lowQualScore : 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 33333333 11 3333333 22222222222222 22222222222222 11111111 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 3333333 1 2222 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1 444444444
lowQualScore : 44 8 3 66666666 3 22 0000000 55555555555555 22 88 0 4 77777777777777 4 0 55 11111111 2 6 666666 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 9 3 7777777 555 6 55 3 5 2222 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 9 8 444444444 4
lowQualScore : .. . . ........ . .. ....... .............. .. .. . . .............. . . .. ........ . . ...... ........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ . . ....... ... . .. . . .... ......................................................................................................................... . . ......... .
lowQualScore : 00 3 3 88888888 1 88 0000000 22222222222222 99 77 5 2 66666666666666 2 9 33 33333333 2 3 111111 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 2 3 4444444 888 7 88 3 0 1111 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 3 0 222222222 0
consensus : CGGGGCGCC-GAATGG-GAC--TC----TGA-T-CTTTTG-CTAAT-CAAAA-T-C------AA--TT--T--GTGT-ACACAA-AA-A---G--AA-TTCCG--T-----CANA-AC-A------A------AA-TT--C-----------ATT----TCTTG-N--C--A-CA----AA-A---AGT--A-TG-TTG-CTT-CA-T--A-AT-AA-N--TTNAT-TTTTTG-TA-TT---GATAAG--------T-T---GT---AC-A-A----AA--TT----ANAT--T-T-T-C---G-GT--T---G-A---C-A--CAAAAT-----T---GAAT-TTT---G--T-------NGA-C---CTG--A---AAGTCA----------AC-TTTTGT-CA--CG--ACA-AA-A--TT-C--A--TTTT------TGT-------A---A---A----AA----TC-A--A-TT----TTG----TCA--------AT-G----ACA-AA-A------TTGG--TA----A-TT---TG---T--CA-------AT-T-A----T--GTA-T--GCAA-A---T-A---TT----TTG--AT--CT-CATTTG--C-ATA-C-AAAAT--A----------G-ACTTTTGTTA---------NCT-T-G-TTTGC--AT---T----A-AA-T-------------A-----AN--AAA-AGT-NA--ATTTTG---T-N-A-GA-CA-AA---AT------TGAATT--A--T--T---TGT-CA--GA--CA------A----A---A----A--------GT---T--CG-A-TC--------TG---T-T--A--CG-C---A---A---AA-T-TG--AAT-T------TT---T---C---G--T--G--AC-A-AA---AT------TAAT-T---TT----TG----T-----T-A-G--GT-G-A---------T-C-------A-A----------A---A---AT----TT----TTGT--C--TA--TG-AC-CAA-A--TA-G--T-------C-------G-A---AT---TT-T-G------T----CA----T--G-A----CA-A--A--AA---T--TG-A---------ATT-T--TG-T-CT--A-T--A--C------A-A--AA--------T--G-A---C--T---T---T-------TGT-----C-A----T-G-----A-C-AA--------A----A-TT-----------NAAT-T---T---T-----------------T-----T-TGT---------CAT--G-----------A----CA---AA---A------AT----TG---------A-----A---------A-------T--T----------TT--G----T-----------C-A-TG-A--------A----------C-----AA----AA--------T--G-----A-A---TTT-T---G----T--C-A--T-G----A-CA--------AAA-N-------T-G--A--A---------T-T-T--G---T---C---CG---AC--A-------A-----AA-----T-T-C-G---A----T----T------T----GT-T----CG-T----T---------CA--------G----------C-A-----C--A-A------A---------A---GTN-G----A---AT-T--T-T--G-----------T---T-T-G-----T----CA-----C-A--AA-T--N-G--A-AT---T----TTG-TC---A--A-------G-ACGAAAA---C--A--------TG-A--T---TT-TG--T--C----CA----C---C--A-AA-----ATTC---G-ATTTTTG-TCTT-CACAC-A--AAA--T-GAA-TT---T----A--C----GATCA---AC---AAAA-TG--AAG---T-------TGTTG----T--C--CA-NN-----AAA-TT--A---T-TTT--GTC----TA--C-CTA-----A-ATATAATCTCTTTA-TGC--AACTTTTTTTTCCCG-C-A---TTGT-CCCA----ATT-TAAGTTT-AAATTAT-CAT-TAGTA-AA---AA-CA-TTT-TGTCCGACAA----AATTC--T------A--ATTAC--ATG--A---CG---N-----T------TTTC--CATTTTGGT--ATGCA-AA--TTAG-TTTACAAAAATCC-AAATT---CAACT-ANTT-C-T-C---ATACAAAATCC-ACTTATGT--TTACAA-AAGTTAATT
Reference ( gi|1 ) : CGGGGCGCC-GATTGG-GAC--T-----TGA-T-CTTTTG-CTAAT-CAAAA-C-C------AA--TT--T--GTGT-ACACTA-AA-A---G--AA-TTCCG--T-----CATA-AC-A------A------G--TT--C-----------ATT----TCTTG-A--C--A-CA----AA-A---AGT--A-TG-TTG-CTT-CA-T--A-AT-AA-C--TTCAT-TTTTTG-TA-TT---GATAAG--------T-T---GT---AC-A-A----AA--TT----AGAT--T-T-T-C---A-GT--T---G-A---C-A--CAAAAT-----T---GAAT-ATT---G--T-------AGAAC---CTG--A---AACTTA----------AC-TTTTGT-CA--CG--ACA-AA-A--TT-C--A--TTTT------TGT-------A---A---A--T-AA----TC-A--A-TT-A--TTG----TCA--------AT-G----ACA-AA-A------TTGG--TA----A-TT---TG---T--CA-------AT-T-A----T--GTAGT--GCAA-A---T-A---TT----TTG--AT--CT-CATTTG--C-ATA-C-AAAAT--A----------A-ACTTTTGTTA---------TCT-T-G-TTTGC--AT---T----A-AA-T-------------A-----AG--AAA-AGT-AA--ATTTTG---T-G-A-GA-CA-AA---AT------TGAATT-CA--T--T---TGT-CA--GA--CA------A----A---A----A--------GT---T--TGCA-TC--------TG---T-T--A--TG-T---A---A---AA-T-TG--AAT-T------TT---T---C---A--T--G--AC-A-AA---GT-----GTAAT-TC--TT----TG----T-----T-A-G--GT-G-A---------T-C-------A-A----------A---G---GT----TC----TTGT--CC-TA--TG-AC-CAA-A--TA-G--T-------C-------G-A---AT---TT-T-G------T----CA----T--G-A----TA-A--A--AG--GT--TG-A---------ATT-T--CG-T-TT--A-T--A--C------A-A--AA--------T--G-AT--C--T---T---C-------TGT-----C-A----T-G-----A-C-AA--------A----A-CT-----------GAAT-T---T---T-----------------T-----T-TGT---------CAT--G-----------A----CA---AA---A------AT----TG---------A-----A-----G---A-------T--T----------TT--G----T-----------C-A-TG-A--------A----------C-----AA----AA--------T--G-----A-A---TGT-T---G----T--C-A--T-G----A-CA--------GAA-G-------T-G--A--A---------T-T-T--G---T---C---CA---AC--A-------A-----AA-----T-T-C-G---A----T----T------T----GT-T----CG-T----T---------CA----A---G----------C-A-----C--A-A------A---------A---GTG-G----A---AT-T--T-T--G-----------T---TCT-G-----T----CA-----C-A--AA-T--G-G--A-AT---T----TTG-TC---A--A----G--G-ACGAGAA---C--A---G----TG-A--T---TT-TA--T--C----CA----C---C--A-AA-----ATTTC--G-ATTTTTG-TCTT-CACAC-C--AAG--T-GAA-TT---T----A--C----GATCA---AC---AAAA-TG--AGG---T-------TGTTG----T--C--CA-GT-----AAA-TT--A---T-TTT--GTC----T---C-CTA-----ACATATAATTTCTTAT-TGC--A-CTTTTTTTTCCCG-C-A---TTGTGCCCATTCCATTCTAAGTTT-AAATTAT-CATCTAGT--AA---AA-CA-TTT-TGTCCACCAA----AATTC--TT-----A--ATTAC--ATG--A---TG---G-----T------TTTC--AATTTGGGT--ATGC--AA--TTA--TTTACATAAAT-C-AAATT-AACACCT-ATTTTCATAT---ATACAAATTCC-A-TAATGT--TTACAA-AAGTTAATT
gi|13 : CGGGGCGCC-GATTGG-GAC--T-----TGA-TCCTTTTG-C-AAT-CAAAA-C-C------AAT-TT--T--GTGT-ACACAA-AATA---G--AA-TTCCG--T-----CATA-ACAA------A------A--TT--C-----------AAT----T-TTG-T--C--A-CAC---AA-A---AGT--G-TG-CTG-CTT-CG-T--A-AT-AA-C--TTCAT-
gi|14 : taCGGGGCGCC-GATTGG--AC--T-----TGA-T-CTTTTG--TAAT-CCAAA----------AT--TT--T--GT-T-ACAC-A-AA-ATACG--AA-TTTCGG-T-----CATA-AA-A------A------AA-TT--C------------TT----TTTTG-T--C--A-CACCATAG-A---AGT--AATGATTGACTT-CA-T--A-AT-AA-A--T-CAT-TTTT-G-TAATT---GA-AAA--------TAT---AT---AC-A-A----A---TT----A-----T-T-T-C------T--T--------------CAGAGC-----T---AAAT---------------------------TG--A---A----------------T-TTCTGT-AA--CG--ACAAAA-A--TC-C--A---TTT------TGT-------A---A-----------------------------TGC---TCA--------TT-G----ACA-AA-A------TTCA--T-----T-TT---TG---T--CA-------ATCT-A----T--GTA-T--GTCA-A---T-A---------TCA--AT--CT-C-TTTG--CAATA-C-AAAAT--AG---------G-ACTGTTTTTA---------TC--T-A-ATTGC--AT---T----A-TA---------------A-----AC--AAACAGTAAA--ATTTTannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataacttcatatttgtattgataagttatacaaaattatttttcattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtatgcaaatatcaatctcatttgcatacaaaatagacttttgttatctagtttgcattaaat
gi|21 : CGGGGCGCC-AAATGG-GAC--CTTG--TGA----TTTTG-TT-CT-CAAAA-T-T------CATTTT--T--GTGT-GGACAA-AA-AT--G--AA-TTTTG--TAGAAACAAA-AT-G------A------G--TT--CAGGTCAACAAAATTGA--TCATG-AATC--A-CA----AA-A---A-TCAA-TG-TTG-TCG-CA-C--A-A--AA-----TTAT-CTTT
gi|32 : gctgCGGGGAGCC-AAATGG-GACTAT-----TGT-T-ATTTTG-TT-CT-CAAAA-T-TCAGATGAA--TT--T---TGT-ACAACAGAA-A---G--GC-TTTC
gi|33 : atctCGGGGAGCC-AAATGG-GACTAT-----TGT-T-ATTTTG-GTTCT-CAA------------AA--TT--C--ATGT---------------G--AA-TTTTG--T------ATA-AC-A------t
gi|10 : atctgaaagcctttcGGGGCGCC-AAATGG-GAC--TCTTG-TGA-T---TTTG-TTC-T-CAAAA-T-T------CA--TT--TTTGTGT-GGACAA-AA-AT--G--AA-TTTTG--T------AGA-AC-A------AAAATGAG--TT--C-----------AGG----TC----A-----A-CA----AA-A---TTG--A-TC-ATG-AAT-CA-C--A-A--AA-A--TTAAT-TTT-----------------G--------T-C---GC---AC-A-A----AA--TT----AT-C--T-T-T-C---A-GC--------A---G-A--CAAAAT-----T---CA------------------------------------------------------C-TTTTGT-CA--TG--ACA-AATA--TT-C--A--CTTT------TGT-------ATACA---A--A-AG----TC-A--A-TT----TTG----TC----------TGG----AAA-AG-A------TTAA--T-------TT---TG---T---A-------AC-T---------------------A---T-A---TT----TGG--AT-------TTTG--T-ATG-C-AAATT--AGTTGAATTG-G-ATTTTTGTGA---------ACT-A-A-TTTGC--ATAC-C----A-AA---------------A-----TG--AAA-A---AA--ATT---------------CA-TA---AT------TGAAT------T--T---TGT-TG--GA--CA------A----A---A----T--------GT---T--TTTA-CTAA------TGA--T-A--A--TT-T---A---A---AACT-TA--AAT-T------
gi|2 : tctaaattttctctacctaaatataatttctttatgccaacctttttccgcgattgcccGGGCGTC-GAATGGCGAC--T------GACT-TTTTTG--TAAT-CAAAA-C-C------CA--TT--T--GTGT-ACACAA-AT-T---G--AAGTTCCG--T-----CACA-AC-A------A------AA-TT--C-----------ATT----TT-------------------------ATT--A-TG-TTG-CTTTCA-T--ATAT-AAGC--TTCAT-TTTT-G-TA-TT---GATTAG--------T-T---AT---AC-A-A----AA--TT----AT-T--T-T-T-C---GCGT--G---G-A---C-A----AAAT-----T---AAAT-TTT---G--T-------A--AC-----G--A---AAATCA-------------TTTTGT-CA--CG--ACA-GA-AAGTC-C--A--TTTT----------------A---A---AGGT-TA----CC-A--A-TT----TAG----T----------AT-T----CCA-A---------TC------------TT---TG---T--CA-------AT-A-T----T--GTA-T--GCAA-A---T-A---TC------A--AT--CTTCATT-G--T-ATA-C-AAAAT--A----------AGACTTTGTTTA---------TCT-TAG-TTTGC--AT---T----A-AA-T-------------A-----AAC-AAA-AGT-AA--TTATTA---T-T---GA-CA-AA---GT------TGA-----A--T--T---TGT-CA--TA--C-------A----A---A----A--------GC---T--GGAC-TT--------TG---T-T--A---A-C---A---A---AA-C-TG--AAT-T------TGA--T---C---A--------AC-A-AATTCAT-----TNNNN-NN--NN----NN----N-----N-N-N--NN-N-N---------N-N-------N-N----------N---N---NN----NN----NNNN--NN-NN--NN-NN-NNN-N--NN-N--N-------N-------N-N---NN---NN-N-N------N----NN----N--N-N----NN-N--N--NN--NN--NN-N---------NNN-N--NN-N-NN--G-T--T--C------A-ACCAA--------T--C-AT-----T---T---T-------TGT-----C-T----T-C-----A-T-AA-------------------------------T-T---T---T-------------------------TGT---------CA---------------A----CA---AA---A------AT----TC---------A---------------T-------T--T----------TT--G----T-----------C-T-C-----------A----------C-----AA----AAG-------T--G-----A-A---TTT-T---G----T--A-A--T-G----A-CA--------AAA-G-------T-G--A--A---------T-T-T--A---G---T---CA---AC--A-------A-----AA-----
gi|6 : GGGCGCC-AATTGG-GAC--T-----TGA-T-CTTTTT-GTAAT-CGAAA-T-C------AAT-TT--T--GTGT-ACATAA-AA-A---GTAAA-ATCTG--T-----CACA-AC-A------A------A--AT--A-----------ATT----T-TTG-T--CTAA-CA----AATAT--ATT--A-TACTTG-TTT-T-------AT-AA-C--TTCAT-TTTTTG-TA-AT---G------------------------AC-A-A----AA--CC----AAAT--T-T-T-------GC--T-----A---C-A--CAAAAT-----T-----AT-ATT---T--C-------A------------A---AAGTCA-------------TTTTG--------------------------A--TCTT------TAC-------A---A--------AA----TC-A--A-TT-T--TTG----TCA--------AT-A----A---------------GG--TA-----------TG------CA-------AA-T-A----C--AT-GT--ATAA-A------------------------CT-TATCTG--T-ATC-C-AAAAT--T----------G-ACTTTTGTTA---------CCT-A-A-TTTGCAAAT---T----A-AA-T--------------------C--ACA-AGT-TA--ATTTGG---T-G-A-GA-CA-AA---AA------TAAAT------G--T---TGT-CAT-GA--CA------A----A---A----GTGACCTTCGT---C--CGC--TCGATAATAATT---T-T--A--TG-TAACA---A---AA-T-TT--ACT-T------TT-----------G--T--G--AT-A-TG---TT-----GTAA--AA--TT----TG----T-----T-A-AT-CT-G-AAC-------T-C-------A---------------------T----TT----TTGT---------TG-AA-CAA-A--C-----T-------C---------A---CC---TT-T-G------T----CA----A--C-G----CG-A--A--A----T--TG-G---------ATT-T--CA-------AGT--A--C------A-A--AA--------T--aatgaagattttgttagacaaaatttcatttttgatc
gi|9 : GGGCGCCCAAATGG-GAC--TCTTG-TGA-T----TTG-CTTCT-CAAAA-T-T------CA--TTTTT--GTGT-GGACAA-AA-AT--G--AA-TTTTG--T------AGA-AC-AAAAATGA------G--TT--C-----------AGG----TC----A-----A-CA----AA-A---TTG--A-TC-ATG-AAT-CA-C--A-A--AA-A--TTAAT-TTT-----------------G--------T-C---GC---AC-A-A----AA--TT----AT-C--T-T-T-C---A-GC--------A---G-A--CAAAAT-----T---CA------------------------------------------------------C-TTTTGT-CA--TG--ACA-AATA--TT-C--A--CTTT------TGT-------ATACA---A--A-AG----TC-A--A-TT----TTG----TC----------TGG----ACA-GA-A------T-----TA----A-CT---T----T---------------------T--GTA------AC-A---T-A---TT----TGG--AT-------TTTG--T-ATG-C-AAATT--AGTTGAATTTGG-ATTTTTGTGA---------AAC-T-A-ATTGC--ATAC-C----A-AA---------------A-----TG--AAA-A---AA--ATT---------------CA-TA---AT------TGAAT------T--T---TGT-TG--GA--CA------A----A---cacaagaacctcactagtgtcc
gi|11 : acaaaaaattaattttgtccacaaaattaatttttcgtctacctaaatataatttcttttatgcaaccttttttccgcattgcccaatttaagttttaaattatcattgtaaaaacaGGCGCC-AAATGG-GAC--TCTTG-TGA-T-TTTGAG-TT-CT-CAAAA-T-T------CA--TT--TTAGTGT-GGACAA-AA-AT--G--AA-TTTTG--T------AGA-ACAA------A------A--AT--G-----------AAT----TCAGG-T--C--A-GC----AA-A---ATTG-A-TC-ATG-AAT-CA-C--A-A--AA-A--TTTA--TTTTTG-----------------------------GC---AC-A-A----AA--TT----AT-C--T-T-T-C---A-GC--------A---G-A--CAAAAT-----T---CA------------------------------------------------------C-TTTTGT-CA--TG--ACA-AA-A--TT-C--A--CTTT------TGT-------A---G---A--C-AAAAG-TC-A--A-TT----TTG----TC----------TGG----ACA-GA-AATAACTTTTG--TAACATA-TT---TG-------G-------AT-T-T----T--GTA-T--GCAA-A---T-T---AG----TTG--A-------ATTTG--G-AT--------------------------TTTTGTAA---------ACT-A-A-TTTGC--ATAC-C----AGAA-T-------------G-----AA--AAA-----AA--AT----------------CA-TA---AT------TGAATT--G--T--T---TG------GA--CA------A----A---A----T--------GT---T--TTTA--C--------GA---T-A--A--TT-T---A---A---AC-T-TA--AAT-T------g
gi|16 : aaattaattttttgtctacctaaatataatttctttatgcaacttttttccgcgttgcccGGCGCC-AAATGG--AC--TCCTTGTGA-T--TTTTGTCT--TGCAAAA-T-T------CA--TT--TTTGTGT-CGACAA-AA-AT--G--AA-TTTTG--T------AGA-AC-A------A------AAATT--G-----------AGT----TCAGG-T--C--AACA----AA-ATTGATC--A-TG---G-AAT-CA-C--A-AA-AA-T--TTAAT-TTCT----------------G--------T-C---GC---AC-A-A----AA--T-------AT--C-T-TAC---A-GC--------A---G-A--CAAAAT-----T---CACT-ATT---G--T-------AGAAC--------A---AAGTCA----------A--TTTTGT-CT--GG--ACA-GA-A--TT-A--A---CTT------TGT-------A---AC--A--T-AT----TG-G--A-TT----TTG----T----------AT-T----GC--AT-A------TTAG-----------T---TG-------A-------AT-T------------------GG-A---T-T---TT----TTA--AA--CT-AATTTG--C-ATACC-AAAAT--G----------A-A
gi|15 : GCC-GATTGG-GAC--T-----TGA-T-CTTTTT-GTAAT-CAAAA-C-C------AAT-TT--T--GTGT-ACACAA-AT-A---G--AA-TTCCG--T-----CGTA-ACAA------A------A--TT--C-----------ATT----T-TTG-T--C--A-CAC---AA-A---AGT--A-TG-TTG-CTT-CA-T--A-AT-AA-C--TTCA--TTTTTG-TA-TT---GATAAG--------T-T---AT---AC-A-A----AA--TT----AT-T--T-T-T-C---A-GT--T---G-------A--CAAAAT-----T---CAAT------------------------------------------------------TTT-GT-CA--CA--ACA-AA-A--TC-C--A--TT-T------TGT-------A---G---A--T-AAAC--TC-A--A-TT----TTG----TC---------AT-G----ACA-AA-A------TT----CA----ATTT---TG---T--CA-------AT-T-A----T--GTA-T--GCAA-A---T-A---------TCA--AT--CT-CATTTG--C-ATA-C-AAAAT--A----------G-ACTTTTGTTA---------TCT-A-G-TTTGC--AT---T----A-AA-tagtc
gi|3 : t-T-CTTTTG--TGA--CAAAA-TTC------AC--TT--T--GTGA-AGACCA-AA-AAT-G--AA-ATTTG--T-----CATG-AC-A------A------G--TTAAA-----------ATT----T-TTA-A--C--A-AA----A
gi|17 : ctagataacagatgtaataaaaaacagtgaaTTTTG-TGAAT-CAAAA-C--------AA--TT--T--GTGT-ACACAA-AATA---G--AAATTCCG--T-----CATA-AC-A------A------AA-TT--C-----------ATT----T-TTG-T--C--A-AAC---AA-A---AGT--A-TG-TTG-CTT-CC-C--A-AT-AA-C--TT-AT-TTT-TG-TA-TT---GATAAG--------T-T---GT---AC-A-A----AA--TT----AT-T--T-T-T-C---A-GT--T---G-------A--CAAAAT-----C---CATT-TTT---G--T-------AGA------T---A---AACTTA----------AA-TTTTGT-CA--TGAAACA-AA-A--TT-C--A--TTT-------------------------------G----TC-A--A-TT-A---TG----T----------AT-G-----CA-AATA------TCGATCTC----A-TT---TG------------------C-A----T--ACA------AA-A---T-AGACTT----TTGTTAT--CT-AGTTTG--C-ATA-gtacaaaaatgaaattttgttgacaaaattcacttttgtcatacttttaatataaatctcttcaagcaactatttttccaaattgcctaattgaagtttaaaattatcattagtaaaaacagttgtccgacaaaatttaatttatgaaattacagaacttgaatttcttcatttggtaaatgcaaatttagtttacaaaaatctaaattcacatttgctacaaaatccacttatgttacaaaattaattctgtcaaagacaaaattgactgttgtctacaaaaaagtgaattttgtcatgacaaagtgatatttttgtaagacaaattaatttttgtaaattcatgacgattttggttgttacctgaactcatttttgttgtacaaaattcatttttgttcacagcaaaaatgaatttttgagaacaaaatcacaaagagtccatttggcgcccc
gi|9 : TTTG-C--ATACAAAA-T-CCA----AA--TA--T--GT-T-ACA----AA-A---GTTAA-TTCTG--T-----CCAG-AC-A------A------AA-TT--G-----------ACT----T-TTGTA--T--A-CA----AA-AGTGAAT--A-T--TTG---T-CA-T--G-AC-AA-AAGTGAAT-TTTGTC-TG-CT---GA-AAGATAATT--T-T---GTGCGAC-A-A----AA--TT----A-AT--T-T-T-T---G-----T---G-A---T-T--CATGAT-----C----AAT-TTT---G--T-------TGA-C---CTG--A---A-CTCA-----------T-TTTTGT-T---CT--ACA-AA-A--TT-C--A--TTTT------TGTCCACAC-A---A---A----AA----TG-A--A-TT----TTG----a
gi|11 : acaaaaaattaattttgtccacaaaattaatttttcgtctacctaaatataatttcttttatgcaaccttttttccgcattgcccaatttaagttttaaattatcattgtaaaaacatttgtccaacaaaattcaattatgaatttttttcattttggtatgcaattagtttcacaaaaatccaaattcaactaaTTTG-C--ATACAAAA-T-CCA----AA--TA--T--GT-T-ACA----AA-A---GTTAT-TTCTG--T-----CCAG-AC-A------A------AA-TT--G-----------ACT----T-TTG-T--CT-A-CA----AA-A----GTGAA-TT-TTG---T-CA-T--G-AC-AA-AAGTGAAT-TTTGTC-TG-CT---GA-AAGATAATT--T-T---GT---GCCA-A----AA--AT----AAAT--T-T-T-T---G-----T---G-A---T-T--CATGAT-----C----AAT-TTT---G--C-------TGA-C---CTG--A---A--TTC----------AT-TTTTGT-T---CT--ACA-AA-A--TT-C--A--TTTT------TGT-------agaagcaaatcacaagagtcccatttgggcgcccg
gi|3 : aaattaattttttgtctacctaaatataatttctttatgcaacttttttccgcgttgcccaatttaagtttaaattatcgtaaaaacattttgtccaaacaattcaattatgattttttttcattctggtatgcaaattagtttacaaaaatccaaattcaactaaTTTG-CTA---CAAAA-T-C------CA--CT--T--ATGTTACA--A-AA-T---T--AA-TTCTG--T-----CAAAGAC-A------A------AA-TT--G-----------ACTGTTGTCT---A--C--A--A----AA-A---AGTGAA-TT-TTG---T-CA-T--G-AC-AA-A--GTGATATTTTTG-TA----------AG-------------------AC-A-A----A---TT----A-AT--T-T-T-TGTAA-AT--T---C-A---TGA--CGATTT-----T---GGTT-GTT-----------------AC---CTG--A---A-CTCA-----------T-TTTTGT-TG--T---ACA-AA-A--TT-C--A--TTTT------TGTTCACAGCA---A---A----AA----TG-A--A-TT-T--TTG---------------AG-A----ACA-AA-A------Tccacactaaaatgaattttgagaactcaaaatcacaagagtcccatttggcgcc
gi|16 : ctagataacagatgtaataaaaaacagtgaattttgttaaaaattttaacttgtcatgacaaatttcatttttggtcttcacaaagtgaattttgtcacaaaagagtacaaaaatgaaattttgttgacaaaattcacttttgtcatacttttaatataaatctcttcaagcaactatttttccaaattgcctaattgaagtttaaaattatcattagtaaaaacagttgtccgacaaaatttaatttatgaaattacagaacttgaatttcttcatttggtaaatgcaaatttagtttacaaaaatctaaattcacaTG-C-AATACAAAATC-C------AA--TA--T--GT-T-ACA-----A-A---GTTAA-TTCTG--T-----CCAG-AC-A------A------A------------------ATT--------G-A--C-------------------T--T-TG-TT--CTA-CAAT--A-GTGAA-T--TTTGT-CTGCTG-TA-A----GATATT--------T-T---GTGCGAC-AGA----AA--TT----AAAT--T-T-T-T---G-----T---G-ATTCC-A--TGA--------T---CAAT-TTT---G--T-------TGA-C---CTG--A---A-CTCA----------AT-TTTTGT-T---CT--ACA-AA-A--TT-C--A--TTTT------TGTCGACAC-A---A---A----AA----TG-A--A-TT----TTG-----CA--------A--G----ACA-AA-A------cacaaagagtccatttggcgcccc
gi|13 : ttcattttggtatgcaaattagtttaaaaaatccaattcaactaataTAA--CAAAA-TTC------AA--TT--T---TGTCACAC-A-AA-A---G--TG-TGCTGCTT-----CGTA-AT-A------A------C--TT--C-----------ATA----NNNNN-N--N--N-NN----NN-N---NNN--N-NN-NNN-NNN---------AT-AA-C--TTCAT-ATTT-G-TA-TT---GATAAG--------T-T---AT---AC-A-A----AA--TT----AT-T--T-T-T-C---A-TT--N---N-N---N-N--NNNNNN-----N---NNNN-NNN---N--N-------NNNNN---NNN--N---NNNNNN----------NN-NNNNNN-NN--NN--NNN-NN-N--NN-N--N--NNNN------NNN-------N---N---N--N-NN----NN-N--N-NN-N--NNN----NNN--------NN-N----NNN-NN-N------NNNN--NN----A-T------------------------T-A----T--GTA-T--GCAA-A---T-A---------TCA--AT--CT-CATTTG--C-ATA-C-AAAAT--A----------G-ACTTTTGTTA---------TCT-A-G-TTTGC--AT---T----A-AA-T-------------atcacaaggagtccatttggcgcctagtc
gi|10 : tacggggcgccgattgggacttgatccttttgcaatcaaaaccaattttgtgtacacaaaatagaattccgtca-A------A------A--TT--G-----------ACT----T-TTGTA--T--A-CA----AA-AGTGAAT--A-T--TTG---T-CA-T--G-AC-AA-AAGTGAAT-TTTGTC-TG-CT---GA-AAGATAATT--T-T---GTGCGAC-A-A----AA--TT----A-AT--T-T-T-T---G-----T---G-A---T-T--CATGAT-----C----AAT-TTT---G--T-------TGA-C---CTG--A---A-CTCA-----------T-TTTTGT-T---CT--ACA-AA-A--TT-C--A--TTTT------TGTCCACAC-A---A---A----AA----TG-A--A-TT----TTG---------------AG-A----ACA-AA-A------T
gi|31 : tctaaattttctctacctaaatataatttctttatgccaacctttttccgcgattgcccaatttaagttttaaattatcattagtaaaaacattttgtccaacaaaattcaattatgaatttttttcattttggtatgcaaattagttcacaaaaatccaattcaactaatttgcatacaaaatccaaatatagttacaaaattaatcttttccagaca---AGT--A-TG-TTG-CTT-CA-TACA-AT-AA-T--TTCA--TTTTTA-TA-TT---G------------------------AC-A-A----AATCTT-------T--T-T-T-C---A-GT--G---G-A---C------AAAG-----T---GAAT-TTT---G--TC------ATGAC-----G--A---AAGTTA----------Acacaagagtcccatttggcgcccc
gi|3 : tt--A-TT-TTG--TT-CT-C--A-A--AA-A--TTCAT-TTTTGC-TG-TG---AACAAAAATGAATTT-T---GT---AC-A-ACAAAAA--TG----AG------T-T-C---A-GG--T---A-A---C-AACCAAAATCGTCAT---GAAT--TT---A--C-------AAAAA---TTA--ATTTGTCTTACAAAAATATCAC-TTT-GT-CA--TG--ACA-AA-A--TT-C--ACTTTTT------TGT-------A---G---A--C-AACAG-TC-A--A-TT----TTG----TCT--------TT-G----ACA-GA-A------TTAA--T-------TT---TG---TAACATAAGTGGAT-T-T----T--GTAG----CAA-A---T-G---T-------G--A-------ATTT------------------A----------G-ATTTTTGTAA---------ACT-A-AATTTGC--AT---TTACCA-AA-TG------------A-----AG--AAA-TTC-AA--GTTCTG---T-A-A-TTTCATAA---AT------TAAATT--------T---TGT-CG--GA--C-------A----A---C----T--------GT---T--TTTA-CTAA------TG---A-T--AATTT-T---A---A---AC-T-TC--AAT-TAGGCAATT---T---G---------G--AA-A-AA-----------TAGT-TG--CT----TG------------A-A--GA-G-A---------T-TTATATT-A-A----------A---A---GT--------------------A--TG-AC--AA-A---A-G--T---------------G-A---AT---TT-T-G------T----CA---------A----CA-A--A--A----T--TT-C---------ATT-------T-TT--G-T--A--C---------------------------T--C--T---T---T-------TG-------------T-G-----A-C-AA--------A----A-TT-----------CA-----------C-----------------T-----T-TGT---------GAA--G-----------A----CC---AA---A------AA----TG---------A-----A-----A--------------T----------TT--G----T-----------C-A-TG----------A----------C-----AA----
gi|4 : ctagataacagatgtaataaaaaacagtgaattttgttaaaaattttaacAT-TTTTTGGTA-CACAAAATGAG--------T-TCAGGTCA-AC-A-A----AA--TTC---GGAT--C-A-T-G---A-AT--T-----A---C-A---AAAAT-----T----AAT-TTT---G--T-----------C---TTA--C---AAATTA----------AC-TTTTGT-CA--TG--ACA-AA-A--TT-TCAA--CTTT------TGT-------A---G---A--T-AAAGCTTC-A--A-T-----TTG----TC---------TT-G----ACA-TA-A------------TG----A-CT---TC---T---------------------T--GTA-----CAC-A---T-A---AG----TGG--AT-------TTTG--------T-AAGAC--A----------A---TTGTGTGA---------ATT-T-A--TTGC--ATA--C----A-AA-T-------------G-----AG--AAC-ATT-----CTTCTG---T-A-A-T--CA-TA---AT------TAAAT------T--T---TGT-CG--GA--C-------A----A---C----T--------GT---T--T----TT--------TA---C-TA-A--TGAT---A---ATTTAA-TGGG--AAG-TAAAAAGTT---G---C---A--T--G--A--A-GA---GA-----TTAATAAC--TTTACATG----T-----A-AGG--GTAG-A---------T-C-------A-A----------A---A---ATGAAATT----TTGT--C------TA-AC-AAA-A--TC-T--T-------C-------A-T---TT---TT-T-G------T----------T--G-AC---TA-A--A-------T--TC-A---------CTT-T--TG-T-CA--T-T--A--C------A-A--AA--------T--T-CA--C--T---T---T-------TGT-----G-A------G-----A-C-AA--------A----A-AT-----------GAA------T---T-----------------T-----T-TGT-----------T--G-----------A----CA---AA---A------ATTA--TG---------A-----A-----G---A-------cacaaagagtccatttggcgcccc
gi|21 : cggggcgctcaaatgggcctcgtgtgattttgtctcaaaattccattttgtctacagacaaaaata---GATAAT--------T-TT--GTGCGAC-A-A----CA--TT-----GAT--T-T-T-T---G-----T---G-A---T-T--CATGAT-----C----AAT-TTT---G--T-------TGA-C---CTG--A---A-CTCA-------------TTTTGT-TT--CT--ACA-AA-A--TT-C--A--TTTT------TGTCCACAC-A---A---A----AA----TG-A--A-TT----TTG---------------AG-A----ACA-AA-A------Tcaaaaatgattggtt
gi|27 : gctgaaaAAG--------T-T---GC---AT-G-A----AG--------AGATAATAT-T-T---A-GA--T---A-A-----A--CAAAAA-----T---GAAT-TTT---G--T-------CGA-----CTGGCA---AGATTC----------AT-TTTTGT-T----G--ACA-AA-A--TT-C--A--CTcacaaggtcccatttggcgccccg
gi|22 : G--------T-T---G----AC-A-A----AA--TC----A--C--T-T-T-A---T-GT--G---G-A-----G--CAAAAA-----T---AAAT-TTT---G--T-------TGA-C---C----A---AAATTC----------AC-TTTTGT-CA--CA--ACAGAA-A--TT-C--A--CTTT-----------------------------------TC-A--C-TT----TTG----TCA--------TT-G----ACA-AA-A------TT----CA----C-TT---TG---T--tttccccattgcctaatttaagttaaa
gi|15 : acaaaattgaattttgtcatgac--------T-T---GT---AT-GCA----AA--TG----AGAT--T-G-A-T---A-TT--T---GCA---T-A--CATAAT-----T---GA----------------------------C----A---AAATTG----------AA-TTTTGT-CA--TG--ACA-AA-A--TT-G--A--GTTTA-----TCT-------A---C---A--A-AA----TG-G--A-TT----TTG----TT---------GT-G----ACA-AA-A------TTG----A----ATTT---TG---T--CA-------AC--------T--GAA------AA-A---TAA---TT----TTGT-ATAACT-TAT-----CAATA-CAAAAAT--G----------A-A-----GTTA---------TTA-T-G-------------------------------------A-----AG--CAA-CAT--A--CTTTTG---T-G-T-GA-CA-AA---AA------TGAAT------T--T---TGT-TAC-GA--CG------G----A---A------------------T--TCTA-TT--------TG---TGT--A--CA-C---A---A---AA-T-TG--G---T------TT---T---G---A--T--T--AC-A-AA---aaaaattattttgtg
gi|9 : tgccgattgggacttgatctt-T---AT---AC-A-A----AA--GTGA--ATAT--T-TGT-C---A-----T---G-A---C-A----AAAG-----T---GAAT-TTT---G--T-----------CTG-CTG--A---AAGATA----------A--TTTTGT--G--CG--ACA-AA-A--TT-A--A--TTTT------TGT-------G---ATTCA--T-GA----TC-A--A-TT----TTG----T-----------T-G----AC------------CTG----A----A-C---------T--CA-------TT-T-T----T--GTTCT--ACAA-A-----A---TT----C----AT--T----TTTGTCC-ACA-CAAAAAT--G----------A-ATTTTaatagacttttgttatctagtttgcattaaa
gi|10 : acaaaaaattaattttgtccacaaaattaatttttcgtctacctaaatataatttcttttatgcaaccttttttccgcattgcccaatttaagttttaaattatcattgtaaaaacatttgtccaacaaaattcaattatgaatttttttcattttggtatgcaattagtttcacaaaaatccaaattcaactaatttgcatacaaaatccaaatatgttacaaaagttaattctgtccagacaaaattgacttttg-T---AT---AC-A-A----AA--GTGA--ATAT--T-TGT-C---A-----T---G-A---C-A----AAAG-----T---GAAT-TTT---G--T-----------CTG-CTG--A---AAGATA----------A--TTTTGT--G--CG--ACA-AA-A--TT-A--A--TTTT------TGT-------G---ATTCA--T-GA----TC-A--A-TT----TTG----T-----------T-G----AC------------CTG----A----A-C---------T--CA-------TT-T-T----T--GTTCT--ACAA-A-----A---TT----C----AT--T----TTTGTCC-ACA-CAAAAAT--G----------A-ATTTTgagaagcaaatcacaagagtcccatttgggcgcccg
gi|3 : tctaaattttctctacctaaatataatttctttatgccaacctttttccgcgattgcccaatttaagttttaaattatcattagtaaaaacattttgtccaacaaaattcaattatgaatttttttcattttggtatgcaaattagttcacaaaaatccaattcaactaatttgcatacaaaatccaaatatagttacaaaattaatcttttccagacaaaattgacttttgT---AC-A-A----AA--TT----A-AT--T-C-T-------GT--CA--A-A---G-A--CAAAAT-----T---GACT-GTT---GTCT-------ACAA------A--A---AAGTGA----------A--TTTTGT-CA--TG--ACA-AA-G--TGAT--A--TTTT------TGT-------A---AG--A--CAAA----TT-A--A-TT-T--TTG----TAAATTC----AT-G----ACG-AT-T------TTGG--TT----G-TTACCTGAACT--CA-------TT-T-T----T--GTTGT--ACAA-AATTC-AT--TT----TTG--TT--CA-CA---G--C-A-----AAAAT--G----------A-ATTTTTGgagaacaaaatcacaagagtcccatttggcgcccc
gi|6 : ctagataacagatgtaataaaaaacagtgaattttgttaaaaattttaacttgtcatgacaaatttcatttttggtcttcacaaagtgaattttgtcacaaaagagtacaaaaatgaaattttgttgacaaaattcacttttgtcatacttttaatataaatctcttcaagcaactatttttccaaattgcctaattgaagtttaaaattatcattagtaaaaacagttgtccgacaaaatttaatttatgaaattacagaacttgaatttcttcatttggtaaatgcaaatttagtttacaaaaatctaaattcacatttgctacaaaatccacttatgt---AC-A-A----AA--GT----AAAT--T-T-T-------GT--T-----A---C-A--TAAAAT-----T--------ATT---A--T-------CGAGCGGAC-G--A---AGGTCA-----------C-TTTTGT-CA--TG--ACA-AC-A--TT-T--A--TTTT------TGT-------C----------T-CA----CC-A--AATT-AACTTG----T-----------------------G-A------TT----TA----A-TT---TG---C--AA-------AT-T-A----G--GTAA----CAA-A---A-G---TC------A--AT-------TTTG--G-ATA-C-AGA-T--A----------A-G--TTTAT-A---------CATGT-A-TTTGC--ATACCT----T-AT-T-------------G-----AC--AAA-AAT-TG--ATTTTG---T-A-AAGATCA-AA---ATGACTTTTGAAATATAATT--T---TGTGTA--G---CA------A----A---A--------------T---T--TGGT-TT--------TG---T-C--A--T--T---ACAAA---AA-A-TG--AAG-T------T------------A--T--A--AA-ACAA---GT-----ATAATATA--TT----TG----T-----T-A-G--A----------------C-------A-A----------A---A---AT----TA----TTTT--GT-TG--TG-AC--AG-A--T-----T-------T-------T-A---CT---TT-T-------------TA----T--GTA----CA-C--A--AA--AT--TG-A----------TT-T--CG-A-TT--A-------C------A-A--AA--------A--G-AT--C--agaacaaaatcacaaagagtccatttggcgcccc
gi|7 : gggcgccaattgggactt---AC-A-A----AA--AT----GAAT--T-T-T-------GT--C---A-A---C-A----AAATC----T---TCAT-TTT---T--T-------G---C---TTG--ACT-AAATTC----------AC-TTTTGT-CA--TT--ACA-AA-A--TT-C--A--CTTT------TGTGAGAGACA---A---A----AA----TG-A--A-TT-T--TTG----T-----------T-G----ACA-AA-A------gatatgttgtaaaatttgttaatctgaactcatttttgttgaacaaactcacctttgtcaacgcgaaattggatttcaagtacaaaatcacaagaacctcactagtgtcc
gi|22 : ggacaaaattaaattttgtatacgaaatcaaattttgttcacgacaaaatccatttttaaggcattaccaatttatattcaatctttgtcaatatatgtatgcaaatatcaatcttcattgtatacaaaatagactttgtttatcttagtttgattaaataaacaaaagtaattatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaactaaaactgaattgttgtcaaccaattctatttttgtctcattaat---AC-A-A----AA--TT----GAAT--T-T-T-------GTCAT---G-A---C-A--CAAAG------T---GAAT-TTT---G--TCAATGACAAAAG---TGA--A---AAGTGA----------AT-TTCTGT-TG--TG--ACA-AA-AG-TG-A--A--TTTT------GGT-------C---A---A--C-AA-------A--ATTT-A--TTT----T-----------T-GCTCCACATAA-A------GTGA--T-------TT---TG---T--CA-------Atc
gi|30 : -A-A----AA--TTCTAGAGAT--T-T-T-A---A-GT--TTTGG-A---C-A-----AAC-----TCAGGAATCATTTTTG--T-------TGA-----C----A---AAATTA----------AC-TTTTCT-CA--TG--ACA-AA-A--TT-C--A--CTTT------TGT-------caaaaattattttgtg
gi|12 : atg-A----GA--TT----AGAT--T-T-------A-GG--T-----A---G-A--CAAATA-----T---GAAT-TTT---T--T-------C-AAC--------A---AAATTC----------AC-TTTTAT-CA--TG--ACA-TA-A--TT-C--A--TTTT------TGTCATG---A---C---A--C-AA----TT-C--A-CT-A--T------TCACTTTTTTCAT-G----ACA-AA-A------TTCA---A----A-TT---TG---T--C
gi|4 : atgtagtttgcattagataacaaatgtaaattttgtgaAT--T-T-T-T-----GT--C---A-A---C-A---AAAAT-----T---CATT-TTT---G--T-------CTCAC-----A--A---AAGTGA----------A--TTTTGT-AA--TG--ACA-AA-A--GT-G--A--ATTT------AGTCAAC---A---A---A--A-AA----TG-AAGA-TT----TTG----TTA-----------G----ACA-AA-A------TT----TC----A-TT---TT---T--GA-------TC-T-ACCCTT--ACA-T--GTAA-A-----G---TTA---TTA--AT--CT-C-TT----C-ATG-C-------------------A-ACTTT--TTA---------C-------TTCCC--AT---T----A-AATT-------------ATCATTAGTAAAA-AAC-AG-----TTG---T-C-C-GA-CA-AA---AT------TTAATT--A--TGAT---TA--CA--GA---A------G----A---A----T--------GT---T--CTCA-TT--------TG-----T--A--TG-C---A---A--------TA--AAT-T------C---------------------AC-A--------------CAAT-TG--TC----------T-----T-A---------------------C-------A-A----------A---A---------TC----CACT--TA-TG--TG-TA-CAA-G--AA-G--T-------C-------------AT---TA-T-G------T----CA----A--G-A----CA-A--A-------T--TG-A---------AGC-T-------TT--A-TCTA--C------A-A--AAGT------T--G-AA--A--T---T---T-------TGT-----C-A----T-G-----A-C-AA--------A----A-GT-----------TAA----------------------------T-----T-TGT---------AA---G-----------A----C----AA---A------AT----T----------------A-----A---T-------T--T----------TT--GTAATT-----------C-A-TG-A--------T----------C---------------------C--G-----A-A---TTT-T---G----T-------T-G----A-CCT-------GAA-C-------T-C--A--T---------T-T-T--G---TGTAC---CA---A---A-------A-----AA-----T-T-A-T---T----T----T------T----GT-C----TG-T--------------------A---G------------A-----C--A-A------A---------A----TG-G----A---AT-T--T-T--G-----------cttcacgcaattttttcccattgtctaattgaagttaaaattaacattagtaaaaaaaactttgtcccacaaaattgaattatgaataacagtactgaatttcttcattttggtatgcataatagtttacaaaaatctaaattcaacaactttgcttacaaatccacttatgctacaaaagttaattctgtcaaaacatacatgcaattgattgttgtctacaaatgtgagttttgtcatgagaaatt
gi|7 : cggggcgctcaaatgggcctcgtgtgattttgtct-A--CAAAAT-----T---AAAT-TTT---G--T-------ATA------CG--A---AA-TCA----------AA-TTTTGTTCA--CG--ACA-AA-A--TC-C--A--TTTT------T---------A---AGGCA--T-TA----CC-A--A-TTTA--TAT----TCA--------AT-------C--------------------------TT---TG---T--CA-------ATAT-A----T--GTA-T--GCAA-A---T-A---TC------A--AT--CTTCATT-G--T-ATA-C-AAAAT--A----------G-ACTTTGTTTA---------TCT-TAG-TTTG---AT---T----A-AA-T-------------A-----AAC-AAA-AGT-AATTATTTtatgaagacaaaaatgattggtt
gi|27 : gg-----T---GAAT-TTT---G--T-------C-AAC-----A--A---AAATGA----------A--TCTTGC-CAGTCG--ACA-AA-A--TT-C--A--TTTT------TGT------------------T-TA----TCTA--A-AT-A--TTA----TCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaactaaaactgaattgttgtcaaccaattctatttttgtctcattaatttttgtcaacaaaaattcatttttgtctctcacaaaagtgaattttgtaatgacaaaagtgaatttagtcaagcaaaaaatgaagattttgttgacaaaattcatttttgttc
gi|31 : agTTA----------AC-TTTCGT-CA--TG--ACA-AA-A--TT-C--A--CTTTGTCCACTG--------A---A---A--A-AA-------G--A-TT----TTG----TCA--------AT------ATA-AA-A------ATGA---A----A-TT--------------------AT-T-G----T--ATGAA--GCAACA---T-A---CT----tcttcatgcaactttttccccattgcctaatttaagttaaa
gi|17 : ttA----------AA-TTCCGT-CA--TA--ACA-AA-A--TT-C--A--TTTT------TGTC------A---A---A--C-AA-------A--A-GT-ATGTTGCTTCCCA--------AT-A----AC------------TTAT--T-------TT---TG---T-----------AT-TGA----TAAGTTGT--ACAA-AAT-T-A---TT----TT--------T-CAGTTG------A-C-AAAAT--C----------C-ATTTTTG--------------------------------T----A-GA-T-----------------------AAA-CTT-AA--ATTTTGTCAT-G-A-AA-CA-A--------------AATT-CA--T--T---TGT-CA--
gi|9 : ttttgtgaatcaaaacaatttgtgtacacaaaatagA----------AC-ATTTGT-C---CA--ACA-AA-A--TT-C--A--ATT-------------------------------A----TG-A--A-TT-T--TTT----TCA--------TT--------------------TTGG--TA-----------TG------CA-------AT-T-A-------GTTTC--ACAA-A---A-A---TCCAAATTC--AA--CT-AATTTG--C-ATA-C-AAAATCCA----------A-A--TATGTTA---------C-----------------------------------------------------AAA-AGT-TA--ATTCTG---T-CCA-GA-CA-AA---AT------TGACTT--------T---TGT--A--TA--CA------A----A---A-------------GT---G--AATA-TT--------TG---T-C--A--TGAC---A---A---AA-G-TG--AAT-T------TTG--T---C------T--G--CT-G-AA---AG-----ATAAT-T----T----TG----T------------GC-G-A-----------C-------A-A----------A---ATTAAT----TT----TTGTGATT-CA--TG-AT-CAA---------------------------------T---TT-T-G------T----------T--G-ACC--TG-A--A-------C--TC-A---------TTT-T--TG-T-TC----T--A--C------A-A--AA--------T-----T--CATT---T---T-------TGT-----C-C----A-C-----A-C-AA--------A----A-AT-----------GAAT-T---T---T-----------------attatgtatgcaaatatcgatctcatttgcatacaaaatagacttttgttatctagtttgcataa
gi|10 : acaaaaaattaattttgtccacaaaattaatttttcgtctacctaaatataatttcttttatgcaaccttttttccgcattgcccaatttaagttttaaattatcattgtaaaA----------ACATTTTGT-C---CA--ACA-AA-A--TT-C--A--ATT-------------------------------A----TG-A--A-TT-T--TTT----TCA--------TT--------------------TTGG--TA-----------TG---C--AA-------AT-T-A----------GTTCACAA-A---A-A---TCCAA-TTC--AA--CT-AATTTG--C-ATA-C-AAAATCCA----------A-A-TATAGTTACAAAATTAATCT-T----TTCC--A----------------------------G-----AC--AAA-ATT-GA--CTTTTG---T---A-TA-CA-AA---AG------TGAAT---A--T--T---TGT-CAT-GA--CA------A----A---AGTGAA--------TT---T--TG---TC--------TG---C-T------G-A---A---A---GA-T-----AAT-T------TT---G---T---G--C--G--AC-A-AA---AT------TAAT-T---TT----TG----T-----G-A-TTCAT-G-A---------T-C-------A-A------------------------TT----TTGT---------TG-AC-C--------------------T-------G-A---AC---T----------------CA----T----------------------------------------TT-T--TG-T-TC----T--A--C------A-A--AA--------T-----T--CATT---T---T-------TGT-----C-C----A-C-----A-C-AA--------A----A-AT-----------GAAT-T---T---T-----------------gagaagcaaatcacaagagtcccatttgggcgcccg
gi|6 : tctaaattttctctacctaaatataatttctttatgccaacctttttccgcgattgcccaatttaagttttaaattatcattagtaaa----TTG--AT--CT-T-TTTG--T-AAT-C-GAAAT--C----------A-A-TTTTGT----------------------G--------T----A-CA-T-------------A-----A----AA-AGT-AA--AATCTG---T-C-ACAA-CA-AA---AT--------AATT-----T--T---TGT-CT--AA--CA------A----A---T----A--------TA---T--TATA-CT--------TG---T-T--T--TA-T---A---A------C-TT--CAT-T------TT---T---TGTAA--T--G--AC-A-AA---AC-----CAAAT-T----T----TG----C-----T-A-C--AC-A-AAATTATATTT-C-------A-A----------A---A---GTCA--TT----TTGA--TC-T---TT-AC-AAA-A--T-------------C-------A-A---TT---TT-T-G------T----CA---------A----TA-A------G--GTA-TGCA---------AAT-A--CA-T-GT--A-T--A-----------A--AC--------T--T-AT--C--T---G-----------TAT-----C----------------C-AA--------A----A-TT-----------GACT-T---T---T-----------------G-----T-TAC---------C-T--A-----------ATTTGCA---AATTAA------AT----CAC--------A-----A-----GTTAA-------T--T----------TG--G----T-----------G-A--G-A--------C----------A-----AA----AA--------T--A-----A-A---TGT-T---G----T--C-A--T-G----A-CA--------AAA-G-------T-G--AC-C---------T-T-C--G---T---C---Cgagaacaaaatcacaagagtcccatttggcgcccc
gi|15 : gggcgccaattgggacTTTG--T-ATG-C-AAATG--A----------G-A---TTGATA---------T-T-T-G-CATAC--AT--------A-AT-T-------------G-----AC--AAA-ATT-GA--ATTTTG---T-C-ATGA-CA-AA---AT------TGAGTT-TA--T--C---T--------A--CA------A----A---A---------------------TGGATTT--------TG---T-T--G--TGAC---A---A---AA-T-TG--AAT-T------TTG--T---C---AACT--G--AA-A-AA-----------TAAT-----TT----TG----TA----T-A-A--CT-T-A---------T-C-------A-ATACAAAAATGA---A---GT----TA----T--------TA--TGAAG-CAACA--TA------------C--------------T---TT-T-G------T-----G----T--G-A----CA-A--A--AA------TG-A---------ATT-T--TG-T-TA--C-G--A--C------G-G--AA--------T-----T--C--TA--T---T-------TGTG----T-A----C-------A-C-AA--------A----A-TT-----------GG-----------T-----------------T-----T-TG-----------AT--T-----------A----CA---AA---A------Agctcgataataattttatgtaacaaaatttacttttgtgatatgttgtaaaatttgttaatctgaactcatttttgttgaacaaactcacctttgtcaacgcgaaattggatttcaagtacaaaatcacaagaacctcactagtgtcc
gi|10 : tgccgattgggacttgatc-ACTCTTGTGA---------TTT-T-G-TTCTC--A---------A-AA-TTCATTTTTGTGTGG-----AC--AAA-AAT-GA--ATTTTG---T-A-G-AA-CA-AA---AA------TGAGTT-CA---------GGT-CA---A--CA------A----A---A------------------T--TG-A-TCA-------TGAA-T-C--A--CA-----A---A---AA-T-T---AAT-T------TTG--T---C---G--C-----AC-A-AA---AT------TA---TC--TT----------T-----C-A-G--CA-G-A-----------C-------A-A----------A-------AT----TCACTTTTGT--C---A--TG-A--CAA-A--TA-T--T-------C---------A---CT---TT-T-G------T-----A----T----A----CA-A--A--AG------TC-A---------ATT-T--TG-T-CT--G-G--A--A------A-A--GA--------T--T-A---A--T---T---T-------TGT----------------------------------A----A-CT-----------ATAT-T---TGGAT-----------------T-----T-TGT----------AT--G----------------CA---AATT-A------GT----TG---------A-----ATTG--G---AT------T--T----------TT--G----TGAACTAATTTGC-A-T--A--------C----------C-----AA----AA--------T--GAAAAAA-A---T------------T--C-A--T-------------------AA-T-------T-G--A--AT--------T-T-T--G---T---T---GG---AC--A-------A-----AA-----T-atagacttttgttatctagtttgcattaaa
gi|12 : tctaaattttctctacctaaatataatttctttatgccaacctttttccgcgattgcccaatttaagttttaaattatcattagtaaaaac-G-TTTGC--AT---T----A-GA-T-------------A-----AC--AAA-TGT-AA--ATTTTG---T-G-A-GA-CA-AA---TT------TGAAT------T--T---TGT-CAT-GA---A------A----A---A----A--------GTGAATAGTGAA-TTG-------TG---T-C--A--TGAC---A---A---AA-A-TG--AAT-TA-----TG---T---C---A--T--G--ATAA-AA---GT-----G-AAT-----TT----TG----T-------------T-G-A-------------------A-A----------A---A---AT----TCATATTTGT---C-TA--C---C-TAA-ATCTA-A--TCTCTTCAC-------GCA---AT---TT-T-T------TCC--CA----T--T-GTC--TA-ATTG--AA--GT--TA-A---------AAT-TAACA-T-TA--G-T--A--A------A-A--AA-------------AA--C--T---T-----------TGT-----C------C-C-----A-C-AA--------A----A-TT-----------GAAT-T---cccatttggcgcccc
gi|6 : atgta-TTTAC--AA---C----A-TA-T-------------C-----AC--AAA-AGT-AA--ATTTTG---T-T-A-CA-TA-AA---AT------T--ATT--A--T--C---GAG-CG--GA--CG------A----A-----------------GG---T--CACT-TT--------TG---T-C--A--TGAC---A---A---CA-T-TT--ATT-T------TTGTCT---C---A--C------C-A-AA---TTAACTTGTGAT-TTAATT----TGCAAAT-----T-A-G--GT-A-A-----------C-------A-A----------A---A---GTCAA-TT----TTG-----------G-ATACAG-A--TAAG--T-------T-------T-ATACATGTATT-T-GCATACCT----TA----TT-G-A----CA-A--A--AA---T--TG-A----------TT-T--TG-T-AA--A-G--AT-C------A-A--AA--------T--G-A---C--T---T---T-------TGA-----A-A----T-------A-T-AATTTTGTGTA----G-CA-----------AAAT-T---TGG-T-----------------T-----T-TGT---------CAT--T-----------A----CA---AA---A------AA----TG---------A-----A-----G-------------------------TT--A----T-----------A-A----A--------A----------C-----AAGTATAA--------T--A-----T-A---T-T-T---G----T--T-A----G----A-CA--------AAA-A-------T-T--A--T---------T-T-T--G---T---TG--TG---AC--A-------G-----AT-----T-T-T-A---C----T----T------T----TT-A----TG-T------------------------A----------C-A-----C--A-A------A---------A---TTG----------AT-T--T-C--G-------------------A-----T----TA-----C-A--AA-atgaataacagtactgaatttcttcattttggtatgcataatagtttacaaaaatctaaattcaacaactttgcttacaaatccacttatgctacaaaagttaattctgtcaaaacatacatgcaattgattgttgtctacaaatgtgagttttgtcatgagaaatt
gi|4 : gggcgccaattgggacttgatctt-AA-C-------------A-----AA--AAA-TGA-AG--ATTTTG---T-T-A-GA-CA-AA---AT----------TT-CA--T--T-----------------------------------------------T---T--TG-A-TC--------TACCCT-TACA--TG-T---A---A---AG-T-TATTAATCT------CT---T---C---A--T--G---C-A-AC---TT-----TTTAC-TT--CC----CA----T-----T-A-A--AT-T-A---------T-CATTAGTAA-A----------A---A---AC----AG----TTGT--CC------G-AC-AAA-A--T-----T-------T---------A---AT---TA-T-G------------A----T--T-A----CA-G--A--AG--AA--TG------------TTCT--CA-T-TT--G-T--A--T------G-C--AA--------T--A-A---A--T---T---CACACAATTGT-----C------T-T-----A-C-AA--------AATCCA-CTTATGTGTACAAGAAG-T---CA--T-----------------T-----A-TGT---------CAA--G-----------A----C-----A---A------AT----TG---------A-----A-----G-----------C--T----------TT--A----T-----------C---T-----------A----------C-----AA----AAGT------T--GA----A-A---TTT-T---G----T--C-A--T-G----A-CA--------AAA-G-------T-T--A--A---------T-T-T--G---T---A---AG---AC--A-------A-----AA-----T-T---A---A----T----T------------T-T----TG-T------------------------------------------------------------------------------A---AT-T--CAT--G-----------A---TCC-G---------------------------------A-AT---T----TTG-TT--------------G-ACCTGAA---C-----------TC-A--T---TT-TG--T--G----TA----C---CAAA-AA-----ATT------ATTTTTG-TCTG-TAGAC-A--AAA--TGGAA-TT---T-------T----GA--G---AC---AAAA-Tatttgttaatctgaactcatttttgttgaacaaactcacctttgtcaacgcgaaattggatttcaagtacaaaatcacaagaacctcactagtgtcc
gi|3 : cggggcgctcaaatgggcctcgtgtg-AA-T-------------A-----AA--AAACAGT-GA--ATTTTG---T-T-A-----A-AA---AT------T---TT-AA--C--T---TGT-CAT-GA--CA------A----A---gactaaattcacttttgtcattacaaaattcacttttgtgagacaaaaatgaatttttgttgacaaaaattatgaagacaaaaatgattggtt
gi|18 : ctagataacagatgt-T-------------A-----AC--ATA-AGT-GG--ATTTTG---T-A-A-G--CA-AATTTGT------TGAATT-TA--T--TGCATAC-CA--AAATGA------A----G---A----A--------AT---T--CATT-TC--------TG---T-A--A--TT-C---A---T---AA-T-TA--AAT-T------TTG--T---C---G-----G--AC-A-AA---CT-----GTtttcatttttggtcttcacaaagtgaattttgtcacaaaagagtacaaaaatgaaattttgttgacaaaattcacttttgtcatacttttaatataaatctcttcaagcaactatttttccaaattgcctaattgaagtttaaaattatcattagtaaaaacagttgtccgacaaaatttaatttatgaaattacagaacttgaatttcttcatttggtaaatgcaaatttagtttacaaaaatctaaattcacatttgctacaaaatccacttatgttacaaaattaattctgtcaaagacaaaattgactgttgtctacaaaaaagtgaattttgtcatgacaaagtgatatttttgtaagacaaattaatttttgtaaattcatgacgattttggttgttacctgaactcatttttgttgtacaaaattcatttttgttcacagcaaaaatgaatttttgagaacaaaatcacaaagagtccatttggcgcccc
gi|9 : gttgacaaaattcatttttgtctacctacatgtaaatataatctcttcatgcaactttttcttcccattaaattatcattagtaaaa--AAA-AAT-GA--ATTTTG---T-A-G-AA-CA-AA---AA------TGAGTT-CA---------GGT-CA---A--CA------A----A---A------------------T--TG-A-TCA-------TGAA-T-C--A--CA-----A---A---AA-T-T---AAT-T------TTG--T---C---G--C-----AC-A-AA---AT------TA---TC--TT----------T-----C-A-G--CA-G-A-----------C-------A-A----------A-------AT----TCACTTTTGT--C---A--TG-A--CAA-A--TA-T--T-------C---------A---CT---TT-T-G------T-----A----T----A----CA-A--A--AG------TC-A---------ATT-T--TG-T-CT--G-G--A--C------A-G--AA--------T--T-AA--C--T---T---T-------TG-------------T-A-----A-C-AT--------A----T-TT-----------GGA----------T-----------------T-----T-TGT----------AT--G----------------CA---AATT-A------GT----TG---------A-----ATTTG-G---A-------T--T----------TT--caaaagtcaa
gi|11 : acaaaaaattaattttgtccacaaaattaatttttcgtctacctaaatataatttcttttatgcaaccttttttccgcattgcccaatttaagttttaaattatcattgtaaaaacatttgtccaacaaaattcaattatgaatttttttcattttggtatgcaattagtttcaca--AAA-AAT-GA--ATTTTG---T-A-G-AA-CA-AA---AA------TGAATT-CA---------GGT-CA--G---CA------A----A---A------------------T--TG-A-TCA-------TGAA-T-C--A--CA-----A---A---AA-T-TT---AT-T------TT---T---G---G--C-----AC-A-AA---AT------TA---TC--TT----------T-----C-A-G--CA-G-A-----------C-------A-A----------A-------AT----TCACTTTTGT--C---A--TG-AC-AAA-A--T-----T-------C---------A---CT---TT-T-G------T-----A-------G-A----CA-A--A--AG------TC-A---------ATT-T--TG-T-CT--G-G--A--C------AGA--AA--------T--A-A---C--T---T---T-------TG-------------T-A-----A-C-AT--------A----T-TT-----------GGA----------T-----------------T-----T-TGT----------AT--G----------------CA---AATT-A------GT----TG---------A-----ATTTG-G---AT------T--T----------TT--G----T---------------------------------------------A----AA--------C--T-----A-A---T-T-T---G-------C-A--T-A----C-CA--------GAA---------T-G--A--A---------gtccacacaaaaatgaattttgagaagcaaatcacaagagtcccatttgggcgcccg
gi|22 : aaattaattttttgtctacctaaatataatttctttatgcaacttttttccgcgttgcccaatttaagtttaaattatcgtaaaaacattttgtccaaacaattcaattatgatttttt--AAA-ATT-GA--ATTTTG---T-C-ATGA-CACAA---AG------TGAAT------T--T---TGT-CAATGA--CAAAAGTGA----A---A----A--------GTGAAT--T----TC--------TG---T-T--G--TGAC---A---A---AA-G-TG--AAT-T------TTGG-T---C---A--------AC-A-AA---AT-----TTA---TT--TT----TG----C-----T-gtccacactaaaatgaattttgagaactcaaaatcacaagagtcccatttggcgcc
gi|24 : ac--AAA-AGT-TA--ATTCTG---TCA-A-GA-TA-AA---AT------TGACTG--------T---TGT-CT--AA--AA------A----AGCGA----A--------AT---T--CG---TC--------CG---T-T------G-A---A---A---GA-T-----AAT-T------TT---G---C---A--T--G--AC-A-AA---AT------TAAT-AT--TT-----------------------GT-G-A---------T-T-------C-A----------A---G---ATCAA-TT----TTGT--ccacataaagtgattttgtcaacaaaaattattttgtg
gi|16 : cttacaaaatgcacttatgtttcAA-AGT-TA--ATTCTG---T-CCA-GA-CA-AA---AT------TGA----C---T--T---TGT-TC--TA--CA------ATAGTG---A----A--------TT---T--TG---TC--------TG---C-------TG-T---A---A---GA-T------AT-T------TT---G---T---G--C--G--AC-AGAA---AT------TAAA-TT--TT----TGTGA-T-----T-C-C--AT-G-A---------T-C-------A-A------------------------TT----TTGT---------TG-AC-CTG-A---A-C--T-------C-------A-A---TT---TT-T-G------T----TC----T----A----CA-A--A--A----T--TC-A---------TTT-T--TG-T-CG--A-C--A--CA-----A-A--AA--------T--G-A---A--T---T---T-------TG------C-A----A-G-----A-C-AA--------A----A-tg
gi|23 : ttcattttggtatgcaaattagtttaaaaaatccaattcaactaatatgcaatacaaaatccaatatgttacAA-AGT-TA--ATTCTG---T-A-A-GAATA-AA---AT------TGACTG--------T---TGT-CT--AA--AA------A----AGCGA----A--------AT---T--CG---TC--------CG---T-T------G-A---A---A---GA-T-----AAT-T------TT---G---C---A--T--G--AC-A-AA---AT------TAAT-TA--TT----TG----T-----atcacaaggagtccatttggcgcctagtc
gi|20 : gcttacaaaatgcacttatgtttcAA-AGT-TA--ATTCTG---T-A-A-GAATA-AA---AT------TGACTG--------T---TGT-CT--AA--AA------A----AGCGA----A--------AT---T--CG---TC--------CG---T-T------G-A---A---A---GA-T-----AAT-T------TT---G---C---A--T--G--AC-A-AA---AT------TAAT-TA--TT----TG----T-----gattcaagatcaattttgttg
gi|15 : caaaaaaacaacaacaaaacacaccccaaaaaacccaagcttacaaaatgcacttatgtttcA--ATTTTG---T-G---TA-CACAA---AT------AGAATT-CC--G--T---CGT-----AA--CA------A----A---A--------------T---T--CATT-TT--------TG---T-C--A--CA-C---A---A---AA-G-TA--TGT-TG-----CT---T---C---A--T--A--AT-A-A-----C-----TTCAT-T---TT----TG----TATTGAT-A-A--GT-T-A---------TAC-------A-A----------A---A----T----TA----TTTT--TC--AGTTG-AC-AAA-A--T-----T-------C---------A---AT---TT-T-G------T----CA----C--A-A----CA-A--A--A-------TC-C---------ATT-T--TG-T-----A-G--A--T------A-A--AC--------T--C-A---A--T---T---T-------TGT-----C-A----T-G-----A-C-AA--------A----A-TT-----------CAAT-T---T---TGTCAA------------T-----TATGT----------AT--G----------------CA---AA---T------AT----C----------A-----A-----T---C-------TCAT----------TT--G----------------C-A-T-----------A----------C-----AA----AA--------TA-G-----A-C---TTT-T---G----T--T-A--T-gattcaagatcaattttgttga
gi|13 : tgccgattgggacttgatctttttgtaatcaaaaccTTTTG---T-G-T-GA-CA-AA---AT------TGAAT------T--T---TGT-TAT-GA--CG------G----A---A------------------T--TCTATTT--------TG---TGT--A--CA-C---A---A---AA-T-TG--G---T------TT---T---G---A--T--T--GC-A-AA---ctagtttgcattaaa
gi|22 : tacggggcgccgattgggacttgatcctA-CA-AA---AT------TGAAT------T--T---TGT-CAT-GA--CA------C----A---A----A--------G-------------------------------------------------------TG--AAT-T------TTG--T---CA--A--T--G--ACAA-AA---GT-----G-AA--------------------------A-A--GT-G-A----------------------------------------AT----TT----CTGT-----TG--TG-A--CAA-A---A-G--T---------------G-A---AT---TT-TGG------T----CA---------A----CA-A--A--A----T--TT-A---------TTT-T--TGCT-CC--A-C--A--T------A-A--AG--------T--G-A------T---T---T-------TGT-----C-A------------A-C-AA--------A--------------------AAT-T---A---T-----------------T-----T-TGT---------gtgtgctgcttcgtaataacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataacttcatatttgtattgataagttatacaaaattatttttcattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtatgcaaatatcaatctcatttgcatacaaaatagacttttgttatctagtttgcattaaat
gi|11 : -AA---AT------TCAACT-AA--T--T---TG--CA--TA--CA------A----A---A--------------T---C--CAAA-TA--------TG---T-T--A--CA-----A---A---AG-T-T----AT-T------TC---TGTCC---A-----G--AC-A-AA---AT------TGAC-T---TT----TG----TC----T-A---------------------C-------A-A----------A---A---GTGAA-TT----TTGT--C---A--TG-AC--AA-A---A-G--T---------------G-A---AT---TT-T-G------T----C-----T--G-C----TG-A--A--AG--AT-----A---------ATT-T--TG-TGCC--A--------------A-A--AA--------T--A-AA--T--T---T---T-------TGTGATT-C-A----T-G-----ATC-AATTTTGCTGA----C-CT-----------GAAT-TCA-T---T-----------------T-----T-TGT---------TCT--------------A----CA---AA---A-------T----TC---------A-----T-----------------T--T----------TT--G----T-----------C---CA-C--------A----------CT----AA----AA--------T--G-----A-A---TTT-T---G----g
gi|15 : aaattaattttttgtctacctaaatataatttctttatgcaacttttttccgcgttgcccaatttaagtttaaattatcgtaaaaacattttgtccaaacaattcaattatgattttttttcattctggtatgcaaattagtttacaaaaatccT------TGTATT-GA--T--A---AGT-TA--TA--CA------A----A---ATT--A--------TT---T--TTCA------------G---T-T--G---A-C---A---A---AA-T-TC--AAT-T------TTG--T---C---A--C--A--AC-A-AA---AT-----CCA----T--TT----TG----T-------A-G--AT-A-AAC-------T-C-------A-A------------------------TT----TTGT--C---A--TG-AC-AAA-A--T-----T-------C---------A---AT---TT-T-G------T----CAATTAT--GTA----TG-C--A--AA--TA--TC-A---------ATC-T--CA-T-TTGCA-T--A--C------A-A--AA--------T--A-GA--C--T---T---T-------TGT-----T-A----T-agaactcaaaatcacaagagtcccatttggcgcc
gi|17 : tgccgattgggacttgatctttttgtaatcaaaaccaattttgtgtacacaaatagaattccgtcgtaacaaaattcatttttgtcacacaaaagtatgttgcttcataataacttcattt--T--T---TGT-GA--AT--CA------A----A---AC---A--------AT---T--TG-------------TG---T----A--CA-C---A---A---AA-T-AG--AAA-T------TCCG-T---C---A--T--A--AC-A-AA---AT------TCAT-T---TT----TG----T-----C-A---------A---------A-C-------A-A----------A---A---GTA---TG----TTG---CT-T-------C-CCA-A--TA-A--C-------T-------T-A---TT---TT-T-G------T----AT----T--G-A----TA-A---------GT--TG-----------------------------T--A--C------A-A--AA--------T--T-AT--T--T---T-------------T-----C-AGT--T-G-----A-C-AA--------A----A-TC-----------CA-------T---T-----------------T-----T-TGT--------------------------A----GA---TA---A------AC----TT---------A-----A---------A-------T--T----------TT--G----T-----------C-A-TGAA--------A----------C-----AA----AA--------T--T-----C-A---T-T-T---G----T--C----------------------------------------A--A---------T-TAT--G---T---A---T----GC--A-------A-----AT-----A-T-C-G---A----T-----------------C-T----CA-T----T---------T---------G----------C-A-----T--ACA------A---------A---ATA-G----A---CT-T--T-T--G-----------T---Tctagtttgcattaaa
gi|9 : tA--CA------A----A---A----A--------AT---T--AAT--TT--------TG---T-C-----CA-C---A---A---AA-T-T---AAT-T------TT---T---C---G--TCTA--CC-T-AA---AT-----ATAAT-TT--CT----T-----T-----T-A-T--GC-A-A---------C-C-----------------------------T----TT----TT-T--CCGCA--TT-GC-CCA-A--T-----T-------T-------A-A---GT---TT-T-AAATTA-T----CA----T--T-G----TA-A--A--AA--C----------------ATT-T---G-T-CC--A----A--C------A-A--AA--------T---------------T---C-------AAT-----T-A----T-G-----A------------------A-TT--------------T-T---T---T-----------------TCATT-T-TGG---------TAT--GCAATTAGTTTCA----CA---AA---A------AT----CC---------A-----A---------A-------T--TCAACTAAT--TT--G----------------C-A-T-----------A----------C-----AA----AA--------TCCA-----A-A---TAT-----G----T--T-A-----------CA--------AAA-G-------T-T--A--A---------T-TCT--G---T---C---CAG--AC--A-------A-----AA-----T-T---G---A----C----T------T-------T----TG-T------------------------A----------T-A-----C--A-A------A---------A---GT--G----A---ATAT--T-T--G-----------T---CAT-G-----------A-----C-A--AA-A--GTG--A-AT---T----TTG-TC-----------T--G-CTGA-AA---G--A--------TA-A--T---TT-TG--T--G----CG----A---C--A-AA-----ATT----A-ATTTTTG-Tatctagtttgcataa
gi|3 : -TT--------TG---T-T--A---------A---A---AA-T-TTT-AAC-T------TG---T---C---A--T--G--AC-A-AA----T-----TTCAT-TT--TT--------------------G--GT-C-T---------T-C-------ACA----------A---A---GTGAA-TT----TTGT--C---------AC-AAA-A--GA-G--TA------CAAAAATGA-A---AT---TT-T-G------T----------T--G-A----CA-A--A--A----T--TC-A---------CTT-T--TG---TC--A-T--A--CTTTT--A-A--TA--------T--A-AA--T--C---T---C-------T-T-----C-A----A-G-------C-----------A----A-CT-------------AT-T---T---T-----------------TCCAAAT-TGC---------C-T-----------------------------A------AT----TG---------A-----A-----G---T-------T--TAAAA------TT--A----T-----------C-A-TT-A--------G----------T-----AA----AA-----------------A-C---AGT-T---G----T--C----C-G----A-CA--------AAA-T-------T-T--A--A---------T-T-T--A---T---G---AAATTAC--A-------G-----AA-----C-T-T-GA--A----T----T------T----CT-T----CA-T----TTGGTAAATGCA----A---ATTTAGTT---T-A-----C--A-A------A---------A---ATC-T----A---AA-T--T-C--A-----------CA--TTT-G-----C----TA-----CAA--AA-T--C-C--A-CT---T----ATG-TT----------------AC---AA---A--A---T----TA-A--T---TC-TG--T--C----AAAG--A---C--A-AA-----ATT----G-ACTGTTG-TCTA-CA-AA-A--AAG--T-GAA-TT---T-------T----G-TCATG-AC---AAAG-TG--ATA---T-------TTTTG----T--A--AG-AC-----AAA-TT--AAT-T-TTT--GTgattcatgatcaattttgttgacctgaactcatttttgttctacaaaattcatttttgtccacacaaaaatgaattttgagaagcaaatcacaagagtcccatttgggcgcccg
gi|15 : ctagataacagatgtaataaaaaacagtgaat---T-T--G--TG-T---ACACA---AA-T-AG--AAT-T------CCG--T---C---G--T--A--AC-A-AA---AT------TCAT-T---TT----TG----T-----C-A-C--A----------------C-------A-A----------A---A---GTA---TG----TTGC--TT-CA--T-------A-A--TA-ACTT-------C---------A---TT---TT-T-G------T----AT----T--G-A----TA-A--G-----------------------------------TT--A-T--A--C------A-A--AA--------T--T-AT--T--T---T-------------T-----C-AGT--T-G-----A-C-AA--------A----A-TT-----------CAAT-T---T---T--------------------------GT---------CAC--A-----------A----CA---AA---A------TC----C--------------------------A-------T--T----------TT--G----T----------------A-G--------A----------T-----AA----AC--------T--C-----A-A---TTT-T---G----T--C-A--T-G----A-CA--------AAA-T-------T-C--A--AT--------T-T-T--G---T---C---AA---TT--ATGTATGCA-----AA-----TAT-C-A---A----T-----------------C-T----CA-T----T---------T---------G----------C-A-----T--ACA------A---------A---ATA-G----A---CT-T--T-T--G-----------T---Taaattcatgacgattttggttgttacctgaactcatttttgttgtacaaaattcatttttgttcacagcaaaaatgaatttttgagaacaaaatcacaaagagtccatttggcgcccc
gi|16 : tgccgattgggacttgatctttttgtaatcaaaaccaatt--A--TA-C---A---A---AA-T-CC--AAT---------------------A--T--GTTAC-A-AA---GT------TAAT-TC--T------G----T-----CCA-G--A----------------C-------A-A----------AATTG---AC----T-----TTGT--TC-TA--C-------A-A--TA-G--T---------------G-A---AT---TT-T-G------T----C-----T--G-C----TG-T--A--AG--AT---------------ATT-T--TG-TGCG--A-C--A--G------A-A--AT--------T--A-AA--T--T---T---T-------TGTGATTCC-A----T-G-----ATC-AATTTTGTTGA----C-CT-----------GAAC-TCAAT---T-----------------T-----T-TGT---------TCT--------------A----C----AA---A------AT----TC---------A---------------T-------T--T----------TT--G----T-----------C----G-AC-------A----------CA----AA----AA--------T--G-----A-A---TTT-T---G-------C-A--A-G----A-CA--------AAA-A-------T-atctagtttgcattaaa
gi|4 : ttcattttggtatgcaaattagtttaaaaaatccaattcaactaatatgca---A---A---AA-T-TC--CAT-T------TTG--T---CT--A--CA-G--AC-A-AA---A------ATAAT-TT--TT----TG----G-----T-A-C--A----------------C-------A-A----------A---ATGAGT----TC----AGGT--C-------A-AC-AAA-A--T-----T-------C-------G-G---AT--------------------CA----T--G-AAT--TACA--A--AA--AT--T--A---------ATT-T--TG-T-CT----T--A--C------A-A--AT--------T--A-A---C--T---T---T-------TGT-----C-A----T-G-----A-C-AA--------A----ATTT-----------CAAC-T---T---T-----------------T-----G-TA---------------G-----------A----TA---AA---G------CT----TC---------A-----A--------------------T----------TT--G----T-----------C-T-TG----------A----------C-----AT----AA--------T--G-----A-CT--TCT-T---G----T----A--C------A-CA--------TAA-G-------T-G--G--AT--------T-T-T--G---T--------A---AG--A-------C-----AA-----T-TGT-GTGAA----T----T------T----AT-T--------------------------------G----------C-A-----T--A-C------A---------A---ATGAG----A---AC-A--T-T--C-----------T---TCT-G-----T----AAT----C-AT-AA-T--T-A--A-AT---T----TTG-TC-----------G--G-ACAAcacaaggagtccatttggcgcctagtc
gi|22 : cggggcgctcaaatgggcctcgtgtgattttgtctc---A---A---AA-T-----AAT-T------TT---T---G---T--T--G--AC-A-AA---AT------CA----C--TT----TA----T------------GT-GGA---------G-C-------A-A----------A---A---ATAAA-TT----TTGT---------TG-AC-CAA-A---A-T--T-------C---------A---CT---TT-T-G------T----CA----C--A-A----CA----------------G-A---------AAT-T--CA-C-TT--T-T-----C------A-----------------------C--T---T---T-------TGT-----C-A----TTG-----A-C-AA--------A----A-TT-----------CA---C---T---T-----------------T-----G-TGT---------CAT--G-----------A----C----AA---A------AT----TC---------A---------------A-------T--T----------TT--G----T-----------ctgttttttactaatgataatttaatgggaagtaaaaagttgcatgaagagattaataactttacatgtaagggtagatcaaaaatgaaattttgtctaacaaaatcttcattttttgttgactaaattcacttttgtcattacaaaattcacttttgtgagacaaaaatgaatttttgttgacaaaaattatgaagacaaaaatgattggtt
gi|3 : T-----GTGAT-T----T----TG----T-----T-C-------------------T-C-------A-A----------A---A---AT----TCAT--TTTT--GC-TG--TG-AA-CAA-A---A-A--T---------------G-A---AT---TT-T-G------T-----A----C--A-A----CA-A--A--AA------TG-A---------GTT-C--AG-G-TA--A-C--AACC------A-A--AA--------T---------------------------CGT-----C-A----T-GAATTTA-C-AA--------A----A-AT-----------TAA----------------------------T-----T-TGT---------C-T--T-----------A----CA---AA---A------AT---------------A-----T-----C---A-------C--T----------TT--G----T-----------C-A-TG----------A----------C-----AA----AA--------T--T-----C-A---CTT-T---T----T--T-G--TAG----A-CA--------ACA-G-------T-C--A--AT--------T-T-T--G---T---CTT-TG---AC--A-------G-----AA-----T-T-A-A---T----T----T------T----GT-------------------------A---------------------A-----C--A-T------A---------A---GTG-G----A--------------------------T---TTT-G-----T----AG-----C-A--AA-T--GTG--A-AT---T----Tgtg
gi|7 : ctagataacagatgtaataaaaaacagtgaattttgttaaaaattttaacttgtcatgacaaatttcatttttggtcttcacaaagtgaattttgtcacaaaagagtacaaaaatgaaattttgttgacaaaattcacttttgtcatacttttaatataaatctcttcaagcaactatttttccaaattgcctaattgaagtttaaaattatcattagtaaaaacagttgtccgacaaaatttaatttatgaaattacagaacttgaatttcttcatttggtaaatgcaaatttagtttacaaaaatctTAAT-T---TT----TG----T-----C-A-A-------------------C-------A-A----------A---A---AT----TCATTTTTGT--C--TC--TC-AC--AA-A---A-G--T---------------G-A---AT---TT-T-G------T----AA----T--G-A----CA-A--A--AG------TG-A---------ATT-T--AG-T-CA--AGC--A--A------A-A--AA--------T--GAAG--A--T---T---T-------TGT------------T-G-----A-C-AA--------A----A-TT-----------CA-------T---T-----------------T-----T-TGT---------aagagtccatttggcgcccc
gi|2 : ggacaaaattaaattttgtatacgaaatcaaattttgttcacgacaaaatccatttttaaggcattaccaatttatattcaatctttgtcaatatatgtatgcaaatatcaatcttcattgtatacaaaatagactttgtttatcttagtttgattaaataaacaaaagtaattatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaactaaaactgaattgttgtcaaccaattctatttttgtctcat-G-A---------T-C-------A-A----------A---A---ATGAAATT----TTGT--C------TA-AC-AAA-A--TC-T--T-------C-------A-T---TT---TT-T-G------T----------T--G-AC---TA-A--A-------T--TC-A---------CTT-T--TG-T-CA--T-T--A--C------A-A--AA--------T--T-CA--C--T---T---T-------TGT-----G-A------G-----A-C-AA--------A----A-AT-----------GAA------T---T-----------------T-----T-TGT-----------T--G-----------A----CA---AA---A------ATTA--TG---------A-----A-----G---A-------tc
gi|21 : gggcgtcgaatggcgactgacttttttgtaatcaaaacccatttgtgtacacaaattgaagttccgtcacaacaaaattcattttattatgttgctttcatatataagcttcatttttgtattgattagttatacaaaattatttttcgcgtggacaaaattaaattttgtaacgaaaatcattttgtcacgacagaaagtccattttaaaggttaccaatttagtattccaatctttgtcaatattgtatgcaaatatcaatcttcattgtatacaaaataagactttgtttatcttagtttgcattaaataaacaaaagtaattattattgacaaagttgaatttgtcatacaaaagctggactttgttaacaaaactgaatttgatcaacaaattcattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttcaaccaatcatttttg-------A-A----------A---G---ATAA--TT----TTGT--GC------G-AC---A-A--CA----T-------T-------G-A---TT---TT-T-G------TGATTCA----T--G-A----TC-A--A--TTTTGT--TG-ACCTGAACTCATT-T--TG-T-TT--C-T--A--C------A-A--AA--------T-----T--CATT---T---T-------TGT-----C-C----A-C-----A-C-AA--------A----A-AT-----------GAAT-T---T---T-----------------
gi|16 : gctg---G---AT----TT----TTGT--CT-TG--------CAA-A---A-T--T-------C---------A---TT---TT-T-G------T----GT----C--G-A----CA-A--A--AA------TG-A---------ATT-T--TG-T-AG--A----A--C------A-A--AAAT------T--G-AG--T--T---C---A-------GGT-----C-A------------A-C-AA--------A----A-TT-----------GA-----------T-----------------C-----A-TGG---------AAT--C-----------A----CA---AA---A------AT----TT---------A-----A-----T-----------T--T----------CT--G----T-----------C----G-C--------A----------C-----AA----AA--------T----------A---TCT-T---A----CAGC-A----G----A-CA--------AAA-T-------T-C--A--C---------TAT-T--G---T---A---GA---AC--A-------A-----AG-----T---C-A---A----T----T------TT---GT-C----TG--------------------------G------------A-----C--A-G------A---------A---TT-------A---AC-T--T-T--G-----------T------------------AA-----C-A--TA-T--T-G--G-AT---T----TTG-Tgagaacaaaatcacaaggtcccatttggcgccccg
gi|15 : ttcattttggtatgcaaattagtttaaaaaatccaattcaactaatatgcaat--TG-AC-AAA-A--T-------------T-------G-A---AT---TT-T-G------T----CA----T--G-A----CA-A--A--A----T--TG-A-----------------G-T-TT--A-TCTA--C------A-A--AA--------T--G-G---A--T---T---T-------TGT-----T-G----T-G-----A-C-AA--------A----A-TT-----------GAAT-T---T---TGTCAACTGAAAAATAATT-----T-TGTATAACTTATCAA--T-----------A----CA---AA---A------AT-----G---------A-----A-----G-------------------------TT--A----T-----------T-A-TG-A--------AG---------C-----AA----CA--------T--------A-C---TTT-T---G----T----G--T-G----A-CA--------AAA-A-------T-G--A--AT--------T-T-T--G---T---TA--CG---AC--G-------G-----AA-----T-T-C-T---A----T----T------T----GT-------G-T------------------------A----------C-A-----C--A-A------A---------A---TTG-G---------T-T--T-T--G-------------------A-----T----TA-----C-A--AA-acaaggagtccatttggcgcctagtc
gi|17 : tgccgattgggacttgatctt--TG-AC--AA-A--T---------------------G-A---AT---TT-T-G------TTT--CA----T--G-A----CA-A--A--A----T--TT-A---------AGT-T--TA-T-CT--A-C--A---------A-A--AA--------T--G-G---A--T---T---T-------TGT-----C-AAC--T-G-----A---AA--------A----A-T-------------AAT-T---T---TGTACAA-----------C-----T-TAT---------CAA--T-----------A----CA---AA---A------AT---------------A-----A-----G-------------------------TT--A----T-----------T-G-GG-A--------AG---------C-----AA----CA--------T--------A-C---TTT-T---G----T--T----T-G----A-CA--------AAA-A-------T-G--A--AT--------T-T-T--G---T---TA--TG---AC--G-------G-----AAT----T-T-C-T---AT---T----T------T----GT-------G-T------------------------A----------C-A-----C--A-A------A--------------------------------T-T--G-----------T---TTT-GAT---T----CA-----C-A--AA-attatgtatgcaaatatcaatctcatttgcatacaaaatagacttttgttatctagtttgcattaaa
gi|7 : tG-AA-CAA-A---A-A--T---------------G-A---AT---TT-T-G------T----CA---------A----CA-A--A--AT--CT--TC-AT--------TTT-T--TG-C-TT--G----A--C------T-A--AA--------T--T-CA--C--T---T---T-------TGT-----C-A----T-T-----A-C-AA--------A----A-TT-----------CA-------C---T-----------------T-----T-TGT---------GAGA-G-----------A----CA---AA---A------A-----TG---------A-----A-----T-----------T--T----------TT--G----T---------------TG-A--------C----------A-----AA----AA--------T--T-----A-A---TG----------------A----G----A-CA--------AAA-A-------TAG--A--A---------T-T-G--G---T-------TG---AC--A-------AC----AA-----T-T-C-A---G----T----T------T----attatgtatgcaaatatcgatctcatttgcatacaaaatagacttttgttatctagtttgcataa
gi|22 : ggacaaaattaaattttgtatacgaaatcaaattttgttcacgacaaaatccatttttaaggcattaccaatttatattcaatctttgtcaatatatgtatgcaaatatcaatcttcattgtatacaaaatagactttgtttatcttagtttgattaaataaacaaaagtaattatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacta-AC-AAA-A--TA-A--T----------------------T---TT-T-G------T----------T--G-A----CA-A--A--A------------------------T--CACT-TT--A-T--G--TGGAGCAA-A--AA--------T--A-A---A--T---T---T-------TGT------------T-G-----A-CCAA--------A----A-TT-----------CA-------C---T-----------------T-----T-TGT---------CAC--A-----------A----CA---GA---A------AT----TC---------ACTTTTC-----A---C-------T--T----------TT--G----T-----------C-A-TT-G--------A----------C-----AA----AA--------T--T-----C-ACTTTG--T---G----T--C-A--T-G----A-CA--------AAA-T-------T-C--A--A---------T-T-T--
gi|15 : aca-CAA-A---A-G--T-------C-------T-A----T---TT-T-G------T-----A----T--G------CA-A--ATGAG--AT--TG-AT--------ATT-T---G-C-----A-T--A--C------A-T--AA--------T------------------------------------------T-G-----A-C-AA--------A----A-TT-----------GAAT-T---T---T--------------------------GT---------CAT--G-----------A----CA---AA---A-------T----TG---------A-----G--------------------T----------TT--A----T-----------C---T-----------A----------C-----AA----AA--------T--G-----G-A---TTT-T---G----T--T-G--T-G----A-CA--------AAA-T-------T-G--A--AT--------T-T-T--G---T-------CA---ACTGA-------A-----AA-----A-T-A-A---T----T----T------T----GTATAA--CT-TA---T---------CA----A--------------T-A-----C--A-A------A---------A---ATG-A----AGTTAT-T--A-T--GAAGCAACATACT---TTT-G-----TGTGACA-----A-A--AA-T----G--A-AT---T----TTG-TT------A----C--G-ACG-GAA---T--T---C----T--A--T---TTGTG--T--A----CA--------C--A-AA-----ATT----G-GTTTTg
gi|9 : tgccgattgggacttgatctttttgtaatc-CAA-A---A-G--T-------T---------A---AT---TC-T-G------T----CC----A--G-A----CA-A--A--A----T--TG-A---------CTT-T--TG-T-----A-T--A--C------A-A--AAG-------T--G-AA--T--A---T---T-------TGT-----C-A----T-G-----A-C-AA--------A----A-GT-----------GAA----------T-----------------T-----T-TGT---------C-T--G-----------C----TG---AA---A-------------G---------A-----T-----A---A-------T--T----------TT--G----T-------------G-CG----------A----------C-----AA----AA--------T--T-----A-AT--TTT-T---GTGATT--C-A--T-G----ATCAATTTTGTTGAC-C-------T-G--A--ACTCATT---T-T-T--G---T---T---CT---AC--A-------A-----AA-----T-T-C-----A----T----T------------T-T----TG-T----C---------CA-------------------C-A-----C--A-A------A---------A---AT--G----A---AT-T--T-T--G-----------ttatctagtttgcattaaa
gi|11 : acaaaaaattaattttgtccacaaaattaatttttcgtctacctaaatataatttcttttatgcaaccttttttccgcattgcccaatttaagttttaaattatcattgtaaaaacatttgtccaacaaaattcaattatgaatttttttcattttggtatgcaattagtttcacaaaaatccaaattcaactaatttgcatacaaaatccaaatatgtta-CAA-A---A-G--T-------T-------------AT---TTCT-G------T----CC----A--G-A----CA-A--A--A----T--TG-A---------CTT-T--TG-T-CT--A-C--A---------A-A--AG--------T--G-A---A--T---T---T-------TGT-----C-A----T-G-----A-C-AA--------A----A-GT-----------GAA----------T-----------------T-----T-TGT---------C-T--G-----------C----TG---AA---A-------------G---------A-----T-----A---A-------T--T----------TT--G----TGC---------C-A------------------------------AA----AA--------T--A-----A-AT--TTT-T---GTGATT--C-A--T-G----ATCAATTTTGCTGAC-C-------T-G--A--ATTCATT---T-T-T--G---T---T---CT---AC--A-------A-----AA-----T-T-C-----A----T----T------------T-T----TG-T----C---------CA-------------------C-A-----C--T-A------A---------A---AT--G----A---AT-T--T-T--G-----------agaagcaaatcacaagagtcccatttgggcgcccg
gi|30 : aaattaattttttgtctacctaaatataatttctttatgcaacttttttccgcgttgcccaatttaagtttaaattatcgtaaaaacattttgtccaaacaattcaattatgattttttttcattctggtatgcaaattagtttacaaaaatccaaattcaactaatttgcatacaaaatccaaatatgtta-CAA-A---A-G--T---------------G-A---AT---TT-T-G------T----CA----T--G-A----GA-A--A--A---GT--T--A---------ATT-T--TG-T-CA--A-C--A---------A-A--AA--------T--G-ATTCC--TGAGT---T-------TGT-----C----------------C-AA--------A----A-CT-----------TAAagaactcaaaatcacaagagtcccatttggcgcc
gi|22 : atgaaaattctagagattA-A--T-------T-------G-A---AT---TT-T-G------T----CA----T--G-A----CA-C--A--AA--GT---G-A---------ATT-T--TG-T-CA--A-TG-A--C------A-A--AAGTGAAAAGT--G-AA--T--T---T---C-------TGT-----T-G----T-G-----A-C-AA--------A----A-GT-----------GAA------T---T-----------------T-----T-GGT---------CA---------------A----CA---AA---A------TT----T--------------------------AT------T--T----------TT--GCT--C-----------C-A-C-----------A----------T-----AA----AG--------T--G-------A---TTT-T---G----T--C-A---------A-CA--------AAA-A-------T-T--A--T---------T-T-T--G---T---t
gi|3 : acaa--T-------T-------G-A---AT---TT-C-T------T----CA----TTTG-G----TA-A--A--TG------CA-A---------ATT-T--AG-T-TT--A-------C------A-A--AA-------------AT--C--TAAAT-------------T-----C-ACATTT-GCT---A-C-AA--------A----A-TC-----------CA-------C---T-----------------T-----A-TGT---------TAC------------------------AA---A------AT----TA---------A-----------------------T--T----------CT--G----T-----------C-A-AA-G--------A----------C-----AA----AA--------TT-G-----A-C---TGT-T---G----T--CTA--C-A----A--A--------AAA-G-------T-G--A--A---------T-T-TT-G---T---CA--TG---AC--A-------A-----AG-----T-----G---A----T----A------T----TT-T----TG-T---------------A----A---G------------A-----C--A-A------A--------------TT-A----A---TT-T--T-T--G-----------TAAATTC-A-----T----GA-----C-G--AT-TTTG-G--------------TTG-TT---A-------------CCTGAA---C-----------TC-A--T---TT-TTGTT--G----TA----C------A-AA-----ATTC-----ATTTTTG---TT-CACAG-CAAAAA--T-GAA-TT---T----T--T----GA-GA---AC---AAAA-Tg
gi|10 : ctagataacagatgtaataaaaaacagtgaattttgttaaaaattttaacttgtcatgacaaatttcatttttggtcttcacaaagtgaattttgtcacaaaagagtacaaaaatgaaattttgttgacaaaattcacttttgtcatacttttaatataaatctcttcaagcaactatttttccaaattgcctaattgaagtttaaaattatcattagtaaaaacagttgtccgacaaaatttaatttatgaaattacagaac-A---AT---CT-T-T------T----CC----A--G-A----CA-A--A--A----T--TG-A---------CTT-T--TG-T-----A-T--A--C------A-A--AAG-------T--G-AA--T--A---T---T-------TGT-----C-A----T-G-----A-C-AA--------A----A-GT-----------GAA----------T-----------------T-----T-TGT---------C-T--G-----------C----TG---AA---A-------------G---------A-----T-----A---A-------T--T----------TT--G----T-------------G-CG----------A----------C-----AA----AA--------T--T-----A-AT--TTT-T---GTGATT--C-A--T-G----ATCAATTTTGTTGAC-C-------T-G--A--ACTCATT---T-T-T--G---T---T---CT---AC--A-------A-----AA-----T-T-C-----A----T----T------------T-T----TG-T----C---------CA-------------------C-A-----C--A-A------A---------A---AT--G----A---AT-T--T-T--G-----------cacaaagagtccatttggcgcccc
gi|15 : tctaaattttctctacctaaatataatttctttatgccaacctttttccgcgattgcccaatttaagttttaaattatcattagtaaaaacattttgtccaacaaaattcaattatgaatttttttcattttggtatgcaaattagttcacaaaaatccaattcaactaatttgcatacaaaatccaaatatagttacaaaattT---TT-T-G------T----AA----T---------CA-A--A--A-------CC-A---------ATT-T--TG-T-GT--A-C--A--C------A-A--AT--------A--G-A---A--T---T---C-------CGT-----C-G----T-A-----A-C-AA--------A----A-TT-----------CA-------T---T-----------------T-----T-TGT---------CAC--------------A----CA---AA---A------GTATGTTGCTTCAT---A-----A-----T---AACTTCATT--T----------TT--G----T-----------A-T-TG-ATAAGTTATA----------C-----AA----AA--------T--T-----A-----TTT-T--------T--C-AGTT-G----A-CA--------AAA-T-------T-C--A--A---------T-T-TT-G---T---CA--CA---AC--A-------A-----AA-----T-C-C-A---T----T----T------T----GT------------------------------A---G------------A-----T--A-A------A--------------CT-C----A---AT-T--T-T--G-----------T---CAT-G-----A----CA-------A--AA-T--T-C--A-AT---T----TTG-TC---A--ATTATG--T-ATGCAAA---T--A---T----CA-A--T---CT-CA--T--T----TG----CATAC--A-AA-----A--TA--G-ACTTTTG-Tagaacaaaatcacaagagtcccatttggcgcccc
gi|2 : tgccgattgggacttgatctT---TC-T-G------T----CG----T--G-A----CA-A--A--A-------TG-A---------TTT-T--CG-T-T--------A--C------A-A--AA--------T-----T--TAAT---T---T-------TGT-----CCA----C-G-----C-G-AA--------A----A-AT------------AAT-T---T---TGTATAA-----------C-----T-AAT---------CAA--T-----------A----CA---AA---A------AT-----G---------A-----A-----G---C-------T--T----------AT--A----T-------------A-TG-A--------AAGCAACATAAT-----AA----AA--------T--G-----A-A---TTT-T---G----T--T-G--T-G----A-CG--------GAACT-------T-C--A--A---------T-T-T--G---T---G---TAC--AC--A-------A-----Atatctagtttgcattaaa
gi|6 : gggcgtcgaatggcgactgacttttttgtaatcaaaacccaT---TT-T-G------T----AA----T---------CG-A--A--A-------TC-A---------ATT-T--TG-T-GT--A-C--A--T------A-A--AA--------A--GTAA--A--A---T---C-------TGT-----C-A----C-A-----A-C-AA--------A----A--T-----------AA-------T---T-----------------T-----T-TGT---------C-T--A-----------A----CA---AA---T------AT-------------------------------A-------T--TATAC------TT--GTT--T-----------T-A-T--A--------A----------C-----TT----CA--------T--T-----------TTT-T---G----T--A-A--T-G----A-CA--------AAA-C-------C-A--A--A---------T-T-T--T---G---C---TAC--AC--A-------A-----AA-----T-T-A-T---A----T----T------T-----------------------------------------------------------C--A-A------A---------A---GT-------C---AT-T--T-T--G-----------A---TCT-------T----TA-----CAA--AA-T--C-A--A-TT---T----TTG-TCAATA--A----G--GTATGCAAA---T--AC--A----TGTA--TAAACT-TA--T--C----TGTAT-C---C--A-AA-----ATT----G-ACTTTTG-Tagtccattttaaaggttaccaatttagtattccaatctttgtcaatattgtatgcaaatatcaatcttcattgtatacaaaataagactttgtttatcttagtttgcattaaataaacaaaagtaattattattgacaaagttgaatttgtcatacaaaagctggactttgttaacaaaactgaatttgatcaacaaattcattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttcaaccaatcatttttgtcttcataatttttgtcaacaaaaattcatttttgtctcacaaaagtgaattttgtaatgacaaaagtgaatttagtcaacaaaaaatgaagattttgttagacaaaatttcatttttgatc
gi|7 : gggcgccaattgggacttgatctT---TT-T-G------T----CA---------A----CA-A--A--AA---T--TC-A---------TTT-T--TG-T-CT--C-TC-A--C------A-A--AAG-------T--G-A---A--T---T---T-------TGT-----A-A----T-G-----A-C-AA--------A----A-GT-----------GAA----------T-----------------T-----T-AGT---------CAA--G----------------CA---AA---A------AA----TG---------A-----A-----G---A-------T--T----------TT--G----T---------------TG----------A----------C-----AA----AA--------T--tacctaatttgcaaattaaatcacaagttaatttggtgagacaaaaataaatgttgtcatgacaaaagtgaccttcgtccgctcgataataattttatgtaacaaaatttacttttgtgatatgttgtaaaatttgttaatctgaactcatttttgttgaacaaactcacctttgtcaacgcgaaattggatttcaagtacaaaatcacaagaacctcactagtgtcc
gi|21 : ggacaaaattaaattttgtatacgaaatcaaattttgttcacgacaaaatccatttttaaggcattaccaatttatattcaatctttgtcaatatatgtatgcaaatatcaatcttcattgtatacaaaatagactttgtttatcttagtttgattaaataaacaaaagtaattatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaactaaaactgaattgttgtcaaccaattctatttttgtctcattaatT---TT-T-G------T----GT----G--G-A----CA-A--A--AA------TG-A---------ATT-T--TG-T-AG--A-A--A--C------A-A--AA--------T--G-AG--T--T---C---A-------GGT-----C-A------------A-C-AA--------A----A-TT-----------GA---------------------------------------T---------CAT--GAATC-------A----CA---AA---A------AT----C----------------------A---A-------T--G----------TT--G----T-----------C----G-C--------A----------C-----AA----AA--------T--tcatttttgttc
gi|12 : gctgaaagata---TT-T-G-----------CA----TTAG-A----TA-A--C--AA--ATG-TA-A---------ATT-T--TG-T-G---A-G--A--C------A-A--AT--------TT-G-A---A--T---T---T-------TGT-----C-A----T-G-----A-A-AA--------A----A-GT-----------GAATAG---TGAAT-----------------T-----G-TGT---------CAT--G-----------A----CA---AA---A------A-----TG---------A---------------A-------T--T----------AT--G----T-----------C-A-TG-A--------T----------A-----AA----AG--------T--G-----A-A---TTT-T---G----T-------T-G----A-AA--------AAA-T-------T-C--AT-A---------T-T-T--G---T---C---TA---CC--T-------A-----AA-----T-C-T-A---A----T----C------T----CT-T----CA-C----G---------CA----A---atgaattttgagaacaaaatcacaaggtcccatttggcgccccg
gi|9 : atgtagT-T-GA-----T----CA----T--G-AAT--CACA--A--AA--AT--T--A---------ATT-T--TG-T-C---G-C--A--C------A-A--AA--------T--T-AT--C--T---T---T-------CAG-----C-A------G-----A-C-AA--------A----A-TT-----------CA-------C---T-----------------T-----T-TGT---------CAT--G-----------A----CA---AA---T------AT----TC---------A-----C-----------------T--T----------TT--G----T-------------A-T-----------A----------C-----AA----AAG-------T--C-----A-A---TTT-T---G----T--C-T--G-G----A-CA--------GAA---------T-T--A--ACT-------T-T-T--G---T--------A---AC--A-------T-----AT-----T-T-G-G---A----T-----------------T-T----TG-T---------------A----T---G----------C-A-----A--A-T------T---------A---GTT-G----A---AT-T--T-G--GAT---------T---TTT-G-----T----ttttttcccattgtctaattgaagttaaaattaacattagtaaaaaaaactttgtcccacaaaattgaattatgaataacagtactgaatttcttcattttggtatgcataatagtttacaaaaatctaaattcaacaactttgcttacaaatccacttatgctacaaaagttaattctgtcaaaacatacatgcaattgattgttgtctacaaatgtgagttttgtcatgagaaatt
gi|11 : acaaaaaattaattttgtccacaaaattaatttttcgtctacctaaatataatttcttttatgcaaccttttttccgcattgcccaatttaagttttaaattatcattgtaaaaacatttgtccaacaaaattcaattatgaatttttttcattttggtatgcaattagtttcT-T-GA-----T----CA----T--G-AATCACA-A--A--AA--TT--T------------ATT-T-----T-TG--G-C--A--C------A-A--AA--------T--T-AT--C--T---T---T-------CAG-----C-A------G-----A-C-AA--------A----A-TT-----------CA-------C---T-----------------T-----T-TGT---------CAT--G-----------A----C----AA---A------AT----TC---------A---------------C-------T--T----------TT--G--------------------TA-G--------A----------C-----AA----AAG-------T--C-----A-A---TTT-T---G----T--C-T--G-G----A-CA--------GAA-A-------T----A--ACT-------T-T-T--G---T--------A---AC--A-------T-----AT-----T-T-G-G---A----T-----------------T-T----TG-T---------------A----T---G----------C-A-----A--A-T------T---------A---GTT-G----A---AT-T--T-G--GAT---------T---TTT-G-----T----ttttgttgacctgaactcatttttgttctacaaaattcatttttgtccacacaaaaatgaattttgagaagcaaatcacaagagtcccatttgggcgcccg
gi|3 : aaattaattttttgtctacctaaatataatttctttatgcaacttttttccgcgttgcccaatttaagtttaaattatcgtaaaaacattttgtccaaacaattcaattatgattttttttcattctggtatgcaaattagtttT-C-G------T----CA----T--G-AATT-TACA--A--AA--AT--T--A---------ATT-T---G-T-CT----T--A--C------A-A--AA--------A--T-AT--CA-C---T---T-------TGT-----C-A----T-G-----A-C-AA--------A----A-TT------------CAC-T---T---T-----------------T-----T-TGT----------A---G-----------A----CA---AC---A------GT----C----------------------A---A-------T--T----------TT--G----T-----------C-T-TT-G--------A----------C-----AG----AA--------T--T-----A-A---TTT-T---G------------T-A----A-CA--------TAA-G-------T-G--G--AT--------T-T-T--G---T--------A---GC--A-------AATGTGAA-----T-T-TAG---A----T----T------------T-T----TG-TAAACT---------AA----ATTTG----------C-ATTTACC--A-A------A---------T---GAA-G----A---AA-T--T-CAAG-----------T---TCT-GTAATTT----CA-----T-A--AA-T--T-A--A-AT---T----TTG-TC-----------G--G-AC---AA---C-----------TG-T--T---TT-TA--ttttgctgacctgaattcatttttgttctacaaaattcatttttgtccacactaaaatgaattttgagaactcaaaatcacaagagtcccatttggcgcc
gi|16 : ctagataacagatgtaataaaaaacagtgaattttgttaaaaattttaacttgtcatgacaaatttcatttttggtcttcacaaagtgaattttgtcacaaaagagtacaaaaatgaaattttgttgacaaaattcacttttgtcatacttttaatataaatctcttcaagcaactatttttccaaattgcctaattgaagtttaaaattatcattagA----T--G-T----TA-C--A--AA--GT--T--A---------ATT-C--TG-T-CC--A-G--A--C------A-A--AA--------TT-G-A---C--T---T-----------TGT-----T-C----T-------A-C-AA--------T----A-GT-----------GAAT-T---T---TGTCTGCTGTAAGATAT-T-----T-TGT----------GC--G-----------A----CA---GA---A------AT----TA---------A-----A-----T-----------T--T----------TT--G----T-----------G-A-TT-C-------------------C-----AT----GA--------T--C-----A-A---TTT-T---G----T-------T-G----A-CCT-------GAA-C-------T-C--A--A---------T-T-TTTG---T---T---CT---AC--A-------A-----AA-----T-T-C-----A----T----T------------T-T----TG------T---------CG----A--------------C-A-----C--A-A------A---------A---AT--G----A---AT-T--T-T--G-----------ttttggttgttacctgaactcatttttgttgtacaaaattcatttttgttcacagcaaaaatgaatttttgagaacaaaatcacaaagagtccatttggcgcccc
gi|3 : ttcattttggtatgcaaattagtttaaaaaatccaattcaactaatatgcaatacaaaatccaat----T--A-A----TA-A--A--AA--ACAGTG-A---------ATT-T--TG-T-T------------------A-A--AA-------------AT--T--T---TAACT-------TGT-----C-A----T-G-----A-C-AA--------A----T-TT-----------CA---T---T---T-----------------T-----T-GGT---------CTT--C-----------A----CA---AA---G------------TG---------A---------------A-------T--T----------TT--G----T-----------C---------------A----------C-----AA----AA-----------G-----A-G---T---------------------------A-CA--------AAA-A-------T-G--A--AAT-------T-T-T--G---T-------TG---AC--A-------A-----AA-----T-T-C-A---C----T----T------T----caagacaaaaatcacaaggagtccatttggcgcctagtc
gi|12 : ctagataacagatg--TG-A---------ATT-T--T--T-TC--A----A--C------A-A--AA--------T--T-CA--C--T---T---T-------TAT-----C-A----T-G-----A-C-AT--------A----A-TT-----------CA-------T---T-----------------T-----T-TGT---------CAT--G-----------A----CA---CA---ATTCACTAT----TC---------A---------------C-------T--T----------TT--T----T-----------C-A-TG----------A----------C-----AA----AA--------T---------------------------T--C-A--------------------------------------A--A---------T-T-T--G---T---C---TC---AC--A-------A-----AA-----T-T-T-AC--A----T----T------T----GT-T----tgtcatacttttaatataaatctcttcaagcaactatttttccaaattgcctaattgaagtttaaaattatcattagtaaaaacagttgtccgacaaaatttaatttatgaaattacagaacttgaatttcttcatttggtaaatgcaaatttagtttacaaaaatctaaattcacatttgctacaaaatccacttatgttacaaaattaattctgtcaaagacaaaattgactgttgtctacaaaaaagtgaattttgtcatgacaaagtgatatttttgtaagacaaattaatttttgtaaattcatgacgattttggttgttacctgaactcatttttgttgtacaaaattcatttttgttcacagcaaaaatgaatttttgagaacaaaatcacaaagagtccatttggcgcccc
gi|17 : atgtagtttgcattagat-A---------ATT-T---G-T-GT--A-C--A--C------A-A--AA--------TA-G-AA--A--T---T---C-------CGT-----C-A----T-A-----A-C-AA--------A----A-TT-----------CA-------T---T-----------------T-----T-TGT---------CA---A-----------A----CA---AA---A------GTA---TGTTGCTTCCCA-----A-----T---AACTTAT-T--T----------TT--G----T-------------A-TT-G--------A----------T-----AA------------------------------GT-T---G----T--------------A-CA--------AAA-T-------T-------A---------T-T-T--T---T---CAGTTG---AC--A-------A-----AA-----T-C-C-----A----T----T------------T-T----TG-T--------------------A---G------------A-----T----A------A---------A---CTT-A----A---AT-T--T-T--G-----------T---CAT-G-------------------A--AA-C--A-A--A-ATTCAT----TTG-TC---A--ATTATG--T-ATGCAAA---T--A---T----CG-A--T---CT-CA--T--T----TG----CATAC--A-AA-----A--TA--G-ACTTTTG-Ttatttgtctacctaaatctaatctcttcacgcaattttttcccattgtctaattgaagttaaaattaacattagtaaaaaaaactttgtcccacaaaattgaattatgaataacagtactgaatttcttcattttggtatgcataatagtttacaaaaatctaaattcaacaactttgcttacaaatccacttatgctacaaaagttaattctgtcaaaacatacatgcaattgattgttgtctacaaatgtgagttttgtcatgagaaatt
gi|13 : ttttgtgaatcaaaac-A---------ATT-T--TG-T-GT--A-C--A--C------A-A--AA--------T--A-GA--A--T---T---C-------CGT-----C-A----T-A-----A-C-AA--------A----A-TT-----------CAA----------T-----------------T-----T-TGT---------CAC--------------A----CA---AA---A------GT----tatctagtttgcataa
gi|14 : tacggggcgccgattgggacttgatccttttgcaatcaaaacc-A---------ATT-T--TG-T-T---A-C--A--C------A-A--AA--------TACG-AA--T--T---T---C-------GGT-----C-A----T-A-----A-A-AA--------A----A-TT--------------C-T---T---T-----------------T-----T-TGT---------CAC--A-----------C----CAT--AG---A------AG----TA---------A-----T-----G---A-------T--T----------gtgctgcttcgtaataacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataacttcatatttgtattgataagttatacaaaattatttttcattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtatgcaaatatcaatctcatttgcatacaaaatagacttttgttatctagtttgcattaaat
gi|10 : cggggcgccgattggacttgatcttttgtaatccaa---------ATT-T--TG-T-TC----T-----C------A-A--AA--------T-----T--CATT---T---T-------TGT-----G-T----G-G-----A-C-AA--------A----A-AT-----------GAAT-T---T---T--------------------------GT----------AG--A-----------A----CA---AA---A------AT-----G---------AGTTC-A-----G---G-------T--CAACAAAA---TT--GA---T-----------C-A-TG-A--------A----------TCACA-AA----AA--------T--T-----A-A---TTT-T---G----T--C-G--C------A-CA--------AAA-T-------T-------A---------T-C-T--T---T---CAG-CAG--AC--A-------A-----AA-----T-T-C-----A----C----T------T-------T----TG-T--------------CA----T---G------------A-----C--A-A------A---------T---ATT-C----A---CT-T--T-T--G-----------T-------A-----T-----A-----C-A--AA-A--G-TC-A-AT---T----TTG-TC---T--G-----------GAAAA---G--A---T----TA-A--T---TT-TG--T--------A----A---C--T-AT-----ATTTG--G-A-TTTTG-TATG-CAAAT-T--AGT--T-GAA-TT---gacttcataataaatcatttttgtaattgaaaatatatacaaattatttcttcagagctaaattgaatttctgtaacgacaaaaatccattttgtaatgctcattgacaaaattcatttttgtcaatctatgtatgtcaatatcaatctctttgcaatacaaaataggactgtttttatctaattgcattataaacaaacagtaaaatttt
gi|3 : tctaaattttctctacctaaatataatttctttatgccaacctttttccgcgattgcccaatttaagttttaaattatcattagtaaaaacattttgtccaacaaaattcaattatgaatttttttcattttggtatgcaaattagttcacaaaaatcc---------ATT-T--TG-T-TC--T-C--A--A------A-A--AT--------T--C-AT--T--T---TTG-C-------TGT-----G-A------------A-C-AA--------A----A-AT-----------GAAT-T---T---T--------------------------GT----------AC--A-----------A----CA---AA---A------AT-----G---------AGTTC-A-----G---G-------T--AACAACCAAAATC--G----T-----------C-A-TG-A--------A----------TTTACAAA----AA--------T--T-----A-A---T-T-T---G----T--C----T-T----A-CA--------AAA-A-------T-ATCA--C---------T-T-T--G---T---CA--TG---AC--A-------A-----AA-----T-T-C-A---C----T----T------T-----T-T----TG-T--------------------A---G------------A-----C--A-A------C---------A---GTC------A---AT-T--T-T--G-----------TC--TTT-G-----A----CA-----G-A--AT-T-------A-AT---T----TTG-T----------------------AA---C--ATAAG----TGGA--T---TT-TG--T--------A----G---C--A-AATGTGAATTTA--G-ATTTTTG-T-----AAAC-T--AAATTT-GCA-TT---T----A--CCA--AATGA---AG---AAAT-TC--AAG---T-------T-CTGTAATT--T--CA--T-----AAA-TTAAA---T-TTT--GTC----cacaagagtcccatttggcgcccc
gi|21 : ctagataacagatgtaataaaaaacagtgaattttgttaaaaattttaacttgtcatgacaaatttcatttttggtcttcacaaagtgaattttgtcacaaaagagtacaaaaatgaaattttgttgacaaaattcacttttgtcatacttttaatataaatctcttcaagcaactatttttccaaattgcctaattgaagtttaaaattatcattagtaaaaacagttgtcc---------ATT-T--TG-T-TC----T-----C------A-A--AA--------T-----T--CATT---T---T-------TGT-----G-T----G-G-----A-C-AA--------A----A-AT-----------GAA----------T-----------------T-----T-TGT---------AGA--A-----------A----CA---AA---A------------TG---------A-----G--------------------T----------TCAGG----T-----------C------A--------A----------C-----AA----AA--------T--------------TG------A----T--C-A--T-GAATCA-CA--------AAA-A-------T-C--A--A---------TGT-T--G---T---C---GC---AC--A-------A-----AA-----T-T-cacaaagagtccatttggcgcccc
gi|9 : gctgaaagatT-T--TG-C-TT--C-T-----C------A-A--AA--------T-----T--CATT---T---T-------TGT-----G-T----G-G-----A-C-AA--------A----A-AT-----------GAAT-T---T---T--------------------------GT----------AG--A-----------A----CA---AA---A------A-----TG---------AGTTC-A-----G---G-------T--CAACAAAA---TT--GA---T-----------C-A-TG-A--------A----------TCACA-AA----AA--------T--T-----A-A---TTT-T---G----T--C-G--C------A-CA--------AAA-T-------T-------A---------T-C-T--T---T---CAG-CAG--AC--A-------A-----AA-----T-T-C-----A----C----T------------T-T----TG------T---------CA----T---G------------A-----C--A-A------A---------T---ATT-C----A---CT-T--T-T--G-----------------T-A-----T-----A-----C-A--AA-A--GTC--A-AT---T----TTG-TC------T----G--G-AC-AGAA---T-----------TA-AC-T---TT-TG--T-------AA----C--------AT-----ATTTG--G-A-TTTTG-TATG-CAAAT-T--AGT--T-GAA-TT---T----cacaaggtcccatttggcgccccg
gi|24 : acaaaaaattaattttgtccacaaaattaatttttcgtctacctaaatataatttcttttatgcaaccttttttccgcattgcccaatttaagttttaaattatcattgtaaaaacatttgtccaacaaaattcaattatgaatttttttcattttggtatgcaattagtttcacaaaaatcc-T--A--C------A-A--AA--------T--G-CA--C--T---T---A-------TGT-----T------T---------C-AA--------A----A-GT-----------TAA----------T-----------------T-----C-TGT---------CAA--G-----------A----T----AA---A------AT----TG---------A---------------C-------T--G----------TT--G----T-----------C---TA-A--------A----------------AA----AG--------C--G-----A-A---ATT-C---G----T--C-CGTT-G----A-AA--------GA----------T-A--A--T---------T-T-T--G---C---A---TG---AC--A-------A-----AA-----T-T-A-AT--A----T----T------T----GT-------GAT----T---------CA----A---G----------tcacaagagtcccatttgggcgcccg
gi|22 : ct--A--C------A-A--AA--------T--A-AT-----T---T---T-------TGT------------T-G-----A-C-AA--------A----A--T-----------CACT-T---T---A-----------------T-----G-TG---------------G-----------AG---CA---AA---A------AT---------------------A-----A---A-------T--T----------TT--G----T---------------TG-A--------C----------C-----AA----AAT-------T--C-----A-C---TTT-T---G----T--C-A--C-A----A-CA--------GAA-A-------T-T--C--ACTTTTCACTT-T-T--G---T---CAT-TG---AC--A-------A-----AA-----T-T-C-A---C----T----T------T----GT-------G------T---------CA----T---G------------A-----C--A-A------A---------A----TT-C----A---AT-T--T-T--G-----------T---atcaattttgttg
gi|30 : --A--C------A-A--AAG-------T--G-A---A--T---T---T-------TGT-----C-A----T-G-----A-G-AA--------A----A-GT-----------TAA----------T-----------------T-----T-TGT---------CA---------------A----CA---AA---A------A-----TG---------ATTCC-T-----G---A-------G--T----------TT--G----T-----------C-C-AA-A--------A----------CTT---AA----AA--------T--g
gi|16 : atgaaaattctagag--------T--G-AT--T--T---T-----------TGT-----C-T----T-G-------C-AA--------A----A-TT-----------CA-T-T---T---T-----------------T-----G-TGT---------C----G-----------A----CA---AA---A------AT-----G---------A-----A-----------------T--T----------TT--G----T-------------A--G-A--------A----------C-----AA----AAAT------T--G-----A------GT-TCAGG----T--C-A---------A-CA--------AAA-T-------T-G--A--T---------C-A-T--GGAAT---C--------AC--A-------A-----AAA----T-T-T-A---A----T----T------T----CT-------G-T----C-------------------G----------C-A-----C--A-A------AATATCTTACA---GCA-GACAAA---AT-TCAC-T--A-----------T---TGT-A-----G----AA-----C-A--AA-G--T-C--A-AT---T----TTG-TC------T----G--G-AC-AGAA---T-----------TA-A--C---TT-TG--T--------------------A-AC-----ATATT--G-GATTTTG-TATTGCATAT-T--AGT--T-GAA-TT---
gi|13 : ttcattttggtatgcaaattagtttaaaaaatcc--C--T---T---T-------TGT-------G----T-G-----A-C-AA--------A----A-TT-----------GAA----------T-----------------T-----T-TGT---------TAT--G-----------A----CG---GA---A------TT----C----------------------T---A-------T--T----------TT--G----T-------------G-TA-C--------A----------C-----AA----AA--------T--T-----G-G---TTT-T---G---------A--T-T----G-CA--------AAA-G-------caaggagtccatttggcgcctagtc
gi|31 : tacggggcgccgattgggacttgatc--C--T---T---T-------CGT-----C-A----T-G-----A-C-AA--------A----A-TT-----------CA-----------C-----------------T-----T-TGT---------C---------------------CACTGAA---A------A----------------A-----A-----G---A-------T--T----------TT--G----T-----------C-A-AT-A--------T----------A-----AA----AA--------T--G-----A-AAT-TAT-T---G----T----A--T-G----A-tgtgctgcttcgtaataacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataacttcatatttgtattgataagttatacaaaattatttttcattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtatgcaaatatcaatctcatttgcatacaaaatagacttttgttatctagtttgcattaaat
gi|7 : ttagtatgttgct--T---T---T-------TGT-----C-A------------A-C-AA--------A----A-AT-----------TCAT-T---T---T-----------------T-----G-TCT---------C-T--C-----------A----CA---AA---A------GT-----G---------A-----A-----------------T--T----------TT--G----T-----------A-A-TG----------A----------C-----AA----AAG-------T--G-----A-A---TTT-A---G----T--C-A--A-G----C-AA--------AAA-A-------T-G--A--AGAT------T-T-T--G---T-------TG---AC--A-------A-----AA-----T-T-C-----A----T----T------------T-T----TG-T----T---------Cttaa
gi|12 : ggacaaaattaaattttgtatacgaaatcaaattttgttcacgacaaaatccatttttaaggcattaccaatttatattcaatctttgtcaatatatgtatgcaaatatcaatcttcattgtatacaaaatagactttgtttatcttagtttgattaaataaacaaaagtaattatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaactaaaactgaattgttgtcaaccaattctatttttgtctcattaat--T---T---T-------TGT-----G-A------G-----A-C-AA--------A----T-TT-----------GAAT-T---T---T--------------------------GT---------CAT--G-----------A-----A---AA---A------AG----TG---------A-----ATAGTGA---A-------T--T----------GT--G----T-----------C-A-TG-A--------C----------A-----AA----AA--------T--G-----A-A---TTA-T---G----T--C-A--T-G----A-TA--------AAA-G-------T-G--A--AT--------T-T-T--G---T---T---GA---A---A-------A-----AA-----T-T-C-AT--A----T----T------T----GT-
gi|31 : atgtagtttgcattagataacaaatgtaaaT-----C-A----T-------A-C-AAT-------A----A-TT-----------TCAT-T---T---T-----------------T-----A-TAT-----------T--G-----------A----CA---AA---A-------T----C----------------------------------T--T----------TT--T----T-----------C-AGTG-G--------A----------C-----AA----AG--------T--G-----A-A---TTT-T---G----T--C-A--T-G----A-CG--------AAA-G-------T-T--A--A---------ctacctaaatctaatctcttcacgcaattttttcccattgtctaattgaagttaaaattaacattagtaaaaaaaactttgtcccacaaaattgaattatgaataacagtactgaatttcttcattttggtatgcataatagtttacaaaaatctaaattcaacaactttgcttacaaatccacttatgctacaaaagttaattctgtcaaaacatacatgcaattgattgttgtctacaaatgtgagttttgtcatgagaaatt
gi|9 : ttagtatgttgct-----A-C-AA--------A----A-GT-----------TAAT-T---C---T--------------------------GT---------CCA--G-----------A----CA---AA---A-------T----TG---------A-----C-----------------T--T----------TT--G----T-------------A-T-----------A----------C-----AA----AAG-------T--G-----A-A---TAT-TT--G----T--C-A--T-G----A-CA--------AAA-G-------T-G--A--AT--------T-T-T--G---T---C---TG---CT--G-------A-----AA-----------G---ATAATT----T------T----GT-G----CG---------------------------------------A-----C--A-A------A---------A---TT-------A---AT-T--T-T--------------------T-G-----T----GA-----T-T--CA-T--G-ATCA-AT---T----TTG-TT--------------G-ACCTGAA---C-----------TC-AT-T---TT-TG--T--T----CT----A---C--A-AA-----ATTC-----ATTTTTG-TC---CACACAA--AAA--T-GAA-TT---T----
gi|11 : acaaaaaattaattttgtccacaaaattaatttttcgtctacctaaatataatttcttttatgcaaccttttttccgcattgcccaatttaagttttaaattatcattgtaaaaacatttgtccaacaaaattcaattatgaatttttttcattttggtatgcaattagtttcacaaaaatccaaattcaactaatttgcatacaaaatccaaatatgtt-----A-C-AA--------A----A-GT-----------TA-------T---T-----------------T-----C-TGT---------CCA--G-----------A----CA---AA---A-------T----TG---------A-----C-----------------T--T----------TT--G----T-----------C---T-----------A----------C-----AA----AAG-------T--G-----A-A---TTT-T---G----T--C-A--T-G----A-CA--------AAA-G-------T-G--A--AT--------T-T-T--G---T---C---TG---CT--G-------A-----AA-----------G---A----T----A------A----TT-T----TG-T------------------------G----------C-------C--A-A------A---------A---ATA-A----A---TT-T--T-T--G-----------T---GAT-------T----CA-----T-G--AT-C-------A-AT---T----TTG-CT--------------G-ACCTGAATT-C--A--------T-----T---TT-TG--T--T----CT----A---C--A-AA-----ATTC-----ATTTTTG-TC---CACAC-TA-AAA--T-GAA-TT---T----tgagaagcaaatcacaagagtcccatttgggcgcccg
gi|10 : aaattaattttttgtctacctaaatataatttctttatgcaacttttttccgcgttgcccaatttaagtttaaattatcgtaaaaacattttgtccaaacaattcaattatgattttttttcattctggtatgcaaattagtttacaaaaatccaaattcaactaatttgcatacaaaatccaaatatgtt-----A-C-AA--------A----A-TT------------AAT-C---T---T-----------------T-----T-C-----------CA---G-----------A----CA---AA---A-------T----TG---------A-----C-----------------T--T----------TT--G----T-------------A-T-----------A----------C-----AA----AAG-------T--G-----A-A---TAT-TT--G----T--C-A--T-G----A-CA--------AAA-G-------T-G--A--A---------T-T-TT-G---T---C---TG---CT--G-------A-----AA-----------G---A----TAATTT------T----GT-G----CG---------------------------------------A-----C--A-A------A---------A---TT-------A---AT-T--T-T--------------------T-G-----T----GA-----T-T--CA-T--G-ATCA-AT---T----TTG-TT--------------G-ACCTGAA---C-----------TC-A--T---TT-TTGTT--C----TA----C------A-AA-----ATTC-----ATTTTTG-TC---CACACAA--AAA--T-GAA-TT---T-------T----GA-GA---AC---AAAA-Ttgagaactcaaaatcacaagagtcccatttggcgcc
gi|22 : tctaaattttctctacctaaatataatttctttatgccaacctttttccgcgattgcccaatttaagttttaaattatcattagtaaaaacattttgtccaacaaaattcaattatgaatttttttcattttggtatgcaaattagttcacaaaaatccaattcaactaatttgcatacaaaatccaaatatagtt-----A-C-AA--------A----A-TT-----------GAAT-T---T---T--------------------------GT---------CAT--G-----------A----CA---CA---A------AG----TG---------A---------------A-------T--T----------TT--G----T-----------CAA-TG----------A----------C-----AA----AAGTGAAAAGT--G-----A-A---TTTCT---G----T--T-G--T-G----A-CA--------AAA-G-------T-G--A--AT--------T-T-T--G---G---T---CA---AC--A-------A-----AA-----T-T-T-----A----T----T------------T-T----TG-C----T---------C--------------------C-A-----C--ATA------A---------A---GTG----------AT-T--T-T--G-----------T---cacaagagtcccatttggcgcccc
gi|21 : -C-AA--------A----A-TT-----------CA-T-T---T---T-----------------T-----G-TGT---------G----G-----------A----CA---AA---A------AT-----G---------A-----A-----------------T--T----------TT--G----T-------------A-GA-A--------A----------C-----AA----AA--------T--G-----A------GT-TCAGG----T--C-A---------A-CA--------AAA-T-------T-G--ATCA---------T-G-A--A---T---C--------AC--A-------A-----AA-----A-T-C-A---A----T----------------GT-T-----G-T----C-------------------G----------C-A-----C--A-A------A---------A---caacaaaaattattttgtg
gi|7 : gctgaaagataa---T---T-----------------T-----T-TGT---------CA---------------A----CA---AA---A------AT----TC---------A-----T-----------------T--T----------TT--G----T-----------C-T-CT-C--------A----------C-----AA----AAG-------T--G-----A-A---TTT-T---G----T--A-A--T-G----A-CA--------AAA-G-------T-G--A--A---------T-T-TA-G---T---C---AA---GC--A-------A-----AA-----agaacaaaatcacaaggtcccatttggcgccccg
gi|4 : ggacaaaattaaattttgtatacgaaatcaaattttgttcacgacaaaatccatttttaaggcattaccaatttatattcaatctttgtcaatatatgtatgcaaatatcaatcttcattgtatacaaaatagactttgtttatcttagtttgattaaataaacaaaagtaattatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaactaaaactgaattgttgtcaaccaattctatttttgtctcattaa---T-----------------T-----T-TGT---------C-T-------------------CA---AA---A------TT----CC---------A-----------------------T--T----------TT--G----T-----------CTA-CA-G--------A----------C-----AA----AA--------A--T-----A-A---TTT-T---T----T--G-G--T-AC---A-CA--------AAA---------T-G--A--G---------T-T-CAGG---T---C----A---AC--A-------A-----AA-----T-T-C-G-------------------------GA-T----CA------T---------GA----A---T----------T-A-----C--A-A------A---------A---AT--T----A---AT-T--T-T--G-----------T---C---------T----TA-----C-A--AA-T--T-A--A-CT---T----TTG-TC------A----T--G-AC-AAAATTTC--A---A----C-----T---TT-TG--T--A----GA--------T--A-AA-----GCTTC--A-A--TTTG-TCTT-GACAaatgaagattttgttgacaaaattcatttttgttc
gi|21 : cggggcgctcaaatgggcctcgtgtga---T-----------------T-----T-TGT----------GC--G-----------A----CA---AC---A-------T----TG---------A-----T-----------------T--T----------TT--G----T-----------G-A-TT---------------------C-----AT----GA--------T--C-----A-A---TTT-T---G----T-------T-G----A-CCT-------GAA-C-------T-C--A--T---------T-T-T--G---T---TT--CT---AC--A-------A-----AA-----T-T-C-----A----T----T------T-------T----TG-T----C---------CA-------------------C-A-----C--A-A------A---------A---AT--G----A---AT-T--T-T--G-----------taatgacttcttgtacacataagtggattttgtaagacaattgtgtgaatttattgcatacaaatgagaacattcttctgtaatcataattaaattttgtcggacaactgttttttactaatgataatttaatgggaagtaaaaagttgcatgaagagattaataactttacatgtaagggtagatcaaaaatgaaattttgtctaacaaaatcttcattttttgttgactaaattcacttttgtcattacaaaattcacttttgtgagacaaaaatgaatttttgttgacaaaaattatgaagacaaaaatgattggtt
gi|12 : gctgaaagataa-----------------T-----T-TG----------CATTAG-----------A----TA---AC---A------AA----TG---------T-----A-----A---A-------T--T----------TT--G----T----------------G-AG-------A----------C-----AA----AT--------TT-G-----A-A---TTT-T---G----T--C-A--T-G----A-AA--------AAA-G-------T-G--A--A---------T-----------------------------------------AG-----T-----G---A----A----T------T----GT-------G-T--------------CA----T---G------------A-----C--A-A------A---------A---ATG------A---AT-T--A-T--G-----------T---CAT-G-----------A-----T-A--AA-A--GTG--A-AT---T----TTG-T------------------TGAAAA---A--A---T----TC-A--TA--TT-TG--T--C----TA----C---C--T-AA-----ATCT---A-ATC-----TCTT-CACGC-agaacaaaatcacaaggtcccatttggcgccccg
gi|30 : atgtag-----------A----CA---AA---A------GT-----G---------A-----A-----------------T--T----------TT--G----T-----------C-A-TG-A--------G----------A-----AA----AG--------T--T-----A-A---TTT-T---G----T--C-A---------A-CA--------AAA-ATGATTCCT-G--A--G---------T-T-T--G---T---C---CA---Aaattttttcccattgtctaattgaagttaaaattaacattagtaaaaaaaactttgtcccacaaaattgaattatgaataacagtactgaatttcttcattttggtatgcataatagtttacaaaaatctaaattcaacaactttgcttacaaatccacttatgctacaaaagttaattctgtcaaaacatacatgcaattgattgttgtctacaaatgtgagttttgtcatgagaaatt
gi|24 : atgaaaattctagagattttaagtt----CA---AA---A------GT----TA---------A-----------------------T--T----------CT--G----T-----------C-A-AG-A-------------------T-----AA----AA--------TT-G-----A-C---TGT-T---G----T--C----T-A----A--A--------AAA-G-------C-GA-A--A---------T-T-C--G---T---C---C
gi|22 : cttacaaaatgcacttatgttt---AA---A------AT----TG---------A-----A-----------------T--T----------TT--G----T-----------C-A-TG-AC-------A----------C-----AA----AG--------T--G-----A-A---TTT-T---G----T--C-AA-T-G----A-CA--------AAA-G-------T-G--A--A-----------------------------A---AG--T-------G-----AA-----T-T------------T----C------T----GT-T-----G-T------------------------G------------A-----C--A-A------A---------A---GTG------A---AT-T--T-T--G-------------------G-----T----CAA----C-A--AAAT--T-T--A-TT---T----TTGCTC---C--A----------C-ATAA------A---G----TG-A--T---TT-TG--T--C----AA----C---A--A-AA-----ATT------ATTTTgttgaaagataattttgcatgacaaaattaatatttgtgattcaagatcaattttgttg
gi|6 : ac-----G---A-------T--T----------TT--G----TA----------C-T-TG-A--------A-----------------------A--------T--CC----A-A---TTT-C---G----C--G-T--T-G----A-CA--------AAG-G-------T-G--A--G---------T-T-T--G---T---T---CA---AC--A-------A-----AAATGAGT-T-CAG---A----T----TAACAAAT----TT-TACAACA-T--------------------A---T----------C-A-----C--A-A------A---------A---GTA------A---AT-T--T-T--G-----------T---T---------------A-----C-A-----T--A-A--A-AT---TA---TTA-TC---G--A----GCGG-ACGAAG-----------G----TC-AC-T---TT-TG--T--C-----A----TGA-C--A-AC-----ATTT-----ATTTTTG-TCT----CAC-C--AAA--T-TAA-CT---T----G--T----GATgtg
gi|13 : gggcgccaattgggacttgatctttttgtaatcgaaatcaattttgtgtacataaaaagtaaaatctgtcacaacaaaataatttttgtctaacaaatatattatacttgttttataacttcattttttgtaatgacaaaaccaaattttgctacacaaaattatatttcaaaagtcattttgatctttacaaaatcaatttttgtcaataaggtatgcaaatacatgtataaacttatctgtatccaaaattgacttttgttacctaatttgcaaattaa-------T--T----------TT--G----C-----------A-A-T----------------------C-----AA----AA--------C--C-----A-A---TTT-T---G----T----G--T-AC---A-CA--------AAA-T-------A-G--A--A---------T-T-CC-G---T---CA--TA---AC--A-------A-----AA-----T-T-C-A---A----T-----------------T-T----TG------T---------CA-------------------C-A-----C--A-A------A---------A---GTG-acaagaacctcactagtgtcc
gi|16 : tacggggcgccgattgggacttgatcc--------A----------C-----AA----AA--------TCCA-----ATA---TGT-T-----------------------A-CA---------AA-G-------T-T--A--A---------T-TCT--G---T---C---CAG--AC--A-------A-----AA-----T-T---G---AC---T----T------T----GT-T----C--------------------------------------T-A-----C--A-A------T---------A---GT--G----A---AT-T--T-T--G---------------TCT-G-----C----TG-----T-A--A-------G--ATAT---T----TTG-Ttgctgcttcgtaataacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataacttcatatttgtattgataagttatacaaaattatttttcattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtatgcaaatatcaatctcatttgcatacaaaatagacttttgttatctagtttgcattaaat
gi|16 : ttcattttggtatgcaaattagtttaaaaaatccaattcaactaatatgcaat--------A----------C-----AA----AG--------T--T-----A-A---TTC-T---G----T--C-C--A-G----A-CA--------AAA-T-------T-G--A--C---------T-T-T--G---T---T---CT---AC--A-------A-----TA-----G-T---G---AAT--T----T------T----GT-C----TG-C----TG--------TA----A---GATATTTTGTGCGA-----C--A-G------A---------A---ATT-A----A---AT-T--T-T--------------------T-G-----T----GATTC--C-A-----T--G-ATCA-AT---T----TTG-TT--------------G-ACCTGAA---CTCA---A----T-----T---TT-TG--T--T----CT----A---C--A-AA-----ATTC-----ATTTTTG-TCGA-CACA--A--AAA--T-GAATTT---T----G--C----AA--G---AC---AAAA-gcgacagaaattaaatttttgtgattccatgatcaattttgttgacctgaactcaatttttgttctacaaaattcatttttgtcgacacaaaaatgaattttgcaagacaaaaatcacaaggagtccatttggcgcctagtc
gi|30 : ttcattttggtatgcaaattagtttaaaaaatccaattcaactaatatgcaatacaaaatccaatatgtt--------A----------C-----AA----AAG-------T--G-----A-A---TTT-T---G----T--C-A--T-G----A-GA--------AAA-G-------T-T--A--AT--------T-T-T--G---T-------CA---AC--A-------A-----AA-----A-T---G---A----T----T------CCTGAGT-T----TG-T----C---------CA----A---A------------A-----CTTA-A------A---------ATCTCTA-G----A---AT-T--T-T--atcacaaggagtccatttggcgcctagtc
gi|28 : atg--------T--G-----A-A---T---T---A----T--C-A--T-T----AGTA--------AAA-A-------T----A--T---------T-T-T--G---T---C---CA---AC--A-------A-----AA-----T-T-C-A---A----T----T------
gi|31 : gtctaccaaaatataatttctttatgcaaattttttccgcgttgccaaatttaagttT-C---G----T--C-A--T-G----A-CA--------AAA-T-------T-C--A--C---------T-T-T--G---T---C---CACTGAA--A-------A-----AA-----------G---A----T-----------------T-T----TG------T---------CA----A--------------T-A-----T--A-A------A---------A---ATG-A----A---AT-TA-T-T--G-----------T---atgaat
gi|5 : ttagtatgttgcttcat----A-CA--------AAA-A-------T-G--A--A---------T-T-TT-G---T---C---CA----C--A-------A-----AA-----T-T---A---A----T----T------------T-T----CG-T----C---------TACCTTA---A----------T-A-----T--A-ATCTCTTT---------A---G-G-C----A---AC-T--T-T--T-----------T---TCC-G-----T----CATTGTTC-A--AT-T--T-A--A-GT---TTAAATTA-TC---ATTA----G--T-A--AAAA---C--------------A--T---TT-TG--T--C----CA----A---C--A-AA-------TTC--A-ATTaagttaa
gi|7 : ----A-CA--------AAA-A-------T-G--A--A---------T-T-TT-G---T---C----A---AC--A-------A-----AATC---T-T-C-----A----T----T------T-----T-T----TG-C----T---------TG---------------------A-----C--T-A------A---------A----TT-C----A---CT-T--T-T--G-----------T-----C-A-----T----TA-----CAA--AA-T--T-C--A-CT---T----TTG-TG---A--G----A--G-ACAAAAA---------------TG-AATT---TT-TG--T--T----GA----C---A--A-AA-----ATTatgaattacataacagattttttttcattttggtatgcaaattagtttacaaaaatccaaattcaactaatttccatacaaaatccaattatgttacaaaagttaattctgtccagaaaacatcatggtttcaaggttatgtaaaaaatactaacactttccactttctgaacagtttttgtaaatctttgaatattgacttgagttatattctgaaaacaaatgtatttaatctgatcaatcatgaaatgctgttatcatttccatcgttttacagagaagcaattatatttttcatggacggtaagaaaattgagaaattgtgtgacttgtcctcaaactcttttcttcgacaaac
gi|2 : ggacaaaattaaattttgtatacgaaatcaaattttgttcacgacaaaatccatttttaaggcattaccaatttatattcaatctttgtcaatatatgtatgcaaatatcaatcttcattgtatacaaaatagactttgtttatcttagtttgattaaataaacaaaagtaattatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaactaaaactgaattgttgtcaaccaattctatttttgtctcatt-CA--------AAA-A-------T-G--A--AAT-------T-T-T--G---T---C---TA---AC--A-------A-----AATC---T-T-C-----A----T----T------T-----T-T----TG-T----T-------------------G------------A-----C--T-A------A---------A----TT-C----A---CT-T--T-T--G-----------T-----C-A-----T----TA-----CAA--AA-T--T-C--A-CT---T----TTG-TG---A----------G-ACAAAAA---------------TG-AATT---TT-TG--T--T----GA----C---A--A-AA-----ATTtc
gi|21 : gggcgtcgaatggcgactgacttttttgtaatcaaaacccatttgtgtacacaaattgaagttccgtcacaacaaaattcattttattatgttgctttcatatataagcttcatttttgtattgattagttatacaaaattatttttcgcgtggacaaaattaaattttgtaacgaaaatcattttgtcacgacagaaagtccattttaaaggttaccaatttagtattccaatctttgtcaatattgtatgcaaatatcaatcttcattgtatacaaaataagactttgtttatcttagtttgcattaaataaacaaaagtaattattattgacaaagttgaatttgtcatacaaaagctggactttgttaacaaaactgaatttgatcaacaaattcattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttcaaccaatcatttttgtcttcat-G-------T-G--A--T---------T-T-T--G---T---T---CT----C--A-------A-----AA-----T-T-C-----A----T----T------T----TT-G----TG-T------------------------G----------G-A-----C--A-A------A---------A---ATG------A---AT-T--T-T--G-----------T---atc
gi|2 : gctgaaagataattttgtgcgacaacattgatttttgtgattcatgatcaattttgttgacctgaactcattttgtttct---------T-T-T--G---T---C----A---AC--A-------A-----AAA----T-T-C-----A----T----T------T-------T----TG-T----C---------T--------------------C-A-----C--A-A------A---------A---GTG------A---AT-T--T-T--G-----------T---AAT-G-----------A-----C-A--AA-A--GTG--A-AT---T----TAG-TC---A--A----C--A-A--AAAA---T--G---A----AG-A--T---TT-TG--T--T----AG----A---C--A-AA-----ATTTC----ATTTTTG-aaggtcccatttggcgccccg
gi|22 : gggcgtcgaatggcgactgacttttttgtaatcaaaacccatttgtgtacacaaattgaagttccgtcacaacaaaattcattttattatgttgctttcatatataagcttcatttttgtattgattagttatacaaaattatttttcgcgtggacaaaattaaattttgtaacgaaaatcattttgtcacgacagaaagtccattttaaaggttaccaatttagtattccaatctttgtcaatattgtatgcaaatatcaatcttcattgtatacaaaataagactttgtttatcttagtttgcattaaataaacaaaagtaattattattgacaaagttgaatttgtcatacaaaagctggactttgttaacaaaactgaatttgatcaacaaattcattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttcaaccaatcatttttgtcttcataatt-A-----C--A-A------A---------A---TTG------A---AT-T--T-T--G-----------T---CAT-G-----A----CA-----C-A--AA-G--T-G--A-AT---T----TTG-TC---A--A----T--G-AC---AA---A--A---G----TG-A----------------------------------A-AA-----GT-----GAATTTCTG-TTGT-GACA--A--AAG--T-GAA-TT---T-------T----GGTCA---AC---AAAA-TT---TA---T-------TTTTGC---T--C--CACAT-----AAAGTG--A---T-TTT--GTC----atc
gi|12 : -A-----C--A-A------A---------T---GTA------A---AT-T--T-T--G-----------T-------G-----A----GA-----C-A--AA-T--TTG--A-AT---T----TTG-TC---A-------------TGAAAA---A--A---G----TG-A----------A--T-----------------------A-----GT-----G-AATTGTG-TCAT-GACAA----AAA--T-GAA-TT--------A--T----G-TCATG-AT---AAAAGTG--AA----T-------T-TTG----T--T--GA-AA-----AAA-TTC-A---TATTT--GTC----TA--C-CTA-----A-ATCTAATCTCTTCA-CGC--A-A--TTTTTTCC---C-A---TTGT--CTA----ATT-GAAGTTA-AAATTAA-CAT-TAGTAAAA---AA-AA-CTT-TGTCCCACAA----AAT----TG-----A--ATTATGAATA--A---CA---G-----TACTGAATTTCTTCATTTTGGT--ATGCATAA--TAG--TTTACAAAAAT-CTAAATTCAACA----ACTTTGCT------TACAAA-TCC-ACTTATG---CTACAA-AAGTTAATTaacaaaaattattttgtg
gi|30 : atgtagtttgcattagata-A-----C--A-A------A---------A---GT--G----A---AT-T--T-T--G-----------T---CAT-G-----------A-----G-A--AA-A--GTT--A-AT---T----TTG-TC---A------------ACAAAAA---T--G---ATTCCTG-A--G---TT-TG--T--C----CAAAACT---T--A-AA-----ATCTCTAG-AATTTTctgtcaaaacatacatgcaattgattgttgtctacaaatgtgagttttgtcatgagaaatt
gi|7 : atg----A---AT-T--C-T--A-----------T---TTTTG-----T----CT-----C-ATTAA-T----------T---T----TTG-TC---A--A----------CAAAAATT-C--A--------T-----T---TT-TG--T--CTCT-CA----C---A--A-AA-----GT-----G-AATTTTG-TAAT-GACAA----AAG--T-GAA-TT---T----AGTC----AAGCA---A----AAAA-TG--AAG---A-------TTTTG----T--T--GA-CA-----AAA-TTC-A---T-TTT--
gi|2 : ggacaaaattaaattttgtatacgaaatcaaattttgttcacgacaaaatccatttttaaggcattaccaatttatattcaatctttgtcaatatatgtatgcaaatatcaatcttcattgtatacaaaatagactttgtttatcttagtttgattaaataaacaaaagtaattatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaactaaaactgaattgttgtcaaccT-T--T-T--G-----------T----CT-------T----CA-----T-A--A--T----------T---T----TTG-TC---A--A----------CAAAAATT-C--A--------T-----T---TT-TG--T--CT---CA----C---A--A-AA-----GT-----G-AATTTTG-TAAT-GACAA----AAG--T-GAA-TT---T----A--------GTCA---ACAA-AAAA-TG--AAGATTT-------TGTTA----G--A--CA--------AAA-TTTCA---T-TTT--tgttc
gi|4 : gggcgtcgaatggcgactgacttttttgtaatcaaaacccatttgtgtacacaaattgaagttccgtcacaacaaaattcattttattatgttgctttcatatataagcttcatttttgtattgattagttatacaaaattatttttcgcgtggacaaaattaaattttgtaacgaaaatcattttgtcacgacagaaagtccattttaaaggttaccaatttagtattccaatctttgtcaatattgtatgcaaatatcaatcttcattgtatacaaaataagactttgtttatcttagtttgcattaaataaacaaaagtaattattattgacaaagttgaatttgtcatacaaaagctggactttgttaacaaaactgaatttgatcaacaaattcattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttcaaccaatcatT-T--T-T--G-----------T----CT-------T----CA-----T-A--A--T----------T---T----TTG-TC---A--A----------CAAAAATT-C--A--------T-----T---TT-TG--T--CT---CA----C---A--A-AA-----GT-----G-AATTTTG-TAAT-GACAA----AAG--T-GAA-TT---T----A--------GTCA---ACAA-AAAA-TG--AAGATTT-------TGTTA----G--A--CA--------AAA-TTTCA---T-TTTTGATC----TAC-C-CTT-----ACATGTAA--AGTTAT-TA---A----TCTCTTCATG-C-AACTTTTTACT--TCCCA--------TT-AAATTAT-CAT-TAGTAAAA---AA-CA--GT-TGTCCGACAA----AATTTAATT-----ATGATTAC--A-G--A---AGAATG-----T------TCTC---ATTT--GT--ATGC--AA--T------------------AAATT-CACACA--ATTGTC-T------TACAAAATCC-ACTTATGT--GTACAAGAAGTCAtgatc
gi|30 : cggggcgctcaaatgggcctcgtgtgattttgtctcaaaattccattttgtctacagacaaaaataattttttggtacacaaaatgagttcaggtcaacaaaattcggatcatgaattacaaaaattaattttgtcttacaaattaacttttgtcatgacaaaatttcaacttttgtagataaagcttcaatttgtcttgacataaA-----C-A--AA-A--GTG--A-AT---T----TTG-TC----------------ATGAGAA---A--A---GT---TA-A--T---TT-TG--T--C----AA----C---A--A-AA-----AT-----G-ATTCCTG-atgattggtt
gi|15 : atgaaaattctagagattttaagttttggacaaact-A--AA-T--T-G--A-AT---T----TTG-TC----------------ATGACAA---A--A---T----TG-A--G---TT-TA--T--C----TA--------C--A-AA-----AT-----G-GATTTTG-TTGT-GACA--A--AAT--T-GAA-TT---T-------T----G-TCA---ACTGAAAAA-TA--ATT---T-------TGT
gi|3 : tgccgattgggacttgatctttttgtaatcaaaaccaattttgtgtacacaaatagaattccgtcgtaacaaaattcatttttgtcacacaaaagtatgttgcttcataataacttcatttttgtattgataagttat-G--A-AT---T----TTG-TT---A--A--------------AA------------------A--T---TT-TA--A--CTTGTCA----T---G--ACAA-----ATTTC----ATTTTTGGTCTT-CACA-----AAG--T-GAA-TT---TTGTCA--CAAAAGAGTA---CA---AAAA-TG--AAA---T-------T-TTG----T--T--GA-CA-----AAA-TTC-AC--T-TTT--GTCATACT---T-TTA-----ATATA-AATCTCTTCA-AGC--AACTATTTTT--CCA-A-A---TTG--CCTA----ATTG-AAGTTTAAAATTAT-CAT-TAGTA-AA---AA-CA--GT-TGTCCGACAA----AATTTAATTTATGAA--ATTAC--A-G--AACTTG---A-----A------TTTCTTCATTT-GGTAAATGC--AAATTTAG-TTTACAAAAAT-CTAAATT---CAC---ATTTGC--------TACAAAATCC-ACTTATG---TTACAA-AA-TTAATTtgtcaattatgtatgcaaatatcaatctcatttgcatacaaaatagacttttgttatctagtttgcattaaa
gi|21 : ctagataacagatgtaataaaaaacagt--A-AT---T----TTG-TT--------------G-ACCTGAA---C-----------TC-A--T---TT-TG--TTTC----TA----C------A-AA-----ATTC-----ATTTTTG-TC---CACACAA--AAA--T-GAA-TT---T-------T----GA-GA---AC---AAAA-Tctgtcaaagacaaaattgactgttgtctacaaaaaagtgaattttgtcatgacaaagtgatatttttgtaagacaaattaatttttgtaaattcatgacgattttggttgttacctgaactcatttttgttgtacaaaattcatttttgttcacagcaaaaatgaatttttgagaacaaaatcacaaagagtccatttggcgcccc
gi|10 : gctgaaagataattttgtgcgacaacattgatttttgtgattcatgatc---G----TG-A--T---TT-TG--T--T----C-----T---C--A-AA-----ATTC-----ATTTTTG-TGTG-GACA--A--AAA--T-GAA-TTTTGT----A-------GAACA--------AAAA-TG--AGcacaaggtcccatttggcgccccg
gi|4 : tctaaattttctctacctaaatataatttctttatgccaacctttttccgcgattgcccaatttaagttttaaattatcattagtaaaaacattttgtccaacaaaattcaattatgaatttttttcattttggtatgcaaattagttcacaaaaatccaattcaactaatttgcatacaaaatccaaatatagttacaaaattaatcttttccagacaaaattgacttttgtatacaaaagtgaatatttgtcatgacaaaagtgaattttgtctgctgaaagataattttgtgcgacaaaattaatttttgtgattcatgatcaattttgttgacctgaa---G----TG-A--T---TT-TG--T--C----T---------C--A-AA-----ATTCC--A---TTTTG-TCTA-CAGAC-A--AAAA-T-AAT-TT---T----T--T----GGTAC---AC---AAAA-TG--AGaagagtcccatttggcgcccc
gi|21 : cggggcgctcaaatgggcctcgt---G----TG-A--T---TT-TG--T--T----C-----T---C--A-AA-----ATTC-----ATTTTTG-TGTG-GACAA----AAA--T-GAA-TT---TTGT-A-------GA--A---AC---AAAA-TG--AGttcaggtcaacaaaattcggatcatgaattacaaaaattaattttgtcttacaaattaacttttgtcatgacaaaatttcaacttttgtagataaagcttcaatttgtcttgacataatgacttcttgtacacataagtggattttgtaagacaattgtgtgaatttattgcatacaaatgagaacattcttctgtaatcataattaaattttgtcggacaactgttttttactaatgataatttaatgggaagtaaaaagttgcatgaagagattaataactttacatgtaagggtagatcaaaaatgaaattttgtctaacaaaatcttcattttttgttgactaaattcacttttgtcattacaaaattcacttttgtgagacaaaaatgaatttttgttgacaaaaattatgaagacaaaaatgattggtt
gi|15 : gctgaaagataattttgtgcgacaacattgatttttgtgattcatgatcaattttgttgacctgaa---C--A-AA-----ATT----G-AATTTTG-TCAT-GACAA----AAT--T-GAG-TT---T----A---------TCT---AC---AAAA-TGG-ATT---T-------TGTTG----T--GA-CA--------AAA-TTGAA---T-TTT--GTC----A---A-CTG-----AAAAATAATTTTGTAT-aaggtcccatttggcgccccg
gi|22 : tgccgattgggacttgatctttttgtaatcaaaaccaattttgtgtacacaaatagaattccgtcgtaacaaaattcatttttgtcacacaaaagtatgttgcttcataataacttcatttttgtattgataagtt---C--A-AA-----ATT----G-AATTTTG-TCAT-GACAC-A--AAG--T-GAA-TT---T-------T----G-TCAATGAC---AAAAGTGAAAAG---TGAATTTCTGTTG----TGACAAAA-GT-----GAA-T-------T-TTG--GTC------------A-----ACA-A-AATTTATTTT-TGC--tcaattatgtatgcaaatatcaatctcatttgcatacaaaatagacttttgttatctagtttgcattaaa
gi|27 : aAG--T-GAA-TT---T-------T----G-TCA---ACA--AAAA-TG--AA------------TCTTG-------C--CA-GTCGACAAAA-TTC-AT--T-TTT--GTT----TA--T-CTA-----A-ATATTATCTCTTCA-TGCA-A-C---TTTTTCCC--C-A---T--TGCCTA----ATT-TAAG-TT-AAAtccacataaagtgattttgtcaacaaaaattattttgtg
gi|9 : CA---A----AAAA-TT--AA----T-------T-TTG----T--C--CA-CA-----AAA-TT--AATTT-TTC--GTC----TA--C-CTA-----A-ATATAATTTCTTTTATGC--AACCTTTTTT--CCG-C-A---TTG--CCCA----ATT-TAAGTTTTAAATTAT-CATT--GT--AA---AAACA-TTT--GTCCAACAA----AATTC---------A--ATTA----TG--AA--TT---T-----T------TTTC--A-TTTTGGT--ATGC--AA--TTAGTTTCACAAAAATCC-AAATT---CAACT-AATT---TGC---ATACAAAATCC-A--AATATG-TTACAA-AAGTTAATT
gi|5 : a---AAAA-TG--AA----T-------T-TTG----T--C--CA-CA-----AAA-TT--AAT-T-TTC--GTC----TA--C-CTT-----A-ATATAATCTCTTTA-GGC--AACTTTTTT---CCGTC-A---TTGT------TCAATT-TAAGTTT-AAATTAT-CAT-TAGTA-AA---AA-CA-TTT-TGTCCAACAAATTCAATTA--TG-----A--ATTAC--ATA--A---CA---GATTTTT------TTTC---ATTTTGGT--ATGCA-AA--TTAG-TTTACAAAAATCC-AAATT---CAACT-AATTTC---C---ATACAAAATCCAA-TTATG---TTACAA-AAGTTAATTctgtccagacaaaattgacttttgtatacaaaagtgaatatttgtcatgacaaaagtgaattttgtctgctgaaagataattttgtgcgacaaaattaatttttgtgattcatgatcaattttgttgacctgaactcatttttgttctacaaaattcatttttgtccacacaaaaatgaattttgagaagcaaatcacaagagtcccatttgggcgcccg
gi|8 : acaTTG----T--C--CA-CA-----AAA-TT--AAT-T-TTC--GTC----TA--C-CTT-----A-ATATAATCTCTTTA-GGC--AACTTTTTT---CCG-C-A---TTGT------TCAATT-TAAGTTT-AAATTAT-CAT-TAGTA-AA---AA-CA-TTT-TGTCCAACAAATTCAATTA--TG-----A--ATTAC--ATA--A---CA---GATTTTT------TTTC---ATTTTGGT--ATGCA-AA--TTAG-TTTACAAAAATCC-AAATT---CAACT-AATTTC---C---ATACAAAATCCAA-TTATG---TTACAA-AAGTTAATTctgtccagaaaacatcatggtttcaaggttatgtaaaaaatactaacactttccactttctgaacagtttttgtaaatctttgaatattgacttgagttatattctgaaaacaaatgtatttaatctgatcaatcatgaaatgctgttatcatttccatcgttttacagagaagcaattatatttttcatggacggtaagaaaattgagaaattgtgtgacttgtcctcaaactcttttcttcgacaaac
gi|11 : tt-----AAA-TT--AATTT-TTT--GTC----TA--C-CTA-----A-ATATAATTTCTTTA-TGCA-A-CTTTTTT---CCG-C-G---T--TGCCCA----ATT-TAAGTTT-AAATTAT-CG--TA----AA---AA-CA-TTT-TGTCCA--AAC---AATTC---------A--ATT----ATG--A---TT---T-----T------TTTT--CATTCTGGT--ATGCA-AA--TTAG-TTTACAAAAATCC-AAATT---CAACT-AATT---TGC---ATACAAAATCC-A--AATATG-TTACAA-AAGTTATTTctgtccagaaaacatcatggtttcaaggttatgtaaaaaatactaacactttccactttctgaacagtttttgtaaatctttgaatattgacttgagttatattctgaaaacaaatgtatttaatctgatcaatcatgaaatgctgttatcatttccatcgttttacagagaagcaattatatttttcatggacggtaagaaaattgagaaattgtgtgacttgtcctcaaactcttttcttcgacaaac
gi|19 : -----AAA-TT--AAT-T-TTC--GTC----TTAAC-CTA-----A-ATATAATTTCTTTA-TGCG-A-CTTTTTTTCCTTG-C-A---T--TGCCCA----ATT-TAAGTTT-AAATTATGCA--TAGT--AATTTAA-CA-TTTGTGTCCAAC-A----AATTC---------A--ATT-----TG--A---AT---T-----T------TTTC---ATTTTGGT--ATGCA-AA--TTA--GTT-CACAAATCC-AAATT---CAACTAATTTGCATctgtccagacaaaattgacttttgtctacaaaagtgaattttgtcatgacaaaagtgaattttgtctgctgaaagataattttgtgccaaaaataaatttttgtgattcatgatcaattttgctgacctgaattcatttttgttctacaaaattcatttttgtccacactaaaatgaattttgagaactcaaaatcacaagagtcccatttggcgcc
gi|25 : a-----AAA-TTTAA---T-TTT--TTC----TA--CGCTA-----AGATATAATTTCTTTG-TGC--A--TTTTTTTTTCCG-C-A---TTG---CCA---AATTTAAGGTTT-AAATCAT-CAT-TAGTG-AA---AA-CATTTT-TGTT--CCAAAC--AATTT--CA-----G--ATT----ATG--A---Tcct
gi|18 : a-----AAA-TTC-A---T-TTTT-GTC----TA--C-CTACATGTAAATATAATCTCTTCA-TGC--AACTTTTTCTTCCCA-----------------------------TT-AAATTAT-CAT-TAGTA-AA---AA-CA-GTT-TGTCCGACAA----AATTTAATTATG--A--ATTAC--A-GAAA---TG---A-----A------TTTCTTCATTTTGGT--ATGC--A-------------ATAAAT------TC-AACAA---ATTTGC-T------TACAAAATCC-ACTTATG---TTACAA-AAGTCAAt
gi|10 : gttgaca--A---T-TTT--CTC----TA--C-CTA-----A-ATATAATTTCTTTA-TGCCAA-CCTTTTT---CCG-CGA---TTG--CCCA----ATT-TAAGTTTTAAATTAT-CAT-TAGTA-AA---AA-CA-TTT-TGTCCAACAA----AATTC---------A--ATT----ATGA-A---TT---T-----T------TTTC---ATTTTGGT--ATGCA-AA--TTAG-TTCACAAAAAT-C-CAATT---CAACT-AATT---TGC---ATACAAAATCC-A--AATATAGTTACAA-AA-TTAAT
gi|28 : tctaa--GTC----T---A-CCA-----AAATATAATTTCTTTA-TGC--A-AATTTTTT--CCG-C-G---TTG---CCA----AATTTAAGTTT-GAATTAT-CAT-TAGT--AA---AAATA-TTT-TGTCCAACAA----AATTC---------A--ATTActtttccagacaaaattgacttttgtatacaaaagtgaatatttgtcatgacaaaagtgaattttgtctgctgaaagataattttgtgcgacaaaattaatttttgtgattcatgatcaattttgttgacctgaactcatttttgttctacaaaattcatttttgtccacacaaaaatgaattttgagaacaaaatcacaagagtcccatttggcgcccc
gi|16 : TTC--A-TTTTGGT--ATGCA-AA--TTAG-TTTAAA-AAAT-C-CAATT---CAACT-A-----ATATGCAATACAAAATCC-A-ATATG---TTAC-A-AAGTTAATTtgaat
2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|26 ): TCGACAAAATTTAATTATGAATTGCAGAACTGAATTTCTTCATTTTGGTATACAAATTAGCTTACAAAAATCTAAATTCAACAAATTTACTTCCAAAATCCACTTGTGTTACAAAAGTTAAT
Unaligned ( gi|29 ): TAGATGAACCTAGCTGAGCTCATTTTTGTTGAAGCAAAGATTCATTTTGAATCCACATAAGGTAAATTCGAATTCTTGGGAACAAAAATCACCAAGTCCCATTTG
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 333333 11 11111 222222222 222 222 22222222222222 1 33333333333333333333333 2222222 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 333333333333333333333333 666666666666666666666666666666666666666666 1111111111 1111111 11111111 22222222222222 1111111111111 111 111111 1111111 11111111111 33333333333333333 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 2222222 1 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 2222222222222 111 44444444444444444 111111111111 22222 444444444 3333333 3333333 22222222 1 222222222 6666666666666666666 22 333333 222 66666666666666666666666666666666 111111 1 222 4444444444444 1111 1 22222 333333 111111 222 22 1111 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111 222222222 2
lowQualScore : 3 2 3 44 555555 555 3 00 99999 2 2 111111111 33 333 6666 000 5 0 9999 2 3 0 444 00000000000000 555 5 1 2 88 777 2 444 2 6 66 888 33333333333333333333333 2222222 2 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 2 1 33 55 5 111111111111111111111111 2 66 2 5 111111111111111111111111111111111111111111 33 3333333333 0000000 2 00000000 2 66666666666666 1 55555 44 2 0 4444444444444 1 1 000 44 222222 3 7777777 1 5 2 99999999999 33 44444444444444444 3 0 2 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 1111111 1 666 3 3 0 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 5555555555555 5 99 0 111 5 00000000000000000 66 888888888888 66666 88 66 111111111 3 5 88 1 1111111 66 7777777 88888888 2 5 5 5 5 5 5 0 1 1 111111111 444 7777777777777777777 6 2 22 111111 88 222 88888888888888888888888888888888 333333 0 9 888 5555555555555 5555 3 99999 5 2 22 777777 3 6 3 44 3 111111 6 3 3 3 333 4444 66 9 6666 3 3 6 3 3 3 44 6 3 3 3333 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000 555 55 3 3 55 1 555555555 4 5
lowQualScore : . . . .. ...... ... . .. ..... . . ......... .. ... .... ... . . .... . . . ... .............. ... . . . .. ... . ... . . .. ... ....................... ....... . ........................................................... . . .. .. . ........................ . .. . . .......................................... .. .......... ....... . ........ . .............. . ..... .. . . ............. . . ... .. ...... . ....... . . . ........... .. ................. . . . ..................................................................................... ....... . ... . . . ................................................................................................ ............. . .. . ... . ................. .. ............ ..... .. .. ......... . . .. . ....... .. ....... ........ . . . . . . . . . . ......... ... ................... . . .. ...... .. ... ................................ ...... . . ... ............. .... . ..... . . .. ...... . . . .. . ...... . . . . ... .... .. . .... . . . . . . .. . . . .... ....................................................... ... .. . . .. . ......... . .
lowQualScore : 1 8 1 22 555555 444 1 77 99999 7 7 000000000 77 333 1111 000 3 2 4444 1 1 8 333 55555555555555 000 1 4 9 33 111 9 888 9 9 66 444 88888888888888888888888 4444444 7 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 7 1 44 99 0 333333333333333333333333 7 33 7 3 888888888888888888888888888888888888888888 99 4444444444 1111111 9 44444444 9 77777777777777 7 66666 66 9 3 5555555555555 8 0 666 66 888888 1 5555555 0 3 1 77777777777 77 00000000000000000 1 8 2 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 2222222 9 444 6 6 9 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 9999999999999 0 00 2 666 4 55555555555555555 99 888888888888 44444 11 99 888888888 2 4 77 0 1111111 99 8888888 11111111 5 0 0 0 7 7 7 1 0 4 777777777 111 4444444444444444444 7 5 88 000000 88 777 44444444444444444444444444444444 888888 0 8 000 8888888888888 0000 3 11111 0 5 00 777777 3 2 1 22 1 999999 2 1 1 1 555 0000 11 8 5555 1 1 2 1 3 3 66 7 3 7 1111 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555 222 00 6 6 00 0 222222222 6 7
consensus : CGGGGCGCC-GAATGG-GAC--T-C----T---GA-TC-TTTTG-CTAAT-C-AAAAT-C------AA--TTTT-GTGT-AC-ACAAAA-A-GAA-TTCCG--TCANAAC-AAAATTCANTTCNNGTC-ACA----AAA---ANT-A-TG-NTG-CTT-CAC--A-ATAAN-TTNATTTTTTGTA-TTGATAAGT-C--GT--ACAAAATT----AT-TTTT-CA-GTT---GACA----CAAA---ATTNAATTTTG---T--A--G-AC---AAAGTCAACTTTTGT-CACG--AC--AAA-ATTCACTTTTGT----A----AA-A---GTC-AA--TT-TTG-TC-AT-G-ACAAA-A------TTN------G-TA----A----T--TTGTCA-------AT-TA----TGTA-T--------GC-AAATA---TT-T---TA--ATC-T-CATTTGC-ATA-CAAAAT-A-G---------ACTTTTGTTANCTN-GTTTGCA--T--T---A-AAT-------AANAAA-AGT-T---------A--ATT-T----TGTNA-GA---CAAAA-TTGAATT-----AT--TTG------------TCG-G---ACAAA---A---A-----G---TTCG-A-TCCGTTACGNAA--AATT-A---ATTTT-NCG---TGACAAA---AT-T-AATT-TTTGT---------CA------GAT----GAT-----C-----AA---AA---ATT-----TTTGT-CT-AT-ACCAAAT--AGT--CGA---------A-TTTTGTCATG-----------ACA-AAA-GTTGA-A-TTTCGTCT-------A-T-A----CAA--AA-TGA-C--T---TTTG-----TCATGA--CAAAA-TGAATTTTTTTGTCATGACAAAAATTGAA---ATTTTG--T-C-ACG-ACAAAAG-------TNAA-T-TT-TG-TC-GT-GACAAAAGTGAA-TTTGTC--C-G-ACGAAATTCGA--ATTTTGTTCGTTC-AGCACA-AAAGTN-AATTTTGTT-CGTCACA-AATT-GAATTTTGTCAA-GAC--GAAAACG-TG-ATTTTGTC-C-ACAAAN-TTCGATTTTTG-TCTTCACAC-AAAGTGAATTT----AC----GATCA--ACAAAA-TGAA--TTGTT-GTCCACAAAATTC-AAT-T-TTC-GTC-T--AC-CTA------A-ATATAA-TCTCTTT-ATGC-AACTTTTTTTTCCCG-C-ATTG--CCCA----ATT-TAAG-TTT-AAA-TTAT-CAT-TAGTAA--AAACA-TTT-TGTCCAACAAA----ATTC------T--A-ATTA-------C-----------ATGAC--GN----T------TTTT--CATTTTGGTA--TGCAAATT-AGTTT-ACAAAAATCCAAATT--CAACTAATT-TGC----ATACAAAATCCACTTATG-TTACAAAAGTTAATT
Reference ( family-5289 ) : CGGGGCGCC-GAATGG-GAC--T-C----T---GA-TC-TTTTG-CTAAT-C-AAAAT-C------AA--TTT--GTGT-AC-ACAAAA-A-GAA-TTCCG--TCANAAC-AAAATTCATTTCTTGNC-ACA----AAA---AGT-A-TG-TTG-CTT-CAT--A-ATAAN-TTNATTTTTTGTA-TTGATAAGT-T--GT--ACAAAATT----ANATTTT-CG-GTT---GACA----CAAA---ATTGAATTTTG---T--N--G-ACCTGAAAGTCAACTTTTGT-CACG--AC--AAA-ATTCATTTTTGT----A----AA-A---ATC-AA--TT-TTG-TCAAT-G-ACAAA-A------TTG------G-TA----A----T--TTGTCA-------AT-TA----TGTA-T--------GC-AAATA---TT-T---TG--ATC-T-CATTTGC-ATA-CAAAAT-A-G---------ACTTTTGTTANCTT-GTTTGCA--T--T---A-AAT-------AANAAA-AGT-N---------A--ATT-T----TGTNA-GA---CAAAA-TTGAATT-----AT--TTG------------TCA-G---ACAAA---A---A-----G---TTCG-A-TCTGTTACGCAA--AATTGA---ATTTT-TCG---TGACAAA---AT-T-AATT-TTTGT---------TA------GGT----GAT-----C-----AA---AA---ATT-----TTTGT-CT-ATGACCAAAT--AGT--CGA---------A-TTTTGTCATG-----------ACA-AAA-ATTGA-A-TTTTGTCT-------A-T-A----CAA--AA-TGA-C--T---TTTG-----TCATGA--CAAAATTNAATTTTTTTGTCATGACAAAAATTGAA---ATTTTG--T-C-ATGAACAAAA--------TGAA-T-TT-TG-TC-AT-GACAAAANTGAA-TTTGTC--C-G-ACAAAATTCGA----TTTGTTCGTTC-AGCACA-AAAGTNGAATTTTGTT-TGTCACA-AATN-GAATTTTGTCAA-GAC--GAAAACA-TG-ATTTTGTC-CACCAAAA-TTCGATTTTTG-TCTTCACAC-AAAATGAATTT----AC----GATCA--ACAAAA-TGAAG-TTGTT-GTCCANNAAATT--A---T-TTT-GTC-T--AC-CTA------A-ATATAA-TCTCTTT-ATGC-AACTTTTTTTTCCCG-C-ATTGT-CCCA----ATT-TAAG-TTT-AAA-TTAT-CAT-TAGTAA--AAACA-TTT-TGTCCGACAAA----ATTC------T--A-ATTA-------C-----------ATGAC--GN----T------TTTC--CATTTTGGTA--TGCAAATT-AGTTT-ACAAAAATCCAAATT--CAACTANTT-CTC----ATACAAAATCCACTTATGTTTACAAAAGTTAATT
gi|1 : CGGGGCGCC-GATTGG-GAC--T------T---GA-TC-TTTTG-CTAAT-C-AAAAC-C------AA--TTT--GTGT-AC-ACTAAA-A-GAA-TTCCG--TCATAAC-AAG-TTCATTTCTTGAC-ACA----AAA---AGT-A-TG-TTG-CTT-CAT--A-ATAAC-TTCATTTTTTGTA-TTGATAAGT-T--GT--ACAAAATT----AGATTTT-CA-GTT---GACA----CAAA---ATTGAATATTG---T--A--GAACCTGAAACTTAACTTTTGT-CACG--AC--AAA-ATTCATTTTTGT----A----AATA---ATC-AA--TTATTG-TCAAT-G-ACAAA-A------TTG------G-TA----A----T--TTGTCA-------AT-TA----TGTAGT--------GC-AAATA---TT-T---TG--ATC-T-CATTTGC-ATA-CAAAAT-A-A---------ACTTTTGTTATCTT-GTTTGCA--T--T---A-AAT-------AAGAAA-AGT-A---------A--ATT-T----TGTGA-GA---CAAAA-TTGAATTC----AT--TTG------------TCA-G---ACAAA---A---A-----G---TTTGCA-TCTGTTATGTAA--AATTGA---ATTTT-TCA---TGACAAA---GTGT-AATTCTTTGT---------TA------GGT----GAT-----C-----AA---AG---GTT-----CTTGTCCT-ATGACCAAAT--AGT--CGA---------A-TTTTGTCATG-----------ATA-AAAGGTTGA-A-TTTCGTTT-------A-T-A----CAA--AA-TGATC--T---TCTG-----TCATGA--CAAAACTGAATTTTTTTGTCATGACAAAAATTGAAG--ATTTTG--T-C-ATGAACAAAA--------TGAA-T-GT-TG-TC-AT-GACAGAAGTGAA-TTTGTC--C-A-ACAAAATTCGA----TTTGTTCGTTCAAGCACA-AAAGTGGAATTTTGTTCTGTCACA-AATG-GAATTTTGTCAAGGAC--GAGAACAGTG-ATTTTATC-CACCAAAATTTCGATTTTTG-TCTTCACAC-CAAGTGAATTT----AC----GATCA--ACAAAA-TGAGG-TTGTT-GTCCAGTAAATT--A---T-TTT-GTC-T---C-CTA------ACATATAA-TTTCTTA-TTGC--ACTTTTTTTTCCCG-C-ATTGTGCCCATTCCATTCTAAG-TTT-AAA-TTAT-CATCTAGT-A--AAACA-TTT-TGTCCACCAAA----ATTCT-----T--A-ATTA-------C-----------ATGAT--GG----T------TTTC--AATTTGGGTA--TGC-AATT-A-TTT-ACATAAAT-CAAATTAACACCTATTT--TCATATATACAAATTCCA-TAATGTTTACAAAAGTTAATT
gi|10 : --A---T-TTT-CTC-T--AC-CTA------A-ATATAA-TTTCTTT-ATGCCAACCTTTTT---CCG-CGATTG--CCCA----ATT-TAAG-TTTTAAA-TTAT-CAT-TAGTAA--AAACA-TTT-TGTCCAACAAA----ATTC---------A-ATT--------------------ATGAA--TT----T------TTTT--CATTTTGGTA--TGCAAATT-AGTTC-ACAAAAATCC-AATT--CAACTAATT-TGC----ATACAAAATCCAAATATAGTTACAAAA-TTAAT
gi|10 : tctaaGGGGCGCC-AAATGG-GAC--T-C----TTGTGA-T---TTTG-TTC-T-C-AAAAT-T------CA--TTTTTGTGT-GG-ACAAAA-ATGAA-TTTTG--T-AGAAC-AAAAATGAGTTCAGGTC-AAC----AAA---ATTGA-TC-ATG-AAT-CAC--A-A-AAA-TTAATTTT-------------GT-C--GC--ACAAAATT----AT-CTTT-CA-GC-----AGA----CAAA---ATT-----------------------------CA-CTTTTGT-CATG--AC--AAATATTCACTTTTGT----ATACAAA-A---GTC-AA--TT-TTG-TC--T-G-GAAAAGA------TTA------A-T----------T--TTGT-A-------AC-TA----T--------------------A---TT-T---GG--AT------TTTGT-ATG-CAAATT-A-GTTGAATTGGATTTTTGTGAACTA-ATTTGCA--T--ACCAA-AAT-------GAAAAA-A----------------ATT-----------------CATAA-TTGAATT---------TTG------------TTG-G---ACAAA---A---T-----G---TTcttttccagacaaaattgacttttgtatacaaaagtgaatatttgtcatgacaaaagtgaattttgtctgctgaaagataattttgtgcgacaaaattaatttttgtgattcatgatcaattttgttgacctgaactcatttttgttctacaaaattcatttttgtccacacaaaaatgaattttgagaacaaaatcacaagagtcccatttggcgcccc
gi|11 : tctaaattttctctacctaaatataatttctttatgccaacctttttccgcgattgcccaatttaagttttaaattatcattagtaaaAAATT--AATTT-TTT-GTC-T--AC-CTA------A-ATATAA-TTTCTTT-ATGC-AACTTTTTT---CCG-C-GTTG--CCCA----ATT-TAAG-TTT-AAA-TTAT-C-----GTAA--AAACA-TTT-TGTCCAA-ACA----ATTC---------A-ATTA--------------------TGAT--TT----T------TTTT--CATTCTGGTA--TGCAAATT-AGTTT-ACAAAAATCCAAATT--CAACTAATT-TGC----ATACAAAATCCAAATATG-TTACAAAAGTTATTT
gi|11 : GGCGCC-AAATGG-GAC--T-CTTG-T---GA-TT-TTGAG-TT-CT-C-AAAAT-T------CA--TTTTAGTGT-GG-ACAAAA-ATGAA-TTTTG--T-AGAAC-AAAAATGAATTCAGGTC-AGC----AAA---ATTGA-TC-ATG-AAT-CAC--A-A-AAA-TTTA-TTTTTG----------------GC--ACAAAATT----AT-CTTT-CA-GC-----AGA----CAAA---ATT--------------------C----------ACTTTTGT-CATG--AC--AAA-ATTCACTTTTGTAGACA----AA-A---GTC-AA--TT-TTG-TC--TGG-ACAGA-AATAACTTTT------G-TAACATA----T--TTG--G-------AT-TT----TGTA-T--------GC-AAATT---AG-T---TG--A------ATTTG---------------G---------ATTTTTGTAAACTA-ATTTGCA--TACC---AGAAT-------GAAAAA-A-------------A--AT------------------CATAA-TTGAATT-----GT--TTG----------------G---ACAAA---A---T-----G---TTT--------TTACGATA--ATTTAA---ACTTctgtccagacaaaattgacttttgtctacaaaagtgaattttgtcatgacaaaagtgaattttgtctgctgaaagataattttgtgccaaaaataaatttttgtgattcatgatcaattttgctgacctgaattcatttttgttctacaaaattcatttttgtccacactaaaatgaattttgagaactcaaaatcacaagagtcccatttggcgcc
gi|12 : aaattaattttttgtctacctaaatataatttctttatgcaacttttttccgcgttgcccaatttACA-AATGTA-AATTTTGTG-AG--ACA-AATTTGAATTTTGTCAT-GA----AAAAAG-TG-AAT------------AG-T--GAATTGTG-TCATGACA--AAAATGAATT-----AT----G-TCATGATAAAAGTGAA--TT-TT-GTTGAAAAAATTC-A---TATTT-GTC-T--AC-CTA------A-ATCTAA-TCTCTTC-ACGC-AA---TTTTTTCCC----ATTGT-CT-A----ATT-GAAG-TTA-AAA-TTAA-CAT-TAGTAA--AAAAAACTT-TGTCCCACAAA----ATTG---------A-ATTA-------TGA---------ATAAC--AG----TACTGAATTTCTTCATTTTGGTA--TGCATAAT-AGTTT-ACAAAAATCTAAATT--CAACAACTT-TGC----TTAC-AAATCCACTTATG-CTACAAAAGTTAATT
gi|13 : atgtagtttgcattagataCGGGGCGCC-GATTGG-GAC--T------T---GA-TCCTTTTG-C-AAT-C-AAAAC-C------AA--TTTT-GTGT-AC-ACAAAATA-GAA-TTCCG--TCATAAC-AAAATTCAATT-TTGTC-ACAC---AAA---AGT-G-TG-CTG-CTT-CGT--A-ATAAC-TTCATctgtcaaaacatacatgcaattgattgttgtctacaaatgtgagttttgtcatgagaaatt
gi|13 : taTAA--C-AAAATTC------AA--TTT---TGTCAC-ACAAAA---GTG-TGCTGCTTCGTAAT-AAC-TTCATANNNNNNN-NNN----NNN---NNN-N-NN-NNN-NNN--------ATAAC-TTCATATTT-GTA-TTGATAAGT-T--AT--ACAAAATT----A--TTTT-TC-ATT---NNNN----NNNN---NNNNNNNNNNN---N--N--N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNN--NN--NNN-NNNNNNNNNNNN----N----NN-N---NNN-NN--NN-NNN-NNNNN-N-NNNNN-N------NNN------N-NN----N----N--NN-----------AT-TA----TGTA-T--------GC-AAATA---TC------A--ATC-T-CATTTGC-ATA-CAAAAT-A-G---------ACTTTTGTTATCTA-GTTTGCA--T--T---A-AAT-------annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataacttcatatttgtattgataagttatacaaaattatttttcattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtatgcaaatatcaatctcatttgcatacaaaatagacttttgttatctagtttgcattaaat
gi|14 : tacggggcgccgattgggacttgatccttttgcaatcaaaaccaattttgtgtacacaaaatagaattccgtcaCGGGGCGCC-GA-TTG-GAC--T------T---GA-TC-TTTTG--TAAT-CCAAAAT------------TTT--GT-T-AC-ACAAAATACGAA-TTTCGG-TCATAAA-AAAATTC-TTTTTTGTC-ACACCATAGA---AGT-AATGATTGACTT-CAT--A-ATAAA-TCA--TTTTTGTAATTGA-AAATAT--AT--ACAAA-TT----ATTTCTT-CA-G------A-G----CTAA---ATTGAAT-----------------------------TTCTGT-AACG--ACA-AAA-ATCCA-TTTTGT----A----A------------------TGCTCATT-G-ACAAA-A------TTC------A-T-----T----T--TTGTCA-------ATCTA----TGTA-T--------GT-CAATA------T---CA--ATC-T-C-TTTGCAATA-CAAAAT-AGG---------ACTGTTTTTATC-T-AATTGCA--T--T---A-TA--------AACAAACAGTAA---------A--ATT-T----T
gi|15 : GCC-GATTGG-GAC--T------T---GA-TC-TTTTT-GTAAT-C-AAAAC-C------AA--TTTT-GTGT-AC-ACAAAT-A-GAA-TTCCG--TCGTAAC-AAAATTCATTT-TTGTC-ACAC---AAA---AGT-A-TG-TTG-CTT-CAT--A-ATAAC-TTCA-TTTTTGTA-TTGATAAGT-T--AT--ACAAAATT----AT-TTTT-CA-GTT---G--A----CAAA---AT-----------------------------TCAA-TTTTGT-CACA--AC--AAA-ATCCA-TTTTGT----AGAT-AA-A---CTC-AA--TT-TTG-TC-AT-G-ACAAA-A------TT---------CA----AT---T--TTGTCA-------AT-TA----TGTA-T--------GC-AAATA------T---CA--ATC-T-CATTTGC-ATA-CAAAAT-A-G---------ACTTTTGTTATCTA-GTTTGCA--T--T---A-AA
gi|16 : tGGCGCC-AAATGG--AC--T-CCTTGT---GA-T--TTTTGTCT--TGC-AAAAT-T------CA--TTTTTGTGT-CG-ACAAAA-ATGAA-TTTTG--T-AGAACAAAAATTGAGTTCAGGTCAACA----AAATTGATC-A-TG---G-AAT-CAC--A-AAAAT-TTAATTTCT------------GT-C--GC--ACAAAAT-------ATCTTACA-GC-----AGA----CAAA---ATTCACTATTG---T--A--G-AAC--AAAGTCAA-TTTTGT-CTGG--AC--AGA-ATTAA-CTTTGT----A----AC-AT--ATTGGA--TT-TTG-T--AT-T-GC-AT-A------TTA------G---------------TTG--A-------AT-T----------------------GGATT---TT-T---TA--AAC-T-AATTTGC-ATACCAAAAT-
gi|17 : ttc-TTTTG-TGAAT-C-AAAA--C------AA--TTT--GTGT-AC-ACAAAATA-GAAATTCCG--TCATAAC-AAAATTCATTT-TTGTC-AAAC---AAA---AGT-A-TG-TTG-CTT-CCC--A-ATAAC-TTA--TTTTTGTA-TTGATAAGT-T--GT--ACAAAATT----AT-TTTT-CA-GTT---G--A----CAAA---ATCCATTTTTG---T--A--G-AT---AAACTTAAATTTTGT-CATGAAAC--AAA-ATTCATTT--------------------GTC-AA--TT-ATG-T--AT-G--CAAATA------TCG--------------A----T--C--TC--------AT-T-----TGCA-T--------ACAAAATAGACTT-T---TGTTATC-T-AGTTTGC-ATA-tagtc
gi|18 : GTT-G---ACAAAATTC-A---T-TTTTGTC-T--AC-CTACATGTAA-ATATAA-TCTCTTC-ATGC-AACTTTTTCTTCCCA---------------------------TT-AAA-TTAT-CAT-TAGTAA--AAACA-GTT-TGTCCGACAAA----ATT-------T--A-ATTA-------TGAATTACAGAAATGA---AT----T------TCTT--CATTTTGGTA--TGCAA-------------------TAAATT--CAACAAATT-TGC----TTACAAAATCCACTTATG-TTACAAAAGTCAAa
gi|19 : AAATT--AAT-T-TTC-GTC-TTAAC-CTA------A-ATATAA-TTTCTTT-ATGC-GACTTTTTTTCCTTG-C-ATTG--CCCA----ATT-TAAG-TTT-AAA-TTATGCA--TAGTAATTTAACA-TTTGTGTCCAAC-AA----ATTC---------A-ATT---------------------TGA---AT----T------TTTT--CATTTTGGTA--TGCAAATT-AGTTC-AC--AAATCCAAATT--CAACTAATT-TGC----AT
gi|2 : aGGGCGTC-GAATGGCGAC--T----------GACTT-TTTTG--TAAT-C-AAAAC-C------CA--TTT--GTGT-AC-ACAAAT-T-GAAGTTCCG--TCACAAC-AAAATTCATTTT-------------------ATT-A-TG-TTG-CTTTCAT--ATATAAGCTTCATTTT-TGTA-TTGATTAGT-T--AT--ACAAAATT----AT-TTTT-CGCGTG---G--A----CAAA---ATTAAATTTTG---T--A----AC--GAAAATCA--TTTTGT-CACG--ACAGAAA-GTCCATTT---T----A----AA-GGTTACC-AA--TT-TAG-T--AT-T-CC--A-A------TC--------------------T--TTGTCA-------AT-AT----TGTA-T--------GC-AAATA------T---CA--ATCTT-CA-TTGT-ATA-CAAAATAA-G---------ACTTTGTTTATCTTAGTTTGCA--T--T---A-AATA------AACAAA-AGT-----------A--ATTAT----TATT--GA---CAAAG-TTGA--------AT--TTG------------TCA-T---AC-AA---A---A-----G---CTGG-ACTTTGTTA-ACAA--AACTGA---ATTTGATC-----AACAAATTCAT-T-NNNN-NNNNN---------NN------NNN----NNN-----N-----NN---NN---NNN-----NNNNN-NN-NNNNNNNNNN--NNN--NNN---------N-NNNNNNNNNN-----------NNN-NNN-NNNNN-N-NNNNNNNN-------N-N-NNGTTCAACCAA-TCA-T--T---TTTG-----TCTTCA--TAA---------TTTTTGTCA--ACAAAAATT-CA---TTTTTG--T-C-TC--ACAAAAG-------TGAA-T-TT-TG-TA-AT-GACAAAAGTGAA-TTTAGT--C-A-ACAAAAAATGAAGATTTTGTT------AG-ACA-AAATTTCATTTTTGcct
gi|20 : AAAATTGA-----TCTTGAAT-C-ACAAATAA----------TTAA-T-TT-TG-TC-AT-G-CAAAATT--A-TCTTTCAACGG-ACGAATTTCGC----TTT-----TTT-AG-ACA-ACAGTC-AATTTTATT-C-TTACAGAATT--AACTTTG---A-AAC--ATAA--G-TGCATTTTGT------AAGC-TTGGGTTTTTatc
gi|20 : caaaaaaacaacaacaaaacacaccccaAA-AGT-T---------A--ATT-C----TGTAA-GAA--TAAAA-TTGACTG---------TTG------------TCT-A---AAAAAGCGA---A-----A---TTCG---TCCGTT--GAAA--GAT--A---ATTTT-GCA---TGACAAA---AT-T-AATTATTTGT-----------------GATTCAAGAT-----C-----AA----------T-----TTTGT-gttga
gi|21 : caaaaaaacaacaacaaaacacaccccaaaaaacccaagcttacaaaatgcacttatgtttcCGGGGCGCC-AAATGG-GACCTT-G----T---GA----TTTTG-TT-CT-C-AAAAT-T------CATTTTT--GTGT-GG-ACAAAA-ATGAA-TTTTG--TAGAAAC-AAAA-TGAGTTCAGGTC-AAC----AAA---ATTGA-TC-ATG-AAT-CAC--A-A-AAA-TCAATGTT-------------GT-C--GC--ACAAAATT----ATCTTTtga
gi|22 : gctgA--CAAAATTGAATTTT---GTCATGACACAAAGTG-A---ATTTTG--T-CAATG-ACAAAAGTGAAAAGTGAA-T-TTCTG-TT-GT-GACAAAAGTGAATTTTGGT--C-A-ACAAAATTT-A----TT--TTTGCTC---CACATAAAGTG--ATTTTG-T-CAACAAA-AATT---ATTTTGT
gi|23 : TACAAAATGCACTTATGTTT-C-AAAGTTAATTg
gi|23 : gctAA-AGT-T---------A--ATT-C----TGTAA-GAA--TAAAA-TTGACTG---------TTG------------TCT-A---AAAAAGCGA---A-----A---TTCG---TCCGTT--GAAA--GAT--A---ATTTT-GCA---TGACAAA---AT-T-AATTATTTGT-----------------GATTCAAGAT-----C-----AA----------T-----TTTGT-ctgtaagaataaaattgactgttgtctaaaaaagcgaaattcgtccgttgaaagataattttgcatgacaaaattaattatttgtgattcaagatcaattttgttg
gi|24 : gcttacaaaatgcacttatgtttcTACAAAATGCACTTATGTTT-CAAAAGTTAATTtg
gi|24 : ct--AC--AAA-ATGCACTTATGTTTC-A----AA-A---GTT-AA--TT-CTG-TCAA--G-ATAAA-A------TTG------ctgtcaagataaaattgactgttgtctaaaaaagcgaaattcgtccgttgaaagataattttgcatgacaaaattaatatttgtgattcaagatcaattttgttg
gi|24 : cttAAA-AGT-T---------A--ATT-C----TGTCAAGA---TAAAA-TTGACTG---------TTG------------TCT-A---AAAAAGCGA---A-----A---TTCG---TCCGTT--GAAA--GAT--A---ATTTT-GCA---TGACAAA---AT-T-AATA-TTTGT-----------------GATTCAAGAT-----C-----AA----------T-----TTTGT-actgttgtctaaaaaagcgaaattcgtccgttgaaagataattttgcatgacaaaattaatatttgtgattcaagatcaattttgttg
gi|25 : cttacaaaatgcacttatgtttcAAATTTAA---T-TTT-TTC-T--ACGCTA------AGATATAA-TTTCTTT-GTGC-A--TTTTTTTTTCCG-C-ATTG--CCAA----ATT-TAAGGTTT-AAA-TCAT-CAT-TAGTGA--AAACATTTT-TGTTCCAAACA----ATTT------C--AGATTA-------tg
gi|26 : aCGACAAA----ATT-------T--A-ATTATGAATTGC-----------AGAACT-GA----A------TTTCTTCATTTTGGTA--TACAAATT-AGCTT-ACAAAAATCTAAATT--CAACAAATT-TAC----TTCCAAAATCCACTTGTG-TTACAAAAGTTAATtgatt
gi|27 : tAGTGAATTT-----T----G-TCA--ACAAAAATGAATCTTGCCAGTCGACAAAATTC-A---T-TTTTGTT-T--AT-CTA------A-ATATTA-TCTCTTC-ATGC-AAC---TTTTTCCC--C-ATTG--CCTA----ATT-TAAG--TT-AAA-
gi|28 : -GTC-T--AC-CAA------A-ATATAA-TTTCTTT-ATGC-AAATTTTTT---CCG-C-GTTG--CCAA----ATT-TAAG-TTT-GAA-TTAT-CAT-TAGTAA--AAATA-TTT-TGTCCAACAAA----ATTC---------A-ATTA-------
gi|3 : -AAT-------AAAAAACAGT-G---------A--ATT-T----TGTTA-------AAAA-TT---TTA----AC--TTG------------TCATG---ACAAA---tgaat
gi|3 : ctagataacagatgt-GAATTTTGTTAA--------AAATT-TT-AACTTGTCATGACAAAT-TTC-ATTTTTGGTCTTCACA---AAGTGAATTTTGTCACAAAAGAGTA--CAAAAA-TGAAA-TT-TT-GTTGACAAAATTC-AC--T-TTT-GTCAT--AC-TTTT-----A-ATATAAATCTCTTC-AAGC-AACTATTTTT--CCA-A-ATTG--CCTA----ATT-GAAG-TTT-AAAATTAT-CAT-TAGTAA--AAACA-GTT--GTCCGACAAA----ATTTAATTTATGAA-ATTA-------C-----------AGAACTTGA----A------TTTCTTCATTT-GGTAAATGCAAATTTAGTTT-ACAAAAATCTAAATT--CA--CATTTGC-------TACAAAATCCACTTATG-TTACAAAA-TTAATTtttcatttttggtcttcacaaagtgaattttgtcacaaaagagtacaaaaatgaaattttgttgacaaaattcacttttgtcatacttttaatataaatctcttcaagcaactatttttccaaattgcctaattgaagtttaaaattatcattagtaaaaacagttgtccgacaaaatttaatttatgaaattacagaacttgaatttcttcatttggtaaatgcaaatttagtttacaaaaatctaaattcacatttgctacaaaatccacttatgttacaaaattaattctgtcaaagacaaaattgactgttgtctacaaaaaagtgaattttgtcatgacaaagtgatatttttgtaagacaaattaatttttgtaaattcatgacgattttggttgttacctgaactcatttttgttgtacaaaattcatttttgttcacagcaaaaatgaatttttgagaacaaaatcacaaagagtccatttggcgcccc
gi|3 : ctagataacagatgtaataaaaaacagt----AAATTTT-AA-CTT---GTCATGA-CAAA---TTTCATTTTTGGTCT--T--C-AC---AAAGTGAA-TTTTGT-CACA--AA--AGA-GTACA----------------AA-A---ATG-AAA-TT-TTG-T---T-G-ACAAA-A------TTC------ACT----------T--TTGTCATACTTTTAA-TA----TAAA-TCTCTTCAAGC-AACTA---TT-T---T----TC-C-AAATTGC-CTA-----AT-T-G---------AAGTTTA--AAATT-AT---CA--T--T---A-G-T-------AAAAAC-AGT-TGTCCGACAAA--ATT-TAATTTATGA-AATTACAGAACTTGAATTTCTTCAT--TTGGTAAATGCAAATTTA-GTTTACAAA---A---ATCTAAA---TTCACA-TTTGCTAC--AA--AATCCA---CTTAT---G---TTACAAA---AT-T-AATT-CT-GT---------CA------AA-----GA------C-----AA---AATTGACT-----GTTGT-CT-A---CAAAAA--AGT---GA---------A-TTTTGTCATG-----------ACA-AAG---TGATATTTTTGTA--------A-G-A----CAA--AT-TAA-T--T---TTTGTAAATTCATGA--CGA---------TTTTGGTTGTTACCTGAACT-CA---TTTTTG--T----TGTACAAAA--------TTCATT-TT-TGTTC-AC-AGCAAAAATGAA-TTTTTG--A-GAACAAAATctgtcaaagacaaaattgactgttgtctacaaaaaagtgaattttgtcatgacaaagtgatatttttgtaagacaaattaatttttgtaaattcatgacgattttggttgttacctgaactcatttttgttgtacaaaattcatttttgttcacagcaaaaatgaatttttgagaacaaaatcacaaagagtccatttggcgcccc
gi|30 : ctagataacagatgtaataaaaaacagtgaattttgttaaAAAATTCTAGAGATTTT-AA-GTTTTGGACAAACTCAGG---AATCATTTTTG---T--T--G-AC---AAAATTAACTTTTCT-CATG--AC--AAA-ATTCACTTTTGT----cacaaagagtccatttggcgcccc
gi|31 : atg---AGT-A-TG-TTG-CTT-CATACA-ATAAT-TTCA-TTTTTATA-TTG--------------ACAAAATC-----TTTTTT-CA-GTG---GAC-------AA---AGTGAATTTTG---TCAT--G-AC--GAAAGTTAA
gi|32 : ttCGGGGAGCC-AAATGG-GAC--TAT----T---GT-TA-TTTTG-TT-CT-C-AAAAT-TCAGATGAA--TTT---TGT-ACAACAGAA-A-GGC-TTTC
gi|33 : atctCGGGGAGCC-AAATGG-GAC--TAT----T---GT-TA-TTTTG-GTTCT-C-AAAAT-TCATGTGAA--TTT---TGT-ATAACAGAA-A-GGC-TTTCt
gi|4 : atctTTTTTGTC-TTCATAATT-TTTGTCAACAAAAAT----TCATTTT-TG-TCT-----CA----CAAA---AGTGAATTTTG---T--AATG-AC--AAAAGTGAA-TTTAGT-CA----AC--AAA-A-----------------------A---ATG-AAGATT-TTG-TTA---G-ACAAA-A------TT---------TC----A----T--TTTTGA-------TC-TACCCTTACA-T--------GT-AAA-G---TTAT---TA--ATC-T-C--TT-C-ATG-CAA-----------------CTTTT--TAC-----TTCCCA--T--T---A-AATTATCATTAGTAAA-AAA-C---------A--GTT-------GTCC-GA---CAAAA-TTTAATT-----ATGATTA-------------CA-G---A-AGA---A---T-----G---TTCTCA-TTTGT-ATGCAATAAATTCACACAATTG-TCT---T-ACAAA---AT-C-CACT-TATGTG--------TACAAGA-AGT----CATTATGTC-----AAGACAA---ATTGAAGCTTTAT-CT-A----CAAA---AGT--TGA---------AATTTTGTCATG-----------ACA-AAA-GTTAA----TTTGTA--------A-G-A----CAA--AATTAA-T--T---TTTGTAAT-TCATGATCCGAA---------TTTTGT--TGAC-----CTGAACTCATTTTG--TGT-ACCAA-AAAA--------TTAT-T-TT-TG-TCTGTAGACAAAATGGAA-TTT-TG--A-G-ACAAAAT
gi|5 : cggggcgctcaaatgggcctcgtgtgAAAA-TGAA--TT-TT-GTCCACAAAATT--AAT-T-TTC-GTC-T--AC-CTT------A-ATATAA-TCTCTTT-AGGC-AACTTTTTT---CCGTC-ATTGT-TC-A----ATT-TAAG-TTT-AAA-TTAT-CAT-TAGTAA--AAACA-TTT-TGTCCAACAAATTCAATTA------TG-A-ATTA-------C-----------ATAAC--AGATTTT------TTTT--CATTTTGGTA--TGCAAATT-AGTTT-ACAAAAATCCAAATT--CAACTAATT-TCC----ATACAAAATCCAATTATG-TTACAAAAGTTAATTtgattggtt
gi|6 : acaGGGCGCC-AATTGG-GAC--T------T---GA-TC-TTTTT-GTAAT-C-GAAAT-C------AA--TTT---TGT-GT-ACATAA-A-AAG-T--------------AAAATC-------TGTC-ACA----ACA---A---------------------A-ATAA-------TTTTTGT--CTAACAAAT-----------ATATT----ATACTT-----GTT---T-TA----TAACTTCATT---TTTTG---T--AATG-AC---AAAACCAAATTTTGC-TAC---AC--AAA-ATT-ATATTT-C----A----AA-A---GTC-A---TT-TTGATCT-T-T-ACAAA-A------TCA------A-TT---------T--TTGTCA-------AT-AA----GGTA-T--------GC-AAATA---CA-TGTATA--AAC-T-TATCTGT-ATC-CAAAAT-T-G---------ACTTTTGTTACCTA-ATTTGCAAAT--T---A-AAT-------CACAA---GT-T---------A--ATT-T----GGTGA-GA---CAAAA-ATAAATG---------TTG------------TCATG---ACAAA---A---GT----GACCTTCG---TCCGCT-CG-AT--AAT--A---ATTTT-ATG---TAACAAA---AT-T-TACT-TTTGTGATATGTTGTAAAATTTGTT----AAT-----C-----TG---AACTCATT-----TTTGT-----TGAACAAAC----T--C-A---------C-CTTTGTCA-------------ACGCGAA-ATTGG-A-TTT---CA-------AGT-A----CAA--AA-TCA-C--ctgtccagaaaacatcatggtttcaaggttatgtaaaaaatactaacactttccactttctgaacagtttttgtaaatctttgaatattgacttgagttatattctgaaaacaaatgtatttaatctgatcaatcatgaaatgctgttatcatttccatcgttttacagagaagcaattatatttttcatggacggtaagaaaattgagaaattgtgtgacttgtcctcaaactcttttcttcgacaaac
gi|7 : A----CAAA---ATTAAATTTTG---T--A--T-AC--GAAA-TCAAATTTTGTTCACG--AC--AAA-ATCCATTTTT------------A-A---GGC-A------TTA-CCAAT----TTAT-A------TT---------CA----A----TCTTTGTCA-------ATATA----TGTA-T--------GC-AAATA---TC------A--ATC-TTCATT-GT-ATA-CAAAAT-A-G---------ACTTTGTTTATCTTAGTTTG-A--T--T---A-AATA------AACAAA-AGT-A---------ATTATT-T----aagaacctcactagtgtcc
gi|7 : ggAAA---AC-TGAATT-GTTGT---------CA--------------AC-----C-----AATT-CT---ATT-----TTTGT-CTCAT-------T--AAT----------------TTTTGTCA-------------ACA-AAA-ATTCA-T-TTTTGTCT-------C-TCA----CAA--AAGTGA-A--T---TTTG-----TAATGA--CAAAAGTGAATTTA---GTCAAG-CAAAAAATGAAG--ATTTTG--T----TG-ACAAAA--------TTCA-T-TT-Tnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaactaaaactgaattgttgtcaaccaattctatttttgtctcattaatttttgtcaacaaaaattcatttttgtctctcacaaaagtgaattttgtaatgacaaaagtgaatttagtcaagcaaaaaatgaagattttgttgacaaaattcatttttgttc
gi|7 : ggacaaaattaaattttgtatacgaaatcaaattttgttcacgacaaaatccatttttaaggcattaccaatttatattcaatctttgtcaatatatgtatgcaaatatcaatcttcattgtatacaaaatagactttgtttatcttagtttgattaaataaacaaaagtaattatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaact---AT-T-AATT-TTTGT---------CA------A--------------C-----AA---AA---ATTCATT-TTTGT-CT-CTCAC-AAA---AGT---GA---------A-TTTTGTAATG-----------ACA-AAA-GT-GA-A-TTTAGTCA-------AGC-A----AAA--AA-TGA-AGAT---TTTG-----T--TGA--CAAAATTCA---TTTTTGTtgttc
gi|8 : ggacaaaattaaattttgtatacgaaatcaaattttgttcacgacaaaatccatttttaaggcattaccaatttatattcaatctttgtcaatatatgtatgcaaatatcaatcttcattgtatacaaaatagactttgtttatcttagtttgattaaataaacaaaagtaattatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaactaaaactgaattgttgtcaaccaattctatttttgtctcTT-GTCCACAAAATT--AAT-T-TTC-GTC-T--AC-CTT------A-ATATAA-TCTCTTT-AGGC-AACTTTTTT---CCG-C-ATTGT-TC-A----ATT-TAAG-TTT-AAA-TTAT-CAT-TAGTAA--AAACA-TTT-TGTCCAACAAATTCAATTA------TG-A-ATTA-------C-----------ATAAC--AGATTTT------TTTT--CATTTTGGTA--TGCAAATT-AGTTT-ACAAAAATCCAAATT--CAACTAATT-TCC----ATACAAAATCCAATTATG-TTACAAAAGTTAATTtc
gi|9 : ttCA--A-AAAA-TTAA--TT-TT-GTCCACAAAATT--AATTT-TTC-GTC-T--AC-CTA------A-ATATAA-TTTCTTTTATGC-AACCTTTTTT--CCG-C-ATTG--CCCA----ATT-TAAG-TTTTAAA-TTAT-CAT-T-GTAA--AAACA-TTT--GTCCAACAAA----ATTC---------A-ATTA--------------------TGAA--TT----T------TTTT--CATTTTGGTA--TGC-AATT-AGTTTCACAAAAATCCAAATT--CAACTAATT-TGC----ATACAAAATCCAAATATG-TTACAAAAGTTAATTctgtccagaaaacatcatggtttcaaggttatgtaaaaaatactaacactttccactttctgaacagtttttgtaaatctttgaatattgacttgagttatattctgaaaacaaatgtatttaatctgatcaatcatgaaatgctgttatcatttccatcgttttacagagaagcaattatatttttcatggacggtaagaaaattgagaaattgtgtgacttgtcctcaaactcttttcttcgacaaac
gi|9 : aAAA-AAT-T---------A--ATT-T----TGTC--CA---CAAAA-TT-AATT-----TT--TCG------------TCT-A---CCTAA---ATATA-----A---TT-----TCTTTTATGCAA--CCTT------TTTT-CCGCATTGCCCAA---TT-T-AAGT-T---T---------TA------AAT----TAT-----CATTGTAA---AA---ACA-----TTTGT-CC-A--ACAAAATTCAATTATGAATTTTTTTCA-TTTTGGTATGCAATTAGTTTCACA-AAA-ATCCA-A-ATTCAACTAATTTGCA-T-A----CAA--AA-T---C--CAAATATG-----TT---A--CAAAAGTTAA---TTCTGTCCAGAC-AAAATTG-A---CTTTTG--T---AT--ACAAAAG-------TGAA-TATT-TG-TC-AT-GACAAAAGTGAATTTTGTC--T-G-CTGAAA---GATAATTTTGTGCG-------ACA-AAA-TTAATTTTTGTG-ATTCAT--GATC--AATTTTGTT---GACCTGAACTCA-T---TTTTGTT-CTACAAAA-TTC-ATTTTTG-TC--CACACAAAAATGAATTT----ctgtccagacaaaattgacttttgtatacaaaagtgaatatttgtcatgacaaaagtgaattttgtctgctgaaagataattttgtgcgacaaaattaatttttgtgattcatgatcaattttgttgacctgaactcatttttgttctacaaaattcatttttgtccacacaaaaatgaattttgagaagcaaatcacaagagtcccatttgggcgcccg
gi|9 : acaGGGCGCCCAAATGG-GAC--T-C----T---TG-TG-ATTTG-CTTCT-C-AAAAT-T------CA--TTTTTGTGT-GG-ACAAAA-ATGAA-TTTTG--T-AGAAC-AAAAATGAGTTCAGGTC-AAC----AAA---ATTGA-TC-ATG-AAT-CAC--A-A-AAA-TTAATTTT-------------GT-C--GC--ACAAAATT----AT-CTTT-CA-GC-----AGA----CAAA---ATT-----------------------------CA-CTTTTGT-CATG--AC--AAATATTCACTTTTGT----ATACAAA-A---GTC-AA--TT-TTG-TC--T-GGACAGA-A------TTAACTTTTG-TA----ACATAT--TTG--G-------AT-TT----TGTA-T--------GC-AAATT---AG-T---TG--A------ATTTG---------------G---------ATTTTTGTGAAACT-AATTGCA--T--ACCAA-AAT-------GAAAAA-A----------------ATT-----------------CATAA-TTGAAT-------T--TTG------------TTG-G---ACAAA---tgagaagcaaatcacaagagtcccatttgggcgcccg
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|29 ): TAGATGAACCTAGCTGAGCTCATTTTTGTTGAAGCAAAGATTCATTTTGAATCCACATAAGGTAAATTCGAATTCTTGGGAACAAAAATCACCAAGTCCCATTTG
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 3333333333 1111 22222 22222222222 111 111 2222222 1 4444444444444444444444444 11111 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555 222222222222222 1111 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 111111111111111 111111 111111111111 22222222222 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11 11 444444444444444444444444444444 11 222222 222 2222222 22222222 111 222 555555555 111 222222 22 666666666666666666666666666666666 11 1 33 5555555555555 11 111111111 1111 11111111 111111 222 1111 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777
lowQualScore : 33 2 33 6666666666 1111 11111 2 44444444444 22 2 5 888 33 4 222 33 8 1 33 2 1 333 33 1111111 2 666 1 2 55 33 555 2 333 2 9 44 1 6666666666666666666666666 33 22222 2 2 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333 2 2 4 33 33 4 555 4444 444444444444444 666666 2 2 2 2222 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 2 66 33 2 555555555555555 33 7777 2 33 000000 3 999999999999 2 99999999999 2 999 6 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 2 888 4 666 3 666 0 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 22 00 5 666666666666666666666666666666 44 0 555555 1 5 2 7 3 4 1 111 77 1111111 0 5 5 888 00000000 999 6 8 888 2 2 55555 333 222222222 8 000 333333 8 0 11 666666666666666666666666666666666 1 00 1 0 4 2 00 0000000000000 9999 99 5 777777777 8 444 5555 5 2 2 33 2 00000000 111111 5 33 2 2 2 2 555 5555 33 6666 2 2 2 2 2 3 3 3 44 6 3 3 2222 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1 44 3 3 44 3 5 555 4 3 3 3 3 3
lowQualScore : .. . .. .......... .... ..... . ........... .. . . ... .. . ... .. . . .. . . ... .. ....... . ... . . .. .. ... . ... . . .. . ......................... .. ..... . . ........................................................ . . . .. .. . ... .... ............... ...... . . . .... ......................................................................................... . .. .. . ............... .. .... . .. ...... . ............ . ........... . ... . .............................................................................. . ... . ... . ... . ................................................................................... .. .. . .............................. .. . ...... . . . . . . . ... .. ....... . . . ... ........ ... . . ... . . ..... ... ......... . ... ...... . . .. ................................. . .. . . . . .. ............. .... .. . ......... . ... .... . . . .. . ........ ...... . .. . . . . ... .... .. .... . . . . . . . . .. . . . .... ........................................................... . .. . . .. . . ... . . . . . .
lowQualScore : 11 9 99 1111111111 9999 99999 5 22222222222 77 5 6 999 22 7 888 77 3 0 99 7 0 000 77 4444444 7 999 0 5 99 44 888 5 888 5 4 44 9 2222222222222222222222222 22 44444 4 4 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000 5 5 5 22 22 7 999 4444 999999999999999 888888 5 5 5 6666 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 7 33 77 7 111111111111111 99 1111 0 99 999999 1 555555555555 9 77777777777 9 555 7 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 0 333 0 444 6 111 9 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 44 33 9 333333333333333333333333333333 22 1 000000 4 0 5 8 2 0 4 444 99 7777777 7 7 3 999 77777777 888 7 0 444 8 8 88888 555 222222222 0 888 666666 0 8 77 888888888888888888888888888888888 0 88 4 0 0 5 55 6666666666666 3333 33 7 666666666 9 999 7777 8 9 9 99 9 44444444 111111 7 99 9 9 9 9 000 9999 99 1111 9 9 9 9 9 1 1 1 22 2 1 1 1111 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 2 66 3 3 66 3 7 888 8 5 1 1 1 1
consensus : CGGGGCGCC-GAATGG-GAC--T-C----T---GA-TC-TTTTG-TTAAT-CAAAA--T-C------AATTTT-G-TGTACACAAAA-A-G--AA-TTCC-G--TCANAACAAAA-TTCANTTCNGGTC--A-CA----AA-A---ANT-ATG-NT--G-CTT-CA--CA-ATAAN-TTNATTTTTTGT-AT-TGATAA-----GT-CGCACAAAA--TTAT-----TT-T-TCA-GTT---GA-A----CAAAATTNAA--TTTTGT-A--G-A--C--AA--AGTCAA-TTTTGT-C-ACG--AC--AAA-ATTCA--CTTT---TGT----A----A---A-AGT---C--AA-TT-TTG-TCA-TGACAAAA------TTC------GT-A----A-------------T--TTGTCAAT-T-A----TGTA-TGCAAATAT--TTAATC-T-----CATTT-GC-A--TA-CAAAAT--A-G---------ACTTTT--GTTAT-C-TAGTTTGC--AT--T---A-AA-------T-AANAAA-AGT-T--------AATT-TTGTNA-GA-CAAAATTGAATT--T--TTGTCA--GACA----A----A---AA-G---TTC-G-A-TC---CGTTA---CGAA--AAATT-----AATTTTGCATGACA-AA---AT-T-A-ATT-TTTGT---CAG---------AT----GATCAA---AAAT---T-----T-TT-GT-CT-AT-ANCAA--ATAGTCG-AA---------TTTTGTCATGACAAAA-GTTGAATTTCGT-CTA-T-A-----CAA--AA-TGA--CTTTTGT-ATGACAAAA-T--GAATTTTTTTGTCATGACAAAAANTGAA---ATTTTG--T-C-ACG-ACAAA-AGT--NAA--------TTTTGTC-GT-GACAAAAGTGAA-TTTGTTCAACAAAATTCGA--ATTTTGCTC-TTC-AGCACA-AAAGT-NAATTTTGTTC-GTCACA-AATT-GAATTTTGTCAA-GACGAAAA--C-GTG-ATTTTGTC-C--AC--AAANTTCGATTTTTG-TCNTNACA-AAAGTGAATTT----AC----GATCA--ACAAAA--TGA-A----T--TGTT-GTCCACAAAATTCA-ATTTTCG-TC-T--AC-C--------TA------A-A--TAT-AA-TCTCTTT-ATG-CAACTTTTTTTTCCCG-C-AT--TGCCCA----ATT-TAA-G-TTT-AAA-TTAT-CAT-TAGT-AA--AAACA-TTT-TG-TCCGACAAA----ATTC------T--A-ATTA-------C-----------ATGAC----AT----T--------TTTTCATTTTGGTA--TGCAAATT-AGTTT-ACAAAAATCCAAATT--CA-ACTAATT---TGCATACAAAATCCACTTAT-G-T-TACAA-AAGTTAATT
Reference ( family-5289 ) : CGGGGCGCC-GAATGG-GAC--T-C----T---GA-TC-TTTTG-CTAAT-CAAAA--T-C------AATTTT-G-TGTACACAAAA-A-G--AA-TTCC-G--TCANAACAAAA-TTCANTTCNNGTC--A-CA----AA-A---ANT-ATG-NT--G-CTT-CA--CA-ATAAN-TTNATTTTTTGT-AT-TGATAA-----GT-CGTACAAAA--TTAT-----TT-T-TCA-GTT---GACA----CAAAATTNAA--TTTTGT-A--G-A--C--AA--AGTCAACTTTTGT-C-ACG--AC--AAA-ATTCA--CTTT---TGT----A----A---A-AGT---C--AA-TT-TTG-TCA-TGACAAAA------TTN------GT-A----A-------------T--TTGTCAAT-T-A----TGTA-TGCAAATATT-TTAATC-T-----CATTT-GC-A--TA-CAAAAT--A-G---------ACTTTT--GTTAN-C-TNGTTTGC--AT--T---A-AA-------T-AANAAA-AGT-T--------AATT-TTGTNA-GA-CAAAATTGAATT-AT--TTGTCG--GACA----A----A---AA-G---TTC-G-A-TC---CGTTA---CGNA--AAATT-----AATTTTNCGTGACA-AA---AT-T-A-ATT-TTTGT---CAG---------AT----GATCAA---AAAT---T-----T-TT-GT-CT-AT-ACCAA--ATAGTCG-AA---------TTTTGTCATGACAAAA-GTTGAATTTCGT-CTA-T-A-----CAA--AA-TGA--CTTTTGTCATGACAAAA-T--GAATTTTTTTGTCATGACAAAAATTGAA---ATTTTG--T-C-ACG-ACAAA-AGT--NAA--------TTTTGTC-GT-GACAAAAGTGAA-TTTGTCCGACGAAATTCGA--ATTTTGTTCGTTC-AGCACA-AAAGT-NAATTTTGTTC-GTCACA-AATT-GAATTTTGTCAA-GACGAAAA--C-GTG-ATTTTGTC-C--AC--AAANTTCGATTTTTG-TCTTCACACAAAGTGAATTT----AC----GATCA--ACAAAA--TGA-A----T--TGTT-GTCCACAAAATTCA-ATTTTCG-TC-T--AC-C--------TA------A-A--TAT-AA-TCTCTTT-ATG-CAACTTTTTTTTCCCG-C-AT--TGCCCA----ATT-TAA-G-TTT-AAA-TTAT-CAT-TAGT-AA--AAACA-TTT-TG-TCCAACAAA----ATTC------T--A-ATTA-------C-----------ATGAC----GN----T--------TTTTCATTTTGGTA--TGCAAATT-AGTTT-ACAAAAATCCAAATT--CA-ACTAATT---TGCATACAAAATCCACTTAT-G-T-TACAA-AAGTTAATT
gi|1 : CGGGGCGCC-GATTGG-GAC--T------T---GA-TC-TTTTG-CTAAT-CAAAA--C-C------AATTT--G-TGTACACTAAA-A-G--AA-TTCC-G--TCATAACAAG--TTCATTTCTTGAC--A-CA----AA-A---AGT-ATG-TT--G-CTT-CA--TA-ATAAC-TTCATTTTTTGT-AT-TGATAA-----GT-TGTACAAAA--TTAGA----TT-T-TCA-GTT---GACA----CAAAATTGAA--TATTGT-A--G-AACCTGAA--ACTTAACTTTTGT-C-ACG--AC--AAA-ATTCA--TTTT---TGT----A----A---ATAAT---C--AA-TTATTG-TCAATGACAAAA------TTG------GT-A----A-------------T--TTGTCAAT-T-A----TGTAGTGCAAATATT-TTGATC-T-----CATTT-GC-A--TA-CAAAAT--A-A---------ACTTTT--GTTAT-C-TTGTTTGC--AT--T---A-AA-------T-AAGAAA-AGT-A--------AATT-TTGTGA-GA-CAAAATTGAATTCAT--TTGTCA--GACA----A----A---AA-G---TTT-GCA-TC---TGTTA---TGTA--AAATTG----AATTTTTCATGACA-AA---GTGT-A-ATTCTTTGT---TAG---------GT----GATCAA---AGGT---T-----C-TT-GTCCT-ATGACCAA--ATAGTCG-AA---------TTTTGTCATGATAAAAGGTTGAATTTCGT-TTA-T-A-----CAA--AA-TGAT-CTTCTGTCATGACAAAACT--GAATTTTTTTGTCATGACAAAAATTGAAG--ATTTTG--T-C-ATGAACAAA-A-T--GAA--------TGTTGTC-AT-GACAGAAGTGAA-TTTGTCCAACAAAATTCGA----TTTGTTCGTTCAAGCACA-AAAGTGGAATTTTGTTCTGTCACA-AATG-GAATTTTGTCAAGGACGAGAA--CAGTG-ATTTTATC-C--ACCAAAATTTCGATTTTTG-TCTTCACACCAAGTGAATTT----AC----GATCA--ACAAAA--TGAGG----T--TGTT-GTCCAGTAAATT---ATTTT-G-TC-T---C-C--------TA------ACA--TAT-AA-TTTCTTA-TTG-C-ACTTTTTTTTCCCG-C-ATTGTGCCCATTCCATTCTAA-G-TTT-AAA-TTAT-CATCTAGT--A--AAACA-TTT-TG-TCCACCAAA----ATTCT-----T--A-ATTA-------C-----------ATGAT----GG----T--------TTTCAATTTGGGTA--TGC-AATT-A-TTT-ACATAAAT-CAAATTAACA-CCTATTTTCATATATACAAATTCCA-TAAT-GTT-TACAA-AAGTTAATT
gi|10 : A-ATTTTC--TC-T--AC-C--------TA------A-A--TAT-AA-TTTCTTT-ATGCCAACCTTTTT---CCG-CGAT--TGCCCA----ATT-TAA-GTTTT-AAA-TTAT-CAT-TAGT-AA--AAACA-TTT-TG-TCCAACAAA----ATTC---------A-ATT--------------------ATGAA----TT----T--------TTTTCATTTTGGTA--TGCAAATT-AGTTC-ACAAAAATCC-AATT--CA-ACTAATT---TGCATACAAAATCCAAATATAG-T-TACAA-AA-TTAAT
gi|10 : tctaGGGGCGCC-AAATGG-GAC--T-C----TTGTGA-T---TTTG-TTC-T-CAAAA--TTC------ATTTTT-G-TGTGGACAAAA-ATG--AA-TTTT-G--T-AGAACAAAA-ATGAGTTCAGGTC--A-AC----AA-A---ATTGATC-AT--G-AAT-CA--CA-A-AAA-TTAATTTT-------------------GT-CGCACAAAA--TTAT-----CT-T-TCA-GC-------------------------------A--G-A--C--AA--AATTCACTTTTGT-C-ATG--AC--AAATATTCA--CTTT---TGT----ATACAA---A-AGT---C--AA-TT-TTG-TCT-GGAAAAGA------TTA------AT--------------------T--TTGT-AAC-T-A----T-----------ATT-TGGAT----------TTT-GT-A--TG-CAAATT--A-GTTGAATTGGATTTTT--GTGAA-C-TAATTTGC--AT--ACCAA-AA-------T-GAAAAA-AAT-TCATAATTGAATT-TTGTTG-GA-CAAAATcttttccagacaaaattgacttttgtatacaaaagtgaatatttgtcatgacaaaagtgaattttgtctgctgaaagataattttgtgcgacaaaattaatttttgtgattcatgatcaattttgttgacctgaactcatttttgttctacaaaattcatttttgtccacacaaaaatgaattttgagaacaaaatcacaagagtcccatttggcgcccc
gi|11 : tctaaattttctctacctaaatataatttctttatgccaacctttttccgcgattgcccaatttaagttttaaattatcattagtaaaaacAAATTAA-TTTTTTG-TC-T--AC-C--------TA------A-A--TAT-AA-TTTCTTT-ATG-CAACTTTTTT---CCG-C-GT--TGCCCA----ATT-TAA-G-TTT-AAA-TTAT-C-----GT-AA--AAACA-TTT-TG-TCCAA-ACA----ATTC---------A-ATTA--------------------TGAT----TT----T--------TTTTCATTCTGGTA--TGCAAATT-AGTTT-ACAAAAATCCAAATT--CA-ACTAATT---TGCATACAAAATCCAAATAT-G-T-TACAA-AAGTTATTT
gi|11 : GGCGCC-AAATGG-GAC--T-C----TTGTGA-TT-TTGAG-TTC-T-CAAAA--T-T------CATTTTAG-TGTGGACAAAA-ATG--AA-TTTT-G--T-AGAACAAAA-ATGAATTCAGGTC--A-GC----AA-A---ATTGATC-AT--G-AAT-CA--CA-A-AAA-TTTATTTTT------------------G---GCACAAAA--TTAT-----CT-T-TCA-GC-------------------------------A--G-A--C--AA--AATTCACTTTTGT-C-ATG--AC--AAA-ATTCA--CTTT---TGTAGACA----A---A-AGT---C--AA-TT-TTG-TCT-GGACAGAAATAACTTTT------GT-AACATA-------------T--TTG--GAT-T-T----TGTA-TGCAAA-----TTAGTT-G-----AATTT-G------------------G---------ATTTTT--GTAAA-C-TAATTTGC--ATACC---AGAA-------T-GAAAAA-A------------AAT------------CATAATTGAATT-GT--TT---G--GACA----A----A---AT-G---TTT------------TTA---CGAT--AATTT-----AActgtccagacaaaattgacttttgtctacaaaagtgaattttgtcatgacaaaagtgaattttgtctgctgaaagataattttgtgccaaaaataaatttttgtgattcatgatcaattttgctgacctgaattcatttttgttctacaaaattcatttttgtccacactaaaatgaattttgagaactcaaaatcacaagagtcccatttggcgcc
gi|12 : aaattaattttttgtctacctaaatataatttctttatgcaacttttttccgcgttgcccaatttaagtACA-AATGT-AAATTTTGTGA-G--ACA-AATTTGAATTTTGTCAT-GA--AAAA--A-GTG-AAT---------------AGT--GAATTGTG-TCATGACA-AAAATGAATT-----AT----G-TCATGATAAAAG-TGA-A----T--T-TT-GTTGAAAAAATTCATATTT--G-TC-T--AC-C--------TA------A-A--TCT-AA-TCTCTTC-ACG-CAA---TTTTTTCCC----AT--TGTCTA----ATT-GAA-G-TTA-AAA-TTAA-CAT-TAGT-AA--AAAAAACTT-TG-TCCCACAAA----ATTG---------A-ATTA-------TGA---------ATAAC----AG----TACTGAATTTCTTCATTTTGGTA--TGCATAAT-AGTTT-ACAAAAATCTAAATT--CA-ACAACTT---TGCTTAC-AAATCCACTTAT-G-C-TACAA-AAGTTAATT
gi|13 : atgtagtttgcattagataCGGGGCGCC-GATTGG-GAC--T------T---GA-TCCTTTTG-C-AAT-CAAAA--C-C------AATTTT-G-TGTACACAAAATA-G--AA-TTCC-G--TCATAACAAAA-TTCAATT-TTGTC--A-CAC---AA-A---AGT-GTG-CT--G-CTT-CG--TA-ATAAC-TTCATctgtcaaaacatacatgcaattgattgttgtctacaaatgtgagttttgtcatgagaaatt
gi|13 : taTAA--CAAAA--TTC------AATTTT-G-T-CACACAAAA---G--TG-TGCT-GCTTCGTAATAAC--TTCAT----ANNN--N-NN----NN-N---NNN-NNN-NN--N-NNN-NN--NN-ATAAC-TTCATATTT-GT-AT-TGATAA-----GT-TATACAAAA--TTAT-----TT-T-TCA--TT---NNNN----NNNNNNNNNN--NNNNNN-N--N-N--N--NN--NNNNNNNNNNNNN-N-NNN--NN--NNN-NNNNN--NNNN---NNN----N----N---N-NNN---N--NN-NN-NNN-NNN-NNNNNNNN------NNN------NN-N----N-------------N--NNNNNNAT-T-A----TGTA-TGCAAATATC---AATC-T-----CATTT-GC-A--TA-CAAAAT--A-G---------ACTTTT--GTTAT-C-TAGTTTGC--AT--T---A-AA-------T-annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataacttcatatttgtattgataagttatacaaaattatttttcattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtatgcaaatatcaatctcatttgcatacaaaatagacttttgttatctagtttgcattaaat
gi|14 : tacggggcgccgattgggacttgatccttttgcaatcaaaaccaattttgtgtacacaaaatagaattccgtcaCGGGGCGCC-G-ATTG-GAC--T------T---GA-TC-TTTTG--TAAT-CCAA------------AATTTT-G-T-TACACAAAATACG--AA-TTTCGG--TCATAAAAAAA-TTC-TTTTTTGTC--A-CACCATAG-A---AGTAATG-ATTGA-CTT-CA--TA-ATAAA-TCA--TTTTTGTAAT-TGA-AA-----ATATATAC-AAA--TTAT-----TTCT-TCA-------GA-G----CTAAATTGAA--T----------------------------TTCTGT-A-ACG--AC--AAA-AATCC--ATTT---TGT----A----A---------------------TGCTCATTGACAAAA------TTC------AT------T-------------T--TTGTCAATCT-A----TGTA-TGTCAATA---TCAATC-T-----C-TTT-GCAA--TA-CAAAAT--AGG---------ACTGTT--TTTAT-C-TAA-TTGC--AT--T---A-TA---------AACAAACAGTAA--------AATT-TT
gi|15 : GCC-GATTGG-GAC--T------T---GA-TC-TTTTT-GTAAT-CAAAA--C-C------AATTTT-G-TGTACACAAAT-A-G--AA-TTCC-G--TCGTAACAAAA-TTCATTT-TTGTC--A-CAC---AA-A---AGT-ATG-TT--G-CTT-CA--TA-ATAAC-TTCA-TTTTTGT-AT-TGATAA-----GT-TATACAAAA--TTAT-----TT-T-TCA-GTT---G--A----CAAAATTCAA-------------------------------TTTTGT-C-ACA--AC--AAA-ATCCA---TTT---TGT----AGAT-A---A-ACT---C--AA-TT-TTG-TCA-TGACAAAA------TTC---------A----AT------------T--TTGTCAAT-T-A----TGTA-TGCAAATA---TCAATC-T-----CATTT-GC-A--TA-CAAAAT--A-G---------ACTTTT--GTTAT-C-TAGTTTGC--AT--T---A-AA-------
gi|16 : tGGCGCC-AAATGG--AC--T-CCTTGT---GA-T--TTTTGTCT--TGCAAAA--TTC------ATTTTT-G-TGTCGACAAAA-ATG--AA-TTTT-G--T-AGAACAAAAATTGAGTTCAGGTC--AACA----AA-ATTGATC-ATG-----G-AAT-CA--CA-AAAAT-TTAATTTCT------------------GT-CGCACAAAA--T-AT-----CT-T-ACA-GC-----AGA----CAAAATTCAC--TATTGT-A--GAA--C--AA--AGTCAA-TTTTGT-C-TGG--AC--AGA-ATTAA--C-TT---TGT----A----AC--ATATT---G--GA-TT-TTG-T-A-TTGC-ATA------TTA------G------------------------TTG--AAT-T--------------GGATTTT-TTAAAC-T-----AATTT-GC-A--TACCAAAAT--
gi|17 : ttc-TTTTG-TGAAT-CAAAA----C------AATTT--G-TGTACACAAAATA-G--AAATTCC-G--TCATAACAAAA-TTCATTT-TTGTC--A-AAC---AA-A---AGT-ATG-TT--G-CTT-CC--CA-ATAAC-TTA--TTTTTGT-AT-TGATAA-----GT-TGTACAAAA--TTAT-----TT-T-TCA-GTT---G--A----CAAAATCCAT--TTTTGT-A--G-A--T--AA--ACTTAAATTTTGT-C-ATGAAAC--AAA-ATTCA--TTT-----------------------GT---C--AA-TT-ATG-T-A-TG-CAAAT------ATC------G-------A-------------T--C--TC-AT-T------TGCA-TACAAA---------------------------A--TA-----------G---------ACTTTT--GTTAT-C-TAGTTTGC--AT--tagtc
gi|18 : GTT-G---ACAAAATTCA--TTTTTG-TC-T--AC-C--------TACATGTAA-A--TAT-AA-TCTCTTC-ATG-CAACTTTTTCTTCCCA----------------------------TT-AAA-TTAT-CAT-TAGT-AA--AAACA-GTT-TG-TCCGACAAA----ATT-------T--A-ATTA-------TGAATTACAGAAATGA-----AT----T--------TCTTCATTTTGGTA--TGCAA-------------------TAAATT--CA-ACAAATT---TGCTTACAAAATCCACTTAT-G-T-TACAA-AAGTCAAaa
gi|19 : AAAATT-A-ATTTTCG-TC-TTAAC-C--------TA------A-A--TAT-AA-TTTCTTT-ATG-CGACTTTTTTTCCTTG-C-AT--TGCCCA----ATT-TAA-G-TTT-AAA-TTATGCA--TAGT-AATTTAACA-TTTGTG-TCCAAC-AA----ATTC---------A-ATT---------------------TGA-----AT----T--------TTTTCATTTTGGTA--TGCAAATT-AGTTC-AC--AAATCCAAATT--CA-ACTAATT---TGCAT
gi|2 : GGGCGTC-GAATGGCGAC--T----------GACTT-TTTTG--TAAT-CAAAA--C-C------CATTT--G-TGTACACAAAT-T-G--AAGTTCC-G--TCACAACAAAA-TTCATTTT----------------------ATT-ATG-TT--G-CTTTCA--TATATAAGCTTCATTTT-TGT-AT-TGATTA-----GT-TATACAAAA--TTAT-----TT-T-TCGCGTG---G--A----CAAAATTAAA--TTTTGT-A----A--CG-AA--AATCA--TTTTGT-C-ACG--ACAGAAA-GTCCA--TTT------T----A----A---A-GGTTACC--AA-TT-TAG-T-A-TTCCAA---------TC----------------------------T--TTGTCAAT-A-T----TGTA-TGCAAATA---TCAATCTT-----CA-TT-GT-A--TA-CAAAATA-A-G---------ACTTTG--TTTAT-CTTAGTTTGC--AT--T---A-AA-------TAAACAAA-AG--T--------AATTATTATT--GA-CAAAGTTGA----AT--TTGTCA--TAC-----A----A---AA-G---CTG-G-ACTT---TGTTA----ACA--AAACT-----GAATTTGATCAACA-AATTCAT-T-N-NNN-NNNNN---NNN---------NN----NNNNNN---NNNN---N-----N-NN-NN-NN-NN-NNNNN--NNNNNNN-NN---------NNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-NNN-N-NNNGTTCAACCAA-TCA--TTTTTGTCTTCATAA-----------TTTTTGTCA--ACAAAAATT-CA---TTTTTG--T-C-TC--ACAAA-AGT--GAA--------TTTTGTA-AT-GACAAAAGTGAA-TTTAGTCAACAAAAAATGAAGATTTTGTT------AG-ACA-AAATT-TCATTTTcct
gi|20 : AAAATTGA-----TCTTGAAT-C-AC----AAATAAT--TAA--------TTTTGTC-AT-G-CAAAATT--A-TCT-TTCAACGGA---CGA--ATTTCGCTTTTTT-AG-ACA-ACAGT-CAATTTTATTC--TTACAGAATT--AACTTTG---A-AACATAA-----GTGCATTTTGT---------AAGCTTGGGTTTTTtgatc
gi|20 : caaaaaaacaacaacaaaacacaccccaAA-AGT-T--------AATT-CTGTAA-GAATAAAATTGACTG-----TTGTCT--AAAA----A----AGCGAA-A---TTC-G---TC---CGTT-----GAA--AGAT------AATTTTGCATGACA-AA---AT-T-A-ATTATTTGT-----G---------ATTCAAGATCAA----------T-----T-TT-GT-gttga
gi|21 : caaaaaaacaacaacaaaacacaccccaaaaaacccaagcttacaaaatgcacttatgtttcCGGGGCGCC-AAATGG-GACCTT-G----T---GA----TTTTG-TT-CT-CAAAAT-T-C------ATTTTT-G-TGTGGACAAAA-ATG--AA-TTTT-G--TAGAAACAAAA--TGAGTTCAGGTC--A-AC----AA-A---ATTGATC-AT--G-AAT-CA--CA-A-AAA-TCAATGTT-------------------GT-CGCACAAAA--TTAT-----CT-T-TCA-Gtga
gi|22 : gACAAAA-TT-GAATTTT---GTCATGACACAAAGTG-A---ATTTTG--T-CAATG-ACAAA-AGT--GAAAAGTGAATTTCTGTT-GT-GACAAAAGTGAATTTTGGTCAACAAAATTT-A--TTTTTGCTC-------CACATAAAGT-G-ATTTTG-TC-AACAAA-AATT---ATTTTGT
gi|23 : GCTTACAAAATGCACTTAT-G-T-TTC-A-AAGTTAATTg
gi|23 : AA-AGT-T--------AATT-CTGTAA-GAATAAAATTGACTG-----TTGTCT--AAAA----A----AGCGAA-A---TTC-G---TC---CGTT-----GAA--AGAT------AATTTTGCATGACA-AA---AT-T-A-ATTATTTGT-----G---------ATTCAAGATCAA----------T-----T-TT-GT-ctgtaagaataaaattgactgttgtctaaaaaagcgaaattcgtccgttgaaagataattttgcatgacaaaattaattatttgtgattcaagatcaattttgttg
gi|24 : gcttacaaaatgcacttatgtttcTACAAAATGCACTTAT-G-T-TTCAA-AAGTTAATTtg
gi|24 : ct--AC--AAA-ATGCA--CTTA---TGTTTC-A----A---A-AGT---T--AA-TT-CTG-TCA-AGATAAAA------TTctgtcaagataaaattgactgttgtctaaaaaagcgaaattcgtccgttgaaagataattttgcatgacaaaattaatatttgtgattcaagatcaattttgttg
gi|24 : cttAAA-AGT-T--------AATT-CTGTCAAGA-TAAAATTGACTG-----TTGTCT--AAAA----A----AGCGAA-A---TTC-G---TC---CGTT-----GAA--AGAT------AATTTTGCATGACA-AA---AT-T-A-ATA-TTTGT-----G---------ATTCAAGATCAA----------T-----T-TT-GT-gactgttgtctaaaaaagcgaaattcgtccgttgaaagataattttgcatgacaaaattaatatttgtgattcaagatcaattttgttg
gi|25 : cttacaaaatgcacttatgtttcAAAATTTA-ATTTTT--TC-T--ACGC--------TA------AGA--TAT-AA-TTTCTTT-GTG-CA--TTTTTTTTTCCG-C-AT--TGCCAA----ATT-TAAGG-TTT-AAA-TCAT-CAT-TAGT-GA--AAACATTTT-TGTTCCAA-ACA----ATTT------C--AGATTA-------tg
gi|26 : CGACAAA----ATT-------T--A-ATTATGAATTGC-----------AGAACTGA-AT----T--------TCTTCATTTTGGTA--TACAAATT-AGCTT-ACAAAAATCTAAATT--CA-ACAAATT---TACTTCCAAAATCCACTTGT-G-T-TACAA-AAGTTAATtgatt
gi|27 : tAGTGAATTT-----T----G-TCA--ACAAAAA-TGA-A----TCTTGCCAGTCGACAAAATTCA--TTTTTG-TT-T--AT-C--------TA------A-A--TAT-TA-TCTCTTC-ATG-CAAC---TTTTTCCC--C-AT--TGCCTA----ATT-TAA-G--TT-AAA-
gi|28 : G-TC-T--AC-C--------AA------A-A--TAT-AA-TTTCTTT-ATG-CAAATTTTTT---CCG-C-GT--TGCCAA----ATT-TAA-G-TTT-GAA-TTAT-CAT-TAGT-AA--AAATA-TTT-TG-TCCAACAAA----ATTC---------A-ATTA-------
gi|3 : T-GAATTTTGTTAA------AAA--T-TTT-AACTTGTC-ATGAC--AAATTTC-ATTTTTGGTCTTCACA--AAGTGAATTTTGTCACAAAAGAGTA--CAAAAA--TGA-A----A--TTTT-GTTGACAAAATTCA-CTTTT-G-TCAT--AC-T--------TTT-----A-A--TAT-AAATCTCTTC-AAG-CAACTATTTTT--CCA-A-AT--TGCCTA----ATT-GAA-G-TTT-AAAATTAT-CAT-TAGT-AA--AAACA-GTT--G-TCCGACAAA----ATTTAATTTATGAA-ATTA-------C-----------AGAACTTGAAT----T--------TCTTCATTT-GGTAAATGCAAATTTAGTTT-ACAAAAATCTAAATT--CA--C--ATT---TGC-TACAAAATCCACTTAT-G-T-TACAA-AA-TTAATTtgaat
gi|3 : ctagataacagatgtaataaaaaacagGGGGCGCC-AAAT-G-GAC--T-CTTTGT---GA----TTTTG-TT-CT-CAAAAATT-C------ATTTTT-GCTGTGAACAAAA-ATG--AA-TTTT-G--T-ACAACAAAA-ATGAGTTCAGGTA--A-CAACC-AA-A---ATC-GTC-AT--GAATT-TA--CA-A-AAA-TTAATTT--------------------GT-CTTACAAAA--ATATCAC--TT-TGTCA---T---G--A----CAAAATTCACTTTTTTGT-A--G-A--C--AAC-AGTCAA-TTTTGT-CTTTG--AC--AGA-ATT-A--ATTT---TGT----A----ACATA-AGT---G--GA-TT-TTG-----TAGCAAA---------T------GTGA----A-------------T--TTA--GAT-T--------TT-TGTAAA-----CTAA----------ATTT-GC-ATTTA-CCAAATGAA-G---------AAATTCAAGTTCT-G-TAATTT-C--A---T---A-AA-------T----------T-A--------AATT-TTGTCG-GA-C--AACTG--TT--T--TTACTAATGATA----ATTTTA---AA-C---TTC-A-A-TT---AGGCAATTTGGA--AAAAT-----AG--TTGCTTGAAG-AG---AT-T-T-AT-----------------------------ATTAA---AAG-------------------T-AT-GACAA--A-AGT-G-AA---------TTTTGTCA--ACAAAA-TTTCATTTTTGTACT-----------------------CTTTTG---TGACAAAA-T-----TCACTTTGTGAAGACCAAAAATGAA---A-TTTG--T-C-ATG-AC--A-AGTTAAAA--------TTTT-----T-AACAAAActgtcaaagacaaaattgactgttgtctacaaaaaagtgaattttgtcatgacaaagtgatatttttgtaagacaaattaatttttgtaaattcatgacgattttggttgttacctgaactcatttttgttgtacaaaattcatttttgttcacagcaaaaatgaatttttgagaacaaaatcacaaagagtccatttggcgcccc
gi|30 : ctagataacagatgtaataaaaaacagtgaaAAAA--TTCTAGAGATT-T-TAA-GTTTTGGACAAACTCAGGAATCAT--TTTTGT-T--G-A--C--AA--AATTAACTTTTCT-C-ATG--AC--AAA-ATTCA--CTTT---TGT----
gi|31 : atg---AGT-ATG-TT--G-CTT-CATACA-ATAAT-TTCATTTTT-AT-AT-TGA---------------CAAAA--TCTT-----TT-T-TCA-GTG---GAC-------AAAGTGAA--TTTTGTCAT-G-A--CG-AA--AGTTAA
gi|32 : ttCGGGGAGCC-AAATGG-GAC--TAT----T---GT-TA-TTTTG-TT-CT-CAAAA--T-TCAGATGAATTTT-G-TACA-ACAGAA-A-G--GC-TTTC-
gi|33 : atctCGGGGAGCC-AAATGG-GAC--TAT----T---GT-TA-TTTTG-GTTCT-CAAAA--T-TCATGTGAATTTT-G-TATA-ACAGAA-A-G--GC-TTTC-t
gi|4 : atctAAAA-A-C--AG-TT---G--TC-CGACAAAA-TTTAATTATGATT--A-CA----GA-A---GA--ATG-TT-----CT-CA------------------TTTGT-ATGCAATAA-----AT-T-CACACAA--TTGT-----CT-T--------------A----CAAAATCCAC--TTATGT-G--T-A--C--AAGAAGTCA--TTATGT-C-AAG--AC--AAA--TTGAAGCTTTATCTAC----A----A---A-AGT---TGAAA-TT-TTG-TCA-TGACAAAAGTTAA-TTT------GT-A----AGACAAAATTAATTT--TTGT-AAT-TCA----TG-A-TCCGAATTTTGTTGACC-TGAACTCATTTTGT-G--TA-CCAAA---A-A---------A---TT--ATT---T-TTGTCTG-------T---A-GA-------C-AA-AAT-GG-----------AATT-TTG--A-GA-CAAAAT
gi|4 : cggggcgctcaaatgggcctcgtgtgTTTTTGT-CT-TCATAATTTTTGT-CA-ACAAAAATTCAT-----TT-T-T---GTC---T-CA----CAAAAGTGAA--TTTTGT-AATG-A--CA-AA--AGTGAA-TTTAGT-C-A----AC--AAA-A--------------------A----ATG-A-AG--------A-TT-TTG-TTA--GACAAAA------TT--------T-C----A-------------T--TTTTGATC-T-ACCCTTACA-TGTAAA-GTTATTAATC-T-----C-TT---C-A--TG-CA------------------ACTTT----TTAC------TTCCC--AT--T---A-AATTATCATT-AGTAAA-AAA-C--------AG---TTGTCC-GA-CAAAATTTAATT-ATGATTA-CA--GA-A----G----A---AT-G---TTCTC-A-TT---TG-TA---TGCAATAAATTCACACAATTGTC--TTACA-AA---AT-C-C-ACT-TATGTGTACAAGAAGTCATTAT----G-TCAAGACAAAT---TGAAGCT-TT-AT-CT-A----CAA--A-AGTTGAAA---------TTTTGTCATGACAAAA-GTT-AATTT-GT-A-A-G-A-----CAA--AATTAA--TTTTTGTAATT-CATGA-TCCGAA---TTTTGT--TGAC-----CTGAACTCATTTTG--TGT-ACC-A-AAA-AAT--TAT--------TTTTGTCTGTAGACAAAATGGAA-TTT-TGAGACAAAATtactaatgataatttaatgggaagtaaaaagttgcatgaagagattaataactttacatgtaagggtagatcaaaaatgaaattttgtctaacaaaatcttcattttttgttgactaaattcacttttgtcattacaaaattcacttttgtgagacaaaaatgaatttttgttgacaaaaattatgaagacaaaaatgattggtt
gi|4 : cggggcgctcaaatgggcctcgtgtgAAT-CATTTTTGT-C-TTCATA-A--T----TTTTGTCAA---CAAAAATTC-AT---TTTTGTCTC--AC--AAAAGT-GAATTTTG-TAATGACA-AAAGTGAATTT----A------GTCA--ACAAAAAATGA-AGATTT--TGTTAG---ACAAAATTTC-ATTTTTGATC-T--AC-CCTTACATGTA------A-AGTTATTAA-TCTCTTC-ATG-CAACTTTTT----------AC--TTCCCA---------------TT-AAA-TTAT-CAT-TAGTAAA--AAACA--GT-TG-TCCGACAAA----ATTTAATTA-T--G-ATTA-------C-----------AGAAG----AA----TG-------TTCTCATTT--GTA--TGCAA-------------------TAAATT--CACAC-AATT---GTCTTACAAAATCCACTTAT-G-TGTACAAGAAGTCAtgattggtt
gi|5 : cggggcgctcaaatgggcctcgtgtgattttgtctcaaaattccattttgtctacagacaaaaataattttttggtacacaaaatgagttcaggtcaacaaaattcggatcatgaattacaaaaattaattttgtcttacaaattaacttttgtcatgacaaaatttcaacttttgtagataaagcttcaatttgtcttgacataaAAAA--TGA-A----T--T-TT-GTCCACAAAATT-A-ATTTTCG-TC-T--AC-C--------TT------A-A--TAT-AA-TCTCTTT-AGG-CAACTTTTTT---CCGTC-AT--TGTTCA----ATT-TAA-G-TTT-AAA-TTAT-CAT-TAGT-AA--AAACA-TTT-TG-TCCAACAAATTCAATTA------TG-A-ATTA-------C-----------ATAAC----AGATTTT--------TTTTCATTTTGGTA--TGCAAATT-AGTTT-ACAAAAATCCAAATT--CA-ACTAATT---TCCATACAAAATCCAATTAT-G-T-TACAA-AAGTTAATTggtt
gi|6 : acaGGGCGCC-AATTGG-GAC--T------T---GA-TC-TTTTT-GTAAT-CGAAA--T-C------AATTTT-G-TGTACATAAAA-A-GTAAA-ATCT-G--TCACAACAAAA-T--AATTTTTGTCTAA-CA----AATAT--ATT-ATACTT--G-TTT-T------ATAAC-TTCATTTTTTGT-AA-TGACAA-----A-----ACCAAA--TT-T-----T--------GCT----ACA----CAAAATTATA--TTTCA-------------AA--AGTCA--TTTTG---------------------A--TCTT---TAC----A----A---A-A-T---C--AATTT-TTG-TCA---ATAA----------G------GT-A----------------------TG-CAA----A----TACA-TGTA--------TAAAC-T-----TATCT-GT-A--TC-CAAAAT--T-G---------ACTTTT--GTTAC-C-TAATTTGCAAAT--T---A-AA-------T---CACA-AGT-T--------AATT-TGGTGA-GA-CAAAAATAAAT---G--TTGTCAT-GACA----A----A---AGTGACCTTC-G---TC---CGCT----CGAT--AA--T-----AATTTTATGTAACA-AA---AT-T-T-ACT-TTTGT---GAT---------AT----GTTGTA---AAAT---T-----TGTTAAT-CT-GA-ACTCATTTTTGTTG-AACAAACTCACCTTTGTCAACGCGAAA--TTGGATTTCA----AGT-A-----CAA--AA-TCA--Cctgtccagaaaacatcatggtttcaaggttatgtaaaaaatactaacactttccactttctgaacagtttttgtaaatctttgaatattgacttgagttatattctgaaaacaaatgtatttaatctgatcaatcatgaaatgctgttatcatttccatcgttttacagagaagcaattatatttttcatggacggtaagaaaattgagaaattgtgtgacttgtcctcaaactcttttcttcgacaaac
gi|7 : A----CAAAATTAAA--TTTTGT-A--T-A--C--GA--AATCAAATTTTGTTC-ACG--AC--AAA-ATCCA--TTTT---T---------------A-AGG---C--A-----TTA-CCA--------A------TTT------AT-ATTCAA-------------TCTTTGTCAATAT-A----TGTA-TGCAAATATC---AATC-TT----CATT--GT-A--TA-CAAAAT--A-G---------ACTTTG--TTTAT-CTTAGTTTG---AT--T---A-AA-------TAAACAAA-AG--T--------AATT-aagaacctcactagtgtcc
gi|7 : ggA-AA---AC-TGA-ATT-GTTGT---CA-----------------ACCAATT-CTAT---T-----T-TT-GT-CTCAT---------TAAT--------------TTTTGTCA--ACAAAA-ATTCATTTTTGT-CTC-TCA-----CAA--AAGTGA--ATTTTGTAATGACAAAAGT--GAATTTA---GTCAAG-CAAAAAATGAAG--ATTTTG--T-T---G-ACAAA-ATT--CAT--------TTTTGTatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaactaaaactgaattgttgtcaaccaattctatttttgtctcattaatttttgtcaacaaaaattcatttttgtctctcacaaaagtgaattttgtaatgacaaaagtgaatttagtcaagcaaaaaatgaagattttgttgacaaaattcatttttgttc
gi|7 : ggacaaaattaaattttgtatacgaaatcaaattttgttcacgacaaaatccatttttaaggcattaccaatttatattcaatctttgtcaatatatgtatgcaaatatcaatcttcattgtatacaaaatagactttgtttatcttagtttgattaaataaacaaaagtaattatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaact---AT-T-A-ATT-TTTGT---CAA------------------CAA---AAAT---TCATT-T-TT-GT-CT-CT-CACAA--A-AGT-G-AA---------TTTTGTAATGACAAAA-G-TGAATTTAGT-CAAGC-A-----AAA--AA-TGAAGATTTTGT--TGACAAAA-T--TCATTTTTtc
gi|8 : ggacaaaattaaattttgtatacgaaatcaaattttgttcacgacaaaatccatttttaaggcattaccaatttatattcaatctttgtcaatatatgtatgcaaatatcaatcttcattgtatacaaaatagactttgtttatcttagtttgattaaataaacaaaagtaattatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaactaaaactgaattgttgtcaaccaattctatttttgtctcTT-GTCCACAAAATT-A-ATTTTCG-TC-T--AC-C--------TT------A-A--TAT-AA-TCTCTTT-AGG-CAACTTTTTT---CCG-C-AT--TGTTCA----ATT-TAA-G-TTT-AAA-TTAT-CAT-TAGT-AA--AAACA-TTT-TG-TCCAACAAATTCAATTA------TG-A-ATTA-------C-----------ATAAC----AGATTTT--------TTTTCATTTTGGTA--TGCAAATT-AGTTT-ACAAAAATCCAAATT--CA-ACTAATT---TCCATACAAAATCCAATTAT-G-T-TACAA-AAGTTAATTgttc
gi|9 : ttCA--A-AAAA--TTA-A----T--T-TT-GTCCACAAAATTAA-TTTTTCG-TC-T--AC-C--------TA------A-A--TAT-AA-TTTCTTTTATG-CAACCTTTTTT--CCG-C-AT--TGCCCA----ATT-TAA-G-TTTTAAA-TTAT-CAT-T-GT-AA--AAACA-TTT--G-TCCAACAAA----ATTC---------A-ATTA--------------------TGAA----TT----T--------TTTTCATTTTGGTA--TGC-AATT-AGTTTCACAAAAATCCAAATT--CA-ACTAATT---TGCATACAAAATCCAAATAT-G-T-TACAA-AAGTTAATTctgtccagaaaacatcatggtttcaaggttatgtaaaaaatactaacactttccactttctgaacagtttttgtaaatctttgaatattgacttgagttatattctgaaaacaaatgtatttaatctgatcaatcatgaaatgctgttatcatttccatcgttttacagagaagcaattatatttttcatggacggtaagaaaattgagaaattgtgtgacttgtcctcaaactcttttcttcgacaaac
gi|9 : aGGGCGCCCAAATGG-GAC--T-C----T---TG-TG-ATTTG-CTTCT-CAAAA--TTC------ATTTTT-G-TGTGGACAAAA-ATG--AA-TTTT-G--T-AGAACAAAA-ATGAGTTCAGGTC--A-AC----AA-A---ATTGATC-AT--G-AAT-CA--CA-A-AAA-TTAATTTT-------------------GT-CGCACAAAA--TTAT-----CT-T-TCA-GC-------------------------------A--G-A--C--AA--AATTCACTTTTGT-C-ATG--AC--AAATATTCA--CTTT---TGT----ATACAA---A-AGT---C--AA-TT-TTG-TCT-GGACAGAA------TTAACTTTTGT-A----ACATA---------T--TTG--GAT-T-T----TGTA-TGCAAAT-----TAGTT-G-----AATTT-G------------------G---------ATTTTT--GTGAAAC-TAATT-GC--AT--ACCAA-AA-------T-GAAAAA-AAT-TCATAATTGAATT-TTGTTG-GA-CAAA--TG--TT--T--TTA-CAATGATAATTTA----A---AA-C---TTA-A-A-TTGGGCAATG---CGGA--AAA-------AAGGTTGCATAAAAGAA---AT-T-ATATT-TAGGT----AG---------AC----G---AA---AAATTAAT-----T-TT-GT-ctgtccagacaaaattgacttttgtatacaaaagtgaatatttgtcatgacaaaagtgaattttgtctgctgaaagataattttgtgcgacaaaattaatttttgtgattcatgatcaattttgttgacctgaactcatttttgttctacaaaattcatttttgtccacacaaaaatgaattttgagaagcaaatcacaagagtcccatttgggcgcccg
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|29 ): TAGATGAACCTAGCTGAGCTCATTTTTGTTGAAGCAAAGATTCATTTTGAATCCACATAAGGTAAATTCGAATTCTTGGGAACAAAAATCACCAAGTCCCATTTG
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 33333333333 11 1111111111111111 1111 22222222222 111 11 222222222222222222222 1 5555555555555 22222222 6666666666666666666666666666666 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 3333333333333333 1111 11 222222222222 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1 1 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 222 33333333333 111 222 1111111 2222222 22222 22222222 1 22222222 111 1111 333333333333 5555555555555 3333333 222 33333333333333333333333333333333333 11 111 1 222222 11 111111111 1111 11111111 111111 222 1111 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888
lowQualScore : 2 33 1 2 33 77777777777 2 22 6666666666666666 7777 444 44444444444 22 2 2 5 999 33 5 333 9 2 8888 2 11 33 000000000000000000000 888 33 666 2 33 2 2 33 1 0 8888888888888 6666 33 666 2 5 77777777 2 3333333333333333333333333333333 6666 2 44 33 33 5 6 2 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 999 2 7777777777777777 66 7777 7777 77777 44 3 6 0 44 7777 3 22 4 3 888888888888 888 3 666 7 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 44 7777 3 3 555 3 0 555 0 6666 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 8 1 3 333 1 0 55555555555 99 6 5 666 222 6 8888888 3 1 6666666 77 11111 5 5 1 44444444 4 44 1 22222222 2 6 000 4444 111111111111 7777777777777 5 666 3333333 5 5 222 66666666666666666666666666666666666 1 88 4 222 0 0 000000 9999 99 5 777777777 8 444 5555 5 2 2 33 2 00000000 111111 5 33 2 2 2 2 555 5555 33 6666 2 2 2 2 2 3 3 3 44 6 3 2 2222 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1 44 3 3 44 3 5 555 4 3 3 3 3 3
lowQualScore : . .. . . .. ........... . .. ................ .... ... ........... .. . . . ... .. . ... . . .... . .. .. ..................... ... .. ... . .. . . .. . . ............. .... .. ... . . ........ . ............................... .... . .. .. .. . . . ......................................................................... ... . ................ .. .... .... ..... .. . . . .. .... . .. . . ............ ... . ... . ........................................................................................... .. .... . . ... . . ... . .... ............................................................................... . . . ... . . ........... .. . . ... ... . ....... . . ....... .. ..... . . . ........ . .. . ........ . . ... .... ............ ............. . ... ....... . . ... ................................... . .. . ... . . ...... .... .. . ......... . ... .... . . . .. . ........ ...... . .. . . . . ... .... .. .... . . . . . . . . .. . . . .... ....................................................... . .. . . .. . . ... . . . . . .
lowQualScore : 7 33 2 7 77 11111111111 7 55 6666666666666666 8888 444 33333333333 77 5 5 6 222 44 0 666 6 0 8888 0 66 99 444444444444444444444 333 77 777 7 77 7 3 77 0 7 2222222222222 9999 44 999 5 0 11111111 5 6666666666666666666666666666666 9999 7 22 77 77 3 1 7 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 888 7 2222222222222222 99 9999 7777 77777 22 1 2 4 22 7777 3 44 9 1 888888888888 555 6 999 3 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 44 7777 6 6 888 3 0 888 0 1111 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 5 3 5 000 3 8 00000000000 22 7 2 888 666 7 7777777 2 0 0000000 99 66666 7 3 0 22222222 7 22 7 77777777 5 7 888 2222 222222222222 4444444444444 7 111 4444444 7 7 333 77777777777777777777777777777777777 0 22 0 222 0 8 666666 3333 33 7 666666666 9 999 7777 8 9 9 99 9 44444444 111111 7 99 9 9 9 9 000 9999 99 1111 9 9 9 9 9 1 1 1 22 2 1 7 1111 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2 66 3 3 66 3 7 888 8 5 1 1 1 1
consensus : CGGGGCGC-C-GAATGG-GAC--T-C----T----GA-T-CTT----------------TTGTTNAT---CAAAA--T-C------AATTTT-G-TG-TACACAAAA-ATG--AA-TTC-C-GTCANAACAAAA-TTNANTTCNGGTC--A-CA----A---A-A---ATT-ATG-NT--GC-TT-C--ACA-ATAAN-TTNATTTTTTGT-ATTGA-AAGT-CGTACAAAATTA--T---TT-T-TCAGC-TG--ACAAAA-TTNAA-TTTT--GT--A-GA--C--AA-AG--TC-AA-TTTTGT-CAC-G--AC--AAA-ATTCACTT-TTGT-----A---A---A-AGT-----CAA-TT-TTG-TCA-TGACAAAA------TTCGT-A-----A-T--TTGTCGAT-TNTGTA-TGCAAATA-TT-AATC-T-C--ATTTGC-AT--A-CAAAAT--A-GA-----CTTTT--GTT-ATC-TAGTTTGC--AT---TA-AAT-AANAAA-AGT--T--------AATT---TTG-TCG-GA-CAAAATTGA-TT--TTTGTCA--GANA----A----A---AA-N---TTCG-A-T----C---C--------------GTT-G---C--GAAAA-AT--AATTTT----GCAT-GACA-AA---AT-TA-AT---T-TT---TGT-A-GAT----GATCAAAA----AT----T----T-TT-G------T-CT------AT--------AACAAATANTCGAATTTTGTNATGACNAAA-GTTGAATTTCGTCAA-T-A-----CAA--AA-TNA--CTTTTGT-ATGAC-AAAA-T-GAATTTTTTTGTCATGACAAAAATTGAA--TTTTG--TC-ACG-ACAAA-AGTGAA--------TTTTGTCGTGACAAAAG-------TGAA-TTTGT-TCAA----CAAAA-T-TC--GA--ATTTTG-C-TC-TTT-AGCACA-AAAGT-GAATTTTGTTC-GTCAC-A-AATT-GAATTTTGTCAA-GACAAAAA--C-G-TG-ATTTT--GTC--CAC--AAANTT-GANTTTTGTCATGACA-AAAGTGAATTTACGATCA--ACAAAA--TGA-A----T--TGTT-GTCCACAAAATTCA-ATTTTCG-TC-T--AC-C--------TA------A-A--TAT-AA-TCTCTTT-ATG-CAACTTTTTTTTCCCG-C-AT--TGCCCA----ATT-TAA-G-TTT-AAA-TTAT-CAT-TAGT-AA--AAACA-TTT-TGTCCGACAAA----ATTC------T--A-ATTA-------C-----------ATGAC------A--------TTTTTTCATTTTGGTA--TGCAAATT-AGTTT-ACAAAAATCCAAATT--CA-ACTAATT---TGCATACAAAATCCACTTAT-G-T-TACAA-AAGTTAATT
Reference ( family-5289 ) : CGGGGCGC-C-GAATGG-GAC--T-C----T----GA-T-CTT----------------TTGTTAAT---CAAAA--T-C------AATTTT-G-TG-TACACAAAA-A-G--AA-TTC-C-GTCANAACAAAA-TTCANTTCNGGTC--A-CA----A---A-A---ANT-ATG-NT--GC-TT-C--ACA-ATAAN-TTNATTTTTTGT-ATTGATAAGT-CGCACAAAATTA--T---TT-T-TCAGT-TGA-ACAAAA-TTNAA-TTTT--GT--A-GA--C--AA-AG--TC-AA-TTTTGT-CAC-G--AC--AAA-ATTCACTT-TTGT-----A---A---A-AGT-----CAA-TT-TTG-TCA-TGACAAAA------TTCGT-A-----A-T--TTGTCAAT-TATGTA-TGCAAATATTT-AATC-T-C--ATTTGC-AT--A-CAAAAT--A-GA-----CTTTT--GTT-ATC-TAGTTTGC--AT---TA-AAT-AANAAA-AGT--T--------AATT---TTG-TNA-GA-CAAAATTGAATT--TTTGTCA--GACA----A----A---AA-G---TTCG-A-T----C---C--------------GTT-A---C--GAAAA-ATT-AATTTT----GCAT-GACA-AA---AT-TA-AT---T-TT---TGTCA-GAT----GATCAAAA----AT----T----T-TT-G------T-CT------AT--------ANCAAATAGTCGAATTTTGTCATGACAAAA-GTTGAATTTCGTCTA-T-A-----CAA--AA-TGA--CTTTTGT-ATGAC-AAAA-T-GAATTTTTTTGTCATGACAAAAANTGAA-ATTTTG--TC-ACG-ACAAA-AGTNAA--------TTTTGTCGTGACAAAAG-------TGAA-TTTGT-TCAA----CAAAA-T-TC--GA--ATTTTG-C-TC-TTC-AGCACA-AAAGT-NAATTTTGTTC-GTCAC-A-AATT-GAATTTTGTCAA-GACGAAAA--C-G-TG-ATTTT--GTC--CAC--AAANTTCGATTTTTGTCNTNACA-AAAGTGAATTTACGATCA--ACAAAA--TGA-A----T--TGTT-GTCCACAAAATTCA-ATTTTCG-TC-T--AC-C--------TA------A-A--TAT-AA-TCTCTTT-ATG-CAACTTTTTTTTCCCG-C-AT--TGCCCA----ATT-TAA-G-TTT-AAA-TTAT-CAT-TAGT-AA--AAACA-TTT-TGTCCGACAAA----ATTC------T--A-ATTA-------C-----------ATGAC------A--------TTTTTTCATTTTGGTA--TGCAAATT-AGTTT-ACAAAAATCCAAATT--CA-ACTAATT---TGCATACAAAATCCACTTAT-G-T-TACAA-AAGTTAATT
gi|1 : CGGGGCGC-C-GATTGG-GAC--T------T----GA-T-CTT----------------TTGCTAAT---CAAAA--C-C------AATTT--G-TG-TACACTAAA-A-G--AA-TTC-C-GTCATAACAAG--TTCATTTCTTGAC--A-CA----A---A-A---AGT-ATG-TT--GC-TT-C--ATA-ATAAC-TTCATTTTTTGT-ATTGATAAGT-TGTACAAAATTA--GA--TT-T-TCAGT-TGACACAAAA-TTGAA-TATT--GT--A-GAACCTGAA-AC--TT-AACTTTTGT-CAC-G--AC--AAA-ATTCATTT-TTGT-----A---A---ATAAT-----CAA-TTATTG-TCAATGACAAAA------TTGGT-A-----A-T--TTGTCAAT-TATGTAGTGCAAATATTTTGATC-T-C--ATTTGC-AT--A-CAAAAT--A-AA-----CTTTT--GTT-ATC-TTGTTTGC--AT---TA-AAT-AAGAAA-AGT--A--------AATT---TTG-TGA-GA-CAAAATTGAATTCATTTGTCA--GACA----A----A---AA-G---TTTGCA-T----C---T--------------GTT-A---T--GTAAA-ATTGAATTTT----TCAT-GACA-AA---GTGTA-AT---TCTT---TGTTA-GGT----GATCAAAG----GT----T----C-TT-G------TCCT------ATG-------ACCAAATAGTCGAATTTTGTCATGATAAAAGGTTGAATTTCGTTTA-T-A-----CAA--AA-TGAT-CTTCTGTCATGAC-AAAACT-GAATTTTTTTGTCATGACAAAAATTGAAGATTTTG--TC-ATGAACAAA-A-TGAA--------TGTTGTCATGACAGAAG-------TGAA-TTTGT-CCAA----CAAAA-T-TC--GA----TTTG-T-TCGTTCAAGCACA-AAAGTGGAATTTTGTTCTGTCAC-A-AATG-GAATTTTGTCAAGGACGAGAA--CAG-TG-ATTTT--ATC--CACCAAAATTTCGATTTTTGTCTTCACACCAAGTGAATTTACGATCA--ACAAAA--TGAGG----T--TGTT-GTCCAGTAAATT---ATTTT-G-TC-T---C-C--------TA------ACA--TAT-AA-TTTCTTA-TTG-C-ACTTTTTTTTCCCG-C-ATTGTGCCCATTCCATTCTAA-G-TTT-AAA-TTAT-CATCTAGT--A--AAACA-TTT-TGTCCACCAAA----ATTCT-----T--A-ATTA-------C-----------ATGAT------G--------GTTTTCAATTTGGGTA--TGC-AATT-A-TTT-ACATAAAT-CAAATTAACA-CCTATTTTCATATATACAAATTCCA-TAAT-GTT-TACAA-AAGTTAATT
gi|10 : GGGGCGC-C-AAATGG-GAC--T-C----TTGT-GA-T---T----------------TTGTTC-T---CAAAA--TTC------ATTTTT-G-TG-TGGACAAAA-ATG--AA-TTT-T-GT-AGAACAAAA-ATGAGTTCAGGTC--A-AC----A---A-A---ATTGATC-AT--GA-AT-C--ACA-A-AAA-TTAATTTT-------------GT-CGCACAAAATTA--T---CT-T-TCAGC-AG--ACAAAA-T-------------------------------TC-AC-TTTTGT-CAT-G--AC--AAATATTCACTT-TTGTATAC-A---A---A-AGT-----CAA-TT-TTG-TCT-GGAAAAGATTAAT-TTTGT-AACTATA-T--TTG--GAT-TTTGTA-TGCAAA---TT-AG----------TTGA-AT---------T--G-GA-----TTTTT--GTG-AAC-TAATTTGC--ATACCAA-AAT-GAAAAA-AAT--TCATAATTGAATT---TTG-TTG-GA-CAAAAT---GTT--TTTACTAATGATAATTTA----A---AA-C---TTAA-A-TTGGGC---A--------------ATC-G---C--GGAAA-A---AGGTTG----GCAT-AAAG-AA---AT-TATAT---T-TA---GGT-A-GA---------GAAA----AT----T----T-
gi|10 : tctA-ATTTTC--TC-T--AC-C--------TA------A-A--TAT-AA-TTTCTTT-ATGCCAACCTTTTT---CCG-CGAT--TGCCCA----ATT-TAA-GTTTT-AAA-TTAT-CAT-TAGT-AA--AAACA-TTT-TGTCCAACAAA----ATTC---------A-ATT--------------------ATGAA------T--------TTTTTTCATTTTGGTA--TGCAAATT-AGTTC-ACAAAAATCC-AATT--CA-ACTAATT---TGCATACAAAATCCAAATATAG-T-TACAA-AA-TTAAT
gi|11 : tctaAAATTAA-TTTTTTG-TC-T--AC-C--------TA------A-A--TAT-AA-TTTCTTT-ATG-CAACTTTTTT---CCG-C-GT--TGCCCA----ATT-TAA-G-TTT-AAA-TTAT-C-----GT-AA--AAACA-TTT-TGTCCAA-ACA----ATTC---------A-ATTA--------------------TGAT------T--------TTTTTTCATTCTGGTA--TGCAAATT-AGTTT-ACAAAAATCCAAATT--CA-ACTAATT---TGCATACAAAATCCAAATAT-G-T-TACAA-AAGTTATTTcttttccagacaaaattgacttttgtatacaaaagtgaatatttgtcatgacaaaagtgaattttgtctgctgaaagataattttgtgcgacaaaattaatttttgtgattcatgatcaattttgttgacctgaactcatttttgttctacaaaattcatttttgtccacacaaaaatgaattttgagaacaaaatcacaagagtcccatttggcgcccc
gi|11 : GGCGC-C-AAATGG-GAC--T-C----TTGT-GA-T-TTT----------------GAGTTC-T---CAAAA--T-T------CATTTTAG-TG-TGGACAAAA-ATG--AA-TTT-T-GT-AGAACAAAA-ATGAATTCAGGTC--A-GC----A---A-A---ATTGATC-AT--GA-AT-C--ACA-A-AAA-TTTATTTTT------------G---GCACAAAATTA--T---CT-T-TCAGC-AG--ACAAAA-T-------------------------------TC-AC-TTTTGT-CAT-G--AC--AAA-ATTCACTT-TTGTAGAC-A---A---A-AGT-----CAA-TT-TTG-TCT-GGACAGAAATAACTTTTGT-AACAT-A-T--TTG--GAT-TTTGTA-TGCAAA---TT-AGTT-G-A--ATTTG------------------GA-----TTTTT--GTA-AAC-TAATTTGC--ATAC-CAGAATGAAAAAA-AATCAT--------AATTGAATTGTTTG-GA-CAAAAT---GTT--TTTAC----GATA----ATTT-A---AA-C---TTAA-A-T----T---G--------------GGC-AACGC--GGAAA-A---AA-GTT----GCAT-AAAG-AA---AT-TATAT---T-T--------A-GGTA---GACAAAAA----AT----T----ctgtccagacaaaattgacttttgtctacaaaagtgaattttgtcatgacaaaagtgaattttgtctgctgaaagataattttgtgccaaaaataaatttttgtgattcatgatcaattttgctgacctgaattcatttttgttctacaaaattcatttttgtccacactaaaatgaattttgagaactcaaaatcacaagagtcccatttggcgcc
gi|12 : aaattACA-AATGT-AAATTTTGTGA-G--AC-A-AATTTGAATTTTGTCAT-GA--AAAA--A-G-TG-AAT----------------AGT--GAATTGTGTCATGACA-AAAATGAATT-ATG-TCATGATAAAAG-TGA-A----T--T-TT-GTTGAAAAAATTCATATTT--G-TC-T--AC-C--------TA------A-A--TCT-AA-TCTCTTC-ACG-CAA---TTTTTTCCC----AT--TGTCTA----ATT-GAA-G-TTA-AAA-TTAA-CAT-TAGT-AA--AAAAAACTT-TGTCCCACAAA----ATTG---------A-ATTA-------TGA---------ATAAC------AGTACTGAATTTCTTCATTTTGGTA--TGCATAAT-AGTTT-ACAAAAATCTAAATT--CA-ACAACTT---TGCTTAC-AAATCCACTTAT-G-C-TACAA-AAGTTAATT
gi|13 : atgtagtttgcattagataCGGGGCGC-C-GATTGG-GAC--T------T----GA-TCCTT----------------TTG-CAAT---CAAAA--C-C------AATTTT-G-TG-TACACAAAATA-G--AA-TTC-C-GTCATAACAAAA-TTCAATTTT-GTC--A-CAC---A---A-A---AGT-GTG-CT--GC-TT-C--GTA-ATAAC-TTCATctgtcaaaacatacatgcaattgattgttgtctacaaatgtgagttttgtcatgagaaatt
gi|13 : ta--T---TT-T-GCAAT------CAAAA-C-CAA-TTTT--GTGTA-CA--C--AA-AA--TAGAA-TTCCGT-CAT-A--AC--AAA-ATTCAATT-TTGTCACACA---A---A-AGTGTG--CTG-CT-TCG-TAA-TAAC----------TTCAT-A-----N-N--NNNNNNNN-NNNNNN-NNNNNNNNNAT-AACT-T-CATATTTGT-AT--annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataacttcatatttgtattgataagttatacaaaattatttttcattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtatgcaaatatcaatctcatttgcatacaaaatagacttttgttatctagtttgcattaaat
gi|13 : tacggggcgccgattgggacttgatccTTT-GT-ATTGATAAGT-TATACAAAATTA--T---TT-T-TCATTNNNN-NNNNNN-NNNNN-NNNN--NN--N-NN--N--NN-NN--NN-NN-NNNNNN-NNN-N--NN--NNN-NNNNNNNN-NNNN-----N---N---N-NNN-----NNN-NN-NNN-NNN-NNNNNNNN------NNNNN-N-----N-N--NNNNNNAT-TATGTA-TGCAAATA-TC-AATC-T-C--ATTTGC-AT--A-CAAAAT--A-GA-----CTTTT--GTT-ATC-TAGTTTGC--AT---TA-AAT-tgataagttatacaaaattatttttcattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtatgcaaatatcaatctcatttgcatacaaaatagacttttgttatctagtttgcattaaat
gi|14 : tacggggcgccgattgggacttgatccttttgcaatcaaaaccaattttgtgtacacaaaatagaattccgtcataacaaaattcaattttgtcacacaaaagtgtgctgcttcgtaataacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataacttcataCGGGGCGC-C-GA-TTG-GAC--T------T----GA-T-CTT----------------TTG-TAAT---CCAA------------AATTTT-G-T--TACACAAAATACG--AA-TTT-CGGTCATAAAAAAA-TTC-TTTTTTGTC--A-CACCATA---G-A---AGTAATG-ATTGAC-TT-C--ATA-ATAAA-TCA--TTTTTGTAATTGA-AAATATATAC-AAATTA--T---TTCT-TCA----GA-GCTAAA-TTGAA-T-------------------------------TTCTGT-AAC-G--AC--AAA-AATCCATT-TTGT-----A---A---------------------TGCTCATTGACAAAA------TTCAT-------T-T--TTGTCAATCTATGTA-TGTCAATA-TC-AATC-T-C---TTTGCAAT--A-CAAAAT--AGGA-----CTGTT--TTT-ATC-TAA-TTGC--AT---TA-TA--AACAAACAGTA-A--------AATT---TT
gi|15 : GC-C-GATTGG-GAC--T------T----GA-T-CTT----------------TTTGTAAT---CAAAA--C-C------AATTTT-G-TG-TACACAAAT-A-G--AA-TTC-C-GTCGTAACAAAA-TTCATTTTT-GTC--A-CAC---A---A-A---AGT-ATG-TT--GC-TT-C--ATA-ATAAC-TTCA-TTTTTGT-ATTGATAAGT-TATACAAAATTA--T---TT-T-TCAGT-TG--ACAAAA-T-------------------------------TC-AA-TTTTGT-CAC-A--AC--AAA-ATCCA-TT-TTGT-----AGATA---A-ACT-----CAA-TT-TTG-TCA-TGACAAAA------TTC---A-----ATT--TTGTCAAT-TATGTA-TGCAAATA-TC-AATC-T-C--ATTTGC-AT--A-CAAAAT--A-GA-----CTTTT--GTT-ATC-TAGTTTGC--AT---TA-AA
gi|16 : tGGCGC-C-AAATGG--AC--T-CCTTGT----GA-T--TT----------------TTGTCTTG---CAAAA--TTC------ATTTTT-G-TG-TCGACAAAA-ATG--AA-TTT-T-GT-AGAACAAAAATTGAGTTCAGGTC--AACA----A---A-ATTGATC-ATG-----GA-AT-C--ACA-AAAAT-TTAATTTCT------------GT-CGCACAAAAT-A--T---CT-T-ACAGC-AGA--CAAAA-TTCAC-TATT--GT--A-GAA-C--AA-AG--TC-AA-TTTTGT-CTG-G--AC--AGA-ATTAAC-T-TTGT-----A---AC--ATATT-----GGA-TT-TTG-T-A-TTGC-ATA------TTAG-------------TTG--AAT---TGGA-T-----TTTTT-AAAC-T-A--ATTTGC-AT--ACCAAAAT--
gi|17 : ttcTT----------------TTGTGAAT---CAAAA----C------AATTT--G-TG-TACACAAAATA-G--AAATTC-C-GTCATAACAAAA-TTCATTTTT-GTC--A-AAC---A---A-A---AGT-ATG-TT--GC-TT-C--CCA-ATAAC-TTA--TTTTTGT-ATTGATAAGT-TGTACAAAATTA--T---TT-T-TCAGT-TG--ACAAAA-TCCAT-TTTT--GT--A-GA--T--AA-AC--TTAAA-TTTTGT-CAT-GAAAC--AAA-ATTCATTT---------------------GT-----CAA-TT-ATG-T-A-TG-CAAAT------ATCG--------A-T--C--TC-AT-T-TGCA-TACAA---------------------------------AAT--A-GA-----CTTTT--GTT-ATC-TAGTTTGC--AT---tagtc
gi|18 : GTT-G---ACAAAATTCA--TTTTTG-TC-T--AC-C--------TACATGTAA-A--TAT-AA-TCTCTTC-ATG-CAACTTTTTCTTCCCA----------------------------TT-AAA-TTAT-CAT-TAGT-AA--AAACA-GTT-TGTCCGACAAA----ATT-------T--A-ATTA-------TGAATTACAGAAATGA-------A--------TTTCTTCATTTTGGTA--TGCAA-------------------TAAATT--CA-ACAAATT---TGCTTACAAAATCCACTTAT-G-T-TACAA-AAGTCAAaa
gi|19 : AAAATT-A-ATTTTCG-TC-TTAAC-C--------TA------A-A--TAT-AA-TTTCTTT-ATG-CGACTTTTTTTCCTTG-C-AT--TGCCCA----ATT-TAA-G-TTT-AAA-TTATGCA--TAGT-AATTTAACA-TTTGTGTCCAAC-AA----ATTC---------A-ATT---------------------TGA-------A--------TTTTTTCATTTTGGTA--TGCAAATT-AGTTC-AC--AAATCCAAATT--CA-ACTAATT---TGCAT
gi|2 : GGGCGT-C-GAATGGCGAC--T-----------GACT-TTT----------------TTGT-AAT---CAAAA--C-C------CATTT--G-TG-TACACAAAT-T-G--AAGTTC-C-GTCACAACAAAA-TTCATTTT-------------------------ATT-ATG-TT--GC-TTTC--ATATATAAGCTTCATTTT-TGT-ATTGATTAGT-TATACAAAATTA--T---TT-T-TCGCG-TGG-ACAAAA-TTAAA-TTTT--GT--A--A--CG-AA-AA--TC--A-TTTTGT-CAC-G--ACAGAAA-GTCCATTT----T-----A---A---A-GGTTAC--CAA-TT-TAG-T-A-TTCCAA---------TC-----------T--TTGTCAAT-ATTGTA-TGCAAATA-TC-AATCTT-C--A-TTGT-AT--A-CAAAATA-A-GA-----CTTTG--TTT-ATCTTAGTTTGC--AT---TA-AATAAACAAA-AG---T--------AATTA--TTA-TT--GA-CAAAGTTGAA----TTTGTCA--TAC-----A----A---AA-G---CTGG-ACT----T---T--------------GTTAA---C----AAA-ACT-GAATTT----G-ATCAACA-AATTCAT-TN-NN---N-NN---NNNNN-NNN----NNNNNNNN----NN----N----N-NN-N------N-NN------NN--------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN-N-NNNGTTCAACCAA-TCA--TTTTTGT-CTT-C-ATAA--------TTTTTGTCA--ACAAAAATT-CA-TTTTTG--TC-TC--ACAAA-AGTGAA--------TTTTGTAATGACAAAAG-------TGAA-TTTAG-TCAA----CAAAA-A-AT--GAAGATTTTG-------TT-AG-ACA-AAATT-TCATTTTcct
gi|20 : AAAATTGA---TCTTGAATC-AC----AAATAATTAA--------TTTTGTCATG-CAAAAT-------T--A-TCT-T-TCAA----CGGA-----C--GA--ATTTCG-CTTT-TTT-AG-ACA-ACAGT-CAATTTTATTC--TTAC-AGAATT--AACTTTG---A-AACATAA-----G-TGCATTTT--GT--------AAGCTTGGGTTTTTtgatc
gi|20 : caaaaaaacaacaacaaaacacaccccaAA-AGT--T--------AATT---CTG-TAA-GAATAAAATTGA-CT--GTTGTCT--AAAA----A----AGCGAA-A---TTCG---T----C---C--------------GTT--------GAAAG-AT--AATTTT----GCAT-GACA-AA---AT-TA-AT---TATT---TGT---GATTCAAGATCAA------------T----T-TT-G------T-gttga
gi|21 : caaaaaaacaacaacaaaacacaccccaaaaaacccaagcttacaaaatgcacttatgtttcCGGGGCGC-C-AAATGG-GACCTT-G----T----GA----TT----------------TTGTT-CT---CAAAAT-T-C------ATTTTT-G-TG-TGGACAAAA-ATG--AA-TTT-T-GTAGAAACAAAA--TGAGTTCAGGTC--A-AC----A---A-A---ATTGATC-AT--GA-AT-C--ACA-A-AAA-TCAATGTT-------------GT-CGCACAAAATTA--T---CT-T-TCAGtga
gi|22 : gAC-AAAA-TTGAATTTT---GTCATGACACAAAGTG-A-ATTTTG--TCAATG-ACAAA-AGTGAAAAGTGAATTTCTGTTGTGACAAAAG-------TGAATTTTGG-TCAA----CAAAA-T-TT---A--TTTTTG-C-TC-------CACATAAAGT-G-ATTTTG-TC-AACAA-A-AATT---ATTTTGT
gi|23 : GCTTACAAAATGCACTTAT-G-T-TTC-A-AAGTTAATTg
gi|23 : AA-AGT--T--------AATT---CTG-TAA-GAATAAAATTGA-CT--GTTGTCT--AAAA----A----AGCGAA-A---TTCG---T----C---C--------------GTT--------GAAAG-AT--AATTTT----GCAT-GACA-AA---AT-TA-AT---TATT---TGT---GATTCAAGATCAA------------T----T-TT-G------T-ctgtaagaataaaattgactgttgtctaaaaaagcgaaattcgtccgttgaaagataattttgcatgacaaaattaattatttgtgattcaagatcaattttgttg
gi|24 : gcttacaaaatgcacttatgtttcTACAAAATGCACTTAT-G-T-TTCAA-AAGTTAATTtg
gi|24 : ctAAA-AGT--T--------AATT---CTG-TCAAGA-TAAAATTGA-CT--GTTGTCT--AAAA----A----AGCGAA-A---TTCG---T----C---C--------------GTT--------GAAAG-AT--AATTTT----GCAT-GACA-AA---AT-TA-AT---A-TT---TGT---GATTCAAGATCAA------------T----T-TT-G------T-ctgtcaagataaaattgactgttgtctaaaaaagcgaaattcgtccgttgaaagataattttgcatgacaaaattaatatttgtgattcaagatcaattttgttg
gi|25 : cttacaaaatgcacttatgtttcAAAATTTA-ATTTTT--TC-T--ACGC--------TA------AGA--TAT-AA-TTTCTTT-GTG-CA--TTTTTTTTTCCG-C-AT--TGCCAA----ATT-TAAGG-TTT-AAA-TCAT-CAT-TAGT-GA--AAACATTTT-TGTTCCAAACA----ATTT------C--AGATTA-------tg
gi|26 : CGACAAA----ATT-------T--A-ATTATGAATTGC-----------AGAACTGA---A--------TTTCTTCATTTTGGTA--TACAAATT-AGCTT-ACAAAAATCTAAATT--CA-ACAAATT---TACTTCCAAAATCCACTTGT-G-T-TACAA-AAGTTAATtgatt
gi|27 : tAGTGAATTT-TG-TCA--ACAAAAA-TGA-A----TCTTGCCAGTCGACAAAATTCA--TTTTTG-TT-T--AT-C--------TA------A-A--TAT-TA-TCTCTTC-ATG-CAAC---TTTTTCCC--C-AT--TGCCTA----ATT-TAA-G--TT-AAA-
gi|28 : G-TC-T--AC-C--------AA------A-A--TAT-AA-TTTCTTT-ATG-CAAATTTTTT---CCG-C-GT--TGCCAA----ATT-TAA-G-TTT-GAA-TTAT-CAT-TAGT-AA--AAATA-TTT-TGTCCAACAAA----ATTC---------A-ATTA-------
gi|3 : GGGGCGC-C-AAATGG--AC--T-C----TTTGTGA-T---T----------------TTGTTC-T---CAAAAATT-C------ATTTTT-GCTG-TGAACAAAA-ATG--AA-TTT-T-GT-ACAACAAAA-ATGAGTTCAGGTA--A-CA----ACCAA-A---ATC-GTC-AT--GAATT-T--ACA-A-AAA-TTAATTT--------------GT-CTTACAAAAATA--TCACTT-TGTCA---TGA--CAAAA-TTCAC-TTTTTTGT--A-GA--C--AACAG--TC-AA-TTTTGT-CTTTG--AC--AGA-ATTAA-TT-TTGT-----A---ACATA-AGT-----GGA-TT-TTG-T----AGCAAA---------TGTGA-----A-T--TTA--GAT-TTT----TGTAAAC---T-AA--------ATTTGC-ATTTA-CCAAATGAA-GA-----AATTCAAGTT-CTG-TAATTT-C--AT----A-AAT-TA-------------------AATT---TTG-TCG-GA-CAA--CTG--TT--TTTACTAATGATA----ATTTTA---AA-C---TTCA-A-T----TAGGCAATTTGGAAAAATAGTT-G---CTTGAAGAGATT-TATATTAAAAGTAT-GACA-AA---AG-TG-AA---T-TT---TGTCA-A---------CAAAATTTCAT----T----T-TT-GTACTCTT-TT------GT--------GACAAA-ATTC--ACTTTGTGAAGACCAAA-AATGAAATTTGTC-A-TGA-----CAA--GT-TAA--AATTTTT-A--AC-AAAA-T-TCACTGTTTT-TTATTACAtgaat
gi|3 : ctagataacagaA-ACAGT-GAATTTTGTT-----AA-A-AATT-TTAACTTGTCAT-GAC--AAA--T-T-TC-ATTTTTGGTCTTCAC--AAAGT--GAATTTTGTC---ACA-AAAGAG----TACAA--------AAA--TGA-A----A--TTTT-GTTGACAAAATTCA-CTTTT-G-TCAT--AC-T--------TTT-----A-A--TAT-AAATCTCTTC-AAG-CAACTATTTTT--CCA-A-AT--TGCCTA----ATT-GAA-G-TTT-AAAATTAT-CAT-TAGT-AA--AAACA-GTT--GTCCGACAAA----ATTTAATTTATGAA-ATTA-------C-----------AGAACTTGA--A--------TTTCTTCATTT-GGTAAATGCAAATTTAGTTT-ACAAAAATCTAAATT--CA--C--ATT---TGC-TACAAAATCCACTTAT-G-T-TACAA-AA-TTAATT
gi|30 : ctagataacagatgtaataaaaAAAAGTGAA--TTTTG--TC-ATG-AGAAA-AGTTAA--------TTTTGTC--AACAAAAATGATTCCTGAG-TTTGT-CCAAAACTTAAAA-TCTCTAGA--ATTTTctgtcaaagacaaaattgactgttgtctacaaaaaagtgaattttgtcatgacaaagtgatatttttgtaagacaaattaatttttgtaaattcatgacgattttggttgttacctgaactcatttttgttgtacaaaattcatttttgttcacagcaaaaatgaatttttgagaacaaaatcacaaagagtccatttggcgcccc
gi|31 : atg---AGT-ATG-TT--GC-TT-CATACA-ATAAT-TTCA-TTTTTAT-ATTG----------ACAAAATCT--T---TT-T-TCAG--TGG-ACAAAG--TGAA-TTTT--GTC-ATGA--CG-AA-AG--TT-AA-gt
gi|32 : ttCGGGGAGC-C-AAATGG-GAC--TAT----T----GT-T-ATT----------------TTGTT-CT---CAAAA--T-TCAGATGAATTTT-G-TA-CA-ACAGAA-A-G--GC-TTT-C-
gi|33 : atctCGGGGAGC-C-AAATGG-GAC--TAT----T----GT-T-ATT----------------TTGGTTCT---CAAAA--T-TCATGTGAATTTT-G-TA-TA-ACAGAA-A-G--GC-TTT-C-t
gi|4 : atctCGGGGCGCTC-AAATGG-GCC--T-CGTG-T----GA-T-TTTGTCTCAAAATTCCATTTTGTCTACAGACAAAA--A-T------AATTTT-T-TGGTACACAAAA-T-G--AG-TTCAG-GTC--AACAAAA------TTCGGATC--A-TG----A---A---------------------T-T--ACA-A-AAA-TTAATTTT-------------GT-CTTAC-AAATTAACT---TT-TGTCA---TG--ACAAAATTTCAACTTTT--GT--A-GA--T--AA-AGCTTC-AA--TTTGT-CTT-G--AC--ATA-A-TGACTTCTTGT-----AC--ACATA-AGT-----GGA-TT-TTG-T-------AAGA---------------------------CAAT-TGTGTG----A---ATTT-A-----------TTGC-AT--A-CAAATG--A-GAACATTCTTCT--GTA-ATC--------------------AT-AAT------T--A--------AATT---TTG-TCG-GA-C--AACTG-TTT--TTTACTAATGATA----A---------------TTTA-A-T-----------------------GGG-A---A--GTAAA-A---AGT--T----GCAT-GAAG-AG---AT-TA-ATAACT-TTACATGTAAGGGTA---GATCAAAA----ATGAAAT----T-TT-G------T-CT------A---------ACAAAATCTTCATTTTTTGT--TGACTAAA--TTCACTTTTGTCAT-T-A-----CAA--AATTCA--CTTTTGT-GAGACAAAAA-T-GAA--TTTTTGT--TGACAAAAA---------TTA--TG-AAG-ACAAA-AATGA
gi|4 : AAT-CATTTTTGT-C-TTCAT-A-A--T----TTTTGTCAA---CAAAAATTC-A-T---TTTT--GTCT-CAC--AAAAGT-GAATTTTGTAATGACA-AAAGTGAATTTA--GTCA--ACAAAAAATGA-AGATTT--TGTTAG---ACAAAATTTC-ATTTTTGATC-T--AC-CCTTACATGTA------A-AGTTATTAA-TCTCTTC-ATG-CAACTTTTT----------AC--TTCCCA---------------TT-AAA-TTAT-CAT-TAGTAAA--AAACA--GT-TGTCCGACAAA----ATT-------T--A-ATTA-------TG----------ATTACAGAAGAA--------TGTTCTCATTT--GTA--TGCAA-------------------TAAATT--CACAC-AATT---GTCTTACAAAATCCACTTAT-G-TGTACAAGAAGTCAttggtt
gi|5 : cggggcgctcaaatgggcctcgtgtgattttgtctcaaaattccattttgtctacagacaaaaataattttttggtacacaaaatgagttcaggtcaacaaaattcggatcatgaattacaaaaattaattttgtcttacaaattaacttttgtcatgacaaaatttcaacttttgtagataaagcttcaatttgtcttgacataaAAAA--TGA-A----T--T-TT-GTCCACAAAATT-A-ATTTTCG-TC-T--AC-C--------TT------A-A--TAT-AA-TCTCTTT-AGG-CAACTTTTTT---CCGTC-AT--TGTTCA----ATT-TAA-G-TTT-AAA-TTAT-CAT-TAGT-AA--AAACA-TTT-TGTCCAACAAATTCAATTA------TG-A-ATTA-------C-----------ATAAC------AGATT----TTTTTTCATTTTGGTA--TGCAAATT-AGTTT-ACAAAAATCCAAATT--CA-ACTAATT---TCCATACAAAATCCAATTAT-G-T-TACAA-AAGTTAATTggtt
gi|6 : acaGGGCGC-C-AATTGG-GAC--T------T----GA-T-CTT----------------TTTGTAAT---CGAAA--T-C------AATTTT-G-TG-TACATAAAA-A-GTAAA-ATC-T-GTCACAACAAAA-T--AATTTTTGTCTAA-CA----A---ATAT--ATT-ATACTT--GT-TT-T------ATAAC-TTCATTTTTTGT-AATGACAAA-----ACCAAATT---T---T-------GC-TAC-ACAAAA-TTATA-TTTC--A------------AA-AG--TC--A-TTTTG---------------------ATCT-TTAC-----A---A---A-A-T-----CAATTT-TTG-TCA---ATAAG----------GT-A-----------TG-CAA---ATACA-TGTA------T-AAAC-T-T--ATCTGT-AT--C-CAAAAT--T-GA-----CTTTT--GTT-ACC-TAATTTGCAAAT---TA-AAT---CACA-AGT--T--------AATT---TGG-TGA-GA-CAAAAATAAA-T--GTTGTCAT-GACA----A----A---AGTGACCTTCG---T----C---C--------------GCT-----C--GATAA---T-AATTTT----ATGT-AACA-AA---AT-TT-AC---T-TT---TGTGA-TAT----GTTGTAAA----AT----T----TGTTAA------T-CTGAACTCATTTTTGTTGAACAAAC--TC-ACCTTTGTCAACGCGAAA--TTGGATTTCA---AGT-A-----CAA--AA-TCA--Cctgtccagaaaacatcatggtttcaaggttatgtaaaaaatactaacactttccactttctgaacagtttttgtaaatctttgaatattgacttgagttatattctgaaaacaaatgtatttaatctgatcaatcatgaaatgctgttatcatttccatcgttttacagagaagcaattatatttttcatggacggtaagaaaattgagaaattgtgtgacttgtcctcaaactcttttcttcgacaaac
gi|7 : GG-ACAAAA-TTAAA-TTTT--GT--A-TA--C--GA-AA--TC-AAATTTTGTTCAC-G--AC--AAA-ATCCATTT-TT-----------A---A-GGCATTACCAA-TT-T-----A-T------A------TTC---A-----A-TCTTTGTCAATATATGTA-TGCAAATATC--AATC-TTC--ATT-GT-AT--A-CAAAAT--A-GA-----CTTTG--TTT-ATCTTAGTTTG---AT---TA-AATAAACAAA-AG---T--------AATT---aagaacctcactagtgtcc
gi|7 : TAACTAAAACTGAA-TTGTTG--TC-A---ACCAA-TTCTAT--------TTTTGTC-T--CA-----------TTAA-TTTTTGTCAA----CAAAAAT-TC---A--TTTTTGTC-TC-T-----CACA-AAAGT-GAATTTTG-TA-ATGACAA-AAGT-GAATTTAGTCAA-GCAAAAAA--T-GAAG-ATTTT--GTT--GAC--AAAATTC-ATTTTTGTatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaactaaaactgaattgttgtcaaccaattctatttttgtctcattaatttttgtcaacaaaaattcatttttgtctctcacaaaagtgaattttgtaatgacaaaagtgaatttagtcaagcaaaaaatgaagattttgttgacaaaattcatttttgttc
gi|7 : ggacaaaattaaattttgtatacgaaatcaaattttgttcacgacaaaatccatttttaaggcattaccaatttatattcaatctttgtcaatatatgtatgcaaatatcaatcttcattgtatacaaaatagactttgtttatcttagtttgattaaataaacaaaagtaattatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn---AT-TA-AT---T-TT---TGTCA-A---------CAAAA----AT----TCATTT-TT-G------T-CT------CT--------CACAAA-AGT-GAATTTTGTAATGACAAAA-G-TGAATTTAGTCAAGC-A-----AAA--AA-TGAAGATTTTGT--TGAC-AAAA-T-TCATTTTTtc
gi|8 : ggacaaaattaaattttgtatacgaaatcaaattttgttcacgacaaaatccatttttaaggcattaccaatttatattcaatctttgtcaatatatgtatgcaaatatcaatcttcattgtatacaaaatagactttgtttatcttagtttgattaaataaacaaaagtaattatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaactaaaactgaattgttgtcaaccaattctatttttgtctcTT-GTCCACAAAATT-A-ATTTTCG-TC-T--AC-C--------TT------A-A--TAT-AA-TCTCTTT-AGG-CAACTTTTTT---CCG-C-AT--TGTTCA----ATT-TAA-G-TTT-AAA-TTAT-CAT-TAGT-AA--AAACA-TTT-TGTCCAACAAATTCAATTA------TG-A-ATTA-------C-----------ATAAC------AGATT----TTTTTTCATTTTGGTA--TGCAAATT-AGTTT-ACAAAAATCCAAATT--CA-ACTAATT---TCCATACAAAATCCAATTAT-G-T-TACAA-AAGTTAATTgttc
gi|9 : ttCA--A-AAAA--TTA-A----T--T-TT-GTCCACAAAATTAA-TTTTTCG-TC-T--AC-C--------TA------A-A--TAT-AA-TTTCTTTTATG-CAACCTTTTTT--CCG-C-AT--TGCCCA----ATT-TAA-G-TTTTAAA-TTAT-CAT-T-GT-AA--AAACA-TTT--GTCCAACAAA----ATTC---------A-ATTA--------------------TGAA------T--------TTTTTTCATTTTGGTA--TGC-AATT-AGTTTCACAAAAATCCAAATT--CA-ACTAATT---TGCATACAAAATCCAAATAT-G-T-TACAA-AAGTTAATTctgtccagaaaacatcatggtttcaaggttatgtaaaaaatactaacactttccactttctgaacagtttttgtaaatctttgaatattgacttgagttatattctgaaaacaaatgtatttaatctgatcaatcatgaaatgctgttatcatttccatcgttttacagagaagcaattatatttttcatggacggtaagaaaattgagaaattgtgtgacttgtcctcaaactcttttcttcgacaaac
gi|9 : aGGGCGC-CCAAATGG-GAC--T-C----T----TG-T-GAT----------------TTGCTTCT---CAAAA--TTC------ATTTTT-G-TG-TGGACAAAA-ATG--AA-TTT-T-GT-AGAACAAAA-ATGAGTTCAGGTC--A-AC----A---A-A---ATTGATC-AT--GA-AT-C--ACA-A-AAA-TTAATTTT-------------GT-CGCACAAAATTA--T---CT-T-TCAGC-AG--ACAAAA-T-------------------------------TC-AC-TTTTGT-CAT-G--AC--AAATATTCACTT-TTGTATAC-A---A---A-AGT-----CAA-TT-TTG-TCT-GGACAGAATTAACTTTTGT-AACAT-A-T--TTG--GAT-TTTGTA-TGCAAA---TT-AGTT-G-A--ATTTG------------------GA-----TTTTT--GTGAAAC-TAA-TTGC--ATACCAA-AAT-GAAAAA-AAT--TCATAATTGAATT---TTG-TTG-GA-CAAA--TG--TT--TTTA-CAATGATAATTTA----A---AA-C---TTAA-A-T----TGGGC--------------AAT-G---C--GGAAA-A---AAGGTT----GCAT-AAAAGAA---AT-TATAT---T-TA---GGT-A-GAC----G---AAAA----ATTAA-T----T-TT-G------T-ctgtccagacaaaattgacttttgtatacaaaagtgaatatttgtcatgacaaaagtgaattttgtctgctgaaagataattttgtgcgacaaaattaatttttgtgattcatgatcaattttgttgacctgaactcatttttgttctacaaaattcatttttgtccacacaaaaatgaattttgagaagcaaatcacaagagtcccatttgggcgcccg
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|29 ): TAGATGAACCTAGCTGAGCTCATTTTTGTTGAAGCAAAGATTCATTTTGAATCCACATAAGGTAAATTCGAATTCTTGGGAACAAAAATCACCAAGTCCCATTTG
Alignments
lowQualScore : 33333333333 11 1111 22222222222 11111111 111 1 6666666666666 11111 66666666666666666666666666666666 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 11111111111111111 1111 11 222222222222 111 111 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 11 22 444444444444 11 11 33333333 1111 11111 22222222 2222222 1111 22222222222 444444444444 333333 22 111 66666666666666666666666666666666666 1 22222222222222 1 111111111 1111 111111 222 1111 77777777777777777777777777777777777777777777777777777
lowQualScore : 2 33 0 2 33 88888888888 2 77 8888 66666666666 666666 2 2 4 33 4 33 2 2 0 2 9 1 2 2 3 1 1 999 66 88888888 444 2 777 444 777 33 999 33 2 1 33 1 0 9999999999999 555 33 33 777 2 5 00000 2 33 2 33333333333333333333333333333333 6666 2 44 33 33 5 6 2 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 555 0 2 0 55555555555555555 0 55 6666 7777 77777 44 3 6 0 44 7777 3 22 4 3 888888888888 888 3 000 7 000 55 0 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000 999 9 3 1 3 666 3 0 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1 00 1 55 2 3 000000000000 11 8 3 8 44 0 8 22222222 0 666 77 1111 77 55555 5 0 66 00000000 9 1111111 2 6 88 4444 55555555555 555555555555 6 999 444444 6 00 222 11111111111111111111111111111111111 1 55 0 0 88888888888888 1 5 777777777 4 444 6666 5 3 44 3 111111 6 3 3 3 333 4444 44 6666 3 3 3 3 3 3 3 44 6 3 3 3333 77777777777777777777777777777777777777777777777777777 55 3 3 55 2 666 3 4 3 3
lowQualScore : . .. . . .. ........... . .. .... ........... ...... . . . .. . .. . . . . . . . . . . . ... .. ........ ... . ... ... ... .. ... .. . . .. . . ............. ... .. .. ... . . ..... . .. . ................................ .... . .. .. .. . . . ............................................................................ ... . . . ................. . .. .... .... ..... .. . . . .. .... . .. . . ............ ... . ... . ... .. . ........................................................ ... . . . . ... . . .................................................................................. . .. . .. . . ............ .. . . . .. . . ........ . ... .. .... .. ..... . . .. ........ . ....... . . .. .... ........... ............ . ... ...... . .. ... ................................... . .. . . .............. . . ......... . ... .... . . .. . ...... . . . . ... .... .. .... . . . . . . . .. . . . .... ..................................................... .. . . .. . ... . . . .
lowQualScore : 5 55 6 5 44 00000000000 5 88 1111 99999999999 444444 2 2 8 11 4 44 5 5 6 5 8 0 5 5 7 9 0 444 33 33333333 777 7 333 444 000 44 000 44 5 0 55 0 1 9999999999999 000 77 77 333 7 3 88888 7 44 5 66666666666666666666666666666666 9999 7 22 77 77 3 1 7 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 555 1 7 6 33333333333333333 7 33 2222 7777 77777 22 1 2 4 22 7777 3 44 9 1 888888888888 555 6 444 3 555 00 9 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999 666 0 6 4 6 444 6 9 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 0 22 0 22 2 0 888888888888 00 0 8 0 55 8 0 22222222 8 888 99 3333 99 99999 0 2 99 77777777 9 7777777 5 7 22 2222 44444444444 000000000000 7 111 777777 7 22 666 88888888888888888888888888888888888 0 88 0 8 44444444444444 4 7 666666666 4 999 2222 8 1 22 1 999999 2 1 1 1 555 0000 22 5555 1 1 1 1 1 3 3 66 7 3 7 1111 33333333333333333333333333333333333333333333333333333 00 6 6 00 5 444 8 6 3 3
consensus : CGGGGCGC-C-GAATGG-GAC--T-C----T----GA-TC-TTTTGTTNATCAAAA--T-C------AATTT------T-G-TGTACA--CAAAA-A-TGAA-T-TTC-GTCANA-AC-AAAATTGAGTTCA-GGTC--AC-----A-A---A-A---ATT---ATG-NT--GN-TTCA--CA-ATAA-NTTNATTTTTTGT-ATTGA--AGT-CGTACAAAATT--A--T---TT-T-TCA--GCNG-ACA--AAA-TTNAA-TTTT--GT--A-G-A--C--AA-AG--TC-AA-TTTTGT-CAC-G--AC--AAA-ATTCACTT-TTGT-----A---A---A-AGT-----CAA-TT-TTG-TCA-TGACAAAA------TTCGT--A-----A-T--TTGTCGAT-TNTGTA-TGCAAATAT-T--AATC-TC--ATTTGC-AT--A-CAAAAT--A-GA-----CTTTT--GTT-ATC-TAGTTTGC--AT---TA-AAT-AANAAA-AGT--T--------AATT---TTG-TCG-GA-CAAAATTG-ATT--TTTGTCA--GANA----A----A---AA----NTTCG-A-T----C---CG-----TTGCGAAAAAT--AANTTTGCAT-GACG-AA---AT-TA-AT---T-TT---TG-T-A--GAT----GATCAAAAAT----TT-TT-GT-CT------AT--------AA-C-AAATANTCGAATTTTGTCATGACGAAA--TTNANTTTCGTCANTA------CAA--AA-TCA-CTTTTGT-GTGAC-AAAA-T-GAATTTTTTTGTCATGACAAAAAT--TGA--ATTTTG--TC-ACG-ACAAA-AGT--GAA--------TTTTGTCATGACAAAAG-------TGAA-TTTGNTCAA----CAAAAT-TC--GA--ATTTTGC-TC-TT--AGCACA-AAAGT-GAATTTTGTTC--GTCACA-AATT-GAATTTTGTCAA-GACAAAAA--C-GTG-ATTTT--GTCT--CA-CAAAATT--GAATTTTGTCATGACA-AAAGTGAATTTA--CGATCA--ACAAAA-TGA-A----T--TGTT-GTCCACAAAATTCA-ATTTTCGTC-T--AC-CTA------A-ATATAA-TCTCTTT-ATG-CAACTTTTTTTTCCCG-C-AT--TGCCCA----ATT-TAA-G-TTT-AAA-TTAT-CAT-TAGTAA--AAACA-TTT-TGTCCAACAAA----ATTC------T--A-ATTA-------C-----------ATGAC----A--------TTTTTTCATTTTGGTA--TGCAAATT-AGTTT-ACAAAAATCCAAATT--CAACTAATT---TGCATACAAAATCCACTTAT-G-TTACAAAAGTTAATT
Reference ( family-5289 ) : CGGGGCGC-C-GAATGG-GAC--T-C----T----GA-TC-TTTTGTTNATCAAAA--T-C------AATTT------T-G-TGTACA--CAAAA-A-TGAA-T-TCC-GTCANA-AC-AAAATTNANTTCN-GGTC--AC-----A-A---A-A---ATT---ATG-NT--GC-TTCA--CA-ATAA-NTTNATTTTTTGT-ATTGA-AAGT-CGTACAAAATT--A--T---TT-T-TCA--GCTG-ACA--AAA-TTNAA-TTTT--GT--A-G-A--C--AA-AG--TC-AA-TTTTGT-CAC-G--AC--AAA-ATTCACTT-TTGT-----A---A---A-AGT-----CAA-TT-TTG-TCA-TGACAAAA------TTCGT--A-----A-T--TTGTCGAT-TNTGTA-TGCAAATAT-T--AATC-TC--ATTTGC-AT--A-CAAAAT--A-GA-----CTTTT--GTT-ATC-TAGTTTGC--AT---TA-AAT-AANAAA-AGT--T--------AATT---TTG-TCG-GA-CAAAATTG-ATT--TTTGTCA--GANA----A----A---AA----NTTCG-A-T----C---CG-----TTGCGAAAAAT--AATTTTGCAT-GACA-AA---AT-TA-AT---T-TT---TG-T-A--GAT----GATCAAAAAT----TT-TT-GT-CT------AT--------AA-C-AAATANTCGAATTTTGTNATGACNAAA-GTTGAATTTCGTCAATA------CAA--AA-TNA-CTTTTGT-ATGAC-AAAA-T-GAATTTTTTTGTCATGACAAAAAT--TGA--ATTTTG--TC-ACG-ACAAA-AGT--GAA--------TTTTGTCGTGACAAAAG-------TGAA-TTTGTTCAA----CAAAAT-TC--GA--ATTTTGC-TCTTT--AGCACA-AAAGT-GAATTTTGTTC--GTCACA-AATT-GAATTTTGTCAA-GACAAAAA--C-GTG-ATTTT--GTC---CA-CAAANTT--GANTTTTGTCATGACA-AAAGTGAATTTA--CGATCA--ACAAAA-TGA-A----T--TGTT-GTCCACAAAATTCA-ATTTTCGTC-T--AC-CTA------A-ATATAA-TCTCTTT-ATG-CAACTTTTTTTTCCCG-C-AT--TGCCCA----ATT-TAA-G-TTT-AAA-TTAT-CAT-TAGTAA--AAACA-TTT-TGTCCGACAAA----ATTC------T--A-ATTA-------C-----------ATGAC----A--------TTTTTTCATTTTGGTA--TGCAAATT-AGTTT-ACAAAAATCCAAATT--CAACTAATT---TGCATACAAAATCCACTTAT-G-TTACAAAAGTTAATT
gi|1 : CGGGGCGC-C-GATTGG-GAC--T------T----GA-TC-TTTTGCTAATCAAAA--C-C------AATTT--------G-TGTACA--CTAAA-A--GAA-T-TCC-GTCATA-AC-AAG-TTCATTTCT-TGAC--AC-----A-A---A-A---AGT---ATG-TT--GC-TTCA--TA-ATAA-CTTCATTTTTTGT-ATTGATAAGT-TGTACAAAATT--A--GA--TT-T-TCA--GTTG-ACACAAAA-TTGAA-TATT--GT--A-G-AACCTGAA-AC--TT-AACTTTTGT-CAC-G--AC--AAA-ATTCATTT-TTGT-----A---A---ATAAT-----CAA-TTATTG-TCAATGACAAAA------TTGGT--A-----A-T--TTGTCAAT-TATGTAGTGCAAATAT-TTTGATC-TC--ATTTGC-AT--A-CAAAAT--A-AA-----CTTTT--GTT-ATC-TTGTTTGC--AT---TA-AAT-AAGAAA-AGT--A--------AATT---TTG-TGA-GA-CAAAATTGAATTCATTTGTCA--GACA----A----A---AA----GTTTGCA-T----C---TG-----TTATGTAAAATTGAATTTTTCAT-GACA-AA---GTGTA-AT---TCTT---TGTT-A--GGT----GATCAAAGGT----TC-TT-GTCCT------AT--------GACC-AAATAGTCGAATTTTGTCATGATAAAAGGTTGAATTTCGTTTATA------CAA--AA-TGATCTTCTGTCATGAC-AAAACT-GAATTTTTTTGTCATGACAAAAAT--TGAAGATTTTG--TC-ATGAACAAA-A-T--GAA--------TGTTGTCATGACAGAAG-------TGAA-TTTGTCCAA----CAAAAT-TC--GA----TTTGT-TCGTTCAAGCACA-AAAGTGGAATTTTGTTCT-GTCACA-AATG-GAATTTTGTCAAGGACGAGAA--CAGTG-ATTTT--ATC---CACCAAAATTTCGATTTTTGTCTTCACACCAAGTGAATTTA--CGATCA--ACAAAA-TGAGG----T--TGTT-GTCCAGTAAATT---ATTTT-GTC-T---C-CTA------ACATATAA-TTTCTTA-TTG-C-ACTTTTTTTTCCCG-C-ATTGTGCCCATTCCATTCTAA-G-TTT-AAA-TTAT-CATCTAGT-A--AAACA-TTT-TGTCCACCAAA----ATTCT-----T--A-ATTA-------C-----------ATGAT----G--------GTTTTCAATTTGGGTA--TGC-AATT-A-TTT-ACATAAAT-CAAATTAACACCTATTTTCATATATACAAATTCCA-TAAT-GTTTACAAAAGTTAATT
gi|10 : GGGGCGC-C-AAATGG-GAC--T-C----TTGT-GA-T---TTTGTTC-TCAAAA--TTC------ATTTT------T-G-TGTGGA--CAAAA-A-TGAA-T-TTT-GT-AGA-AC-AAAAATGAGTTCA-GGTC--AA-----C-A---A-A---ATTG--ATC-AT--GA-ATCA--CA-A-AA-ATTAATTTT-------------GT-CGCACAAAATT--A--T---CT-T-TCA--GCAG-ACA--AAA-T--------------------------------TC-AC-TTTTGT-CAT-G--AC--AAATATTCACTT-TTGTATAC-A---A---A-AGT-----CAA-TT-TTG-TCT-GGAAAAGATTAAT-TTTGT--AACTATA-T--TTG--GAT-TTTGTA-TGCAA--AT-T--AG---------TTGA-AT---------T--G-GA-----TTTTT--GTG-AAC-TAATTTGC--ATACCAA-AAT-GAAAAA-AAT--TCATAATTGAATT---TTG-TTG-GA-CAAAAT---GTT--TTTACTAATGATAATTTA----A---AA----CTTAA-A-TTGGGC---AA-----TCGCGGAAAA---AGGTTGGCAT-AAAG-AA---AT-TATAT---T-TA---GG-T-A--GA---------GAAAAT----TT-
gi|10 : tctA-ATTTTC-TC-T--AC-CTA------A-ATATAA-TTTCTTT-ATGCCAACCTTTTT---CCG-CGAT--TGCCCA----ATT-TAA-GTTTT-AAA-TTAT-CAT-TAGTAA--AAACA-TTT-TGTCCAACAAA----ATTC---------A-ATT--------------------ATGAA----T--------TTTTTTCATTTTGGTA--TGCAAATT-AGTTC-ACAAAAATCC-AATT--CAACTAATT---TGCATACAAAATCCAAATATAG-TTACAAAA-TTAAT
gi|11 : tctaAAATTAA-TTTTTTGTC-T--AC-CTA------A-ATATAA-TTTCTTT-ATG-CAACTTTTTT---CCG-C-GT--TGCCCA----ATT-TAA-G-TTT-AAA-TTAT-C-----GTAA--AAACA-TTT-TGTCCAA-ACA----ATTC---------A-ATTA--------------------TGAT----T--------TTTTTTCATTCTGGTA--TGCAAATT-AGTTT-ACAAAAATCCAAATT--CAACTAATT---TGCATACAAAATCCAAATAT-G-TTACAAAAGTTATTTcttttccagacaaaattgacttttgtatacaaaagtgaatatttgtcatgacaaaagtgaattttgtctgctgaaagataattttgtgcgacaaaattaatttttgtgattcatgatcaattttgttgacctgaactcatttttgttctacaaaattcatttttgtccacacaaaaatgaattttgagaacaaaatcacaagagtcccatttggcgcccc
gi|11 : GGCGC-C-AAATGG-GAC--T-C----TTGT-GA-TT-TTGAGTTC-TCAAAA--T-T------CATTT------TAG-TGTGGA--CAAAA-A-TGAA-T-TTT-GT-AGA-AC-AAAAATGAATTCA-GGTC--AG-----C-A---A-A---ATTG--ATC-AT--GA-ATCA--CA-A-AA-ATTTATTTTT------------G---GCACAAAATT--A--T---CT-T-TCA--GCAG-ACA--AAA-T--------------------------------TC-AC-TTTTGT-CAT-G--AC--AAA-ATTCACTT-TTGTAGAC-A---A---A-AGT-----CAA-TT-TTG-TCT-GGACAGAAATAACTTTTGT--AACAT-A-T--TTG--GAT-TTTGTA-TGCAA--AT-T--AGTT-GA--ATTTG------------------GA-----TTTTT--GTA-AAC-TAATTTGC--ATAC-CAGAATGAAAAAA-AATCAT--------AATTGAATTGTTTG-GA-CAAAAT---GTT--TTTAC----GATA----ATTT-A---AA----CTTAA-A-T----TGGGCA-----ACGCGGAAAAA--AG--TTGCAT-AAAG-AA---AT-TATAT---T-TA---GG-T-A--GAC----A---AAAAAT----Tctgtccagacaaaattgacttttgtctacaaaagtgaattttgtcatgacaaaagtgaattttgtctgctgaaagataattttgtgccaaaaataaatttttgtgattcatgatcaattttgctgacctgaattcatttttgttctacaaaattcatttttgtccacactaaaatgaattttgagaactcaaaatcacaagagtcccatttggcgcc
gi|12 : aaattACA-AATGT-AAATTTTGTGA--G--ACA-AATTTGAATTTTGTCAT-GA-AAAAA----GTG-A-------------A-TAG---T--GAATTGTGTCATGACA-AAAATGAATT-A--TG-TCATGATAAAAGTGA-A----T--T-TT-GTTGAAAAAATTCATATTT--GTC-T--AC-CTA------A-ATCTAA-TCTCTTC-ACG-CAA---TTTTTTCCC----AT--TGTCTA----ATT-GAA-G-TTA-AAA-TTAA-CAT-TAGTAA--AAAAAACTT-TGTCCCACAAA----ATTG---------A-ATTA-------TGA---------ATAAC----AGTACTGAATTTCTTCATTTTGGTA--TGCATAAT-AGTTT-ACAAAAATCTAAATT--CAACAACTT---TGCTTAC-AAATCCACTTAT-G-CTACAAAAGTTAATT
gi|13 : atgtagtttgcattagataCGGGGCGC-C-GATTGG-GAC--T------T----GA-TCCTTTTGC-AATCAAAA--C-C------AATTT------T-G-TGTACA--CAAAA-T-AGAA-T-TCC-GTCATA-AC-AAAATTCAATTTT--GTC--AC-----ACA---A-A---AGT---GTG-CT--GC-TTCG--TA-ATAA-CTTCATctgtcaaaacatacatgcaattgattgttgtctacaaatgtgagttttgtcatgagaaatt
gi|13 : taCA--AAA-C-CAA-TTTT--GTGTA-C-A--C--AA-AA--TAGAA-TTCCGT-CAT-A--AC--AAA-ATTCAATT-TTGTCACACA---A---A-AGTGTG--CTG-CT-TCG-TAA-TAAC----------TTCAT--A-----N-N--NNNNNNNN-NNNNNN-NNNNNNNNNAT--AACT-TCATATTTGT-AT--annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataacttcatatttgtattgataagttatacaaaattatttttcattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtatgcaaatatcaatctcatttgcatacaaaatagacttttgttatctagtttgcattaaat
gi|13 : tacggggcgccgattgggacttgatccttttgcaatCAAAA--TTC------AATTT------T-G-T-CACA--CAAAA-G-TGTG-C-TGC-TTCGTA-A-------TAACTTCATANNN--NN-----N-N---N-N---NNN---NNN-NN--NN-NNNN--NN-ATAA-CTTCATATTT-GT-ATTGATAAGT-TATACAAAATT--A--T---TT-T-TCATTNNNN-NNN--NNN-NNNNN-NNNN--NN--N-N-N--N--NN-NN--NN-NN-NNNNNN-NNN-N--NN--NNN-NNNNNNNN-NNNN-----N---N---N-NNN-----NNN-NN-NNN-NNN-NNNNNNNN------NNNNN--N-----N-N--NNNNNNAT-TATGTA-TGCAAATAT-C--AATC-TC--ATTTGC-AT--A-CAAAAT--A-GA-----CTTTT--GTT-ATC-TAGTTTGC--AT---TA-AAT-tgataagttatacaaaattatttttcattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtatgcaaatatcaatctcatttgcatacaaaatagacttttgttatctagtttgcattaaat
gi|14 : tacggggcgccgattgggacttgatccttttgcaatcaaaaccaattttgtgtacacaaaatagaattccgtcataaCGGGGCGC-C-GA-TTG-GAC--T------T----GA-TC-TTTTG-TAATCCAA------------AATTT------T-G-T-TACA--CAAAATA-CGAA-T-TTCGGTCATA-AA-AAAATTC-TTTTT-TGTC--ACACCATA-G---A-A---GTA---ATG-ATTGAC-TTCA--TA-ATAA-ATCA--TTTTTGTAATTGA-AAATATATAC-AAATT--A--T---TTCT-TCA--G--A-GCT--AAA-TTGAA-T--------------------------------TTCTGT-AAC-G--AC--AAA-AATCCATT-TTGT-----A---A---------------------TGCTCATTGACAAAA------TTCAT--------T-T--TTGTCAATCTATGTA-TGTCAATAT-C--AATC-TC---TTTGCAAT--A-CAAAAT--AGGA-----CTGTT--TTT-ATC-TAA-TTGC--AT---TA-TA--AACAAACAGTA-A--------AATT---TT
gi|15 : GC-C-GATTGG-GAC--T------T----GA-TC-TTTTTGTAATCAAAA--C-C------AATTT------T-G-TGTACA--CAAAT-A--GAA-T-TCC-GTCGTA-AC-AAAATTCATTTTT-G-TC--AC-----ACA---A-A---AGT---ATG-TT--GC-TTCA--TA-ATAA-CTTCATTTTT-GT-ATTGATAAGT-TATACAAAATT--A--T---TT-T-TCA--GTTG-ACA--AAA-T--------------------------------TC-AA-TTTTGT-CAC-A--AC--AAA-ATCCA-TT-TTGT-----AGATA---A-ACT-----CAA-TT-TTG-TCA-TGACAAAA------TTC----A-----ATT--TTGTCAAT-TATGTA-TGCAAATAT-C--AATC-TC--ATTTGC-AT--A-CAAAAT--A-GA-----CTTTT--GTT-ATC-TAGTTTGC--AT---TA-AA
gi|16 : tGGCGC-C-AAATGG--AC--T-CCTTGT----GA-T--TTTTGTCTTGCAAAA--TTC------ATTTT------T-G-TGTCGA--CAAAA-A-TGAA-T-TTT-GT-AGA-ACAAAAATTGAGTTCA-GGTCA-AC-----A-A---A-ATTGATC---ATG-----GA-ATCA--CA-AAAA-TTTAATTTCT------------GT-CGCACAAAA-T--A--T---CT-T-ACA--GCAG-ACA--AAA-TTCAC-TATT--GT--A-GAA--C--AA-AG--TC-AA-TTTTGT-CTG-G--AC--AGA-ATTAAC-T-TTGT-----A---AC--ATATT-----GGA-TT-TTG-T-A-TTGC-ATA------TTAGTTGA-----A----TTG--GAT-TTT------------T-T--AAAC-TA--ATTTGC-AT--ACCAAAAT--
gi|17 : ttc-TTTTGTGAATCAAAA----C------AATTT--------G-TGTACA--CAAAATA-GAAA-T-TCC-GTCATA-AC-AAAATTCATTTTT--GTC--AA-----ACA---A-A---AGT---ATG-TT--GC-TTCC--CA-ATAA-CTTA--TTTTTGT-ATTGATAAGT-TGTACAAAATT--A--T---TT-T-TCA--GTTG-ACA--AAA-TCCAT-TTTT--GT--A-G-A--T--AA-AC--TTAAA-TTTTGT-CAT-GAAAC--AAA-ATTCATTT---------------------GT-----CAA-TT-ATG-T-A-TG-CAAA--------------------------TATCGA------------------------TC-TC--ATTTGC-AT--A-CAAAAT--A-GA-----CTTTT--GTT-ATC-TAGTTTGC--AT---tagtc
gi|18 : GTT-G---ACAAAATTCA--TTTTTGTC-T--AC-CTACATGTAA-ATATAA-TCTCTTC-ATG-CAACTTTTTCTTCCCA----------------------------TT-AAA-TTAT-CAT-TAGTAA--AAACA-GTT-TGTCCGACAAA----ATT-------T--A-ATTA-------TGAATTACAGAAATGA-----A--------TTTCTTCATTTTGGTA--TGCAA-------------------TAAATT--CAACAAATT---TGCTTACAAAATCCACTTAT-G-TTACAAAAGTCAAaa
gi|19 : AAAATT-A-ATTTTCGTC-TTAAC-CTA------A-ATATAA-TTTCTTT-ATG-CGACTTTTTTTCCTTG-C-AT--TGCCCA----ATT-TAA-G-TTT-AAA-TTATGCA--TAGTAATTTAACA-TTTGTGTCCAAC-AA----ATTC---------A-ATT---------------------TGA-----A--------TTTTTTCATTTTGGTA--TGCAAATT-AGTTC-AC--AAATCCAAATT--CAACTAATT---TGCAT
gi|2 : GGGCGT-C-GAATGGCGAC--T-----------GACTT-TTTTGT-AATCAAAA--C-C------CA-TT------T-G-TGTACA--C-AAA-T-TGAAGT-TCC-GTCACA-AC-AAAATTCATTTT---------------------------ATT---ATG-TT--GCTTTCA--TATATAAGCTTCA-TTTTTGT-ATTGATTAGT-TATACAAAATT--A--T---TT-T-TCGC-GTGG-ACA--AAA-TTAAA-TTTT--GT--A---A--CG-AA-AA--TC--A-TTTTGT-CAC-G--ACAGAAA-GTCCATTT----T-----A---A---A-GGTTAC--CAA-TT-TAG-T-A-TTCCAA---------TC------------T--TTGTCAAT-ATTGTA-TGCAAATAT-C--AATCTTC--A-TTGT-AT--A-CAAAATA-A-GA-----CTTTG--TTT-ATCTTAGTTTGC--AT---TA-AATAAACAAA-AG---T--------AATTA--TTA-TT--GA-CAAAGTTG-A-A--TTTGTCA--TAC-----A----A---AA----GCTGG-ACT----T---TG-----TTAACAAAACT--GAATTTG-ATCAACA-AATTCAT-TN-NN---N-NN---NN-N-N--NNN----NNNNNNNNNN----NN-NN-NN-NN------NN--------NN-N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTTCAACCAA-TCA-TTTTTGT-CTT-C-ATAA--------TTTTTGTCA--ACAAAAAT--TCA--TTTTTG--TC-TC--ACAAA-AGT--GAA--------TTTTGTAATGACAAAAG-------TGAA-TTTAGTCAA----CAAAAA-AT--GAAGATTTTG-----TT--AG-ACA-AAATT-TCATTTTcct
gi|20 : AAAAT--TGA---TCTTGAATC-AC----AAATAAT--TAA--------TTTTGTCATG-CAAAAT-------T--A-TCT-TTCAA----CGGA----C--GA--ATTTCGCTTTTTT--AG-ACA-ACAGT-CAATTTTATTC---TTACAGAATT--AACTTTG---A-AACATAA-----GTGCATTTT--GT--------AAGCTT--GGGTTTTtgatc
gi|20 : caaaaaaacaacaacaaaacacaccccaaAA-AGT--T--------AATT---CTG-TAA-GAATAAAATTG-ACT--GTTGTCT--AAAA----A----AGCGAA----ATTCG---T----C---CG-----TTG--AAAGAT--AATTTTGCAT-GACA-AA---AT-TA-AT---TATT---TG-T----GATTCAAGATCAA--------TT-TT-GT-gttga
gi|21 : caaaaaaacaacaacaaaacacaccccaaaaaacccaagcttacaaaatgcacttatgtttcCGGGGCGC-C-AAATGG-GACCTT-G----T----GA-T---TTTGTTC-TCAAAA--TTC------ATTTT------T-G-TGTGGA--CAAAA-A-TGAA-T-TTT-GTAGAA-AC-AAAA-TGAGTTCA-GGTC--AA-----C-A---A-A---ATTG--ATC-AT--GA-ATCA--CA-A-AA-ATCAATGTT-------------GT-CGCACAAAATT--A--T---CT-T-TCA--GCtga
gi|22 : AC-AAAA-TTGAATTTT---GTCATGACACAAAG--TGA--ATTTTG--TCAATG-ACAAA-AGT--GAAAAGTGAATTTCTGTTGTGACAAAAG-------TGAATTTTGGTCAA----CAAAAT-TT---A--TTTTTGC-TC-------CACATAAAGT-G-ATTTTG-TC--AACAAA-AATT---ATTTTGT
gi|23 : GCTTACAAAATGCACTTAT-G-TTTC-AAAGTTAATTg
gi|23 : AA-AGT--T--------AATT---CTG-TAA-GAATAAAATTG-ACT--GTTGTCT--AAAA----A----AGCGAA----ATTCG---T----C---CG-----TTG--AAAGAT--AATTTTGCAT-GACA-AA---AT-TA-AT---TATT---TG-T----GATTCAAGATCAA--------TT-TT-GT-ctgtaagaataaaattgactgttgtctaaaaaagcgaaattcgtccgttgaaagataattttgcatgacaaaattaattatttgtgattcaagatcaattttgttg
gi|24 : gcttacaaaatgcacttatgtttcTACAAAATGCACTTAT-G-TTTCAAAAGTTAATTtg
gi|24 : ctAAA-AGT--T--------AATT---CTG-TCAAGA-TAAAATTG-ACT--GTTGTCT--AAAA----A----AGCGAA----ATTCG---T----C---CG-----TTG--AAAGAT--AATTTTGCAT-GACA-AA---AT-TA-AT---A-TT---TG-T----GATTCAAGATCAA--------TT-TT-GT-ctgtcaagataaaattgactgttgtctaaaaaagcgaaattcgtccgttgaaagataattttgcatgacaaaattaatatttgtgattcaagatcaattttgttg
gi|25 : cttacaaaatgcacttatgtttcAAAATTTA-ATTTTT-TC-T--ACGCTA------AGATATAA-TTTCTTT-GTG-CA--TTTTTTTTTCCG-C-AT--TGCCAA----ATT-TAAGG-TTT-AAA-TCAT-CAT-TAGTGA--AAACATTTT-TGTTCCAAACA----ATTT------C--AGATTA-------tg
gi|26 : CGACAAA----ATT-------T--A-ATTATGAATTGC-----------AGAACTGA-A--------TTTCTTCATTTTGGTA--TACAAATT-AGCTT-ACAAAAATCTAAATT--CAACAAATT---TACTTCCAAAATCCACTTGT-G-TTACAAAAGTTAATtgatt
gi|27 : tAGTGAATTT---TG-TCA--ACAAAAATGA-A----TCTTGCCAGTCGACAAAATTCA--TTTTTGTT-T--AT-CTA------A-ATATTA-TCTCTTC-ATG-CAAC---TTTTTCCC--C-AT--TGCCTA----ATT-TAA-G--TT-AAA-
gi|28 : GTC-T--AC-CAA------A-ATATAA-TTTCTTT-ATG-CAAATTTTTT---CCG-C-GT--TGCCAA----ATT-TAA-G-TTT-GAA-TTAT-CAT-TAGTAA--AAATA-TTT-TGTCCAACAAA----ATTC---------A-ATTA-------
gi|29 : -C-AAATGG-GAC--T-TGG--T----GA-T--TTTTGTTC-CCAAGAATT-CG-----AATTTACCTTAT-G-TGGATT--C-AAA-A-TGAA-TCTTT-GCTTCA-AC-AAAAATGAGCTCA-Gtgaat
gi|3 : tagatgaacctagA-ACAGT-GAATTTTGTT------AAA-AATT-TTAACTTGTCAT-GACAAA----T-TTC-ATTTTTGGTCTT-CA-CAAAGT---GAATTTTGTCA---CA-AAAGAG----TA--CAA--------AAA-TGA-A----A--TTTT-GTTGACAAAATTCA-CTTTT-GTCAT--AC-TTTT-----A-ATATAAATCTCTTC-AAG-CAACTATTTTT--CCA-A-AT--TGCCTA----ATT-GAA-G-TTT-AAAATTAT-CAT-TAGTAA--AAACA-GTT--GTCCGACAAA----ATTTAATTTATGAA-ATTA-------C-----------AGAACTTGAA--------TTTCTTCATTT-GGTAAATGCAAATTTAGTTT-ACAAAAATCTAAATT--CA-C--ATT---TGC-TACAAAATCCACTTAT-G-TTACAAAA-TTAATT
gi|3 : ctagataacagatgtaataaaaGGGGCGC-C-AAATGG--AC--T-C----TTTGTGA-T---TTTGTTC-TCAAAAATT-C------ATTTT------T-GCTGTGAA--CAAAA-A-TGAA-T-TTT-GT-ACA-AC-AAAAATGAGTTCA-GGTA--AC-----A-ACCAA-A---ATC---GTC-AT--GAATTTA--CA-A-AA-ATTAATTT--------------GT-CTTACAAAAAT--A--TCACTT-TGTCA----TG-ACA--AAA-TTCAC-TTTTTTGT--A-G-A--C--AACAG--TC-AA-TTTTGT-CTTTG--AC--AGA-ATTAA-TT-TTGT-----A---ACATA-AGT-----GGA-TT-TTG-T----AGCAAA---------TGTG-A-----A-T--TTA--GAT-TTT----TGTAAAC---T--AA-------ATTTGC-ATTTA-CCAAATGAA-GA-----AATTCAAGTT-CTG-TAATTT-C--AT----A-AAT-TA-------------------AATT---TTG-TCG-GA-C--AACTG--TT--TTTACTAATGATA----ATTTTA---AA----CTTCA-A-T----T---AGGCAATTTG-GAAAAAT--AG--TTGCTT-GAAG-AG---AT-TT-AT--------------------------ATTAAAAG---------------T------AT--------GA-C-AAA-AGT-GAATTTTGTCA--ACAAAA-TTTCATTTTTGT---------------------A-CTCTTTT-GTGAC-AAAA-T----TCACTTTGTGAAGACCAAAAA--TGA--AATTTG--TC-ATG-AC--A-AGTTAAAA--------TTTT----TAACAAAActgtcaaagacaaaattgactgttgtctacaaaaaagtgaattttgtcatgacaaagtgatatttttgtaagacaaattaatttttgtaaattcatgacgattttggttgttacctgaactcatttttgttgtacaaaattcatttttgttcacagcaaaaatgaatttttgagaacaaaatcacaaagagtccatttggcgcccc
gi|30 : ctagataacagatgtaataaaaaacagtgaaACAAAAGT---GA--ATTTTG--TC-ATG-AGAAA-AGT--TAA--------TTTTGTC--AACAAAAATGATTCCTGAG-TTTGTCCAAAACTTAAAATCTCTAGA--ATTTT
gi|30 : atg-ACAAA-AGT--GAA--------TTTTGTCATGAGAAAAG-------TTAA-TTTTGTCAA----CAAAA
gi|31 : atgaaaattctagagattttaagttttggacaaactcaggaatcatT---ATG-TT--GC-TTCATACA-ATAA-TTTCA-TTTTTAT-ATTG----------ACAAAATC--T--T---TT-T-TCA--GTGG-ACA--AAG--TGAA-TTTT--GTC-ATG-A--CG-AA-AG--TT-AA-
gi|32 : ttagCGGGGAGC-C-AAATGG-GAC--TAT----T----GT-TA-TTTTGTTC-TCAAAA--T-TCAGATGAATTT------T-G-TACA-A--CAGAA-A-
gi|33 : atctgaaagccCGGGGAGC-C-AAATGG-GAC--TAT----T----GT-TA-TTTTGGTTCTCAAAA--T-TCATGTGAATTT------T-G-TATA-A--CAGAA-A-t
gi|4 : atctgaaagccCGGGGCGCTC-AAATGG-GCC--T-CGTG-T----GA-T---TTTGTC--TCAAAA--TTC------CATTT------T-G-TCTACAGACAAAA-A-T-AA-T-TTT-TTGGTACAC-AAAAT-GAGTTCA-GGTC--AA-----C-A---A-A---ATTCGGATC-AT--GA-ATTA--CA-A-AA-ATTAATTTT-------------GT-CTTACAAA-TT--AACT---TT-TGTCA----TG-ACA--AAATTTCAACTTTT--GT--A-G-A--T--AA-AGCTTC-AA--TTTGT-CTT-G--AC--ATA-A-TGACTTCTTGT-----AC--ACATA-AGT-----GGA-TT-TTG-TAA--GACAA------------------------------------TTGTG-TG--AAT-T-T--A----------TTGC-AT--A-CAAATG--A-GAACATTCTTCT--GTA-ATC--------------------AT-AAT------T--A--------AATT---TTG-TCG-GA-C--AACTG-TTT--TTTACTA---ATG----A----T---AA----TTT-A-A------------------TGGGAAGTAA--AAAGTTGCAT-GAAG-AG---AT-TA-ATAACT-TTACATG-T-AAGGGTA---GATCAAAAATGAAATT-TT-GT-C--------T--------AA-CAAAATCTTC--ATTTTTTGTTGACTAAA--TTCACTTTTGTCATTA------CAA--AATTCA-CTTTTGT-GAGACAAAAA-T-GAA--TTTTTGT--TGACAAAAATTATGA--A------------G-ACAAA-AAT--GA
gi|5 : AAAA-TGA-A----T--T-TT-GTCCACAAAATT-A-ATTTTCGTC-T--AC-CTT------A-ATATAA-TCTCTTT-AGG-CAACTTTTTT---CCGTC-AT--TGTTCA----ATT-TAA-G-TTT-AAA-TTAT-CAT-TAGTAA--AAACA-TTT-TGTCCAACAAATTCAATTA------TG-A-ATTA-------C-----------ATAAC----AGATT----TTTTTTCATTTTGGTA--TGCAAATT-AGTTT-ACAAAAATCCAAATT--CAACTAATT---TCCATACAAAATCCAATTAT-G-TTACAAAAGTTAATTttggtt
gi|6 : acaGGGCGC-C-AATTGG-GAC--T------T----GA-TC-TTTTTGTAATCGAAA--T-C------AATTT------T-G-TGTACA--TAAAA-AGTAAA-A-TCT-GTCACA-AC-AAAAT--AATTTT-TGTCTAAC-----A-A---ATAT--ATT---ATACTT--GT-TTT------ATAA-CTTCATTTTTTGT-AATG----------ACAAAACCAAA--T---TT-T------GCTACACA--AAA-TTATA-TTTC--A-------------AA-AG--TC--A-TTTTG---------------------ATCT-TTAC-----A---A---A-A-T-----CAATTT-TTG-TCA---ATAAGG------TATGC--A-----A--------------ATACA-TGTA------T--AAAC-TT--ATCTGT-AT--C-CAAAAT--T-GA-----CTTTT--GTT-ACC-TAATTTGCAAAT---TA-AAT---CACA-AGT--T--------AATT---TGG-TGA-GA-CAAAAATA-AAT--GTTGTCAT-GACA----A----A---AGTGACCTTCG---T----C---CG-----CT-CG-ATAAT--AATTTTATGT-AACA-AA---AT-TT-AC---T-TT---TG-TGA--TAT----GTTGTAAAAT----TTGTTAAT-CTGAACTCATTTTTGTTGAA-C-AA--ACTC-ACCTTTGTCAACGCGAAA--TTGGATTTCA--AGTA------CAA--AA-TCA-Cctgtccagaaaacatcatggtttcaaggttatgtaaaaaatactaacactttccactttctgaacagtttttgtaaatctttgaatattgacttgagttatattctgaaaacaaatgtatttaatctgatcaatcatgaaatgctgttatcatttccatcgttttacagagaagcaattatatttttcatggacggtaagaaaattgagaaattgtgtgacttgtcctcaaactcttttcttcgacaaac
gi|7 : G-ACA--AAA-TTAAA-TTTT--GT--A-T-A--C--GA-AA--TC-AAATTTTGTTCAC-G--AC--AAA-ATCCATTT-TT-----------A---A-GGCATTACCAA-TT-T-----A-T------A------TTC----A-----A-TCTTTGTCAATATATGTA-TGCAAATAT-C--AATCTTC--A-TTGT-AT--A-CAAAAT--A-GA-----CTTTG--TTT-ATCTTAGTTTG---AT---TA-AATAAACAAA-AG---T--------AATT---aagaacctcactagtgtcc
gi|7 : gAATTCTATTTTTGTCTCA---TT-AATTTTTGTCAA---CAAAAATTC-AT---TTTT--GTCTCTCA-CAAAAGT--GAATTTTGTAATGACA-AAAGTGAATTTAGTCAAGCA--A-AAAA-TGA-AGATTT--TGTT-G---ACAAAATTC--ATTTTTGTatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaactaaaactgaattgttgtcaaccaattctatttttgtctcattaatttttgtcaacaaaaattcatttttgtctctcacaaaagtgaattttgtaatgacaaaagtgaatttagtcaagcaaaaaatgaagattttgttgacaaaattcatttttgttc
gi|8 : ggacaaaattaaattttgtatacgaaatcaaattttgttcacgacaaaatccatttttaaggcattaccaatttatattcaatctttgtcaatatatgtatgcaaatatcaatcttcattgtatacaaaatagactttgtttatcttagtttgattaaataaacaaaagtaattatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaactaaaactgaattgttgtcaaccTT-GTCCACAAAATT-A-ATTTTCGTC-T--AC-CTT------A-ATATAA-TCTCTTT-AGG-CAACTTTTTT---CCG-C-AT--TGTTCA----ATT-TAA-G-TTT-AAA-TTAT-CAT-TAGTAA--AAACA-TTT-TGTCCAACAAATTCAATTA------TG-A-ATTA-------C-----------ATAAC----AGATT----TTTTTTCATTTTGGTA--TGCAAATT-AGTTT-ACAAAAATCCAAATT--CAACTAATT---TCCATACAAAATCCAATTAT-G-TTACAAAAGTTAATTtc
gi|9 : ttGGGCGC-CCAAATGG-GAC--T-C----T----TG-TG-ATTTGCTTCTCAAAA--TTC------ATTTT------T-G-TGTGGA--CAAAA-A-TGAA-T-TTT-GT-AGA-AC-AAAAATGAGTTCA-GGTC--AA-----C-A---A-A---ATTG--ATC-AT--GA-ATCA--CA-A-AA-ATTAATTTT-------------GT-CGCACAAAATT--A--T---CT-T-TCA--GCAG-ACA--AAA-T--------------------------------TC-AC-TTTTGT-CAT-G--AC--AAATATTCACTT-TTGTATAC-A---A---A-AGT-----CAA-TT-TTG-TCT-GGACAGAATTAACTTTTGT--AACAT-A-T--TTG--GAT-TTTGTA-TGCAA--AT-T--AGTT-GA--ATTTG------------------GA-----TTTTT--GTGAAAC-TAA-TTGC--ATACCAA-AAT-GAAAAA-AAT--TCATAATTGAATT---TTG-TTG-GA-CAAA--TG--TT--TTTA-CAATGATAATTTA----A---AA----CTTAA-A-T----TGGGCA-----ATGCGGAAAA---AAGGTTGCAT-AAAAGAA---AT-TATAT---T-TA---GG-T-A--GAC----G---AAAAATTAA-TT-TT-GT-GG------AC--------AA---AATTAATT---TTTTGTctgtccagaaaacatcatggtttcaaggttatgtaaaaaatactaacactttccactttctgaacagtttttgtaaatctttgaatattgacttgagttatattctgaaaacaaatgtatttaatctgatcaatcatgaaatgctgttatcatttccatcgttttacagagaagcaattatatttttcatggacggtaagaaaattgagaaattgtgtgacttgtcctcaaactcttttcttcgacaaac
gi|9 : CA--A-AAAA-TTA-A----T--T-TT-GTCCACAAAATTAA-TTTTTCGTC-T--AC-CTA------A-ATATAA-TTTCTTTTATG-CAACCTTTTTT--CCG-C-AT--TGCCCA----ATT-TAA-G-TTTTAAA-TTAT-CAT-T-GTAA--AAACA-TTT--GTCCAACAAA----ATTC---------A-ATTA--------------------TGAA----T--------TTTTTTCATTTTGGTA--TGC-AATT-AGTTTCACAAAAATCCAAATT--CAACTAATT---TGCATACAAAATCCAAATAT-G-TTACAAAAGTTAATTg
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 55555555555555555555555555555555555 11 33333333333 1 1 2222222222222222222 22222 111 111 1 777777777777777 11111 11111 666666666666666666666666666666666 3333333333333333333333 7777777777777777777777777777777777777 11 1111111111111111111 111111 11 22222222222 111 111 555555555555555555555555555555555555555555555555555555 111 1 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 11 11 111111 1 222 11 222222222 1111111 11111 11111 11111111 1111 1111111 1111 222222222222 555555555555555555 11 1111 11111 33333 11 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2222222222222 1 111111111 1111 111111 111 1111 88888888888888888888888888888888888888888888888888888
lowQualScore : 2 33 2 33 11111111111111111111111111111111111 88 2 00000000000 88888888 2 2 0 33 666 2 2 2 2 1 2 3333333333333333333 1 5555 777 2 00000 555 555 66 33 222 33 2 3 33 1 4 444444444444444 0 2 444 33 44444 2 5 11111 33 2 444444444444444444444444444444444 2 8 2 2 33 33 5 1 3 2 1 1111111111111111111111 2 7777777777777777777777777777777777777 33 22 555 2 3333333333333333333 1 55 33 2 7777 77777 44 3 6 0 555555 3 22 2 3 88888888888 888 3 000 7 000 55 0 999999999999999999999999999999999999999999999999999999 111 66 3 3 3 0 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2 00 3 99 1 1 555555 3 0 6 3 000 5 33 5 666666666 3 6 6666666 5 5 11111 1 66 0 44444 2 66 88888888 4444 8888888 5 3 2222 0 111111111111 444444444444444444 33 5 0 0000 22222 11111 5 1 99 2 999 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 0 0 8 1 7777777777777 4 3 4 222222222 3 5 5555 7 3 44 3 222222 6 3 3 999 44 44 0 7777 3 3 3 3 3 3 55 7 3 3 4444 00000000000000000000000000000000000000000000000000000 55 0 4 4 55 3 777 4 3 3
lowQualScore : . .. . .. ................................... .. . ........... ........ . . . .. ... . . . . . . ................... . .... ... . ..... ... ... .. .. ... .. . . .. . . ............... . . ... .. ..... . . ..... .. . ................................. . . . . .. .. . . . . . ...................... . ..................................... .. .. ... . ................... . .. .. . .... ..... .. . . . ...... . .. . . ........... ... . ... . ... .. . ...................................................... ... .. . . . . .................................................................................. . .. . .. . . ...... . . . . ... . .. . ......... . . ....... . . ..... . .. . ..... . .. ........ .... ....... . . .... . ............ .................. .. . . .... ..... ..... . . .. . ... ........................................................... . . . . ............. . . . ......... . . .... . . .. . ...... . . . ... .. .. . .... . . . . . . .. . . . .... ..................................................... .. . . . .. . ... . . .
lowQualScore : 5 55 5 44 99999999999999999999999999999999999 22 4 22222222222 22222222 4 4 1 22 555 4 4 4 7 0 7 0000000000000000000 1 7777 999 9 66666 000 333 00 77 666 77 7 3 77 0 0 111111111111111 9 7 777 77 00000 7 3 88888 77 7 999999999999999999999999999999999 7 0 9 9 99 99 7 5 6 9 5 4444444444444444444444 9 1111111111111111111111111111111111111 99 44 999 9 1111111111111111111 4 22 99 9 7777 77777 22 1 2 4 888888 3 22 4 1 66666666666 555 6 444 3 555 00 9 999999999999999999999999999999999999999999999999999999 777 55 6 6 6 9 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 2 22 6 00 0 0 777777 3 2 7 8 222 7 66 7 777777777 6 6 2222222 0 0 00000 4 99 4 22222 9 11 11111111 0000 6666666 7 0 1111 1 888888888888 666666666666666666 66 7 1 6666 55555 99999 7 4 44 5 888 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 8 8 0 7 1111111111111 4 3 4 999999999 6 9 1111 0 1 22 3 999999 7 3 3 666 33 66 2 1111 3 3 3 3 6 6 00 3 6 6 2222 99999999999999999999999999999999999999999999999999999 55 8 0 0 55 7 000 9 6 6
consensus : CGGGGCGC-C-GAATGG-GAC--T-C----T----GA-TC-------------------TTTTGTTN-T-CAAAA--T-C------AATTT------T-G-T-GTANA--CAAAA-ATGAA-T-TTC-GTCANA-ACAAAA-NTG---------------AGT----TCA-GGTC-ANN---AAA---ATT---ATGNT--G-NNTCA--CA-ATAA-NTTAATTTTTTGT-ATTG--A--AGTCGTACA-AA---ATTA--T-----TT-T-TCA--GCGGACA--AAA-TTNAA--TTTT--GT-A--G-A--C--AA-AG--TC-AA-TTTTGT-C-ACG--AC--AAA-ATTCACTT-TTGT----A---A---A-AGT-----CAATT-TTG-TCA-TGACAAAA------TTCGT--A-----A-T--TT--GTCGAT-TNTGTA-TGCAAATAT-----T--AATC-TCATTTGC-A--TA-CAAAAT--A-GA-----CTTTT--GTT-ATC-TAGTTTGCA--T---TA-AAT-AANAAA-AGT--T--------AATT---TTG-TCG-GA-CAAAATTG-ATT--TTTGTCA--GANA----A----A---AAN----TTCG-A-T----C---CG-----TTGCGAAAAAT--AANTTTGCAT-GACGAAAT-TA-AT---T-TT---TG-T-A--GAT----GATCAAAAAT----TT-TTG-T-CT------AT--------AA-C-AAATANTCGANTTTTGTCATGACGAAA--TTNAATTTCGTCANTACAAAA-TCA-CTTTTGT-GTGAC-AA--AA-T-GAATT---TTTTTGTCATGA-------CAA-A-AA--T--TGA--ATTTTGTC-ATG-ACAAAAGT--GAA--------TTTTGTCATGACAAAAG-------TGAA-TTTGNTCAA----CAAAAT-TC--GA--ATTTTG----C--TC-TT--A-GCACA--AAAGT-GAA----TTT-----TGTTC--GTCACA-AATT-NAATTTTGTCAN-GACAAA------------AA--C-G-TG-ATTTT--GTCT-C--A-CAA------AATT--G---AATTTTGTCATGACA-AAAGTGAATTTA--CGATCA--AC-AAA-A-TGA-A----T--TGTT-GTCGACAAAATTCA-ATTTTCGTC-T--AC-CTA------A-ATATAA-TCTCTTT-ATGCAACTTTTTTTTCCCG-CAT--TGCCCA----ATT-TAA-GTTT-AAA-TTAT-CAT-TAGTAA--AAACA-TTT-TG-TCCAACAAA----ATTC------T--A-ATTA-------C-----------ATGAC----A--------TTTTTTCATTTTGGTA--TGCAAATT-AGTTT-ACAAAAATCCAAATT--CAACTAATT---TGCATACAAAATCCACTTATG-TTACAAAAGTTAATT
Reference ( family-5289 ) : CGGGGCGC-C-GAATGG-GAC--T-C----T----GA-TC-------------------TTTTGTTNAT-CAAAA--T-C------AATTT------T-G-T-GTACA--CAAAA-ATGAA-T-TTC-GTCANA-ACAAAA-TTG---------------AGT----TCA-GGTC-ACA---AAA---ATT---ATGNT--G-NTTCA--CA-ATAA-NTTNATTTTTTGT-ATTG--A--AGTCGTACA-AA---ATTA--T-----TT-T-TCA--GCNGACA--AAA-TTNAA--TTTT--GT-A--G-A--C--AA-AG--TC-AA-TTTTGT-C-ACG--AC--AAA-ATTCACTT-TTGT----A---A---A-AGT-----CAATT-TTG-TCA-TGACAAAA------TTCGT--A-----A-T--TT--GTCGAT-TNTGTA-TGCAAATAT-----T--AATC-TCATTTGC-A--TA-CAAAAT--A-GA-----CTTTT--GTT-ATC-TAGTTTGCA--T---TA-AAT-AANAAA-AGT--T--------AATT---TTG-TCG-GA-CAAAATTG-ATT--TTTGTCA--GANA----A----A---AAN----TTCG-A-T----C---CG-----TTGCGAAAAAT--AANTTTGCAT-GACGAAAT-TA-AT---T-TT---TG-T-A--GAT----GATCAAAAAT----TT-TTG-T-CT------AT--------AA-C-AAATANTCGAATTTTGTCATGACGAAA--TTNANTTTCGTCANTACAAAA-TCA-CTTTTGT-GTGAC-AA--AA-T-GAATT---TTTTTGTCATGA-------CAA-A-AA--T--TGA--ATTTTGTC-ACG-ACAAAAGT--GAA--------TTTTGTCATGACAAAAG-------TGAA-TTTGNTCAA----CAAAAT-TC--GA--ATTTTG----C--TC-TT--A-GCACA--AAAGT-GAA----TTT-----TGTTC--GTCACA-AATT-GAATTTTGTCAA-GACAAA------------AA--C-G-TG-ATTTT--GTCT-C--A-CAA------AATT--G---AATTTTGTCATGACA-AAAGTGAATTTA--CGATCA--AC-AAA-A-TGA-A----T--TGTT-GTCCACAAAATTCA-ATTTTCGTC-T--AC-CTA------A-ATATAA-TCTCTTT-ATGCAACTTTTTTTTCCCG-CAT--TGCCCA----ATT-TAA-GTTT-AAA-TTAT-CAT-TAGTAA--AAACA-TTT-TG-TCCAACAAA----ATTC------T--A-ATTA-------C-----------ATGAC----A--------TTTTTTCATTTTGGTA--TGCAAATT-AGTTT-ACAAAAATCCAAATT--CAACTAATT---TGCATACAAAATCCACTTATG-TTACAAAAGTTAATT
gi|1 : CGGGGCGC-C-GATTGG-GAC--T------T----GA-TC-------------------TTTTGCTAAT-CAAAA--C-C------AATTT--------G-T-GTACA--CTAAA-A-GAA-T-TCC-GTCATA-ACAAG--TTC---------------ATT----TCT-TGAC-ACA---AAA---AGT---ATGTT--G-CTTCA--TA-ATAA-CTTCATTTTTTGT-ATTG--ATAAGTTGTACA-AA---ATTA--GA----TT-T-TCA--GTTGACACAAAA-TTGAA--TATT--GT-A--G-AACCTGAA-AC--TT-AACTTTTGT-C-ACG--AC--AAA-ATTCATTT-TTGT----A---A---ATAAT-----CAATTATTG-TCAATGACAAAA------TTGGT--A-----A-T--TT--GTCAAT-TATGTAGTGCAAATAT-----TTTGATC-TCATTTGC-A--TA-CAAAAT--A-AA-----CTTTT--GTT-ATC-TTGTTTGCA--T---TA-AAT-AAGAAA-AGT--A--------AATT---TTG-TGA-GA-CAAAATTGAATTCATTTGTCA--GACA----A----A---AAG----TTTGCA-T----C---TG-----TTATGTAAAATTGAATTTTTCAT-GACAAAGTGTA-AT---TCTT---TGTT-A--GGT----GATCAAAGGT----TC-TTG-TCCT------AT--------GACC-AAATAGTCGAATTTTGTCATGATAAAAGGTTGAATTTCGTTTATACAAAA-TGATCTTCTGTCATGAC-AA--AACT-GAATT---TTTTTGTCATGA-------CAA-A-AA--T--TGAAGATTTTGTC-ATGAACAAAA-T--GAA--------TGTTGTCATGACAGAAG-------TGAA-TTTGTCCAA----CAAAAT-TC--GA----TTTG----T--TCGTTCAA-GCACA--AAAGTGGAA----TTT-----TGTTCT-GTCACA-AATG-GAATTTTGTCAAGGACGAG------------AA--CAG-TG-ATTTT--ATC--C--ACCAA------AATTTCG---ATTTTTGTCTTCACACCAAGTGAATTTA--CGATCA--AC-AAA-A-TGAGG----T--TGTT-GTCCAGTAAATT---ATTTT-GTC-T---C-CTA------ACATATAA-TTTCTTA-TTGC-ACTTTTTTTTCCCG-CATTGTGCCCATTCCATTCTAA-GTTT-AAA-TTAT-CATCTAGT-A--AAACA-TTT-TG-TCCACCAAA----ATTCT-----T--A-ATTA-------C-----------ATGAT----G--------GTTTTCAATTTGGGTA--TGC-AATT-A-TTT-ACATAAAT-CAAATTAACACCTATTTTCATATATACAAATTCCA-TAATGTTTACAAAAGTTAATT
gi|10 : GGGGCGC-C-AAATGG-GAC--T-C----TTGT-GA-T---------------------TTTGTTC-T-CAAAA--TTC------ATTTT------T-G-T-GTGGA--CAAAA-ATGAA-T-TTT-GT-AGA-ACAAAA-ATG---------------AGT----TCA-GGTC-AAC---AAA---ATTG--ATCAT--G-AATCA--CA-A-AA-ATTAATTTT---------------GTCGCACA-AA---ATTA--T-----CT-T-TCA--GCAGACA--AAA-T---------------------------------TC-AC-TTTTGT-C-ATG--AC--AAATATTCACTT-TTGTATACA---A---A-AGT-----CAATT-TTG-TCT-GGAAAAGATTAAT-TTTGT--AACTATA-T--TT--G--GAT-TTTGTA-TGCAA--AT-----T--AG-------TTGA-A--T-------T--G-GA-----TTTTT--GTG-AAC-TAATTTGCA--TACCAA-AAT-GAAAAA-AAT--TCATAATTGAATT---TTG-TTG-GA-CAAAAT---GTT--TTTACTAATGATAATTTA----A---AAC----TTAA-A-TTGGGC---AA-----TCGCGGAAAA---AGGTTGGCAT-AAAGAAAT-TATAT---T-TA---GG-T-A--GA---------GAAAAT----TT-
gi|11 : tctAAATTAA-TTTTTTGTC-T--AC-CTA------A-ATATAA-TTTCTTT-ATGCAACTTTTTT---CCG-CGT--TGCCCA----ATT-TAA-GTTT-AAA-TTAT-C-----GTAA--AAACA-TTT-TG-TCCAA-ACA----ATTC---------A-ATTA--------------------TGAT----T--------TTTTTTCATTCTGGTA--TGCAAATT-AGTTT-ACAAAAATCCAAATT--CAACTAATT---TGCATACAAAATCCAAATATG-TTACAAAAGTTATTT
gi|11 : GGCGC-C-AAATGG-GAC--T-C----TTGT-GA-TT-------------------TTGAGTTC-T-CAAAA--T-T------CATTT------TAG-T-GTGGA--CAAAA-ATGAA-T-TTT-GT-AGA-ACAAAA-ATG---------------AAT----TCA-GGTC-AGC---AAA---ATTG--ATCAT--G-AATCA--CA-A-AA-ATTTATTTTT--------------G--GCACA-AA---ATTA--T-----CT-T-TCA--GCAGACA--AAA-T---------------------------------TC-AC-TTTTGT-C-ATG--AC--AAA-ATTCACTT-TTGTAGACA---A---A-AGT-----CAATT-TTG-TCT-GGACAGAAATAACTTTTGT--AACAT-A-T--TT--G--GAT-TTTGTA-TGCAA--AT-----T--AGTT-GAATTTG------------------GA-----TTTTT--GTA-AAC-TAATTTGCA--TAC-CAGAATGAAAAAA-AATCAT--------AATTGAATTGTTTG-GA-CAAAAT---GTT--TTTAC----GATA----ATTT-A---AAC----TTAA-A-T----TGGGCA-----ACGCGGAAAA---AAG-TTGCAT-AAAGAAAT-TATAT---T-TA---GG-T-A--GAC----A---AAAAAT----Tctgtccagacaaaattgacttttgtctacaaaagtgaattttgtcatgacaaaagtgaattttgtctgctgaaagataattttgtgccaaaaataaatttttgtgattcatgatcaattttgctgacctgaattcatttttgttctacaaaattcatttttgtccacactaaaatgaattttgagaactcaaaatcacaagagtcccatttggcgcc
gi|12 : aaattACA--AATGT-AAA----TTT-----TGTGA--G--ACA-AATTTGAATTTTGTCAT-GA-AAA------------AA----G-TG-AAT------------------------AGT--G---AATTGTGTCATGACA-AAAATGAATT-A--TG-TCATGAT-AAA-AGTGA-A----T--T-TT-GTTGAAAAAATTCATATTT--GTC-T--AC-CTA------A-ATCTAA-TCTCTTC-ACGCAA---TTTTTTCCC---AT--TGTCTA----ATT-GAA-GTTA-AAA-TTAA-CAT-TAGTAA--AAAAAACTT-TG-TCCCACAAA----ATTG---------A-ATTA-------TGA---------ATAAC----AGTACTGAATTTCTTCATTTTGGTA--TGCATAAT-AGTTT-ACAAAAATCTAAATT--CAACAACTT---TGCTTAC-AAATCCACTTATG-CTACAAAAGTTAATT
gi|12 : atgtagtttgcattagataAATTTC-TCATGACAAAACTCA-CATTTGT-A-GAC-AAC-AA-T-CAATTGCATGTATGTTTTGA-------CAG-A-A---T--TAA--CTTTTGT----A-GCATAAGT--GGA--------TTT-GT--------AAG-------CAAA-GTTGTTGAA----T----T-TA--GA--TTTTTGTAAAC--TA-TT--ATGCATACCAAAAT-GAAGAAATTCAGTACTGTTA--TTCATA-A-TT-CAATTTTGT-GG-GACAAAGTTTTTTTTACTAA--T-GTTA-ATTTT--AACT-T----CAATTAGACAATG--GGAAAAAATTG-CGTGAAG-AGATTAGATTTA---GGTAG--AC-AAATA-TGA-A----T--T-TT-TTCAACAAAATTCA-CTTTTctgtcaaaacatacatgcaattgattgttgtctacaaatgtgagttttgtcatgagaaatt
gi|13 : atgtagtttgcattagataacaaatgtaaattttgtgagacaaatttgaattttgtcatgaaaaaagtgaatagtgaattgtgtcatgacaaaaatgaattatgtcatgatCGGGGCGC-C-GATTGG-GAC--T------T----GA-TCCTTTTGCAATCAAAACCAATTTTGTGTACACAAAA--T-AG-----AATTC------C-G-TCATA-A--CAAAA-TTCAA-T-TTT-GTCACA--CAAAA-GTGTGCTGCTTCGTAATAACT----TCATANNN-NNN---NNN---NNN---NNNNN--N-NNNNN--NN-ATAA-CTTCATATTT-GT-ATTG--ATAAGTTATACA-AA---ATTA--T-----TT-T-TCATTNNNNNNN--NNN-NNNNN--NNNN--NN-N--N-N--N--NN-NN--NN-NN-NNNNNN-N-NNN--NN--NNN-NNNNNNNN-NNNN----N---N---N-NNN-----NNNNN-NNN-NNN-NNNNNNNN------NNNNN--N-----N-N--NN--NNNNAT-TATGTA-TGCAAATAT-----C--AATC-TCATTTGC-A--TA-CAAAAT--A-GA-----CTTTT--GTT-ATC-TAGTTTGCA--T---TA-AAT-
gi|14 : taCGGGGCGC-C-G-ATTG-GAC--T------T----GA-TC-------------------TTTTG-TAAT-CCAA------------AATTT------T-G-T--TACA--CAAAATACGAA-T-TTCGGTCATA-AAAAAA-TTC---------------TTTTTTGTCA-CACC-ATA---GAA---GTA---ATGATTGA-CTTCA--TA-ATAA-ATCA--TTTTTGTAATTG--A--AAATATATACAA---ATTA--T-----TTCT-TCA--G-AG-CT--AAA-TTGAA--T--------------------------------TTCTGT-A-ACG--AC--AAA-AATCCATT-TTGT----A---A--------------------TGCTCATTGACAAAA------TTCAT--------T-T--TT--GTCAATCTATGTA-TGTCAATAT-----C--AATC-TC-TTTGCAA--TA-CAAAAT--AGGA-----CTGTT--TTT-ATC-TAA-TTGCA--T---TA-TA--AACAAACAGTA-A--------AATT---TT
gi|15 : GC-C-GATTGG-GAC--T------T----GA-TC-------------------TTTTTGTAAT-CAAAA--C-C------AATTT------T-G-T-GTACA--CAAAT-A-GAA-T-TCC-GTCGTA-ACAAAA-TTC---------------ATT----TT--TGTC-ACAC--AAA---AGT---ATGTT--G-CTTCA--TA-ATAA-CTTCA-TTTTTGT-ATTGATA--AGTTATACA-AA---ATTA--T-----TT-T-TCA--GTTGACA--AAA-T---------------------------------TC-AA-TTTTGT-C-ACA--AC--AAA-ATCCA-TT-TTGT----AGATA---A-ACT-----CAATT-TTG-TCA-TGACAAAA------TTC----A-----ATT--TT--GTCAAT-TATGTA-TGCAAATAT-----C--AATC-TCATTTGC-A--TA-CAAAAT--A-GA-----CTTTT--GTT-ATC-TAGTTTGCA--T---TA-AA
gi|16 : tGGCGC-C-AAATGG--AC--T-CCTTGT----GA-T--------------------TTTTGTCTTG-CAAAA--TTC------ATTTT------T-G-T-GTCGA--CAAAA-ATGAA-T-TTT-GT-AGA-ACAAAAATTG---------------AGT----TCA-GGTCAACA---AAATTGATC---ATG----G-AATCA--CA-AAAA-TTTAATTTCT--------------GTCGCACA-AA---A-TA--T-----CT-T-ACA--GCAGACA--AAA-TTCAC--TATT--GT-A--GAA--C--AA-AG--TC-AA-TTTTGT-C-TGG--AC--AGA-ATTAAC-T-TTGT----A---AC--ATATT-----GGATT-TTG-T-A-TTGC-ATA------TTAGTTGA-----A----TT--G--GAT-TTT------------T-----T--AAAC-TAATTTGC-A--TACCAAAAT--
gi|17 : ttc-------------------TTTTGTGAAT-CAAAA----C------AATTT--------G-T-GTACA--CAAAATAGAAA-T-TCC-GTCATA-ACAAAA-TTC---------------ATT----TT--TGTC-AAAC--AAA---AGT---ATGTT--G-CTTCC--CA-ATAA-CTTA--TTTTTGT-ATTG--ATAAGTTGTACA-AA---ATTA--T-----TT-T-TCA--GTTGACA--AAA-TCCAT--TTTT--GT-A--G-A--T--AA-AC--TTAAA-TTTTGT-C-ATGAAAC--AAA-ATTCATTT--------------------GT-----CAATT-ATG-T-A-TG-CAAA--------------------------T--ATCGA----------------------------TC-TCATTTGC-A--TA-CAAAAT--A-GA-----CTTTT--GTT-ATC-TAGTTTGCA--T---tagtc
gi|18 : GTT-G---ACAAAATTCA--TTTTTGTC-T--AC-CTACATGTAA-ATATAA-TCTCTTC-ATGCAACTTTTTCTTCCCA--------------------------TT-AAA-TTAT-CAT-TAGTAA--AAACA-GTT-TG-TCCGACAAA----ATT-------T--A-ATTA-------TGAATTACAGAAATGA-----A--------TTTCTTCATTTTGGTA--TGCAA-------------------TAAATT--CAACAAATT---TGCTTACAAAATCCACTTATG-TTACAAAAGTCAAaa
gi|19 : AAAATT-A-ATTTTCGTC-TTAAC-CTA------A-ATATAA-TTTCTTT-ATGCGACTTTTTTTCCTTG-CAT--TGCCCA----ATT-TAA-GTTT-AAA-TTATGCA--TAGTAATTTAACA-TTTGTG-TCCAAC-AA----ATTC---------A-ATT---------------------TGA-----A--------TTTTTTCATTTTGGTA--TGCAAATT-AGTTC-AC--AAATCCAAATT--CAACTAATT---TGCAT
gi|2 : GGGCGT-C-GAATGGCGAC--T-----------GACTT-------------------TTTTGT-AAT-CAAAA--C-C------CA-TT------T-G-T-GTACA--C-AAA-TTGAAGT-TCC-GTCACA-ACAAAA-TTC---------------ATT----TT-------------------ATT---ATGTT--GCTTTCA--TATATAAGCTTCA-TTTTTGT-ATTG--ATTAGTTATACA-AA---ATTA--T-----TT-T-TCGC-GTGGACA--AAA-TTAAA--TTTT--GT-A----A--CG-AA-AA--TC--A-TTTTGT-C-ACG--ACAGAAA-GTCCATTT----T----A---A---A-GGTTAC--CAATT-TAG-T-A-TTCCAA---------TC------------T--TT--GTCAAT-ATTGTA-TGCAAATAT-----C--AATCTTCA-TTGT-A--TA-CAAAATA-A-GA-----CTTTG--TTT-ATCTTAGTTTGCA--T---TA-AATAAACAAA-AG---T--------AATTA--TTA-TT--GA-CAAAGTTG-A-A--TTTGTCA--TAC-----A----A---AAG----CTGG-ACT----T---TG-----TTAACAAAACT--GAATTTG-AT-CAACAAAT-TC-AT---T-NN---NN-N-N--NNN----NNNNNNNNNN----NN-NNN-N-NN------NN--------NN-N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNN-GTT---------C-AACCAA-T-CATTT---TTGTCTTCATAATTTTTGTCAACA-AAAAT--TCA--TTTTTGTC-TC--ACAAAAGT--GAA--------TTTTGTAATGACAAAAG-------TGAA-TTTAGTCAA----CAAAAA-AT--GAAGATTTTG----------TT--A-G-ACA--AAATT-TCA----TTT-----Tcct
gi|20 : AC-AA--AA-TTGA-------TCTTG-AATCA-------CAA-ATAA--T--T-A--ATTTTGTC-ATG--CAAAA-----------------TTATC----------------------TT---TCAA----CGGA----C--GA--ATTTCG----CTTTT-TT--A-G-ACA--ACAGT-CAA----TTT-----TATTC---TTACAGAATT--AACTTTG---A-AACATA------------A-----G-TGCATTTT--GT---------AA------GCTT--G---GGTTTTtgatc
gi|20 : caaaaaaacaacaacaaaacacaccccaaAA-AGT--T--------AATT---CTG-TAA-GAATAAAATTG-ACT--GTTGTCT--AAAA----A----AGCGAAA----TTCG---T----C---CG-----TTG--AAAGAT--AATTTTGCAT-GACAAAAT-TA-AT---TATT---TG-T----GATTCAAGATCAA--------TT-TTG-T-tga
gi|21 : caaaaaaacaacaacaaaacacaccccaaaaaacccaagcttacaaaatgcacttatgtttcCGGGGCGC-C-AAATGG-GACCTT-G----T----GA-T---------------------TTTGTTC-T-CAAAA--TTC------ATTTT------T-G-T-GTGGA--CAAAA-ATGAA-T-TTT-GTAGAA-ACAAAA--TG---------------AGT----TCA-GGTC-AAC---AAA---ATTG--ATCAT--G-AATCA--CA-A-AA-ATCAATGTT---------------GTCGCACA-AA---ATTA--T-----CT-T-TCA--GCtga
gi|22 : AC-AA--AA-TTGAATT---TT---GTCATGA-------CAC-A-AA--G--TGA--ATTTTGTCAATG-ACAAAAGT--GAAAAGTGAATTTCTGTTGTGACAAAAG-------TGAATTTTGGTCAA----CAAAAT-TT---A--TTTTTG----C--TC--------CACAT-AAAGT-G-A----TTT-----TG-TC--AACAAA-AATT---ATTTTGT
gi|23 : GCTTACAAAATGCACTTATG-TTTC-AAAGTTAATTg
gi|23 : AA-AGT--T--------AATT---CTG-TAA-GAATAAAATTG-ACT--GTTGTCT--AAAA----A----AGCGAAA----TTCG---T----C---CG-----TTG--AAAGAT--AATTTTGCAT-GACAAAAT-TA-AT---TATT---TG-T----GATTCAAGATCAA--------TT-TTG-T-ctgtaagaataaaattgactgttgtctaaaaaagcgaaattcgtccgttgaaagataattttgcatgacaaaattaattatttgtgattcaagatcaattttgttg
gi|24 : gcttacaaaatgcacttatgtttcTACAAAATGCACTTATG-TTTCAAAAGTTAATTtg
gi|24 : ctAAA-AGT--T--------AATT---CTG-TCAAGA-TAAAATTG-ACT--GTTGTCT--AAAA----A----AGCGAAA----TTCG---T----C---CG-----TTG--AAAGAT--AATTTTGCAT-GACAAAAT-TA-AT---A-TT---TG-T----GATTCAAGATCAA--------TT-TTG-T-ctgtcaagataaaattgactgttgtctaaaaaagcgaaattcgtccgttgaaagataattttgcatgacaaaattaatatttgtgattcaagatcaattttgttg
gi|25 : cttacaaaatgcacttatgtttcAAAATTTA-ATTTTT-TC-T--ACGCTA------AGATATAA-TTTCTTT-GTGCA--TTTTTTTTTCCG-CAT--TGCCAA----ATT-TAAGGTTT-AAA-TCAT-CAT-TAGTGA--AAACATTTT-TGTTCCAA-ACA----ATTT------C--AGATTA-------tg
gi|26 : CGACAAA----ATT-------T--A-ATTATGAATTGC-----------AGAACTGA-A--------TTTCTTCATTTTGGTA--TACAAATT-AGCTT-ACAAAAATCTAAATT--CAACAAATT---TACTTCCAAAATCCACTTGTG-TTACAAAAGTTAATtgatt
gi|27 : tAGTGAATTT---TG-TCA--AC-AAA-AATGA-A----TCTTGCCAGTCGACAAAATTCA--TTTTTGTT-T--AT-CTA------A-ATATTA-TCTCTTC-ATGCAAC---TTTTTCCC--CAT--TGCCTA----ATT-TAA-G-TT-AAA-
gi|28 : GTC-T--AC-CAA------A-ATATAA-TTTCTTT-ATGCAAATTTTTT---CCG-CGT--TGCCAA----ATT-TAA-GTTT-GAA-TTAT-CAT-TAGTAA--AAATA-TTT-TG-TCCAACAAA----ATTC---------A-ATTA-------
gi|29 : -C-AAATGG-GAC--T-TGG--T----GA-T--------------------TTTTGTTC-C-CAAGAATT-CG-----AATTTACCTTAT-G-T-GGATT--CAAAA--TGAA-TCTTT-GCTTCA-ACAAAA-ATG---------------AGC----TCA-Gtgaat
gi|3 : tagatgaacctagA--ACAGT-GAA----TTT-----TGTT------AAA-AATT-TTAACTTGTCAT-GACAAA----------------T-T-TC-ATTTTTGGTCTTC--A-CAA------AGT---G---AATTTTGTCA---CA-AAAGAG----TA--CAA---------AA-A-TGA-A----A--TTTT-GTTGACAAAATTCA-CTTTT-GTCAT--AC-TTTT-----A-ATATAAATCTCTTC-AAGCAACTATTTTT--CCA-AAT--TGCCTA----ATT-GAA-GTTT-AAAATTAT-CAT-TAGTAA--AAACA-GTT--G-TCCGACAAA----ATTTAATTTATGAA-ATTA-------C-----------AGAACTTGAA--------TTTCTTCATTT-GGTAAATGCAAATTTAGTTT-ACAAAAATCTAAATT--CA-C--ATT---TGC-TACAAAATCCACTTATG-TTACAAAA-TTAATT
gi|3 : ctagataacagatgtaataaaaGGGGCGC-C-AAATGG--AC--T-C----TTTGTGA-T---------------------TTTGTTC-T-CAAAAATT-C------ATTTT------T-GCT-GTGAA--CAAAA-ATGAA-T-TTT-GT-ACA-ACAAAA-ATG---------------AGT----TCA-GGTA-ACAACCAAA---ATC---GTCAT--GAATTTA--CA-A-AA-ATTAATTT----------------GTCTTACA-AA---AATA--TCAC--TT-TGTCA----TGACA--AAA-TTCACTTTTTT--GT-A--G-A--C--AACAG--TC-AA-TTTTGT-CTTTG--AC--AGA-ATT-AATT-TTGT----A---ACATA-AGT-----GGATT-TTG-----TAGCAAA---------TGTG-A-----A-T--TT--A--GAT-TTT----TGTAA--AC-----T--AA-----ATTTGC-ATTTA-CCAAATGAA-GA-----AATTCAAGTT-CTG-TAATTT-CA------TA-AAT----------T--A--------AATT---TTG-TCG-GA-C--AACTG--TT--TTTACTAATGATA----ATTTTA---AAC----TTCA-A-T----T---AGGCAATTTG-GAAAAAT--AG--TTGCTT-GAAGAGAT-TT-AT--------------------------ATTAAAAG---------------T------AT--------GA-C-AAA-AGT-GAATTTTGTCA--ACAAAAT-TTCATTTTTGT-------------A-CTCTTTT-GTGAC-AA--AA-T----TC---ACTTTGTGAAGA-------CCA-A-AA--A--TGA--AATTTGTC-ATG-AC--AAGTTAAAA--------TTTT----TAACAAAActgtcaaagacaaaattgactgttgtctacaaaaaagtgaattttgtcatgacaaagtgatatttttgtaagacaaattaatttttgtaaattcatgacgattttggttgttacctgaactcatttttgttgtacaaaattcatttttgttcacagcaaaaatgaatttttgagaacaaaatcacaaagagtccatttggcgcccc
gi|30 : ctagataacagatgtaataaaaaacagtgaaA-------CAA-A-AG--T---GA--ATTTTGTC-ATG-AGAAAAGT--TAA--------TTTTGTCA--ACAAAAATGATTCCTGAG-TTTGTCCAAAACTTAAAATCTCTAGA--ATTTT
gi|30 : atg-ACAAAAGT--GAA--------TTTTGTCATGAGAAAAG-------TTAA-TTTTGTCAA----CAAAA
gi|31 : atgaaaattctagagattttaagttttggacaaactcaggaatcatT---ATGTT--G-CTTCATACA-ATAA-TTTCA-TTTTTAT-ATTG-----------ACA-AA---ATCT--T-----TT-T-TCA--GTGGACA--AAG--TGAA--TTTT--GTCAT-G-A--CG-AA-AG--TT-AA-
gi|32 : ttagCGGGGAGC-C-AAATGG-GAC--TAT----T----GT-TA-------------------TTTTGTTC-T-CAAAA--T-TCAGATGAATTT------T-G-T-ACA-A--CAGAA-A-GGC-T-TTC-
gi|33 : atctCGGGGAGC-C-AAATGG-GAC--TAT----T----GT-TA-------------------TTTTGGTTCT-CAAAA--T-TCATGTGAATTT------T-G-T-ATA-A--CAGAA-A-GGC-T-TTC-t
gi|4 : atctCGGGGCGCTC-AAATGG-GCC--T-CGTG-T----GA-T---------------------TTTGTC--T-CAAAA--TTC------CATTT------T-G-T-CTACAGACAAAA-AT-AA-T-TTT-TTGGTACACAAAA-T-G---------------AGT----TCA-GGTC-AAC---AAA---ATTCGGATCAT--G-AATTA--CA-A-AA-ATTAATTTT---------------GTCTTAC--AA---ATTAACT-----TT-TGTCA----TGACA--AAATTTCAAC-TTTT--GT-A--G-A--T--AA-AGCTTC-AA--TTTGT-C-TTG--AC--ATA-A-TGACTTCTTGT----AC--ACATA-AGT-----GGATT-TTG-TAA--GACAA--------------------------------------TTGTG-TG--AAT-T-----T--A--------TTGC-A--TA-CAAATG--A-GAACATTCTTCT--GTA-ATC--------------------AT-AAT------T--A--------AATT---TTG-TCG-GA-C--AACTG-TTT--TTTACTA---ATG----A----T---AAT----TT-A-A------------------TGGGAAGTAA--AAAGTTGCAT-GAAGAGAT-TA-ATAACT-TTACATG-T-AAGGGTA---GATCAAAAATGAAATT-TTG-T-C--------T--------AA-CAAAATCTTCATTTTTTGT--TGACTAAA--TTCACTTTTGTCATTACAAAATTCA-CTTTTGT-GAGACAAA--AA-T-GAA-----TTTTTGT--TGA-------CAA-A-AA--TTATGA--A----------G-ACAAAAAT--GA
gi|5 : -AAA-A-TGA-A----T--T-TT-GTCCACAAAATT-A-ATTTTCGTC-T--AC-CTT------A-ATATAA-TCTCTTT-AGGCAACTTTTTT---CCGTCAT--TGTTCA----ATT-TAA-GTTT-AAA-TTAT-CAT-TAGTAA--AAACA-TTT-TG-TCCAACAAATTCAATTA------TG-A-ATTA-------C-----------ATAAC----AGATT----TTTTTTCATTTTGGTA--TGCAAATT-AGTTT-ACAAAAATCCAAATT--CAACTAATT---TCCATACAAAATCCAATTATG-TTACAAAAGTTAATTttggtt
gi|6 : acaGGGCGC-C-AATTGG-GAC--T------T----GA-TC-------------------TT---TTTGT----AA--T-C------GA--------------------------A-ATCAA-T-TTT-GTGTAC-ATAAAA-------------------AGT-------------------AAA---AT-------CT--G---TCA--CA-ACAA-AATAATTTTT--------------GTCTAACA-AATATATTA--TACTTGTT-T-T----------A--TAA-CTTCA--TTTTTTGT-AATG-A--C--AA-AA--CC-AAATTTTGC-T-AC---AC--AAA-ATT-ATAT-TT-C----A---A---A-AGT-----CA-TT-TTGATCT-TTACAAAA------TC-----A-----A-T--TTTTGTCAAT-AAGGTA-TGCAAATACATGTAT--AAAC-TTATCTGT-A--TC-CAAAAT--T-GA-----CTTTT--GTT-ACC-TAATTTGCAAAT---TA-AAT-CACAA---GT--T--------AATT---TGG-TGA-GA-CAAAAATA-AAT--GTTGTCAT-GACA----A----A---AGTGACCTTCG---T----C---CG-----CT-CGATAA-T--AATTTTATGT-AACAAAAT-TT-AC---T-TT---TG-TGA--TAT----GTTGTAAAAT----TTGTTAAT-CTGAACTCATTTTTGTTGAA-C-AAA--CTC-ACCTTTGTCAACGCGAAA--TTGGATTTCA--AGTACAAAA-TCA-Cctgtccagaaaacatcatggtttcaaggttatgtaaaaaatactaacactttccactttctgaacagtttttgtaaatctttgaatattgacttgagttatattctgaaaacaaatgtatttaatctgatcaatcatgaaatgctgttatcatttccatcgttttacagagaagcaattatatttttcatggacggtaagaaaattgagaaattgtgtgacttgtcctcaaactcttttcttcgacaaac
gi|7 : GACA--AAA-TTAAA--TTTT--GT-A--T-A--C--GA-AA--TC-AAATTTTGTTC-ACG--AC--AAA-ATCCATTT-TT----------A---A-GGCATTACCAATT-T-----A-T------A------TTC----A-----A-TCTTT--GTCAATATATGTA-TGCAAATAT-----C--AATCTTCA-TTGT-A--TA-CAAAAT--A-GA-----CTTTG--TTT-ATCTTAGTTTG-A--T---TA-AATAAACAAA-AG---T--------AATT---aagaacctcactagtgtcc
gi|7 : gA--ACTAAA-ACTGA-A----T--TGTT-GTCAAC-CAATTCT-ATTTTTGTC-T--atttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaactaaaactgaattgttgtcaaccaattctatttttgtctcattaatttttgtcaacaaaaattcatttttgtctctcacaaaagtgaattttgtaatgacaaaagtgaatttagtcaagcaaaaaatgaagattttgttgacaaaattcatttttgttc
gi|7 : ggacaaaattaaattttgtatacgaaatcaaattttgttcacgacaaaatccatttttaaggcattaccaatttatattcaatctttgtcaatatatgtatgcaaatatcaatcttcattgtatacaaaatagactttgtttatcttagtttgattaaataaacaaaagtaattatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntAA----TTC-----TATTTTTGTCTCA---TT-AATTTTTGTCAA---CAAA------------AATTC-A-T---TTTT--GTCT-CTCA-CAA------AAGT--G---AATTTTGTAATGACA-AAAGTGAATTTAGTCAAGCA--A--AAA-A-TGA-AGATTT--TGTT-G---ACAAAATTC--ATTTTTGTcattaatttttgtcaacaaaaattcatttttgtctctcacaaaagtgaattttgtaatgacaaaagtgaatttagtcaagcaaaaaatgaagattttgttgacaaaattcatttttgttc
gi|8 : ggacaaaattaaattttgtatacgaaatcaaattttgttcacgacaaaatccatttttaaggcattaccaatttatattcaatctttgtcaatatatgtatgcaaatatcaatcttcattgtatacaaaatagactttgtttatcttagtttgattaaataaacaaaagtaattatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaactaaaactgaattgttgtcaaccTT-GTCCACAAAATT-A-ATTTTCGTC-T--AC-CTT------A-ATATAA-TCTCTTT-AGGCAACTTTTTT---CCG-CAT--TGTTCA----ATT-TAA-GTTT-AAA-TTAT-CAT-TAGTAA--AAACA-TTT-TG-TCCAACAAATTCAATTA------TG-A-ATTA-------C-----------ATAAC----AGATT----TTTTTTCATTTTGGTA--TGCAAATT-AGTTT-ACAAAAATCCAAATT--CAACTAATT---TCCATACAAAATCCAATTATG-TTACAAAAGTTAATTtc
gi|9 : ttGGGCGC-CCAAATGG-GAC--T-C----T----TG-TG-------------------ATTTGCTTCT-CAAAA--TTC------ATTTT------T-G-T-GTGGA--CAAAA-ATGAA-T-TTT-GT-AGA-ACAAAA-ATG---------------AGT----TCA-GGTC-AAC---AAA---ATTG--ATCAT--G-AATCA--CA-A-AA-ATTAATTTT---------------GTCGCACA-AA---ATTA--T-----CT-T-TCA--GCAGACA--AAA-T---------------------------------TC-AC-TTTTGT-C-ATG--AC--AAATATTCACTT-TTGTATACA---A---A-AGT-----CAATT-TTG-TCT-GGACAGAATTAACTTTTGT--AACAT-A-T--TT--G--GAT-TTTGTA-TGCAA--AT-----T--AGTT-GAATTTG------------------GA-----TTTTT--GTGAAAC-TAA-TTGCA--TACCAA-AAT-GAAAAA-AAT--TCATAATTGAATT---TTG-TTG-GA-CAAA--TG--TT--TTTA-CAATGATAATTTA----A---AAC----TTAA-A-T----TGGGCA-----ATGCGGAAAA---AAGGTTGCATAAAAGAAAT-TATAT---T-TA---GG-T-A--GAC----G---AAAAATTAA-TT-TTG-T-GG------AC--------AA---AATTAATT---TTTTGTctgtccagaaaacatcatggtttcaaggttatgtaaaaaatactaacactttccactttctgaacagtttttgtaaatctttgaatattgacttgagttatattctgaaaacaaatgtatttaatctgatcaatcatgaaatgctgttatcatttccatcgttttacagagaagcaattatatttttcatggacggtaagaaaattgagaaattgtgtgacttgtcctcaaactcttttcttcgacaaac
gi|9 : CA--A--AAA-A-TTA-A----T--T-TT-GTCCACAAAATTAA-TTTTTCGTC-T--AC-CTA------A-ATATAA-TTTCTTTTATGCAACCTTTTTT--CCG-CAT--TGCCCA----ATT-TAA-GTTTTAAA-TTAT-CAT-T-GTAA--AAACA-TTT--G-TCCAACAAA----ATTC---------A-ATTA--------------------TGAA----T--------TTTTTTCATTTTGGTA--TGC-AATT-AGTTTCACAAAAATCCAAATT--CAACTAATT---TGCATACAAAATCCAAATATG-TTACAAAAGTTAATTg
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 33333333333 11 111111111111111 33333333333 11111111 1111 1111111111111111 111 111 1 8888888888888 11111 11111 555555555555555555555555555555555 33333333333333 11111 77777777777777777777777777777777777777777777 1111111111111111111 111111 11 33333333333 111 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666 111 1 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 11 11 111111 1 222 11 222222222 1111111 11111 11111111 1111 1111111 1111 222222222222 555555555555555555 11 1111 11111 33333 11 1111 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2222222222222 1 11 2 1111 111111 111 1111 88888888888888888888888888888888888888888888888888888
lowQualScore : 2 33 0 2 33 88888888888 2 77 4 777777777777777 666 88888 11111111111 11111111 2 2 8 33 777 2 2 2 5555 1 2 2 6 8888888888888888 2 66666666 33 2 111 999 55 55 777 2 33 2 3 33 0 3333333333333 1 2 444 33 33333 2 5 11111 33 2 222222222222222222222222222222222 2 88 2 2 33 5 33 2 2 2 0 11111111111111 11111 2 66666666666666666666666666666666666666666666 555 2 3333333333333333333 1 55 33 2 7777 77777 44 3 6 0 555555 3 22 2 3 11111111111 999 4 77 8 0 0 111 55 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666 333 88 4 5 4 2 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 2 00 3 11 1 6 555555 3 0 6 3 000 5 33 5 666666666 3 6 6666666 5 5 11111 1 66 0 88 4 2 66 88888888 4444 8888888 5 3 2222 0 111111111111 444444444444444444 33 5 0 0000 22222 11111 11 22 4444 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 0 0 8 1 7777777777777 4 3 00 66 0 3 2 5555 7 3 44 3 222222 6 3 3 999 44 44 0 7777 3 3 3 3 3 3 55 7 3 3 4444 00000000000000000000000000000000000000000000000000000 55 0 4 4 55 3 777 4 5 4
lowQualScore : . .. . . .. ........... . .. . ............... ... ..... ........... ........ . . . .. ... . . . .... . . . . ................ . ........ .. . ... ... .. .. ... . .. . . .. . ............. . . ... .. ..... . . ..... .. . ................................. . .. . . .. . .. . . . . .............. ..... . ............................................ ... . ................... . .. .. . .... ..... .. . . . ...... . .. . . ........... ... . .. . . . ... .. ........................................................ ... .. . . . . .................................................................................. . .. . .. . . ...... . . . . ... . .. . ......... . . ....... . . ..... . .. . .. . . .. ........ .... ....... . . .... . ............ .................. .. . . .... ..... ..... .. .. .... ........................................................... . . . . ............. . . .. .. . . . .... . . .. . ...... . . . ... .. .. . .... . . . . . . .. . . . .... ..................................................... .. . . . .. . ... . . .
lowQualScore : 5 55 6 5 44 00000000000 5 88 7 111111111111111 555 22222 66666666666 11111111 4 4 7 22 888 4 4 7 7777 0 7 7 2 3333333333333333 7 88888888 77 7 111 444 88 99 888 5 44 5 6 55 2 5555555555555 2 5 444 44 11111 5 0 44444 44 5 666666666666666666666666666666666 5 22 7 7 77 3 77 4 7 7 7 00000000000000 33333 7 22222222222222222222222222222222222222222222 999 9 1111111111111111111 4 22 99 9 7777 77777 22 1 2 4 888888 3 22 4 3 77777777777 222 0 88 0 8 8 999 55 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000 888 00 0 0 0 0 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 2 22 6 00 0 7 777777 3 2 7 8 222 7 66 7 777777777 6 6 2222222 0 0 00000 4 99 4 11 4 9 11 11111111 0000 6666666 7 0 1111 1 888888888888 666666666666666666 66 7 1 6666 55555 99999 66 33 2222 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 8 8 0 7 1111111111111 4 3 66 11 6 6 0 1111 0 1 22 3 999999 7 3 3 666 33 66 2 1111 3 3 3 3 6 6 00 3 6 6 2222 99999999999999999999999999999999999999999999999999999 55 8 0 0 55 7 000 9 0 0
consensus : CGGGGCGC-C-GAATGG-GAC--T-C----T----GA-TC-TTTT-G---------------TTC-T-----CAAAA--T-C------AATTT------T-G-T-GTANA--CAAAA-ATGAA-T-TTCG-T---CANA-AC-AAAANTG---------------AGTT----CA-GGT--C-AAC-AAAATTG--ATCNT--G-ANT-CA--CA-ATAAN-TTAATTTTT-GTA-TTGA--AGTCGTACA-AA---ATTA--T-----TT-T-TCA--GCGGACA--AAA-TTNAA--TTTT--GT-A--G-A--C--AA-AG--TC-AA-TTTTGT-C-ACG--ACAAA-A--TTCACTT-TTGT----A---A---A-AGT-----CAATT-TTG-TCA-T-GACAAAA------TTCGT--A-----AT--TT--GTCGAT-TNTGTA-TGCAAATAT-----T--AATC-TCATTTGC-A--TA-CAAAAT--A-GA-----CTTTT--GTT-ATC-TAGTTTGCA--T---TA-AAT-AANAAA-AGT--T--------AATT---TTG-TCGGA-CAAAATTG-ATT--TTTGCCA--GATA----A----A---AAN----TTCG-A-T----C---CG-----TTGCGAAAAAT--AANTTTGCAT-GAAGAAAT-TA-AT---T-TT---TG-T-A--GAC----GATCAAAAAT----TT-TTG-T-CT------AT--------AA-C-AAATANTCGANTTTTGTCATGACGAAA--TTNAA-TTTCGTCANTACAAAA-TCA-CTTTTGT-GTGAC-AA--AA-T-GAATT---TTTTTGTCATGA-------CAA-A-AA--T--TGA--ATTTTGTC-ATG-ACAAAAGT--GAA--------TTTTGTCATGACAAAAG-------TGAA-TTTGNTCAA----CAAAAT-TC--GA--ATTTTG----C--TC-TT--A-GCACA--AAAGT-GAA----TTT-----TGTTC--GTCACAAATTN-AATTTTGTC-ANGACAAA------------AA--C-G-TG-ATTTT--GTCT-C--A-CAA------AATT--G---AATTTTGTCATGACA-AAAGTGAATTTA--CGATCA--AC-AAA-A-TGA--AT--T-TT-GTCGACAAAATTCA-ATTTTCGTC-T--AC-CTA------A-ATATAA-TCTCTTT-ATGCAACTTTTTTTTCCCG-CAT--TGCCCA----ATT-TAA-GTTT-AAA-TTAT-CAT-TAGTAA--AAACA-TTT-TG-TCCAACAAA----ATTC------T--A-ATTA-------C-----------ATGAC----A--------TTTTTTCATTTTGGTA--TGCAAATT-AGTTT-ACAAAAATCCAAATT--CAACTAATT---TGCATACAAAATCCACTTATG-TTACAAAAGTTAATT
Reference ( family-5289 ) : CGGGGCGC-C-GAATGG-GAC--T-C----T----GA-TC-TTTT-G---------------TTN-T-----CAAAA--T-C------AATTT------T-G-T-GTANA--CAAAA-ATGAA-T-TTCG-T---CANA-AC-AAAANTG---------------AGTT----CA-GGT--C-ANN-AAAATT---ATGNT--G-NNT-CA--CA-ATAAN-TTAATTTTTTGTA-TTGA--AGTCGTACA-AA---ATTA--T-----TT-T-TCA--GCGGACA--AAA-TTNAA--TTTT--GT-A--G-A--C--AA-AG--TC-AA-TTTTGT-C-ACG--ACAAA-A--TTCACTT-TTGT----A---A---A-AGT-----CAATT-TTG-TCA-T-GACAAAA------TTCGT--A-----AT--TT--GTCGAT-TNTGTA-TGCAAATAT-----T--AATC-TCATTTGC-A--TA-CAAAAT--A-GA-----CTTTT--GTT-ATC-TAGTTTGCA--T---TA-AAT-AANAAA-AGT--T--------AATT---TTG-TCGGA-CAAAATTG-ATT--TTTGTCA--GANA----A----A---AAN----TTCG-A-T----C---CG-----TTGCGAAAAAT--AANTTTGCAT-GACGAAAT-TA-AT---T-TT---TG-T-A--GAT----GATCAAAAAT----TT-TTG-T-CT------AT--------AA-C-AAATANTCGANTTTTGTCATGACGAAA--TTNAA-TTTCGTCANTACAAAA-TCA-CTTTTGT-GTGAC-AA--AA-T-GAATT---TTTTTGTCATGA-------CAA-A-AA--T--TGA--ATTTTGTC-ATG-ACAAAAGT--GAA--------TTTTGTCATGACAAAAG-------TGAA-TTTGNTCAA----CAAAAT-TC--GA--ATTTTG----C--TC-TT--A-GCACA--AAAGT-GAA----TTT-----TGTTC--GTCACAAATTN-AATTTTGTC-ANGACAAA------------AA--C-G-TG-ATTTT--GTCT-C--A-CAA------AATT--G---AATTTTGTCATGACA-AAAGTGAATTTA--CGATCA--AC-AAA-A-TGA--AT--TGTT-GTCGACAAAATTCA-ATTTTCGTC-T--AC-CTA------A-ATATAA-TCTCTTT-ATGCAACTTTTTTTTCCCG-CAT--TGCCCA----ATT-TAA-GTTT-AAA-TTAT-CAT-TAGTAA--AAACA-TTT-TG-TCCAACAAA----ATTC------T--A-ATTA-------C-----------ATGAC----A--------TTTTTTCATTTTGGTA--TGCAAATT-AGTTT-ACAAAAATCCAAATT--CAACTAATT---TGCATACAAAATCCACTTATG-TTACAAAAGTTAATT
gi|1 : CGGGGCGC-C-GATTGG-GAC--T------T----GA-TC-TTTT-G---------------CTAAT-----CAAAA--C-C------AATTT--------G-T-GTACA--CTAAA-A-GAA-T-TCCG-T---CATA-AC-AAG-TTC---------------ATTT----CT-TGA--C-ACA-AAAAGT---ATGTT--G-CTT-CA--TA-ATAAC-TTCATTTTTTGTA-TTGATAAGTTGTACA-AA---ATTA--GA----TT-T-TCA--GTTGACACAAAA-TTGAA--TATT--GT-A--G-AACCTGAA-AC--TT-AACTTTTGT-C-ACG--ACAAA-A--TTCATTT-TTGT----A---A---ATAAT-----CAATTATTG-TCAAT-GACAAAA------TTGGT--A-----AT--TT--GTCAAT-TATGTAGTGCAAATAT-----TTTGATC-TCATTTGC-A--TA-CAAAAT--A-AA-----CTTTT--GTT-ATC-TTGTTTGCA--T---TA-AAT-AAGAAA-AGT--A--------AATT---TTG-TGAGA-CAAAATTGAATTCATTTGTCA--GACA----A----A---AAG----TTTGCA-T----C---TG-----TTATGTAAAATTGAATTTTTCAT-GACAAAGTGTA-AT---TCTT---TGTT-A--GGT----GATCAAAGGT----TC-TTG-TCCT------AT--------GACC-AAATAGTCGAATTTTGTCATGATAAAAGGTTGAA-TTTCGTTTATACAAAA-TGATCTTCTGTCATGAC-AA--AACT-GAATT---TTTTTGTCATGA-------CAA-A-AA--T--TGAAGATTTTGTC-ATGAACAAAA-T--GAA--------TGTTGTCATGACAGAAG-------TGAA-TTTGTCCAA----CAAAAT-TC--GA----TTTG----T--TCGTTCAA-GCACA--AAAGTGGAA----TTT-----TGTTCT-GTCACAAATGG-AATTTTGTCAAGGACGAG------------AA--CAG-TG-ATTTT--ATC--C--ACCAA------AATTTCG---ATTTTTGTCTTCACACCAAGTGAATTTA--CGATCA--AC-AAA-A-TGAG-GT--TGTT-GTCCAGTAAATT---ATTTT-GTC-T---C-CTA------ACATATAA-TTTCTTA-TTGC-ACTTTTTTTTCCCG-CATTGTGCCCATTCCATTCTAA-GTTT-AAA-TTAT-CATCTAGT-A--AAACA-TTT-TG-TCCACCAAA----ATTCT-----T--A-ATTA-------C-----------ATGAT----G--------GTTTTCAATTTGGGTA--TGC-AATT-A-TTT-ACATAAAT-CAAATTAACACCTATTTTCATATATACAAATTCCA-TAATGTTTACAAAAGTTAATT
gi|10 : GGGGCGC-C-AAATGG-GAC--T-C----TTGT-GA-T---TTT-G---------------TTC-T-----CAAAA--TTC------ATTTT------T-G-T-GTGGA--CAAAA-ATGAA-T-TTTG-T----AGA-AC-AAAAATG---------------AGTT----CA-GGT--C-AAC-AAAATTG--ATCAT--G-AAT-CA--CA-A-AAA-TTAATTTT-------------GTCGCACA-AA---ATTA--T-----CT-T-TCA--GCAGACA--AAA-T---------------------------------TC-AC-TTTTGT-C-ATG--ACAAATA--TTCACTT-TTGTATACA---A---A-AGT-----CAATT-TTG-TCT-G-GAAAAGATTAAT-TTTGT--AACTATAT--TT--G--GAT-TTTGTA-TGCAA--AT-----T--AG-------TTGA-A--T-------T--G-GA-----TTTTT--GTG-AAC-TAATTTGCA--TACCAA-AAT-GAAAAA-AAT--TCATAATTGAATT---TTG-TTGGA-CAAAAT---GTT--TTTACTAATGATAATTTA----A---AAC----TTAA-A-TTGGGC---AA-----TCGCGGAAAA---AGGTTGGCAT-AAAGAAAT-TATAT---T-TA---GG-T-A--GA---------GAAAAT----TT-
gi|11 : tctAAATTAA-TTTTTTGTC-T--AC-CTA------A-ATATAA-TTTCTTT-ATGCAACTTTTTT---CCG-CGT--TGCCCA----ATT-TAA-GTTT-AAA-TTAT-C-----GTAA--AAACA-TTT-TG-TCCAA-ACA----ATTC---------A-ATTA--------------------TGAT----T--------TTTTTTCATTCTGGTA--TGCAAATT-AGTTT-ACAAAAATCCAAATT--CAACTAATT---TGCATACAAAATCCAAATATG-TTACAAAAGTTATTT
gi|11 : GGCGC-C-AAATGG-GAC--T-C----TTGT-GA-TT-TTGA-G---------------TTC-T-----CAAAA--T-T------CATTT------TAG-T-GTGGA--CAAAA-ATGAA-T-TTTG-T----AGA-AC-AAAAATG---------------AATT----CA-GGT--C-AGC-AAAATTG--ATCAT--G-AAT-CA--CA-AAAAT-TTA--TTTTTG-------------GCACA-AA---ATTA--T-----CT-T-TCA--GCAGACA--AAA-T---------------------------------TC-AC-TTTTGT-C-ATG--ACAAA-A--TTCACTT-TTGTAGACA---A---A-AGT-----CAATT-TTG-TCT-G-GACAGAAATAACTTTTGT--AACAT-AT--TT--G--GAT-TTTGTA-TGCAA--AT-----T--AGTT-GAATTTG------------------GA-----TTTTT--GTA-AAC-TAATTTGCA--TAC-CAGAATGAAAAAA-AATCAT--------AATTGAATTGTTTGGA-CAAAAT---GTT--TTTAC----GATA----ATTT-A---AAC----TTAA-A-T----TGGGCA-----ACGCGGAAAA---AAG-TTGCAT-AAAGAAAT-TATAT---T-TA---GG-T-A--GAC----A---AAAAAT----Tctgtccagacaaaattgacttttgtctacaaaagtgaattttgtcatgacaaaagtgaattttgtctgctgaaagataattttgtgccaaaaataaatttttgtgattcatgatcaattttgctgacctgaattcatttttgttctacaaaattcatttttgtccacactaaaatgaattttgagaactcaaaatcacaagagtcccatttggcgcc
gi|12 : aaattACA--AATGT-AAA----TTT-----TGTGA--G--ACAAATTTGAATTTTGTC-ATGA-AAA------------AA----G-TG-AAT------------------------AGT--G---AATTGTGTCATGACA-AAAATGAATT-A--TG-TCATGAT-AAA-AGTGA--AT--T-TT-GTTGAAAAAATTCATATTT--GTC-T--AC-CTA------A-ATCTAA-TCTCTTC-ACGCAA---TTTTTTCCC---AT--TGTCTA----ATT-GAA-GTTA-AAA-TTAA-CAT-TAGTAA--AAAAAACTT-TG-TCCCACAAA----ATTG---------A-ATTA-------TGA---------ATAAC----AGTACTGAATTTCTTCATTTTGGTA--TGCATAAT-AGTTT-ACAAAAATCTAAATT--CAACAACTT---TGCTTAC-AAATCCACTTATG-CTACAAAAGTTAATT
gi|12 : atgtagtttgcattagataAA-TTTC-TCATGACAAAACTCA-CATTTGT-A-GAC-AAC-AA-T-CAATTGCATGTATGTTTTGA-------CAG-A-A---T--TAA--CTTTTGT----A-GCATAAGT--GGA--------TTT-GT--------AAG-------CAAA-GTTGTTGAA----T----T-TA--GA--TTTTTGTAAAC--TA-TT--ATGCATACCAAAAT-GAAGAAATTCAGTACTGTTA--TTCATAA-TTC-AATTTTGT--GGGACAAAGTTTTTTTTACTAA--T-GTTA-ATTTT--AACT-T----CAATTAGACAATG--GGAAAAAATTG-CGTGAAG-AGATTAGATTTA---GGTAG--AC-AAATA-TGA--AT--T-TT-TTCAACAAAATTCA-CTTTTctgtcaaaacatacatgcaattgattgttgtctacaaatgtgagttttgtcatgagaaatt
gi|13 : atgtagtttgcattagataacaaatgtaaattttgtgagacaaatttgaattttgtcatgaaaaaagtgaatagtgaattgtgtcatgacaaaaatgaattatgtcatgatCGGGGCGC-C-GATTGG-GAC--T------T----GA-TCCTTTT-GCAATCAAAACCAATTTTG-TGTACACAAAA--T-AG-----AATTC------C-G-TCATA-A--CAAAA-TTCAA-T-TTTG-T---CACA--C-AAAAGTGTGCTGCTTCGTAATAACTT----CATANN--N-NNN-NNNNNN---NNNNN--N-NNN-NN--NN-ATAAC-TTCATATTT-GTA-TTGATAAGTTATACA-AA---ATTA--T-----TT-T-TCATTNNNNNNN--NNN-NNNNN--NNNN--NN-N--N-N--N--NN-NN--NN-NN-NNNNNN-N-NNN--NNNNN-N--NNNNNNN-NNNN----N---N---N-NNN-----NNNNN-NNN-NNN-N-NNNNNNN------NNNNN--N-----NN--NN--NNNNAT-TATGTA-TGCAAATAT-----C--AATC-TCATTTGC-A--TA-CAAAAT--A-GA-----CTTTT--GTT-ATC-TAGTTTGCA--T---TA-AAT-
gi|14 : taCGGGGCGC-C-GA-TTG-GAC--T------T----GA-TC-TTTT-G---------------TAA-T-----CCAAA------------ATTT------T-G-T--TACA--CAAAATACGAA-T-TTCGGT---CATA-AA-AAAATTC---------------TTTTTTGTCA-CAC--C-ATA-GAAGTA---ATGATTGA-CTT-CA--TA-ATAAA-TCA--TTTTTGTAATTGA--AAATATATACAA---ATTA--T-----TTCT-TCA--GAG--CT--AAA-TTGAA--TTTC--------------------------------TGT-A-ACG--ACAAA-A--ATCCATT-TTGT----A---A--------------------TGCTCA-TTGACAAAA------TTCAT--------TT--TT--GTCAATCTATGTA-TGTCAATAT-----C--AATC-TC-TTTGCAA--TA-CAAAAT--AGGA-----CTGTT--TTT-ATC-TAA-TTGCA--T---TA-TA--AACAAACAGTA-A--------AATT---TT
gi|15 : GC-C-GATTGG-GAC--T------T----GA-TC-TTTTTG---------------TAA-T-----CAAAA--C-C------AATTT------T-G-T-GTACA--CAAAT-A-GAA-T-TCCG-T---CGTA-AC-AAAATTC---------------ATTT----T--TGT--C-ACACAAAAGT---ATGTT--G-CTT-CA--TA-ATAAC-TTCATTTTT-GTA-TTGATAAGTTATACA-AA---ATTA--T-----TT-T-TCA--GTTGACA--AAA-TT---------------------------------C-AA-TTTTGT-C-ACA--ACAAA-A--TCCA-TT-TTGT----AGATA---A-ACT-----CAATT-TTG-TCA-T-GACAAAA------TTC----A-----AT--TTT-GTCAAT-TATGTA-TGCAAATAT-----C--AATC-TCATTTGC-A--TA-CAAAAT--A-GA-----CTTTT--GTT-ATC-TAGTTTGCA--T---TA-AA
gi|16 : tGGCGC-C-AAATGG--AC--T-CCTTGT----GA-T--TTTT-G---------------TCT-TG----CAAAA--TTC------ATTTT------T-G-T-GTCGA--CAAAA-ATGAA-T-TTTG-T----AGA-ACAAAAATTG---------------AGTT----CA-GGT--C-AAC-AAAATTG--ATCATG-G-AAT-CA--CA-AAAAT-TTAATTTCT------------GTCGCACA-AA---A-TA--T-----CT-T-ACA--GCAGACA--AAA-TTCAC--TATT--GT-A--GAA--C--AA-AG--TC-AA-TTTTGT-C-TGG--ACAGA-A--TTAAC-T-TTGT----A---AC--ATATT-----GGATT-TTG-T-A-T-TGC-ATA------TTAGTTGA-----A---TT--G--GAT-TTT------------T-----T--AAAC-TAATTTGC-A--TACCAAAAT--
gi|17 : ttc-TTTT-G---------------TGAAT-----CAAAA----C------AATTT--------G-T-GTACA--CAAAATAGAAA-T-TCCG-T---CATA-AC-AAAATTC---------------ATTT----T--TGT--C-AAACAAAAGT---ATGTT--G-CTT-CC--CA-ATAAC-TTA--TTTTTGTA-TTGATAAGTTGTACA-AA---ATTA--T-----TT-T-TCA--GTTGACA--AAA-TCCAT--TTTT--GT-A--G-A--T--AA-AC--TTAAA-TTTTGT-C-ATGAAACAAA-A--TTCATTT--------------------GT-----CAATT-ATG-T-A-T-G-CAAA-------------------------T--ATCGA----------------------------TC-TCATTTGC-A--TA-CAAAAT--A-GA-----CTTTT--GTT-ATC-TAGTTTGCA--T---tagtc
gi|18 : -GTTGACAAAATTCA--TTTTTGTC-T--AC-CTACATGTAA-ATATAA-TCTCTTC-ATGCAACTTTTTCTTCCCA--------------------------TT-AAA-TTAT-CAT-TAGTAA--AAACA-GTT-TG-TCCGACAAA----ATT-------T--A-ATTA-------TGAATTACAGAAATGA-----A--------TTTCTTCATTTTGGTA--TGCAA-------------------TAAATT--CAACAAATT---TGCTTACAAAATCCACTTATG-TTACAAAAGTCAAaa
gi|19 : AAAATT-A-ATTTTCGTC-TTAAC-CTA------A-ATATAA-TTTCTTT-ATGCGACTTTTTTTCCTTG-CAT--TGCCCA----ATT-TAA-GTTT-AAA-TTATGCA--TAGTAATTTAACA-TTTGTG-TCCAAC-AA----ATTC---------A-ATT---------------------TGA-----A--------TTTTTTCATTTTGGTA--TGCAAATT-AGTTC-AC--AAATCCAAATT--CAACTAATT---TGCAT
gi|2 : GGGCGT-C-GAATGGCGAC--T-----------GACTT-TTTT-G---------------TAA-T-----CAAAA--C-C------CATTT--------G-T-GTACA--CAAAT--TGAAGT-TCCG-T---CACA-AC-AAAATTC---------------ATTT----TA----------------TT---ATGTT--G-CTTTCA--TATATAAGCTTCATTTTT-GTA-TTGATTAGTTATACA-AA---ATTA--T-----TT-T-TCGC-GTGGACA--AAA-TTAAA--TTTT--GT-A----A--CG-AA-AA--TC-A--TTTTGT-C-ACG--ACAGA-AAGTCCATTT-T-------A---A---A-GGTTAC--CAATT-TAG-T-A-T-TCCAA---------TC-----------T--TT--GTCAAT-ATTGTA-TGCAAATAT-----C--AATCTTCA-TTGT-A--TA-CAAAATA-A-GA-----CTTTG--TTT-ATCTTAGTTTGCA--T---TA-AATAAACAAA-AG---T--------AATTA--TTA-TT-GA-CAAAGTTG-A-A--TTTGTCA--TAC-----A----A---AAG----CTGG-ACT----T---TG-----TTAACAAAACT--GAATTTG-AT-CAACAAAT-TC-AT---T-NN---NN-N-N--NNN----NNNNNNNNNN----NN-NNN-N-NN------NN--------NN-N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNN-NNN-GTT---------C-AACCAA-T-CATTT---TTGTCTTCATAATTTTTGTCAACA-AAAAT--TCA--TTTTTGTC--TC-ACAAAAGT--GAA--------TTTTGTAATGACAAAAG-------TGAA-TTTAGTCAA----CAAAAA-AT--GAAGATTTTG----------TT--A-G-ACA--AAATT-TCA----TTT-----Tcct
gi|20 : AC-AA--AA-TTGA-------TCTTG-AATCA-------CAA-ATAA--T--T-A--ATTTTGTC-ATG--CAAAA-----------------TTATC----------------------TT---TCAA----CGGA----C--GA--ATTTCG----CTTTT-TT--A-G-ACA--ACAGT-CAA----TTT-----TATTC---TTACAGAATT-AACTTTG----AAACATA------------A-----G-TGCATTTT--GT---------AA------GCTT--G---GGTTTTtgatc
gi|20 : caaaaaaacaacaacaaaacacaccccaaAA-AGT--T--------AATT---CTG-TAAGAATAAAATTG-ACT--GTTGTCT--AAAA----A----AGCGAAA----TTCG---T----C---CG-----TTG--AAAGAT--AATTTTGCAT-GACAAAAT-TA-AT---TATT---TG-T----GATTCAAGATCAA--------TT-TTG-T-tga
gi|21 : caaaaaaacaacaacaaaacacaccccaaaaaacccaagcttacaaaatgcacttatgtttcCGGGGCGC-C-AAATGG-GACCTT-G----T----GA-T---TTT-G---------------TTC-T-----CAAAA--TTC------ATTTT------T-G-T-GTGGA--CAAAA-ATGAA-T-TTTG-T---AGAA-AC-AAAA-TG---------------AGTT----CA-GGT--C-AAC-AAAATTG--ATCAT--G-AAT-CA--CA-A-AAA-TCAATGTT-------------GTCGCACA-AA---ATTA--T-----CT-T-TCA--GCtga
gi|22 : AC-AA--AA-TTGAATT---TT---GTCATGA-------CAC-A-AA--G--TGA--ATTTTGTCAATG-ACAAAAGT--GAAAAGTGAATTTCTGTTGTGACAAAAG-------TGAATTTTGGTCAA----CAAAAT-TT---A--TTTTTG----C--TC--------CACAT-AAAGT-G-A----TTT-----TG-TC--AACAAAAATT---ATTTTGT
gi|23 : GCTTACAAAATGCACTTATG-TTTC-AAAGTTAATTg
gi|23 : AA-AGT--T--------AATT---CTG-TAAGAATAAAATTG-ACT--GTTGTCT--AAAA----A----AGCGAAA----TTCG---T----C---CG-----TTG--AAAGAT--AATTTTGCAT-GACAAAAT-TA-AT---TATT---TG-T----GATTCAAGATCAA--------TT-TTG-T-ctgtaagaataaaattgactgttgtctaaaaaagcgaaattcgtccgttgaaagataattttgcatgacaaaattaattatttgtgattcaagatcaattttgttg
gi|24 : gcttacaaaatgcacttatgtttc--C-AAC-AAAATTG--ATCTT--G-AAT-CA--CA-A-ATA-TTAATTTT-------------GTCATGCA-AA---ATTA--T-----CT-T-TCA--ACGGACG--AAT-TTCGC--TTTT--TT-A--G-A--C--AACAG--TC-AA-TTTTAT-C-TTG--ACAGA-A--TTAACTT-TTGA----A---ACATA-AGT-----GCATT-TTG-Ttg
gi|25 : cttAAAATTTA-ATTTTT-TC-T--ACGCTA------AGATATAA-TTTCTTT-GTGCA--TTTTTTTTTCCG-CAT--TGCCAA----ATT-TAAGGTTT-AAA-TCAT-CAT-TAGTGA--AAACATTTT-TGTTCCAA-ACA----ATTT------C--AGATTA-------
gi|26 : CGACAAA----ATT-------T--A-ATTATGAATTGC-----------AGAACTGA-A--------TTTCTTCATTTTGGTA--TACAAATT-AGCTT-ACAAAAATCTAAATT--CAACAAATT---TACTTCCAAAATCCACTTGTG-TTACAAAAGTTAATtgatt
gi|27 : tAGTGAATTT---TG-TCA--AC-AAA-AATGA--ATCTTGCCAGTCGACAAAATTCA--TTTTTGTT-T--AT-CTA------A-ATATTA-TCTCTTC-ATGCAAC---TTTTTCCC--CAT--TGCCTA----ATT-TAA-G-TT-AAA-
gi|28 : GTC-T--AC-CAA------A-ATATAA-TTTCTTT-ATGCAAATTTTTT---CCG-CGT--TGCCAA----ATT-TAA-GTTT-GAA-TTAT-CAT-TAGTAA--AAATA-TTT-TG-TCCAACAAA----ATTC---------A-ATTA-------
gi|29 : -C-AAATGG-GAC--T-TGG--T----GA-T--TTTT-G---------------TTC-C-----CAAGAATT-CG-----AATTTACCTTAT-G-T-GGATT--CAAAA--TGAA-TCTTTG-C---TTCA-AC-AAAAATG---------------AGCT----CA-Gtgaat
gi|3 : tagatgaacctagA--ACAGT-GAA----TTT-----TGTT------AAAAATTT-TAACTTGTC-ATGACAAA----------------T-T-TC-ATTTTTGGTCTTC--A-CAA------AGT---G---AATTTTGTCA---CA-AAAGAG----TA--CAA---------AA-A-TGA--AA--TTTT-GTTGACAAAATTCA-CTTTT-GTCAT--AC-TTTT-----A-ATATAAATCTCTTC-AAGCAACTATTTTT--CCA-AAT--TGCCTA----ATT-GAA-GTTT-AAAATTAT-CAT-TAGTAA--AAACA-GTT--G-TCCGACAAA----ATTTAATTTATGAA-ATTA-------C-----------AGAACTTGAA--------TTTCTTCATTT-GGTAAATGCAAATTTAGTTT-ACAAAAATCTAAATT--CA-C--ATT---TGC-TACAAAATCCACTTATG-TTACAAAA-TTAATT
gi|3 : ctagataacagatgtaataaaaGGGGCGC-C-AAATGG--AC--T-C----TTTGTGA-T---TTT-G---------------TTC-T-----CAAAAATT-C------ATTTT------T-GCT-GTGAA--CAAAA-ATGAA-T-TTTG-T----ACA-AC-AAAAATG---------------AGTT----CA-GGTAACAACC-AAAATC---GTCAT--GAATT-TA--CA-A-AAA-TTAATTT--------------GTCTTACA-AA---AATA--TCAC--TT-TGTCA----TGACA--AAA-TTCACTTTTTT--GT-A--G-A--C--AACAG--TC-AA-TTTTGT-CTTTG--ACAGA-A--TT-AATT-TTGT----A---ACATA-AGT-----GGATT-TTG-----T-AGCAAA---------TGTG-A-----AT--TT--A--GAT-TTT----TGTAA--AC-----T--AA-----ATTTGC-ATTTA-CCAAATGAA-GA-----AATTCAAGTT-CTG-TAATTT-CA------TA-AAT----------T--A--------AATT---TTG-TCGGA-C--AACTG--TT--TTTACTAATGATA----ATTTTA---AAC----TTCA-A-T----T---AGGCAATTTG-GAAAAAT--AG--TTGCTT-GAAGAGAT-TT-AT--------------------------ATTAAAAG---------------T------AT--------GA-C-AAA-AGT-GAATTTTGTCA--ACAAAA--TTTCATTTTTGT-------------A-CTCTTTT-GTGAC-AA--AA-T----TC---ACTTTGTGAAGA-------CCA-A-AA--A--TGA--AATTTGTC-ATG-AC--AAGTTAAAA--------TTTT----TAACAAAActgtcaaagacaaaattgactgttgtctacaaaaaagtgaattttgtcatgacaaagtgatatttttgtaagacaaattaatttttgtaaattcatgacgattttggttgttacctgaactcatttttgttgtacaaaattcatttttgttcacagcaaaaatgaatttttgagaacaaaatcacaaagagtccatttggcgcccc
gi|30 : ctagataacagatgtaataaaaaacagtgaaA-------CAA-A-AG--T---GA--ATTTTGTC-ATG-AGAAAAGT--TAA--------TTTTGTCA--ACAAAAATGATTCCTGAG-TTTGTCCAAAACTTAAAATCTCTAGA--ATTTT
gi|30 : atg-ACAAAAGT--GAA--------TTTTGTCATGAGAAAAG-------TTAA-TTTTGTCAA----CAAAA
gi|31 : atgaaaattctagagattttaagttttggacaaactcaggaatcatT---ATGTT--G-CTT-CATACA-ATAAT-TTCA-TTTTTATA-TTG---------ACA-AA---ATCT--T-----TT-T-TCA--GTGGACA--AAG--TGAA--TTTT--GTCAT-G-A--CG-AA-AG--TT-AA-
gi|32 : ttagCGGGGAGC-C-AAATGG-GAC--TAT----T----GT-TA-TTTT-G---------------TTC-T-----CAAAA--T-TCAGATGAATTT------T-G-T-ACA-A--CAGAA-A-GGC-T-TTC
gi|33 : atctCGGGGAGC-C-AAATGG-GAC--TAT----T----GT-TA-TTTTGG---------------TTC-T-----CAAAA--T-TCATGTGAATTT------T-G-T-ATA-A--CAGAA-A-GGC-T-TTCt
gi|4 : atctCGGGGCGCTC-AAATGG-GCC--T-CGTG-T----GA-T---TTT-G---------------T-C-T-----CAAAA--TTC------CATTT------T-G-T-CTACAGACAAAA-AT-AA-T-TTTT-T---GGTACAC-AAAA-TG---------------AGTT----CA-GGT--C-AAC-AAAATTCGGATCAT--G-AAT-TA--CA-A-AAA-TTAATTTT-------------GTCTTAC--AA---ATTAACT-----TT-TGTCA----TGACA--AAATTTCAAC-TTTT--GT-A--G-A--T--AA-AGCTTC-AA--TTTGT-C-TTG--ACATA-A---TGACTTCTTGT----AC--ACATA-AGT-----GGATT-TTG-TAA---GACAA-------------------------------------TTGTG-TG--AAT-T-----T--A--------TTGC-A--TA-CAAATG--A-GAACATTCTTCT--GTA-ATC--------------------AT-AAT------T--A--------AATT---TTG-TCGGA-C--AACTG-TTT--TTTACTA---ATG----A----T---AAT----TT-A-A------------------TGGGAAGTAA--AAAGTTGCAT-GAAGAGAT-TA-ATAACT-TTACATG-T-AAGGGTA---GATCAAAAATGAAATT-TTG-T-C--------T--------AA-CAAAATCTTCATTTTTTGT--TGACTAAA--TTCAC-TTTTGTCATTACAAAATTCA-CTTTTGT-GAGACAAA--AA-T-GAA-----TTTTTGT--TGA-------CAA-A-AA--TTATGA--A----------G-ACAAAAAT--GA
gi|5 : -AAA-A-TGA--AT--T-TT-GTCCACAAAATT-A-ATTTTCGTC-T--AC-CTT------A-ATATAA-TCTCTTT-AGGCAACTTTTTT---CCGTCAT--TGTTCA----ATT-TAA-GTTT-AAA-TTAT-CAT-TAGTAA--AAACA-TTT-TG-TCCAACAAATTCAATTA------TG-A-ATTA-------C-----------ATAAC----AGATT----TTTTTTCATTTTGGTA--TGCAAATT-AGTTT-ACAAAAATCCAAATT--CAACTAATT---TCCATACAAAATCCAATTATG-TTACAAAAGTTAATTttggtt
gi|6 : acaGGGCGC-C-AATTGG-GAC--T------T----GA-TC-TTTT------------------TG-T--------AA--T-C------GA--------------------------A-ATCAA-T-TTTG-TGTACATA-A---AAAGT--------------------------------------AAAAT-------CT--G---T-CA--CA-ACAAA-ATAATTTTT------------GTCTAACA-AATATATTA--TACTTGTT-T-T----------A--TAA-CTTCA--TTTTTTGT-AATG-A--C--AA-AA--CC-AAATTTTGC-T-AC---ACAAA-A--TT-ATAT-TT-C----A---A---A-AGT-----CA-TT-TTGATCT-T-TACAAAA------TC-----A-----AT--TTTTGTCAAT-AAGGTA-TGCAAATACATGTAT--AAAC-TTATCTGT-A--TC-CAAAAT--T-GA-----CTTTT--GTT-ACC-TAATTTGCAAAT---TA-AAT-CACAA---GT--T--------AATT---TGG-TGAGA-CAAAAATA-AAT--GTTGTCAT-GACA----A----A---AGTGACCTTCG---T----C---CG-----CT-CGATAA-T--AATTTTATGT-AACAAAAT-TT-AC---T-TT---TG-TGA--TAT----GTTGTAAAAT----TTGTTAAT-CTGAACTCATTTTTGTTGAA-C-AAA--CTC-ACCTTTGTCAACGCGAAA--TTGGA-TTTCA--AGTACAAAA-TCA-Cctgtccagaaaacatcatggtttcaaggttatgtaaaaaatactaacactttccactttctgaacagtttttgtaaatctttgaatattgacttgagttatattctgaaaacaaatgtatttaatctgatcaatcatgaaatgctgttatcatttccatcgttttacagagaagcaattatatttttcatggacggtaagaaaattgagaaattgtgtgacttgtcctcaaactcttttcttcgacaaac
gi|7 : GGACA--AAA-TTAAA--TTTT--GT-A--T-A--C--GA-AA--TC-AAATTTTGTTC-ACG--ACAAA-A--TCCATTT-TT----------A---A-GGCATTACCAATT-T-----A-T-------A------TTC----A-----ATCTTT--GTCAATATATGTA-TGCAAATAT-----C--AATCTTCA-TTGT-A--TA-CAAAAT--A-GA-----CTTTG--TTT-ATCTTAGTTTG-A--T---TA-AATAAACAAA-AG---T--------AATT---aagaacctcactagtgtcc
gi|7 : A--ACTAAA-ACTGA--AT--TGTT-GTCAAC-CAATTCT-ATTTTTGTC-T--atttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaactaaaactgaattgttgtcaaccaattctatttttgtctcattaatttttgtcaacaaaaattcatttttgtctctcacaaaagtgaattttgtaatgacaaaagtgaatttagtcaagcaaaaaatgaagattttgttgacaaaattcatttttgttc
gi|7 : ggacaaaattaaattttgtatacgaaatcaaattttgttcacgacaaaatccatttttaaggcattaccaatttatattcaatctttgtcaatatatgtatgcaaatatcaatcttcattgtatacaaaatagactttgtttatcttagtttgattaaataaacaaaagtaattatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntAA----TTC-----TATTTTTGTCTCA--TTA-ATTTTTGTC-A--ACAAA------------AATTC-A-T---TTTT--GTCT-CTCA-CAA------AAGT--G---AATTTTGTAATGACA-AAAGTGAATTTAGTCAAGCA--A--AAA-A-TGAAGAT--T-TT-GTTGACAAAATTC--ATTTTTGTcattaatttttgtcaacaaaaattcatttttgtctctcacaaaagtgaattttgtaatgacaaaagtgaatttagtcaagcaaaaaatgaagattttgttgacaaaattcatttttgttc
gi|8 : ggacaaaattaaattttgtatacgaaatcaaattttgttcacgacaaaatccatttttaaggcattaccaatttatattcaatctttgtcaatatatgtatgcaaatatcaatcttcattgtatacaaaatagactttgtttatcttagtttgattaaataaacaaaagtaattatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaactaaaactgaattgttgtcaaccTT-GTCCACAAAATT-A-ATTTTCGTC-T--AC-CTT------A-ATATAA-TCTCTTT-AGGCAACTTTTTT---CCG-CAT--TGTTCA----ATT-TAA-GTTT-AAA-TTAT-CAT-TAGTAA--AAACA-TTT-TG-TCCAACAAATTCAATTA------TG-A-ATTA-------C-----------ATAAC----AGATT----TTTTTTCATTTTGGTA--TGCAAATT-AGTTT-ACAAAAATCCAAATT--CAACTAATT---TCCATACAAAATCCAATTATG-TTACAAAAGTTAATTtc
gi|9 : ttGGGCGC-CCAAATGG-GAC--T-C----T----TG-TG-ATTT-GC--------------TTC-T-----CAAAA--TTC------ATTTT------T-G-T-GTGGA--CAAAA-ATGAA-T-TTTG-T----AGA-AC-AAAAATG---------------AGTT----CA-GGT--C-AAC-AAAATTG--ATCAT--G-AAT-CA--CA-A-AAA-TTAATTTT-------------GTCGCACA-AA---ATTA--T-----CT-T-TCA--GCAGACA--AAA-T---------------------------------TC-AC-TTTTGT-C-ATG--ACAAATA--TTCACTT-TTGTATACA---A---A-AGT-----CAATT-TTG-TCT-G-GACAGAATTAACTTTTGT--AACAT-AT--TT--G--GAT-TTTGTA-TGCAA--AT-----T--AGTT-GAATTTG------------------GA-----TTTTT--GTGAAAC-TAA-TTGCA--TACCAA-AAT-GAAAAA-AAT--TCATAATTGAATT---TTG-TTGGA-CAAA--TG--TT--TTTA-CAATGATAATTTA----A---AAC----TTAA-A-T----TGGGCA-----ATGCGGAAAA---AAGGTTGCATAAAAGAAAT-TATAT---T-TA---GG-T-A--GAC----G---AAAAATTAA-TT-TTG-T-GG------AC--------AA---AATTAAT---TTTTTGTctgtccagaaaacatcatggtttcaaggttatgtaaaaaatactaacactttccactttctgaacagtttttgtaaatctttgaatattgacttgagttatattctgaaaacaaatgtatttaatctgatcaatcatgaaatgctgttatcatttccatcgttttacagagaagcaattatatttttcatggacggtaagaaaattgagaaattgtgtgacttgtcctcaaactcttttcttcgacaaac
gi|9 : CA--A--AAA-A-TTA--AT--T-TT-GTCCACAAAATTAA-TTTTTCGTC-T--AC-CTA------A-ATATAA-TTTCTTTTATGCAACCTTTTTT--CCG-CAT--TGCCCA----ATT-TAA-GTTTTAAA-TTAT-CAT-T-GTAA--AAACA-TTT--G-TCCAACAAA----ATTC---------A-ATTA--------------------TGAA----T--------TTTTTTCATTTTGGTA--TGC-AATT-AGTTTCACAAAAATCCAAATT--CAACTAATT---TGCATACAAAATCCAAATATG-TTACAAAAGTTAATTg
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 33333333333 11 1111111111111111111111111 33333333333 1111 22222222222222222 111111 11 7777777777777 11111 444444444444444444444444444444444 333333333333333 111111 77777777777777777777777777777777777777777777 11111111111111111111 111 44444444444444444444444 111 11111 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 11 11 33333333333333 1 111 333333333 111 22222222 2222222 1111 88888888888888888888888888888888888 1111 11111 33333 111 111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 222222222222 1 11 1111 111111 111 1111 88888888888888888888888888888888888888888888888888888
lowQualScore : 2 33 0 2 33 88888888888 2 66 4 8888888888888888888888888 33333333333 0 99999999 2 2 2 7 33 999 4 2 2 7777 1 2 6 00000000000000000 1 66 33 333 111111 33 1 4 555 2 2 2 44 77 6666666666666 1 2 333 33 11111 2 4 88888 33 2 000000000000000000000000000000000 2 6 2 444444 4 33 3 33 2 333333333333333 000000 2 44444444444444444444444444444444444444444444 555 2 33333333333333333333 55 33 2 7777 77777 44 3 3 3 0 44 555 3 55555555555555555555555 111 5 4 3 77777 66 5 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 2 00 3 11 1 6 44444444444444 99 3 6 555 6 6 6 111111111 888 0 77 77 1 111 5 66 00000000 888 1111111 6 1 4444 44444444444444444444444444444444444 6 1 2222 44444 22222 6 1 333 000 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 0 0 8 1 666666666666 5 1 33 5 5 9999 0 5555 8 4 55 4 555555 8 4 111 77 55 2 8888 4 4 4 4 4 66 8 4 4 7777 99999999999999999999999999999999999999999999999999999 0 66 5 00 66 0 6 888 0 6 4 5
lowQualScore : . .. . . .. ........... . .. . ......................... ........... . ........ . . . . .. ... . . . .... . . . ................. . .. .. ... ...... .. . . ... . . . .. .. ............. . . ... .. ..... . . ..... .. . ................................. . . . ...... . .. . .. . ............... ...... . ............................................ ... . .................... .. .. . .... ..... .. . . . . .. ... . ....................... ... . . . ..... .. . ....................................................................................................................................................................... . .. . .. . . .............. .. . . ... . . . ......... ... . .. .. . ... . .. ........ ... ....... . . .... ................................... . . .... ..... ..... . . ... ... .......................................................... . . . . ............ . . .. . . .... . .... . . .. . ...... . . ... .. .. . .... . . . . . .. . . . .... ..................................................... . .. . .. .. . . ... . . . .
lowQualScore : 5 55 6 5 44 00000000000 5 33 7 8888888888888888888888888 88888888888 9 99999999 2 2 2 5 11 111 4 2 5 2222 0 5 8 66666666666666666 4 11 11 999 555555 11 0 4 222 2 1 1 11 22 6666666666666 8 2 999 11 77777 2 4 66666 11 2 999999999999999999999999999999999 2 7 4 222222 7 22 9 00 4 777777777777777 999999 4 99999999999999999999999999999999999999999999 999 9 11111111111111111111 22 99 9 9999 77777 22 1 1 1 4 22 000 3 99999999999999999999999 000 0 2 2 88888 99 4 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 2 22 6 00 0 7 00000000000000 22 3 7 444 7 7 7 888888888 000 1 99 99 7 333 0 99 77777777 000 7777777 7 0 2222 00000000000000000000000000000000000 7 4 1111 33333 00000 6 4 999 888 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 8 8 0 7 333333333333 7 4 66 0 0 4444 1 2222 9 0 55 0 555555 0 0 999 22 55 3 5555 0 0 0 4 4 11 9 4 4 0000 77777777777777777777777777777777777777777777777777777 1 99 0 44 99 1 9 888 2 9 3 7
consensus : CGGGGCGC-C-GAATGG-GAC--T-C----T----GA-TC-TTTT-G-------------TTC-T-------CAAAA--T-C------AATTT------T-G-T-G-TANA--CAAAA-ATGAA-T-TTCG-T---CANA-ACAAAAAT-G---------------AGTTCAGGT--C---A----A-CAAAATT--GATCNT-G-AAT-CAC-A-A-TAAN-TTAATTTTT-GTA-TTG---AGTCGTACA-AA---ATTA--T-----CT-T-TCA--GCGGACA--AAA-TTCAN--TTTT--GT-A--G-A--C--AA-AG--TC-AA-TTTTGT-C-ACG--ACAAA-A--TTCACTT-TTGT----A---A---A-AGT-----CAATT-TTG-TCA-T-GACAAAA------TTCGT--A-----AT--TT--GTCGAT-TNTGTA-TGCAAATAT-----T--AATC-T-CATTTGC-A--TA-CAAAAT--A-GA-----CTTTT--GTT-ATC-T-AGTTTGC--AT---TA-AAT-AAN-AAA-AGT--N--------AATT---TTG-TCGGACAAAATTG-ATT--TTTACCA--GATA----A----AAA----CTTCG-A-T----C---CG-----TTGCGGAAAAT--AAGTTTGCAT-GAAGAA----AT-TATAT---T-TN---NG-T-A---GACGATCAAAAAT----TT-TT-GT-CT------AT--------AA-C-AAATANTCGANTTTTGTCATGACGAAA--TTNAA-TTTCGTCANTA-------CAA--AA-TCA-CTTTTGT-GTGAC-AA-AA-T-GAATT---TTTTTGTCATGACAAAAAT--TGA--ATTTTGTC-ATG-ACAAAAGT--GAA--------TTTTGTCATGACAAAAG-------TGAA-TTTGNTCAA----CAAAAT-TC--GANTTTTG----CTC-TT--A-GCACA--AAAGT-GAA----TTT-----TGTTN--GTCACAAATTN-AATTTTGTC-ANGACAAA------------AA--C-G-TGATTTT--GTCT-C--A-CAA------AATT--G---AATTTTGTCATGACA-AAAGTGAATTTA--CGATCA--ACAAA-A-TGA--A-TT-TTG----TCGACAAAATTCA-ATTTTCGTC-T--AC-CTA------A-ATATAA-TCTCTTCATGCAACTTTTTTTTCCCG-CAT--TGCCCA----ATT-TAA-GTTTAAA-TTAT-CAT-TAGTAA--AAACA-TTT-TG-TCCGACAAA----ATTN------T--A-ATTA-------C-----------ATAAC----AG-------TTTCTTCATTTTGGTA--TGCAAATT-AGTTTACAAAAATCCAAATT--CAACNAATT---TGCNTACAAAATCCACTTATG-TTACAAAAGTTAATT
Reference ( family-5289 ) : CGGGGCGC-C-GAATGG-GAC--T-C----T----GA-TC-TTTT-G-------------TTC-T-------CAAAA--T-C------AATTT------T-G-T-G-TANA--CAAAA-ATGAA-T-TTCG-T---CANA-ACAAAANT-G---------------AGTTCAGGT--C---A----A-CAAAATT--GATCNT-G-ANT-CAC-A-A-TAAN-TTAATTTTT-GTA-TTGA--AGTCGTACA-AA---ATTA--T-----TT-T-TCA--GCGGACA--AAA-TTNAA--TTTT--GT-A--G-A--C--AA-AG--TC-AA-TTTTGT-C-ACG--ACAAA-A--TTCACTT-TTGT----A---A---A-AGT-----CAATT-TTG-TCA-T-GACAAAA------TTCGT--A-----AT--TT--GTCGAT-TNTGTA-TGCAAATAT-----T--AATC-T-CATTTGC-A--TA-CAAAAT--A-GA-----CTTTT--GTT-ATC-T-AGTTTGC--AT---TA-AAT-AAN-AAA-AGT--T--------AATT---TTG-TCGGACAAAATTG-ATT--TTTGCCA--GATA----A----AAA----NTTCG-A-T----C---CG-----TTGCGAAAAAT--AANTTTGCAT-GAAGAA----AT-TA-AT---T-TT---TG-T-A---GACGATCAAAAAT----TT-TT-GT-CT------AT--------AA-C-AAATANTCGANTTTTGTCATGACGAAA--TTNAA-TTTCGTCANTA-------CAA--AA-TCA-CTTTTGT-GTGAC-AA-AA-T-GAATT---TTTTTGTCATGACAAAAAT--TGA--ATTTTGTC-ATG-ACAAAAGT--GAA--------TTTTGTCATGACAAAAG-------TGAA-TTTGNTCAA----CAAAAT-TC--GAATTTTG----CTC-TT--A-GCACA--AAAGT-GAA----TTT-----TGTTC--GTCACAAATTN-AATTTTGTC-ANGACAAA------------AA--C-G-TGATTTT--GTCT-C--A-CAA------AATT--G---AATTTTGTCATGACA-AAAGTGAATTTA--CGATCA--ACAAA-A-TGA--A-TT-TTG----TCGACAAAATTCA-ATTTTCGTC-T--AC-CTA------A-ATATAA-TCTCTTTATGCAACTTTTTTTTCCCG-CAT--TGCCCA----ATT-TAA-GTTTAAA-TTAT-CAT-TAGTAA--AAACA-TTT-TG-TCCAACAAA----ATTC------T--A-ATTA-------C-----------ATGAC----A--------TTTTTTCATTTTGGTA--TGCAAATT-AGTTTACAAAAATCCAAATT--CAACTAATT---TGCATACAAAATCCACTTATG-TTACAAAAGTTAATT
gi|1 : CGGGGCGC-C-GATTGG-GAC--T------T----GA-TC-TTTT-G-------------CTAAT-------CAAAA--C-C------AATTT--------G-T-G-TACA--CTAAA-A-GAA-T-TCCG-T---CATA-ACAA----------------------GTTCATTT--CTTGAC---A-CAAAAAG--TATGTT-G-CTT-CAT-A-A-TAAC-TTCATTTTTTGTA-TTGATAAGTTGTACA-AA---ATTA--GA----TT-T-TCA--GTTGACACAAAA-TTGAA--TATT--GT-A--G-AACCTGAA-AC--TT-AACTTTTGT-C-ACG--ACAAA-A--TTCATTT-TTGT----A---A---ATAAT-----CAATTATTG-TCAAT-GACAAAA------TTGGT--A-----AT--TT--GTCAAT-TATGTAGTGCAAATAT-----TTTGATC-T-CATTTGC-A--TA-CAAAAT--A-AA-----CTTTT--GTT-ATC-T-TGTTTGC--AT---TA-AAT-AAG-AAA-AGT--A--------AATT---TTG-TGAGACAAAATTGAATTCATTTGTCA--GACA----A----AAA----GTTTGCA-T----C---TG-----TTATGTAAAATTGAATTTTTCAT-GACAAA----GTGTA-AT---TCTT---TGTT-A---GGTGATCAAAGGT----TC-TT-GTCCT------AT--------GACC-AAATAGTCGAATTTTGTCATGATAAAAGGTTGAA-TTTCGTTTATA-------CAA--AA-TGATCTTCTGTCATGAC-AA-AACT-GAATT---TTTTTGTCATGACAAAAAT--TGAAGATTTTGTC-ATGAACAAAA-T--GAA--------TGTTGTCATGACAGAAG-------TGAA-TTTGTCCAA----CAAAAT-TC--GA--TTTG----TTCGTTCAA-GCACA--AAAGTGGAA----TTT-----TGTTCT-GTCACAAATGG-AATTTTGTCAAGGACGAG------------AA--CAG-TGATTTT--ATC--C--ACCAA------AATTTCG---ATTTTTGTCTTCACACCAAGTGAATTTA--CGATCA--ACAAA-A-TGAG-G-TTGTTG----TCCAGTAAATT---ATTTT-GTC-T---C-CTA------ACATATAA-TTTCTTATTGC-ACTTTTTTTTCCCG-CATTGTGCCCATTCCATTCTAA-GTTTAAA-TTAT-CATCTAGT-A--AAACA-TTT-TG-TCCACCAAA----ATTCT-----T--A-ATTA-------C-----------ATGAT----G--------GTTTTCAATTTGGGTA--TGC-AATT-A-TTTACATAAAT-CAAATTAACACCTATTTTCATATATACAAATTCCA-TAATGTTTACAAAAGTTAATT
gi|10 : GGGGCGC-C-AAATGG-GAC--T-C----TTGT-GA-T---TTT-G-------------TTC-T-------CAAAAT-T-C------ATTTT------T-G-T-G-TGGA--CAAAA-ATGAA-T-TTTG-T----AGA-ACAAAAAT-G---------------AGTTCAGGT--C---A----A-CAAAATT--GATCAT-G-AAT-CAC-A-A--AAA-TTAATTTT-------------GTCGCACA-AA---ATTA--T-----CT-T-TCA--GCAGACA--AAA-T---------------------------------TC-AC-TTTTGT-C-ATG--ACAAATA--TTCACTT-TTGTATACA---A---A-AGT-----CAATT-TTG-TCT-G-GAAAAGATTAAT-TTTGT--AACTATAT--TT--G--GAT-TTTGTA-TGCAA--AT-----T--AG--------TTGA-A--T-------T--G-GA-----TTTTT--GTG-AAC-T-AATTTGC--ATACCAA-AAT-GAA-AAA-AAT--TCATAATTGAATT---TTG-TTGGACAAAAT---GTT--TTTACTAATGATAATTTA----AAA----CTTAA-A-TTGGGC---AA-----TCGCGGAAAA---AGGTTGGCAT-AAAGAA----AT-TATAT---T-TA---GG-T-A---GA-----GAAAAT----TT-
gi|11 : tctGGCGC-C-AAATGG-GAC--T-C----TTGT-GA-TT-TTGA-G-------------TTC-T-------CAAAA--T-T------CATTT------TAG-T-G-TGGA--CAAAA-ATGAA-T-TTTG-T----AGA-ACAAAAAT-G---------------AATTCAGGT--C---A----G-CAAAATT--GATCAT-G-AAT-CAC-A-A--AAA-TTTATTTTT-G-------------GCACA-AA---ATTA--T-----CT-T-TCA--GCAGACA--AAA-T---------------------------------TC-AC-TTTTGT-C-ATG--ACAAA-A--TTCACTT-TTGTAGACA---A---A-AGT-----CAATT-TTG-TCT-G-GACAGAAATAACTTTTGT--AACAT-AT--TT--G--GAT-TTTGTA-TGCAA--AT-----T--AGTT-G-AATTTG------------------GA-----TTTTT--GTA-AAC-T-AATTTGC--ATAC-CAGAATGAAA-AAA-AATCAT--------AATTGAATTGTTTGGACAAAAT---GTT--TTTAC----GATA----ATTT-AAA----CTTAA-A-T----TGGGCA-----ACGCGGAAAA---AAG-TTGCAT-AAAGAA----AT-TATAT---T-TA---GG-T-A---GACA---AAAAAT----T
gi|12 : aaattACA--AATGT-AAA----TTT-----TGTGA--G--ACAAATTTGAATTTTGTC-ATGA-AAA------------AA----G-TGAAT------------------------AGT--G---AATTGTGTCATGACA-AAAATGAATT-A--TG-TCATGATAAA-AGTGA--A-TT-TTG----TTGAAAAAATTCATATTT--GTC-T--AC-CTA------A-ATCTAA-TCTCTTCACGCAA---TTTTTTCCC---AT--TGTCTA----ATT-GAA-GTTAAAA-TTAA-CAT-TAGTAA--AAAAAACTT-TG-TCCCACAAA----ATTG---------A-ATTA-------TGA---------ATAAC----AGTACTGAATTTCTTCATTTTGGTA--TGCATAAT-AGTTTACAAAAATCTAAATT--CAACAACTT---TGCTTAC-AAATCCACTTATG-CTACAAAAGTTAATT
gi|12 : atgtagtttgcattagataAA-TTTC-TCATGA-------CAA--AACTCA-CATTTGT-A-GAC-AACAA-T-CAATTGCATGTATGTTTTGACAGAA-T--TAA--CTTTTGT----A-GCATAAGT--GGA--------TTT-GT--------AAG-------CAAA-GTTGTTGAA----T----T-TA--GATTTTTGTAAACTA-TT--ATGCATACCAAAAT-GAAGAAATTCAGTACTGTTA--TTCATAA-TTC-AATTTTGT--GGGACAAAGTTTTTTTTACTAA--T-GTTAATTTT--AACT-T----CAATTAGACAATG--GGAAAAAATTG-CGTGAAG-AGATTAGATTTA---GGTAG--ACAAATA-TGA--A-TT-TTT----TCAACAAAATTCA-CTTTTctgtcaaaacatacatgcaattgattgttgtctacaaatgtgagttttgtcatgagaaatt
gi|13 : atgtagtttgcattagataacaaatgtaaattttgtgagacaaatttgaattttgtcatgaaaaaagtgaatagtgaattgtgtcatgacaaaaatgaattatgtcatgatCGGGGCGC-C-GATTGG-GAC--T------T----GA-TCCTTTT-GCAATCAAAACCAATTT-TGTGTACACAAAA--T-AG-----AATTC------C-G-TCA-TA-A--CAAAA-TTCAA-T-TTTG-T---CACA--CAAAAGT-GTGCTGCTTCGTAATAACTTCATAN--N---N----N-NNNNNNN--NNNNNN-N-NNN-NNN-N-A-TAAC-TTCATATTT-GTA-TTGATAAGTTATACA-AA---ATTA--T-----TT-T-TCATTNNNNNNN--NNN-NNNNN--NNNN--NN-N--N-N--N--NN-NN--NN-NN-NNNNNN-N-NNN--NNNNN-N--NNNNNNN-NNNN----N---N---N-NNN-----NNNNN-NNN-NNN-N-NNNNNNN------NNNNN--N-----NN--NN--NNNNAT-TATGTA-TGCAAATAT-----C--AATC-T-CATTTGC-A--TA-CAAAAT--A-GA-----CTTTT--GTT-ATC-T-AGTTTGC--AT---TA-AAT-
gi|14 : taCGGGGCGC-C-GA-TTG-GAC--T------T----GA-TC-TTTT-G-------------TAA-T-------CCAAA------------ATTT------T-G-T---TACA--CAAAATACGAA-T-TTCGGT---CATA-AAAAAATT-C---------------TTTTT-TGT--C---ACACCA-TAGAAGT--AATGATTG-ACTTCAT-A-A-TAAA-TCA-TTTTT-GTAATTGA--AAATATATACAA---ATTA--T-----TTCT-TCA--GAG--CT--AAA-TTGAA--TTTC--------------------------------TGT-A-ACG--ACAAA-A--ATCCATT-TTGT----A---A--------------------TGCTCA-TTGACAAAA------TTCAT--------TT--TT--GTCAATCTATGTA-TGTCAATAT-----C--AATC-T-C-TTTGCAA--TA-CAAAAT--AGGA-----CTGTT--TTT-ATC-T-AA-TTGC--AT---TA-TA--AAC-AAACAGTA-A--------AATT---TT
gi|15 : GC-C-GATTGG-GAC--T------T----GA-TC-TTTTTG-------------TAA-T-------CAAAA--C-C------AATTT------T-G-T-G-TACA--CAAAT-A-GAA-T-TCCG-T---CGTA-ACAAAATT-C---------------ATTTT-TGT--C---AC---A-CAAAAGT---ATGTT-G-CTT-CAT-A-A-TAAC-TTCATTTTT-GTA-TTGATAAGTTATACA-AA---ATTA--T-----TT-T-TCA--GTTGACA--AAA-TT---------------------------------C-AA-TTTTGT-C-ACA--ACAAA-A--TCCA-TT-TTGT----AGATA---A-ACT-----CAATT-TTG-TCA-T-GACAAAA------TTC----A-----AT--TTT-GTCAAT-TATGTA-TGCAAATAT-----C--AATC-T-CATTTGC-A--TA-CAAAAT--A-GA-----CTTTT--GTT-ATC-T-AGTTTGC--AT---TA-AA
gi|16 : tGGCGC-C-AAATGG--AC--T-CCTTGT----GA-T--TTTT-G-------------TCT-TG------CAAAA--TTC------ATTTT------T-G-T-G-TCGA--CAAAA-ATGAA-T-TTTG-T----AGA-ACAAAAATTG---------------AGTTCAGGT--C---A----A-CAAAATT--GATCATGG-AAT-CAC-A-A-AAAT-TTAATTTCT------------GTCGCACA-AA---A-TA--T-----CT-T-ACA--GCAGACA--AAA-TTCAC--TATT--GT-A--GAA--C--AA-AG--TC-AA-TTTTGT-C-TGG--ACAGA-A--TTAAC-T-TTGT----A---AC--ATATT-----GGATT-TTG-T-A-T-TGC-ATA------TTAGTTGA-----A---TT--G--GAT-TTT------------T-----T--AAAC-T-AATTTGC-A--TACCAAAAT--
gi|17 : ttc-T-------CAAAA----C------AATTT--------G-T-G-TACA--CAAAATAGAAA-T-TCCG-T---CATA-ACAAAATT-C---------------ATTTT-TGT--C---A----AACAAAAGT---ATGTT-G-CTT-CCC-A-A-TAAC-TTA-TTTTT-GTA-TTGATAAGTTGTACA-AA---ATTA--T-----TT-T-TCA--GTTGACA--AAA-TCCAT--TTTT--GT-A--G-A--T--AA-AC--TTAAA-TTTTGT-C-ATGAAACAAA-A--TTCATTT--------------------GT-----CAATT-ATG-T-A-T-G-CAAA-------------------------T--ATCGA----------------------------TC-T-CATTTGC-A--TA-CAAAAT--A-GA-----CTTTT--GTT-ATC-T-AGTTTGC--AT---tagtc
gi|18 : ttttgtgaaG----TTGACAAAATTCA--TTTTTGTC-T--AC-CTACATGTAA-ATATAA-TCTCTTCATGCAACTTTTTCTTCCCA--------------------------TTAAA-TTAT-CAT-TAGTAA--AAACA-GTT-TG-TCCGACAAA----ATT-------T--A-ATTA-------TGAATTACAGAAATGA-----A--------TTTCTTCATTTTGGTA--TGCAA------------------TAAATT--CAACAAATT---TGCTTACAAAATCCACTTATG-TTACAAAAGTCAAaa
gi|19 : AAAATT-A-ATTTTCGTC-TTAAC-CTA------A-ATATAA-TTTCTTTATGCGACTTTTTTTCCTTG-CAT--TGCCCA----ATT-TAA-GTTTAAA-TTATGCA--TAGTAATTTAACA-TTTGTG-TCCAAC-AA----ATTC---------A-ATT---------------------TGA-----A--------TTTTTTCATTTTGGTA--TGCAAATT-AGTTCAC--AAATCCAAATT--CAACTAATT---TGCAT
gi|2 : GGGCGT-C-GAATGGCGAC--T-----------GACTT-TTTT-G-------------TAA-T-------CAAAA--C-C------CATTT--------G-T-G-TACA--CAAAT--TGAAGT-TCCG-T---CACA-ACAAAATT-C---------------ATTTTA--T--T---A----T-----GTT--G--CTT-----T-CAT-ATA-TAAGCTTCATTTTT-GTA-TTGATTAGTTATACA-AA---ATTA--T-----TT-T-TCGC-GTGGACA--AAA-TTAAA--TTTT--GT-A----A--CG-AA-AA--TC-A--TTTTGT-C-ACG--ACAGA-AAGTCCATTT-T-------A---A---A-GGTTAC--CAATT-TAG-T-A-T-TCCAA---------TC-----------T--TT--GTCAAT-ATTGTA-TGCAAATAT-----C--AATC-TTCATT-GT-A--TA-CAAAAT--AAGA-----CTTTG--TTT-ATC-TTAGTTTGC--AT---TA-AAT-AAACAAA-AGT-----------AATTA--TTA-TTG-ACAAAGTTG-AAT--TT-GTCA--TACA----A----AAG----CTG-G-ACT----T---TG-----TTAACAAAACT--GAATTTG-AT-CAACAAATTCAT-TN-NN---N-NN---NN-N-N---NNNNNNNNNNNNN----NN-NN-NN-NN------NN--------NN-N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNGTTCAACCAA-TCA-TTTTTGT-CTT-C-AT-AA-T----------TTTTGTCA--ACAAAAAT--TCA--TTTTTGTC--TC-ACAAAAGT--GAA--------TTTTGTAATGACAAAAG-------TGAA-TTTAGTCAA----CAAAA-------AAT-------------------------GAAG----A----TTT-----TGTTA--GACA-AAATTT-CATTTTcct
gi|20 : T--C---A----A-CAAAATT--GATCTT-G-AAT-CACAA-A-TAA--TTAATTTT-------------GTCATGCA-AA---ATTA--T-----CT-T-TCA--ACGGACG--AAT-TTCGC--TTTT--TT-A--G-A--C--AACAG--TC-AA-TTTTAT-T-CTT--ACAGA-A--TTAAC-T-TTGA----A---ACATA-AGT-----GCATT-TTG-Ttgatc
gi|21 : caaaaaaacaacaacaaaacacaccccaaaaaacccaagcttCGGGGCGC-C-AAATGG-GACCTT-G----T----GA-T---TTT-G-------------TTC-T-------CAAAA--TTC------ATTTT------T-G-T-G-TGGA--CAAAA-ATGAA-T-TTTG-T---AGAA-ACAAAA-T-G---------------AGTTCAGGT--C---A----A-CAAAATT--GATCAT-G-AAT-CAC-A-A--AAA-TCAATGTT-------------GTCGCACA-AA---ATTA--T-----CT-T-TCA--GC
gi|22 : AC-AA-AA-TTGAATT---TT---GTCATGACACAAAG--TGA--ATTTTGTCAATG-ACAAAAGT--GAAAAGTGAATTTCTGTTGTGACAAAAG-------TGAATTTTGGTCAA----CAAAAT-TT---ATTTTTG----CTC--------CACAT-AAAGT-G-A----TTT-----TG-TC--AACAAAAATT---ATTTTGT
gi|23 : --C---A----A-CAAAATT--GATCTT-G-AAT-CAC-A-AATAA--TTAATTTT-------------GTCATGCA-AA---ATTA--T-----CT-T-TCA--ACGGACG--AAT-TTCGC--TTTT--TT-A--G-A--C--AACAG--TC-AA-TTTTAT-T-CTT--ACAGA-A--TTAAC-T-TTGA----A---ACATA-AGT-----GCATT-TTG-Tg
gi|24 : gctt--C---A----A-CAAAATT--GATCTT-G-AAT-CAC-A-A--ATA-TTAATTTT-------------GTCATGCA-AA---ATTA--T-----CT-T-TCA--ACGGACG--AAT-TTCGC--TTTT--TT-A--G-A--C--AACAG--TC-AA-TTTTAT-C-TTG--ACAGA-A--TTAACTT-TTGA----A---ACATA-AGT-----GCATT-TTG-T
gi|25 : cttAAAATTTA-ATTTTT-TC-T--ACGCTA------AGATATAA-TTTCTTTGTGCA--TTTTTTTTTCCG-CAT--TGCCAA----ATT-TAAGGTTTAAA-TCAT-CAT-TAGTGA--AAACATTTT-TGTTCCAA-ACA----ATTT------C--AGATTA-------
gi|26 : CGACAAA----ATT-------T--A-ATTATGAATTGC-----------AGAACTGA-A--------TTTCTTCATTTTGGTA--TACAAATT-AGCTTACAAAAATCTAAATT--CAACAAATT---TACTTCCAAAATCCACTTGTG-TTACAAAAGTTAATtgatt
gi|27 : tAGTGAATTT---TG-TCA--ACAAA-AATGA--A-TC-TTGCCAGTCGACAAAATTCA--TTTTTGTT-T--AT-CTA------A-ATATTA-TCTCTTCATGCAAC---TTTTTCCC--CAT--TGCCTA----ATT-TAA-G-TTAAA-
gi|28 : GTC-T--AC-CAA------A-ATATAA-TTTCTTTATGCAAATTTTTT---CCG-CGT--TGCCAA----ATT-TAA-GTTTGAA-TTAT-CAT-TAGTAA--AAATA-TTT-TG-TCCAACAAA----ATTC---------A-ATTA-------
gi|29 : -C-AAATGG-GAC--T-TGG--T----GA-T--TTTT-G-------------TTC-C-------CAAGAATT-CG-----AATTTACCTTAT-G-T-G-GATT--CAAAA--TGAA-TCTTTG-C---TTCA-ACAAAAAT-G---------------AGCTCAGtgaat
gi|3 : tagatgaacctagA--ACAGT-GAA----TTT-----TGTT------AAAAATTT-TAACTTGTC-ATGACAAA----------------T-T-TCATTTTTGGTCTTC--A-CAA------AGT---G---AATTTTGTCA---CA-AAAGAG----TA--CAA--------AA-A-TGA--AATT-TTG----TTGACAAAATTCA-CTTTT-GTCAT--AC-TTTT-----A-ATATAAATCTCTTCAAGCAACTATTTTT--CCA-AAT--TGCCTA----ATT-GAA-GTTTAAAATTAT-CAT-TAGTAA--AAACA-GTT--G-TCCGACAAA----ATTTAATTTATGAA-ATTA-------C-----------AGAACTTGAA--------TTTCTTCATTT-GGTAAATGCAAATTTAGTTTACAAAAATCTAAATT--CA-C--ATT---TGC-TACAAAATCCACTTATG-TTACAAAA-TTAATT
gi|3 : ctagataacagatgtaataaaaGGGGCGC-C-AAATGG--AC--T-C----TTTGTGA-T---TTT-G-------------TTC-T-------CAAAAATT-C------ATTTT------T-GCT-G-TGAA--CAAAA-ATGAA-T-TTTG-T----ACA-ACAAAAAT-G---------------AGTTCAGGTAAC---A----ACCAAAATC--G-TCAT-GAATT-TAC-A-A--AAA-TTAATTT--------------GTCTTACA-AA---AATA--TCAC--TT-TGTCA----TGACA--AAA-TTCACTTTTTT--GT-A--G-A--C--AACAG--TC-AA-TTTTGT-CTTTG--ACAGA-A--TT-AATT-TTGT----A---ACATA-AGT-----GGATT-TTG-----T-AGCAAA---------TGTG-A-----AT--TT--A--GAT-TTT----TGTAA--AC-----T--AA------ATTTGC-ATTTA-CCAAATGAA-GA-----AATTCAAGTT-CTG-T-AATTT-C--A----TA-AAT-----------T--A--------AATT---TTG-TCGGAC--AACTG--TT--TTTACTAATGATA----ATTTTAAA----CTTCA-A-T----T---AGGCAATTTG-GAAAAAT--AG--TTGCTT-GAAGAG----AT-TT-AT-----------------------ATTAAAAG---------------T------AT--------GA-C-AAA-AGT-GAATTTTGTCA--ACAAAA--TTTCATTTTTGT----------------------A-CTCTTTT-GTGAC-AA-AA-T----TC---ACTTTGTGAAGACCAAAAA--TGA--AATTTGTC-ATG-AC--AAGTTAAAA--------TTTT----TAACAAAActgtcaaagacaaaattgactgttgtctacaaaaaagtgaattttgtcatgacaaagtgatatttttgtaagacaaattaatttttgtaaattcatgacgattttggttgttacctgaactcatttttgttgtacaaaattcatttttgttcacagcaaaaatgaatttttgagaacaaaatcacaaagagtccatttggcgcccc
gi|30 : ctagataacagatgtaataaaaaacagtgaaACAAAAGT---GA--ATTTTGTC-ATG-AGAAAAGT--TAA--------TTTTGTCA--ACAAAAATGATTCCTGAG-TTTGTCCAAAACTTAAAATCTCTAGAATTTT
gi|30 : atg-ACAAAAGT--GAA--------TTTTGTCATGAGAAAAG-------TTAA-TTTTGTCAA----CAAAA
gi|31 : atgaaaattctagagattttaagttttggacaaactcaggaatcatAC-A-A-TAAT-TTCATTTTT-ATA-TTG---------ACA-AA---ATCT--T-----TT-T-TCA--GTGGACA--AAG--TGAA--TTTT--GTCAT-G-A--CG-AA-AG--TT-AA-
gi|32 : ttagtatgttgcttcatCGGGGAGC-C-AAATGG-GAC--TAT----T----GT-TA-TTTT-G-------------TTC-T-------CAAAA--T-TCAGATGAATTT------T-G-T-A-CA-A--CAGAA-A-GGC-T-TTC
gi|33 : atctCGGGGAGC-C-AAATGG-GAC--TAT----T----GT-TA-TTTTGG-------------TTC-T-------CAAAA--T-TCATGTGAATTT------T-G-T-A-TA-A--CAGAA-A-GGC-T-TTCt
gi|4 : atctCGGGGCGCTC-AAATGG-GCC--T-CGTG-T----GA-T---TTT-G-------------T-C-T-------CAAAA--TTC------CATTT------T-G-T-C-TACAGACAAAA-AT-AA-T-TTTT-T---GGTACACAAAA-T-G---------------AGTTCAGGT--C---A----A-CAAAATTCGGATCAT-G-AAT-TAC-A-A--AAA-TTAATTTT-------------GTCTTAC--AA---ATTAACT-----TT-TGTCA----TGACA--AAATTTCAAC-TTTT--GT-A--G-A--T--AA-AGCTTC-AA--TTTGT-C-TTG--ACATA-A---TGACTTCTTGT----AC--ACATA-AGT-----GGATT-TTG-TAA---GACAA-------------------------------------TTGTG-TG--AAT-T-----T--A---------TTGC-A--TA-CAAATG--A-GAACATTCTTCT--GTA-ATC---------------------AT-AAT-------T--A--------AATT---TTG-TCGGAC--AACTG-TTT--TTTACTA---ATG----A----TAA----TTT-A-A------------------TGGGAAGTAA--AAAGTTGCAT-GAAGAG----AT-TA-ATAACT-TTACATG-T-AAGGGTAGATCAAAAATGAAATT-TT-GT-C--------T--------AA-CAAAATCTTCATTTTTTGT--TGACTAAA--TTCAC-TTTTGTCATTA-------CAA--AATTCA-CTTTTGT-GAGACAAA-AA-T-GAA-----TTTTTGT--TGACAAAAATTATGA--A----------G-ACAAAAAT--GA
gi|5 : AAA-A-TGA--A-TT-TTG----TCCACAAAATT-A-ATTTTCGTC-T--AC-CTT------A-ATATAA-TCTCTTTAGGCAACTTTTTT---CCGTCAT--TGTTCA----ATT-TAA-GTTTAAA-TTAT-CAT-TAGTAA--AAACA-TTT-TG-TCCAACAAATTCAATTA------TG-A-ATTA-------C-----------ATAAC----AGATT----TTTTTTCATTTTGGTA--TGCAAATT-AGTTTACAAAAATCCAAATT--CAACTAATT---TCCATACAAAATCCAATTATG-TTACAAAAGTTAATTttggtt
gi|6 : acaGGGCGC-C-AATTGG-GAC--T------T----GA-TC-TTTT----------------------------------------------------------T-G-TAAT--CGAAA--TCAA-T-TTTG-TGTACATA-A--AAAGT----------------------------------------AAAAT-------CT-G---T-CAC-A-A-CAAA-ATAATTTTT-GTC-T-----A-----ACA-AATATATTA--TACTTGTT-T-T----------A--TAA-CTTCA--TTTTTTGT-AATG-A--C--AA-AA--CC-AAATTTTGC-T-AC---ACAAA-A--TT-ATAT-TT-C----A---A---A-AGT-----CA-TT-TTGATCT-T-TACAAAA------TC-----A-----AT--TTTTGTCAAT-AAGGTA-TGCAAATACATGTAT--AAAC-T-TATCTGT-A--TC-CAAAAT--T-GA-----CTTTT--GTT-ACC-T-AATTTGCAAAT---TA-AAT---C-ACA-AGT--T--------AATT---TGG-TGAGACAAAAATA-AAT--GTTGTCAT-GACA----A----AAGTGACCTTCG---T----C---CG-----CT-CG-ATAAT--AATTTTATGT-AACAAA----AT-TT-AC---T-TT---TG-TGA---TATGTTGTAAAAT----TTGTTAAT-CTGAACTCATTTTTGTTGAA-C-AA--ACTC-ACCTTTGTCAACGCGAAA--TTGGA-TTTCA--AGTA-------CAA--AA-TCA-Cctgtccagaaaacatcatggtttcaaggttatgtaaaaaatactaacactttccactttctgaacagtttttgtaaatctttgaatattgacttgagttatattctgaaaacaaatgtatttaatctgatcaatcatgaaatgctgttatcatttccatcgttttacagagaagcaattatatttttcatggacggtaagaaaattgagaaattgtgtgacttgtcctcaaactcttttcttcgacaaac
gi|7 : GGACA--AAA-TTAAA--TTTT--GT-A--T-A--C--GA-AA--TC-AAATTTTGTTC-ACG--ACAAA-A--TCCATTT-TT----------A---A-GGCATTACCAATT-T-----A-T-------A------TTC----A-----ATCTTT--GTCAATATATGTA-TGCAAATAT-----C--AATCTT-CA-TTGT-A--TA-CAAAAT--A-GA-----CTTTG--TTT-ATCTT-AGTTTG---AT---TA-AATAAAC-AAA-AG---T--------AATT---aagaacctcactagtgtcc
gi|7 : C-TTTT-G-------------TCA-TTA-----CAAAA--TTC------ACTTT------T-G-T-GAGAGA--CAAAA-ATGAATT-TTTG-T-----TG-ACAAAAAT-T---------------AAT--GAGA--C---A-------AAAATA--GA-ATT-G-GTT-GAC-A-A-CAAT-TCAGTTTTA-GTatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaactaaaactgaattgttgtcaaccaattctatttttgtctcattaatttttgtcaacaaaaattcatttttgtctctcacaaaagtgaattttgtaatgacaaaagtgaatttagtcaagcaaaaaatgaagattttgttgacaaaattcatttttgttc
gi|7 : ggacaaaattaaattttgtatacgaaatcaaattttgttcacgacaaaatccatttttaaggcattaccaatttatattcaatctttgtcaatatatgtatgcaaatatcaatcttcattgtatacaaaatagactttgtttatcttagtttgattaaataaacaaaagtaattatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaAA----TTC-----TATTTTTGTCTCA--TTA-ATTTTTGTC-A--ACAAA------------AATTC-A-T--TTTT--GTCT-CTCA-CAA------AAGT--G---AATTTTGTAATGACA-AAAGTGAATTTAGTCAAGCA--A-AAA-A-TGAAGA-TT-TTG----TTGACAAAATTC--ATTTTTGTtgaatttagtcaagcaaaaaatgaagattttgttgacaaaattcatttttgttc
gi|8 : ggacaaaattaaattttgtatacgaaatcaaattttgttcacgacaaaatccatttttaaggcattaccaatttatattcaatctttgtcaatatatgtatgcaaatatcaatcttcattgtatacaaaatagactttgtttatcttagtttgattaaataaacaaaagtaattatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaactaaaactgaattgttgtcaacc-TT-TTG----TCCACAAAATT-A-ATTTTCGTC-T--AC-CTT------A-ATATAA-TCTCTTTAGGCAACTTTTTT---CCG-CAT--TGTTCA----ATT-TAA-GTTTAAA-TTAT-CAT-TAGTAA--AAACA-TTT-TG-TCCAACAAATTCAATTA------TG-A-ATTA-------C-----------ATAAC----AGATT----TTTTTTCATTTTGGTA--TGCAAATT-AGTTTACAAAAATCCAAATT--CAACTAATT---TCCATACAAAATCCAATTATG-TTACAAAAGTTAATTtc
gi|9 : GGGCGC-CCAAATGG-GAC--T-C----T----TG-TG-ATTT-GC------------TTC-T-------CAAAA--TTC------ATTTT------T-G-T-G-TGGA--CAAAA-ATGAA-T-TTTG-T----AGA-ACAAAAAT-G---------------AGTTCAGGT--C---A----A-CAAAATT--GATCAT-G-AAT-CAC-A-A--AAA-TTAATTTT-------------GTCGCACA-AA---ATTA--T-----CT-T-TCA--GCAGACA--AAA-T---------------------------------TC-AC-TTTTGT-C-ATG--ACAAATA--TTCACTT-TTGTATACA---A---A-AGT-----CAATT-TTG-TCT-G-GACAGAATTAACTTTTGT--AACAT-AT--TT--G--GAT-TTTGTA-TGCAA--AT-----T--AGTT-G-AATTTG------------------GA-----TTTTT--GTGAAAC-T-AA-TTGC--ATACCAA-AAT-GAA-AAA-AAT--TCATAATTGAATT---TTG-TTGGACAAA--TG--TT--TTTACAAT-GATAATTTA----AAA----CTTAA-A-T----TGGGCA-----ATGCGGAAAA---AAGGTTGCATAAAAGAA----AT-TATAT---T-TA---GG-T-A---GACG---AAAAATTAA-TT-TT-GT-GG------AC--------AA---AATTAAT---TTTTTGTctgtccagaaaacatcatggtttcaaggttatgtaaaaaatactaacactttccactttctgaacagtttttgtaaatctttgaatattgacttgagttatattctgaaaacaaatgtatttaatctgatcaatcatgaaatgctgttatcatttccatcgttttacagagaagcaattatatttttcatggacggtaagaaaattgagaaattgtgtgacttgtcctcaaactcttttcttcgacaaac
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 33333333333 11 1111111111111111111111111 33333333333 1 11111111111111111 11 7777777777777 111111 22222222222222222222222222222222222 333333333333333 111111 88888888888888888888888888888888888888888888888888888 222222222222222222222222222222 111111111 111 4444444444444444444444 11111 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 22 111 11111 11111 222 33333333333 11 1111 11 22222222 1111 2222222 111 1111 1111 222 55555555555555 11 1111 11111 333333 11 111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 222222222222 1 11 1111 111111 111 1111 5555555555555555555555555555555555555555555555555555 11111
lowQualScore : 2 33 2 33 88888888888 2 66 4 8888888888888888888888888 22222222222 0 99999999 2 2 2 7 33 999 4 2 2 5 1 5 2 99999999999999999 33 33 333 9999 4 333 33 22 2 8888 2 66 77 1 6666666666666 2 333 2 77 666 111111 33 0 33 88888888888888888888888888888888888 2 2 444444 4 33 3 33 2 333333333333333 000000 2 22222222222222222222222222222222222222222222222222222 5 2 6666 2 555555555555555555555555555555 44 33 111111111 2 4444 77777 44 3 0 3 22 44 555 3 44 0000000000000000000000 55 777 5 4 3 99999 66 5 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 00 6 111 1 6 88888 66666 333 6 6 00000000000 22 5555 77 1 00 5 66 00000000 1 4444 5 1111111 888 1 4444 4444 6 000 7 55555555555555 99 8 4444 66666 555555 1 3 44 000 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 0 0 8 1 666666666666 5 1 33 5 5 9999 0 5555 8 4 55 4 555555 8 4 0 111 77 55 2 8888 4 4 4 4 4 66 8 4 3 7777 6666666666666666666666666666666666666666666666666666 5 0 66 5 00 5 5 1 66666 4 5
lowQualScore : . .. . .. ........... . .. . ......................... ........... . ........ . . . . .. ... . . . . . . . ................. .. .. ... .... . ... .. .. . .... . .. .. . ............. . ... . .. ... ...... .. . .. ................................... . . ...... . .. . .. . ............... ...... . ..................................................... . . .... . .............................. .. .. ......... . .... ..... .. . . . .. .. ... . .. ...................... .. ... . . . ..... .. . ................................................................................................................................................................... .. . ... . . ..... ..... ... . . ........... .. .... .. . .. . .. ........ . .... . ....... ... . .... .... . ... . .............. .. . .... ..... ...... . . .. ... .......................................................... . . . . ............ . . .. . . .... . .... . . .. . ...... . . . ... .. .. . .... . . . . . .. . . . .... .................................................... . . .. . .. . . . ..... . .
lowQualScore : 5 55 5 44 00000000000 5 33 7 8888888888888888888888888 44444444444 9 99999999 2 2 2 5 11 111 4 2 2 4 0 0 8 11111111111111111 11 11 999 2222 4 999 11 11 2 3333 1 22 22 3 4444444444444 3 999 2 55 999 777777 11 8 11 11111111111111111111111111111111111 4 4 222222 7 22 9 00 4 777777777777777 999999 4 22222222222222222222222222222222222222222222222222222 7 0 1111 9 444444444444444444444444444444 11 99 888888888 9 9999 77777 22 1 2 1 88 22 000 3 66 6666666666666666666666 55 000 0 2 2 66666 99 4 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 88 4 888 0 7 55555 77777 444 7 7 77777777777 77 3333 99 7 00 0 99 77777777 7 4444 7 7777777 333 0 2222 2222 7 888 5 88888888888888 00 0 2222 77777 777777 0 2 22 888 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 8 8 0 7 333333333333 7 4 66 0 0 4444 1 2222 9 0 55 0 555555 0 0 5 999 22 55 3 5555 0 0 0 4 4 11 9 4 0 0000 1111111111111111111111111111111111111111111111111111 0 1 99 0 44 0 9 4 55555 3 7
consensus : CGGGGCGC-C-GAATGG-GAC--T-C----T----GA-TC-TTTT-G-------------TTC-T-------CAAAA--T-C------AATTT------T-G-T-G-TANA--CAAAA-ATGAA-T-TTC-GTCANAACA-AAAAT-G---------------AGTTCAGGT--C---A----A-CAA---AATT--GATCNT-GAA--TCACA-A-TAAN-TTAATTTTT-GT-ATTG----GTCGTACAAA---AT-TAT--CTT---TCA--GCG-GACA--AAATTC--A--CTTTT-GT-A--G-A--C--AA-AG--TC-AA-TTT-TGT-C-ACG--ACAAA-A--TTCACTT-TTGT----A---A---A-AGT-----CAATT-TTG-TCA-TGACAAAA------TTCGT--A-----AT--TT--GT----------CGAT-TNT----GTA-TGCAAA---------TAT-----T--AATC-TCA-TTTGC-A--T-------A-CAAAA-T--A-GA-----CTTTT--GTT-ATC-TAATTTGC--AT---TA-A--AT-AANAAA-AG--------T--AA--ATT---TTG-TCGGACAAAACTG-ATT--TTTACCA-TGATA----A----AAA----CTTNA-AT----C---CG-----NTGCGGAA--AAT--AAGTTTGCAT-GAAGAAAT-T-ATA--TT-T--ANG-T-A---GACGATCAAAAAT----TT-TT-GT-CT------AT--------AA-C-AAATANTCGANTTTTGTCATGACNAAA--TTCGA-TTTCGTCA-TACAAAA-TCA-CTTTTGT-GCGAC-AA-AA-T-GAATT---TTTTTGTCATGACAAAAAT--TGA--ATTTTGTC-ATG-ACAAAAGT--GAA--------TTTTGTCATGAC-AAAAG-------TGAA---TTTGTTCAA----CAAA----AT-TC--GATTTTTG----CTC-TT--A-GCACA--AAAGT-GAA----TTT-----TGTT-A--GTCACAAATTN-AATTTTGTC-ANGACAAA------------AA--C-G-TGATTTT--GTCT-C--A-CAA------AATT--G---AATTTTGTCATGACA-AAAGTGAATTTA--CGATCA--ACAAA-A-TGA--A-TT-TTG----TCGACAAAATTCA-ATTTTCGTC-T--AC-CTA------A-ATATAA-TCTCTTCATGCAACTTTTTTTTCCCG-CAT--TGCCCA----ATT-TAA-GTTTAAA-TTAT-CAT-TAGTAA--AAACA-TTT-TGTCCGACAAA----ATT-N------T--A-ATTA-------C--ATAAC---AGA------T-------TTCTTC-ATTTTGGTA--TGCAAATT-AGTTTACAAAAATCCAAATTCA-ACNAATTTGC----NTACAAAATCCACTTATG-TTACAAAAGTTAATT
Reference ( family-5289 ) : CGGGGCGC-C-GAATGG-GAC--T-C----T----GA-TC-TTTT-G-------------TTC-T-------CAAAA--T-C------AATTT------T-G-T-G-TANA--CAAAA-ATGAA-T-TTC-GTCANAACA-AAAAT-G---------------AGTTCAGGT--C---A----A-CAA---AATT--GATCNT-GAA--TCACA-A-TAAN-TTAATTTTT-GT-ATTGA---GTCGTACAAA---AT-TAT--CTT---TCA--GCG-GACA--AAATTC--A--NTTTT-GT-A--G-A--C--AA-AG--TC-AA-TTT-TGT-C-ACG--ACAAA-A--TTCACTT-TTGT----A---A---A-AGT-----CAATT-TTG-TCA-TGACAAAA------TTCGT--A-----AT--TT--GT----------CGAT-TNT----GTA-TGCAAA---------TAT-----T--AATC-TCA-TTTGC-A--T-------A-CAAAA-T--A-GA-----CTTTT--GTT-ATC-TAGTTTGC--AT---TA-A--AT-AANAAA-AG--------T--NA--ATT---TTG-TCGGACAAAATTG-ATT--TTTACCA--GATA----A----AAA----CTTCG-AT----C---CG-----TTGCGGAA--AAT--AAGTTTGCAT-GAAGAAAT-T-ATA--TT-T--NNG-T-A---GACGATCAAAAAT----TT-TT-GT-CT------AT--------AA-C-AAATANTCGANTTTTGTCATGACGAAA--TTNAA-TTTCGTCANTACAAAA-TCA-CTTTTGT-GTGAC-AA-AA-T-GAATT---TTTTTGTCATGACAAAAAT--TGA--ATTTTGTC-ATG-ACAAAAGT--GAA--------TTTTGTCATGAC-AAAAG-------TGAA---TTTGNTCAA----CAAA----AT-TC--GANTTTTG----CTC-TT--A-GCACA--AAAGT-GAA----TTT-----TGTT-N--GTCACAAATTN-AATTTTGTC-ANGACAAA------------AA--C-G-TGATTTT--GTCT-C--A-CAA------AATT--G---AATTTTGTCATGACA-AAAGTGAATTTA--CGATCA--ACAAA-A-TGA--A-TT-TTG----TCGACAAAATTCA-ATTTTCGTC-T--AC-CTA------A-ATATAA-TCTCTTCATGCAACTTTTTTTTCCCG-CAT--TGCCCA----ATT-TAA-GTTTAAA-TTAT-CAT-TAGTAA--AAACA-TTT-TGTCCGACAAA----ATT-N------T--A-ATTA-------C--ATAAC---AG-------T-------TTCTTC-ATTTTGGTA--TGCAAATT-AGTTTACAAAAATCCAAATTCA-ACNAATTTGC----NTACAAAATCCACTTATG-TTACAAAAGTTAATT
gi|1 : CGGGGCGC-C-GATTGG-GAC--T------T----GA-TC-TTTT-G-------------CTAAT-------CAAAA--C-C------AATTT--------G-T-G-TACA--CTAAA-A-GAA-T-TCC-GTCATAACA-A----------------------GTTCATTT--CTTGAC---A-CAA---AAAG--TATGTT-GCT--TCATA-A-TAAC-TTCATTTTTTGT-ATTGATAAGTTGTACAAA---AT-TAGA-TTT---TCA--GTT-GACACAAAATTG--A--ATATT-GT-A--G-AACCTGAA-AC--TT-AACTTT-TGT-C-ACG--ACAAA-A--TTCATTT-TTGT----A---A---ATAAT-----CAATTATTG-TCAATGACAAAA------TTGGT--A-----AT--TT--GT----------CAAT-TAT----GTAGTGCAAA---------TAT-----TTTGATC-TCA-TTTGC-A--T-------A-CAAAA-T--A-AA-----CTTTT--GTT-ATC-TTGTTTGC--AT---TA-A--AT-AAGAAA-AG--------T--AA--ATT---TTG-TGAGACAAAATTGAATTCATTTGTCA--GACA----A----AAA----GTTTGCAT----C---TG-----TTATGTAA--AATTGAATTTTTCAT-GACAAAGTGT-A-A--TTCT--TTGTT-A---GGTGATCAAAGGT----TC-TT-GTCCT------AT--------GACC-AAATAGTCGAATTTTGTCATGATAAAAGGTTGAA-TTTCGTTTATACAAAA-TGATCTTCTGTCATGAC-AA-AACT-GAATT---TTTTTGTCATGACAAAAAT--TGAAGATTTTGTC-ATGAACAAAA-T--GAA--------TGTTGTCATGAC-AGAAG-------TGAA---TTTGTCCAA----CAAA----AT-TC--GA--TTTG----TTCGTTCAA-GCACA--AAAGTGGAA----TTT-----TGTTCT--GTCACAAATGG-AATTTTGTCAAGGACGAG------------AA--CAG-TGATTTT--ATC--C--ACCAA------AATTTCG---ATTTTTGTCTTCACACCAAGTGAATTTA--CGATCA--ACAAA-A-TGAG-G-TTGTTG----TCCAGTAAATT---ATTTT-GTC-T---C-CTA------ACATATAA-TTTCTTATTGC-ACTTTTTTTTCCCG-CATTGTGCCCATTCCATTCTAA-GTTTAAA-TTAT-CATCTAGT-A--AAACA-TTT-TGTCCACCAAA----ATTCT------T--A-ATTA-------C--ATGAT---GG-------T-------T--TTCAATTTGGGTA--TGC-AATT-A-TTTACATAAAT-CAAATTAACACCTATTTTCATATATACAAATTCCA-TAATGTTTACAAAAGTTAATT
gi|10 : GGGGCGC-C-AAATGG-GAC--T-C----TTGT-GA-T---TTT-G-------------TTC-T-------CAAAAT-T-C------ATTTT------T-G-T-G-TGGA--CAAAA-ATGAA-T-TTT-GT-AGAACA-AAAAT-G---------------AGTTCAGGT--C---A----A-CAA---AATT--GATCAT-GAA--TCACA-A--AAA-TTAATTTT-------------GTCGCACAAA---AT-TAT--CTT---TCA--GCA-GACA--AAATTC--A--C--------------------------------TTT-TGT-C-ATG--ACAAATA--TTCACTT-TTGTATACA---A---A-AGT-----CAATT-TTG-TCT-GGAAAAGATTAAT-TTTGT--AACTATAT--TT--G------------GAT-TTT----GTA-TGCAA-----------AT-----T--AG--------TTGA-A--T---------------T--G-GA-----TTTTT--GTG-AAC-TAATTTGC--ATACCAA-A--AT-GAAAAA-AATTCATAATT--GA--ATT---TTG-TTGGACAAAAT---GTT--TTTACTAATGATAATTTA----AAA----CTTAA-ATTGGGC---AA-----TCGCGGAA--AA---AGGTTGGCAT-AAAGAAAT-T-ATA--TT-T--AGG-T-A---GA-----GAAAAT----TT-
gi|11 : tctGGCGC-C-AAATGG-GAC--T-C----TTGT-GA-TT-TTGA-G-------------TTC-T-------CAAAA--T-T------CATTT------TAG-T-G-TGGA--CAAAA-ATGAA-T-TTT-GT-AGAACA-AAAAT-G---------------AATTCAGGT--C---A----G-CAA---AATT--GATCAT-GAA--TCACA-A--AAA-TTTATTTTT-G-------------GCACAAA---AT-TAT--CTT---TCA--GCA-GACA--AAATTC--A--C--------------------------------TTT-TGT-C-ATG--ACAAA-A--TTCACTT-TTGTAGACA---A---A-AGT-----CAATT-TTG-TCT-GGACAGAAATAACTTTTGT--AACAT-AT--TT--G------------GAT-TTT----GTA-TGCAA-----------AT-----T--AGTT-GAA-TTTG--------------------------GA-----TTTTT--GTA-AAC-TAATTTGC--ATAC-CAGA--ATGAAAAAA-AA--------TCATA--ATTGAATTGTTTGGACAAAAT---GTT--TTTAC----GATA----ATTT-AAA----CTTAA-AT----TGGGCA-----ACGCGGAA--AA---AAG-TTGCAT-AAAGAAAT-T-ATA--TT-T--AGG-T-A---GACA---AAAAAT----T
gi|12 : aaattACA--AATGT-AAA----TTT-----TGTG-A--G--ACAAATTTGAATTTTGTC-ATGA-AAA------------AA----G-TGAAT------------------------AGT--G---AATTGTGTCATGACA-AAAATGAATT-A--TG-TCATGATAAA-AGTGA--A-TT-TTG----TTGAAAAAATTCATATTT--GTC-T--AC-CTA------A-ATCTAA-TCTCTTCACGCAA---TTTTTTCCC---AT--TGTCTA----ATT-GAA-GTTAAAA-TTAA-CAT-TAGTAA--AAAAAACTT-TGTCCCACAAA----ATT-G---------A-ATTA-------TGAATAAC---AG-------TACTGAATTTCTTC-ATTTTGGTA--TGCATAAT-AGTTTACAAAAATCTAAATTCA-ACAACTTTGC----TTAC-AAATCCACTTATG-CTACAAAAGTTAATT
gi|12 : atgtagtttgcattagataAA-TTTC-TCATGACAAAACTCA-CATTTGT-A-GAC-AACAA-T-CAATTGCATGTATGTTTTGACAGAA-T--TAA--CTTTTGT----A-GCATAAGT--GGA--------TTT-GT---------AAG-------CAAA---GTTGTTGAA----T--------T-TA--GATTTTTGTAAACTA-TT--ATGCATACCAAAAT-GAAGAAATTCAGTACTGTT-A--TTCATAA-TTC-AATTTTGT--GGGACAAAGTTTTTTTTACTAA--T-GTTAATTTT--AACT-T----CAATTAGACAATG--GGAAAAAATTG-CGTGAAG-AGATTAGATTTA---GGTAG--ACAAATA-TGA--A-TT-TTT----TCAACAAAATTCA-CTTTTctgtcaaaacatacatgcaattgattgttgtctacaaatgtgagttttgtcatgagaaatt
gi|13 : atgtagtttgcattagataacaaatgtaaattttgtgagacaaatttgaattttgtcatgaaaaaagtgaatagtgaattgtgtcatgacaaaaatgaattatgtcatgatCGGGGCGC-C-GATTGG-GAC--T------T----GA-TCCTTTT-GCAATCAAAACCAATTT-TGTGTACACAAAA--T-AG-----AATTC------C-G-TCA-TA-A--CAAAA-TTCAA-T-TTT-GTCACA-CA-AAAGT-GTGCTGCTTCGTAATAACTTCATAN--N---N----N-NNN---NNNN--NNNNNN-NNN--NNNNN-A-TAAC-TTCATATTT-GT-ATTGATAAGTTATACAAA---AT-TAT--TTT---TCATTNNN-NNNN--NNNNNN--N--NNNNN-NN-N--N-N--N--NN-NN--NN-NN-NNN-NNN-N-NNN--NNNNN-N--NNNNNNN-NNNN----N---N---N-NNN-----NNNNN-NNN-NNN-NNNNNNNN------NNNNN--N-----NN--NN--NN----------NNAT-TAT----GTA-TGCAAA---------TAT-----C--AATC-TCA-TTTGC-A--T-------A-CAAAA-T--A-GA-----CTTTT--GTT-ATC-TAGTTTGC--AT---TA-A--AT-
gi|14 : taCGGGGCGC-C-G-ATTG-GAC--T------T----GA-TC-TTTT-G-------------TAA-T-------CCAA------------AATTT------T-G-T---TACA--CAAAATACGAA-T-TTCGGTCATAA-A-AAAAT-T---------------CTTTTTTGT--C---ACACCA-TAG---AAGT--AATGAT-TGACTTCATA-A-TAAA-TC-ATTTTT-GTAATTG-----------AAA---ATATAT------------------ACA--AA--TT--A--TTTCT-TC-A--G-AGCT--AA-AT--TG-AA-TTTCTGT-A-ACG--ACAAA-A--ATCCATT-TTGT----A---A--------------------TGCTCATTGACAAAA------TTCAT--------TT--TT--GT----------CAATCTAT----GTA-TGTCAA---------TAT-----C--AATC-TC--TTTGCAA--T-------A-CAAAA-T--AGGA-----CTGTT--TTT-ATC-TAA-TTGC--AT---TA-T--A--AACAAACAG--------TA-AA--ATT---TT
gi|15 : GC-C-GATTGG-GAC--T------T----GA-TC-TTTTTG-------------TAA-T-------CAAAA--C-C------AATTT------T-G-T-G-TACA--CAAAT-A-GAA-T-TCC-GTCGTAACA-AAATT-C---------------ATTTT-TGT--C---AC---A-CAA---AAGT---ATGTT-GCT--TCATA-A-TAAC-TTCATTTTT-GT-ATTGATAAGTTATACAAA---AT-TAT--TTT---TCA--GTT-GACA--AAATTC--A---------------------------------A-TTT-TGT-C-ACA--ACAAA-A--TCCA-TT-TTGT----AGATA---A-ACT-----CAATT-TTG-TCA-TGACAAAA------TTC----A-----AT--TTT-GT----------CAAT-TAT----GTA-TGCAAA---------TAT-----C--AATC-TCA-TTTGC-A--T-------A-CAAAA-T--A-GA-----CTTTT--GTT-ATC-TAGTTTGC--AT---TA-A--A
gi|16 : tGGCGC-C-AAATGG--AC--T-CCTTGT----GA-T--TTTT-G-------------TCT-TG------CAAAA--TTC------ATTTT------T-G-T-G-TCGA--CAAAA-ATGAA-T-TTT-GT-AGAACA-AAAATTG---------------AGTTCAGGT--C---A----A-CAA---AATT--GATCATGGAA--TCACA-A-AAAT-TTAATTTCT------------GTCGCACAAA---A--TAT--CTT---ACA--GCA-GACA--AAATTC--A--CTATT-GT-A--GAA--C--AA-AG--TC-AA-TTT-TGT-C-TGG--ACAGA-A--TTAAC-T-TTGT----A---AC--ATATT-----GGATT-TTG-T-A-TTGC-ATA------TTAGTTGA-----A---TT--G------------GAT-TTT-------------------------T-----T--AAAC-TAA-TTTGC-A--T-------ACCAAAA-T--
gi|17 : ttc-T-------CAAAA----C------AATTT--------G-T-G-TACA--CAAAATAGAAA-T-TCC-GTCATAACA-AAATT-C---------------ATTTT-TGT--C---A----AACAA---AAGT---ATGTT-GCT--TCCCA-A-TAAC-TTA-TTTTT-GT-ATTGATAAGTTGTACAAA---AT-TAT--TTT---TCA--GTT-GACA--AAATCC--A--TTTTT-GT-A--G-A--T--AA-AC--TTAAA-TTT-TGT-C-ATGAAACAAA-A--TTCATTT--------------------GT-----CAATT-ATG-T-A-TG-CAAA-------------------------T--AT----------CGA-----------------------------------------TC-TCA-TTTGC-A--T-------A-CAAAA-T--A-GA-----CTTTT--GTT-ATC-TAGTTTGC--AT---tagtc
gi|18 : ttttgtgaaG----TTGACAAAATTCA--TTTTTGTC-T--AC-CTACATGTAA-ATATAA-TCTCTTCATGCAACTTTTTCTTCCCA--------------------------TTAAA-TTAT-CAT-TAGTAA--AAACA-GTT-TGTCCGACAAA----ATT--------T--A-ATTA-------TGAATTAC---AGAAATGAAT-------TTCTTC-ATTTTGGTA--TGCAA------------------TAAATTCA-ACAAATTTGC----TTACAAAATCCACTTATG-TTACAAAAGTCAAaa
gi|19 : AAAATT-A-ATTTTCGTC-TTAAC-CTA------A-ATATAA-TTTCTTTATGCGACTTTTTTTCCTTG-CAT--TGCCCA----ATT-TAA-GTTTAAA-TTATGCA--TAGTAATTTAACA-TTTGTGTCCAACAAA------T-T------C--A-ATT------------TG-----AA-------T-------TTTTTC-ATTTTGGTA--TGCAAATT-AGTTCAC--AAATCCAAATTCA-ACTAATTTGC----AT
gi|2 : GGGCGT-C-GAATGGCGAC--T-----------GACTT-TTTT-G-------------TAA-T-------CAAAA--C-C------CATTT--------G-T-G-TACA--CAAAT--TGAAGT-TCC-GTCACAACA-AAA---------------------TTCATTT--T---A----T-TAT---G-TT--G--CTT------TCATATA-TAAGCTTCATTTTT-GT-ATTGATTAGTTATACAAA---AT-TAT--TTT---TCGC-GTG-GACA--AAATTA--A--ATTTT-GT-A----A--CG-AA-AA--TC-A--TTT-TGT-C-ACG--ACAGA-AAGTCCATTT-T-------A---A---A-GGTTAC--CAATT-TAG-T-A-TTCCAATC------TTTGTC-A-----ATA-TT--GTATGCAAATATCAAT-CTTCATTGTA-TACAAAATAAGACTTTGT-----T--TATC-TTAGTTTGC-A--TTAAATAAA-CAAAAGT--A--A-----TTATT--ATT-GAC-AAAGTTGA--AT---TT-GTCAT-A-CAAA-AGC-------T--GG--ACT---TTG-TTA-ACAAAACTG-AAT--TTGATCA---ACA----A----A-------TTC--AT----T---NN-----NNNNNNNN--NNN--NNNNNNNNNN-NNNNNNNN-N-NNN--NN-N--NNN-N-N---NNNNNNNNNNNNN----NN-NN-NN-NN------NN--------NN-N-NNNNNNNNNNNNNNGTTCA--ACCAA----TCAT-TTTTGTC--TTCATAA-T----TTTTGT--CAAC-AA-AA-----ATTCA-TTTTTGTC-TCACAAAAG---TGA--ATTTTGTA-ATG-ACAAAAGT--GAA--------TTTAGTCA--ACAAAAAA-------TGAAGATTTTGTTAGA----CAAA----AT-TT--CATTTTTG----ATC-cct
gi|20 : T--C---A----A-CAA---AATT--GATCTT-GAA--TCACA-AATAA--TTAATTTT-------------GTCATGCAAA---AT-TAT--CTT---TCA--ACG-GACG--AATTTC--G--CTTTT-TT-A--G-A--C--AACAG--TC-AA-TTT-TAT-T-CTT--ACAGA-A--TTAAC-T-TTGA----A---ACATA-AGT-----GCATT-TTG-T
gi|21 : caaaaaaacaacaacaaaacacaccccaaaaaacccaagcttCGGGGCGC-C-AAATGG-GACCTT-G----T----GA-T---TTT-G-------------TTC-T-------CAAAA--TTC------ATTTT------T-G-T-G-TGGA--CAAAA-ATGAA-T-TTT-GTAGAAACA-AAA-T-G---------------AGTTCAGGT--C---A----A-CAA---AATT--GATCAT-GAA--TCACA-A--AAA-TCAATGTT-------------GTCGCACAAA---AT-TAT--CTT---TCA--GC
gi|22 : AC-AA-AA-TTGAATT---TT---GTCATGACACAAAG--TGA--ATTTTGTCAATG-ACAAAAGT--GAAAAGTGAATTTCTGTTGTGAC-AAAAG-------TGAAT--TTTGGTCAA----CAAA----AT-TT---ATTTTTG----CTC--------CACAT-AAAGT-G-A----TTT-----TGTC-A--A-CAAAAATT---ATTTTGT
gi|23 : --C---A----A-CAA---AATT--GATCTT-GAA--TCACA-AATAA--TTAATTTT-------------GTCATGCAAA---AT-TAT--CTT---TCA--ACG-GACG--AATTTC--G--CTTTT-TT-A--G-A--C--AACAG--TC-AA-TTT-TAT-T-CTT--ACAGA-A--TTAAC-T-TTGA----A---ACATA-AGT-----GCATT-TTG-Tg
gi|24 : gctt--C---A----A-CAA---AATT--GATCTT-GAA--TCACA-A--ATA-TTAATTTT-------------GTCATGCAAA---AT-TAT--CTT---TCA--ACG-GACG--AATTTC--G--CTTTT-TT-A--G-A--C--AACAG--TC-AA-TTT-TAT-C-TTG--ACAGA-A--TTAACTT-TTGA----A---ACATA-AGT-----GCATT-TTG-T
gi|25 : cttAAAATTTA-ATTTTT-TC-T--ACGCTA------AGATATAA-TTTCTTTGTGCA--TTTTTTTTTCCG-CAT--TGCCAA----ATT-TAAGGTTTAAA-TCAT-CAT-TAGTGA--AAACATTTT-TGTTCCAAACA----ATT-T------C--AGATTA-------
gi|26 : CGACAAA----ATT--------T--A-ATTATGAATTGC--AGAACTG-AA-------T-------TTCTTC-ATTTTGGTA--TACAAATT-AGCTTACAAAAATCTAAATTCA-ACAAATTTAC----TTCCAAAATCCACTTGTG-TTACAAAAGTTAATtgatt
gi|27 : tAGTGAATTT---TG-TCA--ACAAA-AATGA--A-TC-TTGCCAGTCGACAAAATTCA--TTTTTGTT-T--AT-CTA------A-ATATTA-TCTCTTCATGCAAC---TTTTTCCC--CAT--TGCCTA----ATT-TAA-G-TTAAA-
gi|28 : GTC-T--AC-CAA------A-ATATAA-TTTCTTTATGCAAATTTTTT---CCG-CGT--TGCCAA----ATT-TAA-GTTTGAA-TTAT-CAT-TAGTAA--AAATA-TTT-TGTCCAACAAA----ATT-C---------A-ATTA-------
gi|29 : -C-AAATGG-GAC--T-TGG--T----GA-T--TTTT-G-------------TTC-C-------CAAGAATT-CG-----AATTTACCTTAT-G-T-G-GATT--CAAAA--TGAA-TCTTT-GCTTCAACA-AAAAT-G---------------AGCTCAGtgaat
gi|3 : tagatgaacctagA--ACAGT-GAA----TTT-----TGTT-------AAAAATTT-TAACTTGTC-ATGACAAA----------------T-T-TCATTTTTGGTCTTC--A-CAA------AGT---G---AATTTTGTCA---CA-AAAGAG----TA--CAA--------AA-A-TGA--AATT-TTG----TTGACAAAATTCA-CTTTT-GTCAT--AC-TTTT-----A-ATATAAATCTCTTCAAGCAACTATTTTT--CCA-AAT--TGCCTA----ATT-GAA-GTTTAAAATTAT-CAT-TAGTAA--AAACA-GTT--GTCCGACAAA----ATT-TAATTTATGAA-ATTA-------C--AGAACTTGAA-------T-------TTCTTC-ATTT-GGTAAATGCAAATTTAGTTTACAAAAATCTAAATTCA--C--ATTTGC-----TACAAAATCCACTTATG-TTACAAAA-TTAATT
gi|3 : ctagataacagatgtaataaaaGGGGCGC-C-AAATGG--AC--T-C----TTTGTGA-T---TTT-G-------------TTC-T-------CAAAAATT-C------ATTTT------T-GCT-G-TGAA--CAAAA-ATGAA-T-TTT-GT-ACAACA-AAAAT-G---------------AGTTCAGGTAAC---A----ACCAA---AATC--G-TCAT-GAAT-TTACA-A--AAA-TTAATTT--------------GTCTTACAAA---AA-TATCACTTTG-TCA----T-GACA--AAATTC--ACTTTTTT-GT-A--G-A--C--AACAG--TC-AA-TTT-TGT-CTTTG--ACAGA-A--TT-AATT-TTGT----A---ACATA-AGT-----GGATT-TTG-----TAGCAAA---------TGTG-A-----AT--TT--A------------GAT-TTT--------TGTAA-----------AC-----T--AA-----A-TTTGC-ATTT-------A-CCAAA-TGAA-GA-----AATTCAAGTT-CTG-TAATTT-C--A----TA-A--AT------------------T--AA--ATT---TTG-TCGGAC--AACTG--TT--TTTACTAATGATA----ATTTTAAA----CTTCA-AT----T---AGGCAATTTG-GAAA--AAT--AG--TTGCTT-GAAGAGAT-T--TA--T-------------------ATTAAAAG---------------T------AT--------GA-C-AAA-AGT-GAATTTTGTCA--ACAAAA--TTTCATTTTTGT-------------A-CTCTTTT-GTGAC-AA-AA-T----TC---ACTTTGTGAAGACCAAAAA--TGA--AATTTGTC-ATG-AC--AAGTTAAAA--------TTTT----TAAC-AAAActgtcaaagacaaaattgactgttgtctacaaaaaagtgaattttgtcatgacaaagtgatatttttgtaagacaaattaatttttgtaaattcatgacgattttggttgttacctgaactcatttttgttgtacaaaattcatttttgttcacagcaaaaatgaatttttgagaacaaaatcacaaagagtccatttggcgcccc
gi|30 : ctagataacagatgtaataaaaaacagtgaaACAAAAGT---GA--ATTTTGTC-ATG-AGAAAAGT--TAA--------TTTTGTCA--AC-AAAAATGATTCCTGAG---TTTGTCCAAAACTTAAA----ATCTCTAGAATTTT
gi|30 : atg-ACAAAAGT--GAA--------TTTTGTCATGAG-AAAAG-------TTAA---TTTTGTCAA----CAAAAATGAT-TCCTGAGTTT
gi|31 : atgaaaattctagagattttaagttttggacACA-A-TAAT-TTCATTTTT-AT-ATTG---------ACAAA---AT-CTT--TTT---TCA--GTG-GACA--AAG-TG--A--ATTTT-GTCAT-G-A--CG-AA-AG--TT-AA-
gi|32 : ttagtatgttgcttcatCGGGGAGC-C-AAATGG-GAC--TAT----T----GT-TA-TTTT-G-------------TTC-T-------CAAAA--T-TCAGATGAATTT------T-G-T-A-CA-A--CAGAA-A-GGC-T-TTC-
gi|33 : atctCGGGGAGC-C-AAATGG-GAC--TAT----T----GT-TA-TTTTGG-------------TTC-T-------CAAAA--T-TCATGTGAATTT------T-G-T-A-TA-A--CAGAA-A-GGC-T-TTC-t
gi|4 : atctCGGGGCGCTC-AAATGG-GCC--T-CGTG-T----GA-T---TTT-G-------------T-C-T-------CAAAA--TTC------CATTT------T-G-T-C-TACAGACAAAA-AT-AA-T-TTT--TTGGTACACAAAAT-G---------------AGTTCAGGT--C---A----A-CAA---AATTCGGATCAT-GAA--TTACA-A--AAA-TTAATTTT-------------GTCTTAC-AA---AT-TAA--CTT---TTG--TCATGACA--AAATTTCAA--CTTTT-GT-A--G-A--T--AA-AGCTTC-AA--TT-TGT-C-TTG--ACATA-A---TGACTTCTTGT----AC--ACATA-AGT-----GGATT-TTG-TAA--GACAA-----------------------------------------------TT----GTG-TG--AA---------T-T-----T--A---------TTGC-A--T-------A-CAAAT-G--A-GAACATTCTTCT--GTA-ATC----------------------AT-AAT--------------T--AA--ATT---TTG-TCGGAC--AACTG-TTT--TTTACTAATGATA----A------------TTTA-AT---------G---------GGAAGTAAA--AAG-TTGCAT-GAAGAGAT-TAATAACTT-TACATG-T-AAGGGTAGATCAAAAATGAAATT-TT-GT-C--------T--------AA-CAAAATCTTCATTTTTTGT--TGACTAAA--TTCAC-TTTTGTCATTACAAAATTCA-CTTTTGT-GAGACAAA-AA-T-GAA-----TTTTTGT--TGACAAAAATTATGA--A----------G-ACAAAAAT--GA
gi|5 : AAA-A-TGA--A-TT-TTG----TCCACAAAATT-A-ATTTTCGTC-T--AC-CTT------A-ATATAA-TCTCTTTAGGCAACTTTTTT---CCGTCAT--TGTTCA----ATT-TAA-GTTTAAA-TTAT-CAT-TAGTAA--AAACA-TTT-TGTCCAACAAATTCAATT-A------TG-A-ATTA-------C--ATAAC---AGATT----T-------TTTTTC-ATTTTGGTA--TGCAAATT-AGTTTACAAAAATCCAAATTCA-ACTAATTTCC----ATACAAAATCCAATTATG-TTACAAAAGTTAATTttggtt
gi|6 : acaGGGCGC-C-AATTGG-GAC--T------T----GA-TC-TTTT----------------------------------------------------------T-G-TAAT--CGAAA--TCAA-T-TTT-GT--GTACATAAAA------------------AGT--------------------AA---AAT-------CT-G----TCACA-A-CAAA-ATAATTTTT-GT-CT--A--------ACAAATATAT-TATA-CTTGTTTTA--T---------AACTTC--A--TTTTTTGT-AATG-A--C--AA-AA--CC-AAATTT-TGC-T-AC---ACAAA-A--TT-ATAT-TT-C----A---A---A-AGT-----CA-TT-TTGATCT-TTACAAAA------TC-----A-----AT--TTTTGT----------CAAT-AAG----GTA-TGCAAA---------TACATGTAT--AAAC-TTA-TCTGT-A--T-------C-CAAAA-T--T-GA-----CTTTT--GTT-ACC-TAATTTGCAAAT---TA-A--AT---CACA-AG--------T--TA--ATT---TGG-TGAGACAAAAATA-AAT--GTTGTCAT-GACA----A----AAGTGACCTTCG--T----C---CG-----CT-C-GAT--AAT--AATTTTATGT-AACAAAAT-T--TA--CT-T--TTG-TGA---TATGTTGTAAAAT----TTGTTAAT-CTGAACTCATTTTTGTTGAA-C-AA--ACTC-ACCTTTGTCAACGCGAAA--TTGGA-TTTCA--AGTACAAAA-TCA-Cctgtccagaaaacatcatggtttcaaggttatgtaaaaaatactaacactttccactttctgaacagtttttgtaaatctttgaatattgacttgagttatattctgaaaacaaatgtatttaatctgatcaatcatgaaatgctgttatcatttccatcgttttacagagaagcaattatatttttcatggacggtaagaaaattgagaaattgtgtgacttgtcctcaaactcttttcttcgacaaac
gi|7 : G-GACA--AAATTA--A--ATTTT-GT-A--T-A--C--GA-AA--TC-AAATTT-TGTTC-ACG--ACAAA-A--TCCATTT-TT----------A---A-GGCATTACCAATT-T-----A-T------A------TTC----A-----ATCTTT--GT----------CAATATAT----GTA-TGCAAA---------TAT-----C--AATCTTCA--TTGT-A--T-------A-CAAAA-T--A-GA-----CTTTG--TTT-ATCTTAGTTTG---AT---TA-A--ATAAACAAA-AG--------T--AATTATT---Taagaacctcactagtgtcc
gi|7 : C-TTTT-G-------------TCA-TTA-----CAAAA--TTC------ACTTT------T-G-T-GAGAGA--CAAAA-ATGAATT-TTT-GT--TGACA-AAAAT-T---------------AAT--GAGA--C---A----A-AAATAGAATT--GGT--T-G------ACA-A-CAAT-TCAGTTTTA-GT-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaactaaaactgaattgttgtcaaccaattctatttttgtctcattaatttttgtcaacaaaaattcatttttgtctctcacaaaagtgaattttgtaatgacaaaagtgaatttagtcaagcaaaaaatgaagattttgttgacaaaattcatttttgttc
gi|7 : ggacaaaattaaattttgtatacgaaatcaaattttgttcacgacaaaatccatttttaaggcattaccaatttatattcaatctttgtcaatatatgtatgcaaatatcaatcttcattgtatacaaaatagactttgtttatcttagtttgattaaataaacaaaagtaattatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaAA----TTC-----TATT-TTTGTCTCA--TTA-ATTTTTGTC-A--ACAAA------------AATTC-A-T--TTTT--GTCT-CTCA-CAA------AAGT--G---AATTTTGTAATGACA-AAAGTGAATTTAGTCAAGCA--A-AAA-A-TGAAGA-TT-TTG----TTGACAAAATTC--ATTTTTGTtgaatttagtcaagcaaaaaatgaagattttgttgacaaaattcatttttgttc
gi|8 : ggacaaaattaaattttgtatacgaaatcaaattttgttcacgacaaaatccatttttaaggcattaccaatttatattcaatctttgtcaatatatgtatgcaaatatcaatcttcattgtatacaaaatagactttgtttatcttagtttgattaaataaacaaaagtaattatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaactaaaactgaattgttgtcaacc-TT-TTG----TCCACAAAATT-A-ATTTTCGTC-T--AC-CTT------A-ATATAA-TCTCTTTAGGCAACTTTTTT---CCG-CAT--TGTTCA----ATT-TAA-GTTTAAA-TTAT-CAT-TAGTAA--AAACA-TTT-TGTCCAACAAATTCAATT-A------TG-A-ATTA-------C--ATAAC---AGATT----T-------TTTTTC-ATTTTGGTA--TGCAAATT-AGTTTACAAAAATCCAAATTCA-ACTAATTTCC----ATACAAAATCCAATTATG-TTACAAAAGTTAATTtc
gi|9 : GGGCGC-CCAAATGG-GAC--T-C----T----TG-TG-ATTT-GC------------TTC-T-------CAAAA--TTC------ATTTT------T-G-T-G-TGGA--CAAAA-ATGAA-T-TTT-GT-AGAACA-AAAAT-G---------------AGTTCAGGT--C---A----A-CAA---AATT--GATCAT-GAA--TCACA-A--AAA-TTAATTTT-------------GTCGCACAAA---AT-TAT--CTT---TCA--GCA-GACA--AAATTC--A--C--------------------------------TTT-TGT-C-ATG--ACAAATA--TTCACTT-TTGTATACA---A---A-AGT-----CAATT-TTG-TCT-GGACAGAATTAACTTTTGT--AACAT-AT--TT--G------------GAT-TTT----GTA-TGCAA-----------AT-----T--AGTT-GAA-TTTG--------------------------GA-----TTTTT--GTGAAAC-TAA-TTGC--ATACCAA-A--AT-GAAAAA-AATTCATAATT--GA--ATT---TTG-TTGGACAAA--TG--TT--TTTACAAT-GATAATTTA----AAA----CTTAA-AT----TGGGCA-----ATGCGGAA--AA---AAGGTTGCATAAAAGAAAT-T-ATA--TT-T--AGG-T-A---GACG---AAAAATTAA-TT-TT-GT-GG------AC--------AA---AATTAAT---TTTTTGTctgtccagaaaacatcatggtttcaaggttatgtaaaaaatactaacactttccactttctgaacagtttttgtaaatctttgaatattgacttgagttatattctgaaaacaaatgtatttaatctgatcaatcatgaaatgctgttatcatttccatcgttttacagagaagcaattatatttttcatggacggtaagaaaattgagaaattgtgtgacttgtcctcaaactcttttcttcgacaaac
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 33333333333 11 1111111111111111111111111 33333333333 11111111 111 1 2222222222222222222 11 7777777777777 111111 22222222222222222222222222222222222 333333333333333 111111 88888888888888888888888888888888888888888888888888888 222222222222222222222222222222 111111111 1111 3333333333333333333333 22222 222222 2222222222222222 5555555555 2222222 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 22 111 333333333333333333333 333 44444444444 111 11111 11 11111111 1111111 1111111 222 1111 2222 44444444444444 22 1 2222 22222 222 11 1111 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1 2222222 11 1 11 1111 1111 111111 1 1111 2222 3333333333333333333333333 11 11111
lowQualScore : 2 33 2 33 88888888888 2 77 5 6666666666666666666666666 33333333333 0 11111111 2 2 7 33 000 2 2 2 3 1 5 0000000000000000000 22 33 444 999999 333 1 2 1 55 2 66 77 1 3333333333333 2 333 2 77 666 111111 33 0 33 66666666666666666666666666666666666 2 2 444444 4 33 5 33 2 333333333333333 000000 2 22222222222222222222222222222222222222222222222222222 5 2 6666 2 555555555555555555555555555555 44 33 111111111 2 4444 44 3 0 3 0 44 5555 3 44 9999999999999999999999 55 666 4 8 1 22222 66 333333 1 9999999999999999 1 0000000000 66 4444444 5 5 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 5 66 1 666 77 111111111111111111111 666 5 5 00000000000 777 66666 66 0 00 4 66 88888888 3 2222222 8888888 555 4 2222 5 1111 1 66666666666666 33 0 3 1111 55555 0 555 0 0 66 8888 2 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555 3 1 0 5555555 11 3 6 3 55 5 0000 1 7777 5 66 4 222222 8 1 1 888 77 66 1 9999 4 4 5 5 66 0 5 4 8888 8888 4 3333333333333333333333333 55 0 33 0 5 1 3 33333 6 6
lowQualScore : . .. . .. ........... . .. . ......................... ........... . ........ . . . .. ... . . . . . . ................... .. .. ... ...... ... . . . .. . .. .. . ............. . ... . .. ... ...... .. . .. ................................... . . ...... . .. . .. . ............... ...... . ..................................................... . . .... . .............................. .. .. ......... . .... .. . . . . .. .... . .. ...................... .. ... . . . ..... .. ...... . ................ . .......... .. ....... . . ................................................................................... . .. . ... .. ..................... ... . . ........... ... ..... .. . .. . .. ........ . ....... ....... ... . .... . .... . .............. .. . . .... ..... . ... . . .. .... . ....................................................... . . . ....... .. . . . .. . .... . .... . .. . ...... . . . ... .. .. . .... . . . . .. . . . .... .... . ......................... .. . .. . . . . ..... . .
lowQualScore : 5 55 5 44 00000000000 5 99 0 5555555555555555555555555 11111111111 1 11111111 4 4 9 22 777 4 4 4 8 0 3 4444444444444444444 55 22 111 888888 666 0 4 0 66 2 88 66 8 6666666666666 3 999 2 55 999 777777 11 8 11 55555555555555555555555555555555555 4 4 222222 7 22 4 00 4 777777777777777 999999 4 22222222222222222222222222222222222222222222222222222 7 0 1111 9 444444444444444444444444444444 11 99 888888888 9 9999 22 1 2 1 4 22 7777 1 22 8888888888888888888888 00 444 4 2 9 33333 11 777777 9 5555555555555555 0 4444444444 99 9999999 0 0 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 7 55 0 555 33 999999999999999999999 333 7 7 33333333333 333 22222 99 4 66 4 11 11111111 6 5555555 6666666 777 3 1111 7 0000 7 66666666666666 88 0 2 2222 00000 8 888 2 8 88 0000 5 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555 2 2 0 8888888 00 2 7 3 88 7 6666 4 1111 4 11 4 888888 9 7 1 111 33 11 9 4444 4 4 0 0 99 0 0 4 9999 2222 4 7777777777777777777777777 77 7 00 7 7 0 0 11111 7 7
consensus : CGGGGCGC-C-GAATGG-GAC--T-C----T----GA-TC-TTTT-G-------------TTC-T-------CAAAA--T-C------AATTT------T-G-T-GTANA--CAAAA-ATGAA-T-TTC-GTCANAACA-AAAAT-G---------------AGTTCAGGT--C---A----A-CAAAATT--GATCNT-GAA--TCACA-A-TAAA-TTAATTTTT-GT-ATTG----GTCGTACAAA---AT-TAT--CTT---TCA--GCG-GACA--AAATTC--AC--TTTT-GT-A--G-A--C--AA-AG--TC-AA-TTT-TGT-C-ACG--ACAAA-A--TTCACTT-TTGT----A---A---A-AGT-----CAATT-TTG-TCA-TGACAAAA------TTCGT--A-----AT--TT--GT----------CGAT-TNT----GTA-TGCAAA---------TAT-----T--AATC-TCA-TTTGC-A--T-------A-CAAAA-T--A-GACTTTT--GTT-ATC-TAATTTGC--AT---TA-A--AT-AANAAA-AG--------T-A-A--ATT---TTG-TCGGACAAAACTG-ATT--TTTAC----C-ATGACA----A----AA---A-CTTNAATCGGGCGAT-GCGGAA--AA---AAGTTTGCAT-GAAGAAAT-T----------A--TA--TTT--ANGTA---GA------CGATCAAAA---AT----TTTTGT-CTATAA-C-AAATANTCGANTT-TTGTCA--ACNAAA--TTCGATTTC-G-TCG-T-ACAAAA-TCA-CTTTTGT-ACGAC-AA-AA-T-GAATT---TTTTTGTC-ATGACAAAAGT--TGA--ATTTTGTC-ATG-ACAAAAGT--GAA--------TTTTGTCATGAC-AAAAG-------TGAA---TTTGTTCGA----CAAAAT-TC--GATTTTTG----CTC-TT--A-GCACAC-AAAGT-GAA----TTT-----TGTTA-GTCACAAATTN-AATTTTGTC-AGGACAAA------------AA--C-G-TGATTTTATCTC--A-CAA------AANT--G---AATTTTGTCGTGACA-AAAGTGAATTTA--CGATCA--ACAAA-A-TGA--ATT-TTG----TCGACAAAATTCA-ATTTTCGTCT--AC-CTA------A-ATATAATCTCTTTATGCAACTTTTTTTTCCCG-CAT--TGCCCA----ATT-TAA-GTTTAAATTAT-CAT-TAGTAA--AAACA-TTT-TGTCCGACAAA----ATT-NT-A-ATTA-------C--ATAACAG------A-TTTCTT--CATTTTGGTATGCAAATTAGTTTACAAAAATCCAAATTCA-ACNAATTTNC----NTACAAAATCCACTTATG-TTACAAAAGTTAATT
Reference ( family-5289 ) : CGGGGCGC-C-GAATGG-GAC--T-C----T----GA-TC-TTTT-G-------------TTC-T-------CAAAA--T-C------AATTT------T-G-T-GTANA--CAAAA-ATGAA-T-TTC-GTCANAACA-AAAAT-G---------------AGTTCAGGT--C---A----A-CAAAATT--GATCNT-GAA--TCACA-A-TAAN-TTAATTTTT-GT-ATTG----GTCGTACAAA---AT-TAT--CTT---TCA--GCG-GACA--AAATTC--AC--TTTT-GT-A--G-A--C--AA-AG--TC-AA-TTT-TGT-C-ACG--ACAAA-A--TTCACTT-TTGT----A---A---A-AGT-----CAATT-TTG-TCA-TGACAAAA------TTCGT--A-----AT--TT--GT----------CGAT-TNT----GTA-TGCAAA---------TAT-----T--AATC-TCA-TTTGC-A--T-------A-CAAAA-T--A-GACTTTT--GTT-ATC-TAATTTGC--AT---TA-A--AT-AANAAA-AG--------T-A-A--ATT---TTG-TCGGACAAAACTG-ATT--TTTAC----C-ATGATA----A----AA---A-CTTNAATC---CGNT-GCGGAA--AAT--AAGTTTGCAT-GAAGAAAT-T----------A--TA--TTT--ANGTA---GA------CGATCAAAA---AT----TTTTGT-CTATAA-C-AAATANTCGANTT-TTGTCATGACNAAA--TTCGATTTC-G-TCA-T-ACAAAA-TCA-CTTTTGT-GCGAC-AA-AA-T-GAATT---TTTTTGTC-ATGACAAAAAT--TGA--ATTTTGTC-ATG-ACAAAAGT--GAA--------TTTTGTCATGAC-AAAAG-------TGAA---TTTGTTCAA----CAAAAT-TC--GATTTTTG----CTC-TT--A-GCACA--AAAGT-GAA----TTT-----TGTTA-GTCACAAATTN-AATTTTGTC-ANGACAAA------------AA--C-G-TGATTTTGTCTC--A-CAA------AATT--G---AATTTTGTCATGACA-AAAGTGAATTTA--CGATCA--ACAAA-A-TGA--ATT-TTG----TCGACAAAATTCA-ATTTTCGTCT--AC-CTA------A-ATATAATCTCTTCATGCAACTTTTTTTTCCCG-CAT--TGCCCA----ATT-TAA-GTTTAAATTAT-CAT-TAGTAA--AAACA-TTT-TGTCCGACAAA----ATT-NT-A-ATTA-------C--ATAACAG------A-TTTCTT--CATTTTGGTATGCAAATTAGTTTACAAAAATCCAAATTCA-ACNAATTTGC----NTACAAAATCCACTTATG-TTACAAAAGTTAATT
gi|1 : CGGGGCGC-C-GATTGG-GAC--T------T----GA-TC-TTTT-G-------------CTAAT-------CAAAA--C-C------AATTT--------G-T-GTACA--CTAAA-A-GAA-T-TCC-GTCATAACA-A----------------------GTTCATTT--CTTGAC---A-CAAAAAG--TATGTT-GCT--TCATA-A-TAAC-TTCATTTTTTGT-ATTGATAAGTTGTACAAA---AT-TAGA-TTT---TCA--GTT-GACACAAAATTG--AA--TATT-GT-A--G-AACCTGAA-AC--TT-AACTTT-TGT-C-ACG--ACAAA-A--TTCATTT-TTGT----A---A---ATAAT-----CAATTATTG-TCAATGACAAAA------TTGGT--A-----AT--TT--GT----------CAAT-TAT----GTAGTGCAAA---------TAT-----TTTGATC-TCA-TTTGC-A--T-------A-CAAAA-T--A-AACTTTT--GTT-ATC-TTGTTTGC--AT---TA-A--AT-AAGAAA-AG--------T-A-A--ATT---TTG-TGAGACAAAATTGAATTCATTTGT----C-A-GACA----A----AA---AGTTTGCATC---TGTT-ATGTAA--AATTGAATTTTTCAT-GACAAAGTGT----------AATTC--TTT--GT-TA---GG------TGATCAAAG---GT----TCTTGTCCTATGACC-AAATAGTCGAATT-TTGTCATGATAAAAGGTTGAATTTC-GTTTA-T-ACAAAA-TGATCTTCTGTCATGAC-AA-AACT-GAATT---TTTTTGTC-ATGACAAAAAT--TGAAGATTTTGTC-ATGAACAAAA-T--GAA--------TGTTGTCATGAC-AGAAG-------TGAA---TTTGTCCAA----CAAAAT-TC--GA--TTTG----TTCGTTCAA-GCACA--AAAGTGGAA----TTT-----TGTTCTGTCACAAATGG-AATTTTGTCAAGGACGAG------------AA--CAG-TGATTTTATC-C--ACCAA------AATTTCG---ATTTTTGTCTTCACACCAAGTGAATTTA--CGATCA--ACAAA-A-TGAG-GTTGTTG----TCCAGTAAATT---ATTTT-GTCT---C-CTA------ACATATAATTTCTTATTGC-ACTTTTTTTTCCCG-CATTGTGCCCATTCCATTCTAA-GTTTAAATTAT-CATCTAGT-A--AAACA-TTT-TGTCCACCAAA----ATTCTT-A-ATTA-------C--ATGATGG------T-TTTC----AATTTGGGTATGC-AATTA-TTTACATAAAT-CAAATTAACACCTATTTTCATATATACAAATTCCA-TAATGTTTACAAAAGTTAATT
gi|10 : GGGGCGC-C-AAATGG-GAC--T-C----TTGT-GA-T---TTT-G-------------TTC-T-------CAAAAT-T-C------ATTTT------T-G-T-GTGGA--CAAAA-ATGAA-T-TTT-GT-AGAACA-AAAAT-G---------------AGTTCAGGT--C---A----A-CAAAATT--GATCAT-GAA--TCACA-A--AAA-TTAATTTT-------------GTCGCACAAA---AT-TAT--CTT---TCA--GCA-GACA--AAATTC--AC----------------------------------TTT-TGT-C-ATG--ACAAATA--TTCACTT-TTGTATACA---A---A-AGT-----CAATT-TTG-TCT-GGAAAAGATTAAT-TTTGT--AACTATAT--TT--G------------GAT-TTT----GTA-TGCAA-----------AT-----T--AG--------TTGA-A--T---------------T--G-GATTTTT--GTG-AAC-TAATTTGC--ATACCAA-A--AT-GAAAAA-AATTCATAATT-G-A--ATT---TTG-TTGGACAAAA-TG--TT--TTTAC----TAATGATAATTTA----AA---A-CTTAAATTGGGCAATCGCGGAA--AA---AGGTTGGCAT-AAAGAAAT-T----------A--TA--TTT--AGGTA---GA-----------GAAA---AT----TT
gi|11 : tctGGCGC-C-AAATGG-GAC--T-C----TTGT-GA-TT-TTGA-G-------------TTC-T-------CAAAA--T-T------CATTT------TAG-T-GTGGA--CAAAA-ATGAA-T-TTT-GT-AGAACA-AAAAT-G---------------AATTCAGGT--C---A----G-CAAAATT--GATCAT-GAA--TCACA-A--AAA-TTTATTTTT-G-------------GCACAAA---AT-TAT--CTT---TCA--GCA-GACA--AAATTC--AC----------------------------------TTT-TGT-C-ATG--ACAAA-A--TTCACTT-TTGTAGACA---A---A-AGT-----CAATT-TTG-TCT-GGACAGAAATAACTTTTGT--AACAT-AT--TT--G------------GAT-TTT----GTA-TGCAA-----------AT-----T--AGTT-GAA-TTTG--------------------------GATTTTT--GTA-AAC-TAATTTGC--ATAC-CAGA--ATGAAAAAA-AA--------TCATA--ATTGAATTGTTTGGACAAAA-TG--TT--TTTAC----G-ATAATT----T----AA---A-CTTAAATTGGGCAAC-GCGGAA--AA---AAG-TTGCAT-AAAGAAAT-T----------A--TA--TTT--AGGTA---GA------CA---AAAA---AT----T
gi|12 : aaattACA--AATGT-AAA----TTT-----TGTGA-G--ACAAATTTGAATTTTGTC-ATGA-AAA------------AA----G-TGAAT---------------------AGT--G---AATTGTGTCATGACA-AAAATGAATT-A--TG-TCATGATAAA-AGTGA--ATT-TTG----TTGAAAAAATTCATATTT--GTCT--AC-CTA------A-ATCTAATCTCTTCACGCAA---TTTTTTCCC---AT--TGTCTA----ATT-GAA-GTTAAAATTAA-CAT-TAGTAA--AAAAAACTT-TGTCCCACAAA----ATT-G--A-ATTA-------TGAATAACAGTACTGAA-TTTCTT--CATTTTGGTATGCATAATAGTTTACAAAAATCTAAATTCA-ACAACTTTGC----TTAC-AAATCCACTTATG-CTACAAAAGTTAATT
gi|12 : atgtagtttgcattagataATTTC---TCA-TGACAAAACTCA-CATTTGT-A-GAC-AACAA-T-CAATTGCATGTATGTT-TTGACAGAA-T--TAA--CTTTTGT----A-GCATAAGT--GGA--------TTT-GT---------AAG-------CAAA---GTTGTTGAA----T----T-TA--GATTTTTGTAAACTA-TT--ATGCATACCAAAAT-GAAGAAATTCAGTACTGTTA-TTCATAA-TTC-AATTTTGT--GGGACAAAGTTTTTTTTACTAA--T-GTTAATTTTAACTT----CAATTAGACAATG--GGAAAAAATTG-CGTGAAG-AGATTAGATTTA---GGTAG--ACAAATA-TGA--ATT-TTT----TCAACAAAATTCA-CTTTTctgtcaaaacatacatgcaattgattgttgtctacaaatgtgagttttgtcatgagaaatt
gi|13 : atgtagtttgcattagataacaaatgtaaattttgtgagacaaatttgaattttgtcatgaaaaaagtgaatagtgaattgtgtcatgacaaaaatgaattatgtcatgatCGGGGCGC-C-GATTGG-GAC--T------T----GA-TCCTTTT-GCAATCAAAACCAATTT-TGTGTACACAAAA--T-AG-----AATTC------C-G-TCATA-A--CAAAA-TTCAA-T-TTT-GTCACA-CA-AAAGT-GTGCTGCTTCGTAATAACTTCATAN--N---N----N-NNNNNNN--NNNNNN-NNN--NNNNN-A-TAAC-TTCATATTT-GT-ATTGATAAGTTATACAAA---AT-TAT--TTT---TCATTNNN-NNNN--NNNNNN--NN--NNNN-NN-N--N-N--N--NN-NN--NN-NN-NNN-NNN-N-NNN--NNNNN-N--NNNNNNN-NNNN----N---N---N-NNN-----NNNNN-NNN-NNN-NNNNNNNN------NNNNN--N-----NN--NN--NN----------NNAT-TAT----GTA-TGCAAA---------TAT-----C--AATC-TCA-TTTGC-A--T-------A-CAAAA-T--A-GACTTTT--GTT-ATC-TAGTTTGC--AT---TA-A--AT-t
gi|14 : taCGGGGCGC-C-G-ATTG-GAC--T------T----GA-TC-TTTT-G-------------TAA-T-------CCAA------------AATTT------T-G-T--TACA--CAAAATACGAA-T-TTCGGTCATAA-A-AAAAT-T---------------CTTTTTTGT--C---ACACCA-TAGAAGT--AATGAT-TGACTTCATA-A-TAAA-TC-ATTTTT-GTAATTG-----------AAA---ATATAT------------------ACA--AA--TT--AT--TTCT-TC-A--G-AGCT--AA-AT--TG-AA-TTTCTGT-A-ACG--ACAAA-A--ATCCATT-TTGT----A---A--------------------TGCTCATTGACAAAA------TTCAT--------TT--TT--GT----------CAATCTAT----GTA-TGTCAA---------TAT-----C--AATC-TC--TTTGCAA--T-------A-CAAAA-T--AGGACTGTT--TTT-ATC-TAA-TTGC--AT---TA-T--A--AACAAACAG--------TAA-A--ATT---TT
gi|15 : GC-C-GATTGG-GAC--T------T----GA-TC-TTTTTG-------------TAA-T-------CAAAA--C-C------AATTT------T-G-T-GTACA--CAAAT-A-GAA-T-TCC-GTCGTAACA-AAATT-C---------------ATTTT-TGT--C---AC---A-CAAAAGT---ATGTT-GCT--TCATA-A-TAAC-TTCATTTTT-GT-ATTGATAAGTTATACAAA---AT-TAT--TTT---TCA--GTT-GACA--AAATTC--A---------------------------------A-TTT-TGT-C-ACA--ACAAA-A--TCCA-TT-TTGT----AGATA---A-ACT-----CAATT-TTG-TCA-TGACAAAA------TTC----A-----AT--TTT-GT----------CAAT-TAT----GTA-TGCAAA---------TAT-----C--AATC-TCA-TTTGC-A--T-------A-CAAAA-T--A-GACTTTT--GTT-ATC-TAGTTTGC--AT---TA-A--A
gi|16 : tGGCGC-C-AAATGG--AC--T-CCTTGT----GA-T--TTTT-G-------------TCT-TG------CAAAA--TTC------ATTTT------T-G-T-GTCGA--CAAAA-ATGAA-T-TTT-GT-AGAACA-AAAATTG---------------AGTTCAGGT--C---A----A-CAAAATT--GATCATGGAA--TCACA-A-AAAT-TTAATTTCT------------GTCGCACAAA---A--TAT--CTT---ACA--GCA-GACA--AAATTC--AC--TATT-GT-A--GAA--C--AA-AG--TC-AA-TTT-TGT-C-TGG--ACAGA-A--TTAAC-T-TTGT----A---AC--ATATT-----GGATT-TTG-T-A-TTGC-ATA------TTAGTTGA-----A---TT--G------------GAT-TTT-------------------------T-----T--AAAC-TAA-TTTGC-A--T-------ACCAAAA-T--
gi|17 : ttc-T-------CAAAA----C------AATTT--------G-T-GTACA--CAAAATAGAAA-T-TCC-GTCATAACA-AAATT-C---------------ATTTT-TGT--C---A----AACAAAAGT---ATGTT-GCT--TCCCA-A-TAAC-TTA-TTTTT-GT-ATTGATAAGTTGTACAAA---AT-TAT--TTT---TCA--GTT-GACA--AAATCC--AT--TTTT-GT-A--G-A--T--AA-AC--TTAAA-TTT-TGT-C-ATGAAACAAA-A--TTCATTT--------------------GT-----CAATT-ATG-T-A-TG-CAAA-------------------------T--AT----------CGA-----------------------------------------TC-TCA-TTTGC-A--T-------A-CAAAA-T--A-GACTTTT--GTT-ATC-TAGTTTGC--AT---tagtc
gi|18 : ttttgtgaaG----TTGACAAAATTCA--TTTTTGTCT--AC-CTACATGTAA-ATATAATCTCTTCATGCAACTTTTTCTTCCCA--------------------------TTAAATTAT-CAT-TAGTAA--AAACA-GTT-TGTCCGACAAA----ATT--T-A-ATTA-------TGAATTACAGAAATGAA-TTTCTT--CATTTTGGTATGCAA-----------------TAAATTCA-ACAAATTTGC----TTACAAAATCCACTTATG-TTACAAAAGTCAAaa
gi|19 : AAAATT-A-ATTTTCGTCTTAAC-CTA------A-ATATAATTTCTTTATGCGACTTTTTTTCCTTG-CAT--TGCCCA----ATT-TAA-GTTTAAATTATGCA--TAGTAATTTAACA-TTTGTGTCCAACAAA------T-TC-A-ATT------------TGA---------A-TTTTTT--CATTTTGGTATGCAAATTAGTTCAC--AAATCCAAATTCA-ACTAATTTGC----AT
gi|2 : GGGCGT-C-GAATGGCGAC--T-----------GACTT-TTTT-G-------------TAA-T-------CAAAA--C-C------CATTT--------G-T-GTACA--CAAAT--TGAAGT-TCC-GTCACAACA-AAA---------------------TTCATTT--T---A----T-TATG-TT--G--CTT------TCATATA-TAAGCTTCATTTTT-GT-ATTGATTAGTTATACAAA---AT-TAT--TTT---TCGC-GTG-GACA--AAATTA--AA--TTTT-GT-A----A--CG-AA-AA--TC-A--TTT-TGT-C-ACG--ACAGA-AAGTCCATTT-T-------A---A---A-GGTTAC--CAATT-TAG-T-A-TTCCAATC------TTTGTC-A-----ATA-TT--GTATGCAAATATCAAT-CTTCATTGTA-TACAAAATAAGACTTTGT-----T--TATC-TTAGTTTGC-A--TTAAATAAA-CAAAAGT--A--ATTATT--ATT-GAC-AAAGTTGA--AT---TT-GTCAT-A-CAAA-AGC-------T-G-G--ACT---TTG-TTA-ACAAAACTG-AAT--TTGAT----C-A--ACA----A----A-------TTCATTN---NNNN-NNNNNN--NNN--NNNNNNNNNN-NNNNNNNN-N----------N--NN--NNN--NNNNN---NN------NNNNNNNNN---NN----NNNNNN-NNNNNN-N-NNNNNNNNNNNNN-GT-TCA--ACCAA----TCATTTTT-G-TCT-T--CATAA-T----TTTTGT--CAAC-AA-AA-----ATTCA-TTTTTGTC--TCACAAAAG---TGA--ATTTTGTA-ATG-ACAAAAGT--GAA--------TTTAGTCA--ACAAAAAA-------TGAAGATTTTGTTAGA----CAAAAT-TT--CATTTTTG----ATC-cct
gi|20 : T--C---A----A-CAAAATT--GATCTT-GAA--TCACA-AATAA--TTAATTTT-------------GTCATGCAAA---AT-TAT--CTT---TCA--ACG-GACG--AATTTC--GC--TTTT-TT-A--G-A--C--AACAG--TC-AA-TTT-TAT-T-CTT--ACAGA-A--TTAAC-T-TTGA----A---ACATA-AGT-----GCATT-TTG-T
gi|21 : caaaaaaacaacaacaaaacacaccccaaaaaacccaagcttCGGGGCGC-C-AAATGG-GACCTT-G----T----GA-T---TTT-G-------------TTC-T-------CAAAA--TTC------ATTTT------T-G-T-GTGGA--CAAAA-ATGAA-T-TTT-GTAGAAACA-AAA-T-G---------------AGTTCAGGT--C---A----A-CAAAATT--GATCAT-GAA--TCACA-A--AAA-TCAATGTT-------------GTCGCACAAA---AT-TAT--CTT---TCA--GC
gi|22 : AC-AA-AA-TTGAATT---TT---GTC-ATGACACAAAG--TGA--ATTTTGTCAATG-ACAAAAGT--GAAAAGTGAATTTCTGTTGTGAC-AAAAG-------TGAAT--TTTGGTCAA----CAAAAT-TT---ATTTTTG----CTC--------CACAT-AAAGT-G-A----TTT-----TGTCA-A-CAAAAATT---ATTTTGT
gi|23 : --C---A----A-CAAAATT--GATCTT-GAA--TCACA-AATAA--TTAATTTT-------------GTCATGCAAA---AT-TAT--CTT---TCA--ACG-GACG--AATTTC--GC--TTTT-TT-A--G-A--C--AACAG--TC-AA-TTT-TAT-T-CTT--ACAGA-A--TTAAC-T-TTGA----A---ACATA-AGT-----GCATT-TTG-Tg
gi|24 : gctt--C---A----A-CAAAATT--GATCTT-GAA--TCACA-A--ATA-TTAATTTT-------------GTCATGCAAA---AT-TAT--CTT---TCA--ACG-GACG--AATTTC--GC--TTTT-TT-A--G-A--C--AACAG--TC-AA-TTT-TAT-C-TTG--ACAGA-A--TTAACTT-TTGA----A---ACATA-AGT-----GCATT-TTG-T
gi|25 : cttAAAATTTA-ATTTTT-TCT--ACGCTA------AGATATAATTTCTTTGTGCA--TTTTTTTTTCCG-CAT--TGCCAA----ATT-TAAGGTTTAAATCAT-CAT-TAGTGA--AAACATTTT-TGTTCCAAACA----ATT-TC-AGATTA-------
gi|26 : CGACAAA----ATT--T-A-ATTATGAATTGC--AGAACTG------AATTTCTT--CATTTTGGTATACAAATTAGCTTACAAAAATCTAAATTCA-ACAAATTTAC----TTCCAAAATCCACTTGTG-TTACAAAAGTTAATtgatt
gi|27 : tAGTGAATTT---TG-TCA--ACAAA-AATGA--ATC-TTGCCAGTCGACAAAATTCA--TTTTTGTTT--AT-CTA------A-ATATTATCTCTTCATGCAAC---TTTTTCCC--CAT--TGCCTA----ATT-TAA-G-TTAAA
gi|28 : GTCT--AC-CAA------A-ATATAATTTCTTTATGCAAATTTTTT---CCG-CGT--TGCCAA----ATT-TAA-GTTTGAATTAT-CAT-TAGTAA--AAATA-TTT-TGTCCAACAAA----ATT-C--A-ATTA-------
gi|29 : -C-AAATGG-GAC--T-TGG--T----GA-T--TTTT-G-------------TTC-C-------CAAGAATT-CG-----AATTTACCTTAT-G-T-GGATT--CAAAA--TGAA-TCTTT-GCTTCAACA-AAAAT-G---------------AGCTCAGtgaat
gi|3 : tagatgaacctag-A--AT-AAAAAACAG--------T-G-A--ATT---TTG-T----TAAAA----ATT--TTAACTTGTC-ATGACA----A----A
gi|3 : ctagataacagatgtGGGGCGC-C-AAATGG--AC--T-C----TTTGTGA-T---TTT-G-------------TTC-T-------CAAAAATT-C------ATTTT------T-GCT-GTGAA--CAAAA-ATGAA-T-TTT-GT-ACAACA-AAAAT-G---------------AGTTCAGGTAAC---A----ACCAAAATC--G-TCAT-GAAT-TTACA-A--AAA-TTAATTT--------------GTCTTACAAA---AA-TATCACTTTG-TCA----T-GACA--AAATTC--ACTTTTTT-GT-A--G-A--C--AACAG--TC-AA-TTT-TGT-CTTTG--ACAGA-A--TT-AATT-TTGT----A---ACATA-AGT-----GGATT-TTG-----TAGCAAA---------TGTG-A-----AT--TT--A------------GAT-TTT--------TGTAA-----------AC-----T--AA-----A-TTTGC-ATTT-------A-CCAAA-TGAA-GAAATTCAAGTT-CTG-TAATTT-C--A----TA-A--AT------------------T-A-A--ATT---TTG-TCGGAC--AACTG--TT--TTTAC----TAATGATA----ATTTTAA---A-CTTCAATTAGGCAAT-TTGGAA--AAA--TAG-TTGCTT-GAAGAGAT-T-------------TA--T----------------------ATTAAAA---G-------------TATGA-C-AAA-AGT-GAATT-TTGTCA--ACAAAA--TTTCATTT----TTG-T-AC-----T---CTTTTGT---GAC-AA-AA-T----TC---ACTTTGTG-AAGACCAAAAA--TGA--AATTTGTC-ATG-AC--AAGTTAAAA--------TTTT----TAAC-AAAAtttcatttttggtcttcacaaagtgaattttgtcacaaaagagtacaaaaatgaaattttgttgacaaaattcacttttgtcatacttttaatataaatctcttcaagcaactatttttccaaattgcctaattgaagtttaaaattatcattagtaaaaacagttgtccgacaaaatttaatttatgaaattacagaacttgaatttcttcatttggtaaatgcaaatttagtttacaaaaatctaaattcacatttgctacaaaatccacttatgttacaaaattaattctgtcaaagacaaaattgactgttgtctacaaaaaagtgaattttgtcatgacaaagtgatatttttgtaagacaaattaatttttgtaaattcatgacgattttggttgttacctgaactcatttttgttgtacaaaattcatttttgttcacagcaaaaatgaatttttgagaacaaaatcacaaagagtccatttggcgcccc
gi|30 : ctagataacagatgtaataaaaaacagtgaaACAAAAGT---GA--ATTTTGTC-ATG-AGAAAAGT--TAA--------TTTTGTCA--AC-AAAAATGATTCCTGAG---TTTGTCCAAAACTTAAAATCTCTAGAATTTT
gi|30 : atg-ACAAAAGT--GAA--------TTTTGTCATGAG-AAAAG-------TTAA---TTTTGTCAA----CAAAAA-T---GATTCCTG----
gi|31 : atgaaaattctagagattttaagttttggacaaactACA-A-TAAT-TTCATTTTT-AT-ATTG---------ACAAA---AT-CTT--TTT---TCA--GTG-GACA--AAG-TG--AA--TTTT-GTCAT-G-A--CG-AA-AG--TT-AA-
gi|32 : ttagtatgttgcttcatCGGGGAGC-C-AAATGG-GAC--TAT----T----GT-TA-TTTT-G-------------TTC-T-------CAAAA--T-TCAGATGAATTT------T-G-T-ACA-A--CAGAA-A-GGC-T-TTC-
gi|33 : atctCGGGGAGC-C-AAATGG-GAC--TAT----T----GT-TA-TTTTGG-------------TTC-T-------CAAAA--T-TCATGTGAATTT------T-G-T-ATA-A--CAGAA-A-GGC-T-TTC-t
gi|4 : atctCGGGGCGCTC-AAATGG-GCC--T-CGTG-T----GA-T---TTT-G-------------T-C-T-------CAAAA--TTC------CATTT------T-G-T-CTACAGACAAAA-AT-AA-T-TTT--TTGGTACACAAAAT-G---------------AGTTCAGGT--C---A----A-CAAAATTCGGATCAT-GAA--TTACA-A--AAA-TTAATTTT-------------GTCTTACAAA----T-TAA--CTT---TTG--TCATGACA--AAATTTCAAC--TTTT-GT-A--G-A--T--AA-AGCTTC-AA-TTT--GT-C-TTG--ACATA-A--TG-ACTTCTTGT----ACACAT--A-AGT-----GGATT-TTG-TAA--GACAA-----------------------------------------------TT----GTG-TG--AA---------T-T-----T--A---------TTGC-A--T-------A-CAAAT-G--A-GAACATT--CTT-CTG-TAAT---C--AT------A--AT------------------T-A-A--ATT---TTG-TCGGAC--AACTG-TTT--TTTAC----TAATGATA----A------------TTTAAT-----G-----GGAAGTAAA--AAG-TTGCAT-GAAGAGAT-TA---------A--TAACTTTACATGTAAGGGT------AGATCAAAA---ATGAAATTTTGT-C--TAA-CAAAATCTTCATTTT-TTGT--TGACTAAA--TTCACTTTT-G-TCATT-ACAAAATTCA-CTTTTGT-GAGACAAA-AA-T-GAA-----TTTTTGT---TGACAAAAATTATGA--A----------G-ACAAAAAT--GA
gi|5 : AAA-A-TGA--ATT-TTG----TCCACAAAATT-A-ATTTTCGTCT--AC-CTT------A-ATATAATCTCTTTAGGCAACTTTTTT---CCGTCAT--TGTTCA----ATT-TAA-GTTTAAATTAT-CAT-TAGTAA--AAACA-TTT-TGTCCAACAAATTCAATT-ATGA-ATTA-------C--ATAACAG------A-TTTTTTTTCATTTTGGTATGCAAATTAGTTTACAAAAATCCAAATTCA-ACTAATTTCC----ATACAAAATCCAATTATG-TTACAAAAGTTAATTttggtt
gi|6 : acaGGGCGC-C-AATTGG-GAC--T------T----GA-TC-TTTT----------------------------------------------------------T-GTAAT--CGAAA--TCAA-T-TTT-GT--GTACATAAAA------------------AGT--------------------AAAAT-------CT-G----TCACA-A-CAAA-ATAATTTTT-GT-----------CTAACAAATATAT-TATA-CTTGTTTTA--T---------AACTTC--AT--TTTTTGT-AATG-A--C--AA-AA--CC-AAATTT-TGC-T-AC---ACAAA-A--TT-ATAT-TT-C----A---A---A-AGT-----CA-TT-TTGATCT-TTACAAAA------TC-----A-----AT--TTTTGT----------CAAT-AAG----GTA-TGCAAA---------TACATGTAT--AAAC-TTA-TCTGT-A--T-------C-CAAAA-T--T-GACTTTT--GTT-ACC-TAATTTGCAAAT---TA-A--AT---CACA-AG--------T-T-A--ATT---TGG-TGAGACAAAAATA-AAT--GTTGT----C-ATGACA----A----AAGTGA-CCTTCGTC---CGCT--C-GAT--AAT--AATTTTATGT-AACAAAAT-TTACTTTTGTGA--TA--TGT---TGTA---AAATTTGTTAATCTGAACTCAT----TTTTGT--TG-AA-C-AA--ACTC-ACCT-TTGTCAACGCGAAA--TTGGATTTC-A--AG-T-ACAAAA-TCA-Cctgtccagaaaacatcatggtttcaaggttatgtaaaaaatactaacactttccactttctgaacagtttttgtaaatctttgaatattgacttgagttatattctgaaaacaaatgtatttaatctgatcaatcatgaaatgctgttatcatttccatcgttttacagagaagcaattatatttttcatggacggtaagaaaattgagaaattgtgtgacttgtcctcaaactcttttcttcgacaaac
gi|7 : G-GACA--AAATTA--AA--TTTT-GT-A--T-A--C--GA-AA--TC-AAATTT-TGTTC-ACG--ACAAA-A--TCCATTT-TT----------A---A-GGCATTACCAATT-T-----A-T------A------TTC----A-----ATCTTT--GT----------CAATATAT----GTA-TGCAAA---------TAT-----C--AATCTTCA--TTGT-A--T-------A-CAAAA-T--A-GACTTTG--TTT-ATCTTAGTTTG---AT---TA-A--ATAAACAAA-AG--------T-A-ATTATT---Taagaacctcactagtgtcc
gi|7 : TAA-C-TAAAACT-GAATTGTTGTCA--ACCAA---TTCTATTTTTG-TCT-C-AT-----TAA-TTTTTGT--CAAC-AA-AA-----ATTCA-TTTTTGTCTCTCACAAAAGT---GA--ATTTTGTA-ATG-ACAAAAGT--GAA--------TTTAGTCAAGCA-AAAAA-------TGAAGATTTTGTT-GA----CAAAAT-TC---ATTTTTG----TTC-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaactaaaactgaattgttgtcaaccaattctatttttgtctcattaatttttgtcaacaaaaattcatttttgtctctcacaaaagtgaattttgtaatgacaaaagtgaatttagtcaagcaaaaaatgaagattttgttgacaaaattcatttttgttc
gi|7 : ggacaaaattaaattttgtatacgaaatcaaattttgttcacgacaaaatccatttttaaggcattaccaatttatattcaatctttgtcaatatatgtatgcaaatatcaatcttcattgtatacaaaatagactttgtttatcttagtttgattaaataaacaaaagtaattatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATTA-ATTTTTGTC-A--ACAAA------------AATTC-A-T--TTTTGTCTCTCA-CAA------AAGT--G---AATTTTGTAATGACA-AAAGTGAATTTAGTCAAGCA--A-AAA-A-TGAAGATT-TTG----TTGACAAAATTC--ATTTTTGT
gi|8 : ggacaaaattaaattttgtatacgaaatcaaattttgttcacgacaaaatccatttttaaggcattaccaatttatattcaatctttgtcaatatatgtatgcaaatatcaatcttcattgtatacaaaatagactttgtttatcttagtttgattaaataaacaaaagtaattatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaactaaaactgaattgttgtcaaccaattctatttttgtctcTT-TTG----TCCACAAAATT-A-ATTTTCGTCT--AC-CTT------A-ATATAATCTCTTTAGGCAACTTTTTT---CCG-CAT--TGTTCA----ATT-TAA-GTTTAAATTAT-CAT-TAGTAA--AAACA-TTT-TGTCCAACAAATTCAATT-ATGA-ATTA-------C--ATAACAG------A-TTTTTTTTCATTTTGGTATGCAAATTAGTTTACAAAAATCCAAATTCA-ACTAATTTCC----ATACAAAATCCAATTATG-TTACAAAAGTTAATTtc
gi|9 : GGGCGC-CCAAATGG-GAC--T-C----T----TG-TG-ATTT-GC------------TTC-T-------CAAAA--TTC------ATTTT------T-G-T-GTGGA--CAAAA-ATGAA-T-TTT-GT-AGAACA-AAAAT-G---------------AGTTCAGGT--C---A----A-CAAAATT--GATCAT-GAA--TCACA-A--AAA-TTAATTTT-------------GTCGCACAAA---AT-TAT--CTT---TCA--GCA-GACA--AAATTC--AC----------------------------------TTT-TGT-C-ATG--ACAAATA--TTCACTT-TTGTATACA---A---A-AGT-----CAATT-TTG-TCT-GGACAGAATTAACTTTTGT--AACAT-AT--TT--G------------GAT-TTT----GTA-TGCAA-----------AT-----T--AGTT-GAA-TTTG--------------------------GATTTTT--GTGAAAC-TAA-TTGC--ATACCAA-A--AT-GAAAAA-AATTCATAATT-G-A--ATT---TTG-TTGGACAAA--TG--TT--TTTAC----A-ATGATAATTTA----AA---A-CTTAAATTGGGCAAT-GCGGAA--AA---AAGGTTGCATAAAAGAAAT-T----------A--TA--TTT--AGGTA---GA------CG---AAAA---ATTAA-TTTTGT-GGACAA---AATTAAT---TTT-TTGTctgtccagaaaacatcatggtttcaaggttatgtaaaaaatactaacactttccactttctgaacagtttttgtaaatctttgaatattgacttgagttatattctgaaaacaaatgtatttaatctgatcaatcatgaaatgctgttatcatttccatcgttttacagagaagcaattatatttttcatggacggtaagaaaattgagaaattgtgtgacttgtcctcaaactcttttcttcgacaaac
blockSeqs : T CA C CT CCTTGT C CC T CAATCAAAACCAATTTTGTGTACA TTCAGATG ACCTTAT C C G GA TAC G C G C G C GTGTGCTGCTTCGTAATA AG AA . CACCA CGG A G A CT T AT GC A TGTATTGATAA G TAT A CA GTT TTNNN . CA TTTTTTGTAATGACAAAACCAAA C T ATGAA T AG C CT C TATACAAA ATTACC . TATTCCAATCTTTGTCAATATTGTATGCAAATATC C T CATT . AATAAGACTTTGTTTATCTTAG CA TT TAAATAAA G GAA AA A T AA ACCA G TC GAAAAAAATTCATAATTG TT GAA T T A CTGA . TTGTC T ATTTAAAA A TGGGCAATCG GT NNNNN A . TACTTTTGTGATATGTTGTAAAATTTGTTAATCTGAACTCATTTTTGTTGAACAAACTCAC G TG C A CA TGTCATTACAAAATTCA GA A C TCAATTGCA CTC ATTAT . CA . TA AAGTGAAT A TGTGAC TGATTCC GAT G AACT C CTAG T TAAACTATTAT CC . A GAAA AGTAC TT TG CAT C GTTTTTTTTACTAATGTTAATTTTAACTTCAATTAGACAATGGGAA T A . TAGTCAA TG T T G AG . CCAG G CATA T TA G CATGTA G C C TTC GT . T . . G G . TT A G C TTCA ATG G TGAATAACAGTACTGAA TT AA . A G T C .
blockSeqs : . A . . CTTTGT . T G TCTTG TTCATGTG TA . . G . TAG . . . C G T ATTG AG . . CA G A . A T . AT A T TGTATTGATAA G . . A TG CGTG . . CTTTTTTGTAGACAACAGTCAA . . TTTG T . C CT . TAGACAAA TACC . TCTGGAAAAGATTAATTTTGTAACTATATTTG A T . . ATACATGTATAAACTTA A . AC . AG . . . . ACCA . . GAAAAAAATTCATAATTG . . . T A CTGT . TA T ATTTTAAA A TGGGCAACG . TAATT . . AATAACTTTACATGTAAGGGTAGATCAAAAATGAAATTTTGTCTAACAAAATCTTCATT . AC A A TC CTCATGACAAAACTCA A . . TTGAATT TT AGT . A . . . T CATGAG . GAT A . . AG T CTC T . A . . G C GG C AATTCATTTTTGTCTCTCACAAAAGTG T G . TAGG . C . A . . . A CAC C . . . . C C TTC A . C . . . . . . T . G TTCA ATG . TGAATTACAGAAATGAA TT AA . A G T C .
blockSeqs : . A . . CTTGT . C . CTTCT ATTCG T . . C . AT . . . C C . ATG AT . . AA G N . N . . T A C TGTATTGATAA A . . . . TCAT . . ATTTTGTCATGACGAAAGTTAA . . ATG . . N NN . TACACATA C . TCTGGACAGAAATAACTTTTGTAACATATTTG . A . . ATATCAATCTTCA C . A . G . . . . ACC . . GAAAAAAAATCAT . . . T A ATAA . TA T ATTTAAAA C TAGGCAATT . AGGT . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN . . T A CA CAAGTACAAAATCA C . . ATTCA CA AAT . C . . . T CAAGCA . T C . . TC T . . . . . A A CA . AAGTGAATAGTG . A . ATG . C . . . . . G TAA T . . . . T C TCC G . A . . . . . . . . A . TC . TGAATTGCAGAACTGAA . AA . T G A C .
blockSeqs : . G . . CTTGT . C . TTCT ATTC C . . C . AT . . . C T . ATG TT . . AC N A . G . . T C C TGTATTGATTA A . . . . GCA . . TTTCTTCAGAGCTAAATTGAA . . ATG . . C AT . TATACAAA C . TCTGGACAGAATTAACTTTTGTAACATATTTG . A . . ATATCAATCTCA C . A . A . . . . T . . AACAAACAGTAA . . . C A CTG . TA T AAAGTGA C TGGGCAATG . ATAG . . ATATTTAGGTAGACGAAAAATTAATTTTGTGGACAAAATTAATT . . G . GG TGTCTTCATAAT C . . ATTCA GA TT . C . . . T CAACA . . C . . T A . TTG . . . . . . . G CA T . . . . T A TTT G . T . . . . . . . . C . TC . CATAACAGA . AA . A A T A .
blockSeqs : . G . . CGTGT . T . TTCT TTC T . . G . TT . . . C T . ATT AG . . A A T . C . . T A A TGTAATTG G . . . . GCA . . CTTTTGTAGATAAAGCTTCAA . . NNN . . C TT . TAGATAA N . CTCATTGACAAAATTCATTTTTGTC . A . . ATATCAATCTCA C . A . A . . . . T . . AAAAAACAGTG . . . C A TG . G T TAAA T NNNNNN . AAAG . . TATATTAAAAGTATGACAAAAGTGAA . . C . CT TTGTCTCATTAA . . . TGAA C GT . A . . . T TAAC . . C . . G T . . . . . C AA C . . . . C C TTC G . A . . . . . . . . G . G . CATAACAGA . . . T C A A .
blockSeqs : . G . . TGGT . A . TAAT TAG T . . C . AT . . . A G . TTC AT . . G G A . A . . A C A TATATTG G . . . . GTT . . CTATTGTAGAACAAAGTCAA . . ACG . . A TT . AAACATA C . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN . T . . ATATCAATCTC C . A . A . . . . T . . AAACAAAAGTA . . . G A TG . C T AA T CCGCT . AAGG . . . TTGTACT . . TTC . GT . . . . . A CAAC . . . . . C T . . G CA T . . . . T C . G . C . . . . . . . . A . T . TGAA . . . T C A
blockSeqs : . A . . ATT . A . TAAT TTC T . . C . AT . . . T T . TTC AG . . N G T . C . . T T C TGT A . . . . GCA . . TTTTTGTAGATAAACTTAAA . . ACA . . C CT . AAACATA G . ATCTTTACAAAATCAATTTTTGTC . T . . ATTAGTTGAA C . A . A . . . . T . . ACAAAAGCTG . . . T . TG . C T A A G . AAG . . GT . . . . . . . . C AA C . . . . T . . . . C . . . . . . . . A . T .
blockSeqs : . G . . ATT . C . TAAT TTC T . . G . AT . . . T C . ATG AG . . A G T . A . . T C A TG A . . . . GTT . . CTTTTTTAGACAACAGTCAA . . TGG . . C AT . AAACATA C . TCATGACAAAATTCAATTTTGTC . T . . ATTAGTTGAA C . A . A . . . . T . . CACAAGTT . . . . . A . A . . . CA . . . . . T . . . . . . . . A . C .
blockSeqs : . A . . GT . G . TTCT TTC T . . T . AT . . . . A . ATG AG . . T G T . A . . T A A T G . . . . ACG . . CTTTTTTAGACAACAGTCAA . . ACG . . A CT . TAACATA G . TATTGCATATTAGTTGAATTG . T . . TTAAACTAA C . C . T . . . . T . . TA . . AA
blockSeqs : . A . . CT . . . TTCC TTC T . . A . AT . . . . C . ATG AG . . A G A . A . . C A A . A . . . . ACG . . CTTTTTTAGACAACAGTCAA . . CTT . . A TA . TAACAT G . TAGCAAATGTGAATTTA . A . . ACTAAA T . A . A . . . . T . . TA . .
blockSeqs : . A . . T . . . TTCT TT T . . C . A . . . . C . ATG AG . . A G T . A . . . A A . A . . . . ACG . . ATTTTGTATACGAAATCAAA . . CTT . . A TT . NNNN G . ATATTCAATCTTTGTC . A . . ATTAG T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . T . . . TTCT CC T . . A . T . . . . G . TG T . . A G T . A . . . T A . T . . . . GTG . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNN . . TTG . . C CT . CAAA G . TATGCAAATATC . T . . TCTCA . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . T . . . TTCT CC T . . G . T . . . . G . A T . . A G A . A . . . A C . T . . . . GCA . . ATTTTGTAACGAAAATCA . . TTG . . C T . TAA G . TAAGACAA . . . . ATTTA . . . .
blockSeqs : . A . . T . . . TCT C . . . . . A . . . . G . . . . . A . A . A . . . A A . T . . . . T . . C . . ACG . . . C . AAA C .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . . . A . . . . . A . C . . . . . A A . G . . . . T . . C . . ATG . . . C . AA C .
blockSeqs : . . . . . . T . . . . . . . A . . . . . . A . . . . . . . . . A . . AC . . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . C
blockSeqCons : TTCT********************* TTC******** T******* AT* ATG**************** *** A***** TGT********** ** ** CTTTTNTAGACGAAGTCAA**************** TAACATA******** ATTTAATCTNA******************* GAAAAAAAGTG*********** TG*** ** ATAAAA********** TGGGCAATG* AAGG*** ** A** TTGTCATTACAAAATTCA*** C** TATTCA***** GT*** ** N*** TNG**** ** NA** ** **** T*** CGAATNACAGAATGAA********* N****
originalCons : CGGGGCGC-C-GAATGG-GAC--T-C----T----GA-TC-TTTT-G-------------TTC-T-------CAAAA--T-C------AATTT------T-G-T-GTANA--CAAAA-ATGAA-T-TTC-GTCANAACA-AAAAT-G---------------AGTTCAGGT--C---A----A-CAAAATT--GATCNT-GAA--TCACA-A-TAAA-TTAATTTTT-GT-ATTG----GTCGTACAAA---AT-TAT--CTT---TCA--GCG-GACA--AAATTC--AC--TTTT-GT-A--G-A--C--AA-AG--TC-AA-TTT-TGT-C-ACG--ACAAA-A--TTCACTT-TTGT----A---A---A-AGT-----CAATT-TTG-TCA-TGACAAAA------TTCGT--A-----AT--TT--GT----------CGAT-TNT----GTA-TGCAAA---------TAT-----T--AATC-TCA-TTTGC-A--T-------A-CAAAA-T--A-GACTTTT--GTT-ATC-TAATTTGC--AT---TA-A--AT-AANAAA-AG--------T-A-A--ATT---TTG-TCGGACAAAACTG-ATT--TTTAC----C-ATGACA----A----AA---A-CTTNAATCGGGCGAT-GCGGAA--AA---AAGTTTGCAT-GAAGAAAT-T----------A--TA--TTT--ANGTA---GA------CGATCAAAA---AT----TTTTGT-CTATAA-C-AAATANTCGANTT-TTGTCA--ACNAAA--TTCGATTTC-G-TCG-T-ACAAAA-TCA-CTTTTGT-ACGAC-AA-AA-T-GAATT---TTTTTGTC-ATGACAAAAGT--TGA--ATTTTGTC-ATG-ACAAAAGT--GAA--------TTTTGTCATGAC-AAAAG-------TGAA---TTTGTTCGA----CAAAAT-TC--GATTTTTG----CTC-TT--A-GCACAC-AAAGT-GAA----TTT-----TGTTA-GTCACAAATTN-AATTTTGTC-AGGACAAA------------AA--C-G-TGATTTTATCTC--A-CAA------AANT--G---AATTTTGTCGTGACA-AAAGTGAATTTA--CGATCA--ACAAA-A-TGA--ATT-TTG----TCGACAAAATTCA-ATTTTCGTCT--AC-CTA------A-ATATAATCTCTTTATGCAACTTTTTTTTCCCG-CAT--TGCCCA----ATT-TAA-GTTTAAATTAT-CAT-TAGTAA--AAACA-TTT-TGTCCGACAAA----ATT-NT-A-ATTA-------C--ATAACAG------A-TTTCTT--CATTTTGGTATGCAAATTAGTTTACAAAAATCCAAATTCA-ACNAATTTNC----NTACAAAATCCACTTATG-TTACAAAAGTTAATT
finalCons : CGGGGCGC-C-GAATGG-GAC--T-C----T----GA-TC-TTTT-GTTCT---------------------CAAAATTC--------AATTTT-------G-T-GTANA--CAAAAAT-GAA-T-TTC-GTCANAACA-AAAATG----------------AGTTCAGGT--C---AA-----CAAAATT--GATCNT-GAA--TCACA-A-TAAA-TTAATTTTTGT----------GTCGTACAAA---AT-TAT--CTT---TCA--GCG-GACA--AAATTC--ACTTTTNTAGACGAAGTCAA----------------TTT-TGT-C-ACG--ACAAA-A--TTCACTT-TTGTAACATA--------AGT-----CAATT-TTG-TCA-TGACAAAA------TTCGT--A-----AT--TT--GT----------CGAT-TNT----GTA-TGCAAATTTAATCTNA-------------------TTTGC-A--T-------A-CAAAA-T--A-GACTTTT--GTT-ATC-TAATTTGC--AT---TA-A--ATGAAAAAAAGTG-----------A--ATT---TTG-TCGGACAAAATG---TT--TTTAC----C-ATGACAATAAAA----------CTTNAATTGGGCAATG-CGGAA--AAAAGG---TTGCAT-GAAGAAAT-T----------A--TA--TTT--ANGTA---GA------CGATCAAAA---AT----TTTTGT-CTATAA-C-AAATANTCGANTT-TTGTCA--ACNAAA--TTCGATTTTTGTCATTACAAAATTCA---CTTTTGTC--GAC-AA-AATATTCA-----TTTTTGTC-ATGACAAAAGT---GA--ATTTTGTC-ATG-ACAAAAGT--GAA--------TTTTGTCATGAC-AAAAG-------TGAA---TTTGTTCGA----CAAAAT-TN---ATTTTTG----CTC-TT--A-GCACAC-AAAGT-GAA----TTT-----TGTTA-GTCACAAATTN-AATTTTGTC-AGGACAAA------------AA--C-G-TGATTTTATCTC--A-CAA------AANT--G---AATTTTGTCGTGACA-AAAGTGAATTTNG----TCA--ACAAA-A-TGA--ATT-TTG----TCGACAAAATTNA--TTTTCGTCT--AC-CTA------A-ATATAATCTCTTTATGCAACTTTTTTTTCCCG-CAT--TGCCCA----ATT-TAA-GTTTAAATTAT-CAT-TAGTAA--AAACA-TTT-TGTCCGACAAA----ATTT---A-ATTACGAATNACAGAATGAA---------TTTCTT--CATTTTGGTATGCAAATTAGTTTACAAAAATCCAAATTCA-ACNAATTTNCN----TACAAAATCCACTTATG-TTACAAAAGTTAATT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 44444444444444444444444444444444444 11111 1111 1 11111111111111111 1 44444444444444444444444444444444444444 11111111111111 4444444444444444444444444444444 111111111111 111 111111111 666666666666666666666666666666666 333333333333333333333333333333 1111111111111111 5555555555555555555555555555555555555 1 4444444444444 222222 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 11 111111 44444444444444444444 22222 3333333 111 111111 1111 222 2222 222 55555555 5555555555 111 333333 11 3333333333333333333333333333333333333333333333 11 111 111 444444444444444444444444444444444 111111 1 11111 11 11111
lowQualScore : 2 33 0 2 77777777777777777777777777777777777 7 2 99999 2 2 2 4 44444 666 666666 2 2 7 33 0000 2 2 2 0 1 2 3 88888888888888888 1 1 33 444 9999 2 2 333 444 2 2 1 2 33 2 2 4 333 2 55555 88888888888888888888888888888888888888 2 33 66666 333 2 44444444444444 33 1 555 8888888888888888888888888888888 2 4 777 5555555 4 33 3 1 2 111111111111 111 333 555555555 55 2 2 99999999 888888888888888888888888888888888 5 3 888888 2 33 333333333333333333333333333333 3333333333333333 5555 3 2 44 3 3 2 7777777777777777777777777777777777777 55 1 5 1 5 5 888 5 66 1111111111111 66 1 0 0 222222 888 7 5 55 5 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1 5 55 66 1 555555 66 55555555555555555555 5 33333 5 5555555 2 5 777 5 444444 66 66 3 5555 11 66 66 5 8 888 2222 111 3 8 11111111 2 1111111111 777 000000 2 11 3333333333333333333333333333333333333333333333 1 11 8 4 8 000 6 99 555 999999999999999999999999999999999 5 9999 4 7 4 4 66 4 222222 8 1 888 77 66 1 9999 4 4 5 5 66 0 5 4 1 888 99 3 55555 55 0 33 0 5 1 1 33333 6 6
lowQualScore : . .. . . ................................... . . ..... . . . . ..... ... ...... . . . .. .... . . . . . . . ................. . . .. ... .... . . ... ... . . . . .. . . . ... . ..... ...................................... . .. ..... ... . .............. .. . ... ............................... . . ... ....... . .. . . . ............ ... ... ......... .. . . ........ ................................. . . ...... . .. .............................. ................ .... . . .. . . . ..................................... .. . . . . . ... . .. ............. .. . . . ...... ... . . .. . .................................................................. . . .. .. . ...... .. .................... . ..... . ....... . . ... . ...... .. .. . .... .. .. .. . . ... .... ... . . ........ . .......... ... ...... . .. .............................................. . .. . . . ... . .. ... ................................. . .... . . . . .. . ...... . . ... .. .. . .... . . . . .. . . . . ... .. . ..... .. . .. . . . . ..... . .
lowQualScore : 5 55 6 5 66666666666666666666666666666666666 5 5 11111 4 4 4 4 11111 333 888888 4 4 9 22 2222 4 4 7 5 0 7 6 77777777777777777 1 0 22 111 2222 2 2 999 333 2 2 0 2 11 2 2 4 999 2 22222 77777777777777777777777777777777777777 2 11 11111 999 2 33333333333333 11 3 222 9999999999999999999999999999999 2 4 888 8888888 4 11 1 5 2 444444444444 444 999 444444444 33 2 2 11111111 000000000000000000000000000000000 7 8 222222 9 99 111111111111111111111111111111 2222222222222222 8888 1 6 22 1 1 2 1111111111111111111111111111111111111 44 1 0 2 0 0 888 0 99 2222222222222 55 0 1 2 666666 888 9 0 55 0 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 0 0 77 99 0 444444 99 99999999999999999999 7 11111 0 0000000 5 0 000 0 666666 99 99 4 5555 88 99 11 1 0 000 8888 000 2 2 00000000 5 5555555555 555 888888 5 00 0000000000000000000000000000000000000000000000 0 00 0 6 0 222 7 22 777 888888888888888888888888888888888 0 4444 4 4 5 4 11 4 888888 9 1 111 33 11 9 4444 4 4 0 0 99 0 0 4 9 111 99 0 99999 77 7 00 7 7 0 0 11111 7 7
consensus : CGGGGCGC-C-GAATGG-GAC--------T-C----T----G--A-TC--------TTTT-G-T-T-C-T-CAA-AA-TTC-----AA--TTT------TG-T-GTACA--CAAAA-A-TGAA-T-TTCG-TCANAACA-AAAAT-G---------------AGTTCAGGT--C---A----A-C-AAA---ATT--GA-T-CNT-GAA--TC-ACA-ATA---AA-TT----AATTTTT-GT--------G-T-CG--------T-A--------CAAAAT-TA--T-C---T---T-TCA-GCG-G--------ACA--AAATTC--AC--TT-TTNTAG-A---CGA-AG--TC-AA-TTT-TG-TC-NCGACA---A---A-A--TTCACTT-T------------TGTA-ACAT---AA-----G---T-NAATT-TTG-TCA-T-G--ACAAA---A------TTCGT--A-----A--TTTGTCGAT-TNTGT------A-T--GCAAA-------TA--TCA---ATC------TCA-TTTGC--A--T-------A-CAAAA-T--AG-ACTTTT--GTT-ATC-TAATTTGCAT---TA-AATG----AA-AAA-------AAG-------T-GAATTTTGTCGGA-CAA-AA-T---G-TT--TTTAC--ATGATAATTTAAAACTTNAATTGGGCAAT-GCGGAAAA---AANGTT-GCAT-GAAGAAAT-T-A--TA--TTT--ANGTA---GACGATCAAAA---AT----TTT-TGTN-TATAAC-AAATANTCGANTT-TTGTCA--A--CNAAAT-TCGAT--TTTTGTC--ATTACAAA---ATT-CACTT-TTGT-C--GACAA-AA----A--TTCA-TTTTTGTC-ATGA-CAAAANC-G-AA--TT--TTGTCA-TG-ACAAAAGT--GAATTTTGTCATGACAAAAG-TGAAGATTTTGTTC--GACAAAATT-N-ATTTTTGTTC-NTCAAAGGCACGCAAAT------GT-GAATTT---TGTTATGNCACAAATTG-AATTTTGTC-A--------G-GACA--AAAAC-GCGA-TT-ATC-------A-CAAAAGT--GAATTT-TGTCGTGACA-AAAGTGAATTT--TG-TCA--AC---AAA-----------------A-TGA------A----TT-TTG----T-CGACAAAATTNATTTTCGTCT--AC-CTA------A-ATATAATCTCTTTATGCAACTTTTTTTTCCCG-CAT--TGCCCA----ATT-TAA-GTTTAAATTAT-CAT-TAGTAA--AAACA-TTT-TGTCCGACAAAATTC--AATTATGAATTACAN-AA-CGGATTTCTT--CATTTTGGTATGCAAATTAGTTTACAAAAATCCAAATTCA-ACNAATTTNC----NTACAAAATCCACTTATG-TTACAAAAGTTAATT
Reference ( family-5289 ) : CGGGGCGC-C-GAATGG-GAC--------T-C----T----G--A-TC--------TTTT-G-T-T-C-T-CAA-AA-TTC-----AA--TTT------TG-T-GTANA--CAAAA-A-TGAA-T-TTCG-TCANAACA-AAAAT-G---------------AGTTCAGGT--C---A----A-C-AAA---ATT--GA-T-CNT-GAA--TC-ACA-ATA---AA-TT----AATTTTT-GT--------G-T-CG--------T-A--------CAAAAT-TA--T-C---T---T-TCA-GCG-G--------ACA--AAATTC--AC--TT-TTNTAG-A---CGA-AG--TC-AA-TTT-TG-TC-ACGACA---A---A-A--TTCACTT-T------------TGTA-ACAT---AA-----G---T-CAATT-TTG-TCA-T-G--ACAAA---A------TTCGT--A-----A--TTTGTCGAT-TNTGT------A-T--GCAAA-------T---TTA---ATC------TNA-TTTGC--A--T-------A-CAAAA-T--AG-ACTTTT--GTT-ATC-TAATTTGCAT---TA-AATG----AA-AAA-------AAG-------T-GAATTTTGTCGGA-CAA-AA-T---G-TT--TTTACC-ATGACAA--TAAAACTTNAATTGGGCAAT-GCGGAAAA---AAGGTT-GCAT-GAAGAAAT-T-A--TA--TTT--ANGTA---GACGATCAAAA---AT----TTT-TGTC-TATAAC-AAATANTCGANTT-TTGTCA--A--CNAAAT-TCGAT--TTTTGTC--ATTACAAA---ATT-CACTT-TTGT-C--GACAA-AAT---A--TTCA-TTTTTGTC-ATGA-CAAAAGT-G-AA--TT--TTGTCA-TG-ACAAAAGT--GAATTTTGTCATGACAAAAG-TGAA---TTTGTTC--GACAAAATT-N-ATTTTTGCTC-TT--A--GCACACAAA-------GT-GAATTT---TGTTA-GTCACAAATTN-AATTTTGTC-A--------G-GACA--AAAAC-GTGATTTTATCT-----CA-CAAAANT--GAATTT-TGTCGTGACA-AAAGTGAATTT--NG-TCA--AC---AAA-----------------A-TGA------A----TT-TTG----T-CGACAAAATTNATTTTCGTCT--AC-CTA------A-ATATAATCTCTTTATGCAACTTTTTTTTCCCG-CAT--TGCCCA----ATT-TAA-GTTTAAATTAT-CAT-TAGTAA--AAACA-TTT-TGTCCGACAAAATTT--AATTACGAATNACAG-AA-TGAATTTCTT--CATTTTGGTATGCAAATTAGTTTACAAAAATCCAAATTCA-ACNAATTTNC----NTACAAAATCCACTTATG-TTACAAAAGTTAATT
gi|1 : CGGGGCGC-C-GATTGG-GAC--------T------T----G--A-TC--------TTTT-G-C-T-AAT-CAA-AA-C-C-----AA--TTT-------G-T-GTACA--CTAAA-A--GAA-T-TCCG-TCATAACA-A----------------------GTTCATTT--CTTGAC---A-C-AAA---AAG--TA-T-GTT-GCT--TC-ATA-ATA---AC-TT----CATTTTTTGTATTGATAAG-T-TG--------T-A--------CAAAAT-TA--GAT---T---T-TCA-GTT-G--------ACACAAAATTG--AA--TA-TTGTAG-AACCTGA-AAC-TT-AACTTT-TG-TC-ACGACA---A---A-A--TTCATTT-T------------TGTA-A-AT---AA---------T-CAATTATTG-TCAAT-G--ACAAA---A------TTGGT--A-----A--TTTGTCAAT-TATGT------AGT--GCAAA-------TATTTTG---ATC------TCA-TTTGC--A--T-------A-CAAAA-T--AA-ACTTTT--GTT-ATC-TTGTTTGCAT---TA-AAT-----AA-GAA-------AAG-------T-AAATTTTGTGAGA-CAA-AA-TTGAA-TTCATTTGTC-A-GACAA---AAAGTTTGCATCTGTTA-T-GT--AAAATTGAATTTT-TCAT-GACAAAGTGT-AATTC--TTT--GT-TA---GGTGATCAAAG---GT----TCT-TGTCCTATGACCAAATAGTCGAATT-TTGTCATGA--TAAAAGGTTGAA--TTTCGTT--TATACAAA---ATG-ATCTT-CTGT-CATGACAA-AACTGAA--TT---TTTTTGTC-ATGA-CAAAAATTG-AAGATT--TTGTCA-TGAACAAAA-T--GAATGTTGTCATGACAGAAG-TGAA---TTTGTCC--AACAAAATTCG-A--TTTGTTCGTTCAA--GCACA-AAA-------GTGGAATTT---TGTTCTGTCACAAATGG-AATTTTGTCAA--------G-GACG--AGAACAGTGATTTTATC------CACCAAAATTTCGATTTT-TGTCTTCACACCAAGTGAATTTACGA-TCA--AC---AAA-----------------A-TGAG-----G----TTGTTG----T-CCAGTAAATT-ATTTT-GTCT---C-CTA------ACATATAATTTCTTATTGC-ACTTTTTTTTCCCG-CATTGTGCCCATTCCATTCTAA-GTTTAAATTAT-CATCTAGT-A--AAACA-TTT-TGTCCACCAAAATTC----TT---AATTACAT-GA-TGGTTTTC----AATTTGGGTATGC-AATTA-TTTACATAAAT-CAAATTAACACCTATTTTCATATATACAAATTCCA-TAATGTTTACAAAAGTTAATT
gi|10 : GGGGCGC-C-AAATGG-GAC--------T-C----TTGT-G--A-T----------TTT-G-T-T-C-T-CAA-AA-TTC-----AT--TTT------TG-T-GTGGA--CAAAA-A-TGAA-T-TTTG-T-AGAACA-AAAAT-G---------------AGTTCAGGT--C---A----A-C-AAA---ATT--GA-T-CAT-GAA--TC-ACA-A-A---AA-TT----AATTT----T--------G-T-CG--------C-A--------CAAAAT-TA--T-C---T---T-TCA-GCA-G--------ACA--AAATTC--AC------------------------------TTT-TG-TC-ATGACA---A---ATA--TTCACTT-T------------TGTATACAA---AA-----G---T-CAATT-TTG-TCT-G-G--AAAAG---ATTAAT-TTTGT--AACTATA--TTTG--GAT-TTTGT------A-T--GCAAA-------T---T----------------A-GTTGA--A--T---------------T--GG-ATTTTT--GTG-AAC-TAATTTGCATACCAA-AATG----AA-AAAAATTCATAAT-------T-GAATTTTGTTGGA-CAA-AA-T---G-TT--TTTACTAATGATAATTTAAAACTTAAATTGGGCAATCGCGG-AAA---AAGGTTGGCAT-AAAGAAAT-T-A--TA--TTT--AGGTA---GA-----GAAA---AT----TT
gi|11 : tctGGCGC-C-AAATGG-GAC--------T-C----TTGT-G--A-TT--------TTGA-G-T-T-C-T-CAA-AA-TTC-----AT--TTT------AG-T-GTGGA--CAAAA-A-TGAA-T-TTTG-T-AGAACA-AAAAT-G---------------AATTCAGGT--C---A----G-C-AAA---ATT--GA-T-CAT-GAA--TC-ACA-A-A---AA-TT----TATTTTT-G--------------G--------C-A--------CAAAAT-TA--T-C---T---T-TCA-GCA-G--------ACA--AAATTC--AC------------------------------TTT-TG-TC-ATGACA---A---A-A--TTCACTT-T------------TGTAGACAA---AA-----G---T-CAATT-TTG-TCT-G-G--ACAGA---AATAACTTTTGT--AACAT-A--TTTG--GAT-TTTGT------A-T--GCAAA-----------TTA---GTT------GAA-TTTG--------------------------G-ATTTTT--GTA-AAC-TAATTTGCATAC-CAGAATG----AA-AAA-------AAATCATAATT-GAATTGT-TTGGA-CAA-AA-T---G-TT--TTTAC----GATAAT-TTAAACTTAAATTGGGCAAC-GCGGAAAA---AA-GTT-GCAT-AAAGAAAT-T-A--TA--TTT--AGGTA---GACA---AAAA---AT----T
gi|12 : aaattACAAAT------GT-AAATTT---TGTGA-G--ACAAATTTGAATTTTGTC-A--------T-GA-A--AAAA--GTGA----AT--------------AGT--GAATTG-TGTCATGACA-AAAATGAATTA--TG-TCATGAT---AAA-----------------AGTGA------A----TT-TTG----T-TGAAAAAATTCATATTTGTCT--AC-CTA------A-ATCTAATCTCTTCACGCAA---TTTTTTCCC---AT--TGTCTA----ATT-GAA-GTTAAAATTAA-CAT-TAGTAA--AAAAAACTT-TGTCCCACAAAATTG--AATTATGAATAACAGTAC-TGAATTTCTT--CATTTTGGTATGCATAATAGTTTACAAAAATCTAAATTCA-ACAACTTTGC----TTAC-AAATCCACTTATG-CTACAAAAGTTAATT
gi|12 : atgtagtttgcattagata----A-C-AAA---ATT--GAAT-TAT-GAA--TA-ACA-GTACTGAA-TTTCTTCATTTTG-GT--------A-TGCA--------T-AATAGTTTACAAAA---A--T-C---TAAAT-TCA-ACA-ACTTTGCTTACA--AA-TCC--AC--TTATGCTAC-A----AA-AG--TT-AA-TTC-TG-TC-AAAACATACATGCA-A--TTGATTG-T------------TGTCTACAA---AT-----G---T-GAGTT-TTG-TCA-T-G--A-GAA---A------TTctgtcaaaacatacatgcaattgattgttgtctacaaatgtgagttttgtcatgagaaatt
gi|12 : atgtagtttgcattagataacaaatgtaaattttgtgagacaaatttgaattttgtcatgaaaaaagtgaatagtgaattgtgtcatgacaaaaatgaattatgtcatgataaaagtgaattttgttgaaaaaattcatatttgtctacctaaatctaatctcttcacgcaattttttcccattgtctaattgaagttaaaattaacattagtaaaaaaaactttgtccc--CTAAAT-TCAACAACTTTGC----TTACAAA----TC-CACTT-ATG--C--TACAA-AA----G--TTAA-TTCT-GTC-AAAA-CATACAT-GCAA--TTGATTGTTG-TCTACAAATGT--GAGTTTTGTCATGAGAAA
gi|13 : atgtagtttgcattagataacaaatgtaaattttgtgagacaaatttgaattttgtcatgaaaaaagtgaatagtgaattgtgtcatgacaaaaatgaattatgtcatgataaaagtgaattttgttgaaaaaattcatatttgtctacctaaatctaatctcttcacgcaattttttcccattgtctaattgaagttaaaattaacattagtaaaaaaaactttgtcccacaaaattgaattatgaataacagtactgaatttcttcattttggtatgcataatagtttacaaaaatCGGGGCGC-C-GATTGG-GACTTGATCCTT-T----T----GCAA-TCAAAACCAATTTT-G-TGTAC-A-CAA-AA-TAG-----AA--TTC------CG-TCATA-A--CAAAA-T-TCAA-T-TTTG-TCACA-CA-AAAGT-GTGCTGCTTCGTAATAACTTCATAN--N---N----N-N-NNN---NNN--NN-N-NNN-NNN--NN-NNN-ATA---AC-TT----CATATTT-GT--------A-T-TGATAAGTTAT-A--------CAAAAT-TA--T-T---T---T-TCA-TTN-N--------NNN--NNNNNN--NN--NN-NNNNNN-N---NNN-NN--NN-NN-NNN-NN-NN-NNNNNN---N---N-N--NNNNNNN-N------------NNNN-NNNN---NN-----N---N-NNNNN-NNN-NNN-N-N--NNNNN---N------NNNNN--N-----N--NNNNNN-AT-TATGT------A-T--GCAAA-------TA--TCA---ATC------TCA-TTTGC--A--T-------A-CAAAA-T--AG-ACTTTT--GTT-ATC-TAGTTTGCAT---TA-AATtt
gi|14 : taCGGGGCGC-C-GA-TTG-GAC--------T------T----G--A-TC--------TTTT-G-T-----------AA-TCC-----AAAATTT------TG-T--TACA--CAAAATA-CGAA-T-TTCGGTCATAA-A-AAAAT-T---------------CTTTTTTGT--C---ACACCA-T-AGA---AGT--AA-T-GAT-TGACTTC-ATA-ATA---AA-TC----A-TTTTT-GT--------AAT-TG--------------------AAAATATA--T----------------------------ACA--AA--TT--AT--TT-CTTCAG-AG--CTA-AA--TTGAA-TTTCTG-TA-ACGACA---A---A-A--ATCCATT-T------------TGTA-A--------------------------TGCTCA-TTG--ACAAA---A------TTCAT--T--------TTTGTCAATCTATGT------A-T--GTCAA-------TA--TCA---ATC------TC--TTTGC--AA-T-------A-CAAAA-T--AGGACTGTT--TTT-ATC-TAA-TTGCAT---T---ATA----AACAAA-------CAG-------TAAAATTTT
gi|15 : GC-C-GATTGG-GAC--------T------T----G--A-TC--------TTTTTG-T-A-A-T-CAA-AA-C-C-----AA--TTT------TG-T-GTACA--CAAAT-A--GAA-T-TCCG-TCGTAACA-AAATT-C---------------ATTTT-TGT--C---AC---A-C-AAA---AGT---A-T-GTT-GCT--TC-ATA-ATA---AC-TT----CATTTTT-GT--------A-T-TGATAAGTTAT-A--------CAAAAT-TA--T-T---T---T-TCA-GTT-G--------ACA--AAATTC--A-----------------------------A-TTT-TG-TC-ACAACA---A---A-A--TCCA-TT-T------------TGTA-G-AT---AA-----AC--T-CAATT-TTG-TCA-T-G--ACAAA---A------TTC----A-----AT-TTTGTCAAT-TATGT------A-T--GCAAA-------TA--TCA---ATC------TCA-TTTGC--A--T-------A-CAAAA-T--AG-ACTTTT--GTT-ATC-TAGTTTGCAT---TA-AA
gi|16 : tGGCGC-C-AAATGG--AC--------T-CCTTGT----G--A-T---------TTTT-G-T-C-T-TGCAA-AA-TTC-----AT--TTT------TG-T-GTCGA--CAAAA-A-TGAA-T-TTTG-T-AGAACA-AAAATTG---------------AGTTCAGGT--C---A----A-C-AAA---ATT--GA-T-CATGGAA--TC-ACA-AAA---AT-TT----AATTTC---T--------G-T-CG--------C-A--------CAAAA--TA--T-C---T---T-ACA-GCA-G--------ACA--AAATTC--AC--TA-TTGTAGAA---CAA-AG--TC-AA-TTT-TG-TC-TGGACA---G---A-A--TTAAC-T-T------------TGTA-ACAT----A-----T---T-GGATT-TTG-T-A-T-T--GC-AT---A------TTAGTTGA-----A---TTG--GAT-TT--------------------------T---TTA---AAC------TAA-TTTGC--A--T-------ACCAAAA-T--
gi|17 : ttc-T-CAA-AA---C-----AA--TTT-------G-T-GTACA--CAAAATA-GAAA-T-TCCG-TCATAACA-AAATT-C---------------ATTTT-TGT--C---A----AAC-AAA---AGT---A-T-GTT-GCT--TC-CCA-ATA---AC-TT----A-TTTTT-GT--------A-T-TG----------A--------TAAG-T-TG--T----------------------------ACA--AAATT---AT--TT-TT------------------C-AG-TT----------GACA---A---A-A--TCCATTT-T------------TGTA-G-AT---AA-----ACT-T-AAATT-TTG-TCA-T-GAAACAAA---A------TTC----------A--TTTGTCAAT-TATGT------A-T--GCAAA-------TA--TCG---ATC------TCA-TTTGC--A--T-------A-CAAAA-T--AG-ACTTTT--GTT-ATC-TAGTTTGCAT---tagtc
gi|18 : ttttgtgaaG----T-TGACAAAATTCATTTTTGTCT--AC-CTACATGTAA-ATATAATCTCTTCATGCAACTTTTTCTTCCCA--------------------------TTAAATTAT-CAT-TAGTAA--AAACA-GTT-TGTCCGACAAAATTT--AATTATGAATTACAGAAA-TGAATTTCTT--CATTTTGGTATGCAA-----------------TAAATTCA-ACAAATTTGC----TTACAAAATCCACTTATG-TTACAAAAGTCAAaa
gi|19 : AAAATTAATTTTCGTCTTAAC-CTA------A-ATATAATTTCTTTATGCGACTTTTTTTCCTTG-CAT--TGCCCA----ATT-TAA-GTTTAAATTATGCA--TAGTAATTTAACA-TTTGTGTCCAAC-AAATTC--AATT---------------TGAATTTTTT--CATTTTGGTATGCAAATTAGTTCAC--AAATCCAAATTCA-ACTAATTTGC----AT
gi|2 : GGGCGT-C-GAATGGCGAC--------T-----------G--ACTT--------TTTT-G-T-A-A-T-CAA-AA-CCC-----A----TT------TG-T-GTACA--CAAAT---TGAAGT-TCCG-TCACAACA-AAA---------------------TTCATTT--T---A----T-T-ATG----TT--G----CTT------TC-ATATATA---AGCTT----CATTTTT-GT--------A-T-TGATTAGTTAT-A--------CAAAAT-TA--T-T---T---T-TCGCGTG-G--------ACA--AAATTA--AA--TT-TTGTA--A---CGA-AAA-TC-A--TTT-TG-TC-ACGACA---G---A-AAGTCCATTT-TAAAGGTTACCAATTTA-GTATTCCAATCTTTG---T-CAATA-TTG-T-A-T-G---CAAA---T------ATC----A-----A--TCT-TC-AT-T--GT------A-T--ACAAAATAAGACT---TTGTTTATC------TTAGTTTGC--A--TTAAATAAA-CAAAAGT--A--ATTATT--ATT-GAC-AAAGTTGAAT---T----TGTCATAC-AAA-------AGC-------T-GGACTTTGTTA-A-CAA-AACT---G-AA--TTTG---AT--CAA--CAAA--TTCA-TTNNNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNN-NNNN-NNNNNNNN-N-N--NN--NNN--NNNNN---NNNNNNNNNNN---NN----NNN-NNNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNG-TT--CA--A--CCAA---TC-AT--TTTTGTC---TT-CATA---ATT-----T-TTGT-C--AACAA-AA----A--TTCA-TTTTTGTC--TCA-CAAAAGT-G-AA--TT--TTGTAA-TG-ACAAAAGT--GAATTTAGTCA--ACAAAAAATGAAGATTTTGTTA--GACAAAATT-TCATTTTTGATC-cct
gi|20 : T--C---A----A-C-AAA---ATT--GA-T-CTT-GAA--TC-ACA-AAT---AA-TT----AATTTT------------G-T-CA--------T-G--------CAAAAT-TA--T-C---T---T-TCA-ACG-G--------ACG--AATTTC--GC--TT-TTTTAG-A---CAACAG--TC-AA-TTT-TA-TT-CTTACA---G---A-A--TTAAC-T-T------------TGAA-ACAT---AA-----G---T-GCATT-TTG-T
gi|21 : caaaaaaacaacaacaaaacacaccccaaaaaacccaagcttCGGGGCGC-C-AAATGG-GACCT------T-G----T----G--A-T----------TTT-G-T-T-C-T-CAA-AA-TTC-----AT--TTT------TG-T-GTGGA--CAAAA-A-TGAA-T-TTTG-TAGAAAC--AAAAT-G---------------AGTTCAGGT--C---A----A-C-AAA---ATT--GA-T-CAT-GAA--TC-ACA-A-A---AA-TC----AATGT----T--------G-T-CG--------C-A--------CAAAAT-TA--T-C---T---T-TCA-GC
gi|22 : ACAAA-------ATTGAATTT---TGTCATGACACAAAGTG-AATTTTGTC-A--------ATGACA--AAA---GTGA------------------AAAGT--GAATTTCTGTTGTGACA-AAAGTGAATTT--TGGTCA--AC---AAAATTTATTTTTGCTCCACA-TAA------AGTGATT-TTG----T-CAACAAAAATTATTTT
gi|23 : --C---A----A-C-AAA---ATT--GA-T-CTT-GAA--TC-ACA-AAT---AA-TT----AATTTT------------G-T-CA--------T-G--------CAAAAT-TA--T-C---T---T-TCA-ACG-G--------ACG--AATTTC--GC--TT-TTTTAG-A---CAACAG--TC-AA-TTT-TA-TT-CTTACA---G---A-A--TTAAC-T-T------------TGAA-ACAT---AA-----G---T-GCATT-TTG-Tgtg
gi|24 : gctt--C---A----A-C-AAA---ATT--GA-T-CTT-GAA--TC-ACA-A-A---TA-TT----AATTTT------------G-T-CA--------T-G--------CAAAAT-TA--T-C---T---T-TCA-ACG-G--------ACG--AATTTC--GC--TT-TTTTAG-A---CAACAG--TC-AA-TTT-TA-TC-TTGACA---G---A-A--TTAACTT-T------------TGAA-ACAT---AA-----G---T-GCATT-TTG-T
gi|25 : cttAAAATTTAATTTTTTCT--ACGCTA------AGATATAATTTCTTTGTGCA--TTTTTTTTTCCG-CAT--TGCCAA----ATT-TAAGGTTTAAATCAT-CAT-TAGTGA--AAACATTTT-TGTTCCAAACAATTTCAGATTATGA
gi|26 : CGACAAAATTT--AATTATGAATTGCAG-AACTGAATTTCTT--CATTTTGGTATACAAATTAGCTTACAAAAATCTAAATTCA-ACAAATTTAC----TTCCAAAATCCACTTGTG-TTACAAAAGTTAATtt
gi|27 : tAGTGAATTT--TG-TCA--AC---AAA-----------------AATGA------A----TC-TTGCCAGT-CGACAAAATTCATTTTTGTTT--AT-CTA------A-ATATTATCTCTTCATGCAAC---TTTTTCCC--CAT--TGCCTA----ATT-TAA-G-TTAAA
gi|28 : GTCT--AC-CAA------A-ATATAATTTCTTTATGCAAATTTTTT---CCG-CGT--TGCCAA----ATT-TAA-GTTTGAATTAT-CAT-TAGTAA--AAATA-TTT-TGTCCAACAAAATTC--AATTATGAAT
gi|29 : -C-AAATGG-GAC--------T-TGG--T----G--A-T---------TTTT-G-T-T-C-C-CAAGAA-TTCG----AA--TTTACCTTATG-T-GGATT--CAAAA---TGAA-TCTTTG-CTTCAACA-AAAAT-G---------------AGCTCAG
gi|3 : tagatgaacctagGGGGCGC-C-AAATGG--AC--------T-C----TTTGTG--A-T----------TTT-G-T-T-C-T-CAA-AAATTC-----AT--TTT------TGCT-GTGAA--CAAAA-A-TGAA-T-TTTG-T-ACAACA-AAAAT-G---------------AGTTCAGGTAAC---A----A-CCAAA---ATC--G--T-CAT-GAA--TTTACA-A-A---AA-TT----AATTT-------------G-T-CT--------T-A--------CAAAAA-TA--T-CACTT---TGTCA-T---G--------ACA--AAATTC--ACTTTT-TTGTAG-A---CAACAG--TC-AA-TTT-TG-TCTTTGACA---G---A-A--TT-AATT-T------------TGTA-ACAT---AA-----G---T-GGATT-TTG-----T-A--GCAAA------------TGTG-A-----A--TTTA--GAT-TTT----------T--GTAAA-----------CTA---A----------A-TTTGC--ATTT-------A-CCAAA-TGAAG-AAATTCAAGTT-CTG-TAATTT-CA----TA-AAT----------------------------T-AAATTTTGTCGGA-C-A-AC-T---G-TT--TTTACTAATGATAATTTTAAACTTCAATTAGGCAAT-TTGGAAAA---ATAGTT-GCTT-GAAGAGAT-T----TA--T----------------ATTAAAA---G--------------TATGAC-AAA-AGT-GAATT-TTGTCA--A--CAAAAT-TTCAT--TTTTGT---ACT--------------CTT-TTGT----GACAA-A-----A--TTCA--CTTTGTG-AAGACCAAAAAT-G-AA--AT--TTGTCA-TG-AC--AAGTTAAAATTTT----TAACAAAA
gi|30 : ctagataacagatgtaataaaaaacagtgaaA-CAAAAGT--GAATTT-TGTCATGAGA-AAAGTTAATTT--TG-TCA--ACA--AAA-----------------A-TGATTCCTGA----GT-TTG----T-C--CAAAACTTA
gi|31 : atgaaaattctagagatttACAATAAT------TTCA-TTTTTATA-TTGA-CAAAATC-------TT--TTTTCAGTGGACAAA-GT--GAATTTTGTCATGACGAAAG-TTAA---
gi|32 : ttagtatgttgcttcatCGGGGAGC-C-AAATGG-GAC--------TAT----T----G--T-TA--------TTTT-G-T-T-C-T-CAA-AA-TTCAGATGAA--TTT------TG-T-ACA-A--CAGAA-A--GGC-T-TTC
gi|33 : atctCGGGGAGC-C-AAATGG-GAC--------TAT----T----G--T-TA--------TTTTGG-T-T-C-T-CAA-AA-TTCATGTGAA--TTT------TG-T-ATA-A--CAGAA-A--GGC-T-TTCt
gi|4 : atctCGGGGCGCTC-AAATGG-GCC--------T-CGTG-T----G--A-T----------TTT-G-T---C-T-CAA-AA-TTC-----CA--TTT------TG-T-CTACAGACAAAA-A-T-AA-T-TTT--TTGGTACACAAAAT-G---------------AGTTCAGGT--C---A----A-C-AAA---ATTCGGA-T-CAT-GAA--TT-ACA-A-A---AA-TT----AATTT----T--------G-T-CT--------T-A--------C-AAAT-TA--A-C---T---T-TTG-TCATG--------ACA--AAATTTCAAC--TT-TTGTAG-A---TAA-AGCTTC-AA--TT-TG-TC-TTGACA---T---A-A---TGACTTCT------------TGTACACAT---AA-----G---T-GGATT-TTG-TAA---G--ACAA--------------------------------------TTGT------G-T--G--AA-------T---TTA-----------------TTGC--A--T-------A-CAAAT-G--AG-AACATT--CTT-CTG-TAAT---CAT------AAT----------------------------T-AAATTTTGTCGGA-C-A-AC-T---GTTT--TTTAC---TAATGA--TAA---TTTAA-TGGGAAGT-------AA---AAAGTT-GCAT-GAAGAGAT-TAA--TAACTTTACATGTAAGGGTAGATCAAAA---ATGAAATTT-TGTC---TAACAAAATCTTCATTTT-TTGTTG--A--CTAAAT-TC-AC--TTTTGTC--ATTACAAA---ATT-CACTT-TTGTGA--GACAA-AA----A--TGAA-TTTTTGT---TGA-CAAA------AA--TT--ATG--A-AG-ACAAAAAT--GA
gi|5 : ---AAA-----------------A-TGA------A----TT-TTG----T-CCACAAAATTAATTTTCGTCT--AC-CTT------A-ATATAATCTCTTTAGGCAACTTTTTT---CCGTCAT--TGTTCA----ATT-TAA-GTTTAAATTAT-CAT-TAGTAA--AAACA-TTT-TGTCCAACAAA-TTC--AATTATGAATTACAT-AA-CAGATTTTTTTTCATTTTGGTATGCAAATTAGTTTACAAAAATCCAAATTCA-ACTAATTTCC----ATACAAAATCCAATTATG-TTACAAAAGTTAATTttggtt
gi|6 : acaGGGCGC-C-AATTGG-GAC--------T------T----G--A-TC--------TTTTTG-T-A-A-T-CGA-AA-T-C-----AA--TTT------TG-T-GTACA--TAAAA-AGTAAA-A-TCTG-TCACAACA-AAA-T-A---------------ATTTTTGTC--T---A----A-C-AAATATATT---A-TACTT-GTT--TT-A----TA---AC-TT----CATTTTT--T--------G-T-AA--------TGA--------CAAAAC-CAAAT-T---T---T-GCT-AC-----------ACA--AAATT---AT--AT-TTCAA--------A-AG--TC-A--TTT-TGATC-TTTACA---A---A-A--TCAATTT-T------------TGTC-A-AT---AA-----GGTATGCAAAT-A----CA-T-GT-ATAAACTTA------TCTGT--ATCCAAA--ATTGAC--T-TTTGTTACCTAA-TTTGCAAA-------T---TAA---ATCACAAGTTAA-TTTGGTGA--G-------A-CAAAAAT--AA-A----T--GTT-GTC------------------ATG----AC-AAA-------A-G-------T-GACCTTCGTCCGCTCGATAA-T---A-AT--TTTA----TG-TAA--CAAAA-TTTACTTTTGTGAT-------------ATGTT-GTA------AAAT-T----TG--TTA--ATCTG---AAC--TCA-------T----TTT-TGT--TG-AAC-AAA--CTC-ACCT-TTGTCA--ACGCGAAAT-TGGAT--T----TCA-AGTACAAA---A-T-CACctgtccagaaaacatcatggtttcaaggttatgtaaaaaatactaacactttccactttctgaacagtttttgtaaatctttgaatattgacttgagttatattctgaaaacaaatgtatttaatctgatcaatcatgaaatgctgttatcatttccatcgttttacagagaagcaattatatttttcatggacggtaagaaaattgagaaattgtgtgacttgtcctcaaactcttttcttcgacaaac
gi|6 : ATCGAAATCAAT----TTTGTGTA-CATAAA-AAGTA----AAAT-CTGTCACAA--CAAAAT---AAT--TTTTGTC---TAACAAATATATTATACTTGTTTT-----------AT---AACTTCATTTTTTGTA-ATGA-CAAAACC-A-AA--TT--TTGCTA-C--ACAAAATT--ATATTT--------CAAAAG-TCAT---TTTGATCTTTACAAAATC-A-ATTTTTGTCA-AT--AAGGTATGCAAATACATGTAT-AAACTTATCTG-TA-TCCA-AAATTG-ACTTTTGTT-ACCTAATTTG-CAAATTAAATC-ACAAGTTAATTTGGTGAGA-CAAAAAT--AAATGT-TGTCATGACA-AAAGTGACCTT--CG-TCC--GCTCGATA-----------------A-T-A------A----TT-TTA----TGTAACAAAATTTACTTTTGTaagaacctcactagtgtcc
gi|7 : gggcgccaattgggacttgatctttttgtaG-G--------ACA--AAATTA--AA--TT-TTGTAT-A---CGA-AA--TCAAA-TTT-TGTTC-ACGACA---A---A-A--TCCATTT-T------------TAAG-GCAT---TA---------C-CAATT-T-----A-T------------A------TTC----A-----ATCTTTGTCAATATATGT------A-T--GCAAA-------TA--TCA---ATC------TTC-ATTGT--A--T-------A-CAAAA-T--AG-ACTTTG--TTT-ATCTTAGTTTG-AT---TA-AATA----AA-CAA-------AAG-------T--AATTgatatgttgtaaaatttgttaatctgaactcatttttgttgaacaaactcacctttgtcaacgcgaaattggatttcaagtacaaaatcacaagaacctcactagtgtcc
gi|7 : TAAC-TAAAACT-GAATTGTTGTCA--A--CCAA-T-TCTAT--TTTTGTCTCATTA------------ATTT-TTGT-C--AACAA-AA----A--TTCA-TTTTTGTCTCTCA-CAAAAGT-G-AA--TT--TTGTAA-TG-ACAAAAGT--GAATTTAGTCAAGCAAAAAA-TGAAGATTTTGTT---GACAAAATT-C-ATTTTTGTTC-atttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaactaaaactgaattgttgtcaaccaattctatttttgtctcattaatttttgtcaacaaaaattcatttttgtctctcacaaaagtgaattttgtaatgacaaaagtgaatttagtcaagcaaaaaatgaagattttgttgacaaaattcatttttgttc
gi|8 : ggacaaaattaaattttgtatacgaaatcaaattttgttcacgacaaaatccatttttaaggcattaccaatttatattcaatctttgtcaatatatgtatgcaaatatcaatcttcattgtatacaaaatagactttgtttatcttagtttgattaaataaacaaaagtaattatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn----TT-TTG----T-CCACAAAATTAATTTTCGTCT--AC-CTT------A-ATATAATCTCTTTAGGCAACTTTTTT---CCG-CAT--TGTTCA----ATT-TAA-GTTTAAATTAT-CAT-TAGTAA--AAACA-TTT-TGTCCAACAAA-TTC--AATTATGAATTACAT-AA-CAGATTTTTTTTCATTTTGGTATGCAAATTAGTTTACAAAAATCCAAATTCA-ACTAATTTCC----ATACAAAATCCAATTATG-TTACAAAAGTTAATT
gi|9 : GGGCGC-CCAAATGG-GAC--------T-C----T----T--G-TG--------ATTT-GCT-T-C-T-CAA-AA-TTC-----AT--TTT------TG-T-GTGGA--CAAAA-A-TGAA-T-TTTG-T-AGAACA-AAAAT-G---------------AGTTCAGGT--C---A----A-C-AAA---ATT--GA-T-CAT-GAA--TC-ACA-A-A---AA-TT----AATTT----T--------G-T-CG--------C-A--------CAAAAT-TA--T-C---T---T-TCA-GCA-G--------ACA--AAATTC--AC------------------------------TTT-TG-TC-ATGACA---A---ATA--TTCACTT-T------------TGTATACAA---AA-----G---T-CAATT-TTG-TCT-G-G--ACAGA---ATTAACTTTTGT--AACAT-A--TTTG--GAT-TTTGT------A-T--GCAAA-----------TTA---GTT------GAA-TTTG--------------------------G-ATTTTT--GTGAAAC-TAA-TTGCATACCAA-AATG----AA-AAAAATTCATAAT-------T-GAATTTTGTTGGA-C-A-AA-T---G-TT--TTTACA-ATGATAATTTAAAACTTAAATTGGGCAAT-GCGGAAAA---AAGGTT-GCATAAAAGAAAT-T-A--TA--TTT--AGGTA---GACG---AAAA---ATTAA-TTT-TGTG-GACAA--AATTAAT---TTT-TTGTctgtccagaaaacatcatggtttcaaggttatgtaaaaaatactaacactttccactttctgaacagtttttgtaaatctttgaatattgacttgagttatattctgaaaacaaatgtatttaatctgatcaatcatgaaatgctgttatcatttccatcgttttacagagaagcaattatatttttcatggacggtaagaaaattgagaaattgtgtgacttgtcctcaaactcttttcttcgacaaac