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gi|16 : ---------C-AAAA----------------A-A-----A-T--AA-GTTAACA-------C------AT--ACTGGTAG-TC-TT---TATCAAG----AGC-C--------CC-----C-T------CT----CC--C-T----------T---------G-------AA-ACTA---GAT--A----TGATGA--GTGT---A-ACTTC-G---A--ATCGA-T-GA---C------TA--AA-T--AT--------CA-----AC----TG---------CTAGCA-------------GCACTCTATAT--A------CCTCTT-T--ACTGCCTTAC---------TCA-CAAATaaacttcgatcttttaatctctctcct
gi|11 : aggggtaagatcgattaacttttAA----------------A-G-----C-TTCAA-ATT--CA-------C------AT--A------G-TT-TT---CGCTTAA----A---T--------A--------------------------------------T---------G-------AT-ATAA---AAT--A----T--TGA--AAGTT-----------------ATGGA-TTAA---C-GAG--TAT-AATA--AT--A---------------A-ATA---------TTA-CTA---AA-AT----GCACCCCGTATGTA------CCTTTTCT--ACTG-TTTAT---------TCA-CAAATGCATGAA-------AGCT--A--------------A----TC-TAA-A----A------CTATTTTAACGTC----A-ATTAAGAT----AT------A-----AC---T------CTC-T------ATG---------TCGGAT------GACAGA----GAC-TT-ACG--GGAGTTTTTA--C--C------------aaac
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gi|12 : ----TGATGA--ATGCTG-A-AAC-T-ATTTA--ATGGA-TTAA---C-AAG--TA--AA-AACAT--G-----CG--AGTAT-G-ATA---------ATT-AATC--AA-AT----GCAgtaggactccaaagtgcgatggtact
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gi|7 : gcgagtatacggt-A-ATA----------TA-AAT---AACAT----GCACTCTGTAT--A------CCTTTTCT--ACT--TTTCT---------CCA-CAAATG---AAA-------ATGT--A-----C-----A---------TTAA-A----A------CTG-ATAAATGTA----C-ATTAAAAT----GT------AAT---GTATGT------ATTAT------Gcccctccccctaactacatgtatttgagttctaattttttttttaccgacatcaatttctaaggaagcatttt
gi|36 : ggatttcaaaagttcagtgtctgacaaaaaaaccaactaaattcacatagttttcaccaagactctcctcttcacccccttttaaacta----GCACT--ATAT--A------CCCTTTTT--ACTA-TTTAT---------TCA-CAAATA---AAA-------GTGT--ACATGTG-----AT-C----TTTTAA-A----A-------TA-TCAAAatatgataaaaagtgttatattattatgtaatggatgtcgaatgatagtttttacccaccttcactaatctatatgaatttagatttttatttgacatggattttttta
gi|15 : TAT--A------GATTTTCT--ATTT-TTTGT---------TTA-CAAATG---AAA-------AT---------CT-----AC-A----T--TAA-A----A------CTG-CTAAATGAA----A-ATGAAAATTATTGT------AAT---AT---C------ATTAT------GTGTAATCGATGTCGGATGACAGGAACTGACGGCAACGTC-CAC--ACACCCTTCT--T--C------------T----------AG--CT------------A-----T-TTAGATTTAGA-TTTTATCCGAAAT
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gi|7 : tcaataTTCA--C--T------------A----------AT--CT------------A-----TATGA-ATTTAGATTTTTATTTGACATGcaatcttttgatctcgctctcaagt
gi|40 : ggatttcaaaagttcagtgtctgacaaaaaaaccaactaaattcacatagttttcaccaagactctcctcttcacccccttttaaactaaatataaataacatgcactctgtataccttttctacttttctccacaaatgaaaatgtacattaaaactgataaatgtacattaaaatgtaatgtatgtattatgatatgataaaaagtgttatattattatgtaatggatgtcgaatgatagtttttacccacc-----T-TGA-ATTTAGA-TTTTATCTGACATgattttttta
gi|43 : cccccccccccaactatA-ATTTAGATTTTTATCCCACATcaatcttttgatctcaccc
7 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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lowQualScore : . ........ .. . .. ......................... . . ......... ..... . .. . .. ....... .. ...... . ...................................................................................... . ... . .. .... ... .. ............. .. . ... .. .. ..... .. .... . . . .. ................................... . .. .. ...... .. . .... ....................................... ...... ..... . . ............................................................................................ . . .. .... . . ................................................................ . .
lowQualScore : 2 44444444 11 2 66 4444444444444444444444444 3 3 444444444 11111 3 66 1 66 6666666 88 222222 2 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 6 444 6 22 3333 999 66 3333333333333 22 8 555 88 88 99999 88 0000 0 2 2 11 44444444444444444444444444444444444 2 11 22 888888 44 5 3333 666666666666666666666666666666666666666 222222 11111 1 1 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 4 8 11 8888 2 1 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1 8
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Reference ( family-5484 ) : GCGA-GATCAA--------AAGTTC-GATGTC-TG--A-------------------------C-ANAA---------AA-----C-T--AAAT-T--CAC------AT--A------GTT-TTCACCAAG----A--CNC-----C---------C------C---T----NCC------------C--------T---------A-------A-AACTA---AA-T--A----TGATG---A--ATGTTG-A-A---C-A---A--ATCGATTAA---CAAG--TA--AAA--A--T--A----CGA-GTATA--ATAA-------TANA----T-A-------A----A-T-GCACTCC--GTAT--A------CCTTTTCT--ACTG-TTTATTCACAAATG----AAA-------GTGT--A----TTA-----------TA----TTTTAAAA------CTATTA-AACGTACNT-TAAAAT----GT------AATAT---T--------ATT-------AT------G--------------------------T-------GT--------AA-TCGATGTCGGATGACAG--AAACTTNNAGG-AGTTTTTA--T---C-----------C------------A--CC-------------A---T-----T----GA-ATTTAGATTTTTATCCGACATGT
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gi|14 : gGCAA-GGTCAA--------AAGTTC-AATATC-TG--A-------------------------T-AAAAAAAAAAATGAA-----T-T--AAAT-T--CAT------AT--AC-----TTT-TTCATCAAG----A--CCC-----TGTGGTGCCAC------C---T----TCC------------T--------T---------A-------A-AACTAAATAA-T--A----TGATA---A--ATATTG-A-T---CTA---A--ATCTATTAAT--CAAG--TA--AAA--G--T--AATTTCTATTTATA--A-AA-------CACA----T-A-----------------CTCTAC--TAAT--A-------TTTTTCT--TTTG-TTTATTCACAAATG----ATA-------GAAT--A----TTA-----------TG----Ttccccctaactacatgtatttgagttctaattttttttttaccgacatcaatttctaaggaagcatttt
gi|15 : aA-------TAAA----T-A-------AC---G-T-GCTCTTTTAATAT--A------GATTTTCT--ATTT-TTTGTTTACAAATG----AAA-------AT---------CTA-----------CA----TT--AAAA------CTGCTA-AATGAAAAT-GAAAATTATTGT------AATAT---C--------ATT-------AT------G--------------------------T-------GT--------AA-TCGATGTCGGATGACAG--GAACTGACGGC-AACGTCCA--C---A-----------C------------A--CCCTTCTTCTAGCT-A---T-----T----TAGATTTAGA-TTTTATCCGAAATggtct
gi|15 : atA-GATCAA--------AAGATC-GATTTC-GG--A-------------------------T-A-AA---------AT-----C-T--AAAT-C--TAA------AT--A------GCT-cgatcttttgatct
gi|16 : atataaataacgtgctcttttaatatagattttctattttttgtttacaaatgaaaatctacattaaaactgctaaatgaaaatgaaaattattgtaatatcattatgtgtaatcgatgtcggatgacaggaactgacggcaacgtccacacacccttcttct-------------------------C-AAAA---------AA-----A-T--AAGT-TAACAC------AT--ACTGGTAGTC-TTTATCAAG----AGCCCC-----C---------T------C---T----CCC------------T--------T---------G-------A-AACTA---GA-T--A----TGATG---A--GTGT---A-ACTTC-G---A--ATCGATGAC---TAAA--TAT-CAA--C--T--G----CTA-GCA------------------------------------------GCACTCT--ATAT--A------CCTCTT-T--ACTGCCTTACTCACAAATA----AA
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gi|27 : aggg-TCAATATCGAATGACAG--AAACTTAAAAG-AGGTTTTA--T---C-----------C------------C--CCTCCCCCT------AACTT-----T----GA-ATTTAAATTTTTATCCAACATattctgt
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gi|32 : ggATGACAG--AAACTCGCGGG-ATATTTTA--TATAC-----------C------------C--CC-------------C---T-----------A-ACT---ATTTTTATTCAATAT
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gi|38 : cGA-GATCAATAGTAATTAAGTTCCAACGTC-TG--A-------------------------C-AAAA---------AA-----T-T--TAAT-T--CAT------AT--A------GTT-ATCAtcattcccca
gi|39 : ga---T--------ATT-------AT------G--------------------------TGTACCAGGT--------AA-TCGATGT-------CAG--AAACTTACAGG-AGTTTTTA--T---
gi|4 : GTGA-GATCAA--------AAGTTT-AATGCA-TG--A-------------------------T-A-AA---------AT-----C-T--AAAT-T--GA--------T--A------GTT-TTCACCAAGCCCCA--CTC-----C---------C------C---C----ACC------------C--------C---------------------CTT---CA-C--A----T--TG---A--ATGTTG-A-A-----ATT-A--ATCGATTAA---CAAA--TG--AAA--A--C--A----TGA-GTATA--A--A-------TA--------A-------A----A-T-GCACTCC--GTAT--AGATCTACCTTTTCT--TCTG-CTTATTCACAAATA----GAA-------ATGT--A----TT--------------------TTAAAA------CTATTA-AATGTACAT-TAAAAT----GT------TACAT---T--------ATT-------AT------G--------------------------T-------GT--------AA-TT-------GATGGCAG--AA---------------TTA--T---CCCCCTCCCCCTC------------A--CT-------------AT--T-----T----GA-ATTTAGATTTTTATCT--CATGTtacccctcccct
gi|4 : gGA-GATCAA--------AAGATT-GACATG-AG--A-------------------------T-AAAA---------AT-----C-T--AAAT-T--CAA------AT--A------GTcaatcttttgatctccctc
gi|40 : ggtgagatcaaaagtttaatgcatgataaaatctaaattgatagttttcaccaagccccactcccccacccccttcacattgaatgttgaaattaatcgattaacaaatgaaaacatgagtataaataaaatgcactccgtatagatctaccttttcttctgcttattcacaaatagaaatgtattttaaaactattaaatgtacattaaaatgttacattattatgtgtaattgatggcagaattatccccctccccctcGTGA-GATCAA--------AAGATT-GATGTC-AG--A-------------------------T-A-AA---------AT-----C-T--AAAT-T--CAA------AT--A------GTT-cctc
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gi|9 : aacactCGA-GATCGA--------AAGATC-GATGTC-GG--A-------------------------T-AAAA---------AT-----C-T--AAAT-T--Ccgatctttcgatctcgtcc
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|8 : ggatttcaaaagttcagtgtctgacaaaaaaaccaactaaattcacatagttttcaccaagactctcctcttcacccccttttaaactaGCGA-GATCAA--------AACTTC-GATATC---TG--A-----------C-AAAA---------AA-----------------------T-T--CAC------AT--A------GTTGTTCACC----------------C------C---------CC---TC----CC------------C--------T---------A-------A-AAC-T-A---AAT--AATTATGAAG---A--ATGTTG-A-A-----ATT-A--ATCAATTAA---GAAA--TA--AAA--A--T-------GTTCA--AACTT-AGAT-------AA-AATGCACTCC--ATA--TA------CCTTT-------------TCT--A-------------TTG-TTTGTTAACAA----ATGAAA-------GTG----------------------TA----TTTTGCAA------TGA-TT----------T-TAAAAT----G----------------------------------------------------------------------------------------A-TCGAT-------GACAGAAACTTA----TGGAA-GTTTT---T-----------------------------------------------------------A-AGTTAGAATTTTATCCAACATgattttttta
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gi|3 : gcgcacGTGA-AATCAA--------AAGTTC-AATGTC---TG--A-----------C-TAAA---------AA--------------C-C---CAACAT--TAC------AT--A------GTT-CCCCCC--G-G--C-C------C------C---------CC---TC----CCA-----------C--------TTAAAATTAAA-------A-AAC-T-A---AAT--A----TGAAG---G--ATGTTGAA-A---C-T---A--ATTCATTAA---AAAG--TA--AAC--A--TA--C-A-GAACT--GTTAT-AAAT-------AA-----CACTCA--GTG--TA------CA-TT-------------ACT--A-------------C------ATTCACAA----ATGAAAAGGATACATGTTCA----TTA-----------AA----ATTTAAAT------TTA-TTATGATTT---T-TAACA-----GT------CAT-T---T--------ATC-------TTTTCCCAA--------------------------T-------AA--------AA-TCGATGTCAGATGACAGAAACTTA----TGGGA-AATTT---TA-------CCC------------A----CCCTCTCCCAAACAAA---T-----T----GA-AGATAGATTTTAATCTGACATcttttgatcttgcccctaa
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gi|32 : ggATGACAGAAACTCG----CGGGATATTTTATATA-------CCC-----------------CC-------------C---T-----------A-ACT---ATTTTTATTCAATAT
gi|33 : AAT-T--CACTTACATGT--A------GTT-TTCATCCAA-A--C-C------T------C---------CA---TC----CC------------CT-------T---------G-------A-AAT-G-A---AAT--A----TGGTG---AATATATTG-ATC---C-A---A--ATtgatcttttgatctcacctcttacattat
gi|34 : GTGA-GATCAA--------ACGTTC-AATGTT---TG--A-----------C-AAGA---------AA--------------T-T---AAAT-T--CCC------AT--T------GTT-TTCACCAAG-A--C-T------C------C---------TC---TC----CC------------C--------T---------
gi|35 : ggCGACGATCAA--------AAGTTC-AATGTC----GAAA-----------C-AAAA---------AA--------------CTT---AATT-T--CAC------ACTAA------GCT-TTCACAGAA-A--C-C------C------C---------
gi|36 : ggtgtGCACT----ATA--TA------CCCTT-------------TTT--A-------------CTA-TTTATTCACAA----ATAAAA-------GTGT--ACATGTGA-----------TC----TTTTAAAA-------TA-TCA-AA
gi|37 : TT-------TT------G--------------------------T-------GT--------AA-TCGATGTCGGATGGCAGAAACTGA-----GGAA-ATTTT---TC-------CCC------------A----CC-------------
gi|38 : cGA-GATCAATAGTAATTAAGTTCCAACGTC---TG--A-----------C-AAAA---------AA--------------T-T---TAAT-T--CAT------AT--A------GTT-ATCAtcattcccca
gi|39 : ga---T--------ATT-------AT------G--------------------------TGTACCAGGT--------AA-TCGATGT-------CAGAAACTTA----CAGGA-GTTTT---TA-------
gi|4 : GTGA-GATCAA--------AAGTTT-AATGCA---TG--A-----------T-AAAA---------T---------------C-T---AAAT-T--GA--------T--A------GTT-TTCACCAAG----C-C------C------C---------AC---TC----CC------------C--------C---------A-------C-CCCCT-T---CAC--A----T--TG---A--ATGTTG-A-A-----ATT-A--ATCGATTAA---CAAA--TG--AAA--A--CA--TGA-GTATA--A--AT-AAA-----------A-TGCACTCC--GTA--TAGATCTACCTTT-------------TCT--T-------------CTG-CTTATTCACAA----ATAGAA-------ATGT--A----TT--------------------TTAAAA------CTA-TTA-AATGTACAT-TAAAAT----GT------TACAT---T--------ATT-------AT------G--------------------------T-------GT--------AA-TT-------GATGGCAGAA--TTATCCCC------CTCC---CC-------CTC------------A----CT-------------AT--T-----T----GA-ATTTAGATTTTTATCT--CATGTttacccctcccct
gi|4 : gGA-GATCAA--------AAGATT-GACATG---AG--A-----------T-AAAA---------AT--------------C-T---AAAT-T--CAA------AT--A------GTcaatcttttgatctccctc
gi|40 : ggtgagatcaaaagtttaatgcatgataaaatctaaattgatagttttcaccaagccccactcccccacccccttcacattgaatgttgaaattaatcgattaacaaatgaaaacatgagtataaataaaatgcactccgtatagatctaccttttcttctgcttattcacaaatagaaatgtattttaaaactattaaatgtacattaaaatgttacattattatgtgtaattgatggcagaattatccccctccccctcGTGA-GATCAA--------AAGATT-GATGTC---AG--A-----------T--AAA---------AT--------------C-T---AAAT-T--CAA------AT--A------GTT-cctc
gi|41 : cccccccccccGCGA-TATCAA--------ATGTTC-AATGTG---TG--T-----------C-AAAA---------AA--------------C-G---TAAT-T--CAC------AT--A------Gcc
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gi|8 : ggatttcaaaagttcagtgtctgacaaaaaaaccaactaaattcacatagttttcaccaagactctcctcttcacccccttttaaactaGCGA-GATCAA--------AACTTC-GATATC---TG--A-----------C-AAAA---------AA-----------------------T-T--CAC------AT--A------GTTGTTCACC----------------C------C---------CC---TC----CC------------C--------T---------A-------A-AAC-T-A---AAT--AATTATGAAG---A--ATGTTG-A-A-----ATT-A--ATCAATTAA---GAAA--TA--AAA--A--T-------GTTCA--AACTT-AGAT-------AA-AATGCACTCC--ATA--TA------CCTTT-------------TCT--A-------------TTG-TTTGTTAACAA----ATGAAA-------GTG----------------------TA----TTTTGCAA------TGA-TT----------T-TAAAAT----G----------------------------------------------------------------------------------------A-TCGAT-------GACAGAAACTTA----TGGAA-GTTTT---T-----------------------------------------------------------A-AGTTAGAATTTTATCCAACATgattttttta
gi|8 : GA-GATCAA--------AAGATC-AATGTT---GG--A-----------T-AAAATTCT-----AA--------------C-TTAAAAAC-T--TCC------AT--A------AGT-TTCtgatcttttgatctctctcctaaatattagacatgcaat
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blockSeqs : . . A . . . . . A . . . . A . . . AAGACTCC . . CGA . . . . . . . . AAATT . G . . . A . G . C AAC . AAA . . . . A . . GCTAATC . . . . . TATAACTC . AA . . . ATCATT .
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blockSeqs : . . A . . . . . A . . . . G . . . AAGATCTC . . CCA . . . . . . . . ATCC . G . . . G . G . T A . T . . . . T . . . NN . . .
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blockSeqs : . . G . . . . . A . . . . A . . . TAGGCACA . . CTA . . . . . . . . AAA . C . . . A . . . . A . . . . . . G . . .
blockSeqs : . . A . . . . . T . . . . T . . . AAACCCC . . CTA . . . . . . . . CA . C . . . A . . . . . . . . . .
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blockSeqs : . . A . . . . . A . . . . A . . . CCCA . . CT . . . . . . . .
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blockSeqs : . . A . . . . . T . . . . A . . . C . . . . . . . . .
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-5484 ) : GCGA-GATCAA--------AAGTTC-GATGTC-TG--A-----------C-AAAA---------AA--------------C-T---AAAT-T--CAC------AT--A------GTT-TTCACCAAG-A--C-C------C------C---------CC---TC----CC------------C--------T---------A-------A-AAC-T-A---AAT--A----TGATG---A--ATGTTG-A-A---C-A---A--ATCGATTAA---CAAG--TA--AAA--A--T--A--CGA-GTATA--ATAAT-AAAT-A-------A-A-TGCACTCC--GTAT--A------CCTTT-------------TCT--A-------------CTG-TTTATTCACAA--------------AT-G----AAAGTG-----TA---------TT-----TTA-A-AA------CTATTA-AA-----TGTACAT-TAAAA--T----GT------AATA-T---T--------A-TT-------AT-G--------------------------T-------GT---------AA-TCGATGTCGGATGACAGAAACTTACGGGAGTTTTTA-C--CC--A-C----CTC--C----C----A--C------------------TA--TTTGAATTTAGATTTTTAT----CCGACATGT
gi|1 : CAA-GATCAA--------AAGTTC-GGTGTC-GG--A-----------C-AAAA---------AAACCT----------C-T----AAT-T--TAC----------A------GTT-ATCATCAAG-A--T-C------C------CTT-------CCGCACC----CC------------C--------T---------A-------ATTAC-T-A---AAT--A----TGATG---A--ATATTG-GTT---C-A---A--ATTGATTAT---TAAT--TG--CAG--C--T--A--C-----------TAGT-AAAT-A------------GCACTCT--CTAT--A------CCTTTAAAACCATAGTACTTT--ATATAGTTTTACTACTG-TTTATTCACAA--------------AT-G----AAAGTG-----TACTATAGTCTTT-----TTA-A-AAAAGTTGCT-TTA-GA-----TATACATGTAAAA--G----GTTTTCAGAAT--T---T--------G-TCTCCAAAAATCA--------------------------T-------GT---------AA-TCAATGTTGGAC-ACAAAAA-TTGCAGGAATTTTTA-C--CT--C-C----CTT--C----C------------------------------CTTGAATTCAGATATTTAT----CAAACAT
gi|10 : GTGA-GATCAA--------AAGTTC-AATGAC-TG--A-----------C-AAAA---------AA--------------C-T---GAAT-T--C----------------------------------------------------C---------CT---TC----CC------------C--------T---------A-------A-AAC-G-A---AAT--G----TGATG---A--TTTTTG-A-A--------------------A---CTAG--TA--AAA--A--TCTA--TGA-GTACG--A-----AGA--A-------A-A-TGCACTCC--GTAT--A------CTTTT-------------TTT-------------------------TCACAA--------------AT-G----AAAGT-------A---------TT-----ATA-A-AA------CTATTA-CA-----CATACTT-TAAAA--T----AT------A-------------------TT-------AT-G--------------------------T-------GT---------AA-TTG----CAGATGTCAGAAACTTACAGG---TTTTATC--CC--C-C----CTC--C----CCCTAA--C------------------TA--TTTGAATTTAGATTTTTAT----CCAACATtaatctttg
gi|10 : GCGA-AATCAA--------AATATC-AATGTT-GG--A-----------T-AAAA---------AT--------------C-T---AAAT-T--CAA------AT--A------GTT-tgatattttgatttcgctt
gi|11 : gtgagatcaaaagttcaatgactgacaaaaaactgaattcccttcccctaaaacgaaatgtgatgatttttgaaactagtaaaaatctatgagtacgaagaaaatgcactccgtatacttttttttcacaaatgaaagtattataaaactattacacatactttaaaatatattatgtgtaattgcagatgtcagaaacttacaggttttatcccccctccccctAA---------AG--------------C-TTC-AAAT-T--CAC------AT--A------GTT-TTCGCT-------------------------------------------------------------------------------------------T-A---AAT--A----TGATATAAA--ATATTG-A-A-----A---GTTATGGATTAA---C------------------------GA-GTATA--ATAAT-AAAT-ATTACTAAA-A-TGCACCCC--GTATGTA------CCTTT-------------TCT--A-------------CTG-TTTATTCACAA--------------AT-GCATGAAAGC------TA---------AT-----CTA-A-AA------CTATTTTAA-----CGTCAAT-TAAGA--T----AT------AAC-----------------TC-----------------------------------------------------------TCTATGTCGGATGACAGAGACTTACGGGAGTTTTTA-C--CCAAA-C----TTC--C----CCTA-A--C------------------TA--CATGTATTTGTATTTTtt
gi|12 : ----TGATG---A--ATGCTG-A-AAC-T-ATTTA--ATGGATTAA---CAAG--TA--AAAACA--T--G--CGA-GTATG--ATAAT-TAATCA-------A-A-TGCAGTCC--aacattttaatttttt
gi|13 : --CGA-GTATACGGTAAT-AATA-A-------A-A-TGCACTCC--GTAT--A------CCTCT-------------TTTGAA-------------CTG-TGAATTCACAATTGAATTGAATTAAATTG----AAAGTG-----TA---------CT-----TCA-A-AA------CTATTA--------TTT---T-TAAA------------------TA-T---T--------A-TT-------AT-G--------------------------T-------GT---------AA-TCGACGTCGGATGACAGAAACTAATGGGGGATTTTA-T--CC--C-C----CTC--C----CCCTAA--CTACATG------------TA--TTTGAGTTCTAATTTTTTTTTTACCGACATannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatttttatccgatattgatcttttgatctcgttcct
gi|14 : gGCAA-GGTCAA--------AAGTTC-AATATC-TG--A-----------T-AAAAAAAAAAATGAA--------------T-T---AAAT-T--CAT------AT--AC-----TTT-TTCATCAAG-A--C-C------C------TGTGGTGCCACC---TT----CC------------T--------T---------A-------A-AAC-T-AAATAAT--A----TGATA---A--ATATTG-A-T---CTA---A--ATCTATTAAT--CAAG--TA--AAA--G--T--A----ATTTCTA--TTTATAAAAC-A-------C-A-TACTCTAC--TAAT--A-------TTTT-------------TCT--T-------------TTG-TTTATTCACAA--------------AT-G----ATAGAA-----TA---------TT-----caatttctaaggaagcatttt
gi|15 : aAT-AAAT-A-------ACG-TGCTCTTTTAATAT--A------GATTT-------------TCT--A-------------TTT-TTTGTTTACAA--------------AT-G----AAAATC-----TA---------CA-----TTA-A-AA------CTGCTA-AA-----TGAAAAT-GAAAA--TTATTGT------AATA-T---C--------A-TT-------AT-G--------------------------T-------GT---------AA-TCGATGTCGGATGACAGGAACTGACGGCAACGTCCA-C--AC--A-CCCTTCTT--C----T----AG-C------------------TA--TTTAGATTTAGA-TTTTAT----CCGAAATatgtggtct
gi|15 : atA-GATCAA--------AAGATC-GATTTC-GG--A-----------T--AAA---------AT--------------C-T---AAAT-C--TAA------AT--A------GCT-cgatcttttgatct
gi|16 : atataaataacgtgctcttttaatatagattttctattttttgtttacaaatgaaaatctacattaaaactgctaaatgaaaatgaaaattattgtaatatcattatgtgtaatcgatgtcggatgacaggaactgacggcaacgtccacacacccttcttct-----------C-AAAA---------AA--------------A-T---AAGT-TAACAC------AT--ACTGGTAGTC-TTTATCAAG-AGCC-C------C------C---------TC---TC----CC------------T--------T---------G-------A-AAC-T-A---GAT--A----TGATG---A--GTGT---A-ACTTC-G---A--ATCGATGAC---TAAA--TAT-CAA--C--T--G--CTA-GCA----------------------------GCACTCT--ATAT--A------CCTCT-------------T-T--A-------------CTGCCTTACTCACAA--------------AT-A----AA
gi|17 : aggggtaagatcgattaacttttGCGA-GATCAA--------AAGTTC-AATATC-TG--AACCCCCCCCCCT-AAAA---------AAAACACCCCACACAAC-T---AAAT-G--CAC------AT--A------GTT-TTCACTAAG-A--CAC------C------C---------AC---CC----CC------------T--------T---------A-------A-AAC-A-A---AAT--A----TGAAG---A--ATGTTGAA-A---C-T---A--ATTGATTAA---CAAG--CAGTAAC--A--T--A--CGA-c
gi|18 : gGCGA-GATCAA--------TAGTAC-AATGTA-CG--A-----------C-ACTA---------AA--------------T-T----AAT-A--CAT------GT--A------GTT-TTCATCAGA-A--C-C------C------T---------TC---TT----C----------------------------------------A-AAC-T-A---AAA--A----GGATG---AATATGTTG-A-T---C-C---A--A---ATTAA---T--G--TA--AAA--G--T--A--CAA-TTA-A--ATAA
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gi|2 : aGCGA-GATCAG--------AAGTTC-AA-GTC-TG--A-----------C-GAAA---------AA--------------T-T---AAAT-T--CAC------GT--A------GTT-TTCATTAAGCA--C-C------C------C---------CC---CC----CC------------CCAATTACTT---------A-------A-AAC-T-A---AGT--A----CGATG---A--ATGTTG---A---C-ATC-A--ATCGATTAA---CAAG--TA--AAC--A--T--A--CGA-GTATA----AAC-AA-----------------CACTCT--GTAT--A------CATTT-------------TCT--A-------------CTG-CTTACTAACTA---------------------------G-----TA----------------TCACA-AA------CGA--A-AA-----TGTACAT-TAA---------GT------GATT-T---TTTTTCTTGA-TT-------GT-G--------------------------T-------TTCCCCACTC-AGCTCGATGTCGGGTGACAGAAACTAACGAAAG-TTTTA-C--CA--T-T----CTC--C----CCCAAA--CTACATGTACATGTACATGTA--TTTAAATTTTGATTTTAAT----CTGACgtaggactccaaagtgcgatggtact
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gi|21 : tGTGG-GATCAA--------AAGTTC-AGTGTC-TG--A-----------CTAAAA---------AA--------------C-T---CAAT-T---AC------TT--A------GTT-TTCACCAAG-A--C-C------CCTCTT-C---------CC---TT----CC------------C--------T---------A-------A-ACT-T-A---AAT--A----TGATG---A--A
gi|22 : ggGA-GATCAA--------AAGTTA-AATGTC-TG--A-----------C-AAGA---------------------------------------CAC------------------TT-TTCGCTAAG-A--C-C------C------C---------CC---CC----CCGCCGCGCCCGCTT--------T---------A-------A-AAC-T-A---AAT--A----CGGTG---A--ATGTTG-A-A---A-AT--A--ATCGATTAA---TAAGAATC--AAA--A--T--ataaggatgtgaggttttaatcga
gi|23 : GTGG-GATCAA--------AAGTTC-AGTGTC-TG--A-----------C-TAAA---------AA--------------C-T---CAAT-T--TAC------TT--A------GTT-TTCACCAAG-A--C-CCCCTCTC------C---------CT---TC----CC------------C--------T-----------------A-AAC-T-A---AAT--A----TGA
gi|24 : gCAA-GATCAA--------AAGTT--AATGTC-TG--A-----------G-AAAA---------AA--------------C-T---AAAT-T--CAG------GT--A------GTT-TT------------------------------------------TG----CC------------C--------------------------A-AGG-T-A---CATGCA----TGGTG---A--ATGTTG-ATC---C-A---A--ATTGATTAATATCAAG--TAC-AAA--G--T--A--Caaggatgtgaggttttaatcgataaat
gi|25 : aGTGG-GATCAA--------AAGT-C-AGTGTCCTG--A-----------CTAAAA---------AA--------------CCT---CAAT-T--TAC------TTT-A------GTT-TTCACCAAG-A--C-T------CCCTCTTC---------CC---TT----CC------------C--------T-----------------A-AAC-TAA---AAT--A----TGATG---A--Ataaa
gi|26 : ggaGCAA-GGTAAA--------AAA-------GTC-TA--A-----------C-AAAA---------AA--------------C-T---GAAT-T------------T--A------GT-------CATG-------------C------C---------CC---TT---------------------------T---------A-------A-AA---------AT--A----T--TG---A--A-ATT--------------A--ATGTATTAA---CAAG--TA--AAG--ACAT--A--CGA-GTATA----AAT-AAAaaaaggatgttg
gi|27 : aggg-TCAATATCGAATGACAGAAACTTAAAAGAGGTTTTA-T--CC--C-C----CTC--C----C----C--C------------------TAACTTTGAATTTAAATTTTTAT----CCAACATattctgt
gi|27 : GCGA-GATCAA--------AAGATT-GATGTT-GG--A-----------T-AAAA---------AT--------------T-T---AAAT-T--CAcaatcttttgatctcgctctcaagt
gi|28 : tcaatatcgaatgacagaaacttaaaagaggttttatccccctccccctaacttT------AAAA-T---A--------A-TT--------C-G--------------------------T-------GT---------AA-TCAATGTCGGATGACAG----TTA----------TA-C--TC----C----CAC--T----A----A--C------------------TA--TTTGAATTCAGATTTTTtctcaagt
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gi|33 : AAT-T--CACTTACATGT--A------GTT-TTCATCCAA-A--C-C------T------C---------CA---TC----CC------------CT-------T---------G-------A-AAT-G-A---AAT--A----TGGTG---AATATATTG-ATC---C-A---A--ATttttgatctcacctcttacattat
gi|34 : GTGA-GATCAA--------ACGTTC-AATGTT-TG--A-----------C-AAGA---------AA--------------T-T---AAAT-T--CCC------AT--T------GTT-TTCACCAAG-A--C-T------C------C---------TC---TC----CC------------C--------T---------
gi|35 : ggCGACGATCAA--------AAGTTC-AATGTC--GAAA-----------C-AAAA---------AA--------------CTT---AATT-T--CAC------ACTAA------GCT-TTCACAGAA-A--C-C------C------C---------
gi|36 : ggtgtGCACT----ATAT--A------CCCTT-------------TTT--A-------------CTA-TTTATTCACAA--------------AT-A----AAAGTG-----TACATGTGATCTT-----TTA-A-AA-------TATCA-AA-----
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gi|4 : gGA-GATCAA--------AAGATT-GACATG-AG--A-----------T-AAAA---------AT--------------C-T---AAAT-T--CAA------AT--A------GTcaatcttttgatctccctc
gi|40 : ggtgagatcaaaagtttaatgcatgataaaatctaaattgatagttttcaccaagccccactcccccacccccttcacattgaatgttgaaattaatcgattaacaaatgaaaacatgagtataaataaaatgcactccgtatagatctaccttttcttctgcttattcacaaatagaaatgtattttaaaactattaaatgtacattaaaatgttacattattatgtgtaattgatggcagaattatccccctccccctc-C--CC--C-C----CCC--C----A----A--C------------------TA--TTTGAATTTAGA-TTTTAT----CTGACATcctc
gi|40 : ccGTGA-GATCAA--------AAGATT-GATGTC-AG--A-----------T--AAA---------AT--------------C-T---AAAT-T--CAA------AT--A------GTT-caatcttttgatctcaccc
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gi|42 : tctagtaagggGTGA-GATCAA--------AAGTTC-AATGTC-TG--A-----------C-AAAA---------AA--------------A-T---AAAT-T--CAC------AT--A------GTT-TTCACC
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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