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Reference ( gi|3 ) : CAT-TTTTGGCGC-AAT-TCCGGATATG----TTCGCTTACATGGGTACACCGATATTT-AGGTTCTCGG-ATCTG--TTGTCG-GTGAACGGT-CATGCGGTATCTTAGT--GTGTC-TCCTGTCT-G--GGCGATA-TAAT----TTT--CA-CCACAT-ACGG-CGCAGGT-A-A--TAACATA---GA--T----CA-GATT--G--GA-AC-TAA-C--AC-A-T-G-CCAT--TGATGAT---TTTACT---GTAAATTTACTGCCGTTTTTGAAAACAAAG-T-----CGGACCCTTGTGATAAATATAAGGGCACGTAG-CGCA-TCTTGGTTAGCT-------G-CAT-TTAGAAAT--GATAGG-A-GA-CTCTTTAAATAAAATATTACTAGTAAAACAG-GCTCTTGTAAGGATGGAT-TTA-AGCG--AT-GGACTTTGCCGTTTA--CTTTTGATGATTTGGGAATTTTCTAAAACTTTTTTTTTATG-TATG-GGTC-GGCTTCTATGATTTGGA-------AGGTTATGTTTGATTATTTGGAAAACTTCTGGCATGGATTTTTGGGATTATTTGTTGAAACGTATGGTATGACACAATTTTTGGATTTATTTTTCACC--TTAAGGAGGTCCTTTCTTTCATGTGATTTTGCTTTGTTAATTC-CATTT-TCAATTAATTTTTTTAGGGTTGGC-TTC-TTGG-AGGAGTTATTTCTCTAATTCCGCGAGACGAATATT--TAGAAT-TTCAGTGTCTGATATTATT--GTACAAAGA-CT-TCTTG-CTAA-ATTATATGGAATA--TTGTTTCT-GGTATG--TTTAGGG-TGGCACA-AA--TCAAATAATAGATATTGCTTCCATGGTATCCGTTATT-TTGTAGAAGA--TATCG---G--A------AATGTTA-CTTTCTTT--TTTC------CTCACC-ATAACGTCAAGGAA-T----GCT-A---GCC--A---ATTTC--TATCCGATT--C-CATT--GTAAATTTCATA----GTGGGGC---TCAGG---GAGTTTAG-AATATCAAACAAA--T-TGTTTTAGTTGATCTCCACCTTTGTCC----------------CA-AAT------GATAAA--ACAGTCGT--CTAAATAGCGTTTCCA--TGAT-GT-TC--T---AATAAAAGTTT-----CAAAG-----TTTTGTC----CGAACT-TTTCCTTG-AC----AACAGAGTACAAGTG--T-----T-CTTCT-AAAAAT--CCT------AAGA--CGAGTGTTGCAT-AAGTCGGCG--CAACTTTAGTT-CTCATC-GC---AGTACCTA----ATTTTTGTC--TGTAA-ACCATTTCA---TT-GAAATGC----AATAAAA---TGTTTCTCTATGGATT---AA-TT-T-AGACTTTTTAA
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gi|41 : CCTGTCT-ACAGCCGATA-TAAT----TTTTTC--CCACAT-CCGGGCGCAGGT-A-A--TAACATA---GAT-T----CA-GATT--G--GA-ACATAA-C--AC-A-T-G-TCATC-TGATTAT---TTTA
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gi|8 : aATG-TCTA-GGCCTGGGTT-TAAGACTTGAA-------AAGT-ATTTTTGAATGTTTGGAAAACCCC--AC------------GATTATTTGTTAAAACTTAT-AT-TTACACAATAT----ACTTA-TTGTCAACGGTTAA-AAGATGTTTTCTTTC
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gi|48 : GTGACTTTGCTTTGTTAATTC-CATTT-TCTATTAA-TATCTTAGG
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gi|37 : tgatttgagatttatccatgtctaggccctgggttttaagacttgaaaagattatttttgaatgtttggaaaaccccacgatttatttgttaaaactattatttacacaatatacttatgtcaacggttaaaagatgtttctgtcctttcttacggataattgagattttttaaaTT--TAGAAT-TTTTGTGTCTGATATTATT--GTACAAAGA-CG-TATTC-CTAA-ATTATATGGAATA--TTATTTTT-GGCATG--CTTAGGG-TGGCACG-AA--TAGAATAGTTAGTATTGTTTg
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gi|21 : --T-----T-CTTCT-AAAACT--CAT------AAGAAACATATGTTGCAC-GCGGCGACG--CAACTTTGGTT-ACCATT-GT---AATGCCTA----ACTTTTGTC--TATAA-AAAATTTCA---TT-AAAATG-----GATACAA---TTGTTCTCGA-GAAAT---AA-Taacaaaattctttaggaaatctatcatttaaaagatttggaaatctgtctatccaatgttctgtgcggctatcttagtttatgtggaatattagagtagaggttagtaacatcgaatgacattaaaattgattccgtgttgactttttcgggaagagtgtttagaaaatctatcgtatctcttatgtaactttgaactttaataatacatttaatagataactaattctgtgagtttcacatgacggtcccgcaactataggtctgattttgaggtctgttgggctttcaacacttacatgtacatgtagtaatgatgaatgcggaatttttgcatttatcgttaatgacttgtttttgtgtatttgggtaagccataaaaattactggttttgacattaaacgagagtaggaatcagtttctttggggtaagttcttccgtgttcatcaacaattgtttcgagttttttcatgacttctttagcatcatatgttgccttttttcatagtattactgtcctctaacatagaaaggcacattgatttataataatcgcagtccattataacaacttattac
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Reference ( family-580 ) : CAT-TTTTGGCGCAA-TTTCGGA-TGTG----TTCGCTTACATGGGTACACTGATATTT-AGGTTCTCGG-ATCTG--TTGTCG-GTGAACGG-TCATGCGGTGTCTTAGT--GTGTC-TCCTGTCT-G--GCCGATA-TAATTTT----CGCC-ACATC-CGG-CGCAGGT-A-A--T----AACATA---G-AC--CA-G--ATT--GG--A-AC-TAAC--AC-A-T-GTC-ATC-TGATGA--T---TTCACT---GTAAATTTACTGCCGTTTTTGAAAATAAAG-----T-CGGACCCNTGTGTTTAGTAT--GGGCACGTAAC-GCGT-CTTGGCTTGCTCTTTCTCGCCATCTTNGNGATCGGATGGGCACGGCCTCCTTTAATATNNTACTACTNGTAAGACAGCGCTCTTGCAGGGATTGATCTCACAGCGAAATGGNANTTTGTCGTTTAGCCTTTTNATGATTTGGGAATTT-CTAAAACTTTTTTCTNATG-TCTG-GGCC--GGNTTCTAAGA-TT-GAA-------AGG-TTATTTTTGATTATTTGGAAAACCTCTG-CAT----TTTTAGGA-TTATNTGTTGAAANNTATGGTA-TNACACAANNTTTG-GACTTATTTNTCANCGGTTAAGGAG--------GTCCTTTCTTTCATGTGATTTTGCTTTGTTAATTC-CATTT-TCAATTAATTTCTT-AGGGT-AGCNTC-TT--GCAGAAGTA----ATCTCTCTAATTCCGCGAGACGAATATC--TAGAATTTTAGTGTCTGATATTATT--GTACAAAGA--CG-TCTTG-CTAA-ATTATATGGAATA--TTATTTCT-GGCATG--TTTAGGG-TGGCACG-AA--TCA-AATAATAAGTATTGCT---T----GGTATCCGTTATT-TTGTAGAAGA--TATCG-GT-AT-----AACGTTA-CTTTCTTT--TTTCA------TCACC-ATCGCGTCAAGGAA-T----GTTA---GCT--GATT---TC--TATCCGATTC-CATTGTAAATTTCG-TA----GTGGGGC---TCAGAGCGTTTAG-AATATCAAAAAAA--T-TGTTTTAGTTGATCTTCACCTTTGTCC----------------CA-AAT------GATAAA--ACAGCCGT--CTGAATAGCGTTTCCG--TGAT-GT-TC--T---AATAAAAGTTT-----CAAAG-----TTTTGTC----CGAACTTTTCCTT--AACANCAGAGCA--CAA-------TT-TTTCTTCT-AAAAAT--CCT------AA--AACGAGTGTTGCAT-AAGTCGGCG--CAACTTTGGTT-CCCATC-GC---AGTGCCTAAC-----TTTTGTC--TGTAA-AACATTTCA---TT-AAAATGC-----ATGAAA--TTNTTCTCTA-GGA-TT---AA-TT-T-AGACTTTTTAA
gi|1 : CTTAGTCCGTGTCCTCCTGTCTCG--GCCGATACTAACTCTGTCTCGCCCACCTCACGG-CGCCAGT-ACACCT----AACATAC--G-ACTCCACG--ATTCCGG--ACAC-TAAC--AC-ACT-GTCCATCCTGATGA--TTCCTTCACTCTCGTAAACT
gi|1 : --GGGCACGTAGCCGCATTCTTGGC--GCTCTTTCTCGCCATCTTAGAAATCGAATAGGCACGACCTCCTTTAATATTCTACT-CTTGTAAAACAGCGCTCTTGTAAGGATTGATCTCACAGCGA--TGGGACTTTGTCGTTTAGCTTTTTGATGATTTGGGAATTT-CTAAAACTTTTTTCTACTGCTATGAGGTC--GGCTTCTATGA-TT-GGACAGGTTCAGG-TTATTTTTGATTATTTGGAAAACTTCTG-CAT----TTTTAGGA-TTATGTGTTGAAAAATATGGTA-TGACATAAATTTTG-GATTTATTTTTCACC--TTAAGGAG--------GTCCTTTCTTTCATGTGATTTTGCTTTGTTAAATC-CATTT-TCAATTAATTTTTT-AGGGT-AGCGTC-TTT-GCAGAAGTA----ATTTCTCTAATTCTGCGAGACGAATATT--TAGAATTTTAGTGTCTGATATTATT--GTACAAAGA--CG-TCTTG-CTAA-ATTATATGGAATA--TTATTTCT-GGTATG--TTTAGGG-TGGCACG-AA--TCA-AATAATAAGTATAGCT---T----GGTATCCGTTATT-ATGTAGAAAA--TATCG-GTTAT-----AATGTTA-CTTTCTTT--TTTCA------TCACC-ATCACGTCAAGTAA-T----GCTA---GCT--GATTATTTC--TATCCGATTC-CATTGTAAATATAA-TT----GTAGGGC---TCAGAGAGTTTTT-AATATCAAACAA---T-TGTTTCAGTTGATCTTCACCTTTGTCC----------------CA-AAT------GATAAA--ACAGTCGT--CTAAATAGCGTTTCCA--TGAT-GT-TC--T---AATGAACGTTT-----CAAAA-----GTTTGTC----CGAACTTTTCCTT--AACAACAGAGTA--CAA-------TT-TTTCTTCT-AAAAAT--CCT------TA--CACGAGTGTTGCAT-AAGTCGGCG--CAATTTTAGTT-CCCATC-GC---AGTACCTAAC-----TTTTGTC--TGTAA-AATATTTCA---TT-GACATGC-----ATAAAA--TTGTTCTCTA-GGA-TT---AACCT-T-AGACTTTTTAActcctagcctcccccgtccctttctcgaaaacactcacacgtcagcccaccccttccgtcgtcctcatcccgccctcaacccgccgggcacgtagccgcattcttggcgctctttctcgccatcttagaaatcgaataggcacgacctcctttaatattctactcttgtaaaacagcgctcttgtaaggattgatctcacagcgatgggactttgtcgtttagctttttgatgatttgggaatttctaaaacttttttctactgctatgaggtcggcttctatgattggacaggttcaggttatttttgattatttggaaaacttctgcatttttaggattatgtgttgaaaaatatggtatgacataaattttggatttatttttcaccttaaggaggtcctttctttcatgtgattttgctttgttaaatccattttcaattaattttttagggtagcgtctttgcagaagtaatttctctaattctgcgagacgaatatttagaattttagtgtctgatattattgtacaaagacgtcttgctaaattatatggaatattatttctggtatgtttagggtggcacgaatcaaataataagtatagcttggtatccgttattatgtagaaaatatcggttataatgttactttcttttttcatcaccatcacgtcaagtaatgctagctgattatttctatccgattccattgtaaatataattgtagggctcagagagtttttaatatcaaacaattgtttcagttgatcttcacctttgtcccaaatgataaaacagtcgtctaaatagcgtttccatgatgttctaatgaacgtttcaaaagtttgtccgaacttttccttaacaacagagtacaatttttcttctaaaaatccttacacgagtgttgcataagtcggcgcaattttagttcccatcgcagtacctaacttttgtctgtaaaatatttcattgacatgcataaaattgttctctaggattaaccttagactttttaaaaaaaattatttaagaaatctatcatttaaaagatttgaaatctgtctatccaatgttctatggcggctaatcctagttcatgtggaatattagagtagaggttagtaacatcgaatgacactaaaattgattccgtgttgactttttcgggaagagtgtttagaaaatctatcgtatctcttatgtaactttga
gi|10 : cttagtccgtgtcctcctgtctcggccgatactaactctgtctcgcccacctcacggcgccagtacacctaacatacgactccacgattccggacactaacacactgtccatcctgatgattccttcactctcgtaaactctcctagcctcccccgtccctttctcgaaaacactcacacgtcagcccaccccttccgtcgtcctcatcccgccctcaacccgccTCCTTTCTTTCATGTGATTTTGCTTTGTTAATTCACTTTTCTCAATTAAGTTTCT-AGGGT-AG-GTC-TTTGGCAGAAGTA----ATTTCTCTAATTCCGCGAGACGAAATTT--TAGAAATTATGTGTCTGATATTATT--GTA-AAAGA--CGATCTTGTCTAATTTTATATGGAATATGTTATTTCT-GGTATAGTTTTAGGGTTGGCACGCCA--TCA-AATAATAAATATTGCTATGT----GG--TCCGTTATTGTCGTAGTAGATTTATCG-GT-ATTATTCAATGTTATCTTTCTTTTATTTCATACTACTCATT-ACAACGTCAAGGAA-T----GATAAAGGCTTGAATT---TCTATATCCGATTCACATTGTAAGTTTCATTG----GTAGG-----T--AAGCGTTTGA-AAT-TC-AAGAAA--T-TGTTTTAGTTGATCTTCACCTTTGTCCAATGTCTATATTTAGGCAGAATTCATCCAATGAATAAAAGTCGT--CTAAATAGCG-TTCCA--TGAT-GT-TC--T---AATAAAAGTTTACACATAAAG-----TTTTGTCACCATAAACTTTaaaaaattatttaagaaatctatcatttaaaagatttgaaatctgtctatccaatgttctatggcggctaatcctagttcatgtggaatattagagtagaggttagtaacatcgaatgacactaaaattgattccgtgttgactttttcgggaagagtgtttagaaaatctatcgtatctcttatgtaactttga
gi|13 : -TTTTGGTACAT-TTTCTAA-TTTG----TTGGTTTACATGGTTATACTGATATTT-AGTTTCTCGA-ATCTG--TTATCA-GTGAACAA-TTATGCGGT
gi|14 : gaatttatgaaattgaagagacgcgtaaaaaaattcccgcgacattttccctcttattggggcaaccactttgtcacaagaatgttgaaatgaaggcgacaggtggcacgagcaatcgtagagcagttggcctcacgttcgtaatcaacgttcgaatgtgctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacagttgatgtcaacagtgattccgtctctattccatggattatttcgtgGA-TAACCTGACAAAACTTATAG-A-TTACGCAACGTATGTGGTTTACTT---------TAAGAAG--------ACCCTGGCTTT-----GATTAT--TTCATTAATTG-CACTT------------------GTT-AGCGTC-TT--T--GAAGTGGCTTAT-TCTTTAATTCCGACAAACGGCTGTT--TAGGATtga
gi|16 : caaggtgctaagtttggcaatgcgttgcacctgcttttattacgtttccagacgataagggtttcattgttcctactggggaaaataattgatttgagagaagagttttgtcgattaattttaattccaatattcttttcatttgatgatcttcttcaaagataagggagttacatgtattatcGCTTTGTTAATTC-CATTT-TCAATTAATTTTAT-AGGAT-AGCGTCCTT--GCAGAAGTA----ATCTCTCTAATTCCGCGAGACGAATATT--CAGAATTTTAGTGTCTAATATTATT--GTACAAAGA--CG-TCTTG-CTAA-ATTATATGGAATA--TCATTTCT-GGTATG--TTTAGGG-TGGCACG-AA--TCA-AATAAAAAGTATTGCT---T----GGTATCCGTTATT-TTGTAGAAGA--TATCGTTT-AC-----AATGTTA-TTTTCTTT--TTTCA------TCACC-ATCACGTCAAGGAA-T----GCTA---GTT--GATT---TC--TATCCGATTT-CTTTGTAA
gi|17 : CATCTTTTGGCGCAA-TT-CGGA-TGTG----TTCGCTTACA-GGGTACACTGATATTT-AGGTTCTCGG-ATCTG--TTGTCGTGTGAACGGTTCATGCGGTGTCTTAGT--GTGTC-TCCTGTCT----GCCGATA-TAATTTT----CGCC-ACATC-CGG-CGCAGGTAA-A--T----AACATA-----AT--CA-G--ATT--GG--A-AC-TAAC--AC-A-TAGTC-AT--TGATGA--T---TTTACT---GTAAATTTACTGCCGTTTTTGAAAATAAAG-----T-CGGACCC
gi|18 : ttttctgttgtgtctttatgaaatttataaaatagaaaaccggtaaaattggataaa-TTTTGGCGCAA-TTGC-GA-TGTGT---TTCGCTTACATGGGTACACTGATATTT-AGGTTCTCGG-ATCTG--TTGTCG-GTGAACGG-TCATGCGGTGTCTTAGT--GTGTC-TCCTGTCT-G--GCCGATT-AAATTTT----CGCC-ACATC-CGG-CGCAGGT-A-A--T----AACATA---G-AC--TA-G--ATT--GG--A-AC-TAAC--ACAA-T-GTC-AT--TGATGA--T---TTTACT---GTAAATTTACTGCCGTTTTTGAAAATAAAG-----T-CGGACCCt
gi|2 : tttttctgttgtgtctttatgaaatttataaaatagaaaaacggtaaaatttggataaacaTCTTT-CCTCTGTCC-----------------A-AAT-------ATAAA--AT---CATAACAAAATCGTGTTCCCGGCTGG--GT-TT--TTTAAAAAAAAACCT-----CAAAAAGTTTTTTTGTC----CCAAATGTTTCTTCGAACTGTAAAGAAATTAAAATTATTTT-TCTCTTCC-AAATATTCCCT------AA--AACTAATGTCGCATAAAGTTGGGGGCCAACATTGGTTCCCCAT--GCATAAGTGGCT-ACTCCCTTTTTGTCCTTGTAATAAAGTTTCA---TTCAAAATGCCCCAAATGAAGTTTTGTTTTCCA-AGT-TTAAAAA-TT-TAAGACTT
gi|20 : aaatgaattattatttttttgtatgtttttttgggtgacaggaaccccttttaaacatagttatgggcccttggttaaacaatctggtcaattttggtaaaaaacaccgtccctggttactaatgcggttgtctctttaataacccatgacatcaaggaaaaacaagacccagccaatattttcctattggactcccatgggtaaaaaaataaatcaaggtaggactacgtattgaaaaggtccccAT-TTTTGGCACAG-CATCCAACTGTG----TCCACAGAC-TGGG-------ATATTT--GGTTCTTTC-ATTTG--TTTACG-ATGTACAA-CCATTCTGTATCGTAGA--GCGTC-GATTGTCT-G--GCCGATA-TAATTCT----CGCA-ACAGT-CTG-TGCAAGT-T-A--TTGCCTACATT---GTAC--AA-GTTGTT--GGGCA-A---AGT--GC-A-C-GTA-ATA--AATGT--T---TTCAAT---ATAAATTGACT-TCATTTTTTTAAATGAAA-----TACAGACgaaatatgaaccgaattcttttaaggaatctctcgtgtaaaagatgaaaaaaggaaaaacggtccctaatccaatattcagtggcggccccctagtcccccgaggtccaaaaaagatgagaatatttgaaaaatagagggtttcgtggcaaatcaaaatggaggaaaaacctaataatggattcccgaagtttaaaatttcccctctggagtgattagaaaagtccccttacgggttgggggttcctcttgatgtaacctttgaaacctttggtgatgaaatgtttccacaaatccatctaagaagataacttaaaatccttgtgggtttttttccgccaggtggtccccgccaacaaatgggttttcccttaaattttttttaaaaagattcatcttggacattcaatacaaatttaattaaatgttttggattccgaaaaattttacattttggggtcgtttaatggattttgaccctttttttttaatgttatttttttttggtaaaaaaccataaaaggttacttgttttttccacattaaaaatcattcaaaaaggtaagattttttcctttgggatttggtaagttttaatctcccgtgattcgttatgatttttttcaagttttttttgccaagaccttttttagagttcatacgattttcctgtttttcctcgtaagtaaaatggtaactgtttctctagcacgggcaaaagaacataatttgaatttgggtaataa
gi|21 : aaaaatgcagacagag-TTTCTTCT-AAAACT--CAT------AAGAAACATATGTTGCAC-GCGGCGACG--CAACTTTGGTT-ACCATT-GT---AATGCCTAAC-----TTTTGTC--TATAA-AAAATTTCA---TT-AAAATGG-----ATACAA--TTGTTCTCGA-GAA-AT---AA-T
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gi|23 : ------AA--AAAGAGTGTTCCAC-AGGTCTGCA--CACCTTTGGAT-CTCATC-CC---AGTACCTAAC-----TTTTGTA--TATGA-ATCATATCATTTTT-AAAATGA-----ATGAAA--Tggtacacccgatgctaacaaataagggaaaaaatctcacttgttgaagattaggaacatcagtcatatccattattctactggcggcaatcctagattatgaggaatactagtaatggattgggtt
gi|24 : cAAC-GCAT-TTTGGTTTGTT-------GC-AT-TTCGTGAT--GATGGG-A-GG------TTA-TATGATATTACTGGTAAGACAA-GCTCTTGCAGGGATTGAT-TTA-AGCGAAAT--CAGTTTGTCGTTTA--CTTTTCATGATTTGGGA--------------TTTTC--ATG-TCTG-GCCT--GGTTTTTAAGA-CT-GAA-------AGG-TTATCTTTGATGATTTGAAAAACCTCcaactgtagacaattgaaaataaattcctaggaaatctgtcatgcataagacttttttacgcaatgatctacggtgactaatctatatcatatggaaaattcagatta
gi|25 : aT-TTTTGATGCAA-TTTGTAA-TGTG----TTCGCTTACAT----ATATGGATATTT-ACGTTCTCAG-ATCTG--TTGTTG-GTGAACAG-T
gi|27 : ttttttctgttgcgtctttatagaaagcagaaacccgactataaataaaattttcttaatctgaatgagttggaaaaatgttagaactcggattaatg-TTTTAGTGCAA-CTTCTAG-TGTG----TTCGCGTACATGGGAACACTGATAATA-TGGTTTTCGG-GTCTG--TTGTCG-TAGAACGT-TCATGTAGT
gi|29 : ttgtaaattgaaaaagcattataattcggcataataTTGTAAATTTCA-TC----GTCAGGC---TCAGAGAGTTTAG-AATATCAAAA-AA--T-TGTTTTAGCTGATCTTCACTTTTGTCC----------------CA-AAT------GATAAA--ACAGTCGT--CTAAATAGCGTTTCCA--TGAT-GT-TC--T---AATAAAAGTTT-----CAAAtactataatttgcacatgacaagggacagtgacatcctacaggc
gi|3 : CAT-TTTTGGCGCAA-TTCCGGA-TATG----TTCGCTTACATGGGTACACCGATATTT-AGGTTCTCGG-ATCTG--TTGTCG-GTGAACGG-TCATGCGGTATCTTAGT--GTGTC-TCCTGTCT-G--GGCGATA-TAATTTT----CACC-ACATA-CGG-CGCAGGT-A-A--T----AACATA---G-AT--CA-G--ATT--GG--A-AC-TAAC--AC-A-T-GCC-AT--TGATGA--T---TTTACT---GTAAATTTACTGCCGTTTTTGAAAACAAAG-----T-CGGACCCTTGTGATAAATATAAGGGCACGTAGC-GCAT-CTTGGTTAGCT-------GC-AT-TTAGAAAT--GATAGG---AGACTCTTTAAATAAAATATTACTAGTAAAACAG-GCTCTTGTAAGGATGGATTT-A-AGCGA--TGG-ACTTTGCCGTTTA--CTTTTGATGATTTGGGAATTTTCTAAAACTTTTTTTTTATG-TATG-GGTC--GGCTTCTATGA-TTTGGA-------AGG-TTATGTTTGATTATTTGGAAAACTTCTGGCATGGATTTTTGGGA-TTATTTGTTGAAACGTATGGTA-TGACACAATTTTTG-GATTTATTTTTCACC--TTAAGGAG--------GTCCTTTCTTTCATGTGATTTTGCTTTGTTAATTC-CATTT-TCAATTAATTTTTTTAGGGTTGGCTTC-TT--GGAGGAGTT----ATTTCTCTAATTCCGCGAGACGAATATT--TAGAATTTCAGTGTCTGATATTATT--GTACAAAGA--CT-TCTTG-CTAA-ATTATATGGAATA--TTGTTTCT-GGTATG--TTTAGGG-TGGCACA-AA--TCA-AATAATAGATATTGCT---TCCATGGTATCCGTTATT-TTGTAGAAGA--TATCG-G--A------AATGTTA-CTTTCTTT--TTTCC------TCACC-ATAACGTCAAGGAA-T----GCTA---GCC--AATT---TC--TATCCGATTC-CATTGTAAATTTCA-TA----GTGGGGC---TCAGGGAGTTTAG-AATATCAAACAAA--T-TGTTTTAGTTGATCTCCACCTTTGTCC----------------CA-AAT------GATAAA--ACAGTCGT--CTAAATAGCGTTTCCA--TGAT-GT-TC--T---AATAAAAGTTT-----CAAAG-----TTTTGTC----CGAACTTTTCCTT--GACAACAGAGTA--CAA-------GT-GTTCTTCT-AAAAAT--CCT------AA--GACGAGTGTTGCAT-AAGTCGGCG--CAACTTTAGTT-CTCATC-GC---AGTACCTAAT-----TTTTGTC--TGTAA-ACCATTTCA---TT-GAAATGCA----ATAAAA--TGTTTCTCTATGGA-TT---AA-TT-T-AGACTTTTTAAtatatatatatcacgcatactgt
gi|30 : TTCGTGCAA-TTTCGGA-TGTG----TTCGCTTACATTGATAGGCTTATATTC-ATGTCCTTGG-ATCTG--TTGTCA-GTGA
gi|32 : gtttttctgttgtctttacaaaataaaataaaagtggaagaacggtaaaattcggattaatatgT-A-A--C----AACATATAAA-AC--AA-G--ATT--GG--G-AC-TAACCTAT-A-T-GTC-A-----ATGACAT---TTCACT---GTAGATTTACTTTC--TTTT-AAAAGAAAGATTCATGCAGACTCATGTGTTTAGTAT--GGACACGTAAC-ACGT-CTTGGATT
gi|35 : TATTGCT---T----GGTATACGTTATT-TTGTAGAAGA--CATCG-GTTAC-----AATTTTA-CTTTCTTT--ATTCA------TCACC-ATCACGTCAAGTAA-TTAATGTTA---GCT--GATT---TC--TATCCGATTC-CATTGTAAtact
gi|36 : ----ATCTTTCTAATTCCGCAAGAAGAATGTCAATA-AATTTT-GTGC---ATTTTGTTAAGTTTAAAGA--CG-TCTAG-CTAA-ATTATATTCAATA--TTATTTCT-AGTCTG--TTAAAAG-TG
gi|37 : TT--TAGAATTTTTGTGTCTGATATTATT--GTACAAAGA--CG-TATTC-CTAA-ATTATATGGAATA--TTATTTTT-GGCATG--CTTAGGG-TGGCACG-AA--TAG-AATAGTTAGTATTGTT---T----GGttattgca
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gi|40 : CAT-TTTTGGCGCAA-TTTCGGA-TGTGTTAATTTGCTTACATGGGTACACTGATaacaaaattctttaggaaatctatcatttaaaagatttggaaatctgtctatccaatgttctgtgcggctatcttagtttatgtggaatattagagtagaggttagtaacatcgaatgacattaaaattgattccgtgttgactttttcgggaagagtgtttagaaaatctatcgtatctcttatgtaactttgaactttaataatacatttaatagataactaattctgtgagtttcacatgacggtcccgcaactataggtctgattttgaggtctgttgggctttcaacacttacatgtacatgtagtaatgatgaatgcggaatttttgcatttatcgttaatgacttgtttttgtgtatttgggtaagccataaaaattactggttttgacattaaacgagagtaggaatcagtttctttggggtaagttcttccgtgttcatcaacaattgtttcgagttttttcatgacttctttagcatcatatgttgccttttttcatagtattactgtcctctaacatagaaaggcacattgatttataataatcgcagtccattataacaacttattac
gi|41 : gttgtgtctttatgaaatttataaaatggaaaaatggtaaaatttggataaaCCTGTCT-ACAGCCGATA-TAATTTTTT--C-CC-ACATC-CGGGCGCAGGT-A-A--T----AACATA---G-ATT-CA-G--ATT--GG--A-ACATAAC--AC-A-T-GTC-ATC-TGATTA--T---TTTA
gi|42 : CCTGTCT-ACAGCCGATA-TAATTTTTT--C-CC-ACATC-CGGGCGCAGGT-A-A--T----AACATA---G-ATT-CA-G--ATT--GG--A-ACATAAC--AC-A-T-GTC-ATC-TGATTA--T---TTTA
gi|43 : CAT-TTTGGGCGCAAATTTCG-A-TGTG----TTCGCCT
gi|44 : ttttctttgtgtctttatgagaatttataaaatggaaaaacggtaaaatttggaaaaCCTTTCTCC----------------CA-TGT------GATGTC--GCAGCCAT--CTGAATAGCATTCCCA--CGAT-GT-CC--T---AAGAAAATTGT-----AGAAG-----TTTTGTC----TGAATTTTTTC
gi|46 : gACTGATGTTT-AGGTTCTCGG-ATCTG--TTATCG-GTGAATGA-TCA-ACGATA---TAAT--GTGAC-T
gi|47 : AT-TTTTGGCGCAA-TT-CGGA-TGTG----TTCGCTTACATGAGTACACTGATATgcagcgatctgagacaacat
gi|48 : tggaaaaacggtaaaatttggattaatGTGACTTTGCTTTGTTAATTC-CATTT-TCTATTAATATCTT-AGGAC-AACGT
gi|49 : AT-TTTTTATGCAG-TTTCTAA-TGTG----TTCACTTATATGGGTACACTCATAatctatcggagcaat
gi|5 : gtaagattcggattTCT-AAGAAT--CCTTTAGAGAA--AAAGAGTGTTGCAT-AAGTCGGCT--TAACTT-AGTT-CCCATC-GC---CATGCCTTAC-----TGTTATC--TATAA-ACCTTTTCA---TT-AAAATGC-----TTGAAA--TTGTTCT-TA-AAATTT---AA-TCGT-AAACGTTTTAA
gi|51 : GATATTT-AGGTAC-CGGCATCTGTTTTGTCG-ATGAACAG-TC-TGCGGTGaataaattctttttcaagtctgtcatgcaaaagatcaggaaatatatctatccaatgttccatgacgactaatcctagatcttgtggaatgttagtaaatgaagctaaattgatcctgtgttgactttctcgggaattgtggttagaaaatccaccgtatctcttatgtatctttgaacatttataaatgtgatatgttctgataatacgtctaatagattacttattctgtaagtttcacatgttggtcccgcaactatgggtctgaatttgaggtctgctgggctttaaacactaatttatatacgatgattcggaagttttgcatttatcgtttatgacatggcttttatatatttaaggcaagcatagaaattaaaagtactggttttgattctaaacgagagtaggtatttggtctcattagccgtaattttcttagtgtgttcatcgatacttgtttcgagattttgctttttcgcatagtattcactattttctaacagaaataagctagatttgtaataatcgcgatctattataactactatgctacctttatcggtttccttaatgatgatggt
gi|54 : TT--GTACAAAGA--CG-ACTTG-C-AA-ATTATATGGAATA--T
gi|6 : CAT-TTTTGGGGCAA-TTTCGGA-TGTG----TTCGCTTACATGAGTACACTGATTTTTTAGGTTCTCGG-ATCTG--TTGTCG-GTGAACGG-TCATGTGGTGTCTTAGT--ATG
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gi|8 : tgatttgagatttatccatgtctaggccctgggttttaagacttgaaaagattatttttgaatgtttggaaaaccccacgatttatttgttaaaactattatttacacaatatacttatgtcaacggttaaaagatgtttctgtcctttcttacggataattgagattttttaaaATG-TCTA-GGCCT-GGGTT-TAAGACTT-GAA-------AAG-T-ATTTTTGAATGTTTGGAAAACCCC--------------ACGA-TTATTTGTTAAAACTTAT-AT--TTACACAATAT-----ACTTA-TTGTCAACGGTTAA-AAG--------ATGTTTTCTTTCg
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15 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|2 : tttttctgttgtgtctttatgaaatttataaaatagaaaaacggtaaaatttggataaacaATGAATTA--TTATTTTT-TTGTATG--TTTTTTTGGG-TGACAGG-AA--CCCCTTTTA-AACA-TAGTTATGGGCCCT---T----GGTTAAACAATCTGGTCAATT-TTGGTAAAAAA--CACCG---TC-----CCTGGTTA-CTAATGCGGTTGTCTC-TTTAA------TAACCCATGACATCAAG----GAA-
gi|2 : aaTCTTT-CCTCTGTCC-----------------A-AAT-------ATAAA--AT---CATAACAAAATCGTGTTCCCGGCTGG--GT-TT--TTTAAAAAAAAACCT-----CAAAAAGTTTTTTTGTC----CCAAATGTTTCTTCGAACTGTAAAGAAATTAAAATTATTTT-TCTCTTCC-AAATATTCCCT------AA--AACTAATGTCGCATAAAGTTGGGGGCCAACATTGGTTCCCCAT--GCATAAGTGGCT-ACTCCCTTTTTGTCCTTGTAATA-AAGTTTCA---TTCAAAATGCCCCAAATGAAGTTTTGTTTTCCA-AGT-TTAAAAA-TT-TAAGACTTaaacaagacccagccaatattttcctattggactcccatgggtaaaaaaataaatcaaggtaggactacgtattgaaaaggtcccctctttcctctgtccaaatataaaatcataacaaaatcgtgttcccggctgggttttttaaaaaaaaacctcaaaaagtttttttgtcccaaatgtttcttcgaactgtaaagaaattaaaattatttttctcttccaaatattccctaaaactaatgtcgcataaagttgggggccaacattggttccccatgcataagtggctactccctttttgtccttgtaataaagtttcattcaaaatgccccaaatgaagttttgttttccaagtttaaaaatttaagacttgaaatatgaaccgaattcttttaaggaatctctcgtgtaaaagatgaaaaaaggaaaaacggtccctaatccaatattcagtggcggccccctagtcccccgaggtccaaaaaagatgagaatatttgaaaaatagagggtttcgtggcaaatcaaaatggaggaaaaacctaataatggattcccgaagtttaaaatttcccctctggagtgattagaaaagtccccttacgggttgggggttcctcttgatgtaacctttgaaacctttggtgatgaaatgtttccacaaatccatctaagaagataacttaaaatccttgtgggtttttttccgccaggtggtccccgccaacaaatgggttttcccttaaattttttttaaaaagattcatcttggacattcaatacaaatttaattaaatgttttggattccgaaaaattttacattttggggtcgtttaatggattttgaccctttttttttaatgttatttttttttggtaaaaaaccataaaaggttacttgttttttccacattaaaaatcattcaaaaaggtaagattttttcctttgggatttggtaagttttaatctcccgtgattcgttatgatttttttcaagttttttttgccaagaccttttttagagttcatacgattttcctgtttttcctcgtaagtaaaatggtaactgtttctctagcacgggcaaaagaacataatttgaatttgggtaataa
gi|20 : aaatgaattattatttttttgtatgtttttttgggtgacaggaaccccttttaaacatagttatgggcccttggttaaacaatctggtcaattttggtaaaaaacaccgtccctggttactaatgcggttgtctctttaataacccatgacatcaaggaaaaacaagacccagccaatattttcctattggactcccatgggtaaaaaaataaatcaaggtaggactacgtattgaaaaggtccccAT-TTTTGGCACAG-CATCCAACTGTG----TCCACAGAC-TGGG-------ATATTT--GGTTCTTTC-ATTTG--TTTACG-ATGTACAAC-CATTCTGTATCGTAGA--GCGTC-GATTGTCT-G--GCCGATA-TAA-T---TCTCG-CAACAGT-CTG-TGCAAGTT-A--TTGCCTA---CATTGTACA-AGTT--GTTGG-GC-AAAGT--GC-A-C-GT-AAT-A-AATGT--T---TTCAAT---ATAAATTGACT-TCATTTTTTTAAATGAAA-----TACAGACgaaatatgaaccgaattcttttaaggaatctctcgtgtaaaagatgaaaaaaggaaaaacggtccctaatccaatattcagtggcggccccctagtcccccgaggtccaaaaaagatgagaatatttgaaaaatagagggtttcgtggcaaatcaaaatggaggaaaaacctaataatggattcccgaagtttaaaatttcccctctggagtgattagaaaagtccccttacgggttgggggttcctcttgatgtaacctttgaaacctttggtgatgaaatgtttccacaaatccatctaagaagataacttaaaatccttgtgggtttttttccgccaggtggtccccgccaacaaatgggttttcccttaaattttttttaaaaagattcatcttggacattcaatacaaatttaattaaatgttttggattccgaaaaattttacattttggggtcgtttaatggattttgaccctttttttttaatgttatttttttttggtaaaaaaccataaaaggttacttgttttttccacattaaaaatcattcaaaaaggtaagattttttcctttgggatttggtaagttttaatctcccgtgattcgttatgatttttttcaagttttttttgccaagaccttttttagagttcatacgattttcctgtttttcctcgtaagtaaaatggtaactgtttctctagcacgggcaaaagaacataatttgaatttgggtaataa
gi|21 : aaaaatgcagacagag-TTTCTTCT-AAAACT--CAT------AAGAAACATATGTTGCAC-GCGGCGACG--CAACTTTGGTT-ACCATT-GT---AATGCCTAAC-----TTTTGTC--TATAA-A-AAATTTCA---TT-AAAATGG-----ATACAA--TTGTTCTCGA-GAA-AT---AA-T
gi|22 : ATTTTGCTT-CCTATC-GC---AGGGGCCAGC-----ATTCGTT--TGTGA-A-ACATTTCA---TT--AAGTGC-----ATAAAA--TTGTTTTCCA-AGA------AA-TT-cgttaacattgaaaaacaaagtcgttggggaatcagtcatgtgaatacatgattatctatccaatgctcttctttgattaatcctagatcttgtgaaatgcta
gi|23 : ------AA--AAAGAGTGTTCCAC-AGGTCTGCA--CACCTTTGGAT-CTCATC-CC---AGTACCTAAC-----TTTTGTA--TATGA-A-TCATATCATTTTT-AAAATGA-----ATGAAA--Tggtacacccgatgctaacaaataagggaaaaaatctcacttgttgaagattaggaacatcagtcatatccattattctactggcggcaatcctagattatgaggaatactagtaatggattgggtt
gi|24 : cAAC-GCAT-TTTGG-----TTTGTTGC-AT-TTCGTGAT--GATGGG-AGG--TT------ATATGATATTACTGGTAAGACAA-GCTCTTGCAGGGATTGATTT-A-AGCGAAATCAG---TTTGTCGTTTA--CTTTTCATGATTTGGGA--------------TTTTC--ATG-TCTG-GCCT--GGTTTTTAAGAC-TGAA-------AGG-TTATCTTTGATGATTTGAAAAACCTCcaactgtagacaattgaaaataaattcctaggaaatctgtcatgcataagacttttttacgcaatgatctacggtgactaatctatatcatatggaaaattcagatta
gi|25 : aT-TTTTGATGCAA-TTTGTAA-TGTG----TTCGCTTACAT----ATATGGATATTT-ACGTTCTCAG-ATCTG--TTGTTG-GTGAACAGT-
gi|27 : ttttttctgttgcgtctttatagaaagcagaaacccgactataaataaaattttcttaatctgaatgagttggaaaaatgttagaactcggattaatg-TTTTAGTGCAA-CTTCTAG-TGTG----TTCGCGTACATGGGAACACTGATAATA-TGGTTTTCGG-GTCTG--TTGTCG-TAGAACGTT-CATGTAGT
gi|29 : ttgtaaattgaaaaagcattataattcggcataataTTGTAAATTTCA-TC----GTCAGGCTCAGA-----GAGTTTAG-AATATCAAAA-AA--T-TGTTTTAGCTGATCTTCACTTTTGTCC----------------CA-AAT------GATAAA--ACAGTCGT--CTAAATAGCGTTTCCA--TGAT-GT-TC--T---AATAAAAGTTT-----CAAAtactataatttgcacatgacaagggacagtgacatcctacaggc
gi|3 : CAT-TTTTGGCGCAA-TTCCGGA-TATG----TTCGCTTACATGGGTACACCGATATTT-AGGTTCTCGG-ATCTG--TTGTCG-GTGAACGGT-CATGCGGTATCTTAGT--GTGTC-TCCTGTCT-G--GGCGATA-TAATT---TT-CA-CCACATA-CGG-CGCAGGTA-A--TAACATA---GA-T---CA-GATT--G--GA-AC-TAA-C--AC-A-T-GC-CAT--TGATGA--T---TTTACT---GTAAATTTACTGCCGTTTTTGAAAACAAAG-----T-CGGACCCTTGTGATAAATATAAGGGCACGTAGC-GCAT-CTTGG-----TTAGCTGC-AT-TTAGAAAT--GATAGG-AGA--CTCTTTAAATAAAATATTACTAGTAAAACAG-GCTCTTGTAAGGATGGATTT-A-AGCGA---TGG-ACTTTGCCGTTTA--CTTTTGATGATTTGGGAATTTTCTAAAACTTTTTTTTTATG-TATG-GGTC--GGCTTCTATGATTTGGA-------AGG-TTATGTTTGATTATTTGGAAAACTTCTGGCATGGATTTTTGGGA-TTATTTGTTGAAACGTATGGTA-TGACACAATTTTTG-GATTTATTTTTCACC--TTAAGGAG--------GTCCTTTCTTTCATGTGATTTTGCTTTGTTAATTC-CATTT-TCAATTAATTTTTTTAGGGTTGGCTTCTTGG--AGGAGTTAT---TTCTCTAATTCCGCGAGACGAATATTTAGAATTTCAGTGTCTGATATTATT--GTACAAAGA--CT-TCTTG-CTAA-ATTATATGGAATA--TTGTTTCT-G-GTATG--TTTA---GGG-TGGCACA-AA--TC------A-AATAATAGATATTG---CT---TCCATGGT------ATCCGTT--ATT-TTG-TAGAAGA--TATCG-G--A------AATGTTA-CT-------TTCTTT--TTTCC------TCACC-ATAACGTCAAG----GAA-TGCTA---GCC--A---ATTTC--TATCCGATTC-CATTGTAAATTTCA-TA----GTGGGGCTCAGG-----GAGTTTAG-AATATCAAACAAA--T-TGTTTTAGTTGATCTCCACCTTTGTCC----------------CA-AAT------GATAAA--ACAGTCGT--CTAAATAGCGTTTCCA--TGAT-GT-TC--T---AATAAAAGTTT-----CAAAG-----TTTTGTC----CGAACTTTTCCTT--GACAACAGAGTA--CAA-------GT-GTTCTTCT-AAAAAT--CCT------AA--GACGAGTGTTGCAT-AAGTCGGCG--CAACTTTAGTT-CTCATC-GC---AGTACCTAAT-----TTTTGTC--TGTAA-A-CCATTTCA---TT-GAAATGCA----ATAAAA--TGTTTCTCTATGGA-TT---AA-TT-T-AGACTTTTTAAtatatatatatcacgcatactgt
gi|30 : TTCGTGCAA-TTTCGGA-TGTG----TTCGCTTACATTGATAGGCTTATATTC-ATGTCCTTGG-ATCTG--TTGTCA-GTGA
gi|32 : gtttttctgttgtctttacaaaataaaataaaagtggaagaacggtaaaattcggattaatatgTA-A--CAACATATAAAAC----AA-GATT--G--GG-AC-TAA-CCTAT-A-T-GT-CA-----ATGACAT---TTCACT---GTAGATTTACTTTC--TTTT-AAAAGAAAGATTCATGCAGACTCATGTGTTTAGTAT--GGACACGTAAC-ACGT-CTTGGA----TTTACT
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gi|40 : CAT-TTTTGGCGCAA-TTTCGGA-TGTGTTAATTTGCTTACATGGGTACACTGATaacaaaattctttaggaaatctatcatttaaaagatttggaaatctgtctatccaatgttctgtgcggctatcttagtttatgtggaatattagagtagaggttagtaacatcgaatgacattaaaattgattccgtgttgactttttcgggaagagtgtttagaaaatctatcgtatctcttatgtaactttgaactttaataatacatttaatagataactaattctgtgagtttcacatgacggtcccgcaactataggtctgattttgaggtctgttgggctttcaacacttacatgtacatgtagtaatgatgaatgcggaatttttgcatttatcgttaatgacttgtttttgtgtatttgggtaagccataaaaattactggttttgacattaaacgagagtaggaatcagtttctttggggtaagttcttccgtgttcatcaacaattgtttcgagttttttcatgacttctttagcatcatatgttgccttttttcatagtattactgtcctctaacatagaaaggcacattgatttataataatcgcagtccattataacaacttattac
gi|41 : gttgtgtctttatgaaatttataaaatggaaaaatggtaaaatttggataaaCCTGTCT-ACAGCCGATA-TAATT---TTTTC-CCACATC-CGGGCGCAGGTA-A--TAACATA---GATT---CA-GATT--G--GA-ACATAA-C--AC-A-T-GT-CAT-CTGATTA--T---TTTA
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gi|44 : ttttctttgtgtctttatgagaatttataaaatggaaaaacggtaaaatttggaaaaCCTTTCTCC----------------CA-TGT------GATGTC--GCAGCCAT--CTGAATAGCATTCCCA--CGAT-GT-CC--T---AAGAAAATTGT-----AGAAG-----TTTTGTC----TGAATTTTTTC
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gi|41 : gttgtgtctttatgaaatttataaaatggaaaaatggtaaaatttggataaaCCTGTCT-ACAGCCGATA-TAATT---TTTTC-CCACATC-CGGGCGCAGGTA-A--TAACATA---GATT---CA-GATT--G--GA-ACATAA-C--AC-A-T-GT-CAT-CTGATTA--T---TTTA
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gi|40 : CAT-TTTTGGCGCAA-TTTCGGA-TGTGTTAATTTGCTTACATGGGTACACTGATaacaaaattctttaggaaatctatcatttaaaagatttggaaatctgtctatccaatgttctgtgcggctatcttagtttatgtggaatattagagtagaggttagtaacatcgaatgacattaaaattgattccgtgttgactttttcgggaagagtgtttagaaaatctatcgtatctcttatgtaactttgaactttaataatacatttaatagataactaattctgtgagtttcacatgacggtcccgcaactataggtctgattttgaggtctgttgggctttcaacacttacatgtacatgtagtaatgatgaatgcggaatttttgcatttatcgttaatgacttgtttttgtgtatttgggtaagccataaaaattactggttttgacattaaacgagagtaggaatcagtttctttggggtaagttcttccgtgttcatcaacaattgtttcgagttttttcatgacttctttagcatcatatgttgccttttttcatagtattactgtcctctaacatagaaaggcacattgatttataataatcgcagtccattataacaacttattac
gi|41 : gttgtgtctttatgaaatttataaaatggaaaaatggtaaaatttggataaaCCTGTCT-ACAGCCGATA-TAATT---TTTTC-CCACATC-CGGGCGCAGGTA-A--TAACATA---GATT---CA-GATT--G--GA-ACATAA-C--AC-A-T-GT-CAT-CTGATTA--T---TTTA
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gi|54 : TT--GTACAAAGA--CG-ACTTG-C-AA-ATTATATGGAATA--T
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gi|8 : ttatccTAATTCTACGAGA---ATATCTAGAATATTCATGT--GGTATTATT--ATACAAAGA--AC-TATAA-TTTA-ATAATATGCAACA--TTATTTCT-A-GCATG--TTTT---GAA-TGACACG-AA--TC------A-AATA-T--GTATTG----------------------------T--AT-----------GC--TATC--------------CATTA--T-------TTCGTT--TT--A------TTACC-ATAGCATTAAG----GAA-TT-------TTG---ACT--G---AT----TTT--TATCTGATTT-C-ATTG---------TAAA---CC-TTGTAAGGCGCAGATCTCGAGCGTCTAG-AATATTAAAAAAAAATATGT---AGTTGATCTTCACCT--G--------------------A-AAT------GATAAA--ATAGCAAT--CTGAATAACGTTTCCG--TTAT-GT-AT--C---AATAAAAGTTT-----CAAAG-----TT------------------CTTT--AACACCAGAGCA--TAA-------TTCTTTCGTCT-AAAAAT--CCC------AA--AATGAGCTATGCAT-AAGTCGGTG--CAACTTTCGTT-CTCATA-GT---CGTACCAAAC-----TTTGGTC--GATGA-ATGCATctttcttcgggataatgagattttttaaataattctacgagaatatctagaatattcatgtggtattattatacaaagaactataatttaataatatgcaacattatttctagcatgttttgaatgacacgaatcaaatatgtattgtatgctatccattatttcgttttattaccatagcattaaggaattttgactgatttttatctgatttcattgtaaaccttgtaaggcgcagatctcgagcgtctagaatattaaaaaaaaatatgtagttgatcttcacctgaaatgataaaatagcaatctgaataacgtttccgttatgtatcaataaaagtttcaaagttctttaacaccagagcataattctttcgtctaaaaatcccaaaatgagctatgcataagtcggtgcaactttcgttctcatagtcgtaccaaactttggtcgatgaatgcatat
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blockSeqs : . . T C . T . . . . . . . ACA . A . T . . G . . TAAAAC . . . . A . . . . . . CT . . . G A T TA . . . . . . . . TTA A A A . A AGAGT C G T A TT . . T T T CT . . . C AC . G AGA T TTG T G A GG G . . . A . . GC . C A C . . . G . . AG . . . . . . . A AA CTTCCATGGT . TTTGG . GTTTACAAT TCT C T . G C . . . . TG . . C . . . TTT . G C TCCGA T . A A T TTT C T C . . . T . . . . ATC . . T CC C . A T . AT . . . . . . . G . T . . . . A . A A . . TTT . . .
blockSeqs : . . T T . . . . . . . . . G . T . T . . . . . GACT . . . . . . . . . . . T . . . T G G T . . . A TGGAC C . . . C . . . C C CT . . . G AC . T TAT A . . G A . . . . . T . . AT . C A C . . . G . . G . . . . . . . A AG CTATGTGG . TTTG . GGTTACAAT TT . T . . G . . . . CA . . G . . . TTT . C C . T . A A T TTT T T C . . . T . . . . T . . T CG T . C C . . . . . . . . . G . C . . . . A . A . . . AT . . .
blockSeqs : . . T T . . . . . . . . . G . T . T . . . . . GATT . . . . . . . . . . . T . . . . . . T . . . . G T C . . . T . . . AT A . . . . . . . . . T . . G . C T C . . . G . . G . . . . . . . G AG CTTGGT . TTTG . GTCCCTG CT . T . . A . . . . CA . . C . . . T . A C . C . A A T GCT T T C . . . C . . . . T . . T TG C . C C . . . . . . . . . G . C . . . . A . G . . . TT . . .
blockSeqs : . . C G . . . . . . . . . G . T . . . . . . . GATT . . . . . . . . . . . A . . . . . . G . . . . . T . . . . . . . A T . . . . C . . G . . . . . . . A TA CTTGGT . TTTG . GGAAAT CT . T . . C . . . . TG . . C . . . . . T . . C . A A T CT T T . . . . C . . . . T . . . . . . . . . . . . . . A . C . . . . T . G . . . TT . .
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originalCons : CAT-TTTTGGCGCAA-TTTCGGA-TGTG----TTCGCTTACATGGGTACACTGATATTT-AGGTTCTCGG-ATCTG--TTGTCG-GTGAACGGT-CATGCGGTGTCTTAGT--GTGTC-TCCTGTCT-G--GCCGATA-TAATT---TTTCG-CCACATC-CGG-CGCAGGTA-A--TAACATA---GACT---CA-GATT--G--GA-AC-TAA-C--AC-A-T-GT-CAT-CTGATGA--T---TTTACT---GTAAATTTACTGCCGTTTTTGAAAATAAAG-----T-CGGACCCNTGTGNTNAGTAT--GGGCACGTAGC-GCAT-CTTGG-----TTTGCTGC-AT-TTAGAAAT--GATAGG-AGG--CTCCTT-AA-TATNATATTACTNGTAAAACAG-GCTCTTGTAAGGATTGATTT-A-AGCGA---CGG-ACTTTGTCGTTTA--CTTTTGATGATTTGGGAATTT-CTAAAACTTTTTTC---TNATG-TCTG-GGCC--GGCTTCTAAGACTTGAA-------AG-G-TTATNTTTGATTATTTGGAAAACCTCTG-CAT----TTTTANGA-TTATTTGTTAAAACNTATGGTA-TTACACAATNTTTG-GATTTATTTNTCANCGGTTAAGAAG--------GTCCTTTCTTTCATGTGATTTTGCTTTGTTAATTC-CATTT-TCAATTAATTTTTT-AGGGT-AGCGTCTTTG-CAGAAGTAAT---TTCTCTAATTCCGCGAGACGAATATTTAGAATTTTCGTGTCTGATATTATT--GTACAAAGA--CG-TCTTG-CTAA-ATTATATGGAATA--TTATTTCT-G-GTATG--TTTA---GGG-TGGCACG-AA--TC------A-AATAATAAGTATTG---CT---T----GGT------ATCCGTT--ATT-TTG-TAGAAGA--TATCG-G-TA-----CAACGTTA-CT-------TTCTTT--TTTCA------TCACC-ATNACGTCAAG----GAA-TG-------CTA---GCC--G---AT----TTC--TATCCGATTC-C-ATTG---------TAAATTTCA-TNGTAGGGCTCAGA------GCGTTTAG-AATATCAAAAAAA--T-TGTTTTAGTTGATCTTCACCTTTGTCC----------------CA-AAT------GATAAA--ACAGCCGT--CTAAATAGCGTTTCCG--TGAT-GT-TC--T---AATAAAAGTTT-----CAAAG-----TTTTGTC----CGAACTTTTCCTT--AACANCAGAGCA--CAA-------TT-TTTCTTCT-AAAAAT--CCT------AA--AACGAGTGTTGCAT-AAGTCGGCG--CAACTTTGGTT-CCCATC-GC---AGTACCTAAC-----TTTTGTC--TGTAA-A-NCATTTCA---TT-GAAATGC-----ATAAAA--TTGTTCTCTA-GGA-TT---AA-TT-T-AGACTTTTTAA
finalCons : CAT-TTTTGGCGCAA-TTTCGGA-TGTG----TTCGCTTACATGGGTACACTGATATTT-AGGTTCTCGG-ATCTG--TTGTCG-GTGAACGGT-CATGCGGTGTCTTAGT--GTGTC-TCCTGTCTG---GCCGATA-TAATT---TTTCG-CCACATC-CGG-CGCAGGTA-A--TAACATAGAT-------CA-GATT--G--GA-AC-TAA-C--AC-A-T-GT-CATT--GATGA--T---TTTACT---GTAAATTTACTGCCGTTTTTGAAAATAAAG-----T-CGGACCCNTGTGNTNAGTAT--GGGCACGTAGC-GCAT-CTTGG-----TTTGCTGC-AT-TTAGAAAT--GATAGG-AGG--CTCCTT-AA-TATNATATTACTNGTAAAACAG-GCTCTTGTAAGGATTGATTT-A-AGCGA---CGG-ACTTTGTCGTTTA--CTTTTGATGATTTGGGAATTT-CTAAAACTTTTTTC---TNATG-TCTG-GGCC--GGCTTCTAAGACTTGAA-------AG-G-TTATNTTTGATTATTTGGAAAACCTCGC--------------GA-TTATTTGTTAAAACNTATGGT--TTACACAATNTTG--GATTTATTTNTCANC--TTAAGAAG--------GTCCTTTCTTTCATGTGATTTTGCTTTGTTAATTC-CATTT-TCAATTAATTTTTT-AGGGT-AGCGTCTTTG-CAGAAGTAAT---TTCTCTAATTCCGCGAGACGAATATTTAGAATTTTCGTGTCTGATATTATT--GTACAAAGA--CG-TCTTG-CTAA-ATTATATGGAATA--TTATTTCT-G-GTATG--TTTA---GGG-TGGCACG-AA--TC------A-AATAATAAGTATTG---CT---T----GGT------ATCCGTT--ATT-TTG-TAGAAGA--TATCG-G-TA-----CAACGTTA-CT-------TTCTTT--TTTCA------TCACC-ATNACGTCAAG----GAA-TG-------CTA---GCCG-----AT----TTC--TATCCGATTC-C-ATTG---------TAAATTTCA-TNGTAGGGCTCAGA------GCGTTTAG-AATATCAAAAAAA--T-TGTTTTAGTTGATCTTCACCTTTGTCC----------------CA-AAT------GATAAA--ACAGCCGT--CTAAATAGCGTTTCCG--TGAT-GT-TC--T---AATAAAAGTTT-----CAAAG-----TTTTGTC----CGAACTTTTCCTT--AACANCAGAGCA--CAA-------TT-TTTCTTCT-AAAAAT--CCT------AA--AACGAGTGTTGCAT-AAGTCGGCG--CAACTTTGGTT-CCCATC-GC---AGTACCTAAC-----TTTTGTC--TGTAA-A-NCATTTCA---TT-GAAATGC-----ATAAAA--TTGTTCTCTA-GGA-TT---AA-TT-T-AGACTTTTTAA
15 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|11 ): CGTGTAAAAGATTAGGAAAACGCTCATTCCAATATTCAATGACGGCTACTCTGAGGTCATTGGGAATATTAGAATAGAGGTTCGTGACATCAAATGAGACTAATATGGATTCCGAGTTAATTTCCTCTGGAAGTGAATTAAGAAAGTCTACGGTGTCTCTGCTGTAACGAATGGCTTCCGCAATAAATCTAAGAGAACTAATCCTCTGAATTTTGCAAATAGGCCCCGCGACAATGGGTCTAATTTTAACATCATCTGGACATTCAATGTATATATTTGTGATTCCGAATTTTTACATTTGTCGTTTATGATTTGACTTTTATGTATTTTGGTAAACCCATAAAAGTTACTGATTTTTGCTTTAAATCTTAAAAGATTAGATTTTTCTTTCGTTGTAAGTTTATCTCCGTTTTCACATATATATTAACATTTGTGGTGTTCTTAGGTGGCCTGTTTTCATTATCTGT
Unaligned ( gi|12 ): ATTATATATTCCAAAAGATTAAAAATCCACACAAGTAGTACAGTAATAAATAAAAATATTAGAAGGCCGATGAGTATACTCGAACTCAGTTTTCTCCAATCCCTTCAGGATATAATGAACATTGCTAGAATACATAAATCAGCAGTATTCAAAGTGATATGAAAGCCCCAATGAAATTGTTACGCTTTGATAAAGTTCATTTATTTATTACATGATAATGTAACGTTGGGAAAATAATATGGGAAAATTTTACTTTTACATAAAAACGGGAACTTATATATATGATTTAGCATTCTATTTTTGTTGTGTATATGTAGAATATATTAATTTGAAAAACGATAAAATTTGGATTTTTACTCTCATTGAGAATCCTTGTCCCAAATATTAGAAGGTCGATTGAGTATACATGTACATGTACATATATATGTAAGAAA
Unaligned ( gi|15 ): ATATATAATTCATAATCAATTAAAATATTTGAAGGCCATTGAGTCTATATACTTCGACTAGTTGTTCAATTCTTCAGGACTATAATGACATTGCTAGTTTACATTGTAAAATACAAGTATTTAAAGTGATATGAAAAAGCGCCAATGATTGTTACGCTTTATTAAGTTATGTTACGTCACATGTAACGTTGGGAAATTATATGGGAATTTTACATTACATAAAAAACGGGAACTTTTATCAATTAACATTCTTTTCTGTGTATCTGAGAATTTTATATTGAAAAAAAAATTTATGGTACTTTATTTACTTT
Unaligned ( gi|19 ): ACATTTTTTTCTATTCGACACGGTTTGCCACTAACACGCTTCGCCGCACCCCTTCGTTCCCAATCCGCCATCACCCTCAAACCTTTTTGTCTGCTACCCTATGCATTCATTGGAGAAATGCCATAAGCCCTTGTTATCTCGTACACGGATTACAATTTTAGCTTGTATAATAACACAAATTCTTTCACGAGATCTATTCGGTATTAAAAAAAGAATTTGAGAAATCAGATCTTACAATGTTCTATGGCGGCTATCTAGTTCTGTTGGAAAACTATTAGAGTAGA
Unaligned ( gi|26 ): ATGTAATATTCATGGTTACACAAATACACTTCTATTTCAAAGTGATATGAAAAGCGCCAATGAATCGAACACATTACGCTTCGATAAAATTCAATGTTACGTCATAATGTAACGTTGGGAAAATAGTACGGGGAAATTTTAGTTTTACATAAAAACTGGAACTTGTATA
Unaligned ( gi|28 ): TTTAATGAACATTGATAGGATATATACATGTATATACCGTGATTTTTAAGTGAGTGATATCAAATAGCACCAATAAAATATTACGTTTTGATAAAGTTCTCTATTACGTCATAATATAAGTCGATAATAATTATAGTACGAGAAAATTAACCTTCTTATCATT
Unaligned ( gi|31 ): ATATTATAATATATTCCACAATTAGATTAAGGTATTCTAGAAAAATTCACACAAGTAAGTAGTTTCTAATAAAATTTTGAATGGCCCGATTTGAGGATATACTCGACTATGTTTCTCTAACCAATTCCGTTCAGGA
Unaligned ( gi|33 ): AAATGCCTGAAAGCCGATTGAGTATACTCGACAAGTTTCTATAATTCTTTAGGTGCCCGTTTCACAATACAGGAGTATAATTAACATTGCTAGGTTACACATTTACACAGTGATTTCAAAGTGATATCAAAAAG
Unaligned ( gi|34 ): AGGTATTTAAAATCCCGACACAAGTAGTAGCTATAACTAAATTATTGGAAGGCCCGATTAGTTACCGACTAGTTTCTACCTACAATTCTTCAGGAGTATAATGAACATTTAATATATATATAT
Unaligned ( gi|45 ): CCCTACACACAAATATATATAATAAAAATATTAGAAGGCCGATTGAGTATACTCGACTAGTTTCTACAATTCTTCAGGG
Unaligned ( gi|50 ): ATACACATATTATATATATTAGTATAAAAATATTAGAAGGCCGTTGAGTATAC
Unaligned ( gi|52 ): TATCACACAGCCGACTGAGTATACTCGACTAGTTTCTGTAA
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Unaligned ( gi|55 ): CGATCGAGTATATTCGACTAGTTTCTACATTTCT
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Reference ( family-580 ) : CAT-TTTTGGCGCAA-TTTCGGA-TGTG----TTCGCTTACATGGGTACACTGATATTT-AGGTTCTCGG-ATCTG--TTGTCG-GTGAACGG-TCATGCGGTGTCTTAGT--GTGTC-TCCTGTCT-G--GCCGATA-TAATT---TTTCG-CCACATC-C-GGCGCAGGT-A-A--TAACATA---GA--T----CA-GATT--G--GA-AC-TAA-C--AC-A-T-GT-CAT--TGATGAT---TTTACT---GTAAATTTACTGCCGTTTTTGAAAATAAAG-----T-CGGACCCNTGTGNTNAGTAT--GGGCACGTAGC-GCAT-CTTGG-----TTTGCTGC-AT-TTAGAAAT--GATAGG-AGG--CTCCTT-AATATNATATTACTNGTAAAACAG-GCTCTTGTAAGGATTGATTT-A-AGCGA---CGG-ACTTTGTCGTTTA--CTTTTGATGATTTGGGAA-TTTCTAAAACTTTTTTC---TNATG-TCTG-GGCC--GGCTTCTAAGACTTGAA-------AG-G-TTATNTTTGATTATTTGGAAAACCTC--GC------------GA-TTATTTGTTAAAACNTATGGT-TTACACAA-TNT-TG-GATTTATTTNTCANC--TTAAGAAG--------GTCCTTTCTTTCATGTGATTTTGCTTTGTTAATTC-CATTT-TCAATTAA-TTTTTTAGGG-TAGCGTCTTTG-CAGAAGTAAT---TTCTCTAATTCCGCGAGACGAATATTTAGAATTTTCGTGTCTGATATTATT--GTACAAAGA--CG-TCTTG-CTAA-ATTATATGGAATA--TTATTTCT-G-GTATG--TTTA---GGG-TGGCACG-AA--TC------A-AATAATAAGTATTG---CT----TGGT------ATCCGTT--ATT-TTG-TAGAAGA--TATCG-G-TA-----CAACGTTA-CT-------TTCTTT--TTTCA------TCACC-ATNACGTCAAG----GAA-TG-------CTA---GCC--G---AT----TTC--TATCCGATTC-C-ATTG---------TAAATTTCA-TNGTAGGGCTCAGA------GCGTTTAG-AATATCAAAAAAA--T-TGTTTTAGTTGATCTTCACCTTTGTCC----------------CA-AAT------GATAAA--ACAGCCGT--CTAAATAGCGTTTCCG--TGAT-GT-TC--T---AATAAAAGTTT-----CAAAG-----TTTTGTC----CGAACTTTTCCTT--AACANCAGAGCA--CAA-------TT-TTTCTTCT-AAAAAT--CCT------AA--AACGAGTGTTGCAT-AAGTCGGCG--CAACTTTGGTT-CCCATC-GC---AGTACCTAAC-----TTTTGTC--TGTAA-A-NCATTTCA---TT-GAAATGC-----ATAAAA--TTGTTCTCTA-GGA-TT---AA-TT-T-AGACTTTTTAA
gi|1 : CTTAGTCCGTGTCCTCCTGTCTCG--GCCGATACTAACTCTGTCTCGCCCACCTCAC-GGCGCCAGT-ACACCTAACATAC--GACTC----CACGATTCCG--GACAC-TAA-C--AC-ACT-GTCCATCCTGATGATTCCTTCACTCTCGTAAACT
gi|1 : --GGGCACGTAGCCGCATTCTTGGCGCTCTTTCTCGCCATCTTAGAAATCGAATAGGCACGACCTCCTTTAATATTCTACT-CTTGTAAAACAGCGCTCTTGTAAGGATTGATCTCACAGCGA---TGGGACTTTGTCGTTTAGCTTTTTGATGATTTGGGAA-TTTCTAAAACTTTTTTC---TACTGCTATGAGGTC--GGCTTCTATGA-TTGGACAGGTTCAG-G-TTATTTTTGATTATTTGGAAAACTTCT-GCATTTTTAG----GA-TTATGTGTTGAAAAATATGGTATGACATAAATTT-TG-GATTTATTTTTCACC--TTAAGGAG--------GTCCTTTCTTTCATGTGATTTTGCTTTGTTAAATC-CATTT-TCAATTAA-TTTTTTAGGG-TAGCGTCTTTG-CAGAAGTAAT---TTCTCTAATTCTGCGAGACGAATATTTAGAATTTTAGTGTCTGATATTATT--GTACAAAGA--CG-TCTTG-CTAA-ATTATATGGAATA--TTATTTCT-G-GTATG--TTTA---GGG-TGGCACG-AA--TC------A-AATAATAAGTATAG---CT----TGGT------ATCCGTT--ATT-ATG-TAGAAAA--TATCG-GTTA-----TAATGTTA-CT-------TTCTTT--TTTCA------TCACC-ATCACGTCAAG----TAA-TG-------CTA---GCT--GATTAT----TTC--TATCCGATTC-C-ATTG---------TAAATATAA-TTGTAGGGCTCAGA------GAGTTTTT-AATATC-AAACAA--T-TGTTTCAGTTGATCTTCACCTTTGTCC----------------CA-AAT------GATAAA--ACAGTCGT--CTAAATAGCGTTTCCA--TGAT-GT-TC--T---AATGAACGTTT-----CAAAA-----GTTTGTC----CGAACTTTTCCTT--AACAACAGAGTA--CAA-------TT-TTTCTTCT-AAAAAT--CCT------TA--CACGAGTGTTGCAT-AAGTCGGCG--CAATTTTAGTT-CCCATC-GC---AGTACCTAAC-----TTTTGTC--TGTAA-A-ATATTTCA---TT-GACATGC-----ATAAAA--TTGTTCTCTA-GGA-TT---AACCT-T-AGACTTTTTAActcctagcctcccccgtccctttctcgaaaacactcacacgtcagcccaccccttccgtcgtcctcatcccgccctcaacccgccgggcacgtagccgcattcttggcgctctttctcgccatcttagaaatcgaataggcacgacctcctttaatattctactcttgtaaaacagcgctcttgtaaggattgatctcacagcgatgggactttgtcgtttagctttttgatgatttgggaatttctaaaacttttttctactgctatgaggtcggcttctatgattggacaggttcaggttatttttgattatttggaaaacttctgcatttttaggattatgtgttgaaaaatatggtatgacataaattttggatttatttttcaccttaaggaggtcctttctttcatgtgattttgctttgttaaatccattttcaattaattttttagggtagcgtctttgcagaagtaatttctctaattctgcgagacgaatatttagaattttagtgtctgatattattgtacaaagacgtcttgctaaattatatggaatattatttctggtatgtttagggtggcacgaatcaaataataagtatagcttggtatccgttattatgtagaaaatatcggttataatgttactttcttttttcatcaccatcacgtcaagtaatgctagctgattatttctatccgattccattgtaaatataattgtagggctcagagagtttttaatatcaaacaattgtttcagttgatcttcacctttgtcccaaatgataaaacagtcgtctaaatagcgtttccatgatgttctaatgaacgtttcaaaagtttgtccgaacttttccttaacaacagagtacaatttttcttctaaaaatccttacacgagtgttgcataagtcggcgcaattttagttcccatcgcagtacctaacttttgtctgtaaaatatttcattgacatgcataaaattgttctctaggattaaccttagactttttaaaaaaaattatttaagaaatctatcatttaaaagatttgaaatctgtctatccaatgttctatggcggctaatcctagttcatgtggaatattagagtagaggttagtaacatcgaatgacactaaaattgattccgtgttgactttttcgggaagagtgtttagaaaatctatcgtatctcttatgtaactttga
gi|10 : cttagtccgtgtcctcctgtctcggccgatactaactctgtctcgcccacctcacggcgccagtacacctaacatacgactccacgattccggacactaacacactgtccatcctgatgattccttcactctcgtaaactctcctagcctcccccgtccctttctcgaaaacactcacacgtcagcccaccccttccgtcgtcctcatcccgccctcaacccgccTCCTTTCTTTCATGTGATTTTGCTTTGTTAATTCACTTTTCTCAATTAA-GTTTCTAGGG-TAG-GTCTTTGGCAGAAGTAAT---TTCTCTAATTCCGCGAGACGAAATTTTAGAAATTATGTGTCTGATATTATT--GTA-AAAGA--CGATCTTGTCTAATTTTATATGGAATATGTTATTTCT-G-GTATAGTTTTA---GGGTTGGCACGCCA--TC------A-AATAATAAATATTG---CTATG-TGG--------TCCGTT--ATTGTCG-TAGTAGATTTATCG-G-TATTATTCAATGTTATCT-------TTCTTTTATTTCATACTACTCATT-ACAACGTCAAG----GAA-TG-------ATAAAGGCTTGA---AT----TTCTATATCCGATTCAC-ATTG---------TAAGTTTCATTGGTAGG--T--AA------GCGTTTGA-AAT-TC-AAGAAA--T-TGTTTTAGTTGATCTTCACCTTTGTCCAATGTCTATATTTAGGCAGAATTCATCCAATGAATAAAAGTCGT--CTAAATAGCG-TTCCA--TGAT-GT-TC--T---AATAAAAGTTTACACATAAAG-----TTTTGTCACCATAAACTTTaaaaaattatttaagaaatctatcatttaaaagatttgaaatctgtctatccaatgttctatggcggctaatcctagttcatgtggaatattagagtagaggttagtaacatcgaatgacactaaaattgattccgtgttgactttttcgggaagagtgtttagaaaatctatcgtatctcttatgtaactttga
gi|13 : -TTTTGGTACAT-TTTCTAA-TTTG----TTGGTTTACATGGTTATACTGATATTT-AGTTTCTCGA-ATCTG--TTATCA-GTGAACAA-TTATGCGGT
gi|14 : gaatttatgaaattgaagagacgcgtaaaaaaattcccgcgacattttccctcttattggggcaaccactttgtcacaagaatgttgaaatgaaggcgacaggtggcacgagcaatcgtagagcagttggcctcacgttcgtaatcaacgttcgaatgtgctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacagttgatgtcaacagtgattccgtctctattccatggattatttcgtgATTGATTT-G-AGAGA---AGA-GTTTTGTCGATTA--ATTTTAAT-------------TCCAATATTCTTTTCATTTGATGATCTT---------CTTCAAAGA--TAAG-------GGAG-TTACATGT-ATTATC--GATAACCT-----------------GA-C--------AAAACTTATAGA-TTACGCAA-CGTATGTGGTTTACTT---------TAAGAAG--------ACCCTGGCTTT-----GATTAT--TTCATTAATTG-CACTT------------------GT-TAGCGTCTTT----GAAGTGGCTTATTCTTTAATTCCGACAAACGGCTGTTTAGGATtga
gi|16 : caaggtgctaagtttggcaatgcgttgcacctgcttttattacgtttccagacgataagggtttcattgttcctactggggaaaataGCTTTGTTAATTC-CATTT-TCAATTAA-TTTTATAGGA-TAGCGTCCTTG-CAGAAGTAAT---CTCTCTAATTCCGCGAGACGAATATTCAGAATTTTAGTGTCTAATATTATT--GTACAAAGA--CG-TCTTG-CTAA-ATTATATGGAATA--TCATTTCT-G-GTATG--TTTA---GGG-TGGCACG-AA--TC------A-AATAAAAAGTATTG---CT----TGGT------ATCCGTT--ATT-TTG-TAGAAGA--TATCGTT-TA-----CAATGTTA-TT-------TTCTTT--TTTCA------TCACC-ATCACGTCAAG----GAA-TG-------CTA---GTT--G---AT----TTC--TATCCGATTT-C-TTTG---------TAA
gi|17 : CATCTTTTGGCGCAA-TT-CGGA-TGTG----TTCGCTTACA-GGGTACACTGATATTT-AGGTTCTCGG-ATCTG--TTGTCGTGTGAACGGTTCATGCGGTGTCTTAGT--GTGTC-TCCTGTCT----GCCGATA-TAA-T---TTTCG-CCACATC-C-GGCGCAGGTAA-A--TAACATA----A--T----CA-GATT--G--GA-AC-TAA-C--AC-A-TAGT-CAT--TGATGAT---TTTACT---GTAAATTTACTGCCGTTTTTGAAAATAAAG-----T-CGGACCC
gi|18 : ttttctgttgtgtctttatgaaatttataaaatagaaaaccggtaaaattggataaa-TTTTGGCGCAA-TTGC-GA-TGTGT---TTCGCTTACATGGGTACACTGATATTT-AGGTTCTCGG-ATCTG--TTGTCG-GTGAACGG-TCATGCGGTGTCTTAGT--GTGTC-TCCTGTCT-G--GCCGAT--TAAAT---TTTCG-CCACATC-C-GGCGCAGGT-A-A--TAACATA---GA--C----TA-GATT--G--GA-AC-TAA-C--ACAA-T-GT-CAT--TGATGAT---TTTACT---GTAAATTTACTGCCGTTTTTGAAAATAAAG-----T-CGGACCCt
gi|2 : tttttctgttgtgtctttatgaaatttataaaatagaaaaacggtaaaatttggataaacaATGAATTA--TTATTTTT-TTGTATG--TTTTTTTGGG-TGACAGG-AA--CCCCTTTTA-AACA-TAGTTATGGGCCCT----TGGTTAAACAATCTGGTCAATT-TTGGTAAAAAA--CACCG---TC-----CCTGGTTA-CTAATGCGGTTGTCTC-TTTAA------TAACCCATGACATCAAG----GAA-AAACAAGACCCA---GCC--A---ATATTTTCC--TATTGGACTC-CCATGGGTAAAAAAATAAAT--CA-AGGTAGGACT----------ACGT--------ATTGAAAAGG--T-CCCCT--------CTTT-CCTCTGTCC-----------------A-AAT-------ATAAA--AT---CATAACAAAATCGTGTTCCCGGCTGG--GT-TT--TTTAAAAAAAAACCT-----CAAAAAGTTTTTTTGTC----CCAAATGTTTCTTCGAACTGTAAAGAAATTAAAATTATTTT-TCTCTTCC-AAATATTCCCT------AA--AACTAATGTCGCATAAAGTTGGGGGCCAACATTGGTTCCCCAT--GCATAAGTGGCT-ACTCCCTTTTTGTCCTTGTAATA-AAGTTTCA---TTCAAAATGCCCCAAATGAAGTTTTGTTTTCCA-AGT-TTAAAAA-TT-TAAGACTT
gi|20 : aaAT-TTTTGGCACAG-CATCCAACTGTG----TCCACAGAC-TGGG-------ATATTT--GGTTCTTTC-ATTTG--TTTACG-ATGTACAA-CCATTCTGTATCGTAGA--GCGTC-GATTGTCT-G--GCCGATA-TAA-T---TCTCG-CAACAGT-C-TGTGCAAGT-T-A--TTGCCTA---CA--TTGTACA-AGTT--GTTGG-GC-AAAGT--GC-A-C-GT-AAT--AAATGTT---TTCAAT---ATAAATTGACT-TCATTTTTTTAAATGAAA-----TACAGACgaaatatgaaccgaattcttttaaggaatctctcgtgtaaaagatgaaaaaaggaaaaacggtccctaatccaatattcagtggcggccccctagtcccccgaggtccaaaaaagatgagaatatttgaaaaatagagggtttcgtggcaaatcaaaatggaggaaaaacctaataatggattcccgaagtttaaaatttcccctctggagtgattagaaaagtccccttacgggttgggggttcctcttgatgtaacctttgaaacctttggtgatgaaatgtttccacaaatccatctaagaagataacttaaaatccttgtgggtttttttccgccaggtggtccccgccaacaaatgggttttcccttaaattttttttaaaaagattcatcttggacattcaatacaaatttaattaaatgttttggattccgaaaaattttacattttggggtcgtttaatggattttgaccctttttttttaatgttatttttttttggtaaaaaaccataaaaggttacttgttttttccacattaaaaatcattcaaaaaggtaagattttttcctttgggatttggtaagttttaatctcccgtgattcgttatgatttttttcaagttttttttgccaagaccttttttagagttcatacgattttcctgtttttcctcgtaagtaaaatggtaactgtttctctagcacgggcaaaagaacataatttgaatttgggtaataa
gi|21 : aaaaatgcagacagag-TTTCTTCT-AAAACT--CAT------AAGAAACATATGTTGCAC-GCGGCGACG--CAACTTTGGTT-ACCATT-GT---AATGCCTAAC-----TTTTGTC--TATAA-A-AAATTTCA---TT-AAAATGG-----ATACAA--TTGTTCTCGA-GAA-AT---AA-T
gi|22 : ATTTTGCTT-CCTATC-GC---AGGGGCCAGC-----ATTCGTT--TGTGA-A-ACATTTCA---TT--AAGTGC-----ATAAAA--TTGTTTTCCA-AGA------AA-TT-cgttaacattgaaaaacaaagtcgttggggaatcagtcatgtgaatacatgattatctatccaatgctcttctttgattaatcctagatcttgtgaaatgcta
gi|23 : ------AA--AAAGAGTGTTCCAC-AGGTCTGCA--CACCTTTGGAT-CTCATC-CC---AGTACCTAAC-----TTTTGTA--TATGA-A-TCATATCATTTTT-AAAATGA-----ATGAAA--Tggtacacccgatgctaacaaataagggaaaaaatctcacttgttgaagattaggaacatcagtcatatccattattctactggcggcaatcctagattatgaggaatactagtaatggattgggtt
gi|24 : cAAC-GCAT-TTTGG-----TTTGTTGC-AT-TTCGTGAT--GATGGG-AGG--TT------ATATGATATTACTGGTAAGACAA-GCTCTTGCAGGGATTGATTT-A-AGCGAAATCAG---TTTGTCGTTTA--CTTTTCATGATTTGGGA--------------TTTTC-----ATG-TCTG-GCCT--GGTTTTTAAGAC-TGAA-------AG-G-TTATCTTTGATGATTTGAAAAACCTC--caactgtagacaattgaaaataaattcctaggaaatctgtcatgcataagacttttttacgcaatgatctacggtgactaatctatatcatatggaaaattcagatta
gi|25 : aT-TTTTGATGCAA-TTTGTAA-TGTG----TTCGCTTACAT----ATATGGATATTT-ACGTTCTCAG-ATCTG--TTGTTG-GTGAACAG-T
gi|27 : ttttttctgttgcgtctttatagaaagcagaaacccgactataaataaaattttcttaatctgaatgagttggaaaaatgttagaactcggattaatg-TTTTAGTGCAA-CTTCTAG-TGTG----TTCGCGTACATGGGAACACTGATAATA-TGGTTTTCGG-GTCTG--TTGTCG-TAGAACGT-TCATGTAGT
gi|29 : ttgtaaattgaaaaagcattataattcggcataataTTG---------TAAATTTCA-TCGTCAGGCTCAGA------GAGTTTAG-AATATCAAAA-AA--T-TGTTTTAGCTGATCTTCACTTTTGTCC----------------CA-AAT------GATAAA--ACAGTCGT--CTAAATAGCGTTTCCA--TGAT-GT-TC--T---AATAAAAGTTT-----CAAAtactataatttgcacatgacaagggacagtgacatcctacaggc
gi|3 : CAT-TTTTGGCGCAA-TTCCGGA-TATG----TTCGCTTACATGGGTACACCGATATTT-AGGTTCTCGG-ATCTG--TTGTCG-GTGAACGG-TCATGCGGTATCTTAGT--GTGTC-TCCTGTCT-G--GGCGATA-TAA-T---TTTCA-CCACATA-C-GGCGCAGGT-A-A--TAACATA---GA--T----CA-GATT--G--GA-AC-TAA-C--AC-A-T-GC-CAT--TGATGAT---TTTACT---GTAAATTTACTGCCGTTTTTGAAAACAAAG-----T-CGGACCCTTGTGATAAATATAAGGGCACGTAGC-GCAT-CTTGG-----TTAGCTGC-AT-TTAGAAAT--GATAGG-AGA--CTCTTTAAATAAAATATTACTAGTAAAACAG-GCTCTTGTAAGGATGGATTT-A-AGCGA---TGG-ACTTTGCCGTTTA--CTTTTGATGATTTGGGAATTTTCTAAAACTTTTTTT---TTATG-TATG-GGTC--GGCTTCTATGATTTGGA-------AG-G-TTATGTTTGATTATTTGGAAAACTTCTGGCATGGATTTTTGGGA-TTATTTGTTGAAACGTATGGTATGACACAATTTT-TG-GATTTATTTTTCACC--TTAAGGAG--------GTCCTTTCTTTCATGTGATTTTGCTTTGTTAATTC-CATTT-TCAATTAATTTTTTTAGGGTTGGCTTC-TTG-GAGGAGTTAT---TTCTCTAATTCCGCGAGACGAATATTTAGAATTTCAGTGTCTGATATTATT--GTACAAAGA--CT-TCTTG-CTAA-ATTATATGGAATA--TTGTTTCT-G-GTATG--TTTA---GGG-TGGCACA-AA--TC------A-AATAATAGATATTG---CTTCCATGGT------ATCCGTT--ATT-TTG-TAGAAGA--TATCG-G--A------AATGTTA-CT-------TTCTTT--TTTCC------TCACC-ATAACGTCAAG----GAA-TG-------CTA---GCC--A---AT----TTC--TATCCGATTC-C-ATTG---------TAAATTTCA-TAGTGGGGCTCAGG------GAGTTTAG-AATATCAAACAAA--T-TGTTTTAGTTGATCTCCACCTTTGTCC----------------CA-AAT------GATAAA--ACAGTCGT--CTAAATAGCGTTTCCA--TGAT-GT-TC--T---AATAAAAGTTT-----CAAAG-----TTTTGTC----CGAACTTTTCCTT--GACAACAGAGTA--CAA-------GT-GTTCTTCT-AAAAAT--CCT------AA--GACGAGTGTTGCAT-AAGTCGGCG--CAACTTTAGTT-CTCATC-GC---AGTACCTAAT-----TTTTGTC--TGTAA-A-CCATTTCA---TT-GAAATGCA----ATAAAA--TGTTTCTCTATGGA-TT---AA-TT-T-AGACTTTTTAAtatatatatatcacgcatactgt
gi|30 : TTCGTGCAA-TTTCGGA-TGTG----TTCGCTTACATTGATAGGCTTATATTC-ATGTCCTTGG-ATCTG--TTGTCA-GTGA
gi|32 : gtttttctgttgtctttacaaaataaaataaaagtggaagaacggtaaaattcggattaatatgT-A-A--CAACATATAAAA--C----AA-GATT--G--GG-AC-TAA-CCTAT-A-T-GT-CAA--TGAC-AT---TTCACT---GTAGATTTACTTTC--TTTT-AAAAGAAAGATTCATGCAGACTCATGTGTTTAGTAT--GGACACGTAAC-ACGT-CTTGGA----TTTACT
gi|35 : TATTG---CT----TGGT------ATACGTT--ATT-TTG-TAGAAGA--CATCG-GTTA-----CAATTTTA-CT-------TTCTTT--ATTCA------TCACC-ATCACGTCAAGTAATTAA-TG-------TTA---GCT--G---AT----TTC--TATCCGATTC-C-ATTG---------TAA
gi|36 : AT---CTTTCTAATTCCGCAAGAAGAATGTCAATAAATTTTGTGC---ATTTTGTTAAGTTTAAAGA--CG-TCTAG-CTAA-ATTATATTCAATA--TTATTTCT-A-GTCTG--TTAA---AAG-TG
gi|37 : TTTAGAATTTTTGTGTCTGATATTATT--GTACAAAGA--CG-TATTC-CTAA-ATTATATGGAATA--TTATTTTT-G-GCATG--CTTA---GGG-TGGCACG-AA--TA------G-AATAGTTAGTATTG---TT----TGGttattgca
gi|38 : A-TGTG----TTAGCTTACATGGGTACACTGATAGTT-GGGTCCTC----------TTGTCG-ATGAACGG-TCATGCGGT
gi|39 : tctataA-TGTG----TTAGCTTACATGGGTACACTGATAGTT-GGGTCCTC----------TTGTCG-ATGAACGG-TCATGCGGTttgtatgtgatgatttaaggattagtgacaacctataggca
gi|4 : taA--CAA-------TT-TTTCTTCT-AATAAT--CCT------AA--GACGAGTGTTGCAT-AAGTCGGCG--TAACTTTAGTT-CCCATC-GC---AGTACCTAAC-----TTTTGTC--TGTAA-A-CCATTTCA---TT-GAAATGC-----ATAGAA--TTG-TCTCTA-GGA-TT---AATTT-T-AGACTTTTTAAttgtatgtgatgatttaaggattagtgacaacctataggc
gi|40 : CAT-TTTTGGCGCAA-TTTCGGA-TGTGTTAATTTGCTTACATGGGTACACTGATaacaaaattctttaggaaatctatcatttaaaagatttggaaatctgtctatccaatgttctgtgcggctatcttagtttatgtggaatattagagtagaggttagtaacatcgaatgacattaaaattgattccgtgttgactttttcgggaagagtgtttagaaaatctatcgtatctcttatgtaactttgaactttaataatacatttaatagataactaattctgtgagtttcacatgacggtcccgcaactataggtctgattttgaggtctgttgggctttcaacacttacatgtacatgtagtaatgatgaatgcggaatttttgcatttatcgttaatgacttgtttttgtgtatttgggtaagccataaaaattactggttttgacattaaacgagagtaggaatcagtttctttggggtaagttcttccgtgttcatcaacaattgtttcgagttttttcatgacttctttagcatcatatgttgccttttttcatagtattactgtcctctaacatagaaaggcacattgatttataataatcgcagtccattataacaacttattac
gi|41 : gttgtgtctttatgaaatttataaaatggaaaaatggtaaaatttggataaaCCTGTCT-ACAGCCGATA-TAATT---TTTTC-CCACATC-CGGGCGCAGGT-A-A--TAACATA---GAT-T----CA-GATT--G--GA-ACATAA-C--AC-A-T-GT-CATC-TGATTAT---TTTA
gi|42 : CCTGTCT-ACAGCCGATA-TAATT---TTTTC-CCACATC-CGGGCGCAGGT-A-A--TAACATA---GAT-T----CA-GATT--G--GA-ACATAA-C--AC-A-T-GT-CATC-TGATTAT---TTTA
gi|43 : CAT-TTTGGGCGCAAATTTCG-A-TGTG----TTCGCCT
gi|44 : ttttctttgtgtctttatgagaatttataaaatggaaaaacggtaaaatttggaaaaCCTTTCTCC----------------CA-TGT------GATGTC--GCAGCCAT--CTGAATAGCATTCCCA--CGAT-GT-CC--T---AAGAAAATTGT-----AGAAG-----TTTTGTC----TGAATTTTTTC
gi|46 : gACTGATGTTT-AGGTTCTCGG-ATCTG--TTATCG-GTGAATGA-TCA-ACGATA---TAAT--GTGAC-T
gi|47 : AT-TTTTGGCGCAA-TT-CGGA-TGTG----TTCGCTTACATGAGTACACTGATATgcagcgatctgagacaacat
gi|48 : tggaaaaacggtaaaatttggattaatGTGACTTTGCTTTGTTAATTC-CATTT-TCTATTAA-TATCTTAGGA-CAACGTATCTA-TCGGAGCAAT---
gi|49 : AT-TTTTTATGCAG-TTTCTAA-TGTG----TTCACTTATATGGGTACACTCATA
gi|5 : gtaagattcggattTCT-AAGAAT--CCTTTAGAGAA--AAAGAGTGTTGCAT-AAGTCGGCT--TAACTT-AGTT-CCCATC-GC---CATGCCTTAC-----TGTTATC--TATAA-A-CCTTTTCA---TT-AAAATGC-----TTGAAA--TTGTTCT-TA-AAATTT---AA-TCGT-AAACGTTTTAA
gi|51 : GATATTT-AGGTAC-CGGCATCTGTTTTGTCG-ATGAACAG-TC-TGCGGTGaataaattctttttcaagtctgtcatgcaaaagatcaggaaatatatctatccaatgttccatgacgactaatcctagatcttgtggaatgttagtaaatgaagctaaattgatcctgtgttgactttctcgggaattgtggttagaaaatccaccgtatctcttatgtatctttgaacatttataaatgtgatatgttctgataatacgtctaatagattacttattctgtaagtttcacatgttggtcccgcaactatgggtctgaatttgaggtctgctgggctttaaacactaatttatatacgatgattcggaagttttgcatttatcgtttatgacatggcttttatatatttaaggcaagcatagaaattaaaagtactggttttgattctaaacgagagtaggtatttggtctcattagccgtaattttcttagtgtgttcatcgatacttgtttcgagattttgctttttcgcatagtattcactattttctaacagaaataagctagatttgtaataatcgcgatctattataactactatgctacctttatcggtttccttaatgatgatggt
gi|54 : TT--GTACAAAGA--CG-ACTTG-C-AA-ATTATATGGAATA--T
gi|6 : CAT-TTTTGGGGCAA-TTTCGGA-TGTG----TTCGCTTACATGAGTACACTGATTTTTTAGGTTCTCGG-ATCTG--TTGTCG-GTGAACGG-TCATGTGGTGTCTTAGT--ATG
gi|7 : gtataaaaaaaatatttgaaggccgaattgattacgtcgactagtttctacaattctattaagagtattaatgaacattgtagttacagcaaaatacacagcaatttattcacaacgtgataaagaaaagctaccaagtgattgttaacaagctttaagaaaaaaaggttcatgtgttagacgtctatatgtaacgttgggaaaataatacgaggataagattttacatattacaataaaaacgtaggaactgtatttctgattttaaacattctaatttgcatgtttatctagatatgaatttatcaattctgagaaagaaaaaacaataaaattcggattgtttaactctcattgagaatgcctttctccaaatgagatgtaagttgaacgcacataaatgtctctgtcagatatttatgaattatgaaaaacagtaaaagtccgaagatattttaccctcattgagaatcccttgtcccaaaatgagataggaagttgaaagggcaggtgtgcaatcgatagcatcatagaagttgtcgtgcaacagtcgacttatatatttattcaaatttataaaattgaaaaacggtaaaatttggatataTTTATC----CATG-TCTA-GGCCCTGGGTTTTAAGACTTGAA-------AA-GATTATTTTTGAATGTTTGGAAAACCCC--AC------------GATTTATTTGTTAAAAC-TATTAT-TTACACAA-TAT-----ACTTA--TGTCAACGGTTAA-AAGATGTTTCTGTCCTTTCTTACGGATAATTGAGATTTTTTAA
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gi|8 : tgatttgagatttatccatgtctaggccctgggttttaagacttgaaaagattatttttgaatgtttggaaaaccccacgatttatttgttaaaactattatttacacaatatacttatgtcaacggttaaaagatgtttctgtcctttcttacggataattgagattttttaaaATG-TCTA-GGCCT-GGGTT-TAAGACTTGAA-------AA-G-T-ATTTTTGAATGTTTGGAAAACCCC--AC------------GA-TTATTTGTTAAAACTTAT-AT-TTACACAA-TAT-----ACTTA-TTGTCAACGGTTAA-AAG--------ATGTTTTCTTTCg
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15 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|12 ): ATTATATATTCCAAAAGATTAAAAATCCACACAAGTAGTACAGTAATAAATAAAAATATTAGAAGGCCGATGAGTATACTCGAACTCAGTTTTCTCCAATCCCTTCAGGATATAATGAACATTGCTAGAATACATAAATCAGCAGTATTCAAAGTGATATGAAAGCCCCAATGAAATTGTTACGCTTTGATAAAGTTCATTTATTTATTACATGATAATGTAACGTTGGGAAAATAATATGGGAAAATTTTACTTTTACATAAAAACGGGAACTTATATATATGATTTAGCATTCTATTTTTGTTGTGTATATGTAGAATATATTAATTTGAAAAACGATAAAATTTGGATTTTTACTCTCATTGAGAATCCTTGTCCCAAATATTAGAAGGTCGATTGAGTATACATGTACATGTACATATATATGTAAGAAA
Unaligned ( gi|15 ): ATATATAATTCATAATCAATTAAAATATTTGAAGGCCATTGAGTCTATATACTTCGACTAGTTGTTCAATTCTTCAGGACTATAATGACATTGCTAGTTTACATTGTAAAATACAAGTATTTAAAGTGATATGAAAAAGCGCCAATGATTGTTACGCTTTATTAAGTTATGTTACGTCACATGTAACGTTGGGAAATTATATGGGAATTTTACATTACATAAAAAACGGGAACTTTTATCAATTAACATTCTTTTCTGTGTATCTGAGAATTTTATATTGAAAAAAAAATTTATGGTACTTTATTTACTTT
Unaligned ( gi|19 ): ACATTTTTTTCTATTCGACACGGTTTGCCACTAACACGCTTCGCCGCACCCCTTCGTTCCCAATCCGCCATCACCCTCAAACCTTTTTGTCTGCTACCCTATGCATTCATTGGAGAAATGCCATAAGCCCTTGTTATCTCGTACACGGATTACAATTTTAGCTTGTATAATAACACAAATTCTTTCACGAGATCTATTCGGTATTAAAAAAAGAATTTGAGAAATCAGATCTTACAATGTTCTATGGCGGCTATCTAGTTCTGTTGGAAAACTATTAGAGTAGA
Unaligned ( gi|26 ): ATGTAATATTCATGGTTACACAAATACACTTCTATTTCAAAGTGATATGAAAAGCGCCAATGAATCGAACACATTACGCTTCGATAAAATTCAATGTTACGTCATAATGTAACGTTGGGAAAATAGTACGGGGAAATTTTAGTTTTACATAAAAACTGGAACTTGTATA
Unaligned ( gi|28 ): TTTAATGAACATTGATAGGATATATACATGTATATACCGTGATTTTTAAGTGAGTGATATCAAATAGCACCAATAAAATATTACGTTTTGATAAAGTTCTCTATTACGTCATAATATAAGTCGATAATAATTATAGTACGAGAAAATTAACCTTCTTATCATT
Unaligned ( gi|31 ): ATATTATAATATATTCCACAATTAGATTAAGGTATTCTAGAAAAATTCACACAAGTAAGTAGTTTCTAATAAAATTTTGAATGGCCCGATTTGAGGATATACTCGACTATGTTTCTCTAACCAATTCCGTTCAGGA
Unaligned ( gi|33 ): AAATGCCTGAAAGCCGATTGAGTATACTCGACAAGTTTCTATAATTCTTTAGGTGCCCGTTTCACAATACAGGAGTATAATTAACATTGCTAGGTTACACATTTACACAGTGATTTCAAAGTGATATCAAAAAG
Unaligned ( gi|34 ): AGGTATTTAAAATCCCGACACAAGTAGTAGCTATAACTAAATTATTGGAAGGCCCGATTAGTTACCGACTAGTTTCTACCTACAATTCTTCAGGAGTATAATGAACATTTAATATATATATAT
Unaligned ( gi|45 ): CCCTACACACAAATATATATAATAAAAATATTAGAAGGCCGATTGAGTATACTCGACTAGTTTCTACAATTCTTCAGGG
Unaligned ( gi|50 ): ATACACATATTATATATATTAGTATAAAAATATTAGAAGGCCGTTGAGTATAC
Unaligned ( gi|52 ): TATCACACAGCCGACTGAGTATACTCGACTAGTTTCTGTAA
Unaligned ( gi|53 ): ATATATATAATAAGAATACCAGAAGGCCGATTGTAGTAT
Unaligned ( gi|55 ): CGATCGAGTATATTCGACTAGTTTCTACATTTCT