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1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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gi|8                          :                            taCTCTC-CATTTT--T------AT-----A-------A---A-C-----AT------AC------AAGA-AACCG-G-TTTTTTCTGTCCCGA-A--G-CTTTG-T-TA--TTTTTC-TTGG--T-AG-TA-A---TTAACAA-C-----------AG---A--A-T-ACA-TAAT-G--T--TGG---TT---GAAAAA-TT-G---T-C-A-TTTA-T----T-AATG-AC-GA-T-TG-T-A-GACTTTG--C--AAACTTT-A-AAC-TT-A--T-A----CA-C-CCTT-----AAAA-CT--A-GGGAGA-----------------TCCCC-G-A-TTCA--C--A--A-AAATACA-AC--TC---AGACAACC-T-A---G--CCAAGAATG-ACA-T-T-GGGA-TCTCCCTA-A-TAATTTA-TA--TAAACTTGGTA--AATA------TAAAC-ATC---ATAAAATAGAAAAAT-
gi|9                          :                               TCTC-CATTTT--T------AT-----A-------A---A-C-----AT------AC------AAAA-AACCG-G-TTTTCTCTGTCCCGT-A--G-CTTTG-T-TA--TTTTTC-TTGG--T-AG-TA-A---CTAACAA-C-----------AT---A--A-T-ACA-TAAT-G--T--TGG---TT---GA---------------------A-T----T-AATG-AC-GA-T-TG-T-A-GACTTTG--C--AAATTTT-A-AAC-TT-A--T-A----CA-C-CCTT-----AAAA-CT--A-GGGAGA-----------------TCCCC-G-A-TTCA--C--A--A-AAATACA-AC--TC---AGAC-ACC-T-A---G--CCAAGAATG-TCA-T-T-GGGA-TATCCCTA-A-TAATTTA-TA--TAAACTTGGTA--AATATACCGGTAAAC-ATC---ATAAAATAGAAAAAT-AAGGT
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Reference ( family-5008 )     :                            TGCTCTC-CATTTT--T------AT-----A-------A---A-C-----AT------AC------AAGA-AACCG-G-TTTTCTCTGTCCCGT-A--G-CTTTG-T-TA--TTTTTC-TTGG--T-AG-TA-A---TTAACAA-C-----------AG---A--A-T-ACA-TAAT-G--T--TGG---TT---GAAAAA-TT-G---T-C-A-TTTA-T----T-AATG-AC-GA-T-TG-T-A-GACTTTG--C--AAACTTT-A-AAC-TT-A--T-A----CA-C-CCTT-----AAAA-CT--A-GGGAGA-----------------TCCCC-G-A-TTCA--C--A--A-AAATACA-AC--TC---AGACAACC-T-A---G--CCAAGAATG-ACA-T-T-GGGA-TCTCCCTA-A-TAATTTA-TA--TAAACTTGGTA--AATA------TAAAC-ATC---ATAAAATAGAAAAAT-AAGGTGGCAGC
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gi|18                         :                                                   attttatcctttttttcaaaagaacaatcccagtttttccgtccAGA-AACCT-G-TTTTCCTAGTTCTGA-A--G-ATTTG-T-TA--TTTTTC-TTGG--C-AA-TG-A---TTTCCAA-C-----------AG---A--A-C-AC---------------------------CAA-TT-G---T-T-A-TTTA-T----T-AATG-AC-AG-T-TG-T-A-Gagtctaaaactt
gi|2                          : taatagtattttgtgttattgttgaaatgtTCTC-CATTTT--T------AT-----A-------A---A-C-----AT------AC------AAGA-AACCG-G-TTTTCTCTGTCCCGT-A--G-CTTTG-T-TATTTTTTTT-TTGG--T-AG-TA-A---TTAACAA-C-----------AG---A--A-T-ACA-TAAT-G--T--TGG---TT---GAAAAA-AT-G---T-C-A-TTTA-TAAAAT-TATG-AC-GA-T-TG-TAA-GACTTT----------TTT-A-AAC-TTAA--T-A----CG-C-CCTTC----AAAA-CT--A--GGAGA-----------------TCGTC-----TTCA--TCAA--A-AAATACA-AC--TC---AGACAACC-T-GAATA--CCAAGAATA-ACA-T-T--GGA-TCT-CCTA-A-TAATTTA-TA--TTAAATTGGTA--A--A------TAAACTATC-----AAAATAGAAAAATAAAGGTGGCAGC
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gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GGTA--AATA------TAAAC-ATC---ATAAAATGGAAAAAT-AAGATa
gi|3                          :                            TGCTCTC-CATTTT--T------AT-----A-------A---A-C-----AT------AC------AAGA-GACCG-G-TTTTCTCTGTCCGCT-AG-G-TTTTG-T-TA--TTTTTC-TTGG--T-AGTTA-A---TTAACAA-C-----------AG---A--A-T-ACA-TAAT-G--T--TGGGT-TT---GAAAAA-TT-G---TGC-A-TTTATT----T-AATG-AC-AA-T-TG-T-A-TACTTTG--C--AAA-TTT-ACAACTTT-AT-T-A----CA-C-CCTT-----AAAA-CT--A-GGGAGG-----------------TCCCC-G-ATTTCA-----A--A-AAATACA-AC--TCG--GGACAACC-T-A---A--CC-AGAATG-GCA-T-T--GGA-TCTCCCTA-A-TAATTTA-TAATTAAACTTGGTA--AATA------TAAAC-ATCATAATAAAATAGAAAAAT-AATGTGGCA
gi|4                          :                               TCTC-CATTTT--T------CT-----A-------A---A-C-----A-------AC------AAGA-A-CCG-G-TTTTCTCTGT-CCGTAA--G-CTTTG-T-TA--TTTTTC-TTGG--A-GA-TA-A---TTAGC-A-C-----------AG---A--A-TAACA-TAAT-G-----TGT---TT---GAAAAATTT-G---T-C-A-TTTA-T----T-AATGAAC-GA-T-TG-T-A--ACTGTA--C--AAACTTT-A-AAC-TT-G--T-A----CA-C-CCTT-----AAAATCT--A-GGGAAA-----------------TTCCC-GAA-TTCA--C--A--A-AAATACA-AC--TC---AGACAACC-T-A---A--CCCAG-ATG-ACATT-T-GGGA-T---TCTA-A-TAATTTA-TA--TAAACTTGGTA--AATA------TAAAC-ATC---ATAAAATAGAAA
gi|5                          :                           tTGCTCTC-CATTTT--T------AT-----A-------A---A-C-----AT------AC------AAGA-AACCG-T-TTTTTCCTGTCCCGT-A--G-CTTTG-T-TA--TTTTTC-TTGT--T-AG-TA-A---TTAACAA-C-----------AG---A--A-T-ACA-TAAT-G--T--TGG---TT---GAAAAA-TT-G---T-C-A-TTTA-T----T-AATG-AC-GA-T-TG-T-A-GACTTTG--C--AAACTTT-A-AAC-TT-A--T-A----CA-C-CCTT-----AAAA-CT--A-GGGAGA-----------------TCCCC-G-A-TTCA--C--A--A-AAATACA-AC--TC---AGACAACC-T-A---G--CCAAGAATG-ACA-T-T-GGGA-TCTCCCTA-A-TAATTTA-TA--TAAACTTGGTA--AATA------TAAAC-ATC---ATAAAATAGAAAAAT-AAGGTGGCAGCtagtacagcttacaatttgc
gi|6                          :                                CTCGCATTCTGTT------AT-----A-------A---AAC-----AT------AC------AAGA-AACCG-GCTTTTCTC--TTACGT-AGGG-CTTTG-T-TA---TTTTC-TTGG--T-AG-TA-AAGTTCAACAA-CCACGAATAAATAG---A--A-T-ACACTAAT-GATT--CGG---TTTGAAAAAAA-TTGG---TGC-ATTTTA-T----A-GAT---C-GA-T-TG-T-A-GACTTTT--CTAAAACTTT-ATAAC--T-G--T-AGTGGCATC-CCTTGTATAAAAG-CT--AGGGGAGA-----------------TCCCTGG-A-TTCA--C--A--A-AAACA-A-AC--TCGCTGAACAACC---A---GACCTAAGAATG-ACA-TCT-GGGA-TCTCCCTA-ATTAATTT
gi|7                          :                         tggTGCTCTC-CATTTT--TTTTTCTATTAAAAA-------A---A-C-----AT------AC------AAGA-AACCGCG-TTTTCACC-TCGCCT-AC-G-CTTTG-T-TA--TTTTTC-TTGG--TTAG-TACA---TTAACAA-C-----------AG---A--AAT-ACA-TAGTTG--T--TGG---TT---GAAAAA-TT-G---T-C-G-TTTA-T----T-AATG-ACTGA-TCTG-T-A-GACTTTGAAA--AAACTTTAA-AAC-TT-A--TAA----CA-C-CTTT-----AAAA-CA--A-GGGAGA-----------------TTCCC-G-A-TTTCTTC--A--A-AATTACACAC--TC---AGACAACC-A-A-------CAAGAATGAACA-T-TCGGGACTCTCCCTA-A-T-ATTTACTA--TAAACTTGGcgt
gi|8                          :                            taCTCTC-CATTTT--T------AT-----A-------A---A-C-----AT------AC------AAGA-AACCG-G-TTTTTTCTGTCCCGA-A--G-CTTTG-T-TA--TTTTTC-TTGG--T-AG-TA-A---TTAACAA-C-----------AG---A--A-T-ACA-TAAT-G--T--TGG---TT---GAAAAA-TT-G---T-C-A-TTTA-T----T-AATG-AC-GA-T-TG-T-A-GACTTTG--C--AAACTTT-A-AAC-TT-A--T-A----CA-C-CCTT-----AAAA-CT--A-GGGAGA-----------------TCCCC-G-A-TTCA--C--A--A-AAATACA-AC--TC---AGACAACC-T-A---G--CCAAGAATG-ACA-T-T-GGGA-TCTCCCTA-A-TAATTTA-TA--TAAACTTGGTA--AATA------TAAAC-ATC---ATAAAATAGAAAAAT-
gi|9                          :                               TCTC-CATTTT--T------AT-----A-------A---A-C-----AT------AC------AAAA-AACCG-G-TTTTCTCTGTCCCGT-A--G-CTTTG-T-TA--TTTTTC-TTGG--T-AG-TA-A---CTAACAA-C-----------AT---A--A-T-ACA-TAAT-G--T--TGG---TT---GA---------------------A-T----T-AATG-AC-GA-T-TG-T-A-GACTTTG--C--AAATTTT-A-AAC-TT-A--T-A----CA-C-CCTT-----AAAA-CT--A-GGGAGA-----------------TCCCC-G-A-TTCA--C--A--A-AAATACA-AC--TC---AGAC-ACC-T-A---G--CCAAGAATG-TCA-T-T-GGGA-TATCCCTA-A-TAATTTA-TA--TAAACTTGGTA--AATATACCGGTAAAC-ATC---ATAAAATAGAAAAAT-AAGGT


blockSeqs                     :                                   G      GT TTTTCT  TAAAA ATGATAT TTG A TTACA  TAAATT  TGTCAG    C     C C               A GG G     . C  TT      .    .  T  T  C AGT       C CACGAATAAAT  CCT CC A A   C    T AT TG   GT   TGA      T  G GTC G A T    T AAAA G    A  T  T C  T A .       AA TA       A C   T  A TAGTGG     T A    GTATA    T  .  G      .                     G A T    TT CA .  T       C  TG  GCT        TA  AATA           A   T C C    C        . T       C  AT           TT    TACCGG     T   ATA               A
blockSeqs                     :                                   .      .  .       .     .       .   . .      .       TGTTAG    .     . .               . G  .     . .  .       .    .  .  .  . .         . .            .   .  . .   .    . .  .    .    .        .  . .   G A .    . .    .    .  .  . .  . . .       .  .        A T   .  . TTA        . .    C        .  .  .      .                     . . .    .  .  .  .       .  .   G          T   GAC            A   . . .    .        . .       .  .            .     .          .   .                 .
blockSeqs                     :                                   .      .  .       .     .       .   . .      .       .         .     . .               . C  .     . .  .       .    .  .  .  . .         . .            .   .  . .   .    . .  .    .    .        .  . .   . . .    . .    .    .  .  . .  . . .       .  .        . .   .  . TAA        . .    .        .  .  .      .                     . . .    .  .  .  .       .  .   .          T   G              .   . . .    .        . .       .  .            .     .          .   .                 .
blockSeqs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
blockSeqs                     :                                   .      .  .       .     .       .   . .      .       .         .     . .               . .  .     . .  .       .    .  .  .  . .         . .            .   .  . .   .    . .  .    .    .        .  . .   . . .    . .    .    .  .  . .  . . .       .  .        . .   .  . TC         . .    .        .  .  .      .                     . . .    .  .  .  .       .  .   .          T   T              .   . . .    .        . .       .  .            .     .          .   .                 .
blockSeqs                     :                                   .      .  .       .     .       .   . .      .       .         .     . .               . .  .     . .  .       .    .  .  .  . .         . .            .   .  . .   .    . .  .    .    .        .  . .   . . .    . .    .    .  .  . .  . . .       .  .        . .   .  . CA         . .    .        .  .  .      .                     . . .    .  .  .  .       .  .   .          T   A              .   . . .    .        . .       .  .            .     .          .   .                 .
blockSeqs                     :                                   .      .  .       .     .       .   . .      .       .         .     . .               . .  .     . .  .       .    .  .  .  . .         . .            .   .  . .   .    . .  .    .    .        .  . .   . . .    . .    .    .  .  . .  . . .       .  .        . .   .  . CA         . .    .        .  .  .      .                     . . .    .  .  .  .       .  .   .          T   A              .   . . .    .        . .       .  .            .     .          .   .                 .
blockSeqs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
blockSeqs                     :                                   .      .  .       .     .       .   . .      .       .         .     . .               . .  .     . .  .       .    .  .  .  . .         . .            .   .  . .   .    . .  .    .    .        .  . .   . . .    . .    .    .  .  . .  . . .       .  .        . .   .  . TA         . .    .        .  .  .      .                     . . .    .  .  .  .       .  .   .          T   A              .   . . .    .        . .       .  .            .     .          .   .                  
blockSeqs                     :                                   .      .  .       .     .       .   . .      .       .         .     . .               . .  .     . .  .       .    .  .  .  . .         . .            .   .  . .   .    . .  .    .    .        .  . .   . . .    . .    .    .  .  . .  . . .       .  .        . .   .  . TA         . .    .        .  .  .      .                     . . .    .  .  .  .       .  .   .          A   G              .   . . .    .        . .       .  .                                                    
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): GAACCCCCCTCCCCCCCCCCCCCCAAATGATAAATGGGGAGCAAAAATAATCTCAGCAGAGATATTGGTGACCTTAATCCAATAT






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Reference ( family-5008 )     :                            TGCTCTC-CATTTT--T------AT-----A-------A---A-C-----AT------AC------AAGA-AACCG-G-TTTTCTCTGTCCCGT-A--G-CTTTG-T-TA--TTTTTC-TTGG--T-AG-TA-A---TTAACAA-C-----------AG---A--A-T-ACA-TAAT-G--T--TGG---TT---GAAAAA-TT-G---T-C-A-TTTA-T----T-AATG-AC-GA-T-TG-T-A-GACTTTG--C--AAACTTT-A-AAC-TT-A--T-A----CA-C-CCTT-----AAAA-CT--A-GGGAGA-----------------TCCCC-G-A-TTCA--C--A--A-AAATACA-AC--TC---AGACAACC-T-A---G--CCAAGAATG-ACA-T-T-GGGA-TCTCCCTA-A-TAATTTA-TA--TAAACTTGGTA--AATA------TAAAC-ATC---ATAAAATAGAAAAAT-AAGGTGGCAGC
gi|1                          :                                  C-CATTTT--T------AT-----A-------A---A-C-----AT------AC------AAGA-AACCG-T-TTTACTCTGTCCCGT----G-CTTTGTT-TA--TTTTTCTTTGGTTT-AG-TA-A---TT-ACAA-A-----------AA---A--A-T-ACA-TTAA-G--T--TGGTTTTT---GAAAAA-TT-GTT-T-C-A-TTTA-T----T-AATG-AT-AG-T-TG-T-ATTACTTTG--C--AAACTTTAA-AAC-TT-AATT-A----CA-C-CCTT-----AAAA-CTTAG-GGGAGACCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC-G-A-TTCA--C--AGGG-GAATACA-AC--TC---AGATAACCTT-A---A--CCAAGAATG-ACA-T-TGGGGA-TCTC---ATA-TAATTAA-TA--TAAACTTGGT---AATA------TAAAC-ATC---AT-AAATAGAAAAAT-AAGTTGACAGC
gi|10                         :                                                                                                   tcCCG-G-TTTTTTCTGTCCCGT-A--G-CTTTG-T-TA--TTTTTC-TTGG--T-AG-TA-A---TTAACAA-C-----------AG---A--A-T-ACA-TAAT-G--T--TGG---TT---GAAAAA-TT-G---T-C-A-TTTA-T----T-AATG-AC-GA-T-TG-T-A-GACTTTG--C--AAACTTT-A-AAC-TT-A--T-A----CA-C-CCTT-----AAAA-CT--A-GGGAGA-----------------TCCCC-G-A-TTCA--C--A--A-AAATACA-AC--TC---AGACAACC-T-A---G--CCAAGAATG-ACA-T-T-GGGA-TCTCCCTA-A-TAATTTA-TA--TAAACTTGGTA--AATA------TAAAC-ATC---ATAAAATAGAAAAAT-AAGGTGGCAGCttacaattttgcc
gi|11                         :                            TGCTCTC-CATTTT--T------AT-----A-------A---A-C-----AT------AC------AAGA-AACCG-G-TTTTCTCTGTCCC-T-A--G-CTTTG-T-TA--TTTTTC-TTGG--T-AG-TA-A---TTAACAA-C-----------AG---A--A-T-ACA-TAAT-A--T--TGG---TT---GAAAAA-TT-G---T-CAA-TTTA-T----T-AATG-AC-GA-T-TG-T-A-GACTTTT--C--AAACTTT-A-AAC-TT-A--T-------A-C-CCTT-----AAAA-CT--A-GGGAGA-----------------TCCCC-G-A-TTCA--C--A--A-AAATACA-AC--TC---AGA-AACC-T-A---G--CCAAGAATG-ACA-T-T-GGGA-TCTCCCT--A-TAATTTA-TA--TAAACTTGGTttaca
gi|12                         :                                       TTT--T------AT-----A-------A---A-C-----AT------AC------AAGACAACC--G-TTTTCTCTGTCCCG--A--G-CTTTG-TCTA--TTTTTC-TTTG--T-AT-T------TT-ACAACC-----------AGCCTACCC-T-ACA-TGTT-G--TTGTGA---TA---GAGAAA-TT-GGTCT-T-A-TATA-T----T-AGTG-AC-GATT-TGTT-A-GACTTTG--C--AAACTTTAA-AAC-TT-A--T-C----TA-CATCTT-----AAAA-CT--A-GGGAGA-----------------TTCCC-G-A-TTCA--C--A--ATAAATACA-ACTGTC---GGACAACT-A-A---T--CCAAGAATG-ACA-
gi|13                         :                                CTC-CATTTT--T------AT-----A-------ATTGA-T-----ATTAAATTACTGTCAGAAGA-AA--G-G-TTTTCTTAGTCCCGC-A--GGCTTCA-T-TA--TTTT-C-TTCG--T-AG-CA-A---T-AACAA-C-----------AA---A--A-T-ACA-TATT-G--T--TGG---CT---G-AAAA-TT-G---T-CAA-TTTC-T----CGAATG-AC-GA-T-T--T-A-GA-TTTG--A--AAACTT-----AT-TT-A--C-A-----A-C-CCTT-----AAA--------------------------------CCCC-G-A-GTAT--C--A--A-AAATACA-A---TC---AGACTACC-TAA---A--CAAAGAATGAACA------GGA-TCTC
gi|14                         :                         ttcTGCTCTC-CATTTT--T------AT-----A-------A---A-CTTACAGT------AC------AAGA-AACTG-G-TTTTCTCTGTCCCAT-A--G-CTTTG-T-TT--TTTTTC-TTGG--T-AG-TA-A---TTAACAA-C-----------AG---A--A-T-ACA-TAAT-G--T--TGG---TT---GAAAAA-TT-G---T-C-A-TTTA-T----T-AATG-AC-GA-T-TG-T-A-GATTTTG--C--AAACTTT-A-AAC-TT-A--C-A----CA-C-CCTT-----AAAA-CT--A-GGGAG
gi|15                         :                            TGCTCTC-CATTTT--T------AT-----A-------A---A-C-----AT------AC------AAGA-AACCG-G-TTTTCTCTGTCCCGT-A--G-CTTTG-T-TA--TTTTTC-TTGG--T-AG-TA-A---TTAACAA-C-----------AG---A--A-T-ACA-TAAT-G--T--TGG---TT---GAAAAA-TT-G---T-C-A-TTTA-T----T-AATG-AC-GA-T-TG-T-A-GACTTTG--C--AAACTTT-A-AAC-T----------------------------AA-CT--A-GGGAGA-----------------TCCC
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aCTT-----AAAA-CT--A-GGGAGA-----------------TCCCC-G-A-TTCA--C--A--A-AAATACA-AC--TC---AGACAACC-T-A---A--CCAAGAATG-ACA-T-T-GGGA-TCTCCCTA-A-TAATTTA-TA--TAAACTTGGTATTAATA------TAAAC-ATT---ATAAAATAGAAAAAT-AAAGTGGCAGC
gi|17                         :                                                                                                                                             TTTTC-TCGG--T-AG-TG-T---TAAACAA-C-----------AG---A--A-T-ATA-TATT-G--G--TGT---TT---G-GAAA-TT-G---T-C-G-TGTA-C----T-AGTG-AA-GA-T-TG-T-A-GAttacaattttgc
gi|18                         :                                                   attttatcctttttttcaaaagaacaatcccagtttttccgtccAGA-AACCT-G-TTTTCCTAGTTCTGA-A--G-ATTTG-T-TA--TTTTTC-TTGG--C-AA-TG-A---TTTCCAA-C-----------AG---A--A-C-AC---------------------------CAA-TT-G---T-T-A-TTTA-T----T-AATG-AC-AG-T-TG-T-A-Gagtctaaaactt
gi|2                          : taatagtattttgtgttattgttgaaatgtTCTC-CATTTT--T------AT-----A-------A---A-C-----AT------AC------AAGA-AACCG-G-TTTTCTCTGTCCCGT-A--G-CTTTG-T-TATTTTTTTT-TTGG--T-AG-TA-A---TTAACAA-C-----------AG---A--A-T-ACA-TAAT-G--T--TGG---TT---GAAAAA-AT-G---T-C-A-TTTA-TAAAAT-TATG-AC-GA-T-TG-TAA-GACTTT----------TTT-A-AAC-TTAA--T-A----CG-C-CCTTC----AAAA-CT--A--GGAGA-----------------TCGTC-----TTCA--TCAA--A-AAATACA-AC--TC---AGACAACC-T-GAATA--CCAAGAATA-ACA-T-T--GGA-TCT-CCTA-A-TAATTTA-TA--TTAAATTGGTA--A--A------TAAACTATC-----AAAATAGAAAAATAAAGGTGGCAGC
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gi|22                         :                               TCTC-CATTTT--T------AT-----A-------A---A-C-----AT------AC------AAGA-AACCG-G-TTTTTTCTGTCCCGT-
gi|23                         :                               TCTC-CATTTT--T------AT-----A-------A---A-C-----AT------AC------AAGA-AACCG-G-TTTTCTCTGTCCCgatgtgtcg
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GGTA--AATA------TAAAC-ATC---ATAAAATGGAAAAAT-AAGATa
gi|3                          :                            TGCTCTC-CATTTT--T------AT-----A-------A---A-C-----AT------AC------AAGA-GACCG-G-TTTTCTCTGTCCGCT-AG-G-TTTTG-T-TA--TTTTTC-TTGG--T-AGTTA-A---TTAACAA-C-----------AG---A--A-T-ACA-TAAT-G--T--TGGGT-TT---GAAAAA-TT-G---TGC-A-TTTATT----T-AATG-AC-AA-T-TG-T-A-TACTTTG--C--AAA-TTT-ACAACTTT-AT-T-A----CA-C-CCTT-----AAAA-CT--A-GGGAGG-----------------TCCCC-G-ATTTCA-----A--A-AAATACA-AC--TCG--GGACAACC-T-A---A--CC-AGAATG-GCA-T-T--GGA-TCTCCCTA-A-TAATTTA-TAATTAAACTTGGTA--AATA------TAAAC-ATCATAATAAAATAGAAAAAT-AATGTGGCA
gi|4                          :                               TCTC-CATTTT--T------CT-----A-------A---A-C-----A-------AC------AAGA-A-CCG-G-TTTTCTCTGT-CCGTAA--G-CTTTG-T-TA--TTTTTC-TTGG--A-GA-TA-A---TTAGC-A-C-----------AG---A--A-TAACA-TAAT-G-----TGT---TT---GAAAAATTT-G---T-C-A-TTTA-T----T-AATGAAC-GA-T-TG-T-A--ACTGTA--C--AAACTTT-A-AAC-TT-G--T-A----CA-C-CCTT-----AAAATCT--A-GGGAAA-----------------TTCCC-GAA-TTCA--C--A--A-AAATACA-AC--TC---AGACAACC-T-A---A--CCCAG-ATG-ACATT-T-GGGA-T---TCTA-A-TAATTTA-TA--TAAACTTGGTA--AATA------TAAAC-ATC---ATAAAATAGAAA
gi|5                          :                           tTGCTCTC-CATTTT--T------AT-----A-------A---A-C-----AT------AC------AAGA-AACCG-T-TTTTTCCTGTCCCGT-A--G-CTTTG-T-TA--TTTTTC-TTGT--T-AG-TA-A---TTAACAA-C-----------AG---A--A-T-ACA-TAAT-G--T--TGG---TT---GAAAAA-TT-G---T-C-A-TTTA-T----T-AATG-AC-GA-T-TG-T-A-GACTTTG--C--AAACTTT-A-AAC-TT-A--T-A----CA-C-CCTT-----AAAA-CT--A-GGGAGA-----------------TCCCC-G-A-TTCA--C--A--A-AAATACA-AC--TC---AGACAACC-T-A---G--CCAAGAATG-ACA-T-T-GGGA-TCTCCCTA-A-TAATTTA-TA--TAAACTTGGTA--AATA------TAAAC-ATC---ATAAAATAGAAAAAT-AAGGTGGCAGCtagtacagcttacaatttgc
gi|6                          :                                CTCGCATTCTGTT------AT-----A-------A---AAC-----AT------AC------AAGA-AACCG-GCTTTTCTC--TTACGT-AGGG-CTTTG-T-TA---TTTTC-TTGG--T-AG-TA-AAGTTCAACAA-CCACGAATAAATAG---A--A-T-ACACTAAT-GATT--CGG---TTTGAAAAAAA-TTGG---TGC-ATTTTA-T----A-GAT---C-GA-T-TG-T-A-GACTTTT--CTAAAACTTT-ATAAC--T-G--T-AGTGGCATC-CCTTGTATAAAAG-CT--AGGGGAGA-----------------TCCCTGG-A-TTCA--C--A--A-AAACA-A-AC--TCGCTGAACAACC---A---GACCTAAGAATG-ACA-TCT-GGGA-TCTCCCTA-ATTAATTT
gi|7                          :                         tggTGCTCTC-CATTTT--TTTTTCTATTAAAAA-------A---A-C-----AT------AC------AAGA-AACCGCG-TTTTCACC-TCGCCT-AC-G-CTTTG-T-TA--TTTTTC-TTGG--TTAG-TACA---TTAACAA-C-----------AG---A--AAT-ACA-TAGTTG--T--TGG---TT---GAAAAA-TT-G---T-C-G-TTTA-T----T-AATG-ACTGA-TCTG-T-A-GACTTTGAAA--AAACTTTAA-AAC-TT-A--TAA----CA-C-CTTT-----AAAA-CA--A-GGGAGA-----------------TTCCC-G-A-TTTCTTC--A--A-AATTACACAC--TC---AGACAACC-A-A-------CAAGAATGAACA-T-TCGGGACTCTCCCTA-A-T-ATTTACTA--TAAACTTGGcgt
gi|8                          :                            taCTCTC-CATTTT--T------AT-----A-------A---A-C-----AT------AC------AAGA-AACCG-G-TTTTTTCTGTCCCGA-A--G-CTTTG-T-TA--TTTTTC-TTGG--T-AG-TA-A---TTAACAA-C-----------AG---A--A-T-ACA-TAAT-G--T--TGG---TT---GAAAAA-TT-G---T-C-A-TTTA-T----T-AATG-AC-GA-T-TG-T-A-GACTTTG--C--AAACTTT-A-AAC-TT-A--T-A----CA-C-CCTT-----AAAA-CT--A-GGGAGA-----------------TCCCC-G-A-TTCA--C--A--A-AAATACA-AC--TC---AGACAACC-T-A---G--CCAAGAATG-ACA-T-T-GGGA-TCTCCCTA-A-TAATTTA-TA--TAAACTTGGTA--AATA------TAAAC-ATC---ATAAAATAGAAAAAT-
gi|9                          :                               TCTC-CATTTT--T------AT-----A-------A---A-C-----AT------AC------AAAA-AACCG-G-TTTTCTCTGTCCCGT-A--G-CTTTG-T-TA--TTTTTC-TTGG--T-AG-TA-A---CTAACAA-C-----------AT---A--A-T-ACA-TAAT-G--T--TGG---TT---GA---------------------A-T----T-AATG-AC-GA-T-TG-T-A-GACTTTG--C--AAATTTT-A-AAC-TT-A--T-A----CA-C-CCTT-----AAAA-CT--A-GGGAGA-----------------TCCCC-G-A-TTCA--C--A--A-AAATACA-AC--TC---AGAC-ACC-T-A---G--CCAAGAATG-TCA-T-T-GGGA-TATCCCTA-A-TAATTTA-TA--TAAACTTGGTA--AATATACCGGTAAAC-ATC---ATAAAATAGAAAAAT-AAGGT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): GAACCCCCCTCCCCCCCCCCCCCCAAATGATAAATGGGGAGCAAAAATAATCTCAGCAGAGATATTGGTGACCTTAATCCAATAT