lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333
lowQualScore : 1 2 2 1 2 33 22 3333 33 1 2 6666666666666666666666666666666666666666666 1 1 666666666 1 3333333333 2222 22 2 33333 1 1 11 11 66666 11 111 11 33 22 22 1 333333333 11 1 33 3333 1 1 222222 11 4444444444444 111 3333 11 11 1111 11 1 22222 2222 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2222222222222222 11 22222222 1111 5555555555 11 222 11 11111111 11 11 11111 1111 1 111 22222 1 888888888888888888888888888888888888888888888888888 1 111111 1111 222 22 2 2 1 1 33333333 2222 22222 11 1 11 222 1 2 11 1 33 222 333 11 1 2222 11 11 11 4444444 1 1 33333 11 33333333333333 1 111 2222 2 11111 11 1 11 1 11 1 444 222 11 11 111 11 1 222 2222 5555555555 222222 11 5555555555555 1 44444444 222 111111 1 1 1 555555555555555 1 1 55 222 1 3 222 222 6666666666666666666666 111 1 222 1 3333333333 1 11 1 222222 1 3333 44 222 1 1 555555 222 1 888888888888888888888888888888 222 2 2222 2 2 2 66666666 1 333 5555555555555555555555 22222 3333 666666666666 1 11111 1 555555555555555 444444444444444444444 2222222 22222222 11 11 4444444 11 33333333333 11111 111 11 444444 1 1 1 22 11 1 2 11 5555555555 1 1 111 1 222 1 11 2 1 11 111 4 1 1 444444 1 1 1 1 2 1 9999999999999999999999999999999999999999999999999 3333333 11 2222222 888888888888888888888888888888888888888888888888 2222222 222 2222 1 1 111 11 111 11 11 111111111111111111111111111111111111111111111111111 333333333 111111 1 1111111 111 11 22222 1 111 1111 1111 1 11 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 11111 111 33333333333 1111 11111 33333333333333333333333333333333333333333 1111 111 1111 4444444444 22222222 111 33333333 4444444 11 11 33333 22222 11 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 22222 11 333333333333 11 11 2222 1 22222 11111111111 99999999999999999999999999999999999999999999999 11 11 2222222 1111111111 11111 44444444444444444444444444 11 11 11111 11111 111 111111 111 1 111 222222 111111 1 333333333333333333333
lowQualScore : 3 5 0 0 5 0 55 66 9999 55 5 7 3 3333333333333333333333333333333333333333333 6 4 3 666666666 3 3333333333 7777 33 7 7 6 1 7 88888 5 3 88 88 22222 88 777 88 11 00 22 3 8888 888888888 7 6 88 3 00 7 6 1111 0 0 222222 33 3333333333333 6 111 6 6666 6 999999 55 22 1111 1 5 88 5 77 44 77 0 22222 1 3 5 1111 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 5 66 4444444444444444 0 88 77 0 77777777 1111 5 1 1111111111 33 000 11 6 5 66666666 0 5 00 22 99999999999 66 999 6 4 5 44444 4 2 5555 66 0 5 7 99 6 666 11111 3 1 2 2 6 222222222222222222222222222222222222222222222222222 0 3 3 8 2 0 000000 0 2222 000 99 4 0 55 2 0 0 0 0 3 22 55555555 0000 55 0 44444 33 666 0 4 33 333 3 3 77 6 3 44 6 777 6 000 88 3 7 9999 88 7 7 6 33 11 0 1111111 0 0 44444 33 00000000000000 2 0 777 0000 22 0 44444 2 22 6 0 2 22 3 3 0 6 9 22 2 2 0 3 111 000 33 2 3 33 777 2 33 0 333 1111 3333333333 6 111111 88 1111111111111 66 0 22222222 2 3 3 3 222 888888 2 0 2 0 0 999999999999999 0 0 0 0 55 3 2 333 5 6 1 444 444 6666666666666666666666 444 7 3 333 3 4 2 4444444444 5 6 6 88 0 5 888888 3 5555 77 7 999 3 2 3 99 777777 111 0 777777777777777777777777777777 111 3 4444 0 0 0 00000000 5 4 111 1111111111111111111111 66666 2222 666666666666 3 44444 0 666666666666666 2 3 222222222222222222222 9999999 99 8 33333333 33 8 44 22 88 5555555 33 2 3 99999999999 2 33333 8 444 11 000000 8 8 6 8 0 5 11 7 44 3 6 7 88 1 3333333333 3 7 3 3 3 6 666 6 3 000 6 3 44 6 6 7 7 99 9 999 7 6 0 7 3 2 6 555555 7 7 2 3 3 3 6 6 3 2 8888888888888888888888888888888888888888888888888 4444444 88 6 6666666 6 333333333333333333333333333333333333333333333333 1111111 3 777 8888 33 3 6 5 88 4 555 8 3 8 8 6 0 11 888 00 6 7 33 6 6 4 1 555555555555555555555555555555555555555555555555555 555555555 6 666666 0 8 6666666 8 8 8 8 8 999 0 8 11 00000 8 6 444 7777 7777 2 6 88 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 00000 6 333 7 55555555555 5555 77 3 66666 77777777777777777777777777777777777777777 1 44 7777 7 000 77 2222 0000000000 77 77 00000000 5 000 5 3 77 5 5 66666666 77 5555555 5 33 77 7 999 55 77 00000 88888 77 55 5 5 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 88888 0 55 777777777777 00 99 5 0000 5 5 2 0 1 88888 5 5 66666666666 33333333333333333333333333333333333333333333333 33 88 4 4 8888888 66 55 777 8 4 4 4 4 4 4 66 4 9999999999 11111 4 4 0 00000000000000000000000000 66 777 1 66 777 00 00 11111 888888 77777 5 555 5 77 222222 000 0 88 1 000 333333 999999 77 3 6 999999999999999999999 77 99
lowQualScore : . . . . . . .. .. .... .. . . . ........................................... . . . ......... . .......... .... .. . . . . . ..... . . .. .. ..... .. ... .. .. .. .. . .... ......... . . .. . .. . . .... . . ...... .. ............. . ... . .... . ...... .. .. .... . . .. . .. .. .. . ..... . . . .... ...................................................................................................................... . .. ................ . .. .. . ........ .... . . .......... .. ... .. . . ........ . . .. .. ........... .. ... . . . ..... . . .... .. . . . .. . ... ..... . . . . . ................................................... . . . . . . ...... . .... ... .. . . .. . . . . . . .. ........ .... .. . ..... .. ... . . .. ... . . .. . . .. . ... . ... .. . . .... .. . . . .. .. . ....... . . ..... .. .............. . . ... .... .. . ..... . .. . . . .. . . . . . .. . . . . ... ... .. . . .. ... . .. . ... .... .......... . ...... .. ............. .. . ........ . . . . ... ...... . . . . . ............... . . . . .. . . ... . . . ... ... ...................... ... . . ... . . . .......... . . . .. . . ...... . .... .. . ... . . . .. ...... ... . .............................. ... . .... . . . ........ . . ... ...................... ..... .... ............ . ..... . ............... . . ..................... ....... .. . ........ .. . .. .. .. ....... .. . . ........... . ..... . ... .. ...... . . . . . . .. . .. . . . .. . .......... . . . . . . ... . . ... . . .. . . . . .. . ... . . . . . . . ...... . . . . . . . . . . ................................................. ....... .. . ....... . ................................................ ....... . ... .... .. . . . .. . ... . . . . . . .. ... .. . . .. . . . . ................................................... ......... . ...... . . ....... . . . . . ... . . .. ..... . . ... .... .... . . .. ..................................................................................................... ..... . ... . ........... .... .. . ..... ......................................... . .. .... . ... .. .... .......... .. .. ........ . ... . . .. . . ........ .. ....... . .. .. . ... .. .. ..... ..... .. .. . . .................................................................................................................................. ..... . .. ............ .. .. . .... . . . . . ..... . . ........... ............................................... .. .. . . ....... .. .. ... . . . . . . . .. . .......... ..... . . . .......................... .. ... . .. ... .. .. ..... ...... ..... . ... . .. ...... ... . .. . ... ...... ...... .. . . ..................... .. ..
lowQualScore : 0 5 0 0 0 0 00 00 5555 55 0 3 3 0000000000000000000000000000000000000000000 0 7 3 777777777 3 7777777777 0000 88 3 3 7 0 3 33333 0 3 33 33 77777 33 777 33 77 00 00 3 3333 333333333 3 7 33 3 77 3 7 2222 0 0 222222 88 0000000000000 7 777 7 2222 7 777777 77 44 6666 4 7 33 7 99 99 99 0 55555 1 8 4 0000 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 7 44 4444444444444444 1 66 99 7 11111111 0000 7 4 6666666666 88 666 88 5 0 00000000 2 0 11 22 66666666666 11 000 6 4 4 22222 4 9 2222 44 6 9 7 22 7 777 00000 5 0 2 0 3 888888888888888888888888888888888888888888888888888 8 5 5 8 5 0 555555 2 5555 000 00 4 8 00 5 0 0 0 0 2 88 88888888 8888 88 8 00000 88 888 0 2 88 333 3 7 00 7 3 00 7 333 7 000 33 3 3 7777 33 3 3 7 88 88 2 5555555 8 0 00000 88 55555555555555 5 0 555 0000 88 0 22222 5 55 5 0 5 22 2 2 0 5 0 00 5 5 8 2 222 888 88 5 2 88 555 5 88 0 333 7777 3333333333 7 333333 33 5555555555555 88 0 00000000 5 2 2 0 555 222222 2 0 5 0 0 000000000000000 2 2 0 0 00 2 5 333 0 7 7 000 777 0000000000000000000000 777 3 3 333 3 3 0 0000000000 5 7 0 33 7 0 000000 3 3333 00 3 000 3 0 0 00 555555 000 5 000000000000000000000000000000 000 0 0000 0 0 0 55555555 0 0 000 7777777777777777777777 77777 3333 777777777777 3 33333 0 000000000000000 5 2 000000000000000000000 8888888 44 0 66666666 66 0 00 55 33 7777777 88 5 2 00000000000 5 00000 0 000 00 000000 0 0 0 0 0 0 00 3 00 3 7 3 33 0 3333333333 3 3 7 7 3 7 777 7 3 777 7 3 00 7 0 3 3 00 0 777 3 7 0 3 3 0 7 777777 0 3 3 3 3 3 7 7 7 0 7777777777777777777777777777777777777777777777777 3333333 77 7 0000000 7 777777777777777777777777777777777777777777777777 6666666 2 555 5555 22 2 2 0 88 4 666 0 8 0 0 0 8 00 888 00 7 2 33 7 7 2 7 666666666666666666666666666666666666666666666666666 222222222 0 000000 6 0 8888888 0 0 0 0 0 666 8 0 00 00000 0 0 000 8888 0000 2 0 44 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 33333 7 222 0 22222222222 3333 33 7 77777 88888888888888888888888888888888888888888 6 44 9999 9 666 99 1111 1111111111 99 11 33333333 7 000 7 9 99 7 7 11111111 99 0000000 7 66 99 1 666 77 99 00000 66666 99 77 7 7 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 66666 7 77 333333333333 00 33 7 0000 7 7 6 2 4 66666 7 7 99999999999 88888888888888888888888888888888888888888888888 88 88 4 4 3333333 11 11 888 9 4 4 4 4 4 4 11 4 4444444444 99999 4 4 1 99999999999999999999999999 11 888 9 11 888 66 66 11111 333333 44444 7 777 7 99 333333 000 1 77 4 000 555555 222222 77 3 7 000000000000000000000 77 22
consensus : AGAGNGAGAATACATGGGTTCGTTAACGGGGTCCTGAACTCTTCTAGGAGCATGCGGTCCCATAGCCCGAGACCCGTACCAGG---TAT----GA-GT--ACCAGT-ACC--CCGTATGTA-----AGA-CGNGAGA-GAG---------TGTAA-GTGG---ATNT---TTAGT--G-ATGAG-TGCATGTGTACATGATGAGAGAGGTACTCGTCCCGC--ATCAAGAGTTACTA-GTCCC--GT--ATCGNGAGTTA--CTCGTCTCGCA-T-CGAA--CAA--CAGACTGATGCC-AGAT-ATA-CGTCCCAGGATGGAT--GCA---AACCTGCATGGACAGA--TCCGGTCTA-AG-CCCGAAACTTCGT----AAG-CCA-GCGACATN---TGATGGTACG--GGTCTCTGG----GATGATTA-CTTGTC-GCATT---TC-GAG-CTGCG-TG--TCTACT--GAATGAGTGG--A-CAGAC-ANTGA-GAAA--GGTNT--ATA-CTT-GG-CTGCGTCNCTNAGGGGNAC-AAGCACAAGG--AG-TN-T-TG-----------GGAAA-TCAGC------C-----A----------A--G-------------A--A-----TCATTGGA-----------AGCTA-----------GT-TAAAGC-CCTT---CGGGG----TA-GATTTGCT-T--CCAG-T------AAA-C--CAG-ACTGAGCTATATN--------GAGCACAGCT--GAGA---GAGAAAGGAGGC-AAAAG-----GCATCT-GAA-AGTT--TGCCGGA----GCT----GGGT--CAA-GACGTAAGAA-GGCTNG-CNAAT-CTAGCNTACCCN---ACC-GCTCCNGATGAGGT--AAGAG-AAA-TCCTTGC--TA-AGGAGCAATTCTTNGATGG-ACTA---CGNAGT-TCA-GAGAT--GC-GTCT--CAAG-------ATC-AAACAGGCGAGACCNGTCGACCTGAAT-GATGNNATACGGAG-A-GCC--GTT-GAACTGGANGCATACAN-CAGGNC-AGAGGA-GTCGCCG-GATAGATGCTGT----AAGAGTCA--T-GAGTGGAAGT-T--CTA--CAGAACCGTC-CAAAG--AAAACAAACTCGAT---CGAT-CAT-GAGACTN-AGAAA-AGAATATGCGCTCTCT-ACAGCGAGAT-ATTAA--GGAT-TTGAAACAATGGAAGTTTCAGNNACAGGGTCAA--GGACGTATGCCTCATCAAC--AGACAAGCTCA-GG--TTGCTAA-G-GTCAAGTTAGAA--AATGTTAACA-ANT---GCGGTTC-TGAA---AAG---CACCTTAAAAGGG-ACT-GCCCGCAATGGAG-CAAAGAGTTGG-AACTCC-GTAGCAATTCAAAAGAG-AATGAACACAAGGGGACTGATGCAGNTCGTAATGCACCTGACCAA-TATT-CTAGGG--TAGTGCATT--CCATAAA---CGAGAAAGGGGTT--TA-TGT---CGCGGCA-C--GTATCC--------ATGGAAT-GATG-TAT--ACCTGTT-G-TT--TGATN-CGGGCGCTA-CG-G-----CGTCCTTGCTATCTACAATTTGTTA-TGAGAACATTTGC-AAGGGT-CACAG-GTCAA-TCCTTGA--CAA-G---GTCGGAGAGAGATGTGCTATCAGC-TAGTGG-ATCA--CCGCTAAANGTACTGGGA---AAAGTTC-AGTAGATT-TAAA-GCTGGA-GACATTGC--GT-----T---G-AGCATG-AAT-GGTCATAGC-TGA---CCTA-ACAGTGGATNGGA--TCTT--GGATTAGATTTCCCGGTTAAGCATG--AGGTA-TAAT-CG---ACA-TGCGCATGC-A-AGATAAAAA--TATCTGGCA-TCGAGCAC-CCTATCAAGCTGGACGGGTNGCCGGTCGAACCTCATANAGGGTAGTCCACCGTGGCTCNCATGGGACGTCACGGATACCACCTGGATCGGAAGCTGGTGGTAGGAAGGAGAAGATACGTGACTAGGATCGGGGATGGAGGNCATCTCAGCCAAG--CT--GA-ATATGACAA-N--GCATT---C-GGAAA--AGTTTCAGAAG-----TC---GGGT-TCTTGTT-TG-CTGGCC------------A--AAANACCTG--T----CCGT-----A-CA-CAGAAGNA----CATGC-GACACAAA-CGGCC----GGATG-CCTCTTC-CAC--ATCAT--C-ANCGGGAA--TAGTTGAAGATGA-GACG-GTGACTGGGATGT--A--GA-TCCC---GAA--GTTC--AA--GT-T-GGGGA-CGAGGGGGTTGA-GGTCTCGGAGAAGN-GATGGGAGC-AGGGCCATCCTTATCTG--GTAGCGCAGAGCT-A-TTACTA-CCGTGTT-ATTCGCAAAAGAACATNTCNAA-TCCTGTCCAGA-C-CTCCAGAAA-AGTCACAAGTCGAGAAGAGGA-AGTGGTACAGTAGGAAGTGTGTAGA-GTGCCGGTAT-TCAGACAGTCACGTTTGAGCC-CATCCGAGTGA-CAA--TCAGCAGAAATGGTGGGTCAG-GGT-ACTCAGACAGAAGGATANCGTCGA---------CG--GGT----CA-AAGA-AGT--T-C--GT--CGC--A-GTAT--CAAG-AAACGGACAAAGAGTCAA-GA---GAAGGAAGAATN------TTTCG-TAAGATGTAGACG---GATATA-CAGCGCAT--A-CTGTAA-CATTAAAAGACCT--GTTGTTTTATTGNGCTTGACTTTTGCAATT-TANTGC--AT-GTTCA-AC-TTTCAATCACCAGGG--GAGTGCGA-AGAATT-CATTATTCAT-CTT-G-TACATTTTTTTT--CATGTT-TGCT-CAC---TCT-T---------AT-C----G----TGTTTTGA--A-AAAAGATTAAGATT--A---TCAT-GTATA--TT---TTAT-CATGT-GA-GGA-CAC-ATG-NNGCATAGA-G--GCGTGG---GT-AAGTGTGA---CAA--TTAAAGA----TCGGGGT-CGGGGATG--GGTTNGTN----ATGTATC------AGA---T----------G--C---------CT--TAAA----TATG-------------TT--------CG---GG-TG--TTATT-GTN--GGGCAT--T----AT--GAAA---GCAT-CCGAG-----GGTAGTTCGGGTG-----CAGAGTAC---T-ATA-ATA-GGC-GTGATCT-GCTGATATTTCG---NCAGTTCAA--CTGT--GG----AG---NTC---GAC--GAGAAGAAG-A------C-GG---T-GATA--AA-GGT-AC---CAA--TA--TATAATAC-A-----GGC-G--T--GTATTATA--ATATT--CAG--TATA-----CGGTG-----G--CTA--GTGTACTGG-T-C------TG-----GA---G--A--ATAGTAATAA--AGTA--T--TT-C-CA-G-GT---TTA-AAGTGT-C-A---------GATCGGTCC-GG--GTA--GAGGNA--TA-AT----TG-ATA-T---GACAAG-----CACCTGTCCGG--TATA-----------AGGA-CAG--AA-CT----AG-CAT-AGGGCGCAG-ACA-----AG-C-A---TA---G-GTCCC---------AG-C----CTTA-----C--GCA-----------CA-CCAT--ACC--TT-A-GG---TC--T--CT-A---T-GC-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-AT----------AGG-T---AATC-C-TGT-----A----TA---A------TAT-TATCTGT--AT---ATAT--TG---AC--TCG--TT-----ATTTT--T--AATAG---T-GTTCA-TA---TTT-TGCAT--TC---A--TTC---ATTG-ATAAT-C---AT-C---ATGC------C-CCAG-A-CTG-----GT-C-C-G-ATCA---A-CGAAC--CTAAACAC
Reference ( gi|1 ) : AGAGAGAGA-TACATGA-TTCGTTA-CGGG-TCCTGAATTCTTCTAGATGCATGCA-TCCCATAGCCCGAGACCCATAACAGG---TAT----GA-GT--ACCAGT-ACC--CCGTATGTA-----AGAACAAGAGA-GAG---------TGTAA-GTGG---ATAT--GTTAGT--G-ATGA--TGCATGTGTACATGATGAG-GAAGTACTCGTCCCGA--ATCAAGATTTACTA-GTCCC--GT--ATCTCG--TTA--CTCGTCTCGCA-T-CGAA--CAA--CAGACTGATGCC-AGAGAATA-CGTCCCAGGATGGAT-GGCA---AACCTGCATGGACAGA--TCCGGTCTA-AG-TCCGAAACTTCGT----AAA-CCA-GCGACATA---TGATGGTACA--GGTCTCTGG----AATGATTAACTTGTC-GCATT---TC-GAGTATGTG-TG--TCTACT--GAATGAGTGG--A-CAGAT-ATTGA-GAAA--GGTTT--ATA-CTT-G--CTGCATCTCTTAGGGGAAC-AAGCACAAGGG-AG-TA-T-TA-----------GGAAA-TCAGC------C-----A----------A--G-------------A--A-----TTATTGGA-----------AGCTA-----------GT-TAAAGC-CCTT---CAAGG----TA-GATTTGCT-T--CCAG-T------AAA-T--CAG-ACTGAGCTATAT---------GAGCACAGCT--GAGA---GAGAAAGGAGGC-AAAAG-----GCATCT-GAA-AGTT--TGCCGGA----GAT----GGGT--CAA-GACATAAGAA-GGCTTG-TTAAT-TTAGCCTACCCC---ACC-GCTCCTGATGACGT--AAGAG-AAA-TACTTGC--TACAGAAACAGTTCTTGGATGG-ACTA---CATAGT-TCA-GAGAT--GC-ATCT--CAAG-------ATC-AAACAGGCAAGACCTGTAAACCTGAAT-GATGCGATACAGAG-A-GCT--GTT-GAACTGGAAGCATACAAACAGGGC-AGA-GA-GTCGCCG-GATAGATGCTGT----AAG-GTCA--T-GAGTGGAAGT-T--CTA--CAGAACCGTC-CAGAG--AAAACAAACTCGAT---CGAT-CATAGAGACTG-AGAAA-AGAAT-TGCGCTCTCT-CCAGCGAGATTATTAA--GGAT-TTGAAACAATGGAAGTTTC-GTCACAGGGTCAA--GGACGTATGCCTCATCAAC--AGACAAGCTC--G---TTACTAA-G-ATCAAGTTAGAA--AATGTTAACA-ATT---GCGGTTC-TGAA---AAG---CACCTTAAA-GGG-ACT-GCCCGCAATGGAG-CAAAGAGTTGG-AACTCC-ATAGCAATTCAAAAGAG-AATGAACAAAAGGGGACTGATGCAGCTCGTAATGTATCTGACC---TATT-CCAGAG--TAGTGCATT--CCATAAA---CGAGAAAGGGGTT--TA-TGT---CACGGCA-C--GTATCC--------ATGGAAT-GATG-TAT--ACTTGTT-GTTT--TGA-A-CAGGCGCTA-CG-G-----TGTCCTTGCTATCTACAATTTGTTA-TGAGAACATTTGC-AAGAGT-CACAG-GTCAA-TCCTTGA--TAA-G---GTCGGAGAGAGATGTGCTATCAGC-TAGTGG-ATCAACCCGCTAAAGGTACTGGGA---AAAGTTCCAGTAGATTCTAAA-GTTGGAAGGCATTGC--GT-----T---GCAGCGTG-AAT-GATCATAGC-TGA---CCTA-ACAGTAGATGGGA--TCTT--GGATTAGATTTCCTGGTTAGGCATG--AGGCAGTAAT-TG---ACA-TGCGCATGC-ATCGATAAAAAATTATCTGGCA-CGGAGCAC-CCTATCAAGCTGGAAGGGCTGC------AACCTCATACAAGGTAG----CCAT---TCACAT-AGA-GTCACA-ATACCACCTAGATCAGAA-CTAATGGTA-GAAGGAG-AGATACGT-ACTAAGATC--GGATGGAGGAC-T-TCAGCCAAA--CT--GA-AC-TGATAA-T--GCATT---C-GGAAA--AGTTTCAGAAA-----CT---AGGT-TCTTGTT-TG-CTGGCC------------A--AAACACTTG--T----CCGT-----A-TA-CAGAAGAA----TATGC-GACACAAA-CAGCT----GGGTG-CCTCTTC-CAC--ATCAT--A-AGTGGGAA--TAGTTGAATATGAAGACA-GTGACTGGGATGT--A--GA-TCCT---GAA--GTTC--A---GT-T-GGG-A-CGAGGGAGTTGA-GGTCTAAGAGAAGT-GATGGGAGC-AGGGC-ATCCTTATCTG--GTAGTGTAGAGCTTA-TTACAAGCCGTGTT-ATTCGCAAAAGAACATCTCCAA-TCCTGTCCAGA-C-CTCCAGAAA-AGTCATAAGTCGAGAAGAGGA-AGTGGTACAG-AAGAAGTATGTAGATGTGCTGGTAT-TCAGACAGTC-CGTTTGAGCC-CATCCAAGTGAATAAGTTCTGCAGAAATGGTGGATCAG-GGT-ACGCAGACAGAAGGATACCGTCGA---------CG--GGT----CA-AAGA-AGT-AT-C--GT--CA---A-GTAT--CAAGAAAACGGACAAAGAGTCAT-GA---GAAGGAAGAATTA-----TTCCG-TAAGAT-TAGACG---GATATAACAGC-CAT--A-CTGTAA-CATTAAAAGACC---GTTGTTT-AT-GTGCTTGACATTGGCAATT-TAATGC--GT-GTTCA-AC-TTTCAGTCACCAGGG--GAGTGTGG-AAAATT-CATTATTCAT-CTT-G-TACATTTTTTTT--CATGTT-TGCT-TAC---TC------------AT-T----G----TGTTTTGA--A-AAAAGATTAAGATT--A---TCAT-GTATA--TT---TTAT-CATGT-GA-GGA-CAC-ATG-CAGCATAGA-G--GCGT-G---GT-AA-TGTGA---CAA--TTAAAGG----TCGGGAT-CGGAAATG--GGCTCGGA----ATGCATC------A-----T----------G--C---------CT--TAGA----TATA-------------TT--------CG---GG-TG--TTATT-GTT--GTGCAT--C----AT--GAAA---GCAC-CCGAG-----GGTAGTTCGGGTG-----CAGGGTAC---T-ATATATA-GGCTGTGATCA-GC-GATATTTCG---GCACTTCAG--CTGT--GG----AG---AT----GAC--GAGAAGAAG-A------C-GG---T-GATA--AA-GGT-AC---TAA--TA--TATAATAC-------GGC-G--T--GTATTATA--ATATT--CAG--TATA-----CGGTG-----G--CTA--GTGTACTGG-T-C------TG-----GA---G--A--ATAG-AATAA--AGTA--T--TC-C-CA-G-GT---T---AAGTAT-C-A---------GGT--GTCC-GG--GTA--GAGGTATCTATACCTA-TACATACTT--GACAAG-----CACCTGTCCGG--TATA-----------AGGA-CAG--AA-CT----AG-CAT-AGGACACAG-ACA-----AG-C-A---TA---G-GTCC----------AG-C----CATA-----C--GCA-----------C--CCAT--ACC--TT-A-GG---TC--T--CC-A---T-GC-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-AT----------AGG-T---AATC-C-TGT-----A----TA---A------TAT-TATCTGT--AT---ATAT--TG---AC--TCG--TT-----ATTTT--T--AATAG---T-GTTCA-TA---TTT-TGCAT--TC---A--TTC---ATTA-ATAAT-C---AT-C---ATGC------C-CCAG-A-CTG-----GT-C-C-G-ATCAA-CA-CGAAC--CTAAACAC
gi|2 : AGAGCGAGAATACATGAGTTCGTTA-CGG--TCCTGAA--CTTCTAGGAGCATGCAGTCCCATAGCCCGAGACCCATA-CAGGAAATA-----GT-GT--ACT--TCACC--CAGTAT-TA-----AGA-CAGGAGAAGAG---------TGTAA-GTGA---ATGT---TTAGT--GGATGAGATGCATGTG-ACATGATGAGAGAGGTACTCGTCC-----ATCAAGAGTTACTA-GTCCC--GTGGATC-CGAGTTA--CTCGTCTCGCA-TTCGAA--CAAA-CAGACTGATGCCGAGATACTATCGATCCAGGATGGA---GCA---A-CCTGCATG-ACAGAAATCCGGTCTA-AG-CCCGAAACATCGTTAGAAAA-CCA-GCGAC-TA---TGATGGTACA--GGTCTCTGGTGGAGATTATT--CTTGTC-GCATTCGGTCTGAG-ATGTG-TG--TCTACT--GAA-GAGTGG--A-CAGAT-ATTGATGAAA--GGTTT--ATA-CT--G--CTGCATCTCTTAGGGACAA-AAGCACAAGG------A-TGTG-----------GAAAA-TCAGC------C-----AGGATAAGGCAA--G-------------A--A-----T-ATTG-A-----------AGCTA-----------GT-TAAAGC-CCTT---CAGGA----TA-GATTTGC--T--CCAGTT------AAA-T--CAG-ACTGAGCTATA----------GAGCACAGCT--GAGA---GAG--AGGAGGC-AAAAG-----GCATCTAGAA-AGTT--TGCCGG-----GAT----GGGTGCCA---ACA-AAGAATGACTTG-TTAA--TTAGCT--CCCCGAAACC-GCTCCTGATGAGGT--AAGGGAAAA-TACTTGC--TACACGAACAGTTTTGAGATGGAACTA---CATAGTATCA-GAGATTGACGATCT--CAAA-------ATCAAAACAGGCAAGACCTGTAAA-CTGAACAGACGAGTCACGAAGTA-GC---GTTGGAACT-GAGGCATACATACAGTCC-AGAGGA-GTCGCCG-GATAGAAGCTGT-----AG-ATCA--GAGAGT-GAAGT-TTCCTA--CAGAATCGTCACGAAGGCAAAACAAACTCGATTCGTGAT-CAT-GAGACTT-AGAAAGAGAA--TGCGCT-TCTACCA--GAG--TATTAA--GGATATTGAAACAATGATGATTTCAGCAACAGGGTCAACGGAACGTATGCC-CATCAACAAAGAC-AGCTCAGG---TT-CTAAGG-AT---ATGAGAAAGAATGTTTACACACT---GC-GTTCATGAATCGAAGGATCACTCTAAA-AGGTACTGGCCCGCAATGGAGACAAAGA-TTGGTAACTCCGATAGCAATTCAAAAGAA-GGT-AACAAAAGGAGAA-GATGCAGCTC-CGATATCCTTGACCAAATATCACAAGAG--TAGT-CA-T--CCATAGAAATCGA-AAAGGGGTT--TA-TGT---CACGGCAGC--GTAT-C--------AT-GAAT-GAGGATAT--ACTTGTTAG--T--TGATA-CAGGCGCCA-CGCGGAAATCGTCCTTGCTATCTACAATGTGTTAGTGAGAACA-TTGC-AAGAGT-CACAGTGCTAACTCCTTGGACTAAGG---GTC-GAGAAGGATTTGCTATCAGCTTAGTGGCATCA--CCGC-GAATGTACTTGGATATACAGTTCCAGTA-ATT-TAAACGTTGGA--GCATTGCAAGTAAAAAT---G--GCATG-AAG-AGTCA-AGCTTGA---CCTACACAGTGGATGG-----CTT--GGATT-GATTTCCCTGTTAAGCATAGTGGGCA-TAAT-CATACACA-TGCGCATAC-A-GGATTAAAAA-TATC-GGCA-ACGAGCACGCCTATCATACTGGGAAGGTGGTCGGTCGAACCTC-TAAAGGGTAG----CCATGGCTTTCATGAGACGTC-CAGATACCA-CTAGATC-GAA-CT-GTGATAGGAAGGAGAAGATACGT-ACT-AGATCGGGGATGGA-GAC-TCTCAACCAAAGCTT--GA-ATATGA-AA-A--GCATT---CTGGAAA--A-----AGAAA-----TTCAGAGGTGTTCTG-T-TG-CTGGCC------------ACGAAAAACCTGGTT----TAGC-----A-CA-GAGTAGCA----CATGC-AACACAAAGC--CC----GGATGCCCTCTTC-CA
gi|4 : actggtacacgaatcaacgaacctaacaacgttaaaattttggtggccagcaacgggatttggatcagtcatttaagtaaaagcattagtattcgtaaaaatgaatgagcaggattacaaagacaagtgtaatcagttagaagggggagatagatcgcctcAGAGAG-GA-TACATGG-TT-GTTAACGGGGTTCTGAACTCTTCTAGG---ATGCG--CCCATAGCC-GAGACCCG-ACCAGG---TGTACTGGA-GT--A--AGT-ACCGACTGAATA-G-----AGAAAGAGAGA-GAGC--------TGTAAAGTGG---ATAT--TTTAGT--G-ATGAA-TGCATGTGTACA-GATGAG-AGAG--CTCGTCCCGCGCATCAAAGGTTACTAAGTCCCAAGT--ATGAGA--GTATTCTCATCCCGCAAT-CGAAGACAATGCAGACTGATGC--AGATCATA-C-TC----GATGGATAGGGATGCAACCTGGATGGACAGA--TCCGGTCTATAG--CCGA--CTT-GT----AAAACCAAGCGACATACGCTGATGGTACATCGGTCTTTGA----A--GATTA-CTTGTT-TCATT---TC-G-GTCTGTGGTG--TCT-CT--AAATGA-TGG----CAGCTTATTGA-GAAA--GGTTTTAATA-CTT-GG-CTGAATCTT----GGGGAC-AAGCACAAGG--AG-T----TA-----------GGAAACTCAGCAAGGGAT-----A----------A--G-------------GCGA-----TTATTGGA-----------AG-TA-----------GT-TAAAGCGCCTT---CA-GA----TA-G-CTTGCT-T--CGAG-T------AAAAT--CAGGACTGAGCTATATA--------GAG-ACAGCT--GA-A---GAGAA-GGAGGC-AAAAG-----GCATCT-GAA-AGTT--TGCCGGA----GAT----GG-T--CAAAGAC-TAAGAA-G--TTG-TTAAT-TTTAACT-CCCG---ACCTGCTC-TGATGATGTCAAGGAG-AAA-TTCTTGCCCTACAGAAG----TCTTG-ATGG-ACTA------AGT-TAAAGAGAT--GC--TCTGTCAAG-------AT---GACAGGCAAGACCTGTAAAGCT-AAT-GATCGGATACAGAG-A-GCTTGGTT--AACTGGAAGCA-ACAC-CAGGGCCAGAAGA-GTCGCCG-GATAGATCCTGTCAGTAAGAGTCA--T-GAGTGGACGTCT--CTA--CAGAA--GTC-CACAG--AAAACAAACTCGAT---CGAT-CAT-GAGAGTA-A--AA-AGAATATGCGCTCTC--ACAGCGAGAT-ATTAAAAGGAT-TGAAAACA-TGGAAGTTTC-AGTACAGGGTCAA--GGATGTA-GCCTCAT-AAC--AGA--AGATG--GGATTTGCTAA-G-GATAAGTTAGAC--AAT-TTA-CA-AAT---GCGGTTC-TGAA---AAG----A--TTAAA-AGG-G---GCGCG-AATGGAG---AAGAGTTGA-AACT-C-GTAGC-ATTC-AAAGAGCAATGAACACAAGGGGA-TGATGCAGGTCGTAATGCATCTGACCA--TATT--TAGGG--TAGTGCCTT--CCATAAA---CGAGAAAGGGGTT--TA-a
gi|27 : tcaagaaactaaacaacgtcgttataaccagcataaattttggtggagaacgagatttgggagtccatgattaattaaaacattagtatctaaaaagatgagcaacggattacacaagaagtaaaccagttgaaagggaatagattgctccACGCATACCAGG---TAT----GAAGTTAACCAGT-ACC--CCGTATGTAGACAGAGATCATGAGA-GAGATTGCAAAATGTAA-GTGGGCCATCTTCGTTAATTGA-ATGA--TACA
gi|14 : gagaacA--TGCATGTATATATGATGAGAGAGGTACTCGTCCCGC--ATCAAGAGTTACTA-GTCCC--GT--ATCGAGAGTTA--CTCGTCTCGCA-T-CGAA--CAA--CAGACTGATGCC-AGAG-ATA-CGTCCCAGGATGGAT--GCA---AACCTGCATGGACAGA--TCCGGTCTA-AGCCCCGAAACTTCGTG---AAG-CCA-GCGACATT---TGATGGTACG--GGTCTCTGG----AATGATT-ACTTGGCTGCATC---TC-
gi|24 : ----AAG-CTA-GCAACAAT---TGATGGTATG--GGTTCCTGG----GTAGACTA-CAAATC-CCATT---TT-GAGGCT-TG-TAGCTCT-TT--GAATCAGTGG--A-CGGAC-AGGGA-AAAA--GGTCT--ATATCTA-A--GTGTGTCGCTCA-GAGAAC-AGGCttaggggacaagcacaaggagtgttaggaaatcagccaagggatgagaggcagaattattggaagctagttaaagcccttcaggatagatttgctccagtaaatcagactgagctatatagagcacagctgagagagaggaggtaaaaggcatctgaaagtttgccggagatcgatgggtcaagacataagaaggctttttaatttagcctacccgaccg
gi|16 : -GCACT---TT-GA---TGCC-TG--T--ACTAGGAA-AAGTGG--AGCAAAC-AA-GA-AAAA--GGAAT--AAA-TTTCG--CTGTGTCACTAAGAGGT-C-AAACACAAGG--AG-TCCT-TG-----------GTAAT-TCATC------T-----A----------AA-G-------------A--A-----GCACTGAACAACTATAATGAACTA-----------GC-CAAAGC-ACT----CGACG----AACGATTTGCTCT--CCCG---------AA-C--CAA-ACTGAGCTATATC--------GAGCACAGCTTCGTGAACTGACAAAGAAAGC-TA------------CT-GAA---TTCCTGCCAAA----ACT----AGGT--CAA-AGTTTCAGAA-GACTGA-CAAAT-CTAGCATACCCT---ACG-GCACCATATGAATT--GAGAG-AAACTCTTTGT--TA-GGGGGCAATT-TTAGATGtattatacggt
gi|17 : cttgagctcaca-GCACT---TT-GA---TGCC-TG--T--ACTAGGAA-AAGTGG--A-GAAAC-AA-GA-AAAA--GGAAT--AAA-TTTCG--CTGTGTCACTAAGAGGT-C-AAACACAAGG--AG-TC-T-TG-----------GTAAT-TCATC------T-----A----------AAAG-------------A--A-----GCACTGAC-----------AACTATAATGAACTACGC-CAAAGC-ACT----CGACG----AACGATTTGCTCT--CCCG---------AA-C--CAA-ACTGAGCTATATC--------GAGCACAGCTTCGTAACT-GACAAAGAAAGC-TA------------CT-GAA---TTCCTGCCAAA----ACT----AGGT--CAA-AGTTTCAGAA-GAC--GACAAAT-CTAGCATAACCT---ACG-GCACCATATGA-AT--GAGAG-AAACTCTTTGT--TA-GGGGGCAATT-TTAGATGctcttggtgagtcaga
gi|18 : cacaG-TG--TCTACT--AAATGAGTGGGGA-CAGAT-ACTGA-GAAA--AGTTT--ATA-CTT-GGCCTGCATCTCTTAGGG--ACAAAGCACAAGAGCAGTTA-T-TATTATATTTTAGAGGAA-TCAGC------C-----A----------ctcttggtgagtcaga
gi|15 : TACT--AAATAAATGG--A-TAG-T-AAC-A-GAAATGGGCAT--GCATCTA-G--TGGTATCATTGAGTAGA-T-AAGCTCAAAGT--G-TC-T-TA-----------GGAAA-TCTAC------CTGAGGG----------A--G-------------A--AAAGTGTAAATACA-----------GGCTGTT---------GTGTAAAGC-ACAG---GAGGA----GA-GGTTT--T-TACCCAC-T------AA--C--CAG-ACGGAACTTTACA--------GAGCACAGCT--GAGA---GAGAGACGA--C-AGAAA-----GCCACA-GAG-ACAC--TACCGGA----ACT----GGGA--CAG-GAAATACGGC-GGTTAA-CGAAT-CTAGCATACCCC---TCA-GCTCCAGTGGAGGT--AAGAG-AGA-CACTTGC---AAAGGAACAGTTTCTTGATGC-GTTAAGGGACAG----G-GACAT--GC-GTTT--GAGA-------GTC-AAACAGGCGAGACCGGCTGACTTGAAT-GATACTGT-CAGAC-ACGCA--GTA-GAGTTGGATGCATcagtcgaagatccagaaccgatcttctgcgttcgagatccatttttgccacagctaaaatctagttaaaagccttgtacaaggaatttagattgcctcagtcaaggaaaattccaggcgactttatcttctaatagagcacagctgagacgagcaggaaggctaagagataatgcatctgaaagttccggagctacaagcgtcaacacctaagaagcccttagtgtgagactactc
gi|14 : aTA-CTT-GG-CTGCATCTCTTAGGGGA-C-AAGCACAAGG--AG-TG-T-TA-----------GGAAA-TCAGC------C-----A----------A--GGGATGAGAGGCAGA--A-----TTATTGGA-----------AGCTA-----------GT-TAAAGC-CCTT---CAGGA----TA-GATTTGC--T--CCAG-T------AAA-T--CAG-ACTGAGCTATATA--------GAGCACAGCT--GAGA---GAG--AGGAGGT-AAAAG-----GCATCT-GAA-AGTT--TGCCGGAGATCGAT----GGGT--CAA-GACATAAGAA-GGCTTT-TTAAT-TTAGCCTACCCG---ACC-Gtccaggca
gi|18 : atgcatgtatatatgatgagagaggtactcgtcccgcatcaagagttactagtcccgtatcgagagttactcgtctcgcatcgaacaacagactgatgccagagatacgtcccaggatggatgcaaacctgcatggacagatccggtctaagccccgaaacttcgtgaagccagcgacatttgatggtacgggtctctggaatgatA-----------ATCTA-----------GT-TAAAAG-CCTTGTACAAGGAATTTA-GATT-GCC-T--C-AG-TCAAGGAAAA-TTCCAG-GC-GA-CTTTATCTTCTAATAGAGCACAGCT--GAGAC--GAGCAGGAAGGCTAAGAGATAATGCATCT-GAA-AGTT----CCGGA----GCTACAAGCGT--CAA-CACCTAAGAA-GCCC---TTAGTGTGAGACTACTC
gi|28 : gtgtctactaaatgagtggggacagatactgagaaaagtttatacttggcctgcatctcttagggacaaagcacaagagcagttattattatattttagaggaatcagccacagtcgaagatccagaaccgatcttctgcgttcgagatccatttttgccacagctaaCAGCT--GAGA---GA--AAGCA-GC-AAAAT-----ATATCT-TAAGGGTT--TACCGAC----GAT----GGAT--CAT-CATGTAAAAA-GACTAG-TCAAT-CTAGCCAACTCA---ATC-TCTCCTGA
gi|19 : acagacT--TGCCAGA----GCT----TGGG--CAG-GACATACTCA-GGCTGG-CCAAC-CTCGCATATCCA---ACT-GCCCCAATTGAGGT--CAGAG-AAA-CCCTTGC--CA-AGGAGCAATTCATTGATG---CTC---TGAAGG-ACA-GTGA----C-AT-----GAGAATACGCATT-AAACAAGCCAGACCAGTCGACCTGAAT-AATGCTATCCGTCA-T-GCC--GTG-GAGTTGGATGCATTTAACTCTGCCAAAA-GACGTCTCCGTGA-AGATA--------AAG-GTTATTT-GAG-GGAGG-----CTAATCAG--CCATG-CAAAA--CAGACAAA
gi|9 : aaca-A-GCT--GTT-GAACTGGAAGCATACAA-CAGGGC-AGA-GA-GTCGCCG-GATAGATGCTGT----TGGAGTCA--T-GAGTGGAAGT-T--CTA--CAGAACCGTC-CAGAG--AAAACAAACTCGAT---CGATTCATAGAGACTGTAGAAA-AGAATATGCGCTCTCT-ACAGCGAGAT-ATTAA--GGAT-TTGAAACAATGGAAGTTTCAGTCACAGGGTCAA--GGACGTATGCCTCATCAAC--AGACAAGCTT--GG--TTACTAA-GGATCAAGTTAGAA--AATGTTG-CA-AAT---GCGGTTC-TGAA---AAG---CACCTTAAAAGGG-ACT-GCCCGCAATGGAG-CAAAGAATTGG-AACTCC-GTAGCAATTCAAAAGAG-AATAAACACAAGGGGACTGATGCAGCTCGTAATG-ACC-AATA---TATT-CTAGAGAGTAGTGCATTTGCCATAAA---CAAGAAAGGGGTTAATACTGTTCACGCGACA-CAAGTATCATTTTGAGAATGGAAT-G-TT-TATTTACCTGTT-AGTTGGTGA-T-TGG----TA-CG-A-----GGGC--TGC-ATTTACG---TGGT--------CCTT------GGGT-CACAG-GTCAA-TCCTTGA--CAA-A---GGTAGAGAGAGATGTTCTATCAGC-TAGTGG-ATCA--CCGCTAAATGTACTGGGG---AAAGTTCGAGTAGATT-TAAA-GCTGGACAACATTGC--AT-----T---AAAGCATGAAAT-GGTCATAGC-NNN---NNNN-NNNNNNNNNNNNN--NNNN--NGAT
gi|10 : --AGACAAGTTCA-G---CTGCTAA-G-G---AGTTACAA--AAT--TAA-A-ATTAATGCGGTTC-TGAA---AAG---CACCTTAAAAGGG-ACT-GTCCACAACGGAT-CAAAGAGTTGG-AACTCC-GTAGCAATTCAAAAGAG-AATGAACACAAAAGGACTGATGCAGGTCGTAATGCATCTGATCAA-TATT-CTAGGG--TAGTGCATT--CCATAAA---CGAGAAAGGGGTT--TA-TGT---CACGGCA-C--GTATCC--------ATGGAATGGATG-TAT--ATCTGTT-G-GT--TGATA-CAGGTGCTA-CG-G-----TGTCCTTGCTATCTACAATTTGTTA-TGAGAACA-TTGC-AAGGGT-CACAG-GTCAA-CCCTTAA--CA---------------AGATGTACTATCATC-TAGTGG-ATCA--CCGCTAACGGT
gi|3 : TTGTT-GTTT---GA-TTCAGGTGCTAACG-G------GTCCTTGCTATCTACAATTTGTTA--GAGAACATTGGCCAAGGGTTCA-AG-GTCAA-TCCTTGA--CAA-GAGGGTCG-AGAGAGATGTGCTATCAGC-TAGTGG-ATCA--CCGCTAAAGGTAATGGGA---AAAGTTC-AGTAGATTATAAG---TGGCGGACTTTGC--GT-----TAAAGCAATAGA-AATCGGTCATAGC-TGATGACTTA-ACAGTGGATTGGAATTCTTTGGGATTAGATTTC-TGGTTAAGCATG--AGGTGTTAATATG---ACAATTCGCTGGC-ATAGATAAAGA--TATCTGGCAATGAAGCAC-CCTATCAA-CTGGACGGGTTGC------AACC-CATATAAGGTAGTCCACCGT---TCA--T-GGA-GTTACG--TAC-ACCTGAATCGGAAGCTGATGGTA-GAAGGAG-AGATACGTGACTAG---T--GGATGGAGGTCAT-TCAGCCAAG--CTCGGAGAC-TGATAAAG--GCATT---C-GGAAA---GTTTCAGAA------TT---GGGT-TCTTGTT-TGGCTGGCC------------A--AAACACT-G--T----TCGT-----AACA-CAGAAGA-----CATGCAGA---AAA-CGCCC----GGA---CCTCTTC--AC--ATCAT--C-AACGGGAA--TA-TTGAAGATGT------GTGACTGGGATGT--AAAGA-TCCC---GAA--GTTTCAA---GT-T-GGGGA-CGAGGGAGTTGA-GGTCTCAGAGAAGT-GATGG-AGCTAGGGC-CACCTTATCTG--GTAGTGCCGAGCTGAATTACTA-CCGTGTTTATTCGCAAA-GAACCTGTCTAA-GTCTGT--AGA-CGCTC--GAAATAGTC-CAAGTCGAGAAGAGGA-AGTGTT-CAGTAGGAAGT-TGT-GAGATGCCGGT---TTAGACAATCACGTT-GAGCC-CATC-AAGTGA-CA---TCAGCAGAAATGGTGGGTCAGTGGT-AC-CA-ATCGAAAGATAGTGTTGATGGCTCGTGCG--GGT----CATAAGA-AGTCATTC--GT--CACTAG-GTATTCCAAGCAAACA-AGAAAGAGTCAA-GA---GAAGGAAGAATCT-----TTCCG-TAAGATGTAG-CG---GATAT--CAGCGCCT--A-CTGTAAACATGTCAAGACGTTGGTTGTTA-TT-GGACTTG-C-TTGGCAATT--AATGC--AT-GT-CA-ACCTTTCAATCACCAGGG--GAG-GTGG-AAGAAT-C-TTATTCAT--TT-G-TACATTTTTTTTTTCATGTT-TGCT-CACAGATCTATA--------ATCT----GGTCCTGTTTTGATAA-AAAAGATTA-GATT--AATATCAT-GTATA--TT---TTATTCATGTCGA-GGA-CACGATG-CC-CATAGA-G--GCGG-G---GTGAA-TGTGA---CA---TTAAAGG----TCGGGAT-CGGA--TG--GGTTGGTATTATATGTATC------AGATAGT----------G--C----------TAATAAAAGCTCATG-------------TC--------CA---GACTT--TTACT-AGTAGGGGCAT--TGGCGAT--ATAA----CAT-C-GAGTGGCAGGTAGTTCGGGTG-----TTGAGCAAGTGT-ATAAATA-GG--GCG-TCT-GCTGAAATT--G---TCACTTCAG--CTGT--GG----AG---ATTCATGAC--GAGGAGAAGGA------CAGG---T-GATATAAATGGT-CC---TAGGCTA--TATTATACCA-----GGA-GC-T--ATGTTATA--ATATT--CAG---ATAAC---CGGTG-----GGTCTA--GTGTACTGG-TTC------TG-----GACCCA--G--ATAG-TATGAGTAATA--T--TT-CACA-A-TT---TTA-AAGTG--C-A---------AA---GTCC-GG--TC-----GGT---TATAGAGAGTAAATG-TTAAGACAAG-----CACCTGTCCGG--CGTAGT---------AGGATCAGGAAA-CTAA--AG-CAT-AGGGATCAG-TAA-----AG-C-A----A---G-GTCCCACTGCTCTTAGTC----CGCAAGAGGA--GCA-----------CCTCTAT--A-C--TT-A-GG---TC--TGCCC-ATCCT-GCTTATATTGCA-T-TATTACCGG-ATTAGCTTACTCAGGCT---AATC-T-TCTAAGCGA----TG---AATAGACTAT-TATCTGT--AT---AT-T--TG---ACCGTCGAATG-----ATTTT--T--AATAG---T-ccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcctggttgagaatgaggtagtaattgacatgcgcatgcaaaagataaaaatatctggcattgagcaccttatcaagctgga
gi|10 : TCCTGGTTGAGAATG--AGGTAGTAAT-TG---ACA-TGCGCATGCAAAAGATAAAAA--TATCTGGCA-TTGAGCAC-CTTATCAAGCTGGAtgt
gi|20 : agacaagttcagctgctaaggagttacaaaattaaaattaatgcggttctgaaaagcaccttaaaagggactgtccacaacggatcaaagagttggaactccgtagcaattcaaaagagaatgaacacaaaaggactgatgcaggtcgtaatgcatctgatcaatattctagggtagtgcattccataaacgagaaaggggtttatgtcacggcacgtatccatggaatggatgtatatctgttggttgatacaggtgctacggtgtccttgctatctacaatttgttatgagaacattgcaagggtcacaggtcaacccttaacaagatgtactatcatctagtggatcaccgctaacggtccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--CT--GA-ATATAACAG-TAAGCATTTTGC-GGAAAGGAGTTTCAGGAGACGGTCC---GGGT-TCT-ATTATG-CTGGCCCGATCATTGGAGA--GAACACCTG--TAATGCTGTTAAACA-CATCAGAAGCACACCTATGC-AACACAAA-C-GCTTCGCGGATG-CCTCTCCTCACTAATCATCTATACTGGAAAATTAGT-GAAT-----GATG-GTGACTGGGATGT--A--GA-TCCTCCGAAA--GTTC--AACGGT-T-GTG-AGCGAGGCAG
gi|22 : -CTGGCC------------A--AAAGACTTG--T----CCGT-----A-CA-CAGAAGAA----CATGC-TACACAAA-CAGCC----GGATG-CCTC
gi|13 : -GACAAGAG-CAGCC----GGGTG-TCTC--C-CAC--CTCAT--C-ATGGGGAA--TAGTTGAGAGTGA-GACAAGTGAGTGG-ATGTTGA--GAATCCT---GGAAGGTTC--AA--GTGT-GGG-A--GAGGGGGTTGATGGTCTCGGGGAAGA-G-TGGG-GC-AGAACCATGCTT-TCTGTAGTCGCATAGGACT------------GTGTT-ATACGTTAAAGGAAATCTCAAG-TCCTGTCCAGGCC-CTCCAGAAA-GGTCAC-AGT--GGAAGAGGATAGTGGTA-AGTAGGAAGTGTGTAGATGGGCGGGTATGTC-GA-AGTCAGGTTTGAGCCGCATCTGA--GAATAA-TTCAGCAG-AATGGTGG-TCAG-AGTAACTCAGACAAAAG---ATCGT-GA---------CG--GGT----CA-AAGA-AGT-CT-CCAGTAACG---ACGTATG-CATG--AACGGGCAAGGAGTCAA-GAAATAAACGGAGAGTGAAAGATTTTTGTTTAGATGTAGACGTTTAATA-AGCAG--CA---A-CTGTAA-ccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntagatcctgaagttcaagttggggacgagggggttatggtctc
gi|5 : aGGAA--TAGTTGAAGATGAAGACA-GTGACTGGGATGT--A--GA-TCCC---GAA--GTTC--AA--GT-T-GGGGA-CGAGGGGGTTGA-GGTCTCAGAGAAGGAGATGGGAGC-AAGGCCATCCTTATCTG--GTAGTGCAGAGCTTA-TTACTAGCCGTGTT-ATTCGCAAAAGAACATTTCCAAGTCCTGTCCAGA-C-CTCCAGAAA-AGTCACAAGTCGAAAAGAGGA-AGTGGTACAG-AGGAAGTGTGTAGA--TGCCGGTAT-TCAGACAGTCACGTTTGAGCC-CATTCAAGTGATCAAG-TCAGCAGAAATTGTGGATCAG-GGT-ATTCAGACAGAAGGATACCGTCGA---------CGTTGGTTAGGCA-AAGACAG-----C--TG--CAC--A-GTAT--CAA-AAAAC-GACCAAGA-TCATCGA---GAAGGAA-AATT------TTTCG-AAAG---TA-AT----GATATA--AGCACATTAA-CTGTAA-T-----AAG--C---GTTGTGT-AT-GGCCTTGACATT-GCAATT-TAATGCATGT-GTTCA-AC-TTTCAATCACCA-GG--GAGTGCGA-AGAATT-CATTACTCATGCTT-GATACA--TTTTTT--CATG-T-TG-T-CAC---TC---------------T----C----TGTTAT----A-AAAAAACTATAATTCAA---TC-T--TATA---T---TTAT--ATGT-GAGGGA-CAC-ATG-GCGCGTAGA-G--G-GT-G---GG-TA-GATTA---CAA---TAAAGG----TC--GAT-GGAGAATGATGGTTGCGT----ATGTATC------A-----TTATCGAGATAG--CATAAATAAGCT--TA-------ATG-------------TC--------CAACCAG-TGACTTTTC-GTA--GGGCATGGT----AT--TACA---ATACTCCGA-------GTAGTTCAGGTG-----TTGAA-AC---TAATA-ATA-GGC----ATCT-GCTGATA---CG---TCACTTCAG--TTGT--GG----AG---ATC---GAC--GAG-AGAAG-A------C-GG---T-GACA--AA-GGT-AC---T-A--TA--TATAATAC-------GGC-G--T--GTATTATA--ATATT--CAG--TATA-----CGGTG-----G--CTA--GTGTACTGA-T-A------TG-----GA---C--A--ATAGTAATAA--AGTA--T--TT-C-CA-G-GT---TTA-AAGTGT-CAA---------GATCGGTCC-GGTTATA--GAGAAAGTTA-A----------------GACAAG-----CACCTGTCCGG--TATAGGCGGGGGTATAGGA-CAGA-AA-CT----AG-CAT-AGGGCAC
gi|22 : caT--A--GA-TCCT---GAA--GTTCA-A---GT-TGGGG-A-CGAGGGGGTTAT-GGTCT
gi|6 : ctggccaaaagacttgtccgtacacagaagaacatgctacacaaacagccggatgcctcccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-CAT--ATCTGTTA-CTTTAAAAGACCT--GTTGTTTTATTGTGCTTGACTTTTGTCATTGTATTGC--ATTGTT-A-AC-TTATAGTTA--AGGGAGGAG-GCGACAAAATTTCCTTATT-AT--TT-G-TGCATGCTTTT-----------GCTGTA----TC------------AT-C---------TGTTTTGA--A--------TAAGATT--A---TCATTGTATA--TT---TTAT-CATGT-GA-GGA-CA--ATG-AAGGCT-GA-GTCGCGTGG---GT-AAGTGTGGCATCAA--TTAGAGA----TCGGGGTGCGGGAc
gi|8 : agctgATTAAAAGACC---GTTGTTTTATTGTGCTTGACTTTTGCAATT-TATTGC--AT-GTTCA-AC-TTTCAGTTACCAGGG--AGGAGCGA-AAAATT-CCTTATTCAT-CTT-G-TGCATT------------TT-TGCT-GAC---TC------------AT-C---------TGTTTTGA---------ATAAAGATT--A---TCAT-GTATA--TT---TTAT-CATGT-GA-GGA-CAC-ATG-AGGCATAGA-G--GCGTGG---GT-AA-TGTGA---CAA--ATTGAGA----TCGGGGT-CGG-GATG--TA-TC-------ATATATCAAATAGA-----T----------G--C-------------TAAA----TATAAAGC---------TTACGTCAACCG---GA-CT--TTATT-GTA--GGACAT--T----AG--GATA---ACAT-CCGAG-----GGTAGTTCGGGTGTT---CA--GCAG---T-ATAAATACGGC---AATCT-GCTGAGATTT-G---TCAGTTCAA--CTGT--GG----AG---CTC---GACAAGAGAAGAAG-T------C-GA---TAAAAA--AA-GGT-ACGG-CAA--TA--TATAATATAAATGCGGGC-GTTT--GT-TTAT---ACATTGACAGTATATA-----CGGTGCTTACG--CTAAGGTCTATTGA-T-CGCG---TGCTGTCGA---GATA--ATAATAATAA--AGTATCT--TCAC-AA-G-GTTTAT---AAGTGTAC-ATGAGGGATTGGA--GTCCTGG--GT----AGGTA---AGAT----TGCATATTA--GAGGAGTACGTCACGTGTCCGGGTTATA-----------GGCA--AC--AA-CT----AG-TAT-GGGCGGTAGCACATATTTAG-C-ATATTA---G-CTCCCG--------AG-CGCTTC-TT-----C--TCA-----------CAGCCATTAACCAGTTAA-GG---ACATT--CT-A---T-GG-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-AT----------ACA-A---AATC-CTTGT-----A----T----C------TG--TACATGT--AT---ATAT--TG---AC--TCG--TT-----ATT------------------TTCA-TAT--TTT-TGCAT--TC---A--TTC---A-TG-ATAAT-C---Atgttcagcatattaatatagatgctaaatctataactatgctttactgtcaaccggacttcatattgtaggagctacttaggtcataccacatgcgcgagggttagtacatcggtggtatcagcagctctaatatatcgcgtggcagtattctgctagcattttgtttcgttcaaatctgttgggagctcgtcaagagaagaacaagcagtcggatacaataaaggttacggcaatatataatataaatgcgggcgtttgtttatacattgacagtatatacggtgcttacgctaaggtctattgatcgcgtgctgtcgagataataataataaagtatcttcacaaggtttataagtgtacatgagggattggagtcctgggtaggtaagattgcatattagaggagtacgtcacgtgtccgggttataggcaacaactagtatgggcggtagcacatatttagcatattagctcccgagcgcttcttctcacagccattaaccagttaaggacattctatggcatttgattttaggctacaaaatctttgtatctgtaggcatgtatatcgtattcgacttgtctcgtttattttcctcattgtttggcattatcattcattagataatccatttgccgccagtatctggttcgcgcaatcatcgaacctaa
gi|7 : att-TAGTGC--TT-TTCCATAC-TT-CAATC-CCAGGG--AGAT-CGA-AGAAAT-CATTATTCAT-CT--G-T-CATTTT------CATGTTGTCCT-CAC---TCTTTTTTACCGGTAT-TACATG----TATTTTGA--ATAAACGATTAATATA--A---TT-T-GTATAATTTCAATTGT-CATGT-GA-GGAACAC-ATGACGGCATAGAAG--GCGT-GTGGGT-AAGTGTGA---CAAACTTGAAGAACAATCGGGTTTCGGCGATG-----TTGTC----ATTTATC------AGA---T----------AGAT---------CT--GACA----TATAAGTTTACGTCAACTT--------CT---GG-TA--CTTTTCGTA--GGACAT--A----GTAGGAAACATGCTC-CCGAG-----GGTAGTTCGGGTGTTTTTCACAGTAT---G-A---ATA-GGGCATAATCTTGCTGAGATTTTGCTCGTAGTTCAT--CTGT--GGTCTCCG---AT--------------------------C-GA---T-TA-A--AA-AGT-ACACGCAA--TA--TAATATAC-------GGCTG--T--GTATTATTTTATATT---AG--TATATATAACGGTG-----G--TTA--GTATACTGGGT-C------TGC----GC---A--G--ATAG-TTCGT--AGTA--T-----C-CA-GAGT---TTGTAAG-AT-C-C---------G-T--GTCC-GG--GTAATGAG----------CTA-------------ATAGG-----TACATGTCCGG--TATA-----------AGGA-CAG--AA-CTGTAAAGTCATCAGAACACAG-CCA-----AGTC-A---TA--------C----------GG-C----CAAA-----CAAGCACCTTGCCGAGCC--CCAT--ACCT-TT-A-AGTTTTT--T--CCAA---TAGT-CAT-TTG-G-A-T-TTA--GGAAT----------AGG-TGGGAATC-C-C-T-----A----TAAC-A------TAT-TATCTGT--AT---ATAT--TGTCAGC--TCG--TTTTTTAATTTTCCT--AATAGCTCT-GTTCA-TGTATTTT-TGTAT--TC---ATTTTC---ATTC-ATAATGCACGAC-C---ATGT------C-GCCT-A-TTGATTCTGT-C-C-GAATCAA--A--GAACCACTAAACA
gi|32 : ttaGA-AGAATT-CATTATTCAT-CTTCG-TACATTTTTTTT--C
gi|12 : gcatattctacatcaccagggatggattgtttatgtgtgtttgcca----TAT--------------TT--------CG---GG-TG--TTATT-GTT--GTGCAT--T----AT--GAAA---GCAT-CTGAG-----GGTAGTTCGGGTG-----CAGGGTAC---T-ATATA-A-CGCAGTGATCA-GC-GATATTTCG---GCAGTTCAA--CTGT--GG----AG---CTA---GAC--GAGA-GAAG-A------C-GG---T-GATA--AA-GGT-AC---TA---TA--TATAGAAC-------GGC-G--T--GTATTATA--ATATT--CAG--TATA-----CGGTG-----G--CTA--GTGTACTGG-T-C------TG-----GA-----------------------CA--T--TT-C-CA-G-GT---TTA-AAGTGT-CGA---------GATCGGTCC-GGCTATA--GAGAAATTTA------------A-----GACAAG-----CACCTGTCCGG--TATA------------GGA-CAG--AAACT----AG-CTT-AGGACACAG-ACA-----AG-C-A---CA---G-GTCCC---------AG-C----CTTA-----C--GCA-----------C--CCAT--ACC--TT-A-GG---TT--T--CT-A---T-GC-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-AT----------AGG-T---AATC-C-TGT-----A----TA---A------TA---ATATGT--AT---ATAT--TG---AC--TCG--TT-----ATTTT--T--AATAGT--T-GTTCA-TA---TTT-TGCAT--TC---A--TTC---ATTG-ATAAT-C---ATAC---ATGC------C-CCAG-A-CTG-----GT-C-CAA-ATCA---A-CGAAC--CTAAACAC
gi|11 : ----TAT--------------TT--------CG---GG-TG--TTATT-GTT--GTGCAT--T----ATT-GAAA---GCAT-CTGAG-----GGT-GTTCGGGTG-----CAGGGTAC---T-ATATA-A-CGCAGTGATCA-GC-GATATTTCG---GCAGTTCAA--CTGT--GG----AG---CTA---GAC--GAGAGAAAG-A------C-GG---T-GATA--AA-GGT-AC---TA---TAATTATAGAAC-------GGC-G--T--GTATTATA--ATATT--CAG--TATA-----CGGTG-----G--CTA--GTGTACTGG-T-C------TG-----GA-----------------------CA--T--TT-C-CA-G-GT---TTA-AAGTGT-CGA---------GATCGGTCC-GG--CTA--TAGAGA---ATAT----TA-AGA------ACAAG-----CACCTGTCCGG--TAT------------AGGA-CAGA-AA-CT----AG-CTT-AGGACACAG-ACA-----AG-C-A---CA---GTGTCC----------AG-C----CTTA-----C--GCC-----------A--CCAT--ACC--TT-A-GG---T---T--CT-A---T-GC-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-AT----------AGG-T---AATC-C-TGTATA--A----TA---A------TAT-TATCTGT--AT---ATA---TG---AC--TCG--TT-----ATTTT--T--AATAGT--T-GTTCA-TA---TTT-TGCAT--TC---A--TTC---ATTG-ATAAT-C---ATAC---ATGC------C-CCAG-A-CTG-----GT-C-CAA-ATCA---A-CGAAC--CTAAACACg
gi|6 : TGTTTCG-------TTCAAATCTGTTGGG----AGCTCGT----CAA--GAGAAGAAC-AAGCAGTC-GGATAC-AATA--AA-GGTTACGG-CAA--TA--TATAATATAAATGCGGGC-G--TTTGT-TTATA---CATTGACAG--TATATA---CGGTGCTTACG--CTAAGGTCTATTGA-T-CGCGTGCTGTC---GA---G--ATAATAATAATAA--AGTA--TCTTC-A-CAAG-GT---TTATAAGTGTAC-ATGAGGGATTGGA--GTCCTGG--GTA--G--GTA---AGAT----TGCATATTA--GAGGAGTACGTCACGTGTCCGGGTTATA-----------GGCA--AC--AA-CT----AG-TAT-GGGCGGTAGCACATATTTAG-C-A---TATTAG-CTCCCG--------AG-CGCTTCTT------C--TCA-----------CAGCCATTAACCAGTT-AAGG---ACATT--CT-A---T-GG-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-CT----------ACA-A---AATCTT-TGT-----ATCTGTAGGCA------TGTATATC-GT--ATTCGAC-T--TG---TC--TCGT-TT-----ATTTT--C-------------CTCATTG---TTT-GGCATTATC---A--TTC---ATTAGATAATCC---AT-T----TGC------CGCCAGTATCTG-----GT-T-C-G-CGCAATCATCGAAC--CTAAg
gi|21 : agctgcatatctgttactttaaaagacctgttgttttattgtgcttgacttttgtcattgtattgcattgttaacttatagttaagggaggaggcgacaaaatttccttattatttgtgcatgcttttgctgtatcatctgttttgaataagattatcattgtatattttatcatgtgaggacaatgaaggctgagtcgcgtgggtaagtgtggcatcaattagagatcggggtgcgggatgttcagcatattaatatagatgctaaatctataactatgctttactgtcaaccggacttcatattgtaggagctacttaggtcataccacatgcgcgagggttagtacatcggtggtatcagcagctctaatatatcgcgtggcagtattctgctagcatttGGGCA-AG-ACA-----AG-CCA---TA---G-GTCCC---------AG-C----CTTAA----C--GCG-----------CA-CCAT--ACC--T--A-GG---TCG-T--CC-A---T-GC-C-T-TTG-AATAT-TTA--GG-AT----------AGG-T---CATG-C-TGT-----A----TA---A------TAT-TATCTGTTAGT---A-AT--TG---ACT-TCG--TT-----AATTT--T--AATAG---T-GTTGA-TT---TTTATGCAT--TCAGGA--TTCGCGATTA-AT-AT-C---AT-CTCAATACATTGCAC-TAAG-A-CTG-----GTACAC-GAATCA---A-CGAAC--CTAA
gi|30 : CC----------AG-T----CTTA-----C--GCA-----------G--CCAT--ACC--TT-A-GG---TT--T--GT-A---T-GT-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-AT----------AGG-T---AATC-C-TAT-----A----TA---A----------TATCTAT--AT---ATAT--TG---AC--TCG--TT-----ATTTT--T--AATAG---T-caacgt
gi|23 : c-A-GG---TTA-T--CT-A---TTGC-CAT-TTG-A-T-T-T-A--GG-AT----------ACA-A---AGTA-C-TG----------------A------TGT-AATCTGT--AT---ATATATTG---GC--TCG--TT-----ATTTT--TCTGATAG---TTATTCA-TA---TTT-T---------------TT---GCTG-A-AAT-C---AT-A---GTGC------C-GCAGCA-CTGC----GT-C-C-G-AT-AT-CA-TCAAC--CTAAAC
5 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|25 ): AGCTCAAAGTTGTTAGGAAATCATACTCCTGGGGAGGAAAAGTGTAATTACAGGCTGTTGTGTAAAGCACTGGAGGAGAGGTTTTTACCCCACTAACGCAGACGAACTCTAACAGAGCACAACTGAGAAG
Unaligned ( gi|26 ): GTAACGAATTGAGATCGGATTTGGAAGCATTATATATCGATTATCTAGAGGAAAAGGCAAATATGACGAAAAACGCTTATGTCAACCGGACTTTGGTGTAGAGTATCACGAT
Unaligned ( gi|29 ): TGTAACGAATTGAGATCGGATGTGGAAGCATTATATATCGATTATCTAGAGGAAAAGGCAAATATGACGAAAAACGCTTATGTCAACCGGACTTTGGGTGTA
Unaligned ( gi|31 ): AATTTTGGTGGCAGCAACGGGATTTGGATCGGTCAGNTCAATAAGTTTGTTAATAGACAGAAGAGTGAACAATAATAATATATAAGTTACTCGGCTAG
Unaligned ( gi|33 ): ATTGTGACAAATTGAGATCGGGTTCGGGATGTGTCATTTATCAGATAGATGTT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 22 2 22 22 2222222222 1 11 11 111 222 1 555555555 1 111 1 1 1 1 11 11 1 11 11 111 1 2 11 1 11 11 2222 1 11 1 11 1 1 2222 1111 11 111111 11 111 333 1111111 11 11 111 11 222222222222222 777777777777777777777777777777777777777777777 22222222222 33333333333 2222222222222222222222 111 11111111 11 1111111111 11 111 111111 11 11111111111 11 1 1 11 222222222 11 1111111111111 11 1 111 111 1 1111 1111 11111 11 11 111 1 2 111 1 1 1 11 1 11 11 11 222222 222 11 1 11 111 111 2222 11111 11 111 11 111 1 11 333333333 1 1 11 1111111 222222 11 1 2222222222222 11 111 2 1 1 1 1 22222 11 4444444444 1 1 1 111 222 1 1111 11 11 3 222222 1 3333 1 11 1 1 555555 55555555555555 333 22 1 11 2 2 2 3333333 33333 1 111 111 22222 111 1 11 111 444444444 111 444444444444444 1111111 22222 1111 1111 11 111 11 33333333 11 11 11 1 11 33333 2 1 1 1 1 1 1 1 333 1 1 33333333 1 1 444444444 11 2222 1 1 6666666666666666666 22 22 11 3333333 111 1 1 1 222 11 111 22 1 11 111 99999999999999999999999999999999999999999 11 222222 11 111 1 111 1111 111 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1 1111111111111 111 111111 11111 4444444444444444444444444444444444444444444444 1111 111111 3333333333 44444444 11 111 11 11 11111 22222 11 1 111 555555555555555555555555555 111 11 3333333333333333333 1 11 66666666666666666666666666 22222 11 333333333333 11 1111 11 1 22222 1111 2222 2222 2222222222 11 11 222 1111111111 33333333333333333333333333 11111 11 111 111 1 111111 111111 1 22222 333333
lowQualScore : 1 7 44 3 11 6 6 44 6 55 8 7777777777 0 33 666 33 0 6 777 777 33 0 000000000 0 777 1 0 0 0 0 88 3 3 3 2 2 33 0 33 33 222 3 0 0 33 0 33 22 4444 0 2 33 3 0 3 3 2 33 0 0 2 2 5555 8 8 0 5555 11 999999 99 5 000 5 111 66 6666666 33 9 9999 66 66 55 5 1 66 1 4 0 1 2 111 11 5 555555555555555 5 555555555555555555555555555555555555555555555 33333333333 00000000000 4 55 6666666666666666666666 888 99999999 00 4 4 66 4444444444 11 666 88 4 4 3 111111 4 88 11 11111111111 55 4 0 33 4 2 1 1 4 0 5 777 44 1 6 77 5 1 3 77 7 0 8 6 33 333333333 11 7777777777777 5 8 11 4 1 3 8 22 5 888 111 6 1 666 888 1 0 8 8 0 6 7777 6 3 4444 0 55555 11 0 3 8 1 11 777 0 0 444 0 333 2 3 3 0 3 0 33 0 3 3 11 33 3 3 2 11 0 0 222222 6 777 11 0 99 99 1 8 444 444 0 0 8 8 3 8 8 0 0 8 3 55 1 0 666 9999 88888 0 11 444 11 8 777 2 0 33 888888888 2 0 3 0 33 1111111 9999 8 8 666666 0 0 0 33 0 5 8 8 8 8 8 5555555555555 8 8 11 0 1 777 0 0 2 0 0 0 55555 33 7777777777 0 0 0 444 3 777 0 1 8888 33 7 2 2 33 0 333333 0 4444 0 33 3 0 77 0 6 6 1 777777 7 7 1 0 66666666666666 111 7 44 6 6 0 6 2 22 3 3 3 7777777 44444 3 111 444 55555 1 777 0 3 33 777 000000000 66 3 111 333333333333333 1 9999999 88888 8 8 7777 6 4444 1 6 0 8 33 777 22 11 0 8 33333333 88 6 99 55 6 99 2 8 2 11 3 2 3 0 2 3 3 2 22 33333 3 0 0 9 1 1 0 2 0 0 2 0 3 3 2 0 55 5 6 3 222 0 3 0 3 2 3 3 0 6 2 3 77777777 3 2 0 0 9 2 2 1 6 000000000 33 1111 0 0 1111111111111111111 33 33 99 2 33 2222222 777 6 0 1 0 999 55 8 0 888 99 111 8 8 3333 0 33 8 0 8 0 0 44 0 4 0 0 6 1 6 99 6 6 3 99 3 6 3 1 5 5 1 00 5 5 2 77 111 3 11111111111111111111111111111111111111111 99 00 2 44 000000 44 99 111 6 6 6 6 6 7777 6 99 99 2 000 77 0 2222 1 000 1 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 66 0 66 5 5 5 9999999999999 3 111 5 666666 22222 5 888 66 3333333333333333333333333333333333333333333333 55 9 2 33 777 888 66 66 1 3333 66 66 8 5 444444 5 888 5 2 5 66 5 2222222222 44444444 88 5 333 33 33 99999 55555 66 33 0 777 777777777777777777777777777 0 5 777 5 00 5555555555555555555 0 2 44 44444444444444444444444444 55555 33 111111111111 77 66 5 7777 5 88 22 0 55555 5 5 8888 5 5 8888 8 66 66 3333 0000 5555555555 777 22 66 8 000 55 8888 777 8 4 4 4 4 4 4 55 4 7777777777 99999 4 4 00000000000000000000000000 55 777 0 55 777 99 99 00000 11 999 5 333 55 66 999999 888 5 0 888 777777 666666 5 1 5 00000 5 5 777777 77 77
lowQualScore : . . .. . .. . . .. . .. . .......... . .. ... .. . . ... ... .. . ......... . ... . . . . . .. . . . . . .. . .. .. ... . . . .. . .. .. .... . . .. . . . . . .. . . . . .... . . . .... .. ...... .. . ... . ... .. ....... .. . .... .. .. .. . . .. . . . . . ... .. . ............... . ............................................. ........... ........... . .. ...................... ... ........ .. . . .. .......... .. ... .. . . . ...... . .. .. ........... .. . . .. . . . . . . . ... .. . . .. . . . .. . . . . .. ......... .. ............. . . .. . . . . .. . ... ... . . ... ... . . . . . . .... . . .... . ..... .. . . . . .. ... . . ... . ... . . . . . . .. . . . .. .. . . . .. . . ...... . ... .. . .. .. . . ... ... . . . . . . . . . . . .. . . ... .... ..... . .. ... .. . ... . . .. ......... . . . . .. ....... .... . . ...... . . . .. . . . . . . . ............. . . .. . . ... . . . . . . ..... .. .......... . . . ... . ... . . .... .. . . . .. . ...... . .... . .. . . .. . . . . ...... . . . . .............. ... . .. . . . . . .. . . . ....... ..... . ... ... ..... . ... . . .. ... ......... .. . ... ............... . ....... ..... . . .... . .... . . . . .. ... .. .. . . ........ .. . .. .. . .. . . . .. . . . . . . . . .. ..... . . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . ... . . . . . . . . . . . ........ . . . . . . . . . ......... .. .... . . ................... .. .. .. . .. ....... ... . . . . ... .. . . ... .. ... . . .... . .. . . . . . .. . . . . . . . .. . . . .. . . . . . . . .. . . . .. ... . ......................................... .. .. . .. ...... .. .. ... . . . . . .... . .. .. . ... .. . .... . ... . ............................................................................................................... .. . .. . . . ............. . ... . ...... ..... . ... .. .............................................. .. . . .. ... ... .. .. . .... .. .. . . ...... . ... . . . .. . .......... ........ .. . ... .. .. ..... ..... .. .. . ... ........................... . . ... . .. ................... . . .. .......................... ..... .. ............ .. .. . .... . .. .. . ..... . . .... . . .... . .. .. .... .... .......... ... .. .. . ... .. .... ... . . . . . . . .. . .......... ..... . . .......................... .. ... . .. ... .. .. ..... .. ... . ... .. .. ...... ... . . ... ...... ...... . . . ..... . . ...... .. ..
lowQualScore : 0 3 00 7 77 7 7 00 7 22 8 8888888888 0 88 000 88 2 5 555 555 00 0 000000000 0 555 0 0 0 0 0 55 2 2 2 5 5 88 0 88 88 222 2 0 0 88 0 88 55 0000 0 5 88 2 0 2 2 5 88 0 0 5 5 0000 0 0 8 0000 00 888888 00 7 000 7 000 44 7777777 88 4 0000 99 99 11 0 0 99 9 4 7 0 6 777 99 0 888888888888888 0 333333333333333333333333333333333333333333333 88888888888 66666666666 4 66 1111111111111111111111 777 11111111 66 4 6 11 9999999999 00 555 33 7 4 6 222222 4 00 00 22222222222 55 0 7 77 0 7 0 0 4 9 3 111 66 0 6 99 7 4 0 99 1 9 9 6 00 222222222 00 8888888888888 0 0 22 6 0 2 0 00 6 777 333 7 0 777 333 0 0 0 0 8 0 0000 0 8 8888 8 66666 00 8 2 0 8 00 555 0 0 222 0 555 5 2 2 0 2 0 88 0 2 2 88 88 2 2 5 00 8 8 888888 4 000 00 0 88 00 0 0 000 000 8 8 0 0 2 0 0 8 8 0 2 88 0 8 666 6666 22222 8 00 000 00 0 555 0 0 88 888888888 5 0 2 0 88 8888888 6666 0 0 444444 8 8 8 66 6 6 0 0 0 0 0 0000000000000 0 0 00 8 0 555 0 0 5 0 0 5 88888 88 2222222222 0 0 0 555 2 555 0 0 5555 88 3 5 0 88 0 555555 0 5555 0 88 2 0 88 0 5 7 0 000000 3 3 0 7 00000000000000 000 3 00 7 7 7 7 0 77 3 7 3 0000000 00000 3 000 000 22222 0 555 0 2 88 555 888888888 55 2 000 000000000000000 0 0000000 00000 0 8 0000 7 2222 0 7 8 0 88 555 44 00 8 2 22222222 33 7 22 88 7 22 5 0 0 00 2 5 2 0 5 2 2 5 00 22222 5 0 0 8 0 0 0 5 0 0 5 0 2 2 5 0 88 5 5 2 555 2 2 0 2 5 2 2 0 5 0 2 00000000 2 5 0 0 2 5 5 0 5 000000000 88 2222 0 0 8888888888888888888 88 22 00 5 55 5555555 555 5 0 0 0 000 88 8 0 222 22 888 0 0 0000 8 44 0 8 0 8 8 22 8 4 4 8 7 0 7 22 7 7 5 22 7 7 5 0 7 7 3 00 7 7 3 99 000 2 22222222222222222222222222222222222222222 22 22 5 55 222222 00 22 777 7 7 7 7 7 0000 7 22 22 0 000 99 6 1111 7 777 7 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 99 0 00 0 0 0 5555555555555 8 111 0 999999 55555 0 888 99 5555555555555555555555555555555555555555555555 88 4 1 55 999 888 99 99 0 2222 99 99 1 0 444444 0 888 0 2 0 99 0 4444444444 99999999 88 1 444 88 88 44444 00000 99 88 0 555 111111111111111111111111111 9 0 555 0 11 9999999999999999999 0 5 00 66666666666666666666666666 00000 88 555555555555 55 99 0 5555 0 22 33 0 00000 0 0 4444 0 0 9999 9 11 11 3333 2222 1111111111 888 22 77 0 444 55 5555 000 0 0 0 0 0 0 0 55 0 5555555555 88888 0 0 55555555555555555555555555 55 000 8 55 000 55 55 00000 00 000 0 888 11 99 666666 888 0 0 888 444444 444444 7 4 7 00000 7 7 444444 99 99
consensus : AGAGAGAGAATACATGA-TTCGTTA-CGGG-TCCTGAACTCTTCTAGGAGCATGCG-TCCCATAGCCCGAGACCCATACCAGG---TAT----GA-GT--ACCAGTACC--CCGTATGTA---AGAG--CAAGAG-AGAG---------TGTAA-GTGG---ATAT-TT-AGT-GA-TGAA-TGCATGTGTACATGATGAGAGAGGTACTCGTCCCGC--ATCAAGAGTTACTA-GTCCC--GT--ATCGNGAGT-TACTCGTCTCGCA-TCGAA--C-AA--CAGACTGATGCC-AGAN-A-TA-CGTCCCAGGAT--GGATG-CAAACCTGCATGGACAG--ATCCGGTCTA-AG-CCCGAAACTTCGT----AAA-CCA-GCGACATA---TGATGGTACG--GGTCTCTG--GGANGATTA--CTTGTC-GCATT---TC-GAG--TGCG-TGT----CTACT--GAATGAGTGG--A-CAG--AC--ANTGA-GAAAGGTNT--ATACTTGG-CTGCGTCNCTNAGGGGNACAAGCACAAGG--AG-TN-TT-----------GGGAAA-TCAGC----------C-----AA--G-------------A--A-----TTATTGGA-----------AGCTA-----------GT-TAAAGC-CCTT---CGGGG----NA-GA----TTTGCT-TCCAG-T------AAA--CCAG-ACTGAGCT--AT------A-TAGAGCACAGCT--GAGA---GAGAAAGGAGGC-AAAAG-----GCATCT-GAA-AGTT--TGCCGGAG--C--T----GGGT--C-AAGACGTAAGAA-GGCTNGCNAA-TCTAGCNTACCC--NACC-GCTCCNGATGAGGT--AAGAG-AAA-TNCTTG--CTACAGGAGCAGTTCTTNGATGG-ACTACGNAGT-T-CA--GAGA--T--GCG-TC--TCAAG-ATC-AAACAGGCAAGACCTGTNAACCTGAAT-GATGCGATACGGAG-A-GCC--GTT-GAACTGGANGCATACA-A-C-A-GGCCAGAGGA-GTCGCCG-GATAGATGCT----GTAAGAGTCA--T-GAGTGGAAGT-T--CTA--CAGAACCGTC-CAGAG--AAAACAAACTCGAT---CGAT-CATAGAGACTG-AGAAA-AGAATATGCGCTCTCTACAGC-GAGAT-ATT--AAGGAT-TTGAAACAATGGAAGTTTCAGTCACAGGGTCAA--GGACGTATGCCTCATCAAC--AGACAAGCTCGGG--TTGCTAAGG-TCAAGTTAGAA--AATGTTAACA--AATGCGGTTC-TGAA---AAG---CACCTTAAAAGGGACT-GCCCGCAATGGAG-CAAAGAGTTGG-AACTCCG-TAGCAATTCAAAAGAG-AATGAACACAAGGGGACTGATGCAGCTCGTAATGCATCTGACC-A--ATATT-CT--AGAGTAGTGCATT--CCATAAA---CGAGAAAGGGGTT--TA-TGT---CACGGCA-C--GTATC--------CATGGAAT-GATG-TA--TACCTGTT-G-TT--TGATACAGGCGCTA-CG-G-----CGTCCTTGCTATCTACAATTTGTTA-TGAGAACATTTGC-AAGGGT-CACAG-GTCAA-TCCTT-GAC--AAG---GTCGGAGAGAGATGTGCTATCAGC-TAGTGG-ATCA--CCGCTAAAGGTACTGGGA---AAAGTTCC-AGTAGATT-TAAA-GTTGG-A-GACATTGC--GT-----TAG-AGC-AT-G-AA--CGGTCATAGCT--TGACCTA-ACAGTGGATGGGA--TCTT--GGATTAGATTTCCTGGTTAAGCATG--AGGCAGTAAT-CG---AC-ATGCGCATGCATA--GA-TAAAAA--TATCTGGC-ACGGAGCAC-CCTATCAAGCTGGAAGGGTTGC------AACCTCATANAAGGTAG-CCACCGT--CTCTCATGGA--GTCACGGATACCACCTAGATCGGAAGCTGATGGTA-GAAGGAG-AGATACGT-ACTAGGATC--GGATGGAGGNC-TCTCAGCC-AAGC-T-GAATA-TGAT-A--AAGCATT---C-GGAAA--AGT---TTCAGAAG-----CCGGGTTCTTGTT-T-GCTGGCC------------A--AAACACCTG--T----CCGT-----ACA-CAGAAGNACA----TGC-GACACAAACG----GCCGGATG-CCTCTTC-CAC--ATCATC---ANCGGGAA--TAGTTGAAGATG-A-GAC-GGTGACTGGGATGT--AG-ATC--CCG--AAG-TTCAA--GTTGGGGACGAGGGGGTTGA-GGTCTCAGAGAAGN-GATGGGAGC-AGGGCCATCCTTATCTGGTAG-TGCAGAGC-T--ATTACNAGCCGTG-TTATTCGCAAAAGAACATCTCCAA-TCCTGTCCAGA-C-CTCCAGAAA-AGTCACAAGTCGAGAAGAGGA-AGTGGTACAGTAGGAAGTGTGTAGATG-TGCCGGTAT-TCAGACAGTCACGTTTGAGCC-CATCCGAGTG-A-CAAG-TCAGCAGAAATGGTGGGTCAG-GGT-ACTCAGACAGAAGGATACCGTCGA---------CG--GGT----CA-AAGA-AG---T-TC--GT--CAC--AGTAT--CAAG-AAACGGACAAAGAGTCA-NGA-------GAAG---GAAGAA-TTTTT-CGTAAGATGTAGACGGAT-AT-ACAGC-GCAT--A-CTGT-AACATTAAAAGACC-GTT-GTT-TTATTGCGCTTGACNTTNGCAATT-TANTGCA-TGT--TCA-A-CTTTCAGTCACCAGG--GGA-GTGCGA-AGAA-TTCATTATTCAT-CTT-G-TACA--TTTTTTTTCATGTT-TGCTCAC----------TCTC----ATC-----------TGTTTTG--AA-AAAAGATTAAGAT---T--ATCA-TGTATA--TT---TTA-TCATGT-GAGG-A-CAC-ATGANG-CATAGA-G--GCGTG--GGTAAGTGTGA---CAA--TTAGAGG----TCGGGGT-CGGGGATG--GGTTCGT----CATGT--AT-CA-------GAT-G--C-----CT--TAAA----TA-------T---------GTT-----------CG---------G---G-TG--T--TATT-GT-NGG-GC-A-T--T----AT-G--ANA--GCA-T----C-CGAG-----GG-TAGT---TCG--GGTGT----CAG-AGTA---CTA-T-A-ATA---G-G-C-GTGA------TCT-GCTGANATTTCG--NC---AGTTCAG--CTGT--GGAGCT---CG--AC--GAGAAGAA-GA------C-GG---T-GATA-AA--GG-TAC---TA--A--TATATAATA------CGGGCG--TGTATTATA--ATATT--CAG--TATA-----CGGTG-----G--CTA--GTGTACTGG-TC---TGC----GA---G--AATAGT-AATAA--AGTATTTC-C---AG-GTTTA-AAGTGT-C-A-----GA--TC-G--GTCC-GGNTATAG-GNA--NA-----ATTG-ATA-----GACAAG-----CACCTGTCCGG--TATA-----------AGGA-CAG--AA-CT----AG-CAT-AGGGC-ACAG-ACA-----AG-C-A---TA-G-GTC---CC-A--G--C----CTTA---CGCA-------CA-CC---AT--ACC--TT-AGGTC--T--CT----A---T-GC-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-AT----------AGG-T---AATC-C-TGT-----A----TA---A------TAT-TATCTGT--AT---ATAT--TG---AC--TCG--TT-----ATTTT--TAATAG---TGTTCA-TA---TTT-TGCAT--TC---A--TTC---ATT-GATAAT-C---AT-C---ATGC------C-CCAG-A-CTG-----GT-C-C-GA---ATCA--ACGAAC--CTAAACAC
Reference ( family-5610 ) : AGAGNGAGAATACATGGGTTCGTTAACGGGGTCCTGAACTCTTCTAGGAGCATGCGGTCCCATAGCCCGAGACCCGTACCAGG---TAT----GA-GT--ACCAGTACC--CCGTATGTA---AGA---CGNGAG-AGAG---------TGTAA-GTGG---ATNT-TT-AGT-GA-TGAG-TGCATGTGTACATGATGAGAGAGGTACTCGTCCCGC--ATCAAGAGTTACTA-GTCCC--GT--ATCGNGAGT-TACTCGTCTCGCA-TCGAA--C-AA--CAGACTGATGCC-AGAT-A-TA-CGTCCCAGGAT--GGATG-CAAACCTGCATGGACAG--ATCCGGTCTA-AG-CCCGAAACTTCGT----AAG-CCA-GCGACATN---TGATGGTACG--GGTCTCTG--GGATGATTA--CTTGTC-GCATT---TC-GAGC-TGCG-TGT----CTACT--GAATGAGTGG--A-CAG--AC--ANTGA-GAAAGGTNT--ATACTTGG-CTGCGTCNCTNAGGGGNACAAGCACAAGG--AG-TN-TT-----------GGGAAA-TCAGC----------C-----AA--G-------------A--A-----TCATTGGA-----------AGCTA-----------GT-TAAAGC-CCTT---CGGGG----TA-GA----TTTGCT-TCCAG-T------AAA--CCAG-ACTGAGCT--AT------A-TNGAGCACAGCT--GAGA---GAGAAAGGAGGC-AAAAG-----GCATCT-GAA-AGTT--TGCCGGAG--C--T----GGGT--C-AAGACGTAAGAA-GGCTNGCNAA-TCTAGCNTACCC--NACC-GCTCCNGATGAGGT--AAGAG-AAA-TCCTTG--CTA-AGGAGCAATTCTTNGATGG-ACTACGNAGT-T-CA--GAGA--T--GCG-TC--TCAAG-ATC-AAACAGGCGAGACCNGTCGACCTGAAT-GATGNNATACGGAG-A-GCC--GTT-GAACTGGANGCATACA-N-C-A-GGNCAGAGGA-GTCGCCG-GATAGATGCT----GTAAGAGTCA--T-GAGTGGAAGT-T--CTA--CAGAACCGTC-CAAAG--AAAACAAACTCGAT---CGAT-CAT-GAGACTN-AGAAA-AGAATATGCGCTCTCTACAGC-GAGAT-ATT--AAGGAT-TTGAAACAATGGAAGTTTCAGNNACAGGGTCAA--GGACGTATGCCTCATCAAC--AGACAAGCTCAGG--TTGCTAAGG-TCAAGTTAGAA--AATGTTAACA--ANTGCGGTTC-TGAA---AAG---CACCTTAAAAGGGACT-GCCCGCAATGGAG-CAAAGAGTTGG-AACTCCG-TAGCAATTCAAAAGAG-AATGAACACAAGGGGACTGATGCAGNTCGTAATGCACCTGACC-A--ATATT-CT--AGGGTAGTGCATT--CCATAAA---CGAGAAAGGGGTT--TA-TGT---CGCGGCA-C--GTATC--------CATGGAAT-GATG-TA--TACCTGTT-G-TT--TGATNCGGGCGCTA-CG-G-----CGTCCTTGCTATCTACAATTTGTTA-TGAGAACATTTGC-AAGGGT-CACAG-GTCAA-TCCTT-GAC--AAG---GTCGGAGAGAGATGTGCTATCAGC-TAGTGG-ATCA--CCGCTAAANGTACTGGGA---AAAGTT-C-AGTAGATT-TAAA-GCTGG-A-GACATTGC--GT-----T-G-AGC-AT-G-AA--TGGTCATAGC---TGACCTA-ACAGTGGATNGGA--TCTT--GGATTAGATTTCCCGGTTAAGCATG--AGGTA-TAAT-CG---AC-ATGCGCATGCA-A--GA-TAAAAA--TATCTGGC-ATCGAGCAC-CCTATCAAGCTGGACGGGTNGCCGGTCGAACCTCATANAGGGTAGTCCACCGTGGCTCNCATGGGACGTCACGGATACCACCTGGATCGGAAGCTGGTGGTAGGAAGGAGAAGATACGTGACTAGGATCGGGGATGGAGGNCATCTCAGCC-AAGC-T-GAATA-TGAC-A--ANGCATT---C-GGAAA--AGT---TTCAGAAG-----TCGGGTTCTTGTT-T-GCTGGCC------------A--AAANACCTG--T----CCGT-----ACA-CAGAAGNACA----TGC-GACACAAACG----GCCGGATG-CCTCTTC-CAC--ATCATC---ANCGGGAA--TAGTTGAAGATG-A-GAC-GGTGACTGGGATGT--AG-ATC--CCG--AAG-TTCAA--GTTGGGGACGAGGGGGTTGA-GGTCTCGGAGAAGN-GATGGGAGC-AGGGCCATCCTTATCTGGTAG-CGCAGAGC-T--ATTACTA-CCGTG-TTATTCGCAAAAGAACATNTCNAA-TCCTGTCCAGA-C-CTCCAGAAA-AGTCACAAGTCGAGAAGAGGA-AGTGGTACAGTAGGAAGTGTGTAGA-G-TGCCGGTAT-TCAGACAGTCACGTTTGAGCC-CATCCGAGTG-A-CAA--TCAGCAGAAATGGTGGGTCAG-GGT-ACTCAGACAGAAGGATANCGTCGA---------CG--GGT----CA-AAGA-AG---T-TC--GT--CGC--AGTAT--CAAG-AAACGGACAAAGAGTCA-AGA-------GAAG---GAAGAA-TNTTT-CGTAAGATGTAGACGGAT-AT-ACAGC-GCAT--A-CTGT-AACATTAAAAGACCTGTT-GTT-TTATTGNGCTTGACTTTTGCAATT-TANTGCA-TGT--TCA-A-CTTTCAATCACCAGG--GGA-GTGCGA-AGAA-TTCATTATTCAT-CTT-G-TACA--TTTTTTTTCATGTT-TGCTCAC----------TCTT----ATCG----------TGTTTTG--AA-AAAAGATTAAGAT---T--ATCA-TGTATA--TT---TTA-TCATGT-GAGG-A-CAC-ATGNNG-CATAGA-G--GCGTG--GGTAAGTGTGA---CAA--TTAAAGA----TCGGGGT-CGGGGATG--GGTTNGT----NATGT--AT-CA-------GAT-G--C-----CT--TAAA----TA-------T---------GTT-----------CG---------G---G-TG--T--TATT-GT-NGG-GC-A-T--T----AT-G--AAA--GCA-T----C-CGAG-----GG-TAGT---TCG--GGTG-----CAG-AGTA---CTA-T-A-ATA---G-G-C-GTGA------TCT-GCTGATATTTCG--NC---AGTTCAA--CTGT--GGAGNT---CG--AC--GAGAAGAA-GA------C-GG---T-GATA-AA--GG-TAC---CA--A--TATATAATA------CAGGCG--TGTATTATA--ATATT--CAG--TATA-----CGGTG-----G--CTA--GTGTACTGG-TC---TG-----GA---G--AATAGT-AATAA--AGTATTTC-C---AG-GTTTA-AAGTGT-C-A-----GA--TC-G--GTCC-GGGTAGAG-GNA--TA-----ATTG-ATA--T--GACAAG-----CACCTGTCCGG--TATA-----------AGGA-CAG--AA-CT----AG-CAT-AGGGC-GCAG-ACA-----AG-C-A---TA-G-GTC---CC-A--G--C----CTTA---CGCA-------CA-CC---AT--ACC--TT-AGGTC--T--CT----A---T-GC-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-AT----------AGG-T---AATC-C-TGT-----A----TA---A------TAT-TATCTGT--AT---ATAT--TG---AC--TCG--TT-----ATTTT--TAATAG---TGTTCA-TA---TTT-TGCAT--TC---A--TTC---ATT-GATAAT-C---AT-C---ATGC------C-CCAG-A-CTG-----GT-C-C-G----ATCA--ACGAAC--CTAAACAC
gi|1 : AGAGAGAGA-TACATGA-TTCGTTA-CGGG-TCCTGAATTCTTCTAGATGCATGCA-TCCCATAGCCCGAGACCCATAACAGG---TAT----GA-GT--ACCAGTACC--CCGTATGTA---AGAA--CAAGAG-AGAG---------TGTAA-GTGG---ATATGTT-AGT-GA-TGA--TGCATGTGTACATGATGAG-GAAGTACTCGTCCCGA--ATCAAGATTTACTA-GTCCC--GT--ATCTCG--T-TACTCGTCTCGCA-TCGAA--C-AA--CAGACTGATGCC-AGAG-AATA-CGTCCCAGGAT--GGATGGCAAACCTGCATGGACAG--ATCCGGTCTA-AG-TCCGAAACTTCGT----AAA-CCA-GCGACATA---TGATGGTACA--GGTCTCTG--GAATGATTAA-CTTGTC-GCATT---TC-GAGTATGTG-TGT----CTACT--GAATGAGTGG--A-CAG--AT--ATTGA-GAAAGGTTT--ATACTTG--CTGCATCTCTTAGGGGAACAAGCACAAGGG-AG-TA-TT-----------AGGAAA-TCAGC----------C-----AA--G-------------A--A-----TTATTGGA-----------AGCTA-----------GT-TAAAGC-CCTT---CAAGG----TA-GA----TTTGCT-TCCAG-T------AAA--TCAG-ACTGAGCT--AT------A-T-GAGCACAGCT--GAGA---GAGAAAGGAGGC-AAAAG-----GCATCT-GAA-AGTT--TGCCGGAG--A--T----GGGT--C-AAGACATAAGAA-GGCTTGTTAA-TTTAGCCTACCC--CACC-GCTCCTGATGACGT--AAGAG-AAA-TACTTG--CTACAGAAACAGTTCTTGGATGG-ACTACATAGT-T-CA--GAGA--T--GCA-TC--TCAAG-ATC-AAACAGGCAAGACCTGTAAACCTGAAT-GATGCGATACAGAG-A-GCT--GTT-GAACTGGAAGCATACA-AAC-A-GGGCAGAG-A-GTCGCCG-GATAGATGCT----GTAAG-GTCA--T-GAGTGGAAGT-T--CTA--CAGAACCGTC-CAGAG--AAAACAAACTCGAT---CGAT-CATAGAGACTG-AGAAA-AGAAT-TGCGCTCTCTCCAGC-GAGATTATT--AAGGAT-TTGAAACAATGGAAGTTTC-GTCACAGGGTCAA--GGACGTATGCCTCATCAAC--AGACAAGCTC--G--TTACTAAGA-TCAAGTTAGAA--AATGTTAACA--ATTGCGGTTC-TGAA---AAG---CACCTTAAA-GGGACT-GCCCGCAATGGAG-CAAAGAGTTGG-AACTCCA-TAGCAATTCAAAAGAG-AATGAACAAAAGGGGACTGATGCAGCTCGTAATGTATCTGACC-----TATT-CC--AGAGTAGTGCATT--CCATAAA---CGAGAAAGGGGTT--TA-TGT---CACGGCA-C--GTATC--------CATGGAAT-GATG-TA--TACTTGTT-GTTT--TGA-ACAGGCGCTA-CG-G-----TGTCCTTGCTATCTACAATTTGTTA-TGAGAACATTTGC-AAGAGT-CACAG-GTCAA-TCCTT-GAT--AAG---GTCGGAGAGAGATGTGCTATCAGC-TAGTGG-ATCAACCCGCTAAAGGTACTGGGA---AAAGTTCC-AGTAGATTCTAAA-GTTGGAA-GGCATTGC--GT-----T-GCAGC-GT-G-AA--TGATCATAGC---TGACCTA-ACAGTAGATGGGA--TCTT--GGATTAGATTTCCTGGTTAGGCATG--AGGCAGTAAT-TG---AC-ATGCGCATGCATC--GA-TAAAAAATTATCTGGC-ACGGAGCAC-CCTATCAAGCTGGAAGGGCTGC------AACCTCATACAAGGTAG-CCA------TTCACATAGA--GTCAC-AATACCACCTAGATCAGAA-CTAATGGTA-GAAGGAG-AGATACGT-ACTAAGATC--GGATGGAGGAC--TTCAGCC-AAAC-T-GAAC--TGAT-A--ATGCATT---C-GGAAA--AGT---TTCAGAAA-----CTAGGTTCTTGTT-T-GCTGGCC------------A--AAACACTTG--T----CCGT-----ATA-CAGAAGAATA----TGC-GACACAAACA----GCTGGGTG-CCTCTTC-CAC--ATCATA---AGTGGGAA--TAGTTGAATATGAA-GAC-AGTGACTGGGATGT--AG-ATC--CTG--AAG-TTC-A--GTT-GGGACGAGGGAGTTGA-GGTCTAAGAGAAGT-GATGGGAGC-AGGG-CATCCTTATCTGGTAG-TGTAGAGCTT--ATTACAAGCCGTG-TTATTCGCAAAAGAACATCTCCAA-TCCTGTCCAGA-C-CTCCAGAAA-AGTCATAAGTCGAGAAGAGGA-AGTGGTACAG-AAGAAGTATGTAGATG-TGCTGGTAT-TCAGACAGTC-CGTTTGAGCC-CATCCAAGTGAA-TAAGTTCTGCAGAAATGGTGGATCAG-GGT-ACGCAGACAGAAGGATACCGTCGA---------CG--GGT----CA-AAGA-AG---TATC--GT--CA---AGTAT--CAAGAAAACGGACAAAGAGTCA-TGA-------GAAG---GAAGAATTATTC-CGTAAGAT-TAGACGGAT-ATAACAGC--CAT--A-CTGT-AACATTAAAAGACC-GTT-G-T-TTA-TGTGCTTGACATTGGCAATT-TAATGCG-TGT--TCA-A-CTTTCAGTCACCAGG--GGA-GTGTGG-AAAA-TTCATTATTCAT-CTT-G-TACA--TTTTTTTTCATGTT-TGCTTAC----------TC------ATTG----------TGTTTTG--AA-AAAAGATTAAGAT---T--ATCA-TGTATA--TT---TTA-TCATGT-GAGG-A-CAC-ATGCAG-CATAGA-G--GCGT---GGTAA-TGTGA---CAA--TTAAAGG----TCGGGAT-CGGAAATG--GGCTCGG----AATGC--AT-C---------AT-G--C-----CT--TAGA----TA-------T---------ATT-----------CG---------G---G-TG--T--TATT-GT-TGT-GC-A-T--C----AT-G--AAA--GCA-C----C-CGAG-----GG-TAGT---TCG--GGTG-----CAG-GGTA---CTA-T-ATATA---G-G-CTGTGA------TCA-GC-GATATTTCG--GC---ACTTCAG--CTGT--GGAGAT----G--AC--GAGAAGAA-GA------C-GG---T-GATA-AA--GG-TAC---TA--A--TATATAATA------C-GGCG--TGTATTATA--ATATT--CAG--TATA-----CGGTG-----G--CTA--GTGTACTGG-TC---TG-----GA---G--AATAG--AATAA--AGTATTCC-C---AG-GTT---AAGTAT-C-A-----GG--T-----GTCC-GGGTAGAG-GTATCTATACCTATAC-ATACTT--GACAAG-----CACCTGTCCGG--TATA-----------AGGA-CAG--AA-CT----AG-CAT-AGGAC-ACAG-ACA-----AG-C-A---TA-G-GT----CC-A--G--C----CATA---CGCA-------C--CC---AT--ACC--TT-AGGTC--T--CC----A---T-GC-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-AT----------AGG-T---AATC-C-TGT-----A----TA---A------TAT-TATCTGT--AT---ATAT--TG---AC--TCG--TT-----ATTTT--TAATAG---TGTTCA-TA---TTT-TGCAT--TC---A--TTC---ATT-AATAAT-C---AT-C---ATGC------C-CCAG-A-CTG-----GT-C-C-G----ATCAACACGAAC--CTAAACAC
gi|10 : --AGACAAGTTCAG---CTGCTAAGG----AGTTACAA--AAT--TAAAATTAATGCGGTTC-TGAA---AAG---CACCTTAAAAGGGACT-GTCCACAACGGAT-CAAAGAGTTGG-AACTCCG-TAGCAATTCAAAAGAG-AATGAACACAAAAGGACTGATGCAGGTCGTAATGCATCTGATC-A--ATATT-CT--AGGGTAGTGCATT--CCATAAA---CGAGAAAGGGGTT--TA-TGT---CACGGCA-C--GTATC--------CATGGAATGGATG-TA--TATCTGTT-G-GT--TGATACAGGTGCTA-CG-G-----TGTCCTTGCTATCTACAATTTGTTA-TGAGAACA-TTGC-AAGGGT-CACAG-GTCAA-CCCTT-AAC--A--------------AGATGTACTATCATC-TAGTGG-ATCA--CCGCTAACGGT
gi|10 : TCCTGGTTGAGAATG--AGGTAGTAAT-TG---AC-ATGCGCATGCA-AAAGA-TAAAAA--TATCTGGC-ATTGAGCAC-CTTATCAAGCTGGAccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcctggttgagaatgaggtagtaattgacatgcgcatgcaaaagataaaaatatctggcattgagcaccttatcaagctgga
gi|11 : agacaagttcagctgctaaggagttacaaaattaaaattaatgcggttctgaaaagcaccttaaaagggactgtccacaacggatcaaagagttggaactccgtagcaattcaaaagagaatgaacacaaaaggactgatgcaggtcgtaatgcatctgatcaatattctagggtagtgcattccataaacgagaaaggggtttatgtcacggcacgtatccatggaatggatgtatatctgttggttgatacaggtgctacggtgtccttgctatctacaatttgttatgagaacattgcaagggtcacaggtcaacccttaacaagatgtactatcatctagtggatcaccgctaacggtccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn----TA-------T----------TT-----------CG---------G---G-TG--T--TATT-GT-TGT-GC-A-T--T----ATTG--AAA--GCA-T----C-TGAG-----GG-T-GT---TCG--GGTG-----CAG-GGTA---CTA-T-A--TA---ACG-CAGTGA------TCA-GC-GATATTTCG--GC---AGTTCAA--CTGT--GGAGCT---AG--AC--GAGAGAAA-GA------C-GG---T-GATA-AA--GG-TAC---TATAA--T-TATAGAA------C-GGCG--TGTATTATA--ATATT--CAG--TATA-----CGGTG-----G--CTA--GTGTACTGG-TC---TG-----GA----------------------CATTTC-C---AG-GTTTA-AAGTGT-CGA-----GA--TC-G--GTCC-GGCTATAGAGAA--TA------TTA-AGA------ACAAG-----CACCTGTCCGG--TAT------------AGGA-CAGA-AA-CT----AG-CTT-AGGAC-ACAG-ACA-----AG-C-A---CA-GTGT----CC-A--G--C----CTTA---CGC--------CA-CC---AT--ACC--TT-AGGT---T--CT----A---T-GC-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-AT----------AGG-T---AATC-C-TGTATA--A----TA---A------TAT-TATCTGT--AT---ATA---TG---AC--TCG--TT-----ATTTT--TAATAGT--TGTTCA-TA---TTT-TGCAT--TC---A--TTC---ATT-GATAAT-C---ATAC---ATGC------C-CCAG-A-CTG-----GT-C-CAA----ATCA--ACGAAC--CTAAACAC
gi|12 : ----TA-------T----------TT-----------CG---------G---G-TG--T--TATT-GT-TGT-GC-A-T--T----AT-G--AAA--GCA-T----C-TGAG-----GG-TAGT---TCG--GGTG-----CAG-GGTA---CTA-T-A--TA---ACG-CAGTGA------TCA-GC-GATATTTCG--GC---AGTTCAA--CTGT--GGAGCT---AG--AC--GAGA-GAA-GA------C-GG---T-GATA-AA--GG-TAC---TA-----TATATAGAA------C-GGCG--TGTATTATA--ATATT--CAG--TATA-----CGGTG-----G--CTA--GTGTACTGG-TC---TG-----GA----------------------CATTTC-C---AG-GTTTA-AAGTGT-CGA-----GA--TC-G--GTCC-GGCTATAG-AGA---A-----ATT---TA--A--GACAAG-----CACCTGTCCGG--TATA------------GGA-CAG--AAACT----AG-CTT-AGGAC-ACAG-ACA-----AG-C-A---CA-G-GTC---CC-A--G--C----CTTA---CGCA-------C--CC---AT--ACC--TT-AGGTT--T--CT----A---T-GC-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-AT----------AGG-T---AATC-C-TGT-----A----TA---A------TA---ATATGT--AT---ATAT--TG---AC--TCG--TT-----ATTTT--TAATAGT--TGTTCA-TA---TTT-TGCAT--TC---A--TTC---ATT-GATAAT-C---ATAC---ATGC------C-CCAG-A-CTG-----GT-C-CAA----ATCA--ACGAAC--CTAAACACg
gi|13 : -GACAAGAGCA----GCCGGGTG-TCTC--C-CAC--CTCATC---ATGGGGAA--TAGTTGAGAGTG-A-GACAAGTGAGT-GGATGTTGAGAATC--CTGGAAGG-TTCAA--GTGTGGGA-GAGGGGGTTGATGGTCTCGGGGAAGA-G-TGGG-GC-AGAACCATGCTT-TCT-GTAGTCGCATAG----------GA-CTGTG-TTATACGTTAAAGGAAATCTCAAG-TCCTGTCCAGGCC-CTCCAGAAA-GGTCAC-AGT--GGAAGAGGATAGTGGTA-AGTAGGAAGTGTGTAGATG-GGCGGGTATGTC-GA-AGTCAGGTTTGAGCCGCATCTGAG-A-A-TAAT-TCAGCAG-AATGGT-GGTCAG-AGTAACTCAGACAAAAG---ATCGT-GA---------CG--GGT----CA-AAGA-AG---TCTCCAGTAACGA--CGTATG-CATG--AACGGGCAAGGAGTCA-AGAAATAAACGGAGAGTGAAAGA-TTTTT-GTTTAGATGTAGACGTTTAAT-A-AGCAGCA---A-CTGT-AAg
gi|14 : a-TGCATGTATATATGATGAGAGAGGTACTCGTCCCGC--ATCAAGAGTTACTA-GTCCC--GT--ATCGAGAGT-TACTCGTCTCGCA-TCGAA--C-AA--CAGACTGATGCC-AGAG-A-TA-CGTCCCAGGAT--GGATG-CAAACCTGCATGGACAG--ATCCGGTCTA-AGCCCCGAAACTTCGTG---AAG-CCA-GCGACATT---TGATGGTACG--GGTCTCTG--GAATGATTA--CTTGGCTGCATC---TC-
gi|14 : aTACTTGG-CTGCATCTCTTAGGGG-ACAAGCACAAGG--AG-TG-TT-----------AGGAAA-TCAGC----------C-----AA--GGGATGAGAGGCAGA--A-----TTATTGGA-----------AGCTA-----------GT-TAAAGC-CCTT---CAGGA----TA-GA----TTTGCT--CCAG-T------AAA--TCAG-ACTGAGCT--AT------A-TAGAGCACAGCT--GAGA---GAG--AGGAGGT-AAAAG-----GCATCT-GAA-AGTT--TGCCGGAGATCGAT----GGGT--C-AAGACATAAGAA-GGCTTTTTAA-TTTAGCCTACCC--GACC-Gttaggggacaagcacaaggagtgttaggaaatcagccaagggatgagaggcagaattattggaagctagttaaagcccttcaggatagatttgctccagtaaatcagactgagctatatagagcacagctgagagagaggaggtaaaaggcatctgaaagtttgccggagatcgatgggtcaagacataagaaggctttttaatttagcctacccgaccg
gi|15 : atgcatgtatatatgatgagagaggtactcgtcccgcatcaagagttactagtcccgtatcgagagttactcgtctcgcatcgaacaacagactgatgccagagatacgtcccaggatggatgcaaacctgcatggacagatccggtctaagccccgaaacttcgtgaagccagcgacatttgatggtacgggtctctggaatgatTACT--AAATAAATGG--A-TAGTAAC--A--GA-AATGGGCAT--GCATCTAG-TGGTATCATTGAGTAG-ATAAGCTCAAAG--TG-TC-TT-----------AGGAAA-TCTAC----------CTGAGGGA--G-------------A--AAAGTGTAAATACA-----------GGCTGTT---------GTGTAAAGC-AC-----AGGAG----GA-GAGGTTTTTAC---CCAC-T------AA---CCAG-ACGGAACT--TT------A-CAGAGCACAGCT--GAGA---GAGAGACGA--C-AGAAA-----GCCACA-GAG-ACAC--TACCGGAA--C--T----GGGA--C-AGGAAATACGGC-GGTTAACGAA-TCTAGCATACCC--CTCA-GCTCCAGTGGAGGT--AAGAG-AGA-CACTTG--CAA-AGGAACAGTTTCTTGATGC-GTTAAGGGA----CA--GGGACAT--GCG-TT--TGAGA-GTC-AAACAGGCGAGACCGGCTGACTTGAAT-GATACTGT-CAGAC-ACGCA--GTA-GAGTTGGATGCATTC----C-A-GG
gi|16 : a-GCACT---TT-GA---TGCC-TGT------ACTAGGAA-AAGTGG--AGCAA--AC--AA-GA-AAAAGGAAT--AAATTTCG-CTGTGTCACTAAGAGGT-CAAACACAAGG--AG-TCCTT-----------GGTAAT-TCATC----------T-----AAA-G-------------A--A-----GCACTGAACAACTATAATGAACTA-----------GC-CAAAGC-ACT----CGACG----AACGA----TTTGCTCTCCCG---------AA--CCAA-ACTGAGCT--AT------A-TCGAGCACAGCTTCGTGAACTGACAAAGAAAGC-TA------------CT-GAA---TTCCTGCCAAAA--C--T----AGGT--C-AAAGTTTCAGAA-GACTGACAAA-TCTAGCATACCC--TACG-GCACCATATGAATT--GAGAG-AAACTCTTTG--TTA-GGGGGCAATT-TTAGATGca
gi|17 : cttgagctcaca-GCACT---TT-GA---TGCC-TGT------ACTAGGAA-AAGTGG--A-GAA--AC--AA-GA-AAAAGGAAT--AAATTTCG-CTGTGTCACTAAGAGGT-CAAACACAAGG--AG-TC-TT-----------GGTAAT-TCATC----------T-----AAAAG-------------A--A-----GCACTGAC-----------AACTATAATGAACTACGC-CAAAGC-ACT----CGACG----AACGA----TTTGCTCTCCCG---------AA--CCAA-ACTGAGCT--AT------A-TCGAGCACAGCTTCGTAACT-GACAAAGAAAGC-TA------------CT-GAA---TTCCTGCCAAAA--C--T----AGGT--C-AAAGTTTCAGAA-GAC-GACAAA-TCTAGCATAACC--TACG-GCACCATATGA-AT--GAGAG-AAACTCTTTG--TTA-GGGGGCAATT-TTAGATGctcttggtgagtcaga
gi|18 : cacaG-TGT----CTACT--AAATGAGTGGGGA-CAG--AT--ACTGA-GAAAAGTTT--ATACTTGGCCTGCATCTCTTAGGGACA-AAGCACAAGAGCAGTTA-TTATTATATTTTAGAGGAA-TCAGC----------C-----Actcttggtgagtcaga
gi|18 : A-----------ATCTA-----------GT-TAAAAG-CCTTGTACAAGGAATTTA-GA----TT-GCC-TC-AG-TCAAGGAAAATTCCAG-GC-GA-CTTTATCTTCTAA-TAGAGCACAGCT--GAGAC--GAGCAGGAAGGCTAAGAGATAATGCATCT-GAA-AGTT----CCGGAG--C--TACAAGCGT--C-AACACCTAAGAA-Gcagtcgaagatccagaaccgatcttctgcgttcgagatccatttttgccacagctaaaatctagttaaaagccttgtacaaggaatttagattgcctcagtcaaggaaaattccaggcgactttatcttctaatagagcacagctgagacgagcaggaaggctaagagataatgcatctgaaagttccggagctacaagcgtcaacacctaagaagcccttagtgtgagactactc
gi|19 : gtgtctactaaatgagtggggacagatactgagaaaagtttatacttggcctgcatctcttagggacaaagcacaagagcagttattattatattttagaggaatcagccacagtcgaagatccagaaccgatcttctgcgttcgagatccatttttgccacagctaaT--TGCCAGAG--C--T----TGGG--C-AGGACATACTCA-GGCTGGCCAA-CCTCGCATATCC--AACT-GCCCCAATTGAGGT--CAGAG-AAA-CCCTTG--CCA-AGGAGCAATTCATTGATG---CTCTGAAGG-A-CAGTGACA--T--GAG-AA--T-ACGCATT-AAACAAGCCAGACCAGTCGACCTGAAT-AATGCTATCCGTCA-T-GCC--GTG-GAGTTGGATGCATTTA-A-CTC-TGCCAAAAGACGTCTCCGTGA-AGA---------TAAAGGTTATTT-GAG-GGAGG-----CTAATCAG--CCATG-CAAAA--CAGACAAAcccttagtgtgagactactc
gi|2 : aacaAGAGCGAGAATACATGAGTTCGTTA-CGG--TCCTGAACT--TCTAGGAGCATGCAGTCCCATAGCCCGAGACCCATA-CAGGAAATA-----GT-GT--ACT-TCACC--CAGTAT-TA---AGA---CAGGAGAAGAG---------TGTAA-GTGA---ATGT-TT-AGTGGA-TGAGATGCATGTG-ACATGATGAGAGAGGTACTCGTC---C--ATCAAGAGTTACTA-GTCCC--GTGGATC-CGAGT-TACTCGTCTCGCATTCGAA--CAAA--CAGACTGATGCCGAGAT-ACTATCGATCCAGGAT--GGA-G-C-AACCTGCAT-GACAGAAATCCGGTCTA-AG-CCCGAAACATCGTTAGAAAA-CCA-GCGAC-TA---TGATGGTACA--GGTCTCTGGTGGA-GATTATTCTTGTC-GCATTCGGTCTGAGA-TGTG-TGT----CTACT--GAA-GAGTGG--A-CAG--AT--ATTGATGAAAGGTTT--ATACT--G-CTGCATCTCTTAGGGACAAAAGCACAAGG--A--TG--T-----------GGAAAA-TCAGCCAGGATAAGGC-----AA--G-------------A--A-----T-ATT-GA-----------AGCTA-----------GT-TAAAGC-CCTT---CAGGA----TA-GA----TTTGC--TCCAGTT------AAA--TCAG-ACTGAGCT--AT------A---GAGCACAGCT--GAGA---GAG--AGGAGGC-AAAAG-----GCATCTAGAA-AGTT--TGCCGG-G--A--T----GGGTGCC-AACA---AAGAATGACTTGTTAA-T-TAGC-TCCCCGAAACC-GCTCCTGATGAGGT--AAGGGAAAA-TACTTG--CTACACGAACAGTTTTGAGATGGAACTACATAGTAT-CA--GAGA--TTGACGATC--TCAAA-ATCAAAACAGGCAAGACCTGT-AAACTGAACAGACGAGTCACGAAGTA-G-C--GTTGGAACT-GAGGCATACATA-C-A-GTCCAGAGGA-GTCGCCG-GATAGAAGCT----GT-AGA-TCA--GAGAGT-GAAGT-TTCCTA--CAGAATCGTCACGAAGGCAAAACAAACTCGATTCGTGAT-CAT-GAGACTT-AGAAAGAGA--ATGCGCT-TCTAC--CAGAG-T-ATT--AAGGATATTGAAACAATGATGATTTCAGCAACAGGGTCAACGGAACGTATGCC-CATCAACAAAGAC-AGCTCAGG--TT-CTAAGG---ATATGAGAAAGAATGTTTACAC-ACTGC-GTTCATGAATCGAAGGATCACTCTAAAAGGTACTGGCCCGCAATGGAGACAAAGA-TTGGTAACTCCGATAGCAATTCAAAAGAA-GGT-AACAAAAGGAGAA-GATGCAGCTC-CGATATCCTTGACCAA--ATATCACA--AGAGTAGT-CA-T--CCATAGAAATCGA-AAAGGGGTT--TA-TGT---CACGGCAGC--GTAT---------CAT-GAAT-GAGGATA--TACTTGTT-A-GT--TGATACAGGCGCCA-CGCGGAAATCGTCCTTGCTATCTACAATGTGTTAGTGAGAACA-TTGC-AAGAGT-CACAGTGCTAACTCCTTGGACTAAGG---GTC-GAGAAGGATTTGCTATCAGCTTAGTGGCATCA--CCGC-GAATGTACTTGGATATACAGTTCC-AGTA-ATT-TAAACGTTGG-A-G-CATTGCAAGTAAAAAT-G--GC-AT-G-AA--GAGTCA-AGCT--TGACCTACACAGTGGATGG-----CTT--GGATT-GATTTCCCTGTTAAGCATAGTGGGCA-TAAT-CATACAC-ATGCGCATACA-G--GATTAAAAA--TATC-GGC-AACGAGCACGCCTATCATACTGGGAAGGTGGTCGGTCGAACCTC-TAAAGGGTAG----CCATGGCTTTCATGAGACGTC-CAGATACCA-CTAGATCG--AACT-GTGATAGGAAGGAGAAGATACGT-ACTA-GATCGGGGATGGAGAC--TCTCAACCAAAGCTT-GAATA-TGA--A--AAGCATT---CTGGAAA--AAGAAATTCAGAGG-----T---GTTC-TG-T-T-GCTGGCC------------ACGAAAAACCTGGTT----TAGC-----ACA-GAGTAGCACA----TGC-AACACAAA-G----CCCGGATGCCCTCTTC-CA
gi|20 : actggtacacgaatcaacgaacctaacaacgttaaaattttggtggccagcaacgggatttggatcagtcatttaagtaaaagcattagtattcgtaaaaatgaatgagcaggattacaaagacaagtgtaatcagttagaagggggagatagatcgcctcC-T-GAATA-TAAC-AGTAAGCATTTTGC-GGAAAGGAGT---TTCAGGAGACGGTCCGGGTTCT-ATTAT-GCTGGCCCGATCATTGGAGA--GAACACCTG--TAATGCTGTTAAACACATCAGAAGCACACCTATGC-AACACAAACGCTTCGC-GGATG-CCTCTCCTCACTAATCATCTATACTGGAAAATTAGT-GAA--TG-A---T-GGTGACTGGGATGT--AG-ATCCTCCGA-AAG-TTCAACGGTTGTGAGCGAGGa
gi|21 : GGGC-A-AG-ACA-----AG-CCA---TA-G-GTC---CC-A--G--C----CTTAA--CGCG-------CA-CC---AT--ACC--T--AGGTCG-T--CC----A---T-GC-C-T-TTG-AATAT-TTA--GG-AT----------AGG-T---CATG-C-TGT-----A----TA---A------TAT-TATCTGTTAGT---A-AT--TG---ACT-TCG--TT-----AATTT--TAATAG---TGTTGA-TT---TTTATGCAT--TCAGGA--TTCGCGATT-AAT-AT-C---AT-CTCAATACATTGCAC-TAAG-A-CTG-----GTACAC-GA---ATCA--ACGAAC--CTAAcag
gi|22 : CTGGCC------------A--AAAGACTTG--T----CCGT-----ACA-CAGAAGAACA----TGC-TACACAAACA----GCCGGATG-CCTCcaacgt
gi|22 : T--AG-ATC--CTG--AAG-TTCAA--GTTGGGGACGAGGGGGTTAT-GGTCTCccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntagatcctgaagttcaagttggggacgagggggttatggtctc
gi|23 : ctggccaaaagacttgtccgtacacagaagaacatgctacacaaacagccggatgcctcccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-AGGTTA-T--CT----A---TTGC-CAT-TTG-A-T-T-T-A--GG-AT----------ACA-A---AGTA-C-TG----------------A------TGT-AATCTGT--AT---ATATATTG---GC--TCG--TT-----ATTTTTCTGATAGT--TATTCA-TA---TTT----------------TTT---GCT-GA-AAT-C---AT-A---GTGC------C-GCAGCA-CTGC----GT-C-C-GAT--ATCA--TC-AAC--CTAAAC
gi|24 : ----AAG-CTA-GCAACAAT---TGATGGTATG--GGTTCCTG--GGTAGACTA--CAAATC-CCATT---TT-GAG---GCT-TGTAGCTCT-TT--GAATCAGTGG--A-CGG--AC--AGGGA-AAAAGGTCT--ATATCTAA-GTGTGTCGCTCA-GAGAACAGGCcgt
gi|25 : -TAAAGC-ACT-----GGAG----GA-GAGGTTTTTACC--CCAC-T------AAC--GCAG-AC-GAACT--CT------AACAGAGCACAACT--GAGA---tattatacggt
gi|27 : agctcaaagttgttaggaaatcatactcctggggaggaaaagtgtaattacaggctgttgtgACGCATACCAGG---TAT----GAAGTTAACCAGTACC--CCGTATGTAGACAGAGATCATGAG-AGAGATTGCAAAATGTAA-GTGGGCCATCT-TC-GTT-AATTGAA-TGag
gi|28 : gagaacCAGCT--GAGA---GA--AAGCA-GC-AAAAT-----ATATCT-TAAGGGTT--TACCGACG--A--T----GGAT--C-ATCATGTAAAAA-GACTAGTCAA-TCTAGCCAACTC--AATC-TCTCCTGAataca
gi|3 : acagacTGTT-G-TT--TGATTCAGGTGCTAACG-G------GTCCTTGCTATCTACAATTTGTTA--GAGAACATTGGCCAAGGGTTCA-AG-GTCAA-TCCTT-GAC--AAGAGGGTCG-AGAGAGATGTGCTATCAGC-TAGTGG-ATCA--CCGCTAAAGGTAATGGGA---AAAGTT-C-AGTAGATT-ATAA-G-TGGCG-GACTTTGC--GT-----TAA-AGCAATAG-AAATCGGTCATAGCTGATGACTTA-ACAGTGGATTGGAATTCTTTGGGATTAGATTT-CTGGTTAAGCATG--AGGTGTTAATATG---ACAATTCGCTGGCATA--GA-TAAAGA--TATCTGGCAATGAAGCAC-CCTATCAA-CTGGACGGGTTGC------AACC-CATATAAGGTAGTCCACCGT-----TCATGGA--GTTACG--TA-CACCTGAATCGGAAGCTGATGGTA-GAAGGAG-AGATACGTGACTAG--T---GGATGGAGGTCAT-TCAGCC-AAGC-TCGGAGACTGATAA--AGGCATT---C-GG-AA--AGT---TTCAGAA------TTGGGTTCTTGTT-TGGCTGGCC------------A--AAACA-CTG--T----TCGTA----ACA-CAGAAG-ACA----TGCAGA---AAACG----CCCGGA---CCTCTT--CAC--ATCATC---AACGGGAA--TA-TTGAAGATG-------TGTGACTGGGATGTAAAG-ATC--CCG--AAGTTTCAA--GTTGGGGACGAGGGAGTTGA-GGTCTCAGAGAAGT-GAT-GGAGCTAGGGCCA-CCTTATCTGGTAG-TGCCGAGC-TGAATTACTA-CCGTGTTTATTCGC-AAAGAACCTGTCTAA-GTCTGT--AGA-CGCTC--GAAATAGTC-CAAGTCGAGAAGAGGA-AGTGTT-CAGTAGGAAGT-TGT-GA-GATGCCGG--T-TTAGACAATCACG-TTGAGCC-CAT-CAAGTG-A-C-A--TCAGCAGAAATGGTGGGTCAGTGGT-AC-CA-ATCGAAAGATAGTGTTGATGGCTCGTGCG--GGT----CATAAGA-AGTCAT-TC--GT--CACTAGGTATTCCAAGCAAAC-AAGAAAGAGTCA-AGA-------GAAG---GAAGAA-TCTTTCCGTAAGATGTAG-CGGAT-AT--CAGC-GCCT--A-CTGTAAACATGTCAAGAC--GTTGGTTGTTATTGGACTTG--CTTGGCAA-T-TAATGCA-TG---TCA-ACCTTTCAATCACCAGG--GGAGGTG-GA-AGAA-TC--TTATTCAT--TT-G-TACATTTTTTTTTTCATGTT-TGCTCACAGATCTATAATCTG----GTCC----------TGTTTTGATAA-AAAAGATT-AGATTAAT--ATCA-TGTATA--TT---TTATTCATGTCGAGG-A-CACGATGCC--CATAGA-G--GCG-G--GGTGAATGTGA---C-A--TTAAAGG----TCGGGAT-C--GGATG--GGTTGGTATTATATGT--AT-CA-------GATAG--TG----CTAATAAAAGCTCA-------T---------GTC-----------CA---------G---ACTT--T--TACTAGTAGGG-GC-A-T--TGGCGAT----ATA--ACA-T------CGAGTGGCAGG-TAGT---TCG--GGTG-----TTG-AGCAAGTGTA-TAA-ATA---G-G---GCG-------TCT-GCTGAAATT--G--TC---ACTTCAG--CTGT--GGAGATTCATG--AC--GAGGAGAAGGA------CAGG---T-GATATAAATGG-TCC---TA--GGCTATATTATAC-----CAGGAGC-TATGTTATA--ATATT--CAG---ATAAC---CGGTG-----GGTCTA--GTGTACTGGTTC---TG-----GACCCA--GATAGT--ATGAGTAATATTTCAC---AA-TTTTA-AAGTG--C-A-----AAGTCC-G--GT-C-GGTTATAGAGAG--TA-----AATG-TTA--A--GACAAG-----CACCTGTCCGG--CGTAGT---------AGGATCAGGAAA-CTAA--AG-CAT-AGGGA-TCAG-TAA-----AG-C-A----A-G-GTC---CC-ACTG--CT---CTTAGTCCGCAAGAGGAGCA-CCTCTAT--A-C--TT-AGGTC--TGCCC----ATCCT-GCTTATATTGCA-T-TATTACCGG-ATTAGCTTACTCAGGCT---AATC-T-TCTAAGCGA----TG---AATAGACTAT-TATCTGT--AT---AT-T--TG---ACCGTCGAATG-----ATTTT--TAATAG---T
gi|30 : tC---CC-A--G--T----CTTA---CGCA--------G-CC---AT--ACC--TT-AGGTT--T--GT----A---T-GT-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-AT----------AGG-T---AATC-C-TAT-----A----TA---A----------TATCTAT--AT---ATAT--TG---AC--TCG--TT-----ATTTT--TAATAG---Ttgt
gi|32 : GA-AGAA-TTCATTATTCAT-CTTCG-TACA--TTTTTTTTC
gi|33 : gcatattctacatcaccagggatggattgtttatgtgtgtttgccaTGTGA---CAA--ATTGAGA----TCGGGTT-C-GGGATG------TGT----CATTT--AT-CA-------GAT-
gi|4 : atAGAGAGGATACATGG--TTGTTAACGGGGTTCTGAACTCTTCTAGGA---TGCG--CCCATAGCC-GAGACCCG-ACCAGG---TGTACTGGA-GT--A--AGTACCGACTGAATAGA---GAA---AGAGAG-AGAGC--------TGTAAAGTGG---ATAT-TTTAGT-GA-TGAA-TGCATGTGTACA-GATGAGAGAG---CTCGTCCCGCGCATCAAAGGTTACTAAGTCCCAAGT--AT-GAGAGTATTCTCATCCCGCAATCGAAGAC-AATGCAGACTGATGC--AGATCA-TA-C-TCGATGGATAGGGATG-CAA-CCTGGATGGACAG--ATCCGGTCTATAG-CC---GACTT-GT----AAAACCAAGCGACATACGCTGATGGTACATCGGTCTTTG----AAGATTA--CTTGTT-TCATT---TC-GGTC-TGTGGTGT----CT-CT--AAATGA-TGG----CAG---CTTATTGA-GAAAGGTTTTAATACTTGG-CTGAATCTT----GGGGACAAGCACAAGG--AG-T---T-----------AGGAAACTCAGCAAGGGA----T-----AA--G-------------GCGA-----TTATTGGA-----------AG-TA-----------GT-TAAAGCGCCTT---CAGA-----TA-G-----CTTGCT-TCGAG-T------AAAA-TCAGGACTGAGCT--AT------A-TAGAG-ACAGCT--GA-A---GAGAA-GGAGGC-AAAAG-----GCATCT-GAA-AGTT--TGCCGGAG--A--T-----GGT--CAAAGAC-TAAGAA-G--TTGTTAATTTTAACT--CCC--GACCTGCT-CTGATGATGTCAAGGAG-AAA-TTCTTGCCCTACAGAAG----TCTT-GATGG-ACTA---AGT-TAAA--GAGA--T--GC--TCTGTCAAG-AT---GACAGGCAAGACCTGTAAAGCT-AAT-GATCGGATACAGAG-A-GCTTGGTT--AACTGGAAGCA-ACA-C-C-AGGGCCAGAAGA-GTCGCCG-GATAGATCCTGTCAGTAAGAGTCA--T-GAGTGGACGTCT--CTA--CAGAA--GTC-CACAG--AAAACAAACTCGAT---CGAT-CAT-GAGAGTA---AAA-AGAATATGCGCTCTC-ACAGC-GAGAT-ATTAAAAGGAT-TGAAAAC-ATGGAAGTTTCAG-TACAGGGTCAA--GGATGTA-GCCTCAT-AAC--AG--AAGAT-GGGATTTGCTAAGG-ATAAGTTAGAC--AAT-TT-ACA--AATGCGGTTC-TGAA---AAG----A--TTAAAAGGG----GCGCG-AATGGAG---AAGAGTTGA-AACT-CG-TAGC-ATTC-AAAGAGCAATGAACACAAGGGGA-TGATGCAGGTCGTAATGCATCTGACC----ATATT--T--AGGGTAGTGCCTT--CCATAAA---CGAGAAAGGGGTT--TA-agatgtt
gi|5 : tcaagaaactaaacaacgtcgttataaccagcataaattttggtggagaacgagatttgggagtccatgattaattaaaacattagtatctaaaaagatgagcaacggattacacaagaagtaaaccagttgaaagggaatagattgctccCAGGAA--TAGTTGAAGATG-AAGAC-AGTGACTGGGATGT--AG-ATC--CCG--AAG-TTCAA--GTTGGGGACGAGGGGGTTGA-GGTCTCAGAGAAGGAGATGGGAGC-AAGGCCATCCTTATCTGGTAG-TGCAGAGC-TT-ATTACTAGCCGTG-TTATTCGCAAAAGAACATTTCCAAGTCCTGTCCAGA-C-CTCCAGAAA-AGTCACAAGTCGAAAAGAGGA-AGTGGTACAG-AGGAAGTGTGTAGA---TGCCGGTAT-TCAGACAGTCACGTTTGAGCC-CATTCAAGTG-ATCAAG-TCAGCAGAAATTGTGGATCAG-GGT-ATTCAGACAGAAGGATACCGTCGA---------CGTTGGTTAGGCA-AAGACAG---C-T---G---CAC--AGTAT--CAAA-AAACG-ACCAAGA-TCATCGA-------GAAG---GAA-AA-TTTTT-CGAAAG---TA-ATG-AT-AT-A-AGC-ACATTAA-CTGT-AATA-----AG---CGTT-GTG-T-ATGGC-CTTGACATT-GCAATT-TAATGCA-TGTGTTCA-A-CTTTCAATCACCAGG--G-A-GTGCGA-AGAA-TTCATTACTCATGCTT-GATACA--TTTTTT--CATGTT--G-TCAC----------TCTC------------------TGTTATA--AA-AAAA--CTATAAT---TCAATC--T-TATA--TT---T-A-T-ATGT-GAGGGA-CAC-ATGGCG-CGTAGA-G--G-GTG--GGTAGAT-T-A---CAA--T-AAAGG----TCGATG---GAGAATGATGGTTGCG----TATGT--AT-CATTATCGAGAT-A--G-----CA--TAAA----TAAGCTTAAT---------GTC-----------CA---------ACCAG-TGACT--TTTC-GT-AGG-GC-A-TGGT----AT-T--ACA--ATACT----C-CGAG--------TAGT---TCA--GGTG-----TTG-AA-A---CTAAT-A-ATA---G-G-C----A------TCT-GCTGATA---CG--TC---ACTTCAG--TTGT--GGAGAT---CG--AC--GAGA-GAA-GA------C-GG---T-GACA-AA--GG-TAC---TA-----TATATAATA------C-GGCG--TGTATTATA--ATATT--CAG--TATA-----CGGTG-----G--CTA--GTGTACTGA-TA---TG-----GA---C--AATAGT-AATAA--AGTATTTC-C---AG-GTTTA-AAGTGT-CAA-----GA--TC-G--GTCC-GGTTATAG-AGA--AA-----GTTA-A-------GACAAG-----CACCTGTCCGG--TATAGGCGGGGGTATAGGA-CAGA-AA-CT----AG-CAT-AGGGC-AC
gi|6 : AGCTGCAT--ATCTGT-TACTTTAAAAGACCTGTT-GTT-TTATTGTGCTTGACTTTTGTCATTGTATTGCATTGT--T-A-A-CTTATAGTTA--AGGGAGGA-G-GCGACAAAATTTCCTTATT-AT--TT-G-TGCA--TGCTTTTGC-TGT-------A-------------TC----ATC-----------TGTTTTG--AA--------TAAGAT---T--ATCATTGTATA--TT---TTA-TCATGT-GAGG-A-CA--ATGAAG-GCT-GA-GTCGCGTG--GGTAAGTGTGGCATCAA--TTAGAGA----TCGGGGT-GCGGGAT----GTTCAG----CATATTAATATA-------GAT-G--CTAAATCTA-TAAC----TA-------T---------GCTTTACTGTCAACCG---------G---A-CT--TCATATT-GT-AGGAGCTACT--T----AG-GTCATACCACA-TG---CGCGAG-----GGTTAGTACATCGGTGGTAT----CAGCAG-----CTC-T-A-ATATATC-G-C-GTGGCAGTATTCT-GCTAGCATTTTGTTTC----GTTCAAATCTGTTGGGAGCT---CGTCAA--GAGAAGAA-CAAGCAGTC-GGATAC-AATA-AA--GGTTACGG-CA--A--TATATAATATAAATGCGGGCGTTTGT-TTAT---ACATTGACAGTATATA-----CGGTGCTTACG--CTAAGGTCTATTGA-TCGCGTGCTGTCGA---GATAATAAT-AATAA--AGTATCTT-CACAAG-GTTTATAAGTGTAC-ATGAGGGA--TT-GGAGTCCTGGGT--AG-GTA--AG-----ATTGCATA--TTAGAGGAGTACGTCACGTGTCCGGGTTATA-----------GGCA--AC--AA-CT----AG-TAT--GGGCGGTAGCACATATTTAG-C-ATATTA-G-CTC---CCGA--G--CGCTTCTT----CTCA-------CAGCC---ATTAACCAGTTAAGGACATT--CT----A---T-GG-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-CT----------ACA-A---AATCTT-TGT-----ATCTGTAGGCA------TGTATATC-GT--ATTCGAC-T--TG---TC--TCGT-TT-----ATTTT--C----------CTCATTG---TTT-GGCATTATC---A--TTC---ATTAGATAATCC---AT-T----TGC------CGCCAGTATCTG-----GT-T-C-GCGCAATCA--TCGAAC--CTAA
gi|7 : -TAGTGCT-TTT--CCATA-CTT-CAATC-CCAGG--GAG-AT-CGA-AGAA-ATCATTATTCAT-CT--G-T-CA--TTTT----CATGTTGTCCTCAC----------TCTTTTTTACCGGTATTACATGTATTTTG--AATAAACGATTAATAT---A--ATT--TGTATAATTTCAATTG-TCATGT-GAGG-AACAC-ATGACGGCATAGAAG--GCGTGTGGGTAAGTGTGA---CAAACTTGAAGAACAATCGGGTTTCGGCGATG-----TTGT----CATTT--AT-CA-------GAT-AGAT-----CT--GACA----TA-------TAA-------GTTTA---------CGTCAACTTCTG---G-TA--C--TTTTCGT-AGG-AC-A-TAGT----AG-G--AAA---CA-TGCTCC-CGAG-----GG-TAGT---TCG--GGTGTTTTTCAC-AGTA----TG---A-ATA---G-GGC-ATAA------TCTTGCTGAGATTTTG--CTCGTAGTTCAT--CTGT--GGTCTC---CG--AT-------------------C-GA---T-TA-A-AA--AG-TACACGCA--A--TATAATATA------CGGCTG--TGTATTATTTTATATT---AG--TATATATAACGGTG-----G--TTA--GTATACTGGGTC---TGC----GC---A--GATAGTTCGTA----GTAT--C-C---AGAGTTT------GT-A-A-----GA--TCCGT-GTCC-GGGTAATG-AGC--TA-----AT--------------AGG-----TACATGTCCGG--TATA-----------AGGA-CAG--AA-CTGTAAAGTCATCAGAAC-ACAG-CCA-----AGTC-A---TACG-GCCAAACA-A--GCAC----CTTGC--CGAG-------CC-CC---AT--ACCT-TT-AAGTT--T--TTTCCAA---TAGT-CAT-TTG-G-A-T-TTA--GGAAT----------AGG-TGGGAATC-C-C-T-----A----TAAC-A------TAT-TATCTGT--AT---ATAT--TGTCAGC--TCG--TTTTTTAATTTTCCTAATAGCTCTGTTCA-TGTATTTT-TGTAT--TC---ATTTTC---ATT-CATAATGCACGAC-C---ATGT------C-GCCT-A-TTGATTCTGT-C-C-GA---ATCA--AAGAACCACTAAACA
gi|8 : ttaATTAAAAGACC-GTT-GTT-TTATTGTGCTTGACTTTTGCAATT-TATTGCA-TGT--TCA-A-CTTTCAGTTACCAGG--GAG-GAGCGA-AAAA-TTCCTTATTCAT-CTT-G-TGCA--TTTTT-----------GCTGAC----------TC------ATC-----------TGTTTTG--AA-TAAAGATTA-----------TCA-TGTATA--TT---TTA-TCATGT-GAGG-A-CAC-ATGAGG-CATAGA-G--GCGTG--GGTAA-TGTGA---CAA--ATTGAGA----TCGGGGT-CGGG-ATG------TAT----CATAT--AT-CAAATA---GAT-G--C---------TAAA----TA-------TAAAGCTTACGTCAAC--------CG---------G---A-CT--T--TATT-GT-AGG-AC-A-T--T----AG-G--ATA--ACA-T----C-CGAG-----GG-TAGT---TCG--GGTGTT---CAGCAGTA----TA---A-ATAC--G-G-C---AA------TCT-GCTGAGATTT-G--TC---AGTTCAA--CTGT--GGAGCT---CG--ACAAGAGAAGAA-GT------C-GA---TAAAAA-AA--GG-TACGG-CA--A--TATATAATATAAATGCGGGCGTTTGT-TTAT---ACATTGACAGTATATA-----CGGTGCTTACG--CTAAGGTCTATTGA-TCGCGTGCTGTCGA---GATAATAAT-AATAA--AGTATCTT-CACAAG-GTTTATAAGTGTAC-ATGAGGGA--TT-GGAGTCCTGGGT--AG-GTA--AG-----ATTGCATA--TTAGAGGAGTACGTCACGTGTCCGGGTTATA-----------GGCA--AC--AA-CT----AG-TAT--GGGCGGTAGCACATATTTAG-C-ATATTA-G-CTC---CCGA--G--CGCTTCTT----CTCA-------CAGCC---ATTAACCAGTTAAGGACATT--CT----A---T-GG-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-AT----------ACA-A---AATC-CTTGT-----A----T----C------TG--TACATGT--AT---ATAT--TG---AC--TCG--TT-----ATT---------------TTCA-TAT--TTT-TGCAT--TC---A--TTC---A-T-GATAAT-C---A
gi|9 : att-A-GCT--GTT-GAACTGGAAGCATACA-A-C-A-GGGCAGAG-A-GTCGCCG-GATAGATGCT----GTTGGAGTCA--T-GAGTGGAAGT-T--CTA--CAGAACCGTC-CAGAG--AAAACAAACTCGAT---CGATTCATAGAGACTGTAGAAA-AGAATATGCGCTCTCTACAGC-GAGAT-ATT--AAGGAT-TTGAAACAATGGAAGTTTCAGTCACAGGGTCAA--GGACGTATGCCTCATCAAC--AGACAAGCTT-GG--TTACTAAGGATCAAGTTAGAA--AATGTTG-CA--AATGCGGTTC-TGAA---AAG---CACCTTAAAAGGGACT-GCCCGCAATGGAG-CAAAGAATTGG-AACTCCG-TAGCAATTCAAAAGAG-AATAAACACAAGGGGACTGATGCAGCTCGTAA------TGACC-AATATATT-CTAGAGAGTAGTGCATTTGCCATAAA---CAAGAAAGGGGTTAATACTGTTCACGCGACA-CAAGTATCATTTTGAGAATGGAAT-G-TT-TATTTACCTGTTAG-TTGGTGATT--GGTACGA-GG-G-----C-----TGC-ATTTACG--TGGT---------CCTT------GGGT-CACAG-GTCAA-TCCTT-GAC--AAA---GGTAGAGAGAGATGTTCTATCAGC-TAGTGG-ATCA--CCGCTAAATGTACTGGGG---AAAGTT-CGAGTAGATT-TAAA-GCTGG-ACAACATTGC--AT-----TAA-AGC-AT-GAAA--TGGTCATAGC---NNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN--NNNN--NGAT
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|26 ): GTAACGAATTGAGATCGGATTTGGAAGCATTATATATCGATTATCTAGAGGAAAAGGCAAATATGACGAAAAACGCTTATGTCAACCGGACTTTGGTGTAGAGTATCACGAT
Unaligned ( gi|29 ): TGTAACGAATTGAGATCGGATGTGGAAGCATTATATATCGATTATCTAGAGGAAAAGGCAAATATGACGAAAAACGCTTATGTCAACCGGACTTTGGGTGTA
Unaligned ( gi|31 ): AATTTTGGTGGCAGCAACGGGATTTGGATCGGTCAGNTCAATAAGTTTGTTAATAGACAGAAGAGTGAACAATAATAATATATAAGTTACTCGGCTAG
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 1 22 111 2222222222 1 11 1 11 222222 222 1 555555555 1 111 1 1 111 111 1 11 11 111 1 111 11 22 1111 11 111 11 1 1 11 1 1 2222 1111 11 11 111 33333333 1111 11 11 111 11 222222222222222 777777777777777777777777777777777777777777777777777 22222222222 33333333333 222222222222222222222 111 11111111 11 111111 11 111 111111 11 11111111111 11 1 1 11 222222222 11 11 11 111111 11 111 111 1111 1111 11111 11 11 111 1 1 11 1 1 11 11 1 11 11 222222 222 11 1 1 11 111 111 11 2222 11111 11 111 11 111 1 11 333333333 1 1 11 11 222222 11 1 2222222222222 11 111 1 1 11111 11 111 1 1 1 111 222 1 2222 11 11 222222 1 222 1 11 1 1 333333 1 4444444 1 1 22 1 1 1 1 3333333 1 1 111 111 11 1 111 1 11 111 444444444 111 444444444444444 1111111 22222 1111 1111 11 111 11 33333333 11 1 1 1 33333 1 1 1 1 1 1 1 1 11 1 1 111 111 1 1 444444444 11 2222 1 1 4444444444444444444 22 22 1 11 3333333 111 111 1 222 11 111 1 11 111 888888888888888888888888888888888888 11 222222 111 11 1 111 111 1111 111 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1 1111111111111 111 111111 11111 4444444444444444444444444444444444444444444444 111111 111111 2222222222 33333333333 11 111 11 11 11111 22222 11 1 111 666666666666666666666666 111 11 3333333333333333333 1 555555555555555555555555 22222 11 333333333333 11 1111 22222 1 1111 2222 2222 2222222222 11 11 222 1111111111 33333333333333333333333333 11111 11 111 111 1 111111 111111 1 11111 111 11111
lowQualScore : 7 3 6 3 00 6 6 666 6 3 2 7777777777 0 33 666 0 33 0 666666 000 1 0 777777777 0 777 0 0 0 111 88 3 3 3 2 2 666 0 33 33 222 3 0 111 33 33 55 2222 66 777 33 3 0 5 2 33 0 0 2 2 5555 8 8 0 5555 11 9999 99 5 000 5 33333333 44 2222 444 33 9 9999 66 66 55 5 1 66 1 4 0 1 2 111 11 5 555555555555555 5 333333333333333333333333333333333333333333333333333 5 33333333333 00000000000 4 55 555555555555555555555 888 99999999 00 4 4 66 222222 4 1 11 666 88 4 4 3 111111 4 88 11 11111111111 55 4 0 33 4 2 1 1 4 0 5 777 44 1 6 77 5 1 1 77 0 5 0 8 6 33 333333333 11 11 11 666666 5 8 11 1 1 5 8 5 888 111 6 1 222 888 6 8 8 0 6 7777 6 3 4444 0 55555 11 0 3 8 1 11 777 0 5 88 0 333 2 3 3 0 33 33 0 3 3 8 33 3 3 2 11 0 0 555555 6 777 11 0 5 99 1 8 444 444 0 0 8 8 3 8 8 0 0 8 3 55 999 11 9999 88888 0 11 444 11 8 777 0 33 888888888 2 0 3 0 33 33 88 8 8 666666 0 0 0 33 0 5 8 8 8 8 8 5555555555555 8 8 11 0 777 2 2 0 0 55555 33 8 777 0 0 0 888 3 555 3 4444 88 7 2 33 8 333333 0 000 0 33 3 0 66 0 6 888888 7 7 1 3 7777777 3 3 7 44 6 6 6 2 7 3 3 3 0000000 6 1 2 3 111 444 7 33 0 777 0 3 33 777 000000000 66 3 111 333333333333333 9999999 88888 8 8 7777 6 4444 1 6 0 8 33 777 22 11 0 8 33333333 88 6 99 6 99 6 99 2 8 0 1 3 2 3 0 2 3 3 2 0 33333 4 6 0 9 0 0 0 2 0 0 2 0 3 3 2 0 55 5 0 3 88 0 3 0 3 2 3 3 0 6 2 3 111 555 3 2 0 0 9 2 2 0 6 000000000 33 1111 0 0 8888888888888888888 33 33 5 2 11 2222222 777 6 111 2 2 55 2 0 888 99 111 8 8 6 222 55 8 8 0 8 0 77 0 1 8 0 6 1 99 6 6 6 3 99 6 3 1 5 5 1 00 5 5 2 77 1 1 3 333 2 1 333333333333333333333333333333333333 99 00 44 000000 7 6 99 111 6 6 6 6 1 55 6 99 99 2 000 333 0 2222 1 000 1 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 5 888 66 0 66 5 5 5 9999999999999 1 111 5 666666 22222 5 888 66 8888888888888888888888888888888888888888888888 55 9 1 33 777 888 888 66 5 222222 66 77 5 444444 5 888 5 2 5 66 5 9999999999 00000000000 5 33 5 333 33 33 99999 55555 66 33 0 777 888888888888888888888888 0 5 777 5 00 5555555555555555555 0 44 0 111111111111111111111111 888 55555 33 111111111111 77 66 5 7777 5 5 22222 0 5 5 8888 5 5 8888 8 66 66 3333 0000 5555555555 777 22 66 8 000 55 8888 777 8 4 4 4 4 4 4 55 4 7777777777 99999 4 4 00000000000000000000000000 55 777 0 55 777 99 99 00000 11 999 5 333 55 66 999999 888 5 0 888 777777 666666 5 0 5 77777 222 00000 66 66
lowQualScore : . . . . .. . . ... . . . .......... . .. ... . .. . ...... ... . . ......... . ... . . . ... .. . . . . . ... . .. .. ... . . ... .. .. .. .... .. ... .. . . . . .. . . . . .... . . . .... .. .... .. . ... . ........ .. .... ... .. . .... .. .. .. . . .. . . . . . ... .. . ............... . ................................................... . ........... ........... . .. ..................... ... ........ .. . . .. ...... . . .. ... .. . . . ...... . .. .. ........... .. . . .. . . . . . . . ... .. . . .. . . . .. . . . . . .. ......... .. .. .. ...... . . .. . . . . . ... ... . . ... ... . . . . . .... . . .... . ..... .. . . . . .. ... . . .. . ... . . . . .. .. . . . . .. . . . .. . . ...... . ... .. . . .. . . ... ... . . . . . . . . . . . .. ... .. .... ..... . .. ... .. . ... . .. ......... . . . . .. .. .. . . ...... . . . .. . . . . . . . ............. . . .. . ... . . . . ..... .. . ... . . . ... . ... . .... .. . . .. . ...... . ... . .. . . .. . . ...... . . . . ....... . . . .. . . . . . . . . ....... . . . . ... ... . .. . ... . . .. ... ......... .. . ... ............... ....... ..... . . .... . .... . . . . .. ... .. .. . . ........ .. . .. . .. . .. . . . . . . . . . . . . . ..... . . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . .. . . . . . . . . . . . ... ... . . . . . . . . . ......... .. .... . . ................... .. .. . . .. ....... ... . ... . . .. . . ... .. ... . . . ... .. . . . . . .. . . . . . . .. . . . . .. . . . . . . .. . . . .. . . . ... . . .................................... .. .. .. ...... . . .. ... . . . . . .. . .. .. . ... ... . .... . ... . .......................................................................................................... . ... .. . .. . . . ............. . ... . ...... ..... . ... .. .............................................. .. . . .. ... ... ... .. . ...... .. .. . ...... . ... . . . .. . .......... ........... . .. . ... .. .. ..... ..... .. .. . ... ........................ . . ... . .. ................... . .. . ........................ ... ..... .. ............ .. .. . .... . . ..... . . . .... . . .... . .. .. .... .... .......... ... .. .. . ... .. .... ... . . . . . . . .. . .......... ..... . . .......................... .. ... . .. ... .. .. ..... .. ... . ... .. .. ...... ... . . ... ...... ...... . . . ..... ... ..... .. ..
lowQualScore : 3 3 7 3 00 7 7 000 7 2 5 8888888888 0 88 000 0 88 2 555555 222 2 0 555555555 0 555 8 0 0 000 88 2 2 2 5 5 222 0 88 88 222 2 0 000 88 88 88 0000 55 555 88 2 0 5 5 88 0 0 5 5 0000 0 0 8 4444 00 6666 00 7 000 7 33333333 44 1111 555 88 4 0000 99 99 11 0 0 99 9 4 7 0 6 777 99 0 888888888888888 0 888888888888888888888888888888888888888888888888888 3 88888888888 66666666666 4 66 000000000000000000000 777 11111111 66 4 6 11 888888 4 8 00 555 33 7 4 6 222222 4 00 00 22222222222 55 0 7 77 0 7 0 0 4 9 3 111 66 0 6 99 7 0 4 99 1 0 4 9 6 00 222222222 00 00 00 666666 0 0 22 0 0 0 0 6 777 333 7 0 555 333 4 0 0 8 0 0000 0 8 8888 8 66666 00 8 2 0 4 00 555 0 5 88 0 555 5 2 2 0 22 88 0 2 2 8 88 2 2 5 00 8 8 666666 4 000 00 0 8 00 0 0 000 000 8 8 0 0 2 0 0 8 8 0 2 88 000 00 6666 22222 8 00 000 00 0 555 0 88 888888888 5 0 2 0 88 44 88 0 0 444444 8 8 8 66 6 6 0 0 0 0 0 0000000000000 0 0 00 8 555 5 5 0 0 88888 88 2 555 0 0 0 000 2 777 3 0000 33 3 5 88 8 555555 0 555 0 88 2 0 88 0 5 333333 3 3 0 3 0000000 3 3 3 00 7 7 7 0 3 3 3 3 3333333 7 0 0 3 000 000 0 88 0 555 0 2 88 555 222222222 55 2 000 000000000000000 0000000 00000 0 8 0000 7 2222 0 7 8 0 88 555 44 00 8 2 22222222 33 7 22 7 22 7 22 5 0 0 0 2 5 2 0 5 2 2 5 0 22222 5 5 0 8 2 2 0 5 0 0 5 0 2 2 5 0 88 5 0 2 00 2 2 0 2 5 2 2 0 5 0 2 000 888 2 5 0 0 2 5 5 2 5 000000000 88 2222 0 0 5555555555555555555 88 22 0 5 00 5555555 555 5 000 5 5 88 5 0 222 22 888 0 0 0 222 88 0 0 6 0 8 88 8 0 8 8 7 0 22 7 7 7 5 22 7 5 0 7 7 3 00 7 7 3 99 4 3 2 000 5 0 333333333333333333333333333333333333 22 22 55 222222 3 7 22 777 7 7 7 7 0 88 7 22 22 0 000 333 6 1111 7 777 7 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 0 222 99 0 00 0 0 0 5555555555555 0 111 0 999999 55555 0 888 99 9999999999999999999999999999999999999999999999 88 4 0 55 999 888 000 99 0 555555 99 11 0 444444 0 888 0 2 0 99 0 0000000000 00000000000 6 88 1 444 88 88 44444 00000 99 88 0 555 888888888888888888888888 9 0 555 0 11 9999999999999999999 0 22 1 111111111111111111111111 888 00000 88 555555555555 55 99 0 5555 0 0 22222 0 0 0 4444 0 0 9999 9 11 11 3333 2222 1111111111 888 22 77 0 444 55 5555 000 0 0 0 0 0 0 0 55 0 5555555555 88888 0 0 55555555555555555555555555 55 000 8 55 000 55 55 00000 00 000 0 888 11 99 666666 888 0 0 888 444444 444444 7 0 0 55555 000 99999 99 99
consensus : AGAGAGAGAATACATGA-TTCGTTA-CGGG-TCCTGAACTCTTCTAGGAGCATGC-GTCCCATAGCCCGAGACCCATACCAGG---TAT----GA-GT--ACCAGT-ACC--CCGTATGTA---AGAG--CAAGAGA-GAGA-C------TGTAA-GTGG---ATAT-TT-AGTG-A-TGA-ATGCATGTGTACATGATGAGAGAGGTACTCGTCCCGC--ATCAAGAGTTACTA-GTCCC--GT--ATCGNGAGT-TACTCGTCTCGCA-T-CGAA--CAA--CAGACTGATGCCAGAG-A-TAC-GTC---CCAGGAT--GGATG-CAAACCTGCATGGACAGA--TCCGGTCTA-AG-CCCGAAACTTCGT----AAA-CCA-GCGACATA---TGATGGTACG--GGTCTCTGG-GAAGATTA--CTTGTC-GCATT---TC-GA---G-T--GCGTG----TCTACT--GAATGAGTGG--A-CAG--AC--ANTGA-GAAAGGTNT--ATACTTGG-CTGCGTCNCTNAGGGGNACAAGCACAAGG--AG-TN-TT-----------GGGAAA-TCAGC------C-----A----------A--G-------------A--A-----TTATTGGA-----------AGCTA-----------GT-TAAAGC-CCTT---CGGGGNA----GA----TTTGCT-TCCAG-T------AAA--CCAG-ACTGAGCT--AT------A-TAGAGCACAGCT--GAGA---GAGAAAGGAGGC-AAAAG-----GCATCT-GAA-AGTT--TGCCGGAG--C--T----GGGT--C-AAGACGTAAGAA-GGCTNGCNAA-TCTAGCNTACCC--NACC-GCTCCNGATGAGGT--AAGAG-AAACNC-TTG--CTACAGGAGCAGTTCTTNGATGG-ACTACGNAGT-T-CA--GAG--AT--GCG-TC--TCAAG-ATC-AAACAGGCAAGACCTGTAAACCTGAAT-GATGCGATACGGAG-A-GCC--GTT-GAACTGGANGCATAC-A-AC-A-GGCCAGAGGA-GTCGCCG-GATAGATGCT----GTAAGAGTCA--T-GAGTGGAAGT-T--CTA--CAGAACCGTC-CAGAG--AAAACAAACTCGAT---CGAT-CATAGAGACTG-AGAAA-AGAATATGCGCTCTCTACAGC-GAGA-TATT--AAGGAT-TTGAAACAATGGAAGTTTCAGTCACAGGGTCAA--GGACGTATGCCTCATCAAC--AGACAAGCTCGGG--TTGCTAAGG-TCAAGTTAGAA--AATGTTAACA--AATGCGGTTC-TGAA---AAG---CACCTTAAAAGGGACT-GCCCGCAATGGAG-CAAAGAGTTGG-AACTCCG-TAGCAATTCAAAAGAG-AATGAACACAAGGGGACTGATGCAGCTCGTAATGCATC--TGACC-A--ATATT-CT--AGAGTAGTGCATT--CCATAAA---CGAGAAAGGGGTT--TA-TGT---CACGGCA-C--GTATC--------CATGGAAT-GATG-TA--TACCTGTTG-GTTGAT-ACAGGCGCTA-CG-G-----CGTCCTTGCTATCTACAATTTGTTA-TGAGAACATTTGC-AAGGGT-CACAG-GTCAA-TCCTT-GAC--AAG---GTCGGAGAGAGATGTGCTATCAGC-TAGTGG-ATCA--CCGCTAAAGGTACTGGGA---AAAGTTCCAGTAGATT-TAAA-GTTGG-A-GACATTGC--GTTAAA---GC-AT-G-AA--CGGTCATAGCT--TGACCTA-ACAGTGGATGGGA--TCTT--GGATTAGATTTCCTGGTTAAGCATG--AGGCAGTAAT-CG---AC-ATGCGCATGCATA-GA-TAAAAA--TATCTGGC-ACGGAGCAC-CCTATCAAGCTGGAAGGGTTGC------AACCTCATANAAGGTAG-CCA-CG-CTCTCATG-GA-GTCACGGATACCACCTAGATCGGAAGCTGATGGTA-GAAGGAG-AGATACGT-ACTAGGATC--GGATGGAGGACTCTCAGCC-AAGC-T-GAATA-TGATA--AA-GCATT---C-GGAAA--AGT---TTCAGAAG-----CCGGGTTCTTGTT-T-GCTGGCC------------A--AAACACCTG--T----CCGT-----ACA-CAGAAGNACA----TGC-GACACAAACG----GCCGGATG-CCTCTTC-CAC--ATCATC---ANCGGGAA--TAGTTGAAGATG-A-GACG-GTGACTGGGATGT--AGA-TC--CCG-AA--G-TTCAA--GTTGGGGACGAGGGGGTTGA-GGTCTCAGAGAA-GNGATGGGAGC-AGGGCCATCCTTATCTGGTAGT-GCAGAGCTT--ATTACTAGCCGTG-TTATTCGCAAAAGAACATCTCCAA-TCCTGTCCAGA-C-CTCCAGAAA-AGTCACAAGTCGAGAAGAGGA-AGTGGTACAGTAGGAAG-TGTGTAGATGTGCCGGTAT-TCAGACAGTCACGTTTGAGCC-CATCCGAGTG-A-CAAG-TCAGCAGAAATGGTGGGTCAG-GGT-ACTCAGACAGAAGGATACCGTCGA---------CG--GGT----CA-AAGA-AG---T-TC--GTCAC--G--GTAT--CAAG-AAACGGACAAAGAGTCA-NGA-------GAAG---GAAGAAT-T-TTCCGTAAGATGTAGACGGAT-AT-ACAGC-GCAT--A-CTGT-AACATTAAAAGACC-GTT-GTT-TTATTGCGCTTGACNTTNGCAATT-TANTGCA--T-GTTCA-A-CTTTCAGTCACCAGGG--GA-GTGCGA-AGAATT-CATTATTCAT-CTT-G-TACA--TTTTTTTTCATGTT-TGCTCAC---TCT---------------CAT---------C-TGTTTTG--AA-AAAAGATTAAGAT---T--ATCAT-GTATA--TT---TTA-TCATGT-GA-GGA-CACATGANG--CATAGA-G--GCGTG--GGTAAGTGTGA---CAA--TTAGAGG----TCGGGGT-CGGGGATG--GGTT-CGT----CATGT--AT-C-------A----GAT-G--C-----CT--TAAA----T-------AT---------GTT-----------CG---------GG-TG--T--TATT-GT-NGG-GC-A-T--T----AT-G--ANA--GCA-T----C-CGAG-----GG-TAGT---TCG--GGTG-T----C-AGC-GGTACT-AT-A-ATA---G-G-C-GTGA------TCT-GCTGANATTTCG--NC---AGTTCAG--CTGT--GGAG-CTC--G--AC--GAGAAGAA-GA------C-GG---T-GATA-AA--GG-TAC---TA--A--TATATAATA------C---GGGCG--TGTATTATA--ATATT--CAG--TATA-----CGGTG-----G--CTA--GTGTACTGG-TC---TG----CGAG--AATAGT-AATAA--AGTATTTC-C---AG-GTTTA-AAGTGT-C-A-----GA--TC-G--GTCC-GGNTATAG-GNA--AA-----ATTG-A---T-A---GACGAG-----CACCTGTCCGG--TATA-----------AGGA-CAG--AA-CT----AG-CAT-AGG-----GCACAGA-CAAG-C-A---TA-G-GTC---CC-A--G--C----CTTA---CGCA-------CA-CC---AT--ACC--TT-AGGTC--T--CT----A---T-GC-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-AT----------AGG-T---AATC-C-TGT-----A----TA---A------TAT-TATCTGT--AT---ATAT--TG---AC--TCG--TT-----ATTTT--TAATAG---TGTTCA-TA---TTT-TGCAT--TC---A--TTC---ATT-GATAAT-C---AT-C---ATGC------C-CCAG-A-CTG-----GT-C-CG---A-ATCA--ACGAAC--CTAAACAC
Reference ( family-5610 ) : AGAGAGAGAATACATGA-TTCGTTA-CGGG-TCCTGAACTCTTCTAGGAGCATGC-GTCCCATAGCCCGAGACCCATACCAGG---TAT----GA-GT--ACCAGT-ACC--CCGTATGTA---AGAG--CAAGAGA-GAG---------TGTAA-GTGG---ATAT-TT-AGTG-A-TGA-ATGCATGTGTACATGATGAGAGAGGTACTCGTCCCGC--ATCAAGAGTTACTA-GTCCC--GT--ATCGNGAGT-TACTCGTCTCGCA-T-CGAA--CAA--CAGACTGATGCCAGAN-A-TAC-GTC---CCAGGAT--GGATG-CAAACCTGCATGGACAGA--TCCGGTCTA-AG-CCCGAAACTTCGT----AAA-CCA-GCGACATA---TGATGGTACG--GGTCTCTGG-GANGATTA--CTTGTC-GCATT---TC-GA---G-T--GCGTG----TCTACT--GAATGAGTGG--A-CAG--AC--ANTGA-GAAAGGTNT--ATACTTGG-CTGCGTCNCTNAGGGGNACAAGCACAAGG--AG-TN-TT-----------GGGAAA-TCAGC------C-----A----------A--G-------------A--A-----TTATTGGA-----------AGCTA-----------GT-TAAAGC-CCTT---CGGGGNA----GA----TTTGCT-TCCAG-T------AAA--CCAG-ACTGAGCT--AT------A-TAGAGCACAGCT--GAGA---GAGAAAGGAGGC-AAAAG-----GCATCT-GAA-AGTT--TGCCGGAG--C--T----GGGT--C-AAGACGTAAGAA-GGCTNGCNAA-TCTAGCNTACCC--NACC-GCTCCNGATGAGGT--AAGAG-AAATNC-TTG--CTACAGGAGCAGTTCTTNGATGG-ACTACGNAGT-T-CA--GAG--AT--GCG-TC--TCAAG-ATC-AAACAGGCAAGACCTGTNAACCTGAAT-GATGCGATACGGAG-A-GCC--GTT-GAACTGGANGCATAC-A-AC-A-GGCCAGAGGA-GTCGCCG-GATAGATGCT----GTAAGAGTCA--T-GAGTGGAAGT-T--CTA--CAGAACCGTC-CAGAG--AAAACAAACTCGAT---CGAT-CATAGAGACTG-AGAAA-AGAATATGCGCTCTCTACAGC-GAGA-TATT--AAGGAT-TTGAAACAATGGAAGTTTCAGTCACAGGGTCAA--GGACGTATGCCTCATCAAC--AGACAAGCTCGGG--TTGCTAAGG-TCAAGTTAGAA--AATGTTAACA--AATGCGGTTC-TGAA---AAG---CACCTTAAAAGGGACT-GCCCGCAATGGAG-CAAAGAGTTGG-AACTCCG-TAGCAATTCAAAAGAG-AATGAACACAAGGGGACTGATGCAGCTCGTAATGCATC--TGACC-A--ATATT-CT--AGAGTAGTGCATT--CCATAAA---CGAGAAAGGGGTT--TA-TGT---CACGGCA-C--GTATC--------CATGGAAT-GATG-TA--TACCTGTTG-TTTGAT-ACAGGCGCTA-CG-G-----CGTCCTTGCTATCTACAATTTGTTA-TGAGAACATTTGC-AAGGGT-CACAG-GTCAA-TCCTT-GAC--AAG---GTCGGAGAGAGATGTGCTATCAGC-TAGTGG-ATCA--CCGCTAAAGGTACTGGGA---AAAGTTCCAGTAGATT-TAAA-GTTGG-A-GACATTGC--GTTAGA---GC-AT-G-AA--CGGTCATAGCT--TGACCTA-ACAGTGGATGGGA--TCTT--GGATTAGATTTCCTGGTTAAGCATG--AGGCAGTAAT-CG---AC-ATGCGCATGCATA-GA-TAAAAA--TATCTGGC-ACGGAGCAC-CCTATCAAGCTGGAAGGGTTGC------AACCTCATANAAGGTAG-CCACCGTCTCTCATG-GA-GTCACGGATACCACCTAGATCGGAAGCTGATGGTA-GAAGGAG-AGATACGT-ACTAGGATC--GGATGGAGGNCTCTCAGCC-AAGC-T-GAATA-TGATA--AA-GCATT---C-GGAAA--AGT---TTCAGAAG-----CCGGGTTCTTGTT-T-GCTGGCC------------A--AAACACCTG--T----CCGT-----ACA-CAGAAGNACA----TGC-GACACAAACG----GCCGGATG-CCTCTTC-CAC--ATCATC---ANCGGGAA--TAGTTGAAGATG-A-GACG-GTGACTGGGATGT--AGA-TC--CCG-AA--G-TTCAA--GTTGGGGACGAGGGGGTTGA-GGTCTCAGAGAA-GNGATGGGAGC-AGGGCCATCCTTATCTGGTAGT-GCAGAGC-T--ATTACNAGCCGTG-TTATTCGCAAAAGAACATCTCCAA-TCCTGTCCAGA-C-CTCCAGAAA-AGTCACAAGTCGAGAAGAGGA-AGTGGTACAGTAGGAAG-TGTGTAGATGTGCCGGTAT-TCAGACAGTCACGTTTGAGCC-CATCCGAGTG-A-CAAG-TCAGCAGAAATGGTGGGTCAG-GGT-ACTCAGACAGAAGGATACCGTCGA---------CG--GGT----CA-AAGA-AG---T-TC--GTCAC--A--GTAT--CAAG-AAACGGACAAAGAGTCA-NGA-------GAAG---GAAGAAT-T-TTTCGTAAGATGTAGACGGAT-AT-ACAGC-GCAT--A-CTGT-AACATTAAAAGACC-GTT-GTT-TTATTGCGCTTGACNTTNGCAATT-TANTGCA--T-GTTCA-A-CTTTCAGTCACCAGGG--GA-GTGCGA-AGAATT-CATTATTCAT-CTT-G-TACA--TTTTTTTTCATGTT-TGCTCAC---TCT---------------CAT---------C-TGTTTTG--AA-AAAAGATTAAGAT---T--ATCAT-GTATA--TT---TTA-TCATGT-GA-GGA-CACATGANG--CATAGA-G--GCGTG--GGTAAGTGTGA---CAA--TTAGAGG----TCGGGGT-CGGGGATG--GGTT-CGT----CATGT--AT-C-------A----GAT-G--C-----CT--TAAA----T-------AT---------GTT-----------CG---------GG-TG--T--TATT-GT-NGG-GC-A-T--T----AT-G--ANA--GCA-T----C-CGAG-----GG-TAGT---TCG--GGTG-T----C-AG--AGTACT-AT-A-ATA---G-G-C-GTGA------TCT-GCTGANATTTCG--NC---AGTTCAG--CTGT--GGAG-CTC--G--AC--GAGAAGAA-GA------C-GG---T-GATA-AA--GG-TAC---TA--A--TATATAATA------C---GGGCG--TGTATTATA--ATATT--CAG--TATA-----CGGTG-----G--CTA--GTGTACTGG-TC---TG----CGAG--AATAGT-AATAA--AGTATTTC-C---AG-GTTTA-AAGTGT-C-A-----GA--TC-G--GTCC-GGNTATAG-GNA--NA-----ATTG-A---T-A---GACAAG-----CACCTGTCCGG--TATA-----------AGGA-CAG--AA-CT----AG-CAT-AGG-----GCACAGA-CAAG-C-A---TA-G-GTC---CC-A--G--C----CTTA---CGCA-------CA-CC---AT--ACC--TT-AGGTC--T--CT----A---T-GC-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-AT----------AGG-T---AATC-C-TGT-----A----TA---A------TAT-TATCTGT--AT---ATAT--TG---AC--TCG--TT-----ATTTT--TAATAG---TGTTCA-TA---TTT-TGCAT--TC---A--TTC---ATT-GATAAT-C---AT-C---ATGC------C-CCAG-A-CTG-----GT-C-CG---A-ATCA--ACGAAC--CTAAACAC
gi|1 : AGAGAGAGA-TACATGA-TTCGTTA-CGGG-TCCTGAATTCTTCTAGATGCATGC-ATCCCATAGCCCGAGACCCATAACAGG---TAT----GA-GT--ACCAGT-ACC--CCGTATGTA---AGAA--CAAGAGA-GAG---------TGTAA-GTGG---ATATGTT-AGTG-A-TGA--TGCATGTGTACATGATGAG-GAAGTACTCGTCCCGA--ATCAAGATTTACTA-GTCCC--GT--ATCTCG--T-TACTCGTCTCGCA-T-CGAA--CAA--CAGACTGATGCCAGAG-AATAC-GTC---CCAGGAT--GGATGGCAAACCTGCATGGACAGA--TCCGGTCTA-AG-TCCGAAACTTCGT----AAA-CCA-GCGACATA---TGATGGTACA--GGTCTCTGG-AATGATTAA-CTTGTC-GCATT---TC-GA---G-TATGTGTG----TCTACT--GAATGAGTGG--A-CAG--AT--ATTGA-GAAAGGTTT--ATACTTG--CTGCATCTCTTAGGGGAACAAGCACAAGGG-AG-TA-TT-----------AGGAAA-TCAGC------C-----A----------A--G-------------A--A-----TTATTGGA-----------AGCTA-----------GT-TAAAGC-CCTT---CAAGGTA----GA----TTTGCT-TCCAG-T------AAA--TCAG-ACTGAGCT--AT------A-T-GAGCACAGCT--GAGA---GAGAAAGGAGGC-AAAAG-----GCATCT-GAA-AGTT--TGCCGGAG--A--T----GGGT--C-AAGACATAAGAA-GGCTTGTTAA-TTTAGCCTACCC--CACC-GCTCCTGATGACGT--AAGAG-AAATAC-TTG--CTACAGAAACAGTTCTTGGATGG-ACTACATAGT-T-CA--GAG--AT--GCA-TC--TCAAG-ATC-AAACAGGCAAGACCTGTAAACCTGAAT-GATGCGATACAGAG-A-GCT--GTT-GAACTGGAAGCATACAA-AC-A-GGGCAGA-GA-GTCGCCG-GATAGATGCT----GTAAG-GTCA--T-GAGTGGAAGT-T--CTA--CAGAACCGTC-CAGAG--AAAACAAACTCGAT---CGAT-CATAGAGACTG-AGAAA-AGAAT-TGCGCTCTCTCCAGC-GAGATTATT--AAGGAT-TTGAAACAATGGAAGTTTC-GTCACAGGGTCAA--GGACGTATGCCTCATCAAC--AGACAAGCTC--G--TTACTAAGA-TCAAGTTAGAA--AATGTTAACA--ATTGCGGTTC-TGAA---AAG---CACCTT-AAAGGGACT-GCCCGCAATGGAG-CAAAGAGTTGG-AACTCCA-TAGCAATTCAAAAGAG-AATGAACAAAAGGGGACTGATGCAGCTCGTAATGTATC--TGACC-----TATT-CC--AGAGTAGTGCATT--CCATAAA---CGAGAAAGGGGTT--TA-TGT---CACGGCA-C--GTATC--------CATGGAAT-GATG-TA--TACTTGTTGTTTTGA--ACAGGCGCTA-CG-G-----TGTCCTTGCTATCTACAATTTGTTA-TGAGAACATTTGC-AAGAGT-CACAG-GTCAA-TCCTT-GAT--AAG---GTCGGAGAGAGATGTGCTATCAGC-TAGTGG-ATCAACCCGCTAAAGGTACTGGGA---AAAGTTCCAGTAGATTCTAAA-GTTGGAA-GGCATTGC--GTTGCA---GC-GT-G-AA--TGATCATAGC---TGACCTA-ACAGTAGATGGGA--TCTT--GGATTAGATTTCCTGGTTAGGCATG--AGGCAGTAAT-TG---AC-ATGCGCATGCATC-GA-TAAAAAATTATCTGGC-ACGGAGCAC-CCTATCAAGCTGGAAGGGCTGC------AACCTCATACAAGGTAG-CCA----TTCACATA-GA-GTCAC-AATACCACCTAGATCAGAA-CTAATGGTA-GAAGGAG-AGATACGT-ACTAAGATC--GGATGGAGGACT-TCAGCC-AAAC-T-GAAC--TGATA--AT-GCATT---C-GGAAA--AGT---TTCAGAAA-----CTAGGTTCTTGTT-T-GCTGGCC------------A--AAACACTTG--T----CCGT-----ATA-CAGAAGAATA----TGC-GACACAAACA----GCTGGGTG-CCTCTTC-CAC--ATCATA---AGTGGGAA--TAGTTGAATATGAA-GACA-GTGACTGGGATGT--AGA-TC--CTG-AA--G-TTC-A--GTT-GGGACGAGGGAGTTGA-GGTCTAAGAGAA-GTGATGGGAGC-AGGG-CATCCTTATCTGGTAGT-GTAGAGCTT--ATTACAAGCCGTG-TTATTCGCAAAAGAACATCTCCAA-TCCTGTCCAGA-C-CTCCAGAAA-AGTCATAAGTCGAGAAGAGGA-AGTGGTACAG-AAGAAG-TATGTAGATGTGCTGGTAT-TCAGACAGTC-CGTTTGAGCC-CATCCAAGTGAA-TAAGTTCTGCAGAAATGGTGGATCAG-GGT-ACGCAGACAGAAGGATACCGTCGA---------CG--GGT----CA-AAGA-AG---TATC--GTCA---A--GTAT--CAAGAAAACGGACAAAGAGTCA-TGA-------GAAG---GAAGAAT-TATTCCGTAAGAT-TAGACGGAT-ATAACAGC--CAT--A-CTGT-AACATTAAAAGACC-GTT-G-T-TTA-TGTGCTTGACATTGGCAATT-TAATGCG--T-GTTCA-A-CTTTCAGTCACCAGGG--GA-GTGTGG-AAAATT-CATTATTCAT-CTT-G-TACA--TTTTTTTTCATGTT-TGCTTA-----CT---------------CAT---------TGTGTTTTG--AA-AAAAGATTAAGAT---T--ATCAT-GTATA--TT---TTA-TCATGT-GA-GGA-CACATGCAG--CATAGA-G--GCGT---GGTAA-TGTGA---CAA--TTAAAGG----TCGGGAT-CGGAAATG--GGCT-CGG----AATGC--AT-C-------------AT-G--C-----CT--TAGA----T-------AT---------ATT-----------CG---------GG-TG--T--TATT-GT-TGT-GC-A-T--C----AT-G--AAA--GCA-C----C-CGAG-----GG-TAGT---TCG--GGTG------C-AG--GGTACT-AT-ATATA---G-G-CTGTGA------TCA-GC-GATATTTCG--GC---ACTTCAG--CTGT--GGAG-AT---G--AC--GAGAAGAA-GA------C-GG---T-GATA-AA--GG-TAC---TA--A--TATATAATA------C----GGCG--TGTATTATA--ATATT--CAG--TATA-----CGGTG-----G--CTA--GTGTACTGG-TC---TG-----GAG--AATAG--AATAA--AGTATTCC-C---AG-GTT---AAGTAT-C-A-----GG--T-----GTCC-GGGTAGAG-GTATCTATACCTATAC-A---T-ACTTGACAAG-----CACCTGTCCGG--TATA-----------AGGA-CAG--AA-CT----AG-CAT-AGG-----ACACAGA-CAAG-C-A---TA-G-GT----CC-A--G--C----CATA---CGCA-------C--CC---AT--ACC--TT-AGGTC--T--CC----A---T-GC-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-AT----------AGG-T---AATC-C-TGT-----A----TA---A------TAT-TATCTGT--AT---ATAT--TG---AC--TCG--TT-----ATTTT--TAATAG---TGTTCA-TA---TTT-TGCAT--TC---A--TTC---ATT-AATAAT-C---AT-C---ATGC------C-CCAG-A-CTG-----GT-C-CG-----ATCAACACGAAC--CTAAACAC
gi|10 : --AGACAAGTTCAG---CTGCTAAGG----AGTTACAA--AAT--TAAAATTAATGCGGTTC-TGAA---AAG---CACCTTAAAAGGGACT-GTCCACAACGGAT-CAAAGAGTTGG-AACTCCG-TAGCAATTCAAAAGAG-AATGAACACAAAAGGACTGATGCAGGTCGTAATGCATC--TGATC-A--ATATT-CT--AGGGTAGTGCATT--CCATAAA---CGAGAAAGGGGTT--TA-TGT---CACGGCA-C--GTATC--------CATGGAATGGATG-TA--TATCTGTTG-GTTGAT-ACAGGTGCTA-CG-G-----TGTCCTTGCTATCTACAATTTGTTA-TGAGAACA-TTGC-AAGGGT-CACAG-GTCAA-CCCTT-AAC--A--------------AGATGTACTATCATC-TAGTGG-ATCA--CCGCTAACGGT
gi|10 : TCCTGGTTGAGAATG--AGGTAGTAAT-TG---AC-ATGCGCATGCAAAAGA-TAAAAA--TATCTGGC-ATTGAGCAC-CTTATCAAGCTGGAccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcctggttgagaatgaggtagtaattgacatgcgcatgcaaaagataaaaatatctggcattgagcaccttatcaagctgga
gi|11 : agacaagttcagctgctaaggagttacaaaattaaaattaatgcggttctgaaaagcaccttaaaagggactgtccacaacggatcaaagagttggaactccgtagcaattcaaaagagaatgaacacaaaaggactgatgcaggtcgtaatgcatctgatcaatattctagggtagtgcattccataaacgagaaaggggtttatgtcacggcacgtatccatggaatggatgtatatctgttggttgatacaggtgctacggtgtccttgctatctacaatttgttatgagaacattgcaagggtcacaggtcaacccttaacaagatgtactatcatctagtggatcaccgctaacggtccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn----T-------AT----------TT-----------CG---------GG-TG--T--TATT-GT-TGT-GC-A-T--T----ATTG--AAA--GCA-T----C-TGAG-----GG-T-GT---TCG--GGTG------C-AG--GGTACT-AT-A--TA---ACG-CAGTGA------TCA-GC-GATATTTCG--GC---AGTTCAA--CTGT--GGAG-CTA--G--AC--GAGAGAAA-GA------C-GG---T-GATA-AA--GG-TAC---TATAA--T-TATAGAA------C---GG-CG--TGTATTATA--ATATT--CAG--TATA-----CGGTG-----G--CTA--GTGTACTGG-TC---TG-------G--A---------------CATTTC-C---AG-GTTTA-AAGTGT-CGA-----GA--TC-G--GTCC-GGCTATAG-AGA--AT-----ATTA-A---G-A----ACAAG-----CACCTGTCCGG--TAT------------AGGA-CAGA-AA-CT----AG-CTT-AGG-----ACACAGA-CAAG-C-A---CA-GTGT----CC-A--G--C----CTTA---CGC--------CA-CC---AT--ACC--TT-AGGT---T--CT----A---T-GC-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-AT----------AGG-T---AATC-C-TGTATA--A----TA---A------TAT-TATCTGT--AT---ATA---TG---AC--TCG--TT-----ATTTT--TAATAGT--TGTTCA-TA---TTT-TGCAT--TC---A--TTC---ATT-GATAAT-C---ATAC---ATGC------C-CCAG-A-CTG-----GT-C-CA---A-ATCA--ACGAAC--CTAAACAC
gi|12 : ----T-------AT----------TT-----------CG---------GG-TG--T--TATT-GT-TGT-GC-A-T--T----AT-G--AAA--GCA-T----C-TGAG-----GG-TAGT---TCG--GGTG------C-AG--GGTACT-AT-A--TA---ACG-CAGTGA------TCA-GC-GATATTTCG--GC---AGTTCAA--CTGT--GGAG-CTA--G--AC--GAGA-GAA-GA------C-GG---T-GATA-AA--GG-TAC---TA-----TATATAGAA------C---GG-CG--TGTATTATA--ATATT--CAG--TATA-----CGGTG-----G--CTA--GTGTACTGG-TC---TG-------G--A---------------CATTTC-C---AG-GTTTA-AAGTGT-CGA-----GA--TC-G--GTCC-GGCTATAG-AGA---A-----ATTT-A-----A---GACAAG-----CACCTGTCCGG--TATA------------GGA-CAG--AAACT----AG-CTT-AGG-----ACACAGA-CAAG-C-A---CA-G-GTC---CC-A--G--C----CTTA---CGCA-------C--CC---AT--ACC--TT-AGGTT--T--CT----A---T-GC-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-AT----------AGG-T---AATC-C-TGT-----A----TA---A------TA---ATATGT--AT---ATAT--TG---AC--TCG--TT-----ATTTT--TAATAGT--TGTTCA-TA---TTT-TGCAT--TC---A--TTC---ATT-GATAAT-C---ATAC---ATGC------C-CCAG-A-CTG-----GT-C-CA---A-ATCA--ACGAAC--CTAAACACg
gi|13 : -GACAAGAGCA----GCCGGGTG-TCTC--C-CAC--CTCATC---ATGGGGAA--TAGTTGAGAGTG-A-GACAAGTGAGTGG-ATGTTGAGAATC--CTG-GAAGG-TTCAA--GTGTGGGA-GAGGGGGTTGATGGTCTCGGGGAA-GAG-TGGG-GC-AGAACCATGCTT-TCTG-TAGTCGCATAG-----------GACTGTG-TTATACGTTAAAGGAAATCTCAAG-TCCTGTCCAGGCC-CTCCAGAAA-GGTCAC-AGT--GGAAGAGGATAGTGGTA-AGTAGGAAG-TGTGTAGATGGGCGGGTATGTC-GA-AGTCAGGTTTGAGCCGCATCTGAG-A-A-TAAT-TCAGCAG-AATGGT-GGTCAG-AGTAACTCAGACAAAAG---ATCGT-GA---------CG--GGT----CA-AAGA-AG---TCTCCAGTAAC--GACGTATG-CATG--AACGGGCAAGGAGTCA-AGAAATAAACGGAGAGTGAAAGAT-T-TTTGTTTAGATGTAGACGTTTAAT-A-AGCAGCA---A-CTGT-AAg
gi|14 : a-ATGCATGTATATATGATGAGAGAGGTACTCGTCCCGC--ATCAAGAGTTACTA-GTCCC--GT--ATCGAGAGT-TACTCGTCTCGCA-T-CGAA--CAA--CAGACTGATGCCAGAG-A-TAC-GTC---CCAGGAT--GGATG-CAAACCTGCATGGACAGA--TCCGGTCTA-AGCCCCGAAACTTCGTG---AAG-CCA-GCGACATT---TGATGGTACG--GGTCTCTGG-AATGATTA--CTTGGCTGCATC---TC-
gi|14 : TACTTGG-CTGCATCTCTTAGGGG-ACAAGCACAAGG--AG-TG-TT-----------AGGAAA-TCAGC------C-----A----------A--GGGATGAGAGGCAGA--A-----TTATTGGA-----------AGCTA-----------GT-TAAAGC-CCTT---CAGGATA----GA----TTTGCT--CCAG-T------AAA--TCAG-ACTGAGCT--AT------A-TAGAGCACAGCT--GAGA---GAG--AGGAGGT-AAAAG-----GCATCT-GAA-AGTT--TGCCGGAGATCGAT----GGGT--C-AAGACATAAGAA-GGCTTTTTAA-TTTAGCCTACCC--GACC-Gttaggggacaagcacaaggagtgttaggaaatcagccaagggatgagaggcagaattattggaagctagttaaagcccttcaggatagatttgctccagtaaatcagactgagctatatagagcacagctgagagagaggaggtaaaaggcatctgaaagtttgccggagatcgatgggtcaagacataagaaggctttttaatttagcctacccgaccg
gi|15 : atgcatgtatatatgatgagagaggtactcgtcccgcatcaagagttactagtcccgtatcgagagttactcgtctcgcatcgaacaacagactgatgccagagatacgtcccaggatggatgcaaacctgcatggacagatccggtctaagccccgaaacttcgtgaagccagcgacatttgatggtacgggtctctggaatgatTACT--AAATAAATGG--A-TAGTAAC--A--GA-AATGGGCAT--GCATCTAG-TGGTATCATTGAGTAG-ATAAGCTCAAAG--TG-TC-TT-----------AGGAAA-TCTAC------CTGAGGG----------A--G-------------A--AAAGTGTAAATACA-----------GGCTGTT---------GTGTAAAGC-AC-----AGGAGGA----GAGGTTTTTAC---CCAC-T------AA---CCAG-ACGGAACT--TT------A-CAGAGCACAGCT--GAGA---GAGAGACGA--C-AGAAA-----GCCACA-GAG-ACAC--TACCGGAA--C--T----GGGA--C-AGGAAATACGGC-GGTTAACGAA-TCTAGCATACCC--CTCA-GCTCCAGTGGAGGT--AAGAG-AGACAC-TTG--C-AAAGGAACAGTTTCTTGATGC-GTTAAGGGA----CA--GGGACAT--GCG-TT--TGAGA-GTC-AAACAGGCGAGACCGGCTGACTTGAAT-GATACTGT-CAGAC-ACGCA--GTA-GAGTTGGATGCATTC----C-A-GGC
gi|16 : a-GCACT---TT-GA-----T--GCCTG----T--ACTAGGAA-AAGTGG--AGCAA--AC--AA-GA-AAAAGGAAT--AAATTTCG-CTGTGTCACTAAGAGGT-CAAACACAAGG--AG-TCCTT-----------GGTAAT-TCATC------T-----A----------AA-G-------------A--A-----GCACTGAACAACTATAATGAACTA-----------GC-CAAAGC-ACT----CGACGAAC---GA----TTTGCTCTCCCG---------AA--CCAA-ACTGAGCT--AT------A-TCGAGCACAGCTTCGTGAACTGACAAAGAAAGC-TA------------CT-GAA---TTCCTGCCAAAA--C--T----AGGT--C-AAAGTTTCAGAA-GACTGACAAA-TCTAGCATACCC--TACG-GCACCATATGAATT--GAGAG-AAACTCTTTG--TTA-GGGGGCAATT-TTAGATGa
gi|17 : cttgagctcaca-GCACT---TT-GA-----T--GCCTG----T--ACTAGGAA-AAGTGG--A-GAA--AC--AA-GA-AAAAGGAAT--AAATTTCG-CTGTGTCACTAAGAGGT-CAAACACAAGG--AG-TC-TT-----------GGTAAT-TCATC------T-----A----------AAAG-------------A--A-----GCACTGAC-----------AACTATAATGAACTACGC-CAAAGC-ACT----CGACGAAC---GA----TTTGCTCTCCCG---------AA--CCAA-ACTGAGCT--AT------A-TCGAGCACAGCTTCGTAACT-GACAAAGAAAGC-TA------------CT-GAA---TTCCTGCCAAAA--C--T----AGGT--C-AAAGTTTCAGAA-GAC-GACAAA-TCTAGCATAACC--TACG-GCACCATATGA-AT--GAGAG-AAACTCTTTG--TTA-GGGGGCAATT-TTAGATGctcttggtgagtcaga
gi|18 : cacaGTG----TCTACT--AAATGAGTGGGGA-CAG--AT--ACTGA-GAAAAGTTT--ATACTTGGCCTGCATCTCTTAGGGACA-AAGCACAAGAGCAGTTA-TTATTATATTTTAGAGGAA-TCAGC------C-----A----------ctcttggtgagtcaga
gi|18 : A-----------ATCTA-----------GT-TAAAAG-CCTTGTACAAGGAATTTAGA----TT-GCC-TC-AG-TCAAGGAAAATTCCAG-GC-GA-CTTTATCTTCTAA-TAGAGCACAGCT--GAGAC--GAGCAGGAAGGCTAAGAGATAATGCATCT-GAA-AGTT----CCGGAG--C--TACAAGCGT--C-AACACCTAAGAA-Gcagtcgaagatccagaaccgatcttctgcgttcgagatccatttttgccacagctaaaatctagttaaaagccttgtacaaggaatttagattgcctcagtcaaggaaaattccaggcgactttatcttctaatagagcacagctgagacgagcaggaaggctaagagataatgcatctgaaagttccggagctacaagcgtcaacacctaagaagcccttagtgtgagactactc
gi|19 : gtgtctactaaatgagtggggacagatactgagaaaagtttatacttggcctgcatctcttagggacaaagcacaagagcagttattattatattttagaggaatcagccacagtcgaagatccagaaccgatcttctgcgttcgagatccatttttgccacagctaaT--TGCCAGAG--C--T----TGGG--C-AGGACATACTCA-GGCTGGCCAA-CCTCGCATATCC--AACT-GCCCCAATTGAGGT--CAGAG-AAACCC-TTG--CCA-AGGAGCAATTCATTGATG---CTCTGAAGG-A-CAGTGAC--AT--GAG-AA--T-ACGCATT-AAACAAGCCAGACCAGTCGACCTGAAT-AATGCTATCCGTCA-T-GCC--GTG-GAGTTGGATGCATTT-A-ACTC-TGCCAAAAGACGTCTCCGTGA-AGA---------TAAAGGTTATTT-GAG-GGAGG-----CTAATCAG--CCATG-CAAAA--CAGACAAAcccttagtgtgagactactc
gi|2 : aaca-A-CTG-----GTACACG---A-ATCA--ACGAAC--CTAA
gi|2 : AGAGCGAGAATACATGAGTTCGTTA-CGG--TCCTGAACT--TCTAGGAGCATGCAGTCCCATAGCCCGAGACCCATAC-AGGAAATA-----GT-GT--ACT--TCACC--CAGTAT-TA---AGA---CAGGAGAAGAG---------TGTAA-GTGA---ATGT-TT-AGTGGA-TGAGATGCATGTG-ACATGATGAGAGAGGTACTCGTCC-----ATCAAGAGTTACTA-GTCCC--GTGGATC-CGAGT-TACTCGTCTCGCA-TTCGAA--CAAA-CAGACTGATGCC-GAG-A-TACTATCGATCCAGGAT--GGA-G-CAA-CCTGCATG-ACAGAAATCCGGTCTA-AG-CCCGAAACATCGTTAGAAAA-CCA-GCGAC-TA---TGATGGTACA--GGTCTCTGGTGGAGATTATTCTTGTC-GCATTCGGTCTGA---GAT--GTGTG----TCTACT--GAA-GAGTGG--A-CAG--AT--ATTGATGAAAGGTTT--ATACT--G-CTGCATCTCTTAGGGACAAAAGCACAAGG--A--TG-T------------GGAAAA-TCAGC------C-----AGGATAAGGCAA--G-------------A--A-----T-ATTG-A-----------AGCTA-----------GT-TAAAGC-CCTT---CAGGATA----GA----TTTGC--TCCAGTT------AAA--TCAG-ACTGAGC----T------A-TAGAGCACAGCT--GAGA---GAG--AGGAGGC-AAAAG-----GCATCTAGAA-AGTT--TGCCGG-G--A--T----GGGTGCC-AACA---AAGAATGACTTGTTAA-T-TAGC-TCCCCGAAACC-GCTCCTGATGAGGT--AAGGGAAAATAC-TTG--CTACACGAACAGTTTTGAGATGGAACTACATAGTAT-CA--GAG--ATTGACGATC--TCAAA-ATCAAAACAGGCAAGACCTGTAAA-CTGAACAGACGAGTCACGAAGTA-G-C--GTTGGAACT-GAGGCATAC-ATAC-A-GTCCAGAGGA-GTCGCCG-GATAGAAGCT----GT-AGA-TCA--GAGAGT-GAAGT-TTCCTA--CAGAATCGTCACGAAGGCAAAACAAACTCGATTCGTGAT-CAT-GAGACTT-AGAAAGAGA--ATGCGCT-TCTAC--CAGAG--TATT--AAGGATATTGAAACAATGATGATTTCAGCAACAGGGTCAACGGAACGTATGCC-CATCAACAAAGAC-AGCTCAGG--TT-CTAAGG---ATATGAGAAAGAATGTTTACAC-ACTGC-GTTCATGAATCGAAGGATCACTCTAAAAGGTACTGGCCCGCAATGGAGACAAAGA-TTGGTAACTCCGATAGCAATTCAAAAGAA-GGT-AACAAAAGGAGAA-GATGCAGCTC-CGAT--ATCCTTGACCAA--ATATCACA--AGAGTAGT-CA-T--CCATAGAAATCGA-AAAGGGGTT--TA-TGT---CACGGCAGC--GTAT---------CAT-GAAT-GAGGATA--TACTTGTTA-GTTGAT-ACAGGCGCCA-CGCGGAAATCGTCCTTGCTATCTACAATGTGTTAGTGAGAACA-TTGC-AAGAGT-CACAGTGCTAACTCCTTGGACTAAGG---GTC-GAGAAGGATTTGCTATCAGCTTAGTGGCATCA--CCGC-GAATGTACTTGGATATACAGTTCCAGTA-ATT-TAAACGTTGG-A-G-CATTGCAAGTAAAAATGGC-AT-G-AA--GAGTCA-AGCT--TGACCTACACAGTGGATGG-----CTT--GGATT-GATTTCCCTGTTAAGCATAGTGGGCA-TAAT-CATACAC-ATGCGCATACA-G-GATTAAAAA--TATC-GGC-AACGAGCACGCCTATCATACTGGGAAGGTGGTCGGTCGAACCTC-TAAAGGGTAG-CCA-TGGCTTTCATGAGACGTC-CAGATACCA-CTAGATCG--AACTG-TGATAGGAAGGAGAAGATACGT-ACTA-GATCGGGGATGGA-GACTCTCAACCAAAGCTT-GAATA-TGA-A--AA-GCATT---CTGGAAA--AAGAAATTCAGAGG-----T---GTTC-TG-T-T-GCTGGCC------------ACGAAAAACCTGGTT----TAGC-----ACA-GAGTAGCACA----TGC-AACACAAA-G----CCCGGATGCCCTCTTC-CAcaacgttaaaattttggtggccagcaacgggatttggatcagtcatttaagtaaaagcattagtattcgtaaaaatgaatgagcaggattacaaagacaagtgtaatcagttagaagggggagatagatcgcctcagagcgagaatacatgagttcgttacggtcctgaacttctaggagcatgcagtcccatagcccgagacccatacaggaaatagtgtacttcacccagtattaagacaggagaagagtgtaagtgaatgtttagtggatgagatgcatgtgacatgatgagagaggtactcgtccatcaagagttactagtcccgtggatccgagttactcgtctcgcattcgaacaaacagactgatgccgagatactatcgatccaggatggagcaacctgcatgacagaaatccggtctaagcccgaaacatcgttagaaaaccagcgactatgatggtacaggtctctggtggagattattcttgtcgcattcggtctgagatgtgtgtctactgaagagtggacagatattgatgaaaggtttatactgctgcatctcttagggacaaaagcacaaggatgtggaaaatcagccaggataaggcaagaatattgaagctagttaaagcccttcaggatagatttgctccagttaaatcagactgagctatagagcacagctgagagagaggaggcaaaaggcatctagaaagtttgccgggatgggtgccaacaaagaatgacttgttaattagctccccgaaaccgctcctgatgaggtaagggaaaatacttgctacacgaacagttttgagatggaactacatagtatcagagattgacgatctcaaaatcaaaacaggcaagacctgtaaactgaacagacgagtcacgaagtagcgttggaactgaggcatacatacagtccagaggagtcgccggatagaagctgtagatcagagagtgaagtttcctacagaatcgtcacgaaggcaaaacaaactcgattcgtgatcatgagacttagaaagagaatgcgcttctaccagagtattaaggatattgaaacaatgatgatttcagcaacagggtcaacggaacgtatgcccatcaacaaagacagctcaggttctaaggatatgagaaagaatgtttacacactgcgttcatgaatcgaaggatcactctaaaaggtactggcccgcaatggagacaaagattggtaactccgatagcaattcaaaagaaggtaacaaaaggagaagatgcagctccgatatccttgaccaaatatcacaagagtagtcatccatagaaatcgaaaaggggtttatgtcacggcagcgtatcatgaatgaggatatacttgttagttgatacaggcgccacgcggaaatcgtccttgctatctacaatgtgttagtgagaacattgcaagagtcacagtgctaactccttggactaagggtcgagaaggatttgctatcagcttagtggcatcaccgcgaatgtacttggatatacagttccagtaatttaaacgttggagcattgcaagtaaaaatggcatgaagagtcaagcttgacctacacagtggatggcttggattgatttccctgttaagcatagtgggcataatcatacacatgcgcatacaggattaaaaatatcggcaacgagcacgcctatcatactgggaaggtggtcggtcgaacctctaaagggtagccatggctttcatgagacgtccagataccactagatcgaactgtgataggaaggagaagatacgtactagatcggggatggagactctcaaccaaagcttgaatatgaaaagcattctggaaaaagaaattcagaggtgttctgttgctggccacgaaaaacctggtttagcacagagtagcacatgcaacacaaagcccggatgccctcttccaa
gi|20 : actggtacacgaatcaacgaacctaacaacgttaaaattttggtggccagcaacgggatttggatcagtcatttaagtaaaagcattagtattcgtaaaaatgaatgagcaggattacaaagacaagtgtaatcagttagaagggggagatagatcgcctcC-T-GAATA-TAACAGTAA-GCATTTTGC-GGAAAGGAGT---TTCAGGAGACGGTCCGGGTTCT-ATTAT-GCTGGCCCGATCATTGGAGA--GAACACCTG--TAATGCTGTTAAACACATCAGAAGCACACCTATGC-AACACAAACGCTTCGC-GGATG-CCTCTCCTCACTAATCATCTATACTGGAAAATTAGT-GAA--TG-A---TG-GTGACTGGGATGT--AGA-TCCTCCGAAA--G-TTCAACGGTTGTGAGCGAGGa
gi|21 : GG-----GCA-AGA-CAAG-CCA---TA-G-GTC---CC-A--G--C----CTTAA--CGCG-------CA-CC---AT--ACC--T--AGGTCG-T--CC----A---T-GC-C-T-TTG-AATAT-TTA--GG-AT----------AGG-T---CATG-C-TGT-----A----TA---A------TAT-TATCTGTTAGT---A-AT--TG---ACT-TCG--TT-----AATTT--TAATAG---TGTTGA-TT---TTTATGCAT--TCAGGA--TTCGCGATT-AAT-AT-C---AT-CTCAATACATTGCAC-TAAG-A-CTG-----GTACACG---A-ATCA--ACGAAC--CTAAcag
gi|22 : CTGGCC------------A--AAAGACTTG--T----CCGT-----ACA-CAGAAGAACA----TGC-TACACAAACA----GCCGGATG-CCTCcaacgt
gi|22 : T--AGA-TC--CTG-AA--G-TTCAA--GTTGGGGACGAGGGGGTTAT-GGTCTCccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntagatcctgaagttcaagttggggacgagggggttatggtctc
gi|23 : ctggccaaaagacttgtccgtacacagaagaacatgctacacaaacagccggatgcctcccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-AGGTTA-T--CT----A---TTGC-CAT-TTG-A-T-T-T-A--GG-AT----------ACA-A---AGTA-C-TG----------------A------TGT-AATCTGT--AT---ATATATTG---GC--TCG--TT-----ATTTTTCTGATAGT--TATTCA-TA---TTT----------------TTT---GCT-GA-AAT-C---AT-A---GTGC------C-GCAGCA-CTGC----GT-C-CG---ATATCA--TC-AAC--CTAAAC
gi|24 : ----AAG-CTA-GCAACAAT---TGATGGTATG--GGTTCCTGG-GTAGACTA--CAAATC-CCATT---TT-GA---G----GCTTGTAGCTCT-TT--GAATCAGTGG--A-CGG--AC--AGGGA-AAAAGGTCT--ATATCTAA-GTGTGTCGCTCA-GAGAACAGGCcgt
gi|25 : -TAAAGC-ACT-----GGAGGA----GAGGTTTTTACC--CCAC-T------AAC--GCAG-AC-GAACT--CT------AACAGAGCACAACT--GAGA---tattatacggt
gi|27 : agctcaaagttgttaggaaatcatactcctggggaggaaaagtgtaattacaggctgttgtgACGCATACCAGG---TAT----GAAGTTAACCAGT-ACC--CCGTATGTAGACAGAGATCATGAGA-GAGATTGCAAAATGTAA-GTGGGCCATCT-TC-GTTA-ATTGA-ATGag
gi|28 : gagaacCAGCT--GAGA---GA--AAGCA-GC-AAAAT-----ATATCT-TAAGGGTT--TACCGACG--A--T----GGAT--C-ATCATGTAAAAA-GACTAGTCAA-TCTAGCCAACTC--AATC-TCTCCTGAataca
gi|3 : acagacTGTTG-TTTGAT-TCAGGTGCTAACG-G------GTCCTTGCTATCTACAATTTGTTA--GAGAACATTGGCCAAGGGTTCA-AG-GTCAA-TCCTT-GAC--AAGAGGGTCG-AGAGAGATGTGCTATCAGC-TAGTGG-ATCA--CCGCTAAAGGTAATGGGA---AAAGTT-CAGTAGATT-ATAA-GTGGC-G-GACTTTGC--GTTAAA---GCAATAG-AAATCGGTCATAGCTGATGACTTA-ACAGTGGATTGGAATTCTTTGGGATTAGATTT-CTGGTTAAGCATG--AGGTGTTAATATG---ACAATTCGCTGGCATA-GA-TAAAGA--TATCTGGCAATGAAGCAC-CCTATCAA-CTGGACGGGTTGC------AACC-CATATAAGGTAGTCCACCGT---TCATG-GA-GTTACG--TA-CACCTGAATCGGAAGCTGATGGTA-GAAGGAG-AGATACGTGACTAG---T--GGATGGAGGTCATTCAGCC-AAGC-TCGGAGACTGATA--AAGGCATT---C-GG-AA--AGT---TTCAGAA------TTGGGTTCTTGTT-TGGCTGGCC------------A--AAACA-CTG--T----TCGTA----ACA-CAGAAG-ACA----TGCAGA---AAACG----CCCGGA---CCTCTT--CAC--ATCATC---AACGGGAA--TA-TTGAAGATG------T-GTGACTGGGATGTAAAGA-TC--CCG-AA--GTTTCAA--GTTGGGGACGAGGGAGTTGA-GGTCTCAGAGAA-GTGAT-GGAGCTAGGGCCA-CCTTATCTGGTAGT-GCCGAGC-TGAATTACTA-CCGTGTTTATTCGC-AAAGAACCTGTCTAA-GTCTGT--AGA-CGCTC--GAAATAGTC-CAAGTCGAGAAGAGGA-AGTGTT-CAGTAGGAAGTTGTG-AGA--TGCCGG--T-TTAGACAATCACG-TTGAGCC-CAT-CAAGTG-A-CA---TCAGCAGAAATGGTGGGTCAGTGGT-AC-CA-ATCGAAAGATAGTGTTGATGGCTCGTGCG--GGT----CATAAGA-AGTCAT-TC--GTCACTAG--GTATTCCAAGCAAAC-AAGAAAGAGTCA-AGA-------GAAG---GAAGAATCT-TTCCGTAAGATGTAG-CGGAT-AT--CAGC-GCCT--A-CTGTAAACATGTCAAGA-C-GTTGGTTGTTATTGGACTTG--CTTGGCAA-T-TAATGCA--T-G-TCA-ACCTTTCAATCACCAGGG--GAGGTG-GA-AGAATC---TTATTCAT--TT-G-TACATTTTTTTTTTCATGTT-TGCTCACAGATCT----------------ATAATCTGGTCC-TGTTTTGATAA-AAAAGATT-AGATTAAT--ATCAT-GTATA--TT---TTATTCATGTCGA-GGA-CAC--GATGCCCATAGA-G--GCG-G--GGTGAATGTGA---C-A--TTAAAGG----TCGGGAT-C--GGATG--GGTT-GGTATTATATGT--AT-C-------A----GATAG--TG----CTAATAAAAGCTC-------AT---------GTC-----------CA---------GACTT--T--TACTAGTAGGG-GC-A-T--TGGCGAT----ATA--ACA-T------CGAGTGGCAGG-TAGT---TCG--GGTG-T----TGAGCAAGTG-T-ATAA-ATA---G-G---GCG-------TCT-GCTGAAATT--G--TC---ACTTCAG--CTGT--GGAGATTCATG--AC--GAGGAGAAGGA------CAGG---T-GATATAAATGG-TCC---TA--GGCTATATTATA------CCAGGAGC---TATGTTATA--ATATT--CAG---ATAAC---CGGTG-----GGTCTA--GTGTACTGGTTC---TGGAC-CCAG---ATAGT--ATGAGTAATATTTCAC---AA-TTTTA-AAGTG--C-A-----AAGTCC-G--GT-C-GGTTATAGAGAG--TA-----AATG-T---TAA---GACAAG-----CACCTGTCCGG--CGTAGT---------AGGATCAGGAAA-CTAA--AG-CAT-AGG-----GATCAGT-AAAG-C-A----A-G-GTC---CC-ACTG--CT---CTTAGTCCGCAAGAGGAGCA-CCTCTAT--A-C--TT-AGGTC--TGCCC----ATCCT-GCTTATATTGCA-T-TATTACCGG-ATTAGCTTACTCAGGCT---AATC-T-TCTAAGCGA----TG---AATAGACTAT-TATCTGT--AT---AT-T--TG---ACCGTCGAATG-----ATTTT--TAATAG---T
gi|30 : tC---CC-A--G--T----CTTA---CGCA--------G-CC---AT--ACC--TT-AGGTT--T--GT----A---T-GT-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-AT----------AGG-T---AATC-C-TAT-----A----TA---A----------TATCTAT--AT---ATAT--TG---AC--TCG--TT-----ATTTT--TAATAG---Ttgt
gi|32 : GA-AGAATT-CATTATTCAT-CTTCG-TACA--TTTTTTTTC
gi|33 : gcatattctacatcaccagggatggattgtttatgtgtgtttgccaTGTGA---CAA--ATTGAGA----TCGGGTT-C-GGGATG-------TGT----CATTT--AT-C-------A----GAT-
gi|4 : atAGAGAGGATACATGG-TT-GTTAACGGGGTTCTGAACTCTTCTAGGA---TGC-G-CCCATAGCC-GAGACCCG-ACCAGG---TGTACTGGA-GT--A--AGT-ACCGACTGAAT------AGAG--AAAGAGA-GAGAGC------TGTAAAGTGG---ATAT-TTTAGTG-A-TGA-ATGCATGTGTACA-GATGAGAGAG---CTCGTCCCGCGCATCAAAGGTTACTAAGTCCCAAGT--AT-GAGAGTATTCTCATCCCGCAAT-CGAAGACAATGCAGACTGATGC-AGATCA-TAC--TC---GATGGATAGGGATG-CAA-CCTGGATGGACAGA--TCCGGTCTATAG-CC---GACTT-GT----AAAACCAAGCGACATACGCTGATGGTACATCGGTCTTTG---AAGATTA--CTTGTT-TCATT---TC-GGTCTG-T--G-GTG----TCT-CT--AAATGA-TGG----CAG---CTTATTGA-GAAAGGTTTTAATACTTGG-CTGAATCTT----GGGGACAAGCACAAGG--AG-T---T-----------AGGAAACTCAGCAAGGGAT-----A----------A--G-------------GCGA-----TTATTGGA-----------AG-TA-----------GT-TAAAGCGCCTT---CAGA-TA----G-----CTTGCT-TCGAG-T------AAAA-TCAGGACTGAGCT--AT------A-TAGAG-ACAGCT--GA-A---GAGAA-GGAGGC-AAAAG-----GCATCT-GAA-AGTT--TGCCGGAG--A--T-----GGT--CAAAGAC-TAAGAA-G--TTGTTAATTTTAACT--CCC--GACCTGCT-CTGATGATGTCAAGGAG-AAATTC-TTGCCCTACAGAAG----TCTT-GATGG-ACTA---AGT-TAAA--GAG--AT--GC--TCTGTCAAG-AT---GACAGGCAAGACCTGTAAAGCT-AAT-GATCGGATACAGAG-A-GCTTGGTT--AACTGGAAGCA-AC-A-CC-AGGGCCAGAAGA-GTCGCCG-GATAGATCCTGTCAGTAAGAGTCA--T-GAGTGGACGTCT--CTA--CAGAA--GTC-CACAG--AAAACAAACTCGAT---CGAT-CAT-GAGAGT---AAAA-AGAATATGCGCTCTC-ACAGC-GAGA-TATTAAAAGGAT-TGAAAAC-ATGGAAGTTTCAGT-ACAGGGTCAA--GGATGTA-GCCTCAT-AAC--AG--AAGAT-GGGATTTGCTAAGG-ATAAGTTAGAC--AAT-TT-ACA--AATGCGGTTC-TGAA---AAG----A--TTAAAAGGG----GCGCG-AATGGAG---AAGAGTTGA-AACT-CG-TAGC-ATTC-AAAGAGCAATGAACACAAGGGGA-TGATGCAGGTCGTAATGCATC--TGACC----ATATT--T--AGGGTAGTGCCTT--CCATAAA---CGAGAAAGGGGTT--TA-agatgtt
gi|5 : tcaagaaactaaacaacgtcgttataaccagcataaattttggtggagaacgagatttgggagtccatgattaattaaaacattagtatctaaaaagatgagcaacggattacacaagaagtaaaccagttgaaagggaatagattgctccCAGGAA--TAGTTGAAGATG-AAGACA-GTGACTGGGATGT--AGA-TC--CCG-AA--G-TTCAA--GTTGGGGACGAGGGGGTTGA-GGTCTCAGAGAAGGAGATGGGAGC-AAGGCCATCCTTATCTGGTAGT-GCAGAGCTT--ATTACTAGCCGTG-TTATTCGCAAAAGAACATTTCCAAGTCCTGTCCAGA-C-CTCCAGAAA-AGTCACAAGTCGAAAAGAGGA-AGTGGTACAG-AGGAAG-TGTGTAGA--TGCCGGTAT-TCAGACAGTCACGTTTGAGCC-CATTCAAGTG-ATCAAG-TCAGCAGAAATTGTGGATCAG-GGT-ATTCAGACAGAAGGATACCGTCGA---------CGTTGGTTAGGCA-AAGACAG---C-T---G-CAC--A--GTAT--CAAA-AAAC-GACCAAGA-TCATCGA-------GAAG---GAA-AAT-T-TTTCGAAA---GTA-AT-GAT-AT-A-AGC-ACATTAA-CTGT-AAT-----AAG--C-GTT-G-T-GTATGGC-CTTGACATT-GCAATT-TAATGCATGT-GTTCA-A-CTTTCAATCACCA-GG--GA-GTGCGA-AGAATT-CATTACTCATGCTT-GATACA----TTTTTTCATG-T-TG-TCAC---TC------------------T---------C-TGTTAT----A-AAAAAACTATAAT---TCAATC-T--TATA---T---TTA-T-ATGT-GAGGGA-CACATGGCG--CGTAGA-G--G-GTG--GGTAGAT-T-A---CAA---TAAAGG----TCGATG---GAGAATGATGGTTGCGT-----ATGT--AT-CATTATCGA----GAT-A--G-----CA--TAAA----TAAGCTTAAT---------GTC-----------CAACC------AG-TGACT--TTTC-GT-AGG-GC-A-TGGT----AT-T--ACA--ATACT----C-CGA-------G-TAGT---TCA--GGTG-T----T-GA--A--ACTAAT-A-ATA---G-G-C----A------TCT-GCTGATA---CG--TC---ACTTCAG--TTGT--GGAG-ATC--G--AC--GAG-AGAA-GA------C-GG---T-GACA-AA--GG-TAC---T---A--TATATAATA------C----GGCG--TGTATTATA--ATATT--CAG--TATA-----CGGTG-----G--CTA--GTGTACTGA-TA---TG-----GAC--AATAGT-AATAA--AGTATTTC-C---AG-GTTTA-AAGTGT-CAA-----GA--TC-G--GTCC-GGTTATAG-AGA--AA-----GTTA-------A---GACAAG-----CACCTGTCCGG--TATAGGCGGGGGTATAGGA-CAGA-AA-CT----AG-CAT-AGG-----GCAC
gi|6 : AGCTGCAT--ATCTGT-TACTTTAAAAGACCTGTT-GTT-TTATTGTGCTTGACTTTTGTCATTGTATTGCA--TTGTT-A-A-CTTATAGTTA--AGGGAGGA-G-GCGACAAAATTTCCTTATT-AT--TT-G-TGCA--TGCTTTTGC-TGT-------A------T---------------CAT---------C-TGTTTTG--AA--------TAAGAT---T--ATCATTGTATA--TT---TTA-TCATGT-GA-GGA-CA-ATGAAG--GCT-GA-GTCGCGTG--GGTAAGTGTGGCATCAA--TTAGAGA----TCGGGGT-GCGGGAT----GTT-CAG----CATATTAATAT-------A----GAT-G--CTAAATCTA-TAAC----T-------AT---------GCTTTACTGTCAACCG---------GA-CT--TCATATT-GT-AGGAGCTACT--T----AG-GTCATACCACA-TG---CGCGAG-----GGTTAGTACATCGGTGGTA-T----C-AGC-AG--CT-CT-A-ATATATC-G-C-GTGGCAGTATTCT-GCTAGCATTTTGTTTC----GTTCAAATCTGTTGGGAG-CTC--GTCAA--GAGAAGAA-CAAGCAGTC-GGATAC-AATA-AA--GGTTACGG-CA--A--TATATAATATAAATGC---GGGCGTTTGT-TTAT---ACATTGACAGTATATA-----CGGTGCTTACG--CTAAGGTCTATTGA-TCGCGTGCTGTCGAGATAATAAT-AATAA--AGTATCTT-CACAAG-GTTTATAAGTGTAC-ATGAGGGA--TT-GGAGTCCTGGG--TAG-GTA--AG-----ATTGCATATT-A---GAGGAGTACGTCACGTGTCCGGGTTATA-----------GGCA--AC--AA-CT----AG-TAT-GGGCGGTAGCACATATTTAG-C-ATATTA-G-CTC---CCGA--G--CGCTTCTT----CTCA-------CAGCC---ATTAACCAGTTAAGGACATT--CT----A---T-GG-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-CT----------ACA-A---AATCTT-TGT-----ATCTGTAGGCA------TGTATATC-GT--ATTCGAC-T--TG---TC--TCGT-TT-----ATTTT--C----------CTCATTG---TTT-GGCATTATC---A--TTC---ATTAGATAATCC---AT-T----TGC------CGCCAGTATCTG-----GT-T-CGCGCA-ATCA--TCGAAC--CTAA
gi|7 : -TAGTGCT--T-TTCCATA-CTT-CAATC-CCAGGG--AG-AT-CGA-AGAAAT-CATTATTCAT-CT--G-T-CA--TTTT----CATGTTGTCCTCAC---TCTTTTTTACCGGTATTACAT---------G-TATTTTG--AATAAACGATTAATAT---A--ATT-T-GTATAATTTCAATTG-TCATGT-GA-GGAACACATGACGG-CATAGAAG--GCGTGTGGGTAAGTGTGA---CAAACTTGAAGAACAATCGGGTTTCGGCGATG-----T-TGT----CATTT--AT-C-------A----GAT-AGAT-----CT--GACA----T-------ATAA-------GTTTA---------CGTCAACTTCTGG-TA--C--TTTTCGT-AGG-AC-A-TAGT----AG-G--AAA---CA-TGCTCC-CGAG-----GG-TAGT---TCG--GGTG-TTTTTC-AC--AGTA-T-G--A-ATA---G-GGC-ATAA------TCTTGCTGAGATTTTG--CTCGTAGTTCAT--CTGT--GG-T-CTC------C--GAT--------------C-GA---T-TA-A-AA--AG-TACACGCA--A--TATAATATA------C---GGCTG--TGTATTATTTTATATT---AG--TATATATAACGGTG-----G--TTA--GTATACTGGGTC---TG----CGCA--GATAGTTCGTA----GTAT--C-C---AGAGTTT------GT-A-A-----GA--TCCGT-GTCC-GGGTA-AT-G-----A-----GCTA-A---T-A---G----G-----TACATGTCCGG--TATA-----------AGGA-CAG--AA-CTGTAAAGTCATCAGA-----ACACAGC-CAAGTC-A---TACG-GCCAAACA-A--GCAC----CTTGC--CGAG-------CC-CC---AT--ACCT-TT-AAGTT--T--TTTCCAA---TAGT-CAT-TTG-G-A-T-TTA--GGAAT----------AGG-TGGGAATC-C-C-T-----A----TAAC-A------TAT-TATCTGT--AT---ATAT--TGTCAGC--TCG--TTTTTTAATTTTCCTAATAGCTCTGTTCA-TGTATTTT-TGTAT--TC---ATTTTC---ATT-CATAATGCACGAC-C---ATGT------C-GCCT-A-TTGATTCTGT-C-CG---A-ATCA--AAGAACCACTAAACA
gi|8 : ttaATTAAAAGACC-GTT-GTT-TTATTGTGCTTGACTTTTGCAATT-TATTGCA--T-GTTCA-A-CTTTCAGTTACCAGGG--AG-GAGCGA-AAAATT-CCTTATTCAT-CTT-G-TGCA--TTTTT-----------GCTGAC---TC-----------------AT---------C-TGTTTTG--AA-TAAAGATTA-----------TCAT-GTATA--TT---TTA-TCATGT-GA-GGA-CACATGAGG--CATAGA-G--GCGTG--GGTAA-TGTGA---CAA--ATTGAGA----TCGGGGT-CGGG-ATG-------TAT----CATAT--AT-C-------AAATAGAT-G--C---------TAAA----T-------ATAAAGCTTACGTCAAC--------CG---------GA-CT--T--TATT-GT-AGG-AC-A-T--T----AG-G--ATA--ACA-T----C-CGAG-----GG-TAGT---TCG--GGTGTT----C-AGC-AGTA-T-A--A-ATAC--G-G-C---AA------TCT-GCTGAGATTT-G--TC---AGTTCAA--CTGT--GGAG-CTC--G--ACAAGAGAAGAA-GT------C-GA---TAAAAA-AA--GG-TACGG-CA--A--TATATAATATAAATGC---GGGCGTTTGT-TTAT---ACATTGACAGTATATA-----CGGTGCTTACG--CTAAGGTCTATTGA-TCGCGTGCTGTCGAGATAATAAT-AATAA--AGTATCTT-CACAAG-GTTTATAAGTGTAC-ATGAGGGA--TT-GGAGTCCTGGG--TAG-GTA--AG-----ATTGCATATT-A---GAGGAGTACGTCACGTGTCCGGGTTATA-----------GGCA--AC--AA-CT----AG-TAT-GGGCGGTAGCACATATTTAG-C-ATATTA-G-CTC---CCGA--G--CGCTTCTT----CTCA-------CAGCC---ATTAACCAGTTAAGGACATT--CT----A---T-GG-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-AT----------ACA-A---AATC-CTTGT-----A----T----C------TG--TACATGT--AT---ATAT--TG---AC--TCG--TT-----ATT---------------TTCA-TAT--TTT-TGCAT--TC---A--TTC---A-T-GATAAT-C---A
gi|9 : att-A-GCT--GTT-GAACTGGAAGCATAC-A-AC-A-GGGCAGAG-A-GTCGCCG-GATAGATGCT----GTTGGAGTCA--T-GAGTGGAAGT-T--CTA--CAGAACCGTC-CAGAG--AAAACAAACTCGAT---CGATTCATAGAGACTGTAGAAA-AGAATATGCGCTCTCTACAGC-GAGA-TATT--AAGGAT-TTGAAACAATGGAAGTTTCAGTCACAGGGTCAA--GGACGTATGCCTCATCAAC--AGACAAGCTT-GG--TTACTAAGGATCAAGTTAGAA--AATGTT-GCA--AATGCGGTTC-TGAA---AAG---CACCTTAAAAGGGACT-GCCCGCAATGGAG-CAAAGAATTGG-AACTCCG-TAGCAATTCAAAAGAG-AATAAACACAAGGGGACTGATGCAGCTCGTAA--------TGACC-AATATATT-CTAGAGAGTAGTGCATTTGCCATAAA---CAAGAAAGGGGTTAATACTGTTCACGCGACA-CAAGTATCATTTTGAGAATGGAAT-G-TT-TATTTACCTGTTA-GTTGGTGATTGGTACGA-GG-G-----C-----TGC-ATTTACG--TGGT---------CCTT------GGGT-CACAG-GTCAA-TCCTT-GAC--AAA---GGTAGAGAGAGATGTTCTATCAGC-TAGTGG-ATCA--CCGCTAAATGTACTGGGG---AAAGTTCGAGTAGATT-TAAA-GCTGG-ACAACATTGC--ATTAAA---GC-AT-GAAA--TGGTCATAGC
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|26 ): GTAACGAATTGAGATCGGATTTGGAAGCATTATATATCGATTATCTAGAGGAAAAGGCAAATATGACGAAAAACGCTTATGTCAACCGGACTTTGGTGTAGAGTATCACGAT
Unaligned ( gi|29 ): TGTAACGAATTGAGATCGGATGTGGAAGCATTATATATCGATTATCTAGAGGAAAAGGCAAATATGACGAAAAACGCTTATGTCAACCGGACTTTGGGTGTA
Unaligned ( gi|31 ): AATTTTGGTGGCAGCAACGGGATTTGGATCGGTCAGNTCAATAAGTTTGTTAATAGACAGAAGAGTGAACAATAATAATATATAAGTTACTCGGCTAG
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 1 22 111 2222222222 1 11 1 11 222222 222 5555555555 1 111 1 1 111 111 1 11 11 111 1 111 11 22 111 11 111 11 1 1 11 1 1 2222 1111 11 1111 11 111 33333333 1111111 11 11 111 11 333333333333 777777777777777777777777777777777777777777777777777 22222222222 33333333333 2222222222222222222222 111 1111111 111 111111 11 111 111111 11 11111111111 11 1 1 11 222222222 11 11 11 111111 11 111 111 1111 1111 11111 11 11 111 1 1 11 1 1 11 11 1 11 11 222222 222 11 1 1 11 111 111 11 2222 11111 11 111 11 111 1 11 333333333 1 1 11 222222 11 1 2222222222222 11 111 1 1 11111 11 111 1 1 1 111 222 1 2222 11 11 222222 1 222 1 11 1 1 333333 1 444 1 1 22 1 1 1 1 3333333 1 1 111 111 11 1 111 1 11 111 444444444 111 444444444444444 1111111 22222 1111 1111 11 111 11 33333333 11 11 11 1 1 11 11 1 1 1 1 1 1 1 1 11 1 1 111 111 1 1 444444444 11 2222 1 1 4444444444444444444 22 22 1 11 3333333 111 111 1 222 11 111 1 11 111 888888888888888888888888888888888888 11 222222 111 11 1 111 111 1111 111 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1 1111111111111 111 111111 11111 5555555555555555555555555555555555555555555555 111111 111111 2222222222 33333333333 11 111 11 11 11111 22222 11 1 111 666666666666666666666666 111 11 3333333333333333333 1 55555555555555555555555555555555555 11 333333333333 11 1111 22222 1 1111 2222 2222 2222222222 11 11 222 1111111111 33333333333333333333333333 11111 11 111 111 1 111111 111111 1 11111 111 11111
lowQualScore : 7 3 6 3 00 6 6 666 6 3 2 7777777777 0 33 666 0 33 0 666666 000 1 2 2222222222 0 777 0 0 0 111 88 3 3 3 2 2 666 0 33 33 222 3 0 111 33 33 55 111 66 777 33 3 0 5 2 33 0 0 2 2 5555 8 8 0 5555 11 0000 99 5 000 5 33333333 44 6666666 33 9 9999 66 66 55 5 1 66 1 4 0 1 2 111 11 444444444444 5 5 333333333333333333333333333333333333333333333333333 5 33333333333 00000000000 4 55 5555555555555555555555 888 7777777 222 4 4 66 222222 4 1 11 666 88 4 4 3 111111 4 88 11 11111111111 55 4 0 33 4 2 1 1 4 0 5 777 44 1 6 77 5 1 1 77 0 5 0 8 6 33 333333333 11 11 11 666666 5 8 11 1 1 5 8 5 888 111 6 1 222 888 6 8 8 0 6 7777 6 3 4444 0 55555 11 0 3 8 1 11 777 0 5 88 0 333 2 3 3 0 33 33 0 3 3 8 33 3 3 2 11 0 0 555555 6 777 11 0 5 99 1 8 444 444 0 0 8 8 3 8 8 0 0 8 3 55 999 11 9999 88888 0 11 444 11 8 777 0 33 888888888 2 0 3 0 33 8 88 8 8 666666 0 0 0 33 0 5 8 8 8 8 8 5555555555555 8 8 11 0 777 2 2 0 0 55555 33 777 0 0 0 888 3 555 3 4444 88 7 2 33 8 333333 0 000 0 33 3 0 66 0 6 888888 7 7 1 3 000 0 3 3 7 44 6 6 6 2 7 3 3 3 0000000 6 2 3 111 444 7 33 0 777 0 3 33 777 000000000 66 3 111 333333333333333 9999999 88888 8 8 7777 6 4444 1 6 0 8 33 777 22 11 0 8 33333333 88 6 99 55 6 99 2 8 11 3 2 3 0 2 3 3 2 0 2 33 22 0 9 0 0 0 2 0 0 2 0 3 3 2 0 55 5 0 3 88 0 3 0 3 2 3 3 0 6 2 3 111 555 3 2 0 0 9 2 2 0 6 000000000 33 1111 0 0 8888888888888888888 33 33 5 2 11 2222222 777 6 111 2 2 55 2 0 888 99 111 8 8 6 222 55 8 8 0 8 0 77 0 1 8 0 6 1 99 6 6 6 3 99 6 3 1 5 5 1 00 5 5 2 77 1 1 3 333 2 1 333333333333333333333333333333333333 99 00 44 000000 7 6 99 111 6 6 6 6 1 55 6 99 99 2 000 333 0 2222 1 000 1 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 5 888 66 0 66 5 5 5 9999999999999 1 111 5 666666 22222 5 888 66 4444444444444444444444444444444444444444444444 55 9 1 33 777 888 888 66 5 222222 66 77 5 444444 5 888 5 2 5 66 5 9999999999 00000000000 5 33 5 333 33 33 99999 55555 66 33 0 777 888888888888888888888888 0 5 777 5 00 5555555555555555555 0 44 0 5 44444444444444444444444444444444444 33 111111111111 77 66 5 7777 5 5 22222 0 5 5 8888 5 5 8888 8 66 66 3333 0000 5555555555 777 22 66 8 000 55 8888 777 8 4 4 4 4 4 4 55 4 7777777777 99999 4 4 00000000000000000000000000 55 777 0 55 777 99 99 00000 11 999 5 333 55 66 999999 888 5 0 888 777777 666666 5 0 5 77777 222 00000 66 66
lowQualScore : . . . . .. . . ... . . . .......... . .. ... . .. . ...... ... . . .......... . ... . . . ... .. . . . . . ... . .. .. ... . . ... .. .. .. ... .. ... .. . . . . .. . . . . .... . . . .... .. .... .. . ... . ........ .. ....... .. . .... .. .. .. . . .. . . . . . ... .. ............ . . ................................................... . ........... ........... . .. ...................... ... ....... ... . . .. ...... . . .. ... .. . . . ...... . .. .. ........... .. . . .. . . . . . . . ... .. . . .. . . . .. . . . . . .. ......... .. .. .. ...... . . .. . . . . . ... ... . . ... ... . . . . . .... . . .... . ..... .. . . . . .. ... . . .. . ... . . . . .. .. . . . . .. . . . .. . . ...... . ... .. . . .. . . ... ... . . . . . . . . . . . .. ... .. .... ..... . .. ... .. . ... . .. ......... . . . . .. . .. . . ...... . . . .. . . . . . . . ............. . . .. . ... . . . . ..... .. ... . . . ... . ... . .... .. . . .. . ...... . ... . .. . . .. . . ...... . . . . ... . . . . .. . . . . . . . . ....... . . . ... ... . .. . ... . . .. ... ......... .. . ... ............... ....... ..... . . .... . .... . . . . .. ... .. .. . . ........ .. . .. .. . .. . . .. . . . . . . . . . . .. .. . . . . . . . . . . . . . . .. . . . .. . . . . . . . . . . . ... ... . . . . . . . . . ......... .. .... . . ................... .. .. . . .. ....... ... . ... . . .. . . ... .. ... . . . ... .. . . . . . .. . . . . . . .. . . . . .. . . . . . . .. . . . .. . . . ... . . .................................... .. .. .. ...... . . .. ... . . . . . .. . .. .. . ... ... . .... . ... . .......................................................................................................... . ... .. . .. . . . ............. . ... . ...... ..... . ... .. .............................................. .. . . .. ... ... ... .. . ...... .. .. . ...... . ... . . . .. . .......... ........... . .. . ... .. .. ..... ..... .. .. . ... ........................ . . ... . .. ................... . .. . . ................................... .. ............ .. .. . .... . . ..... . . . .... . . .... . .. .. .... .... .......... ... .. .. . ... .. .... ... . . . . . . . .. . .......... ..... . . .......................... .. ... . .. ... .. .. ..... .. ... . ... .. .. ...... ... . . ... ...... ...... . . . ..... ... ..... .. ..
lowQualScore : 3 3 7 3 00 7 7 000 7 2 5 8888888888 0 88 000 0 88 2 555555 222 2 5 2222222222 0 555 8 0 0 000 88 2 2 2 5 5 222 0 88 88 222 2 0 000 88 88 88 000 55 555 88 2 0 5 5 88 0 0 5 5 0000 0 0 8 4444 00 0000 00 7 000 7 33333333 44 7777777 88 4 0000 99 99 11 0 0 99 9 4 7 0 6 777 99 666666666666 0 0 888888888888888888888888888888888888888888888888888 3 88888888888 66666666666 4 66 0000000000000000000000 777 4444444 222 4 6 11 888888 4 8 00 555 33 7 4 6 222222 4 00 00 22222222222 55 0 7 77 0 7 0 0 4 9 3 111 66 0 6 99 7 0 4 99 1 0 4 9 6 00 222222222 00 00 00 666666 0 0 22 0 0 0 0 6 777 333 7 0 555 333 4 0 0 8 0 0000 0 8 8888 8 66666 00 8 2 0 4 00 555 0 5 88 0 555 5 2 2 0 22 88 0 2 2 8 88 2 2 5 00 8 8 666666 4 000 00 0 8 00 0 0 000 000 8 8 0 0 2 0 0 8 8 0 2 88 000 00 6666 22222 8 00 000 00 0 555 0 88 888888888 5 0 2 0 88 0 88 0 0 444444 8 8 8 66 6 6 0 0 0 0 0 0000000000000 0 0 00 8 555 5 5 0 0 88888 88 555 0 0 0 000 2 777 3 0000 33 3 5 88 8 555555 0 555 0 88 2 0 88 0 5 333333 3 3 0 3 333 7 3 3 3 00 7 7 7 0 3 3 3 3 3333333 7 0 3 000 000 0 88 0 555 0 2 88 555 222222222 55 2 000 000000000000000 0000000 00000 0 8 0000 7 2222 0 7 8 0 88 555 44 00 8 2 22222222 33 7 22 88 7 22 5 0 00 2 5 2 0 5 2 2 5 0 5 00 00 0 8 2 2 0 5 0 0 5 0 2 2 5 0 88 5 0 2 00 2 2 0 2 5 2 2 0 5 0 2 000 888 2 5 0 0 2 5 5 2 5 000000000 88 2222 0 0 0000000000000000000 88 22 0 5 00 5555555 555 5 000 5 5 88 5 0 222 22 888 0 0 0 222 88 0 0 6 0 8 88 8 0 8 8 7 0 22 7 7 7 5 22 7 5 0 7 7 3 00 7 7 3 99 4 3 2 000 5 0 333333333333333333333333333333333333 22 22 55 222222 3 7 22 777 7 7 7 7 0 88 7 22 22 0 000 333 6 1111 7 777 7 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 0 222 99 0 00 0 0 0 5555555555555 0 111 0 999999 55555 0 888 99 8888888888888888888888888888888888888888888888 88 4 0 55 999 888 000 99 0 555555 99 11 0 444444 0 888 0 2 0 99 0 0000000000 00000000000 6 88 1 444 88 88 44444 00000 99 88 0 555 888888888888888888888888 9 0 555 0 11 9999999999999999999 0 22 1 9 88888888888888888888888888888888888 88 555555555555 55 99 0 5555 0 0 22222 0 0 0 4444 0 0 9999 9 11 11 3333 2222 1111111111 888 22 77 0 444 55 5555 000 0 0 0 0 0 0 0 55 0 5555555555 88888 0 0 55555555555555555555555555 55 000 8 55 000 55 55 00000 00 000 0 888 11 99 666666 888 0 0 888 444444 444444 7 0 0 55555 000 99999 99 99
consensus : AGAGAGAGAATACATGA-TTCGTTA-CGGG-TCCTGAACTCTTCTAGGAGCATGC-GTCCCATAGCCCGAGACCCATACCAGG---TAT----GA-GT--ACCAGT-ACC--CCGTATGTA---AGAG--CAAGAGAGAGA-N-------TGTAA-GTGG---ATAT-TT-AGTG-A-TGA-ATGCATGTGTACATGATGAGAGAGGTACTCGTCCCGC--ATCAAGAGTTACTA-GTCCC--GT--ATCGNGAGT-TACTCGTCTCGCA-T-CGAA--CAA--CAGACTGATGCCAGAG-A-TAC-GTC---CCAGGAT--GGATG-CAAACCTGCATGGACAGA--TCCGGTCTA-AG-CCCGAAACTTCGT----AAA-CCA-GCGACATA---TGATGGTACG--GGTCTCTGG-GAAGATTA--CTTGTC-GCATT---TC-GA---G-T--GCGTGT----CTACT--GAATGAGTGG--A-CAG--AC--ANTGA-GAAAGGTNT--ATACTTGGC-TGCGTCNCTNAGGGGNACAAGCACAAGG--AGTN-----------TTAG-GAAA-TCAGC------C-----A----------A--G-------------A--A-----TTATTGGA-----------AGCTA-----------GT-TAAAGC-CCTT---CGGGG----NA-GA----TTTGCT-TCCAG-T-----AAA---CCAG-ACTGAGC--TAT------A-TAGAGCACAGCT--GAGA---GAGAAAGGAGGC-AAAAG-----GCATCT-GAA-AGTT--TGCCGGAG--C--T----GGGT--C-AAGACGTAAGAA-GGCTNGCNAA-TCTAGCNTACCC--NACC-GCTCCNGATGAGGT--AAGAG-AAACNC-TTG--CTACAGGAGCAGTTCTTNGATGG-ACTACGNAGT-T-CA--GAG--AT--GCG-TC--TCAAG-ATC-AAACAGGCAAGACCTGTAAACCTGAAT-GATGCGATACGGAG-A-GCC--GTT-GAACTGGANGCATAC-A-AC-A-GGCCAGAGGA-GTCGCCG-GATAGATGCT----GTAAGAGTCA--T-GAGTGGAAGT-T--CTA--CAGAACCGTC-CAGAG--AAAACAAACTCGAT---CGAT-CATAGAGACTG-AGAAA-AGAATATGCGCTCTCTACAGC-GAGA-TATT--AAGGAT-TTGAAACAATGGAAGTTTCAGTCACAGGGTCAA--GGACGTATGCCTCATCAAC--AGACAAGCTCGGG--TTGCTAAGG-TCAAGTTAGAA--AATGTTAACA--AATGCGGTTC-TGAA---AAG---CACCTTAAAAGGGACT-GCCCGCAATGGAG-CAAAGAGTTGG-AACTCCG-TAGCAATTCAAAAGAG-AATGAACACAAGGGGACTGATGCAGCTCGTAATGCATC--TGACC-A--ATATT-CT--AGAGTAGTGCATT--CCATAAA---CGAGAAAGGGGTT--TA-TGT---CACGGCA-C--GTATC--------CATGGAAT-GATG-TA--TACCTGTTG-GTTGAT-ACAGGCGCTA-CG-G-----CGTCCTTGCTATCTACAATTTGTTA-TGAGAACATTTGC-AAGGGT-CACAG-GTCAA-TCCTT-GAC--AAG---GTCGGAGAGAGATGTGCTATCAGC-TAGTGG-ATCA--CCGCTAAAGGTACTGGGA---AAAGTTCCAGTAGATT-TAAA-GTTGG-A-GACATTGC--GTTAAA---GC-AT-G-AA--CGGTCATAGCT--TGACCTA-ACAGTGGATGGGA--TCTT--GGATTAGATTTCCTGGTTAAGCATG--AGGCAGTAAT-CG---AC-ATGCGCATGCATA-GA-TAAAAA--TATCTGGC-ACGGAGCAC-CCTATCAAGCTGGAAGGGTTGC------AACCTCATANAAGGTAG-CCAC--CTTTCATG-GA-GTCACGGATACCACCTAGATCGGAAGCTGATGGTA-GAAGGAG-AGATACGT-ACTAGGATC--GGATGGAGGACTCTCAGCC-AAGC-T-GAATA-TGATA--AA-GCATT---C-GGAAA--AGT---TTCAGAAG-----CCGGGTTCTTGTT-T-GCTGGCC------------A--AAACACCTG--T----CCGT-----ACA-CAGAAGNACA----TGC-GACACAAACG----GCCGGATG-CCTCTTC-CAC--ATCATC---ANCGGGAA--TAGTTGAAGATG-A-GAC-GGTGACTGGGATGT--AG-ATC--CCG--AAG-TTCAA--GTTGGGGACGAGGGGGTTGA-GGTCTCAGAGAAGN-GATGGGAGC-AGGGCCATCCTTATCTGGTAGT-GCAGAGCTT-ATTACTAGCCGTG-TTATTCGCAAAAGAACATCTCCAA-TCCTGTCCAGA-C-CTCCAGAAA-AGTCACAAGTCGAGAAGAGGA-AGTGGTACAGTAGGAAG-TGTGTAGATGTGCCGGTAT-TCAGACAGTCACGTTTGAGCC-CATCCGAGTG-A-CAAG-TCAGCAGAAATGGTGGGTCAG-GGT-ACTCAGACAGAAGGATACCGTCGA---------CG--GGT----CA-AAGA-AG---T-TC--GTCAC--G--GTAT--CAAG-AAACGGACAAAGAGTCA-NGA-------GAAG---GAAGAAT-T-TTCCGTAAGATGTAGACGGAT-AT-ACAGC-GCAT--A-CTGT-AACATTAAAAGACC-GTT-GTT-TTATTGCGCTTGACNTTNGCAATT-TANTGCA--T-GTTCA-A-CTTTCAGTCACCAGGG--GA-GTGCGA-AGAATT-CATTATTCAT-CTT-G-TACA--TTTTTTTTCATGTT-TGCTCAC---TCT---------------CAT---------C-TGTTTTG--AA-AAAAGATTAAGAT---T--ATCAT-GTATA--TT---TTA-TCATGT-GA-GGA-CACATGANG--CATAGA-G--GCGTG--GGTAAGTGTGA---CAA--TTAGAGG----TCGGGGT-CGGGGATG--GGTT-CGT----CATGT--AT-C-------A----GAT-G--C-----CT--TAAA----T-------AT---------GTT-----------CG---------GG-TG--T--TATT-GT-NGG-GC-A-T--T----AT-G--ANA--GCA-T----C-CGAG-----GG-TAGT---TCG--GGTG-T----C-AGC-GGTACT-AT-A-ATA---G-G-C-GTGA------TCT-GCTGANATTTCG--NC---AGTTCAG--CTGT--GGAG-CTC--G--AC--GAGAAGAA-GA------C-GG---T-GATA-AA--GG-TAC---TA--A--TATATAATA------C---GGGCG--TGTATTATA--ATATT--CAG--TATA-----CGGTG-----G--CTA--GTGTACTGG-TC---TG----CGAG--AATAGT-AATAA--AGTATTTC-C---AG-GTTTA-AAGTGT-C-A-----GA--TC-G--GTCC-GGNTATAGGGA---AAAT-TA-A---TA-------GACGAG-----CACCTGTCCGG--TATA-----------AGGA-CAG--AA-CT----AG-CAT-AGG-----GCACAGA-CAAG-C-A---TA-G-GTC---CC-A--G--C----CTTA---CGCA-------CA-CC---AT--ACC--TT-AGGTC--T--CT----A---T-GC-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-AT----------AGG-T---AATC-C-TGT-----A----TA---A------TAT-TATCTGT--AT---ATAT--TG---AC--TCG--TT-----ATTTT--TAATAG---TGTTCA-TA---TTT-TGCAT--TC---A--TTC---ATT-GATAAT-C---AT-C---ATGC------C-CCAG-A-CTG-----GT-C-CG---A-ATCA--ACGAAC--CTAAACAC
Reference ( family-5610 ) : AGAGAGAGAATACATGA-TTCGTTA-CGGG-TCCTGAACTCTTCTAGGAGCATGC-GTCCCATAGCCCGAGACCCATACCAGG---TAT----GA-GT--ACCAGT-ACC--CCGTATGTA---AGAG--CAAGAGAGAGA-C-------TGTAA-GTGG---ATAT-TT-AGTG-A-TGA-ATGCATGTGTACATGATGAGAGAGGTACTCGTCCCGC--ATCAAGAGTTACTA-GTCCC--GT--ATCGNGAGT-TACTCGTCTCGCA-T-CGAA--CAA--CAGACTGATGCCAGAG-A-TAC-GTC---CCAGGAT--GGATG-CAAACCTGCATGGACAGA--TCCGGTCTA-AG-CCCGAAACTTCGT----AAA-CCA-GCGACATA---TGATGGTACG--GGTCTCTGG-GAAGATTA--CTTGTC-GCATT---TC-GA---G-T--GCGTGT----CTACT--GAATGAGTGG--A-CAG--AC--ANTGA-GAAAGGTNT--ATACTTGGC-TGCGTCNCTNAGGGGNACAAGCACAAGG--AGTN-----------TTGG-GAAA-TCAGC------C-----A----------A--G-------------A--A-----TTATTGGA-----------AGCTA-----------GT-TAAAGC-CCTT---CGGGG----NA-GA----TTTGCT-TCCAG-T-----AAA---CCAG-ACTGAGC--TAT------A-TAGAGCACAGCT--GAGA---GAGAAAGGAGGC-AAAAG-----GCATCT-GAA-AGTT--TGCCGGAG--C--T----GGGT--C-AAGACGTAAGAA-GGCTNGCNAA-TCTAGCNTACCC--NACC-GCTCCNGATGAGGT--AAGAG-AAACNC-TTG--CTACAGGAGCAGTTCTTNGATGG-ACTACGNAGT-T-CA--GAG--AT--GCG-TC--TCAAG-ATC-AAACAGGCAAGACCTGTAAACCTGAAT-GATGCGATACGGAG-A-GCC--GTT-GAACTGGANGCATAC-A-AC-A-GGCCAGAGGA-GTCGCCG-GATAGATGCT----GTAAGAGTCA--T-GAGTGGAAGT-T--CTA--CAGAACCGTC-CAGAG--AAAACAAACTCGAT---CGAT-CATAGAGACTG-AGAAA-AGAATATGCGCTCTCTACAGC-GAGA-TATT--AAGGAT-TTGAAACAATGGAAGTTTCAGTCACAGGGTCAA--GGACGTATGCCTCATCAAC--AGACAAGCTCGGG--TTGCTAAGG-TCAAGTTAGAA--AATGTTAACA--AATGCGGTTC-TGAA---AAG---CACCTTAAAAGGGACT-GCCCGCAATGGAG-CAAAGAGTTGG-AACTCCG-TAGCAATTCAAAAGAG-AATGAACACAAGGGGACTGATGCAGCTCGTAATGCATC--TGACC-A--ATATT-CT--AGAGTAGTGCATT--CCATAAA---CGAGAAAGGGGTT--TA-TGT---CACGGCA-C--GTATC--------CATGGAAT-GATG-TA--TACCTGTTG-GTTGAT-ACAGGCGCTA-CG-G-----CGTCCTTGCTATCTACAATTTGTTA-TGAGAACATTTGC-AAGGGT-CACAG-GTCAA-TCCTT-GAC--AAG---GTCGGAGAGAGATGTGCTATCAGC-TAGTGG-ATCA--CCGCTAAAGGTACTGGGA---AAAGTTCCAGTAGATT-TAAA-GTTGG-A-GACATTGC--GTTAAA---GC-AT-G-AA--CGGTCATAGCT--TGACCTA-ACAGTGGATGGGA--TCTT--GGATTAGATTTCCTGGTTAAGCATG--AGGCAGTAAT-CG---AC-ATGCGCATGCATA-GA-TAAAAA--TATCTGGC-ACGGAGCAC-CCTATCAAGCTGGAAGGGTTGC------AACCTCATANAAGGTAG-CCAC-GCTCTCATG-GA-GTCACGGATACCACCTAGATCGGAAGCTGATGGTA-GAAGGAG-AGATACGT-ACTAGGATC--GGATGGAGGACTCTCAGCC-AAGC-T-GAATA-TGATA--AA-GCATT---C-GGAAA--AGT---TTCAGAAG-----CCGGGTTCTTGTT-T-GCTGGCC------------A--AAACACCTG--T----CCGT-----ACA-CAGAAGNACA----TGC-GACACAAACG----GCCGGATG-CCTCTTC-CAC--ATCATC---ANCGGGAA--TAGTTGAAGATG-A-GAC-GGTGACTGGGATGT--AG-ATC--CCG--AAG-TTCAA--GTTGGGGACGAGGGGGTTGA-GGTCTCAGAGAAGN-GATGGGAGC-AGGGCCATCCTTATCTGGTAGT-GCAGAGCTT-ATTACTAGCCGTG-TTATTCGCAAAAGAACATCTCCAA-TCCTGTCCAGA-C-CTCCAGAAA-AGTCACAAGTCGAGAAGAGGA-AGTGGTACAGTAGGAAG-TGTGTAGATGTGCCGGTAT-TCAGACAGTCACGTTTGAGCC-CATCCGAGTG-A-CAAG-TCAGCAGAAATGGTGGGTCAG-GGT-ACTCAGACAGAAGGATACCGTCGA---------CG--GGT----CA-AAGA-AG---T-TC--GTCAC--G--GTAT--CAAG-AAACGGACAAAGAGTCA-NGA-------GAAG---GAAGAAT-T-TTCCGTAAGATGTAGACGGAT-AT-ACAGC-GCAT--A-CTGT-AACATTAAAAGACC-GTT-GTT-TTATTGCGCTTGACNTTNGCAATT-TANTGCA--T-GTTCA-A-CTTTCAGTCACCAGGG--GA-GTGCGA-AGAATT-CATTATTCAT-CTT-G-TACA--TTTTTTTTCATGTT-TGCTCAC---TCT---------------CAT---------C-TGTTTTG--AA-AAAAGATTAAGAT---T--ATCAT-GTATA--TT---TTA-TCATGT-GA-GGA-CACATGANG--CATAGA-G--GCGTG--GGTAAGTGTGA---CAA--TTAGAGG----TCGGGGT-CGGGGATG--GGTT-CGT----CATGT--AT-C-------A----GAT-G--C-----CT--TAAA----T-------AT---------GTT-----------CG---------GG-TG--T--TATT-GT-NGG-GC-A-T--T----AT-G--ANA--GCA-T----C-CGAG-----GG-TAGT---TCG--GGTG-T----C-AGC-GGTACT-AT-A-ATA---G-G-C-GTGA------TCT-GCTGANATTTCG--NC---AGTTCAG--CTGT--GGAG-CTC--G--AC--GAGAAGAA-GA------C-GG---T-GATA-AA--GG-TAC---TA--A--TATATAATA------C---GGGCG--TGTATTATA--ATATT--CAG--TATA-----CGGTG-----G--CTA--GTGTACTGG-TC---TG----CGAG--AATAGT-AATAA--AGTATTTC-C---AG-GTTTA-AAGTGT-C-A-----GA--TC-G--GTCC-GGNTATAGGNA---AAAT-TG-A---TA-------GACGAG-----CACCTGTCCGG--TATA-----------AGGA-CAG--AA-CT----AG-CAT-AGG-----GCACAGA-CAAG-C-A---TA-G-GTC---CC-A--G--C----CTTA---CGCA-------CA-CC---AT--ACC--TT-AGGTC--T--CT----A---T-GC-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-AT----------AGG-T---AATC-C-TGT-----A----TA---A------TAT-TATCTGT--AT---ATAT--TG---AC--TCG--TT-----ATTTT--TAATAG---TGTTCA-TA---TTT-TGCAT--TC---A--TTC---ATT-GATAAT-C---AT-C---ATGC------C-CCAG-A-CTG-----GT-C-CG---A-ATCA--ACGAAC--CTAAACAC
gi|1 : AGAGAGAGA-TACATGA-TTCGTTA-CGGG-TCCTGAATTCTTCTAGATGCATGC-ATCCCATAGCCCGAGACCCATAACAGG---TAT----GA-GT--ACCAGT-ACC--CCGTATGTA---AGAA--CAAGAGAGAG----------TGTAA-GTGG---ATATGTT-AGTG-A-TGA--TGCATGTGTACATGATGAG-GAAGTACTCGTCCCGA--ATCAAGATTTACTA-GTCCC--GT--ATCTCG--T-TACTCGTCTCGCA-T-CGAA--CAA--CAGACTGATGCCAGAG-AATAC-GTC---CCAGGAT--GGATGGCAAACCTGCATGGACAGA--TCCGGTCTA-AG-TCCGAAACTTCGT----AAA-CCA-GCGACATA---TGATGGTACA--GGTCTCTGG-AATGATTAA-CTTGTC-GCATT---TC-GA---G-TATGTGTGT----CTACT--GAATGAGTGG--A-CAG--AT--ATTGA-GAAAGGTTT--ATACTTG-C-TGCATCTCTTAGGGGAACAAGCACAAGGG-AGTA-----------TTAG-GAAA-TCAGC------C-----A----------A--G-------------A--A-----TTATTGGA-----------AGCTA-----------GT-TAAAGC-CCTT---CAAGG----TA-GA----TTTGCT-TCCAG-T-----AAA---TCAG-ACTGAGC--TAT------A-T-GAGCACAGCT--GAGA---GAGAAAGGAGGC-AAAAG-----GCATCT-GAA-AGTT--TGCCGGAG--A--T----GGGT--C-AAGACATAAGAA-GGCTTGTTAA-TTTAGCCTACCC--CACC-GCTCCTGATGACGT--AAGAG-AAATAC-TTG--CTACAGAAACAGTTCTTGGATGG-ACTACATAGT-T-CA--GAG--AT--GCA-TC--TCAAG-ATC-AAACAGGCAAGACCTGTAAACCTGAAT-GATGCGATACAGAG-A-GCT--GTT-GAACTGGAAGCATACAA-AC-A-GGGCAGA-GA-GTCGCCG-GATAGATGCT----GTAAG-GTCA--T-GAGTGGAAGT-T--CTA--CAGAACCGTC-CAGAG--AAAACAAACTCGAT---CGAT-CATAGAGACTG-AGAAA-AGAAT-TGCGCTCTCTCCAGC-GAGATTATT--AAGGAT-TTGAAACAATGGAAGTTTC-GTCACAGGGTCAA--GGACGTATGCCTCATCAAC--AGACAAGCTC--G--TTACTAAGA-TCAAGTTAGAA--AATGTTAACA--ATTGCGGTTC-TGAA---AAG---CACCTT-AAAGGGACT-GCCCGCAATGGAG-CAAAGAGTTGG-AACTCCA-TAGCAATTCAAAAGAG-AATGAACAAAAGGGGACTGATGCAGCTCGTAATGTATC--TGACC-----TATT-CC--AGAGTAGTGCATT--CCATAAA---CGAGAAAGGGGTT--TA-TGT---CACGGCA-C--GTATC--------CATGGAAT-GATG-TA--TACTTGTTGTTTTGA--ACAGGCGCTA-CG-G-----TGTCCTTGCTATCTACAATTTGTTA-TGAGAACATTTGC-AAGAGT-CACAG-GTCAA-TCCTT-GAT--AAG---GTCGGAGAGAGATGTGCTATCAGC-TAGTGG-ATCAACCCGCTAAAGGTACTGGGA---AAAGTTCCAGTAGATTCTAAA-GTTGGAA-GGCATTGC--GTTGCA---GC-GT-G-AA--TGATCATAGC---TGACCTA-ACAGTAGATGGGA--TCTT--GGATTAGATTTCCTGGTTAGGCATG--AGGCAGTAAT-TG---AC-ATGCGCATGCATC-GA-TAAAAAATTATCTGGC-ACGGAGCAC-CCTATCAAGCTGGAAGGGCTGC------AACCTCATACAAGGTAG-CCA---TTCACATA-GA-GTCAC-AATACCACCTAGATCAGAA-CTAATGGTA-GAAGGAG-AGATACGT-ACTAAGATC--GGATGGAGGACT-TCAGCC-AAAC-T-GAAC--TGATA--AT-GCATT---C-GGAAA--AGT---TTCAGAAA-----CTAGGTTCTTGTT-T-GCTGGCC------------A--AAACACTTG--T----CCGT-----ATA-CAGAAGAATA----TGC-GACACAAACA----GCTGGGTG-CCTCTTC-CAC--ATCATA---AGTGGGAA--TAGTTGAATATGAA-GAC-AGTGACTGGGATGT--AG-ATC--CTG--AAG-TTC-A--GTT-GGGACGAGGGAGTTGA-GGTCTAAGAGAAGT-GATGGGAGC-AGGG-CATCCTTATCTGGTAGT-GTAGAGCTT-ATTACAAGCCGTG-TTATTCGCAAAAGAACATCTCCAA-TCCTGTCCAGA-C-CTCCAGAAA-AGTCATAAGTCGAGAAGAGGA-AGTGGTACAG-AAGAAG-TATGTAGATGTGCTGGTAT-TCAGACAGTC-CGTTTGAGCC-CATCCAAGTGAA-TAAGTTCTGCAGAAATGGTGGATCAG-GGT-ACGCAGACAGAAGGATACCGTCGA---------CG--GGT----CA-AAGA-AG---TATC--GTCA---A--GTAT--CAAGAAAACGGACAAAGAGTCA-TGA-------GAAG---GAAGAAT-TATTCCGTAAGAT-TAGACGGAT-ATAACAGC--CAT--A-CTGT-AACATTAAAAGACC-GTT-G-T-TTA-TGTGCTTGACATTGGCAATT-TAATGCG--T-GTTCA-A-CTTTCAGTCACCAGGG--GA-GTGTGG-AAAATT-CATTATTCAT-CTT-G-TACA--TTTTTTTTCATGTT-TGCTTA-----CT---------------CAT---------TGTGTTTTG--AA-AAAAGATTAAGAT---T--ATCAT-GTATA--TT---TTA-TCATGT-GA-GGA-CACATGCAG--CATAGA-G--GCGT---GGTAA-TGTGA---CAA--TTAAAGG----TCGGGAT-CGGAAATG--GGCT-CGG----AATGC--AT-C-------------AT-G--C-----CT--TAGA----T-------AT---------ATT-----------CG---------GG-TG--T--TATT-GT-TGT-GC-A-T--C----AT-G--AAA--GCA-C----C-CGAG-----GG-TAGT---TCG--GGTG------C-AG--GGTACT-AT-ATATA---G-G-CTGTGA------TCA-GC-GATATTTCG--GC---ACTTCAG--CTGT--GGAG-AT---G--AC--GAGAAGAA-GA------C-GG---T-GATA-AA--GG-TAC---TA--A--TATATAATA------C----GGCG--TGTATTATA--ATATT--CAG--TATA-----CGGTG-----G--CTA--GTGTACTGG-TC---TG-----GAG--AATAG--AATAA--AGTATTCC-C---AG-GTT---AAGTAT-C-A-----GG--T-----GTCC-GGGTAGAGGTATCTATAC-CT-A---TACATACTTGACAAG-----CACCTGTCCGG--TATA-----------AGGA-CAG--AA-CT----AG-CAT-AGG-----ACACAGA-CAAG-C-A---TA-G-GT----CC-A--G--C----CATA---CGCA-------C--CC---AT--ACC--TT-AGGTC--T--CC----A---T-GC-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-AT----------AGG-T---AATC-C-TGT-----A----TA---A------TAT-TATCTGT--AT---ATAT--TG---AC--TCG--TT-----ATTTT--TAATAG---TGTTCA-TA---TTT-TGCAT--TC---A--TTC---ATT-AATAAT-C---AT-C---ATGC------C-CCAG-A-CTG-----GT-C-CG-----ATCAACACGAAC--CTAAACAC
gi|10 : --AGACAAGTTCAG---CTGCTAAGG----AGTTACAA--AAT--TAAAATTAATGCGGTTC-TGAA---AAG---CACCTTAAAAGGGACT-GTCCACAACGGAT-CAAAGAGTTGG-AACTCCG-TAGCAATTCAAAAGAG-AATGAACACAAAAGGACTGATGCAGGTCGTAATGCATC--TGATC-A--ATATT-CT--AGGGTAGTGCATT--CCATAAA---CGAGAAAGGGGTT--TA-TGT---CACGGCA-C--GTATC--------CATGGAATGGATG-TA--TATCTGTTG-GTTGAT-ACAGGTGCTA-CG-G-----TGTCCTTGCTATCTACAATTTGTTA-TGAGAACA-TTGC-AAGGGT-CACAG-GTCAA-CCCTT-AAC--A--------------AGATGTACTATCATC-TAGTGG-ATCA--CCGCTAACGGT
gi|10 : TCCTGGTTGAGAATG--AGGTAGTAAT-TG---AC-ATGCGCATGCAAAAGA-TAAAAA--TATCTGGC-ATTGAGCAC-CTTATCAAGCTGGAccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcctggttgagaatgaggtagtaattgacatgcgcatgcaaaagataaaaatatctggcattgagcaccttatcaagctgga
gi|11 : agacaagttcagctgctaaggagttacaaaattaaaattaatgcggttctgaaaagcaccttaaaagggactgtccacaacggatcaaagagttggaactccgtagcaattcaaaagagaatgaacacaaaaggactgatgcaggtcgtaatgcatctgatcaatattctagggtagtgcattccataaacgagaaaggggtttatgtcacggcacgtatccatggaatggatgtatatctgttggttgatacaggtgctacggtgtccttgctatctacaatttgttatgagaacattgcaagggtcacaggtcaacccttaacaagatgtactatcatctagtggatcaccgctaacggtccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn----T-------AT----------TT-----------CG---------GG-TG--T--TATT-GT-TGT-GC-A-T--T----ATTG--AAA--GCA-T----C-TGAG-----GG-T-GT---TCG--GGTG------C-AG--GGTACT-AT-A--TA---ACG-CAGTGA------TCA-GC-GATATTTCG--GC---AGTTCAA--CTGT--GGAG-CTA--G--AC--GAGAGAAA-GA------C-GG---T-GATA-AA--GG-TAC---TATAA--T-TATAGAA------C---GG-CG--TGTATTATA--ATATT--CAG--TATA-----CGGTG-----G--CTA--GTGTACTGG-TC---TG-------G--A---------------CATTTC-C---AG-GTTTA-AAGTGT-CGA-----GA--TC-G--GTCC-GGCTATAGAGA---ATAT-TA-A---GA--------ACAAG-----CACCTGTCCGG--TAT------------AGGA-CAGA-AA-CT----AG-CTT-AGG-----ACACAGA-CAAG-C-A---CA-GTGT----CC-A--G--C----CTTA---CGC--------CA-CC---AT--ACC--TT-AGGT---T--CT----A---T-GC-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-AT----------AGG-T---AATC-C-TGTATA--A----TA---A------TAT-TATCTGT--AT---ATA---TG---AC--TCG--TT-----ATTTT--TAATAGT--TGTTCA-TA---TTT-TGCAT--TC---A--TTC---ATT-GATAAT-C---ATAC---ATGC------C-CCAG-A-CTG-----GT-C-CA---A-ATCA--ACGAAC--CTAAACAC
gi|12 : ----T-------AT----------TT-----------CG---------GG-TG--T--TATT-GT-TGT-GC-A-T--T----AT-G--AAA--GCA-T----C-TGAG-----GG-TAGT---TCG--GGTG------C-AG--GGTACT-AT-A--TA---ACG-CAGTGA------TCA-GC-GATATTTCG--GC---AGTTCAA--CTGT--GGAG-CTA--G--AC--GAGA-GAA-GA------C-GG---T-GATA-AA--GG-TAC---TA-----TATATAGAA------C---GG-CG--TGTATTATA--ATATT--CAG--TATA-----CGGTG-----G--CTA--GTGTACTGG-TC---TG-------G--A---------------CATTTC-C---AG-GTTTA-AAGTGT-CGA-----GA--TC-G--GTCC-GGCTATAGAGA---AATT-TA-A------------GACAAG-----CACCTGTCCGG--TATA------------GGA-CAG--AAACT----AG-CTT-AGG-----ACACAGA-CAAG-C-A---CA-G-GTC---CC-A--G--C----CTTA---CGCA-------C--CC---AT--ACC--TT-AGGTT--T--CT----A---T-GC-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-AT----------AGG-T---AATC-C-TGT-----A----TA---A------TA---ATATGT--AT---ATAT--TG---AC--TCG--TT-----ATTTT--TAATAGT--TGTTCA-TA---TTT-TGCAT--TC---A--TTC---ATT-GATAAT-C---ATAC---ATGC------C-CCAG-A-CTG-----GT-C-CA---A-ATCA--ACGAAC--CTAAACACg
gi|13 : -GACAAGAGCA----GCCGGGTG-TCTC--C-CAC--CTCATC---ATGGGGAA--TAGTTGAGAGTG-A-GACAAGTGAGT-GGATGTTGAGAATC--CTGGAAGG-TTCAA--GTGTGGGA-GAGGGGGTTGATGGTCTCGGGGAAGA-G-TGGG-GC-AGAACCATGCTT-TCT-GTAGTCGCATAG------GACT----GTG-TTATACGTTAAAGGAAATCTCAAG-TCCTGTCCAGGCC-CTCCAGAAA-GGTCAC-AGT--GGAAGAGGATAGTGGTA-AGTAGGAAG-TGTGTAGATGGGCGGGTATGTC-GA-AGTCAGGTTTGAGCCGCATCTGAG-A-A-TAAT-TCAGCAG-AATGGT-GGTCAG-AGTAACTCAGACAAAAG---ATCGT-GA---------CG--GGT----CA-AAGA-AG---TCTCCAGTAAC--GACGTATG-CATG--AACGGGCAAGGAGTCA-AGAAATAAACGGAGAGTGAAAGAT-T-TTTGTTTAGATGTAGACGTTTAAT-A-AGCAGCA---A-CTGT-AAg
gi|14 : a-ATGCATGTATATATGATGAGAGAGGTACTCGTCCCGC--ATCAAGAGTTACTA-GTCCC--GT--ATCGAGAGT-TACTCGTCTCGCA-T-CGAA--CAA--CAGACTGATGCCAGAG-A-TAC-GTC---CCAGGAT--GGATG-CAAACCTGCATGGACAGA--TCCGGTCTA-AGCCCCGAAACTTCGTG---AAG-CCA-GCGACATT---TGATGGTACG--GGTCTCTGG-AATGATTA--CTTGGCTGCATC---TC-
gi|14 : TACTTGGC-TGCATCTCTTAGGGG-ACAAGCACAAGG--AGTG-----------TTAG-GAAA-TCAGC------C-----A----------A--GGGATGAGAGGCAGA--A-----TTATTGGA-----------AGCTA-----------GT-TAAAGC-CCTT---CAGGA----TA-GA----TTTGCT--CCAG-T-----AAA---TCAG-ACTGAGC--TAT------A-TAGAGCACAGCT--GAGA---GAG--AGGAGGT-AAAAG-----GCATCT-GAA-AGTT--TGCCGGAGATCGAT----GGGT--C-AAGACATAAGAA-GGCTTTTTAA-TTTAGCCTACCC--GACC-Gttaggggacaagcacaaggagtgttaggaaatcagccaagggatgagaggcagaattattggaagctagttaaagcccttcaggatagatttgctccagtaaatcagactgagctatatagagcacagctgagagagaggaggtaaaaggcatctgaaagtttgccggagatcgatgggtcaagacataagaaggctttttaatttagcctacccgaccg
gi|15 : atgcatgtatatatgatgagagaggtactcgtcccgcatcaagagttactagtcccgtatcgagagttactcgtctcgcatcgaacaacagactgatgccagagatacgtcccaggatggatgcaaacctgcatggacagatccggtctaagccccgaaacttcgtgaagccagcgacatttgatggtacgggtctctggaatgatTACT--AAATAAATGG--A-TAGTAAC--A--GA-AATGGGCAT--GCATCTAGT-GGTATCATTGAGTAG-ATAAGCTCAAAG--TGTC-----------TTAG-GAAA-TCTAC------CTGAGGG----------A--G-------------A--AAAGTGTAAATACA-----------GGCTGTT---------GTGTAAAGC-AC-----AGGAG----GA-GAGGTTTTTAC---CCAC-T-----AA----CCAG-ACGGAAC--TTT------A-CAGAGCACAGCT--GAGA---GAGAGACGA--C-AGAAA-----GCCACA-GAG-ACAC--TACCGGAA--C--T----GGGA--C-AGGAAATACGGC-GGTTAACGAA-TCTAGCATACCC--CTCA-GCTCCAGTGGAGGT--AAGAG-AGACAC-TTG--C-AAAGGAACAGTTTCTTGATGC-GTTAAGGGA----CA--GGGACAT--GCG-TT--TGAGA-GTC-AAACAGGCGAGACCGGCTGACTTGAAT-GATACTGT-CAGAC-ACGCA--GTA-GAGTTGGATGCATTC----C-A-GGC
gi|16 : a-GCACT---TT-GA-----T--GCCTGT------ACTAGGAA-AAGTGG--AGCAA--AC--AA-GA-AAAAGGAAT--AAATTTCGC-TGTGTCACTAAGAGGT-CAAACACAAGG--AGTCC----------TTGG-TAAT-TCATC------T-----A----------AA-G-------------A--A-----GCACTGAACAACTATAATGAACTA-----------GC-CAAAGC-ACT----CGACG----AACGA----TTTGCTCTCCCG--------AA---CCAA-ACTGAGC--TAT------A-TCGAGCACAGCTTCGTGAACTGACAAAGAAAGC-TA------------CT-GAA---TTCCTGCCAAAA--C--T----AGGT--C-AAAGTTTCAGAA-GACTGACAAA-TCTAGCATACCC--TACG-GCACCATATGAATT--GAGAG-AAACTCTTTG--TTA-GGGGGCAATT-TTAGATGa
gi|17 : cttgagctcaca-GCACT---TT-GA-----T--GCCTGT------ACTAGGAA-AAGTGG--A-GAA--AC--AA-GA-AAAAGGAAT--AAATTTCGC-TGTGTCACTAAGAGGT-CAAACACAAGG--AGTC-----------TTGG-TAAT-TCATC------T-----A----------AAAG-------------A--A-----GCACTGAC-----------AACTATAATGAACTACGC-CAAAGC-ACT----CGACG----AACGA----TTTGCTCTCCCG--------AA---CCAA-ACTGAGC--TAT------A-TCGAGCACAGCTTCGTAACT-GACAAAGAAAGC-TA------------CT-GAA---TTCCTGCCAAAA--C--T----AGGT--C-AAAGTTTCAGAA-GAC-GACAAA-TCTAGCATAACC--TACG-GCACCATATGA-AT--GAGAG-AAACTCTTTG--TTA-GGGGGCAATT-TTAGATGctcttggtgagtcaga
gi|18 : cacaGTGT----CTACT--AAATGAGTGGGGA-CAG--AT--ACTGA-GAAAAGTTT--ATACTTGGCCTGCATCTCTTAGGGACA-AAGCACAAGAGCAGTTATTATTATATTTTAGAGGAA-TCAGC------C-----A----------ctcttggtgagtcaga
gi|18 : A-----------ATCTA-----------GT-TAAAAG-CCTTGTACAAGGAATTTA-GA-----TTGCC-T-CAG-TCAAGGAAAATTCCAG-GC-GA-CTTTATCTTCTAA-TAGAGCACAGCT--GAGAC--GAGCAGGAAGGCTAAGAGATAATGCATCT-GAA-AGTT----CCGGAG--C--TACAAGCGT--C-AACACCTAAGAA-Gcagtcgaagatccagaaccgatcttctgcgttcgagatccatttttgccacagctaaaatctagttaaaagccttgtacaaggaatttagattgcctcagtcaaggaaaattccaggcgactttatcttctaatagagcacagctgagacgagcaggaaggctaagagataatgcatctgaaagttccggagctacaagcgtcaacacctaagaagcccttagtgtgagactactc
gi|19 : gtgtctactaaatgagtggggacagatactgagaaaagtttatacttggcctgcatctcttagggacaaagcacaagagcagttattattatattttagaggaatcagccacagtcgaagatccagaaccgatcttctgcgttcgagatccatttttgccacagctaaT--TGCCAGAG--C--T----TGGG--C-AGGACATACTCA-GGCTGGCCAA-CCTCGCATATCC--AACT-GCCCCAATTGAGGT--CAGAG-AAACCC-TTG--CCA-AGGAGCAATTCATTGATG---CTCTGAAGG-A-CAGTGAC--AT--GAG-AA--T-ACGCATT-AAACAAGCCAGACCAGTCGACCTGAAT-AATGCTATCCGTCA-T-GCC--GTG-GAGTTGGATGCATTT-A-ACTC-TGCCAAAAGACGTCTCCGTGA-AGA---------TAAAGGTTATTT-GAG-GGAGG-----CTAATCAG--CCATG-CAAAA--CAGACAAAcccttagtgtgagactactc
gi|2 : aaca-A-CTG-----GTACACG---A-ATCA--ACGAAC--CTAA
gi|2 : AGAGCGAGAATACATGAGTTCGTTA-CGG--TCCTGAACT--TCTAGGAGCATGCAGTCCCATAGCCCGAGACCCATAC-AGGAAATA-----GT-GT--ACT--TCACC--CAGTAT-TA---AGA---CAGGAGA-AGA-G-------TGTAA-GTGA---ATGT-TT-AGTGGA-TGAGATGCATGTG-ACATGATGAGAGAGGTACTCGTCC-----ATCAAGAGTTACTA-GTCCC--GTGGATC-CGAGT-TACTCGTCTCGCA-TTCGAA--CAAA-CAGACTGATGCC-GAG-A-TACTATCGATCCAGGAT--GGA-G-CAA-CCTGCATG-ACAGAAATCCGGTCTA-AG-CCCGAAACATCGTTAGAAAA-CCA-GCGAC-TA---TGATGGTACA--GGTCTCTGGTGGAGATTATTCTTGTC-GCATTCGGTCTGA---GAT--GTGTGT----CTACT--GAA-GAGTGG--A-CAG--AT--ATTGATGAAAGGTTT--ATACT--GC-TGCATCTCTTAGGGACAAAAGCACAAGG--A-TG-----------T-GG-AAAA-TCAGC------C-----AGGATAAGGCAA--G-------------A--A-----T-ATTG-A-----------AGCTA-----------GT-TAAAGC-CCTT---CAGGA----TA-GA----TTTGC--TCCAGTT-----AAA---TCAG-ACTGAGC----T------A-TAGAGCACAGCT--GAGA---GAG--AGGAGGC-AAAAG-----GCATCTAGAA-AGTT--TGCCGG-G--A--T----GGGTGCC-AACA---AAGAATGACTTGTTAA-T-TAGC-TCCCCGAAACC-GCTCCTGATGAGGT--AAGGGAAAATAC-TTG--CTACACGAACAGTTTTGAGATGGAACTACATAGTAT-CA--GAG--ATTGACGATC--TCAAA-ATCAAAACAGGCAAGACCTGTAAA-CTGAACAGACGAGTCACGAAGTA-G-C--GTTGGAACT-GAGGCATAC-ATAC-A-GTCCAGAGGA-GTCGCCG-GATAGAAGCT----GT-AGA-TCA--GAGAGT-GAAGT-TTCCTA--CAGAATCGTCACGAAGGCAAAACAAACTCGATTCGTGAT-CAT-GAGACTT-AGAAAGAGA--ATGCGCT-TCTAC--CAGAG--TATT--AAGGATATTGAAACAATGATGATTTCAGCAACAGGGTCAACGGAACGTATGCC-CATCAACAAAGAC-AGCTCAGG--TT-CTAAGG---ATATGAGAAAGAATGTTTACAC-ACTGC-GTTCATGAATCGAAGGATCACTCTAAAAGGTACTGGCCCGCAATGGAGACAAAGA-TTGGTAACTCCGATAGCAATTCAAAAGAA-GGT-AACAAAAGGAGAA-GATGCAGCTC-CGAT--ATCCTTGACCAA--ATATCACA--AGAGTAGT-CA-T--CCATAGAAATCGA-AAAGGGGTT--TA-TGT---CACGGCAGC--GTAT---------CAT-GAAT-GAGGATA--TACTTGTTA-GTTGAT-ACAGGCGCCA-CGCGGAAATCGTCCTTGCTATCTACAATGTGTTAGTGAGAACA-TTGC-AAGAGT-CACAGTGCTAACTCCTTGGACTAAGG---GTC-GAGAAGGATTTGCTATCAGCTTAGTGGCATCA--CCGC-GAATGTACTTGGATATACAGTTCCAGTA-ATT-TAAACGTTGG-A-G-CATTGCAAGTAAAAATGGC-AT-G-AA--GAGTCA-AGCT--TGACCTACACAGTGGATGG-----CTT--GGATT-GATTTCCCTGTTAAGCATAGTGGGCA-TAAT-CATACAC-ATGCGCATACA-G-GATTAAAAA--TATC-GGC-AACGAGCACGCCTATCATACTGGGAAGGTGGTCGGTCGAACCTC-TAAAGGGTAG-CCATGGCTTTCATGAGACGTC-CAGATACCA-CTAGATCG--AACTG-TGATAGGAAGGAGAAGATACGT-ACTA-GATCGGGGATGGA-GACTCTCAACCAAAGCTT-GAATA-TGA-A--AA-GCATT---CTGGAAA--AAGAAATTCAGAGG-----T---GTTC-TG-T-T-GCTGGCC------------ACGAAAAACCTGGTT----TAGC-----ACA-GAGTAGCACA----TGC-AACACAAA-G----CCCGGATGCCCTCTTC-CAcaacgttaaaattttggtggccagcaacgggatttggatcagtcatttaagtaaaagcattagtattcgtaaaaatgaatgagcaggattacaaagacaagtgtaatcagttagaagggggagatagatcgcctcagagcgagaatacatgagttcgttacggtcctgaacttctaggagcatgcagtcccatagcccgagacccatacaggaaatagtgtacttcacccagtattaagacaggagaagagtgtaagtgaatgtttagtggatgagatgcatgtgacatgatgagagaggtactcgtccatcaagagttactagtcccgtggatccgagttactcgtctcgcattcgaacaaacagactgatgccgagatactatcgatccaggatggagcaacctgcatgacagaaatccggtctaagcccgaaacatcgttagaaaaccagcgactatgatggtacaggtctctggtggagattattcttgtcgcattcggtctgagatgtgtgtctactgaagagtggacagatattgatgaaaggtttatactgctgcatctcttagggacaaaagcacaaggatgtggaaaatcagccaggataaggcaagaatattgaagctagttaaagcccttcaggatagatttgctccagttaaatcagactgagctatagagcacagctgagagagaggaggcaaaaggcatctagaaagtttgccgggatgggtgccaacaaagaatgacttgttaattagctccccgaaaccgctcctgatgaggtaagggaaaatacttgctacacgaacagttttgagatggaactacatagtatcagagattgacgatctcaaaatcaaaacaggcaagacctgtaaactgaacagacgagtcacgaagtagcgttggaactgaggcatacatacagtccagaggagtcgccggatagaagctgtagatcagagagtgaagtttcctacagaatcgtcacgaaggcaaaacaaactcgattcgtgatcatgagacttagaaagagaatgcgcttctaccagagtattaaggatattgaaacaatgatgatttcagcaacagggtcaacggaacgtatgcccatcaacaaagacagctcaggttctaaggatatgagaaagaatgtttacacactgcgttcatgaatcgaaggatcactctaaaaggtactggcccgcaatggagacaaagattggtaactccgatagcaattcaaaagaaggtaacaaaaggagaagatgcagctccgatatccttgaccaaatatcacaagagtagtcatccatagaaatcgaaaaggggtttatgtcacggcagcgtatcatgaatgaggatatacttgttagttgatacaggcgccacgcggaaatcgtccttgctatctacaatgtgttagtgagaacattgcaagagtcacagtgctaactccttggactaagggtcgagaaggatttgctatcagcttagtggcatcaccgcgaatgtacttggatatacagttccagtaatttaaacgttggagcattgcaagtaaaaatggcatgaagagtcaagcttgacctacacagtggatggcttggattgatttccctgttaagcatagtgggcataatcatacacatgcgcatacaggattaaaaatatcggcaacgagcacgcctatcatactgggaaggtggtcggtcgaacctctaaagggtagccatggctttcatgagacgtccagataccactagatcgaactgtgataggaaggagaagatacgtactagatcggggatggagactctcaaccaaagcttgaatatgaaaagcattctggaaaaagaaattcagaggtgttctgttgctggccacgaaaaacctggtttagcacagagtagcacatgcaacacaaagcccggatgccctcttccaa
gi|20 : actggtacacgaatcaacgaacctaacaacgttaaaattttggtggccagcaacgggatttggatcagtcatttaagtaaaagcattagtattcgtaaaaatgaatgagcaggattacaaagacaagtgtaatcagttagaagggggagatagatcgcctcC-T-GAATA-TAACAGTAA-GCATTTTGC-GGAAAGGAGT---TTCAGGAGACGGTCCGGGTTCT-ATTAT-GCTGGCCCGATCATTGGAGA--GAACACCTG--TAATGCTGTTAAACACATCAGAAGCACACCTATGC-AACACAAACGCTTCGC-GGATG-CCTCTCCTCACTAATCATCTATACTGGAAAATTAGT-GAA--TG-A---T-GGTGACTGGGATGT--AG-ATCCTCCGA-AAG-TTCAACGGTTGTGAGCGAGGa
gi|21 : GG-----GCA-AGA-CAAG-CCA---TA-G-GTC---CC-A--G--C----CTTAA--CGCG-------CA-CC---AT--ACC--T--AGGTCG-T--CC----A---T-GC-C-T-TTG-AATAT-TTA--GG-AT----------AGG-T---CATG-C-TGT-----A----TA---A------TAT-TATCTGTTAGT---A-AT--TG---ACT-TCG--TT-----AATTT--TAATAG---TGTTGA-TT---TTTATGCAT--TCAGGA--TTCGCGATT-AAT-AT-C---AT-CTCAATACATTGCAC-TAAG-A-CTG-----GTACACG---A-ATCA--ACGAAC--CTAAcag
gi|22 : CTGGCC------------A--AAAGACTTG--T----CCGT-----ACA-CAGAAGAACA----TGC-TACACAAACA----GCCGGATG-CCTCcaacgt
gi|22 : T--AG-ATC--CTG--AAG-TTCAA--GTTGGGGACGAGGGGGTTAT-GGTCTCccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntagatcctgaagttcaagttggggacgagggggttatggtctc
gi|23 : ctggccaaaagacttgtccgtacacagaagaacatgctacacaaacagccggatgcctcccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-AGGTTA-T--CT----A---TTGC-CAT-TTG-A-T-T-T-A--GG-AT----------ACA-A---AGTA-C-TG----------------A------TGT-AATCTGT--AT---ATATATTG---GC--TCG--TT-----ATTTTTCTGATAGT--TATTCA-TA---TTT----------------TTT---GCT-GA-AAT-C---AT-A---GTGC------C-GCAGCA-CTGC----GT-C-CG---ATATCA--TC-AAC--CTAAAC
gi|24 : ----AAG-CTA-GCAACAAT---TGATGGTATG--GGTTCCTGG-GTAGACTA--CAAATC-CCATT---TT-GA---G----GCTTGTAGCTCT-TT--GAATCAGTGG--A-CGG--AC--AGGGA-AAAAGGTCT--ATATCTAAG-TGTGTCGCTCA-GAGAACAGGCcgt
gi|25 : -TAAAGC-ACT-----GGAG----GA-GAGGTTTTTACC--CCAC-T-----AAC---GCAG-AC-GAAC--TCT------AACAGAGCACAACT--GAGA---tattatacggt
gi|27 : agctcaaagttgttaggaaatcatactcctggggaggaaaagtgtaattacaggctgttgtgACGCATACCAGG---TAT----GAAGTTAACCAGT-ACC--CCGTATGTAGACAGAGATCATGAGAGAGA-TTGCAAAATGTAA-GTGGGCCATCT-TC-GTTA-ATTGA-ATGag
gi|28 : gagaacCAGCT--GAGA---GA--AAGCA-GC-AAAAT-----ATATCT-TAAGGGTT--TACCGACG--A--T----GGAT--C-ATCATGTAAAAA-GACTAGTCAA-TCTAGCCAACTC--AATC-TCTCCTGAataca
gi|3 : acagacTGTTG-TTTGAT-TCAGGTGCTAACG-G------GTCCTTGCTATCTACAATTTGTTA--GAGAACATTGGCCAAGGGTTCA-AG-GTCAA-TCCTT-GAC--AAGAGGGTCG-AGAGAGATGTGCTATCAGC-TAGTGG-ATCA--CCGCTAAAGGTAATGGGA---AAAGTT-CAGTAGATT-ATAA-GTGGC-G-GACTTTGC--GTTAAA---GCAATAG-AAATCGGTCATAGCTGATGACTTA-ACAGTGGATTGGAATTCTTTGGGATTAGATTT-CTGGTTAAGCATG--AGGTGTTAATATG---ACAATTCGCTGGCATA-GA-TAAAGA--TATCTGGCAATGAAGCAC-CCTATCAA-CTGGACGGGTTGC------AACC-CATATAAGGTAGTCCAC--CGTTCATG-GA-GTTACG--TA-CACCTGAATCGGAAGCTGATGGTA-GAAGGAG-AGATACGTGACTAG---T--GGATGGAGGTCATTCAGCC-AAGC-TCGGAGACTGATA--AAGGCATT---C-GG-AA--AGT---TTCAGAA------TTGGGTTCTTGTT-TGGCTGGCC------------A--AAACA-CTG--T----TCGTA----ACA-CAGAAG-ACA----TGCAGA---AAACG----CCCGGA---CCTCTT--CAC--ATCATC---AACGGGAA--TA-TTGAAGATG-------TGTGACTGGGATGTAAAG-ATC--CCG--AAGTTTCAA--GTTGGGGACGAGGGAGTTGA-GGTCTCAGAGAAGT-GAT-GGAGCTAGGGCCA-CCTTATCTGGTAGT-GCCGAGCTGAATTACTA-CCGTGTTTATTCGC-AAAGAACCTGTCTAA-GTCTGT--AGA-CGCTC--GAAATAGTC-CAAGTCGAGAAGAGGA-AGTGTT-CAGTAGGAAGTTGTG-AGA--TGCCGG--T-TTAGACAATCACG-TTGAGCC-CAT-CAAGTG-A-CA---TCAGCAGAAATGGTGGGTCAGTGGT-AC-CA-ATCGAAAGATAGTGTTGATGGCTCGTGCG--GGT----CATAAGA-AGTCAT-TC--GTCACTAG--GTATTCCAAGCAAAC-AAGAAAGAGTCA-AGA-------GAAG---GAAGAATCT-TTCCGTAAGATGTAG-CGGAT-AT--CAGC-GCCT--A-CTGTAAACATGTCAAGA-C-GTTGGTTGTTATTGGACTTG--CTTGGCAA-T-TAATGCA--T-G-TCA-ACCTTTCAATCACCAGGG--GAGGTG-GA-AGAATC---TTATTCAT--TT-G-TACATTTTTTTTTTCATGTT-TGCTCACAGATCT----------------ATAATCTGGTCC-TGTTTTGATAA-AAAAGATT-AGATTAAT--ATCAT-GTATA--TT---TTATTCATGTCGA-GGA-CAC--GATGCCCATAGA-G--GCG-G--GGTGAATGTGA---C-A--TTAAAGG----TCGGGAT-C--GGATG--GGTT-GGTATTATATGT--AT-C-------A----GATAG--TG----CTAATAAAAGCTC-------AT---------GTC-----------CA---------GACTT--T--TACTAGTAGGG-GC-A-T--TGGCGAT----ATA--ACA-T------CGAGTGGCAGG-TAGT---TCG--GGTG-T----TGAGCAAGTG-T-ATAA-ATA---G-G---GCG-------TCT-GCTGAAATT--G--TC---ACTTCAG--CTGT--GGAGATTCATG--AC--GAGGAGAAGGA------CAGG---T-GATATAAATGG-TCC---TA--GGCTATATTATA------CCAGGAGC---TATGTTATA--ATATT--CAG---ATAAC---CGGTG-----GGTCTA--GTGTACTGGTTC---TGGAC-CCAG---ATAGT--ATGAGTAATATTTCAC---AA-TTTTA-AAGTG--C-A-----AAGTCC-G--GT-C-GGTTATAGAGAGT-AAATGTT-A----A-------GACAAG-----CACCTGTCCGG--CGTAGT---------AGGATCAGGAAA-CTAA--AG-CAT-AGG-----GATCAGT-AAAG-C-A----A-G-GTC---CC-ACTG--CT---CTTAGTCCGCAAGAGGAGCA-CCTCTAT--A-C--TT-AGGTC--TGCCC----ATCCT-GCTTATATTGCA-T-TATTACCGG-ATTAGCTTACTCAGGCT---AATC-T-TCTAAGCGA----TG---AATAGACTAT-TATCTGT--AT---AT-T--TG---ACCGTCGAATG-----ATTTT--TAATAG---T
gi|30 : tC---CC-A--G--T----CTTA---CGCA--------G-CC---AT--ACC--TT-AGGTT--T--GT----A---T-GT-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-AT----------AGG-T---AATC-C-TAT-----A----TA---A----------TATCTAT--AT---ATAT--TG---AC--TCG--TT-----ATTTT--TAATAG---Ttgt
gi|32 : GA-AGAATT-CATTATTCAT-CTTCG-TACA--TTTTTTTTC
gi|33 : gcatattctacatcaccagggatggattgtttatgtgtgtttgccaTGTGA---CAA--ATTGAGA----TCGGGTT-C-GGGATG-------TGT----CATTT--AT-C-------A----GAT-
gi|4 : atAGAGAGGATACATGG-TT-GTTAACGGGGTTCTGAACTCTTCTAGGA---TGC-G-CCCATAGCC-GAGACCCG-ACCAGG---TGTACTGGA-GT--A--AGT-ACCGACTGAAT------AGAG--AAAGAGAGAGAGC-------TGTAAAGTGG---ATAT-TTTAGTG-A-TGA-ATGCATGTGTACA-GATGAGAGAG---CTCGTCCCGCGCATCAAAGGTTACTAAGTCCCAAGT--AT-GAGAGTATTCTCATCCCGCAAT-CGAAGACAATGCAGACTGATGC-AGATCA-TAC--TC---GATGGATAGGGATG-CAA-CCTGGATGGACAGA--TCCGGTCTATAG-CC---GACTT-GT----AAAACCAAGCGACATACGCTGATGGTACATCGGTCTTTG---AAGATTA--CTTGTT-TCATT---TC-GGTCTG-T--G-GTGT----CT-CT--AAATGA-TGG----CAG---CTTATTGA-GAAAGGTTTTAATACTTGGC-TGAATCTT----GGGGACAAGCACAAGG--AGT-------------TAG-GAAACTCAGCAAGGGAT-----A----------A--G-------------GCGA-----TTATTGGA-----------AG-TA-----------GT-TAAAGCGCCTT---CAGA-----TA-G-----CTTGCT-TCGAG-T-----AAAA--TCAGGACTGAGC--TAT------A-TAGAG-ACAGCT--GA-A---GAGAA-GGAGGC-AAAAG-----GCATCT-GAA-AGTT--TGCCGGAG--A--T-----GGT--CAAAGAC-TAAGAA-G--TTGTTAATTTTAACT--CCC--GACCTGCT-CTGATGATGTCAAGGAG-AAATTC-TTGCCCTACAGAAG----TCTT-GATGG-ACTA---AGT-TAAA--GAG--AT--GC--TCTGTCAAG-AT---GACAGGCAAGACCTGTAAAGCT-AAT-GATCGGATACAGAG-A-GCTTGGTT--AACTGGAAGCA-AC-A-CC-AGGGCCAGAAGA-GTCGCCG-GATAGATCCTGTCAGTAAGAGTCA--T-GAGTGGACGTCT--CTA--CAGAA--GTC-CACAG--AAAACAAACTCGAT---CGAT-CAT-GAGAGT---AAAA-AGAATATGCGCTCTC-ACAGC-GAGA-TATTAAAAGGAT-TGAAAAC-ATGGAAGTTTCAGT-ACAGGGTCAA--GGATGTA-GCCTCAT-AAC--AG--AAGAT-GGGATTTGCTAAGG-ATAAGTTAGAC--AAT-TT-ACA--AATGCGGTTC-TGAA---AAG----A--TTAAAAGGG----GCGCG-AATGGAG---AAGAGTTGA-AACT-CG-TAGC-ATTC-AAAGAGCAATGAACACAAGGGGA-TGATGCAGGTCGTAATGCATC--TGACC----ATATT--T--AGGGTAGTGCCTT--CCATAAA---CGAGAAAGGGGTT--TA-agatgtt
gi|5 : tcaagaaactaaacaacgtcgttataaccagcataaattttggtggagaacgagatttgggagtccatgattaattaaaacattagtatctaaaaagatgagcaacggattacacaagaagtaaaccagttgaaagggaatagattgctccCAGGAA--TAGTTGAAGATG-AAGAC-AGTGACTGGGATGT--AG-ATC--CCG--AAG-TTCAA--GTTGGGGACGAGGGGGTTGA-GGTCTCAGAGAAGGAGATGGGAGC-AAGGCCATCCTTATCTGGTAGT-GCAGAGCTT-ATTACTAGCCGTG-TTATTCGCAAAAGAACATTTCCAAGTCCTGTCCAGA-C-CTCCAGAAA-AGTCACAAGTCGAAAAGAGGA-AGTGGTACAG-AGGAAG-TGTGTAGA--TGCCGGTAT-TCAGACAGTCACGTTTGAGCC-CATTCAAGTG-ATCAAG-TCAGCAGAAATTGTGGATCAG-GGT-ATTCAGACAGAAGGATACCGTCGA---------CGTTGGTTAGGCA-AAGACAG---C-T---G-CAC--A--GTAT--CAAA-AAAC-GACCAAGA-TCATCGA-------GAAG---GAA-AAT-T-TTTCGAAA---GTA-AT-GAT-AT-A-AGC-ACATTAA-CTGT-AAT-----AAG--C-GTT-G-T-GTATGGC-CTTGACATT-GCAATT-TAATGCATGT-GTTCA-A-CTTTCAATCACCA-GG--GA-GTGCGA-AGAATT-CATTACTCATGCTT-GATACA----TTTTTTCATG-T-TG-TCAC---TC------------------T---------C-TGTTAT----A-AAAAAACTATAAT---TCAATC-T--TATA---T---TTA-T-ATGT-GAGGGA-CACATGGCG--CGTAGA-G--G-GTG--GGTAGAT-T-A---CAA---TAAAGG----TCGATG---GAGAATGATGGTTGCGT-----ATGT--AT-CATTATCGA----GAT-A--G-----CA--TAAA----TAAGCTTAAT---------GTC-----------CAACC------AG-TGACT--TTTC-GT-AGG-GC-A-TGGT----AT-T--ACA--ATACT----C-CGA-------G-TAGT---TCA--GGTG-T--------T-GAAACTAAT-A-ATA---G-G-C----A------TCT-GCTGATA---CG--TC---ACTTCAG--TTGT--GGAG-ATC--G--AC--GAG-AGAA-GA------C-GG---T-GACA-AA--GG-TAC---T---A--TATATAATA------C----GGCG--TGTATTATA--ATATT--CAG--TATA-----CGGTG-----G--CTA--GTGTACTGA-TA---TG-----GAC--AATAGT-AATAA--AGTATTTC-C---AG-GTTTA-AAGTGT-CAA-----GA--TC-G--GTCC-GGTTATAGAGA---AAGT-TA------A-------GACAAG-----CACCTGTCCGG--TATAGGCGGGGGTATAGGA-CAGA-AA-CT----AG-CAT-AGG-----GCAC
gi|6 : AGCTGCAT--ATCTGT-TACTTTAAAAGACCTGTT-GTT-TTATTGTGCTTGACTTTTGTCATTGTATTGCA--TTGTT-A-A-CTTATAGTTA--AGGGAGGA-G-GCGACAAAATTTCCTTATT-AT--TT-G-TGCA--TGCTTTTGC-TGT-------A------T---------------CAT---------C-TGTTTTG--AA--------TAAGAT---T--ATCATTGTATA--TT---TTA-TCATGT-GA-GGA-CA-ATGAAG--GCT-GA-GTCGCGTG--GGTAAGTGTGGCATCAA--TTAGAGA----TCGGGGT-GCGGGAT----GTT-CAG----CATATTAATAT-------A----GAT-G--CTAAATCTA-TAAC----T-------AT---------GCTTTACTGTCAACCG---------GA-CT--TCATATT-GT-AGGAGCTACT--T----AG-GTCATACCACA-TG---CGCGAG-----GGTTAGTACATCGGTGGTA-T----C-AGC-AG--CT-CT-A-ATATATC-G-C-GTGGCAGTATTCT-GCTAGCATTTTGTTTC----GTTCAAATCTGTTGGGAG-CTC--GTCAA--GAGAAGAA-CAAGCAGTC-GGATAC-AATA-AA--GGTTACGG-CA--A--TATATAATATAAATGC---GGGCGTTTGT-TTAT---ACATTGACAGTATATA-----CGGTGCTTACG--CTAAGGTCTATTGA-TCGCGTGCTGTCGAGATAATAAT-AATAA--AGTATCTT-CACAAG-GTTTATAAGTGTAC-ATGAGGGA--TT-GGAGTCCTGGG--TAGGTA---AGAT-TGCATATTA-------GAGGAGTACGTCACGTGTCCGGGTTATA-----------GGCA--AC--AA-CT----AG-TAT-GGGCGGTAGCACATATTTAG-C-ATATTA-G-CTC---CCGA--G--CGCTTCTT----CTCA-------CAGCC---ATTAACCAGTTAAGGACATT--CT----A---T-GG-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-CT----------ACA-A---AATCTT-TGT-----ATCTGTAGGCA------TGTATATC-GT--ATTCGAC-T--TG---TC--TCGT-TT-----ATTTT--C----------CTCATTG---TTT-GGCATTATC---A--TTC---ATTAGATAATCC---AT-T----TGC------CGCCAGTATCTG-----GT-T-CGCGCA-ATCA--TCGAAC--CTAA
gi|7 : -TAGTGCT--T-TTCCATA-CTT-CAATC-CCAGGG--AG-AT-CGA-AGAAAT-CATTATTCAT-CT--G-T-CA--TTTT----CATGTTGTCCTCAC---TCTTTTTTACCGGTATTACAT---------G-TATTTTG--AATAAACGATTAATAT---A--ATT-T-GTATAATTTCAATTG-TCATGT-GA-GGAACACATGACGG-CATAGAAG--GCGTGTGGGTAAGTGTGA---CAAACTTGAAGAACAATCGGGTTTCGGCGATG-----T-TGT----CATTT--AT-C-------A----GAT-AGAT-----CT--GACA----T-------ATAA-------GTTTA---------CGTCAACTTCTGG-TA--C--TTTTCGT-AGG-AC-A-TAGT----AG-G--AAA---CA-TGCTCC-CGAG-----GG-TAGT---TCG--GGTG-TTTTTC-A-C-AGTA-T-G--A-ATA---G-GGC-ATAA------TCTTGCTGAGATTTTG--CTCGTAGTTCAT--CTGT--GG-T-CTC------C--GAT--------------C-GA---T-TA-A-AA--AG-TACACGCA--A--TATAATATA------C---GGCTG--TGTATTATTTTATATT---AG--TATATATAACGGTG-----G--TTA--GTATACTGGGTC---TG----CGCA--GATAGTTCGTA----GTAT--C-C---AGAGTTT------GT-A-A-----GA--TCCGT-GTCC-GGGTA-ATG------AGC-TA-A---TA-------G----G-----TACATGTCCGG--TATA-----------AGGA-CAG--AA-CTGTAAAGTCATCAGA-----ACACAGC-CAAGTC-A---TACG-GCCAAACA-A--GCAC----CTTGC--CGAG-------CC-CC---AT--ACCT-TT-AAGTT--T--TTTCCAA---TAGT-CAT-TTG-G-A-T-TTA--GGAAT----------AGG-TGGGAATC-C-C-T-----A----TAAC-A------TAT-TATCTGT--AT---ATAT--TGTCAGC--TCG--TTTTTTAATTTTCCTAATAGCTCTGTTCA-TGTATTTT-TGTAT--TC---ATTTTC---ATT-CATAATGCACGAC-C---ATGT------C-GCCT-A-TTGATTCTGT-C-CG---A-ATCA--AAGAACCACTAAACA
gi|8 : ttaATTAAAAGACC-GTT-GTT-TTATTGTGCTTGACTTTTGCAATT-TATTGCA--T-GTTCA-A-CTTTCAGTTACCAGGG--AG-GAGCGA-AAAATT-CCTTATTCAT-CTT-G-TGCA--TTTTT-----------GCTGAC---TC-----------------AT---------C-TGTTTTG--AA-TAAAGATTA-----------TCAT-GTATA--TT---TTA-TCATGT-GA-GGA-CACATGAGG--CATAGA-G--GCGTG--GGTAA-TGTGA---CAA--ATTGAGA----TCGGGGT-CGGG-ATG-------TAT----CATAT--AT-C-------AAATAGAT-G--C---------TAAA----T-------ATAAAGCTTACGTCAAC--------CG---------GA-CT--T--TATT-GT-AGG-AC-A-T--T----AG-G--ATA--ACA-T----C-CGAG-----GG-TAGT---TCG--GGTGTT----C-AGC-AGTA-T-A--A-ATAC--G-G-C---AA------TCT-GCTGAGATTT-G--TC---AGTTCAA--CTGT--GGAG-CTC--G--ACAAGAGAAGAA-GT------C-GA---TAAAAA-AA--GG-TACGG-CA--A--TATATAATATAAATGC---GGGCGTTTGT-TTAT---ACATTGACAGTATATA-----CGGTGCTTACG--CTAAGGTCTATTGA-TCGCGTGCTGTCGAGATAATAAT-AATAA--AGTATCTT-CACAAG-GTTTATAAGTGTAC-ATGAGGGA--TT-GGAGTCCTGGG--TAGGTA---AGAT-TGCATATTA-------GAGGAGTACGTCACGTGTCCGGGTTATA-----------GGCA--AC--AA-CT----AG-TAT-GGGCGGTAGCACATATTTAG-C-ATATTA-G-CTC---CCGA--G--CGCTTCTT----CTCA-------CAGCC---ATTAACCAGTTAAGGACATT--CT----A---T-GG-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-AT----------ACA-A---AATC-CTTGT-----A----T----C------TG--TACATGT--AT---ATAT--TG---AC--TCG--TT-----ATT---------------TTCA-TAT--TTT-TGCAT--TC---A--TTC---A-T-GATAAT-C---A
gi|9 : att-A-GCT--GTT-GAACTGGAAGCATAC-A-AC-A-GGGCAGAG-A-GTCGCCG-GATAGATGCT----GTTGGAGTCA--T-GAGTGGAAGT-T--CTA--CAGAACCGTC-CAGAG--AAAACAAACTCGAT---CGATTCATAGAGACTGTAGAAA-AGAATATGCGCTCTCTACAGC-GAGA-TATT--AAGGAT-TTGAAACAATGGAAGTTTCAGTCACAGGGTCAA--GGACGTATGCCTCATCAAC--AGACAAGCTT-GG--TTACTAAGGATCAAGTTAGAA--AATGTT-GCA--AATGCGGTTC-TGAA---AAG---CACCTTAAAAGGGACT-GCCCGCAATGGAG-CAAAGAATTGG-AACTCCG-TAGCAATTCAAAAGAG-AATAAACACAAGGGGACTGATGCAGCTCGTAA--------TGACC-AATATATT-CTAGAGAGTAGTGCATTTGCCATAAA---CAAGAAAGGGGTTAATACTGTTCACGCGACA-CAAGTATCATTTTGAGAATGGAAT-G-TT-TATTTACCTGTTA-GTTGGTGATTGGTACGA-GG-G-----C-----TGC-ATTTACG--TGGT---------CCTT------GGGT-CACAG-GTCAA-TCCTT-GAC--AAA---GGTAGAGAGAGATGTTCTATCAGC-TAGTGG-ATCA--CCGCTAAATGTACTGGGG---AAAGTTCGAGTAGATT-TAAA-GCTGG-ACAACATTGC--ATTAAA---GC-AT-GAAA--TGGTCATAGC
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|26 ): GTAACGAATTGAGATCGGATTTGGAAGCATTATATATCGATTATCTAGAGGAAAAGGCAAATATGACGAAAAACGCTTATGTCAACCGGACTTTGGTGTAGAGTATCACGAT
Unaligned ( gi|29 ): TGTAACGAATTGAGATCGGATGTGGAAGCATTATATATCGATTATCTAGAGGAAAAGGCAAATATGACGAAAAACGCTTATGTCAACCGGACTTTGGGTGTA
Unaligned ( gi|31 ): AATTTTGGTGGCAGCAACGGGATTTGGATCGGTCAGNTCAATAAGTTTGTTAATAGACAGAAGAGTGAACAATAATAATATATAAGTTACTCGGCTAG
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 1 22 111 2222222222 1 11 1 11 222222 222 5555555555 1 111 1 1 111 111 1 11 11 111 1 111 11 22 111 11 111 11 1 1 11 1 1 2222 1111 11 1111 11 111 33333333 1111 11 11 111 333333333333333333 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 222222222222222222222 111 11111111 11 111111 11 111 111111 11 11111111111 11 1 1 11 222222222 11 11 11 111111 11 111 111 1111 1111 11111 11 11 111 1 1 11 1 1 11 11 1 11 11 222222 222 11 1 1 11 111 111 11 2222 11111 11 111 11 111 1 11 333333333 1 1 11 222222 11 1 2222222222222 11 111 1 1 11111 11 111 1 1 1 111 222 1 2222 11 11 222222 1 222 1 11 1 1 333333 1 333 1 1 1 22 1 1 1 1 3333333 1 1 111 111 11 1 111 1 11 111 444444444 111 444444444444444 1111111 22222 1111 1111 11 111 11 33333333 11 11 1 1 111 11 1 1 1 1 1 1 1 1 11 1 1 111 111 1 1 444444444 11 2222 1 1 4444444444444444444 22 22 1 11 3333333 111 111 1 222 11 111 1 11 111 888888888888888888888888888888888888 11 222222 111 11 1 111 111 1111 111 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1 1111111111111 111 111111 11111 5555555555555555555555555555555555555555555555 111111 111111 2222222222 33333333333 11 111 11 11 11111 22222 11 1 111 666666666666666666666666 111 11 3333333333333333333 1 555555555555555555555555555555555555 11 333333333333 11 1111 22222 1 1111 2222 2222 2222222222 11 11 222 1111111111 33333333333333333333333333 11111 11 111 111 1 111111 111111 1 11111 111 11111
lowQualScore : 7 3 6 3 00 6 6 666 6 3 2 7777777777 0 33 666 0 33 0 666666 000 1 2 0000000000 0 777 0 0 0 111 88 3 3 3 2 2 666 0 33 33 222 3 0 111 33 33 55 111 66 777 33 3 0 5 2 33 0 0 2 2 5555 8 8 0 5555 11 0000 99 5 000 5 33333333 44 2222 444 33 9 9999 66 66 55 5 1 66 1 4 0 1 2 111 000000000000000000 4 4 7777 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 8 55 555555555555555555555 888 99999999 00 4 4 66 222222 4 1 11 666 88 4 4 3 111111 4 88 11 11111111111 55 4 0 33 4 2 1 1 4 0 5 777 44 1 6 77 5 1 1 77 0 5 0 8 6 33 333333333 11 11 11 666666 5 8 11 1 1 5 8 5 888 111 6 1 222 888 6 8 8 0 6 7777 6 3 4444 0 55555 11 0 3 8 1 11 777 0 5 88 0 333 2 3 3 0 33 33 0 3 3 8 33 3 3 2 11 0 0 555555 6 777 11 0 5 99 1 8 444 444 0 0 8 8 3 8 8 0 0 8 3 55 999 11 9999 88888 0 11 444 11 8 777 0 33 888888888 2 0 3 0 33 8 88 8 8 666666 0 0 0 33 0 5 8 8 8 8 8 5555555555555 8 8 11 0 777 2 2 0 0 55555 33 777 0 0 0 888 3 555 3 4444 88 7 2 33 8 333333 0 000 0 33 3 0 66 0 6 888888 7 7 1 3 000 3 3 3 7 44 6 6 6 2 7 3 3 3 0000000 6 2 3 111 444 7 33 0 777 0 3 33 777 000000000 66 3 111 333333333333333 9999999 88888 8 8 7777 6 4444 1 6 0 8 33 777 22 11 0 8 33333333 88 6 99 6 99 6 99 2 8 11 3 2 3 0 2 3 3 2 0 666 22 0 9 0 0 0 2 0 0 2 0 3 3 2 0 55 5 0 3 88 0 3 0 3 2 3 3 0 6 2 3 111 555 3 2 0 0 9 2 2 0 6 000000000 33 1111 0 0 8888888888888888888 33 33 5 2 11 2222222 777 6 111 2 2 55 2 0 888 99 111 8 8 6 222 55 8 8 0 8 0 77 0 1 8 0 6 1 99 6 6 6 3 99 6 3 1 5 5 1 00 5 5 2 77 1 1 3 333 2 1 333333333333333333333333333333333333 99 00 44 000000 7 6 99 111 6 6 6 6 1 55 6 99 99 2 000 333 0 2222 1 000 1 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 5 888 66 0 66 5 5 5 9999999999999 1 111 5 666666 22222 5 888 66 4444444444444444444444444444444444444444444444 55 9 1 33 777 888 888 66 5 222222 66 77 5 444444 5 888 5 2 5 66 5 9999999999 00000000000 5 33 5 333 33 33 99999 55555 66 33 0 777 888888888888888888888888 0 5 777 5 00 5555555555555555555 0 44 0 5 000000000000000000000000000000000000 33 111111111111 77 66 5 7777 5 5 22222 0 5 5 8888 5 5 8888 8 66 66 3333 0000 5555555555 777 22 66 8 000 55 8888 777 8 4 4 4 4 4 4 55 4 7777777777 99999 4 4 00000000000000000000000000 55 777 0 55 777 99 99 00000 11 999 5 333 55 66 999999 888 5 0 888 777777 666666 5 0 5 77777 222 00000 66 66
lowQualScore : . . . . .. . . ... . . . .......... . .. ... . .. . ...... ... . . .......... . ... . . . ... .. . . . . . ... . .. .. ... . . ... .. .. .. ... .. ... .. . . . . .. . . . . .... . . . .... .. .... .. . ... . ........ .. .... ... .. . .... .. .. .. . . .. . . . . . ... .................. . . .... .................................................................................... . .. ..................... ... ........ .. . . .. ...... . . .. ... .. . . . ...... . .. .. ........... .. . . .. . . . . . . . ... .. . . .. . . . .. . . . . . .. ......... .. .. .. ...... . . .. . . . . . ... ... . . ... ... . . . . . .... . . .... . ..... .. . . . . .. ... . . .. . ... . . . . .. .. . . . . .. . . . .. . . ...... . ... .. . . .. . . ... ... . . . . . . . . . . . .. ... .. .... ..... . .. ... .. . ... . .. ......... . . . . .. . .. . . ...... . . . .. . . . . . . . ............. . . .. . ... . . . . ..... .. ... . . . ... . ... . .... .. . . .. . ...... . ... . .. . . .. . . ...... . . . . ... . . . . .. . . . . . . . . ....... . . . ... ... . .. . ... . . .. ... ......... .. . ... ............... ....... ..... . . .... . .... . . . . .. ... .. .. . . ........ .. . .. . .. . .. . . .. . . . . . . . . . ... .. . . . . . . . . . . . . . . .. . . . .. . . . . . . . . . . . ... ... . . . . . . . . . ......... .. .... . . ................... .. .. . . .. ....... ... . ... . . .. . . ... .. ... . . . ... .. . . . . . .. . . . . . . .. . . . . .. . . . . . . .. . . . .. . . . ... . . .................................... .. .. .. ...... . . .. ... . . . . . .. . .. .. . ... ... . .... . ... . .......................................................................................................... . ... .. . .. . . . ............. . ... . ...... ..... . ... .. .............................................. .. . . .. ... ... ... .. . ...... .. .. . ...... . ... . . . .. . .......... ........... . .. . ... .. .. ..... ..... .. .. . ... ........................ . . ... . .. ................... . .. . . .................................... .. ............ .. .. . .... . . ..... . . . .... . . .... . .. .. .... .... .......... ... .. .. . ... .. .... ... . . . . . . . .. . .......... ..... . . .......................... .. ... . .. ... .. .. ..... .. ... . ... .. .. ...... ... . . ... ...... ...... . . . ..... ... ..... .. ..
lowQualScore : 3 3 7 3 00 7 7 000 7 2 5 8888888888 0 88 000 0 88 2 555555 222 2 5 2222222222 0 555 8 0 0 000 88 2 2 2 5 5 222 0 88 88 222 2 0 000 88 88 88 000 55 555 88 2 0 5 5 88 0 0 5 5 0000 0 0 8 4444 00 0000 00 7 000 7 33333333 44 1111 555 88 4 0000 99 99 11 0 0 99 9 4 7 0 6 777 111111111111111111 4 4 9999 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 9 66 000000000000000000000 777 11111111 66 4 6 11 888888 4 8 00 555 33 7 4 6 222222 4 00 00 22222222222 55 0 7 77 0 7 0 0 4 9 3 111 66 0 6 99 7 0 4 99 1 0 4 9 6 00 222222222 00 00 00 666666 0 0 22 0 0 0 0 6 777 333 7 0 555 333 4 0 0 8 0 0000 0 8 8888 8 66666 00 8 2 0 4 00 555 0 5 88 0 555 5 2 2 0 22 88 0 2 2 8 88 2 2 5 00 8 8 666666 4 000 00 0 8 00 0 0 000 000 8 8 0 0 2 0 0 8 8 0 2 88 000 00 6666 22222 8 00 000 00 0 555 0 88 888888888 5 0 2 0 88 0 88 0 0 444444 8 8 8 66 6 6 0 0 0 0 0 0000000000000 0 0 00 8 555 5 5 0 0 88888 88 555 0 0 0 000 2 777 3 0000 33 3 5 88 8 555555 0 555 0 88 2 0 88 0 5 333333 3 3 0 3 333 3 3 3 3 00 7 7 7 0 3 3 3 3 3333333 7 0 3 000 000 0 88 0 555 0 2 88 555 222222222 55 2 000 000000000000000 0000000 00000 0 8 0000 7 2222 0 7 8 0 88 555 44 00 8 2 22222222 33 7 22 7 22 7 22 5 0 00 2 5 2 0 5 2 2 5 0 222 00 0 8 2 2 0 5 0 0 5 0 2 2 5 0 88 5 0 2 00 2 2 0 2 5 2 2 0 5 0 2 000 888 2 5 0 0 2 5 5 2 5 000000000 88 2222 0 0 0000000000000000000 88 22 0 5 00 5555555 555 5 000 5 5 88 5 0 222 22 888 0 0 0 222 88 0 0 6 0 8 88 8 0 8 8 7 0 22 7 7 7 5 22 7 5 0 7 7 3 00 7 7 3 99 4 3 2 000 5 0 333333333333333333333333333333333333 22 22 55 222222 3 7 22 777 7 7 7 7 0 88 7 22 22 0 000 333 6 1111 7 777 7 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 0 222 99 0 00 0 0 0 5555555555555 0 111 0 999999 55555 0 888 99 8888888888888888888888888888888888888888888888 88 4 0 55 999 888 000 99 0 555555 99 11 0 444444 0 888 0 2 0 99 0 0000000000 00000000000 6 88 1 444 88 88 44444 00000 99 88 0 555 888888888888888888888888 9 0 555 0 11 9999999999999999999 0 22 1 6 888888888888888888888888888888888888 88 555555555555 55 99 0 5555 0 0 22222 0 0 0 4444 0 0 9999 9 11 11 3333 2222 1111111111 888 22 77 0 444 55 5555 000 0 0 0 0 0 0 0 55 0 5555555555 88888 0 0 55555555555555555555555555 55 000 8 55 000 55 55 00000 00 000 0 888 11 99 666666 888 0 0 888 444444 444444 7 0 0 55555 000 99999 99 99
consensus : AGAGAGAGAATACATGA-TTCGTTA-CGGG-TCCTGAACTCTTCTAGGAGCATGC-GTCCCATAGCCCGAGACCCATACCAGG---TAT----GA-GT--ACCAGT-ACC--CCGTATGTA---AGAG--CAAGAGAGAG-------AG-TGTAA-GTGG---ATAT-TT-AGTG-A-TGA-ATGCATGTGTACATGATGAGAGAGGTACTCGTCCCGC--ATCAAGAGTTACTA-GTCCC--GT--ATCGNGAGT-TACTCGTCTCGCA-T-CGAA--CAA--CAGACTGATGCCAGAG-A-TAC-GTC---CCAGGAT--GGATG-CAAACCTGCATGGACAGA--TCCGGTCTA-AG-CCCGAAACTTCGT----AAA-CCA-GCGACATA---TGATGGTACG--GGTCTCTGG-GAAGATTA--CTTGTC-GCATT---TC-GA---G-T--GCGTG----TCTACT--GAATGAGTGG--A-CAG--AC--ANTGA-GAAAGGTNT--ATACTTGG-CTGCGTCNCTNAGGGGNACAAGCACAAGG--AG-----------TN-TTAG-GAAA-TCAG---C------C-----A----------A--G-------------A--A-----TNATTGGA-----------AGCTA-----------GT-TAAAGC-CCTT---CGGGGNA----GA----TTTGCT-TCCAG-T------AAA--CCAG-ACTGAGCT--AT------A-TAGAGCACAGCT--GAGA---GAGAAAGGAGGC-AAAAG-----GCATCT-GAA-AGTT--TGCCGGAG--C--T----GGGT--C-AAGACGTAAGAA-GGCTNGCNAA-TCTAGCNTACCC--NACC-GCTCCNGATGAGGT--AAGAG-AAACNC-TTG--CTACAGGAGCAGTTCTTNGATGG-ACTACGNAGT-T-CA--GAG--AT--GCG-TC--TCAAG-ATC-AAACAGGCAAGACCTGTAAACCTGAAT-GATGCGATACGGAG-A-GCC--GTT-GAACTGGANGCATAC-A-AC-A-GGCCAGAGGA-GTCGCCG-GATAGATGCT----GTAAGAGTCA--T-GAGTGGAAGT-T--CTA--CAGAACCGTC-CAGAG--AAAACAAACTCGAT---CGAT-CATAGAGACTG-AGAAA-AGAATATGCGCTCTCTACAGC-GAGA-TATT--AAGGAT-TTGAAACAATGGAAGTTTCAGTCACAGGGTCAA--GGACGTATGCCTCATCAAC--AGACAAGCTCGGG--TTGCTAAGG-TCAAGTTAGAA--AATGTTAACA--AATGCGGTTC-TGAA---AAG---CACCTTAAAAGGGACT-GCCCGCAATGGAG-CAAAGAGTTGG-AACTCCG-TAGCAATTCAAAAGAG-AATGAACACAAGGGGACTGATGCAGCTCGTAATGCATC--TGACC-A--ATATT-CT--AGAGTAGTGCATT--CCATAAA---CGAGAAAGGGGTT--TA-TGT---CACGGCA-C--GTATC--------CATGGAAT-GATG-TA--TACCTGTTG-GTTGAT-ACAGGCGCTA-CG-G-----CGTCCTTGCTATCTACAATTTGTTA-TGAGAACATTTGC-AAGGGT-CACAG-GTCAA-TCCTT-GAC--AAG---GTCGGAGAGAGATGTGCTATCAGC-TAGTGG-ATCA--CCGCTAAAGGTACTGGGA---AAAGTTCCAGTAGATT-TAAA-GTTGG-A-GACATTGC--GTTAAA---GC-AT-G-AA--CGGTCATAGCT--TGACCTA-ACAGTGGATGGGA--TCTT--GGATTAGATTTCCTGGTTAAGCATG--AGGCAGTAAT-CG---AC-ATGCGCATGCATA-GA-TAAAAA--TATCTGGC-ACGGAGCAC-CCTATCAAGCTGGAAGGGTTGC------AACCTCATANAAGGTAG-CCAC--CTTT-CATG-GA-GTCACGGATACCACCTAGATCGGAAGCTGATGGTA-GAAGGAG-AGATACGT-ACTAGGATC--GGATGGAGGACTCTCAGCC-AAGC-T-GAATA-TGATA--AA-GCATT---C-GGAAA--AGT---TTCAGAAG-----CCGGGTTCTTGTT-T-GCTGGCC------------A--AAACACCTG--T----CCGT-----ACA-CAGAAGNACA----TGC-GACACAAACG----GCCGGATG-CCTCTTC-CAC--ATCATC---ANCGGGAA--TAGTTGAAGATG-A-GACG-GTGACTGGGATGT--AGA-TC--CCG-AA--G-TTCAA--GTTGGGGACGAGGGGGTTGA-GGTCTCAGAGAAGN-GATGGGAGC-AGGGCCATCCTTATCTGGTAGT-GCAGAGCTT-ATTACTAGCCGTG-TTATTCGCAAAAGAACATCTCCAA-TCCTGTCCAGA-C-CTCCAGAAA-AGTCACAAGTCGAGAAGAGGA-AGTGGTACAGTAGGAAG-TGTGTAGATGTGCCGGTAT-TCAGACAGTCACGTTTGAGCC-CATCCGAGTG-A-CAAG-TCAGCAGAAATGGTGGGTCAG-GGT-ACTCAGACAGAAGGATACCGTCGA---------CG--GGT----CA-AAGA-AG---T-TC--GTCAC--G--GTAT--CAAG-AAACGGACAAAGAGTCA-NGA-------GAAG---GAAGAAT-T-TTCCGTAAGATGTAGACGGAT-AT-ACAGC-GCAT--A-CTGT-AACATTAAAAGACC-GTT-GTT-TTATTGCGCTTGACNTTNGCAATT-TANTGCA--T-GTTCA-A-CTTTCAGTCACCAGGG--GA-GTGCGA-AGAATT-CATTATTCAT-CTT-G-TACA--TTTTTTTTCATGTT-TGCTCAC---TCT---------------CAT---------C-TGTTTTG--AA-AAAAGATTAAGAT---T--ATCAT-GTATA--TT---TTA-TCATGT-GA-GGA-CACATGANG--CATAGA-G--GCGTG--GGTAAGTGTGA---CAA--TTAGAGG----TCGGGGT-CGGGGATG--GGTT-CGT----CATGT--AT-C-------A----GAT-G--C-----CT--TAAA----T-------AT---------GTT-----------CG---------GG-TG--T--TATT-GT-NGG-GC-A-T--T----AT-G--ANA--GCA-T----C-CGAG-----GG-TAGT---TCG--GGTG-T----C-AGC-GGTACT-AT-A-ATA---G-G-C-GTGA------TCT-GCTGANATTTCG--NC---AGTTCAG--CTGT--GGAG-CTC--G--AC--GAGAAGAA-GA------C-GG---T-GATA-AA--GG-TAC---TA--A--TATATAATA------C---GGGCG--TGTATTATA--ATATT--CAG--TATA-----CGGTG-----G--CTA--GTGTACTGG-TC---TG----CGAG--AATAGT-AATAA--AGTATTTC-C---AG-GTTTA-AAGTGT-C-A-----GA--TC-G--GTCC-GGNTATAGGGA---A-AA--T----TA---ATA---GACGAG-----CACCTGTCCGG--TATA-----------AGGA-CAG--AA-CT----AG-CAT-AGG-----GCACAGA-CAAG-C-A---TA-G-GTC---CC-A--G--C----CTTA---CGCA-------CA-CC---AT--ACC--TT-AGGTC--T--CT----A---T-GC-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-AT----------AGG-T---AATC-C-TGT-----A----TA---A------TAT-TATCTGT--AT---ATAT--TG---AC--TCG--TT-----ATTTT--TAATAG---TGTTCA-TA---TTT-TGCAT--TC---A--TTC---ATT-GATAAT-C---AT-C---ATGC------C-CCAG-A-CTG-----GT-C-CG---A-ATCA--ACGAAC--CTAAACAC
Reference ( family-5610 ) : AGAGAGAGAATACATGA-TTCGTTA-CGGG-TCCTGAACTCTTCTAGGAGCATGC-GTCCCATAGCCCGAGACCCATACCAGG---TAT----GA-GT--ACCAGT-ACC--CCGTATGTA---AGAG--CAAGAGAGAG-------AN-TGTAA-GTGG---ATAT-TT-AGTG-A-TGA-ATGCATGTGTACATGATGAGAGAGGTACTCGTCCCGC--ATCAAGAGTTACTA-GTCCC--GT--ATCGNGAGT-TACTCGTCTCGCA-T-CGAA--CAA--CAGACTGATGCCAGAG-A-TAC-GTC---CCAGGAT--GGATG-CAAACCTGCATGGACAGA--TCCGGTCTA-AG-CCCGAAACTTCGT----AAA-CCA-GCGACATA---TGATGGTACG--GGTCTCTGG-GAAGATTA--CTTGTC-GCATT---TC-GA---G-T--GCGTG----TCTACT--GAATGAGTGG--A-CAG--AC--ANTGA-GAAAGGTNT--ATACTTGG-CTGCGTCNCTNAGGGGNACAAGCACAAGG--AG-----------TN-TTAG-GAAA-TCAG---C------C-----A----------A--G-------------A--A-----TTATTGGA-----------AGCTA-----------GT-TAAAGC-CCTT---CGGGGNA----GA----TTTGCT-TCCAG-T------AAA--CCAG-ACTGAGCT--AT------A-TAGAGCACAGCT--GAGA---GAGAAAGGAGGC-AAAAG-----GCATCT-GAA-AGTT--TGCCGGAG--C--T----GGGT--C-AAGACGTAAGAA-GGCTNGCNAA-TCTAGCNTACCC--NACC-GCTCCNGATGAGGT--AAGAG-AAACNC-TTG--CTACAGGAGCAGTTCTTNGATGG-ACTACGNAGT-T-CA--GAG--AT--GCG-TC--TCAAG-ATC-AAACAGGCAAGACCTGTAAACCTGAAT-GATGCGATACGGAG-A-GCC--GTT-GAACTGGANGCATAC-A-AC-A-GGCCAGAGGA-GTCGCCG-GATAGATGCT----GTAAGAGTCA--T-GAGTGGAAGT-T--CTA--CAGAACCGTC-CAGAG--AAAACAAACTCGAT---CGAT-CATAGAGACTG-AGAAA-AGAATATGCGCTCTCTACAGC-GAGA-TATT--AAGGAT-TTGAAACAATGGAAGTTTCAGTCACAGGGTCAA--GGACGTATGCCTCATCAAC--AGACAAGCTCGGG--TTGCTAAGG-TCAAGTTAGAA--AATGTTAACA--AATGCGGTTC-TGAA---AAG---CACCTTAAAAGGGACT-GCCCGCAATGGAG-CAAAGAGTTGG-AACTCCG-TAGCAATTCAAAAGAG-AATGAACACAAGGGGACTGATGCAGCTCGTAATGCATC--TGACC-A--ATATT-CT--AGAGTAGTGCATT--CCATAAA---CGAGAAAGGGGTT--TA-TGT---CACGGCA-C--GTATC--------CATGGAAT-GATG-TA--TACCTGTTG-GTTGAT-ACAGGCGCTA-CG-G-----CGTCCTTGCTATCTACAATTTGTTA-TGAGAACATTTGC-AAGGGT-CACAG-GTCAA-TCCTT-GAC--AAG---GTCGGAGAGAGATGTGCTATCAGC-TAGTGG-ATCA--CCGCTAAAGGTACTGGGA---AAAGTTCCAGTAGATT-TAAA-GTTGG-A-GACATTGC--GTTAAA---GC-AT-G-AA--CGGTCATAGCT--TGACCTA-ACAGTGGATGGGA--TCTT--GGATTAGATTTCCTGGTTAAGCATG--AGGCAGTAAT-CG---AC-ATGCGCATGCATA-GA-TAAAAA--TATCTGGC-ACGGAGCAC-CCTATCAAGCTGGAAGGGTTGC------AACCTCATANAAGGTAG-CCAC--CTTT-CATG-GA-GTCACGGATACCACCTAGATCGGAAGCTGATGGTA-GAAGGAG-AGATACGT-ACTAGGATC--GGATGGAGGACTCTCAGCC-AAGC-T-GAATA-TGATA--AA-GCATT---C-GGAAA--AGT---TTCAGAAG-----CCGGGTTCTTGTT-T-GCTGGCC------------A--AAACACCTG--T----CCGT-----ACA-CAGAAGNACA----TGC-GACACAAACG----GCCGGATG-CCTCTTC-CAC--ATCATC---ANCGGGAA--TAGTTGAAGATG-A-GACG-GTGACTGGGATGT--AGA-TC--CCG-AA--G-TTCAA--GTTGGGGACGAGGGGGTTGA-GGTCTCAGAGAAGN-GATGGGAGC-AGGGCCATCCTTATCTGGTAGT-GCAGAGCTT-ATTACTAGCCGTG-TTATTCGCAAAAGAACATCTCCAA-TCCTGTCCAGA-C-CTCCAGAAA-AGTCACAAGTCGAGAAGAGGA-AGTGGTACAGTAGGAAG-TGTGTAGATGTGCCGGTAT-TCAGACAGTCACGTTTGAGCC-CATCCGAGTG-A-CAAG-TCAGCAGAAATGGTGGGTCAG-GGT-ACTCAGACAGAAGGATACCGTCGA---------CG--GGT----CA-AAGA-AG---T-TC--GTCAC--G--GTAT--CAAG-AAACGGACAAAGAGTCA-NGA-------GAAG---GAAGAAT-T-TTCCGTAAGATGTAGACGGAT-AT-ACAGC-GCAT--A-CTGT-AACATTAAAAGACC-GTT-GTT-TTATTGCGCTTGACNTTNGCAATT-TANTGCA--T-GTTCA-A-CTTTCAGTCACCAGGG--GA-GTGCGA-AGAATT-CATTATTCAT-CTT-G-TACA--TTTTTTTTCATGTT-TGCTCAC---TCT---------------CAT---------C-TGTTTTG--AA-AAAAGATTAAGAT---T--ATCAT-GTATA--TT---TTA-TCATGT-GA-GGA-CACATGANG--CATAGA-G--GCGTG--GGTAAGTGTGA---CAA--TTAGAGG----TCGGGGT-CGGGGATG--GGTT-CGT----CATGT--AT-C-------A----GAT-G--C-----CT--TAAA----T-------AT---------GTT-----------CG---------GG-TG--T--TATT-GT-NGG-GC-A-T--T----AT-G--ANA--GCA-T----C-CGAG-----GG-TAGT---TCG--GGTG-T----C-AGC-GGTACT-AT-A-ATA---G-G-C-GTGA------TCT-GCTGANATTTCG--NC---AGTTCAG--CTGT--GGAG-CTC--G--AC--GAGAAGAA-GA------C-GG---T-GATA-AA--GG-TAC---TA--A--TATATAATA------C---GGGCG--TGTATTATA--ATATT--CAG--TATA-----CGGTG-----G--CTA--GTGTACTGG-TC---TG----CGAG--AATAGT-AATAA--AGTATTTC-C---AG-GTTTA-AAGTGT-C-A-----GA--TC-G--GTCC-GGNTATAGGGA---A-AA--T----TA---ATA---GACGAG-----CACCTGTCCGG--TATA-----------AGGA-CAG--AA-CT----AG-CAT-AGG-----GCACAGA-CAAG-C-A---TA-G-GTC---CC-A--G--C----CTTA---CGCA-------CA-CC---AT--ACC--TT-AGGTC--T--CT----A---T-GC-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-AT----------AGG-T---AATC-C-TGT-----A----TA---A------TAT-TATCTGT--AT---ATAT--TG---AC--TCG--TT-----ATTTT--TAATAG---TGTTCA-TA---TTT-TGCAT--TC---A--TTC---ATT-GATAAT-C---AT-C---ATGC------C-CCAG-A-CTG-----GT-C-CG---A-ATCA--ACGAAC--CTAAACAC
gi|1 : AGAGAGAGA-TACATGA-TTCGTTA-CGGG-TCCTGAATTCTTCTAGATGCATGC-ATCCCATAGCCCGAGACCCATAACAGG---TAT----GA-GT--ACCAGT-ACC--CCGTATGTA---AGAA--CAAGAGAGAG----------TGTAA-GTGG---ATATGTT-AGTG-A-TGA--TGCATGTGTACATGATGAG-GAAGTACTCGTCCCGA--ATCAAGATTTACTA-GTCCC--GT--ATCTCG--T-TACTCGTCTCGCA-T-CGAA--CAA--CAGACTGATGCCAGAG-AATAC-GTC---CCAGGAT--GGATGGCAAACCTGCATGGACAGA--TCCGGTCTA-AG-TCCGAAACTTCGT----AAA-CCA-GCGACATA---TGATGGTACA--GGTCTCTGG-AATGATTAA-CTTGTC-GCATT---TC-GA---G-TATGTGTG----TCTACT--GAATGAGTGG--A-CAG--AT--ATTGA-GAAAGGTTT--ATACTTG--CTGCATCTCTTAGGGGAACAAGCACAAGGG-AG-----------TA-TTAG-GAAA-TCAG---C------C-----A----------A--G-------------A--A-----TTATTGGA-----------AGCTA-----------GT-TAAAGC-CCTT---CAAGGTA----GA----TTTGCT-TCCAG-T------AAA--TCAG-ACTGAGCT--AT------A-T-GAGCACAGCT--GAGA---GAGAAAGGAGGC-AAAAG-----GCATCT-GAA-AGTT--TGCCGGAG--A--T----GGGT--C-AAGACATAAGAA-GGCTTGTTAA-TTTAGCCTACCC--CACC-GCTCCTGATGACGT--AAGAG-AAATAC-TTG--CTACAGAAACAGTTCTTGGATGG-ACTACATAGT-T-CA--GAG--AT--GCA-TC--TCAAG-ATC-AAACAGGCAAGACCTGTAAACCTGAAT-GATGCGATACAGAG-A-GCT--GTT-GAACTGGAAGCATACAA-AC-A-GGGCAGA-GA-GTCGCCG-GATAGATGCT----GTAAG-GTCA--T-GAGTGGAAGT-T--CTA--CAGAACCGTC-CAGAG--AAAACAAACTCGAT---CGAT-CATAGAGACTG-AGAAA-AGAAT-TGCGCTCTCTCCAGC-GAGATTATT--AAGGAT-TTGAAACAATGGAAGTTTC-GTCACAGGGTCAA--GGACGTATGCCTCATCAAC--AGACAAGCTC--G--TTACTAAGA-TCAAGTTAGAA--AATGTTAACA--ATTGCGGTTC-TGAA---AAG---CACCTT-AAAGGGACT-GCCCGCAATGGAG-CAAAGAGTTGG-AACTCCA-TAGCAATTCAAAAGAG-AATGAACAAAAGGGGACTGATGCAGCTCGTAATGTATC--TGACC-----TATT-CC--AGAGTAGTGCATT--CCATAAA---CGAGAAAGGGGTT--TA-TGT---CACGGCA-C--GTATC--------CATGGAAT-GATG-TA--TACTTGTTGTTTTGA--ACAGGCGCTA-CG-G-----TGTCCTTGCTATCTACAATTTGTTA-TGAGAACATTTGC-AAGAGT-CACAG-GTCAA-TCCTT-GAT--AAG---GTCGGAGAGAGATGTGCTATCAGC-TAGTGG-ATCAACCCGCTAAAGGTACTGGGA---AAAGTTCCAGTAGATTCTAAA-GTTGGAA-GGCATTGC--GTTGCA---GC-GT-G-AA--TGATCATAGC---TGACCTA-ACAGTAGATGGGA--TCTT--GGATTAGATTTCCTGGTTAGGCATG--AGGCAGTAAT-TG---AC-ATGCGCATGCATC-GA-TAAAAAATTATCTGGC-ACGGAGCAC-CCTATCAAGCTGGAAGGGCTGC------AACCTCATACAAGGTAG-CCA----TTCACATA-GA-GTCAC-AATACCACCTAGATCAGAA-CTAATGGTA-GAAGGAG-AGATACGT-ACTAAGATC--GGATGGAGGACT-TCAGCC-AAAC-T-GAAC--TGATA--AT-GCATT---C-GGAAA--AGT---TTCAGAAA-----CTAGGTTCTTGTT-T-GCTGGCC------------A--AAACACTTG--T----CCGT-----ATA-CAGAAGAATA----TGC-GACACAAACA----GCTGGGTG-CCTCTTC-CAC--ATCATA---AGTGGGAA--TAGTTGAATATGAA-GACA-GTGACTGGGATGT--AGA-TC--CTG-AA--G-TTC-A--GTT-GGGACGAGGGAGTTGA-GGTCTAAGAGAAGT-GATGGGAGC-AGGG-CATCCTTATCTGGTAGT-GTAGAGCTT-ATTACAAGCCGTG-TTATTCGCAAAAGAACATCTCCAA-TCCTGTCCAGA-C-CTCCAGAAA-AGTCATAAGTCGAGAAGAGGA-AGTGGTACAG-AAGAAG-TATGTAGATGTGCTGGTAT-TCAGACAGTC-CGTTTGAGCC-CATCCAAGTGAA-TAAGTTCTGCAGAAATGGTGGATCAG-GGT-ACGCAGACAGAAGGATACCGTCGA---------CG--GGT----CA-AAGA-AG---TATC--GTCA---A--GTAT--CAAGAAAACGGACAAAGAGTCA-TGA-------GAAG---GAAGAAT-TATTCCGTAAGAT-TAGACGGAT-ATAACAGC--CAT--A-CTGT-AACATTAAAAGACC-GTT-G-T-TTA-TGTGCTTGACATTGGCAATT-TAATGCG--T-GTTCA-A-CTTTCAGTCACCAGGG--GA-GTGTGG-AAAATT-CATTATTCAT-CTT-G-TACA--TTTTTTTTCATGTT-TGCTTA-----CT---------------CAT---------TGTGTTTTG--AA-AAAAGATTAAGAT---T--ATCAT-GTATA--TT---TTA-TCATGT-GA-GGA-CACATGCAG--CATAGA-G--GCGT---GGTAA-TGTGA---CAA--TTAAAGG----TCGGGAT-CGGAAATG--GGCT-CGG----AATGC--AT-C-------------AT-G--C-----CT--TAGA----T-------AT---------ATT-----------CG---------GG-TG--T--TATT-GT-TGT-GC-A-T--C----AT-G--AAA--GCA-C----C-CGAG-----GG-TAGT---TCG--GGTG------C-AG--GGTACT-AT-ATATA---G-G-CTGTGA------TCA-GC-GATATTTCG--GC---ACTTCAG--CTGT--GGAG-AT---G--AC--GAGAAGAA-GA------C-GG---T-GATA-AA--GG-TAC---TA--A--TATATAATA------C----GGCG--TGTATTATA--ATATT--CAG--TATA-----CGGTG-----G--CTA--GTGTACTGG-TC---TG-----GAG--AATAG--AATAA--AGTATTCC-C---AG-GTT---AAGTAT-C-A-----GG--T-----GTCC-GGGTAGAGGTATCTATAC--C----TATACATACTTGACAAG-----CACCTGTCCGG--TATA-----------AGGA-CAG--AA-CT----AG-CAT-AGG-----ACACAGA-CAAG-C-A---TA-G-GT----CC-A--G--C----CATA---CGCA-------C--CC---AT--ACC--TT-AGGTC--T--CC----A---T-GC-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-AT----------AGG-T---AATC-C-TGT-----A----TA---A------TAT-TATCTGT--AT---ATAT--TG---AC--TCG--TT-----ATTTT--TAATAG---TGTTCA-TA---TTT-TGCAT--TC---A--TTC---ATT-AATAAT-C---AT-C---ATGC------C-CCAG-A-CTG-----GT-C-CG-----ATCAACACGAAC--CTAAACAC
gi|10 : --AGACAAGTTCAG---CTGCTAAGG----AGTTACAA--AAT--TAAAATTAATGCGGTTC-TGAA---AAG---CACCTTAAAAGGGACT-GTCCACAACGGAT-CAAAGAGTTGG-AACTCCG-TAGCAATTCAAAAGAG-AATGAACACAAAAGGACTGATGCAGGTCGTAATGCATC--TGATC-A--ATATT-CT--AGGGTAGTGCATT--CCATAAA---CGAGAAAGGGGTT--TA-TGT---CACGGCA-C--GTATC--------CATGGAATGGATG-TA--TATCTGTTG-GTTGAT-ACAGGTGCTA-CG-G-----TGTCCTTGCTATCTACAATTTGTTA-TGAGAACA-TTGC-AAGGGT-CACAG-GTCAA-CCCTT-AAC--A--------------AGATGTACTATCATC-TAGTGG-ATCA--CCGCTAACGGT
gi|10 : TCCTGGTTGAGAATG--AGGTAGTAAT-TG---AC-ATGCGCATGCAAAAGA-TAAAAA--TATCTGGC-ATTGAGCAC-CTTATCAAGCTGGAccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcctggttgagaatgaggtagtaattgacatgcgcatgcaaaagataaaaatatctggcattgagcaccttatcaagctgga
gi|11 : agacaagttcagctgctaaggagttacaaaattaaaattaatgcggttctgaaaagcaccttaaaagggactgtccacaacggatcaaagagttggaactccgtagcaattcaaaagagaatgaacacaaaaggactgatgcaggtcgtaatgcatctgatcaatattctagggtagtgcattccataaacgagaaaggggtttatgtcacggcacgtatccatggaatggatgtatatctgttggttgatacaggtgctacggtgtccttgctatctacaatttgttatgagaacattgcaagggtcacaggtcaacccttaacaagatgtactatcatctagtggatcaccgctaacggtccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn----T-------AT----------TT-----------CG---------GG-TG--T--TATT-GT-TGT-GC-A-T--T----ATTG--AAA--GCA-T----C-TGAG-----GG-T-GT---TCG--GGTG------C-AG--GGTACT-AT-A--TA---ACG-CAGTGA------TCA-GC-GATATTTCG--GC---AGTTCAA--CTGT--GGAG-CTA--G--AC--GAGAGAAA-GA------C-GG---T-GATA-AA--GG-TAC---TATAA--T-TATAGAA------C---GG-CG--TGTATTATA--ATATT--CAG--TATA-----CGGTG-----G--CTA--GTGTACTGG-TC---TG-------G--A---------------CATTTC-C---AG-GTTTA-AAGTGT-CGA-----GA--TC-G--GTCC-GGCTATAGAGA---A-TA--T----TA---AGA----ACAAG-----CACCTGTCCGG--TAT------------AGGA-CAGA-AA-CT----AG-CTT-AGG-----ACACAGA-CAAG-C-A---CA-GTGT----CC-A--G--C----CTTA---CGC--------CA-CC---AT--ACC--TT-AGGT---T--CT----A---T-GC-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-AT----------AGG-T---AATC-C-TGTATA--A----TA---A------TAT-TATCTGT--AT---ATA---TG---AC--TCG--TT-----ATTTT--TAATAGT--TGTTCA-TA---TTT-TGCAT--TC---A--TTC---ATT-GATAAT-C---ATAC---ATGC------C-CCAG-A-CTG-----GT-C-CA---A-ATCA--ACGAAC--CTAAACAC
gi|12 : ----T-------AT----------TT-----------CG---------GG-TG--T--TATT-GT-TGT-GC-A-T--T----AT-G--AAA--GCA-T----C-TGAG-----GG-TAGT---TCG--GGTG------C-AG--GGTACT-AT-A--TA---ACG-CAGTGA------TCA-GC-GATATTTCG--GC---AGTTCAA--CTGT--GGAG-CTA--G--AC--GAGA-GAA-GA------C-GG---T-GATA-AA--GG-TAC---TA-----TATATAGAA------C---GG-CG--TGTATTATA--ATATT--CAG--TATA-----CGGTG-----G--CTA--GTGTACTGG-TC---TG-------G--A---------------CATTTC-C---AG-GTTTA-AAGTGT-CGA-----GA--TC-G--GTCC-GGCTATAGAGA---A-AT--T----TA---A-----GACAAG-----CACCTGTCCGG--TATA------------GGA-CAG--AAACT----AG-CTT-AGG-----ACACAGA-CAAG-C-A---CA-G-GTC---CC-A--G--C----CTTA---CGCA-------C--CC---AT--ACC--TT-AGGTT--T--CT----A---T-GC-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-AT----------AGG-T---AATC-C-TGT-----A----TA---A------TA---ATATGT--AT---ATAT--TG---AC--TCG--TT-----ATTTT--TAATAGT--TGTTCA-TA---TTT-TGCAT--TC---A--TTC---ATT-GATAAT-C---ATAC---ATGC------C-CCAG-A-CTG-----GT-C-CA---A-ATCA--ACGAAC--CTAAACACg
gi|13 : -GACAAGAGCA----GCCGGGTG-TCTC--C-CAC--CTCATC---ATGGGGAA--TAGTTGAGAGTG-A-GACAAGTGAGTGG-ATGTTGAGAATC--CTG-GAAGG-TTCAA--GTGTGGGA-GAGGGGGTTGATGGTCTCGGGGAAGA-G-TGGG-GC-AGAACCATGCTT-TCTG-TAGTCGCATAGG------ACT----GTG-TTATACGTTAAAGGAAATCTCAAG-TCCTGTCCAGGCC-CTCCAGAAA-GGTCAC-AGT--GGAAGAGGATAGTGGTA-AGTAGGAAG-TGTGTAGATGGGCGGGTATGTC-GA-AGTCAGGTTTGAGCCGCATCTGAG-A-A-TAAT-TCAGCAG-AATGGT-GGTCAG-AGTAACTCAGACAAAAG---ATCGT-GA---------CG--GGT----CA-AAGA-AG---TCTCCAGTAAC--GACGTATG-CATG--AACGGGCAAGGAGTCA-AGAAATAAACGGAGAGTGAAAGAT-T-TTTGTTTAGATGTAGACGTTTAAT-A-AGCAGCA---A-CTGT-AAg
gi|14 : a-ATGCATGTATATATGATGAGAGAGGTACTCGTCCCGC--ATCAAGAGTTACTA-GTCCC--GT--ATCGAGAGT-TACTCGTCTCGCA-T-CGAA--CAA--CAGACTGATGCCAGAG-A-TAC-GTC---CCAGGAT--GGATG-CAAACCTGCATGGACAGA--TCCGGTCTA-AGCCCCGAAACTTCGTG---AAG-CCA-GCGACATT---TGATGGTACG--GGTCTCTGG-AATGATTA--CTTGGCTGCATC---TC-
gi|14 : TACTTGG-CTGCATCTCTTAGGGG-ACAAGCACAAGG--AG-----------TG-TTAG-GAAA-TCAG---C------C-----A----------A--GGGATGAGAGGCAGA--A-----TTATTGGA-----------AGCTA-----------GT-TAAAGC-CCTT---CAGGATA----GA----TTTGCT--CCAG-T------AAA--TCAG-ACTGAGCT--AT------A-TAGAGCACAGCT--GAGA---GAG--AGGAGGT-AAAAG-----GCATCT-GAA-AGTT--TGCCGGAGATCGAT----GGGT--C-AAGACATAAGAA-GGCTTTTTAA-TTTAGCCTACCC--GACC-Gttaggggacaagcacaaggagtgttaggaaatcagccaagggatgagaggcagaattattggaagctagttaaagcccttcaggatagatttgctccagtaaatcagactgagctatatagagcacagctgagagagaggaggtaaaaggcatctgaaagtttgccggagatcgatgggtcaagacataagaaggctttttaatttagcctacccgaccg
gi|15 : atgcatgtatatatgatgagagaggtactcgtcccgcatcaagagttactagtcccgtatcgagagttactcgtctcgcatcgaacaacagactgatgccagagatacgtcccaggatggatgcaaacctgcatggacagatccggtctaagccccgaaacttcgtgaagccagcgacatttgatggtacgggtctctggaatgatTACT--AAATAAATGG--A-TAGTAAC--A--GA-AATGGGCAT--GCATCTAG-TGGTATCATTGAGTAG-ATAAGCTCAAAG--TG-----------TC-TTAG-GAAA-TCTA---C------CTGAGGG----------A--G-------------A--AAAGTGTAAATACA-----------GGCTGTT---------GTGTAAAGC-AC-----AGGAGGA----GAGGTTTTTAC---CCAC-T------AA---CCAG-ACGGAACT--TT------A-CAGAGCACAGCT--GAGA---GAGAGACGA--C-AGAAA-----GCCACA-GAG-ACAC--TACCGGAA--C--T----GGGA--C-AGGAAATACGGC-GGTTAACGAA-TCTAGCATACCC--CTCA-GCTCCAGTGGAGGT--AAGAG-AGACAC-TTG--C-AAAGGAACAGTTTCTTGATGC-GTTAAGGGA----CA--GGGACAT--GCG-TT--TGAGA-GTC-AAACAGGCGAGACCGGCTGACTTGAAT-GATACTGT-CAGAC-ACGCA--GTA-GAGTTGGATGCATTC----C-A-GGC
gi|16 : a-GCACT---TT-GA-----T--GCCTG----T--ACTAGGAA-AAGTGG--AGCAA--AC--AA-GA-AAAAGGAAT--AAATTTCG-CTGTGTCACTAAGAGGT-CAAACACAAGG--AG-----------TCCTTGG-TAAT-TCAT---C------T-----A----------AA-G-------------A--A-----GCACTGAACAACTATAATGAACTA-----------GC-CAAAGC-ACT----CGACGAAC---GA----TTTGCTCTCCCG---------AA--CCAA-ACTGAGCT--AT------A-TCGAGCACAGCTTCGTGAACTGACAAAGAAAGC-TA------------CT-GAA---TTCCTGCCAAAA--C--T----AGGT--C-AAAGTTTCAGAA-GACTGACAAA-TCTAGCATACCC--TACG-GCACCATATGAATT--GAGAG-AAACTCTTTG--TTA-GGGGGCAATT-TTAGATGa
gi|17 : cttgagctcaca-GCACT---TT-GA-----T--GCCTG----T--ACTAGGAA-AAGTGG--A-GAA--AC--AA-GA-AAAAGGAAT--AAATTTCG-CTGTGTCACTAAGAGGT-CAAACACAAGG--AG-----------TC-TTGG-TAAT-TCAT---C------T-----A----------AAAG-------------A--A-----GCACTGAC-----------AACTATAATGAACTACGC-CAAAGC-ACT----CGACGAAC---GA----TTTGCTCTCCCG---------AA--CCAA-ACTGAGCT--AT------A-TCGAGCACAGCTTCGTAACT-GACAAAGAAAGC-TA------------CT-GAA---TTCCTGCCAAAA--C--T----AGGT--C-AAAGTTTCAGAA-GAC-GACAAA-TCTAGCATAACC--TACG-GCACCATATGA-AT--GAGAG-AAACTCTTTG--TTA-GGGGGCAATT-TTAGATGctcttggtgagtcaga
gi|18 : cacaGTG----TCTACT--AAATGAGTGGGGA-CAG--AT--ACTGA-GAAAAGTTT--ATACTTGGCCTGCATCTCTTAGGGACA-AAGCACAAGAGCAGTTATTATTATATT-TTAGAGGAA-TCAG---C------C-----A----------ctcttggtgagtcaga
gi|18 : A-----------ATCTA-----------GT-TAAAAG-CCTTGTACAAGGAATTTAGA----TT-GCC-TC-AG-TCAAGGAAAATTCCAG-GC-GA-CTTTATCTTCTAA-TAGAGCACAGCT--GAGAC--GAGCAGGAAGGCTAAGAGATAATGCATCT-GAA-AGTT----CCGGAG--C--TACAAGCGT--C-AACACCTAAGAA-Gcagtcgaagatccagaaccgatcttctgcgttcgagatccatttttgccacagctaaaatctagttaaaagccttgtacaaggaatttagattgcctcagtcaaggaaaattccaggcgactttatcttctaatagagcacagctgagacgagcaggaaggctaagagataatgcatctgaaagttccggagctacaagcgtcaacacctaagaagcccttagtgtgagactactc
gi|19 : gtgtctactaaatgagtggggacagatactgagaaaagtttatacttggcctgcatctcttagggacaaagcacaagagcagttattattatattttagaggaatcagccacagtcgaagatccagaaccgatcttctgcgttcgagatccatttttgccacagctaaT--TGCCAGAG--C--T----TGGG--C-AGGACATACTCA-GGCTGGCCAA-CCTCGCATATCC--AACT-GCCCCAATTGAGGT--CAGAG-AAACCC-TTG--CCA-AGGAGCAATTCATTGATG---CTCTGAAGG-A-CAGTGAC--AT--GAG-AA--T-ACGCATT-AAACAAGCCAGACCAGTCGACCTGAAT-AATGCTATCCGTCA-T-GCC--GTG-GAGTTGGATGCATTT-A-ACTC-TGCCAAAAGACGTCTCCGTGA-AGA---------TAAAGGTTATTT-GAG-GGAGG-----CTAATCAG--CCATG-CAAAA--CAGACAAAcccttagtgtgagactactc
gi|2 : aaca-A-CTG-----GTACACG---A-ATCA--ACGAAC--CTAA
gi|2 : AGAGCGAGAATACATGAGTTCGTTA-CGG--TCCTGAACT--TCTAGGAGCATGCAGTCCCATAGCCCGAGACCCATAC-AGGAAATA-----GT-GT--ACT--TCACC--CAGTAT-TA---AGA---CAGGAGA-AG-------AG-TGTAA-GTGA---ATGT-TT-AGTGGA-TGAGATGCATGTG-ACATGATGAGAGAGGTACTCGTCC-----ATCAAGAGTTACTA-GTCCC--GTGGATC-CGAGT-TACTCGTCTCGCA-TTCGAA--CAAA-CAGACTGATGCC-GAG-A-TACTATCGATCCAGGAT--GGA-G-CAA-CCTGCATG-ACAGAAATCCGGTCTA-AG-CCCGAAACATCGTTAGAAAA-CCA-GCGAC-TA---TGATGGTACA--GGTCTCTGGTGGAGATTATTCTTGTC-GCATTCGGTCTGA---GAT--GTGTG----TCTACT--GAA-GAGTGG--A-CAG--AT--ATTGATGAAAGGTTT--ATACT--G-CTGCATCTCTTAGGGACAAAAGCACAAGG--A------------TG-T-GG-AAAA-TCAG---C------C-----AGGATAAGGCAA--G-------------A--A-----T-ATTG-A-----------AGCTA-----------GT-TAAAGC-CCTT---CAGGATA----GA----TTTGC--TCCAGTT------AAA--TCAG-ACTGAGC----T------A-TAGAGCACAGCT--GAGA---GAG--AGGAGGC-AAAAG-----GCATCTAGAA-AGTT--TGCCGG-G--A--T----GGGTGCC-AACA---AAGAATGACTTGTTAA-T-TAGC-TCCCCGAAACC-GCTCCTGATGAGGT--AAGGGAAAATAC-TTG--CTACACGAACAGTTTTGAGATGGAACTACATAGTAT-CA--GAG--ATTGACGATC--TCAAA-ATCAAAACAGGCAAGACCTGTAAA-CTGAACAGACGAGTCACGAAGTA-G-C--GTTGGAACT-GAGGCATAC-ATAC-A-GTCCAGAGGA-GTCGCCG-GATAGAAGCT----GT-AGA-TCA--GAGAGT-GAAGT-TTCCTA--CAGAATCGTCACGAAGGCAAAACAAACTCGATTCGTGAT-CAT-GAGACTT-AGAAAGAGA--ATGCGCT-TCTAC--CAGAG--TATT--AAGGATATTGAAACAATGATGATTTCAGCAACAGGGTCAACGGAACGTATGCC-CATCAACAAAGAC-AGCTCAGG--TT-CTAAGG---ATATGAGAAAGAATGTTTACAC-ACTGC-GTTCATGAATCGAAGGATCACTCTAAAAGGTACTGGCCCGCAATGGAGACAAAGA-TTGGTAACTCCGATAGCAATTCAAAAGAA-GGT-AACAAAAGGAGAA-GATGCAGCTC-CGAT--ATCCTTGACCAA--ATATCACA--AGAGTAGT-CA-T--CCATAGAAATCGA-AAAGGGGTT--TA-TGT---CACGGCAGC--GTAT---------CAT-GAAT-GAGGATA--TACTTGTTA-GTTGAT-ACAGGCGCCA-CGCGGAAATCGTCCTTGCTATCTACAATGTGTTAGTGAGAACA-TTGC-AAGAGT-CACAGTGCTAACTCCTTGGACTAAGG---GTC-GAGAAGGATTTGCTATCAGCTTAGTGGCATCA--CCGC-GAATGTACTTGGATATACAGTTCCAGTA-ATT-TAAACGTTGG-A-G-CATTGCAAGTAAAAATGGC-AT-G-AA--GAGTCA-AGCT--TGACCTACACAGTGGATGG-----CTT--GGATT-GATTTCCCTGTTAAGCATAGTGGGCA-TAAT-CATACAC-ATGCGCATACA-G-GATTAAAAA--TATC-GGC-AACGAGCACGCCTATCATACTGGGAAGGTGGTCGGTCGAACCTC-TAAAGGGTAG-CCATGGCTTT-CATGAGACGTC-CAGATACCA-CTAGATCG--AACTG-TGATAGGAAGGAGAAGATACGT-ACTA-GATCGGGGATGGA-GACTCTCAACCAAAGCTT-GAATA-TGA-A--AA-GCATT---CTGGAAA--AAGAAATTCAGAGG-----T---GTTC-TG-T-T-GCTGGCC------------ACGAAAAACCTGGTT----TAGC-----ACA-GAGTAGCACA----TGC-AACACAAA-G----CCCGGATGCCCTCTTC-CAcaacgttaaaattttggtggccagcaacgggatttggatcagtcatttaagtaaaagcattagtattcgtaaaaatgaatgagcaggattacaaagacaagtgtaatcagttagaagggggagatagatcgcctcagagcgagaatacatgagttcgttacggtcctgaacttctaggagcatgcagtcccatagcccgagacccatacaggaaatagtgtacttcacccagtattaagacaggagaagagtgtaagtgaatgtttagtggatgagatgcatgtgacatgatgagagaggtactcgtccatcaagagttactagtcccgtggatccgagttactcgtctcgcattcgaacaaacagactgatgccgagatactatcgatccaggatggagcaacctgcatgacagaaatccggtctaagcccgaaacatcgttagaaaaccagcgactatgatggtacaggtctctggtggagattattcttgtcgcattcggtctgagatgtgtgtctactgaagagtggacagatattgatgaaaggtttatactgctgcatctcttagggacaaaagcacaaggatgtggaaaatcagccaggataaggcaagaatattgaagctagttaaagcccttcaggatagatttgctccagttaaatcagactgagctatagagcacagctgagagagaggaggcaaaaggcatctagaaagtttgccgggatgggtgccaacaaagaatgacttgttaattagctccccgaaaccgctcctgatgaggtaagggaaaatacttgctacacgaacagttttgagatggaactacatagtatcagagattgacgatctcaaaatcaaaacaggcaagacctgtaaactgaacagacgagtcacgaagtagcgttggaactgaggcatacatacagtccagaggagtcgccggatagaagctgtagatcagagagtgaagtttcctacagaatcgtcacgaaggcaaaacaaactcgattcgtgatcatgagacttagaaagagaatgcgcttctaccagagtattaaggatattgaaacaatgatgatttcagcaacagggtcaacggaacgtatgcccatcaacaaagacagctcaggttctaaggatatgagaaagaatgtttacacactgcgttcatgaatcgaaggatcactctaaaaggtactggcccgcaatggagacaaagattggtaactccgatagcaattcaaaagaaggtaacaaaaggagaagatgcagctccgatatccttgaccaaatatcacaagagtagtcatccatagaaatcgaaaaggggtttatgtcacggcagcgtatcatgaatgaggatatacttgttagttgatacaggcgccacgcggaaatcgtccttgctatctacaatgtgttagtgagaacattgcaagagtcacagtgctaactccttggactaagggtcgagaaggatttgctatcagcttagtggcatcaccgcgaatgtacttggatatacagttccagtaatttaaacgttggagcattgcaagtaaaaatggcatgaagagtcaagcttgacctacacagtggatggcttggattgatttccctgttaagcatagtgggcataatcatacacatgcgcatacaggattaaaaatatcggcaacgagcacgcctatcatactgggaaggtggtcggtcgaacctctaaagggtagccatggctttcatgagacgtccagataccactagatcgaactgtgataggaaggagaagatacgtactagatcggggatggagactctcaaccaaagcttgaatatgaaaagcattctggaaaaagaaattcagaggtgttctgttgctggccacgaaaaacctggtttagcacagagtagcacatgcaacacaaagcccggatgccctcttccaa
gi|20 : actggtacacgaatcaacgaacctaacaacgttaaaattttggtggccagcaacgggatttggatcagtcatttaagtaaaagcattagtattcgtaaaaatgaatgagcaggattacaaagacaagtgtaatcagttagaagggggagatagatcgcctcC-T-GAATA-TAACAGTAA-GCATTTTGC-GGAAAGGAGT---TTCAGGAGACGGTCCGGGTTCT-ATTAT-GCTGGCCCGATCATTGGAGA--GAACACCTG--TAATGCTGTTAAACACATCAGAAGCACACCTATGC-AACACAAACGCTTCGC-GGATG-CCTCTCCTCACTAATCATCTATACTGGAAAATTAGT-GAA--TG-A---TG-GTGACTGGGATGT--AGA-TCCTCCGAAA--G-TTCAACGGTTGTGAGCGAGGa
gi|21 : GG-----GCA-AGA-CAAG-CCA---TA-G-GTC---CC-A--G--C----CTTAA--CGCG-------CA-CC---AT--ACC--T--AGGTCG-T--CC----A---T-GC-C-T-TTG-AATAT-TTA--GG-AT----------AGG-T---CATG-C-TGT-----A----TA---A------TAT-TATCTGTTAGT---A-AT--TG---ACT-TCG--TT-----AATTT--TAATAG---TGTTGA-TT---TTTATGCAT--TCAGGA--TTCGCGATT-AAT-AT-C---AT-CTCAATACATTGCAC-TAAG-A-CTG-----GTACACG---A-ATCA--ACGAAC--CTAAcag
gi|22 : CTGGCC------------A--AAAGACTTG--T----CCGT-----ACA-CAGAAGAACA----TGC-TACACAAACA----GCCGGATG-CCTCcaacgt
gi|22 : T--AGA-TC--CTG-AA--G-TTCAA--GTTGGGGACGAGGGGGTTAT-GGTCTCccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntagatcctgaagttcaagttggggacgagggggttatggtctc
gi|23 : ctggccaaaagacttgtccgtacacagaagaacatgctacacaaacagccggatgcctcccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-AGGTTA-T--CT----A---TTGC-CAT-TTG-A-T-T-T-A--GG-AT----------ACA-A---AGTA-C-TG----------------A------TGT-AATCTGT--AT---ATATATTG---GC--TCG--TT-----ATTTTTCTGATAGT--TATTCA-TA---TTT----------------TTT---GCT-GA-AAT-C---AT-A---GTGC------C-GCAGCA-CTGC----GT-C-CG---ATATCA--TC-AAC--CTAAAC
gi|24 : ----AAG-CTA-GCAACAAT---TGATGGTATG--GGTTCCTGG-GTAGACTA--CAAATC-CCATT---TT-GA---G----GCTTGTAGCTCT-TT--GAATCAGTGG--A-CGG--AC--AGGGA-AAAAGGTCT--ATATCTAA-GTGTGTCGCTCA-GAGAACAGGCcgt
gi|25 : AGCTCAAAG---T-----------TG-TTAG-GAAA-TCATACTC------CTGGGGA----------G--G-------------A--AAAGTGTAATTACA-----------GGCTGTT---------GTGTAAAGC-ACT-----GGAGGA----GAGGTTTTTACC--CCAC-T------AAC--GCAG-AC-GAACT--CT------AACAGAGCACAACT--GAGA---tattatacggt
gi|27 : ACGCATACCAGG---TAT----GAAGTTAACCAGT-ACC--CCGTATGTAGACAGAGATCATGAGAGAGATTGCAAAA-TGTAA-GTGGGCCATCT-TC-GTTA-ATTGA-ATGag
gi|28 : gagaacCAGCT--GAGA---GA--AAGCA-GC-AAAAT-----ATATCT-TAAGGGTT--TACCGACG--A--T----GGAT--C-ATCATGTAAAAA-GACTAGTCAA-TCTAGCCAACTC--AATC-TCTCCTGAataca
gi|3 : acagacTGTTG-TTTGAT-TCAGGTGCTAACG-G------GTCCTTGCTATCTACAATTTGTTA--GAGAACATTGGCCAAGGGTTCA-AG-GTCAA-TCCTT-GAC--AAGAGGGTCG-AGAGAGATGTGCTATCAGC-TAGTGG-ATCA--CCGCTAAAGGTAATGGGA---AAAGTT-CAGTAGATT-ATAA-GTGGC-G-GACTTTGC--GTTAAA---GCAATAG-AAATCGGTCATAGCTGATGACTTA-ACAGTGGATTGGAATTCTTTGGGATTAGATTT-CTGGTTAAGCATG--AGGTGTTAATATG---ACAATTCGCTGGCATA-GA-TAAAGA--TATCTGGCAATGAAGCAC-CCTATCAA-CTGGACGGGTTGC------AACC-CATATAAGGTAGTCCAC--CGTT-CATG-GA-GTTACG--TA-CACCTGAATCGGAAGCTGATGGTA-GAAGGAG-AGATACGTGACTAG---T--GGATGGAGGTCATTCAGCC-AAGC-TCGGAGACTGATA--AAGGCATT---C-GG-AA--AGT---TTCAGAA------TTGGGTTCTTGTT-TGGCTGGCC------------A--AAACA-CTG--T----TCGTA----ACA-CAGAAG-ACA----TGCAGA---AAACG----CCCGGA---CCTCTT--CAC--ATCATC---AACGGGAA--TA-TTGAAGATG------T-GTGACTGGGATGTAAAGA-TC--CCG-AA--GTTTCAA--GTTGGGGACGAGGGAGTTGA-GGTCTCAGAGAAGT-GAT-GGAGCTAGGGCCA-CCTTATCTGGTAGT-GCCGAGCTGAATTACTA-CCGTGTTTATTCGC-AAAGAACCTGTCTAA-GTCTGT--AGA-CGCTC--GAAATAGTC-CAAGTCGAGAAGAGGA-AGTGTT-CAGTAGGAAGTTGTG-AGA--TGCCGG--T-TTAGACAATCACG-TTGAGCC-CAT-CAAGTG-A-CA---TCAGCAGAAATGGTGGGTCAGTGGT-AC-CA-ATCGAAAGATAGTGTTGATGGCTCGTGCG--GGT----CATAAGA-AGTCAT-TC--GTCACTAG--GTATTCCAAGCAAAC-AAGAAAGAGTCA-AGA-------GAAG---GAAGAATCT-TTCCGTAAGATGTAG-CGGAT-AT--CAGC-GCCT--A-CTGTAAACATGTCAAGA-C-GTTGGTTGTTATTGGACTTG--CTTGGCAA-T-TAATGCA--T-G-TCA-ACCTTTCAATCACCAGGG--GAGGTG-GA-AGAATC---TTATTCAT--TT-G-TACATTTTTTTTTTCATGTT-TGCTCACAGATCT----------------ATAATCTGGTCC-TGTTTTGATAA-AAAAGATT-AGATTAAT--ATCAT-GTATA--TT---TTATTCATGTCGA-GGA-CAC--GATGCCCATAGA-G--GCG-G--GGTGAATGTGA---C-A--TTAAAGG----TCGGGAT-C--GGATG--GGTT-GGTATTATATGT--AT-C-------A----GATAG--TG----CTAATAAAAGCTC-------AT---------GTC-----------CA---------GACTT--T--TACTAGTAGGG-GC-A-T--TGGCGAT----ATA--ACA-T------CGAGTGGCAGG-TAGT---TCG--GGTG-T----TGAGCAAGTG-T-ATAA-ATA---G-G---GCG-------TCT-GCTGAAATT--G--TC---ACTTCAG--CTGT--GGAGATTCATG--AC--GAGGAGAAGGA------CAGG---T-GATATAAATGG-TCC---TA--GGCTATATTATA------CCAGGAGC---TATGTTATA--ATATT--CAG---ATAAC---CGGTG-----GGTCTA--GTGTACTGGTTC---TGGAC-CCAG---ATAGT--ATGAGTAATATTTCAC---AA-TTTTA-AAGTG--C-A-----AAGTCC-G--GT-C-GGTTATAGAGAGT-A-AATGT----TA-----A---GACAAG-----CACCTGTCCGG--CGTAGT---------AGGATCAGGAAA-CTAA--AG-CAT-AGG-----GATCAGT-AAAG-C-A----A-G-GTC---CC-ACTG--CT---CTTAGTCCGCAAGAGGAGCA-CCTCTAT--A-C--TT-AGGTC--TGCCC----ATCCT-GCTTATATTGCA-T-TATTACCGG-ATTAGCTTACTCAGGCT---AATC-T-TCTAAGCGA----TG---AATAGACTAT-TATCTGT--AT---AT-T--TG---ACCGTCGAATG-----ATTTT--TAATAG---T
gi|30 : tC---CC-A--G--T----CTTA---CGCA--------G-CC---AT--ACC--TT-AGGTT--T--GT----A---T-GT-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-AT----------AGG-T---AATC-C-TAT-----A----TA---A----------TATCTAT--AT---ATAT--TG---AC--TCG--TT-----ATTTT--TAATAG---Ttgt
gi|32 : GA-AGAATT-CATTATTCAT-CTTCG-TACA--TTTTTTTTC
gi|33 : gcatattctacatcaccagggatggattgtttatgtgtgtttgccaTGTGA---CAA--ATTGAGA----TCGGGTT-C-GGGATG-------TGT----CATTT--AT-C-------A----GAT-
gi|4 : atAGAGAGGATACATGG-TT-GTTAACGGGGTTCTGAACTCTTCTAGGA---TGC-G-CCCATAGCC-GAGACCCG-ACCAGG---TGTACTGGA-GT--A--AGT-ACCGACTGAAT------AGAG--AAAGAGAGAG-------AGCTGTAAAGTGG---ATAT-TTTAGTG-A-TGA-ATGCATGTGTACA-GATGAGAGAG---CTCGTCCCGCGCATCAAAGGTTACTAAGTCCCAAGT--AT-GAGAGTATTCTCATCCCGCAAT-CGAAGACAATGCAGACTGATGC-AGATCA-TAC--TC---GATGGATAGGGATG-CAA-CCTGGATGGACAGA--TCCGGTCTATAG-CC---GACTT-GT----AAAACCAAGCGACATACGCTGATGGTACATCGGTCTTTG---AAGATTA--CTTGTT-TCATT---TC-GGTCTG-T--G-GTG----TCT-CT--AAATGA-TGG----CAG---CTTATTGA-GAAAGGTTTTAATACTTGG-CTGAATCTT----GGGGACAAGCACAAGG--AG-----------T---TAG-GAAACTCAG---CAAGGGAT-----A----------A--G-------------GCGA-----TTATTGGA-----------AG-TA-----------GT-TAAAGCGCCTT---CAGA-TA----G-----CTTGCT-TCGAG-T------AAAA-TCAGGACTGAGCT--AT------A-TAGAG-ACAGCT--GA-A---GAGAA-GGAGGC-AAAAG-----GCATCT-GAA-AGTT--TGCCGGAG--A--T-----GGT--CAAAGAC-TAAGAA-G--TTGTTAATTTTAACT--CCC--GACCTGCT-CTGATGATGTCAAGGAG-AAATTC-TTGCCCTACAGAAG----TCTT-GATGG-ACTA---AGT-TAAA--GAG--AT--GC--TCTGTCAAG-AT---GACAGGCAAGACCTGTAAAGCT-AAT-GATCGGATACAGAG-A-GCTTGGTT--AACTGGAAGCA-AC-A-CC-AGGGCCAGAAGA-GTCGCCG-GATAGATCCTGTCAGTAAGAGTCA--T-GAGTGGACGTCT--CTA--CAGAA--GTC-CACAG--AAAACAAACTCGAT---CGAT-CAT-GAGAGT---AAAA-AGAATATGCGCTCTC-ACAGC-GAGA-TATTAAAAGGAT-TGAAAAC-ATGGAAGTTTCAGT-ACAGGGTCAA--GGATGTA-GCCTCAT-AAC--AG--AAGAT-GGGATTTGCTAAGG-ATAAGTTAGAC--AAT-TT-ACA--AATGCGGTTC-TGAA---AAG----A--TTAAAAGGG----GCGCG-AATGGAG---AAGAGTTGA-AACT-CG-TAGC-ATTC-AAAGAGCAATGAACACAAGGGGA-TGATGCAGGTCGTAATGCATC--TGACC----ATATT--T--AGGGTAGTGCCTT--CCATAAA---CGAGAAAGGGGTT--TA-agatgtt
gi|5 : tcaagaaactaaacaacgtcgttataaccagcataaattttggtggagaacgagatttgggagtccatgattaattaaaacattagtatctaaaaagatgagcaacggattacacaagaagtaaaccagttgaaagggaatagattgctccCAGGAA--TAGTTGAAGATG-AAGACA-GTGACTGGGATGT--AGA-TC--CCG-AA--G-TTCAA--GTTGGGGACGAGGGGGTTGA-GGTCTCAGAGAAGGAGATGGGAGC-AAGGCCATCCTTATCTGGTAGT-GCAGAGCTT-ATTACTAGCCGTG-TTATTCGCAAAAGAACATTTCCAAGTCCTGTCCAGA-C-CTCCAGAAA-AGTCACAAGTCGAAAAGAGGA-AGTGGTACAG-AGGAAG-TGTGTAGA--TGCCGGTAT-TCAGACAGTCACGTTTGAGCC-CATTCAAGTG-ATCAAG-TCAGCAGAAATTGTGGATCAG-GGT-ATTCAGACAGAAGGATACCGTCGA---------CGTTGGTTAGGCA-AAGACAG---C-T---G-CAC--A--GTAT--CAAA-AAAC-GACCAAGA-TCATCGA-------GAAG---GAA-AAT-T-TTTCGAAA---GTA-AT-GAT-AT-A-AGC-ACATTAA-CTGT-AAT-----AAG--C-GTT-G-T-GTATGGC-CTTGACATT-GCAATT-TAATGCATGT-GTTCA-A-CTTTCAATCACCA-GG--GA-GTGCGA-AGAATT-CATTACTCATGCTT-GATACA----TTTTTTCATG-T-TG-TCAC---TC------------------T---------C-TGTTAT----A-AAAAAACTATAAT---TCAATC-T--TATA---T---TTA-T-ATGT-GAGGGA-CACATGGCG--CGTAGA-G--G-GTG--GGTAGAT-T-A---CAA---TAAAGG----TCGATG---GAGAATGATGGTTGCGT-----ATGT--AT-CATTATCGA----GAT-A--G-----CA--TAAA----TAAGCTTAAT---------GTC-----------CAACC------AG-TGACT--TTTC-GT-AGG-GC-A-TGGT----AT-T--ACA--ATACT----C-CGA-------G-TAGT---TCA--GGTG-T--------T-GAAACTAAT-A-ATA---G-G-C----A------TCT-GCTGATA---CG--TC---ACTTCAG--TTGT--GGAG-ATC--G--AC--GAG-AGAA-GA------C-GG---T-GACA-AA--GG-TAC---T---A--TATATAATA------C----GGCG--TGTATTATA--ATATT--CAG--TATA-----CGGTG-----G--CTA--GTGTACTGA-TA---TG-----GAC--AATAGT-AATAA--AGTATTTC-C---AG-GTTTA-AAGTGT-CAA-----GA--TC-G--GTCC-GGTTATAGAGA---A-AG--T----TA-----A---GACAAG-----CACCTGTCCGG--TATAGGCGGGGGTATAGGA-CAGA-AA-CT----AG-CAT-AGG-----GCAC
gi|6 : AGCTGCAT--ATCTGT-TACTTTAAAAGACCTGTT-GTT-TTATTGTGCTTGACTTTTGTCATTGTATTGCA--TTGTT-A-A-CTTATAGTTA--AGGGAGGA-G-GCGACAAAATTTCCTTATT-AT--TT-G-TGCA--TGCTTTTGC-TGT-------A------T---------------CAT---------C-TGTTTTG--AA--------TAAGAT---T--ATCATTGTATA--TT---TTA-TCATGT-GA-GGA-CA-ATGAAG--GCT-GA-GTCGCGTG--GGTAAGTGTGGCATCAA--TTAGAGA----TCGGGGT-GCGGGAT----GTT-CAG----CATATTAATAT-------A----GAT-G--CTAAATCTA-TAAC----T-------AT---------GCTTTACTGTCAACCG---------GA-CT--TCATATT-GT-AGGAGCTACT--T----AG-GTCATACCACA-TG---CGCGAG-----GGTTAGTACATCGGTGGTA-T----C-AGC-AG--CT-CT-A-ATATATC-G-C-GTGGCAGTATTCT-GCTAGCATTTTGTTTC----GTTCAAATCTGTTGGGAG-CTC--GTCAA--GAGAAGAA-CAAGCAGTC-GGATAC-AATA-AA--GGTTACGG-CA--A--TATATAATATAAATGC---GGGCGTTTGT-TTAT---ACATTGACAGTATATA-----CGGTGCTTACG--CTAAGGTCTATTGA-TCGCGTGCTGTCGAGATAATAAT-AATAA--AGTATCTT-CACAAG-GTTTATAAGTGTAC-ATGAGGGA--TT-GGAGTCCTGGG--TAGGTA---A-GA--TTGCATA---TTA---GAGGAGTACGTCACGTGTCCGGGTTATA-----------GGCA--AC--AA-CT----AG-TAT-GGGCGGTAGCACATATTTAG-C-ATATTA-G-CTC---CCGA--G--CGCTTCTT----CTCA-------CAGCC---ATTAACCAGTTAAGGACATT--CT----A---T-GG-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-CT----------ACA-A---AATCTT-TGT-----ATCTGTAGGCA------TGTATATC-GT--ATTCGAC-T--TG---TC--TCGT-TT-----ATTTT--C----------CTCATTG---TTT-GGCATTATC---A--TTC---ATTAGATAATCC---AT-T----TGC------CGCCAGTATCTG-----GT-T-CGCGCA-ATCA--TCGAAC--CTAA
gi|7 : -TAGTGCT--T-TTCCATA-CTT-CAATC-CCAGGG--AG-AT-CGA-AGAAAT-CATTATTCAT-CT--G-T-CA--TTTT----CATGTTGTCCTCAC---TCTTTTTTACCGGTATTACAT---------G-TATTTTG--AATAAACGATTAATAT---A--ATT-T-GTATAATTTCAATTG-TCATGT-GA-GGAACACATGACGG-CATAGAAG--GCGTGTGGGTAAGTGTGA---CAAACTTGAAGAACAATCGGGTTTCGGCGATG-----T-TGT----CATTT--AT-C-------A----GAT-AGAT-----CT--GACA----T-------ATAA-------GTTTA---------CGTCAACTTCTGG-TA--C--TTTTCGT-AGG-AC-A-TAGT----AG-G--AAA---CA-TGCTCC-CGAG-----GG-TAGT---TCG--GGTG-TTTTTC-A-C-AGTA-T-G--A-ATA---G-GGC-ATAA------TCTTGCTGAGATTTTG--CTCGTAGTTCAT--CTGT--GG-T-CTC------C--GAT--------------C-GA---T-TA-A-AA--AG-TACACGCA--A--TATAATATA------C---GGCTG--TGTATTATTTTATATT---AG--TATATATAACGGTG-----G--TTA--GTATACTGGGTC---TG----CGCA--GATAGTTCGTA----GTAT--C-C---AGAGTTT------GT-A-A-----GA--TCCGT-GTCC-GGGTA-ATG-------AG--C----TA---ATA---G----G-----TACATGTCCGG--TATA-----------AGGA-CAG--AA-CTGTAAAGTCATCAGA-----ACACAGC-CAAGTC-A---TACG-GCCAAACA-A--GCAC----CTTGC--CGAG-------CC-CC---AT--ACCT-TT-AAGTT--T--TTTCCAA---TAGT-CAT-TTG-G-A-T-TTA--GGAAT----------AGG-TGGGAATC-C-C-T-----A----TAAC-A------TAT-TATCTGT--AT---ATAT--TGTCAGC--TCG--TTTTTTAATTTTCCTAATAGCTCTGTTCA-TGTATTTT-TGTAT--TC---ATTTTC---ATT-CATAATGCACGAC-C---ATGT------C-GCCT-A-TTGATTCTGT-C-CG---A-ATCA--AAGAACCACTAAACA
gi|8 : ttaATTAAAAGACC-GTT-GTT-TTATTGTGCTTGACTTTTGCAATT-TATTGCA--T-GTTCA-A-CTTTCAGTTACCAGGG--AG-GAGCGA-AAAATT-CCTTATTCAT-CTT-G-TGCA--TTTTT-----------GCTGAC---TC-----------------AT---------C-TGTTTTG--AA-TAAAGATTA-----------TCAT-GTATA--TT---TTA-TCATGT-GA-GGA-CACATGAGG--CATAGA-G--GCGTG--GGTAA-TGTGA---CAA--ATTGAGA----TCGGGGT-CGGG-ATG-------TAT----CATAT--AT-C-------AAATAGAT-G--C---------TAAA----T-------ATAAAGCTTACGTCAAC--------CG---------GA-CT--T--TATT-GT-AGG-AC-A-T--T----AG-G--ATA--ACA-T----C-CGAG-----GG-TAGT---TCG--GGTGTT----C-AGC-AGTA-T-A--A-ATAC--G-G-C---AA------TCT-GCTGAGATTT-G--TC---AGTTCAA--CTGT--GGAG-CTC--G--ACAAGAGAAGAA-GT------C-GA---TAAAAA-AA--GG-TACGG-CA--A--TATATAATATAAATGC---GGGCGTTTGT-TTAT---ACATTGACAGTATATA-----CGGTGCTTACG--CTAAGGTCTATTGA-TCGCGTGCTGTCGAGATAATAAT-AATAA--AGTATCTT-CACAAG-GTTTATAAGTGTAC-ATGAGGGA--TT-GGAGTCCTGGG--TAGGTA---A-GA--TTGCATA---TTA---GAGGAGTACGTCACGTGTCCGGGTTATA-----------GGCA--AC--AA-CT----AG-TAT-GGGCGGTAGCACATATTTAG-C-ATATTA-G-CTC---CCGA--G--CGCTTCTT----CTCA-------CAGCC---ATTAACCAGTTAAGGACATT--CT----A---T-GG-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-AT----------ACA-A---AATC-CTTGT-----A----T----C------TG--TACATGT--AT---ATAT--TG---AC--TCG--TT-----ATT---------------TTCA-TAT--TTT-TGCAT--TC---A--TTC---A-T-GATAAT-C---A
gi|9 : att-A-GCT--GTT-GAACTGGAAGCATAC-A-AC-A-GGGCAGAG-A-GTCGCCG-GATAGATGCT----GTTGGAGTCA--T-GAGTGGAAGT-T--CTA--CAGAACCGTC-CAGAG--AAAACAAACTCGAT---CGATTCATAGAGACTGTAGAAA-AGAATATGCGCTCTCTACAGC-GAGA-TATT--AAGGAT-TTGAAACAATGGAAGTTTCAGTCACAGGGTCAA--GGACGTATGCCTCATCAAC--AGACAAGCTT-GG--TTACTAAGGATCAAGTTAGAA--AATGTT-GCA--AATGCGGTTC-TGAA---AAG---CACCTTAAAAGGGACT-GCCCGCAATGGAG-CAAAGAATTGG-AACTCCG-TAGCAATTCAAAAGAG-AATAAACACAAGGGGACTGATGCAGCTCGTAA--------TGACC-AATATATT-CTAGAGAGTAGTGCATTTGCCATAAA---CAAGAAAGGGGTTAATACTGTTCACGCGACA-CAAGTATCATTTTGAGAATGGAAT-G-TT-TATTTACCTGTTA-GTTGGTGATTGGTACGA-GG-G-----C-----TGC-ATTTACG--TGGT---------CCTT------GGGT-CACAG-GTCAA-TCCTT-GAC--AAA---GGTAGAGAGAGATGTTCTATCAGC-TAGTGG-ATCA--CCGCTAAATGTACTGGGG---AAAGTTCGAGTAGATT-TAAA-GCTGG-ACAACATTGC--ATTAAA---GC-AT-GAAA--TGGTCATAGC
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|26 ): GTAACGAATTGAGATCGGATTTGGAAGCATTATATATCGATTATCTAGAGGAAAAGGCAAATATGACGAAAAACGCTTATGTCAACCGGACTTTGGTGTAGAGTATCACGAT
Unaligned ( gi|29 ): TGTAACGAATTGAGATCGGATGTGGAAGCATTATATATCGATTATCTAGAGGAAAAGGCAAATATGACGAAAAACGCTTATGTCAACCGGACTTTGGGTGTA
Unaligned ( gi|31 ): AATTTTGGTGGCAGCAACGGGATTTGGATCGGTCAGNTCAATAAGTTTGTTAATAGACAGAAGAGTGAACAATAATAATATATAAGTTACTCGGCTAG
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 1 22 111 2222222222 1 11 1 11 222222 222 4444444444 1 111 1 1 111 111 1 11 11 111 1 111 11 22 111 11 111 11 1 1 11 1 1 2222 1111 11 1111 11 111 33333333 1111111 11 11 111 333333333333333333 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 11111 2222222222 111 11111111 11 111111 11 111 111111 11 11111111111 11 1 1 11 222222222 11 11 11 111111 11 111 111 1111 1111 11111 11 11 111 1 1 11 1 1 11 11 1 11 11 222222 222 11 1 1 11 111 111 11 2222 11111 11 111 11 111 1 11 333333333 1 1 11 222222 11 1 2222222222222 11 111 1 1 11111 11 111 1 1 1 111 222 1 2222 11 11 222222 1 222 1 11 1 1 333333 1 333 1 1 1 22 1 1 1 1 3333333 1 1 111 111 11 1 111 1 11 111 444444444 111 444444444444444 1111111 22222 1111 1111 11 111 11 33333333 11 11 1 1 111 11 1 1 1 1 1 1 1 1 11 1 1 111 111 1 1 444444444 11 2222 1 1 4444444444444444444 22 22 1 11 3333333 111 111 1 222 11 111 1 11 111 888888888888888888888888888888888888 11 222222 111 11 1 111 111 1111 111 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1 1111111111111 111 111111 11111 5555555555555555555555555555555555555555555555 111111 111111 2222222222 33333333333 11 111 11 11 11111 22222 11 1 111 666666666666666666666666 111 11 3333333333333333333 1 555555555555555555555555555555555555 11 333333333333 11 1111 22222 1 1111 2222 2222 2222222222 11 11 222 1111111111 33333333333333333333333333 11111 11 111 111 1 111111 111111 1 11111 111 11111
lowQualScore : 7 3 6 3 00 6 6 666 6 3 2 7777777777 0 33 666 0 33 0 666666 000 1 2 6666666666 0 777 0 0 0 111 88 3 3 3 2 2 666 0 33 33 222 3 0 111 33 33 55 111 66 777 33 3 0 5 2 33 0 0 2 2 5555 8 8 0 5555 11 0000 99 5 000 5 33333333 44 6666666 33 9 9999 66 66 55 5 1 66 1 4 0 1 2 111 000000000000000000 4 4 7777 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 8 55 44444 0 1 3333333333 888 99999999 00 4 4 66 222222 4 1 11 666 88 4 4 3 111111 4 88 11 11111111111 55 4 0 33 4 2 1 1 4 0 5 777 44 1 6 77 5 1 1 77 0 5 0 8 6 33 333333333 11 11 11 666666 5 8 11 1 1 5 8 5 888 111 6 1 222 888 6 8 8 0 6 7777 6 3 4444 0 55555 11 0 3 8 1 11 777 0 5 88 0 333 2 3 3 0 33 33 0 3 3 8 33 3 3 2 11 0 0 555555 6 777 11 0 5 99 1 8 444 444 0 0 8 8 3 8 8 0 0 8 3 55 999 11 9999 88888 0 11 444 11 8 777 0 33 888888888 2 0 3 0 33 8 88 8 8 666666 0 0 0 33 0 5 8 8 8 8 8 5555555555555 8 8 11 0 777 2 2 0 0 55555 33 777 0 0 0 888 3 555 3 4444 88 7 2 33 8 333333 0 000 0 33 3 0 66 0 6 888888 7 7 1 3 000 3 3 3 7 44 6 6 6 2 7 3 3 3 0000000 6 2 3 111 444 7 33 0 777 0 3 33 777 000000000 66 3 111 333333333333333 9999999 88888 8 8 7777 6 4444 1 6 0 8 33 777 22 11 0 8 33333333 88 6 99 6 99 6 99 2 8 11 3 2 3 0 2 3 3 2 0 666 22 0 9 0 0 0 2 0 0 2 0 3 3 2 0 55 5 0 3 88 0 3 0 3 2 3 3 0 6 2 3 111 555 3 2 0 0 9 2 2 0 6 000000000 33 1111 0 0 8888888888888888888 33 33 5 2 11 2222222 777 6 111 2 2 55 2 0 888 99 111 8 8 6 222 55 8 8 0 8 0 77 0 1 8 0 6 1 99 6 6 6 3 99 6 3 1 5 5 1 00 5 5 2 77 1 1 3 333 2 1 333333333333333333333333333333333333 99 00 44 000000 7 6 99 111 6 6 6 6 1 55 6 99 99 2 000 333 0 2222 1 000 1 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 5 888 66 0 66 5 5 5 9999999999999 1 111 5 666666 22222 5 888 66 4444444444444444444444444444444444444444444444 55 9 1 33 777 888 888 66 5 222222 66 77 5 444444 5 888 5 2 5 66 5 9999999999 00000000000 5 33 5 333 33 33 99999 55555 66 33 0 777 888888888888888888888888 0 5 777 5 00 5555555555555555555 0 44 0 5 000000000000000000000000000000000000 33 111111111111 77 66 5 7777 5 5 22222 0 5 5 8888 5 5 8888 8 66 66 3333 0000 5555555555 777 22 66 8 000 55 8888 777 8 4 4 4 4 4 4 55 4 7777777777 99999 4 4 00000000000000000000000000 55 777 0 55 777 99 99 00000 11 999 5 333 55 66 999999 888 5 0 888 777777 666666 5 0 5 77777 222 00000 66 66
lowQualScore : . . . . .. . . ... . . . .......... . .. ... . .. . ...... ... . . .......... . ... . . . ... .. . . . . . ... . .. .. ... . . ... .. .. .. ... .. ... .. . . . . .. . . . . .... . . . .... .. .... .. . ... . ........ .. ....... .. . .... .. .. .. . . .. . . . . . ... .................. . . .... .................................................................................... . .. ..... . . .......... ... ........ .. . . .. ...... . . .. ... .. . . . ...... . .. .. ........... .. . . .. . . . . . . . ... .. . . .. . . . .. . . . . . .. ......... .. .. .. ...... . . .. . . . . . ... ... . . ... ... . . . . . .... . . .... . ..... .. . . . . .. ... . . .. . ... . . . . .. .. . . . . .. . . . .. . . ...... . ... .. . . .. . . ... ... . . . . . . . . . . . .. ... .. .... ..... . .. ... .. . ... . .. ......... . . . . .. . .. . . ...... . . . .. . . . . . . . ............. . . .. . ... . . . . ..... .. ... . . . ... . ... . .... .. . . .. . ...... . ... . .. . . .. . . ...... . . . . ... . . . . .. . . . . . . . . ....... . . . ... ... . .. . ... . . .. ... ......... .. . ... ............... ....... ..... . . .... . .... . . . . .. ... .. .. . . ........ .. . .. . .. . .. . . .. . . . . . . . . . ... .. . . . . . . . . . . . . . . .. . . . .. . . . . . . . . . . . ... ... . . . . . . . . . ......... .. .... . . ................... .. .. . . .. ....... ... . ... . . .. . . ... .. ... . . . ... .. . . . . . .. . . . . . . .. . . . . .. . . . . . . .. . . . .. . . . ... . . .................................... .. .. .. ...... . . .. ... . . . . . .. . .. .. . ... ... . .... . ... . .......................................................................................................... . ... .. . .. . . . ............. . ... . ...... ..... . ... .. .............................................. .. . . .. ... ... ... .. . ...... .. .. . ...... . ... . . . .. . .......... ........... . .. . ... .. .. ..... ..... .. .. . ... ........................ . . ... . .. ................... . .. . . .................................... .. ............ .. .. . .... . . ..... . . . .... . . .... . .. .. .... .... .......... ... .. .. . ... .. .... ... . . . . . . . .. . .......... ..... . . .......................... .. ... . .. ... .. .. ..... .. ... . ... .. .. ...... ... . . ... ...... ...... . . . ..... ... ..... .. ..
lowQualScore : 3 3 7 3 00 7 7 000 7 2 5 8888888888 0 88 000 0 88 2 555555 222 2 5 0000000000 0 555 8 0 0 000 88 2 2 2 5 5 222 0 88 88 222 2 0 000 88 88 88 000 55 555 88 2 0 5 5 88 0 0 5 5 0000 0 0 8 4444 00 0000 00 7 000 7 33333333 44 7777777 88 4 0000 99 99 11 0 0 99 9 4 7 0 6 777 111111111111111111 4 4 9999 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 9 66 22222 9 0 7777777777 777 11111111 66 4 6 11 888888 4 8 00 555 33 7 4 6 222222 4 00 00 22222222222 55 0 7 77 0 7 0 0 4 9 3 111 66 0 6 99 7 0 4 99 1 0 4 9 6 00 222222222 00 00 00 666666 0 0 22 0 0 0 0 6 777 333 7 0 555 333 4 0 0 8 0 0000 0 8 8888 8 66666 00 8 2 0 4 00 555 0 5 88 0 555 5 2 2 0 22 88 0 2 2 8 88 2 2 5 00 8 8 666666 4 000 00 0 8 00 0 0 000 000 8 8 0 0 2 0 0 8 8 0 2 88 000 00 6666 22222 8 00 000 00 0 555 0 88 888888888 5 0 2 0 88 0 88 0 0 444444 8 8 8 66 6 6 0 0 0 0 0 0000000000000 0 0 00 8 555 5 5 0 0 88888 88 555 0 0 0 000 2 777 3 0000 33 3 5 88 8 555555 0 555 0 88 2 0 88 0 5 333333 3 3 0 3 333 3 3 3 3 00 7 7 7 0 3 3 3 3 3333333 7 0 3 000 000 0 88 0 555 0 2 88 555 222222222 55 2 000 000000000000000 0000000 00000 0 8 0000 7 2222 0 7 8 0 88 555 44 00 8 2 22222222 33 7 22 7 22 7 22 5 0 00 2 5 2 0 5 2 2 5 0 222 00 0 8 2 2 0 5 0 0 5 0 2 2 5 0 88 5 0 2 00 2 2 0 2 5 2 2 0 5 0 2 000 888 2 5 0 0 2 5 5 2 5 000000000 88 2222 0 0 0000000000000000000 88 22 0 5 00 5555555 555 5 000 5 5 88 5 0 222 22 888 0 0 0 222 88 0 0 6 0 8 88 8 0 8 8 7 0 22 7 7 7 5 22 7 5 0 7 7 3 00 7 7 3 99 4 3 2 000 5 0 333333333333333333333333333333333333 22 22 55 222222 3 7 22 777 7 7 7 7 0 88 7 22 22 0 000 333 6 1111 7 777 7 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 0 222 99 0 00 0 0 0 5555555555555 0 111 0 999999 55555 0 888 99 8888888888888888888888888888888888888888888888 88 4 0 55 999 888 000 99 0 555555 99 11 0 444444 0 888 0 2 0 99 0 0000000000 00000000000 6 88 1 444 88 88 44444 00000 99 88 0 555 888888888888888888888888 9 0 555 0 11 9999999999999999999 0 22 1 6 888888888888888888888888888888888888 88 555555555555 55 99 0 5555 0 0 22222 0 0 0 4444 0 0 9999 9 11 11 3333 2222 1111111111 888 22 77 0 444 55 5555 000 0 0 0 0 0 0 0 55 0 5555555555 88888 0 0 55555555555555555555555555 55 000 8 55 000 55 55 00000 00 000 0 888 11 99 666666 888 0 0 888 444444 444444 7 0 0 55555 000 99999 99 99
consensus : AGAGAGAGAATACATGA-TTCGTTA-CGGG-TCCTGAACTCTTCTAGGAGCATGC-GTCCCATAGCCCGAGACCCATACCAGG---TAT----GA-GT--ACCAGT-ACC--CCGTATGTA---AGAG--CAAGAGAGAG-------AG-TGTAA-GTGG---ATAT-TT-AGTG-A-TGA-ATGCATGTGTACATGATGAGAGAGGTACTCGTCCCGC--ATCAAGAGTTACTA-GTCCC--GT--ATCGNGAGT-TACTCGTCTCGCA-T-CGAA--CAA--CAGACTGATGCCAGAG-A-TAC-GTC---CCAGGAT--GGATG-CAAACCTGCATGGACAGA--TCCGGTCTA-AG-CCCGAAACTTCGT----AAA-CCA-GCGACATA---TGATGGTACG--GGTCTCTGG-GAAGATTA--CTTGTC-GCATT---TC-GA---G-T--GCGTGT----CTACT--GAATGAGTGG--A-CAG--AC--ANTGA-GAAAGGTNT--ATACTTGG-CTGCGTCNCTNAGGGGNACAAGCACAAGG--AG-----------T-NTTAG-GAAA-TCAG---C------C-----A----------A--G-------------A--A-----TNATTGGA-----------AGCTA-----------GT-TAAAGC-CCTT---CGGGGNA----GA----TTTGCT-TCCAG-T------AAA--CCAG-ACTGAGCT--AT------A-TAGAGCACAGCT--GAGA---GAGAAAGGAGGC-AAAAG-----GCATCT-GAA-AGTT--TGCCGGAG--C--T----GGGT--C-AAGACGTAAGAA-GGCTNGCNAA-TCTAGCNTACCC--NACC-GCTCCNGATGAGGT--AAGAG-AAACNC-TTG--CTACAGGAGCAGTTCTTNGATGG-ACTACGNAGT-T-CA--GAG--AT--GCG-TC--TCAAG-ATC-AAACAGGCAAGACCTGTAAACCTGAAT-GATGCGATACGGAG-A-GCC--GTT-GAACTGGANGCATAC-A-AC-A-GGCCAGAGGA-GTCGCCG-GATAGATGCT----GTAAGAGTCA--T-GAGTGGAAGT-T--CTA--CAGAACCGTC-CAGAG--AAAACAAACTCGAT---CGAT-CATAGAGACTG-AGAAA-AGAATATGCGCTCTCTACAGC-GAGA-TATT--AAGGAT-TTGAAACAATGGAAGTTTCAGTCACAGGGTCAA--GGACGTATGCCTCATCAAC--AGACAAGCTCGGG--TTGCTAAGG-TCAAGTTAGAA--AATGTTAACA--AATGCGGTTC-TGAA---AAG---CACCTTAAAAGGGACT-GCCCGCAATGGAG-CAAAGAGTTGG-AACTCCG-TAGCAATTCAAAAGAG-AATGAACACAAGGGGACTGATGCAGCTCGTAATGCATC--TGACC-A--ATATT-CT--AGAGTAGTGCATT--CCATAAA---CGAGAAAGGGGTT--TA-TGT---CACGGCA-C--GTATC--------CATGGAAT-GATG-TA--TACCTGTTG-GTTGAT-ACAGGCGCTA-CG-G-----CGTCCTTGCTATCTACAATTTGTTA-TGAGAACATTTGC-AAGGGT-CACAG-GTCAA-TCCTT-GAC--AAG---GTCGGAGAGAGATGTGCTATCAGC-TAGTGG-ATCA--CCGCTAAAGGTACTGGGA---AAAGTTCCAGTAGATT-TAAA-GTTGG-A-GACATTGC--GTTAAA---GC-AT-G-AA--CGGTCATAGCT--TGACCTA-ACAGTGGATGGGA--TCTT--GGATTAGATTTCCTGGTTAAGCATG--AGGCAGTAAT-CG---AC-ATGCGCATGCATA-GA-TAAAAA--TATCTGGC-ACGGAGCAC-CCTATCAAGCTGGAAGGGTTGC------AACCTCATANAAGGTAG-CCAC--CTTT-CATG-GA-GTCACGGATACCACCTAGATCGGAAGCTGATGGTA-GAAGGAG-AGATACGT-ACTAGGATC--GGATGGAGGACTCTCAGCC-AAGC-T-GAATA-TGATA--AA-GCATT---C-GGAAA--AGT---TTCAGAAG-----CCGGGTTCTTGTT-T-GCTGGCC------------A--AAACACCTG--T----CCGT-----ACA-CAGAAGNACA----TGC-GACACAAACG----GCCGGATG-CCTCTTC-CAC--ATCATC---ANCGGGAA--TAGTTGAAGATG-A-GACG-GTGACTGGGATGT--AGA-TC--CCG-AA--G-TTCAA--GTTGGGGACGAGGGGGTTGA-GGTCTCAGAGAAGN-GATGGGAGC-AGGGCCATCCTTATCTGGTAGT-GCAGAGCTT-ATTACTAGCCGTG-TTATTCGCAAAAGAACATCTCCAA-TCCTGTCCAGA-C-CTCCAGAAA-AGTCACAAGTCGAGAAGAGGA-AGTGGTACAGTAGGAAG-TGTGTAGATGTGCCGGTAT-TCAGACAGTCACGTTTGAGCC-CATCCGAGTG-A-CAAG-TCAGCAGAAATGGTGGGTCAG-GGT-ACTCAGACAGAAGGATACCGTCGA---------CG--GGT----CA-AAGA-AG---T-TC--GTCAC--G--GTAT--CAAG-AAACGGACAAAGAGTCA-NGA-------GAAG---GAAGAAT-T-TTCCGTAAGATGTAGACGGAT-AT-ACAGC-GCAT--A-CTGT-AACATTAAAAGACC-GTT-GTT-TTATTGCGCTTGACNTTNGCAATT-TANTGCA--T-GTTCA-A-CTTTCAGTCACCAGGG--GA-GTGCGA-AGAATT-CATTATTCAT-CTT-G-TACA--TTTTTTTTCATGTT-TGCTCAC---TCT---------------CAT---------C-TGTTTTG--AA-AAAAGATTAAGAT---T--ATCAT-GTATA--TT---TTA-TCATGT-GA-GGA-CACATGANG--CATAGA-G--GCGTG--GGTAAGTGTGA---CAA--TTAGAGG----TCGGGGT-CGGGGATG--GGTT-CGT----CATGT--AT-C-------A----GAT-G--C-----CT--TAAA----T-------AT---------GTT-----------CG---------GG-TG--T--TATT-GT-NGG-GC-A-T--T----AT-G--ANA--GCA-T----C-CGAG-----GG-TAGT---TCG--GGTG-T----C-AGC-GGTACT-AT-A-ATA---G-G-C-GTGA------TCT-GCTGANATTTCG--NC---AGTTCAG--CTGT--GGAG-CTC--G--AC--GAGAAGAA-GA------C-GG---T-GATA-AA--GG-TAC---TA--A--TATATAATA------C---GGGCG--TGTATTATA--ATATT--CAG--TATA-----CGGTG-----G--CTA--GTGTACTGG-TC---TG----CGAG--AATAGT-AATAA--AGTATTTC-C---AG-GTTTA-AAGTGT-C-A-----GA--TC-G--GTCC-GGNTATAGGGA---A-AA--T----TA---ATA---GACGAG-----CACCTGTCCGG--TATA-----------AGGA-CAG--AA-CT----AG-CAT-AGG-----GCACAGA-CAAG-C-A---TA-G-GTC---CC-A--G--C----CTTA---CGCA-------CA-CC---AT--ACC--TT-AGGTC--T--CT----A---T-GC-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-AT----------AGG-T---AATC-C-TGT-----A----TA---A------TAT-TATCTGT--AT---ATAT--TG---AC--TCG--TT-----ATTTT--TAATAG---TGTTCA-TA---TTT-TGCAT--TC---A--TTC---ATT-GATAAT-C---AT-C---ATGC------C-CCAG-A-CTG-----GT-C-CG---A-ATCA--ACGAAC--CTAAACAC
Reference ( family-5610 ) : AGAGAGAGAATACATGA-TTCGTTA-CGGG-TCCTGAACTCTTCTAGGAGCATGC-GTCCCATAGCCCGAGACCCATACCAGG---TAT----GA-GT--ACCAGT-ACC--CCGTATGTA---AGAG--CAAGAGAGAG-------AG-TGTAA-GTGG---ATAT-TT-AGTG-A-TGA-ATGCATGTGTACATGATGAGAGAGGTACTCGTCCCGC--ATCAAGAGTTACTA-GTCCC--GT--ATCGNGAGT-TACTCGTCTCGCA-T-CGAA--CAA--CAGACTGATGCCAGAG-A-TAC-GTC---CCAGGAT--GGATG-CAAACCTGCATGGACAGA--TCCGGTCTA-AG-CCCGAAACTTCGT----AAA-CCA-GCGACATA---TGATGGTACG--GGTCTCTGG-GAAGATTA--CTTGTC-GCATT---TC-GA---G-T--GCGTGT----CTACT--GAATGAGTGG--A-CAG--AC--ANTGA-GAAAGGTNT--ATACTTGG-CTGCGTCNCTNAGGGGNACAAGCACAAGG--AG-----------T-NTTAG-GAAA-TCAG---C------C-----A----------A--G-------------A--A-----TNATTGGA-----------AGCTA-----------GT-TAAAGC-CCTT---CGGGGNA----GA----TTTGCT-TCCAG-T------AAA--CCAG-ACTGAGCT--AT------A-TAGAGCACAGCT--GAGA---GAGAAAGGAGGC-AAAAG-----GCATCT-GAA-AGTT--TGCCGGAG--C--T----GGGT--C-AAGACGTAAGAA-GGCTNGCNAA-TCTAGCNTACCC--NACC-GCTCCNGATGAGGT--AAGAG-AAACNC-TTG--CTACAGGAGCAGTTCTTNGATGG-ACTACGNAGT-T-CA--GAG--AT--GCG-TC--TCAAG-ATC-AAACAGGCAAGACCTGTAAACCTGAAT-GATGCGATACGGAG-A-GCC--GTT-GAACTGGANGCATAC-A-AC-A-GGCCAGAGGA-GTCGCCG-GATAGATGCT----GTAAGAGTCA--T-GAGTGGAAGT-T--CTA--CAGAACCGTC-CAGAG--AAAACAAACTCGAT---CGAT-CATAGAGACTG-AGAAA-AGAATATGCGCTCTCTACAGC-GAGA-TATT--AAGGAT-TTGAAACAATGGAAGTTTCAGTCACAGGGTCAA--GGACGTATGCCTCATCAAC--AGACAAGCTCGGG--TTGCTAAGG-TCAAGTTAGAA--AATGTTAACA--AATGCGGTTC-TGAA---AAG---CACCTTAAAAGGGACT-GCCCGCAATGGAG-CAAAGAGTTGG-AACTCCG-TAGCAATTCAAAAGAG-AATGAACACAAGGGGACTGATGCAGCTCGTAATGCATC--TGACC-A--ATATT-CT--AGAGTAGTGCATT--CCATAAA---CGAGAAAGGGGTT--TA-TGT---CACGGCA-C--GTATC--------CATGGAAT-GATG-TA--TACCTGTTG-GTTGAT-ACAGGCGCTA-CG-G-----CGTCCTTGCTATCTACAATTTGTTA-TGAGAACATTTGC-AAGGGT-CACAG-GTCAA-TCCTT-GAC--AAG---GTCGGAGAGAGATGTGCTATCAGC-TAGTGG-ATCA--CCGCTAAAGGTACTGGGA---AAAGTTCCAGTAGATT-TAAA-GTTGG-A-GACATTGC--GTTAAA---GC-AT-G-AA--CGGTCATAGCT--TGACCTA-ACAGTGGATGGGA--TCTT--GGATTAGATTTCCTGGTTAAGCATG--AGGCAGTAAT-CG---AC-ATGCGCATGCATA-GA-TAAAAA--TATCTGGC-ACGGAGCAC-CCTATCAAGCTGGAAGGGTTGC------AACCTCATANAAGGTAG-CCAC--CTTT-CATG-GA-GTCACGGATACCACCTAGATCGGAAGCTGATGGTA-GAAGGAG-AGATACGT-ACTAGGATC--GGATGGAGGACTCTCAGCC-AAGC-T-GAATA-TGATA--AA-GCATT---C-GGAAA--AGT---TTCAGAAG-----CCGGGTTCTTGTT-T-GCTGGCC------------A--AAACACCTG--T----CCGT-----ACA-CAGAAGNACA----TGC-GACACAAACG----GCCGGATG-CCTCTTC-CAC--ATCATC---ANCGGGAA--TAGTTGAAGATG-A-GACG-GTGACTGGGATGT--AGA-TC--CCG-AA--G-TTCAA--GTTGGGGACGAGGGGGTTGA-GGTCTCAGAGAAGN-GATGGGAGC-AGGGCCATCCTTATCTGGTAGT-GCAGAGCTT-ATTACTAGCCGTG-TTATTCGCAAAAGAACATCTCCAA-TCCTGTCCAGA-C-CTCCAGAAA-AGTCACAAGTCGAGAAGAGGA-AGTGGTACAGTAGGAAG-TGTGTAGATGTGCCGGTAT-TCAGACAGTCACGTTTGAGCC-CATCCGAGTG-A-CAAG-TCAGCAGAAATGGTGGGTCAG-GGT-ACTCAGACAGAAGGATACCGTCGA---------CG--GGT----CA-AAGA-AG---T-TC--GTCAC--G--GTAT--CAAG-AAACGGACAAAGAGTCA-NGA-------GAAG---GAAGAAT-T-TTCCGTAAGATGTAGACGGAT-AT-ACAGC-GCAT--A-CTGT-AACATTAAAAGACC-GTT-GTT-TTATTGCGCTTGACNTTNGCAATT-TANTGCA--T-GTTCA-A-CTTTCAGTCACCAGGG--GA-GTGCGA-AGAATT-CATTATTCAT-CTT-G-TACA--TTTTTTTTCATGTT-TGCTCAC---TCT---------------CAT---------C-TGTTTTG--AA-AAAAGATTAAGAT---T--ATCAT-GTATA--TT---TTA-TCATGT-GA-GGA-CACATGANG--CATAGA-G--GCGTG--GGTAAGTGTGA---CAA--TTAGAGG----TCGGGGT-CGGGGATG--GGTT-CGT----CATGT--AT-C-------A----GAT-G--C-----CT--TAAA----T-------AT---------GTT-----------CG---------GG-TG--T--TATT-GT-NGG-GC-A-T--T----AT-G--ANA--GCA-T----C-CGAG-----GG-TAGT---TCG--GGTG-T----C-AGC-GGTACT-AT-A-ATA---G-G-C-GTGA------TCT-GCTGANATTTCG--NC---AGTTCAG--CTGT--GGAG-CTC--G--AC--GAGAAGAA-GA------C-GG---T-GATA-AA--GG-TAC---TA--A--TATATAATA------C---GGGCG--TGTATTATA--ATATT--CAG--TATA-----CGGTG-----G--CTA--GTGTACTGG-TC---TG----CGAG--AATAGT-AATAA--AGTATTTC-C---AG-GTTTA-AAGTGT-C-A-----GA--TC-G--GTCC-GGNTATAGGGA---A-AA--T----TA---ATA---GACGAG-----CACCTGTCCGG--TATA-----------AGGA-CAG--AA-CT----AG-CAT-AGG-----GCACAGA-CAAG-C-A---TA-G-GTC---CC-A--G--C----CTTA---CGCA-------CA-CC---AT--ACC--TT-AGGTC--T--CT----A---T-GC-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-AT----------AGG-T---AATC-C-TGT-----A----TA---A------TAT-TATCTGT--AT---ATAT--TG---AC--TCG--TT-----ATTTT--TAATAG---TGTTCA-TA---TTT-TGCAT--TC---A--TTC---ATT-GATAAT-C---AT-C---ATGC------C-CCAG-A-CTG-----GT-C-CG---A-ATCA--ACGAAC--CTAAACAC
gi|1 : AGAGAGAGA-TACATGA-TTCGTTA-CGGG-TCCTGAATTCTTCTAGATGCATGC-ATCCCATAGCCCGAGACCCATAACAGG---TAT----GA-GT--ACCAGT-ACC--CCGTATGTA---AGAA--CAAGAGAGAG----------TGTAA-GTGG---ATATGTT-AGTG-A-TGA--TGCATGTGTACATGATGAG-GAAGTACTCGTCCCGA--ATCAAGATTTACTA-GTCCC--GT--ATCTCG--T-TACTCGTCTCGCA-T-CGAA--CAA--CAGACTGATGCCAGAG-AATAC-GTC---CCAGGAT--GGATGGCAAACCTGCATGGACAGA--TCCGGTCTA-AG-TCCGAAACTTCGT----AAA-CCA-GCGACATA---TGATGGTACA--GGTCTCTGG-AATGATTAA-CTTGTC-GCATT---TC-GA---G-TATGTGTGT----CTACT--GAATGAGTGG--A-CAG--AT--ATTGA-GAAAGGTTT--ATACTTG--CTGCATCTCTTAGGGGAACAAGCACAAGGG-AG-----------T-ATTAG-GAAA-TCAG---C------C-----A----------A--G-------------A--A-----TTATTGGA-----------AGCTA-----------GT-TAAAGC-CCTT---CAAGGTA----GA----TTTGCT-TCCAG-T------AAA--TCAG-ACTGAGCT--AT------A-T-GAGCACAGCT--GAGA---GAGAAAGGAGGC-AAAAG-----GCATCT-GAA-AGTT--TGCCGGAG--A--T----GGGT--C-AAGACATAAGAA-GGCTTGTTAA-TTTAGCCTACCC--CACC-GCTCCTGATGACGT--AAGAG-AAATAC-TTG--CTACAGAAACAGTTCTTGGATGG-ACTACATAGT-T-CA--GAG--AT--GCA-TC--TCAAG-ATC-AAACAGGCAAGACCTGTAAACCTGAAT-GATGCGATACAGAG-A-GCT--GTT-GAACTGGAAGCATACAA-AC-A-GGGCAGA-GA-GTCGCCG-GATAGATGCT----GTAAG-GTCA--T-GAGTGGAAGT-T--CTA--CAGAACCGTC-CAGAG--AAAACAAACTCGAT---CGAT-CATAGAGACTG-AGAAA-AGAAT-TGCGCTCTCTCCAGC-GAGATTATT--AAGGAT-TTGAAACAATGGAAGTTTC-GTCACAGGGTCAA--GGACGTATGCCTCATCAAC--AGACAAGCTC--G--TTACTAAGA-TCAAGTTAGAA--AATGTTAACA--ATTGCGGTTC-TGAA---AAG---CACCTT-AAAGGGACT-GCCCGCAATGGAG-CAAAGAGTTGG-AACTCCA-TAGCAATTCAAAAGAG-AATGAACAAAAGGGGACTGATGCAGCTCGTAATGTATC--TGACC-----TATT-CC--AGAGTAGTGCATT--CCATAAA---CGAGAAAGGGGTT--TA-TGT---CACGGCA-C--GTATC--------CATGGAAT-GATG-TA--TACTTGTTGTTTTGA--ACAGGCGCTA-CG-G-----TGTCCTTGCTATCTACAATTTGTTA-TGAGAACATTTGC-AAGAGT-CACAG-GTCAA-TCCTT-GAT--AAG---GTCGGAGAGAGATGTGCTATCAGC-TAGTGG-ATCAACCCGCTAAAGGTACTGGGA---AAAGTTCCAGTAGATTCTAAA-GTTGGAA-GGCATTGC--GTTGCA---GC-GT-G-AA--TGATCATAGC---TGACCTA-ACAGTAGATGGGA--TCTT--GGATTAGATTTCCTGGTTAGGCATG--AGGCAGTAAT-TG---AC-ATGCGCATGCATC-GA-TAAAAAATTATCTGGC-ACGGAGCAC-CCTATCAAGCTGGAAGGGCTGC------AACCTCATACAAGGTAG-CCA----TTCACATA-GA-GTCAC-AATACCACCTAGATCAGAA-CTAATGGTA-GAAGGAG-AGATACGT-ACTAAGATC--GGATGGAGGACT-TCAGCC-AAAC-T-GAAC--TGATA--AT-GCATT---C-GGAAA--AGT---TTCAGAAA-----CTAGGTTCTTGTT-T-GCTGGCC------------A--AAACACTTG--T----CCGT-----ATA-CAGAAGAATA----TGC-GACACAAACA----GCTGGGTG-CCTCTTC-CAC--ATCATA---AGTGGGAA--TAGTTGAATATGAA-GACA-GTGACTGGGATGT--AGA-TC--CTG-AA--G-TTC-A--GTT-GGGACGAGGGAGTTGA-GGTCTAAGAGAAGT-GATGGGAGC-AGGG-CATCCTTATCTGGTAGT-GTAGAGCTT-ATTACAAGCCGTG-TTATTCGCAAAAGAACATCTCCAA-TCCTGTCCAGA-C-CTCCAGAAA-AGTCATAAGTCGAGAAGAGGA-AGTGGTACAG-AAGAAG-TATGTAGATGTGCTGGTAT-TCAGACAGTC-CGTTTGAGCC-CATCCAAGTGAA-TAAGTTCTGCAGAAATGGTGGATCAG-GGT-ACGCAGACAGAAGGATACCGTCGA---------CG--GGT----CA-AAGA-AG---TATC--GTCA---A--GTAT--CAAGAAAACGGACAAAGAGTCA-TGA-------GAAG---GAAGAAT-TATTCCGTAAGAT-TAGACGGAT-ATAACAGC--CAT--A-CTGT-AACATTAAAAGACC-GTT-G-T-TTA-TGTGCTTGACATTGGCAATT-TAATGCG--T-GTTCA-A-CTTTCAGTCACCAGGG--GA-GTGTGG-AAAATT-CATTATTCAT-CTT-G-TACA--TTTTTTTTCATGTT-TGCTTA-----CT---------------CAT---------TGTGTTTTG--AA-AAAAGATTAAGAT---T--ATCAT-GTATA--TT---TTA-TCATGT-GA-GGA-CACATGCAG--CATAGA-G--GCGT---GGTAA-TGTGA---CAA--TTAAAGG----TCGGGAT-CGGAAATG--GGCT-CGG----AATGC--AT-C-------------AT-G--C-----CT--TAGA----T-------AT---------ATT-----------CG---------GG-TG--T--TATT-GT-TGT-GC-A-T--C----AT-G--AAA--GCA-C----C-CGAG-----GG-TAGT---TCG--GGTG------C-AG--GGTACT-AT-ATATA---G-G-CTGTGA------TCA-GC-GATATTTCG--GC---ACTTCAG--CTGT--GGAG-AT---G--AC--GAGAAGAA-GA------C-GG---T-GATA-AA--GG-TAC---TA--A--TATATAATA------C----GGCG--TGTATTATA--ATATT--CAG--TATA-----CGGTG-----G--CTA--GTGTACTGG-TC---TG-----GAG--AATAG--AATAA--AGTATTCC-C---AG-GTT---AAGTAT-C-A-----GG--T-----GTCC-GGGTAGAGGTATCTATAC--C----TATACATACTTGACAAG-----CACCTGTCCGG--TATA-----------AGGA-CAG--AA-CT----AG-CAT-AGG-----ACACAGA-CAAG-C-A---TA-G-GT----CC-A--G--C----CATA---CGCA-------C--CC---AT--ACC--TT-AGGTC--T--CC----A---T-GC-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-AT----------AGG-T---AATC-C-TGT-----A----TA---A------TAT-TATCTGT--AT---ATAT--TG---AC--TCG--TT-----ATTTT--TAATAG---TGTTCA-TA---TTT-TGCAT--TC---A--TTC---ATT-AATAAT-C---AT-C---ATGC------C-CCAG-A-CTG-----GT-C-CG-----ATCAACACGAAC--CTAAACAC
gi|10 : --AGACAAGTTCAG---CTGCTAAGG----AGTTACAA--AAT--TAAAATTAATGCGGTTC-TGAA---AAG---CACCTTAAAAGGGACT-GTCCACAACGGAT-CAAAGAGTTGG-AACTCCG-TAGCAATTCAAAAGAG-AATGAACACAAAAGGACTGATGCAGGTCGTAATGCATC--TGATC-A--ATATT-CT--AGGGTAGTGCATT--CCATAAA---CGAGAAAGGGGTT--TA-TGT---CACGGCA-C--GTATC--------CATGGAATGGATG-TA--TATCTGTTG-GTTGAT-ACAGGTGCTA-CG-G-----TGTCCTTGCTATCTACAATTTGTTA-TGAGAACA-TTGC-AAGGGT-CACAG-GTCAA-CCCTT-AAC--A--------------AGATGTACTATCATC-TAGTGG-ATCA--CCGCTAACGGT
gi|10 : TCCTGGTTGAGAATG--AGGTAGTAAT-TG---AC-ATGCGCATGCAAAAGA-TAAAAA--TATCTGGC-ATTGAGCAC-CTTATCAAGCTGGAccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcctggttgagaatgaggtagtaattgacatgcgcatgcaaaagataaaaatatctggcattgagcaccttatcaagctgga
gi|11 : agacaagttcagctgctaaggagttacaaaattaaaattaatgcggttctgaaaagcaccttaaaagggactgtccacaacggatcaaagagttggaactccgtagcaattcaaaagagaatgaacacaaaaggactgatgcaggtcgtaatgcatctgatcaatattctagggtagtgcattccataaacgagaaaggggtttatgtcacggcacgtatccatggaatggatgtatatctgttggttgatacaggtgctacggtgtccttgctatctacaatttgttatgagaacattgcaagggtcacaggtcaacccttaacaagatgtactatcatctagtggatcaccgctaacggtccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn----T-------AT----------TT-----------CG---------GG-TG--T--TATT-GT-TGT-GC-A-T--T----ATTG--AAA--GCA-T----C-TGAG-----GG-T-GT---TCG--GGTG------C-AG--GGTACT-AT-A--TA---ACG-CAGTGA------TCA-GC-GATATTTCG--GC---AGTTCAA--CTGT--GGAG-CTA--G--AC--GAGAGAAA-GA------C-GG---T-GATA-AA--GG-TAC---TATAA--T-TATAGAA------C---GG-CG--TGTATTATA--ATATT--CAG--TATA-----CGGTG-----G--CTA--GTGTACTGG-TC---TG-------G--A---------------CATTTC-C---AG-GTTTA-AAGTGT-CGA-----GA--TC-G--GTCC-GGCTATAGAGA---A-TA--T----TA---AGA----ACAAG-----CACCTGTCCGG--TAT------------AGGA-CAGA-AA-CT----AG-CTT-AGG-----ACACAGA-CAAG-C-A---CA-GTGT----CC-A--G--C----CTTA---CGC--------CA-CC---AT--ACC--TT-AGGT---T--CT----A---T-GC-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-AT----------AGG-T---AATC-C-TGTATA--A----TA---A------TAT-TATCTGT--AT---ATA---TG---AC--TCG--TT-----ATTTT--TAATAGT--TGTTCA-TA---TTT-TGCAT--TC---A--TTC---ATT-GATAAT-C---ATAC---ATGC------C-CCAG-A-CTG-----GT-C-CA---A-ATCA--ACGAAC--CTAAACAC
gi|12 : ----T-------AT----------TT-----------CG---------GG-TG--T--TATT-GT-TGT-GC-A-T--T----AT-G--AAA--GCA-T----C-TGAG-----GG-TAGT---TCG--GGTG------C-AG--GGTACT-AT-A--TA---ACG-CAGTGA------TCA-GC-GATATTTCG--GC---AGTTCAA--CTGT--GGAG-CTA--G--AC--GAGA-GAA-GA------C-GG---T-GATA-AA--GG-TAC---TA-----TATATAGAA------C---GG-CG--TGTATTATA--ATATT--CAG--TATA-----CGGTG-----G--CTA--GTGTACTGG-TC---TG-------G--A---------------CATTTC-C---AG-GTTTA-AAGTGT-CGA-----GA--TC-G--GTCC-GGCTATAGAGA---A-AT--T----TA---A-----GACAAG-----CACCTGTCCGG--TATA------------GGA-CAG--AAACT----AG-CTT-AGG-----ACACAGA-CAAG-C-A---CA-G-GTC---CC-A--G--C----CTTA---CGCA-------C--CC---AT--ACC--TT-AGGTT--T--CT----A---T-GC-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-AT----------AGG-T---AATC-C-TGT-----A----TA---A------TA---ATATGT--AT---ATAT--TG---AC--TCG--TT-----ATTTT--TAATAGT--TGTTCA-TA---TTT-TGCAT--TC---A--TTC---ATT-GATAAT-C---ATAC---ATGC------C-CCAG-A-CTG-----GT-C-CA---A-ATCA--ACGAAC--CTAAACACg
gi|13 : -GACAAGAGCA----GCCGGGTG-TCTC--C-CAC--CTCATC---ATGGGGAA--TAGTTGAGAGTG-A-GACAAGTGAGTGG-ATGTTGAGAATC--CTG-GAAGG-TTCAA--GTGTGGGA-GAGGGGGTTGATGGTCTCGGGGAAGA-G-TGGG-GC-AGAACCATGCTT-TCTG-TAGTCGCATAGG------ACT----GTG-TTATACGTTAAAGGAAATCTCAAG-TCCTGTCCAGGCC-CTCCAGAAA-GGTCAC-AGT--GGAAGAGGATAGTGGTA-AGTAGGAAG-TGTGTAGATGGGCGGGTATGTC-GA-AGTCAGGTTTGAGCCGCATCTGAG-A-A-TAAT-TCAGCAG-AATGGT-GGTCAG-AGTAACTCAGACAAAAG---ATCGT-GA---------CG--GGT----CA-AAGA-AG---TCTCCAGTAAC--GACGTATG-CATG--AACGGGCAAGGAGTCA-AGAAATAAACGGAGAGTGAAAGAT-T-TTTGTTTAGATGTAGACGTTTAAT-A-AGCAGCA---A-CTGT-AAg
gi|14 : a-ATGCATGTATATATGATGAGAGAGGTACTCGTCCCGC--ATCAAGAGTTACTA-GTCCC--GT--ATCGAGAGT-TACTCGTCTCGCA-T-CGAA--CAA--CAGACTGATGCCAGAG-A-TAC-GTC---CCAGGAT--GGATG-CAAACCTGCATGGACAGA--TCCGGTCTA-AGCCCCGAAACTTCGTG---AAG-CCA-GCGACATT---TGATGGTACG--GGTCTCTGG-AATGATTA--CTTGGCTGCATC---TC-
gi|14 : TACTTGG-CTGCATCTCTTAGGGG-ACAAGCACAAGG--AG-----------T-GTTAG-GAAA-TCAG---C------C-----A----------A--GGGATGAGAGGCAGA--A-----TTATTGGA-----------AGCTA-----------GT-TAAAGC-CCTT---CAGGATA----GA----TTTGCT--CCAG-T------AAA--TCAG-ACTGAGCT--AT------A-TAGAGCACAGCT--GAGA---GAG--AGGAGGT-AAAAG-----GCATCT-GAA-AGTT--TGCCGGAGATCGAT----GGGT--C-AAGACATAAGAA-GGCTTTTTAA-TTTAGCCTACCC--GACC-Gttaggggacaagcacaaggagtgttaggaaatcagccaagggatgagaggcagaattattggaagctagttaaagcccttcaggatagatttgctccagtaaatcagactgagctatatagagcacagctgagagagaggaggtaaaaggcatctgaaagtttgccggagatcgatgggtcaagacataagaaggctttttaatttagcctacccgaccg
gi|15 : atgcatgtatatatgatgagagaggtactcgtcccgcatcaagagttactagtcccgtatcgagagttactcgtctcgcatcgaacaacagactgatgccagagatacgtcccaggatggatgcaaacctgcatggacagatccggtctaagccccgaaacttcgtgaagccagcgacatttgatggtacgggtctctggaatgatTACT--AAATAAATGG--A-TAGTAAC--A--GA-AATGGGCAT--GCATCTAG-TGGTATCATTGAGTAG-ATAAGCTCAAAG--TG-----------T-CTTAG-GAAA-TCTA---C------CTGAGGG----------A--G-------------A--AAAGTGTAAATACA-----------GGCTGTT---------GTGTAAAGC-AC-----AGGAGGA----GAGGTTTTTAC---CCAC-T------AA---CCAG-ACGGAACT--TT------A-CAGAGCACAGCT--GAGA---GAGAGACGA--C-AGAAA-----GCCACA-GAG-ACAC--TACCGGAA--C--T----GGGA--C-AGGAAATACGGC-GGTTAACGAA-TCTAGCATACCC--CTCA-GCTCCAGTGGAGGT--AAGAG-AGACAC-TTG--C-AAAGGAACAGTTTCTTGATGC-GTTAAGGGA----CA--GGGACAT--GCG-TT--TGAGA-GTC-AAACAGGCGAGACCGGCTGACTTGAAT-GATACTGT-CAGAC-ACGCA--GTA-GAGTTGGATGCATTC----C-A-GGC
gi|16 : a-GCACT---TT-GA-----T--GCCTGT------ACTAGGAA-AAGTGG--AGCAA--AC--AA-GA-AAAAGGAAT--AAATTTCG-CTGTGTCACTAAGAGGT-CAAACACAAGG--AG-----------TCCTTGG-TAAT-TCAT---C------TA----A----------A--G-------------A--A-----GCACTGAACAACTATAATGAACTA-----------GC-CAAAGC-AC-T---CGACGAAC---GA----TTTGCTCTCCCG---------AA--CCAA-ACTGAGCT--AT------A-TCGAGCACAGCTTCGTGAACTGACAAAGAAAGC-TA------------CT-GAA---TTCCTGCCAAAA--C--T----AGGT--C-AAAGTTTCAGAA-GACTGACAAA-TCTAGCATACCC--TACG-GCACCATATGAATT--GAGAG-AAACTCTTTG--TTA-GGGGGCAATT-TTAGATGa
gi|17 : cttgagctcaca-GCACT---TT-GA-----T--GCCTGT------ACTAGGAA-AAGTGG--A-GAA--AC--AA-GA-AAAAGGAAT--AAATTTCG-CTGTGTCACTAAGAGGT-CAAACACAAGG--AG-----------T-CTTGG-TAAT-TCAT---C------T-----A----------AAAG-------------A--A-----GCACTGAC-----------AACTATAATGAACTACGC-CAAAGC-ACT----CGACGAAC---GA----TTTGCTCTCCCG---------AA--CCAA-ACTGAGCT--AT------A-TCGAGCACAGCTTCGTAACT-GACAAAGAAAGC-TA------------CT-GAA---TTCCTGCCAAAA--C--T----AGGT--C-AAAGTTTCAGAA-GAC-GACAAA-TCTAGCATAACC--TACG-GCACCATATGA-AT--GAGAG-AAACTCTTTG--TTA-GGGGGCAATT-TTAGATGctcttggtgagtcaga
gi|18 : cacaGTGT----CTACT--AAATGAGTGGGGA-CAG--AT--ACTGA-GAAAAGTTT--ATACTTGGCCTGCATCTCTTAGGGACA-AAGCACAAGAGCAGTTATTATTATAT-TTTAGAGGAA-TCAG---C------C-----A----------ctcttggtgagtcaga
gi|18 : A-----------ATCTA-----------GT-TAAAAG-CCTTGTACAAGGAATTTAGA----TT-GCC-TC-AG-TCAAGGAAAATTCCAG-GC-GA-CTTTATCTTCTAA-TAGAGCACAGCT--GAGAC--GAGCAGGAAGGCTAAGAGATAATGCATCT-GAA-AGTT----CCGGAG--C--TACAAGCGT--C-AACACCTAAGAA-Gcagtcgaagatccagaaccgatcttctgcgttcgagatccatttttgccacagctaaaatctagttaaaagccttgtacaaggaatttagattgcctcagtcaaggaaaattccaggcgactttatcttctaatagagcacagctgagacgagcaggaaggctaagagataatgcatctgaaagttccggagctacaagcgtcaacacctaagaagcccttagtgtgagactactc
gi|19 : gtgtctactaaatgagtggggacagatactgagaaaagtttatacttggcctgcatctcttagggacaaagcacaagagcagttattattatattttagaggaatcagccacagtcgaagatccagaaccgatcttctgcgttcgagatccatttttgccacagctaaT--TGCCAGAG--C--T----TGGG--C-AGGACATACTCA-GGCTGGCCAA-CCTCGCATATCC--AACT-GCCCCAATTGAGGT--CAGAG-AAACCC-TTG--CCA-AGGAGCAATTCATTGATG---CTCTGAAGG-A-CAGTGAC--AT--GAG-AA--T-ACGCATT-AAACAAGCCAGACCAGTCGACCTGAAT-AATGCTATCCGTCA-T-GCC--GTG-GAGTTGGATGCATTT-A-ACTC-TGCCAAAAGACGTCTCCGTGA-AGA---------TAAAGGTTATTT-GAG-GGAGG-----CTAATCAG--CCATG-CAAAA--CAGACAAAcccttagtgtgagactactc
gi|2 : aaca-A-CTG-----GTACACG---A-ATCA--ACGAAC--CTAA
gi|2 : AGAGCGAGAATACATGAGTTCGTTA-CGG--TCCTGAACT--TCTAGGAGCATGCAGTCCCATAGCCCGAGACCCATAC-AGGAAATA-----GT-GT--ACT--TCACC--CAGTAT-TA---AGA---CAGGAGA-AG-------AG-TGTAA-GTGA---ATGT-TT-AGTGGA-TGAGATGCATGTG-ACATGATGAGAGAGGTACTCGTCC-----ATCAAGAGTTACTA-GTCCC--GTGGATC-CGAGT-TACTCGTCTCGCA-TTCGAA--CAAA-CAGACTGATGCC-GAG-A-TACTATCGATCCAGGAT--GGA-G-CAA-CCTGCATG-ACAGAAATCCGGTCTA-AG-CCCGAAACATCGTTAGAAAA-CCA-GCGAC-TA---TGATGGTACA--GGTCTCTGGTGGAGATTATTCTTGTC-GCATTCGGTCTGA---GAT--GTGTGT----CTACT--GAA-GAGTGG--A-CAG--AT--ATTGATGAAAGGTTT--ATACT--G-CTGCATCTCTTAGGGACAAAAGCACAAGG--A------------T-GT-GG-AAAA-TCAG---C------C-----AGGATAAGGCAA--G-------------A--A-----T-ATTG-A-----------AGCTA-----------GT-TAAAGC-CCTT---CAGGATA----GA----TTTGC--TCCAGTT------AAA--TCAG-ACTGAGC----T------A-TAGAGCACAGCT--GAGA---GAG--AGGAGGC-AAAAG-----GCATCTAGAA-AGTT--TGCCGG-G--A--T----GGGTGCC-AACA---AAGAATGACTTGTTAA-T-TAGC-TCCCCGAAACC-GCTCCTGATGAGGT--AAGGGAAAATAC-TTG--CTACACGAACAGTTTTGAGATGGAACTACATAGTAT-CA--GAG--ATTGACGATC--TCAAA-ATCAAAACAGGCAAGACCTGTAAA-CTGAACAGACGAGTCACGAAGTA-G-C--GTTGGAACT-GAGGCATAC-ATAC-A-GTCCAGAGGA-GTCGCCG-GATAGAAGCT----GT-AGA-TCA--GAGAGT-GAAGT-TTCCTA--CAGAATCGTCACGAAGGCAAAACAAACTCGATTCGTGAT-CAT-GAGACTT-AGAAAGAGA--ATGCGCT-TCTAC--CAGAG--TATT--AAGGATATTGAAACAATGATGATTTCAGCAACAGGGTCAACGGAACGTATGCC-CATCAACAAAGAC-AGCTCAGG--TT-CTAAGG---ATATGAGAAAGAATGTTTACAC-ACTGC-GTTCATGAATCGAAGGATCACTCTAAAAGGTACTGGCCCGCAATGGAGACAAAGA-TTGGTAACTCCGATAGCAATTCAAAAGAA-GGT-AACAAAAGGAGAA-GATGCAGCTC-CGAT--ATCCTTGACCAA--ATATCACA--AGAGTAGT-CA-T--CCATAGAAATCGA-AAAGGGGTT--TA-TGT---CACGGCAGC--GTAT---------CAT-GAAT-GAGGATA--TACTTGTTA-GTTGAT-ACAGGCGCCA-CGCGGAAATCGTCCTTGCTATCTACAATGTGTTAGTGAGAACA-TTGC-AAGAGT-CACAGTGCTAACTCCTTGGACTAAGG---GTC-GAGAAGGATTTGCTATCAGCTTAGTGGCATCA--CCGC-GAATGTACTTGGATATACAGTTCCAGTA-ATT-TAAACGTTGG-A-G-CATTGCAAGTAAAAATGGC-AT-G-AA--GAGTCA-AGCT--TGACCTACACAGTGGATGG-----CTT--GGATT-GATTTCCCTGTTAAGCATAGTGGGCA-TAAT-CATACAC-ATGCGCATACA-G-GATTAAAAA--TATC-GGC-AACGAGCACGCCTATCATACTGGGAAGGTGGTCGGTCGAACCTC-TAAAGGGTAG-CCATGGCTTT-CATGAGACGTC-CAGATACCA-CTAGATCG--AACTG-TGATAGGAAGGAGAAGATACGT-ACTA-GATCGGGGATGGA-GACTCTCAACCAAAGCTT-GAATA-TGA-A--AA-GCATT---CTGGAAA--AAGAAATTCAGAGG-----T---GTTC-TG-T-T-GCTGGCC------------ACGAAAAACCTGGTT----TAGC-----ACA-GAGTAGCACA----TGC-AACACAAA-G----CCCGGATGCCCTCTTC-CAcaacgttaaaattttggtggccagcaacgggatttggatcagtcatttaagtaaaagcattagtattcgtaaaaatgaatgagcaggattacaaagacaagtgtaatcagttagaagggggagatagatcgcctcagagcgagaatacatgagttcgttacggtcctgaacttctaggagcatgcagtcccatagcccgagacccatacaggaaatagtgtacttcacccagtattaagacaggagaagagtgtaagtgaatgtttagtggatgagatgcatgtgacatgatgagagaggtactcgtccatcaagagttactagtcccgtggatccgagttactcgtctcgcattcgaacaaacagactgatgccgagatactatcgatccaggatggagcaacctgcatgacagaaatccggtctaagcccgaaacatcgttagaaaaccagcgactatgatggtacaggtctctggtggagattattcttgtcgcattcggtctgagatgtgtgtctactgaagagtggacagatattgatgaaaggtttatactgctgcatctcttagggacaaaagcacaaggatgtggaaaatcagccaggataaggcaagaatattgaagctagttaaagcccttcaggatagatttgctccagttaaatcagactgagctatagagcacagctgagagagaggaggcaaaaggcatctagaaagtttgccgggatgggtgccaacaaagaatgacttgttaattagctccccgaaaccgctcctgatgaggtaagggaaaatacttgctacacgaacagttttgagatggaactacatagtatcagagattgacgatctcaaaatcaaaacaggcaagacctgtaaactgaacagacgagtcacgaagtagcgttggaactgaggcatacatacagtccagaggagtcgccggatagaagctgtagatcagagagtgaagtttcctacagaatcgtcacgaaggcaaaacaaactcgattcgtgatcatgagacttagaaagagaatgcgcttctaccagagtattaaggatattgaaacaatgatgatttcagcaacagggtcaacggaacgtatgcccatcaacaaagacagctcaggttctaaggatatgagaaagaatgtttacacactgcgttcatgaatcgaaggatcactctaaaaggtactggcccgcaatggagacaaagattggtaactccgatagcaattcaaaagaaggtaacaaaaggagaagatgcagctccgatatccttgaccaaatatcacaagagtagtcatccatagaaatcgaaaaggggtttatgtcacggcagcgtatcatgaatgaggatatacttgttagttgatacaggcgccacgcggaaatcgtccttgctatctacaatgtgttagtgagaacattgcaagagtcacagtgctaactccttggactaagggtcgagaaggatttgctatcagcttagtggcatcaccgcgaatgtacttggatatacagttccagtaatttaaacgttggagcattgcaagtaaaaatggcatgaagagtcaagcttgacctacacagtggatggcttggattgatttccctgttaagcatagtgggcataatcatacacatgcgcatacaggattaaaaatatcggcaacgagcacgcctatcatactgggaaggtggtcggtcgaacctctaaagggtagccatggctttcatgagacgtccagataccactagatcgaactgtgataggaaggagaagatacgtactagatcggggatggagactctcaaccaaagcttgaatatgaaaagcattctggaaaaagaaattcagaggtgttctgttgctggccacgaaaaacctggtttagcacagagtagcacatgcaacacaaagcccggatgccctcttccaa
gi|20 : actggtacacgaatcaacgaacctaacaacgttaaaattttggtggccagcaacgggatttggatcagtcatttaagtaaaagcattagtattcgtaaaaatgaatgagcaggattacaaagacaagtgtaatcagttagaagggggagatagatcgcctcC-T-GAATA-TAACAGTAA-GCATTTTGC-GGAAAGGAGT---TTCAGGAGACGGTCCGGGTTCT-ATTAT-GCTGGCCCGATCATTGGAGA--GAACACCTG--TAATGCTGTTAAACACATCAGAAGCACACCTATGC-AACACAAACGCTTCGC-GGATG-CCTCTCCTCACTAATCATCTATACTGGAAAATTAGT-GAA--TG-A---TG-GTGACTGGGATGT--AGA-TCCTCCGAAA--G-TTCAACGGTTGTGAGCGAGGa
gi|21 : GG-----GCA-AGA-CAAG-CCA---TA-G-GTC---CC-A--G--C----CTTAA--CGCG-------CA-CC---AT--ACC--T--AGGTCG-T--CC----A---T-GC-C-T-TTG-AATAT-TTA--GG-AT----------AGG-T---CATG-C-TGT-----A----TA---A------TAT-TATCTGTTAGT---A-AT--TG---ACT-TCG--TT-----AATTT--TAATAG---TGTTGA-TT---TTTATGCAT--TCAGGA--TTCGCGATT-AAT-AT-C---AT-CTCAATACATTGCAC-TAAG-A-CTG-----GTACACG---A-ATCA--ACGAAC--CTAAcag
gi|22 : CTGGCC------------A--AAAGACTTG--T----CCGT-----ACA-CAGAAGAACA----TGC-TACACAAACA----GCCGGATG-CCTCcaacgt
gi|22 : T--AGA-TC--CTG-AA--G-TTCAA--GTTGGGGACGAGGGGGTTAT-GGTCTCccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntagatcctgaagttcaagttggggacgagggggttatggtctc
gi|23 : ctggccaaaagacttgtccgtacacagaagaacatgctacacaaacagccggatgcctcccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-AGGTTA-T--CT----A---TTGC-CAT-TTG-A-T-T-T-A--GG-AT----------ACA-A---AGTA-C-TG----------------A------TGT-AATCTGT--AT---ATATATTG---GC--TCG--TT-----ATTTTTCTGATAGT--TATTCA-TA---TTT----------------TTT---GCT-GA-AAT-C---AT-A---GTGC------C-GCAGCA-CTGC----GT-C-CG---ATATCA--TC-AAC--CTAAAC
gi|24 : ----AAG-CTA-GCAACAAT---TGATGGTATG--GGTTCCTGG-GTAGACTA--CAAATC-CCATT---TT-GA---G----GCTTGTAGCTCT-TT--GAATCAGTGG--A-CGG--AC--AGGGA-AAAAGGTCT--ATATCTAA-GTGTGTCGCTCA-GAGAACAGGCcgt
gi|25 : AGCTCAAAG---T-----------T-GTTAG-GAAA-TCATACTC------CTGGGGA----------G--G-------------A--AAAGTGTAATTACA-----------GGCTGTT---------GTGTAAAGC-ACT-----GGAGGA----GAGGTTTTTACC--CCAC-T------AAC--GCAG-AC-GAACT--CT------AACAGAGCACAACT--GAGA---tattatacggt
gi|27 : ACGCATACCAGG---TAT----GAAGTTAACCAGT-ACC--CCGTATGTAGACAGAGATCATGAGAGAGATTGCAAAA-TGTAA-GTGGGCCATCT-TC-GTTA-ATTGA-ATGag
gi|28 : gagaacCAGCT--GAGA---GA--AAGCA-GC-AAAAT-----ATATCT-TAAGGGTT--TACCGACG--A--T----GGAT--C-ATCATGTAAAAA-GACTAGTCAA-TCTAGCCAACTC--AATC-TCTCCTGAataca
gi|3 : acagacTGTTG-TTTGAT-TCAGGTGCTAACG-G------GTCCTTGCTATCTACAATTTGTTA--GAGAACATTGGCCAAGGGTTCA-AG-GTCAA-TCCTT-GAC--AAGAGGGTCG-AGAGAGATGTGCTATCAGC-TAGTGG-ATCA--CCGCTAAAGGTAATGGGA---AAAGTT-CAGTAGATT-ATAA-GTGGC-G-GACTTTGC--GTTAAA---GCAATAG-AAATCGGTCATAGCTGATGACTTA-ACAGTGGATTGGAATTCTTTGGGATTAGATTT-CTGGTTAAGCATG--AGGTGTTAATATG---ACAATTCGCTGGCATA-GA-TAAAGA--TATCTGGCAATGAAGCAC-CCTATCAA-CTGGACGGGTTGC------AACC-CATATAAGGTAGTCCAC--CGTT-CATG-GA-GTTACG--TA-CACCTGAATCGGAAGCTGATGGTA-GAAGGAG-AGATACGTGACTAG---T--GGATGGAGGTCATTCAGCC-AAGC-TCGGAGACTGATA--AAGGCATT---C-GG-AA--AGT---TTCAGAA------TTGGGTTCTTGTT-TGGCTGGCC------------A--AAACA-CTG--T----TCGTA----ACA-CAGAAG-ACA----TGCAGA---AAACG----CCCGGA---CCTCTT--CAC--ATCATC---AACGGGAA--TA-TTGAAGATG------T-GTGACTGGGATGTAAAGA-TC--CCG-AA--GTTTCAA--GTTGGGGACGAGGGAGTTGA-GGTCTCAGAGAAGT-GAT-GGAGCTAGGGCCA-CCTTATCTGGTAGT-GCCGAGCTGAATTACTA-CCGTGTTTATTCGC-AAAGAACCTGTCTAA-GTCTGT--AGA-CGCTC--GAAATAGTC-CAAGTCGAGAAGAGGA-AGTGTT-CAGTAGGAAGTTGTG-AGA--TGCCGG--T-TTAGACAATCACG-TTGAGCC-CAT-CAAGTG-A-CA---TCAGCAGAAATGGTGGGTCAGTGGT-AC-CA-ATCGAAAGATAGTGTTGATGGCTCGTGCG--GGT----CATAAGA-AGTCAT-TC--GTCACTAG--GTATTCCAAGCAAAC-AAGAAAGAGTCA-AGA-------GAAG---GAAGAATCT-TTCCGTAAGATGTAG-CGGAT-AT--CAGC-GCCT--A-CTGTAAACATGTCAAGA-C-GTTGGTTGTTATTGGACTTG--CTTGGCAA-T-TAATGCA--T-G-TCA-ACCTTTCAATCACCAGGG--GAGGTG-GA-AGAATC---TTATTCAT--TT-G-TACATTTTTTTTTTCATGTT-TGCTCACAGATCT----------------ATAATCTGGTCC-TGTTTTGATAA-AAAAGATT-AGATTAAT--ATCAT-GTATA--TT---TTATTCATGTCGA-GGA-CAC--GATGCCCATAGA-G--GCG-G--GGTGAATGTGA---C-A--TTAAAGG----TCGGGAT-C--GGATG--GGTT-GGTATTATATGT--AT-C-------A----GATAG--TG----CTAATAAAAGCTC-------AT---------GTC-----------CA---------GACTT--T--TACTAGTAGGG-GC-A-T--TGGCGAT----ATA--ACA-T------CGAGTGGCAGG-TAGT---TCG--GGTG-T----TGAGCAAGTG-T-ATAA-ATA---G-G---GCG-------TCT-GCTGAAATT--G--TC---ACTTCAG--CTGT--GGAGATTCATG--AC--GAGGAGAAGGA------CAGG---T-GATATAAATGG-TCC---TA--GGCTATATTATA------CCAGGAGC---TATGTTATA--ATATT--CAG---ATAAC---CGGTG-----GGTCTA--GTGTACTGGTTC---TGGAC-CCAG---ATAGT--ATGAGTAATATTTCAC---AA-TTTTA-AAGTG--C-A-----AAGTCC-G--GT-C-GGTTATAGAGAGT-A-AATGT----TA-----A---GACAAG-----CACCTGTCCGG--CGTAGT---------AGGATCAGGAAA-CTAA--AG-CAT-AGG-----GATCAGT-AAAG-C-A----A-G-GTC---CC-ACTG--CT---CTTAGTCCGCAAGAGGAGCA-CCTCTAT--A-C--TT-AGGTC--TGCCC----ATCCT-GCTTATATTGCA-T-TATTACCGG-ATTAGCTTACTCAGGCT---AATC-T-TCTAAGCGA----TG---AATAGACTAT-TATCTGT--AT---AT-T--TG---ACCGTCGAATG-----ATTTT--TAATAG---T
gi|30 : tC---CC-A--G--T----CTTA---CGCA--------G-CC---AT--ACC--TT-AGGTT--T--GT----A---T-GT-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-AT----------AGG-T---AATC-C-TAT-----A----TA---A----------TATCTAT--AT---ATAT--TG---AC--TCG--TT-----ATTTT--TAATAG---Ttgt
gi|32 : GA-AGAATT-CATTATTCAT-CTTCG-TACA--TTTTTTTTC
gi|33 : gcatattctacatcaccagggatggattgtttatgtgtgtttgccaTGTGA---CAA--ATTGAGA----TCGGGTT-C-GGGATG-------TGT----CATTT--AT-C-------A----GAT-
gi|4 : atAGAGAGGATACATGG-TT-GTTAACGGGGTTCTGAACTCTTCTAGGA---TGC-G-CCCATAGCC-GAGACCCG-ACCAGG---TGTACTGGA-GT--A--AGT-ACCGACTGAAT------AGAG--AAAGAGAGAG-------AGCTGTAAAGTGG---ATAT-TTTAGTG-A-TGA-ATGCATGTGTACA-GATGAGAGAG---CTCGTCCCGCGCATCAAAGGTTACTAAGTCCCAAGT--AT-GAGAGTATTCTCATCCCGCAAT-CGAAGACAATGCAGACTGATGC-AGATCA-TAC--TC---GATGGATAGGGATG-CAA-CCTGGATGGACAGA--TCCGGTCTATAG-CC---GACTT-GT----AAAACCAAGCGACATACGCTGATGGTACATCGGTCTTTG---AAGATTA--CTTGTT-TCATT---TC-GGTCTG-T--G-GTGT----CT-CT--AAATGA-TGG----CAG---CTTATTGA-GAAAGGTTTTAATACTTGG-CTGAATCTT----GGGGACAAGCACAAGG--AG-----------T---TAG-GAAACTCAG---CAAGGGAT-----A----------A--G-------------GCGA-----TTATTGGA-----------AG-TA-----------GT-TAAAGCGCCTT---CAGA-TA----G-----CTTGCT-TCGAG-T------AAAA-TCAGGACTGAGCT--AT------A-TAGAG-ACAGCT--GA-A---GAGAA-GGAGGC-AAAAG-----GCATCT-GAA-AGTT--TGCCGGAG--A--T-----GGT--CAAAGAC-TAAGAA-G--TTGTTAATTTTAACT--CCC--GACCTGCT-CTGATGATGTCAAGGAG-AAATTC-TTGCCCTACAGAAG----TCTT-GATGG-ACTA---AGT-TAAA--GAG--AT--GC--TCTGTCAAG-AT---GACAGGCAAGACCTGTAAAGCT-AAT-GATCGGATACAGAG-A-GCTTGGTT--AACTGGAAGCA-AC-A-CC-AGGGCCAGAAGA-GTCGCCG-GATAGATCCTGTCAGTAAGAGTCA--T-GAGTGGACGTCT--CTA--CAGAA--GTC-CACAG--AAAACAAACTCGAT---CGAT-CAT-GAGAGT---AAAA-AGAATATGCGCTCTC-ACAGC-GAGA-TATTAAAAGGAT-TGAAAAC-ATGGAAGTTTCAGT-ACAGGGTCAA--GGATGTA-GCCTCAT-AAC--AG--AAGAT-GGGATTTGCTAAGG-ATAAGTTAGAC--AAT-TT-ACA--AATGCGGTTC-TGAA---AAG----A--TTAAAAGGG----GCGCG-AATGGAG---AAGAGTTGA-AACT-CG-TAGC-ATTC-AAAGAGCAATGAACACAAGGGGA-TGATGCAGGTCGTAATGCATC--TGACC----ATATT--T--AGGGTAGTGCCTT--CCATAAA---CGAGAAAGGGGTT--TA-agatgtt
gi|5 : tcaagaaactaaacaacgtcgttataaccagcataaattttggtggagaacgagatttgggagtccatgattaattaaaacattagtatctaaaaagatgagcaacggattacacaagaagtaaaccagttgaaagggaatagattgctccCAGGAA--TAGTTGAAGATG-AAGACA-GTGACTGGGATGT--AGA-TC--CCG-AA--G-TTCAA--GTTGGGGACGAGGGGGTTGA-GGTCTCAGAGAAGGAGATGGGAGC-AAGGCCATCCTTATCTGGTAGT-GCAGAGCTT-ATTACTAGCCGTG-TTATTCGCAAAAGAACATTTCCAAGTCCTGTCCAGA-C-CTCCAGAAA-AGTCACAAGTCGAAAAGAGGA-AGTGGTACAG-AGGAAG-TGTGTAGA--TGCCGGTAT-TCAGACAGTCACGTTTGAGCC-CATTCAAGTG-ATCAAG-TCAGCAGAAATTGTGGATCAG-GGT-ATTCAGACAGAAGGATACCGTCGA---------CGTTGGTTAGGCA-AAGACAG---C-T---G-CAC--A--GTAT--CAAA-AAAC-GACCAAGA-TCATCGA-------GAAG---GAA-AAT-T-TTTCGAAA---GTA-AT-GAT-AT-A-AGC-ACATTAA-CTGT-AAT-----AAG--C-GTT-G-T-GTATGGC-CTTGACATT-GCAATT-TAATGCATGT-GTTCA-A-CTTTCAATCACCA-GG--GA-GTGCGA-AGAATT-CATTACTCATGCTT-GATACA----TTTTTTCATG-T-TG-TCAC---TC------------------T---------C-TGTTAT----A-AAAAAACTATAAT---TCAATC-T--TATA---T---TTA-T-ATGT-GAGGGA-CACATGGCG--CGTAGA-G--G-GTG--GGTAGAT-T-A---CAA---TAAAGG----TCGATG---GAGAATGATGGTTGCGT-----ATGT--AT-CATTATCGA----GAT-A--G-----CA--TAAA----TAAGCTTAAT---------GTC-----------CAACC------AG-TGACT--TTTC-GT-AGG-GC-A-TGGT----AT-T--ACA--ATACT----C-CGA-------G-TAGT---TCA--GGTG-T--------T-GAAACTAAT-A-ATA---G-G-C----A------TCT-GCTGATA---CG--TC---ACTTCAG--TTGT--GGAG-ATC--G--AC--GAG-AGAA-GA------C-GG---T-GACA-AA--GG-TAC---T---A--TATATAATA------C----GGCG--TGTATTATA--ATATT--CAG--TATA-----CGGTG-----G--CTA--GTGTACTGA-TA---TG-----GAC--AATAGT-AATAA--AGTATTTC-C---AG-GTTTA-AAGTGT-CAA-----GA--TC-G--GTCC-GGTTATAGAGA---A-AG--T----TA-----A---GACAAG-----CACCTGTCCGG--TATAGGCGGGGGTATAGGA-CAGA-AA-CT----AG-CAT-AGG-----GCAC
gi|6 : AGCTGCAT--ATCTGT-TACTTTAAAAGACCTGTT-GTT-TTATTGTGCTTGACTTTTGTCATTGTATTGCA--TTGTT-A-A-CTTATAGTTA--AGGGAGGA-G-GCGACAAAATTTCCTTATT-AT--TT-G-TGCA--TGCTTTTGC-TGT-------A------T---------------CAT---------C-TGTTTTG--AA--------TAAGAT---T--ATCATTGTATA--TT---TTA-TCATGT-GA-GGA-CA-ATGAAG--GCT-GA-GTCGCGTG--GGTAAGTGTGGCATCAA--TTAGAGA----TCGGGGT-GCGGGAT----GTT-CAG----CATATTAATAT-------A----GAT-G--CTAAATCTA-TAAC----T-------AT---------GCTTTACTGTCAACCG---------GA-CT--TCATATT-GT-AGGAGCTACT--T----AG-GTCATACCACA-TG---CGCGAG-----GGTTAGTACATCGGTGGTA-T----C-AGC-AG--CT-CT-A-ATATATC-G-C-GTGGCAGTATTCT-GCTAGCATTTTGTTTC----GTTCAAATCTGTTGGGAG-CTC--GTCAA--GAGAAGAA-CAAGCAGTC-GGATAC-AATA-AA--GGTTACGG-CA--A--TATATAATATAAATGC---GGGCGTTTGT-TTAT---ACATTGACAGTATATA-----CGGTGCTTACG--CTAAGGTCTATTGA-TCGCGTGCTGTCGAGATAATAAT-AATAA--AGTATCTT-CACAAG-GTTTATAAGTGTAC-ATGAGGGA--TT-GGAGTCCTGGG--TAGGTA---A-GA--TTGCATA---TTA---GAGGAGTACGTCACGTGTCCGGGTTATA-----------GGCA--AC--AA-CT----AG-TAT-GGGCGGTAGCACATATTTAG-C-ATATTA-G-CTC---CCGA--G--CGCTTCTT----CTCA-------CAGCC---ATTAACCAGTTAAGGACATT--CT----A---T-GG-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-CT----------ACA-A---AATCTT-TGT-----ATCTGTAGGCA------TGTATATC-GT--ATTCGAC-T--TG---TC--TCGT-TT-----ATTTT--C----------CTCATTG---TTT-GGCATTATC---A--TTC---ATTAGATAATCC---AT-T----TGC------CGCCAGTATCTG-----GT-T-CGCGCA-ATCA--TCGAAC--CTAA
gi|7 : -TAGTGCT--T-TTCCATA-CTT-CAATC-CCAGGG--AG-AT-CGA-AGAAAT-CATTATTCAT-CT--G-T-CA--TTTT----CATGTTGTCCTCAC---TCTTTTTTACCGGTATTACAT---------G-TATTTTG--AATAAACGATTAATAT---A--ATT-T-GTATAATTTCAATTG-TCATGT-GA-GGAACACATGACGG-CATAGAAG--GCGTGTGGGTAAGTGTGA---CAAACTTGAAGAACAATCGGGTTTCGGCGATG-----T-TGT----CATTT--AT-C-------A----GAT-AGAT-----CT--GACA----T-------ATAA-------GTTTA---------CGTCAACTTCTGG-TA--C--TTTTCGT-AGG-AC-A-TAGT----AG-G--AAA---CA-TGCTCC-CGAG-----GG-TAGT---TCG--GGTG-TTTTTC-A-C-AGTA-T-G--A-ATA---G-GGC-ATAA------TCTTGCTGAGATTTTG--CTCGTAGTTCAT--CTGT--GG-T-CTC------C--GAT--------------C-GA---T-TA-A-AA--AG-TACACGCA--A--TATAATATA------C---GGCTG--TGTATTATTTTATATT---AG--TATATATAACGGTG-----G--TTA--GTATACTGGGTC---TG----CGCA--GATAGTTCGTA----GTAT--C-C---AGAGTTT------GT-A-A-----GA--TCCGT-GTCC-GGGTA-ATG-------AG--C----TA---ATA---G----G-----TACATGTCCGG--TATA-----------AGGA-CAG--AA-CTGTAAAGTCATCAGA-----ACACAGC-CAAGTC-A---TACG-GCCAAACA-A--GCAC----CTTGC--CGAG-------CC-CC---AT--ACCT-TT-AAGTT--T--TTTCCAA---TAGT-CAT-TTG-G-A-T-TTA--GGAAT----------AGG-TGGGAATC-C-C-T-----A----TAAC-A------TAT-TATCTGT--AT---ATAT--TGTCAGC--TCG--TTTTTTAATTTTCCTAATAGCTCTGTTCA-TGTATTTT-TGTAT--TC---ATTTTC---ATT-CATAATGCACGAC-C---ATGT------C-GCCT-A-TTGATTCTGT-C-CG---A-ATCA--AAGAACCACTAAACA
gi|8 : ttaATTAAAAGACC-GTT-GTT-TTATTGTGCTTGACTTTTGCAATT-TATTGCA--T-GTTCA-A-CTTTCAGTTACCAGGG--AG-GAGCGA-AAAATT-CCTTATTCAT-CTT-G-TGCA--TTTTT-----------GCTGAC---TC-----------------AT---------C-TGTTTTG--AA-TAAAGATTA-----------TCAT-GTATA--TT---TTA-TCATGT-GA-GGA-CACATGAGG--CATAGA-G--GCGTG--GGTAA-TGTGA---CAA--ATTGAGA----TCGGGGT-CGGG-ATG-------TAT----CATAT--AT-C-------AAATAGAT-G--C---------TAAA----T-------ATAAAGCTTACGTCAAC--------CG---------GA-CT--T--TATT-GT-AGG-AC-A-T--T----AG-G--ATA--ACA-T----C-CGAG-----GG-TAGT---TCG--GGTGTT----C-AGC-AGTA-T-A--A-ATAC--G-G-C---AA------TCT-GCTGAGATTT-G--TC---AGTTCAA--CTGT--GGAG-CTC--G--ACAAGAGAAGAA-GT------C-GA---TAAAAA-AA--GG-TACGG-CA--A--TATATAATATAAATGC---GGGCGTTTGT-TTAT---ACATTGACAGTATATA-----CGGTGCTTACG--CTAAGGTCTATTGA-TCGCGTGCTGTCGAGATAATAAT-AATAA--AGTATCTT-CACAAG-GTTTATAAGTGTAC-ATGAGGGA--TT-GGAGTCCTGGG--TAGGTA---A-GA--TTGCATA---TTA---GAGGAGTACGTCACGTGTCCGGGTTATA-----------GGCA--AC--AA-CT----AG-TAT-GGGCGGTAGCACATATTTAG-C-ATATTA-G-CTC---CCGA--G--CGCTTCTT----CTCA-------CAGCC---ATTAACCAGTTAAGGACATT--CT----A---T-GG-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-AT----------ACA-A---AATC-CTTGT-----A----T----C------TG--TACATGT--AT---ATAT--TG---AC--TCG--TT-----ATT---------------TTCA-TAT--TTT-TGCAT--TC---A--TTC---A-T-GATAAT-C---A
gi|9 : att-A-GCT--GTT-GAACTGGAAGCATAC-A-AC-A-GGGCAGAG-A-GTCGCCG-GATAGATGCT----GTTGGAGTCA--T-GAGTGGAAGT-T--CTA--CAGAACCGTC-CAGAG--AAAACAAACTCGAT---CGATTCATAGAGACTGTAGAAA-AGAATATGCGCTCTCTACAGC-GAGA-TATT--AAGGAT-TTGAAACAATGGAAGTTTCAGTCACAGGGTCAA--GGACGTATGCCTCATCAAC--AGACAAGCTT-GG--TTACTAAGGATCAAGTTAGAA--AATGTT-GCA--AATGCGGTTC-TGAA---AAG---CACCTTAAAAGGGACT-GCCCGCAATGGAG-CAAAGAATTGG-AACTCCG-TAGCAATTCAAAAGAG-AATAAACACAAGGGGACTGATGCAGCTCGTAA--------TGACC-AATATATT-CTAGAGAGTAGTGCATTTGCCATAAA---CAAGAAAGGGGTTAATACTGTTCACGCGACA-CAAGTATCATTTTGAGAATGGAAT-G-TT-TATTTACCTGTTA-GTTGGTGATTGGTACGA-GG-G-----C-----TGC-ATTTACG--TGGT---------CCTT------GGGT-CACAG-GTCAA-TCCTT-GAC--AAA---GGTAGAGAGAGATGTTCTATCAGC-TAGTGG-ATCA--CCGCTAAATGTACTGGGG---AAAGTTCGAGTAGATT-TAAA-GCTGG-ACAACATTGC--ATTAAA---GC-AT-GAAA--TGGTCATAGC
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|26 ): GTAACGAATTGAGATCGGATTTGGAAGCATTATATATCGATTATCTAGAGGAAAAGGCAAATATGACGAAAAACGCTTATGTCAACCGGACTTTGGTGTAGAGTATCACGAT
Unaligned ( gi|29 ): TGTAACGAATTGAGATCGGATGTGGAAGCATTATATATCGATTATCTAGAGGAAAAGGCAAATATGACGAAAAACGCTTATGTCAACCGGACTTTGGGTGTA
Unaligned ( gi|31 ): AATTTTGGTGGCAGCAACGGGATTTGGATCGGTCAGNTCAATAAGTTTGTTAATAGACAGAAGAGTGAACAATAATAATATATAAGTTACTCGGCTAG
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 1 22 111 2222222222 1 11 1 11 222222 222 4444444444 1 111 1 1 111 111 1 11 11 111 1 111 11 22 111 11 111 11 1 1 11 1 1 2222 1111 11 1111 11 111 33333333 1111111 11 11 111 333333333333333333 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 11111 2222222222 111 11111111 11 111111 11 111 111111 11 11111111111 11 1 1 11 222222222 11 11 11 111111 11 111 111 1111 1111 11111 11 11 111 1 1 11 1 1 11 11 1 11 11 222222 222 11 1 1 11 111 111 11 2222 11111 11 111 11 111 1 11 333333333 1 1 11 222222 11 1 2222222222222 11 111 1 1 11111 11 111 1 1 1 111 222 1 2222 11 11 222222 1 222 1 11 1 1 333333 1 333 1 1 1 22 1 1 1 1 3333333 1 1 111 111 11 1 111 1 11 111 444444444 111 444444444444444 1111111 22222 1111 1111 11 111 11 33333333 11 11 1 1 111 11 1 1 1 1 1 1 1 1 11 1 1 111 111 1 1 444444444 11 2222 1 1 4444444444444444444 22 22 1 11 3333333 111 111 1 222 11 111 1 11 111 888888888888888888888888888888888888 11 222222 111 11 1 111 111 1111 111 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1 1111111111111 111 111111 11111 5555555555555555555555555555555555555555555555 111111 111111 2222222222 33333333333 11 111 11 11 11111 22222 11 1 111 666666666666666666666666 111 11 3333333333333333333 1 555555555555555555555555555555555555 11 333333333333 11 1111 22222 1 1111 2222 2222 2222222222 11 11 222 1111111111 33333333333333333333333333 11111 11 111 111 1 111111 111111 1 11111 111 11111
lowQualScore : 7 3 6 3 00 6 6 666 6 3 2 7777777777 0 33 666 0 33 0 666666 000 1 2 6666666666 0 777 0 0 0 111 88 3 3 3 2 2 666 0 33 33 222 3 0 111 33 33 55 111 66 777 33 3 0 5 2 33 0 0 2 2 5555 8 8 0 5555 11 0000 99 5 000 5 33333333 44 6666666 33 9 9999 66 66 55 5 1 66 1 4 0 1 2 111 000000000000000000 4 4 7777 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 8 55 44444 0 1 3333333333 888 99999999 00 4 4 66 222222 4 1 11 666 88 4 4 3 111111 4 88 11 11111111111 55 4 0 33 4 2 1 1 4 0 5 777 44 1 6 77 5 1 1 77 0 5 0 8 6 33 333333333 11 11 11 666666 5 8 11 1 1 5 8 5 888 111 6 1 222 888 6 8 8 0 6 7777 6 3 4444 0 55555 11 0 3 8 1 11 777 0 5 88 0 333 2 3 3 0 33 33 0 3 3 8 33 3 3 2 11 0 0 555555 6 777 11 0 5 99 1 8 444 444 0 0 8 8 3 8 8 0 0 8 3 55 999 11 9999 88888 0 11 444 11 8 777 0 33 888888888 2 0 3 0 33 8 88 8 8 666666 0 0 0 33 0 5 8 8 8 8 8 5555555555555 8 8 11 0 777 2 2 0 0 55555 33 777 0 0 0 888 3 555 3 4444 88 7 2 33 8 333333 0 000 0 33 3 0 66 0 6 888888 7 7 1 3 000 3 3 3 7 44 6 6 6 2 7 3 3 3 0000000 6 2 3 111 444 7 33 0 777 0 3 33 777 000000000 66 3 111 333333333333333 9999999 88888 8 8 7777 6 4444 1 6 0 8 33 777 22 11 0 8 33333333 88 6 99 6 99 6 99 2 8 11 3 2 3 0 2 3 3 2 0 666 22 0 9 0 0 0 2 0 0 2 0 3 3 2 0 55 5 0 3 88 0 3 0 3 2 3 3 0 6 2 3 111 555 3 2 0 0 9 2 2 0 6 000000000 33 1111 0 0 8888888888888888888 33 33 5 2 11 2222222 777 6 111 2 2 55 2 0 888 99 111 8 8 6 222 55 8 8 0 8 0 77 0 1 8 0 6 1 99 6 6 6 3 99 6 3 1 5 5 1 00 5 5 2 77 1 1 3 333 2 1 333333333333333333333333333333333333 99 00 44 000000 7 6 99 111 6 6 6 6 1 55 6 99 99 2 000 333 0 2222 1 000 1 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 5 888 66 0 66 5 5 5 9999999999999 1 111 5 666666 22222 5 888 66 4444444444444444444444444444444444444444444444 55 9 1 33 777 888 888 66 5 222222 66 77 5 444444 5 888 5 2 5 66 5 9999999999 00000000000 5 33 5 333 33 33 99999 55555 66 33 0 777 888888888888888888888888 0 5 777 5 00 5555555555555555555 0 44 0 5 000000000000000000000000000000000000 33 111111111111 77 66 5 7777 5 5 22222 0 5 5 8888 5 5 8888 8 66 66 3333 0000 5555555555 777 22 66 8 000 55 8888 777 8 4 4 4 4 4 4 55 4 7777777777 99999 4 4 00000000000000000000000000 55 777 0 55 777 99 99 00000 11 999 5 333 55 66 999999 888 5 0 888 777777 666666 5 0 5 77777 222 00000 66 66
lowQualScore : . . . . .. . . ... . . . .......... . .. ... . .. . ...... ... . . .......... . ... . . . ... .. . . . . . ... . .. .. ... . . ... .. .. .. ... .. ... .. . . . . .. . . . . .... . . . .... .. .... .. . ... . ........ .. ....... .. . .... .. .. .. . . .. . . . . . ... .................. . . .... .................................................................................... . .. ..... . . .......... ... ........ .. . . .. ...... . . .. ... .. . . . ...... . .. .. ........... .. . . .. . . . . . . . ... .. . . .. . . . .. . . . . . .. ......... .. .. .. ...... . . .. . . . . . ... ... . . ... ... . . . . . .... . . .... . ..... .. . . . . .. ... . . .. . ... . . . . .. .. . . . . .. . . . .. . . ...... . ... .. . . .. . . ... ... . . . . . . . . . . . .. ... .. .... ..... . .. ... .. . ... . .. ......... . . . . .. . .. . . ...... . . . .. . . . . . . . ............. . . .. . ... . . . . ..... .. ... . . . ... . ... . .... .. . . .. . ...... . ... . .. . . .. . . ...... . . . . ... . . . . .. . . . . . . . . ....... . . . ... ... . .. . ... . . .. ... ......... .. . ... ............... ....... ..... . . .... . .... . . . . .. ... .. .. . . ........ .. . .. . .. . .. . . .. . . . . . . . . . ... .. . . . . . . . . . . . . . . .. . . . .. . . . . . . . . . . . ... ... . . . . . . . . . ......... .. .... . . ................... .. .. . . .. ....... ... . ... . . .. . . ... .. ... . . . ... .. . . . . . .. . . . . . . .. . . . . .. . . . . . . .. . . . .. . . . ... . . .................................... .. .. .. ...... . . .. ... . . . . . .. . .. .. . ... ... . .... . ... . .......................................................................................................... . ... .. . .. . . . ............. . ... . ...... ..... . ... .. .............................................. .. . . .. ... ... ... .. . ...... .. .. . ...... . ... . . . .. . .......... ........... . .. . ... .. .. ..... ..... .. .. . ... ........................ . . ... . .. ................... . .. . . .................................... .. ............ .. .. . .... . . ..... . . . .... . . .... . .. .. .... .... .......... ... .. .. . ... .. .... ... . . . . . . . .. . .......... ..... . . .......................... .. ... . .. ... .. .. ..... .. ... . ... .. .. ...... ... . . ... ...... ...... . . . ..... ... ..... .. ..
lowQualScore : 3 3 7 3 00 7 7 000 7 2 5 8888888888 0 88 000 0 88 2 555555 222 2 5 0000000000 0 555 8 0 0 000 88 2 2 2 5 5 222 0 88 88 222 2 0 000 88 88 88 000 55 555 88 2 0 5 5 88 0 0 5 5 0000 0 0 8 4444 00 0000 00 7 000 7 33333333 44 7777777 88 4 0000 99 99 11 0 0 99 9 4 7 0 6 777 111111111111111111 4 4 9999 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 9 66 22222 9 0 7777777777 777 11111111 66 4 6 11 888888 4 8 00 555 33 7 4 6 222222 4 00 00 22222222222 55 0 7 77 0 7 0 0 4 9 3 111 66 0 6 99 7 0 4 99 1 0 4 9 6 00 222222222 00 00 00 666666 0 0 22 0 0 0 0 6 777 333 7 0 555 333 4 0 0 8 0 0000 0 8 8888 8 66666 00 8 2 0 4 00 555 0 5 88 0 555 5 2 2 0 22 88 0 2 2 8 88 2 2 5 00 8 8 666666 4 000 00 0 8 00 0 0 000 000 8 8 0 0 2 0 0 8 8 0 2 88 000 00 6666 22222 8 00 000 00 0 555 0 88 888888888 5 0 2 0 88 0 88 0 0 444444 8 8 8 66 6 6 0 0 0 0 0 0000000000000 0 0 00 8 555 5 5 0 0 88888 88 555 0 0 0 000 2 777 3 0000 33 3 5 88 8 555555 0 555 0 88 2 0 88 0 5 333333 3 3 0 3 333 3 3 3 3 00 7 7 7 0 3 3 3 3 3333333 7 0 3 000 000 0 88 0 555 0 2 88 555 222222222 55 2 000 000000000000000 0000000 00000 0 8 0000 7 2222 0 7 8 0 88 555 44 00 8 2 22222222 33 7 22 7 22 7 22 5 0 00 2 5 2 0 5 2 2 5 0 222 00 0 8 2 2 0 5 0 0 5 0 2 2 5 0 88 5 0 2 00 2 2 0 2 5 2 2 0 5 0 2 000 888 2 5 0 0 2 5 5 2 5 000000000 88 2222 0 0 0000000000000000000 88 22 0 5 00 5555555 555 5 000 5 5 88 5 0 222 22 888 0 0 0 222 88 0 0 6 0 8 88 8 0 8 8 7 0 22 7 7 7 5 22 7 5 0 7 7 3 00 7 7 3 99 4 3 2 000 5 0 333333333333333333333333333333333333 22 22 55 222222 3 7 22 777 7 7 7 7 0 88 7 22 22 0 000 333 6 1111 7 777 7 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 0 222 99 0 00 0 0 0 5555555555555 0 111 0 999999 55555 0 888 99 8888888888888888888888888888888888888888888888 88 4 0 55 999 888 000 99 0 555555 99 11 0 444444 0 888 0 2 0 99 0 0000000000 00000000000 6 88 1 444 88 88 44444 00000 99 88 0 555 888888888888888888888888 9 0 555 0 11 9999999999999999999 0 22 1 6 888888888888888888888888888888888888 88 555555555555 55 99 0 5555 0 0 22222 0 0 0 4444 0 0 9999 9 11 11 3333 2222 1111111111 888 22 77 0 444 55 5555 000 0 0 0 0 0 0 0 55 0 5555555555 88888 0 0 55555555555555555555555555 55 000 8 55 000 55 55 00000 00 000 0 888 11 99 666666 888 0 0 888 444444 444444 7 0 0 55555 000 99999 99 99
consensus : AGAGAGAGAATACATGA-TTCGTTA-CGGG-TCCTGAACTCTTCTAGGAGCATGC-GTCCCATAGCCCGAGACCCATACCAGG---TAT----GA-GT--ACCAGT-ACC--CCGTATGTA---AGAG--CAAGAGAGAG-------AG-TGTAA-GTGG---ATAT-TT-AGTG-A-TGA-ATGCATGTGTACATGATGAGAGAGGTACTCGTCCCGC--ATCAAGAGTTACTA-GTCCC--GT--ATCGNGAGT-TACTCGTCTCGCA-T-CGAA--CAA--CAGACTGATGCCAGAG-A-TAC-GTC---CCAGGAT--GGATG-CAAACCTGCATGGACAGA--TCCGGTCTA-AG-CCCGAAACTTCGT----AAA-CCA-GCGACATA---TGATGGTACG--GGTCTCTGG-GAAGATTA--CTTGTC-GCATT---TC-GA---G-T--GCGTGT----CTACT--GAATGAGTGG--A-CAG--AC--ANTGA-GAAAGGTNT--ATACTTGG-CTGCGTCNCTNAGGGGNACAAGCACAAGG--AG-----------T-NTTAG-GAAA-TCAG---C------C-----A----------A--G-------------A--A-----TNATTGGA-----------AGCTA-----------GT-TAAAGC-CCTT---CGGGGNA----GA----TTTGCT-TCCAG-T------AAA--CCAG-ACTGAGCT--AT------A-TAGAGCACAGCT--GAGA---GAGAAAGGAGGC-AAAAG-----GCATCT-GAA-AGTT--TGCCGGAG--C--T----GGGT--C-AAGACGTAAGAA-GGCTNGCNAA-TCTAGCNTACCC--NACC-GCTCCNGATGAGGT--AAGAG-AAACNC-TTG--CTACAGGAGCAGTTCTTNGATGG-ACTACGNAGT-T-CA--GAG--AT--GCG-TC--TCAAG-ATC-AAACAGGCAAGACCTGTAAACCTGAAT-GATGCGATACGGAG-A-GCC--GTT-GAACTGGANGCATAC-A-AC-A-GGCCAGAGGA-GTCGCCG-GATAGATGCT----GTAAGAGTCA--T-GAGTGGAAGT-T--CTA--CAGAACCGTC-CAGAG--AAAACAAACTCGAT---CGAT-CATAGAGACTG-AGAAA-AGAATATGCGCTCTCTACAGC-GAGA-TATT--AAGGAT-TTGAAACAATGGAAGTTTCAGTCACAGGGTCAA--GGACGTATGCCTCATCAAC--AGACAAGCTCGGG--TTGCTAAGG-TCAAGTTAGAA--AATGTTAACA--AATGCGGTTC-TGAA---AAG---CACCTTAAAAGGGACT-GCCCGCAATGGAG-CAAAGAGTTGG-AACTCCG-TAGCAATTCAAAAGAG-AATGAACACAAGGGGACTGATGCAGCTCGTAATGCATC--TGACC-A--ATATT-CT--AGAGTAGTGCATT--CCATAAA---CGAGAAAGGGGTT--TA-TGT---CACGGCA-C--GTATC--------CATGGAAT-GATG-TA--TACCTGTTG-GTTGAT-ACAGGCGCTA-CG-G-----CGTCCTTGCTATCTACAATTTGTTA-TGAGAACATTTGC-AAGGGT-CACAG-GTCAA-TCCTT-GAC--AAG---GTCGGAGAGAGATGTGCTATCAGC-TAGTGG-ATCA--CCGCTAAAGGTACTGGGA---AAAGTTCCAGTAGATT-TAAA-GTTGG-A-GACATTGC--GTTAAA---GC-AT-G-AA--CGGTCATAGCT--TGACCTA-ACAGTGGATGGGA--TCTT--GGATTAGATTTCCTGGTTAAGCATG--AGGCAGTAAT-CG---AC-ATGCGCATGCATA-GA-TAAAAA--TATCTGGC-ACGGAGCAC-CCTATCAAGCTGGAAGGGTTGC------AACCTCATANAAGGTAG-CCAC--CTTT-CATG-GA-GTCACGGATACCACCTAGATCGGAAGCTGATGGTA-GAAGGAG-AGATACGT-ACTAGGATC--GGATGGAGGACTCTCAGCC-AAGC-T-GAATA-TGATA--AA-GCATT---C-GGAAA--AGT---TTCAGAAG-----CCGGGTTCTTGTT-T-GCTGGCC------------A--AAACACCTG--T----CCGT-----ACA-CAGAAGNACA----TGC-GACACAAACG----GCCGGATG-CCTCTTC-CAC--ATCATC---ANCGGGAA--TAGTTGAAGATG-A-GACG-GTGACTGGGATGT--AGA-TC--CCG-AA--G-TTCAA--GTTGGGGACGAGGGGGTTGA-GGTCTCAGAGAAGN-GATGGGAGC-AGGGCCATCCTTATCTGGTAGT-GCAGAGCTT-ATTACTAGCCGTG-TTATTCGCAAAAGAACATCTCCAA-TCCTGTCCAGA-C-CTCCAGAAA-AGTCACAAGTCGAGAAGAGGA-AGTGGTACAGTAGGAAG-TGTGTAGATGTGCCGGTAT-TCAGACAGTCACGTTTGAGCC-CATCCGAGTG-A-CAAG-TCAGCAGAAATGGTGGGTCAG-GGT-ACTCAGACAGAAGGATACCGTCGA---------CG--GGT----CA-AAGA-AG---T-TC--GTCAC--G--GTAT--CAAG-AAACGGACAAAGAGTCA-NGA-------GAAG---GAAGAAT-T-TTCCGTAAGATGTAGACGGAT-AT-ACAGC-GCAT--A-CTGT-AACATTAAAAGACC-GTT-GTT-TTATTGCGCTTGACNTTNGCAATT-TANTGCA--T-GTTCA-A-CTTTCAGTCACCAGGG--GA-GTGCGA-AGAATT-CATTATTCAT-CTT-G-TACA--TTTTTTTTCATGTT-TGCTCAC---TCT---------------CAT---------C-TGTTTTG--AA-AAAAGATTAAGAT---T--ATCAT-GTATA--TT---TTA-TCATGT-GA-GGA-CACATGANG--CATAGA-G--GCGTG--GGTAAGTGTGA---CAA--TTAGAGG----TCGGGGT-CGGGGATG--GGTT-CGT----CATGT--AT-C-------A----GAT-G--C-----CT--TAAA----T-------AT---------GTT-----------CG---------GG-TG--T--TATT-GT-NGG-GC-A-T--T----AT-G--ANA--GCA-T----C-CGAG-----GG-TAGT---TCG--GGTG-T----C-AGC-GGTACT-AT-A-ATA---G-G-C-GTGA------TCT-GCTGANATTTCG--NC---AGTTCAG--CTGT--GGAG-CTC--G--AC--GAGAAGAA-GA------C-GG---T-GATA-AA--GG-TAC---TA--A--TATATAATA------C---GGGCG--TGTATTATA--ATATT--CAG--TATA-----CGGTG-----G--CTA--GTGTACTGG-TC---TG----CGAG--AATAGT-AATAA--AGTATTTC-C---AG-GTTTA-AAGTGT-C-A-----GA--TC-G--GTCC-GGNTATAGGGA---A-AA--T----TA---ATA---GACGAG-----CACCTGTCCGG--TATA-----------AGGA-CAG--AA-CT----AG-CAT-AGG-----GCACAGA-CAAG-C-A---TA-G-GTC---CC-A--G--C----CTTA---CGCA-------CA-CC---AT--ACC--TT-AGGTC--T--CT----A---T-GC-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-AT----------AGG-T---AATC-C-TGT-----A----TA---A------TAT-TATCTGT--AT---ATAT--TG---AC--TCG--TT-----ATTTT--TAATAG---TGTTCA-TA---TTT-TGCAT--TC---A--TTC---ATT-GATAAT-C---AT-C---ATGC------C-CCAG-A-CTG-----GT-C-CG---A-ATCA--ACGAAC--CTAAACAC
Reference ( family-5610 ) : AGAGAGAGAATACATGA-TTCGTTA-CGGG-TCCTGAACTCTTCTAGGAGCATGC-GTCCCATAGCCCGAGACCCATACCAGG---TAT----GA-GT--ACCAGT-ACC--CCGTATGTA---AGAG--CAAGAGAGAG-------AG-TGTAA-GTGG---ATAT-TT-AGTG-A-TGA-ATGCATGTGTACATGATGAGAGAGGTACTCGTCCCGC--ATCAAGAGTTACTA-GTCCC--GT--ATCGNGAGT-TACTCGTCTCGCA-T-CGAA--CAA--CAGACTGATGCCAGAG-A-TAC-GTC---CCAGGAT--GGATG-CAAACCTGCATGGACAGA--TCCGGTCTA-AG-CCCGAAACTTCGT----AAA-CCA-GCGACATA---TGATGGTACG--GGTCTCTGG-GAAGATTA--CTTGTC-GCATT---TC-GA---G-T--GCGTGT----CTACT--GAATGAGTGG--A-CAG--AC--ANTGA-GAAAGGTNT--ATACTTGG-CTGCGTCNCTNAGGGGNACAAGCACAAGG--AG-----------T-NTTAG-GAAA-TCAG---C------C-----A----------A--G-------------A--A-----TNATTGGA-----------AGCTA-----------GT-TAAAGC-CCTT---CGGGGNA----GA----TTTGCT-TCCAG-T------AAA--CCAG-ACTGAGCT--AT------A-TAGAGCACAGCT--GAGA---GAGAAAGGAGGC-AAAAG-----GCATCT-GAA-AGTT--TGCCGGAG--C--T----GGGT--C-AAGACGTAAGAA-GGCTNGCNAA-TCTAGCNTACCC--NACC-GCTCCNGATGAGGT--AAGAG-AAACNC-TTG--CTACAGGAGCAGTTCTTNGATGG-ACTACGNAGT-T-CA--GAG--AT--GCG-TC--TCAAG-ATC-AAACAGGCAAGACCTGTAAACCTGAAT-GATGCGATACGGAG-A-GCC--GTT-GAACTGGANGCATAC-A-AC-A-GGCCAGAGGA-GTCGCCG-GATAGATGCT----GTAAGAGTCA--T-GAGTGGAAGT-T--CTA--CAGAACCGTC-CAGAG--AAAACAAACTCGAT---CGAT-CATAGAGACTG-AGAAA-AGAATATGCGCTCTCTACAGC-GAGA-TATT--AAGGAT-TTGAAACAATGGAAGTTTCAGTCACAGGGTCAA--GGACGTATGCCTCATCAAC--AGACAAGCTCGGG--TTGCTAAGG-TCAAGTTAGAA--AATGTTAACA--AATGCGGTTC-TGAA---AAG---CACCTTAAAAGGGACT-GCCCGCAATGGAG-CAAAGAGTTGG-AACTCCG-TAGCAATTCAAAAGAG-AATGAACACAAGGGGACTGATGCAGCTCGTAATGCATC--TGACC-A--ATATT-CT--AGAGTAGTGCATT--CCATAAA---CGAGAAAGGGGTT--TA-TGT---CACGGCA-C--GTATC--------CATGGAAT-GATG-TA--TACCTGTTG-GTTGAT-ACAGGCGCTA-CG-G-----CGTCCTTGCTATCTACAATTTGTTA-TGAGAACATTTGC-AAGGGT-CACAG-GTCAA-TCCTT-GAC--AAG---GTCGGAGAGAGATGTGCTATCAGC-TAGTGG-ATCA--CCGCTAAAGGTACTGGGA---AAAGTTCCAGTAGATT-TAAA-GTTGG-A-GACATTGC--GTTAAA---GC-AT-G-AA--CGGTCATAGCT--TGACCTA-ACAGTGGATGGGA--TCTT--GGATTAGATTTCCTGGTTAAGCATG--AGGCAGTAAT-CG---AC-ATGCGCATGCATA-GA-TAAAAA--TATCTGGC-ACGGAGCAC-CCTATCAAGCTGGAAGGGTTGC------AACCTCATANAAGGTAG-CCAC--CTTT-CATG-GA-GTCACGGATACCACCTAGATCGGAAGCTGATGGTA-GAAGGAG-AGATACGT-ACTAGGATC--GGATGGAGGACTCTCAGCC-AAGC-T-GAATA-TGATA--AA-GCATT---C-GGAAA--AGT---TTCAGAAG-----CCGGGTTCTTGTT-T-GCTGGCC------------A--AAACACCTG--T----CCGT-----ACA-CAGAAGNACA----TGC-GACACAAACG----GCCGGATG-CCTCTTC-CAC--ATCATC---ANCGGGAA--TAGTTGAAGATG-A-GACG-GTGACTGGGATGT--AGA-TC--CCG-AA--G-TTCAA--GTTGGGGACGAGGGGGTTGA-GGTCTCAGAGAAGN-GATGGGAGC-AGGGCCATCCTTATCTGGTAGT-GCAGAGCTT-ATTACTAGCCGTG-TTATTCGCAAAAGAACATCTCCAA-TCCTGTCCAGA-C-CTCCAGAAA-AGTCACAAGTCGAGAAGAGGA-AGTGGTACAGTAGGAAG-TGTGTAGATGTGCCGGTAT-TCAGACAGTCACGTTTGAGCC-CATCCGAGTG-A-CAAG-TCAGCAGAAATGGTGGGTCAG-GGT-ACTCAGACAGAAGGATACCGTCGA---------CG--GGT----CA-AAGA-AG---T-TC--GTCAC--G--GTAT--CAAG-AAACGGACAAAGAGTCA-NGA-------GAAG---GAAGAAT-T-TTCCGTAAGATGTAGACGGAT-AT-ACAGC-GCAT--A-CTGT-AACATTAAAAGACC-GTT-GTT-TTATTGCGCTTGACNTTNGCAATT-TANTGCA--T-GTTCA-A-CTTTCAGTCACCAGGG--GA-GTGCGA-AGAATT-CATTATTCAT-CTT-G-TACA--TTTTTTTTCATGTT-TGCTCAC---TCT---------------CAT---------C-TGTTTTG--AA-AAAAGATTAAGAT---T--ATCAT-GTATA--TT---TTA-TCATGT-GA-GGA-CACATGANG--CATAGA-G--GCGTG--GGTAAGTGTGA---CAA--TTAGAGG----TCGGGGT-CGGGGATG--GGTT-CGT----CATGT--AT-C-------A----GAT-G--C-----CT--TAAA----T-------AT---------GTT-----------CG---------GG-TG--T--TATT-GT-NGG-GC-A-T--T----AT-G--ANA--GCA-T----C-CGAG-----GG-TAGT---TCG--GGTG-T----C-AGC-GGTACT-AT-A-ATA---G-G-C-GTGA------TCT-GCTGANATTTCG--NC---AGTTCAG--CTGT--GGAG-CTC--G--AC--GAGAAGAA-GA------C-GG---T-GATA-AA--GG-TAC---TA--A--TATATAATA------C---GGGCG--TGTATTATA--ATATT--CAG--TATA-----CGGTG-----G--CTA--GTGTACTGG-TC---TG----CGAG--AATAGT-AATAA--AGTATTTC-C---AG-GTTTA-AAGTGT-C-A-----GA--TC-G--GTCC-GGNTATAGGGA---A-AA--T----TA---ATA---GACGAG-----CACCTGTCCGG--TATA-----------AGGA-CAG--AA-CT----AG-CAT-AGG-----GCACAGA-CAAG-C-A---TA-G-GTC---CC-A--G--C----CTTA---CGCA-------CA-CC---AT--ACC--TT-AGGTC--T--CT----A---T-GC-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-AT----------AGG-T---AATC-C-TGT-----A----TA---A------TAT-TATCTGT--AT---ATAT--TG---AC--TCG--TT-----ATTTT--TAATAG---TGTTCA-TA---TTT-TGCAT--TC---A--TTC---ATT-GATAAT-C---AT-C---ATGC------C-CCAG-A-CTG-----GT-C-CG---A-ATCA--ACGAAC--CTAAACAC
gi|1 : AGAGAGAGA-TACATGA-TTCGTTA-CGGG-TCCTGAATTCTTCTAGATGCATGC-ATCCCATAGCCCGAGACCCATAACAGG---TAT----GA-GT--ACCAGT-ACC--CCGTATGTA---AGAA--CAAGAGAGAG----------TGTAA-GTGG---ATATGTT-AGTG-A-TGA--TGCATGTGTACATGATGAG-GAAGTACTCGTCCCGA--ATCAAGATTTACTA-GTCCC--GT--ATCTCG--T-TACTCGTCTCGCA-T-CGAA--CAA--CAGACTGATGCCAGAG-AATAC-GTC---CCAGGAT--GGATGGCAAACCTGCATGGACAGA--TCCGGTCTA-AG-TCCGAAACTTCGT----AAA-CCA-GCGACATA---TGATGGTACA--GGTCTCTGG-AATGATTAA-CTTGTC-GCATT---TC-GA---G-TATGTGTGT----CTACT--GAATGAGTGG--A-CAG--AT--ATTGA-GAAAGGTTT--ATACTTG--CTGCATCTCTTAGGGGAACAAGCACAAGGG-AG-----------T-ATTAG-GAAA-TCAG---C------C-----A----------A--G-------------A--A-----TTATTGGA-----------AGCTA-----------GT-TAAAGC-CCTT---CAAGGTA----GA----TTTGCT-TCCAG-T------AAA--TCAG-ACTGAGCT--AT------A-T-GAGCACAGCT--GAGA---GAGAAAGGAGGC-AAAAG-----GCATCT-GAA-AGTT--TGCCGGAG--A--T----GGGT--C-AAGACATAAGAA-GGCTTGTTAA-TTTAGCCTACCC--CACC-GCTCCTGATGACGT--AAGAG-AAATAC-TTG--CTACAGAAACAGTTCTTGGATGG-ACTACATAGT-T-CA--GAG--AT--GCA-TC--TCAAG-ATC-AAACAGGCAAGACCTGTAAACCTGAAT-GATGCGATACAGAG-A-GCT--GTT-GAACTGGAAGCATACAA-AC-A-GGGCAGA-GA-GTCGCCG-GATAGATGCT----GTAAG-GTCA--T-GAGTGGAAGT-T--CTA--CAGAACCGTC-CAGAG--AAAACAAACTCGAT---CGAT-CATAGAGACTG-AGAAA-AGAAT-TGCGCTCTCTCCAGC-GAGATTATT--AAGGAT-TTGAAACAATGGAAGTTTC-GTCACAGGGTCAA--GGACGTATGCCTCATCAAC--AGACAAGCTC--G--TTACTAAGA-TCAAGTTAGAA--AATGTTAACA--ATTGCGGTTC-TGAA---AAG---CACCTT-AAAGGGACT-GCCCGCAATGGAG-CAAAGAGTTGG-AACTCCA-TAGCAATTCAAAAGAG-AATGAACAAAAGGGGACTGATGCAGCTCGTAATGTATC--TGACC-----TATT-CC--AGAGTAGTGCATT--CCATAAA---CGAGAAAGGGGTT--TA-TGT---CACGGCA-C--GTATC--------CATGGAAT-GATG-TA--TACTTGTTGTTTTGA--ACAGGCGCTA-CG-G-----TGTCCTTGCTATCTACAATTTGTTA-TGAGAACATTTGC-AAGAGT-CACAG-GTCAA-TCCTT-GAT--AAG---GTCGGAGAGAGATGTGCTATCAGC-TAGTGG-ATCAACCCGCTAAAGGTACTGGGA---AAAGTTCCAGTAGATTCTAAA-GTTGGAA-GGCATTGC--GTTGCA---GC-GT-G-AA--TGATCATAGC---TGACCTA-ACAGTAGATGGGA--TCTT--GGATTAGATTTCCTGGTTAGGCATG--AGGCAGTAAT-TG---AC-ATGCGCATGCATC-GA-TAAAAAATTATCTGGC-ACGGAGCAC-CCTATCAAGCTGGAAGGGCTGC------AACCTCATACAAGGTAG-CCA----TTCACATA-GA-GTCAC-AATACCACCTAGATCAGAA-CTAATGGTA-GAAGGAG-AGATACGT-ACTAAGATC--GGATGGAGGACT-TCAGCC-AAAC-T-GAAC--TGATA--AT-GCATT---C-GGAAA--AGT---TTCAGAAA-----CTAGGTTCTTGTT-T-GCTGGCC------------A--AAACACTTG--T----CCGT-----ATA-CAGAAGAATA----TGC-GACACAAACA----GCTGGGTG-CCTCTTC-CAC--ATCATA---AGTGGGAA--TAGTTGAATATGAA-GACA-GTGACTGGGATGT--AGA-TC--CTG-AA--G-TTC-A--GTT-GGGACGAGGGAGTTGA-GGTCTAAGAGAAGT-GATGGGAGC-AGGG-CATCCTTATCTGGTAGT-GTAGAGCTT-ATTACAAGCCGTG-TTATTCGCAAAAGAACATCTCCAA-TCCTGTCCAGA-C-CTCCAGAAA-AGTCATAAGTCGAGAAGAGGA-AGTGGTACAG-AAGAAG-TATGTAGATGTGCTGGTAT-TCAGACAGTC-CGTTTGAGCC-CATCCAAGTGAA-TAAGTTCTGCAGAAATGGTGGATCAG-GGT-ACGCAGACAGAAGGATACCGTCGA---------CG--GGT----CA-AAGA-AG---TATC--GTCA---A--GTAT--CAAGAAAACGGACAAAGAGTCA-TGA-------GAAG---GAAGAAT-TATTCCGTAAGAT-TAGACGGAT-ATAACAGC--CAT--A-CTGT-AACATTAAAAGACC-GTT-G-T-TTA-TGTGCTTGACATTGGCAATT-TAATGCG--T-GTTCA-A-CTTTCAGTCACCAGGG--GA-GTGTGG-AAAATT-CATTATTCAT-CTT-G-TACA--TTTTTTTTCATGTT-TGCTTA-----CT---------------CAT---------TGTGTTTTG--AA-AAAAGATTAAGAT---T--ATCAT-GTATA--TT---TTA-TCATGT-GA-GGA-CACATGCAG--CATAGA-G--GCGT---GGTAA-TGTGA---CAA--TTAAAGG----TCGGGAT-CGGAAATG--GGCT-CGG----AATGC--AT-C-------------AT-G--C-----CT--TAGA----T-------AT---------ATT-----------CG---------GG-TG--T--TATT-GT-TGT-GC-A-T--C----AT-G--AAA--GCA-C----C-CGAG-----GG-TAGT---TCG--GGTG------C-AG--GGTACT-AT-ATATA---G-G-CTGTGA------TCA-GC-GATATTTCG--GC---ACTTCAG--CTGT--GGAG-AT---G--AC--GAGAAGAA-GA------C-GG---T-GATA-AA--GG-TAC---TA--A--TATATAATA------C----GGCG--TGTATTATA--ATATT--CAG--TATA-----CGGTG-----G--CTA--GTGTACTGG-TC---TG-----GAG--AATAG--AATAA--AGTATTCC-C---AG-GTT---AAGTAT-C-A-----GG--T-----GTCC-GGGTAGAGGTATCTATAC--C----TATACATACTTGACAAG-----CACCTGTCCGG--TATA-----------AGGA-CAG--AA-CT----AG-CAT-AGG-----ACACAGA-CAAG-C-A---TA-G-GT----CC-A--G--C----CATA---CGCA-------C--CC---AT--ACC--TT-AGGTC--T--CC----A---T-GC-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-AT----------AGG-T---AATC-C-TGT-----A----TA---A------TAT-TATCTGT--AT---ATAT--TG---AC--TCG--TT-----ATTTT--TAATAG---TGTTCA-TA---TTT-TGCAT--TC---A--TTC---ATT-AATAAT-C---AT-C---ATGC------C-CCAG-A-CTG-----GT-C-CG-----ATCAACACGAAC--CTAAACAC
gi|10 : --AGACAAGTTCAG---CTGCTAAGG----AGTTACAA--AAT--TAAAATTAATGCGGTTC-TGAA---AAG---CACCTTAAAAGGGACT-GTCCACAACGGAT-CAAAGAGTTGG-AACTCCG-TAGCAATTCAAAAGAG-AATGAACACAAAAGGACTGATGCAGGTCGTAATGCATC--TGATC-A--ATATT-CT--AGGGTAGTGCATT--CCATAAA---CGAGAAAGGGGTT--TA-TGT---CACGGCA-C--GTATC--------CATGGAATGGATG-TA--TATCTGTTG-GTTGAT-ACAGGTGCTA-CG-G-----TGTCCTTGCTATCTACAATTTGTTA-TGAGAACA-TTGC-AAGGGT-CACAG-GTCAA-CCCTT-AAC--A--------------AGATGTACTATCATC-TAGTGG-ATCA--CCGCTAACGGT
gi|10 : TCCTGGTTGAGAATG--AGGTAGTAAT-TG---AC-ATGCGCATGCAAAAGA-TAAAAA--TATCTGGC-ATTGAGCAC-CTTATCAAGCTGGAccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcctggttgagaatgaggtagtaattgacatgcgcatgcaaaagataaaaatatctggcattgagcaccttatcaagctgga
gi|11 : agacaagttcagctgctaaggagttacaaaattaaaattaatgcggttctgaaaagcaccttaaaagggactgtccacaacggatcaaagagttggaactccgtagcaattcaaaagagaatgaacacaaaaggactgatgcaggtcgtaatgcatctgatcaatattctagggtagtgcattccataaacgagaaaggggtttatgtcacggcacgtatccatggaatggatgtatatctgttggttgatacaggtgctacggtgtccttgctatctacaatttgttatgagaacattgcaagggtcacaggtcaacccttaacaagatgtactatcatctagtggatcaccgctaacggtccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn----T-------AT----------TT-----------CG---------GG-TG--T--TATT-GT-TGT-GC-A-T--T----ATTG--AAA--GCA-T----C-TGAG-----GG-T-GT---TCG--GGTG------C-AG--GGTACT-AT-A--TA---ACG-CAGTGA------TCA-GC-GATATTTCG--GC---AGTTCAA--CTGT--GGAG-CTA--G--AC--GAGAGAAA-GA------C-GG---T-GATA-AA--GG-TAC---TATAA--T-TATAGAA------C---GG-CG--TGTATTATA--ATATT--CAG--TATA-----CGGTG-----G--CTA--GTGTACTGG-TC---TG-------G--A---------------CATTTC-C---AG-GTTTA-AAGTGT-CGA-----GA--TC-G--GTCC-GGCTATAGAGA---A-TA--T----TA---AGA----ACAAG-----CACCTGTCCGG--TAT------------AGGA-CAGA-AA-CT----AG-CTT-AGG-----ACACAGA-CAAG-C-A---CA-GTGT----CC-A--G--C----CTTA---CGC--------CA-CC---AT--ACC--TT-AGGT---T--CT----A---T-GC-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-AT----------AGG-T---AATC-C-TGTATA--A----TA---A------TAT-TATCTGT--AT---ATA---TG---AC--TCG--TT-----ATTTT--TAATAGT--TGTTCA-TA---TTT-TGCAT--TC---A--TTC---ATT-GATAAT-C---ATAC---ATGC------C-CCAG-A-CTG-----GT-C-CA---A-ATCA--ACGAAC--CTAAACAC
gi|12 : ----T-------AT----------TT-----------CG---------GG-TG--T--TATT-GT-TGT-GC-A-T--T----AT-G--AAA--GCA-T----C-TGAG-----GG-TAGT---TCG--GGTG------C-AG--GGTACT-AT-A--TA---ACG-CAGTGA------TCA-GC-GATATTTCG--GC---AGTTCAA--CTGT--GGAG-CTA--G--AC--GAGA-GAA-GA------C-GG---T-GATA-AA--GG-TAC---TA-----TATATAGAA------C---GG-CG--TGTATTATA--ATATT--CAG--TATA-----CGGTG-----G--CTA--GTGTACTGG-TC---TG-------G--A---------------CATTTC-C---AG-GTTTA-AAGTGT-CGA-----GA--TC-G--GTCC-GGCTATAGAGA---A-AT--T----TA---A-----GACAAG-----CACCTGTCCGG--TATA------------GGA-CAG--AAACT----AG-CTT-AGG-----ACACAGA-CAAG-C-A---CA-G-GTC---CC-A--G--C----CTTA---CGCA-------C--CC---AT--ACC--TT-AGGTT--T--CT----A---T-GC-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-AT----------AGG-T---AATC-C-TGT-----A----TA---A------TA---ATATGT--AT---ATAT--TG---AC--TCG--TT-----ATTTT--TAATAGT--TGTTCA-TA---TTT-TGCAT--TC---A--TTC---ATT-GATAAT-C---ATAC---ATGC------C-CCAG-A-CTG-----GT-C-CA---A-ATCA--ACGAAC--CTAAACACg
gi|13 : -GACAAGAGCA----GCCGGGTG-TCTC--C-CAC--CTCATC---ATGGGGAA--TAGTTGAGAGTG-A-GACAAGTGAGTGG-ATGTTGAGAATC--CTG-GAAGG-TTCAA--GTGTGGGA-GAGGGGGTTGATGGTCTCGGGGAAGA-G-TGGG-GC-AGAACCATGCTT-TCTG-TAGTCGCATAGG------ACT----GTG-TTATACGTTAAAGGAAATCTCAAG-TCCTGTCCAGGCC-CTCCAGAAA-GGTCAC-AGT--GGAAGAGGATAGTGGTA-AGTAGGAAG-TGTGTAGATGGGCGGGTATGTC-GA-AGTCAGGTTTGAGCCGCATCTGAG-A-A-TAAT-TCAGCAG-AATGGT-GGTCAG-AGTAACTCAGACAAAAG---ATCGT-GA---------CG--GGT----CA-AAGA-AG---TCTCCAGTAAC--GACGTATG-CATG--AACGGGCAAGGAGTCA-AGAAATAAACGGAGAGTGAAAGAT-T-TTTGTTTAGATGTAGACGTTTAAT-A-AGCAGCA---A-CTGT-AAg
gi|14 : a-ATGCATGTATATATGATGAGAGAGGTACTCGTCCCGC--ATCAAGAGTTACTA-GTCCC--GT--ATCGAGAGT-TACTCGTCTCGCA-T-CGAA--CAA--CAGACTGATGCCAGAG-A-TAC-GTC---CCAGGAT--GGATG-CAAACCTGCATGGACAGA--TCCGGTCTA-AGCCCCGAAACTTCGTG---AAG-CCA-GCGACATT---TGATGGTACG--GGTCTCTGG-AATGATTA--CTTGGCTGCATC---TC-
gi|14 : TACTTGG-CTGCATCTCTTAGGGG-ACAAGCACAAGG--AG-----------T-GTTAG-GAAA-TCAG---C------C-----A----------A--GGGATGAGAGGCAGA--A-----TTATTGGA-----------AGCTA-----------GT-TAAAGC-CCTT---CAGGATA----GA----TTTGCT--CCAG-T------AAA--TCAG-ACTGAGCT--AT------A-TAGAGCACAGCT--GAGA---GAG--AGGAGGT-AAAAG-----GCATCT-GAA-AGTT--TGCCGGAGATCGAT----GGGT--C-AAGACATAAGAA-GGCTTTTTAA-TTTAGCCTACCC--GACC-Gttaggggacaagcacaaggagtgttaggaaatcagccaagggatgagaggcagaattattggaagctagttaaagcccttcaggatagatttgctccagtaaatcagactgagctatatagagcacagctgagagagaggaggtaaaaggcatctgaaagtttgccggagatcgatgggtcaagacataagaaggctttttaatttagcctacccgaccg
gi|15 : atgcatgtatatatgatgagagaggtactcgtcccgcatcaagagttactagtcccgtatcgagagttactcgtctcgcatcgaacaacagactgatgccagagatacgtcccaggatggatgcaaacctgcatggacagatccggtctaagccccgaaacttcgtgaagccagcgacatttgatggtacgggtctctggaatgatTACT--AAATAAATGG--A-TAGTAAC--A--GA-AATGGGCAT--GCATCTAG-TGGTATCATTGAGTAG-ATAAGCTCAAAG--TG-----------T-CTTAG-GAAA-TCTA---C------CTGAGGG----------A--G-------------A--AAAGTGTAAATACA-----------GGCTGTT---------GTGTAAAGC-AC-----AGGAGGA----GAGGTTTTTAC---CCAC-T------AA---CCAG-ACGGAACT--TT------A-CAGAGCACAGCT--GAGA---GAGAGACGA--C-AGAAA-----GCCACA-GAG-ACAC--TACCGGAA--C--T----GGGA--C-AGGAAATACGGC-GGTTAACGAA-TCTAGCATACCC--CTCA-GCTCCAGTGGAGGT--AAGAG-AGACAC-TTG--C-AAAGGAACAGTTTCTTGATGC-GTTAAGGGA----CA--GGGACAT--GCG-TT--TGAGA-GTC-AAACAGGCGAGACCGGCTGACTTGAAT-GATACTGT-CAGAC-ACGCA--GTA-GAGTTGGATGCATTC----C-A-GGC
gi|16 : a-GCACT---TT-GA-----T--GCCTGT------ACTAGGAA-AAGTGG--AGCAA--AC--AA-GA-AAAAGGAAT--AAATTTCG-CTGTGTCACTAAGAGGT-CAAACACAAGG--AG-----------TCCTTGG-TAAT-TCAT---C------TA----A----------A--G-------------A--A-----GCACTGAACAACTATAATGAACTA-----------GC-CAAAGC-AC-T---CGACGAAC---GA----TTTGCTCTCCCG---------AA--CCAA-ACTGAGCT--AT------A-TCGAGCACAGCTTCGTGAACTGACAAAGAAAGC-TA------------CT-GAA---TTCCTGCCAAAA--C--T----AGGT--C-AAAGTTTCAGAA-GACTGACAAA-TCTAGCATACCC--TACG-GCACCATATGAATT--GAGAG-AAACTCTTTG--TTA-GGGGGCAATT-TTAGATGa
gi|17 : cttgagctcaca-GCACT---TT-GA-----T--GCCTGT------ACTAGGAA-AAGTGG--A-GAA--AC--AA-GA-AAAAGGAAT--AAATTTCG-CTGTGTCACTAAGAGGT-CAAACACAAGG--AG-----------T-CTTGG-TAAT-TCAT---C------T-----A----------AAAG-------------A--A-----GCACTGAC-----------AACTATAATGAACTACGC-CAAAGC-ACT----CGACGAAC---GA----TTTGCTCTCCCG---------AA--CCAA-ACTGAGCT--AT------A-TCGAGCACAGCTTCGTAACT-GACAAAGAAAGC-TA------------CT-GAA---TTCCTGCCAAAA--C--T----AGGT--C-AAAGTTTCAGAA-GAC-GACAAA-TCTAGCATAACC--TACG-GCACCATATGA-AT--GAGAG-AAACTCTTTG--TTA-GGGGGCAATT-TTAGATGctcttggtgagtcaga
gi|18 : cacaGTGT----CTACT--AAATGAGTGGGGA-CAG--AT--ACTGA-GAAAAGTTT--ATACTTGGCCTGCATCTCTTAGGGACA-AAGCACAAGAGCAGTTATTATTATAT-TTTAGAGGAA-TCAG---C------C-----A----------ctcttggtgagtcaga
gi|18 : A-----------ATCTA-----------GT-TAAAAG-CCTTGTACAAGGAATTTAGA----TT-GCC-TC-AG-TCAAGGAAAATTCCAG-GC-GA-CTTTATCTTCTAA-TAGAGCACAGCT--GAGAC--GAGCAGGAAGGCTAAGAGATAATGCATCT-GAA-AGTT----CCGGAG--C--TACAAGCGT--C-AACACCTAAGAA-Gcagtcgaagatccagaaccgatcttctgcgttcgagatccatttttgccacagctaaaatctagttaaaagccttgtacaaggaatttagattgcctcagtcaaggaaaattccaggcgactttatcttctaatagagcacagctgagacgagcaggaaggctaagagataatgcatctgaaagttccggagctacaagcgtcaacacctaagaagcccttagtgtgagactactc
gi|19 : gtgtctactaaatgagtggggacagatactgagaaaagtttatacttggcctgcatctcttagggacaaagcacaagagcagttattattatattttagaggaatcagccacagtcgaagatccagaaccgatcttctgcgttcgagatccatttttgccacagctaaT--TGCCAGAG--C--T----TGGG--C-AGGACATACTCA-GGCTGGCCAA-CCTCGCATATCC--AACT-GCCCCAATTGAGGT--CAGAG-AAACCC-TTG--CCA-AGGAGCAATTCATTGATG---CTCTGAAGG-A-CAGTGAC--AT--GAG-AA--T-ACGCATT-AAACAAGCCAGACCAGTCGACCTGAAT-AATGCTATCCGTCA-T-GCC--GTG-GAGTTGGATGCATTT-A-ACTC-TGCCAAAAGACGTCTCCGTGA-AGA---------TAAAGGTTATTT-GAG-GGAGG-----CTAATCAG--CCATG-CAAAA--CAGACAAAcccttagtgtgagactactc
gi|2 : aaca-A-CTG-----GTACACG---A-ATCA--ACGAAC--CTAA
gi|2 : AGAGCGAGAATACATGAGTTCGTTA-CGG--TCCTGAACT--TCTAGGAGCATGCAGTCCCATAGCCCGAGACCCATAC-AGGAAATA-----GT-GT--ACT--TCACC--CAGTAT-TA---AGA---CAGGAGA-AG-------AG-TGTAA-GTGA---ATGT-TT-AGTGGA-TGAGATGCATGTG-ACATGATGAGAGAGGTACTCGTCC-----ATCAAGAGTTACTA-GTCCC--GTGGATC-CGAGT-TACTCGTCTCGCA-TTCGAA--CAAA-CAGACTGATGCC-GAG-A-TACTATCGATCCAGGAT--GGA-G-CAA-CCTGCATG-ACAGAAATCCGGTCTA-AG-CCCGAAACATCGTTAGAAAA-CCA-GCGAC-TA---TGATGGTACA--GGTCTCTGGTGGAGATTATTCTTGTC-GCATTCGGTCTGA---GAT--GTGTGT----CTACT--GAA-GAGTGG--A-CAG--AT--ATTGATGAAAGGTTT--ATACT--G-CTGCATCTCTTAGGGACAAAAGCACAAGG--A------------T-GT-GG-AAAA-TCAG---C------C-----AGGATAAGGCAA--G-------------A--A-----T-ATTG-A-----------AGCTA-----------GT-TAAAGC-CCTT---CAGGATA----GA----TTTGC--TCCAGTT------AAA--TCAG-ACTGAGC----T------A-TAGAGCACAGCT--GAGA---GAG--AGGAGGC-AAAAG-----GCATCTAGAA-AGTT--TGCCGG-G--A--T----GGGTGCC-AACA---AAGAATGACTTGTTAA-T-TAGC-TCCCCGAAACC-GCTCCTGATGAGGT--AAGGGAAAATAC-TTG--CTACACGAACAGTTTTGAGATGGAACTACATAGTAT-CA--GAG--ATTGACGATC--TCAAA-ATCAAAACAGGCAAGACCTGTAAA-CTGAACAGACGAGTCACGAAGTA-G-C--GTTGGAACT-GAGGCATAC-ATAC-A-GTCCAGAGGA-GTCGCCG-GATAGAAGCT----GT-AGA-TCA--GAGAGT-GAAGT-TTCCTA--CAGAATCGTCACGAAGGCAAAACAAACTCGATTCGTGAT-CAT-GAGACTT-AGAAAGAGA--ATGCGCT-TCTAC--CAGAG--TATT--AAGGATATTGAAACAATGATGATTTCAGCAACAGGGTCAACGGAACGTATGCC-CATCAACAAAGAC-AGCTCAGG--TT-CTAAGG---ATATGAGAAAGAATGTTTACAC-ACTGC-GTTCATGAATCGAAGGATCACTCTAAAAGGTACTGGCCCGCAATGGAGACAAAGA-TTGGTAACTCCGATAGCAATTCAAAAGAA-GGT-AACAAAAGGAGAA-GATGCAGCTC-CGAT--ATCCTTGACCAA--ATATCACA--AGAGTAGT-CA-T--CCATAGAAATCGA-AAAGGGGTT--TA-TGT---CACGGCAGC--GTAT---------CAT-GAAT-GAGGATA--TACTTGTTA-GTTGAT-ACAGGCGCCA-CGCGGAAATCGTCCTTGCTATCTACAATGTGTTAGTGAGAACA-TTGC-AAGAGT-CACAGTGCTAACTCCTTGGACTAAGG---GTC-GAGAAGGATTTGCTATCAGCTTAGTGGCATCA--CCGC-GAATGTACTTGGATATACAGTTCCAGTA-ATT-TAAACGTTGG-A-G-CATTGCAAGTAAAAATGGC-AT-G-AA--GAGTCA-AGCT--TGACCTACACAGTGGATGG-----CTT--GGATT-GATTTCCCTGTTAAGCATAGTGGGCA-TAAT-CATACAC-ATGCGCATACA-G-GATTAAAAA--TATC-GGC-AACGAGCACGCCTATCATACTGGGAAGGTGGTCGGTCGAACCTC-TAAAGGGTAG-CCATGGCTTT-CATGAGACGTC-CAGATACCA-CTAGATCG--AACTG-TGATAGGAAGGAGAAGATACGT-ACTA-GATCGGGGATGGA-GACTCTCAACCAAAGCTT-GAATA-TGA-A--AA-GCATT---CTGGAAA--AAGAAATTCAGAGG-----T---GTTC-TG-T-T-GCTGGCC------------ACGAAAAACCTGGTT----TAGC-----ACA-GAGTAGCACA----TGC-AACACAAA-G----CCCGGATGCCCTCTTC-CAcaacgttaaaattttggtggccagcaacgggatttggatcagtcatttaagtaaaagcattagtattcgtaaaaatgaatgagcaggattacaaagacaagtgtaatcagttagaagggggagatagatcgcctcagagcgagaatacatgagttcgttacggtcctgaacttctaggagcatgcagtcccatagcccgagacccatacaggaaatagtgtacttcacccagtattaagacaggagaagagtgtaagtgaatgtttagtggatgagatgcatgtgacatgatgagagaggtactcgtccatcaagagttactagtcccgtggatccgagttactcgtctcgcattcgaacaaacagactgatgccgagatactatcgatccaggatggagcaacctgcatgacagaaatccggtctaagcccgaaacatcgttagaaaaccagcgactatgatggtacaggtctctggtggagattattcttgtcgcattcggtctgagatgtgtgtctactgaagagtggacagatattgatgaaaggtttatactgctgcatctcttagggacaaaagcacaaggatgtggaaaatcagccaggataaggcaagaatattgaagctagttaaagcccttcaggatagatttgctccagttaaatcagactgagctatagagcacagctgagagagaggaggcaaaaggcatctagaaagtttgccgggatgggtgccaacaaagaatgacttgttaattagctccccgaaaccgctcctgatgaggtaagggaaaatacttgctacacgaacagttttgagatggaactacatagtatcagagattgacgatctcaaaatcaaaacaggcaagacctgtaaactgaacagacgagtcacgaagtagcgttggaactgaggcatacatacagtccagaggagtcgccggatagaagctgtagatcagagagtgaagtttcctacagaatcgtcacgaaggcaaaacaaactcgattcgtgatcatgagacttagaaagagaatgcgcttctaccagagtattaaggatattgaaacaatgatgatttcagcaacagggtcaacggaacgtatgcccatcaacaaagacagctcaggttctaaggatatgagaaagaatgtttacacactgcgttcatgaatcgaaggatcactctaaaaggtactggcccgcaatggagacaaagattggtaactccgatagcaattcaaaagaaggtaacaaaaggagaagatgcagctccgatatccttgaccaaatatcacaagagtagtcatccatagaaatcgaaaaggggtttatgtcacggcagcgtatcatgaatgaggatatacttgttagttgatacaggcgccacgcggaaatcgtccttgctatctacaatgtgttagtgagaacattgcaagagtcacagtgctaactccttggactaagggtcgagaaggatttgctatcagcttagtggcatcaccgcgaatgtacttggatatacagttccagtaatttaaacgttggagcattgcaagtaaaaatggcatgaagagtcaagcttgacctacacagtggatggcttggattgatttccctgttaagcatagtgggcataatcatacacatgcgcatacaggattaaaaatatcggcaacgagcacgcctatcatactgggaaggtggtcggtcgaacctctaaagggtagccatggctttcatgagacgtccagataccactagatcgaactgtgataggaaggagaagatacgtactagatcggggatggagactctcaaccaaagcttgaatatgaaaagcattctggaaaaagaaattcagaggtgttctgttgctggccacgaaaaacctggtttagcacagagtagcacatgcaacacaaagcccggatgccctcttccaa
gi|20 : actggtacacgaatcaacgaacctaacaacgttaaaattttggtggccagcaacgggatttggatcagtcatttaagtaaaagcattagtattcgtaaaaatgaatgagcaggattacaaagacaagtgtaatcagttagaagggggagatagatcgcctcC-T-GAATA-TAACAGTAA-GCATTTTGC-GGAAAGGAGT---TTCAGGAGACGGTCCGGGTTCT-ATTAT-GCTGGCCCGATCATTGGAGA--GAACACCTG--TAATGCTGTTAAACACATCAGAAGCACACCTATGC-AACACAAACGCTTCGC-GGATG-CCTCTCCTCACTAATCATCTATACTGGAAAATTAGT-GAA--TG-A---TG-GTGACTGGGATGT--AGA-TCCTCCGAAA--G-TTCAACGGTTGTGAGCGAGGa
gi|21 : GG-----GCA-AGA-CAAG-CCA---TA-G-GTC---CC-A--G--C----CTTAA--CGCG-------CA-CC---AT--ACC--T--AGGTCG-T--CC----A---T-GC-C-T-TTG-AATAT-TTA--GG-AT----------AGG-T---CATG-C-TGT-----A----TA---A------TAT-TATCTGTTAGT---A-AT--TG---ACT-TCG--TT-----AATTT--TAATAG---TGTTGA-TT---TTTATGCAT--TCAGGA--TTCGCGATT-AAT-AT-C---AT-CTCAATACATTGCAC-TAAG-A-CTG-----GTACACG---A-ATCA--ACGAAC--CTAAcag
gi|22 : CTGGCC------------A--AAAGACTTG--T----CCGT-----ACA-CAGAAGAACA----TGC-TACACAAACA----GCCGGATG-CCTCcaacgt
gi|22 : T--AGA-TC--CTG-AA--G-TTCAA--GTTGGGGACGAGGGGGTTAT-GGTCTCccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntagatcctgaagttcaagttggggacgagggggttatggtctc
gi|23 : ctggccaaaagacttgtccgtacacagaagaacatgctacacaaacagccggatgcctcccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-AGGTTA-T--CT----A---TTGC-CAT-TTG-A-T-T-T-A--GG-AT----------ACA-A---AGTA-C-TG----------------A------TGT-AATCTGT--AT---ATATATTG---GC--TCG--TT-----ATTTTTCTGATAGT--TATTCA-TA---TTT----------------TTT---GCT-GA-AAT-C---AT-A---GTGC------C-GCAGCA-CTGC----GT-C-CG---ATATCA--TC-AAC--CTAAAC
gi|24 : ----AAG-CTA-GCAACAAT---TGATGGTATG--GGTTCCTGG-GTAGACTA--CAAATC-CCATT---TT-GA---G----GCTTGTAGCTCT-TT--GAATCAGTGG--A-CGG--AC--AGGGA-AAAAGGTCT--ATATCTAA-GTGTGTCGCTCA-GAGAACAGGCcgt
gi|25 : AGCTCAAAG---T-----------T-GTTAG-GAAA-TCATACTC------CTGGGGA----------G--G-------------A--AAAGTGTAATTACA-----------GGCTGTT---------GTGTAAAGC-ACT-----GGAGGA----GAGGTTTTTACC--CCAC-T------AAC--GCAG-AC-GAACT--CT------AACAGAGCACAACT--GAGA---tattatacggt
gi|27 : ACGCATACCAGG---TAT----GAAGTTAACCAGT-ACC--CCGTATGTAGACAGAGATCATGAGAGAGATTGCAAAA-TGTAA-GTGGGCCATCT-TC-GTTA-ATTGA-ATGag
gi|28 : gagaacCAGCT--GAGA---GA--AAGCA-GC-AAAAT-----ATATCT-TAAGGGTT--TACCGACG--A--T----GGAT--C-ATCATGTAAAAA-GACTAGTCAA-TCTAGCCAACTC--AATC-TCTCCTGAataca
gi|3 : acagacTGTTG-TTTGAT-TCAGGTGCTAACG-G------GTCCTTGCTATCTACAATTTGTTA--GAGAACATTGGCCAAGGGTTCA-AG-GTCAA-TCCTT-GAC--AAGAGGGTCG-AGAGAGATGTGCTATCAGC-TAGTGG-ATCA--CCGCTAAAGGTAATGGGA---AAAGTT-CAGTAGATT-ATAA-GTGGC-G-GACTTTGC--GTTAAA---GCAATAG-AAATCGGTCATAGCTGATGACTTA-ACAGTGGATTGGAATTCTTTGGGATTAGATTT-CTGGTTAAGCATG--AGGTGTTAATATG---ACAATTCGCTGGCATA-GA-TAAAGA--TATCTGGCAATGAAGCAC-CCTATCAA-CTGGACGGGTTGC------AACC-CATATAAGGTAGTCCAC--CGTT-CATG-GA-GTTACG--TA-CACCTGAATCGGAAGCTGATGGTA-GAAGGAG-AGATACGTGACTAG---T--GGATGGAGGTCATTCAGCC-AAGC-TCGGAGACTGATA--AAGGCATT---C-GG-AA--AGT---TTCAGAA------TTGGGTTCTTGTT-TGGCTGGCC------------A--AAACA-CTG--T----TCGTA----ACA-CAGAAG-ACA----TGCAGA---AAACG----CCCGGA---CCTCTT--CAC--ATCATC---AACGGGAA--TA-TTGAAGATG------T-GTGACTGGGATGTAAAGA-TC--CCG-AA--GTTTCAA--GTTGGGGACGAGGGAGTTGA-GGTCTCAGAGAAGT-GAT-GGAGCTAGGGCCA-CCTTATCTGGTAGT-GCCGAGCTGAATTACTA-CCGTGTTTATTCGC-AAAGAACCTGTCTAA-GTCTGT--AGA-CGCTC--GAAATAGTC-CAAGTCGAGAAGAGGA-AGTGTT-CAGTAGGAAGTTGTG-AGA--TGCCGG--T-TTAGACAATCACG-TTGAGCC-CAT-CAAGTG-A-CA---TCAGCAGAAATGGTGGGTCAGTGGT-AC-CA-ATCGAAAGATAGTGTTGATGGCTCGTGCG--GGT----CATAAGA-AGTCAT-TC--GTCACTAG--GTATTCCAAGCAAAC-AAGAAAGAGTCA-AGA-------GAAG---GAAGAATCT-TTCCGTAAGATGTAG-CGGAT-AT--CAGC-GCCT--A-CTGTAAACATGTCAAGA-C-GTTGGTTGTTATTGGACTTG--CTTGGCAA-T-TAATGCA--T-G-TCA-ACCTTTCAATCACCAGGG--GAGGTG-GA-AGAATC---TTATTCAT--TT-G-TACATTTTTTTTTTCATGTT-TGCTCACAGATCT----------------ATAATCTGGTCC-TGTTTTGATAA-AAAAGATT-AGATTAAT--ATCAT-GTATA--TT---TTATTCATGTCGA-GGA-CAC--GATGCCCATAGA-G--GCG-G--GGTGAATGTGA---C-A--TTAAAGG----TCGGGAT-C--GGATG--GGTT-GGTATTATATGT--AT-C-------A----GATAG--TG----CTAATAAAAGCTC-------AT---------GTC-----------CA---------GACTT--T--TACTAGTAGGG-GC-A-T--TGGCGAT----ATA--ACA-T------CGAGTGGCAGG-TAGT---TCG--GGTG-T----TGAGCAAGTG-T-ATAA-ATA---G-G---GCG-------TCT-GCTGAAATT--G--TC---ACTTCAG--CTGT--GGAGATTCATG--AC--GAGGAGAAGGA------CAGG---T-GATATAAATGG-TCC---TA--GGCTATATTATA------CCAGGAGC---TATGTTATA--ATATT--CAG---ATAAC---CGGTG-----GGTCTA--GTGTACTGGTTC---TGGAC-CCAG---ATAGT--ATGAGTAATATTTCAC---AA-TTTTA-AAGTG--C-A-----AAGTCC-G--GT-C-GGTTATAGAGAGT-A-AATGT----TA-----A---GACAAG-----CACCTGTCCGG--CGTAGT---------AGGATCAGGAAA-CTAA--AG-CAT-AGG-----GATCAGT-AAAG-C-A----A-G-GTC---CC-ACTG--CT---CTTAGTCCGCAAGAGGAGCA-CCTCTAT--A-C--TT-AGGTC--TGCCC----ATCCT-GCTTATATTGCA-T-TATTACCGG-ATTAGCTTACTCAGGCT---AATC-T-TCTAAGCGA----TG---AATAGACTAT-TATCTGT--AT---AT-T--TG---ACCGTCGAATG-----ATTTT--TAATAG---T
gi|30 : tC---CC-A--G--T----CTTA---CGCA--------G-CC---AT--ACC--TT-AGGTT--T--GT----A---T-GT-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-AT----------AGG-T---AATC-C-TAT-----A----TA---A----------TATCTAT--AT---ATAT--TG---AC--TCG--TT-----ATTTT--TAATAG---Ttgt
gi|32 : GA-AGAATT-CATTATTCAT-CTTCG-TACA--TTTTTTTTC
gi|33 : gcatattctacatcaccagggatggattgtttatgtgtgtttgccaTGTGA---CAA--ATTGAGA----TCGGGTT-C-GGGATG-------TGT----CATTT--AT-C-------A----GAT-
gi|4 : atAGAGAGGATACATGG-TT-GTTAACGGGGTTCTGAACTCTTCTAGGA---TGC-G-CCCATAGCC-GAGACCCG-ACCAGG---TGTACTGGA-GT--A--AGT-ACCGACTGAAT------AGAG--AAAGAGAGAG-------AGCTGTAAAGTGG---ATAT-TTTAGTG-A-TGA-ATGCATGTGTACA-GATGAGAGAG---CTCGTCCCGCGCATCAAAGGTTACTAAGTCCCAAGT--AT-GAGAGTATTCTCATCCCGCAAT-CGAAGACAATGCAGACTGATGC-AGATCA-TAC--TC---GATGGATAGGGATG-CAA-CCTGGATGGACAGA--TCCGGTCTATAG-CC---GACTT-GT----AAAACCAAGCGACATACGCTGATGGTACATCGGTCTTTG---AAGATTA--CTTGTT-TCATT---TC-GGTCTG-T--G-GTGT----CT-CT--AAATGA-TGG----CAG---CTTATTGA-GAAAGGTTTTAATACTTGG-CTGAATCTT----GGGGACAAGCACAAGG--AG-----------T---TAG-GAAACTCAG---CAAGGGAT-----A----------A--G-------------GCGA-----TTATTGGA-----------AG-TA-----------GT-TAAAGCGCCTT---CAGA-TA----G-----CTTGCT-TCGAG-T------AAAA-TCAGGACTGAGCT--AT------A-TAGAG-ACAGCT--GA-A---GAGAA-GGAGGC-AAAAG-----GCATCT-GAA-AGTT--TGCCGGAG--A--T-----GGT--CAAAGAC-TAAGAA-G--TTGTTAATTTTAACT--CCC--GACCTGCT-CTGATGATGTCAAGGAG-AAATTC-TTGCCCTACAGAAG----TCTT-GATGG-ACTA---AGT-TAAA--GAG--AT--GC--TCTGTCAAG-AT---GACAGGCAAGACCTGTAAAGCT-AAT-GATCGGATACAGAG-A-GCTTGGTT--AACTGGAAGCA-AC-A-CC-AGGGCCAGAAGA-GTCGCCG-GATAGATCCTGTCAGTAAGAGTCA--T-GAGTGGACGTCT--CTA--CAGAA--GTC-CACAG--AAAACAAACTCGAT---CGAT-CAT-GAGAGT---AAAA-AGAATATGCGCTCTC-ACAGC-GAGA-TATTAAAAGGAT-TGAAAAC-ATGGAAGTTTCAGT-ACAGGGTCAA--GGATGTA-GCCTCAT-AAC--AG--AAGAT-GGGATTTGCTAAGG-ATAAGTTAGAC--AAT-TT-ACA--AATGCGGTTC-TGAA---AAG----A--TTAAAAGGG----GCGCG-AATGGAG---AAGAGTTGA-AACT-CG-TAGC-ATTC-AAAGAGCAATGAACACAAGGGGA-TGATGCAGGTCGTAATGCATC--TGACC----ATATT--T--AGGGTAGTGCCTT--CCATAAA---CGAGAAAGGGGTT--TA-agatgtt
gi|5 : tcaagaaactaaacaacgtcgttataaccagcataaattttggtggagaacgagatttgggagtccatgattaattaaaacattagtatctaaaaagatgagcaacggattacacaagaagtaaaccagttgaaagggaatagattgctccCAGGAA--TAGTTGAAGATG-AAGACA-GTGACTGGGATGT--AGA-TC--CCG-AA--G-TTCAA--GTTGGGGACGAGGGGGTTGA-GGTCTCAGAGAAGGAGATGGGAGC-AAGGCCATCCTTATCTGGTAGT-GCAGAGCTT-ATTACTAGCCGTG-TTATTCGCAAAAGAACATTTCCAAGTCCTGTCCAGA-C-CTCCAGAAA-AGTCACAAGTCGAAAAGAGGA-AGTGGTACAG-AGGAAG-TGTGTAGA--TGCCGGTAT-TCAGACAGTCACGTTTGAGCC-CATTCAAGTG-ATCAAG-TCAGCAGAAATTGTGGATCAG-GGT-ATTCAGACAGAAGGATACCGTCGA---------CGTTGGTTAGGCA-AAGACAG---C-T---G-CAC--A--GTAT--CAAA-AAAC-GACCAAGA-TCATCGA-------GAAG---GAA-AAT-T-TTTCGAAA---GTA-AT-GAT-AT-A-AGC-ACATTAA-CTGT-AAT-----AAG--C-GTT-G-T-GTATGGC-CTTGACATT-GCAATT-TAATGCATGT-GTTCA-A-CTTTCAATCACCA-GG--GA-GTGCGA-AGAATT-CATTACTCATGCTT-GATACA----TTTTTTCATG-T-TG-TCAC---TC------------------T---------C-TGTTAT----A-AAAAAACTATAAT---TCAATC-T--TATA---T---TTA-T-ATGT-GAGGGA-CACATGGCG--CGTAGA-G--G-GTG--GGTAGAT-T-A---CAA---TAAAGG----TCGATG---GAGAATGATGGTTGCGT-----ATGT--AT-CATTATCGA----GAT-A--G-----CA--TAAA----TAAGCTTAAT---------GTC-----------CAACC------AG-TGACT--TTTC-GT-AGG-GC-A-TGGT----AT-T--ACA--ATACT----C-CGA-------G-TAGT---TCA--GGTG-T--------T-GAAACTAAT-A-ATA---G-G-C----A------TCT-GCTGATA---CG--TC---ACTTCAG--TTGT--GGAG-ATC--G--AC--GAG-AGAA-GA------C-GG---T-GACA-AA--GG-TAC---T---A--TATATAATA------C----GGCG--TGTATTATA--ATATT--CAG--TATA-----CGGTG-----G--CTA--GTGTACTGA-TA---TG-----GAC--AATAGT-AATAA--AGTATTTC-C---AG-GTTTA-AAGTGT-CAA-----GA--TC-G--GTCC-GGTTATAGAGA---A-AG--T----TA-----A---GACAAG-----CACCTGTCCGG--TATAGGCGGGGGTATAGGA-CAGA-AA-CT----AG-CAT-AGG-----GCAC
gi|6 : AGCTGCAT--ATCTGT-TACTTTAAAAGACCTGTT-GTT-TTATTGTGCTTGACTTTTGTCATTGTATTGCA--TTGTT-A-A-CTTATAGTTA--AGGGAGGA-G-GCGACAAAATTTCCTTATT-AT--TT-G-TGCA--TGCTTTTGC-TGT-------A------T---------------CAT---------C-TGTTTTG--AA--------TAAGAT---T--ATCATTGTATA--TT---TTA-TCATGT-GA-GGA-CA-ATGAAG--GCT-GA-GTCGCGTG--GGTAAGTGTGGCATCAA--TTAGAGA----TCGGGGT-GCGGGAT----GTT-CAG----CATATTAATAT-------A----GAT-G--CTAAATCTA-TAAC----T-------AT---------GCTTTACTGTCAACCG---------GA-CT--TCATATT-GT-AGGAGCTACT--T----AG-GTCATACCACA-TG---CGCGAG-----GGTTAGTACATCGGTGGTA-T----C-AGC-AG--CT-CT-A-ATATATC-G-C-GTGGCAGTATTCT-GCTAGCATTTTGTTTC----GTTCAAATCTGTTGGGAG-CTC--GTCAA--GAGAAGAA-CAAGCAGTC-GGATAC-AATA-AA--GGTTACGG-CA--A--TATATAATATAAATGC---GGGCGTTTGT-TTAT---ACATTGACAGTATATA-----CGGTGCTTACG--CTAAGGTCTATTGA-TCGCGTGCTGTCGAGATAATAAT-AATAA--AGTATCTT-CACAAG-GTTTATAAGTGTAC-ATGAGGGA--TT-GGAGTCCTGGG--TAGGTA---A-GA--TTGCATA---TTA---GAGGAGTACGTCACGTGTCCGGGTTATA-----------GGCA--AC--AA-CT----AG-TAT-GGGCGGTAGCACATATTTAG-C-ATATTA-G-CTC---CCGA--G--CGCTTCTT----CTCA-------CAGCC---ATTAACCAGTTAAGGACATT--CT----A---T-GG-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-CT----------ACA-A---AATCTT-TGT-----ATCTGTAGGCA------TGTATATC-GT--ATTCGAC-T--TG---TC--TCGT-TT-----ATTTT--C----------CTCATTG---TTT-GGCATTATC---A--TTC---ATTAGATAATCC---AT-T----TGC------CGCCAGTATCTG-----GT-T-CGCGCA-ATCA--TCGAAC--CTAA
gi|7 : -TAGTGCT--T-TTCCATA-CTT-CAATC-CCAGGG--AG-AT-CGA-AGAAAT-CATTATTCAT-CT--G-T-CA--TTTT----CATGTTGTCCTCAC---TCTTTTTTACCGGTATTACAT---------G-TATTTTG--AATAAACGATTAATAT---A--ATT-T-GTATAATTTCAATTG-TCATGT-GA-GGAACACATGACGG-CATAGAAG--GCGTGTGGGTAAGTGTGA---CAAACTTGAAGAACAATCGGGTTTCGGCGATG-----T-TGT----CATTT--AT-C-------A----GAT-AGAT-----CT--GACA----T-------ATAA-------GTTTA---------CGTCAACTTCTGG-TA--C--TTTTCGT-AGG-AC-A-TAGT----AG-G--AAA---CA-TGCTCC-CGAG-----GG-TAGT---TCG--GGTG-TTTTTC-A-C-AGTA-T-G--A-ATA---G-GGC-ATAA------TCTTGCTGAGATTTTG--CTCGTAGTTCAT--CTGT--GG-T-CTC------C--GAT--------------C-GA---T-TA-A-AA--AG-TACACGCA--A--TATAATATA------C---GGCTG--TGTATTATTTTATATT---AG--TATATATAACGGTG-----G--TTA--GTATACTGGGTC---TG----CGCA--GATAGTTCGTA----GTAT--C-C---AGAGTTT------GT-A-A-----GA--TCCGT-GTCC-GGGTA-ATG-------AG--C----TA---ATA---G----G-----TACATGTCCGG--TATA-----------AGGA-CAG--AA-CTGTAAAGTCATCAGA-----ACACAGC-CAAGTC-A---TACG-GCCAAACA-A--GCAC----CTTGC--CGAG-------CC-CC---AT--ACCT-TT-AAGTT--T--TTTCCAA---TAGT-CAT-TTG-G-A-T-TTA--GGAAT----------AGG-TGGGAATC-C-C-T-----A----TAAC-A------TAT-TATCTGT--AT---ATAT--TGTCAGC--TCG--TTTTTTAATTTTCCTAATAGCTCTGTTCA-TGTATTTT-TGTAT--TC---ATTTTC---ATT-CATAATGCACGAC-C---ATGT------C-GCCT-A-TTGATTCTGT-C-CG---A-ATCA--AAGAACCACTAAACA
gi|8 : ttaATTAAAAGACC-GTT-GTT-TTATTGTGCTTGACTTTTGCAATT-TATTGCA--T-GTTCA-A-CTTTCAGTTACCAGGG--AG-GAGCGA-AAAATT-CCTTATTCAT-CTT-G-TGCA--TTTTT-----------GCTGAC---TC-----------------AT---------C-TGTTTTG--AA-TAAAGATTA-----------TCAT-GTATA--TT---TTA-TCATGT-GA-GGA-CACATGAGG--CATAGA-G--GCGTG--GGTAA-TGTGA---CAA--ATTGAGA----TCGGGGT-CGGG-ATG-------TAT----CATAT--AT-C-------AAATAGAT-G--C---------TAAA----T-------ATAAAGCTTACGTCAAC--------CG---------GA-CT--T--TATT-GT-AGG-AC-A-T--T----AG-G--ATA--ACA-T----C-CGAG-----GG-TAGT---TCG--GGTGTT----C-AGC-AGTA-T-A--A-ATAC--G-G-C---AA------TCT-GCTGAGATTT-G--TC---AGTTCAA--CTGT--GGAG-CTC--G--ACAAGAGAAGAA-GT------C-GA---TAAAAA-AA--GG-TACGG-CA--A--TATATAATATAAATGC---GGGCGTTTGT-TTAT---ACATTGACAGTATATA-----CGGTGCTTACG--CTAAGGTCTATTGA-TCGCGTGCTGTCGAGATAATAAT-AATAA--AGTATCTT-CACAAG-GTTTATAAGTGTAC-ATGAGGGA--TT-GGAGTCCTGGG--TAGGTA---A-GA--TTGCATA---TTA---GAGGAGTACGTCACGTGTCCGGGTTATA-----------GGCA--AC--AA-CT----AG-TAT-GGGCGGTAGCACATATTTAG-C-ATATTA-G-CTC---CCGA--G--CGCTTCTT----CTCA-------CAGCC---ATTAACCAGTTAAGGACATT--CT----A---T-GG-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-AT----------ACA-A---AATC-CTTGT-----A----T----C------TG--TACATGT--AT---ATAT--TG---AC--TCG--TT-----ATT---------------TTCA-TAT--TTT-TGCAT--TC---A--TTC---A-T-GATAAT-C---A
gi|9 : att-A-GCT--GTT-GAACTGGAAGCATAC-A-AC-A-GGGCAGAG-A-GTCGCCG-GATAGATGCT----GTTGGAGTCA--T-GAGTGGAAGT-T--CTA--CAGAACCGTC-CAGAG--AAAACAAACTCGAT---CGATTCATAGAGACTGTAGAAA-AGAATATGCGCTCTCTACAGC-GAGA-TATT--AAGGAT-TTGAAACAATGGAAGTTTCAGTCACAGGGTCAA--GGACGTATGCCTCATCAAC--AGACAAGCTT-GG--TTACTAAGGATCAAGTTAGAA--AATGTT-GCA--AATGCGGTTC-TGAA---AAG---CACCTTAAAAGGGACT-GCCCGCAATGGAG-CAAAGAATTGG-AACTCCG-TAGCAATTCAAAAGAG-AATAAACACAAGGGGACTGATGCAGCTCGTAA--------TGACC-AATATATT-CTAGAGAGTAGTGCATTTGCCATAAA---CAAGAAAGGGGTTAATACTGTTCACGCGACA-CAAGTATCATTTTGAGAATGGAAT-G-TT-TATTTACCTGTTA-GTTGGTGATTGGTACGA-GG-G-----C-----TGC-ATTTACG--TGGT---------CCTT------GGGT-CACAG-GTCAA-TCCTT-GAC--AAA---GGTAGAGAGAGATGTTCTATCAGC-TAGTGG-ATCA--CCGCTAAATGTACTGGGG---AAAGTTCGAGTAGATT-TAAA-GCTGG-ACAACATTGC--ATTAAA---GC-AT-GAAA--TGGTCATAGC
blockSeqs : A G C A GG C G AGT C T C TGTACTG A TA CCA C GA GTAGAC GAT G G ATTGCAAAA A GCC . T GA GA T T A G C CGC A AA GG CGA A A TT GA TG CA CA TA GAT AG T . A G AA T C C C TAGA A A ACGC TC TGGA TT T CGG T TCTGT CC AGCTCT AG T GGA TA TT CT T A TA G C T T CAA GCAGTTATTATTATATT A C TACT CAAGGGATGAGAGGCAGAATTATTGGAAGCTA G GC TTGTA T GAGGTT TCT TCAAGGA TT G T TT CTTCTA A A TC ACT GA G T A GATAAT A GG CC ATCGATG GC A CA T G T T T C GAA CT A G CA A A T CC A T T GA CATAGTAT GT AC TG GATC G C CA G T C A C AC TTG G T AT TC A C T A GTCA A G TTT TTTC AT C A A GC TCG T A GT G ATA C T A A A AA A A A A CG T T C AA GGGAT G ATC AG G A TT A A TCG GAT G A G T A C G CT TGC CT AAT CTAG TG AAT AA C TCA G AA CATTTTGAG G G A A TT . TG A C GAAATC GT T T C T T C G AAGAGGGTCG T C . TAT C G . C ACAA AA ATG A A A ATC T TGA C GAAT TG A C GT G CATAC A AAA T . T A TT G G CGGTCG T A A T TGG . A C A AG C C G A A G A G GATCGG G C A TT GAC C GT G TTG T A GG AAA GACGGTCCG TT T AT CGATCATTGGAGA TAATG TAAAC T C CCTA A CTTC C C T TA TAT TG AT A AGACAA TG A CT A AG T CG T T GA A G A T C T A G C TGA AG T T G C C G C T A A C T AC T T T TG T G A C A T G C G T AT AT A G T A T G G T TGGCTCGTG TT TAGG T C TCTCCAGTAACGAC TC CA G G TC AATAAAC AGT A CT G G GA G A A AG TTA T A A GTC AC T G T G GA C G G A TG T T C T AG G T C C T A GC C A A TT T T A TTG C C CTCTTTTTTACCGGTATTACATG AT TA AG TAAT A T AT CAA T C G A T CC A TC TG A CAT ACT ACAA A TCG G ATGGTTGCGTATGTATCATTATCGAGATAGCATAAATAAGCTTAATGTCCAACC C GAC CA A AG A T C TGGCGAT A CCA C GCTCC TGGCA T ACA GT TCAGCAGCTCTAATATATCGCGTGGCAGTAT TT T T TC TTT CGT AAT TG A CATG AA AG G AGCAGT A ATA A T T AT T ACGCAA TAAATGCG G TT A TTT GA TA TATAA CTTAC GT AG T GCG CTGTCGAGATAATAATAATAA A ACA A AT ACATGAGGGATTGGA T CT G AGATTGCATATTAGAGGAGTACGT GT GGCGGGGGTATA TC GA A GTAA T C CGGTA T T C TATT C T CAAA G CT CA GCTT AGTC AGAGGAGCA TCT TA AG A CAT GC TCCA TCC T T A C A A A CC A TAGCTTACTC TGGG T T AAGCGATGAATAGACTAT TA TCG AT TCA CG AA TTTTA TC CTC T TAT AT TA AGGA GCG A C ACG CTCAA ATTGCA G C T ATTCT ACA CGCA . CA
blockSeqs : A . . . . . . G . T C AAATA . . CT . . TA G T G AGC . . . . AT A T T A G C C . . . CC A . AT . A C A G . . T . . G . . . C C G . . T . AAT . . . . GAT CC CTA AG T AG . . TT . A . A . A G AAC AGTCC . . G TAAAAGAAGCACTGACAACTATAATGAACTAC G C TT G TTTAGA TCT TT A . G . . . A TC CT CA A . A G . A CC CTACAAG . . AA . G A G . A G C A A . . T T . C C A C TGAAGGA . . . TCTG C . C A C C . A TA A . T A AG G . . T . A A GA TCT . T . A . . . . T . ATA C T A . A . . A A C . T T C . CAGG G AT . G T C C . . . . . G . . . G CT TGC . AA ACA . . . . . . . C G . A . . . T . . T T T T . . . . . TAAGGGTCG . . . . C G . . GGA . . . . . G T T . . . . C . T ATG . TA . . T . AC . A . . . T . C . . . . G . . . G . . . . GT . T . TC TA T . . . . A . . TTG T T TG ACG GTT A . C . . . C . . . . CT . G AAGACA AA . . . . . . G . A A G A . C T A G . TT A . A . C . . C . A A C . A T . T . T . A C A T . T A T A AG A G . . T G G C . . . . . TCATTCGTCACTAG G A . G A . . G T G G G G . C TG T . . T TAA AC . . T . TG A T . A . . . . T . . T C . . A C . . A . T T A TT C C CAGATCTATAATCTGGTCC . A TA TCA A . . . . . . . C G . . . A . T . T GC G GTTCAGCATATTAATATAGATGCTAAATCTATAACTATGCTTTACTGTCAACCG . G . C T . . . GGTATT A G . GCG . . . . TTTTTCACAGTATGAATAGGGCATAA A T T TC G . A . . CGTC . GA . . . . . T . . . TATAA TAAATGCG G TT A A GA TA AC CTTAC . AG G GCG CTGTCGAGATAATAATAATAA . ACA . AT ACATGAGGGATTGGA T CT G AGATTGCATATTAGAGGAGTACGT GT GTA C A . AA . . CGGTA T . . TATT . . C G . . GCTT AA CAG . TA AG A CAT . . . A . . . . . . . . . CT . . ATCTGTAGGCATGTA . . . . T T . CC T . T T . ATT . . G . ACA . . T . C ACA AT . .
blockSeqs : . . TAT . . A . . . . A . AG . . . . A A . . A . . . . . . GA A . T . . A A . . . . . . . . . . . . . . . A . GTA . . . . T TG CTA . T A . . GG . A . C . A A GAC AGTG . . A CTGAGGGAGAAAAGTGTAAATACAGGCTGTT . A TT A GAGGTT CT T . . T . . . C . C CA A . G A . A . CTG . . TT . A G A . A C A A G . . T . . C T A G AGGGA . . . GTT C . T T A G . A T C . G A A A . . T . T A T TT . C . C . . . . . . A . . . . . . . . A . . . . . . CAG A . . . . . A . . . . . A . . . A A T . A CT . . . . . . . . . . . . . . T . . C . . G . . . . . AAAGGTAG . . . . . . . . AG . . . . . T . . . . TG . G . . . . TG . . T TA . . . . . . . . GT T . T A T . . A . . . C . . . . AC . G ATG . . . . . . . G . T . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . A . . . A . A . . . . . . . . . . . . . . CTGCACA . . . . A . . . T . G A . . A G T . . A TAA A . . T . TG T T . T . . . . A . . T C . . C C . . A . T T A T C C CTCATC . A AG T A . . . . . . . A . . . . G . A . G CG A GGTTGGTATTATATGTATCAGATAGTGCTAATAAAAGCTCATGTCCA . G . . T . . . TAGGTC T G . C . . . . TTGAGCAAGTGTATAAATAGGGCG A T A TT G . A . . AG . AA . . . . . T . . . TAGGC CCAGG G . G A . . . . . . . . GACCCAGATAGTATGAGT . . . A CAAAGTCCG . TT G GTAAATGTTAAGACAAG . A C A . . . . . . . . C . . C . . . T GC CAG . . T . CG . . . . . . . . . . . . . T . . ATAATAATAT . . . . . . . . T . . T . A . . . . ACA . . . . . C A . .
blockSeqs : A . . . T . AA . . . . T CT CT . T A . . TT . T . C . A A AC TGTC . . T TAAAGAAGCACTGAACAACTATAATGAACTA . A TT A CGA TT T . . T . . . C . . GC G . A G . A . CTA . . TT . A G A . A T G A G . . C . . . C T . AGTTA . . . GAA . . . T A . . . A C . A A A G . . . . . A T . . . . G . . TGG . . . . . . A . . . . . . . . . . T . . . T . . . . . T . . . . . . . . . . . A . . . A T . . . . . . C . . . . T . . . . . . . G . A . . . . . . . . . . C T . . G . . . . T . . A C . . A C . . G . T G . T . G CTCTC . T AT A . . . . . . . . C . . . . G . T . G C G TTGTCATTTATCAGATAGATCTGACATATAAGTTTACGTCAACTTCT . T . . A . . . AGTAGG C A . C . . . . CAGGGTACTATATAACGCAGTGA T T T TT T . G . . AG . AA . . . . . C . . . GGCAA CG C . A A . . . . . . . . CGCAGATAGTTCGTA . . . A AAGATCCGT . TT G ATATTAAGAACAAG . G C . . . . . . . . . C . . C . . . . A CA . . . . TA . . . . . . . . . . . . . T . . ATAACATAT . . . . . . . . T . . G . A . . . . AG . . . . . C A . .
blockSeqs : . . . G G A . . A . . A . T . G . T T AT AGTC . . T CTGGGGAGGAAAAGTGTAATTACAGGCTGTT . A T A CGA T T . . T . . . A . . GA G . A T . A . CTA . . CC . G G C . A T G T T . . A . . . . A A T . A . A . . . . . . . . . . . G . T . . . . . . . . . . . C . . . G . . . . . . . TCATC . . . . . . . . . . . . G . . . . . . A . T C G TATCATATATCAAATAGATGCTAAATATAAAGCTTACGTCAACCG . T . . A . . . TATTG T A . C . . . . CAGGGTACTATATAACGCAGTGA T T C C T . G . . CG . A . . . . . T . . . GGCAA CG G . A A . . . . . . . . GACAATAGTAATAA . . . A CGAGATCG . GT T AATTTAAGACAAG . A C . . . . . . . . . T . . C . . . . A CA . . . . T . . . . . . . . . . . . . T . . ATAATAT . . . . . . . . . . . T . A . . . . CA . . . . . C A . .
blockSeqs : . . . A . . A . . A . C . A . T T TC ATG . . G CAGGATAAGGCAAGAATATTGAAGCTA . C T T GA T T . . T . . . A . . G G . A G . A . CTT . . CA . A T T . C A T T . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . G G . . A . . A . . . TATG A A . C . . . . TTCAGCAGTATAAATACGGCAA T . G T C . T . . CG . A . . . . . A . . . TA CG . . . . . . . . . . . . GA . . . A CGAGATCG . G T AAGTTAAGACAAG . G . . . . . . . . . . T . . C . . . . A CC . . . . C . . . . . . . . . . . . . A . . ATAATA . . . . . . . . . . . T . A . . . . T . . . . . T A . .
blockSeqs : . . . . . . . T . G . G C TC TTG . . G AAGGGATAAGGCGATTATTGGAAGTA . C T G GA C . . . . . . . A . . G . . . . . . . ATG . . TG . A A C . T A C T . T . . A . . . TAGG T . . . . . . . TTGAAACTAATAATAGGCA T . G . T . A . . C . . . . . . . . . . . TA C . . . . . . . . . . . . GA . . . . CAAGATCG . G . AGCTAATAGG . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . C . . . . T . . . . . . . . . . . . . T . . ATCTG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C A . .
blockSeqs : . . T . CA AGT . . G . A . T G . . . . . . . . A . . . . . . . . . . ATG . . C . . T T . . G C . . . . . . . G . . . . T . . . . . . . . . . . . . A . . ATGT . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . AT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . ATAA . . . . . . . . .
blockSeqCons : A* ** T******* NC* AGTN************** GA******** CT* CGAGTNA** GNN*** A** TT*** CGG*** AT* T* A*** CT*** T* ** AAGGTG******* ** G* T** CTCTTATC**************************** C** TANG********* TTGAGCANTATAAATACGGCGA************************ NG**** NGCAA***** CG********* GCAGATAGTATAGTGA******** A* CGAGATCG*********** AGATTAAGACGAG*********************** C*** CA******** ATAATAT******************* ACA*** A**** **
originalCons : AGAGAGAGAATACATGA-TTCGTTA-CGGG-TCCTGAACTCTTCTAGGAGCATGC-GTCCCATAGCCCGAGACCCATACCAGG---TAT----GA-GT--ACCAGT-ACC--CCGTATGTA---AGAG--CAAGAGAGAG-------AG-TGTAA-GTGG---ATAT-TT-AGTG-A-TGA-ATGCATGTGTACATGATGAGAGAGGTACTCGTCCCGC--ATCAAGAGTTACTA-GTCCC--GT--ATCGNGAGT-TACTCGTCTCGCA-T-CGAA--CAA--CAGACTGATGCCAGAG-A-TAC-GTC---CCAGGAT--GGATG-CAAACCTGCATGGACAGA--TCCGGTCTA-AG-CCCGAAACTTCGT----AAA-CCA-GCGACATA---TGATGGTACG--GGTCTCTGG-GAAGATTA--CTTGTC-GCATT---TC-GA---G-T--GCGTGT----CTACT--GAATGAGTGG--A-CAG--AC--ANTGA-GAAAGGTNT--ATACTTGG-CTGCGTCNCTNAGGGGNACAAGCACAAGG--AG-----------T-NTTAG-GAAA-TCAG---C------C-----A----------A--G-------------A--A-----TNATTGGA-----------AGCTA-----------GT-TAAAGC-CCTT---CGGGGNA----GA----TTTGCT-TCCAG-T------AAA--CCAG-ACTGAGCT--AT------A-TAGAGCACAGCT--GAGA---GAGAAAGGAGGC-AAAAG-----GCATCT-GAA-AGTT--TGCCGGAG--C--T----GGGT--C-AAGACGTAAGAA-GGCTNGCNAA-TCTAGCNTACCC--NACC-GCTCCNGATGAGGT--AAGAG-AAACNC-TTG--CTACAGGAGCAGTTCTTNGATGG-ACTACGNAGT-T-CA--GAG--AT--GCG-TC--TCAAG-ATC-AAACAGGCAAGACCTGTAAACCTGAAT-GATGCGATACGGAG-A-GCC--GTT-GAACTGGANGCATAC-A-AC-A-GGCCAGAGGA-GTCGCCG-GATAGATGCT----GTAAGAGTCA--T-GAGTGGAAGT-T--CTA--CAGAACCGTC-CAGAG--AAAACAAACTCGAT---CGAT-CATAGAGACTG-AGAAA-AGAATATGCGCTCTCTACAGC-GAGA-TATT--AAGGAT-TTGAAACAATGGAAGTTTCAGTCACAGGGTCAA--GGACGTATGCCTCATCAAC--AGACAAGCTCGGG--TTGCTAAGG-TCAAGTTAGAA--AATGTTAACA--AATGCGGTTC-TGAA---AAG---CACCTTAAAAGGGACT-GCCCGCAATGGAG-CAAAGAGTTGG-AACTCCG-TAGCAATTCAAAAGAG-AATGAACACAAGGGGACTGATGCAGCTCGTAATGCATC--TGACC-A--ATATT-CT--AGAGTAGTGCATT--CCATAAA---CGAGAAAGGGGTT--TA-TGT---CACGGCA-C--GTATC--------CATGGAAT-GATG-TA--TACCTGTTG-GTTGAT-ACAGGCGCTA-CG-G-----CGTCCTTGCTATCTACAATTTGTTA-TGAGAACATTTGC-AAGGGT-CACAG-GTCAA-TCCTT-GAC--AAG---GTCGGAGAGAGATGTGCTATCAGC-TAGTGG-ATCA--CCGCTAAAGGTACTGGGA---AAAGTTCCAGTAGATT-TAAA-GTTGG-A-GACATTGC--GTTAAA---GC-AT-G-AA--CGGTCATAGCT--TGACCTA-ACAGTGGATGGGA--TCTT--GGATTAGATTTCCTGGTTAAGCATG--AGGCAGTAAT-CG---AC-ATGCGCATGCATA-GA-TAAAAA--TATCTGGC-ACGGAGCAC-CCTATCAAGCTGGAAGGGTTGC------AACCTCATANAAGGTAG-CCAC--CTTT-CATG-GA-GTCACGGATACCACCTAGATCGGAAGCTGATGGTA-GAAGGAG-AGATACGT-ACTAGGATC--GGATGGAGGACTCTCAGCC-AAGC-T-GAATA-TGATA--AA-GCATT---C-GGAAA--AGT---TTCAGAAG-----CCGGGTTCTTGTT-T-GCTGGCC------------A--AAACACCTG--T----CCGT-----ACA-CAGAAGNACA----TGC-GACACAAACG----GCCGGATG-CCTCTTC-CAC--ATCATC---ANCGGGAA--TAGTTGAAGATG-A-GACG-GTGACTGGGATGT--AGA-TC--CCG-AA--G-TTCAA--GTTGGGGACGAGGGGGTTGA-GGTCTCAGAGAAGN-GATGGGAGC-AGGGCCATCCTTATCTGGTAGT-GCAGAGCTT-ATTACTAGCCGTG-TTATTCGCAAAAGAACATCTCCAA-TCCTGTCCAGA-C-CTCCAGAAA-AGTCACAAGTCGAGAAGAGGA-AGTGGTACAGTAGGAAG-TGTGTAGATGTGCCGGTAT-TCAGACAGTCACGTTTGAGCC-CATCCGAGTG-A-CAAG-TCAGCAGAAATGGTGGGTCAG-GGT-ACTCAGACAGAAGGATACCGTCGA---------CG--GGT----CA-AAGA-AG---T-TC--GTCAC--G--GTAT--CAAG-AAACGGACAAAGAGTCA-NGA-------GAAG---GAAGAAT-T-TTCCGTAAGATGTAGACGGAT-AT-ACAGC-GCAT--A-CTGT-AACATTAAAAGACC-GTT-GTT-TTATTGCGCTTGACNTTNGCAATT-TANTGCA--T-GTTCA-A-CTTTCAGTCACCAGGG--GA-GTGCGA-AGAATT-CATTATTCAT-CTT-G-TACA--TTTTTTTTCATGTT-TGCTCAC---TCT---------------CAT---------C-TGTTTTG--AA-AAAAGATTAAGAT---T--ATCAT-GTATA--TT---TTA-TCATGT-GA-GGA-CACATGANG--CATAGA-G--GCGTG--GGTAAGTGTGA---CAA--TTAGAGG----TCGGGGT-CGGGGATG--GGTT-CGT----CATGT--AT-C-------A----GAT-G--C-----CT--TAAA----T-------AT---------GTT-----------CG---------GG-TG--T--TATT-GT-NGG-GC-A-T--T----AT-G--ANA--GCA-T----C-CGAG-----GG-TAGT---TCG--GGTG-T----C-AGC-GGTACT-AT-A-ATA---G-G-C-GTGA------TCT-GCTGANATTTCG--NC---AGTTCAG--CTGT--GGAG-CTC--G--AC--GAGAAGAA-GA------C-GG---T-GATA-AA--GG-TAC---TA--A--TATATAATA------C---GGGCG--TGTATTATA--ATATT--CAG--TATA-----CGGTG-----G--CTA--GTGTACTGG-TC---TG----CGAG--AATAGT-AATAA--AGTATTTC-C---AG-GTTTA-AAGTGT-C-A-----GA--TC-G--GTCC-GGNTATAGGGA---A-AA--T----TA---ATA---GACGAG-----CACCTGTCCGG--TATA-----------AGGA-CAG--AA-CT----AG-CAT-AGG-----GCACAGA-CAAG-C-A---TA-G-GTC---CC-A--G--C----CTTA---CGCA-------CA-CC---AT--ACC--TT-AGGTC--T--CT----A---T-GC-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-AT----------AGG-T---AATC-C-TGT-----A----TA---A------TAT-TATCTGT--AT---ATAT--TG---AC--TCG--TT-----ATTTT--TAATAG---TGTTCA-TA---TTT-TGCAT--TC---A--TTC---ATT-GATAAT-C---AT-C---ATGC------C-CCAG-A-CTG-----GT-C-CG---A-ATCA--ACGAAC--CTAAACAC
finalCons : AGAGAGAGAATACATGA-TTCGTTA-CGGG-TCCTGAACTCTTCTAGGAGCATGC-GTCCCATAGCCCGAGACCCATACCAGG---TAT----GA-GT--ACCAGT-ACC--CCGTATGTA---AGAG--CAAGAGAGAG-------AG-TGTAA-GTGG---ATAT-TT-AGTG-A-TGAA-TGCATGTGTACATGATGAGAGAGGTACTCGTCCCGC--ATCAAGAGTTACTA-GTCCC--GT--ATCGNGAGT-TACTCGTCTCGCA-T-CGAA--CAA--CAGACTGATGCCAGAG-A-TAC-GTC---CCAGGAT--GGATG-CAAACCTGCATGGACAGA--TCCGGTCTA-AG-CCCGAAACTTCGT----AAA-CCA-GCGACATA---TGATGGTACG--GGTCTCTGG-GAAGATTA--CTTGTC-GCATT---TC-GAT-------GCGTGT----CTACT--GAATGAGTGG--A-CAG--AC--ANTGA-GAAAGGTNT--ATACTTGG-CTGCGTCNCTNAGGGGNC-AAGCACAAGGAGTN--------------TTAG-GAAA-TCAG---C------C-----A----------A--G-------------A--A-----TNATTGGA-----------AGCTA-----------GT-TAAAGC-CCTT---CGGGGNAGA--------TTTGCCT-CCAG-T------AAA--CCAG-ACTGAGCT--AT------A-TAGAGCACAGCT--GAGA---GAGAAAGGAGGC-AAAAG-----GCATCT-GAA-AGTT--TGCCGGAG--C--T----GGGT--C-AAGACGTAAGAA-GGCTNGCNAA-TCTAGCNTACCC--NACC-GCTCCNGATGAGGT--AAGAG-AAACNC-TTG--CTACAGGAGCAGTTCTTNGATGG-ACTACGAGTNA--CA--GAG--AT--GCGNN---TCAAG-ATC-AAACAGGCAAGACCTGTAAACCTGAAT-GATGCGATACGGAG-A-GCC--GTT-GAACTGGANGCATACA--AC-A-GGCCAGAGGA-GTCGCCG-GATAGATGCT----GTAAGAGTCA--T-GAGTGGAAGTT---CTA--CAGAACCGTC-CAGAG--AAAACAAACTCGAT---CGAT-CATAGAGACTG-AGAAA-AGAATATGCGCTCTCTACAGC-GAGA-TATT--AAGGAT-TTGAAACAATGGAAGTTTCAGTCACAGGGTCAA--GGACGTATGCCTCATCAAC--AGACAAGCTCGG---TTGCTAAGGAT-AAGTTAGAA--AATGTTAACA--AATGCGGTTC-TGAA---AAG---CACCTTAAAAGGGACT-GCCCGCAATGGAG-CAAAGAGTTGG-AACTCCG-TAGCAATTCAAAAGAG-AATGAACACAAGGGGAT-GATGCAGCTCGTAATGCATC--TGACCA---ATATTCT---AGAGTAGTGCATT--CCATAAA---CGAGAAAGGGGTT--TA-TGT---CACGGCA-C--GTATC--------CATGGAAT-GATG-TA--TACCTGTTG-GTTGAT-ACAGGCGCTA-CG-G-----CGTCCTTGCTATCTACAATTTGTTA--GAGAACATTTGC-AAGGGT-CACAG-GTCAA-TCCTT-GACAAGGTG-------AGAGAGATGTGCTATCAGC-TAGTGG-ATCA--CCGCTAAAGGTACTGGGA---AAAGTTCCAGTAGATT-TAAA-GTTGG-A-GACATTGC--GTTAAA---GC-AT-G-AA--CGGTCATAGCT--TGACCTA-ACAGTGGATGGGA--TCTT--GGATTAGATTTCCTGGTTAAGCATG--AGGCAGTAAT-CG---AC-ATGCGCATGCATA-GA-TAAAAA--TATCTGGC-ACGGAGCAC-CCTATCAAGCTGGAAGGGTTGC------AACCTCATANAAGGTAG-CCAC--CTTT-CATG-GA-GTCACGGATACCACCTAGATCGGAAGCTGATGGTA-GAAGGAG-AGATACGT-ACTAGGATC--GGATGGAGGACTCTCAGCC-AAGC-T-GAATA-TGATA--AA-GCATT---C-GGAAA--AGT---TTCAGAAG-----CCGGGTTCTTGTT-T-GCTGGCC------------A--AAACACCTG--T----CCGT-----ACA-CAGAAGNACA----TGC-GACACAAACG----GCCGGATG-CCTCTTC-CAC--ATCATC---ANCGGGAA--TAGTTGAAGATG-A-GACG-GTGACTGGGATGT--AGA-TC--CCG-AA--G-TTCAA--GTTGGGGACGAGGGGGTTGA-GGTCTCAGAGAAGN-GATGGGAGC-AGGGCCATCCTTATCTGGTAGT-GCAGAGCTT-ATTACTAGCCGTG-TTATTCGCAAAAGAACATCTCCAA-TCCTGTCCAGA-C-CTCCAGAAA-AGTCACAAGTCGAGAAGAGGA-AGTGGTACAGTAGGAAG-TGTGTAGATGTGCCGGTAT-TCAGACAGTCACGTTTGAGCC-CATCCGAGTG-A-CAAG-TCAGCAGAAATGGTGGGTCAG-GGT-ACTCAGACAGAAGGATACCGTCGA---------CG--GGT----CA-AAGA-AG---T-TC--GTCAC--G--GTAT--CAAG-AAACGGACAAAGAGTCA-NGA-------GAAG---GAAGAAT-T-TTCCGTAAGATGTAGACGGAT-AT-ACAGCG-CAT--A-CTGT-AACATTAAAAGACC-GTT-GTT-TTATTGCGCTTGACNTTNGCAATT-TANTGCA--T-GTTCA-A-CTTTCAGTCACCAGGG--GA-GTGCGA-AGAATT-CATTATTCAT-CTT-G-TACA--TTTTTTTTCATGT--TGCTCACTCTTATC----------------------------TGTTTTG--AA-AAAAGATTAAGAT---T--ATCAT-GTATA--TT---TTA-TCATGT-GA-GGA-CACATGANG--CATAGA-G--GCGTG--GGTAAGTGTGA---CAA--TTAGAGG----TCGGGGTC--GGGATG--GGTT-CGT----CATGT--AT-C-------A----GAT-G--C-----CT--TAAA----T-------AT---------GTT-----------CG---------GG-TG--T--TATT-GT-NGG-GC-A-TTANG---------ANA--GCA-T----C-CGAG-----GG-TAGT---TCG--GGTGTTGAGCANTATAAATACGGCGA------------------------TCT-GCTGANATTTCG--NC---AGTTCAG--CTGT--GGAG-CTNG----AC--GAGAAGAA-GA------C-GG---T-GATA-AA--GG-TACNGCAA-----TATATAATACG---------GGCG--TGTATTATA--ATATT--CAG--TATA-----CGGTG-----G--CTA--GTGTACTGG-TC---TGGCAGATAGTATAGTGA--------AGTATTTC-C---AG-GTTTA-AAGTGTCGAGATCG-----------GTCC-GGNTATAGGGAAGATTAAGACGAG-----------------------CACCTGTCCGG--TATA-----------AGGA-CAG--AA-CT----AG-CAT-AGG-----GCACAGA-CAAG-C-A---TA-G-GTC---CC-A--G--C----CTTA---CGCACA--------CC---AT--ACC--TT-AGGTC--T--CT----A---T-GC-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-AT----------AGG-T---AATC-C-TGTATAATAT-------------------TATCTGT--AT---ATAT--TG---AC--TCG--TT-----ATTTT--TAATAG---TGTTCA-TA---TTT-TGCAT--TC---A--TTC---ATT-GATAAT-C---ATACA---TGC------C-CCAG-A-CTG-----GT-C-CGA----ATCA--ACGAAC--CTAAACAC
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|26 ): GTAACGAATTGAGATCGGATTTGGAAGCATTATATATCGATTATCTAGAGGAAAAGGCAAATATGACGAAAAACGCTTATGTCAACCGGACTTTGGTGTAGAGTATCACGAT
Unaligned ( gi|29 ): TGTAACGAATTGAGATCGGATGTGGAAGCATTATATATCGATTATCTAGAGGAAAAGGCAAATATGACGAAAAACGCTTATGTCAACCGGACTTTGGGTGTA
Unaligned ( gi|31 ): AATTTTGGTGGCAGCAACGGGATTTGGATCGGTCAGNTCAATAAGTTTGTTAATAGACAGAAGAGTGAACAATAATAATATATAAGTTACTCGGCTAG
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 1 22 111 2222222222 1 11 1 11 222222 222 4444444444 1 111 1 1 111 111 1 11 11 111 1 111 11 22 111 11 111 11 1 1 11 1 1 2222 1111 11 1111 11 111 111 111111 1111111 11 11 333333333333333333 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 22222222222222222222222 1111111 111 111111 11 111 111111 11 11111 11 1 1 11 333 11 11 11 1111 11 111 111 22222 1111 11111 11 11 111 1 1 11 1 1 11 11 1 11 11 11111 1111 11 1 11 111 111 2 11 2222 11111 11 111 11 111 1 11 333333333 1 1 11 222222 22 1 4444444444444 11 111 1 1 11111 11 111 1 1 1 111 222 1 2222 11 11 222222 1 222 1 11 1 1 333333 1 333 1 1 1 22 1 1 1 1 3333333 1 1 111 111 11 1 111 1 11 111 444444444 111 444444444444444 1111111 22222 1111 1111 11 111 11 33333333 11 11 11 1 1 11 11 1 1 1 1 1 1 1 1 11 1 1 111 111 1 1 444444444 11 2222 1 1 4444444444444444444 22 22 1 11 3333333 111 111 1 222 11 111 1 11 1 111 111 88888888888888888888888888 11 222222 111 11 1 111 111 1111 1 1 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1 1111111111 111 111111 11111 1111111111111 1 1 3333333333333 1111111 111111 2222222 33333333333 11 111 11 11 11111 22222 11 8888888888888888888888888888888888 111 11 3333333 11 1 4444444444444444444444444444444444444 11 333333333333 11 1111 22222 1 1111 2222 2222 2222222222 11 11 222 1111111111 33333333333333333333333333 11111 11 111 111 11111111111 1 11111 111 11111
lowQualScore : 7 3 6 3 00 6 6 666 6 3 2 7777777777 0 33 666 0 33 0 666666 000 1 2 6666666666 0 777 0 0 0 111 88 3 3 3 2 2 666 0 33 33 222 3 0 111 33 33 55 111 66 777 33 3 0 5 2 33 0 0 2 2 5555 8 8 0 5555 11 0000 99 5 000 000 555555 66 6666666 33 9 9999 66 66 55 5 1 66 1 4 0 1 2 55 55 000000000000000000 4 4 7777 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 8 55 11111111111111111111111 999 7777777 222 4 4 66 222222 4 1 11 666 88 4 4 3 111111 4 88 11 11111 8888 55 44 33 4 2 1 1 0 4 5 777 44 1 6 77 5 1 1 888 5 0 8 6 33 555 777 11 11 11 8888 5 8 11 1 1 5 8 5 888 111 6 1 222 6 6 6 8 8 0 6 33333 3 4444 0 55555 11 0 3 8 1 11 777 0 5 00 2 0 333 2 3 3 0 33 33 0 3 3 8 33 3 3 2 11 5 22222 6 3333 11 0 99 99 1 8 444 444 0 0 8 8 3 8 8 0 0 8 3 4 999 11 9999 88888 0 11 444 11 8 777 0 33 888888888 2 0 3 0 33 8 88 8 8 666666 0 0 0 77 0 5 8 8 8 8 8 8888888888888 8 8 11 0 777 2 2 0 0 55555 33 777 0 0 0 888 3 555 3 4444 88 7 2 33 8 333333 0 000 0 33 3 0 66 0 6 888888 7 7 1 3 000 3 3 3 7 44 6 6 6 2 7 3 3 3 0000000 6 2 3 111 444 7 33 0 777 0 3 33 777 000000000 66 3 111 333333333333333 9999999 88888 8 8 7777 6 4444 1 6 0 8 33 777 22 11 0 8 33333333 88 6 99 55 6 99 2 8 11 3 2 3 0 2 3 3 2 0 2 33 22 0 9 0 0 0 2 0 0 2 0 3 3 2 0 55 5 0 3 88 0 3 0 3 2 3 3 0 6 2 3 111 555 3 2 0 0 9 2 2 0 6 000000000 33 1111 0 0 8888888888888888888 33 33 5 2 11 2222222 777 6 111 2 2 55 2 0 888 99 111 8 8 6 222 55 8 8 0 8 0 77 0 1 8 0 6 1 99 6 6 6 3 99 6 3 1 5 5 1 00 5 5 2 77 1 4 3 555 1 111 66666666666666666666666666 99 00 44 000000 7 6 99 111 6 6 6 6 1 55 6 99 99 2 000 333 0 2222 5 1 1 1 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 5 888 66 0 66 5 5 5 7777777777 1 111 5 666666 22222 5 888 66 6666666666666 0 5 0 4444444444444 55 9 1 33 777 888 888 66 7777777 66 77 5 444444 5 888 5 2 5 66 5 8888888 00000000000 5 33 5 333 33 33 99999 55555 66 33 3333333333333333333333333333333333 0 5 777 5 00 2222222 55 88 0 44 0 5 7777777777777777777777777777777777777 33 111111111111 77 66 5 7777 5 5 22222 0 5 5 8888 5 5 777 8 66 66 3333 0000 5555555555 777 22 66 8 000 55 8888 777 8 4 4 4 4 4 4 55 4 7777777777 99999 4 4 00000000000000000000000000 55 777 0 55 777 99 99 00000 11 999 5 333 55 66 999999 888 5 66 5 11111111111 5 5 0 5 77777 222 00000 66 66
lowQualScore : . . . . .. . . ... . . . .......... . .. ... . .. . ...... ... . . .......... . ... . . . ... .. . . . . . ... . .. .. ... . . ... .. .. .. ... .. ... .. . . . . .. . . . . .... . . . .... .. .... .. . ... ... ...... .. ....... .. . .... .. .. .. . . .. . . . . . .. .. .................. . . .... .................................................................................... . .. ....................... ... ....... ... . . .. ...... . . .. ... .. . . . ...... . .. .. ..... .... .. .. .. . . . . . . . ... .. . . .. . . . ... . . . . .. ... ... .. .. .. .... . . .. . . . . . ... ... . . ... . . . . . . . ..... . .... . ..... .. . . . . .. ... . . .. . . ... . . . . .. .. . . . . .. . . . .. . ..... . .... .. . .. .. . . ... ... . . . . . . . . . . . . ... .. .... ..... . .. ... .. . ... . .. ......... . . . . .. . .. . . ...... . . . .. . . . . . . . ............. . . .. . ... . . . . ..... .. ... . . . ... . ... . .... .. . . .. . ...... . ... . .. . . .. . . ...... . . . . ... . . . . .. . . . . . . . . ....... . . . ... ... . .. . ... . . .. ... ......... .. . ... ............... ....... ..... . . .... . .... . . . . .. ... .. .. . . ........ .. . .. .. . .. . . .. . . . . . . . . . . .. .. . . . . . . . . . . . . . . .. . . . .. . . . . . . . . . . . ... ... . . . . . . . . . ......... .. .... . . ................... .. .. . . .. ....... ... . ... . . .. . . ... .. ... . . . ... .. . . . . . .. . . . . . . .. . . . . .. . . . . . . .. . . . .. . . . ... . ... .......................... .. .. .. ...... . . .. ... . . . . . .. . .. .. . ... ... . .... . . . . .......................................................................................................... . ... .. . .. . . . .......... . ... . ...... ..... . ... .. ............. . . . ............. .. . . .. ... ... ... .. ....... .. .. . ...... . ... . . . .. . ....... ........... . .. . ... .. .. ..... ..... .. .. .................................. . . ... . .. ....... .. .. . .. . . ..................................... .. ............ .. .. . .... . . ..... . . . .... . . ... . .. .. .... .... .......... ... .. .. . ... .. .... ... . . . . . . . .. . .......... ..... . . .......................... .. ... . .. ... .. .. ..... .. ... . ... .. .. ...... ... . .. . ........... . . . . ..... ... ..... .. ..
lowQualScore : 3 3 7 3 00 7 7 000 7 2 5 8888888888 0 88 000 0 88 2 555555 222 2 5 0000000000 0 555 8 0 0 000 88 2 2 2 5 5 222 0 88 88 222 2 0 000 88 88 88 000 55 555 88 2 0 5 5 88 0 0 5 5 0000 0 0 8 4444 00 0000 00 7 000 000 888888 44 7777777 88 4 0000 99 99 11 0 0 99 9 4 7 0 6 44 55 111111111111111111 4 4 9999 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 9 66 44444444444444444444444 999 4444444 222 4 6 11 888888 4 8 00 555 33 7 4 6 222222 4 00 00 00000 5555 55 77 77 0 7 0 0 9 4 3 111 66 0 6 99 7 0 4 000 0 4 9 6 00 666 666 00 00 00 0000 0 0 22 0 0 0 0 6 777 333 7 0 555 7 7 4 0 0 8 0 00000 8 8888 8 66666 00 8 2 0 4 00 555 0 5 22 5 0 555 5 2 2 0 22 88 0 2 2 8 88 2 2 5 00 6 22222 4 2222 00 0 88 00 0 0 000 000 8 8 0 0 2 0 0 8 8 0 2 0 000 00 6666 22222 8 00 000 00 0 555 0 88 888888888 5 0 2 0 88 0 88 0 0 444444 8 8 8 00 6 6 0 0 0 0 0 6666666666666 0 0 00 8 555 5 5 0 0 88888 88 555 0 0 0 000 2 777 3 0000 33 3 5 88 8 555555 0 555 0 88 2 0 88 0 5 333333 3 3 0 3 333 3 3 3 3 00 7 7 7 0 3 3 3 3 3333333 7 0 3 000 000 0 88 0 555 0 2 88 555 222222222 55 2 000 000000000000000 0000000 00000 0 8 0000 7 2222 0 7 8 0 88 555 44 00 8 2 22222222 33 7 22 88 7 22 5 0 00 2 5 2 0 5 2 2 5 0 5 00 00 0 8 2 2 0 5 0 0 5 0 2 2 5 0 88 5 0 2 00 2 2 0 2 5 2 2 0 5 0 2 000 888 2 5 0 0 2 5 5 2 5 000000000 88 2222 0 0 0000000000000000000 88 22 0 5 00 5555555 555 5 000 5 5 88 5 0 222 22 888 0 0 0 222 88 0 0 6 0 8 88 8 0 8 8 7 0 22 7 7 7 5 22 7 5 0 7 7 3 00 7 7 3 99 4 9 3 888 0 777 33333333333333333333333333 22 22 55 222222 3 7 22 777 7 7 7 7 0 88 7 22 22 0 000 333 6 1111 7 7 4 4 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 0 222 99 0 00 0 0 0 4444444444 0 111 0 999999 55555 0 888 99 8888888888888 0 0 8 2222222222222 88 4 0 55 999 888 000 99 8888888 99 11 0 444444 0 888 0 2 0 99 0 1111111 00000000000 6 88 1 444 88 88 44444 00000 99 88 0000000000000000000000000000000000 9 0 555 0 11 9999999 22 88 0 22 1 6 1111111111111111111111111111111111111 88 555555555555 55 99 0 5555 0 0 22222 0 0 0 4444 0 0 888 9 11 11 3333 2222 1111111111 888 22 77 0 444 55 5555 000 0 0 0 0 0 0 0 55 0 5555555555 88888 0 0 55555555555555555555555555 55 000 8 55 000 55 55 00000 00 000 0 888 11 99 666666 888 0 99 0 22222222222 7 7 0 0 55555 000 99999 99 99
consensus : AGAGAGAGAATACATGA-TTCGTTA-CGGG-TCCTGAACTCTTCTAGGAGCATGC-GTCCCATAGCCCGAGACCCATACCAGG---TAT----GA-GT--ACCAGT-ACC--CCGTATGTA---AGAG--CAAGAGAGAG-------AG-TGTAA-GTGG---ATAT-TT-AGTG-A-TGA-ATGCATGTGTACATGATGAGAGAGGTACTCGTCCCGC--ATCAAGAGTTACTA-GTCCC--GT--ATCGNGAGT-TACTCGTCTCGCA-T-CGAA--CAA--CAGACTGATGCCAGAG-A-TAC-GTC---CCAGGAT--GGATG-CAAACCTGCATGGACAGA--TCCGGTCTA-AG-CCCGAAACTTCGT----AAA-CCA-GCGACATA---TGATGGTACG--GGTCTCTGG-GAAGATTA--CTTGTC-GCATT---TC---GA---T--GCG-TGT----CTACT--GAATGAGTGG--A-CAG--AC--ANTGA-GAAAGGTNT--ATACTTGG-CTGCGTCNCTNAGGGGA-CAA--GCACAAGG--AG-----------T-NTTAG-GAAA-TCAG---C------C-----A----------A--G-------------A--A-----TNATTGGA-----------AGCTA-----------GT-TAAAGC-CCTT---CGGGG----NA-GA----TTTGC-CTCCAG-T-----AAA---CCAG-ACTGAGC--TAT------A-TAGAGCACAGCT--GAGA---GAGAAAGGAGGC-AAAAG-----GCATCT-GAA-AGTT--TGCCGGAG--C--T----GGGT--CAA-GACGTAAGAA-GGCTNGCNAATCT-AGCNTACCC--NACC-GCTCCNGATGAGGT--AAGAG-AAACNC-TTGC--TACAGGAGCAGTTCTTNGATGG-ACTACGTAGTNACA--GAG--AT--GCG-TC-TCAAG-ATC-AAACAGGCAAGACCTGTAAACCTGAAT-GATGCGATACGGAG-A-GCC--GTT-GAACTGGANGCATAC-A-AC-AGG-CCAGAGGA-GTCGCCG-GATAGATGCTGT----AAGAGTCA--T-GAGTGGAAGT-T--CTA--CAGAACCGTC-CAGAG--AAAACAAACTCGAT---CGAT-CATAGAGACTG-AGAAA-AGAATATGCGCTCTCTACAGC-GAGA-TATTAA--GGAT-TTGAAACAATGGAAGTTTCAGTCACAGGGTCAA--GGACGTATGCCTCATCAAC--AGACAAGCTC-GG--TTGCTAAGGAT-AAGTTAGAA--AATGTTAACA--AATGCGGTTC-TGAA---AAG---CACCTTAAAAGGGACT-GCCCGCAATGGAG-CAAAGAGTTGG-AACTCCG-TAGCAATTCAAAAGAG-AATGAACACAAGGGGACTGATGCAGCTCGTAATGCATC--TGACC-A--ATATT-CT--AGAGTAGTGCATT--CCATAAA---CGAGAAAGGGGTT--TA-TGT---CACGGCA-C--GTATC--------CATGGAAT-GATG-TA--TACCTGTTG-GTTGAT-ACAGGCGCTA-CG-G-----CGTCCTTGCTATCTACAATTTGTTAT-GAGAACATTTGC-AAGGGT-CACAG-GTCAA-TCCTT-GAC-AAG---G--TC-GAGAGAGATGTGCTATCAGC-TAGTGG-ATCA--CCGCTAAAGGTACTGGGA---AAAGTTCCAGTAGATT-TAAA-GTTGG-A-GACATTGC--GTTAAA---GC-AT-G-AA--CGGTCATAGCT--TGACCTA-ACAGTGGATGGGA--TCTT--GGATTAGATTTCCTGGTTAAGCATG--AGGCAGTAAT-CG---AC-ATGCGCATGCATA-GA-TAAAAA--TATCTGGC-ACGGAGCAC-CCTATCAAGCTGGAAGGGTTGC------AACCTCATANAAGGTAG-CCAC--CTTT-CATG-GA-GTCACGGATACCACCTAGATCGGAAGCTGATGGTA-GAAGGAG-AGATACGT-ACTAGGATC--GGATGGAGGACTCTCAGCC-AAGC-T-GAATA-TGATA--AA-GCATT---C-GGAAA--AGT---TTCAGAAG-----CCGGGTTCTTGTT-T-GCTGGCC------------A--AAACACCTG--T----CCGT-----ACA-CAGAAGNACA----TGC-GACACAAACG----GCCGGATG-CCTCTTC-CAC--ATCATC---ANCGGGAA--TAGTTGAAGATG-A-GAC-GGTGACTGGGATGT--AG-ATC--CCG--AAG-TTCAA--GTTGGGGACGAGGGGGTTGA-GGTCTCAGAGAAGN-GATGGGAGC-AGGGCCATCCTTATCTGGTAGT-GCAGAGCTT-ATTACTAGCCGTG-TTATTCGCAAAAGAACATCTCCAA-TCCTGTCCAGA-C-CTCCAGAAA-AGTCACAAGTCGAGAAGAGGA-AGTGGTACAGTAGGAAG-TGTGTAGATGTGCCGGTAT-TCAGACAGTCACGTTTGAGCC-CATCCGAGTG-A-CAAG-TCAGCAGAAATGGTGGGTCAG-GGT-ACTCAGACAGAAGGATACCGTCGA---------CG--GGT----CA-AAGA-AG---T-TC--GTCAC--G--GTAT--CAAG-AAACGGACAAAGAGTCA-NGA-------GAAG---GAAGAAT-T-TTCCGTAAGATGTAGACGGAT-AT-ACAGC-GCAT--A-CTGT-AACATTAAAAGACC-GTT-GTT-TTATTGCGCTTGACNTTNGCAATT-TANTGCA--T-GTTCA-A-CTTTCAGTCACCAGGG--GA-GTGCGA-AGAATT-CATTATTCAT-CTT-G-TACA--TTTTTTTTCATG-TTG--CTCAC---TCT-T---------------A-------TCTGTTTTG--AA-AAAAGATTAAGAT---T--ATCAT-GTATA--TT---TTA-TCATGT-GA-GGA-CACATGANG--CATAGA-G--GCGTG--GGTAAGTGTGA---CAA--TTAGAGG----TCGG-GGT-CGG-GATG--GGTT-CGT----CATGT--AT-C-------A----GAT-G--C-----CT--TAAA----T-------AT---------GTT-----------CG---------GG-TG--T--TATT-GT-NGG-GC-A-T--T-AN-G--ANA--GCA-T----C-CGAG-----GG-TAGT---TCG--GGTGTNG---AGCA---CTATA-A-ATACGGC---G----A----TCT-GCTGANATTTCG--NC---AGTTCAG--CTGT--GGAGCT---CG--AC--GAGAAGAA-GA------C-GG---T-GATA-AA--GG-TAC--N-GCAATATATAATA------C---GGGCG--TGTATTATA--ATATT--CAG--TATA-----CGGTG-----G--CTA--GTGTACTGG-T------CTG-G---C-AGATAGT-AT-AATAAAGTATTTC-C---AG-GTTTA-AAGTGT-C----GAGATC-G--GTCC-GGNTATAGGGA---AGA--TTA------A-------GA-CGAG-----CACCTGTCCGG--TATA-----------AGGA-CAG--AA-CT----AG-CAT-AGG-----GCACAGA-CAAG-C-A---TA-G-GTC---CC-A--G--C----CTTA---CGCA-------CA-CC---AT--ACC--TT-AGGTC--T--CT----A---T-GC-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-AT----------AGG-T---AATC-C-TGT-----A----TA---A------TAT-TATCTGT--AT---ATAT--TG---AC--TCG--TT-----ATTTT--TAATAG---TGTTCA-TA---TTT-TGCAT--TC---A--TTC---ATT-GATA--AT-C---ATA--CA-TGC-C-CCAG-A-CTG-----GT-C-CG---A-ATCA--ACGAAC--CTAAACAC
Reference ( family-5610 ) : AGAGAGAGAATACATGA-TTCGTTA-CGGG-TCCTGAACTCTTCTAGGAGCATGC-GTCCCATAGCCCGAGACCCATACCAGG---TAT----GA-GT--ACCAGT-ACC--CCGTATGTA---AGAG--CAAGAGAGAG-------AG-TGTAA-GTGG---ATAT-TT-AGTG-A-TGA-ATGCATGTGTACATGATGAGAGAGGTACTCGTCCCGC--ATCAAGAGTTACTA-GTCCC--GT--ATCGNGAGT-TACTCGTCTCGCA-T-CGAA--CAA--CAGACTGATGCCAGAG-A-TAC-GTC---CCAGGAT--GGATG-CAAACCTGCATGGACAGA--TCCGGTCTA-AG-CCCGAAACTTCGT----AAA-CCA-GCGACATA---TGATGGTACG--GGTCTCTGG-GAAGATTA--CTTGTC-GCATT---TC---GA---T--GCG-TGT----CTACT--GAATGAGTGG--A-CAG--AC--ANTGA-GAAAGGTNT--ATACTTGG-CTGCGTCNCTNAGGGGN-CAA--GCACAAGG--AG-----------T-NTTAG-GAAA-TCAG---C------C-----A----------A--G-------------A--A-----TNATTGGA-----------AGCTA-----------GT-TAAAGC-CCTT---CGGGG----NA-GA----TTTGC-CTCCAG-T-----AAA---CCAG-ACTGAGC--TAT------A-TAGAGCACAGCT--GAGA---GAGAAAGGAGGC-AAAAG-----GCATCT-GAA-AGTT--TGCCGGAG--C--T----GGGT--CAA-GACGTAAGAA-GGCTNGCNAATCT-AGCNTACCC--NACC-GCTCCNGATGAGGT--AAGAG-AAACNC-TTGC--TACAGGAGCAGTTCTTNGATGG-ACTACG-AGTNACA--GAG--AT--GCG-NN-TCAAG-ATC-AAACAGGCAAGACCTGTAAACCTGAAT-GATGCGATACGGAG-A-GCC--GTT-GAACTGGANGCATAC-A-AC-AGG-CCAGAGGA-GTCGCCG-GATAGATGCTGT----AAGAGTCA--T-GAGTGGAAGT-T--CTA--CAGAACCGTC-CAGAG--AAAACAAACTCGAT---CGAT-CATAGAGACTG-AGAAA-AGAATATGCGCTCTCTACAGC-GAGA-TATTAA--GGAT-TTGAAACAATGGAAGTTTCAGTCACAGGGTCAA--GGACGTATGCCTCATCAAC--AGACAAGCTC-GG--TTGCTAAGGAT-AAGTTAGAA--AATGTTAACA--AATGCGGTTC-TGAA---AAG---CACCTTAAAAGGGACT-GCCCGCAATGGAG-CAAAGAGTTGG-AACTCCG-TAGCAATTCAAAAGAG-AATGAACACAAGGGGA-TGATGCAGCTCGTAATGCATC--TGACC-A--ATATT-CT--AGAGTAGTGCATT--CCATAAA---CGAGAAAGGGGTT--TA-TGT---CACGGCA-C--GTATC--------CATGGAAT-GATG-TA--TACCTGTTG-GTTGAT-ACAGGCGCTA-CG-G-----CGTCCTTGCTATCTACAATTTGTTA--GAGAACATTTGC-AAGGGT-CACAG-GTCAA-TCCTT-GAC-AAG---G--T--GAGAGAGATGTGCTATCAGC-TAGTGG-ATCA--CCGCTAAAGGTACTGGGA---AAAGTTCCAGTAGATT-TAAA-GTTGG-A-GACATTGC--GTTAAA---GC-AT-G-AA--CGGTCATAGCT--TGACCTA-ACAGTGGATGGGA--TCTT--GGATTAGATTTCCTGGTTAAGCATG--AGGCAGTAAT-CG---AC-ATGCGCATGCATA-GA-TAAAAA--TATCTGGC-ACGGAGCAC-CCTATCAAGCTGGAAGGGTTGC------AACCTCATANAAGGTAG-CCAC--CTTT-CATG-GA-GTCACGGATACCACCTAGATCGGAAGCTGATGGTA-GAAGGAG-AGATACGT-ACTAGGATC--GGATGGAGGACTCTCAGCC-AAGC-T-GAATA-TGATA--AA-GCATT---C-GGAAA--AGT---TTCAGAAG-----CCGGGTTCTTGTT-T-GCTGGCC------------A--AAACACCTG--T----CCGT-----ACA-CAGAAGNACA----TGC-GACACAAACG----GCCGGATG-CCTCTTC-CAC--ATCATC---ANCGGGAA--TAGTTGAAGATG-A-GAC-GGTGACTGGGATGT--AG-ATC--CCG--AAG-TTCAA--GTTGGGGACGAGGGGGTTGA-GGTCTCAGAGAAGN-GATGGGAGC-AGGGCCATCCTTATCTGGTAGT-GCAGAGCTT-ATTACTAGCCGTG-TTATTCGCAAAAGAACATCTCCAA-TCCTGTCCAGA-C-CTCCAGAAA-AGTCACAAGTCGAGAAGAGGA-AGTGGTACAGTAGGAAG-TGTGTAGATGTGCCGGTAT-TCAGACAGTCACGTTTGAGCC-CATCCGAGTG-A-CAAG-TCAGCAGAAATGGTGGGTCAG-GGT-ACTCAGACAGAAGGATACCGTCGA---------CG--GGT----CA-AAGA-AG---T-TC--GTCAC--G--GTAT--CAAG-AAACGGACAAAGAGTCA-NGA-------GAAG---GAAGAAT-T-TTCCGTAAGATGTAGACGGAT-AT-ACAGC-GCAT--A-CTGT-AACATTAAAAGACC-GTT-GTT-TTATTGCGCTTGACNTTNGCAATT-TANTGCA--T-GTTCA-A-CTTTCAGTCACCAGGG--GA-GTGCGA-AGAATT-CATTATTCAT-CTT-G-TACA--TTTTTTTTCATG-TTG--CTCAC---TCT-T---------------A-------TCTGTTTTG--AA-AAAAGATTAAGAT---T--ATCAT-GTATA--TT---TTA-TCATGT-GA-GGA-CACATGANG--CATAGA-G--GCGTG--GGTAAGTGTGA---CAA--TTAGAGG----TCGG-GGT-CGG-GATG--GGTT-CGT----CATGT--AT-C-------A----GAT-G--C-----CT--TAAA----T-------AT---------GTT-----------CG---------GG-TG--T--TATT-GT-NGG-GC-A-T--T-AN-G--ANA--GCA-T----C-CGAG-----GG-TAGT---TCG--GGTGTTG---AGCA---NTATA-A-ATACGGC---G----A----TCT-GCTGANATTTCG--NC---AGTTCAG--CTGT--GGAGCT---NG--AC--GAGAAGAA-GA------C-GG---T-GATA-AA--GG-TAC--N-GCAATATATAATA------C---GGGCG--TGTATTATA--ATATT--CAG--TATA-----CGGTG-----G--CTA--GTGTACTGG-T------CTG-G---C-AGATAGT-AT-AGTGAAGTATTTC-C---AG-GTTTA-AAGTGT-C----GAGATC-G--GTCC-GGNTATAGGGA---AGA--TTA------A-------GA-CGAG-----CACCTGTCCGG--TATA-----------AGGA-CAG--AA-CT----AG-CAT-AGG-----GCACAGA-CAAG-C-A---TA-G-GTC---CC-A--G--C----CTTA---CGCA-------CA-CC---AT--ACC--TT-AGGTC--T--CT----A---T-GC-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-AT----------AGG-T---AATC-C-TGT-----A----TA---A------TAT-TATCTGT--AT---ATAT--TG---AC--TCG--TT-----ATTTT--TAATAG---TGTTCA-TA---TTT-TGCAT--TC---A--TTC---ATT-GATA--AT-C---ATA--CA-TGC-C-CCAG-A-CTG-----GT-C-CG---A-ATCA--ACGAAC--CTAAACAC
gi|1 : AGAGAGAGA-TACATGA-TTCGTTA-CGGG-TCCTGAATTCTTCTAGATGCATGC-ATCCCATAGCCCGAGACCCATAACAGG---TAT----GA-GT--ACCAGT-ACC--CCGTATGTA---AGAA--CAAGAGAGAG----------TGTAA-GTGG---ATATGTT-AGTG-A-TGA--TGCATGTGTACATGATGAG-GAAGTACTCGTCCCGA--ATCAAGATTTACTA-GTCCC--GT--ATCTCG--T-TACTCGTCTCGCA-T-CGAA--CAA--CAGACTGATGCCAGAG-AATAC-GTC---CCAGGAT--GGATGGCAAACCTGCATGGACAGA--TCCGGTCTA-AG-TCCGAAACTTCGT----AAA-CCA-GCGACATA---TGATGGTACA--GGTCTCTGG-AATGATTAA-CTTGTC-GCATT---TC---GAGTAT--GTG-TGT----CTACT--GAATGAGTGG--A-CAG--AT--ATTGA-GAAAGGTTT--ATACTTG--CTGCATCTCTTAGGGGAACAA--GCACAAGGG-AG-----------T-ATTAG-GAAA-TCAG---C------C-----A----------A--G-------------A--A-----TTATTGGA-----------AGCTA-----------GT-TAAAGC-CCTT---CAAGG----TA-GA----TTTGC-TTCCAG-T-----AAA---TCAG-ACTGAGC--TAT------A-T-GAGCACAGCT--GAGA---GAGAAAGGAGGC-AAAAG-----GCATCT-GAA-AGTT--TGCCGGAG--A--T----GGGT--CAA-GACATAAGAA-GGCTTGTTAATTT-AGCCTACCC--CACC-GCTCCTGATGACGT--AAGAG-AAATAC-TTGC--TACAGAAACAGTTCTTGGATGG-ACTACATAGTT-CA--GAG--AT--GCA-TC-TCAAG-ATC-AAACAGGCAAGACCTGTAAACCTGAAT-GATGCGATACAGAG-A-GCT--GTT-GAACTGGAAGCATACAA-AC-AGG-GCAGA-GA-GTCGCCG-GATAGATGCTGT----AAG-GTCA--T-GAGTGGAAGT-T--CTA--CAGAACCGTC-CAGAG--AAAACAAACTCGAT---CGAT-CATAGAGACTG-AGAAA-AGAAT-TGCGCTCTCTCCAGC-GAGATTATTAA--GGAT-TTGAAACAATGGAAGTTTC-GTCACAGGGTCAA--GGACGTATGCCTCATCAAC--AGACAAGCTC--G--TTACTAAGATC-AAGTTAGAA--AATGTTAACA--ATTGCGGTTC-TGAA---AAG---CACCTT-AAAGGGACT-GCCCGCAATGGAG-CAAAGAGTTGG-AACTCCA-TAGCAATTCAAAAGAG-AATGAACAAAAGGGGACTGATGCAGCTCGTAATGTATC--TGACC-----TATT-CC--AGAGTAGTGCATT--CCATAAA---CGAGAAAGGGGTT--TA-TGT---CACGGCA-C--GTATC--------CATGGAAT-GATG-TA--TACTTGTTGTTTTGA--ACAGGCGCTA-CG-G-----TGTCCTTGCTATCTACAATTTGTTAT-GAGAACATTTGC-AAGAGT-CACAG-GTCAA-TCCTT-GAT-AAG---G--TCGGAGAGAGATGTGCTATCAGC-TAGTGG-ATCAACCCGCTAAAGGTACTGGGA---AAAGTTCCAGTAGATTCTAAA-GTTGGAA-GGCATTGC--GTTGCA---GC-GT-G-AA--TGATCATAGC---TGACCTA-ACAGTAGATGGGA--TCTT--GGATTAGATTTCCTGGTTAGGCATG--AGGCAGTAAT-TG---AC-ATGCGCATGCATC-GA-TAAAAAATTATCTGGC-ACGGAGCAC-CCTATCAAGCTGGAAGGGCTGC------AACCTCATACAAGGTAG-CCA----TTCACATA-GA-GTCAC-AATACCACCTAGATCAGAA-CTAATGGTA-GAAGGAG-AGATACGT-ACTAAGATC--GGATGGAGGACT-TCAGCC-AAAC-T-GAAC--TGATA--AT-GCATT---C-GGAAA--AGT---TTCAGAAA-----CTAGGTTCTTGTT-T-GCTGGCC------------A--AAACACTTG--T----CCGT-----ATA-CAGAAGAATA----TGC-GACACAAACA----GCTGGGTG-CCTCTTC-CAC--ATCATA---AGTGGGAA--TAGTTGAATATGAA-GAC-AGTGACTGGGATGT--AG-ATC--CTG--AAG-TTC-A--GTT-GGGACGAGGGAGTTGA-GGTCTAAGAGAAGT-GATGGGAGC-AGGG-CATCCTTATCTGGTAGT-GTAGAGCTT-ATTACAAGCCGTG-TTATTCGCAAAAGAACATCTCCAA-TCCTGTCCAGA-C-CTCCAGAAA-AGTCATAAGTCGAGAAGAGGA-AGTGGTACAG-AAGAAG-TATGTAGATGTGCTGGTAT-TCAGACAGTC-CGTTTGAGCC-CATCCAAGTGAA-TAAGTTCTGCAGAAATGGTGGATCAG-GGT-ACGCAGACAGAAGGATACCGTCGA---------CG--GGT----CA-AAGA-AG---TATC--GTCA---A--GTAT--CAAGAAAACGGACAAAGAGTCA-TGA-------GAAG---GAAGAAT-TATTCCGTAAGAT-TAGACGGAT-ATAACAGC--CAT--A-CTGT-AACATTAAAAGACC-GTT-G-T-TTA-TGTGCTTGACATTGGCAATT-TAATGCG--T-GTTCA-A-CTTTCAGTCACCAGGG--GA-GTGTGG-AAAATT-CATTATTCAT-CTT-G-TACA--TTTTTTTTCATGTTTG--CTTAC---TCA-T-----------------------TGTGTTTTG--AA-AAAAGATTAAGAT---T--ATCAT-GTATA--TT---TTA-TCATGT-GA-GGA-CACATGCAG--CATAGA-G--GCGT---GGTAA-TGTGA---CAA--TTAAAGG----TCGG-GAT-CGGAAATG--GGCT-CGG----AATGC--AT-C-------------AT-G--C-----CT--TAGA----T-------AT---------ATT-----------CG---------GG-TG--T--TATT-GT-TGT-GC-A-T--C-AT-G--AAA--GCA-C----C-CGAG-----GG-TAGT---TCG--GGTGCAG---GGTA---CTATA-T-ATA-GGCTGTG----A----TCA-GC-GATATTTCG--GC---ACTTCAG--CTGT--GGAGAT----G--AC--GAGAAGAA-GA------C-GG---T-GATA-AA--GG-TAC--T---AATATATAATA------C----GGCG--TGTATTATA--ATATT--CAG--TATA-----CGGTG-----G--CTA--GTGTACTGG-T------CTG-G---A-GAATAGA-AT-A---AAGTATTCC-C---AG-GTT---AAGTAT-C-----AGGT-----GTCC-GGGTAGAGGTATCTATAC-CTAT-----ACATACTTGA-CAAG-----CACCTGTCCGG--TATA-----------AGGA-CAG--AA-CT----AG-CAT-AGG-----ACACAGA-CAAG-C-A---TA-G-GT----CC-A--G--C----CATA---CGCA-------C--CC---AT--ACC--TT-AGGTC--T--CC----A---T-GC-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-AT----------AGG-T---AATC-C-TGT-----A----TA---A------TAT-TATCTGT--AT---ATAT--TG---AC--TCG--TT-----ATTTT--TAATAG---TGTTCA-TA---TTT-TGCAT--TC---A--TTC---ATT-AATA--AT-C---AT---CA-TGC-C-CCAG-A-CTG-----GT-C-CG-----ATCAACACGAAC--CTAAACAC
gi|10 : --AGACAAGTTC-AG--CTGCTAAGGA----GTTACAA--AAT--TAAAATTAATGCGGTTC-TGAA---AAG---CACCTTAAAAGGGACT-GTCCACAACGGAT-CAAAGAGTTGG-AACTCCG-TAGCAATTCAAAAGAG-AATGAACACAAAAGGACTGATGCAGGTCGTAATGCATC--TGATC-A--ATATT-CT--AGGGTAGTGCATT--CCATAAA---CGAGAAAGGGGTT--TA-TGT---CACGGCA-C--GTATC--------CATGGAATGGATG-TA--TATCTGTTG-GTTGAT-ACAGGTGCTA-CG-G-----TGTCCTTGCTATCTACAATTTGTTAT-GAGAACA-TTGC-AAGGGT-CACAG-GTCAA-CCCTT-AAC-A----------------AGATGTACTATCATC-TAGTGG-ATCA--CCGCTAACGGT
gi|10 : TCCTGGTTGAGAATG--AGGTAGTAAT-TG---AC-ATGCGCATGCAAAAGA-TAAAAA--TATCTGGC-ATTGAGCAC-CTTATCAAGCTGGAccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcctggttgagaatgaggtagtaattgacatgcgcatgcaaaagataaaaatatctggcattgagcaccttatcaagctgga
gi|11 : agacaagttcagctgctaaggagttacaaaattaaaattaatgcggttctgaaaagcaccttaaaagggactgtccacaacggatcaaagagttggaactccgtagcaattcaaaagagaatgaacacaaaaggactgatgcaggtcgtaatgcatctgatcaatattctagggtagtgcattccataaacgagaaaggggtttatgtcacggcacgtatccatggaatggatgtatatctgttggttgatacaggtgctacggtgtccttgctatctacaatttgttatgagaacattgcaagggtcacaggtcaacccttaacaagatgtactatcatctagtggatcaccgctaacggtccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn----T-------AT----------TT-----------CG---------GG-TG--T--TATT-GT-TGT-GC-A-T--T-ATTG--AAA--GCA-T----C-TGAG-----GG-T-GT---TCG--GGTGCAG---GGTA---CTATATA-ACGCAGT---G----A----TCA-GC-GATATTTCG--GC---AGTTCAA--CTGT--GGAGCT---AG--AC--GAGAGAAA-GA------C-GG---T-GATA-AA--GG-TAC--T-ATAAT-TATAGAA------C---GG-CG--TGTATTATA--ATATT--CAG--TATA-----CGGTG-----G--CTA--GTGTACTGG-T------CTG-G----------------------ACATTTC-C---AG-GTTTA-AAGTGT-C----GAGATC-G--GTCC-GGCTATAGAGA---ATA--TTA------A-------GAACAAG-----CACCTGTCCGG--TATA------------GGA-CAG--AAACT----AG-CTT-AGG-----ACACAGA-CAAG-C-A---CA-GTGTC---C--A--G--C----CTTA---CGC--------CA-CC---AT--ACC--TT-AGGT---T--CT----A---T-GC-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-AT----------AGG-T---AATC-C-TGT-----A----TA---ATAA---TAT-TATCTGT--AT---ATA---TG---AC--TCG--TT-----ATTTT--TAATAGT--TGTTCA-TA---TTT-TGCAT--TC---A--TTC---ATT-GATA--AT-C---ATA--CA-TGC-C-CCAG-A-CTG-----GT-C-CA---A-ATCA--ACGAAC--CTAAACAC
gi|12 : ----T-------AT----------TT-----------CG---------GG-TG--T--TATT-GT-TGT-GC-A-T--T-AT-G--AAA--GCA-T----C-TGAG-----GG-TAGT---TCG--GGTGCAG---GGTA---CTATATA-ACGCAGT---G----A----TCA-GC-GATATTTCG--GC---AGTTCAA--CTGT--GGAGCT---AG--AC--GAGA-GAA-GA------C-GG---T-GATA-AA--GG-TAC--T----ATATATAGAA------C---GG-CG--TGTATTATA--ATATT--CAG--TATA-----CGGTG-----G--CTA--GTGTACTGG-T------CTG-G----------------------ACATTTC-C---AG-GTTTA-AAGTGT-C----GAGATC-G--GTCC-GGCTATAGAGA---AAT--TTA------A-------GA-CAAG-----CACCTGTCCGG--TAT------------AGGA-CAGA-AA-CT----AG-CTT-AGG-----ACACAGA-CAAG-C-A---CA-G-GTC---CC-A--G--C----CTTA---CGCA-------C--CC---AT--ACC--TT-AGGTT--T--CT----A---T-GC-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-AT----------AGG-T---AATC-C-TGT-----A----TA---A------TA---ATATGT--AT---ATAT--TG---AC--TCG--TT-----ATTTT--TAATAGT--TGTTCA-TA---TTT-TGCAT--TC---A--TTC---ATT-GATA--AT-C---ATA--CA-TGC-C-CCAG-A-CTG-----GT-C-CA---A-ATCA--ACGAAC--CTAAACACg
gi|13 : -GACAAGAGCA----GCCGGGTG-TCTC--C-CAC--CTCATC---ATGGGGAA--TAGTTGAGAGTG-A-GACAAGTGAGT-GGATGTTGAGAATC--CTGGAAGG-TTCAA--GTGTGGGA-GAGGGGGTTGATGGTCTCGGGGAAGA-G-TGGG-GC-AGAACCATGCTT-TCT-GTAGTCGCATAG------GACT----GTG-TTATACGTTAAAGGAAATCTCAAG-TCCTGTCCAGGCC-CTCCAGAAA-GGTCAC-AGT--GGAAGAGGATAGTGGTA-AGTAGGAAG-TGTGTAGATGGGCGGGTATGTC-GA-AGTCAGGTTTGAGCCGCATCTGAG-A-A-TAAT-TCAGCAG-AATGGT-GGTCAG-AGTAACTCAGACAAAAG---ATCGT-GA---------CG--GGT----CA-AAGA-AG---TCTCCAGTAAC--GACGTATG-CATG--AACGGGCAAGGAGTCA-AGAAATAAACGGAGAGTGAAAGAT-T-TTTGTTTAGATGTAGACGTTTAAT-A-AGCAGCA---A-CTGT-AAg
gi|14 : a-ATGCATGTATATATGATGAGAGAGGTACTCGTCCCGC--ATCAAGAGTTACTA-GTCCC--GT--ATCGAGAGT-TACTCGTCTCGCA-T-CGAA--CAA--CAGACTGATGCCAGAG-A-TAC-GTC---CCAGGAT--GGATG-CAAACCTGCATGGACAGA--TCCGGTCTA-AGCCCCGAAACTTCGTG---AAG-CCA-GCGACATT---TGATGGTACG--GGTCTCTGG-AATGATTA--CTTGGCTGCATC---TC---
gi|14 : TACTTGG-CTGCATCTCTTAGGGGA-CAA--GCACAAGG--AG-----------T-GTTAG-GAAA-TCAG---C------C-----A----------A--GGGATGAGAGGCAGA--A-----TTATTGGA-----------AGCTA-----------GT-TAAAGC-CCTT---CAGGA----TA-GA----TTTGC--TCCAG-T-----AAA---TCAG-ACTGAGC--TAT------A-TAGAGCACAGCT--GAGA---GAG--AGGAGGT-AAAAG-----GCATCT-GAA-AGTT--TGCCGGAGATCGAT----GGGT--CAA-GACATAAGAA-GGCTTTTTAATTT-AGCCTACCC--GACC-Gttaggggacaagcacaaggagtgttaggaaatcagccaagggatgagaggcagaattattggaagctagttaaagcccttcaggatagatttgctccagtaaatcagactgagctatatagagcacagctgagagagaggaggtaaaaggcatctgaaagtttgccggagatcgatgggtcaagacataagaaggctttttaatttagcctacccgaccg
gi|15 : atgcatgtatatatgatgagagaggtactcgtcccgcatcaagagttactagtcccgtatcgagagttactcgtctcgcatcgaacaacagactgatgccagagatacgtcccaggatggatgcaaacctgcatggacagatccggtctaagccccgaaacttcgtgaagccagcgacatttgatggtacgggtctctggaatgatTACT--AAATAAATGG--A-TAGTAAC--A--GA-AATGGGCAT--GCATCTAG-TGGTATCATTGAGTAGA-TAA--GCTCAAAG--TG-----------T-CTTAG-GAAA-TCTA---C------CTGAGGG----------A--G-------------A--AAAGTGTAAATACA-----------GGCTGTT---------GTGTAAAGC-AC-----AGGAG----GA-GAGGTTTTTAC-C--CAC-T-----AA----CCAG-ACGGAAC--TTT------A-CAGAGCACAGCT--GAGA---GAGAGACGA--C-AGAAA-----GCCACA-GAG-ACAC--TACCGGAA--C--T----GGGA--CAG-GAAATACGGC-GGTTAACGAATCT-AGCATACCC--CTCA-GCTCCAGTGGAGGT--AAGAG-AGACAC-TTGC---AAAGGAACAGTTTCTTGATGC-GTTA---AGGGACA--GGGACAT--GCG-TT-TGAGA-GTC-AAACAGGCGAGACCGGCTGACTTGAAT-GATACTGT-CAGAC-ACGCA--GTA-GAGTTGGATGCATTC----C-AGG-C
gi|16 : a-GCACT---TT---GA---T--GCC-TGT------ACTAGGAA-AAGTGG--AGCAA--AC--AA-GA-AAAAGGAAT--AAATTTCG-CTGTGTCACTAAGAGGT-CAA--ACACAAGG--AG-----------TCCTTGG-TAAT-TCAT---C------TA----A----------A--G-------------A--A-----GCACTGAACAACTATAATGAACTA-----------GC-CAAAGC-AC-T---CGACG----AACGA----TTTGCTCTCCCG--------AA---CCAA-ACTGAGC--TAT------A-TCGAGCACAGCTTCGTGAACTGACAAAGAAAGC-TA------------CT-GAA---TTCCTGCCAAAA--C--T----AGGT--CAA-AGTTTCAGAA-GACTGACAAATCT-AGCATACCC--TACG-GCACCATATGAATT--GAGAG-AAACTCTTTGT--TA-GGGGGCAATT-TTAGATGa
gi|17 : cttgagctcaca-GCACT---TT---GA---T--GCC-TGT------ACTAGGAA-AAGTGG--A-GAA--AC--AA-GA-AAAAGGAAT--AAATTTCG-CTGTGTCACTAAGAGGT-CAA--ACACAAGG--AG-----------T-CTTGG-TAAT-TCAT---C------T-----A----------AAAG-------------A--A-----GCACTGAC-----------AACTATAATGAACTACGC-CAAAGC-ACT----CGACG----AACGA----TTTGCTCTCCCG--------AA---CCAA-ACTGAGC--TAT------A-TCGAGCACAGCTTCGTAACT-GACAAAGAAAGC-TA------------CT-GAA---TTCCTGCCAAAA--C--T----AGGT--CAA-AGTTTCAGAA-GAC-GACAAATCT-AGCATAACC--TACG-GCACCATATGA-AT--GAGAG-AAACTCTTTGT--TA-GGGGGCAATT-TTAGATGctcttggtgagtcaga
gi|18 : cacaG-TGT----CTACT--AAATGAGTGGGGA-CAG--AT--ACTGA-GAAAAGTTT--ATACTTGGCCTGCATCTCTTAGGGAC-AAA--GCACAAGAGCAGTTATTATTATAT-TTTAGAGGAA-TCAG---C------C-----A----------ctcttggtgagtcaga
gi|18 : A-----------ATCTA-----------GT-TAAAAG-CCTTGTACAAGGAATTTA-GA-----TTGC-CT-CAG-TCAAGGAAAATTCCAG-GC-GA-CTTTATCTTCTAA-TAGAGCACAGCT--GAGAC--GAGCAGGAAGGCTAAGAGATAATGCATCT-GAA-AGTT----CCGGAG--C--TACAAGCGT--CAA-CACCTAAGAA-Gcagtcgaagatccagaaccgatcttctgcgttcgagatccatttttgccacagctaaaatctagttaaaagccttgtacaaggaatttagattgcctcagtcaaggaaaattccaggcgactttatcttctaatagagcacagctgagacgagcaggaaggctaagagataatgcatctgaaagttccggagctacaagcgtcaacacctaagaagcccttagtgtgagactactc
gi|19 : gtgtctactaaatgagtggggacagatactgagaaaagtttatacttggcctgcatctcttagggacaaagcacaagagcagttattattatattttagaggaatcagccacagtcgaagatccagaaccgatcttctgcgttcgagatccatttttgccacagctaaT--TGCCAGAG--C--T----TGGG--CAG-GACATACTCA-GGCTGGCCAACCT-CGCATATCC--AACT-GCCCCAATTGAGGT--CAGAG-AAACCC-TTGC--CA-AGGAGCAATTCATTGATG---CTCTG-AAGGACAGTGAC--AT--GAG-AA-T-ACGCATT-AAACAAGCCAGACCAGTCGACCTGAAT-AATGCTATCCGTCA-T-GCC--GTG-GAGTTGGATGCATTT-A-ACTCTG-CCAAAAGACGTCTCCGTGA-AGA-----T----AAAGGTTATTT-GAG-GGAGG-----CTAATCAG--CCATG-CAAAA--CAGACAAAcccttagtgtgagactactc
gi|2 : aaca-A-CTG-----GTACACG---A-ATCA--ACGAAC--CTAA
gi|2 : AGAGCGAGAATACATGAGTTCGTTA-CGG--TCCTGAACT--TCTAGGAGCATGCAGTCCCATAGCCCGAGACCCATAC-AGGAAATA-----GT-GT--ACT--TCACC--CAGTAT-TA---AGA---CAGGAGA-AG-------AG-TGTAA-GTGA---ATGT-TT-AGTGGA-TGAGATGCATGTG-ACATGATGAGAGAGGTACTCGTCC-----ATCAAGAGTTACTA-GTCCC--GTGGATC-CGAGT-TACTCGTCTCGCA-TTCGAA--CAAA-CAGACTGATGCC-GAG-A-TACTATCGATCCAGGAT--GGA-G-CAA-CCTGCATG-ACAGAAATCCGGTCTA-AG-CCCGAAACATCGTTAGAAAA-CCA-GCGAC-TA---TGATGGTACA--GGTCTCTGGTGGAGATTATTCTTGTC-GCATTCGGTCTGAGA---T--GTG-TGT----CTACT--GAA-GAGTGG--A-CAG--AT--ATTGATGAAAGGTTT--ATACT--G-CTGCATCTCTTAGGG-A-CAAAAGCACAAGG--A------------T-GT-GG-AAAA-TCAG---C------C-----AGGATAAGGCAA--G-------------A--A-----T-ATTG-A-----------AGCTA-----------GT-TAAAGC-CCTT---CAGGA----TA-GA----TTTG--CTCCAGTT-----AAA---TCAG-ACTGAGC----T------A-TAGAGCACAGCT--GAGA---GAG--AGGAGGC-AAAAG-----GCATCTAGAA-AGTT--TGCCGG-G--A--T----GGGTGCCAA-CA---AAGAATGACTTGTTAAT-T-AGC-TCCCCGAAACC-GCTCCTGATGAGGT--AAGGGAAAATAC-TTGC--TACACGAACAGTTTTGAGATGGAACTACATAGTATCA--GAG--ATTGACGATC-TCAAA-ATCAAAACAGGCAAGACCTGTAAA-CTGAACAGACGAGTCACGAAGTA-G-C--GTTGGAACT-GAGGCATAC-ATAC-AGT-CCAGAGGA-GTCGCCG-GATAGAAGCTGT-----AGA-TCA--GAGAGT-GAAGT-TTCCTA--CAGAATCGTCACGAAGGCAAAACAAACTCGATTCGTGAT-CAT-GAGACTT-AGAAAGAGA--ATGCGCT-TCTAC--CAGAG--TATTAA--GGATATTGAAACAATGATGATTTCAGCAACAGGGTCAACGGAACGTATGCC-CATCAACAAAGAC-AGCTCAGG--TT-CTAAGGAT-A--TGAGAAAGAATGTTTACAC-ACTGC-GTTCATGAATCGAAGGATCACTCTAAAAGGTACTGGCCCGCAATGGAGACAAAGA-TTGGTAACTCCGATAGCAATTCAAAAGAA-GGT-AACAAAAGGAGA-AGATGCAGCTC-CGAT--ATCCTTGACCAA--ATATCACA--AGAGTAGT-CA-T--CCATAGAAATCGA-AAAGGGGTT--TA-TGT---CACGGCAGC--GTAT---------CAT-GAAT-GAGGATA--TACTTGTTA-GTTGAT-ACAGGCGCCA-CGCGGAAATCGTCCTTGCTATCTACAATGTGTTAGTGAGAACA-TTGC-AAGAGT-CACAGTGCTAACTCCTTGGACTAAG---GGTC--GAGAAGGATTTGCTATCAGCTTAGTGGCATCA--CCGC-GAATGTACTTGGATATACAGTTCCAGTA-ATT-TAAACGTTGG-A-G-CATTGCAAGTAAAAATGGC-AT-G-AA--GAGTCA-AGCT--TGACCTACACAGTGGATGG-----CTT--GGATT-GATTTCCCTGTTAAGCATAGTGGGCA-TAAT-CATACAC-ATGCGCATACA-G-GATTAAAAA--TATC-GGC-AACGAGCACGCCTATCATACTGGGAAGGTGGTCGGTCGAACCTC-TAAAGGGTAG-CCATGGCTTT-CATGAGACGTC-CAGATACCA-CTAGATCG--AACTG-TGATAGGAAGGAGAAGATACGT-ACTA-GATCGGGGATGGA-GACTCTCAACCAAAGCTT-GAATA-TGA-A--AA-GCATT---CTGGAAA--AAGAAATTCAGAGG-----T---GTTC-TG-T-T-GCTGGCC------------ACGAAAAACCTGGTT----TAGC-----ACA-GAGTAGCACA----TGC-AACACAAA-G----CCCGGATGCCCTCTTC-CAcaacgttaaaattttggtggccagcaacgggatttggatcagtcatttaagtaaaagcattagtattcgtaaaaatgaatgagcaggattacaaagacaagtgtaatcagttagaagggggagatagatcgcctcagagcgagaatacatgagttcgttacggtcctgaacttctaggagcatgcagtcccatagcccgagacccatacaggaaatagtgtacttcacccagtattaagacaggagaagagtgtaagtgaatgtttagtggatgagatgcatgtgacatgatgagagaggtactcgtccatcaagagttactagtcccgtggatccgagttactcgtctcgcattcgaacaaacagactgatgccgagatactatcgatccaggatggagcaacctgcatgacagaaatccggtctaagcccgaaacatcgttagaaaaccagcgactatgatggtacaggtctctggtggagattattcttgtcgcattcggtctgagatgtgtgtctactgaagagtggacagatattgatgaaaggtttatactgctgcatctcttagggacaaaagcacaaggatgtggaaaatcagccaggataaggcaagaatattgaagctagttaaagcccttcaggatagatttgctccagttaaatcagactgagctatagagcacagctgagagagaggaggcaaaaggcatctagaaagtttgccgggatgggtgccaacaaagaatgacttgttaattagctccccgaaaccgctcctgatgaggtaagggaaaatacttgctacacgaacagttttgagatggaactacatagtatcagagattgacgatctcaaaatcaaaacaggcaagacctgtaaactgaacagacgagtcacgaagtagcgttggaactgaggcatacatacagtccagaggagtcgccggatagaagctgtagatcagagagtgaagtttcctacagaatcgtcacgaaggcaaaacaaactcgattcgtgatcatgagacttagaaagagaatgcgcttctaccagagtattaaggatattgaaacaatgatgatttcagcaacagggtcaacggaacgtatgcccatcaacaaagacagctcaggttctaaggatatgagaaagaatgtttacacactgcgttcatgaatcgaaggatcactctaaaaggtactggcccgcaatggagacaaagattggtaactccgatagcaattcaaaagaaggtaacaaaaggagaagatgcagctccgatatccttgaccaaatatcacaagagtagtcatccatagaaatcgaaaaggggtttatgtcacggcagcgtatcatgaatgaggatatacttgttagttgatacaggcgccacgcggaaatcgtccttgctatctacaatgtgttagtgagaacattgcaagagtcacagtgctaactccttggactaagggtcgagaaggatttgctatcagcttagtggcatcaccgcgaatgtacttggatatacagttccagtaatttaaacgttggagcattgcaagtaaaaatggcatgaagagtcaagcttgacctacacagtggatggcttggattgatttccctgttaagcatagtgggcataatcatacacatgcgcatacaggattaaaaatatcggcaacgagcacgcctatcatactgggaaggtggtcggtcgaacctctaaagggtagccatggctttcatgagacgtccagataccactagatcgaactgtgataggaaggagaagatacgtactagatcggggatggagactctcaaccaaagcttgaatatgaaaagcattctggaaaaagaaattcagaggtgttctgttgctggccacgaaaaacctggtttagcacagagtagcacatgcaacacaaagcccggatgccctcttccaa
gi|20 : actggtacacgaatcaacgaacctaacaacgttaaaattttggtggccagcaacgggatttggatcagtcatttaagtaaaagcattagtattcgtaaaaatgaatgagcaggattacaaagacaagtgtaatcagttagaagggggagatagatcgcctcC-T-GAATA-TAACAGTAA-GCATTTTGC-GGAAAGGAGT---TTCAGGAGACGGTCCGGGTTCT-ATTAT-GCTGGCCCGATCATTGGAGA--GAACACCTG--TAATGCTGTTAAACACATCAGAAGCACACCTATGC-AACACAAACGCTTCGC-GGATG-CCTCTCCTCACTAATCATCTATACTGGAAAATTAGT-GAA--TG-A---T-GGTGACTGGGATGT--AG-ATCCTCCGA-AAG-TTCAACGGTTGTGAGCGAGGa
gi|21 : GG-----GCA-AGA-CAAG-CCA---TA-G-GTC---CC-A--G--C----CTTAA--CGCG-------CA-CC---AT--ACC--T--AGGTCG-T--CC----A---T-GC-C-T-TTG-AATAT-TTA--GG-AT----------AGG-T---CATG-C-TGT-----A----TA---A------TAT-TATCTGTTAGT---A-AT--TG---ACT-TCG--TT-----AATTT--TAATAG---TGTTGA-TT---TTTATGCAT--TCAGGA--TTCGCGATT-AATATCAT-CTCAATA--CATTGCAC-TAAG-A-CTG-----GTACACG---A-ATCA--ACGAAC--CTAAcag
gi|22 : CTGGCC------------A--AAAGACTTG--T----CCGT-----ACA-CAGAAGAACA----TGC-TACACAAACA----GCCGGATG-CCTCcaacgt
gi|22 : T--AG-ATC--CTG--AAG-TTCAA--GTTGGGGACGAGGGGGTTAT-GGTCTCccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntagatcctgaagttcaagttggggacgagggggttatggtctc
gi|23 : ctggccaaaagacttgtccgtacacagaagaacatgctacacaaacagccggatgcctcccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-AGGTTA-T--CT----A---TTGC-CAT-TTG-A-T-T-T-A--GG-AT----------ACA-A---AGTA-C-TG----------------A------TGT-AATCTGT--AT---ATATATTG---GC--TCG--TT-----ATTTTTCTGATAGT--TATTCA-TA---TTT----------------TTT---GCT-GA-A--AT-C---ATA---G-TGC-C-GCAGCA-CTGC----GT-C-CG---ATATCA--TC-AAC--CTAAAC
gi|24 : ----AAG-CTA-GCAACAAT---TGATGGTATG--GGTTCCTGG-GTAGACTA--CAAATC-CCATT---TT---GA---G--GCT-TGTAGCTCT-TT--GAATCAGTGG--A-CGG--AC--AGGGA-AAAAGGTCT--ATATCTAA-GTGTGTCGCTCAGAGAA-CAG--GCcgt
gi|25 : A--GCTCAAAG---T-----------T-GTTAG-GAAA-TCATACTC------CTGGGGA----------G--G-------------A--AAAGTGTAATTACA-----------GGCTGTT---------GTGTAAAGC-ACT-----GGAG----GA-GAGGTTTTTAC-C-CCAC-T-----AAC---GCAG-AC-GAAC--TCT------AACAGAGCACAACT--GAGA---tattatacggt
gi|27 : ACGCATACCAGG---TAT----GAAGTTAACCAGT-ACC--CCGTATGTAGACAGAGATCATGAGAGAGATTGCAAAA-TGTAA-GTGGGCCATCT-TC-GTTA-ATTGA-ATGag
gi|28 : gagaacCAGCT--GAGA---GA--AAGCA-GC-AAAAT-----ATATCT-TAAGGGTT--TACCGACG--A--T----GGAT--CAT-CATGTAAAAA-GACTAGTCAATCT-AGCCAACTC--AATC-TCTCCTGAataca
gi|3 : acagacTGTTG-TTTGAT-TCAGGTGCTAACG-G------GTCCTTGCTATCTACAATTTGTTA--GAGAACATTGGCCAAGGGTTCA-AG-GTCAA-TCCTT-GAC-AAGAGGG--TC-GAGAGAGATGTGCTATCAGC-TAGTGG-ATCA--CCGCTAAAGGTAATGGGA---AAAGTT-CAGTAGATT-ATAA-GTGGC-G-GACTTTGC--GTTAAA---GCAATAG-AAATCGGTCATAGCTGATGACTTA-ACAGTGGATTGGAATTCTTTGGGATTAGATTT-CTGGTTAAGCATG--AGGTGTTAATATG---ACAATTCGCTGGCATA-GA-TAAAGA--TATCTGGCAATGAAGCAC-CCTATCAA-CTGGACGGGTTGC------AACC-CATATAAGGTAGTCCAC--CGTT-CATG-GA-GTTACG--TA-CACCTGAATCGGAAGCTGATGGTA-GAAGGAG-AGATACGTGACTAG---T--GGATGGAGGTCATTCAGCC-AAGC-TCGGAGACTGATA--AAGGCATT---C-GG-AA--AGT---TTCAGAA------TTGGGTTCTTGTT-TGGCTGGCC------------A--AAACA-CTG--T----TCGTA----ACA-CAGAAG-ACA----TGCAGA---AAACG----CCCGGA---CCTCTT--CAC--ATCATC---AACGGGAA--TA-TTGAAGATG-------TGTGACTGGGATGTAAAG-ATC--CCG--AAGTTTCAA--GTTGGGGACGAGGGAGTTGA-GGTCTCAGAGAAGT-GAT-GGAGCTAGGGCCA-CCTTATCTGGTAGT-GCCGAGCTGAATTACTA-CCGTGTTTATTCGC-AAAGAACCTGTCTAA-GTCTGT--AGA-CGCTC--GAAATAGTC-CAAGTCGAGAAGAGGA-AGTGTT-CAGTAGGAAGTTGTG-AGA--TGCCGG--T-TTAGACAATCACG-TTGAGCC-CAT-CAAGTG-A-CA---TCAGCAGAAATGGTGGGTCAGTGGT-AC-CA-ATCGAAAGATAGTGTTGATGGCTCGTGCG--GGT----CATAAGA-AGTCAT-TC--GTCACTAG--GTATTCCAAGCAAAC-AAGAAAGAGTCA-AGA-------GAAG---GAAGAATCT-TTCCGTAAGATGTAG-CGGAT-AT--CAGC-GCCT--A-CTGTAAACATGTCAAGA-C-GTTGGTTGTTATTGGACTTG--CTTGGCAA-T-TAATGCA--T-G-TCA-ACCTTTCAATCACCAGGG--GAGGTG-GA-AGAATC---TTATTCAT--TT-G-TACATTTTTTTTTTCATGTTTG--CTCACAGATCTAT---------------AATCTGGTCCTGTTTTGATAA-AAAAGATT-AGATTAAT--ATCAT-GTATA--TT---TTATTCATGTCGA-GGA-CAC--GATGCCCATAGA-G--GCG-G--GGTGAATGTGA---C-A--TTAAAGG----TCGG-GAT-C-G-GATG--GGTT-GGTATTATATGT--AT-C-------A----GATAG--TG----CTAATAAAAGCTC-------AT---------GTC-----------CA---------GACTT--T--TACTAGTAGGG-GC-A-T--TGGC-GATATA--ACA-T------CGAGTGGCAGG-TAGT---TCG--GGTGTTG---AGCAAGTGTATA-A-ATAGGGC---G---------TCT-GCTGAAATT--G--TC---ACTTCAG--CTGT--GGAGATTCATG--AC--GAGGAGAAGGA------CAGG---T-GATATAAATGG-TCCTAG-GC--TATATTATA------CCAGGAGC---TATGTTATA--ATATT--CAG---ATAAC---CGGTG-----GGTCTA--GTGTACTGGTT------CTG-GACCC-AGATAGT-ATGAGT--AATATTTCAC---AA-TTTTA-AAGTGC-A----AAGTCC-G--GT-C-GGTTATAGAGAGT-AAATGTTA------A-------GA-CAAG-----CACCTGTCCGG--CGTAGT---------AGGATCAGGAAA-CTAA--AG-CAT-AGG-----GATCAGT-AAAG-C-A----A-G-GTC---CC-ACTG--CT---CTTAGTCCGCAAGAGGAGCA-CCTCTAT--A-C--TT-AGGTC--TGCCC----ATCCT-GCTTATATTGCA-T-TATTACCGG-ATTAGCTTACTCAGGCT---AATC-T-TCTAAGCGA----TG---AATAGACTAT-TATCTGT--AT---AT-T--TG---ACCGTCGAATG-----ATTTT--TAATAG---T
gi|30 : tC---CC-A--G--T----CTTA---CGCA--------G-CC---AT--ACC--TT-AGGTT--T--GT----A---T-GT-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-AT----------AGG-T---AATC-C-TAT-----A----TA---A----------TATCTAT--AT---ATAT--TG---AC--TCG--TT-----ATTTT--TAATAG---Ttgt
gi|32 : GA-AGAATT-CATTATTCAT-CTTCG-TACA--TTTTTTTTC
gi|33 : gcatattctacatcaccagggatggattgtttatgtgtgtttgccaTGTGA---CAA--ATTGAGA----TCGG-GTT-CGG-GATG-------TGT----CATTT--AT-C-------A----GAT-
gi|4 : atAGAGAGGATACATGG-TT-GTTAACGGGGTTCTGAACTCTTCTAGGA---TGC-G-CCCATAGCC-GAGACCCG-ACCAGG---TGTACTGGA-GT--A--AGT-ACCGACTGAAT------AGAG--AAAGAGAGAG-------AGCTGTAAAGTGG---ATAT-TTTAGTG-A-TGA-ATGCATGTGTACA-GATGAGAGAG---CTCGTCCCGCGCATCAAAGGTTACTAAGTCCCAAGT--AT-GAGAGTATTCTCATCCCGCAAT-CGAAGACAATGCAGACTGATGC-AGATCA-TAC--TC---GATGGATAGGGATG-CAA-CCTGGATGGACAGA--TCCGGTCTATAG-CC---GACTT-GT----AAAACCAAGCGACATACGCTGATGGTACATCGGTCTTTG---AAGATTA--CTTGTT-TCATT---TC---GG---TCTGTGGTGT----CT-CT--AAATGA-TGG----CAG---CTTATTGA-GAAAGGTTTTAATACTTGG-CTGAATCTT---GGGGA-CAA--GCACAAGG--AG-----------T---TAG-GAAACTCAG---CAAGGGAT-----A----------A--G-------------GCGA-----TTATTGGA-----------AG-TA-----------GT-TAAAGCGCCTT---CAGA-----TA-G-----CTTGC-TTCGAG-T-----AAAA--TCAGGACTGAGC--TAT------A-TAGAG-ACAGCT--GA-A---GAGAA-GGAGGC-AAAAG-----GCATCT-GAA-AGTT--TGCCGGAG--A--T----GG-T--CAAAGAC-TAAGAA-G--TTGTTAATTTTAACT--CCC--GACCTGCTC-TGATGATGTCAAGGAG-AAATTC-TTGCCCTACAGAAG----TCTT-GATGG-ACTA---AGTTAAA--GAG--AT--GCT-CTGTCAAG-AT---GACAGGCAAGACCTGTAAAGCT-AAT-GATCGGATACAGAG-A-GCTTGGTT--AACTGGAAGCA-AC-A-CC-AGGGCCAGAAGA-GTCGCCG-GATAGATCCTGTCAGTAAGAGTCA--T-GAGTGGACGTCT--CTA--CAGAA--GTC-CACAG--AAAACAAACTCGAT---CGAT-CAT-GAGAGTA-A--AA-AGAATATGCGCTCTC-ACAGC-GAGA-TATTAAAAGGAT-TGAAAACA-TGGAAGTTTCAGT-ACAGGGTCAA--GGATGTA-GCCTCAT-AAC--AGA--AGATG-GGATTTGCTAAGGAT-AAGTTAGAC--AAT-TTA-CA--AATGCGGTTC-TGAA---AAG----A--TTAAAAGGG----GCGCG-AATGGAG---AAGAGTTGA-AACTC-G-TAGCA-TTCAAA-GAGCAATGAACACAAGGGGA-TGATGCAGGTCGTAATGCATC--TGACC----ATATT--T--AGGGTAGTGCCTT--CCATAAA---CGAGAAAGGGGTT--TA-agatgtt
gi|5 : tcaagaaactaaacaacgtcgttataaccagcataaattttggtggagaacgagatttgggagtccatgattaattaaaacattagtatctaaaaagatgagcaacggattacacaagaagtaaaccagttgaaagggaatagattgctccCAGGAA--TAGTTGAAGATG-AAGAC-AGTGACTGGGATGT--AG-ATC--CCG--AAG-TTCAA--GTTGGGGACGAGGGGGTTGA-GGTCTCAGAGAAGGAGATGGGAGC-AAGGCCATCCTTATCTGGTAGT-GCAGAGCTT-ATTACTAGCCGTG-TTATTCGCAAAAGAACATTTCCAAGTCCTGTCCAGA-C-CTCCAGAAA-AGTCACAAGTCGAAAAGAGGA-AGTGGTACAG-AGGAAG-TGTGTAGA--TGCCGGTAT-TCAGACAGTCACGTTTGAGCC-CATTCAAGTG-ATCAAG-TCAGCAGAAATTGTGGATCAG-GGT-ATTCAGACAGAAGGATACCGTCGA---------CGTTGGTTAGGCA-AAGACAG---C-T---G-CAC--A--GTAT--CAAA-AAAC-GACCAAGA-TCATCGA-------GAAG---GAA-AAT-T-TTTCGAAA---GTA-AT-GAT-AT-A-AGC-ACATTAA-CTGT-AAT-----AAG--C-GTT-G-T-GTATGGC-CTTGACATT-GCAATT-TAATGCATGT-GTTCA-A-CTTTCAATCACCA-GG--GA-GTGCGA-AGAATT-CATTACTCATGCTT-GATACA----TTTTTTCATG-TTG---TCAC---TC--------------------------TCTGTTAT----A-AAAAAACTATAAT---TCAATC-T--TATA---T---TTA-T-ATGT-GAGGGA-CACATGGCG--CGTAGA-G--G-GTG--GGTAGAT-T-A---CAA---TAAAGG----TCGATGG---AG-AATGATGGTTGCGT-----ATGT--AT-CATTATCGA----GAT-A--G-----CA--TAAA----TAAGCTTAAT---------GTC-----------CAACC------AG-TGACT--TTTC-GT-AGG-GC-A-TGGT-AT-T--ACA--ATACT----C-CGA-------G-TAGT---TCA--GGTGTTG---AA-A---CTAAT-A-ATA-GGC--------A----TCT-GCTGATA---CG--TC---ACTTCAG--TTGT--GGAGAT---CG--AC--GAG-AGAA-GA------C-GG---T-GACA-AA--GG-TAC--T----ATATATAATA------C----GGCG--TGTATTATA--ATATT--CAG--TATA-----CGGTG-----G--CTA--GTGTACTGA-T------ATG-GA--C-A-ATAG---T-AATAAAGTATTTC-C---AG-GTTTA-AAGTGT-C----AAGATC-G--GTCC-GGTTATAGAGA---AAG--TTA------A-------GA-CAAG-----CACCTGTCCGG--TATAGGCGGGGGTATAGGA-CAGA-AA-CT----AG-CAT-AGG-----GCAC
gi|6 : AGCTGCAT--ATCTGT-TACTTTAAAAGACCTGTT-GTT-TTATTGTGCTTGACTTTTGTCATTGTATTGCA--TTGTT-A-A-CTTATAGTTA--AGGGAGGA-G-GCGACAAAATTTCCTTATT-AT--TT-G-TGCA--TGCTTTT----G-CTG----------TAT-C---------------A-------TCTGTTTTG--AA--------TAAGAT---T--ATCATTGTATA--TT---TTA-TCATGT-GA-GGA-CA-ATGAAG--GCT-GA-GTCGCGTG--GGTAAGTGTGGCATCAA--TTAGAGA----TCGG-GGTGCGG-GAT----GTT-CAG----CATATTAATAT-------A----GAT-G--CTAAATCTA-TAAC----T-------AT---------GCTTTACTGTCAACCG---------GA-CT--TCATATT-GT-AGGAGCTACT--T-AG-GTCATACCACA-TG---CGCGAG-----GGTTAGTACATCGGTGGTATC----AGCAG--CTCTA-ATATATCGC---GTGGCAGTATTCT-GCTAGCATTTTGTTTC----GTTCAAATCTGTTGGGAGCT---CGTCAA--GAGAAGAA-CAAGCAGTC-GGATAC-AATA-AA--GGTTAC--G-GCAATATATAATATAAATGC---GGGCGTTTGT-TTAT---ACATTGACAGTATATA-----CGGTGCTTACG--CTAAGGTCTATTGA-TCGCGTGCTG-T---CGAGATAATAAT-AATAAAGTATCTT-CACAAG-GTTTATAAGTGTACATGAGGGATT-GGAGTCCTGGG--TAGGTA---AGA--TTGCATATTA-------GA-GGAGTACGTCACGTGTCCGGGTTATA-----------GGCA--AC--AA-CT----AG-TAT-GGGCGGTAGCACATATTTAG-C-ATATTA-G-CTC---CCGA--G--CGCTTCTT----CTCA-------CAGCC---ATTAACCAGTTAAGGACATT--CT----A---T-GG-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-CT----------ACA-A---AATCTT-TGT-----ATCTGTAGGCA------TGTATATC-GT--ATTCGAC-T--TG---TC--TCGT-TT-----ATTTT--C----------CTCATTG---TTT-GGCATTATC---A--TTC---ATTAGATA--AT-C----CA--TT-TGC-CGCCAGTATCTG-----GT-T-CGCGCA-ATCA--TCGAAC--CTAA
gi|7 : -TAGTGCT--T-TTCCATA-CTT-CAATC-CCAGGG--AG-AT-CGA-AGAAAT-CATTATTCAT-CT--G-T-CA--TTTT----CATG-TTGTCCTCAC---TCT-TTTTTACCGGTATTACA-------TGTATTTTG--AATAAACGATTAATAT---A--ATT-T-GTATAATTTCAATTG-TCATGT-GA-GGAACACATGACGG-CATAGAAG--GCGTGTGGGTAAGTGTGA---CAAACTTGAAGAACAATCGG-GTTTCGGCGATG-----T-TGT----CATTT--AT-C-------A----GAT-AGAT-----CT--GACA----T-------ATAA-------GTTTA---------CGTCAACTTCTGG-TA--C--TTTTCGT-AGG-AC-A-TAGT-AG-G--AAA---CA-TGCTCC-CGAG-----GG-TAGT---TCG--GGTGTTTTTCA-CA---GTATG-A-ATAGGGC---ATA--A----TCTTGCTGAGATTTTG--CTCGTAGTTCAT--CTGT--GG-TCT---C----C--GAT--------------C-GA---T-TA-A-AA--AG-TAC--ACGCAATATAATATA------C---GGCTG--TGTATTATTTTATATT---AG--TATATATAACGGTG-----G--TTA--GTATACTGGGT------CTGCG---C-AGATAGT--T-CGT--AGTAT--C-C---AGAGTTT------GT------AAGATCCGT-GTCC-GGGTA-ATG-----AG---CTA------A-------TA---GG-----TACATGTCCGG--TATA-----------AGGA-CAG--AA-CTGTAAAGTCATCAGA-----ACACAGC-CAAGTC-A---TACG-GCCAAACA-A--GCAC----CTTGC--CGAG-------CC-CC---AT--ACCT-TT-AAGTT--T--TTTCCAA---TAGT-CAT-TTG-G-A-T-TTA--GGAAT----------AGG-TGGGAATC-C-C-T-----A----TAAC-A------TAT-TATCTGT--AT---ATAT--TGTCAGC--TCG--TTTTTTAATTTTCCTAATAGCTCTGTTCA-TGTATTTT-TGTAT--TC---ATTTTC---ATT-CATA--ATGC---ACGACCA-TGT-C-GCCT-A-TTGATTCTGT-C-CG---A-ATCA--AAGAACCACTAAACA
gi|8 : ttaATTAAAAGACC-GTT-GTT-TTATTGTGCTTGACTTTTGCAATT-TATTGCA--T-GTTCA-A-CTTTCAGTTACCAGGG--AG-GAGCGA-AAAATT-CCTTATTCAT-CTT-G-TGCA--TTTTT----------G--CTGAC---TC------------------A-------TCTGTTTTG--AA-TAAAGATTA-----------TCAT-GTATA--TT---TTA-TCATGT-GA-GGA-CACATGAGG--CATAGA-G--GCGTG--GGTAA-TGTGA---CAA--ATTGAGA----TCGG-GGT-CGG-GATG-------TAT----CATAT--AT-C-------AAATAGAT-G--C---------TAAA----T-------ATAAAGCTTACGTCAAC--------CG---------GA-CT--T--TATT-GT-AGG-AC-A-T--T-AG-G--ATA--ACA-T----C-CGAG-----GG-TAGT---TCG--GGTGTTC---AGCA---GTATA-A-ATACGGC---A----A----TCT-GCTGAGATTT-G--TC---AGTTCAA--CTGT--GGAGCT---CG--ACAAGAGAAGAA-GT------C-GA---TAAAAA-AA--GG-TAC--G-GCAATATATAATATAAATGC---GGGCGTTTGT-TTAT---ACATTGACAGTATATA-----CGGTGCTTACG--CTAAGGTCTATTGA-TCGCGTGCTG-T---CGAGATAATAAT-AATAAAGTATCTT-CACAAG-GTTTATAAGTGTACATGAGGGATT-GGAGTCCTGGG--TAGGTA---AGA--TTGCATATTA-------GA-GGAGTACGTCACGTGTCCGGGTTATA-----------GGCA--AC--AA-CT----AG-TAT-GGGCGGTAGCACATATTTAG-C-ATATTA-G-CTC---CCGA--G--CGCTTCTT----CTCA-------CAGCC---ATTAACCAGTTAAGGACATT--CT----A---T-GG-CAT-TTG-A-T-T-TTA--GG-AT----------ACA-A---AATC-CTTGT-----A----T----C------TG--TACATGT--AT---ATAT--TG---AC--TCG--TT-----ATT---------------TTCA-TAT--TTT-TGCAT--TC---A--TTC---A-T-GATA--AT-C---A
gi|9 : att-A-GCT--GTT-GAACTGGAAGCATAC-A-AC-AGG-GCAGAG-A-GTCGCCG-GATAGATGCTGT----TGGAGTCA--T-GAGTGGAAGT-T--CTA--CAGAACCGTC-CAGAG--AAAACAAACTCGAT---CGATTCATAGAGACTGTAGAAA-AGAATATGCGCTCTCTACAGC-GAGA-TATTAA--GGAT-TTGAAACAATGGAAGTTTCAGTCACAGGGTCAA--GGACGTATGCCTCATCAAC--AGACAAGCTT-GG--TTACTAAGGATCAAGTTAGAA--AATGTT-GCA--AATGCGGTTC-TGAA---AAG---CACCTTAAAAGGGACT-GCCCGCAATGGAG-CAAAGAATTGG-AACTCCG-TAGCAATTCAAAAGAG-AATAAACACAAGGGGACTGATGCAGCTCGTAA--------TGACC-AATATATT-CTAGAGAGTAGTGCATTTGCCATAAA---CAAGAAAGGGGTTAATACTGTTCACGCGACA-CAAGTATCATTTTGAGAATGGAAT-G-TT-TATTTACCTGTTA-GTTGGTGATTGGTACGA-GG-G-----C-----TGC-ATTTACG--TGGT---------CCTT------GGGT-CACAG-GTCAA-TCCTT-GACAAAG---G--TA-GAGAGAGATGTTCTATCAGC-TAGTGG-ATCA--CCGCTAAATGTACTGGGG---AAAGTTCGAGTAGATT-TAAA-GCTGG-ACAACATTGC--ATTAAA---GC-AT-GAAA--TGGTCATAGC
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|26 ): GTAACGAATTGAGATCGGATTTGGAAGCATTATATATCGATTATCTAGAGGAAAAGGCAAATATGACGAAAAACGCTTATGTCAACCGGACTTTGGTGTAGAGTATCACGAT
Unaligned ( gi|29 ): TGTAACGAATTGAGATCGGATGTGGAAGCATTATATATCGATTATCTAGAGGAAAAGGCAAATATGACGAAAAACGCTTATGTCAACCGGACTTTGGGTGTA
Unaligned ( gi|31 ): AATTTTGGTGGCAGCAACGGGATTTGGATCGGTCAGNTCAATAAGTTTGTTAATAGACAGAAGAGTGAACAATAATAATATATAAGTTACTCGGCTAG