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Reference ( gi|6 )            :                                 CCAGT-AT-A-ACCTCAA--CTTTT-GCATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----A----A-------AA---A----T-TAT-TTT---TT-T-CA--TTT--GT--AATA-T--T-TCTC---A-T-T----T-CCATCC-ACC-AT---T-G-A-CAA--TA--TTA-T-GAGT---------G-ATTC---C--A----C-----T--A-TT-CAAAAT--GT--T-CT-CT-AA-T-A-G-GACTG-CACACAATTTG-TACA--TG-T-AAC-ATTTT---GA---CT-G-GGT-AT----G-AAT--TGA-CTT--G-GG-C--A--TG--ATTT-GA-C---C---A-A-C--AT--A--CCT-GACTT-----CCGGAAG-TTTGTAA-A------C-AA--A--------A---A-TAGCTAATG-CG-TA--T-T--AAATGA------------AACTT-TTGAC-AGG-----------TTT--T-CA--ACTT-AT-GTCT---A--GGT-AAGA---C--A-AAATA-T-T-T-AA-AGCAA-TC-AG----TG---C-C----TTC--A-A-TT-A-G-CCAC-CA-GA-TTGTC-A--T-T----T-AGGT--G-ACC-T-A-C-AT----TGGA----AA-T-GG-T-T-TG-G-AG-A--AT-AC-G-AAATA-GA-----A--CT-G-CG-G-GG-A-A-C--------GT-C-TTGT--AAT-ATTCCAA------TACAA-AATCTCCTT--TCAT-A-CGAATGTCAATGTGTTCA-TGCGC-CGTAT-----G-A-TACTGA--GGC-CTGAAATATC-CC-----------AA-TGA-------------TT--------GT--------GC------------------------T-G-TTTTA-CAAT-C-AA--TATA---A--T--A--T---GTCGT--TATATTC-A-A-AAT---A---TTTTTC--A--TTTC--ATC-AT--GTTA---T---T--CAGAAAACGAAT--TT-A-CAT-ACAC-T-------C-C-----------AC------CACA-CA-C--ACT-CGCACAAC-T-------A-T--A-T--G-T---G--------TT-----G---CGT---AG---ACAA-GT---AG-T--A-G--CGGTG--A---AGAGGG-AGATC-CG-CG---A-AAA-T--C--GC-CT-GA-CG-ACAAGGA----G-TACGCT-CGCTA--CGCGAGCC-G-CCTAAAA
gi|10                         :                                 CCAGTTATGA-ACCTCAA--CTTTT-GCATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA-----A----AT------AAAATA----T-TTT-TTT---TT-T-CAATTTT--GT--AATATT--T-TCTCCA-A-T-T----T-CCATCC-AAC-CT---TGG-A-C-A--TT--TTA-TAAAAT---------G-ATTTTCAC--A----C-----T--A-TT-CAAAAT--GT--T-CTAAT-AT-T-A-G-AACTG--GCA-AA--TG-TACATGTG-T-AAC-ATTTT---GA---CT-G-GGT-AT----G-AAT--TGA-TTT--G-GG-C--A--T---ATTT-GA-C---C---T-A-C--AT--A--CC------T-----CCGGAAG-TTTGTAA-A------C-AA--A--------A---A-TAGCTAATG-CG-TA--T-T--AAATGA------------AACCT-TTGAC-AGG-----------TTT--T-CA--ACTT-AT-GTTT---A--GGT-AAGA---C--C-AAATA-T-T-T-TA-AGCAA-TC-AG----GG---C-C----TTC--C-A-TT-A-G-CCAC-CA-AA-TTGTC-A--T-T----T-AGGT--G-ACC-T-A-C-AT----TGGA----AA-T-GG-T-T-TG-G-AG-A--AT-AC-C-AAATA-GA-----A--CT-G-CG-G-GG-A-A-C--------GT-C-TTGT--AAT-AT---------------------TTCTT--TCAT-A-CA------AATGTGTTCA-TACGC-CGTAT-----G-A-TACT-A--GGG-CTG--ATATC-CC-----------AA-TGA-------------TT--------GT--------GC------------------------T-G-TTTTA-CAAT-C-AA--TATA---A--T--ATGT---GTC-T--TATATTC-A-A-AAT---A---TTTTTC--A--TTTC--ATC-AT--GTTA---T---T--CAGAAAACGAAT--TT-A-CAT-ACAC-T-------C-C-----------AC------CACA--G-C--ACT-CACACAAC-T-------A-T--ATT--C-T---G--------TT-----G---CGT---AG---ACAA-GT---AG-T--A-G--CGGTG--A---AGAGGG-AGATC-CG-CG---A-AAA-T--C--GC-CT-GA-CG-ACAAGGA----G-TATGCT-CGCTA--CGCGAGCC-G-
gi|9                          :                           aaacccCCAGTTATGA-ACCTCAA--CTTTT-GCATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC----A----A-------AA---A----A-TATGTTT---TT-T-CA--TTTT-GT--AATA-T--T-TCTC---A-T-T----T-CCATCC-ACC-AT---T-G-A-CAA--TT--TTA-T-GAGT---------GAATTCA--C--A----C-----T--A-TT-CAAAAT--GT--T-CT-CT-AA-T-A-G-GACTG-----CAATATG-TACA--TG-T-AAC-ATTTT---GA---CT-G-GGT-AT----G-AAT--TGA-CTT--G-GG-CATA--TG--ATTT-GA-C---A---T-G-C--AT--A--CCT-GA-TT-----CCGGAAG-TTTGTAA-A------C--A--A--------A---A-TAGCT-ATG-CG-TA----T--AAATGA------------AACTT-TTGAC-A-G-----------TTT--T-CA--ACTT-AT-GTCT---A--GGT-AAGA---C--C-AAATATT-T-T-AATAGCAA-TC-AG----TG---C-C----TTC--A-A-TT-A-G-CCAC-CA-GA-TTGTC-A--T-T----T-AGGT--G-ACC-T-A-CAAT----TGG-----AA-T-GGTT-T-TG-G-AGAA--AT-ACAA-AAATA-GA-----A--CT-G-CG-G-GGAA-A-C--------GT-CTTTGT--AAT-ATT----------------------CTT--TCAT-A-CG------AATGTGTTCA-TACG--CGTAT-----G-A-TACT-A--GGG-CTG--ATATC-CC-----------AATTGA-------------TTG-------GT--------GC------------------------T-G--TTTA-CAAT-C-AA--TATAAGTA--T--G--T---GTCTT--AATATTC-A-A-AAT---AT--TTTTTC--A--TTTC--ATC-AT--GTTAT--T---T--CAGAAAACGAAT--TT-A-CAT-ACAC-T-------T-C-----------AC------CAC--TG-C--ACT-CGCACAAC-T-------A-T--ATT--A-T---G--------TT-----G---CGT---AG---AGAA-GT---AG-T--A-G--GGGTG--A---AGAGGA-AGATC-CG-CG---A-AAA-T--C--GC-CT-GA-CG-ACAAGGA----G-TACACT-CGCTA--CGCGAGCC-G-ACTCAAAattcaaa
gi|7                          :                            aacccCCAGTTATGA-ACCTCAA--CTTTT-GCATAAAGTTTGGTGATTTTGCGCCCGATTATTCTGGGAACAAGATTTTTCCCTTATATAAA----A-------AA---AGATTT-TTT-TTT---TT-T-TT--TTT--GA--AATA-T--T-T-TC---A-T-T----T-TCATCC-ACC-AT---A-G-A-CAA--T---TTA-T-GAGT---------G-ATTT---C--A----CAC---T--A-TT-CAAAAT--GT--T-CT-CT-AACT-A-G-GACTG-CA----ATATG-TACA--TG-T-AACTATTTT---GA---CT-G-GGT-AT----G-AAT--TGA-CTT--G-AGAC--A--TG--ATTT-GA-C---T---A---C--AT--A--CCT-GACTT-----CCGGAAG-TTTGTAA-AA-----C-AA--A--------A---A-TAGCTA-TG-CGGTA--T-A--AATTGA------------AAACT-TTGAC-AGG-----------TTT--T-CA--ACTTTAT-GTCT---A--GGT-AAGA---C--C-AAATA-T-T-T-TA-AGCAA-TC-AG----TG---C-C----TTC--A-A-TTTA-G-CCAC-CA-GA-TTGTC-A--A-T----T-AGGT--G-ACCAT-A-C--T----TGAG----AA-T-GG-T-T-TG-G-AG-A--AT-AC-G-AAATA-GA-----A--CT-G-CC-G-GG-A-A-C--------GT-C-TTCT--AG----GCC--------TA--------------------A-CGAAT------GTGTTCA-TACGC-CGTAT-----G-A-TACT-A--GGG-CTG--ATATC-CC-----------AA-TGA-------------TT--------GT--------GC------------------------T-G-TTTTA-CAAT-CAAA--AATA---A--T--ATGT---GTC-T--TATATTCAA-A-AAT---A---TTTTTC--A--TTTC--ATC-AT--GTTA---T---T--CAGAAAACGAAT--TT-A-TAT-ACAC-T-------C-C-----------AC------CACA--G-C--ACT-CGCACAACAT-------A-T--ATT--C-T---G--------TT-----G---CGT---AG---ACAA-GT---AG-T--A-G--CGGTG--A---AGAGGG-AGATC-CG-CG---A-AAA-T--C--GC-CT-GA-CG-ACAAGGAGTACG-TACGCT-CGCTA--CGCGAGCC-G-ACTCAAA
gi|3                          :                            aaaccCCAGTTATGA-ACCTCAA--CTTT--GCATAAGTTTGTGTGTATTTTTTTGGCCGGCTTGTTCTGGACAAGATTTTCCCTTAT----ATC--A-------AA---A----T-T-T-TTT---TT-T-TA--TTTTTGT--A-TA-T--T-TCTC---T-TGT----C-CCATCC-ACC-AA---T-G-A-CAA--T----TA-T-GAGTT--------G-ATTT---CGAA----C-----T--A-TT-CAAAA---GT--T-CT-CTTAA-T-A-G-GACTG-CACA---TTTG-TACA--TG-T-AAC-ATTTC---GA---CTCG-GGT-ATAT--G-AAT--TGA-CTT--T-GG-C--A--TG--ATTT-GA-C---C---T-ATC--AT--A--CCG-GACTT-----CCAGAAG-TTTGTAA-A------C-AA--A--------ATAAA-TAGCTAATG--G-TA--CGT--A-----------------------TTGAC-AGG-----------TTT--TTCA--ACTT-AT-GTCT---A--G-T-A-GA---C--A-AAATA-T-T-T-TA-AGCAA-TC-AG----TGTG-C-C----TTC--A-A-TT-AAG-CCAC-CCCGA-TTGTC-A--T-T----T-AGGT--G-ACC-T-A-C-AT----TGGA----CA-T-GG-T-T-TG-G-A--A--AT-AC-G-AAATA-GA-----A--CT-G-CG-G-G--A-A-C--------AT-C-TTGT--AATTATTCCAA------TATAA-ATGCTCCTT---CAT-A-CGAATGT----GTTTCCA-TGCGC-CGTAT-----C-A-TACT-A--GTG-CTGA--TATC-CC-----------AA-TGA-------------TT--------GT--------TT------------------------T-G-TTTTA-CA-T-C-AA--TATA---A--T--A--T---GT-GTC-TATAATC-A-A-AAT---A---TTTTTC--A--TTTC--ATC-ATTTGTTA---T---TT-CAGAAAACGAAT--TT-A-CAT-ACAC-T-------C-C-----------AC------CACA--G-C--ACTTCGCACAAC-T-------A-TT-A-TT-G-T---G--------TT-----G---CGT---AG---ACAA-GT---AG-T--AAG--CGGTGGAA---AGAGCG-AGATCGCG-CA---A-AAT-T--C--GC-C--GA-CG-ACAAGGA----G-TACGCT-CGCTA--CGCGAGCC-G-ACTCAAAa
gi|2                          :                            accccCCAGTTAT-GGACCTCAA--CTTTT-GCATAAGTTTGGTGATTTTTGGCCCGAAGTTATTCTGGACAAGAAAGTTTTCACTT-----A----ATATCAAAAA---A----A-TAT-TTTGTTTT-T-CA--TTTT-GT--AATA-T--T-TCTC---AGT-T----T-CCATCCGACC-AT---T-G-AGCAA--TT--TTAGT-GAGT---------G-ATTT---C--AAACAC-----T--A-TTTCAAAAT--GT--T-CT-CT-AA-T-A-GCGAGTG-CA----ATATG-TACA--TGGT-AAC-ATTTTT--GA---CT-G-GGT-AT----G-AAT--TGAGCTT--G-G-----A--TG--AGTT-GAAC---C---T-A-C--AT--AA-CCT-GACT------CCGGAAG-TTTGTAA-AA-----C-AA--A--------A---AATAGCTAATGGCG-TAAAT-T--AAATGA------------A-CTTGTTGAC-AGG-----------TTT--TTCA--ACTTCAT-GTCTTA-A--GGT-AAGA---CCCA-AAGTA-T-T-T-TA-AGCAA-TC--G----TG---C-C----TTC--A-AGTT-A-GGCCAC-CA-GA-TTGTC-A--TGT----T-AGGT--G-ACT-----C-AT----TGGA----AA-T-GG-T-T-TT-G-AG-A--AT-AC-GGAAATA-GA-----A--CT-G-CT-G-GG-A-A-C--------GT-C-TTCT--AA--------A------TA----AAT-TCCTT--T-AT-A-CGAATGT------GTTCA-TACGCGCGT-T-----G-A-TACTGA--GGC--TGA--TATC-C------------AA-TGA-------------TTT-------GT--------GC------------------------TTG-TTTTA-CAAT-CCAA--AATA---A--T--A--T---GGTGTCTTATATTC-A-A-CAT---A---TTTTTC--AACTTTC--ATC-AT--GTTA---T---TT-CAGAAAA-GAAT--TT-AACGT-ACACAT-------C-A-----------AC------CACA--G-C--ACT-TGCACAAC-T-------AAT--A-TT-GCT---G--------TT-----G---CGT---AG---GCAA-GT---AG-T--A-G--CAGTG--A----GAGGG-AGATC-CG-CA---A-AAA-T--C--ACTCT-G--CG-ACAAGGA----G-TAaa
gi|1                          :                            aaaccCCAGTTATGA-ACCTCAAAACTTTTCGCATAAGTTTGGTGATTTTTGGGCCCGCATTGTTCTGGACAAGATTTTGCCCTTAT-----ATCAAA-------AA---A----A-TAT-TTT---TT-TTCA--TTTTTGT--AATA-T--T-TCTC---A-C-TATTGT-CCATCC-ACC-AT---T-GGA-CAA--TTCTTTA-T-GGTT---------G-ATTT---C--A----CAACCCT--A-TC-TAAAAT--GT--TTCT-AT-AA-T-AAG-GACTT-CACATATGTTG-TATGC-TG-TGAACGATTTTTAGAA---CA-G-GGC-ATATGTG-AATC-TGA-CTT--G-G--C--AGTTG--ATTTTGA-A---C---ACG-C--ATTTA--ACT-GACTTAGATACCGGAAG----GTA-------------------------------------TG-TG-TA--------AACAA------------AA-------AT-AA------------TCT--G-CA--ACTT-AT-GCCT----------------------------T-C-T-AA-TGCAA-TC-AGC---TGGACCGC----TTC--ATA-CT-A-G-CCAC-CA-GA-TTGTC-ACGT-TG---T-AGGTT-G-AAT-T-A-C-AT----TGGA----AAAT-GG-TAT-TG-GTAG-A--AT-AC---AAATA-GA-----A--CT-GGCGTG-GGCG-A-T--------AC-T-TTGTT-AAT-ATTGC----------------TCTC--T--TCAT-ATCGAATGT------GTTC--TACGC-CGTAT-----G-AATACTAG--GG---TGAA---TC-CC-----------AA-TGA-------------TT--------GT--------GCTGTTTTTACATCAATATAACTATGT-G-TCTTA-GGAT-C-AAAAGATG---A--TTCA--TTCAATCATCGTATGTTC-ATG-AACGCAA---TTTTCA--A--TTTT--GTTTAT--TTTA---CGTAT--AAGCAGACAAAT--TTTA-CAT-ACAC-T-------T-CTACTCGTGTGGAC------CACA-AAGCTAACT-CGCACAAC-TGCTGAGTA-T--ACT--A-G---G--------TTCTTGTG---CGT---AGTAGACAA-GTTTAGG-TTAA-G--CGGTG--A---AGAGTGCAGATTACG-CC---ATAAA-T--CTTGC-CTTGA-CGGACA-GGA----G-TACGCTCCGCT---CGCCAGCCTA-CTCAAAAgcggcggagcgactgcaaga
gi|8                          :                                 aaccT-ATGA-ACCTCAA--CTTTT-GCATAAGTTTGGTGATTTTTGGCCCGGTTCGTTCTGGACAAAGATTTTCCCTTATATCA--A----A-------AA---A----T-TAT-TTT---TT---CA--TTTT-GT--A-TA-T--T--CTC---A-T-T----T-CCATCC-ACC-AT---T-G-A-CAA--TT--TTA-T-GAGT---------G-ATTT---C--A----CAC---T--A-TTTCAAAAT--GT--T-CT-CT-AA-T-AAG-GACTG-CACACAATT-G-TACA--TG-T-AA--ATTTT---GA---CT-G-GGT-AT----G-AAT---GA-CTT--G-GG-C--A--TG--ATTT-GA-C-------A-A-C--AT--A--CCT-GACTT-----CCGGAAG-TTTGTAA-A------C-AA--A--------A---A-TAGCTAATG-CG-TA--T-T--AAATGA------------AACTT-TTGAC-AGG------------TT--T-CA--ACTT-AT-GTCT---A--GGT-AAGA---C--A-AAATA-T-T-T-AA-AGCAA-TC-AG----TG---C-C----TTC--A-A-TT-A-G-CCAC-CA-GA-TTGTCAA--T-T----T-AGGT--G-ACC-T-A-C-AT----TGGA----AA-T-GG-T-T-TG-G-AG-A--ATAAC-G-AAATA-GA-----A--CT-G-CG-G-GG-A-A-C--------GT-C-TTGT--AAT-ATTCCAA------TAC-A-AATCTCCCT--TCTT-A-CGAATGTC-ATGTGTTCA-TGCGC-GCTAT-----G-A-TACT-A--GGG-CTG-AATATC-CC-----------AA--GA-------------TT--------GT--------GC------------------------T-G-TTTTA-CAATCC-AA--T-TA---A--T--A--T---GTC-T--TATATTC-A-A-AAT-------TTTTTC--A--TTTC--ATC-AT--GTTA---T---T--CAGAAAACGAAT--TT-A-CAT-ACAC-T-------C-C-----------AC------CACA--A-C--ACT-CGCACAAC-T-------A-T--A-T--G-T---G--------TT-----G---CGT---AG---ACAA-GT---AG-T--A-G--CGGTG--A---AGAGGG-AGATC-CG-CG---A-AAA-TCGC--GC-CT-GA-CG-ACAAGGA----G-TACGCC-GGCTA--CGCGAGCC-GACCTAAA
gi|5                          :                                                                                                                  t-----A----A-------AA---A----A-TAT-TTT---TT-TTCAC-TTT--GT--AATA-T--T-TCTC---A-T-T----TGTTATCC-ACC-AT---T-G-A-CAA--T----TA-T-TAGT---------G-ATTT---CGTA----T-----T--A-TTACAAAATATGT--T-CT-CT-AA-T-A-G-GACTG-CA-----------ATA--TG-T-A----------------CT-G-G-T-AT----GGAAT--TGA-CTTT-G-GG-C--A--TG--ATTT-AAAC---C---T-A-C--AC--AAACCC-GACTT-----CCGGAAG-TTTGTAA-A------C-AATAA--------A---A-CAGCTAACG-CG-T---T-TGCAAATGAG-----------AACTT-TTGAC-AGG-----------TTT--T-CA--ACTT-ATTGTCT---G--AGT-AAGA---A--A-AAATA-T-C-T-TA-AACAA-TT-AT----TG---C-C----TTC--A-A-TT-A-G-CCAC-CA-GA-TCGTC-A--T-T----T-AGGTG-G-ACC-T-A-C-AT----T-GA----AA-T-GG-T-T-TG-G-AG-A--AT-AC-G-ATGTG-GA-----A--CT-G-CG-G-GG-AGA-C--------GT-C-------------------------------ATCTCCTT--TCAT-A--G------AATGTGTTCA-TACGC-CGTAT-----G-A-TACT-A--GGG-CTG--ATATC-CC-----------AC-AGACTCTAAAGTAAACCT--------GT--------GC------------------------T-G-TTTTA-CAAT-C-AA--TATG---A--T--ATGT---GTC-T--TATATTC-G-A-AAT---AT--TTTTTT--A--TTTC--ACC-AT--GTTA---G---T---AGAAAACGAAT--TT-A-CAT-ACAT-TACATTTAC-G-----------AC------CAAG-AG-C--ACT-CCCACAAC-T-------A-T--A-T--T-TTCAG--------TT-----G---CGT---AG---ACAA-ATTCAAG-T--A------GTG--A---AGAGGC-AAATC-CG-CG-----GAA-T--CA-GC-CT-GA-TG-GCAAGGA----G-TA-GCT-CGCTA--CGCGAGCC-G-ACTCAAA
gi|12                         :                        agctttgggaaacttcatttttacacttagcacacttcaaaatatatagatatccctataaaacaaaaataaattatttccccgaaattaa-----A----A-------AA---A----TATTT-TTT---TT-T-TA--CTT--GTGTAATA-TGGT-TCTCTTCA-T-T----T-GCATCC-ACCCAT---T-G---CAA--TG--TTT-T-TAGTTAATGGTGGG-ATTT---CGTA----T-----G--A-TT-TAAAAT--ATG-T-CT-CT-AA-TTA-G-GACTG-C---CAATATG-TATA--TG-T-AAT-ATTTT---GA---CT-G-GGT-AT----G-AAT--TGA-CTT--G-GA-C--A--TG--ATTT-GG-C---C---T-A-C--AT--A--CCT-GACTT-----CTGG----------------------A--A--------A---A-CAGCTAACG-CG-T---T-TACAAATGA------------AAC-T-TTGAC-AGG-----------TTT--C-CA--ACTT-AT-GTCT---G--AGT-AAGA---C--A-AAATG-T-C-T-TA-AACAA-TC-AT----TG---C-C----TTC--A-A-TT-A-G-CCAC-CA-GA-TCCTC-A--T-T----T-AGGT--G-ACC-T-A-C-AT----TGG-----AA-T-GG-T-T-TG-G-AG-A--AT-AC-A-ATGTA-GA-----A--CT-G-AG-G-GG-A-A---------------------------TCC---------------------TT--TCAT-A-CG------AATGTGTTCA-TACGC-CGTAT-----G-A-TACTGG--GG--CTG--ATATC-CCACATACTCTAAAG-TAAAC-----------TT--------GT--------GC------------------------T-G-TTTTA-CAAT-C-CA--TATG---A--T--AGGT---GTC-T--TATATTC-A-A-AAT---A---TTTTTT--A--GTTC--ACC-AT--GTTA---T---T--CAGAAAACGAAT--TT-A-CAT-GCAT-T-------A-C-----------AC------CACA--A-C--ACT-CCCACACC-T-------A-A--A-T--A-TTCAG--------TT-----G---CGT---AG---ACAA-TTC--A-----A-G--TGGTG--A---AGAGGC-AAATC-CG-CG---A-GAA-G--CG-GC-CT-GA-TG-GCAAGGA----G--AAGCT-CGCTA--CGCGAGCC-A-ACTCAAA
gi|13                         :                                                                      ataaaatcaaagaaggtgaagttattgtcgccgacgcattttaaa-----A----A-------AA---A----T-TTT-TTT---TT-T-AAC-TTT--GT--AATA-T--T-TCTC---A-T-T----T-GCATCC-ACC-AG---T-G-A-CAA--TT--TTA-T-TAGT---------G-ATTT---C--G----CAT---T--A-TT-CAAAAT--ATATT-CT-CT-AC-C-A-G-GACTG-CA----ATATG-TACA--TG-T-AAT-ATTTT---GA---CT-A-GGT-AT----G-AAT--TGA-CTT--G-GG-C--A--TG--ATTT-AA-C---C---A-A-C--AT--A--CCT-GACTT-----CCGGAGG-TTTGTAT-A------C-AA--A--------A---AACAGCTAACG-CG-T---T-TGCAAATGA------------AACTT-T-GAC-AGG-----------TTT--T-CA--ACTT-AT-GTCT---G--AGT-AAGA---C--A-AAATA-T-C-T-TA-AACAA-TC-AT----TG---C-C----TTC--A-A-TT-A-G-CCAC-CA-GA-TCGTC-A--T-T----T-AGGT--G-ACC-T-A-C-AT----TGGA----AA-T-GG-T-T-TG-G-AG-AATAT-AC-G-ATGTA-Ga
gi|4                          :                                                                                                              aaaaa-----A----A-------AA---A----T-TTT-TTT---TT-T-TAACTTT--GT--AATA-T--T-TCTC---A-T-T----T-GCATCC-ACC-AG---T-G-A-CAA--T---TTA-T-TAGT---------G-ATTT---C--G----CAT---T--A-TT-CAAAAT--ATATT-CT-CT-AC-C-A-G-GACTG-CA----ATATG-TACA--TG-T-AAT-ATTTT---GA---CT-A-GGT-AT----G-AAT--TGA-CTT--G-G--C--A--TG--ATTT-AA-C---C---A-A-C--AT--A--CCT-GACTT-----CCGGAGG-TTTGTAT-A------C-AA--A--------A---AACAGCTAACG-CG-T---T-TGCAAATGA------------AACTT-T-GACCAGG-----------TTT--T-CA--ACTT-AT-GTCT---G--AGT-AAGAA--C--A-AAATA-T-C-T-TA-AACAA-TC-AT----TG---C-C----TTC--A-A-TT-A-G-CCAC-CA-GA-TCGTC-A--T-T----T-AGGT--G-ACC-T-A-C-AT----TGGA----AA-T-GG-T-T-TG-G-AG-AATAT-AC-G-ATGTA-Gtccttttatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacatacattacatttacagcatatagcactcccacaactatattcagttgcatagtcaattcaagtagtgaagaggcaaatccgcgagaatcagcctgatggcaaggagtagctcgctacgcgagctgactcaa
gi|15                         :             aagctttgggaaacatcattcatttttacacttaccacacttcaaaatataatagatctccttataaaacaaaaatgaaatatttacccgaatattaaaaaa-----A----A-------AT---A----T-TTT-TTT---TTAT-TAG-TTT--GT--AATA-T--T-T-TC---A-T-T----C-CAATCCCACC-ATAACT-G-A-CAAGTTT--TTA-T-GAGT---------G-ATTTTCAC--A----C-----T--A-TT-CAAAAT--GT--T-CT-CTTAA-T---G-GACTGGCATACTATATGATTTA--TG-T-AAC-TTTTT---GA---CT-GTGGTTATT---G-AATGGTGATCTTATG-GG-C--A--TG--ATTT-GA-C---A---T-G-C--AT--A--CCT-GATCT-----CCGGAAG-TT-GTGAGA------C-AA--A--------A-----T-GCT---G-CG-TA--T-T--AAATGA------------AACTT-TTGAC-AGG-----------TTT--T-C---ACTT-A--GTCT---AGGGGT--AGA---C--C-AAATA-T-TGT-TA-AGCAA-TCAAG----TG---G-CGTTGTCT--A-ATTT-A-G-CCACTCA-GATTTGTC-A--T-T----TAAGGT--C-ACC-TAA-C-AT----TGAAACACAA-TCGG-T-T-TGCGCAG-A--AT-ACAA-AAATAGGA-----A--CT-G-C--G-GG-A-A-C--------GT-C-TTGT--AAA-G----AA------T-----AGT----GT--TCAT-A-CG--CGT--ATATACT-A-TGGGC-----T-----G-A-TATT------C-C---AAT---------------------GA-------------TT--------GT--------GC------------------------T-GTTTTTA-CAAT-C-tccttttatcgaatgtgttcatacgccgtatgatactagggctgatatcccacagactctaaagtaaacttgtgctgttttacaattaatatgatatgtgtcttatattcgaaatattttttatttcaccatgttatttcagaaaacgaatgtacatacattacatttacagcatatagcactcccacaactatattcagttgcatagtcaattcaagtagtgaagaggcaaatccgcgagaatcagcctgatggcaaggagtagctcgctacgcgagctgactcaaaa
gi|24                         : aaccaaccacagtgttggaagaacctctactttattgcataatgtttttggtgatcttttagtagagaactcacttgtcatctaggacacagattttgccttatagtcaaaagg-----A----A-------AA---A----T-TAT-TT---------CAC-TTT--GT--AATA-T--T-TCTC---A-T-T----T-GCA
gi|11                         :                                   aagctttgggaaacaccattaatttttacacttagcacacttcaaaatacatagatctccttataaaacaaaaatgaattatttccccgaaattaaaaaaaaat----T-TAT-TTT---TT-T-CA--TTTT-GT--AATA-T--TATCTC---A-T-T----T-C--TCC-ACC-AT---T-G-A-CCA--TT--TTA-T-GAGT---------G-ATTT---C--AACA-C-----T--AATT-CAAA-T--GT--T-CT-CT-AC-T-A-G-GACT--CGCG-AATATG-TTTA--TG-T-AAC-CTTTC---GA---TG-G-GGT-AT----G-AAT---GA-CTT--G-GG-C--A--TG--ATTT-GA-CATGT---A-A----AT--A--CCT-GACTT-----CCGGAAAATTTGTAA-A------C-AA--A--------A-----TAGCT---G-CG-TA--TAT--AAATGA------------AACTT-TTGAC-AGG-----------TTT--T-CATAACTT-AT-TTTTCTAA--GGT-AGAC---C--A-AAGTA-T-T-TTAC-AGCAACTC-AG----TG---C-CA---TTA--A-A-TT-A-G-CCAC-CA-GA-TTGTCCA--T-A----T-AGGT--GGACC-T-AGC-AT----TGGA----A--T-GG-T-T-TG-A-GG-A--AT-AC---AAATA-GA-----AA-CT-G-CG-G-GG-A-AAC--------GT-C-TTTT--AAT-ATTCC---------------------TT--TCAT-A-CGA---T--ATGTGTTCAGTACGC-CGTAT-----G-A-T-CT-A--GGG-CTGA--TATC-CCT----------AA-TGA-------------TT--------GT--------GC------------------------T-G-TTTTA-GAAT---AA--TATA---A--T--A--T---GT-GTCTTATAATT-A-A-AAT---AATTTTTTTC--A--TTTC--ATC-AT--GTTA---T---CAGCAAGAAGCGAAT--TT---CAT-ACAC-T-------T-C-----------AC------CACAGCA----ACT-CGCACAAC-C-------A-T--A-T--TCT---G--------TT-----G---CGTT--AG---ACAA-GT---AG-T--A-G--AGGTG--A---AGAGGC-AGATC-CG-CGAC-A-AAA-T--C--G--CT-GACCG-ACAAGGA----T-TACGCT-
gi|22                         :                                                                accccagtgtatgactaacttttggcataagtttggtgatttttgccccatctgtgttctgtgacaagattttgcttatatcaaaagatattt-T-CAC-TTT--GT--AATA-C--T--CTT---A-T-T----G-CATTCC-ACC-AT---T-G-A-CAA--TT--TTA-T-TAGT---------G-AATT---C--A----T-----TTTA-TT-CAAAATATGT--T-CT-CT-AA-T-A-G-GACTG-CA----ATATG-TAC---TA-T-AAT-ATTTT---TA---T----GGT-AT----G-AAT--TGA-CTT--G-GG-C--A--TGTGATCG-GA-C---C---T-A-C--AT--A--CCT-GACTT-----CCGGAAG-TTTGTAA-A------CAAA--A--------A---A-CATCTAACG-CG-------------------------------TT-TTGAC-AGG------------GT--T-CA--ACT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                      aagcttttggaaacatcatttatttttaacacttggcacaattcaaatatatagatctccttataaaacaaaaatgaattattccccgaaattaaaaaataaaaAT--GT--TTCT-CT-AG-TCA-A-GACTG-CA-----------ATA--TG-T-AAT-ATTTT---GAACTTT-T-GGT-GT----G-AAC--TGA-CTT--TTGG-C--AG-TG--AGC--AA-T---C---A-A-A--A---A--CCTTGACTT-----CCG-----------A-A------C-AA--A--------A---A-TAAT--ATC-AG-TA--T----AAACGATAAGTCGGACATAATTT-TAAAT-TAT-----------TTT--T-CA--ACTC-AT-ATTA---A--CTT-AAGAATAC--A-AAGTA-T-T-T-CA-AATAG-TG-AGAAAGTG---A-C----TTC--C-A-TT---T-CCAC-TA-GA-TT-TC-A--T-T----T-AAGC--G-ACG-T-A-C-ATGTCATTGA----GA-T-AG-T-TGCG-G-------------G-AAAAA-GACTCCGA--CA-G-CA-A-GG-A-G-CTTTAAGCAGT-T-TCCT--ATT-TCTCCAA------C-C----ATCTCCTTG-GCAT-G-CGA-----AATGTGTACA-TCCAT-AGTCTG----G-A-TACTG-------TTGACATATC-CT-----------AT-CGA-------------CTCTAAA---GTCAAAGGACGT------------------------T-G-TTTTG-CAAA-C-AA--TTTG---AC-T--G--T---ATCAT--ACCATTC-A-A-TAC---A---TTTCTCTTA--TTTCA-AAC-AC--GTTA---
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                              atttactatttcattttatgatctagtcatacatat-A-G-GACTG-C--------TA-TGCA--TG-T-------------GA---CT-G-GGT-ATAT--G-AAA--TGA-CT-----GA-C--AAACG--ATTT-GA-C---CTATA-A-CCAAA--A--CCT-GATTT-----ATGGACG-TTTGTAG-AGTGATGC-AA--ACCCAGAGGA---A-AGGAAAACA-AA-CA--T----AAACGA------------AACGT-T-GAC-AGGATTTTAAATAATTT--T-CA--ATTG-AA-ATCT---G--AGT-AGGA---T----------T-T-T-AA-A-CA--TCGAG----TG---A-C----TTC--A-T-TT-A-G-CCAC-CA-GA-TTGTC-A--T-T----C-AGTC--G-AAC-A-A-C-AT----TTGA----GA-T-GG---T-TG-G-AA-A--A--GT-G-ACTTC-GA-----A--CT-G-CA-G-GG-A-A-C--------TT-C-ATGT--AGT-ATCCTAATTCT--TGCAACCATCTCCTT--TCAT-aaacatgcaatatttggctaacgtgaactatttacaattttgcgtatgaaaaaagggttgtgaagaagacaatccacaggcgcccgatccagtgtagttcgcta
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            T---GA---CT-G-CGT-AT-----------T---CTT--T-GA-T--A---G--ATCT-GA-A---T---A-A----AT--A--CTT-GACTT-----CCGGAAG-TTGGTAA-A------C-TA--A--------A---A-TAGCTAATG-CG-TA--T-T--AAATGA------------AACTT-TTGAC-AGG-----------TTT--A-CA--ACTT-AT-GTCT---A--GGT-AAGA---C--C-AAATA-T-T-T-TA-AGCAA-TC-AG----TG---C-C----TTC--A-A-TT-A-G-CCAC-CA-GA-TTGTC-A--T-T----T-AGGT--G-ACC-T-A-C-AT----TGGA----AA-T-GG-T-T-TG-G-AG-A--AT-AC-G-AAATA-GA-----A--CT-G-CG-G-GG-A-A-C--------GT-C-TTGT--AAT-ATTCC---------------------TT--TCAT-A-CGAATGT------GTTCA-TACGC-CGTAT-----G-A-TACT-A--GGG-CTGA--TATC-CC-----------AA-TGA-------------TT--------GT--------GC------------------------T-G-TTTTA-CAAT-C-AA--TATA---A--T--A--T---GT-GTCTTATATTC-A-A-AAT---A---TTTTTC--A--TTTC--ATC-AT--GTTAATAT---T--CAGAAAACGAAT--TT-A-CAT-ACAC-T-------C-C-----------AC------CACA--G-C--ACT-CGCACAAC-T-------A-T--ATT--C-T---G--------TT-----G---CGT---AG---ACAA-GT---AG-T--A-G--TGTTG--A---AGAGGG-AGATC-CG-CG---A-AAA-T--C--GC-CA-GA-CG-ACAAGGA----G-TACGCT-CGCTA--CGCGAGCC-G-ACTCAAA
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          --A--TG--ATTT-GA-C---C---T-A-C--AT--A--CCC-GACTT-----CCGGAAa
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    -A-C--AT--G--CCT-GACTG-----TCGAAAG-TTTGTAA-A------C-AA--A-----------------CC--CG-CG-TA-------ACATGA------------AACTT----AC-AAG-----------TTT----------------ATCT---G--AGTCAAGA---C--A-AAACA-TCT-T-AA-ACAAA-TC-AG----TG---C-C----TGCCAA-A-TA-A-G-CCAC-CA-TA-TCATC-A--TCT----T-AGGCCGG-ACC-T-A-C-AT----TGGA----AA-T-TA-T-T-TG-ACAG-A--GT-AC-G-AAGCA-GA-----A--CT-G-CA-TTGG-A-A-C---------T-T-TCATTCAGT-ATTCCAAATTCTCCCCAACCATCTCCTTCGTCCTCC-CGAATGTTA-------CA-TGCGT-C---T-----GCA-TA-TGA--GGC-CT--AATATCTCC-----------AC-TGA-------------CTCTAAAAGCAT--------GG------------------------T-G--TTTA-C-AT-C-AA--TATG---A--T--A--C---ATGGTC-TATATTC-A-A-TAT---A---aac
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TG-CG-TA--T-T--AAATGA------------AAATT-TTGAC-AGA-----------TTT--T-CA--ACTT-AT-GTCT---A--AGT-AAGA---C--C-AAATA-T-T-T-TA-AGCAA-TC-AG----TG---C-C----TTC--A-A-TT-A-G-CCAC-CA-GA-TTGTC-A--T-T----T-AGGT--G-ACC-T-A-C-AT----TGGA----AA-T-GG-T-T-TG-G-AG-A--AT-AC-G-AAATA-GA-----A--CT-G-AG-G-
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AATGA------------AACTT-TTGCC-AG------------TTTGAT-CA--ACTT-G--GCTT---A--GGT-AGAC---C--ATAAATA-T-T-T-TA-AGCAA-TC-AG----TG---C-C----TCT--A-A-TT-A-G-GCA--CA-GA-TTGTC----T-T----T-AGGT--G-------A-C-AT----TGG------A-T-GGTT-T-TG-G-AG-A--AT--C---AATTA-GA-----ATGCTGG-CG-G-GG-A-A-C--------GTGC-TTGT--AAccataaggggaatttcatacgaatgtgttcatacattctgactaacatatgaaattcgaaatcaaatattcttttgttaataccttctaaccactaacaacaatcctctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcagaaaacgaatttacatacactccaccactgcactcgcacaactatattctgttgcgtagacaagtaatagcggtgaagagggagatccgcgaaaatcgcctgacgacaaggagtacgctcgctacgcgagccgactcaaa
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           t-AT-GTCT---G--GGT-AAGG---C--A-AAATA-TCT-T-AA-ACAAA-CC-ATC---TG---C-C----T-C--A-A-TT-A-GACCAC-CAAGA-TCGTT----T-T----T-AGGT--G-ACC-T-A-A-AT----TGGA----A--T-GG-T-T-TG-G-AG-A---T-AC-G-ATGTA--A-----A--CT-G-CT-G-GG-A-A-T--------GT----TGT--AGC-AT-------------------------------T-A-CGAATGT------GTTCA-TACGCGCGTATAGGCTG-A-TACCCACCAGA-CTTAAATA----------------AA-CG---------------T--------GT--------GC------------------------T-G-TTTTA-CAAT-C-AA--TATG---A--T--G--T---GC--T--TATATTC-A-A-ATT---A---TTT-----A--CT----ATC-CA--GTTA---T---C--GAGAAAACGAATTATT-A-CAT-ACAT-T-------A-C-----------AC------CACA--G-C--ACT-CCCACAAC-T-------A-TTCA-TTCG-T---AATAGAAACTT-----GGGACGCCAAAG---ACAACGT---AGAC--A-ATTCAATA--AATTAGAGGC-A-ATC-CGACG---A-GAA-T--CG-GG-CT-GA-TG-GCA--GA----G-TA-G---CGCTA--CGCGACCG-G-TCTCAAAaagaatgtgttctagcgtatgaactaggtgctgatatccaatgattgtgctgttttaccaatcaatatatttggctattacaataatatttttaatttcatatcatgttattacagaacgaattaacatacattccacagcactcgcacaacatattctgttgcgtagcaagtagataagtggtgaagaggcaattccgcgaacaaaatgctgacgaaaggagttacactcgctaactgcggccgactccaata
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       A-AGCAA-TC-AG----TG---C-C----TTC--A-A-TT-A-G-CCAC-CA-AA-TTGTC-A--T-TAAAAT-AGGT--G-ACC-T-A-C-AT----TGGA----AA-T-GG-T-T-TG-G-AG-A--AT-AC-G-AAATA-GA-----A--CT-G-CG-G-GG-A-A-C--------GT-C-TTGT--AAT-ATTCCAG------TACAA-AATCTCCTT--TCAT-A-CGAATGT------GTTCA-TGCG----TGT-----G-A-TACT-A--GGG-CTGA--TATC-CC-----------AA-TGA-------------TT--------GT--------GC------------------------C-A-TTTTA-CAAT-C-AA--TATA---A--T--A--T---GT-GTCTTATATTC-A-A-AAT---A---TTTTTC--A--TTTC--ATC-AT--GTTA---T---T--CAGAAAACGAAT--TT-A-CAT-ACAC-T-------C-C-----------AC------CACA--G-C--ACT-CGCACAAC-T-------A-T--ATT--G-T---G--------TT-----G---CGT---AG---ACAA-GT---AG-T--A-G--CGGTG--A---AGAGGG-AGATC-CG-CG---A-AAA-T--C--GC-CT-GA-CG-ACAAGGA----G-TACGCT-CGCTA--CGCGAGCC-G-ACTCAAa
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      G-G-GG-A-A-C--------GT-C-TTGT--AAT-ATTCCAA------TACAA-AATCTCCTT--TCAT-A-CG------AATGTGTTCA-TGCGC-CGTAT-----G-A-TACT-A--GGG-CTG--ATATC-CC-----------AA-TGA-------------TT--------GT--------GC------------------------T-G-TTTTA-CAAT-C-AA--TATA---ATTT--G--T---GTC-T--TATATTC-A-A-Ata
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TCCTT--TTAT---CGAATGT------GTTCA-TACGC-CGTAT-----G-A-TACT-A--GGG-CTGA--TATC-CC-----------AC-AGACTCTAAAGTAAACTT--------GT--------GC------------------------T-G-TTTTA-CAAT-T-AA--TATG---A--T--A--T---GT-GTCTTATATTC-G-A-AAT---A---TTTTTT--A--TTTC--ACC-AT--GTTAT--T---T--CAGAAAACGAAT--GT-A-CAT-ACAT-T-------A-C-----------ATTTACAGCATA-TAGC--ACT-CCCACAAC-T-------A-T--A-T----TCA-G--------TT-----G---CAT---AG---TCAA-TTCA-AG-T--A------GTG--A---AGAGGC-AAATC-CG-CG---A-GAA-T--CA-GC-CT-GA-TG-GCAAGGA----G-TA-GCT-CGCTA--CGCGAGCT-G-ACTCAAA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aagctttgggaaacatcattcatttttacacttaccacacttcaaaatataatagatctccttataaaacaaaaatgaaatatttacccgaatattaaaaaaaaaaatttttttttttaactttgtaatatttctcatttgcatccaccagtgacaatttattagtgatttcgcattattcaaaatatattctctaccaggactgcaatatgtacatgtaatattttgactaggtatgaattgacttggcatgatttaaccaacatacctgacttccggaggtttgtatacaaaaaacagctaacgcgtttgcaaatgaaactttgaccaggttttcaacttatgtctgagtaagaacaaaatatcttaaacaatcattgccttcaattagccaccagatcgtcatttaggtgacctacattggaaatggtttggagaatatacgatgtagAATGTGTTCT-AGCG----TAT-----G-A--ACT-A--GGTGCTGA--TATC-C------------AA-TGA-------------TT--------GT--------GC------------------------T-G-TTTTACCAAT-C-AA--TAT----A--T--T--T---G--GC--TAT-TAC-A-ATAAT---A---TTTTTA--A--TTTCATATC-AT--GTTA---T---TA-CAG--AACGAAT--TA-A-CAT-ACAT-T-------C-C-----------A-------CA----G-C--ACT-CGCACAACAT-------A-T----T--C-T---G--------TT-----G---CGT---AG----CAA-GT---AGATA-A-G--TGGTG--A---AGAGGC-AATTC-CG-CGAACA-AAA-T-----G--CT-GA-CG-A-AAGGA----GTTACACT-CGCTAACTGCG-GCC-G-ACTa
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     taatgaaacttttgccagtttgatcaacttggcttaggtagaccataaatattttaagcaatcagtgcctctaattaggcacagattgtctttaggtgacattggatggttttggagaatcaattagaatgctggcggggaacgtgcttgtaaaag---T--CAGAAAACGAAT--TT-A-CAT-ACAC-T-------C-C-----------AC------CAC--TG-C--ACT-CGCACAAC-T-------A-T--ATT--C-T---G--------TT-----G---CGT---AG---ACAA-GT---AA-T--A-G--CGGTG--A---AGAGGG-AGATC-CG-CG---A-AAA-T--C--GC-CT-GA-CG-ACAAGGA----G-TACGCT-CGCTA--CGCGAGCC-G-ACTCAAAccaata
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tgcgtattaaatgaaaattttgacagattttcaacttatgtctaagtaagaccaaatattttaagcaatcagtgccttcaattagccaccagattgtcatttaggtgacctacattggaaatggtttggagaatacgaaatagaactgaggccataaggggaatttcatacgaatgtgttcatacattctgactaacatatgaaattcgaaatcaaatattcttttgttaataccttctaaccactaacaacaatcctctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnT-A-CATTACAT-T-------TAC-----------AG------CATA-TAGC--ACT-CCCACAAC-T-------A-T--A-T----TCA-G--------TT-----G---CAT---AG---TCAA-TTCA-AG-T--A------GTG--A---AGAGGC-AAATC-CG-CG---A-GAA-T--CA-GC-CT-GA-TG-GCAAGGA----G-TA-GCT-CGCTA--CGCGAGCT-G-ACTCAA
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aaaaaaaaaattttttttttaactttgtaatatttctcatttgcatccaccagtgacaattttattagtgatttcgcattattcaaaatatattctctaccaggactgcaatatgtacatgtaatattttgactaggtatgaattgacttgggcatgatttaaccaacatacctgacttccggaggtttgtatacaaaaaacagctaacgcgtttgcaaatgaaactttgacaggttttcaacttatgtctgagtaagacaaaatatcttaaacaatcattgccttcaattagccaccagatcgtcatttaggtgacctacattggaaatggtttggagaatatacgatgtagtccttttatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaca-C-----------AC------CACA--G-C--ACT-CCCACAAC-T-------G-T--A-T--T-CA--G--------TT-----A---CGT---AG---ACAA-TT---CA-T----G--TAGTG--A---AGAGGC-GAATC-TG-CG---A-GAA-T--CA-GT-CT-GA-TG-GCAAGGA----G-TA-GCT-CGCTA--CACAAGCC-G-ACT
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tgaCACAAC-T-------A-T--A-T--TCT---G--------TT-----G---CGT---AG---ACAA-GT---A
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cta-T--A-T--T-T---G--------GC-----G---CTT---AG---ATAA--T---GG-T--A-G--N------------AGGC-AGATC-CG-CG---A-AAAAT--C--GC-AT-GA-CG-ACA--------------CT-CGCTA--CGCGAGCC-G-ACTCAAA
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tatgaccgtacttcctgtGTG--A---AAACG--ACATC-TG-C----A-AAG-T--T--GTTCC-AA-TG-GCAAGGA----A-TA-GCT-CGCTA--CACaa
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         atttgcaattgcaaatgaaaaatgttA----G-TACGCT-CGCTA--CGCGAGTC-G-ACTCAAAatgtcaact
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ----G-TACACT-CGCTA--CGCGAGCC-G-ACTCAAAaa
4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|27 ): TGCATTATAATCATTATAATGATAGAATTAGAATGTAACTGCGACATAACGGGATCTTGGAAATGAGGAAGCAATACCAATACAAACTGTCTAATGTTCTGTGTACCATATCAA
Unaligned ( gi|28 ): TCTAAAACATTATATAGATCTCCTTTTTTTTTTAAAAAGAGAGAATCATTTCCCCAATATTTAAAAAAAAAAAATTTTTTCATCTCGTAATATTTCTCATTTGC
Unaligned ( gi|31 ): GATAATATGAATACCCGCAAACGATTGTTGTTTGTTCCATATGCAACATGATTACATGTAATATTGAAACACAC
Unaligned ( gi|32 ): GCCGACTCAAAAACCAACCGAAAAACAGGGGAGTGGTGTTTGAGGCATGTTGGGA






Alignments
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Reference ( family-585 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CCAGT-TATGAACCTCAA--CTTT--T-G-CATAA-GTTT--G-GTG-ATTTTT-------G-GNCCGGNN-TNT--TCTTGGAN-A-A-G-ANTT-T--TTCCC-----T----T-------A------A--AAA------A---T-----TNT-----T-TTTT-TC-A-TTT-T-GTAATA-T--T-TCTC---A-T-T----T-CCATCC-ACC-AT---T-G-A-CAA--TT--TTA-T-GAGT---------GATTT----C--A---C-----TA-TT-CAAA--AT--GT--T-CT-CT-AA-T-A-G-GACT-G-C-A----ATA--TG-T-ACA--T-GT----AAC-A-TTTT---GA---CT-G-GGT-AT----G-AAT--TGA-C-TT--GGG-C--A--TGATTT-G-A-CCN--A-CAT-----A--CC-TGACTTCCGGAAG-TT-TGT-AAA------C-AA--A--------A---A-TAGCTA-AC-GCGT--AT---T--AAATGA------------AACTT-TTGAC-AGG-----------TTT--T-CA--ACTT-AT-GTCT---AGGT-A-AG---A--CA-AAATATT-TTA--A-GCA----A-T----C-AG-TG---C-C----TTC--A-A-TT-A-G-CCAC-C-A-GA-TCGTC-A--T-T----T-AGGT--G-ACC-T-A-C-AT----TGGA----AA-T-GG-T-T-TG-G-AG-A--ATA-C-GAAATA-GA-----A--CT-G-CG-G-GG-A-A-C--------GT-C-TTGT--AAT-ATTCCAA------------T----------A-----T-----CTCCTT--TCATA-C-GAATGT-AATGTGTTCA-TACGC-CGTA-----T-G-A-T----ACT-A-GG-GCTG-A-ATATC-CC-----------A-------------------------A-TGA-------------TT--------GT--------GC-TG-TTTTA-CAAT-C-AA--TATAA-T--AT---GTCGT-C-T--ATATTC-A-A-AAT---A---TTTTTC--A--TTTC--ATC-AT--GT---TA-T---T--CAGAAAACGAAT--TT-ACATACAC-T-------CC-----------AC--------C--------AC--A-GC--A-CT-CGCACAAC-------T-AT--A-T--N-T---G----------T-----TG---C---GT---AGACAA-GT---AG-T--A-G--CGGTG--A---AGAG-GNAGATC-CG-CG---A-AAA-T--C--GC-C-TGA-C-GACAAGGA----G-TACGCT-CGCTA--CGCGAGCCGA-CT-CAAA
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          atttactatttcGAACCTCTA--CTTTATT-G-CATAATGTTTTTG-GTG-ATCTTTTAGTAGAG-AACTCACT-TGTCATCTAGGAC-ACA-G-A--T-T--TTGCC-----T----T-------ATAGTC-A--AAAGGAAATA---T-----TTT-----T-TTTTATT-A-GTT-T-GTAATA-T--T-T-TC---A-T-T----C-CAATCCCACC-ATAACT-G-A-CAAGTTT--TTA-T-GAGT---------GATTTTCA-C--A---C-----TA-TT-CAAA--AT--GT--T-CT-CTTAA-T---G-GACT-GGC-ATACTATA--TGAT-TTA--T-GT----AAC-T-TTTT---GA---CT-GTGGTTATT---G-AATGGTGATC-TTATGGG-C--A--TGATTT-G-A-CAT--G-CAT-----A--CC-TGATCTCCGGAAG-TTGTG--AGA------C-AA--A--------A-----T-GCT-----GCGT--AT---T--AAATGA------------AACTT-TTGAC-AGG-----------TTT--T-C---ACTT-A--GTCT---AGGG-GTAG---A--CC-AAATATTGTTA--A-GCA----A-T----CAAG-TG---G-CGTTGTCT--A-ATTT-A-G-CCACTC-A-GATTTGTC-A--T-T----TAAGGT--C-ACC-TAA-C-AT----TGAAACACAA-TCGG-T-T-TGCGCAG-A--ATA-CAAAAATAGGA-----A--CT-G-C--G-GG-A-A-C--------GT-C-TTGT--AA--A---------------------------------------------------------GAATA-----GTGTTCA-TACG--CGTA-----T---A-T----ACT-ATGG-GCTG---ATATT-CC-----------A-------------------------A-TGA-------------TT--------GT--------GC-TGTTTTTA-CAAT-C-aaacatgcaatatttggctaacgtgaactatttacaattttgcgtatgaaaaaagggttgtgaagaagacaatccacaggcgcccgatccagtgtagttcgcta
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gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -GCGT--AT---T--AAATGA------------AAATT-TTGAC-AGA-----------TTT--T-CA--ACTT-AT-GTCT---AAGT-A-AG---A--CC-AAATATT-TTA--A-GCA----A-T----C-AG-TG---C-C----TTC--A-A-TT-A-G-CCAC-C-A-GA-TTGTC-A--T-T----T-AGGT--G-ACC-T-A-C-AT----TGGA----AA-T-GG-T-T-TG-G-AG-A--ATA-C-GAAATA-GA-----A--CT-G-AG-G-a
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tTT--TCATA-C-G------AATGTGTTCA-TACccataaggggaatttcatacgaatgtgttcatacattctgactaacatatgaaattcgaaatcaaatattcttttgttaataccttctaaccactaacaacaatcctctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcagaaaacgaatttacatacactccaccactgcactcgcacaactatattctgttgcgtagacaagtaatagcggtgaagagggagatccgcgaaaatcgcctgacgacaaggagtacgctcgctacgcgagccgactcaaa
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tgcgtattaaatgaaaattttgacagattttcaacttatgtctaagtaagaccaaatattttaagcaatcagtgccttcaattagccaccagattgtcatttaggtgacctacattggaaatggtttggagaatacgaaatagaactgaggccataaggggaa---T--CAGAAAACGAAT--TT-ACATACAC-T-------CC-----------AC--------C--------AC--T-GC--A-CT-CGCACAAC-------T-AT--A-T--TCT---G----------T-----TG---C---GT---AGACAA-GT---AA-T--A-G--CGGTG--A---AGAG-GGAGATC-CG-CG---A-AAA-T--C--GC-C-TGA-C-GACAAGGA----G-TACGCT-CGCTA--CGCGAGCCGA-CT-CAAAattctgactaacatatgaaattcgaaatcaaatattcttttgttaataccttctaaccactaacaacaatcctctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcagaaaacgaatttacatacactccaccactgcactcgcacaactatattctgttgcgtagacaagtaatagcggtgaagagggagatccgcgaaaatcgcctgacgacaaggagtacgctcgctacgcgagccgactcaaa
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tgcgtattaaatgaaaattttgacagattttcaacttatgtctaagtaagaccaaatattttaagcaatcagtgccttcaattagccaccagattgtcatttaggtgacctacattggaaatggtttggagaatacgaaatagaactgaggccataaggggaatttcatacgaatgtgttcatacattctgactaacatatgaaattcgaaatcaaatattcttttgttaataccttctaaccactaacaacaatcctctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-AT-GTCT---GGGT-A-AG---G--CA-AAATATC-TTA--A-ACAAACCA-T----C----TG---C-C-----TC--A-A-TT-A-GACCAC-CAA-GA-TCGTT----T-T----T-AGGT--G-ACC-T-A-A-AT----TGG-----AA-T-GG-T-T-TG-G-AG----ATA-C-GATGTA--A-----A--CT-G-CT-G-GG-A-A-T--------G----TTGT--AGC-AT---------------------------------------------------TA-C-G------AATGTGTTCA-TACGCGCGTATAGGCT-G-A-TACCCACC-A-GA-CTTA-A-ATA----------------A-------------------------A-CG---------------T--------GT--------GC-TG-TTTTA-CAAT-C-AA--TATGA-T--GT------GC-T-T--ATATTC-A-A-ATT---A---TTT-----A--CT----ATC-CA--GT---TA-T---C--GAGAAAACGAATTATT-ACATACAT-T-------AC-----------AC--------C--------AC--A-GC--A-CT-CCCACAAC-------T-ATTCA-T--T-C---GTAATAGAAACT-----TGGGAC---GCCAAAGACAACGT---AGAC--A-ATTCAATA--AATTAGAG-GCA-ATC-CGACG---A-GAA-T--CG-GG-C-TGA-T-GGCA--GA----G-TA-G---CGCTA--CGCGA-CCGGTCT-CAAA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AATGA------------AACTT-TTGCC-AG------------TTTGAT-CA--ACTT-G--GCTT---AGGT-A-GA---C--CATAAATATT-TTA--A-GCA----A-T----C-AG-TG---C-C----TCT--A-A-TT-A-G-GCA--C-A-GA-TTGTC----T-T----T-AGGT--G-------A-C-AT----TGG------A-T-GGTT-T-TG-G-AG-A--AT--C--AATTA-GA-----ATGCTGG-CG-G-GG-A-A-C--------GTGC-TTGT--AA-------AA---------------------------------------------------GAA------TGTGTTC--TA-G--CGTA-----T-G-A------ACT-A-GGTGCTG---ATAT--CC-----------A-------------------------A-TGA-------------TT--------GT--------GC-TG-TTTTACCAAT-C-AA--TAT-A-T--------TTGG-C-T--AT-TAC-A-ATAAT---A---TTTTTA--A--TTTCATATC-AT--GT---TA-T---TA-CAG--AACGAAT--TA-ACATACAT-T---------------------C--------C--------AC--A-GC--A-CT-CGCACAAC---------AT--ATT--C-T---G----------T-----TG---C---GT---AG-CAA-GT---AGATA-A-G--TGGTG--A---AGAG-GCAATTC-CG-CGAACA-AAA-T-----G--C-TGA-C-GA-AAGGA----GTTACACT-CGCTAACTGCG-GCCGA-CT-CCAAa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tCCAGT-TATGGACCTCAA--CTTT--T-G-CATAA-GTTT--G-GTG-ATTTTT-------G-GCCCGAAG-TTA--TTCTGGAC-A-A-GAAAGT-T--TTCAC-----T----TAATATCAA------A--AAA------A---TA----TTT-----TGTTTT-TC-A-TTT-T-GTAATA-T--T-TCTC---AGT-T----T-CCATCCGACC-AT---T-G-AGCAA--TT--TTAGT-GAGT---------GATTTCAAAC--A---C-----TATTT-CAAA--AT--GT--T-CT-CT-AA-T-A-GCGAGT-G-C-A----ATA--TG-T-ACA--TGGT----AAC-ATTTTT---GA---CT-G-GGT-AT----G-AAT--TGAGC-TT--GG-----A--TGAGTT-GAA-CCT--A-CATA----A--CC-TGAC-TCCGGAAG-TT-TGTAAAA------CAAA--A--------A---A-TAGCTA-ATGGCGTAAAT---T--AAATG-------------AACTTGTTGAC-AGGT----------TTT--T-CA--ACTTCAT-GTCTTA-AGGT-A-AG---ACCCA-AAGTATT-TTA--A-GCA----A-T----C--G-TG---C-C----TTC--A-AGTT-AGG-CCAC-C-A-GA-TTGTC-A--TGT----T-AGGT--G-ACT-----C-AT----TGGA----AA-T-GG-T-T-TT-G-AG-A--ATA-CGGAAATA-GA-----A--CT-G-CT-G-GG-A-A-C--------GT-C-TTCTA-AAT-A----AA------------T-----------------------TCCTT--T-ATA-C-G------AATGTGTTCA-TACGCGCGT------T-G-A-T----ACT-G-AG-GCTG---ATAT--CC-----------A-------------------------A-TGAT------------TT--------GT--------GCTTG-TTTTA-CAATCC-AA--AATAA-T--AT---GGTGT-CTT--ATATTC-A-A-CAT---A---TTTTTC--AACTTTC--ATC-AT--GT---TATT---T--CAGAAAA-GAAT--TTAACGTACACAT-------CA-----------AC--------C--------AC--A-GC--A-CT-TGCACAAC-------TAAT--A-TTGC-T---G----------T-----TG---C---GT---AGGCAA-GT---AG-T--A-G--CAGTG------AGAG-GGAGATC-CG-CA---A-AAA-T--C--ACTC-TG--C-GACAAGGA----G-TA------GCGG--CG-GAG-CGA-CTGCAAta
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gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         --A-CAT-----G--CC-TGACTGTCGAAAG-TT-TGT-AAA------C-AA--A-----------------CC---C-GCGT--A-------ACATGA------------AACTT----AC-AAG-----------TTT----------------ATCT---GAGTCA-AG---A--CA-AAACATC-TTA--A-ACA----AAT----C-AG-TG---C-C----TGCCAA-A-TA-A-G-CCAC-C-A-TA-TCATC-A--TCT----T-AGGCCGG-ACC-T-A-C-AT----TGGA----AA-T-TA-T-T-TG-ACAG-A--GTA-C-GAAGCA-GA-----A--CT-G-CA-TTGG-A-A-C---------T-T-TCATTCAGT-ATTCCAAATTCTCCCCAACC----------A-----T-----CTCCTTCGTCCTC-CCGAATGT-TA------CA-TGCGT-C--------T-GCA-T----ATG-A-GG-CCT--A-ATATCTCC-----------A-------------------------C-TGA-------------CTCTAAAAGCAT--------GG-TG-TTT-A-CA-T-C-AA--TATGA-T--AC---ATGGT-C-T--ATATTC-A-A-TAT---A---ta
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AA-A-ATG-AATT-A--TTCCCCGAAAT----T-------A------A--AAA------A---T-----AA----------AA-TC-A-CTT-T-GTAATA----C-TCTT---A-T-T----G-CATTCC-ACC-AT---T-G-A-CAA--TT--TTA-T-TAGT---------GAATT----C--ATT-T-----TA-TT-CAAAATAT--GT--T-CT-CT-AA-T-A-G-GACT-G-C-A----ATA--TG-T-AC---T-AT----AAT-A-TTTT---TA---T----GGT-AT----G-AAT--TGA-C-TT--GGG-C--ATGTGATCG-G-A-CCT--A-CAT-----A--CC-TGACTTCCGGAAG-TT-TGT-AAA------CAAA--A--------A---A-CATCTA-AC-GCG--------------------------------TT-TTGAC-AGG------------GT--T-CA--ACT
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aagcttttggaaacatcatttatttttaacacttggcacaattcaaatatatagatctccttataaaaca-A-G-GACT-G-C-------TA--TG----CA--T-GT-----------------GA---CT-G-GGT-ATAT--G-AAA--TGA-C-T----GA-C--AAACGATTT-G-A-CCT--A-TAACCAAAA--CC-TGATTTATGGACG-TT-TGT-AGAGTGATGC-AA--ACCCAGAGGA---A-AGGAAA-AC-AAAC--AT------AAACGA------------AACGT-T-GAC-AGGATTTTAAATAATTT--T-CA--ATTG-AA-ATCT---GAGT-A-GG---A----------TT-TTA--A-ACA------T----CGAG-TG---A-C----TTC--A-T-TT-A-G-CCAC-C-A-GA-TTGTC-A--T-T----C-AGTC--G-AAC-A-A-C-AT----TTGA----GA-T-GG---T-TG-G-AA-A--A-G-T-GACTTC-GA-----A--CT-G-CA-G-GG-A-A-C--------TT-C-ATGT--AGT-ATCCTAA------------TTCTTGCAACCA-----T-----CTCCTT--TCAT
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AA-A-ATG-AATTAT--TTCCCCGAAAT----T-------A------A--AAA------A---A-----AATAAAAAT-TATT-TC-A-CTT-T-GTAATA-T--T-TCTC---A-T-T----T-GCA
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aagctttgggaaacaccattaatttttacacttagcacacttcaaaatacatagatctccttataaaacaG-G-GG-A-A-C--------GT-C-TTGT--AAT-ATTCCAA------------T----------ACAAAAT-----CTCCTT--TCATA-C-GAATGT------GTTCA-TGCGC-CGTA-----T-G-A-T----ACT-A-GG-GCTG-A--TATC-CC-----------A-------------------------A-TGA-------------TT--------GT--------GC-TG-TTTTA-CAAT-C-AA--TATAA-T--TT---GT-GT-CTT--ATATTC-A-A-A
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gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tatgaccgtacttcctgtCCAGT-TATGAACCTCAA--CTTT----G-CATAA-GTTT--GTGTGTATTTTT-------TTGGCCGGCT-TGT--TCT-GGAC-A-A-G-A--T-T--TTCCC-----T----T-------AT-----ATCAAA------A---T-----TTT-----T-TTTT-TA-T-TTT-T-GTA-TA-T--T-TCTC---T-TGT----C-CCATCC-ACC-AA---T-G-A-CAA--TT----A-T-GAGTT--------GATTT----CGAA---C-----TA-TT-CAAA--A---GT--T-CT-CTTAA-T-A-G-GACT-G-C-AC---ATT--TG-T-ACA--T-GT----AAC-A-TTTC---GA---CTCG-GGT-ATAT--G-AAT--TGA-C-TT--TGG-C--A--TGATTT-G-A-CCT--ATCAT-----A--CC-GGACTTCCAGAAG-TT-TGT-AAA------C-AA--A--------ATAAA-TAGCTA-AT-G-GT--ACG--T--A-----------------------TTGAC-AGG-----------TTT--TTCA--ACTT-AT-GTCT---AG-T-A--G---A--CA-AAATATT-TTA--A-GCA----A-T----C-AG-TGTG-C-C----TTC--A-A-TT-AAG-CCAC-C-CCGA-TTGTC-A--T-T----T-AGGT--G-ACC-T-A-C-AT----TGGA----CA-T-GG-T-T-TG-G-A--A--ATA-C-GAAATA-GA-----A--CT-G-CG-G-G--A-A-C--------AT-C-TTGT--AATTATTCCAA------------T----------A-----TAAATGCTCCTT---CATA-C-GAATGT----GTTTCCA-TGCGC-CGTA-----T-C-A-T----ACT-A-GT-GCTG-A--TATC-CC-----------A-------------------------A-TGA-------------TT--------GT--------TT-TG-TTTTA-CA-T-C-AA--TATAA-T--AT---GT-GT-C-T--ATAATC-A-A-AAT---A---TTTTTC--A--TTTC--ATC-ATTTGT---TA-T---TT-CAGAAAACGAAT--TT-ACATACAC-T-------CC-----------AC--------C--------AC--A-GC--A-CTTCGCACAAC-------T-ATT-A-T--TGT---G----------T-----TG---C---GT---AGACAA-GT---AG-T--AAG--CGGTGGAA---AGAG-CGAGATCGCG-CA---A-AAT-T--C--GC-C--GA-C-GACAAGGA----G-TACGCT-CGCTA--CGCGAGCCGA-CT-CAAAaa
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gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            atttgcaattgcaaatgaaaaatgtt--A--TGATTT-G-A-CCT--A-CAT-----A--CC-CGACTTCCGGAA
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CACAAC-------T-AT--A-T--TCT---G----------T-----TG---C---GT---AGACAA-GT---Aaac
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ctaA----G-TACGCT-CGCTA--CGCGAGTCGA-CT-CAAA
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ----G-TACACT-CGCTA--CGCGAGCCGA-CT-CAAAaa
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -------A------A--AAA------A---T-----TTT-----T-TTTT-TT-AACTT-T-GTAATA-T--T-TCTC---A-T-T----T-GCATCC-ACC-AG---T-G-A-CAA--TT--T-A-T-TAGT---------GATTT----C--G---CAT---TA-TT-CAAA--AT--ATATT-CT-CT-AC-C-A-G-GACT-G-C-A----ATA--TG-T-ACA--T-GT----AAT-A-TTTT---GA---CT-A-GGT-AT----G-AAT--TGA-C-TT--GG--C--A--TGATTT-A-A-CCA--A-CAT-----A--CC-TGACTTCCGGAGG-TT-TGT-ATA------C-AA--A--------A---AACAGCTA-AC-GCGT---T---TGCAAATGA------------AACTT-T-GACCAGG-----------TTT--T-CA--ACTT-AT-GTCT---GAGT-A-AG---AA-CA-AAATATC-TTA--A-ACA----A-T----C-AT-TG---C-C----TTC--A-A-TT-A-G-CCAC-C-A-GA-TCGTC-A--T-T----T-AGGT--G-ACC-T-A-C-AT----TGGA----AA-T-GG-T-T-TG-G-AG-AATATA-C-GATGTA-Gaaa
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aagctttgggaaacatcattcatttttacacttaccacacttcaaaatataatagatctccttataaaacaaaaatgaaatatttacccgaatattaaaaaTCCTT--TTAT--C-GAATGT------GTTCA-TACGC-CGTA-----T-G-A-T----ACT-A-GG-GCTG-A--TATC-CC-----------A-------------------------C-AGACTCTAAAGTAAACTT--------GT--------GC-TG-TTTTA-CAAT-T-AA--TATGA-T--AT---GT-GT-CTT--ATATTC-G-A-AAT---A---TTTTTT--A--TTTC--ACC-AT--GT---TATT---T--CAGAAAACGAAT--GT-ACATACAT-T-------AC-----------ATTTACAGCAT--------AT--A-GC--A-CT-CCCACAAC-------T-AT--A-T--T-CA--G----------T-----TG---C---AT---AGTCAA-TTCA-AG-T--A------GTG--A---AGAG-GCAAATC-CG-CG---A-GAA-T--CA-GC-C-TGA-T-GGCAAGGA----G-TA-GCT-CGCTA--CGCGAGCTGA-CT-CAAAtccttttatcgaatgtgttcatacgccgtatgatactagggctgatatcccacagactctaaagtaaacttgtgctgttttacaattaatatgatatgtgtcttatattcgaaatattttttatttcaccatgttatttcagaaaacgaatgtacatacattacatttacagcatatagcactcccacaactatattcagttgcatagtcaattcaagtagtgaagaggcaaatccgcgagaatcagcctgatggcaaggagtagctcgctacgcgagctgactcaaaa
gi|5                          : aagctttgggaaacatcattcatttttacacttaccacacttcaaaatataatagatctccttataaaacaaaaatgaaatatttacccgaatattaaaaaaaaaaatttttttttttaactttgtaatatttctcatttgcatccaccagtgacaatttattagtgatttcgcattattcaaaatatattctctaccaggactgcaatatgtacatgtaatattttgactaggtatgaattgacttggcatgatttaaccaacatacctgacttccggaggtttgtatacaaaaaacagctaacgcgtttgcaaatgaaactttgaccaggttttcaacttatgtctgagtaagaacaaaatatcttaaacaatcattgccttcaattagccaccagatcgtcatttaggtgacctacattggaaatggtttggagaatatacgatgtag-A-A-ATTA-T--TTCCCCGAAAT----T-------A------A--AAA------AAA-T-----ATT-----T-TTTT-TC-A-CTT-T-GTAATA-T--T-TCTC---A-T-T----TGTTATCC-ACC-AT---T-G-A-CAA--TT----A-T-TAGT---------GATTT----CGTA---T-----TA-TTACAAA--ATATGT--T-CT-CT-AA-T-A-G-GACT-G-C-A----ATA--TG-T-AC------------------------------T-G-G-T-AT----GGAAT--TGA-C-TTT-GGG-C--A--TGATTT-A-AACCT--A-CAC-----AAACC-CGACTTCCGGAAG-TT-TGT-AAA------C-AATAA--------A---A-CAGCTA-AC-GCGT---T---TGCAAATGAG-----------AACTT-TTGAC-AGG-----------TTT--T-CA--ACTT-ATTGTCT---GAGT-A-AG---A--AA-AAATATC-TTA--A-ACA----A-T----T-AT-TG---C-C----TTC--A-A-TT-A-G-CCAC-C-A-GA-TCGTC-A--T-T----T-AGGTG-G-ACC-T-A-C-AT----T-GA----AA-T-GG-T-T-TG-G-AG-A--ATA-C-GATGTG-GA-----A--CT-G-CG-G-GG-AGA-C--------GT-C-----------------------------------------A-----T-----CTCCTT--TCATA---G------AATGTGTTCA-TACGC-CGTA-----T-G-A-T----ACT-A-GG-GCTG---ATATC-CC-----------A-------------------------C-AGACTCTAAAGTAAACCT--------GT--------GC-TG-TTTTA-CAAT-C-AA--TATGA-T--AT---GT-GT-CTT--ATATTC-G-A-AAT---AT--TTTTTT--A--TTTC--ACC-AT--GT---TA-G---T---AGAAAACGAAT--TT-ACATACAT-TACATTTACG-----------AC--------CA-------AG--A-GC--A-CT-CCCACAAC-------T-AT--A-T--T-TTCAG----------T-----TG---C---GT---AGACAA-ATTCAAG-T--A------GTG--A---AGAG-GCAAATC-CG-CG-----GAA-T--CA-GC-C-TGA-T-GGCAAGGA----G-TA-GCT-CGCTA--CGCGAGCCGA-CT-CAAAa
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                       agctttgggaaacttcatttttacacttagcacacttcaaaatatatagatatccctataaaacaaaaatCCAGT--AT-AACCTCAA--CTTT--T-G-CATNN-NNNN--N-NNN-NNNNNN-------N-NNNNNNNN-NNN--NNNNNNNN-N-N-N-NNNN-N--NNNNN-----N----N-------N------A--AAA------A---T-----TAT-----T-TTTT-TC-A-TTT---GTAATA-T--T-TCTC---A-T-T----T-CCATCC-ACC-AT---T-G-A-CAA--TA--TTA-T-GAGT---------GATTC----C--A---C-----TA-TT-CAAA--AT--GT--T-CT-CT-AA-T-A-G-GACT-G-C-ACACAATT--TG-T-ACA--T-GT----AAC-A-TTTT---GA---CT-G-GGT-AT----G-AAT--TGA-C-TT--GGG-C--A--TGATTT-G-A-CCA--A-CAT-----A--CC-TGACTTCCGGAAG-TT-TGT-AAA------C-AA--A--------A---A-TAGCTA-AT-GCGT--AT---T--AAATGA------------AACTT-TTGAC-AGG-----------TTT--T-CA--ACTT-AT-GTCT---AGGT-A-AG---A--CA-AAATATT-TAA--A-GCA----A-T----C-AG-TG---C-C----TTC--A-A-TT-A-G-CCAC-C-A-GA-TTGTC-A--T-T----T-AGGT--G-ACC-T-A-C-AT----TGGA----AA-T-GG-T-T-TG-G-AG-A--ATA-C-GAAATA-GA-----A--CT-G-CG-G-GG-A-A-C--------GT-C-TTGT--AAT-ATTCCAA------------TACAAA-----A-----T-----CTCCTT--TCATA-C-GAATGTCAATGTGTTCA-TGCGC-CGTA-----T-G-A-T----ACTGA-GG-CCTGAA-ATATC-CC-----------A-------------------------A-TGA-------------TT--------GT--------GC-TG-TTTTA-CAAT-C-AA--TATAA-T--AT---GTCGT---T--ATATTC-A-A-AAT---A---TTTTTC--A--TTTC--ATC-AT--GT---TA-T---T--CAGAAAACGAAT--TT-ACATACAC-T-------CC-----------AC--------C--------AC--ACAC--A-CT-CGCACAAC-------T-AT--A-T--G-T---G----------T-----TG---C---GT---AGACAA-GT---AG-T--A-G--CGGTG--A---AGAG-GGAGATC-CG-CG---A-AAA-T--C--GC-C-TGA-C-GACAAGGA----G-TACGCT-CGCTA--CGCGAGCCGC-CT-AAAA
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CCAGT-TATGAACCTCAA--CTTT--T-G-CATAAAGTTT--G-GTG-ATTTTG-------C-GCCCG-AT-TAT--TCTGGGAACA-A-G-A-TT-T--TTCCC-----T----T-------ATATAA-A--AAA------AGATT-----TTT-----T-TTTT-TT-T-TTT-T-GAAATA-T--T-T-TC---A-T-T----T-TCATCC-ACC-AT---A-G-A-CAA--TT--T-A-T-GAGT---------GATTT----C--A---CAC---TA-TT-CAAA--AT--GT--T-CT-CT-AACT-A-G-GACT-G-C-A----ATA--TG-T-ACA--T-GT----AACTA-TTTT---GA---CT-G-GGT-AT----G-AAT--TGA-C-TT--GAGAC--A--TGATTT-G-A-C-T--A-CAT-----A--CC-TGACTTCCGGAAG-TT-TGT-AAAA-----C-AA--A--------A---A-TAGCTATGC-G-GT--AT---A--AATTGA------------AAACT-TTGAC-AGG-----------TTT--T-CA--ACTTTAT-GTCT---AGGT-A-AG---A--CC-AAATATT-TTA--A-GCA----A-T----C-AG-TG---C-C----TTC--A-A-TTTA-G-CCAC-C-A-GA-TTGTC-A--A-T----T-AGGT--G-ACCAT-A-C--T----TGAG----AA-T-GG-T-T-TG-G-AG-A--ATA-C-GAAATA-GA-----A--CT-G-CC-G-GG-A-A-C--------GT-C-TTCT--AG---------------------------------------------GCCT------------AACG--AATGTGTTCA-TACGC-CGTA-----T-G-A-T----ACT-A-GG-GCTG---ATATC-CC-----------A-------------------------A-TGA-------------TT--------GT--------GC-TG-TTTTA-CAAT-CAAA--AATAA-T--AT---GT-GT-CTT--ATATTCAA-A-AAT---A---TTTTTC--A--TTTC--ATC-AT--GT---TA-T---T--CAGAAAACGAAT--TT-ATATACAC-T-------CC-----------AC--------C--------AC--A-GC--A-CT-CGCACAACA------T-AT--ATT--C-T---G----------T-----TG---C---GT---AGACAA-GT---AG-T--A-G--CGGTG--A---AGAG-GGAGATC-CG-CG---A-AAA-T--C--GC-C-TGA-C-GACAAGGAGTACG-TACGCT-CGCTA--CGCGAGCCGA-CT-CAAA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aaaccT-TATGAACCTCAA--CTTT--T-G-CATAA-GTTT--G-GTG-ATTTTT-------G-GCCCGGTT-CGT--TCT-GGAC-A-A---AGAT-T--TTCCC-----T----T-------ATATCA-A--AAA------A---T-----TAT-----T-TTTT--C-A-TTT-T-GTA-TA-T--T--CTC---A-T-T----T-CCATCC-ACC-AT---T-G-A-CAA--TT--TTA-T-GAGT---------GATTT----C--A---CAC---TA-TTTCAAA--AT--GT--T-CT-CT-AA-T-AAG-GACT-G-C-AC---ACAATTG-T-ACA--T-GT----AA--A-TTTT---GA---CT-G-GGT-AT----G-AAT---GA-C-TT--GGG-C--A--TGATTT-G-A-C-A--A-CAT-----A--CC-TGACTTCCGGAAG-TT-TGT-AAA------C-AA--A--------A---A-TAGCTA-AT-GCGT--AT---T--AAATGA------------AACTT-TTGAC-AGG-----------TTT----CA--ACTT-AT-GTCT---AGGT-A-AG---A--CA-AAATATT-TAA--A-GCA----A-T----C-AG-TG---C-C----TTC--A-A-TT-A-G-CCAC-C-A-GA-TTGTC-AA-T-T----T-AGGT--G-ACC-T-A-C-AT----TGGA----AA-T-GG-T-T-TG-G-AG-A--ATAAC-GAAATA-GA-----A--CT-G-CG-G-GG-A-A-C--------GT-C-TTGT--AAT-ATTCCAA------------T----------ACAAA-T-----CTCCCT--TCTTA-C-GAATGT-CATGTGTTCA-TGCGC-GCTA-----T-G-A-T----ACT-A-GG-GCTG-A-ATATC-CC-----------A-------------------------A--GA-------------TT--------GT--------GC-TG-TTTTA-CAAT-CCAA--T-TAA-T--AT---GTC---T-T--ATATTC-A-A-AAT-------TTTTTC--A--TTTC--ATC-AT--GT---TA-T---T--CAGAAAACGAAT--TT-ACATACAC-T-------CC-----------AC--------C--------AC--A-AC--A-CT-CGCACAAC-------T-AT--A-T--G-T---G----------T-----TG---C---GT---AGACAA-GT---AG-T--A-G--CGGTG--A---AGAG-GGAGATC-CG-CG---A-AAA-TCGC--GC-C-TGA-C-GACAAGGA----G-TACGCC-GGCTA--CGCGAGCCGA-CC-TAAAa
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CCAGT-TATGAACCTCAA--CTTT--T-G-CATNN-NNNN--N-NNN-NNNNNN-------N-NNNNNNNN-NNN--NNNNNNNN-N-N-N-NNNN-N--NNNNN-----N----NNC-----A------A--AAA------A---T-----ATG-----T-TTTT-TC-A-TTT-T-GTAATA-T--T-TCTC---A-T-T----T-CCATCC-ACC-AT---T-G-A-CAA--TT--TTA-T-GAGT---------GAATTCA--C--A---C-----TA-TT-CAAA--AT--GT--T-CT-CT-AA-T-A-G-GACT-G-C-A----ATA--TG-T-ACA--T-GT----AAC-A-TTTT---GA---CT-G-GGT-AT----G-AAT--TGA-C-TT--GGG-CATA--TGATTT-G-A-CAT--G-CAT-----A--CC-TGA-TTCCGGAAG-TT-TGT-AAA------C--A--A--------A---A-TAGCT--AT-GCGT--A----T--AAATGA------------AACTT-TTGAC-A-G-----------TTT--T-CA--ACTT-AT-GTCT---AGGT-A-AG---A--CC-AAATATT-TTAATA-GCA----A-T----C-AG-TG---C-C----TTC--A-A-TT-A-G-CCAC-C-A-GA-TTGTC-A--T-T----T-AGGT--G-ACC-T-A-CAAT----TGG-----AA-T-GGTT-T-TG-G-AGAA--ATA-CAAAAATA-GA-----A--CT-G-CG-G-GGAA-A-C--------GT-CTTTGT--AAT-ATT------------------------------------------CTT--TCATA-C-G------AATGTGTTCA-TACG--CGTA-----T-G-A-T----ACT-A-GG-GCTG---ATATC-CC-----------A-------------------------ATTGA-------------TTG-------GT--------GC-TG--TTTA-CAAT-C-AA--TATAAGT--AT---GT-GT-C-TTAATATTC-A-A-AAT---AT--TTTTTC--A--TTTC--ATC-AT--GT---TATT---T--CAGAAAACGAAT--TT-ACATACAC-T-------TC-----------AC--------C--------AC--T-GC--A-CT-CGCACAAC-------T-AT--ATT--A-T---G----------T-----TG---C---GT---AGAGAA-GT---AG-T--A-G--GGGTG--A---AGAG-GAAGATC-CG-CG---A-AAA-T--C--GC-C-TGA-C-GACAAGGA----G-TACACT-CGCTA--CGCGAGCCGA-CT-CAAA
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|27 ): TGCATTATAATCATTATAATGATAGAATTAGAATGTAACTGCGACATAACGGGATCTTGGAAATGAGGAAGCAATACCAATACAAACTGTCTAATGTTCTGTGTACCATATCAA
Unaligned ( gi|31 ): GATAATATGAATACCCGCAAACGATTGTTGTTTGTTCCATATGCAACATGATTACATGTAATATTGAAACACAC
Unaligned ( gi|32 ): GCCGACTCAAAAACCAACCGAAAAACAGGGGAGTGGTGTTTGAGGCATGTTGGGA






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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     atttactatttcGAACCTCTA--CTTTATT-G-CATAATGTTTTTG-GTG-ATCTTTT--AGTAGAGAACTCA---C-T-TGTCATCTAGGA-CACAG-A--TT--TTGCC-----T----T-------ATAGTC-A--AAAGGAAATA---T----TT-TT-TTTTATT-A-GTT-T-GTAATA-T--T-T-TC---A-T-T----C-CAATCCCACC-ATAACT-G-A-CAAGTTT--TTA-T-GAGT---------GATTTTCA-C--A---C-----T--A-TT-CAAA-AT--GT--T-CT-CTTAA-T---G-GACT-GGC-ATACTATA--TGAT-TTA--T-GT----AAC-T-TTTT---GA---CT-GTGGTTATT---G-AATGGTGATCTTATG-GG-C--A--TG--ATTT-G-A-CAT--G-CAT-----A--CCT-GATCTCCGGAAG-TTGTG--AGA------C-AA--A--------A-----T-GCT-----GCGT--AT---T--AAATGA------------AACTT-TTGAC-AGG-----------TTT--T-C---ACTT-A--GTCT---AGGG-GTAGA---CC-AAATATTGTTA--A-GCA----A-TCAAG----TG---G-CGTTGTCT--A-ATTT-A-G-CCACTC-A-GATTTGTC-A--T-T----TAAGGT--C-ACC-TAA-C-AT----TGAAACACAA-TCGG-T-T-TGCGCAG-A--ATA-CAAAAATAGGA-----A--CT-G-C--G-GG-A-A-C--------GT-C-TTGT--AA--A---------------------------------------------------------GAATA-----GTGTTCA-TACG--CGTA-----T---A-T----ACT-ATGG-GCTG---ATATT-CC-----------A-------------------------A-TGA-------------TT--------GT--------GC-TGTTTTTA-CAAT-C-aaacatgcaatatttggctaacgtgaactatttacaattttgcgtatgaaaaaagggttgtgaagaagacaatccacaggcgcccgatccagtgtagttcgcta
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gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -GCGT--AT---T--AAATGA------------AAATT-TTGAC-AGA-----------TTT--T-CA--ACTT-AT-GTCT---AAGT-A-AGA---CC-AAATATT-TTA--A-GCA----A-TC-AG----TG---C-C----TTC--A-A-TT-A-G-CCAC-C-A-GA-TTGTC-A--T-T----T-AGGT--G-ACC-T-A-C-AT----TGGA----AA-T-GG-T-T-TG-G-AG-A--ATA-C-GAAATA-GA-----A--CT-G-AG-G-a
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tTT--TCATA-C-G------AATGTGTTCA-TACccataaggggaatttcatacgaatgtgttcatacattctgactaacatatgaaattcgaaatcaaatattcttttgttaataccttctaaccactaacaacaatcctctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcagaaaacgaatttacatacactccaccactgcactcgcacaactatattctgttgcgtagacaagtaatagcggtgaagagggagatccgcgaaaatcgcctgacgacaaggagtacgctcgctacgcgagccgactcaaa
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tgcgtattaaatgaaaattttgacagattttcaacttatgtctaagtaagaccaaatattttaagcaatcagtgccttcaattagccaccagattgtcatttaggtgacctacattggaaatggtttggagaatacgaaatagaactgaggccataaggggaa---T--CAGAAAACGAAT--TT-ACATACAC-T-------CC-----------AC--------C--------AC--T-GC--A-CT-CGCACAAC-------T-AT--A-T--TCT---G----------T-----TG---C---GT---AGACAA-GT---AA-T--A-G--CGGTG--A---AGAG-GGAGATC-CG-CG---A-AAA-T--C--GC-C-TGA-C-GACAAGGA----G-TACGCT-CGCTA--CGCGAGCCGA-CT-CAAAattctgactaacatatgaaattcgaaatcaaatattcttttgttaataccttctaaccactaacaacaatcctctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcagaaaacgaatttacatacactccaccactgcactcgcacaactatattctgttgcgtagacaagtaatagcggtgaagagggagatccgcgaaaatcgcctgacgacaaggagtacgctcgctacgcgagccgactcaaa
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tgcgtattaaatgaaaattttgacagattttcaacttatgtctaagtaagaccaaatattttaagcaatcagtgccttcaattagccaccagattgtcatttaggtgacctacattggaaatggtttggagaatacgaaatagaactgaggccataaggggaatttcatacgaatgtgttcatacattctgactaacatatgaaattcgaaatcaaatattcttttgttaataccttctaaccactaacaacaatcctctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-AT-GTCT---GGGT-A-AGG---CA-AAATATC-TTA--A-ACAAACCA-TC-------TG---C-C-----TC--A-A-TT-A-GACCAC-CAA-GA-TCGTT----T-T----T-AGGT--G-ACC-T-A-A-AT----TGG-----AA-T-GG-T-T-TG-G-AG----ATA-C-GATGTA--A-----A--CT-G-CT-G-GG-A-A-T--------G----TTGT--AGC-AT---------------------------------------------------TA-C-G------AATGTGTTCA-TACGCGCGTATAGGCT-G-A-TACCCACC-A-GA-CTTA-A-ATA----------------A-------------------------A-CG---------------T--------GT--------GC-TG-TTTTA-CAAT-C-AA--TATGA-T-------GT-G---C-TT-A-TATT-C-A-A-ATT---A---TTT-----A--CT----ATC-CA--GT---TA-T---C--GAGAAAACGAATTATT-ACATACAT-T-------AC-----------AC--------C--------AC--A-GC--A-CT-CCCACAAC-------T-ATTCA-T--T-C---GTAATAGAAACT-----TGGGAC---GCCAAAGACAACGT---AGAC--A-ATTCAATA--AATTAGAG-GCA-ATC-CGACG---A-GAA-T--CG-GG-C-TGA-T-GGCA--GA----G-TA-G---CGCTA--CGCGA-CCGGTCT-CAAA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AATGA------------AACTT-TTGCC-AG------------TTTGAT-CA--ACTT-G--GCTT---AGGT-A-GAC---CATAAATATT-TTA--A-GCA----A-TC-AG----TG---C-C----TCT--A-A-TT-A-G-GCA--C-A-GA-TTGTC----T-T----T-AGGT--G-------A-C-AT----TGG------A-T-GGTT-T-TG-G-AG-A--AT--C--AATTA-GA-----ATGCTGG-CG-G-GG-A-A-C--------GTGC-TTGT--AA-------AA---------------------------------------------------GAA------TGTGTTC--TA-G--CGTA-----T-G-A------ACT-A-GGTGCTG---ATAT--CC-----------A-------------------------A-TGA-------------TT--------GT--------GC-TG-TTTTACCAAT-C-AA--T---A-T-------AT-TTGGC------TATTAC-A-ATAAT---A---TTTTTA--A--TTTCATATC-AT--GT---TA-T---TA-CAG--AACGAAT--TA-ACATACAT-T---------------------C--------C--------AC--A-GC--A-CT-CGCACAAC---------AT--ATT--C-T---G----------T-----TG---C---GT---AG-CAA-GT---AGATA-A-G--TGGTG--A---AGAG-GCAATTC-CG-CGAACA-AAA-T-----G--C-TGA-C-GA-AAGGA----GTTACACT-CGCTAACTGCG-GCCGA-CT-CCAAa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tCCAGT-TATGGACCTCAA--CTTT--T-G-CATAA-GTTT--G-GTG-AT-TTTT--GG-------CCCGAAG--T-TAT--TCT-GGA-CA-AGAAAGTT--TTCAC-----T----TAATATCAA------A--AAA------A---TA---TT-TTGTTTT-TC-A-TTT-T-GTAATA-T--T-TCTC---AGT-T----T-CCATCCGACC-AT---T-G-AGCAA--TT--TTAGT-GAGT---------GATTTCAAAC--A---C-----T--ATTT-CAAA-AT--GT--T-CT-CT-AA-T-A-GCGAGT-G-C-A----ATA--TG-T-ACA--TGGT----AAC-ATTTTT---GA---CT-G-GGT-AT----G-AAT--TGAGCTT--G-G-----A--TG--AGTT-GAA-CCT--A-CATA----A--CCT-GAC-TCCGGAAG-TT-TGTAAAA------CAAA--A--------A---A-TAGCTA-ATGGCGTAAAT---T--AAATG-------------AACTTGTTGAC-AGGT----------TTT--T-CA--ACTTCAT-GTCTTA-AGGT-A-AGACC-CA-AAGTATT-TTA--A-GCA----A-TC--G----TG---C-C----TTC--A-AGTT-AGG-CCAC-C-A-GA-TTGTC-A--TGT----T-AGGT--G-ACT-----C-AT----TGGA----AA-T-GG-T-T-TT-G-AG-A--ATA-CGGAAATA-GA-----A--CT-G-CT-G-GG-A-A-C--------GT-C-TTCTA-AAT-A----AA------------T-----------------------TCCTT--T-ATA-C-G------AATGTGTTCA-TACGCGCGT------T-G-A-T----ACT-G-AG-GCTG---ATAT--CC-----------A-------------------------A-TGAT------------TT--------GT--------GCTTG-TTTTA-CAATCC-AA--AATAA-T-------ATGGTGTC-TT-A-TATT-C-A-A-CAT---A---TTTTTC--AACTTTC--ATC-AT--GT---TATT---T--CAGAAAA-GAAT--TTAACGTACACAT-------CA-----------AC--------C--------AC--A-GC--A-CT-TGCACAAC-------TAAT--A-TTGC-T---G----------T-----TG---C---GT---AGGCAA-GT---AG-T--A-G--CAGTG------AGAG-GGAGATC-CG-CA---A-AAA-T--C--ACTC-TG--C-GACAAGGA----G-TA------GCGG--CG-GAG-CGA-CTGCAAta
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aaaccA--A-GCA----A-TC-AG----TG---C-C----TTC--A-A-TT-A-G-CCAC-C-A-AA-TTGTC-A--T-TAAAAT-AGGT--G-ACC-T-A-C-AT----TGGA----AA-T-GG-T-T-TG-G-AG-A--ATA-C-GAAATA-GA-----A--CT-G-CG-G-GG-A-A-C--------GT-C-TTGT--AAT-ATTCCAG------------T----------ACAAAAT-----CTCCTT--TCATA-C-GAATGT------GTTCA-TGCG----TG-----T-G-A-T----ACT-A-GG-GCTG-A--TATC-CC-----------A-------------------------A-TGA-------------TT--------GT--------GC-CA-TTTTA-CAAT-C-AA--TATAA-T-------AT-GTGTC-TT-A-TATT-C-A-A-AAT---A---TTTTTC--A--TTTC--ATC-AT--GT---TA-T---T--CAGAAAACGAAT--TT-ACATACAC-T-------CC-----------AC--------C--------AC--A-GC--A-CT-CGCACAAC-------T-AT--ATT--G-T---G----------T-----TG---C---GT---AGACAA-GT---AG-T--A-G--CGGTG--A---AGAG-GGAGATC-CG-CG---A-AAA-T--C--GC-C-TGA-C-GACAAGGA----G-TACGCT-CGCTA--CGCGAGCCGA-CT-CAAga
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     --A-CAT-----G--CCT-GACTGTCGAAAG-TT-TGT-AAA------C-AA--A-----------------CC---C-GCGT--A-------ACATGA------------AACTT----AC-AAG-----------TTT----------------ATCT---GAGTCA-AGA---CA-AAACATC-TTA--A-ACA----AATC-AG----TG---C-C----TGCCAA-A-TA-A-G-CCAC-C-A-TA-TCATC-A--TCT----T-AGGCCGG-ACC-T-A-C-AT----TGGA----AA-T-TA-T-T-TG-ACAG-A--GTA-C-GAAGCA-GA-----A--CT-G-CA-TTGG-A-A-C---------T-T-TCATTCAGT-ATTCCAAATTCTCCCCAACC----------A-----T-----CTCCTTCGTCCTC-CCGAATGT-TA------CA-TGCGT-C--------T-GCA-T----ATG-A-GG-CCT--A-ATATCTCC-----------A-------------------------C-TGA-------------CTCTAAAAGCAT--------GG-TG-TTT-A-CA-T-C-AA--TATGA-T-------AC-ATGGT-CT-A-TATT-C-A-A-TAT---A---ta
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      G-AATTA--TTCCCCGAAAT----T-------A------A--AAA------A---TAAAAT-----------C-A-CTT-T-GTAATA-C--T--CTT---A-T-T----G-CATTCC-ACC-AT---T-G-A-CAA--TT--TTA-T-TAGT---------GAATT----C--A---T-----TTTA-TT-CAAA-ATATGT--T-CT-CT-AA-T-A-G-GACT-G-C-A----ATA--TG-T-AC---T-AT----AAT-A-TTTT---TA---T----GGT-AT----G-AAT--TGA-CTT--G-GG-C--A--TGTGATCG-G-A-CCT--A-CAT-----A--CCT-GACTTCCGGAAG-TT-TGT-AAA------CAAA--A--------A---A-CATCTA-AC-GCG--------------------------------TT-TTGAC-AGG------------GT--T-CA--ACT
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aagcttttggaaacatcatttatttttaacacttggcacaattcaaatatatagatctccttataaaacaaaaat-A-G-GACT-G-C-------TA--TG----CA--T-GT-----------------GA---CT-G-GGT-ATAT--G-AAA--TGA-CT-----GA-C--AAACG--ATTT-G-A-CCT--A-TAACCAAAA--CCT-GATTTATGGACG-TT-TGT-AGAGTGATGC-AA--ACCCAGAGGA---A-AGGAAA-AC-AAAC--AT------AAACGA------------AACGT-T-GAC-AGGATTTTAAATAATTT--T-CA--ATTG-AA-ATCT---GAGT-A-GGA-----------TT-TTA--A-ACA------TCGAG----TG---A-C----TTC--A-T-TT-A-G-CCAC-C-A-GA-TTGTC-A--T-T----C-AGTC--G-AAC-A-A-C-AT----TTGA----GA-T-GG---T-TG-G-AA-A--A-G-T-GACTTC-GA-----A--CT-G-CA-G-GG-A-A-C--------TT-C-ATGT--AGT-ATCCTAA------------TTCTTGCAACCA-----T-----CTCCTT--TCAT
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ----T-------A------A--AAA-------------------T-TATT-TC-A-CTT-T-GTAATA-T--T-TCTC---A-T-T----T-GCA
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aagctttgggaaacaccattaatttttacacttagcacacttcaaaatacatagatctccttataaaacaaaaatgaattatttccccgaaattaaaaaaaaaG-G-GG-A-A-C--------GT-C-TTGT--AAT-ATTCCAA------------T----------ACAAAAT-----CTCCTT--TCATA-C-GAATGT------GTTCA-TGCGC-CGTA-----T-G-A-T----ACT-A-GG-GCTG-A--TATC-CC-----------A-------------------------A-TGA-------------TT--------GT--------GC-TG-TTTTA-CAAT-C-AA--TATAA-T-------TT-GTGTC-TT-A-TATT-C-A-A-A
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      C-----------AC--------C--------AC--A-GC--A-CT-CCCACAAC-------T-GT--A-T--T-CA--G----------T-----TA---C---GT---AGACAA-TT---CA-T----G--TAGTG--A---AGAG-GCGAATC-TG-CG---A-GAA-T--CA-GT-C-TGA-T-GGCAAGGA----G-TA-GCT-CGCTA--CACAAGCCGA-CT-
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tga-------A------A--AAA------A---T----TT-TT-T-----C-A-TCT-C-GTAATA-T--T-TCTC---A-T-T----T-
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gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       accccGTG--A---AAAC-G-ACATC-TG-C----A-AAG-T--T--GTTC-CAA-T-GGCAAGGA----A-TA-GCT-CGCTA--CACATGTCAA-CT-aa
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      atttgcaattgcaaatgaaaaatgtt--A--TG--ATTT-G-A-CCT--A-CAT-----A--CCC-GACTTCCGGAA
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CACAAC-------T-AT--A-T--TCT---G----------T-----TG---C---GT---AGACAA-GT---Aaac
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ctaA----G-TACGCT-CGCTA--CGCGAGTCGA-CT-CAAA
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ----G-TACACT-CGCTA--CGCGAGCCGA-CT-CAAAaa
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -------A------A--AAA------A---T----TT-TT-TTTT-TT-AACTT-T-GTAATA-T--T-TCTC---A-T-T----T-GCATCC-ACC-AG---T-G-A-CAA--TT--T-A-T-TAGT---------GATTT----C--G---CAT---T--A-TT-CAAA-AT--ATATT-CT-CT-AC-C-A-G-GACT-G-C-A----ATA--TG-T-ACA--T-GT----AAT-A-TTTT---GA---CT-A-GGT-AT----G-AAT--TGA-CTT--G-G--C--A--TG--ATTT-A-A-CCA--A-CAT-----A--CCT-GACTTCCGGAGG-TT-TGT-ATA------C-AA--A--------A---AACAGCTA-AC-GCGT---T---TGCAAATGA------------AACTT-T-GACCAGG-----------TTT--T-CA--ACTT-AT-GTCT---GAGT-A-AGAA--CA-AAATATC-TTA--A-ACA----A-TC-AT----TG---C-C----TTC--A-A-TT-A-G-CCAC-C-A-GA-TCGTC-A--T-T----T-AGGT--G-ACC-T-A-C-AT----TGGA----AA-T-GG-T-T-TG-G-AG-AATATA-C-GATGTA-Gaaa
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    atttactatttcGAACCTCTA--CTTTATT-G-CAT-AATGTTTTTG-GTG-ATCTTTT--AGTAGAGAACTCA---C-T-TGTCATCTAGGA-CACAG--ATT-TTGCCT-----TATAGTC-------A------A--AAGGAA---A---T-ATTT---TTTTTT-A-TTAGTT-T-GTAATA-T--T-T-TC---A-T-T----C-CAATCCCACC-ATAACT-G-A-CAAGTTT--TTA-T-GAGT---------GATTTTCA-C--A---C-----T--A-TT-CAAA-AT--GT--T-CT-CTTAA-T---G-GACT-GG---C-ATACTATA--TGAT-TTA--T-GT----AAC-T-TTTT---GA---CT-GTGGTTATT---G-AATGGTGATCTTATG-GG-CA--T--G--ATTT-G-A-CAT--G-CAT-----A--CCT-GATCTCCGGAAG-TTGTG--AGA------C-AA--A--------A-----T-GCT-----GCGT--AT---T--AAATGA------------AACTT-TTGAC-AGG-----------TTT--T-C---ACTT-A--GTCT---AGGG-GTAGA---CC-AAATATTGTTA-A--GCA----A-TCAAG----TG---G-CGTTGTCT--A-ATTT-A-G-CCACTC-A-GATTTGTC-A--T-T----TAAGGT--C-ACC-TAA-CA-T----TGAAACACAA-TCGG-T-T-T-GCGCAGA--A-TA-CAAAAA-TAGGA-----A--CT-G-C--G-GG-A-A-C--------GT-CTT-GT--AA--A---------------------------------------------------------GAATA-----GTGTTCA-TACG--CGTA-----T---A-T----ACT-ATGG-GCTG---ATATT-CC-----------A-------------------------AT-GA-------------TT--------G-T--------GC-TGTTTTTA-CAAT-C-aaacatgcaatatttggctaacgtgaactatttacaattttgcgtatgaaaaaagggttgtgaagaagacaatccacaggcgcccgatccagtgtagttcgcta
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gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -GCGT--AT---T--AAATGA------------AAATT-TTGAC-AGA-----------TTT--T-CA--ACTT-AT-GTCT---AAGT-A-AGA---CC-AAATATT-TTA-A--GCA----A-TC-AG----TG---C-C----TTC--A-A-TT-A-G-CCAC-C-A-GA-TTGTC-A--T-T----T-AGGT--G-ACC-T-A-CA-T----TGGA----AA-T-GG-T-T-T-G-G-AGA--A-TA-C-GAAA-TA-GA-----A--CT-G-AG-G-a
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tTT--TCATA-C-G------AATGTGTTCA-TACccataaggggaatttcatacgaatgtgttcatacattctgactaacatatgaaattcgaaatcaaatattcttttgttaataccttctaaccactaacaacaatcctctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcagaaaacgaatttacatacactccaccactgcactcgcacaactatattctgttgcgtagacaagtaatagcggtgaagagggagatccgcgaaaatcgcctgacgacaaggagtacgctcgctacgcgagccgactcaaa
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tgcgtattaaatgaaaattttgacagattttcaacttatgtctaagtaagaccaaatattttaagcaatcagtgccttcaattagccaccagattgtcatttaggtgacctacattggaaatggtttggagaatacgaaatagaactgaggccataaggggaa---T--CAGAAAACGAAT--TT-ACATACAC-T-------CC-----------AC--------C--------ACT--GC--A-CT-CGCACAAC-T-------AT--A-T--TCT---G----------TT-----G---CGT---AG---ACAA-GT---AA-T--A-G--CGGTG--A---AGAG-GGAGATC-CG-CG---A-AAA-T--C--GC-CT-GA-CG-ACAAGGA----G-TACGCT-CGCTA--CGCGAGCCGA-CT-CAAAattctgactaacatatgaaattcgaaatcaaatattcttttgttaataccttctaaccactaacaacaatcctctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcagaaaacgaatttacatacactccaccactgcactcgcacaactatattctgttgcgtagacaagtaatagcggtgaagagggagatccgcgaaaatcgcctgacgacaaggagtacgctcgctacgcgagccgactcaaa
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tgcgtattaaatgaaaattttgacagattttcaacttatgtctaagtaagaccaaatattttaagcaatcagtgccttcaattagccaccagattgtcatttaggtgacctacattggaaatggtttggagaatacgaaatagaactgaggccataaggggaatttcatacgaatgtgttcatacattctgactaacatatgaaattcgaaatcaaatattcttttgttaataccttctaaccactaacaacaatcctctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-AT-GTCT---GGGT-A-AGG---CA-AAATATC-TTA-A--ACAAACCA-TC-------TG---C-C-----TC--A-A-TT-A-GACCAC-CAA-GA-TCGTT----T-T----T-AGGT--G-ACC-T-A-AA-T----TGG-----AA-T-GG-T-T-T-G-G-AG---A-TA-C-GATG-TA--A-----A--CT-G-CT-G-GG-A-A-T--------G---TT-GT--AGC-AT---------------------------------------------------TA-C-G------AATGTGTTCA-TACGCGCGTATAGGCT-G-A-TACCCACC-A-GA-CTTA-A-ATA----------------A-------------------------AC-G---------------T--------G-T--------GC-TG-TTTTA-CAAT-C-AA--TATGA-T-------GT-G---C-TTA-TATT-C-A-A-ATT---A---TTT------A--CT----ATC-CA--GT---TA-T---C--GAGAAAACGAATTATT-ACATACAT-T-------AC-----------AC--------C--------ACA--GC--A-CT-CCCACAAC-T-------ATTCA-T--T-C---GTAATAGAAACTT-----GGGACGCCAAAG---ACAACGT---AGAC--A-ATTCAATA--AATTAGAG-GCA-ATC-CGACG---A-GAA-T--CG-GG-CT-GA-TG-GCA--GA----G-TA-G---CGCTA--CGCGA-CCGGTCT-CAAA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AATGA------------AACTT-TTGCC-AG------------TTTGAT-CA--ACTT-G--GCTT---AGGT-A-GAC---CATAAATATT-TTA-A--GCA----A-TC-AG----TG---C-C----TCT--A-A-TT-A-G-GCA--C-A-GA-TTGTC----T-T----T-AGGT--G-------A-CA-T----TGG------A-T-GGTT-T-T-G-G-AGA--A-T--C--AAT-TA-GA-----ATGCTGG-CG-G-GG-A-A-C--------GTGCTT-GT--AA-------AA---------------------------------------------------GAA------TGTGTTC--TA-G--CGTA-----T-G-A------ACT-A-GGTGCTG---ATAT--CC-----------A-------------------------AT-GA-------------TT--------G-T--------GC-TG-TTTTACCAAT-C-AA--T---A-T-------AT-TTGGC-----TATTAC-A-ATAAT---A---TTTTT-A--A--TTTCATATC-AT--GT---TA-T---TA-CAG--AACGAAT--TA-ACATACAT-T---------------------C--------C--------ACA--GC--A-CT-CGCACAAC---------AT--ATT--C-T---G----------TT-----G---CGT---AG----CAA-GT---AGATA-A-G--TGGTG--A---AGAG-GCAATTC-CG-CGAACA-AAA-T-----G--CT-GA-CG-A-AAGGA----GTTACACT-CGCTAACTGCG-GCCGA-CT-CCAAa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tCCAGT-TATGGACCTCAA--CTTT--T-G-CAT-AA-GTTT--G-GTG-AT-TTTT--GG-------CCCGAAG--T-TAT--TCT-GGA-CA-AGAAAGT-TTTCAC-----T-----TAATATCAA------A--AA---A---A---TATTTTG--TTTTTC-A-TT---T-T-GTAATA-T--T-TCTC---AGT-T----T-CCATCCGACC-AT---T-G-AGCAA--TT--TTAGT-GAGT---------GATTTCAAAC--A---C-----T--ATTT-CAAA-AT--GT--T-CT-CT-AA-T-A-GCGAGT-G----C-A----ATA--TG-T-ACA--TGGT----AAC-ATTTTT---GA---CT-G-GGT-AT----G-AAT--TGAGCTT--G-G---A--T--G--AGTT-GAA-CCT--A-CATA----A--CCT-GAC-TCCGGAAG-TT-TGTAAAA------CAAA--A--------A---A-TAGCTA-ATGGCGTAAAT---T--AAATG-------------AACTTGTTGAC-AGGT----------TTT--T-CA--ACTTCAT-GTCTTA-AGGT-A-AGACC-CA-AAGTATT-TTA-A--GCA----A-TC--G----TG---C-C----TTC--A-AGTT-AGG-CCAC-C-A-GA-TTGTC-A--TGT----T-AGGT--G-ACT-----CA-T----TGGA----AA-T-GG-T-T-T-T-G-AGA--A-TA-CGGAAA-TA-GA-----A--CT-G-CT-G-GG-A-A-C--------GT-CTT-CTA-AAT-A----AA------------T-----------------------TCCTT--T-ATA-C-G------AATGTGTTCA-TACGCGCGT------T-G-A-T----ACT-G-AG-GCTG---ATAT--CC-----------A-------------------------AT-GAT------------TT--------G-T--------GCTTG-TTTTA-CAATCC-AA--AATAA-T-------ATGGTGTC-TTA-TATT-C-A-A-CAT---A---TTTTT-C--AACTTTC--ATC-AT--GT---TATT---T--CAGAAAA-GAAT--TTAACGTACACAT-------CA-----------AC--------C--------ACA--GC--A-CT-TGCACAAC-TA------AT--A-TTGC-T---G----------TT-----G---CGT---AG---GCAA-GT---AG-T--A-G--CAGTG------AGAG-GGAGATC-CG-CA---A-AAA-T--C--ACTCT-G--CG-ACAAGGA----G-TA------GCGG--CG-GAG-CGA-CTGCAAta
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gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        --A-CAT-----G--CCT-GACTGTCGAAAG-TT-TGT-AAA------C-AA--A-----------------CC---C-GCGT--A-------ACATGA------------AACTT----AC-AAG-----------TTT----------------ATCT---GAGTCA-AGA---CA-AAACATC-TTA-A--ACA----AATC-AG----TG---C-C----TGCCAA-A-TA-A-G-CCAC-C-A-TA-TCATC-A--TCT----T-AGGCCGG-ACC-T-A-CA-T----TGGA----AA-T-TA-T-T-T-G-ACAGA--G-TA-C-GAAG-CA-GA-----A--CT-G-CA-TTGG-A-A-C---------T-TTC-ATTCAGT-ATTCCAAATTCTCCCCAACC----------A-----T-----CTCCTTCGTCCTC-CCGAATGT-TA------CA-TGCGT-C--------T-GCA-T----ATG-A-GG-CCT--A-ATATCTCC-----------A-------------------------CT-GA-------------CTCTAAAAGCA-T--------GG-TG-TTT-A-CA-T-C-AA--TATGA-T-------AC-ATGGT-CTA-TATT-C-A-A-TAT---A---ta
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TC-A-CT---T-T-GTAATA-C--T--CTT---A-T-T----G-CATTCC-ACC-AT---T-G-A-CAA--TT--TTA-T-TAGT---------GAATT----C--A---T-----TTTA-TT-CAAA-ATATGT--T-CT-CT-AA-T-A-G-GACT-G----C-A----ATA--TG-T-AC---T-AT----AAT-A-TTTT---TA---T----GGT-AT----G-AAT--TGA-CTT--G-GG-CA--T--GTGATCG-G-A-CCT--A-CAT-----A--CCT-GACTTCCGGAAG-TT-TGT-AAA------CAAA--A--------A---A-CATCTA-AC-GCG--------------------------------TT-TTGAC-AGG------------GT--T-CA--ACT
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gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -----T-------A------A--AA---A------------T---TATTTC-A-CT---T-T-GTAATA-T--T-TCTC---A-T-T----T-GCA
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gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tatgaccgtacttcctgtCCAGT-TATGAACCTCAA--CTTT----G-CAT-AA-GTTT--GTGTGTAT-TTTTTTGG-------CC-G--GC-T-TGT--TCTGG-A-CA-AG--ATT-TT-CCC-----T-----T-------AT-----ATCAA---A---A---T-TTTT---TTTTTA-T-TT---T-T-GTA-TA-T--T-TCTC---T-TGT----C-CCATCC-ACC-AA---T-G-A-CAA--TT----A-T-GAGTT--------GATTT----CGAA---C-----T--A-TT-CAAA-A---GT--T-CT-CTTAA-T-A-G-GACT-G----C-AC---ATT--TG-T-ACA--T-GT----AAC-A-TTTC---GA---CTCG-GGT-ATAT--G-AAT--TGA-CTT--T-GG-CA--T--G--ATTT-G-A-CCT--ATCAT-----A--CCG-GACTTCCAGAAG-TT-TGT-AAA------C-AA--A--------ATAAA-TAGCTA-AT-G-GT--ACG--T--A-----------------------TTGAC-AGG-----------TTT--TTCA--ACTT-AT-GTCT---AG-T-A--GA---CA-AAATATT-TTA-A--GCA----A-TC-AG----TGTG-C-C----TTC--A-A-TT-AAG-CCAC-C-CCGA-TTGTC-A--T-T----T-AGGT--G-ACC-T-A-CA-T----TGGA----CA-T-GG-T-T-T-G-G-A-A--A-TA-C-GAAA-TA-GA-----A--CT-G-CG-G-G--A-A-C--------AT-CTT-GT--AATTATTCCAA------------T----------A-----TAAATGCTCCTT---CATA-C-GAATGT----GTTTCCA-TGCGC-CGTA-----T-C-A-T----ACT-A-GT-GCTG-A--TATC-CC-----------A-------------------------AT-GA-------------TT--------G-T--------TT-TG-TTTTA-CA-T-C-AA--TATAA-T-------AT-GTGTC-T-A-TAAT-C-A-A-AAT---A---TTTTT-C--A--TTTC--ATC-ATTTGT---TA-T---TT-CAGAAAACGAAT--TT-ACATACAC-T-------CC-----------AC--------C--------ACA--GC--A-CTTCGCACAAC-T-------ATT-A-T--TGT---G----------TT-----G---CGT---AG---ACAA-GT---AG-T--AAG--CGGTGGAA---AGAG-CGAGATCGCG-CA---A-AAT-T--C--GC-C--GA-CG-ACAAGGA----G-TACGCT-CGCTA--CGCGAGCCGA-CT-CAAAaa
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gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         atttgcaattgcaaatgaaaaatgttA--T--G--ATTT-G-A-CCT--A-CAT-----A--CCC-GACTTCCGGAA
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CACAAC-T-------AT--A-T--TCT---G----------TT-----G---CGT---AG---ACAA-GT---Aaac
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ctaA----G-TACGCT-CGCTA--CGCGAGTCGA-CT-CAAA
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ----G-TACACT-CGCTA--CGCGAGCCGA-CT-CAAAaa
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -------A------A--AA---A---A---T-TTTT---TTTTTT-AACT---T-T-GTAATA-T--T-TCTC---A-T-T----T-GCATCC-ACC-AG---T-G-A-CAA--TT--T-A-T-TAGT---------GATTT----C--G---CAT---T--A-TT-CAAA-AT--ATATT-CT-CT-AC-C-A-G-GACT-G----C-A----ATA--TG-T-ACA--T-GT----AAT-A-TTTT---GA---CT-A-GGT-AT----G-AAT--TGA-CTT--G-G--CA--T--G--ATTT-A-A-CCA--A-CAT-----A--CCT-GACTTCCGGAGG-TT-TGT-ATA------C-AA--A--------A---AACAGCTA-AC-GCGT---T---TGCAAATGA------------AACTT-T-GACCAGG-----------TTT--T-CA--ACTT-AT-GTCT---GAGT-A-AGAA--CA-AAATATC-TTA-A--ACA----A-TC-AT----TG---C-C----TTC--A-A-TT-A-G-CCAC-C-A-GA-TCGTC-A--T-T----T-AGGT--G-ACC-T-A-CA-T----TGGA----AA-T-GG-T-T-T-G-G-AGAATA-TA-C-GATG-TA-Gaaa
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aagctttgggaaacatcattcatttttacacttaccacacttcaaaatataatagatctccttataaaacaaaaatgaaatatttacccgaatattaaaaaTCCTT--TTAT--C-GAATGT------GTTCA-TACGC-CGTA-----T-G-A-T----ACT-A-GG-GCTG-A--TATC-CC-----------A-------------------------CA-GACTCTAAAGTAAACTT--------G-T--------GC-TG-TTTTA-CAAT-T-AA--TATGA-T-------AT-GTGTC-TTA-TATT-C-G-A-AAT---A---TTTTT-T--A--TTTC--ACC-AT--GT---TATT---T--CAGAAAACGAAT--GT-ACATACAT-T-------AC-----------ATTTACAGCAT--------ATA--GC--A-CT-CCCACAAC-T-------AT--A-T--T-CA--G----------TT-----G---CAT---AG---TCAA-TTCA-AG-T--A------GTG--A---AGAG-GCAAATC-CG-CG---A-GAA-T--CA-GC-CT-GA-TG-GCAAGGA----G-TA-GCT-CGCTA--CGCGAGCTGA-CT-CAAAtccttttatcgaatgtgttcatacgccgtatgatactagggctgatatcccacagactctaaagtaaacttgtgctgttttacaattaatatgatatgtgtcttatattcgaaatattttttatttcaccatgttatttcagaaaacgaatgtacatacattacatttacagcatatagcactcccacaactatattcagttgcatagtcaattcaagtagtgaagaggcaaatccgcgagaatcagcctgatggcaaggagtagctcgctacgcgagctgactcaaaa
gi|5                          : aagctttgggaaacatcattcatttttacacttaccacacttcaaaatataatagatctccttataaaacaaaaatgaaatatttacccgaatattaaaaaaaaaaatttttttttttaactttgtaatatttctcatttgcatccaccagtgacaatttattagtgatttcgcattattcaaaatatattctctaccaggactgcaatatgtacatgtaatattttgactaggtatgaattgacttggcatgatttaaccaacatacctgacttccggaggtttgtatacaaaaaacagctaacgcgtttgcaaatgaaactttgaccaggttttcaacttatgtctgagtaagaacaaaatatcttaaacaatcattgccttcaattagccaccagatcgtcatttaggtgacctacattggaaatggtttggagaatatacgatgtag-AA--ATTATTTCCCCGAAAT-----T-------A------A--AA---A---AAA-T-ATTT---TTTTTC-A-CT---T-T-GTAATA-T--T-TCTC---A-T-T----TGTTATCC-ACC-AT---T-G-A-CAA--TT----A-T-TAGT---------GATTT----CGTA---T-----T--A-TTACAAA-ATATGT--T-CT-CT-AA-T-A-G-GACT-G----C-A----ATA--TG-T-AC------------------------------T-G-G-T-AT----GGAAT--TGA-CTTT-G-GG-CA--T--G--ATTT-A-AACCT--A-CAC-----AAACCC-GACTTCCGGAAG-TT-TGT-AAA------C-AATAA--------A---A-CAGCTA-AC-GCGT---T---TGCAAATGAG-----------AACTT-TTGAC-AGG-----------TTT--T-CA--ACTT-ATTGTCT---GAGT-A-AGA---AA-AAATATC-TTA-A--ACA----A-TT-AT----TG---C-C----TTC--A-A-TT-A-G-CCAC-C-A-GA-TCGTC-A--T-T----T-AGGTG-G-ACC-T-A-CA-T----T-GA----AA-T-GG-T-T-T-G-G-AGA--A-TA-C-GATG-TG-GA-----A--CT-G-CG-G-GG-AGA-C--------GT-C-----------------------------------------A-----T-----CTCCTT--TCATA---G------AATGTGTTCA-TACGC-CGTA-----T-G-A-T----ACT-A-GG-GCTG---ATATC-CC-----------A-------------------------CA-GACTCTAAAGTAAACCT--------G-T--------GC-TG-TTTTA-CAAT-C-AA--TATGA-T-------AT-GTGTC-TTA-TATT-C-G-A-AAT---AT--TTTTT-T--A--TTTC--ACC-AT--GT---TA-G---T---AGAAAACGAAT--TT-ACATACAT-TACATTTACG-----------AC--------CA-------AGA--GC--A-CT-CCCACAAC-T-------AT--A-T--T-TTCAG----------TT-----G---CGT---AG---ACAA-ATTCAAG-T--A------GTG--A---AGAG-GCAAATC-CG-CG-----GAA-T--CA-GC-CT-GA-TG-GCAAGGA----G-TA-GCT-CGCTA--CGCGAGCCGA-CT-CAAAa
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                 agctttgggaaacttcatttttacacttagcacacttcaaaatatatagatatccctataaaacaaaaatCCAGT--AT-AACCTCAA--CTTT--T-G-CATNNN-NNNN--N-NNN-NN-NNNN--NN-------NNNN--NN-N-NNN--NNNNNNN-NN-NN--NNN-NNNNNN-----N-----N-------N------A--AA---A---A---T-TATT---TTTTTC-A--T---T-T-GTAATA-T--T-TCTC---A-T-T----T-CCATCC-ACC-AT---T-G-A-CAA--TA--TTA-T-GAGT---------GATTC----C--A---C-----T--A-TT-CAAA-AT--GT--T-CT-CT-AA-T-A-G-GACT-GCACAC-A----ATT--TG-T-ACA--T-GT----AAC-A-TTTT---GA---CT-G-GGT-AT----G-AAT--TGA-CTT--G-GG-CA--T--G--ATTT-G-A-CCA--A-CAT-----A--CCT-GACTTCCGGAAG-TT-TGT-AAA------C-AA--A--------A---A-TAGCTA-AT-GCGT--AT---T--AAATGA------------AACTT-TTGAC-AGG-----------TTT--T-CA--ACTT-AT-GTCT---AGGT-A-AGA---CA-AAATATT-TAA-A--GCA----A-TC-AG----TG---C-C----TTC--A-A-TT-A-G-CCAC-C-A-GA-TTGTC-A--T-T----T-AGGT--G-ACC-T-A-CA-T----TGGA----AA-T-GG-T-T-T-G-G-AGA--A-TA-C-GAAA-TA-GA-----A--CT-G-CG-G-GG-A-A-C--------GT-CTT-GT--AAT-ATTCCAA------------TACAAA-----A-----T-----CTCCTT--TCATA-C-GAATGTCAATGTGTTCA-TGCGC-CGTA-----T-G-A-T----ACTGA-GG-CCTGAA-ATATC-CC-----------A-------------------------AT-GA-------------TT--------G-T--------GC-TG-TTTTA-CAAT-C-AA--TATAA-T-------A---TGTCGTTA-TATT-C-A-A-AAT---A---TTTTT-C--A--TTTC--ATC-AT--GT---TA-T---T--CAGAAAACGAAT--TT-ACATACAC-T-------CC-----------AC--------C--------ACAC-AC--A-CT-CGCACAAC-T-------AT--A-T--G-T---G----------TT-----G---CGT---AG---ACAA-GT---AG-T--A-G--CGGTG--A---AGAG-GGAGATC-CG-CG---A-AAA-T--C--GC-CT-GA-CG-ACAAGGA----G-TACGCT-CGCTA--CGCGAGCCGC-CT-AAAA
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CCAGT-TATGAACCTCAA--CTTT--T-G-CAT-AAAGTTT--G-GTG-AT-TTTG--CG-------CCCG--A--T-TAT--TCTGGGAACA-AG--ATT-TTTCCC-----T-----T-------ATATAA-A--AA---A---AGATT-TTTT---TTTTTT-T-TT---T-T-GAAATA-T--T-T-TC---A-T-T----T-TCATCC-ACC-AT---A-G-A-CAA--TT--T-A-T-GAGT---------GATTT----C--A---CAC---T--A-TT-CAAA-AT--GT--T-CT-CT-AACT-A-G-GACT-G----C-A----ATA--TG-T-ACA--T-GT----AACTA-TTTT---GA---CT-G-GGT-AT----G-AAT--TGA-CTT--G-AGACA--T--G--ATTT-G-A-C-T--A-CAT-----A--CCT-GACTTCCGGAAG-TT-TGT-AAAA-----C-AA--A--------A---A-TAGCTATGC-G-GT--AT---A--AATTGA------------AAACT-TTGAC-AGG-----------TTT--T-CA--ACTTTAT-GTCT---AGGT-A-AGA---CC-AAATATT-TTA-A--GCA----A-TC-AG----TG---C-C----TTC--A-A-TTTA-G-CCAC-C-A-GA-TTGTC-A--A-T----T-AGGT--G-ACCAT-A-C--T----TGAG----AA-T-GG-T-T-T-G-G-AGA--A-TA-C-GAAA-TA-GA-----A--CT-G-CC-G-GG-A-A-C--------GT-CTT-CT--AG---------------------------------------------GCCT------------AACG--AATGTGTTCA-TACGC-CGTA-----T-G-A-T----ACT-A-GG-GCTG---ATATC-CC-----------A-------------------------AT-GA-------------TT--------G-T--------GC-TG-TTTTA-CAAT-CAAA--AATAA-T-------AT-GTGTC-TTA-TATT-CAA-A-AAT---A---TTTTT-C--A--TTTC--ATC-AT--GT---TA-T---T--CAGAAAACGAAT--TT-ATATACAC-T-------CC-----------AC--------C--------ACA--GC--A-CT-CGCACAACAT-------AT--ATT--C-T---G----------TT-----G---CGT---AG---ACAA-GT---AG-T--A-G--CGGTG--A---AGAG-GGAGATC-CG-CG---A-AAA-T--C--GC-CT-GA-CG-ACAAGGAGTACG-TACGCT-CGCTA--CGCGAGCCGA-CT-CAAA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aaaccT-TATGAACCTCAA--CTTT--T-G-CAT-AA-GTTT--G-GTG-AT-TTTT--GG-------CCCG--GT-T-CGT--TCTGG-A-CA-AA--GAT-TTTCCC-----T-----T-------ATATC--A--AA---A---A---A-TTAT---TTTTTC-A-TT---T-T-GTA-TA-T--T--CTC---A-T-T----T-CCATCC-ACC-AT---T-G-A-CAA--TT--TTA-T-GAGT---------GATTT----C--A---CAC---T--A-TTTCAAA-AT--GT--T-CT-CT-AA-T-AAG-GACT-G----C-AC---ACAATTG-T-ACA--T-GT----AA--A-TTTT---GA---CT-G-GGT-AT----G-AAT---GA-CTT--G-GG-CA--T--G--ATTT-G-A-CA---A-CAT-----A--CCT-GACTTCCGGAAG-TT-TGT-AAA------C-AA--A--------A---A-TAGCTA-AT-GCGT--AT---T--AAATGA------------AACTT-TTGAC-AGG-----------TTT----CA--ACTT-AT-GTCT---AGGT-A-AGA---CA-AAATATT-TAA-A--GCA----A-TC-AG----TG---C-C----TTC--A-A-TT-A-G-CCAC-C-A-GA-TTGTC-AA-T-T----T-AGGT--G-ACC-T-A-CA-T----TGGA----AA-T-GG-T-T-T-G-G-AGA--A-TAAC-GAAA-TA-GA-----A--CT-G-CG-G-GG-A-A-C--------GT-CTT-GT--AAT-ATTCCAA------------T----------ACAAA-T-----CTCCCT--TCTTA-C-GAATGT-CATGTGTTCA-TGCGC-GCTA-----T-G-A-T----ACT-A-GG-GCTG-A-ATATC-CC-----------A-------------------------A--GA-------------TT--------G-T--------GC-TG-TTTTA-CAAT-CCAA--T-TAA-T-------AT-GT--C-TTA-TATT-C-A-A-AAT-------TTTTT-C--A--TTTC--ATC-AT--GT---TA-T---T--CAGAAAACGAAT--TT-ACATACAC-T-------CC-----------AC--------C--------ACA--AC--A-CT-CGCACAAC-T-------AT--A-T--G-T---G----------TT-----G---CGT---AG---ACAA-GT---AG-T--A-G--CGGTG--A---AGAG-GGAGATC-CG-CG---A-AAA-TCGC--GC-CT-GA-CG-ACAAGGA----G-TACGCC-GGCTA--CGCGAGCCGA-CC-TAAAa
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CCAGT-TATGAACCTCAA--CTTT--T-G-CAT-NN-NNNN--N-NNN-NN-NNNN--NN-------NNNN--NN-N-NNN--NNNNNNN-NN-NN--NNN-NNNNNN-----N-----NNNC----A------A--AA---A---A---T-ATGT---TTTTTC-A-TT---T-T-GTAATA-T--T-TCTC---A-T-T----T-CCATCC-ACC-AT---T-G-A-CAA--TT--TTA-T-GAGT---------GAATT----C--A---CAC---T--A-TT-CAAA-AT--GT--T-CT-CT-AA-T-A-G-GACT-G----C-A----ATA--TG-T-ACA--T-GT----AAC-A-TTTT---GA---CT-G-GGT-AT----G-AAT--TGA-CTT--G-GG-CA--TATG--ATTT-G-A-CAT--G-CAT-----A--CCT-GA-TTCCGGAAG-TT-TGT-AAA------C-AA--A--------A-----TAGCTA--T-GCGT--AT------AAATGA------------AACTT-TTGAC-AG------------TTT--T-CA--ACTT-AT-GTCT---AGGT-A-AGA---CC-AAATATT-TTA-ATAGCA----A-TC-AG----TG---C-C----TTC--A-A-TT-A-G-CCAC-C-A-GA-TTGTC-A--T-T----T-AGGT--G-ACC-T-A-CAAT----TGGA----A--T-GG-T-T-TTG-G-AGA--AATA-C-AAAAATA-GA-----A--CT-G-CG-G-GG-A-AAC--------GT-CTTTGT--AAT-ATTC------------------------------------------TT--TCATA-C-GAATGT------GTTCA-TACGC--GTA-----T-G-A-T----ACT-A-GG-GCTG-A--TATC-CC-----------A-------------------------ATTGA-------------TT--------GGT--------GC-TG-TTT-A-CAAT-C-AA--TATAAGT-------AT-GTGTC-TTAATATT-C-A-A-AAT---A---TTTTTTC--A--TTTC--ATC-AT--GT---TA-T---TT-CAGAAAACGAAT--TT-ACATACAC-T-------TC-----------AC--------C--------ACT--GC--A-CT-CGCACAAC-T-------AT--A-T--TAT---G----------TT-----G---CGT---AG---AGAA-GT---AG-T--A-G--GGGTG--A---AGAG-GAAGATC-CG-CG---A-AAA-T--C--GC-CT-GA-CG-ACAAGGA----G-TACACT-CGCTA--CGCGAGCCGA-CT-CAAA
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|27 ): TGCATTATAATCATTATAATGATAGAATTAGAATGTAACTGCGACATAACGGGATCTTGGAAATGAGGAAGCAATACCAATACAAACTGTCTAATGTTCTGTGTACCATATCAA
Unaligned ( gi|31 ): GATAATATGAATACCCGCAAACGATTGTTGTTTGTTCCATATGCAACATGATTACATGTAATATTGAAACACAC
Unaligned ( gi|32 ): GCCGACTCAAAAACCAACCGAAAAACAGGGGAGTGGTGTTTGAGGCATGTTGGGA






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Reference ( family-585 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CCAGT-TATGAACCTCAA--CTTT--T-G-CAT-AA-GTTT--G-GTG-AT-TTTT--GG-------CCCG--GC-T-TGT--TCTGGGA-CA-AG--ATT-TTTCCC-----T-----T-------A------A--AA---A---A---T-TTTT---TTTTTC-A-TT---T-T-GTAATA-T--T-TCTC---A-T-T----T-CCATCC-ACC-AT---T-G-A-CAA--TT--TTA-T-GA----GT---------GA-TTT-C--A-CA----T--A----TT-CAAAAT--GT--T-CT-CT-AA-T-A-G-GACT-G----C-A----ATA--TG-T-ACA--T-GT----AAC-A-TTTT---GA---CT-G-GGT-AT----G-AAT--TGA-CTT--G-GG-CA--T--G--ATTT-G-A-CCT--A-CAT-----A--CCT-GACTTCCGGAAG-TT-TGT-AAA------C-AA--A--------A---A-TAGCTA-AC-GCGT--AT---T--AAATGA------------AACTT-TTGAC-AGG-----------TTT--T-CA--ACTT-AT-GTCT---AGGT-A-AGA---CA-AAATATT-TTA-A--GCA----A-TC-AG----TG---C-C----TTC--A-A-TT-A-G-CCAC-C-A-GA-TTGTC-A--T-T----T-AGGT--G-ACC-T-A-CA-T----TGGA----AA-T-GG-T-T-T-G-G-AGA--A-TA-C-GAAA-TA-GA-----A--CT-G-CG-G-GG-A-A-C--------GT-CTT-GT--AAT-ATTCCAA------------T----------A-----T-----CTCCTT--TCATA-C-GAATGT-AATGTGTTCA-TACGC-CGTA-----T-G-A-T----ACT-A-GG-GCTG-A-ATATC-CC-----------A-------------------------AT-GA-------------TT--------G-T--------GC-TG-TTTTA-CAAT-C-AA--TATAA-T-------AT-GTGTC-TTA-TATT-C-A-A-AAT---A---TTTTT-C--A--TTTC--ATC-AT--GT---TA-T---T--CAGAAAACGAAT--TT-ACATACAC-T-------CC-----------AC--------C--------AC--A-GC--A-CT-CGCACAAC-------T--AT--A-------TT--T---G----------TTG---C---GT---AGACAA-GT---AG-T--A-G--CGGTG--A---AGAG-GNAGATC-CG-CG---A-AAA-T--C--GC-C-TGA-C-GACAAGGA----G-TACGCT-CGCTA--CGCGAGCCGA-CT-CAAA
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gi|14                         :                                                                   aaaaaaaaaattttttttttaactttgtaatatttctcatttgcatccaccagtgacaattttattagtgatttcgcattattcaaaatatattctctaccaggactgcaatatgtacatgtaatattttgactaggtatgaattgacttgggcatgatttaaccaacatacctgacttccggaggtttgtatacaaaaaacagctaacgcgtttgcaaatgaaactttgacaggttttcaacttatgtctgagtaagacaaaatatcttaaacaatcattgccttcaattagccaccagatcgtcatttaggtgacctacattggaaatggtttggagaatatacgatgtagtccttttatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnA--TT--TTA-T-GATCTAGT---------CA-T------A-CA----T--A----T------AT--GT--TTCT-CT-AG-TCA-A-GACT-G----C-A----ATA--TG-T-A-------------AT-A-TTTT---GAACTTT-T-GGT-GT----G-AAC--TGA-CTT--TTGG-CAG-T--G--AGC--A-A-TCA--A-AA------A--CCTTGACTTCCG-------------AA------C-AA--A--------A---A-TAA-TA-TC-A-GT--AT------AAACGATAAGTCGGACATAATTT-TAAAT-TAT-----------TTT--T-CA--ACTC-AT-ATTA---ACTT-A-AGAATACA-AAGTATT-TCA-A--ATA----G-TG-AGAAAGTG---A-C----TTC--C-A-TT---T-CCAC-T-A-GA-TT-TC-A--T-T----T-AAGC--G-ACG-T-A-CA-TGTCATTGA----GA-T-AG-T-TGC-G-G-------------GAAA-AA-GACTCCGA--CA-G-CA-A-GG-A-G-CTTTAAGCAGT-TTC-CT--ATT-TCTCCAAC-----------C----------A-----T-----CTCCTTG-GCATG-C-GA-----AATGTGTACA-TCCAT-AGTC-----TGG-A-T----ACT------GTTG-ACATATC-CT-----------A-------------------------TC-GA-------------CTCTAAA---G-TCAAAGGACGT-TG-TTTTG-CAAA-C-AA--TTTGA-C--------T-GTATC-ATACCATT-C-A-A-TAC---A---TTTCT-CTTA--TTTCA-AAC-AC--GT---TA-
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aaccaaccacagtgttggaaT---GA---CT-G-CGT-AT-----------T---CTT--T-GA-TA-----G--ATCT-G-A-A-T--A-AAT-----A--CTT-GACTTCCGGAAG-TT-GGT-AAA------C-TA--A--------A---A-TAGCTA-AT-GCGT--AT---T--AAATGA------------AACTT-TTGAC-AGG-----------TTT--A-CA--ACTT-AT-GTCT---AGGT-A-AGA---CC-AAATATT-TTA-A--GCA----A-TC-AG----TG---C-C----TTC--A-A-TT-A-G-CCAC-C-A-GA-TTGTC-A--T-T----T-AGGT--G-ACC-T-A-CA-T----TGGA----AA-T-GG-T-T-T-G-G-AGA--A-TA-C-GAAA-TA-GA-----A--CT-G-CG-G-GG-A-A-C--------GT-CTT-GT--AAT-AT-----------------------------------------TCCTT--TCATA-C-G------AATGTGTTCA-TACGC-CGTA-----T-G-A-T----ACT-A-GG-GCTG---ATATC-CC-----------A-------------------------AT-GA-------------TT--------G-T--------GC-TG-TTTTA-CAAT-C-AA--TATAA-T-------AT-GTGTC-TTA-TATT-C-A-A-AAT---A---TTTTT-C--A--TTTC--ATC-AT--GTTAATA-T---T--CAGAAAACGAAT--TT-ACATACAC-T-------CC-----------AC--------C--------AC--A-GC--A-CT-CGCACAAC-------T--AT--A-------TTC-T---G----------TTG---C---GT---AGACAA-GT---AG-T--A-G--TGTTG--A---AGAG-GGAGATC-CG-CG---A-AAA-T--C--GC-C-AGA-C-GACAAGGA----G-TACGCT-CGCTA--CGCGAGCCGA-CT-CAAA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -GCGT--AT---T--AAATGA------------AAATT-TTGAC-AGA-----------TTT--T-CA--ACTT-AT-GTCT---AAGT-A-AGA---CC-AAATATT-TTA-A--GCA----A-TC-AG----TG---C-C----TTC--A-A-TT-A-G-CCAC-C-A-GA-TTGTC-A--T-T----T-AGGT--G-ACC-T-A-CA-T----TGGA----AA-T-GG-T-T-T-G-G-AGA--A-TA-C-GAAA-TA-GA-----A--CT-G-AG-G-a
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tTT--TCATA-C-G------AATGTGTTCA-TACccataaggggaatttcatacgaatgtgttcatacattctgactaacatatgaaattcgaaatcaaatattcttttgttaataccttctaaccactaacaacaatcctctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcagaaaacgaatttacatacactccaccactgcactcgcacaactatattctgttgcgtagacaagtaatagcggtgaagagggagatccgcgaaaatcgcctgacgacaaggagtacgctcgctacgcgagccgactcaaa
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tgcgtattaaatgaaaattttgacagattttcaacttatgtctaagtaagaccaaatattttaagcaatcagtgccttcaattagccaccagattgtcatttaggtgacctacattggaaatggtttggagaatacgaaatagaactgaggccataaggggaa---T--CAGAAAACGAAT--TT-ACATACAC-T-------CC-----------AC--------C--------AC--T-GC--A-CT-CGCACAAC-------T--AT--A-------TTC-T---G----------TTG---C---GT---AGACAA-GT---AA-T--A-G--CGGTG--A---AGAG-GGAGATC-CG-CG---A-AAA-T--C--GC-C-TGA-C-GACAAGGA----G-TACGCT-CGCTA--CGCGAGCCGA-CT-CAAAattctgactaacatatgaaattcgaaatcaaatattcttttgttaataccttctaaccactaacaacaatcctctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcagaaaacgaatttacatacactccaccactgcactcgcacaactatattctgttgcgtagacaagtaatagcggtgaagagggagatccgcgaaaatcgcctgacgacaaggagtacgctcgctacgcgagccgactcaaa
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tgcgtattaaatgaaaattttgacagattttcaacttatgtctaagtaagaccaaatattttaagcaatcagtgccttcaattagccaccagattgtcatttaggtgacctacattggaaatggtttggagaatacgaaatagaactgaggccataaggggaatttcatacgaatgtgttcatacattctgactaacatatgaaattcgaaatcaaatattcttttgttaataccttctaaccactaacaacaatcctctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-AT-GTCT---GGGT-A-AGG---CA-AAATATC-TTA-A--ACAAACCA-TC-------TG---C-C-----TC--A-A-TT-A-GACCAC-CAA-GA-TCGTT----T-T----T-AGGT--G-ACC-T-A-AA-T----TGG-----AA-T-GG-T-T-T-G-G-AG---A-TA-C-GATG-TA--A-----A--CT-G-CT-G-GG-A-A-T--------G---TT-GT--AGC-AT---------------------------------------------------TA-C-G------AATGTGTTCA-TACGCGCGTATAGGCT-G-A-TACCCACC-A-GA-CTTA-A-ATA----------------A-------------------------AC-G---------------T--------G-T--------GC-TG-TTTTA-CAAT-C-AA--TATGA-T-------GT-G---C-TTA-TATT-C-A-A-ATT---A---TTT------A--CT----ATC-CA--GT---TA-T---C--GAGAAAACGAATTATT-ACATACAT-T-------AC-----------AC--------C--------AC--A-GC--A-CT-CCCACAAC-------T--ATTCA-------TT--C---GTAATAGAAACTTGGGAC---GCCAAAGACAACGT---AGAC--A-ATTCAATA--AATTAGAG-GCA-ATC-CGACG---A-GAA-T--CG-GG-C-TGA-T-GGCA--GA----G-TA-G---CGCTA--CGCGA-CCGGTCT-CAAA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AATGA------------AACTT-TTGCC-AG------------TTTGAT-CA--ACTT-G--GCTT---AGGT-A-GAC---CATAAATATT-TTA-A--GCA----A-TC-AG----TG---C-C----TCT--A-A-TT-A-G-GCA--C-A-GA-TTGTC----T-T----T-AGGT--G-------A-CA-T----TGG------A-T-GGTT-T-T-G-G-AGA--A-T--C--AAT-TA-GA-----ATGCTGG-CG-G-GG-A-A-C--------GTGCTT-GT--AA-------AA---------------------------------------------------GAA------TGTGTTC--TA-G--CGTA-----T-G-A------ACT-A-GGTGCTG---ATAT--CC-----------A-------------------------AT-GA-------------TT--------G-T--------GC-TG-TTTTACCAAT-C-AA--T---A-T-------AT-TTGGC-----TATTAC-A-ATAAT---A---TTTTT-A--A--TTTCATATC-AT--GT---TA-T---TA-CAG--AACGAAT--TA-ACATACAT-T---------------------C--------C--------AC--A-GC--A-CT-CGCACAAC----------AT--A-------TTC-T---G----------TTG---C---GT---AG-CAA-GT---AGATA-A-G--TGGTG--A---AGAG-GCAATTC-CG-CGAACA-AAA-T-----G--C-TGA-C-GA-AAGGA----GTTACACT-CGCTAACTGCG-GCCGA-CT-CCAAa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tCCAGT-TATGGACCTCAA--CTTT--T-G-CAT-AA-GTTT--G-GTG-AT-TTTT--GG-------CCCGAAG--T-TAT--TCT-GGA-CA-AGAAAGT-TTTCAC-----T-----TAATATCAA------A--AA---A---A---TATTTTG--TTTTTC-A-TT---T-T-GTAATA-T--T-TCTC---AGT-T----T-CCATCCGACC-AT---T-G-AGCAA--TT--TTAGT-GA----GT---------GA-TTT-C--A-AA----C--ACTATTT-CAAAAT--GT--T-CT-CT-AA-T-A-GCGAGT-G----C-A----ATA--TG-T-ACA--TGGT----AAC-ATTTTT---GA---CT-G-GGT-AT----G-AAT--TGAGCTT--G-G---A--T--G--AGTT-GAA-CCT--A-CATA----A--CCT-GAC-TCCGGAAG-TT-TGTAAAA------CAAA--A--------A---A-TAGCTA-ATGGCGTAAAT---T--AAATG-------------AACTTGTTGAC-AGGT----------TTT--T-CA--ACTTCAT-GTCTTA-AGGT-A-AGACC-CA-AAGTATT-TTA-A--GCA----A-TC--G----TG---C-C----TTC--A-AGTT-AGG-CCAC-C-A-GA-TTGTC-A--TGT----T-AGGT--G-ACT-----CA-T----TGGA----AA-T-GG-T-T-T-T-G-AGA--A-TA-CGGAAA-TA-GA-----A--CT-G-CT-G-GG-A-A-C--------GT-CTT-CTA-AAT-A----AA------------T-----------------------TCCTT--T-ATA-C-G------AATGTGTTCA-TACGCGCGT------T-G-A-T----ACT-G-AG-GCTG---ATAT--CC-----------A-------------------------AT-GAT------------TT--------G-T--------GCTTG-TTTTA-CAATCC-AA--AATAA-T-------ATGGTGTC-TTA-TATT-C-A-A-CAT---A---TTTTT-C--AACTTTC--ATC-AT--GT---TATT---T--CAGAAAA-GAAT--TTAACGTACACAT-------CA-----------AC--------C--------AC--A-GC--A-CT-TGCACAAC-------TA-AT--A-------TTGCT---G----------TTG---C---GT---AGGCAA-GT---AG-T--A-G--CAGTG------AGAG-GGAGATC-CG-CA---A-AAA-T--C--ACTC-TG--C-GACAAGGA----G-TA------GCGG--CG-GAG-CGA-CTGCAAta
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aaaccA-A--GCA----A-TC-AG----TG---C-C----TTC--A-A-TT-A-G-CCAC-C-A-AA-TTGTC-A--T-TAAAAT-AGGT--G-ACC-T-A-CA-T----TGGA----AA-T-GG-T-T-T-G-G-AGA--A-TA-C-GAAA-TA-GA-----A--CT-G-CG-G-GG-A-A-C--------GT-CTT-GT--AAT-ATTCCAG------------T----------ACAAAAT-----CTCCTT--TCATA-C-GAATGT------GTTCA-TGCG----TG-----T-G-A-T----ACT-A-GG-GCTG-A--TATC-CC-----------A-------------------------AT-GA-------------TT--------G-T--------GC-CA-TTTTA-CAAT-C-AA--TATAA-T-------AT-GTGTC-TTA-TATT-C-A-A-AAT---A---TTTTT-C--A--TTTC--ATC-AT--GT---TA-T---T--CAGAAAACGAAT--TT-ACATACAC-T-------CC-----------AC--------C--------AC--A-GC--A-CT-CGCACAAC-------T--AT--A-------TTG-T---G----------TTG---C---GT---AGACAA-GT---AG-T--A-G--CGGTG--A---AGAG-GGAGATC-CG-CG---A-AAA-T--C--GC-C-TGA-C-GACAAGGA----G-TACGCT-CGCTA--CGCGAGCCGA-CT-CAAga
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          --A-CAT-----G--CCT-GACTGTCGAAAG-TT-TGT-AAA------C-AA--A-----------------CC---C-GCGT--A-------ACATGA------------AACTT----AC-AAG-----------TTT----------------ATCT---GAGTCA-AGA---CA-AAACATC-TTA-A--ACA----AATC-AG----TG---C-C----TGCCAA-A-TA-A-G-CCAC-C-A-TA-TCATC-A--TCT----T-AGGCCGG-ACC-T-A-CA-T----TGGA----AA-T-TA-T-T-T-G-ACAGA--G-TA-C-GAAG-CA-GA-----A--CT-G-CA-TTGG-A-A-C---------T-TTC-ATTCAGT-ATTCCAAATTCTCCCCAACC----------A-----T-----CTCCTTCGTCCTC-CCGAATGT-TA------CA-TGCGT-C--------T-GCA-T----ATG-A-GG-CCT--A-ATATCTCC-----------A-------------------------CT-GA-------------CTCTAAAAGCA-T--------GG-TG-TTT-A-CA-T-C-AA--TATGA-T-------AC-ATGGT-CTA-TATT-C-A-A-TAT---A---ta
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TC-A-CT---T-T-GTAATA-C--T--CTT---A-T-T----G-CATTCC-ACC-AT---T-G-A-CAA--TT--TTA-T-TA----GT---------GA-ATT-C--A-TT----TT-A----TT-CAAAATATGT--T-CT-CT-AA-T-A-G-GACT-G----C-A----ATA--TG-T-AC---T-AT----AAT-A-TTTT---TA---T----GGT-AT----G-AAT--TGA-CTT--G-GG-CA--T--GTGATCG-G-A-CCT--A-CAT-----A--CCT-GACTTCCGGAAG-TT-TGT-AAA------CAAA--A--------A---A-CATCTA-AC-GCG--------------------------------TT-TTGAC-AGG------------GT--T-CA--ACT
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aagcttttggaaacatcatttatttttaacacttggcacaattcaaatatatagatctccttataaaacaaaaatgaattattccccgaaattaaaaaataaaa-A-G-GACT-G----C-------TA--TG----CA--T-GT-----------------GA---CT-G-GGT-ATAT--G-AAA--TGA-CT-----GA-CAAAC--G--ATTT-G-A-CCT--A-TAACCAAAA--CCT-GATTTATGGACG-TT-TGT-AGAGTGATGC-AA--ACCCAGAGGA---A-AGGAAA-AC-AAAC--AT------AAACGA------------AACGT-T-GAC-AGGATTTTAAATAATTT--T-CA--ATTG-AA-ATCT---GAGT-A-GGA-----------TT-TTA-A--ACA------TCGAG----TG---A-C----TTC--A-T-TT-A-G-CCAC-C-A-GA-TTGTC-A--T-T----C-AGTC--G-AAC-A-A-CA-T----TTGA----GA-T-GG---T-T-G-G-AAA--A--G-T-GACT-TC-GA-----A--CT-G-CA-G-GG-A-A-C--------TT-CAT-GT--AGT-ATCCTAA------------TTCTTGCAACCA-----T-----CTCCTT--TCAT
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -----T-------A------A--AA---A------------T---TATTTC-A-CT---T-T-GTAATA-T--T-TCTC---A-T-T----T-GCA
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gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tatgaccgtacttcctgtCCAGT-TATGAACCTCAA--CTTT----G-CAT-AA-GTTT--GTGTGTAT-TTTTTTGG-------CC-G--GC-T-TGT--TCTGG-A-CA-AG--ATT-TT-CCC-----T-----T-------AT-----ATCAA---A---A---T-TTTT---TTTTTA-T-TT---T-T-GTA-TA-T--T-TCTC---T-TGT----C-CCATCC-ACC-AA---T-G-A-CAA--TT----A-T-GA----GTT--------GA-TTT-CGAA-C-----T--A----TT-CAAAA---GT--T-CT-CTTAA-T-A-G-GACT-G----C-AC---ATT--TG-T-ACA--T-GT----AAC-A-TTTC---GA---CTCG-GGT-ATAT--G-AAT--TGA-CTT--T-GG-CA--T--G--ATTT-G-A-CCT--ATCAT-----A--CCG-GACTTCCAGAAG-TT-TGT-AAA------C-AA--A--------ATAAA-TAGCTA-AT-G-GT--ACG--T--A-----------------------TTGAC-AGG-----------TTT--TTCA--ACTT-AT-GTCT---AG-T-A--GA---CA-AAATATT-TTA-A--GCA----A-TC-AG----TGTG-C-C----TTC--A-A-TT-AAG-CCAC-C-CCGA-TTGTC-A--T-T----T-AGGT--G-ACC-T-A-CA-T----TGGA----CA-T-GG-T-T-T-G-G-A-A--A-TA-C-GAAA-TA-GA-----A--CT-G-CG-G-G--A-A-C--------AT-CTT-GT--AATTATTCCAA------------T----------A-----TAAATGCTCCTT---CATA-C-GAATGT----GTTTCCA-TGCGC-CGTA-----T-C-A-T----ACT-A-GT-GCTG-A--TATC-CC-----------A-------------------------AT-GA-------------TT--------G-T--------TT-TG-TTTTA-CA-T-C-AA--TATAA-T-------AT-GTGTC-T-A-TAAT-C-A-A-AAT---A---TTTTT-C--A--TTTC--ATC-ATTTGT---TA-T---TT-CAGAAAACGAAT--TT-ACATACAC-T-------CC-----------AC--------C--------AC--A-GC--A-CTTCGCACAAC-------T--ATT-A-------TTG-T---G----------TTG---C---GT---AGACAA-GT---AG-T--AAG--CGGTGGAA---AGAG-CGAGATCGCG-CA---A-AAT-T--C--GC-C--GA-C-GACAAGGA----G-TACGCT-CGCTA--CGCGAGCCGA-CT-CAAAaa
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gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           atttgcaattgcaaatgaaaaatgttA--T--G--ATTT-G-A-CCT--A-CAT-----A--CCC-GACTTCCGGAA
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CACAAC-------T--AT--A-------TTC-T---G----------TTG---C---GT---AGACAA-GT---Aaac
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ctaA----G-TACGCT-CGCTA--CGCGAGTCGA-CT-CAAA
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ----G-TACACT-CGCTA--CGCGAGCCGA-CT-CAAAaa
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -------A------A--AA---A---A---T-TTTT---TTTTTT-AACT---T-T-GTAATA-T--T-TCTC---A-T-T----T-GCATCC-ACC-AG---T-G-A-CAA--TT--T-A-T-TA----GT---------GA-TTT-C--G-CA----TT-A----TT-CAAAAT--ATATT-CT-CT-AC-C-A-G-GACT-G----C-A----ATA--TG-T-ACA--T-GT----AAT-A-TTTT---GA---CT-A-GGT-AT----G-AAT--TGA-CTT--G-G--CA--T--G--ATTT-A-A-CCA--A-CAT-----A--CCT-GACTTCCGGAGG-TT-TGT-ATA------C-AA--A--------A---AACAGCTA-AC-GCGT---T---TGCAAATGA------------AACTT-T-GACCAGG-----------TTT--T-CA--ACTT-AT-GTCT---GAGT-A-AGAA--CA-AAATATC-TTA-A--ACA----A-TC-AT----TG---C-C----TTC--A-A-TT-A-G-CCAC-C-A-GA-TCGTC-A--T-T----T-AGGT--G-ACC-T-A-CA-T----TGGA----AA-T-GG-T-T-T-G-G-AGAATA-TA-C-GATG-TA-Gaaa
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aagctttgggaaacatcattcatttttacacttaccacacttcaaaatataatagatctccttataaaacaaaaatgaaatatttacccgaatattaaaaaTCCTT--TTAT--C-GAATGT------GTTCA-TACGC-CGTA-----T-G-A-T----ACT-A-GG-GCTG-A--TATC-CC-----------A-------------------------CA-GACTCTAAAGTAAACTT--------G-T--------GC-TG-TTTTA-CAAT-T-AA--TATGA-T-------AT-GTGTC-TTA-TATT-C-G-A-AAT---A---TTTTT-T--A--TTTC--ACC-AT--GT---TATT---T--CAGAAAACGAAT--GT-ACATACAT-T-------AC-----------ATTTACAGCAT--------AT--A-GC--A-CT-CCCACAAC-------T--AT--A-------TT--CA--G----------TTG---C---AT---AGTCAA-TTCA-AG-T--A------GTG--A---AGAG-GCAAATC-CG-CG---A-GAA-T--CA-GC-C-TGA-T-GGCAAGGA----G-TA-GCT-CGCTA--CGCGAGCTGA-CT-CAAAtccttttatcgaatgtgttcatacgccgtatgatactagggctgatatcccacagactctaaagtaaacttgtgctgttttacaattaatatgatatgtgtcttatattcgaaatattttttatttcaccatgttatttcagaaaacgaatgtacatacattacatttacagcatatagcactcccacaactatattcagttgcatagtcaattcaagtagtgaagaggcaaatccgcgagaatcagcctgatggcaaggagtagctcgctacgcgagctgactcaaaa
gi|5                          : aagctttgggaaacatcattcatttttacacttaccacacttcaaaatataatagatctccttataaaacaaaaatgaaatatttacccgaatattaaaaaaaaaaatttttttttttaactttgtaatatttctcatttgcatccaccagtgacaatttattagtgatttcgcattattcaaaatatattctctaccaggactgcaatatgtacatgtaatattttgactaggtatgaattgacttggcatgatttaaccaacatacctgacttccggaggtttgtatacaaaaaacagctaacgcgtttgcaaatgaaactttgaccaggttttcaacttatgtctgagtaagaacaaaatatcttaaacaatcattgccttcaattagccaccagatcgtcatttaggtgacctacattggaaatggtttggagaatatacgatgtag-AA--ATTATTTCCCCGAAAT-----T-------A------A--AA---A---AAA-T-ATTT---TTTTTC-A-CT---T-T-GTAATA-T--T-TCTC---A-T-T----TGTTATCC-ACC-AT---T-G-A-CAA--TT----A-T-TA----GT---------GA-TTT-C--G-TA----TT-A----TTACAAAATATGT--T-CT-CT-AA-T-A-G-GACT-G----C-A----ATA--TG-T-AC------------------------------T-G-G-T-AT----GGAAT--TGA-CTTT-G-GG-CA--T--G--ATTT-A-AACCT--A-CAC-----AAACCC-GACTTCCGGAAG-TT-TGT-AAA------C-AATAA--------A---A-CAGCTA-AC-GCGT---T---TGCAAATGAG-----------AACTT-TTGAC-AGG-----------TTT--T-CA--ACTT-ATTGTCT---GAGT-A-AGA---AA-AAATATC-TTA-A--ACA----A-TT-AT----TG---C-C----TTC--A-A-TT-A-G-CCAC-C-A-GA-TCGTC-A--T-T----T-AGGTG-G-ACC-T-A-CA-T----T-GA----AA-T-GG-T-T-T-G-G-AGA--A-TA-C-GATG-TG-GA-----A--CT-G-CG-G-GG-AGA-C--------GT-C-----------------------------------------A-----T-----CTCCTT--TCATA---G------AATGTGTTCA-TACGC-CGTA-----T-G-A-T----ACT-A-GG-GCTG---ATATC-CC-----------A-------------------------CA-GACTCTAAAGTAAACCT--------G-T--------GC-TG-TTTTA-CAAT-C-AA--TATGA-T-------AT-GTGTC-TTA-TATT-C-G-A-AAT---AT--TTTTT-T--A--TTTC--ACC-AT--GT---TA-G---T---AGAAAACGAAT--TT-ACATACAT-TACATTTACG-----------AC--------CA-------AG--A-GC--A-CT-CCCACAAC-------T--AT--A-------TT--TTCAG----------TTG---C---GT---AGACAA-ATTCAAG-T--A------GTG--A---AGAG-GCAAATC-CG-CG-----GAA-T--CA-GC-C-TGA-T-GGCAAGGA----G-TA-GCT-CGCTA--CGCGAGCCGA-CT-CAAAa
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                 agctttgggaaacttcatttttacacttagcacacttcaaaatatatagatatccctataaaacaaaaatCCAGT--AT-AACCTCAA--CTTT--T-G-CATNNN-NNNN--N-NNN-NN-NNNN--NN-------NNNN--NN-N-NNN--NNNNNNN-NN-NN--NNN-NNNNNN-----N-----N-------N------A--AA---A---A---T-TATT---TTTTTC-A--T---T-T-GTAATA-T--T-TCTC---A-T-T----T-CCATCC-ACC-AT---T-G-A-CAA--TA--TTA-T-GA----GT---------GA-TTC-C--A-C-----T--A----TT-CAAAAT--GT--T-CT-CT-AA-T-A-G-GACT-GCACAC-A----ATT--TG-T-ACA--T-GT----AAC-A-TTTT---GA---CT-G-GGT-AT----G-AAT--TGA-CTT--G-GG-CA--T--G--ATTT-G-A-CCA--A-CAT-----A--CCT-GACTTCCGGAAG-TT-TGT-AAA------C-AA--A--------A---A-TAGCTA-AT-GCGT--AT---T--AAATGA------------AACTT-TTGAC-AGG-----------TTT--T-CA--ACTT-AT-GTCT---AGGT-A-AGA---CA-AAATATT-TAA-A--GCA----A-TC-AG----TG---C-C----TTC--A-A-TT-A-G-CCAC-C-A-GA-TTGTC-A--T-T----T-AGGT--G-ACC-T-A-CA-T----TGGA----AA-T-GG-T-T-T-G-G-AGA--A-TA-C-GAAA-TA-GA-----A--CT-G-CG-G-GG-A-A-C--------GT-CTT-GT--AAT-ATTCCAA------------TACAAA-----A-----T-----CTCCTT--TCATA-C-GAATGTCAATGTGTTCA-TGCGC-CGTA-----T-G-A-T----ACTGA-GG-CCTGAA-ATATC-CC-----------A-------------------------AT-GA-------------TT--------G-T--------GC-TG-TTTTA-CAAT-C-AA--TATAA-T-------A---TGTCGTTA-TATT-C-A-A-AAT---A---TTTTT-C--A--TTTC--ATC-AT--GT---TA-T---T--CAGAAAACGAAT--TT-ACATACAC-T-------CC-----------AC--------C--------AC--ACAC--A-CT-CGCACAAC-------T--AT--A-------TG--T---G----------TTG---C---GT---AGACAA-GT---AG-T--A-G--CGGTG--A---AGAG-GGAGATC-CG-CG---A-AAA-T--C--GC-C-TGA-C-GACAAGGA----G-TACGCT-CGCTA--CGCGAGCCGC-CT-AAAA
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CCAGT-TATGAACCTCAA--CTTT--T-G-CAT-AAAGTTT--G-GTG-AT-TTTG--CG-------CCCG--A--T-TAT--TCTGGGAACA-AG--ATT-TTTCCC-----T-----T-------ATATAA-A--AA---A---AGATT-TTTT---TTTTTT-T-TT---T-T-GAAATA-T--T-T-TC---A-T-T----T-TCATCC-ACC-AT---A-G-A-CAA--TT--T-A-T-GA----GT---------GA-TTT-C--A-CAC---T--A----TT-CAAAAT--GT--T-CT-CT-AACT-A-G-GACT-G----C-A----ATA--TG-T-ACA--T-GT----AACTA-TTTT---GA---CT-G-GGT-AT----G-AAT--TGA-CTT--G-AGACA--T--G--ATTT-G-A-C-T--A-CAT-----A--CCT-GACTTCCGGAAG-TT-TGT-AAAA-----C-AA--A--------A---A-TAGCTATGC-G-GT--AT---A--AATTGA------------AAACT-TTGAC-AGG-----------TTT--T-CA--ACTTTAT-GTCT---AGGT-A-AGA---CC-AAATATT-TTA-A--GCA----A-TC-AG----TG---C-C----TTC--A-A-TTTA-G-CCAC-C-A-GA-TTGTC-A--A-T----T-AGGT--G-ACCAT-A-C--T----TGAG----AA-T-GG-T-T-T-G-G-AGA--A-TA-C-GAAA-TA-GA-----A--CT-G-CC-G-GG-A-A-C--------GT-CTT-CT--AG---------------------------------------------GCCT------------AACG--AATGTGTTCA-TACGC-CGTA-----T-G-A-T----ACT-A-GG-GCTG---ATATC-CC-----------A-------------------------AT-GA-------------TT--------G-T--------GC-TG-TTTTA-CAAT-CAAA--AATAA-T-------AT-GTGTC-TTA-TATT-CAA-A-AAT---A---TTTTT-C--A--TTTC--ATC-AT--GT---TA-T---T--CAGAAAACGAAT--TT-ATATACAC-T-------CC-----------AC--------C--------AC--A-GC--A-CT-CGCACAACA------T--AT--A-------TTC-T---G----------TTG---C---GT---AGACAA-GT---AG-T--A-G--CGGTG--A---AGAG-GGAGATC-CG-CG---A-AAA-T--C--GC-C-TGA-C-GACAAGGAGTACG-TACGCT-CGCTA--CGCGAGCCGA-CT-CAAA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aaaccT-TATGAACCTCAA--CTTT--T-G-CAT-AA-GTTT--G-GTG-AT-TTTT--GG-------CCCG--GT-T-CGT--TCTGG-A-CA-AA--GAT-TTTCCC-----T-----T-------ATATC--A--AA---A---A---A-TTAT---TTTTTC-A-TT---T-T-GTA-TA-T--T--CTC---A-T-T----T-CCATCC-ACC-AT---T-G-A-CAA--TT--TTA-T-GA----GT---------GA-TTT-C--A-CAC---T--A----TTTCAAAAT--GT--T-CT-CT-AA-T-AAG-GACT-G----C-AC---ACAATTG-T-ACA--T-GT----AA--A-TTTT---GA---CT-G-GGT-AT----G-AAT---GA-CTT--G-GG-CA--T--G--ATTT-G-A-CA---A-CAT-----A--CCT-GACTTCCGGAAG-TT-TGT-AAA------C-AA--A--------A---A-TAGCTA-AT-GCGT--AT---T--AAATGA------------AACTT-TTGAC-AGG-----------TTT----CA--ACTT-AT-GTCT---AGGT-A-AGA---CA-AAATATT-TAA-A--GCA----A-TC-AG----TG---C-C----TTC--A-A-TT-A-G-CCAC-C-A-GA-TTGTC-AA-T-T----T-AGGT--G-ACC-T-A-CA-T----TGGA----AA-T-GG-T-T-T-G-G-AGA--A-TAAC-GAAA-TA-GA-----A--CT-G-CG-G-GG-A-A-C--------GT-CTT-GT--AAT-ATTCCAA------------T----------ACAAA-T-----CTCCCT--TCTTA-C-GAATGT-CATGTGTTCA-TGCGC-GCTA-----T-G-A-T----ACT-A-GG-GCTG-A-ATATC-CC-----------A-------------------------A--GA-------------TT--------G-T--------GC-TG-TTTTA-CAAT-CCAA--T-TAA-T-------AT-GT--C-TTA-TATT-C-A-A-AAT-------TTTTT-C--A--TTTC--ATC-AT--GT---TA-T---T--CAGAAAACGAAT--TT-ACATACAC-T-------CC-----------AC--------C--------AC--A-AC--A-CT-CGCACAAC-------T--AT--A-------TG--T---G----------TTG---C---GT---AGACAA-GT---AG-T--A-G--CGGTG--A---AGAG-GGAGATC-CG-CG---A-AAA-TCGC--GC-C-TGA-C-GACAAGGA----G-TACGCC-GGCTA--CGCGAGCCGA-CC-TAAAa
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CCAGT-TATGAACCTCAA--CTTT--T-G-CAT-NN-NNNN--N-NNN-NN-NNNN--NN-------NNNN--NN-N-NNN--NNNNNNN-NN-NN--NNN-NNNNNN-----N-----NNNC----A------A--AA---A---A---T-ATGT---TTTTTC-A-TT---T-T-GTAATA-T--T-TCTC---A-T-T----T-CCATCC-ACC-AT---T-G-A-CAA--TT--TTA-T-GA----GT---------GA-ATT-C--A-CAC---T--A----TT-CAAAAT--GT--T-CT-CT-AA-T-A-G-GACT-G----C-A----ATA--TG-T-ACA--T-GT----AAC-A-TTTT---GA---CT-G-GGT-AT----G-AAT--TGA-CTT--G-GG-CA--TATG--ATTT-G-A-CAT--G-CAT-----A--CCT-GA-TTCCGGAAG-TT-TGT-AAA------C-AA--A--------A-----TAGCTA--T-GCGT--AT------AAATGA------------AACTT-TTGAC-AG------------TTT--T-CA--ACTT-AT-GTCT---AGGT-A-AGA---CC-AAATATT-TTA-ATAGCA----A-TC-AG----TG---C-C----TTC--A-A-TT-A-G-CCAC-C-A-GA-TTGTC-A--T-T----T-AGGT--G-ACC-T-A-CAAT----TGGA----A--T-GG-T-T-TTG-G-AGA--AATA-C-AAAAATA-GA-----A--CT-G-CG-G-GG-A-AAC--------GT-CTTTGT--AAT-ATTC------------------------------------------TT--TCATA-C-GAATGT------GTTCA-TACGC--GTA-----T-G-A-T----ACT-A-GG-GCTG-A--TATC-CC-----------A-------------------------ATTGA-------------TT--------GGT--------GC-TG-TTT-A-CAAT-C-AA--TATAAGT-------AT-GTGTC-TTAATATT-C-A-A-AAT---A---TTTTTTC--A--TTTC--ATC-AT--GT---TA-T---TT-CAGAAAACGAAT--TT-ACATACAC-T-------TC-----------AC--------C--------AC--T-GC--A-CT-CGCACAAC-------T--AT--A-------TTA-T---G----------TTG---C---GT---AGAGAA-GT---AG-T--A-G--GGGTG--A---AGAG-GAAGATC-CG-CG---A-AAA-T--C--GC-C-TGA-C-GACAAGGA----G-TACACT-CGCTA--CGCGAGCCGA-CT-CAAA
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|27 ): TGCATTATAATCATTATAATGATAGAATTAGAATGTAACTGCGACATAACGGGATCTTGGAAATGAGGAAGCAATACCAATACAAACTGTCTAATGTTCTGTGTACCATATCAA
Unaligned ( gi|31 ): GATAATATGAATACCCGCAAACGATTGTTGTTTGTTCCATATGCAACATGATTACATGTAATATTGAAACACAC
Unaligned ( gi|32 ): GCCGACTCAAAAACCAACCGAAAAACAGGGGAGTGGTGTTTGAGGCATGTTGGGA






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Reference ( family-585 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CCAGT-TATGAACCTCAA--CTTT--T-G-CAT-AA-GTTT--G-GTG-AT-TTTT--GG-------CCCG--GC-T-TGT--TCTGGGA-CA-AG--ATT-TTTCCC-----T-----T-------A------A--AA---A---A---T-TTTT---TTTTTC-A-TT---T-T-GTAATA-T--T-TCTC---A-T-T----T-CCATCC-ACC-AT---T-G-A-CAA--TT--TTA-T-GA----GT---------GA-TTT-C--A-CA----T--A----TT-CAAAAT--GT--T-CT-CT-AA-T-A-G-GACT-G----C-A----ATA--TG-T-ACA--T-GT----AAC-A-TTTT---GA---CT-G-GGT-AT----G-AAT--TGA-CTT--G-GG-CA--T--G--ATTT-G-A-CCT--A-CAT-----A--CCT-GACTTCCGGAAG-TT-TGT-AAA------C-AA--A--------A---A-TAGCTA-AC-GCGT--AT---T--AAATGA------------AACTT-TTGAC-AGG-----------TTT--T-CA--ACTT-AT-GTCT---AGGT-A-AGA---CA-AAATATT-TTA-A--GCA----A-TC-AG----TG---C-C----TTC--A-A-TT-A-G-CCAC-C-A-GA-TTGTC-A--T-T----T-AGGT--G-ACC-T-A-CA-T----TGGA----AA-T-GG-T-T-T-G-G-AGA--A-TA-C-GAAA-TA-GA-----A--CT-G-CG-G-GG-A-A-C--------GT-CTT-GT--AAT-ATTCCAA------------T----------A-----T-----CTCCTT--TCATA-C-GAATGT-AATGTGTTCA-TACGC-CGTA-----T-G-A-T----ACT-A-GG-GCTG-A-ATATC-CC-----------A-------------------------AT-GA-------------TT--------G-T--------GC-TG-TTTTA-CAAT-C-AA--TATAA-T-------AT-GTGTC-TTA-TATT-C-A-A-AAT---A---TTTTT-C--A--TTTC--ATC-AT--GT---TA-T---T--CAGAAAACGAAT--TT-ACATACAC-T-------CC-----------AC--------C--------AC--A-GC--A-CT-CGCACAAC-------T--AT--A-------TT--T---G----------TTG---C---GT---AGACAA-GT---AG-T--A-G--CGGTG--A---AGAG-GNAGATC-CG-CG---A-AAA-T--C--GC-C-TGA-C-GACAAGGA----G-TACGCT-CGCTA--CGCGAGCCGA-CT-CAAA
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gi|14                         :                                                                   aaaaaaaaaattttttttttaactttgtaatatttctcatttgcatccaccagtgacaattttattagtgatttcgcattattcaaaatatattctctaccaggactgcaatatgtacatgtaatattttgactaggtatgaattgacttgggcatgatttaaccaacatacctgacttccggaggtttgtatacaaaaaacagctaacgcgtttgcaaatgaaactttgacaggttttcaacttatgtctgagtaagacaaaatatcttaaacaatcattgccttcaattagccaccagatcgtcatttaggtgacctacattggaaatggtttggagaatatacgatgtagtccttttatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnA--TT--TTA-T-GATCTAGT---------CA-T------A-CA----T--A----T------AT--GT--TTCT-CT-AG-TCA-A-GACT-G----C-A----ATA--TG-T-A-------------AT-A-TTTT---GAACTTT-T-GGT-GT----G-AAC--TGA-CTT--TTGG-CAG-T--G--AGC--A-A-TCA--A-AA------A--CCTTGACTTCCG-------------AA------C-AA--A--------A---A-TAA-TA-TC-A-GT--AT------AAACGATAAGTCGGACATAATTT-TAAAT-TAT-----------TTT--T-CA--ACTC-AT-ATTA---ACTT-A-AGAATACA-AAGTATT-TCA-A--ATA----G-TG-AGAAAGTG---A-C----TTC--C-A-TT---T-CCAC-T-A-GA-TT-TC-A--T-T----T-AAGC--G-ACG-T-A-CA-TGTCATTGA----GA-T-AG-T-TGC-G-G-------------GAAA-AA-GACTCCGA--CA-G-CA-A-GG-A-G-CTTTAAGCAGT-TTC-CT--ATT-TCTCCAAC-----------C----------A-----T-----CTCCTTG-GCATG-C-GA-----AATGTGTACA-TCCAT-AGTC-----TGG-A-T----ACT------GTTG-ACATATC-CT-----------A-------------------------TC-GA-------------CTCTAAA---G-TCAAAGGACGT-TG-TTTTG-CAAA-C-AA--TTTGA-C--------T-GTATC-ATACCATT-C-A-A-TAC---A---TTTCT-CTTA--TTTCA-AAC-AC--GT---TA-
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aaccaaccacagtgttggaaT---GA---CT-G-CGT-AT-----------T---CTT--T-GA-TA-----G--ATCT-G-A-A-T--A-AAT-----A--CTT-GACTTCCGGAAG-TT-GGT-AAA------C-TA--A--------A---A-TAGCTA-AT-GCGT--AT---T--AAATGA------------AACTT-TTGAC-AGG-----------TTT--A-CA--ACTT-AT-GTCT---AGGT-A-AGA---CC-AAATATT-TTA-A--GCA----A-TC-AG----TG---C-C----TTC--A-A-TT-A-G-CCAC-C-A-GA-TTGTC-A--T-T----T-AGGT--G-ACC-T-A-CA-T----TGGA----AA-T-GG-T-T-T-G-G-AGA--A-TA-C-GAAA-TA-GA-----A--CT-G-CG-G-GG-A-A-C--------GT-CTT-GT--AAT-AT-----------------------------------------TCCTT--TCATA-C-G------AATGTGTTCA-TACGC-CGTA-----T-G-A-T----ACT-A-GG-GCTG---ATATC-CC-----------A-------------------------AT-GA-------------TT--------G-T--------GC-TG-TTTTA-CAAT-C-AA--TATAA-T-------AT-GTGTC-TTA-TATT-C-A-A-AAT---A---TTTTT-C--A--TTTC--ATC-AT--GTTAATA-T---T--CAGAAAACGAAT--TT-ACATACAC-T-------CC-----------AC--------C--------AC--A-GC--A-CT-CGCACAAC-------T--AT--A-------TTC-T---G----------TTG---C---GT---AGACAA-GT---AG-T--A-G--TGTTG--A---AGAG-GGAGATC-CG-CG---A-AAA-T--C--GC-C-AGA-C-GACAAGGA----G-TACGCT-CGCTA--CGCGAGCCGA-CT-CAAA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -GCGT--AT---T--AAATGA------------AAATT-TTGAC-AGA-----------TTT--T-CA--ACTT-AT-GTCT---AAGT-A-AGA---CC-AAATATT-TTA-A--GCA----A-TC-AG----TG---C-C----TTC--A-A-TT-A-G-CCAC-C-A-GA-TTGTC-A--T-T----T-AGGT--G-ACC-T-A-CA-T----TGGA----AA-T-GG-T-T-T-G-G-AGA--A-TA-C-GAAA-TA-GA-----A--CT-G-AG-G-a
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tTT--TCATA-C-G------AATGTGTTCA-TACccataaggggaatttcatacgaatgtgttcatacattctgactaacatatgaaattcgaaatcaaatattcttttgttaataccttctaaccactaacaacaatcctctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcagaaaacgaatttacatacactccaccactgcactcgcacaactatattctgttgcgtagacaagtaatagcggtgaagagggagatccgcgaaaatcgcctgacgacaaggagtacgctcgctacgcgagccgactcaaa
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tgcgtattaaatgaaaattttgacagattttcaacttatgtctaagtaagaccaaatattttaagcaatcagtgccttcaattagccaccagattgtcatttaggtgacctacattggaaatggtttggagaatacgaaatagaactgaggccataaggggaa---T--CAGAAAACGAAT--TT-ACATACAC-T-------CC-----------AC--------C--------AC--T-GC--A-CT-CGCACAAC-------T--AT--A-------TTC-T---G----------TTG---C---GT---AGACAA-GT---AA-T--A-G--CGGTG--A---AGAG-GGAGATC-CG-CG---A-AAA-T--C--GC-C-TGA-C-GACAAGGA----G-TACGCT-CGCTA--CGCGAGCCGA-CT-CAAAattctgactaacatatgaaattcgaaatcaaatattcttttgttaataccttctaaccactaacaacaatcctctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcagaaaacgaatttacatacactccaccactgcactcgcacaactatattctgttgcgtagacaagtaatagcggtgaagagggagatccgcgaaaatcgcctgacgacaaggagtacgctcgctacgcgagccgactcaaa
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tgcgtattaaatgaaaattttgacagattttcaacttatgtctaagtaagaccaaatattttaagcaatcagtgccttcaattagccaccagattgtcatttaggtgacctacattggaaatggtttggagaatacgaaatagaactgaggccataaggggaatttcatacgaatgtgttcatacattctgactaacatatgaaattcgaaatcaaatattcttttgttaataccttctaaccactaacaacaatcctctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-AT-GTCT---GGGT-A-AGG---CA-AAATATC-TTA-A--ACAAACCA-TC-------TG---C-C-----TC--A-A-TT-A-GACCAC-CAA-GA-TCGTT----T-T----T-AGGT--G-ACC-T-A-AA-T----TGG-----AA-T-GG-T-T-T-G-G-AG---A-TA-C-GATG-TA--A-----A--CT-G-CT-G-GG-A-A-T--------G---TT-GT--AGC-AT---------------------------------------------------TA-C-G------AATGTGTTCA-TACGCGCGTATAGGCT-G-A-TACCCACC-A-GA-CTTA-A-ATA----------------A-------------------------AC-G---------------T--------G-T--------GC-TG-TTTTA-CAAT-C-AA--TATGA-T-------GT-G---C-TTA-TATT-C-A-A-ATT---A---TTT------A--CT----ATC-CA--GT---TA-T---C--GAGAAAACGAATTATT-ACATACAT-T-------AC-----------AC--------C--------AC--A-GC--A-CT-CCCACAAC-------T--ATTCA-------TT--C---GTAATAGAAACTTGGGAC---GCCAAAGACAACGT---AGAC--A-ATTCAATA--AATTAGAG-GCA-ATC-CGACG---A-GAA-T--CG-GG-C-TGA-T-GGCA--GA----G-TA-G---CGCTA--CGCGA-CCGGTCT-CAAA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AATGA------------AACTT-TTGCC-AG------------TTTGAT-CA--ACTT-G--GCTT---AGGT-A-GAC---CATAAATATT-TTA-A--GCA----A-TC-AG----TG---C-C----TCT--A-A-TT-A-G-GCA--C-A-GA-TTGTC----T-T----T-AGGT--G-------A-CA-T----TGG------A-T-GGTT-T-T-G-G-AGA--A-T--C--AAT-TA-GA-----ATGCTGG-CG-G-GG-A-A-C--------GTGCTT-GT--AA-------AA---------------------------------------------------GAA------TGTGTTC--TA-G--CGTA-----T-G-A------ACT-A-GGTGCTG---ATAT--CC-----------A-------------------------AT-GA-------------TT--------G-T--------GC-TG-TTTTACCAAT-C-AA--T---A-T-------AT-TTGGC-----TATTAC-A-ATAAT---A---TTTTT-A--A--TTTCATATC-AT--GT---TA-T---TA-CAG--AACGAAT--TA-ACATACAT-T---------------------C--------C--------AC--A-GC--A-CT-CGCACAAC----------AT--A-------TTC-T---G----------TTG---C---GT---AG-CAA-GT---AGATA-A-G--TGGTG--A---AGAG-GCAATTC-CG-CGAACA-AAA-T-----G--C-TGA-C-GA-AAGGA----GTTACACT-CGCTAACTGCG-GCCGA-CT-CCAAa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tCCAGT-TATGGACCTCAA--CTTT--T-G-CAT-AA-GTTT--G-GTG-AT-TTTT--GG-------CCCGAAG--T-TAT--TCT-GGA-CA-AGAAAGT-TTTCAC-----T-----TAATATCAA------A--AA---A---A---TATTTTG--TTTTTC-A-TT---T-T-GTAATA-T--T-TCTC---AGT-T----T-CCATCCGACC-AT---T-G-AGCAA--TT--TTAGT-GA----GT---------GA-TTT-C--A-AA----C--ACTATTT-CAAAAT--GT--T-CT-CT-AA-T-A-GCGAGT-G----C-A----ATA--TG-T-ACA--TGGT----AAC-ATTTTT---GA---CT-G-GGT-AT----G-AAT--TGAGCTT--G-G---A--T--G--AGTT-GAA-CCT--A-CATA----A--CCT-GAC-TCCGGAAG-TT-TGTAAAA------CAAA--A--------A---A-TAGCTA-ATGGCGTAAAT---T--AAATG-------------AACTTGTTGAC-AGGT----------TTT--T-CA--ACTTCAT-GTCTTA-AGGT-A-AGACC-CA-AAGTATT-TTA-A--GCA----A-TC--G----TG---C-C----TTC--A-AGTT-AGG-CCAC-C-A-GA-TTGTC-A--TGT----T-AGGT--G-ACT-----CA-T----TGGA----AA-T-GG-T-T-T-T-G-AGA--A-TA-CGGAAA-TA-GA-----A--CT-G-CT-G-GG-A-A-C--------GT-CTT-CTA-AAT-A----AA------------T-----------------------TCCTT--T-ATA-C-G------AATGTGTTCA-TACGCGCGT------T-G-A-T----ACT-G-AG-GCTG---ATAT--CC-----------A-------------------------AT-GAT------------TT--------G-T--------GCTTG-TTTTA-CAATCC-AA--AATAA-T-------ATGGTGTC-TTA-TATT-C-A-A-CAT---A---TTTTT-C--AACTTTC--ATC-AT--GT---TATT---T--CAGAAAA-GAAT--TTAACGTACACAT-------CA-----------AC--------C--------AC--A-GC--A-CT-TGCACAAC-------TA-AT--A-------TTGCT---G----------TTG---C---GT---AGGCAA-GT---AG-T--A-G--CAGTG------AGAG-GGAGATC-CG-CA---A-AAA-T--C--ACTC-TG--C-GACAAGGA----G-TA------GCGG--CG-GAG-CGA-CTGCAAta
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aaaccA-A--GCA----A-TC-AG----TG---C-C----TTC--A-A-TT-A-G-CCAC-C-A-AA-TTGTC-A--T-TAAAAT-AGGT--G-ACC-T-A-CA-T----TGGA----AA-T-GG-T-T-T-G-G-AGA--A-TA-C-GAAA-TA-GA-----A--CT-G-CG-G-GG-A-A-C--------GT-CTT-GT--AAT-ATTCCAG------------T----------ACAAAAT-----CTCCTT--TCATA-C-GAATGT------GTTCA-TGCG----TG-----T-G-A-T----ACT-A-GG-GCTG-A--TATC-CC-----------A-------------------------AT-GA-------------TT--------G-T--------GC-CA-TTTTA-CAAT-C-AA--TATAA-T-------AT-GTGTC-TTA-TATT-C-A-A-AAT---A---TTTTT-C--A--TTTC--ATC-AT--GT---TA-T---T--CAGAAAACGAAT--TT-ACATACAC-T-------CC-----------AC--------C--------AC--A-GC--A-CT-CGCACAAC-------T--AT--A-------TTG-T---G----------TTG---C---GT---AGACAA-GT---AG-T--A-G--CGGTG--A---AGAG-GGAGATC-CG-CG---A-AAA-T--C--GC-C-TGA-C-GACAAGGA----G-TACGCT-CGCTA--CGCGAGCCGA-CT-CAAga
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          --A-CAT-----G--CCT-GACTGTCGAAAG-TT-TGT-AAA------C-AA--A-----------------CC---C-GCGT--A-------ACATGA------------AACTT----AC-AAG-----------TTT----------------ATCT---GAGTCA-AGA---CA-AAACATC-TTA-A--ACA----AATC-AG----TG---C-C----TGCCAA-A-TA-A-G-CCAC-C-A-TA-TCATC-A--TCT----T-AGGCCGG-ACC-T-A-CA-T----TGGA----AA-T-TA-T-T-T-G-ACAGA--G-TA-C-GAAG-CA-GA-----A--CT-G-CA-TTGG-A-A-C---------T-TTC-ATTCAGT-ATTCCAAATTCTCCCCAACC----------A-----T-----CTCCTTCGTCCTC-CCGAATGT-TA------CA-TGCGT-C--------T-GCA-T----ATG-A-GG-CCT--A-ATATCTCC-----------A-------------------------CT-GA-------------CTCTAAAAGCA-T--------GG-TG-TTT-A-CA-T-C-AA--TATGA-T-------AC-ATGGT-CTA-TATT-C-A-A-TAT---A---ta
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TC-A-CT---T-T-GTAATA-C--T--CTT---A-T-T----G-CATTCC-ACC-AT---T-G-A-CAA--TT--TTA-T-TA----GT---------GA-ATT-C--A-TT----TT-A----TT-CAAAATATGT--T-CT-CT-AA-T-A-G-GACT-G----C-A----ATA--TG-T-AC---T-AT----AAT-A-TTTT---TA---T----GGT-AT----G-AAT--TGA-CTT--G-GG-CA--T--GTGATCG-G-A-CCT--A-CAT-----A--CCT-GACTTCCGGAAG-TT-TGT-AAA------CAAA--A--------A---A-CATCTA-AC-GCG--------------------------------TT-TTGAC-AGG------------GT--T-CA--ACT
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aagcttttggaaacatcatttatttttaacacttggcacaattcaaatatatagatctccttataaaacaaaaatgaattattccccgaaattaaaaaataaaa-A-G-GACT-G----C-------TA--TG----CA--T-GT-----------------GA---CT-G-GGT-ATAT--G-AAA--TGA-CT-----GA-CAAAC--G--ATTT-G-A-CCT--A-TAACCAAAA--CCT-GATTTATGGACG-TT-TGT-AGAGTGATGC-AA--ACCCAGAGGA---A-AGGAAA-AC-AAAC--AT------AAACGA------------AACGT-T-GAC-AGGATTTTAAATAATTT--T-CA--ATTG-AA-ATCT---GAGT-A-GGA-----------TT-TTA-A--ACA------TCGAG----TG---A-C----TTC--A-T-TT-A-G-CCAC-C-A-GA-TTGTC-A--T-T----C-AGTC--G-AAC-A-A-CA-T----TTGA----GA-T-GG---T-T-G-G-AAA--A--G-T-GACT-TC-GA-----A--CT-G-CA-G-GG-A-A-C--------TT-CAT-GT--AGT-ATCCTAA------------TTCTTGCAACCA-----T-----CTCCTT--TCAT
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -----T-------A------A--AA---A------------T---TATTTC-A-CT---T-T-GTAATA-T--T-TCTC---A-T-T----T-GCA
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gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tatgaccgtacttcctgtCCAGT-TATGAACCTCAA--CTTT----G-CAT-AA-GTTT--GTGTGTAT-TTTTTTGG-------CC-G--GC-T-TGT--TCTGG-A-CA-AG--ATT-TT-CCC-----T-----T-------AT-----ATCAA---A---A---T-TTTT---TTTTTA-T-TT---T-T-GTA-TA-T--T-TCTC---T-TGT----C-CCATCC-ACC-AA---T-G-A-CAA--TT----A-T-GA----GTT--------GA-TTT-CGAA-C-----T--A----TT-CAAAA---GT--T-CT-CTTAA-T-A-G-GACT-G----C-AC---ATT--TG-T-ACA--T-GT----AAC-A-TTTC---GA---CTCG-GGT-ATAT--G-AAT--TGA-CTT--T-GG-CA--T--G--ATTT-G-A-CCT--ATCAT-----A--CCG-GACTTCCAGAAG-TT-TGT-AAA------C-AA--A--------ATAAA-TAGCTA-AT-G-GT--ACG--T--A-----------------------TTGAC-AGG-----------TTT--TTCA--ACTT-AT-GTCT---AG-T-A--GA---CA-AAATATT-TTA-A--GCA----A-TC-AG----TGTG-C-C----TTC--A-A-TT-AAG-CCAC-C-CCGA-TTGTC-A--T-T----T-AGGT--G-ACC-T-A-CA-T----TGGA----CA-T-GG-T-T-T-G-G-A-A--A-TA-C-GAAA-TA-GA-----A--CT-G-CG-G-G--A-A-C--------AT-CTT-GT--AATTATTCCAA------------T----------A-----TAAATGCTCCTT---CATA-C-GAATGT----GTTTCCA-TGCGC-CGTA-----T-C-A-T----ACT-A-GT-GCTG-A--TATC-CC-----------A-------------------------AT-GA-------------TT--------G-T--------TT-TG-TTTTA-CA-T-C-AA--TATAA-T-------AT-GTGTC-T-A-TAAT-C-A-A-AAT---A---TTTTT-C--A--TTTC--ATC-ATTTGT---TA-T---TT-CAGAAAACGAAT--TT-ACATACAC-T-------CC-----------AC--------C--------AC--A-GC--A-CTTCGCACAAC-------T--ATT-A-------TTG-T---G----------TTG---C---GT---AGACAA-GT---AG-T--AAG--CGGTGGAA---AGAG-CGAGATCGCG-CA---A-AAT-T--C--GC-C--GA-C-GACAAGGA----G-TACGCT-CGCTA--CGCGAGCCGA-CT-CAAAaa
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gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           atttgcaattgcaaatgaaaaatgttA--T--G--ATTT-G-A-CCT--A-CAT-----A--CCC-GACTTCCGGAA
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CACAAC-------T--AT--A-------TTC-T---G----------TTG---C---GT---AGACAA-GT---Aaac
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ctaA----G-TACGCT-CGCTA--CGCGAGTCGA-CT-CAAA
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ----G-TACACT-CGCTA--CGCGAGCCGA-CT-CAAAaa
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -------A------A--AA---A---A---T-TTTT---TTTTTT-AACT---T-T-GTAATA-T--T-TCTC---A-T-T----T-GCATCC-ACC-AG---T-G-A-CAA--TT--T-A-T-TA----GT---------GA-TTT-C--G-CA----TT-A----TT-CAAAAT--ATATT-CT-CT-AC-C-A-G-GACT-G----C-A----ATA--TG-T-ACA--T-GT----AAT-A-TTTT---GA---CT-A-GGT-AT----G-AAT--TGA-CTT--G-G--CA--T--G--ATTT-A-A-CCA--A-CAT-----A--CCT-GACTTCCGGAGG-TT-TGT-ATA------C-AA--A--------A---AACAGCTA-AC-GCGT---T---TGCAAATGA------------AACTT-T-GACCAGG-----------TTT--T-CA--ACTT-AT-GTCT---GAGT-A-AGAA--CA-AAATATC-TTA-A--ACA----A-TC-AT----TG---C-C----TTC--A-A-TT-A-G-CCAC-C-A-GA-TCGTC-A--T-T----T-AGGT--G-ACC-T-A-CA-T----TGGA----AA-T-GG-T-T-T-G-G-AGAATA-TA-C-GATG-TA-Gaaa
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aagctttgggaaacatcattcatttttacacttaccacacttcaaaatataatagatctccttataaaacaaaaatgaaatatttacccgaatattaaaaaTCCTT--TTAT--C-GAATGT------GTTCA-TACGC-CGTA-----T-G-A-T----ACT-A-GG-GCTG-A--TATC-CC-----------A-------------------------CA-GACTCTAAAGTAAACTT--------G-T--------GC-TG-TTTTA-CAAT-T-AA--TATGA-T-------AT-GTGTC-TTA-TATT-C-G-A-AAT---A---TTTTT-T--A--TTTC--ACC-AT--GT---TATT---T--CAGAAAACGAAT--GT-ACATACAT-T-------AC-----------ATTTACAGCAT--------AT--A-GC--A-CT-CCCACAAC-------T--AT--A-------TT--CA--G----------TTG---C---AT---AGTCAA-TTCA-AG-T--A------GTG--A---AGAG-GCAAATC-CG-CG---A-GAA-T--CA-GC-C-TGA-T-GGCAAGGA----G-TA-GCT-CGCTA--CGCGAGCTGA-CT-CAAAtccttttatcgaatgtgttcatacgccgtatgatactagggctgatatcccacagactctaaagtaaacttgtgctgttttacaattaatatgatatgtgtcttatattcgaaatattttttatttcaccatgttatttcagaaaacgaatgtacatacattacatttacagcatatagcactcccacaactatattcagttgcatagtcaattcaagtagtgaagaggcaaatccgcgagaatcagcctgatggcaaggagtagctcgctacgcgagctgactcaaaa
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aaaccT-TATGAACCTCAA--CTTT--T-G-CAT-AA-GTTT--G-GTG-AT-TTTT--GG-------CCCG--GT-T-CGT--TCTGG-A-CA-AA--GAT-TTTCCC-----T-----T-------ATATC--A--AA---A---A---A-TTAT---TTTTTC-A-TT---T-T-GTA-TA-T--T--CTC---A-T-T----T-CCATCC-ACC-AT---T-G-A-CAA--TT--TTA-T-GA----GT---------GA-TTT-C--A-CAC---T--A----TTTCAAAAT--GT--T-CT-CT-AA-T-AAG-GACT-G----C-AC---ACAATTG-T-ACA--T-GT----AA--A-TTTT---GA---CT-G-GGT-AT----G-AAT---GA-CTT--G-GG-CA--T--G--ATTT-G-A-CA---A-CAT-----A--CCT-GACTTCCGGAAG-TT-TGT-AAA------C-AA--A--------A---A-TAGCTA-AT-GCGT--AT---T--AAATGA------------AACTT-TTGAC-AGG-----------TTT----CA--ACTT-AT-GTCT---AGGT-A-AGA---CA-AAATATT-TAA-A--GCA----A-TC-AG----TG---C-C----TTC--A-A-TT-A-G-CCAC-C-A-GA-TTGTC-AA-T-T----T-AGGT--G-ACC-T-A-CA-T----TGGA----AA-T-GG-T-T-T-G-G-AGA--A-TAAC-GAAA-TA-GA-----A--CT-G-CG-G-GG-A-A-C--------GT-CTT-GT--AAT-ATTCCAA------------T----------ACAAA-T-----CTCCCT--TCTTA-C-GAATGT-CATGTGTTCA-TGCGC-GCTA-----T-G-A-T----ACT-A-GG-GCTG-A-ATATC-CC-----------A-------------------------A--GA-------------TT--------G-T--------GC-TG-TTTTA-CAAT-CCAA--T-TAA-T-------AT-GT--C-TTA-TATT-C-A-A-AAT-------TTTTT-C--A--TTTC--ATC-AT--GT---TA-T---T--CAGAAAACGAAT--TT-ACATACAC-T-------CC-----------AC--------C--------AC--A-AC--A-CT-CGCACAAC-------T--AT--A-------TG--T---G----------TTG---C---GT---AGACAA-GT---AG-T--A-G--CGGTG--A---AGAG-GGAGATC-CG-CG---A-AAA-TCGC--GC-C-TGA-C-GACAAGGA----G-TACGCC-GGCTA--CGCGAGCCGA-CC-TAAAa
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            .            .     .  . .   .  .    .  .   .  .    .   CCCATC           .   .      G .  .  .    .  T   CGAAATTA                   .   .   .   .   .    .        . .  .   . .      . .  .    .   . . .    .      .   .  .   . . .   .   .    . .  .     .          .   . .  .  TT      .     .      .   .  .  .  .  . . . .    . .    . .      .   . .   .  .  .     T  .    .    .    . .   .  .    .   .    .   .  . A   .  .  .     . . . CA   .   .     .    .            .  .   .   .      .  .  AAA                 AC   C  TTGC            .                .     .   .             T     .     .  .    .      . .   .   A        .   . .    .    .  .  .     .   . .      .  . .  . . .    . . .  .     . .  . .    .    .  .   . . .  . .       .     . .  . . . . . .   .  .  . A    .  .  .     .   . .  . .  . . . .         .   .  .   TATTCCAGTACAAAATCTCCTTTCATACGAATGT                                           .     .    .     . . . .      . .  .    AA      .  TAATGA                                                   .        . .         .  .     .    . .  .      . .        .     .   .    . . . .   .   .       . .  .     .    .  .   .    . .   T             .   .        . AC                    .        .         .  .  .  .  .        .       .   .  .        CT     .            .   .    .        .  C    . .  . T      .  .      . C     .  .  .   .   . .  A   . .   . .        .    .  C   .     .           .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            .            .     .  . .   .  .    .  .   .  .    .   NNNNNN           .   .      N .  .  .    .  T   TTATATAA                   .   .   .   .   .    .        . .  .   . .      . .  .    .   . . .    .      .   .  .   . . .   .   .    . .  .     .          .   . .  .  CT      .     .      .   .  .  .  .  . . . .    . .    . .      .   . .   .  .  .     T  .    .    .    . .   .  .    .   .    .   .  . G   .  .  .     . . . CA   .   .     .    .            .  .   .   .      .  .  AA                  AC   C  ACGT            .                .     .   .             C     .     .  .    .      . .   .   A        .   . .    .    .  .  .     .   . .      .  . .  . . .    . . .  .     . .  . .    .    .  .   . . .  . .       .     . .  . . . . . .   .  .  . G    .  .  .     .   . .  . .  . . . .         .   .  .   TATTCCAATACAAAATCTCCTTTCATACGAATGT                                           .     .    .     . . . .      . .  .    AA      .  AATGAT                                                   .        . .         .  .     .    . .  .      . .        .     .   .    . . . .   .   .       . .  .     .    .  .   .    . .   .             .   .        . AC                    .        .         .  .  .  .  .        .       .   .  .        CA     .            .   .    .        .  .    . .  . T      .  .      . G     .  .  .   .   . .  A   . .   . .        .    .  C   .     .           .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            .            .     .  . .   .  .    .  .   .  .    .   CCCGGT           .   .      G .  .  .    .  N   TTATATC                    .   .   .   .   .    .        . .  .   . .      . .  .    .   . . .    .      .   .  .   . . .   .   .    . .  .     .          .   . .  .  TT      .     .      .   .  .  .  .  . . . .    . .    . .      .   . .   .  .  .     T  .    .    .    . .   .  .    .   .    .   .  . G   .  .  .     . . . AT   .   .     .    .            .  .   .   .      .  .  AA                  TC   C  TTGC            .                .     .   .             T     .     .  .    .      . .   .   A        .   . .    .    .  .  .     .   . .      .  . .  . . .    . . .  .     . .  . .    .    .  .   . . .  . .       .     . .  . . . . . .   .  .  . G    .  .  .     .   . .  . .  . . . .         .   .  .   TTATTCCAATATAAATGCTCCTTCATACGAATGT                                           .     .    .     . . . .      . .  .    A       .  AATTGA                                                   .        . .         .  .     .    . .  .      . .        .     .   .    . . . .   .   .       . .  .     .    .  .   .    . .   .             .   .        . CC                    .        .         .  .  .  .  .        .       .   .  .        CA     .            .   .    .        .  .    . .  . C      .  .      . G     .  .  .   .   . .  A   . .   . .        .    .  C   .     .           .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            .            .     .  . .   .  .    .  .   .  .    .   NNNNNN           .   .      N .  .  .    .  T   NNNNCA                     .   .   .   .   .    .        . .  .   . .      . .  .    .   . . .    .      .   .  .   . . .   .   .    . .  .     .          .   . .  .  TT      .     .      .   .  .  .  .  . . . .    . .    . .      .   . .   .  .  .     C  .    .    .    . .   .  .    .   .    .   .  . G   .  .  .     . . . CT   .   .     .    .            .  .   .   .      .  .  AA                  AT   C  TTGC            .                .     .   .             T     .     .  .    .      . .   .   C        .   . .    .    .  .  .     .   . .      .  . .  . . .    . . .  .     . .  . .    .    .  .   . . .  . .       .     . .  . . . . . .   .  .  . G    .  .  .     .   . .  . .  . . . .         .   .  .   TTCTCCAACCATCTCCTTGGCATGCGAAAT                                               .     .    .     . . . .      . .  .    A       .  AATGA                                                    .        . .         .  .     .    . .  .      . .        .     .   .    . . . .   .   .       . .  .     .    .  .   .    . .   .             .   .        . CC                    .        .         .  .  .  .  .        .       .   .  .        CT     .            .   .    .        .  .    . .  . T      .  .      . C     .  .  .   .   . .  .   . .   . .        .    .  C   .     .           .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            .            .     .  . .   .  .    .  .   .  .    .   CCGGC            .   .      . .  .  .    .  T   ATATC                      .   .   .   .   .    .        . .  .   . .      . .  .    .   . . .    .      .   .  .   . . .   .   .    . .  .     .          .   . .  .  TT      .     .      .   .  .  .  .  . . . .    . .    . .      .   . .   .  .  .     C  .    .    .    . .   .  .    .   .    .   .  . A   .  .  .     . . . CT   .   .     .    .            .  .   .   .      .  .  AA                  AC   C  ATT             .                .     .   .             T     .     .  .    .      . .   .   C        .   . .    .    .  .  .     .   . .      .  . .  . . .    . . .  .     . .  . .    .    .  .   . . .  . .       .     . .  . . . . . .   .  .  . G    .  .  .     .   . .  . .  . . . .         .   .  .   TATTCCTTTCATACGATAT                                                          .     .    .     . . . .      . .  .    A       .  ATCGA                                                    .        . .         .  .     .    . .  .      . .        .     .   .    . . . .   .   .       . .  .     .    .  .   .    . .   .             .   .        . AC                    .        .         .  .  .  .  .        .       .   .  .        CT     .            .   .    .        .  .    . .  . C      .  .      . C     .  .  .   .   . .  .   . .   . .        .    .  C   .     .           .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         .     .  . .   .  .    .  .   .  .    .   CCCGA            .   .      . .  .  .    .  N   TTAT                       .   .   .   .   .    .        . .  .   . .      . .  .    .   . . .    .      .   .  .   . . .   .   .    . .  .     .          .   . .  .  CT      .     .      .   .  .  .  .  . . . .    . .    . .      .   . .   .  .  .     T  .    .    .    . .   .  .    .   .    .   .  . G   .  .  .     . . . CT   .   .     .    .            .  .   .   .      .  .  AA                  AC   C  ATT             .                .     .   .             A     .     .  .    .      . .   .   C        .   . .    .    .  .  .     .   . .      .  . .  . . .    . . .  .     . .  . .    .    .  .   . . .  . .       .     . .  . . . . . .   .  .  . G    .  .  .     .   . .  . .  . . . .         .   .  .   TAAATTCCTTTATACGAAT                                                          .     .    .     . . . .      . .  .    A       .  AATGA                                                    .        . .         .  .     .    . .  .      . .        .     .   .    . . . .   .   .       . .  .     .    .  .   .    . .   .             .   .        . CA                    .        .         .  .  .  .  .        .       .   .  .        CT     .            .   .    .        .  .    . .  . C      .  .      . G     .  .  .   .   . .  .   . .   . .        .    .  C   .     .           .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .  .    .  .   NNN                        .   .   .   .   .    .        . .  .   . .      . .  .    .   . . .    .      .   .  .   . . .   .   .    . .  .     .          .   . .  .  CT      .     .      .   .  .  .  .  . . . .    . .    . .      .   . .   .  .  .     C  .    .    .    . .   .  .    .   .    .   .  . A   .  .  .     . . . CT   .   .     .    .            .  .   .   .      .  .  AA                  AT   C  ATT             .                .     .   .             T     .     .  .    .      . .   .   A        .   . .    .    .  .  .     .   . .      .  . .  . . .    . . .  .     . .  . .    .    .  .   . . .  . .       .     . .  . . . . . .   .  .  . G    .  .  .     .   . .  . .  . . . .         .   .  .   TATTCTTTCATACGAATGT                                                          .     .    .     . . . .      . .  .    A       .  AATGA                                                    .        . .         .  .     .    . .  .      . .        .     .   .    . . . .   .   .       . .  .     .    .  .   .    . .   .             .   .        . CC                    .        .         .  .  .  .  .        .       .   .  .        GT     .            .   .    .        .  .    . .  . T      .  .      . G     .  .  .   .   . .  .   . .   . .        .    .  C   .     .           .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              .   .   .   .   .    .        . .  .   . .      . .  .    .   . . .    .      .   .  .   . . .   .   .    . .  .     .          .   . .  .  CT      .     .      .   .  .  .  .  . . . .    . .    . .      .   . .   .  .  .     T  .    .    .    . .   .  .    .   .    .   .  . G   .  .  .     . . . CT   .   .     .    .            .  .   .   .      .  .  AA                  AC   A  ATT             .                .     .   .             T     .     .  .    .      . .   .   A        .   . .    .    .  .  .     .   . .      .  . .  . . .    . . .  .     . .  . .    .    .  .   . . .  . .       .     . .  . . . . . .   .  .  . G    .  .  .     .   . .  . .  . . . .         .   .  .   TATTTCTTTCATACAAAT                                                           .     .    .     . . . .      . .  .    A       .  AATGA                                                    .        . .         .  .     .    . .  .      . .        .     .   .    . . . .   .   .       . .  .     .    .  .   .    . .   .             .   .        . CC                    .        .         .  .  .  .  .        .       .   .  .        CA     .            .   .    .        .  .    . .  . N      .  .      . C     .  .  .   .   . .  .   . .   . .        .    .  C   .     .           .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              .   .   .   .   .    .        . .  .   . .      . .  .    .   . . .    .      .   .  .   . . .   .   .    . .  .     .          .   . .  .  T       .     .      .   .  .  .  .  . . . .    . .    . .      .   . .   .  .  .     C  .    .    .    . .   .  .    .   .    .   .  . G   .  .  .     . . . CA   .   .     .    .            .  .   .   .      .  .  AA                  AC   C  ATT             .                .     .   .             T     .     .  .    .      . .   .   A        .   . .    .    .  .  .     .   . .      .  . .  . . .    . . .  .     . .  . .    .    .  .   . . .  . .       .     . .  . . . . . .   .  .  . G    .  .  .     .   . .  . .  . . . .         .   .  .   TATTCCTTTCATACGAAT                                                           .     .    .     . . . .      . .  .    A       .  AATGA                                                    .        . .         .  .     .    . .  .      . .        .     .   .    . . . .   .   .       . .  .     .    .  .   .    . .   .             .   .        . AC                    .        .         .  .  .  .  .        .       .   .  .        GT     .            .   .    .        .  .    . .  . C      .  .      . C     .  .  .   .   . .  .   . .   . .        .    .  C   .     .           .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              .   .   .   .   .    .        . .  .   . .      . .  .    .   . . .    .      .   .  .   . . .   .   .    . .  .     .          .   . .  .  C       .     .      .   .  .  .  .  . . . .    . .    . .      .   . .   .  .  .     C  .    .    .    . .   .  .    .   .    .   .  . G   .  .  .     . . . CT   .   .     .    .            .  .   .   .      .  .  AA                  AT   C  ATA             .                .     .   .             T     .     .  .    .      . .   .   A        .   . .    .    .  .  .     .   . .      .  . .  . . .    . . .  .     . .  . .    .    .  .   . . .  . .       .     . .  . . . . . .   .  .  . G    .  .  .     .   . .  . .  . . . .         .   .  .   ATCTCCTTTCATAGAAT                                                            .     .    .     . . . .      . .  .    A       .  ACTGA                                                    .        . .         .  .     .    . .  .      . .        .     .   .    . . . .   .   .       . .  .     .    .  .   .    . .   .             .   .        . CC                    .        .         .  .  .  .  .        .       .   .  .        CT     .            .   .    .        .  .    . .  . C      .  .      . G     .  .  .   .   . .  .   . .   . .        .    .  C   .     .           .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              .   .   .   .   .    .        . .  .   . .      . .  .    .   . . .    .      .   .  .   . . .   .   .    . .  .     .          .   . .  .  T       .     .      .   .  .  .  .  . . . .    . .    . .      .   . .   .  .  .     .  .    .    .    . .   .  .    .   .    .   .  . G   .  .  .     . . . CA   .   .     .    .            .  .   .   .      .  .  AA                  AT   C  ATT             .                .     .   .             T     .     .  .    .      . .   .   A        .   . .    .    .  .  .     .   . .      .  . .  . . .    . . .  .     . .  . .    .    .  .   . . .  . .       .     . .  . . . . . .   .  .  . G    .  .  .     .   . .  . .  . . . .         .   .  .   TCCTTTCATACGAAT                                                              .     .    .     . . . .      . .  .    A       .  AATGA                                                    .        . .         .  .     .    . .  .      . .        .     .   .    . . . .   .   .       . .  .     .    .  .   .    . .   .             .   .        . CC                    .        .         .  .  .  .  .        .       .   .  .        CA     .            .   .    .        .  .    . .  . C      .  .      . C     .  .  .   .   . .  .   . .   . .        .    .  C   .     .           .  .
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-585 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CCAGT-TATGAACCTCAA--CTTT--T-G-CATAA-GTTT--G-GTG-AT-TTTT--GG-------CCCG-NCT-TGT--TCTGGGA-CA-AG--ATT-TTTCCCTT-ATA-TNAAAA------A-------T-TTTT---TTTT-TCA-TTT-T-GTAATAT--T-T-CTC---A-T-T----T-CCATCC-ACC-AT---TG-A-CAA--TT--TTA-TGA----G-T---------GATTT-C--A-CA---CTA-TT-CAAAAT--GT--T-CTC-T-AA-T-A-G-GACT-G----C-A----ATA--TG-T-ACAT-GT----AAC-A-TTTT---GA---CT-G-GG--T-AT----G-AAT--TGA-CTT--G-GG-C--A--TG--ATTT-G-A-CCT--A-CAT-----A--CCT-GACTTCCGGAAG-TT-TGT-AAA------C-AA---A--------AA-TAGCTA-AC-GCGT--AT---T--AAATGA------------AACTT-TTGAC-AGG-----------TTT--TCA--ACTT-AT-GTCT---AGGT-A-AGA---CA-AAATATT-TTA--A-GCAA----TC-A--G----TG---C-C----TTC--A-A-TT-A-G-CCA-C-CA-GA-TTGTC-A--T-T----T-AGGT--G-ACC-T-A-C-AT----TGGA----AA-T-GG-T-T-TG-G-AG-A--AT-AC-GAAATA-GA-----A--CT-G-CG-G-GG-A-A-C--------GT-C-TTGT--AA-TATTCCAA------------T----------A-----T-----CTCCTT--TCATA-C-GAATGT-AATGTGTTCA-TACGC-CGTAT-G-A-TACT-A-GG-GCTG--ATATC-C-C-----------A-------------------------A-TGA-------------TT--------GT--------GC-TG-TTTTA-CAAT-C-AA--TATAA-T-------AT-GTGTC-TT-A-TATT-C-A-A-AAT---A---TTTTTC--A--TTTC--ATC-A--TGT---TA-T---T--CAGAAAACGAAT--TT-ACATACAC-T-------CC-----------AC--------C--------ACA--GC--A-C-TCGCACAAC-T-------A-T--A-----TT-C-T--G--------TTG---CGT---AG---ACAA-GT---AG-T--AG--CGGTG--A---AGAG-GNAGATC-CG-CG---A-AAA-T--C--GC-CT-GA-CG-ACAAGGA----G-TACGCT-CGCTA--CGCGAGCCGA-CT-CAAA
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       atttactatttcGAACCTCTA--CTTTATT-G-CATAATGTTTTTG-GTG-ATCTTTT--AGTAGAGAACTC--ACT-TGTCATCTAGGA-CACAG--ATT-TTGCC-TT-ATAGTCAAAAGGAAATA-------T-TTTT---TTTTATTA-GTT-T-GTAATAT--T-T--TC---A-T-T----C-CAATCCCACC-ATAACTG-A-CAAGTTT--TTA-TGA----G-T---------GATTTTC--A-CA---CTA-TT-CAAAAT--GT--T-CTC-TTAA-T---G-GACT-GG---C-ATACTATA--TGAT-TTAT-GT----AAC-T-TTTT---GA---CT-GTGG--TTATT---G-AATGGTGATCTTATG-GG-C--A--TG--ATTT-G-A-CAT--G-CAT-----A--CCT-GATCTCCGGAAG-TTGTG--AGA------C-AA---A--------A--T-GCT-----GCGT--AT---T--AAATGA------------AACTT-TTGAC-AGG-----------TTT--TC---ACTT-A--GTCT---AGGG-GTAGA---CC-AAATATTGTTA--A-GCAA----TCAA--G----TG---G-CGTTGTCT--A-ATTT-A-G-CCA-CTCA-GATTTGTC-A--T-T----TAAGGT--C-ACC-TAA-C-AT----TGAAACACAA-TCGG-T-T-TGCGCAG-A--AT-ACAAAAATAGGA-----A--CT-G-C--G-GG-A-A-C--------GT-C-TTGT--AA--A---------------------------------------------------------GAATA-----GTGTTCA-TACG--CGTAT---A-TACT-ATGG-GCTG--ATATT-C-C-----------A-------------------------A-TGA-------------TT--------GT--------GC-TGTTTTTA-CAAT-C-aaacatgcaatatttggctaacgtgaactatttacaattttgcgtatgaaaaaagggttgtgaagaagacaatccacaggcgcccgatccagtgtagttcgcta
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gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -GCGT--AT---T--AAATGA------------AAATT-TTGAC-AGA-----------TTT--TCA--ACTT-AT-GTCT---AAGT-A-AGA---CC-AAATATT-TTA--A-GCAA----TC-A--G----TG---C-C----TTC--A-A-TT-A-G-CCA-C-CA-GA-TTGTC-A--T-T----T-AGGT--G-ACC-T-A-C-AT----TGGA----AA-T-GG-T-T-TG-G-AG-A--AT-AC-GAAATA-GA-----A--CT-G-AG-G-a
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tTT--TCATA-C-G------AATGTGTTCA-TACccataaggggaatttcatacgaatgtgttcatacattctgactaacatatgaaattcgaaatcaaatattcttttgttaataccttctaaccactaacaacaatcctctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcagaaaacgaatttacatacactccaccactgcactcgcacaactatattctgttgcgtagacaagtaatagcggtgaagagggagatccgcgaaaatcgcctgacgacaaggagtacgctcgctacgcgagccgactcaaa
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tgcgtattaaatgaaaattttgacagattttcaacttatgtctaagtaagaccaaatattttaagcaatcagtgccttcaattagccaccagattgtcatttaggtgacctacattggaaatggtttggagaatacgaaatagaactgaggccataaggggaa---T--CAGAAAACGAAT--TT-ACATACAC-T-------CC-----------AC--------C--------ACT--GC--A-C-TCGCACAAC-T-------A-T--A-----TT-C-T--G--------TTG---CGT---AG---ACAA-GT---AA-T--AG--CGGTG--A---AGAG-GGAGATC-CG-CG---A-AAA-T--C--GC-CT-GA-CG-ACAAGGA----G-TACGCT-CGCTA--CGCGAGCCGA-CT-CAAAattctgactaacatatgaaattcgaaatcaaatattcttttgttaataccttctaaccactaacaacaatcctctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcagaaaacgaatttacatacactccaccactgcactcgcacaactatattctgttgcgtagacaagtaatagcggtgaagagggagatccgcgaaaatcgcctgacgacaaggagtacgctcgctacgcgagccgactcaaa
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tgcgtattaaatgaaaattttgacagattttcaacttatgtctaagtaagaccaaatattttaagcaatcagtgccttcaattagccaccagattgtcatttaggtgacctacattggaaatggtttggagaatacgaaatagaactgaggccataaggggaatttcatacgaatgtgttcatacattctgactaacatatgaaattcgaaatcaaatattcttttgttaataccttctaaccactaacaacaatcctctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-AT-GTCT---GGGT-A-AGG---CA-AAATATC-TTA--A-ACAAACCATC---------TG---C-C----T-C--A-A-TT-A-GACCA-C-CAAGA-TCGTT----T-T----T-AGGT--G-ACC-T-A-A-AT----TGGA----A--T-GG-T-T-TG-G-AG-A---T-AC-GATGTA--A-----A--CT-G-CT-G-GG-A-A-T--------GT----TGT--AG-CATT---------------------------------------------------A-C-GAATG------TGTTCA-TACGCGCGTAT------------AG-GCTG--ATACC-CACCAGACTTA---A-------------------------A-TAAAC-----------GT--------GT--------GC-TG-TTTTA-CAAT-C-AA--TATGA-T-------GT-G---C-TT-A-TATT-C-A-A-ATT---A---TTT-----A--CT----ATC-C--AGT---TA-T---C--GAGAAAACGAATTATT-ACATACAT-T-------AC-----------AC--------C--------ACA--GC--A-C-TCCCACAAC-T-------A-TTCA-----TT-CGT--AATAGAAACTTGGGACGCCAAAG---ACAACGT---AGAC--AATTCAATA--AATTAGAG-GCA-ATC-CGACG---A-GAA-T--CG-GG-CT-GA-TG-GCA--GA----G-TA-G---CGCTA--CGCGA-CCGGTCT-CAAA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AATGA------------AACTT-TTGCC-AG------------TTTGATCA--ACTT-G--GCTT---AGGT-A-GAC---CATAAATATT-TTA--A-GCAA----TC-A--G----TG---C-C----TCT--A-A-TT-A-G-GCA---CA-GA-TTGTC----T-T----T-AGGT--G-------A-C-AT----TGG------A-T-GGTT-T-TG-G-AG-A--AT--C--AATTA-GA-----ATGCTGG-CG-G-GG-A-A-C--------GTGC-TTGT--AA-------AA---------------------------------------------------GAA------TGTGTTC--TA-G--CGTAT-G-A--ACT-A-GGTGCTG--ATAT--C-C-----------A-------------------------A-TGA-------------TT--------GT--------GC-TG-TTTTACCAAT-C-AA--T---A-T-------AT-TTGGC------TATTAC-A-ATAAT---A---TTTTTA--A--TTTCATATC-A--TGT---TA-T---TA-CAG--AACGAAT--TA-ACATACAT-T---------------------C--------C--------ACA--GC--A-C-TCGCACAAC---------A-T--A-----TT-C-T--G--------TTG---CGT---AG----CAA-GT---AGATA-AG--TGGTG--A---AGAG-GCAATTC-CG-CGAACA-AAA-T-----G--CT-GA-CG-A-AAGGA----GTTACACT-CGCTAACTGCG-GCCGA-CT-CCAAa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tCCAGT-TATGGACCTCAA--CTTT--T-G-CATAA-GTTT--G-GTG-AT-TTTT--GG-------CCCGAAGT-TAT--TCT-GGA-CA-AGAAAGT-TTTCACTTAATA-TCAAAAAAAT--A-------T-TTTG---TTTT-TCA-TTT-T-GTAATAT--T-T-CTC---AGT-T----T-CCATCCGACC-AT---TG-AGCAA--TT--TTAGTGA----G-T---------GATTT-CAAA-CA---CTATTT-CAAAAT--GT--T-CTC-T-AA-T-A-GCGAGT-G----C-A----ATA--TG-T-ACATGGT----AAC-ATTTTT---GA---CT-G-GG--T-AT----G-AAT--TGAGCTT--G-G-----A--TG--AGTT-GAA-CCT--A-CATA----A--CCT-GAC-TCCGGAAG-TT-TGTAAAA------CAAA---A--------AA-TAGCTA-ATGGCGTAAAT---T--AAATG-------------AACTTGTTGAC-AGGT----------TTT--TCA--ACTTCAT-GTCTTA-AGGT-A-AGACC-CA-AAGTATT-TTA--A-GCAA----TC----G----TG---C-C----TTC--A-AGTT-AGG-CCA-C-CA-GA-TTGTC-A--TGT----T-AGGT--G-ACT-----C-AT----TGGA----AA-T-GG-T-T-TT-G-AG-A--AT-ACGGAAATA-GA-----A--CT-G-CT-G-GG-A-A-C--------GT-C-TTCTA-AA-TA----AA------------T-----------------------TCCTT--T-ATA-C-G------AATGTGTTCA-TACGCGCGT-T-G-A-TACT-G-AG-GCTG--ATAT--C-C-----------A-------------------------A-TGAT------------TT--------GT--------GCTTG-TTTTA-CAATCC-AA--AATAA-T-------ATGGTGTC-TT-A-TATT-C-A-A-CAT---A---TTTTTC--AACTTTC--ATC-A--TGT---TATT---T--CAGAAAA-GAAT--TTAACGTACACAT-------CA-----------AC--------C--------ACA--GC--A-C-TTGCACAAC-TA------A-T--A-----TTGC-T--G--------TTG---CGT---AG---GCAA-GT---AG-T--AG--CAGTG------AGAG-GGAGATC-CG-CA---A-AAA-T--C--ACTCT-G--CG-ACAAGGA----G-TA------GCGG--CG-GAG-CGA-CTGCAAta
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gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 --A-CAT-----G--CCT-GACTGTCGAAAG-TT-TGT-AAA------C-AA---A--------------CC---C-GCGT--A-------ACATGA------------AACTT----AC-AAG-----------TTT---------------ATCT---GAGTCA-AGA---CA-AAACATC-TTA--A-ACAAA---TC-A--G----TG---C-C----TGCCAA-A-TA-A-G-CCA-C-CA-TA-TCATC-A--TCT----T-AGGCCGG-ACC-T-A-C-AT----TGGA----AA-T-TA-T-T-TG-ACAG-A--GT-AC-GAAGCA-GA-----A--CT-G-CA-TTGG-A-A-C---------T-T-TCATTCAG-TATTCCAAATTCTCCCCAACC----------A-----T-----CTCCTTCGTCCTC-CCGAATGT-TA------CA-TGCGT-C---T-GCA-TATG-A-GG-CCTA--ATATCTC-C-----------A-------------------------C-TGA-------------CTCTAAAAGCAT--------GG-TG-TTT-A-CA-T-C-AA--TATGA-T-------AC-ATGGT-CT-A-TATT-C-A-A-TAT---A---ta
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           -TCA-CTT-T-GTAATAC--T---CTT---A-T-T----G-CATTCC-ACC-AT---TG-A-CAA--TT--TTA-TTA----G-T---------GAATT-C--A-TT---TTA-TT-CAAAATATGT--T-CTC-T-AA-T-A-G-GACT-G----C-A----ATA--TG-T-AC-T-AT----AAT-A-TTTT---TA---T----GG--T-AT----G-AAT--TGA-CTT--G-GG-C--A--TGTGATCG-G-A-CCT--A-CAT-----A--CCT-GACTTCCGGAAG-TT-TGT-AAA------CAAA---A--------AA-CATCTA-AC-GCG--------------------------------TT-TTGAC-AGG------------GT--TCA--ACT
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gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tga-T--A-----TT---T--G--------GCG---CTT---AG---ATAA--T---GG-T--AG--N------------AG-GCAGATC-CG-CG---A-AAAAT--C--GC-AT-GA-CG-ACA--------------CT-CGCTA--CGCGAGCCGA-CT-CAAA
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gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   accccGTG--A---AAAC-G-ACATC-TG-C----A-AAG-T--T--GTTCC-AA-TG-GCAAGGA----A-TA-GCT-CGCTA--CACATGTCAA-CT-aa
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  atttgcaattgcaaatgaaaaatgtt--A--TG--ATTT-G-A-CCT--A-CAT-----A--CCC-GACTTCCGGAA
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CACAAC-T-------A-T--A-----TT-C-T--G--------TTG---CGT---AG---ACAA-GT---Aaac
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ctaA----G-TACGCT-CGCTA--CGCGAGTCGA-CT-CAAA
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ----G-TACACT-CGCTA--CGCGAGCCGA-CT-CAAAaa
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    agctttgggaaacttcatttttacacttagcacacttcaaaatatatagatatccctataaaacaaaaatCCAGT--AT-AACCTCAA--CTTT--T-G-CAT----NNN--N-NNN-NN-NNNN--NN-------NNNN-NNN-NNN--NNNNNNN-NN-NN--NNN-NNNNNNNN-NNN-NNAAAA------A-------T-TATT---TTTT-TCA--TT-T-GTAATAT--T-T-CTC---A-T-T----T-CCATCC-ACC-AT---TG-A-CAA--TA--TTA-TGA----G-T---------GATTC------CA---CTA-TT-CAAAAT--GT--T-CTC-T-AA-T-A-G-GACT-GCACAC-A----ATT--TG-T-ACAT-GT----AAC-A-TTTT---GA---CT-G-GG--T-AT----G-AAT--TGA-CTT--G-GG-C--A--TG--ATTT-G-A-CCA--A-CAT-----A--CCT-GACTTCCGGAAG-TT-TGT-AAA------C-AA---A--------AA-TAGCTA-AT-GCGT--AT---T--AAATGA------------AACTT-TTGAC-AGG-----------TTT--TCA--ACTT-AT-GTCT---AGGT-A-AGA---CA-AAATATT-TAA--A-GCAA----TC-A--G----TG---C-C----TTC--A-A-TT-A-G-CCA-C-CA-GA-TTGTC-A--T-T----T-AGGT--G-ACC-T-A-C-AT----TGGA----AA-T-GG-T-T-TG-G-AG-A--AT-AC-GAAATA-GA-----A--CT-G-CG-G-GG-A-A-C--------GT-C-TTGT--AA-TATTCCAA------------TACAAA-----A-----T-----CTCCTT--TCATA-C-GAATGTCAATGTGTTCA-TGCGC-CGTAT-G-A-TACTGA-GG-CCTGAAATATC-C-C-----------A-------------------------A-TGA-------------TT--------GT--------GC-TG-TTTTA-CAAT-C-AA--TATAA-T-------A---TGTCGTT-A-TATT-C-A-A-AAT---A---TTTTTC--A--TTTC--ATC-A--TGT---TA-T---T--CAGAAAACGAAT--TT-ACATACAC-T-------CC-----------AC--------C--------ACAC-AC--A-C-TCGCACAAC-T-------A-T--A------T-G-T--G--------TTG---CGT---AG---ACAA-GT---AG-T--AG--CGGTG--A---AGAG-GGAGATC-CG-CG---A-AAA-T--C--GC-CT-GA-CG-ACAAGGA----G-TACGCT-CGCTA--CGCGAGCCGC-CT-AAAA
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CCAGT-TATGAACCTCAA--CTTT--T-G-CATAAAGTTT--G-GTG-AT-TTTG--CG-------CCCG-A-T-TAT--TCTGGGAACA-AG--ATT-TTTCCCTT-ATA-TAAAAA------AAGAT---T-TTTT---TTTT-TTT-TTT-T-GAAATAT--T-T--TC---A-T-T----T-TCATCC-ACC-AT---AG-A-CAA--TT--T-A-TGA----G-T---------GATTT-C--A-CA---CTA-TT-CAAAAT--GT--T-CTC-T-AACT-A-G-GACT-G----C-A----ATA--TG-T-ACAT-GT----AACTA-TTTT---GA---CT-G-GG--T-AT----G-AAT--TGA-CTT--G-AGAC--A--TG--ATTT-G-A-C-T--A-CAT-----A--CCT-GACTTCCGGAAG-TT-TGT-AAAA-----C-AA---A--------AA-TAGCTATGC-G-GT--AT---A--AATTGA------------AAACT-TTGAC-AGG-----------TTT--TCA--ACTTTAT-GTCT---AGGT-A-AGA---CC-AAATATT-TTA--A-GCAA----TC-A--G----TG---C-C----TTC--A-A-TTTA-G-CCA-C-CA-GA-TTGTC-A--A-T----T-AGGT--G-ACCAT-A-C--T----TGAG----AA-T-GG-T-T-TG-G-AG-A--AT-AC-GAAATA-GA-----A--CT-G-CC-G-GG-A-A-C--------GT-C-TTCT--AG---------------------------------------------GCCT------------AACG--AATGTGTTCA-TACGC-CGTAT-G-A-TACT-A-GG-GCTG--ATATC-C-C-----------A-------------------------A-TGA-------------TT--------GT--------GC-TG-TTTTA-CAAT-CAAA--AATAA-T-------AT-GTGTC-TT-A-TATT-CAA-A-AAT---A---TTTTTC--A--TTTC--ATC-A--TGT---TA-T---T--CAGAAAACGAAT--TT-ATATACAC-T-------CC-----------AC--------C--------ACA--GC--A-C-TCGCACAACAT-------A-T--A-----TT-C-T--G--------TTG---CGT---AG---ACAA-GT---AG-T--AG--CGGTG--A---AGAG-GGAGATC-CG-CG---A-AAA-T--C--GC-CT-GA-CG-ACAAGGAGTACG-TACGCT-CGCTA--CGCGAGCCGA-CT-CAAA
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4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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