGGCTT--TGGGTC-A-TTCAGTGATTGAACC--AGCAAAC-TTACAAAAAG--AT-----GGAGAATA---GCCCTAAACGCTCTG-----ATAAA-TGTGC--A------------------------AATGT-------A------------TA----GCGG-TTA---TCCA-TC---CAGGTTGCTCAAATTT----CCTCT------------------TATACTGCCCGCTAC-ACTTTTC----gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccactgtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngccaaacaccagtcacctagctgctacc
gi|7 : CCAAACACCAGAGTCACTAAGCT-GGC-ACCAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccactgtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntccaaacaccagagtcactaagctggcaccaa
gi|8 : ttttactttttaaaaccatttatgaaccattctgatataaatttcgggctttgggtcattcagtgattgaaccagcaaacttacaaaaagatggagaatagccctaaacgctctgataaatgtgcaaatgtatagcggttatccatccaggttgctcaaatttcctcttatactgcccgctacacttttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccactgtctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntTATC--ATTTATC-------T--TT-C---AG-TTTTA-CCTTT-A-AAACCATT-------AT----GAACCATT-C---TGATTTGAATTC-CCGGGTT--TTGGTC-A-CTCAGTGAAA---------------------AAA---ATTGTTTGGAGAATA---A---TAAACCTTCTG-----ATAAA-TGTGC-TA-------------------------ATGT-------AACG--T-----GTACATAACGG-TCA---TCCA-TC---CAGGTTGCTCAAGTTT----CCTCT------------------TATACTGTCCGCCAC-ACTTTCC----CCCGCACAGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCACTGTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCCAAACACCAGAGTCACTAAGCT-GCC-ACCAAA
gi|9 : gtTGGTTTACA-TTTATTACATCACTCA---TTTC---CTC----AT--AAAACTCATTAATATATTT-CATT---AAGA--ATTAACGGAAAGTAAAGGACAAGATATCATGT---T--------A---------AA------TA-GT--------------------------------------------------------A-CA----A--T----A------CG-T-----------CCCT----GAGCAA--TGGCG--GTCG--------AGT--TG-CTCTGATTTCCTG-ATCACGTTAAT--CGGC-TG------TATA--ACGGTAA----C--TGTACC--ATTTATC-------T--TTTT---AAATTTTA-CTTTT-A-A---CATTT-A---T------GGATCATT-C---TGATAAGAATTC-TGGGGCT--TTGGCC-A-TTCAGTGAAAGAACC--AGCAAAA-TTACATAAA---ATT-TTTGGAGAATA---A---TAAACATTCTG-----ATAAA-TGTGC----------T----------------AATGA-------AACC--T-----GTA----GCAG-CCA---CCCA-TC---CACGTTGCTTAAATTT----CCTCTAAGGC-------------TA-ATTGTCCGCTAC-ACTT
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|35 ): TGTAGGGTTATGGCTACTTTATTTTGGGCTTTGTGGTATATAACGAGTTTTGTGCACTTTTCTAACATCGGAATGAGAGAGGCAGTCATCTAACCTTAAACTTGTCATTCAGTG
Unaligned ( gi|37 ): TTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAACCACTGTC
Unaligned ( gi|39 ): TTGTCTCGCGGCGTTGAGTTTTGGCTACTTTATTTTGAGCTTAGTGATGTTTCTCGAGTTTGGTGCATTTTCCTAGAAACCACTCATTTAACCTTAAA
Unaligned ( gi|49 ): GTATAAAGCGTATATTTCATAAGTTTTGAACGTG