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gi|25 : tagtaGTTACA-T-AA-TAGG-TTT-AATT--G----GT----T-AG-GT---A-CA--GAAG-GA--C--GA-A--GG--CG-GGG------C--AATAAT-TGCAT-T-G-A--GGAA-G-----C-G-T-A---GC-GTT-G-GT----G-TG-AC-A-T-----T-TT-A-A--C--C-C-ACC--T-T---CG--C-T--GT-TC-T-TT---A-C-A-T--AT------TC--A--ATT---AAA-----CCg
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gi|2 : tagtaTTACA-C-AA-TAGG-TTT-AATT--G----GT----T-AA-GT---A-AA--G-AG-GA--C--GA-A--GG--CG-GGT------T--AA-AAT-GTCA--C-T-------C-G-------G-C-A---GC-GCC-C-TC----G-TG-AC-A-T-----T-TT-T-G--C--C-CGGCC--T-T---CG--T-C--CT-TC-T-GT---A-C-A-T------A-A-CC--A--ATT---AAA-----CCTATTGT-G---T-A--A-
gi|8 : agtagTTACA-C-AA-TAGG-TTT-AATT--G----GT----T-AT-GT---A-AA--GAAG-GA--C--GA-A--GG--CG-GGT------T--AA-AAT-GTCA--C-T-C--GGAC-G-----CTG-G-T---GC-GTC-C-TC----G-TG-AC-ATT-----T-TT-G-C--C--C-C-GCC--T-T---CG--T-C--CT-TC-T-GT---A-C-A-T------A-A-CC--A--ATT---AAA-----CCTATTGT-G---T-A--A-gtcacatgtatgcagagcaacccaaattacttcattctcgcttggaatagaatacggaaggtcgctgaaaaatattggaatagacgacgcatgtggggtatttttgatgtgggtgaactatcggacaatgatgaaccagctaacgggcaaataggcaaaccctagtgaaatgaaaatccgaaacgtgaagattgcgaatgtaaaaaacacggtgaagtatatttcaaattttgaaggatgtcagtggttaaagcagagatttttttccgtgttctataagactgtgaaaattcaattttgtttgctgaaatgagagcccgagaggataaacaacactgttcattgattatttattttttttcgttttcattccgttgagaatacatacatgtatttcatcatattgagaggccgctccaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgttcgtagaatgctgttacttatatgcaaatgatgtgtatgtcatgttttatgaaagcacttgcgccacgcctatagggtacggtggttatgtacagatacccacagcctaacaacaaaagaaattcactgctgctatgatacata
gi|9 : gtagTTACA-CCAA-TAGG-TTT-AATT--G----GTA---T-ATCGTTAAA-AA--CAAG-GA--CTCGA-ATCGA--CG-GGA------GTTAA-AAT-GTCA--C-TCA--GGTC-G-----CTG-C-G---G--GCC-C-TC----G-TG-AC-A-TCTTTGT-TT-G-G--C--C-CCGCC--T-----CT--T-C--CT-TC-TGTT---A-C-A-TGAACA-A-T-TC--A--ATT---AAA-----CCTATTGT-G---T-A--A-gtcacatgtatcagagcaaccccaaattatcatgaatttaggactttcatttctcgcttggaatagaatatggaaggtcgctgaaaaataatggaagtagacgacgcatgtgggggtatgtttgatgtgggtgaactatcggacaatgatgaaccagctaacgggcaaaaaggcaaaaggcgatccctaggtgaaattgaaaatccgaaacgtgtattgcgagggttgtaaaaacacgtcaagtaaactgaaagtatatttcaatcctttttgagcgatcgtctgtggaataaaagcaaacatattttttatcttgttctttagcatttaagtgcacatgtgagaaataattttgttgtgataattaaagagcccag
gi|6 : tagtagTTACAAC-AA-TAGG-TTT-AATT--G----GT---------AT---A-CA--AAAG-GA--C---A-A--G---CG-GGA------C--AA-AAT-GTCAGCT-G-A--GACCTG-----C-GGC-A---GCCGTC-C-GA----G-TG-AC-A-T-----T-TT-GTA--A--C-C-GAC--T-T---CG--T-CTCCT-TC-T-GT---A-T-A-T--A-----A-CC--A---TT---AAAT----CCTATTG------T-A--A-G---------TCA-----T---G-T-A-T---A-GT-----A--G-A---------A--CCCAA-A----T-T-T--A---CA---TCG-------------------A--A--TT----TATGGA---A----TTT-----TC-ATTTCTC-GCTTTGG-AA-AA-A-----A------TAT--G-GG------AAG-GT-----------------C-GC-T---GGA--A-AT--TA-A--T-G--GAGA-G--T-G--ACAGA-C--G-C-ATG-T-G-G-A------GG--TA---TTTAT----T-GT-GG-TGAGA-A-T--ATC------G-GA-C-A-AT--------------------GATT--G-AA----------AGCTAAC--G-CAC------AAGGCAAAA------CCC--AA-TTG-AA---ACATTGAAAATGCC--GA-AACGA----------TG--GAAA-C----GCGA---ATGT--A-AA-AATCG-T-GTA-TCAA----T-A-CTG-T-G-A-AGTA-TA----TATTGT--T---CCA---AAT-T---CGAAG-A--T-G-T-C-----A--TGT--TAAAAG-CA---A---G--------ATTGGAGGTGGGTTGTTG--TTTTC--CCAGTGTTC-------T-T--T-AAA--------------G---AGA-G---G--------TT-GAACT------A--AA--T---------TTTG----TT-T----GCTG---A---AATA-GAAAGAGTCCGAG--AAGA---TAAACACACATCACTGTTCGT-----TG-ATTA----TTT-TT-------GTTTT------------gtcactgtattcagagcaaccccagaattatcaatgaacttaaggactttccatttctcgcttggaataaatatggaagcatcgctgaacaaaataatgtggaagagtagacgaacgcatgtggggtaatttgatgtgggtgaactatcggaccaatgatatcgaaccagctgacaggcaaaaaggcaaaaccctagtgtgaacacattgaaatccgacaccgtgaagattagcgtaatgtataaaaacaccgttcataacgtgagagtatatttgtcaaatttgtgaaggaattgtttagtggtttaagcatgagatttttgattcccttgttctttaaagacagtgtgg
gi|14 : caacgaacgaTTACA-C-AA-TAGG-TT--AATT--G----GT------AT-GT---A-CA--GAAAAGA--C--GA-A--GG--CG-GGG------C--AA-AAT-GT-A--CAG-A--GAAC-G-----C-G-C-A---GC-GTT-C-GA----G-TA-A----T-----T-TT-A-A--C--C-C-GCC--T-----CG--C-G--CT-CT-A-TT---AGC-A-T--GAA-ACA-CA--A--ATT---AAA-----CTCATTG--------A--A-G---------T---------------A-----A-G------A--ATA---------A--CC---------A-TGT--AT--CA-----------------------------------------GG---AG---CTT-----TC-ATTTCTC-GCTT-GG-AATAG-A-----A-------AT--G-G-------AAG-GT-------------------GC-T---GAA--A-AA--TA-A--T-G---A-A-G--T-G--AC-GA-C--G-C-A---T-G-G-G------GG--TAT--TTTTTG-ATT-GT-GGGTGA-A-C-T--ATC------G-GA-C-A-AT--------------------GAT---G-AACTACGGT---AGCTAAC--G-GGC-A-A-AAAGGCAAAA------CCCT-
gi|7 : tagtagtTTACA-C-CA-AATG-TTT-AATT--G----GT----T-AT-GG---A-AA--CAAG-GA--C--
gi|21 : TTACA-C-AA-GAGG-TTT-AATT--G----GT----T-AT-GTTT-A-CAAAGAAG-GA--C--GA-A--AG--CG-GGT------T--AA-AAT-GTCA--C-T-A--GGAC-G-----CTG-C-----GC-GTC-C-TC----G-TG-AC-ATT-----T-TT-G-C--C--C-C-GCC--T-T---CG--T-C--CT-TC-T-GT---A-C-A-T------A-A-CC--A--ATT---AAA-----CCTATTGT-G---T-A--A-agtcctgtatcagagcaaccccaaaattaccatgcatgtgcaaagagaaatgtaggctcagcctccttcatttccttagcatagaggactataaggaaggttgctcaaaaataatggaatagaagtatttttagggtatttttgatgtgggtgaactattggacaattaaaacacttattggaaccaaatgaaccagctagcgggcaaaaaggcaaaacctaaggtgaaattgtaaatcagaaacgtggagattgtgagtgtaaaactgtgaagttgaaggatgtcaggggttaaagcaggaggggggggcgtttcattttgttcaagacttgtttgctgacgtagacagcctgataagataaacacgcactgttcgtagaactagatgttactttataaaaaatgagcccaacagacgaatcgctcacaagaatcataaatttgcttattgaaattaatgtaatgctgttacttttatgcaaaagatgtgttgtgtcatggtttt
gi|10 : atcgTTACA-C-AA-TAGG-TGT-AATT--G----AT----T-AT-AT---A-AA--GAAG-GA--C--AA-A--GG--CG-GGT------T--AA-AAT-GTTA--C-C-C--GGAC-G-----CTG-C-A----C-GTC-C-TC----G-TG-AC-A-T-----T-TT---A--C--T-C-ACC--T-T---CG--T-C--CT-TC-T-GT---A-C-A-T------A-A-CC--A--TTT---AAA-----CCTATCGT-G---T-A--A-gtcacatgtatcagagc
gi|16 : gtagTTACA-C-AAATAGG-TT--AATTATG----GT----T-AT--T---A-AA--GAAG-GAA-C--GA-G--G---CG-GGA------GTTAA-AAT-GTCA--C-gtcagatgtatcagagcaaccctacattaccaccattatcatgcatgtgtaaagagatcttaaaagataataaggaaagttgctcanctacattatatgcatgtgtaaagagaaatttaggatcttaaaagataataaggaaagttgctcaaaaataaaggaagtagacaacacatgtcagggtattatgaactattgaacaataatgatccagctaacggacaaaaaggcaaaaccctaggtgatattgaaaatctgaactgtggatattgcgagtgtaaaagacacgttcaataactgtagagtatatatctattttgaaggatgtcaggggttaaagcagagtgggttttttttaatttcgttttgtttttt
gi|28 : caatattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttagctggttgcatcattgtctattaagttcacccacaatcaaaatagcccccactggtcgtctacattccattatttatccaggcgactcccatattctattccaagcgaaaatgaaatcctacgctaaatttcatgatacatcttagggcaaggggaggtgctcatgataacatgtgacTTACA-C-AA-TAGG-TTT-AATT--G----AT-----------------------------C--GA-G--GA--CG-GGT------T--AA-AAT-AACA--C-T-C--GGAC-G-----CTG-C-----GC-GTC-C-TC----G-TG-ACAA-T-----T-TT-G-C--C--C-C-GCC--T-T---CG--T-C--CT-TC-T-GT---G-C-A-T--A
gi|19 : TACA-C-AA-TAGG-TTT-AGTT--------------------------A--GAAG-GA--C--GA-A--GG--CGTGGC------A--AA-AAT-GTCACTC-G-ATCGGAC-G-----C-gtcacatg
gi|5 : aaaatactcccacatgcgtcgtctactttcattattttttttagcaaccttctttattctcttctaagcgagaaatgaagatttgcacacgcatgatataatttggtattgctctgatacatgtgacttaCA-T-AC-TAGG-TTTTAATTATG----GG----T-AT-GT---A-AAT-GAAG-GA--C--GA-A--CAAGCG-AGGTT----T--AA-AAT-GTCA--C-
gi|6 : tcgaaA-C-AA-TAGGATTT-AAT---G----GT----T-AT-AT---A-CA--GAAG-GAGAC--GA-A--GT--CG-GTT------AC-AA-AAT-GTCA--C-T-C--GGAC-GGCTGCC-G-C-A---G--GTC-T-CA----GCTG-AC-A-T-----T-TT-G-T--C--C-C-GCT--T------G--T-C--CT-TT-T----------G-T--ATA-----CC--A--ATT---AAA-----CCTATTGatataaatttcaccgagttattcagaaggcaagctcccaaaccgattatcatgaattttaggacttatcatttctcgcttggaatagaatatgagaaaggtcgctgaaataattgatttggatagtagtacgaccggcaatgtagggggctactgaacatattggacaatgatgaaccgcaagctaacggaggcatttcaaatggcttgttaggacgtcgtcaaattgcagtgtaattcgagaacgaaatcaccgagagagatttaatctgtgcagatgtatattcgaggtgagtgtttaaagatcaaacagtctcgcctaattttagaaactgatggaagtaattcaaacaataattttgaaggatgtcagttggtttaaagtcagagcttttttctctgttctttcaaacgacatgtggttgtgtttggaaaaatctactgatatgtctgtatttgctgttttgctgatagagtagagagcccgaagcagaatgggatactattgttaactatat
gi|14 : caacgaacgaaaaacaaaaataatcaacgaacagtgatgtgtgtttatcttctcggactctttctatttcagcaaacaaaatttagttcaacctctctttaaagaacactgggaaaacaacaacccacctccaatcttgcttttaacatgacatcttcgaatttggaacaatatatacttcacagtattgatacacgatttttacattcgcgtttccatcgtttcggcattttcaatgtttcaattgggttttgccttgtgcgttagctttcaatcattgtccgatattctcaccacaataaatacctccacatgcgtctgtcactctccattaatttccagcgaccttcccatattttttccaaagcgagaaatgaaaattccataaattcgatgtaaatttgggttctactatacatgactt-C-AA-TGAG-TTT-AATT--T----GTGTTTC-AT-GCTA-A-TA--GAGC-G---C--GA-G--G---CG-GGT------T--AA-AAT-TACT--C-G-A----AC-G-----CTG-C-----GC-GTT-C-TC------TGTAC-A-T-----T-TT-G-C--C--C-C-GCC--T-T---CG--T-CT-TT-TC-T-GT---A-C-A-T--------A-CC--A--ATT----AA-----CCTATTGT-G---T-A--A-A---------CTA-C--ttgtaa
gi|25 : taGG-TTT-AATT--G----AA----T-AT-GT---A-AA--GAAC-AG--C--GA-A--GG--TG-GGT------T--AA-AAT-GTCA--C-A-C--CAAC-G-----C-T-A-C---GC-TTC-CTCA----A-TG-CA-A-T-----TATT-G-C--C--C-C-GCC--T-T---CG--T-C--CT-TC-T-GT---A-C-C-T------A-A-CC--A--ATT---AAA-----CCTATTAT-G---T-A--A-C---------TCaagtaagaataaccatgtatcaggagctttcatttctcgcttggaatagaaatggaaggtgctgaaaaataatgaagtgacgacgcatgggggtattttttgattgtgggtgaactatcggacaatgatgaactacggtagctaacgggcaaaaaggcaaaaccct
gi|24 : gtagTT-AATT--G----GT----T-AT-GT---A-AA--GAAG-GA--C--
gi|26 : gATT--G----GT----T-AT-GT---A-AA--GTAG-GA--C--GA-A--GG--CG-GGT------T--AA-AAT-GTCA--C-T-C--GGAC-G-----CTG-C-----GC-ATC-C-TC----G-TG-AT-ATT-----T-TT-G-C--C--C-C-GCC--T-T---CG--C-C--CT-TC-T-GT---A-C-A-T------A-A-CC--A--ATT---AAA-----CCTATTGT-G---T-A--A-gtcacatgtatcagagcaacctcaaatcatcatacatttaggactttcatgtctcgcttggaatagagtattgaaggtcgcagaaaaataattgaagtagacgacgcatgtgggggtattt
gi|37 : tagtagATT--G----GT----T-AT-GT---G-CA--GAAG-GA--C--GA-A--GG--CG-GGT------T--AA-AAT-GTCA--C-T-G--GGAC-G-----g
gi|28 : ----T-AT-GC---A-CA--GAAG-GA--C--GA-A--GG--CG-GGG------C--AA-AATTGTCA--C-G-A--GGAC-G-----C-G-C-A---GC-GTC-C-GA----G-TG-TT-A-T-----T-TT-A-A--C--C-C-GTC--C-T---CG-----------------------------------A-TC--A--ATT---AAA-----CCTATTGT-G---T-A--A-G---------TCA-C--AT---G-
gi|29 : A-AAT-GTCA--C-T-C--GGAC-G-----CTG-C-----GC-GTC-T-TC----G-TG-AC-A-T-----T-TTTG-C--C--C-C-ACC--T-T---CG--T-C--CT-TT-T-GT---A-C-A-T------A-A-CC--A--ACT---CAA-----CCTATTGT-G---T-A--A-
gi|4 : tagtag--GGA--G-----C-G-C-GAGGGC-GTCGC-GA----G-GA-GC-A-T-----T-TT-A-A--C--C-CTGCC--C-TATCCG--T-G--CTATC-T-TT---A-C-ACT--CTG-A-AGTC--A--ATTTAGAGAGCTCTCCTATTTGTG---T-A--A-GCTTAGCGACTTA-C--CTCTAGCT-A-T-C-A-GCACGACA--GCA---------A--AC--A-A----A-T-TTAAT--CAATTT-A-------------------ATCA--TTGACGTA--GT---A----CTAGAGCATA-ATTTATC-GCTA-GGGAATAGCA-----ACAGTATTAT--G-AGAATTGTAAG-GT-----------------C-GT-TAGTGAT--C-AC--TATA--T-G-----A-G--CAGTCAC-G--C--GTC-ATGGTAG-G-G------GG--TAATTCTTTTGTA-T-GT-CGGTGATATC-T--ATC------AAGATC-A-AT--------------------GATTG-G-AACAAT--C---AGCTAACCAG-GAC-A-A-AAAGGCAAAA------CCCT-AG-GTG-AA---ATT--AGAAAT-CC--GA-AACGGCATCAGGTATTGACGAG--TT---GTGA-----GT--A-AA-GAACA-ACGTCATCAAATCTT-AA--G-TAG-A-TGTG-TAATGCT----T--T---TAA---ATTGTG--TGAAGGA--T-G-TACG----AG-TGGA-TTAAAG-CA-GAA---G--------ATT------------TTT--TT--A--TTTTTGTTA-------T-TGAT-AATATTTAGCATACCTCG---ATA-GTTTT--------TATGAACATTT---T--AC--T---------TTTG----TC-TATGAACTGAATA---AATAGGAG--AGCCCGAG--ATGACATTAAA--------ACCGTTTCTAATTATG-ATTATAATTTTGTT-------GTTT
gi|17 : g--GGAC-G-----CTG-C-----GC-ATC-C-TC----G-TG-AC-A-T-----T-TTTG-C--C--C-C-GCC--T-T---CG--T-C--CT-TC-T-GT---A-C-A-T------A-A-CC--A--ATT---AAA-----CCTACTGT-G---T-A--A-
gi|19 : agtag---GC-GTC-C-GATCGAG-TG-AC-A-T-----T-TT-T-G--C--CAC-GCC--T-T---CG--T-C--CT-TC-T---------------------------A--ACT---AAA-----CCTATTGT-G---T-ATAA-G---------TCA-C--AT---G-T-A-T-C-A-G------A--GCA---------A--TACCA-A----A-T-T--ATATCA---T-G-------------------C--G--TG----TGC-AA---A----TCT-----TC-ATTTCTC-GCTT-AG-AAGAG-A-----A------TAA--A-G-------AAG-GT-----------------T-GC-T---AAA--A-AAAATA-A--T-G--AA-A-G--TAG--AC-GA-C--G-C-ATG-T-G-G-G------AG--TA---TTTTgagtcacgtgtatcagagcgaccccaaatagtcatgcacgtgcaaagcaaaactttggctcttcatttcccgctcagaagagaaaaaagaaggttcccggagaagggtatccgttagaaagtatggaagtagacgatgtgtttgatattagtggactatgggac
gi|33 : ---GC-GTC-C-TC----G-TG-CC-A-T-----T-TT-T-G--C--C-CTGCC--T-T---CG--C-T--CT-TC-T-GT---A-C-A-T--A-----A-CC--A--ATT---AAA-----CCTATTGG-G---T-A--A-
gi|37 : gtagtagC-GTC-C-CA----G-TG-AC-A-T-----T-TT-A-A--C--C-C-GCC--T-T---CG--T-C--CT-TC-T-GC---A-C-A-T------A-A-CC--A--ATgcagcg
gi|5 : A----G-TG-AC-A-T-----T-TT-A-AACC--T-C-GCTTGT-T---CG--T-C--CT-TCAT-TT---A-C-A-T--AC------CCATA--ATTA--AAA-----CCTAGTAT-GATAT-A--A-ATT-------TCA-CCGAG---T-T-ATT-C-A-G------AAGGCA---------AGCTCCCA-AACCGA-T-T--AT--CA---T-G-------------------A--AT-TT----TA--GG---A----CTTA----TC-ATTTCTC-GCTT-GG-AATAG-A-----A------TATGAG-A-------AAG-GT-----------------C-GC-T---GAA--ATAAT-TG-ATTT-G--GATA-G--TAGT-AC-GA-CCGG-CAATG-T-A-G-G------GGGCTA---C----------------TGA-A-CAT--ATT------G-GA-C-A-AT--------------------GAT---G-AAC-----CGCAAGCTAAC--G-G
gi|16 : tcga----G-TG-AC-A-T-----T-TT-A-A--CTCC-C-GCC--T-----CG--TTC--CT-TC-T-TT---A--------ATA-A---CC--ATAATT---AA------CCTATTTGTG---T-A--A-G---------TCA-C--AT---G-TTA-T-C-ATG------A--GCACCTCCCCTTG--CCCTA-AG---A-TGT--AT--CA---T-G-------------------A--AATTTAGCGTA--GG---A-----TT-----TC-ATTT-TC-GCTT-GG-AATAG-A-----A------TAT--G-G-------GAG--T-----------------C-GCCT---GGAT-A-AA--TA-A--T-G--GA-ATG--TAG--AC-GA-C----C-A-G-T-G-G-G------GGC-TA---TTTT-G-A-TTGT-GGGTGA-A-C-TTAAT-------A-GA-C-A-AT--------------------GAT---GCAAC-----C---AGCTAAC--aggcatttcaaatggcttgttaggacgtcgtcaaattgcagtgtaattcgagaacgaaatcaccgagagagatttaatctgtgcagatgtatattcgaggtgagtgtttaaagatcaaacagtctcgcctaattttagaaactgatggaagtaattcaaacaataattttgaaggatgtcagttggtttaaagtcagagcttttttctctgttctttcaaacgacatgtggttgtgtttggaaaaatctactgatatgtctgtatttgctgttttgctgatagagtagagagcccgaagcagaatgggatactattgttaactatat
gi|34 : caatattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn----G-TG-AC-A-T-----T-TT-T-G--C--C-C-GCC--TAT---CG--T-C--CT-TC-T-GT---A-C-A-T---TA-A----C--A--ATT---AAA-----CCTA-TGT-G---T-A--A-
gi|27 : tagtag-A-A--C--C-C-GCC--T-T---CG--T-C--CT-Tgaagaacgcgca
gi|7 : cttattctcttctaagcgagaaatgaagagcttaagtttctctttgcacatacatgataattaatggctgttcagatacatgcgatttacatG--T-C--CT-TG-T-TT---C-C-A-T--A-----A-CC--A--ATT---AAA-----CAT-TTGGTG---T-A--AAG---------TC--C---T---G-T-A-T-C-A-G------A--GCA---------A--CCCCA-A----AAT-T--AC--CA---T-GCATGTGCAAAGAGA-----A--A--TG----TA--GGCTCAGCCTCCT-----TC-ATTTC----CTT-AG-CATAG-AGGACTA------TAA--G-G-------AAG-GT-----------------T-GC-T---CAA--A-AA--TA-A--T-G--GA-A----TAG--A---A----G-T-ATT-T-TTA-G------GG--TA---TTTTTG-A-T-GT-GGGTGA-A-C-T--ATT------G-GA-C-A-ATTAAAACACTTATTGGAACCAAAT---G-AAC-----C---AGCTAGC--G-GGC-A-A-AAAGGCAAAA------CCTA-AG-GTG-AA---ATT--GTAAAT-CA--GA-AACG-----------TG--GAGA-TT---GTGA---GTGT--A-A------------------------AACTG-T-G-A-AG-------------------------------T---TGAAGGA--T-G-T-C-----AG-GGG--TTAAAG-CAGG-A---GGGGGGGGCGTT------------TCA--TTT--------TGTTC--------------AA---------------G---AC-----------------------------------------------TTG----TT-T----GCTG---A---CGTA-GAC--AGCCTGAT--AAGA---TAAACACG---CACTGTTCGT-----AGAACTA----GATGTT-------ACTTT------------A
gi|24 : G--T-C--CT-TC-T-TT---A-C-A-T--A-----A-CC--A--ATT---AA--------------------------G---------TCA-C--AT---G-T-A-T-C-A-G------A--GCA---------A--CCTCA-A----A-T-C--AT--CA---T-A-------------------C--A--TT----TA--GG---A----CTT-----TC-ATGTCTC-GCTT-GG-AATAG-A-----G------TAT--T-G-------AAG-GT-----------------C-GC-A---GAA--A-AA--TA-A--T-T--GA-A-G--TAG--AC-GA-C--G-C-ATG-T-G-G-G------GG--TA---TTTtaaaaaatgagcccaacagacgaatcgctcacaagaatcataaatttgcttattgaaattaatgtaatgctgttacttttatgcaaaagatgtgttgtgtcatggtttt
gi|12 : g--A--ATT---AAAA----CCTATTGT-G---TTA--A-G----------CA-C--AT---G-T-A-T-C-A-G------A--GCA---------A--CCCCA-T----A-T-T--AT--CA---T-C-------------------A--A--TT----TA--GG---A----CTT-----TC-A-TTCTC--CT---G-GATAGAA-----A------AAT--GCG-------AAG-GT-----------------C-GC-T---GAA--A-AA--TA-A--T----GA-A-G--TAG--AC-GA-C--G-C-ATG-T-G-GCGGGGCCCGG--TA---TTTTTG-A-T-GTCGGGTGA-A-C----ATC------G-GA-C-ACATG-------------------GAT---G-AAC-----C---AGCTAAC--GCGGC-ACACAACGGCAAAA------CCCT-AG-GTGCAA---ATT--GAAAAT-CCCGAA-AACG-----------TGCCGAGACTT---ACGA---GTGT--A-AA-AATCA-G-TT--TCAA----T-AACTG-T-G-A-AGGATTA----T----TC-T---CAA---ATTGTGTGTGAAGGA--T---T-C-----AG-TGG--TTAAAG-C--C-A---G--------ATT------------TTC--TTTCCCGTCC---TTC-------TCT--T-AA---------------G---ACA-GC-TG--------TG-GAAAAC-----T--AA--T---------TTTGT---TT-T----GCTG---A---AATA--AG--AGCCCGA
gi|3 : ccaTTGT-G---T-A--A-G---------TCAAC--AT---G-T-A-T-CAA-G------A--GC--------------------------T-T--TT--CA---T-----------------------------------------------------------TTTCTCAGCTT-GG-AATAG-A-----A------AGT--G-G-------AAG-GT-----------------CGGC-T---GGA--A-AA--TA-A--T-G--GA-A-G--TAA--AC-GA-C--G-C-ATG-T-G-G-G------GG--TA---TTTTTGCA-T-GT-GGGT-A-A-C-C--CCCCTAAATG-GA-CTA-AT--------------------GTG---G-AAC-----T---AGCTAACG-G-GGCAA-A-AAAGGCAAAA------CCCTAAG-GTG-AAT--ATT--GAAAAT-CC--GA-AACG-----------TG-------TC---G-------------------AC----GT--TCAA----T-AACTG-T-G---AGTA-TA---------T--T---CAA---ATT-T---TGAAGGA--T-G-T-CCAGCTAG-TGG--GTAAAG-CA-G-A---G--------ATT------------TTT--TTCCC-----GTGTTC-------T-T--T-AA---------------G---ACA-G--TG---------A-GGAAACC----T--AAATT---------TTTGT---TT-T----G--G---A---AATA-GAG--AGCCCGAG--AGGA---TAAA-ACA---CAC
gi|27 : -G---T-A--A-A---------TCG-C--AT---G-T-A-T-C-T-G------A--ACA---------G--CCATT-A----A-T-T--AT--CA---T-GTATGTGCAAAGAGA-----A--A--CT----TA--AG---C----TCT-----TC-ATTTCTC-GCTT-AG-AAGAG-A-----A------TAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgcgactgacccgccggaagtcaaatgagcaagagcttaccattgatttttcgtaaacgctgttacttatatgaaaattgtgttatgtcatggttttatgaaagcattggtgccgacgcctattgggaatctgtggttatgtaacagatacccacagcctaagaacaaagaaaatcactgcctgctcatgatacaatt
gi|17 : ct--A-G---------TCA-C--GT---G-T-A-T-C-A-G------A--GCG---------A--CCCCA-A----A-T-A--GT--CA---T-GCACGTGCAAAGCAA-----A--A--CT----TT--GG---C----TCT-----TC-ATTTCCC-GCTC-AG-AAGAG-A-----A------AAA--A-G-------AAG-GTTCCCGGAGAAGGGTATCC-GT-T---AGA--A-AG--T--A--T-G--GA-A-G--TAG--AC-G---------ATG-T-G---------------------TTTG-A-T-AT-TAGTGG-A-C-T--ATG------G-GA-C-ataaggacgaaggcgggtt
gi|11 : agtagttacacagtaggtttaattggttatgtacagaaggacgaaggcggggcaaaaatgtcacgaggatgcgcagcgtccg-T-A-T-C-A-G------A--TCA---------A--CCACA-A----A-T-C--AC--CA---T-GCATGTGCAAGGAGAAATTAA--G--TT----TA--AG---C----TCT-----CC-ATTTCTT-ACT--------------------------T--G-G-------AAG-GT-----------------T-GT-T--------A-AA--TA-A--TTG--GA-A-G--TGA--AC-GA-A--G-C-ATG-C-A-A-C------GC--T----CTTTTG-A-A-GT-GGGTGT-A-C-T--ATT------G-GA-C-A-ATTAATTCACTTTTTGGAGCCAAAT---G-ACC-----C---ATCTAGC--A-TGC-A-A-AAAAGCAAAA------CCTT-AA-TTG-GA---ATT--AAAAAT-CC--AT-AACG-----------CA--GAAA-TT---CCGA---GTGT--A-AAGGAACA-C-GT--TCAA----T-ATCT--T-A-A-AATA-TA----T----T--T---C--------------GAAGGA--T-T-T-C-----AG-GGG--TCAATG-CA-G-A---G--------AAT------------TTT--TTCGT--TTCATTTTG-------T-TAAA-AA---------------A---ACA-T--TG--------TG-GAAGC------T---A--T---------TTTA----TT-T----ACTG---A---CATA-GGC--ATCCTGAT--AGGA---TTAACA
gi|20 : --CCCCA-A----A-T-T--AA--CA---T-G-------------------C--A--CT----TA--GA---A----CTT-----TC-ATTTCTC-GCTT-GG-AATAG-A-----A------TAC--G-G-------AAG-GT-----------------C-GC-T---GAA--A-AA--TA-T--T-G--CA-A-G--TAG--AC-GA-C--G-C-ATG-T-G-G-G------GG--TA---TTTTTG-A-T-AT-GGGTGA-A-C-T--ATC------G-GA-C-A-AT--------------------GAT---G-AAC-----C---AGCTAAC--G-GGC-A-A-AAAGGCAAAagggttgcaaaacttaagggttgctt
gi|15 : G-A-----A------TAT--G-G-------AAG-GT-----------------C-GC-T---GAA--A-AA--TA-A--T-G--GA-A-G--TAG--AC-GA-C--G-C-ATG-T-G-G-G------GG--TA---TCTTTG-A-T-GT-GGGTGA-A-C-T--ATC------A-GA-C-A-AT--------------------GAT---G-AAC-----T---AGCTAAC--G-AGC-A-A-AAAGGCAAAA------CCCT-GG-GTG-AA---ATT--GAAAAT-CA--GA-AACG-----------TG--TAGA-TT---GCGA---GTGTAAA-AA-AAACA-C-GT--CCAA----T-AACTG-T-G-A-AGTT-TA----T----T--T---CAA---ATT-T---TGAAGGA--T-G-T-C-----AG-TGG--ATAAAG-CA-G-A---G--------ATT------------TTT--T------TCCGTGTTC-------T-T--T-AA---------------G---ACA-T--CG--------TG-GAAAC------T--AA--T---------TTTG----TT-T----GCTG---A---AATA-ccacaaataccctgaagtcctcacattga
gi|10 : -A-----A------TAA--G-G-------AAA-GT-----------------T-GC-T---CAA--A-AA--TA-A--A-G--GA-A-G--TAG--AC-AA-C--A-C-ATG-T-C-A-G------GG--TA---TT--------------ATGA-A-C-T--ATT------G-AA-C-A-AT--------------------AAT---G-ATC-----C---AGCTAAC--G-GAC-A-A-AAAGGCAAAA------CCCT-AG-GTG-AT---ATT--GAAAAT-CT--GA-ACTG-----------TG--GATA-TT---GCGA---GTGT--A-AA-AGACA-C-GT--TCAA----T-AACTG-T-A-G-AGTA-TA----T----A--T---C-T---ATT-T---TGAAGGA--T-G-T-C-----AG-GGG--TTAAAG-CA-G-AGTGG--------GTT------------TTT--TTT
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Reference ( family-5303 ) : GTTACA-CAATAGGTTTAATTG----GTT-ATGTA-CAGAAG-GACGA-AGGC-GGGNN------AA-AA-T-GT-CA--CG-AGGAC-GCG-CA---GC-GTC-CN-A----GTGACATTTTG-A--C--C-C-GCC--T--T---CG--T-C--CT-TC-TNT----AC-AT----A--AACC---A---ATT---AAA-----CCTATT-G-TG---TA--A-G---------T--CA-C--AT---G-T-AT-CA-G------A--GCA---------A--CCCCA-A-A----T-T--AT--CA---T-G-------------------A--A--TT----T-A--GG---A----CTT-----TC-ATTTCTC-GCT-T-GGAATAG-A-----A------TAT--G-G-------AAG-GT-----------------CG-CT---GAA--A-AA--TA-A--T-G--GA-A-G--TAG--AC-GA-C--G-C-ATG-T-G-G-G------GG--TA---TTTTTG-A-TGT-GGGTGA-A-C-T--ATC------G-GA-C-A-AT--------------------GAT---G-AAC-----C---AGCTAAC--G-GGC-A-A-AAAGGCAAAA------CCCT-AG-GTG-AA---A--TTGAAAAT-CC--GA-AACG----TG--GAGA-TT-G-CG-AG---T-----GT--A-AA----AAAC-A----CGT--TCAA----T------AACTG-T-G-A-AGTA-TA----T----T--T---CAA---ATT-T---TGAAGGA--T-G-T-C-----AG-TGG--TTAAAG-CA-G-A---G--------AT-T------------TTT--TT-T-CC--TCCGTGTTC-------T-T--T-AA---------------G---ACA-G-TG--------T---GGAAA-A------T--AA--T---------TTTG----TT-T----GCTG---A---AATA-G--AGAGCCCGAG--AGGA---TAAACACA---CACTGTTCGT-----TG-ATTA----TTTGTT-------GTTTT------------AATACATAC-ATG-TATTTCA---TCAT-ATTGAGAGGCCGCT-CCAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGTTCGTAGA-ACGCT-G-TTACTTATAT---GCAAATGATGT------GT-T--A-TG-T--CAT----G-G-TT-TTATGAAA--GCACT-TGC-GC-C-ACGCCT--ATAGG-GT-ATCG-G-TGGT-TATGT-AC-A-GA----TA---C-CCACAG------------CCTA--AG-AACAAA-A-GAAA--TT-CACCG-CTG-CT-A-TGA-TACATG
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gi|10 : GTTACA-CGATAGGTTTAAATG----GTT-ATGTA-CAGAAG-GACGA-AGGT-GAGT-------AA-AA-T-GT-CA--CG-AGGAC-GTG-CA---GC-GTC-CG-G----GTAACATTTTA-A--C--C-C-GCC--T--T---TG--T-C--CT-TC-TTT----AT-AT-------AATC---A---ATT---ACA-----CCTATT-G-TG---TA--A-G---------T--CA-G--AT---G-T-AT-CA-G------A--GCA---------A--CCCTA-C-A----T-T--AC--CA---g
gi|10 : gtaCT-T-AAAAGAT-A-----A------TAA--G-G-------AAA-GT-----------------TG-CT---CAA--A-AA--TA-A--A-G--GA-A-G--TAG--AC-AA-C--A-C-ATG-T-C-A-G------GG--TA---TT-------------ATGA-A-C-T--ATT------G-AA-C-A-AT--------------------AAT---G-ATC-----C---AGCTAAC--G-GAC-A-A-AAAGGCAAAA------CCCT-AG-GTG-AT---A--TTGAAAAT-CT--GA-ACTG----TG--GATA-TT-G-CG-AG---T-----GT--A-AA----AGAC-A----CGT--TCAA----T------AACTG-T-A-G-AGTA-TA----T----A--T---C-T---ATT-T---TGAAGGA--T-G-T-C-----AG-GGG--TTAAAG-CA-G-AGTGG--------GT-T------------TTT--TT-TAAT--TTCGTTTTG-------T-T--T-ccattatcatgcatgtgtaaagagatcttaaaagataataaggaaagttgctcanctacattatatgcatgtgtaaagagaaatttaggatcttaaaagataataaggaaagttgctcaaaaataaaggaagtagacaacacatgtcagggtattatgaactattgaacaataatgatccagctaacggacaaaaaggcaaaaccctaggtgatattgaaaatctgaactgtggatattgcgagtgtaaaagacacgttcaataactgtagagtatatatctattttgaaggatgtcaggggttaaagcagagtgggttttttttaatttcgttttgtttttt
gi|11 : gtagttacacgataggtttaaatggttatgtacagaaggacgaaggtgagtaaaatgtcacgaggacgtgcagcgtccgggtaacattttaacccgcctttgtccttctttatataatcaattacacctattgtgtaagtcagatgtatcagagcaaccctacattaccaccattatcatgcatgtgtaaagagatcttaaaagataataaggaaagttgctcanctacattatatgcatgtgtaaagagaaatttaggat-T-AT-CA-G------A--TCA---------A--CCACA-A-A----T-C--AC--CA---T-GCATGTGCAAGGAGAAATTAA--G--TT----T-A--AG---C----TCT-----CC-ATTTCTT-ACT-T-GGAA----------------------------------G-GT-----------------TG-TT--------A-AA--TA-A--TTG--GA-A-G--TGA--AC-GA-A--G-C-ATG-C-A-A-C------GC--T----CTTTTG-A-AGT-GGGTGT-A-C-T--ATT------G-GA-C-A-ATTAATTCACTTTTTGGAGCCAAAT---G-ACC-----C---ATCTAGC--A-TGC-A-A-AAAAGCAAAA------CCTT-AA-TTG-GA---A--TTAAAAAT-CC--AT-AACG----CA--GAAA-TT-C-CG-AG---T-----GT--A-AAG---GAAC-A----CGT--TCAA----T------ATCT--T-A-A-AATA-TA----T----T--T---C--------------GAAGGA--T-T-T-C-----AG-GGG--TCAATG-CA-G-A---G--------AA-T------------TTT--TT-C-GT--TTCATTTTG-------T-TAAA-AA---------------A---ACA-T-TG--------T---GGAAG-C------T---A--T---------TTTA----TT-T----ACTG---A---CATA-G--GCATCCTGAT--AGGA---TTAACAttt
gi|12 : ---A---ATT---AAAA----CCTATT-G-TGT--TA--A-G------------CA-C--AT---G-T-AT-CA-G------A--GCA---------A--CCCCA-T-A----T-T--AT--CA---T-C-------------------A--A--TT----T-A--GG---A----CTT-----TC-A-TTCTC--CT----GGATAGAA-----A------AAT--GCG-------AAG-GT-----------------CG-CT---GAA--A-AA--TA-A--T----GA-A-G--TAG--AC-GA-C--G-C-ATG-T-G-GCGGGGCCCGG--TA---TTTTTG-A-TGTCGGGTGA-A-C----ATC------G-GA-C-ACATG-------------------GAT---G-AAC-----C---AGCTAAC--GCGGC-ACACAACGGCAAAA------CCCT-AG-GTGCAA---A--TTGAAAAT-CCCGAA-AACG----TGCCGAGACTT-A-CG-AG---T-----GT--A-AA----AATC-A----GTT--TCAA----T------AACTG-T-G-A-AGGATTA----T----TC-T---CAA---ATTGTGTGTGAAGGA--T---T-C-----AG-TGG--TTAAAG-C--C-A---G--------AT-T------------TTC--TT-T-CCCGTCC---TTC-------TCT--T-AA---------------G---ACA-GCTG--------T---GGAAA-AC-----T--AA--T---------TTTGT---TT-T----GCTG---A---AATA----AGAGCCCGAagggttgcaaaacttaagggttgctt
gi|13 : cca---A---AATA-G--AGAGCCCGAG--AGGA---TAAACACA---C
gi|13 : TTGTTCGGAGA-ACGCT-G-TTACTTATAT---GCAAATGATGT------GT-T--A-TG-TT-CAT----G---------TG---------T-TGC-GC-C-ACCGCT--ATAGG-GT-ATCG-G-TGGT-TATGT-AC-ACGA----TA---C-CCACAG------------CCTA--AG-AACAAAGA-GAAA--TT-CACTG-CTGCCT-A--GA-TACATGtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttgttcggagaacgctgttacttatatgcaaatgatgtgttatgttcatgtgttgcgccaccgctatagggtatcggtggttatgtacacgatacccacagcctaagaacaaagagaaattcactgctgcctagatacatgatc
gi|14 : aaatagagagcccgagaggataaacacactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgTTACA-CAATAGGTT-AATTG----GT--ATGTA-CAGAAAAGACGA-AGGC-GGGGC------AA-AA-T-GTACA---G-AGAAC-GCG-CA---GC-GTT-CG-A----GTAA--TTTTA-A--C--C-C-GCC--T------CG--C-G--CT--C-TATTA--GC-AT----G--AAAC---ACAAATT---AAA-----CTCATT-G-------A--A-G---------T-----------------A---A-G------A--ATA---------A--CC------A----TGT--AT--CA------------------------------------------GG---AG---CTT-----TC-ATTTCTC-GCT-T-GGAATAG-A-----A-------AT--G-G-------AAG-GT------------------G-CT---GAA--A-AA--TA-A--T-G---A-A-G--T-G--AC-GA-C--G-C-A---T-G-G-G------GG--TAT--TTTTTG-ATTGT-GGGTGA-A-C-T--ATC------G-GA-C-A-AT--------------------GAT---G-AACTACGGT---AGCTAAC--G-GGC-A-A-AAAGGCAAAA------CCCT-atc
gi|15 : tagtagtG-A-----A------TAT--G-G-------AAG-GT-----------------CG-CT---GAA--A-AA--TA-A--T-G--GA-A-G--TAG--AC-GA-C--G-C-ATG-T-G-G-G------GG--TA---TCTTTG-A-TGT-GGGTGA-A-C-T--ATC------A-GA-C-A-AT--------------------GAT---G-AAC-----T---AGCTAAC--G-AGC-A-A-AAAGGCAAAA------CCCT-GG-GTG-AA---A--TTGAAAAT-CA--GA-AACG----TG--TAGA-TT-G-CG-AG---T-----GTAAA-AA----AAAC-A----CGT--CCAA----T------AACTG-T-G-A-AGTT-TA----T----T--T---CAA---ATT-T---TGAAGGA--T-G-T-C-----AG-TGG--ATAAAG-CA-G-A---G--------AT-T------------TTT--T--------TCCGTGTTC-------T-T--T-AA---------------G---ACA-T-CG--------T---GGAAA-C------T--AA--T---------TTTG----TT-T----GCTG---A---AATA-
gi|16 : ----GTGACATTTTA-A--CTCC-C-GCC--T------CG--TTC--CT-TC-TTT----A--AT----A--A-CC---ATA-ATT---AA------CCTATTTG-TG---TA--A-G---------T--CA-C--AT---G-TTAT-CATG------A--GCACCTCCCCTTG--CCCTA-AGA----TGT--AT--CA---T-G-------------------A--AATTTAGCGT-A--GG---A-----TT-----TC-ATTT-TC-GCT-T-GGAATAG-A-----A------TAT--G-G-------GA--GT-----------------CGCCT---GGAT-A-AA--TA-A--T-G--GA-ATG--TAG--AC-GA-C----C-A-G-T-G-G-G------GGC-TA----TTTTG-ATTGT-GGGTGA-A-C-TTAAT-------A-GA-C-A-AT--------------------GAT---GCAAC-----C---AGCTAAC--N-NNN-N-N-NNNNNNNNNN------NNNN-NN-NNN-AAT--A--TTG
gi|17 : GTTACA-CAGTAGGTTTAATTG----GTT-ATGTA-CAGAAG-GACGA-AGGCGGGGCA------AA-AA-T-GT-CA--CG-AGGAT-GCG-CA---GC-GTC-CG-A----GTCACGT
gi|17 : agta--A-G---------T--CA-C--GT---G-T-AT-CA-G------A--GCG---------A--CCCCA-A-A----T-A--GT--CA---T-GCACGTGCAAAGCAA-----A--A--CT----T-T--GG---C----TCT-----TC-ATTTCCC-GCT-C-AGAAGAG-A-----A------AAA--A-G-------AAG-GTTCCCGGAGAAGGGTATCCG-TT---AGA--A-AG--T--A--T-G--GA-A-G--TAG--AC-G---------ATG-T-G---------------------TTTG-A-TAT-TAGTGG-A-C-T--ATG------G-GA-C-gtatcagagcgaccccaaatagtcatgcacgtgcaaagcaaaactttggctcttcatttcccgctcagaagagaaaaaagaaggttcccggagaagggtatccgttagaaagtatggaagtagacgatgtgtttgatattagtggactatgggac
gi|18 : agtagttacacagtaggtttaattggttatgtacagaaggacgaaggcggggcaaaaatgtcacgaggatgcgcagcgtccgATACCATGCTATCTTAAGCTCATTATTCAGAGGCCGCT-CCAAGCACGAGGCCTCAAACGCACGAACCGCACGCCTCTCACCATTGATTGCT--------TCCGTAGA-ACGCT-GCTTACTTATAT---GCCAATGATGT------GTCT--A-GC-T--CAT----G-GCTT-TTAT-AAA--G-ACT-TGC-GC-C-ACGCCCTAATAGC-G--ATCG-GTTGAT-TATGT-AC-A-GA----TA---C-CCA
gi|19 : agg---GC-GTC-CG-ATCGAGTGACATTTTT-G--C--CAC-GCC--T--T---CG--T-C--CT-TC-T-------------------------A---ACT---AAA-----CCTATT-G-TG---TATAA-G---------T--CA-C--AT---G-T-AT-CA-G------A--GCA---------A--TACCA-A-A----T-T--ATATCA---T-G-------------------C--G--TG----T-GC-AA---A----TCT-----TC-ATTTCTC-GCT-T-AGAAGAG-A-----A------TAA--A-G-------AAG-GT-----------------TG-CT---AAA--A-AAAATA-A--T-G--AA-A-G--TAG--AC-GA-C--G-C-ATG-T-G-G-G------AG--TA---TTTT
gi|2 : GTTACA-CAATAGGTTTAATTG----GTT-ATGTA-CAGAAG-GACGA-AGGCCGGGCA------AA-AA-T-GT-CA--CG-AGG---GCG-CT---GC-----CG-A----GTGACATTTTA-A--C--C-C-GCC--T--T---CG--T-C--CT--C-TTT----AC-TT----A--A-CC---A---ATT---AAA-----CCTATT-G-TG---TA--A-G---------T--CA-C--AT---G-T-ATGCA-G------A--GCA---------A--CCC-A-A-A----T-T--AC----------------------------------------------------------T-----TC-ATT-CTC-GCT-T-GGAATAG-A-----A------TAC--G-G-------AAG-GT-----------------CG-CT---GAA--A-AA--TA-T--T-G--GA-A----TAG--AC-GA-C--G-C-ATG-T-G-G-G------G---TA---TTTTTG-A-TGT-GGGTGA-A-C-T--ATC------G-GA-C-A-AT--------------------GAT---G-AAC-----C---AGCTAAC--G-GGC-A-A-ATAGGC-AAA------CCCT-A--GTG-AA---A---TGAAAAT-CC--GA-AACG----TG--AAGA-TT-G-CG-AA---T-----GT--A-AA----AAAC-A----CG----------------------G-T-G-A-AGTA-TA----T----T--T---CAA---ATT-T---TGAAGGA--T-G-T-C-----AG-TGG--TTAAAG-CA-G-A---G--------AT-T------------TTT--T--------TCCGTGTTC-------T-A--T-AA---------------G---AC----TG--------T----GAAA-A------TTCAA--T---------TTTG----TT-T----GCTG---A---AAT--G--AGAGCCCGAG--AGGA---TAAACA-A---CACTGTTCAT-----TG-ATTA----TTTATTTTTTTTCGTTTTCATTCCGTTGAGAATACATAC-ATG-TATTTCA---TCAT-ATTGAGAGGCCGCT-CCAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGTTCGTAGA-ATGCT-G-TTACTTATAT---GCAAATGATGT------G--T--A-TG-T--CAT------G-TT-TTATGAAA--GCACT-TGC-GC-C-ACGCCT--ATAGG-GT-A-CG-G-TGGT-TATGT-AC-A-GA----TA---C-CCACAG------------CCTA--AC-AACAAA-A-GAAA--TT-CACTG-CTG-CT-A-TGA-TACAT
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gi|21 : GTTACA-CAATAGGTTTAATTG----GTT-ATGTA-CAGAAG-GACGA-AGGC-GGGGC------AA-AAAT-GT-CA--CG-AGGAC-GCG-CA---GC-GTC-CT-A----GTGACATTTTA-A--C--C-C-GCT--T--T---CG--T-C--CT-TC-TTTGTAAAC-AT-------AACC---A---ATT---AAA-----CCTCTT-G-TG---TA--A-G---------T--CA-C--AT---G-T-AT-CA-G------A--GCccacaaataccctgaagtcctcacattga
gi|22 : atcTGTCAGTAGACACGCTCG-TTACTAAAATCACGCAAAATATGTATGCTAGT-TTCA-TGCT--CATATAGG-G-TTATTATGAAA--GCACT-TGCTGCGT-TCACCT--A-AGGTGT-ATCGAG-TGGTGTA-GT-ACAA-GA----TA---TACCTCAG------------CCTACTAGTAACACA-ATGAGA--AT-CA
gi|23 : ATGT------GT-T--AATG-TTCCAT----GCG-TT-TTATGAAAAAGCACTATGC-GC-C-ACGCCT--ATTAG-GTAATCG-G-TGGT-TAT-T-AC-A-AAGAATTACCCC-CCACAGCACAGCCTGAAACCTA--AGAAACAAA-A-AAAAAGTTACACCG-CTG-CT-ATTGATTACAT
gi|24 : G--T-C--CT-TC-TTT----AC-AT----A--A-CC---A---ATT---AA--------------------------G---------T--CA-C--AT---G-T-AT-CA-G------A--GCA---------A--CCTCA-A-A----T-C--AT--CA---T-A-------------------C--A--TT----T-A--GG---A----CTT-----TC-ATGTCTC-GCT-T-GGAATAG-A-----G------TAT--T-G-------AAG-GT-----------------CG-CA---GAA--A-AA--TA-A--T-T--GA-A-G--TAG--AC-GA-C--G-C-ATG-T-G-G-G------GG--TA---TTTtgg
gi|25 : gGTTACA-TAATAGGTTTAATTG----GTT-AGGTA-CAGAAG-GACGA-AGGC-GGGGC------AATAA-T-TG-CAT-TG-AGGAA-GCG-TA---GC-GTT-GG-T----GTGACATTTTA-A--C--C-C-ACC--T--T---CG--C-T--GT-TC-TTT----AC-AT-------ATTC---A---ATT---AAA-----CC
gi|26 : gtaggaGTTACA-CAATAGGTTTAATTG----GTT-ATGTA-CAGAAG-GGCGA-AGGC-GGGGC------AA-AAAT-AT-CA--CG-AGGAT-GCG-CA---GC-GTC-CG-A----GTGACATTTTA-A--C--C-C-GCC--T--T---CG--T-C--CT-AC-TTT----AC-AT-------AACC---A---AT
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gi|27 : ct-A--C--C-C-GCC--T--T---CG--T-C--CT-TA-TGT----Aggacgaaggcgggtt
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Reference ( family-5303 ) : GTTACA-CAATAGGTTTAATTG----GTT-ATGTA-CAGAAG-GACGA-AGGCGGGGC------AA-AA-T-GT-CA--CG-AGGAC-GCG-CA---GC-GTC-C-GA----GTGACATTTTA-A--C--C-C-GCC--T--T---CG--T-C--CT-TC-TTT----A-C-AT----A--AACC---A---ATT---AAA-----CCTATT-G-TG---TA--A-G---------T--CA-C--AT---G-T-AT-CA-G------A--GCA---------A--CCCCA-A-A----T-T--AT--CA---T-G-------------------A--A--TT----T-A--GG---A----CTT-----TC-ATTTCTC-GCT-T-GGAATAG-A-----A------TAT--G-G-------AAG-GT-----------------CG-CT---GAA--A-AA--TA-A--T-G--GA-A-G--TAG--AC-GA-C--G-C-ATG-T-G-G-G------GG--TA---TTTTTG-A-TGT-GGGTGA-A-C-T--ATC------G-GA-C-A-AT--------------------GAT---G-AAC-----C---AGCTAAC--G-GGC-A-A-AAAGGCAAAA------CCCT-AG-GTG-AA---A--TTGAAAAT-CC--GA-AACG----TG--GAGA-TT-G-CG-AG---T-----GT--A-AA----AAAC-A----CGT--TCAA----T------AACTG-T-G-A-AGTA-TA----T----T--T---CAA---ATT-T---TGAAGGA--T-G-T-C-----AG-TGG--TTAAAG-CA-G-A---G--------AT-T------------TTT--TT-T-CC--TCCGTGTTC-------T-T--T-AA---------------G---ACA-G-TG--------T---GGAAA-A------T--AA--T---------TTTG----TT-T----GCTG---A---AATA-G--AGAGCCCGAG--AGGA---TAAACACA---CACTGTTCGT-----TG-ATTA----TTTGTT-------GTTTT------------AATACATAC-ATG-TATCTCA---TCAT-ATTGAGAGGCCGCT-CCAAGCACGAGGCCTCAAACGCACGAACCGCACGCCTCTCACCATTGATTGCTNNNNNTTGTTCGTAGA-ACGCT-G-TTACTTATAT---GCAAATGATGT------GT-T--A-TG-T--CAT----G-G-TT-TTATGAAA--GCACT-TGC-GC-C-ACGCCT--ATAGG-GT-ATCG-G-TGGT-TATGT-AC-A-GA----TA---C-CCACAG------------CCTA--AG-AACAAA-A-GAAA--TT-CACTG-CTG-CT-A-TGA-TACATG
gi|1 : GTTACA-CAATAGGTTCAATTG----GTT-ATGTA-CAGAAG-GACGA-AGACGGGGA------AA-AA-T-GT-CA--CG-AGGAC-GCG-CA---GC-GTC-C-GA----GTGACATTTTA-A--C--C-C-GCC--T--T---CG--T-C--CT-TC-TTT----A-C-AT----ATAAACC---A---ATT---AAA-----CCTATT-G-GG---TA--A-G---------T--CA-C--AT---G-T-AT-CA-G------A--GCA---------A--CCCCA-A-A----T-T--AT--CA---T-G-------------------A--A--TT----T-A--GG---A----CTT-----TC-ATTTCTC-GCT-C-GGAATAG-A-----A------TAT--G-G-------AAG-GT-----------------CG-CT---GAA--A-AA--TA-A--T-G--GA-A-G--TAG--AC-GA-C--G-C-ATG-T-G-G-G------GG--TA---TTTTTG-A-TGT-GGGTGA-A-C-T--ATC------G-GA-C-A-AT--------------------GAT---G-AAC-----C---AGCTAAC--G-GGC-G-A-AAAGGCAAAA------CCTT-GG-GTG-AA---A--TAGAAAAT-CT--GA-AACG----TG--GAGA-TT-G-TG-AT---T-----GT--A-AA----AAAC-A----AGT--TCAA----T------AACTG-T-G-A-AGTA-TA----T----T--T---CAA---ATT-T---TGAAGGA--T-G-T-C-----AG-TGG--TTAAAG-CA-G-A---G--------AT-T------------TTT--TT-T-CC--TCTGTGTTC-------T-T--T-AA---------------G---ACA-G-TG--------T---AGAAA-A------T--AA--T---------TTTG----TT-T----GCTG---A---AATA-G--AAAGCCCGAA--AGGA---TAAACACA---CACTGTTCGT-----TG-ATTA----TTTGTT-------GTTTT------------AATA---------------------CAT-ATTGAGAGACCGCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGTTTGTAGA-ACGCT-G-TTACTTATAT---GC-AATGATGT------GT-T--A-TG-T--CAT----G-G-TT-TTATGAAC--GCACT-TGT-GC-C-ACGCCT--ATAGG-GT-ATCG-G-TGGT-TATGT-AC-A-GA----TA---C-CCACAG------------CCTA--AG-AACAAA-A-GAAA--TT-CACTG-CTG-CT-A-TGA-TACATG
gi|10 : GTTACA-CGATAGGTTTAAATG----GTT-ATGTA-CAGAAG-GACGA-AGGTGAG-T------AA-AA-T-GT-CA--CG-AGGAC-GTG-CA---GC-GTC-C-GG----GTAACATTTTA-A--C--C-C-GCC--T--T---TG--T-C--CT-TC-TTT----A-T-AT-------AATC---A---ATT---ACA-----CCTATT-G-TG---TA--A-G---------T--CA-G--AT---G-T-AT-CA-G------A--GCA---------A--CCCTA-C-A----T-T--AC--CA---g
gi|10 : gtaCT-T-AAAAGAT-A-----A------TAA--G-G-------AAA-GT-----------------TG-CT---CAA--A-AA--TA-A--A-G--GA-A-G--TAG--AC-AA-C--A-C-ATG-T-C-A-G------GG--TA---TT-------------ATGA-A-C-T--ATT------G-AA-C-A-AT--------------------AAT---G-ATC-----C---AGCTAAC--G-GAC-A-A-AAAGGCAAAA------CCCT-AG-GTG-AT---A--TTGAAAAT-CT--GA-ACTG----TG--GATA-TT-G-CG-AG---T-----GT--A-AA----AGAC-A----CGT--TCAA----T------AACTG-T-A-G-AGTA-TA----T----A--T---C-T---ATT-T---TGAAGGA--T-G-T-C-----AG-GGG--TTAAAG-CA-G-AGTGG--------GT-T------------TTT--TT-TAAT--TTCGTTTTG-------T-T--T-ccattatcatgcatgtgtaaagagatcttaaaagataataaggaaagttgctcanctacattatatgcatgtgtaaagagaaatttaggatcttaaaagataataaggaaagttgctcaaaaataaaggaagtagacaacacatgtcagggtattatgaactattgaacaataatgatccagctaacggacaaaaaggcaaaaccctaggtgatattgaaaatctgaactgtggatattgcgagtgtaaaagacacgttcaataactgtagagtatatatctattttgaaggatgtcaggggttaaagcagagtgggttttttttaatttcgttttgtttttt
gi|11 : gtagttacacgataggtttaaatggttatgtacagaaggacgaaggtgagtaaaatgtcacgaggacgtgcagcgtccgggtaacattttaacccgcctttgtccttctttatataatcaattacacctattgtgtaagtcagatgtatcagagcaaccctacattaccaccattatcatgcatgtgtaaagagatcttaaaagataataaggaaagttgctcanctacattatatgcatgtgtaaagagaaatttaggat-T-AT-CA-G------A--TCA---------A--CCACA-A-A----T-C--AC--CA---T-GCATGTGCAAGGAGAAATTAA--G--TT----T-A--AG---C----TCT-----CC-ATTTCTT-ACT-T-GGAA----------------------------------G-GT-----------------TG-TT--------A-AA--TA-A--TTG--GA-A-G--TGA--AC-GA-A--G-C-ATG-C-A-A-C------GC--T----CTTTTG-A-AGT-GGGTGT-A-C-T--ATT------G-GA-C-A-ATTAATTCACTTTTTGGAGCCAAAT---G-ACC-----C---ATCTAGC--A-TGC-A-A-AAAAGCAAAA------CCTT-AA-TTG-GA---A--TTAAAAAT-CC--AT-AACG----CA--GAAA-TT-C-CG-AG---T-----GT--A-AAG---GAAC-A----CGT--TCAA----T------ATCT--T-A-A-AATA-TA----T----T--T---C--------------GAAGGA--T-T-T-C-----AG-GGG--TCAATG-CA-G-A---G--------AA-T------------TTT--TT-C-GT--TTCATTTTG-------T-TAAA-AA---------------A---ACA-T-TG--------T---GGAAG-C------T---A--T---------TTTA----TT-T----ACTG---A---CATA-G--GCATCCTGAT--AGGA---TTAACAttt
gi|12 : ---A---ATT---AAAA----CCTATT-G-TGT--TA--A-G------------CA-C--AT---G-T-AT-CA-G------A--GCA---------A--CCCCA-T-A----T-T--AT--CA---T-C-------------------A--A--TT----T-A--GG---A----CTT-----TC-A-TTCTC--CT----GGATAGAA-----A------AAT--GCG-------AAG-GT-----------------CG-CT---GAA--A-AA--TA-A--T----GA-A-G--TAG--AC-GA-C--G-C-ATG-T-G-GCGGGGCCCGG--TA---TTTTTG-A-TGTCGGGTGA-A-C----ATC------G-GA-C-ACATG-------------------GAT---G-AAC-----C---AGCTAAC--GCGGC-ACACAACGGCAAAA------CCCT-AG-GTGCAA---A--TTGAAAAT-CCCGAA-AACG----TGCCGAGACTT-A-CG-AG---T-----GT--A-AA----AATC-A----GTT--TCAA----T------AACTG-T-G-A-AGGATTA----T----TC-T---CAA---ATTGTGTGTGAAGGA--T---T-C-----AG-TGG--TTAAAG-C--C-A---G--------AT-T------------TTC--TT-T-CCCGTCC---TTC-------TCT--T-AA---------------G---ACA-GCTG--------T---GGAAA-AC-----T--AA--T---------TTTGT---TT-T----GCTG---A---AATA----AGAGCCCGAagggttgcaaaacttaagggttgctt
gi|13 : cca---A---AATA-G--AGAGCCCGAG--AGGA---TAAACACA---C
gi|13 : TTGTTCGGAGA-ACGCT-G-TTACTTATAT---GCAAATGATGT------GT-T--A-TG-TT-CAT----G---------TG---------T-TGC-GC-C-ACCGCT--ATAGG-GT-ATCG-G-TGGT-TATGT-AC-ACGA----TA---C-CCACAG------------CCTA--AG-AACAAAGA-GAAA--TT-CACTG-CTGCCT-A--GA-TACATGtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttgttcggagaacgctgttacttatatgcaaatgatgtgttatgttcatgtgttgcgccaccgctatagggtatcggtggttatgtacacgatacccacagcctaagaacaaagagaaattcactgctgcctagatacatgatc
gi|14 : aaatagagagcccgagaggataaacacactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgTTACA-CAATAGGTT-AATTG----GT--ATGTA-CAGAAAAGACGA-AGGCGGGGC------AA-AA-T-GTACA---G-AGAAC-GCG-CA---GC-GTT-C-GA----GTAA--TTTTA-A--C--C-C-GCC--T------CG--C-G--CT-CT-ATT----AGC-AT----G--AAAC---ACAAATT---AAA-----CTCATT-G-------A--A-G---------T-----------------A---A-G------A--ATA---------A--CC------A----TGT--AT--CA------------------------------------------GG---AG---CTT-----TC-ATTTCTC-GCT-T-GGAATAG-A-----A-------AT--G-G-------AAG-GT------------------G-CT---GAA--A-AA--TA-A--T-G---A-A-G--T-G--AC-GA-C--G-C-A---T-G-G-G------GG--TAT--TTTTTG-ATTGT-GGGTGA-A-C-T--ATC------G-GA-C-A-AT--------------------GAT---G-AACTACGGT---AGCTAAC--G-GGC-A-A-AAAGGCAAAA------CCCT-atc
gi|15 : tagtagtG-A-----A------TAT--G-G-------AAG-GT-----------------CG-CT---GAA--A-AA--TA-A--T-G--GA-A-G--TAG--AC-GA-C--G-C-ATG-T-G-G-G------GG--TA---TCTTTG-A-TGT-GGGTGA-A-C-T--ATC------A-GA-C-A-AT--------------------GAT---G-AAC-----T---AGCTAAC--G-AGC-A-A-AAAGGCAAAA------CCCT-GG-GTG-AA---A--TTGAAAAT-CA--GA-AACG----TG--TAGA-TT-G-CG-AG---T-----GTAAA-AA----AAAC-A----CGT--CCAA----T------AACTG-T-G-A-AGTT-TA----T----T--T---CAA---ATT-T---TGAAGGA--T-G-T-C-----AG-TGG--ATAAAG-CA-G-A---G--------AT-T------------TTT--T--------TCCGTGTTC-------T-T--T-AA---------------G---ACA-T-CG--------T---GGAAA-C------T--AA--T---------TTTG----TT-T----GCTG---A---AATA-
gi|16 : ----GTGACATTTTA-A--CTCC-C-GCC--T------CG--TTC--CT-TC-TTT----A---AT----A--A-CC---ATA-ATT---AA------CCTATTTG-TG---TA--A-G---------T--CA-C--AT---G-TTAT-CATG------A--GCACCTCCCCTTG--CCCTA-AGA----TGT--AT--CA---T-G-------------------A--AATTTAGCGT-A--GG---A-----TT-----TC-ATTT-TC-GCT-T-GGAATAG-A-----A------TAT--G-G-------GA--GT-----------------CGCCT---GGAT-A-AA--TA-A--T-G--GA-ATG--TAG--AC-GA-C----C-A-G-T-G-G-G------GGC-TA----TTTTG-ATTGT-GGGTGA-A-C-TTAAT-------A-GA-C-A-AT--------------------GAT---GCAAC-----C---AGCTAAC--N-NNN-N-N-NNNNNNNNNN------NNNN-NN-NNN-AAT--A--TTG
gi|17 : GTTACA-CAGTAGGTTTAATTG----GTT-ATGTA-CAGAAG-GACGA-AGGCGGGGCA-----AA-AA-T-GT-CA--CG-AGGAT-GCG-CA---GC-GTC-C-GA----GTCACGT
gi|17 : agta--A-G---------T--CA-C--GT---G-T-AT-CA-G------A--GCG---------A--CCCCA-A-A----T-A--GT--CA---T-GCACGTGCAAAGCAA-----A--A--CT----T-T--GG---C----TCT-----TC-ATTTCCC-GCT-C-AGAAGAG-A-----A------AAA--A-G-------AAG-GTTCCCGGAGAAGGGTATCCG-TT---AGA--A-AG--T--A--T-G--GA-A-G--TAG--AC-G---------ATG-T-G---------------------TTTG-A-TAT-TAGTGG-A-C-T--ATG------G-GA-C-gtatcagagcgaccccaaatagtcatgcacgtgcaaagcaaaactttggctcttcatttcccgctcagaagagaaaaaagaaggttcccggagaagggtatccgttagaaagtatggaagtagacgatgtgtttgatattagtggactatgggac
gi|18 : agtagttacacagtaggtttaattggttatgtacagaaggacgaaggcggggcaaaaatgtcacgaggatgcgcagcgtccgATACCATGCTATCTTAAGCTCATTATTCAGAGGCCGCT-CCAAGCACGAGGCCTCAAACGCACGAACCGCACGCCTCTCACCATTGATTGCT--------TCCGTAGA-ACGCT-GCTTACTTATAT---GCCAATGATGT------GTCT--A-GC-T--CAT----G-GCTT-TTAT-AAA--G-ACT-TGC-GC-C-ACGCCCTAATAGC-G--ATCG-GTTGAT-TATGT-AC-A-GA----TA---C-CCA
gi|19 : agg---GC-GTC-C-GATCGAGTGACATTTTT-G--C--CAC-GCC--T--T---CG--T-C--CT-TC-T--------------------------A---ACT---AAA-----CCTATT-G-TG---TATAA-G---------T--CA-C--AT---G-T-AT-CA-G------A--GCA---------A--TACCA-A-A----T-T--ATATCA---T-G-------------------C--G--TG----T-GC-AA---A----TCT-----TC-ATTTCTC-GCT-T-AGAAGAG-A-----A------TAA--A-G-------AAG-GT-----------------TG-CT---AAA--A-AAAATA-A--T-G--AA-A-G--TAG--AC-GA-C--G-C-ATG-T-G-G-G------AG--TA---TTTT
gi|2 : GTTACA-CAATAGGTTTAATTG----GTT-ATGTA-CAGAAG-GACGA-AGGCCGGGC------AA-AAAT-GT-CA--CG-AGG---GCG-CT---GC-----C-GA----GTGACATTTTA-A--C--C-C-GCC--T--T---CG--T-C--CT--C-TTT----A-C-TT----A--A-CC---A---ATT---AAA-----CCTATT-G-TG---TA--A-G---------T--CA-C--AT---G-T-ATGCA-G------A--GCA---------A--CCC-A-A-A----T-T--AC----------------------------------------------------------T-----TC-ATT-CTC-GCT-T-GGAATAG-A-----A------TAC--G-G-------AAG-GT-----------------CG-CT---GAA--A-AA--TA-T--T-G--GA-A----TAG--AC-GA-C--G-C-ATG-T-G-G-G------G---TA---TTTTTG-A-TGT-GGGTGA-A-C-T--ATC------G-GA-C-A-AT--------------------GAT---G-AAC-----C---AGCTAAC--G-GGC-A-A-ATAGGC-AAA------CCCT-A--GTG-AA---A---TGAAAAT-CC--GA-AACG----TG--AAGA-TT-G-CG-AA---T-----GT--A-AA----AAAC-A----CG----------------------G-T-G-A-AGTA-TA----T----T--T---CAA---ATT-T---TGAAGGA--T-G-T-C-----AG-TGG--TTAAAG-CA-G-A---G--------AT-T------------TTT--T--------TCCGTGTTC-------T-A--T-AA---------------G---AC----TG--------T----GAAA-A------TTCAA--T---------TTTG----TT-T----GCTG---A---AAT--G--AGAGCCCGAG--AGGA---TAAACA-A---CACTGTTCAT-----TG-ATTA----TTTATTTTTTTTCGTTTTCATTCCGTTGAGAATACATAC-ATG-TATTTCA---TCAT-ATTGAGAGGCCGCT-CCAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGTTCGTAGA-ATGCT-G-TTACTTATAT---GCAAATGATGT------G--T--A-TG-T--CAT------G-TT-TTATGAAA--GCACT-TGC-GC-C-ACGCCT--ATAGG-GT-A-CG-G-TGGT-TATGT-AC-A-GA----TA---C-CCACAG------------CCTA--AC-AACAAA-A-GAAA--TT-CACTG-CTG-CT-A-TGA-TACAT
gi|20 : agta--CCCCA-A-A----T-T--AA--CA---T-G-------------------C--A--CT----T-A--GA---A----CTT-----TC-ATTTCTC-GCT-T-GGAATAG-A-----A------TAC--G-G-------AAG-GT-----------------CG-CT---GAA--A-AA--TA-T--T-G--CA-A-G--TAG--AC-GA-C--G-C-ATG-T-G-G-G------GG--TA---TTTTTG-A-TAT-GGGTGA-A-C-T--ATC------G-GA-C-A-AT--------------------GAT---G-AAC-----C---AGCTAAC--G-GGC-A-A-AAAGGCAAAa
gi|21 : GTTACA-CAATAGGTTTAATTG----GTT-ATGTA-CAGAAG-GACGA-AGGCGGGGC------AA-AAAT-GT-CA--CG-AGGAC-GCG-CA---GC-GTC-C-TA----GTGACATTTTA-A--C--C-C-GCT--T--T---CG--T-C--CT-TC-TTTGTAAA-C-AT-------AACC---A---ATT---AAA-----CCTCTT-G-TG---TA--A-G---------T--CA-C--AT---G-T-AT-CA-G------A--GCccacaaataccctgaagtcctcacattga
gi|22 : atcTGTCAGTAGACACGCTCG-TTACTAAAATCACGCAAAATATGTATGCTAGT-TTCA-TGCT--CATATAGG-G-TTATTATGAAA--GCACT-TGCTGCGT-TCACCT--A-AGGTGT-ATCGAG-TGGTGTA-GT-ACAA-GA----TA---TACCTCAG------------CCTACTAGTAACACA-ATGAGA--AT-CA
gi|23 : ATGT------GT-T--AATG-TTCCAT----GCG-TT-TTATGAAAAAGCACTATGC-GC-C-ACGCCT--ATTAG-GTAATCG-G-TGGT-TAT-T-AC-A-AAGAATTACCCC-CCACAGCACAGCCTGAAACCTA--AGAAACAAA-A-AAAAAGTTACACCG-CTG-CT-ATTGATTACAT
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gi|25 : gGTTACA-TAATAGGTTTAATTG----GTT-AGGTA-CAGAAG-GACGA-AGGCGGGGC------AATAA-T-TG-CAT-TG-AGGAA-GCG-TA---GC-GTT-G-GT----GTGACATTTTA-A--C--C-C-ACC--T--T---CG--C-T--GT-TC-TTT----A-C-AT-------ATTC---A---ATT---AAA-----CC
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lowQualScore : 9 1111 7 7 7 7 777777 7 7 7 7 33 7 5 0 111 4 5 5 7777 4 22 55 4 4 22 22 111 99 1 99 1 1 2222 1 1 222222222 777 666 111 99999 4 2 111 99 1 444444444 99 1 666 777 0 1 3 2 222222 99 999999999 99 55 1 1 6666 2 99 99 2222222222222222222222222222222222222222222222222222 88888 2 2 1 1 2 0 00000 888888 99 1 9999999 1 77777777777777777 2 777 00 1 00 1 99 1 99 2 1 99 00 1 1 99 1 1 1 1 1 1 111111 00 888 7 7 4 7 4 4 22 888888 4 4 7 5 11111111111111111111 333 5 66666 444 99 5 7 7 7 222222 9 1 1 555 22 3 66 3 4444 777 0 3 1 1 1 444 77777 55 1 6666 1 6666 33 22222222222 1 1 1 1 1 9999999999999999999999 2 555 22 1 1 1 88888 1 44 1 222 444 22222222 1 888888888888 22 88888888888 22222222222222 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 7777 1 5555 000 000 9 22 66 888 5 4 444 2 55555 0 6666 7777777 222222222222 00000000000000000000 3 777777777777777 3333 5 7 7 7 888 1 888888 4 11 4 4 66 4444 4 4 4 55 0 0 4 4 11 8 4 4 4 4 4 4 4 4 4444 66666 666666666666 99 9 4 4 11 4 0 0 0 0 0
consensus : GTTACA-CAATAGGTTTAATTG----GTT-ATGTA-CAGAAG-GACGA-AGGCGGGGC------AA-AA-T-GT-CA--CG-AGGAC-GCG-CA---GC-GTC-C-GA----GTGACATTTTA-A--C--C-C-GCC--T--T---CG--T-C--CT-TC-TTT----A-C-AT----A--AACC---A---ATT---AAA-----CCTATT-G-TG---TA--A-G---------T--CA-C--AT---G-T-AT-CA-G------A--GCA---------A--CCCCA-A-A----T-T--AT--CA---T-G-------------------A--A--TT----T-A--GG---A----CTT-----TC-ATTTCTC-GCT-T-GGAATAG-A-----A------TAT--G-G-------AAG-GT-----------------CG-CT---GAA--A-AA--TA-A--T-G--GA-A-G--TAG--AC-GA-C--G-C-ATG-T-G-G-G------GG--TA---TTTTTG-A-TGT-GGGTGA-A-C-T--ATC------G-GA-C-A-AT--------------------GAT---G-AAC-----C---AGCTAAC--G-GGC-A-A-AAAGGCAAAA------CCCT-AG-GTG-AA---A--TTGAAAAT-CC--GA-AACG----TG--GAGA-TT-G-CG-AG---T-----GT--A-AA----AAAC-A----CGT--TCAA----T------AACTG-T-G-A-AGTA-TA----T----T--T---CAA---ATT-T---TGAAGGA--T-G-T-C-----AG-TGG--TTAAAG-CA-G-A---G--------AT-T------------TTT--TT-T-CC--TCCGTGTTC-------T-T--T-AA---------------G---ACA-G-TG--------T---GGAAA-A------T--AA--T---------TTTG----TT-T----GCTG---A---AATA-G--AGAGCCCGAG--AGGA---TAAACACA---CACTGTTCGT-----TG-ATTA----TTTGTT-------GTTTT------------AATACATAC-ATG-TATCTCA---TCAT-ATTGAGAGGCCGCT------CCAA-----GCACGAGGCCTCAAACGCACGAACCGCACGCCTCTCACCATTGATTGCTTTGTTCGTAGA-ACGCT-G-TTACTTATAT---GCAAATGATGT------GT-T--A-TG-T--CAT----G-G-TT-TTATGAAA--GCACT-TGC-GC-C-ACGCCT--ATAGG-GT-ATCG-G-TGGT-TATGT-AC-A-GA----TA---C-CCACAG------------CCTA--AG-AACAAA-A-GAAA--TT-CACTG-CTG-CT-A-TGA-TACATG
Reference ( family-5303 ) : GTTACA-CAATAGGTTTAATTG----GTT-ATGTA-CAGAAG-GACGA-AGGCGGGGC------AA-AA-T-GT-CA--CG-AGGAC-GCG-CA---GC-GTC-C-GA----GTGACATTTTA-A--C--C-C-GCC--T--T---CG--T-C--CT-TC-TTT----A-C-AT----A--AACC---A---ATT---AAA-----CCTATT-G-TG---TA--A-G---------T--CA-C--AT---G-T-AT-CA-G------A--GCA---------A--CCCCA-A-A----T-T--AT--CA---T-G-------------------A--A--TT----T-A--GG---A----CTT-----TC-ATTTCTC-GCT-T-GGAATAG-A-----A------TAT--G-G-------AAG-GT-----------------CG-CT---GAA--A-AA--TA-A--T-G--GA-A-G--TAG--AC-GA-C--G-C-ATG-T-G-G-G------GG--TA---TTTTTG-A-TGT-GGGTGA-A-C-T--ATC------G-GA-C-A-AT--------------------GAT---G-AAC-----C---AGCTAAC--G-GGC-A-A-AAAGGCAAAA------CCCT-AG-GTG-AA---A--TTGAAAAT-CC--GA-AACG----TG--GAGA-TT-G-CG-AG---T-----GT--A-AA----AAAC-A----CGT--TCAA----T------AACTG-T-G-A-AGTA-TA----T----T--T---CAA---ATT-T---TGAAGGA--T-G-T-C-----AG-TGG--TTAAAG-CA-G-A---G--------AT-T------------TTT--TT-T-CC--TCCGTGTTC-------T-T--T-AA---------------G---ACA-G-TG--------T---GGAAA-A------T--AA--T---------TTTG----TT-T----GCTG---A---AATA-G--AGAGCCCGAG--AGGA---TAAACACA---CACTGTTCGT-----TG-ATTA----TTTGTT-------GTTTT------------AATACATAC-ATG-TATCTCA---TCAT-ATTGAGAGGCCGCT------CCAA-----GCACGAGGCCTCAAACGCACGAACCGCACGCCTCTCACCATTGATTGCTTTGTTCGTAGA-ACGCT-G-TTACTTATAT---GCAAATGATGT------GT-T--A-TG-T--CAT----G-G-TT-TTATGAAA--GCACT-TGC-GC-C-ACGCCT--ATAGG-GT-ATCG-G-TGGT-TATGT-AC-A-GA----TA---C-CCACAG------------CCTA--AG-AACAAA-A-GAAA--TT-CACTG-CTG-CT-A-TGA-TACATG
gi|1 : GTTACA-CAATAGGTTCAATTG----GTT-ATGTA-CAGAAG-GACGA-AGACGGGGA------AA-AA-T-GT-CA--CG-AGGAC-GCG-CA---GC-GTC-C-GA----GTGACATTTTA-A--C--C-C-GCC--T--T---CG--T-C--CT-TC-TTT----A-C-AT----ATAAACC---A---ATT---AAA-----CCTATT-G-GG---TA--A-G---------T--CA-C--AT---G-T-AT-CA-G------A--GCA---------A--CCCCA-A-A----T-T--AT--CA---T-G-------------------A--A--TT----T-A--GG---A----CTT-----TC-ATTTCTC-GCT-C-GGAATAG-A-----A------TAT--G-G-------AAG-GT-----------------CG-CT---GAA--A-AA--TA-A--T-G--GA-A-G--TAG--AC-GA-C--G-C-ATG-T-G-G-G------GG--TA---TTTTTG-A-TGT-GGGTGA-A-C-T--ATC------G-GA-C-A-AT--------------------GAT---G-AAC-----C---AGCTAAC--G-GGC-G-A-AAAGGCAAAA------CCTT-GG-GTG-AA---A--TAGAAAAT-CT--GA-AACG----TG--GAGA-TT-G-TG-AT---T-----GT--A-AA----AAAC-A----AGT--TCAA----T------AACTG-T-G-A-AGTA-TA----T----T--T---CAA---ATT-T---TGAAGGA--T-G-T-C-----AG-TGG--TTAAAG-CA-G-A---G--------AT-T------------TTT--TT-T-CC--TCTGTGTTC-------T-T--T-AA---------------G---ACA-G-TG--------T---AGAAA-A------T--AA--T---------TTTG----TT-T----GCTG---A---AATA-G--AAAGCCCGAA--AGGA---TAAACACA---CACTGTTCGT-----TG-ATTA----TTTGTT-------GTTTT------------AATA---------------------CAT-ATTGAGAGACCGCTNNNNNNNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGTTTGTAGA-ACGCT-G-TTACTTATAT---GC-AATGATGT------GT-T--A-TG-T--CAT----G-G-TT-TTATGAAC--GCACT-TGT-GC-C-ACGCCT--ATAGG-GT-ATCG-G-TGGT-TATGT-AC-A-GA----TA---C-CCACAG------------CCTA--AG-AACAAA-A-GAAA--TT-CACTG-CTG-CT-A-TGA-TACATG
gi|10 : GTTACA-CGATAGGTTTAAATG----GTT-ATGTA-CAGAAG-GACGA-AGGTGAG-T------AA-AA-T-GT-CA--CG-AGGAC-GTG-CA---GC-GTC-C-GG----GTAACATTTTA-A--C--C-C-GCC--T--T---TG--T-C--CT-TC-TTT----A-T-AT-------AATC---A---ATT---ACA-----CCTATT-G-TG---TA--A-G---------T--CA-G--AT---G-T-AT-CA-G------A--GCA---------A--CCCTA-C-A----T-T--AC--CA---g
gi|10 : gtaCT-T-AAAAGAT-A-----A------TAA--G-G-------AAA-GT-----------------TG-CT---CAA--A-AA--TA-A--A-G--GA-A-G--TAG--AC-AA-C--A-C-ATG-T-C-A-G------GG--TA---TT-------------ATGA-A-C-T--ATT------G-AA-C-A-AT--------------------AAT---G-ATC-----C---AGCTAAC--G-GAC-A-A-AAAGGCAAAA------CCCT-AG-GTG-AT---A--TTGAAAAT-CT--GA-ACTG----TG--GATA-TT-G-CG-AG---T-----GT--A-AA----AGAC-A----CGT--TCAA----T------AACTG-T-A-G-AGTA-TA----T----A--T---C-T---ATT-T---TGAAGGA--T-G-T-C-----AG-GGG--TTAAAG-CA-G-AGTGG--------GT-T------------TTT--TT-TAAT--TTCGTTTTG-------T-T--T-ccattatcatgcatgtgtaaagagatcttaaaagataataaggaaagttgctcanctacattatatgcatgtgtaaagagaaatttaggatcttaaaagataataaggaaagttgctcaaaaataaaggaagtagacaacacatgtcagggtattatgaactattgaacaataatgatccagctaacggacaaaaaggcaaaaccctaggtgatattgaaaatctgaactgtggatattgcgagtgtaaaagacacgttcaataactgtagagtatatatctattttgaaggatgtcaggggttaaagcagagtgggttttttttaatttcgttttgtttttt
gi|11 : gtagttacacgataggtttaaatggttatgtacagaaggacgaaggtgagtaaaatgtcacgaggacgtgcagcgtccgggtaacattttaacccgcctttgtccttctttatataatcaattacacctattgtgtaagtcagatgtatcagagcaaccctacattaccaccattatcatgcatgtgtaaagagatcttaaaagataataaggaaagttgctcanctacattatatgcatgtgtaaagagaaatttaggat-T-AT-CA-G------A--TCA---------A--CCACA-A-A----T-C--AC--CA---T-GCATGTGCAAGGAGAAATTAA--G--TT----T-A--AG---C----TCT-----CC-ATTTCTT-ACT-T-GGAA----------------------------------G-GT-----------------TG-TT--------A-AA--TA-A--TTG--GA-A-G--TGA--AC-GA-A--G-C-ATG-C-A-A-C------GC--T----CTTTTG-A-AGT-GGGTGT-A-C-T--ATT------G-GA-C-A-ATTAATTCACTTTTTGGAGCCAAAT---G-ACC-----C---ATCTAGC--A-TGC-A-A-AAAAGCAAAA------CCTT-AA-TTG-GA---A--TTAAAAAT-CC--AT-AACG----CA--GAAA-TT-C-CG-AG---T-----GT--A-AAG---GAAC-A----CGT--TCAA----T------ATCT--T-A-A-AATA-TA----T----T--T---C--------------GAAGGA--T-T-T-C-----AG-GGG--TCAATG-CA-G-A---G--------AA-T------------TTT--TT-C-GT--TTCATTTTG-------T-TAAA-AA---------------A---ACA-T-TG--------T---GGAAG-C------T---A--T---------TTTA----TT-T----ACTG---A---CATA-G--GCATCCTGAT--AGGA---TTAACAttt
gi|12 : ---A---ATT---AAAA----CCTATT-G-TGT--TA--A-G------------CA-C--AT---G-T-AT-CA-G------A--GCA---------A--CCCCA-T-A----T-T--AT--CA---T-C-------------------A--A--TT----T-A--GG---A----CTT-----TC-A-TTCTC--CT----GGATAGAA-----A------AAT--GCG-------AAG-GT-----------------CG-CT---GAA--A-AA--TA-A--T----GA-A-G--TAG--AC-GA-C--G-C-ATG-T-G-GCGGGGCCCGG--TA---TTTTTG-A-TGTCGGGTGA-A-C----ATC------G-GA-C-ACATG-------------------GAT---G-AAC-----C---AGCTAAC--GCGGC-ACACAACGGCAAAA------CCCT-AG-GTGCAA---A--TTGAAAAT-CCCGAA-AACG----TGCCGAGACTT-A-CG-AG---T-----GT--A-AA----AATC-A----GTT--TCAA----T------AACTG-T-G-A-AGGATTA----T----TC-T---CAA---ATTGTGTGTGAAGGA--T---T-C-----AG-TGG--TTAAAG-C--C-A---G--------AT-T------------TTC--TT-T-CCCGTCC---TTC-------TCT--T-AA---------------G---ACA-GCTG--------T---GGAAA-AC-----T--AA--T---------TTTGT---TT-T----GCTG---A---AATA----AGAGCCCGAagggttgcaaaacttaagggttgctt
gi|13 : cca---A---AATA-G--AGAGCCCGAG--AGGA---TAAACACA---C
gi|13 : TTGTTCGGAGA-ACGCT-G-TTACTTATAT---GCAAATGATGT------GT-T--A-TG-TT-CAT----G---------TG---------T-TGC-GC-C-ACCGCT--ATAGG-GT-ATCG-G-TGGT-TATGT-AC-ACGA----TA---C-CCACAG------------CCTA--AG-AACAAAGA-GAAA--TT-CACTG-CTGCCT-A--GA-TACATGtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttgttcggagaacgctgttacttatatgcaaatgatgtgttatgttcatgtgttgcgccaccgctatagggtatcggtggttatgtacacgatacccacagcctaagaacaaagagaaattcactgctgcctagatacatgatc
gi|14 : aaatagagagcccgagaggataaacacactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgTTACA-CAATAGGTT-AATTG----GT--ATGTA-CAGAAAAGACGA-AGGCGGGGC------AA-AA-T-GTACA---G-AGAAC-GCG-CA---GC-GTT-C-GA----GTAA--TTTTA-A--C--C-C-GCC--T------CG--C-G--CT-CT-ATT----AGC-AT----G--AAAC---ACAAATT---AAA-----CTCATT-G-------A--A-G---------T-----------------A---A-G------A--ATA---------A--CC------A----TGT--AT--CA------------------------------------------GG---AG---CTT-----TC-ATTTCTC-GCT-T-GGAATAG-A-----A-------AT--G-G-------AAG-GT------------------G-CT---GAA--A-AA--TA-A--T-G---A-A-G--T-G--AC-GA-C--G-C-A---T-G-G-G------GG--TAT--TTTTTG-ATTGT-GGGTGA-A-C-T--ATC------G-GA-C-A-AT--------------------GAT---G-AACTACGGT---AGCTAAC--G-GGC-A-A-AAAGGCAAAA------CCCT-atc
gi|15 : tagtagtG-A-----A------TAT--G-G-------AAG-GT-----------------CG-CT---GAA--A-AA--TA-A--T-G--GA-A-G--TAG--AC-GA-C--G-C-ATG-T-G-G-G------GG--TA---TCTTTG-A-TGT-GGGTGA-A-C-T--ATC------A-GA-C-A-AT--------------------GAT---G-AAC-----T---AGCTAAC--G-AGC-A-A-AAAGGCAAAA------CCCT-GG-GTG-AA---A--TTGAAAAT-CA--GA-AACG----TG--TAGA-TT-G-CG-AG---T-----GTAAA-AA----AAAC-A----CGT--CCAA----T------AACTG-T-G-A-AGTT-TA----T----T--T---CAA---ATT-T---TGAAGGA--T-G-T-C-----AG-TGG--ATAAAG-CA-G-A---G--------AT-T------------TTT--T--------TCCGTGTTC-------T-T--T-AA---------------G---ACA-T-CG--------T---GGAAA-C------T--AA--T---------TTTG----TT-T----GCTG---A---AATA-
gi|16 : ----GTGACATTTTA-A--CTCC-C-GCC--T------CG--TTC--CT-TC-TTT----A---AT----A--A-CC---ATA-ATT---AA------CCTATTTG-TG---TA--A-G---------T--CA-C--AT---G-TTAT-CATG------A--GCACCTCCCCTTG--CCCTA-AGA----TGT--AT--CA---T-G-------------------A--AATTTAGCGT-A--GG---A-----TT-----TC-ATTT-TC-GCT-T-GGAATAG-A-----A------TAT--G-G-------GA--GT-----------------CGCCT---GGAT-A-AA--TA-A--T-G--GA-ATG--TAG--AC-GA-C----C-A-G-T-G-G-G------GGC-TA----TTTTG-ATTGT-GGGTGA-A-C-TTAAT-------A-GA-C-A-AT--------------------GAT---GCAAC-----C---AGCTAAC--N-NNN-N-N-NNNNNNNNNN------NNNN-NN-NNN-AAT--A--TTG
gi|17 : GTTACA-CAGTAGGTTTAATTG----GTT-ATGTA-CAGAAG-GACGA-AGGCGGGGCA-----AA-AA-T-GT-CA--CG-AGGAT-GCG-CA---GC-GTC-C-GA----GTCACGT
gi|17 : agta--A-G---------T--CA-C--GT---G-T-AT-CA-G------A--GCG---------A--CCCCA-A-A----T-A--GT--CA---T-GCACGTGCAAAGCAA-----A--A--CT----T-T--GG---C----TCT-----TC-ATTTCCC-GCT-C-AGAAGAG-A-----A------AAA--A-G-------AAG-GTTCCCGGAGAAGGGTATCCG-TT---AGA--A-AG--T--A--T-G--GA-A-G--TAG--AC-G---------ATG-T-G---------------------TTTG-A-TAT-TAGTGG-A-C-T--ATG------G-GA-C-gtatcagagcgaccccaaatagtcatgcacgtgcaaagcaaaactttggctcttcatttcccgctcagaagagaaaaaagaaggttcccggagaagggtatccgttagaaagtatggaagtagacgatgtgtttgatattagtggactatgggac
gi|18 : agtagttacacagtaggtttaattggttatgtacagaaggacgaaggcggggcaaaaatgtcacgaggatgcgcagcgtccgATACCATGCTATCTTAAGCTCATTATTCAGAGGCCGCT------CCAA-----GCACGAGGCCTCAAACGCACGAACCGCACGCCTCTCACCATTGATTGCT---TCCGTAGA-ACGCT-GCTTACTTATAT---GCCAATGATGT------GTCT--A-GC-T--CAT----G-GCTT-TTAT-AAA--G-ACT-TGC-GC-C-ACGCCCTAATAGC-G--ATCG-GTTGAT-TATGT-AC-A-GA----TA---C-CCA
gi|19 : agg---GC-GTC-C-GATCGAGTGACATTTTT-G--C--CAC-GCC--T--T---CG--T-C--CT-TC-T--------------------------A---ACT---AAA-----CCTATT-G-TG---TATAA-G---------T--CA-C--AT---G-T-AT-CA-G------A--GCA---------A--TACCA-A-A----T-T--ATATCA---T-G-------------------C--G--TG----T-GC-AA---A----TCT-----TC-ATTTCTC-GCT-T-AGAAGAG-A-----A------TAA--A-G-------AAG-GT-----------------TG-CT---AAA--A-AAAATA-A--T-G--AA-A-G--TAG--AC-GA-C--G-C-ATG-T-G-G-G------AG--TA---TTTT
gi|2 : GTTACA-CAATAGGTTTAATTG----GTT-ATGTA-CAGAAG-GACGA-AGGCCGGGC------AA-AAAT-GT-CA--CG-AGG---GCG-CT---GC-----C-GA----GTGACATTTTA-A--C--C-C-GCC--T--T---CG--T-C--CT--C-TTT----A-C-TT----A--A-CC---A---ATT---AAA-----CCTATT-G-TG---TA--A-G---------T--CA-C--AT---G-T-ATGCA-G------A--GCA---------A--CCC-A-A-A----T-T--AC----------------------------------------------------------T-----TC-ATT-CTC-GCT-T-GGAATAG-A-----A------TAC--G-G-------AAG-GT-----------------CG-CT---GAA--A-AA--TA-T--T-G--GA-A----TAG--AC-GA-C--G-C-ATG-T-G-G-G------G---TA---TTTTTG-A-TGT-GGGTGA-A-C-T--ATC------G-GA-C-A-AT--------------------GAT---G-AAC-----C---AGCTAAC--G-GGC-A-A-ATAGGC-AAA------CCCT-A--GTG-AA---A---TGAAAAT-CC--GA-AACG----TG--AAGA-TT-G-CG-AA---T-----GT--A-AA----AAAC-A----CG----------------------G-T-G-A-AGTA-TA----T----T--T---CAA---ATT-T---TGAAGGA--T-G-T-C-----AG-TGG--TTAAAG-CA-G-A---G--------AT-T------------TTT--T--------TCCGTGTTC-------T-A--T-AA---------------G---AC----TG--------T----GAAA-A------TTCAA--T---------TTTG----TT-T----GCTG---A---AAT--G--AGAGCCCGAG--AGGA---TAAACA-A---CACTGTTCAT-----TG-ATTA----TTTATTTTTTTTCGTTTTCATTCCGTTGAGAATACATAC-ATG-TATTTCA---TCAT-ATTGAGAGGCCGCT------CCAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGTTCGTAGA-ATGCT-G-TTACTTATAT---GCAAATGATGT------G--T--A-TG-T--CAT------G-TT-TTATGAAA--GCACT-TGC-GC-C-ACGCCT--ATAGG-GT-A-CG-G-TGGT-TATGT-AC-A-GA----TA---C-CCACAG------------CCTA--AC-AACAAA-A-GAAA--TT-CACTG-CTG-CT-A-TGA-TACAT
gi|20 : agta--CCCCA-A-A----T-T--AA--CA---T-G-------------------C--A--CT----T-A--GA---A----CTT-----TC-ATTTCTC-GCT-T-GGAATAG-A-----A------TAC--G-G-------AAG-GT-----------------CG-CT---GAA--A-AA--TA-T--T-G--CA-A-G--TAG--AC-GA-C--G-C-ATG-T-G-G-G------GG--TA---TTTTTG-A-TAT-GGGTGA-A-C-T--ATC------G-GA-C-A-AT--------------------GAT---G-AAC-----C---AGCTAAC--G-GGC-A-A-AAAGGCAAAa
gi|21 : GTTACA-CAATAGGTTTAATTG----GTT-ATGTA-CAGAAG-GACGA-AGGCGGGGC------AA-AAAT-GT-CA--CG-AGGAC-GCG-CA---GC-GTC-C-TA----GTGACATTTTA-A--C--C-C-GCT--T--T---CG--T-C--CT-TC-TTTGTAAA-C-AT-------AACC---A---ATT---AAA-----CCTCTT-G-TG---TA--A-G---------T--CA-C--AT---G-T-AT-CA-G------A--GCccacaaataccctgaagtcctcacattga
gi|22 : atcTGTCAGTAGACACGCTCG-TTACTAAAATCACGCAAAATATGTATGCTAGT-TTCA-TGCT--CATATAGG-G-TTATTATGAAA--GCACT-TGCTGCGT-TCACCT--A-AGGTGT-ATCGAG-TGGTGTA-GT-ACAA-GA----TA---TACCTCAG------------CCTACTAGTAACACA-ATGAGA--AT-CA
gi|23 : ATGT------GT-T--AATG-TTCCAT----GCG-TT-TTATGAAAAAGCACTATGC-GC-C-ACGCCT--ATTAG-GTAATCG-G-TGGT-TAT-T-AC-A-AAGAATTACCCC-CCACAGCACAGCCTGAAACCTA--AGAAACAAA-A-AAAAAGTTACACCG-CTG-CT-ATTGATTACAT
gi|24 : G--T-C--CT-TC-TTT----A-C-AT----A--A-CC---A---ATT---AA--------------------------G---------T--CA-C--AT---G-T-AT-CA-G------A--GCA---------A--CCTCA-A-A----T-C--AT--CA---T-A-------------------C--A--TT----T-A--GG---A----CTT-----TC-ATGTCTC-GCT-T-GGAATAG-A-----G------TAT--T-G-------AAG-GT-----------------CG-CA---GAA--A-AA--TA-A--T-T--GA-A-G--TAG--AC-GA-C--G-C-ATG-T-G-G-G------GG--TA---TTTtgg
gi|25 : gGTTACA-TAATAGGTTTAATTG----GTT-AGGTA-CAGAAG-GACGA-AGGCGGGGC------AATAA-T-TG-CAT-TG-AGGAA-GCG-TA---GC-GTT-G-GT----GTGACATTTTA-A--C--C-C-ACC--T--T---CG--C-T--GT-TC-TTT----A-C-AT-------ATTC---A---ATT---AAA-----CC
gi|26 : gtaggaGTTACA-CAATAGGTTTAATTG----GTT-ATGTA-CAGAAG-GGCGA-AGGCGGGGC------AA-AAAT-AT-CA--CG-AGGAT-GCG-CA---GC-GTC-C-GA----GTGACATTTTA-A--C--C-C-GCC--T--T---CG--T-C--CT-AC-TTT----A-C-AT-------AACC---A---AT
gi|27 : tagtaTT-A-TG---TA--A-A---------T--CG-C--AT---G-T-AT-CT-G------A--ACA---------G--CCATT-A-A----T-T--AT--CA---T-GTATGTGCAAAGAGA-----A--A--CT----T-A--AG---C----TCT-----TC-ATTTCTC-GCT-T-AGAAGAG-A-----A------TAg
gi|27 : ctA-A--C--C-C-GCC--T--T---CG--T-C--C------TT----A-T-GT----A--AAggacgaaggcgggtt
gi|28 : cttattctcttctaagcgagaaatgaagagcttaagtttctctttgcacatacatgataattaatggctgttcagatacatgcgaT-ATGCA-CAGAAG-GACGA-AGGCGGGGC------AA-AA-TTGT-CA--CG-AGGAC-GCG-CA---GC-GTC-C-GA----GTGTTATTTTA-A--C--C-C-GTC--C--T---CG----------------------------------ATC---A---ATT---AAA-----CCTATT-G-TG---TA--A-G---------T--CA-C--AT---G-
gi|29 : GTTACA-CAATAGGTTGAGTTG----GTT-ATGTA-CAAAAG-GACGA-AGGTGGGGCA-----AA-AA-T-GT-CA--CG-AAGAC-GCG-CA---GC-GTC-C-GA----GTGACATTT
gi|3 : tagtaTT-G-TG---TA--A-G---------T--CAAC--AT---G-T-AT-CAAG------A--GC--------------------------T-T--TT--CA---T------------------------------------------------------------TTTCTCAGCT-T-GGAATAG-A-----A------AGT--G-G-------AAG-GT-----------------CGGCT---GGA--A-AA--TA-A--T-G--GA-A-G--TAA--AC-GA-C--G-C-ATG-T-G-G-G------GG--TA---TTTTTGCA-TGT-GGGT-A-A-C-C--CCCCTAAATG-GA-CTA-AT--------------------GTG---G-AAC-----T---AGCTAACG-G-GGCAA-A-AAAGGCAAAA------CCCTAAG-GTG-AAT--A--TTGAAAAT-CC--GA-AACG----TG-------TC-G--------------------------------A----CGT--TCAA----T------AACTG-T-G---AGTA-TA---------T--T---CAA---ATT-T---TGAAGGA--T-G-T-CCAGCTAG-TGG--GTAAAG-CA-G-A---G--------AT-T------------TTT--TT-------CCCGTGTTC-------T-T--T-AA---------------G---ACA-G-TG--------A---GGAAACC------T--AAATT---------TTTGT---TT-T----G--G---A---AATA-G--AGAGCCCGAG--AGGA---TAAA-ACA---CAC
gi|3 : CTTACCATTGATT----T-TTCGTA-A-ACGCT-G-TTACTTATAT---GAAAAT--TGT------GT-T--A-TG-T--CAT----G-G-TT-TTATGAAA--GCATT-GGT-GC-CGACGCCT--ATTGG-GA-ATCT-G-TGGT-TATGTAAC-A-GA----TA---C-CCACAG------------CCTA--AG-AAC-AA-A-GAAA--AT-CACTGCCTG-CTCA-TGA-TACAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgcgactgacccgccggaagtcaaatgagcaagagcttaccattgatttttcgtaaacgctgttacttatatgaaaattgtgttatgtcatggttttatgaaagcattggtgccgacgcctattgggaatctgtggttatgtaacagatacccacagcctaagaacaaagaaaatcactgcctgctcatgatacaatt
gi|30 : ttgtgtaagtcaacatgtatcaagagcttttcattttctcagcttggaatagaaagtggaaggtcggctggaaaataatggaagtaaacgacgcatgtgggggtatttttgcatgtgggtaacccccctaaatggactaatgtggaactagctaacggggcaaaaaaggcaaaaccctaaggtgaatattgaaaatccgaaacgtgtcgacgttcaataactgtgagtatattcaaattttgaaggatgtccagctagtgggtaaagcagagatttttttcccgtgttctttaagacagtgaggaaacctaaatttttgttttggaaatagagagcccgagaggataaaacacacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgcgactgacccgccggaagtcaaatgagcaagagA--GCAGT-TAT-GC-C-ACGCCT--ACAGT-GT-GTCA-G-TGTT-TATGT-AC-A-AA----TA---C-CCACAG------------CCTA--AG-AACAAA-A-GAAA--TT-CACCA-CTG-CT-A-TGA-TACATatt
gi|31 : ------T--AA--T---------TTTG----TT-T----GCTG---A---AATA-G--AGAGCCCTTG--AGGA---TAAACAAA---CACTGTTTGT-----TG-ATTA----TTTGTT-------GTTTT------------t
gi|33 : GTTACC-CAATAGGTTTAATTG----GTT-ATGTA-CAGAAG-AGCGA-AGGCAGGGCA-----AA-AA-T-GG-CA--CG-AGGAC-GCG-CA---GC-Gtcgctttcgtt
gi|34 : gtagtaGTTACA-CA-TAGGTTTAATTG----TTA-ATGTA-CAGAAG-GACGATAGGCGGGCA------AA-AA-T-GT-CA--CGAAGAAC-GCG-CA---
gi|35 : tagtaATTAAA--GCACT-TAC-GC-C-ACTCTT--AGAAG-GT-ATAA-G-TGGT-TATGT-TG-A-GA----TA-----CCACAG------------CCTA--GG-AAC
gi|36 : CGAG--AGGA---TAAACACA---AACTATTCGT-----TG-ATTA----TTTGTTTTTC---GTTTT------------
gi|37 : acgC-GTC-C-CA----GTGACATTTTA-A--C--C-C-GCC--T--T---CG--T-C--CT-TC-TGC----A-C-AT-------AACC---A---AT
gi|38 : ------T--AA--T---------TTTG----TT-T----GCAG---A---AATA-G--AG--CCCGAG--AGGA---TAAACACA---CAC
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gi|14 : aaatagagagcccgagaggataaacacactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgTTACA-CAATAGGTT-AATTG----GT--ATGTA-CAGAAAAGACGA-AGGCGGGGC------AA-AA-T-GTACA---G-AGAAC-GCG-CA---GC-GTT-C-GA----GTAA--TTTTA-A--C--C-C-GCC--T------CG--C-G--CT-CT-ATT----AGC-AT----G--AAAC---ACAAATT---AAA-----CTCATT-G-------A--A-G---------T-----------------A---A-G------A--ATA---------A--CC------A----TGT--AT--CA------------------------------------------GG---AG---CTT-----TC-ATTTCTC-GCT-T-GGAATAG-A-----A-------AT--G-G-------AAG-GT------------------G-CT---GAA--A-AA--TA-A--T-G---A-A-G--T-G--AC-GA-C--G-C-A---T-G-G-G------GG--TAT--TTTTTG-ATTGT-GGGTGA-A-C-T--ATC------G-GA-C-A-AT--------------------GAT---G-AACTACGGT---AGCTAAC--G-GGC-A-A-AAAGGCAAAA------CCCT-atc
gi|15 : tagtagtG-A-----A------TAT--G-G-------AAG-GT-----------------CG-CT---GAA--A-AA--TA-A--T-G--GA-A-G--TAG--AC-GA-C--G-C-ATG-T-G-G-G------GG--TA---TCTTTG-A-TGT-GGGTGA-A-C-T--ATC------A-GA-C-A-AT--------------------GAT---G-AAC-----T---AGCTAAC--G-AGC-A-A-AAAGGCAAAA------CCCT-GG-GTG-AA---A--TTGAAAAT-CA--GA-AACG----TG--TAGA-TT-G-CG-AG---T-----GTAAA-AA----AAAC-A----CGT--CCAA----T------AACTG-T-G-A-AGTT-TA----T----T--T---CAA---ATT-T---TGAAGGA--T-G-T-C-----AG-TGG--ATAAAG-CA-G-A---G--------AT-T------------TTT--T--------TCCGTGTTC-------T-T--T-AA---------------G---ACA-T-CG--------T---GGAAA-C------T--AA--T---------TTTG----TT-T----GCTG---A---AATA-
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gi|17 : agta--A-G---------T--CA-C--GT---G-T-AT-CA-G------A--GCG---------A--CCCCA-A-A----T-A--GT--CA---T-GCACGTGCAAAGCAA-----A--A--CT----T-T--GG---C----TCT-----TC-ATTTCCC-GCT-C-AGAAGAG-A-----A------AAA--A-G-------AAG-GTTCCCGGAGAAGGGTATCCG-TT---AGA--A-AG--T--A--T-G--GA-A-G--TAG--AC-G---------ATG-T-G---------------------TTTG-A-TAT-TAGTGG-A-C-T--ATG------G-GA-C-gtatcagagcgaccccaaatagtcatgcacgtgcaaagcaaaactttggctcttcatttcccgctcagaagagaaaaaagaaggttcccggagaagggtatccgttagaaagtatggaagtagacgatgtgtttgatattagtggactatgggac
gi|18 : agtagttacacagtaggtttaattggttatgtacagaaggacgaaggcggggcaaaaatgtcacgaggatgcgcagcgtccgATACCATGCTATCTTAAGCTCATTATTCAGAGGCCGCT------CCAA-----GCACGAGGCCTCAAACGCACGAACCGCACGCCTCTCACCATTGATTGCT---TCCGTAGA-ACGCT-GCTTACTTATAT---GCCAATGATGT------GTCT--A-GC-T--CAT----G-GCTT-TTAT-AAA--G-ACT-TGC-GC-C-ACGCCCTAATAGC-G--ATCG-GTTGAT-TATGT-AC-A-GA----TA---C-CCA
gi|19 : agg---GC-GTC-C-GATCGAGTGACATTTTT-G--C--CAC-GCC--T--T---CG--T-C--CT-TC-T--------------------------A---ACT---AAA-----CCTATT-G-TG---TATAA-G---------T--CA-C--AT---G-T-AT-CA-G------A--GCA---------A--TACCA-A-A----T-T--ATATCA---T-G-------------------C--G--TG----T-GC-AA---A----TCT-----TC-ATTTCTC-GCT-T-AGAAGAG-A-----A------TAA--A-G-------AAG-GT-----------------TG-CT---AAA--A-AAAATA-A--T-G--AA-A-G--TAG--AC-GA-C--G-C-ATG-T-G-G-G------AG--TA---TTTT
gi|2 : GTTACA-CAATAGGTTTAATTG----GTT-ATGTA-CAGAAG-GACGA-AGGCCGGGC------AA-AAAT-GT-CA--CG-AGG---GCG-CT---GC-----C-GA----GTGACATTTTA-A--C--C-C-GCC--T--T---CG--T-C--CT--C-TTT----A-C-TT----A--A-CC---A---ATT---AAA-----CCTATT-G-TG---TA--A-G---------T--CA-C--AT---G-T-ATGCA-G------A--GCA---------A--CCC-A-A-A----T-T--AC----------------------------------------------------------T-----TC-ATT-CTC-GCT-T-GGAATAG-A-----A------TAC--G-G-------AAG-GT-----------------CG-CT---GAA--A-AA--TA-T--T-G--GA-A----TAG--AC-GA-C--G-C-ATG-T-G-G-G------G---TA---TTTTTG-A-TGT-GGGTGA-A-C-T--ATC------G-GA-C-A-AT--------------------GAT---G-AAC-----C---AGCTAAC--G-GGC-A-A-ATAGGC-AAA------CCCT-A--GTG-AA---A---TGAAAAT-CC--GA-AACG----TG--AAGA-TT-G-CG-AA---T-----GT--A-AA----AAAC-A----CG----------------------G-T-G-A-AGTA-TA----T----T--T---CAA---ATT-T---TGAAGGA--T-G-T-C-----AG-TGG--TTAAAG-CA-G-A---G--------AT-T------------TTT--T--------TCCGTGTTC-------T-A--T-AA---------------G---AC----TG--------T----GAAA-A------TTCAA--T---------TTTG----TT-T----GCTG---A---AAT--G--AGAGCCCGAG--AGGA---TAAACA-A---CACTGTTCAT-----TG-ATTA----TTTATTTTTTTTCGTTTTCATTCCGTTGAGAATACATAC-ATG-TATTTCA---TCAT-ATTGAGAGGCCGCT------CCAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGTTCGTAGA-ATGCT-G-TTACTTATAT---GCAAATGATGT------G--T--A-TG-T--CAT------G-TT-TTATGAAA--GCACT-TGC-GC-C-ACGCCT--ATAGG-GT-A-CG-G-TGGT-TATGT-AC-A-GA----TA---C-CCACAG------------CCTA--AC-AACAAA-A-GAAA--TT-CACTG-CTG-CT-A-TGA-TACAT
gi|20 : agta--CCCCA-A-A----T-T--AA--CA---T-G-------------------C--A--CT----T-A--GA---A----CTT-----TC-ATTTCTC-GCT-T-GGAATAG-A-----A------TAC--G-G-------AAG-GT-----------------CG-CT---GAA--A-AA--TA-T--T-G--CA-A-G--TAG--AC-GA-C--G-C-ATG-T-G-G-G------GG--TA---TTTTTG-A-TAT-GGGTGA-A-C-T--ATC------G-GA-C-A-AT--------------------GAT---G-AAC-----C---AGCTAAC--G-GGC-A-A-AAAGGCAAAa
gi|21 : GTTACA-CAATAGGTTTAATTG----GTT-ATGTA-CAGAAG-GACGA-AGGCGGGGC------AA-AAAT-GT-CA--CG-AGGAC-GCG-CA---GC-GTC-C-TA----GTGACATTTTA-A--C--C-C-GCT--T--T---CG--T-C--CT-TC-TTTGTAAA-C-AT-------AACC---A---ATT---AAA-----CCTCTT-G-TG---TA--A-G---------T--CA-C--AT---G-T-AT-CA-G------A--GCccacaaataccctgaagtcctcacattga
gi|22 : atcTGTCAGTAGACACGCTCG-TTACTAAAATCACGCAAAATATGTATGCTAGT-TTCA-TGCT--CATATAGG-G-TTATTATGAAA--GCACT-TGCTGCGT-TCACCT--A-AGGTGT-ATCGAG-TGGTGTA-GT-ACAA-GA----TA---TACCTCAG------------CCTACTAGTAACACA-ATGAGA--AT-CA
gi|23 : ATGT------GT-T--AATG-TTCCAT----GCG-TT-TTATGAAAAAGCACTATGC-GC-C-ACGCCT--ATTAG-GTAATCG-G-TGGT-TAT-T-AC-A-AAGAATTACCCC-CCACAGCACAGCCTGAAACCTA--AGAAACAAA-A-AAAAAGTTACACCG-CTG-CT-ATTGATTACAT
gi|24 : G--T-C--CT-TC-TTT----A-C-AT----A--A-CC---A---ATT---AA--------------------------G---------T--CA-C--AT---G-T-AT-CA-G------A--GCA---------A--CCTCA-A-A----T-C--AT--CA---T-A-------------------C--A--TT----T-A--GG---A----CTT-----TC-ATGTCTC-GCT-T-GGAATAG-A-----G------TAT--T-G-------AAG-GT-----------------CG-CA---GAA--A-AA--TA-A--T-T--GA-A-G--TAG--AC-GA-C--G-C-ATG-T-G-G-G------GG--TA---TTTtgg
gi|25 : gGTTACA-TAATAGGTTTAATTG----GTT-AGGTA-CAGAAG-GACGA-AGGCGGGGC------AATAA-T-TG-CAT-TG-AGGAA-GCG-TA---GC-GTT-G-GT----GTGACATTTTA-A--C--C-C-ACC--T--T---CG--C-T--GT-TC-TTT----A-C-AT-------ATTC---A---ATT---AAA-----CC
gi|26 : gtaggaGTTACA-CAATAGGTTTAATTG----GTT-ATGTA-CAGAAG-GGCGA-AGGCGGGGC------AA-AAAT-AT-CA--CG-AGGAT-GCG-CA---GC-GTC-C-GA----GTGACATTTTA-A--C--C-C-GCC--T--T---CG--T-C--CT-AC-TTT----A-C-AT-------AACC---A---AT
gi|27 : tagtaTT-A-TG---TA--A-A---------T--CG-C--AT---G-T-AT-CT-G------A--ACA---------G--CCATT-A-A----T-T--AT--CA---T-GTATGTGCAAAGAGA-----A--A--CT----T-A--AG---C----TCT-----TC-ATTTCTC-GCT-T-AGAAGAG-A-----A------TAg
gi|27 : ctA-A--C--C-C-GCC--T--T---CG--T-C--C------TT----A-T-GT----A--AAggacgaaggcgggtt
gi|28 : cttattctcttctaagcgagaaatgaagagcttaagtttctctttgcacatacatgataattaatggctgttcagatacatgcgaT-ATGCA-CAGAAG-GACGA-AGGCGGGGC------AA-AA-TTGT-CA--CG-AGGAC-GCG-CA---GC-GTC-C-GA----GTGTTATTTTA-A--C--C-C-GTC--C--T---CG----------------------------------ATC---A---ATT---AAA-----CCTATT-G-TG---TA--A-G---------T--CA-C--AT---G-
gi|29 : GTTACA-CAATAGGTTGAGTTG----GTT-ATGTA-CAAAAG-GACGA-AGGTGGGGCA-----AA-AA-T-GT-CA--CG-AAGAC-GCG-CA---GC-GTC-C-GA----GTGACATTT
gi|3 : tagtaTT-G-TG---TA--A-G---------T--CAAC--AT---G-T-AT-CAAG------A--GC--------------------------T-T--TT--CA---T------------------------------------------------------------TTTCTCAGCT-T-GGAATAG-A-----A------AGT--G-G-------AAG-GT-----------------CGGCT---GGA--A-AA--TA-A--T-G--GA-A-G--TAA--AC-GA-C--G-C-ATG-T-G-G-G------GG--TA---TTTTTGCA-TGT-GGGT-A-A-C-C--CCCCTAAATG-GA-CTA-AT--------------------GTG---G-AAC-----T---AGCTAACG-G-GGCAA-A-AAAGGCAAAA------CCCTAAG-GTG-AAT--A--TTGAAAAT-CC--GA-AACG----TG-------TC-G--------------------------------A----CGT--TCAA----T------AACTG-T-G---AGTA-TA---------T--T---CAA---ATT-T---TGAAGGA--T-G-T-CCAGCTAG-TGG--GTAAAG-CA-G-A---G--------AT-T------------TTT--TT-------CCCGTGTTC-------T-T--T-AA---------------G---ACA-G-TG--------A---GGAAACC------T--AAATT---------TTTGT---TT-T----G--G---A---AATA-G--AGAGCCCGAG--AGGA---TAAA-ACA---CAC
gi|3 : CTTACCATTGATT----T-TTCGTA-A-ACGCT-G-TTACTTATAT---GAAAAT--TGT------GT-T--A-TG-T--CAT----G-G-TT-TTATGAAA--GCATT-GGT-GC-CGACGCCT--ATTGG-GA-ATCT-G-TGGT-TATGTAAC-A-GA----TA---C-CCACAG------------CCTA--AG-AAC-AA-A-GAAA--AT-CACTGCCTG-CTCA-TGA-TACAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgcgactgacccgccggaagtcaaatgagcaagagcttaccattgatttttcgtaaacgctgttacttatatgaaaattgtgttatgtcatggttttatgaaagcattggtgccgacgcctattgggaatctgtggttatgtaacagatacccacagcctaagaacaaagaaaatcactgcctgctcatgatacaatt
gi|30 : ttgtgtaagtcaacatgtatcaagagcttttcattttctcagcttggaatagaaagtggaaggtcggctggaaaataatggaagtaaacgacgcatgtgggggtatttttgcatgtgggtaacccccctaaatggactaatgtggaactagctaacggggcaaaaaaggcaaaaccctaaggtgaatattgaaaatccgaaacgtgtcgacgttcaataactgtgagtatattcaaattttgaaggatgtccagctagtgggtaaagcagagatttttttcccgtgttctttaagacagtgaggaaacctaaatttttgttttggaaatagagagcccgagaggataaaacacacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgcgactgacccgccggaagtcaaatgagcaagagA--GCAGT-TAT-GC-C-ACGCCT--ACAGT-GT-GTCA-G-TGTT-TATGT-AC-A-AA----TA---C-CCACAG------------CCTA--AG-AACAAA-A-GAAA--TT-CACCA-CTG-CT-A-TGA-TACATatt
gi|31 : ------T--AA--T---------TTTG----TT-T----GCTG---A---AATA-G--AGAGCCCTTG--AGGA---TAAACAAA---CACTGTTTGT-----TG-ATTA----TTTGTT-------GTTTT------------t
gi|33 : GTTACC-CAATAGGTTTAATTG----GTT-ATGTA-CAGAAG-AGCGA-AGGCAGGGCA-----AA-AA-T-GG-CA--CG-AGGAC-GCG-CA---GC-Gtcgctttcgtt
gi|34 : gtagtaGTTACA-CA-TAGGTTTAATTG----TTA-ATGTA-CAGAAG-GACGATAGGCGGGCA------AA-AA-T-GT-CA--CGAAGAAC-GCG-CA---
gi|35 : tagtaATTAAA--GCACT-TAC-GC-C-ACTCTT--AGAAG-GT-ATAA-G-TGGT-TATGT-TG-A-GA----TA-----CCACAG------------CCTA--GG-AAC
gi|36 : CGAG--AGGA---TAAACACA---AACTATTCGT-----TG-ATTA----TTTGTTTTTC---GTTTT------------
gi|37 : acgC-GTC-C-CA----GTGACATTTTA-A--C--C-C-GCC--T--T---CG--T-C--CT-TC-TGC----A-C-AT-------AACC---A---AT
gi|38 : ------T--AA--T---------TTTG----TT-T----GCAG---A---AATA-G--AG--CCCGAG--AGGA---TAAACACA---CAC
gi|4 : acGGA--GCG-CGAGGGC-GTCGC-GA----GGAGCATTTTA-A--C--C-CTGCC--C--TATCCG--T-G--CTATC-TTT----A-C-ACTCTGA--AGTC---A---ATTTAGAGAGCTCTCCTATTTG-TG---TA--A-GCTTAGCGACT--TA-C--CTCTAGCT-AT-CA-GCACGACA--GCA---------A--AC--A-A-A----T-TTAAT--CAATTT-A-------------------ATCA--TTGACGT-A--GT---A----CTAGAGCATA-ATTTATC-GCTAG-GGAATAGCA-----ACAGTATTAT--G-AGAATTGTAAG-GT-----------------CG-TTAGTGAT--C-AC--TATA--T-G-----A-G--CAGTCAC-G--C--GTC-ATGGTAG-G-G------GG--TAATTCTTTTGTA-TGT-CGGTGATATC-T--ATC------AAGATC-A-AT--------------------GATTG-G-AACAAT--C---AGCTAACCAG-GAC-A-A-AAAGGCAAAA------CCCT-AG-GTG-AA---A--TTAGAAAT-CC--GA-AACGGCATCA--GGTA-TT-GACG-AG---TTGTGAGT--A-AA----GAACAA----CGTCATCAAATCTT------AA--G-TAG-A-TGTG-TAATGCT----T--T---TAA---ATTGTG--TGAAGGA--T-G-TACG----AG-TGGA-TTAAAG-CA-GAA---G--------AT-T------------TTT--TTAT-TT--T---TGTTA-------T-TGAT-AATATTTAGCATACCTCG---ATA-G-TT--------TTTATGAAC-ATTT---T--AC--T---------TTTG----TC-TATGAACTGAATA---AATAGG--AGAGCCCGAG--ATGACATTAAA--------ACCGTTTCTAATTATG-ATTATAATTTTGTT-------GTTT
gi|40 : gTAT---GCAAATGATGT------GA-T--A-TG-T--CAT----G-G-TT-TTATGAAA--GCACT-TGC-G
gi|42 : G-AACAAA-A-GAAA--TT-CACTG-CTG-CT-A-TGA-TA-ATG
gi|43 : A-A-GAAA--TT-CACTG-CTG-CT-A-TGA-TACATGa
gi|5 : A----GTGACATTTTA-AACC--T-C-GCT--TGTT---CG--T-C--CT-TCATTT----A-C-AT----A----CCCATA---ATT---AAAA----CCTAGT-A-TGATATA--A-A---------TTTCA-CCGAG---T-T-ATTCA-G------AAGGCA---------AGCTCCCA-A-ACCGAT-T--AT--CA---T-G-------------------A--A--TT----TTA--GG---A----CTTA----TC-ATTTCTC-GCT-T-GGAATAG-A-----A------TATGAG-A-------AAG-GT-----------------CG-CT---GAA--ATAAT-TG-ATTT-G--GATA-G--TAGT-AC-GA-CCGG-CAATG-T-A-G-G------GGGCTA---C---------------TGA-A-CAT--ATT------G-GA-C-A-AT--------------------GAT---G-AAC-----CGCAAGCTAAC--G-Ga
gi|5 : tcga-G-TG-AG---T-----GTTTA-AAGATCAAAC-AGTCTCGC--CTAA----TTTTAGAAACTGAT-GGA-AGTA--A----T----T--CAAACAATA-ATT-T---TGAAGGA--T-G-T-C-----AGTTGGT-TTAAAGTCA-G-A---G--------CT-T------------TTT--TC-T-C-------TGTTC-------T-T--TCAAAC-------------G---ACATG-TGGTTGTGTTT---GGAAA-AATCTACT--GA--TATGTCTGTATTTGCTGTTT-T----GCTG---ATAGAGTA-G--AGAGCCCGAAGCAGAA---TGGG---A---TACTATT-GT-----TA-ACTA----Taggcatttcaaatggcttgttaggacgtcgtcaaattgcagtgtaattcgagaacgaaatcaccgagagagatttaatctgtgcagatgtatattcgaggtgagtgtttaaagatcaaacagtctcgcctaattttagaaactgatggaagtaattcaaacaataattttgaaggatgtcagttggtttaaagtcagagcttttttctctgttctttcaaacgacatgtggttgtgtttggaaaaatctactgatatgtctgtatttgctgttttgctgatagagtagagagcccgaagcagaatgggatactattgttaactatat
gi|6 : tcgaagtgacattttaaacctcgcttgttcgtccttcatttacatacccataattaaaacctagtatgatataaatttcaccgagttattcagaaggcaagctcccaaaccgattatcatgaattttaggacttatcatttctcgcttggaatagaatatgagaaaggtcgctgaaataattgatttggatagtagtacgaccggcaatgtagggggctactgaacatattggacaatgatgaaccgcaagctaacggaggcatttcaaatggcttgttaggacgtcgtcaaattgcagtgtaattcgagaacgaaatcaccgagagagatttaatctgtgcagatgtatattcgagTTACAACAATAGGTTTAATTG----GT----ATA-CAAAAG-GACAA---GCGGGAC------AA-AA-T-GT-CAGCTG-AGACCTGCGGCA---GCCGTC-C-GA----GTGACATTTTGTA--A--C-C-GAC--T--T---CG--T-CTCCT-TC-TGT----A-T-AT----A--A-CC---A----TT---AAAT----CCTATT-G-T-----A--A-G---------T--CA-----T---G-T-AT--A-GT-----A--G-A---------A--CCCAA-A-T----T-T--A---CA---TCG-------------------A--A--TT----T-ATGGA---A----TTT-----TC-ATTTCTC-GCT-TTGGAA-AA-A-----A------TAT--G-GG------AAG-GT-----------------CG-CT---GGA--A-AT--TA-A--T-G--GAGA-G--T-G--ACAGA-C--G-C-ATG-T-G-G-A------GG--TA---TTTAT----TGT-GG-TGAGA-A-T--ATC------G-GA-C-A-AT--------------------GATT--G-AA----------AGCTAAC--G-CAC-A-A----GGCAAAA------CCC--AA-TTG-AA---ACATTGAAAATGCC--GA-AACGA---TG--GAAA-C--G-CG-AA---T-----GT--A-AA----AATC-G----TGTA-TCAA----T------A-CTG-T-G-A-AGTA-TA----TATTGT--T---CCA---AAT-T---CGAAG-A--T-G-T-C-----A--TGT--TAAAAG-CA---A---G--------AT-TGGAGGTGGGTTGTTG--TT-T-TC--CCAGTGTTC-------T-T--TAAA---------------G---AGA-G--G--------T---TGAAC-T------A--AA--T---------TTTG----TT-T----GCTG---A---AATA-GAAAGAGTCCGAG--AAGA---TAAACACACATCACTGTTCGT-----TG-ATTA----TTT-TT-------GTTTT------------at
gi|7 : caacgaacgaG--T-C--CT-TG-TTT----C-C-AT----A--A-CC---A---ATT---AAA-----CATTTG-G-TG---TA--AAG---------T--C--C---T---G-T-AT-CA-G------A--GCA---------A--CCCCA-A-AA---T-T--AC--CA---T-GCATGTGCAAAGAGA-----A--A--TG----T-A--GGCTCAGCCTCCT-----TC-ATTTC----CT-T-AGCATAG-AGGACTA------TAA--G-G-------AAG-GT-----------------TG-CT---CAA--A-AA--TA-A--T-G--GA-A----TAG--A---A----G-T-ATT-T-TTA-G------GG--TA---TTTTTG-A-TGT-GGGTGA-A-C-T--ATT------G-GA-C-A-ATTAAAACACTTATTGGAACCAAAT---G-AAC-----C---AGCTAGC--G-GGC-A-A-AAAGGCAAAA------CCTA-AG-GTG-AA---A--TTGTAAAT-CA--GA-AACG----TG--GAGA-TT-G-TG-AG---T-----GT--A-A-----------------------------------AACTG-T-G-A-AG-------------------------------T---TGAAGGA--T-G-T-C-----AG-GGG--TTAAAG-CAGG-A---GGGGGGGGCGT-T------------TCA--TT-T---------TGTTC--------------AA---------------G---AC-------------------------------------------------TTG----TT-T----GCTG---A---CGTA-G--ACAGCCTGAT--AAGA---TAAACACG---CACTGTTCGT-----AGAACTA----GATGTT-------ACTTT------------A
gi|7 : A-ATGCT-G-TTACTTTTAT---GCAAAAGATGT------GT-T--G-TG-T--CAT----G-G-TT-TTtaaaaaatgagcccaacagacgaatcgctcacaagaatcataaatttgcttattgaaattaatgtaatgctgttacttttatgcaaaagatgtgttgtgtcatggtttt
gi|8 : gtccttgtttccataaccaattaaacatttggtgtaaagtcctgtatcagagcaaccccaaaattaccatgcatgtgcaaagagaaatgtaggctcagcctccttcatttccttagcatagaggactataaggaaggttgctcaaaaataatggaatagaagtatttttagggtatttttgatgtgggtgaactattggacaattaaaacacttattggaaccaaatgaaccagctagcgggcaaaaaggcaaaacctaaggtgaaattgtaaatcagaaacgtggagattgtgagtgtaaaactgtgaagttgaaggatgtcaggggttaaagcaggaggggggggcgtttcattttgttcaagacttgtttgctgacgtagacagcctgataagataaacacgcactgttcgtagaactagatgttactttataaaaaatgagcccaacagacgaatcgctcacaagaatcataaatttgcttattgaaattaatgtGTTACA-CAATAGGTTTAATTG----GTT-ATGTA-CAGAAG-GACGA-AGGCGGGGC------AA-AAAT-GT-CA--CG-AGGAC-GCACCA---GC-GTC-C-GA----GTGACATTTTA-A--C--C-C-GCC--T--T---CG--T-C--CT-TC-TTT----A-C-AT-------AACC---A---ATT---AAA-----CCTATT-G-TG---TA--A-G---------T--CA-C--AT---G-T-AT-CA-G------A--GCA---------A--CCCCA-A-A----T-T--AT--CA---T-G-------------------A--A--TT----T-A--GG---A----CTT-----TC-ATTTCTC-GCT-T-GGAATAG-A-----A------TAT--G-G-------AAG-GT-----------------CG-CT---GAA--A-AA--TA-A--T-G--GA-A-G--TAG--AC-GA-C--G-C-ATG-T-G-G-G------GG--TA---TGTTTG-A-TGT-GGGTGA-A-C-T--ATC------G-GA-C-A-AT--------------------GAT---G-AAC-----C---AGCTAAC--G-GGC-A-A-AAAGGCAAAAGGCGATCCCT-AG-GTG-AA---A--TTGAAAAT-CC--GA-AACG----TG----TA-TT-G-CG-AGGGTT-----GT----AA----AAAC-A----CGT--CAAG----TA-----AACTG---A-A-AGTA-TA----T----T--T---CAATCCTTT-T---TGAGCGA--TCG-T-C-----TG-TGGAATAAAAG-CA-A-A---C--------ATAT------------TTT--TT-A-TC--T---TGTTCTTTAGCAT-T--T-AA---------------GTGCACA---TG--------T---GAGAA-A------T--AA--T---------TTTG----TTGT----GAT----A---ATTA-A--AGAGCCC
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blockSeqs : . . . . . . A . A . . T . . C . . . . . . . TC . . . . . . . . . . TTA . . GAA . TA . A T . T . . . . . A . . . T A T . . . . . A G . . TGCATGTGCAAGGAGAAATTAAGTTTAAGC A . . . . T C . . . . G . . G . T . T . . . . G . . T . . . . . . . . . . C T T T . G . . . . . . C . TAAAACACTTATTGGAACCA TG . AAT . G . . . . . . . . T . . . . A G A . . . . . . TT . G . C A ATCTT . . . . . ATGCTTTTAA G G . . . . G . A . GG . . . . . TCCCGTCC TTAAA TATTTAGCATACCTCGATAGTTTTTATGAACATTTTACT T . . . . . . . . C C . . . . TTTC . . CCAA GCT G . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TA . . A . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . A . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AAA . . . A . . . . . . . . A . . . T . . . . . . . . . . . TGCACGTGCAAAGCAAAACTTTGGC . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G T . . . . . . . . . . . . T . . . . . G G . . . . . . . . . . . . TA . . . . . TATTGTTCCA . G . . . . . . T . TG . . . . . CGTTTCA TTGAT GACAGTGAGGAAACCTAAATT T . . . . . . . . C A . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . A . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATA . . . T . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . TGTATGTGCAAAGAGAAACTTAAGC . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T G . . . . . . . . . . . . T . . . . . TTTCAATCC . . . . . . . . . . G . . . . . TTCCCAG TCTT GACAGCTGTGGAAAACTAAT . . . . . . . . . C C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . ATTTAATCATTGACGTAGTA . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A G . . . . . . . . . . . . T . . . . . TTTGTCAA . . . . . . . . . . G . . . . . ATTTT TTTC GTGCACATGTGAGAAATAAT . . . . . . . . . C C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . TGAAATTTAGCGTAGGA . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G T . . . . . . . . . . . . T . . . . . TTCTCAA . . . . . . . . . . C . . . . . TCCG TTTA GACATCGTGGAAACTAAT . . . . . . . . . C C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . TCGAATTTATGGAA . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G A . . . . . . . . . . . . T . . . . . TTTCAA . . . . . . . . . . G . . . . . TCCG TTTA AACATTGTGGAAGCTAT . . . . . . . . . C C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . ATGAACTTAAGGA . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G G . . . . . . . . . . . . T . . . . . TTTCAA . . . . . . . . . . G . . . . . CCCG TTT GACTGTGAAAATTCAAT . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . TGCGTGTGCAAA . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A T . . . . . . . . . . . . T . . . . . TATCT . . . . . . . . . . G . . . . . ATCT TTT GAGAGGTTGAACTAAAT . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . TGAATTTTAGGA . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . T . . . . . TTCAA . . . . . . . . . . G . . . . . CCCT TAT GAC . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . TCAATTTAGGA . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTTC . . . . . . . . . . A . . . . . TC TTT . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . TGCACTTAGAA . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . TACATTTAGGA . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . TGAATTTAGGA . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GGAG . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . .
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originalCons : GTTACA-CAATAGGTTTAATTG----GTT-ATGTA-CAGAAG-GACGA-AGGCGGGGC------AA-AA-T-GT-CA--CG-AGGAC-GCG-CA---GC-GTC-C-GA----GTGACATTTTA-A--C--C-C-GCC--T--T---CG--T-C--CT-TC-TTT----A-C-AT----A--AACC---A---ATT---AAA-----CCTATT-G-TG---TA--A-G---------T--CA-C--AT---G-T-AT-CA-G------A--GCA---------A--CCCCA-A-A----T-T--AT--CA---T-G-------------------A--A--TT----T-A--GG---A----CTT-----TC-ATTTCTC-GCT-T-GGAATAG-A-----A------TAT--G-G-------AAG-GT-----------------CG-CT---GAA--A-AA--TA-A--T-G--GA-A-G--TAG--AC-GA-C--G-C-ATG-T-G-G-G------GG--TA---TTTTTG-A-TGT-GGGTGA-A-C-T--ATC------G-GA-C-A-AT--------------------GAT---G-AAC-----C---AGCTAAC--G-GGC-A-A-AAAGGCAAAA------CCCT-AG-GTG-AA---A--TTGAAAAT-CC--GA-AACG----TG--GAGA-TT-G-CG-AG---T-----GT--A-AA----AAAC-A----CGT--TCAA----T------AACTG-T-G-A-AGTA-TA----T----T--T---CAA---ATT-T---TGAAGGA--T-G-T-C-----AG-TGG--TTAAAG-CA-G-A---G--------AT-T------------TTT--TT-T-CC--TCCGTGTTC-------T-T--T-AA---------------G---ACA-G-TG--------T---GGAAA-A------T--AA--T---------TTTG----TT-T----GCTG---A---AATA-G--AGAGCCCGAG--AGGA---TAAACACA---CACTGTTCGT-----TG-ATTA----TTTGTT-------GTTTT------------AATACATAC-ATG-TATCTCA---TCAT-ATTGAGAGGCCGCT------CCAA-----GCACGAGGCCTCAAACGCACGAACCGCACGCCTCTCACCATTGATTGCTTTGTTCGTAGA-ACGCT-G-TTACTTATAT---GCAAATGATGT------GT-T--A-TG-T--CAT----G-G-TT-TTATGAAA--GCACT-TGC-GC-C-ACGCCT--ATAGG-GT-ATCG-G-TGGT-TATGT-AC-A-GA----TA---C-CCACAG------------CCTA--AG-AACAAA-A-GAAA--TT-CACTG-CTG-CT-A-TGA-TACATG
finalCons : GTTACA-CAATAGGTTTAATTG----GTT-ATGTA-CAGAAG-GACGA-AGGCGGGGC------AA-AA-T-GT-CA--CG-AGGAC-GCG-CA---GC-GTC-C-GA----GTGACATTTTA-A--C--C-C-GCC--T--T---CG--T-C--CT-TC-TTT----A-C-ATAA-------CC---A---ATT---AAA-----CCTATT-G-TG---TA--A-G---------T--CA-C--AT---G-T-AT-CA-G------A--GCA---------A--CCCCA-A-A----T-T--AT--CA---T-G-------------------A--A--TT----T-A--GG---A----CTT-----TC-ATTTCTC-GCT-T-GGAATAG-A-----A------TAT--G-G-------AAG-GT-----------------CG-CT---GAA--A-AA--TA-A--T-G--GA-A-G--TAG--AC-GA-C--G-C-ATG-T-G-G-G------GG--TA---TTTTTG-A-TGT-GGGTGA-A-C-T--ATC------G-GA-C-A-AT--------------------GAT---G-AAC-----C---AGCTAAC--G-GGC-A-A-AAAGGCAAAA------CCCT-AG-GTG-AA---A--TTGAAAAT-CC--GA-AACG----TG--GAGA-TT-G-CG-AG---T-----GT--A-AA----AAAC-A----CGT--TCAA----T------AACTG-T-G-A-AGTA-TATTTCAA----------------ATT-T---TGAAGGA--T-G-T-C-----AG-TGG--TTAAAG-CA-G-A---G--------AT-T------------TTT--TTTCCG-------TGTTCTTT-----------AA---------------G---ACA-G-TG--------T---GGAAA-A------T--AA--T---------TTTG----TT-T----GCTG---A---AATA-G--AGAGCCCGAG--AGGA---TAAACACA---CACTGTTCGT-----TG-ATTA----TTTGTT-------GTTTT------------AATACATAC-ATG-TATCTCA---TCAT-ATTGAGAGGCCGCT------CCAA-----GCACGAGGCCTCAAACGCACGAACCGCACGCCTCTCACCATTGATTGCTTTGTTCGTAGA-ACGCT-G-TTACTTATAT---GCAAATGATGT------GT-T--A-TG-T--CAT----G-G-TT-TTATGAAA--GCACT-TGC-GC-C-ACGCCT--ATAGG-GT-ATCG-G-TGGT-TATGT-AC-A-GA----TA---C-CCACAG------------CCTA--AG-AACAAA-A-GAAA--TT-CACTG-CTG-CT-A-TGA-TACATG
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|32 ): TCGTTTGCTGATATGATACGAAGCGCACAAAGTACATTGATCGATTATTTAATTGTTTGTTTATCGTCCCGTTGAGAATA
Unaligned ( gi|39 ): TACATGTAATTGATTATTTATTTGTTTATCGTTCCGTTGAGAATAT
Unaligned ( gi|41 ): ATCTTGATCTCATGTAATCTTATTTGTAAAGGAATTTGATTTCT
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lowQualScore : 9 1111 7 7 7 7 777777 7 7 7 7 33 7 5 5 5 111 4 5 5 7777 4 22 55 4 4 22 22 111 99 1 99 1 1 2222 555 44444444444444 55 999 22222 4 2 111 99 1 444444444 99 1 666 777 0 1 3 2 222222 99 999999999 99 55 1 1 6666 2 99 99 2222222222222222222222222222222222222222222222222222 88888 2 2 1 1 2 0 00000 888888 99 1 9999999 1 77777777777777777 2 777 00 1 00 1 99 1 99 2 1 99 00 1 1 99 1 1 1 1 1 1 111111 00 888 7 7 4 7 4 4 22 888888 4 4 7 5 11111111111111111111 333 5 66666 444 99 5 7 7 7 222222 9 1 1 555 22 3 66 3 4444 777 0 3 1 1 1 444 77777 55 1 6666 1 6666 33 22222222222 1 1 1 1 1 9999999999999999999999 2 555 22 1 1 1 88888 1 44 1 000000 1 444 9999999999999999 1 22 33 8888 3 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 7777 1 5555 000 000 9 22 66 888 5 4 444 2 55555 0 6666 7777777 222222222222 00000000000000000000 3 777777777777777 3333 5 7 7 7 888 1 888888 4 11 4 4 66 4444 4 4 4 55 0 0 4 4 11 8 4 4 4 4 4 4 4 4 4444 66666 666666666666 99 9 4 4 11 4 0 0 0 0 0
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Reference ( family-5303 ) : GTTACA-CAATAGGTTTAATTG----GTT-ATGTA-CAGAAG-GACGA-AGGCGGGGC------AA-AA-T-GT-CA--CG-AGGAC-GCG-C-A---GC-GTC-C-GA----GTGACATTTTA-A--C--C-C-GCC--T--T---CG--T-C--CT-TC-TTT----A-C-AT-----A---A----CCA--ATT---AAA-----CCTATT-G-TG---TA--A-G---------T--CA-C--AT---G-T-AT-CA-G------A--GCA---------A--CCCCA-A-A----T-T--AT--CA---T-G-------------------A--A--TT----T-A--GG---A----CTT-----TC-ATTTCTC-GCT-T-GGAATAG-A-----A------TAT--G-G-------AAG-GT-----------------CG-CT---GAA--A-AA--TA-A--T-G--GA-A-G--TAG--AC-GA-C--G-C-ATG-T-G-G-G------GG--TA---TTTTTG-A-TGT-GGGTGA-A-C-T--ATC------G-GA-C-A-AT--------------------GAT---G-AAC-----C---AGCTAAC--G-GGC-A-A-AAAGGCAAAA------CCCT-AG-GTG-AA---A--TTGAAAAT-CC--GA-AACG----TG--GAGA-TT-G-CG-AG---T-----GT--A-AA----AAAC-A----CGT--TCAA----T------AACTG-T-G-A-AGTA-TA----T----T--T---CAA---ATT-T---TGAAGGA--T-G-T-C-----AG-TGG--TTAAAG-CA------G-A---G--------AT------TTT-T--TT-TCC---GT-GTTC-------T-T--T-------AA---------------G---ACA-G-TG--------T---GGAAA-A------T--AA--T---------TTTG----TT-T----GCTG---A---AATA-G--AGAGCCCGAG--AGGA---TAAACACA---CACTGTTCGT-----TG-ATTA----TTTGTT-------GTTTT------------AATACATAC-ATG-TATCTCA---TCAT-ATTGAGAGGCCGCT------CCAA-----GCACGAGGCCTCAAACGCACGAACCGCACGCCTCTCACCATTGATTGCTTTGTTCGTAGA-ACGCT-G-TTACTTATAT---GCAAATGATGT------GT-T--A-TG-T--CAT----G-G-TT-TTATGAAA--GCACT-TGC-GC-C-ACGCCT--ATAGG-GT-ATCG-G-TGGT-TATGT-AC-A-GA----TA---C-CCACAG------------CCTA--AG-AACAAA-A-GAAA--TT-CACTG-CTG-CT-A-TGA-TACATG
gi|1 : GTTACA-CAATAGGTTCAATTG----GTT-ATGTA-CAGAAG-GACGA-AGACGGGGA------AA-AA-T-GT-CA--CG-AGGAC-GCG-C-A---GC-GTC-C-GA----GTGACATTTTA-A--C--C-C-GCC--T--T---CG--T-C--CT-TC-TTT----A-C-AT-----ATAAA----CCA--ATT---AAA-----CCTATT-G-GG---TA--A-G---------T--CA-C--AT---G-T-AT-CA-G------A--GCA---------A--CCCCA-A-A----T-T--AT--CA---T-G-------------------A--A--TT----T-A--GG---A----CTT-----TC-ATTTCTC-GCT-C-GGAATAG-A-----A------TAT--G-G-------AAG-GT-----------------CG-CT---GAA--A-AA--TA-A--T-G--GA-A-G--TAG--AC-GA-C--G-C-ATG-T-G-G-G------GG--TA---TTTTTG-A-TGT-GGGTGA-A-C-T--ATC------G-GA-C-A-AT--------------------GAT---G-AAC-----C---AGCTAAC--G-GGC-G-A-AAAGGCAAAA------CCTT-GG-GTG-AA---A--TAGAAAAT-CT--GA-AACG----TG--GAGA-TT-G-TG-AT---T-----GT--A-AA----AAAC-A----AGT--TCAA----T------AACTG-T-G-A-AGTA-TA----T----T--T---CAA---ATT-T---TGAAGGA--T-G-T-C-----AG-TGG--TTAAAG-CA------G-A---G--------AT------TTT-T--TT-TCCTCTGT-GTTC-------T-T--T-------AA---------------G---ACA-G-TG--------T---AGAAA-A------T--AA--T---------TTTG----TT-T----GCTG---A---AATA-G--AAAGCCCGAA--AGGA---TAAACACA---CACTGTTCGT-----TG-ATTA----TTTGTT-------GTTTT------------AATA---------------------CAT-ATTGAGAGACCGCTNNNNNNNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGTTTGTAGA-ACGCT-G-TTACTTATAT---GC-AATGATGT------GT-T--A-TG-T--CAT----G-G-TT-TTATGAAC--GCACT-TGT-GC-C-ACGCCT--ATAGG-GT-ATCG-G-TGGT-TATGT-AC-A-GA----TA---C-CCACAG------------CCTA--AG-AACAAA-A-GAAA--TT-CACTG-CTG-CT-A-TGA-TACATG
gi|10 : GTTACA-CGATAGGTTTAAATG----GTT-ATGTA-CAGAAG-GACGA-AGGTGAG-T------AA-AA-T-GT-CA--CG-AGGAC-GTG-C-A---GC-GTC-C-GG----GTAACATTTTA-A--C--C-C-GCC--T--T---TG--T-C--CT-TC-TTT----A-T-AT-----A---A----TCA--ATT---ACA-----CCTATT-G-TG---TA--A-G---------T--CA-G--AT---G-T-AT-CA-G------A--GCA---------A--CCCTA-C-A----T-T--AC--CA---g
gi|10 : gtaCT-T-AAAAGAT-A-----A------TAA--G-G-------AAA-GT-----------------TG-CT---CAA--A-AA--TA-A--A-G--GA-A-G--TAG--AC-AA-C--A-C-ATG-T-C-A-G------GG--TA---TT-------------ATGA-A-C-T--ATT------G-AA-C-A-AT--------------------AAT---G-ATC-----C---AGCTAAC--G-GAC-A-A-AAAGGCAAAA------CCCT-AG-GTG-AT---A--TTGAAAAT-CT--GA-ACTG----TG--GATA-TT-G-CG-AG---T-----GT--A-AA----AGAC-A----CGT--TCAA----T------AACTG-T-A-G-AGTA-TA----T----A--T---C-T---ATT-T---TGAAGGA--T-G-T-C-----AG-GGG--TTAAAG-CA------G-AGTGG--------GT------TTT-T--TT-Tccattatcatgcatgtgtaaagagatcttaaaagataataaggaaagttgctcanctacattatatgcatgtgtaaagagaaatttaggatcttaaaagataataaggaaagttgctcaaaaataaaggaagtagacaacacatgtcagggtattatgaactattgaacaataatgatccagctaacggacaaaaaggcaaaaccctaggtgatattgaaaatctgaactgtggatattgcgagtgtaaaagacacgttcaataactgtagagtatatatctattttgaaggatgtcaggggttaaagcagagtgggttttttttaatttcgttttgtttttt
gi|11 : gtagttacacgataggtttaaatggttatgtacagaaggacgaaggtgagtaaaatgtcacgaggacgtgcagcgtccgggtaacattttaacccgcctttgtccttctttatataatcaattacacctattgtgtaagtcagatgtatcagagcaaccctacattaccaccattatcatgcatgtgtaaagagatcttaaaagataataaggaaagttgctcanctacattatatgcatgtgtaaagagaaatttaggat-T-AT-CA-G------A--TCA---------A--CCACA-A-A----T-C--AC--CA---T-GCATGTGCAAGGAGAAATTAA--G--TT----T-A--AG---C----TCT-----CC-ATTTCTT-ACT-T-GGAA----------------------------------G-GT-----------------TG-TT--------A-AA--TA-A--TTG--GA-A-G--TGA--AC-GA-A--G-C-ATG-C-A-A-C------GC--T----CTTTTG-A-AGT-GGGTGT-A-C-T--ATT------G-GA-C-A-ATTAATTCACTTTTTGGAGCCAAAT---G-ACC-----C---ATCTAGC--A-TGC-A-A-AAAAGCAAAA------CCTT-AA-TTG-GA---A--TTAAAAAT-CC--AT-AACG----CA--GAAA-TT-C-CG-AG---T-----GT--A-AAG---GAAC-A----CGT--TCAA----T------ATCT--T-A-A-AATA-TA----T----T--T---C--------------GAAGGA--T-T-T-C-----AG-GGG--TCAATG-CA------G-A---G--------AA------TTT-T--TT---C---GT--TTCA------T-T--TTGTTAAAAA---------------A---ACA-T-TG--------T---GGAAG-C------T---A--T---------TTTA----TT-T----ACTG---A---CATA-G--GCATCCTGAT--AGGA---TTAACAaatttcgttttgtttttt
gi|12 : A--ATT---AAAA----CCTATT-G-TGT--TA--A-G------------CA-C--AT---G-T-AT-CA-G------A--GCA---------A--CCCCA-T-A----T-T--AT--CA---T-C-------------------A--A--TT----T-A--GG---A----CTT-----TC-A-TTCTC--CT----GGATAGAA-----A------AAT--GCG-------AAG-GT-----------------CG-CT---GAA--A-AA--TA-A--T----GA-A-G--TAG--AC-GA-C--G-C-ATG-T-G-GCGGGGCCCGG--TA---TTTTTG-A-TGTCGGGTGA-A-C----ATC------G-GA-C-ACATG-------------------GAT---G-AAC-----C---AGCTAAC--GCGGC-ACACAACGGCAAAA------CCCT-AG-GTGCAA---A--TTGAAAAT-CCCGAA-AACG----TGCCGAGACTT-A-CG-AG---T-----GT--A-AA----AATC-A----GTT--TCAA----T------AACTG-T-G-A-AGGATTA----T----TC-T---CAA---ATTGTGTGTGAAGGA--T---T-C-----AG-TGG--TTAAAG-C-------C-A---G--------AT------TTTCT--TT-CCC---GTCCTTC-------TCT--T-------AA---------------G---ACA-GCTG--------T---GGAAA-AC-----T--AA--T---------TTTGT---TT-T----GCTG---A---AATA----AGAGCCCGAagggttgcaaaacttaagggttgctt
gi|13 : cca---A---AATA-G--AGAGCCCGAG--AGGA---TAAACACA---C
gi|13 : TTGTTCGGAGA-ACGCT-G-TTACTTATAT---GCAAATGATGT------GT-T--A-TG-TT-CAT----G---------TG---------T-TGC-GC-C-ACCGCT--ATAGG-GT-ATCG-G-TGGT-TATGT-AC-ACGA----TA---C-CCACAG------------CCTA--AG-AACAAAGA-GAAA--TT-CACTG-CTGCCT-A--GA-TACATGtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttgttcggagaacgctgttacttatatgcaaatgatgtgttatgttcatgtgttgcgccaccgctatagggtatcggtggttatgtacacgatacccacagcctaagaacaaagagaaattcactgctgcctagatacatgatc
gi|14 : aaatagagagcccgagaggataaacacactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgTTACA-CAATAGGTT-AATTG----GT--ATGTA-CAGAAAAGACGA-AGGCGGGGC------AA-AA-T-GTACA---G-AGAAC-GCG-C-A---GC-GTT-C-GA----GTAA--TTTTA-A--C--C-C-GCC--T------CG--C-G--CT-CT-ATT----AGC-AT-----G---AAACACAA--ATT---AAA-----CTCATT-G-------A--A-G---------T-----------------A---A-G------A--ATA---------A--CC------A----TGT--AT--CA------------------------------------------GG---AG---CTT-----TC-ATTTCTC-GCT-T-GGAATAG-A-----A-------AT--G-G-------AAG-GT------------------G-CT---GAA--A-AA--TA-A--T-G---A-A-G--T-G--AC-GA-C--G-C-A---T-G-G-G------GG--TAT--TTTTTG-ATTGT-GGGTGA-A-C-T--ATC------G-GA-C-A-AT--------------------GAT---G-AACTACGGT---AGCTAAC--G-GGC-A-A-AAAGGCAAAA------CCCT-atc
gi|15 : tagtagtG-A-----A------TAT--G-G-------AAG-GT-----------------CG-CT---GAA--A-AA--TA-A--T-G--GA-A-G--TAG--AC-GA-C--G-C-ATG-T-G-G-G------GG--TA---TCTTTG-A-TGT-GGGTGA-A-C-T--ATC------A-GA-C-A-AT--------------------GAT---G-AAC-----T---AGCTAAC--G-AGC-A-A-AAAGGCAAAA------CCCT-GG-GTG-AA---A--TTGAAAAT-CA--GA-AACG----TG--TAGA-TT-G-CG-AG---T-----GTAAA-AA----AAAC-A----CGT--CCAA----T------AACTG-T-G-A-AGTT-TA----T----T--T---CAA---ATT-T---TGAAGGA--T-G-T-C-----AG-TGG--ATAAAG-CA------G-A---G--------A-------TTT-T--TT-TCC---GT-GTTC-------T-T--T-------AA---------------G---ACA-T-CG--------T---GGAAA-C------T--AA--T---------TTTG----TT-T----GCTG---A---AATA-
gi|16 : ----GTGACATTTTA-A--CTCC-C-GCC--T------CG--TTC--CT-TC-TTT----A---AT-----A---A----CCATAATT---AA------CCTATTTG-TG---TA--A-G---------T--CA-C--AT---G-TTAT-CATG------A--GCACCTCCCCTTG--CCCTA-AGA----TGT--AT--CA---T-G-------------------A--AATTTAGCGT-A--GG---A-----TT-----TC-ATTT-TC-GCT-T-GGAATAG-A-----A------TAT--G-G-------GA--GT-----------------CGCCT---GGAT-A-AA--TA-A--T-G--GA-ATG--TAG--AC-GA-C----C-A-G-T-G-G-G------GGC-TA----TTTTG-ATTGT-GGGTGA-A-C-TTAAT-------A-GA-C-A-AT--------------------GAT---GCAAC-----C---AGCTAAC--N-NNN-N-N-NNNNNNNNNN------NNNN-NN-NNN-AAT--A--TTG
gi|17 : GTTACA-CAGTAGGTTTAATTG----GTT-ATGTA-CAGAAG-GACGA-AGGCGGGGCA-----AA-AA-T-GT-CA--CG-AGGAT-GCG-C-A---GC-GTC-C-GA----GTCACGT
gi|17 : agta--A-G---------T--CA-C--GT---G-T-AT-CA-G------A--GCG---------A--CCCCA-A-A----T-A--GT--CA---T-GCACGTGCAAAGCAA-----A--A--CT----T-T--GG---C----TCT-----TC-ATTTCCC-GCT-C-AGAAGAG-A-----A------AAA--A-G-------AAG-GTTCCCGGAGAAGGGTATCCG-TT---AGA--A-AG--T--A--T-G--GA-A-G--TAG--AC-G---------ATG-T-G---------------------TTTG-A-TAT-TAGTGG-A-C-T--ATG------G-GA-C-gtatcagagcgaccccaaatagtcatgcacgtgcaaagcaaaactttggctcttcatttcccgctcagaagagaaaaaagaaggttcccggagaagggtatccgttagaaagtatggaagtagacgatgtgtttgatattagtggactatgggac
gi|18 : agtagttacacagtaggtttaattggttatgtacagaaggacgaaggcggggcaaaaatgtcacgaggatgcgcagcgtccgATACCATGCTATCTTAAGCTCATTATTCAGAGGCCGCT------CCAA-----GCACGAGGCCTCAAACGCACGAACCGCACGCCTCTCACCATTGATTGCT---TCCGTAGA-ACGCT-GCTTACTTATAT---GCCAATGATGT------GTCT--A-GC-T--CAT----G-GCTT-TTAT-AAA--G-ACT-TGC-GC-C-ACGCCCTAATAGC-G--ATCG-GTTGAT-TATGT-AC-A-GA----TA---C-CCA
gi|19 : agg---GC-GTC-C-GATCGAGTGACATTTTT-G--C--CAC-GCC--T--T---CG--T-C--CT-TC-T----------------------------A--ACT---AAA-----CCTATT-G-TG---TATAA-G---------T--CA-C--AT---G-T-AT-CA-G------A--GCA---------A--TACCA-A-A----T-T--ATATCA---T-G-------------------C--G--TG----T-GC-AA---A----TCT-----TC-ATTTCTC-GCT-T-AGAAGAG-A-----A------TAA--A-G-------AAG-GT-----------------TG-CT---AAA--A-AAAATA-A--T-G--AA-A-G--TAG--AC-GA-C--G-C-ATG-T-G-G-G------AG--TA---TTTT
gi|2 : GTTACA-CAATAGGTTTAATTG----GTT-ATGTA-CAGAAG-GACGA-AGGCCGGGC------AA-AAAT-GT-CA--CG-AGG---GCG-C-T---GC-----C-GA----GTGACATTTTA-A--C--C-C-GCC--T--T---CG--T-C--CT--C-TTT----A-C-TT-----A---A----CCA--ATT---AAA-----CCTATT-G-TG---TA--A-G---------T--CA-C--AT---G-T-ATGCA-G------A--GCA---------A--CCC-A-A-A----T-T--AC----------------------------------------------------------T-----TC-ATT-CTC-GCT-T-GGAATAG-A-----A------TAC--G-G-------AAG-GT-----------------CG-CT---GAA--A-AA--TA-T--T-G--GA-A----TAG--AC-GA-C--G-C-ATG-T-G-G-G------G---TA---TTTTTG-A-TGT-GGGTGA-A-C-T--ATC------G-GA-C-A-AT--------------------GAT---G-AAC-----C---AGCTAAC--G-GGC-A-A-ATAGGC-AAA------CCCT-A--GTG-AA---A---TGAAAAT-CC--GA-AACG----TG--AAGA-TT-G-CG-AA---T-----GT--A-AA----AAAC-A----CG----------------------G-T-G-A-AGTA-TA----T----T--T---CAA---ATT-T---TGAAGGA--T-G-T-C-----AG-TGG--TTAAAG-CA------G-A---G--------A-------TTT-T--TT-TCC---GT-GTTC-------T-A--T-------AA---------------G---AC----TG--------T----GAAA-A------TTCAA--T---------TTTG----TT-T----GCTG---A---AAT--G--AGAGCCCGAG--AGGA---TAAACA-A---CACTGTTCAT-----TG-ATTA----TTTATTTTTTTTCGTTTTCATTCCGTTGAGAATACATAC-ATG-TATTTCA---TCAT-ATTGAGAGGCCGCT------CCAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGTTCGTAGA-ATGCT-G-TTACTTATAT---GCAAATGATGT------G--T--A-TG-T--CAT------G-TT-TTATGAAA--GCACT-TGC-GC-C-ACGCCT--ATAGG-GT-A-CG-G-TGGT-TATGT-AC-A-GA----TA---C-CCACAG------------CCTA--AC-AACAAA-A-GAAA--TT-CACTG-CTG-CT-A-TGA-TACAT
gi|20 : agta--CCCCA-A-A----T-T--AA--CA---T-G-------------------C--A--CT----T-A--GA---A----CTT-----TC-ATTTCTC-GCT-T-GGAATAG-A-----A------TAC--G-G-------AAG-GT-----------------CG-CT---GAA--A-AA--TA-T--T-G--CA-A-G--TAG--AC-GA-C--G-C-ATG-T-G-G-G------GG--TA---TTTTTG-A-TAT-GGGTGA-A-C-T--ATC------G-GA-C-A-AT--------------------GAT---G-AAC-----C---AGCTAAC--G-GGC-A-A-AAAGGCAAAa
gi|21 : GTTACA-CAATAGGTTTAATTG----GTT-ATGTA-CAGAAG-GACGA-AGGCGGGGC------AA-AAAT-GT-CA--CG-AGGAC-GCG-C-A---GC-GTC-C-TA----GTGACATTTTA-A--C--C-C-GCT--T--T---CG--T-C--CT-TC-TTTGTAAA-C-AT-----A---A----CCA--ATT---AAA-----CCTCTT-G-TG---TA--A-G---------T--CA-C--AT---G-T-AT-CA-G------A--GCccacaaataccctgaagtcctcacattga
gi|22 : atcTGTCAGTAGACACGCTCG-TTACTAAAATCACGCAAAATATGTATGCTAGT-TTCA-TGCT--CATATAGG-G-TTATTATGAAA--GCACT-TGCTGCGT-TCACCT--A-AGGTGT-ATCGAG-TGGTGTA-GT-ACAA-GA----TA---TACCTCAG------------CCTACTAGTAACACA-ATGAGA--AT-CA
gi|23 : ATGT------GT-T--AATG-TTCCAT----GCG-TT-TTATGAAAAAGCACTATGC-GC-C-ACGCCT--ATTAG-GTAATCG-G-TGGT-TAT-T-AC-A-AAGAATTACCCC-CCACAGCACAGCCTGAAACCTA--AGAAACAAA-A-AAAAAGTTACACCG-CTG-CT-ATTGATTACAT
gi|24 : G--T-C--CT-TC-TTT----A-C-AT-----A---A----CCA--ATT---AA--------------------------G---------T--CA-C--AT---G-T-AT-CA-G------A--GCA---------A--CCTCA-A-A----T-C--AT--CA---T-A-------------------C--A--TT----T-A--GG---A----CTT-----TC-ATGTCTC-GCT-T-GGAATAG-A-----G------TAT--T-G-------AAG-GT-----------------CG-CA---GAA--A-AA--TA-A--T-T--GA-A-G--TAG--AC-GA-C--G-C-ATG-T-G-G-G------GG--TA---TTTtgg
gi|25 : gGTTACA-TAATAGGTTTAATTG----GTT-AGGTA-CAGAAG-GACGA-AGGCGGGGC------AATAA-T-TG-CAT-TG-AGGAA-GCG-T-A---GC-GTT-G-GT----GTGACATTTTA-A--C--C-C-ACC--T--T---CG--C-T--GT-TC-TTT----A-C-AT-----A---T----TCA--ATT---AAA-----CC
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