lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 22222 555555555555555555555555555555 22 00000000000000000000000000000000000000000000 33 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 22222222 2222 1 3 1 888888888888888888888888888888888888888888888 11 66666666 22222 333 6666 1 1 77777777777777777 1 1 111 4444444444444 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1 1 1 44 2 22 22 8888888888888888888888888888 1 1 1111 11 1 111 555 8888888888888888888 1 2 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1 44 1 222 1 22222 3333 44444 666666666 333 4 11 3 33 222 2 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1 33333 3 3 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 4444 2222222222222222 111111 11111 777777777777777777777777777777777777777777777 22 1111 11 44444 1 1 3333333 22222 444444 1 1 5555555555 1 11 11 4 11 111 33 44444 333 11 33 333333333 4 1 3 444444 4 1 333333333333333333333333333333 1 22 11 3333 4 22 2 4 22 1 22 1 333 44444444 1111111 11 222222 555555555555 1111 11 1 11 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11 11 1 33333 222 33 11 555555555555555555555555555555555555555555555 11111 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 22222 11 11111 99999999999999999999999999999999999999999999999999 1111 33333333333 1111 1 22222 22 11 2222 1 2 888888888888888 1 1111 11 111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111 1 111 222 22 2 111 4 11 555 222 33 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 2 444444444 4 33333 88888888888888 9999999999999999999999999999999999 2
lowQualScore : 6 66666 999999999999999999999999999999 8 44 8 44444444444444444444444444444444444444444444 3 11 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 22222222 7777 0 3 3 0 777777777777777777777777777777777777777777777 33 77777777 11111 6 777 9 9999 7 5 3 77777777777777777 3 0 0 777 7777777777777 2 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 3 3 3 33 0 77 77 8888888888888888888888888888 0 0 0 4444 11 8 5 888 888 4 0000000000000000000 5 2 0 4 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 6 3 11 3 333 3 0 8 66666 4444 22222 999999999 444 0 1 44 5 55 6 6 555 0 4 4 11 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1 11111 4 5 4 3 4 4 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 0000 7 9999999999999999 7 7 55 444444 3 88888 4 4 888888888888888888888888888888888888888888888 88 1111 5 33 1 88888 2 0 2 2 0 6 8888888 11111 0 888888 0 0 9999999999 3 0 99 22 8 0 11 2 444 8 66 44444 0 222 8 8 11 55 888888888 0 3 1 444444 3 0 5 999999999999999999999999999999 5 77 88 1111 0 77 0 0 11 5 66 4 5 000 99999999 3 6 7 4444444 11 333333 222222222222 8888 33 0 8 33 8 6 99 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1 88 6 7 77 9999 5 00000 222 55 6 22 777777777777777777777777777777777777777777777 3 6666 3 77777 3 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 7 55 3 3 3 3 555 22222 88 9 3 7 11 8 22222 2 22222222222222222222222222222222222222222222222222 2222 5 88888888888 5 1 2222 99 6 99 6 5 00000 8 0 11 8 11 8 5555 0 0 4 3 111111111111111 0 6666 11 111 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 2222 666 1 5 555 666 6 11 7 444 0 8 33 222 3 999 3 4 00 6 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 77 0 1 7 111111111 0 7 88888 2 33333333333333 9 2 6 6 1111111111111111111111111111111111 3
lowQualScore : . ..... .............................. . .. . ............................................ . .. .................................................................................................................................................................................................................... ........ .... . . . . ............................................. .. ........ ..... . ... . .... . . . ................. . . . ... ............. . ........................................................................................... . . . .. . .. .. ............................ . . . .... .. . . ... ... . ................... . . . . ........................................................................................................................... . . .. . ... . . . ..... .... ..... ......... ... . . .. . .. . . ... . . . .. ........................................................................................... . ..... . . . . . . .............................................................................................................................................................................................................................. .... . ................ . . .. ...... . ..... . . ............................................. .. .... . .. . ..... . . . . . . ....... ..... . ...... . . .......... . . .. .. . . .. . ... . .. ..... . ... . . .. .. ......... . . . ...... . . . .............................. . .. .. .... . .. . . .. . .. . . ... ........ . . . ....... .. ...... ............ .... .. . . .. . . .. ....................................................... . .. . . .. .... . ..... ... .. . .. ............................................. . .... . ..... . ............................................................................................. . .. . . . . ... ..... .. . . . .. . ..... . .................................................. .... . ........... . . .... .. . .. . . ..... . . .. . .. . .... . . . . ............... . .... .. ... ............................................................................................................................................................................... .... ... . . ... ... . .. . ... . . .. ... . ... . . .. . ............................................................................................................................................................ .. . . . ......... . . ..... . .............. . . . . .................................. .
lowQualScore : 0 88888 888888888888888888888888888888 0 00 0 44444444444444444444444444444444444444444444 2 00 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 88888888 8888 0 2 8 0 222222222222222222222222222222222222222222222 33 55555555 33333 7 333 0 0000 3 0 3 00000000000000000 2 0 0 555 5555555555555 5 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 3 3 3 55 0 55 55 2222222222222222222222222222 2 0 0 8888 33 3 5 000 000 0 0000000000000000000 0 5 0 7 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 7 3 00 3 333 3 7 3 00000 0000 00000 000000000 000 0 4 66 4 88 0 0 888 7 9 3 00 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 0 99999 6 3 4 4 4 4 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 5555 3 6666666666666666 3 0 00 111111 6 88888 4 4 444444444444444444444444444444444444444444444 22 9999 0 88 4 22222 5 2 5 8 0 0 2222222 55555 8 222222 0 0 2222222222 2 0 55 22 0 0 00 8 000 0 22 00000 8 000 0 0 00 00 444444444 0 3 7 333333 0 0 0 555555555555555555555555555555 0 55 55 5555 0 55 0 0 00 0 00 0 5 000 77777777 0 4 8 8888888 00 000000 222222222222 5555 88 0 0 88 8 7 22 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0 33 7 5 77 5555 5 00000 000 33 7 22 111111111111111111111111111111111111111111111 1 5555 1 44444 3 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 3 00 6 3 3 3 888 11111 33 3 6 3 00 0 77777 6 00000000000000000000000000000000000000000000000000 1111 7 77777777777 7 4 1111 22 7 22 7 0 00000 0 8 22 0 00 8 2222 0 0 2 2 000000000000000 0 2222 00 888 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1111 777 4 7 777 888 7 00 7 000 0 0 88 222 2 888 2 0 77 7 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 00 8 6 3 333333333 0 0 00000 0 88888888888888 2 0 5 5 3333333333333333333333333333333333 7
consensus : NACAATGAGTTAAT-AAGTAACAAACC-ATTCAATACA--------TTTGTAAGTA-AGTCT-TTAA-TAT-ATTAATTGCGCA---CC----------------TACCG--T-----TGANTACAAAT-ATTGACTGAA-ATTATCAA---------C---A-----------G---AAG--TCCATAC-A--A---CA--TTG-CACATTTAN-TAAA--NGA-AAATA-CAT-T--A-A-ACAAT-----A-TTCTGTACAG---AA------A-NNNTT------GATTGTTCTATGT-CG-ANTAAA----TA------ANTT--TACGGGTAT-TTCTTCTCCTAACTATTGACAGAAATTA---ATTCTAGGCT-TCTGTG-GCTGTCTGTA-TTTTT----TGT-ATG--GTTCCTGTCTAAGTGAAC--TTTGNNTAA-GACTGTTAACGCCCNG-TGACAGGTCCCCCACACAATATGTTGACA-GATCCCCAGTA---TCTGCCA-GACAGGTC-TCTA--NCGT--AAAA-C--TACGTATCTCCC-AT-CATC---ATAGAGCA-GCA------GGGTNTGT--GTGAT-TG-----TC---AGTCG-CCTG-TAGATAN-----TTG---TGACCTGTT-ACCTAG--T------A--CTGT--A-CGATA-GGG-ACGG-ATA-ACACATGTGCACAGGTAGCGCAACCAGGGCTCACCAGATATAATATA-AACTNTCTATCCCGT-TCATTTCA-CTGACTTCTTGT-T--CCAACNTTAATTCTTTCANCTACAGCAGTAANCTCTTCATACAGAANANGGTCAACNTTCTTGCCCAANCATTCCTANACTTAG-----TA-A-CAT-AGACTGAC--CACCT---CCGC--T--C--ACTGTA-TCTCTG-TCTGT-------CTAC--TGCC-ACCA--CGN-ATGATNTGGGGCT-TG-GA-AG-CCTCTG-CTTCATTCTATC-TGTGACAGTTTTAGCGCT-GT---TTGAT-ATTTACCGG-TAATCGTAC-G-GTATAANCGCCTAAATACNAACCCATCATNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGAACTACAACCTANCATGTGATTA-TTGA-CCTA-TCAATGGCGTATCTCTTTTTCT-TTGACACAGACAAAC-A-CTGTG-CTTT---CAA-TGACA-TGGAA----GTG----AATAATA--AG-CA-ATTTAT-CAACGCATCATGAAATATAA-CAACCATTATGACAGGTG---TGAGA-ATAACTG-ATCTATTACATT-TAAA-TGCATCA-TGT-TTNAAAGGAA------ATCTG--A-TCCCTG-TGCGA--G------ACTT-TA--AAC-----GC-A--ATGTT--T--T-----TC--C----C-CGA-T---AN----A-AA-GCAATATCTAT-TAT-------CTA-TT----TCTGA-C-TTGAGGT---AA-CTTTCCCC---TGTCTG-------CA-TTAC-AA---------AGTA-TGGATC--G-GAGAGGGC---------------C-GGGAT--C------AGAA-T-CC--TC-TGAGAGT-GG-GGCTA--T-GT-A-C-AGGAAGG-------------AG--AACGCCCA--TTTC---GTAAAATGTTTCT-AAC--TTTTGAT---ACAGGGANATNTGTTGC-GCCCCG-ACAA-TTTT-C---CTGCAAACATATG-TTGTTCT-CCGG-AATG---------AAAGAAATT-TGGGAGGGTAACC-GGTAT-ATA-CACA--CTGCAT---CAAGGA-TTTGAAA--CAAAACCA--ACACGTGTTGG-AGC-AATGTT-GA--TGGTAT-CCATGGA-GTTGAA-GAGCTTTCT-TGA-ATTCTC-CAAAATAATATTTG--TTTTCNTGAAAT-ATGAACAC-AGTNA-ATTCGTC--GNCAGANATCACT-TCCTTCAGAATNATTTTCANTGATTCTGTAACGGAGAAAACTGGGACAATGGTTCATAGAGTACACTACTTTTGCCCCGCTTGGTGNAAAAGAAATT-CTCCA-CT-CCAAAGTCCGAGTTTAATTC--ATT--TGT------CTGTTTG-TTTGC-AAT-AGGAA-CG-AG--AT-GAA-ATCCTTCGTCAA-TAATT--GATT--G-T--AGG--T-ACGA--CTACGCG-------AT-GGCCA---------ATGCGC--GAGT-CAAAC-ATC--TATCAAACCCAGGGAAAGGGGCTGGTAAATGG-GCA-GTGACGGGAA--TGGAAACA------C-AGCGGCGATAT-C---AG-T-TT--C-ATNAGA--TAGATAAGTGTA-G----TTGT-GA--CANGGACC-GTGCAG-GGTTCTC---ACCTTCACTGGC-T--TGGA-T-CA--C--C---CACTCAAT-AA-TT-TGA-A----TGGT-T--TC-TCA-T-CCG---G-AG--TA-AT-G-AACTTGA-AAT---GTAAT-ACAG-TATTGTTT-CTC-TCC--AATA-GT---GGAGNCACG-CG---A--C---AATTCG-GT-----------C-ATTT-GA---CCGG----TGTG-AGTAA--GT-T--GTA-ATCTGGCGAA----TCC-CGG-G--GG-AGTATCAGAC-GG-TC-TCCATAAT-AGA--TAAGGTGTATGT-CTG-GGTGAATGAATTGGAN---A------CGTG-GACTGAGACATCT--CACA-T-ATCA-C-CCTTTAT----GGA---------TCAGG-CA--NCCAACGCA---TGT-AANTCAT--GT--TCAG----ATG---AT-TT---A-AACCT----AAATC-CCTCCCTANGA--CTA-CCACTCAGCA------TA-TTC---TNN----ATC--CTCTAT--ATA-ACTN-TGAAGGTTTC----CGTATCATC-T-CC-C-C---GTGTCCCCCAGATCCCTTCTG-AAGGTCACTTCTGTCGG-TGTCCC---TATCTCAC-G--ACACA---CACCCACATA-CAGGGCTTCTGACACNCGGGGAAT-GTGATCCATCC-TGTAACGA-TTC-GTTAACGTTAGTTTGAT-CGAC-ACAATA-CAAATTTCT-ATT-AATACGAA-ACTACACAT-T--ATACAGCG--TTCTGAAAT-AAT-TC--GTGAAA--AGTTTGT---A------------TAAAAATGTG-----------TAATTCTTACAAAATCCACTCTACCTGAGAATTT--CAAAAC-TCTATTTATAGACAATCGGAAAATAC-CCAGTTAAA-CT-CCGCCAGCTACTTTTCTNTCGCATGTACTCTGTTGACCTTAATATGGAATACCAGT-C-TTATTTGATTCG-TTATCGA
Reference ( gi|1 ) : CACAATGGGTTAAT-AAGTAACAAACCTATTCATTAC---------TT-GTACGTATAGTCT-TTAACTAT-ATTAATTGCGC----CC----------------TATCG-CT-----TGAGTACAAATTATTGACTGAACATTATCTA---------C---A-----------T---AAG--TCCATACGA--A---TA--TTG-TACATTTAC-TAAACCTGA-AAATA-CAT-T--A-AGACAAT-----AGTCCTGCACAG---AA------A-CGGTT------GATTGTTCTAT-T-CA-ACTAAACCCATATCCGCTATTT--TATGGATAT-TCCCTCTTCTA-CTATTGACAGAAGTTA---ATTCTAGGCT-TCTGTGTGCTGTCTGTA-TTTGT----TCTCCTG--GTTCCTGTCTAAGTGAACTCTTTGAATAACGACTGGTAACGCCCCGTTG-TAAGTCCCCCACACAACATGTTGACATGACCCCCAGTAATTTCTGCCAGGACAGGTC-TCTA--ACTTCTAAAATC--TACGTATCTCCC-AT-CATC---ATAGA-CATGTA------GGGTGTGT--GTAAT-TG-----TC---AGTTG-CCTG-TAGATAT-----TTG---TGA-CTGG--ACCT----T------A--CTGT--A-TGACA-GGG-ACAG-ATA-ACAGTTGTGCAC-GGT--CACAA--AGGG------AGATATAATATAAAAATATCTATCCCGT-TCATTTCA-CTGACTTCTTGT-T--CCAACTTAAATTCTTTCAATTATATT-GTAAACTCTTTATTC-GAACATAGT--GTCCTCTTGCCCAACC-TTCCTAAACTT-G-----TA-A-CAG-AGACTGACTCCACCTGAGCCAC-GT--C--ACTGTA-TCTCTGGTCTGT-----TCCTACGATACCGACCAAATAACATGATATGGGGCT-TGGGAGAGTCCTCT--CTTCCTTCTATC-TGTGACAGTTAAAGCGCT-GT---TTGAT-ATCTTCCGGTTAATCGTAC-G-GTATATCCGCCTAAA-ATAAA--CATCATATACATAACCTAGACTTTAGAACTAGAACCTA-CATGTGATTT-TTGAACCTACTCAACGGTGTATTTATATTTCTATGGACACAAACAAAT-A-TCA-G-CTTT---CAAATTACAATGGAA--AGGTG----AATTATA--AG-TA-ATTTAA-CAACGCTTGATGAAA-ATAGACAACCATTATGACTGGTG---TGAGATATAATTG-ATCTATTGCATTCTAAA-TGCATCAATAT-TTTGAAAGTA------ACCT---A-TCCCTG-TGCGA--G------ACTGCTA--AAC-----GC-A--ATGTT--T--T-----TC--C----C-TGA-T---AT----A-AATGCAATATCTATCTAT-------CTACTT----TCTGAACGTTGAGGT---A--CTTTCCCC---T--CTG-----AACACTTACCAA---------AGAAATGGATT--GCGAGAAGGG---------------C-GGAAT--C------AGAA-T-TT--TC-TGAGAGT-GGCGACT---T-GT-A-C-AGGAAGG-------------AG--AATCCCCA-GTTTC---GTAAAATGTTTCT-AAC--TCTTGTTTA-ACAGGGACATCTGTTGC-GCTCCGTACAG-CTTT-C---CTGCAAACTTATGGTTGTTCT-CCGG-AATA---------AAAGAAATT-TGGAAAGGTAACC-AGTAT-ATATCACA--CCGCAT---CAAGGA-TTTGAAA-CCAAAACCA-AATACATGTT-A-AGC-AATGTT-GA--TGGTA--CCATGG--GTTGAATGAGCTTTCTATGA-ATTCTCACAAAATAATACTTGGTTTTTCATAAAATGATTAACACGAGTAATATTCATCTGGACAGGAA--ATTGTCCTTCAAAAAGATTTTCAATGATTCCGTAACAGAG-AAACTGG--CAATGG-TCATAGAGT-CACTAGCTTTGGCCCGCTC-GTGAAAAAGAAATTTCTCCATCTGCCAAAATCCGAATTTAATTC--ATT--TGT------CTGTTTG-TGTGCTAATCAGGAA-CA-AG--AT-GAA-ATCTCTCTTCAA-TAATT--G-TT--G-T--AGG--T-ACGG--CTACGCG-----GAAT-GGCCA---------ATGTGC--GAGT-CAGAA-ATC--TCTCAAACCCAGGGAAGGGGGCTGGTAAATGGTGCA-GTGACGGGAA--TGGAAACA------CTAGCGGCGACAT-C---A--T-TT--C-ACGAGA--CAGATAAGTGTA-G----TTGT-GA--AAGGGACC-GTGCAGCGGTTCCTGCAACCTTCTCTAGCCTG-TGAA-T-CA--C--T---CACTCAGT-AGCTT-TGA-A----TGGTCT--TC-TCA-T-C-----G-AG--TA-AT-G-AACTTGA-AAT---GTAAT-GCAA-TACTGTTT-CTC-TCC--AATA-GT---GGAGTCGCG-CA---A--C---AATTGG-GT-----------T-ATAG-GA---CCGG----TGTG-AGGAA--GT-T--GTA-ATCTGGCGAA----TCC-CGG-G--GG-AGTAGCAGA--GA-TC-TCCATAAT-AGA--TAAGGTGTATCT-CTG-G-TGGATGAAT---AT---A------CGTG-GATGAAGACATCT--CACA-T-ATCA-CACCTTTAT----GGA---------GCAGGGTA--CCTAATGCA---TGTTAATCCAT--GT--TCAG---TAGA---AT-TT---A-AACCT---GAAATC-CCTCCCTACGA--CTAGCCACTCAGC-------TAGTTC---TGT----ATC--CTCTAT--ATA-ACTCCTGAAGGTTTC----CGTATCATC-T-CC-C-C---GTGTCCACGAGATCCCTTCTG-AAGGCAACTTCTGTCGGTTGTCCC---TA-CTCAC-G--ACACAAATCACCCACATAGCGGGGCTTCTGACACACGGGGAA--GTGATCCATCC-TGTAACGAGTTCAGTTAA-ATTAGTTTGAT-CGACTCCAATA-CGAATTTCTAATTGAATACGAGCACTACACAT-T--ACACAGCA--TTCTGAAATGAAT-TC--GTGAAA--AGTTTGT---T------------TAAAAATGTA-----------TAATTCTTACAAAATCTACACTACCTGAGAATTTTACAAAGT-TCTATTTAT-GACAATCGGAAAATACTCCGGTTAAAGCTGCCGCTAGCTATTTCTCTGTTGCATGCG----------------ATGGAATAC--G----TTATTTGATTCGTTTATCAAAGCTG
gi|5 : ACAATAAGT--ATGAAGTAACATACC-ATTTAT-A-------------GTAT-TAAAGTCTATTAAATATGAT--ATTGCGCA---CC----------------TACTG--T-----TGATTACAAAT-ATTGTCTGCAAACTGACTAAAACAGAATC---A-----------G---AAGGTTCCATCTAA--ACCCTAACTTG--ACATTTATGTAAAATGGA-AACCAGCTT-TGCA-ATACAATTTACTATTTCTGTCCAGTGGAATACCCCA-CATTT------GATCGTTCTAT-GGCATAATAAA---ATAT-----AATAAATATAAATATATCTTTC--CTAACTTATGAGAGA--TTA---ATTTT--GCTCTCTG---GTTGTCTGTA-TTT-T----T----TGATGTTC--GT----GTGA------TGTGTAA-GACCGTTAACGCCCGG--GACAGGTCTCCCACACATTGT-TTGA---GATCCCACGT----TC-GCCAGGACAGGTCCTCTA--TCTTC-AAAATC---ACGAATCTCCCCATACATCCCAATAGA-AATGCAAGTGAAGGGTTTGT--GTAAT-CGCGTTCTCCTAGGTCATCCTGCTAGAAATC----TTGAATTGATCTGTT-ACCTAGTCT------G--CTGTCGA-CAATA-GGA-ACGGGATACACACATGTGCACAGGTAGCGCAACCAGGGCTCACCAG---TCATAT-----TATCT---CTGTATCATTTCAACTGAACTTTTGTGTGGCCAA-TTAACTTCTTTCATCTATAGCAGTAAACTCTTTATAC--AATATGGTCAACATTCTTGCC-AACC-TTCCTATACTT-AGGTTCTA-A--AT-AGACTGAC-CCACCT--ACCGC--T--C--ACTGTACTCTCTGCTCTGTCACACTACTAGGATACC--CCATTCGA---GAAGTGTGGCTGTGAGA-AGGCCTCTG-CTCACTTCTATCTTGTGACATTTTTAACGCTAGTTTATTGATAATTCTC----TAAACGCA--G-GTAT
gi|22 : CAATGAGTTA-T-AAATAACAAACC-ATTCATTAC---------TTTGTAAGTA-AGTCT-TTA--TAT-ATTA-TTGTGT----CC----------------TATCG--T-----TGAGAACAAAT-ATTGACTGAA-AT-ATTTA---------C---A-----------G---AGG--TCCATAC-A--A---TA--TT---ACATTTAC--AAA--TGA-AAAT--TAT-T--A-A-ACAAC-----A-TTCTGCACAG---AA------A-ACGTC------GATTGTTATATGT-CA-AC--AACCC-TAACC-TTATTT---ATGGGTAT-TT--TCTTCTAACTATTGACAAAA-TTA---ATTCTAG-TT-TCTGTG-GCTGTCTGTATTTTGT----GAT-ATG--GTCTCTGTCTAAGTG-ACTCTT--GATAA-GACT-GTAACGCcagttacctgagtaatga
gi|39 : AT-AAGTAACAAATC-GTTCAAAACA--------TT-GTAATTA-AGTAT-TTAA-TAT-ATT-ATTGCGC----CC----------------TACTG--T-----TGAGTACAAA-TATTGACTGAA-A-TATCAA---------C---A-----------G---AA
gi|18 : ataaattT-AAGTAACAAACC-ATTCAATACAATGTACAGTT-GTAAGTA-ATTCT-TTAA-TAT-ATTA-TCGCACACAACCATTGATTTATTATAAATATTGACTGAAATCGAATACAAAT-ATTGACTGGA-AT-ATCAA---------C---AGAATCAGAAAATG--AAA--TCCATAC--------CA--TTT-CACATTTA--TGAACGAGATAAATG-TAA-T--ACAAACAAT-----AATC-TGTACAG---AA------AACAATTAACTTTGATTTTTCTATGT-CG--TTAAA---------G--GGTT--TAC-----T-TTCTTCTCCTAACTATTGACAGAAAT-A---ATTCTAG-TT-TCTATG-GCTATCTGTA-TTTTG----TGACATG--GTTCTTGTCTAAt
gi|29 : aataagtcgTTCAATAC---------TTTGTAAGTA-AGTCT-TTAATAAT-AT--A-----------C----------------TACCG--T-----TGATTACAAAT-ATTGACTGAA-A-TATCAA---------CAGAA-----------TCAGAAG--TCCATAC-ATTA---CA--TTGATAC-TATAG-TAAA--TGA-AA--A-CATGT--A-A-ACGGT-----A-TTCTGTACAG---GA------A-ATCTT------GATTGGCCTGT-
gi|23 : gAAATTATATATTC--AGCT-TCTGTG-GCTGTCTGTA-TTTTTTGAATGTGCTT--GTT----TTTAAGTGAACAATTTGATTTAAGACTGTTAACGCCCTG-TG-T-AGTCCCCCAC-C-ATATGTTGACA--AATCCCAGTA---TCTGCCA-GACAGGTC-TCTATGGCGT---AAAGG--TGCGTATCTCCC-AT-CATC---ATAGAGCAAGTA------GGGTGTGT--AGGGT-TG-----TC---AG-TG-CCTG--AGATAA-----ATG---TGACCTGT--ACCTAG--TCGTTAGA--GTGG--A-TTTTA-GGGTACAG-ATA-ACAgtattaattggtaatatcttctcctaactattgaca
gi|36 : gaACATGCTGACA-GATCCCCAGTA---TCTGCCACAAGAGGTC-TCTA--AGGAGTAA---CGGTACATGTTTGTC-AT-CATC---ATATATCA-GCA------GGGTGTGTAGGT--C-TG-----TC---AGT
gi|13 : --TACGTA-CTCCC-AT-CATC---GTAGAGCA-GTA------GGGTTTGT---TGATCTG-----CC---AGTT---CTG-TAGATACATGTATTG---TGA-CTTGTTACCT-----------AGTCTGT--AGTGACATAGG-ATAG-ATA-GCA--TATGCAC-GGT--CACAA--AGGG------AGATA-AACATAAAACTG-ATATTCCGT-TCATTCCA-CTCACTGCTTGT-T--CCAACATTAATTCTT-CAAT-ACAG--GTAATCTTTTCA--CAGAAAAGAGT--ATC-TCTTGCCCAAGCATTCCTAAACTTAG-----TCTA-CAT-AGACTGAC--CACC-----CACCGT--CGCACTTTA-TCTTTG-TCTAT-------CTAC-------ACTA--TGGCATGATATGGG-------------TCTCTG-CTTCATTCTATC-TGTGACAGTT--AGGGCT-GT---GTGAT-ATTTACCGGT--ATCGTACAA-GTATA-ACG-CTAAATATAA----ATCATgact
gi|44 : AATATATAATTTTC-ATCCCGT-TCATTTCA-CTGACTTCTTCT-T--CCAACCTTAATTCTTtgccaaaacacaaa
gi|50 : cagccacagaagctgTCCCGT-TCATTTTA-CTGACTTCTTGT-T--CCAAc
gi|28 : CCTAGACTTAG-----TA-AGCAATAGACTGAC--CACCTA--CCGC-CTTCC--ACTGTA-TCTCTG--CTGT-------CTACTCTGTTGA---GATACAATTATTTGGGGCT-TGTGAGAGTCCTCTGTCTTCACTCTTTC-TGTGACAGTTTTAGCGCT-GT---TTGAT-ATCTACCGG-TATTCATAC-ATGTATAATTGCCTAAATACCAACCCATCAT
gi|19 : taccAGAACTA-AACCTAACATGTGAATT-ATTATCCTA-TCAATGGCGTATCTCTTTTTGTATG-ACACAAACAAATTA-TGT-G-CTTT---TAG--TGAGATGAAA----GTC----GACAATAG-AG-CA--CTTAC-CAGCCAATAATGAAA-TC---TAAC----ATGACAGGT----TGAGAT-TAATCG-ATCTATTGCGTT-TAAA-CGCTTCA-TGT-TACAAAGGAA------ATTTGAAA-CCTCTG----GA---------ACTG-TA-----------C-AT-ATGGTACT--T-----TC----------AA-T---AA----AGAAAGCAATATCTA--TAT-------CTA-TC----TCTG-AC-TTGAGGTA--A--CTTTCCCCTG-T--CTG-------CA-TTA-CAA---------AG-AGTGGATC--A-GAGAGGGC---------------C-GGGAT--T------AGAA-T-CT--gattgcgaaa
gi|9 : GAACTACA-CCTATCATGTGAACTATTGA-CCTA-TCAATGGCATATCTCTTTTTCT-TGGACACAAACAAAC-A-CTGTG-ATTT---CAA-TGACA-TGGAA----GTG----AAT-ATA--AG-TACATTTAT-CAACGCATCATGAAA--TA--CAAC-ATAATGACTGGT----TGAGA-ATAACTG-A--------------AA-TGCATCA-TGT-TTGAAAGGAA------ATCT---GGTCCCAT-TGTGT--A------ACTTATA--A--------C-A--CTGCTGCT--T-----TC--C----A-CAT-T---AT----A-A--GAAATATCTATCT---------CTA-TC----TCTGA-C-TTGAGGT---AA-CTTTCACC---TGTCTG-------CA-TTACAAAGTATGGATTAGAAA-GGGTN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTC-GGGATTTC------AGAA-T-CTCATC-TGAGAGTGGGAGACTAGCT-GTAA-C-A-GAAGG--------------------CCCCA-ATGCCACTGGAAAATGTGTCT-ATCCTTTTTGATT--ACAGAGACAT-TGTTGC-ACCCCA-ACAA-TTTT-TCCACTGCAAACATA-GTTTGTTAC-CGGG-AACGATCTCAAATAAAGACATTGCGAAAGGGTAACC-GGTAT-ATA-CACATTCCCCAT---CAAGGATTTTAAAA-ACAATACCA-c
gi|14 : TTA-TTGA-CCTA-TCATTATTGAATCTCTTTTTGTTTGG-CACAGACAATC-T-TTGTG-CTTT---TAA--TGCCATGGAC----GTT----GATAATA--AC-AC-ATTTAT-CAACGCATCATGAAATATAA-----CATTATGGCAGGT----TGATA-ATAACTG-ATCTATGACATT-TAAA-TGCATC-ATG--TTTGAAAGGA------A------A-T--CTGATACGA--GAATTGTACTTCT---AAC-----ACTG--ATG-C--T--T-----TC--G----C-CAA-A---AC----A-A--GCAATATCTA--TAT-------CTA-TT----TCT----GCTTAGGT---A--ATTTTCCG---T--CTG-------CA-TTA-CAA---------AG-TGTGGATT-----AGAGAGG---------------C-CGGGT--C------AGAA-TCTC--TC-TGAGAGT-GG-GACTG--C-GTAA-C-AGGAAAG--------------C--AACGCCCA--TTTT---GTCAAATGTTTCTGAGC--TTTTGc
gi|26 : TTA-TTGA-CCTAA-CAATGGTGTATCTTCTTTTCT-TTGACACAGACAAAC-A-CTGTG-TTTT---CAA-CGACA-TGGAA----GTG----AAT-ACA--AGCTT-ATTTAT-CAACGCTTCATG-AA-AT--ACAA-CATTATGACAGGT----TGAGA-ATAACTG-ATCTGTTACAT--TAAATTGCATC-ATGT-TTAAAAGGAA------ATCTG--A-TTCCTG-TGTG---G------A-----A--AAT-----CT-ATCACGTC--TGAT-----TT--C----C-CGA-T---A-----A-AATGCAATATCTA--TAT-------CTAatacaa
gi|21 : TTA-TTGA-CCTA-TCAATGGTGAATCTCTTTTTGT-TTGATAC---CAAA------A-GACTTTGTGTTAATGACA-TGGACGTAGATACTAAAACAATACTAG-TA-AT-----CAACTTATCATGGAATATAA-----CATTATGACAGGT----TGAGA-GTAACTG-ATCCATTACATT-TAAA-TGAATCA-TGT-TT-GATAGGA------A------A-TC--TGATGCAATTGTCCC--ACTTATATTACT-----GC-----TGCT--T--T-----CG--C----C---A-T---AA----A-AA-GCAATATCAAT--AT-------CTA-TT----TCTGA-C-TTGAGGT---AA-CTTTCCCC---TGTCTG-------CACT-AC-AA---------AGTA-TGGATT--G-GAGAGGAC---------------C-GGGGT--C------AGAA-T-CT--
gi|7 : TATCTCTTTTTC-GTTGACACGAACATAC-A-CTGTG-CTTT---CAA-TGACA-TGGAA----GTG----AAT-ATA--AG-CG-CATTAATCAACGCATCATGAAA--TA--CAAC-ATTATGACAAGTG----GAGA-ATAACTG-ATCTATGACATT-TAAT-TGCATCA-TGT-TTAAAAGGAA------ATCTG--A-TTCCTT-T--------------TTG-TA--AATT----AT-A--ACTTT--T--C-----TG--CTTTAC-TGA-T---AA----A-AA-GCAATATCTAT--AT-------CTA-TT----TCTGA-C-TTGAGGT---AA-CTTTCCAT---TGTCTG-------CA-TTAC-AC---------AGTA-TGGATT---TGAGAGAGC---------------C-GGGGT--A------AGAA-T-CTC-TT-TGAGAGT-GG-GGCTA--T-GT-AAC-AGAAAAGCAACNNNNNNGAAAGC-AACGCCCATGTT-----GTGAAATGTTTCT-AAC--TTTTGAT---ACAGGAACGTCTGTTGC-GCCCCG-ACAA-CTTTTC---CTGCAAACATA---TTGTTCT-CCGG-AAT----------AAAGAAATT-TGG-AAGGTAACC-GGTAT-ATA-CACA--CTGAAT---CAAGGA-TTTGAAA--CAAAACC---ACACATGTTGG-AGC-AATGTT-GA--TGGTAT-CCATGG--GGTAGAAGAGCATTCT-TGA-ATTCTC-CAAAATAATATT--GTTTTc
gi|15 : TTTCT-TTGACACAGACAAAC-ACTGA-G-TTTT---TAA-TGACA-TGGAA----GTG----AAT-ATA--AG-CACATTTAT-CAAAGCATCATGAAATATAA-----CATTATGACAGGTG----GAGA-ATAACTG-ATCTATTACATT-TATA-CGCATCA-TGT-TTGAAAGGAA------ATCTG--A-ACTCTT-TATGA--A------AC--------AT-----GT-A---TCTT--T--TGTGCTTT--C----C-CGA-T---A-----A-AATGCAATATCTAT--AT-------CTACTT-----CTGA-C-TTGAGGT---AA-CTTTCCTC---TGTCTG-------CA-TTAC-AA---------AGTA-TGGATT--G-GAGAAGGC---------------C-GGGAT--C------AGAA-TCTC--TC-TGAGAGT-GG-GGC----T-AT-A-T-AGCAAAA-------------AGGCAATGCCCA--TTTT---GTAAAACTTTTCC-AAC--TTTTG
gi|2 : ctA-ATA-ACAAC-ATT-TG---GATGC--TGAGA-ATAAGTGCATCTATTGCATT-TAAA-T--ATCATCATGTTTACAAGCAAATCTGACTT---G-ACCAAG-CTCGA--C------ATCTCTAC-AACTTGTCGC-A------------T-----TCAAC----T-TAAAT---TT----A-AA--CATTATCAACCCATAAATTAGCTACTTCTATTTTGCAC-TTGAGGCCAAA--CTGTCCTC------CTGTTTATGACAATTGCTAA---------AGTA-TGGATTTAG-GAGAGGTG---------------CCGGGAT--CTGATTGACAA-TATC--TC-TGAGAAT-GG-GGCTAT-T-GT-AAC-AGGAAAG-------------GGC-AACCCCCA--TTTT---GTAAATTTTTTCT-AACTTTCTTGAT---ACAGAGAAATTCGTCCC-GCCCCG-AC---TTTT-C---CTACACACATAT--TTGTTCTGCCAG-AAT----------AGAGAAATT-TG--AAGGTAACC-GGTAT-ATA-CACA--TTGCAT---CAAGGA-TTTGAAA--CAAAACCACACCACG-GTG-A-AGC-AGTGTTGGA--TGGTAT-CCGTGGA-GTTGAA-GAGCTCTCT-TTA-ATTCTC-CAAAATAATATTTG--TCTTCATAAAAT-ATGAACAC-AGTTA-ATTCGTC---ACAAATA--AT--TCCTT-AGAATTATTTTC-ATGATTCTGTAACAGAGAAAATTGGGACAATGGTTCATAGAGTACACTACTTTTGCCTCGCTTGGTGTAAAAGAAA--TCTCCATT--CC-AAGTCTGAGTTT--TCC--ATTCGTGT------CTGTTTGTTTTACAAAT-AGGAATCG-AGGAAT-GAA-ACCCGTCTTCAATTAATTGAG-CT--G-C--A-T--T-ACAAACTTACGTG-----G--TGGGCC------------GTGC--TCGT-CAAAC-ATC--TATC-AACCCAAGGCA--GAGCTGGT-AATGG-ACA-GTGACGGGAAAGTGGAAATA------ACA-CAGCGATAT-C---AGTC-TT--C-TTTAAT--CGTACAAGTGAAGG----CTGT-AA--ACAGGACC-GTGTAa
gi|20 : gttaatcaagtccattgtgcATTGGCGAGTTGAGA-ATAACTG-ATCTATTACATT-TAAA-TGCATCA-TGT-TTAAAAGGAA------ATCTG--A-TCT-----------A------ACAATCA--CACCC---GC-A---------C--T-----TC--C----CATGA-TTTCATTAAAA-AAGGCAATATCAAT--GT-------C-AATT----TCTGA-C-TTGAGGT---AA-CTTTCCCC---TGTCTG-------CA-TTAC-AA---------AGTG-TGGATC---TGAGAGGGT---------------T-GGGAT--C------AGAA-T-TT--CCCTCAGAGT-GG-GACT---TTGT-A-AGAGGAAGG-------------C---AACGCCCA--TTTT---GTAAAATGTTTCT-AAC--TTTTGttttcccacctttttttccccccccccaaaaagtttttatttggggattcattcccctgagtgattgatggattcccttccgccagcaatgaactgaaatatatactgtattgtttgctctctaatacgtgag
gi|17 : catcgaagttgataaaagcacttctatcaacttatcatcgaatataacatTGTTGCT--T-----TC--A----C-T-A-T---AA----A-AA-GCAATATCGATATA----------AATT----TCTT--CCTTGAGGTA--A--CTTTCCCC---T--ataca
gi|10 : tactaatacCAATATCTAT--AT-------CTA-TT----TCTGA-C-TTGAGGT---AAACTTTCCCTG--T--CTG-----C-CATTTAC-AA---------AGTATGGGATT--G-GAGAGGGC---------------C-GGGAT--CG-----AGAT-C-TC--TC-TGGAAGT-GG-GGCA---T-GT-AGC-AGAAAGC-------------A------CCCCA-GTTTT---GTACAATGTTTCT-AAA--TCTT-TTGATACA-GTAGATGTGTTGTGGCCCCGGACAATTTTT-C---CTGCAGAAATGTG--TGTTCT-CCGGAAATA---------AA--AAATT-TGGGAGCTTAACCAAGTATGATA-CACA--CTGCATTCACAAGGA-TTTGAAAGTCAAAACC---ACACGTGTTGG-AGCAAATGTT-GACGCGGTAATCCATGGTAATTGA--GAGCTTTCT-TGAGATTCCGCCAAAATAATA-TTG--TTTTCCTGAAAT-ATGAACAC-AGTAA-----ATC--GTCAGAAATCACT-TCCTTCAAAATAATTTTCACTGA----GTAACGAAGAAAACTGG--CAATGG-gtctgcaatataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaatacacactgcatcaaggatttgaagcaaaaccacacatgttgaagcaatgttgatggtatccatggagtt
gi|41 : taaatacaatcatgtttgataggaaatcatgatgcttgtatcaacactgtctatttcagtaaaaaaagcTTGAGGT---A--TTTTTCCCCTGT--CTG-------CA--TGACAA---------AG-TGTGGATC--A-GAGAGGGC---------------C-GGTAT--C------AGAACC-TC--TC-TAAGAGT-GG-GACTG--T-GTAA-C-AGGAAatctctcgtcaacaaatgcgtaata
gi|40 : ctgacTTAC-AA---------AGTA-TGGATT--G-GAGA-GGG---------------CAGGGAT--C------AGAA-C-CTC-TC-TGAGAGT-GG-GACTA--T-GT-AAC-AGGAAG--------------AC--AACCCCCA--TTTC---GTAAAATGTTTCT-AAC--accaac
gi|17 : ctgca-ATA-CACA--CTGCAT---CAAGGA-TTTGAAG--CAAAACC---ACACATGTTGA-AGC-AATGTT-GA--TGGTAT-CCATGGA-GTT
gi|49 : tactaatactgttgctttcactataaaaagcaatatcgatataaatttcttccttgaggtaactttcccctgtctgcaatataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaCAAAACCA---CACATGTT-GGAGC-AATGTT-GA--TGATA--TC
gi|12 : TTTGTTCCGCTT-GTGAAAA-GAAATT-CTCC--CTTCTATAATC----TTGAGTTCTTATT--TGTGCTGTACTGTTT----TGC-GAT-AGAAA-GACAG--ATTGAATATCCTTCCTCGA-TAATT--G-TGAAG-TCGAGGATTGATGC--CAACGCGAAGAGGAAT-GATCAGAATCGGCCATGTGTTGAAGTACATAAGATCGCTTTCAAATCAAGGGGAAGTG-CTGGTAA-TGG-GCA-GTGACGGGAA--TGAAAACA------C-AGCG-CAATGT-CGAAA--T-CT-------AAATTCAGAAAAGTGTA-G----CTGT-GA--CAAGGACC-GTGCA--TGTTCTC---ATTTTCGTTGG---A-TGGA-C-TAAGT--C---CATTC--C-AGTTT-TG--A----TGA-AA--TC-TCA-A-CAG---G-AG--CA-TT-G-AACTTGA-AAT---AT-AT-ACAG-CATTGTTT-CTC-TCC--AATA-GT---GAGGACATG------A--C---AATTTG-G
gi|8 : AAATT-CTCCA-CT--CAAAGTCTGAGTTT-------------GT------CTGTTTG-TTTG--AGATAGGAA-CG-AG--AT-GAA-ATCCTTCATCAA-TAATT--GAAT--G-C--A-G--T-ACAG---TAGGTG-------AT-GGCC----------ATGCGC--GAAT-CAAAC-ATC--TATC-AACCCAGGGAA--GGGCTGGT-AATGGC-CA-ATGACGGGAA--CGGAAACA------C-AG-GGCGATAT-C---AGCT-TC--T-ATGGAA--T-TATAAGTGTA-G----TTGT-GA--CATGGACC-GTGCA--TATTCTC---ACCTTCTCTGGC----TGGA-T-CA--A--TTC-CATTCAAT-GACTGATGA-A---------A--TA-TCA-T-CCG---G-AG--TA-AT-G-AACTTGA-AAT---GT-AT-ACAG-TATTGTTT-CTC-TCC--AATA-GT---GAGGACATG------A--C---AATATC-CT-----------C-ATTG-GA----CGG----TGTG-AGT-A--GT-T--GTA-ATCTGGCGAA----TCcgat
gi|4 : AAGTCCGAGTTTAATTC--ATT--TGT------Cnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacatgtaatccatgtcagatgattgaaacctaaatccctccctataactaccact
gi|16 : AGTCCGAGTTTAATTC--ATT--TGA------CTGTTTG-TGTGC-AAT-AGGGA-CG-AG--AT-GAA-ATCCTTCGTCAA-TGATT--GTTT--G-T--A-G--T-AC-A--CTTTGCG-------AT-GGCC----------ATGCGC--GAGT-CAAAC-ATC--TATC-AACCCAGGGAA--GGGCTGGT-AATGG-GCA-GTGACGGGAA--TGGAAACA------C-AAC-GCTAAAT-C---A--T-TTTCT-ATG-GA--GTGATAAGTGTA-G----TTGT-GA--CATGGACC-GTGCAG-GTTTTC----ATTTTCTCTG---TT-TGGA-T-CA--CGTC---CACTCATT-AA--T-TGATA----TTG-----TC-TCA-T-TCG---G-AG--TA-AT-G-AACTCGA-AAT---GT-AT-ACAG-TACTGTTT-CTC-TCC--AATA-GT----GAGTC-CA-TG---A--C---AATatccttcgtcaataattgattgtagtacaatacacgatggccatgcgcgagtcaaacatctctcaacccagggaagggctggtaatgggcagtgacgggaatggaaacacaacgctacatcagtttctatggatagatgagtgtagttgtgacatggaccgtgcaggttctcaccttcaatggctaggatacactcactgagtaattagattgtgttcatccgtatacattcaactgaatagtatacaatagtctttcttatcctagataagctgagtccataagacaattctcgttgatttgacagtgtatagagattattgtaatcggtcgaaagaatccgcgtgagcagtatcagacggtcgtcctaatcagataagtagtatgtctggtgtgttaattggataaaaccccgtttgactatgacatctatcacactatcatcacttctatagatatcatatggtagaacatcgcatactcattaactcatgcttaggatcagactgatttttaaaacattcagaatcgcctccctagtactaccactcagcatccgtctcagtcctctatataactttgaaggtttccgtatcatctccaccgtgtctctcagatcccttctgaaggtcacttctgtcggtgtccctatttcacgacacacacccacatacagggcttctgatacacggggaatgtgatccatcctgtaacgattcgttaacgttagttgatcgacacaatacacatttctattaatacgaaacaaatcattaacgttttaaagcttgtgaaaccttgtatgaaaaatgtaatcaaacaaagtccactctacctgaaaattcacaaaatctatttataaataatcggaaattcccaattatgcccggctacttttctttcgca
gi|4 : -ATCCTTCGTCAA-TAATT--GATT--G-T--AG---T-ACAA---TACACG-------AT-GGCCA----------TGCGC--GAGT-CAAAC-ATC--TCTCAA-CCCAGGGAAGGG--CTGGTAA-TGG-GCA-GTGACGGGAA--TGGAAACA------C-AACG-CTACAT-C---AG-T-TT--CTATG-GA--TAGATGAGTGTA-G----TTGT-GA--CATGGACC-GTGCAG--GTTCTC---ACCTTCAATGGC-TA--GGA-TACA--C--T---CACTGAGT-AA--T-TAG-A----TTGTGT--TCATC----C-----G-TA--TACAT-TCAACT-GA-ATA---GTA-T-ACAA-TAGTCTTT-CTTATCCTAGATAAGC---TGAGTC-CA-TA---AGAC---AATTCTCGT-----------TGATTT-GA---C-AG----TGTATAGAGATTAT-T--GTA-ATCGGTCGAAAGAATCCGCGT-G--AGCAGTATCAGAC-GG-TCGTCC-TAATCAGA--TAAGTAGTATGT-CTG-G-TGTGTTAATTGGAT---AAAACCCCGTTTGACTATGACATCTATCACACT-ATCATCACTTCTAT----AGATATCATATGGTAGAACA--TCGCATACT---CATTAACTCAT--GC--TTAGGATCAGACTGAT-TTTTAA-AACATTC-AGAATCGCCTCCCTAGTA--CTA-CCACTCAGC--------A--TC---CGTCTCAGTC--CTCTAT--ATA-ACTT-TGAAGGTTTC----CGTATCATC-T-CCAC-C---GTGTCTCTCAGATCCCTTCTG-AAGGTCACTTCTGTCGG-TGTCCC---TATTTCAC-G--ACACA---CACCCACATA-CAGGGCTTCTGATACACGGGGAAT-GTGATCCATCC-TGTAACGA-TTC-GTTAACGTTAG-TTGAT-CGAC-ACAATA-CACATTTCT-ATT-AATACGAA----ACAAAT-C--AT-TAACG--TTTTAA----AGC-TT--GTG-AA--ACCTTGTA--T------------GAAAAATGTA------------A--TCAAACAAAGTCCACTCTACCTGAAAA-TTCACAAAA--TCTATTTATAAATAATCGGAAATT--CCCAATTA----TGC--CCGGCTACTTTTCTTTCGCAgccgat
gi|3 : aagtccgagtttaattcatttgtcCAA-TAATT--GATT--GGT--AGGA-C-ACGA--C--CGCG------ATT-AGCCA---------TTGCGCCTGAG--CAAAC-ATC--TATCAAACCCAGGGGAAATAGGTGGTAA-TGG-GCAAGTGACGGGAAGATGAAACCAAGGCGCCTCGTGGTTACATTC---AG-T-TT--C-TATAGA--TTAATAA-TGTA------TTGTCGACAAAGGGATCTGTGC--CCGTTCTC---ACCTTCACTTAATTG--GAT-C-CA--A--TGTCCA-TCAGTGAGATT-TGA------TGGTTTG-TC-TCA-T-CCGGCAG-AGGTTA-AT-G-AACTTGT-AATCTTGTAATTGCAG-TAATGTTG-CTCCTCCGCAATA-GTCAAGGA-TC-CA-TG---A--CCCAAGTTGGCGTATTTTGACCGGT-ATAG-GAAAGCTGGATCGTGTG-AGTAG--GTAT--GGA-ATC-GGCGA-----TCC-GGG-GCGGG-AGTATCAGACAGG-TC-TCCATA-T-AGAAATAAGGTATG----CTG-GGTGAATGA-T---AA---A------TGTG-GGCTGAGACAGCT--CACA-G-ATCA-CGCTTATATCAACGGA---------AC----CA--ACCAACGCACTATATGAAATCAT--GTAGTCAG---AATG---AT-TT---GGAACCTTGTGAAATC-CCTCCCTTAGAAACTA-CCACTCAGCACA----TACTTC---T-C----ACC--C---AT--ATA--CTC--GAAGGTTTCTGTGCGTATCATC-T-CC-C-CCGTGTGTCCCCCAGA--CCTTCTGTAAGGTCACTTCTGTCAGGTGTCCCGGATATCTCACTGACACACAAAACACCCAC--AGAAGGGC-TCTGACACTCGGTAAT--GTGATTCATCCATGCAAACA-TTC-GT-----TTAG--CGGTGGGACAC--ATAGCAAAACTC----TGAAGACTA-CACTATATATATAGAAACAGCAGGTTCTTGAAT-AATATCTAGTGAAGGTAATTTGTGGATACAAGAAGTCAGTGAAAATGTGATTACTCATGTTAAATCTTACAAAATCCACTCTACCTG
gi|33 : acagatgaaatgccagtgtagtaccACGTGAA--TGGAAACA-------TAGCG-CGATAT-C---A--AATT--C-ATGAGA--TTTAAAAGTGTA-G----TTGT-GA--CATGGACC-GTGTA--GGTTCTC---ACCTTC---AGCACC-TGGT-T-CA--C------CACTCCAT-AA--T-TG--A----TGGT-T--TC-TCA-T-gtttaaaattgtgatcgtgataac
gi|6 : AA--TGGAAACA------C-AGCG-CTACAT-C---AG-T-TT--C-TATAGA--TAGATAAGTGTA-G----TTGT-GA--CATGGATC-GTGCAG--GTTCTC---ACCTTCACTAAT----TGGA-T-CA--A--TTC-CACTCAGT-GA--T-TGA------TGGTGT--TC-TCA-T-CCG---G-AG--TA-ATTG-AACTTGATAAT---GTAAT--CAGGTA-TGTTT-CTC-TCC--AATA-GT---G-AGTC----CATTGA--C---AATTTG-GC-----------G-ATTGTGA---ACGA-----GTG-AGTA---GT-TTTGTACATCTGGCGAA----TCC-----G--GG-AGTATCAGA--GGGTC-TCCATA-T-AGA--TAAG-TGTATGTGCTG-GGTGAATGTATTAGAA---A------TGTG-GCTGCAGACATCT--CACA-TGATCA-C--CTTTAT----G-A---------TCAGG-TAAACCCAACGCA---TG--AAATCATTAGT--TCAG----ATG---ATGTT---G-AACC-----GAATC-CGTCCC-AGAA--CTTACCACTCAGCA------TACTTC---T-C----A----CTCCAT---TATACTC-TGAAGGTTTC----TGTATCATC-T-CC-C-CC--GTGTCCCCCAGATCCCTTCTG-AAGGTCACTTCTGTCGG-TGTCCC---TATCTCAC-G--ACACA---CACCCACATA-CAGGGCTTCTGACACTCGGTGAAT-GTGATCCATCC-TGCAACGA-TTC-------GTTAGCGT--T-CGAC-ACAATA-CAA--------------ACGAG-ACTACACAT-T--A-ACAGCG--TTCTG--AT-AAT-TC--GTGAAA--A-TTTGT---A------------TACAA---TG-----------TAA-TCTTACAAAATCCACTCTACCTG
gi|11 : AA--TGGAAACA------C-AAC-GCGATGT-C---A--TATT--C-ATTAGA--TAGACGAGTATA-GAACTTTGT-GA--ttaaaat
gi|27 : AGGTAAGTGTA-G----TTGT-GA--CATGGACC-GTGCA--GGTTCTC---ACCTTCATTGGC----TGGA-T-TAACC--C---CATTCCAT-A--TT-TG--A----TGGT-T--TC-TCA-TCC-----GTAG--TA-GT-G-AACTTGA-AAT---GT-AT-ACAG-TATTGTTT-TTC-CCC--GTTA-GT---GAGGACATGACA---A--C-----CCCC-AT-----------C-ATTT-GA----CGA----TGTG-AGT-A--GT-A--GTA-TTCTGGCGAA----TCC-CGGTG--GG-AGTcatagcatggaaaacgtccactaaataattgatggactctcattcggaatatgtagtcggtattgtttctctccaatagtgagtccgtgacaatttggttatatgacggtgtgagtaggtgtaatctggcgaatctcgggggagtgtcagaggtcttcatatagataagtgtatgtctgtgtggatgaattgatagaacgtggactgagacatctcacatctcaccttatgatcagtttgccaaaacatgaaatccatgtcagatgatttaaaccactcagcatatttctcactcctctatataagtctgaaggtttctgtatcatcccctacgtgtcagaaatatcccttctgaaggtcacttctgtcggtgtccctatctcacgacacacccccacatacaggacttctgacgcacgtggaatg
gi|32 : AAGTGTA-A----TTGT-GA--CAAGGACC-GTGCAT--GTTCT--CA---TTTTC--GTCGGATGGA-T-TA----------ATTC------CTT-TCA-AATCTTGATGTAATC-TCA-A-CAG---G-AG--CA-TT-G-TACTTGA-AAT---GT-AT-ACAG-CATTGTTT-CTC-TCtcaccccgtatccatatgagaaagtgta
gi|43 : AAGTGTA-G----TTGT-GA--CAAGGACC-GTGCA
gi|37 : aAGTGAA-G----TTGT-GA--CAAGGACC-GTGCAG-GTTTCC----ACCTTCATTGAC----TGAATT-CA--C--TC--CATTCAAT-AA--T-TG--A----TGGAC---TG-TCATT-C-----GTAG--TA-AT-G-AACTTGA-AAT---GTAcgttctcattttcgctggatggattaaatccattccaatgttgatgtaatctcaacaggagcattgaact
gi|11 : TAGCATG-GAAA-A-CG--T--C---CACTAAAT-AA--T-TGA------TGGACT---C-TCA-TTC-----G-----------G-AAT------AT---GTAGT--CGG-TATTGTTT-CTC-TCC--AATA-GT---G-AGTC-CG-TG---A--C---AATTTG-GT-----------T-ATAT-GA---C-GG----TGTG-AGTAG--GT----GTA-ATCTGGCGAA----TCT-CGG-G--GG-AGTGTCAGA--GG-TC-TTCAT-AT-AGA--TAA-GTGTATGT-CTGTG-TGGATGAATTG-ATAGAA------CGTG-GACTGAGACATCT--CACA-T-CTCA----CCTTAT-----GA---------TCAGTTTG--CC-AAAACA---TG-AAATCCAT--G---TCAG----ATG---AT-TT---A-AAC------------------------------CACTCAGCA------TATTTC---TCA----CTC--CTCTAT--ATA-AGT-CTGAAGGTTTC----TGTATCATC-C-CC-TAC---GTGTCAGAAATATCCCTTCTG-AAGGTCACTTCTGTCGG-TGTCCC---TATCTCAC-G--ACACA---CCCCCACATA-CAGGACTTCTGACGCACGTGGAA--t
gi|2 : aatggaaacacaacgcgatgtcatattcattagatagacgagtatagaactttgtgaca-AG--CA-AT-G-AAC-TGA-AAT---AT-AT-ACTG-TATTGTTTGCTC-TCT--AATACGT---Gtg
gi|30 : gttaatcaagtccattgtgcaataacaacatttggatgctgagaataagtgcatctattgcatttaaatatcatcatgtttacaagcaaatctgacttgaccaagctcgacatctctacaacttgtcgcattcaacttaaatttaaacattatcaacccataaattagctacttctattttgcacttgaggccaaactgtcctcctgtttatgacaattgctaaagtatggatttaggagaggtgccgggatctgattgacaatatctctgagaatggggctattgtaacaggaaagggcaacccccattttgtaaattttttctaactttcttgatacagagaaattcgtcccgccccgacttttcctacacacatatttgttctgccagaatagagaaatttgaaggtaaccggtatatacacattgcatcaaggatttgaaacaaaaccacaccacggtgaagcagtgttggatggtatccgtggagttgaagagctctctttaattctccaaaataatatttgtcttcataaaatatgaacacagttaattcgtcacaaataattccttagaattattttcatgattctgtaacagagaaaattgggacaatggttcatagagtacactacttttgcctcgcttggtgtaaaagaaatctccattccaagtctgagttttccattcgtgtctgtttgttttacaaataggaatcgaggaatgaaacccgtcttcaattaattgagctgcattacaaacttacgtggtgggccgtgctcgtcaaacatctatcaacccaaggcagagctggtaatggacagtgacgggaaagtggaaataacacagcgatatcagtcttctttaatcgtacaagtgaaggctgtaaacaggaccgtgtattttcccacctttttttccccccccccaaaaagtttttatttggggattcattcccctgagtgattgatggattcccttccgccT-G-AACTTGA-AAT---ATA-T-ACAG-CATTGTTT-CAC-TCC--AATA-GT---GAAGACATG------A--C---AATTTC-TT-----------C-ATTT-GA---C-GG----TGTG-AGTA---GC-T--GTA-ATCTGGCGAA----CCC-CGG-G--GG-CGTATCAGA--GA-TC-TCCAT-AT-AGA--TAAGag
gi|48 : CT--CACA-T-ATCA----CCTTAT-----GA---------TCAGGG-A--GCCAACGCA---TGcgt
gi|8 : CA---TGT-AATCCAT--GT---CAG----ATG---AT-TG---A-AACCT----AAATC-CCTCCCTATAA--CTA-CCACTaaatc
gi|42 : aaattctccactcaaagtctgagtttgtctgtttgtttgagataggaacgagatgaaatccttcatcaataattgaatgcagtacagtaggtgatggccatgcgcgaatcaaacatctatcaacccagggaagggctggtaatggccaatgacgggaacggaaacacagggcgatatcagcttctatggaattataagtgtagttgtgacatggaccgtgcatattctcaccttctctggctggatcaattccattcaatgactgatgaaatatcatccggagtaatgaacttgaaatgtatacagtattgtttctctccaatagtgaggacatgacaatatcctcattggacggtgtgagtagttgtaatctggcgaatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaa---AT-TT---A-AACCT----AAATC-CTTCCCTATGG--CTA-CCACTCAGCATCAATCTAACTC---CAT----A--------AT--ATG-AATG-TGAAGCTTTC----CGTATCATC-TCCC-C-C---GTGTCC
gi|34 : tgACCT---GAA-TC-CCTCCCTATGA--CTA-CCACTC-------------TTCATATGG----ATCATCCCTTTCGATA-ACGA-TAAACCTTTC----TGTATTAGCAC-CC-C-C---GTGTCCCAAAGATCCCTTCTG-AAGTTCACTTCTGTCGGTcac
gi|31 : AATC-CCTCCCTAGAA--CTA-CCACTCAGCACA----TA--TC---TCT----TTC--CATTAT--ATA-TCT-GTGAAGGTTTC----CGTATCATC-T-CCTC-C---GTGTCTTCTAGATCCCTTCTG-AATGTCACTTCTGTTGG-TGTCCC---TATCTCAC-
gi|25 : tgGGGAAATGTGATCCATCC-TGTAACAA--TTATTTAACGTTCATTT-AC-CGAA-ACAATA-CAAATGTTT-ATT-AATACGAA-AGAATACAT-T--ACAC--CG--TTCTGAA---AAC-CC--GTGAAA--AG-TTGT---A------------T-AAAATG--------------AATTC---CA----CTGC---ACCTGAGAATTT---AAAACATCTATTTATAGACAATCGG-AAATAC-CCGGTT-AAGCC-CCACTA-CTCTTCTTTTG
gi|45 : GGAAT-GTGATGCATCC-TGTAGCGA-TTC-GTTAA-aaaattgatttgttgactcttaagtctgaatattttattccgttgttaa
gi|24 : GAAT-GTGATCCATCC-TGTAACGA-TTC-TTTAACGTTAGTT-GAT-CGACTC-AATA-TAAGTTTCTA-TTAAAT--------------------TACAGTG--TTCTGA--T-AAT-TC--GTGAGA--AGTT-GT---A------------TAAAA---TG-----------TAAT-CTTACAAAATGTACTCTACCTGAGAATTT--CCAAGT-TCTATTTATAGACAATCGGGAAATAA-CCAGTTTAA-CT-CCG-TA-CT-TTTCT-TATTGCATGTACTCTGTTGACCTTAATATGGAATACCAGTCT-TTATTTGATTCGTTAATCGAcgttactattacatttagctttacacattctattta
gi|38 : TTTATAGACAATCGGAAA-TAC-CCAGTTAA-----CCTCC-GCTACTTTTCTTTTGCATGTACTCTGTTGACCTTAATATGGAATACCAGTACTTTATTTGATTCG-TTATCAgacaattgt
gi|46 : ----------------ATGGAATAC--T----TTATTTGATTCG-TTATCA
2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|35 ): TTATCCTATGATAAGCTGAATATGAAAGGAATGCTTGTTGATTTAATAGTGTCTTCATGGGAATGTACTGTTATCCATCAATCCACTAAATAGAACAGCTGATAACCCTAAC
Unaligned ( gi|47 ): GCTACTTTTCTTCTGCATTTTCTGTTGCACAAAACAAAATACTAGTACTTTATTTTGATT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 222 333333333 666666666666666666666666666666 2222222 222 44444444 333333333333333 1111 333333 22 111 222 111 333333333333 1111 111 44444444444444444 111111111111111111111111111111111111111111 111 222 2222 1 11 222222222 1 1 1111 1 2222 222 1 4444444444 11 111 3333333333 22222 111 222 11 333333 111 1 4444444 111111 1 1 1 1 2 33 33 555555 222222222222 11 1 11 22 2 444444 2 222222222222 1 11 4444444444444 1 22 11 1 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 11 1 1 1 111 11 2222 1111 111111111111111111 1 1 1 11111111 444444 222 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 111 22222 11111111 22222222222222 111111111111 2 111 222 55555555555555555 11 1 111 222 44444444444 111 222 11 1 1 1 1 1 1 11 1 1 1 2222 333333 1 33 1 2 1 1 1 1 11 111 111111 11 1111 111 222222 22222222222222 1111111111 33333333333 11 1 22 111 11 11 11111 222222 111 3333 11 3333333333 2222 11111 11 11 33333 11111111 11 333333333333333333 11111 1111 1111 22 11 333333333333333 22222 22 333333333333333 333333333 2222222222 1 111 22222 222 111 1111 1 111 1111 111 222222222 22222222 11111 11111 11111 22222 66666666666666666666666666666666 1 222 11 1 333333333 111 111 111111111 44444444
lowQualScore : 333 8 8 7 6 666666666 7 2 6 6 6 6 3 333333333333333333333333333333 8888888 1 6 6 6 333 33333333 888888888888888 7777 333333 0 33 8 777 333 444 888888888888 3 99 5555 88 444 33333333333333333 222222222222222222222222222222222222222222 55 0 2 0 444 444 0 8 0 8888 0 6 3 11 888888888 22 0 0 9 1 8888 6 7 9 2 2 0 8 0000 3 444 0 2222222222 66 0 8 8 444 0000000000 4 1 77 8 00000 444 777 33 666666 777 5 3 9999999 777777 0 0 2 0 0 3 7 3 00 0 00 777777 7 888888888888 0 8 8 11 77 0 3 33 0 77 1 88 3 1 11 000000 6 1 3 1 3 333333333333 0 33 9999999999999 0 33 33 0 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 22 3 0 0 3 0 777 3 2 33 0000 3333 2 3 11 99 888888888888888888 5 7 4 3 6 6 0 5 0 0 5 4 66 0 99 4 4 4 99999999 4 55 2 0 4 333333 3 0 444 4 4 3 3 3 3 1 3 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1 000 44 3 999999 66666 3 00000000 3 44 3 77 6666 44444444444444 6 777777777777 3 3 88888 3 44 999999 3 3 0 55 4 55 111 777 3 55555555555555555 3 8 3 4 66 66 66 33 1 8 8 999 0 6 444 888 8 11111111111 8 5 8 6 6 99 111 99 77 5 777 6 3 3 6 6 99 6 11 3 0 0 0 0 0 9 33 1 0 3 3 1 3 8888 6666 1 777777 6 0 1 4 8888 0 7 00 7 5 2 3 3 4 3 0 0 0 99 6 88 222 6 6 6 555555 6 55 5 77 5 5 2222 3 000 5 111111 5 22222222222222 9999999999 5 55555555555 55 5 5 77 1 2 77 555 5 5 11 4 4 44 00000 777 55 444 888888 111 3 2 2 555 2 2222 555 6666 55 3 66 44 3 3 6666666666 1 77 77 3 5555 33333 44 0 555 3 44 5 3 3 555 22 66 3 7 11 4 77777 1 33333 4 4 11111111 777 44 666666666666666666 888 77777 2222 5 0 0000 66 5 77 5 0 00 5 77 5 77 2 88 8 6 0 666666666666666 8 3 8 99 888 99999 6 00 99 444444444444444 5 888888888 1 99 9999999999 3 5 5 555 22222 4 9999 4 4 5 111 333 77 2 66 0000 5 5 0 5 333 2222 5 5 5 111 6 555555555 8 0 1 5 5 888 55555555 6 6 55 33333 7 99999 1 1 88888 99 11111 6 99 99 66 99 00000000000000000000000000000000 1 3 3 222 77 0 3 0 8 99 444444444 5 1 3 000 666 6 666666666 1 77777777 6 8 8
lowQualScore : ... . . . . ......... . . . . . . . .............................. ....... . . . . ... ........ ............... .... ...... . .. . ... ... ... ............ . .. .... .. ... ................. .......................................... .. . . . ... ... . . . .... . . . .. ......... .. . . . . .... . . . . . . . .... . ... . .......... .. . . . ... .......... . . .. . ..... ... ... .. ...... ... . . ....... ...... . . . . . . . . .. . .. ...... . ............ . . . .. .. . . .. . .. . .. . . .. ...... . . . . . ............ . .. ............. . .. .. . ............................................................ .. . . . . . ... . . .. .... .... . . .. .. .................. . . . . . . . . . . . . .. . .. . . . ........ . .. . . . ...... . . ... . . . . . . . . ...................................................................................... . ... .. . ...... ..... . ........ . .. . .. .... .............. . ............ . . ..... . .. ...... . . . .. . .. ... ... . ................. . . . . .. .. .. .. . . . ... . . ... ... . ........... . . . . . .. ... .. .. . ... . . . . . .. . .. . . . . . . . .. . . . . . . .... .... . ...... . . . . .... . . .. . . . . . . . . . . .. . .. ... . . . ...... . .. . .. . . .... . ... . ...... . .............. .......... . ........... .. . . .. . . .. ... . . .. . . .. ..... ... .. ... ...... ... . . . ... . .... ... .... .. . .. .. . . .......... . .. .. . .... ..... .. . ... . .. . . . ... .. .. . . .. . ..... . ..... . . ........ ... .. .................. ... ..... .... . . .... .. . .. . . .. . .. . .. . .. . . . ............... . . . .. ... ..... . .. .. ............... . ......... . .. .......... . . . ... ..... . .... . . . ... ... .. . .. .... . . . . ... .... . . . ... . ......... . . . . . ... ........ . . .. ..... . ..... . . ..... .. ..... . .. .. .. .. ................................ . . . ... .. . . . . .. ......... . . . ... ... . ......... . ........ . . .
lowQualScore : 000 0 0 8 7 333333333 3 5 7 7 7 7 2 000000000000000000000000000000 3333333 0 7 7 7 888 33333333 444444444444444 0000 888888 8 22 0 666 000 000 888888888888 8 44 2222 88 000 00000000000000000 444444444444444444444444444444444444444444 22 8 5 8 000 666 8 0 6 8888 0 4 2 00 000000000 00 0 0 2 0 7777 7 3 8 5 5 0 8 8888 2 000 0 0000000000 55 8 0 0 000 0000000000 6 0 00 0 00000 000 000 22 000000 555 5 2 5555555 000000 0 0 0 0 0 7 3 7 33 7 00 333333 3 555555555555 8 0 0 00 00 0 2 00 7 33 0 00 7 0 77 333333 7 0 7 0 2 888888888888 0 88 8888888888888 0 22 88 0 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 55 2 0 0 2 0 555 5 5 22 5555 0000 5 2 77 22 000000000000000000 0 3 0 3 7 7 7 0 8 4 0 4 11 1 33 4 4 4 44444444 0 55 5 4 0 111111 2 1 888 0 0 6 6 6 6 0 6 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0 444 00 3 666666 00000 3 00000000 3 66 3 33 5555 22222222222222 2 111111111111 3 3 66666 3 66 666666 3 3 0 55 0 55 000 000 7 00000000000000000 9 9 4 4 11 11 99 66 0 8 0 222 8 0 000 666 0 22222222222 0 0 0 7 7 22 777 22 99 7 222 7 3 7 7 7 22 7 88 2 0 0 0 0 0 2 88 0 7 3 3 0 3 3333 0000 0 777777 7 7 0 0 7777 7 3 33 3 5 5 7 3 0 2 0 0 0 88 7 55 333 7 7 7 888888 7 88 2 99 7 7 1111 0 000 7 777777 7 44444444444444 6666666666 7 11111111111 77 7 7 99 6 0 77 000 7 7 00 0 0 11 00000 000 55 999 666666 888 6 9 9 999 9 3333 000 1111 00 1 99 22 1 1 8888888888 2 33 33 1 5555 66666 22 4 888 3 66 0 1 3 888 77 33 6 3 00 0 55555 0 00000 0 0 00000000 000 44 999999999999999999 888 22222 2222 0 1 6666 44 7 99 7 1 77 7 00 7 99 5 88 0 8 8 888888888888888 0 8 0 22 333 77777 7 22 22 555555555555555 7 777777777 0 22 2222222222 3 7 7 777 00000 4 6666 4 4 0 111 222 66 0 00 6666 0 0 0 0 888 1111 7 7 7 777 7 000000000 0 8 0 7 7 666 11111111 7 7 00 00000 2 77777 0 7 33333 22 88888 7 22 22 88 22 88888888888888888888888888888888 7 5 2 222 66 8 6 8 0 88 444444444 7 0 7 000 777 7 333333333 0 88888888 7 0 0
consensus : NACAATAAGTTAAT-AAGTAACAAACC-ATTCAATA-CA---T----TTGTAAGTA-AGTCT-TTAA-TA-TATTA--TTGCGC---ACC----------------TACCG-------TTGAGTACAAAT-ATTGACTG-AA-ATT-ATCAA--------CAGAA------------G--TCCAT----AC---A--ACATTG-ACATT-TAC-TAAAC--GA---AA-----------ATACAT-TA--A-ACAATA-TTCTGTACAG---AA------AACG-------TTGATTGTTCTATGTCA------ACTA-AACCC-TA------A----ATTTACGGGT-ATTTCTTCTCCTAACTATTGACAGAAATTA---ATTCTA-GCTTCTGTG-GCTGTCTGTATTTTTTGATA-TGGTTCCTGTCT--AAGTGAAC--T--TTGAAT-AA-GACTGTTAACGCCCCGTGGTAGGTCCCCCACACAACATGTTGACA-GATCCCCAGTA---TCTGCCA-GGACAGGTC-TCTA--N--CNTC-AAAG-NTACGTATCTCCC-AT-CATC---ATAGA---GC-A---GTAGGGTGTGTGTGAT-TG-----TC---AGTCG-CCTG-TAGATAT-----TTG---TGACCTGTTACCTAGTC-----ACTGT--A-CGACA-GGG-ACAG-ATA-ACANATGTGCAC-GGT--CGCAA--AGGG------AGATATAATATA-AA-C-TNTNTATCCCGTTCATTTC-ACTGACTTCTTGT-T--CCAACNTTAA-TTCTTTCAACTATAGC-GTAAACTCTTTATAC-GAANATAGT-AGCNCTCTTGCCCAACC-TTCCTAAACTTAG----TA-A-CA-TAGACTGA-C--CACCTA--CCG-C-T---CACTGTA-TCTCTG-TCTGT--C-TAC--T-------ACC-A-------CCA--C-GNA---TGATATGGGGCT-TG-GGA-GAGTCCTCTG-CTTCA-TTCTATC-TGTGACAGTTTTAGCGCT-GT---TTGATATCTNCCGGT-AATCGTAC-G-GTAT-AATCGCCTAAATATAAACCCATCATATACATAACCTAGACTTTAGAACTA-AACCTA-CATGTGA-TTATTGA-CCTA-TCAATGGCGTATCTCTTTTTCT-TTGACACAAACAAACACTGTGCTTTCAA-TGACA-TGGAA--GTGGATAATA-AG-C-ACAT-----T-TATCAA--CGCATCATGAAATATA-ACA--CATTATGACAGGTG-TGAGA-ATAACTG-ATCTATTACATT-TAAATG-CA-TCA-TGTTTGAAAGGAAATC-TGAT----CC--CTGTGCGAG------A-CT-T-TA--AAC--GC-A--ATGTT--T-----TTCC----C---CG-A--T--------AAA---AA-GC-AATATC------TA--T-TATCTA-TTTCTG------A-C-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A--------------TTAC-AAAG------------TA-T-GGATC--G-GAGAGG-GCCGGGAT--C------AGAA-T-CTC--TCTGAGAGTGG-GA--CTA--TGTAA-CAGGAAGG-------------AC--AACGCCCA-TTTTGTAAAATGTTTCT-AA--C--TT--TTGAT--ACAGGGACATCTGTTGC-GCCCC-G-ACAA-TTTTCC---TGCAAACATATG-TTGTTCT-CCGGAAT-A---------AAGAAATT-TGGAAGGGTAACC-GGTAT-ATA-CACA--CCGCAT---CAAGGATTT--GAAA--C-AAAACCAA-CA-CATGTTGGAGC-AATGTT-GA--TGGT-ATCCATGG-AGTTGAA-GAGCTTTCT-TGA-ATTCT-C-CAAAATAATACTTG--TTTTCATAAAAT-ATGAACAC-AGTAA-ATTCGTC--GACAGAAA--ACT-TCCTTCAAAATNATTTTCA-TGATTCCGTAACGGAGAAAACTGG--CAATGGTTCATAGAGTACACTANCTTTGNCCCGCTCG-TG-AAAAGAAATT-CTCCA-CT-CCAAAGTCC-GAGTTTAATTCATT--TGT-CTGT-TTG-TTT-GC-GAT-AGGAA--CGAG--AT-GAA-ATCCT----TCGT---CAA-TAATTG----A-TTG-TAGG-T--ACGA--CTACGCG--A-------T-GGCCA---------ATGCGC--GAGT-CA-AACATC--TATCAAACCCAGGGAA--GGGCTGGTAAATGG-GCA-GTGACGGGAA--TGGAAAC-AC-AGCGGC-----GATA---TC--AGT-TTCTATGAGAT--AG-ATAAGTGTA-GTTGT-GACAN--GGACC-GTGCAG-GGTTCTC---ACCTT----CGCTG-GCTTG--GA-T-C----AA-C--CCACTCAGTAA--T-TTGGATG-GN-NT--CTCATCCGG---A-G--TANT-GAACTTGA-AAT---GTAAT-ACAG-TATTGTTTCTC-TCC--AATA-GT---GGAGNC-ACGTGACAA-T-TC--GGT-CATT-T-GACCGGT------------------GT---GAG--TAAGT-T--GTA-ATCTGGCGAA----TCC-CGG-G--GG-AGTATCAGAC-GGTC-TCCATAAT-AGA--TAAGGTGTATGT-CTGG-GTGGATGAATTG---GANA------CGTG-GACTG-AGACATCT--CACA-T-ATCAC-C-CTT-TATGGAT--CA---GG---TAG--C-CAACGCA-TG-----T---AANCCAT--GT--T------CAG-A-TGAT-TT---AAACCT----GAATC-CCTCCCTANG--ACT-A-CCACTCAGCAT-A-T-TCTCNNTCC-NCTATATAACT-CTGAAGGTTTC----CGTATCATC-T-CC-C-C---GTGTCCCCCAG----ATCCCTTCTG-AAGGTCACTTCTGTC-GG-TGTCCC---TATCTCAC-GACAC-----A---CACCCACATA-CAGGGCTTCTGACACACGGGGAATGTGATCCATCC-TGTAACGA-TTC-G-TTAACGTTAG-TTGATCGAC-ACAATA-CAAATTTCT-ATT-AATACGAG-ACTACACATTAT----ACAGC--GTTCTGAAAT-AAT-TC--GTGAAA--AGTTTGT--ATA-------------AAAA-GTG-----------TAATTCTTACAAAATCCACTCTACCTGAGAATTT--CAAAAT-TCTATTTATAGACAATCGGAAAATAC-CCGGTTAAG-CT-CCGC--GCTACTTTTC-TTTTGCA---TGTACTCTGTTG-AC-C-TTAA-TATGGAATACCAGT--T-TTA-TTTGATTCG-TT-ATCGA
Reference ( family-5170 ) : NACAATGAGTTAAT-AAGTAACAAACC-ATTCAATA-CA---T----TTGTAAGTA-AGTCT-TTAA-TA-TATTA-ATTGCGC---ACC----------------TACCG-------TTGANTACAAAT-ATTGACTG-AA-ATT-ATCAA--------CAGAA------------G--TCCAT----AC---A--ACATTGCACATT-TAN-TAAAN--GA---AA-----------ATACAT-TA--A-ACAATA-TTCTGTACAG---AA------ANNN-------TTGATTGTTCTATGTCG------ANTA-AA----TA------A----NTTTACGGGT-ATTTCTTCTCCTAACTATTGACAGAAATTA---ATTCTAGGCTTCTGTG-GCTGTCTGTATTTTTTG-TA-TGGTTCCTGTCT--AAGTGAAC--T--TTGNNT-AA-GACTGTTAACGCCCNGTGACAGGTCCCCCACACAATATGTTGACA-GATCCCCAGTA---TCTGCCA-G-ACAGGTC-TCTA--N--CGT--AAAA-CTACGTATCTCCC-AT-CATC---ATAGA---GC-A---GCAGGGTNTGTGTGAT-TG-----TC---AGTCG-CCTG-TAGATAN-----TTG---TGACCTGTTACCTAGT------ACTGT--A-CGATA-GGG-ACGG-ATA-ACACATGTGCACAGGTAGCGCAACCAGGGCTCACCAGATATAATATA-AA-C-TNTCTATCCCGTTCATTTC-ACTGACTTCTTGT-T--CCAACNTTAA-TTCTTTCANCTACAGCAGTAANCTCTTCATACAGAANANGGTCAACNTTCTTGCCCAANCATTCCTANACTTAG----TA-A-CA-TAGACTGA-C--CACCT---CCG-C-T---CACTGTA-TCTCTG-TCTGT--C-TAC--T-------GCC-A-------CCA--C-GNA---TGATNTGGGGCT-TG-GAA-G---CCTCTG-CTTCA-TTCTATC-TGTGACAGTTTTAGCGCT-GT---TTGATATTTACCGGT-AATCGTAC-G-GTAT-AANCGCCTAAATACNAACCCATCATNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGAACTACAACCTANCATGTGA-TTATTGA-CCTA-TCAATGGCGTATCTCTTTTTCT-TTGACACAGACAAACACTGTGCTTTCAA-TGACA-TGGAA--GTGAATAATA-AG-C-A-AT-----T-TATCAA--CGCATCATGAAATATA-ACAACCATTATGACAGGTG-TGAGA-ATAACTG-ATCTATTACATT-TAAATG-CA-TCA-TGTTTNAAAGGAAATC-TGAT----CC--CTGTGCGAG------A-CT-T-TA--AAC--GC-A--ATGTT--T-----TTCC----C---CG-A--T--------ANA---AA-GC-AATATC------TA--T-TATCTA-TTTCTG------A-C-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A--------------TTAC-AAAG------------TA-T-GGATC--G-GAGAGG-GCCGGGAT--C------AGAA-T-C-C--TCTGAGAGTGG-GG--CTA--TGT-A-CAGGAAGG-------------AG--AACGCCCA-TTTCGTAAAATGTTTCT-AA--C--TT--TTGAT--ACAGGGANATNTGTTGC-GCCCC-G-ACAA-TTTTCC---TGCAAACATATG-TTGTTCT-CCGGAATGA---------AAGAAATT-TGGGAGGGTAACC-GGTAT-ATA-CACA--CTGCAT---CAAGGATTT--GAAA--C-AAAACCAA-CA-CGTGTTGGAGC-AATGTT-GA--TGGT-ATCCATGG-AGTTGAA-GAGCTTTCT-TGA-ATTCT-C-CAAAATAATATTTG--TTTTCNTGAAAT-ATGAACAC-AGTNA-ATTCGTC--GNCAGANATCACT-TCCTTCAGAATNATTTTCANTGATTCTGTAACGGAGAAAACTGGGACAATGGTTCATAGAGTACACTACTTTTGCCCCGCTTGGTGNAAAAGAAATT-CTCCA-CT-CCAAAGTCC-GAGTTTAATTCATT--TGT-CTGT-TTG-TTT-GC-AAT-AGGAA--CGAG--AT-GAA-ATCCT----TCGT---CAA-TAATTG----A-TTG-TAGG-T--ACGA--CTACGCG--A-------T-GGCCA---------ATGCGC--GAGT-CA-AACATC--TATCAAACCCAGGGAAAGGGGCTGGTAAATGG-GCA-GTGACGGGAA--TGGAAAC-AC-AGCGGC-----GATA---TC--AGT-TTC-ATNAGAT--AG-ATAAGTGTA-GTTGT-GACAN--GGACC-GTGCAG-GGTTCTC---ACCTT----CACTG-GCTTG--GA-T-C----A--C--CCACTCAATAA--T-TTGAATG-GT-TT--CTCATCCGG---A-G--TAAT-GAACTTGA-AAT---GTAAT-ACAG-TATTGTTTCTC-TCC--AATA-GT---GGAGNC-ACGCGACAA-T-TC--GGT-CATT-T-GACCGGT------------------GT---GAG--TAAGT-T--GTA-ATCTGGCGAA----TCC-CGG-G--GG-AGTATCAGAC-GGTC-TCCATAAT-AGA--TAAGGTGTATGT-CTGG-GTGAATGAATTG---GANA------CGTG-GACTG-AGACATCT--CACA-T-ATCAC-C-CTT-TATGGAT--CA---GG---CAN--C-CAACGCA-TG-----T---AANTCAT--GT--T------CAG-A-TGAT-TT---AAACCT----AAATC-CCTCCCTANG--ACT-A-CCACTCAGCAT-A-T-TCTNNATCC-TCTATATAACT-NTGAAGGTTTC----CGTATCATC-T-CC-C-C---GTGTCCCCCAG----ATCCCTTCTG-AAGGTCACTTCTGTC-GG-TGTCCC---TATCTCAC-GACAC-----A---CACCCACATA-CAGGGCTTCTGACACNCGGGGAATGTGATCCATCC-TGTAACGA-TTC-G-TTAACGTTAGTTTGATCGAC-ACAATA-CAAATTTCT-ATT-AATACGAA-ACTACACATTAT----ACAGC--GTTCTGAAAT-AAT-TC--GTGAAA--AGTTTGT--ATA-------------AAAATGTG-----------TAATTCTTACAAAATCCACTCTACCTGAGAATTT--CAAAAC-TCTATTTATAGACAATCGGAAAATAC-CCAGTTAAA-CT-CCGCCAGCTACTTTTC-TNTCGCA---TGTACTCTGTTG-AC-C-TTAA-TATGGAATACCAGT--C-TTA-TTTGATTCG-TT-ATCGA
gi|1 : ACAATGGGTTAAT-AAGTAACAAACCTATTCATTA-C---------TTGTACGTATAGTCT-TTAACTA-TATTA-ATTGCGC----CC----------------TATCGC------TTGAGTACAAATTATTGACTG-AACATT-ATCTA--------CATAA------------G--TCCAT----ACG--A--ATATTGTACATT-TAC-TAAACCTGA---AA-----------ATACAT-TA--AGACAATAGTCCTGCACAG---AA------ACGG-------TTGATTGTTCTAT-TCA------ACTA-AACCCATATCCGCTA----TTTTATGGAT-ATTCCCTCTTCTA-CTATTGACAGAAGTTA---ATTCTAGGCTTCTGTGTGCTGTCTGTATTTGTTC-TCCTGGTTCCTGTCT--AAGTGAAC--TCTTTGAAT-AACGACTGGTAACGCCCCGTTGTAAGTCCCCCACACAACATGTTGACATGACCCCCAGTAATTTCTGCCA-GGACAGGTC-TCTA--A--CTTCTAAAATCTACGTATCTCCC-AT-CATC---ATAGA----C-AT--GTAGGGTGTGTGTAAT-TG-----TC---AGTTG-CCTG-TAGATAT-----TTG---TGACTGG--ACCT--T------ACTGT--A-TGACA-GGG-ACAG-ATA-ACAGTTGTGCAC-GGT--CACAA--AGGG------AGATATAATATA-AA-AATATCTATCCCGTTCATTTC-ACTGACTTCTTGT-T--CCAACTTAAA-TTCTTTCAATTATATT-GTAAACTCTTTATTC-GAACATAGT--GTCCTCTTGCCCAACC-TTCCTAAACTT-G----TA-A-CA-GAGACTGA-CTCCACCTGAGCCA-CGT---CACTGTA-TCTCTGGTCTGTTCC-TACGAT-------ACCGA-------CCA--A-ATAACATGATATGGGGCT-TG-GGA-GAGTCCTCT--CTTCC-TTCTATC-TGTGACAGTTAAAGCGCT-GT---TTGATATCTTCCGGTTAATCGTAC-G-GTAT-ATCCGCCTAAA-ATAAAC--ATCATATACATAACCTAGACTTTAGAACTAGAACCTA-CATGTGA-TTTTTGAACCTACTCAACGGTGTATTTATATTTCTATGGACACAAACAAATATCA-GCTTTCAAATTACAATGGAAAGGTGAATTATA-AG-T-A-AT-----T-TAACAA--CGCTTGATGAAA-ATAGACAACCATTATGACTGGTG-TGAGATATAATTG-ATCTATTGCATTCTAAATG-CA-TCAATATTTTGAAAGTAACC-T-AT----CC--CTGTGCGAG------A-CTGC-TA--AAC--GC-A--ATGTT--T-----TTCC----C---TG-A--T--------ATA---AATGC-AATATC------TA--TCTATCTACTTTCTG------AACGTTGAGGT--A-CTTTCC-CCT--CTGAAC----AC-------------TTACCAAAG------------AAAT-GGATT--GCGAGAAG-GGCGGAAT--C------AGAA-T-T-T--TCTGAGAGTGGCGA--CT---TGT-A-CAGGAAGG-------------AG--AATCCCCAGTTTCGTAAAATGTTTCT-AA--C--TC--TTGTTTAACAGGGACATCTGTTGC-GCTCC-GTACAG-CTTTCC---TGCAAACTTATGGTTGTTCT-CCGGAATAA---------AAGAAATT-TGGAAAGGTAACC-AGTAT-ATATCACA--CCGCAT---CAAGGATTT--GAAA--CCAAAACCAAATA-CATGTTA-AGC-AATGTT-GA--TGGT-A-CCATGG--GTTGAATGAGCTTTCTATGA-ATTCT-CACAAAATAATACTTGGTTTTTCATAAAATGATTAACACGAGTAATATTCATCTGGACAGGAA--ATTGTCCTTCAAAAAGATTTTCAATGATTCCGTAACAGAGAAA-CTGG--CAATGGT-CATAGAGT-CACTAGCTTTGGCCCGCTCG-TGAAAAAGAAATTTCTCCATCTGCCAAAATCC-GAATTTAATTCATT--TGT-CTGT-TTG-TGT-GCTAATCAGGAA--CAAG--AT-GAA-ATCTC----TCTT---CAA-TAATTG------TTG-TAGG-T--ACGG--CTACGCGGAA-------T-GGCCA---------ATGTGC--GAGT-CA-GAAATC--TCTCAAACCCAGGGAAGGGGGCTGGTAAATGGTGCA-GTGACGGGAA--TGGAAAC-ACTAGCGGC-----GACA---TC--A-T-TTC-ACGAGAC--AG-ATAAGTGTA-GTTGT-GAAAG--GGACC-GTGCAGCGGTTCCTGCAACCTT----CTCTA-GCCTGTGAA-T-C----A--C--TCACTCAGTAGC-T-TTGAATG-GTCTT--CTCATC--G---A-G--TAAT-GAACTTGA-AAT---GTAAT-GCAA-TACTGTTTCTC-TCC--AATA-GT---GGAGTC-GCGCAACAA-T-TG--GGT-TATA-G-GACCGGT------------------GT---GAG--GAAGT-T--GTA-ATCTGGCGAA----TCC-CGG-G--GG-AGTAGCAGA--GATC-TCCATAAT-AGA--TAAGGTGTATCT-CT-G-GTGGATGAAT------ATA------CGTG-GATGA-AGACATCT--CACA-T-ATCACAC-CTT-TATGGAG--CAG--GG---TAC--C-TAATGCA-TGT----T---AATCCAT--GT--T------CAGTA-GAAT-TT---AAACCTG---AAATC-CCTCCCTACG--ACT-AGCCACTCAGC-T-AGT-TCTGTATCC-TCTATATAACTCCTGAAGGTTTC----CGTATCATC-T-CC-C-C---GTGTCCACGAG----ATCCCTTCTG-AAGGCAACTTCTGTC-GGTTGTCCC---TA-CTCAC-GACAC-----AAATCACCCACATAGCGGGGCTTCTGACACACGGGGAA-GTGATCCATCC-TGTAACGAGTTCAG-TTAA-ATTAGTTTGATCGACTCCAATA-CGAATTTCTAATTGAATACGAGCACTACACATTAC----ACAGC--ATTCTGAAATGAAT-TC--GTGAAA--AGTTTGT--TTA-------------AAAATGTA-----------TAATTCTTACAAAATCTACACTACCTGAGAATTTTACAAAGT-TCTATTTAT-GACAATCGGAAAATACTCCGGTTAAAGCTGCCGCTAGCTATTTCTC-TGTTGCA---TGCG--------------------ATGGAATAC--G-----TTA-TTTGATTCGTTT-ATCAA
gi|10 : c-TAAATA-CAATCA-TGTTTGATAGGAAATCATGAT----GC--TTGTA-----------------TC--AAC--AC-----TGTC--T-----ATTT----C---AGTA--A--------AAA---AA-GCCAATATC------TA--T--ATCTA-TTTCTG------A-C-TTGAGGT--AAACTTTC-CCTGTCTGC-C----AT-------------TTAC-AAAG------------TA-TGGGATT--G-GAGAGG-GCCGGGAT--C------GAGA-T-CTC--TCTGGAAGTGG-GG--C-A--TGT-AGCAGAA----------------AG--CAC-CCCAGTTTTGTACAATGTTTCT-AAATC--TT--TTGAT--ACA-GTAGATGTGTTGTGGCCCCGG-ACAATTTTTCC---TGCAGAAATGTG--TGTTCT-CCGGAAATA---------AA-AAATT-TGGGAGCTTAACCAAGTATGATA-CACA--CTGCATTCACAAGGATTT--GAAAGTC-AAAACC-A-CA-CGTGTTGGAGCAAATGTT-GACGCGGTAATCCATGGTAATTG-A-GAGCTTTCT-TGAGATTCCGC-CAAAATAATA-TTG--TTTTCCTGAAAT-ATGAACAC-AGTAA-A----TC--GTCAGAAATCACT-TCCTTCAAAATAATTTTCACTGA----GTAACGAAGAAAACTGG--CAATGGATCagctg
gi|11 : AA--TGGAAAC-AC-AACG-C-----GATG---TC--ATA-TTC-AT----T--AG-ATA-------------GAC-----GA---GTATAG-A---------ACTTTGTGACA-TA-GCATG--GA-A-A----A--CGTCCACTAAATAA--T-T--GATG-GA-CT--CTCATTCGG---A-A--TA--------------T---GTAGT--CGG-TATTGTTTCTC-TCC--AATA-GT---G-AGTC--CGTGACAA-T-TT--GGT-TATA-T-GAC-GGT------------------GT---GAG--TAGGT----GTA-ATCTGGCGAA----TCT-CGG-G--GG-AGTGTCAGA--GGTC-TTCAT-AT-AGA--TAA-GTGTATGT-CTGT-GTGGATGAATTGATAGA-A------CGTG-GACTG-AGACATCT--CACA-T-CTCAC-C---T-TAT-GAT--CA---GT---TTG--C-CAAAACA-TG-----A---AATCCAT--G---T------CAG-A-TGAT-TT---AA------------------------------A-CCACTCAGCAT-ATT-TCTCACTCC-TCTATATAAGT-CTGAAGGTTTC----TGTATCATC-C-CC-TAC---GTGT----CAGAAATATCCCTTCTG-AAGGTCACTTCTGTC-GG-TGTCCC---TATCTCAC-GACAC-----A---CCCCCACATA-CAGGACTTCTGACGCACGTGGAATGtctcgtcaacaaatgcgtaata
gi|12 : TTTGTTCCGCTTG-TG-AAAAGAAATT-CTCCC-TT-CTATAATCTTGAGTTC---TTATT--TGTGCTGTACTG-TTTTGC-GAT-AGAAAGAC-AG--ATTGAATATCCT----TCCT---CGA-TAATTGTGAAG-TCG-AGGA-TTGATGC--CAACGCG--AAGAGGAAT-GATCAGAATCGGCCATGTGTTGAAGTACATAAGATCGCTTTCAAATCAAGGGGAAGTG-CTGGTAA-TGG-GCA-GTGACGGGAA--TGAAAAC-AC-AGC-GC-----AATG---TCGAAAT-CT-----AAATTCAG-AAAAGTGTA-GCTGT-GACAA--GGACC-GTGCA--TGTTCTC---ATTTT----CGTTG-GA-TG--GA-C-T----AAGT--CCATTC--CAG--T-TTTGATG-AA-AT--CTCAACAGG---A-G--CATT-GAACTTGA-AAT---AT-AT-ACAG-CATTGTTTCTC-TCC--AATA-GT---GAGGAC-A--TGACAA-T-TT--GG
gi|13 : TACGTA-CTCCC-AT-CATC---GTAGA---GC-A---GTAGGGTTTGT-TGATCTG-----CC---AGTT---CTG-TAGATACATGTATTG---TGACTTGTTACCTAGT-------CTGT--AGTGACATAGG-ATAG-ATA-GCATATG--CAC-GGT--CACAA--AGGG------AGATA-AACATA-AAAC-TG-ATATTCCGTTCATTCC-ACTCACTGCTTGT-T--CCAACATTAA-TTC-TTCAA-TACAG--GTAATCTTTTC--ACAGAAAAGAGT-A--TCTCTTGCCCAAGCATTCCTAAACTTAG----TCTA-CA-TAGACTGA-C--CACCCA--CCGTC-G---CACTTTA-TCTTTG-TCTAT--C-TA-------------C-A-------CTA--TGGCA---TGATATGG------------G---TCTCTG-CTTCA-TTCTATC-TGTGACAG--TTAGGGCT-GT---GTGATATTTACCGGT--ATCGTACAA-GTAT-AA-CG-CTAAATATAAATCcgat
gi|14 : -TTATTGA-CCTA-TCATTATTGAATCTCTTTTTGT-TTGGCACAGACAATCTTTGTGCTTTTAA-TGCCA-TGGAC--GTTGATAATA-A--C-ACAT-----T-TATCAA--CGCATCATGAAATATA-A----CATTATGGCAGGT--TGATA-ATAACTG-ATCTATGACATT-TAAATG-CA-TCA-TGTTTGAAAGGAAATC-TGA------------TACGAGAATTGTA-CT-T-CT--AAC--ACTG--ATG-C--T-----TTCG----C---CA-A-----------AAC---AA-GC-AATATC------TA----TATCTA-TTTCTG--------C-TT-AGGT--AATTTTCC----GTCTG--C----A--------------TTAC-AAAG------------TG-T-GGATT--A-GAGA-G-GCCGGG-T--C------AGAA-T-CTC--TCTGAGAGTGG-GA--CTG--CGTAA-CAGGAAAG--------------C--AACGCCCA-TTTTGTCAAATGTTTCTGAG--C--TT--TTGAT--ACAattgccaaaacacaaa
gi|15 : TTTTCT-TTGACACAGACAAACACTGAGTTTTTAA-TGACA-TGGAA--GTGAAT-ATA-AG-C-ACAT-----T-TATCAA--AGCATCATGAAATATA-A----CATTATGACAGGTG--GAGA-ATAACTG-ATCTATTACATT-TATACG-CA-TCA-TGTTTGAAAGGAAATC-TGAA----CT--CTTTATGAA------A-C---------AT--GT----ATCTT--TTGTGCTTTC----C---CG-A--T--------AAA---AT-GC-AATATC------TA----TATCTA-CTTCTG------A-C-TTGAGGT--AACTTTCC-TCTGTCTG--C----A--------------TTAC-AAAG------------TA-T-GGATT--G-GAGAAG-GCCGGGAT--C------AGAA-T-CTC--TCTGAGAGTGG-GG--CTA--TAT-AGCAAAAAGG--------------C--AATGCCCA-TTTTGTAAAACTTTTCC-AA--C--TT--TTGAa
gi|16 : cAGTCC-GAGTTTAATTCATT--TGA-CTGT-TTG-TGT-GC-AAT-AGGGA--CGAG--AT-GAA-ATCCT----TCGT---CAA-TGATTG----T-TTG-TA-G-T--AC-A--CTTTGCG--A-------T-GGCC----------ATGCGC--GAGT-CA-AACATC--TATC-AACCCAGGGAA--GGGCTGGT-AATGG-GCA-GTGACGGGAA--TGGAAAC-AC-AAC-GC-----TAAA---TC--ATT-TTCTATGGAGT---G-ATAAGTGTA-GTTGT-GACAT--GGACC-GTGCA--GGTTTTC---ATTTT----CTCT--GTTTG--GA-T-C----A--CGTCCACTCATTAA--T-T--GATA-TT-GT--CTCATTCGG---A-G--TAAT-GAACTCGA-AAT---GT-AT-ACAG-TACTGTTTCTC-TCC--AATA-GT----GAGTC--CATGACAA-T-
gi|17 : TGTTGCT-----TTCA----C---T--A--T--------AAA---AA-GC-AATATC------GA--T--ATAAA-TTTCTT------C-C-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A--------------ATAT-AAgccgat
gi|17 : tactaatac-ATA-CACA--CTGCAT---CAAGGATTT--GAAG--C-AAAACCA--CA-CATGTTGAAGC-AATGTT-GA--TGGT-ATCCATGG-AGTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaatacacactgcatcaaggatttgaagcaaaaccacacatgttgaagcaatgttgatggtatccatggagtt
gi|18 : tactaatactgttgctttcactataaaaagcaatatcgatataaatttcttccttgaggtaactttcccctgtctgcaatataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaAATAAGTCG-T-AAGTAACAAACC-ATTCAATA-CAATGTACAGTTGTAAGTA-ATTCT-TTAA-TA-TATTA--TCGCACACAACCATTGATTTATTATAAATATTGACTGAAATCGAATACAAAT-ATTGACTG-GA-AT--ATCAA--------CAGAATCAGAAAATGAAA--TCCAT----AC-------CATTTCACATT-TA--TGAAC--GAGATAA-----------ATGTAA-TACAA-ACAATA-ATCTGTACAG---AA------AACAATTAACTTTGATTTTTCTATGTCG-------TTA-AA-----G------G----GTTTAC------TTTCTTCTCCTAACTATTGACAGAAA-TA---ATTCTA-GTTTCTATG-GCTATCTGTATTTTGTGACA-TGGTTCTTGTCT--AA
gi|19 : AGAACTA-AACCTAACATGTGAATTATTAT-CCTA-TCAATGGCGTATCTCTTTTTGT-ATGACACAAACAAATTATGTGCTTTTAG-TGAGA-TGAAA--GTCGACAATAGAG-C-A--C-----T-TACCAG--CCAATAATGAAATCTA-ACA-------TGACAGGT--TGAGA-TTAATCG-ATCTATTGCGTT-TAAACG-CT-TCA-TGTTACAAAGGAAATT-TGAA----AC--CTCTG-GA-------A-CT-G-TA--CAT--AT-G--GTACT--T-----T-----------CA-A--T--------AAAGA-AA-GC-AATATC------TA--T--ATCTA-TCTCTG------A-C-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A--------------TTAC-AAAG------------AG-T-GGATC--A-GAGAGG-GCCGGGAT--T------AGAA-T-C-
gi|2 : T-----T-AATCAAGTC-CATTGTGCAATA---ACAAC-ATT-TG---GATGCTGAGA-ATAAGTGCATCTATTGCATT-TAAATATCA-TCA-TGTTTACAAGCAAATC-TGACTTGACC--AAGCTCGAC------ATCT-C-TA--------C-A--A--CT--T-----GTCG----CATTCA-ACTT--------AAATTTAA-AC-ATTATCAACCCATAAAT-TAGCTA-CTTCTATTTTGCA-C-TTGAGGCCAAACTGTCCTCCTGTTTA--TGACAA--------------TTGCTAAAG------------TA-T-GGATTTAG-GAGAGGTGCCGGGAT--CTGATTGACAA-TAT-C--TCTGAGAATGG-GG--CTAT-TGTAA-CAGGAAAG-------------GGC-AACCCCCA-TTTTGTAAATTTTTTCT-AA--C--TTTCTTGAT--ACAGAGAAATTCGTCCC-GCCCC-G-AC---TTTTCC---TACACACATAT--TTGTTCTGCCAGAAT-A---------GAGAAATT-T--GAAGGTAACC-GGTAT-ATA-CACA--TTGCAT---CAAGGATTT--GAAA--C-AAAACC-A-CACCACGGTGAAGC-AGTGTTGGA--TGGT-ATCCGTGG-AGTTGAA-GAGCTCTCT-TTA-ATTCT-C-CAAAATAATATTTG--TCTTCATAAAAT-ATGAACAC-AGTTA-ATTCGTC---ACAAATA--A-T-TCCTT-AGAATTATTTTCA-TGATTCTGTAACAGAGAAAATTGGGACAATGGTTCATAGAGTACACTACTTTTGCCTCGCTTGGTGTAAAAGAAA-T-CTCCA-TT-CC-AAGTCT-GAGTTT--TCCATTCGTGT-CTGT-TTGTTTT-ACAAAT-AGGAAT-CGAGGAAT-GAA-ACCCG----TCTT---CAATTAATTG----AGCTG-CA-T-T--ACAAACTTACGTG--G-------T-GGGCC---------GTGCTC----GT-CA-AACATC--TATC-AACCCAAGGCA--GAGCTGGT-AATGG-ACA-GTGACGGGAAAGTGGAAATAAC-A-CAGC-----GATA---TC--AGTCTTC-TTTA-AT--CGTACAAGTGAAGGCTGT-AAACA--GGACC-GTGTA--TTTTCCC---ACCTT----tc
gi|20 : gCA-TCGAA--GTTGATAA-A-AG-C-A-CT-----TCTATCAA--CTTATCATCGAATATA-ACA--TATT--GGCGAGT--TGAGA-ATAACTG-ATCTATTACATT-TAAATG-CA-TCA-TGTTTAAAAGGAAATC-TGAT----C----TA-ACAA------------T-CA--CACCCGC-A---------C-----TTCC----CA--TG-A--TTTCATTAAAAA---AG-GC-AATATC------AA--T--GTCAA-TTTCTG------A-C-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A--------------TTAC-AAAG------------TG-T-GGATC--T-GAGAGG-GTTGGGAT--C------AGAATT-T-C--CCTCAGAGTGG-GA--CTT--TGTAA-GAGGAAGG--------------C--AACGCCCA-TTTTGTAAAATGTTTCT-AA--C--TT--TTGAT--ACAtttttccccccccccaaaaagtttttatttggggattcattcccctgagtgattgatggattcccttccgccagcaatgaactgaaatatatactgtattgtttgctctctaatacgtgag
gi|21 : -TTATTGA-CCTA-TCAATGGTGAATCTCTTTTTGT-TTGATACCAAAAGACTTTGTGTT---AA-TGACA-TGGAC--GTAGATACTA-AAAC-A-ATACTAGT-AATCAA--CTTATCATGGAATATA-ACA----TTATGACAGGT--TGAGA-GTAACTG-ATCCATTACATT-TAAATG-AA-TCA-TGTTTGATAGGAAATC-TGAT----GCAATTGTCC--C------A-CT-TATATTACT--GC-----TGCT--T-----TCGC----C------A--T--------AAA---AA-GC-AATATC-------A--A-TATCTA-TTTCTG------A-C-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A--------------CTAC-AAAG------------TA-T-GGATT--G-GAGAGG-ACCGGGGT--C------AGAA-T-C-
gi|22 : CAATGAGTTA-T-AAATAACAAACC-ATTCATTA-C----T----TTGTAAGTA-AGTCT-TTA--TA-TATTA--TTGTGT----CC----------------TATCG-------TTGAGAACAAAT-ATTGACTG-AA-AT--ATTTA--------CAGAG------------G--TCCAT----AC---A--ATATT--ACATT-TAC--AAAT--GA---AA-----------AT-TAT-TA--A-ACAACA-TTCTGCACAG---AA------AACG-------TCGATTGTTATATGTCA------AC---AACCC-TA------ACCTTATTTATGGGT-ATT--TTCTTCTAACTATTGACA-AAATTA---ATTCTA-GTTTCTGTG-GCTGTCTGTATTTTGTGATA-TGGTCTCTGTCT--AAGTG-AC--T--CTTGAT-AA-GACTG-TAACGCtc
gi|23 : AAATTATATATTC--AGCTTCTGTG-GCTGTCTGTATTTTTTG-AA-TG-TGCTTGTTTTTAAGTGAACAAT--TTGATTTAA-GACTGTTAACGCCCTGTG-TAG-TCCCCCAC-CA-TATGTTGACA-AATCCC-AGTA---TCTGCCA-G-ACAGGTC-TCTA--TGGCGT--AAAG-GTGCGTATCTCCC-AT-CATC---ATAGA---GCAA---GTAGGGTGTGTAGGGT-TG-----TC---AGT-G-CCTG--AGATAA-----ATG---TGACCTG-TACCTAGTCGTTAGAGTGG--A-TTTTA-GGGTACAG-ATA-ACA
gi|24 : gaGAATGTGATCCATCC-TGTAACGA-TTC-T-TTAACGTTAG-TTGATCGAC-TCAATA-TAAGTTTCT-ATT-AA--------------AT--T----ACAGT--GTTCTG--AT-AAT-TC--GTGAGA--AG-TTGT--ATA-------------AAA---TG-----------TAA-TCTTACAAAATGTACTCTACCTGAGAATTT--CCAAGT-TCTATTTATAGACAATCGGGAAATAA-CCAGTTTAA-CT-CCG-----TACTTTTCTTATTGCA---TGTACTCTGTTG-AC-C-TTAA-TATGGAATACCAGT--CTTTA-TTTGATTCG-TTAATCGA
gi|25 : GGGAAATGTGATCCATCC-TGTAACAA-TTA-T-TTAACGTTCATTT-ACCGAA-ACAATA-CAAATGTTT-ATT-AATACGAA-AGAATACATTAC----AC--C--GTTCTGAAA---AC-CC--GTGAAA--AGTT-GT--ATA-------------AAA---TG------------AATTC----------CACTGCACCTGAGAATTT---AAAACATCTATTTATAGACAATCGG-AAATAC-CCGGTTAAG-CC-CC----ACTACTCTTC-TTTTGAAAATTG-A-TTTGTTG-ACTC-TTAAGTCT-GAATA----T--T-TTA-TTCCGTT-G-TT-gacaattgt
gi|26 : -TTATTGA-CCTA-ACAATGGTGTATCTTCTTTTCT-TTGACACAGACAAACACTGTGTTTTCAA-CGACA-TGGAA--GTGAAT-ACA-AG-CTT-AT-----T-TATCAA--CGCTTCATGAAATACA-A----CATTATGACAGGT--TGAGA-ATAACTG-ATCTGTTACATT-AAATTG-CA-TCA-TGTTTAAAAGGAAATC-TGAT----TC--CTGTGTG-G------A-------A--AAT--CT-ATCACGTC--TGA---TTTC----C---CG-A--T--------AAA---AT-GC-AATATC------TA----TATCTA-a
gi|27 : --AG-GTAAGTGTA-GTTGT-GACAT--GGACC-GTGCAG-G-TTCTC---ACCTT----CATTG-GCT-G--GA-T-T----AACC--CCATTCCATA---T-TTGA-TG-GT-TT--CTCATCCGT---A-G--TAGT-GAACTTGA-AAT---GT-AT-ACAG-TATTGTTTTTC-CCC--GTTA-GT---GAGGAC-A--TGACAACC-CC--CAT-CATT-T-GA-CGAT------------------GT---GAG--T-AGT-A--GTA-TTCTGGCGAA----TCC-CGGTG--GG-AGT-TCACCC-CGTA-TCCAT-AT--GA--GAAAGTGTA
gi|28 : CCTAGACTTAG----TA-AGCAATAGACTGA-C--CACCTA--CCG-C-CTTCCACTGTA-TCTCTG--CTGT--C-TAC--TCTGTTGAGAT-A-------C-------AA---TTATTTGGGGCT-TG-TGA-GAGTCCTCTGTCTTCA-CTCTTTC-TGTGACAGTTTTAGCGCT-GT---TTGATATCTACCGGT-ATTCATAC-ATGTAT-AATTGCCTAAATACCAACCCATCAT
gi|29 : taccTTCAATA-C----T----TTGTAAGTA-AGTCT-TTAA-TAATAT-------------AC-----------------TACCG-------TTGATTACAAAT-ATTGACTG-AA-A-T-ATCAACAGAAT--CAGAA------------G--TCCAT----AC---ATTACATTG-ATACTATAG-TAAAT--GA---AA-------------ACATGTA--A-ACGGTA-TTCTGTACAG---GA------AATC-------TTGATTGGCCTGTGT--------ATTA-A-------------------TT----GGTAATATCTTCTCCTAACTATTGACAgattgcgaaa
gi|3 : gAG--AT-GAA-ATGCCAGTGTAGTACCCAA-TAATTG----A-TTGGTAGGAC--ACGA--C--CGCG--A-------TTAGCCA---------TTGCGCCTGAG--CA-AACATC--TATCAAACCCAGGGGAAATAGGTGGTAA-TGG-GCAAGTGACGGGAAGATGAAACC-AA-GGCGCCTCGTGGTTACATTC--AGT-TTCTAT-AGAT--TA-ATAA-TGTA--TTGTCGACAAAGGGATCTGTGCCC-G-TTCTC---ACCTT----CACTT-AATTG--GA-T-CCAATG--T--CCA-TCAGTGAGAT-TTGA-TG-GT-TTGTCTCATCCGGCAGA-GGTTAAT-GAACTTGT-AATCTTGTAATTGCAG-TAATGTTGCTCCTCCGCAATA-GTCAAGGATCC-ATGACCCAA-G-TT--GGCGTATT-TTGACCGGTATAGGAAAGCTGGATCGTGT---GAG--TAGGTAT--GGA-ATC-GGCGA-----TCC-GGG-GCGGG-AGTATCAGACAGGTC-TCCATA-T-AGAAATAAGGT--ATG--CTGG-GTGAATGA--T-----AAA------TGTG-GGCTG-AGACAGCT--CACA-G-ATCAC-G-C-T-TAT--AT--CAAC-GGAACCAA--C-CAACGCACTA-----TATGAAATCAT--GTAGT------CAGAA-TGAT-TTG--GAACCTTGTGAAATC-CCTCCCTTAGAAACT-A-CCACTCAGCAC-A-T-ACTTC-TCA-CCCATAT-ACT-C-GAAGGTTTCTGTGCGTATCATC-T-CC-C-CCGTGTGTCCCCCAG----A--CCTTCTGTAAGGTCACTTCTGTCAGG-TGTCCCGGATATCTCACTGACACACAAAA---CACCCACAGA--AGGGC-TCTGACACTC-GGTAATGTGATTCATCCATGCAAACA-TTC-GTTTAGCGGTGG-------GAC-AC-ATAGCAAAACTCT-G---AAGACTAC-ACTATATA-TATAGAAACAGCAGGTTCTTGAAT-AATATCTAGTGAAGGTAATTTGTGGATACAAGAAGTCAGTGAAAATGTGATTACTCATGTTAAATCTTACAAAATCCACTCTACCTGG----TT--TAAAAT-T
gi|30 : acT-GAACTTGA-AAT---ATA-T-ACAG-CATTGTTTCAC-TCC--AATA-GT---GAAGAC-ATG--ACAA-T-TT--CTT-CATT-T-GAC-GGT------------------GT---GAG--TA-GC-T--GTA-ATCTGGCGAA----CCC-CGG-G--GG-CGTATCAGA--GATC-TCCAT-AT-AGA--TAAGgtgatcgtgataac
gi|31 : T----GAATC-CCTCCCTAGA--ACT-A-CCACTCAGCAC-A-TATCTCTTTCC-ATTATATATCT-GTGAAGGTTTC----CGTATCATC-T-CCTC-C---GTGTCTTCTAG----ATCCCTTCTG-AATGTCACTTCTGTT-GG-TGTCCC---TATCTCAC-cgt
gi|32 : AAGTGTA-ATTGT-GACAA--GGACC-GTGCA--TGTTCTC---ATTTT----CGTCG-GA-TG--GA-T-T----AATT--CCTTTCA--AA--T-CTTGATG-TA-AT--CTCAACAGG---A-G--CATT-GTACTTGA-AAT---GT-AT-ACAG-CATTGTTTCTC-TC
gi|33 : ACGTGAA--TGGAAAC-AT-AGCG-C-----GATA---TC--AAA-TTC-ATGAGAT--TT-AAAAGTGTA-GTTGT-GACAT--GGACC-GTGTA--GGTTCTC---ACCTT----CA--GCACCTG--GT-T-C----A-----CCACTCCATAA--T-T--GATG-GT-TT--CTCAT
gi|34 : ACCT----GAATC-CCTCCCTATG--ACT-A-CCACTCTTCAT-A-T-GGATCATCCCTTTCGATAACG-ATAAACCTTTC----TGTATTAGCAC-CC-C-C---GTGTCCCAAAG----ATCCCTTCTG-AAGTTCACTTCTGTC-GG-T
gi|36 : ACATGCTGACA-GATCCCCAGTA---TCTGCCACA-AGAGGTC-TCTAAGG--AGT--AACG-GTACATGTTTGTC-AT-CATC---ATATA---TC-A---GCAGGGTGTGTAGGTC-TG-----TC---AGT
gi|37 : AGTGAA-GTTGT-GACAA--GGACC-GTGCAG-GTTTC-C---ACCTT----CATTG-AC-TG--AATT-C----A--CT-CCATTCAATAA--T-T--GATG-GA-CT--GTCATTCGT---A-G--TAAT-GAACTTGA-AAT---GTAgact
gi|38 : TTTATAGACAATCGGAAA-TAC-CCAGTTAAC-CT-CCGC----TACTTTTC-TTTTGCA---TGTACTCTGTTG-AC-C-TTAA-TATGGAATACCAGTACT-TTA-TTTGATTCG-TT-ATCt
gi|39 : ATAAATTA-T-AAGTAACAAATC-GTTCAAAA-CA---T----T-GTAATTA-AGTAT-TTAA-TA-TATTA--TTGCGC----CC----------------TACTG-------TTGAGTACAAAT-ATTGACTG-AA-A-T-ATCAA--------CAGAA------------a
gi|4 : AAGTCC-GAGTTTAATTCAT------------TTG-TC-----------------------------ATCCT----TCGT---CAA-TAATTG----A-TTG-TAG--T--ACAA---TACACG--A-------T-GGCCA----------TGCGC--GAGT-CA-AACATC--TCTCAA-CCCAGGGAA--GGGCTGGTAA-TGG-GCA-GTGACGGGAA--TGGAAAC-AC-AACG-C-----TACA---TC--AGT-TTCTATG-GAT--AG-ATGAGTGTA-GTTGT-GACAT--GGACC-GTGCAG-G-TTCTC---ACCTT----CAATG-GCTAG--GA-TAC----A--C--TCACTGAGTAA--T-TAGATTGTGT-T-----CATCCGT---ATA--CATT-CAACT-GA-ATA---GTA-T-ACAA-TAGTCTTTCTTATCCTAGATAAGC---TGAGTCCATAAGACAA-T-TCTCGTT-GATT-T-GAC-AGT------------------GTATAGAGATTA--T-T--GTA-ATCGGTCGAAAGAATCCGCGT-G--AGCAGTATCAGAC-GGTCGTCC-TAATCAGA--TAAGTAGTATGT-CTGGTGTG--TTAATTG---GATAAAACCCCGTTTGACTA-TGACATCTATCACACT-ATCAT-CACTTCTATAGATATCATATGG---TAG--AACATCGCA-TACTCATT---AACTCAT--GC--TTAGGATCAG-ACTGAT-TTTTAAAACATTCA-GAATCGCCTCCCTAGT--ACT-A-CCACTCAGCAT-C-CGTCTCAGTCC-TCTATATAACT-TTGAAGGTTTC----CGTATCATC-T-CCAC-C---GTGTCTCTCAG----ATCCCTTCTG-AAGGTCACTTCTGTC-GG-TGTCCC---TATTTCAC-GACAC-----A---CACCCACATA-CAGGGCTTCTGATACACGGGGAATGTGATCCATCC-TGTAACGA-TTC-G-TTAACGTTAG-TTGATCGAC-ACAATA-CACATTTCT-ATT-AATACGAA----ACAAATCAT-----TAAC--GTTTTAA----AGC-TT--GTG-AA--ACCTTGT--ATG-------------AAAA-ATG-----------TAA-TCAAACAAAGTCCACTCTACCTGAAAATTCA-CAAAA--TCTATTTATAAATAATCGG-AAATTC-CCAATTATG-C-----CCGGCTACTTTTC-TTTCGCA---t
gi|40 : CTG--C----A--------------TTAC-AAAG------------TA-T-GGATT--G-GAGAGG-GCAGGGAT--C------AGAA-C-CTC--TCTGAGAGTGG-GA--CTA--TGTAA-CAGGAA-G-------------AC--AACCCCCA-TTTCGTAAAATGTTTCT-AA--C--
gi|41 : CTG------A-C-TTGAGGT--ATTTTTCC-CCTGTCTG--C----A--------------TGAC-AAAG------------TG-T-GGATC--A-GAGAGG-GCCGGTAT--C------AGAA-C-CTC--TCTAAGAGTGG-GA--CTG--TGTAA-CAGGAA
gi|42 : -TGAT-TT---AAACCT----AAATC-CTTCCCTATG--GCT-A-CCACTCAGCATCA-A-TCTAACTCC-ATAATATGAAT-GTGAAGCTTTC----CGTATCATC-TCCC-C-C---GTGTCCCaccaac
gi|43 : AAGTGTA-GTTGT-GACAA--GGACC-GTGCA--CGTTCTC---ATTTT----CGCTG-GA-TG--GA-T-TAA--A--T--CCATTC--CAA--TGTTG-ATG-TA-AT--CTCAACAGG---A-G--CATT-GAACTac
gi|44 : aAATATATAA-T-TTTC-ATCCCGTTCATTTC-ACTGACTTCTTCT-T--CCAACCTTAA-TTCTT
gi|45 : cagccacagaagctgGGAATGTGATGCATCC-TGTAGCGA-TTC-G-TTAACGTTAc
gi|46 : TTTTC-TTTTGCA---TGCACTTTGTTG-CC-CCTTCA-CATGGAATACT-------TTA-TTTGATTCG-TT-ATCctattacatttagctttacacattctattta
gi|47 : GCTACTTTTC-TTCTGCA---TTT--TCTGTTGCAC-----AA-AACAAAATACTAGTACT-TTATTTTGATTacaa
gi|48 : CT--CACA-T-ATCAC-C---T-TATG-AT--CA---GG---GAG--C-CAACGCA-TG---------AAATC
gi|49 : --C-AAAACCA--CA-CATGTTGGAGC-AATGTT-GA--TGAT-ATC
gi|5 : ACAATAAGT--ATGAAGTAACATACC-ATTTA-TAGTA---T----T----A--A-AGTCTATTAA--A-TATGATATTGCGC---ACC----------------TACTG-------TTGATTACAAAT-ATTGTCTGCAA-ACTGACTAAAACAGAATCAGAA------------GGTTCCATCTAAACCCTA--AC-TTG-ACATT-TATGTAAAATGGA---AACCAGCTTTGCAATACAA-TT--T-ACTAT--TTCTGTCCAGTGGAATACCCCACAT-------TTGATCGTTCTATGGCATAATAAAATATAA----TA------A----ATATA--AAT-ATATCTT-TCCTAACTTATGA--GAGATTA---ATTTT--GCT-CTCTG-GTTGTCTGTATTTTTTG--A-TG-TTC--GT------GTGA--------TGTGT-AA-GACCGTTAACGCCCGG-GACAGGTCTCCCACACATTGT-TTGA---GATCCCACGT----TC-GCCA-GGACAGGTCCTCTA--T--CTTC-AAAA-TCACGAATCTCCCCATACATCCCAATAGAAATGC-AAGTGAAGGGTTTGTGTAAT-CGCGTTCTCCTAGGTCATCCTGCTAGAAATC----TTGAATTGATCTGTTACCTAGTCT----GCTGTCGA-CAATA-GGA-ACGGGATACACACATGTGCACAGGTAGCGCAACCAGGGCTCACCAGTCATATTAT-----C-TCTGTA------TCATTTCAACTGAACTTTTGTGTGGCCAA--TTAACTTCTTTCATCTATAGCAGTAAACTCTTTATAC--AATATGGTCAACATTCTTG-CCAACC-TTCCTATACTTAGGTTCTA-A--A-TAGACTGACC--CACCTA--CCG-C-T---CACTGTACTCTCTGCTCTGT--CACAC--T-------ACT-AGGATACCCCATTC-GA-----GAAGTGTGGCTGTGAGAAGG---CCTCTG-C-TCACTTCTATCTTGTGACATTTTTAACGCTAGTTTATTGATAATTCTC--T-AAACGCA--G-GTATCAGTTACCTGAGTA
gi|50 : TCCCGTTCATTTT-ACTGACTTCTTGT-T--CCAAatga
gi|6 : AA--TGGAAAC-AC-AGCG-C-----TACA---TC--AGT-TTCTAT-AGAT--AG-ATAAGTGTA-GTTGT-GACAT--GGATC-GTGCAG-G-TTCTC---ACCTT----CACTA-A-TTG--GA-T-C----AATT--CCACTCAGTGA--T-T--GATG-GTGTT--CTCATCCGG---A-G--TAATTGAACTTGATAAT---GTAAT--CAGGTAT-GTTTCTC-TCC--AATA-GT---GAGTCC-AT-TGACAA-T-TT--GGC-GATTGT-GAACGA-------------------GT---GAG--TA-GT-TTTGTACATCTGGCGAA----TCC-----G--GG-AGTATCAGAG-GGTC-TCCATA-T-AGA--TAAG-TGTATGTGCTGG-GTGAATGTATTA---GAAA------TGTG-G-CTGCAGACATCT--CACA-TGATCAC-C--TT-TATG-AT--CA---GG---TAAACC-CAACGCA-TG---------AAATCATTAGT--T------CAG-A-TGATGTT---GAACC-----GAATC-CGTCCC-AGA--ACTTA-CCACTCAGCAT-ACT-TCTCACTCC-ATTATA---CT-CTGAAGGTTTC----TGTATCATC-T-CC-C-CC--GTGTCCCCCAG----ATCCCTTCTG-AAGGTCACTTCTGTC-GG-TGTCCC---TATCTCAC-GACAC-----A---CACCCACATA-CAGGGCTTCTGACACTCGGTGAATGTGATCCATCC-TGCAACGA-TTC-G-TTAGCGTT--------CGAC-ACAATA-CAAA--------------CGAG-ACTACACATTA-----ACAGC--GTTCTGA--T-AAT-TC--GTGAAA--A-TTTGT--ATA-------------CAA---TG-----------TAAT-CTTACAAAATCCACTCTACCTG
gi|7 : TATCTCTTTTTCG-TTGACACGAACATACACTGTGCTTTCAA-TGACA-TGGAA--GTGAATA-TA-AG-C-GCAT-----T-AATCAA--CGCATCATGAAATACA-ACA----TTATGACAAGTG--GAGA-ATAACTG-ATCTATGACATT-TAATTG-CA-TCA-TGTTTAAAAGGAAATC-TGAT----TC--CTTTTTG---------------TA--AATT-AT-A--ACTTT--T-----CTGCTTTAC---TG-A--T--------AAA---AA-GC-AATATC------TA--T--ATCTA-TTTCTG------A-C-TTGAGGT--AACTTTCC-ATTGTCTG--C----A--------------TTAC-ACAG------------TA-T-GGATT--T-GAGAGA-GCCGGGGT--A------AGAA-T-CTC--TTTGAGAGTGG-GG--CTA--TGT-AACAGAAAAGCAACNNNNNNGAAAGC-AACGCCCA-TGTTGTGAAATGTTTCT-AA--C--TT--TTGAT--ACAGGAACGTCTGTTGC-GCCCC-G-ACAACTTTTCC---TGCAAACATAT---TGTTCT-CCGGAAT-A---------AAGAAATT-TGGAAGG-TAACC-GGTAT-ATA-CACA--CTGAAT---CAAGGATTT--GAAA--C-AAAACCA--CA-CATGTTGGAGC-AATGTT-GA--TGGT-ATCCATGG-GGTAGAA-GAGCATTCT-TGA-ATTCT-C-CAAAATAATA-TTG--TTTTttaaaat
gi|8 : AAATT-CTCCA-CT-C-AAAGTCT-GAGTTT-----------GT-CTGT-TTG-TTT-GA-GAT-AGGAA--CGAG--AT-GAA-ATCCT----TCAT---CAA-TAATTG----A-ATG-CA-G-T--AC-A--GTAGGTG--A-------T-GGCC----------ATGCGC--GAAT-CA-AACATC--TATC-AACCCAGGGAA--GGGCTGGT-AATGG-CCA-ATGACGGGAA--CGGAAAC-AC-AG-GGC-----GATA---TC--AGC-TTCTATGGAAT---T-ATAAGTGTA-GTTGT-GACAT--GGACC-GTGCA--TATTCTC---ACCTT----CTCTG-GC-TG--GA-T-C----AATT--CCATTCAATGA--C-T--GATG-AA-AT--ATCATCCGG---A-G--TAAT-GAACTTGA-AAT---GT-AT-ACAG-TATTGTTTCTC-TCC--AATA-GT---GAGGAC-A--TGACAA-TATC---CT-CATT-G-GA-CGGT------------------GT---GAG--T-AGT-T--GTA-ATCTGGCGAA----TC
gi|8 : CA-TG-----T---AATCCAT--GT---------CAG-A-TGAT-TG---AAACCT----AAATC-CCTCCCTATA--ACT-A-CCACTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacatgtaatccatgtcagatgattgaaacctaaatccctccctataactaccact
gi|9 : aaattctccactcaaagtctgagtttgtctgtttgtttgagataggaacgagatgaaatccttcatcaataattgaatgcagtacagtaggtgatggccatgcgcgaatcaaacatctatcaacccagggaagggctggtaatggccaatgacgggaacggaaacacagggcgatatcagcttctatggaattataagtgtagttgtgacatggaccgtgcatattctcaccttctctggctggatcaattccattcaatgactgatgaaatatcatccggagtaatgaacttgaaatgtatacagtattgtttctctccaatagtgaggacatgacaatatcctcattggacggtgtgagtagttgtaatctggcgaatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaaGAACTACA-CCTATCATGTGAACTATTGA-CCTA-TCAATGGCATATCTCTTTTTCT-TGGACACAAACAAACACTGTGATTTCAA-TGACA-TGGAA--GTGAATA-TA-AG-T-ACAT-----T-TATCAA--CGCATCATGAAATACA-ACA----TAATGACTGGT--TGAGA-ATAACTG-A--------------AATG-CA-TCA-TGTTTGAAAGGAAATC-TGGT----CC--CATTGTGTA------A-CT-TATA--A-----C-A--CTGCTGCT-----TTCC----A---CA-T--T--------ATA---A--GA-AATATC------TA--T-C-TCTA-TCTCTG------A-C-TTGAGGT--AACTTTCA-CCTGTCTG--C----ATTACAAAGTATGGATTAG-AAAGGGTNNNNNNNNNNN-N-NNNNN--N-NNNNNN-NTCGGGATTTC------AGAA-T-C-TCATCTGAGAGTGG-GAGACTAGCTGT-AACAG-AAGG-------------CCCCAATGCC-A-CT--GGAAAATGTGTCT-AT--CCTTT--TTGATT-ACAGAGACAT-TGTTGC-ACCCC-A-ACAA-TTTTTCCACTGCAAACATAGT-TTGTTAC-CGGGAACGATCTCAAATAAAGACATTGCGAAAGGGTAACC-GGTAT-ATA-CACATTCCCCAT---CAAGGATTTTAAAAA--C-AATACCA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|35 ): TTATCCTATGATAAGCTGAATATGAAAGGAATGCTTGTTGATTTAATAGTGTCTTCATGGGAATGTACTGTTATCCATCAATCCACTAAATAGAACAGCTGATAACCCTAAC
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 222 333333333 11111 5555555555555555555555 2222222 222 44444444 333333333333333 1111 333333 22 111 1111 111 3333333333333333 22222 111 55555555 88888888888888888888888888888888888 222 1111 11 222222222 111 1 1 1 1 2222 1 33333333333 111 222222 11 111 22222 222 11 333333 111 1 4444444444444444444 1 1 1 1 1 11 11 333333 222222 11 1 1 22 11 33333 1 222222222222 1 11 11 1 22222 1 22 11 1 1111111111111111111111111111111 1111111 11 1 1 1 111 11 2222 1 1 2 1 3333 22 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2222 22222222222222222222 111111111 444444444444444 1 111 222 44444444444 111 222 11 1 1 1 1 1 1 11 1 1 1 4444 222222 2 11 1 1 1 1 11 1 1 11 111 22222222222 11 1111 111 222222 22222222222222 1111111111 33333333333 11 11 1 11 11 11111 11111111 3333 3333333333333333333333333333333333333333333 22 11 11 333 111111 11 333333333333333333 11111 1111 1111 22 11 333333333333333 22222 22 222 1111111111 333333333 2222222222 1 111 111111 222 1111 1 111 1111 111 222222222 11111111 11111 11111 11111 22222 11111 1111 777777777777777777777777777777777 11 1 11 2222 111 111 11111111111 444444
lowQualScore : 333 8 8 7 6 666666666 7 2 6 6 6 6 00000 9999999999999999999999 8888888 1 6 6 6 333 33333333 888888888888888 7777 333333 0 11 8 777 8888 444 0 0000000000000000 00000 8 8 444 22222222 00000000000000000000000000000000000 1 0 1 3 333 7 6 6 0 3333 6 11 3 888888888 222 0 9 2 5 2 7 7 2 3 0 2 0000 3 8 0 00000000000 11 0 8 8 444 555555 8 11 77 8 444 00000 777 33 666666 777 5 3 2222222222222222222 0 0 0 0 1 7 3 88 0 88 888888 7 666666 555 0 8 8 11 77 0 7 2 55 33 1 77777 6 3 1 3 333333333333 0 33 33 0 88888 0 33 33 0 8888888888888888888888888888888 1 2 1111111 3 22 3 0 0 3 0 777 1 2 33 0000 0 88 2 3 99 3 6 3 6 6 0 5 0 0 5 4 66 0 99 4 9999 4 4 1111 55 4 4 4 4 4 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 55 3 3 3333 3 333 3 44 3 44 9999 3 3 6 3 3 99999 3 77777777777777777777 999999 333333333 99 777 4 4 555555555555555 1 8 4 66 66 66 5 77 8 8 999 0 6 444 888 88 66666666666 8 8 0 5 8 6 6 99 0 111 99 77 5 777 3 6 6 99 6 11 3 0 0 0 0 0 9 33 3 3 3 7 0000 555555 6 1 6 8888 0 7 88 7 5 1 1 0 3 3 3 33 0 0 6 6 88 222 6 6 11111111111 55 5 77 5 5 2222 3 000 5 111111 5 22222222222222 9999999999 5 55555555555 55 5 5 77 1 5 5 33 77 5 9 5 5 11 4 4 44 00000 777 777 5 44444444 3 2 2 777 2 4444 555 77777 7777777777777777777777777777777777777777777 2 0 66 66 88 22 99 888 3 44 4 2 1 3 555 44 55 3 3 6 00 7 666 3 1 444 55 777 4 4 444444 3 5 44 666666666666666666 888 77777 2222 5 0 0000 66 5 77 5 0 00 5 77 5 77 2 88 8 6 0 666666666666666 8 3 8 99 888 99999 6 00 99 777 4444444444 5 555555555 1 99 9999999999 3 5 5 555 999999 4 9999 4 4 5 111 5 444 1 2 66 0000 5 5 0 5 333 2222 5 5 5 111 6 555555555 8 0 1 5 5 888 22222222 6 6 55 33333 7 99999 1 1 88888 99 55555 6 99 55555 4444 555555555555555555555555555555555 3 99 77 0 3 0 8 8 11 4444 5 000 666 66666666666 1 333333 6 8 8
lowQualScore : ... . . . . ......... . . . . . . ..... ...................... ....... . . . . ... ........ ............... .... ...... . .. . ... .... ... . ................ ..... . . ... ........ ................................... . . . . ... . . . . .... . .. . ......... ... . . . . . . . . . . . .... . . . ........... .. . . . ... ...... . .. .. . ... ..... ... .. ...... ... . . ................... . . . . . . . .. . .. ...... . ...... ... . . . .. .. . . . .. .. . ..... . . . . ............ . .. .. . ..... . .. .. . ............................... . . ....... . .. . . . . . ... . . .. .... . .. . . .. . . . . . . . . . . . .. . .. . .... . . .... .. . . . . . ............................................................................. .. . . .... . ... . .. . .. .... . . . . . ..... . .................... ...... ......... .. ... . . ............... . . . .. .. .. . .. . . ... . . ... ... .. ........... . . . . . . . .. . ... .. .. . ... . . . .. . .. . . . . . . . .. . . . . .... ...... . . . .... . . .. . . . . . . . . .. . . . . .. ... . . ........... .. . .. . . .... . ... . ...... . .............. .......... . ........... .. . . .. . . . .. .. . . . . .. . . .. ..... ... ... . ........ . . . ... . .... ... ..... ........................................... . . .. .. .. .. .. ... . .. . . . . ... .. .. . . . .. . ... . . ... .. ... . . ...... . . .. .................. ... ..... .... . . .... .. . .. . . .. . .. . .. . .. . . . ............... . . . .. ... ..... . .. .. ... .......... . ......... . .. .......... . . . ... ...... . .... . . . ... . ... . . .. .... . . . . ... .... . . . ... . ......... . . . . . ... ........ . . .. ..... . ..... . . ..... .. ..... . .. ..... .... ................................. . .. .. . . . . . .. .... . ... ... ........... . ...... . . .
lowQualScore : 000 0 0 8 7 333333333 3 5 7 7 7 7 00000 7777777777777777777777 3333333 0 7 7 7 888 33333333 444444444444444 0000 888888 8 00 0 000 6666 000 8 2222222222222222 00000 0 0 000 22222222 22222222222222222222222222222222222 4 8 0 2 333 3 7 7 6 2222 4 00 2 000000000 555 0 2 5 0 0 3 3 5 2 0 5 8888 2 8 0 22222222222 22 8 0 0 000 000000 0 00 00 0 000 00000 000 22 222222 555 5 2 0000000000000000000 0 0 0 0 0 3 3 33 7 33 333333 3 222222 222 8 0 0 00 00 0 3 0 33 33 0 33333 7 3 2 2 888888888888 0 88 88 0 22222 0 22 88 0 0000000000000000000000000000000 2 5 8888888 0 55 2 0 0 2 0 555 0 5 22 5555 0 22 5 2 22 3 7 3 7 7 7 0 8 4 0 4 11 1 33 4 4444 4 4 8888 22 4 0 0 0 0 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 00 6 6 1111 3 777 3 66 3 22 6666 1 1 2 3 3 44444 3 11111111111111111111 666666 333333333 55 000 0 0 666666666666666 1 9 4 11 11 99 0 99 2 0 222 8 0 000 666 88 00000000000 0 0 8 0 0 7 7 22 7 777 22 99 7 999 7 7 7 22 7 88 2 0 0 0 0 0 0 88 3 3 3 3 0000 777777 7 0 7 3333 7 3 33 3 5 0 0 7 3 3 3 22 0 0 5 7 55 333 7 7 33333333333 88 2 99 7 7 1111 0 000 7 777777 7 44444444444444 6666666666 7 11111111111 77 7 7 99 6 0 0 66 99 0 0 7 7 00 0 0 11 00000 000 555 7 33333333 6 9 9 777 9 1111 000 11111 1111111111111111111111111111111111111111111 9 4 11 88 00 00 66 555 1 22 0 9 5 1 444 33 00 3 3 7 00 3 444 0 0 555 55 000 0 0 444444 4 0 44 999999999999999999 888 22222 2222 0 1 6666 44 7 99 7 1 77 7 00 7 99 5 88 0 4 8 888888888888888 0 8 0 22 333 77777 7 22 22 555 0000000000 7 444444444 0 22 2222222222 3 7 7 777 888888 4 6666 4 4 0 111 0 555 0 0 44 6666 0 0 0 0 888 1111 7 7 7 777 7 000000000 0 8 4 7 7 666 22222222 7 7 00 00000 2 33333 0 7 33333 22 88888 7 22 22222 2222 222222222222222222222222222222222 2 00 88 8 6 8 0 0 88 3333 7 000 777 22222222222 0 000000 7 0 0
consensus : NACAATAAGTTAAT-AAGTAACAAACC-ATTCAATA-CA---T----TTGTAAGTA-AGTCT-TTAA-TA-TAT--TA-TTGCGC---ACC----------------TACCG-------TTGAGTACAAAT-ATTGACTG-AA-ATT-ATCAA--------CAGAA------------G--TCCAT----AC---A--ACATTG-ACATT-TAC-TAAA-C--GA---AAATACA---T-T--A--A-ACAAT-----A-TT-CTGTACAG---AAAACG----A--TTGATTGTTCTATGTCA-ACTAAACCC-TA------A----ATTTATGGGT-ATTTCTTCTCCTAACTATTGACAGAAATTA---ATTCTAG-CTTCTGTG-GCTGTCTGTATTTTTTGACATGGTTCCTG--TCTAAGTGAAC--T--TTGA-ATAA-GACTGTTAACGCCCCGT-GTAGGTCCCCCACACAACATGTTGACA-GATCCCCAGTA---TCTGCCAGGACAGGT-CTCT-A--GCNTC--AAAGNTACGTATCT-CCCAT-CATC---ATAGA---GCAA-GT--AGGGTGTGTGTGAT-TG---TC-----AGTCG-CCTG-TAGATAT-----TTG---TGACCTGTTACCTAGTC-GCT---GT--A-CGA---CA-GGG-AC-AGATA-ACANATGTGCAC-GGT--CGCAA--AGGG------AGATATAATATAAA-N-TNTNTATCCCGTTCATTTC-ACTGACTTCTTGT-T--CCAACNTTAA-TTCTTTCAACTATAGC-GTAAACTCTTTATACGAANATAGT-AGCNCTCTTGCCCAACC-TTCCTAAACTTAG----TA-A-CA-TAGACTGA-C--CACCTA--CCG-C-T---CACTGTA-TCTCTG-TCTGT--C-TAC--TACT-A-------CCA--NGAC---A---TGATATGGGGCT-TGNGAGAGTCCTCTG-CTTCA-TTCTATC-TGTGACAGTTTTAGCGCT-GT---TTGATATCTNCCGGT-AATCGTAC-G-GTAT-AATCGCCTAAATATAAACCCATCATATACATAACCTAGACTTTAGAACTA-AACCTA-CATGTGA-TTATTGA-CCTA-TCAATGGCGTATCTCTTTTTCT-TTGACACAAACAAACACTGTGCTTTCAA-TGACA-TGGAA--GTGGATAATA-AG----CAC-ATTTATCAACGCATCATGAAATATA-ACA---ATTATGACAGGT-TGAGA-ATAACTGATCTATTACATT-TAAATGCA-TCA-TGTTTGAAAGGAAATC-TGATCC--CTNTGCGAG------ACT-T-TA--AAC--GC-G--ATGTT--T-----TTCC----C-CG-AT--------AAA--AA-GC-AATATCTAT-TATCTA-TTTCTG-A-C-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A-TT-AC-AAAGTA-TGG-ATT--G-GAGAGG-G--------------------CCGGGATC------AGAATCTC---------TCTGAGAGTGG--GACTA--T-GTAACAGGAA-GG--------------ACAACGCCCA-TTTTGTAAAATGTTTCT-AA--C--TTT--TGA-T--ACAGGGACATCTGTTGC-GCCCC-G-ACAA-TTTTC---CTGCAAACATATG-TTGTTCT-CCGG-----------AATAAA-GAAATT-TGGAAGGGTAACC-GGTAT-ATA-CACA--CCGCAT---CAAGGATTT--GAAA--C-AAAACCA-A-CACATGTTGGAGC-AATGTTG-A--TGGT-ATCCATGG-AGTTGAA-GAGCTTTCT-TGA-ATTCT-C-CAAAATAATACTTG--TTTTCATAAAAT-ATGAACAC-AGTAA-ATTCGTC---ACAGAAA--ACT-TCCTTCAAAATNATTTTCA-TGATTCCGTAACGGAGAAAACTGG--CAATGGTTCATAGAGTACACTANCTTTGNCCCGCTCG-TG-AAAA-GAAATT-CTCCA-CT-CCAAAGTCC-GAGTTTAATTCATT--TGT-CTGT-TTGTTT-GC-GA-T-AGGAA--CGAG--AT-GAA-ATCCT----TCGT---CAAT-AATTG----A-TTG-TAGG-T--ACGA--CTACGCG--A-------T-GGCCA---------ATGCGC--GAGT-CA-AACATC--TATCAAACCCAGGG--AAGGG--CTGGTAAATGG-GCA-GTGACGGGAA--TGGAAACA-C-AGCGGC-----GATA---TCAGT-TTCTATGAGAT--AG-ATAAGTGTAG-TTGT-GACAN--GGACC-GTGCAG-GGTTCTC---ACC-----TTC-GCT----------GGCTT--------G--GAT-C-A-A-T--CC-ACTCAGTAA--TTT-GATGGNNT--CTCATCCGG---A-G--TAAT-GAACTTGA-AAT---GTAAT-ACAG-TATTGTTT-CTC-TCC--AATA-GT---GGAGNCAC-T--GAC---AA-T-TC--G-GTNATT-TGACCGGT------------------GT---GAG--TAAGT-T--GTA-ATCTGGCGAA----TCC-CGG-G--GG-AGTATCAGAC-GGTC-TCCATAAT-AGA--TAAGGTGTATGT-CTGG-GTGGATGAATTG---GANA------CGTG-GACTG-AGACATCT--CACA-T-ATCAC-C-CTT-TATGGAT--CA---GG---TAG--C-CAACGCA-TG-----T---AATCCAT--GT--T------CAG-A-TGAT-TT---AAACCT----G-AATC-CCTCCCTANG--ACT-A-CCACTCAGCAT-A-T-TC-TCACTCCNCTATATAACT-CTGAAGGTTTC----CGTATCATC-T-CC-C-C---GTGTCCCCCAG----ATCCCTTCTG-AAGGTCACTTCTGTC-GG-TGTCCC---TATCTCAC-GACAC-----A---CACCCACATA-CAGGGCTTCTGACACACGGGGAATGTGATCCATCC-TGTAACGA-TTC-G-TTAACGTTAG-TTGATCGAC-ACAATA-CAAATTTCT-ATT-AATACGAG-ACTACACATTAT----ACAGC--GTTCTGAAAT-AAT-TC--GTGAAA--AGTTTG----TATAAAAA-G----------TGTAAT-------------TCTTACAAAATCCACTCTACCTGAGAATTT--CAAAGTTCTATTTATAGACAATCGGAAAATAC-CCGGTT-AAGCT-CCGC--GCTACTTTTCTT-TTGCA---TGTACTCTGTTG-AC-CTTAA-TATGGAATACCAGT--TTTA-TTTGATTCG-TT-ATCGA
Reference ( family-5170 ) : NACAATAAGTTAAT-AAGTAACAAACC-ATTCAATA-CA---T----TTGTAAGTA-AGTCT-TTAA-TA-TAT--TA-TTGCGC---ACC----------------TACCG-------TTGAGTACAAAT-ATTGACTG-AA-ATT-ATCAA--------CAGAA------------G--TCCAT----AC---A--ACATTG-ACATT-TAC-TAAA-C--GA---AAATACA---T-T--A--A-ACAAT-----A-TT-CTGTACAG---AAAACG-------TTGATTGTTCTATGTCA-ACTAAACCC-TA------A----ATTTACGGGT-ATTTCTTCTCCTAACTATTGACAGAAATTA---ATTCTAG-CTTCTGTG-GCTGTCTGTATTTTTTGATATGGTTCCTG--TCTAAGTGAAC--T--TTGA-ATAA-GACTGTTAACGCCCCGTGGTAGGTCCCCCACACAACATGTTGACA-GATCCCCAGTA---TCTGCCAGGACAGGT-CTCT-A--NCNTC--AAAGNTACGTATCT-CCCAT-CATC---ATAGA---GC-A-GT--AGGGTGTGTGTGAT-TG---TC-----AGTCG-CCTG-TAGATAT-----TTG---TGACCTGTTACCTAGTC-ACT---GT--A-CGA---CA-GGG-AC-AGATA-ACANATGTGCAC-GGT--CGCAA--AGGG------AGATATAATATAAA-C-TNTNTATCCCGTTCATTTC-ACTGACTTCTTGT-T--CCAACNTTAA-TTCTTTCAACTATAGC-GTAAACTCTTTATACGAANATAGT-AGCNCTCTTGCCCAACC-TTCCTAAACTTAG----TA-A-CA-TAGACTGA-C--CACCTA--CCG-C-T---CACTGTA-TCTCTG-TCTGT--C-TAC--TACC-A-------CCA--CGN----A---TGATATGGGGCT-TGGGAGAGTCCTCTG-CTTCA-TTCTATC-TGTGACAGTTTTAGCGCT-GT---TTGATATCTNCCGGT-AATCGTAC-G-GTAT-AATCGCCTAAATATAAACCCATCATATACATAACCTAGACTTTAGAACTA-AACCTA-CATGTGA-TTATTGA-CCTA-TCAATGGCGTATCTCTTTTTCT-TTGACACAAACAAACACTGTGCTTTCAA-TGACA-TGGAA--GTGGATAATA-AG----CAC-ATTTATCAACGCATCATGAAATATA-ACA--CATTATGACAGGTGTGAGA-ATAACTGATCTATTACATT-TAAATGCA-TCA-TGTTTGAAAGGAAATC-TGATCC--CTGTGCGAG------ACT-T-TA--AAC--GC-A--ATGTT--T-----TTCC----C-CG-AT--------AAA--AA-GC-AATATCTAT-TATCTA-TTTCTG-A-C-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A-TT-AC-AAAGTA-TGG-ATC--G-GAGAGG-G--------------------CCGGGATC------AGAATCTC---------TCTGAGAGTGG--GACTA--T-GTAACAGGAA-GG--------------ACAACGCCCA-TTTTGTAAAATGTTTCT-AA--C--TTT--TGA-T--ACAGGGACATCTGTTGC-GCCCC-G-ACAA-TTTTC---CTGCAAACATATG-TTGTTCT-CCGG-----------AATAAA-GAAATT-TGGAAGGGTAACC-GGTAT-ATA-CACA--CCGCAT---CAAGGATTT--GAAA--C-AAAACCA-A-CACATGTTGGAGC-AATGTTG-A--TGGT-ATCCATGG-AGTTGAA-GAGCTTTCT-TGA-ATTCT-C-CAAAATAATACTTG--TTTTCATAAAAT-ATGAACAC-AGTAA-ATTCGTC--GACAGAAA--ACT-TCCTTCAAAATNATTTTCA-TGATTCCGTAACGGAGAAAACTGG--CAATGGTTCATAGAGTACACTANCTTTGNCCCGCTCG-TG-AAAA-GAAATT-CTCCA-CT-CCAAAGTCC-GAGTTTAATTCATT--TGT-CTGT-TTGTTT-GC-GA-T-AGGAA--CGAG--AT-GAA-ATCCT----TCGT---CAAT-AATTG----A-TTG-TAGG-T--ACGA--CTACGCG--A-------T-GGCCA---------ATGCGC--GAGT-CA-AACATC--TATCAAACCCAGGG--AAGGG--CTGGTAAATGG-GCA-GTGACGGGAA--TGGAAACA-C-AGCGGC-----GATA---TCAGT-TTCTATGAGAT--AG-ATAAGTGTAG-TTGT-GACAN--GGACC-GTGCAG-GGTTCTC---ACC-----TTC-GCT----------GGCTT--------G--GAT-C-A-A-C--CC-ACTCAGTAA--TTTGGATGGNNT--CTCATCCGG---A-G--TANT-GAACTTGA-AAT---GTAAT-ACAG-TATTGTTT-CTC-TCC--AATA-GT---GGAGNCACGT--GAC---AA-T-TC--G-GTCATT-TGACCGGT------------------GT---GAG--TAAGT-T--GTA-ATCTGGCGAA----TCC-CGG-G--GG-AGTATCAGAC-GGTC-TCCATAAT-AGA--TAAGGTGTATGT-CTGG-GTGGATGAATTG---GANA------CGTG-GACTG-AGACATCT--CACA-T-ATCAC-C-CTT-TATGGAT--CA---GG---TAG--C-CAACGCA-TG-----T---AANCCAT--GT--T------CAG-A-TGAT-TT---AAACCT----G-AATC-CCTCCCTANG--ACT-A-CCACTCAGCAT-A-T-TC-TCNNTCCNCTATATAACT-CTGAAGGTTTC----CGTATCATC-T-CC-C-C---GTGTCCCCCAG----ATCCCTTCTG-AAGGTCACTTCTGTC-GG-TGTCCC---TATCTCAC-GACAC-----A---CACCCACATA-CAGGGCTTCTGACACACGGGGAATGTGATCCATCC-TGTAACGA-TTC-G-TTAACGTTAG-TTGATCGAC-ACAATA-CAAATTTCT-ATT-AATACGAG-ACTACACATTAT----ACAGC--GTTCTGAAAT-AAT-TC--GTGAAA--AGTTTG----TATAAAAA-G----------TGTAAT-------------TCTTACAAAATCCACTCTACCTGAGAATTT--CAAAATTCTATTTATAGACAATCGGAAAATAC-CCGGTT-AAGCT-CCGC--GCTACTTTTCTT-TTGCA---TGTACTCTGTTG-AC-CTTAA-TATGGAATACCAGT--TTTA-TTTGATTCG-TT-ATCGA
gi|1 : ACAATGGGTTAAT-AAGTAACAAACCTATTCATTA-C---------TTGTACGTATAGTCT-TTAACTA-TAT--TAATTGCGC----CC----------------TATCGC------TTGAGTACAAATTATTGACTG-AACATT-ATCTA--------CATAA------------G--TCCAT----ACG--A--ATATTGTACATT-TAC-TAAA-CCTGA---AAATACA---T-T--A--AGACAAT-----AGTC-CTGCACAG---AAACGG-------TTGATTGTTCTAT-TCA-ACTAAACCCATATCCGCTA----TTTTATGGAT-ATTCCCTCTTCTA-CTATTGACAGAAGTTA---ATTCTAGGCTTCTGTGTGCTGTCTGTATTTGTTCTCCTGGTTCCTG--TCTAAGTGAAC--TCTTTGA-ATAACGACTGGTAACGCCCCGTTGTAAGTCCCCCACACAACATGTTGACATGACCCCCAGTAATTTCTGCCAGGACAGGT-CTCT-A--ACTTCTAAAATCTACGTATCT-CCCAT-CATC---ATAGA----C-ATGT--AGGGTGTGTGTAAT-TG---TC-----AGTTG-CCTG-TAGATAT-----TTG---TGACTGG--ACCT---T-ACT---GT--A-TGA---CA-GGG-AC-AGATA-ACAGTTGTGCAC-GGT--CACAA--AGGG------AGATATAATATAAA-AATATCTATCCCGTTCATTTC-ACTGACTTCTTGT-T--CCAACTTAAA-TTCTTTCAATTATATT-GTAAACTCTTTATTCGAACATAGT--GTCCTCTTGCCCAACC-TTCCTAAACTT-G----TA-A-CA-GAGACTGA-CTCCACCTGAGCCA-CGT---CACTGTA-TCTCTGGTCTGTTCC-TACGATACCGA-------CCA--AAT----AACATGATATGGGGCT-TGGGAGAGTCCTCT--CTTCC-TTCTATC-TGTGACAGTTAAAGCGCT-GT---TTGATATCTTCCGGTTAATCGTAC-G-GTAT-ATCCGCCTAAA-ATAAAC--ATCATATACATAACCTAGACTTTAGAACTAGAACCTA-CATGTGA-TTTTTGAACCTACTCAACGGTGTATTTATATTTCTATGGACACAAACAAATATCA-GCTTTCAAATTACAATGGAAAGGTGAATTATA-AG----TA--ATTTAACAACGCTTGATGAAA-ATAGACAACCATTATGACTGGTGTGAGATATAATTGATCTATTGCATTCTAAATGCA-TCAATATTTTGAAAGTAACC-T-ATCC--CTGTGCGAG------ACTGC-TA--AAC--GC-A--ATGTT--T-----TTCC----C-TG-AT--------ATA--AATGC-AATATCTATCTATCTACTTTCTG-AACGTTGAGGT--A-CTTTCC-CCT--CTGAAC----ACTT-ACCAAAGAAATGG-ATT--GCGAGAAG-G--------------------GCGGAATC------AGAATTT----------TCTGAGAGTGGC-GACT---T-GTA-CAGGAA-GG--------------AGAATCCCCAGTTTCGTAAAATGTTTCT-AA--C--TCT--TGT-TTAACAGGGACATCTGTTGC-GCTCC-GTACAG-CTTTC---CTGCAAACTTATGGTTGTTCT-CCGG-----------AATAAAAGAAATT-TGGAAAGGTAACC-AGTAT-ATATCACA--CCGCAT---CAAGGATTT--GAAA--CCAAAACCA-AATACATGTTA-AGC-AATGTTG-A--TGGT-A-CCATGG--GTTGAATGAGCTTTCTATGA-ATTCT-CACAAAATAATACTTGGTTTTTCATAAAATGATTAACACGAGTAATATTCATCTGGACAGGAA--ATTGTCCTTCAAAAAGATTTTCAATGATTCCGTAACAGAGAAA-CTGG--CAATGGT-CATAGAGT-CACTAGCTTTGGCCCGCTCG-TG-AAAAAGAAATTTCTCCATCTGCCAAAATCC-GAATTTAATTCATT--TGT-CTGT-TTGTGT-GCTAA-TCAGGAA--CAAG--AT-GAA-ATCTC----TCTT---CAAT-AATTG------TTG-TAGG-T--ACGG--CTACGCGGAA-------T-GGCCA---------ATGTGC--GAGT-CA-GAAATC--TCTCAAACCCAGGG--AAGGGGGCTGGTAAATGGTGCA-GTGACGGGAA--TGGAAACA-CTAGCGGC-----GACA---TCA-T-TTC-ACGAGAC--AG-ATAAGTGTAG-TTGT-GAAAG--GGACC-GTGCAGCGGTTCCTGCAACC-----TTC-TCT----------AGCCT--------GTGAAT-C-A---C--TC-ACTCAGTAGC-TTTGAATGGTCTT-CTCATC--G---A-G--TAAT-GAACTTGA-AAT---GTAAT-GCAA-TACTGTTT-CTC-TCC--AATA-GT---GGAGTCGCGC--AAC---AA-T-TG--G-GTTATA-GGACCGGT------------------GT---GAG--GAAGT-T--GTA-ATCTGGCGAA----TCC-CGG-G--GG-AGTAGCAGA--GATC-TCCATAAT-AGA--TAAGGTGTATCT-CT-G-GTGGATGAAT------ATA------CGTG-GATGA-AGACATCT--CACA-T-ATCACAC-CTT-TATGGAG--CAG--GG---TAC--C-TAATGCA-TGT----T---AATCCAT--GT--T------CAGTA-GAAT-TT---AAACCT----GAAATC-CCTCCCTACG--ACT-AGCCACTCAGC-T-AGT-TC-TGTATCCTCTATATAACTCCTGAAGGTTTC----CGTATCATC-T-CC-C-C---GTGTCCACGAG----ATCCCTTCTG-AAGGCAACTTCTGTC-GGTTGTCCC---TA-CTCAC-GACAC-----AAATCACCCACATAGCGGGGCTTCTGACACACGGGGAA-GTGATCCATCC-TGTAACGAGTTCAG-TTAA-ATTAGTTTGATCGACTCCAATA-CGAATTTCTAATTGAATACGAGCACTACACATTAC----ACAGC--ATTCTGAAATGAAT-TC--GTGAAA--AGTTTG----TTTAAAAATG----------TATAAT-------------TCTTACAAAATCTACACTACCTGAGAATTTTACAAAGTTCTATTTAT-GACAATCGGAAAATACTCCGGTTAAAGCTGCCGCTAGCTATTTCTCTG-TTGCA---TGCG-------------------ATGGAATAC--G----TTA-TTTGATTCGTTT-ATCAA
gi|10 : c-TAAATACAATCA-TGTTTGATAGGAAATCATGATGC--TTGTA----------------TC--AAC--AC-----TGTC--T-----ATTT----C-AGTAA--------AAA--AA-GCCAATATCTAT--ATCTA-TTTCTG-A-C-TTGAGGT--AAACTTTC-CCTGTCTG--CC---A-TTTAC-AAAGTA-TGGGATT--G-GAGAGG-G--------------------CCGGGATC------GAGATCTC---------TCTGGAAGTGG--GGC-A--T-GTAGCAGAAA-GC--------------AC----CCCAGTTTTGTACAATGTTTCT-AAATC--TTT--TGA-T--ACA-GTAGATGTGTTGTGGCCCCGG-ACAATTTTTC---CTGCAGAAATGTG--TGTTCT-CCGGA----------AATAAA--AAATT-TGGGAGCTTAACCAAGTATGATA-CACA--CTGCATTCACAAGGATTT--GAAAGTC-AAAACC--A-CACGTGTTGGAGCAAATGTTG-ACGCGGTAATCCATGGTAATTG-A-GAGCTTTCT-TGAGATTCCGC-CAAAATAATA-TTG--TTTTCCTGAAAT-ATGAACAC-AGTAA-A-TCGT-----CAGAAATCACT-TCCTTCAAAATAATTTTCACTGA----GTAACGAAGAAAACTGG--CAATGGATCagctg
gi|11 : AA--TGGAAACA-C-AACG-C-----GATG---TCATA-TTC-AT----T--AG-ATAGACG-AG-T-----ATA---GAACT-TTGTGA-------C---A-------------T----------AGCAT--------G--GA--A-A-A-CGTCC-ACTAAATAA--TT--GATGGACT--CTCATTCGG---A-A--TA--------------T---GTAGT--CGG-TATTGTTT-CTC-TCC--AATA-GT---G-AGTC-CGT--GAC---AA-T-TT--G-GTTATA-TGAC-GGT------------------GT---GAG--TAGGT----GTA-ATCTGGCGAA----TCT-CGG-G--GG-AGTGTCAGA--GGTC-TTCAT-AT-AGA--TAA-GTGTATGT-CTGT-GTGGATGAATTGATAGA-A------CGTG-GACTG-AGACATCT--CACA-T-CTCAC-C---T-TAT-GAT--CA---GT---TTG--C-CAAAACA-TG-----A---AATCCAT--G---T------CAG-A-TGAT-TT---AA-------------------------------A-CCACTCAGCAT-ATT-TC-TCACTCCTCTATATAAGT-CTGAAGGTTTC----TGTATCATC-C-CC-TAC---GTGT----CAGAAATATCCCTTCTG-AAGGTCACTTCTGTC-GG-TGTCCC---TATCTCAC-GACAC-----A---CCCCCACATA-CAGGACTTCTGACGCACGTGGAATGtctcgtcaacaaatgcgtaata
gi|12 : TTTGTTCCGCTTG-TG-AAAA-GAAATT-CTCCC-TT-CTATAATCTTGAGTTC---TTATT--TGTGCTGTACTGTTTTGC-GA-T-AGAAAGAC-AG--ATTGAATATCCT----TCCT---CGAT-AATTGTGAAG-TCG-AGGA-TTGATGC--CAACGCG--AAGAGGAAT-GATCAGAATCGGCCATGTGTTGAAGTACATAAGATCGCTTTCAAATCAAGGGG-AAGTG--CTGGTAA-TGG-GCA-GTGACGGGAA--TGAAAACA-C-AGC-GC-----AATG---TCGAA-ATCT---AAATTCAG-AAAAGTGTAG-CTGT-GACAA--GGACC-GTGCA--TGTTCTC---ATT-----TTC-GTT----------GGA-T--------G--GAC-T-A-AGT--CC-ATTC--CAG--TTTTGATGAAAT--CTCAACAGG---A-G--CATT-GAACTTGA-AAT---AT-AT-ACAG-CATTGTTT-CTC-TCC--AATA-GT---GAGGACA--T--GAC---AA-T-TT--G-G
gi|13 : TACGTA-CT-CCCAT-CATC---GTAGA---GC-A-GT--AGGGTTTGT-TGATCTG---CC-----AGTT---CTG-TAGATACATGTATTG---TGACTTGTTACCTAGTC---T---GT--AGTGA---CATAGG-AT-AGATA-GCATATG--CAC-GGT--CACAA--AGGG------AGATA-AACATAAAAC-TG-ATATTCCGTTCATTCC-ACTCACTGCTTGT-T--CCAACATTAA-TTCTT-CAA-TACAG--GTAATCTTTTCACA-GAAAAGAGT-A--TCTCTTGCCCAAGCATTCCTAAACTTAG----TCTA-CA-TAGACTGA-C--CACCCA--CCGTC-G---CACTTTA-TCTTTG-TCTAT--C-TAC-------A-------CTA--TGGC---A---TGATATGGG-------------TCTCTG-CTTCA-TTCTATC-TGTGACAG--TTAGGGCT-GT---GTGATATTTACCGGT--ATCGTACAA-GTAT-AA-CG-CTAAATATAAATCcgat
gi|14 : -TTATTGA-CCTA-TCATTATTGAATCTCTTTTTGT-TTGGCACAGACAATCTTTGTGCTTTTAA-TGCCA-TGGAC--GTTGATAATA-A-----CAC-ATTTATCAACGCATCATGAAATATA-ACA----TTATGGCAGGT-TGATA-ATAACTGATCTATGACATT-TAAATGCA-TCA-TGTTTGAAAGGAAATC-TGA--------TACGAGAATTGTACT-T-CT--AAC--ACTG--ATG-C--T-----TTCG----C-CA-A---------AAC--AA-GC-AATATCTA--TATCTA-TTTCTG---C-TT-AGGT--AATTTTCC----GTCTG--C----A-TT-AC-AAAGTG-TGG-ATT--A-GAGA-G-G--------------------CCGGG-TC------AGAATCTC---------TCTGAGAGTGG--GACTG--C-GTAACAGGAA-AG---------------CAACGCCCA-TTTTGTCAAATGTTTCTGAG--C--TTT--TGA-T--ACAattgccaaaacacaaa
gi|15 : TTTTCT-TTGACACAGACAAACACTGAGTTTTTAA-TGACA-TGGAA--GTGAATA-TA-AG----CAC-ATTTATCAAAGCATCATGAAATATA-ACA----TTATGACAGGTG-GAGA-ATAACTGATCTATTACATT-TATACGCA-TCA-TGTTTGAAAGGAAATC-TGAACT--CTTTATGAA------AC---------AT--GT----ATCTT--TTGTGCTTTC----C-CG-AT--------AAA--AT-GC-AATATCTA--TATCTA-CTTCTG-A-C-TTGAGGT--AACTTTCC-TCTGTCTG--C----A-TT-AC-AAAGTA-TGG-ATT--G-GAGAAG-G--------------------CCGGGATC------AGAATCTC---------TCTGAGAGTGG--GGCTA--T-ATAGCAAAAA-GG---------------CAATGCCCA-TTTTGTAAAACTTTTCC-AA--C--TTT--TGA-a
gi|16 : cAGTCC-GAGTTTAATTCATT--TGA-CTGT-TTGTGT-GC-AA-T-AGGGA--CGAG--AT-GAA-ATCCT----TCGT---CAAT-GATTG----T-TTG-TA-G-T--AC-A--CTTTGCG--A-------T-GGCC----------ATGCGC--GAGT-CA-AACATC--TATC-AACCCAGGG--AAGGG--CTGGT-AATGG-GCA-GTGACGGGAA--TGGAAACA-C-AAC-GC-----TAAA---TCATT-TTCTATGGAGT---G-ATAAGTGTAG-TTGT-GACAT--GGACC-GTGCA--GGTTTTC---ATT-----TTC-TCT-----------GTTT--------G--GAT-C-ACG-T--CC-ACTCATTAA--TT--GATATTGT--CTCATTCGG---A-G--TAAT-GAACTCGA-AAT---GT-AT-ACAG-TACTGTTT-CTC-TCC--AATA-GT----GAGTC-CAT--GAC---AA-T-
gi|17 : TGTTGCT-----TTCA----C-T--AT--------AAA--AA-GC-AATATCGAT--ATAAA-TTTCTT-C-C-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A-AT-AT-AAgccgat
gi|17 : tactaatac-ATA-CACA--CTGCAT---CAAGGATTT--GAAG--C-AAAACCA---CACATGTTGAAGC-AATGTTG-A--TGGT-ATCCATGG-AGTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaatacacactgcatcaaggatttgaagcaaaaccacacatgttgaagcaatgttgatggtatccatggagtt
gi|18 : tactaatactgttgctttcactataaaaagcaatatcgatataaatttcttccttgaggtaactttcccctgtctgcaatataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaAATAAGTCG-T-AAGTAACAAACC-ATTCAATA-CAATGTACAGTTGTAAGTA-ATTCT-TTAA-TA-TAT--TA-TCGCACACAACCATTGATTTATTATAAATATTGACTGAAATCGAATACAAAT-ATTGACTG-GA-AT--ATCAA--------CAGAATCAGAAAATGAAA--TCCAT----AC-------CATTTCACATT-TA--TGAA-C--GAGATAAATGTA---A-T--ACAA-ACAAT-----A-AT-CTGTACAG---AAAACAATTAACTTTGATTTTTCTATGTCG--TTAAA-----G------G----GTTTAC------TTTCTTCTCCTAACTATTGACAGAAAT-A---ATTCTAG-TTTCTATG-GCTATCTGTATTTTGTGACATGGTTCTTG--TCTAA
gi|19 : AGAACTA-AACCTAACATGTGAATTATTAT-CCTA-TCAATGGCGTATCTCTTTTTGT-ATGACACAAACAAATTATGTGCTTTTAG-TGAGA-TGAAA--GTCGACAATAGAG----CAC---TTACCAGCCAATAATGAAATCTA-ACA-------TGACAGGT-TGAGA-TTAATCGATCTATTGCGTT-TAAACGCT-TCA-TGTTACAAAGGAAATT-TGAAAC--CTCTG-GA-------ACT-G-TA--CAT--AT-G--GTACT--T-----T---------CA-AT--------AAAGAAA-GC-AATATCTAT--ATCTA-TCTCTG-A-C-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A-TT-AC-AAAGAG-TGG-ATC--A-GAGAGG-G--------------------CCGGGATT------AGAATCTC---------
gi|2 : TAGCTAC-T-TCTA-TTT-TGCA-C-TTGAGGCCAAACTGTCCTCCTGTTTA--TGACAA-TT-GCTAAAGTA-TGG-ATTTAG-GAGAGGTG--------------------CCGGGATCTGATTGACAATATC---------TCTGAGAATGG--GGCTA--TTGTAACAGGAAAGG--------------GCAACCCCCA-TTTTGTAAATTTTTTCT-AA--C--TTTCTTGA-T--ACAGAGAAATTCGTCCC-GCCCC-G-AC---TTTTC---CTACACACATAT--TTGTTCTGCCAG-----------AATAGA-GAAATT-TGAA--GGTAACC-GGTAT-ATA-CACA--TTGCAT---CAAGGATTT--GAAA--C-AAAACCACA-C-CACGGTGAAGC-AGTGTTGGA--TGGT-ATCCGTGG-AGTTGAA-GAGCTCTCT-TTA-ATTCT-C-CAAAATAATATTTG--TCTTCATAAAAT-ATGAACAC-AGTTA-ATTCGTC---ACAAATA--A-T-TCCTT-AGAATTATTTTCA-TGATTCTGTAACAGAGAAAATTGGGACAATGGTTCATAGAGTACACTACTTTTGCCTCGCTTGGTGTAAAA-GAAAT--CTCCA-TT-CCAA-GTCT-GAGTTT--TCCATTCGTGT-CTGT-TTGTTTTAC-AAAT-AGGAAT-CGAGGAAT-GAA-ACCCG----TCTT---CAATTAATTG----AGCTG-CAT--T--ACAAACTTACGTG--G-------T-GGGCC---------GTGCTC--G--T-CA-AACATC--TATCAA-CCCAAGG--CAGAG--CTGGTAA-TGG-ACA-GTGACGGGAAAGTGGAAATAAC-A-CAGC-----GATA---TCAGTCTTCTTTAA--T--CGTACAAGTGAAGGCTGT-AAACA--GGACC-GTGTAT-T-TTCCC---ACCTTTTTTTC-CCCCCCCCCAAAAAGTTTTTATTTGGG--GATTC-A-T-T--CC-CCTGAGTGA--TT--GATGGATT--CCCTTCCGCC--A-G--CAAT-GAACT-GA-AAT---ATA-T-ACTG-TATTGTTTGCTC-TCT--AATACGT---G
gi|20 : gttaatcaagtccattgtgcaataacaacatttggatgctgagaataagtgcatctattgcatttaaatatcatcatgtttacaagcaaatctgacttgaccaagctcgacatctctacaacttgtcgcattcaacttaaatttaaacattatcaacccataaatCA-TCGAA--GTTGATAA-A-AG----CAC-TTCTATCAACTTATCATCGAATATA-ACA--TATT--GGCGAGT-TGAGA-ATAACTGATCTATTACATT-TAAATGCA-TCA-TGTTTAAAAGGAAATC-TGATC----TA-ACAA-----------T-CA--CACCCGC-A---------C-----TTCC----CATG-ATTTCATTAAAAA--AG-GC-AATATCAAT--GTCAA-TTTCTG-A-C-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A-TT-AC-AAAGTG-TGG-ATC--T-GAGAGG-G--------------------TTGGGATC------AGAATTTC---------CCTCAGAGTGG--GACTT--T-GTAAGAGGAA-GG---------------CAACGCCCA-TTTTGTAAAATGTTTCT-AA--C--TTT--TGA-T--ACAag
gi|21 : -TTATTGA-CCTA-TCAATGGTGAATCTCTTTTTGT-TTGATACCAAAAGACTTTGTGTT---AA-TGACA-TGGAC--GTAGATACTA-AAACAATACTAGTAATCAACTTATCATGGAATATA-ACA----TTATGACAGGT-TGAGA-GTAACTGATCCATTACATT-TAAATGAA-TCA-TGTTTGATAGGAAATC-TGATGCAATTGTCC--C------ACT-TATATTACT--GC-----TGCT--T-----TCGC----C----AT--------AAA--AA-GC-AATATC-AA-TATCTA-TTTCTG-A-C-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A-CT-AC-AAAGTA-TGG-ATT--G-GAGAGG-A--------------------CCGGGGTC------AGAATCTC---------
gi|22 : CAATGAGTTA-T-AAATAACAAACC-ATTCATTA-C----T----TTGTAAGTA-AGTCT-TTA--TA-TAT--TA-TTGTGT----CC----------------TATCG-------TTGAGAACAAAT-ATTGACTG-AA-AT--ATTTA--------CAGAG------------G--TCCAT----AC---A--ATATT--ACATT-TAC--AAA-T--GA---AAAT-TA---T-T--A--A-ACAAC-----A-TT-CTGCACAG---AAAACG-------TCGATTGTTATATGTCA-AC--AACCC-TA------ACCTTATTTATGGGT-ATTT--TCTTCTAACTATTGACA-AAATTA---ATTCTAG-TTTCTGTG-GCTGTCTGTATTTTGTGATATGGTCTCTG--TCTAAGTG-AC--T--CTTG-ATAA-GACTG-TAACGC
gi|23 : AAATTATATATTC-AG-CTTCTGTG-GCTGTCTGTATTTTTTGA-AT-GTGCTTGTTTTTAAGTGAACAAT--TTGATTTAA-GACTGTTAACGCCCTGT-GTA-GTCCCCCAC-C-ATATGTTGACA-AAT-CCCAGTA---TCTGCCA-GACAGGT-CTCT-ATGGCGT---AAAGGTGCGTATCT-CCCAT-CATC---ATAGA---GCAA-GT--AGGGTGTGTAGGGT-TG---TC-----AGT-G-CCTG--AGATAA-----ATG---TGACCTG-TACCTAGTC-GTTAGAGT--G--GATTTTA-GGGTAC-AGATA-ACA
gi|24 : gaGAATGTGATCCATCC-TGTAACGA-TTC-T-TTAACGTTAG-TTGATCGAC-TCAATA-TAAGTTTCT-ATT-AA--------------AT--T----ACAGT--GTTCTG--AT-AAT-TC--GTGAGA--AG-TTG----TATAAAA-------------TGTAA--------------TCTTACAAAATGTACTCTACCTGAGAATTT--CCAAGTTCTATTTATAGACAATCGGGAAATAA-CCAGTT-TAACT-CCG-----TACTTTTCTTATTGCA---TGTACTCTGTTG-AC-CTTAA-TATGGAATACCAGTC-TTTA-TTTGATTCG-TTAATCGA
gi|25 : GGGAAATGTGATCCATCC-TGTAACAA-TTA-T-TTAACGTTCA-TTTACCGAA-ACAATA-CAAATGTTT-ATT-AATACGAA-AGAATACATTAC----AC--C--GTTCTGAA---AAC-CC--GTGAAA--AG-TTG----TATAAAA-------------TG-AAT-----------------------TCCACTGCACCTGAGAATTT--AAAACATCTATTTATAGACAATCGG-AAATAC-CCGGTT-AAGCC-C--C--ACTACTCTTCTT-TTGAAAATTG-A-TTTGTTG-ACTCTTAAGTCT-GAATA----T--TTTA-TTCCGTT-G-TT-gacaattgt
gi|26 : -TTATTGA-CCTA-ACAATGGTGTATCTTCTTTTCT-TTGACACAGACAAACACTGTGTTTTCAA-CGACA-TGGAA--GTGAAT-ACA-AG----CTT-ATTTATCAACGCTTCATGAAATACA---A--CATTATGACAGGT-TGAGA-ATAACTGATCTGTTACATT-AAATTGCA-TCA-TGTTTAAAAGGAAATC-TGATTC--CTGTGTG-G------A------A--AAT--CT-ATCACGTC--TGA---TTTC----C-CG-AT--------AAA--AT-GC-AATATCTA--TATCTA-a
gi|27 : --AG-GTAAGTGTAG-TTGT-GACAT--GGACC-GTGCAG-G-TTCTC---ACC-----TTC-ATT----------GGCT---------G--GAT-T-A-A-C--CCCATTCCATA---TTTG-ATGGTTT--CTCATCCGT---A-G--TAGT-GAACTTGA-AAT---GT-AT-ACAG-TATTGTTT-TTC-CCC--GTTA-GT---GAGGACA--T--GAC---AACC-CC--C-ATCATT-TGA-CGAT------------------GT---GAG--T-AGT-A--GTA-TTCTGGCGAA----TCC-CGGTG--GG-AGT-TCACCC-CGTA-TCCAT-AT--GA--GAAAGTGTA
gi|28 : CCTAGACTTAG----TA-AGCAATAGACTGA-C--CACCTA--CCG-C-CTTCCACTGTA-TCTCTG--CTGT--C-TAC--T-CT-G-------TTG--AGATACAA---TTATTTGGGGCT-TGTGAGAGTCCTCTGTCTTCA-CTCTTTC-TGTGACAGTTTTAGCGCT-GT---TTGATATCTACCGGT-ATTCATAC-ATGTAT-AATTGCCTAAATACCAACCCATCAT
gi|29 : taccTTCAATA-C----T----TTGTAAGTA-AGTCT-TTAA-TAATAT--------------AC-----------------TACCG-------TTGATTACAAAT-ATTGACTG-AA-A-T-ATCAACAGAAT--CAGAA------------G--TCCAT----AC---ATTACATTG-ATACTATAG-TAAA-T--GA---AA--ACA---TGT--A--A-ACGGT-----A-TT-CTGTACAG---GAAATC-------TTGATTGGCCTGTGT---ATT---------------A----ATT----GGTAATATCTTCTCCTAACTATTGACAgattgcgaaa
gi|3 : gAG--AT-GAA-ATGCCAGTGTAGTACCCAAT-AATTG----A-TTGGTAGGAC--ACGA--C--CGCG--A-------TTAGCCA---------TTGCGCCTGAG--CA-AACATC--TATCAAACCCAGGGGAAATAG--GTGGTAA-TGG-GCAAGTGACGGGAAGATGAAACCA-A-GGCGCCTCGTGGTTACATTCAGT-TTCTAT-AGAT--TA-ATAA-TGTA--TTGTCGACAAAGGGATCTGTGCCC-G-TTCTC---ACC-----TTC-ACT----------TAATT--------G--GAT-CCA-A-TGTCC-A-TCAGTGAGATTTG-ATGGTTTGTCTCATCCGGCAGA-GGTTAAT-GAACTTGT-AATCTTGTAATTGCAG-TAATGTTG-CTCCTCCGCAATA-GTCAAGGATCCA--T--GACCCAAG-T-TG--GCGTATTT-TGACCGGTATAGGAAAGCTGGATCGTGT---GAG--TAGGTAT--GGA-ATC-GGCGA-----TCC-GGG-GCGGG-AGTATCAGACAGGTC-TCCATA-T-AGAAATAAGGT--ATG--CTGG-GTGAATGA--T-----AAA------TGTG-GGCTG-AGACAGCT--CACA-G-ATCAC-G-C-T-TAT--AT--CAAC-GGAACCAA--C-CAACGCACTA-----TATGAAATCAT--GTAGT------CAGAA-TGAT-TTG--GAACCTTGTGA-AATC-CCTCCCTTAGAAACT-A-CCACTCAGCAC-A-T-AC-T-TCTCACCCATAT-ACT-C-GAAGGTTTCTGTGCGTATCATC-T-CC-C-CCGTGTGTCCCCCAG----A--CCTTCTGTAAGGTCACTTCTGTCAGG-TGTCCCGGATATCTCACTGACACACAAAA---CACCCACAGA--AGGGC-TCTGACACTC-GGTAATGTGATTCATCCATGCAAACA-TTC-GTTTAGCGGTGG-------GAC-AC-ATAGCAAAACTCT-G---AAGACTAC-ACTATATA-TATAGAAACAGCAGGTTCTTGAAT-AATATCTAGTGAAGGTAATTTGTGGATACAAGAA-GTCAGTGAAAATGTGATTACTCATGTTAAATCTTACAAAATCCACTCTACCTGG----TT--TAAAATT
gi|30 : acT-GAACTTGA-AAT---ATA-T-ACAG-CATTGTTT-CAC-TCC--AATA-GT---GAAGACA--T--GAC---AA-T-TT--C-TTCATT-TGAC-GGT------------------GT---GAG--TA-GC-T--GTA-ATCTGGCGAA----CCC-CGG-G--GG-CGTATCAGA--GATC-TCCAT-AT-AGA--TAAGgtgatcgtgataac
gi|31 : T----G-AATC-CCTCCCTAGA--ACT-A-CCACTCAGCAC-A-TATC-TCTTTCCATTATATATCT-GTGAAGGTTTC----CGTATCATC-T-CCTC-C---GTGTCTTCTAG----ATCCCTTCTG-AATGTCACTTCTGTT-GG-TGTCCC---TATCTCAC-cgt
gi|32 : AAGTGTAA-TTGT-GACAA--GGACC-GTGCA--TGTTCTC---ATT-----TTC-GTC----------GGA-T--------G--GAT-T-A-ATT--CC-TTTCA--AA--TCTTGATGTAAT--CTCAACAGG---A-G--CATT-GTACTTGA-AAT---GT-AT-ACAG-CATTGTTT-CTC-TC
gi|33 : ACGTGAA--TGGAAACA-T-AGCG-C-----GATA---TCAAA-TTC-ATGAGAT--TT-AAAAGTGTAG-TTGT-GACAT--GGACC-GTGTA--GGTTCTC---ACC-----TTCAGC------------ACCT--------G--GTT-C-A------CC-ACTCCATAA--TT--GATGGTTT--CTCAT
gi|34 : ACCT----G-AATC-CCTCCCTATG--ACT-A-CCACTCTTCAT-A-T-GGATCATCCCTTTCGATAACG-ATAAACCTTTC----TGTATTAGCAC-CC-C-C---GTGTCCCAAAG----ATCCCTTCTG-AAGTTCACTTCTGTC-GG-T
gi|36 : ACATGCTGACA-GATCCCCAGTA---TCTGCCACAAGAGGT-CTCTAA--GGAGT--AACGGTACATGTTT-GTCAT-CATC---ATATA---TC-A-GC--AGGGTGTGTAGGTC-TG---TC-----AGT
gi|37 : AGTGAAG-TTGT-GACAA--GGACC-GTGCAG-GTTTC-C---ACC-----TTC-ATT----------GACT---------G--AAT-T-C-A-CT-CC-ATTCAATAA--TT--GATGGACT--GTCATTCGT---A-G--TAAT-GAACTTGA-AAT---GTAgact
gi|38 : TTTATAGACAATCGGAAA-TAC-CCAGTT-AACCT-CCGC----TACTTTTCTT-TTGCA---TGTACTCTGTTG-AC-CTTAA-TATGGAATACCAGTACTTTA-TTTGATTCG-TT-ATCt
gi|39 : ATAAATTA-T-AAGTAACAAATC-GTTCAAAA-CA---T----T-GTAATTA-AGTAT-TTAA-TA-TAT--TA-TTGCGC----CC----------------TACTG-------TTGAGTACAAAT-ATTGACTG-AA-A-T-ATCAA--------CAGAA------------a
gi|4 : AAGTCC-GAGTTTAATTCAT------------TTGTC------------------------------ATCCT----TCGT---CAAT-AATTG----A-TTG-TAG--T--ACAA---TACACG--A-------T-GGCCA----------TGCGC--GAGT-CA-AACATC--TCTCAA-CCCAGGG--AAGGG--CTGGTAA-TGG-GCA-GTGACGGGAA--TGGAAACA-C-AACG-C-----TACA---TCAGT-TTCTATG-GAT--AG-ATGAGTGTAG-TTGT-GACAT--GGACC-GTGCAG-G-TTCTC---ACC-----TTC-AAT----------GGCTA--------G--GAT-A-C-A-C--TC-ACTGAGTAA--TT-AGATTGTGT---TCATCCGT---ATA--CATT-CAACT-GA-ATA---GTA-T-ACAA-TAGTCTTT-CTTATCCTAGATAAGC---TGAGTC-CATAAGAC---AA-T-TCTCG-TTGATT-TGAC-AGT------------------GTATAGAGATTA--T-T--GTA-ATCGGTCGAAAGAATCCGCGT-G--AGCAGTATCAGAC-GGTCGTCC-TAATCAGA--TAAGTAGTATGT-CTGGTGTG--TTAATTG---GATAAAACCCCGTTTGACTA-TGACATCTATCACACT-ATCAT-CACTTCTATAGATATCATATGG---TAG--AACATCGCA-TACTCATT---AACTCAT--GC--TTAGGATCAG-ACTGAT-TTTTAAAACATTCA-G-AATCGCCTCCCTAGT--ACT-A-CCACTCAGCAT-C-CGTC-TCAGTCCTCTATATAACT-TTGAAGGTTTC----CGTATCATC-T-CCAC-C---GTGTCTCTCAG----ATCCCTTCTG-AAGGTCACTTCTGTC-GG-TGTCCC---TATTTCAC-GACAC-----A---CACCCACATA-CAGGGCTTCTGATACACGGGGAATGTGATCCATCC-TGTAACGA-TTC-G-TTAACGTTAG-TTGATCGAC-ACAATA-CACATTTCT-ATT-AATACGAA----ACAAATCAT-----TAAC--GTTTTAA----AGC-TT--GTG-AA--ACCTTG----TATGAAAA-A----------TGTAA--------------TCAAACAAAGTCCACTCTACCTGAAAATTCA-CAAAA-TCTATTTATAAATAATCGG-AAATTC-CCAATT-ATGC--CCG---GCTACTTTTCTT-TCGCA---t
gi|40 : CTG--C----A-TT-AC-AAAGTA-TGG-ATT--G-GAGAGG-G--------------------CAGGGATC------AGAACCTC---------TCTGAGAGTGG--GACTA--T-GTAACAGGAA--G--------------ACAACCCCCA-TTTCGTAAAATGTTTCT-AA--C--
gi|41 : CTG-A-C-TTGAGGT--ATTTTTCC-CCTGTCTG--C----A-TG-AC-AAAGTG-TGG-ATC--A-GAGAGG-G--------------------CCGGTATC------AGAACCTC---------TCTAAGAGTGG--GACTG--T-GTAACAGGAA-
gi|42 : -TGAT-TT---AAACCT----A-AATC-CTTCCCTATG--GCT-A-CCACTCAGCATCA-A-TC-TAACTCCATAATATGAAT-GTGAAGCTTTC----CGTATCATC-TCCC-C-C---GTGTCCCaccaac
gi|43 : AAGTGTAG-TTGT-GACAA--GGACC-GTGCA--CGTTCTC---ATT-----TTC-GCT----------GGA-T--------G--GAT-TAA-A-T--CC-ATTC--CAA--TGTTGATGTAAT--CTCAACAGG---A-G--CATT-GAACTac
gi|44 : aGATGAAAATTATATATTC-AG-CTTCTGTG-GCTG
gi|44 : AATATATA-A-TTTTCATCCCGTTCATTTC-ACTGACTTCTTCT-T--CCAACCTTAA-TTCTTccgttcatttcactgacttcttcttccaaccttaattcttc
gi|45 : cagccacagaagctgGGAATGTGATGCATCC-TGTAGCGA-TTC-G-TTAACGTTAc
gi|46 : TTTTCTT-TTGCA---TGCACTTTGTTGCCC-CTTCA-CATGGAATAC------TTTA-TTTGATTCG-TT-ATCctattacatttagctttacacattctattta
gi|47 : --GCTACTTTTCTT-CTGCA---TTT--TCTGTTGCAC----AA-AACAAAATACTAGTACTTTATTTTGATTacaa
gi|48 : CT--CACA-T-ATCAC-C---T-TATG-AT--CA---GG---GAG--C-CAACGCA-TG-----A---AATC
gi|49 : --C-AAAACCA---CACATGTTGGAGC-AATGTTG-A--TGAT-ATC
gi|5 : ACAATAAGT--ATGAAGTAACATACC-ATTTA-TAGTA---T----T----A--A-AGTCTATTAA--A-TATGATA-TTGCGC---ACC----------------TACTG-------TTGATTACAAAT-ATTGTCTGCAA-ACTGACTAAAACAGAATCAGAA------------GGTTCCATCTAAACCCTA--AC-TTG-ACATT-TATGTAAAAT--GG---AAAC-CAGCTT-TGCA--ATACAATTTACTA-TTTCTGTCCAGTGGAATACCCCACAT-TTGATCGTTCTATGGCATAATAAAATA-TA------AT---AAATATAAAT-ATATCTT-TCCTAACTTATGA--GAGATTA---ATTTT-G-CT-CTCTG-GTTGTCTGTATTTTTTGAT---GTTC--G--T----GTGA--------TGT-GTAA-GACCGTTAACG-CCCGGGACAGGTCTCCCACACATTGT-TTG--A-GATCCCACGT----TC-GCCAGGACAGGTCCTCT-A--TCTTC--AAAATCACGAATCTCCCCATACATCCCAATAGAAATGCAA-GTGAAGGGTTTGTGTAAT-CGCGTTCTCCTAGGTCATCCTGCTAGAAATC----TTGAATTGATCTGTTACCTAGTCTGCT---GTCGA-CAA---TA-GGA-ACGGGATACACACATGTGCACAGGTAGCGCAACCAGGGCTCACCAGTCATATTAT----C-TCTGTA------TCATTTCAACTGAACTTTTGTGTGGCCAA--TTAACTTCTTTCATCTATAGCAGTAAACTCTTTATAC-AATATGGTCAACATTCTTG-CCAACC-TTCCTATACTTAGGTTCTA-A--A-TAGACTGACC--CACCTA--CCG-C-T---CACTGTACTCTCTGCTCTGT--CACAC--TACT-AGGATACCCCATTCGA---------GAAGTGTGGCTGTGAGA-AGGCCTCTG-C-TCACTTCTATCTTGTGACATTTTTAACGCTAGTTTATTGATAATTCTC--T-AAACGCA--G-GTATCAGTTACCTGAGTA
gi|50 : TCCCGTTCATTTT-ACTGACTTCTTGT-T--CCAAatga
gi|6 : AA--TGGAAACA-C-AGCG-C-----TACA---TCAGT-TTCTAT-AGAT--AG-ATAAGTGTAG-TTGT-GACAT--GGATC-GTGCAG-G-TTCTC---ACC-----TTC-ACT----------AA-TT--------G--GAT-C-A-A-TT-CC-ACTCAGTGA--TT--GATGGTGTT-CTCATCCGG---A-G--TAATTGAACTTGATAAT---GTAAT--CAGGTAT-GTTT-CTC-TCC--AATA-GT---GAGTCCAT-T--GAC---AA-T-TT--G-GCGATTGTGAACGA-------------------GT---GAG--TA-GT-TTTGTACATCTGGCGAA----TCC-----G--GG-AGTATCAGAG-GGTC-TCCATA-T-AGA--TAAG-TGTATGTGCTGG-GTGAATGTATTA---GAAA------TGTG-G-CTGCAGACATCT--CACA-TGATCAC-C--TT-TATG-AT--CA---GG---TAAACC-CAACGCA-TG---------AAATCATTAGT--T------CAG-A-TGATGTT---GAACC-----G-AATC-CGTCCC-AGA--ACTTA-CCACTCAGCAT-ACT-TC-TCACTCCATTATA---CT-CTGAAGGTTTC----TGTATCATC-T-CC-C-CC--GTGTCCCCCAG----ATCCCTTCTG-AAGGTCACTTCTGTC-GG-TGTCCC---TATCTCAC-GACAC-----A---CACCCACATA-CAGGGCTTCTGACACTCGGTGAATGTGATCCATCC-TGCAACGA-TTC-G-TTAGCGTT--------CGAC-ACAATA-CAAA--------------CGAG-ACTACACATTA-----ACAGC--GTTCTGA--T-AAT-TC--GTGAAA--A-TTTG----TATACAA-------------TGTAAT--------------CTTACAAAATCCACTCTACCTG
gi|7 : TATCTCTTTTTCG-TTGACACGAACATACACTGTGCTTTCAA-TGACA-TGGAA--GTGAATA-TA-AG----CGC-ATTAATCAACGCATCATGAAATACA-ACA----TTATGACAAGTG-GAGA-ATAACTGATCTATGACATT-TAATTGCA-TCA-TGTTTAAAAGGAAATC-TGATTC--CTTTTTG--------------TA--AATT-AT-A--ACTTT--T-----CTGCTTTAC-TG-AT--------AAA--AA-GC-AATATCTAT--ATCTA-TTTCTG-A-C-TTGAGGT--AACTTTCC-ATTGTCTG--C----A-TT-AC-ACAGTA-TGG-ATT--T-GAGAGA-G--------------------CCGGGGTA------AGAATCTC---------TTTGAGAGTGG--GGCTA--T-GTAACAGAAA-AGCAACNNNNNNGAAAGCAACGCCCA-TGTTGTGAAATGTTTCT-AA--C--TTT--TGA-T--ACAGGAACGTCTGTTGC-GCCCC-G-ACAACTTTTC---CTGCAAACATAT---TGTTCT-CCGG-----------AATAAA-GAAATT-TGGAAGG-TAACC-GGTAT-ATA-CACA--CTGAAT---CAAGGATTT--GAAA--C-AAAACCA---CACATGTTGGAGC-AATGTTG-A--TGGT-ATCCATGG-GGTAGAA-GAGCATTCT-TGA-ATTCT-C-CAAAATAATA-TTG--TTTTttaaaat
gi|8 : AAATT-CTCCA-CT-C-AAAGTCT-GAGTTT-----------GT-CTGT-TTGTTT-GA-GA-T-AGGAA--CGAG--AT-GAA-ATCCT----TCAT---CAAT-AATTG----A-ATG-CA-G-T--AC-A--GTAGGTG--A-------T-GGCC----------ATGCGC--GAAT-CA-AACATC--TATC-AACCCAGGG--AAGGG--CTGGT-AATGG-CCA-ATGACGGGAA--CGGAAACA-C-AG-GGC-----GATA---TCAGC-TTCTATGGAAT---T-ATAAGTGTAG-TTGT-GACAT--GGACC-GTGCA--TATTCTC---ACC-----TTC-TCT----------GGC-T--------G--GAT-C-A-ATT--CC-ATTCAATGA--CT--GATGAAAT--ATCATCCGG---A-G--TAAT-GAACTTGA-AAT---GT-AT-ACAG-TATTGTTT-CTC-TCC--AATA-GT---GAGGACA--T--GAC---AA-TATC----CTCATT-GGA-CGGT------------------GT---GAG--T-AGT-T--GTA-ATCTGGCGAA----TC
gi|8 : CA-TG-----T---AATCCAT--GT---------CAG-A-TGAT-TG---AAACCT----A-AATC-CCTCCCTATA--ACT-A-CCACTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacatgtaatccatgtcagatgattgaaacctaaatccctccctataactaccact
gi|9 : aaattctccactcaaagtctgagtttgtctgtttgtttgagataggaacgagatgaaatccttcatcaataattgaatgcagtacagtaggtgatggccatgcgcgaatcaaacatctatcaacccagggaagggctggtaatggccaatgacgggaacggaaacacagggcgatatcagcttctatggaattataagtgtagttgtgacatggaccgtgcatattctcaccttctctggctggatcaattccattcaatgactgatgaaatatcatccggagtaatgaacttgaaatgtatacagtattgtttctctccaatagtgaggacatgacaatatcctcattggacggtgtgagtagttgtaatctggcgaatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaaGAACTA-CACCTATCATGTGAACTATTGA-CCTA-TCAATGGCATATCTCTTTTTCT-TGGACACAAACAAACACTGTGATTTCAA-TGACA-TGGAA--GTGAAT-ATA-AG----TAC-ATTTATCAACGCATCATGAAATACA-ACA--TA--ATGACTGGT-TGAGA-ATAACTG--------------AAATGCA-TCA-TGTTTGAAAGGAAATC-TGGTCC--CATTGTGTA------ACT-TATA--A-----C-A--CTGCTGCT-----TTCC----A-C--AT--------TAT--AA-GA-AATATCTAT-C-TCTA-TCTCTG-A-C-TTGAGGT--AACTTTCA-CCTGTCTG--C----A-TT-AC-AAAGTA-TGG-ATT--A-GAAAGG-GTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTC------GGGATTTCAGAATCTCATCTGAGAGTGGGAGACTAGCT-GTAACA-GAA-GGCC------------CCAATG-CCA---CTGGAAAATGTGTCT-AT--CCTTTT--TGATT--ACAGAGACAT-TGTTGC-ACCCC-A-ACAA-TTTTTCCACTGCAAACATAGT-TTGTTA--CCGGGAACGATCTCAAATAAA-GACATTGCGAAAGGGTAACC-GGTAT-ATA-CACATTCCCCAT---CAAGGATTTTAAAAA--C-AATACCA-
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|35 ): TTATCCTATGATAAGCTGAATATGAAAGGAATGCTTGTTGATTTAATAGTGTCTTCATGGGAATGTACTGTTATCCATCAATCCACTAAATAGAACAGCTGATAACCCTAAC
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 222 333333333 11111 5555555555555555555555 2222222 222 44444444 333333333333333 1111 333333 22 111 1111 111 3333333333333333 22222 11 5555555555555555555 888888888888888888888888 11111 222 11 11 222222222 1 1 1 1 2222 1 22222222222 111 1111 11 111 22222 222 11 333333 111 1 3333333333333333333 1 1 1 1 1 11 11 333333 11111 11 1 1 22 11 33333 1 222222222222 22 11 1 22222 1 1 11 11 6666666666666666666666666666 1 11 1 11 1 1 1 111 1 2222 1 1 1 2 1 222 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2222 22222222222222222222 111111111 444444444444444 1 111 222 44444444444 111 11 2222 11 1 1 1 1 1 1 11 1 1 1 3333 222222 111 11 1 1 1 2 1 1 1 11 111 22222222222 11 1111 111 222222 22222222222222 1111111111 33333333333 11 11 1 11 11 11111 11111111 3333 33333333333333333333333333333 222222222222 1111 11 11 22 111111 11 333333333333333333 11111 1111 1111 22 11 333333333333333 22222 22 222 1111111111 11111 222222 2222222222 1 111 111111 222 1111 1 111 1111 111 222222222 11111111 11111 11111 11111 22222 11111 1111 777777777777777777777777777777777 11 1 11 2222 111 111 11111111111 444444
lowQualScore : 333 8 8 7 6 666666666 7 2 6 6 6 6 00000 9999999999999999999999 8888888 1 6 6 6 333 33333333 888888888888888 7777 333333 0 11 8 777 8888 444 0 0000000000000000 00000 8 8 11 0000000000000000000 777777777777777777777777 11111 1 0 1 3 333 7 6 6 0 22 6 3 11 888888888 22 0 0 9 3 3 6 7 9 2 3 0 8 0000 3 8 0 99999999999 11 0 8 8 444 9999 66 11 77 8 444 00000 777 33 666666 777 5 3 7777777777777777777 0 0 0 0 1 7 3 88 0 88 888888 7 44444 1 1 0 8 8 11 77 0 7 2 55 33 1 77777 6 3 1 3 333333333333 33 33 0 88888 0 0 33 33 3 0000000000000000000000000000 0 33 2 9 4 0 3 22 3 0 0 3 0 777 1 2 0 3 0000 0 88 2 3 2 3 6 3 6 6 0 5 0 0 5 4 66 0 99 4 9999 4 4 66 777 4 4 4 4 4 4 44 2 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 3 55 3 3333 3 6 3 44 3 44 9999 3 3 3 3 3 3 7777 3 77777777777777777777 999999 333333333 99 777 4 4 555555555555555 1 8 4 66 66 66 5 77 8 8 999 0 6 444 888 88 66666666666 8 8 0 5 8 6 6 99 0 111 99 33 4444 6 6 99 6 11 3 0 0 0 0 0 9 33 3 3 3 7 0000 555555 6 1 777 8888 0 7 88 6 5 1 1 0 3 6 0 3 0 0 6 6 88 222 6 6 11111111111 55 5 77 5 5 2222 3 000 5 111111 5 22222222222222 9999999999 5 55555555555 55 5 5 77 1 5 5 33 77 5 9 5 5 11 4 4 44 00000 777 777 5 44444444 3 2 2 777 2 4444 555 77777 77777777777777777777777777777 111111111111 2 0 2 2 4444 6 2 444 66 66666 3 44 3 2 3 555 44 55 3 3 6 00 7 666 3 1 88 55 777 4 4 444444 1 5 44 666666666666666666 888 77777 2222 5 0 0000 66 5 77 5 0 00 5 77 5 77 2 88 8 6 0 666666666666666 8 3 8 99 888 99999 6 00 99 777 4444444444 44444 555555 99 9999999999 3 5 5 555 999999 4 9999 4 4 5 111 5 33 1 2 66 0000 5 5 0 5 333 2222 5 5 5 111 6 555555555 8 0 1 5 5 888 22222222 6 6 55 33333 7 99999 1 1 88888 99 55555 6 99 55555 4444 555555555555555555555555555555555 3 99 77 0 3 0 8 8 11 4444 5 000 666 66666666666 1 333333 6 8 8
lowQualScore : ... . . . . ......... . . . . . . ..... ...................... ....... . . . . ... ........ ............... .... ...... . .. . ... .... ... . ................ ..... . . .. ................... ........................ ..... . . . . ... . . . . .. . . .. ......... .. . . . . . . . . . . . . .... . . . ........... .. . . . ... .... .. .. .. . ... ..... ... .. ...... ... . . ................... . . . . . . . .. . .. ...... . ..... . . . . . .. .. . . . .. .. . ..... . . . . ............ .. .. . ..... . . .. .. . ............................ . .. . . . . . .. . . . . . ... . . . . .... . .. . . . . . . . . . . . . . . .. . .. . .... . . .. ... . . . . . . .. . ...................................................................... . .. . .... . . . .. . .. .... . . . . . . .... . .................... ...... ......... .. ... . . ............... . . . .. .. .. . .. . . ... . . ... ... .. ........... . . . . . . . .. . ... .. .. .... . . .. . .. . . . . . . . .. . . . . .... ...... . . ... .... . . .. . . . . . . . . . . . . . .. ... . . ........... .. . .. . . .... . ... . ...... . .............. .......... . ........... .. . . .. . . . .. .. . . . . .. . . .. ..... ... ... . ........ . . . ... . .... ... ..... ............................. ............ . . . . .... . . ... .. ..... . .. . . . ... .. .. . . . .. . ... . . .. .. ... . . ...... . . .. .................. ... ..... .... . . .... .. . .. . . .. . .. . .. . .. . . . ............... . . . .. ... ..... . .. .. ... .......... ..... ...... .. .......... . . . ... ...... . .... . . . ... . .. . . .. .... . . . . ... .... . . . ... . ......... . . . . . ... ........ . . .. ..... . ..... . . ..... .. ..... . .. ..... .... ................................. . .. .. . . . . . .. .... . ... ... ........... . ...... . . .
lowQualScore : 000 0 0 8 7 333333333 3 5 7 7 7 7 00000 7777777777777777777777 3333333 0 7 7 7 888 33333333 444444444444444 0000 888888 8 00 0 000 6666 000 8 2222222222222222 00000 0 0 00 0000000000000000000 000000000000000000000000 66666 4 8 0 2 333 3 7 7 6 00 4 2 00 000000000 55 0 0 2 7 3 7 3 8 5 2 0 8 8888 2 8 0 55555555555 22 8 0 0 000 0000 88 00 00 0 000 00000 000 22 222222 555 5 2 8888888888888888888 0 0 0 0 0 3 3 33 7 33 333333 3 88888 0 0 8 0 0 00 00 0 3 0 33 33 0 33333 7 3 2 2 888888888888 88 88 0 22222 0 0 22 88 2 5555555555555555555555555555 0 88 5 2 5 0 0 55 2 0 0 2 0 555 0 5 0 2 5555 0 22 5 2 0 3 7 3 7 7 7 0 8 4 0 4 11 1 33 4 4444 4 4 11 222 4 4 0 0 0 0 33 4 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 6 00 6 1111 3 7 3 66 3 22 6666 1 1 1 1 3 3 4444 3 11111111111111111111 666666 333333333 55 000 0 0 666666666666666 1 9 4 11 11 99 0 99 2 0 222 8 0 000 666 88 00000000000 0 0 8 0 0 7 7 22 7 777 22 66 9999 7 7 22 7 88 2 0 0 0 0 0 0 88 3 3 3 3 0000 777777 7 0 777 3333 7 3 33 0 5 0 0 7 3 7 0 2 0 0 5 7 55 333 7 7 33333333333 88 2 99 7 7 1111 0 000 7 777777 7 44444444444444 6666666666 7 11111111111 77 7 7 99 6 0 0 66 99 0 0 7 7 00 0 0 11 00000 000 555 7 33333333 6 9 9 777 9 1111 000 11111 22222222222222222222222222222 222222222222 9 4 9 9 0000 9 9 999 88 22222 1 22 9 9 1 444 00 00 3 3 7 00 3 444 0 0 11 55 000 0 0 444444 0 0 44 999999999999999999 888 22222 2222 0 1 6666 44 7 99 7 1 77 7 00 7 99 5 88 0 4 8 888888888888888 0 8 0 22 333 77777 7 22 22 555 0000000000 33333 999999 22 2222222222 3 7 7 777 888888 4 6666 4 4 0 111 0 99 0 0 44 6666 0 0 0 0 888 1111 7 7 7 777 7 000000000 0 8 4 7 7 666 22222222 7 7 00 00000 2 33333 0 7 33333 22 88888 7 22 22222 2222 222222222222222222222222222222222 2 00 44 8 6 8 0 0 88 3333 7 000 777 22222222222 0 000000 7 0 0
consensus : NACAATAAGTTAAT-AAGTAACAAACC-ATTCAATA-CA---T----TTGTAAGTA-AGTCT-TTAA-TA-TAT--TA-TTGCGC---ACC----------------TACCG-------TTGAGTACAAAT-ATTGACTG-AA-ATT-ATCAA--------CAGAA------------G--TCCAT----AC---A--ACATTG-ACATT-TAC-TAAA-C--GA---AAATACA---T-T--A--A-ACAAT-----A-TT-CTGTACAG--AAA------A-CG-TT------GATTGTTCTATGTCA-ACTAAACCC-TA------A----ATTTATGGGT-ATTTCTTCTCCTAACTATTGACAGAAATTA---ATTCTAG-CTTCTGTG-GCTGTCTGTATTTTTTGACATGGTTCCTGTCT--AAGTGAAC--T--TTGAAT-AA-GACTGTTAACGCCCCGT-GTAGGTCCCCCACACAACATGTTGACA-GATCCCCAGTA---TCTGCCAGGACAGGT-CTCT-A--GCNTC--AAAGNTACGTATCT-CCCAT-CATC---ATAGA---GCAAGT--AGGGTGTGTGTGAT-TG---TC-----AGTCG-CCTG-TAGATAT-----TTG---TGACCTGTTACCTAGTC-GCT---GT--A-CGA---CA-GGG-AC-AGATA-ACANATGTGCAC-GGT--CGCAA--AGGG------AGATATAATATAAAA-TTTNTATCCCGTTCATTTC-ACTGACTTCTTGT-T--CCAACNTTAA-TTCTTTCAACTATAGC-GTAAACTCTTTATACGAANATAGT-AGCNCTCTTGCCCAACC-TTCCTAAACTTAG----TA-A-CA-TAGACTGAC-CCACCT--ACCG-C-T---CACTGTA-TCTCT-G-TCTGT--CTAC--TACT-ACT--ANGA-----CAC----GAT-AT--GGGGCTTGTGAG-AGTCCTCTG-CTTCA-TTCTATC-TGTGACAGTTTTAGCGCT-GT---TTGATATCTNCCGG-TAATCGTAC-G-GTAT-AATCGCCTAAATATAAACCCATCATATACATAACCTAGACTTTAGAACTA-AACCTA-CATGTGA-TTATTG-ACCTA-TCAATGGCGTATCTCTTTTTCT-TTGACACAAACAAACACTGTGCTTTC-AATGAC-ATGGAA--GTGGATAATA-AG----CAC-ATTTATCAACGCATCATG-AAAT--ACAACA-ATTATGACAGGT-TGAGA-ATAACTGATCTATTACATT-TAAATGCA-TC-ATGTTTGAAAGGAAATC-TGATCCCTNTGC-G-AA------ACT-T-TA--AACGC-G-ATGCT--T--T-----TCC------C-CG-AT--------A-AA--AAGC-AATATCTAT-TATCTA-TTTCTG-AC-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A-TT-A-C-AAAG-TATGG-ATT--G-GAGAGG-G--------------------CCGGGATC------AGAATCTC---------TCTGAGAGTGG--GACTA--T-GTAACAGGAA-GG--------------ACAACGCCCA-TTTTGTAAAATGTTTCT-AA--C--TTT--TGA-T--ACAGGGACATCTGTTGC-GCCCC-G-ACAA-TTTTC---CTGCAAACATAT-GTTGTTCT-CCGG-----------AAT-AAAGAAATT-TGGAAGGGTAACC-GGTAT-ATA-CACA--CCGCAT---CAAGGATTT--GAAA--CAAAACC-A-ACACATGTTGGAGC-AATGTTG-A--TGGT-ATCCATGG-AGTTGAA-GAGCTTTCT-TGA-ATTCT-C-CAAAATAATACTTG--TTTTCATAAAAT-ATGAACAC-AGTAA-ATTCGTC---ACAGAAA--ACT-TCCTTCAAAATNATTTTC-A-TGATTCCGTAACGGAGAAAACTGG--CAATGG-TCATAGAGTACACTANCTTTGNCCCGCTCG-TG-AAAAGAAA-TTCTCCA-CT-CCAAAGTCC-GAGTTTAATTCATT--TGT-CTGT-TTGTTT-GC-GA-T-AGGAA--CGAG--AT-GAA-ATCCT----TCGT---CAAT-AATTG----A-TTG-TAGG-T--ACGA--CTACGCG--A-------T-GGCCA---------ATGCGC--GAGT-CA-AACATC--TATCAAACCCAGGG--AA--GGGCTGGTAAATGG-GCA-GTGACGGGAA--TGGAAACA-C-AGCGGC-----GATA---TCAGT-TTCTATGAGAT--AG-ATAAGTGTAG-TTGT-GACAN--GGACC-GTGCAG-GGTTCTC---ACC-----TTC-GCT----------GGCT--T--------GGAT-C-A-A---T--CC-ACT-CAGTAA--T-TTG-ATGG-NNT--CTCATCCG-G---A-G--TAAT-GAACTTGA-AAT---GTAAT-ACAG-TATTGTTT-CTC-TCC--AATA-GT---GGAGNCA--T--GAC---AA-T-TC--G-GTNATT-TGACCGGT------------------GT---GAG--TAAGT-T--GTA-ATCTGGCGAA----TCC-CGG-G--GG-AGTATCAGAC-GGTC-TCCATAAT-AGA--TAAGGTGTATGT-CTGG-GTGGATGAATTG---GANA------CGTG-GACTG-AGACATCT--CACA-T-ATCAC-C-CTT-TATGGAT--CA---GG---TAG--C-CAACGC-----ATG-----NAATCCAT--GT--T------CAG-A-TGAT-TT---AAACCT----G-AATC-CCTCCCTANG--ACT-A-CCACTCAGCAT-A-T-TC-TCACTCCNCTATATAACT-CTGAAGGTTTC----CGTATCATC-T-CC-C-C---GTGTCCCCCAG----ATCCCTTCTG-AAGGTCACTTCTGTC-GG-TGTCCC---TATCTCAC-GACAC-----A---CACCCACATA-CAGGGCTTCTGACACACGGGGAATGTGATCCATCC-TGTAACGA-TTC-G-TTAACGTTAG-TTGATCGAC-ACAATA-CAAATTTCT-ATT-AATACGAG-ACTACACATTAT----ACAGC--GTTCTGAAAT-AAT-TC--GTGAAA--AGTTTG----TATAAAAA-G----------TGTAAT-------------TCTTACAAAATCCACTCTACCTGAGAATTT--CAAAGTTCTATTTATAGACAATCGGAAAATAC-CCGGTT-AAGCT-CCGC--GCTACTTTTCTT-TTGCA---TGTACTCTGTTG-AC-CTTAA-TATGGAATACCAGT--TTTA-TTTGATTCG-TT-ATCGA
Reference ( family-5170 ) : NACAATAAGTTAAT-AAGTAACAAACC-ATTCAATA-CA---T----TTGTAAGTA-AGTCT-TTAA-TA-TAT--TA-TTGCGC---ACC----------------TACCG-------TTGAGTACAAAT-ATTGACTG-AA-ATT-ATCAA--------CAGAA------------G--TCCAT----AC---A--ACATTG-ACATT-TAC-TAAA-C--GA---AAATACA---T-T--A--A-ACAAT-----A-TT-CTGTACAG--AAA------A-CGATT------GATTGTTCTATGTCA-ACTAAACCC-TA------A----ATTTATGGGT-ATTTCTTCTCCTAACTATTGACAGAAATTA---ATTCTAG-CTTCTGTG-GCTGTCTGTATTTTTTGACATGGTTCCTGTCT--AAGTGAAC--T--TTGAAT-AA-GACTGTTAACGCCCCGT-GTAGGTCCCCCACACAACATGTTGACA-GATCCCCAGTA---TCTGCCAGGACAGGT-CTCT-A--GCNTC--AAAGNTACGTATCT-CCCAT-CATC---ATAGA---GCAAGT--AGGGTGTGTGTGAT-TG---TC-----AGTCG-CCTG-TAGATAT-----TTG---TGACCTGTTACCTAGTC-GCT---GT--A-CGA---CA-GGG-AC-AGATA-ACANATGTGCAC-GGT--CGCAA--AGGG------AGATATAATATAAAN-TNTNTATCCCGTTCATTTC-ACTGACTTCTTGT-T--CCAACNTTAA-TTCTTTCAACTATAGC-GTAAACTCTTTATACGAANATAGT-AGCNCTCTTGCCCAACC-TTCCTAAACTTAG----TA-A-CA-TAGACTGA--CCACCT--ACCG-C-T---CACTGTA-TCTCT-G-TCTGT--CTAC--TACT-ACC--ANGA-----CAT----GAT-AT--GGGGCTTGNGAG-AGTCCTCTG-CTTCA-TTCTATC-TGTGACAGTTTTAGCGCT-GT---TTGATATCTNCCGG-TAATCGTAC-G-GTAT-AATCGCCTAAATATAAACCCATCATATACATAACCTAGACTTTAGAACTA-AACCTA-CATGTGA-TTATTG-ACCTA-TCAATGGCGTATCTCTTTTTCT-TTGACACAAACAAACACTGTGCTTTC-AATGAC-ATGGAA--GTGGATAATA-AG----CAC-ATTTATCAACGCATCATG-AAAT--ATAACA-ATTATGACAGGT-TGAGA-ATAACTGATCTATTACATT-TAAATGCA-TC-ATGTTTGAAAGGAAATC-TGATCCCTNTGC-G-AG------ACT-T-TA--AACGC-G-ATGTT--T--T-----TCC------C-CG-AT--------A-AA--AAGC-AATATCTAT-TATCTA-TTTCTG-AC-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A-TT-A-C-AAAG-TATGG-ATT--G-GAGAGG-G--------------------CCGGGATC------AGAATCTC---------TCTGAGAGTGG--GACTA--T-GTAACAGGAA-GG--------------ACAACGCCCA-TTTTGTAAAATGTTTCT-AA--C--TTT--TGA-T--ACAGGGACATCTGTTGC-GCCCC-G-ACAA-TTTTC---CTGCAAACATAT-GTTGTTCT-CCGG-----------AAT-AAAGAAATT-TGGAAGGGTAACC-GGTAT-ATA-CACA--CCGCAT---CAAGGATTT--GAAA--CAAAACC-A-ACACATGTTGGAGC-AATGTTG-A--TGGT-ATCCATGG-AGTTGAA-GAGCTTTCT-TGA-ATTCT-C-CAAAATAATACTTG--TTTTCATAAAAT-ATGAACAC-AGTAA-ATTCGTC---ACAGAAA--ACT-TCCTTCAAAATNATTTTC-A-TGATTCCGTAACGGAGAAAACTGG--CAATGGTTCATAGAGTACACTANCTTTGNCCCGCTCG-TG-AAAAGAAA-TTCTCCA-CT-CCAAAGTCC-GAGTTTAATTCATT--TGT-CTGT-TTGTTT-GC-GA-T-AGGAA--CGAG--AT-GAA-ATCCT----TCGT---CAAT-AATTG----A-TTG-TAGG-T--ACGA--CTACGCG--A-------T-GGCCA---------ATGCGC--GAGT-CA-AACATC--TATCAAACCCAGGG--AA--GGGCTGGTAAATGG-GCA-GTGACGGGAA--TGGAAACA-C-AGCGGC-----GATA---TCAGT-TTCTATGAGAT--AG-ATAAGTGTAG-TTGT-GACAN--GGACC-GTGCAG-GGTTCTC---ACC-----TTC-GCT----------GGCT--T--------GGAT-C-A-A---T--CC-ACT-CAGTAA--T-TTG-ATGG-NNT--CTCATCCG-G---A-G--TAAT-GAACTTGA-AAT---GTAAT-ACAG-TATTGTTT-CTC-TCC--AATA-GT---GGAGNCAC-T--GAC---AA-T-TC--G-GTNATT-TGACCGGT------------------GT---GAG--TAAGT-T--GTA-ATCTGGCGAA----TCC-CGG-G--GG-AGTATCAGAC-GGTC-TCCATAAT-AGA--TAAGGTGTATGT-CTGG-GTGGATGAATTG---GANA------CGTG-GACTG-AGACATCT--CACA-T-ATCAC-C-CTT-TATGGAT--CA---GG---TAG--C-CAACGC-----ATG-----TAATCCAT--GT--T------CAG-A-TGAT-TT---AAACCT----G-AATC-CCTCCCTANG--ACT-A-CCACTCAGCAT-A-T-TC-TCACTCCNCTATATAACT-CTGAAGGTTTC----CGTATCATC-T-CC-C-C---GTGTCCCCCAG----ATCCCTTCTG-AAGGTCACTTCTGTC-GG-TGTCCC---TATCTCAC-GACAC-----A---CACCCACATA-CAGGGCTTCTGACACACGGGGAATGTGATCCATCC-TGTAACGA-TTC-G-TTAACGTTAG-TTGATCGAC-ACAATA-CAAATTTCT-ATT-AATACGAG-ACTACACATTAT----ACAGC--GTTCTGAAAT-AAT-TC--GTGAAA--AGTTTG----TATAAAAA-G----------TGTAAT-------------TCTTACAAAATCCACTCTACCTGAGAATTT--CAAAGTTCTATTTATAGACAATCGGAAAATAC-CCGGTT-AAGCT-CCGC--GCTACTTTTCTT-TTGCA---TGTACTCTGTTG-AC-CTTAA-TATGGAATACCAGT--TTTA-TTTGATTCG-TT-ATCGA
gi|1 : ACAATGGGTTAAT-AAGTAACAAACCTATTCATTA-C---------TTGTACGTATAGTCT-TTAACTA-TAT--TAATTGCGC----CC----------------TATCGC------TTGAGTACAAATTATTGACTG-AACATT-ATCTA--------CATAA------------G--TCCAT----ACG--A--ATATTGTACATT-TAC-TAAA-CCTGA---AAATACA---T-T--A--AGACAAT-----AGTC-CTGCACAG--AAA--------CGGTT------GATTGTTCTAT-TCA-ACTAAACCCATATCCGCTA----TTTTATGGAT-ATTCCCTCTTCTA-CTATTGACAGAAGTTA---ATTCTAGGCTTCTGTGTGCTGTCTGTATTTGTTCTCCTGGTTCCTGTCT--AAGTGAAC--TCTTTGAAT-AACGACTGGTAACGCCCCGTTGTAAGTCCCCCACACAACATGTTGACATGACCCCCAGTAATTTCTGCCAGGACAGGT-CTCT-A--ACTTCTAAAATCTACGTATCT-CCCAT-CATC---ATAGA----CATGT--AGGGTGTGTGTAAT-TG---TC-----AGTTG-CCTG-TAGATAT-----TTG---TGACTGG--ACCT---T-ACT---GT--A-TGA---CA-GGG-AC-AGATA-ACAGTTGTGCAC-GGT--CACAA--AGGG------AGATATAATATAAAAATATCTATCCCGTTCATTTC-ACTGACTTCTTGT-T--CCAACTTAAA-TTCTTTCAATTATATT-GTAAACTCTTTATTCGAACATAGT--GTCCTCTTGCCCAACC-TTCCTAAACTT-G----TA-A-CA-GAGACTGACTCCACCTGAGCCA-CGT---CACTGTA-TCTCTGG-TCTGTTCCTACGATACCGACCAAATAA-----CAT----GAT-AT--GGGGCTTGGGAG-AGTCCTCT--CTTCC-TTCTATC-TGTGACAGTTAAAGCGCT-GT---TTGATATCTTCCGGTTAATCGTAC-G-GTAT-ATCCGCCTAAA-ATAAA--CATCATATACATAACCTAGACTTTAGAACTAGAACCTA-CATGTGA-TTTTTGAACCTACTCAACGGTGTATTTATATTTCTATGGACACAAACAAATATCA-GCTTTCAAATTACAATGGAAAGGTGAATTATA-AG----TA--ATTTAACAACGCTTGATGAAAATAGACAACC-ATTATGACTGGTGTGAGATATAATTGATCTATTGCATTCTAAATGCA-TCAATATTTTGAAAGTAACC-T-ATCCCTGTGC-G-AG------ACTGC-TA--AACGC-A-ATGTT--T--T-----TCC------C-TG-AT--------ATAA--ATGC-AATATCTATCTATCTACTTTCTGAACGTTGAGGT---ACTTTCC-CC--TCTGAAC----ACTT-ACC-AAAGAAATGG-ATT--GCGAGAAG-G--------------------GCGGAATC------AGAAT-TT---------TCTGAGAGTGGC-GACT---T-GT-ACAGGAA-GG--------------AGAATCCCCAGTTTCGTAAAATGTTTCT-AA--C--TCT--TGT-TTAACAGGGACATCTGTTGC-GCTCC-GTACAG-CTTTC---CTGCAAACTTATGGTTGTTCT-CCGG-----------AATAAAAGAAATT-TGGAAAGGTAACC-AGTAT-ATATCACA--CCGCAT---CAAGGATTT--GAAAC-CAAAACCAA-ATACATGTT-AAGC-AATGTTG-A--TGGT-A-CCATGG--GTTGAATGAGCTTTCTATGA-ATTCT-CACAAAATAATACTTGGTTTTTCATAAAATGATTAACACGAGTAATATTCATCTGGACAGGAA--ATTGTCCTTCAAAAAGATTTTCAA-TGATTCCGTAACAGAG-AAACTGG--CAATGG-TCATAGAGT-CACTAGCTTTGGCCCGCTCG-TGAAAAAGAAATTTCTCCATCTGCCAAAATCC-GAATTTAATTCATT--TGT-CTGT-TTGTGT-GCTAA-TCAGGAA--CAAG--AT-GAA-ATCTC----TCTT---CAAT-AATTG------TTG-TAGG-T--ACGG--CTACGCGGAA-------T-GGCCA---------ATGTGC--GAGT-CA-GAAATC--TCTCAAACCCAGGG--AAGGGGGCTGGTAAATGGTGCA-GTGACGGGAA--TGGAAACA-CTAGCGGC-----GACA---TCA-T-TTC-ACGAGAC--AG-ATAAGTGTAG-TTGT-GAAAG--GGACC-GTGCAGCGGTTCCTGCAACC-----TTC-TCT----------AGCCTGT--------GAAT-C-A-C---T---C-ACT-CAGTAGC-T-TTGAATGGTCTT--CTCATC---G---A-G--TAAT-GAACTTGA-AAT---GTAAT-GCAA-TACTGTTT-CTC-TCC--AATA-GT---GGAGTCGCGC--AAC---AA-T-TG--G-GTTATA-GGACCGGT------------------GT---GAG--GAAGT-T--GTA-ATCTGGCGAA----TCC-CGG-G--GG-AGTAGCAGA--GATC-TCCATAAT-AGA--TAAGGTGTATCT-CT-G-GTGGATGAAT------ATA------CGTG-GATGA-AGACATCT--CACA-T-ATCACAC-CTT-TATGGAG--CAG--GG---TAC--C-TAATGC-----ATGT----TAATCCAT--GT--T------CAGTA-GAAT-TT---AAACCT----GAAATC-CCTCCCTACG--ACT-AGCCACTCAGC-T-AGT-TC-TGTATCCTCTATATAACTCCTGAAGGTTTC----CGTATCATC-T-CC-C-C---GTGTCCACGAG----ATCCCTTCTG-AAGGCAACTTCTGTC-GGTTGTCCC---TA-CTCAC-GACAC-----AAATCACCCACATAGCGGGGCTTCTGACACACGGGGAA-GTGATCCATCC-TGTAACGAGTTCAG-TTAA-ATTAGTTTGATCGACTCCAATA-CGAATTTCTAATTGAATACGAGCACTACACATTAC----ACAGC--ATTCTGAAATGAAT-TC--GTGAAA--AGTTTG----TTTAAAAATG----------TATAAT-------------TCTTACAAAATCTACACTACCTGAGAATTTTACAAAGTTCTATTTAT-GACAATCGGAAAATACTCCGGTTAAAGCTGCCGCTAGCTATTTCTCTG-TTGCA---TGCG-------------------ATGGAATAC--G----TTA-TTTGATTCGTTT-ATCAA
gi|10 : c-TAAATACAATC-ATGTTTGATAGGAAATCATGATGCTTGTA------------------TC--AACAC----TGTC--T--A-----TTT------C-AGTAA--------A-AA--AAGCCAATATCTAT--ATCTA-TTTCTG-AC-TTGAGGT--AAACTTTC-CCTGTCTG--CC---A-TTTA-C-AAAG-TATGGGATT--G-GAGAGG-G--------------------CCGGGATC------GAGATCTC---------TCTGGAAGTGG--GGC-A--T-GTAGCAGAAA-GC--------------AC----CCCAGTTTTGTACAATGTTTCT-AAATC--TTT--TGA-T--ACA-GTAGATGTGTTGTGGCCCCGG-ACAATTTTTC---CTGCAGAAATGT-G-TGTTCT-CCGGA----------AAT-AAA-AAATT-TGGGAGCTTAACCAAGTATGATA-CACA--CTGCATTCACAAGGATTT--GAAAGTCAAAACC---ACACGTGTTGGAGCAAATGTTG-ACGCGGTAATCCATGGTAATTG-A-GAGCTTTCT-TGAGATTCCGC-CAAAATAATA-TTG--TTTTCCTGAAAT-ATGAACAC-AGTAA-A-TCGT-----CAGAAATCACT-TCCTTCAAAATAATTTTC-ACTGA----GTAACGAAGAAAACTGG--CAATGGATCagctg
gi|11 : AA--TGGAAACA-C-AACG-C-----GATG---TCATA-TTC-AT----T--AG-ATAGACG-AG-T-----ATA---GAACT-TTGTGA-------C---A-------------T----------AGCA--T--------GGA----A-AACGT--CC-ACT-AAATAA--T-T-G-ATGG-ACT--CTCATTCG-G---A-A--TA--------------T---GTAGT--CGG-TATTGTTT-CTC-TCC--AATA-GT---G-AGTCCG-T--GAC---AA-T-TT--G-GTTATA-TGAC-GGT------------------GT---GAG--TAGGT----GTA-ATCTGGCGAA----TCT-CGG-G--GG-AGTGTCAGA--GGTC-TTCAT-AT-AGA--TAA-GTGTATGT-CTGT-GTGGATGAATTGATAGA-A------CGTG-GACTG-AGACATCT--CACA-T-CTCAC-C---T-TAT-GAT--CA---GT---TTG--C-CAAAAC-----ATG-----AAATCCAT--G---T------CAG-A-TGAT-TT---AA-------------------------------A-CCACTCAGCAT-ATT-TC-TCACTCCTCTATATAAGT-CTGAAGGTTTC----TGTATCATC-C-CC-TAC---GTGT----CAGAAATATCCCTTCTG-AAGGTCACTTCTGTC-GG-TGTCCC---TATCTCAC-GACAC-----A---CCCCCACATA-CAGGACTTCTGACGCACGTGGAATGtctcgtcaacaaatgcgtaata
gi|12 : TTTGTTCCGCTTG-TG-AAAAGAAA-TTCTCCC-TT-CTATAATCTTGAGTTC---TTATT--TGTGCTGTACTGTTTTGC-GA-T-AGAAAGAC-AG--ATTGAATATCCT----TCCT---CGAT-AATTGTGAAG-TCG-AGGA-TTGATGC--CAACGCG--AAGAGGAAT-GATCAGAATCGGCCATGTGTTGAAGTACATAAGATCGCTTTCAAATCAAGGGG-AA--GTGCTGGTAA-TGG-GCA-GTGACGGGAA--TGAAAACA-C-AGC-GC-----AATG---TCGAA-ATCT---AAATTCAG-AAAAGTGTAG-CTGT-GACAA--GGACC-GTGCA--TGTTCTC---ATT-----TTC-GTT----------GGA---T--------GGAC-T-A-AG--T--CC-ATTCCAGT----T-TTG-ATGA-AAT--CTCAACAG-G---A-G--CATT-GAACTTGA-AAT---AT-AT-ACAG-CATTGTTT-CTC-TCC--AATA-GT---GAGGACA--T--GAC---AA-T-TT--G-GCGAT
gi|13 : TACGTA-CT-CCCAT-CATC---GTAGA---GCA-GT--AGGGTTTGT-TGATCTG---CC-----AGTT---CTG-TAGATACATGTATTG---TGACTTGTTACCTAGTC---T---GT--AGTGA---CATAGG-AT-AGATA-GCATATG--CAC-GGT--CACAA--AGGG------AGATA-AACATAAAA-CTGATATTCCGTTCATTCC-ACTCACTGCTTGT-T--CCAACATTAA-TTCTT-CAA-TACAG--GTAATCTTTTCACA-GAAAAGAGT-A--TCTCTTGCCCAAGCATTCCTAAACTTAG----TCTA-CA-TAGACTGA--CCACCC--ACCGTC-G---CACTTTA-TCTTT-G-TCTAT--CTAC-------ACT--ATGG-----CAT----GAT-AT--GGG-------------TCTCTG-CTTCA-TTCTATC-TGTGACAG--TTAGGGCT-GT---GTGATATTTACCGG-T-ATCGTACAA-GTAT-AA-CG-CTAAATATAAATC
gi|14 : -TTATTG-ACCTA-TCATTATTGAATCTCTTTTTGT-TTGGCACAGACAATCTTTGTGCTTTT-AATGCC-ATGGAC--GTTGATAATA-A-----CAC-ATTTATCAACGCATCATG-AAAT--ATAACA--TTATGGCAGGT-TGATA-ATAACTGATCTATGACATT-TAAATGCA-TC-ATGTTTGAAAGGAAATC-TGA------TAC-G-AGAATTGTACT-T-CT--AACACTG-ATG-C--T--T-----TCG------C-CA-A---------A-AC--AAGC-AATATCTA--TATCTA-TTTCTG--C-TT-AGGT--AATTTTCC----GTCTG--C----A-TT-A-C-AAAG-TGTGG-ATT--A-GAGA-G-G--------------------CCGGG-TC------AGAATCTC---------TCTGAGAGTGG--GACTG--C-GTAACAGGAA-AG---------------CAACGCCCA-TTTTGTCAAATGTTTCTGAG--C--TTT--TGA-T--ACAattgccaaaacacaaa
gi|15 : TTTTCT-TTGACACAGACAAACACTGAGTTTTT-AATGAC-ATGGAA--GTGAATA-TA-AG----CAC-ATTTATCAAAGCATCATG-AAAT--ATAACA--TTATGACAGGT-GGAGA-ATAACTGATCTATTACATT-TATACGCA-TC-ATGTTTGAAAGGAAATC-TGAACTCTTTAT-G-AA------AC---------ATGT---ATCTT--T--TGTGCTTTC------C-CG-AT--------A-AA--ATGC-AATATCTAT--ATCTA-CTTCTG-AC-TTGAGGT--AACTTTCC-TCTGTCTG--C----A-TT-A-C-AAAG-TATGG-ATT--G-GAGAAG-G--------------------CCGGGATC------AGAATCTC---------TCTGAGAGTGG--GGCTA--T-ATAGCAAAAA-GG---------------CAATGCCCA-TTTTGTAAAACTTTTCC-AA--C--TTT--TGA-a
gi|16 : cAGTCC-GAGTTTAATTCATT--TGA-CTGT-TTGTGT-GC-AA-T-AGGGA--CGAG--AT-GAA-ATCCT----TCGT---CAAT-GATTG----T-TTG-TA-G-T--AC-A--CTTTGCG--A-------T-GGCC----------ATGCGC--GAGT-CA-AACATC--TATC-AACCCAGGG--AA--GGGCTGGT-AATGG-GCA-GTGACGGGAA--TGGAAACA-C-AAC-GC-----TAAA---TCATT-TTCTATGGAGT---G-ATAAGTGTAG-TTGT-GACAT--GGACC-GTGCA--GGTTTTC---ATT-----TTC-TCT-----------GTT--T--------GGAT-C-ACG---T--CC-ACT-CATTAA----TTG-ATAT-TGT--CTCATTCG-G---A-G--TAAT-GAACTCGA-AAT---GT-AT-ACAG-TACTGTTT-CTC-TCC--AATA-GT----GAGTCCA-T--GAC---AA-T-
gi|17 : TGTTGCT--T-----TCA------C-T--AT--------A-AA--AAGC-AATATCGAT--ATAAA-TTTCTT-CC-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A-AT-A-T-AAgccgat
gi|17 : tactaatac-ATA-CACA--CTGCAT---CAAGGATTT--GAAG--CAAAACC-A--CACATGTTGAAGC-AATGTTG-A--TGGT-ATCCATGG-AGTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaatacacactgcatcaaggatttgaagcaaaaccacacatgttgaagcaatgttgatggtatccatggagtt
gi|18 : tactaatactgttgctttcactataaaaagcaatatcgatataaatttcttccttgaggtaactttcccctgtctgcaatataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaAATAAGTCG-T-AAGTAACAAACC-ATTCAATA-CAATGTACAGTTGTAAGTA-ATTCT-TTAA-TA-TAT--TA-TCGCACACAACCATTGATTTATTATAAATATTGACTGAAATCGAATACAAAT-ATTGACTG-GA-AT--ATCAA--------CAGAATCAGAAAATGAAA--TCCAT----AC-------CATTTCACATT-TA--TGAA-C--GAGATAAATGTA---A-T--ACAA-ACAAT-----A-AT-CTGTACAG--AAA------A-CAATTAACTTTGATTTTTCTATGTCG--TTAAA-----G------G----GTTTAC------TTTCTTCTCCTAACTATTGACAGAAAT-A---ATTCTAG-TTTCTATG-GCTATCTGTATTTTGTGACATGGTTCTTGTCT--AA
gi|19 : AGAACTA-AACCTAACATGTGAATTATTA-TCCTA-TCAATGGCGTATCTCTTTTTGT-ATGACACAAACAAATTATGTGCTTTT-AGTGAG-ATGAAA--GTCGACAATAGAG----CAC---TTACCAGCCAATAATG-AAAT--CTAACA-----TGACAGGT-TGAGA-TTAATCGATCTATTGCGTT-TAAACGCT-TC-ATGTTACAAAGGAAATT-TGAAACCTCTG--G-A-------ACT-G-TA--CATAT-G-GTACT--T--T----------------CA-AT--------A-AAGAAAGC-AATATCTAT--ATCTA-TCTCTG-AC-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A-TT-A-C-AAAG-AGTGG-ATC--A-GAGAGG-G--------------------CCGGGATT------AGAATCTC---------
gi|2 : TAGCTAC-T-TCTA-TTT-TGCAC-TTGAGGCCAAACTGTCCTCCTGTTTA--TGACAA-TT-G-CTAAAG-TATGG-ATTTAG-GAGAGGTG--------------------CCGGGATCTGATTGACAATATC---------TCTGAGAATGG--GGCTA--TTGTAACAGGAAAGG--------------GCAACCCCCA-TTTTGTAAATTTTTTCT-AA--C--TTTCTTGA-T--ACAGAGAAATTCGTCCC-GCCCC-G-AC---TTTTC---CTACACACATAT--TTGTTCTGCCAG-----------AAT-AGAGAAATT-TGAA--GGTAACC-GGTAT-ATA-CACA--TTGCAT---CAAGGATTT--GAAA--CAAAACC-ACAC-CACGGTGAAGC-AGTGTTGGA--TGGT-ATCCGTGG-AGTTGAA-GAGCTCTCT-TTA-ATTCT-C-CAAAATAATATTTG--TCTTCATAAAAT-ATGAACAC-AGTTA-ATTCGTC---ACAAATA--A-T-TCCTT-AGAATTATTTTC-A-TGATTCTGTAACAGAGAAAATTGGGACAATGGTTCATAGAGTACACTACTTTTGCCTCGCTTGGTGTAAAAGAAA-T-CTCCA-TT-CCAA-GTCT-GAGTTT--TCCATTCGTGT-CTGT-TTGTTTTAC-AAAT-AGGAAT-CGAGGAAT-GAA-ACCCG----TCTT---CAATTAATTG----AGCTG-CAT--T--ACAAACTTACGTG--G-------T-GGGCC---------GTGCTC--G--T-CA-AACATC--TATCAA-CCCAAGG--CA--GAGCTGGTAA-TGG-ACA-GTGACGGGAAAGTGGAAATAAC-A-CAGC-----GATA---TCAGTCTTCTTTAA--T--CGTACAAGTGAAGGCTGT-AAACA--GGACC-GTGTAT-T-TTCCC---ACCTTTTTTTC-CCCCCCCCCAAAAAGTT--TTTATTTGGGGATTC-A-T---T--CC-CCT-GAGTGA--T-T-G-ATGG-ATT--CCCTTCCGCC---A-G--CAAT-GAAC-TGA-AAT---AT-AT-ACTG-TATTGTTTGCTC-TCT--AATACGT---G
gi|20 : gttaatcaagtccattgtgcaataacaacatttggatgctgagaataagtgcatctattgcatttaaatatcatcatgtttacaagcaaatctgacttgaccaagctcgacatctctacaacttgtcgcattcaacttaaatttaaacattatcaacccataaatC-ATCGAA--GTTGATAA-A-AG----CAC-TTCTATCAACTTATCATC-GAAT--ATAACATATT--GGCGAGT-TGAGA-ATAACTGATCTATTACATT-TAAATGCA-TC-ATGTTTAAAAGGAAATC-TGATC--TA-AC-A-A-----------T-CA--CACCC-GCAC--------T-----TCC------CATG-ATTTCATTAAA-AA--AGGC-AATATCAAT--GTCAA-TTTCTG-AC-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A-TT-A-C-AAAG-TGTGG-ATC--T-GAGAGG-G--------------------TTGGGATC------AGAATTTC---------CCTCAGAGTGG--GACTT--T-GTAAGAGGAA-GG---------------CAACGCCCA-TTTTGTAAAATGTTTCT-AA--C--TTT--TGA-T--ACAag
gi|21 : -TTATTG-ACCTA-TCAATGGTGAATCTCTTTTTGT-TTGATACCAAAAGACTTTGTGTT----AATGAC-ATGGAC--GTAGATACTA-AAACAATACTAGTAATCAACTTATCATG-GAAT--ATAACA--TTATGACAGGT-TGAGA-GTAACTGATCCATTACATT-TAAATGAA-TC-ATGTTTGATAGGAAATC-TGATGCAATTGT-C-CC------ACT-TATATTACTGC----TGCT--T--T-----CGC------C----AT--------A-AA--AAGC-AATATC-AA-TATCTA-TTTCTG-AC-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A-CT-A-C-AAAG-TATGG-ATT--G-GAGAGG-A--------------------CCGGGGTC------AGAATCTC---------
gi|22 : CAATGAGTTA-T-AAATAACAAACC-ATTCATTA-C----T----TTGTAAGTA-AGTCT-TTA--TA-TAT--TA-TTGTGT----CC----------------TATCG-------TTGAGAACAAAT-ATTGACTG-AA-AT--ATTTA--------CAGAG------------G--TCCAT----AC---A--ATATT--ACATT-TAC--AAA-T--GA---AAAT-TA---T-T--A--A-ACAAC-----A-TT-CTGCACAG--AAA------A-CG-TC------GATTGTTATATGTCA-AC--AACCC-TA------ACCTTATTTATGGGT-ATTT--TCTTCTAACTATTGACA-AAATTA---ATTCTAG-TTTCTGTG-GCTGTCTGTATTTTGTGATATGGTCTCTGTCT--AAGTG-AC--T--CTTGAT-AA-GACTG-TAACGC
gi|23 : AAATTATATATTC-AG-CTTCTGTG-GCTGTCTGTATTTTTTGA-ATG-TGCTTGTTTTTAAGTGAACAAT--TTGATTTAA-GACTGTTAACGCCCTGT-GTAG-TCCCCCAC-CA-TATGTTGACA-AATCCC-AGTA---TCTGCCA-GACAGGT-CTCT-ATGGCGT---AAAGGTGCGTATCT-CCCAT-CATC---ATAGA---GCAAGT--AGGGTGTGTAGGGT-TG---TC-----AGT-G-CCTG--AGATAA-----ATG---TGACCTG-TACCTAGTC-GTTAGAGT--G--GATTTTA-GGGTAC-AGATA-ACA
gi|24 : gaGAATGTGATCCATCC-TGTAACGA-TTC-T-TTAACGTTAG-TTGATCGAC-TCAATA-TAAGTTTCT-ATT-AA--------------AT--T----ACAGT--GTTCTG--AT-AAT-TC--GTGAGA--AG-TTG----TATAAAA-------------TGTAA--------------TCTTACAAAATGTACTCTACCTGAGAATTT--CCAAGTTCTATTTATAGACAATCGGGAAATAA-CCAGTT-TAACT-CCG-----TACTTTTCTTATTGCA---TGTACTCTGTTG-AC-CTTAA-TATGGAATACCAGTC-TTTA-TTTGATTCG-TTAATCGA
gi|25 : GGGAAATGTGATCCATCC-TGTAACAA-TTA-T-TTAACGTTCA-TTTACCGAA-ACAATA-CAAATGTTT-ATT-AATACGAA-AGAATACATTAC----AC--C--GTTCTGAA---AAC-CC--GTGAAA--AG-TTG----TATAAAA-------------TG-AAT-----------------------TCCACTGCACCTGAGAATTT--AAAACATCTATTTATAGACAATCGG-AAATAC-CCGGTT-AAGCC-C--C--ACTACTCTTCTT-TTGAAAATTG-A-TTTGTTG-ACTCTTAAGTCT-GAATA----T--TTTA-TTCCGTT-G-TT-gacaattgt
gi|26 : -TTATTG-ACCTA-ACAATGGTGTATCTTCTTTTCT-TTGACACAGACAAACACTGTGTTTTC-AACGAC-ATGGAA--GTGAAT-ACA-AG----CTT-ATTTATCAACGCTTCATG-AAAT--ACAAC--ATTATGACAGGT-TGAGA-ATAACTGATCTGTTACATT-AAATTGCA-TC-ATGTTTAAAAGGAAATC-TGATTCCTGTGTGG-AA------AAT-C-TA------T-C-ACGTC--TGAT-----TTC------C-CG-AT--------A-AA--ATGC-AATATCTA--TATCTA-a
gi|27 : --AG-GTAAGTGTAG-TTGT-GACAT--GGACC-GTGCAG-G-TTCTC---ACC-----TTC-ATT----------GGCT-----------GGAT-T-A-A---C--CCCATT-CCATA---T-TTG-ATGG-TTT--CTCATCCG-T---A-G--TAGT-GAACTTGA-AAT---GT-AT-ACAG-TATTGTTT-TTC-CCC--GTTA-GT---GAGGACA--T--GAC---AACC-CC--C-ATCATT-TGA-CGAT------------------GT---GAG--T-AGT-A--GTA-TTCTGGCGAA----TCC-CGGTG--GG-AGT-TCACCC-CGTA-TCCAT-AT--GA--GAAAGTGTA
gi|28 : CCTAGACTTAG----TA-AGCAATAGACTGA--CCACCT--ACCG-C-CTTCCACTGTA-TCTCT-G--CTGT--CTAC--T-CT-GTT--GAGA-----TAC----AATTATTTGGGGCTTGTGAG-AGTCCTCTGTCTTCA-CTCTTTC-TGTGACAGTTTTAGCGCT-GT---TTGATATCTACCGG-TATTCATAC-ATGTAT-AATTGCCTAAATACCAACCCATCAT
gi|29 : taccTTCAATA-C----T----TTGTAAGTA-AGTCT-TTAA-TAATAT--------------AC-----------------TACCG-------TTGATTACAAAT-ATTGACTG-AA-A-T-ATCAACAGAAT--CAGAA------------G--TCCAT----AC---ATTACATTG-ATACTATAG-TAAA-T--GA---AA--ACA---TGT--A--A-ACGGT-----A-TT-CTGTACAG--GAA------ATC--TT------GATTGGCCTGTGT--------------------------ATTAATTGGTAATATCTTCTCCTAACTATTGACAgattgcgaaa
gi|3 : gAG--AT-GAA-ATGCCAGTGTAGTACCCAAT-AATTG----A-TTGGTAGGAC--ACGA--C--CGCG--A-------TTAGCCA---------TTGCGCCTGAG--CA-AACATC--TATCAAACCCAGGGGAAA--TAGGTGGTAA-TGG-GCAAGTGACGGGAAGATGAAACCA-A-GGCGCCTCGTGGTTACATTCAGT-TTCTAT-AGAT--TA-ATAA-TGTA--TTGTCGACAAAGGGATCTGTGCCC-G-TTCTC---ACC-----TTC-ACT----------TAAT--T--------GGAT-CCA-A---TGTCC-A-T-CAGTGAGAT-TTG-ATGG-TTTGTCTCATCCG-GCAGA-GGTTAAT-GAACTTGT-AATCTTGTAATTGCAG-TAATGTTG-CTCCTCCGCAATA-GTCAAGGATCCA--T--GACCCAAG-T-TG--GCGTATTT-TGACCGGTATAGGAAAGCTGGATCGTGT---GAG--TAGGTAT--GGA-ATC-GGCGA-----TCC-GGG-GCGGG-AGTATCAGACAGGTC-TCCATA-T-AGAAATAAGGT--ATG--CTGG-GTGAATGA--T-----AAA------TGTG-GGCTG-AGACAGCT--CACA-G-ATCAC-G-C-T-TAT--AT--CAAC-GGAACCAA--C-CAACGCACTATATG-----AAAT-CAT--GTAGT------CAGAA-TGAT-TTG--GAACCTTGTGA-AATC-CCTCCCTTAGAAACT-A-CCACTCAGCAC-A-T-AC-TT-CTCACCCATAT-ACT-C-GAAGGTTTCTGTGCGTATCATC-T-CC-C-CCGTGTGTCCCCCAG----A--CCTTCTGTAAGGTCACTTCTGTCAGG-TGTCCCGGATATCTCACTGACACACAAAA---CACCCACAGA--AGGGC-TCTGACACTC-GGTAATGTGATTCATCCATGCAAACA-TTC-GTTTAGCGGTGG-------GAC-AC-ATAGCAAAACTCT-G---AAGACTAC-ACTATATA-TATAGAAACAGCAGGTTCTTGAAT-AATATCTAGTGAAGGTAATTTGTGGATACAAGAA-GTCAGTGAAAATGTGATTACTCATGTTAAATCTTACAAAATCCACTCTACCTGG----TT--TAAAATT
gi|30 : acT-GAACTTGA-AAT---ATA-T-ACAG-CATTGTTT-CAC-TCC--AATA-GT---GAAGACA--T--GAC---AA-T-TT--C-TTCATT-TGAC-GGT------------------GT---GAG--TA-GC-T--GTA-ATCTGGCGAA----CCC-CGG-G--GG-CGTATCAGA--GATC-TCCAT-AT-AGA--TAAGgtgatcgtgataac
gi|31 : T----G-AATC-CCTCCCTAGA--ACT-A-CCACTCAGCAC-A-TATC-TCTTTCCATTATATATCT-GTGAAGGTTTC----CGTATCATC-T-CCTC-C---GTGTCTTCTAG----ATCCCTTCTG-AATGTCACTTCTGTT-GG-TGTCCC---TATCTCAC-cgt
gi|32 : AAGTGTAA-TTGT-GACAA--GGACC-GTGCA--TGTTCTC---ATT-----TTC-GTC----------GGA---T--------GGAT-T-A-AT--T--CC-TTT-CA--AA--TCTTG-ATGT-AAT--CTCAACAG-G---A-G--CATT-GTACTTGA-AAT---GT-AT-ACAG-CATTGTTT-CTC-TC
gi|33 : ACGTGAA--TGGAAACA-T-AGCG-C-----GATA---TCAAA-TTC-ATGAGAT--TT-AAAAGTGTAG-TTGT-GACAT--GGACC-GTGTA--GGTTCTC---ACC-----TTCAGC------------ACC--T--------GGTT-C-A--------CC-ACT-CCATAA----TTG-ATGG-TTT--CTCAT
gi|34 : ACCT----G-AATC-CCTCCCTATG--ACT-A-CCACTCTTCAT-A-T-GGATCATCCCTTTCGATAACG-ATAAACCTTTC----TGTATTAGCAC-CC-C-C---GTGTCCCAAAG----ATCCCTTCTG-AAGTTCACTTCTGTC-GG-T
gi|36 : ACATGCTGACA-GATCCCCAGTA---TCTGCCACAAGAGGT-CTCTAA--GGAGT--AACGGTACATGTTT-GTCAT-CATC---ATATA---TC-AGC--AGGGTGTGTAGGTC-TG---TC-----AGT
gi|37 : AGTGAAG-TTGT-GACAA--GGACC-GTGCAG-GTTTC-C---ACC-----TTC-ATT----------GACT-----------GAATTC-A-C---T--CC-ATT-CAATAA--T-T-G-ATGG-ACT--GTCATTCG-T---A-G--TAAT-GAACTTGA-AAT---GTAgact
gi|38 : TTTATAGACAATCGGAAA-TAC-CCAGTT-AACCT-CCGC----TACTTTTCTT-TTGCA---TGTACTCTGTTG-AC-CTTAA-TATGGAATACCAGTACTTTA-TTTGATTCG-TT-ATCt
gi|39 : ATAAATTA-T-AAGTAACAAATC-GTTCAAAA-CA---T----T-GTAATTA-AGTAT-TTAA-TA-TAT--TA-TTGCGC----CC----------------TACTG-------TTGAGTACAAAT-ATTGACTG-AA-A-T-ATCAA--------CAGAA------------a
gi|4 : AAGTCC-GAGTTTAATTCAT------------TTGTC------------------------------ATCCT----TCGT---CAAT-AATTG----A-TTG-TAG--T--ACAA---TACACG--A-------T-GGCCA----------TGCGC--GAGT-CA-AACATC--TCTCAA-CCCAGGG--AA--GGGCTGGTAA-TGG-GCA-GTGACGGGAA--TGGAAACA-C-AACG-C-----TACA---TCAGT-TTCTATG-GAT--AG-ATGAGTGTAG-TTGT-GACAT--GGACC-GTGCAG-G-TTCTC---ACC-----TTC-AAT----------GGCT--A--------GGAT-A-C-A---C--TC-ACT-GAGTAA--T-TAG-ATTG-TGT---TCATCCG-T---ATA--CATT-CAACT-GA-ATA---GTA-T-ACAA-TAGTCTTT-CTTATCCTAGATAAGC---TGAGTCCA-TAAGAC---AA-T-TCTCG-TTGATT-TGAC-AGT------------------GTATAGAGATTA--T-T--GTA-ATCGGTCGAAAGAATCCGCGT-G--AGCAGTATCAGAC-GGTCGTCC-TAATCAGA--TAAGTAGTATGT-CTGGTGTG--TTAATTG---GATAAAACCCCGTTTGACTA-TGACATCTATCACACT-ATCAT-CACTTCTATAGATATCATATGG---TAG--AACATCGC-----ATACTCATTAACTCAT--GC--TTAGGATCAG-ACTGAT-TTTTAAAACATTCA-G-AATCGCCTCCCTAGT--ACT-A-CCACTCAGCAT-C-CGTC-TCAGTCCTCTATATAACT-TTGAAGGTTTC----CGTATCATC-T-CCAC-C---GTGTCTCTCAG----ATCCCTTCTG-AAGGTCACTTCTGTC-GG-TGTCCC---TATTTCAC-GACAC-----A---CACCCACATA-CAGGGCTTCTGATACACGGGGAATGTGATCCATCC-TGTAACGA-TTC-G-TTAACGTTAG-TTGATCGAC-ACAATA-CACATTTCT-ATT-AATACGAA----ACAAATCAT-----TAAC--GTTTTAA----AGC-TT--GTG-AA--ACCTTG----TATGAAAA-A----------TGTAA--------------TCAAACAAAGTCCACTCTACCTGAAAATTCA-CAAAA-TCTATTTATAAATAATCGG-AAATTC-CCAATT-ATGC--CCG---GCTACTTTTCTT-TCGCA---t
gi|40 : CTG--C----A-TT-A-C-AAAG-TATGG-ATT--G-GAGAGG-G--------------------CAGGGATC------AGAACCTC---------TCTGAGAGTGG--GACTA--T-GTAACAGGAA--G--------------ACAACCCCCA-TTTCGTAAAATGTTTCT-AA--C--
gi|41 : CTG-AC-TTGAGGT--ATTTTTCC-CCTGTCTG--C----A-TG-A-C-AAAG-TGTGG-ATC--A-GAGAGG-G--------------------CCGGTATC------AGAACCTC---------TCTAAGAGTGG--GACTG--T-GTAACAGGAA-
gi|42 : -TGAT-TT---AAACCT----A-AATC-CTTCCCTATG--GCT-A-CCACTCAGCATCA-A-TC-TAACTCCATAATATGAAT-GTGAAGCTTTC----CGTATCATC-TCCC-C-C---GTGTCCCaccaac
gi|43 : AAGTGTAG-TTGT-GACAA--GGACC-GTGCA--CGTTCTC---ATT-----TTC-GCT----------GGA---T--------GGAT-TAA-A---T--CC-ATT-C--CAA--TGTTG-ATGT-AAT--CTCAACAG-G---A-G--CATT-GAACTac
gi|44 : aGATGAAAATTATATATTC-AG-CTTCTGTG-GCTG
gi|44 : AATATATAA-TTTTCATCCCGTTCATTTC-ACTGACTTCTTCT-T--CCAACCTTAA-TTCTTccgttcatttcactgacttcttcttccaaccttaattcttc
gi|45 : cagccacagaagctgGGAATGTGATGCATCC-TGTAGCGA-TTC-G-TTAACGTTAc
gi|46 : TTTTCTT-TTGCA---TGCACTTTGTTGCCC-CTTCA-CATGGAATAC------TTTA-TTTGATTCG-TT-ATCctattacatttagctttacacattctattta
gi|47 : --GCTACTTTTCTT-CTGCA---TTT--TCTGTTGCAC----AA-AACAAAATACTAGTACTTTATTTTGATTacaa
gi|48 : CT--CACA-T-ATCAC-C---T-TATG-AT--CA---GG---GAG--C-CAACGC-----ATG-----AAATC
gi|49 : --CAAAACC-A--CACATGTTGGAGC-AATGTTG-A--TGAT-ATC
gi|5 : ACAATAAGT--ATGAAGTAACATACC-ATTTA-TAGTA---T----T----A--A-AGTCTATTAA--A-TATGATA-TTGCGC---ACC----------------TACTG-------TTGATTACAAAT-ATTGTCTGCAA-ACTGACTAAAACAGAATCAGAA------------GGTTCCATCTAAACCCTA--AC-TTG-ACATT-TATGTAAAAT--GG---AAAC-CAGCTT-TGCA--ATACAATTTACTA-TTTCTGTCCAGTGGAATACCCCA-CATTT------GATCGTTCTATGGCATAATAAAATA-TA------AT---AAATATAAAT-ATATCTT-TCCTAACTTATGA--GAGATTA---ATTTT-G-CT-CTCTG-GTTGTCTGTATTTTTTGAT---GTTC--GT------GTGA--------TGTGT-AA-GACCGTTAACGCCCGGG-ACAGGTCTCCCACACATTGT-TTG--A-GATCCCACGT----TC-GCCAGGACAGGTCCTCT-A--TCTTC--AAAATCACGAATCTCCCCATACATCCCAATAGAAATGCAAGTGAAGGGTTTGTGTAAT-CGCGTTCTCCTAGGTCATCCTGCTAGAAATC----TTGAATTGATCTGTTACCTAGTCTGCT---GTCGA-CAA---TA-GGA-ACGGGATACACACATGTGCACAGGTAGCGCAACCAGGGCTCACCAGTCATATTAT---C-TCTGTA------TCATTTCAACTGAACTTTTGTGTGGCCAA--TTAACTTCTTTCATCTATAGCAGTAAACTCTTTATAC-AATATGGTCAACATTCTTG-CCAACC-TTCCTATACTTAGGTTCTA-A--A-TAGACTGAC-CCACCT--ACCG-C-T---CACTGTACTCTCT-GCTCTGT--C-AC---ACT-ACT--AGGATACCCCATTCGAGAA-GT--GTGGC-TGTGAGAAGGCCTCTG-C-TCACTTCTATCTTGTGACATTTTTAACGCTAGTTTATTGATAATTCTC---TAAACGCA--G-GTATCAGTTACCTGAGTA
gi|50 : TCCCGTTCATTTT-ACTGACTTCTTGT-T--CCAAatga
gi|6 : AA--TGGAAACA-C-AGCG-C-----TACA---TCAGT-TTCTAT-AGAT--AG-ATAAGTGTAG-TTGT-GACAT--GGATC-GTGCAG-G-TTCTC---ACC-----TTC-ACT----------AA-T--T--------GGAT-C-A-A---TT-CC-ACT-CAGTGA--T-T-G-ATGG-TGTT-CTCATCCG-G---A-G--TAATTGAACTTGATAAT---GTAAT--CAGGTAT-GTTT-CTC-TCC--AATA-GT---GAGTCCAT-T--GAC---AA-T-TT--G-GCGATTGTGAACGA-------------------GT---GAG--TA-GT-TTTGTACATCTGGCGAA----TCC-----G--GG-AGTATCAGAG-GGTC-TCCATA-T-AGA--TAAG-TGTATGTGCTGG-GTGAATGTATTA---GAAA------TGTG-G-CTGCAGACATCT--CACA-TGATCAC-C--TT-TATG-AT--CA---GG---TAAACC-CAACGC-----ATG-----AAATC-ATTAGT--T------CAG-A-TGATGTT---GAACC-----G-AATC-CGTCCC-AGA--ACTTA-CCACTCAGCAT-ACT-TC-TCACTCCATTATA---CT-CTGAAGGTTTC----TGTATCATC-T-CC-C-CC--GTGTCCCCCAG----ATCCCTTCTG-AAGGTCACTTCTGTC-GG-TGTCCC---TATCTCAC-GACAC-----A---CACCCACATA-CAGGGCTTCTGACACTCGGTGAATGTGATCCATCC-TGCAACGA-TTC-G-TTAGCGTT--------CGAC-ACAATA-CAAA--------------CGAG-ACTACACATTA-----ACAGC--GTTCTGA--T-AAT-TC--GTGAAA--A-TTTG----TATACAA-------------TGTAAT--------------CTTACAAAATCCACTCTACCTG
gi|7 : TATCTCTTTTTCG-TTGACACGAACATACACTGTGCTTTC-AATGAC-ATGGAA--GTGAATA-TA-AG----CGC-ATTAATCAACGCATCATG-AAAT--ACAACA--TTATGACAAGT-GGAGA-ATAACTGATCTATGACATT-TAATTGCA-TC-ATGTTTAAAAGGAAATC-TGATTCCTTTTT-GTAA------ATT-A-TA--A----------CT--T--T-----TCTGCTTTAC-TG-AT--------A-AA--AAGC-AATATCTAT--ATCTA-TTTCTG-AC-TTGAGGT--AACTTTCC-ATTGTCTG--C----A-TT-A-C-ACAG-TATGG-ATT--T-GAGAGA-G--------------------CCGGGGTA------AGAATCTC---------TTTGAGAGTGG--GGCTA--T-GTAACAGAAA-AGCAACNNNNNNGAAAGCAACGCCCA-TGTTGTGAAATGTTTCT-AA--C--TTT--TGA-T--ACAGGAACGTCTGTTGC-GCCCC-G-ACAACTTTTC---CTGCAAACATAT---TGTTCT-CCGG-----------AAT-AAAGAAATT-TGGAAGG-TAACC-GGTAT-ATA-CACA--CTGAAT---CAAGGATTT--GAAA--CAAAACC-A--CACATGTTGGAGC-AATGTTG-A--TGGT-ATCCATGG-GGTAGAA-GAGCATTCT-TGA-ATTCT-C-CAAAATAATA-TTG--TTTTttaaaat
gi|8 : AAA-TTCTCCA-CT-C-AAAGTCT-GAGTTT-----------GT-CTGT-TTGTTT-GA-GA-T-AGGAA--CGAG--AT-GAA-ATCCT----TCAT---CAAT-AATTG----A-ATG-CA-G-T--AC-A--GTAGGTG--A-------T-GGCC----------ATGCGC--GAAT-CA-AACATC--TATC-AACCCAGGG--AA--GGGCTGGT-AATGG-CCA-ATGACGGGAA--CGGAAACA-C-AG-GGC-----GATA---TCAGC-TTCTATGGAAT---T-ATAAGTGTAG-TTGT-GACAT--GGACC-GTGCA--TATTCTC---ACC-----TTC-TCT----------GGC---T--------GGAT-C-A-AT--T--CC-ATT-CAATGA----CTG-ATGA-AAT--ATCATCCG-G---A-G--TAAT-GAACTTGA-AAT---GT-AT-ACAG-TATTGTTT-CTC-TCC--AATA-GT---GAGGACA--T--GAC---AA-TATC----CTCATT-GGA-CGGT------------------GT---GAG--T-AGT-T--GTA-ATCTGGCGAA----TC
gi|8 : C-----ATG-----TAATCCAT--GT---------CAG-A-TGAT-TG---AAACCT----A-AATC-CCTCCCTATA--ACT-A-CCACTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacatgtaatccatgtcagatgattgaaacctaaatccctccctataactaccact
gi|9 : aaattctccactcaaagtctgagtttgtctgtttgtttgagataggaacgagatgaaatccttcatcaataattgaatgcagtacagtaggtgatggccatgcgcgaatcaaacatctatcaacccagggaagggctggtaatggccaatgacgggaacggaaacacagggcgatatcagcttctatggaattataagtgtagttgtgacatggaccgtgcatattctcaccttctctggctggatcaattccattcaatgactgatgaaatatcatccggagtaatgaacttgaaatgtatacagtattgtttctctccaatagtgaggacatgacaatatcctcattggacggtgtgagtagttgtaatctggcgaatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaaGAACTA-CACCTATCATGTGAACTATTG-ACCTA-TCAATGGCATATCTCTTTTTCT-TGGACACAAACAAACACTGTGATTTC-AATGAC-ATGGAA--GTGAAT-ATA-AG----TAC-ATTTATCAACGCATCATG-AAAT--ACAAC--ATAATGACTGGT-TGAGA-ATAACTG--------------AAATGCA-TC-ATGTTTGAAAGGAAATC-TGGTCCCATTGT-G-TA------ACT-T-AT--AACACTG-CTGCT--T--T-----CCA------C----AT--------T-AT--AAGA-AATATCTAT-C-TCTA-TCTCTG-AC-TTGAGGT--AACTTTCA-CCTGTCTG--C----A-TT-A-C-AAAG-TATGG-ATT--A-GAAAGG-GTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTC------GGGATTTCAGAATCTCATCTGAGAGTGGGAGACTAGCT-GTAACA-GAA-GGCC------------CCAATG-CCA---CTGGAAAATGTGTCT-AT--CCTTTT--TGATT--ACAGAGACAT-TGTTGC-ACCCC-A-ACAA-TTTTTCCACTGCAAACATAG-TTTGTTA--CCGGGAACGATCTCAAAT-AAAGACATTGCGAAAGGGTAACC-GGTAT-ATA-CACATTCCCCAT---CAAGGATTTTAAAAA--CAATACC-A-
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|35 ): TTATCCTATGATAAGCTGAATATGAAAGGAATGCTTGTTGATTTAATAGTGTCTTCATGGGAATGTACTGTTATCCATCAATCCACTAAATAGAACAGCTGATAACCCTAAC
Alignments
lowQualScore : 222 333333333 11111 5555555555555555555555 2222222 222 44444444 333333333333333 1111 333333 22 111 1111 111 3333333333333333 22222 111 55555555 888888888888888888888888 11111 222 11 11 222222222 1 1 1 1 2222 1 22222222222 111 1111 11 111 22222 222 11 333333 111 1 3333333333333333333 1 1 1 1 1 11 11 333333 1111 222222222 11 1 1 22 11 33333 1 222222222222 1 1 11 1 22222 1 1 11 11 5555555555555555555555555555 1 11 1 11 1 1 1 111 1 2222 1 1 1 2 1 222 11111 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 111 22222 111111 22222222222222222222 111111111 444444444444444 1 111 222 44444444444 111 11 2222 11 1 1 1 1 1 1 11 1 1 1 3333 222222 111 11 2 1 1 2 1 1 1 11 111 22222222222 11 1111 111 222222 22222222222222 1111111111 33333333333 11 11 1 11 1 11111 11111111 3333 33333333333333333333333333333 222222222222 1111 11 11 111111 1 333333333333333333 11111 1111 22 11 333333333333333 22222 22 222 1111111111 11111 2222222 2222222222 1 111 111111 222 1111 1 111 1111 111 222222222 11111111 11111 11111 11111 22222 11111 1111 777777777777777777777777777777777 11 1 11 2222 111 111 11111111111 444444
lowQualScore : 333 8 8 7 6 666666666 7 2 6 6 6 6 00000 9999999999999999999999 8888888 1 6 6 6 333 33333333 888888888888888 7777 333333 0 11 8 777 8888 444 0 0000000000000000 00000 8 8 444 22222222 777777777777777777777777 11111 1 0 1 3 333 7 6 6 0 22 6 3 11 888888888 22 0 0 9 3 3 6 7 9 2 3 0 8 0000 3 8 0 99999999999 11 0 8 8 444 9999 66 11 77 8 444 00000 777 33 666666 777 5 3 7777777777777777777 0 0 0 0 1 7 3 88 0 88 888888 2222 222222222 8 8 8 8 11 77 0 7 2 55 33 1 77777 6 3 1 3 333333333333 0 5 33 0 88888 0 0 33 33 3 4444444444444444444444444444 0 33 2 9 3 0 3 22 3 0 0 3 0 777 1 2 0 3 0000 0 88 2 3 2 3 6 3 6 6 0 5 0 0 5 4 66 0 99 4 9999 4 55 2 4 55 4 555 2 4 4 4 3 3 3 3 0 22222 22 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 3 000 3 999999 66666 3 222222 3 44 3 44 9999 3 3 3 3 3 3 7777 3 77777777777777777777 999999 333333333 99 777 4 4 555555555555555 1 8 4 66 66 66 5 77 8 8 999 0 6 444 888 88 66666666666 8 8 0 5 8 6 6 99 0 111 99 33 4444 6 6 99 6 11 3 0 0 0 0 0 9 33 3 3 3 7 0000 555555 6 1 777 8888 0 7 88 0 5 1 1 0 3 6 0 3 0 0 6 6 88 222 6 6 11111111111 55 5 77 5 5 2222 3 000 5 111111 5 22222222222222 9999999999 5 55555555555 55 5 5 77 1 5 5 33 77 5 9 5 5 11 4 4 7 00000 777 777 5 66666666 3 2 2 777 2 4444 555 77777 77777777777777777777777777777 111111111111 2 0 333 4444 6 2 444 66 888 3 44 3 2 1 3 555 44 55 3 3 6 00 7 666 2222 4 99 55 777 4 4 444444 1 5 8 666666666666666666 888 77777 5 66 5 0 0000 66 5 77 5 0 00 5 77 5 77 2 88 8 6 0 666666666666666 8 3 8 99 888 99999 6 00 99 777 4444444444 44444 1111111 99 9999999999 3 5 5 555 999999 4 9999 4 4 5 111 5 33 1 2 66 0000 5 5 0 5 333 2222 5 5 5 111 6 555555555 8 0 1 5 5 888 22222222 6 6 55 33333 7 99999 1 1 88888 99 55555 6 99 55555 4444 555555555555555555555555555555555 3 99 77 0 3 0 8 8 11 4444 5 000 666 66666666666 1 333333 6 8 8
lowQualScore : ... . . . . ......... . . . . . . ..... ...................... ....... . . . . ... ........ ............... .... ...... . .. . ... .... ... . ................ ..... . . ... ........ ........................ ..... . . . . ... . . . . .. . . .. ......... .. . . . . . . . . . . . . .... . . . ........... .. . . . ... .... .. .. .. . ... ..... ... .. ...... ... . . ................... . . . . . . . .. . .. ...... .... ......... . . . . .. .. . . . .. .. . ..... . . . . ............ . . .. . ..... . . .. .. . ............................ . .. . . . . . .. . . . . . ... . . . . .... . .. . . . . . . . . . . . . . . .. . .. . .... . .. . . .. . ... . . . . . . . . . ..... .. ....................................................................... . ... . ...... ..... . ...... . .. . .. .... . . . . . . .... . .................... ...... ......... .. ... . . ............... . . . .. .. .. . .. . . ... . . ... ... .. ........... . . . . . . . .. . ... .. .. .... . . .. . .. . . . . . . . .. . . . . .... ...... . . ... .... . . .. . . . . . . . . . . . . . .. ... . . ........... .. . .. . . .... . ... . ...... . .............. .......... . ........... .. . . .. . . . .. .. . . . . .. . . . ..... ... ... . ........ . . . ... . .... ... ..... ............................. ............ . . ... .... . . ... .. ... . .. . . . . ... .. .. . . . .. . ... .... . .. .. ... . . ...... . . . .................. ... ..... . .. . . .... .. . .. . . .. . .. . .. . .. . . . ............... . . . .. ... ..... . .. .. ... .......... ..... ....... .. .......... . . . ... ...... . .... . . . ... . .. . . .. .... . . . . ... .... . . . ... . ......... . . . . . ... ........ . . .. ..... . ..... . . ..... .. ..... . .. ..... .... ................................. . .. .. . . . . . .. .... . ... ... ........... . ...... . . .
lowQualScore : 000 0 0 8 7 333333333 3 5 7 7 7 7 00000 7777777777777777777777 3333333 0 7 7 7 888 33333333 444444444444444 0000 888888 8 00 0 000 6666 000 8 2222222222222222 00000 0 0 000 22222222 000000000000000000000000 66666 4 8 0 2 333 3 7 7 6 00 4 2 00 000000000 55 0 0 2 7 3 7 3 8 5 2 0 8 8888 2 8 0 55555555555 22 8 0 0 000 0000 88 00 00 0 000 00000 000 22 222222 555 5 2 8888888888888888888 0 0 0 0 0 3 3 33 7 33 333333 7777 555555555 0 0 0 0 00 00 0 3 0 33 33 0 33333 7 3 2 2 888888888888 0 0 88 0 22222 0 0 22 88 2 2222222222222222222222222222 0 88 5 2 0 0 0 55 2 0 0 2 0 555 0 5 0 2 5555 0 22 5 2 0 3 7 3 7 7 7 0 8 4 0 4 11 1 33 4 4444 4 55 5 0 55 0 333 6 0 0 0 6 6 6 6 4 77777 22 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 3 444 3 666666 00000 3 999999 3 66 3 22 6666 1 1 1 1 3 3 4444 3 11111111111111111111 666666 333333333 55 000 0 0 666666666666666 1 9 4 11 11 99 0 99 2 0 222 8 0 000 666 88 00000000000 0 0 8 0 0 7 7 22 7 777 22 66 9999 7 7 22 7 88 2 0 0 0 0 0 0 88 3 3 3 3 0000 777777 7 0 777 3333 7 3 33 0 5 0 0 7 3 7 0 2 0 0 5 7 55 333 7 7 33333333333 88 2 99 7 7 1111 0 000 7 777777 7 44444444444444 6666666666 7 11111111111 77 7 7 99 6 0 0 66 99 0 0 7 7 00 0 0 5 00000 000 555 7 77777777 6 9 9 777 9 1111 000 11111 22222222222222222222222222222 222222222222 9 4 666 0000 9 9 999 88 555 1 22 9 9 5 1 444 77 00 3 3 7 00 3 444 2222 0 55 55 000 0 0 444444 0 0 1 999999999999999999 888 22222 0 99 0 1 6666 44 7 99 7 1 77 7 00 7 99 5 88 0 4 8 888888888888888 0 8 0 22 333 77777 7 22 22 555 0000000000 33333 0000000 22 2222222222 3 7 7 777 888888 4 6666 4 4 0 111 0 99 0 0 44 6666 0 0 0 0 888 1111 7 7 7 777 7 000000000 0 8 4 7 7 666 22222222 7 7 00 00000 2 33333 0 7 33333 22 88888 7 22 22222 2222 222222222222222222222222222222222 2 00 44 8 6 8 0 0 88 3333 7 000 777 22222222222 0 000000 7 0 0
consensus : NACAATAAGTTAAT-AAGTAACAAACC-ATTCAATA-CA---T----TTGTAAGTA-AGTCT-TTAA-TA-TAT--TA-TTGCGC---ACC----------------TACCG-------TTGAGTACAAAT-ATTGACTG-AA-ATT-ATCAA--------CAGAA------------G--TCCAT----AC---A--ACATTG-ACATT-TAC-TAAA-C--GA---AAATACA---T-T--A--A-ACAAT-----A-TT-CTGTACAG---AAAACG----A--TTGATTGTTCTATGTCA-ACTAAACCC-TA------A----ATTTATGGGT-ATTTCTTCTCCTAACTATTGACAGAAATTA---ATTCTAG-CTTCTGTG-GCTGTCTGTATTTTTTGACATGGTTCCTGTCT--AAGTGAAC--T--TTGAAT-AA-GACTGTTAACGCCCCGT-GTAGGTCCCCCACACAACATGTTGACA-GATCCCCAGTA---TCTGCCAGGACAGGT-CTCT-A--GCNTC--AAAGNTACGTATCT-CCCAT-CATC---ATAGA---GCAAGT--AGGGTGTGTGTGAT-TG---TC-----AGTCG-CCTG-TAGATAT-----TTG---TGACCTGTTACCTAGTC-GCT---GT--A-CGA---CA-GGG-AC-AGATA-ACANATGTGCAC-GGT--CGCAA--AGGG------AGATATAATATAAAANT-TNTATC-CCGT-TCATTTC-ACTGACTTCTTGT-T--CCAACNTTAA-TTCTTTCAACTATAGC-GTAAACTCTTTATACGAANATAGT-AGCNCTCTTGCCCAACC-TTCCTAAACTTAG----TA-A-CA-TAGACTGAC-CCACCT--ACCG-C-T---CACTGTA-TCTCT-G-TCTGT--CTAC--TACT-ACT--ANGACAC---------GAT-AT--GGGGCTTGTGAG-AGTCCTCTG-CTTCA-TTCTATC-TGTGACAGTTTTAGCGCT-GT---TTGATATCTNCCGG-TAATCGTAC-G-GTAT-AATCGCCTAAATATAAACCCATCATATACATAACCTAGACTTTAGAACTA-AACCTA-CATGTGA-TTATTG-ACCTA-TCAATGGCGTATCTCTTTTTCT-TTGACACAAACAAACACTGTGCTTTC-AATGAC-ATGGAA--GTGGATAATA-AG----CAC-ATTTATCAA--CGCATCATG-AAAT--A-CAACA-ATTATGACAGGT-TGAGA-ATAACTG-ATCTATTACATT-TAAATG-CA-TC-ATGTTTGAAAGGAAATC-----TGATCC---CTNTGC-G-AA----A-C-T-N-TA--AACG-C-G-TGCTTTTCC------C-CG-A--T--------A-AA---AAGC-AATATC------TA--T-TATCTA-TTTCTG------AC-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A-TT-A-C-AAAG-TATGG-ATT--G-GAGAGG-G--------------------CCGGGATC------AGAATCTC---------TCTGAGAGTGG--GACTA--T-GTAACAGGAA-GG--------------ACAACGCCCA-TTTTGTAAAATGTTTCT-AA--C--TTT--TGA-T--ACAGGGACATCTGTTGC-GCCCC-G-ACAA-TTTTC---CTGCAAACATAT-GTTGTTCT-CCGG-----------AAT-AAAGAAATT-TGGAAGGGTAACC-GGTAT-ATA-CACA--CCGCAT---CAAGGATTT--GAAA--CAAAACC-A-ACACATGTTGGAGC-AATGTTG-A--TGGT-ATCCATGG-AGTTGAA-GAGCTTTCT-TGA-ATTCT-C-CAAAATAATACTTG--TTTTCATAAAAT-ATGAACAC-AGTAA-ATTCGTC---ACAGAAA--ACT-TCCTTCAAAATNATTTTC-A-TGATTCCGTAACGGAGAAAACTGG--CAATGGTTCATAGAGTACACTANCTTTGNCCCGCTCG-TG-AAAAGAAA-TTCTCCA-CT-CCAAAGTCC-GAGTTTAATTCATT--TGT-CTGT-TTGTTT-GC-GA-T-AGGAA--CGAG--AT-GAA-ATCCT----TCGT---CAAT-AATTG----A-TTG-TAGG-T--ACGA--CTACGCG--A-------T-GGCCA---------ATGCGC--GAGT-CA-AACATC--TATCAAACCCAGGG--AA--GGGCTGGTAAATGG-GCA-GTGACGGGAA--TGGAAACA-C-AGCGGC-----GATA---TCAGT-TTCTATGAGAT--AG-ATAAGTGTAG-TTGT-GACAN--GGACC-GTGCAG-GGTTCTC---ACC-----TTC-GCT----------GGCT--T--------GGAT-C-A-A---T--CC-ACTC-AGTAA--T-TTG-ATGG-NNT--CTCATCCGG---A-G--TAAT-GAACTTGA-AAT---GTAAT-ACAG-TATTGTTT-CTC-TCC--AATA-GT---GAGGNC-AT--G--AC---AA-T-TC--G-GTNATT-TGACCGGT------------------GT---GAG--TAAGT-T--GTA-ATCTGGCGAA----TCC-CGG-G--GG-AGTATCAGAC-GGTC-TCCATAAT-AGA--TAAGGTGTATGT-CTGG-GTGGATGAATTG---GANA------CGTG-GACTG-AGACATCT--CACA-T-ATCAC-C-CTT-TATGGAT--CA---GG---TAG--C-CAACGC-----ATG-A-----AATCCAT--GT--T------CAG-A-TGAT-TT---AAACCT----G-AATC-CCTCCCTANG--ACT-A-CCACTCAGCAT-A-T-TC-TCACTCCNCTATATAACT-CTGAAGGTTTC----CGTATCATC-T-CC-C-C---GTGTCCCCCAG----ATCCCTTCTG-AAGGTCACTTCTGTC-GG-TGTCCC---TATCTCAC-GACAC-----A---CACCCACATA-CAGGGCTTCTGACACACGGGGAATGTGATCCATCC-TGTAACGA-TTC-G-TTAACGTTAG-TTGATCGAC-ACAATA-CAAATTTCT-ATT-AATACGAG-ACTACACATTAT----ACAGC--GTTCTGAAAT-AAT-TC--GTGAAA--AGTTTG----TATAAAAA-G----------TGTAAT-------------TCTTACAAAATCCACTCTACCTGAGAATTT--CAAAGTTCTATTTATAGACAATCGGAAAATAC-CCGGTT-AAGCT-CCGC--GCTACTTTTCTT-TTGCA---TGTACTCTGTTG-AC-CTTAA-TATGGAATACCAGT--TTTA-TTTGATTCG-TT-ATCGA
Reference ( family-5170 ) : NACAATAAGTTAAT-AAGTAACAAACC-ATTCAATA-CA---T----TTGTAAGTA-AGTCT-TTAA-TA-TAT--TA-TTGCGC---ACC----------------TACCG-------TTGAGTACAAAT-ATTGACTG-AA-ATT-ATCAA--------CAGAA------------G--TCCAT----AC---A--ACATTG-ACATT-TAC-TAAA-C--GA---AAATACA---T-T--A--A-ACAAT-----A-TT-CTGTACAG---AAAACG-------TTGATTGTTCTATGTCA-ACTAAACCC-TA------A----ATTTATGGGT-ATTTCTTCTCCTAACTATTGACAGAAATTA---ATTCTAG-CTTCTGTG-GCTGTCTGTATTTTTTGACATGGTTCCTGTCT--AAGTGAAC--T--TTGAAT-AA-GACTGTTAACGCCCCGT-GTAGGTCCCCCACACAACATGTTGACA-GATCCCCAGTA---TCTGCCAGGACAGGT-CTCT-A--GCNTC--AAAGNTACGTATCT-CCCAT-CATC---ATAGA---GCAAGT--AGGGTGTGTGTGAT-TG---TC-----AGTCG-CCTG-TAGATAT-----TTG---TGACCTGTTACCTAGTC-GCT---GT--A-CGA---CA-GGG-AC-AGATA-ACANATGTGCAC-GGT--CGCAA--AGGG------AGATATAATATAAAATT-TNTATC-CCGT-TCATTTC-ACTGACTTCTTGT-T--CCAACNTTAA-TTCTTTCAACTATAGC-GTAAACTCTTTATACGAANATAGT-AGCNCTCTTGCCCAACC-TTCCTAAACTTAG----TA-A-CA-TAGACTGAC-CCACCT--ACCG-C-T---CACTGTA-TCTCT-G-TCTGT--CTAC--TACT-ACT--ANGACAC---------GAT-AT--GGGGCTTGTGAG-AGTCCTCTG-CTTCA-TTCTATC-TGTGACAGTTTTAGCGCT-GT---TTGATATCTNCCGG-TAATCGTAC-G-GTAT-AATCGCCTAAATATAAACCCATCATATACATAACCTAGACTTTAGAACTA-AACCTA-CATGTGA-TTATTG-ACCTA-TCAATGGCGTATCTCTTTTTCT-TTGACACAAACAAACACTGTGCTTTC-AATGAC-ATGGAA--GTGGATAATA-AG----CAC-ATTTATCAA--CGCATCATG-AAAT--A-CAACA-ATTATGACAGGT-TGAGA-ATAACTG-ATCTATTACATT-TAAATG-CA-TC-ATGTTTGAAAGGAAATC-----TGATCC---CTNTGC-G-AA----A-C-T-T-TA--AACG-C-GATGCTTTTCC------C-CG-A--T--------A-AA---AAGC-AATATC------TA--T-TATCTA-TTTCTG------AC-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A-TT-A-C-AAAG-TATGG-ATT--G-GAGAGG-G--------------------CCGGGATC------AGAATCTC---------TCTGAGAGTGG--GACTA--T-GTAACAGGAA-GG--------------ACAACGCCCA-TTTTGTAAAATGTTTCT-AA--C--TTT--TGA-T--ACAGGGACATCTGTTGC-GCCCC-G-ACAA-TTTTC---CTGCAAACATAT-GTTGTTCT-CCGG-----------AAT-AAAGAAATT-TGGAAGGGTAACC-GGTAT-ATA-CACA--CCGCAT---CAAGGATTT--GAAA--CAAAACC-A-ACACATGTTGGAGC-AATGTTG-A--TGGT-ATCCATGG-AGTTGAA-GAGCTTTCT-TGA-ATTCT-C-CAAAATAATACTTG--TTTTCATAAAAT-ATGAACAC-AGTAA-ATTCGTC---ACAGAAA--ACT-TCCTTCAAAATNATTTTC-A-TGATTCCGTAACGGAGAAAACTGG--CAATGGT-CATAGAGTACACTANCTTTGNCCCGCTCG-TG-AAAAGAAA-TTCTCCA-CT-CCAAAGTCC-GAGTTTAATTCATT--TGT-CTGT-TTGTTT-GC-GA-T-AGGAA--CGAG--AT-GAA-ATCCT----TCGT---CAAT-AATTG----A-TTG-TAGG-T--ACGA--CTACGCG--A-------T-GGCCA---------ATGCGC--GAGT-CA-AACATC--TATCAAACCCAGGG--AA--GGGCTGGTAAATGG-GCA-GTGACGGGAA--TGGAAACA-C-AGCGGC-----GATA---TCAGT-TTCTATGAGAT--AG-ATAAGTGTAG-TTGT-GACAN--GGACC-GTGCAG-GGTTCTC---ACC-----TTC-GCT----------GGCT--T--------GGAT-C-A-A---T--CC-ACTC-AGTAA--T-TTG-ATGG-NNT--CTCATCCGG---A-G--TAAT-GAACTTGA-AAT---GTAAT-ACAG-TATTGTTT-CTC-TCC--AATA-GT---GGAGNC-AT--G--AC---AA-T-TC--G-GTNATT-TGACCGGT------------------GT---GAG--TAAGT-T--GTA-ATCTGGCGAA----TCC-CGG-G--GG-AGTATCAGAC-GGTC-TCCATAAT-AGA--TAAGGTGTATGT-CTGG-GTGGATGAATTG---GANA------CGTG-GACTG-AGACATCT--CACA-T-ATCAC-C-CTT-TATGGAT--CA---GG---TAG--C-CAACGC-----ATG-N-----AATCCAT--GT--T------CAG-A-TGAT-TT---AAACCT----G-AATC-CCTCCCTANG--ACT-A-CCACTCAGCAT-A-T-TC-TCACTCCNCTATATAACT-CTGAAGGTTTC----CGTATCATC-T-CC-C-C---GTGTCCCCCAG----ATCCCTTCTG-AAGGTCACTTCTGTC-GG-TGTCCC---TATCTCAC-GACAC-----A---CACCCACATA-CAGGGCTTCTGACACACGGGGAATGTGATCCATCC-TGTAACGA-TTC-G-TTAACGTTAG-TTGATCGAC-ACAATA-CAAATTTCT-ATT-AATACGAG-ACTACACATTAT----ACAGC--GTTCTGAAAT-AAT-TC--GTGAAA--AGTTTG----TATAAAAA-G----------TGTAAT-------------TCTTACAAAATCCACTCTACCTGAGAATTT--CAAAGTTCTATTTATAGACAATCGGAAAATAC-CCGGTT-AAGCT-CCGC--GCTACTTTTCTT-TTGCA---TGTACTCTGTTG-AC-CTTAA-TATGGAATACCAGT--TTTA-TTTGATTCG-TT-ATCGA
gi|1 : ACAATGGGTTAAT-AAGTAACAAACCTATTCATTA-C---------TTGTACGTATAGTCT-TTAACTA-TAT--TAATTGCGC----CC----------------TATCGC------TTGAGTACAAATTATTGACTG-AACATT-ATCTA--------CATAA------------G--TCCAT----ACG--A--ATATTGTACATT-TAC-TAAA-CCTGA---AAATACA---T-T--A--AGACAAT-----AGTC-CTGCACAG---AAACGG-------TTGATTGTTCTAT-TCA-ACTAAACCCATATCCGCTA----TTTTATGGAT-ATTCCCTCTTCTA-CTATTGACAGAAGTTA---ATTCTAGGCTTCTGTGTGCTGTCTGTATTTGTTCTCCTGGTTCCTGTCT--AAGTGAAC--TCTTTGAAT-AACGACTGGTAACGCCCCGTTGTAAGTCCCCCACACAACATGTTGACATGACCCCCAGTAATTTCTGCCAGGACAGGT-CTCT-A--ACTTCTAAAATCTACGTATCT-CCCAT-CATC---ATAGA----CATGT--AGGGTGTGTGTAAT-TG---TC-----AGTTG-CCTG-TAGATAT-----TTG---TGACTGG--ACCT---T-ACT---GT--A-TGA---CA-GGG-AC-AGATA-ACAGTTGTGCAC-GGT--CACAA--AGGG------AGATATAATATAAAAATATCTATC-CCGT-TCATTTC-ACTGACTTCTTGT-T--CCAACTTAAA-TTCTTTCAATTATATT-GTAAACTCTTTATTCGAACATAGT--GTCCTCTTGCCCAACC-TTCCTAAACTT-G----TA-A-CA-GAGACTGACTCCACCTGAGCCA-CGT---CACTGTA-TCTCTGG-TCTGTTCCTACGATACCGACCAAATAACAT---------GAT-AT--GGGGCTTGGGAG-AGTCCTCT--CTTCC-TTCTATC-TGTGACAGTTAAAGCGCT-GT---TTGATATCTTCCGGTTAATCGTAC-G-GTAT-ATCCGCCTAAA-ATAAA--CATCATATACATAACCTAGACTTTAGAACTAGAACCTA-CATGTGA-TTTTTGAACCTACTCAACGGTGTATTTATATTTCTATGGACACAAACAAATATCA-GCTTTCAAATTACAATGGAAAGGTGAATTATA-AG----TA--ATTTAACAA--CGCTTGATGAAAATAGA-CAACC-ATTATGACTGGTGTGAGATATAATTG-ATCTATTGCATTCTAAATG-CA-TCAATATTTTGAAAGTAACC-----T-ATCC---CTGTGC-G-AG----A-C-TGC-TA--AACG-C-AATGTTTTTCC------C-TG-A--T--------ATAA---ATGC-AATATC------TA--TCTATCTACTTTCTGA-----ACGTTGAGGT---ACTTTCC-CC--TCTGAAC----ACTT-ACC-AAAGAAATGG-ATT--GCGAGAAG-G--------------------GCGGAATC------AGAAT-TT---------TCTGAGAGTGGC-GACT---T-GT-ACAGGAA-GG--------------AGAATCCCCAGTTTCGTAAAATGTTTCT-AA--C--TCT--TGT-TTAACAGGGACATCTGTTGC-GCTCC-GTACAG-CTTTC---CTGCAAACTTATGGTTGTTCT-CCGG-----------AATAAAAGAAATT-TGGAAAGGTAACC-AGTAT-ATATCACA--CCGCAT---CAAGGATTT--GAAAC-CAAAACCAA-ATACATGTT-AAGC-AATGTTG-A--TGGT-A-CCATGG--GTTGAATGAGCTTTCTATGA-ATTCT-CACAAAATAATACTTGGTTTTTCATAAAATGATTAACACGAGTAATATTCATCTGGACAGGAA--ATTGTCCTTCAAAAAGATTTTCAA-TGATTCCGTAACAGAG-AAACTGG--CAATGGT-CATAGAGT-CACTAGCTTTGGCCCGCTCG-TGAAAAAGAAATTTCTCCATCTGCCAAAATCC-GAATTTAATTCATT--TGT-CTGT-TTGTGT-GCTAA-TCAGGAA--CAAG--AT-GAA-ATCTC----TCTT---CAAT-AATTG------TTG-TAGG-T--ACGG--CTACGCGGAA-------T-GGCCA---------ATGTGC--GAGT-CA-GAAATC--TCTCAAACCCAGGG--AAGGGGGCTGGTAAATGGTGCA-GTGACGGGAA--TGGAAACA-CTAGCGGC-----GACA---TCA-T-TTC-ACGAGAC--AG-ATAAGTGTAG-TTGT-GAAAG--GGACC-GTGCAGCGGTTCCTGCAACC-----TTC-TCT----------AGCCTGT--------GAAT-C-A-C---T---C-ACTC-AGTAGC-T-TTGAATGGTCTT--CTCATC--G---A-G--TAAT-GAACTTGA-AAT---GTAAT-GCAA-TACTGTTT-CTC-TCC--AATA-GT---GGAGTC-GC--GCAAC---AA-T-TG--G-GTTATA-GGACCGGT------------------GT---GAG--GAAGT-T--GTA-ATCTGGCGAA----TCC-CGG-G--GG-AGTAGCAGA--GATC-TCCATAAT-AGA--TAAGGTGTATCT-CT-G-GTGGATGAAT------ATA------CGTG-GATGA-AGACATCT--CACA-T-ATCACAC-CTT-TATGGAG--CAG--GG---TAC--C-TAATGC-----ATGTT-----AATCCAT--GT--T------CAGTA-GAAT-TT---AAACCT----GAAATC-CCTCCCTACG--ACT-AGCCACTCAGC-T-AGT-TC-TGTATCCTCTATATAACTCCTGAAGGTTTC----CGTATCATC-T-CC-C-C---GTGTCCACGAG----ATCCCTTCTG-AAGGCAACTTCTGTC-GGTTGTCCC---TA-CTCAC-GACAC-----AAATCACCCACATAGCGGGGCTTCTGACACACGGGGAA-GTGATCCATCC-TGTAACGAGTTCAG-TTAA-ATTAGTTTGATCGACTCCAATA-CGAATTTCTAATTGAATACGAGCACTACACATTAC----ACAGC--ATTCTGAAATGAAT-TC--GTGAAA--AGTTTG----TTTAAAAATG----------TATAAT-------------TCTTACAAAATCTACACTACCTGAGAATTTTACAAAGTTCTATTTAT-GACAATCGGAAAATACTCCGGTTAAAGCTGCCGCTAGCTATTTCTCTG-TTGCA---TGCG-------------------ATGGAATAC--G----TTA-TTTGATTCGTTT-ATCAA
gi|10 : c-TAAATA-CAATC-ATGTTTGATAGGAAATCA----TGATGC---TTGTA------------------TC--AACA-C---TGTCTATTT------C-AGTA--A--------A-AA---AAGCCAATATC------TA--T--ATCTA-TTTCTG------AC-TTGAGGT--AAACTTTC-CCTGTCTG--CC---A-TTTA-C-AAAG-TATGGGATT--G-GAGAGG-G--------------------CCGGGATC------GAGATCTC---------TCTGGAAGTGG--GGC-A--T-GTAGCAGAAA-GC--------------AC----CCCAGTTTTGTACAATGTTTCT-AAATC--TTT--TGA-T--ACA-GTAGATGTGTTGTGGCCCCGG-ACAATTTTTC---CTGCAGAAATGT-G-TGTTCT-CCGGA----------AAT-AAA-AAATT-TGGGAGCTTAACCAAGTATGATA-CACA--CTGCATTCACAAGGATTT--GAAAGTCAAAACC---ACACGTGTTGGAGCAAATGTTG-ACGCGGTAATCCATGGTAATTG-A-GAGCTTTCT-TGAGATTCCGC-CAAAATAATA-TTG--TTTTCCTGAAAT-ATGAACAC-AGTAA-A-TCGT-----CAGAAATCACT-TCCTTCAAAATAATTTTC-ACTGA----GTAACGAAGAAAACTGG--CAATGGagctg
gi|11 : AA--TGGAAACA-C-AACG-C-----GATG---TCATA-TTC-AT----T--AG-ATAGACG-AG-T-----ATA---GAACT-TTGTGA-------C---A-------------T----------AGCA--T--------GGA----A-AACGT--CC-ACTA-AATAA--T-T-G-ATGG-ACT--CTCATTCGG---A-A--TA--------------T---GTAGT--CGG-TATTGTTT-CTC-TCC--AATA-GT---GAGTCC-GT--G--AC---AA-T-TT--G-GTTATA-TGA-CGGT------------------GT---GAG--TAGG--T--GTA-ATCTGGCGAA----TCT-CGG-G--GG-AGTGTCAGA--GGTC-TTCAT-AT-AGA--TAA-GTGTATGT-CTGT-GTGGATGAATTGATAGA-A------CGTG-GACTG-AGACATCT--CACA-T-CTCAC-C---T-TAT-GAT--CA---GT---TTG--C-CAAAAC-----ATG-A-----AATCCAT--G---T------CAG-A-TGAT-TT---AA-------------------------------A-CCACTCAGCAT-ATT-TC-TCACTCCTCTATATAAGT-CTGAAGGTTTC----TGTATCATC-C-CC-TAC---GTGT----CAGAAATATCCCTTCTG-AAGGTCACTTCTGTC-GG-TGTCCC---TATCTCAC-GACAC-----A---CCCCCACATA-CAGGACTTCTGACGCACGTGGAATGatctctcgtcaacaaatgcgtaata
gi|12 : TTTGTTCCGCTTG-TG-AAAAGAAA-TTCTCCC-TT-CTATAATCTTGAGTTC---TTATT--TGTGCTGTACTGTTTTGC-GA-T-AGAAAGAC-AG--ATTGAATATCCT----TCCT---CGAT-AATTGTGAAG-TCG-AGGA-TTGATGC--CAACGCG--AAGAGGAAT-GATCAGAATCGGCCATGTGTTGAAGTACATAAGATCGCTTTCAAATCAAGGGG-AA--GTGCTGGTAA-TGG-GCA-GTGACGGGAA--TGAAAACA-C-AGCG-C-----AATG---TCGAA-ATCTA---AATTCAG-AAAAGTGTAG-CTGT-GACAA--GGACC-GTGCAT-G-TTCTC---ATT-----TTC-GTT----------GGAT-----------GGAC-T-A-AG--T--CC-ATTCCAGT----T-TTG-ATGA-AAT--CTCAACAGG---A-G--CATT-GAACTTGA-AAT---ATA-T-ACAG-CATTGTTT-CTC-TCC--AATA-GT---GAGGAC-AT--G--AC---AA-T-TT--G-GCGAT
gi|13 : TACGTA-CT-CCCAT-CATC---GTAGA---GCA-GT--AGGGTTTGT-TGATCTG---CC-----AGTT---CTG-TAGATACATGTATTG---TGACTTGTTACCTAGTC---T---GT--AGTGA---CATAGG-AT-AGATA-GCATATG--CAC-GGT--CACAA--AGGG------AGATA-AACATAAAACT-GATATT-CCGT-TCATTCC-ACTCACTGCTTGT-T--CCAACATTAA-TTCTT-CAA-TACAG--GTAATCTTTTCACA-GAAAAGAGT-A--TCTCTTGCCCAAGCATTCCTAAACTTAG----TCTA-CA-TAGACTGAC-C-ACCC--ACCGTC-G---CACTTTA-TCTTT-G-TCTAT--CTAC-------ACT--ATGGCAT---------GAT-AT--GGG-------------TCTCTG-CTTCA-TTCTATC-TGTGACAG--TTAGGGCT-GT---GTGATATTTACCGG-T-ATCGTACAA-GTAT-AA-CG-CTAAATATAAATC
gi|14 : -TTATTG-ACCTA-TCATTATTGAATCTCTTTTTGT-TTGGCACAGACAATCTTTGTGCTTTT-AATGCC-ATGGAC--GTTGATAATA-A-----CAC-ATTTATCAA--CGCATCATG-AAAT--A-TAACA--TTATGGCAGGT-TGATA-ATAACTG-ATCTATGACATT-TAAATG-CA-TC-ATGTTTGAAAGGAAATC-----TGATAC-------GA-G-AATTGTA-C-T-T-CT--AACA-CTGATGC-TTTCG------C-CA-A-----------A-AC---AAGC-AATATC------TA----TATCTA-TTTCTG-------C-TT-AGGT--AATTTTCC----GTCTG--C----A-TT-A-C-AAAG-TGTGG-ATT--A-GAGA-G-G--------------------CCGGG-TC------AGAATCTC---------TCTGAGAGTGG--GACTG--C-GTAACAGGAA-AG---------------CAACGCCCA-TTTTGTCAAATGTTTCTGAG--C--TTT--TGA-T--ACAattgccaaaacacaaa
gi|15 : TTTTCT-TTGACACAGACAAACACTGAGTTTTT-AATGAC-ATGGAA--GTGAATA-TA-AG----CAC-ATTTATCAA--AGCATCATG-AAAT--A-TAACA--TTATGACAGGT-GGAGA-ATAACTG-ATCTATTACATT-TATACG-CA-TC-ATGTTTGAAAGGAAATC-----TGAACT---CTTTAT-G-AA----A-CAT-G-TA--TCTT-T-TGTGCTTT--C------C-CG-A--T--------A-AA---ATGC-AATATC------TA--T--ATCTA-CTTCTG------AC-TTGAGGT--AACTTTCC-TCTGTCTG--C----A-TT-A-C-AAAG-TATGG-ATT--G-GAGAAG-G--------------------CCGGGATC------AGAATCTC---------TCTGAGAGTGG--GGCTA--T-ATAGCAAAAA-GG---------------CAATGCCCA-TTTTGTAAAACTTTTCC-AA--C--TTT--TGA-a
gi|16 : cAGTCC-GAGTTTAATTCATT--TGA-CTGT-TTGTGT-GC-AA-T-AGGGA--CGAG--AT-GAA-ATCCT----TCGT---CAAT-GATTG----T-TTG-TA-G-T--AC-A--CTTTGCG--A-------T-GGCC----------ATGCGC--GAGT-CA-AACATC--TATC-AACCCAGGG--AA--GGGCTGGT-AATGG-GCA-GTGACGGGAA--TGGAAACA-C-AAC-GC-----TAAA---TCATT-TTCTATGGAGT---G-ATAAGTGTAG-TTGT-GACAT--GGACC-GTGCA--GGTTTTC---ATT-----TTC-TCT-----------GTT--T--------GGAT-C-ACG---T--CC-ACTC-ATTAA----TTG-ATAT-TGT--CTCATTCGG---A-G--TAAT-GAACTCGA-AAT---GT-AT-ACAG-TACTGTTT-CTC-TCC--AATA-GT---GAGTCC-AT--G--AC---AA-T-
gi|17 : TGCTTT--C------A-CT-A--T--------A-AA---AAGC-AATATC------GA--T--ATAAA-TTTCTT------CC-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A-AT-A-T-AAgccgat
gi|17 : tactaatactgt-ATA-CACA--CTGCAT---CAAGGATTT--GAAG--CAAAACC-A--CACATGTTGAAGC-AATGTTG-A--TGGT-ATCCATGG-AGTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaatacacactgcatcaaggatttgaagcaaaaccacacatgttgaagcaatgttgatggtatccatggagtt
gi|18 : tactaatactgttgctttcactataaaaagcaatatcgatataaatttcttccttgaggtaactttcccctgtctgcaatataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaAATAAGTCG-T-AAGTAACAAACC-ATTCAATA-CAATGTACAGTTGTAAGTA-ATTCT-TTAA-TA-TAT--TA-TCGCACACAACCATTGATTTATTATAAATATTGACTGAAATCGAATACAAAT-ATTGACTG-GA-AT--ATCAA--------CAGAATCAGAAAATGAAA--TCCAT----AC-------CATTTCACATT-TA--TGAA-C--GAGATAAATGTA---A-T--ACAA-ACAAT-----A-AT-CTGTACAG---AAAACAATTAACTTTGATTTTTCTATGTCG--TTAAA-----G------G----GTTTAC------TTTCTTCTCCTAACTATTGACAGAAAT-A---ATTCTAG-TTTCTATG-GCTATCTGTATTTTGTGACATGGTTCTTGTCT--AA
gi|19 : AGAACTA-AACCTAACATGTGAATTATTA-TCCTA-TCAATGGCGTATCTCTTTTTGT-ATGACACAAACAAATTATGTGCTTTT-AGTGAG-ATGAAA--GTCGACAATAGAG----CAC---TTACCAG--CCAATAATG-AAAT--C-TAACA-----TGACAGGT-TGAGA-TTAATCG-ATCTATTGCGTT-TAAACG-CT-TC-ATGTTACAAAGGAAATT-----TGAAAC---CTCTG----GA----A-C-T-G-TA--CATA-T-GGTACTTT-----------CA-A--T--------A-AAGA-AAGC-AATATC------TA--T--ATCTA-TCTCTG------AC-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A-TT-A-C-AAAG-AGTGG-ATC--A-GAGAGG-G--------------------CCGGGATT------AGAATCTC---------
gi|2 : TTAATCAAGTC-CATTGTG-CAAT--AACAACA-TTTG-GAT--GC-TGAGA-ATAAGTGCATCTATTGCATT-TAAATATCA-TC-ATGTTTACAAGCAAATCTGACTTGA-CCAAGCT---C-G-AC----ATC-T-C-TAC-AACT-T-GTCGCATT-----------CA-ACTT--------A-AATTTAAAC-ATTATCAACCCATAAAT-TAGCTA-CTTCTATTTTGCAC-TTGAGGCCAAACTGTCCTCCTGTTTA--TGACAA-TT-G-CTAAAG-TATGG-ATTTAG-GAGAGGTG--------------------CCGGGATCTGATTGACAATATC---------TCTGAGAATGG--GGCTA--TTGTAACAGGAAAGG--------------GCAACCCCCA-TTTTGTAAATTTTTTCT-AA--C--TTTCTTGA-T--ACAGAGAAATTCGTCCC-GCCCC-G-AC---TTTTC---CTACACACATAT--TTGTTCTGCCAG-----------AAT-AGAGAAATT-TGAA--GGTAACC-GGTAT-ATA-CACA--TTGCAT---CAAGGATTT--GAAA--CAAAACC-ACAC-CACGGTGAAGC-AGTGTTGGA--TGGT-ATCCGTGG-AGTTGAA-GAGCTCTCT-TTA-ATTCT-C-CAAAATAATATTTG--TCTTCATAAAAT-ATGAACAC-AGTTA-ATTCGTC---ACAAATA--A-T-TCCTT-AGAATTATTTTC-A-TGATTCTGTAACAGAGAAAATTGGGACAATGGTTCATAGAGTACACTACTTTTGCCTCGCTTGGTGTAAAAGAAA-T-CTCCA-TT-CCAA-GTCT-GAGTTT--TCCATTCGTGT-CTGT-TTGTTTTAC-AAAT-AGGAAT-CGAGGAAT-GAA-ACCCG----TCTT---CAATTAATTG----AGCTG-CAT--T--ACAAACTTACGTG--G-------T-GGGCC---------GTGCTC--G--T-CA-AACATC--TATCAA-CCCAAGG--CA--GAGCTGGTAA-TGG-ACA-GTGACGGGAAAGTGGAAATAAC-A-CAGC-----GATA---TCAGTCTTCTTTAA--T--CGTACAAGTGAAGGCTGT-AAACA--GGACC-GTGTAT-T-TTCCC---ACCTTTTTTTC-CCCCCCCCCAAAAAGTT--TTTATTTGGGGATTC-A-T---T--CC-CCTG-AGTGA--T-T-G-ATGG-ATT--CCCTTCCGCC--A-G--CAAT-GAACT-GA-AAT---ATA-T-ACTG-TATTGTTTGCTC-TCT--AATACGT---G
gi|20 : gC-ATCGAA--GTTGATAA-A-AG----CAC-TTCTATCAA--CTTATCATC-GAAT--A-TAACATATT--GGCGAGT-TGAGA-ATAACTG-ATCTATTACATT-TAAATG-CA-TC-ATGTTTAAAAGGAAATC-----TGATCT-------------A----A-C-AAT-CA--CACC-C-G---CACTTCC------CATG-A--TTTCATTAAA-AA---AGGC-AATATC------AA--T--GTCAA-TTTCTG------AC-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A-TT-A-C-AAAG-TGTGG-ATC--T-GAGAGG-G--------------------TTGGGATC------AGAATTTC---------CCTCAGAGTGG--GACTT--T-GTAAGAGGAA-GG---------------CAACGCCCA-TTTTGTAAAATGTTTCT-AA--C--TTT--TGA-T--ACAag
gi|21 : -TTATTG-ACCTA-TCAATGGTGAATCTCTTTTTGT-TTGATACCAAAAGACTTTGTGTT----AATGAC-ATGGAC--GTAGATACTA-AAACAATACTAGTAATCAA--CTTATCATG-GAAT--A-TAACA--TTATGACAGGT-TGAGA-GTAACTG-ATCCATTACATT-TAAATG-AA-TC-ATGTTTGATAGGAAATC-----TGATGC---AATTGT-C-CC----A-C-T-TATATTACTG-C---TGCTTTCGC------C----A--T--------A-AA---AAGC-AATATC-------A--A-TATCTA-TTTCTG------AC-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A-CT-A-C-AAAG-TATGG-ATT--G-GAGAGG-A--------------------CCGGGGTC------AGAATCTC---------
gi|22 : CAATGAGTTA-T-AAATAACAAACC-ATTCATTA-C----T----TTGTAAGTA-AGTCT-TTA--TA-TAT--TA-TTGTGT----CC----------------TATCG-------TTGAGAACAAAT-ATTGACTG-AA-AT--ATTTA--------CAGAG------------G--TCCAT----AC---A--ATATT--ACATT-TAC--AAA-T--GA---AAAT-TA---T-T--A--A-ACAAC-----A-TT-CTGCACAG---AAAACG-------TCGATTGTTATATGTCA-AC--AACCC-TA------ACCTTATTTATGGGT-ATTT--TCTTCTAACTATTGACA-AAATTA---ATTCTAG-TTTCTGTG-GCTGTCTGTATTTTGTGATATGGTCTCTGTCT--AAGTG-AC--T--CTTGAT-AA-GACTG-TAACGC
gi|23 : AAATTATATATTC-AG-CTTCTGTG-GCTGTCTGTATTTTTTGA-ATG-TGCTTGTTTTTAAGTGAACAAT--TTGATTTAA-GACTGTTAACGCCCTGT-GTAG-TCCCCCAC-CA-TATGTTGACA-AATCCC-AGTA---TCTGCCA-GACAGGT-CTCT-ATGGCGT---AAAGGTGCGTATCT-CCCAT-CATC---ATAGA---GCAAGT--AGGGTGTGTAGGGT-TG---TC-----AGT-G-CCTG--AGATAA-----ATG---TGACCTG-TACCTAGTC-GTTAGAGT--G--GATTTTA-GGGTAC-AGATA-ACA
gi|24 : gaGAATGTGATCCATCC-TGTAACGA-TTC-T-TTAACGTTAG-TTGATCGAC-TCAATA-TAAGTTTCT-ATT-AA--------------AT--T----ACAGT--GTTCTG--AT-AAT-TC--GTGAGA--AG-TTG----TATAAAA-------------TGTAA--------------TCTTACAAAATGTACTCTACCTGAGAATTT--CCAAGTTCTATTTATAGACAATCGGGAAATAA-CCAGTT-TAACT-CCG-----TACTTTTCTTATTGCA---TGTACTCTGTTG-AC-CTTAA-TATGGAATACCAGTC-TTTA-TTTGATTCG-TTAATCGA
gi|25 : GGGAAATGTGATCCATCC-TGTAACAA-TTA-T-TTAACGTTCA-TTTACCGAA-ACAATA-CAAATGTTT-ATT-AATACGAA-AGAATACATTAC----AC--C--GTTCTGAA---AAC-CC--GTGAAA--AG-TTG----TATAAAA-------------TG-AAT-----------------------TCCACTGCACCTGAGAATTT--AAAACATCTATTTATAGACAATCGG-AAATAC-CCGGTT-AAGCC-C--C--ACTACTCTTCTT-TTGAAAATTG-A-TTTGTTG-ACTCTTAAGTCT-GAATA----T--TTTA-TTCCGTT-G-TT-gacaattgt
gi|26 : -TTATTG-ACCTA-ACAATGGTGTATCTTCTTTTCT-TTGACACAGACAAACACTGTGTTTTC-AACGAC-ATGGAA--GTGAAT-ACA-AG----CTT-ATTTATCAA--CGCTTCATG-AAAT--A-CAAC--ATTATGACAGGT-TGAGA-ATAACTG-ATCTGTTACATT-AAATTG-CA-TC-ATGTTTAAAAGGAAATC-----TGATTC---CTGTGTGG-AA----A-A-T-C-TAT-CACGTC---TGATTT--C------C-CG-A--T--------A-AA---ATGC-AATATC------TA----TATCTA-a
gi|27 : --AG-GTAAGTGTAG-TTGT-GACAT--GGACC-GTGCAG-G-TTCTC---ACC-----TTC-ATT----------GGCT-----------GGAT-T-A-A---C--CCCATTC-CATA---T-TTG-ATGG-TTT--CTCATCCGT---A-G--TAGT-GAACTTGA-AAT---GT-AT-ACAG-TATTGTTT-TTC-CCC--GTTA-GT---GAGGAC-AT--G--AC---AACC-CC--C-ATCATT-TGA-CGAT------------------GT---GAG--T-AGT-A--GTA-TTCTGGCGAA----TCC-CGGTG--GG-AGT-TCACCC-CGTA-TCCAT-AT--GA--GAAAGTGTA
gi|28 : CCTAGACTTAG----TA-AGCAATAGACTGAC-C-ACCT--ACCG-C-CTTCCACTGTA-TCTCT-G--CTGT--CTAC--T-CT-GTT--GAGATAC---------AATTATTTGGGGCTTGTGAG-AGTCCTCTGTCTTCA-CTCTTTC-TGTGACAGTTTTAGCGCT-GT---TTGATATCTACCGG-TATTCATAC-ATGTAT-AATTGCCTAAATACCAACCCATCAT
gi|29 : taccTTCAATA-C----T----TTGTAAGTA-AGTCT-TTAA-TAATAT--------------AC-----------------TACCG-------TTGATTACAAAT-ATTGACTG-AA-A-T-ATCAACAGAAT--CAGAA------------G--TCCAT----AC---ATTACATTG-ATACTATAG-TAAA-T--GA---AA--ACA---TGT--A--A-ACGGT-----A-TT-CTGTACAG---GAAATC-------TTGATTGGCCTGTGT--------------------------ATTAATTGGTAATATCTTCTCCTAACTATTGACAgattgcgaaa
gi|3 : gAG--AT-GAA-ATGCCAGTGTAGTACCCAAT-AATTG----A-TTGGTAGGAC--ACGA--C--CGCG--A-------TTAGCCA---------TTGCGCCTGAG--CA-AACATC--TATCAAACCCAGGGGAAA--TAGGTGGTAA-TGG-GCAAGTGACGGGAAGATGAAACCA-A-GGCGCCTCGTGGTTACATTCAGT-TTCTAT-AGAT--TA-ATAA-TGTA--TTGTCGACAAAGGGATCTGTGCCC-G-TTCTC---ACC-----TTC-ACT----------TAAT--T--------GGAT-CCA-A---TGTCC-A-TC-AGTGAGAT-TTG-ATGG-TTTGTCTCATCCGGCAGA-GGTTAAT-GAACTTGT-AATCTTGTAATTGCAG-TAATGTTG-CTCCTCCGCAATA-GTCAAGGATCC-AT--G--ACCCAAG-T-TG--GCGTATTT-TGACCGGTATAGGAAAGCTGGATCGTGT---GAG--TAGGTAT--GGA-ATC-GGCGA-----TCC-GGG-GCGGG-AGTATCAGACAGGTC-TCCATA-T-AGAAATAAGGT--ATG--CTGG-GTGAATGA--T-----AAA------TGTG-GGCTG-AGACAGCT--CACA-G-ATCAC-G-C-T-TAT--AT--CAAC-GGAACCAA--C-CAACGCACTATATG-A-----AAT-CAT--GTAGT------CAGAA-TGAT-TTG--GAACCTTGTGA-AATC-CCTCCCTTAGAAACT-A-CCACTCAGCAC-A-T-AC-TT-CTCACCCATAT-ACT-C-GAAGGTTTCTGTGCGTATCATC-T-CC-C-CCGTGTGTCCCCCAG----A--CCTTCTGTAAGGTCACTTCTGTCAGG-TGTCCCGGATATCTCACTGACACACAAAA---CACCCACAGA--AGGGC-TCTGACACTC-GGTAATGTGATTCATCCATGCAAACA-TTC-GTTTAGCGGTGG-------GAC-AC-ATAGCAAAACTCT-G---AAGACTAC-ACTATATA-TATAGAAACAGCAGGTTCTTGAAT-AATATCTAGTGAAGGTAATTTGTGGATACAAGAA-GTCAGTGAAAATGTGATTACTCATGTTAAATCTTACAAAATCCACTCTACCTGG----TT--TAAAATT
gi|30 : acT-GAACTTGA-AAT---ATA-T-ACAG-CATTGTTT-CAC-TCC--AATA-GT---GAAGAC-AT--G--AC---AA-T-TT--C-TTCATT-TGA-CGGT------------------GT---GAG--T-AGC-T--GTA-ATCTGGCGAA----CCC-CGG-G--GG-CGTATCAGA--GATC-TCCAT-AT-AGA--TAAGgtgatcgtgataac
gi|31 : T----G-AATC-CCTCCCTAGA--ACT-A-CCACTCAGCAC-A-TATC-TCTTTCCATTATATATCT-GTGAAGGTTTC----CGTATCATC-T-CCTC-C---GTGTCTTCTAG----ATCCCTTCTG-AATGTCACTTCTGTT-GG-TGTCCC---TATCTCAC-cgt
gi|32 : AAGTGTAA-TTGT-GACAA--GGACC-GTGCA--TGTTCTC---ATT-----TTC-GTC----------GGA---T--------GGAT-T-A-AT--T--CC-TTTC-A--AA--TCTTG-ATGT-AAT--CTCAACAGG---A-G--CATT-GTACTTGA-AAT---GT-AT-ACAG-CATTGTTT-CTC-TC
gi|33 : ACGTGAA--TGGAAACA-T-AGCG-C-----GATA---TCAAA-TTC-ATGAGAT--TT-AAAAGTGTAG-TTGT-GACAT--GGACC-GTGTA--GGTTCTC---ACC-----TTCAGC------------ACC--T--------GGTT-C-A--------CC-ACTC-CATAA----TTG-ATGG-TTT--CTCAT
gi|34 : ACCT----G-AATC-CCTCCCTATG--ACT-A-CCACTCTTCAT-A-T-GGATCATCCCTTTCGATAACG-ATAAACCTTTC----TGTATTAGCAC-CC-C-C---GTGTCCCAAAG----ATCCCTTCTG-AAGTTCACTTCTGTC-GG-T
gi|36 : ACATGCTGACA-GATCCCCAGTA---TCTGCCACAAGAGGT-CTCTAA--GGAGT--AACGGTACATGTTT-GTCAT-CATC---ATATA---TC-AGC--AGGGTGTGTAGGTC-TG---TC-----AGT
gi|37 : AGTGAAG-TTGT-GACAA--GGACC-GTGCAG-GTTTC-C---ACC-----TTC-ATT----------GACT-----------GAATTC-A-C---T--CC-ATTC-AATAA--T-T-G-ATGG-ACT--GTCATTCGT---A-G--TAAT-GAACTTGA-AAT---GTAgact
gi|38 : TTTATAGACAATCGGAAA-TAC-CCAGTT-AACCT-CCGC----TACTTTTCTT-TTGCA---TGTACTCTGTTG-AC-CTTAA-TATGGAATACCAGTACTTTA-TTTGATTCG-TT-ATCt
gi|39 : ATAAATTA-T-AAGTAACAAATC-GTTCAAAA-CA---T----T-GTAATTA-AGTAT-TTAA-TA-TAT--TA-TTGCGC----CC----------------TACTG-------TTGAGTACAAAT-ATTGACTG-AA-A-T-ATCAA--------CAGAA------------a
gi|4 : AAGTCC-GAGTTTAATTCAT------------TTGTC------------------------------ATCCT----TCGT---CAAT-AATTG----A-TTG-TAG--T--ACAA---TACACG--A-------T-GGCCA----------TGCGC--GAGT-CA-AACATC--TCTCAA-CCCAGGG--AA--GGGCTGGTAA-TGG-GCA-GTGACGGGAA--TGGAAACA-C-AACG-C-----TACA---TCAGT-TTCTATG-GAT--AG-ATGAGTGTAG-TTGT-GACAT--GGACC-GTGCAG-G-TTCTC---ACC-----TTC-AAT----------GGCT--A--------GGAT-A-C-A---C--TC-ACTG-AGTAA--T-TAG-ATTG-TGT---TCATCCGT---ATA--CATT-CAACT-GA-ATA---GTA-T-ACAA-TAGTCTTT-CTTATCCTAGATAAGC---TGAGTCCATAAG--AC---AA-T-TCTCG-TTGATT-TGAC-AGT------------------GTATAGAGATTA--T-T--GTA-ATCGGTCGAAAGAATCCGCGT-G--AGCAGTATCAGAC-GGTCGTCC-TAATCAGA--TAAGTAGTATGT-CTGGTGTG--TTAATTG---GATAAAACCCCGTTTGACTA-TGACATCTATCACACT-ATCAT-CACTTCTATAGATATCATATGG---TAG--AACATCGC-----ATA-CTCATTAACTCAT--GC--TTAGGATCAG-ACTGAT-TTTTAAAACATTCA-G-AATCGCCTCCCTAGT--ACT-A-CCACTCAGCAT-C-CGTC-TCAGTCCTCTATATAACT-TTGAAGGTTTC----CGTATCATC-T-CCAC-C---GTGTCTCTCAG----ATCCCTTCTG-AAGGTCACTTCTGTC-GG-TGTCCC---TATTTCAC-GACAC-----A---CACCCACATA-CAGGGCTTCTGATACACGGGGAATGTGATCCATCC-TGTAACGA-TTC-G-TTAACGTTAG-TTGATCGAC-ACAATA-CACATTTCT-ATT-AATACGAA----ACAAATCAT-----TAAC--GTTTTAA----AGC-TT--GTG-AA--ACCTTG----TATGAAAA-A----------TGTAA--------------TCAAACAAAGTCCACTCTACCTGAAAATTCA-CAAAA-TCTATTTATAAATAATCGG-AAATTC-CCAATT-ATGC--CCG---GCTACTTTTCTT-TCGCA---t
gi|40 : CTG--C----A-TT-A-C-AAAG-TATGG-ATT--G-GAGAGG-G--------------------CAGGGATC------AGAACCTC---------TCTGAGAGTGG--GACTA--T-GTAACAGGAA--G--------------ACAACCCCCA-TTTCGTAAAATGTTTCT-AA--C--
gi|41 : CTG------AC-TTGAGGT--ATTTTTCC-CCTGTCTG--C----A-TG-A-C-AAAG-TGTGG-ATC--A-GAGAGG-G--------------------CCGGTATC------AGAACCTC---------TCTAAGAGTGG--GACTG--T-GTAACAGGAA-
gi|42 : -TGAT-TT---AAACCT----A-AATC-CTTCCCTATG--GCT-A-CCACTCAGCATCA-A-TC-TAACTCCATAATATGAAT-GTGAAGCTTTC----CGTATCATC-TCCC-C-C---GTGTCCCaccaac
gi|43 : AAGTGTAG-TTGT-GACAA--GGACC-GTGCA--CGTTCTC---ATT-----TTC-GCT----------GGA---T--------GGAT-TAA-A---T--CC-ATTC---CAA--TGTTG-ATGT-AAT--CTCAACAGG---A-G--CATT-GAACTac
gi|44 : aGATGAAAATTATATATTC-AG-CTTCTGTG-GCTG
gi|44 : AATATATAATT-TTCATC-CCGT-TCATTTC-ACTGACTTCTTCT-T--CCAACCTTAA-TTCTTccgttcatttcactgacttcttcttccaaccttaattcttc
gi|45 : cagccacagaagctgGGAATGTGATGCATCC-TGTAGCGA-TTC-G-TTAACGTTAc
gi|46 : TTTTCTT-TTGCA---TGCACTTTGTTGCCC-CTTCA-CATGGAATAC------TTTA-TTTGATTCG-TT-ATCctattacatttagctttacacattctattta
gi|47 : --GCTACTTTTCTT-CTGCA---TTT--TCTGTTGCAC----AA-AACAAAATACTAGTACTTTATTTTGATTacaa
gi|48 : CT--CACA-T-ATCAC-C---T-TATG-AT--CA---GG---GAG--C-CAACGC-----ATG-A-----AATC
gi|49 : --CAAAACC-A--CACATGTTGGAGC-AATGTTG-A--TGAT-ATC
gi|5 : ACAATAAGT--ATGAAGTAACATACC-ATTTA-TAGTA---T----T----A--A-AGTCTATTAA--A-TATGATA-TTGCGC---ACC----------------TACTG-------TTGATTACAAAT-ATTGTCTGCAA-ACTGACTAAAACAGAATCAGAA------------GGTTCCATCTAAACCCTA--AC-TTG-ACATT-TATGTAAAAT--GG---AAAC-CAGCTT-TGCA--ATACAATTTACTA-TTTCTGTCCAGTGGAATACCCCACAT-TTGATCGTTCTATGGCATAATAAAATA-TA------AT---AAATATAAAT-ATATCTT-TCCTAACTTATGA--GAGATTA---ATTTT-G-CT-CTCTG-GTTGTCTGTATTTTTTGAT---GTTC--GT------GTGA--------TGTGT-AA-GACCGTTAACGCCCGGG-ACAGGTCTCCCACACATTGT-TTG--A-GATCCCACGT----TC-GCCAGGACAGGTCCTCT-A--TCTTC--AAAATCACGAATCTCCCCATACATCCCAATAGAAATGCAAGTGAAGGGTTTGTGTAAT-CGCGTTCTCCTAGGTCATCCTGCTAGAAATC----TTGAATTGATCTGTTACCTAGTCTGCT---GTCGA-CAA---TA-GGA-ACGGGATACACACATGTGCACAGGTAGCGCAACCAGGGCTCACCAG---TCATAT---------TATCTCTGTATCATTTCAACTGAACTTTTGTGTGGCCAA--TTAACTTCTTTCATCTATAGCAGTAAACTCTTTATAC-AATATGGTCAACATTCTTG-CCAACC-TTCCTATACTTAGGTTCTA-A--A-TAGACTGAC-CCACCT--ACCG-C-T---CACTGTACTCTCT-GCTCTGT--C-AC---ACT-ACT--AGGATACCCCATTCGAGAA-GT--GTGGC-TGTGAGAAGGCCTCTG-C-TCACTTCTATCTTGTGACATTTTTAACGCTAGTTTATTGATAATTCTC---TAAACGCA--G-GTATCAGTTACCTGAGTA
gi|50 : TC-CCGT-TCATTTT-ACTGACTTCTTGT-T--CCAAatga
gi|6 : AA--TGGAAACA-C-AGCG-C-----TACA---TCAGT-TTCTAT-AGAT--AG-ATAAGTGTAG-TTGT-GACAT--GGATC-GTGCAG-G-TTCTC---ACC-----TTC-ACT----------AA-T--T--------GGAT-C-A-A---TT-CC-ACTC-AGTGA--T-T-G-ATGG-TGTT-CTCATCCGG---A-G--TAATTGAACTTGATAAT---GTAAT--CAGGTAT-GTTT-CTC-TCC--AATA-GT---GAGTCC-ATT-G--AC---AA-T-TT--G-GCGATTGTGAACGA-------------------GT---GAG--TA-GT-TTTGTACATCTGGCGAA----TCC-----G--GG-AGTATCAGAG-GGTC-TCCATA-T-AGA--TAAG-TGTATGTGCTGG-GTGAATGTATTA---GAAA------TGTG-G-CTGCAGACATCT--CACA-TGATCAC-C--TT-TATG-AT--CA---GG---TAAACC-CAACGC-----ATG-A-----AATC-ATTAGT--T------CAG-A-TGATGTT---GAACC-----G-AATC-CGTCCC-AGA--ACTTA-CCACTCAGCAT-ACT-TC-TCACTCCATTATA---CT-CTGAAGGTTTC----TGTATCATC-T-CC-C-CC--GTGTCCCCCAG----ATCCCTTCTG-AAGGTCACTTCTGTC-GG-TGTCCC---TATCTCAC-GACAC-----A---CACCCACATA-CAGGGCTTCTGACACTCGGTGAATGTGATCCATCC-TGCAACGA-TTC-G-TTAGCGTT--------CGAC-ACAATA-CAAA--------------CGAG-ACTACACATTA-----ACAGC--GTTCTGA--T-AAT-TC--GTGAAA--A-TTTG----TATACAA-------------TGTAAT--------------CTTACAAAATCCACTCTACCTG
gi|7 : TATCTCTTTTTCG-TTGACACGAACATACACTGTGCTTTC-AATGAC-ATGGAA--GTGAATA-TA-AG----CGC-ATTAATCAA--CGCATCATG-AAAT--A-CAACA--TTATGACAAGT-GGAGA-ATAACTG-ATCTATGACATT-TAATTG-CA-TC-ATGTTTAAAAGGAAATC-----TGATTC---CTTTTT-GTAA----A-T-T-A-TA--A----------CTTTTCTGCTTTAC-TG-A--T--------A-AA---AAGC-AATATC------TA--T--ATCTA-TTTCTG------AC-TTGAGGT--AACTTTCC-ATTGTCTG--C----A-TT-A-C-ACAG-TATGG-ATT--T-GAGAGA-G--------------------CCGGGGTA------AGAATCTC---------TTTGAGAGTGG--GGCTA--T-GTAACAGAAA-AGCAACNNNNNNGAAAGCAACGCCCA-TGTTGTGAAATGTTTCT-AA--C--TTT--TGA-T--ACAGGAACGTCTGTTGC-GCCCC-G-ACAACTTTTC---CTGCAAACATAT---TGTTCT-CCGG-----------AAT-AAAGAAATT-TGGAAGG-TAACC-GGTAT-ATA-CACA--CTGAAT---CAAGGATTT--GAAA--CAAAACC-A--CACATGTTGGAGC-AATGTTG-A--TGGT-ATCCATGG-GGTAGAA-GAGCATTCT-TGA-ATTCT-C-CAAAATAATA-TTG--TTTTttaaaat
gi|8 : AAA-TTCTCCA-CT-C-AAAGTCT-GAGTTT-----------GT-CTGT-TTGTTT-GA-GA-T-AGGAA--CGAG--AT-GAA-ATCCT----TCAT---CAAT-AATTG----A-ATG-CA-G-T--AC-A--GTAGGTG--A-------T-GGCC----------ATGCGC--GAAT-CA-AACATC--TATC-AACCCAGGG--AA--GGGCTGGT-AATGG-CCA-ATGACGGGAA--CGGAAACA-C-AG-GGC-----GATA---TCAGC-TTCTATGGAAT---T-ATAAGTGTAG-TTGT-GACAT--GGACC-GTGCA--TATTCTC---ACC-----TTC-TCT----------GGC---T--------GGAT-C-A-AT--T--CC-ATTC-AATGA----CTG-ATGA-AAT--ATCATCCGG---A-G--TAAT-GAACTTGA-AAT---GT-AT-ACAG-TATTGTTT-CTC-TCC--AATA-GT---GAGGAC-AT--G--AC---AA-TATC----CTCATT-GGA-CGGT------------------GT---GAG--T-AGT-T--GTA-ATCTGGCGAA----TC
gi|8 : C-----ATG-T-----AATCCAT--GT---------CAG-A-TGAT-TG---AAACCT----A-AATC-CCTCCCTATA--ACT-A-CCACTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacatgtaatccatgtcagatgattgaaacctaaatccctccctataactaccact
gi|9 : aaattctccactcaaagtctgagtttgtctgtttgtttgagataggaacgagatgaaatccttcatcaataattgaatgcagtacagtaggtgatggccatgcgcgaatcaaacatctatcaacccagggaagggctggtaatggccaatgacgggaacggaaacacagggcgatatcagcttctatggaattataagtgtagttgtgacatggaccgtgcatattctcaccttctctggctggatcaattccattcaatgactgatgaaatatcatccggagtaatgaacttgaaatgtatacagtattgtttctctccaatagtgaggacatgacaatatcctcattggacggtgtgagtagttgtaatctggcgaatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaaGAACTA-CACCTATCATGTGAACTATTG-ACCTA-TCAATGGCATATCTCTTTTTCT-TGGACACAAACAAACACTGTGATTTC-AATGAC-ATGGAA--GTGAAT-ATA-AG----TAC-ATTTATCAA--CGCATCATG-AAAT--A-CAAC--ATAATGACTGGT-TGAGA-ATAACTG---------------AAATG-CA-TC-ATGTTTGAAAGGAAATC-----TGGTCC---CATTGT-G-TA----A-C-T-T-AT--AACA-CTGCTGCTTTCCA------C----A--T--------T-AT---AAGA-AATATC------TA--T-C-TCTA-TCTCTG------AC-TTGAGGT--AACTTTCA-CCTGTCTG--C----A-TT-A-C-AAAG-TATGG-ATT--A-GAAAGG-GTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTC------GGGATTTCAGAATCTCATCTGAGAGTGGGAGACTAGCT-GTAACA-GAA-GGCC------------CCAATG-CCA---CTGGAAAATGTGTCT-AT--CCTTTT--TGATT--ACAGAGACAT-TGTTGC-ACCCC-A-ACAA-TTTTTCCACTGCAAACATAG-TTTGTTA--CCGGGAACGATCTCAAAT-AAAGACATTGCGAAAGGGTAACC-GGTAT-ATA-CACATTCCCCAT---CAAGGATTTTAAAAA--CAATACC-A-
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|35 ): TTATCCTATGATAAGCTGAATATGAAAGGAATGCTTGTTGATTTAATAGTGTCTTCATGGGAATGTACTGTTATCCATCAATCCACTAAATAGAACAGCTGATAACCCTAAC
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 222 333333333 11111 5555555555555555555555 2222222 222 44444444 333333333333333 1111 333333 22 111 1111 111 3333333333333333 22222 11 5555555555555555555 888888888888888888888888 11111 222 11 11 222222222 1 1 1 1 2222 1 22222222222 111 1111 11 111 22222 222 11 333333 111 1 3333333333333333333 1 1 1 1 1 11 11 333333 1111 111111111 11 1 1 22 11 33333 1 222222222222 1 1 11 1 22222 1 1 11 11 5555555555555555555555555555 1 11 1 11 1 1 1 111 1 2222 1 1 1 2 1 1 22 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 111 22222 111111 22222222222222222222 111111111 444444444444444 1 111 222 44444444444 111 11 2222 11 1 1 1 1 1 1 11 1 1 1 3333 222222 111 11 1 1 1 2 1 1 1 11 111 22222222222 11 1111 111 222222 22222222222222 1111111111 33333333333 11 11 1 11 1 11111 11111111 3333 33333333333333333333333333333 222222222222 1111 11 11 111111 1 333333333333333333 11111 1111 22 11 333333333333333 22222 22 222 1111111111 11111 222222 2222222222 1 111 111111 222 1111 1 111 1111 111 222222222 11111111 11111 11111 11111 22222 11111 1111 777777777777777777777777777777777 11 1 11 2222 111 111 11111111111 444444
lowQualScore : 333 8 8 7 6 666666666 7 2 6 6 6 6 00000 9999999999999999999999 8888888 1 6 6 6 333 33333333 888888888888888 7777 333333 0 11 8 777 8888 444 0 0000000000000000 00000 8 8 11 0000000000000000000 777777777777777777777777 11111 1 0 1 3 333 7 6 6 0 22 6 3 11 888888888 22 0 0 9 3 3 6 7 9 2 3 0 8 0000 3 8 0 99999999999 11 0 8 8 444 9999 66 11 77 8 444 00000 777 33 666666 777 5 3 7777777777777777777 0 0 0 0 1 7 3 88 0 88 888888 2222 999999999 8 8 8 8 11 77 0 7 2 55 33 1 77777 6 3 1 3 333333333333 0 5 33 0 88888 0 0 33 33 3 4444444444444444444444444444 0 33 2 9 3 0 3 22 3 0 0 3 0 777 1 2 0 3 0000 0 88 2 3 2 3 6 3 6 6 0 5 0 0 5 4 66 0 0 4 9999 4 55 2 4 55 4 77 2 4 4 4 3 3 3 3 0 3 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 3 000 3 999999 66666 3 222222 3 44 3 44 9999 3 3 3 3 3 3 7777 3 77777777777777777777 999999 333333333 99 777 4 4 555555555555555 1 8 4 66 66 66 5 77 8 8 999 0 6 444 888 88 66666666666 8 8 0 5 8 6 6 99 0 111 99 33 4444 6 6 99 6 11 3 0 0 0 0 0 9 33 3 3 3 7 0000 555555 6 1 777 8888 0 7 88 6 5 1 1 0 3 6 0 3 0 0 6 6 88 222 6 6 11111111111 55 5 77 5 5 2222 3 000 5 111111 5 22222222222222 9999999999 5 55555555555 55 5 5 77 1 5 5 33 77 5 9 5 5 11 4 4 7 00000 777 777 5 66666666 3 2 2 777 2 4444 555 77777 77777777777777777777777777777 111111111111 2 0 333 4444 6 2 444 66 888 3 44 3 2 1 3 555 44 55 3 3 6 00 3 55 3 666 99 55 777 4 4 444444 1 5 8 666666666666666666 888 77777 5 66 5 0 0000 66 5 77 5 0 00 5 77 5 77 2 88 8 6 0 666666666666666 8 3 8 99 888 99999 6 00 99 777 4444444444 44444 222222 99 9999999999 3 5 5 555 999999 4 9999 4 4 5 111 5 33 1 2 66 0000 5 5 0 5 333 2222 5 5 5 111 6 555555555 8 0 1 5 5 888 22222222 6 6 55 33333 7 99999 1 1 88888 99 55555 6 99 55555 4444 555555555555555555555555555555555 3 99 77 0 3 0 8 8 11 4444 5 000 666 66666666666 1 333333 6 8 8
lowQualScore : ... . . . . ......... . . . . . . ..... ...................... ....... . . . . ... ........ ............... .... ...... . .. . ... .... ... . ................ ..... . . .. ................... ........................ ..... . . . . ... . . . . .. . . .. ......... .. . . . . . . . . . . . . .... . . . ........... .. . . . ... .... .. .. .. . ... ..... ... .. ...... ... . . ................... . . . . . . . .. . .. ...... .... ......... . . . . .. .. . . . .. .. . ..... . . . . ............ . . .. . ..... . . .. .. . ............................ . .. . . . . . .. . . . . . ... . . . . .... . .. . . . . . . . . . . . . . . .. . . . .... . .. . . .. . .. . . . . . . . . . . .................................................................................. . ... . ...... ..... . ...... . .. . .. .... . . . . . . .... . .................... ...... ......... .. ... . . ............... . . . .. .. .. . .. . . ... . . ... ... .. ........... . . . . . . . .. . ... .. .. .... . . .. . .. . . . . . . . .. . . . . .... ...... . . ... .... . . .. . . . . . . . . . . . . . .. ... . . ........... .. . .. . . .... . ... . ...... . .............. .......... . ........... .. . . .. . . . .. .. . . . . .. . . . ..... ... ... . ........ . . . ... . .... ... ..... ............................. ............ . . ... .... . . ... .. ... . .. . . . . ... .. .. . . . .. . .. . ... .. .. ... . . ...... . . . .................. ... ..... . .. . . .... .. . .. . . .. . .. . .. . .. . . . ............... . . . .. ... ..... . .. .. ... .......... ..... ...... .. .......... . . . ... ...... . .... . . . ... . .. . . .. .... . . . . ... .... . . . ... . ......... . . . . . ... ........ . . .. ..... . ..... . . ..... .. ..... . .. ..... .... ................................. . .. .. . . . . . .. .... . ... ... ........... . ...... . . .
lowQualScore : 000 0 0 8 7 333333333 3 5 7 7 7 7 00000 7777777777777777777777 3333333 0 7 7 7 888 33333333 444444444444444 0000 888888 8 00 0 000 6666 000 8 2222222222222222 00000 0 0 00 0000000000000000000 000000000000000000000000 66666 4 8 0 2 333 3 7 7 6 00 4 2 00 000000000 55 0 0 2 7 3 7 3 8 5 2 0 8 8888 2 8 0 55555555555 22 8 0 0 000 0000 88 00 00 0 000 00000 000 22 222222 555 5 2 8888888888888888888 0 0 0 0 0 3 3 33 7 33 333333 7777 888888888 0 0 0 0 00 00 0 3 0 33 33 0 33333 7 3 2 2 888888888888 0 0 88 0 22222 0 0 22 88 2 2222222222222222222222222222 0 88 5 2 0 0 0 55 2 0 0 2 0 555 0 5 0 2 5555 0 22 5 2 0 3 7 3 7 7 7 0 8 4 0 4 11 1 0 4 4444 4 55 5 0 55 0 00 6 0 0 0 6 6 6 6 4 6 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 3 444 3 666666 00000 3 999999 3 66 3 22 6666 1 1 1 1 3 3 4444 3 11111111111111111111 666666 333333333 55 000 0 0 666666666666666 1 9 4 11 11 99 0 99 2 0 222 8 0 000 666 88 00000000000 0 0 8 0 0 7 7 22 7 777 22 66 9999 7 7 22 7 88 2 0 0 0 0 0 0 88 3 3 3 3 0000 777777 7 0 777 3333 7 3 33 0 5 0 0 7 3 7 0 2 0 0 5 7 55 333 7 7 33333333333 88 2 99 7 7 1111 0 000 7 777777 7 44444444444444 6666666666 7 11111111111 77 7 7 99 6 0 0 66 99 0 0 7 7 00 0 0 5 00000 000 555 7 77777777 6 9 9 777 9 1111 000 11111 22222222222222222222222222222 222222222222 9 4 666 0000 9 9 999 88 555 1 22 9 9 5 1 444 77 00 3 3 7 00 6 00 6 555 55 55 000 0 0 444444 0 0 1 999999999999999999 888 22222 0 99 0 1 6666 44 7 99 7 1 77 7 00 7 99 5 88 0 4 8 888888888888888 0 8 0 22 333 77777 7 22 22 555 0000000000 33333 000000 22 2222222222 3 7 7 777 888888 4 6666 4 4 0 111 0 99 0 0 44 6666 0 0 0 0 888 1111 7 7 7 777 7 000000000 0 8 4 7 7 666 22222222 7 7 00 00000 2 33333 0 7 33333 22 88888 7 22 22222 2222 222222222222222222222222222222222 2 00 44 8 6 8 0 0 88 3333 7 000 777 22222222222 0 000000 7 0 0
consensus : NACAATAAGTTAAT-AAGTAACAAACC-ATTCAATA-CA---T----TTGTAAGTA-AGTCT-TTAA-TA-TAT--TA-TTGCGC---ACC----------------TACCG-------TTGAGTACAAAT-ATTGACTG-AA-ATT-ATCAA--------CAGAA------------G--TCCAT----AC---A--ACATTG-ACATT-TAC-TAAA-C--GA---AAATACA---T-T--A--A-ACAAT-----A-TT-CTGTACAG--AAA------A-CG-TT------GATTGTTCTATGTCA-ACTAAACCC-TA------A----ATTTATGGGT-ATTTCTTCTCCTAACTATTGACAGAAATTA---ATTCTAG-CTTCTGTG-GCTGTCTGTATTTTTTGACATGGTTCCTGTCT--AAGTGAAC--T--TTGAAT-AA-GACTGTTAACGCCCCGT-GTAGGTCCCCCACACAACATGTTGACA-GATCCCCAGTA---TCTGCCAGGACAGGT-CTCT-A--GCNTC--AAAGNTACGTATCT-CCCAT-CATC---ATAGA---GCAAGT--AGGGTGTGTGTGAT-TG---TC-----AGTCG-CCTG-TAGATAT-----TTG---TGACCTGTTACCTAGTC-GCT---GT--A-CGA---CA-GGG-AC-AGATA-ACANATGTGCAC-GGT--CGCAA--AGGG------AGATATAATATAAAANT-TNTATC-CCGT-TCATTTC-ACTGACTTCTTGT-T--CCAACNTTAA-TTCTTTCAACTATAGC-GTAAACTCTTTATACGAANATAGT-AGCNCTCTTGCCCAACC-TTCCTAAACTTAG----TA-A-CA-TAGACTGAC-CCACCT--ACCG-C-T---CACTGTA-TCTCT-G-TCTGT--CTAC--TACT-ACT--ANGACAC---------GAT-AT--GGGGCTTGTGAG-AGTCCTCTG-CTTCA-TTCTATC-TGTGACAGTTTTAGCGCT-GT---TTGATATCTNCCGG-TAATCGTAC-G-GTAT-AATCGCCTAAATATAAACCCATCATATACATAACCTAGACTTTAGAACTA-AACCTA-CATGTGA-TTATTG-ACCTA-TCAATGGCGTATCTCTTTTTCT-TTGACACAAACAAACACTGTGCTTTC-AATGAC-ATGGAA--GTGGATAATA-AG----CAC-ATTTATCAA--CGCATCATG-AAAT--A-CAACA--TTATGACAGGT-TGAGA-ATAACTG-ATCTATTACATT-TAAATG-CA-TC-ATGTTTGAAAGGAAATC-TGAT----CC---CTNTG-C-G-AA----A-C-T-NTA--A-ACGC----G-T-GCT--TTTCC------C-CGA--T--------A-AA---AAGC-AATATC------TA--T-TATCTA-TTTCTG------AC-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A-TT-A-C-AAAG-TATGG-ATT--G-GAGAGG-G--------------------CCGGGATC------AGAATCTC---------TCTGAGAGTGG--GACTA--T-GTAACAGGAA-GG--------------ACAACGCCCA-TTTTGTAAAATGTTTCT-AA--C--TTT--TGA-T--ACAGGGACATCTGTTGC-GCCCC-G-ACAA-TTTTC---CTGCAAACATAT-GTTGTTCT-CCGG-----------AAT-AAAGAAATT-TGGAAGGGTAACC-GGTAT-ATA-CACA--CCGCAT---CAAGGATTT--GAAA--CAAAACC-A-ACACATGTTGGAGC-AATGTTG-A--TGGT-ATCCATGG-AGTTGAA-GAGCTTTCT-TGA-ATTCT-C-CAAAATAATACTTG--TTTTCATAAAAT-ATGAACAC-AGTAA-ATTCGTC---ACAGAAA--ACT-TCCTTCAAAATNATTTTC-A-TGATTCCGTAACGGAGAAAACTGG--CAATGG-TCATAGAGTACACTANCTTTGNCCCGCTCG-TG-AAAAGAAA-TTCTCCA-CT-CCAAAGTCC-GAGTTTAATTCATT--TGT-CTGT-TTGTTT-GC-GA-T-AGGAA--CGAG--AT-GAA-ATCCT----TCGT---CAAT-AATTG----A-TTG-TAGG-T--ACGA--CTACGCG--A-------T-GGCCA---------ATGCGC--GAGT-CA-AACATC--TATCAAACCCAGGG--AA--GGGCTGGTAAATGG-GCA-GTGACGGGAA--TGGAAACA-C-AGCGGC-----GATA---TCAGT-TTCTATGAGAT--AG-ATAAGTGTAG-TTGT-GACAN--GGACC-GTGCAG-GGTTCTC---ACC-----TTC-GCT----------GGCT--T--------GGAT-C-A-A---T--CC-ACTC-AGTAA--T-TTG-ATGG-NNT--CTCATCCGG---A-G--TAAT-GAACTTGA-AAT---GTAAT-ACAG-TATTGTTT-CTC-TCC--AATA-G--T-GAGGN--CAT--G--AC---AA-T-TC--G-GTNATT-TGACCGGT------------------GT---GAG--TAAGT-T--GTA-ATCTGGCGAA----TCC-CGG-G--GG-AGTATCAGAC-GGTC-TCCATAAT-AGA--TAAGGTGTATGT-CTGG-GTGGATGAATTG---GANA------CGTG-GACTG-AGACATCT--CACA-T-ATCAC-C-CTT-TATGGAT--CA---GG---TAG--C-CAACGC-----ATG---A--AATCCAT--GT--T------CAG-A-TGAT-TT---AAACCT----G-AATC-CCTCCCTANG--ACT-A-CCACTCAGCAT-A-T-TC-TCACTCCNCTATATAACT-CTGAAGGTTTC----CGTATCATC-T-CC-C-C---GTGTCCCCCAG----ATCCCTTCTG-AAGGTCACTTCTGTC-GG-TGTCCC---TATCTCAC-GACAC-----A---CACCCACATA-CAGGGCTTCTGACACACGGGGAATGTGATCCATCC-TGTAACGA-TTC-G-TTAACGTTAG-TTGATCGAC-ACAATA-CAAATTTCT-ATT-AATACGAG-ACTACACATTAT----ACAGC--GTTCTGAAAT-AAT-TC--GTGAAA--AGTTTG----TATAAAAA-G----------TGTAAT-------------TCTTACAAAATCCACTCTACCTGAGAATTT--CAAAGTTCTATTTATAGACAATCGGAAAATAC-CCGGTT-AAGCT-CCGC--GCTACTTTTCTT-TTGCA---TGTACTCTGTTG-AC-CTTAA-TATGGAATACCAGT--TTTA-TTTGATTCG-TT-ATCGA
Reference ( family-5170 ) : NACAATAAGTTAAT-AAGTAACAAACC-ATTCAATA-CA---T----TTGTAAGTA-AGTCT-TTAA-TA-TAT--TA-TTGCGC---ACC----------------TACCG-------TTGAGTACAAAT-ATTGACTG-AA-ATT-ATCAA--------CAGAA------------G--TCCAT----AC---A--ACATTG-ACATT-TAC-TAAA-C--GA---AAATACA---T-T--A--A-ACAAT-----A-TT-CTGTACAG--AAA------A-CGATT------GATTGTTCTATGTCA-ACTAAACCC-TA------A----ATTTATGGGT-ATTTCTTCTCCTAACTATTGACAGAAATTA---ATTCTAG-CTTCTGTG-GCTGTCTGTATTTTTTGACATGGTTCCTGTCT--AAGTGAAC--T--TTGAAT-AA-GACTGTTAACGCCCCGT-GTAGGTCCCCCACACAACATGTTGACA-GATCCCCAGTA---TCTGCCAGGACAGGT-CTCT-A--GCNTC--AAAGNTACGTATCT-CCCAT-CATC---ATAGA---GCAAGT--AGGGTGTGTGTGAT-TG---TC-----AGTCG-CCTG-TAGATAT-----TTG---TGACCTGTTACCTAGTC-GCT---GT--A-CGA---CA-GGG-AC-AGATA-ACANATGTGCAC-GGT--CGCAA--AGGG------AGATATAATATAAAANT-TNTATC-CCGT-TCATTTC-ACTGACTTCTTGT-T--CCAACNTTAA-TTCTTTCAACTATAGC-GTAAACTCTTTATACGAANATAGT-AGCNCTCTTGCCCAACC-TTCCTAAACTTAG----TA-A-CA-TAGACTGAC-CCACCT--ACCG-C-T---CACTGTA-TCTCT-G-TCTGT--CTAC--TACT-ACT--ANGACAC---------GAT-AT--GGGGCTTGTGAG-AGTCCTCTG-CTTCA-TTCTATC-TGTGACAGTTTTAGCGCT-GT---TTGATATCTNCCGG-TAATCGTAC-G-GTAT-AATCGCCTAAATATAAACCCATCATATACATAACCTAGACTTTAGAACTA-AACCTA-CATGTGA-TTATTG-ACCTA-TCAATGGCGTATCTCTTTTTCT-TTGACACAAACAAACACTGTGCTTTC-AATGAC-ATGGAA--GTGGATAATA-AG----CAC-ATTTATCAA--CGCATCATG-AAAT--A-CAACA-ATTATGACAGGT-TGAGA-ATAACTG-ATCTATTACATT-TAAATG-CA-TC-ATGTTTGAAAGGAAATC-TGAT----CC---CTNTG-C-G-AA----A-C-T-NTA--A-ACGC----G-T-GCT--TTTCC------C-CGA--T--------A-AA---AAGC-AATATC------TA--T-TATCTA-TTTCTG------AC-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A-TT-A-C-AAAG-TATGG-ATT--G-GAGAGG-G--------------------CCGGGATC------AGAATCTC---------TCTGAGAGTGG--GACTA--T-GTAACAGGAA-GG--------------ACAACGCCCA-TTTTGTAAAATGTTTCT-AA--C--TTT--TGA-T--ACAGGGACATCTGTTGC-GCCCC-G-ACAA-TTTTC---CTGCAAACATAT-GTTGTTCT-CCGG-----------AAT-AAAGAAATT-TGGAAGGGTAACC-GGTAT-ATA-CACA--CCGCAT---CAAGGATTT--GAAA--CAAAACC-A-ACACATGTTGGAGC-AATGTTG-A--TGGT-ATCCATGG-AGTTGAA-GAGCTTTCT-TGA-ATTCT-C-CAAAATAATACTTG--TTTTCATAAAAT-ATGAACAC-AGTAA-ATTCGTC---ACAGAAA--ACT-TCCTTCAAAATNATTTTC-A-TGATTCCGTAACGGAGAAAACTGG--CAATGGTTCATAGAGTACACTANCTTTGNCCCGCTCG-TG-AAAAGAAA-TTCTCCA-CT-CCAAAGTCC-GAGTTTAATTCATT--TGT-CTGT-TTGTTT-GC-GA-T-AGGAA--CGAG--AT-GAA-ATCCT----TCGT---CAAT-AATTG----A-TTG-TAGG-T--ACGA--CTACGCG--A-------T-GGCCA---------ATGCGC--GAGT-CA-AACATC--TATCAAACCCAGGG--AA--GGGCTGGTAAATGG-GCA-GTGACGGGAA--TGGAAACA-C-AGCGGC-----GATA---TCAGT-TTCTATGAGAT--AG-ATAAGTGTAG-TTGT-GACAN--GGACC-GTGCAG-GGTTCTC---ACC-----TTC-GCT----------GGCT--T--------GGAT-C-A-A---T--CC-ACTC-AGTAA--T-TTG-ATGG-NNT--CTCATCCGG---A-G--TAAT-GAACTTGA-AAT---GTAAT-ACAG-TATTGTTT-CTC-TCC--AATA-G--T-GAGGN--CAT--G--AC---AA-T-TC--G-GTNATT-TGACCGGT------------------GT---GAG--TAAGT-T--GTA-ATCTGGCGAA----TCC-CGG-G--GG-AGTATCAGAC-GGTC-TCCATAAT-AGA--TAAGGTGTATGT-CTGG-GTGGATGAATTG---GANA------CGTG-GACTG-AGACATCT--CACA-T-ATCAC-C-CTT-TATGGAT--CA---GG---TAG--C-CAACGC-----ATG---A--AATCCAT--GT--T------CAG-A-TGAT-TT---AAACCT----G-AATC-CCTCCCTANG--ACT-A-CCACTCAGCAT-A-T-TC-TCACTCCNCTATATAACT-CTGAAGGTTTC----CGTATCATC-T-CC-C-C---GTGTCCCCCAG----ATCCCTTCTG-AAGGTCACTTCTGTC-GG-TGTCCC---TATCTCAC-GACAC-----A---CACCCACATA-CAGGGCTTCTGACACACGGGGAATGTGATCCATCC-TGTAACGA-TTC-G-TTAACGTTAG-TTGATCGAC-ACAATA-CAAATTTCT-ATT-AATACGAG-ACTACACATTAT----ACAGC--GTTCTGAAAT-AAT-TC--GTGAAA--AGTTTG----TATAAAAA-G----------TGTAAT-------------TCTTACAAAATCCACTCTACCTGAGAATTT--CAAAGTTCTATTTATAGACAATCGGAAAATAC-CCGGTT-AAGCT-CCGC--GCTACTTTTCTT-TTGCA---TGTACTCTGTTG-AC-CTTAA-TATGGAATACCAGT--TTTA-TTTGATTCG-TT-ATCGA
gi|1 : ACAATGGGTTAAT-AAGTAACAAACCTATTCATTA-C---------TTGTACGTATAGTCT-TTAACTA-TAT--TAATTGCGC----CC----------------TATCGC------TTGAGTACAAATTATTGACTG-AACATT-ATCTA--------CATAA------------G--TCCAT----ACG--A--ATATTGTACATT-TAC-TAAA-CCTGA---AAATACA---T-T--A--AGACAAT-----AGTC-CTGCACAG--AAA--------CGGTT------GATTGTTCTAT-TCA-ACTAAACCCATATCCGCTA----TTTTATGGAT-ATTCCCTCTTCTA-CTATTGACAGAAGTTA---ATTCTAGGCTTCTGTGTGCTGTCTGTATTTGTTCTCCTGGTTCCTGTCT--AAGTGAAC--TCTTTGAAT-AACGACTGGTAACGCCCCGTTGTAAGTCCCCCACACAACATGTTGACATGACCCCCAGTAATTTCTGCCAGGACAGGT-CTCT-A--ACTTCTAAAATCTACGTATCT-CCCAT-CATC---ATAGA----CATGT--AGGGTGTGTGTAAT-TG---TC-----AGTTG-CCTG-TAGATAT-----TTG---TGACTGG--ACCT---T-ACT---GT--A-TGA---CA-GGG-AC-AGATA-ACAGTTGTGCAC-GGT--CACAA--AGGG------AGATATAATATAAAAATATCTATC-CCGT-TCATTTC-ACTGACTTCTTGT-T--CCAACTTAAA-TTCTTTCAATTATATT-GTAAACTCTTTATTCGAACATAGT--GTCCTCTTGCCCAACC-TTCCTAAACTT-G----TA-A-CA-GAGACTGACTCCACCTGAGCCA-CGT---CACTGTA-TCTCTGG-TCTGTTCCTACGATACCGACCAAATAACAT---------GAT-AT--GGGGCTTGGGAG-AGTCCTCT--CTTCC-TTCTATC-TGTGACAGTTAAAGCGCT-GT---TTGATATCTTCCGGTTAATCGTAC-G-GTAT-ATCCGCCTAAA-ATAAA--CATCATATACATAACCTAGACTTTAGAACTAGAACCTA-CATGTGA-TTTTTGAACCTACTCAACGGTGTATTTATATTTCTATGGACACAAACAAATATCA-GCTTTCAAATTACAATGGAAAGGTGAATTATA-AG----TA--ATTTAACAA--CGCTTGATGAAAATAGA-CAACC-ATTATGACTGGTGTGAGATATAATTG-ATCTATTGCATTCTAAATG-CA-TCAATATTTTGAAAGTAACC-T-AT----CC---CTGTG-C-G-AG----A-C-TGCTA--A-ACGCA---A-T-GTT--TTTCC------C-TGA--T--------ATAA---ATGC-AATATC------TA--TCTATCTACTTTCTGA-----ACGTTGAGGT---ACTTTCC-CC--TCTGAAC----ACTT-ACC-AAAGAAATGG-ATT--GCGAGAAG-G--------------------GCGGAATC------AGAAT-TT---------TCTGAGAGTGGC-GACT---T-GT-ACAGGAA-GG--------------AGAATCCCCAGTTTCGTAAAATGTTTCT-AA--C--TCT--TGT-TTAACAGGGACATCTGTTGC-GCTCC-GTACAG-CTTTC---CTGCAAACTTATGGTTGTTCT-CCGG-----------AATAAAAGAAATT-TGGAAAGGTAACC-AGTAT-ATATCACA--CCGCAT---CAAGGATTT--GAAAC-CAAAACCAA-ATACATGTT-AAGC-AATGTTG-A--TGGT-A-CCATGG--GTTGAATGAGCTTTCTATGA-ATTCT-CACAAAATAATACTTGGTTTTTCATAAAATGATTAACACGAGTAATATTCATCTGGACAGGAA--ATTGTCCTTCAAAAAGATTTTCAA-TGATTCCGTAACAGAG-AAACTGG--CAATGG-TCATAGAGT-CACTAGCTTTGGCCCGCTCG-TGAAAAAGAAATTTCTCCATCTGCCAAAATCC-GAATTTAATTCATT--TGT-CTGT-TTGTGT-GCTAA-TCAGGAA--CAAG--AT-GAA-ATCTC----TCTT---CAAT-AATTG------TTG-TAGG-T--ACGG--CTACGCGGAA-------T-GGCCA---------ATGTGC--GAGT-CA-GAAATC--TCTCAAACCCAGGG--AAGGGGGCTGGTAAATGGTGCA-GTGACGGGAA--TGGAAACA-CTAGCGGC-----GACA---TCA-T-TTC-ACGAGAC--AG-ATAAGTGTAG-TTGT-GAAAG--GGACC-GTGCAGCGGTTCCTGCAACC-----TTC-TCT----------AGCCTGT--------GAAT-C-A-C---T---C-ACTC-AGTAGC-T-TTGAATGGTCTT--CTCATC--G---A-G--TAAT-GAACTTGA-AAT---GTAAT-GCAA-TACTGTTT-CTC-TCC--AATA-G--T-GGAGT--CGC--GCAAC---AA-T-TG--G-GTTATA-GGACCGGT------------------GT---GAG--GAAGT-T--GTA-ATCTGGCGAA----TCC-CGG-G--GG-AGTAGCAGA--GATC-TCCATAAT-AGA--TAAGGTGTATCT-CT-G-GTGGATGAAT------ATA------CGTG-GATGA-AGACATCT--CACA-T-ATCACAC-CTT-TATGGAG--CAG--GG---TAC--C-TAATGC-----ATGT--T--AATCCAT--GT--T------CAGTA-GAAT-TT---AAACCT----GAAATC-CCTCCCTACG--ACT-AGCCACTCAGC-T-AGT-TC-TGTATCCTCTATATAACTCCTGAAGGTTTC----CGTATCATC-T-CC-C-C---GTGTCCACGAG----ATCCCTTCTG-AAGGCAACTTCTGTC-GGTTGTCCC---TA-CTCAC-GACAC-----AAATCACCCACATAGCGGGGCTTCTGACACACGGGGAA-GTGATCCATCC-TGTAACGAGTTCAG-TTAA-ATTAGTTTGATCGACTCCAATA-CGAATTTCTAATTGAATACGAGCACTACACATTAC----ACAGC--ATTCTGAAATGAAT-TC--GTGAAA--AGTTTG----TTTAAAAATG----------TATAAT-------------TCTTACAAAATCTACACTACCTGAGAATTTTACAAAGTTCTATTTAT-GACAATCGGAAAATACTCCGGTTAAAGCTGCCGCTAGCTATTTCTCTG-TTGCA---TGCG-------------------ATGGAATAC--G----TTA-TTTGATTCGTTT-ATCAA
gi|10 : c-TAAATA-CAATC-ATGTTTGATAGGAAATCATGAT----GC---TTGTATC-A-AC----A-C-T-GT------------------CTA-TTTCA------G-TAA-----------A-AA---AAGCCAATATC------TA--T--ATCTA-TTTCTG------AC-TTGAGGT--AAACTTTC-CCTGTCTG--CC---A-TTTA-C-AAAG-TATGGGATT--G-GAGAGG-G--------------------CCGGGATC------GAGATCTC---------TCTGGAAGTGG--GGC-A--T-GTAGCAGAAA-GC--------------AC----CCCAGTTTTGTACAATGTTTCT-AAATC--TTT--TGA-T--ACA-GTAGATGTGTTGTGGCCCCGG-ACAATTTTTC---CTGCAGAAATGT-G-TGTTCT-CCGGA----------AAT-AAA-AAATT-TGGGAGCTTAACCAAGTATGATA-CACA--CTGCATTCACAAGGATTT--GAAAGTCAAAACC---ACACGTGTTGGAGCAAATGTTG-ACGCGGTAATCCATGGTAATTG-A-GAGCTTTCT-TGAGATTCCGC-CAAAATAATA-TTG--TTTTCCTGAAAT-ATGAACAC-AGTAA-A-TCGT-----CAGAAATCACT-TCCTTCAAAATAATTTTC-ACTGA----GTAACGAAGAAAACTGG--CAATGGATCagctg
gi|11 : AA--TGGAAACA-C-AACG-C-----GATG---TCATA-TTC-AT----T--AG-ATAGACG-AG-T-----ATA---GAACT-TTGTGA-------C---A-------------T----------AGCA--T--------GGA----A-AACGT--CC-ACTA-AATAA--T-T-G-ATGG-ACT--CTCATTCGG---A-A--TA--------------T---GTAGT--CGG-TATTGTTT-CTC-TCC--AATA-G--T-GAGTC--CGT--G--AC---AA-T-TT--G-GTTATA-TGA-CGGT------------------GT---GAG--TAGG--T--GTA-ATCTGGCGAA----TCT-CGG-G--GG-AGTGTCAGA--GGTC-TTCAT-AT-AGA--TAA-GTGTATGT-CTGT-GTGGATGAATTGATAGA-A------CGTG-GACTG-AGACATCT--CACA-T-CTCAC-C---T-TAT-GAT--CA---GT---TTG--C-CAAAAC-----ATG---A--AATCCAT--G---T------CAG-A-TGAT-TT---AA-------------------------------A-CCACTCAGCAT-ATT-TC-TCACTCCTCTATATAAGT-CTGAAGGTTTC----TGTATCATC-C-CC-TAC---GTGT----CAGAAATATCCCTTCTG-AAGGTCACTTCTGTC-GG-TGTCCC---TATCTCAC-GACAC-----A---CCCCCACATA-CAGGACTTCTGACGCACGTGGAATGtctcgtcaacaaatgcgtaata
gi|12 : TTTGTTCCGCTTG-TG-AAAAGAAA-TTCTCCC-TT-CTATAATCTTGAGTTC---TTATT--TGTGCTGTACTGTTTTGC-GA-T-AGAAAGAC-AG--ATTGAATATCCT----TCCT---CGAT-AATTGTGAAG-TCG-AGGA-TTGATGC--CAACGCG--AAGAGGAAT-GATCAGAATCGGCCATGTGTTGAAGTACATAAGATCGCTTTCAAATCAAGGGG-AA--GTGCTGGTAA-TGG-GCA-GTGACGGGAA--TGAAAACA-C-AGCG-C-----AATG---TCGAA-ATCTA---AATTCAG-AAAAGTGTAG-CTGT-GACAA--GGACC-GTGCAT-G-TTCTC---ATT-----TTC-GTT----------GGAT-----------GGAC-T-A-AG--T--CC-ATTCCAGT----T-TTG-ATGA-AAT--CTCAACAGG---A-G--CATT-GAACTTGA-AAT---ATA-T-ACAG-CATTGTTT-CTC-TCC--AATA-G--T-GAGGA--CAT--G--AC---AA-T-TT--G-GCGAT
gi|13 : TACGTA-CT-CCCAT-CATC---GTAGA---GCA-GT--AGGGTTTGT-TGATCTG---CC-----AGTT---CTG-TAGATACATGTATTG---TGACTTGTTACCTAGTC---T---GT--AGTGA---CATAGG-AT-AGATA-GCATATG--CAC-GGT--CACAA--AGGG------AGATA-AACATAAAACT-GATATT-CCGT-TCATTCC-ACTCACTGCTTGT-T--CCAACATTAA-TTCTT-CAA-TACAG--GTAATCTTTTCACA-GAAAAGAGT-A--TCTCTTGCCCAAGCATTCCTAAACTTAG----TCTA-CA-TAGACTGAC-C-ACCC--ACCGTC-G---CACTTTA-TCTTT-G-TCTAT--CTAC-------ACT--ATGGCAT---------GAT-AT--GGG-------------TCTCTG-CTTCA-TTCTATC-TGTGACAG--TTAGGGCT-GT---GTGATATTTACCGG-T-ATCGTACAA-GTAT-AA-CG-CTAAATATAAATC
gi|14 : -TTATTG-ACCTA-TCATTATTGAATCTCTTTTTGT-TTGGCACAGACAATCTTTGTGCTTTT-AATGCC-ATGGAC--GTTGATAATA-A-----CAC-ATTTATCAA--CGCATCATG-AAAT--A-TAACA--TTATGGCAGGT-TGATA-ATAACTG-ATCTATGACATT-TAAATG-CA-TC-ATGTTTGAAAGGAAATC-TGAT----AC-------G-A-G-AATTGTA-C-T-TCT--A-ACACTG--A-T-GC---TTTCG------C-CAA-----------A-AC---AAGC-AATATC------TA----TATCTA-TTTCTG-------C-TT-AGGT--AATTTTCC----GTCTG--C----A-TT-A-C-AAAG-TGTGG-ATT--A-GAGA-G-G--------------------CCGGG-TC------AGAATCTC---------TCTGAGAGTGG--GACTG--C-GTAACAGGAA-AG---------------CAACGCCCA-TTTTGTCAAATGTTTCTGAG--C--TTT--TGA-T--ACAattgccaaaacacaaa
gi|15 : TTTTCT-TTGACACAGACAAACACTGAGTTTTT-AATGAC-ATGGAA--GTGAATA-TA-AG----CAC-ATTTATCAA--AGCATCATG-AAAT--A-TAACA--TTATGACAGGT-GGAGA-ATAACTG-ATCTATTACATT-TATACG-CA-TC-ATGTTTGAAAGGAAATC-TGAA----CT---CTTTA-T-G-AA----A-CAT-GTA------TCTTTTG-T-GCT--TT--C------C-CGA--T--------A-AA---ATGC-AATATC------TA----TATCTA-CTTCTG------AC-TTGAGGT--AACTTTCC-TCTGTCTG--C----A-TT-A-C-AAAG-TATGG-ATT--G-GAGAAG-G--------------------CCGGGATC------AGAATCTC---------TCTGAGAGTGG--GGCTA--T-ATAGCAAAAA-GG---------------CAATGCCCA-TTTTGTAAAACTTTTCC-AA--C--TTT--TGA-a
gi|16 : cAGTCC-GAGTTTAATTCATT--TGA-CTGT-TTGTGT-GC-AA-T-AGGGA--CGAG--AT-GAA-ATCCT----TCGT---CAAT-GATTG----T-TTG-TA-G-T--AC-A--CTTTGCG--A-------T-GGCC----------ATGCGC--GAGT-CA-AACATC--TATC-AACCCAGGG--AA--GGGCTGGT-AATGG-GCA-GTGACGGGAA--TGGAAACA-C-AAC-GC-----TAAA---TCATT-TTCTATGGAGT---G-ATAAGTGTAG-TTGT-GACAT--GGACC-GTGCA--GGTTTTC---ATT-----TTC-TCT-----------GTT--T--------GGAT-C-ACG---T--CC-ACTC-ATTAA----TTG-ATAT-TGT--CTCATTCGG---A-G--TAAT-GAACTCGA-AAT---GT-AT-ACAG-TACTGTTT-CTC-TCC--AATA-G--T-GAGTC--CAT--G--AC---AA-T-
gi|17 : -T-GCT--TT--C------A-CTA--T--------A-AA---AAGC-AATATC------GA--T--ATAAA-TTTCTT------CC-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A-AT-A-T-AAgccgat
gi|17 : tactaatactgt-ATA-CACA--CTGCAT---CAAGGATTT--GAAG--CAAAACC-A--CACATGTTGAAGC-AATGTTG-A--TGGT-ATCCATGG-AGTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaatacacactgcatcaaggatttgaagcaaaaccacacatgttgaagcaatgttgatggtatccatggagtt
gi|18 : tactaatactgttgctttcactataaaaagcaatatcgatataaatttcttccttgaggtaactttcccctgtctgcaatataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaAATAAGTCG-T-AAGTAACAAACC-ATTCAATA-CAATGTACAGTTGTAAGTA-ATTCT-TTAA-TA-TAT--TA-TCGCACACAACCATTGATTTATTATAAATATTGACTGAAATCGAATACAAAT-ATTGACTG-GA-AT--ATCAA--------CAGAATCAGAAAATGAAA--TCCAT----AC-------CATTTCACATT-TA--TGAA-C--GAGATAAATGTA---A-T--ACAA-ACAAT-----A-AT-CTGTACAG--AAA------A-CAATTAACTTTGATTTTTCTATGTCG--TTAAA-----G------G----GTTTAC------TTTCTTCTCCTAACTATTGACAGAAAT-A---ATTCTAG-TTTCTATG-GCTATCTGTATTTTGTGACATGGTTCTTGTCT--AA
gi|19 : AGAACTA-AACCTAACATGTGAATTATTA-TCCTA-TCAATGGCGTATCTCTTTTTGT-ATGACACAAACAAATTATGTGCTTTT-AGTGAG-ATGAAA--GTCGACAATAGAG----CAC---TTACCAG--CCAATAATG-AAAT--C-TAACA-----TGACAGGT-TGAGA-TTAATCG-ATCTATTGCGTT-TAAACG-CT-TC-ATGTTACAAAGGAAATT-TGAA----AC---CTCTG-----GA----A-C-T-GTA--C-ATAT----GGT-ACT--TT-----------CAA--T--------A-AAGA-AAGC-AATATC------TA--T--ATCTA-TCTCTG------AC-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A-TT-A-C-AAAG-AGTGG-ATC--A-GAGAGG-G--------------------CCGGGATT------AGAATCTC---------
gi|2 : TTAATCAAGTC-CATTGTG-CAAT--AACAACA-TTTG-GAT--GC-TGAGA-ATAAGTGCATCTATTGCATT-TAAATATCA-TC-ATGTTTACAAGCAAATC-TGACTTGACCAAGCT----C-G-AC----ATC-T-CTAC-A-ACTT----G-TCGCA--TT-----------CAACTT--------A-AATTTAAAC-ATTATCAACCCATAAAT-TAGCTA-CTTCTATTTTGCAC-TTGAGGCCAAACTGTCCTCCTGTTTA--TGACAA-TT-G-CTAAAG-TATGG-ATTTAG-GAGAGGTG--------------------CCGGGATCTGATTGACAATATC---------TCTGAGAATGG--GGCTA--TTGTAACAGGAAAGG--------------GCAACCCCCA-TTTTGTAAATTTTTTCT-AA--C--TTTCTTGA-T--ACAGAGAAATTCGTCCC-GCCCC-G-AC---TTTTC---CTACACACATAT--TTGTTCTGCCAG-----------AAT-AGAGAAATT-TGAA--GGTAACC-GGTAT-ATA-CACA--TTGCAT---CAAGGATTT--GAAA--CAAAACC-ACAC-CACGGTGAAGC-AGTGTTGGA--TGGT-ATCCGTGG-AGTTGAA-GAGCTCTCT-TTA-ATTCT-C-CAAAATAATATTTG--TCTTCATAAAAT-ATGAACAC-AGTTA-ATTCGTC---ACAAATA--A-T-TCCTT-AGAATTATTTTC-A-TGATTCTGTAACAGAGAAAATTGGGACAATGGTTCATAGAGTACACTACTTTTGCCTCGCTTGGTGTAAAAGAAA-T-CTCCA-TT-CCAA-GTCT-GAGTTT--TCCATTCGTGT-CTGT-TTGTTTTAC-AAAT-AGGAAT-CGAGGAAT-GAA-ACCCG----TCTT---CAATTAATTG----AGCTG-CAT--T--ACAAACTTACGTG--G-------T-GGGCC---------GTGCTC--G--T-CA-AACATC--TATCAA-CCCAAGG--CA--GAGCTGGTAA-TGG-ACA-GTGACGGGAAAGTGGAAATAAC-A-CAGC-----GATA---TCAGTCTTCTTTAA--T--CGTACAAGTGAAGGCTGT-AAACA--GGACC-GTGTAT-T-TTCCC---ACCTTTTTTTC-CCCCCCCCCAAAAAGTT--TTTATTTGGGGATTC-A-T---T--CC-CCTG-AGTGA--T-T-G-ATGG-ATT--CCCTTCCGCC--A-G--CAAT-GAACT-GA-AAT---ATA-T-ACTG-TATTGTTTGCTC-TCT--AATACG--T-GAG
gi|20 : gC-ATCGAA--GTTGATAA-A-AG----CAC-TTCTATCAA--CTTATCATC-GAAT--A-TAACATATT--GGCGAGT-TGAGA-ATAACTG-ATCTATTACATT-TAAATG-CA-TC-ATGTTTAAAAGGAAATC-TGAT----CT--------------A----A-C-A-ATC--ACACCC----G-C-ACT--T--CC------CATGA--TTTCATTAAA-AA---AGGC-AATATC------AA--T--GTCAA-TTTCTG------AC-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A-TT-A-C-AAAG-TGTGG-ATC--T-GAGAGG-G--------------------TTGGGATC------AGAATTTC---------CCTCAGAGTGG--GACTT--T-GTAAGAGGAA-GG---------------CAACGCCCA-TTTTGTAAAATGTTTCT-AA--C--TTT--TGA-T--ACA
gi|21 : -TTATTG-ACCTA-TCAATGGTGAATCTCTTTTTGT-TTGATACCAAAAGACTTTGTGTT----AATGAC-ATGGAC--GTAGATACTA-AAACAATACTAGTAATCAA--CTTATCATG-GAAT--A-TAACA--TTATGACAGGT-TGAGA-GTAACTG-ATCCATTACATT-TAAATG-AA-TC-ATGTTTGATAGGAAATC-TGAT----GC---AATTGTC-C-CA----C-T-T-ATATTA-CTGC------T-GCT--TTCGC------C---A--T--------A-AA---AAGC-AATATC-------A--A-TATCTA-TTTCTG------AC-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A-CT-A-C-AAAG-TATGG-ATT--G-GAGAGG-A--------------------CCGGGGTC------AGAATCTC---------
gi|22 : CAATGAGTTA-T-AAATAACAAACC-ATTCATTA-C----T----TTGTAAGTA-AGTCT-TTA--TA-TAT--TA-TTGTGT----CC----------------TATCG-------TTGAGAACAAAT-ATTGACTG-AA-AT--ATTTA--------CAGAG------------G--TCCAT----AC---A--ATATT--ACATT-TAC--AAA-T--GA---AAAT-TA---T-T--A--A-ACAAC-----A-TT-CTGCACAG--AAA------A-CG-TC------GATTGTTATATGTCA-AC--AACCC-TA------ACCTTATTTATGGGT-ATTT--TCTTCTAACTATTGACA-AAATTA---ATTCTAG-TTTCTGTG-GCTGTCTGTATTTTGTGATATGGTCTCTGTCT--AAGTG-AC--T--CTTGAT-AA-GACTG-TAACGC
gi|23 : AAATTATATATTC-AG-CTTCTGTG-GCTGTCTGTATTTTTTGA-ATG-TGCTTGTTTTTAAGTGAACAAT--TTGATTTAA-GACTGTTAACGCCCTGT-GTAG-TCCCCCAC-CA-TATGTTGACA-AATCCC-AGTA---TCTGCCA-GACAGGT-CTCT-ATGGCGT---AAAGGTGCGTATCT-CCCAT-CATC---ATAGA---GCAAGT--AGGGTGTGTAGGGT-TG---TC-----AGT-G-CCTG--AGATAA-----ATG---TGACCTG-TACCTAGTC-GTTAGAGT--G--GATTTTA-GGGTAC-AGATA-ACA
gi|24 : gaGAATGTGATCCATCC-TGTAACGA-TTC-T-TTAACGTTAG-TTGATCGAC-TCAATA-TAAGTTTCT-ATT-AA--------------AT--T----ACAGT--GTTCTG--AT-AAT-TC--GTGAGA--AG-TTG----TATAAAA-------------TGTAA--------------TCTTACAAAATGTACTCTACCTGAGAATTT--CCAAGTTCTATTTATAGACAATCGGGAAATAA-CCAGTT-TAACT-CCG-----TACTTTTCTTATTGCA---TGTACTCTGTTG-AC-CTTAA-TATGGAATACCAGTC-TTTA-TTTGATTCG-TTAATCGA
gi|25 : GGGAAATGTGATCCATCC-TGTAACAA-TTA-T-TTAACGTTCA-TTTACCGAA-ACAATA-CAAATGTTT-ATT-AATACGAA-AGAATACATTAC----AC--C--GTTCTGAA---AAC-CC--GTGAAA--AG-TTG----TATAAAA-------------TG-AAT-----------------------TCCACTGCACCTGAGAATTT--AAAACATCTATTTATAGACAATCGG-AAATAC-CCGGTT-AAGCC-C--C--ACTACTCTTCTT-TTGAAAATTG-A-TTTGTTG-ACTCTTAAGTCT-GAATA----T--TTTA-TTCCGTT-G-TT-gacaattgt
gi|26 : -TTATTG-ACCTA-ACAATGGTGTATCTTCTTTTCT-TTGACACAGACAAACACTGTGTTTTC-AACGAC-ATGGAA--GTGAATA-CA-AG----CTT-ATTTATCAA--CGCTTCATG-AAAT--A-CAACA--TTATGACAGGT-TGAGA-ATAACTG-ATCTGTTACATT-AAATTG-CA-TC-ATGTTTAAAAGGAAATC-TGAT----TC---CTGTG-TGG-AA----A-A-T-CTAT-C-ACGT----C-T-GAT--TT--C------C-CGA--T--------A-AA---ATGC-AATATC------TA----TATCTA-a
gi|27 : --AG-GTAAGTGTAG-TTGT-GACAT--GGACC-GTGCAG-G-TTCTC---ACC-----TTC-ATT----------GGCT-----------GGAT-T-A-A---C--CCCATTC-CATA---T-TTG-ATGG-TTT--CTCATCCGT---A-G--TAGT-GAACTTGA-AAT---GT-AT-ACAG-TATTGTTT-TTC-CCC--GTTA-G--T-GAGGA--CAT--G--AC---AACC-CC--C-ATCATT-TGA-CGAT------------------GT---GAG--T-AGT-A--GTA-TTCTGGCGAA----TCC-CGGTG--GG-AGT-TCACCC-CGTA-TCCAT-AT--GA--GAAAGTGTA
gi|28 : CCTAGACTTAG----TA-AGCAATAGACTGAC-C-ACCT--ACCG-C-CTTCCACTGTA-TCTCT-G--CTGT--CTAC--T-CT-GTT--GAGATAC---------AATTATTTGGGGCTTGTGAG-AGTCCTCTGTCTTCA-CTCTTTC-TGTGACAGTTTTAGCGCT-GT---TTGATATCTACCGG-TATTCATAC-ATGTAT-AATTGCCTAAATACCAACCCATCAT
gi|29 : taccTTCAATA-C----T----TTGTAAGTA-AGTCT-TTAA-TAATAT--------------AC-----------------TACCG-------TTGATTACAAAT-ATTGACTG-AA-A-T-ATCAACAGAAT--CAGAA------------G--TCCAT----AC---ATTACATTG-ATACTATAG-TAAA-T--GA---AA--ACA---TGT--A--A-ACGGT-----A-TT-CTGTACAG--GAA------ATC--TT------GATTGGCCTGTGT--------------------------ATTAATTGGTAATATCTTCTCCTAACTATTGACAgattgcgaaa
gi|3 : gAG--AT-GAA-ATGCCAGTGTAGTACCCAAT-AATTG----A-TTGGTAGGAC--ACGA--C--CGCG--A-------TTAGCCA---------TTGCGCCTGAG--CA-AACATC--TATCAAACCCAGGGGAAA--TAGGTGGTAA-TGG-GCAAGTGACGGGAAGATGAAACCA-A-GGCGCCTCGTGGTTACATTCAGT-TTCTAT-AGAT--TA-ATAA-TGTA--TTGTCGACAAAGGGATCTGTGCCC-G-TTCTC---ACC-----TTC-ACT----------TAAT--T--------GGAT-CCA-A---TGTCC-A-TC-AGTGAGAT-TTG-ATGG-TTTGTCTCATCCGGCAGA-GGTTAAT-GAACTTGT-AATCTTGTAATTGCAG-TAATGTTG-CTCCTCCGCAATA-G--TCAAGGATCCAT--G--ACCCAAG-T-TG--GCGTATTT-TGACCGGTATAGGAAAGCTGGATCGTGT---GAG--TAGGTAT--GGA-ATC-GGCGA-----TCC-GGG-GCGGG-AGTATCAGACAGGTC-TCCATA-T-AGAAATAAGGT--ATG--CTGG-GTGAATGA--T-----AAA------TGTG-GGCTG-AGACAGCT--CACA-G-ATCAC-G-C-T-TAT--AT--CAAC-GGAACCAA--C-CAACGCACTATATG---A--AAT-CAT--GTAGT------CAGAA-TGAT-TTG--GAACCTTGTGA-AATC-CCTCCCTTAGAAACT-A-CCACTCAGCAC-A-T-AC-TT-CTCACCCATAT-ACT-C-GAAGGTTTCTGTGCGTATCATC-T-CC-C-CCGTGTGTCCCCCAG----A--CCTTCTGTAAGGTCACTTCTGTCAGG-TGTCCCGGATATCTCACTGACACACAAAA---CACCCACAGA--AGGGC-TCTGACACTC-GGTAATGTGATTCATCCATGCAAACA-TTC-GTTTAGCGGTGG-------GAC-AC-ATAGCAAAACTCT-G---AAGACTAC-ACTATATA-TATAGAAACAGCAGGTTCTTGAAT-AATATCTAGTGAAGGTAATTTGTGGATACAAGAA-GTCAGTGAAAATGTGATTACTCATGTTAAATCTTACAAAATCCACTCTACCTGG----TT--TAAAATT
gi|30 : acT-GAACTTGA-AAT---ATA-T-ACAG-CATTGTTT-CAC-TCC--AATA-G--T-GAAGA--CAT--G--AC---AA-T-TT--C-TTCATT-TGA-CGGT------------------GT---GAG--T-AGC-T--GTA-ATCTGGCGAA----CCC-CGG-G--GG-CGTATCAGA--GATC-TCCAT-AT-AGA--TAAGgtgatcgtgataac
gi|31 : T----G-AATC-CCTCCCTAGA--ACT-A-CCACTCAGCAC-A-TATC-TCTTTCCATTATATATCT-GTGAAGGTTTC----CGTATCATC-T-CCTC-C---GTGTCTTCTAG----ATCCCTTCTG-AATGTCACTTCTGTT-GG-TGTCCC---TATCTCAC-cgt
gi|32 : AAGTGTAA-TTGT-GACAA--GGACC-GTGCA--TGTTCTC---ATT-----TTC-GTC----------GGA---T--------GGAT-T-A-AT--T--CC-TTTC-A--AA--TCTTG-ATGT-AAT--CTCAACAGG---A-G--CATT-GTACTTGA-AAT---GT-AT-ACAG-CATTGTTT-CTC-TC
gi|33 : ACGTGAA--TGGAAACA-T-AGCG-C-----GATA---TCAAA-TTC-ATGAGAT--TT-AAAAGTGTAG-TTGT-GACAT--GGACC-GTGTA--GGTTCTC---ACC-----TTCAGC------------ACC--T--------GGTT-C-A--------CC-ACTC-CATAA----TTG-ATGG-TTT--CTCAT
gi|34 : ACCT----G-AATC-CCTCCCTATG--ACT-A-CCACTCTTCAT-A-T-GGATCATCCCTTTCGATAACG-ATAAACCTTTC----TGTATTAGCAC-CC-C-C---GTGTCCCAAAG----ATCCCTTCTG-AAGTTCACTTCTGTC-GG-T
gi|36 : ACATGCTGACA-GATCCCCAGTA---TCTGCCACAAGAGGT-CTCTAA--GGAGT--AACGGTACATGTTT-GTCAT-CATC---ATATA---TC-AGC--AGGGTGTGTAGGTC-TG---TC-----AGT
gi|37 : AGTGAAG-TTGT-GACAA--GGACC-GTGCAG-GTTTC-C---ACC-----TTC-ATT----------GACT-----------GAATTC-A-C---T--CC-ATTC-AATAA--T-T-G-ATGG-ACT--GTCATTCGT---A-G--TAAT-GAACTTGA-AAT---GTAgact
gi|38 : TTTATAGACAATCGGAAA-TAC-CCAGTT-AACCT-CCGC----TACTTTTCTT-TTGCA---TGTACTCTGTTG-AC-CTTAA-TATGGAATACCAGTACTTTA-TTTGATTCG-TT-ATCt
gi|39 : ATAAATTA-T-AAGTAACAAATC-GTTCAAAA-CA---T----T-GTAATTA-AGTAT-TTAA-TA-TAT--TA-TTGCGC----CC----------------TACTG-------TTGAGTACAAAT-ATTGACTG-AA-A-T-ATCAA--------CAGAA------------a
gi|4 : AAGTCC-GAGTTTAATTCAT------------TTGTC------------------------------ATCCT----TCGT---CAAT-AATTG----A-TTG-TAG--T--ACAA---TACACG--A-------T-GGCCA----------TGCGC--GAGT-CA-AACATC--TCTCAA-CCCAGGG--AA--GGGCTGGTAA-TGG-GCA-GTGACGGGAA--TGGAAACA-C-AACG-C-----TACA---TCAGT-TTCTATG-GAT--AG-ATGAGTGTAG-TTGT-GACAT--GGACC-GTGCAG-G-TTCTC---ACC-----TTC-AAT----------GGCT--A--------GGAT-A-C-A---C--TC-ACTG-AGTAA--T-TAG-ATTG-TGT---TCATCCGT---ATA--CATT-CAACT-GA-ATA---GTA-T-ACAA-TAGTCTTT-CTTATCCTAGATA-AGCT-GAGTC--CATAAG--AC---AA-T-TCTCG-TTGATT-TGAC-AGT------------------GTATAGAGATTA--T-T--GTA-ATCGGTCGAAAGAATCCGCGT-G--AGCAGTATCAGAC-GGTCGTCC-TAATCAGA--TAAGTAGTATGT-CTGGTGTG--TTAATTG---GATAAAACCCCGTTTGACTA-TGACATCTATCACACT-ATCAT-CACTTCTATAGATATCATATGG---TAG--AACATCGC-----ATACTCATTAACTCAT--GC--TTAGGATCAG-ACTGAT-TTTTAAAACATTCA-G-AATCGCCTCCCTAGT--ACT-A-CCACTCAGCAT-C-CGTC-TCAGTCCTCTATATAACT-TTGAAGGTTTC----CGTATCATC-T-CCAC-C---GTGTCTCTCAG----ATCCCTTCTG-AAGGTCACTTCTGTC-GG-TGTCCC---TATTTCAC-GACAC-----A---CACCCACATA-CAGGGCTTCTGATACACGGGGAATGTGATCCATCC-TGTAACGA-TTC-G-TTAACGTTAG-TTGATCGAC-ACAATA-CACATTTCT-ATT-AATACGAA----ACAAATCAT-----TAAC--GTTTTAA----AGC-TT--GTG-AA--ACCTTG----TATGAAAA-A----------TGTAA--------------TCAAACAAAGTCCACTCTACCTGAAAATTCA-CAAAA-TCTATTTATAAATAATCGG-AAATTC-CCAATT-ATGC--CCG---GCTACTTTTCTT-TCGCA---t
gi|40 : CTG--C----A-TT-A-C-AAAG-TATGG-ATT--G-GAGAGG-G--------------------CAGGGATC------AGAACCTC---------TCTGAGAGTGG--GACTA--T-GTAACAGGAA--G--------------ACAACCCCCA-TTTCGTAAAATGTTTCT-AA--C--
gi|41 : CTG------AC-TTGAGGT--ATTTTTCC-CCTGTCTG--C----A-TG-A-C-AAAG-TGTGG-ATC--A-GAGAGG-G--------------------CCGGTATC------AGAACCTC---------TCTAAGAGTGG--GACTG--T-GTAACAGGAA-
gi|42 : -TGAT-TT---AAACCT----A-AATC-CTTCCCTATG--GCT-A-CCACTCAGCATCA-A-TC-TAACTCCATAATATGAAT-GTGAAGCTTTC----CGTATCATC-TCCC-C-C---GTGTCCCaccaac
gi|43 : AAGTGTAG-TTGT-GACAA--GGACC-GTGCA--CGTTCTC---ATT-----TTC-GCT----------GGA---T--------GGAT-TAA-A---T--CC-ATTC---CAA--TGTTG-ATGT-AAT--CTCAACAGG---A-G--CATT-GAACTac
gi|44 : aGATGAAAATTATATATTC-AG-CTTCTGTG-GCTG
gi|44 : AATATATAATT-TTCATC-CCGT-TCATTTC-ACTGACTTCTTCT-T--CCAACCTTAA-TTCTTccgttcatttcactgacttcttcttccaaccttaattcttc
gi|45 : cagccacagaagctgGGAATGTGATGCATCC-TGTAGCGA-TTC-G-TTAACGTTAc
gi|46 : TTTTCTT-TTGCA---TGCACTTTGTTGCCC-CTTCA-CATGGAATAC------TTTA-TTTGATTCG-TT-ATCctattacatttagctttacacattctattta
gi|47 : --GCTACTTTTCTT-CTGCA---TTT--TCTGTTGCAC----AA-AACAAAATACTAGTACTTTATTTTGATTacaa
gi|48 : CT--CACA-T-ATCAC-C---T-TATG-AT--CA---GG---GAG--C-CAACGC-----ATG---A--AATC
gi|49 : --CAAAACC-A--CACATGTTGGAGC-AATGTTG-A--TGAT-ATC
gi|5 : ACAATAAGT--ATGAAGTAACATACC-ATTTA-TAGTA---T----T----A--A-AGTCTATTAA--A-TATGATA-TTGCGC---ACC----------------TACTG-------TTGATTACAAAT-ATTGTCTGCAA-ACTGACTAAAACAGAATCAGAA------------GGTTCCATCTAAACCCTA--AC-TTG-ACATT-TATGTAAAAT--GG---AAAC-CAGCTT-TGCA--ATACAATTTACTA-TTTCTGTCCAGTGGAATACCCCA-CATTT------GATCGTTCTATGGCATAATAAAATA-TA------AT---AAATATAAAT-ATATCTT-TCCTAACTTATGA--GAGATTA---ATTTT-G-CT-CTCTG-GTTGTCTGTATTTTTTGAT---GTTC--GT------GTGA--------TGTGT-AA-GACCGTTAACGCCCGGG-ACAGGTCTCCCACACATTGT-TTG--A-GATCCCACGT----TC-GCCAGGACAGGTCCTCT-A--TCTTC--AAAATCACGAATCTCCCCATACATCCCAATAGAAATGCAAGTGAAGGGTTTGTGTAAT-CGCGTTCTCCTAGGTCATCCTGCTAGAAATC----TTGAATTGATCTGTTACCTAGTCTGCT---GTCGA-CAA---TA-GGA-ACGGGATACACACATGTGCACAGGTAGCGCAACCAGGGCTCACCAG---TCATAT---------TATCTCTGTATCATTTCAACTGAACTTTTGTGTGGCCAA--TTAACTTCTTTCATCTATAGCAGTAAACTCTTTATAC-AATATGGTCAACATTCTTG-CCAACC-TTCCTATACTTAGGTTCTA-A--A-TAGACTGAC-CCACCT--ACCG-C-T---CACTGTACTCTCT-GCTCTGT--C-AC---ACT-ACT--AGGATACCCCATTCGAGAA-GT--GTGGC-TGTGAGAAGGCCTCTG-C-TCACTTCTATCTTGTGACATTTTTAACGCTAGTTTATTGATAATTCTC---TAAACGCA--G-GTATCAGTTACCTGAGTA
gi|50 : TC-CCGT-TCATTTT-ACTGACTTCTTGT-T--CCAAatga
gi|6 : AA--TGGAAACA-C-AGCG-C-----TACA---TCAGT-TTCTAT-AGAT--AG-ATAAGTGTAG-TTGT-GACAT--GGATC-GTGCAG-G-TTCTC---ACC-----TTC-ACT----------AA-T--T--------GGAT-C-A-A---TT-CC-ACTC-AGTGA--T-T-G-ATGG-TGTT-CTCATCCGG---A-G--TAATTGAACTTGATAAT---GTAAT--CAGGTAT-GTTT-CTC-TCC--AATA-G--T-GAGTC--CATT-G--AC---AA-T-TT--G-GCGATTGTGAACGA-------------------GT---GAG--TA-GT-TTTGTACATCTGGCGAA----TCC-----G--GG-AGTATCAGAG-GGTC-TCCATA-T-AGA--TAAG-TGTATGTGCTGG-GTGAATGTATTA---GAAA------TGTG-G-CTGCAGACATCT--CACA-TGATCAC-C--TT-TATG-AT--CA---GG---TAAACC-CAACGC-----ATG---A--AATC-ATTAGT--T------CAG-A-TGATGTT---GAACC-----G-AATC-CGTCCC-AGA--ACTTA-CCACTCAGCAT-ACT-TC-TCACTCCATTATA---CT-CTGAAGGTTTC----TGTATCATC-T-CC-C-CC--GTGTCCCCCAG----ATCCCTTCTG-AAGGTCACTTCTGTC-GG-TGTCCC---TATCTCAC-GACAC-----A---CACCCACATA-CAGGGCTTCTGACACTCGGTGAATGTGATCCATCC-TGCAACGA-TTC-G-TTAGCGTT--------CGAC-ACAATA-CAAA--------------CGAG-ACTACACATTA-----ACAGC--GTTCTGA--T-AAT-TC--GTGAAA--A-TTTG----TATACAA-------------TGTAAT--------------CTTACAAAATCCACTCTACCTG
gi|7 : TATCTCTTTTTCG-TTGACACGAACATACACTGTGCTTTC-AATGAC-ATGGAA--GTGAATA-TA-AG----CGC-ATTAATCAA--CGCATCATG-AAAT--A-CAACA--TTATGACAAGT-GGAGA-ATAACTG-ATCTATGACATT-TAATTG-CA-TC-ATGTTTAAAAGGAAATC-TGAT----TC---CTTTT-T-GTAA----A-T-T-ATA--A--------------CT--TTTCTGCTTTAC-TGA--T--------A-AA---AAGC-AATATC------TA--T--ATCTA-TTTCTG------AC-TTGAGGT--AACTTTCC-ATTGTCTG--C----A-TT-A-C-ACAG-TATGG-ATT--T-GAGAGA-G--------------------CCGGGGTA------AGAATCTC---------TTTGAGAGTGG--GGCTA--T-GTAACAGAAA-AGCAACNNNNNNGAAAGCAACGCCCA-TGTTGTGAAATGTTTCT-AA--C--TTT--TGA-T--ACAGGAACGTCTGTTGC-GCCCC-G-ACAACTTTTC---CTGCAAACATAT---TGTTCT-CCGG-----------AAT-AAAGAAATT-TGGAAGG-TAACC-GGTAT-ATA-CACA--CTGAAT---CAAGGATTT--GAAA--CAAAACC-A--CACATGTTGGAGC-AATGTTG-A--TGGT-ATCCATGG-GGTAGAA-GAGCATTCT-TGA-ATTCT-C-CAAAATAATA-TTG--TTTTttaaaat
gi|8 : AAA-TTCTCCA-CT-C-AAAGTCT-GAGTTT-----------GT-CTGT-TTGTTT-GA-GA-T-AGGAA--CGAG--AT-GAA-ATCCT----TCAT---CAAT-AATTG----A-ATG-CA-G-T--AC-A--GTAGGTG--A-------T-GGCC----------ATGCGC--GAAT-CA-AACATC--TATC-AACCCAGGG--AA--GGGCTGGT-AATGG-CCA-ATGACGGGAA--CGGAAACA-C-AG-GGC-----GATA---TCAGC-TTCTATGGAAT---T-ATAAGTGTAG-TTGT-GACAT--GGACC-GTGCA--TATTCTC---ACC-----TTC-TCT----------GGC---T--------GGAT-C-A-AT--T--CC-ATTC-AATGA----CTG-ATGA-AAT--ATCATCCGG---A-G--TAAT-GAACTTGA-AAT---GT-AT-ACAG-TATTGTTT-CTC-TCC--AATA-G--T-GAGGA--CAT--G--AC---AA-TATC----CTCATT-GGA-CGGT------------------GT---GAG--T-AGT-T--GTA-ATCTGGCGAA----TC
gi|8 : C-----ATG---T--AATCCAT--GT---------CAG-A-TGAT-TG---AAACCT----A-AATC-CCTCCCTATA--ACT-A-CCACTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacatgtaatccatgtcagatgattgaaacctaaatccctccctataactaccact
gi|9 : aaattctccactcaaagtctgagtttgtctgtttgtttgagataggaacgagatgaaatccttcatcaataattgaatgcagtacagtaggtgatggccatgcgcgaatcaaacatctatcaacccagggaagggctggtaatggccaatgacgggaacggaaacacagggcgatatcagcttctatggaattataagtgtagttgtgacatggaccgtgcatattctcaccttctctggctggatcaattccattcaatgactgatgaaatatcatccggagtaatgaacttgaaatgtatacagtattgtttctctccaatagtgaggacatgacaatatcctcattggacggtgtgagtagttgtaatctggcgaatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaaGAACTA-CACCTATCATGTGAACTATTG-ACCTA-TCAATGGCATATCTCTTTTTCT-TGGACACAAACAAACACTGTGATTTC-AATGAC-ATGGAA--GTGAAT-ATA-AG----TAC-ATTTATCAA--CGCATCATG-AAAT--A-CAAC--ATAATGACTGGT-TGAGA-ATAACTG---------------AAATG-CA-TC-ATGTTTGAAAGGAAATC-TGGT----CC---CATTG-T-G-TA----A-C-T--TAT-A-ACAC------T-GCTGCTTTCC------A-C-A--T--------T-AT---AAGA-AATATC------TA--T-C-TCTA-TCTCTG------AC-TTGAGGT--AACTTTCA-CCTGTCTG--C----A-TT-A-C-AAAG-TATGG-ATT--A-GAAAGG-GTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTC------GGGATTTCAGAATCTCATCTGAGAGTGGGAGACTAGCT-GTAACA-GAA-GGCC------------CCAATG-CCA---CTGGAAAATGTGTCT-AT--CCTTTT--TGATT--ACAGAGACAT-TGTTGC-ACCCC-A-ACAA-TTTTTCCACTGCAAACATAG-TTTGTTA--CCGGGAACGATCTCAAAT-AAAGACATTGCGAAAGGGTAACC-GGTAT-ATA-CACATTCCCCAT---CAAGGATTTTAAAAA--CAATACC-A-
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|35 ): TTATCCTATGATAAGCTGAATATGAAAGGAATGCTTGTTGATTTAATAGTGTCTTCATGGGAATGTACTGTTATCCATCAATCCACTAAATAGAACAGCTGATAACCCTAAC
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 222 333333333 11111 5555555555555555555555 2222222 222 44444444 333333333333333 1111 333333 22 111 1111 111 3333333333333333 22222 111 55555555 888888888888888888888888 11111 222 11 11 222222222 1 1 1 1 2222 1 22222222222 111 1111 11 111 22222 222 11 333333 111 1 3333333333333333333 1 1 1 1 1 11 11 333333 1111 111111111 11 1 1 22 11 33333 1 222222222222 1 1 11 1 22222 1 1 11 11 5555555555555555555555555555 1 11 1 11 1 1 1 111 1 2222 1 1 1 2 1 1 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 111 22222 111111 22222222222222222222 111111111 444444444444444 1 111 222 44444444444 111 11 2222 11 1 1 1 1 1 1 11 1 1 1 3333 222222 111 11 2 1 1 2 1 1 1 11 111 22222222222 11 1111 111 222222 22222222222222 1111111111 33333333333 11 11 1 11 1 11111 11111111 3333 33333333333333333333333333333 222222222222 1111 11 11 111111 1 333333333333333333 11111 1111 22 11 333333333333333 22222 22 222 1111111111 11111 222222 2222222222 1 111 111111 222 1111 1 111 1111 111 222222222 11111111 11111 11111 11111 22222 11111 1111 777777777777777777777777777777777 11 1 11 2222 111 111 11111111111 444444
lowQualScore : 333 8 8 7 6 666666666 7 2 6 6 6 6 00000 9999999999999999999999 8888888 1 6 6 6 333 33333333 888888888888888 7777 333333 0 11 8 777 8888 444 0 0000000000000000 00000 8 8 444 22222222 777777777777777777777777 11111 1 0 1 3 333 7 6 6 0 22 6 3 11 888888888 22 0 0 9 3 3 6 7 9 2 3 0 8 0000 3 8 0 99999999999 11 0 8 8 444 9999 66 11 77 8 444 00000 777 33 666666 777 5 3 7777777777777777777 0 0 0 0 1 7 3 88 0 88 888888 2222 999999999 8 8 8 8 11 77 0 7 2 55 33 1 77777 6 3 1 3 333333333333 0 5 33 0 88888 0 0 33 33 3 4444444444444444444444444444 0 33 2 9 3 0 3 22 3 0 0 3 0 777 1 2 0 3 0000 0 88 2 3 2 3 6 3 6 6 0 5 0 0 5 4 66 0 0 4 9999 4 55 2 4 55 4 4 22 4 4 4 3 3 3 3 0 3 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 3 000 3 999999 66666 3 222222 3 44 3 44 9999 3 3 3 3 3 3 7777 3 77777777777777777777 999999 333333333 99 777 4 4 555555555555555 1 8 4 66 66 66 5 77 8 8 999 0 6 444 888 88 66666666666 8 8 0 5 8 6 6 99 0 111 99 33 4444 6 6 99 6 11 3 0 0 0 0 0 9 33 3 3 3 7 0000 555555 6 1 777 8888 0 7 88 0 5 1 1 0 3 6 0 3 0 0 6 6 88 222 6 6 11111111111 55 5 77 5 5 2222 3 000 5 111111 5 22222222222222 9999999999 5 55555555555 55 5 5 77 1 5 5 33 77 5 9 5 5 11 4 4 7 00000 777 777 5 66666666 3 2 2 777 2 4444 555 77777 77777777777777777777777777777 111111111111 2 0 333 4444 6 2 444 66 66666 3 44 3 2 3 555 44 55 3 3 6 00 3 55 3 666 99 55 777 4 4 444444 1 5 8 666666666666666666 888 77777 5 66 5 0 0000 66 5 77 5 0 00 5 77 5 77 2 88 8 6 0 666666666666666 8 3 8 99 888 99999 6 00 99 777 4444444444 44444 222222 99 9999999999 3 5 5 555 999999 4 9999 4 4 5 111 5 33 1 2 66 0000 5 5 0 5 333 2222 5 5 5 111 6 555555555 8 0 1 5 5 888 22222222 6 6 55 33333 7 99999 1 1 88888 99 55555 6 99 55555 4444 555555555555555555555555555555555 3 99 77 0 3 0 8 8 11 4444 5 000 666 66666666666 1 333333 6 8 8
lowQualScore : ... . . . . ......... . . . . . . ..... ...................... ....... . . . . ... ........ ............... .... ...... . .. . ... .... ... . ................ ..... . . ... ........ ........................ ..... . . . . ... . . . . .. . . .. ......... .. . . . . . . . . . . . . .... . . . ........... .. . . . ... .... .. .. .. . ... ..... ... .. ...... ... . . ................... . . . . . . . .. . .. ...... .... ......... . . . . .. .. . . . .. .. . ..... . . . . ............ . . .. . ..... . . .. .. . ............................ . .. . . . . . .. . . . . . ... . . . . .... . .. . . . . . . . . . . . . . . .. . . . .... . .. . . .. . . .. . . . . . . . . . .................................................................................. . ... . ...... ..... . ...... . .. . .. .... . . . . . . .... . .................... ...... ......... .. ... . . ............... . . . .. .. .. . .. . . ... . . ... ... .. ........... . . . . . . . .. . ... .. .. .... . . .. . .. . . . . . . . .. . . . . .... ...... . . ... .... . . .. . . . . . . . . . . . . . .. ... . . ........... .. . .. . . .... . ... . ...... . .............. .......... . ........... .. . . .. . . . .. .. . . . . .. . . . ..... ... ... . ........ . . . ... . .... ... ..... ............................. ............ . . ... .... . . ... .. ..... . .. . . . ... .. .. . . . .. . .. . ... .. .. ... . . ...... . . . .................. ... ..... . .. . . .... .. . .. . . .. . .. . .. . .. . . . ............... . . . .. ... ..... . .. .. ... .......... ..... ...... .. .......... . . . ... ...... . .... . . . ... . .. . . .. .... . . . . ... .... . . . ... . ......... . . . . . ... ........ . . .. ..... . ..... . . ..... .. ..... . .. ..... .... ................................. . .. .. . . . . . .. .... . ... ... ........... . ...... . . .
lowQualScore : 000 0 0 8 7 333333333 3 5 7 7 7 7 00000 7777777777777777777777 3333333 0 7 7 7 888 33333333 444444444444444 0000 888888 8 00 0 000 6666 000 8 2222222222222222 00000 0 0 000 22222222 000000000000000000000000 66666 4 8 0 2 333 3 7 7 6 00 4 2 00 000000000 55 0 0 2 7 3 7 3 8 5 2 0 8 8888 2 8 0 55555555555 22 8 0 0 000 0000 88 00 00 0 000 00000 000 22 222222 555 5 2 8888888888888888888 0 0 0 0 0 3 3 33 7 33 333333 7777 888888888 0 0 0 0 00 00 0 3 0 33 33 0 33333 7 3 2 2 888888888888 0 0 88 0 22222 0 0 22 88 2 2222222222222222222222222222 0 88 5 2 0 0 0 55 2 0 0 2 0 555 0 5 0 2 5555 0 22 5 2 0 3 7 3 7 7 7 0 8 4 0 4 11 1 0 4 4444 4 55 5 0 55 0 0 00 0 0 0 6 6 6 6 4 6 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 3 444 3 666666 00000 3 999999 3 66 3 22 6666 1 1 1 1 3 3 4444 3 11111111111111111111 666666 333333333 55 000 0 0 666666666666666 1 9 4 11 11 99 0 99 2 0 222 8 0 000 666 88 00000000000 0 0 8 0 0 7 7 22 7 777 22 66 9999 7 7 22 7 88 2 0 0 0 0 0 0 88 3 3 3 3 0000 777777 7 0 777 3333 7 3 33 0 5 0 0 7 3 7 0 2 0 0 5 7 55 333 7 7 33333333333 88 2 99 7 7 1111 0 000 7 777777 7 44444444444444 6666666666 7 11111111111 77 7 7 99 6 0 0 66 99 0 0 7 7 00 0 0 5 00000 000 555 7 77777777 6 9 9 777 9 1111 000 11111 22222222222222222222222222222 222222222222 9 4 666 0000 9 9 999 88 22222 1 22 9 9 1 444 33 00 3 3 7 00 6 00 6 555 55 55 000 0 0 444444 0 0 1 999999999999999999 888 22222 0 99 0 1 6666 44 7 99 7 1 77 7 00 7 99 5 88 0 4 8 888888888888888 0 8 0 22 333 77777 7 22 22 555 0000000000 33333 000000 22 2222222222 3 7 7 777 888888 4 6666 4 4 0 111 0 99 0 0 44 6666 0 0 0 0 888 1111 7 7 7 777 7 000000000 0 8 4 7 7 666 22222222 7 7 00 00000 2 33333 0 7 33333 22 88888 7 22 22222 2222 222222222222222222222222222222222 2 00 44 8 6 8 0 0 88 3333 7 000 777 22222222222 0 000000 7 0 0
consensus : NACAATAAGTTAAT-AAGTAACAAACC-ATTCAATA-CA---T----TTGTAAGTA-AGTCT-TTAA-TA-TAT--TA-TTGCGC---ACC----------------TACCG-------TTGAGTACAAAT-ATTGACTG-AA-ATT-ATCAA--------CAGAA------------G--TCCAT----AC---A--ACATTG-ACATT-TAC-TAAA-C--GA---AAATACA---T-T--A--A-ACAAT-----A-TT-CTGTACAG---AAAACG----A--TTGATTGTTCTATGTCA-ACTAAACCC-TA------A----ATTTATGGGT-ATTTCTTCTCCTAACTATTGACAGAAATTA---ATTCTAG-CTTCTGTG-GCTGTCTGTATTTTTTGACATGGTTCCTGTCT--AAGTGAAC--T--TTGAAT-AA-GACTGTTAACGCCCCGT-GTAGGTCCCCCACACAACATGTTGACA-GATCCCCAGTA---TCTGCCAGGACAGGT-CTCT-A--GCNTC--AAAGNTACGTATCT-CCCAT-CATC---ATAGA---GCAAGT--AGGGTGTGTGTGAT-TG---TC-----AGTCG-CCTG-TAGATAT-----TTG---TGACCTGTTACCTAGTC-GCT---GT--A-CGA---CA-GGG-AC-AGATA-ACANATGTGCAC-GGT--CGCAA--AGGG------AGATATAATATAAAANT-TNTATC-CCGT-TCATTTC-ACTGACTTCTTGT-T--CCAACNTTAA-TTCTTTCAACTATAGC-GTAAACTCTTTATACGAANATAGT-AGCNCTCTTGCCCAACC-TTCCTAAACTTAG----TA-A-CA-TAGACTGAC-CCACCT--ACCG-C-T---CACTGTA-TCTCT-G-TCTGT--CTAC--TACT-ACT--ANGACAC---------GAT-AT--GGGGCTTGTGAG-AGTCCTCTG-CTTCA-TTCTATC-TGTGACAGTTTTAGCGCT-GT---TTGATATCTNCCGG-TAATCGTAC-G-GTAT-AATCGCCTAAATATAAACCCATCATATACATAACCTAGACTTTAGAACTA-AACCTA-CATGTGA-TTATTG-ACCTA-TCAATGGCGTATCTCTTTTTCT-TTGACACAAACAAACACTGTGCTTTC-AATGAC-ATGGAA--GTGGATAATA-AG----CAC-ATTTATCAA--CGCATCATG-AAAT--A-CAA-CATTATGACAGGT-TGAGA-ATAACTG-ATCTATTACATT-TAAATG-CA-TC-ATGTTTGAAAGGAAATC-TGAT----CC---CTNTG-C-G-AA----A-C-T-NTA--A-ACGC----G-T-GCT--TTTCC------C-CGA--T--------A-AA---AAGC-AATATC------TA--T-TATCTA-TTTCTG------AC-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A-TT-A-C-AAAG-TATGG-ATT--G-GAGAGG-G--------------------CCGGGATC------AGAATCTC---------TCTGAGAGTGG--GACTA--T-GTAACAGGAA-GG--------------ACAACGCCCA-TTTTGTAAAATGTTTCT-AA--C--TTT--TGA-T--ACAGGGACATCTGTTGC-GCCCC-G-ACAA-TTTTC---CTGCAAACATAT-GTTGTTCT-CCGG-----------AAT-AAAGAAATT-TGGAAGGGTAACC-GGTAT-ATA-CACA--CCGCAT---CAAGGATTT--GAAA--CAAAACC-A-ACACATGTTGGAGC-AATGTTG-A--TGGT-ATCCATGG-AGTTGAA-GAGCTTTCT-TGA-ATTCT-C-CAAAATAATACTTG--TTTTCATAAAAT-ATGAACAC-AGTAA-ATTCGTC---ACAGAAA--ACT-TCCTTCAAAATNATTTTC-A-TGATTCCGTAACGGAGAAAACTGG--CAATGGTTCATAGAGTACACTANCTTTGNCCCGCTCG-TG-AAAAGAAA-TTCTCCA-CT-CCAAAGTCC-GAGTTTAATTCATT--TGT-CTGT-TTGTTT-GC-GA-T-AGGAA--CGAG--AT-GAA-ATCCT----TCGT---CAAT-AATTG----A-TTG-TAGG-T--ACGA--CTACGCG--A-------T-GGCCA---------ATGCGC--GAGT-CA-AACATC--TATCAAACCCAGGG--AA--GGGCTGGTAAATGG-GCA-GTGACGGGAA--TGGAAACA-C-AGCGGC-----GATA---TCAGT-TTCTATGAGAT--AG-ATAAGTGTAG-TTGT-GACAN--GGACC-GTGCAG-GGTTCTC---ACC-----TTC-GCT----------GGCT--T--------GGAT-C-A-A---T--CC-ACTC-AGTAA--T-TTG-ATGG-NNT--CTCATCCG-G---A-G--TAAT-GAACTTGA-AAT---GTAAT-ACAG-TATTGTTT-CTC-TCC--AATA-G--T-GAGGN--CAT--G--AC---AA-T-TC--G-GTNATT-TGACCGGT------------------GT---GAG--TAAGT-T--GTA-ATCTGGCGAA----TCC-CGG-G--GG-AGTATCAGAC-GGTC-TCCATAAT-AGA--TAAGGTGTATGT-CTGG-GTGGATGAATTG---GANA------CGTG-GACTG-AGACATCT--CACA-T-ATCAC-C-CTT-TATGGAT--CA---GG---TAG--C-CAACGC-----ATG---A--AATCCAT--GT--T------CAG-A-TGAT-TT---AAACCT----G-AATC-CCTCCCTANG--ACT-A-CCACTCAGCAT-A-T-TC-TCACTCCNCTATATAACT-CTGAAGGTTTC----CGTATCATC-T-CC-C-C---GTGTCCCCCAG----ATCCCTTCTG-AAGGTCACTTCTGTC-GG-TGTCCC---TATCTCAC-GACAC-----A---CACCCACATA-CAGGGCTTCTGACACACGGGGAATGTGATCCATCC-TGTAACGA-TTC-G-TTAACGTTAG-TTGATCGAC-ACAATA-CAAATTTCT-ATT-AATACGAG-ACTACACATTAT----ACAGC--GTTCTGAAAT-AAT-TC--GTGAAA--AGTTTG----TATAAAAA-G----------TGTAAT-------------TCTTACAAAATCCACTCTACCTGAGAATTT--CAAAGTTCTATTTATAGACAATCGGAAAATAC-CCGGTT-AAGCT-CCGC--GCTACTTTTCTT-TTGCA---TGTACTCTGTTG-AC-CTTAA-TATGGAATACCAGT--TTTA-TTTGATTCG-TT-ATCGA
Reference ( family-5170 ) : NACAATAAGTTAAT-AAGTAACAAACC-ATTCAATA-CA---T----TTGTAAGTA-AGTCT-TTAA-TA-TAT--TA-TTGCGC---ACC----------------TACCG-------TTGAGTACAAAT-ATTGACTG-AA-ATT-ATCAA--------CAGAA------------G--TCCAT----AC---A--ACATTG-ACATT-TAC-TAAA-C--GA---AAATACA---T-T--A--A-ACAAT-----A-TT-CTGTACAG---AAAACG-------TTGATTGTTCTATGTCA-ACTAAACCC-TA------A----ATTTATGGGT-ATTTCTTCTCCTAACTATTGACAGAAATTA---ATTCTAG-CTTCTGTG-GCTGTCTGTATTTTTTGACATGGTTCCTGTCT--AAGTGAAC--T--TTGAAT-AA-GACTGTTAACGCCCCGT-GTAGGTCCCCCACACAACATGTTGACA-GATCCCCAGTA---TCTGCCAGGACAGGT-CTCT-A--GCNTC--AAAGNTACGTATCT-CCCAT-CATC---ATAGA---GCAAGT--AGGGTGTGTGTGAT-TG---TC-----AGTCG-CCTG-TAGATAT-----TTG---TGACCTGTTACCTAGTC-GCT---GT--A-CGA---CA-GGG-AC-AGATA-ACANATGTGCAC-GGT--CGCAA--AGGG------AGATATAATATAAAANT-TNTATC-CCGT-TCATTTC-ACTGACTTCTTGT-T--CCAACNTTAA-TTCTTTCAACTATAGC-GTAAACTCTTTATACGAANATAGT-AGCNCTCTTGCCCAACC-TTCCTAAACTTAG----TA-A-CA-TAGACTGAC-CCACCT--ACCG-C-T---CACTGTA-TCTCT-G-TCTGT--CTAC--TACT-ACT--ANGACAC---------GAT-AT--GGGGCTTGTGAG-AGTCCTCTG-CTTCA-TTCTATC-TGTGACAGTTTTAGCGCT-GT---TTGATATCTNCCGG-TAATCGTAC-G-GTAT-AATCGCCTAAATATAAACCCATCATATACATAACCTAGACTTTAGAACTA-AACCTA-CATGTGA-TTATTG-ACCTA-TCAATGGCGTATCTCTTTTTCT-TTGACACAAACAAACACTGTGCTTTC-AATGAC-ATGGAA--GTGGATAATA-AG----CAC-ATTTATCAA--CGCATCATG-AAAT--A-CAA-CATTATGACAGGT-TGAGA-ATAACTG-ATCTATTACATT-TAAATG-CA-TC-ATGTTTGAAAGGAAATC-TGAT----CC---CTNTG-C-G-AA----A-C-T-NTA--A-ACGC----G-T-GCT--TTTCC------C-CGA--T--------A-AA---AAGC-AATATC------TA--T-TATCTA-TTTCTG------AC-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A-TT-A-C-AAAG-TATGG-ATT--G-GAGAGG-G--------------------CCGGGATC------AGAATCTC---------TCTGAGAGTGG--GACTA--T-GTAACAGGAA-GG--------------ACAACGCCCA-TTTTGTAAAATGTTTCT-AA--C--TTT--TGA-T--ACAGGGACATCTGTTGC-GCCCC-G-ACAA-TTTTC---CTGCAAACATAT-GTTGTTCT-CCGG-----------AAT-AAAGAAATT-TGGAAGGGTAACC-GGTAT-ATA-CACA--CCGCAT---CAAGGATTT--GAAA--CAAAACC-A-ACACATGTTGGAGC-AATGTTG-A--TGGT-ATCCATGG-AGTTGAA-GAGCTTTCT-TGA-ATTCT-C-CAAAATAATACTTG--TTTTCATAAAAT-ATGAACAC-AGTAA-ATTCGTC---ACAGAAA--ACT-TCCTTCAAAATNATTTTC-A-TGATTCCGTAACGGAGAAAACTGG--CAATGGT-CATAGAGTACACTANCTTTGNCCCGCTCG-TG-AAAAGAAA-TTCTCCA-CT-CCAAAGTCC-GAGTTTAATTCATT--TGT-CTGT-TTGTTT-GC-GA-T-AGGAA--CGAG--AT-GAA-ATCCT----TCGT---CAAT-AATTG----A-TTG-TAGG-T--ACGA--CTACGCG--A-------T-GGCCA---------ATGCGC--GAGT-CA-AACATC--TATCAAACCCAGGG--AA--GGGCTGGTAAATGG-GCA-GTGACGGGAA--TGGAAACA-C-AGCGGC-----GATA---TCAGT-TTCTATGAGAT--AG-ATAAGTGTAG-TTGT-GACAN--GGACC-GTGCAG-GGTTCTC---ACC-----TTC-GCT----------GGCT--T--------GGAT-C-A-A---T--CC-ACTC-AGTAA--T-TTG-ATGG-NNT--CTCATCCG-G---A-G--TAAT-GAACTTGA-AAT---GTAAT-ACAG-TATTGTTT-CTC-TCC--AATA-G--T-GAGGN--CAT--G--AC---AA-T-TC--G-GTNATT-TGACCGGT------------------GT---GAG--TAAGT-T--GTA-ATCTGGCGAA----TCC-CGG-G--GG-AGTATCAGAC-GGTC-TCCATAAT-AGA--TAAGGTGTATGT-CTGG-GTGGATGAATTG---GANA------CGTG-GACTG-AGACATCT--CACA-T-ATCAC-C-CTT-TATGGAT--CA---GG---TAG--C-CAACGC-----ATG---A--AATCCAT--GT--T------CAG-A-TGAT-TT---AAACCT----G-AATC-CCTCCCTANG--ACT-A-CCACTCAGCAT-A-T-TC-TCACTCCNCTATATAACT-CTGAAGGTTTC----CGTATCATC-T-CC-C-C---GTGTCCCCCAG----ATCCCTTCTG-AAGGTCACTTCTGTC-GG-TGTCCC---TATCTCAC-GACAC-----A---CACCCACATA-CAGGGCTTCTGACACACGGGGAATGTGATCCATCC-TGTAACGA-TTC-G-TTAACGTTAG-TTGATCGAC-ACAATA-CAAATTTCT-ATT-AATACGAG-ACTACACATTAT----ACAGC--GTTCTGAAAT-AAT-TC--GTGAAA--AGTTTG----TATAAAAA-G----------TGTAAT-------------TCTTACAAAATCCACTCTACCTGAGAATTT--CAAAGTTCTATTTATAGACAATCGGAAAATAC-CCGGTT-AAGCT-CCGC--GCTACTTTTCTT-TTGCA---TGTACTCTGTTG-AC-CTTAA-TATGGAATACCAGT--TTTA-TTTGATTCG-TT-ATCGA
gi|1 : ACAATGGGTTAAT-AAGTAACAAACCTATTCATTA-C---------TTGTACGTATAGTCT-TTAACTA-TAT--TAATTGCGC----CC----------------TATCGC------TTGAGTACAAATTATTGACTG-AACATT-ATCTA--------CATAA------------G--TCCAT----ACG--A--ATATTGTACATT-TAC-TAAA-CCTGA---AAATACA---T-T--A--AGACAAT-----AGTC-CTGCACAG---AAACGG-------TTGATTGTTCTAT-TCA-ACTAAACCCATATCCGCTA----TTTTATGGAT-ATTCCCTCTTCTA-CTATTGACAGAAGTTA---ATTCTAGGCTTCTGTGTGCTGTCTGTATTTGTTCTCCTGGTTCCTGTCT--AAGTGAAC--TCTTTGAAT-AACGACTGGTAACGCCCCGTTGTAAGTCCCCCACACAACATGTTGACATGACCCCCAGTAATTTCTGCCAGGACAGGT-CTCT-A--ACTTCTAAAATCTACGTATCT-CCCAT-CATC---ATAGA----CATGT--AGGGTGTGTGTAAT-TG---TC-----AGTTG-CCTG-TAGATAT-----TTG---TGACTGG--ACCT---T-ACT---GT--A-TGA---CA-GGG-AC-AGATA-ACAGTTGTGCAC-GGT--CACAA--AGGG------AGATATAATATAAAAATATCTATC-CCGT-TCATTTC-ACTGACTTCTTGT-T--CCAACTTAAA-TTCTTTCAATTATATT-GTAAACTCTTTATTCGAACATAGT--GTCCTCTTGCCCAACC-TTCCTAAACTT-G----TA-A-CA-GAGACTGACTCCACCTGAGCCA-CGT---CACTGTA-TCTCTGG-TCTGTTCCTACGATACCGACCAAATAACAT---------GAT-AT--GGGGCTTGGGAG-AGTCCTCT--CTTCC-TTCTATC-TGTGACAGTTAAAGCGCT-GT---TTGATATCTTCCGGTTAATCGTAC-G-GTAT-ATCCGCCTAAA-ATAAA--CATCATATACATAACCTAGACTTTAGAACTAGAACCTA-CATGTGA-TTTTTGAACCTACTCAACGGTGTATTTATATTTCTATGGACACAAACAAATATCA-GCTTTCAAATTACAATGGAAAGGTGAATTATA-AG----TA--ATTTAACAA--CGCTTGATGAAAATAGA-CAACCATTATGACTGGTGTGAGATATAATTG-ATCTATTGCATTCTAAATG-CA-TCAATATTTTGAAAGTAACC-T-AT----CC---CTGTG-C-G-AG----A-C-TGCTA--A-ACGCA---A-T-GTT--TTTCC------C-TGA--T--------ATAA---ATGC-AATATC------TA--TCTATCTACTTTCTGA-----ACGTTGAGGT---ACTTTCC-CC--TCTGAAC----ACTT-ACC-AAAGAAATGG-ATT--GCGAGAAG-G--------------------GCGGAATC------AGAAT-TT---------TCTGAGAGTGGC-GACT---T-GT-ACAGGAA-GG--------------AGAATCCCCAGTTTCGTAAAATGTTTCT-AA--C--TCT--TGT-TTAACAGGGACATCTGTTGC-GCTCC-GTACAG-CTTTC---CTGCAAACTTATGGTTGTTCT-CCGG-----------AATAAAAGAAATT-TGGAAAGGTAACC-AGTAT-ATATCACA--CCGCAT---CAAGGATTT--GAAAC-CAAAACCAA-ATACATGTT-AAGC-AATGTTG-A--TGGT-A-CCATGG--GTTGAATGAGCTTTCTATGA-ATTCT-CACAAAATAATACTTGGTTTTTCATAAAATGATTAACACGAGTAATATTCATCTGGACAGGAA--ATTGTCCTTCAAAAAGATTTTCAA-TGATTCCGTAACAGAG-AAACTGG--CAATGGT-CATAGAGT-CACTAGCTTTGGCCCGCTCG-TGAAAAAGAAATTTCTCCATCTGCCAAAATCC-GAATTTAATTCATT--TGT-CTGT-TTGTGT-GCTAA-TCAGGAA--CAAG--AT-GAA-ATCTC----TCTT---CAAT-AATTG------TTG-TAGG-T--ACGG--CTACGCGGAA-------T-GGCCA---------ATGTGC--GAGT-CA-GAAATC--TCTCAAACCCAGGG--AAGGGGGCTGGTAAATGGTGCA-GTGACGGGAA--TGGAAACA-CTAGCGGC-----GACA---TCA-T-TTC-ACGAGAC--AG-ATAAGTGTAG-TTGT-GAAAG--GGACC-GTGCAGCGGTTCCTGCAACC-----TTC-TCT----------AGCCTGT--------GAAT-C-A-C---T---C-ACTC-AGTAGC-T-TTGAATGGTCTT--CTCATC---G---A-G--TAAT-GAACTTGA-AAT---GTAAT-GCAA-TACTGTTT-CTC-TCC--AATA-G--T-GGAGT--CGC--GCAAC---AA-T-TG--G-GTTATA-GGACCGGT------------------GT---GAG--GAAGT-T--GTA-ATCTGGCGAA----TCC-CGG-G--GG-AGTAGCAGA--GATC-TCCATAAT-AGA--TAAGGTGTATCT-CT-G-GTGGATGAAT------ATA------CGTG-GATGA-AGACATCT--CACA-T-ATCACAC-CTT-TATGGAG--CAG--GG---TAC--C-TAATGC-----ATGT--T--AATCCAT--GT--T------CAGTA-GAAT-TT---AAACCT----GAAATC-CCTCCCTACG--ACT-AGCCACTCAGC-T-AGT-TC-TGTATCCTCTATATAACTCCTGAAGGTTTC----CGTATCATC-T-CC-C-C---GTGTCCACGAG----ATCCCTTCTG-AAGGCAACTTCTGTC-GGTTGTCCC---TA-CTCAC-GACAC-----AAATCACCCACATAGCGGGGCTTCTGACACACGGGGAA-GTGATCCATCC-TGTAACGAGTTCAG-TTAA-ATTAGTTTGATCGACTCCAATA-CGAATTTCTAATTGAATACGAGCACTACACATTAC----ACAGC--ATTCTGAAATGAAT-TC--GTGAAA--AGTTTG----TTTAAAAATG----------TATAAT-------------TCTTACAAAATCTACACTACCTGAGAATTTTACAAAGTTCTATTTAT-GACAATCGGAAAATACTCCGGTTAAAGCTGCCGCTAGCTATTTCTCTG-TTGCA---TGCG-------------------ATGGAATAC--G----TTA-TTTGATTCGTTT-ATCAA
gi|10 : c-TAAATA-CAATC-ATGTTTGATAGGAAATCATGAT----GC---TTGTATC-A-AC----A-C-T-GT------------------CTA-TTTCA------G-TAA-----------A-AA---AAGCCAATATC------TA--T--ATCTA-TTTCTG------AC-TTGAGGT--AAACTTTC-CCTGTCTG--CC---A-TTTA-C-AAAG-TATGGGATT--G-GAGAGG-G--------------------CCGGGATC------GAGATCTC---------TCTGGAAGTGG--GGC-A--T-GTAGCAGAAA-GC--------------AC----CCCAGTTTTGTACAATGTTTCT-AAATC--TTT--TGA-T--ACA-GTAGATGTGTTGTGGCCCCGG-ACAATTTTTC---CTGCAGAAATGT-G-TGTTCT-CCGGA----------AAT-AAA-AAATT-TGGGAGCTTAACCAAGTATGATA-CACA--CTGCATTCACAAGGATTT--GAAAGTCAAAACC---ACACGTGTTGGAGCAAATGTTG-ACGCGGTAATCCATGGTAATTG-A-GAGCTTTCT-TGAGATTCCGC-CAAAATAATA-TTG--TTTTCCTGAAAT-ATGAACAC-AGTAA-A-TCGT-----CAGAAATCACT-TCCTTCAAAATAATTTTC-ACTGA----GTAACGAAGAAAACTGG--CAATGGagctg
gi|11 : AA--TGGAAACA-C-AACG-C-----GATG---TCATA-TTC-AT----T--AG-ATAGACG-AG-T-----ATA---GAACT-TTGTGA-------C---A-------------T----------AGCA--T--------GGA----A-AACGT--CC-ACTA-AATAA--T-T-G-ATGG-ACT--CTCATTCG-G---A-A--TA--------------T---GTAGT--CGG-TATTGTTT-CTC-TCC--AATA-G--T-GAGTC--CGT--G--AC---AA-T-TT--G-GTTATA-TGA-CGGT------------------GT---GAG--TAGG--T--GTA-ATCTGGCGAA----TCT-CGG-G--GG-AGTGTCAGA--GGTC-TTCAT-AT-AGA--TAA-GTGTATGT-CTGT-GTGGATGAATTGATAGA-A------CGTG-GACTG-AGACATCT--CACA-T-CTCAC-C---T-TAT-GAT--CA---GT---TTG--C-CAAAAC-----ATG---A--AATCCAT--G---T------CAG-A-TGAT-TT---AA-------------------------------A-CCACTCAGCAT-ATT-TC-TCACTCCTCTATATAAGT-CTGAAGGTTTC----TGTATCATC-C-CC-TAC---GTGT----CAGAAATATCCCTTCTG-AAGGTCACTTCTGTC-GG-TGTCCC---TATCTCAC-GACAC-----A---CCCCCACATA-CAGGACTTCTGACGCACGTGGAATGatctctcgtcaacaaatgcgtaata
gi|12 : TTTGTTCCGCTTG-TG-AAAAGAAA-TTCTCCC-TT-CTATAATCTTGAGTTC---TTATT--TGTGCTGTACTGTTTTGC-GA-T-AGAAAGAC-AG--ATTGAATATCCT----TCCT---CGAT-AATTGTGAAG-TCG-AGGA-TTGATGC--CAACGCG--AAGAGGAAT-GATCAGAATCGGCCATGTGTTGAAGTACATAAGATCGCTTTCAAATCAAGGGG-AA--GTGCTGGTAA-TGG-GCA-GTGACGGGAA--TGAAAACA-C-AGCG-C-----AATG---TCGAA-ATCTA---AATTCAG-AAAAGTGTAG-CTGT-GACAA--GGACC-GTGCAT-G-TTCTC---ATT-----TTC-GTT----------GGAT-----------GGAC-T-A-AG--T--CC-ATTCCAGT----T-TTG-ATGA-AAT--CTCAACAG-G---A-G--CATT-GAACTTGA-AAT---ATA-T-ACAG-CATTGTTT-CTC-TCC--AATA-G--T-GAGGA--CAT--G--AC---AA-T-TT--G-GCGAT
gi|13 : TACGTA-CT-CCCAT-CATC---GTAGA---GCA-GT--AGGGTTTGT-TGATCTG---CC-----AGTT---CTG-TAGATACATGTATTG---TGACTTGTTACCTAGTC---T---GT--AGTGA---CATAGG-AT-AGATA-GCATATG--CAC-GGT--CACAA--AGGG------AGATA-AACATAAAACT-GATATT-CCGT-TCATTCC-ACTCACTGCTTGT-T--CCAACATTAA-TTCTT-CAA-TACAG--GTAATCTTTTCACA-GAAAAGAGT-A--TCTCTTGCCCAAGCATTCCTAAACTTAG----TCTA-CA-TAGACTGAC-C-ACCC--ACCGTC-G---CACTTTA-TCTTT-G-TCTAT--CTAC-------ACT--ATGGCAT---------GAT-AT--GGG-------------TCTCTG-CTTCA-TTCTATC-TGTGACAG--TTAGGGCT-GT---GTGATATTTACCGG-T-ATCGTACAA-GTAT-AA-CG-CTAAATATAAATC
gi|14 : -TTATTG-ACCTA-TCATTATTGAATCTCTTTTTGT-TTGGCACAGACAATCTTTGTGCTTTT-AATGCC-ATGGAC--GTTGATAATA-A-----CAC-ATTTATCAA--CGCATCATG-AAAT--A-TAA-CATTATGGCAGGT-TGATA-ATAACTG-ATCTATGACATT-TAAATG-CA-TC-ATGTTTGAAAGGAAATC-TGAT----AC-------G-A-G-AATTGTA-C-T-TCT--A-ACACTG--A-T-GC---TTTCG------C-CAA-----------A-AC---AAGC-AATATC------TA----TATCTA-TTTCTG-------C-TT-AGGT--AATTTTCC----GTCTG--C----A-TT-A-C-AAAG-TGTGG-ATT--A-GAGA-G-G--------------------CCGGG-TC------AGAATCTC---------TCTGAGAGTGG--GACTG--C-GTAACAGGAA-AG---------------CAACGCCCA-TTTTGTCAAATGTTTCTGAG--C--TTT--TGA-T--ACAattgccaaaacacaaa
gi|15 : TTTTCT-TTGACACAGACAAACACTGAGTTTTT-AATGAC-ATGGAA--GTGAATA-TA-AG----CAC-ATTTATCAA--AGCATCATG-AAAT--A-TAA-CATTATGACAGGT-GGAGA-ATAACTG-ATCTATTACATT-TATACG-CA-TC-ATGTTTGAAAGGAAATC-TGAA----CT---CTTTA-T-G-AA----A-CAT-GTA------TCTTTTG-T-GCT--TT--C------C-CGA--T--------A-AA---ATGC-AATATC------TA----TATCTA-CTTCTG------AC-TTGAGGT--AACTTTCC-TCTGTCTG--C----A-TT-A-C-AAAG-TATGG-ATT--G-GAGAAG-G--------------------CCGGGATC------AGAATCTC---------TCTGAGAGTGG--GGCTA--T-ATAGCAAAAA-GG---------------CAATGCCCA-TTTTGTAAAACTTTTCC-AA--C--TTT--TGA-a
gi|16 : cAGTCC-GAGTTTAATTCATT--TGA-CTGT-TTGTGT-GC-AA-T-AGGGA--CGAG--AT-GAA-ATCCT----TCGT---CAAT-GATTG----T-TTG-TA-G-T--AC-A--CTTTGCG--A-------T-GGCC----------ATGCGC--GAGT-CA-AACATC--TATC-AACCCAGGG--AA--GGGCTGGT-AATGG-GCA-GTGACGGGAA--TGGAAACA-C-AAC-GC-----TAAA---TCATT-TTCTATGGAGT---G-ATAAGTGTAG-TTGT-GACAT--GGACC-GTGCA--GGTTTTC---ATT-----TTC-TCT-----------GTT--T--------GGAT-C-ACG---T--CC-ACTC-ATTAA----TTG-ATAT-TGT--CTCATTCG-G---A-G--TAAT-GAACTCGA-AAT---GT-AT-ACAG-TACTGTTT-CTC-TCC--AATA-G--T-GAGTC--CAT--G--AC---AA-T-
gi|17 : -T-GCT--TT--C------A-CTA--T--------A-AA---AAGC-AATATC------GA--T--ATAAA-TTTCTT------CC-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A-AT-A-T-AAgccgat
gi|17 : tactaatactgt-ATA-CACA--CTGCAT---CAAGGATTT--GAAG--CAAAACC-A--CACATGTTGAAGC-AATGTTG-A--TGGT-ATCCATGG-AGTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaatacacactgcatcaaggatttgaagcaaaaccacacatgttgaagcaatgttgatggtatccatggagtt
gi|18 : tactaatactgttgctttcactataaaaagcaatatcgatataaatttcttccttgaggtaactttcccctgtctgcaatataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaAATAAGTCG-T-AAGTAACAAACC-ATTCAATA-CAATGTACAGTTGTAAGTA-ATTCT-TTAA-TA-TAT--TA-TCGCACACAACCATTGATTTATTATAAATATTGACTGAAATCGAATACAAAT-ATTGACTG-GA-AT--ATCAA--------CAGAATCAGAAAATGAAA--TCCAT----AC-------CATTTCACATT-TA--TGAA-C--GAGATAAATGTA---A-T--ACAA-ACAAT-----A-AT-CTGTACAG---AAAACAATTAACTTTGATTTTTCTATGTCG--TTAAA-----G------G----GTTTAC------TTTCTTCTCCTAACTATTGACAGAAAT-A---ATTCTAG-TTTCTATG-GCTATCTGTATTTTGTGACATGGTTCTTGTCT--AA
gi|19 : AGAACTA-AACCTAACATGTGAATTATTA-TCCTA-TCAATGGCGTATCTCTTTTTGT-ATGACACAAACAAATTATGTGCTTTT-AGTGAG-ATGAAA--GTCGACAATAGAG----CAC---TTACCAG--CCAATAATG-AAAT--C-TAA-CAT---GACAGGT-TGAGA-TTAATCG-ATCTATTGCGTT-TAAACG-CT-TC-ATGTTACAAAGGAAATT-TGAA----AC---CTCTG-----GA----A-C-T-GTA--C-ATAT----GGT-ACT--TT-----------CAA--T--------A-AAGA-AAGC-AATATC------TA--T--ATCTA-TCTCTG------AC-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A-TT-A-C-AAAG-AGTGG-ATC--A-GAGAGG-G--------------------CCGGGATT------AGAATCTC---------
gi|2 : TTAATCAAGTC-CATTGTG-CAAT--AACAA-CATT-TGG-ATGC-TGAGA-ATAAGTGCATCTATTGCATT-TAAATATCA-TC-ATGTTTACAAGCAAATC-TGACTTGACCAAGCT----C-G-AC----ATC-T-CTAC-A-ACTT----G-TCGCA--TT-----------CAACTT--------A-AATTTAAAC-ATTATCAACCCATAAAT-TAGCTA-CTTCTATTTTGCAC-TTGAGGCCAAACTGTCCTCCTGTTTA--TGACAA-TT-G-CTAAAG-TATGG-ATTTAG-GAGAGGTG--------------------CCGGGATCTGATTGACAATATC---------TCTGAGAATGG--GGCTA--TTGTAACAGGAAAGG--------------GCAACCCCCA-TTTTGTAAATTTTTTCT-AA--C--TTTCTTGA-T--ACAGAGAAATTCGTCCC-GCCCC-G-AC---TTTTC---CTACACACATAT--TTGTTCTGCCAG-----------AAT-AGAGAAATT-TGAA--GGTAACC-GGTAT-ATA-CACA--TTGCAT---CAAGGATTT--GAAA--CAAAACC-ACAC-CACGGTGAAGC-AGTGTTGGA--TGGT-ATCCGTGG-AGTTGAA-GAGCTCTCT-TTA-ATTCT-C-CAAAATAATATTTG--TCTTCATAAAAT-ATGAACAC-AGTTA-ATTCGTC---ACAAATA--A-T-TCCTT-AGAATTATTTTC-A-TGATTCTGTAACAGAGAAAATTGGGACAATGGTTCATAGAGTACACTACTTTTGCCTCGCTTGGTGTAAAAGAAA-T-CTCCA-TT-CCAA-GTCT-GAGTTT--TCCATTCGTGT-CTGT-TTGTTTTAC-AAAT-AGGAAT-CGAGGAAT-GAA-ACCCG----TCTT---CAATTAATTG----AGCTG-CAT--T--ACAAACTTACGTG--G-------T-GGGCC---------GTGCTC--G--T-CA-AACATC--TATCAA-CCCAAGG--CA--GAGCTGGTAA-TGG-ACA-GTGACGGGAAAGTGGAAATAAC-A-CAGC-----GATA---TCAGTCTTCTTTAA--T--CGTACAAGTGAAGGCTGT-AAACA--GGACC-GTGTAT-T-TTCCC---ACCTTTTTTTC-CCCCCCCCCAAAAAGTT--TTTATTTGGGGATTC-A-T---T--CC-CCTG-AGTGA--T-T-G-ATGG-ATT--CCCTTCCGCC---A-G--CAAT-GAAC-TGA-AAT---AT-AT-ACTG-TATTGTTTGCTC-TCT--AATACG--T-GAG
gi|20 : gC-ATCGAA--GTTGATAA-A-AG----CAC-TTCTATCAA--CTTATCATC-GAAT--A-TAA-CATATTGGCGAGT-TGAGA-ATAACTG-ATCTATTACATT-TAAATG-CA-TC-ATGTTTAAAAGGAAATC-TGAT----CT--------------A----A-C-A-ATC--ACACCC----G-C-ACT--T--CC------CATGA--TTTCATTAAA-AA---AGGC-AATATC------AA--T--GTCAA-TTTCTG------AC-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A-TT-A-C-AAAG-TGTGG-ATC--T-GAGAGG-G--------------------TTGGGATC------AGAATTTC---------CCTCAGAGTGG--GACTT--T-GTAAGAGGAA-GG---------------CAACGCCCA-TTTTGTAAAATGTTTCT-AA--C--TTT--TGA-T--ACA
gi|21 : -TTATTG-ACCTA-TCAATGGTGAATCTCTTTTTGT-TTGATACCAAAAGACTTTGTGTT----AATGAC-ATGGAC--GTAGATACTA-AAACAATACTAGTAATCAA--CTTATCATG-GAAT--A-TAA-CATTATGACAGGT-TGAGA-GTAACTG-ATCCATTACATT-TAAATG-AA-TC-ATGTTTGATAGGAAATC-TGAT----GC---AATTGTC-C-CA----C-T-T-ATATTA-CTGC------T-GCT--TTCGC------C---A--T--------A-AA---AAGC-AATATC-------A--A-TATCTA-TTTCTG------AC-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A-CT-A-C-AAAG-TATGG-ATT--G-GAGAGG-A--------------------CCGGGGTC------AGAATCTC---------
gi|22 : CAATGAGTTA-T-AAATAACAAACC-ATTCATTA-C----T----TTGTAAGTA-AGTCT-TTA--TA-TAT--TA-TTGTGT----CC----------------TATCG-------TTGAGAACAAAT-ATTGACTG-AA-AT--ATTTA--------CAGAG------------G--TCCAT----AC---A--ATATT--ACATT-TAC--AAA-T--GA---AAAT-TA---T-T--A--A-ACAAC-----A-TT-CTGCACAG---AAAACG-------TCGATTGTTATATGTCA-AC--AACCC-TA------ACCTTATTTATGGGT-ATTT--TCTTCTAACTATTGACA-AAATTA---ATTCTAG-TTTCTGTG-GCTGTCTGTATTTTGTGATATGGTCTCTGTCT--AAGTG-AC--T--CTTGAT-AA-GACTG-TAACGC
gi|23 : AAATTATATATTC-AG-CTTCTGTG-GCTGTCTGTATTTTTTGA-ATG-TGCTTGTTTTTAAGTGAACAAT--TTGATTTAA-GACTGTTAACGCCCTGT-GTAG-TCCCCCAC-CA-TATGTTGACA-AATCCC-AGTA---TCTGCCA-GACAGGT-CTCT-ATGGCGT---AAAGGTGCGTATCT-CCCAT-CATC---ATAGA---GCAAGT--AGGGTGTGTAGGGT-TG---TC-----AGT-G-CCTG--AGATAA-----ATG---TGACCTG-TACCTAGTC-GTTAGAGT--G--GATTTTA-GGGTAC-AGATA-ACA
gi|24 : gaGAATGTGATCCATCC-TGTAACGA-TTC-T-TTAACGTTAG-TTGATCGAC-TCAATA-TAAGTTTCT-ATT-AA--------------AT--T----ACAGT--GTTCTG--AT-AAT-TC--GTGAGA--AG-TTG----TATAAAA-------------TGTAA--------------TCTTACAAAATGTACTCTACCTGAGAATTT--CCAAGTTCTATTTATAGACAATCGGGAAATAA-CCAGTT-TAACT-CCG-----TACTTTTCTTATTGCA---TGTACTCTGTTG-AC-CTTAA-TATGGAATACCAGTC-TTTA-TTTGATTCG-TTAATCGA
gi|25 : GGGAAATGTGATCCATCC-TGTAACAA-TTA-T-TTAACGTTCA-TTTACCGAA-ACAATA-CAAATGTTT-ATT-AATACGAA-AGAATACATTAC----AC--C--GTTCTGAA---AAC-CC--GTGAAA--AG-TTG----TATAAAA-------------TG-AAT-----------------------TCCACTGCACCTGAGAATTT--AAAACATCTATTTATAGACAATCGG-AAATAC-CCGGTT-AAGCC-C--C--ACTACTCTTCTT-TTGAAAATTG-A-TTTGTTG-ACTCTTAAGTCT-GAATA----T--TTTA-TTCCGTT-G-TT-gacaattgt
gi|26 : -TTATTG-ACCTA-ACAATGGTGTATCTTCTTTTCT-TTGACACAGACAAACACTGTGTTTTC-AACGAC-ATGGAA--GTGAATA-CA-AG----CTT-ATTTATCAA--CGCTTCATG-AAAT--A-CAA-CATTATGACAGGT-TGAGA-ATAACTG-ATCTGTTACATT-AAATTG-CA-TC-ATGTTTAAAAGGAAATC-TGAT----TC---CTGTG-TGG-AA----A-A-T-CTAT-C-ACGT----C-T-GAT--TT--C------C-CGA--T--------A-AA---ATGC-AATATC------TA----TATCTA-a
gi|27 : --AG-GTAAGTGTAG-TTGT-GACAT--GGACC-GTGCAG-G-TTCTC---ACC-----TTC-ATT----------GGCT-----------GGAT-T-A-A---C--CCCATTC-CATA---T-TTG-ATGG-TTT--CTCATCCG-T---A-G--TAGT-GAACTTGA-AAT---GT-AT-ACAG-TATTGTTT-TTC-CCC--GTTA-G--T-GAGGA--CAT--G--AC---AACC-CC--C-ATCATT-TGA-CGAT------------------GT---GAG--T-AGT-A--GTA-TTCTGGCGAA----TCC-CGGTG--GG-AGT-TCACCC-CGTA-TCCAT-AT--GA--GAAAGTGTA
gi|28 : CCTAGACTTAG----TA-AGCAATAGACTGAC-C-ACCT--ACCG-C-CTTCCACTGTA-TCTCT-G--CTGT--CTAC--T-CT-GTT--GAGATAC---------AATTATTTGGGGCTTGTGAG-AGTCCTCTGTCTTCA-CTCTTTC-TGTGACAGTTTTAGCGCT-GT---TTGATATCTACCGG-TATTCATAC-ATGTAT-AATTGCCTAAATACCAACCCATCAT
gi|29 : taccTTCAATA-C----T----TTGTAAGTA-AGTCT-TTAA-TAATAT--------------AC-----------------TACCG-------TTGATTACAAAT-ATTGACTG-AA-A-T-ATCAACAGAAT--CAGAA------------G--TCCAT----AC---ATTACATTG-ATACTATAG-TAAA-T--GA---AA--ACA---TGT--A--A-ACGGT-----A-TT-CTGTACAG---GAAATC-------TTGATTGGCCTGTGT--------------------------ATTAATTGGTAATATCTTCTCCTAACTATTGACAgattgcgaaa
gi|3 : gAG--AT-GAA-ATGCCAGTGTAGTACCCAAT-AATTG----A-TTGGTAGGAC--ACGA--C--CGCG--A-------TTAGCCA---------TTGCGCCTGAG--CA-AACATC--TATCAAACCCAGGGGAAA--TAGGTGGTAA-TGG-GCAAGTGACGGGAAGATGAAACCA-A-GGCGCCTCGTGGTTACATTCAGT-TTCTAT-AGAT--TA-ATAA-TGTA--TTGTCGACAAAGGGATCTGTGCCC-G-TTCTC---ACC-----TTC-ACT----------TAAT--T--------GGAT-CCA-A---TGTCC-A-TC-AGTGAGAT-TTG-ATGG-TTTGTCTCATCCG-GCAGA-GGTTAAT-GAACTTGT-AATCTTGTAATTGCAG-TAATGTTG-CTCCTCCGCAATA-G--TCAAGGATCCAT--G--ACCCAAG-T-TG--GCGTATTT-TGACCGGTATAGGAAAGCTGGATCGTGT---GAG--TAGGTAT--GGA-ATC-GGCGA-----TCC-GGG-GCGGG-AGTATCAGACAGGTC-TCCATA-T-AGAAATAAGGT--ATG--CTGG-GTGAATGA--T-----AAA------TGTG-GGCTG-AGACAGCT--CACA-G-ATCAC-G-C-T-TAT--AT--CAAC-GGAACCAA--C-CAACGCACTATATG---A--AAT-CAT--GTAGT------CAGAA-TGAT-TTG--GAACCTTGTGA-AATC-CCTCCCTTAGAAACT-A-CCACTCAGCAC-A-T-AC-TT-CTCACCCATAT-ACT-C-GAAGGTTTCTGTGCGTATCATC-T-CC-C-CCGTGTGTCCCCCAG----A--CCTTCTGTAAGGTCACTTCTGTCAGG-TGTCCCGGATATCTCACTGACACACAAAA---CACCCACAGA--AGGGC-TCTGACACTC-GGTAATGTGATTCATCCATGCAAACA-TTC-GTTTAGCGGTGG-------GAC-AC-ATAGCAAAACTCT-G---AAGACTAC-ACTATATA-TATAGAAACAGCAGGTTCTTGAAT-AATATCTAGTGAAGGTAATTTGTGGATACAAGAA-GTCAGTGAAAATGTGATTACTCATGTTAAATCTTACAAAATCCACTCTACCTGG----TT--TAAAATT
gi|30 : acT-GAACTTGA-AAT---ATA-T-ACAG-CATTGTTT-CAC-TCC--AATA-G--T-GAAGA--CAT--G--AC---AA-T-TT--C-TTCATT-TGA-CGGT------------------GT---GAG--T-AGC-T--GTA-ATCTGGCGAA----CCC-CGG-G--GG-CGTATCAGA--GATC-TCCAT-AT-AGA--TAAGgtgatcgtgataac
gi|31 : T----G-AATC-CCTCCCTAGA--ACT-A-CCACTCAGCAC-A-TATC-TCTTTCCATTATATATCT-GTGAAGGTTTC----CGTATCATC-T-CCTC-C---GTGTCTTCTAG----ATCCCTTCTG-AATGTCACTTCTGTT-GG-TGTCCC---TATCTCAC-cgt
gi|32 : AAGTGTAA-TTGT-GACAA--GGACC-GTGCA--TGTTCTC---ATT-----TTC-GTC----------GGA---T--------GGAT-T-A-AT--T--CC-TTTC-A--AA--TCTTG-ATGT-AAT--CTCAACAG-G---A-G--CATT-GTACTTGA-AAT---GT-AT-ACAG-CATTGTTT-CTC-TC
gi|33 : ACGTGAA--TGGAAACA-T-AGCG-C-----GATA---TCAAA-TTC-ATGAGAT--TT-AAAAGTGTAG-TTGT-GACAT--GGACC-GTGTA--GGTTCTC---ACC-----TTCAGC------------ACC--T--------GGTT-C-A--------CC-ACTC-CATAA----TTG-ATGG-TTT--CTCAT
gi|34 : ACCT----G-AATC-CCTCCCTATG--ACT-A-CCACTCTTCAT-A-T-GGATCATCCCTTTCGATAACG-ATAAACCTTTC----TGTATTAGCAC-CC-C-C---GTGTCCCAAAG----ATCCCTTCTG-AAGTTCACTTCTGTC-GG-T
gi|36 : ACATGCTGACA-GATCCCCAGTA---TCTGCCACAAGAGGT-CTCTAA--GGAGT--AACGGTACATGTTT-GTCAT-CATC---ATATA---TC-AGC--AGGGTGTGTAGGTC-TG---TC-----AGT
gi|37 : AGTGAAG-TTGT-GACAA--GGACC-GTGCAG-GTTTC-C---ACC-----TTC-ATT----------GACT-----------GAATTC-A-C---T--CC-ATTC-AATAA--T-T-G-ATGG-ACT--GTCATTCG-T---A-G--TAAT-GAACTTGA-AAT---GTAgact
gi|38 : TTTATAGACAATCGGAAA-TAC-CCAGTT-AACCT-CCGC----TACTTTTCTT-TTGCA---TGTACTCTGTTG-AC-CTTAA-TATGGAATACCAGTACTTTA-TTTGATTCG-TT-ATCt
gi|39 : ATAAATTA-T-AAGTAACAAATC-GTTCAAAA-CA---T----T-GTAATTA-AGTAT-TTAA-TA-TAT--TA-TTGCGC----CC----------------TACTG-------TTGAGTACAAAT-ATTGACTG-AA-A-T-ATCAA--------CAGAA------------a
gi|4 : AAGTCC-GAGTTTAATTCAT------------TTGTC------------------------------ATCCT----TCGT---CAAT-AATTG----A-TTG-TAG--T--ACAA---TACACG--A-------T-GGCCA----------TGCGC--GAGT-CA-AACATC--TCTCAA-CCCAGGG--AA--GGGCTGGTAA-TGG-GCA-GTGACGGGAA--TGGAAACA-C-AACG-C-----TACA---TCAGT-TTCTATG-GAT--AG-ATGAGTGTAG-TTGT-GACAT--GGACC-GTGCAG-G-TTCTC---ACC-----TTC-AAT----------GGCT--A--------GGAT-A-C-A---C--TC-ACTG-AGTAA--T-TAG-ATTG-TGT---TCATCCG-T---ATA--CATT-CAACT-GA-ATA---GTA-T-ACAA-TAGTCTTT-CTTATCCTAGATA-AGCT-GAGTC--CATAAG--AC---AA-T-TCTCG-TTGATT-TGAC-AGT------------------GTATAGAGATTA--T-T--GTA-ATCGGTCGAAAGAATCCGCGT-G--AGCAGTATCAGAC-GGTCGTCC-TAATCAGA--TAAGTAGTATGT-CTGGTGTG--TTAATTG---GATAAAACCCCGTTTGACTA-TGACATCTATCACACT-ATCAT-CACTTCTATAGATATCATATGG---TAG--AACATCGC-----ATACTCATTAACTCAT--GC--TTAGGATCAG-ACTGAT-TTTTAAAACATTCA-G-AATCGCCTCCCTAGT--ACT-A-CCACTCAGCAT-C-CGTC-TCAGTCCTCTATATAACT-TTGAAGGTTTC----CGTATCATC-T-CCAC-C---GTGTCTCTCAG----ATCCCTTCTG-AAGGTCACTTCTGTC-GG-TGTCCC---TATTTCAC-GACAC-----A---CACCCACATA-CAGGGCTTCTGATACACGGGGAATGTGATCCATCC-TGTAACGA-TTC-G-TTAACGTTAG-TTGATCGAC-ACAATA-CACATTTCT-ATT-AATACGAA----ACAAATCAT-----TAAC--GTTTTAA----AGC-TT--GTG-AA--ACCTTG----TATGAAAA-A----------TGTAA--------------TCAAACAAAGTCCACTCTACCTGAAAATTCA-CAAAA-TCTATTTATAAATAATCGG-AAATTC-CCAATT-ATGC--CCG---GCTACTTTTCTT-TCGCA---t
gi|40 : CTG--C----A-TT-A-C-AAAG-TATGG-ATT--G-GAGAGG-G--------------------CAGGGATC------AGAACCTC---------TCTGAGAGTGG--GACTA--T-GTAACAGGAA--G--------------ACAACCCCCA-TTTCGTAAAATGTTTCT-AA--C--
gi|41 : CTG------AC-TTGAGGT--ATTTTTCC-CCTGTCTG--C----A-TG-A-C-AAAG-TGTGG-ATC--A-GAGAGG-G--------------------CCGGTATC------AGAACCTC---------TCTAAGAGTGG--GACTG--T-GTAACAGGAA-
gi|42 : -TGAT-TT---AAACCT----A-AATC-CTTCCCTATG--GCT-A-CCACTCAGCATCA-A-TC-TAACTCCATAATATGAAT-GTGAAGCTTTC----CGTATCATC-TCCC-C-C---GTGTCCCaccaac
gi|43 : AAGTGTAG-TTGT-GACAA--GGACC-GTGCA--CGTTCTC---ATT-----TTC-GCT----------GGA---T--------GGAT-TAA-A---T--CC-ATTC---CAA--TGTTG-ATGT-AAT--CTCAACAG-G---A-G--CATT-GAACTac
gi|44 : aGATGAAAATTATATATTC-AG-CTTCTGTG-GCTG
gi|44 : AATATATAATT-TTCATC-CCGT-TCATTTC-ACTGACTTCTTCT-T--CCAACCTTAA-TTCTTccgttcatttcactgacttcttcttccaaccttaattcttc
gi|45 : cagccacagaagctgGGAATGTGATGCATCC-TGTAGCGA-TTC-G-TTAACGTTAc
gi|46 : TTTTCTT-TTGCA---TGCACTTTGTTGCCC-CTTCA-CATGGAATAC------TTTA-TTTGATTCG-TT-ATCctattacatttagctttacacattctattta
gi|47 : --GCTACTTTTCTT-CTGCA---TTT--TCTGTTGCAC----AA-AACAAAATACTAGTACTTTATTTTGATTacaa
gi|48 : CT--CACA-T-ATCAC-C---T-TATG-AT--CA---GG---GAG--C-CAACGC-----ATG---A--AATC
gi|49 : --CAAAACC-A--CACATGTTGGAGC-AATGTTG-A--TGAT-ATC
gi|5 : ACAATAAGT--ATGAAGTAACATACC-ATTTA-TAGTA---T----T----A--A-AGTCTATTAA--A-TATGATA-TTGCGC---ACC----------------TACTG-------TTGATTACAAAT-ATTGTCTGCAA-ACTGACTAAAACAGAATCAGAA------------GGTTCCATCTAAACCCTA--AC-TTG-ACATT-TATGTAAAAT--GG---AAAC-CAGCTT-TGCA--ATACAATTTACTA-TTTCTGTCCAGTGGAATACCCCACAT-TTGATCGTTCTATGGCATAATAAAATA-TA------AT---AAATATAAAT-ATATCTT-TCCTAACTTATGA--GAGATTA---ATTTT-G-CT-CTCTG-GTTGTCTGTATTTTTTGAT---GTTC--GT------GTGA--------TGTGT-AA-GACCGTTAACGCCCGGG-ACAGGTCTCCCACACATTGT-TTG--A-GATCCCACGT----TC-GCCAGGACAGGTCCTCT-A--TCTTC--AAAATCACGAATCTCCCCATACATCCCAATAGAAATGCAAGTGAAGGGTTTGTGTAAT-CGCGTTCTCCTAGGTCATCCTGCTAGAAATC----TTGAATTGATCTGTTACCTAGTCTGCT---GTCGA-CAA---TA-GGA-ACGGGATACACACATGTGCACAGGTAGCGCAACCAGGGCTCACCAG---TCATAT---------TATCTCTGTATCATTTCAACTGAACTTTTGTGTGGCCAA--TTAACTTCTTTCATCTATAGCAGTAAACTCTTTATAC-AATATGGTCAACATTCTTG-CCAACC-TTCCTATACTTAGGTTCTA-A--A-TAGACTGAC-CCACCT--ACCG-C-T---CACTGTACTCTCT-GCTCTGT--C-AC---ACT-ACT--AGGATACCCCATTCGAGAA-GT--GTGGC-TGTGAGAAGGCCTCTG-C-TCACTTCTATCTTGTGACATTTTTAACGCTAGTTTATTGATAATTCTC---TAAACGCA--G-GTATCAGTTACCTGAGTA
gi|50 : TC-CCGT-TCATTTT-ACTGACTTCTTGT-T--CCAAatga
gi|6 : AA--TGGAAACA-C-AGCG-C-----TACA---TCAGT-TTCTAT-AGAT--AG-ATAAGTGTAG-TTGT-GACAT--GGATC-GTGCAG-G-TTCTC---ACC-----TTC-ACT----------AA-T--T--------GGAT-C-A-A---TT-CC-ACTC-AGTGA--T-T-G-ATGG-TGTT-CTCATCCG-G---A-G--TAATTGAACTTGATAAT---GTAAT--CAGGTAT-GTTT-CTC-TCC--AATA-G--T-GAGTC--CATT-G--AC---AA-T-TT--G-GCGATTGTGAACGA-------------------GT---GAG--TA-GT-TTTGTACATCTGGCGAA----TCC-----G--GG-AGTATCAGAG-GGTC-TCCATA-T-AGA--TAAG-TGTATGTGCTGG-GTGAATGTATTA---GAAA------TGTG-G-CTGCAGACATCT--CACA-TGATCAC-C--TT-TATG-AT--CA---GG---TAAACC-CAACGC-----ATG---A--AATC-ATTAGT--T------CAG-A-TGATGTT---GAACC-----G-AATC-CGTCCC-AGA--ACTTA-CCACTCAGCAT-ACT-TC-TCACTCCATTATA---CT-CTGAAGGTTTC----TGTATCATC-T-CC-C-CC--GTGTCCCCCAG----ATCCCTTCTG-AAGGTCACTTCTGTC-GG-TGTCCC---TATCTCAC-GACAC-----A---CACCCACATA-CAGGGCTTCTGACACTCGGTGAATGTGATCCATCC-TGCAACGA-TTC-G-TTAGCGTT--------CGAC-ACAATA-CAAA--------------CGAG-ACTACACATTA-----ACAGC--GTTCTGA--T-AAT-TC--GTGAAA--A-TTTG----TATACAA-------------TGTAAT--------------CTTACAAAATCCACTCTACCTG
gi|7 : TATCTCTTTTTCG-TTGACACGAACATACACTGTGCTTTC-AATGAC-ATGGAA--GTGAATA-TA-AG----CGC-ATTAATCAA--CGCATCATG-AAAT--A-CAA-CATTATGACAAGT-GGAGA-ATAACTG-ATCTATGACATT-TAATTG-CA-TC-ATGTTTAAAAGGAAATC-TGAT----TC---CTTTT-T-GTAA----A-T-T-ATA--A--------------CT--TTTCTGCTTTAC-TGA--T--------A-AA---AAGC-AATATC------TA--T--ATCTA-TTTCTG------AC-TTGAGGT--AACTTTCC-ATTGTCTG--C----A-TT-A-C-ACAG-TATGG-ATT--T-GAGAGA-G--------------------CCGGGGTA------AGAATCTC---------TTTGAGAGTGG--GGCTA--T-GTAACAGAAA-AGCAACNNNNNNGAAAGCAACGCCCA-TGTTGTGAAATGTTTCT-AA--C--TTT--TGA-T--ACAGGAACGTCTGTTGC-GCCCC-G-ACAACTTTTC---CTGCAAACATAT---TGTTCT-CCGG-----------AAT-AAAGAAATT-TGGAAGG-TAACC-GGTAT-ATA-CACA--CTGAAT---CAAGGATTT--GAAA--CAAAACC-A--CACATGTTGGAGC-AATGTTG-A--TGGT-ATCCATGG-GGTAGAA-GAGCATTCT-TGA-ATTCT-C-CAAAATAATA-TTG--TTTTttaaaat
gi|8 : AAA-TTCTCCA-CT-C-AAAGTCT-GAGTTT-----------GT-CTGT-TTGTTT-GA-GA-T-AGGAA--CGAG--AT-GAA-ATCCT----TCAT---CAAT-AATTG----A-ATG-CA-G-T--AC-A--GTAGGTG--A-------T-GGCC----------ATGCGC--GAAT-CA-AACATC--TATC-AACCCAGGG--AA--GGGCTGGT-AATGG-CCA-ATGACGGGAA--CGGAAACA-C-AG-GGC-----GATA---TCAGC-TTCTATGGAAT---T-ATAAGTGTAG-TTGT-GACAT--GGACC-GTGCA--TATTCTC---ACC-----TTC-TCT----------GGC---T--------GGAT-C-A-AT--T--CC-ATTC-AATGA----CTG-ATGA-AAT--ATCATCCG-G---A-G--TAAT-GAACTTGA-AAT---GT-AT-ACAG-TATTGTTT-CTC-TCC--AATA-G--T-GAGGA--CAT--G--AC---AA-TATC----CTCATT-GGA-CGGT------------------GT---GAG--T-AGT-T--GTA-ATCTGGCGAA----TC
gi|8 : C-----ATG---T--AATCCAT--GT---------CAG-A-TGAT-TG---AAACCT----A-AATC-CCTCCCTATA--ACT-A-CCACTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacatgtaatccatgtcagatgattgaaacctaaatccctccctataactaccact
gi|9 : aaattctccactcaaagtctgagtttgtctgtttgtttgagataggaacgagatgaaatccttcatcaataattgaatgcagtacagtaggtgatggccatgcgcgaatcaaacatctatcaacccagggaagggctggtaatggccaatgacgggaacggaaacacagggcgatatcagcttctatggaattataagtgtagttgtgacatggaccgtgcatattctcaccttctctggctggatcaattccattcaatgactgatgaaatatcatccggagtaatgaacttgaaatgtatacagtattgtttctctccaatagtgaggacatgacaatatcctcattggacggtgtgagtagttgtaatctggcgaatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaaGAACTA-CACCTATCATGTGAACTATTG-ACCTA-TCAATGGCATATCTCTTTTTCT-TGGACACAAACAAACACTGTGATTTC-AATGAC-ATGGAA--GTGAAT-ATA-AG----TAC-ATTTATCAA--CGCATCATG-AAAT--A-CAA-CATAATGACTGGT-TGAGA-ATAACTG---------------AAATG-CA-TC-ATGTTTGAAAGGAAATC-TGGT----CC---CATTG-T-G-TA----A-C-T--TAT-A-ACAC------T-GCTGCTTTCC------A-C-A--T--------T-AT---AAGA-AATATC------TA--T-C-TCTA-TCTCTG------AC-TTGAGGT--AACTTTCA-CCTGTCTG--C----A-TT-A-C-AAAG-TATGG-ATT--A-GAAAGG-GTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTC------GGGATTTCAGAATCTCATCTGAGAGTGGGAGACTAGCT-GTAACA-GAA-GGCC------------CCAATG-CCA---CTGGAAAATGTGTCT-AT--CCTTTT--TGATT--ACAGAGACAT-TGTTGC-ACCCC-A-ACAA-TTTTTCCACTGCAAACATAG-TTTGTTA--CCGGGAACGATCTCAAAT-AAAGACATTGCGAAAGGGTAACC-GGTAT-ATA-CACATTCCCCAT---CAAGGATTTTAAAAA--CAATACC-A-
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|35 ): TTATCCTATGATAAGCTGAATATGAAAGGAATGCTTGTTGATTTAATAGTGTCTTCATGGGAATGTACTGTTATCCATCAATCCACTAAATAGAACAGCTGATAACCCTAAC
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 222 333333333 11111 5555555555555555555555 2222222 222 44444444 333333333333333 1111 333333 22 111 1111 111 3333333333333333 22222 11 5555555555555555555 888888888888888888888888 11111 222 11 11 222222222 1 1 1 1 2222 1 22222222222 111 1111 11 111 22222 222 11 333333 111 1 3333333333333333333 1 1 1 1 1 11 11 333333 1111 111111111 11 1 1 22 11 33333 1 222222222222 1 1 11 1 22222 1 1 11 11 5555555555555555555555555555 1 11 1 11 1 1 1 111 1 2222 1 1 1 2 1 1 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 111 22222 111111 22222222222222222222 111111111 444444444444444 1 111 222 44444444444 111 11 2222 11 1 1 1 1 1 1 11 1 1 1 3333 222222 111 11 1 1 1 2 1 1 1 11 111 22222222222 11 1111 111 222222 22222222222222 1111111111 33333333333 11 11 1 11 1 11111 11111111 3333 33333333333333333333333333333 222222222222 1111 11 11 111111 1 333333333333333333 11111 1111 22 11 333333333333333 22222 22 222 1111111111 11111 222222 2222222222 1 111 111111 222 1111 1 111 1111 111 222222222 11111111 11111 11111 11111 22222 11111 1111 777777777777777777777777777777777 11 1 11 2222 111 111 11111111111 444444
lowQualScore : 333 8 8 7 6 666666666 7 2 6 6 6 6 00000 9999999999999999999999 8888888 1 6 6 6 333 33333333 888888888888888 7777 333333 0 11 8 777 8888 444 0 0000000000000000 00000 8 8 11 0000000000000000000 777777777777777777777777 11111 1 0 1 3 333 7 6 6 0 22 6 3 11 888888888 22 0 0 9 3 3 6 7 9 2 3 0 8 0000 3 8 0 99999999999 11 0 8 8 444 9999 66 11 77 8 444 00000 777 33 666666 777 5 3 7777777777777777777 0 0 0 0 1 7 3 88 0 88 888888 2222 999999999 8 8 8 8 11 77 0 7 2 55 33 1 77777 6 3 1 3 333333333333 0 5 33 0 88888 0 0 33 33 3 4444444444444444444444444444 0 33 2 9 3 0 3 22 3 0 0 3 0 777 1 2 0 3 0000 0 88 2 3 2 3 6 3 6 6 0 5 0 0 5 4 66 0 0 4 9999 4 55 2 4 55 4 4 22 4 4 4 3 3 3 3 0 3 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 3 000 3 999999 66666 3 222222 3 44 3 77 6666 6 3 3 3 3 7777 3 77777777777777777777 999999 333333333 99 777 4 4 555555555555555 1 8 4 66 66 66 5 77 8 8 999 0 6 444 888 88 66666666666 8 8 0 5 8 6 6 99 0 111 99 33 4444 6 6 99 6 11 3 0 0 0 0 0 9 33 3 3 3 7 0000 555555 6 1 777 8888 0 7 88 6 5 1 1 0 3 6 0 3 0 0 6 6 88 222 6 6 11111111111 55 5 77 5 5 2222 3 000 5 111111 5 22222222222222 9999999999 5 55555555555 55 5 5 77 1 5 5 33 77 5 9 5 5 11 4 4 7 00000 777 777 5 66666666 3 2 2 777 2 4444 555 77777 77777777777777777777777777777 111111111111 2 0 333 4444 6 2 444 66 66666 3 44 3 2 3 555 44 55 3 3 6 00 3 55 3 666 99 55 777 4 4 444444 1 5 8 666666666666666666 888 77777 5 66 5 0 0000 66 5 77 5 0 00 5 77 5 77 2 88 8 6 0 666666666666666 8 3 8 99 888 99999 6 00 99 777 4444444444 44444 222222 99 9999999999 3 5 5 555 999999 4 9999 4 4 5 111 5 33 1 2 66 0000 5 5 0 5 333 2222 5 5 5 111 6 555555555 8 0 1 5 5 888 22222222 6 6 55 33333 7 99999 1 1 88888 99 55555 6 99 55555 4444 555555555555555555555555555555555 3 99 77 0 3 0 8 8 11 4444 5 000 666 66666666666 1 333333 6 8 8
lowQualScore : ... . . . . ......... . . . . . . ..... ...................... ....... . . . . ... ........ ............... .... ...... . .. . ... .... ... . ................ ..... . . .. ................... ........................ ..... . . . . ... . . . . .. . . .. ......... .. . . . . . . . . . . . . .... . . . ........... .. . . . ... .... .. .. .. . ... ..... ... .. ...... ... . . ................... . . . . . . . .. . .. ...... .... ......... . . . . .. .. . . . .. .. . ..... . . . . ............ . . .. . ..... . . .. .. . ............................ . .. . . . . . .. . . . . . ... . . . . .... . .. . . . . . . . . . . . . . . .. . . . .... . .. . . .. . . .. . . . . . . . . . .................................................................................. . ... . ...... ..... . ...... . .. . .. .... . . . . . .... . .................... ...... ......... .. ... . . ............... . . . .. .. .. . .. . . ... . . ... ... .. ........... . . . . . . . .. . ... .. .. .... . . .. . .. . . . . . . . .. . . . . .... ...... . . ... .... . . .. . . . . . . . . . . . . . .. ... . . ........... .. . .. . . .... . ... . ...... . .............. .......... . ........... .. . . .. . . . .. .. . . . . .. . . . ..... ... ... . ........ . . . ... . .... ... ..... ............................. ............ . . ... .... . . ... .. ..... . .. . . . ... .. .. . . . .. . .. . ... .. .. ... . . ...... . . . .................. ... ..... . .. . . .... .. . .. . . .. . .. . .. . .. . . . ............... . . . .. ... ..... . .. .. ... .......... ..... ...... .. .......... . . . ... ...... . .... . . . ... . .. . . .. .... . . . . ... .... . . . ... . ......... . . . . . ... ........ . . .. ..... . ..... . . ..... .. ..... . .. ..... .... ................................. . .. .. . . . . . .. .... . ... ... ........... . ...... . . .
lowQualScore : 000 0 0 8 7 333333333 3 5 7 7 7 7 00000 7777777777777777777777 3333333 0 7 7 7 888 33333333 444444444444444 0000 888888 8 00 0 000 6666 000 8 2222222222222222 00000 0 0 00 0000000000000000000 000000000000000000000000 66666 4 8 0 2 333 3 7 7 6 00 4 2 00 000000000 55 0 0 2 7 3 7 3 8 5 2 0 8 8888 2 8 0 55555555555 22 8 0 0 000 0000 88 00 00 0 000 00000 000 22 222222 555 5 2 8888888888888888888 0 0 0 0 0 3 3 33 7 33 333333 7777 888888888 0 0 0 0 00 00 0 3 0 33 33 0 33333 7 3 2 2 888888888888 0 0 88 0 22222 0 0 22 88 2 2222222222222222222222222222 0 88 5 2 0 0 0 55 2 0 0 2 0 555 0 5 0 2 5555 0 22 5 2 0 3 7 3 7 7 7 0 8 4 0 4 11 1 0 4 4444 4 55 5 0 55 0 0 00 0 0 0 6 6 6 6 4 6 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 3 444 3 666666 00000 3 999999 3 66 3 33 5555 2 1 1 3 3 4444 3 11111111111111111111 666666 333333333 55 000 0 0 666666666666666 1 9 4 11 11 99 0 99 2 0 222 8 0 000 666 88 00000000000 0 0 8 0 0 7 7 22 7 777 22 66 9999 7 7 22 7 88 2 0 0 0 0 0 0 88 3 3 3 3 0000 777777 7 0 777 3333 7 3 33 0 5 0 0 7 3 7 0 2 0 0 5 7 55 333 7 7 33333333333 88 2 99 7 7 1111 0 000 7 777777 7 44444444444444 6666666666 7 11111111111 77 7 7 99 6 0 0 66 99 0 0 7 7 00 0 0 5 00000 000 555 7 77777777 6 9 9 777 9 1111 000 11111 22222222222222222222222222222 222222222222 9 4 666 0000 9 9 999 88 22222 1 22 9 9 1 444 33 00 3 3 7 00 6 00 6 555 55 55 000 0 0 444444 0 0 1 999999999999999999 888 22222 0 99 0 1 6666 44 7 99 7 1 77 7 00 7 99 5 88 0 4 8 888888888888888 0 8 0 22 333 77777 7 22 22 555 0000000000 33333 000000 22 2222222222 3 7 7 777 888888 4 6666 4 4 0 111 0 99 0 0 44 6666 0 0 0 0 888 1111 7 7 7 777 7 000000000 0 8 4 7 7 666 22222222 7 7 00 00000 2 33333 0 7 33333 22 88888 7 22 22222 2222 222222222222222222222222222222222 2 00 44 8 6 8 0 0 88 3333 7 000 777 22222222222 0 000000 7 0 0
consensus : NACAATAAGTTAAT-AAGTAACAAACC-ATTCAATA-CA---T----TTGTAAGTA-AGTCT-TTAA-TA-TAT--TA-TTGCGC---ACC----------------TACCG-------TTGAGTACAAAT-ATTGACTG-AA-ATT-ATCAA--------CAGAA------------G--TCCAT----AC---A--ACATTG-ACATT-TAC-TAAA-C--GA---AAATACA---T-T--A--A-ACAAT-----A-TT-CTGTACAG--AAA------A-CG-TT------GATTGTTCTATGTCA-ACTAAACCC-TA------A----ATTTATGGGT-ATTTCTTCTCCTAACTATTGACAGAAATTA---ATTCTAG-CTTCTGTG-GCTGTCTGTATTTTTTGACATGGTTCCTGTCT--AAGTGAAC--T--TTGAAT-AA-GACTGTTAACGCCCCGT-GTAGGTCCCCCACACAACATGTTGACA-GATCCCCAGTA---TCTGCCAGGACAGGT-CTCT-A--GCNTC--AAAGNTACGTATCT-CCCAT-CATC---ATAGA---GCAAGT--AGGGTGTGTGTGAT-TG---TC-----AGTCG-CCTG-TAGATAT-----TTG---TGACCTGTTACCTAGTC-GCT---GT--A-CGA---CA-GGG-AC-AGATA-ACANATGTGCAC-GGT--CGCAA--AGGG------AGATATAATATAAAANT-TNTATC-CCGT-TCATTTC-ACTGACTTCTTGT-T--CCAACNTTAA-TTCTTTCAACTATAGC-GTAAACTCTTTATACGAANATAGT-AGCNCTCTTGCCCAACC-TTCCTAAACTTAG----TA-A-CA-TAGACTGAC-CCACCT--ACCG-C-T---CACTGTA-TCTCT-G-TCTGT--CTAC--TACT-ACT--ANGACAC---------GAT-AT--GGGGCTTGTGAG-AGTCCTCTG-CTTCA-TTCTATC-TGTGACAGTTTTAGCGCT-GT---TTGATATCTNCCGG-TAATCGTAC-G-GTAT-AATCGCCTAAATATAAACCCATCATATACATAACCTAGACTTTAGAACTA-AACCTA-CATGTGA-TTATTG-ACCTA-TCAATGGCGTATCTCTTTTTCT-TTGACACAAACAAACACTGTGCTTTC-AATGAC-ATGGAA--GTGGATAATA-AG----CAC-ATTTATCAA--CGCATCATG-AAAT--A-CAA-CATTATGACAGGT-TGAGA-ATAACTG-ATCTATTACATT-TAAATG-CA-TC-ATGTTTGAAAGGAAATC-TGAT----CC---CTNTG-C-G-AA----A-C-T-NTA--A-ACGC----G-T-GCT--TTTCC------C-CGA--T--------A-AA---AAG-CAATATC------TA--T-TATCTA-TTTCTG------AC-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A-TTA-C-AAAG-TAT-GGATT--G-GAGAGG-G--------------------CCGGGATC------AGAATCTC---------TCTGAGAGTGG--GACTA--T-GTAACAGGAA-GG--------------ACAACGCCCA-TTTTGTAAAATGTTTCT-AA--C--TTT--TGA-T--ACAGGGACATCTGTTGC-GCCCC-G-ACAA-TTTTC---CTGCAAACATAT-GTTGTTCT-CCGG-----------AAT-AAAGAAATT-TGGAAGGGTAACC-GGTAT-ATA-CACA--CCGCAT---CAAGGATTT--GAAA--CAAAACC-A-ACACATGTTGGAGC-AATGTTG-A--TGGT-ATCCATGG-AGTTGAA-GAGCTTTCT-TGA-ATTCT-C-CAAAATAATACTTG--TTTTCATAAAAT-ATGAACAC-AGTAA-ATTCGTC---ACAGAAA--ACT-TCCTTCAAAATNATTTTC-A-TGATTCCGTAACGGAGAAAACTGG--CAATGG-TCATAGAGTACACTANCTTTGNCCCGCTCG-TG-AAAAGAAA-TTCTCCA-CT-CCAAAGTCC-GAGTTTAATTCATT--TGT-CTGT-TTGTTT-GC-GA-T-AGGAA--CGAG--AT-GAA-ATCCT----TCGT---CAAT-AATTG----A-TTG-TAGG-T--ACGA--CTACGCG--A-------T-GGCCA---------ATGCGC--GAGT-CA-AACATC--TATCAAACCCAGGG--AA--GGGCTGGTAAATGG-GCA-GTGACGGGAA--TGGAAACA-C-AGCGGC-----GATA---TCAGT-TTCTATGAGAT--AG-ATAAGTGTAG-TTGT-GACAN--GGACC-GTGCAG-GGTTCTC---ACC-----TTC-GCT----------GGCT--T--------GGAT-C-A-A---T--CC-ACTC-AGTAA--T-TTG-ATGG-NNT--CTCATCCG-G---A-G--TAAT-GAACTTGA-AAT---GTAAT-ACAG-TATTGTTT-CTC-TCC--AATA-G--T-GAGGN--CAT--G--AC---AA-T-TC--G-GTNATT-TGACCGGT------------------GT---GAG--TAAGT-T--GTA-ATCTGGCGAA----TCC-CGG-G--GG-AGTATCAGAC-GGTC-TCCATAAT-AGA--TAAGGTGTATGT-CTGG-GTGGATGAATTG---GANA------CGTG-GACTG-AGACATCT--CACA-T-ATCAC-C-CTT-TATGGAT--CA---GG---TAG--C-CAACGC-----ATG---A--AATCCAT--GT--T------CAG-A-TGAT-TT---AAACCT----G-AATC-CCTCCCTANG--ACT-A-CCACTCAGCAT-A-T-TC-TCACTCCNCTATATAACT-CTGAAGGTTTC----CGTATCATC-T-CC-C-C---GTGTCCCCCAG----ATCCCTTCTG-AAGGTCACTTCTGTC-GG-TGTCCC---TATCTCAC-GACAC-----A---CACCCACATA-CAGGGCTTCTGACACACGGGGAATGTGATCCATCC-TGTAACGA-TTC-G-TTAACGTTAG-TTGATCGAC-ACAATA-CAAATTTCT-ATT-AATACGAG-ACTACACATTAT----ACAGC--GTTCTGAAAT-AAT-TC--GTGAAA--AGTTTG----TATAAAAA-G----------TGTAAT-------------TCTTACAAAATCCACTCTACCTGAGAATTT--CAAAGTTCTATTTATAGACAATCGGAAAATAC-CCGGTT-AAGCT-CCGC--GCTACTTTTCTT-TTGCA---TGTACTCTGTTG-AC-CTTAA-TATGGAATACCAGT--TTTA-TTTGATTCG-TT-ATCGA
Reference ( family-5170 ) : NACAATAAGTTAAT-AAGTAACAAACC-ATTCAATA-CA---T----TTGTAAGTA-AGTCT-TTAA-TA-TAT--TA-TTGCGC---ACC----------------TACCG-------TTGAGTACAAAT-ATTGACTG-AA-ATT-ATCAA--------CAGAA------------G--TCCAT----AC---A--ACATTG-ACATT-TAC-TAAA-C--GA---AAATACA---T-T--A--A-ACAAT-----A-TT-CTGTACAG--AAA------A-CGATT------GATTGTTCTATGTCA-ACTAAACCC-TA------A----ATTTATGGGT-ATTTCTTCTCCTAACTATTGACAGAAATTA---ATTCTAG-CTTCTGTG-GCTGTCTGTATTTTTTGACATGGTTCCTGTCT--AAGTGAAC--T--TTGAAT-AA-GACTGTTAACGCCCCGT-GTAGGTCCCCCACACAACATGTTGACA-GATCCCCAGTA---TCTGCCAGGACAGGT-CTCT-A--GCNTC--AAAGNTACGTATCT-CCCAT-CATC---ATAGA---GCAAGT--AGGGTGTGTGTGAT-TG---TC-----AGTCG-CCTG-TAGATAT-----TTG---TGACCTGTTACCTAGTC-GCT---GT--A-CGA---CA-GGG-AC-AGATA-ACANATGTGCAC-GGT--CGCAA--AGGG------AGATATAATATAAAANT-TNTATC-CCGT-TCATTTC-ACTGACTTCTTGT-T--CCAACNTTAA-TTCTTTCAACTATAGC-GTAAACTCTTTATACGAANATAGT-AGCNCTCTTGCCCAACC-TTCCTAAACTTAG----TA-A-CA-TAGACTGAC-CCACCT--ACCG-C-T---CACTGTA-TCTCT-G-TCTGT--CTAC--TACT-ACT--ANGACAC---------GAT-AT--GGGGCTTGTGAG-AGTCCTCTG-CTTCA-TTCTATC-TGTGACAGTTTTAGCGCT-GT---TTGATATCTNCCGG-TAATCGTAC-G-GTAT-AATCGCCTAAATATAAACCCATCATATACATAACCTAGACTTTAGAACTA-AACCTA-CATGTGA-TTATTG-ACCTA-TCAATGGCGTATCTCTTTTTCT-TTGACACAAACAAACACTGTGCTTTC-AATGAC-ATGGAA--GTGGATAATA-AG----CAC-ATTTATCAA--CGCATCATG-AAAT--A-CAA-CATTATGACAGGT-TGAGA-ATAACTG-ATCTATTACATT-TAAATG-CA-TC-ATGTTTGAAAGGAAATC-TGAT----CC---CTNTG-C-G-AA----A-C-T-NTA--A-ACGC----G-T-GCT--TTTCC------C-CGA--T--------A-AA---AAG-CAATATC------TA--T-TATCTA-TTTCTG------AC-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A-TTA-C-AAAG-TAT-GGATT--G-GAGAGG-G--------------------CCGGGATC------AGAATCTC---------TCTGAGAGTGG--GACTA--T-GTAACAGGAA-GG--------------ACAACGCCCA-TTTTGTAAAATGTTTCT-AA--C--TTT--TGA-T--ACAGGGACATCTGTTGC-GCCCC-G-ACAA-TTTTC---CTGCAAACATAT-GTTGTTCT-CCGG-----------AAT-AAAGAAATT-TGGAAGGGTAACC-GGTAT-ATA-CACA--CCGCAT---CAAGGATTT--GAAA--CAAAACC-A-ACACATGTTGGAGC-AATGTTG-A--TGGT-ATCCATGG-AGTTGAA-GAGCTTTCT-TGA-ATTCT-C-CAAAATAATACTTG--TTTTCATAAAAT-ATGAACAC-AGTAA-ATTCGTC---ACAGAAA--ACT-TCCTTCAAAATNATTTTC-A-TGATTCCGTAACGGAGAAAACTGG--CAATGGTTCATAGAGTACACTANCTTTGNCCCGCTCG-TG-AAAAGAAA-TTCTCCA-CT-CCAAAGTCC-GAGTTTAATTCATT--TGT-CTGT-TTGTTT-GC-GA-T-AGGAA--CGAG--AT-GAA-ATCCT----TCGT---CAAT-AATTG----A-TTG-TAGG-T--ACGA--CTACGCG--A-------T-GGCCA---------ATGCGC--GAGT-CA-AACATC--TATCAAACCCAGGG--AA--GGGCTGGTAAATGG-GCA-GTGACGGGAA--TGGAAACA-C-AGCGGC-----GATA---TCAGT-TTCTATGAGAT--AG-ATAAGTGTAG-TTGT-GACAN--GGACC-GTGCAG-GGTTCTC---ACC-----TTC-GCT----------GGCT--T--------GGAT-C-A-A---T--CC-ACTC-AGTAA--T-TTG-ATGG-NNT--CTCATCCG-G---A-G--TAAT-GAACTTGA-AAT---GTAAT-ACAG-TATTGTTT-CTC-TCC--AATA-G--T-GAGGN--CAT--G--AC---AA-T-TC--G-GTNATT-TGACCGGT------------------GT---GAG--TAAGT-T--GTA-ATCTGGCGAA----TCC-CGG-G--GG-AGTATCAGAC-GGTC-TCCATAAT-AGA--TAAGGTGTATGT-CTGG-GTGGATGAATTG---GANA------CGTG-GACTG-AGACATCT--CACA-T-ATCAC-C-CTT-TATGGAT--CA---GG---TAG--C-CAACGC-----ATG---A--AATCCAT--GT--T------CAG-A-TGAT-TT---AAACCT----G-AATC-CCTCCCTANG--ACT-A-CCACTCAGCAT-A-T-TC-TCACTCCNCTATATAACT-CTGAAGGTTTC----CGTATCATC-T-CC-C-C---GTGTCCCCCAG----ATCCCTTCTG-AAGGTCACTTCTGTC-GG-TGTCCC---TATCTCAC-GACAC-----A---CACCCACATA-CAGGGCTTCTGACACACGGGGAATGTGATCCATCC-TGTAACGA-TTC-G-TTAACGTTAG-TTGATCGAC-ACAATA-CAAATTTCT-ATT-AATACGAG-ACTACACATTAT----ACAGC--GTTCTGAAAT-AAT-TC--GTGAAA--AGTTTG----TATAAAAA-G----------TGTAAT-------------TCTTACAAAATCCACTCTACCTGAGAATTT--CAAAGTTCTATTTATAGACAATCGGAAAATAC-CCGGTT-AAGCT-CCGC--GCTACTTTTCTT-TTGCA---TGTACTCTGTTG-AC-CTTAA-TATGGAATACCAGT--TTTA-TTTGATTCG-TT-ATCGA
gi|1 : ACAATGGGTTAAT-AAGTAACAAACCTATTCATTA-C---------TTGTACGTATAGTCT-TTAACTA-TAT--TAATTGCGC----CC----------------TATCGC------TTGAGTACAAATTATTGACTG-AACATT-ATCTA--------CATAA------------G--TCCAT----ACG--A--ATATTGTACATT-TAC-TAAA-CCTGA---AAATACA---T-T--A--AGACAAT-----AGTC-CTGCACAG--AAA--------CGGTT------GATTGTTCTAT-TCA-ACTAAACCCATATCCGCTA----TTTTATGGAT-ATTCCCTCTTCTA-CTATTGACAGAAGTTA---ATTCTAGGCTTCTGTGTGCTGTCTGTATTTGTTCTCCTGGTTCCTGTCT--AAGTGAAC--TCTTTGAAT-AACGACTGGTAACGCCCCGTTGTAAGTCCCCCACACAACATGTTGACATGACCCCCAGTAATTTCTGCCAGGACAGGT-CTCT-A--ACTTCTAAAATCTACGTATCT-CCCAT-CATC---ATAGA----CATGT--AGGGTGTGTGTAAT-TG---TC-----AGTTG-CCTG-TAGATAT-----TTG---TGACTGG--ACCT---T-ACT---GT--A-TGA---CA-GGG-AC-AGATA-ACAGTTGTGCAC-GGT--CACAA--AGGG------AGATATAATATAAAAATATCTATC-CCGT-TCATTTC-ACTGACTTCTTGT-T--CCAACTTAAA-TTCTTTCAATTATATT-GTAAACTCTTTATTCGAACATAGT--GTCCTCTTGCCCAACC-TTCCTAAACTT-G----TA-A-CA-GAGACTGACTCCACCTGAGCCA-CGT---CACTGTA-TCTCTGG-TCTGTTCCTACGATACCGACCAAATAACAT---------GAT-AT--GGGGCTTGGGAG-AGTCCTCT--CTTCC-TTCTATC-TGTGACAGTTAAAGCGCT-GT---TTGATATCTTCCGGTTAATCGTAC-G-GTAT-ATCCGCCTAAA-ATAAA--CATCATATACATAACCTAGACTTTAGAACTAGAACCTA-CATGTGA-TTTTTGAACCTACTCAACGGTGTATTTATATTTCTATGGACACAAACAAATATCA-GCTTTCAAATTACAATGGAAAGGTGAATTATA-AG----TA--ATTTAACAA--CGCTTGATGAAAATAGA-CAACCATTATGACTGGTGTGAGATATAATTG-ATCTATTGCATTCTAAATG-CA-TCAATATTTTGAAAGTAACC-T-AT----CC---CTGTG-C-G-AG----A-C-TGCTA--A-ACGCA---A-T-GTT--TTTCC------C-TGA--T--------ATAA---ATG-CAATATC------TA--TCTATCTACTTTCTGA-----ACGTTGAGGT---ACTTTCC-CC--TCTGAAC----ACTTACC-AAAGAAAT-GGATT--GCGAGAAG-G--------------------GCGGAATC------AGAAT-TT---------TCTGAGAGTGGC-GACT---T-GT-ACAGGAA-GG--------------AGAATCCCCAGTTTCGTAAAATGTTTCT-AA--C--TCT--TGT-TTAACAGGGACATCTGTTGC-GCTCC-GTACAG-CTTTC---CTGCAAACTTATGGTTGTTCT-CCGG-----------AATAAAAGAAATT-TGGAAAGGTAACC-AGTAT-ATATCACA--CCGCAT---CAAGGATTT--GAAAC-CAAAACCAA-ATACATGTT-AAGC-AATGTTG-A--TGGT-A-CCATGG--GTTGAATGAGCTTTCTATGA-ATTCT-CACAAAATAATACTTGGTTTTTCATAAAATGATTAACACGAGTAATATTCATCTGGACAGGAA--ATTGTCCTTCAAAAAGATTTTCAA-TGATTCCGTAACAGAG-AAACTGG--CAATGG-TCATAGAGT-CACTAGCTTTGGCCCGCTCG-TGAAAAAGAAATTTCTCCATCTGCCAAAATCC-GAATTTAATTCATT--TGT-CTGT-TTGTGT-GCTAA-TCAGGAA--CAAG--AT-GAA-ATCTC----TCTT---CAAT-AATTG------TTG-TAGG-T--ACGG--CTACGCGGAA-------T-GGCCA---------ATGTGC--GAGT-CA-GAAATC--TCTCAAACCCAGGG--AAGGGGGCTGGTAAATGGTGCA-GTGACGGGAA--TGGAAACA-CTAGCGGC-----GACA---TCA-T-TTC-ACGAGAC--AG-ATAAGTGTAG-TTGT-GAAAG--GGACC-GTGCAGCGGTTCCTGCAACC-----TTC-TCT----------AGCCTGT--------GAAT-C-A-C---T---C-ACTC-AGTAGC-T-TTGAATGGTCTT--CTCATC---G---A-G--TAAT-GAACTTGA-AAT---GTAAT-GCAA-TACTGTTT-CTC-TCC--AATA-G--T-GGAGT--CGC--GCAAC---AA-T-TG--G-GTTATA-GGACCGGT------------------GT---GAG--GAAGT-T--GTA-ATCTGGCGAA----TCC-CGG-G--GG-AGTAGCAGA--GATC-TCCATAAT-AGA--TAAGGTGTATCT-CT-G-GTGGATGAAT------ATA------CGTG-GATGA-AGACATCT--CACA-T-ATCACAC-CTT-TATGGAG--CAG--GG---TAC--C-TAATGC-----ATGT--T--AATCCAT--GT--T------CAGTA-GAAT-TT---AAACCT----GAAATC-CCTCCCTACG--ACT-AGCCACTCAGC-T-AGT-TC-TGTATCCTCTATATAACTCCTGAAGGTTTC----CGTATCATC-T-CC-C-C---GTGTCCACGAG----ATCCCTTCTG-AAGGCAACTTCTGTC-GGTTGTCCC---TA-CTCAC-GACAC-----AAATCACCCACATAGCGGGGCTTCTGACACACGGGGAA-GTGATCCATCC-TGTAACGAGTTCAG-TTAA-ATTAGTTTGATCGACTCCAATA-CGAATTTCTAATTGAATACGAGCACTACACATTAC----ACAGC--ATTCTGAAATGAAT-TC--GTGAAA--AGTTTG----TTTAAAAATG----------TATAAT-------------TCTTACAAAATCTACACTACCTGAGAATTTTACAAAGTTCTATTTAT-GACAATCGGAAAATACTCCGGTTAAAGCTGCCGCTAGCTATTTCTCTG-TTGCA---TGCG-------------------ATGGAATAC--G----TTA-TTTGATTCGTTT-ATCAA
gi|10 : c-TAAATA-CAATC-ATGTTTGATAGGAAATCATGAT----GC---TTGTATC-A-AC----A-C-T-GT------------------CTA-TTTCA------G-TAA-----------A-AA---AAGCCAATATC------TA----TATCTA-TTTCTG------AC-TTGAGGT--AAACTTTC-CCTGTCTGC-C----ATTTA-C-AAAG-TATGGGATT--G-GAGAGG-G--------------------CCGGGATC------GAGATCTC---------TCTGGAAGTGG--GGC-A--T-GTAGCAGAAA-GC--------------AC----CCCAGTTTTGTACAATGTTTCT-AAATC--TTT--TGA-T--ACA-GTAGATGTGTTGTGGCCCCGG-ACAATTTTTC---CTGCAGAAATGT-G-TGTTCT-CCGGA----------AAT-AAA-AAATT-TGGGAGCTTAACCAAGTATGATA-CACA--CTGCATTCACAAGGATTT--GAAAGTCAAAACC---ACACGTGTTGGAGCAAATGTTG-ACGCGGTAATCCATGGTAATTG-A-GAGCTTTCT-TGAGATTCCGC-CAAAATAATA-TTG--TTTTCCTGAAAT-ATGAACAC-AGTAA-A-TCGT-----CAGAAATCACT-TCCTTCAAAATAATTTTC-ACTGA----GTAACGAAGAAAACTGG--CAATGGATCagctg
gi|11 : AA--TGGAAACA-C-AACG-C-----GATG---TCATA-TTC-AT----T--AG-ATAGACG-AG-T-----ATA---GAACT-TTGTGA-------C---A-------------T----------AGCA--T--------GGA----A-AACGT--CC-ACTA-AATAA--T-T-G-ATGG-ACT--CTCATTCG-G---A-A--TA--------------T---GTAGT--CGG-TATTGTTT-CTC-TCC--AATA-G--T-GAGTC--CGT--G--AC---AA-T-TT--G-GTTATA-TGA-CGGT------------------GT---GAG--TAGG--T--GTA-ATCTGGCGAA----TCT-CGG-G--GG-AGTGTCAGA--GGTC-TTCAT-AT-AGA--TAA-GTGTATGT-CTGT-GTGGATGAATTGATAGA-A------CGTG-GACTG-AGACATCT--CACA-T-CTCAC-C---T-TAT-GAT--CA---GT---TTG--C-CAAAAC-----ATG---A--AATCCAT--G---T------CAG-A-TGAT-TT---AA-------------------------------A-CCACTCAGCAT-ATT-TC-TCACTCCTCTATATAAGT-CTGAAGGTTTC----TGTATCATC-C-CC-TAC---GTGT----CAGAAATATCCCTTCTG-AAGGTCACTTCTGTC-GG-TGTCCC---TATCTCAC-GACAC-----A---CCCCCACATA-CAGGACTTCTGACGCACGTGGAATGtctcgtcaacaaatgcgtaata
gi|12 : TTTGTTCCGCTTG-TG-AAAAGAAA-TTCTCCC-TT-CTATAATCTTGAGTTC---TTATT--TGTGCTGTACTGTTTTGC-GA-T-AGAAAGAC-AG--ATTGAATATCCT----TCCT---CGAT-AATTGTGAAG-TCG-AGGA-TTGATGC--CAACGCG--AAGAGGAAT-GATCAGAATCGGCCATGTGTTGAAGTACATAAGATCGCTTTCAAATCAAGGGG-AA--GTGCTGGTAA-TGG-GCA-GTGACGGGAA--TGAAAACA-C-AGCG-C-----AATG---TCGAA-ATCTA---AATTCAG-AAAAGTGTAG-CTGT-GACAA--GGACC-GTGCAT-G-TTCTC---ATT-----TTC-GTT----------GGAT-----------GGAC-T-A-AG--T--CC-ATTCCAGT----T-TTG-ATGA-AAT--CTCAACAG-G---A-G--CATT-GAACTTGA-AAT---ATA-T-ACAG-CATTGTTT-CTC-TCC--AATA-G--T-GAGGA--CAT--G--AC---AA-T-TT--G-GCGAT
gi|13 : TACGTA-CT-CCCAT-CATC---GTAGA---GCA-GT--AGGGTTTGT-TGATCTG---CC-----AGTT---CTG-TAGATACATGTATTG---TGACTTGTTACCTAGTC---T---GT--AGTGA---CATAGG-AT-AGATA-GCATATG--CAC-GGT--CACAA--AGGG------AGATA-AACATAAAACT-GATATT-CCGT-TCATTCC-ACTCACTGCTTGT-T--CCAACATTAA-TTCTT-CAA-TACAG--GTAATCTTTTCACA-GAAAAGAGT-A--TCTCTTGCCCAAGCATTCCTAAACTTAG----TCTA-CA-TAGACTGAC-C-ACCC--ACCGTC-G---CACTTTA-TCTTT-G-TCTAT--CTAC-------ACT--ATGGCAT---------GAT-AT--GGG-------------TCTCTG-CTTCA-TTCTATC-TGTGACAG--TTAGGGCT-GT---GTGATATTTACCGG-T-ATCGTACAA-GTAT-AA-CG-CTAAATATAAATC
gi|14 : -TTATTG-ACCTA-TCATTATTGAATCTCTTTTTGT-TTGGCACAGACAATCTTTGTGCTTTT-AATGCC-ATGGAC--GTTGATAATA-A-----CAC-ATTTATCAA--CGCATCATG-AAAT--A-TAA-CATTATGGCAGGT-TGATA-ATAACTG-ATCTATGACATT-TAAATG-CA-TC-ATGTTTGAAAGGAAATC-TGAT----AC-------G-A-G-AATTGTA-C-T-TCT--A-ACACTG--A-T-GC---TTTCG------C-CAA-----------A-AC---AAG-CAATATC------TA----TATCTA-TTTCTG-------C-TT-AGGT--AATTTTCC----GTCTG--C----A-TTA-C-AAAG-TGT-GGATT--A-GAGA-G-G--------------------CCGGG-TC------AGAATCTC---------TCTGAGAGTGG--GACTG--C-GTAACAGGAA-AG---------------CAACGCCCA-TTTTGTCAAATGTTTCTGAG--C--TTT--TGA-T--ACAattgccaaaacacaaa
gi|15 : TTTTCT-TTGACACAGACAAACACTGAGTTTTT-AATGAC-ATGGAA--GTGAATA-TA-AG----CAC-ATTTATCAA--AGCATCATG-AAAT--A-TAA-CATTATGACAGGT-GGAGA-ATAACTG-ATCTATTACATT-TATACG-CA-TC-ATGTTTGAAAGGAAATC-TGAA----CT---CTTTA-T-G-AA----A-CAT-GTA------TCTTTTG-T-GCT--TT--C------C-CGA--T--------A-AA---ATG-CAATATC------TA----TATCTA-CTTCTG------AC-TTGAGGT--AACTTTCC-TCTGTCTG--C----A-TTA-C-AAAG-TAT-GGATT--G-GAGAAG-G--------------------CCGGGATC------AGAATCTC---------TCTGAGAGTGG--GGCTA--T-ATAGCAAAAA-GG---------------CAATGCCCA-TTTTGTAAAACTTTTCC-AA--C--TTT--TGA-a
gi|16 : cAGTCC-GAGTTTAATTCATT--TGA-CTGT-TTGTGT-GC-AA-T-AGGGA--CGAG--AT-GAA-ATCCT----TCGT---CAAT-GATTG----T-TTG-TA-G-T--AC-A--CTTTGCG--A-------T-GGCC----------ATGCGC--GAGT-CA-AACATC--TATC-AACCCAGGG--AA--GGGCTGGT-AATGG-GCA-GTGACGGGAA--TGGAAACA-C-AAC-GC-----TAAA---TCATT-TTCTATGGAGT---G-ATAAGTGTAG-TTGT-GACAT--GGACC-GTGCA--GGTTTTC---ATT-----TTC-TCT-----------GTT--T--------GGAT-C-ACG---T--CC-ACTC-ATTAA----TTG-ATAT-TGT--CTCATTCG-G---A-G--TAAT-GAACTCGA-AAT---GT-AT-ACAG-TACTGTTT-CTC-TCC--AATA-G--T-GAGTC--CAT--G--AC---AA-T-
gi|17 : -T-GCT--TT--C------A-CTA--T--------A-AA---AAG-CAATATC------GA--T--ATAAA-TTTCTT------CC-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A-ATA-T-AAgccgat
gi|17 : tactaatactgt-ATA-CACA--CTGCAT---CAAGGATTT--GAAG--CAAAACC-A--CACATGTTGAAGC-AATGTTG-A--TGGT-ATCCATGG-AGTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaatacacactgcatcaaggatttgaagcaaaaccacacatgttgaagcaatgttgatggtatccatggagtt
gi|18 : tactaatactgttgctttcactataaaaagcaatatcgatataaatttcttccttgaggtaactttcccctgtctgcaatataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaAATAAGTCG-T-AAGTAACAAACC-ATTCAATA-CAATGTACAGTTGTAAGTA-ATTCT-TTAA-TA-TAT--TA-TCGCACACAACCATTGATTTATTATAAATATTGACTGAAATCGAATACAAAT-ATTGACTG-GA-AT--ATCAA--------CAGAATCAGAAAATGAAA--TCCAT----AC-------CATTTCACATT-TA--TGAA-C--GAGATAAATGTA---A-T--ACAA-ACAAT-----A-AT-CTGTACAG--AAA------A-CAATTAACTTTGATTTTTCTATGTCG--TTAAA-----G------G----GTTTAC------TTTCTTCTCCTAACTATTGACAGAAAT-A---ATTCTAG-TTTCTATG-GCTATCTGTATTTTGTGACATGGTTCTTGTCT--AA
gi|19 : AGAACTA-AACCTAACATGTGAATTATTA-TCCTA-TCAATGGCGTATCTCTTTTTGT-ATGACACAAACAAATTATGTGCTTTT-AGTGAG-ATGAAA--GTCGACAATAGAG----CAC---TTACCAG--CCAATAATG-AAAT--C-TAA-CAT---GACAGGT-TGAGA-TTAATCG-ATCTATTGCGTT-TAAACG-CT-TC-ATGTTACAAAGGAAATT-TGAA----AC---CTCTG-----GA----A-C-T-GTA--C-ATAT----GGT-ACT--TT-----------CAA--T--------A-AAGA-AAG-CAATATC------TA--T--ATCTA-TCTCTG------AC-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A-TTA-C-AAAG-AGT-GGATC--A-GAGAGG-G--------------------CCGGGATT------AGAATCTC---------
gi|2 : TTAATCAAGTC-CATTGTG-CAAT--AACAA-CATT-TGG-ATGC-TGAGA-ATAAGTGCATCTATTGCATT-TAAATATCA-TC-ATGTTTACAAGCAAATC-TGACTTGACCAAGCT----C-G-AC----ATC-T-CTAC-A-ACTT----G-TCGCA--TT-----------CAACTT--------A-AATTTAAA-CATTATCAACCCATAAAT-TAGCTA-CTTCTATTTTGCAC-TTGAGGCCAAACTGTCCTCCTGTTTA--TGACAA-TTG-CTAAAG-TAT-GGATTTAG-GAGAGGTG--------------------CCGGGATCTGATTGACAATATC---------TCTGAGAATGG--GGCTA--TTGTAACAGGAAAGG--------------GCAACCCCCA-TTTTGTAAATTTTTTCT-AA--C--TTTCTTGA-T--ACAGAGAAATTCGTCCC-GCCCC-G-AC---TTTTC---CTACACACATAT--TTGTTCTGCCAG-----------AAT-AGAGAAATT-TGAA--GGTAACC-GGTAT-ATA-CACA--TTGCAT---CAAGGATTT--GAAA--CAAAACC-ACAC-CACGGTGAAGC-AGTGTTGGA--TGGT-ATCCGTGG-AGTTGAA-GAGCTCTCT-TTA-ATTCT-C-CAAAATAATATTTG--TCTTCATAAAAT-ATGAACAC-AGTTA-ATTCGTC---ACAAATA--A-T-TCCTT-AGAATTATTTTC-A-TGATTCTGTAACAGAGAAAATTGGGACAATGGTTCATAGAGTACACTACTTTTGCCTCGCTTGGTGTAAAAGAAA-T-CTCCA-TT-CCAA-GTCT-GAGTTT--TCCATTCGTGT-CTGT-TTGTTTTAC-AAAT-AGGAAT-CGAGGAAT-GAA-ACCCG----TCTT---CAATTAATTG----AGCTG-CAT--T--ACAAACTTACGTG--G-------T-GGGCC---------GTGCTC--G--T-CA-AACATC--TATCAA-CCCAAGG--CA--GAGCTGGTAA-TGG-ACA-GTGACGGGAAAGTGGAAATAAC-A-CAGC-----GATA---TCAGTCTTCTTTAA--T--CGTACAAGTGAAGGCTGT-AAACA--GGACC-GTGTAT-T-TTCCC---ACCTTTTTTTC-CCCCCCCCCAAAAAGTT--TTTATTTGGGGATTC-A-T---T--CC-CCTG-AGTGA--T-T-G-ATGG-ATT--CCCTTCCGCC---A-G--CAAT-GAAC-TGA-AAT---AT-AT-ACTG-TATTGTTTGCTC-TCT--AATACG--T-GAG
gi|20 : gC-ATCGAA--GTTGATAA-A-AG----CAC-TTCTATCAA--CTTATCATC-GAAT--A-TAA-CATATTGGCGAGT-TGAGA-ATAACTG-ATCTATTACATT-TAAATG-CA-TC-ATGTTTAAAAGGAAATC-TGAT----CT--------------A----A-C-A-ATC--ACACCC----G-C-ACT--T--CC------CATGA--TTTCATTAAA-AA---AGG-CAATATC------AA--T--GTCAA-TTTCTG------AC-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A-TTA-C-AAAG-TGT-GGATC--T-GAGAGG-G--------------------TTGGGATC------AGAATTTC---------CCTCAGAGTGG--GACTT--T-GTAAGAGGAA-GG---------------CAACGCCCA-TTTTGTAAAATGTTTCT-AA--C--TTT--TGA-T--ACA
gi|21 : -TTATTG-ACCTA-TCAATGGTGAATCTCTTTTTGT-TTGATACCAAAAGACTTTGTGTT----AATGAC-ATGGAC--GTAGATACTA-AAACAATACTAGTAATCAA--CTTATCATG-GAAT--A-TAA-CATTATGACAGGT-TGAGA-GTAACTG-ATCCATTACATT-TAAATG-AA-TC-ATGTTTGATAGGAAATC-TGAT----GC---AATTGTC-C-CA----C-T-T-ATATTA-CTGC------T-GCT--TTCGC------C---A--T--------A-AA---AAG-CAATATC-------A--A-TATCTA-TTTCTG------AC-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A-CTA-C-AAAG-TAT-GGATT--G-GAGAGG-A--------------------CCGGGGTC------AGAATCTC---------
gi|22 : CAATGAGTTA-T-AAATAACAAACC-ATTCATTA-C----T----TTGTAAGTA-AGTCT-TTA--TA-TAT--TA-TTGTGT----CC----------------TATCG-------TTGAGAACAAAT-ATTGACTG-AA-AT--ATTTA--------CAGAG------------G--TCCAT----AC---A--ATATT--ACATT-TAC--AAA-T--GA---AAAT-TA---T-T--A--A-ACAAC-----A-TT-CTGCACAG--AAA------A-CG-TC------GATTGTTATATGTCA-AC--AACCC-TA------ACCTTATTTATGGGT-ATTT--TCTTCTAACTATTGACA-AAATTA---ATTCTAG-TTTCTGTG-GCTGTCTGTATTTTGTGATATGGTCTCTGTCT--AAGTG-AC--T--CTTGAT-AA-GACTG-TAACGC
gi|23 : AAATTATATATTC-AG-CTTCTGTG-GCTGTCTGTATTTTTTGA-ATG-TGCTTGTTTTTAAGTGAACAAT--TTGATTTAA-GACTGTTAACGCCCTGT-GTAG-TCCCCCAC-CA-TATGTTGACA-AATCCC-AGTA---TCTGCCA-GACAGGT-CTCT-ATGGCGT---AAAGGTGCGTATCT-CCCAT-CATC---ATAGA---GCAAGT--AGGGTGTGTAGGGT-TG---TC-----AGT-G-CCTG--AGATAA-----ATG---TGACCTG-TACCTAGTC-GTTAGAGT--G--GATTTTA-GGGTAC-AGATA-ACA
gi|24 : gaGAATGTGATCCATCC-TGTAACGA-TTC-T-TTAACGTTAG-TTGATCGAC-TCAATA-TAAGTTTCT-ATT-AA--------------AT--T----ACAGT--GTTCTG--AT-AAT-TC--GTGAGA--AG-TTG----TATAAAA-------------TGTAA--------------TCTTACAAAATGTACTCTACCTGAGAATTT--CCAAGTTCTATTTATAGACAATCGGGAAATAA-CCAGTT-TAACT-CCG-----TACTTTTCTTATTGCA---TGTACTCTGTTG-AC-CTTAA-TATGGAATACCAGTC-TTTA-TTTGATTCG-TTAATCGA
gi|25 : GGGAAATGTGATCCATCC-TGTAACAA-TTA-T-TTAACGTTCA-TTTACCGAA-ACAATA-CAAATGTTT-ATT-AATACGAA-AGAATACATTAC----AC--C--GTTCTGAA---AAC-CC--GTGAAA--AG-TTG----TATAAAA-------------TG-AAT-----------------------TCCACTGCACCTGAGAATTT--AAAACATCTATTTATAGACAATCGG-AAATAC-CCGGTT-AAGCC-C--C--ACTACTCTTCTT-TTGAAAATTG-A-TTTGTTG-ACTCTTAAGTCT-GAATA----T--TTTA-TTCCGTT-G-TT-gacaattgt
gi|26 : -TTATTG-ACCTA-ACAATGGTGTATCTTCTTTTCT-TTGACACAGACAAACACTGTGTTTTC-AACGAC-ATGGAA--GTGAATA-CA-AG----CTT-ATTTATCAA--CGCTTCATG-AAAT--A-CAA-CATTATGACAGGT-TGAGA-ATAACTG-ATCTGTTACATT-AAATTG-CA-TC-ATGTTTAAAAGGAAATC-TGAT----TC---CTGTG-TGG-AA----A-A-T-CTAT-C-ACGT----C-T-GAT--TT--C------C-CGA--T--------A-AA---ATG-CAATATC------TA----TATCTA-a
gi|27 : --AG-GTAAGTGTAG-TTGT-GACAT--GGACC-GTGCAG-G-TTCTC---ACC-----TTC-ATT----------GGCT-----------GGAT-T-A-A---C--CCCATTC-CATA---T-TTG-ATGG-TTT--CTCATCCG-T---A-G--TAGT-GAACTTGA-AAT---GT-AT-ACAG-TATTGTTT-TTC-CCC--GTTA-G--T-GAGGA--CAT--G--AC---AACC-CC--C-ATCATT-TGA-CGAT------------------GT---GAG--T-AGT-A--GTA-TTCTGGCGAA----TCC-CGGTG--GG-AGT-TCACCC-CGTA-TCCAT-AT--GA--GAAAGTGTA
gi|28 : CCTAGACTTAG----TA-AGCAATAGACTGAC-C-ACCT--ACCG-C-CTTCCACTGTA-TCTCT-G--CTGT--CTAC--T-CT-GTT--GAGATAC---------AATTATTTGGGGCTTGTGAG-AGTCCTCTGTCTTCA-CTCTTTC-TGTGACAGTTTTAGCGCT-GT---TTGATATCTACCGG-TATTCATAC-ATGTAT-AATTGCCTAAATACCAACCCATCAT
gi|29 : taccTTCAATA-C----T----TTGTAAGTA-AGTCT-TTAA-TAATAT--------------AC-----------------TACCG-------TTGATTACAAAT-ATTGACTG-AA-A-T-ATCAACAGAAT--CAGAA------------G--TCCAT----AC---ATTACATTG-ATACTATAG-TAAA-T--GA---AA--ACA---TGT--A--A-ACGGT-----A-TT-CTGTACAG--GAA------ATC--TT------GATTGGCCTGTGT--------------------------ATTAATTGGTAATATCTTCTCCTAACTATTGACAgattgcgaaa
gi|3 : gAG--AT-GAA-ATGCCAGTGTAGTACCCAAT-AATTG----A-TTGGTAGGAC--ACGA--C--CGCG--A-------TTAGCCA---------TTGCGCCTGAG--CA-AACATC--TATCAAACCCAGGGGAAA--TAGGTGGTAA-TGG-GCAAGTGACGGGAAGATGAAACCA-A-GGCGCCTCGTGGTTACATTCAGT-TTCTAT-AGAT--TA-ATAA-TGTA--TTGTCGACAAAGGGATCTGTGCCC-G-TTCTC---ACC-----TTC-ACT----------TAAT--T--------GGAT-CCA-A---TGTCC-A-TC-AGTGAGAT-TTG-ATGG-TTTGTCTCATCCG-GCAGA-GGTTAAT-GAACTTGT-AATCTTGTAATTGCAG-TAATGTTG-CTCCTCCGCAATA-G--TCAAGGATCCAT--G--ACCCAAG-T-TG--GCGTATTT-TGACCGGTATAGGAAAGCTGGATCGTGT---GAG--TAGGTAT--GGA-ATC-GGCGA-----TCC-GGG-GCGGG-AGTATCAGACAGGTC-TCCATA-T-AGAAATAAGGT--ATG--CTGG-GTGAATGA--T-----AAA------TGTG-GGCTG-AGACAGCT--CACA-G-ATCAC-G-C-T-TAT--AT--CAAC-GGAACCAA--C-CAACGCACTATATG---A--AAT-CAT--GTAGT------CAGAA-TGAT-TTG--GAACCTTGTGA-AATC-CCTCCCTTAGAAACT-A-CCACTCAGCAC-A-T-AC-TT-CTCACCCATAT-ACT-C-GAAGGTTTCTGTGCGTATCATC-T-CC-C-CCGTGTGTCCCCCAG----A--CCTTCTGTAAGGTCACTTCTGTCAGG-TGTCCCGGATATCTCACTGACACACAAAA---CACCCACAGA--AGGGC-TCTGACACTC-GGTAATGTGATTCATCCATGCAAACA-TTC-GTTTAGCGGTGG-------GAC-AC-ATAGCAAAACTCT-G---AAGACTAC-ACTATATA-TATAGAAACAGCAGGTTCTTGAAT-AATATCTAGTGAAGGTAATTTGTGGATACAAGAA-GTCAGTGAAAATGTGATTACTCATGTTAAATCTTACAAAATCCACTCTACCTGG----TT--TAAAATT
gi|30 : acT-GAACTTGA-AAT---ATA-T-ACAG-CATTGTTT-CAC-TCC--AATA-G--T-GAAGA--CAT--G--AC---AA-T-TT--C-TTCATT-TGA-CGGT------------------GT---GAG--T-AGC-T--GTA-ATCTGGCGAA----CCC-CGG-G--GG-CGTATCAGA--GATC-TCCAT-AT-AGA--TAAGgtgatcgtgataac
gi|31 : T----G-AATC-CCTCCCTAGA--ACT-A-CCACTCAGCAC-A-TATC-TCTTTCCATTATATATCT-GTGAAGGTTTC----CGTATCATC-T-CCTC-C---GTGTCTTCTAG----ATCCCTTCTG-AATGTCACTTCTGTT-GG-TGTCCC---TATCTCAC-cgt
gi|32 : AAGTGTAA-TTGT-GACAA--GGACC-GTGCA--TGTTCTC---ATT-----TTC-GTC----------GGA---T--------GGAT-T-A-AT--T--CC-TTTC-A--AA--TCTTG-ATGT-AAT--CTCAACAG-G---A-G--CATT-GTACTTGA-AAT---GT-AT-ACAG-CATTGTTT-CTC-TC
gi|33 : ACGTGAA--TGGAAACA-T-AGCG-C-----GATA---TCAAA-TTC-ATGAGAT--TT-AAAAGTGTAG-TTGT-GACAT--GGACC-GTGTA--GGTTCTC---ACC-----TTCAGC------------ACC--T--------GGTT-C-A--------CC-ACTC-CATAA----TTG-ATGG-TTT--CTCAT
gi|34 : ACCT----G-AATC-CCTCCCTATG--ACT-A-CCACTCTTCAT-A-T-GGATCATCCCTTTCGATAACG-ATAAACCTTTC----TGTATTAGCAC-CC-C-C---GTGTCCCAAAG----ATCCCTTCTG-AAGTTCACTTCTGTC-GG-T
gi|36 : ACATGCTGACA-GATCCCCAGTA---TCTGCCACAAGAGGT-CTCTAA--GGAGT--AACGGTACATGTTT-GTCAT-CATC---ATATA---TC-AGC--AGGGTGTGTAGGTC-TG---TC-----AGT
gi|37 : AGTGAAG-TTGT-GACAA--GGACC-GTGCAG-GTTTC-C---ACC-----TTC-ATT----------GACT-----------GAATTC-A-C---T--CC-ATTC-AATAA--T-T-G-ATGG-ACT--GTCATTCG-T---A-G--TAAT-GAACTTGA-AAT---GTAgact
gi|38 : TTTATAGACAATCGGAAA-TAC-CCAGTT-AACCT-CCGC----TACTTTTCTT-TTGCA---TGTACTCTGTTG-AC-CTTAA-TATGGAATACCAGTACTTTA-TTTGATTCG-TT-ATCt
gi|39 : ATAAATTA-T-AAGTAACAAATC-GTTCAAAA-CA---T----T-GTAATTA-AGTAT-TTAA-TA-TAT--TA-TTGCGC----CC----------------TACTG-------TTGAGTACAAAT-ATTGACTG-AA-A-T-ATCAA--------CAGAA------------a
gi|4 : AAGTCC-GAGTTTAATTCAT------------TTGTC------------------------------ATCCT----TCGT---CAAT-AATTG----A-TTG-TAG--T--ACAA---TACACG--A-------T-GGCCA----------TGCGC--GAGT-CA-AACATC--TCTCAA-CCCAGGG--AA--GGGCTGGTAA-TGG-GCA-GTGACGGGAA--TGGAAACA-C-AACG-C-----TACA---TCAGT-TTCTATG-GAT--AG-ATGAGTGTAG-TTGT-GACAT--GGACC-GTGCAG-G-TTCTC---ACC-----TTC-AAT----------GGCT--A--------GGAT-A-C-A---C--TC-ACTG-AGTAA--T-TAG-ATTG-TGT---TCATCCG-T---ATA--CATT-CAACT-GA-ATA---GTA-T-ACAA-TAGTCTTT-CTTATCCTAGATA-AGCT-GAGTC--CATAAG--AC---AA-T-TCTCG-TTGATT-TGAC-AGT------------------GTATAGAGATTA--T-T--GTA-ATCGGTCGAAAGAATCCGCGT-G--AGCAGTATCAGAC-GGTCGTCC-TAATCAGA--TAAGTAGTATGT-CTGGTGTG--TTAATTG---GATAAAACCCCGTTTGACTA-TGACATCTATCACACT-ATCAT-CACTTCTATAGATATCATATGG---TAG--AACATCGC-----ATACTCATTAACTCAT--GC--TTAGGATCAG-ACTGAT-TTTTAAAACATTCA-G-AATCGCCTCCCTAGT--ACT-A-CCACTCAGCAT-C-CGTC-TCAGTCCTCTATATAACT-TTGAAGGTTTC----CGTATCATC-T-CCAC-C---GTGTCTCTCAG----ATCCCTTCTG-AAGGTCACTTCTGTC-GG-TGTCCC---TATTTCAC-GACAC-----A---CACCCACATA-CAGGGCTTCTGATACACGGGGAATGTGATCCATCC-TGTAACGA-TTC-G-TTAACGTTAG-TTGATCGAC-ACAATA-CACATTTCT-ATT-AATACGAA----ACAAATCAT-----TAAC--GTTTTAA----AGC-TT--GTG-AA--ACCTTG----TATGAAAA-A----------TGTAA--------------TCAAACAAAGTCCACTCTACCTGAAAATTCA-CAAAA-TCTATTTATAAATAATCGG-AAATTC-CCAATT-ATGC--CCG---GCTACTTTTCTT-TCGCA---t
gi|40 : CTG--C----A-TTA-C-AAAG-TAT-GGATT--G-GAGAGG-G--------------------CAGGGATC------AGAACCTC---------TCTGAGAGTGG--GACTA--T-GTAACAGGAA--G--------------ACAACCCCCA-TTTCGTAAAATGTTTCT-AA--C--
gi|41 : CTG------AC-TTGAGGT--ATTTTTCC-CCTGTCTG--C----A-TGA-C-AAAG-TGT-GGATC--A-GAGAGG-G--------------------CCGGTATC------AGAACCTC---------TCTAAGAGTGG--GACTG--T-GTAACAGGAA-
gi|42 : -TGAT-TT---AAACCT----A-AATC-CTTCCCTATG--GCT-A-CCACTCAGCATCA-A-TC-TAACTCCATAATATGAAT-GTGAAGCTTTC----CGTATCATC-TCCC-C-C---GTGTCCCaccaac
gi|43 : AAGTGTAG-TTGT-GACAA--GGACC-GTGCA--CGTTCTC---ATT-----TTC-GCT----------GGA---T--------GGAT-TAA-A---T--CC-ATTC---CAA--TGTTG-ATGT-AAT--CTCAACAG-G---A-G--CATT-GAACTac
gi|44 : aGATGAAAATTATATATTC-AG-CTTCTGTG-GCTG
gi|44 : AATATATAATT-TTCATC-CCGT-TCATTTC-ACTGACTTCTTCT-T--CCAACCTTAA-TTCTTccgttcatttcactgacttcttcttccaaccttaattcttc
gi|45 : cagccacagaagctgGGAATGTGATGCATCC-TGTAGCGA-TTC-G-TTAACGTTAc
gi|46 : TTTTCTT-TTGCA---TGCACTTTGTTGCCC-CTTCA-CATGGAATAC------TTTA-TTTGATTCG-TT-ATCctattacatttagctttacacattctattta
gi|47 : --GCTACTTTTCTT-CTGCA---TTT--TCTGTTGCAC----AA-AACAAAATACTAGTACTTTATTTTGATTacaa
gi|48 : CT--CACA-T-ATCAC-C---T-TATG-AT--CA---GG---GAG--C-CAACGC-----ATG---A--AATC
gi|49 : --CAAAACC-A--CACATGTTGGAGC-AATGTTG-A--TGAT-ATC
gi|5 : ACAATAAGT--ATGAAGTAACATACC-ATTTA-TAGTA---T----T----A--A-AGTCTATTAA--A-TATGATA-TTGCGC---ACC----------------TACTG-------TTGATTACAAAT-ATTGTCTGCAA-ACTGACTAAAACAGAATCAGAA------------GGTTCCATCTAAACCCTA--AC-TTG-ACATT-TATGTAAAAT--GG---AAAC-CAGCTT-TGCA--ATACAATTTACTA-TTTCTGTCCAGTGGAATACCCCA-CATTT------GATCGTTCTATGGCATAATAAAATA-TA------AT---AAATATAAAT-ATATCTT-TCCTAACTTATGA--GAGATTA---ATTTT-G-CT-CTCTG-GTTGTCTGTATTTTTTGAT---GTTC--GT------GTGA--------TGTGT-AA-GACCGTTAACGCCCGGG-ACAGGTCTCCCACACATTGT-TTG--A-GATCCCACGT----TC-GCCAGGACAGGTCCTCT-A--TCTTC--AAAATCACGAATCTCCCCATACATCCCAATAGAAATGCAAGTGAAGGGTTTGTGTAAT-CGCGTTCTCCTAGGTCATCCTGCTAGAAATC----TTGAATTGATCTGTTACCTAGTCTGCT---GTCGA-CAA---TA-GGA-ACGGGATACACACATGTGCACAGGTAGCGCAACCAGGGCTCACCAG---TCATAT---------TATCTCTGTATCATTTCAACTGAACTTTTGTGTGGCCAA--TTAACTTCTTTCATCTATAGCAGTAAACTCTTTATAC-AATATGGTCAACATTCTTG-CCAACC-TTCCTATACTTAGGTTCTA-A--A-TAGACTGAC-CCACCT--ACCG-C-T---CACTGTACTCTCT-GCTCTGT--C-AC---ACT-ACT--AGGATACCCCATTCGAGAA-GT--GTGGC-TGTGAGAAGGCCTCTG-C-TCACTTCTATCTTGTGACATTTTTAACGCTAGTTTATTGATAATTCTC---TAAACGCA--G-GTATCAGTTACCTGAGTA
gi|50 : TC-CCGT-TCATTTT-ACTGACTTCTTGT-T--CCAAatga
gi|6 : AA--TGGAAACA-C-AGCG-C-----TACA---TCAGT-TTCTAT-AGAT--AG-ATAAGTGTAG-TTGT-GACAT--GGATC-GTGCAG-G-TTCTC---ACC-----TTC-ACT----------AA-T--T--------GGAT-C-A-A---TT-CC-ACTC-AGTGA--T-T-G-ATGG-TGTT-CTCATCCG-G---A-G--TAATTGAACTTGATAAT---GTAAT--CAGGTAT-GTTT-CTC-TCC--AATA-G--T-GAGTC--CATT-G--AC---AA-T-TT--G-GCGATTGTGAACGA-------------------GT---GAG--TA-GT-TTTGTACATCTGGCGAA----TCC-----G--GG-AGTATCAGAG-GGTC-TCCATA-T-AGA--TAAG-TGTATGTGCTGG-GTGAATGTATTA---GAAA------TGTG-G-CTGCAGACATCT--CACA-TGATCAC-C--TT-TATG-AT--CA---GG---TAAACC-CAACGC-----ATG---A--AATC-ATTAGT--T------CAG-A-TGATGTT---GAACC-----G-AATC-CGTCCC-AGA--ACTTA-CCACTCAGCAT-ACT-TC-TCACTCCATTATA---CT-CTGAAGGTTTC----TGTATCATC-T-CC-C-CC--GTGTCCCCCAG----ATCCCTTCTG-AAGGTCACTTCTGTC-GG-TGTCCC---TATCTCAC-GACAC-----A---CACCCACATA-CAGGGCTTCTGACACTCGGTGAATGTGATCCATCC-TGCAACGA-TTC-G-TTAGCGTT--------CGAC-ACAATA-CAAA--------------CGAG-ACTACACATTA-----ACAGC--GTTCTGA--T-AAT-TC--GTGAAA--A-TTTG----TATACAA-------------TGTAAT--------------CTTACAAAATCCACTCTACCTG
gi|7 : TATCTCTTTTTCG-TTGACACGAACATACACTGTGCTTTC-AATGAC-ATGGAA--GTGAATA-TA-AG----CGC-ATTAATCAA--CGCATCATG-AAAT--A-CAA-CATTATGACAAGT-GGAGA-ATAACTG-ATCTATGACATT-TAATTG-CA-TC-ATGTTTAAAAGGAAATC-TGAT----TC---CTTTT-T-GTAA----A-T-T-ATA--A--------------CT--TTTCTGCTTTAC-TGA--T--------A-AA---AAG-CAATATC------TA--T--ATCTA-TTTCTG------AC-TTGAGGT--AACTTTCC-ATTGTCTG--C----A-TTA-C-ACAG-TAT-GGATT--T-GAGAGA-G--------------------CCGGGGTA------AGAATCTC---------TTTGAGAGTGG--GGCTA--T-GTAACAGAAA-AGCAACNNNNNNGAAAGCAACGCCCA-TGTTGTGAAATGTTTCT-AA--C--TTT--TGA-T--ACAGGAACGTCTGTTGC-GCCCC-G-ACAACTTTTC---CTGCAAACATAT---TGTTCT-CCGG-----------AAT-AAAGAAATT-TGGAAGG-TAACC-GGTAT-ATA-CACA--CTGAAT---CAAGGATTT--GAAA--CAAAACC-A--CACATGTTGGAGC-AATGTTG-A--TGGT-ATCCATGG-GGTAGAA-GAGCATTCT-TGA-ATTCT-C-CAAAATAATA-TTG--TTTTttaaaat
gi|8 : AAA-TTCTCCA-CT-C-AAAGTCT-GAGTTT-----------GT-CTGT-TTGTTT-GA-GA-T-AGGAA--CGAG--AT-GAA-ATCCT----TCAT---CAAT-AATTG----A-ATG-CA-G-T--AC-A--GTAGGTG--A-------T-GGCC----------ATGCGC--GAAT-CA-AACATC--TATC-AACCCAGGG--AA--GGGCTGGT-AATGG-CCA-ATGACGGGAA--CGGAAACA-C-AG-GGC-----GATA---TCAGC-TTCTATGGAAT---T-ATAAGTGTAG-TTGT-GACAT--GGACC-GTGCA--TATTCTC---ACC-----TTC-TCT----------GGC---T--------GGAT-C-A-AT--T--CC-ATTC-AATGA----CTG-ATGA-AAT--ATCATCCG-G---A-G--TAAT-GAACTTGA-AAT---GT-AT-ACAG-TATTGTTT-CTC-TCC--AATA-G--T-GAGGA--CAT--G--AC---AA-TATC----CTCATT-GGA-CGGT------------------GT---GAG--T-AGT-T--GTA-ATCTGGCGAA----TC
gi|8 : C-----ATG---T--AATCCAT--GT---------CAG-A-TGAT-TG---AAACCT----A-AATC-CCTCCCTATA--ACT-A-CCACTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacatgtaatccatgtcagatgattgaaacctaaatccctccctataactaccact
gi|9 : aaattctccactcaaagtctgagtttgtctgtttgtttgagataggaacgagatgaaatccttcatcaataattgaatgcagtacagtaggtgatggccatgcgcgaatcaaacatctatcaacccagggaagggctggtaatggccaatgacgggaacggaaacacagggcgatatcagcttctatggaattataagtgtagttgtgacatggaccgtgcatattctcaccttctctggctggatcaattccattcaatgactgatgaaatatcatccggagtaatgaacttgaaatgtatacagtattgtttctctccaatagtgaggacatgacaatatcctcattggacggtgtgagtagttgtaatctggcgaatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaaGAACTA-CACCTATCATGTGAACTATTG-ACCTA-TCAATGGCATATCTCTTTTTCT-TGGACACAAACAAACACTGTGATTTC-AATGAC-ATGGAA--GTGAAT-ATA-AG----TAC-ATTTATCAA--CGCATCATG-AAAT--A-CAA-CATAATGACTGGT-TGAGA-ATAACTG---------------AAATG-CA-TC-ATGTTTGAAAGGAAATC-TGGT----CC---CATTG-T-G-TA----A-C-T--TAT-A-ACAC------T-GCTGCTTTCC------A-C-A--T--------T-AT---AAG-AAATATC------TA--T-C-TCTA-TCTCTG------AC-TTGAGGT--AACTTTCA-CCTGTCTG--C----A-TTA-C-AAAG-TAT-GGATT--A-GAAAGG-GTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTC------GGGATTTCAGAATCTCATCTGAGAGTGGGAGACTAGCT-GTAACA-GAA-GGCC------------CCAATG-CCA---CTGGAAAATGTGTCT-AT--CCTTTT--TGATT--ACAGAGACAT-TGTTGC-ACCCC-A-ACAA-TTTTTCCACTGCAAACATAG-TTTGTTA--CCGGGAACGATCTCAAAT-AAAGACATTGCGAAAGGGTAACC-GGTAT-ATA-CACATTCCCCAT---CAAGGATTTTAAAAA--CAATACC-A-
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|35 ): TTATCCTATGATAAGCTGAATATGAAAGGAATGCTTGTTGATTTAATAGTGTCTTCATGGGAATGTACTGTTATCCATCAATCCACTAAATAGAACAGCTGATAACCCTAAC
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 222 333333333 11111 5555555555555555555555 2222222 222 44444444 333333333333333 1111 333333 22 111 1111 111 3333333333333333 22222 111 55555555 888888888888888888888888 11111 222 11 11 222222222 1 1 1 1 2222 1 22222222222 111 1111 11 111 22222 222 11 333333 111 1 3333333333333333333 1 1 1 1 1 11 11 333333 1111 111111111 11 1 1 22 11 33333 1 222222222222 1 1 11 1 22222 1 1 11 11 5555555555555555555555555555 1 11 1 11 1 1 1 111 1 2222 1 1 1 2 1 1 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 111 22222 111111 22222222222222222222 111111111 444444444444444 1 111 222 44444444444 111 11 2222 11 1 1 1 1 1 1 11 1 1 1 3333 222222 111 11 2 1 1 2 1 1 1 11 111 22222222222 11 1111 111 222222 22222222222222 1111111111 33333333333 11 11 1 11 1 11111 11111111 3333 33333333333333333333333333333 222222222222 1111 11 11 111111 1 333333333333333333 11111 1111 22 11 333333333333333 22222 22 222 1111111111 11111 222222 2222222222 1 111 111111 222 1111 1 111 1111 111 222222222 11111111 11111 11111 11111 22222 11111 1111 777777777777777777777777777777777 11 1 11 2222 111 111 11111111111 444444
lowQualScore : 333 8 8 7 6 666666666 7 2 6 6 6 6 00000 9999999999999999999999 8888888 1 6 6 6 333 33333333 888888888888888 7777 333333 0 11 8 777 8888 444 0 0000000000000000 00000 8 8 444 22222222 777777777777777777777777 11111 1 0 1 3 333 7 6 6 0 22 6 3 11 888888888 22 0 0 9 3 3 6 7 9 2 3 0 8 0000 3 8 0 99999999999 11 0 8 8 444 9999 66 11 77 8 444 00000 777 33 666666 777 5 3 7777777777777777777 0 0 0 0 1 7 3 88 0 88 888888 2222 999999999 8 8 8 8 11 77 0 7 2 55 33 1 77777 6 3 1 3 333333333333 0 5 33 0 88888 0 0 33 33 3 4444444444444444444444444444 0 33 2 9 3 0 3 22 3 0 0 3 0 777 1 2 0 3 0000 0 88 2 3 2 3 6 3 6 6 0 5 0 0 5 4 66 0 0 4 9999 4 55 2 4 55 4 4 22 4 4 4 3 3 3 3 0 3 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 3 000 3 999999 66666 3 222222 3 44 3 44 9999 3 3 3 3 3 3 7777 3 77777777777777777777 999999 333333333 99 777 4 4 555555555555555 1 8 4 66 66 66 5 77 8 8 999 0 6 444 888 88 66666666666 8 8 0 5 8 6 6 99 0 111 99 33 4444 6 6 99 6 11 3 0 0 0 0 0 9 33 3 3 3 7 0000 555555 6 1 777 8888 0 7 88 0 5 1 1 0 3 6 0 3 0 0 6 6 88 222 6 6 11111111111 55 5 77 5 5 2222 3 000 5 111111 5 22222222222222 9999999999 5 55555555555 55 5 5 77 1 5 5 33 77 5 9 5 5 11 4 4 7 00000 777 777 5 66666666 3 2 2 777 2 4444 555 77777 77777777777777777777777777777 111111111111 2 0 333 4444 6 2 444 66 66666 3 44 3 2 3 555 44 55 3 3 6 00 3 55 3 666 99 55 777 4 4 444444 1 5 8 666666666666666666 888 77777 5 66 5 0 0000 66 5 77 5 0 00 5 77 5 77 2 88 8 6 0 666666666666666 8 3 8 99 888 99999 6 00 99 777 4444444444 44444 222222 99 9999999999 3 5 5 555 999999 4 9999 4 4 5 111 5 33 1 2 66 0000 5 5 0 5 333 2222 5 5 5 111 6 555555555 8 0 1 5 5 888 22222222 6 6 55 33333 7 99999 1 1 88888 99 55555 6 99 55555 4444 555555555555555555555555555555555 3 99 77 0 3 0 8 8 11 4444 5 000 666 66666666666 1 333333 6 8 8
lowQualScore : ... . . . . ......... . . . . . . ..... ...................... ....... . . . . ... ........ ............... .... ...... . .. . ... .... ... . ................ ..... . . ... ........ ........................ ..... . . . . ... . . . . .. . . .. ......... .. . . . . . . . . . . . . .... . . . ........... .. . . . ... .... .. .. .. . ... ..... ... .. ...... ... . . ................... . . . . . . . .. . .. ...... .... ......... . . . . .. .. . . . .. .. . ..... . . . . ............ . . .. . ..... . . .. .. . ............................ . .. . . . . . .. . . . . . ... . . . . .... . .. . . . . . . . . . . . . . . .. . . . .... . .. . . .. . . .. . . . . . . . . . .................................................................................. . ... . ...... ..... . ...... . .. . .. .... . . . . . . .... . .................... ...... ......... .. ... . . ............... . . . .. .. .. . .. . . ... . . ... ... .. ........... . . . . . . . .. . ... .. .. .... . . .. . .. . . . . . . . .. . . . . .... ...... . . ... .... . . .. . . . . . . . . . . . . . .. ... . . ........... .. . .. . . .... . ... . ...... . .............. .......... . ........... .. . . .. . . . .. .. . . . . .. . . . ..... ... ... . ........ . . . ... . .... ... ..... ............................. ............ . . ... .... . . ... .. ..... . .. . . . ... .. .. . . . .. . .. . ... .. .. ... . . ...... . . . .................. ... ..... . .. . . .... .. . .. . . .. . .. . .. . .. . . . ............... . . . .. ... ..... . .. .. ... .......... ..... ...... .. .......... . . . ... ...... . .... . . . ... . .. . . .. .... . . . . ... .... . . . ... . ......... . . . . . ... ........ . . .. ..... . ..... . . ..... .. ..... . .. ..... .... ................................. . .. .. . . . . . .. .... . ... ... ........... . ...... . . .
lowQualScore : 000 0 0 8 7 333333333 3 5 7 7 7 7 00000 7777777777777777777777 3333333 0 7 7 7 888 33333333 444444444444444 0000 888888 8 00 0 000 6666 000 8 2222222222222222 00000 0 0 000 22222222 000000000000000000000000 66666 4 8 0 2 333 3 7 7 6 00 4 2 00 000000000 55 0 0 2 7 3 7 3 8 5 2 0 8 8888 2 8 0 55555555555 22 8 0 0 000 0000 88 00 00 0 000 00000 000 22 222222 555 5 2 8888888888888888888 0 0 0 0 0 3 3 33 7 33 333333 7777 888888888 0 0 0 0 00 00 0 3 0 33 33 0 33333 7 3 2 2 888888888888 0 0 88 0 22222 0 0 22 88 2 2222222222222222222222222222 0 88 5 2 0 0 0 55 2 0 0 2 0 555 0 5 0 2 5555 0 22 5 2 0 3 7 3 7 7 7 0 8 4 0 4 11 1 0 4 4444 4 55 5 0 55 0 0 00 0 0 0 6 6 6 6 4 6 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 3 444 3 666666 00000 3 999999 3 66 3 22 6666 1 1 1 1 3 3 4444 3 11111111111111111111 666666 333333333 55 000 0 0 666666666666666 1 9 4 11 11 99 0 99 2 0 222 8 0 000 666 88 00000000000 0 0 8 0 0 7 7 22 7 777 22 66 9999 7 7 22 7 88 2 0 0 0 0 0 0 88 3 3 3 3 0000 777777 7 0 777 3333 7 3 33 0 5 0 0 7 3 7 0 2 0 0 5 7 55 333 7 7 33333333333 88 2 99 7 7 1111 0 000 7 777777 7 44444444444444 6666666666 7 11111111111 77 7 7 99 6 0 0 66 99 0 0 7 7 00 0 0 5 00000 000 555 7 77777777 6 9 9 777 9 1111 000 11111 22222222222222222222222222222 222222222222 9 4 666 0000 9 9 999 88 22222 1 22 9 9 1 444 33 00 3 3 7 00 6 00 6 555 55 55 000 0 0 444444 0 0 1 999999999999999999 888 22222 0 99 0 1 6666 44 7 99 7 1 77 7 00 7 99 5 88 0 4 8 888888888888888 0 8 0 22 333 77777 7 22 22 555 0000000000 33333 000000 22 2222222222 3 7 7 777 888888 4 6666 4 4 0 111 0 99 0 0 44 6666 0 0 0 0 888 1111 7 7 7 777 7 000000000 0 8 4 7 7 666 22222222 7 7 00 00000 2 33333 0 7 33333 22 88888 7 22 22222 2222 222222222222222222222222222222222 2 00 44 8 6 8 0 0 88 3333 7 000 777 22222222222 0 000000 7 0 0
consensus : NACAATAAGTTAAT-AAGTAACAAACC-ATTCAATA-CA---T----TTGTAAGTA-AGTCT-TTAA-TA-TAT--TA-TTGCGC---ACC----------------TACCG-------TTGAGTACAAAT-ATTGACTG-AA-ATT-ATCAA--------CAGAA------------G--TCCAT----AC---A--ACATTG-ACATT-TAC-TAAA-C--GA---AAATACA---T-T--A--A-ACAAT-----A-TT-CTGTACAG---AAAACG----A--TTGATTGTTCTATGTCA-ACTAAACCC-TA------A----ATTTATGGGT-ATTTCTTCTCCTAACTATTGACAGAAATTA---ATTCTAG-CTTCTGTG-GCTGTCTGTATTTTTTGACATGGTTCCTGTCT--AAGTGAAC--T--TTGAAT-AA-GACTGTTAACGCCCCGT-GTAGGTCCCCCACACAACATGTTGACA-GATCCCCAGTA---TCTGCCAGGACAGGT-CTCT-A--GCNTC--AAAGNTACGTATCT-CCCAT-CATC---ATAGA---GCAAGT--AGGGTGTGTGTGAT-TG---TC-----AGTCG-CCTG-TAGATAT-----TTG---TGACCTGTTACCTAGTC-GCT---GT--A-CGA---CA-GGG-AC-AGATA-ACANATGTGCAC-GGT--CGCAA--AGGG------AGATATAATATAAAANT-TNTATC-CCGT-TCATTTC-ACTGACTTCTTGT-T--CCAACNTTAA-TTCTTTCAACTATAGC-GTAAACTCTTTATACGAANATAGT-AGCNCTCTTGCCCAACC-TTCCTAAACTTAG----TA-A-CA-TAGACTGAC-CCACCT--ACCG-C-T---CACTGTA-TCTCT-G-TCTGT--CTAC--TACT-ACT--ANGACAC---------GAT-AT--GGGGCTTGTGAG-AGTCCTCTG-CTTCA-TTCTATC-TGTGACAGTTTTAGCGCT-GT---TTGATATCTNCCGG-TAATCGTAC-G-GTAT-AATCGCCTAAATATAAACCCATCATATACATAACCTAGACTTTAGAACTA-AACCTA-CATGTGA-TTATTG-ACCTA-TCAATGGCGTATCTCTTTTTCT-TTGACACAAACAAACACTGTGCTTTC-AATGAC-ATGGAA--GTGGATAATA-AG----CAC-ATTTATCAA--CGCATCATG-AAAT--A-CAA-CATTATGACAGGT-TGAGA-ATAACTG-ATCTATTACATT-TAAATG-CA-TC-ATGTTTGAAAGGAAATC-TGAT----CC---CTNTG-C-G-AA----A-C-T-NTA--A-ACGC----G-T-GCT--TTTCC------C-CGA--T--------A-AA---AAGC-AATATC------TA--T-TATCTA-TTTCTG------AC-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A-TT-A-C-AAAG-TATGG-ATT--G-GAGAGG-G--------------------CCGGGATC------AGAATCTC---------TCTGAGAGTGG--GACTA--T-GTAACAGGAA-GG--------------ACAACGCCCA-TTTTGTAAAATGTTTCT-AA--C--TTT--TGA-T--ACAGGGACATCTGTTGC-GCCCC-G-ACAA-TTTTC---CTGCAAACATAT-GTTGTTCT-CCGG-----------AAT-AAAGAAATT-TGGAAGGGTAACC-GGTAT-ATA-CACA--CCGCAT---CAAGGATTT--GAAA--CAAAACC-A-ACACATGTTGGAGC-AATGTTG-A--TGGT-ATCCATGG-AGTTGAA-GAGCTTTCT-TGA-ATTCT-C-CAAAATAATACTTG--TTTTCATAAAAT-ATGAACAC-AGTAA-ATTCGTC---ACAGAAA--ACT-TCCTTCAAAATNATTTTC-A-TGATTCCGTAACGGAGAAAACTGG--CAATGGTTCATAGAGTACACTANCTTTGNCCCGCTCG-TG-AAAAGAAA-TTCTCCA-CT-CCAAAGTCC-GAGTTTAATTCATT--TGT-CTGT-TTGTTT-GC-GA-T-AGGAA--CGAG--AT-GAA-ATCCT----TCGT---CAAT-AATTG----A-TTG-TAGG-T--ACGA--CTACGCG--A-------T-GGCCA---------ATGCGC--GAGT-CA-AACATC--TATCAAACCCAGGG--AA--GGGCTGGTAAATGG-GCA-GTGACGGGAA--TGGAAACA-C-AGCGGC-----GATA---TCAGT-TTCTATGAGAT--AG-ATAAGTGTAG-TTGT-GACAN--GGACC-GTGCAG-GGTTCTC---ACC-----TTC-GCT----------GGCT--T--------GGAT-C-A-A---T--CC-ACTC-AGTAA--T-TTG-ATGG-NNT--CTCATCCG-G---A-G--TAAT-GAACTTGA-AAT---GTAAT-ACAG-TATTGTTT-CTC-TCC--AATA-G--T-GAGGN--CAT--G--AC---AA-T-TC--G-GTNATT-TGACCGGT------------------GT---GAG--TAAGT-T--GTA-ATCTGGCGAA----TCC-CGG-G--GG-AGTATCAGAC-GGTC-TCCATAAT-AGA--TAAGGTGTATGT-CTGG-GTGGATGAATTG---GANA------CGTG-GACTG-AGACATCT--CACA-T-ATCAC-C-CTT-TATGGAT--CA---GG---TAG--C-CAACGC-----ATG---A--AATCCAT--GT--T------CAG-A-TGAT-TT---AAACCT----G-AATC-CCTCCCTANG--ACT-A-CCACTCAGCAT-A-T-TC-TCACTCCNCTATATAACT-CTGAAGGTTTC----CGTATCATC-T-CC-C-C---GTGTCCCCCAG----ATCCCTTCTG-AAGGTCACTTCTGTC-GG-TGTCCC---TATCTCAC-GACAC-----A---CACCCACATA-CAGGGCTTCTGACACACGGGGAATGTGATCCATCC-TGTAACGA-TTC-G-TTAACGTTAG-TTGATCGAC-ACAATA-CAAATTTCT-ATT-AATACGAG-ACTACACATTAT----ACAGC--GTTCTGAAAT-AAT-TC--GTGAAA--AGTTTG----TATAAAAA-G----------TGTAAT-------------TCTTACAAAATCCACTCTACCTGAGAATTT--CAAAGTTCTATTTATAGACAATCGGAAAATAC-CCGGTT-AAGCT-CCGC--GCTACTTTTCTT-TTGCA---TGTACTCTGTTG-AC-CTTAA-TATGGAATACCAGT--TTTA-TTTGATTCG-TT-ATCGA
Reference ( family-5170 ) : NACAATAAGTTAAT-AAGTAACAAACC-ATTCAATA-CA---T----TTGTAAGTA-AGTCT-TTAA-TA-TAT--TA-TTGCGC---ACC----------------TACCG-------TTGAGTACAAAT-ATTGACTG-AA-ATT-ATCAA--------CAGAA------------G--TCCAT----AC---A--ACATTG-ACATT-TAC-TAAA-C--GA---AAATACA---T-T--A--A-ACAAT-----A-TT-CTGTACAG---AAAACG-------TTGATTGTTCTATGTCA-ACTAAACCC-TA------A----ATTTATGGGT-ATTTCTTCTCCTAACTATTGACAGAAATTA---ATTCTAG-CTTCTGTG-GCTGTCTGTATTTTTTGACATGGTTCCTGTCT--AAGTGAAC--T--TTGAAT-AA-GACTGTTAACGCCCCGT-GTAGGTCCCCCACACAACATGTTGACA-GATCCCCAGTA---TCTGCCAGGACAGGT-CTCT-A--GCNTC--AAAGNTACGTATCT-CCCAT-CATC---ATAGA---GCAAGT--AGGGTGTGTGTGAT-TG---TC-----AGTCG-CCTG-TAGATAT-----TTG---TGACCTGTTACCTAGTC-GCT---GT--A-CGA---CA-GGG-AC-AGATA-ACANATGTGCAC-GGT--CGCAA--AGGG------AGATATAATATAAAANT-TNTATC-CCGT-TCATTTC-ACTGACTTCTTGT-T--CCAACNTTAA-TTCTTTCAACTATAGC-GTAAACTCTTTATACGAANATAGT-AGCNCTCTTGCCCAACC-TTCCTAAACTTAG----TA-A-CA-TAGACTGAC-CCACCT--ACCG-C-T---CACTGTA-TCTCT-G-TCTGT--CTAC--TACT-ACT--ANGACAC---------GAT-AT--GGGGCTTGTGAG-AGTCCTCTG-CTTCA-TTCTATC-TGTGACAGTTTTAGCGCT-GT---TTGATATCTNCCGG-TAATCGTAC-G-GTAT-AATCGCCTAAATATAAACCCATCATATACATAACCTAGACTTTAGAACTA-AACCTA-CATGTGA-TTATTG-ACCTA-TCAATGGCGTATCTCTTTTTCT-TTGACACAAACAAACACTGTGCTTTC-AATGAC-ATGGAA--GTGGATAATA-AG----CAC-ATTTATCAA--CGCATCATG-AAAT--A-CAA-CATTATGACAGGT-TGAGA-ATAACTG-ATCTATTACATT-TAAATG-CA-TC-ATGTTTGAAAGGAAATC-TGAT----CC---CTNTG-C-G-AA----A-C-T-NTA--A-ACGC----G-T-GCT--TTTCC------C-CGA--T--------A-AA---AAGC-AATATC------TA--T-TATCTA-TTTCTG------AC-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A-TT-A-C-AAAG-TATGG-ATT--G-GAGAGG-G--------------------CCGGGATC------AGAATCTC---------TCTGAGAGTGG--GACTA--T-GTAACAGGAA-GG--------------ACAACGCCCA-TTTTGTAAAATGTTTCT-AA--C--TTT--TGA-T--ACAGGGACATCTGTTGC-GCCCC-G-ACAA-TTTTC---CTGCAAACATAT-GTTGTTCT-CCGG-----------AAT-AAAGAAATT-TGGAAGGGTAACC-GGTAT-ATA-CACA--CCGCAT---CAAGGATTT--GAAA--CAAAACC-A-ACACATGTTGGAGC-AATGTTG-A--TGGT-ATCCATGG-AGTTGAA-GAGCTTTCT-TGA-ATTCT-C-CAAAATAATACTTG--TTTTCATAAAAT-ATGAACAC-AGTAA-ATTCGTC---ACAGAAA--ACT-TCCTTCAAAATNATTTTC-A-TGATTCCGTAACGGAGAAAACTGG--CAATGGT-CATAGAGTACACTANCTTTGNCCCGCTCG-TG-AAAAGAAA-TTCTCCA-CT-CCAAAGTCC-GAGTTTAATTCATT--TGT-CTGT-TTGTTT-GC-GA-T-AGGAA--CGAG--AT-GAA-ATCCT----TCGT---CAAT-AATTG----A-TTG-TAGG-T--ACGA--CTACGCG--A-------T-GGCCA---------ATGCGC--GAGT-CA-AACATC--TATCAAACCCAGGG--AA--GGGCTGGTAAATGG-GCA-GTGACGGGAA--TGGAAACA-C-AGCGGC-----GATA---TCAGT-TTCTATGAGAT--AG-ATAAGTGTAG-TTGT-GACAN--GGACC-GTGCAG-GGTTCTC---ACC-----TTC-GCT----------GGCT--T--------GGAT-C-A-A---T--CC-ACTC-AGTAA--T-TTG-ATGG-NNT--CTCATCCG-G---A-G--TAAT-GAACTTGA-AAT---GTAAT-ACAG-TATTGTTT-CTC-TCC--AATA-G--T-GAGGN--CAT--G--AC---AA-T-TC--G-GTNATT-TGACCGGT------------------GT---GAG--TAAGT-T--GTA-ATCTGGCGAA----TCC-CGG-G--GG-AGTATCAGAC-GGTC-TCCATAAT-AGA--TAAGGTGTATGT-CTGG-GTGGATGAATTG---GANA------CGTG-GACTG-AGACATCT--CACA-T-ATCAC-C-CTT-TATGGAT--CA---GG---TAG--C-CAACGC-----ATG---A--AATCCAT--GT--T------CAG-A-TGAT-TT---AAACCT----G-AATC-CCTCCCTANG--ACT-A-CCACTCAGCAT-A-T-TC-TCACTCCNCTATATAACT-CTGAAGGTTTC----CGTATCATC-T-CC-C-C---GTGTCCCCCAG----ATCCCTTCTG-AAGGTCACTTCTGTC-GG-TGTCCC---TATCTCAC-GACAC-----A---CACCCACATA-CAGGGCTTCTGACACACGGGGAATGTGATCCATCC-TGTAACGA-TTC-G-TTAACGTTAG-TTGATCGAC-ACAATA-CAAATTTCT-ATT-AATACGAG-ACTACACATTAT----ACAGC--GTTCTGAAAT-AAT-TC--GTGAAA--AGTTTG----TATAAAAA-G----------TGTAAT-------------TCTTACAAAATCCACTCTACCTGAGAATTT--CAAAGTTCTATTTATAGACAATCGGAAAATAC-CCGGTT-AAGCT-CCGC--GCTACTTTTCTT-TTGCA---TGTACTCTGTTG-AC-CTTAA-TATGGAATACCAGT--TTTA-TTTGATTCG-TT-ATCGA
gi|1 : ACAATGGGTTAAT-AAGTAACAAACCTATTCATTA-C---------TTGTACGTATAGTCT-TTAACTA-TAT--TAATTGCGC----CC----------------TATCGC------TTGAGTACAAATTATTGACTG-AACATT-ATCTA--------CATAA------------G--TCCAT----ACG--A--ATATTGTACATT-TAC-TAAA-CCTGA---AAATACA---T-T--A--AGACAAT-----AGTC-CTGCACAG---AAACGG-------TTGATTGTTCTAT-TCA-ACTAAACCCATATCCGCTA----TTTTATGGAT-ATTCCCTCTTCTA-CTATTGACAGAAGTTA---ATTCTAGGCTTCTGTGTGCTGTCTGTATTTGTTCTCCTGGTTCCTGTCT--AAGTGAAC--TCTTTGAAT-AACGACTGGTAACGCCCCGTTGTAAGTCCCCCACACAACATGTTGACATGACCCCCAGTAATTTCTGCCAGGACAGGT-CTCT-A--ACTTCTAAAATCTACGTATCT-CCCAT-CATC---ATAGA----CATGT--AGGGTGTGTGTAAT-TG---TC-----AGTTG-CCTG-TAGATAT-----TTG---TGACTGG--ACCT---T-ACT---GT--A-TGA---CA-GGG-AC-AGATA-ACAGTTGTGCAC-GGT--CACAA--AGGG------AGATATAATATAAAAATATCTATC-CCGT-TCATTTC-ACTGACTTCTTGT-T--CCAACTTAAA-TTCTTTCAATTATATT-GTAAACTCTTTATTCGAACATAGT--GTCCTCTTGCCCAACC-TTCCTAAACTT-G----TA-A-CA-GAGACTGACTCCACCTGAGCCA-CGT---CACTGTA-TCTCTGG-TCTGTTCCTACGATACCGACCAAATAACAT---------GAT-AT--GGGGCTTGGGAG-AGTCCTCT--CTTCC-TTCTATC-TGTGACAGTTAAAGCGCT-GT---TTGATATCTTCCGGTTAATCGTAC-G-GTAT-ATCCGCCTAAA-ATAAA--CATCATATACATAACCTAGACTTTAGAACTAGAACCTA-CATGTGA-TTTTTGAACCTACTCAACGGTGTATTTATATTTCTATGGACACAAACAAATATCA-GCTTTCAAATTACAATGGAAAGGTGAATTATA-AG----TA--ATTTAACAA--CGCTTGATGAAAATAGA-CAACCATTATGACTGGTGTGAGATATAATTG-ATCTATTGCATTCTAAATG-CA-TCAATATTTTGAAAGTAACC-T-AT----CC---CTGTG-C-G-AG----A-C-TGCTA--A-ACGCA---A-T-GTT--TTTCC------C-TGA--T--------ATAA---ATGC-AATATC------TA--TCTATCTACTTTCTGA-----ACGTTGAGGT---ACTTTCC-CC--TCTGAAC----ACTT-ACC-AAAGAAATGG-ATT--GCGAGAAG-G--------------------GCGGAATC------AGAAT-TT---------TCTGAGAGTGGC-GACT---T-GT-ACAGGAA-GG--------------AGAATCCCCAGTTTCGTAAAATGTTTCT-AA--C--TCT--TGT-TTAACAGGGACATCTGTTGC-GCTCC-GTACAG-CTTTC---CTGCAAACTTATGGTTGTTCT-CCGG-----------AATAAAAGAAATT-TGGAAAGGTAACC-AGTAT-ATATCACA--CCGCAT---CAAGGATTT--GAAAC-CAAAACCAA-ATACATGTT-AAGC-AATGTTG-A--TGGT-A-CCATGG--GTTGAATGAGCTTTCTATGA-ATTCT-CACAAAATAATACTTGGTTTTTCATAAAATGATTAACACGAGTAATATTCATCTGGACAGGAA--ATTGTCCTTCAAAAAGATTTTCAA-TGATTCCGTAACAGAG-AAACTGG--CAATGGT-CATAGAGT-CACTAGCTTTGGCCCGCTCG-TGAAAAAGAAATTTCTCCATCTGCCAAAATCC-GAATTTAATTCATT--TGT-CTGT-TTGTGT-GCTAA-TCAGGAA--CAAG--AT-GAA-ATCTC----TCTT---CAAT-AATTG------TTG-TAGG-T--ACGG--CTACGCGGAA-------T-GGCCA---------ATGTGC--GAGT-CA-GAAATC--TCTCAAACCCAGGG--AAGGGGGCTGGTAAATGGTGCA-GTGACGGGAA--TGGAAACA-CTAGCGGC-----GACA---TCA-T-TTC-ACGAGAC--AG-ATAAGTGTAG-TTGT-GAAAG--GGACC-GTGCAGCGGTTCCTGCAACC-----TTC-TCT----------AGCCTGT--------GAAT-C-A-C---T---C-ACTC-AGTAGC-T-TTGAATGGTCTT--CTCATC---G---A-G--TAAT-GAACTTGA-AAT---GTAAT-GCAA-TACTGTTT-CTC-TCC--AATA-G--T-GGAGT--CGC--GCAAC---AA-T-TG--G-GTTATA-GGACCGGT------------------GT---GAG--GAAGT-T--GTA-ATCTGGCGAA----TCC-CGG-G--GG-AGTAGCAGA--GATC-TCCATAAT-AGA--TAAGGTGTATCT-CT-G-GTGGATGAAT------ATA------CGTG-GATGA-AGACATCT--CACA-T-ATCACAC-CTT-TATGGAG--CAG--GG---TAC--C-TAATGC-----ATGT--T--AATCCAT--GT--T------CAGTA-GAAT-TT---AAACCT----GAAATC-CCTCCCTACG--ACT-AGCCACTCAGC-T-AGT-TC-TGTATCCTCTATATAACTCCTGAAGGTTTC----CGTATCATC-T-CC-C-C---GTGTCCACGAG----ATCCCTTCTG-AAGGCAACTTCTGTC-GGTTGTCCC---TA-CTCAC-GACAC-----AAATCACCCACATAGCGGGGCTTCTGACACACGGGGAA-GTGATCCATCC-TGTAACGAGTTCAG-TTAA-ATTAGTTTGATCGACTCCAATA-CGAATTTCTAATTGAATACGAGCACTACACATTAC----ACAGC--ATTCTGAAATGAAT-TC--GTGAAA--AGTTTG----TTTAAAAATG----------TATAAT-------------TCTTACAAAATCTACACTACCTGAGAATTTTACAAAGTTCTATTTAT-GACAATCGGAAAATACTCCGGTTAAAGCTGCCGCTAGCTATTTCTCTG-TTGCA---TGCG-------------------ATGGAATAC--G----TTA-TTTGATTCGTTT-ATCAA
gi|10 : c-TAAATA-CAATC-ATGTTTGATAGGAAATCATGAT----GC---TTGTATC-A-AC----A-C-T-GT------------------CTA-TTTCA------G-TAA-----------A-AA---AAGCCAATATC------TA--T--ATCTA-TTTCTG------AC-TTGAGGT--AAACTTTC-CCTGTCTG--CC---A-TTTA-C-AAAG-TATGGGATT--G-GAGAGG-G--------------------CCGGGATC------GAGATCTC---------TCTGGAAGTGG--GGC-A--T-GTAGCAGAAA-GC--------------AC----CCCAGTTTTGTACAATGTTTCT-AAATC--TTT--TGA-T--ACA-GTAGATGTGTTGTGGCCCCGG-ACAATTTTTC---CTGCAGAAATGT-G-TGTTCT-CCGGA----------AAT-AAA-AAATT-TGGGAGCTTAACCAAGTATGATA-CACA--CTGCATTCACAAGGATTT--GAAAGTCAAAACC---ACACGTGTTGGAGCAAATGTTG-ACGCGGTAATCCATGGTAATTG-A-GAGCTTTCT-TGAGATTCCGC-CAAAATAATA-TTG--TTTTCCTGAAAT-ATGAACAC-AGTAA-A-TCGT-----CAGAAATCACT-TCCTTCAAAATAATTTTC-ACTGA----GTAACGAAGAAAACTGG--CAATGGagctg
gi|11 : AA--TGGAAACA-C-AACG-C-----GATG---TCATA-TTC-AT----T--AG-ATAGACG-AG-T-----ATA---GAACT-TTGTGA-------C---A-------------T----------AGCA--T--------GGA----A-AACGT--CC-ACTA-AATAA--T-T-G-ATGG-ACT--CTCATTCG-G---A-A--TA--------------T---GTAGT--CGG-TATTGTTT-CTC-TCC--AATA-G--T-GAGTC--CGT--G--AC---AA-T-TT--G-GTTATA-TGA-CGGT------------------GT---GAG--TAGG--T--GTA-ATCTGGCGAA----TCT-CGG-G--GG-AGTGTCAGA--GGTC-TTCAT-AT-AGA--TAA-GTGTATGT-CTGT-GTGGATGAATTGATAGA-A------CGTG-GACTG-AGACATCT--CACA-T-CTCAC-C---T-TAT-GAT--CA---GT---TTG--C-CAAAAC-----ATG---A--AATCCAT--G---T------CAG-A-TGAT-TT---AA-------------------------------A-CCACTCAGCAT-ATT-TC-TCACTCCTCTATATAAGT-CTGAAGGTTTC----TGTATCATC-C-CC-TAC---GTGT----CAGAAATATCCCTTCTG-AAGGTCACTTCTGTC-GG-TGTCCC---TATCTCAC-GACAC-----A---CCCCCACATA-CAGGACTTCTGACGCACGTGGAATGatctctcgtcaacaaatgcgtaata
gi|12 : TTTGTTCCGCTTG-TG-AAAAGAAA-TTCTCCC-TT-CTATAATCTTGAGTTC---TTATT--TGTGCTGTACTGTTTTGC-GA-T-AGAAAGAC-AG--ATTGAATATCCT----TCCT---CGAT-AATTGTGAAG-TCG-AGGA-TTGATGC--CAACGCG--AAGAGGAAT-GATCAGAATCGGCCATGTGTTGAAGTACATAAGATCGCTTTCAAATCAAGGGG-AA--GTGCTGGTAA-TGG-GCA-GTGACGGGAA--TGAAAACA-C-AGCG-C-----AATG---TCGAA-ATCTA---AATTCAG-AAAAGTGTAG-CTGT-GACAA--GGACC-GTGCAT-G-TTCTC---ATT-----TTC-GTT----------GGAT-----------GGAC-T-A-AG--T--CC-ATTCCAGT----T-TTG-ATGA-AAT--CTCAACAG-G---A-G--CATT-GAACTTGA-AAT---ATA-T-ACAG-CATTGTTT-CTC-TCC--AATA-G--T-GAGGA--CAT--G--AC---AA-T-TT--G-GCGAT
gi|13 : TACGTA-CT-CCCAT-CATC---GTAGA---GCA-GT--AGGGTTTGT-TGATCTG---CC-----AGTT---CTG-TAGATACATGTATTG---TGACTTGTTACCTAGTC---T---GT--AGTGA---CATAGG-AT-AGATA-GCATATG--CAC-GGT--CACAA--AGGG------AGATA-AACATAAAACT-GATATT-CCGT-TCATTCC-ACTCACTGCTTGT-T--CCAACATTAA-TTCTT-CAA-TACAG--GTAATCTTTTCACA-GAAAAGAGT-A--TCTCTTGCCCAAGCATTCCTAAACTTAG----TCTA-CA-TAGACTGAC-C-ACCC--ACCGTC-G---CACTTTA-TCTTT-G-TCTAT--CTAC-------ACT--ATGGCAT---------GAT-AT--GGG-------------TCTCTG-CTTCA-TTCTATC-TGTGACAG--TTAGGGCT-GT---GTGATATTTACCGG-T-ATCGTACAA-GTAT-AA-CG-CTAAATATAAATC
gi|14 : -TTATTG-ACCTA-TCATTATTGAATCTCTTTTTGT-TTGGCACAGACAATCTTTGTGCTTTT-AATGCC-ATGGAC--GTTGATAATA-A-----CAC-ATTTATCAA--CGCATCATG-AAAT--A-TAA-CATTATGGCAGGT-TGATA-ATAACTG-ATCTATGACATT-TAAATG-CA-TC-ATGTTTGAAAGGAAATC-TGAT----AC-------G-A-G-AATTGTA-C-T-TCT--A-ACACTG--A-T-GC---TTTCG------C-CAA-----------A-AC---AAGC-AATATC------TA----TATCTA-TTTCTG-------C-TT-AGGT--AATTTTCC----GTCTG--C----A-TT-A-C-AAAG-TGTGG-ATT--A-GAGA-G-G--------------------CCGGG-TC------AGAATCTC---------TCTGAGAGTGG--GACTG--C-GTAACAGGAA-AG---------------CAACGCCCA-TTTTGTCAAATGTTTCTGAG--C--TTT--TGA-T--ACAattgccaaaacacaaa
gi|15 : TTTTCT-TTGACACAGACAAACACTGAGTTTTT-AATGAC-ATGGAA--GTGAATA-TA-AG----CAC-ATTTATCAA--AGCATCATG-AAAT--A-TAA-CATTATGACAGGT-GGAGA-ATAACTG-ATCTATTACATT-TATACG-CA-TC-ATGTTTGAAAGGAAATC-TGAA----CT---CTTTA-T-G-AA----A-CAT-GTA------TCTTTTG-T-GCT--TT--C------C-CGA--T--------A-AA---ATGC-AATATC------TA----TATCTA-CTTCTG------AC-TTGAGGT--AACTTTCC-TCTGTCTG--C----A-TT-A-C-AAAG-TATGG-ATT--G-GAGAAG-G--------------------CCGGGATC------AGAATCTC---------TCTGAGAGTGG--GGCTA--T-ATAGCAAAAA-GG---------------CAATGCCCA-TTTTGTAAAACTTTTCC-AA--C--TTT--TGA-a
gi|16 : cAGTCC-GAGTTTAATTCATT--TGA-CTGT-TTGTGT-GC-AA-T-AGGGA--CGAG--AT-GAA-ATCCT----TCGT---CAAT-GATTG----T-TTG-TA-G-T--AC-A--CTTTGCG--A-------T-GGCC----------ATGCGC--GAGT-CA-AACATC--TATC-AACCCAGGG--AA--GGGCTGGT-AATGG-GCA-GTGACGGGAA--TGGAAACA-C-AAC-GC-----TAAA---TCATT-TTCTATGGAGT---G-ATAAGTGTAG-TTGT-GACAT--GGACC-GTGCA--GGTTTTC---ATT-----TTC-TCT-----------GTT--T--------GGAT-C-ACG---T--CC-ACTC-ATTAA----TTG-ATAT-TGT--CTCATTCG-G---A-G--TAAT-GAACTCGA-AAT---GT-AT-ACAG-TACTGTTT-CTC-TCC--AATA-G--T-GAGTC--CAT--G--AC---AA-T-
gi|17 : -T-GCT--TT--C------A-CTA--T--------A-AA---AAGC-AATATC------GA--T--ATAAA-TTTCTT------CC-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A-AT-A-T-AAgccgat
gi|17 : tactaatactgt-ATA-CACA--CTGCAT---CAAGGATTT--GAAG--CAAAACC-A--CACATGTTGAAGC-AATGTTG-A--TGGT-ATCCATGG-AGTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaatacacactgcatcaaggatttgaagcaaaaccacacatgttgaagcaatgttgatggtatccatggagtt
gi|18 : tactaatactgttgctttcactataaaaagcaatatcgatataaatttcttccttgaggtaactttcccctgtctgcaatataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaAATAAGTCG-T-AAGTAACAAACC-ATTCAATA-CAATGTACAGTTGTAAGTA-ATTCT-TTAA-TA-TAT--TA-TCGCACACAACCATTGATTTATTATAAATATTGACTGAAATCGAATACAAAT-ATTGACTG-GA-AT--ATCAA--------CAGAATCAGAAAATGAAA--TCCAT----AC-------CATTTCACATT-TA--TGAA-C--GAGATAAATGTA---A-T--ACAA-ACAAT-----A-AT-CTGTACAG---AAAACAATTAACTTTGATTTTTCTATGTCG--TTAAA-----G------G----GTTTAC------TTTCTTCTCCTAACTATTGACAGAAAT-A---ATTCTAG-TTTCTATG-GCTATCTGTATTTTGTGACATGGTTCTTGTCT--AA
gi|19 : AGAACTA-AACCTAACATGTGAATTATTA-TCCTA-TCAATGGCGTATCTCTTTTTGT-ATGACACAAACAAATTATGTGCTTTT-AGTGAG-ATGAAA--GTCGACAATAGAG----CAC---TTACCAG--CCAATAATG-AAAT--C-TAA-CAT---GACAGGT-TGAGA-TTAATCG-ATCTATTGCGTT-TAAACG-CT-TC-ATGTTACAAAGGAAATT-TGAA----AC---CTCTG-----GA----A-C-T-GTA--C-ATAT----GGT-ACT--TT-----------CAA--T--------A-AAGA-AAGC-AATATC------TA--T--ATCTA-TCTCTG------AC-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A-TT-A-C-AAAG-AGTGG-ATC--A-GAGAGG-G--------------------CCGGGATT------AGAATCTC---------
gi|2 : TTAATCAAGTC-CATTGTG-CAAT--AACAA-CATT-TGG-ATGC-TGAGA-ATAAGTGCATCTATTGCATT-TAAATATCA-TC-ATGTTTACAAGCAAATC-TGACTTGACCAAGCT----C-G-AC----ATC-T-CTAC-A-ACTT----G-TCGCA--TT-----------CAACTT--------A-AATTTAAAC-ATTATCAACCCATAAAT-TAGCTA-CTTCTATTTTGCAC-TTGAGGCCAAACTGTCCTCCTGTTTA--TGACAA-TT-G-CTAAAG-TATGG-ATTTAG-GAGAGGTG--------------------CCGGGATCTGATTGACAATATC---------TCTGAGAATGG--GGCTA--TTGTAACAGGAAAGG--------------GCAACCCCCA-TTTTGTAAATTTTTTCT-AA--C--TTTCTTGA-T--ACAGAGAAATTCGTCCC-GCCCC-G-AC---TTTTC---CTACACACATAT--TTGTTCTGCCAG-----------AAT-AGAGAAATT-TGAA--GGTAACC-GGTAT-ATA-CACA--TTGCAT---CAAGGATTT--GAAA--CAAAACC-ACAC-CACGGTGAAGC-AGTGTTGGA--TGGT-ATCCGTGG-AGTTGAA-GAGCTCTCT-TTA-ATTCT-C-CAAAATAATATTTG--TCTTCATAAAAT-ATGAACAC-AGTTA-ATTCGTC---ACAAATA--A-T-TCCTT-AGAATTATTTTC-A-TGATTCTGTAACAGAGAAAATTGGGACAATGGTTCATAGAGTACACTACTTTTGCCTCGCTTGGTGTAAAAGAAA-T-CTCCA-TT-CCAA-GTCT-GAGTTT--TCCATTCGTGT-CTGT-TTGTTTTAC-AAAT-AGGAAT-CGAGGAAT-GAA-ACCCG----TCTT---CAATTAATTG----AGCTG-CAT--T--ACAAACTTACGTG--G-------T-GGGCC---------GTGCTC--G--T-CA-AACATC--TATCAA-CCCAAGG--CA--GAGCTGGTAA-TGG-ACA-GTGACGGGAAAGTGGAAATAAC-A-CAGC-----GATA---TCAGTCTTCTTTAA--T--CGTACAAGTGAAGGCTGT-AAACA--GGACC-GTGTAT-T-TTCCC---ACCTTTTTTTC-CCCCCCCCCAAAAAGTT--TTTATTTGGGGATTC-A-T---T--CC-CCTG-AGTGA--T-T-G-ATGG-ATT--CCCTTCCGCC---A-G--CAAT-GAAC-TGA-AAT---AT-AT-ACTG-TATTGTTTGCTC-TCT--AATACG--T-GAG
gi|20 : gC-ATCGAA--GTTGATAA-A-AG----CAC-TTCTATCAA--CTTATCATC-GAAT--A-TAA-CATATTGGCGAGT-TGAGA-ATAACTG-ATCTATTACATT-TAAATG-CA-TC-ATGTTTAAAAGGAAATC-TGAT----CT--------------A----A-C-A-ATC--ACACCC----G-C-ACT--T--CC------CATGA--TTTCATTAAA-AA---AGGC-AATATC------AA--T--GTCAA-TTTCTG------AC-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A-TT-A-C-AAAG-TGTGG-ATC--T-GAGAGG-G--------------------TTGGGATC------AGAATTTC---------CCTCAGAGTGG--GACTT--T-GTAAGAGGAA-GG---------------CAACGCCCA-TTTTGTAAAATGTTTCT-AA--C--TTT--TGA-T--ACA
gi|21 : -TTATTG-ACCTA-TCAATGGTGAATCTCTTTTTGT-TTGATACCAAAAGACTTTGTGTT----AATGAC-ATGGAC--GTAGATACTA-AAACAATACTAGTAATCAA--CTTATCATG-GAAT--A-TAA-CATTATGACAGGT-TGAGA-GTAACTG-ATCCATTACATT-TAAATG-AA-TC-ATGTTTGATAGGAAATC-TGAT----GC---AATTGTC-C-CA----C-T-T-ATATTA-CTGC------T-GCT--TTCGC------C---A--T--------A-AA---AAGC-AATATC-------A--A-TATCTA-TTTCTG------AC-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A-CT-A-C-AAAG-TATGG-ATT--G-GAGAGG-A--------------------CCGGGGTC------AGAATCTC---------
gi|22 : CAATGAGTTA-T-AAATAACAAACC-ATTCATTA-C----T----TTGTAAGTA-AGTCT-TTA--TA-TAT--TA-TTGTGT----CC----------------TATCG-------TTGAGAACAAAT-ATTGACTG-AA-AT--ATTTA--------CAGAG------------G--TCCAT----AC---A--ATATT--ACATT-TAC--AAA-T--GA---AAAT-TA---T-T--A--A-ACAAC-----A-TT-CTGCACAG---AAAACG-------TCGATTGTTATATGTCA-AC--AACCC-TA------ACCTTATTTATGGGT-ATTT--TCTTCTAACTATTGACA-AAATTA---ATTCTAG-TTTCTGTG-GCTGTCTGTATTTTGTGATATGGTCTCTGTCT--AAGTG-AC--T--CTTGAT-AA-GACTG-TAACGC
gi|23 : AAATTATATATTC-AG-CTTCTGTG-GCTGTCTGTATTTTTTGA-ATG-TGCTTGTTTTTAAGTGAACAAT--TTGATTTAA-GACTGTTAACGCCCTGT-GTAG-TCCCCCAC-CA-TATGTTGACA-AATCCC-AGTA---TCTGCCA-GACAGGT-CTCT-ATGGCGT---AAAGGTGCGTATCT-CCCAT-CATC---ATAGA---GCAAGT--AGGGTGTGTAGGGT-TG---TC-----AGT-G-CCTG--AGATAA-----ATG---TGACCTG-TACCTAGTC-GTTAGAGT--G--GATTTTA-GGGTAC-AGATA-ACA
gi|24 : gaGAATGTGATCCATCC-TGTAACGA-TTC-T-TTAACGTTAG-TTGATCGAC-TCAATA-TAAGTTTCT-ATT-AA--------------AT--T----ACAGT--GTTCTG--AT-AAT-TC--GTGAGA--AG-TTG----TATAAAA-------------TGTAA--------------TCTTACAAAATGTACTCTACCTGAGAATTT--CCAAGTTCTATTTATAGACAATCGGGAAATAA-CCAGTT-TAACT-CCG-----TACTTTTCTTATTGCA---TGTACTCTGTTG-AC-CTTAA-TATGGAATACCAGTC-TTTA-TTTGATTCG-TTAATCGA
gi|25 : GGGAAATGTGATCCATCC-TGTAACAA-TTA-T-TTAACGTTCA-TTTACCGAA-ACAATA-CAAATGTTT-ATT-AATACGAA-AGAATACATTAC----AC--C--GTTCTGAA---AAC-CC--GTGAAA--AG-TTG----TATAAAA-------------TG-AAT-----------------------TCCACTGCACCTGAGAATTT--AAAACATCTATTTATAGACAATCGG-AAATAC-CCGGTT-AAGCC-C--C--ACTACTCTTCTT-TTGAAAATTG-A-TTTGTTG-ACTCTTAAGTCT-GAATA----T--TTTA-TTCCGTT-G-TT-gacaattgt
gi|26 : -TTATTG-ACCTA-ACAATGGTGTATCTTCTTTTCT-TTGACACAGACAAACACTGTGTTTTC-AACGAC-ATGGAA--GTGAATA-CA-AG----CTT-ATTTATCAA--CGCTTCATG-AAAT--A-CAA-CATTATGACAGGT-TGAGA-ATAACTG-ATCTGTTACATT-AAATTG-CA-TC-ATGTTTAAAAGGAAATC-TGAT----TC---CTGTG-TGG-AA----A-A-T-CTAT-C-ACGT----C-T-GAT--TT--C------C-CGA--T--------A-AA---ATGC-AATATC------TA----TATCTA-a
gi|27 : --AG-GTAAGTGTAG-TTGT-GACAT--GGACC-GTGCAG-G-TTCTC---ACC-----TTC-ATT----------GGCT-----------GGAT-T-A-A---C--CCCATTC-CATA---T-TTG-ATGG-TTT--CTCATCCG-T---A-G--TAGT-GAACTTGA-AAT---GT-AT-ACAG-TATTGTTT-TTC-CCC--GTTA-G--T-GAGGA--CAT--G--AC---AACC-CC--C-ATCATT-TGA-CGAT------------------GT---GAG--T-AGT-A--GTA-TTCTGGCGAA----TCC-CGGTG--GG-AGT-TCACCC-CGTA-TCCAT-AT--GA--GAAAGTGTA
gi|28 : CCTAGACTTAG----TA-AGCAATAGACTGAC-C-ACCT--ACCG-C-CTTCCACTGTA-TCTCT-G--CTGT--CTAC--T-CT-GTT--GAGATAC---------AATTATTTGGGGCTTGTGAG-AGTCCTCTGTCTTCA-CTCTTTC-TGTGACAGTTTTAGCGCT-GT---TTGATATCTACCGG-TATTCATAC-ATGTAT-AATTGCCTAAATACCAACCCATCAT
gi|29 : taccTTCAATA-C----T----TTGTAAGTA-AGTCT-TTAA-TAATAT--------------AC-----------------TACCG-------TTGATTACAAAT-ATTGACTG-AA-A-T-ATCAACAGAAT--CAGAA------------G--TCCAT----AC---ATTACATTG-ATACTATAG-TAAA-T--GA---AA--ACA---TGT--A--A-ACGGT-----A-TT-CTGTACAG---GAAATC-------TTGATTGGCCTGTGT--------------------------ATTAATTGGTAATATCTTCTCCTAACTATTGACAgattgcgaaa
gi|3 : gAG--AT-GAA-ATGCCAGTGTAGTACCCAAT-AATTG----A-TTGGTAGGAC--ACGA--C--CGCG--A-------TTAGCCA---------TTGCGCCTGAG--CA-AACATC--TATCAAACCCAGGGGAAA--TAGGTGGTAA-TGG-GCAAGTGACGGGAAGATGAAACCA-A-GGCGCCTCGTGGTTACATTCAGT-TTCTAT-AGAT--TA-ATAA-TGTA--TTGTCGACAAAGGGATCTGTGCCC-G-TTCTC---ACC-----TTC-ACT----------TAAT--T--------GGAT-CCA-A---TGTCC-A-TC-AGTGAGAT-TTG-ATGG-TTTGTCTCATCCG-GCAGA-GGTTAAT-GAACTTGT-AATCTTGTAATTGCAG-TAATGTTG-CTCCTCCGCAATA-G--TCAAGGATCCAT--G--ACCCAAG-T-TG--GCGTATTT-TGACCGGTATAGGAAAGCTGGATCGTGT---GAG--TAGGTAT--GGA-ATC-GGCGA-----TCC-GGG-GCGGG-AGTATCAGACAGGTC-TCCATA-T-AGAAATAAGGT--ATG--CTGG-GTGAATGA--T-----AAA------TGTG-GGCTG-AGACAGCT--CACA-G-ATCAC-G-C-T-TAT--AT--CAAC-GGAACCAA--C-CAACGCACTATATG---A--AAT-CAT--GTAGT------CAGAA-TGAT-TTG--GAACCTTGTGA-AATC-CCTCCCTTAGAAACT-A-CCACTCAGCAC-A-T-AC-TT-CTCACCCATAT-ACT-C-GAAGGTTTCTGTGCGTATCATC-T-CC-C-CCGTGTGTCCCCCAG----A--CCTTCTGTAAGGTCACTTCTGTCAGG-TGTCCCGGATATCTCACTGACACACAAAA---CACCCACAGA--AGGGC-TCTGACACTC-GGTAATGTGATTCATCCATGCAAACA-TTC-GTTTAGCGGTGG-------GAC-AC-ATAGCAAAACTCT-G---AAGACTAC-ACTATATA-TATAGAAACAGCAGGTTCTTGAAT-AATATCTAGTGAAGGTAATTTGTGGATACAAGAA-GTCAGTGAAAATGTGATTACTCATGTTAAATCTTACAAAATCCACTCTACCTGG----TT--TAAAATT
gi|30 : acT-GAACTTGA-AAT---ATA-T-ACAG-CATTGTTT-CAC-TCC--AATA-G--T-GAAGA--CAT--G--AC---AA-T-TT--C-TTCATT-TGA-CGGT------------------GT---GAG--T-AGC-T--GTA-ATCTGGCGAA----CCC-CGG-G--GG-CGTATCAGA--GATC-TCCAT-AT-AGA--TAAGgtgatcgtgataac
gi|31 : T----G-AATC-CCTCCCTAGA--ACT-A-CCACTCAGCAC-A-TATC-TCTTTCCATTATATATCT-GTGAAGGTTTC----CGTATCATC-T-CCTC-C---GTGTCTTCTAG----ATCCCTTCTG-AATGTCACTTCTGTT-GG-TGTCCC---TATCTCAC-cgt
gi|32 : AAGTGTAA-TTGT-GACAA--GGACC-GTGCA--TGTTCTC---ATT-----TTC-GTC----------GGA---T--------GGAT-T-A-AT--T--CC-TTTC-A--AA--TCTTG-ATGT-AAT--CTCAACAG-G---A-G--CATT-GTACTTGA-AAT---GT-AT-ACAG-CATTGTTT-CTC-TC
gi|33 : ACGTGAA--TGGAAACA-T-AGCG-C-----GATA---TCAAA-TTC-ATGAGAT--TT-AAAAGTGTAG-TTGT-GACAT--GGACC-GTGTA--GGTTCTC---ACC-----TTCAGC------------ACC--T--------GGTT-C-A--------CC-ACTC-CATAA----TTG-ATGG-TTT--CTCAT
gi|34 : ACCT----G-AATC-CCTCCCTATG--ACT-A-CCACTCTTCAT-A-T-GGATCATCCCTTTCGATAACG-ATAAACCTTTC----TGTATTAGCAC-CC-C-C---GTGTCCCAAAG----ATCCCTTCTG-AAGTTCACTTCTGTC-GG-T
gi|36 : ACATGCTGACA-GATCCCCAGTA---TCTGCCACAAGAGGT-CTCTAA--GGAGT--AACGGTACATGTTT-GTCAT-CATC---ATATA---TC-AGC--AGGGTGTGTAGGTC-TG---TC-----AGT
gi|37 : AGTGAAG-TTGT-GACAA--GGACC-GTGCAG-GTTTC-C---ACC-----TTC-ATT----------GACT-----------GAATTC-A-C---T--CC-ATTC-AATAA--T-T-G-ATGG-ACT--GTCATTCG-T---A-G--TAAT-GAACTTGA-AAT---GTAgact
gi|38 : TTTATAGACAATCGGAAA-TAC-CCAGTT-AACCT-CCGC----TACTTTTCTT-TTGCA---TGTACTCTGTTG-AC-CTTAA-TATGGAATACCAGTACTTTA-TTTGATTCG-TT-ATCt
gi|39 : ATAAATTA-T-AAGTAACAAATC-GTTCAAAA-CA---T----T-GTAATTA-AGTAT-TTAA-TA-TAT--TA-TTGCGC----CC----------------TACTG-------TTGAGTACAAAT-ATTGACTG-AA-A-T-ATCAA--------CAGAA------------a
gi|4 : AAGTCC-GAGTTTAATTCAT------------TTGTC------------------------------ATCCT----TCGT---CAAT-AATTG----A-TTG-TAG--T--ACAA---TACACG--A-------T-GGCCA----------TGCGC--GAGT-CA-AACATC--TCTCAA-CCCAGGG--AA--GGGCTGGTAA-TGG-GCA-GTGACGGGAA--TGGAAACA-C-AACG-C-----TACA---TCAGT-TTCTATG-GAT--AG-ATGAGTGTAG-TTGT-GACAT--GGACC-GTGCAG-G-TTCTC---ACC-----TTC-AAT----------GGCT--A--------GGAT-A-C-A---C--TC-ACTG-AGTAA--T-TAG-ATTG-TGT---TCATCCG-T---ATA--CATT-CAACT-GA-ATA---GTA-T-ACAA-TAGTCTTT-CTTATCCTAGATA-AGCT-GAGTC--CATAAG--AC---AA-T-TCTCG-TTGATT-TGAC-AGT------------------GTATAGAGATTA--T-T--GTA-ATCGGTCGAAAGAATCCGCGT-G--AGCAGTATCAGAC-GGTCGTCC-TAATCAGA--TAAGTAGTATGT-CTGGTGTG--TTAATTG---GATAAAACCCCGTTTGACTA-TGACATCTATCACACT-ATCAT-CACTTCTATAGATATCATATGG---TAG--AACATCGC-----ATACTCATTAACTCAT--GC--TTAGGATCAG-ACTGAT-TTTTAAAACATTCA-G-AATCGCCTCCCTAGT--ACT-A-CCACTCAGCAT-C-CGTC-TCAGTCCTCTATATAACT-TTGAAGGTTTC----CGTATCATC-T-CCAC-C---GTGTCTCTCAG----ATCCCTTCTG-AAGGTCACTTCTGTC-GG-TGTCCC---TATTTCAC-GACAC-----A---CACCCACATA-CAGGGCTTCTGATACACGGGGAATGTGATCCATCC-TGTAACGA-TTC-G-TTAACGTTAG-TTGATCGAC-ACAATA-CACATTTCT-ATT-AATACGAA----ACAAATCAT-----TAAC--GTTTTAA----AGC-TT--GTG-AA--ACCTTG----TATGAAAA-A----------TGTAA--------------TCAAACAAAGTCCACTCTACCTGAAAATTCA-CAAAA-TCTATTTATAAATAATCGG-AAATTC-CCAATT-ATGC--CCG---GCTACTTTTCTT-TCGCA---t
gi|40 : CTG--C----A-TT-A-C-AAAG-TATGG-ATT--G-GAGAGG-G--------------------CAGGGATC------AGAACCTC---------TCTGAGAGTGG--GACTA--T-GTAACAGGAA--G--------------ACAACCCCCA-TTTCGTAAAATGTTTCT-AA--C--
gi|41 : CTG------AC-TTGAGGT--ATTTTTCC-CCTGTCTG--C----A-TG-A-C-AAAG-TGTGG-ATC--A-GAGAGG-G--------------------CCGGTATC------AGAACCTC---------TCTAAGAGTGG--GACTG--T-GTAACAGGAA-
gi|42 : -TGAT-TT---AAACCT----A-AATC-CTTCCCTATG--GCT-A-CCACTCAGCATCA-A-TC-TAACTCCATAATATGAAT-GTGAAGCTTTC----CGTATCATC-TCCC-C-C---GTGTCCCaccaac
gi|43 : AAGTGTAG-TTGT-GACAA--GGACC-GTGCA--CGTTCTC---ATT-----TTC-GCT----------GGA---T--------GGAT-TAA-A---T--CC-ATTC---CAA--TGTTG-ATGT-AAT--CTCAACAG-G---A-G--CATT-GAACTac
gi|44 : aGATGAAAATTATATATTC-AG-CTTCTGTG-GCTG
gi|44 : AATATATAATT-TTCATC-CCGT-TCATTTC-ACTGACTTCTTCT-T--CCAACCTTAA-TTCTTccgttcatttcactgacttcttcttccaaccttaattcttc
gi|45 : cagccacagaagctgGGAATGTGATGCATCC-TGTAGCGA-TTC-G-TTAACGTTAc
gi|46 : TTTTCTT-TTGCA---TGCACTTTGTTGCCC-CTTCA-CATGGAATAC------TTTA-TTTGATTCG-TT-ATCctattacatttagctttacacattctattta
gi|47 : --GCTACTTTTCTT-CTGCA---TTT--TCTGTTGCAC----AA-AACAAAATACTAGTACTTTATTTTGATTacaa
gi|48 : CT--CACA-T-ATCAC-C---T-TATG-AT--CA---GG---GAG--C-CAACGC-----ATG---A--AATC
gi|49 : --CAAAACC-A--CACATGTTGGAGC-AATGTTG-A--TGAT-ATC
gi|5 : ACAATAAGT--ATGAAGTAACATACC-ATTTA-TAGTA---T----T----A--A-AGTCTATTAA--A-TATGATA-TTGCGC---ACC----------------TACTG-------TTGATTACAAAT-ATTGTCTGCAA-ACTGACTAAAACAGAATCAGAA------------GGTTCCATCTAAACCCTA--AC-TTG-ACATT-TATGTAAAAT--GG---AAAC-CAGCTT-TGCA--ATACAATTTACTA-TTTCTGTCCAGTGGAATACCCCACAT-TTGATCGTTCTATGGCATAATAAAATA-TA------AT---AAATATAAAT-ATATCTT-TCCTAACTTATGA--GAGATTA---ATTTT-G-CT-CTCTG-GTTGTCTGTATTTTTTGAT---GTTC--GT------GTGA--------TGTGT-AA-GACCGTTAACGCCCGGG-ACAGGTCTCCCACACATTGT-TTG--A-GATCCCACGT----TC-GCCAGGACAGGTCCTCT-A--TCTTC--AAAATCACGAATCTCCCCATACATCCCAATAGAAATGCAAGTGAAGGGTTTGTGTAAT-CGCGTTCTCCTAGGTCATCCTGCTAGAAATC----TTGAATTGATCTGTTACCTAGTCTGCT---GTCGA-CAA---TA-GGA-ACGGGATACACACATGTGCACAGGTAGCGCAACCAGGGCTCACCAG---TCATAT---------TATCTCTGTATCATTTCAACTGAACTTTTGTGTGGCCAA--TTAACTTCTTTCATCTATAGCAGTAAACTCTTTATAC-AATATGGTCAACATTCTTG-CCAACC-TTCCTATACTTAGGTTCTA-A--A-TAGACTGAC-CCACCT--ACCG-C-T---CACTGTACTCTCT-GCTCTGT--C-AC---ACT-ACT--AGGATACCCCATTCGAGAA-GT--GTGGC-TGTGAGAAGGCCTCTG-C-TCACTTCTATCTTGTGACATTTTTAACGCTAGTTTATTGATAATTCTC---TAAACGCA--G-GTATCAGTTACCTGAGTA
gi|50 : TC-CCGT-TCATTTT-ACTGACTTCTTGT-T--CCAAatga
gi|6 : AA--TGGAAACA-C-AGCG-C-----TACA---TCAGT-TTCTAT-AGAT--AG-ATAAGTGTAG-TTGT-GACAT--GGATC-GTGCAG-G-TTCTC---ACC-----TTC-ACT----------AA-T--T--------GGAT-C-A-A---TT-CC-ACTC-AGTGA--T-T-G-ATGG-TGTT-CTCATCCG-G---A-G--TAATTGAACTTGATAAT---GTAAT--CAGGTAT-GTTT-CTC-TCC--AATA-G--T-GAGTC--CATT-G--AC---AA-T-TT--G-GCGATTGTGAACGA-------------------GT---GAG--TA-GT-TTTGTACATCTGGCGAA----TCC-----G--GG-AGTATCAGAG-GGTC-TCCATA-T-AGA--TAAG-TGTATGTGCTGG-GTGAATGTATTA---GAAA------TGTG-G-CTGCAGACATCT--CACA-TGATCAC-C--TT-TATG-AT--CA---GG---TAAACC-CAACGC-----ATG---A--AATC-ATTAGT--T------CAG-A-TGATGTT---GAACC-----G-AATC-CGTCCC-AGA--ACTTA-CCACTCAGCAT-ACT-TC-TCACTCCATTATA---CT-CTGAAGGTTTC----TGTATCATC-T-CC-C-CC--GTGTCCCCCAG----ATCCCTTCTG-AAGGTCACTTCTGTC-GG-TGTCCC---TATCTCAC-GACAC-----A---CACCCACATA-CAGGGCTTCTGACACTCGGTGAATGTGATCCATCC-TGCAACGA-TTC-G-TTAGCGTT--------CGAC-ACAATA-CAAA--------------CGAG-ACTACACATTA-----ACAGC--GTTCTGA--T-AAT-TC--GTGAAA--A-TTTG----TATACAA-------------TGTAAT--------------CTTACAAAATCCACTCTACCTG
gi|7 : TATCTCTTTTTCG-TTGACACGAACATACACTGTGCTTTC-AATGAC-ATGGAA--GTGAATA-TA-AG----CGC-ATTAATCAA--CGCATCATG-AAAT--A-CAA-CATTATGACAAGT-GGAGA-ATAACTG-ATCTATGACATT-TAATTG-CA-TC-ATGTTTAAAAGGAAATC-TGAT----TC---CTTTT-T-GTAA----A-T-T-ATA--A--------------CT--TTTCTGCTTTAC-TGA--T--------A-AA---AAGC-AATATC------TA--T--ATCTA-TTTCTG------AC-TTGAGGT--AACTTTCC-ATTGTCTG--C----A-TT-A-C-ACAG-TATGG-ATT--T-GAGAGA-G--------------------CCGGGGTA------AGAATCTC---------TTTGAGAGTGG--GGCTA--T-GTAACAGAAA-AGCAACNNNNNNGAAAGCAACGCCCA-TGTTGTGAAATGTTTCT-AA--C--TTT--TGA-T--ACAGGAACGTCTGTTGC-GCCCC-G-ACAACTTTTC---CTGCAAACATAT---TGTTCT-CCGG-----------AAT-AAAGAAATT-TGGAAGG-TAACC-GGTAT-ATA-CACA--CTGAAT---CAAGGATTT--GAAA--CAAAACC-A--CACATGTTGGAGC-AATGTTG-A--TGGT-ATCCATGG-GGTAGAA-GAGCATTCT-TGA-ATTCT-C-CAAAATAATA-TTG--TTTTttaaaat
gi|8 : AAA-TTCTCCA-CT-C-AAAGTCT-GAGTTT-----------GT-CTGT-TTGTTT-GA-GA-T-AGGAA--CGAG--AT-GAA-ATCCT----TCAT---CAAT-AATTG----A-ATG-CA-G-T--AC-A--GTAGGTG--A-------T-GGCC----------ATGCGC--GAAT-CA-AACATC--TATC-AACCCAGGG--AA--GGGCTGGT-AATGG-CCA-ATGACGGGAA--CGGAAACA-C-AG-GGC-----GATA---TCAGC-TTCTATGGAAT---T-ATAAGTGTAG-TTGT-GACAT--GGACC-GTGCA--TATTCTC---ACC-----TTC-TCT----------GGC---T--------GGAT-C-A-AT--T--CC-ATTC-AATGA----CTG-ATGA-AAT--ATCATCCG-G---A-G--TAAT-GAACTTGA-AAT---GT-AT-ACAG-TATTGTTT-CTC-TCC--AATA-G--T-GAGGA--CAT--G--AC---AA-TATC----CTCATT-GGA-CGGT------------------GT---GAG--T-AGT-T--GTA-ATCTGGCGAA----TC
gi|8 : C-----ATG---T--AATCCAT--GT---------CAG-A-TGAT-TG---AAACCT----A-AATC-CCTCCCTATA--ACT-A-CCACTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacatgtaatccatgtcagatgattgaaacctaaatccctccctataactaccact
gi|9 : aaattctccactcaaagtctgagtttgtctgtttgtttgagataggaacgagatgaaatccttcatcaataattgaatgcagtacagtaggtgatggccatgcgcgaatcaaacatctatcaacccagggaagggctggtaatggccaatgacgggaacggaaacacagggcgatatcagcttctatggaattataagtgtagttgtgacatggaccgtgcatattctcaccttctctggctggatcaattccattcaatgactgatgaaatatcatccggagtaatgaacttgaaatgtatacagtattgtttctctccaatagtgaggacatgacaatatcctcattggacggtgtgagtagttgtaatctggcgaatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaaGAACTA-CACCTATCATGTGAACTATTG-ACCTA-TCAATGGCATATCTCTTTTTCT-TGGACACAAACAAACACTGTGATTTC-AATGAC-ATGGAA--GTGAAT-ATA-AG----TAC-ATTTATCAA--CGCATCATG-AAAT--A-CAA-CATAATGACTGGT-TGAGA-ATAACTG---------------AAATG-CA-TC-ATGTTTGAAAGGAAATC-TGGT----CC---CATTG-T-G-TA----A-C-T--TAT-A-ACAC------T-GCTGCTTTCC------A-C-A--T--------T-AT---AAGA-AATATC------TA--T-C-TCTA-TCTCTG------AC-TTGAGGT--AACTTTCA-CCTGTCTG--C----A-TT-A-C-AAAG-TATGG-ATT--A-GAAAGG-GTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTC------GGGATTTCAGAATCTCATCTGAGAGTGGGAGACTAGCT-GTAACA-GAA-GGCC------------CCAATG-CCA---CTGGAAAATGTGTCT-AT--CCTTTT--TGATT--ACAGAGACAT-TGTTGC-ACCCC-A-ACAA-TTTTTCCACTGCAAACATAG-TTTGTTA--CCGGGAACGATCTCAAAT-AAAGACATTGCGAAAGGGTAACC-GGTAT-ATA-CACATTCCCCAT---CAAGGATTTTAAAAA--CAATACC-A-
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|35 ): TTATCCTATGATAAGCTGAATATGAAAGGAATGCTTGTTGATTTAATAGTGTCTTCATGGGAATGTACTGTTATCCATCAATCCACTAAATAGAACAGCTGATAACCCTAAC
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 222 333333333 11111 5555555555555555555555 2222222 222 44444444 333333333333333 1111 333333 22 111 1111 111 3333333333333333 22222 11 5555555555555555555 888888888888888888888888 11111 222 11 11 222222222 1 1 1 1 2222 1 22222222222 111 1111 11 111 22222 222 11 333333 111 1 3333333333333333333 1 1 1 1 1 11 11 333333 1111 111111111 11 1 1 22 11 33333 1 222222222222 1 1 11 1 22222 1 1 11 11 5555555555555555555555555555 1 11 1 11 1 1 1 111 1 2222 1 1 1 2 1 1 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 111 22222 111111 22222222222222222222 111111111 444444444444444 1 111 222 44444444444 111 11 2222 11 1 1 1 1 1 1 11 1 1 1 3333 222222 111 11 1 1 1 2 1 1 1 11 111 22222222222 11 1111 111 222222 22222222222222 1111111111 33333333333 11 11 1 11 1 11111 11111111 3333 33333333333333333333333333333 222222222222 1111 11 11 111111 1 333333333333333333 11111 1111 22 11 333333333333333 22222 22 222 1111111111 11111 222222 2222222222 1 111 111111 222 1111 1 111 1111 111 222222222 11111111 11111 11111 11111 22222 11111 1111 777777777777777777777777777777777 11 1 11 2222 111 111 11111111111 444444
lowQualScore : 333 8 8 7 6 666666666 7 2 6 6 6 6 00000 9999999999999999999999 8888888 1 6 6 6 333 33333333 888888888888888 7777 333333 0 11 8 777 8888 444 0 0000000000000000 00000 8 8 11 0000000000000000000 777777777777777777777777 11111 1 0 1 3 333 7 6 6 0 22 6 3 11 888888888 22 0 0 9 3 3 6 7 9 2 3 0 8 0000 3 8 0 99999999999 11 0 8 8 444 9999 66 11 77 8 444 00000 777 33 666666 777 5 3 7777777777777777777 0 0 0 0 1 7 3 88 0 88 888888 2222 999999999 8 8 8 8 11 77 0 7 2 55 33 1 77777 6 3 1 3 333333333333 0 5 33 0 88888 0 0 33 33 3 4444444444444444444444444444 0 33 2 9 3 0 3 22 3 0 0 3 0 777 1 2 0 3 0000 0 88 2 3 2 3 6 3 6 6 0 5 0 0 5 4 66 0 0 4 9999 4 55 2 4 55 4 4 22 4 4 4 3 3 3 3 0 3 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 3 000 3 999999 66666 3 222222 3 44 3 77 6666 6 3 3 3 3 7777 3 77777777777777777777 999999 333333333 99 777 4 4 555555555555555 1 8 4 66 66 66 5 77 8 8 999 0 6 444 888 88 66666666666 8 8 0 5 8 6 6 99 0 111 99 33 4444 6 6 99 6 11 3 0 0 0 0 0 9 33 3 3 3 7 0000 555555 6 1 777 8888 0 7 88 6 5 1 1 0 3 6 0 3 0 0 6 6 88 222 6 6 11111111111 55 5 77 5 5 2222 3 000 5 111111 5 22222222222222 9999999999 5 55555555555 55 5 5 77 1 5 5 33 77 5 9 5 5 11 4 4 7 00000 777 777 5 66666666 3 2 2 777 2 4444 555 77777 77777777777777777777777777777 111111111111 2 0 333 4444 6 2 444 66 66666 3 44 3 2 3 555 44 55 3 3 6 00 3 55 3 666 99 55 777 4 4 444444 1 5 8 666666666666666666 888 77777 5 66 5 0 0000 66 5 77 5 0 00 5 77 5 77 2 88 8 6 0 666666666666666 8 3 8 99 888 99999 6 00 99 777 4444444444 44444 222222 99 9999999999 3 5 5 555 999999 4 9999 4 4 5 111 5 33 1 2 66 0000 5 5 0 5 333 2222 5 5 5 111 6 555555555 8 0 1 5 5 888 22222222 6 6 55 33333 7 99999 1 1 88888 99 55555 6 99 55555 4444 555555555555555555555555555555555 3 99 77 0 3 0 8 8 11 4444 5 000 666 66666666666 1 333333 6 8 8
lowQualScore : ... . . . . ......... . . . . . . ..... ...................... ....... . . . . ... ........ ............... .... ...... . .. . ... .... ... . ................ ..... . . .. ................... ........................ ..... . . . . ... . . . . .. . . .. ......... .. . . . . . . . . . . . . .... . . . ........... .. . . . ... .... .. .. .. . ... ..... ... .. ...... ... . . ................... . . . . . . . .. . .. ...... .... ......... . . . . .. .. . . . .. .. . ..... . . . . ............ . . .. . ..... . . .. .. . ............................ . .. . . . . . .. . . . . . ... . . . . .... . .. . . . . . . . . . . . . . . .. . . . .... . .. . . .. . . .. . . . . . . . . . .................................................................................. . ... . ...... ..... . ...... . .. . .. .... . . . . . .... . .................... ...... ......... .. ... . . ............... . . . .. .. .. . .. . . ... . . ... ... .. ........... . . . . . . . .. . ... .. .. .... . . .. . .. . . . . . . . .. . . . . .... ...... . . ... .... . . .. . . . . . . . . . . . . . .. ... . . ........... .. . .. . . .... . ... . ...... . .............. .......... . ........... .. . . .. . . . .. .. . . . . .. . . . ..... ... ... . ........ . . . ... . .... ... ..... ............................. ............ . . ... .... . . ... .. ..... . .. . . . ... .. .. . . . .. . .. . ... .. .. ... . . ...... . . . .................. ... ..... . .. . . .... .. . .. . . .. . .. . .. . .. . . . ............... . . . .. ... ..... . .. .. ... .......... ..... ...... .. .......... . . . ... ...... . .... . . . ... . .. . . .. .... . . . . ... .... . . . ... . ......... . . . . . ... ........ . . .. ..... . ..... . . ..... .. ..... . .. ..... .... ................................. . .. .. . . . . . .. .... . ... ... ........... . ...... . . .
lowQualScore : 000 0 0 8 7 333333333 3 5 7 7 7 7 00000 7777777777777777777777 3333333 0 7 7 7 888 33333333 444444444444444 0000 888888 8 00 0 000 6666 000 8 2222222222222222 00000 0 0 00 0000000000000000000 000000000000000000000000 66666 4 8 0 2 333 3 7 7 6 00 4 2 00 000000000 55 0 0 2 7 3 7 3 8 5 2 0 8 8888 2 8 0 55555555555 22 8 0 0 000 0000 88 00 00 0 000 00000 000 22 222222 555 5 2 8888888888888888888 0 0 0 0 0 3 3 33 7 33 333333 7777 888888888 0 0 0 0 00 00 0 3 0 33 33 0 33333 7 3 2 2 888888888888 0 0 88 0 22222 0 0 22 88 2 2222222222222222222222222222 0 88 5 2 0 0 0 55 2 0 0 2 0 555 0 5 0 2 5555 0 22 5 2 0 3 7 3 7 7 7 0 8 4 0 4 11 1 0 4 4444 4 55 5 0 55 0 0 00 0 0 0 6 6 6 6 4 6 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 3 444 3 666666 00000 3 999999 3 66 3 33 5555 2 1 1 3 3 4444 3 11111111111111111111 666666 333333333 55 000 0 0 666666666666666 1 9 4 11 11 99 0 99 2 0 222 8 0 000 666 88 00000000000 0 0 8 0 0 7 7 22 7 777 22 66 9999 7 7 22 7 88 2 0 0 0 0 0 0 88 3 3 3 3 0000 777777 7 0 777 3333 7 3 33 0 5 0 0 7 3 7 0 2 0 0 5 7 55 333 7 7 33333333333 88 2 99 7 7 1111 0 000 7 777777 7 44444444444444 6666666666 7 11111111111 77 7 7 99 6 0 0 66 99 0 0 7 7 00 0 0 5 00000 000 555 7 77777777 6 9 9 777 9 1111 000 11111 22222222222222222222222222222 222222222222 9 4 666 0000 9 9 999 88 22222 1 22 9 9 1 444 33 00 3 3 7 00 6 00 6 555 55 55 000 0 0 444444 0 0 1 999999999999999999 888 22222 0 99 0 1 6666 44 7 99 7 1 77 7 00 7 99 5 88 0 4 8 888888888888888 0 8 0 22 333 77777 7 22 22 555 0000000000 33333 000000 22 2222222222 3 7 7 777 888888 4 6666 4 4 0 111 0 99 0 0 44 6666 0 0 0 0 888 1111 7 7 7 777 7 000000000 0 8 4 7 7 666 22222222 7 7 00 00000 2 33333 0 7 33333 22 88888 7 22 22222 2222 222222222222222222222222222222222 2 00 44 8 6 8 0 0 88 3333 7 000 777 22222222222 0 000000 7 0 0
consensus : NACAATAAGTTAAT-AAGTAACAAACC-ATTCAATA-CA---T----TTGTAAGTA-AGTCT-TTAA-TA-TAT--TA-TTGCGC---ACC----------------TACCG-------TTGAGTACAAAT-ATTGACTG-AA-ATT-ATCAA--------CAGAA------------G--TCCAT----AC---A--ACATTG-ACATT-TAC-TAAA-C--GA---AAATACA---T-T--A--A-ACAAT-----A-TT-CTGTACAG--AAA------A-CG-TT------GATTGTTCTATGTCA-ACTAAACCC-TA------A----ATTTATGGGT-ATTTCTTCTCCTAACTATTGACAGAAATTA---ATTCTAG-CTTCTGTG-GCTGTCTGTATTTTTTGACATGGTTCCTGTCT--AAGTGAAC--T--TTGAAT-AA-GACTGTTAACGCCCCGT-GTAGGTCCCCCACACAACATGTTGACA-GATCCCCAGTA---TCTGCCAGGACAGGT-CTCT-A--GCNTC--AAAGNTACGTATCT-CCCAT-CATC---ATAGA---GCAAGT--AGGGTGTGTGTGAT-TG---TC-----AGTCG-CCTG-TAGATAT-----TTG---TGACCTGTTACCTAGTC-GCT---GT--A-CGA---CA-GGG-AC-AGATA-ACANATGTGCAC-GGT--CGCAA--AGGG------AGATATAATATAAAANT-TNTATC-CCGT-TCATTTC-ACTGACTTCTTGT-T--CCAACNTTAA-TTCTTTCAACTATAGC-GTAAACTCTTTATACGAANATAGT-AGCNCTCTTGCCCAACC-TTCCTAAACTTAG----TA-A-CA-TAGACTGAC-CCACCT--ACCG-C-T---CACTGTA-TCTCT-G-TCTGT--CTAC--TACT-ACT--ANGACAC---------GAT-AT--GGGGCTTGTGAG-AGTCCTCTG-CTTCA-TTCTATC-TGTGACAGTTTTAGCGCT-GT---TTGATATCTNCCGG-TAATCGTAC-G-GTAT-AATCGCCTAAATATAAACCCATCATATACATAACCTAGACTTTAGAACTA-AACCTA-CATGTGA-TTATTG-ACCTA-TCAATGGCGTATCTCTTTTTCT-TTGACACAAACAAACACTGTGCTTTC-AATGAC-ATGGAA--GTGGATAATA-AG----CAC-ATTTATCAA--CGCATCATG-AAAT--A-CAA-CATTATGACAGGT-TGAGA-ATAACTG-ATCTATTACATT-TAAATG-CA-TC-ATGTTTGAAAGGAAATC-TGAT----CC---CTNTG-C-G-AA----A-C-T-NTA--A-ACGC----G-T-GCT--TTTCC------C-CGA--T--------A-AA---AAG-CAATATC------TA--T-TATCTA-TTTCTG------AC-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A-TTA-C-AAAG-TAT-GGATT--G-GAGAGG-G--------------------CCGGGATC------AGAATCTC---------TCTGAGAGTGG--GACTA--T-GTAACAGGAA-GG--------------ACAACGCCCA-TTTTGTAAAATGTTTCT-AA--C--TTT--TGA-T--ACAGGGACATCTGTTGC-GCCCC-G-ACAA-TTTTC---CTGCAAACATAT-GTTGTTCT-CCGG-----------AAT-AAAGAAATT-TGGAAGGGTAACC-GGTAT-ATA-CACA--CCGCAT---CAAGGATTT--GAAA--CAAAACC-A-ACACATGTTGGAGC-AATGTTG-A--TGGT-ATCCATGG-AGTTGAA-GAGCTTTCT-TGA-ATTCT-C-CAAAATAATACTTG--TTTTCATAAAAT-ATGAACAC-AGTAA-ATTCGTC---ACAGAAA--ACT-TCCTTCAAAATNATTTTC-A-TGATTCCGTAACGGAGAAAACTGG--CAATGG-TCATAGAGTACACTANCTTTGNCCCGCTCG-TG-AAAAGAAA-TTCTCCA-CT-CCAAAGTCC-GAGTTTAATTCATT--TGT-CTGT-TTGTTT-GC-GA-T-AGGAA--CGAG--AT-GAA-ATCCT----TCGT---CAAT-AATTG----A-TTG-TAGG-T--ACGA--CTACGCG--A-------T-GGCCA---------ATGCGC--GAGT-CA-AACATC--TATCAAACCCAGGG--AA--GGGCTGGTAAATGG-GCA-GTGACGGGAA--TGGAAACA-C-AGCGGC-----GATA---TCAGT-TTCTATGAGAT--AG-ATAAGTGTAG-TTGT-GACAN--GGACC-GTGCAG-GGTTCTC---ACC-----TTC-GCT----------GGCT--T--------GGAT-C-A-A---T--CC-ACTC-AGTAA--T-TTG-ATGG-NNT--CTCATCCG-G---A-G--TAAT-GAACTTGA-AAT---GTAAT-ACAG-TATTGTTT-CTC-TCC--AATA-G--T-GAGGN--CAT--G--AC---AA-T-TC--G-GTNATT-TGACCGGT------------------GT---GAG--TAAGT-T--GTA-ATCTGGCGAA----TCC-CGG-G--GG-AGTATCAGAC-GGTC-TCCATAAT-AGA--TAAGGTGTATGT-CTGG-GTGGATGAATTG---GANA------CGTG-GACTG-AGACATCT--CACA-T-ATCAC-C-CTT-TATGGAT--CA---GG---TAG--C-CAACGC-----ATG---A--AATCCAT--GT--T------CAG-A-TGAT-TT---AAACCT----G-AATC-CCTCCCTANG--ACT-A-CCACTCAGCAT-A-T-TC-TCACTCCNCTATATAACT-CTGAAGGTTTC----CGTATCATC-T-CC-C-C---GTGTCCCCCAG----ATCCCTTCTG-AAGGTCACTTCTGTC-GG-TGTCCC---TATCTCAC-GACAC-----A---CACCCACATA-CAGGGCTTCTGACACACGGGGAATGTGATCCATCC-TGTAACGA-TTC-G-TTAACGTTAG-TTGATCGAC-ACAATA-CAAATTTCT-ATT-AATACGAG-ACTACACATTAT----ACAGC--GTTCTGAAAT-AAT-TC--GTGAAA--AGTTTG----TATAAAAA-G----------TGTAAT-------------TCTTACAAAATCCACTCTACCTGAGAATTT--CAAAGTTCTATTTATAGACAATCGGAAAATAC-CCGGTT-AAGCT-CCGC--GCTACTTTTCTT-TTGCA---TGTACTCTGTTG-AC-CTTAA-TATGGAATACCAGT--TTTA-TTTGATTCG-TT-ATCGA
Reference ( family-5170 ) : NACAATAAGTTAAT-AAGTAACAAACC-ATTCAATA-CA---T----TTGTAAGTA-AGTCT-TTAA-TA-TAT--TA-TTGCGC---ACC----------------TACCG-------TTGAGTACAAAT-ATTGACTG-AA-ATT-ATCAA--------CAGAA------------G--TCCAT----AC---A--ACATTG-ACATT-TAC-TAAA-C--GA---AAATACA---T-T--A--A-ACAAT-----A-TT-CTGTACAG--AAA------A-CGATT------GATTGTTCTATGTCA-ACTAAACCC-TA------A----ATTTATGGGT-ATTTCTTCTCCTAACTATTGACAGAAATTA---ATTCTAG-CTTCTGTG-GCTGTCTGTATTTTTTGACATGGTTCCTGTCT--AAGTGAAC--T--TTGAAT-AA-GACTGTTAACGCCCCGT-GTAGGTCCCCCACACAACATGTTGACA-GATCCCCAGTA---TCTGCCAGGACAGGT-CTCT-A--GCNTC--AAAGNTACGTATCT-CCCAT-CATC---ATAGA---GCAAGT--AGGGTGTGTGTGAT-TG---TC-----AGTCG-CCTG-TAGATAT-----TTG---TGACCTGTTACCTAGTC-GCT---GT--A-CGA---CA-GGG-AC-AGATA-ACANATGTGCAC-GGT--CGCAA--AGGG------AGATATAATATAAAANT-TNTATC-CCGT-TCATTTC-ACTGACTTCTTGT-T--CCAACNTTAA-TTCTTTCAACTATAGC-GTAAACTCTTTATACGAANATAGT-AGCNCTCTTGCCCAACC-TTCCTAAACTTAG----TA-A-CA-TAGACTGAC-CCACCT--ACCG-C-T---CACTGTA-TCTCT-G-TCTGT--CTAC--TACT-ACT--ANGACAC---------GAT-AT--GGGGCTTGTGAG-AGTCCTCTG-CTTCA-TTCTATC-TGTGACAGTTTTAGCGCT-GT---TTGATATCTNCCGG-TAATCGTAC-G-GTAT-AATCGCCTAAATATAAACCCATCATATACATAACCTAGACTTTAGAACTA-AACCTA-CATGTGA-TTATTG-ACCTA-TCAATGGCGTATCTCTTTTTCT-TTGACACAAACAAACACTGTGCTTTC-AATGAC-ATGGAA--GTGGATAATA-AG----CAC-ATTTATCAA--CGCATCATG-AAAT--A-CAA-CATTATGACAGGT-TGAGA-ATAACTG-ATCTATTACATT-TAAATG-CA-TC-ATGTTTGAAAGGAAATC-TGAT----CC---CTNTG-C-G-AA----A-C-T-NTA--A-ACGC----G-T-GCT--TTTCC------C-CGA--T--------A-AA---AAG-CAATATC------TA--T-TATCTA-TTTCTG------AC-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A-TTA-C-AAAG-TAT-GGATT--G-GAGAGG-G--------------------CCGGGATC------AGAATCTC---------TCTGAGAGTGG--GACTA--T-GTAACAGGAA-GG--------------ACAACGCCCA-TTTTGTAAAATGTTTCT-AA--C--TTT--TGA-T--ACAGGGACATCTGTTGC-GCCCC-G-ACAA-TTTTC---CTGCAAACATAT-GTTGTTCT-CCGG-----------AAT-AAAGAAATT-TGGAAGGGTAACC-GGTAT-ATA-CACA--CCGCAT---CAAGGATTT--GAAA--CAAAACC-A-ACACATGTTGGAGC-AATGTTG-A--TGGT-ATCCATGG-AGTTGAA-GAGCTTTCT-TGA-ATTCT-C-CAAAATAATACTTG--TTTTCATAAAAT-ATGAACAC-AGTAA-ATTCGTC---ACAGAAA--ACT-TCCTTCAAAATNATTTTC-A-TGATTCCGTAACGGAGAAAACTGG--CAATGGTTCATAGAGTACACTANCTTTGNCCCGCTCG-TG-AAAAGAAA-TTCTCCA-CT-CCAAAGTCC-GAGTTTAATTCATT--TGT-CTGT-TTGTTT-GC-GA-T-AGGAA--CGAG--AT-GAA-ATCCT----TCGT---CAAT-AATTG----A-TTG-TAGG-T--ACGA--CTACGCG--A-------T-GGCCA---------ATGCGC--GAGT-CA-AACATC--TATCAAACCCAGGG--AA--GGGCTGGTAAATGG-GCA-GTGACGGGAA--TGGAAACA-C-AGCGGC-----GATA---TCAGT-TTCTATGAGAT--AG-ATAAGTGTAG-TTGT-GACAN--GGACC-GTGCAG-GGTTCTC---ACC-----TTC-GCT----------GGCT--T--------GGAT-C-A-A---T--CC-ACTC-AGTAA--T-TTG-ATGG-NNT--CTCATCCG-G---A-G--TAAT-GAACTTGA-AAT---GTAAT-ACAG-TATTGTTT-CTC-TCC--AATA-G--T-GAGGN--CAT--G--AC---AA-T-TC--G-GTNATT-TGACCGGT------------------GT---GAG--TAAGT-T--GTA-ATCTGGCGAA----TCC-CGG-G--GG-AGTATCAGAC-GGTC-TCCATAAT-AGA--TAAGGTGTATGT-CTGG-GTGGATGAATTG---GANA------CGTG-GACTG-AGACATCT--CACA-T-ATCAC-C-CTT-TATGGAT--CA---GG---TAG--C-CAACGC-----ATG---A--AATCCAT--GT--T------CAG-A-TGAT-TT---AAACCT----G-AATC-CCTCCCTANG--ACT-A-CCACTCAGCAT-A-T-TC-TCACTCCNCTATATAACT-CTGAAGGTTTC----CGTATCATC-T-CC-C-C---GTGTCCCCCAG----ATCCCTTCTG-AAGGTCACTTCTGTC-GG-TGTCCC---TATCTCAC-GACAC-----A---CACCCACATA-CAGGGCTTCTGACACACGGGGAATGTGATCCATCC-TGTAACGA-TTC-G-TTAACGTTAG-TTGATCGAC-ACAATA-CAAATTTCT-ATT-AATACGAG-ACTACACATTAT----ACAGC--GTTCTGAAAT-AAT-TC--GTGAAA--AGTTTG----TATAAAAA-G----------TGTAAT-------------TCTTACAAAATCCACTCTACCTGAGAATTT--CAAAGTTCTATTTATAGACAATCGGAAAATAC-CCGGTT-AAGCT-CCGC--GCTACTTTTCTT-TTGCA---TGTACTCTGTTG-AC-CTTAA-TATGGAATACCAGT--TTTA-TTTGATTCG-TT-ATCGA
gi|1 : ACAATGGGTTAAT-AAGTAACAAACCTATTCATTA-C---------TTGTACGTATAGTCT-TTAACTA-TAT--TAATTGCGC----CC----------------TATCGC------TTGAGTACAAATTATTGACTG-AACATT-ATCTA--------CATAA------------G--TCCAT----ACG--A--ATATTGTACATT-TAC-TAAA-CCTGA---AAATACA---T-T--A--AGACAAT-----AGTC-CTGCACAG--AAA--------CGGTT------GATTGTTCTAT-TCA-ACTAAACCCATATCCGCTA----TTTTATGGAT-ATTCCCTCTTCTA-CTATTGACAGAAGTTA---ATTCTAGGCTTCTGTGTGCTGTCTGTATTTGTTCTCCTGGTTCCTGTCT--AAGTGAAC--TCTTTGAAT-AACGACTGGTAACGCCCCGTTGTAAGTCCCCCACACAACATGTTGACATGACCCCCAGTAATTTCTGCCAGGACAGGT-CTCT-A--ACTTCTAAAATCTACGTATCT-CCCAT-CATC---ATAGA----CATGT--AGGGTGTGTGTAAT-TG---TC-----AGTTG-CCTG-TAGATAT-----TTG---TGACTGG--ACCT---T-ACT---GT--A-TGA---CA-GGG-AC-AGATA-ACAGTTGTGCAC-GGT--CACAA--AGGG------AGATATAATATAAAAATATCTATC-CCGT-TCATTTC-ACTGACTTCTTGT-T--CCAACTTAAA-TTCTTTCAATTATATT-GTAAACTCTTTATTCGAACATAGT--GTCCTCTTGCCCAACC-TTCCTAAACTT-G----TA-A-CA-GAGACTGACTCCACCTGAGCCA-CGT---CACTGTA-TCTCTGG-TCTGTTCCTACGATACCGACCAAATAACAT---------GAT-AT--GGGGCTTGGGAG-AGTCCTCT--CTTCC-TTCTATC-TGTGACAGTTAAAGCGCT-GT---TTGATATCTTCCGGTTAATCGTAC-G-GTAT-ATCCGCCTAAA-ATAAA--CATCATATACATAACCTAGACTTTAGAACTAGAACCTA-CATGTGA-TTTTTGAACCTACTCAACGGTGTATTTATATTTCTATGGACACAAACAAATATCA-GCTTTCAAATTACAATGGAAAGGTGAATTATA-AG----TA--ATTTAACAA--CGCTTGATGAAAATAGA-CAACCATTATGACTGGTGTGAGATATAATTG-ATCTATTGCATTCTAAATG-CA-TCAATATTTTGAAAGTAACC-T-AT----CC---CTGTG-C-G-AG----A-C-TGCTA--A-ACGCA---A-T-GTT--TTTCC------C-TGA--T--------ATAA---ATG-CAATATC------TA--TCTATCTACTTTCTGA-----ACGTTGAGGT---ACTTTCC-CC--TCTGAAC----ACTTACC-AAAGAAAT-GGATT--GCGAGAAG-G--------------------GCGGAATC------AGAAT-TT---------TCTGAGAGTGGC-GACT---T-GT-ACAGGAA-GG--------------AGAATCCCCAGTTTCGTAAAATGTTTCT-AA--C--TCT--TGT-TTAACAGGGACATCTGTTGC-GCTCC-GTACAG-CTTTC---CTGCAAACTTATGGTTGTTCT-CCGG-----------AATAAAAGAAATT-TGGAAAGGTAACC-AGTAT-ATATCACA--CCGCAT---CAAGGATTT--GAAAC-CAAAACCAA-ATACATGTT-AAGC-AATGTTG-A--TGGT-A-CCATGG--GTTGAATGAGCTTTCTATGA-ATTCT-CACAAAATAATACTTGGTTTTTCATAAAATGATTAACACGAGTAATATTCATCTGGACAGGAA--ATTGTCCTTCAAAAAGATTTTCAA-TGATTCCGTAACAGAG-AAACTGG--CAATGG-TCATAGAGT-CACTAGCTTTGGCCCGCTCG-TGAAAAAGAAATTTCTCCATCTGCCAAAATCC-GAATTTAATTCATT--TGT-CTGT-TTGTGT-GCTAA-TCAGGAA--CAAG--AT-GAA-ATCTC----TCTT---CAAT-AATTG------TTG-TAGG-T--ACGG--CTACGCGGAA-------T-GGCCA---------ATGTGC--GAGT-CA-GAAATC--TCTCAAACCCAGGG--AAGGGGGCTGGTAAATGGTGCA-GTGACGGGAA--TGGAAACA-CTAGCGGC-----GACA---TCA-T-TTC-ACGAGAC--AG-ATAAGTGTAG-TTGT-GAAAG--GGACC-GTGCAGCGGTTCCTGCAACC-----TTC-TCT----------AGCCTGT--------GAAT-C-A-C---T---C-ACTC-AGTAGC-T-TTGAATGGTCTT--CTCATC---G---A-G--TAAT-GAACTTGA-AAT---GTAAT-GCAA-TACTGTTT-CTC-TCC--AATA-G--T-GGAGT--CGC--GCAAC---AA-T-TG--G-GTTATA-GGACCGGT------------------GT---GAG--GAAGT-T--GTA-ATCTGGCGAA----TCC-CGG-G--GG-AGTAGCAGA--GATC-TCCATAAT-AGA--TAAGGTGTATCT-CT-G-GTGGATGAAT------ATA------CGTG-GATGA-AGACATCT--CACA-T-ATCACAC-CTT-TATGGAG--CAG--GG---TAC--C-TAATGC-----ATGT--T--AATCCAT--GT--T------CAGTA-GAAT-TT---AAACCT----GAAATC-CCTCCCTACG--ACT-AGCCACTCAGC-T-AGT-TC-TGTATCCTCTATATAACTCCTGAAGGTTTC----CGTATCATC-T-CC-C-C---GTGTCCACGAG----ATCCCTTCTG-AAGGCAACTTCTGTC-GGTTGTCCC---TA-CTCAC-GACAC-----AAATCACCCACATAGCGGGGCTTCTGACACACGGGGAA-GTGATCCATCC-TGTAACGAGTTCAG-TTAA-ATTAGTTTGATCGACTCCAATA-CGAATTTCTAATTGAATACGAGCACTACACATTAC----ACAGC--ATTCTGAAATGAAT-TC--GTGAAA--AGTTTG----TTTAAAAATG----------TATAAT-------------TCTTACAAAATCTACACTACCTGAGAATTTTACAAAGTTCTATTTAT-GACAATCGGAAAATACTCCGGTTAAAGCTGCCGCTAGCTATTTCTCTG-TTGCA---TGCG-------------------ATGGAATAC--G----TTA-TTTGATTCGTTT-ATCAA
gi|10 : c-TAAATA-CAATC-ATGTTTGATAGGAAATCATGAT----GC---TTGTATC-A-AC----A-C-T-GT------------------CTA-TTTCA------G-TAA-----------A-AA---AAGCCAATATC------TA----TATCTA-TTTCTG------AC-TTGAGGT--AAACTTTC-CCTGTCTGC-C----ATTTA-C-AAAG-TATGGGATT--G-GAGAGG-G--------------------CCGGGATC------GAGATCTC---------TCTGGAAGTGG--GGC-A--T-GTAGCAGAAA-GC--------------AC----CCCAGTTTTGTACAATGTTTCT-AAATC--TTT--TGA-T--ACA-GTAGATGTGTTGTGGCCCCGG-ACAATTTTTC---CTGCAGAAATGT-G-TGTTCT-CCGGA----------AAT-AAA-AAATT-TGGGAGCTTAACCAAGTATGATA-CACA--CTGCATTCACAAGGATTT--GAAAGTCAAAACC---ACACGTGTTGGAGCAAATGTTG-ACGCGGTAATCCATGGTAATTG-A-GAGCTTTCT-TGAGATTCCGC-CAAAATAATA-TTG--TTTTCCTGAAAT-ATGAACAC-AGTAA-A-TCGT-----CAGAAATCACT-TCCTTCAAAATAATTTTC-ACTGA----GTAACGAAGAAAACTGG--CAATGGATCagctg
gi|11 : AA--TGGAAACA-C-AACG-C-----GATG---TCATA-TTC-AT----T--AG-ATAGACG-AG-T-----ATA---GAACT-TTGTGA-------C---A-------------T----------AGCA--T--------GGA----A-AACGT--CC-ACTA-AATAA--T-T-G-ATGG-ACT--CTCATTCG-G---A-A--TA--------------T---GTAGT--CGG-TATTGTTT-CTC-TCC--AATA-G--T-GAGTC--CGT--G--AC---AA-T-TT--G-GTTATA-TGA-CGGT------------------GT---GAG--TAGG--T--GTA-ATCTGGCGAA----TCT-CGG-G--GG-AGTGTCAGA--GGTC-TTCAT-AT-AGA--TAA-GTGTATGT-CTGT-GTGGATGAATTGATAGA-A------CGTG-GACTG-AGACATCT--CACA-T-CTCAC-C---T-TAT-GAT--CA---GT---TTG--C-CAAAAC-----ATG---A--AATCCAT--G---T------CAG-A-TGAT-TT---AA-------------------------------A-CCACTCAGCAT-ATT-TC-TCACTCCTCTATATAAGT-CTGAAGGTTTC----TGTATCATC-C-CC-TAC---GTGT----CAGAAATATCCCTTCTG-AAGGTCACTTCTGTC-GG-TGTCCC---TATCTCAC-GACAC-----A---CCCCCACATA-CAGGACTTCTGACGCACGTGGAATGtctcgtcaacaaatgcgtaata
gi|12 : TTTGTTCCGCTTG-TG-AAAAGAAA-TTCTCCC-TT-CTATAATCTTGAGTTC---TTATT--TGTGCTGTACTGTTTTGC-GA-T-AGAAAGAC-AG--ATTGAATATCCT----TCCT---CGAT-AATTGTGAAG-TCG-AGGA-TTGATGC--CAACGCG--AAGAGGAAT-GATCAGAATCGGCCATGTGTTGAAGTACATAAGATCGCTTTCAAATCAAGGGG-AA--GTGCTGGTAA-TGG-GCA-GTGACGGGAA--TGAAAACA-C-AGCG-C-----AATG---TCGAA-ATCTA---AATTCAG-AAAAGTGTAG-CTGT-GACAA--GGACC-GTGCAT-G-TTCTC---ATT-----TTC-GTT----------GGAT-----------GGAC-T-A-AG--T--CC-ATTCCAGT----T-TTG-ATGA-AAT--CTCAACAG-G---A-G--CATT-GAACTTGA-AAT---ATA-T-ACAG-CATTGTTT-CTC-TCC--AATA-G--T-GAGGA--CAT--G--AC---AA-T-TT--G-GCGAT
gi|13 : TACGTA-CT-CCCAT-CATC---GTAGA---GCA-GT--AGGGTTTGT-TGATCTG---CC-----AGTT---CTG-TAGATACATGTATTG---TGACTTGTTACCTAGTC---T---GT--AGTGA---CATAGG-AT-AGATA-GCATATG--CAC-GGT--CACAA--AGGG------AGATA-AACATAAAACT-GATATT-CCGT-TCATTCC-ACTCACTGCTTGT-T--CCAACATTAA-TTCTT-CAA-TACAG--GTAATCTTTTCACA-GAAAAGAGT-A--TCTCTTGCCCAAGCATTCCTAAACTTAG----TCTA-CA-TAGACTGAC-C-ACCC--ACCGTC-G---CACTTTA-TCTTT-G-TCTAT--CTAC-------ACT--ATGGCAT---------GAT-AT--GGG-------------TCTCTG-CTTCA-TTCTATC-TGTGACAG--TTAGGGCT-GT---GTGATATTTACCGG-T-ATCGTACAA-GTAT-AA-CG-CTAAATATAAATC
gi|14 : -TTATTG-ACCTA-TCATTATTGAATCTCTTTTTGT-TTGGCACAGACAATCTTTGTGCTTTT-AATGCC-ATGGAC--GTTGATAATA-A-----CAC-ATTTATCAA--CGCATCATG-AAAT--A-TAA-CATTATGGCAGGT-TGATA-ATAACTG-ATCTATGACATT-TAAATG-CA-TC-ATGTTTGAAAGGAAATC-TGAT----AC-------G-A-G-AATTGTA-C-T-TCT--A-ACACTG--A-T-GC---TTTCG------C-CAA-----------A-AC---AAG-CAATATC------TA----TATCTA-TTTCTG-------C-TT-AGGT--AATTTTCC----GTCTG--C----A-TTA-C-AAAG-TGT-GGATT--A-GAGA-G-G--------------------CCGGG-TC------AGAATCTC---------TCTGAGAGTGG--GACTG--C-GTAACAGGAA-AG---------------CAACGCCCA-TTTTGTCAAATGTTTCTGAG--C--TTT--TGA-T--ACAattgccaaaacacaaa
gi|15 : TTTTCT-TTGACACAGACAAACACTGAGTTTTT-AATGAC-ATGGAA--GTGAATA-TA-AG----CAC-ATTTATCAA--AGCATCATG-AAAT--A-TAA-CATTATGACAGGT-GGAGA-ATAACTG-ATCTATTACATT-TATACG-CA-TC-ATGTTTGAAAGGAAATC-TGAA----CT---CTTTA-T-G-AA----A-CAT-GTA------TCTTTTG-T-GCT--TT--C------C-CGA--T--------A-AA---ATG-CAATATC------TA----TATCTA-CTTCTG------AC-TTGAGGT--AACTTTCC-TCTGTCTG--C----A-TTA-C-AAAG-TAT-GGATT--G-GAGAAG-G--------------------CCGGGATC------AGAATCTC---------TCTGAGAGTGG--GGCTA--T-ATAGCAAAAA-GG---------------CAATGCCCA-TTTTGTAAAACTTTTCC-AA--C--TTT--TGA-a
gi|16 : cAGTCC-GAGTTTAATTCATT--TGA-CTGT-TTGTGT-GC-AA-T-AGGGA--CGAG--AT-GAA-ATCCT----TCGT---CAAT-GATTG----T-TTG-TA-G-T--AC-A--CTTTGCG--A-------T-GGCC----------ATGCGC--GAGT-CA-AACATC--TATC-AACCCAGGG--AA--GGGCTGGT-AATGG-GCA-GTGACGGGAA--TGGAAACA-C-AAC-GC-----TAAA---TCATT-TTCTATGGAGT---G-ATAAGTGTAG-TTGT-GACAT--GGACC-GTGCA--GGTTTTC---ATT-----TTC-TCT-----------GTT--T--------GGAT-C-ACG---T--CC-ACTC-ATTAA----TTG-ATAT-TGT--CTCATTCG-G---A-G--TAAT-GAACTCGA-AAT---GT-AT-ACAG-TACTGTTT-CTC-TCC--AATA-G--T-GAGTC--CAT--G--AC---AA-T-
gi|17 : -T-GCT--TT--C------A-CTA--T--------A-AA---AAG-CAATATC------GA--T--ATAAA-TTTCTT------CC-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A-ATA-T-AAgccgat
gi|17 : tactaatactgt-ATA-CACA--CTGCAT---CAAGGATTT--GAAG--CAAAACC-A--CACATGTTGAAGC-AATGTTG-A--TGGT-ATCCATGG-AGTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaatacacactgcatcaaggatttgaagcaaaaccacacatgttgaagcaatgttgatggtatccatggagtt
gi|18 : tactaatactgttgctttcactataaaaagcaatatcgatataaatttcttccttgaggtaactttcccctgtctgcaatataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaAATAAGTCG-T-AAGTAACAAACC-ATTCAATA-CAATGTACAGTTGTAAGTA-ATTCT-TTAA-TA-TAT--TA-TCGCACACAACCATTGATTTATTATAAATATTGACTGAAATCGAATACAAAT-ATTGACTG-GA-AT--ATCAA--------CAGAATCAGAAAATGAAA--TCCAT----AC-------CATTTCACATT-TA--TGAA-C--GAGATAAATGTA---A-T--ACAA-ACAAT-----A-AT-CTGTACAG--AAA------A-CAATTAACTTTGATTTTTCTATGTCG--TTAAA-----G------G----GTTTAC------TTTCTTCTCCTAACTATTGACAGAAAT-A---ATTCTAG-TTTCTATG-GCTATCTGTATTTTGTGACATGGTTCTTGTCT--AA
gi|19 : AGAACTA-AACCTAACATGTGAATTATTA-TCCTA-TCAATGGCGTATCTCTTTTTGT-ATGACACAAACAAATTATGTGCTTTT-AGTGAG-ATGAAA--GTCGACAATAGAG----CAC---TTACCAG--CCAATAATG-AAAT--C-TAA-CAT---GACAGGT-TGAGA-TTAATCG-ATCTATTGCGTT-TAAACG-CT-TC-ATGTTACAAAGGAAATT-TGAA----AC---CTCTG-----GA----A-C-T-GTA--C-ATAT----GGT-ACT--TT-----------CAA--T--------A-AAGA-AAG-CAATATC------TA--T--ATCTA-TCTCTG------AC-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A-TTA-C-AAAG-AGT-GGATC--A-GAGAGG-G--------------------CCGGGATT------AGAATCTC---------
gi|2 : TTAATCAAGTC-CATTGTG-CAAT--AACAA-CATT-TGG-ATGC-TGAGA-ATAAGTGCATCTATTGCATT-TAAATATCA-TC-ATGTTTACAAGCAAATC-TGACTTGACCAAGCT----C-G-AC----ATC-T-CTAC-A-ACTT----G-TCGCA--TT-----------CAACTT--------A-AATTTAAA-CATTATCAACCCATAAAT-TAGCTA-CTTCTATTTTGCAC-TTGAGGCCAAACTGTCCTCCTGTTTA--TGACAA-TTG-CTAAAG-TAT-GGATTTAG-GAGAGGTG--------------------CCGGGATCTGATTGACAATATC---------TCTGAGAATGG--GGCTA--TTGTAACAGGAAAGG--------------GCAACCCCCA-TTTTGTAAATTTTTTCT-AA--C--TTTCTTGA-T--ACAGAGAAATTCGTCCC-GCCCC-G-AC---TTTTC---CTACACACATAT--TTGTTCTGCCAG-----------AAT-AGAGAAATT-TGAA--GGTAACC-GGTAT-ATA-CACA--TTGCAT---CAAGGATTT--GAAA--CAAAACC-ACAC-CACGGTGAAGC-AGTGTTGGA--TGGT-ATCCGTGG-AGTTGAA-GAGCTCTCT-TTA-ATTCT-C-CAAAATAATATTTG--TCTTCATAAAAT-ATGAACAC-AGTTA-ATTCGTC---ACAAATA--A-T-TCCTT-AGAATTATTTTC-A-TGATTCTGTAACAGAGAAAATTGGGACAATGGTTCATAGAGTACACTACTTTTGCCTCGCTTGGTGTAAAAGAAA-T-CTCCA-TT-CCAA-GTCT-GAGTTT--TCCATTCGTGT-CTGT-TTGTTTTAC-AAAT-AGGAAT-CGAGGAAT-GAA-ACCCG----TCTT---CAATTAATTG----AGCTG-CAT--T--ACAAACTTACGTG--G-------T-GGGCC---------GTGCTC--G--T-CA-AACATC--TATCAA-CCCAAGG--CA--GAGCTGGTAA-TGG-ACA-GTGACGGGAAAGTGGAAATAAC-A-CAGC-----GATA---TCAGTCTTCTTTAA--T--CGTACAAGTGAAGGCTGT-AAACA--GGACC-GTGTAT-T-TTCCC---ACCTTTTTTTC-CCCCCCCCCAAAAAGTT--TTTATTTGGGGATTC-A-T---T--CC-CCTG-AGTGA--T-T-G-ATGG-ATT--CCCTTCCGCC---A-G--CAAT-GAAC-TGA-AAT---AT-AT-ACTG-TATTGTTTGCTC-TCT--AATACG--T-GAG
gi|20 : gC-ATCGAA--GTTGATAA-A-AG----CAC-TTCTATCAA--CTTATCATC-GAAT--A-TAA-CATATTGGCGAGT-TGAGA-ATAACTG-ATCTATTACATT-TAAATG-CA-TC-ATGTTTAAAAGGAAATC-TGAT----CT--------------A----A-C-A-ATC--ACACCC----G-C-ACT--T--CC------CATGA--TTTCATTAAA-AA---AGG-CAATATC------AA--T--GTCAA-TTTCTG------AC-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A-TTA-C-AAAG-TGT-GGATC--T-GAGAGG-G--------------------TTGGGATC------AGAATTTC---------CCTCAGAGTGG--GACTT--T-GTAAGAGGAA-GG---------------CAACGCCCA-TTTTGTAAAATGTTTCT-AA--C--TTT--TGA-T--ACA
gi|21 : -TTATTG-ACCTA-TCAATGGTGAATCTCTTTTTGT-TTGATACCAAAAGACTTTGTGTT----AATGAC-ATGGAC--GTAGATACTA-AAACAATACTAGTAATCAA--CTTATCATG-GAAT--A-TAA-CATTATGACAGGT-TGAGA-GTAACTG-ATCCATTACATT-TAAATG-AA-TC-ATGTTTGATAGGAAATC-TGAT----GC---AATTGTC-C-CA----C-T-T-ATATTA-CTGC------T-GCT--TTCGC------C---A--T--------A-AA---AAG-CAATATC-------A--A-TATCTA-TTTCTG------AC-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A-CTA-C-AAAG-TAT-GGATT--G-GAGAGG-A--------------------CCGGGGTC------AGAATCTC---------
gi|22 : CAATGAGTTA-T-AAATAACAAACC-ATTCATTA-C----T----TTGTAAGTA-AGTCT-TTA--TA-TAT--TA-TTGTGT----CC----------------TATCG-------TTGAGAACAAAT-ATTGACTG-AA-AT--ATTTA--------CAGAG------------G--TCCAT----AC---A--ATATT--ACATT-TAC--AAA-T--GA---AAAT-TA---T-T--A--A-ACAAC-----A-TT-CTGCACAG--AAA------A-CG-TC------GATTGTTATATGTCA-AC--AACCC-TA------ACCTTATTTATGGGT-ATTT--TCTTCTAACTATTGACA-AAATTA---ATTCTAG-TTTCTGTG-GCTGTCTGTATTTTGTGATATGGTCTCTGTCT--AAGTG-AC--T--CTTGAT-AA-GACTG-TAACGC
gi|23 : AAATTATATATTC-AG-CTTCTGTG-GCTGTCTGTATTTTTTGA-ATG-TGCTTGTTTTTAAGTGAACAAT--TTGATTTAA-GACTGTTAACGCCCTGT-GTAG-TCCCCCAC-CA-TATGTTGACA-AATCCC-AGTA---TCTGCCA-GACAGGT-CTCT-ATGGCGT---AAAGGTGCGTATCT-CCCAT-CATC---ATAGA---GCAAGT--AGGGTGTGTAGGGT-TG---TC-----AGT-G-CCTG--AGATAA-----ATG---TGACCTG-TACCTAGTC-GTTAGAGT--G--GATTTTA-GGGTAC-AGATA-ACA
gi|24 : gaGAATGTGATCCATCC-TGTAACGA-TTC-T-TTAACGTTAG-TTGATCGAC-TCAATA-TAAGTTTCT-ATT-AA--------------AT--T----ACAGT--GTTCTG--AT-AAT-TC--GTGAGA--AG-TTG----TATAAAA-------------TGTAA--------------TCTTACAAAATGTACTCTACCTGAGAATTT--CCAAGTTCTATTTATAGACAATCGGGAAATAA-CCAGTT-TAACT-CCG-----TACTTTTCTTATTGCA---TGTACTCTGTTG-AC-CTTAA-TATGGAATACCAGTC-TTTA-TTTGATTCG-TTAATCGA
gi|25 : GGGAAATGTGATCCATCC-TGTAACAA-TTA-T-TTAACGTTCA-TTTACCGAA-ACAATA-CAAATGTTT-ATT-AATACGAA-AGAATACATTAC----AC--C--GTTCTGAA---AAC-CC--GTGAAA--AG-TTG----TATAAAA-------------TG-AAT-----------------------TCCACTGCACCTGAGAATTT--AAAACATCTATTTATAGACAATCGG-AAATAC-CCGGTT-AAGCC-C--C--ACTACTCTTCTT-TTGAAAATTG-A-TTTGTTG-ACTCTTAAGTCT-GAATA----T--TTTA-TTCCGTT-G-TT-gacaattgt
gi|26 : -TTATTG-ACCTA-ACAATGGTGTATCTTCTTTTCT-TTGACACAGACAAACACTGTGTTTTC-AACGAC-ATGGAA--GTGAATA-CA-AG----CTT-ATTTATCAA--CGCTTCATG-AAAT--A-CAA-CATTATGACAGGT-TGAGA-ATAACTG-ATCTGTTACATT-AAATTG-CA-TC-ATGTTTAAAAGGAAATC-TGAT----TC---CTGTG-TGG-AA----A-A-T-CTAT-C-ACGT----C-T-GAT--TT--C------C-CGA--T--------A-AA---ATG-CAATATC------TA----TATCTA-a
gi|27 : --AG-GTAAGTGTAG-TTGT-GACAT--GGACC-GTGCAG-G-TTCTC---ACC-----TTC-ATT----------GGCT-----------GGAT-T-A-A---C--CCCATTC-CATA---T-TTG-ATGG-TTT--CTCATCCG-T---A-G--TAGT-GAACTTGA-AAT---GT-AT-ACAG-TATTGTTT-TTC-CCC--GTTA-G--T-GAGGA--CAT--G--AC---AACC-CC--C-ATCATT-TGA-CGAT------------------GT---GAG--T-AGT-A--GTA-TTCTGGCGAA----TCC-CGGTG--GG-AGT-TCACCC-CGTA-TCCAT-AT--GA--GAAAGTGTA
gi|28 : CCTAGACTTAG----TA-AGCAATAGACTGAC-C-ACCT--ACCG-C-CTTCCACTGTA-TCTCT-G--CTGT--CTAC--T-CT-GTT--GAGATAC---------AATTATTTGGGGCTTGTGAG-AGTCCTCTGTCTTCA-CTCTTTC-TGTGACAGTTTTAGCGCT-GT---TTGATATCTACCGG-TATTCATAC-ATGTAT-AATTGCCTAAATACCAACCCATCAT
gi|29 : taccTTCAATA-C----T----TTGTAAGTA-AGTCT-TTAA-TAATAT--------------AC-----------------TACCG-------TTGATTACAAAT-ATTGACTG-AA-A-T-ATCAACAGAAT--CAGAA------------G--TCCAT----AC---ATTACATTG-ATACTATAG-TAAA-T--GA---AA--ACA---TGT--A--A-ACGGT-----A-TT-CTGTACAG--GAA------ATC--TT------GATTGGCCTGTGT--------------------------ATTAATTGGTAATATCTTCTCCTAACTATTGACAgattgcgaaa
gi|3 : gAG--AT-GAA-ATGCCAGTGTAGTACCCAAT-AATTG----A-TTGGTAGGAC--ACGA--C--CGCG--A-------TTAGCCA---------TTGCGCCTGAG--CA-AACATC--TATCAAACCCAGGGGAAA--TAGGTGGTAA-TGG-GCAAGTGACGGGAAGATGAAACCA-A-GGCGCCTCGTGGTTACATTCAGT-TTCTAT-AGAT--TA-ATAA-TGTA--TTGTCGACAAAGGGATCTGTGCCC-G-TTCTC---ACC-----TTC-ACT----------TAAT--T--------GGAT-CCA-A---TGTCC-A-TC-AGTGAGAT-TTG-ATGG-TTTGTCTCATCCG-GCAGA-GGTTAAT-GAACTTGT-AATCTTGTAATTGCAG-TAATGTTG-CTCCTCCGCAATA-G--TCAAGGATCCAT--G--ACCCAAG-T-TG--GCGTATTT-TGACCGGTATAGGAAAGCTGGATCGTGT---GAG--TAGGTAT--GGA-ATC-GGCGA-----TCC-GGG-GCGGG-AGTATCAGACAGGTC-TCCATA-T-AGAAATAAGGT--ATG--CTGG-GTGAATGA--T-----AAA------TGTG-GGCTG-AGACAGCT--CACA-G-ATCAC-G-C-T-TAT--AT--CAAC-GGAACCAA--C-CAACGCACTATATG---A--AAT-CAT--GTAGT------CAGAA-TGAT-TTG--GAACCTTGTGA-AATC-CCTCCCTTAGAAACT-A-CCACTCAGCAC-A-T-AC-TT-CTCACCCATAT-ACT-C-GAAGGTTTCTGTGCGTATCATC-T-CC-C-CCGTGTGTCCCCCAG----A--CCTTCTGTAAGGTCACTTCTGTCAGG-TGTCCCGGATATCTCACTGACACACAAAA---CACCCACAGA--AGGGC-TCTGACACTC-GGTAATGTGATTCATCCATGCAAACA-TTC-GTTTAGCGGTGG-------GAC-AC-ATAGCAAAACTCT-G---AAGACTAC-ACTATATA-TATAGAAACAGCAGGTTCTTGAAT-AATATCTAGTGAAGGTAATTTGTGGATACAAGAA-GTCAGTGAAAATGTGATTACTCATGTTAAATCTTACAAAATCCACTCTACCTGG----TT--TAAAATT
gi|30 : acT-GAACTTGA-AAT---ATA-T-ACAG-CATTGTTT-CAC-TCC--AATA-G--T-GAAGA--CAT--G--AC---AA-T-TT--C-TTCATT-TGA-CGGT------------------GT---GAG--T-AGC-T--GTA-ATCTGGCGAA----CCC-CGG-G--GG-CGTATCAGA--GATC-TCCAT-AT-AGA--TAAGgtgatcgtgataac
gi|31 : T----G-AATC-CCTCCCTAGA--ACT-A-CCACTCAGCAC-A-TATC-TCTTTCCATTATATATCT-GTGAAGGTTTC----CGTATCATC-T-CCTC-C---GTGTCTTCTAG----ATCCCTTCTG-AATGTCACTTCTGTT-GG-TGTCCC---TATCTCAC-cgt
gi|32 : AAGTGTAA-TTGT-GACAA--GGACC-GTGCA--TGTTCTC---ATT-----TTC-GTC----------GGA---T--------GGAT-T-A-AT--T--CC-TTTC-A--AA--TCTTG-ATGT-AAT--CTCAACAG-G---A-G--CATT-GTACTTGA-AAT---GT-AT-ACAG-CATTGTTT-CTC-TC
gi|33 : ACGTGAA--TGGAAACA-T-AGCG-C-----GATA---TCAAA-TTC-ATGAGAT--TT-AAAAGTGTAG-TTGT-GACAT--GGACC-GTGTA--GGTTCTC---ACC-----TTCAGC------------ACC--T--------GGTT-C-A--------CC-ACTC-CATAA----TTG-ATGG-TTT--CTCAT
gi|34 : ACCT----G-AATC-CCTCCCTATG--ACT-A-CCACTCTTCAT-A-T-GGATCATCCCTTTCGATAACG-ATAAACCTTTC----TGTATTAGCAC-CC-C-C---GTGTCCCAAAG----ATCCCTTCTG-AAGTTCACTTCTGTC-GG-T
gi|36 : ACATGCTGACA-GATCCCCAGTA---TCTGCCACAAGAGGT-CTCTAA--GGAGT--AACGGTACATGTTT-GTCAT-CATC---ATATA---TC-AGC--AGGGTGTGTAGGTC-TG---TC-----AGT
gi|37 : AGTGAAG-TTGT-GACAA--GGACC-GTGCAG-GTTTC-C---ACC-----TTC-ATT----------GACT-----------GAATTC-A-C---T--CC-ATTC-AATAA--T-T-G-ATGG-ACT--GTCATTCG-T---A-G--TAAT-GAACTTGA-AAT---GTAgact
gi|38 : TTTATAGACAATCGGAAA-TAC-CCAGTT-AACCT-CCGC----TACTTTTCTT-TTGCA---TGTACTCTGTTG-AC-CTTAA-TATGGAATACCAGTACTTTA-TTTGATTCG-TT-ATCt
gi|39 : ATAAATTA-T-AAGTAACAAATC-GTTCAAAA-CA---T----T-GTAATTA-AGTAT-TTAA-TA-TAT--TA-TTGCGC----CC----------------TACTG-------TTGAGTACAAAT-ATTGACTG-AA-A-T-ATCAA--------CAGAA------------a
gi|4 : AAGTCC-GAGTTTAATTCAT------------TTGTC------------------------------ATCCT----TCGT---CAAT-AATTG----A-TTG-TAG--T--ACAA---TACACG--A-------T-GGCCA----------TGCGC--GAGT-CA-AACATC--TCTCAA-CCCAGGG--AA--GGGCTGGTAA-TGG-GCA-GTGACGGGAA--TGGAAACA-C-AACG-C-----TACA---TCAGT-TTCTATG-GAT--AG-ATGAGTGTAG-TTGT-GACAT--GGACC-GTGCAG-G-TTCTC---ACC-----TTC-AAT----------GGCT--A--------GGAT-A-C-A---C--TC-ACTG-AGTAA--T-TAG-ATTG-TGT---TCATCCG-T---ATA--CATT-CAACT-GA-ATA---GTA-T-ACAA-TAGTCTTT-CTTATCCTAGATA-AGCT-GAGTC--CATAAG--AC---AA-T-TCTCG-TTGATT-TGAC-AGT------------------GTATAGAGATTA--T-T--GTA-ATCGGTCGAAAGAATCCGCGT-G--AGCAGTATCAGAC-GGTCGTCC-TAATCAGA--TAAGTAGTATGT-CTGGTGTG--TTAATTG---GATAAAACCCCGTTTGACTA-TGACATCTATCACACT-ATCAT-CACTTCTATAGATATCATATGG---TAG--AACATCGC-----ATACTCATTAACTCAT--GC--TTAGGATCAG-ACTGAT-TTTTAAAACATTCA-G-AATCGCCTCCCTAGT--ACT-A-CCACTCAGCAT-C-CGTC-TCAGTCCTCTATATAACT-TTGAAGGTTTC----CGTATCATC-T-CCAC-C---GTGTCTCTCAG----ATCCCTTCTG-AAGGTCACTTCTGTC-GG-TGTCCC---TATTTCAC-GACAC-----A---CACCCACATA-CAGGGCTTCTGATACACGGGGAATGTGATCCATCC-TGTAACGA-TTC-G-TTAACGTTAG-TTGATCGAC-ACAATA-CACATTTCT-ATT-AATACGAA----ACAAATCAT-----TAAC--GTTTTAA----AGC-TT--GTG-AA--ACCTTG----TATGAAAA-A----------TGTAA--------------TCAAACAAAGTCCACTCTACCTGAAAATTCA-CAAAA-TCTATTTATAAATAATCGG-AAATTC-CCAATT-ATGC--CCG---GCTACTTTTCTT-TCGCA---t
gi|40 : CTG--C----A-TTA-C-AAAG-TAT-GGATT--G-GAGAGG-G--------------------CAGGGATC------AGAACCTC---------TCTGAGAGTGG--GACTA--T-GTAACAGGAA--G--------------ACAACCCCCA-TTTCGTAAAATGTTTCT-AA--C--
gi|41 : CTG------AC-TTGAGGT--ATTTTTCC-CCTGTCTG--C----A-TGA-C-AAAG-TGT-GGATC--A-GAGAGG-G--------------------CCGGTATC------AGAACCTC---------TCTAAGAGTGG--GACTG--T-GTAACAGGAA-
gi|42 : -TGAT-TT---AAACCT----A-AATC-CTTCCCTATG--GCT-A-CCACTCAGCATCA-A-TC-TAACTCCATAATATGAAT-GTGAAGCTTTC----CGTATCATC-TCCC-C-C---GTGTCCCaccaac
gi|43 : AAGTGTAG-TTGT-GACAA--GGACC-GTGCA--CGTTCTC---ATT-----TTC-GCT----------GGA---T--------GGAT-TAA-A---T--CC-ATTC---CAA--TGTTG-ATGT-AAT--CTCAACAG-G---A-G--CATT-GAACTac
gi|44 : aGATGAAAATTATATATTC-AG-CTTCTGTG-GCTG
gi|44 : AATATATAATT-TTCATC-CCGT-TCATTTC-ACTGACTTCTTCT-T--CCAACCTTAA-TTCTTccgttcatttcactgacttcttcttccaaccttaattcttc
gi|45 : cagccacagaagctgGGAATGTGATGCATCC-TGTAGCGA-TTC-G-TTAACGTTAc
gi|46 : TTTTCTT-TTGCA---TGCACTTTGTTGCCC-CTTCA-CATGGAATAC------TTTA-TTTGATTCG-TT-ATCctattacatttagctttacacattctattta
gi|47 : --GCTACTTTTCTT-CTGCA---TTT--TCTGTTGCAC----AA-AACAAAATACTAGTACTTTATTTTGATTacaa
gi|48 : CT--CACA-T-ATCAC-C---T-TATG-AT--CA---GG---GAG--C-CAACGC-----ATG---A--AATC
gi|49 : --CAAAACC-A--CACATGTTGGAGC-AATGTTG-A--TGAT-ATC
gi|5 : ACAATAAGT--ATGAAGTAACATACC-ATTTA-TAGTA---T----T----A--A-AGTCTATTAA--A-TATGATA-TTGCGC---ACC----------------TACTG-------TTGATTACAAAT-ATTGTCTGCAA-ACTGACTAAAACAGAATCAGAA------------GGTTCCATCTAAACCCTA--AC-TTG-ACATT-TATGTAAAAT--GG---AAAC-CAGCTT-TGCA--ATACAATTTACTA-TTTCTGTCCAGTGGAATACCCCA-CATTT------GATCGTTCTATGGCATAATAAAATA-TA------AT---AAATATAAAT-ATATCTT-TCCTAACTTATGA--GAGATTA---ATTTT-G-CT-CTCTG-GTTGTCTGTATTTTTTGAT---GTTC--GT------GTGA--------TGTGT-AA-GACCGTTAACGCCCGGG-ACAGGTCTCCCACACATTGT-TTG--A-GATCCCACGT----TC-GCCAGGACAGGTCCTCT-A--TCTTC--AAAATCACGAATCTCCCCATACATCCCAATAGAAATGCAAGTGAAGGGTTTGTGTAAT-CGCGTTCTCCTAGGTCATCCTGCTAGAAATC----TTGAATTGATCTGTTACCTAGTCTGCT---GTCGA-CAA---TA-GGA-ACGGGATACACACATGTGCACAGGTAGCGCAACCAGGGCTCACCAG---TCATAT---------TATCTCTGTATCATTTCAACTGAACTTTTGTGTGGCCAA--TTAACTTCTTTCATCTATAGCAGTAAACTCTTTATAC-AATATGGTCAACATTCTTG-CCAACC-TTCCTATACTTAGGTTCTA-A--A-TAGACTGAC-CCACCT--ACCG-C-T---CACTGTACTCTCT-GCTCTGT--C-AC---ACT-ACT--AGGATACCCCATTCGAGAA-GT--GTGGC-TGTGAGAAGGCCTCTG-C-TCACTTCTATCTTGTGACATTTTTAACGCTAGTTTATTGATAATTCTC---TAAACGCA--G-GTATCAGTTACCTGAGTA
gi|50 : TC-CCGT-TCATTTT-ACTGACTTCTTGT-T--CCAAatga
gi|6 : AA--TGGAAACA-C-AGCG-C-----TACA---TCAGT-TTCTAT-AGAT--AG-ATAAGTGTAG-TTGT-GACAT--GGATC-GTGCAG-G-TTCTC---ACC-----TTC-ACT----------AA-T--T--------GGAT-C-A-A---TT-CC-ACTC-AGTGA--T-T-G-ATGG-TGTT-CTCATCCG-G---A-G--TAATTGAACTTGATAAT---GTAAT--CAGGTAT-GTTT-CTC-TCC--AATA-G--T-GAGTC--CATT-G--AC---AA-T-TT--G-GCGATTGTGAACGA-------------------GT---GAG--TA-GT-TTTGTACATCTGGCGAA----TCC-----G--GG-AGTATCAGAG-GGTC-TCCATA-T-AGA--TAAG-TGTATGTGCTGG-GTGAATGTATTA---GAAA------TGTG-G-CTGCAGACATCT--CACA-TGATCAC-C--TT-TATG-AT--CA---GG---TAAACC-CAACGC-----ATG---A--AATC-ATTAGT--T------CAG-A-TGATGTT---GAACC-----G-AATC-CGTCCC-AGA--ACTTA-CCACTCAGCAT-ACT-TC-TCACTCCATTATA---CT-CTGAAGGTTTC----TGTATCATC-T-CC-C-CC--GTGTCCCCCAG----ATCCCTTCTG-AAGGTCACTTCTGTC-GG-TGTCCC---TATCTCAC-GACAC-----A---CACCCACATA-CAGGGCTTCTGACACTCGGTGAATGTGATCCATCC-TGCAACGA-TTC-G-TTAGCGTT--------CGAC-ACAATA-CAAA--------------CGAG-ACTACACATTA-----ACAGC--GTTCTGA--T-AAT-TC--GTGAAA--A-TTTG----TATACAA-------------TGTAAT--------------CTTACAAAATCCACTCTACCTG
gi|7 : TATCTCTTTTTCG-TTGACACGAACATACACTGTGCTTTC-AATGAC-ATGGAA--GTGAATA-TA-AG----CGC-ATTAATCAA--CGCATCATG-AAAT--A-CAA-CATTATGACAAGT-GGAGA-ATAACTG-ATCTATGACATT-TAATTG-CA-TC-ATGTTTAAAAGGAAATC-TGAT----TC---CTTTT-T-GTAA----A-T-T-ATA--A--------------CT--TTTCTGCTTTAC-TGA--T--------A-AA---AAG-CAATATC------TA--T--ATCTA-TTTCTG------AC-TTGAGGT--AACTTTCC-ATTGTCTG--C----A-TTA-C-ACAG-TAT-GGATT--T-GAGAGA-G--------------------CCGGGGTA------AGAATCTC---------TTTGAGAGTGG--GGCTA--T-GTAACAGAAA-AGCAACNNNNNNGAAAGCAACGCCCA-TGTTGTGAAATGTTTCT-AA--C--TTT--TGA-T--ACAGGAACGTCTGTTGC-GCCCC-G-ACAACTTTTC---CTGCAAACATAT---TGTTCT-CCGG-----------AAT-AAAGAAATT-TGGAAGG-TAACC-GGTAT-ATA-CACA--CTGAAT---CAAGGATTT--GAAA--CAAAACC-A--CACATGTTGGAGC-AATGTTG-A--TGGT-ATCCATGG-GGTAGAA-GAGCATTCT-TGA-ATTCT-C-CAAAATAATA-TTG--TTTTttaaaat
gi|8 : AAA-TTCTCCA-CT-C-AAAGTCT-GAGTTT-----------GT-CTGT-TTGTTT-GA-GA-T-AGGAA--CGAG--AT-GAA-ATCCT----TCAT---CAAT-AATTG----A-ATG-CA-G-T--AC-A--GTAGGTG--A-------T-GGCC----------ATGCGC--GAAT-CA-AACATC--TATC-AACCCAGGG--AA--GGGCTGGT-AATGG-CCA-ATGACGGGAA--CGGAAACA-C-AG-GGC-----GATA---TCAGC-TTCTATGGAAT---T-ATAAGTGTAG-TTGT-GACAT--GGACC-GTGCA--TATTCTC---ACC-----TTC-TCT----------GGC---T--------GGAT-C-A-AT--T--CC-ATTC-AATGA----CTG-ATGA-AAT--ATCATCCG-G---A-G--TAAT-GAACTTGA-AAT---GT-AT-ACAG-TATTGTTT-CTC-TCC--AATA-G--T-GAGGA--CAT--G--AC---AA-TATC----CTCATT-GGA-CGGT------------------GT---GAG--T-AGT-T--GTA-ATCTGGCGAA----TC
gi|8 : C-----ATG---T--AATCCAT--GT---------CAG-A-TGAT-TG---AAACCT----A-AATC-CCTCCCTATA--ACT-A-CCACTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacatgtaatccatgtcagatgattgaaacctaaatccctccctataactaccact
gi|9 : aaattctccactcaaagtctgagtttgtctgtttgtttgagataggaacgagatgaaatccttcatcaataattgaatgcagtacagtaggtgatggccatgcgcgaatcaaacatctatcaacccagggaagggctggtaatggccaatgacgggaacggaaacacagggcgatatcagcttctatggaattataagtgtagttgtgacatggaccgtgcatattctcaccttctctggctggatcaattccattcaatgactgatgaaatatcatccggagtaatgaacttgaaatgtatacagtattgtttctctccaatagtgaggacatgacaatatcctcattggacggtgtgagtagttgtaatctggcgaatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaaGAACTA-CACCTATCATGTGAACTATTG-ACCTA-TCAATGGCATATCTCTTTTTCT-TGGACACAAACAAACACTGTGATTTC-AATGAC-ATGGAA--GTGAAT-ATA-AG----TAC-ATTTATCAA--CGCATCATG-AAAT--A-CAA-CATAATGACTGGT-TGAGA-ATAACTG---------------AAATG-CA-TC-ATGTTTGAAAGGAAATC-TGGT----CC---CATTG-T-G-TA----A-C-T--TAT-A-ACAC------T-GCTGCTTTCC------A-C-A--T--------T-AT---AAG-AAATATC------TA--T-C-TCTA-TCTCTG------AC-TTGAGGT--AACTTTCA-CCTGTCTG--C----A-TTA-C-AAAG-TAT-GGATT--A-GAAAGG-GTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTC------GGGATTTCAGAATCTCATCTGAGAGTGGGAGACTAGCT-GTAACA-GAA-GGCC------------CCAATG-CCA---CTGGAAAATGTGTCT-AT--CCTTTT--TGATT--ACAGAGACAT-TGTTGC-ACCCC-A-ACAA-TTTTTCCACTGCAAACATAG-TTTGTTA--CCGGGAACGATCTCAAAT-AAAGACATTGCGAAAGGGTAACC-GGTAT-ATA-CACATTCCCCAT---CAAGGATTTTAAAAA--CAATACC-A-
blockSeqs : CG G . A G AATGTACAG T G . A . A GATA ACAACCATTGATTTATTATAAA ACTGAAA A . C . CTG AACAGAAT TCAGAAAATGAAA CTAA CCTA TC A TGT AT GAT CAGCTTTGCAAT TTACT . T TG ACAATTAACTTT ACAACCCTAACCTT TGGTA T C G TAT T . . CA T C TT AACAATT GA T . T T . G A A G A . C A T C C ATGGCGT GG C A CCA AATG AA GA AG C CGT TCCTA CAT CT CATGTA AAT T A GTTAGAGTGGATTT T T G C T T A AG CC CTCACC ATA AAAACTGA T A A G GG CA C T C CA G A CAACA C A A A GTTCTAAA . C . T CTTC C . CT . T ACTACTAGGATACCCCATTCGA T TT G T T A T GT T C T T A TTA A G . A CAA C AT C T T . A A . . . . . . A G ACAA T GT G . . A . TA . . C . T A . A TTGACCAAGCTCGACATCTCTACAACTTGTCGCATTCAACTT . TTT C AACCCA AATT . TTTTGC . CA T C GACA T . T . G TAG T TNNNNNNNNNNNNNNNNNNN TGATTG AGAATCTCA GA AGC T A CAACNNNNNNGAAAG G G G AT CT CT T . G G GG T CCA TT TG GAACGATCTCA . G T A G . TT TCA TA GT ACA A G CG A TA A . . G G . T . . . . T C TCACT C A AC TTCT A GA A A C T G T . T . . T T AA TCG G A TTTACAAAT GA G GA T T AGTG C ACC T TGAAG G GATTGATGCCA AAGAGGAA T AGAATCGGCCA TG A T GC T A A GA . A A . A AG A . G TCGTG CAT GTC T AATTCA T G C AAG T GGT . TTTTT CCCCCCCCCAAAAAGTTTTTATTTGG CCAATGT C CAG GAT T . AC GT GCAG T GT T T T CTT AG TG G G C GC C GC C ATC AA . CCA C A CTCGT T G C ATAGGAAAGCTGGATCGT ATA ATTA A TT C AGAA GC T CG C CA G AA C AA G TG T G TGGATAAAACCC T A C AT CT CACT C AG AT TAT AACCAAC ACTAT CTCATT TA CTTAGGAT A C G TTA TGTGA G AGAA T . C TT A AC T A C TGTG A C T A CGT AAAT T A . GGA T ACAAAA . A A . GT AGTTGAT . G TT ATT T AAGA C T TAGAA AG GAAT A TA GTAAT TGGA AGTCAGTGAAAATGTGATTACTCATGTTAAAT G A GT G . . T CA A AAT TAC ACTCTTAAGT G CAGTAC T . A
blockSeqs : TA . . T . AT T G . . . . TA ACC . G . . . T CAGAAT GGT . ATT G . GT C . GTAATACAA . . . . TACCCCACATTT TAATAAAATATAAT GGGT T C A TAT T . . TA C C . ACTC AT . . T G . . . T G A . A A T G . AAGGAGT GG . . . G AA . AG . . . T T TC . T A TGCTGTCGACAA . . . . C . . . . . T ATAATTTT . . . . . CC . . . . C T AT . . G A TAAGCAA . . . . G . . T . T TCTGTTGAGATAC . . G . T . G G T . . T . . A G . A CAT . GT C T C . T A . . . . . . A . . . . G . . . . TA . . . . . . . . ACGAGAATTGTACTTCTAACACTGATGCTTTCGCCAA . GA . . AT . . . . . . . . . . . . G . . . . . A . . CCC G . . . . . . . T . G C . G T A . . G . . . . . . . A . . . . A A . . . . . . . . . . . . AT . T A . A . T C . . . T . . C . AA T . . TTTGCGAT T G . . . . G . . AG . TTACAAACTT A . CG CT . . . A A A G . A A . . GA . . G . . TA T GAGATT . . . A . TG . . ACTTAATT AAACGT . AA TC T . AA T CC . . A . . . AA A . . A TA . . . C T . . . . GGCG G . C . . TAG . . . . C . . . C . A . . G T . A TGATAGAA . G . . TG GC . G . AC TAAACC . A . TAGT . . . G TCAG . GA . . . TA . TT C A C . . . A . C . . . . . . A . T . . T CATTTAC . . TG ATT G CACT T T T . AT . . ACC . AATGTAAT G . CA A . . C C . . TAC CCCCTTCAC G TAGTAC . . .
blockSeqs : TA . . A . AT T G . . . . TA CC . T . . . T . G . A G . T T . ACATGTAA . . . . ACGTC TTAAAGG AAAT A C G . T . . A T T . A TG . . . . . . . . . . . . ATCTTC AT . . . G A . GT . . . G . A . . A TGTAGTGA . . . . . . . . . . . . T A TCTACA . . . . T . . . . . ACTATGGCAT . . . . . . . G . . . . . . C . . . G . A . T . . . . . . . A . . . . C . . . . AT . . . . . . . . CTCTTTATGAAACATGTATCTTTTGTGCTTTCCCGAT . . . . TC . . . . . . . . . . . . A . . . . . G . . A C . . . . . . . C . G . . T T . . . G . . . . . . . A . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . T . . GTGCAAT . G . . . . T . . T . GGACACGAC G . AT . . . . A A A . . A . . . . . . C . . AA T GGAGT . . . T . GG . . AATGGCTA TAAGT . AT TG T . TG . G . . A . . . AA A . . . . . . . A . . . . . TGG C . A . . TAG . . . . C . . . C . A . . G T . A TAGAAA . A . . T CT . G . . TAGAA . A . TT . . . . G . TG . . . CG . AT A A G . . . . . . . . . . . . A . A . . T AGTTGAT . . AC ATT T GACT A C C . AA . . AG . TGTAAT A . AT . . . T G . . CAC ACCTTAAT G CAGTC . . .
blockSeqs : A . . A . T . T . . . . TA AC . G . . . T . G . . . . C T . TATTAA . . . . ATCTT . . A T . . . . . T . . . . . . T A . T . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . T . . . . TA . . . . . . . . CTAACAATCACACCCGCACTTCCCATGATTTCATTAA . . . . T . . . . . . . . . . . . G . . . . . A . . G G . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . G . . . . . TTGAGAT . . . . . . G . . A . GTACACT A . A . . . . A A A . . A . . . . . . G . . TT T AGATT . . . A . TT . . GTTGGAT CACGT . AG T T . AT . G . . G . . . A A . . . . . . . C . . . . . TGG A . . . . TA . . . . G . . . G . A . . T . . . TAAA . . . . G C . G . . TTGC . A . T . . . . G . GT . . . CT . AG T A A . . . . . . . . . . . . A . T . . G GG . . TT G . A C T T . AT . . AG . TGTAAT . . A . . . . . . . A ACCTTAAT A T . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . CC . T . . . T . . . . . . . . . . . . . A . . . . T . . . . TA . . . . . . . . GCAATTGTCCCACTTATATTACTGCTGCTTTCGCCAT . . . . T . . . . . . . . . . . . A . . . . . A . . A C . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . C . . . . . . G . . A . GTACAAT A . A . . . . C . . . . . . . . . . . . . . GT T GGATA . . . T . GG . . TCTGTTT TCATT . CA T T . TT . G . . A . . . A A . . . . . . . A . . . . . CCA C . . . . TA . . . . C . . . . . A . . . . T C . . . . GAGC . A . T . . . . A . TG . . . T . AC T G T . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . A . . AT . TGAAT . . T CACAAA . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . G . . . . TA . . . . . . . . TCCTGTGTGGAAAATCTATCACGTCTGATTTCCCGAT . . . . T . . . . . . . . . . . . T . . . . . T . . . G . . . . . . . . . . . . A . . A . GTACAGT A . A . . . . A . . . . . . . . . . . . . . AA T AGATA . . . A . CG . . ATTGGCT TAATT . AG T T . TT . T . . T . . . A A . . . . . . . A . . . . . TCT G . . . . TA . . . . . . . . . . A . . . T . . . G . GA . . . T . AC A . G . . . . . . . . . . . . G . .
blockSeqs : . . . . . . . . . G . . . . AA . . . . . . . . TCCTTTTTGTAAATTATAACTTTTCTGCTTTACTGAT . . . . T . . . . . . . . . . . . G . . . . . A . . . G . . . . . . . . . . . . GT T GGAAT . . . T . TG . . GTCGGAT TCACT . CA T A . AA . G . . A . . . A A . . . . . . . C . . . . . TGG G . . . . TA . . . . A . TA . . . A . C A . C . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . . T . . . . . . . . CCCATTGTGTAACTTATAACACTGCTGCTTTCCACAT . . . . T . . . . . . . . . . . . G . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . GT . AATC . . . A . GG . . AGCACCT TAAAT . AA T T . TT . T . . T . . . A A . . . . . . . C . . . . . CC C . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . ACCTCTGGAACTGTACATATGGTACTTTCAAT . . . . T . . . . . . . . . . . . A . . . . . A . . . . . . . . GC . TA . . . T . GG . . ATTGACT CAATT . AG T T . AC . T . . T . . . A A . . . . . . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . . GCTTGTATCAACACTGTCTATTTCAGTAA . . . . T . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . A . CG . . GCTGGAT CAATT . AG T . . TG . G . . A . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . . . . . . . . . . A . . . . . . T . GG . . ACTAATT TAAC . AA . . . AA . G . . A . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . TA . . TCTGGCT ACAC . A . . . TG . G . . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . TAGCAT CA . . . . . AA . .
blockSeqCons : TA* AT******* TA*** ******* T** A***** ** T** T*** ACNTT************** CAAAAC****************** CA G*** A* ** ** T**** ****** ** G*** ** A** N************** ** G** *** ** A*** A* ** TTGCGAT**** A***** GTACAAT******* A********* A********** ** GN* GGATT*** NG** *** GCTGGCT********************** TAANT******* T*** NN* A* ** TA*** C* A* TAGAAA********* C**** G* *** A***** TT******** G***** N* A******** G** AGTTGAT* ATT** NACT* AT*** AG*** AGTGTAAT************************* ** T* **** TAC ACCTTAAT*** CAGTC*
originalCons : NACAATAAGTTAAT-AAGTAACAAACC-ATTCAATA-CA---T----TTGTAAGTA-AGTCT-TTAA-TA-TAT--TA-TTGCGC---ACC----------------TACCG-------TTGAGTACAAAT-ATTGACTG-AA-ATT-ATCAA--------CAGAA------------G--TCCAT----AC---A--ACATTG-ACATT-TAC-TAAA-C--GA---AAATACA---T-T--A--A-ACAAT-----A-TT-CTGTACAG--AAA------A-CG-TT------GATTGTTCTATGTCA-ACTAAACCC-TA------A----ATTTATGGGT-ATTTCTTCTCCTAACTATTGACAGAAATTA---ATTCTAG-CTTCTGTG-GCTGTCTGTATTTTTTGACATGGTTCCTGTCT--AAGTGAAC--T--TTGAAT-AA-GACTGTTAACGCCCCGT-GTAGGTCCCCCACACAACATGTTGACA-GATCCCCAGTA---TCTGCCAGGACAGGT-CTCT-A--GCNTC--AAAGNTACGTATCT-CCCAT-CATC---ATAGA---GCAAGT--AGGGTGTGTGTGAT-TG---TC-----AGTCG-CCTG-TAGATAT-----TTG---TGACCTGTTACCTAGTC-GCT---GT--A-CGA---CA-GGG-AC-AGATA-ACANATGTGCAC-GGT--CGCAA--AGGG------AGATATAATATAAAANT-TNTATC-CCGT-TCATTTC-ACTGACTTCTTGT-T--CCAACNTTAA-TTCTTTCAACTATAGC-GTAAACTCTTTATACGAANATAGT-AGCNCTCTTGCCCAACC-TTCCTAAACTTAG----TA-A-CA-TAGACTGAC-CCACCT--ACCG-C-T---CACTGTA-TCTCT-G-TCTGT--CTAC--TACT-ACT--ANGACAC---------GAT-AT--GGGGCTTGTGAG-AGTCCTCTG-CTTCA-TTCTATC-TGTGACAGTTTTAGCGCT-GT---TTGATATCTNCCGG-TAATCGTAC-G-GTAT-AATCGCCTAAATATAAACCCATCATATACATAACCTAGACTTTAGAACTA-AACCTA-CATGTGA-TTATTG-ACCTA-TCAATGGCGTATCTCTTTTTCT-TTGACACAAACAAACACTGTGCTTTC-AATGAC-ATGGAA--GTGGATAATA-AG----CAC-ATTTATCAA--CGCATCATG-AAAT--A-CAA-CATTATGACAGGT-TGAGA-ATAACTG-ATCTATTACATT-TAAATG-CA-TC-ATGTTTGAAAGGAAATC-TGAT----CC---CTNTG-C-G-AA----A-C-T-NTA--A-ACGC----G-T-GCT--TTTCC------C-CGA--T--------A-AA---AAG-CAATATC------TA--T-TATCTA-TTTCTG------AC-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A-TTA-C-AAAG-TAT-GGATT--G-GAGAGG-G--------------------CCGGGATC------AGAATCTC---------TCTGAGAGTGG--GACTA--T-GTAACAGGAA-GG--------------ACAACGCCCA-TTTTGTAAAATGTTTCT-AA--C--TTT--TGA-T--ACAGGGACATCTGTTGC-GCCCC-G-ACAA-TTTTC---CTGCAAACATAT-GTTGTTCT-CCGG-----------AAT-AAAGAAATT-TGGAAGGGTAACC-GGTAT-ATA-CACA--CCGCAT---CAAGGATTT--GAAA--CAAAACC-A-ACACATGTTGGAGC-AATGTTG-A--TGGT-ATCCATGG-AGTTGAA-GAGCTTTCT-TGA-ATTCT-C-CAAAATAATACTTG--TTTTCATAAAAT-ATGAACAC-AGTAA-ATTCGTC---ACAGAAA--ACT-TCCTTCAAAATNATTTTC-A-TGATTCCGTAACGGAGAAAACTGG--CAATGG-TCATAGAGTACACTANCTTTGNCCCGCTCG-TG-AAAAGAAA-TTCTCCA-CT-CCAAAGTCC-GAGTTTAATTCATT--TGT-CTGT-TTGTTT-GC-GA-T-AGGAA--CGAG--AT-GAA-ATCCT----TCGT---CAAT-AATTG----A-TTG-TAGG-T--ACGA--CTACGCG--A-------T-GGCCA---------ATGCGC--GAGT-CA-AACATC--TATCAAACCCAGGG--AA--GGGCTGGTAAATGG-GCA-GTGACGGGAA--TGGAAACA-C-AGCGGC-----GATA---TCAGT-TTCTATGAGAT--AG-ATAAGTGTAG-TTGT-GACAN--GGACC-GTGCAG-GGTTCTC---ACC-----TTC-GCT----------GGCT--T--------GGAT-C-A-A---T--CC-ACTC-AGTAA--T-TTG-ATGG-NNT--CTCATCCG-G---A-G--TAAT-GAACTTGA-AAT---GTAAT-ACAG-TATTGTTT-CTC-TCC--AATA-G--T-GAGGN--CAT--G--AC---AA-T-TC--G-GTNATT-TGACCGGT------------------GT---GAG--TAAGT-T--GTA-ATCTGGCGAA----TCC-CGG-G--GG-AGTATCAGAC-GGTC-TCCATAAT-AGA--TAAGGTGTATGT-CTGG-GTGGATGAATTG---GANA------CGTG-GACTG-AGACATCT--CACA-T-ATCAC-C-CTT-TATGGAT--CA---GG---TAG--C-CAACGC-----ATG---A--AATCCAT--GT--T------CAG-A-TGAT-TT---AAACCT----G-AATC-CCTCCCTANG--ACT-A-CCACTCAGCAT-A-T-TC-TCACTCCNCTATATAACT-CTGAAGGTTTC----CGTATCATC-T-CC-C-C---GTGTCCCCCAG----ATCCCTTCTG-AAGGTCACTTCTGTC-GG-TGTCCC---TATCTCAC-GACAC-----A---CACCCACATA-CAGGGCTTCTGACACACGGGGAATGTGATCCATCC-TGTAACGA-TTC-G-TTAACGTTAG-TTGATCGAC-ACAATA-CAAATTTCT-ATT-AATACGAG-ACTACACATTAT----ACAGC--GTTCTGAAAT-AAT-TC--GTGAAA--AGTTTG----TATAAAAA-G----------TGTAAT-------------TCTTACAAAATCCACTCTACCTGAGAATTT--CAAAGTTCTATTTATAGACAATCGGAAAATAC-CCGGTT-AAGCT-CCGC--GCTACTTTTCTT-TTGCA---TGTACTCTGTTG-AC-CTTAA-TATGGAATACCAGT--TTTA-TTTGATTCG-TT-ATCGA
finalCons : NACAATAAGTTA-T-AAGTAACAAACC-ATTCAATA-CAT-------TTGTAAGTA-AGTCT-TTAA-TA-TATTA---TTGCGC---ACC----------------TACCG-------TTGAGTACAAAT-ATTGACTG-AA-AT--ATCAA--------CAGAA------------G--TCCAT----ACA-----ACATT--ACATT-TAT--AAAT---GA---AAATACA---T-T--A--A-ACAAT-----A-TT-CTGTACAG--AAAACNTT--------------GATTGTTCTATGTCACAAAAC------------------ATTTATGGGT-ATTTCTTCTCCTAACTATTGACAGAAATTA---ATTCTAG-CTTCTGTG-GCTGTCTGTATTTTTTGACATGGTTCCTGTCT--AAGTGAAC--T--TTGAAT-AA-GACTGTTAACGCCCCGT-GTAGGTCCCCCACACAACATGTTGACA-GATCCCCAGTA---TCTGCCAGGACAGGT-CTCT-A--GCNTC--AAAGNTACGTATCT-CCCAT-CATC---ATAGAG---CA-GT--AGGGTGTGTGTGAT-TG---TC-----AGTCG-CCTG-TAGATAT-----TTG---TGACCTGTTACCTAGTC-GCT---GT--A-CGA---CA-GGG-AC-AGATA-ACANATGTGCAC-GGT--CGCAA--AGGG------AGATATAATATAAAANT-TNTATC-CCGT-TCATTTC-ACTGACTTCTTGT-T--CCAACNTTAA-TTCTTTCAACTATAGC-GTAAACTCTTTATACGAANATAGT-AGCNCTCTTGCCCAACC-TTCCTAAACTTAG----TA-A-CA-TAGACTGAC-CCACCT--ACCG-C-T---CACTGTA-TCTCT-G-TCTGT--CTAC--TACT-ACT--ANGACAC---------GAT-AT--GGGGCTTGTGAG-AGTCCTCTG-CTTCA-TTCTATC-TGTGACAGTTTTAGCGCT-GT---TTGATATCTNCCGG-TAATCGTAC-G-GTAT-AATCGCCTAAATATAAACCCATCATATACATAACCTAGACTTTAGAACTA-AACCTA-CATGTGA-TTATTG-ACCTA-TCAATGGCGTATCTCTTTTTCT-TTGACACAAACAAACACTGTGCTTTC-AATGAC-ATGGAA--GTGGATAATA-AG----CAC-ATTTATCAA--CGCATCATG-AAAT--A-CAA-CATTATGACAGGT-TGAGA-ATAACTG-ATCTATTACATT-TAAATG-CA-TC-ATGTTTGAAAGGAAATC-TGAT----CC---CTNTG-C-G-AA----A-C-T-NTA--A-ACGC----G-T-GCT--TTTCC------C-CGA--T--------A-AA---AAG-CAATATC------TAT----ATCTA-TTTCTG------AC-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A-TTA-C-AAAG-TAT-GGATTG---GAGAGG-G--------------------CCGGGATC------AGAATCTC---------TCTGAGAGTGG--GACTA--T-GTAACAGGAA-GGN--------------CAACGCCCA-TTTTGTAAAATGTTTCT-AA--C--TTT--TGA-T--ACAGGGACATCTGTTGC-GCCCCG--ACAA-TTTTC---CTGCAAACATAT---TGTTCT-CCGG-----------AAT-AAAGAAATT-TGGAAGGGTAACC-GGTAT-ATA-CACA--CCGCAT---CAAGGATTT--GAAA--CAAAACCA---CACATGTTGGAGC-AATGTTG-A--TGGT-ATCCATGGA-GTTGAA-GAGCTTTCT-TGA-ATTCT-C-CAAAATAATACTTG--TTTTCATAAAAT-ATGAACAC-AGTAA-ATTCGTC---ACAGAAA--ACT-TCCTTCAAAATNATTTTC-A-TGATTCCGTAACGGAGAAAACTGG--CAATGG-TCATAGAGTACACTANCTTTGNCCCGCTCG-TG-AAAAGAAA-TTCTCCA-CT-CCAAAGTCC-GAGTTT--TTCATT--TGT-CTGT-TTGTTTGCGAT----AGGAA--CGAG--AT-GAA-ATCCT----TCGT---CAAT-AATTGA-----TTG-TAGTACAAT-------ACGCGA---------T-GGCCA----------TGCGC--GAGT-CA-AACATC--TATCAAACCCAGGG--AA--GGGCTGGTAAATGG-GCA-GTGACGGGAA--TGGAAACA-C-AGCGGC-----GATA---TCAGN-TTCTATGGATT---G-ATAAGTGTAG-TTGT-GACAN--GGACC-GTGCANG--TTCTC---ACC-----TTCGCTGGCT----------------------GGATTAANT-------CC-ACTC-AGTAAT---TTG-ATGGNN-T--CTCATCCG-G---A-G--TAAT-GAACTTGA-AAT---GTA-T-ACAG-TATTGTTT-CTC-TCC--AATA-G--T-GAGGN--CAT--G--AC---AA-T-TC--G-GTNATT-TGACCGGT------------------GT---GAGTA---GT-T--GTA-ATCTGGCGAA----TCC-CGG-G--GG-AGTATCAGAC-GGTC-TCCATA-T-AGA--TAAGGTGTATGT-CTGG-GTGGATGAATTAGAAA---------CGTG-GACTG-AGACATCT--CACA-T-ATCACC----T-TATG-AT--CA---GG---TAG--C-CAACGC-----ATGA-----AATCCAT--GTT--------CAG-A-TGAT-TT---AAACCTG-----AATC-CCTCCCTANG--ACT-A-CCACTCAGCAT-A-T-TC-TCACTCCNCTATATAACTN-TGAAGGTTTC----CGTATCATC-T-CC-C-C---GTGTCCCCCAG----ATCCCTTCTG-AAGGTCACTTCTGTC-GG-TGTCCC---TATCTCAC-GACACA--------CACCCACATA-CAGGGCTTCTGACACACGGGGAATGTGATCCATCC-TGTAACGA-TTCG--TTAACGTTAGTTGAT-CGAC-ACAATA-CAAATTTCTATT--AATACGANACT-ACACATTAT----ACAGC--GTTCTGAT---AAT-TC--GTGAAAAG---TTG----TATAAAAAGTGTAAT-------------------------CTTACAAAATCCACTCTACCTGAGAATTT--CAAAGTTCTATTTATAGACAATCGGAAAATAC-CCGGTT-AAGCT-CCG----CTACTTTTCTT-TTGCA---TGTACTCTGTTGACCTTAAT---ATGGAATACCAGTC-TTTA-TTTGATTCG-TT-ATCGA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|35 ): TTATCCTATGATAAGCTGAATATGAAAGGAATGCTTGTTGATTTAATAGTGTCTTCATGGGAATGTACTGTTATCCATCAATCCACTAAATAGAACAGCTGATAACCCTAAC
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 333333333 11111 5555555555555555555555 2222222 33333333333 111111 333333333333333 1111 3333333333333 22222 11 111 3333333333333333 22222 111 55555555 111111111111111111111111111111111111 11111 222 111 11 11 3333333 1 1 1 1 2222 1 22222222222 111 222222 11 111 22222 222 11 333333 111 1 3333333333333333333 1 1 1 1 1 11 11 333333 1111 111111111 11 1 1 22 11 33333 1 222222222222 1 1 11 1 22222 1 1 11 11 5555555555555555555555555555 1 11 1 11 1 1 1 111 1 2222 1 1 1 2 1 1 11111 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 111 111 111111 22222222222222222222 111111111 444444444444444444 1 111 222 44444444444 11 111 11 11 11 11 1 1 1 1 1 1 11 1 1 1 3333 222222 111 11 2 1 1 2 1 1 1 22 1 11 1111 111 111 444444444444444444444444444444444444444 11 11 1 11 1 11111 3333333333333333333333333333333 1111 11 111111 1 333333333333333333 1111 22 3333333 111 2222 111 11111 222 1111111111 11111 222222 2222222222 1 111 111111 222 1111 1 111 1111 111 222222222 11111111 11111 11111 11111 11111111 111 1111 777777777777777777777777777777 11 1 1111 111 111 11111111111 333333
lowQualScore : 3 8 8 8 7 6 666666666 7 2 6 6 6 6 00000 9999999999999999999999 8888888 1 6 11111111111 6 6 999999 888888888888888 7777 9999999999999 8 44444 11 444 0 0000000000000000 00000 8 8 444 00000000 000000000000000000000000000000000000 11111 55 0 1 3 333 333 6 0 22 6 3 11 0000000 0 22 0 0 9 3 3 6 7 9 2 3 0 8 0000 3 8 0 99999999999 11 0 8 8 444 555555 8 11 77 8 444 00000 777 33 666666 777 5 3 7777777777777777777 0 0 0 0 1 7 3 88 0 88 888888 2222 999999999 8 8 8 8 11 77 0 7 2 55 33 1 77777 6 3 1 3 333333333333 0 5 33 0 88888 0 0 33 33 3 4444444444444444444444444444 0 33 2 9 3 0 3 22 3 0 0 3 0 777 1 2 0 3 0000 0 88 2 3 2 3 6 3 6 6 0 5 0 0 5 4 66 0 0 4 9999 4 55 2 4 55 4 4 22 4 4 4 3 3 3 3 0 22222 22 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 3 000 3 999999 000 3 222222 3 44 3 77 6666 6 3 3 3 3 7777 3 77777777777777777777 999999 333333333 99 777 4 333333333333333333 1 8 4 66 66 66 5 77 8 8 999 0 6 444 555 8 8 88 66666666666 8 8 99 8 8 8 11 444 11 55 99 8 8 8 11 8 0 77 3 0 0 0 0 0 9 33 3 3 3 7 0000 555555 6 1 777 8888 0 7 88 0 5 1 1 0 3 6 0 3 0 0 6 6 77 2 99 6 8 0 6 8 8 8 99 3 99 6 5 2222 3 000 5 444 5 5 77 777777777777777777777777777777777777777 5 5 5 5 55 5 5 77 1 5 5 33 77 5 9 5 5 11 4 4 7 00000 777 888 3 8 777 3 8888 2 444 2 555 555 77777 2222222222222222222222222222222 2 777777 0 333 7777 3 2 444 66 888 3 44 2 2 1 3 555 3 44 3 3 6 00 3 55 3 666 99 55 777 4 4 444444 1 5 8 666666666666666666 888 66 5 66 66 5 0 0000 66 5 77 5 0 00 5 5 5 77 2 88 8 6 0 8888888 444 8 3 8 99 0000 111 6 6 6 99999 777 4444444444 44444 222222 99 9999999999 3 5 5 555 999999 4 9999 4 4 5 111 5 33 1 2 66 0000 5 5 0 5 333 2222 5 5 5 111 6 555555555 8 0 1 5 5 888 22222222 6 6 55 33333 7 99999 1 1 88888 99 44444444 6 99 111 99 4444 888888888888888888888888888888 6 3 99 77 0 3 0 8 8 8 4444 5 000 666 66666666666 1 777777 6 8 8
lowQualScore : . . . . . . ......... . . . . . . ..... ...................... ....... . . ........... . . ...... ............... .... ............. . ..... .. ... . ................ ..... . . ... ........ .................................... ..... .. . . . ... ... . . .. . . .. ....... . .. . . . . . . . . . . . . .... . . . ........... .. . . . ... ...... . .. .. . ... ..... ... .. ...... ... . . ................... . . . . . . . .. . .. ...... .... ......... . . . . .. .. . . . .. .. . ..... . . . . ............ . . .. . ..... . . .. .. . ............................ . .. . . . . . .. . . . . . ... . . . . .... . .. . . . . . . . . . . . . . . .. . . . .... . .. . . .. . . .. . . . . . . . . ..... .. ............................................................................ . ... . ...... ... . ...... . .. . .. .... . . . . . .... . .................... ...... ......... .. ... . .................. . . . .. .. .. . .. . . ... . . ... ... . . .. ........... . . .. . . . .. ... .. .. .. . . . .. . . .. . . . . . . . .. . . . . .... ...... . . ... .... . . .. . . . . . . . . . . . . . .. . .. . . . . . . . .. . .. . . .... . ... . ... . . .. ....................................... . . . . .. . . .. . . . .. .. . . . . .. . . . ..... ... ... . . ... . .... . ... . ... ... ..... ............................... . ...... . ... .... . . ... .. ... . .. . . . . ... . .. . . . .. . .. . ... .. .. ... . . ...... . . . .................. ... .. . .. .. . . .... .. . .. . . .. . . . .. . .. . . . ....... ... . . . .. .... ... . . . ..... ... .......... ..... ...... .. .......... . . . ... ...... . .... . . . ... . .. . . .. .... . . . . ... .... . . . ... . ......... . . . . . ... ........ . . .. ..... . ..... . . ..... .. ........ . .. ... .. .... .............................. . . .. .. . . . . . . .... . ... ... ........... . ...... . . .
lowQualScore : 8 0 0 0 8 7 333333333 3 5 7 7 7 7 00000 7777777777777777777777 3333333 0 7 77777777777 7 7 222222 444444444444444 0000 0000000000000 0 00000 00 000 8 2222222222222222 00000 0 0 000 00000000 888888888888888888888888888888888888 66666 22 8 0 2 333 222 7 6 00 4 2 00 2222222 8 55 0 0 2 7 3 7 3 8 5 2 0 8 8888 2 8 0 55555555555 22 8 0 0 000 000000 0 00 00 0 000 00000 000 22 222222 555 5 2 8888888888888888888 0 0 0 0 0 3 3 33 7 33 333333 7777 888888888 0 0 0 0 00 00 0 3 0 33 33 0 33333 7 3 2 2 888888888888 0 0 88 0 22222 0 0 22 88 2 2222222222222222222222222222 0 88 5 2 0 0 0 55 2 0 0 2 0 555 0 5 0 2 5555 0 22 5 2 0 3 7 3 7 7 7 0 8 4 0 4 11 1 0 4 4444 4 55 5 0 55 0 0 00 0 0 0 6 6 6 6 4 77777 22 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 3 444 3 666666 444 3 999999 3 66 3 33 5555 2 1 1 3 3 4444 3 11111111111111111111 666666 333333333 55 000 0 000000000000000000 1 9 4 11 11 99 0 99 2 0 222 8 0 000 000 0 0 88 00000000000 0 0 00 0 0 0 00 000 00 88 22 0 0 0 00 0 8 00 2 0 0 0 0 0 0 88 3 3 3 3 0000 777777 7 0 777 3333 7 3 33 0 5 0 0 7 3 7 0 2 0 0 5 7 55 5 22 7 0 6 0 0 0 0 00 2 22 7 7 1111 0 000 7 777 7 7 99 111111111111111111111111111111111111111 7 7 7 7 77 7 7 99 6 0 0 66 99 0 0 7 7 00 0 0 5 00000 000 222 4 0 999 6 9999 9 999 9 999 000 11111 0000000000000000000000000000000 9 444444 4 666 5555 4 9 999 88 555 1 22 0 9 5 1 444 1 22 3 3 7 00 6 00 6 555 55 55 000 0 0 444444 0 0 1 999999999999999999 888 99 0 99 99 0 1 6666 44 7 99 7 1 77 7 7 7 99 5 88 0 4 8 2222222 000 0 8 0 22 8888 777 7 7 7 33333 555 0000000000 33333 000000 22 2222222222 3 7 7 777 888888 4 6666 4 4 0 111 0 99 0 0 00 6666 0 0 0 0 888 1111 7 7 7 777 7 000000000 0 8 4 7 7 666 22222222 7 7 00 00000 2 00000 0 7 33333 22 88888888 7 22 777 22 2222 555555555555555555555555555555 7 2 00 44 8 6 8 0 0 0 2222 7 000 777 22222222222 0 888888 7 0 0
consensus : NACAATAAGTTA-T-AAGTAACAAACC-ATTCAATA-CA---T----TTGTAAGTA-AGTCT-TTAA-TA-TAT--TA-TTGCGC---ACC----------------TACCG-------TTGAGTACAAAT-ATTG-----------ACTGAA-AT-ATCAA------CAGAA------------G--TCCAT----AC---A--ACATTG-ACATT-TA-T---AAA--TGA---AAATACA---T-T--A--A-ACAAT-----A-TT-CTGTACAG---AAAACG----A--TTGATTGTTCTATGTCAAC-AA----AA--C---A----------T--T---TATGGGT-ATTTCTTCTCCTAACTATTGACAGAAATTA---ATTCTA-GCTTCTGTG-GCTGTCTGTATTTTTTGACATGGTTCCTGTCT--AAGTGAA--C--TTTGAAT-AA-GACTGTTAACGCCCCG-TGTAGGTCCCCCACACAACATGTTGACA-GATCCCCAGTA---TCTGCCAGGACAGGT-CTCT-A--GCNTC--AAAGNTACGTATCT-CCCAT-CATC---ATAGA---GCAA-GT--AGGGTGTGTGTGAT-TG---TC-----AGTCG-CCTG-TAGATAT-----TTG---TGACCTGTTACCTAGTC-GCT---GT--A-CGA---CA-GGG-AC-AGATA-ACANATGTGCAC-GGT--CGCAA--AGGG------AGATATAATATAAAANT-TNTATC-CCGT-TCATTTC-ACTGACTTCTTGT-T--CCAACNTTAA-TTCTTTCAACTATAGC-GTAAACTCTTTATACGAANATAGT-AGCNCTCTTGCCCAACC-TTCCTAAACTTAG----TA-A-CA-TAGACTGAC-CCACCT--ACCG-C-T---CACTGTA-TCTCT-G-TCTGT--CTAC--TACT-ACT--ANGACAC---------GAT-AT--GGGGCTTGTGAG-AGTCCTCTG-CTTCA-TTCTATC-TGTGACAGTTTTAGCGCT-GT---TTGATATCTNCCGG-TAATCGTAC-G-GTAT-AATCGCCTAAATATAAACCCATCATATACATAACCTAGACTTTAGAACTA-AACCTA-CATGTGA-TTATTG-ACCTA-TCAATGGCGTATCTCTTTTTCT-TTGACACAAACAAACACTGTGCTTTC-AATGAC-ATGGAA--GTGGATAATA-AG----CAC-ATTTATCAA--CGCATCATG-AAAT--A-CAA-CATTATGACAGGT-TGAGA-ATAACTG-ATCTATTACATT-TAAATG-CA-TC-ATGTTTGAAAGGAAATC-----TGATCC---CTNTG-C-G-AA----A-C-T-NTA--A-ACGC----G-T-GCT--TTTCC------C-CGA--T--------A-AA---AAGC-AATATC------TA---TATCTA-TTTCTG------AC-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A-TTA-C-AAAG-TAT-GGATT--G-GAGAGG-G--------------------CCGGGATC------AGAATCTC---------TCTGAGAGTGG--GACTA--T-GTAACAGGAA-GG--------------NCAACGCCCA-TTTTGTAAAATGTTTCT-AA--C--TTT--TGA-T--ACAGGGACATCTGTTGC-GCCCC-G-ACAA-TTTTC---CTGCAAACATA---T-T-GTTCT-CCGG-----------AAT-AAAGAAATT-TGGAAGGGTAACC-GGTAT-ATA-CACA--CCGCAT---CAAGGATTT--GAAA--CAAAACC--ACAC-ATGTTGGAGC-AATGTTG-A--TGGT-ATCCATGG-AGTTGAA-GAGCTTTCT-TGA-ATTCT-C-CAAAATAATACTTG--TTTTCATAAAAT-ATGAACAC-AGTAA-ATTCGTC---ACAGAAA--ACT-TCCTTCAAAATNATTTTC-A-TGATTCCGTAACGGAGAAAACTGG--CAATGGTTCATAGAGTACACTANCTTTGNCCCGCTCG-TG-AAAAGAAA-TTCTCCA-CT-CCAAAGTCC-GAGTTTAATTCATT--TGT-CTGT-TTGTTTTGC-GA-T-AGGAA--CGAG--AT-GAA-ATCCT----TCGT---CAAT-AATTGA-TTG-TA-GT--ACGN---T--------AC-GCG--A-----------------T-GG-CC-AT-GCGC--GAGT-CA-AACATC--TATCAAACCCAGGG--AA--GGGCTGGTAAATGG-GCA-GTGACGGGAA--TGGAAACA-C-AGCGGC-----GATA---TCAGT-TTCTATG-GATN--G-ATAAGTGTAG----TTGT-GACAN--GGACC-GTGCA--GGTTCTC---ACC-----TTCGC---------------------T-GGC---T-GGATC-AAN-TCCACTC-AGTAA--T-TTG-ATGG-NNT--CTCATCCGG---A-G--TAAT-GAACTTGA-AAT---GT-A--TACAG-TATTGTTT-CTC-TCC--AATA-G--T-GAGGN--CAT--G--AC---AA-T-TC--G-GTNATT-TGACCGGT------------------GT---GAG--T-AGTT--GT--A-ATCTGGCGAA----TCC-CGG-G--GG-AGTATCAGAC-GGTC-TCCAT-AT-AGA--TAAGGTGTATGT-CTGG-GTGGATGAATTAGATA-AAC---GTG-GACTG-AGACATCT--CACAT----ATCA---C-CT-T-AT-G---ATCA---GG---TAG--C-CAACGC-----ATG---A--AATCCAT--GT--T------CAG-A-TGAT-TT---AAACCT----G-AATC-CCTCCCTANG--ACT-A-CCACTCAGCAT-A-T-TC-TCACTCCNCTATATAACT-CTGAAGGTTTC----CGTATCATC-T-CC-C-C---GTGTCCCCCAG----ATCCCTTCTG-AAGGTCACTTCTGTC-GG-TGTCCC---TATCTCAC-GACAC-----A---CACCCACATA-CAGGGCTTCTGACACACGGGGAATGTGATCCATCC-TGTAACGA-TTC-G-TTAACGTTAG-TTGATCGAC-ACAATA-CAAATTTCT-ATT-AATACGA-NACTACACATTAT----ACAGC--GTTCT--G--AT-AAT-TC--GTGAA---AAN-TTG----TATAAAAA-GT--GT----------------------AA-TCTTACAAAATCCACTCTACCTGAGAATTT--CAAAGTTCTATTTATAGACAATCGGAAAATAC-CCGGTT-AAGCT-CC----GCTACTTTTCTT-TTGCA---TGTACTCTGTTG-AC-CTTAA-TATGGAATACCAGT-CTTTA-TTTGATTCG-TT-ATCGA
Reference ( family-5170 ) : NACAATAAGTTA-T-AAGTAACAAACC-ATTCAATA-CA---T----TTGTAAGTA-AGTCT-TTAA-TA-TAT--TA-TTGCGC---ACC----------------TACCG-------TTGAGTACAAAT-ATTG-----------ACTGAA-AT-ATCAA------CAGAA------------G--TCCAT----AC---A--ACATT--ACATT-TA-T---AAA--TGA---AAATACA---T-T--A--A-ACAAT-----A-TT-CTGTACAG---AAAACN-------TTGATTGTTCTATGTC-AC-AA----AA--C---A----------T--T---TATGGGT-ATTTCTTCTCCTAACTATTGACAGAAATTA---ATTCTA-GCTTCTGTG-GCTGTCTGTATTTTTTGACATGGTTCCTGTCT--AAGTGAA--C--TTTGAAT-AA-GACTGTTAACGCCCCG-TGTAGGTCCCCCACACAACATGTTGACA-GATCCCCAGTA---TCTGCCAGGACAGGT-CTCT-A--GCNTC--AAAGNTACGTATCT-CCCAT-CATC---ATAGA---GC-A-GT--AGGGTGTGTGTGAT-TG---TC-----AGTCG-CCTG-TAGATAT-----TTG---TGACCTGTTACCTAGTC-GCT---GT--A-CGA---CA-GGG-AC-AGATA-ACANATGTGCAC-GGT--CGCAA--AGGG------AGATATAATATAAAANT-TNTATC-CCGT-TCATTTC-ACTGACTTCTTGT-T--CCAACNTTAA-TTCTTTCAACTATAGC-GTAAACTCTTTATACGAANATAGT-AGCNCTCTTGCCCAACC-TTCCTAAACTTAG----TA-A-CA-TAGACTGAC-CCACCT--ACCG-C-T---CACTGTA-TCTCT-G-TCTGT--CTAC--TACT-ACT--ANGACAC---------GAT-AT--GGGGCTTGTGAG-AGTCCTCTG-CTTCA-TTCTATC-TGTGACAGTTTTAGCGCT-GT---TTGATATCTNCCGG-TAATCGTAC-G-GTAT-AATCGCCTAAATATAAACCCATCATATACATAACCTAGACTTTAGAACTA-AACCTA-CATGTGA-TTATTG-ACCTA-TCAATGGCGTATCTCTTTTTCT-TTGACACAAACAAACACTGTGCTTTC-AATGAC-ATGGAA--GTGGATAATA-AG----CAC-ATTTATCAA--CGCATCATG-AAAT--A-CAA-CATTATGACAGGT-TGAGA-ATAACTG-ATCTATTACATT-TAAATG-CA-TC-ATGTTTGAAAGGAAATC-----TGATCC---CTNTG-C-G-AA----A-C-T-NTA--A-ACGC----G-T-GCT--TTTCC------C-CGA--T--------A-AA---AAGC-AATATC------TA---TATCTA-TTTCTG------AC-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A-TTA-C-AAAG-TAT-GGATT--G-GAGAGG-G--------------------CCGGGATC------AGAATCTC---------TCTGAGAGTGG--GACTA--T-GTAACAGGAA-GG--------------NCAACGCCCA-TTTTGTAAAATGTTTCT-AA--C--TTT--TGA-T--ACAGGGACATCTGTTGC-GCCCC-G-ACAA-TTTTC---CTGCAAACATA---T-T-GTTCT-CCGG-----------AAT-AAAGAAATT-TGGAAGGGTAACC-GGTAT-ATA-CACA--CCGCAT---CAAGGATTT--GAAA--CAAAACC--ACAC-ATGTTGGAGC-AATGTTG-A--TGGT-ATCCATGG-AGTTGAA-GAGCTTTCT-TGA-ATTCT-C-CAAAATAATACTTG--TTTTCATAAAAT-ATGAACAC-AGTAA-ATTCGTC---ACAGAAA--ACT-TCCTTCAAAATNATTTTC-A-TGATTCCGTAACGGAGAAAACTGG--CAATGGT-CATAGAGTACACTANCTTTGNCCCGCTCG-TG-AAAAGAAA-TTCTCCA-CT-CCAAAGTCC-GAGTTT--TTCATT--TGT-CTGT-TTGTTT-GC-GA-T-AGGAA--CGAG--AT-GAA-ATCCT----TCGT---CAAT-AATTGA-TTG-TA-GT--ACAA---T--------AC-GCG--A-----------------T-GG-CC-AT-GCGC--GAGT-CA-AACATC--TATCAAACCCAGGG--AA--GGGCTGGTAAATGG-GCA-GTGACGGGAA--TGGAAACA-C-AGCGGC-----GATA---TCAGN-TTCTATG-GATT--G-ATAAGTGTAG----TTGT-GACAN--GGACC-GTGCA--NGTTCTC---ACC-----TTCGC---------------------T-GGC---T-GGATT-AAN-TCCACTC-AGTAA--T-TTG-ATGG-NNT--CTCATCCGG---A-G--TAAT-GAACTTGA-AAT---GT-A--TACAG-TATTGTTT-CTC-TCC--AATA-G--T-GAGGN--CAT--G--AC---AA-T-TC--G-GTNATT-TGACCGGT------------------GT---GAG--T-AGTT--GT--A-ATCTGGCGAA----TCC-CGG-G--GG-AGTATCAGAC-GGTC-TCCAT-AT-AGA--TAAGGTGTATGT-CTGG-GTGGATGAATTAGA---AAC---GTG-GACTG-AGACATCT--CACAT----ATCA---C-CT-T-AT-G---ATCA---GG---TAG--C-CAACGC-----ATG---A--AATCCAT--GT--T------CAG-A-TGAT-TT---AAACCT----G-AATC-CCTCCCTANG--ACT-A-CCACTCAGCAT-A-T-TC-TCACTCCNCTATATAACT-NTGAAGGTTTC----CGTATCATC-T-CC-C-C---GTGTCCCCCAG----ATCCCTTCTG-AAGGTCACTTCTGTC-GG-TGTCCC---TATCTCAC-GACAC-----A---CACCCACATA-CAGGGCTTCTGACACACGGGGAATGTGATCCATCC-TGTAACGA-TTC-G-TTAACGTTAG-TTGATCGAC-ACAATA-CAAATTTCT-ATT-AATACGA-NACTACACATTAT----ACAGC--GTTCT--G--AT-AAT-TC--GTGAA---AAG-TTG----TATAAAAA-GT--GT----------------------AA-TCTTACAAAATCCACTCTACCTGAGAATTT--CAAAGTTCTATTTATAGACAATCGGAAAATAC-CCGGTT-AAGCT-CC----GCTACTTTTCTT-TTGCA---TGTACTCTGTTG-AC-CTTAA-TATGGAATACCAGT-CTTTA-TTTGATTCG-TT-ATCGA
gi|1 : ACAATGGGTTAAT-AAGTAACAAACCTATTCATTA-C---------TTGTACGTATAGTCT-TTAACTA-TAT--TAATTGCGC----CC----------------TATCGC------TTGAGTACAAATTATTG-----------ACTGAACATTATCTA------CATAA------------G--TCCAT----ACG--A--ATATTGTACATT-TACT---AAACCTGA---AAATACA---T-T--A--AGACAAT-----AGTC-CTGCACAG---AAACGG-------TTGATTGTTCTAT-TCAAC-TA----AACCC---ATATCCGCTATT--T---TATGGAT-ATTCCCTCTTCT-ACTATTGACAGAAGTTA---ATTCTAGGCTTCTGTGTGCTGTCTGTATTTGTTCTCCTGGTTCCTGTCT--AAGTGAACTC--TTTGAAT-AACGACTGGTAACGCCCCGTTGTAAGTCCCCCACACAACATGTTGACATGACCCCCAGTAATTTCTGCCAGGACAGGT-CTCT-A--ACTTCTAAAATCTACGTATCT-CCCAT-CATC---ATAGA----C-ATGT--AGGGTGTGTGTAAT-TG---TC-----AGTTG-CCTG-TAGATAT-----TTG---TGACTGG--ACC---TT-ACT---GT--A-TGA---CA-GGG-AC-AGATA-ACAGTTGTGCAC-GGT--CACAA--AGGG------AGATATAATATAAAAATATCTATC-CCGT-TCATTTC-ACTGACTTCTTGT-T--CCAACTTAAA-TTCTTTCAATTATATT-GTAAACTCTTTATTCGAACATAGT--GTCCTCTTGCCCAACC-TTCCTAAACTT-G----TA-A-CA-GAGACTGACTCCACCTGAGCCA-CGT---CACTGTA-TCTCTGG-TCTGTTCCTACGATACCGACCAAATAACAT---------GAT-AT--GGGGCTTGGGAG-AGTCCTCT--CTTCC-TTCTATC-TGTGACAGTTAAAGCGCT-GT---TTGATATCTTCCGGTTAATCGTAC-G-GTAT-ATCCGCCTAAA-ATAAA--CATCATATACATAACCTAGACTTTAGAACTAGAACCTA-CATGTGA-TTTTTGAACCTACTCAACGGTGTATTTATATTTCTATGGACACAAACAAATATCA-GCTTTCAAATTACAATGGAAAGGTGAATTATA-AG----TA--ATTTAACAA--CGCTTGATGAAAATAGA-CAACCATTATGACTGGTGTGAGATATAATTG-ATCTATTGCATTCTAAATG-CA-TCAATATTTTGAAAGTAACC-----T-ATCC---CTGTG-C-G-AG----A-C-TGCTA--A-ACGCA---A-T-GTT--TTTCC------C-TGA--T--------ATAA---ATGC-AATATC------TATC-TATCTACTTTCTGA-----ACGTTGAGGT---ACTTTCC-CC--TCTGAAC----ACTTACC-AAAGAAAT-GGATT--GCGAGAAG-G--------------------GCGGAATC------AGAAT-TT---------TCTGAGAGTGGC-GACT---T-GT-ACAGGAA-GG--------------AGAATCCCCAGTTTCGTAAAATGTTTCT-AA--C--TCT--TGT-TTAACAGGGACATCTGTTGC-GCTCC-GTACAG-CTTTC---CTGCAAACTTATGGT-T-GTTCT-CCGG-----------AATAAAAGAAATT-TGGAAAGGTAACC-AGTAT-ATATCACA--CCGCAT---CAAGGATTT--GAAAC-CAAAACCAAATAC-ATGTT-AAGC-AATGTTG-A--TGGT-A-CCATGG--GTTGAATGAGCTTTCTATGA-ATTCT-CACAAAATAATACTTGGTTTTTCATAAAATGATTAACACGAGTAATATTCATCTGGACAGGAA--ATTGTCCTTCAAAAAGATTTTCAA-TGATTCCGTAACAGAG-AAACTGG--CAATGGT-CATAGAGT-CACTAGCTTTGGCCCGCTCG-TGAAAAAGAAATTTCTCCATCTGCCAAAATCC-GAATTTAATTCATT--TGT-CTGT-TTGTGT-GCTAA-TCAGGAA--CAAG--AT-GAA-ATCTC----TCTT---CAAT-AATTG--TTG-TAGGT--ACGGC--T--------AC-GCGGAA-----------------T-GG-CCAAT-GTGC--GAGT-CA-GAAATC--TCTCAAACCCAGGG--AAGGGGGCTGGTAAATGGTGCA-GTGACGGGAA--TGGAAACA-CTAGCGGC-----GACA---TCA-T-TTC-ACGAGACA--G-ATAAGTGTAG----TTGT-GAAAG--GGACC-GTGCAGCGGTTCCTGCAACC-----TTCTC---------------------T-AGCCTGT-GAATC-A---CTCACTC-AGTAGC-T-TTGAATGGTCTT--CTCATC--G---A-G--TAAT-GAACTTGA-AAT---GTAA--TGCAA-TACTGTTT-CTC-TCC--AATA-G--T-GGAGT--CGC--GCAAC---AA-T-TG--G-GTTATA-GGACCGGT------------------GT---GAG--GAAGTT--GT--A-ATCTGGCGAA----TCC-CGG-G--GG-AGTAGCAGA--GATC-TCCATAAT-AGA--TAAGGTGTATCT-CT-G-GTGGATGAAT---A---TAC---GTG-GATGA-AGACATCT--CACAT----ATCACACC-TT-T-ATGG---AGCAG--GG---TAC--C-TAATGC-----ATGT--T--AATCCAT--GT--T------CAGTA-GAAT-TT---AAACCT----GAAATC-CCTCCCTACG--ACT-AGCCACTCAGC-T-AGT-TC-TGTATCCTCTATATAACTCCTGAAGGTTTC----CGTATCATC-T-CC-C-C---GTGTCCACGAG----ATCCCTTCTG-AAGGCAACTTCTGTC-GGTTGTCCC---TA-CTCAC-GACAC-----AAATCACCCACATAGCGGGGCTTCTGACACACGGGGAA-GTGATCCATCC-TGTAACGAGTTCAG-TTAA-ATTAGTTTGATCGACTCCAATA-CGAATTTCTAATTGAATACGAGCACTACACATTAC----ACAGC--ATTCT--GAAATGAAT-TC--GTGAA---AAGTTTG----TTTAAAAATGT--AT----------------------AATTCTTACAAAATCTACACTACCTGAGAATTTTACAAAGTTCTATTTAT-GACAATCGGAAAATACTCCGGTTAAAGCTGCCGCTAGCTATTTCTCTG-TTGCA---TGCG-------------------ATGGAATAC--G----TTA-TTTGATTCGTTT-ATCAA
gi|10 : c-TAAATA-CAATC-ATGTTTGATAGGAAATCA----TGATGC---TTGTATC-A-AC----A-C-T-GT------------------CTA-TTTCA------G-TAA-----------A-AA---AAGCCAATATC------TA---TATCTA-TTTCTG------AC-TTGAGGT--AAACTTTC-CCTGTCTGC-C----ATTTA-C-AAAG-TATGGGATT--G-GAGAGG-G--------------------CCGGGATC------GAGATCTC---------TCTGGAAGTGG--GGC-A--T-GTAGCAGAAA-GC--------------AC----CCCAGTTTTGTACAATGTTTCT-AAATC--TTT--TGA-T--ACA-GTAGATGTGTTGTGGCCCCGG-ACAATTTTTC---CTGCAGAAATG---TGT-GTTCT-CCGGA----------AAT-AAA-AAATT-TGGGAGCTTAACCAAGTATGATA-CACA--CTGCATTCACAAGGATTT--GAAAGTCAAAACC--ACAC-GTGTTGGAGCAAATGTTG-ACGCGGTAATCCATGGTAATTG-A-GAGCTTTCT-TGAGATTCCGC-CAAAATAATA-TTG--TTTTCCTGAAAT-ATGAACAC-AGTAA-A-TCGT-----CAGAAATCACT-TCCTTCAAAATAATTTTC-ACTGA----GTAACGAAGAAAACTGG--CAATGGagctg
gi|11 : AA--TGGAAACA-C-AACG-C-----GATG---TCATA-TTCATTA-GATA--G-ACGAGTATAGAACTTTGT-GACAT--AG-----------------C---A-----------------------------------------T-GGAAA-ACG-TCCACTA-AATAA--T-T-G-ATGG-ACT--CTCATTCGG---A-A--T--------------AT---GT-A--GTCGG-TATTGTTT-CTC-TCC--AATA-G--T-GAGTC--CGT--G--AC---AA-T-TT--G-GTTATA-TGA-CGGT------------------GT---GAG--T-AGGT--GT--A-ATCTGGCGAA----TCT-CGG-G--GG-AGTGTCAGA--GGTC-TTCAT-AT-AGA--TAA-GTGTATGT-CTGT-GTGGATGAATT-GATAGAAC---GTG-GACTG-AGACATCT--CACAT----CTCA---C-CT-T-AT-G---ATCA---GT---TTG--C-CAAAAC-----ATG---A--AATCCAT--G---T------CAG-A-TGAT-TT---AA-------------------------------A-CCACTCAGCAT-ATT-TC-TCACTCCTCTATATAAGT-CTGAAGGTTTC----TGTATCATC-C-CC-TAC---GTGT----CAGAAATATCCCTTCTG-AAGGTCACTTCTGTC-GG-TGTCCC---TATCTCAC-GACAC-----A---CCCCCACATA-CAGGACTTCTGACGCACGTGGAATGatctctcgtcaacaaatgcgtaata
gi|12 : TTTGTTCCGCTTG-TG-AAAAGAAA-TTCTCCC-TT-CTATAATCTTGAGTTC--TT-ATT--TGTGCTGTACTGTTTTGC-GA-T-AGAAAGAC-AG--ATTGAATATCCT----TCCT---CGAT-AATTG---TG-AA-GTCGAGGA---TTGATGCCAAC-GCG--AAGAGGAATGATCAGAATC-GG-CC-AT-GTGTTGAAGTACATAAGATCGCTTTCAAATCAAGGGG-AA--GTGCTGGTAA-TGG-GCA-GTGACGGGAA--TGAAAACA-C-AGCG-C-----AATG---TCGAA-ATCTA---AATTCAG-AAAAGTGTAG----CTGT-GACAA--GGACC-GTGCA--TGTTCTC---ATT-----TTCGT---------------------T-GGA---T-GGACT-AAG-TCCATTCCAGT----T-TTG-ATGA-AAT--CTCAACAGG---A-G--CATT-GAACTTGA-AAT---AT-A--TACAG-CATTGTTT-CTC-TCC--AATA-G--T-GAGGA--CAT--G--AC---AA-T-TT--G-GCGAT
gi|13 : TACGTA-CT-CCCAT-CATC---GTAGA---GC-A-GT--AGGGTTTGT-TGATCTG---CC-----AGTT---CTG-TAGATACATGTATTG---TGACTTGTTACCTAGTC---T---GT--AGTGA---CATAGG-AT-AGATA-GCATATG--CAC-GGT--CACAA--AGGG------AGATA-AACATAAAACT-GATATT-CCGT-TCATTCC-ACTCACTGCTTGT-T--CCAACATTAA-TTCTT-CAA-TACAG--GTAATCTTTTCACA-GAAAAGAGT-A--TCTCTTGCCCAAGCATTCCTAAACTTAG----TCTA-CA-TAGACTGAC-C-ACCC--ACCGTC-G---CACTTTA-TCTTT-G-TCTAT--CTAC-------ACT--ATGGCAT---------GAT-AT--GGG-------------TCTCTG-CTTCA-TTCTATC-TGTGACAG--TTAGGGCT-GT---GTGATATTTACCGG-T-ATCGTACAA-GTAT-AA-CG-CTAAATATAAATC
gi|14 : -TTATTG-ACCTA-TCATTATTGAATCTCTTTTTGT-TTGGCACAGACAATCTTTGTGCTTTT-AATGCC-ATGGAC--GTTGATAATA-A-----CAC-ATTTATCAA--CGCATCATG-AAAT--A-TAA-CATTATGGCAGGT-TGATA-ATAACTG-ATCTATGACATT-TAAATG-CA-TC-ATGTTTGAAAGGAAATC-----TGATAC-------G-A-G-AATTGTA-C-T-TCT--A-ACACTG--A-T-GC---TTTCG------C-CAA-----------A-AC---AAGC-AATATC------TA---TATCTA-TTTCTG-------C-TT-AGGT--AATTTTCC----GTCTG--C----A-TTA-C-AAAG-TGT-GGATT--A-GAGA-G-G--------------------CCGGG-TC------AGAATCTC---------TCTGAGAGTGG--GACTG--C-GTAACAGGAA-AG---------------CAACGCCCA-TTTTGTCAAATGTTTCTGAG--C--TTT--TGA-T--ACAattgccaaaacacaaa
gi|15 : TTTTCT-TTGACACAGACAAACACTGAGTTTTT-AATGAC-ATGGAA--GTGAATA-TA-AG----CAC-ATTTATCAA--AGCATCATG-AAAT--A-TAA-CATTATGACAGGT-GGAGA-ATAACTG-ATCTATTACATT-TATACG-CA-TC-ATGTTTGAAAGGAAATC-----TGAACT---CTTTA-T-G-AA----A-CAT-GTA------TCTTTTG-T-GCT--TT--C------C-CGA--T--------A-AA---ATGC-AATATC------TA---TATCTA-CTTCTG------AC-TTGAGGT--AACTTTCC-TCTGTCTG--C----A-TTA-C-AAAG-TAT-GGATT--G-GAGAAG-G--------------------CCGGGATC------AGAATCTC---------TCTGAGAGTGG--GGCTA--T-ATAGCAAAAA-GG---------------CAATGCCCA-TTTTGTAAAACTTTTCC-AA--C--TTT--TGA-a
gi|16 : cAGTCC-GAGTTTAATTCATT--TGA-CTGT-TTGTGT-GC-AA-T-AGGGA--CGAG--AT-GAA-ATCCT----TCGT---CAAT-GATTGT-TTG-TA-GT--ACAC---T--------TT-GCG--A-----------------T-GG-CC-AT-GCGC--GAGT-CA-AACATC--TATC-AACCCAGGG--AA--GGGCTGGT-AATGG-GCA-GTGACGGGAA--TGGAAACA-C-AAC-GC-----TAAA---TCATT-TTCTATG-GAGT--G-ATAAGTGTAG----TTGT-GACAT--GGACC-GTGCA--GGTTTTC---ATT-----TTCTC---------------------T-GTT---T-GGATC-ACG-TCCACTC-ATTAA----TTG-ATAT-TGT--CTCATTCGG---A-G--TAAT-GAACTCGA-AAT---GT-A--TACAG-TACTGTTT-CTC-TCC--AATA-G--T-GAGTC--CAT--G--AC---AA-T-
gi|17 : -T-GCT--TT--C------A-CTA--T--------A-AA---AAGC-AATATC------GA---TATAAA-TTTCTT------CC-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A-ATA-T-AAgccgat
gi|18 : tactaatactgtAATAAGTCG-T-AAGTAACAAACC-ATTCAATA-CAATGTACAGTTGTAAGTA-ATTCT-TTAA-TA-TAT--TA-TCGCACACAACCATTGATTTATTATAAATATTGACTGAAATCGAATACAAAT-ATTG-----------ACTGGA-AT-ATCAA------CAGAATCAGAAAATGAAA--TCCAT----AC-------CATTTCACATT-TA-T---GAA--CGAGATAAATGTA---A-T--ACAA-ACAAT-----A-AT-CTGTACAG---AAAACAATTAACTTTGATTTTTCTATGTC-GTTAA----AG--G---G----------T--T---TAC------TTTCTTCTCCTAACTATTGACAGAAAT-A---ATTCTA-GTTTCTATG-GCTATCTGTATTTTGTGACATGGTTCTTGTCT--AAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaatacacactgcatcaaggatttgaagcaaaaccacacatgttgaagcaatgttgatggtatccatggagtt
gi|19 : AGAACTA-AACCTAACATGTGAATTATTA-TCCTA-TCAATGGCGTATCTCTTTTTGT-ATGACACAAACAAATTATGTGCTTTT-AGTGAG-ATGAAA--GTCGACAATAGAG----CAC---TTACCAG--CCAATAATG-AAAT--C-TAA-CAT---GACAGGT-TGAGA-TTAATCG-ATCTATTGCGTT-TAAACG-CT-TC-ATGTTACAAAGGAAATT-----TGAAAC---CTCTG-----GA----A-C-T-GTA--C-ATAT----GGT-ACT--TT-----------CAA--T--------A-AAGA-AAGC-AATATC------TA---TATCTA-TCTCTG------AC-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A-TTA-C-AAAG-AGT-GGATC--A-GAGAGG-G--------------------CCGGGATT------AGAATCTC---------
gi|2 : TTAATCAAGTC-CATTGTG-CAAT--AACAA-CATT-TGG-ATGC-TGAGA-ATAAGTGCATCTATTGCATT-TAAATATCA-TC-ATGTTTACAAGCAAATCTGACTTGA-CCAAGCT----C-G-AC----ATC-T-CTAC-A-ACTT----G-TCGCA--TT-----------CAACTT--------A-AATTTAAAC-ATTATCAACCCATAAATTAGCTA-CTTCTATTTTGCAC-TTGAGGCCAAACTGTCCTCCTGTTTA--TGACAA-TTG-CTAAAG-TAT-GGATTTAG-GAGAGGTG--------------------CCGGGATCTGATTGACAATATC---------TCTGAGAATGG--GGCTA--TTGTAACAGGAAAGG--------------GCAACCCCCA-TTTTGTAAATTTTTTCT-AA--C--TTTCTTGA-T--ACAGAGAAATTCGTCCC-GCCCC-G-AC---TTTTC---CTACACACATA---T-TTGTTCTGCCAG-----------AAT-AGAGAAATT-TGAA--GGTAACC-GGTAT-ATA-CACA--TTGCAT---CAAGGATTT--GAAA--CAAAACC--ACACCACGGTGAAGC-AGTGTTGGA--TGGT-ATCCGTGG-AGTTGAA-GAGCTCTCT-TTA-ATTCT-C-CAAAATAATATTTG--TCTTCATAAAAT-ATGAACAC-AGTTA-ATTCGTC---ACAAATA--A-T-TCCTT-AGAATTATTTTC-A-TGATTCTGTAACAGAGAAAATTGGGACAATGGTTCATAGAGTACACTACTTTTGCCTCGCTTGGTGTAAAAGAAA-T-CTCCA-TT-CCAA-GTCT-GAGTTT--TCCATTCGTGT-CTGT-TTGTTTTAC-AAAT-AGGAAT-CGAGGAAT-GAA-ACCCG----TCTT---CAATTAATTGAGCTG-CA-TT--ACAAACTT--------AC-GTG--G-----------------T-GGGCC-GT-GCTC--G--T-CA-AACATC--TATCAA-CCCAAGG--CA--GAGCTGGTAA-TGG-ACA-GTGACGGGAAAGTGGAAATAAC-A-CAGC-----GATA---TCAGTCTTCT-TT-AATC--GTACAAGTGAAGG---CTGT-AAACA--GGACC-GTGTA--TTTTCCC---ACCTTTTTTTCCCCCCCCCCAAAAAGTTTTTATTT-GG------GGATT-CAT-TCCCCTG-AGTGA--T-T-G-ATGG-ATT--CCCTTCCGCC--A-G--CAAT-GAACT-GA-AAT---AT-A--TACTG-TATTGTTTGCTC-TCT--AATACG--T-GAG
gi|20 : gC-ATCGAA--GTTGATAA-A-AG----CAC-TTCTATCAA--CTTATCATC-GAAT--A-TAA-CATATTGGCGAGT-TGAGA-ATAACTG-ATCTATTACATT-TAAATG-CA-TC-ATGTTTAAAAGGAAATC-----TGATCT--------------A----A-C-A-ATC--ACACCC----G-C-ACT--T--CC------CATGA--TTTCATTAAA-AA---AGGC-AATATC------AA---TGTCAA-TTTCTG------AC-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A-TTA-C-AAAG-TGT-GGATC--T-GAGAGG-G--------------------TTGGGATC------AGAATTTC---------CCTCAGAGTGG--GACTT--T-GTAAGAGGAA-GG---------------CAACGCCCA-TTTTGTAAAATGTTTCT-AA--C--TTT--TGA-T--ACA
gi|21 : -TTATTG-ACCTA-TCAATGGTGAATCTCTTTTTGT-TTGATACCAAAAGACTTTGTGTT----AATGAC-ATGGAC--GTAGATACTA-AAACAATACTAGTAATCAA--CTTATCATG-GAAT--A-TAA-CATTATGACAGGT-TGAGA-GTAACTG-ATCCATTACATT-TAAATG-AA-TC-ATGTTTGATAGGAAATC-----TGATGC---AATTGTC-C-CA----C-T-T-ATATTA-CTGC------T-GCT--TTCGC------C---A--T--------A-AA---AAGC-AATATC------AA---TATCTA-TTTCTG------AC-TTGAGGT--AACTTTCC-CCTGTCTG--C----A-CTA-C-AAAG-TAT-GGATT--G-GAGAGG-A--------------------CCGGGGTC------AGAATCTC---------
gi|22 : CAATGAGTTA-T-AAATAACAAACC-ATTCATTA-C----T----TTGTAAGTA-AGTCT-TTA--TA-TAT--TA-TTGTGT----CC----------------TATCG-------TTGAGAACAAAT-ATTG-----------ACTGAA-AT-ATTTA------CAGAG------------G--TCCAT----AC---A--ATATT--ACATT-TA-C---AAA--TGA---AAAT-TA---T-T--A--A-ACAAC-----A-TT-CTGCACAG---AAAACG-------TCGATTGTTATATGTCAAC-AACCCTAA--CCTTA----------T--T---TATGGGT-ATT--TTCTTCTAACTATTGACA-AAATTA---ATTCTA-GTTTCTGTG-GCTGTCTGTATTTTGTGATATGGTCTCTGTCT--AAGTG-A--C--TCTTGAT-AA-GACTG-TAACGC
gi|23 : AAATTATATATTC-A-GCTTCTGTG-GCTGTCTGTATTTTTTGA-ATG-TGCTTGTTTTTAAGTGAA--CAATTTGATTTAA-GACTGTTAACGCCCTG-TGTAG-TCCCCCAC-CA-TATGTTGACA-AATCCC-AGTA---TCTGCCA-GACAGGT-CTCT-ATGGCGT---AAAGGTGCGTATCT-CCCAT-CATC---ATAGA---GCAA-GT--AGGGTGTGTAGGGT-TG---TC-----AGT-G-CCTG--AGATAA-----ATG---TGACCTG-TACCTAGTC-GTTAGAGT--G--GATTTTA-GGGTAC-AGATA-ACA
gi|24 : gaGAATGTGATCCATCC-TGTAACGA-TTC-T-TTAACGTTAG-TTGATCGAC-TCAATA-TAAGTTTCT-ATT-AA--------------AT--T----ACAGT--GTTCT--G--AT-AAT-TC--GTGAG---AAG-TTG----TATAAAA---T--GT----------------------AA-TCTTACAAAATGTACTCTACCTGAGAATTT--CCAAGTTCTATTTATAGACAATCGGGAAATAA-CCAGTT-TAACT-CC----G-TACTTTTCTTATTGCA---TGTACTCTGTTG-AC-CTTAA-TATGGAATACCAGT-CTTTA-TTTGATTCG-TTAATCGA
gi|25 : GGGAAATGTGATCCATCC-TGTAACAA-TTA-T-TTAACGTTCA-TTTACCGAA-ACAATA-CAAATGTTT-ATT-AATACGA-AAGAATACATTAC----AC--C--GTTCT--G--AA-AAC-CC--GTGAA---AAG-TTG----TATAAAA---T--G-----------------------AA-T---------TCCACTGCACCTGAGAATTT--AAAACATCTATTTATAGACAATCGG-AAATAC-CCGGTT-AAGCC-CC----ACTACTCTTCTT-TTGAAAATTG-A-TTTGTTG-ACTCTTAAGTCT-GAATA------TTTTA-TTCCGTT-G-TT-gacaattgt
gi|26 : -TTATTG-ACCTA-ACAATGGTGTATCTTCTTTTCT-TTGACACAGACAAACACTGTGTTTTC-AACGAC-ATGGAA--GTGAATA-CA-AG----CTT-ATTTATCAA--CGCTTCATG-AAAT--A-CAA-CATTATGACAGGT-TGAGA-ATAACTG-ATCTGTTACATT-AAATTG-CA-TC-ATGTTTAAAAGGAAATC-----TGATTC---CTGTG-TGG-AA----A-A-T-CTAT-C-ACGT----C-T-GAT--TT--C------C-CGA--T--------A-AA---ATGC-AATATC------TA---TATCTA-a
gi|27 : --G-GTAAGTGTAG----TTGT-GACAT--GGACC-GTGCA--GGTTCTC---ACC-----TTCAT---------------------T-GGC---T-GGATT-AAC-CCCATTC-CATA---T-TTG-ATGG-TTT--CTCATCCGT---A-G--TAGT-GAACTTGA-AAT---GT-A--TACAG-TATTGTTT-TTC-CCC--GTTA-G--T-GAGGA--CAT--G--AC---AACC-CC--C-ATCATT-TGA-CGAT------------------GT---GAG--T-AGTA--GT--A-TTCTGGCGAA----TCC-CGGTG--GG-AGT-TCACCC-CGTA-TCCAT-AT--GA--GAAAGTGTA
gi|28 : aCCTAGACTTAG----TA-AGCAATAGACTGAC-C-ACCT--ACCG-C-CTTCCACTGTA-TCTCT-G--CTGT--CTAC--T-CT-GTT--GAGATAC---------AATTATTTGGGGCTTGTGAG-AGTCCTCTGTCTTCA-CTCTTTC-TGTGACAGTTTTAGCGCT-GT---TTGATATCTACCGG-TATTCATAC-ATGTAT-AATTGCCTAAATACCAACCCATCAT
gi|29 : taccTTCAATA-C----T----TTGTAAGTA-AGTCT-TTAA-TAATAT--------------AC-----------------TACCG-------TTGATTACAAAT-ATTG-----------ACTGAA-AT-ATCAACAGAATCAGAA------------G--TCCAT----AC---ATTACATTG-ATACTATAGT---AAA--TGA---AA--ACA---TGT--A--A-ACGGT-----A-TT-CTGTACAG---GAAATC-------TTGATTGGCCTGTGT-------------------A----------T--T---AATTGGTAATATCTTCTCCTAACTATTGACAgattgcgaaa
gi|3 : gAG--AT-GAA-ATGCCAGTGTAGTACCCAAT-AATTGA-TTGGTA-GG--ACAC---G--------ACCGCG--A-----------------TTAG-CC-ATTGCGCCTGAG--CA-AACATC--TATCAAACCCAGGGGAAA--TAGGTGGTAA-TGG-GCAAGTGACGGGAAGATGAAACCA-A-GGCGCCTCGTGGTTACATTCAGT-TTCTATA-GATT--A-ATAA-TGTA-----TTGTCGACAAAGGGATCTGTGCC--CGTTCTC---ACC-----TTCAC---------------------TTAAT---T-GGATCCAATGTCCA-TC-AGTGAGAT-TTG-ATGG-TTTGTCTCATCCGGCAGA-GGTTAAT-GAACTTGT-AATCTTGT-AATTGCAG-TAATGTTG-CTCCTCCGCAATA-G--TCAAGGATCCAT--G--ACCCAAG-T-TG--GCGTATTT-TGACCGGTATAGGAAAGCTGGATCGTGT---GAG--T-AGGT--ATGGA-ATC-GGCGA-----TCC-GGG-GCGGG-AGTATCAGACAGGTC-TCCAT-AT-AGAAATAAGGT--ATG--CTGG-GTGAATGA--TA-----AAT---GTG-GGCTG-AGACAGCT--CACAG----ATCA---CGCT-T-AT-----ATCAAC-GGAACCAA--C-CAACGCACTATATG---A--AAT-CAT--GTAGT------CAGAA-TGAT-TTG--GAACCTTGTGA-AATC-CCTCCCTTAGAAACT-A-CCACTCAGCAC-A-T-AC-TT-CTCACCCATAT-ACT-C-GAAGGTTTCTGTGCGTATCATC-T-CC-C-CCGTGTGTCCCCCAG----A--CCTTCTGTAAGGTCACTTCTGTCAGG-TGTCCCGGATATCTCACTGACACACAAAA---CACCCACAGA--AGGGC-TCTGACACTC-GGTAATGTGATTCATCCATGCAAACA-TTC-GTTTAGCGGTGG-------GAC-AC-ATAGCAAAACTCT-G---AAGACTA-CACTATATA-TATAGAAACAGCAGGTTCTTGA--AT-AATATCTAGTGAAGGTAAT-TTGTGGATACAAGAA-GTCAGTGAAAATGTGATTACTCATGTTAAA-TCTTACAAAATCCACTCTACCTGG----TT--TAAAATT
gi|30 : acT-GAACTTGA-AAT---AT-A--TACAG-CATTGTTT-CAC-TCC--AATA-G--T-GAAGA--CAT--G--AC---AA-T-TT--C-TTCATT-TGA-CGGT------------------GT---GAG--T-AGCT--GT--A-ATCTGGCGAA----CCC-CGG-G--GG-CGTATCAGA--GATC-TCCAT-AT-AGA--TAAGgtgatcgtgataac
gi|31 : T----G-AATC-CCTCCCTAGA--ACT-A-CCACTCAGCAC-A-TATC-TCTTTCCATTATATATCT-GTGAAGGTTTC----CGTATCATC-T-CCTC-C---GTGTCTTCTAG----ATCCCTTCTG-AATGTCACTTCTGTT-GG-TGTCCC---TATCTCAC-cgt
gi|32 : AAGTGTAA----TTGT-GACAA--GGACC-GTGCA--TGTTCTC---ATT-----TTCGT---------------------C-GGA---T-GGATT-AAT-TCCTTTC-A--AA--TCTTG-ATGT-AAT--CTCAACAGG---A-G--CATT-GTACTTGA-AAT---GT-A--TACAG-CATTGTTT-CTC-TC
gi|33 : ACGTGAA--TGGAAACA-T-AGCG-C-----GATA---TCAAA-TTC-ATGAGATT--T-AAAAGTGTAG----TTGT-GACAT--GGACC-GTGTA--GGTTCTC---ACC-----TTCAG---------------------C-ACC---T-GGTTC-A----CCACTC-CATAA----TTG-ATGG-TTT--CTCAT
gi|34 : ACCT----G-AATC-CCTCCCTATG--ACT-A-CCACTCTTCAT-A-T-GGATCATCCCTTTCGATAACG-ATAAACCTTTC----TGTATTAGCAC-CC-C-C---GTGTCCCAAAG----ATCCCTTCTG-AAGTTCACTTCTGTC-GG-T
gi|36 : ACATGCTGACA-GATCCCCAGTA---TCTGCCACAAGAGGT-CTCTAA--GGAGT--AACGGTACATGTTT-GTCAT-CATC---ATATA---TC-A-GC--AGGGTGTGTAGGTC-TG---TC-----AGT
gi|37 : AGTGAAG----TTGT-GACAA--GGACC-GTGCA--GGTTTCC---ACC-----TTCAT---------------------T-GAC---T-GAATT-CAC-TCCATTC-AATAA----TTG-ATGG-ACT--GTCATTCGT---A-G--TAAT-GAACTTGA-AAT---GT-A--Tgact
gi|38 : TTTATAGACAATCGGAAA-TAC-CCAGTT-AACCT-CC----GCTACTTTTCTT-TTGCA---TGTACTCTGTTG-AC-CTTAA-TATGGAATACCAGTACTTTA-TTTGATTCG-TT-ATC
gi|39 : ATAAATTA-T-AAGTAACAAATC-GTTCAAAA-CA---T----T-GTAATTA-AGTAT-TTAA-TA-TAT--TA-TTGCGC----CC----------------TACTG-------TTGAGTACAAAT-ATTG-----------ACTGAA-AT-ATCAA------CAGAA------------a
gi|4 : AAGTCC-GAGTTTAATTCATT--TGT-Ct
gi|4 : -ATCCT----TCGT---CAAT-AATTGA-TTG-TA-GT--ACAA---T--------AC-ACG--A-----------------T-GG-CC-AT-GCGC--GAGT-CA-AACATC--TCTCAA-CCCAGGG--AA--GGGCTGGTAA-TGG-GCA-GTGACGGGAA--TGGAAACA-C-AACG-C-----TACA---TCAGT-TTCTATG-GATA--G-ATGAGTGTAG----TTGT-GACAT--GGACC-GTGCA--GGTTCTC---ACC-----TTCAA---------------------T-GGC---TAGGATA-CAC-TC-ACTG-AGTAA--T-TAG-ATTG-TGT---TCATCCGT---ATA--CATT-CAACT-GA-ATA---GT-A--TACAA-TAGTCTTT-CTTATCCTAGATA-AGCT-GAGTC--CATAAG--AC---AA-T-TCTCG-TTGATT-TGAC-AGT------------------GTATAGAGATT-A-TT--GT--A-ATCGGTCGAAAGAATCCGCGT-G--AGCAGTATCAGAC-GGTCGTCCTA-ATCAGA--TAAGTAGTATGT-CTGGTGTG--TTAATTGGATAAAACCCCGTTTGACTA-TGACATCTATCACACTATCATCA---C-TTCT-AT-AGATATCATATGG---TAG--AACATCGC-----ATACTCATTAACTCAT--GC--TTAGGATCAG-ACTGAT-TTTTAAAACATTCA-G-AATCGCCTCCCTAGT--ACT-A-CCACTCAGCAT-C-CGTC-TCAGTCCTCTATATAACT-TTGAAGGTTTC----CGTATCATC-T-CCAC-C---GTGTCTCTCAG----ATCCCTTCTG-AAGGTCACTTCTGTC-GG-TGTCCC---TATTTCAC-GACAC-----A---CACCCACATA-CAGGGCTTCTGATACACGGGGAATGTGATCCATCC-TGTAACGA-TTC-G-TTAACGTTAG-TTGATCGAC-ACAATA-CACATTTCT-ATT-AATACGA-A---ACAAATCAT-----TAAC--GTTTT--A--A--AGC-TT--GTGAA---ACC-TTG----TATGAAAA-AT--GT----------------------AA-TCAAACAAAGTCCACTCTACCTGAAAATTCA-CAAAA-TCTATTTATAAATAATCGG-AAATTC-CCAATT-ATGCC-CG----GCTACTTTTCTT-TCGCA---atccttcgtcaataattgattgtagtacaatacacgatggccatgcgcgagtcaaacatctctcaacccagggaagggctggtaatgggcagtgacgggaatggaaacacaacgctacatcagtttctatggatagatgagtgtagttgtgacatggaccgtgcaggttctcaccttcaatggctaggatacactcactgagtaattagattgtgttcatccgtatacattcaactgaatagtatacaatagtctttcttatcctagataagctgagtccataagacaattctcgttgatttgacagtgtatagagattattgtaatcggtcgaaagaatccgcgtgagcagtatcagacggtcgtcctaatcagataagtagtatgtctggtgtgttaattggataaaaccccgtttgactatgacatctatcacactatcatcacttctatagatatcatatggtagaacatcgcatactcattaactcatgcttaggatcagactgatttttaaaacattcagaatcgcctccctagtactaccactcagcatccgtctcagtcctctatataactttgaaggtttccgtatcatctccaccgtgtctctcagatcccttctgaaggtcacttctgtcggtgtccctatttcacgacacacacccacatacagggcttctgatacacggggaatgtgatccatcctgtaacgattcgttaacgttagttgatcgacacaatacacatttctattaatacgaaacaaatcattaacgttttaaagcttgtgaaaccttgtatgaaaaatgtaatcaaacaaagtccactctacctgaaaattcacaaaatctatttataaataatcggaaattcccaattatgcccggctacttttctttcgca
gi|40 : aagtccgagtttaattcatttgtcCTG--C----A-TTA-C-AAAG-TAT-GGATT--G-GAGAGG-G--------------------CAGGGATC------AGAACCTC---------TCTGAGAGTGG--GACTA--T-GTAACAGGAA--G--------------ACAACCCCCA-TTTCGTAAAATGTTTCT-AA--C--
gi|41 : CTG------AC-TTGAGGT--ATTTTTCC-CCTGTCTG--C----A-TGA-C-AAAG-TGT-GGATC--A-GAGAGG-G--------------------CCGGTATC------AGAACCTC---------TCTAAGAGTGG--GACTG--T-GTAACAGGAA--A--------------CCAAC
gi|42 : -TGAT-TT---AAACCT----A-AATC-CTTCCCTATG--GCT-A-CCACTCAGCATCA-A-TC-TAACTCCATAATATGAAT-GTGAAGCTTTC----CGTATCATC-TCCC-C-C---GTGTCCC
gi|43 : AAGTGTAG----TTGT-GACAA--GGACC-GTGCA--CGTTCTC---ATT-----TTCGC---------------------T-GGA---T-GGATT-AAA-TCCATTC---CAA--TGTTG-ATGT-AAT--CTCAACAGG---A-G--CATT-GAACTac
gi|44 : aGATGAAAATTATATATTC-A-GCTTCTGTG-GCTG
gi|44 : AATATATAATT-TTCATC-CCGT-TCATTTC-ACTGACTTCTTCT-T--CCAACCTTAA-TTCTTccgttcatttcactgacttcttcttccaaccttaattcttc
gi|45 : cagccacagaagctgGGAATGTGATGCATCC-TGTAGCGA-TTC-G-TTAACGTTAc
gi|46 : TTTTCTT-TTGCA---TGCACTTTGTTGCCC-CTTCA-CATGGAATA------CTTTA-TTTGATTCG-TT-ATCctattacatttagctttacacattctattta
gi|47 : ----GCTACTTTTCTT-CTGCA---TTT--TCTGTTGCAC----AA-AACAAAATACTAGTACTTTATTTTGATTacaa
gi|48 : CT--CACAT----ATCA---C-CT-T-AT-G---ATCA---GG---GAG--C-CAACGC-----ATG---A--AATC
gi|49 : --CAAAACC--ACAC-ATGTTGGAGC-AATGTTG-A--TGAT-ATC
gi|5 : ACAATAAGT-A-TGAAGTAACATACC-ATTTA-TAGTA---T----T----A--A-AGTCTATTAA--A-TATGATA-TTGCGC---ACC----------------TACTG-------TTGATTACAAAT-ATTGTCTGCAAACTGACTAAA-AC-AGAAT------CAGAA------------GGTTCCATCTAAACCCTA--ACTTG--ACATT-TA-TGTAAAA--TGG---AAAC-CAGCTT-TGCA--ATACAATTTACTA-TTTCTGTCCAGTGGAATACCCCACAT-TTGATCGTTCTATGGC-AT-AATAA-AA--T---A----------TAATAAATATAAAT-ATATCTT-TCCTAACTTATGA--GAGATTA---ATTTT--GCT-CTCTG-GTTGTCTGTATTTTTTGAT---GTTC--GT------GTGA--------TGTGT-AA-GACCGTTAACGCCCGG-GACAGGTCTCCCACACATTGT-TTG--A-GATCCCACGT----TC-GCCAGGACAGGTCCTCT-A--TCTTC--AAAATCACGAATCTCCCCATACATCCCAATAGAAATGCAA-GTGAAGGGTTTGTGTAAT-CGCGTTCTCCTAGGTCATCCTGCTAGAAATC----TTGAATTGATCTGTTACCTAGTCTGCT---GTCGA-CAA---TA-GGA-ACGGGATACACACATGTGCACAGGTAGCGCAACCAGGGCTCACCAG---TCATAT---------TATCTCTGTATCATTTCAACTGAACTTTTGTGTGGCCAA--TTAACTTCTTTCATCTATAGCAGTAAACTCTTTATAC-AATATGGTCAACATTCTTG-CCAACC-TTCCTATACTTAGGTTCTA-A--A-TAGACTGAC-CCACCT--ACCG-C-T---CACTGTACTCTCT-GCTCTGT--C-AC---ACT-ACT--AGGATACCCCATTCGAGAA-GT--GTGGC-TGTGAGAAGGCCTCTG-C-TCACTTCTATCTTGTGACATTTTTAACGCTAGTTTATTGATAATTCTC---TAAACGCA--G-GTATCAGTTACCTGAGTA
gi|50 : TC-CCGT-TCATTTT-ACTGACTTCTTGT-T--CCAAatga
gi|6 : AA--TGGAAACA-C-AGCG-C-----TACA---TCAGT-TTCTATA-GATA--G-ATAAGTGTAG----TTGT-GACAT--GGATC-GTGCA--GGTTCTC---ACC-----TTCAC---------------------T-AAT---T-GGATC-AAT-TCCACTC-AGTGA--T-T-G-ATGG-TGTT-CTCATCCGG---A-G--TAATTGAACTTGATAAT---GT-A--ATCAGGTAT-GTTT-CTC-TCC--AATA-G--T-GAGTC--CATT-G--AC---AA-T-TT--G-GCGATTGTGAACGA-------------------GT---GAG--T-AGTTTTGT--ACATCTGGCGAA----TCC-----G--GG-AGTATCAGAG-GGTC-TCCAT-AT-AGA--TAAG-TGTATGTGCTGG-GTGAATGTATTAGA---AAT---GTG-G-CTGCAGACATCT--CACATG---ATCA---C-CT-TTAT-G---ATCA---GG---TAAACC-CAACGC-----ATG---A--AATC-ATTAGT--T------CAG-A-TGATGTT---GAACC-----G-AATC-CGTCCC-AGA--ACTTA-CCACTCAGCAT-ACT-TC-TCACTCCATTATA---CT-CTGAAGGTTTC----TGTATCATC-T-CC-C-CC--GTGTCCCCCAG----ATCCCTTCTG-AAGGTCACTTCTGTC-GG-TGTCCC---TATCTCAC-GACAC-----A---CACCCACATA-CAGGGCTTCTGACACTCGGTGAATGTGATCCATCC-TGCAACGA-TTC-G-TTAGCGTT--------CGAC-ACAATA-CAAA--------------CGA-GACTACACATTA-----ACAGC--GTTCT--G--AT-AAT-TC--GTGAA---AAT-TTG----TATACAA---T--GT----------------------AA-TCTTACAAAATCCACTCTACCTG
gi|7 : TATCTCTTTTTCG-TTGACACGAACATACACTGTGCTTTC-AATGAC-ATGGAA--GTGAATA-TA-AG----CGC-ATTAATCAA--CGCATCATG-AAAT--A-CAA-CATTATGACAAGT-GGAGA-ATAACTG-ATCTATGACATT-TAATTG-CA-TC-ATGTTTAAAAGGAAATC-----TGATTC---CTTTT-T-GTAA----A-T-T-ATA--A--------------CT--TTTCTGCTTTAC-TGA--T--------A-AA---AAGC-AATATC------TA---TATCTA-TTTCTG------AC-TTGAGGT--AACTTTCC-ATTGTCTG--C----A-TTA-C-ACAG-TAT-GGATT--T-GAGAGA-G--------------------CCGGGGTA------AGAATCTC---------TTTGAGAGTGG--GGCTA--T-GTAACAGAAA-AGCAACNNNNNNGAAAGCAACGCCCA-TGTTGTGAAATGTTTCT-AA--C--TTT--TGA-T--ACAGGAACGTCTGTTGC-GCCCC-G-ACAACTTTTC---CTGCAAACATA---T-T-GTTCT-CCGG-----------AAT-AAAGAAATT-TGGAA-GGTAACC-GGTAT-ATA-CACA--CTGAAT---CAAGGATTT--GAAA--CAAAACC--ACAC-ATGTTGGAGC-AATGTTG-A--TGGT-ATCCATGG-GGTAGAA-GAGCATTCT-TGA-ATTCT-C-CAAAATAATA-TTG--TTTTttaaaat
gi|8 : AAA-TTCTCCA-CT-C-AAAGTCT-GAGTTT-----------GT-CTGT-TTGTTT-GA-GA-T-AGGAA--CGAG--AT-GAA-ATCCT----TCAT---CAAT-AATTGA-ATG-CA-GT--ACAG---T--------AG-GTG--A-----------------T-GG-CC-AT-GCGC--GAAT-CA-AACATC--TATC-AACCCAGGG--AA--GGGCTGGT-AATGG-CCA-ATGACGGGAA--CGGAAACA-C-AG-GGC-----GATA---TCAGC-TTCTATG-GAAT--T-ATAAGTGTAG----TTGT-GACAT--GGACC-GTGCA--TATTCTC---ACC-----TTCTC---------------------T-GGC---T-GGATC-AAT-TCCATTC-AATGA----CTG-ATGA-AAT--ATCATCCGG---A-G--TAAT-GAACTTGA-AAT---GT-A--TACAG-TATTGTTT-CTC-TCC--AATA-G--T-GAGGA--CAT--G--AC---AA-TATC----CTCATT-GGA-CGGT------------------GT---GAG--T-AGTT--GT--A-ATCTGGCGAA----TC
gi|8 : C-----ATG---T--AATCCAT--GT---------CAG-A-TGAT-TG---AAACCT----A-AATC-CCTCCCTATA--ACT-A-CCACTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacatgtaatccatgtcagatgattgaaacctaaatccctccctataactaccact
gi|9 : aaattctccactcaaagtctgagtttgtctgtttgtttgagataggaacgagatgaaatccttcatcaataattgaatgcagtacagtaggtgatggccatgcgcgaatcaaacatctatcaacccagggaagggctggtaatggccaatgacgggaacggaaacacagggcgatatcagcttctatggaattataagtgtagttgtgacatggaccgtgcatattctcaccttctctggctggatcaattccattcaatgactgatgaaatatcatccggagtaatgaacttgaaatgtatacagtattgtttctctccaatagtgaggacatgacaatatcctcattggacggtgtgagtagttgtaatctggcgaatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaaGAACTA-CACCTATCATGTGAACTATTG-ACCTA-TCAATGGCATATCTCTTTTTCT-TGGACACAAACAAACACTGTGATTTC-AATGAC-ATGGAA--GTGAAT-ATA-AG----TAC-ATTTATCAA--CGCATCATG-AAAT--A-CAA-CATAATGACTGGT-TGAGA-ATAACTG---------------AAATG-CA-TC-ATGTTTGAAAGGAAATC-----TGGTCC---CATTG-T-G-TA----A-C-T--TAT-A-ACAC------T-GCTGCTTTCC------A-C-A--T--------T-AT---AAGA-AATATC------TA---TCTCTA-TCTCTG------AC-TTGAGGT--AACTTTCA-CCTGTCTG--C----A-TTA-C-AAAG-TAT-GGATT--A-GAAAGG-GTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTC------GGGATTTCAGAATCTCATCTGAGAGTGGGAGACTAGCT-GTAACA-GAA-GGCC------------CCAATG-CCA---CTGGAAAATGTGTCT-AT--CCTTTT--TGATT--ACAGAGACAT-TGTTGC-ACCCC-A-ACAA-TTTTTCCACTGCAAACATAGT-T-T-GTTA--CCGGGAACGATCTCAAAT-AAAGACATTGCGAAAGGGTAACC-GGTAT-ATA-CACATTCCCCAT---CAAGGATTTTAAAAA--CAATACC--AC
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|35 ): TTATCCTATGATAAGCTGAATATGAAAGGAATGCTTGTTGATTTAATAGTGTCTTCATGGGAATGTACTGTTATCCATCAATCCACTAAATAGAACAGCTGATAACCCTAAC