lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 1111 555555555 1111111111111111 11111111 1 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 11111111 1111 111111 4444444444444444444444444444444444444444 11111111111 1111111111111 1111111111111111111111111111111111111 11111111 2222222 5555555555555555555555555555555555555555 33333333333333333333333333333333333 1111111111 111111111 44444444444444444444444444444444444444444 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111 1111111111111111111 111111111111111 3333333333333333 7777
lowQualScore : 44444 1 5555555 1 222 1 0000 44 22 1 3333 1 555555555 22 3333333333333333 22 1 5 22222222 9999999 11 0 44 11 1 333 2 11 4 11 11 222 99999 1 2 2 3333 11 444 22 333333 1 2222 22 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 33333 3 55 99999999 33 2222 22 11 777777 2222 22 1 22222 11 4444444444444444444444444444444444444444 5555 1 11111111111 3333333333333 11 2 22222 33 2222 7777777777777777777777777777777777777 2222 22222 4444 11 1 999999 444 88888888 1 22 3333333 1 5555555555555555555555555555555555555555 33333 1 1 11 2 99999999999999999999999999999999999 0 3 4444 2222 44444 3333333333 555555555 1111 0 11 0 00 0 44444444444444444444444444444444444444444 0 111 0 22222222222 1 222 1111 55555555555 3333 22222222222 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 0 0 44444 22222 11 111111 555555555555 999999 111 111111 111 444444444 1 2222 1 88888 444444444 2 2 11 11111 0 2222222222222222222 33333 0 333 666666666666666 2222 222 4 1 22 5555555555555555 4 777 4 1 3 6666
lowQualScore : ..... . ....... . ... . .... .. .. . .... . ......... .. ................ .. . . ........ ....... .. . .. .. . ... . .. . .. .. ... ..... . . . .... .. ... .. ...... . .... .. ...................................................................................................... ..... . .. ........ .. .... .. .. ...... .... .. . ..... .. ........................................ .... . ........... ............. .. . ..... .. .... ..................................... .... ..... .... .. . ...... ... ........ . .. ....... . ........................................ ..... . . .. . ................................... . . .... .... ..... .......... ......... .... . .. . .. . ......................................... . ... . ........... . ... .... ........... .... ........... ......................................................... . . ..... ..... .. ...... ............ ...... ... ...... ... ......... . .... . ..... ......... . . .. ..... . ................... ..... . ... ............... .... ... . . .. ................ . ... . . . ....
lowQualScore : 22222 7 4444444 4 888 6 1111 44 22 6 4444 5 444444444 00 8888888888888888 00 4 2 66666666 5555555 77 6 00 77 2 333 5 77 3 77 77 222 55555 2 4 4 8888 66 444 66 111111 1 2222 55 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 22222 6 55 88888888 11 8888 55 44 777777 2222 44 0 66666 55 9999999999999999999999999999999999999999 3333 2 77777777777 4444444444444 55 3 99999 11 4444 1111111111111111111111111111111111111 5555 99999 8888 77 2 555555 888 99999999 4 11 7777777 5 7777777777777777777777777777777777777777 00000 1 1 55 2 22222222222222222222222222222222222 8 3 7777 5555 33333 3333333333 666666666 5555 7 66 6 88 6 22222222222222222222222222222222222222222 5 666 5 99999999999 5 444 8888 44444444444 1111 88888888888 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 5 5 44444 00000 44 777777 000000000000 999999 111 888888 111 111111111 3 1111 4 33333 333333333 3 3 11 99999 8 0000000000000000000 55555 9 999 111111111111111 9999 444 1 4 66 6666666666666666 4 888 4 0 2 0000
consensus : TATTCCTT-----A-T-------ACAA---A-A--N-CGT--TGT--AAATA-A----TTAA-AG----A-T-ATCTTC--A----A--T-T---G--A--A-TCAAAGG-G-A--TCAT--N----A--AAT-CAT--TT-AT---ACC--GAGCTC--CA--AA---TTA---A-A-T-T----T--T---GC--GAGC------AA-T----AAT--T----CN------A--C---C---A-AT---T----TG-AT---G-----GCG--G-C---ATC-AA--------T--NT-------AT--T--A--GA--N-GA-----GAGCAAT--AAT-TG-ATTTGA--TGCG-C-GC--A--TCAAT----TC----AA--T-T-----ATT--G-C-----T--C--G--CN-----AT--AT-----T--TC-A----A-TN-------G--ATG-------CG-C-GCA--T-C-----A--AT----T---CA-A--A-T-----A-T--------T--N--CN-CG----C-----A-A-CA--AT-T-N----AATTGATG-C-G-CG---C-ATCAA-ATC--A--N----TT-ATTG---C---C-CG--CA-AT-GAAA--A-AA-N--G------AA-----TTG-ATG-C--G-CG----C--G--C---A----A---------------A-T-C----A----A-----TT--A---T---TG------N--GC----G-CAAT--A-A--T-T----C----A---G-----A-TT-----G------T-----G-C---GC-G-----------C-AT---C----A-----------AT----T-C---------A---A--T-----T-----------G-----A--T--------G----A---G-A---GC-A-AT-----A-----A--T------T-G----------A-N----T---T------G---A---------T-G--C-G-CG----C-----A---T-C-A--A-----T-T------G---A-A------TT-----A-T---T-CA----GC--G---C----A---AT-AA-TTG--AAC-----TG-----CG-AT-A---T-TTGAATTATTTACA---ATGCTT
Reference ( gi|2 ) : TATTCCTT-----A-T-------ACGA---A-A--T-CGT--TGT--AAATA-A----TTAA-AAG-ACA-C-ATCTTC--A----A--C-T---G--A--A-TCAAAAG-A-A--TCAT--A----A--AAT-CAT--TT-AT---ATC--GATCTC--CA--AA---TTG---A-A-T-T----T--T---GC--GAGC------AA-T----AAT--T----CA------G--C---C---A-AT---T----TG-AT---G-----GCA--A-C---ATC-AA--------T--AT-------AT--T--A--GA--A-GA-----GAGTAAT--ACT-TA-ATTTGA--TGCA-T-GC--A--TCATT----TC----AA--T-T-----ATT--G-T-----T--C--A--CT-----AT--AT-----T--TC-A----A-TG-------G--ATG-------TA-T-ACA--T-C-----A--AT----T---CA-A--A-T-----A-T--------T--C--CC-CG----C-----A-A-CA--AT-T-C----AATTGATG-T-G-TT---T-ATCAA-ATC--A--T----TT-ATTG---T---C-CG--CA-AT-GAAA--A-AA-A--A------AA-----TTG-ATG-C--G-CG----G--G--C---A----A---------------A-T-C----A----A-----TT--A---C---TG------G--GC----G-CAAT--A-A--T-T----C----A---G-----A-TT-----G------T-----G-C---GC-G-----------C-AT---C----A-----------AT----T-C---------A---C--T-----T-----------G-----A--T--------G----A---G-A---GC-A-AT-----A-----A--T------T-G----------A-C----T---T------G---A---------T-G--A-G-CA----C-----A---T-C-A--A-----T-T------G---A-G------TT-----A-T---T-CA----GC--A---C----A---AT-AA-TTG--AAC-----TGC----CA-AT-A---T-TTGAATTATTTACGTGTATGCTT
gi|4 : TATTCCTT-----A-T-------ACGA---A-A--T-CGT--GTT--AAATA-A----TTAA-AAGGACA-C-ATCTTC--A----A--C-T---G--A--A-TCAAAAG-A-AA-TCAT--A----A--AAT-CAT--TT-AT---ATC--GATCTC--CA--AA---TTG---A-A-T-T----T------GC--GAGC------AA-T----AAT--T----CA------G--C-------A-AT---T----TG-AT---G-----GCA--A-C---ATC-AA--------T--AT-------AT--TT-A--GA--A-GA-----GAGTAAT--ACT-TA-ATTTGAGATGCAAT-GC--A--TCATT----TC----AA--T-T-----ATT--G-T-----T--C--A--CT-----AT--AT-----T--TC-A----A-TG-------G--ATG-------TA-T-ACA--T-C-----A--AT----T---CA-A--A-T-----A-T--------T--C--CC-CG----C-----A-A-CA--AT-T-C----AATTGATG-TGG-TT---T-ATCAA-ATC--A--T----TT-ATTG---T---C-CG--CA-AT-G-AA--A-AA-A--A------AA-----TTG-ATG-C--G-CG----G--G--C---A----A---------------A-T-C----A----A------T--A---C---T-------G--GC----G-CAAT--A-A--T-TC---C----A---G-----A-TT-----G------TC----G-C---G--G-----------C-AT---C----A-----------AT----T-C---------A---C--T-----T-----------G-----A--T--------G----A---G-GTATGC-A-AT-----A-----A--T------T-G----------A-C----T---T------G---A---------T-G--A-G-CA----C-----A---T-C-A--A-----T-T------G---A-G------TT-----ATT---T-CA----GC--AC--C----A---AT-AA-TTG---AC-----TG-----CA-AT-A---T-TTGA
gi|5 : tgaagtgcagtTATTCCTT-----A-T-------ACAA---A-A--A-CGTAATTT--TAATG-A----TTAA---G-ATT-C---CTTC--G----A--T-T---A--A--A-TCAGATA-G-A--TCAT--G----A--AAT-CAT--TT-AT---ACC--GAGCTC--AA--AA---CGC---A-A-T-T----T--T---GC--GAGC------AA-T----AAT--T----C
gi|12 : attgatgcgcacatatTATTTCCT-----ACT-------ACAA---A-AGGC-GGT--TGT--AA-TAGA----TTAA-A----TA-T-ACCTTCCAA----A--T-TTG-G--A--A-TAAAGAG-A----TCAT--A----C--AATGTAT--TTGAT---ATC--GAGTTG--AC--AG---T-----A-A-T-A----G--T---GC--GAGC------AA-T----AAT--T----CCT-----G--T---T---G-AA---T----TG-AT---G-----ACG--G-C---ATC-AAATCCAACTT--AT-------CTGCT--A--CA--T-GC-----AAGTGA---A-T-TA-A--TG----GCG-C-GC--A--TAATTA---TC----AA--T-T-----ATcatcaccacgggtccatcacattgatgcgcgtattgatcaatgaaattgagagcatatatatatatagagagggatgaatatgaacatcagatcaatttttgctctcatcattggaactagtgcgcaaaattttacctgatttacgcatttagcaataattgatttgatgcgcgtaattgatattcaaataaaaaaagagtttataaatgttaatt
gi|27 : cttaactgaatgtgctcttcttaaaaggaaggatgcaagcggtTATTCCT------A-T-------ACAA---A-A--AACGTAATTT--TAATG-A----TTAATGCG-ATT-C---CTTC--G----A--T-T---A--A--A-TCAGCAT-AGA--TCAT--G----A--A-T-CAT--TT-AT---ACC--GAGCTC--TA--AAGACGCA---A-ATT-T----T--T---GCT-GAGC------AA-T----AAT--T----C
gi|3 : attatgcgcacataatATTCCTT-----A-T-------ACAA---A-A--G-CGT--TGT--AAATA----------------------------------------------A--A-T--GAAG-A----TCAT--C----A--AAT-CAT--TT-AT---TCC--AAGCTC--CA--AA---TGC---A-A-T-T----C--T---GC--GGGC------AA-C----ATT--T----C----------CA--C---A-ACA--T----AG-AT---ACGC--GCA--T-C---ATG-GA--------------------AT--T-----GA--T-CA-----GAGCAAT--AAT-TG-AAATAA--TGCG-C-GC--G--TAAAA----TC----AAATT-T-----ATT--G-T-----T--T--G--C----------AT-----TGATC-A----A-TT-------G--AAC-------TAGT-GCG--CGC-----A--------T---GG-A--A-T-----ACT--------T--T--CT-TGTTTTC-----A-T-CA--AT-T-G----ACTAGATG-C-G------C-ATCAA-ATC--A--A----TC-CTTGCTCT---C-TT--CA-AT-TAAA--T-TA-T--T------AA-----TTT-AT-----------------------A----G---------------A-T-T----A----A-----TT--A---G---TG------G--GA----G-CAAT--A-T--T-T-------------G-----A-TTTA---A------T-----G-C---GT-G-----------T-AT---T----A-----------AT----C-C---------A---G--T-----T-----------A-----C--A--------G----T---G-T---GC-A-AT-----A-----A--T------C-A----------G-A----T---T------G---A---------T-G--A-catcaccacgggttccactcacattgga
gi|1 : tgatatctttaattgaattcttgctctctttcaaaaagattgagacacgcattaATTTCTT-----A-T-------AC-----A-A--T-CGT--TGT--TAATG-A----TTTA-AG----A-T-ATCT-C--A----G--T-T---G--A--A-TCAAAGA-G-A--TCAT--A----G--AAT-AAT--TT-GC---GTC--AAGCTC--TA--AA---GTA---A-A-T-T----C--T---GA--GATC------AA-T----GGT--T----CC------A--T---C---A-AA---A----TG-TT---G-----CCG--CTC---ATC-AG--------T----------------------------G-----GAGTTAT--A----A-GATTGA--TGCG-C-GCA-A--TCAAA----TC----AA--T-T-----ATT--G-T-----T--C--tataatttcagataaataaaggtatcttcaattaatttggtt
gi|11 : aattgatgattctttaccaacattgaagttactcttttcgattgtcgatcgtagcgcgcataactcaatttatgcgcgcaataatttaaatattgtgtctcttccaattgaataattcaatgtgcaaaataaataattcttttgagaaagcaactatctaattggagatagcttcattcaacatatccactattgaattaatatttctttaattagaactgctactcctttaaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaaATTCTTT-----A-TTTTGAAAATAA---G-A--T-CAT--TGA--AAATA-G----T-GA-AAT-ACA-TTATCTTC--A----G--T-T---GG-A--A-TAAAGAG-A----TCAC--T----A--AAT-AGT--TT-AT---ACC--GTGCTC--AA--AA---T-G---ATA-T-T----T--T---AC--GAGC------AA---------------------------C---T---A-AT---T----CC-AT---C-----GCA----T---ATTGAA--------T--GC-------AT--T--A--GA--T-GA-----GAAAAATC-ACTCTA-ACT------GCG-C-GC--A--TCA------------AA--T-C------TT--G---------------------------AA-----T--TC-A----A-TG-------A--AT-----------T------T-T-----A--AT----T------A--G-T-----A-T--------T--G--CC-CA----C-----G-A-GA--AG-T-A----AATTGATG-C-G-ccatcaactgaatctaacacgcgcgcatcatgataatattgatttactcgattgaagagaatgcaaactg
gi|33 : acatgtgtacattaATTCATT-----G-T-------ATAA---A-A--G-CGT--TGT--AAAGA-A----TTTA-AG----A-T-ATC------------------------------AGAG-A----TCAT--T----A--AAT-CAT--TT-AT---ACC--GAGCAC--TA--AA---TTA---G-A-T-T----T--T---GC--GAGC------AA-T----AAT--T----CC------A--C---C---ACAT---T----c
gi|16 : cattgATTCCCT-----A-T-------ATAA---ATA--G-CGT--TGA--AAA-A-A----TTAA-G----CAGT-ATCTTC--T----T--T-T---T--ATTA-T-AAAAG-A-A--TTATTCACTTTA--AAT--AT--TT-AT---ACC--GAACAT--CA--AA---TTA---A-A-T-T----T--TA--AC--GAGC------AA-T----AAT--T----CC------A--CTCAC---A-CTA--T----TG-AT---T-----AAAC-A-C---ATC-AA-----------AT-----------------GA--A-GAATGATGAGGAAT--AAT-TATAATTAA--TG---T-GC--A--TGATTAAAATG----AA--T-TTATTAATT--G-T-----T--C-----------------T-----T--TCAA----A-TG-------G--cattcacgcattaaatcaat
gi|18 : atgtaATTCCTT-----G-C-------AC-A---A-A--G-CGT--AGT--AAAAA-ACCCTTTAA-AA------T-ATCTTT--AGTTTA--C-C---GGTA--A-TTGAAGA-G-A--TCAT--A----A--A------------T---ACC--GAGCTG--CA--AA---CGA---A-A-T-T----T--T---GC--GGGC------AA------AAT--T----TT------A--T---C---A-TA---T----TG-AT---------ACA--AGC---ATC-AA--------TTGA--------AT--T-----GA--T-CA-----GAGCAATAGAC--TA-A-TTAA--TGCG-C-AC--A--TCAAA----TC----AA--C-C-----ATT--G-T-----T--C--
gi|6 : taATTCCTT-----A-T-------ACAA---A-A--T--GT--TGTGTAAATA-A----CTAA-AA--AGA-T-ATCTTC--C----A--TAG---G--A--A-TTAAA-G-T-A--TCAT--T----A--AAT--AT--TT-ATT--ACCAAGGCCTT---A--AA---TTA---A-A-T-T----T--TT--GT--GAGC------AA-T----AAT--T----GA------ATTC---CAA-A-AT---TAATATG-ATCA-T-----GCAT-A-A---ATCAAA--------T--CT-------AA--TGCA--GA--A--A-----GACTAAT--A---TA-A-TTGA-------------------------------AA----T-----AAT--G-C-----C--C--A--C----------AT-----T--T--A----A-TG-------A--ATC-------T--------------------AT----T---CA-A--A-------A-C--------T--C--TC-GG----T---------CA--AT-T-G----AATTCATG-T-GACA---C-ATTAA-AAG--A-------TT-ATTG---T---C-ccatcaactgaataatccgc
gi|31 : tttttaattcaacagttattccacaatttgaattaaattaaatgttctctttcaattgaattattgctgtcttttaatgaattaATTCCTT-----A-T-------ACAA---A-A--T-CGT--TGT--AAATA-A----TTAA-AG----A-T-ATCT-----------------------------AAGG-A----------A----A--GAT-CAT--TT-AT---ACC--A----C--CA--CA---TTA---A-------------T---GC--GCGC------AT-C----AAT--T----GA------A--T---C---A-t
gi|41 : cattcATTCCCA-----A-T-------AGAA---A-A--G-CAA--TGT--AAATA-A----TCAG-A-------C-ATCTTC--A----A--T-T---G--A--A-TCAAAGA-G-A--TCAT--T----A--AAT-CAT--Tcaggtatgaataacaggtctctgaattttaatcaa
gi|36 : acaattgaattcatgctctctttgaaaatgcgcgccataATTCCTTTAAGTA-T-------ACAA---A-A--G-CGT--TGT--AAATA-T----CTAA-AA----A-C-ATCTTC--G----A--T-T---G--T--A-TAAAGAG---A--TTAT--T----A--AGT-CAT--TT-AT---
gi|25 : catgattggagtcagttgctctatatatatatggtcgcattaATTCTTT-----A-T-------AC-A---A-A--T-CGT--TTT--AAATA-A----TTAA-AG----A-T-ATCTTC--G----A--T-T---T--T--A-GC-----------TTGT--A----A--AGT----------G---AGC--GA------CA--AA---TTGATTA-A-T-T----T--T---AC--TGGC------A-------AAT--T----CC------A--C---C---A-AA---T----TT-AT---GC----GT---G-C---ATC-AA--------T--
gi|40 : taattgaatatctctctggttgaattgaattgttgttctgtctaaaagatatagcgcttgcattaTTCCTT-----A-T-------AGAA---A-G--G-TGT--TGT--AAATA-A----TTAA-AG----A-T-ATCTT---A----A--T-T---G--A--A-TTAAGAG-A-T--ACGT--A----A--A-T-CAT--TT-AT---ATC--GAGCGT--TA--AA---TTA---A-T-T-T----T--T---GC--GAGC------AA-T----AAT--tg
gi|19 : TTCCTT-----A-T-------ACAA---A-A--G-CAT--TGT--AAATG-A----TTAA-AG----A-T-ATCTTC--A----A--T-T---G--A--A-TTAAATG-G-A--TAAT--T----A--AAT-CAT--TT-AT---ACC---ACCTG--CA--AA---TTC---A-A-T-C----C--T---GC--A---------AA-T----AGT--T----Cattcca
gi|15 : ctatttgaaatatagtttatataattagggatatcgttatgtgccctctttcaaagaatgaatgggtgcatccatTCTTT-----A-T-------ATAA---A-A--A-CGT--TGT--AAATA-A----TTA---------------TTT--A----A------------------GAAAG-G-A--GTAC--A----A--A-T-CAT--TT-AT---TCC--AGGCTC--CA--AA---TTG---A-A-T-T----T--T----T--GAGA------AA-T----AAT--G----CA------A--C---C---A-CA---T----TG-AT---GC----GC---G-C---ATC-AAG-------T--AC-------AT--T-----GATCA-CA-----GA-------AC--------TGA--TGAA----C--A--T-ATT----GC----------T-----CTC--G-------T--C--A--AT-----GTGAAT-----T-----A----A-TG-------C--ATG-------CA-T-GCA--T-C-----A--AT----G---CT-A--T-T-----C-T--------T--T--CG-CG----T-----A-A-TG--AC-C-G----AATTGATGAT-G-TC---T--TCAA-caaaatgcgtgcattcatattaagcaat
gi|57 : TCCTT-----A-T-------ACAA---A-A--T-CTT--TGT--AAATA-A----TTAA-Attg
gi|48 : ttcattgtaTCCTT-----G-C-------TCTA---A-A--G-CAT--TGT--AAATA-A----TTAA-AG----A-T-ATCCTC--A----G--T-T---C--A--G-TT--------A--T--T--G----A--GAT-C-------AT---ACC--GAGCTC--CA--AA---TGC---A-A-C-T----T--T---GC--gat
gi|20 : gCCTT-----C-T-------ACAATATA-A--G-CGA--TGT--AAATA-A----TCAA-A-G-ATA-T-AT--TC--A----A--T-T---G--A--A-TCAAAGA-G-A--TCAT--C----A--AAC-CAT--TT-AT---ACC--GAGCTC--CA--AA---TGC---A-A-T-T----T--T---GC--AAGC------AA-T----AAT--T----GA------A-----------------T----TG-AT---GAGA--GCA--A-ag
gi|14 : ttatgcgcgcattgttgCTT-----A-T-------ACAA---A-A--G-CGT--TGA--TAATA-G----TTTT-AA---TA-T-ATCGTC--A----A--A-T---G--A--A-TTAAAGA-G-A--TCAT--C----T--AAC-CAC------------C--GAGCTC--CA--AA---TTG---A-A-TAT----TGAT---GC--GCGC------G------------T----CA------A--C---TG--A-AT---T----T---T---G-----G-----------------------------------------------------------GAGCAATA-ACT-TA-A-TTGA--TGCG-C-GC--A--TCAAA----TC----AA--G-T-----ATT--T-C-----T--C--T--CTG----AC--ATCAG--T--TG-A----A-TT-------A--GTG-------CG-T-GAA--T-C-----A--AT----T---CA-A--tgagagagttagattaatcattactctcttgaattgaattcaggcgcacataaaataattt
gi|7 : tctttagctgaattgttgctttctttaaaagtgcgctCTT-----T-T-------ACAA---A-A--A-GTT--TGC--GAATG-T----TTAA-AG----A-C-ATCATC--A----A--T-T---G--A--A-TTGAAGA-G-A--TCAT--C----A--AAT-------T-AT---GTC--TA---C--CG--AA---CTGT--A-G-T-T----T--T---GCGAGAGA------AA-C----AAT--T------------G----------A-AT---TCC--TG-AA---A-----GCATTA-A---ATC-GC--------T--TC-------AT--T-----GA--A-G------GA----------------TTGA---GC----GC--A--TAAAA----TC----AA--T-T-----ATT--G-C-----T--C--C--CT------T--CTTAGGAT--TT-A----A-TG-------T--GCGCA-----TA-T-ACA--TGT-----A--AT----C---CATA--ATT-----A-C--------T--T--TC-CA----C-----A-A-
gi|8 : attcaacatatcaactactaattaatgatacctttaactgaattgttgctctctttaaaaaaatgaggtgtgcatgcattaatatT-----A-T-------AC-A---A-A--T-CGT--TGT--TAATG-A----TTTA-AG----A-T-ATCT-C--A----G--T-T---G--A--A-TCAAAGA-G-A--TCAT--A----G--AAT-AAT--TT-GC---GTC--AAGCTC--TA--AA---GTA---A-A-T-T----C--T---A---GATC------AA-T----GGT--T----CC------A--T---C---A-A----------A-AT---GTT---GCG--G-CT--ATC-AG--------T----------------------------G-----GAGTTAT--A----A-GATTGA--TGC----GCCAA--TCAAA----TC----AA--T-T-----A-T--G-T-----T--C-----CC-----A-------------TC-A----ACTG-------A--AT--------TA-C-ACA--ttgcagtgcagtgcacaatgcaat
gi|9 : ctttaatagaactgctactctttaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaattttaA---A-T--T-CTT--TAT--ACATG-A----TTAA-AA----A-T-ATCTTC--A----G--T-T---G--A--AATCGA--GCA-A--TCAT--G----A--AAT-CAT--TT-GT---ACC---------------------------A-T-T----T--T---GC--GAGC------AG-T----AATC-C----CA------A--CA--C---A-A---------TA-AT---GCAT--GCA--T-C---ATT-AA--------A--AT-----------------GA--T-GA-----GAACAAT--GGT-TG-AATTAA--AG---------------------TC----AA--T-T-----ATT--G-T-----T--C--gcgcgcatcatgattaattattgatttactcgattgaatgagaatgcaaacttgaattaaacgatatcctcaaataatg
gi|32 : ttggtttaataaatgcgggcaataatagaattattgctctcttcaatttgattattgattaaagatatttctaataatgatttcgaattgaatttttgctttctttaaaagaattggtgcgagcgttAA-AAG-A-----ATGTTT--A----ATCC-TATCG--A--A-TTAAAGA-T-A--TCATT-A----A--AAT--AT--TT-AT---ACC--GAGCAT--TA--AA---TAA---A-A-T-T----T--T---GC--GAAC------AA-T----AAT--T----CA------A--C---T---A-CA---T----TA-AT---G-----CGA--G-T---ATT-AAT-------T--AG-------AT--T--A---A--T-GA-----GAGttatcaattgagtacgc
gi|29 : tcttta-ACA-T-AACCTC--A----A--T-C---A--A--A-CTAAAGA-G-A--TAAT--T----A--AAT-CAT--TC-AT---ACT--GAGCTT--GA--AA---TTG---A-A-T-A----T--T---TC--GAGC------AA-T----AGT--T----CC------A--C---C---ACAT---T-------AC---C-----GCGC-G-C---ATC-AA--------T--GTGA-----AT--T--A--c
gi|37 : ccgtatgcaaaggcattgtA-T-ATCTTC--A----A--A-T---G--A--A-TTAAGAG-A-------T--A----ACTATT-CATAATT-AT----TC---AT-TG--CATTAA---CTG---A-A-T-TA---T--T---GA--TAGC------AA-T----AATTAT----CT------G--C---T---G-AA---T----TG-AT---G-----acgtcctcttcctttgaattaatgcatg
gi|50 : aaaccattgggaattgtcattgatg--A----A--A-T---A--A--A-TTAAGAT-A-ACTTCAG--T----A--ATT-TAT--TT-AA---ATC--AAGCTC--CA--GT---TTA---G-A-T-T----C--A---GC--GAGC------AAGT----AAT--T----Ccgct
gi|34 : cgttgtAGG-G-G--TCAT--C----A--ACT-CAT--TT-AT---ACC--GAGCTC--CA--AA---TTA---A-A-TAT----A--TACAGC--GAGCTTATAGAA-T----AAT--T----CC------A--C---C---A-CA---T----TG-AT---GC----GC---G-C---ATC-CA--------T--GA-------AT--T--A--c
gi|26 : -A--TCAT--A----G--AAT-AAT--TT-GC---GTC--AAGCTC--TA--AA---GTA---A-A-T-T----C--T---GA--GATC------AA-T----GGT--T----CC------A--T---C---A-----------TA-AT---GTT---GCG--CTC---ATC-AG--------T---------------T--G--GA-------------GTTAT--A----A-GATTGA--TGCG-C-GC--A--TCAAA----TC----AA--T-T-----ATT--G-T-----T--C-----CC-----ATC-AA-----C--TG-A----A-TT-------A--ACG-------CG-C-GCA--T-C-----ATGAT----T----A-A--T-T-----A-T--------T--atgcgcgcaataatcattactatcatcagt
gi|4 : gag--TCAT--C----A--AGT-CAA--TT-ATTGCAT----ACCTCATCA--AG---T-G---A-A-T-TGATGC--C---GC--GA-C------AA-TCTGGAAT--TATTGC-------G--C---C---A-GTA--T----TG-ATTT-GCCC--GCG----C---ATC-AA--------T--TTTTTTTTCAT--T-----GC--G-GA-----CAATAA---A---TG-ATTTGA--TAAA-CCAC--A--TCAAT----TG----AA--T-T-----GTT--G-C-----G--G--G--GA-----AT--AT-----T--TG-A----A-TT-------G--ATG-------TA-T-ACA--T-C-----C--AT----T---GA-A--A-T-----A-T--------A--G--TG-AA----C-----A-A-TA--AT-T-G----AAATGATG-C-A-TTGCAT-CTCAA-ATT--AAGTA---TT-ACTC---T---C-TT--C---T-------A-AA-T--A------TA-----TTG-ATGTT--G-CC----A--T--C---A----A---------------A-T-TGCTGA----A-----TT--A---T---TG------C--TC----G-CA----A-A--T-T----C----A---A-----T-TT-----G------gatttactcgattgaagagaat
gi|42 : tgaagtgcagttattccttatacgaaatcgtgttaaataattaaaaggacacatcttcaactgaatcaaaagaaatcataaaatcatttatatcgatctc--TCAT--A----C--AAT-TAT--TT-AT---ATC--GAGTTT--TG--AA---AGA---A-A-T-A----T--T---GC--GAGC------AA-T----AAT--T----CC------T--T---G---A-A----T----TG-ATACGG-----GCATCA-A---ATC-AA--------C---T-------AT--T--gcacatcaattgagttatttcagcaccaataattgactgcaatatttga
gi|56 : --AAT-CAT--TT-AT---A-C--GAGCAT--TA--GG---TCA---G-A-T-T----T--T---GC--ATGC------AA-T----AAT--T----gctatcatcaagtgaattaatgc
gi|39 : ttT---ACC--GAACTC--CA--AA---TTA---A-ACT-T----T--T---GC--GATC------AA-A----AAT--TC---CA------G--C---T---A-TTA--T----TA-AT---G-----GAT--G-C---ATC-AGT-------T--AA-------AG--T--A---A--T-GA-----GAGCAAT--A----A-ATT--A--TAAA-T-AC--G---CGCT----TC----AA--tcac
gi|30 : -T-T----T--T---GC--G--C------A-----------------CA------G--T---T---G-AA---T----TG-AC---G------CA--CTC---ATC-AA--------T---TCG-----AC--T-----GA--T-GA-----GAGCAAG--AAT-TG-ATTTGA--TGCA-C-AC--A--TAAAC----TC----AG--T-C-----ATT--G-C-----T--------CT------T--AT-----T--TT-A----A-------------AAG-------CG-T-GCA--T-C-----A--AT----atcagctacc
gi|3 : c--T---GC--GCGC------AC-T----AGT--T----CA------A-----------------T----TG-AT----------------------C-AA--------T---------------------GC--A-AA-----CAATAA---ATT-TG-ATTTTA--CGCG-C-GC--A--TTATT----TC----AA--T-T-----ATT--G-C-----T--CTGA--TC-----A---AT-----T--CC-ATG--A-TG-------C--GCG-------TA-T-CTA--T----------GT----TGTGGA-A--A-T-----G-T--------T--G--CC-CG----C-----A-G--A--AT-TGC----ATTTGacttgattaaagtttgactccat
gi|24 : tgatatctttaattgaattcttgctctctttcaaaaagattgagacacgcattaattccttatacaaaagcgttgtaaataaatgaagatcatcaaatcatttattccaagctc--GAGC------AA-T----------------------G--C---T---G-AT---T----TG-AT---G------CAT-G-C---ATT-AA--------TC-AA-------AT--T--ACTGC--A-CA-----CAGTAAT------------TGA--TGTA-T-GC---------T----TC----AAG-T-T-----ACT----------T--C------T-----TT--CT-----T--TC-ATCTGA-CA-------A--ATA-------CA-T-GCA--T-C-----A--AT----T---GA-A--A-TG----A-TGA------T--C--AG-CG----C-----A-G-GA--AT-T-G----ATTCGATG-C-G-CA---C-ATCAA-TTC--A--G----TT-ATTA---C---A-CA--CA-AT-AAtggaatactttcttgttttcatcaattgactagatgcgcatcaaatcaatccttgctctcttcaattaaattattaatttatagattaattagtgggagcaatatttgatttaatgcgtgtattaatccagttacagtgtgcaataatcagattgatgatataatttcagataaataaaggtatcttcaattaatttggtt
gi|28 : --GAGC------AA-T----AAT--T----CC------A--C---C---A-CA---T----TA-AT---GAGTACGCC--A-T---ATG-AA--------T--TC-------AT--------------GA-----GAGCAAT--AAT-----TTTAA--TGCA----C--AGTTCAAG----TT----AA--T-T-----ATT--GCC-----T--CA-A--TT-----AA--AT-----T-----A----A-TG-------tagtcaactgaattgatgag
gi|28 : AGC------AA-T----AAT--T----TATGTAATG--C---CCACA-GTATAT----TG-AT---G-----GGA--G-C---ATT-AA--------T--TTA------AT--T-----------GA-----G-GCAAT--AAT-TA-ACTTGAACTG---T-GC--A--TTA-------A----AA--T-T-----ATT--G-C-----T--C--T--C------ATG-AA-----T--TC-AT---A-TG-------G---CG-------TA-C-TCA--T-T-----A--AT----ctcccatcaatatactgtgggcattacataaattattgctgttttcaactgaacttaatgc
gi|26 : gagcaataattccaccacC------AA-T----AAT--T-----A------A--T---C---A-----------TG-AT---GC----GCG----C---GTT-AA--------T--TC-------AG--T--T--GA--T-GG-----GAACAAT--AAT-TG-ATTTGA--TGCG-C-GC--A--TCAgttttcaactgaacttaatgc
gi|22 : gagatcatagaataatttgcgtcaagctctaaagtaaattctgagatcaatggttccatcataatgttgcgctcatcagttggagttataagatA-C----AAT--T----GA------A--C---A---A-AT---T----CGCGC---G-----TCA--A-----ATC-AA-----------ATGG-----AT--C--A---A--T-GA-----GAACAAT--AAT-TC-AATTGA--TGCG-C-GC--A--TCAAA----TC----AA--T-T-----ATTGGG-T-----G--C--A-------------AT-----C----------A-TG-------AACATG-------TA---ACA--T-C---------T----T---CA-A--A-TA----A-T--------T--C--Catttactcgattgaagagaat
gi|24 : tttccatcgaagcaccaaataaaggttgaagttaactt---C---A-AT---T-----G-AT---G------------C---ATG-TA--------T--TT-------GT--C--A--GA--T-GA-----AAGAAAG--AAG-TA-ACTTGA--AGCA-T-AC--A--TCA-------------A--T-T-----ACT--G-T-----G--T--G--CA-----GT--AA-----T--TT-G----A-TT-------A--ATG-------CA-T-GCA--T-C-----A--AA----T---C--A--G-C-----A-T--------T--G--CT-CT----A-----G-T-CA--AC-T-G----AATTGATG-ggagagcagttactgatttaattggtgagcacaaat
gi|44 : ttattgtgtgtaataactgaattgatgtgcgcatcgaatcaattcctgcgctgatcatcattt---A-AT---T----AG-AT---T-----GTA--A-CTGAATC-AG--------T---TCG-----AT--T-----GA--A-GA-----GAGCAGT--AAT-TG-AATTAT--TGCG-C-GC--A--T--TT----TC----AA--T-T-----ag
gi|42 : -C---ATT-AA--------T--TC-------AC--T--T--GA--T-GA-----TAGCAAT--AGT-TG-ATTTGA--TGCC-C-GT--A--TCAAT----TCAAGGAA--T-T-----ATT--G-C-----T--C--G--CA-----AT--AT-----T--TC-gccaacttcaagaattcagcaaacaattaaa
gi|10 : tcatacaattatttatatcgagttttgaaa-C---ATG-AAC-------T--AA-------AT--T-----GA--G-AA-----GACCAAT--AAT-TG-ATTGGA--TGCG-T-GC--G--CCAAT----TG----AA--T-C-----GGT--G-C-----G--C--G--CTTC---AT--AT-----T-----A----A-TT-------A--ATG-------CA-T-ACA--T-CGTATAA--AT----T---AT-G--A-T-----A-TAACTGCTAT--C--CT-CA----C-----A-G-AA--AC-T-G----AAATGATG-T-G--------ATCAA-A-CGGA----------ATTG---A---C-CA--------GAGC--A-AA-T--ATTTTTGAT-----TTG-ATG-C--G-TG----GCAT--C---A----A---------------C-G-G----A----A-----TT--G---A---TA------A--GC----G-CATC--A-A--T-T----T----A---T-----A-TT-----A------T-----GAC---AA-G-----------C-ATC--C----A-----------AT----c
gi|30 : ctttgctatccgT--T--A--AA--ATAA-----GAGCAATG-ACT-GA-GTTT-A--TGTG-T-GC--A--TCAAA----TC----AA--T-T-----CTT--G-C-----T--C--T--C------ATC-AG-----T--CG-A----A-TT-------G--ATG-------AG-T-GCG--T-C-----A--AT----T---CA-A--C-T-----G-T---------------G-CG----C-----A-A-AA--AC-T-T----GATTAAAG-T-
gi|18 : cattgatgcacgctt--GA--T-GG-----GAACAAT--GGT-TG-ATTTGA--TGTG-C-GC--A--TTAAT----T-----AG--TCT-----ATT--G-C-----T--C-----TG-----ATC-AA-----T--TC-A----A-TT-------G--ATG-------CT-T-GTA--T-C-----A--ATATGAT---AA-A--A-T-----T-T--------T--G--CC-CG----C-----A-A--A--AT-T-ttgactccat
gi|14 : taattccttgcacaaagcgtagtaaaaaaccctttaaaatatctttagtttaccggtaattgaagagatcataaataccgagctgcaaacga--A-GA-----GAGAAAT--ACT-TG-ATTTGA--TGCG-C-GC--A--TCAAT----TA----AG--T-T-----ATT--G-C-----T--C-----CC-----AA--AA-----T--TC-A----G-TT-------G--ACG-------CG-C-GCA--T-C-----AATAT----T---CA-A--aactgaataatccgc
gi|21 : tctttagctgaattgttgctttctttaaaagtgcgctcttatacaaaagcgttgataatagttttaatatatcgtcaaatgaattaaagagatcatctaaccaccgagctccaaaGCAAT--AAT-CA-ATTGGA--TTCG-C-GC--A--TCAAT----TC----AA--T-T-----ATT--G-C-----G--C--A--CA-----AT--AT---------------------------G--ATG-------CA-C-GCA--T-T-----A--A----------A-ATGA-T-----G-T--------T--------CG----------A-A-TA--ATAT-C----AA-TAATG-C-A-TT---T-gacatcagttgaattagtgcgtgaatcaattcaa
gi|22 : cggtgtgaataagaagtatcagaaagctagaaagtattcaatctataacaAAT--AAT-TG-ATTTGA--TGCG-C-GC--A--TCAAT----TG----AA--T-T-----ATT--G-T-----T--C--ctttgtcaattgaattttcaaatattgcgcgcaatatattttgcatttttattttc
gi|14 : tttccatcgaagcaccaaataaaggttgaagttaacttggaattatttgaagatgttacatgttcatgattgcacccT-TG-AATTGA--TTCA-C-GC--A--CTAAT----TC----AA--C-T-----GAT--G-T--------C--A--GAGAGAAAT--AC-----T--TG-A----T-TT-------G--ATG-------CG-C-GCA--T-C-----A--AT----T---AA-G--T-T-----A-T--------T--G--CT-CC----C-----A-A--A--AT-T-C----AGTTGACG-C-G-CG---C-ATCAA-tcattgatccatttgatttgacgcgcgaatttgttcaattgtggagagcagttactgatttaattggtgagcacaaat
gi|10 : tctttagctgaattgttgctttctttaaaagtgcgctcttatacaaaagcgttgataatagttttaatatatcgtcaaatgaattaaagagatcatctaaccaccgagctccaaattgaataTTTGA--T-CA----C--A--TCATT----TC----AG--T-T-----TCT--G-TGAGGATAGC--AG-TT-----AT--AT-----C--AT-A----A-TTTATAC--G--ATG-------TA-T-GCA--T-T-----A--AT----T------A--A-T-----A-T--------G--AAGCG-CG----C-----A-C-CG--AT-T-C----AATTGGCG-C-A-CG---C-ATCCA-ATC--A--A----TT-ATTG---
gi|52 : ctttgctatccgcatgaactaaattgagaagac--TGCT-T-GC--A--TCAAT----TC----AG--T-T-----ATT--G-C-----T--C--T--TT-----A---ATCAA--T--TC-A----A-TG-------G--ACG-------TG-T-GCA--T-C-----A--AT----cggaattgaccagagcaaatatttttgatttgatgcgtggcatcaacggaattgataagcgcatcaatttatattatgacaagcatccaat
gi|21 : taacatA-T-GC--A--TTATT----------GA--T-------ATT--A-T-----T--CGAA--C------ATC-AT-----T--TT-A----A-TG-------C--GTG-------------CA--T-C-----A--------------------T-----A-T--------T--G--TG-CG----C-----A-A-TA--AT-T-G----AATTGATG-C-G-CG---A-ATCCA-ATT--G--A----TT-ATTG---C---C-
gi|3 : cggtgtgaataagaagtatcagaaagctagaaagtattcaatctataacaaaC--A--TCAAT----CT----GA--T-T-----ATT--G-C-----A--C--A--CT-----GT--AA-----C--TG-G----A-TT-------A--ATA-------CA-C-GCA--T-T-----A--AA----T---CA-A--A-T-----A-T--------T--G--CT-CC----C-----A-C-TA--AT-T------AATCTATA-A-A-TT---------A-ATA--A--T----TTAATTG--------------A-A--GAGA--G-CA-A--G------GA-----TTG-ATT-T--GATG----C--G--C---ATCT-A---------------G-T-C----A----A-----TT--G---A---TG------A--AA----A-CAAG--A-A--------------A---GT----A-TTCC---A------T-----G-C---GC-G-----------C-AC---T----A-----------GT----T-C---------A---A--T-----T-----------GATCA-A--T--------G----C---A-A---AC-A-AT-----A-----AATT------T-G----------A-T----T---T------T---A---------C-G--C-G-CG----C-----A---T-T-A--T-----T-T------C---A-A------TT-----A-T---T-tttgtcaattgaattttcaaatattgcgcgcaatatattttgcatttttattttc
gi|24 : tgatatctttaattgaattcttgctctctttcaaaaagattgagacacgcattaattccttatacaaaagcgttgtaaataaatgaagatcatcaaatcatttattccaagctccaaatgcaattctgcgggcaacatttccacaacatagatacgcgcatcatggaattgatcagagcC--A--TCAAT----TC----A----------------G-T-----T--G--A--CT-----AG--AG---------C-A----A-TGCTGATTTG--ATG-------CA-T-GCA--T-T-----A--AT--------CA-A--A-T-------------------T--AC-TG----C-----ACA-CA--GT--------AATTGATG-T-A-TG---C-TTCAA-GTT--A--C----TT-CTTT---C---T-TT--CATCT-G--------A-C--A------AA-----TAC-ATG-C-----------------------------------------A-T-C----A----A-----TTGAA---A---TGATGATCA--GC----G-CAGG--A-A--T-T-------------G-----A-TTCG---A------T-----G-C---GC-A-----------C-AT---C----A-----------AT----T-C---------A---G--T-----T-----------------A--T--------T----A---C-AC--AC-A-AT-----A-----A--atataatttcagataaataaaggtatcttcaattaatttggtt
gi|49 : ----TC----AA--C-T-----ATT--G-T-----G--C--GTGCA-----AG--AT-----T--TT-A----A-TT-------G--ATG-------AA-CGACA--T-C-----A--AA----T---CA-A--T-T-----A-T--------T--T--TC--A----T-----A-T-CA--AT-T-T----AATTGATG-C-G-Tag
gi|43 : aC----AA--T-T-----ATT--G-C-----G--C--G--CA-----TT--AA-----T--TA-A----A-TG-------G--ATGCGCGCTATG-T-ACAACT-C-----A--AT----T---GA-A--T-T-----A-------------C--AG-CG----C-----A-A-CA--AT-T-C----AA-TGATa
gi|24 : --T-T-----ATT--G-T-----G--T--G--TA-----AT--AA-----C--TG-A----A-TT-------G--ATG-------TG-C-GCA--T-C-----G--AA----T---CA-A------------T--------T--C--CTGCG----CTGATCA-T-CA--TT-T-C----AATTGATG-C-A-TG---T-AT---------------------TTG---T---C-AG-----AT-GAAA--G-AA-A--G------AAGTAACTTG-AAG-C--A-T---------------A----C---------------A-T-C----A----A-----TT--A---C---TG------T--GT----G-CAGT--A-A--T-T----T--------G-----A-TTA----A------T-----G-C---AT-G-----------C-AT---C----A-----------AA----T-C---------AG--CA-T-----T-----------G-----C--T------------------------CTA-GTC----A-----A--C------T-G----------A-A----T---T------G---A---------T-G--A-G-catgcacattaattaattgaattatt
gi|22 : T--AT-----T--TG-A----A----------G--ATG-------T--T-ACA--T----------GT----T---CA------TG----A-T--------T--G--CA-CC----C-----A-A-TA--AT-T-G----ATTTGATG-C-G-CG---C-ATCAA-TTG--A--A----TT-ATTG---T---T-CT--CA-TT-GA
gi|16 : tttccatcgaagcaccaaataaaggttgaagttaacttggaat--AT-----T--TT-A----A-TC----------ATG-------CA----CA--T-T-----A--AT----TA--TA-A--T-T-----A-T--------T--C--CT-CA----T-----C-A-TT--CT-T-C----ATTTGATG-T-G-TT---TAATCAA-tccatttgatttgacgcgcgaatttgttcaattgtggagagcagttactgatttaattggtgagcacaaat
gi|18 : atgtaattccctatataaatagcgttgaaaaaattaagcagtatcttctttttattataaaagaattattcactttaaatatttataccgaacatcaaattaaattttaacgagcaataattccactcacacta-------G--ATG-------TG-C-GCA--T-T-----A--AT----T---AG-T--C-T-----A-T--------T--G--CT-CT----G-----A-T-CA--AT-T-C----AATTGATG-C-T-TG---T-ATCAATATG--A--TAAAATT--TTG---C---C-CG--CA-Agaatttattaattgttctttcaaatgg
gi|30 : taattccttgcacaaagcgtagtaaaaaaccctttaaaatatctttagtttaccggtaattgaagagatcataaataccgagctgcaaacgaaatt--ATG-------TG-T-GCA--T-C-----A--AA----T---CA-A--T-T-----C-T--------T--G--CT-CT----C-----A-T-CA--GT-C-G----AATTGATG-A-G-TG---C-GTCAA-TTC--A----------ACTG---T---G-CG--CA-Aaaatcaaccattgttcccatcaactgaataatccgc
gi|52 : cattgatgcacgcttttaaaataagagcaatgactgagttt-T-GCA--T-C-----A--AT----T---CA-G--T-T-----A-T--------TG-C--TC-TT----T-----A-ATCA--AT-T-C----AATGGACG-T-G-TG---C-ATCAA-aaacttgattaaagtttgactccat
gi|22 : taacataCA--C-C-----A--AT----T----A-A--A-TCAGTAA-C--------T--G--CT-CT----C-----C-A-CA--AT-T-G----AACAAATT-C-G-CG---C-GTCAA-ATC--A----------AATG----------GATCA-AT-GAGA--ACAATA--ATTC---AA-----TTG-ATG-C--G-CGC---A--T--C---A----A---------------A-T-C----A----A-----TT--A---T---TG------G--GT----G-CAAT--C-A--T-agca
gi|4 : tttccatcgaagcaccaaataaaggttgaagttaacttggaattatttgaagatgttacatgttc----T---CA-A--T-T-----A-T--------TGGT--GC-TG----A-----A-A-TA--AC-T-C----AATTGATG-T-G-CT---C-ATCAA-GTC--A--A----TT-ATTG---CATAC-CT--CA-TC-------A-AG-T--G------AA-----TTG-ATG-C----CG----C--G--A---C----A---------------A-T-CTGG-A----A-----TT--A---T---TG------C--GC------CAGT--A----T-T-------------G-----A-TT------------T-----G-CCC-GC-G-----------C-AT---C----A-----------AT----T-T---------T---T--T-----TTTC--------A-----T--T--------G----C---G-G---AC-A-AT-----A-----A--A------T-G----------A-T----T---T------G---A---------T-A--A-ACCA----C-----A---T-C-A--A-----T-T------G---A-A------TT-----G-T---T-GC----GG--G---G----A---AT-AT-TTG--AAT-----TGagcacaaat
gi|42 : tgaagtgcagttattccttatacgaaatcgtgttaaataattaaaaggacacatcttcaactgaatcaaaagaaatcataaaatcatttatatcgatctccaaattgaatttgcgagcaataattcagcaatttgatggcaacatcaatatatttagaagagagtaatacttaatttgagatgcaatgcatcatttcaattattgttcactatatttcaatggatgtatacatA-A--A-T-----A-T--------T--G--CG-AG----C-----A-A-TA--AT-T-CCTTGAATTGATA-C-G-GG---C-ATCAA-ATC--A--A----CT-ATTG---ctgcaatatttga
gi|21 : tcatacaattatttatatcgagttttgaaag--A-T-----A-T--------T--A--TT-CG----------A-A-CATCAT-T--------TTAATG-C-G-TG---C-ATCA----------------T-ATTG---T---G-CG--CA-AT-------A-AT-T--G------AA-----TTG-ATG-C--G-CG----A--AT-C---C----A---------------A-T-T----G----A-----TT--A---T---T----------GCCTTTGTCAATTGA-ATTT-T----C----A---A-----A-TA-----T------T-----G-C---GC-G-----------C-Actatcatcaagtgaattaatgc
gi|3 : cggtgtgaataagaagtatcagaaagctagaaagtattcaatctataacaaaatgcattattgG----C-----A-A-TA--AT-T-G----AAATAATG-C-G-CG---C-GTAAA-ATC--AAAT----TT-ATTG---T---T-TG--CA-TT-GATC--A-AT-T--G------AA-----CTA-GTG-C--G-CGCAT-G--G------A----ATACTTTCTTGTTTTCA-T-C----A----A-----TTG-A---C---TA------GATGC----G-CATC--A-A--A-T----C----A---A-----T-CC-----T------T-----G-C---TC-T-----------C-TT---C----A-----------AT----T-A---------A---A--T-----TATTAATTTATAG-----A--TTAATTAGTG----G---G-A---GC-A-AT-----A-----T--T------T-G----------A-T----T---T------A---A---------T-G--C-G-TG----T-----A---T-T-A--A-----T-C------C---A-G------TT-----A-------CAGT--GT--G---C----A---AT-AA-TCA--GAT-----TGA----TG-AT-A---T----AATTatatattttgcatttttattttc
gi|30 : tgatatctttaattgaattcttgctctctttcaaaaagattgagacacgcattaattccttatacaaaagcgttgtaaataaatgaagatcatcaaatcatttattccaagctccaaatgcaattctgcgggcaacatttccacaacatagatacgcgcatcatggaattgatcagaG----C-----A-A-TG--AC-T-G----AGTTTATG-T-G-TG---C-ATCAA-ATC--A--A----TT-CTTG---C---T-CT--CA-TC-------A-GT-C--G------AA-----TTG-ATG-A--G-TG----C--G-----------------------------T-C----A----A-----TTCAA---C---TG------T--GC----G-CAAA--A-A--C-T----T--------G-----A-TT-----tcagataaataaaggtatcttcaattaatttggtt
gi|14 : cattgatgcacgcttttaaaataagaG----C-----A-A-TA--AC-T-T----AATTGATG-C-G-CG---C-ATCAA-ATC--A--A----GT-ATTT---C---T-CT--C---T-GACA--T-CA-GTTG------AA-----TTA-GTG-C--G-TG-------------------A---------------A-T-C----A----A-----TT--aaagtttgactccat
gi|15 : tctttagctgaattgttgctttctttaaaagtgcgctcttatacaaaagcgttgataatagttttaatatatcgtcaaatgaattaaagagatcatctaaccaccgagctccaaattgaatattgatgcgcgcgtcaactgaattttggga-C----AATTGAAG-A-C-AT---C-ATCAA-TTC--G--G----TC-ATTA---------CG--C-----GAAA--G-AATA--G------CA-----TTG-ATG-CATG-CA----T--G--C---ATT--A---------------ATT-C----AC---A-----TT--G---A---CG------A--GA----G-CAAT--ATG--T-T----C----ATC-A-----G-TT-----C------T-----G-T---G----------------AT---C----A-----------AT----G-T---------A---C--T-----T-----------G-----A--T--------G----C---G-C---GC-A-TC-----A-----A--T------caa
gi|10 : tctttatataaaaacgttgtaaataattatttaagaaaggagtacaaatcatttattccaggctccaaattgaatttttgagaaataatgcaaccac----AATTGATG-C-G-CT---T-ATCAA-TTC--C--G----TT-GATG---C---CACG--C--AT-CAAATCA-AA-A--A------TA-----TT---TG-C--T-CT----G--G-----------------------------T-C----A----A-----TT--C---CGTTTG------A--TC----A-CATC--A-T--T-T----C----A---G-----T-TT-----C------T-----G-T---GA-GGATAGCAGTTAT-AT---CAT--A-----------AT----T-T---------A---T--A-----C-----------G-----A--T--------G----T---A-T---GC-A-TT-----A-----A--T------T-A----------A-T----A---T------G---A---------A-G--C-G-CG----C-----A---C-C-G--A-----T-T------C---A-A------TT-----
gi|26 : ctttgctatccgcatgaactaaattgagaagaccaataattgattggatgcgtgcgccATTGATG-C-G-CG---C-ATCAA-ATC--A--A----TT-ATTG---T---T-CC--CA-TC-------A-AC-T--G------AA-----TTA-ACG-C--G-C--------G--C---ATCATG---------------A-T-T----A----A-----TT--A---T---TG------tatattatgacaagcatccaat
gi|22 : gagatcatagaataatttgcgtcaagctctaaagtaaattctgagatcaatggttccatcataatgttgcgctcatcagttggagttataag-ATTAA-ATC--A--G----TA-ACTGCTCT---C-CA--CA-ATTGAAC--A-AA------------------TT---CG-C--G-CG----T-----C---A----A---------------A-T-C----A----AATGGATC--A---A---TG------A--GA----A-CAAT--A-A--T-T----C----A---------A-TT-----GA-----T-----G-C---GC-G-----------C-AT---C----A-----------AA----T-C---------A---A--T-----T-----------A-----T--T--------G----G---G-T---GC-A-AT-----C-----A--T------atttactcgattgaagagaat
gi|43 : tttccatcgaagcaccaaataaaggttgaagttaacttggaattatttgaagatgttacatgttcC--A--A----TT-ATTG---C---G-CG--CA-TT-------A-AT-T--A------AA-----TGG-ATG-C--G-CGCTATGT-A--C---A----A---------------C-T-C----A----A-----TTGAA---T---TAC-----A--GC----G-CAAC--A-A--T-T----C----AAT-G-----A-TC-----A------T-----------GC-A-----------C-AT---T----A-----------AT----T-----------A---A--T-----T-----------G-----A--tggtgagcacaaat
gi|32 : -AA-A--A------TA-----TTT-ATA-C----CG----A--G--C---ATTA-A---------------A-T-A----A----A-----AT--T---T---TG------C--GA----A-CAAT--A-A--T-T----C----A---ACTAC-A-TT-----AA-----T-----G-C---GA-G-----------T-AT---T----A-----------AT----T-A---------G---A--T-----T-----------A-----A--T--------G----A---G-A---GC-attatt
gi|1 : tctttaaaaagaatgtttaatcctatcgaattaaagatatcatt-A--A------GA-----TTG-ATG-C--G-CG----C--AATC---A----A---------------A-T-C----A----A-----TT--A---T---TG------T--TC----C-CATC--A-A--C-T-------------G-----A-AT-----C------TAACACG-C---GC-G-----------C-AT---C----ATGATAATATTGAT----T-T---------A---C--T-----C-----------G-----A--TTGAA----G----A---G-AAT-GC-A-A
gi|26 : aattgatgattctttaccaacattgaagttactcttttcgattgtcgatcgtagcgcgcataactcaatttatgcgcgcaataatttaaatattgtgtctcttccaattgaataattcaatgtgcaaaataaataattcttttgagaaagcaactatctaattggagatagcttcattcaacatatccactattgaattaatatttctttaattagaactgctactcctttaaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaaatttcttatacaatcgttgttaatgatttaagatatctcagttgaatcaaagagatcatagaataatttgcgtcaagctctaaagtaaattctgagatcaatggttccatcaaaatgttgccgctcatcagtggagttat-A--A------GA-----TTG-ATG-C--G-CG----C--AT-C---A----A---------------A-T-C----A----A-----TT--A---T---TG------T--TC----C-CATC--A-A--C-T----G----A---------A-TTA----A------C-----G-C---GC-G-----------C-AT---C----ATG---------AT----T-A---------A---TTAT-----T-----------G-----A--T--------actg
gi|14 : gagatcatagaataatttgcgtcaagctctaaagtaaattctgagatcaatggttccatcataatgttgcgctcatcagttggagttat-A--A------TA-----TTG-ATG-C--G-CGC---G--T--C---A----A---------------C-T-G----A----A-----TT------T---TG------G--GA----G-CAAT--A-A--C-T----T----A---------A-TT-----GA-----T-----G-C---GC-G-----------C-AT---C----A-----------AA----T-C---------A---ttactcgattgaagagaat
gi|8 : tctttagctgaattgttgctttctttaaaagtgcgctcttatacaaaagcgttgataatagttttaatatatcgtcaaatgaattaaagagatcatctaaccaccgagctccaaattg-A--A------GA-----TTG-ATG-C--GCCA----A--T--C---A----A---------------A-T-C----A----A-----TT--A-------TG------T--TC----C-CATC--A-A--C-T----G----A---------A-TT-----A------CACA--G-C---GC-G-----------C-AT---C----ATG---------AT----T-A---------A---TTAT-----T-----------G-----A--T--------agtatttctctctgacatcagttgaattagtgcgtgaatcaattcaa
gi|5 : ctttaatagaactgctactctttaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaattttatatacaaatcgttgttaatgatttaagatatctcagttgaatcaaagagatcatagaataatttgcgtcaagctctaaagtaaattctagatcaatggttccatcaaaatgttgcggctatcagtggagttat------AA-----TT--ACG-C--G-CA----T-----C---A----A---------------A-T-C----A----A-----TT--A---T---TGCTA---A--AT----G-CG-T--A-A--A-T----C----A---GGTAAAA-TT-----T------T-----G-C---GC-A-----------C------T----A-----------GT----T-C---------C---A--A-----T-----------G-----A--T--------G----A---G-A---GC-A-AA-----A-----A--T------T-G----------A-T----C---T------G---A---------T-G--ttactcgattgaatgagaatgcaaacttgaattaaacgatatcctcaaataatg
gi|14 : attgatgcgcacatattattccttatacaaaaacgtaattttaatgattaagattccttcgattaaatcagatagatcatgaaatcatttataccgagctcaaaacgcaattttgcgagcaataattccatcaccacgggtccatcacattgatgcgcgtattgatcaatgaaattgagagcatatatatatatagagagggatgaatatgaa------AA-----TTG-ATT-C--A-CG----C--A--C---T----A---------------A-TTC----A----A-----CT--G---A---TGTCAG--A--GA----G-AAAT--A-C--T-T-------------G-----A-TTTG---A------T-----G-C---GC-G-----------C-AT---C----A-----------AT----T-A---------A---G--T-----T-----------A-----T--T--------G----C---T-C---CC-A-A------A-----A--T------T-C----------A-G----T---T------G---A---------C-G--C-G-CG----C-----A---T-C-A--A-----T-gatattcaaataaaaaaagagtttataaatgttaatt
gi|21 : tctttagctgaattgttgctttctttaaaagtgcgctcttatacaaaagcgttgataatagttttaatatatcgtcaaatgaattaaagagatcatctaaccaccgagctccaaattgaat------AA-----TTGGATT-C--G-CG----C--AT-C---A----A---------------T-T-C----A----A-----TT--A---T---TG------C--GC----A-CAAT--A-----------------------------T-----GA-----T-----G-C---AC-G-----------C-AT---T----A-----------Acaa
gi|43 : cggtgtgaataagaagtatcagaaagctagaaagtattcaatctataacaaaatgcattattgatattattcgaacatcatt------AA-----TTA-ATG-T--G-CA----T--G---------------------------A-T-C----ATTGAA-----TT--G---T---TG----------C----G-CTGT--A-A--T-T----C----AATTG-----AGTT-----G------TACATAG-C---GC-G-----------C-AT---C----C-----------AT----T-T---------A---A--T-----T-----------A-----A--T--------G----C---G-C---GC-A-AT-----A-----A--T------T-G----------gattattgcctttgtcaattgaattttcaaatattgcgcgcaatatattttgcatttttattttc
gi|38 : ------AA-----TTG--TG----G-CG----C--G--C---ATTC-A---------------T-T-C----A----A-----CT--AACGC---AG------G--GC----A--AAT--A-A--T-T----C----A---C-----T-TC-----A------T-----G-C---AC-G-------------AT---T----A-----------AT----T-CC--------A---C--T-----T-----------G-----A--T--------G----A---G-T---AC-A-AC-----A-----A--T------aattgaattatt
gi|34 : aattctagtatctaaaattgctattattcA-----TTG-ATG-C--G-C--------G--C---ATC--C---------------A-T-G----A----A-----TT--A---A---TG------C--GC----G-CAAT--A-A--T-catt
gi|24 : aggggtcatcaactcatttataccgagctccaaattaaatatatacagcgagcttatagaataattccaccac-----TTG-ATG-C--A-TG----------C---ATT--A---------------A-T-C----A----AA----TT--A---C---TG------C--AC----A-CAGT--A-A--T-T-------------G-----A---------------T-----G-T---AT-G-----------C-TT---C----A-----------AG----T-T---------A---C--T-----T-----------C-----T--T-----------------------------T-----C-----T--T------T-C----------A-T----C---T------G---A---------C-A--A-A-TACATGC-----A---T-C-A--A-----T-T------GA--A-A------TG-----A-TGA-T-CA----GC--G---C----A---GG-AA-TTG--Acattactatcatcagt
gi|14 : ttattgtgtgtaataactgaattgatgtgcgcatcgaa-----TTG-ATG-C--G-CG----------C---ATC--A---------------A-T-T----A----AG----TT--A---T---TG------C--TC----C-CAA---A-A--T-T----C----A---G-------TT-----GA-----C-----G-C---GC-G-----------C-AT---C----AAT---------AT----T-C---------A---A--T-----T--------------------T--------G--------G-A---GC-atcagcattgctctagtcaactgaattgatgag
gi|22 : tctttagctgaattgttgctttctttaaaagtgcgctcttatacaaaagcgttgataatagttttaatatatcgtcaaatgaattaaagagatcatctaaccaccga-----TTG-ATG-C--G-CG----C--AT-C---A----A---------------T-T-G----A----A-----TT--A---T---TG------T--TC----T-CATT--G-A--T-C----C----ATTTG-----A-TTTG---A------C-----G-C---GC-G-----------A-AT---T----T-----------GT----T-C---------A---A--T-----T-----------G-----T--G--------G----A---G-A---GC-A-GT-----T-----A--C------T-G----------A-TTTAAT---T------G---G---------T-G--A-G-CA----C-----A---atcaagtatttctctctgacatcagttgaattagtgcgtgaatcaattcaa
gi|21 : tttccatcgaagcaccaaataaaggttgaagttaacttggaattatttgaagatgttacatgttcatgattgcacccaataattgat-----TTA-ATG-C--G-TG----------C---A----------------------T-C----A-----------T--A---T---TG------T--GC----G-CAAT--A-A--T-T----G----A---------A-TT-----GA-----T-----G-C---GC-G-----------------------A-----------AT----C-C---------A---A--T-----T-----------G-----A--T-----------------------------T-----A--------T------T-G----------C-C----T---T--------------------T-G----------------------T-C-A--A-----T-T------G---A-A------TT-------T---T-CA-----------------A---AT--A-TTG----------CGCG---CA-AT-ATATT-TTGCATT-TTTAaat
gi|1 : cggtgtgaataagaagtatcagaaagctagaaagtattcaatctataacaaaatgcattattgatattattcgaacatcattTG-ATG-C--G-CG----C--G--TGTTA----G---------------A-TTC----A----G-----TT--G---A---TG------G--GA----A-CAAT--A-A--T-T-------------G-----ATTT-----GAT----T-----G-C---GC-G-----------C-AT---C----A-----------ATCTTAT-A---------A---C--TCCAC-T-----------G-----A--T--------G----A---GCG---GC-A-AC-----------A--T------T-------------------T---T------G---A---------T-G--ttttc
gi|26 : aattgatgattctttaccaacattgaagttactcttttcgattgtcgatcgtagcgcgcataactcaatttatgcgcgcaataatttaaatattgtgtctcttccaattgaataattcaatgtgcaaaataaataattcttttgagaaagcaactatctaattggagatagcttcattcaacatatccactattgaattaatatttctttaattagaactgctactcctttaaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaaatttcttatacaatcgttgttaatgatttaagatatctcagttgaatcaaagagatcatagaataatttgcgtcaagctctaaagtaaattctgagatcaatggttcTG-ATG-C--G-CG----C--G--T---T----A---------------A-TTC----A----G-----TT--G---A---TG------G--GA----A-CAAT--A-A--T-T-------------G-----A-TTTG---A------T-----G-C---GC-G-----------C-AT---C----A-----------ATCTTAT-A---------A---C--TCCAACT-----------G-----A--T--------G----A---G-C---GC-A-AC-----A-----tgataatattgatttactcgattgaagagaatgcaaactg
gi|8 : gagatcatagaataatttgcgtcaagctctaaagtaaattctgagatcaatggttccatcataaTG-ATG-C--G-CGCT--GT-G--T---A----A---------------T-T-C----A----G-----TT--G---A---TG------G--GA----A-C-AT--A-A--T-T----G----ATTTG-----A-TT-----G------------------GC-G-----------C-AT---C----A-----------AT----tgattaattattgatttactcgattgaagagaat
gi|1 : ctttaatagaactgctactctttaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaattttatatacaaatcgttgttaatgatttaagatatctcagttgaatcaaagagatcatagaataatttgcgtcaagctctaaagtaaattctagatcaatggttccatcaaaatgttgcggctatcagtggagttataagG-C--G-CG----C--A--T---A----A---------------C-T-C----A----A-----TT--T---A---TG------C--GC----G-CAAT--A-A--T-T----T----A---AAT---A-TT-----G------T-----G-T----C-T-----------C-TTC--C----A-----------ATTGAAT-A---------A---T--T-----C-----------A-----A--T--------GTGCAA---A-A---TA-A-AT-----A-----A--T------T-C----------T-T----T---T------G---A-----------GAAA-G-CAAC--T-----A---T-CTA--A-----T-TG-----G---A-GATAGCTTC-----A-T---T-CA----AC--A---T----ATCCAC-TA-TTG--AAT-----T-------A-AT-A---T-TTtgattaattattgatttactcgattgaatgagaatgcaaacttgaattaaacgatatcctcaaataatg
gi|44 : aattgatgattctttaccaacattgaagttactcttttcgattgtcgatcgta----G--G--C---A----A---------------T-T-G----A----A---------A---A---TG------C--GC----G-CAAT--A-A--T-T----C----A---------A-TT-----AC-----T-----G-C---TC-T-----------C-TT---C----A-----------AT----C-G---------A---A--C-----T-----------G-----A--T--------ctttaattagaactgctactcctttaaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaaatttcttatacaatcgttgttaatgatttaagatatctcagttgaatcaaagagatcatagaataatttgcgtcaagctctaaagtaaattctgagatcaatggttccatcaaaatgttgccgctcatcagtggagttataagattgatgcgcgcaatcaaatcaattattgttcccatcaactgaatctaacacgcgcgcatcatgataatattgatttactcgattgaagagaatgcaaactg
gi|18 : aattagattgtaactga--G--C---A----A---------------A-C-G----A----A-----AT--T---T---TG------C--GG----G-CAA---A-A--T-TTTATC----A---T-----A-TT-----GA-----T-----A-C---AA-G-----------C-AT---C----A-----------AT----T-G---------A---A--T-----T-----------G-----A--T--------C----A---G-A---GC-A-AT-----AG----A--C------T-A----------A------T---T------A---A---------T-G--C-G-CA----C-----A---T-C-A--A-----aacttcaagaattcagcaaacaattaaa
gi|20 : taattccttgcacaaagcgtagtaaaaaaccctttaaaatatctttagtttaccggtaattgaagagatcataaataccgagct--C---A----A---------------A-C-C----A----T-----TT--ATA-C---CG------A--GC----T-CCA---A-A--T-G----C----A---------A-TT-----T------T-----G-C---AA-G-----------C-AA---T----A-----------AT----T-G---------A---A--T-----T-----------G-----A--T--------G----A---G-A---GC-A-ATGAGAGA-----G--T------T-A----------G-A----T---T------A---A---------T-C--A-T-TA----C---------T-C-T--C-----T-T------G---A-A------TTGA---A-T---T-CAGGC-GC--A---CATAAA---AT-AA-TTatcaaccattgttcccatcaactgaataatccgc
gi|3 : ttatgcgcgcattgttgccttctacaatataagcgatgtaaataatcaaagatatattcaattgaatcaaagagatcat--C---A----A---------------A-TGC----A----A-----TT------C---TG------C--GG----G-CAAC--A-T--T-T----CCACAA---C-----A-TA-----GA-----T-----A-C---GC-G-----------C-AT---C----A------------T----G-G---------A---A--T-----T-----------G-----A--T--------C----A---G-A---GC-A-AT-----A-----A--T------T-G----------A-A----A---T------A---A---------T-G--C-G-CG----CGTAAAA---T-CAA--A-----T-T------T---A--------TT-----G-T---T-T-----GC--AT--T----G---ATCAA-TTG--AAC-----Tt
gi|15 : tgatatctttaattgaattcttgctctctttcaaaaagattgagacacgcattaattccttatacaaaagcgttgtaaataaatgaagatcatcaaatcatttattccaagctc--C---A----A---------------T-T-C----G----G-----TC--A---T---TA------C--GC----G-AAAG--A-A--T-----------A---GC----A-TT-----GATGCA-T-----G-C---AT-G-----------C-AT---T----A-----------AT----T-C---------A---CA-T-----T-----------G-----A--C--------G----A---G-A---GC-A-AT-----ATGTTCA--TCAGTTCT-GTGATCAATGTA-C----T---T------G---A---------T-G--C-G-CG----C-----A---T-C-A--ATGTGGT-T------G---C-A------TT-----A-T---T-T------C--T---C----A---AA-AA-TTC--AAT-----Tagtgcgcgcatggaatactttcttgttttcatcaattgactagatgcgcatcaaatcaatccttgctctcttcaattaaattattaatttatagattaattagtgggagcaatatttgatttaatgcgtgtattaatccagttacagtgtgcaataatcagattgatgatataatttcagataaataaaggtatcttcaattaatttggtt
gi|15 : tctttatataaaaacgttgtaaataattatttaagaaaggagtacaaatcatttattccaggctcca--C---A----A---------------A-T-TG---A----A-----TT--T---T---TG------A--GA-------AAT--A-A--T-G----C----A---ACCAC-A-TT-----GA-----T-----G-C---GC-G-----------C-AT---C----A-----------AG----TAC---------A------T-----T-----------G-----A--T--------C----A---C-A---GA-A-CT-----G-----A--T------G-A----------A-C----A---T------A---T---------T-G--C-T-CT----C-----G---T-C-A--A-----TGT------G---A-A------TT-----A-atgatgtcttcaattg
gi|30 : tctttatataaaaacgttgtaaataattatttaagaaaggagtacaaatcatttattccaggctc--C---A----A---------------A-T-C----A----A-----TT--C---T---TG------C--TC----T-C-AT--C-A--G-T----C----G---A-----A-TT-----GA-----T-----G-A---GT-G-----------C-GT---C----A-----------AT----T-C---------A---A--C-----T-----------G--------T-----------------G-C---GC-A-A------A-----A----------------------A-C----T---T------G---A---------T-atgcatgcatgcatcaatgctattctttcgcgtaatgaccgaattgatgatgtcttcaattg
gi|22 : cattgatgcacgcttttaaaataagagcaatgactgagtttatgtgtgcat---A----A---------------A-T-C----A----G-----TA--A---C---TG------C--TC----T-CCAC--A-A--T-TGAA-C----A---A-----A-TT--------------------C---GC-G-----------C-GT---C----A-----------AA----T-C---------A---A--A-----T-----------GGATCAA--T--------G----A---G-A---AC-A-AT-----A-----A--T------T-C----------A-A----T---T------G---A---------T-G--C-G-CG----C-----A---T-C-A--A-----A-T------C---A-A------TT-----A-T---T-GG----GT--G---C----A---AT-CA--TG--AACA----TGT----AACAT-C---T-TCAAATAATTtaaagtttgactccat
gi|30 : tttccatcgaagcaccaaataaaggttgaagttaacttgg----A---------------A-T-C----A----AG----TT--T---T---TG------C--GC----A-CAGTTGA-A--T-T-------------G-----A-C-------------------G-C---AC-T-----------C-AT---C----A-----------AT----T-C---------G---A--C-----T-----------G-----A--T--------G----A---G-A---GC-A-AG-----A-----A--T------T-G----------A-T----T---T------G---A---------T-G--C-A-CA----C-----A---T-A-A--A-----C-T------C---A-G------TC-----A-T---T-aattggtgagcacaaat
gi|38 : cattgatgcacgcttttaaaataagagc----A---------------A-T-G----A----A-----TT--G-------TG------GC-GC----G-CATT--C-A--T-T----C----A---A-----C-TA-----A------C-----G-CAGGGC-A-----------A-AT--------A-----------AT----T-C---------A---C--T-----T-----------C-----A--T--------G----C---A-C---G--A-TT-----A-----A--T------T-CC---------A-C----T---T------G---A---------T-G--A-G-TA----C-----A---A-C-A--A-------T------G---A-A------TA-----A-T------A----GC--A---aaagtttgactccat
gi|14 : aattctagtatctaaaat---------------A-T-CT---A----A-----CC--A---C---CG------A--GC----T-CCA---A-A--T-T----G----A---AT----A-TT-----GA-----T-----G-C---GC-G-----------C-GT---C----A-----------AC----T-G---------A---A--T-----T-----------T--------T--------G----G---G-A---GC-A-AT-----A-----A--C------T-T----------A-A----T---T------G---A---------T-G--C-G-CG----C-----A---T-CAA--A-----T-C------A---A-G-------T-----A-T---T-
gi|43 : tctttagctgaattgttgctttctttaaaagtgcgctcttatacaaaagcgttgataatagttttaatatatcgtcaaatgaattaaagagatc-C----A----A-----TT--A---T---TG------C--GC----G-CATT--A-A--T-T---------A---A-----A-TG-----GA-----T-----G-C---GC-G-----------CTATGTAC----A-----------AC----T-C---------A---A--T-----T-----------G-----AATT--------AC---A---G-C---GC-A-AC-----A-----A--T------T-C----------A-A--------T------G---A---------T-C--ATG-CA----CATTA-A---T-T-A--A-----T-T------G---A-A------TT-----A-T---T-tctctctgacatcagttgaattagtgcgtgaatcaattcaa
gi|42 : ----A----A-----AT--A---T---TG------C--GA----G-CAAT--A-A--T-T----CCTT-G---A-----A-TT-----GA-----T-----A-C---GG-G-----------C-AT---C----A-----------AA----T-C---------A---
gi|34 : tcatacaattatttatatcgagttttgaaag----A-----TT--A---T---TG------C--GC----G-CATT--A-A--T-T----C----ATG-G-----A---------------T-----G-C---GC-G-----------C-AT---C----A-----------AT----actattgctatcatcaagtgaattaatgc
gi|46 : aggggtcatcaactcatttataccgagctccaaattaaatatatacagcgagcttatagaataattccaccacG------A--GC----A-CATT--A-A--T-T----C----A---ATTTTTA-TT-----AA-----T-----G-A---GC-A-----------C-AT---C----A-----------AT----T-C---------T---A--T-----T-----------------A--T-------------ACT-G-C---GC-A-AT-----G-----A--T------T-G----------A-A----A---T------G---A---------T-G--A-cattactatcatcagt
gi|7 : tttgaagataG------G--GA----G-CAAT--A-A--T-T-------------G-----A-TT-----T------T-----A-T---GC-G-----------C--T---C----A-----------AT----C-C-------------T--T-----C-----------A-----A--T--------G----A-----A---GC-G-AT-----ttcaatgcat
gi|47 : attcaacatatcaactactaattaatgatacctttaactgaattgttgctctctttaaaaaaatgaggtgtgcatgcattaatatcttttacaaaaagtttgcgaatgtttaaagacatcatcaattgaattgaagagatcatcaaattatgtctaccgaactgtagttttgcgagagaaacaattgaattcctgaaagcattaa--GC----G-CATT--A----T-T----C----A---G-------TT-----AAA----T-----A-C---TC-T-----------T-AT---C----A-----------AT----T-C---------A---G--T-----T-----------G-----A--T--------G----C---G-C---GC---ATCTTC-A-----A--T------T-GCA--------A-T----T---T------G---G---------T-G--A-ttcttaggatttaatgtgcgcatatacatgtaatccataattactttccacaattgcagtgcagtgcacaatgcaat
gi|23 : tcttcagaC----G-CAGC--T-A--T-T----G----A---------A-TT-----GA-----T-----G-C---GC-G-----------C-TA---C----A-----------AT----G-C---------A---G--T-----T-----------G-----A--A--------A----A---C-A---GC-A-AT-----A-----C--T------T-C----------A-A--------T------G---A---------T-AT-A-G-CAAT--C-----A---T-C-A--A-----T-T------gtatattatgtatt
gi|30 : ----G-CAAT--G-A--C-T----G----A---G-----T-TT-----A------T-----G-T---GT-G-----------C-AT---C----A-----------AA----T-C---------AATTC--T-----T-----------G-----C--T--------C--------------TC-A-TC-----A-----G--T------C-G----------A-A----T---T------G---A---------T-G--A-G-TG----C-----G---T-C-A--A-----T-T------C---A-A------CT-----G-T-----------GC--G---C----A---AA-AACTTG--Atggtgcagcaatagaattatagagctctctcttcaacacaatcaatatcattataatttgattgaatacgttcttttcgagagagcaactatataattagagagatatttttaactc
gi|21 : cattgatgcacgcttttaaaataaga----G-CAA---A-A--T-----------A---T-----A-TT-----G------C-----G-C---GC-AA----------T-AT---TTGAAA-----------AT----T-C---------A---A--T-----T-----------G-----A--C--------A----A---A-G---GC-A-AT-----A-----A--T------C-A----------A-T----T---G------G---A---------T-T--C-G-CG----C-----A---T-C-A--A-----T-T------C---A-A------TT-----A-T---T-GC----GC--A---C----A---AT-Attaaagtttgactccat
gi|28 : cggtgtgaataagaagtatcagaaagctagaaagtattcaatctataacaaaatgcattattgatattattcgaacatcattttaatgcgtgcatca----G-CAAT--A-A--T-T----CCACCA---C-----A-TTAATGAG------T-----A-C---GCCA-----------T-AT---G----A-----------AT----T-C---------A---------------------------------T--------G----A---G-A---GC-A-AT-----A-----A--T------T-------------------T---T------A---A---------T------G-CA----C-----AGT-T-C-A--A-----G-T------T---A-A------TT-----A-T---T-atttttattttc
gi|1 : ga-CAAT--A-T--TAT----C----AT--G-----A-T------G------C-----G-C---GC-G-----------T-GT---T----AG----------AT----T-C---------A---G--T-----T-----------G-----A--T--------G----G---G-A---AC-A-AT-----A-----A--T------T-G----------A-T----T---T------G---AT--------T-G--C-G-CG----C-----A---T-C-A--A-----T-gcctcaattaaattaatgctcccatcaatatactgtgggcattacataaattattgctgttttcaactgaacttaatgc
gi|26 : aattgatgattctttaccaacattgaagttactcttttcgattgtcgatcgtagcgcgcataactcaatttatgcgcgcaataatttaaatattgtgtctcttccaattgaataattcaatgtgcaaaataaataattcttttgagaaagcaactatctaattggagatagcttcattcaacatatccactattgaattaatatttctttaattagaactgctactcctttaaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaaatttcttatacaatcgttgttaatgatttaagatatctcagttgaatcaaagagatcatagaataatttgcgtcaagctctaaagtaaattctgagatcaatggttccatcaaaatgttgccgctcatcagtggagttataag-CAAT--A-A--T-T----A----A---TC----A-TG-----A------T-----G-C---GC-G-----------C-GT---T----A-----------AT----T-C---------A---G--T-----T-----------G-----A--T--------G----G---G-A---AC-A-AT-----A-----A--T------T-G----------A-T----T---T------G---A---------T-G--C-G-CG----C-----A---T-C-A--A-----T-atttactcgattgaagagaatgcaaactg
gi|8 : gagatcatagaataatttgcgtcaagctctaaagtaaattctgagatcaatggttccatcataatgttgcgctcatcagttggagttataag-CAAT--A-A--T-T----A----A---TC----A-TG-----A------T-----G-C---GC-G-----------CTGTG--T----A-----------AT----T-C---------A---G--T-----T-----------G-----A--T--------G----G---G-A---AC-A--T-----A-----A--T------T-G----------A-T----T---T------G---A---------T-T--G-G-CG----C-----A---T-C-A--A-----T-atttactcgattgaagagaat
gi|43 : ctttaatagaactgctactctttaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaattttatatacaaatcgttgttaatgatttaagatatctcagttgaatcaaagagatcatagaataatttgcgtcaagctctaaagtaaattctagatcaatggttccatcaaaatgttgcggctatcagtggagttataagAAT--A-A--T-T----C----A---ATTA--A-TTAAT--G------T-----G-C---AT-G-------------AT---C----A------------T----T-G---------A---A--T-----T-----------G-----T--T--------G----C---G-CT--GT-A-ATTC---A-----A--T------T-G----------A-G----T---T------GTACA---------TAG--C-G-CG----C-----A---T-C-C--A-----T-T------T---A-A------TT-----A-A---T-GC----GC--G---C----A---AT-AA-TTG--atttactcgattgaatgagaatgcaaacttgaattaaacgatatcctcaaataatg
gi|34 : AAT--A-A--T-T----CCACCA---C-----A-TT-----GA-----T-----G-C---GC-G-----------C-AT---C----C-----------A-----T-G---------A---A--T-----T-----------A-----A--T--------G----C---G-C---GC-A-AT-----A-----A--T------
gi|34 : aggggtcatcaactcatttataccgagctccaaattaaatatatacagcgagcttatagAGT--A-A--T---------------G-----A-TT-----A------TT----G-C---GC-G-----------C-AT---T----A-----------AT----T-C---------A------T-----G-----------G-----A--T--------G----C---G-C---GC-A-TC-----A-----A--T------cattactatcatcagt
gi|12 : aggggtcatcaactcatttataccgagctccaaattaaatatatacagcgagcttatagaataattccaccacAT--A-A--T-T----G----AT--A-----A-TT-----A------T-----G-C---GC-G-----------CCAT---T----A-----------AT----T-C---------A---C--T-----T-----------GC----A--T--------G--------T-A---GC-AGAT-----A-----AG-T------TGG----------A-T----T---T------G---A---------T-GC-C-G-T-----C-----A---T-C-A--A-----T-TCAACAGG---A-A------TT-----A-TTGCT-C-----GC--A---C----T---AT-TA-CTGTCAAC-----T------CG-AT-A---T-atcatcagt
gi|8 : cttaactgaatgtgctcttcttaaaaggaaggatgcaagcggttatttcctactacaaaaggcggttgtaatagattaaatataccttccaaatttggaataaagagatcatacaatgtatttgT--A-A--T-T----C----A---A-----G-TT------------T-----G-C---AT-T-----------C--T---C----A------------T----T-C---------A---A--T-----C-----------G-----A--G--------T----A---A-A---TC-A-AT-----A-----A--T------T-A----------ATC----A---T------G---A---------T-G--C-G-CG----CT----G---TGT-A--A-----T-T------C---A-G------TT-----G-A---T-GG----GA--A---C--------AT-AA-TTG--A
gi|14 : ctttaatagaactgctactctttaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaattttatatacaaatcgttgttaatgatttaagatatctcagttgaatcaaagagatcatagaataatttgcgtcaagctctaaagtaaattctagatcaatggttccatcaaaatgttgcggctatcagtggagttataagattgatgcgccaatcaaa--A-A--T-T-------------G-----A-TT--------------------C---AC-G-----------C-AC---T----A-----------AT----T-C---------A---A--C-----T-----------G-----A--T--------GTCAGA---G-A---GA-A-AT-----A-----C--T------T-G----------A-T----T---T------G---A---------T-G--C-G-CG----C-----A---T-C-A--A-----T-T------A---A-G------TT-----A-T---T-aacgatatcctcaaataatg
gi|44 : tctttagctgaattgttgctttctttaaaagtgcgctcttatacaaaagcgttgataatagttttaatatatcgtcaaatgaattaaagagatcatctaaccaccgagctccaaattgaatattgatgcgcgcgtcaactgaattttgggagc--A-A--T-T---------A---G-----A-TT-----G------T-----A-A---CT-G-----------A-AT---C----A-----------GT----T-C---------G---A--T-----T-----------G-----A--A--------G----A---G-A---GC-A-GT-----A-----A--T------T-G----------A-A----T---T------A---T---------T-G--C-G-CG----C-----ATTTT-C-A--A-----T-T------GCCAA-C------TTCAAGAA-T---T-CA----GC--A--------A---AC-AA-TTA--AAcaa
gi|35 : --A-A--T-T----T----C---G-----A-TT-----GAATTTTT-----G-C---GC-G-----------T-AT---C----A-----------AT----T-CAATGATCGTA---T--T-----T-----------G-----A--A--------G----A---G-A---GC-A-GC-----A-----A--T------TGG----------A-T----T---T--------------------T-G--T-G-CG----C-----A---T-C----A-----T-T------G---ATG------CT-----A-TA--T-CA----AC--AATTC----A---ATCAA-T
gi|47 : --A-A--T-TG---C----A---------A-TT-----GAAGA--T-----G-C---GC-G-----------C-AT---C----A-----------AC----T-G---------A---A--T-----T-----------G-----A--T--------A----A---G-A---G-----T-----A-----T--T------T-A----------A-C----TGAAT------A---A---------T-G--C-G-CG----T-----A---T-gcggatcgacagtaat
gi|45 : tcttcagatcacca-T----C----A---GGA---A-TTA----G------T-----G-T---GC-G-----------C-AT---C----A-----------AT----T-C---------T---T--T-----TAA---------A-----A--A--------G----A---G-A---GG-A-ATA----A-----A--T------C-A----------A-T----T---T------A---A-----------A--A-G-AT----C-----A---C-C-G--A-----T-T------C---A-G------TT-----G-T---attatgtatt
gi|52 : ttcaacatatcc----C----A---T-----A-TT-----GA-----T-----G-C---AC-A-----------C-GT---C----C-----------AT----T-G---------A---A--T-----T-----------G-----A--TTA------A----A---G-A---GC-A-AT-----A-----A--C------T-G----------A-A----T---T------G---A---------T-GCAA-G-CA----tacaaa
gi|26 : taa----A---G-----A-TT-----GA-----T-----G-C---GC-G-----------C-AT---C----A-----------AA----T-C---------A---A--T-----T-----------A-----T--T--------G----T---T-C---CC-A-TC-----A-----A--C------T-G----------A-A----T---T------A---A---------C-G--C-G-CG----C-----A---T-C-ATGA-----T-T----------A-A------TT-----A-T---T-
gi|1 : gagatcatagaataatttgcgtcaagctctaaagtaaattctgagatcaatggttccatcataatgttgcgctcatcagttggagttata---G-----A-TC-----G------TA----G-C---GC-G-----------C-AT--------A-----------AC----T-C---------A---A--T-----T-----------T-----A--T--------G----C---G-C---GC-A-AT-----A-----A--T------T-T----------A-A----A---T------A---T---------T-G--T-GTCT----C-----T---TCC-A--A-----T-T------G---A-A------TA-----A-T---T-CAATGTGC--A---A----A---AT-AA-gatttactcgattgaagagaat
gi|28 : aattgatgattctttaccaacattgaagttactcttttcgattgtc-----A-TT-----GA-----T-----G-G---GA-G-----------C-AT---T----A-----------AT----T-T---------A---A--T-----T-----------G-----A----------------------G---GC-A-AT-----A-----A--T------T-A----------A-C----T---T------G---AAC-------T-G--T-G-------C-----A---T-T-A--A------------------A-A------TT-----A-T---T-ataattcttttgagaaagcaactatctaattggagatagcttcattcaacatatccactattgaattaatatttctttaattagaactgctactcctttaaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaaatttcttatacaatcgttgttaatgatttaagatatctcagttgaatcaaagagatcatagaataatttgcgtcaagctctaaagtaaattctgagatcaatggttccatcaaaatgttgccgctcatcagtggagttataagattgatgcgcgcaatcaaatcaattattgttcccatcaactgaatctaacacgcgcgcatcatgataatattgatttactcgattgaagagaatgcaaactg
gi|23 : gagcaataattccaccacattaatgagtacgccatatgaattcatgagagc-----A-TT-----G------TA----G-C---GC-G-----------C-AT---C----A-----------AT----T-C---------A---A--T-----A-----------G-----C--T--------GCGT-G---G-T---GC-A-GC-----A-----A--T------A-G----------A-A----T---T----------A---------TAG--A-G-CT----C---------T-C---------------------------------T-----C-T---T-CA----AC--A---C----A---ATCAA-Tatactgtgggcattacataaattattgctgttttcaactgaacttaatgc
gi|17 : aattgatgattgctatatcattgaagtattgctgttttcaactgc-----A-TT-----G------TA----G-C---GT-G-----------C-AT---C----A-----------AT----T-C---------A------------------------------A--T--------GC---A---G-A------A-AT-----A-----A--A------T-G----------A-A----T---C------A---T---------T------G-CT----C-----T---T-C-A--A-----C-T------G---A-A------TT-----A-T---T-atcattataatttgattgaatacgttcttttcgagagagcaactatataattagagagatatttttaactc
gi|20 : ctctgaagtaaaattactttcttcacttga-TT-----A------T-----G-T---GC-G-----------C-CT---G----A-----------AT----T-C---------A---A--T-----T-----------C-----A--A--------G----A---G-A---GT-A-AT-----G-----A--T------T-A----------A-T----C---T------A---ACTCTCTCATT-G--C-T-CT----C-----A---T-C-A--A-----T-T------C---A-A------TT-----A-T---T-------GCTTG---C----A---A--AA-TTG--gaaaggaagaaaacagcaattctttttggaaagagaacctaatatatttataatttgacatatcttcaacatacccacgtttgaattattgatctgtttgaattgttggtctctttaaaagaatt
gi|7 : ttatgcgcgcattgttgccttctacaatataagcgatgtaaataatcaaagatatattcaattgaatcaaagagatcatcaaaccatttataccgagctccaaatgT-----A------T-----G-C---GC-A-----------C-AT---T----A-----------AA----T-C-------------C--T-----AA----------G-----A--A--------G----G---G-A---GC-A-AT-----A-----A--T------T-G----------A-T----T---T------T---A---------T-G--C-G-C---------------T-C-A--A-----T-aataattt
gi|24 : attcaacatatcaactactaattaatgatacctttaactgaattgttgctctctttaaaaaaatgaggtgtgcatgcattaatatcttttacaaaaagtttgcgaatgtttaaagacatcatcaattgaattgaagagatcatcaaattatgtctaccgaactgtagttttgcgagagaaacaattgaattcctgaaagcattaaatcgcttcattgaagg------T-----A-C---AT-G-----------C-AT---C----A-----------AT----T-G---------A---A--A-----T-----------G-----A--T--------G----ATCAG-C---GC-A-GG-----A-----A--T------T-G----------A-T----T---C------G---A---------T-G--C-G-CA----C-----A---T-C-A--A-----T-T------C---A-G------TT-----A-T---TACA-----C--A---C----A---AT-AA-tacatgtaatccataattactttccacaattgcagtgcagtgcacaatgcaat
gi|21 : ------T-----G-C---GT-G-----------C-AT---C----AT----------AT----T------------------------------------------------------G----T---G-C---GC-A-AT-----A-----A--T------T-G----------A-A----T---T------G---A---------T-G--C-G-CG----A-----A---TCC-A--A-----T-T------G---A--------TT-----A-T---T-tttgtcagatgaaagaaagaagtaacttgaagcatacatcaattactgtgtgcagtaatttgattaatgcatgcatcaaatcagcattgctctagtcaactgaattgatgag
gi|43 : cggtgtgaataagaagtatcagaaagctagaaagtattcaatctataacaaaatgcattattgatattattcgaacatcattttaa------T-----G-C---GC-G-----------C-AT---T----A-----------AT----T-A---------A---A--T-----G-----------G-----A--T--------G----C---G-C---GC-T-AT-------------------------------------------------------------------------G-TA----C-----AAC-T-C-A--A-----T-T------G---A-A------TT-----A-------CA----GC--G---C----A---AC-AA-TTC--AATGATCATGCACATTA-ATTA---A-TTGAATTATTgcctttgtcaattgaattttcaaatattgcgcgcaatatattttgcatttttattttc
gi|9 : caattat------T-----G-C---AT-G-----------C-AT---C----A------------T----T-A---------A---A--A-----T-----------G-----A--T--------G----A---G-A---AC-A-AT-----G-----G--T------T-G----------A-A----T---T------A---A--------------A-G-----------------T-C-A--A-----T-T------------A------TT-----G-T---T-C
gi|49 : ttggtttaataaatgcgggcaataatagaattattgctctcttcaatttgattattgattaaagatatttctaataatgatttcgaattgaatttttgctttctttaaaagaattggtgcgagcgttaattctttatacatgattaaaaatatcttcagttgaaatcgagcaatcatgaaatcatttgtaccattttgcgagcagtaatcccaacacaataaC-G-----------C-AT---C----A-----------AT----T-A---------A---A--T-----T-----------G-----A--T--------A----T---G-A---A--A-AT-----A-----A--T------T-G----------A-T----T---T------G---A---------T-GT-C-G-TT----C-----A---T-C-A--A-----T-T------A---A-A------AT-----C-T---TGCAC---GC--A---C----A---AT-AG-TTG--Attatcaattgagtacgc
gi|10 : aC-G-----------C-AT---G----A-----------AC----T-A---------A---A--T-----T-----------G-----A--G--------A----A---G-A---CC-A-AT-----A-----A--T------T-G----------A-T----T---G------G---A---------T-G--C-G-TG----C-----G---C-C-A--A-----T-T------G---A-A------Tta
gi|42 : ctttgctatc-G-----------C-AT---T----A-----------AT----T-C---------A---C--T-----T-----------G-----A--T--------G----A---T-A---GC-A-AT-----A-----G--T------T-G----------A-T----T---T------G---A---------T-G--C-C-CG----T-----A---T-C-A--A-----T-TCAAG--G---A-A------TT-----A-T---T-GC----TC--G---C----A---AT-AT-TTcggtgcgcgcttcatattaattaatgcatacatcgtataaattatgatataactgctatcctcacagaaactgaaatgatgtgatcaaacggaattgaccagagcaaatatttttgatttgatgcgtggcatcaacggaattgataagcgcatcaatttatattatgacaagcatccaat
gi|1 : tcatacaattatttatatcgagttttgaaag-----------AT----T-C---------A---A--T-----T-----------GG----A--A--------G----A---G-AC--AC-A-AT-----A-----T--T------T-A----------A-A----T---T------A---T---------T-G--C-G-CG----C-----A---T-A-A--A-----T-T------G---A-G------TT-----A-T---G-C-----GC--G---C----T---AC-GA-TCG--A
gi|9 : aattgatgattctttaccaacattgaagttactcttttcgattg-----------AC----T-C---------A---A--T-----T-----------G-----A--T--------A----A---G-A---AC-A-AT-----A-----A--T------T-G----------A-C----T---T------aattcaatgtgcaaaataaataattcttttgagaaagcaactatctaattggagatagcttcattcaacatatccactattgaattaatatttctttaattagaactgctactcctttaaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaaatttcttatacaatcgttgttaatgatttaagatatctcagttgaatcaaagagatcatagaataatttgcgtcaagctctaaagtaaattctgagatcaatggttccatcaaaatgttgccgctcatcagtggagttataagattgatgcgcgcaatcaaatcaattattgttcccatcaactgaatctaacacgcgcgcatcatgataatattgatttactcgattgaagagaatgcaaactg
gi|26 : ttggtttaataaatgcgggcaataatagaattattgctctcttcaatttgattattgattaaagatatttctaataatgatttcgaattgaatttttgctttctttaaaagaattggtgcgagcgttaattctttatacatgattaaaaatatcttcagttgaaatcgagcaatcatgaaatcatttgtaccattttgcgagcagtaatcccaacacaataatgcatgcatcattaaaatgatgagaacaatggttgaattaT----T-C---------A---A--T-----C-----------G-----A--G--------T----A---A-A---TC-A-AT-----A-----A--T------T-A----------ATC----A---T------G---A---------T-G--C-G-CG----C-----G---T-T-A--A-----T-T------C---A-G------TT-----G-A---T-GG----GA--A---C----A---AT-AA-TTG--Aacgc
gi|46 : gagatcatagaataatttgcgtcaagctctaaagtaaattctgagatcaatggttccatcataatgttgcgctcatcagttggagttataagattgatgcgcgcatcaaa--T-----T-----------G-----A--A--------G----A---G-C---AC-A-TT-----A-----A--T------T-C----------A-A----T---TTTTATTA---A---------T-G--A-G-CA----C-----A---T-C-A--A-----T-T------C---T-A------TT-----A-T---A-CT----GC--G---C----A---AT-GA-TTG--AAA-----TGA----TG-AT-A---T-CTgagaat
gi|5 : tttga-A---GC-A-AT-----A-----A--T------T-G----------A-T----T---T------G---A---------T------G-CG----C-----G---T---A--A-----T-T------G---A---------T-----A-T---T-CA-----------------A---AT-AA-tgcat
gi|22 : attgatgcgcacatattattccttatacaaaaacgtaattttaatgattaagattccttcgattaaatcagatagatcatgaaatcatttataccgagctcaaaacgcaattttgcgagcaataattccatcaccacgggtccatcacattgatgcgcgtattgatcaatgaaattgagagcatatatatatatagagagggatgaatatgaacatcagatcaatttttgctctcatcattggaactagtgcgcaaaattttacctgatttacgcatttC-A-AT-----A-----A--T------T-G----------A-T----T---T------G---A---------T-G--C-G-CG----C-----A---T-C-A--A-----T-T------G---A-A------TT-----A-T---T-aaaaagagtttataaatgttaatt
gi|48 : tttccatcgaagcaccaaataaaggttgaagttaacttggaattatttgaagatgttacatgttcatgattgcacc---C----A---AT-AA-CTG--AAC-----TGA----GG-AT-A---TCTTTAATTATTTACA---ATGCTTgttctcattgatccatttgatttgacgcgcgaatttgttcaattgtggagagcagttactgatttaattggtgagcacaaat
8 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): CGCGCATGCAATAATCATCATAATACACACATTGATCTTTTCTATTGATATCAACTACAAATGTATTCAATTTACGCACGCAATCATTCCGTTAGTGATAGAAGATATCTTCAATTCAACATATCCACAATTGAATTAATGGTATCTTTCATTGAATTATTGCTCTGTAAAACGAATAATTGCGAACATGGATTCCTTACAAAAAATACTTGTAACGTTTTTTAAAACTCATC
Unaligned ( gi|51 ): AGTGCTAGCGATATATTCAATTCCACACATCCACAACTGAATTAATGATCTCTTCAATCATCAA
Unaligned ( gi|53 ): ATGATCTCTTTAACGTTGAATTGTTAATCTCTTTAAGAAAAATGGATGCGTGCATTGATTC
Unaligned ( gi|54 ): TGTATTCATTGAATTATCGATGACATTAATTATCATGCTTAATTGATACGCGCTAA
Unaligned ( gi|55 ): GCTCTCTTTAGAAAGAACTAATGCGCATCGCTAATTCCTTATACAAAAGCTTTGG
Unaligned ( gi|58 ): AACGTATCCTCAAATAATGAAAGAATCTTCGTTATATAATT
Unaligned ( gi|59 ): TATCCAGAACTGAATTAATTATCTTTTTAATT
Unaligned ( gi|60 ): AGTATTCAAATAATGAGACCAAGAAATGATT
Alignments
lowQualScore : 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 33333333333333333333 111111 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1111111111 1111111 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 11111111111111 11111111 3333333333333333333333333333333 111111111111111111 1111111 11111111111111 2222222222222 222
lowQualScore : 33333 1 5555555 1 222 1 33 1 33 11 222 1 2222 1 7777777777 222 11 666666666 11 7 1 3 1 1 8888888 33333 33 1 1 1 1 11 222 33333 3 2 44444 11 444 22 333333 2 22 1 2 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 44 33333 44 2 22 999999999999 33 2 2222 1 5555555 1 999999 88888 3333333 11 1 2222 0 22222222222222222222 2 222 000000 44444 666666 1 1 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 888888888 2222 0000000000 2 2 9999999 2 4444444 55 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 3 88888 88888888888888 55555 2 2 33 11111111 55 66666 3333333333333333333333333333333 1 111 4444 333 222 1 333333 1 55555555555 44444 8888888 333 1 33333 33 222222222222222222 55 444444 666666666 1 33 222 1 3333 1 1111111 333 66666666666666 3333 2 33 9999999999999999 666666 4 5555555555555 66 99 333
lowQualScore : ..... . ....... . ... . .. . .. .. ... . .... . .......... ... .. ......... .. . . . . . ....... ..... .. . . . . .. ... ..... . . ..... .. ... .. ...... . .. . . ................................................................................. .. ..... .. . .. ............ .. . .... . ....... . ...... ..... ....... .. . .... . .................... . ... ...... ..... ...... . . ................................................................ ......... .... .......... . . ....... . ....... .. ............................................................. . ..... .............. ..... . . .. ........ .. ..... ............................... . ... .... ... ... . ...... . ........... ..... ....... ... . ..... .. .................. .. ...... ......... . .. ... . .... . ....... ... .............. .... . .. ................ ...... . ............. .. .. ...
lowQualScore : 88888 5 0000000 5 666 5 99 4 88 99 444 4 9999 4 9999999999 444 99 888888888 99 0 3 0 3 3 1111111 11111 11 3 2 2 2 77 111 33333 6 4 22222 77 555 88 555555 4 99 2 3 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 11 22222 55 5 55 888888888888 00 5 7777 2 6666666 2 111111 66666 9999999 77 2 7777 2 77777777777777777777 7 333 111111 88888 999999 4 5 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 555555555 9999 2222222222 1 2 4444444 8 8888888 00 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 3 33333 88888888888888 99999 4 4 22 22222222 66 66666 3333333333333333333333333333333 8 777 5555 999 555 3 888888 4 77777777777 88888 3333333 999 4 77777 00 999999999999999999 00 444444 222222222 5 88 888 7 7777 7 3333333 000 88888888888888 8888 2 11 9999999999999999 888888 4 1111111111111 33 22 333
consensus : TATTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AG-CG-T--TGT--AAAT---A-A----TTA-A--A--G----A---TATCTTC--AAT-T-----G-A--ATCAA-AGAGA-T-CATN------A-----AAT-CATTT-A-TACCGA-GCTC-CA--AA---TTA---AA-T-T-----T--T---GC--GAGC------AA-TAAT--T-CCA--C---C--A----------AN----T----TGAT--G---GCG-G-C----A--TC-AA-----TNN--A--TT--AG--A-TGA-----GAGCA--ATA-ATT-GAT--TT-------GA--T-G----CG-CGC-------A-TCAA---N--TC-----A-------A--T-TATT----GCTCG-C--NAT-AT------T--TCAA---T---TG-A-----T------GCG-C-GCAT-------C-----A----ATT----CAAA-T--A-T--------T--GC---NC-----G----CA-----A---CAA--T-T---------NAA-TTGATGCGCG--CA-TCAAATCAATT----AT--TGC---C----------CG----CAA------T-GAAAA-----------------AA----AGA-A-----TTGATGCGCGCG--CA---AATC-----AA-T-T--AT--T-----GC-GCGCAA-T--AATT---CAG---------ATT--G------T---G-CG-C-GC----AT---C---AA-T------T-CA-A---------TTG-----A--N--G-AGA---GCA-AT-----AATT-GA-----------------NT--T------GA---------TG-CGCGC--A---T-CA----AT-T----G--A---ATT------A-TT-CA-GC--G-CA-AT--A----------A-----TT------GAAC-T--G-CGA------TAT-TTGAAT--TATTTACG---ATGCTT
Reference ( family-5 ) : TATTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AN-CG-T--TGT--AAAT---A-A----TTA-A--A--G----A---TATCTTC--AAT-T-----G-A--ATCAA-AGGGA-T-CATN------A-----AAT-CATTT-A-TACCGA-GCTC-CA--AA---TTA---AA-T-T-----T--T---GC--GAGC------AA-TAAT--T-CNA--C---C--A----------AT----T----TGAT--G---GCG-G-C----A--TC-AA-----TNT--A--TT--AG--A-NGA-----GAGCA--ATA-ATT-GAT--TT-------GA--T-G----CG-CGC-------A-TCAA---T--TC-----A-------A--T-TATT----GCTCG-C--NAT-AT------T--TCAA---T---NG-A-----T------GCG-C-GCAT-------C-----A----ATT----CAAA-T--A-T--------T--NC---NC-----G----CA-----A---CAA--T-T---------NAA-TTGATGCGCG--CA-TCAAATCANTT----AT--TGC---C----------CG----CAA------T-GAAAA-----------------AA----NGA-A-----TTGATGCGCGCG--CA---AATC-----AA-T-T--AT--T-----GN-GCGCAA-T--AATT---CAG---------ATT--G------T---G-CG-C-GC----AT---C---AA-T------T-CA-A---------TTG-----A--T--G-AGA---GCA-AT-----AATT-GA-----------------NT--T------GA---------TG-CGCGC--A---T-CA----AT-T----G--A---ATT------A-TT-CA-GC--G-CA-AT--A----------A-----TT------GAAC-T--G-CGA------TAT-TTGAAT--TATTTACA---ATGCTT
gi|1 : -----AA-T-T--AT--T-----GC-GCGCAT-A--AATT---GAG----------TT--A------T---G-CG-C-GCTACGAT---C---GA----------CA-A---------TCG-----A--A--A-AGA---GTA-A
gi|1 : aattgatgattctttaccaacattgaagA-T------T-CA-A---------TTGG----A--A--G-AGAC--ACA-AT-----ATTT-AA-----------------AT--T------AT---------TG-CGCGC--A---T-AA----AT-T----G--A---GTT------A-TG-C--GC--G-CT-AC--G----------A-----TC------GAtaaatattgtgtctcttccaattgaataattcaatgtgcaaaataaataattcttttgagaaagcaactatctaattggagatagcttcattcaacatatccactattgaattaatatttctttaattagaactgctactcctttaaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaaatttcttatacaatcgttgttaatgatttaagatatctcagttgaatcaaagagatcatagaataatttgcgtcaagctctaaagtaaattctgagatcaatggttccatcaaaatgttgccgctcatcagtggagttataagattgatgcgcgcaatcaaatcaattattgttcccatcaactgaatctaacacgcgcgcatcatgataatattgatttactcgattgaagagaatgcaaactg
gi|1 : aattgatgattctttaccaacattgaagttactcttttcgattgATTTCTT-----A-T-------ACA-A------T-CG-T--TGT--TAAT---G-A----TTT-A--A--G----A---TATCT-C--AGT-T-----G-A--ATCAA-AGAGA-T-CATA------G-----AAT-AATTT-G-CGTCAA-GCTC-TA--AA---GTA---AA-T-T-----C--T---GA--GATC------AA-TGGT--T-CCA--T---C--A----------AA----A----TGTT--G---CCG-CTC----A--TC-AG-----TG------------------------GAGTT--ATA-A---GAT--T--------GA--T-G----CG-CGC-------AATCAA---A--TC-----A-------A--T-TATT----GTTC--C--CATCAA------C--TGAA---TCTAAC-A-----C------GCG-C-GCAT-------C-----ATG--AT-------AA-T--A-T--------T--aattcaatgtgcaaaataaataattcttttgagaaagcaactatctaattggagatagcttcattcaacatatccactattgaattaatatttctttaattagaactgctactcctttaaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaaatttcttatacaatcgttgttaatgatttaagatatctcagttgaatcaaagagatcatagaataatttgcgtcaagctctaaagtaaattctgagatcaatggttccatcaaaatgttgccgctcatcagtggagttataagattgatgcgcgcaatcaaatcaattattgttcccatcaactgaatctaacacgcgcgcatcatgataatattgatttactcgattgaagagaatgcaaactg
gi|10 : aattgatgattctttaccaacattgaagttactcttttcgattgtcgatcgtagcgcgcataactcaatttatgcgcgcaataatttaaatattgtgtctcttccaattgaataattcaatgtgcaaaataaataattcttttgagaaagcaactatctaattggagatagcttcattcaacatatccactattgaattaatatttctttaattagaactgctactcctttaaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaaT----T----TGCT--A---TCC-G-C----A--TG-AAC----TAA--A--TT---G--A-GAA-----GACCA--ATA-ATT-GAT--TG-------GA--T-G----CG-TGC-------G-CCAA---T--TG-----A-------A--T-CGGT----GCGCG-CTTCAT-AT------T----AA---T---TA-A-----T------GCA-T-ACAT-------CGTATAA----ATT----ATGA-T--A-TAACTGCTAT--CC---TC-----A----CA-----G---AAA--C-T---------GAA-ATGATGTG-----A-TCAAACGGA------AT--TGA---C----------CA----GA---------GCAAA-----------------TATTTTTGA-T-----TTGATGCGTG-G--C-----ATCAACGGAA-T-T--GA--T-----AA-GCGCAT-C--AATT---TAT---------ATT--A------T---GACA-A-GC----ATC--C---AA-T------gatttactcgattgaagagaatgcaaactg
gi|11 : cATTCTTT-----A-TTTTGAAAATA-A---G-AT-CA-T--TGA--AAAT---A-G----TGA-A--A--T----ACATTATCTTC--AGT-T-----G-G--AATAA-AGAGA-T-CACT------A-----AAT-AGTTT-A-TACCGT-GCTC-AA--AA---TGA---TA-T-T-----T--T---AC--GAGC------AACTAAT--T-CCA--T---C--GC---------ATA---T----TGA-------------------------A-----TGC--A--TT--AG--A-TGA-----GA--A--A-A-ATC-ACT--CT-------AAC-T-G----CG-CGC-------A-TCAA---A--TC--------------------TT----G------------AA------T--TCAA---T---GA-A-----T------T--------T-------T-----A----ATT------AG-T--A-T--------T--GC---CC-----A----CG-----A---GAA--G-T---------AAA-TTGATGCGC
gi|12 : acatgtgtacattaTATTTCCT-----ACT-------ACA-A---A-AGGCGGT--TGT--AA-T---AGA----TTA-A--A--T----A---TACCTTCCAAAT-TTG---G-A--AT-AA-AGAGA-T-CATA------C-----AATGTATTTGA-TATCGA-GTTG-AC--AG---T-----AA-T-A-----G--T---GC--GAGC------AA-TAAT--TCCTG--T---T--G----------AA----T----TGAT--G---ACG-G-C----A--TCAAA-----TCC--AACTT--AT--C-TGC-----TA-CAT-GCA-AGT-GAA--TT-------AA--TGG----CG-CGC-------A-T-AA---TTATC-----A-------A--T-TAT
gi|14 : cttaactgaatgtgctcttcttaaaaggaaggatgcaagcggtCTT-----A-T-------ACA-A---A-AG-CG-T--TGA--TAAT---A-G----TTTTA--A--T----A---TATCGTC--AAA-T-----G-A--ATTAA-AGAGA-T-CATC------T-----AAC-CA--------CCGA-GCTC-CA--AA---TTG---AA-TAT-----TGAT---GC--GCGC------G--------T-CAA--C---TG-A----------AT----T----T--T--G---G-------------------------------------------------GAGCA--ATA-ACT-TAA--TT-------GA--T-G----CG-CGC-------A-TCAA---A--TC-----A-------A--G-TATT----TCTCT-CT-GAC-ATCAG---T--TGAA---T---TA-G-----T------GCG-T-GAAT-------C-----A----ATT----CAA
gi|15 : tctttagctgaattgttgctttctttaaaagtgcgctTCTTT-----A-T-------ATA-A---A-AA-CG-T--TGT--AAAT---A-A----TTA--------------------TTT--AA----------------GA-AAGGA-G-TA-C------A-----AAT-CATTT-A-TTCCAG-GCTC-CA--AA---TTG---AA-T-T-----T--T----T--GAGA------AA-TAAT--G-CAA--C---C--A----------CA----T----TGAT------GCGCG-C----A--TC-AAG----TAC--A--TT---G--A-TCA-----CAG------A-ACT-GA----T-------GA-------------AC-------A-T------------------------A--T-TGCT-----CTCGTC--AAT-GT------GAATTAA---T---GC-A-----T------GCA-T-GCAT-------C-----A----ATG----CTAT-T--C-T--------T--TC---GC-----G----TA-----A---TGA--C-C---------GAA-TTGATG
gi|16 : ATTCCCT-----A-T-------ATA-A---ATAG-CG-T--TGA--AAA----A-A----TTA-AGCA--G--------TATCTTC--TTT-T-----T-ATTAT-AA-AAGAA-T-TATTCACTTTA-----AAT--ATTT-A-TACCGA-ACAT-CA--AA---TTA---AA-T-T-----T--TA--AC--GAGC------AA-TAAT--T-CCA--CTCAC--A----------CTA---T----TGATTAA---AC--A-C----A--TC-AA----------A--T----G--A-AGAATGATGAGGA--ATA-ATT--ATAATT-------AA--T-G----TG-CATGATTAAAA-TGAA---T--TT-----A-------T--T-AATT----GTTC----------T------T--TCAA---atgtcttcaattg
gi|17 : atgta---------ATT--G------TA--G-CG-T-GC----AT---C---AA-T------T-CA-------------------A--T--GCAGA-----A-AT-----AAAT-GA-----------------AT--C-------A---------T--TGCTC--T---T-CA----AC-T----G--A---ATT------A-TT-atgg
gi|18 : ctctgaagtaaaattactttcttcacttgaATTCCTT-----G-C-------ACA-A---A--G-CG-T--AGT--AAAA---A-ACCCTTTA-A--A-------A---TATCTTT--AGT-TTACCGGTA--ATTGA-AGAGA-T-CATA------A-----A-----------TACCGA-GCTG-CA--AA---CGA---AA-T-T-----T--T---GC--GGGC------AA--AAT--T-TTA--T---C--A----------TA----T----TGAT--A---CAA-G-C----A--TC-AA-----TTG--A--AT--TG--A-TCA-----GAGCA--ATAGACT-AA---TT-------AA--T-G----CG-CAC-------A-TCAA---A--TC-----A-------A--C-CATT----GTTC--C--CAT-gaaaggaagaaaacagcaattctttttggaaagagaacctaatatatttataatttgacatatcttcaacatacccacgtttgaattattgatctgtttgaattgttggtctctttaaaagaatt
gi|18 : taG-C-GG----AT---T---A--T------T-CA-G---------TTG-----A--T--G-GGA---ACA-AT-----GGTT-GA-----------------TT--T------GA---------TG-TGCGC--A---T-TA----AT-T----A--GTCTATT------G-CT-CT-GA--T-CA-ATTCA----------A-----TT------GAcaactgaataatccgc
gi|19 : taattccttgcacaaagcgtagtaaaaaaccctttaaaatatctttagtttaccggtaattgaagagatcataaataccgagctgcaaacgaaattttgcgggcaaaattttatcatattgatacaagcaTTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AG-CA-T--TGT--AAAT---G-A----TTA-A--A--G----A---TATCTTC--AAT-T-----G-A--ATTAA-ATGGA-T-AATT------A-----AAT-CATTT-A-TACC-A-CCTG-CA--AA---TTC---AA-T-C-----C--T---GC--A---------AA-TAGT--T-CCA--
gi|2 : ctatttgaaatatagtttatataattagggatatcgttatgtgccctctttcaaagaatgaatgggtgcatccatTATTCCTT-----A-T-------ACG-A---A-AT-CG-T--TGT--AAAT---A-A----TTA-A--A--AGAC-A---CATCTTC--AAC-T-----G-A--ATCAA-AAGAA-T-CATA------A-----AAT-CATTT-A-TATCGA-TCTC-CA--AA---TTG---AA-T-T-----T--T---GC--GAGC------AA-TAAT--T-CAG--C---C--A----------AT----T----TGAT--G---GCA-A-C----A--TC-AA-----TAT--A--TT--AG--A-AGA-----GAGTA--ATA-CTT-AAT--TT-------GA--T-G----CA-TGC-------A-TCAT---T--TC-----A-------A--T-TATT----GTTCA-C--TAT-AT------T--TCAA---T---GG-A-----T------GTA-T-ACAT-------C-----A----ATT----CAAA-T--A-T--------T--CC---CC-----G----CA-----A---CAA--T-T---------CAA-TTGATGTGTT--TA-TCAAATCATTT----AT--TGT---C----------CG----CAA------T-GAAAA-----------------AA----AAA-A-----TTGATGCGCGGG--CA---AATC-----AA-T-T--AC--T-----GG-GCGCAA-T--AATT---CAG---------ATT--G------T---G-CG-C-GC----AT---C---AA-T------T-CA-C---------TTG-----A--T--G-AGA---GCA-AT-----AATT-GA-----------------CT--T------GA---------TG-AGCAC--A---T-CA----AT-T----G--A---GTT------A-TT-CA-GC--A-CA-AT--A----------A-----TT------GAAC-T--GCCAA------TAT-TTGAAT--TATTTACGTGTATGCTTaaatgcgtgcattcatattaagcaat
gi|20 : -A-----T------GCG-C-GCAT------------------------------T--G-T--------T--GC---CT-----T----CT-----A---CAA--T-A---------TAA-GCGATGTAAA--TAATCAAAG-ATAT----AT--T----------------------CAA------TTGAATC-----------------AA----AGA-G-----ATCAT---------CA---AACC-----AT-T-T--ATACC-----GA-GCTCCA----AATG---CA----------ATT--T------T---G-CA-A-GC----AA---T---AA-T------T-GA-A---------TTG-----A--T--G-AGA---GCA-ATGAGAGAGTT-AG-----------------AT--T------AA---------T------C--A---T-TACTCTCT-T----G--A---ATTGA----A-TT-CAGGC--G-CACAT--A----------A-----
gi|20 : ttCCTT-----C-T-------ACA-ATATA-AG-CG-A--TGT--AAAT---A-A----TCA-A--A--G----A---TATATTC--AAT-T-----G-A--ATCAA-AGAGA-T-CATC------A-----AAC-CATTT-A-TACCGA-GCTC-CA--AA---TGC---AA-T-T-----T--T---GC--AAGC------AA-TAAT--T-GAA--------------------------T----TGAT--G---AGA-G-C----A--aataattt
gi|20 : ttatgcgcgcattgttgTT--A------T---G-TG-C-GC----CT---G---AA-T------T-CA-A---------TTC-----A--A--G-AGA---GTA-AT-----GATT-AA-----------------TC--T------AACTCTCTCATTG-CTCTC--A---T-CA----AT-T----C--A---ATT------A-TT----GCTTG-CA-A---A----------A-----TT------Gatgagagagttagattaatcattactctcttgaattgaattcaggcgcacataaaataattt
gi|21 : ttatgcgcgcattgttgccttctacaatataagcgatgtaaataatcaaagatatattcaattgaatcaaagagatcatcaaaccatttataccgagctccaaatg-AA-----TTC--A--AT--TG--A-CAA-----AGGCA--ATA-ATC-AAT--TG-------GA--T-T----CG-CGC-------A-TCAA---T--TC-----A-------A--T-TATT----GCGCA-C--AAT-AT---------------------G-A-----T------GCA-C-GCAT-------T-----A------------AAA-T--G-A--------T--GT---TC-----G-----A-----A---TAA--TAT---------CAA--TAATGCaataattt
gi|21 : cggtgtgaataagaagtatcagaaagctagaaagtattcaatctataacaaaatG--CA---AA--------A-TAT--AT--T-----GC-GCGCAA-T--ATTT---GAA---------A--------------------------------------A-T------T-CA-A---------TTG-----A--C--A-AAG---GCA-AT-----AATC-AA-----------------TT--G------GA---------TT-CGCGC--A---T-CA----AT-T----C--A---ATT------A-TT-GC-GC--A-CA-AT--ATGATGCACGCA-----TT------AAAA-T-----GA------TGT-TCGAATAATATCAATA---ATGCttcaaatattgcgcgcaatatattttgcatttttattttc
gi|22 : cggtgtgaataagaagtatcagaaagctagaaagtattcaatctataacaaaat-GCTCACC--AA---TTA---AA-T-CAGTAAC--T---GC--TCTC------CA-CAAT--T-GAA--C---A--A----------AT----T----CGC-------GCG-T-C----AAATC-AAA----TGG--A--TC--A---A-TGA-----GAACA--ATA-ATT-CAA--TT-------GA--T-G----CG-CGC-------A-TCAA---A--TC-----A-------A--T-TATT----GGGTG-C--AA-------------TC-A---T---GA-A-----C------ATG-TAACAT-------C-----------TT----CAAA-TA-A-T--------T--CC---AA-----GT---TA-----ACTTCAACCT-T---------TAT-TTGGTGCatttttattttc
gi|22 : tttccatcgaaA---AATC-----AG-T-A--AC--T-----GC-TCTCCA-C--AATTGAACAA---------ATT---------------CG-C-GC----GT---C---AA-A------T-CA-A---------ATGGATCAA--T--G-AGA---ACA-AT-----AATT-CA-----------------AT--T------GA---------TG-CGCGC--A---T-CA----AA-T----C--A---ATT------A-TT-GG-GT--G-CA-AT--C----------A------T------GAACAT--G-TAA------CATCTTCAAA--TAATTCCA---acaaat
gi|22 : tttccatcgaagcaccaaataaaggttgaagttaacAT--TT-------G---T-G----CT-CACCA-----A-TTAA---A--TC-----A-------G--T-AACT----GCTCT-C--CAC-AA------T--TGAA---C---AA-A-----T------TCG-C-GCGT-------C-----A----AAT----CAAA-TGGA-TCAA-----T--GA---GA-----A----CA-----A---TAA--T-T---------CAA-TTGATGCGCG--CA-TCAAATCAATT----AT--TGG---G----------TG----CAA------T-aattggtgagcacaaat
gi|23 : tttccatcgaagcaccaaataaaggttgaagttaacttggaattatttgaagatgttacatgttcatgA-ATT-GAT-----------GA--TTG----C--TAT-------A-TCA----T--TG-----A-------A--G-TATT----GCT-G-T-------T------T--TCAA---C---TGCA-----TTGTA--GCG-C-GCAT-------C-----A----ATT----C-AA-T--AGC--------T--GCGTGGT-----G----CA-----G---CAA--T-A---------GAA-TT
gi|24 : --T-TATT----GTGTG-T--AAT-AA------C--TGAA---T---TG-A-----T------GTG-C-GCAT-------C-----G----AAT----CAAT-T--C-C--------T--GC---GCT----GAT--CA-----T---CAT--T-T---------CAA-TTGATGCATG--TA-T---------------T--TGT---C----------AG------A------T-GAAAG-----------------AA----AGA-AGTAACTTGAAGCATAC---------ATC-----AA-T-T--AC--T-----GT-GTGCAG-T--AATT---T-G---------ATT--AA-----T---G-CA-T-GC----AT---C---AA-A------T-CA-atagagctctctcttcaacacaatcaatatcattataatttgattgaatacgttcttttcgagagagcaactatataattagagagatatttttaactc
gi|24 : ---C--A----------AT----T-----GAT--G---------C----A--TG-TA-----TTT--G--TC--AG--A-TGA-----AAGAA--AGA-AGT-AAC--TT-------GA--A-G----CA-TAC-------A-TCA----------------------A--T-TACT----GTGTG-C--AGT-AA------T--TTGA---T---TA-A-----T------GCA-T-GCAT-------C-----A----AAT----C-AG-C--A-T--------T--GC---TC-----T----AG-----T---CAA--C-T---------GAA-TTGATGgcattgctctagtcaactgaattgatgag
gi|24 : ttattgtgtgtaataactgaattgatgtgcgcatcgaatcaattcctgcgctgatcatcatttC----AT---C---AA-T------T-CA-G---------TTG-----A--C--T-AGA---GCA-AT-----G-CT-GA-----------------TT--T------GA---------TG-CATGC--A---T-TA----AT-C----A--A---ATT------A-CTGCA--C--A-CA-GT--A----------A-----TT------GAag
gi|25 : ttattgtgtgtaataactgaattgatgtgcgcatcgaatcaattcctgcgctgatcatcatttcaattgatgcatgtatttgtcagatgaaagaaagaagtaacttgaagcatacaATTCTTT-----A-T-------ACA-A---A--T-CG-T--TTT--AAAT---A-A----TTA-A--A--G----A---TATCTTC--GAT-T-----------TTA-----GC-T-TGTA------A-----AGT-------------GA-GCGA-CA--AA---TTGATTAA-T-T-----T--T---AC--TGGC------A---AAT--T-CCA--C---C--A----------AA----T----TTAT------GCGTG-C----A--TC-AA-----Tag
gi|26 : taattgaatatctctctggttgaattgaattgttgttctgtctaaaagatatagcgcttgcattaGAGA-T-CATA------G-----AAT-AATTT-G-CGTCAA-GCTC-TA--AA---GTA---AA-T-T-----C--T---GA--GATC------AA-TGGT--T-CCA--T---C--A---------------------TAAT--GTT-GCG-CTC----A--TC-AG-----TT------------------G-----GAGTT--ATA-A---GAT--T--------GA--T-G----CG-CGC-------A-TCAA---A--TC-----A-------A--T-TATT----GTTC--C--CATCAA------C--TGAA---T---TA-A-----C------GCG-C-GCAT-------C-----ATG--ATT-----AAT-T--A-T--------T--tg
gi|26 : -T------T-CA-A---------TCG-----A--G--T-AAA---TCA-AT-----AATT-AA-----------------TCA-T------GA---------TG-CGCGC--G---T-TA----AT-T----C--A---GTT------G-AT-GG-GA--A-CA-AT--A----------A-----TT------GAgatttactcgattgaagagaat
gi|27 : gagatcatagaataatttgcgtcaagctctaaagtaaattctgagatcaatggttccatcataatgttgcgctcatcagttggagttataagattgatgcgcgcatcaaaTATTCCT------A-T-------ACA-A---A-AAACG-TAATTT--TAAT---G-A----TTA-ATGC--G----A---TTCCTTC--GAT-T-----A-A--ATCAGCATAGA-T-CATG------A-----A-T-CATTT-A-TACCGA-GCTC-TA--AAGACGCA---AATT-T-----T--T---GCT-GAGC------AA-TAAT--T-CCA--T---C--A----------gagaat
gi|28 : attatgcgcacataat--GAGC------AA-TAAT--T-CCA--C---C--A----------CA----T----TAAT--GAGTACG-C-C----A--T---A-----TGA--A--TT---C--A-TGA-----GAGCA--ATA-AT----T--TT-------AA--T-G----CA-CAG-------T-TCAA---G--TT-----A-------A--T-TATT----GC-CT-C--AA----------T--TAAA---T---TA-A-----T------GCT-C-CCAT-------C-----A----AT--------A-T--A-C--------T--GT---GG-----G----CATT---A---CA-----T---------AAA-TTATTGCccacgggttccactcacattgga
gi|28 : -GC----AT---T---AAGT------T-CA-G---------TTG-----A--A--A-ACA---GCA-AT-----AATT-TATGTAATGCCCACAGTATAT--T------GA---------TG-GGAGC--A---T-TA----AT-T----T--A---ATT------G-----A-G---G-CA-AT--A----------ATTAACTT------GAAC-T--G-TG-------CAT-TAAAAT--TATTtgttttcaactgaacttaatgc
gi|29 : gagcaataattccaccacattaatgagtacgccatatgaattcatgagagcCCGT-----A-T-------GCA-A---A-GG-CA-T--TGT--ACAT---A-A--------------------------CCTC--AAT-C-----A-A--ACTAA-AGAGA-T-AATT------A-----AAT-CATTC-A-TACTGA-GCTT-GA--AA---TTG---AA-T-A-----T--T---TC--GAGC------AA-TAGT--T-CCA--C---C--AC---------AT----T------AC--C---GCGCG-C----A--TC-AA-----TGTGAA--TT--A
gi|29 : -GC----AT---T---AA-T------T-CA-A---------AGG-----A--A--G-AGG---ACG-TT-----AATT-CAC----------------AT--T------GA---------TG-CGCGC--G---G-TA----ATGTGGTGG--A---ACT------A-TT-GC-TC--G-AA-AT-------------A-----TT------CAAT-T--T-CAAGCTCAGTA---TGAAT--GATTTAacgtcctcttcctttgaattaatgcatg
gi|29 : ccgtatgcaaaggcattgtacataacctcaatcaaactaaagagataat-G-C----A--TT-AA-----TTC--A--AA--GG--A-AGA-----GGACG--TTA-ATT-CACA-TT-------GA--T-G----CG-CGC-------G-GTAA---T--GTGGTGGA-------A--C-TATT----GCTCG-A--AAT-A-------T--TCAA---T---atg
gi|3 : ccgtatgcaaaggcattgtacataacctcaatcaaactaaagagataattaaatcattcatactgagcttgaaATTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AG-CG-T--TGT--AAAT---A-A---------------------------------AT-------G-A--A--------GA-T-CATC------A-----AAT-CATTT-A-TTCCAA-GCTC-CA--AA---TGC---AA-T-T-----C--T---GC--GGGC------AA-CATT--T-CCA--C---A--A----------CA----T----AGAT------ACGCG-C----A--TC--A-----TGG--A--AT--TG--A-TCA-----GAGCA--ATA-ATT-GAA--AT-------AA--T-G----CG-CGC-------G-TAAA---A--TC-----A-------AATT-TATT----GTTTG-C------AT------TGATCAA---T---TG-AACTAGT------GCG-C-GCA---------------------T----GGAA-T--ACT--------T--TC---TT-----GTTTTCA-----T---CAA--T-T---------GAC-TAGAT--GCG--CA-TCAAATCAATC----CT--TGCTCTC----------TT----CAA------T-TAAAT-----------------TA----TTA-A-----TTTAT----------A---GATT-----AA-T-T--AG--T-----GG-GAGCAA-T--ATTT-----G---------ATTTAA------T---G-CG-T-GT----AT---T---AA-T------C-CA-G---------TTA-----C--A--G-TGT---GCA-AT-----AATC-AG-----------------AT--T------GA---------TG-atg
gi|30 : tgatatctttaattgaattcttgctctctttcaaaaagattgagacacgcatta-C----A--TC-AA-----TTCG-A--CT---G--A-TGA-----GAGCA--AGA-ATT-GAT--TT-------GA--T-G----CA-CAC-------A-TAAA---C--TC-----A-------G--T-CATT----GCTCT------T-AT------T--TTAA----------A-----A------GCG-T-GCAT-------C-----A----ATatataatttcagataaataaaggtatcttcaattaatttggtt
gi|30 : cA---T---TG-A-----T------GCA-C-GCTT-------------------TT----AAAA-T--A--------------A---GA-----G----CA-----A---TGA--C-T---------GAG-TTTATGTGTG--CA-TCAAATCAATT----CT--TGC---T----------CT----CAT------C-----A-----------------GT----CGA-A-----TTGATGAGTGCG---------TC-----AA-T-TCAAC--T-----GT-GCGCAA-A--AACT---T-G---------ATT--agtgcgtcaattcaactgtgcgcaaaaacttgattaaagtttgactccat
gi|30 : c---AATC-----AAGT-T--TT--T-----GC-GCACAG-TTGAATT-----G---------AC--------------G-CA-C-TC----AT---C---AA-T------T-CG-A---------CTG-----A--T--G-AGA---GCA-AG-----AATT-GA-----------------TT--T------GA---------TG-CACAC--A---T-AA----AC-T----C--A---GTC------A-TT-aaagtttgactccat
gi|31 : cattgatgcacgcttttaaaataagagcATTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AT-CG-T--TGT--AAAT---A-A----TTA-A--A--G----A---TATCT-----------------------A-AGGAA-------------A-----GAT-CATTT-A-TACCA-----C-CA--CA---TTA---A-------------T---GC--GCGC------AT-CAAT--T-GAA--T---C--A----------aaagtttgactccat
gi|32 : cattcATCCT----AT-C-----G-A--ATTAA-AGATA-T-CATT------A-----AAA-TATTT-A-TACCGA-GCAT-TA--AA---TAA---AA-T-T-----T--T---GC--GAAC------AA-TAAT--T-CAA--C---T--A----------CA----T----TAAT------GCGAG-T----A--TT-AAT----TAG--A--TT--A---A-TGA-----GAGCcaggtatgaataacaggtctctgaattttaatcaa
gi|33 : tctttaaaaagaatgtttaATTCATT-----G-T-------ATA-A---A-AG-CG-T--TGT--AAAG---A-A----TTT-A--A--G----A---TATC--------------------------AGAGA-T-CATT------A-----AAT-CATTT-A-TACCGA-GCAC-TA--AA---TTA---GA-T-T-----T--T---GC--GAGC------AA-TAAT--T-CCA--C---C--AC---------AT----T----
gi|33 : cattg-ATT-GAT--TT-------AA--T-G----CG-TGA-------A-TGAA---T--GTGGTGGA-------A--T-TATT----GCTCG-C--AAA-AT------C--TAAT---T---TA-G-----T------GCT-C-Gcattcacgcattaaatcaat
gi|34 : cattgattcattgtataaaagcgttgtaaagaatttaagatatcagagatcattaaatcatttatac-AGGGG-T-CATC------A-----ACT-CATTT-A-TACCGA-GCTC-CA--AA---TTA---AA-TAT-----A--TACAGC--GAGCTTATAGAA-TAAT--T-CCA--C---C--A----------CA----T----TGAT------GCGCG-C----A--TC-CA-----TGA--A--TT--A---A-TGC-----GCGCA--ATA-AT
gi|34 : G--A-TGA-----TAGTA--ATG-ATT--AT--T--------------G----CG-CGC-------A-TTAA---T--TC-----A-------cattactatcatcagt
gi|35 : aggggtcatcaactcatttataccgagctccaaattaaatatatacagcgagcttatagaataattccaccacattgatgcgcgcatcca--AATT---TCG---------ATT--GAATTTTT---G-CG-C-GT----AT---C---AA-T------T-CA-ATGATCGTATTTG-----A--A--G-AGA---GCA-GC-----AATTGGA-----------------TT--T-----------------TG-TGCGC--A---T-C-----AT-T----G--A---agt
gi|35 : A---TTG---AA-T-T-----T--TT--GC--GCGT------AT-CAAT--T-CAA-------------------------------TGAT-------CG-----------------------T--A--TT--TG--A-AGA-----GAGCA--GCA-ATTGGAT--TT-----------T-G----TG-CGC-------A-TC-----------------------------ATT----GAT-G-C--TAT-ATCAACAAT--TCAA---T---CA-A-----T------GCG-tgctatatcaacaattcaatcaatgcggatcgacagtaat
gi|36 : aatttcgATTCCTTTAAGTA-T-------ACA-A---A-AG-CG-T--TGT--AAAT---A-T----CTA-A--A--A----A---CATCTTC--GAT-T-----G-T--AT-AA-AGAGA-T-TATT------A-----AGT-CATTT-A-Tgatcgacagtaat
gi|37 : catgattggagtcagttgctctatatatatatggtcgcatta-A---A-AC-CA-T--TGG--GAATTGTC-A----TTG-A--T--G----A---TATCTTC--AAA-T-----G-A--ATT-A-AGAGA-T-AACT------ATTCATAAT-TATTC-A-T--------TG-CATTAA---CTG---AA-T-TA----T--T---GA--TAGC------AA-TAATTAT-CTG--C---T--G----------AA----T----TGAT--G---
gi|37 : G-CGC-------A-TCAA---T--TC-----AGCAGATAA--T-TATT----GCTAT-C--AAT-AA------T--TCAG---T---TA-A-----T------GCcgct
gi|38 : aaaccattgggaattgtcattgatgatatcttcaaatgaattaagagataactattcataattattcatt-----------------AA----TGA-A-----TTG-TG-GCGCG--CATTCATTC-----AA-C-T--AA--C-----GCAGGGCAAAT--AATT---CAC---------TTC--A------T---G-CA-C-G-----AT---T---AA-T------TCCA-C---------TTG-----A--T--G-AGT---ACA-AC-----AA-T-GA-----------------AT--t
gi|39 : aattctagtatctaaaattgctatt-TACCGA-ACTC-CA--AA---TTA---AACT-T-----T--T---GC--GATC------AA-AAAT--T-CCA--G---C--T----------ATTA--T----TAAT--G---GAT-G-C----A--TC-AG-----TTA--A------AGTAA-TGA-----GAGCA--ATA-AAT-TA---TA-------AA--T-A----CG-CGC-------T-TCAA---A--TC-----A-------G--C-TA
gi|4 : TATTCCTT-----A-T-------ACG-A---A-AT-CG-T--GTT--AAAT---A-A----TTA-A--A--AGGACA---CATCTTC--AAC-T-----G-A--ATCAA-AAGAAAT-CATA------A-----AAT-CATTT-A-TATCGA-TCTC-CA--AA---TTG---AA-T-T-----T------GC--GAGC------AA-TAAT--T-C-A--G---C--A----------AT----T----TGAT--G---GCA-A-C----A--TC-AA-----TAT--A--TTT-AG--A-AGA-----GAGTA--ATA-CTT-AAT--TT-------GAGAT-G----CAATGC-------A-TCAT---T--TC-----A-------A--T-TATT----GTTCA-C--TAT-AT------T--TCAA---T---GG-A-----T------GTA-T-ACAT-------C-----A----ATT----CAAA-T--A-T--------T--CC---CC-----G----CA-----A---CAA--T-T---------CAA-TTGATGTG-GTTTA-TCAAATCATTT----AT--TGT---C----------CG----CAA------T-GAAAA-----------------AA----A-A-A-----TTGATGCGCGGG--CA---AATC-----AA---T--AC--T-----G--GCGCAA-T--AATTC--CAG---------ATT--G------T-----CG-CGGC----AT---C---AA-T------T-CA-C---------TTG-----A--T--G-AGGTATGCA-AT-----AATT-GA-----------------CT--T------GA---------TG-AGCAC--A---T-CA----AT-T----G--A---GTT------ATTT-CA-GC--ACCA-AT--A----------A-----TT------G-AC-T--G-CAA------TAT-TTGAcc
gi|40 : tgaagtgcagtTTCCTT-----A-T-------AGA-A---A-GG-TG-T--TGT--AAAT---A-A----TTA-A--A--G----A---TATCTT---AAT-T-----G-A--ATTAA--GAGA-TACGT-------A-----AAT-CATTT-A-TATCGA-GCGT-TA--AA---TTA---AT-T-T-----T--T---GC--GAGC------AA-TAAT--
gi|41 : -----AA-T-T--AT--G-----GC-GCGCAT-T----TT---CAA---------A---------------G-AG-A-GC----AT---G---AA-T------T-CA-A---------TTG-----attcca
gi|41 : aATTCCCA-----A-T-------AGA-A---A-AG-CA-A--TGT--AAAT---A-A----TCA-------G----A---CATCTTC--AAT-T-----G-A--ATCAA-AGAGA-T-CATT------A-----AAT-CATTcccaatagaaaagcaatgtaaataatcagacatcttcaattgaatcaaagagatcattaaatcatt
gi|42 : acaattgaattcatgctctctttgaaaatgcgcgccata-GC----AT---T---AA-T------T-CA-C---------TTG-----A--T--G-ATA---GCA-AT-----AGTT-GA-----------------TT--T------GA---------TG-CCCGT--A---T-CA----AT-TCAAGG--A---ATT------A-TT-GC-TC--G-CA-AT--A----------T-----TTCTTTCAAAAC-T----CGA------TA---TAAAT--AATT
gi|42 : tcatac-G-C----A--TT-AA-----TTC--A--CT--TG--A-TGA-----TAGCA--ATA-GTT-GAT--TT-------GA--T-G----CC-CGT-------A-TCAA---T--TCAAGG-A-------A--T-TATT----GCTCG-C--AAT-AT------T--TC
gi|43 : tcatacaattatttatatcgagttttgaaaC-----AA-T-T--AT--T-----GC-GCGCAT-T--AATT----AA---------ATG--GA-----T---G-CG-C-GCT---ATGTAC---AA-C------T-CA-A---------TTG-----AATT--ACAGC---GCA-AC-----AATT-CA-----------------ATGAT------CA---------TG-CACATTAA---T-TA----AT-T----G--A---ATT------A-TT-
gi|44 : --AATT----AG---------ATT--G------T---A-AC-T-GA----AT---C---AG-T------T-CG-A---------TTG-----A--A--G-AGA---GCA-GT-----AATT-GA-----------------AT--T------AT---------TG-CGCGC--ATTTT-CA----AT-T----GCCA---ACTTCAAGAA-TT-CA-GC--A--A-AC--A----------A-----TT------AAA
gi|46 : -A---------TTG-----A--A--G-AGC---ACA-TT-----AATT-CA-----------------AT--TTTTATTAA---------TG-AGCAC--A---T-CA----AT-T----C--T---ATT------A-TA-CT-GC--G-CA-AT--G----------A-----TT------GAAA-T--GATGA------TAT-CT
gi|47 : tttga--AATTG--CA----------ATT--GAAGA--T---G-CG-C-GC----AT---C---AA-C------T-GA-A---------TTG-----A--T--A-AGA---GTATTT-----AACT-GA-----------------A---T------AA---------TG-CGCGT--A---T-gcat
gi|48 : tcttcagatcaccaTCCTT-----G-C-------TCT-A---A-AG-CA-T--TGT--AAAT---A-A----TTA-A--A--G----A---TATCCTC--AGT-T-----C-A--GTTAT-TGAGA-T-CAT--------------------------ACCGA-GCTC-CA--AA---TGC---AA-C-T-----T--T---GC--attatgtatt
gi|49 : g-C-GC----AT---C---AA-T------T-AA-A---------TTG-----A--T--A-TGA---A-A-AT-----AATT-GA-----------------TT--T------GA---------TGTCGTTC--A---T-CA----AT-T----A--A---AAT------C-TTGCACGC--A-CA-AT--A----------G-----TT------GAag
gi|5 : aTATTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AA-CG-TAATTT--TAAT---G-A----TTA-A-----G----A---TTCCTTC--GAT-T-----A-A--ATCAG-ATAGA-T-CATG------A-----AAT-CATTT-A-TACCGA-GCTC-AA--AA---CGC---AA-T-T-----T--T---GC--GAGC------AA-TAAT--T-CCA--T---C--ACCACGGGTCCATCACAT----TGAT------GCGCG-T----A--TT-GA-----TCA--A--TG--AA--ATTGA-----GAGCAT-ATATAT---AT--ATAGAGAGGGA--T-GAATATG-AAC-------A-TCAG---A--TC-----A-------A--T-TTTT----GCTCT-C--ATC-AT------T--GGAA---C---TA-G-----T------GCG-C-A-A--------------A----ATTTTACCTGA-T----T--------T--AC---GCATTTAG----CA-----A---TAA--T-T---------GAT-TTGATGCGCG--T-----AATTGA-T----AT--T----------------------CAA------A-TAAAA-----------------AA----AGA-G-----TTTATta
gi|50 : attgatgcgcacatat-CG-T--TGT--AAAT---A-A----ATT-A--A--G----A---TAACTTC--AGT---------A--AT------------------------------T-TATTT-A-AATCAA-GCTC-CA--GT---TTA---GA-T-T-----C--A---GC--GAGC------AAGTAAT--T-Caaatgttaatt
gi|52 : ---CAT---------ATT--GA-----T---G-CA-C-AC----GT---C---CA-T------T-GA-A---------TTG-----A--TTAA-AGA---GCA-AT-----AACT-GA-----------------AT--T------GA---------TG-CAAGC--A---c
gi|56 : taa-----AAT-CATTT-A-TAC-GA-GCAT-TA--GG---TCA---GA-T-T-----T--T---GC--ATGC------AA-TAAT--T-TCA--C---
gi|57 : ttTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AT-CT-T--TGT--AAAT---A-A----TTA-A--A--G----A---T
gi|6 : ttcattgtaATTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AT--G-T--TGTGTAAAT---A-A----CTA-A--AAAG----A---TATCTTC--CATAG-----G-A--ATTAA-A-GTA-T-CATT------A-----AAT--ATTT-ATTACCAAGGCCT-TA--AA---TTA---AATT-T-----T--T---GT--GAGC------AA-TAAT--T-GAATTC---CAAA----------AT----TAATATGAT-------CATG-CATAAA--TCAAA-----TCT--A--ATGCAG--A-A-A-----GACTAATATA-ATT-GAA--AT-------AA--T-G----CC-CAC-------A-TTTA---A--TG-----A-------A--TCTATTCAAAACTCT-C--GGTCAA------T--TGAA---T---TC-A-----T------GTGAC-ACAT-------T-----A----A
gi|7 : tttttaattcaacagttattccacaatttgaattaaattaaatgttctctttcaattgaattattgctgtcttttaatgaatta--AG--A-AGG-----GAGCA--ATA-ATT-GAT--TT-------TA--T-G----CG-C-----------TCAATCCT--TC-----A-------A--T-GA---------AG-C--GAT-------------------T---TA-A-----T------GCT-T-TCAG-------G-----A----ATT----CAAT-T--G-T--------TTCTC---TC-----G----CAAAACTA---CAG--T-TCGGTAGACATAATTTGATGATCT--CT-TCAATTCAATTG---ATGATGT---CTTTAAACATTCG----CAAACTTTTT-GTAAA-----------------A------GATA-----TTAATGCATGCA--CA---CCTC-----AT-T-T--TT--TTAAA-GA-GAGCAA-C--AATT---CAG---------aagattattgtct
gi|7 : attcaacatatcaactactaattaatgatacctttaaCTT-----T-T-------ACA-A---A-AA-GT-T--TGC--GAAT---G-T----TTA-A--A--G----A---CATCATC--AAT-T-----G-A--ATTGA-AGAGA-T-CATC------A-----AAT-TATGT-C-TACCGA-ACT-------G---T-----AG-T-T-----T--T---GCGAGAGA------AA-CAAT--T-GAA--------------------------T----TCCT--G---AAA-G-C----A--TT-AAATCGCTTC--A--TT--GA--A-GG-----------------ATT-GA------------------------G-CGC-------A-TAAA---A--TC-----A-------A--T-TATT----GCTCC-C--T----T------C--TTAGGATT---TA-A-----T------GTG-C-GCATATACATGT-----A----ATC----CATA----A-T--------T--AC---TT-----T----CC-----A---CAA--T-T---------GCA-GTGCAGTGCA--CA-taggatttaatgtgcgcatatacatgtaatccataattactttccacaattgcagtgcagtgcacaatgcaat
gi|8 : attcaacatatcaactactaattaatgatacctttaactgaattgttgctctctttaaaaaaatgaggtgtgcatgcattaatatTT-----A-T-------ATACA---A-AT-CG-T--TGT--TAAT---G-A----TTT-A--A--G----A---TATCT-C--AGT-T-----G-A--ATCAA-AGAGA-T-CATA------G-----AAT-AATTT-G-CGTCAA-GCTC-TA--AA---GTA---AA-T-T-----C--T---A---GATC------AA-TGGT--T-CCA--T---C--A----------A-----------AAT--GTT-GCG-G-CT---A--TC-AG-----TG------------------------GAGTT--ATA-A---GAT--T--------GA--T-G----CG-CCA-------A-TCAA---A--TC-----A-------A--T-TA-T----GTTC--C--CA-------------TCAA---C---TGAA-----TTACACAGCG-C-GCAT-------C-----ATG--ATT-----AAT-T--A-T--------T--atgcaat
gi|8 : ctttaatagaactgctactctttaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaatt-A-----TTGATGCGC-CAATCA---AATC-----AA-T-T--AT--------GT-TCCCAT-C--AACT---GA----------ATT--A------CACAG-CG-C-GC----AT---C---A-------------------------TG-----A--T---------------T-----AATT--------------------AT--T------GA---------TT-TAC--------T-CG----AT-T----G--A---ATG------A----GA-AT--G-CA-A---A----------C-----TT------GAAT-TAAA-CGA------TAT-gatttactcgattgaatgagaatgcaaacttgaattaaacgatatcctcaaataatg
gi|8 : ctttaatagaactgctactctttaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaattttatatacaaatcgttgttaatgatttaagatatctcagttgaatcaaagagatcatagaataatttgcgtcaagctctaaagtaaattctagatcaatggttccatcaaaatgttgcggctatcagtggagttataag-T--AATT---CAA---------GTT---------T---G-CA-T-TC-----T---C---A--T------T-CA-A---------TCG-----A--G--T-AAA---TCA-AT-----AATT-AA-----------------TCA-T------GA---------TG-CGCGCT-G---TGTA----AT-T----C--A---GTT------G-AT-GG-GA--A-C--AT--A----------A-----TT------GAcctcaaataatg
gi|9 : ctttaatagaactgctactctttaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaattttatatacaaatcgttgttaatgatttaagatatctcagttgaatcaaagagatcatagaataatttgcgtcaagctctaaagtaaattctagatcaatggttccatcaaaatgttgcggctatcagtggagttataagattgatgcgccaatcaaa--A--TT---G--A-TAA-----GAACA--ATA-ATT-GAC--T----------------------------------TTAA---T--TC-----A-------A--C-CATT----GTTCT-C--ATC-AT------T--TTAA---T----G-A-----T------GCA-T-GCAT-------T-----ATTGTGTT----GGGATT--A-C--------T--GC---TC-----G----CA-----A--------------------------AATG---G--TA--CAAATGATTTCATGAT--TGC---T----------CGATTTCAAC-----T-GAAGATATTTTTAATCATGTATAA----AGA-A-----TTAACGCTCGCA--C-------C-----AA-T-T--CT--TTTAAAGA-AAGCAA-A--AATT---CAATTCGAAATCATT--A------T---T-AGAA-AT----AT---CTTTAA-TCAATAAT-CAAA---------TTG-----A--A--G-AGA---GCA-AT-----AATT-CT-----------------AT--T------AT---------TG-CCCGC--A---T-TT----AT-T----A--A---Aaacgatatcctcaaataatg
gi|9 : ttgg-T--TAT--ACAT---G-A----TTA-A--A--A----A---TATCTTC--AGT-T-----GAA--ATC-G-AGCAA-T-CATG------A-----AAT-CATTT-G-TACC------------------------A-T-T-----T--T---GC--GAGC------AG-TAATC-C-CAA--CA--C--A----------A----------TAAT--G---CAT-G-C----A--TC-AT-----TAA--A--AT---G--A-TGA-----GAACA--ATG-GTT-GAA--TT-------A---------------------------AA---G--TC-----A-------A--T-TATT----GTTC----------T------TA-TCAA---T---TG-AG----T------ACG-C-tgagtacgc
9 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): CGCGCATGCAATAATCATCATAATACACACATTGATCTTTTCTATTGATATCAACTACAAATGTATTCAATTTACGCACGCAATCATTCCGTTAGTGATAGAAGATATCTTCAATTCAACATATCCACAATTGAATTAATGGTATCTTTCATTGAATTATTGCTCTGTAAAACGAATAATTGCGAACATGGATTCCTTACAAAAAATACTTGTAACGTTTTTTAAAACTCATC
Unaligned ( gi|45 ): TTCAACATATCCACAACTGAATCGGTGATCTTTTAAATTGATTTATTCCTCTCTTTTTAAAAGAATTGATGCGCACACTAATTCCTGATACAAA
Unaligned ( gi|51 ): AGTGCTAGCGATATATTCAATTCCACACATCCACAACTGAATTAATGATCTCTTCAATCATCAA
Unaligned ( gi|53 ): ATGATCTCTTTAACGTTGAATTGTTAATCTCTTTAAGAAAAATGGATGCGTGCATTGATTC
Unaligned ( gi|54 ): TGTATTCATTGAATTATCGATGACATTAATTATCATGCTTAATTGATACGCGCTAA
Unaligned ( gi|55 ): GCTCTCTTTAGAAAGAACTAATGCGCATCGCTAATTCCTTATACAAAAGCTTTGG
Unaligned ( gi|58 ): AACGTATCCTCAAATAATGAAAGAATCTTCGTTATATAATT
Unaligned ( gi|59 ): TATCCAGAACTGAATTAATTATCTTTTTAATT
Unaligned ( gi|60 ): AGTATTCAAATAATGAGACCAAGAAATGATT
Alignments
lowQualScore : 2222222222222222 2222222222 111111111111111 111 33333333333333333 22222222222222222222222222222222222222222222222222222 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 11111111 2222222222222222222222222 111111111111111111 1111111 11111111111111 2222222222222 111 333
lowQualScore : 33333 1 4444444 1 222 1 44 1 33 22 1 2222 1 7777777777 222 11 555555555 11 66 1 1 11 2 11 3 33333 33 1 1 1 11 222 44444 2 1 1 444 33 333333 2 33333 11 11 1 3 0000000000000000 0 7777777777 3 3 222 555555555555555 111 1 2 555555555 2 111 222 44444444 33 2 2222 1 44 22 5555 88888 3333333 666666666 22222 55555555555555555 44 222 11 777777777777777777777 11 22 555555555555555 44444444444444444444444444444444444444444444444444444 44 0 44444 22 1 1 22 333 44444 0 5555 3 2 33 33 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 77777 11111111 3 6666 4 3 2 6666666666666666666666666 555 4 1 5555 444 1 22 666666666 22 55555 88888888 444 1 1 1 1 33 444444444444444444 55 777777777777777777 1 44 333 1 2 2222222 66666666666666 0 2 77777 888888 5 3333333333333 000 6 8 555
lowQualScore : ..... . ....... . ... . .. . .. .. . .... . .......... ... .. ......... .. .. . . .. . .. . ..... .. . . . .. ... ..... . . . ... .. ...... . ..... .. .. . . ................ . .......... . . ... ............... ... . . ......... . ... ... ........ .. . .... . .. .. .... ..... ....... ......... ..... ................. .. ... .. ..................... .. .. ............... ..................................................... .. . ..... .. . . .. ... ..... . .... . . .. .. ................................................................................... ..... ........ . .... . . . ......................... ... . . .... ... . .. ......... .. ..... ........ ... . . . . .. .................. .. .................. . .. ... . . ....... .............. . . ..... ...... . ............. ... . . ...
lowQualScore : 77777 5 8888888 5 666 5 55 4 88 00 4 9999 4 9999999999 444 99 999999999 99 55 3 3 88 6 88 2 11111 11 3 2 3 88 333 22222 6 3 3 888 00 777777 6 22222 88 88 3 5 0000000000000000 4 5555555555 0 0 666 333333333333333 777 3 8 333333333 7 333 111 44444444 22 7 8888 2 22 33 3333 66666 9999999 555555555 99999 00000000000000000 22 222 77 777777777777777777777 99 00 333333333333333 77777777777777777777777777777777777777777777777777777 33 8 55555 22 0 8 88 777 22222 5 7777 8 9 99 99 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 77777 22222222 2 5555 0 3 4 6666666666666666666666666 555 0 7 2222 666 5 11 222222222 11 44444 44444444 444 6 6 6 7 77 333333333333333333 44 444444444444444444 7 33 222 9 0 8888888 22222222222222 6 9 11111 222222 0 8888888888888 111 2 0 000
consensus : TATTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AG-CG-T--TGT--AAATA-A----TTA-A--A--G----A---TATCTTC--AAT-T-----G-A--ATCAA-A-GAG--AT-CA--TNA-----AAT-CATTT-AT-ACCGAG-CTCCA--AA---TTA---AA-T-T-TT---GC--GAGC------AA-T-----A--AT--TCC-ACCA--A------------ATTGAT--G---GCG-GC-ATC-A---A--TNNA--TT-AG--A-T-GA-GAGCA-AT---------A-ATTGAT--TT-------GA--T-G----CG-CGC--ATC-AA---NTC-----A-------A---------TT-----ATTGCTCGC--N-AT-AT---T--TC-AA---T--TG--------A-----T------GC--GC--GCA-T-------C-----A--A-----TT----CAAAT--A-T---TG-----C---NC-----G--C----A--ACA-----AT-TGAAT-TGAT--GC---G-CG--CATCA----AATCGATT-A--T--TGT---C----------CG-CAA------TGA--AAAAA-------A-----G----A-A-----TTGATGCG--CGCG--CAAATC-----A--------ATTATT----GCGCGCANTA-ATT---C----A-G--ATT--G------T---G-CGC-GC----AT---CAA-TTCA--A---------TT--G-----A---N--G-AGA---GC-A-A-T-AATT-GA-----------------AT--T------GA----------TG-CGCGC--A---T-CAAT-T----G--AATT------A-TT-GA-GCG-CAATAA-----TT------GAAC-T--G-CGA------TA--TTTGAATNATT-TACGTGTATGCTT
Reference ( family-5 ) : TATTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AG-CG-T--TGT--AAATA-A----TTA-A--A--G----A---TATCTTC--AAT-T-----G-A--ATCAA-A-GAG--AT-CA--TNA-----AAT-CATTT-AT-ACCGAG-CTCCA--AA---TTA---AA-T-T-TT---GC--GAGC------AA-T-----A--AT--TCC-ACCA--A------------NTTGAT--G---GCG-GC-ATC-A---A--TNNA--TT-AG--A-T-GA-GAGCA-AT---------A-ATTGAT--TT-------GA--T-G----CG-CGC--ATC-AA---NTC-----A-------A---------TT-----ATTGCTCGC--N-AT-AT---T--TC-AA---T--TG--------A-----T------GC--GC--GCA-T-------C-----A--A-----TT----CAAAT--A-T---TG-----C---NC-----G--C----A--ACA-----AT-TNAAT-TGAT--GC---G-CG--CATCA----AATCAATT-A--T--TGC---C----------CG-CAA------TGA--AAAAA-------A-----G----A-A-----TTGATGCG--CGCG--CAAATC-----A--------ATTATT----GCGCGCAATA-ATT---C----A-G--ATT--G------T---G-CGC-GC----AT---CAA-TTCA--A---------TT--G-----A---N--G-AGA---GC-A-A-T-AATT-GA-----------------NT--T------GA----------TG-CGCGC--A---T-CAAT-T----G--AATT------A-TT-CA-GCG-CAATAA-----TT------GAAC-T--G-CGA------TA--TTTGAATTATT-TACG---ATGCTT
gi|1 : -----A--------ATTATT----GCGCGCATAA-ATT---G----A-G---TT--A------T---G-CGC-GCTACGAT---CGA---CA--A---------TC--G-----A---A--A-AGA---GT-A-A-
gi|1 : aattgatgattctttaccaacattgaagA-TTCA--A---------TT--GG----A---A--G-AGAC--AC-A-A-T-ATTT-AA-----------------AT--T------AT----------TG-CGCGC--A---T-AAAT-T----G--AGTT------A-TG-C--GCG-CTACGA-----TC------GAtaaatattgtgtctcttccaattgaataattcaatgtgcaaaataaataattcttttgagaaagcaactatctaattggagatagcttcattcaacatatccactattgaattaatatttctttaattagaactgctactcctttaaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaaatttcttatacaatcgttgttaatgatttaagatatctcagttgaatcaaagagatcatagaataatttgcgtcaagctctaaagtaaattctgagatcaatggttccatcaaaatgttgccgctcatcagtggagttataagattgatgcgcgcaatcaaatcaattattgttcccatcaactgaatctaacacgcgcgcatcatgataatattgatttactcgattgaagagaatgcaaactg
gi|1 : aattgatgattctttaccaacattgaagttactcttttcgattgTC-----G-------A---------TC-----GTAGCGCGC----AT-AA---C--TC-AA---T--TT--------A-----T------GC--GC--GCA-A-------T-----A--A-----TT----TAAAT--A-T---TGTGT--C---TCT----T--C--------CA-----AT-TGAA--TAAT--TCAATG-TG--CA--A----AATAAATA-A--T--Taattcaatgtgcaaaataaataattcttttgagaaagcaactatctaattggagatagcttcattcaacatatccactattgaattaatatttctttaattagaactgctactcctttaaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaaatttcttatacaatcgttgttaatgatttaagatatctcagttgaatcaaagagatcatagaataatttgcgtcaagctctaaagtaaattctgagatcaatggttccatcaaaatgttgccgctcatcagtggagttataagattgatgcgcgcaatcaaatcaattattgttcccatcaactgaatctaacacgcgcgcatcatgataatattgatttactcgattgaagagaatgcaaactg
gi|1 : aattgatgattctttaccaacattgaagttactcttttcgattgATTTCTT-----A-T-------ACA-A------T-CG-T--TGT--TAATG-A----TTT-A--A--G----A---TATCT-C--AGT-T-----G-A--ATCAA-A-GAG--AT-CA--TAG-----AAT-AATTT-GC-GTCAAG-CTCTA--AA---GTA---AA-T-T-CT---GA--GATC------AA-T-----G--GT--TCC-ATCA--A------------AATGTT--G---CCGCTC-ATC-A---G--TG------------------GAGTT-AT---------A-A--GA---TT-------GA--T-G----CG-CGCA-ATC-AA---ATC-----A-------A---------TT-----ATTGTTC-C--C-A----------TC-AA---C--TGAATCTAACA-----C------GC--GC--GCA-T-------C-----ATGA-----T-------AAT--A-T---TG-----cttttgagaaagcaactatctaattggagatagcttcattcaacatatccactattgaattaatatttctttaattagaactgctactcctttaaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaaatttcttatacaatcgttgttaatgatttaagatatctcagttgaatcaaagagatcatagaataatttgcgtcaagctctaaagtaaattctgagatcaatggttccatcaaaatgttgccgctcatcagtggagttataagattgatgcgcgcaatcaaatcaattattgttcccatcaactgaatctaacacgcgcgcatcatgataatattgatttactcgattgaagagaatgcaaactg
gi|1 : aattgatgattctttaccaacattgaagttactcttttcgattgtcgatcgtagcgcgcataactcaatttatgcgcgcaataatttaaatattgtgtctcttccaattgaataattcaatgtgcaaaataaataattcttttgagaaagcaactatctaattggagatagcttcattcaacatatccactattgaattaatatttctttaattagaactgctactcctttaaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaaA---T--TG--------A-----T------GC--GC--GCAAT-------C-----A--A-----AT----CAATT--A-T---TG-----T---TC-----C--C----A--TCA-----AC-TGAATCTAACACGC---G-CG--CATCATGATAAT--ATT-GATT--TAC---T----------CG--AT------TGA--AGAGA-------A-----atttactcgattgaagagaatgcaaactg
gi|10 : aattgatgattctttaccaacattgaagttactcttttcgattgtcgatcgtagcgcgcataactcaatttatgcgcgcaataatttaaatattgtgtctcttccaattgaataattcaatgtgcaaaataaataattcttttgagaaagcaactatctaattggagatagcttcattcaacatatccactattgaattaatatttctttaattagaactgctactcctttaaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaaatttcttatacaatcgttgttaatgatttaagatatctcagttgaatcaaagagatcatagaataatttgcgtcaagctctaaagtaaattctgagatcaatggttccatcaaaatgttgccgctcatcagtggagttataag-GC-ATG-A---AC-TAAA--TTGAG--A----A-GACCA-AT---------A-ATTGAT--TG-------GA--T-G----CG-TGC--GCC-AA---TTG-----A-------A---------TC-----GGTGCGCGCTTC-AT-AT---T-----AA---T--TA--------A-----T------GC--AT--ACA-T-------CGTATAA--A-----TT----ATGAT--A-TAACTGCTATCC---TC-----A--C----A--GAA-----AC-TGAAA-TGAT--GT---G------ATCA----AACGGA---A--T--TGA---C----------CA-----------GA--GCAAAT------ATTTTTG----A-T-----TTGATGCG--TG-G--C--ATCAACGGA--------ATTGAT----AAGCGCATCA-ATT---T----A-T--ATT--A------T---GACAA-GC----ATC--CAA-Ttgcaaactg
gi|11 : ctttgctatccATTCTTT-----A-TTTTGAAAATA-A---G-AT-CA-T--TGA--AAATA-G----TGA-A--A--T----ACATTATCTTC--AGT-T-----G-G--AATAA-A-GAG--AT-CA--CTA-----AAT-AGTTT-AT-ACCGTG-CTCAA--AA---TGA---TA-T-T-TT---AC--GAGC------AACT-----A--AT--TCC-ATCG--C------------AT--AT--T---G----------A---A--TGCA--TT-AG--A-T-GA-GA--A-A----------A-ATCACT--CT-------AAC-T-G----CG-CGC--ATC-AA---ATC-------------------------------TTG------------AA---T--TC-AA---T--GA--------A-----T------T-----------T-------T-----A--A-----TT------AGT--A-T---TG-----C---CC-----A--C----G--AGA-----AG-TAAAT-TGAT--GC---G-C
gi|12 : acatgtgtacattaTATTTCCT-----ACT-------ACA-A---A-AGGCGGT--TGT--AA-TAGA----TTA-A--A--T----A---TACCTTCCAAAT-TTG---G-A--AT-AA-A-GAG--AT-CA--TAC-----AATGTATTTGAT-ATCGAG-TTGAC--AG---T-----AA-T-A-GT---GC--GAGC------AA-T-----A--AT--TCCTGTTG--A------------ATTGAT--G---ACG-GC-ATCAA---A--TCCAACTT-AT--C-T-GC-TA-CATGC---------A-AGTGAA--TT-------AA--TGG----CG-CGC--AT--AATT-ATC-----A-------A---------TT-----AT
gi|14 : cttaactgaatgtgctcttcttaaaaggaaggatgcaagcggtCTT-----A-T-------ACA-A---A-AG-CG-T--TGA--TAATA-G----TTTTA--A--T----A---TATCGTC--AAA-T-----G-A--ATTAA-A-GAG--AT-CA--TCT-----AAC-C--------ACCGAG-CTCCA--AA---TTG---AA-T-------------------------------------------------------------ATTGAT------GCGCGC-GTC-A---AC-TGAA--TT-----T-T-GG-GAGCA-AT---------A-ACTTAA--TT-------GA--T-G----CG-CGC--ATC-AA---ATC-----A-------A---------GT-----ATTTCTCTCT-G-AC-ATCAGT--TG-AA---T--TA--------G-----T------GC--GT--GAA-T-------C-----A--A-----TT----CAA
gi|15 : tctttagctgaattgttgctttctttaaaagtgcgctTCTTT-----A-T-------ATA-A---A-AA-CG-T--TGT--AAATA-A----TTA--------------------TTT--AA--------G-A--A---A-G-GAG-----TA---CA-----AAT-CATTT-AT-TCCAGG-CTCCA--AA---TTG---AA-T-T-TT----T--GAGA------AA-T-----A--AT--GCA-ACCA--C------------ATTGAT------GCGCGC-ATC-A---AG-TACA--TT--G--A-T-CA-CAG--------------A-ACTGA----T-------GA-------------AC--AT-----------------------A---------TT-----GCT-CTCGT--C-A--AT---G--TG-AA---T--TA--------A-----T------GCATGCATGCA-T-------C-----A--A-----TG----CTATT--C-T---TT-----C---GC-----G--T----A--ATG-----AC-CGAAT-TGAT--G
gi|16 : ATTCCCT-----A-T-------ATA-A---ATAG-CG-T--TGA--AAA-A-A----TTA-AGCA--G--------TATCTTC--TTT-T-----T-ATTATAAA-A-GAATTATTCACTTTA-----AAT--ATTT-AT-ACCGAA-CATCA--AA---TTA---AA-T-T-TTA--AC--GAGC------AA-T-----A--AT--TCC-ACTC--ACACT--------ATTGATTAA---AC--AC-ATC-A---A--ATGA-----AGA-A-T-GATGAGGA-AT---------A-ATT-ATAATT-------AA--T-G----TG-CATG-ATTAAA---ATG-----A-------A---------TTTATTAATTGTTC----------T---T--TC-AA---A--TG--------atgtcttcaattg
gi|17 : atgta-----ATTACTTTC--T-TC-AC---T--TG-AA---T--TG--------T-----A------GC--GT--GCA-T-------C-----A--A-----TT----CAA----------TG-----C---A------G--A----A--ATA-----AA-TGAAT-C-AT---T---G-CT--CTTCA----ACTGAATT-A--T--T-----------------G-AAA------GGA--AGAAA-------A-----g
gi|17 : ctctgaagtaaa--ATT--G------TA--G-CGT-GC----AT---CAA-TTCA--A----------T--G-----C---A--G-A--------A-A-T-AAAT-GA-----------------AT--C-------A----------T--TGCTC--T---T-CAAC-T----G--AATT------A-TT-cagcaattctttttggaaagagaacctaatatatttataatttgacatatcttcaacatacccacgtttgaattattgatctgtttgaattgttggtctctttaaaagaatt
gi|18 : ctctgaagtaaaattactttcttcacttgaATTCCTT-----G-C-------ACA-A---A--G-CG-T--AGT--AAAAA-ACCCTTTA-A--A-------A---TATCTTT--AGT-TTACCGGTA--ATTGA-A-GAG--AT-CA--TAA-----A----------T-ACCGAG-CTGCA--AA---CGA---AA-T-T-TT---GC--GGGC------AA-------A--AT--TTT-ATCA--T------------ATTGAT--A---CAA-GC-ATC-A---A--TTGA--AT-TG--A-T-CA-GAGCA-AT---------AGACTAA---TT-------AA--T-G----CG-CAC--ATC-AA---ATC-----A-------A---------CC-----ATTGTTC-C--C-A----------TC-AA---C--TG--------A-----gaaaggaagaaaacagcaattctttttggaaagagaacctaatatatttataatttgacatatcttcaacatacccacgtttgaattattgatctgtttgaattgttggtctctttaaaagaatt
gi|19 : taTTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AG-CA-T--TGT--AAATG-A----TTA-A--A--G----A---TATCTTC--AAT-T-----G-A--ATTAA-A-TGG--AT-AA--TTA-----AAT-CATTT-AT-ACC-AC-CTGCA--AA---TTC---AA-T-C-CT---GC--A---------AA-T-----A--GT--TCC-A--A--A------------AT----------GCGTGC-ATT-C---A--T--A--TT-A-----------AGCA-AT---------ataatccgc
gi|2 : ctatttgaaatatagtttatataattagggatatcgttatgtgccctctttcaaagaatgaatgggtgcatccatTATTCCTT-----A-T-------ACG-A---A-AT-CG-T--TGT--AAATA-A----TTA-A--A--AGAC-A---CATCTTC--AAC-T-----G-A--ATCAA-A-AGA--AT-CA--TAA-----AAT-CATTT-AT-ATCGAT-CTCCA--AA---TTG---AA-T-T-TT---GC--GAGC------AA-T-----A--AT--TCA-GCCA--A------------TTTGAT--G---GCA-AC-ATC-A---A--TATA--TT-AG--A-A-GA-GAGTA-AT---------A-CTTAAT--TT-------GA--T-G----CA-TGC--ATC-AT---TTC-----A-------A---------TT-----ATTGTTCAC--T-AT-AT---T--TC-AA---T--GG--------A-----T------GT--AT--ACA-T-------C-----A--A-----TT----CAAAT--A-T---TC-----C---CC-----G--C----A--ACA-----AT-TCAAT-TGAT--GT---G-TT--TATCA----AATCATTT-A--T--TGT---C----------CG-CAA------TGA--AAAAA-------A-----A----A-A-----TTGATGCG--CGGG--CAAATC-----A--------ATTACT----GGGCGCAATA-ATT---C----A-G--ATT--G------T---G-CGC-GC----AT---CAA-TTCA--C---------TT--G-----A---T--G-AGA---GC-A-A-T-AATT-GA-----------------CT--T------GA----------TG-AGCAC--A---T-CAAT-T----G--AGTT------A-TT-CA-GCA-CAATAA-----TT------GAAC-T--GCCAA------TA--TTTGAATTATT-TACGTGTATGCTT
gi|20 : CCTT-----C-T-------ACA-ATATA-AG-CG-A--TGT--AAATA-A----TCA-A--A--G----A---TATATTC--AAT-T-----G-A--ATCAA-A-GAG--AT-CA--TCA-----AAC-CATTT-AT-ACCGAG-CTCCA--AA---TGC---AA-T-T-TT---GC--AAGC------AA-T-----A--AT--T------G--A------------ATTGAT--G---AGA-GCAATG-A---G--AGAG--TT-AG--A-T-TA--ATCA-TTACTCTCTTGA-ATTGAA--TT-------CA--G-G----CG-CAC--ATA-AA---AT------A-------A---------TT-----
gi|21 : ttatgcgcgcattgttg--TCAA--TT--G--A-C-AA-AGGCA-AT---------A-ATCAAT--TG-------GA--T-T----CG-CGC--ATC-AA---TTC-----A-------A---------TT-----ATTGCGCAC--A-AT-A------------------TG--------A-----T------GC--AC--GCA-T-------T-----A---------------AAAT--G-A---TG-----T---TC-----G-------A--ATA-----ATATCAA--TAAT--GC---t
gi|21 : cggtgtgaataagaagtatcagaaagctagaaagtattcaatctataacaaaatT-----ATTATTCG---A-AC-ATCA-T--T-------T--TA--------A-----T------GC--GT--GCA-T-------C-----A------------------T--A-T---TG-----T---GC-----G--C----A--ATA-----AT-TGAAT-TGAT--GC---G-CG--AATCC----AATTGATT-A--T--TGC---CTT--------TGTCAA------TT---------------------G----A-A-----TT--T---------------TC-----A--------AATATT----GCGCGCAATATATT---attttcaaatattgcgcgcaatatattttgcatttttattttc
gi|22 : cggtgtgaataagaagtatcagaaagctagaaagtattcaatctataacaaaatgcattattgaAAATC-----A--------GTAACT----GCTCTCCACA-ATTGAAC----A-A--ATT---------------CGC-GC----GT---CAA-ATCA--A---------AT--GGATCAA---T--G-AGA---AC-A-A-T-AATT-CA-----------------AT--T------GA----------TG-CGCGC--A---T-CAAA-T----C--AATT------A-TT-GG-GTG-CAATCA------T------GAACAT--G-TAA------CATCTTCAAATAATT-ttgcatttttattttc
gi|22 : tttccatcgaagcaccaaataaaggttgaagttaacttggAT--TT-------G---T-G----CT-CACCAATT-AA---ATC-----A-------G---------TA-----ACTGCTCTC--C-AC-AA---T--TG-AA---C--AA--------A-----T------TC--GC--GCG-T-------C-----A--A-----AT----CAAATGGA-TCAATG-----A---GA-----A--C----A--ATA-----AT-TCAAT-TGAT--GC---G-CG--CATCA----AATCAATT-A--T--TGG---G----------TG-CAA------Taattggtgagcacaaat
gi|23 : tttccatcgaagcaccaaataaaggttgaagttaacttggaattatttgaagatgttacatgttcatg---------A-ATTGAT-----------GA--TTG----C--TAT--ATC-A----TTG-----A-------A---------GT-----ATTGCT-GT--------T---T--TC-AA---C--TGC-------A-----TTGTA--GC--GC--GCA-T-------C-----A--A-----TT----C-AAT--AGC---TG-----CGTGGT-----G--C----A--GCA-----AT-AGAAT-T
gi|24 : ---------TT-----ATTGTGTGT--A-AT-AA---C--TG-AA---T--TG--------A-----T------GT--GC--GCA-T-------C-----G--A-----AT----CAATT--C-C---TG-----C---GCT----GATC----A--TCA-----TT-TCAAT-TGAT--GC---A-TG--TAT------------------T--TGT---C----------AG---A------TGA--AAGAA-------A-----G----A-AGTAACTTGAAGCA--TAC------ATC-----A--------ATTACT----GTGTGCAGTA-ATT---T------G--ATTA-A------T---G-CAT-GC----AT---CAA-ATCAGCA---------TT--G-----C---T-----------CTA-G-TCAACT-GA-----------------AT--T------GA----------TG-atagagctctctcttcaacacaatcaatatcattataatttgattgaatacgttcttttcgagagagcaactatataattagagagatatttttaactc
gi|25 : ATTCTTT-----A-T-------ACA-A---A--T-CG-T--TTT--AAATA-A----TTA-A--A--G----A---TATCTTC--GAT-T-----------TT------AG--CT-TG--TAA-----AGT-------------GAG-CGACA--AA---TTGATTAA-T-T-TT---AC--TGGC------A--------A--AT--TCC-ACCA--A------------ATTTAT------GCGTGC-ATC-A---A--Tag
gi|26 : taattgaatatctctctggttgaattgaattgttgttctgtctaaaagatatagcgcttgcatta-GAG--AT-CA--TAG-----AAT-AATTT-GC-GTCAAG-CTCTA--AA---GTA---AA-T-T-CT---GA--GATC------AA-T-----G--GT--TCC-ATCA-----------------TAAT--GTT-GCG---------------CTCA--TC-AG--T-T-G--GAGTT-AT---------A-A--GAT--T--------GA--T-G----CG-CGC--ATC-AA---ATC-----A-------A---------TT-----ATTGTTC-C--C-ATCAA---C--TG-AA---T--TA--------A-----C------GC--GC--GCA-T-------C-----ATGA-----TT-----AATT--A-T---TG-----tg
gi|26 : -TTCA--A---------TC--G-----A---G--T-AAA---TC-A-A-T-AATT-AA-----------------TCA-T------GA----------TG-CGCGC--G---T-TAAT-T----C--AGTT------G-AT-GG-GAA-CAATAA-----TT------GAatttactcgattgaagagaat
gi|27 : gagatcatagaataatttgcgtcaagctctaaagtaaattctgagatcaatggttccatcataatgttgcgctcatcagttggagttataagattgatgcgcgcatcaaaTATTCCT------A-T-------ACA-A---A-AAACG-TAATTT--TAATG-A----TTA-ATGC--G----A---TTCCTTC--GAT-T-----A-A--ATCAGCA-TAG--AT-CA--TGA-----A-T-CATTT-AT-ACCGAG-CTCTA--AAGACGCA---AATT-T-TT---GCT-GAGC------AA-T-----A--AT--TCC-ATCA--gagaat
gi|28 : attatgcgcacataat--GAGC------AA-T-----A--AT--TCC-ACCA--C------------ATTAAT--GAGTACG-CC-AT------A--TGAA--TT--C--A-T-GA-GAGCA-AT---------A-AT---T--TT-------AA--T-G----CA-CAG--TTC-AA---GTT-----A-------A---------TT-----ATTGC-CTC--A-A-------T--TA-AA---T--TA--------A-----T------GC--TC--CCA-T-------C-----A--A-----T--------AT--A-C---TG-----T---GG-----G--C----ATTACA--------TAAAT-TATT--GC---ccacgggttccactcacattgga
gi|28 : -GC----AT---TAAGTTCA--G---------TT--G-----A---A--A-ACA---GC-A-A-T-AATT-TATGTAATGCCCACAGTATAT--T------GA----------TG-GGAGC--A---T-TAAT-T----T--AATT------G-----A-G-G-CAATAATTAACTT------GAAC-T--G-TG-------CA--TTAAAATTATT-tgttttcaactgaacttaatgc
gi|29 : gagcaataattccaccacattaatgagtacgccatatgaattcatgagagcCCGT-----A-T-------GCA-A---A-GG-CA-T--TGT--ACATA-A--------------------------CCTC--AAT-C-----A-A--ACTAA-A-GAG--AT-AA--TTA-----AAT-CATTC-AT-ACTGAG-CTTGA--AA---TTG---AA-T-A-TT---TC--GAGC------AA-T-----A--GT--TCC-ACCA--C------------ATT-AC--C---GCGCGC-ATC-A---ATGTGAA--TT-A
gi|29 : -GC----AT---TAA-TTCA--A---------AG--G-----A---A--G-AGG---AC-G-T-T-AATT-CAC----------------AT--T------GA----------TG-CGCGC--G---G-TAATGTGGTGG--AACT------A-TT-GC-TCG-AAAT-A-----TT------CAAT-T--T-CAAGCTCAGTA----TGAATGATT-TAacgtcctcttcctttgaattaatgcatg
gi|29 : ccgtatgcaaaggcattgtacataacctcaatcaaactaaagagataat-GC-ATT-A---A--TTCA--AA-GG--A-A-GA-GGACG-TT---------A-ATTCACA-TT-------GA--T-G----CG-CGC--GGT-AA---TGTGGTGGA-------A---------CT-----ATTGCTCGA--A-AT-A----T--TC-AA---T--Tatg
gi|3 : ccgtatgcaaaggcattgtacataacctcaatcaaactaaagagataattaaatcattcatactgagcttgaATTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AG-CG-T--TGT--AAATA-A---------------------------------AT-------G-A--A---------G--AT-CA--TCA-----AAT-CATTT-AT-TCCAAG-CTCCA--AA---TGC---AA-T-T-CT---GC--GGGC------AA-C-----A--TT--TCC-ACAA--C------------ATAGAT------ACGCGC-ATC-A---T--GGAA--TT--G--A-T-CA-GAGCA-AT---------A-ATTGAA--AT-------AA--T-G----CG-CGC--GTA-AA---ATC-----A-------AAT-------TT-----ATTGTTTGC-------AT---TGATC-AA---T--TG--------AACTAGT------GC--GC--GCA-T-------G-----G--AATACTTT----C--------T---TG-----T---TT-----T--C----A--TCA-----AT-TGACT-AGAT-------G-CG--CATCA----AATCAATC-C--T--TGCTCTC----------TT-CAA------TTA--AATTA-------T-----T----A-A-----TTTAT------------AGATT-----A--------ATTAGT----GGGAGCAATA-TTT----------G--ATTTAA------T---G-CGT-GT----AT---TAA-TCCA--G---------TT--A-----C---A--G-TGT---GC-A-A-T-AATC-AG-----------------AT--T------GA----------TG-atg
gi|30 : tgatatctttaattgaattcttgctctctttcaaaaagattgagacacgcatta--ATT--GA-----T---G-CAC-GC----TT-------TTAA--A-------------------A---T--A-AGA---GC-A-A-T-GACT-GA-----------------GT--T------TA----------TG-TGTGC--A---T-CAAA-T----C--AATT------C-TT-atataatttcagataaataaaggtatcttcaattaatttggtt
gi|30 : c-AA--A-T-AA-GAGCA-AT---------G-ACTGAG--TT-------TA--T-G----TG-TGC--ATC-AA---ATC-----A-------A---------TT-----CTTGCTCTC--A-TC-AG---T--CG-AA---T--TG--------A-----T------GA--GT--GCG-T-------C-----A--A-----TT----CA-----A-C---TG-----T---GC-----G--C----A--AAA-----AC-TTGAT-TAAgctctcatcagtcgaattgatgagtgcgtcaattcaactgtgcgcaaaaacttgattaaagtttgactccat
gi|31 : cattgatgcacgcttttaATTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AT-CG-T--TGT--AAATA-A----TTA-A--A--G----A---TATCT----------------------AA-G-GA-----------AA-----GAT-CATTT-AT-ACCA-----CCA--CA---TTA---A-------T---GC--GCGC------AT-C-----A--AT--Tagtttgactccat
gi|31 : cattcT--T------AA----------TG-CGCGC--A---T-CAAT-T----G--AATC------A-gaatcacaggtatgaataacaggtctctgaattttaatcaa
gi|32 : cattcattccttatacaaaatcgttgtaaataattaaagatatctaaggaaagatcatttataccaccacaATCCT----AT-C-----G-A--ATTAA-A-GAT--AT-CA--TTA-----AAA-TATTT-AT-ACCGAG-CATTA--AA---TAA---AA-T-T-TT---GC--GAAC------AA-T-----A--AT--TCA-ACTA--C------------ATTAAT------GCGAGT-ATT-A---AT-TAGA--TT-A---A-T-GA-GAGCcaggtatgaataacaggtctctgaattttaatcaa
gi|33 : tctttaaaaagaatgtttaATTCATT-----G-T-------ATA-A---A-AG-CG-T--TGT--AAAGA-A----TTT-A--A--G----A---TATC--------------------------A-GAG--AT-CA--TTA-----AAT-CATTT-AT-ACCGAG-CACTA--AA---TTA---GA-T-T-TT---GC--GAGC------AA-T-----A--AT--TCC-ACCA--C------------ATTCAT--
gi|33 : cattg-ATTGAT--TT-------AA--T-G----CG-TGA--ATG-AA---TGTGGTGGA-------A---------TT-----ATTGCTCGC--A-AA-AT---C--TA-AT---T--TA--------G-----T------GC--TC--Gtcacgcattaaatcaat
gi|34 : cattgattcattgtataaaagcgttgtaaagaatttaagatatcagagatcattaaatcatttatac-A-GGG--GT-CA--TCA-----ACT-CATTT-AT-ACCGAG-CTCCA--AA---TTA---AA-TAT-ATACAGC--GAGCTTATAGAA-T-----A--AT--TCC-ACCA--C------------ATTGAT------GCGCGC-ATC-C---A--TGAA--TT-A---A-T-GC-GCGCA-AT---------A-AT
gi|34 : G--A-T-GA-TAGTA-AT---------G-ATT-AT--T--------------G----CG-CGC--ATT-AA---TTC-----A-------cattactatcatcagt
gi|35 : aggggtcatcaactcatttataccgagctccaaattaaatatatacagcgagcttatagaataattccaccacattgatgcgcgcatccaA-ATT---T----C-G--ATT--GAATTTTT---G-CGC-GT----AT---CAA-TTCA--ATGATCGTATTT--G-----A---A--G-AGA---GC-A-G-C-AATTGGA-----------------TT--T------------------TG-TGCGC--A---T-C-AT-T----G--Aagt
gi|35 : -CGC--ATT-GA---TTG-----A-------A---------TT-----GTTGAT-------AT-AG---CA-TC-AA---T---G--------A-----T------GC--GC--ACA---------A-----A--A-----TC----CAATT--G-C---TG-----C---TC-----T--CTTCAA--ATACGATCAT-TGAAT-TGAT--AC---G-CG--CAAAA----ATTCAATtgctatatcaacaattcaatcaatgcggatcgacagtaat
gi|36 : aatttcgATTCCTTTAAGTA-T-------ACA-A---A-AG-CG-T--TGT--AAATA-T----CTA-A--A--A----A---CATCTTC--GAT-T-----G-T--AT-AA-A-GAG--AT-TA--TTA-----AGT-CATTT-AT-gatcgacagtaat
gi|37 : catgattggagtcagttgctctatatatatatggtcgcatta-A----TTG-A--T--G----A---TATCTTC--AAA-T-----G-A--ATT-A-A-GAG--AT-AA--CTATTCATAAT-TATTC-AT---------TGCATTAA---CTG---AA-T-TATT---GA--TAGC------AA-T-----A--ATTATCT-GCTG--A------------ATTGAT--G---
gi|37 : aaaccattgggaattgtcG-CGC--ATC-AA---TTC-----AGCAGATAA---------TT-----ATTGCTATC--A-AT-AA---T--TC-AG---T--TA--------A-----T------GC--cgct
gi|38 : aaaccattgggaattgtcattgatgatatcttcaaatgaattaagagataactattcataattattcatt--ATT--G------T---GGCGC-GC----AT---TCA-TTCA--A---------CT--A-----A---C--GCAGG---GC-A-AAT-AATT-CA-----------------CT--T------CA----------TG-CACG---A---T-TAAT-TC---C--ACTT------G-AT-GA-GTA-CAACAA------T------GAAt
gi|39 : aattctagtatctaaaattgctattaT-ACCGAA-CTCCA--AA---TTA---AACT-T-TT---GC--GATC------AA-A-----A--AT--TCC-AGCT--ATT----------ATTAAT--G---GAT-GC-ATC-A---G--TTAA-----AGTAA-T-GA-GAGCA-AT---------A-AATTA---TA-------AA--T-A----CG-CGC--TTC-AA---ATC-----A-------G---------CT-----Atcatt
gi|4 : TATTCCTT-----A-T-------ACG-A---A-AT-CG-T--GTT--AAATA-A----TTA-A--A--AGGACA---CATCTTC--AAC-T-----G-A--ATCAA-AAGAA--AT-CA--TAA-----AAT-CATTT-AT-ATCGAT-CTCCA--AA---TTG---AA-T-T-T----GC--GAGC------AA-T-----A--AT--TC--AGCA--A------------TTTGAT--G---GCA-AC-ATC-A---A--TATA--TTTAG--A-A-GA-GAGTA-AT---------A-CTTAAT--TT-------GAGAT-G----CAATGC--ATC-AT---TTC-----A-------A---------TT-----ATTGTTCAC--T-AT-AT---T--TC-AA---T--GG--------A-----T------GT--AT--ACA-T-------C-----A--A-----TT----CAAAT--A-T---TC-----C---CC-----G--C----A--ACA-----AT-TCAAT-TGAT--GT---G--GTTTATCA----AATCATTT-A--T--TGT---C----------CG-CAA------TGA--AAAAA-------A----------A-A-----TTGATGCG--CGGG--CAAATC-----A--------A-TACT----G-GCGCAATA-ATTC--C----A-G--ATT--G------T-----CGCGGC----AT---CAA-TTCA--C---------TT--G-----A---T--G-AGGTATGC-A-A-T-AATT-GA-----------------CT--T------GA----------TG-AGCAC--A---T-CAAT-T----G--AGTT------ATTT-CA-GCACCAATAA-----TT------G-AC-T--G-CAA------TA--TTTGAcc
gi|40 : tgaagtgcagtTTCCTT-----A-T-------AGA-A---A-GG-TG-T--TGT--AAATA-A----TTA-A--A--G----A---TATCTT---AAT-T-----G-A--ATTAA---GAG--ATACG--T-A-----AAT-CATTT-AT-ATCGAG-CGTTA--AA---TTA---AT-T-T-TT---GC--GAGC------AA-T-----AATAT--TCC-A
gi|41 : -----A--------ATTATG----GCGCGCATT---TT---C----A-A--A---------------G-AGA-GC----AT---GAA-TTCA--A---------TT--G-----
gi|41 : aATTCCCA-----A-T-------AGA-A---A-AG-CA-A--TGT--AAATA-A----TCA-------G----A---CATCTTC--AAT-T-----G-A--ATCAA-A-GAG--AT-CA--TTA-----AAT-CATTcccaatagaaaagcaatgtaaataatcagacatcttcaattgaatcaaagagatcattaaatcatt
gi|42 : acaattgaattcatgctctctttgaaaatgcgcgccata-GC----AT---TAA-TTCA--C---------TT--G-----A---T--G-ATA---GC-A-A-T-AGTT-GA-----------------TT--T------GA----------TG-CCCGT--A---T-CAAT-TCAAGG--AATT------A-TT-GC-TCG-CAATAT-----TTCTTTCAAAAC-T----CGA------TA----TAAATAATTGTATG---
gi|42 : -GC-ATT-A---A--TTCA--CT-TG--A-T-GA-TAGCA-AT---------A-GTTGAT--TT-------GA--T-G----CC-CGT--ATC-AA---TTCAAGG-A-------A---------TT-----ATTGCTCGC--A-AT-AT---T--TC-
gi|43 : tcatacaattatttatatcgagttttgaaaC-----A--------ATTATT----GCGCGCATTA-ATT--------A-A--ATG--GA-----T---G-CGC-GCT---ATGTACAA-CTCA--A---------TT--G-----AATTA--C-AGC---GC-A-A-C-AATT-CA-----------------ATGAT------CA----------TG-CACATTAA---T-TAAT-T----G--AATT------A-TT-
gi|44 : A-ATT--------A-G--ATT--G------T---A-ACT-GA----AT---CAG-TTCG--A---------TT--G-----A---A--G-AGA---GC-A-G-T-AATT-GA-----------------AT--T------AT----------TG-CGCGC--ATTTT-CAAT-T----GCCAACTTCAAGAA-TT-CA-GCA--AACAA-----TT------AAA
gi|45 : T---C----A-GGAATTA-G------T---G-TGC-GC----AT---CAA-TTCT--T---------TTAAA-----A---A--G-AGA---GG-A-A-T-AAAT-CA-----------------AT--T------
gi|46 : ttcaacatatccacaactgaatcggtgatctttta--A---------TT--G-----A---A--G-AGC---AC-A-T-T-AATT-CA-----------------AT--TTTTATTAA----------TG-AGCAC--A---T-CAAT-T----C--TATT------A-TA-CT-GCG-CAATGA-----TT------GAAA-T--GATGA------TA--TCTtacaaa
gi|47 : tttgaA-ATTG--C----A----ATT--GAAGA--T---G-CGC-GC----AT---CAA-CTGA--A---------TT--G-----A---T--A-AGA---GT-ATT-T-AACT-GA-----------------A---T------AA----------TG-CGCGT--A---T-gcat
gi|48 : tcttcagatcaccaTCCTT-----G-C-------TCT-A---A-AG-CA-T--TGT--AAATA-A----TTA-A--A--G----A---TATCCTC--AGT-T-----C-A--GTTAT-T-GAG--AT-C---------------------AT-ACCGAG-CTCCA--AA---TGC---AA-C-T-TT---GC--attatgtatt
gi|49 : gC-GC----AT---CAA-TTAA--A---------TT--G-----A---T--A-TGA---A--A-A-T-AATT-GA-----------------TT--T------GA----------TGTCGTTC--A---T-CAAT-T----A--AAAT------C-TTGCACGCA-CAATAG-----TT------GAag
gi|5 : aTATTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AA-CG-TAATTT--TAATG-A----TTA-A-----G----A---TTCCTTC--GAT-T-----A-A--ATCAG-A-TAG--AT-CA--TGA-----AAT-CATTT-AT-ACCGAG-CTCAA--AA---CGC---AA-T-T-TT---GC--GAGC------AA-T-----A--AT--TCC-ATCACCACGGGTCCATCACATTGAT------GCGCGT-ATT-G---A--TCAA--TG-AA--ATT-GA-GAGCATAT---------ATAT--AT--ATAGAGAGGGA--T-GAATATG-AAC--ATC-AG---ATC-----A-------A---------TT-----TTTGCTCTC--A-TC-AT---T--GG-AA---C--TA--------G-----T------GC--GC--A-A---------------A--A-----TTTTACCTGAT----T---TA-----C---GCATTTAG--C----A--ATA-----AT-TGATT-TGAT--GC---G-CG--T--------AATTGA-T-A--T--T-------------------CAA------ATA--AAAAA-------A-----G----A-G-----TTTATta
gi|50 : attgatgcgcacatat-CG-T--TGT--AAATA-A----ATT-A--A--G----A---TAACTTC--AGT---------A--AT----------------------------T-TATTT-AA-ATCAAG-CTCCA--GT---TTA---GA-T-T-CA---GC--GAGC------AAGT-----A--AT--TCC-aaatgttaatt
gi|52 : ---C----A-T--ATT--GA-----T---G-CAC-AC----GT---CCA-TTGA--A---------TT--G-----A---TTAA-AGA---GC-A-A-T-AACT-GA-----------------AT--T------GA----------TG-CAAGC--A---
gi|55 : taaATTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AG-CT-T--TG
gi|56 : gctctctttagaaagaactaatgcgcatcgcta-----AAT-CATTT-AT-AC-GAG-CATTA--GG---TCA---GA-T-T-TT---GC--ATGC------AA-T-----A--AT--TTC-ACg
gi|57 : ttTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AT-CT-T--TGT--AAATA-A----TTA-A--A--G----A---T
gi|6 : ttcattgtaATTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-A--TG-T--TGTGTAAATA-A----CTA-A--AAAG----A---TATCTTC--CATAG-----G-A--ATTAA-A-G-T--AT-CA--TTA-----AAT--ATTT-ATTACCAAGGCCTTA--AA---TTA---AA-T-T-TTT--GT--GAGC------AA-TAATTGA--AT--TCC-A--A--A------------ATTAAT------ATG----ATC-ATGCA--TAAA--TC-AA--A-TCTA-ATGCA-GA---------A-A--GA---CT-------AA--T--------------AT--AA---TTG-----A-------A---------AT-----AATGC---C--C-AC-AT---T--T--AA------TG--------A----------------------A-T-------C-----T--A-----TT----CAAA---A-C---T------C---TC-----G-------G--TCA-----AT-TGAAT-TCAT--GT---GACA--CATTA----AA-AGATT-A--T--TGT---C----------
gi|7 : tttttaattcaacagttattccacaatttgaattaaattaaatgttctctttcaattgaattattgctgtcttttaatgaatta-AG--A-A-GG-GAGCA-AT---------A-ATTGAT--TT-------TA--T-G----CG-C-----TC-AATCCTTC-----A-------ATGAAGCGATTT-----AATGCTTTC--A-GG-AA---T--TC-AA---T--TG--------T-----T------TC--TC--TCG---------C-----A--A------------AACT--A-C---AG-----T---TCG----G--T----AG-ACA--------TAATT-TGAT--GA---T-CT--CTTCA----ATTCAATTGA--TGATGT---CTTTAAACATTCG-CAAACTTTTTG----TAAA-------A-----G----ATA-----TTAATGCA--TGCA--CACCTC-----A--------TTTTTTTAAAGAGAGCAACA-ATT---C----A-G--t
gi|7 : attcaacatatcaactactaattaatgatacctttaaCTT-----T-T-------ACA-A---A-AA-GT-T--TGC--GAATG-T----TTA-A--A--G----A---CATCATC--AAT-T-----G-A--ATTGA-A-GAG--AT-CA--TCA-----AAT-TATGT-CT-ACCGAA-CT------G---T-----AG-T-T-TT---GCGAGAGA------AA-C-----A--AT--T------G--A------------ATTCCT--G---AAA-GC-ATTAA---A--TCGC--TT-CA--T-T-GA-AGG----------------ATTGA------------------------G-CGC--ATA-AA---ATC-----A-------A---------TT-----ATTGCTCCC--T-----T---C--TT-AGGATT--TA--------A-----T------GT--GC--GCA-TATACATGT-----A--A-----TC----CATA---A-T---TA-----C---TT-----T--C----C--ACA-----AT-TGCAG-TGCA--GT---G-CA--CAtaggatttaatgtgcgcatatacatgtaatccataattactttccacaattgcagtgcagtgcacaatgcaat
gi|8 : attcaacatatcaactactaattaatgatacctttaactgaattgttgctctctttaaaaaaatgaggtgtgcatgcattaatatTT-----A-T-------ATACA---A-AT-CG-T--TGT--TAATG-A----TTT-A--A--G----A---TATCT-C--AGT-T-----G-A--ATCAA-A-GAG--AT-CA--TAG-----AAT-AATTT-GC-GTCAAG-CTCTA--AA---GTA---AA-T-T-CT---A---GATC------AA-T-----G--GT--TCC-ATCA--A------------AATG-T--T---GCG-GCTATC-A---G--TG------------------GAGTT-AT---------A-A--GA---TT-------GA--T-G----CG-CCA--ATC-AA---ATC-----A-------A---------TT-----A-TGTTC-C--C-A----------TC-AA---C--TGA-------A-----TTACACAGC--GC--GCA-T-------C-----ATGA-----TT-----AATT--A-T---TG-----atgcaat
gi|8 : ctttaatagaactgctactctttaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaattA-------A-----G----A-------TTGATGCG--C-CAATCAAATC-----A--------ATTA-T----GTTCCCATCA-ACT---G----A----ATT--A------CACAG-CGC-GC----AT---CA-------------------T--G-----A---T-----------------T-AATT--------------------AT--T------GA----------TT-TAC--------T-CGAT-T----G--AATG------A----GA-ATG-CAA-AC-----TT------GAAT-TAAA-CGA------TA--Tatttactcgattgaatgagaatgcaaacttgaattaaacgatatcctcaaataatg
gi|8 : ctttaatagaactgctactctttaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaattttatatacaaatcgttgttaatgatttaagatatctcagttgaatcaaagagatcatagaataatttgcgtcaagctctaaagtaaattctagatcaatggttccatcaaaatgttgcggctatcagtggagttatTA-ATT---C----A-A--GTT---------T---G-CAT-TC-----T---CA--TTCA--A---------TC--G-----A---G--T-AAA---TC-A-A-T-AATT-AA-----------------TCA-T------GA----------TG-CGCGCT-G---TGTAAT-T----C--AGTT------G-AT-GG-GAA-C-ATAA-----TT------GAcctcaaataatg
gi|9 : ctttaatagaactgctactctttaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaattttatatacaaatcgttgttaatgatttaagatatctcagttgaatcaaagagatcatagaataatttgcgtcaagctctaaagtaaattctagatcaatggttccatcaaaatgttgcggctatcagtggagttataagattgatgcgccaatcaaaT-AA--A-T-GC-GGGCA-AT---------A-ATAGAA--TT-------AT--T-G----CT-CTC--TTC-AA---TTT-----G-------A---------TT-----ATTGATTAA--AGAT-AT---T--TCTAA---TAATG--------A-----T------TT---C--G-----------------A--A-----TT----GAATT--T-T---TG-----C---TT-----T--CTTT-A--A-A-----A---GAAT-TGGT--GC---G-AG--CGTTA----ATTCT-TT-A--T--------------------A-CA-------TGATTAAAAATATCTTCA-----GTTGAA-A-----TCGA-GCAATCATG---AAATC-----ATTTGTACCATT-TT----GCGAGCAGTA-ATC---CCAACACA--ATA--A------T---G-CAT-GC----AT---CA--TTAA--A---------AT--G-----A---T--G-AGA---AC-A-A-T-GGTT-GA-----------------AT--T------AAAGTCAATTATTG-TTCTT--A---T-CAAT-T----G--AGTaacgatatcctcaaataatg
gi|9 : ttggtttaa-T--TAT--ACATG-A----TTA-A--A--A----A---TATCTTC--AGT-T-----GAA--ATC-G-A-GCA--AT-CA--TGA-----AAT-CATTT-GT-ACC-----------------------A-T-T-TT---GC--GAGC------AG-T-----A--AT--CCC-AACA--C------------AATAAT--G---CAT-GC-ATC-A---T--TAAA--AT--G--A-T-GA-GAACA-AT---------G-GTTGAA--TT-------A----------------------AA---GTC-----A-------A---------TT-----ATTGTTC----------T---TA-TC-AA---T--TG--------AG----T------AC--GC--acgc
7 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): CGCGCATGCAATAATCATCATAATACACACATTGATCTTTTCTATTGATATCAACTACAAATGTATTCAATTTACGCACGCAATCATTCCGTTAGTGATAGAAGATATCTTCAATTCAACATATCCACAATTGAATTAATGGTATCTTTCATTGAATTATTGCTCTGTAAAACGAATAATTGCGAACATGGATTCCTTACAAAAAATACTTGTAACGTTTTTTAAAACTCATC
Unaligned ( gi|51 ): AGTGCTAGCGATATATTCAATTCCACACATCCACAACTGAATTAATGATCTCTTCAATCATCAA
Unaligned ( gi|53 ): ATGATCTCTTTAACGTTGAATTGTTAATCTCTTTAAGAAAAATGGATGCGTGCATTGATTC
Unaligned ( gi|54 ): TGTATTCATTGAATTATCGATGACATTAATTATCATGCTTAATTGATACGCGCTAA
Unaligned ( gi|58 ): AACGTATCCTCAAATAATGAAAGAATCTTCGTTATATAATT
Unaligned ( gi|59 ): TATCCAGAACTGAATTAATTATCTTTTTAATT
Unaligned ( gi|60 ): AGTATTCAAATAATGAGACCAAGAAATGATT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111 2222222222 111111111111111 111 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 1111111111111111 11111 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 11111111111111 222222222222222222222222 11111111111111111 1111111 1111111111111111 1111111111 111111
lowQualScore : 33333 1 4444444 1 222 1 44 1 33 22 1 2222 1 7777777777 222 11 5555555 1 11 1 6 1 1 11 2 11 3 33333 33 1 1 1 11 222 44444 3 1 1 333 33 333333 2 33333 11 11 1 3 888888888888888 0 8888888888 3 3 222 666666666666666 1 1 1 3 666666666 3 33 444 66666666 33 1 3333 1 3 33 6666 77777 888888888 33333 22 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 3333333333333333 22222 55 666 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 33333333333333 33 0 6666666 1 2 2 888888888888888888888888 1 3 1 3333 4444 444 1 11 555555555 11 44444 555555 1 55555555 1 1 1 1 555 11111111111111111 55 444444 11 222 44 222 1 333 66666666 1 3333333 22 555555 1 8888888888888888 33 7777777777777 33 3 3333333333 777777 1 1 55
lowQualScore : ..... . ....... . ... . .. . .. .. . .... . .......... ... .. ....... . .. . . . . .. . .. . ..... .. . . . .. ... ..... . . . ... .. ...... . ..... .. .. . . ............... . .......... . . ... ............... . . . . ......... . .. ... ........ .. . .... . . .. .... ..... ......... ..... .. ........................................................................................................................................ ................ ..... .. ... ............................................................................ .............. .. . ....... . . . ........................ . . . .... .... ... . .. ......... .. ..... ...... . ........ . . . . ... ................. .. ...... .. ... .. ... . ... ........ . ....... .. ...... . ................ .. ............. .. . .......... ...... . . ..
lowQualScore : 77777 5 8888888 5 666 5 55 4 88 00 4 9999 4 9999999999 444 99 4444444 4 99 4 1 3 3 88 6 88 2 11111 11 3 2 3 88 333 22222 9 3 3 555 00 777777 6 22222 88 88 3 5 444444444444444 4 1111111111 1 1 777 777777777777777 5 5 5 1 222222222 1 22 111 22222222 88 6 4444 5 1 33 3333 11111 000000000 66666 33 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 4444444444444444 00000 00 444 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 00000000000000 77 1 0000000 9 1 0 999999999999999999999999 7 5 5 1111 6666 111 4 99 333333333 88 77777 333333 4 88888888 4 4 4 4 999 44444444444444444 99 111111 99 999 00 999 7 222 66666666 8 0000000 66 555555 9 0000000000000000 11 8888888888888 11 6 3333333333 444444 0 7 00
consensus : TATTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AG-CG-T--TGT--AAATA-A----TTA-A--A--G----A---TATCTTC--AAT-T-----G-A--A-TCAA-A-GAG--AT-CA--TNA-----AAT-CATTT-A-TACCGA-GCTCCA--AA---TTA---AA-T-T-TT---GC--GAGC------AA-T-----A--AT--TCC-ACCA--A------------ATTGAT--G---GCG-GC-ATC-A---A--TNAA--TT-AG--A-T-GA-GAGCA-AT---------A-ATTGAT--TT-------GA--T-G----CG-CGC-ATC-AA---ATC-----AA---------TT-----ATTG-CTC-C--NAT-AT---T--TC-AA---T--TG--------A-----T------GC--GC--GCAT-------C-----A--A-----TT----CAANTAT---TG-----CNC-----G--C----A--ACA-----A-TTGAATTGATGCG-CG--CA-----TCA-AATCGATT-AT--TG---TC----------CG-CAA------TGAAAA---A-A-----A-----G----A-A-----TTGATGCG--CGCGCAA-ATC-----A--------ATT--ATTGCGC----GCANTA-AT-T---CA----G--ATT--G------T-G-CGC-G----C----AT---CAA-TTCA--AT---------T--G-----A---N--G-AGA---G----C-A-A-T-AATTG--A-----------------AT--T------GATG-CGC---GC--A---T-C---AA--------T-T----G--AAT--T------A-TTG--------N-GCG---CAAT--AA-----TT------G--AAC-TG-CGA------TA--T---TTGAATNATTTACGTGTATGCTT
Reference ( family-5 ) : TATTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AG-CG-T--TGT--AAATA-A----TTA-A--A--G----A---TATCTTC--AAT-T-----G-A--A-TCAA-A-GAG--AT-CA--TNA-----AAT-CATTT-A-TACCGA-GCTCCA--AA---TTA---AA-T-T-TT---GC--GAGC------AA-T-----A--AT--TCC-ACCA--A------------ATTGAT--G---GCG-GC-ATC-A---A--TNNA--TT-AG--A-T-GA-GAGCA-AT---------A-ATTGAT--TT-------GA--T-G----CG-CGC-ATC-AA---NTC-----AA---------TT-----ATTG-CTCGC--NAT-AT---T--TC-AA---T--TG--------A-----T------GC--GC--GCAT-------C-----A--A-----TT----CAAATAT---TG-----CNC-----G--C----A--ACA-----A-TTGAATTGATGCG-CG--CA-----TCA-AATCGATT-AT--TG---TC----------CG-CAA------TGAAAA---A-A-----A-----G----A-A-----TTGATGCG--CGCGCAA-ATC-----A--------ATT--ATTGCGC----GCANTA-AT-T---CA----G--ATT--G------T-G-CGC-G----C----AT---CAA-TTCA--AT---------T--G-----A---N--G-AGA---G----C-A-A-T-AATTG--A-----------------AT--T------GATG-CGC---GC--A---T-C---AA--------T-T----G--AAT--T------A-TTG--------A-GCG---CAAT--AA-----TT------G--AAC-TG-CGA------TA--T---TTGAATNATTTACGTGTATGCTT
gi|1 : -----A--------ATT--ATTGCGC----GCATAA-AT-T---GA----G---TT--A------T-G-CGC-G----CTACGAT---CGA---CA--AT---------C--G-----A---A--A-AGA---G----T-A-A-
gi|1 : aattgatgattctttaccaacattgaagA-TTCA--AT---------T--GG----A---A--G-AGAC--A----C-A-A-T-ATTTA--A-----------------AT--T------ATTG-CGC---GC--A---T-A---AA--------T-T----G--AGT--T------A--TG--------C-GCG---CTAC--GA-----TC------G--Ataaatattgtgtctcttccaattgaataattcaatgtgcaaaataaataattcttttgagaaagcaactatctaattggagatagcttcattcaacatatccactattgaattaatatttctttaattagaactgctactcctttaaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaaatttcttatacaatcgttgttaatgatttaagatatctcagttgaatcaaagagatcatagaataatttgcgtcaagctctaaagtaaattctgagatcaatggttccatcaaaatgttgccgctcatcagtggagttataagattgatgcgcgcaatcaaatcaattattgttcccatcaactgaatctaacacgcgcgcatcatgataatattgatttactcgattgaagagaatgcaaactg
gi|1 : aattgatgattctttaccaacattgaagttactcttttcgattgATTTCTT-----A-T-------ACA-A------T-CG-T--TGT--TAATG-A----TTT-A--A--G----A---TATCT-C--AGT-T-----G-A--A-TCAA-A-GAG--AT-CA--TAG-----AAT-AATTT-G-CGTCAA-GCTCTA--AA---GTA---AA-T-T-CT---GA--GATC------AA-T-----G--GT--TCC-ATCA--A------------AATGTT--G---CCGCTC-ATC-A---G--TG------------------GAGTT-AT---------A-A--GA---TT-------GA--T-G----CG-CGCAATC-AA---ATC-----AA---------TT-----ATTG-TTC-C--CA----------TC-AA---C--TGAATCTAACA-----C------GC--GC--GCAT-------C-----ATGA-----T-------AATAT---TG-----aattcaatgtgcaaaataaataattcttttgagaaagcaactatctaattggagatagcttcattcaacatatccactattgaattaatatttctttaattagaactgctactcctttaaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaaatttcttatacaatcgttgttaatgatttaagatatctcagttgaatcaaagagatcatagaataatttgcgtcaagctctaaagtaaattctgagatcaatggttccatcaaaatgttgccgctcatcagtggagttataagattgatgcgcgcaatcaaatcaattattgttcccatcaactgaatctaacacgcgcgcatcatgataatattgatttactcgattgaagagaatgcaaactg
gi|10 : aattgatgattctttaccaacattgaagttactcttttcgattgtcgatcgtagcgcgcataactcaatttatgcgcgcaataatttaaatattgtgtctcttccaattgaataattcaatgtgcaaaataaataattcttttgagaaagcaactatctaattggagatagcttcattcaacatatccactattgaattaatatttctttaattagaactgctactcctttaaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaa-GC-ATG-A---AC-TAAA--TTGAG--A----A-GACCA-AT---------A-ATTGAT--TG-------GA--T-G----CG-TGC-GCC-AA---TTG-----AA---------TC-----GGTG-CGCGCTTCAT-AT---T-----AA---T--TA--------A-----T------GC--AT--ACAT-------CGTATAA--A-----TT----ATGATATAACTGCTATCCTC-----A--C----A--GAA-----A-CTGAAATGATGTG------A-----TCA-AACGGA---AT--TG---AC----------CA-----------GAGCA---A-AT----ATTTTTG----A-T-----TTGATGCG--TG-GC---ATCAACGGA--------ATT--GATAAGC----GCATCA-AT-T---TA----T--ATT--A------T-GACAA-G----C----ATC--CAA-Tatttactcgattgaagagaatgcaaactg
gi|11 : ctttgctatccATTCTTT-----A-TTTTGAAAATA-A---G-AT-CA-T--TGA--AAATA-G----TGA-A--A--T----ACATTATCTTC--AGT-T-----G-G--A-ATAA-A-GAG--AT-CA--CTA-----AAT-AGTTT-A-TACCGT-GCTCAA--AA---TGA---TA-T-T-TT---AC--GAGC------AACT-----A--AT--TCC-ATCG--C------------AT--AT--T---G----------A---A--TGCA--TT-AG--A-T-GA-GA--A-A----------A-ATCACT--CT-------AAC-T-G----CG-CGC-ATC-AA---ATC------------------------TTG------------AA---T--TC-AA---T--GA--------A-----T------T----------T-------T-----A--A-----TT------AGTAT---TG-----CCC-----A--C----G--AGA-----A-GTAAATTGATGCG-C
gi|12 : acatgtgtacattaTATTTCCT-----ACT-------ACA-A---A-AGGCGGT--TGT--AA-TAGA----TTA-A--A--T----A---TACCTTCCAAAT-TTG---G-A--A-T-AA-A-GAG--AT-CA--TAC-----AATGTATTTGA-TATCGA-GTTGAC--AG---T-----AA-T-A-GT---GC--GAGC------AA-T-----A--AT--TCCTGTTG--A------------ATTGAT--G---ACG-GC-ATCAA---A--TCCAACTT-AT--C-T-GC-TA-CATGC---------A-AGTGAA--TT-------AA--TGG----CG-CGC-AT--AATT-ATC-----AA---------TT-----AT
gi|13 : cttaactgaatgtgctcttcttaaaaggaaggatgcaagcggtTC-----A--------ATT--TACGCAC----GCAATC-AT-T---CC----G--TTA--G------T-G-ATA-GAAGAT----AT---C---TTCA--AT---------T--C-----A---A--C-ATA---T----C-C-A-C-AATTG--A-----------------AT--T------AATG-------GT--A---T-CTTTCA--------T-T----G--AAT--T------A-TTGCTCTGTAAA-ACG----AAT--AA-----TT------G--
gi|14 : cgcgcatgcaataatcatcataatacacacattgatcttttctattgatatcaactacaaatgtatCTT-----A-T-------ACA-A---A-AG-CG-T--TGA--TAATA-G----TTTTA--A--T----A---TATCGTC--AAA-T-----G-A--A-TTAA-A-GAG--AT-CA--TCT-----AAC-C--------ACCGA-GCTCCA--AA---TTG---AA-T-------------------------------------------------------------ATTGAT------GCGCGC-GTC-A---AC-TGAA--TT-----T-T-GG-GAGCA-AT---------A-ACTTAA--TT-------GA--T-G----CG-CGC-ATC-AA---ATC-----AA---------GT-----ATTT-CTCTCT-GAC-ATCAGT--TG-AA---T--TA--------G-----T------GC--GT--GAAT-------C-----A--A-----TT----CAAcgaacatggattccttacaaaaaatacttgtaacgttttttaaaactcatc
gi|15 : tctttagctgaattgttgctttctttaaaagtgcgctTCTTT-----A-T-------ATA-A---A-AA-CG-T--TGT--AAATA-A----TTA--------------------TTT--AA--------G-A--A----A-G-GAG-----TA---CA-----AAT-CATTT-A-TTCCAG-GCTCCA--AA---TTG---AA-T-T-TT----T--GAGA------AA-T-----A--AT--GCA-ACCA--C------------ATTGAT------GCGCGC-ATC-A---AG-TACA--TT--G--A-T-CA-CAG--------------A-ACTGA----T-------GA-------------AC-AT----------------A---------TT-----GCT--CTCGT--CA--AT---G--TG-AA---T--TA--------A-----T------GCATGCATGCAT-------C-----A--A-----TG----CTATTCT---TT-----CGC-----G--T----A--ATG-----A-CCGAATTGATG
gi|16 : ATTCCCT-----A-T-------ATA-A---ATAG-CG-T--TGA--AAA-A-A----TTA-AGCA--G--------TATCTTC--TTT-T-----T-ATTA-TAAA-A-GAATTATTCACTTTA-----AAT--ATTT-A-TACCGA-ACATCA--AA---TTA---AA-T-T-TTA--AC--GAGC------AA-T-----A--AT--TCC-ACTC--ACACT--------ATTGATTAA---AC--AC-ATC-A---A--ATGA-----AGA-A-T-GATGAGGA-AT---------A-ATT-ATAATT-------AA--T-G----TG-CATGATTAAA---ATG-----AA---------TTTATTAATTG-TTC---------T---T--TC-AA---A--TG--------atgtcttcaattg
gi|17 : atgtaTC-----A--------TTT--ATTTC-T----GCATTG-A---------------ATT--GA-----T-G-CAC-G----C----TA---CAA-TTCA--AG---------T--G-----A---A--G-AAA---G----T-A-A-T-g
gi|17 : ctctgaagtaaa--ATT--G------TAG-CGT-G----C----AT---CAA-TTCA--A----------T--G-----C---A--G-A------------A-A-T-AAATG--A-----------------AT--C-------AT--TGC---TC--T---T-C---AA--------C-T----G--AAT--T------A-TTG--------A-AAG---GAAG--AA----------------AAC-AG-CAA------Tatcattgctcttcaactgaattattgaaaggaagaaaacagcaattctttttggaaagagaacctaatatatttataatttgacatatcttcaacatacccacgtttgaattattgatctgtttgaattgttggtctctttaaaagaatt
gi|18 : ctctgaagtaaaattactttcttcacttgaATTCCTT-----G-C-------ACA-A---A--G-CG-T--AGT--AAAAA-ACCCTTTA-A--A-------A---TATCTTT--AGT-TTACCGGTA--A-TTGA-A-GAG--AT-CA--TAA-----A-----------TACCGA-GCTGCA--AA---CGA---AA-T-T-TT---GC--GGGC------AA-------A--AT--TTT-ATCA--T------------ATTGAT--A---CAA-GC-ATC-A---A--TTGA--AT-TG--A-T-CA-GAGCA-AT---------AGACTAA---TT-------AA--T-G----CG-CAC-ATC-AA---ATC-----AA---------CC-----ATTG-TTC-C--CA----------TC-AA---C--TG--------A-----tctttttggaaagagaacctaatatatttataatttgacatatcttcaacatacccacgtttgaattattgatctgtttgaattgttggtctctttaaaagaatt
gi|19 : taTTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AG-CA-T--TGT--AAATG-A----TTA-A--A--G----A---TATCTTC--AAT-T-----G-A--A-TTAA-A-TGG--AT-AA--TTA-----AAT-CATTT-A-TACC-A-CCTGCA--AA---TTC---AA-T-C-CT---GC--A---------AA-T-----A--GT--TCC-A--A--A------------AT----------GCGTGC-ATT-C---A--T--A--TT-A-----------AGCA-AT---------ataatccgc
gi|2 : ctatttgaaatatagtttatataattagggatatcgttatgtgccctctttcaaagaatgaatgggtgcatccatTATTCCTT-----A-T-------ACG-A---A-AT-CG-T--TGT--AAATA-A----TTA-A--A--AGAC-A---CATCTTC--AAC-T-----G-A--A-TCAA-A-AGA--AT-CA--TAA-----AAT-CATTT-A-TATCGA-TCTCCA--AA---TTG---AA-T-T-TT---GC--GAGC------AA-T-----A--AT--TCA-GCCA--A------------TTTGAT--G---GCA-AC-ATC-A---A--TATA--TT-AG--A-A-GA-GAGTA-AT---------A-CTTAAT--TT-------GA--T-G----CA-TGC-ATC-AT---TTC-----AA---------TT-----ATTG-TTCAC--TAT-AT---T--TC-AA---T--GG--------A-----T------GT--AT--ACAT-------C-----A--A-----TT----CAAATAT---TC-----CCC-----G--C----A--ACA-----A-TTCAATTGATGTG-TT--TA-----TCA-AATCATTT-AT--TG---TC----------CG-CAA------TGAAAA---A-A-----A-----A----A-A-----TTGATGCG--CGGGCAA-ATC-----A--------ATT--ACTGGGC----GCAATA-AT-T---CA----G--ATT--G------T-G-CGC-G----C----AT---CAA-TTCA--CT---------T--G-----A---T--G-AGA---G----C-A-A-T-AATTG--A-----------------CT--T------GATG-AGC---AC--A---T-C---AA--------T-T----G--AGT--T------A-TTC--------A-GCA---CAAT--AA-----TT------G--AAC-TGCCAA------TA--T---TTGAATTATTTACGTGTATGCTT
gi|20 : CCTT-----C-T-------ACA-ATATA-AG-CG-A--TGT--AAATA-A----TCA-A--A--G----A---TATATTC--AAT-T-----G-A--A-TCAA-A-GAG--AT-CA--TCA-----AAC-CATTT-A-TACCGA-GCTCCA--AA---TGC---AA-T-T-TT---GC--AAGC------AA-T-----A--AT--T------G--A------------ATTGAT--G---AGA-GCAATG-A---G--AGAG--TT-AG--A-T-TA--ATCA-TTACTCTCTTGA-ATTGAA--TT-------CA--G-G----CG-CAC-ATA-AA---AT------AA---------TT-----
gi|21 : ttatgcgcgcattgttgAA------TAAAAATGCA-A-----A-----A----T-A-----T--AT-TG--CGCGCAATATTTGAA-A--------ATTCAATTG-ACAAAGGCAATA-A--T---CA-------ATT--GGA----T-T-CGC-G----C----AT---CAA-TTCA--AT---------T--A-----T---T--G-CGC---A----C-A-A-T-A----------------------------T------GATG-CAC---GC--A---T-T---AAAATGATGTT-C----G--AATAAT------A-T------------------CAAT--AA------T------G--CAT-TT-TGT------TA--TAGATTGAATACTTTt
gi|21 : cggtgtgaataagaagtatcagaaagctagT-----ATTA-TTCG---AAC-ATCA-T--T-------T--TA--------A-----T------GC--GT--GCAT-------C-----A------------------TAT---TG-----TGC-----G--C----A--ATA-----A-TTGAATTGATGCG-CG--AA-----TCC-AATTGATT-AT--TG---CCTT--------TGTCAA------TT---------------------G----A-A-----TT--T--------------TC-----A--------AAT--ATTGCGC----GCAATATAT-T---ttc
gi|22 : cggtgtgaataagaagtatcagaaagctagaaagtattcaatctataacaaaatgcattattgaAA-ATC-----A--------GTA--ACTGCTC----TCCACA-AT-TGAACA----A--ATT-------------CGC-G----C----GT---CAA-ATCA--AA---------T--GGATCAA---T--G-AGA---A----C-A-A-T-AATTC--A-----------------AT--T------GATG-CGC---GC--A---T-C---AA--------A-T----C--AAT--T------A-TTG--------G-GTG---CAAT--CA------T------G--AACATG-TAA------CATCT---TCAAATAATTttgcatttttattttc
gi|23 : tttccatcgaagcaccaaataaaggttgaagttaacttggT---------T--G-----A---A--G-AGA---GAGCTC-T-A-T-AATTC--T-----------------AT--T------GCTG-CACCACGC--A---G-C---TA--------T-T----G--AAT--T------G-ATG--------C-GCGCTACAATGCAG-----TT------GAAAAC-AG-CAA------TA--C---TTCAATGATATAaattggtgagcacaaat
gi|24 : aattgatgattgc---------TT-----ATTG-TGTGT--AAT-AA---C--TG-AA---T--TG--------A-----T------GT--GC--GCAT-------C-----G--A-----AT----CAATTCC---TG-----CGCT----GATC----A--TCA-----T-TTCAATTGATGCA-TG--TA-----T-------------T--TG---TC----------AG---A------TGAAAG---A-A-----A-----G----A-AGTAACTTGAAGCA--TAC-----ATC-----A--------ATT--ACTGTGT----GCAGTA-AT-T---T-----G--ATTA-A------T-G-CAT-G----C----AT---CAA-ATCAGCAT---------T--G-----C---T---------------CTA-G-TCAACTG--A-----------------AT--T------GATG-cacaatcaatatcattataatttgattgaatacgttcttttcgagagagcaactatataattagagagatatttttaactc
gi|25 : ATTCTTT-----A-T-------ACA-A---A--T-CG-T--TTT--AAATA-A----TTA-A--A--G----A---TATCTTC--GAT-T------------TT------AG--CT-TG--TAA-----AGT-------------GA-GCGACA--AA---TTGATTAA-T-T-TT---AC--TGGC------A--------A--AT--TCC-ACCA--A------------ATTTAT------GCGTGC-ATC-A---A--Tag
gi|26 : taattgaatatctctctggttgaattgaattgttgttctgtctaaaagatatagcgcttgcatta-GAG--AT-CA--TAG-----AAT-AATTT-G-CGTCAA-GCTCTA--AA---GTA---AA-T-T-CT---GA--GATC------AA-T-----G--GT--TCC-ATCA-----------------TAAT--GTT-GCG---------------CTCA--TC-AG--T-T-G--GAGTT-AT---------A-A--GAT--T--------GA--T-G----CG-CGC-ATC-AA---ATC-----AA---------TT-----ATTG-TTC-C--CATCAA---C--TG-AA---T--TA--------A-----C------GC--GC--GCAT-------C-----ATGA-----TT-----AATTAT---TG-----tg
gi|26 : -TTCA--AT---------C--G-----A---G--T-AAA---T----C-A-A-T-AATT---A-----------------ATCAT------GATG-CGC---GC--G---T-T---AA--------T-T----C--AGT--T------G-ATG--------G-GAA---CAAT--AA-----TT------G--Aatttactcgattgaagagaat
gi|27 : gagatcatagaataatttgcgtcaagctctaaagtaaattctgagatcaatggttccatcataatgttgcgctcatcagttggagttataagattgatgcgcgcatcaaaTATTCCT------A-T-------ACA-A---A-AAACG-TAATTT--TAATG-A----TTA-ATGC--G----A---TTCCTTC--GAT-T-----A-A--A-TCAGCA-TAG--AT-CA--TGA-----A-T-CATTT-A-TACCGA-GCTCTA--AAGACGCA---AATT-T-TT---GCT-GAGC------AA-T-----A--AT--TCC-ATCA--gagaat
gi|28 : attatgcgcacataat--GAGC------AA-T-----A--AT--TCC-ACCA--C------------ATTAAT--GAGTACG-CC-AT------A--TGAA--TT--C--A-T-GA-GAGCA-AT---------A-AT---T--TT-------AA--T-G----CA-CAG-TTC-AA---GTT-----AA---------TT-----ATTG-C-CTC--AA-------T--TA-AA---T--TA--------A-----T------GC--TC--CCAT-------C-----A--A-----T--------ATAC---TG-----TGG-----G--C----ATTACA--------TAAATTATTGCccacgggttccactcacattgga
gi|28 : -G----C----AT---TAAGTTCA--GT---------T--G-----A---A--A-ACA---G----C-A-A-T-AATTT--ATGTAATGCCCACAGTATAT--T------GATG-GGA---GC--A---T-T---AA--------T-T----T--A-----------A-TTG--------A-G-G---CAAT--AATTAACTT------G--AAC-TG-TG-------CA--T---TAAAATTATTtgttttcaactgaacttaatgc
gi|29 : gagcaataattccaccacattaatgagtacgccatatgaattcatgagagcCCGT-----A-T-------GCA-A---A-GG-CA-T--TGT--ACATA-A--------------------------CCTC--AAT-C-----A-A--A-CTAA-A-GAG--AT-AA--TTA-----AAT-CATTC-A-TACTGA-GCTTGA--AA---TTG---AA-T-A-TT---TC--GAGC------AA-T-----A--GT--TCC-ACCA--C------------ATT-AC--C---GCGCGC-ATC-A---ATGTGAA--TT-A
gi|29 : -G----C----AT---TAA-TTCA--AA---------G--G-----A---A--G-AGG---A----C-G-T-T-AATTC--AC----------------AT--T------GATG-CGC---GC--G---G-T---AA--------TGTGGTGG--AAC--T------A-TTG--------C-TCG---AAAT---A-----TT------C--AAT-TT-CAAGCTCAGTA-------TGAATGATTTAacgtcctcttcctttgaattaatgcatg
gi|3 : ccgtatgcaaaggcattgtacataacctcaatcaaactaaagagataatATTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AG-CG-T--TGT--AAATA-A---------------------------------AT-------G-A--A----------G--AT-CA--TCA-----AAT-CATTT-A-TTCCAA-GCTCCA--AA---TGC---AA-T-T-CT---GC--GGGC------AA-C-----A--TT--TCC-ACAA--C------------ATAGAT------ACGCGC-ATC-A---T--GGAA--TT--G--A-T-CA-GAGCA-AT---------A-ATTGAA--AT-------AA--T-G----CG-CGC-GTA-AA---ATC-----AAAT-------TT-----ATTG-TTTGC------AT---TGATC-AA---T--TG--------AACTAGT------GC--GC--GCAT-------G-----G--AATACTTT----C-----T---TG-----TTT-----T--C----A--TCA-----A-TTGACTAGAT--G-CG--CA-----TCA-AATCAATC-CT--TGCTCTC----------TT-CAA------TTAAAT---T-A-----T-----T----A-A-----TTTAT----------AG-ATT-----A--------ATT--AGTGGGA----GCAATA-TT-T---------G--ATTTAA------T-G-CGT-G----T----AT---TAA-TCCA--GT---------T--A-----C---A--G-TGT---G----C-A-A-T-AATCA--G-----------------AT--T------GATG-atg
gi|30 : tgatatctttaattgaattcttgctctctttcaaaaagattgagacacgcatta--ATT--GA-----T-G-CAC-G----C----TT-------TTAA--A-------------------A---T--A-AGA---G----C-A-A-T-GACTG--A-----------------GT--T------TATG-TGT---GC--A---T-C---AA--------A-T----C--AAT--T------C-TTG--------C-TCT---CATC--AG-----TC------G--AAT-TG-atataatttcagataaataaaggtatcttcaattaatttggtt
gi|30 : c-AA--A-T-AA-GAGCA-AT---------G-ACTGAG--TT-------TA--T-G----TG-TGC-ATC-AA---ATC-----AA---------TT-----CTTG-CTCTC--ATC-AG---T--CG-AA---T--TG--------A-----T------GA--GT--GCGT-------C-----A--A-----TT----CA---AC---TG-----TGC-----G--C----A--AAA-----ACTTGAatgagtgcgtcaattcaactgtgcgcaaaaacttgattaaagtttgactccat
gi|31 : cattgatgcacgcttttaATTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AT-CG-T--TGT--AAATA-A----TTA-A--A--G----A---TATCT-----------------------AA-G-GA-----------AA-----GAT-CATTT-A-TACCA-----CCA--CA---TTA---A-------T---GC--GCGC------AT-C-----A--AT--Tttaaagtttgactccat
gi|31 : cattc-----------------AT--T------AATG-CGC---GC--A---T-C---AA--------T-T----G--AAT--C------A-gaatcacaggtatgaataacaggtctctgaattttaatcaa
gi|32 : cattcattccttatacaaaatcgttgtaaataattaaagatatctaaggaaagatcatttataccaccacATCCT----AT-C-----G-A--A-TTAA-A-GAT--AT-CA--TTA-----AAA-TATTT-A-TACCGA-GCATTA--AA---TAA---AA-T-T-TT---GC--GAAC------AA-T-----A--AT--TCA-ACTA--C------------ATTAAT------GCGAGT-ATT-A---AT-TAGA--TT-A---A-T-GA-GAGCcaggtatgaataacaggtctctgaattttaatcaa
gi|33 : tctttaaaaagaatgtttaATTCATT-----G-T-------ATA-A---A-AG-CG-T--TGT--AAAGA-A----TTT-A--A--G----A---TATC---------------------------A-GAG--AT-CA--TTA-----AAT-CATTT-A-TACCGA-GCACTA--AA---TTA---GA-T-T-TT---GC--GAGC------AA-T-----A--AT--TCC-ACCA--C------------ATTCAT--
gi|33 : cattg-ATTGAT--TT-------AA--T-G----CG-TGA-ATG-AA---TGTGGTGGAA---------TT-----ATTG-CTCGC--AAA-AT---C--TA-AT---T--TA--------G-----T------GC--TC--Gtcacgcattaaatcaat
gi|34 : cattgattcattgtataaaagcgttgtaaagaatttaagatatcagagatcattaaatcatttatac-A-GGG--GT-CA--TCA-----ACT-CATTT-A-TACCGA-GCTCCA--AA---TTA---AA-TAT-ATACAGC--GAGCTTATAGAA-T-----A--AT--TCC-ACCA--C------------ATTGAT------GCGCGC-ATC-C---A--TGAA--TT-A---A-T-GC-GCGCA-AT---------A-AT
gi|34 : ---TG-----CGC-----G--C----A--TCC-----A-T-GAATTAATGCG-CG--CA-------ATAATC-ATT-AC--TA---TC----------cattactatcatcagt
gi|35 : aggggtcatcaactcatttataccgagctccaaattaaatatatacagcgagcttatagaataattccaccacattgaA-AT-T---TC----G--ATT--GAATTTTT-G-CGC-G----T----AT---CAA-TTCA--ATGATCGTATTT--G-----A---A--G-AGA---G----C-A-G-C-AATTG--G-----------------AT--T------T-TG-TGC---GC--A---T-C----A--------T-T----G--Aatcagt
gi|35 : -CGC-ATT-GA---TTG-----AA---------TT-----GTTG-AT------AT-AG---CA-TC-AA---T---G--------A-----T------GC--GC--ACA--------A-----A--A-----TC----CAATTGC---TG-----CTC-----T--CTTCAA--ATACGATCA-TTGAATTGATACG-CG--CAAAAATTC--AATCGAtgctatatcaacaattcaatcaatgcggatcgacagtaat
gi|36 : aattATTCCTTTAAGTA-T-------ACA-A---A-AG-CG-T--TGT--AAATA-T----CTA-A--A--A----A---CATCTTC--GAT-T-----G-T--A-T-AA-A-GAG--AT-TA--TTA-----AGT-CATTT-A-Tgatcgacagtaat
gi|37 : catgattggagtcagttgctctatatatatatggtcgcatta-A----TTG-A--T--G----A---TATCTTC--AAA-T-----G-A--A-TT-A-A-GAG--AT-AA--CTATTCATAAT-TATTC-A-T--------TGCATTAA---CTG---AA-T-TATT---GA--TAGC------AA-T-----A--ATTATCT-GCTG--A------------ATTGAT--G---
gi|38 : aaaccattgggaattgtc--ATT--G------T-GGCGC-G----C----AT---TCA-TTCA--AC---------T--A-----A---C--GCAGG---G----C-A-AAT-AATTC--A-----------------CT--T------CATG-CAC---G---A---T-T---AA--------T-TC---C--ACT--T------G-ATG--------A-GTA---CAAC--AA------T------G--AAcgct
gi|39 : aattctagtatctaaaattgctatta-TACCGA-ACTCCA--AA---TTA---AACT-T-TT---GC--GATC------AA-A-----A--AT--TCC-AGCT--ATT----------ATTAAT--G---GAT-GC-ATC-A---G--TTAA-----AGTAA-T-GA-GAGCA-AT---------A-AATTA---TA-------AA--T-A----CG-CGC-TTC-AA---ATC-----AG---------CT-----Atcatt
gi|4 : TATTCCTT-----A-T-------ACG-A---A-AT-CG-T--GTT--AAATA-A----TTA-A--A--AGGACA---CATCTTC--AAC-T-----G-A--A-TCAA-AAGAA--AT-CA--TAA-----AAT-CATTT-A-TATCGA-TCTCCA--AA---TTG---AA-T-T-T----GC--GAGC------AA-T-----A--AT--TC--AGCA--A------------TTTGAT--G---GCA-AC-ATC-A---A--TATA--TTTAG--A-A-GA-GAGTA-AT---------A-CTTAAT--TT-------GAGAT-G----CAATGC-ATC-AT---TTC-----AA---------TT-----ATTG-TTCAC--TAT-AT---T--TC-AA---T--GG--------A-----T------GT--AT--ACAT-------C-----A--A-----TT----CAAATAT---TC-----CCC-----G--C----A--ACA-----A-TTCAATTGATGTG--GTTTA-----TCA-AATCATTT-AT--TG---TC----------CG-CAA------TGAAAA---A-A-----A----------A-A-----TTGATGCG--CGGGCAA-ATC-----A--------A-T--ACTG-GC----GCAATA-AT-TC--CA----G--ATT--G------T---CGCGG----C----AT---CAA-TTCA--CT---------T--G-----A---T--G-AGGTATG----C-A-A-T-AATTG--A-----------------CT--T------GATG-AGC---AC--A---T-C---AA--------T-T----G--AGT--T------ATTTC--------A-GCAC--CAAT--AA-----TT------G---AC-TG-CAA------TA--T---TTGAcc
gi|40 : tgaagtgcagtTTCCTT-----A-T-------AGA-A---A-GG-TG-T--TGT--AAATA-A----TTA-A--A--G----A---TATCTT---AAT-T-----G-A--A-TTAA---GAG--ATACG--T-A-----AAT-CATTT-A-TATCGA-GCGTTA--AA---TTA---AT-T-T-TT---GC--GAGC------AA-T-----AATAT--TCC-A
gi|41 : -----A--------ATT--ATGGCGC----GCATT---T-T---CA----A--A-------------G-AGA-G----C----AT---GAA-TTCA--AT---------T--G-----
gi|41 : aATTCCCA-----A-T-------AGA-A---A-AG-CA-A--TGT--AAATA-A----TCA-------G----A---CATCTTC--AAT-T-----G-A--A-TCAA-A-GAG--AT-CA--TTA-----AAT-CATTcccaatagaaaagcaatgtaaataatcagacatcttcaattgaatcaaagagatcattaaatcatt
gi|42 : acaattgaattcatgctctctttgaaaatgcgcgccata-G----C----AT---TAA-TTCA--CT---------T--G-----A---T--G-ATA---G----C-A-A-T-AGTTG--A-----------------TT--T------GATG-CCC---GT--A---T-C---AA--------T-TCAAGG--AAT--T------A-TTG--------C-TCG---CAAT--AT-----TTCTTTCAA--AAC-T--CGA------TA-------TAAATAAT-----TGTATG
gi|42 : t-GC-ATT-A---A--TTCA--CT-TG--A-T-GA-TAGCA-AT---------A-GTTGAT--TT-------GA--T-G----CC-CGT-ATC-AA---TTCAAGG-AA---------TT-----ATTG-CTCGC--AAT-AT---T--TC-
gi|43 : tcatacaattatttatatcgagttttgaaaC-----A--------ATT--ATTGCGC----GCATTA-AT-T----A----A--ATG--GA-----T-G-CGC-G----CT---ATGTACAA-CTCA--AT---------T--G-----AATTA--C-AGC---G----C-A-A-C-AATTC--A-----------------ATGAT------CATG-CAC---ATTAA---T-T---AA--------T-T----G--AAT--T------A-TT
gi|44 : A-AT-T----A----G--ATT--G------T-A-ACT-G----A----AT---CAG-TTCG--AT---------T--G-----A---A--G-AGA---G----C-A-G-T-AATTG--A-----------------AT--T------ATTG-CGC---GC--ATTTT-C---AA--------T-T----GCCAAC--TTCAAGAA-TTC--------A-GCA----AAC--AA-----TT------A--AA
gi|45 : -T---CA----GGAATTA-G------T-G-TGC-G----C----AT---CAA-TTCT--TT---------TAAA-----A---A--G-AGA---G----G-A-A-T-AAATC--A-----------------AT--T------
gi|46 : ttcaacatatccacaactgaatcggtgatctttta--AT---------T--G-----A---A--G-AGC---A----C-A-T-T-AATTC--A-----------------AT--TTTTATTAATG-AGC---AC--A---T-C---AA--------T-T----C--TAT--T------A-TAC--------T-GCG---CAAT--GA-----TT------G--AAA-TGATGA------TA--T---CTtacaaa
gi|47 : tttgaA-AT-TG--CA-------ATT--GAAGA--T-G-CGC-G----C----AT---CAA-CTGA--AT---------T--G-----A---T--A-AGA---G----T-ATT-T-AACTG--A-----------------A---T------AATG-CGC---GT--A---T-gcat
gi|48 : tcttcagatcaccaTCCTT-----G-C-------TCT-A---A-AG-CA-T--TGT--AAATA-A----TTA-A--A--G----A---TATCCTC--AGT-T-----C-A--G-TTAT-T-GAG--AT-C---------------------A-TACCGA-GCTCCA--AA---TGC---AA-C-T-TT---GC--attatgtatt
gi|49 : gC-G----C----AT---CAA-TTAA--AT---------T--G-----A---T--A-TGA---A------A-A-T-AATTG--A-----------------TT--T------GATGTCGT---TC--A---T-C---AA--------T-T----A--AAA--T------C-TTGC-------ACGCA---CAAT--AG-----TT------G--Aag
gi|5 : aTATTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AA-CG-TAATTT--TAATG-A----TTA-A-----G----A---TTCCTTC--GAT-T-----A-A--A-TCAG-A-TAG--AT-CA--TGA-----AAT-CATTT-A-TACCGA-GCTCAA--AA---CGC---AA-T-T-TT---GC--GAGC------AA-T-----A--AT--TCC-ATCACCACGGGTCCATCACATTGAT------GCGCGT-ATT-G---A--TCAA--TG-AA--ATT-GA-GAGCATAT---------ATAT--AT--ATAGAGAGGGA--T-GAATATG-AAC-ATC-AG---ATC-----AA---------TT-----TTTG-CTCTC--ATC-AT---T--GG-AA---C--TA--------G-----T------GC--GC--A-A--------------A--A-----TTTTACCTGAT-T---TA-----CGCATTTAG--C----A--ATA-----A-TTGATTTGATGCG-CG--T----------AATTGA-T-AT--T-------------------CAA------ATAAAA---A-A-----A-----G----A-G-----TTTATta
gi|50 : attgatgcgcacatat-CG-T--TGT--AAATA-A----ATT-A--A--G----A---TAACTTC--AGT---------A--A-T----------------------------T-TATTT-A-AATCAA-GCTCCA--GT---TTA---GA-T-T-CA---GC--GAGC------AAGT-----A--AT--TCC-aaatgttaatt
gi|52 : ---CA----T--ATT--GA-----T-G-CAC-A----C----GT---CCA-TTGA--AT---------T--G-----A---TTAA-AGA---G----C-A-A-T-AACTG--A-----------------AT--T------GATG-CAA---GC--A---
gi|55 : taaATTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AG-CT-T--TG
gi|56 : gctctctttagaaagaactaatgcgcatcgcta-----AAT-CATTT-A-TAC-GA-GCATTA--GG---TCA---GA-T-T-TT---GC--ATGC------AA-T-----A--AT--TTC-ACg
gi|57 : ttTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AT-CT-T--TGT--AAATA-A----TTA-A--A--G----A---T
gi|6 : ttcattgtaATTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-A--TG-T--TGTGTAAATA-A----CTA-A--AAAG----A---TATCTTC--CATAG-----G-A--A-TTAA-A-G-T--AT-CA--TTA-----AAT--ATTT-ATTACCAAGGCCTTA--AA---TTA---AATT-T-TT---GT--GAGC------AA-TAATTGA--AT--TCC-A--A--A------------ATTAAT------ATG----ATC-ATGCA--TAAA--TC-AA--A-TCTA-ATGCA-GA---------A-A--GA---CT-------AA--T-------------AT--AA---TTG-----AA---------AT-----AATG-C---C--CAC-AT---T--T--AA------TG--------A----------------------AT-------C-----T--A-----TT----CAAA-AC---T------CTC-----G-------G--TCA-----A-TTGAATTCATGTGACA--CA-----TTA-AA-AGATT-AT--TG---TC----------
gi|7 : tttttaattcaacagttattccacaatttgaattaaattaaatgttctctttcaattgaattattgctgtcttttaatgaatta-AG--A-A-GG-GAGCA-AT---------A-ATTGAT--TT-------TA--T-G----CG-C----TC-AATCCTTC-----AATGAAGCGATTT-----AATG-CTTTC--AGG-AA---T--TC-AA---T--TG--------T-----T------TC--TC--TCG--------C-----A--A------------AACTAC---AG-----TTCG----G--T----AG-ACA--------TAATTTGATGAT-CT--CT-----TCA-ATTCAATTGATGATG---TCTTTAAACATTCG-CAAACTTTTTG--TA---A-A-----A-----G----ATA-----TTAATGCA--TGCACAC-CTC-----A--------TTT--TTT------------TA-A-------A----G--A----------------GA-G----C----AA---CAA-TTCA--GT---------T--A-----A---A--G-GTA---T----C-A-T-T-AATTAGTA-----------------GT--T------GATt
gi|7 : attcaacatCTT-----T-T-------ACA-A---A-AA-GT-T--TGC--GAATG-T----TTA-A--A--G----A---CATCATC--AAT-T-----G-A--A-TTGA-A-GAG--AT-CA--TCA-----AAT-TATGT-C-TACCGA-ACT------G---T-----AG-T-T-TT---GCGAGAGA------AA-C-----A--AT--T------G--A------------ATTCCT--G---AAA-GC-ATTAA---A--TCGC--TT-CA--T-T-GA-AGG----------------ATTGA------------------------G-CGC-ATA-AA---ATC-----AA---------TT-----ATTG-CTCCC--T----T---C--TT-AGGATT--TA--------A-----T------GT--GC--GCATATACATGT-----A--A-----TC----CATA-AT---TA-----CTT-----T--C----C--ACA-----A-TTGCAGTGCAGTG-CA--CA-----taggatttaatgtgcgcatatacatgtaatccataattactttccacaattgcagtgcagtgcacaatgcaat
gi|8 : attcaacatatcaactactaattaatgatacctttaactgaattgttgctctctttaaaaaaatgaggtgtgcatgcattaatatTT-----A-T-------ATACA---A-AT-CG-T--TGT--TAATG-A----TTT-A--A--G----A---TATCT-C--AGT-T-----G-A--A-TCAA-A-GAG--AT-CA--TAG-----AAT-AATTT-G-CGTCAA-GCTCTA--AA---GTA---AA-T-T-CT---A---GATC------AA-T-----G--GT--TCC-ATCA--A------------AATG-T--T---GCG-GCTATC-A---G--TG------------------GAGTT-AT---------A-A--GA---TT-------GA--T-G----CG-CCA-ATC-AA---ATC-----AA---------TT-----A-TG-TTC-C--CA----------TC-AA---C--TGA-------A-----TTACACAGC--GC--GCAT-------C-----ATGA-----TT-----AATTAT---TGATTTACTC-----G------------------A-TTGAATatgcaat
gi|8 : ctttaatagaactgctactctttaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaattTA-AT-T---CA----A--GTT---------T-G-CAT-T----C-----T---CA--TTCA--AT---------C--G-----A---G--T-AAA---T----C-A-A-T-AATT---A-----------------ATCAT------GATG-CGC---GCT-G---TGT---AA--------T-T----C--AGT--T------G-ATG--------G-GAA---C-AT--AA-----TT------G--Agagaatgcaaacttgaattaaacgatatcctcaaataatg
gi|9 : ctttaatagaactgctactctttaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaattttatatacaaatcgttgttaatgatttaagatatctcagttgaatcaaagagatcatagaataatttgcgtcaagctctaaagtaaattctagatcaatggttccatcaaaatgttgcggctatcagtggagttataagattgatgcgccaatcaaaT-AA--A-T-GC-GGGCA-AT---------A-ATAGAA--TT-------AT--T-G----CT-CTC-TTC-AA---TTT-----GA---------TT-----ATTGATTAAA--GAT-AT---T--TCTAA---TAATG--------A-----T-------T--TC--G----------------A--A-----TT----GAATTTT---TG-----CTT-----T--CTTT-A--A-A-----A---GAATTGGTGCG-AG--CG-----TTA-ATTC--T---T--TA---TA----------CA-TGA------TTAAAA---ATATCTTCA-----GTTGAA-A-----TCGA-GCAATCATG-AA-ATC-----ATTTGTACCATT---TTGCGA----GCAGTA-ATCC---CAACACA--ATA--A------T-G-CAT-G----C----AT---C-A-TTAA--AA---------T--G-----A---T--G-AGA---A----C-A-A-T-GGTTG--A-----------------AT--T------AAAG---------------T-C---AA--------T-T--------AT--T------G-TTaacgatatcctcaaataatg
gi|9 : ttggtttaa-T--TAT--ACATG-A----TTA-A--A--A----A---TATCTTC--AGT-T-----G-A--AATCGA---GCA--AT-CA--TGA-----AAT-CATTT-G-TACC-----------------------A-T-T-TT---GC--GAGC------AG-T-----A--AT--CCC-AACA--C------------AATAAT--G---CAT-GC-ATC-A---T--TAAA--AT--G--A-T-GA-GAACA-AT---------G-GTTGAA--TT-------A---------------------AA---GTC-----AA---------TT-----ATTG-TTC---------T---TA-TC-AA---T--TG--------AG----T------AC--GC--cttatcaattgagtacgc
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|51 ): AGTGCTAGCGATATATTCAATTCCACACATCCACAACTGAATTAATGATCTCTTCAATCATCAA
Unaligned ( gi|53 ): ATGATCTCTTTAACGTTGAATTGTTAATCTCTTTAAGAAAAATGGATGCGTGCATTGATTC
Unaligned ( gi|54 ): TGTATTCATTGAATTATCGATGACATTAATTATCATGCTTAATTGATACGCGCTAA
Unaligned ( gi|58 ): AACGTATCCTCAAATAATGAAAGAATCTTCGTTATATAATT
Unaligned ( gi|59 ): TATCCAGAACTGAATTAATTATCTTTTTAATT
Unaligned ( gi|60 ): AGTATTCAAATAATGAGACCAAGAAATGATT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111 33333333333333 222222222222222222222222222 11111111111111 33333333333333333 111111111111111111111 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 11111111111111 11111111 22222222222222222222222222 11111111111111111111111111 111111111111111111111 1111111 11111
lowQualScore : 33333 1 4444444 1 222 1 44 1 33 22 1 2222 1 7777777777 222 11 5555555 1 11 1 6 1 1 11 2 11 3 33333 33 1 1 1 11 222 44444 2 1 1 444 33 333333 2 33333 11 11 1 3 888888888888888 0 22222222222222 3 3 222222222222222222222222222 3 666666666 3 666666666 88888888888888 44 444444 1 3 44444 22 222 22 1 33 33333 1 22 66 33333333333333333 3 1 000000000000000000000 22 22 333 555 55555 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 444 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1 4 77777777777777 0 77777777 77777 2 4 77777 4 2 88888888888888888888888888 11 3333 4444 333 1 11 555555555 11 44444 11111111111111111111111111 1 1 1 1 444444444444444444444 77 555555 1 1 222 33 222 33 444 1 1 1111111 555555555555 333 5555555555 88888888888888888 44444 555555 22 4444 2 9999 999999 22222 1 1 2
lowQualScore : ..... . ....... . ... . .. . .. .. . .... . .......... ... .. ....... . .. . . . . .. . .. . ..... .. . . . .. ... ..... . . . ... .. ...... . ..... .. .. . . ............... . .............. . . ........................... . ......... . ......... .............. .. ...... . . ..... .. ... .. . .. ..... . .. .. ................. . . ..................... .. .. ... ... ..... ......................................................... ... ........................................................... . . .............. . ........ ..... . . ..... . . .......................... .. .... .... ... . .. ......... .. ..... .......................... . . . . ..................... .. ...... . . ... .. ... .. ... . . ....... ............ ... .......... ................. ..... ...... .. .... . .... ...... ..... . . .
lowQualScore : 77777 5 8888888 5 666 5 55 4 88 00 4 9999 4 9999999999 444 99 4444444 4 99 4 1 3 3 88 6 88 2 11111 11 3 2 3 88 333 22222 6 3 3 888 00 777777 6 22222 88 88 3 5 444444444444444 4 33333333333333 2 1 777777777777777777777777777 1 222222222 2 000000000 99999999999999 00 222222 6 2 00000 22 888 22 6 55 88888 6 44 66 55555555555555555 7 7 666666666666666666666 66 66 555 555 00000 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 222 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 9 0 77777777777777 2 66666666 11111 9 2 11111 8 0 55555555555555555555555555 66 0000 5555 999 3 88 000000000 77 44444 00000000000000000000000000 3 3 3 3 666666666666666666666 11 000000 4 5 666 55 666 77 444 6 6 2222222 555555555555 000 3333333333 66666666666666666 55555 555555 66 0000 7 7777 666666 66666 0 7 5
consensus : TATTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AG-CG-T--TGT--AAATA-A----TTA-A--A--G----A---TATCTTC--AAT-T-----G-A--A-TCAA-A-GAG--AT-CA--TNA-----AAT-CATTT-AT-ACCGAG-CTCCA--AA---TTA---AA-T-T-TT---GC--GAGC------AA-T-----A--AT--TCC-ACCA--A------------ATTGAT--G---GCG-----GC-ATC-AA--TG-A-A--TT-AG--A-T---G-A-GAGCA-AT---------A-ATTG------A-T--TT-------GA--T-G----CG-CGC-A-----TC-A---A--A-TCAA--TT-----A-TT--GC-TC---CCAT--AT---T--TCAA-TTG--------A-----T------GC--GC--GCA---T---C-----A----ATT------CAANTATTG-----CTC-G--C----A-------ACA-----A-TTGAATTGATG--CG-CGC--A-----TCA-AAT--CGATT-AT--TG---TC----------CGCAA------TGAAAAAA-A-----GA-A-----TTGATGCGCGCG--CAAATC-----AAT-TANT-----GCGCGCANTAATT---CAG--ATT--G------T---G-CGC-G----C----AT---CAA-TTCA--AT---------T--G-----A---N--G-A-------GA---G----C-A-A-T-AATTG--A-----------------AT--T------GATG-CG-C---GC--A---T--C---A-AT-T----G--AATT------AT----T---G--CGC-G---CAA---T--A----------A-----TT------G--A----AC-T--G-CGA------TA--T--TCGAATNATTTACGTGTATGCTT
Reference ( family-5 ) : TATTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AG-CG-T--TGT--AAATA-A----TTA-A--A--G----A---TATCTTC--AAT-T-----G-A--A-TCAA-A-GAG--AT-CA--TNA-----AAT-CATTT-AT-ACCGAG-CTCCA--AA---TTA---AA-T-T-TT---GC--GAGC------AA-T-----A--AT--TCC-ACCA--A------------ATTGAT--G---GCG-----GC-ATC-AA--TN-A-A--TT-AG--A-T---G-A-GAGCA-AT---------A-ATTG------A-T--TT-------GA--T-G----CG-CGC-A-----TC-A---A--A-TCAA--TT-----A-TT--GC-TC---CNAT--AT---T--TCAA-TTG--------A-----T------GC--GC--GCA---T---C-----A----ATT------CAANTATTG-----CNC-G--C----A-------ACA-----A-TTGAATTGATG--CG-CGC--A-----TCA-AAT--CGATT-AT--TG---TC----------CGCAA------TGAAAAAA-A-----GA-A-----TTGATGCGCGCG--CAAATC-----AAT-TATT-----GCGCGCANTAATT---CAG--ATT--G------T---G-CGC-G----C----AT---CAA-TTCA--AT---------T--G-----A---N--G-A-------GA---G----C-A-A-T-AATTG--A-----------------AT--T------GATG-CG-C---GC--A---T--C---A-AT-T----G--AATT------AT----T---G--NGC-G---CAA---T--A----------A-----TT------G--A----AC-T--G-CGA------TA--T--TTGAATNATTTACGTGTATGCTT
gi|1 : -----AAT-TATT-----GCGCGCATAAATT---GAG---TT--A------T---G-CGC-G----CTACGAT---CGA---CA--AT---------C--G-----A---A--A-A-------GA---G----T-A-A-
gi|1 : aattgatgattctttaccaacattgaagA-TTCA--AT---------T--GG----A---A--G-A-------GAC--A----C-A-A-T-ATTTA--A-----------------AT--T------ATTG-CG-C---GC--A---T--A---A-AT-T----G--AGTT------A-----T---G--CGC-G---CTA---C--G----------A-----TC------G--A----taaatattgtgtctcttccaattgaataattcaatgtgcaaaataaataattcttttgagaaagcaactatctaattggagatagcttcattcaacatatccactattgaattaatatttctttaattagaactgctactcctttaaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaaatttcttatacaatcgttgttaatgatttaagatatctcagttgaatcaaagagatcatagaataatttgcgtcaagctctaaagtaaattctgagatcaatggttccatcaaaatgttgccgctcatcagtggagttataagattgatgcgcgcaatcaaatcaattattgttcccatcaactgaatctaacacgcgcgcatcatgataatattgatttactcgattgaagagaatgcaaactg
gi|1 : aattgatgattctttaccaacattgaagttactcttttcgattgG--ATC--G------TA--G-CGC-G----C----AT----AA-CTCA--AT---------T--T-----A---T--G-C-------GC---G----C-A-A-T-AATTT--A-----------------AA--T------ATTG-TGTC---TC--T---T--CC--A-AT-T----G--AATA------ATTCAAT---G--TGC-A---AAA---T--A----------A-----aattcaatgtgcaaaataaataattcttttgagaaagcaactatctaattggagatagcttcattcaacatatccactattgaattaatatttctttaattagaactgctactcctttaaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaaatttcttatacaatcgttgttaatgatttaagatatctcagttgaatcaaagagatcatagaataatttgcgtcaagctctaaagtaaattctgagatcaatggttccatcaaaatgttgccgctcatcagtggagttataagattgatgcgcgcaatcaaatcaattattgttcccatcaactgaatctaacacgcgcgcatcatgataatattgatttactcgattgaagagaatgcaaactg
gi|1 : aattgatgattctttaccaacattgaagttactcttttcgattgtcATTTCTT-----A-T-------ACA-A------T-CG-T--TGT--TAATG-A----TTT-A--A--G----A---TATCT-C--AGT-T-----G-A--A-TCAA-A-GAG--AT-CA--TAG-----AAT-AATTT-GC-GTCAAG-CTCTA--AA---GTA---AA-T-T-CT---GA--GATC------AA-T-----G--GT--TCC-ATCA--A------------AATGTT--G---CCGC----TC-ATC-AG--TG-----------------------GAGTT-AT---------A-A--G------A----TT-------GA--T-G----CG-CGCAA-----TC-A---A--A-TCAA--TT-----A-TT--GT-TC---CCA-----------TCAA-CTGAATCTAACA-----C------GC--GC--GCA---T---C-----ATG--AT---------AATATTG-----ataattcttttgagaaagcaactatctaattggagatagcttcattcaacatatccactattgaattaatatttctttaattagaactgctactcctttaaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaaatttcttatacaatcgttgttaatgatttaagatatctcagttgaatcaaagagatcatagaataatttgcgtcaagctctaaagtaaattctgagatcaatggttccatcaaaatgttgccgctcatcagtggagttataagattgatgcgcgcaatcaaatcaattattgttcccatcaactgaatctaacacgcgcgcatcatgataatattgatttactcgattgaagagaatgcaaactg
gi|1 : aattgatgattctttaccaacattgaagttactcttttcgattgtcgatcgtagcgcgcataactcaatttatgcgcgcaataatttaaatattgtgtctcttccaattgaataattcaatgtgcaaaataaataattcttttgagaaagcaactatctaattggagatagcttcattcaacatatccactattgaattaatatttctttaattagaactgctactcctttaaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaa-TTCA--AT---------C--G-----A---G--T-A-------AA---T----C-A-A-T-A-TT---------------------ATCAT------GATG-CG-C---GC--G---TGTT---AGAT-T----C--AGTT------GA----T---G--GGA-A---CAA---T--A----------A-----TT------G--ATTTGAT-T--G-CGatttactcgattgaagagaatgcaaactg
gi|10 : aattgatgattctttaccaacattgaagttactcttttcgattgtcgatcgtagcgcgcataactcaatttatgcgcgcaataatttaaatattgtgtctcttccaattgaataattcaatgtgcaaaataaataattcttttgagaaagcaactatctaattggagatagcttcattcaacatatccactattgaattaatatttctttaattagaactgctactcctttaaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaaatttcttatacaatcgttgttaatgatttaagatatctcagttgaatcaaagagatcatagaataatttgcgtcaagctctaaagtaaattctgagatcaatggttccatcaaaatgttgccgctcatcagtggagttataagattgatgcg-----GC-ATG-AAC-TA-A-A--TTGAG--A-------A-GACCA-AT---------A-ATTG------A-T--TG-------GA--T-G----CG-TGC-G-----CC-A---A--T-TGAA--TC-----G-GT--GC-GCGCTTCAT--AT---T----AA-TTA--------A-----T------GC--AT--ACA---T---CGTATAA----ATTATGATATAACTGCTATC---CTC-A--C----A-------GAA-----A-CTGAAATGATG--TG------A-----TCA-AAC--GGA---AT--TG---AC----------CA----------GAGCAAATATTTTTGA-T-----TTGATGCGTG-G--C--ATCAACGGAAT-TGAT-----AAGCGCATCAATT---TAT--ATT--A------T---GACAA-G----C----ATC--CAA-Tgagaatgcaaactg
gi|11 : ctttgctatccATTCTTT-----A-TTTTGAAAATA-A---G-AT-CA-T--TGA--AAATA-G----TGA-A--A--T----ACATTATCTTC--AGT-T-----G-G--A-ATAA-A-GAG--AT-CA--CTA-----AAT-AGTTT-AT-ACCGTG-CTCAA--AA---TGA---TA-T-T-TT---AC--GAGC------AACT-----A--AT--TCC-ATCG--C------------AT--AT--T---G--------------AA--TG-C-A--TT-AG--A-T---G-A-GA--A-A----------A-ATCA------C-T--CT-------AAC-T-G----CG-CGC-A-----TC-A---A--A-TC-------------TT--G-------------AA---T--TCAA-TGA--------A-----T------T-------------T---T-----A----ATT--------AGTATTG-----CCC-A--C----G-------AGA-----A-GTAAATTGATG--CG-C
gi|12 : acatgtgtacattaTATTTCCT-----ACT-------ACA-A---A-AGGCGGT--TGT--AA-TAGA----TTA-A--A--T----A---TACCTTCCAAAT-TTG---G-A--A-T-AA-A-GAG--AT-CA--TAC-----AATGTATTTGAT-ATCGAG-TTGAC--AG---T-----AA-T-A-GT---GC--GAGC------AA-T-----A--AT--TCCTGTTG--A------------ATTGAT--G---ACG-----GC-ATC-AAATCC-A-AC-TT-AT--C-T---G-C-TA-CATGC---------A-AGTG------A-A--TT-------AA--TGG----CG-CGC-A-----T--A---ATTA-TCAA--TT-----A-T
gi|13 : cttaactgaatgtgctcttcttaaaaggaaggatgcaagcggtTC-----AAT-TTAC-----GCACGCAATCATT---CCG--TTA--G------T---G-ATA-GAAGAT----AT---C---TTCA--AT---------T--C-----A---A--C-A-------TA---T----C-C-A-C-AATTG--A-----------------AT--T------AATG--------GT--A---T--CTTTC-AT-T----G--AATT------AT----T---G--CTCTG---TAAAACG--A----------A-----T----------A----AT-T--G-CGA-------A--C--ATGGATTCCTTAC
gi|14 : cgcgcatgcaataatcatcataatacacacattgatcttttctattgatatcaactacaaatgtatCTT-----A-T-------ACA-A---A-AG-CG-T--TGA--TAATA-G----TTTTA--A--T----A---TATCGTC--AAA-T-----G-A--A-TTAA-A-GAG--AT-CA--TCT-----AAC-CA--------CCGAG-CTCCA--AA---TTG---AA-T-------------------------------------------------------------ATTGAT--GC--GCG------C-GTC-AAC-TG-A-A--TT-T-----T---G-G-GAGCA-AT---------A-ACTT------A-A--TT-------GA--T-G----CG-CGC-A-----TC-A---A--A-TCAA--GT-----A-TTTCTC-TC---TGAC--ATCAGT--TGAA-TTA--------G-----T------GC--GT--GAA---T---C-----A----ATT------CAAaaaaaatacttgtaacgttttttaaaactcatc
gi|15 : tctttagctgaattgttgctttctttaaaagtgcgctTCTTT-----A-T-------ATA-A---A-AA-CG-T--TGT--AAATA-A----TTA--------------------TTT--AA--------G-A------AA-G-GAG-----TA---CA-----AAT-CATTT-AT-TCCAGG-CTCCA--AA---TTG---AA-T-T-TT----T--GAGA------AA-T-----A--AT--GCA-ACCA--C------------ATTGAT------GCGC----GC-ATC-AAG-TA-C-A--TT--G--A-T---C-A-CAG--------------A-ACTG------A-----T-------GA-------------AC-A------------------------T-----A-TT--GC-TC---TCGTCAAT---G--TGAA-TTA--------A-----T------GCATGCATGCA---T---C-----A----ATG------CTATTCTTT-----CGC-G--T----A-------ATG-----A-CCGAATTGATG--
gi|16 : ATTCCCT-----A-T-------ATA-A---ATAG-CG-T--TGA--AAA-A-A----TTA-AGCA--G--------TATCTTC--TTT-T-----T-ATTA-TAAA-A-GAATTATTCACTTTA-----AAT--ATTT-AT-ACCGAA-CATCA--AA---TTA---AA-T-T-TTA--AC--GAGC------AA-T-----A--AT--TCC-ACTC--ACACT--------ATTGATTAA---AC------AC-ATCAAA--TG-A-A-----GA--A-T---G-ATGAGGA-AT---------A-ATT-------A-TAATT-------AA--T-G----TG-CATGA-----TTAA---A--A-TGAA--TTTATTAA-TT--GT-TC----------T---T--TCAA-ATG--------atgtcttcaattg
gi|17 : atgtaAA--TT-----ACTT--TC-TT---C-----AC---T--TGAA-TTG--------T-----A------GC--GT--GCA---T---C-----A----ATT------CAA----TG-----CA--G--A----A-------ATA-----A-ATGAATC-AT---TG-CTC--T-----TCA-ACT--GAATT-AT--T-----------------GAAA------GGAAGAAA-A-----g
gi|17 : ctctgaagtaa--ATT--G------TA--G-CGT-G----C----AT---CAA-TTCA--A----------T--G-----C---A--G-A-------------------A-A-T-AAATG--A-----------------AT--C-------AT--TG-C---TC--T---T--C---A-AC-T----G--AATT------AT----T---G--AAA-G---GAA---G--A----------A----------------A----AC-A--G-CAA------Tcagcaattctttttggaaagagaacctaatatatttataatttgacatatcttcaacatacccacgtttgaattattgatctgtttgaattgttggtctctttaaaagaatt
gi|18 : ctctgaagtaaaattactttcttcacttgaATTCCTT-----G-C-------ACA-A---A--G-CG-T--AGT--AAAAA-ACCCTTTA-A--A-------A---TATCTTT--AGT-TTACCGGTA--A-TTGA-A-GAG--AT-CA--TAA-----A----------T-ACCGAG-CTGCA--AA---CGA---AA-T-T-TT---GC--GGGC------AA-------A--AT--TTT-ATCA--T------------ATTGAT--A---CAA-----GC-ATC-AA--TTGA-A--TT--G--A-T---C-A-GAGCA-AT---------AGACTA------A-T--T--------AA--T-G----CG-CAC-A-----TC-A---A--A-TCAA--CC-----A-TT--GT-TC---CCA-----------TCAA-CTG--------A-----tctttttggaaagagaacctaatatatttataatttgacatatcttcaacatacccacgtttgaattattgatctgtttgaattgttggtctctttaaaagaatt
gi|19 : taTTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AG-CA-T--TGT--AAATG-A----TTA-A--A--G----A---TATCTTC--AAT-T-----G-A--A-TTAA-A-TGG--AT-AA--TTA-----AAT-CATTT-AT-ACC-AC-CTGCA--AA---TTC---AA-T-C-CT---GC--A---------AA-T-----A--GT--TCC-A--A--A------------AT----------GCGT----GC-ATT-CA--T----A--TT-A--------------AGCA-AT---------ataatccgc
gi|2 : ctatttgaaatatagtttatataattagggatatcgttatgtgccctctttcaaagaatgaatgggtgcatccatTATTCCTT-----A-T-------ACG-A---A-AT-CG-T--TGT--AAATA-A----TTA-A--A--AGAC-A---CATCTTC--AAC-T-----G-A--A-TCAA-A-AGA--AT-CA--TAA-----AAT-CATTT-AT-ATCGAT-CTCCA--AA---TTG---AA-T-T-TT---GC--GAGC------AA-T-----A--AT--TCA-GCCA--A------------TTTGAT--G---GCA-----AC-ATC-AA--TA-T-A--TT-AG--A-A---G-A-GAGTA-AT---------A-CTTA------A-T--TT-------GA--T-G----CA-TGC-A-----TC-A---T--T-TCAA--TT-----A-TT--GT-TCA--CTAT--AT---T--TCAA-TGG--------A-----T------GT--AT--ACA---T---C-----A----ATT------CAAATATTC-----CCC-G--C----A-------ACA-----A-TTCAATTGATG--TG-TTT--A-----TCA-AAT--CATTT-AT--TG---TC----------CGCAA------TGAAAAAA-A-----AA-A-----TTGATGCGCGGG--CAAATC-----AAT-TACT-----GGGCGCAATAATT---CAG--ATT--G------T---G-CGC-G----C----AT---CAA-TTCA--CT---------T--G-----A---T--G-A-------GA---G----C-A-A-T-AATTG--A-----------------CT--T------GATG-AG-C---AC--A---T--C---A-AT-T----G--AGTT------AT----T---C--AGC-A---CAA---T--A----------A-----TT------G--A----AC-T--GCCAA------TA--T--TTGAATTATTTACGTGTATGCTT
gi|20 : CCTT-----C-T-------ACA-ATATA-AG-CG-A--TGT--AAATA-A----TCA-A--A--G----A---TATATTC--AAT-T-----G-A--A-TCAA-A-GAG--AT-CA--TCA-----AAC-CATTT-AT-ACCGAG-CTCCA--AA---TGC---AA-T-T-TT---GC--AAGC------AA-T-----A--AT--T------G--A------------ATTGAT--G---AGA-----GCAATG-AG--AG-A-G--TT-AG--A-T---T-A--ATCA-TTACTCTCTTGA-ATTG------A-A--TT-------CA--G-G----CG-CAC-A-----TA-A---A--A-T-AA--TT-----
gi|21 : ttatgcgcgcattgttgG--CAAA--------ATATATT-----GCGCGCAATATTT---GAA--A--------------------------------------A-TTCA--AT---------T--G-----A---C--A-A-------AG---G----C-A-A-T-AATC---A-----------------AT--TG-----GATT-CG-C---GC--A---T--C---A-AT-T----C--AATT------AT----T---G--CGC-A---CAA---T--ATGATGCACGCA-----TT------A--A----AA-T-----GA------TG--T--TCGAATAATt
gi|22 : cggtgtgaataagaagtatcagaaagctagaaagtattcaatctataacaaaatgcattattgatAAATC-----AGT-AACT-----GCTCTCCACAATTGAACAA--ATT---------------CGC-G----C----GT---CAA-ATCA--AA---------T--GGATCAA---T--G-A-------GA---A----C-A-A-T-AATTC--A-----------------AT--T------GATG-CG-C---GC--A---T--C---A-AA-T----C--AATT------AT----T---G--GGT-G---CAA---T--C----------A------T------G--A----ACAT--G-TAA------CATCT--TCAAATAATTatttttattttc
gi|23 : tttccatcgaagcaccaaataaaggttgaagttaacttggT---------T--G-----A---A--G-A-------GA---GAGCTC-T-A-T-AATTC--T-----------------AT--T------GCTG-CA-CCACGC--A---G--C---T-AT-T----G--AATT------GA----T---G--CGC-GCTACAA---TGCA----------G-----TT------GAAA----AC-A--G-CAA------TA--C--TTCAATGATATAaattggtgagcacaaat
gi|24 : aattgatgattgc--TT-----A-TT--GTGTG---TAAT--AA---C--TGAA-TTG--------A-----T------GT--GC--GCA---T---C-----G----AAT------CAATTCCTG-----CGCTGATC----A-------TCA-----T-TTCAATTGATG--CA-TGT--A-----T---------------T--TG---TC----------AG--A------TGAAAGAA-A-----GA-AGTAACTTGAAGCATAC------ATC-----AAT-TACT-----GTGTGCAGTAATT---T-G--ATTA-A------T---G-CAT-G----C----AT---CAA-ATCAGCAT---------T--G-----C---T----------------------CTA-G-TCAACTG--A-----------------AT--T------GATG-cacaatcaatatcattataatttgattgaatacgttcttttcgagagagcaactatataattagagagatatttttaactc
gi|25 : ATTCTTT-----A-T-------ACA-A---A--T-CG-T--TTT--AAATA-A----TTA-A--A--G----A---TATCTTC--GAT-T------------TT------AG--CT-TG--TAA-----AGT-------------GAG-CGACA--AA---TTGATTAA-T-T-TT---AC--TGGC------A--------A--AT--TCC-ACCA--A------------ATTTAT------GCGT----GC-ATC-AA--Tag
gi|26 : taattgaatatctctctggttgaattgaattgttgttctgtctaaaagatatagcgcttgcatta-GAG--AT-CA--TAG-----AAT-AATTT-GC-GTCAAG-CTCTA--AA---GTA---AA-T-T-CT---GA--GATC------AA-T-----G--GT--TCC-ATCA-----------------TAAT--GTT-GCGC----TC-ATC-AG--T----------------T---G---GAGTT-AT---------A-A--G------A----TT-------GA--T-G----CG-CGC-A-----TC-A---A--A-TCAA--TT-----A-TT--GT-TC---CCATC-AA---C--TGAA-TTA--------A-----C------GC--GC--GCA---T---C-----ATG--ATT-------AATTATTG-----tg
gi|26 : -TTCA--AT---------C--G-----A---G--T-A-------AA---T----C-A-A-T-AATT---A-----------------ATCAT------GATG-CG-C---GC--G---T--T---A-AT-T----C--AGTT------GA----T---G--GGA-A---CAA---T--A----------A-----TT------G--A----atttactcgattgaagagaat
gi|27 : gagatcatagaataatttgcgtcaagctctaaagtaaattctgagatcaatggttccatcataatgttgcgctcatcagttggagttataagattgatgcgcgcatcaaaTATTCCT------A-T-------ACA-A---A-AAACG-TAATTT--TAATG-A----TTA-ATGC--G----A---TTCCTTC--GAT-T-----A-A--A-TCAGCA-TAG--AT-CA--TGA-----A-T-CATTT-AT-ACCGAG-CTCTA--AAGACGCA---AATT-T-TT---GCT-GAGC------AA-T-----A--AT--TCC-ATCA--gagaat
gi|28 : attatgcgcacataat--GAGC------AA-T-----A--AT--TCC-ACCA--C------------ATTAAT--GAGTACG-----CC-AT---A--TG-A-A--TT--C--A-T---G-A-GAGCA-AT---------A-AT----------T--TT-------AA--T-G----CA-CAG-T-----TC-A---A--G-TTAA--TT-----A-TT--GC-CT---CAA--------T--TAAA-TTA--------A-----T------GC--TC--CCA---T---C-----A----AT----------ATACTG-----TGG-G--C----ATT-----ACA--------TAAATTATTG--Cccacgggttccactcacattgga
gi|28 : -G----C----AT---TAAGTTCA--GT---------T--G-----A---A--A-A-------CA---G----C-A-A-T-AATTT--ATGTAATGCCCACAGTATAT--T------GATG-GG-A---GC--A---T--T---A-AT-T----T--A---------AT----T---G--AG--G---CAA---T--A----------ATTAACTT------G--A----AC-T--G-TG-------CA--T--TAAAATTATTtgttttcaactgaacttaatgc
gi|29 : gagcaataattccaccacattaatgagtacgccatatgaattcatgagagcCCGT-----A-T-------GCA-A---A-GG-CA-T--TGT--ACATA-A--------------------------CCTC--AAT-C-----A-A--A-CTAA-A-GAG--AT-AA--TTA-----AAT-CATTC-AT-ACTGAG-CTTGA--AA---TTG---AA-T-A-TT---TC--GAGC------AA-T-----A--GT--TCC-ACCA--C------------ATT-AC--C---GCGC----GC-ATC-AATGTG-A-A--TT-A
gi|29 : -G----C----AT---TAA-TTCA--AA---------G--G-----A---A--G-A-------GG---A----C-G-T-T-AATTC--AC----------------AT--T------GATG-CG-C---GC--G---G--T---A-ATGTGGTGG--AACT------AT----T---G--CTC-G---AAA---T-------------A-----TT------C--A----AT-T--T-CAAGCTCAGTA------TGAATGATTTAacgtcctcttcctttgaattaatgcatg
gi|3 : ccgtatgcaaaggcattgtacataacctcaatcaaactaaagagataatATTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AG-CG-T--TGT--AAATA-A---------------------------------AT-------G-A--A----------G--AT-CA--TCA-----AAT-CATTT-AT-TCCAAG-CTCCA--AA---TGC---AA-T-T-CT---GC--GGGC------AA-C-----A--TT--TCC-ACAA--C------------ATAGAT------ACGC----GC-ATC-AT--GG-A-A--TT--G--A-T---C-A-GAGCA-AT---------A-ATTG------A-A--AT-------AA--T-G----CG-CGC-G-----TA-A---A--A-TCAAATTT-----A-TT--GT-T-----TGC--AT---TGATCAA-TTG--------AACTAGT------GC--GC--GCA---TG--G-----A----ATA------C-TTTCTTG-----TTT-T--C----A-------TCA-----A-TTGACTAGAT----G-CGC--A-----TCA-AAT--CAATC-CT--TGCTCTC----------TTCAA------TTAAATTA-T-----TA-A-----TTTAT----------AGATT-----AAT-TAGT-----GGGAGCAATATTT-----G--ATTTAA------T---G-CGT-G----T----AT---TAA-TCCA--GT---------T--A-----C---A--G-T-------GT---G----C-A-A-T-AATCA--G-----------------AT--T------GATG-atg
gi|30 : tgatatctttaattgaattcttgctctctttcaaaaagattgagacacgcatta--ATT--GA-----T---G-CAC-G----C----TT-------TTAA--A-------------------A---T--A-A-------GA---G----C-A-A-T-GACTG--A-----------------GT--T------TATG-TG-T---GC--A---T--C---A-AA-T----C--AATT------CT----T---G--CTC-T---CAT---C--A----------G-----TC------G--A----AT-T--G-atataatttcagataaataaaggtatcttcaattaatttggtt
gi|30 : c-AA--A-T---A-A-GAGCA-AT---------G-ACTG------A-G--TT-------TA--T-G----TG-TGC-A-----TC-A---A--A-TCAA--TT-----C-TT--GC-TC---TCATC-AG---T--CGAA-TTG--------A-----T------GA--GT--GCG---T---C-----A----ATT------CAAC---TG-----TGC-G--C----A-------AAA-----ACTTGAatgagtgcgtcaattcaactgtgcgcaaaaacttgattaaagtttgactccat
gi|31 : cattgatgcacgcttttaATTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AT-CG-T--TGT--AAATA-A----TTA-A--A--G----A---TATCT-----------------------AA-G-GA-----------AA-----GAT-CATTT-AT-ACCA-----CCA--CA---TTA---A-------T---GC--GCGC------AT-C-----A--AT--Tttaaagtttgactccat
gi|31 : cattc-----------------AT--T------AATG-CG-C---GC--A---T--C---A-AT-T----G--AATC------Agaatcacaggtatgaataacaggtctctgaattttaatcaa
gi|32 : cattcattccttatacaaaatcgttgtaaataattaaagatatctaaggaaagatcatttataccaccacATCCT----AT-C-----G-A--A-TTAA-A-GAT--AT-CA--TTA-----AAA-TATTT-AT-ACCGAG-CATTA--AA---TAA---AA-T-T-TT---GC--GAAC------AA-T-----A--AT--TCA-ACTA--C------------ATTAAT------GCGA----GT-ATT-AA--TT-AGA--TT-A---A-T---G-A-GAGCcaggtatgaataacaggtctctgaattttaatcaa
gi|33 : tctttaaaaagaatgtttaATTCATT-----G-T-------ATA-A---A-AG-CG-T--TGT--AAAGA-A----TTT-A--A--G----A---TATC---------------------------A-GAG--AT-CA--TTA-----AAT-CATTT-AT-ACCGAG-CACTA--AA---TTA---GA-T-T-TT---GC--GAGC------AA-T-----A--AT--TCC-ACCA--C------------ATTCAT--
gi|33 : cattgC-AC--TA-A-A--TT-AG--A-TTTTG-C-GAGCA-AT---------A-ATTCCACCACA-T--TC--------A--T-T----CA-CGC-A-----TT-A---A--A-TCAA--Ttcacgcattaaatcaat
gi|34 : cattgattcattgtataaaagcgttgtaaagaatttaagatatcagagatcattaaatcatttataccgag-A-GGG--GT-CA--TCA-----ACT-CATTT-AT-ACCGAG-CTCCA--AA---TTA---AA-TAT-ATACAGC--GAGCTTATAGAA-T-----A--AT--TCC-ACCA--C------------ATTGAT------GCGC----GC-ATC-CA--TG-A-A--TT-A---A-T---G-C-GCGCA-AT---------A-AT
gi|34 : TG-----CGC-G--C----A-------TCC-----A-T-GAATTAATG--CG-CGC--A-------ATAAT--C-ATT-AC--TA---TC----------cattactatcatcagt
gi|35 : aggggtcatcaactcatttataccgagctccaaattaaatatatacagcgagcttatagaataattccaccacattgaAATT---TCG--ATT--GAATTTTT---G-CGC-G----T----AT---CAA-TTCA--ATGATCGTATTT--G-----A---A--G-A-------GA---G----C-A-G-C-AATTG--G-----------------AT--T------T-TG-TG-C---GC--A---T--C-----AT-T----G--Aatcagt
gi|35 : -CGC-A-----TT-G---A--T-TGAA--TT-----G-TT--GA-T------AT--AG---CA-TCAA-T-G--------A-----T------GC--GC--ACA-------A-----A----ATC------CAATTGCTG-----CTC-T--CTTCAA-------ATACGATCA-TTGAATTGATA--CG-CGC--AAAAATTC--AAT--CGAtgctatatcaacaattcaatcaatgcggatcgacagtaat
gi|36 : aattATTCCTTTAAGTA-T-------ACA-A---A-AG-CG-T--TGT--AAATA-T----CTA-A--A--A----A---CATCTTC--GAT-T-----G-T--A-T-AA-A-GAG--AT-TA--TTA-----AGT-CATTT-AT-gatcgacagtaat
gi|37 : catgattggagtcagttgctctatatatatatggtcgcatta-A----TTG-A--T--G----A---TATCTTC--AAA-T-----G-A--A-TT-A-A-GAG--AT-AA--CTATTCATAAT-TATTC-AT---------TGCATTAA---CTG---AA-T-TATT---GA--TAGC------AA-T-----A--ATTATCT-GCTG--A------------ATTGAT--G---
gi|38 : aaaccattgggaattgtc--ATT--G------T---GGCGC-G----C----AT---TCA-TTCA--AC---------T--A-----A---C--GCA-------GG---G----C-A-AAT-AATTC--A-----------------CT--T------CATG-CA-C---G---A---T--T---A-AT-TC---C--ACTT------GA----T---G--AGT-A---CAA---C--A----------A------T------G--A----Acgct
gi|39 : aattctagtatctaaaattgctattaT-ACCGAA-CTCCA--AA---TTA---AACT-T-TT---GC--GATC------AA-A-----A--AT--TCC-AGCT--ATT----------ATTAAT--G---GAT-----GC-ATC-AG--TT-A-A-----AGTAA-T---G-A-GAGCA-AT---------A-AATT------A----TA-------AA--T-A----CG-CGC-T-----TC-A---A--A-TCAG--CT-----A-tcatt
gi|4 : TATTCCTT-----A-T-------ACG-A---A-AT-CG-T--GTT--AAATA-A----TTA-A--A--AGGACA---CATCTTC--AAC-T-----G-A--A-TCAA-AAGAA--AT-CA--TAA-----AAT-CATTT-AT-ATCGAT-CTCCA--AA---TTG---AA-T-T-T----GC--GAGC------AA-T-----A--AT--TC--AGCA--A------------TTTGAT--G---GCA-----AC-ATC-AA--TA-T-A--TTTAG--A-A---G-A-GAGTA-AT---------A-CTTA------A-T--TT-------GAGAT-G----CAATGC-A-----TC-A---T--T-TCAA--TT-----A-TT--GT-TCA--CTAT--AT---T--TCAA-TGG--------A-----T------GT--AT--ACA---T---C-----A----ATT------CAAATATTC-----CCC-G--C----A-------ACA-----A-TTCAATTGATG--TG--GTTTA-----TCA-AAT--CATTT-AT--TG---TC----------CGCAA------TGAAAAAA-A------A-A-----TTGATGCGCGGG--CAAATC-----AA--TACT-----G-GCGCAATAATTC--CAG--ATT--G------T-----CGCGG----C----AT---CAA-TTCA--CT---------T--G-----A---T--G-A-------GGTATG----C-A-A-T-AATTG--A-----------------CT--T------GATG-AG-C---AC--A---T--C---A-AT-T----G--AGTT------AT----TTCAG--CAC-----CAA---T--A----------A-----TT------G-------AC-T--G-CAA------TA--T--TTGAcc
gi|40 : tgaagtgcagtTTCCTT-----A-T-------AGA-A---A-GG-TG-T--TGT--AAATA-A----TTA-A--A--G----A---TATCTT---AAT-T-----G-A--A-TTAA---GAG--ATACG--T-A-----AAT-CATTT-AT-ATCGAG-CGTTA--AA---TTA---AT-T-T-TT---GC--GAGC------AA-T-----AATAT--TCC-A
gi|41 : -----AAT-TATG-----GCGCGCATT--TT---CAA--A---------------G-AGA-G----C----AT---GAA-TTCA--AT---------T--G-----
gi|41 : aATTCCCA-----A-T-------AGA-A---A-AG-CA-A--TGT--AAATA-A----TCA-------G----A---CATCTTC--AAT-T-----G-A--A-TCAA-A-GAG--AT-CA--TTA-----AAT-CATTcccaatagaaaagcaatgtaaataatcagacatcttcaattgaatcaaagagatcattaaatcatt
gi|42 : acaattgaattcatgctctctttgaaaatgcgcgccata-G----C----AT---TAA-TTCA--CT---------T--G-----A---T--G-A-------TA---G----C-A-A-T-AGTTG--A-----------------TT--T------GATG-CC-C---GT--A---T--C---A-AT-TCAAGG--AATT------AT----T---G--CTC-G---CAA---T--A----------T-----TTCTTTCAA--A----AC-T----CGA------TA------TAAATAAT-----TGTATG
gi|43 : tC-----AAT-TATT-----GCGCGCATTAATT----AA--ATG--GA-----T---G-CGC-G----CT---ATGTACAA-CTCA--AT---------T--G-----AATTA--C-A-------GC---G----C-A-A-C-AATTC--A-----------------ATGAT------CATG-CA-C---ATTAA---T--T---A-AT-T----G--AATT------AT----T---
gi|44 : AATT----AG--ATT--G------T---A-ACT-G----A----AT---CAG-TTCG--AT---------T--G-----A---A--G-A-------GA---G----C-A-G-T-AATTG--A-----------------AT--T------ATTG-CG-C---GC--ATTTT--C---A-AT-T----GCCAACTTCAAGAAT----T---C--AGC-A----AA---C--A----------A-----TT------A--A----A
gi|45 : T---CAGGAATTA-G------T---G-TGC-G----C----AT---CAA-TTCT--TT---------TAAA-----A---A--G-A-------GA---G----G-A-A-T-AAATC--A-----------------AT--T------
gi|46 : ttcaacatatccacaactgaatcggtgatctttta--AT---------T--G-----A---A--G-A-------GC---A----C-A-T-T-AATTC--A-----------------AT--TTTTATTAATG-AG-C---AC--A---T--C---A-AT-T----C--TATT------AT----A---C--TGC-G---CAA---T--G----------A-----TT------G--A----AA-T--GATGA------TA--T--CTtacaaa
gi|47 : tttgaAATTG--CA---ATT--GAAGA--T---G-CGC-G----C----AT---CAA-CTGA--AT---------T--G-----A---T--A-A-------GA---G----T-ATT-T-AACTG--A-----------------A---T------AATG-CG-C---GT--A---T--gcat
gi|48 : tcttcagatcaccaTCCTT-----G-C-------TCT-A---A-AG-CA-T--TGT--AAATA-A----TTA-A--A--G----A---TATCCTC--AGT-T-----C-A--G-TTAT-T-GAG--AT-C---------------------AT-ACCGAG-CTCCA--AA---TGC---AA-C-T-TT---GC--attatgtatt
gi|49 : gC-G----C----AT---CAA-TTAA--AT---------T--G-----A---T--A-T-------GA---A------A-A-T-AATTG--A-----------------TT--T------GATGTCG-T---TC--A---T--C---A-AT-T----A--AAAT------CT----T---GCACGC-A---CAA---T--A----------G-----TT------G--A----ag
gi|5 : aTATTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AA-CG-TAATTT--TAATG-A----TTA-A-----G----A---TTCCTTC--GAT-T-----A-A--A-TCAG-A-TAG--AT-CA--TGA-----AAT-CATTT-AT-ACCGAG-CTCAA--AA---CGC---AA-T-T-TT---GC--GAGC------AA-T-----A--AT--TCC-ATCACCACGGGTCCATCACATTGAT------GCGC----GT-ATT-GA--TC-A-A--TG-AA--ATT---G-A-GAGCATAT---------ATAT--------A-T--ATAGAGAGGGA--T-GAATATG-AAC-A-----TC-A---G--A-TCAA--TT-----T-TT--GC-TC---TCATC-AT---T--GGAA-CTA--------G-----T------GC--GC--AAAATTT---T-----ACCTGATT------TACGCATT-------TA-G--C----A-------ATA-----A-TTGATTTGATG--CG-CGT------------AAT--TGA-T-AT--T------------------CAA------ATAAAAAA-A-----GA-G-----TTTATta
gi|50 : attgatgcgcacatat-CG-T--TGT--AAATA-A----ATT-A--A--G----A---TAACTTC--AGT---------A--A-T----------------------------T-TATTT-AA-ATCAAG-CTCCA--GT---TTA---GA-T-T-CA---GC--GAGC------AAGT-----A--AT--TCC-aaatgttaatt
gi|52 : ---CAT--ATT--GA-----T---G-CAC-A----C----GT---CCA-TTGA--AT---------T--G-----A---TTAA-A-------GA---G----C-A-A-T-AACTG--A-----------------AT--T------GATG-CA-A---GC--A---
gi|55 : taaATTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AG-CT-T--TG
gi|56 : gctctctttagaaagaactaatgcgcatcgcta-----AAT-CATTT-AT-AC-GAG-CATTA--GG---TCA---GA-T-T-TT---GC--ATGC------AA-T-----A--AT--TTC-ACg
gi|57 : ttTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AT-CT-T--TGT--AAATA-A----TTA-A--A--G----A---T
gi|6 : ttcattgtaATTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-A--TG-T--TGTGTAAATA-A----CTA-A--AAAG----A---TATCTTC--CATAG-----G-A--A-TTAA-A-G-T--AT-CA--TTA-----AAT--ATTT-ATTACCAAGGCCTTA--AA---TTA---AA-T-T-TTT--GT--GAGC------AA-TAATTGA--AT--TCC-A--A--A------------ATTAAT------ATGATCATGC-ATA-AA--TC-A-AATCT-A---A-T---GCA-GA--A-A----------G-ACTA------A-T--AT-------AA--T-------------------TG-A---A--A-T-AA------------T--G---C---CCAC--AT---T--T-AA--TG--------A----------------------A---T---C-----T----ATT------CAAA-ACT------CTC-GGTC----A-------A---------TTGAATTCATG--TGACAC--A-----TTA-AA---AGATT-AT--TG---TC----------
gi|7 : tttttaattcaacagttattccacaatttgaattaaattaaatgttctctttcaattgaattattgctgtcttttaatgaatta-AG--A-A---G-G-GAGCA-AT---------A-ATTG------A-T--TT-------TA--T-G----CG-CTC-AATCCTTC-AATGA--A-GCGAT-TT-----A-AT--GCTTT---CAGG--AA---T--TCAA-TTG--------T-----T------TC--TC--TCG-------C-----A----A---------AACTACAG-----TTCGG--T----AG------ACA--------TAATTTGATG--AT-CTC--T-----TCA-ATT--CAATTGATGATG---TCTTTAAACATTCGCAAACTTTTTG--TAAA-A-----GATA-----TTAATGCATGCA--CACCTC-----ATT-TTTT-------------TAA------AG--A------------------GA-G----C----AA---CAA-TTCA--GT---------T--A-----A---A--G-G-------TA---T----C-A-T-T-AATTAGTA-----------------GT--T------GATt
gi|7 : attcaacatCTT-----T-T-------ACA-A---A-AA-GT-T--TGC--GAATG-T----TTA-A--A--G----A---CATCATC--AAT-T-----G-A--A-TTGA-A-GAG--AT-CA--TCA-----AAT-TATGT-CT-ACCGAA-CT------G---T-----AG-T-T-TT---GCGAGAGA------AA-C-----A--AT--T------G--A------------ATTCCT--G---AAA-----GC-ATTAAA--TC-G-C--TT-CA--T-T---G-A-AGG----------------ATTG------A-------------------------G-CGC-A-----TA-A---A--A-TCAA--TT-----A-TT--GC-TC---CCTT--CT---T--AGGATTTA--------A-----T------GT--GC--GCA---TATAC-----ATGT-AAT------CCATAATTA-----CTT-T--C----C-------ACA-----A-TTGCAGTGCAG--TG-CAC--A-----taggatttaatgtgcgcatatacatgtaatccataattactttccacaattgcagtgcagtgcacaatgcaat
gi|8 : attcaacatatcaactactaattaatgatacctttaactgaattgttgctctctttaaaaaaatgaggtgtgcatgcattaatatTT-----A-T-------ATACA---A-AT-CG-T--TGT--TAATG-A----TTT-A--A--G----A---TATCT-C--AGT-T-----G-A--A-TCAA-A-GAG--AT-CA--TAG-----AAT-AATTT-GC-GTCAAG-CTCTA--AA---GTA---AA-T-T-CT---A---GATC------AA-T-----G--GT--TCC-ATCA--A------------AATG-T--T---GCG-----GCTATC-AG--TG-----------------------GAGTT-AT---------A-A--G------A----TT-------GA--T-G----CG-CCA-A-----TC-A---A--A-TCAA--TT-----A--T--GT-TC---CCA-----------TCAA-CTGA-------A-----TTACACAGC--GC--GCA---T---C-----ATG--ATT-------AATTATTGATTTACTC-G-----------------------A-TTGAATatgcaat
gi|8 : ctttaatagaactgctactctttaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaattA-A-----GA-------TTGATGCGC-CAATCAAATC-----AAT-TA-T-----GTTCCCATCAACT---GA---ATT--A------CACAG-CGC-G----C----AT---CA-------------------T--G-----A---T----------------------------T-AATT---------------------AT--T------GATT-TA-C-----------T--C---G-AT-T----G--AATG------A---------G--AAT-G---CAA------A----------C-----TT------G--A----AT-TAAA-CGA------TA--TCCTCAAATAATgagaatgcaaacttgaattaaacgatatcctcaaataatg
gi|8 : ctttaatagaactgctactctttaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaattttatatacaaatcgttgttaatgatttaagatatctcagttgaatcaaagagatcatagaataatttgcgtcaagctctaaagtaaattctagatcaatggttccatcaaaatgttgcggctatcagtggagttatTAATT---CAA--GTT---------T---G-CAT-T----C-----T---CA--TTCA--AT---------C--G-----A---G--T-A-------AA---T----C-A-A-T-AATT---A-----------------ATCAT------GATG-CG-C---GCT-G---TG-T---A-AT-T----C--AGTT------GA----T---G--GGA-A---C-A---T--A----------A-----TT------G--A----g
gi|9 : ctttaatagaactgctactctttaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaattttatatacaaatcgttgttaatgatttaagatatctcagttgaatcaaagagatcatagaataatttgcgtcaagctctaaagtaaattctagatcaatggttccatcaaaatgttgcggctatcagtggagttataagattgatgcgccaatcaaa--TC-A-A--TT--G--A-T---A-A-GAACA-AT---------A-ATTG------ACT--TT-------AA--T-------------------------------TCAA--CC-----A-TT--GT-TC---TCATC-AT---T--TTAA--TG--------A-----T------GC--AT--GCA---T---T-----ATTGTGTTG-----GGATTACTG-----CTC-G--C----AAAATGGTACA-----A-ATGATTTCATGATTG-CTC--GATT--TCA-ACTGAAGA-T-AT--TT---TT----------AATCA------TG-TATAA-A-----GA-A-----TTAACGCTCGCA--C----C-----AAT-TCTTTTAAAGAAAGCAAAAATT---CA---ATT---------------CG--A----A----AT---C-A-TT----AT---------T--A-----G---A--A-ATATCTTTAA---T----C-A-A-T-AATCA--A-----------------AT--T------GAAG-AG-A---GC--A---A--T---A-AT-T----C--TATT------AT----T---G--CCC-G---CAT---T--T----------A-----TT------A--A----AC-aacgatatcctcaaataatg
gi|9 : ttg-T--TAT--ACATG-A----TTA-A--A--A----A---TATCTTC--AGT-T-----G-A--AATCGA---GCA--AT-CA--TGA-----AAT-CATTT-GT-ACC-----------------------A-T-T-TT---GC--GAGC------AG-T-----A--AT--CCC-AACA--C------------AATAAT--G---CAT-----GC-ATC-AT--TA-A-A--AT--G--A-T---G-A-GAACA-AT---------G-GTTG------A-------------------------------A-----TT-A---A--AGTCAA--TT-----A-TT--GT-TC---TTA-----------TCAA-TTG--------AG----T------AC--GC--gtacgc
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|51 ): AGTGCTAGCGATATATTCAATTCCACACATCCACAACTGAATTAATGATCTCTTCAATCATCAA
Unaligned ( gi|53 ): ATGATCTCTTTAACGTTGAATTGTTAATCTCTTTAAGAAAAATGGATGCGTGCATTGATTC
Unaligned ( gi|54 ): TGTATTCATTGAATTATCGATGACATTAATTATCATGCTTAATTGATACGCGCTAA
Unaligned ( gi|58 ): AACGTATCCTCAAATAATGAAAGAATCTTCGTTATATAATT
Unaligned ( gi|59 ): TATCCAGAACTGAATTAATTATCTTTTTAATT
Unaligned ( gi|60 ): AGTATTCAAATAATGAGACCAAGAAATGATT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111 33333333333333 11111111111111 11111111111111 3333333333333333333 111111111111111111111 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1111111 1111111111 222222222222222222222222 111111111111111111 111111111111111111111111
lowQualScore : 33333 1 4444444 1 222 1 44 1 33 22 1 2222 1 7777777777 222 11 5555555 1 11 1 6 1 1 11 2 11 3 33333 33 1 1 1 11 222 44444 2 1 1 444 33 333333 2 33333 11 11 5555555555 1 444 888888888888888 11111111111111 1 3 3 99999999999999 333 111 222 3 555555555 3 1 5555555 77777777777777 555555555 1 3 33333 22 222 3333 33 33333 1 2 2222222222222222222 2 1 000000000000000000000 22 22 333 555555555 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 2 666 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1 3 99999 4444444 3333333333 3 66666 2 3 55 44 777777777777777777777777 1 1 2222 4444 333 1 11 555555555 11 44444 7777777777777777777777777 1 1 1 555 1 33 555555 1 1 222 33 222 1 444 5555 999999 44444 333 22 77777777 333 111111111111111111 666666 33 44 777777777777777777777777 1 3 55
lowQualScore : ..... . ....... . ... . .. . .. .. . .... . .......... ... .. ....... . .. . . . . .. . .. . ..... .. . . . .. ... ..... . . . ... .. ...... . ..... .. .. .......... . ... ............... .............. . . . .............. ... ... ... . ......... . . ....... .............. ......... . . ..... .. ... .... .. ..... . . ................... . . ..................... .. .. ... ......... ............................................................ . ... .......................................................... . . ..... ....... .......... . ..... . . .. .. ........................ . . .... .... ... . .. ......... .. ..... ......................... . . . ... . .. ...... . . ... .. ... . ... .... ...... ..... ... .. ........ ... .................. ...... .. .. ........................ . . ..
lowQualScore : 77777 5 8888888 5 666 5 55 4 88 00 4 9999 4 9999999999 444 99 4444444 4 99 4 1 3 3 88 6 88 2 11111 11 3 2 3 88 333 22222 6 3 3 888 00 666666 5 11111 77 77 5555555555 3 999 444444444444444 77777777777777 6 2 1 55555555555555 999 888 555 0 999999999 1 5 4444444 33333333333333 333333333 5 1 88888 33 777 0000 55 88888 6 4 5555555555555555555 7 7 777777777777777777777 55 55 333 444444444 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 2 444 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 9 6 11111 0000000 0000000000 1 22222 5 4 44 22 999999999999999999999999 5 4 9999 3333 888 4 88 000000000 77 44444 9999999999999999999999999 2 2 3 999 2 44 000000 4 5 666 55 666 5 444 0000 000000 22222 222 66 22222222 777 111111111111111111 888888 22 55 888888888888888888888888 0 5 00
consensus : TATTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AG-CG-T--TGT--AAATA-A----TTA-A--A--G----A---TATCTTC--AAT-T-----G-A--A-TCAA-A-GAG--AT-CA--TNA-----AAT-CATTT-AT-ACCGAG-CTCCA--AA---TTA---AA-T-T-TT---GC--GAGC------AA-T-----A--AT--T----------CC-AC--CA--A------------ATTGAT--G---GCG-----G-C-ATC-AA---T-GA-ATT-AGAT---G-A-GAG---CA-AT---------A-ATTG------A-T--TT-------GA--T-G----CG-CGC-A-----TC-A---A--A-TCAA--TT-----A-TTGCTC---CC--A-T--AT---T-TCAA-TTG--------A-----T------GC--GC--GCA---T---C-----A----ATT------C-----AANTATTG-----CTC-G--C----A-------ACA-----A-TTGAATTGATG--CG-CGC--A-----TCAAAT--CGATT-AT--TG---TC----------CGCAA------TGAAAAAA-A-----GA-A-----TTGATGCGCGCG--CA---AA-TC-----AAT-TANTGC-GCGCAN-TAATT---CAG--ATT--G------T---G-CGC-G----C----AT---CAATT-CA--AT---------T--G-----A---N--GA-------GA---G----C-A-AT-AATTG--A-AT--T------GATG-CG-C---GC--A---T-C---AAT----T----G-AATTAT----T---G--C--------GCG---CAA----T--A----------ATT------G--AAC-T--G--CGA------TA--T--TCGAATGATTTACGTGTATGCTT
Reference ( family-5 ) : TATTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AG-CG-T--TGT--AAATA-A----TTA-A--A--G----A---TATCTTC--AAT-T-----G-A--A-TCAA-A-GAG--AT-CA--TNA-----AAT-CATTT-AT-ACCGAG-CTCCA--AA---TTA---AA-T-T-TT---GC--GAGC------AA-T-----A--AT--T----------CC-AC--CA--A------------ATTGAT--G---GCG-----G-C-ATC-AA---T-GA-ATT-AGAT---G-A-GAG---CA-AT---------A-ATTG------A-T--TT-------GA--T-G----CG-CGC-A-----TC-A---A--A-TCAA--TT-----A-TTGCTC---CC--A-T--AT---T-TCAA-TTG--------A-----T------GC--GC--GCA---T---C-----A----ATT------C-----AANTATTG-----CTC-G--C----A-------ACA-----A-TTGAATTGATG--CG-CGC--A-----TCAAAT--CGATT-AT--TG---TC----------CGCAA------TGAAAAAA-A-----GA-A-----TTGATGCGCGCG--CA---AA-TC-----AAT-TANTGC-GCGCAN-TAATT---CAG--ATT--G------T---G-CGC-G----C----AT---CAATT-CA--AT---------T--G-----A---N--GA-------GA---G----C-A-AT-AATTG--A-AT--T------GATG-CG-C---GC--A---T-C---AAT----T----G-AATTAT----T---G--C--------GCG---CAA----T--A----------ATT------G--AAC-T--G--CGA------TA--T--TCGAATNATTTACGTGTATGCTT
gi|1 : -----AAT-TATTGC-GCGCAT-AAATT---GAG---TT--A------T---G-CGC-G----CTACGAT---CGA---CA--AT---------C--G-----A---A--AA-------GA---G----T-A-A
gi|1 : aattgatgattctttaccaacattgaagATT-CA--AT---------T--GG----A---A--GA-------GAC--A----C-A-AT-ATTTA--A-AT--T------ATTG-CG-C---GC--A---T-A---AAT----T----G-AGTTA-----T---G--C--------GCG---CTA----C--G----------ATC------G--Ataaatattgtgtctcttccaattgaataattcaatgtgcaaaataaataattcttttgagaaagcaactatctaattggagatagcttcattcaacatatccactattgaattaatatttctttaattagaactgctactcctttaaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaaatttcttatacaatcgttgttaatgatttaagatatctcagttgaatcaaagagatcatagaataatttgcgtcaagctctaaagtaaattctgagatcaatggttccatcaaaatgttgccgctcatcagtggagttataagattgatgcgcgcaatcaaatcaattattgttcccatcaactgaatctaacacgcgcgcatcatgataatattgatttactcgattgaagagaatgcaaactg
gi|1 : aattgatgattctttaccaacattgaagttactcttttcgattgG--ATC--G------TA--G-CGC-G----C----AT----AACT-CA--AT---------T--T-----A---T--GC-------GC---G----C-A-AT-AATTT--A-AA--T------ATTG-TGTC---TC--T---T-CC--AAT----T----G-AATAATTCAAT---G--T--------GCA---AAA----T--A----------Aaattcaatgtgcaaaataaataattcttttgagaaagcaactatctaattggagatagcttcattcaacatatccactattgaattaatatttctttaattagaactgctactcctttaaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaaatttcttatacaatcgttgttaatgatttaagatatctcagttgaatcaaagagatcatagaataatttgcgtcaagctctaaagtaaattctgagatcaatggttccatcaaaatgttgccgctcatcagtggagttataagattgatgcgcgcaatcaaatcaattattgttcccatcaactgaatctaacacgcgcgcatcatgataatattgatttactcgattgaagagaatgcaaactg
gi|1 : aattgatgattctttaccaacattgaagttactcttttcgattgtcATTTCTT-----A-T-------ACA-A------T-CG-T--TGT--TAATG-A----TTT-A--A--G----A---TATCT-C--AGT-T-----G-A--A-TCAA-A-GAG--AT-CA--TAG-----AAT-AATTT-GC-GTCAAG-CTCTA--AA---GTA---AA-T-T-CT---GA--GATC------AA-T-----G--GT--T----------CC-AT--CA--A------------AATGTT--G---CCGC----T-C-ATC-AG---T-G-----------------GAG---TT-AT---------A-A--G------A----TT-------GA--T-G----CG-CGCAA-----TC-A---A--A-TCAA--TT-----A-TTGTTC---CC--A-----------TCAA-CTGAATCTAACA-----C------GC--GC--GCA---T---C-----ATG--AT--------------AATATTGATTTACTC-G-----------------------A-TTGAAataattcttttgagaaagcaactatctaattggagatagcttcattcaacatatccactattgaattaatatttctttaattagaactgctactcctttaaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaaatttcttatacaatcgttgttaatgatttaagatatctcagttgaatcaaagagatcatagaataatttgcgtcaagctctaaagtaaattctgagatcaatggttccatcaaaatgttgccgctcatcagtggagttataagattgatgcgcgcaatcaaatcaattattgttcccatcaactgaatctaacacgcgcgcatcatgataatattgatttactcgattgaagagaatgcaaactg
gi|10 : aattgatgattctttaccaacattgaagttactcttttcgattgtcgatcgtagcgcgcataactcaatttatgcgcgcaataatttaaatattgtgtctcttccaattgaataattcaatgtgcaaaataaataattcttttgagaaagcaactatctaattggagatagcttcattcaacatatccactattgaattaatatttctttaattagaactgctactcctttaaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaaA---T-GA-ACT-AAATT--G-A-GAAGACCA-AT---------A-ATTG------A-T--TG-------GA--T-G----CG-TGC-G-----CC-A---A--T-TGAA--TC-----G-GTGCGCGCTTC--A-T--AT---T---AA-TTA--------A-----T------GC--AT--ACA---T---CGTATAA----ATTATGATAT-----AACTGCTATC---CTC-A--C----A-------GAA-----A-CTGAAATGATG--TG------A-----TCAAAC--GGA---AT--TG---AC----------CA----------GAGCAAATATTTTTGA-T-----TTGATGCGTG-G--C-----A-TCAACGGAAT-TGATAA-GCGCAT-CAATT---TAT--ATT--A------T---GACAA-G----C----ATC--CAATgagaatgcaaactg
gi|11 : ctttgctatccgcATTCTTT-----A-TTTTGAAAATA-A---G-AT-CA-T--TGA--AAATA-G----TGA-A--A--T----ACATTATCTTC--AGT-T-----G-G--A-ATAA-A-GAG--AT-CA--CTA-----AAT-AGTTT-AT-ACCGTG-CTCAA--AA---TGA---TA-T-T-TT---AC--GAGC------AACT-----A--AT--T----------CC-AT--CG--C------------AT--AT--T---G---------------AA---T-GC-ATT-AGAT---G-A-GA-----A-A----------A-ATCA------C-T--CT-------AAC-T-G----CG-CGC-A-----TC-A---A--A-TC-------------TTG---------------AA---T-TCAA-TGA--------A-----T------T-------------T---T-----A----ATT-------------AGTATTG-----CCC-A--C----G-------AGA-----A-GTAAATTGATG--CG-C
gi|12 : acatgtgtacattaTATTTCCT-----ACT-------ACA-A---A-AGGCGGT--TGT--AA-TAGA----TTA-A--A--T----A---TACCTTCCAAAT-TTG---G-A--A-T-AA-A-GAG--AT-CA--TAC-----AATGTATTTGAT-ATCGAG-TTGAC--AG---T-----AA-T-A-GT---GC--GAGC------AA-T-----A--AT--T----------CCTGT--TG--A------------ATTGAT--G---ACG-----G-C-ATC-AAATCC-AA-CTT-ATCT---G-C-TA----CATGC---------A-AGTG------A-A--TT-------AA--TGG----CG-CGC-A-----T--A---ATTA-TCAA--TT-----A-T
gi|13 : cttaactgaatgtgctcttcttaaaaggaaggatgcaagcggt-TC-----AAT-TTACGC-ACGCAA-TCATT---CCG--TTA--G------T---G-ATA-GAAGAT----AT---C--TT-CA--AT---------T--C-----A---A--CA-------TA---T----C-C-AC-AATTG--A-AT--T------AATG--------GT--A---T-CTTTCAT----T----G-AATTAT----T---G--CTCTGTAAAACG----AA----T--A----------ATT------G--
gi|14 : cgcgcatgcaataatcatcataatacacacattgatcttttctattgatatcaactacaaatgtatCTT-----A-T-------ACA-A---A-AG-CG-T--TGA--TAATA-G----TTTTA--A--T----A---TATCGTC--AAA-T-----G-A--A-TTAA-A-GAG--AT-CA--TCT-----AAC-CA--------CCGAG-CTCCA--AA---TTG---AA-T-------------------------------------------------------------------------ATTGAT--GC--GCG-------C-GTC-AAC--T-GA-ATT-T--T---G-G-GAG---CA-AT---------A-ACTT------A-A--TT-------GA--T-G----CG-CGC-A-----TC-A---A--A-TCAA--GT-----A-TTTCTC---TCTGA-C--ATCAGT-TGAA-TTA--------G-----T------GC--GT--GAA---T---C-----A----ATT------C-----AAcgaacatggattccttacaaaaaatacttgtaacgttttttaaaactcatc
gi|15 : tctttagctgaattgttgctttctttaaaagtgcgctTCTTT-----A-T-------ATA-A---A-AA-CG-T--TGT--AAATA-A----TTA--------------------TTT--AA--------G-A------AA-G-GAG-----TA---CA-----AAT-CATTT-AT-TCCAGG-CTCCA--AA---TTG---AA-T-T-TT----T--GAGA------AA-T-----A--AT--G----------CA-AC--CA--C------------ATTGAT------GCGC----G-C-ATC-AAG--T-AC-ATT--GAT---C-A-CAG-----------------A-ACTG------A-----T-------GA-------------AC-A------------------------T-----A-TTGCTC---TC--G-TCAAT---G-TGAA-TTA--------A-----T------GCATGCATGCA---T---C-----A----ATG------C-----TATTCTTT-----CGC-G--T----A-------ATG-----A-CCGAATTGATG--
gi|16 : ATTCCCT-----A-T-------ATA-A---ATAG-CG-T--TGA--AAA-A-A----TTA-AGCA--G--------TATCTTC--TTT-T-----T-ATTA-TAAA-A-GAATTATTCACTTTA-----AAT--ATTT-AT-ACCGAA-CATCA--AA---TTA---AA-T-T-TTA--AC--GAGC------AA-T-----A--AT--T----------CC-AC--TC--ACACT--------ATTGATTAA---AC------A-C-ATCAAA---T-GA-A---GAAT---G-ATGAG---GA-AT---------A-ATT-------A-TAATT-------AA--T-G----TG-CATGA-----TTAA---A--A-TGAA--TTTATTAA-TTGTTC-------------T---T-TCAA-ATG--------atgtcttcaattg
gi|17 : atgtaAA--TT-----ACTTTCTT---C--------AC---T-TGAA-TTG--------T-----A------GC--GT--GCA---T---C-----A----ATT------C-----AA----TG-----C-A-G--A----A-------ATA-----A-ATGAATC-AT---TG-CTC--T-----TCAACT--GAATT-AT--T-----------------GAAA------GGAAGAAA-A-----g
gi|17 : ctctgaagtaa-TC-----ATT-TATTTC--TGCAT-TGA----------ATT--GA-----T---G-CAC-G----C----TA---CAATT-CA--AG---------T--G-----A---A--GA-------AA---G----T-A-AT-cagcaattctttttggaaagagaacctaatatatttataatttgacatatcttcaacatacccacgtttgaattattgatctgtttgaattgttggtctctttaaaagaatt
gi|17 : ctctgaagtaaa--ATT--G------TA--G-CGT-G----C----AT---CAATT-CA--A----------T--G-----C---A--GA-------------------A-AT-AAATG--A-AT--C-------AT--TG-C---TC--T---T-C---AAC----T----G-AATTAT----T---G--atcattgctcttcaactgaattattgaaaggaagaaaacagcaattctttttggaaagagaacctaatatatttataatttgacatatcttcaacatacccacgtttgaattattgatctgtttgaattgttggtctctttaaaagaatt
gi|18 : ctctgaagtaaaattactttcttcacttgaATTCCTT-----G-C-------ACA-A---A--G-CG-T--AGT--AAAAA-ACCCTTTA-A--A-------A---TATCTTT--AGT-TTACCGGTA--A-TTGA-A-GAG--AT-CA--TAA-----A----------T-ACCGAG-CTGCA--AA---CGA---AA-T-T-TT---GC--GGGC------AA-------A--AT--T----------TT-AT--CA--T------------ATTGAT--A---CAA-----G-C-ATC-AA---TTGA-ATT--GAT---C-A-GAG---CA-AT---------AGACTA------A-T--T--------AA--T-G----CG-CAC-A-----TC-A---A--A-TCAA--CC-----A-TTGTTC---CC--A-----------TCAA-CTG--------A-----aaaggaagaaaacagcaattctttttggaaagagaacctaatatatttataatttgacatatcttcaacatacccacgtttgaattattgatctgtttgaattgttggtctctttaaaagaatt
gi|19 : taTTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AG-CA-T--TGT--AAATG-A----TTA-A--A--G----A---TATCTTC--AAT-T-----G-A--A-TTAA-A-TGG--AT-AA--TTA-----AAT-CATTT-AT-ACC-AC-CTGCA--AA---TTC---AA-T-C-CT---GC--A---------AA-T-----A--GT--T----------CC-A----A--A------------AT----------GCGT----G-C-ATT-CA---T----ATT-A-----------AG---CA-AT---------ataatccgc
gi|2 : ctatttgaaatatagtttatataattagggatatcgttatgtgccctctttcaaagaatgaatgggtgcatccatTATTCCTT-----A-T-------ACG-A---A-AT-CG-T--TGT--AAATA-A----TTA-A--A--AGAC-A---CATCTTC--AAC-T-----G-A--A-TCAA-A-AGA--AT-CA--TAA-----AAT-CATTT-AT-ATCGAT-CTCCA--AA---TTG---AA-T-T-TT---GC--GAGC------AA-T-----A--AT--T----------CA-GC--CA--A------------TTTGAT--G---GCA-----A-C-ATC-AA---T-AT-ATT-AGAA---G-A-GAG---TA-AT---------A-CTTA------A-T--TT-------GA--T-G----CA-TGC-A-----TC-A---T--T-TCAA--TT-----A-TTGTTCA--CT--A-T--AT---T-TCAA-TGG--------A-----T------GT--AT--ACA---T---C-----A----ATT------C-----AAATATTC-----CCC-G--C----A-------ACA-----A-TTCAATTGATG--TG-TTT--A-----TCAAAT--CATTT-AT--TG---TC----------CGCAA------TGAAAAAA-A-----AA-A-----TTGATGCGCGGG--CA---AA-TC-----AAT-TACTGG-GCGCAA-TAATT---CAG--ATT--G------T---G-CGC-G----C----AT---CAATT-CA--CT---------T--G-----A---T--GA-------GA---G----C-A-AT-AATTG--A-CT--T------GATG-AG-C---AC--A---T-C---AAT----T----G-AGTTAT----T---C--A--------GCA---CAA----T--A----------ATT------G--AAC-T--GC-CAA------TA--T--TTGAATTATTTACGTGTATGCTT
gi|20 : CCTT-----C-T-------ACA-ATATA-AG-CG-A--TGT--AAATA-A----TCA-A--A--G----A---TATATTC--AAT-T-----G-A--A-TCAA-A-GAG--AT-CA--TCA-----AAC-CATTT-AT-ACCGAG-CTCCA--AA---TGC---AA-T-T-TT---GC--AAGC------AA-T-----A--AT--T------------------G--A------------ATTGAT--G---AGA-----G-CAATG-AG---A-GA-GTT-AGAT---T-A--AT---CA-TTACTCTCTTGA-ATTG------A-A--TT-------CA--G-G----CG-CAC-A-----TA-A---A--A-T-AA--TT-----
gi|21 : ttatgcgcgcattgttgG--CA---AA---------ATATATTGC-GCGCAA-TATTT---GAA--A--------------------------------------ATT-CA--AT---------T--G-----A---C--AA-------AG---G----C-A-AT-AATC---A-AT--TG-----GATT-CG-C---GC--A---T-C---AAT----T----C-AATTAT----T---G--C--------GCA---CAA----T--ATGATGCACGCATT------A--AAA-T------GA------TG--T--TCGAATAATt
gi|22 : cggtgtgaataagaagtatcagaaagctagaaagtattcaatctataacaaaatgcattattgatA---AA-TC-----AGT-AACTGC-TCTCCA-CAATTGAACAA--ATT---------------CGC-G----C----GT---CAAAT-CA--AA---------T--GGATCAA---T--GA-------GA---A----C-A-AT-AATTC--A-AT--T------GATG-CG-C---GC--A---T-C---AAA----T----C-AATTAT----T---G--G--------GTG---CAA----T--C----------A-T------G--AACAT--G--TAA------CATCT--TCAAATAATTatttttattttc
gi|23 : tttccatcgaagcaccaaataaaggttgaagttaacttggT---------T--G-----A---A--GA-------GA---GAGCTC-T-AT-AATTC--T-AT--T------GCTG-CA-CCACGC--A---G-C---TAT----T----G-AATTGA----T---G--C--------GCGCTACAA----TGCA----------GTT------GAAAAC-A--G--CAA------TA--C--TTCAATGATATAaattggtgagcacaaat
gi|24 : aattgatgattgc---G----T-A-AT-AACTG--A-AT--T------GATG-TG-C---GC--A---T-C---GAA----T----C-AATTCC----T---G--C--------GCcacaatcaatatcattataatttgattgaatacgttcttttcgagagagcaactatataattagagagatatttttaactc
gi|24 : ttattgtgtAA-TTG--------A-----T------GT--GC--GCA---T---C-----G----AAT------C-----AATTCCTG-----CGCTGATC----A-------TCA-----T-TTCAATTGATG--CA-TGT--A-----T--------------T--TG---TC----------AG--A------TGAAAGAA-A-----GA-AGTAACTTGAAGCATAC---------A-TC-----AAT-TACTGT-GTGCAG-TAATT---T-G--ATTA-A------T---G-CAT-G----C----AT---CAAAT-CAGCAT---------T--G-----C---T---------------------CTA-GTCAACTG--A-AT--T------GATG-tgatcatcatttcaattgatgcatgtatttgtcagatgaaagaaagaagtaacttgaagcatacatcaattactgtgtgcagtaatttgattaatgcatgcatcaaatcagcattgctctagtcaactgaattgatgag
gi|25 : ttattgtgtgtaataactgATTCTTT-----A-T-------ACA-A---A--T-CG-T--TTT--AAATA-A----TTA-A--A--G----A---TATCTTC--GAT-T------------TT------AG--CT-TG--TAA-----AGT-------------GAG-CGACA--AA---TTGATTAA-T-T-TT---AC--TGGC------A--------A--AT--T----------CC-AC--CA--A------------ATTTAT------GCGT----G-C-ATC-AA---T-ag
gi|26 : taattgaatatctctctggttgaattgaattgttgttctgtctaaaagatatagcgcttgcatta-GAG--AT-CA--TAG-----AAT-AATTT-GC-GTCAAG-CTCTA--AA---GTA---AA-T-T-CT---GA--GATC------AA-T-----G--GT--T----------CC-AT--CA-----------------TAAT--GTT-GCG-----CTC-ATC-AG---T-----------T---G---GAG---TT-AT---------A-A--G------A-T--T--------GA--T-G----CG-CGC-A-----TC-A---A--A-TCAA--TT-----A-TTGTTC---CC--A-TC-AA---C-TGAA-TTA--------A-----C------GC--GC--GCA---T---C-----ATG--ATT------------AATTATTGATTTACTC-G-----------------------A-TTGAAtg
gi|27 : TATTCCT------A-T-------ACA-A---A-AAACG-TAATTT--TAATG-A----TTA-ATGC--G----A---TTCCTTC--GAT-T-----A-A--A-TCAGCA-TAG--AT-CA--TGA-----A-T-CATTT-AT-ACCGAG-CTCTA--AAGACGCA---AATT-T-TT---GCT-GAGC------AA-T-----A--AT--T----------CC-AT--CA--gagaat
gi|28 : attatgcgcacataat--GAGC------AA-T-----A--AT--T----------CC-AC--CA--C------------ATTAAT--GAGTACG-----C-C-AT---A---T-GA-ATT--CAT---G-A-GAG---CA-AT---------A-AT----------T--TT-------AA--T-G----CA-CAG-T-----TC-A---A--G-TTAA--TT-----A-TTGCCT---CA--A---------T-TAAA-TTA--------A-----T------GC--TC--CCA---T---C-----A----ATccacgggttccactcacattgga
gi|28 : AGC------AA-T-----A--AT--TTATGTAATGCCC-ACAGTA--T------------ATTGAT--G---GGA-----G-C-ATT-AA---T-----TT-AATT---G-A-G-G---CA-AT---------A-ATTA------A-C--TT-------GA--A-C----TG-TGC-A-----TT-A---A------AA--TT-----A-TTGCTC---TC--A-TG-AA---T-TCAT-ATG--------G-----C------GT--AC--TCA---T---T-----A----ATG------TGGTGGAATTATTG-----CTC-atactgtgggcattacataaattattgctgttttcaactgaacttaatgc
gi|29 : CCGT-----A-T-------GCA-A---A-GG-CA-T--TGT--ACATA-A--------------------------CCTC--AAT-C-----A-A--A-CTAA-A-GAG--AT-AA--TTA-----AAT-CATTC-AT-ACTGAG-CTTGA--AA---TTG---AA-T-A-TT---TC--GAGC------AA-T-----A--GT--T----------CC-AC--CA--C------------ATT-AC--C---GCGC----G-C-ATC-AATG-T-GA-ATT-Agttttcaactgaacttaatgc
gi|29 : -G----C----AT---TAATT-CA--AA---------G--G-----A---A--GA-------GG---A----C-G-TT-AATTC--ACAT--T------GATG-CG-C---GC--G---G-T---AATG---TGGTGG-AACTAT----T---G--C--------TCG---AAA----T-------------ATT------C--AAT-T--T--CAAGCTCAGTA--T----GAATGATTTAacgtcctcttcctttgaattaatgcatg
gi|3 : ccgtatgcaaaggcattgtacataacctcaatcaaactaaagagataatATTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AG-CG-T--TGT--AAATA-A---------------------------------AT-------G-A--A----------G--AT-CA--TCA-----AAT-CATTT-AT-TCCAAG-CTCCA--AA---TGC---AA-T-T-CT---GC--GGGC------AA-C-----A--TT--T----------CC-AC--AA--C------------ATAGAT------ACGC----G-C-ATC-AT---G-GA-ATT--GAT---C-A-GAG---CA-AT---------A-ATTG------A-A--AT-------AA--T-G----CG-CGC-G-----TA-A---A--A-TCAAATTT-----A-TTGTTT---GC--A-T--TG---A-TCAA-TTG--------AACTAGT------GC--GC--GCA---TG--G-----A----ATA------C------TTTCTTG-----TTT-T--C----A-------TCA-----A-TTGACTAGAT----G-CGC--A-----TCAAAT--CAATC-CT--TGCTCTC----------TTCAA------TTAAATTA-T-----TA-A-----TTTAT----------A---GA-TT-----AAT-TAGTGG-GAGCAA-TATTT-----G--ATTTAA------T---G-CGT-G----T----AT---TAATC-CA--GT---------T--A-----C---A--GT-------GT---G----C-A-AT-AATCA--G-AT--T------GATG-atg
gi|30 : tgatatctttaattgaattcttgctctctttcaaaaagattgagacacgcatta--ATT--GA-----T---G-CAC-G----C----TT------TT-AA--A-------------------A---T--AA-------GA---G----C-A-AT-GACTG--A-GT--T------TATG-TG-T---GC--A---T-C---AAA----T----C-AATTCT----T---G--C--------TCT---CAT----C--A----------GTC------G--AAT-T--G--atataatttcagataaataaaggtatcttcaattaatttggtt
gi|30 : c-AAAT---A-A-GAG---CA-AT---------G-ACTG------A-G--TT-------TA--T-G----TG-TGC-A-----TC-A---A--A-TCAA--TT-----C-TTGCTC---TC--A-TC-AG---T-CGAA-TTG--------A-----T------GA--GT--GCG---T---C-----A----ATT------C-----AACTG-TG-------C-G--C----A-------AAA-----ACTTGAatgagtgcgtcaattcaactgtgcgcaaaaacttgattaaagtttgactccat
gi|31 : cattgatgcacgcttttaATTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AT-CG-T--TGT--AAATA-A----TTA-A--A--G----A---TATCT-----------------------AA-G-GA-----------AA-----GAT-CATTT-AT-ACCA-----CCA--CA---TTA---A-------T---GC--GCGC------AT-C-----A--AT--T----------ttaaagtttgactccat
gi|31 : cattc-AT--T------AATG-CG-C---GC--A---T-C---AAT----T----G-AATCAgaatcacaggtatgaataacaggtctctgaattttaatcaa
gi|32 : cattcattccttatacaaaatcgttgtaaataattaaagatatctaaggaaagatcatttataccaccacATCCT----AT-C-----G-A--A-TTAA-A-GAT--AT-CA--TTA-----AAA-TATTT-AT-ACCGAG-CATTA--AA---TAA---AA-T-T-TT---GC--GAAC------AA-T-----A--AT--T----------CA-AC--TA--C------------ATTAAT------GCGA----G-T-ATT-AA---T-TAGATT-A-AT---G-A-GAG---Ccaggtatgaataacaggtctctgaattttaatcaa
gi|33 : tctttaaaaagaatgtttaATTCATT-----G-T-------ATA-A---A-AG-CG-T--TGT--AAAGA-A----TTT-A--A--G----A---TATC---------------------------A-GAG--AT-CA--TTA-----AAT-CATTT-AT-ACCGAG-CACTA--AA---TTA---GA-T-T-TT---GC--GAGC------AA-T-----A--AT--T----------CC-AC--CA--C------------ATTCAT--
gi|33 : cattgATTG--A-TT--T------AATG-CG-T---GA--A---T-G---AATGTGGT----GGAATTAT----T---G--C--------TCG---CAAAATCT--A----------ATT------T--AG--T--GCTCGG------TA--T----AAATGATTTAtcacgcattaaatcaat
gi|33 : cattgattcattgtataaaagcgttgtaaagaatttaagatatcagagatcatC-AC---T-AA-ATT-AGATTTTG-C-GAG---CA-AT---------A-ATTCCACCACA-T--TC--------A--T-T----CA-CGC-A-----TT-A---A--A-TCAA--T
gi|34 : cattgattcattgtataaaagcgttgtaaagaatttaagatatcagagatcattaaatcatttataccgag-A-GGG--GT-CA--TCA-----ACT-CATTT-AT-ACCGAG-CTCCA--AA---TTA---AA-TAT-ATACAGC--GAGCTTATAGAA-T-----A--AT--T----------CC-AC--CA--C------------ATTGAT------GCGC----G-C-ATC-CA---T-GA-ATT-A-AT---G-C-GCG---CA-AT---------A-AT
gi|34 : --AC---------T--G-----A---T--GA-------TA---G----T-A-AT-GATT-----AT--T------G----CG-C---GC--A---T-T---AAT----T------CATGGA----T---G--C--------GCG---CAT----C--A----------ATcattactatcatcagt
gi|35 : aggggtcatcaactcatttataccgagctccaaattaaatatatacagcgagcttatagaataattccaccacAATT---TCG--ATT--GAATTTTT---G-CGC-G----T----AT---CAATT-CA--ATGATCGTATTT--G-----A---A--GA-------GA---G----C-A-GC-AATTG--G-AT--T------T-TG-TG-C---GC--A---T-C----AT----T----G-A
gi|35 : -CGC-A-----TT-G---A--T-TGAA--TT-----G-TTGAT--------A-T--AG---CATCAA-T-G--------A-----T------GC--GC--ACA-------A-----A----ATC------C-----AATTGCTG-----CTC-T--CTTCAA-------ATACGATCA-TTGAATTGATA--CG-CGC--AAAAATTC-AAT--CGAtgctatatcaacaattcaatcaatgcggatcgacagtaat
gi|36 : aattATTCCTTTAAGTA-T-------ACA-A---A-AG-CG-T--TGT--AAATA-T----CTA-A--A--A----A---CATCTTC--GAT-T-----G-T--A-T-AA-A-GAG--AT-TA--TTA-----AGT-CATTT-AT-gatcgacagtaat
gi|37 : catgattggagtcagttgctctatatatatatggtcgcatta-A----TTG-A--T--G----A---TATCTTC--AAA-T-----G-A--A-TT-A-A-GAG--AT-AA--CTATTCATAAT-TATTC-AT---------TGCATTAA---CTG---AA-T-TATT---GA--TAGC------AA-T-----A--ATTAT----------CT-GC--TG--A------------ATTGAT--G---
gi|38 : aaaccattgggaattgtcAA-T-----GA-A-----TTG-TG-GCGCG--CATTCAT-TC-----AAC-TAACGCAGGGCAAATAATT---CAC--TTC--A------T---G-CAC-G---------AT---TAATTCCA--CT---------T--G-----A---T--GA-------GT---A----C-A-AC-AA-TG--A-AT--cgct
gi|39 : aattctagtatctaaaattgctattT-ACCGAA-CTCCA--AA---TTA---AACT-T-TT---GC--GATC------AA-A-----A--AT--T----------CC-AG--CT--ATT----------ATTAAT--G---GAT-----G-C-ATC-AGT--T-AA-AGT-A-AT---G-A-GAG---CA-AT---------A-AATT------A----TA-------AA--T-A----CG-CGC-T-----TC-A---A--A-TCAG--CT-----A-
gi|4 : TATTCCTT-----A-T-------ACG-A---A-AT-CG-T--GTT--AAATA-A----TTA-A--A--AGGACA---CATCTTC--AAC-T-----G-A--A-TCAA-AAGAA--AT-CA--TAA-----AAT-CATTT-AT-ATCGAT-CTCCA--AA---TTG---AA-T-T-T----GC--GAGC------AA-T-----A--AT--T----------C--AG--CA--A------------TTTGAT--G---GCA-----A-C-ATC-AA---T-AT-ATTTAGAA---G-A-GAG---TA-AT---------A-CTTA------A-T--TT-------GAGAT-G----CAATGC-A-----TC-A---T--T-TCAA--TT-----A-TTGTTCA--CT--A-T--AT---T-TCAA-TGG--------A-----T------GT--AT--ACA---T---C-----A----ATT------C-----AAATATTC-----CCC-G--C----A-------ACA-----A-TTCAATTGATG--TG--GTTTA-----TCAAAT--CATTT-AT--TG---TC----------CGCAA------TGAAAAAA-A------A-A-----TTGATGCGCGGG--CA---AA-TC-----AA--TACTG--GCGCAA-TAATTC--CAG--ATT--G------T-----CGCGG----C----AT---CAATT-CA--CT---------T--G-----A---T--GA-------GGTATG----C-A-AT-AATTG--A-CT--T------GATG-AG-C---AC--A---T-C---AAT----T----G-AGTTAT----TTCAG--C--------AC----CAA----T--A----------ATT------G---AC-T--G--CAA------TA--T--TTGAcc
gi|40 : tgaagtgcagtTTCCTT-----A-T-------AGA-A---A-GG-TG-T--TGT--AAATA-A----TTA-A--A--G----A---TATCTT---AAT-T-----G-A--A-TTAA---GAG--ATACG--T-A-----AAT-CATTT-AT-ATCGAG-CGTTA--AA---TTA---AT-T-T-TT---GC--GAGC------AA-T-----AATAT--T----------CC-A
gi|41 : -----AAT-TATGGC-GCGCAT-T--TT---CAA--A---------------G-AGA-G----C----AT---GAATT-CA--AT---------T--G-----
gi|41 : aATTCCCA-----A-T-------AGA-A---A-AG-CA-A--TGT--AAATA-A----TCA-------G----A---CATCTTC--AAT-T-----G-A--A-TCAA-A-GAG--AT-CA--TTA-----AAT-CATTcccaatagaaaagcaatgtaaataatcagacatcttcaattgaatcaaagagatcattaaatcatt
gi|42 : acaattgaattcatgctctctttgaaaatgcgcgccata-G----C----AT---TAATT-CA--CT---------T--G-----A---T--GA-------TA---G----C-A-AT-AGTTG--A-TT--T------GATG-CC-C---GT--A---T-C---AAT----TCAAGG-AATTAT----T---G--C--------TCG---CAA----T--A----------TTTCTTTCAA--AAC-T-----CGA------TA--T----AAATAAT-----TGTATG
gi|43 : tC-----AAT-TATTGC-GCGCAT-TAATT----AA--ATG--GA-----T---G-CGC-G----CT---ATGTACAACT-CA--AT---------T--G-----AATTA--CA-------GC---G----C-A-AC-AATTC--A-ATGAT------CATG-CA-C---ATTAA---T-T---AAT----T----G-AATTAT----T---
gi|44 : AATT----AG--ATT--G------T---A-ACT-G----A----AT---CAGTT-CG--AT---------T--G-----A---A--GA-------GA---G----C-A-GT-AATTG--A-AT--T------ATTG-CG-C---GC--ATTTT-C---AAT----T----G-
gi|44 : --ATT--G------T---T-TGC------------T---GAATT-C----T---------T--G-----A---A--GT-------TG---G----C-A-AT----TG--A-A----------AATG-CG-C---GC--A---A-T---AAT----T----C-AATTAC----T---G--C--------TCT---CTT----C--A----------ATC------G--AAC-T--G--ccaacttcaagaattcagcaaacaattaaa
gi|45 : aattagattgtaactgaatT---CAGGAATTA-G------T---G-TGC-G----C----AT---CAATT-CT--TT---------TAAA-----A---A--GA-------GA---G----G-A-AT-AAATC--A-AT--T------taaa
gi|46 : ttcaacatatccacaactgaatcggtgatctttta--AT---------T--G-----A---A--GA-------GC---A----C-A-TT-AATTC--A-AT--TTTTATTAATG-AG-C---AC--A---T-C---AAT----T----C-TATTAT----A---C--T--------GCG---CAA----T--G----------ATT------G--AAA-T--GA-TGA------TATCT--TCAAAtacaaa
gi|47 : AATTG--CA---ATT--GAAGA--T---G-CGC-G----C----AT---CAACT-GA--AT---------T--G-----A---T--AA-------GA---G----T-ATTT-AACTG--A-A---T------AATG-CG-C---GT--A---T-gcat
gi|48 : tcttcagatcaccaTCCTT-----G-C-------TCT-A---A-AG-CA-T--TGT--AAATA-A----TTA-A--A--G----A---TATCCTC--AGT-T-----C-A--G-TTAT-T-GAG--AT-C---------------------AT-ACCGAG-CTCCA--AA---TGC---AA-C-T-TT---GC--attatgtatt
gi|49 : gC-G----C----AT---CAATT-AA--AT---------T--G-----A---T--AT-------GA---A------A-AT-AATTG--A-TT--T------GATGTCG-T---TC--A---T-C---AAT----T----A-AAATCT----T---GCAC--------GCA---CAA----T--A----------GTT------G--Aag
gi|5 : aTATTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AA-CG-TAATTT--TAATG-A----TTA-A-----G----A---TTCCTTC--GAT-T-----A-A--A-TCAG-A-TAG--AT-CA--TGA-----AAT-CATTT-AT-ACCGAG-CTCAA--AA---CGC---AA-T-T-TT---GC--GAGC------AA-T-----A--AT--T----------CC-AT--CACCACGGGTCCATCACATTGAT--GC--GCGTATT-G---ATC-AA---T-GA-AAT----T---G-A-GAG---CATAT---------ATAT--------A-T--ATAGAGAGGGA--T-GAATATG-AAC-A-----TC-A---G--A-TCAA--TT-----T-TTGCTC---TC--A-TC-AT---T-GGAA-CTA--------G-----T------GC--GC--AAAATTT---T-----ACCTGATT------T-----ACGCATT-------TA-G--C----A-------ATA-----A-TTGATTTGATG--CG-CGT-----------AAT--TGA-T-AT--T------------------CAA------ATAAAAAA-A-----GA-G-----TTTATta
gi|50 : attgatgcgcacatat-CG-T--TGT--AAATA-A----ATT-A--A--G----A---TAACTTC--AGT---------A--A-T----------------------------T-TATTT-AA-ATCAAG-CTCCA--GT---TTA---GA-T-T-CA---GC--GAGC------AAGT-----A--AT--T----------CC-aaatgttaatt
gi|52 : ---CAT--ATT--GA-----T---G-CAC-A----C----GT---CCATT-GA--AT---------T--G-----A---TTAAA-------GA---G----C-A-AT-AACTG--A-AT--T------GATG-CA-A---GC--A---
gi|55 : taaATTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AG-CT-T--TG
gi|56 : gctctctttagaaagaactaatgcgcatcgcta-----AAT-CATTT-AT-AC-GAG-CATTA--GG---TCA---GA-T-T-TT---GC--ATGC------AA-T-----A--AT--T----------TC-AC--g
gi|57 : ttTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AT-CT-T--TGT--AAATA-A----TTA-A--A--G----A---T
gi|6 : ttcattgtaATTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-A--TG-T--TGTGTAAATA-A----CTA-A--AAAG----A---TATCTTC--CATAG-----G-A--A-TTAA-A-G-T--AT-CA--TTA-----AAT--ATTT-ATTACCAAGGCCTTA--AA---TTA---AA-T-T-TTT--GT--GAGC------AA-TAATTGA--AT--T----------CC-A----A--A------------ATTAAT------ATGATCATG-C-ATA-AA---TCAA-ATC-TAAT---GCA-GA-----A-A----------G-ACTA------A-T--AT-------AA--T-------------------TG-A---A--A-T-AA------------TG--C---CC--A-C--AT---T-T-AA--TG--------A----------------------A---T---C-----T----ATT------C-----AAA-ACT------CTC-G-------G-------TCA-----A-TTGAATTCATG--TGACAC--A-----TTAAA---AGATT-AT--TG---TC----------
gi|7 : tttttaattcaacagttattccacaatttgaattaaattaaatgttctctttcaattgaattattgctgtcttttaatgaatta-AGAA---G-G-GAG---CA-AT---------A-ATTG------A-T--TT-------TA--T-G----CG-CTC-AATCCTTC-AATGA--A-GCGAT-TT-----A-ATGCTT---TC--AGG--AA---T-TCAA-TTG--------T-----T------TC--TC--TCG-------C-----A----A--------------AACTACAG-----TTCGG--T----AG------ACA--------TAATTTGATG--AT-CTC--T-----TCAATT--CAATTGATGATG---TCTTTAAACATTCGCAAACTTTTTG--TAAA-A-----GATA-----TTAATGCATGCA--CA---CC-TC-----ATT-TTTT----------TAA------AG--A------------------GA-G----C----AA---CAATT-CA--GT---------T--A-----A---A--GG-------TA---T----C-A-TT-AATTAGTA-GT--T------GATt
gi|7 : attcaacatCTT-----T-T-------ACA-A---A-AA-GT-T--TGC--GAATG-T----TTA-A--A--G----A---CATCATC--AAT-T-----G-A--A-TTGA-A-GAG--AT-CA--TCA-----AAT-TATGT-CT-ACCGAA-CT------G---T-----AG-T-T-TT---GCGAGAGA------AA-C-----A--AT--T------------------G--A------------ATTCCT--G---AAA-----G-C-ATTAAA---T-CG-CTT-CATT---G-A-AGG-------------------ATTG------A-------------------------G-CGC-A-----TA-A---A--A-TCAA--TT-----A-TTGCTC---CC--T-T--CT---T-AGGATTTA--------A-----T------GT--GC--GCA---TATAC-----ATGT-AAT------C-----CATAATTA-----CTT-T--C----C-------ACA-----A-TTGCAGTGCAG--TG-CAC--A-----taggatttaatgtgcgcatatacatgtaatccataattactttccacaattgcagtgcagtgcacaatgcaat
gi|8 : attcaacatatcaactactaattaatgatacctttaactgaattgttgctctctttaaaaaaatgaggtgtgcatgcattaatatTT-----A-T-------ATACA---A-AT-CG-T--TGT--TAATG-A----TTT-A--A--G----A---TATCT-C--AGT-T-----G-A--A-TCAA-A-GAG--AT-CA--TAG-----AAT-AATTT-GC-GTCAAG-CTCTA--AA---GTA---AA-T-T-CT---A---GATC------AA-T-----G--GT--T----------CC-AT--CA--A------------AATG-T--T---GCG-----G-CTATC-AG---T-G-----------------GAG---TT-AT---------A-A--G------A----TT-------GA--T-G----CG-CCA-A-----TC-A---A--A-TCAA--TT-----A--TGTTC---CC--A-----------TCAA-CTGA-------A-----TTACACAGC--GC--GCA---T---C-----ATG--ATT------------AATTATTGATTTACTC-G-----------------------A-TTGAATatgcaat
gi|8 : ctttaatagaactgctactctttaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaattA-A-----GA-------TTGATGCGC-CAATCA---AA-TC-----AAT-TA-TGT-TCCCAT-CAACT---GA---ATT--A------CACAG-CGC-G----C----AT---CA-------------------T--G-----A---T--------------------------T-AATT-----AT--T------GATT-TA-C-----------T-C---GAT----T----G-AATGA---------G--A--------ATG---CAA-------A----------CTT------G--AAT-TAAA--CGA------TA--TCCTCAAATAATgagaatgcaaacttgaattaaacgatatcctcaaataatg
gi|8 : ctttaatagaactgctactctttaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaattttatatacaaatcgttgttaatgatttaagatatctcagttgaatcaaagagatcatagaataatttgcgtcaagctctaaagtaaattctagatcaatggttccatcaaaatgttgcggctatcagtggagttat-TAATT---CAA--GTT---------T---G-CAT-T----C-----T---CA-TT-CA--AT---------C--G-----A---G--TA-------AA---T----C-A-AT-AATT---A-ATCAT------GATG-CG-C---GCT-G---TGT---AAT----T----C-AGTTGA----T---G--G--------GAA---C-A----T--A----------ATT------G--Ag
gi|9 : ctttaatagaactgctactctttaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaattttatatacaaatcgttgttaatgatttaagatatctcagttgaatcaaagagatcatagaataatttgcgtcaagctctaaagtaaattctagatcaatggttccatcaaaatgttgcggctatcagtggagttataagattgatgcgccaatcaaaA-ATT--GAT---A-A-GAA---CA-AT---------A-ATTG------ACT--TT-------AA--T-------------------------------TCAA--CC-----A-TTGTTC---TC--A-TC-AT---T-TTAA--TG--------A-----T------GC--AT--GCA---T---T-----ATTGTGTTG-----G-----GATTACTG-----CTC-G--C----AAAATGGTACA-----A-ATGATTTCATGATTG-CTC--GATT--TCAACTGAAGA-T-AT--TT---TT----------AATCA------TG-TATAA-A-----GA-A-----TTAACGCTCGCA--CC---AATTC-----TTT-TAAAGA-AAGCAA-AAATT---CA---ATT---------------CG--A----A----AT---C-ATT-----AT---------T--A-----G---A--AATATCTTTAA---T----C-A-AT-AATCA--A-AT--T------GAAG-AG-A---GC--A---A-T---AAT----T----C-TATTAT----T---G--C--------CCG---CAT----T--T----------ATT------A--AAC-aacgatatcctcaaataatg
gi|9 : ttg-T--TAT--ACATG-A----TTA-A--A--A----A---TATCTTC--AGT-T-----G-A--AATCGA---GCA--AT-CA--TGA-----AAT-CATTT-GT-ACC-----------------------A-T-T-TT---GC--GAGC------AG-T-----A--AT--C----------CC-AA--CA--C------------AATAAT--G---CAT-----G-C-ATC-AT---T-AA-AAT--GAT---G-A-GAA---CA-AT---------G-GTTG------A-------------------------------A-----TT-A---A--AGTCAA--TT-----A-TTGTTC---TT--A-----------TCAA-TTG--------AG----T------AC--GC--gagtacgc
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|51 ): AGTGCTAGCGATATATTCAATTCCACACATCCACAACTGAATTAATGATCTCTTCAATCATCAA
Unaligned ( gi|53 ): ATGATCTCTTTAACGTTGAATTGTTAATCTCTTTAAGAAAAATGGATGCGTGCATTGATTC
Unaligned ( gi|54 ): TGTATTCATTGAATTATCGATGACATTAATTATCATGCTTAATTGATACGCGCTAA
Unaligned ( gi|58 ): AACGTATCCTCAAATAATGAAAGAATCTTCGTTATATAATT
Unaligned ( gi|59 ): TATCCAGAACTGAATTAATTATCTTTTTAATT
Unaligned ( gi|60 ): AGTATTCAAATAATGAGACCAAGAAATGATT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111 33333333333333 22222222222222 11111111111111 3333333333333333333 111111111111111111111 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1111111 1111111111 222222222222222222222222 111111111111111111 111111111111111111111111
lowQualScore : 33333 1 4444444 1 222 1 44 1 33 22 1 2222 1 7777777777 222 11 5555555 1 11 1 6 1 1 11 2 11 3 33333 33 1 1 1 11 222 44444 2 1 1 444 33 333333 2 33333 11 11 5555555555 1 444 888888888888888 11111111111111 1 3 3 22222222222222 1 1 1 222 3 666666666 3 1 0 66666666666666 555555555 1 3 44444 22 222 3333 33 33333 1 2 2222222222222222222 2 1 000000000000000000000 22 22 333 555555555 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 2 666 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1 3 99999 4444444 3333333333 3 66666 2 3 55 44 777777777777777777777777 1 1 2222 4444 333 1 11 555555555 11 44444 7777777777777777777777777 1 1 1 555 1 33 555555 1 1 222 33 222 1 444 5555 999999 44444 333 22 77777777 333 111111111111111111 666666 33 44 777777777777777777777777 1 3 55
lowQualScore : ..... . ....... . ... . .. . .. .. . .... . .......... ... .. ....... . .. . . . . .. . .. . ..... .. . . . .. ... ..... . . . ... .. ...... . ..... .. .. .......... . ... ............... .............. . . . .............. . . . ... . ......... . . . .............. ......... . . ..... .. ... .... .. ..... . . ................... . . ..................... .. .. ... ......... ............................................................ . ... .......................................................... . . ..... ....... .......... . ..... . . .. .. ........................ . . .... .... ... . .. ......... .. ..... ......................... . . . ... . .. ...... . . ... .. ... . ... .... ...... ..... ... .. ........ ... .................. ...... .. .. ........................ . . ..
lowQualScore : 77777 5 8888888 5 666 5 55 4 88 00 4 9999 4 9999999999 444 99 4444444 4 99 4 1 3 3 88 6 88 2 11111 11 3 2 3 88 333 22222 6 3 3 888 00 666666 5 11111 77 77 5555555555 3 999 444444444444444 77777777777777 6 2 2 44444444444444 5 5 5 666 1 222222222 2 9 2 88888888888888 333333333 6 2 00000 22 888 4444 77 88888 6 4 5555555555555555555 7 7 777777777777777777777 55 55 333 444444444 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 2 444 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 9 6 11111 0000000 0000000000 1 22222 5 4 44 22 999999999999999999999999 5 4 9999 3333 888 4 88 000000000 77 44444 9999999999999999999999999 2 2 3 999 2 44 000000 4 5 666 55 666 5 444 0000 000000 22222 222 66 22222222 777 111111111111111111 888888 22 55 888888888888888888888888 1 5 00
consensus : TATTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AG-CG-T--TGT--AAATA-A----TTA-A--A--G----A---TATCTTC--AAT-T-----G-A--A-TCAA-A-GAG--AT-CA--TNA-----AAT-CATTT-AT-ACCGAG-CTCCA--AA---TTA---AA-T-T-TT---GC--GAGC------AA-T-----A--AT--T----------CC-AC--CA--A------------ATTGAT--G---GCG-----G-C-ATC-AA---T-GA-ATT-AGAT-G-A-GAG---CA-AT---------A-ATTGA-T--TT-------GA--T-G----CG-CGC-A-----TC-A---A--A-TCAA--TT-----A-TTGCTC---CC--A-T--AT---T-TCAA-TTG--------A-----T------GC--GC--GCA---T---C-----A----ATT------C-----AANTATTG-----CTC-G--C----A-------ACA-----A-TTGAATTGATG--CG-CGC--A-----TCAAAT--CGATT-AT--TG---TC----------CGCAA------TGAAAAAA-A-----GA-A-----TTGATGCGCGCG--CA---AA-TC-----AAT-TANTGC-GCGCAN-TAATT---CAG--ATT--G------T---G-CGC-G----C----AT---CAATT-CA--AT---------T--G-----A---N--GA-------GA---G----C-A-AT-AATTG--A-AT--T------GATG-CG-C---GC--A---T-C---AAT----T----G-AATTAT----T---G--C--------GCG---CAA----T--A----------ATT------G--AAC-T--G--CGA------TA--T--TCGAATGATTTACGTGTATGCTT
Reference ( family-5 ) : TATTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AG-CG-T--TGT--AAATA-A----TTA-A--A--G----A---TATCTTC--AAT-T-----G-A--A-TCAA-A-GAG--AT-CA--TNA-----AAT-CATTT-AT-ACCGAG-CTCCA--AA---TTA---AA-T-T-TT---GC--GAGC------AA-T-----A--AT--T----------CC-AC--CA--A------------ATTGAT--G---GCG-----G-C-ATC-AA---T-GA-ATT-AGAT-G-A-GAG---CA-AT---------A-ATTGA-T--TT-------GA--T-G----CG-CGC-A-----TC-A---A--A-TCAA--TT-----A-TTGCTC---CC--A-T--AT---T-TCAA-TTG--------A-----T------GC--GC--GCA---T---C-----A----ATT------C-----AANTATTG-----CTC-G--C----A-------ACA-----A-TTGAATTGATG--CG-CGC--A-----TCAAAT--CGATT-AT--TG---TC----------CGCAA------TGAAAAAA-A-----GA-A-----TTGATGCGCGCG--CA---AA-TC-----AAT-TANTGC-GCGCAN-TAATT---CAG--ATT--G------T---G-CGC-G----C----AT---CAATT-CA--AT---------T--G-----A---N--GA-------GA---G----C-A-AT-AATTG--A-AT--T------GATG-CG-C---GC--A---T-C---AAT----T----G-AATTAT----T---G--C--------GCG---CAA----T--A----------ATT------G--AAC-T--G--CGA------TA--T--TCGAATGATTTACGTGTATGCTT
gi|1 : -----AAT-TATTGC-GCGCAT-AAATT---GAG---TT--A------T---G-CGC-G----CTACGAT---CGA---CA--AT---------C--G-----A---A--AA-------GA---G----T-A-A
gi|1 : aattgatgattctttaccaacattgaagATT-CA--AT---------T--GG----A---A--GA-------GAC--A----C-A-AT-ATTTA--A-AT--T------ATTG-CG-C---GC--A---T-A---AAT----T----G-AGTTA-----T---G--C--------GCG---CTA----C--G----------ATC------G--Ataaatattgtgtctcttccaattgaataattcaatgtgcaaaataaataattcttttgagaaagcaactatctaattggagatagcttcattcaacatatccactattgaattaatatttctttaattagaactgctactcctttaaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaaatttcttatacaatcgttgttaatgatttaagatatctcagttgaatcaaagagatcatagaataatttgcgtcaagctctaaagtaaattctgagatcaatggttccatcaaaatgttgccgctcatcagtggagttataagattgatgcgcgcaatcaaatcaattattgttcccatcaactgaatctaacacgcgcgcatcatgataatattgatttactcgattgaagagaatgcaaactg
gi|1 : aattgatgattctttaccaacattgaagttactcttttcgattgG--ATC--G------TA--G-CGC-G----C----AT----AACT-CA--AT---------T--T-----A---T--GC-------GC---G----C-A-AT-AATTT--A-AA--T------ATTG-TGTC---TC--T---T-CC--AAT----T----G-AATAATTCAAT---G--T--------GCA---AAA----T--A----------Aaattcaatgtgcaaaataaataattcttttgagaaagcaactatctaattggagatagcttcattcaacatatccactattgaattaatatttctttaattagaactgctactcctttaaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaaatttcttatacaatcgttgttaatgatttaagatatctcagttgaatcaaagagatcatagaataatttgcgtcaagctctaaagtaaattctgagatcaatggttccatcaaaatgttgccgctcatcagtggagttataagattgatgcgcgcaatcaaatcaattattgttcccatcaactgaatctaacacgcgcgcatcatgataatattgatttactcgattgaagagaatgcaaactg
gi|1 : aattgatgattctttaccaacattgaagttactcttttcgattgtcATTTCTT-----A-T-------ACA-A------T-CG-T--TGT--TAATG-A----TTT-A--A--G----A---TATCT-C--AGT-T-----G-A--A-TCAA-A-GAG--AT-CA--TAG-----AAT-AATTT-GC-GTCAAG-CTCTA--AA---GTA---AA-T-T-CT---GA--GATC------AA-T-----G--GT--T----------CC-AT--CA--A------------AATGTT--G---CCGC----T-C-ATC-AG---T-G---------------GAG---TT-AT---------A-A--GA----TT-------GA--T-G----CG-CGCAA-----TC-A---A--A-TCAA--TT-----A-TTGTTC---CC--A-----------TCAA-CTGAATCTAACA-----C------GC--GC--GCA---T---C-----ATG--AT--------------AATATTGATTTACTC-G-----------------------A-TTGAAataattcttttgagaaagcaactatctaattggagatagcttcattcaacatatccactattgaattaatatttctttaattagaactgctactcctttaaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaaatttcttatacaatcgttgttaatgatttaagatatctcagttgaatcaaagagatcatagaataatttgcgtcaagctctaaagtaaattctgagatcaatggttccatcaaaatgttgccgctcatcagtggagttataagattgatgcgcgcaatcaaatcaattattgttcccatcaactgaatctaacacgcgcgcatcatgataatattgatttactcgattgaagagaatgcaaactg
gi|10 : aattgatgattctttaccaacattgaagttactcttttcgattgtcgatcgtagcgcgcataactcaatttatgcgcgcaataatttaaatattgtgtctcttccaattgaataattcaatgtgcaaaataaataattcttttgagaaagcaactatctaattggagatagcttcattcaacatatccactattgaattaatatttctttaattagaactgctactcctttaaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaaA---T-GA-ACT-AAATTG-A-GAAGACCA-AT---------A-ATTGA-T--TG-------GA--T-G----CG-TGC-G-----CC-A---A--T-TGAA--TC-----G-GTGCGCGCTTC--A-T--AT---T---AA-TTA--------A-----T------GC--AT--ACA---T---CGTATAA----ATTATGATAT-----AACTGCTATC---CTC-A--C----A-------GAA-----A-CTGAAATGATG--TG------A-----TCAAAC--GGA---AT--TG---AC----------CA----------GAGCAAATATTTTTGA-T-----TTGATGCGTG-G--C-----A-TCAACGGAAT-TGATAA-GCGCAT-CAATT---TAT--ATT--A------T---GACAA-G----C----ATC--CAATgagaatgcaaactg
gi|11 : ctttgctatccgcATTCTTT-----A-TTTTGAAAATA-A---G-AT-CA-T--TGA--AAATA-G----TGA-A--A--T----ACATTATCTTC--AGT-T-----G-G--A-ATAA-A-GAG--AT-CA--CTA-----AAT-AGTTT-AT-ACCGTG-CTCAA--AA---TGA---TA-T-T-TT---AC--GAGC------AACT-----A--AT--T----------CC-AT--CG--C------------AT--AT--T---G---------------AA---T-GC-ATT-AGAT-G-A-GA-----A-A----------A-ATCAC-T--CT-------AAC-T-G----CG-CGC-A-----TC-A---A--A-TC-------------TTG---------------AA---T-TCAA-TGA--------A-----T------T-------------T---T-----A----ATT-------------AGTATTG-----CCC-A--C----G-------AGA-----A-GTAAATTGATG--CG-C
gi|12 : acatgtgtacattaTATTTCCT-----ACT-------ACA-A---A-AGGCGGT--TGT--AA-TAGA----TTA-A--A--T----A---TACCTTCCAAAT-TTG---G-A--A-T-AA-A-GAG--AT-CA--TAC-----AATGTATTTGAT-ATCGAG-TTGAC--AG---T-----AA-T-A-GT---GC--GAGC------AA-T-----A--AT--T----------CCTGT--TG--A------------ATTGAT--G---ACG-----G-C-ATC-AAATCC-AA-CTT-ATCT-G-C-TA----CATGC---------A-AGTGA-A--TT-------AA--TGG----CG-CGC-A-----T--A---ATTA-TCAA--TT-----A-T
gi|13 : cttaactgaatgtgctcttcttaaaaggaaggatgcaagcggt-TC-----AAT-TTACGC-ACGCAA-TCATT---CCG--TTA--G------T---G-ATA-GAAGAT----AT---C--TT-CA--AT---------T--C-----A---A--CA-------TA---T----C-C-AC-AATTG--A-AT--T------AATG--------GT--A---T-CTTTCAT----T----G-AATTAT----T---G--CTCTGTAAAACG----AA----T--A----------ATT------G--
gi|14 : cgcgcatgcaataatcatcataatacacacattgatcttttctattgatatcaactacaaatgtatCTT-----A-T-------ACA-A---A-AG-CG-T--TGA--TAATA-G----TTTTA--A--T----A---TATCGTC--AAA-T-----G-A--A-TTAA-A-GAG--AT-CA--TCT-----AAC-CA--------CCGAG-CTCCA--AA---TTG---AA-T-------------------------------------------------------------------------ATTGAT--GC--GCG-------C-GTC-AAC--T-GA-ATT-T--T-G-G-GAG---CA-AT---------A-ACTTA-A--TT-------GA--T-G----CG-CGC-A-----TC-A---A--A-TCAA--GT-----A-TTTCTC---TCTGA-C--ATCAGT-TGAA-TTA--------G-----T------GC--GT--GAA---T---C-----A----ATT------C-----AAcgaacatggattccttacaaaaaatacttgtaacgttttttaaaactcatc
gi|15 : tctttagctgaattgttgctttctttaaaagtgcgctTCTTT-----A-T-------ATA-A---A-AA-CG-T--TGT--AAATA-A----TTA--------------------TTT--AA--------G-A------AA-G-GAG-----TA---CA-----AAT-CATTT-AT-TCCAGG-CTCCA--AA---TTG---AA-T-T-TT----T--GAGA------AA-T-----A--AT--G----------CA-AC--CA--C------------ATTGAT------GCGC----G-C-ATC-AAG--T-AC-ATT--GAT-C-A-CAG-----------------A-ACTGA-----T-------GA-------------AC-A------------------------T-----A-TTGCTC---TC--G-TCAAT---G-TGAA-TTA--------A-----T------GCATGCATGCA---T---C-----A----ATG------C-----TATTCTTT-----CGC-G--T----A-------ATG-----A-CCGAATTGATG--
gi|16 : ATTCCCT-----A-T-------ATA-A---ATAG-CG-T--TGA--AAA-A-A----TTA-AGCA--G--------TATCTTC--TTT-T-----T-ATTA-TAAA-A-GAATTATTCACTTTA-----AAT--ATTT-AT-ACCGAA-CATCA--AA---TTA---AA-T-T-TTA--AC--GAGC------AA-T-----A--AT--T----------CC-AC--TC--ACACT--------ATTGATTAA---AC------A-C-ATCAAA---T-GA-A---GAAT-G-ATGAG---GA-AT---------A-ATT-A-TAATT-------AA--T-G----TG-CATGA-----TTAA---A--A-TGAA--TTTATTAA-TTGTTC-------------T---T-TCAA-ATG--------atgtcttcaattg
gi|17 : atgtaAA--TT-----ACTTTCTT---C--------AC---T-TGAA-TTG--------T-----A------GC--GT--GCA---T---C-----A----ATT------C-----AA----TG-----C-A-G--A----A-------ATA-----A-ATGAATC-AT---TG-CTC--T-----TCAACT--GAATT-AT--T-----------------GAAA------GGAAGAAA-A-----g
gi|17 : ctctgaagtaa-TC-----ATT-TATTTC--TGCAT-TGA----------ATT--GA-----T---G-CAC-G----C----TA---CAATT-CA--AG---------T--G-----A---A--GA-------AA---G----T-A-AT-cagcaattctttttggaaagagaacctaatatatttataatttgacatatcttcaacatacccacgtttgaattattgatctgtttgaattgttggtctctttaaaagaatt
gi|17 : ctctgaagtaaa--ATT--G------TA--G-CGT-G----C----AT---CAATT-CA--A----------T--G-----C---A--GA-------------------A-AT-AAATG--A-AT--C-------AT--TG-C---TC--T---T-C---AAC----T----G-AATTAT----T---G--atcattgctcttcaactgaattattgaaaggaagaaaacagcaattctttttggaaagagaacctaatatatttataatttgacatatcttcaacatacccacgtttgaattattgatctgtttgaattgttggtctctttaaaagaatt
gi|18 : ctctgaagtaaaattactttcttcacttgaATTCCTT-----G-C-------ACA-A---A--G-CG-T--AGT--AAAAA-ACCCTTTA-A--A-------A---TATCTTT--AGT-TTACCGGTA--A-TTGA-A-GAG--AT-CA--TAA-----A----------T-ACCGAG-CTGCA--AA---CGA---AA-T-T-TT---GC--GGGC------AA-------A--AT--T----------TT-AT--CA--T------------ATTGAT--A---CAA-----G-C-ATC-AA---TTGA-ATT--GAT-C-A-GAG---CA-AT---------AGACTAA-T--T--------AA--T-G----CG-CAC-A-----TC-A---A--A-TCAA--CC-----A-TTGTTC---CC--A-----------TCAA-CTG--------A-----aaaggaagaaaacagcaattctttttggaaagagaacctaatatatttataatttgacatatcttcaacatacccacgtttgaattattgatctgtttgaattgttggtctctttaaaagaatt
gi|19 : taTTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AG-CA-T--TGT--AAATG-A----TTA-A--A--G----A---TATCTTC--AAT-T-----G-A--A-TTAA-A-TGG--AT-AA--TTA-----AAT-CATTT-AT-ACC-AC-CTGCA--AA---TTC---AA-T-C-CT---GC--A---------AA-T-----A--GT--T----------CC-A----A--A------------AT----------GCGT----G-C-ATT-CA---T----ATT-A---------AG---CA-AT---------ataatccgc
gi|2 : ctatttgaaatatagtttatataattagggatatcgttatgtgccctctttcaaagaatgaatgggtgcatccatTATTCCTT-----A-T-------ACG-A---A-AT-CG-T--TGT--AAATA-A----TTA-A--A--AGAC-A---CATCTTC--AAC-T-----G-A--A-TCAA-A-AGA--AT-CA--TAA-----AAT-CATTT-AT-ATCGAT-CTCCA--AA---TTG---AA-T-T-TT---GC--GAGC------AA-T-----A--AT--T----------CA-GC--CA--A------------TTTGAT--G---GCA-----A-C-ATC-AA---T-AT-ATT-AGAA-G-A-GAG---TA-AT---------A-CTTAA-T--TT-------GA--T-G----CA-TGC-A-----TC-A---T--T-TCAA--TT-----A-TTGTTCA--CT--A-T--AT---T-TCAA-TGG--------A-----T------GT--AT--ACA---T---C-----A----ATT------C-----AAATATTC-----CCC-G--C----A-------ACA-----A-TTCAATTGATG--TG-TTT--A-----TCAAAT--CATTT-AT--TG---TC----------CGCAA------TGAAAAAA-A-----AA-A-----TTGATGCGCGGG--CA---AA-TC-----AAT-TACTGG-GCGCAA-TAATT---CAG--ATT--G------T---G-CGC-G----C----AT---CAATT-CA--CT---------T--G-----A---T--GA-------GA---G----C-A-AT-AATTG--A-CT--T------GATG-AG-C---AC--A---T-C---AAT----T----G-AGTTAT----T---C--A--------GCA---CAA----T--A----------ATT------G--AAC-T--GC-CAA------TA--T--TTGAATTATTTACGTGTATGCTT
gi|20 : CCTT-----C-T-------ACA-ATATA-AG-CG-A--TGT--AAATA-A----TCA-A--A--G----A---TATATTC--AAT-T-----G-A--A-TCAA-A-GAG--AT-CA--TCA-----AAC-CATTT-AT-ACCGAG-CTCCA--AA---TGC---AA-T-T-TT---GC--AAGC------AA-T-----A--AT--T------------------G--A------------ATTGAT--G---AGA-----G-CAATG-AG---A-GA-GTT-AGAT-T-A--AT---CA-TTACTCTCTTGA-ATTGA-A--TT-------CA--G-G----CG-CAC-A-----TA-A---A--A-T-AA--TT-----
gi|21 : ttatgcgcgcattgttgG--CA---AA---------ATATATTGC-GCGCAA-TATTT---GAA--A--------------------------------------ATT-CA--AT---------T--G-----A---C--AA-------AG---G----C-A-AT-AATC---A-AT--TG-----GATT-CG-C---GC--A---T-C---AAT----T----C-AATTAT----T---G--C--------GCA---CAA----T--ATGATGCACGCATT------A--AAA-T------GA------TG--T--TCGAATAATt
gi|22 : cggtgtgaataagaagtatcagaaagctagaaagtattcaatctataacaaaatgcattattgatA---AA-TC-----AGT-AACTGC-TCTCCA-CAATTGAACAA--ATT---------------CGC-G----C----GT---CAAAT-CA--AA---------T--GGATCAA---T--GA-------GA---A----C-A-AT-AATTC--A-AT--T------GATG-CG-C---GC--A---T-C---AAA----T----C-AATTAT----T---G--G--------GTG---CAA----T--C----------A-T------G--AACAT--G--TAA------CATCT--TCAAATAATTatttttattttc
gi|23 : tttccatcgaagcaccaaataaaggttgaagttaacttggT---------T--G-----A---A--GA-------GA---GAGCTC-T-AT-AATTC--T-AT--T------GCTG-CA-CCACGC--A---G-C---TAT----T----G-AATTGA----T---G--C--------GCGCTACAA----TGCA----------GTT------GAAAAC-A--G--CAA------TA--C--TTCAATGATATAaattggtgagcacaaat
gi|24 : aattgatgattgc---G----T-A-AT-AACTG--A-AT--T------GATG-TG-C---GC--A---T-C---GAA----T----C-AATTCC----T---G--C--------GCcacaatcaatatcattataatttgattgaatacgttcttttcgagagagcaactatataattagagagatatttttaactc
gi|24 : ttattgtgtAA-TTG--------A-----T------GT--GC--GCA---T---C-----G----AAT------C-----AATTCCTG-----CGCTGATC----A-------TCA-----T-TTCAATTGATG--CA-TGT--A-----T--------------T--TG---TC----------AG--A------TGAAAGAA-A-----GA-AGTAACTTGAAGCATAC---------A-TC-----AAT-TACTGT-GTGCAG-TAATT---T-G--ATTA-A------T---G-CAT-G----C----AT---CAAAT-CAGCAT---------T--G-----C---T---------------------CTA-GTCAACTG--A-AT--T------GATG-tgatcatcatttcaattgatgcatgtatttgtcagatgaaagaaagaagtaacttgaagcatacatcaattactgtgtgcagtaatttgattaatgcatgcatcaaatcagcattgctctagtcaactgaattgatgag
gi|25 : ttattgtgtgtaataactgATTCTTT-----A-T-------ACA-A---A--T-CG-T--TTT--AAATA-A----TTA-A--A--G----A---TATCTTC--GAT-T------------TT------AG--CT-TG--TAA-----AGT-------------GAG-CGACA--AA---TTGATTAA-T-T-TT---AC--TGGC------A--------A--AT--T----------CC-AC--CA--A------------ATTTAT------GCGT----G-C-ATC-AA---T-ag
gi|26 : taattgaatatctctctggttgaattgaattgttgttctgtctaaaagatatagcgcttgcatta-GAG--AT-CA--TAG-----AAT-AATTT-GC-GTCAAG-CTCTA--AA---GTA---AA-T-T-CT---GA--GATC------AA-T-----G--GT--T----------CC-AT--CA-----------------TAAT--GTT-GCG-----CTC-ATC-AG---T-----------T-G---GAG---TT-AT---------A-A--GA-T--T--------GA--T-G----CG-CGC-A-----TC-A---A--A-TCAA--TT-----A-TTGTTC---CC--A-TC-AA---C-TGAA-TTA--------A-----C------GC--GC--GCA---T---C-----ATG--ATT------------AATTATTGATTTACTC-G-----------------------A-TTGAAtg
gi|27 : TATTCCT------A-T-------ACA-A---A-AAACG-TAATTT--TAATG-A----TTA-ATGC--G----A---TTCCTTC--GAT-T-----A-A--A-TCAGCA-TAG--AT-CA--TGA-----A-T-CATTT-AT-ACCGAG-CTCTA--AAGACGCA---AATT-T-TT---GCT-GAGC------AA-T-----A--AT--T----------CC-AT--CA--gagaat
gi|28 : attatgcgcacataat--GAGC------AA-T-----A--AT--T----------CC-AC--CA--C------------ATTAAT--GAGTACG-----C-C-AT---A---T-GA-ATT--CAT-G-A-GAG---CA-AT---------A-AT----T--TT-------AA--T-G----CA-CAG-T-----TC-A---A--G-TTAA--TT-----A-TTGCCT---CA--A---------T-TAAA-TTA--------A-----T------GC--TC--CCA---T---C-----A----ATccacgggttccactcacattgga
gi|28 : AGC------AA-T-----A--AT--TTATGTAATGCCC-ACAGTA--T------------ATTGAT--G---GGA-----G-C-ATT-AA---T-----TT-AATT-G-A-G-G---CA-AT---------A-ATTAA-C--TT-------GA--A-C----TG-TGC-A-----TT-A---A------AA--TT-----A-TTGCTC---TC--A-TG-AA---T-TCAT-ATG--------G-----C------GT--AC--TCA---T---T-----A----ATG------TGGTGGAATTATTG-----CTC-atactgtgggcattacataaattattgctgttttcaactgaacttaatgc
gi|29 : CCGT-----A-T-------GCA-A---A-GG-CA-T--TGT--ACATA-A--------------------------CCTC--AAT-C-----A-A--A-CTAA-A-GAG--AT-AA--TTA-----AAT-CATTC-AT-ACTGAG-CTTGA--AA---TTG---AA-T-A-TT---TC--GAGC------AA-T-----A--GT--T----------CC-AC--CA--C------------ATT-AC--C---GCGC----G-C-ATC-AATG-T-GA-ATT-Agttttcaactgaacttaatgc
gi|29 : -G----C----AT---TAATT-CA--AA---------G--G-----A---A--GA-------GG---A----C-G-TT-AATTC--ACAT--T------GATG-CG-C---GC--G---G-T---AATG---TGGTGG-AACTAT----T---G--C--------TCG---AAA----T-------------ATT------C--AAT-T--T--CAAGCTCAGTA--T----GAATGATTTAacgtcctcttcctttgaattaatgcatg
gi|3 : ccgtatgcaaaggcattgtacataacctcaatcaaactaaagagataatATTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AG-CG-T--TGT--AAATA-A---------------------------------AT-------G-A--A----------G--AT-CA--TCA-----AAT-CATTT-AT-TCCAAG-CTCCA--AA---TGC---AA-T-T-CT---GC--GGGC------AA-C-----A--TT--T----------CC-AC--AA--C------------ATAGAT------ACGC----G-C-ATC-AT---G-GA-ATT--GAT-C-A-GAG---CA-AT---------A-ATTGA-A--AT-------AA--T-G----CG-CGC-G-----TA-A---A--A-TCAAATTT-----A-TTGTTT---GC--A-T--TG---A-TCAA-TTG--------AACTAGT------GC--GC--GCA---TG--G-----A----ATA------C------TTTCTTG-----TTT-T--C----A-------TCA-----A-TTGACTAGAT----G-CGC--A-----TCAAAT--CAATC-CT--TGCTCTC----------TTCAA------TTAAATTA-T-----TA-A-----TTTAT----------A---GA-TT-----AAT-TAGTGG-GAGCAA-TATTT-----G--ATTTAA------T---G-CGT-G----T----AT---TAATC-CA--GT---------T--A-----C---A--GT-------GT---G----C-A-AT-AATCA--G-AT--T------GATG-atg
gi|30 : tgatatctttaattgaattcttgctctctttcaaaaagattgagacacgcatta--ATT--GA-----T---G-CAC-G----C----TT------TT-AA--A-------------------A---T--AA-------GA---G----C-A-AT-GACTG--A-GT--T------TATG-TG-T---GC--A---T-C---AAA----T----C-AATTCT----T---G--C--------TCT---CAT----C--A----------GTC------G--AAT-T--G--atataatttcagataaataaaggtatcttcaattaatttggtt
gi|30 : c-AAAT-A-A-GAG---CA-AT---------G-ACTGA-G--TT-------TA--T-G----TG-TGC-A-----TC-A---A--A-TCAA--TT-----C-TTGCTC---TC--A-TC-AG---T-CGAA-TTG--------A-----T------GA--GT--GCG---T---C-----A----ATT------C-----AACTG-TG-------C-G--C----A-------AAA-----ACTTGAatgagtgcgtcaattcaactgtgcgcaaaaacttgattaaagtttgactccat
gi|31 : cattgatgcacgcttttaATTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AT-CG-T--TGT--AAATA-A----TTA-A--A--G----A---TATCT-----------------------AA-G-GA-----------AA-----GAT-CATTT-AT-ACCA-----CCA--CA---TTA---A-------T---GC--GCGC------AT-C-----A--AT--T----------ttaaagtttgactccat
gi|31 : cattc-AT--T------AATG-CG-C---GC--A---T-C---AAT----T----G-AATCAgaatcacaggtatgaataacaggtctctgaattttaatcaa
gi|32 : cattcattccttatacaaaatcgttgtaaataattaaagatatctaaggaaagatcatttataccaccacATCCT----AT-C-----G-A--A-TTAA-A-GAT--AT-CA--TTA-----AAA-TATTT-AT-ACCGAG-CATTA--AA---TAA---AA-T-T-TT---GC--GAAC------AA-T-----A--AT--T----------CA-AC--TA--C------------ATTAAT------GCGA----G-T-ATT-AA---T-TAGATT-A-AT-G-A-GAG---Ccaggtatgaataacaggtctctgaattttaatcaa
gi|33 : tctttaaaaagaatgtttaATTCATT-----G-T-------ATA-A---A-AG-CG-T--TGT--AAAGA-A----TTT-A--A--G----A---TATC---------------------------A-GAG--AT-CA--TTA-----AAT-CATTT-AT-ACCGAG-CACTA--AA---TTA---GA-T-T-TT---GC--GAGC------AA-T-----A--AT--T----------CC-AC--CA--C------------ATTCAT--
gi|33 : cattgATTG--A-TT--T------AATG-CG-T---GA--A---T-G---AATGTGGT----GGAATTAT----T---G--C--------TCG---CAAAATCT--A----------ATT------T--AG--T--GCTCGG------TA--T----AAATGATTTAtcacgcattaaatcaat
gi|34 : cattgattcattgtataaaagcgttgtaaagaatttaagatatcagagatcat-A-GGG--GT-CA--TCA-----ACT-CATTT-AT-ACCGAG-CTCCA--AA---TTA---AA-TAT-ATACAGC--GAGCTTATAGAA-T-----A--AT--T----------CC-AC--CA--C------------ATTGAT------GCGC----G-C-ATC-CA---T-GA-ATT-A-AT-G-C-GCG---CA-AT---------A-AT
gi|34 : --AC---------T--G-----A---T--GA-------TA---G----T-A-AT-GATT-----AT--T------G----CG-C---GC--A---T-T---AAT----T------CATGGA----T---G--C--------GCG---CAT----C--A----------ATcattactatcatcagt
gi|35 : aggggtcatcaactcatttataccgagctccaaattaaatatatacagcgagcttatagaataattccaccacAATT---TCG--ATT--GAATTTTT---G-CGC-G----T----AT---CAATT-CA--ATGATCGTATTT--G-----A---A--GA-------GA---G----C-A-GC-AATTG--G-AT--T------T-TG-TG-C---GC--A---T-C----AT----T----G-A
gi|35 : -CGC-A-----TT-G---A--T-TGAA--TT-----G-TTGAT--------A-T--AG---CATCAA-T-G--------A-----T------GC--GC--ACA-------A-----A----ATC------C-----AATTGCTG-----CTC-T--CTTCAA-------ATACGATCA-TTGAATTGATA--CG-CGC--AAAAATTC-AAT--CGAtgctatatcaacaattcaatcaatgcggatcgacagtaat
gi|36 : aattATTCCTTTAAGTA-T-------ACA-A---A-AG-CG-T--TGT--AAATA-T----CTA-A--A--A----A---CATCTTC--GAT-T-----G-T--A-T-AA-A-GAG--AT-TA--TTA-----AGT-CATTT-AT-gatcgacagtaat
gi|37 : catgattggagtcagttgctctatatatatatggtcgcatta-A----TTG-A--T--G----A---TATCTTC--AAA-T-----G-A--A-TT-A-A-GAG--AT-AA--CTATTCATAAT-TATTC-AT---------TGCATTAA---CTG---AA-T-TATT---GA--TAGC------AA-T-----A--ATTAT----------CT-GC--TG--A------------ATTGAT--G---
gi|38 : aaaccattgggaattgtcAA-T-----GA-A-----TTG-TG-GCGCG--CATTCAT-TC-----AAC-TAACGCAGGGCAAATAATT---CAC--TTC--A------T---G-CAC-G---------AT---TAATTCCA--CT---------T--G-----A---T--GA-------GT---A----C-A-AC-AA-TG--A-AT--cgct
gi|39 : aattctagtatctaaaattgctattT-ACCGAA-CTCCA--AA---TTA---AACT-T-TT---GC--GATC------AA-A-----A--AT--T----------CC-AG--CT--ATT----------ATTAAT--G---GAT-----G-C-ATC-AGT--T-AA-AGT-A-AT-G-A-GAG---CA-AT---------A-AATTA----TA-------AA--T-A----CG-CGC-T-----TC-A---A--A-TCAG--CT-----A-
gi|4 : TATTCCTT-----A-T-------ACG-A---A-AT-CG-T--GTT--AAATA-A----TTA-A--A--AGGACA---CATCTTC--AAC-T-----G-A--A-TCAA-AAGAA--AT-CA--TAA-----AAT-CATTT-AT-ATCGAT-CTCCA--AA---TTG---AA-T-T-T----GC--GAGC------AA-T-----A--AT--T----------C--AG--CA--A------------TTTGAT--G---GCA-----A-C-ATC-AA---T-AT-ATTTAGAA-G-A-GAG---TA-AT---------A-CTTAA-T--TT-------GAGAT-G----CAATGC-A-----TC-A---T--T-TCAA--TT-----A-TTGTTCA--CT--A-T--AT---T-TCAA-TGG--------A-----T------GT--AT--ACA---T---C-----A----ATT------C-----AAATATTC-----CCC-G--C----A-------ACA-----A-TTCAATTGATG--TG--GTTTA-----TCAAAT--CATTT-AT--TG---TC----------CGCAA------TGAAAAAA-A------A-A-----TTGATGCGCGGG--CA---AA-TC-----AA--TACTG--GCGCAA-TAATTC--CAG--ATT--G------T-----CGCGG----C----AT---CAATT-CA--CT---------T--G-----A---T--GA-------GGTATG----C-A-AT-AATTG--A-CT--T------GATG-AG-C---AC--A---T-C---AAT----T----G-AGTTAT----TTCAG--C--------AC----CAA----T--A----------ATT------G---AC-T--G--CAA------TA--T--TTGAcc
gi|40 : tgaagtgcagtTTCCTT-----A-T-------AGA-A---A-GG-TG-T--TGT--AAATA-A----TTA-A--A--G----A---TATCTT---AAT-T-----G-A--A-TTAA---GAG--ATACG--T-A-----AAT-CATTT-AT-ATCGAG-CGTTA--AA---TTA---AT-T-T-TT---GC--GAGC------AA-T-----AATAT--T----------CC-A
gi|41 : -----AAT-TATGGC-GCGCAT-T--TT---CAA--A---------------G-AGA-G----C----AT---GAATT-CA--AT---------T--G-----
gi|41 : aATTCCCA-----A-T-------AGA-A---A-AG-CA-A--TGT--AAATA-A----TCA-------G----A---CATCTTC--AAT-T-----G-A--A-TCAA-A-GAG--AT-CA--TTA-----AAT-CATTcccaatagaaaagcaatgtaaataatcagacatcttcaattgaatcaaagagatcattaaatcatt
gi|42 : acaattgaattcatgctctctttgaaaatgcgcgccata-G----C----AT---TAATT-CA--CT---------T--G-----A---T--GA-------TA---G----C-A-AT-AGTTG--A-TT--T------GATG-CC-C---GT--A---T-C---AAT----TCAAGG-AATTAT----T---G--C--------TCG---CAA----T--A----------TTTCTTTCAA--AAC-T-----CGA------TA--T----AAATAAT-----TGTATG
gi|43 : tC-----AAT-TATTGC-GCGCAT-TAATT----AA--ATG--GA-----T---G-CGC-G----CT---ATGTACAACT-CA--AT---------T--G-----AATTA--CA-------GC---G----C-A-AC-AATTC--A-ATGAT------CATG-CA-C---ATTAA---T-T---AAT----T----G-AATTAT----T---
gi|44 : AATT----AG--ATT--G------T---A-ACT-G----A----AT---CAGTT-CG--AT---------T--G-----A---A--GA-------GA---G----C-A-GT-AATTG--A-AT--T------ATTG-CG-C---GC--ATTTT-C---AAT----T----G-
gi|44 : --ATT--G------T---T-TGC------------T---GAATT-C----T---------T--G-----A---A--GT-------TG---G----C-A-AT----TG--A-A----------AATG-CG-C---GC--A---A-T---AAT----T----C-AATTAC----T---G--C--------TCT---CTT----C--A----------ATC------G--AAC-T--G--ccaacttcaagaattcagcaaacaattaaa
gi|45 : aattagattgtaactgaatT---CAGGAATTA-G------T---G-TGC-G----C----AT---CAATT-CT--TT---------TAAA-----A---A--GA-------GA---G----G-A-AT-AAATC--A-AT--T------taaa
gi|46 : ttcaacatatccacaactgaatcggtgatctttta--AT---------T--G-----A---A--GA-------GC---A----C-A-TT-AATTC--A-AT--TTTTATTAATG-AG-C---AC--A---T-C---AAT----T----C-TATTAT----A---C--T--------GCG---CAA----T--G----------ATT------G--AAA-T--GA-TGA------TATCT--TCAAAtacaaa
gi|47 : AATTG--CA---ATT--GAAGA--T---G-CGC-G----C----AT---CAACT-GA--AT---------T--G-----A---T--AA-------GA---G----T-ATTT-AACTG--A-A---T------AATG-CG-C---GT--A---T-gcat
gi|48 : tcttcagatcaccaTCCTT-----G-C-------TCT-A---A-AG-CA-T--TGT--AAATA-A----TTA-A--A--G----A---TATCCTC--AGT-T-----C-A--G-TTAT-T-GAG--AT-C---------------------AT-ACCGAG-CTCCA--AA---TGC---AA-C-T-TT---GC--attatgtatt
gi|49 : gC-G----C----AT---CAATT-AA--AT---------T--G-----A---T--AT-------GA---A------A-AT-AATTG--A-TT--T------GATGTCG-T---TC--A---T-C---AAT----T----A-AAATCT----T---GCAC--------GCA---CAA----T--A----------GTT------G--Aag
gi|5 : aTATTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AA-CG-TAATTT--TAATG-A----TTA-A-----G----A---TTCCTTC--GAT-T-----A-A--A-TCAG-A-TAG--AT-CA--TGA-----AAT-CATTT-AT-ACCGAG-CTCAA--AA---CGC---AA-T-T-TT---GC--GAGC------AA-T-----A--AT--T----------CC-AT--CACCACGGGTCCATCACATTGAT--GC--GCGTATT-G---ATC-AA---T-GA-AAT----T-G-A-GAG---CATAT---------ATAT--A-T--ATAGAGAGGGA--T-GAATATG-AAC-A-----TC-A---G--A-TCAA--TT-----T-TTGCTC---TC--A-TC-AT---T-GGAA-CTA--------G-----T------GC--GC--AAAATTT---T-----ACCTGATT------T-----ACGCATT-------TA-G--C----A-------ATA-----A-TTGATTTGATG--CG-CGT-----------AAT--TGA-T-AT--T------------------CAA------ATAAAAAA-A-----GA-G-----TTTATta
gi|50 : attgatgcgcacatat-CG-T--TGT--AAATA-A----ATT-A--A--G----A---TAACTTC--AGT---------A--A-T----------------------------T-TATTT-AA-ATCAAG-CTCCA--GT---TTA---GA-T-T-CA---GC--GAGC------AAGT-----A--AT--T----------CC-aaatgttaatt
gi|52 : ---CAT--ATT--GA-----T---G-CAC-A----C----GT---CCATT-GA--AT---------T--G-----A---TTAAA-------GA---G----C-A-AT-AACTG--A-AT--T------GATG-CA-A---GC--A---
gi|55 : taaATTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AG-CT-T--TG
gi|56 : gctctctttagaaagaactaatgcgcatcgcta-----AAT-CATTT-AT-AC-GAG-CATTA--GG---TCA---GA-T-T-TT---GC--ATGC------AA-T-----A--AT--T----------TC-AC--g
gi|57 : ttTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AT-CT-T--TGT--AAATA-A----TTA-A--A--G----A---T
gi|6 : ttcattgtaATTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-A--TG-T--TGTGTAAATA-A----CTA-A--AAAG----A---TATCTTC--CATAG-----G-A--A-TTAA-A-G-T--AT-CA--TTA-----AAT--ATTT-ATTACCAAGGCCTTA--AA---TTA---AA-T-T-TTT--GT--GAGC------AA-TAATTGA--AT--T----------CC-A----A--A------------ATTAAT------ATGATCATG-C-ATA-AA---TCAA-ATC-TAAT-GCA-GA-----A-A----------G-ACTAA-T--AT-------AA--T-------------------TG-A---A--A-T-AA------------TG--C---CC--A-C--AT---T-T-AA--TG--------A----------------------A---T---C-----T----ATT------C-----AAA-ACT------CTC-G-------G-------TCA-----A-TTGAATTCATG--TGACAC--A-----TTAAA---AGATT-AT--TG---TC----------
gi|7 : tttttaattcaacagttattccacaatttgaattaaattaaatgttctctttcaattgaattattgctgtcttttaatgaatta-AGAA-G-G-GAG---CA-AT---------A-ATTGA-T--TT-------TA--T-G----CG-CTC-AATCCTTC-AATGA--A-GCGAT-TT-----A-ATGCTT---TC--AGG--AA---T-TCAA-TTG--------T-----T------TC--TC--TCG-------C-----A----A--------------AACTACAG-----TTCGG--T----AG------ACA--------TAATTTGATG--AT-CTC--T-----TCAATT--CAATTGATGATG---TCTTTAAACATTCGCAAACTTTTTG--TAAA-A-----GATA-----TTAATGCATGCA--CA---CC-TC-----ATT-TTTT----------TAA------AG--A------------------GA-G----C----AA---CAATT-CA--GT---------T--A-----A---A--GG-------TA---T----C-A-TT-AATTAGTA-GT--T------GATt
gi|7 : attcaacatCTT-----T-T-------ACA-A---A-AA-GT-T--TGC--GAATG-T----TTA-A--A--G----A---CATCATC--AAT-T-----G-A--A-TTGA-A-GAG--AT-CA--TCA-----AAT-TATGT-CT-ACCGAA-CT------G---T-----AG-T-T-TT---GCGAGAGA------AA-C-----A--AT--T------------------G--A------------ATTCCT--G---AAA-----G-C-ATTAAA---T-CG-CTT-CATT-G-A-AGG-------------------ATTGA-------------------------G-CGC-A-----TA-A---A--A-TCAA--TT-----A-TTGCTC---CC--T-T--CT---T-AGGATTTA--------A-----T------GT--GC--GCA---TATAC-----ATGT-AAT------C-----CATAATTA-----CTT-T--C----C-------ACA-----A-TTGCAGTGCAG--TG-CAC--A-----taggatttaatgtgcgcatatacatgtaatccataattactttccacaattgcagtgcagtgcacaatgcaat
gi|8 : attcaacatatcaactactaattaatgatacctttaactgaattgttgctctctttaaaaaaatgaggtgtgcatgcattaatatTT-----A-T-------ATACA---A-AT-CG-T--TGT--TAATG-A----TTT-A--A--G----A---TATCT-C--AGT-T-----G-A--A-TCAA-A-GAG--AT-CA--TAG-----AAT-AATTT-GC-GTCAAG-CTCTA--AA---GTA---AA-T-T-CT---A---GATC------AA-T-----G--GT--T----------CC-AT--CA--A------------AATG-T--T---GCG-----G-CTATC-AG---T-G---------------GAG---TT-AT---------A-A--GA----TT-------GA--T-G----CG-CCA-A-----TC-A---A--A-TCAA--TT-----A--TGTTC---CC--A-----------TCAA-CTGA-------A-----TTACACAGC--GC--GCA---T---C-----ATG--ATT------------AATTATTGATTTACTC-G-----------------------A-TTGAATatgcaat
gi|8 : ctttaatagaactgctactctttaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaattA-A-----GA-------TTGATGCGC-CAATCA---AA-TC-----AAT-TA-TGT-TCCCAT-CAACT---GA---ATT--A------CACAG-CGC-G----C----AT---CA-------------------T--G-----A---T--------------------------T-AATT-----AT--T------GATT-TA-C-----------T-C---GAT----T----G-AATGA---------G--A--------ATG---CAA-------A----------CTT------G--AAT-TAAA--CGA------TA--TCCTCAAATAATgagaatgcaaacttgaattaaacgatatcctcaaataatg
gi|8 : ctttaatagaactgctactctttaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaattttatatacaaatcgttgttaatgatttaagatatctcagttgaatcaaagagatcatagaataatttgcgtcaagctctaaagtaaattctagatcaatggttccatcaaaatgttgcggctatcagtggagttat-TAATT---CAA--GTT---------T---G-CAT-T----C-----T---CA-TT-CA--AT---------C--G-----A---G--TA-------AA---T----C-A-AT-AATT---A-ATCAT------GATG-CG-C---GCT-G---TGT---AAT----T----C-AGTTGA----T---G--G--------GAA---C-A----T--A----------ATT------G--Ag
gi|9 : ctttaatagaactgctactctttaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaattttatatacaaatcgttgttaatgatttaagatatctcagttgaatcaaagagatcatagaataatttgcgtcaagctctaaagtaaattctagatcaatggttccatcaaaatgttgcggctatcagtggagttataagattgatgcgccaatcaaaA-ATT--GAT-A-A-GAA---CA-AT---------A-ATTGACT--TT-------AA--T-------------------------------TCAA--CC-----A-TTGTTC---TC--A-TC-AT---T-TTAA--TG--------A-----T------GC--AT--GCA---T---T-----ATTGTGTTG-----G-----GATTACTG-----CTC-G--C----AAAATGGTACA-----A-ATGATTTCATGATTG-CTC--GATT--TCAACTGAAGA-T-AT--TT---TT----------AATCA------TG-TATAA-A-----GA-A-----TTAACGCTCGCA--CC---AATTC-----TTT-TAAAGA-AAGCAA-AAATT---CA---ATT---------------CG--A----A----AT---C-ATT-----AT---------T--A-----G---A--AATATCTTTAA---T----C-A-AT-AATCA--A-AT--T------GAAG-AG-A---GC--A---A-T---AAT----T----C-TATTAT----T---G--C--------CCG---CAT----T--T----------ATT------A--AAC-aacgatatcctcaaataatg
gi|9 : ttg-T--TAT--ACATG-A----TTA-A--A--A----A---TATCTTC--AGT-T-----G-A--AATCGA---GCA--AT-CA--TGA-----AAT-CATTT-GT-ACC-----------------------A-T-T-TT---GC--GAGC------AG-T-----A--AT--C----------CC-AA--CA--C------------AATAAT--G---CAT-----G-C-ATC-AT---T-AA-AAT--GAT-G-A-GAA---CA-AT---------G-GTTGA-------------------------------A-----TT-A---A--AGTCAA--TT-----A-TTGTTC---TT--A-----------TCAA-TTG--------AG----T------AC--GC--gagtacgc
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|51 ): AGTGCTAGCGATATATTCAATTCCACACATCCACAACTGAATTAATGATCTCTTCAATCATCAA
Unaligned ( gi|53 ): ATGATCTCTTTAACGTTGAATTGTTAATCTCTTTAAGAAAAATGGATGCGTGCATTGATTC
Unaligned ( gi|54 ): TGTATTCATTGAATTATCGATGACATTAATTATCATGCTTAATTGATACGCGCTAA
Unaligned ( gi|58 ): AACGTATCCTCAAATAATGAAAGAATCTTCGTTATATAATT
Unaligned ( gi|59 ): TATCCAGAACTGAATTAATTATCTTTTTAATT
Unaligned ( gi|60 ): AGTATTCAAATAATGAGACCAAGAAATGATT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111 33333333333333 22222222222222 11111111111111 3333333333333333333 111111111111111111111 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1111111 1111111111 222222222222222222222222 111111111111111111 111111111111111111111111
lowQualScore : 33333 1 4444444 1 222 1 44 1 33 22 1 2222 1 7777777777 222 11 5555555 1 11 1 6 1 1 11 2 11 3 33333 33 1 1 1 11 222 44444 2 1 1 444 33 333333 2 33333 11 11 5555555555 1 444 888888888888888 11111111111111 1 3 3 22222222222222 1 1 1 222 3 666666666 3 1 0 66666666666666 555555555 1 3 44444 22 222 3333 33 33333 1 2 2222222222222222222 2 1 000000000000000000000 22 22 333 555555555 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 2 666 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1 3 99999 4444444 3333333333 3 66666 2 3 55 44 777777777777777777777777 1 1 2222 4444 333 1 11 555555555 11 44444 7777777777777777777777777 1 1 1 555 1 33 555555 1 1 222 33 222 1 444 5555 999999 44444 333 22 77777777 333 111111111111111111 666666 33 44 777777777777777777777777 1 3 55
lowQualScore : ..... . ....... . ... . .. . .. .. . .... . .......... ... .. ....... . .. . . . . .. . .. . ..... .. . . . .. ... ..... . . . ... .. ...... . ..... .. .. .......... . ... ............... .............. . . . .............. . . . ... . ......... . . . .............. ......... . . ..... .. ... .... .. ..... . . ................... . . ..................... .. .. ... ......... ............................................................ . ... .......................................................... . . ..... ....... .......... . ..... . . .. .. ........................ . . .... .... ... . .. ......... .. ..... ......................... . . . ... . .. ...... . . ... .. ... . ... .... ...... ..... ... .. ........ ... .................. ...... .. .. ........................ . . ..
lowQualScore : 77777 5 8888888 5 666 5 55 4 88 00 4 9999 4 9999999999 444 99 4444444 4 99 4 1 3 3 88 6 88 2 11111 11 3 2 3 88 333 22222 6 3 3 888 00 666666 5 11111 77 77 5555555555 3 999 444444444444444 77777777777777 6 2 2 44444444444444 5 5 5 666 1 222222222 2 9 2 88888888888888 333333333 6 2 00000 22 888 4444 77 88888 6 4 5555555555555555555 7 7 777777777777777777777 55 55 333 444444444 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 2 444 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 9 6 11111 0000000 0000000000 1 22222 5 4 44 22 999999999999999999999999 5 4 9999 3333 888 4 88 000000000 77 44444 9999999999999999999999999 2 2 3 999 2 44 000000 4 5 666 55 666 5 444 0000 000000 22222 222 66 22222222 777 111111111111111111 888888 22 55 888888888888888888888888 1 5 00
consensus : TATTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AG-CG-T--TGT--AAATA-A----TTA-A--A--G----A---TATCTTC--AAT-T-----G-A--A-TCAA-A-GAG--AT-CA--TNA-----AAT-CATTT-AT-ACCGAG-CTCCA--AA---TTA---AA-T-T-TT---GC--GAGC------AA-T-----A--AT--T----------CC-AC--CA--A------------ATTGAT--G---GCG-----G-C-ATC-AA---T-GA-ATT-AGAT-G-A-GAG---CA-AT---------A-ATTGA-T--TT-------GA--T-G----CG-CGC-A-----TC-A---A--A-TCAA--TT-----A-TTGCTC---CC--A-T--AT---T-TCAA-TTG--------A-----T------GC--GC--GCA---T---C-----A----ATT------C-----AANTATTG-----CTC-G--C----A-------ACA-----A-TTGAATTGATG--CG-CGC--A-----TCAAAT--CGATT-AT--TG---TC----------CGCAA------TGAAAAAA-A-----GA-A-----TTGATGCGCGCG--CA---AA-TC-----AAT-TANTGC-GCGCAN-TAATT---CAG--ATT--G------T---G-CGC-G----C----AT---CAATT-CA--AT---------T--G-----A---N--GA-------GA---G----C-A-AT-AATTG--A-AT--T------GATG-CG-C---GC--A---T-C---AAT----T----G-AATTAT----T---G--C--------GCG---CAA----T--A----------ATT------G--AAC-T--G--CGA------TA--T--TCGAATGATTTACGTGTATGCTT
Reference ( family-5 ) : TATTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AG-CG-T--TGT--AAATA-A----TTA-A--A--G----A---TATCTTC--AAT-T-----G-A--A-TCAA-A-GAG--AT-CA--TNA-----AAT-CATTT-AT-ACCGAG-CTCCA--AA---TTA---AA-T-T-TT---GC--GAGC------AA-T-----A--AT--T----------CC-AC--CA--A------------ATTGAT--G---GCG-----G-C-ATC-AA---T-GA-ATT-AGAT-G-A-GAG---CA-AT---------A-ATTGA-T--TT-------GA--T-G----CG-CGC-A-----TC-A---A--A-TCAA--TT-----A-TTGCTC---CC--A-T--AT---T-TCAA-TTG--------A-----T------GC--GC--GCA---T---C-----A----ATT------C-----AANTATTG-----CTC-G--C----A-------ACA-----A-TTGAATTGATG--CG-CGC--A-----TCAAAT--CGATT-AT--TG---TC----------CGCAA------TGAAAAAA-A-----GA-A-----TTGATGCGCGCG--CA---AA-TC-----AAT-TANTGC-GCGCAN-TAATT---CAG--ATT--G------T---G-CGC-G----C----AT---CAATT-CA--AT---------T--G-----A---N--GA-------GA---G----C-A-AT-AATTG--A-AT--T------GATG-CG-C---GC--A---T-C---AAT----T----G-AATTAT----T---G--C--------GCG---CAA----T--A----------ATT------G--AAC-T--G--CGA------TA--T--TCGAATGATTTACGTGTATGCTT
gi|1 : -----AAT-TATTGC-GCGCAT-AAATT---GAG---TT--A------T---G-CGC-G----CTACGAT---CGA---CA--AT---------C--G-----A---A--AA-------GA---G----T-A-A
gi|1 : aattgatgattctttaccaacattgaagATT-CA--AT---------T--GG----A---A--GA-------GAC--A----C-A-AT-ATTTA--A-AT--T------ATTG-CG-C---GC--A---T-A---AAT----T----G-AGTTA-----T---G--C--------GCG---CTA----C--G----------ATC------G--Ataaatattgtgtctcttccaattgaataattcaatgtgcaaaataaataattcttttgagaaagcaactatctaattggagatagcttcattcaacatatccactattgaattaatatttctttaattagaactgctactcctttaaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaaatttcttatacaatcgttgttaatgatttaagatatctcagttgaatcaaagagatcatagaataatttgcgtcaagctctaaagtaaattctgagatcaatggttccatcaaaatgttgccgctcatcagtggagttataagattgatgcgcgcaatcaaatcaattattgttcccatcaactgaatctaacacgcgcgcatcatgataatattgatttactcgattgaagagaatgcaaactg
gi|1 : aattgatgattctttaccaacattgaagttactcttttcgattgG--ATC--G------TA--G-CGC-G----C----AT----AACT-CA--AT---------T--T-----A---T--GC-------GC---G----C-A-AT-AATTT--A-AA--T------ATTG-TGTC---TC--T---T-CC--AAT----T----G-AATAATTCAAT---G--T--------GCA---AAA----T--A----------Aaattcaatgtgcaaaataaataattcttttgagaaagcaactatctaattggagatagcttcattcaacatatccactattgaattaatatttctttaattagaactgctactcctttaaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaaatttcttatacaatcgttgttaatgatttaagatatctcagttgaatcaaagagatcatagaataatttgcgtcaagctctaaagtaaattctgagatcaatggttccatcaaaatgttgccgctcatcagtggagttataagattgatgcgcgcaatcaaatcaattattgttcccatcaactgaatctaacacgcgcgcatcatgataatattgatttactcgattgaagagaatgcaaactg
gi|1 : aattgatgattctttaccaacattgaagttactcttttcgattgtcATTTCTT-----A-T-------ACA-A------T-CG-T--TGT--TAATG-A----TTT-A--A--G----A---TATCT-C--AGT-T-----G-A--A-TCAA-A-GAG--AT-CA--TAG-----AAT-AATTT-GC-GTCAAG-CTCTA--AA---GTA---AA-T-T-CT---GA--GATC------AA-T-----G--GT--T----------CC-AT--CA--A------------AATGTT--G---CCGC----T-C-ATC-AG---T-G---------------GAG---TT-AT---------A-A--GA----TT-------GA--T-G----CG-CGCAA-----TC-A---A--A-TCAA--TT-----A-TTGTTC---CC--A-----------TCAA-CTGAATCTAACA-----C------GC--GC--GCA---T---C-----ATG--AT--------------AATATTGATTTACTC-G-----------------------A-TTGAAataattcttttgagaaagcaactatctaattggagatagcttcattcaacatatccactattgaattaatatttctttaattagaactgctactcctttaaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaaatttcttatacaatcgttgttaatgatttaagatatctcagttgaatcaaagagatcatagaataatttgcgtcaagctctaaagtaaattctgagatcaatggttccatcaaaatgttgccgctcatcagtggagttataagattgatgcgcgcaatcaaatcaattattgttcccatcaactgaatctaacacgcgcgcatcatgataatattgatttactcgattgaagagaatgcaaactg
gi|10 : aattgatgattctttaccaacattgaagttactcttttcgattgtcgatcgtagcgcgcataactcaatttatgcgcgcaataatttaaatattgtgtctcttccaattgaataattcaatgtgcaaaataaataattcttttgagaaagcaactatctaattggagatagcttcattcaacatatccactattgaattaatatttctttaattagaactgctactcctttaaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaaA---T-GA-ACT-AAATTG-A-GAAGACCA-AT---------A-ATTGA-T--TG-------GA--T-G----CG-TGC-G-----CC-A---A--T-TGAA--TC-----G-GTGCGCGCTTC--A-T--AT---T---AA-TTA--------A-----T------GC--AT--ACA---T---CGTATAA----ATTATGATAT-----AACTGCTATC---CTC-A--C----A-------GAA-----A-CTGAAATGATG--TG------A-----TCAAAC--GGA---AT--TG---AC----------CA----------GAGCAAATATTTTTGA-T-----TTGATGCGTG-G--C-----A-TCAACGGAAT-TGATAA-GCGCAT-CAATT---TAT--ATT--A------T---GACAA-G----C----ATC--CAATgagaatgcaaactg
gi|11 : ctttgctatccgcATTCTTT-----A-TTTTGAAAATA-A---G-AT-CA-T--TGA--AAATA-G----TGA-A--A--T----ACATTATCTTC--AGT-T-----G-G--A-ATAA-A-GAG--AT-CA--CTA-----AAT-AGTTT-AT-ACCGTG-CTCAA--AA---TGA---TA-T-T-TT---AC--GAGC------AACT-----A--AT--T----------CC-AT--CG--C------------AT--AT--T---G---------------AA---T-GC-ATT-AGAT-G-A-GA-----A-A----------A-ATCAC-T--CT-------AAC-T-G----CG-CGC-A-----TC-A---A--A-TC-------------TTG---------------AA---T-TCAA-TGA--------A-----T------T-------------T---T-----A----ATT-------------AGTATTG-----CCC-A--C----G-------AGA-----A-GTAAATTGATG--CG-C
gi|12 : acatgtgtacattaTATTTCCT-----ACT-------ACA-A---A-AGGCGGT--TGT--AA-TAGA----TTA-A--A--T----A---TACCTTCCAAAT-TTG---G-A--A-T-AA-A-GAG--AT-CA--TAC-----AATGTATTTGAT-ATCGAG-TTGAC--AG---T-----AA-T-A-GT---GC--GAGC------AA-T-----A--AT--T----------CCTGT--TG--A------------ATTGAT--G---ACG-----G-C-ATC-AAATCC-AA-CTT-ATCT-G-C-TA----CATGC---------A-AGTGA-A--TT-------AA--TGG----CG-CGC-A-----T--A---ATTA-TCAA--TT-----A-T
gi|13 : cttaactgaatgtgctcttcttaaaaggaaggatgcaagcggt-TC-----AAT-TTACGC-ACGCAA-TCATT---CCG--TTA--G------T---G-ATA-GAAGAT----AT---C--TT-CA--AT---------T--C-----A---A--CA-------TA---T----C-C-AC-AATTG--A-AT--T------AATG--------GT--A---T-CTTTCAT----T----G-AATTAT----T---G--CTCTGTAAAACG----AA----T--A----------ATT------G--
gi|14 : cgcgcatgcaataatcatcataatacacacattgatcttttctattgatatcaactacaaatgtatCTT-----A-T-------ACA-A---A-AG-CG-T--TGA--TAATA-G----TTTTA--A--T----A---TATCGTC--AAA-T-----G-A--A-TTAA-A-GAG--AT-CA--TCT-----AAC-CA--------CCGAG-CTCCA--AA---TTG---AA-T-------------------------------------------------------------------------ATTGAT--GC--GCG-------C-GTC-AAC--T-GA-ATT-T--T-G-G-GAG---CA-AT---------A-ACTTA-A--TT-------GA--T-G----CG-CGC-A-----TC-A---A--A-TCAA--GT-----A-TTTCTC---TCTGA-C--ATCAGT-TGAA-TTA--------G-----T------GC--GT--GAA---T---C-----A----ATT------C-----AAcgaacatggattccttacaaaaaatacttgtaacgttttttaaaactcatc
gi|15 : tctttagctgaattgttgctttctttaaaagtgcgctTCTTT-----A-T-------ATA-A---A-AA-CG-T--TGT--AAATA-A----TTA--------------------TTT--AA--------G-A------AA-G-GAG-----TA---CA-----AAT-CATTT-AT-TCCAGG-CTCCA--AA---TTG---AA-T-T-TT----T--GAGA------AA-T-----A--AT--G----------CA-AC--CA--C------------ATTGAT------GCGC----G-C-ATC-AAG--T-AC-ATT--GAT-C-A-CAG-----------------A-ACTGA-----T-------GA-------------AC-A------------------------T-----A-TTGCTC---TC--G-TCAAT---G-TGAA-TTA--------A-----T------GCATGCATGCA---T---C-----A----ATG------C-----TATTCTTT-----CGC-G--T----A-------ATG-----A-CCGAATTGATG--
gi|16 : ATTCCCT-----A-T-------ATA-A---ATAG-CG-T--TGA--AAA-A-A----TTA-AGCA--G--------TATCTTC--TTT-T-----T-ATTA-TAAA-A-GAATTATTCACTTTA-----AAT--ATTT-AT-ACCGAA-CATCA--AA---TTA---AA-T-T-TTA--AC--GAGC------AA-T-----A--AT--T----------CC-AC--TC--ACACT--------ATTGATTAA---AC------A-C-ATCAAA---T-GA-A---GAAT-G-ATGAG---GA-AT---------A-ATT-A-TAATT-------AA--T-G----TG-CATGA-----TTAA---A--A-TGAA--TTTATTAA-TTGTTC-------------T---T-TCAA-ATG--------atgtcttcaattg
gi|17 : atgtaAA--TT-----ACTTTCTT---C--------AC---T-TGAA-TTG--------T-----A------GC--GT--GCA---T---C-----A----ATT------C-----AA----TG-----C-A-G--A----A-------ATA-----A-ATGAATC-AT---TG-CTC--T-----TCAACT--GAATT-AT--T-----------------GAAA------GGAAGAAA-A-----g
gi|17 : ctctgaagtaa-TC-----ATT-TATTTC--TGCAT-TGA----------ATT--GA-----T---G-CAC-G----C----TA---CAATT-CA--AG---------T--G-----A---A--GA-------AA---G----T-A-AT-cagcaattctttttggaaagagaacctaatatatttataatttgacatatcttcaacatacccacgtttgaattattgatctgtttgaattgttggtctctttaaaagaatt
gi|17 : ctctgaagtaaa--ATT--G------TA--G-CGT-G----C----AT---CAATT-CA--A----------T--G-----C---A--GA-------------------A-AT-AAATG--A-AT--C-------AT--TG-C---TC--T---T-C---AAC----T----G-AATTAT----T---G--atcattgctcttcaactgaattattgaaaggaagaaaacagcaattctttttggaaagagaacctaatatatttataatttgacatatcttcaacatacccacgtttgaattattgatctgtttgaattgttggtctctttaaaagaatt
gi|18 : ctctgaagtaaaattactttcttcacttgaATTCCTT-----G-C-------ACA-A---A--G-CG-T--AGT--AAAAA-ACCCTTTA-A--A-------A---TATCTTT--AGT-TTACCGGTA--A-TTGA-A-GAG--AT-CA--TAA-----A----------T-ACCGAG-CTGCA--AA---CGA---AA-T-T-TT---GC--GGGC------AA-------A--AT--T----------TT-AT--CA--T------------ATTGAT--A---CAA-----G-C-ATC-AA---TTGA-ATT--GAT-C-A-GAG---CA-AT---------AGACTAA-T--T--------AA--T-G----CG-CAC-A-----TC-A---A--A-TCAA--CC-----A-TTGTTC---CC--A-----------TCAA-CTG--------A-----aaaggaagaaaacagcaattctttttggaaagagaacctaatatatttataatttgacatatcttcaacatacccacgtttgaattattgatctgtttgaattgttggtctctttaaaagaatt
gi|19 : taTTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AG-CA-T--TGT--AAATG-A----TTA-A--A--G----A---TATCTTC--AAT-T-----G-A--A-TTAA-A-TGG--AT-AA--TTA-----AAT-CATTT-AT-ACC-AC-CTGCA--AA---TTC---AA-T-C-CT---GC--A---------AA-T-----A--GT--T----------CC-A----A--A------------AT----------GCGT----G-C-ATT-CA---T----ATT-A---------AG---CA-AT---------ataatccgc
gi|2 : ctatttgaaatatagtttatataattagggatatcgttatgtgccctctttcaaagaatgaatgggtgcatccatTATTCCTT-----A-T-------ACG-A---A-AT-CG-T--TGT--AAATA-A----TTA-A--A--AGAC-A---CATCTTC--AAC-T-----G-A--A-TCAA-A-AGA--AT-CA--TAA-----AAT-CATTT-AT-ATCGAT-CTCCA--AA---TTG---AA-T-T-TT---GC--GAGC------AA-T-----A--AT--T----------CA-GC--CA--A------------TTTGAT--G---GCA-----A-C-ATC-AA---T-AT-ATT-AGAA-G-A-GAG---TA-AT---------A-CTTAA-T--TT-------GA--T-G----CA-TGC-A-----TC-A---T--T-TCAA--TT-----A-TTGTTCA--CT--A-T--AT---T-TCAA-TGG--------A-----T------GT--AT--ACA---T---C-----A----ATT------C-----AAATATTC-----CCC-G--C----A-------ACA-----A-TTCAATTGATG--TG-TTT--A-----TCAAAT--CATTT-AT--TG---TC----------CGCAA------TGAAAAAA-A-----AA-A-----TTGATGCGCGGG--CA---AA-TC-----AAT-TACTGG-GCGCAA-TAATT---CAG--ATT--G------T---G-CGC-G----C----AT---CAATT-CA--CT---------T--G-----A---T--GA-------GA---G----C-A-AT-AATTG--A-CT--T------GATG-AG-C---AC--A---T-C---AAT----T----G-AGTTAT----T---C--A--------GCA---CAA----T--A----------ATT------G--AAC-T--GC-CAA------TA--T--TTGAATTATTTACGTGTATGCTT
gi|20 : CCTT-----C-T-------ACA-ATATA-AG-CG-A--TGT--AAATA-A----TCA-A--A--G----A---TATATTC--AAT-T-----G-A--A-TCAA-A-GAG--AT-CA--TCA-----AAC-CATTT-AT-ACCGAG-CTCCA--AA---TGC---AA-T-T-TT---GC--AAGC------AA-T-----A--AT--T------------------G--A------------ATTGAT--G---AGA-----G-CAATG-AG---A-GA-GTT-AGAT-T-A--AT---CA-TTACTCTCTTGA-ATTGA-A--TT-------CA--G-G----CG-CAC-A-----TA-A---A--A-T-AA--TT-----
gi|21 : ttatgcgcgcattgttgG--CA---AA---------ATATATTGC-GCGCAA-TATTT---GAA--A--------------------------------------ATT-CA--AT---------T--G-----A---C--AA-------AG---G----C-A-AT-AATC---A-AT--TG-----GATT-CG-C---GC--A---T-C---AAT----T----C-AATTAT----T---G--C--------GCA---CAA----T--ATGATGCACGCATT------A--AAA-T------GA------TG--T--TCGAATAATt
gi|22 : cggtgtgaataagaagtatcagaaagctagaaagtattcaatctataacaaaatgcattattgatA---AA-TC-----AGT-AACTGC-TCTCCA-CAATTGAACAA--ATT---------------CGC-G----C----GT---CAAAT-CA--AA---------T--GGATCAA---T--GA-------GA---A----C-A-AT-AATTC--A-AT--T------GATG-CG-C---GC--A---T-C---AAA----T----C-AATTAT----T---G--G--------GTG---CAA----T--C----------A-T------G--AACAT--G--TAA------CATCT--TCAAATAATTatttttattttc
gi|23 : tttccatcgaagcaccaaataaaggttgaagttaacttggT---------T--G-----A---A--GA-------GA---GAGCTC-T-AT-AATTC--T-AT--T------GCTG-CA-CCACGC--A---G-C---TAT----T----G-AATTGA----T---G--C--------GCGCTACAA----TGCA----------GTT------GAAAAC-A--G--CAA------TA--C--TTCAATGATATAaattggtgagcacaaat
gi|24 : aattgatgattgc---G----T-A-AT-AACTG--A-AT--T------GATG-TG-C---GC--A---T-C---GAA----T----C-AATTCC----T---G--C--------GCcacaatcaatatcattataatttgattgaatacgttcttttcgagagagcaactatataattagagagatatttttaactc
gi|24 : ttattgtgtAA-TTG--------A-----T------GT--GC--GCA---T---C-----G----AAT------C-----AATTCCTG-----CGCTGATC----A-------TCA-----T-TTCAATTGATG--CA-TGT--A-----T--------------T--TG---TC----------AG--A------TGAAAGAA-A-----GA-AGTAACTTGAAGCATAC---------A-TC-----AAT-TACTGT-GTGCAG-TAATT---T-G--ATTA-A------T---G-CAT-G----C----AT---CAAAT-CAGCAT---------T--G-----C---T---------------------CTA-GTCAACTG--A-AT--T------GATG-tgatcatcatttcaattgatgcatgtatttgtcagatgaaagaaagaagtaacttgaagcatacatcaattactgtgtgcagtaatttgattaatgcatgcatcaaatcagcattgctctagtcaactgaattgatgag
gi|25 : ttattgtgtgtaataactgATTCTTT-----A-T-------ACA-A---A--T-CG-T--TTT--AAATA-A----TTA-A--A--G----A---TATCTTC--GAT-T------------TT------AG--CT-TG--TAA-----AGT-------------GAG-CGACA--AA---TTGATTAA-T-T-TT---AC--TGGC------A--------A--AT--T----------CC-AC--CA--A------------ATTTAT------GCGT----G-C-ATC-AA---T-ag
gi|26 : taattgaatatctctctggttgaattgaattgttgttctgtctaaaagatatagcgcttgcatta-GAG--AT-CA--TAG-----AAT-AATTT-GC-GTCAAG-CTCTA--AA---GTA---AA-T-T-CT---GA--GATC------AA-T-----G--GT--T----------CC-AT--CA-----------------TAAT--GTT-GCG-----CTC-ATC-AG---T-----------T-G---GAG---TT-AT---------A-A--GA-T--T--------GA--T-G----CG-CGC-A-----TC-A---A--A-TCAA--TT-----A-TTGTTC---CC--A-TC-AA---C-TGAA-TTA--------A-----C------GC--GC--GCA---T---C-----ATG--ATT------------AATTATTGATTTACTC-G-----------------------A-TTGAAtg
gi|27 : TATTCCT------A-T-------ACA-A---A-AAACG-TAATTT--TAATG-A----TTA-ATGC--G----A---TTCCTTC--GAT-T-----A-A--A-TCAGCA-TAG--AT-CA--TGA-----A-T-CATTT-AT-ACCGAG-CTCTA--AAGACGCA---AATT-T-TT---GCT-GAGC------AA-T-----A--AT--T----------CC-AT--CA--gagaat
gi|28 : attatgcgcacataat--GAGC------AA-T-----A--AT--T----------CC-AC--CA--C------------ATTAAT--GAGTACG-----C-C-AT---A---T-GA-ATT--CAT-G-A-GAG---CA-AT---------A-AT----T--TT-------AA--T-G----CA-CAG-T-----TC-A---A--G-TTAA--TT-----A-TTGCCT---CA--A---------T-TAAA-TTA--------A-----T------GC--TC--CCA---T---C-----A----ATccacgggttccactcacattgga
gi|28 : AGC------AA-T-----A--AT--TTATGTAATGCCC-ACAGTA--T------------ATTGAT--G---GGA-----G-C-ATT-AA---T-----TT-AATT-G-A-G-G---CA-AT---------A-ATTAA-C--TT-------GA--A-C----TG-TGC-A-----TT-A---A------AA--TT-----A-TTGCTC---TC--A-TG-AA---T-TCAT-ATG--------G-----C------GT--AC--TCA---T---T-----A----ATG------TGGTGGAATTATTG-----CTC-atactgtgggcattacataaattattgctgttttcaactgaacttaatgc
gi|29 : CCGT-----A-T-------GCA-A---A-GG-CA-T--TGT--ACATA-A--------------------------CCTC--AAT-C-----A-A--A-CTAA-A-GAG--AT-AA--TTA-----AAT-CATTC-AT-ACTGAG-CTTGA--AA---TTG---AA-T-A-TT---TC--GAGC------AA-T-----A--GT--T----------CC-AC--CA--C------------ATT-AC--C---GCGC----G-C-ATC-AATG-T-GA-ATT-Agttttcaactgaacttaatgc
gi|29 : -G----C----AT---TAATT-CA--AA---------G--G-----A---A--GA-------GG---A----C-G-TT-AATTC--ACAT--T------GATG-CG-C---GC--G---G-T---AATG---TGGTGG-AACTAT----T---G--C--------TCG---AAA----T-------------ATT------C--AAT-T--T--CAAGCTCAGTA--T----GAATGATTTAacgtcctcttcctttgaattaatgcatg
gi|3 : ccgtatgcaaaggcattgtacataacctcaatcaaactaaagagataatATTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AG-CG-T--TGT--AAATA-A---------------------------------AT-------G-A--A----------G--AT-CA--TCA-----AAT-CATTT-AT-TCCAAG-CTCCA--AA---TGC---AA-T-T-CT---GC--GGGC------AA-C-----A--TT--T----------CC-AC--AA--C------------ATAGAT------ACGC----G-C-ATC-AT---G-GA-ATT--GAT-C-A-GAG---CA-AT---------A-ATTGA-A--AT-------AA--T-G----CG-CGC-G-----TA-A---A--A-TCAAATTT-----A-TTGTTT---GC--A-T--TG---A-TCAA-TTG--------AACTAGT------GC--GC--GCA---TG--G-----A----ATA------C------TTTCTTG-----TTT-T--C----A-------TCA-----A-TTGACTAGAT----G-CGC--A-----TCAAAT--CAATC-CT--TGCTCTC----------TTCAA------TTAAATTA-T-----TA-A-----TTTAT----------A---GA-TT-----AAT-TAGTGG-GAGCAA-TATTT-----G--ATTTAA------T---G-CGT-G----T----AT---TAATC-CA--GT---------T--A-----C---A--GT-------GT---G----C-A-AT-AATCA--G-AT--T------GATG-atg
gi|30 : tgatatctttaattgaattcttgctctctttcaaaaagattgagacacgcatta--ATT--GA-----T---G-CAC-G----C----TT------TT-AA--A-------------------A---T--AA-------GA---G----C-A-AT-GACTG--A-GT--T------TATG-TG-T---GC--A---T-C---AAA----T----C-AATTCT----T---G--C--------TCT---CAT----C--A----------GTC------G--AAT-T--G--atataatttcagataaataaaggtatcttcaattaatttggtt
gi|30 : c-AAAT-A-A-GAG---CA-AT---------G-ACTGA-G--TT-------TA--T-G----TG-TGC-A-----TC-A---A--A-TCAA--TT-----C-TTGCTC---TC--A-TC-AG---T-CGAA-TTG--------A-----T------GA--GT--GCG---T---C-----A----ATT------C-----AACTG-TG-------C-G--C----A-------AAA-----ACTTGAatgagtgcgtcaattcaactgtgcgcaaaaacttgattaaagtttgactccat
gi|31 : cattgatgcacgcttttaATTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AT-CG-T--TGT--AAATA-A----TTA-A--A--G----A---TATCT-----------------------AA-G-GA-----------AA-----GAT-CATTT-AT-ACCA-----CCA--CA---TTA---A-------T---GC--GCGC------AT-C-----A--AT--T----------ttaaagtttgactccat
gi|31 : cattc-AT--T------AATG-CG-C---GC--A---T-C---AAT----T----G-AATCAgaatcacaggtatgaataacaggtctctgaattttaatcaa
gi|32 : cattcattccttatacaaaatcgttgtaaataattaaagatatctaaggaaagatcatttataccaccacATCCT----AT-C-----G-A--A-TTAA-A-GAT--AT-CA--TTA-----AAA-TATTT-AT-ACCGAG-CATTA--AA---TAA---AA-T-T-TT---GC--GAAC------AA-T-----A--AT--T----------CA-AC--TA--C------------ATTAAT------GCGA----G-T-ATT-AA---T-TAGATT-A-AT-G-A-GAG---Ccaggtatgaataacaggtctctgaattttaatcaa
gi|33 : tctttaaaaagaatgtttaATTCATT-----G-T-------ATA-A---A-AG-CG-T--TGT--AAAGA-A----TTT-A--A--G----A---TATC---------------------------A-GAG--AT-CA--TTA-----AAT-CATTT-AT-ACCGAG-CACTA--AA---TTA---GA-T-T-TT---GC--GAGC------AA-T-----A--AT--T----------CC-AC--CA--C------------ATTCAT--
gi|33 : cattgATTG--A-TT--T------AATG-CG-T---GA--A---T-G---AATGTGGT----GGAATTAT----T---G--C--------TCG---CAAAATCT--A----------ATT------T--AG--T--GCTCGG------TA--T----AAATGATTTAtcacgcattaaatcaat
gi|34 : cattgattcattgtataaaagcgttgtaaagaatttaagatatcagagatcat-A-GGG--GT-CA--TCA-----ACT-CATTT-AT-ACCGAG-CTCCA--AA---TTA---AA-TAT-ATACAGC--GAGCTTATAGAA-T-----A--AT--T----------CC-AC--CA--C------------ATTGAT------GCGC----G-C-ATC-CA---T-GA-ATT-A-AT-G-C-GCG---CA-AT---------A-AT
gi|34 : --AC---------T--G-----A---T--GA-------TA---G----T-A-AT-GATT-----AT--T------G----CG-C---GC--A---T-T---AAT----T------CATGGA----T---G--C--------GCG---CAT----C--A----------ATcattactatcatcagt
gi|35 : aggggtcatcaactcatttataccgagctccaaattaaatatatacagcgagcttatagaataattccaccacAATT---TCG--ATT--GAATTTTT---G-CGC-G----T----AT---CAATT-CA--ATGATCGTATTT--G-----A---A--GA-------GA---G----C-A-GC-AATTG--G-AT--T------T-TG-TG-C---GC--A---T-C----AT----T----G-A
gi|35 : -CGC-A-----TT-G---A--T-TGAA--TT-----G-TTGAT--------A-T--AG---CATCAA-T-G--------A-----T------GC--GC--ACA-------A-----A----ATC------C-----AATTGCTG-----CTC-T--CTTCAA-------ATACGATCA-TTGAATTGATA--CG-CGC--AAAAATTC-AAT--CGAtgctatatcaacaattcaatcaatgcggatcgacagtaat
gi|36 : aattATTCCTTTAAGTA-T-------ACA-A---A-AG-CG-T--TGT--AAATA-T----CTA-A--A--A----A---CATCTTC--GAT-T-----G-T--A-T-AA-A-GAG--AT-TA--TTA-----AGT-CATTT-AT-gatcgacagtaat
gi|37 : catgattggagtcagttgctctatatatatatggtcgcatta-A----TTG-A--T--G----A---TATCTTC--AAA-T-----G-A--A-TT-A-A-GAG--AT-AA--CTATTCATAAT-TATTC-AT---------TGCATTAA---CTG---AA-T-TATT---GA--TAGC------AA-T-----A--ATTAT----------CT-GC--TG--A------------ATTGAT--G---
gi|38 : aaaccattgggaattgtcAA-T-----GA-A-----TTG-TG-GCGCG--CATTCAT-TC-----AAC-TAACGCAGGGCAAATAATT---CAC--TTC--A------T---G-CAC-G---------AT---TAATTCCA--CT---------T--G-----A---T--GA-------GT---A----C-A-AC-AA-TG--A-AT--cgct
gi|39 : aattctagtatctaaaattgctattT-ACCGAA-CTCCA--AA---TTA---AACT-T-TT---GC--GATC------AA-A-----A--AT--T----------CC-AG--CT--ATT----------ATTAAT--G---GAT-----G-C-ATC-AGT--T-AA-AGT-A-AT-G-A-GAG---CA-AT---------A-AATTA----TA-------AA--T-A----CG-CGC-T-----TC-A---A--A-TCAG--CT-----A-
gi|4 : TATTCCTT-----A-T-------ACG-A---A-AT-CG-T--GTT--AAATA-A----TTA-A--A--AGGACA---CATCTTC--AAC-T-----G-A--A-TCAA-AAGAA--AT-CA--TAA-----AAT-CATTT-AT-ATCGAT-CTCCA--AA---TTG---AA-T-T-T----GC--GAGC------AA-T-----A--AT--T----------C--AG--CA--A------------TTTGAT--G---GCA-----A-C-ATC-AA---T-AT-ATTTAGAA-G-A-GAG---TA-AT---------A-CTTAA-T--TT-------GAGAT-G----CAATGC-A-----TC-A---T--T-TCAA--TT-----A-TTGTTCA--CT--A-T--AT---T-TCAA-TGG--------A-----T------GT--AT--ACA---T---C-----A----ATT------C-----AAATATTC-----CCC-G--C----A-------ACA-----A-TTCAATTGATG--TG--GTTTA-----TCAAAT--CATTT-AT--TG---TC----------CGCAA------TGAAAAAA-A------A-A-----TTGATGCGCGGG--CA---AA-TC-----AA--TACTG--GCGCAA-TAATTC--CAG--ATT--G------T-----CGCGG----C----AT---CAATT-CA--CT---------T--G-----A---T--GA-------GGTATG----C-A-AT-AATTG--A-CT--T------GATG-AG-C---AC--A---T-C---AAT----T----G-AGTTAT----TTCAG--C--------AC----CAA----T--A----------ATT------G---AC-T--G--CAA------TA--T--TTGAcc
gi|40 : tgaagtgcagtTTCCTT-----A-T-------AGA-A---A-GG-TG-T--TGT--AAATA-A----TTA-A--A--G----A---TATCTT---AAT-T-----G-A--A-TTAA---GAG--ATACG--T-A-----AAT-CATTT-AT-ATCGAG-CGTTA--AA---TTA---AT-T-T-TT---GC--GAGC------AA-T-----AATAT--T----------CC-A
gi|41 : -----AAT-TATGGC-GCGCAT-T--TT---CAA--A---------------G-AGA-G----C----AT---GAATT-CA--AT---------T--G-----
gi|41 : aATTCCCA-----A-T-------AGA-A---A-AG-CA-A--TGT--AAATA-A----TCA-------G----A---CATCTTC--AAT-T-----G-A--A-TCAA-A-GAG--AT-CA--TTA-----AAT-CATTcccaatagaaaagcaatgtaaataatcagacatcttcaattgaatcaaagagatcattaaatcatt
gi|42 : acaattgaattcatgctctctttgaaaatgcgcgccata-G----C----AT---TAATT-CA--CT---------T--G-----A---T--GA-------TA---G----C-A-AT-AGTTG--A-TT--T------GATG-CC-C---GT--A---T-C---AAT----TCAAGG-AATTAT----T---G--C--------TCG---CAA----T--A----------TTTCTTTCAA--AAC-T-----CGA------TA--T----AAATAAT-----TGTATG
gi|43 : tC-----AAT-TATTGC-GCGCAT-TAATT----AA--ATG--GA-----T---G-CGC-G----CT---ATGTACAACT-CA--AT---------T--G-----AATTA--CA-------GC---G----C-A-AC-AATTC--A-ATGAT------CATG-CA-C---ATTAA---T-T---AAT----T----G-AATTAT----T---
gi|44 : AATT----AG--ATT--G------T---A-ACT-G----A----AT---CAGTT-CG--AT---------T--G-----A---A--GA-------GA---G----C-A-GT-AATTG--A-AT--T------ATTG-CG-C---GC--ATTTT-C---AAT----T----G-
gi|44 : --ATT--G------T---T-TGC------------T---GAATT-C----T---------T--G-----A---A--GT-------TG---G----C-A-AT----TG--A-A----------AATG-CG-C---GC--A---A-T---AAT----T----C-AATTAC----T---G--C--------TCT---CTT----C--A----------ATC------G--AAC-T--G--ccaacttcaagaattcagcaaacaattaaa
gi|45 : aattagattgtaactgaatT---CAGGAATTA-G------T---G-TGC-G----C----AT---CAATT-CT--TT---------TAAA-----A---A--GA-------GA---G----G-A-AT-AAATC--A-AT--T------taaa
gi|46 : ttcaacatatccacaactgaatcggtgatctttta--AT---------T--G-----A---A--GA-------GC---A----C-A-TT-AATTC--A-AT--TTTTATTAATG-AG-C---AC--A---T-C---AAT----T----C-TATTAT----A---C--T--------GCG---CAA----T--G----------ATT------G--AAA-T--GA-TGA------TATCT--TCAAAtacaaa
gi|47 : AATTG--CA---ATT--GAAGA--T---G-CGC-G----C----AT---CAACT-GA--AT---------T--G-----A---T--AA-------GA---G----T-ATTT-AACTG--A-A---T------AATG-CG-C---GT--A---T-gcat
gi|48 : tcttcagatcaccaTCCTT-----G-C-------TCT-A---A-AG-CA-T--TGT--AAATA-A----TTA-A--A--G----A---TATCCTC--AGT-T-----C-A--G-TTAT-T-GAG--AT-C---------------------AT-ACCGAG-CTCCA--AA---TGC---AA-C-T-TT---GC--attatgtatt
gi|49 : gC-G----C----AT---CAATT-AA--AT---------T--G-----A---T--AT-------GA---A------A-AT-AATTG--A-TT--T------GATGTCG-T---TC--A---T-C---AAT----T----A-AAATCT----T---GCAC--------GCA---CAA----T--A----------GTT------G--Aag
gi|5 : aTATTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AA-CG-TAATTT--TAATG-A----TTA-A-----G----A---TTCCTTC--GAT-T-----A-A--A-TCAG-A-TAG--AT-CA--TGA-----AAT-CATTT-AT-ACCGAG-CTCAA--AA---CGC---AA-T-T-TT---GC--GAGC------AA-T-----A--AT--T----------CC-AT--CACCACGGGTCCATCACATTGAT--GC--GCGTATT-G---ATC-AA---T-GA-AAT----T-G-A-GAG---CATAT---------ATAT--A-T--ATAGAGAGGGA--T-GAATATG-AAC-A-----TC-A---G--A-TCAA--TT-----T-TTGCTC---TC--A-TC-AT---T-GGAA-CTA--------G-----T------GC--GC--AAAATTT---T-----ACCTGATT------T-----ACGCATT-------TA-G--C----A-------ATA-----A-TTGATTTGATG--CG-CGT-----------AAT--TGA-T-AT--T------------------CAA------ATAAAAAA-A-----GA-G-----TTTATta
gi|50 : attgatgcgcacatat-CG-T--TGT--AAATA-A----ATT-A--A--G----A---TAACTTC--AGT---------A--A-T----------------------------T-TATTT-AA-ATCAAG-CTCCA--GT---TTA---GA-T-T-CA---GC--GAGC------AAGT-----A--AT--T----------CC-aaatgttaatt
gi|52 : ---CAT--ATT--GA-----T---G-CAC-A----C----GT---CCATT-GA--AT---------T--G-----A---TTAAA-------GA---G----C-A-AT-AACTG--A-AT--T------GATG-CA-A---GC--A---
gi|55 : taaATTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AG-CT-T--TG
gi|56 : gctctctttagaaagaactaatgcgcatcgcta-----AAT-CATTT-AT-AC-GAG-CATTA--GG---TCA---GA-T-T-TT---GC--ATGC------AA-T-----A--AT--T----------TC-AC--g
gi|57 : ttTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AT-CT-T--TGT--AAATA-A----TTA-A--A--G----A---T
gi|6 : ttcattgtaATTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-A--TG-T--TGTGTAAATA-A----CTA-A--AAAG----A---TATCTTC--CATAG-----G-A--A-TTAA-A-G-T--AT-CA--TTA-----AAT--ATTT-ATTACCAAGGCCTTA--AA---TTA---AA-T-T-TTT--GT--GAGC------AA-TAATTGA--AT--T----------CC-A----A--A------------ATTAAT------ATGATCATG-C-ATA-AA---TCAA-ATC-TAAT-GCA-GA-----A-A----------G-ACTAA-T--AT-------AA--T-------------------TG-A---A--A-T-AA------------TG--C---CC--A-C--AT---T-T-AA--TG--------A----------------------A---T---C-----T----ATT------C-----AAA-ACT------CTC-G-------G-------TCA-----A-TTGAATTCATG--TGACAC--A-----TTAAA---AGATT-AT--TG---TC----------
gi|7 : tttttaattcaacagttattccacaatttgaattaaattaaatgttctctttcaattgaattattgctgtcttttaatgaatta-AGAA-G-G-GAG---CA-AT---------A-ATTGA-T--TT-------TA--T-G----CG-CTC-AATCCTTC-AATGA--A-GCGAT-TT-----A-ATGCTT---TC--AGG--AA---T-TCAA-TTG--------T-----T------TC--TC--TCG-------C-----A----A--------------AACTACAG-----TTCGG--T----AG------ACA--------TAATTTGATG--AT-CTC--T-----TCAATT--CAATTGATGATG---TCTTTAAACATTCGCAAACTTTTTG--TAAA-A-----GATA-----TTAATGCATGCA--CA---CC-TC-----ATT-TTTT----------TAA------AG--A------------------GA-G----C----AA---CAATT-CA--GT---------T--A-----A---A--GG-------TA---T----C-A-TT-AATTAGTA-GT--T------GATt
gi|7 : attcaacatCTT-----T-T-------ACA-A---A-AA-GT-T--TGC--GAATG-T----TTA-A--A--G----A---CATCATC--AAT-T-----G-A--A-TTGA-A-GAG--AT-CA--TCA-----AAT-TATGT-CT-ACCGAA-CT------G---T-----AG-T-T-TT---GCGAGAGA------AA-C-----A--AT--T------------------G--A------------ATTCCT--G---AAA-----G-C-ATTAAA---T-CG-CTT-CATT-G-A-AGG-------------------ATTGA-------------------------G-CGC-A-----TA-A---A--A-TCAA--TT-----A-TTGCTC---CC--T-T--CT---T-AGGATTTA--------A-----T------GT--GC--GCA---TATAC-----ATGT-AAT------C-----CATAATTA-----CTT-T--C----C-------ACA-----A-TTGCAGTGCAG--TG-CAC--A-----taggatttaatgtgcgcatatacatgtaatccataattactttccacaattgcagtgcagtgcacaatgcaat
gi|8 : attcaacatatcaactactaattaatgatacctttaactgaattgttgctctctttaaaaaaatgaggtgtgcatgcattaatatTT-----A-T-------ATACA---A-AT-CG-T--TGT--TAATG-A----TTT-A--A--G----A---TATCT-C--AGT-T-----G-A--A-TCAA-A-GAG--AT-CA--TAG-----AAT-AATTT-GC-GTCAAG-CTCTA--AA---GTA---AA-T-T-CT---A---GATC------AA-T-----G--GT--T----------CC-AT--CA--A------------AATG-T--T---GCG-----G-CTATC-AG---T-G---------------GAG---TT-AT---------A-A--GA----TT-------GA--T-G----CG-CCA-A-----TC-A---A--A-TCAA--TT-----A--TGTTC---CC--A-----------TCAA-CTGA-------A-----TTACACAGC--GC--GCA---T---C-----ATG--ATT------------AATTATTGATTTACTC-G-----------------------A-TTGAATatgcaat
gi|8 : ctttaatagaactgctactctttaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaattA-A-----GA-------TTGATGCGC-CAATCA---AA-TC-----AAT-TA-TGT-TCCCAT-CAACT---GA---ATT--A------CACAG-CGC-G----C----AT---CA-------------------T--G-----A---T--------------------------T-AATT-----AT--T------GATT-TA-C-----------T-C---GAT----T----G-AATGA---------G--A--------ATG---CAA-------A----------CTT------G--AAT-TAAA--CGA------TA--TCCTCAAATAATgagaatgcaaacttgaattaaacgatatcctcaaataatg
gi|8 : ctttaatagaactgctactctttaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaattttatatacaaatcgttgttaatgatttaagatatctcagttgaatcaaagagatcatagaataatttgcgtcaagctctaaagtaaattctagatcaatggttccatcaaaatgttgcggctatcagtggagttat-TAATT---CAA--GTT---------T---G-CAT-T----C-----T---CA-TT-CA--AT---------C--G-----A---G--TA-------AA---T----C-A-AT-AATT---A-ATCAT------GATG-CG-C---GCT-G---TGT---AAT----T----C-AGTTGA----T---G--G--------GAA---C-A----T--A----------ATT------G--Ag
gi|9 : ctttaatagaactgctactctttaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaattttatatacaaatcgttgttaatgatttaagatatctcagttgaatcaaagagatcatagaataatttgcgtcaagctctaaagtaaattctagatcaatggttccatcaaaatgttgcggctatcagtggagttataagattgatgcgccaatcaaaA-ATT--GAT-A-A-GAA---CA-AT---------A-ATTGACT--TT-------AA--T-------------------------------TCAA--CC-----A-TTGTTC---TC--A-TC-AT---T-TTAA--TG--------A-----T------GC--AT--GCA---T---T-----ATTGTGTTG-----G-----GATTACTG-----CTC-G--C----AAAATGGTACA-----A-ATGATTTCATGATTG-CTC--GATT--TCAACTGAAGA-T-AT--TT---TT----------AATCA------TG-TATAA-A-----GA-A-----TTAACGCTCGCA--CC---AATTC-----TTT-TAAAGA-AAGCAA-AAATT---CA---ATT---------------CG--A----A----AT---C-ATT-----AT---------T--A-----G---A--AATATCTTTAA---T----C-A-AT-AATCA--A-AT--T------GAAG-AG-A---GC--A---A-T---AAT----T----C-TATTAT----T---G--C--------CCG---CAT----T--T----------ATT------A--AAC-aacgatatcctcaaataatg
gi|9 : ttg-T--TAT--ACATG-A----TTA-A--A--A----A---TATCTTC--AGT-T-----G-A--AATCGA---GCA--AT-CA--TGA-----AAT-CATTT-GT-ACC-----------------------A-T-T-TT---GC--GAGC------AG-T-----A--AT--C----------CC-AA--CA--C------------AATAAT--G---CAT-----G-C-ATC-AT---T-AA-AAT--GAT-G-A-GAA---CA-AT---------G-GTTGA-------------------------------A-----TT-A---A--AGTCAA--TT-----A-TTGTTC---TT--A-----------TCAA-TTG--------AG----T------AC--GC--gagtacgc
blockSeqs : TAAGT C TTTGAAA C TAT T GG G AA GT G CCCT T AAGGAC CAT CA TTACCG T TT A T C A TT T CT T TTCAT GT G T G TT GAC TGATT T A A ACA GA TTATAG C AATTG AT TA TATGTAATGC T CAG CCACGGGTCCATCAC GCGCGTATT T A A ATCCAACTTAT T C T GAC T ACTCTCTTG G T TATAGAGAGGG TGAATA A G ATCCT TA ATG TTA AT TATTA C C TCTGACATCAGT C T AATTACACA AT AT ATT CGTATA TTGTGTTGGGATTACTGCTCGCAAAATGGTACA C ATT CTCTTCAATTCAATTGATGATGTCTTTAAACATTCGCAAACTTTT A . . AGTAAC GCGCATTC T AACGG A A CA AA TCGATTGAATTTTT A G AAGA T GTA C GC GATCGTATT AA GATCA AAATATCTTTAAT T T C AGT C GA TTTATT T T CAC TA TTT G TTT GTGG GGTGG TTCAA TCA CA TCTGTAAA CTA TATGATGCACGC CTTTCA AA CA TCAAGCTCAGTATG A T .
blockSeqs : . . . . . . AA . AA . . . . AAGAC . . TTG . . . T . . . A . A . A . . . . . GA C . . A T . G . . . . . T ACACT ATGATCAT . T A TATATTTAG . . . . T . T T TAATTA GATG . . . C . AG T . . C GCTTCATATT G . AACTAGT . . . ATAC ATCCAATTGCTGCTCTCTTCAAATACGATC . C CTCGATTTCAACTGAAGATATTTTTAATCA A . . TA CAATCA . . . A A T GCAATTGAAGAT . . . . C . . . . G AGAGAGAGCT . . . T . CA G . . . T . . C G CAAGG T . . . . AATCTA . . A AAACGATATCCTCA A A
blockSeqs : . . . . . . T . . . . . . GCAG . . AG . . . A . . . . . C . C . . . . . TG . . . T . . . . . . . . T ATT GAGTACG . . . TCAAATCTA . . . . . . . G CTTTA CTG . . . C . T . . . C TCGTCAATG G . AGT . . . GG ATTATGATATAACTGCTATCCTCACAGAA . T CGCATCAAATCAATCCTTGCTCTCTTCAA A . . A GGGCA . . . T C A CAGGAATTAGT . . . . . . . . . . TGAGGTATG . . . G . . . . . . . . . . . GG T . . . . TGCA . . C GATGATATCTTCA G T
blockSeqs : . . . . . . G . . . . . . TGCG . . T . . . T . . . . . C . C . . . . . TG . . . . . . . . . . . . C C GTTGCG . . . TGAACTAA . . . . . . . C TTGG TGG . . . C . A . . . T ACTATATT C . AT . . . T AATCAATTCCTGCGCTGATCATCA . T GTTTATCAAATCATTTATTGTCCGCAA A . . A GGGCA . . . C C T GAATTACACA . . . . . . . . . . ATTACAGCG . . . G . . . . . . . . . . . G T . . . . TA . . T GTAACATCTTCA G T
blockSeqs : . . . . . . A . . . . . . AAAG . . T . . . T . . . . . T . C . . . . . TA . . . . . . . . . . . . C A GCGCG . . . TGCATTAG . . . . . . . C TCTA TG . . . C . A . . . C CCATCAAC G . AT . . . C TGTAATCCATAATTACTTTCCACA . C TTTATCAAATCATTTATTGTCCGCAA A . . A GCACA . . . T G A GAACAAATT . . . . . . . . . . TTAAAGAG . . . G . . . . . . . . . . . G T . . . . TA . . T GCAATACTTC G .
blockSeqs : . . . . . . G . . . . . . AT . . T . . . C . . . . . A . C . . . . . GA . . . . . . . . . . . . T C TAAAC . . . CTGAATTT . . . . . . . T ATTA TG . . . C . A . . . T TCATGAAT C . GT . . . C CCTGATTTACGCATTTAGCAATA . C CTCTTCAACTGAATTATTGAAA A . . A GCACC . . . C C A CCAGATTGT . . . . . . . . . . AGAGACA . . . C . . . . . . . . . . . G T . . . . TA . . C GCTCGGTATA A
blockSeqs : . . . . . . G . . . . . . AT . . T . . . C . . . . . T . C . . . . . TC . . . . . . . . . . . . C T CGCGC . . . GTACATTG . . . . . . . C ATTG TG . . . A . A . . . T TCATCAGT C . AT . . . C TGATTAATTATTGATTTACTCG . T CGTAATTGATATTCAA . . . G AC . . . C C A CATATTGAT . . . . . . . . . . TGCGCG . . . C . . . . . . . . . . . G A . . . . TC . . C GCAATATTTG A
blockSeqs : . . . . . . G . . . . . . AT . . T . . . T . . . . . A . A . . . . . TG . . . . . . . . . . . . C A GACG . . . TTGAATTG . . . . . . . T TTTG TG . . . C . T . . . T ACTATATT G . TA . . . C TGATTAATTATTGATTTACTCG . C TGTATTTGTCAGA . . . A A . . . G T G TATATTAT . . . . . . . . . . ACATAT . . . G . . . . . . . . . . . C C . . . . CA . . C GATGTTCG
blockSeqs : . . . . . . T . . . . . . AG . . T . . . C . . . . . C . C . . . . . GC . . . . . . . . . . . . T A GCGC . . . TATATTAG . . . . . . . T ATTC TG . . . C . A . . . C TCATCATT A . AT . . . C ATGCTATTCTTTCGCGTAATG . T . . . . . . A G A CCGTTAGT . . . . . . . . . . AGAAAG . . . G . . . . . . . . . . . C T . . . . CA . . A CGATATA
blockSeqs : . . . . . . G . . . . . . AG . . T . . . T . . . . . A . C . . . . . TA . . . . . . . . . . . . T A ACAA . . . AGAGTTAG . . . . . . . T TTTA GG . . . T . A . . . C TCAGGAAT C . AT . . . C ATTCAAATATTCCCCGCAACA . A . . . . . C C A CAGATTGT . . . . . . . . . . TGAGAG . . . C . . . . . . . . . . . G T . . . . TA . . T
blockSeqs : . . . . . . T . . . . . . AG . . T . . . T . . . . . A . C . . . . . CA . . . . . . . . . . . . C A GCGT . . . TTAGATTA . . . . . . . T CTTG TG . . . A . G . . . T TCATCATT C . AC . . . C ATTCAAATATTCCCCGCAACA . T . . . T C T TGATTAAT . . . . . . . . . . CAAAGG . . . A . . . . . . . . . . . C T . . . . TA . . C
blockSeqs : . . . . . . G . . . . . . AG . . C . . . T . . . . . G . C . . . . . TG . . . . . . . . . . . . C C GGCA . . . TTAAAGTA . . . . . . . T AATA TG . . . C . A . . . C GCATTGA G . AT . . . T ATACTTTCTTGTTTTCATCA . . . . . T T T GATTTAAT . . . . . . . . . . TGAGAA . . . G . . . . . . . . . . . C A . . . . CA . . .
blockSeqs : . . . . . . G . . . . . . AG . . C . . . C . . . . . T . T . . . . . GC . . . . . . . . . . . . C T GAGA . . . TCGCTTCA . . . . . . . C GTTT AC . . . T . A . . . A CCACATT C . GC . . . C AAACTACAGTTCGGTAGACA . . . T A T CACTTCAT . . . . . . . . . . AGAGGA . . . G . . . . . . . . . . . G T . . . . TG . .
blockSeqs : . . . . . . T . . . . . . AA . . T . . . T . . . . . C . C . . . . . TA . . . . . . . . . . . . C C GCGT . . . TGAATTC . . . . . . . T TTTG TG . . . C . T . . . T CCTTCTT C . AT . . . A ATTAGTATTGCCCACGAGA . . . A . A AAATGGAT . . . . . . . . . . AGTGTG . . . G . . . . . . . . . . . G T . . . . TA . .
blockSeqs : . . . . . . G . . . . . . TG . . T . . . C . . . . . A . C . . . . . AA . . . . . . . . . . . . C C GGGA . . . GGAATTG . . . . . . . A TATA TG . . . C . A . . . C ATAGCA G . AT . . . C ATTCAACTGTGCGCAAAA . . . . . . AGATTGT . . . . . . . . . . TAAGAG . . . G . . . . . . . . . . . G T . . . . TA . .
blockSeqs : . . . . . . G . . . . . . AG . . T . . . T . . . . . T . C . . . . . TA . . . . . . . . . . . . C C ACGC . . . TGAATTA . . . . . . . T TTTT TA . . . C . T . . . C CACT C . AT . . . T ATTCAAAACTCTCGGTCA . CAAGTTT . . . . . . . . . . TGATAG . . . G . . . . . . . . . . . G C . . . . TT . .
blockSeqs : . . . . . . T . . . . . . AG . . T . . . C . . . . . T . T . . . . . TA . . . . . . . . . . . . C C GCGA . . . TAAAATG . . . . . . . T TTA TG . . . G . A . . . C CAAT G . GT . . . C ATTCAATGCAGAAATA . ATTGAT . . . . . . . . . . AGAGAG . . . G . . . . . . . . . . . G T . . . . T
blockSeqs : . . . . . . G . . . . . . AG . . T . . . T . . . . . C . C . . . . . TG . . . . . . . . . . . . G C GCGC . . . TGAAGA . . . . . . . C TTG TG . . . C . A . . . T AAT C . TT . . . C CAATT . . . . . . . . . . TGAGTA . . . C . . . . . . . . . . . C T . . . . A
blockSeqs : . . . . . . G . . . . . . AG . . T . . . T . . . . . T . C . . . . . TA . . . . . . . . . . . . G A GGAT . . . TGAAAT . . . . . . . T TAA T . . . A . A . . . T CCA T . AT . . . C GAAA . . . . . . . . . . TGATAG . . . G . . . . . . . . . . . C A . . .
blockSeqs : . . . . . . G . . . . . . AG . . T . . . C . . . . . T . C . . . . . TG . . . . . . . . . . . . T A GGCA . . . TATTA . . . . . . . T TTG T . . . C . A . . . T CCA C . AT . . . T CAAA . . . . . . . . . . AGAGAG . . . G . . . . . . . . . . . A T . .
blockSeqs : . . . . . . A . . . . . . AG . . T . . . C . . . . . A . C . . . . . TA . . . . . . . . . . . . C A GAAA . . . TTTAA . . . . . . . T TG . . . . T . A . . . . TTA . . A . . AGA . . . . . . . . . . AGTTGG . . . C . . . . . . . . . . . G . .
blockSeqs : . . . . . . G . . . . . . AA . . T . . . . . . . . . T . T . . . . . GC . . . . . . . . . . . . T A TGCG . . . TG . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . AGAGAG . . . C . . . . . . . . . . . C
blockSeqs : . . . . . . T . . . . . . A . . T . . . . . . . . . G . C . . . . . GC . . . . . . . . . . . . A A GCAT . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AGAGCA . . . G . . . . . . . . . . . C
blockSeqs : . . . . . . A . . . . . . G . . . . . . . . . . . . T . T . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . C TG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TAAGAG . . . G . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T . . . . . . G . . . . . . . . . . . . C . A . . . . . CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TATGAA . . . G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . C . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AGGTAT . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GTAAAT . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AGA . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons : GCGN********** TGAATTA******* NTTG********** TCATCANT*********** AT******************* ***** GCGCA***** CAGATTGT**************** **** T**** GCGATATCTTCG************
originalCons : TATTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AG-CG-T--TGT--AAATA-A----TTA-A--A--G----A---TATCTTC--AAT-T-----G-A--A-TCAA-A-GAG--AT-CA--TNA-----AAT-CATTT-AT-ACCGAG-CTCCA--AA---TTA---AA-T-T-TT---GC--GAGC------AA-T-----A--AT--T----------CC-AC--CA--A------------ATTGAT--G---GCG-----G-C-ATC-AA---T-GA-ATT-AGAT-G-A-GAG---CA-AT---------A-ATTGA-T--TT-------GA--T-G----CG-CGC-A-----TC-A---A--A-TCAA--TT-----A-TTGCTC---CC--A-T--AT---T-TCAA-TTG--------A-----T------GC--GC--GCA---T---C-----A----ATT------C-----AANTATTG-----CTC-G--C----A-------ACA-----A-TTGAATTGATG--CG-CGC--A-----TCAAAT--CGATT-AT--TG---TC----------CGCAA------TGAAAAAA-A-----GA-A-----TTGATGCGCGCG--CA---AA-TC-----AAT-TANTGC-GCGCAN-TAATT---CAG--ATT--G------T---G-CGC-G----C----AT---CAATT-CA--AT---------T--G-----A---N--GA-------GA---G----C-A-AT-AATTG--A-AT--T------GATG-CG-C---GC--A---T-C---AAT----T----G-AATTAT----T---G--C--------GCG---CAA----T--A----------ATT------G--AAC-T--G--CGA------TA--T--TCGAATGATTTACGTGTATGCTT
finalCons : TATTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AG-CG-T--TGT--AAATA-A----TTA-A--A--G----A---TATCTTC--AAT-T-----G-A--A-TCAA-A-GAG--AT-CA--TNA-----AAT-CATTT-AT-ACCGAG-CTCCA--AA---TTA---AA-T-T-TT---GC--GAGC------AA-T-----A--AT--T----------CC-AC--CA--A------------ATTGATGCGN----------G-C-ATC-AATGAATTA-------AT-G-A-GAG---CA-AT---------A-ATTGANTTG----------A--T-G----CG-CGC-A-----TC-A---A--A-TCAA--TT-----A-TTGCTCTCATCANT-----------TCAA-TTGAT-------------------GC--GC--GCA---T---C-----A----ATT------C-----AANTATTG-----CTC-G--C----A-------ACA-----A-TTGAATTGATG--CG-CGC--A-----TCAAAT--CGATT-AT--TG---TC----------CGCAA------TGAAAAAA-A-----GA-A-----TTGATGCGCGCGCA-----AA-TC-----AAT-TANTGC-GCGCAN-TAATTCAGATTGT----------------G-CGC-G----C----AT---CAATT-CA--AT---------T--G-----A---N--GA-------GA---G----C-A-AT-AATTG--A-AT--T------GATG-CG-C---GC--A---T-C---AAT----T----G-AATTAT----T---G--C--------GCG---CAA----T--A----------ATT------G--AAC-TGCGATATCTTCG------------AATGATTTACGTGTATGCTT
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|51 ): AGTGCTAGCGATATATTCAATTCCACACATCCACAACTGAATTAATGATCTCTTCAATCATCAA
Unaligned ( gi|53 ): ATGATCTCTTTAACGTTGAATTGTTAATCTCTTTAAGAAAAATGGATGCGTGCATTGATTC
Unaligned ( gi|54 ): TGTATTCATTGAATTATCGATGACATTAATTATCATGCTTAATTGATACGCGCTAA
Unaligned ( gi|58 ): AACGTATCCTCAAATAATGAAAGAATCTTCGTTATATAATT
Unaligned ( gi|59 ): TATCCAGAACTGAATTAATTATCTTTTTAATT
Unaligned ( gi|60 ): AGTATTCAAATAATGAGACCAAGAAATGATT
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111 222222222222222222222222222222222 111111 1111111111111111111 333333333333333333333333333333333 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 1111111 1111111111 22222222222222222222222222 11111111111111111 111111111111111111111 111111
lowQualScore : 33333 1 4444444 1 222 1 44 1 33 22 1 2222 1 7777777777 222 11 5555555 1 11 1 6 1 1 11 2 11 3 33333 33 1 1 1 11 222 44444 3 1 1 333 33 333333 2 22222 11 11 5555555555 222 1 66666666666666666666 1 5555 2 1 1 333333333333333333333333333333333 44 9999999999999 55555 0 33 333333 1 33 1 1 4 33333 1 222 222 33 1 33333 1 3333 1 7777777 333 4 222 1 333 44444 1 22 1 22 222 555555555 9999999999999999999 3 000000000000000000000000000000000 2 666 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 1 3 99999 4444444 7777777777 3 77777 4 99 55 33333333333333333333333333 1 666666666 444 1 1 222 666666666 22 55555 3333 44444444444444444 1 3 333333333333333333333 22 444444 11 333 22 666 333 1 888888 1 333 99999999999 444 33 66666 111111 33 6 88 0 666 888 2 7 6
lowQualScore : ..... . ....... . ... . .. . .. .. . .... . .......... ... .. ....... . .. . . . . .. . .. . ..... .. . . . .. ... ..... . . . ... .. ...... . ..... .. .. .......... ... . .................... . .... . . . ................................. .. ............. ..... . .. ...... . .. . . . ..... . ... ... .. . ..... . .... . ....... ... . ... . ... ..... . .. . .. ... ......... ................... . ................................. . ... ......................................................... . . ..... ....... .......... . ..... . .. .. .......................... . ......... ... . . ... ......... .. ..... .... ................. . . ..................... .. ...... .. ... .. ... ... . ...... . ... ........... ... .. ..... ...... .. . .. . ... ... . . .
lowQualScore : 77777 5 8888888 5 666 5 55 4 88 00 4 9999 4 9999999999 444 99 4444444 4 99 4 1 3 3 88 6 88 2 11111 11 3 2 3 88 333 22222 9 3 3 555 00 666666 4 99999 66 66 1111111111 111 2 88888888888888888888 2 2222 7 2 2 222222222222222222222222222222222 77 0000000000000 22222 4 66 111111 0 44 4 4 1 44444 4 444 777 22 3 22222 4 1111 5 1111111 222 9 888 6 888 00000 6 22 6 22 999 222222222 7777777777777777777 0 888888888888888888888888888888888 2 444 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 9 6 11111 0000000 0000000000 6 77777 0 00 22 55555555555555555555555555 7 777777777 888 7 7 444 222222222 11 44444 7777 55555555555555555 5 1 000000000000000000000 00 444444 88 222 55 444 222 8 222222 6 999 55555555555 444 44 22222 333333 99 7 66 8 222 444 7 5 7
consensus : TATTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AG-CG-T--TGT--AAATA-A----TTA-A--A--G----A---TATCTTC--AAT-T-----G-A--A-TCAA-A-GAG--AT-CA--TNA-----AAT-CATTT-A-TACCGA-GCTCCA--AA---TTA---AA-TT-T-T---GC--GAGC------AA-T-----A--AT--T----------C---C-AC--CA--N------------ATTGA-TG----CGCGCATC-A-A---T-G-A-AT--T---A-A--T--G-----A-GAGCA--AT-------------A-----ATTG-A-----ATTGA--T-GCG-CGC-A-----TC-A---A--ATCAA--T-T-----AT-T----GC-TCT----C--ATCAAT-TNAA---T-TG--A-----T-GC--G-C--GCA---T---C-----A----ATT------C-----AATTATTG-----CTC-G--C----A-------ACA-----A-TTGAATTGATG--CGCGC--A-----TCAAAT--CGATT-AT--TG---TC----------CGCAA------TGAAAAAA-A-----GA-A-----TTGATGCGCGCG--CA---AA-TC-----AATTANTGC-GCGCAA-TAATT---CAG--ATT--G------T---G-CGC-G----C----AT---CAA-TT-CA--AT---------T--G-----A---AGA-------GA---G----C-AAT-AATTG--A-----------------AT--T------GATG-CGC---GC--A---TC---AAT-T----G-AATTATT---G--C--------GCG---CAAT--AA-----TT------G--AAC-TG--CGATATC--TT-CGAATAATTTAC-TGTATGCTT
Reference ( family-5 ) : TATTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AG-CG-T--TGT--AAATA-A----TTA-A--A--G----A---TATCTTC--AAT-T-----G-A--A-TCAA-A-GAG--AT-CA--TNA-----AAT-CATTT-A-TACCGA-GCTCCA--AA---TTA---AA-TT-T-T---GC--GAGC------AA-T-----A--AT--T----------C---C-AC--CA--A------------ATTGA-TG----CGNGCATC-A-A---T-G-A-AT--T---A-A--T--G-----A-GAGCA--AT-------------A-----ATTG-A-----NTTGA--T-GCG-CGC-A-----TC-A---A--ATCAA--T-T-----AT-T----GC-TCT----C--ATCANT-TCAA---T-TG--A-----T-GC--G-C--GCA---T---C-----A----ATT------C-----AANTATTG-----CTC-G--C----A-------ACA-----A-TTGAATTGATG--CGCGC--A-----TCAAAT--CGATT-AT--TG---TC----------CGCAA------TGAAAAAA-A-----GA-A-----TTGATGCGCGCG--CA---AA-TC-----AATTANTGC-GCGCAN-TAATT---CAG--ATT--G------T---G-CGC-G----C----AT---CAA-TT-CA--AT---------T--G-----A---NGA-------GA---G----C-AAT-AATTG--A-----------------AT--T------GATG-CGC---GC--A---TC---AAT-T----G-AATTATT---G--C--------GCG---CAAT--AA-----TT------G--AAC-TG--CGATATC--TT-CGAATGATTTACGTGTATGCTT
gi|1 : -----AATTATTGC-GCGCAT-AAATT---GAG---TT--A------T---G-CGC-G----CTACGAT---CGA----CA--AT---------C--G-----A---AAA-------GA---G----T-AA
gi|1 : aattgatgattctttaccaacattgaagA-TT-CA--AT---------T--GG----A---AGA-------GAC--A----C-AAT-ATTTA--A-----------------AT--T------ATTG-CGC---GC--A---TA---AAT-T----G-AGTTA-T---G--C--------GCG---CTAC--GA-----TC------G--Ataaatattgtgtctcttccaattgaataattcaatgtgcaaaataaataattcttttgagaaagcaactatctaattggagatagcttcattcaacatatccactattgaattaatatttctttaattagaactgctactcctttaaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaaatttcttatacaatcgttgttaatgatttaagatatctcagttgaatcaaagagatcatagaataatttgcgtcaagctctaaagtaaattctgagatcaatggttccatcaaaatgttgccgctcatcagtggagttataagattgatgcgcgcaatcaaatcaattattgttcccatcaactgaatctaacacgcgcgcatcatgataatattgatttactcgattgaagagaatgcaaactg
gi|1 : aattgatgattctttaccaacattgaagttactcttttcgattgATTTCTT-----A-T-------ACA-A------T-CG-T--TGT--TAATG-A----TTT-A--A--G----A---TATCT-C--AGT-T-----G-A--A-TCAA-A-GAG--AT-CA--TAG-----AAT-AATTT-G-CGTCAA-GCTCTA--AA---GTA---AA-TT-C-T---GA--GATC------AA-T-----G--GT--T----------C---C-AT--CA--A------------AATGT-TGC---CGCTCATC-A-G---T-G---------------------------GAGTT--AT-------------A-----A--G-A------TTGA--T-GCG-CGCAA-----TC-A---A--ATCAA--T-T-----AT-T----GT-TCC----C--ATCAAC-TGAA---TCTAACA-----C-GC--G-C--GCA---T---C-----ATG--AT--------------AATATTGATTTACTC-G-----------------------A-TTGAAaattcaatgtgcaaaataaataattcttttgagaaagcaactatctaattggagatagcttcattcaacatatccactattgaattaatatttctttaattagaactgctactcctttaaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaaatttcttatacaatcgttgttaatgatttaagatatctcagttgaatcaaagagatcatagaataatttgcgtcaagctctaaagtaaattctgagatcaatggttccatcaaaatgttgccgctcatcagtggagttataagattgatgcgcgcaatcaaatcaattattgttcccatcaactgaatctaacacgcgcgcatcatgataatattgatttactcgattgaagagaatgcaaactg
gi|10 : aattgatgattctttaccaacattgaagttactcttttcgattgtcgatcgtagcgcgcataactcaatttatgcgcgcaataatttaaatattgtgtctcttccaattgaataattcaatgtgcaaaataaataattcttttgagaaagcaactatctaattggagatagcttcattcaacatatccactattgaattaatatttctttaattagaactgctactcctttaaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaaGCATG-A-AC--T-A-A-AT--T---G-A--G--A-----A-GACCA--AT-------------A-----ATTG-A-----TTGGA--T-GCG-TGC-G-----CC-A---A--TTGAA--T-C-----GG-T----GC-GCG----C--TTCATA-TTAA---T-TA--A-----T-GC--A-T--ACA---T---CGTATAA----ATTATGATAT-----AACTGCTATC---CTC-A--C----A-------GAA-----A-CTGAAATGATG--TG-----A-----TCAAAC--GGA---AT--TG---AC----------CA----------GAGCAAATATTTTTGA-T-----TTGATGCGTG-G--C-----A-TCAACGGAATTGATAA-GCGCAT-CAATT---TAT--ATT--A------T---GACAA-G----C----ATC--CAA-Tgagaatgcaaactg
gi|11 : ctttgctatccATTCTTT-----A-TTTTGAAAATA-A---G-AT-CA-T--TGA--AAATA-G----TGA-A--A--T----ACATTATCTTC--AGT-T-----G-G--A-ATAA-A-GAG--AT-CA--CTA-----AAT-AGTTT-A-TACCGT-GCTCAA--AA---TGA---TA-TT-T-T---AC--GAGC------AACT-----A--AT--T----------C---C-AT--CG--C------------AT--A-T-----------TG-A-A---T-G-C-AT--T---AGA--T--G-----A-GAAAA--AT-------------C-----ACT---------CTAAC-T-GCG-CGC-A-----TC-A---A--ATC-------------T-T----G---------------AAT-TCAA---T-GA--A-----T-T--------------T---T-----A----ATT-------------AGTATTG-----CCC-A--C----G-------AGA-----A-GTAAATTGATG--CGC
gi|12 : acatgtgtacattaTATTTCCT-----ACT-------ACA-A---A-AGGCGGT--TGT--AA-TAGA----TTA-A--A--T----A---TACCTTCCAAAT-TTG---G-A--A-T-AA-A-GAG--AT-CA--TAC-----AATGTATTTGA-TATCGA-GTTGAC--AG---T-----AA-TA-G-T---GC--GAGC------AA-T-----A--AT--T----------C---CTGT--TG--A------------ATTGA-TGA---CG-GCATC-A-AATCC-A-A-CT--T---ATC--T--G-----C-TA-CAT-GC-------------A-----AGTG-A-----ATTAA--TGGCG-CGC-A-----T--A---ATTATCAA--T-T-----AT-
gi|13 : cttaactgaatgtgctcttcttaaaaggaaggatgcaagcggt-TC-----AATTTACGC-ACGCAA-TCATT---CCG--TTA--G------T---G-ATA-GAAGAT----AT---C---TT-CA--AT---------T--C-----A---ACA-------TA---T----C-CAC-AATTG--A-----------------AT--T------AATG-------GT--A---TCTTTCAT-T----G-AATTATT---G--CTCTGTAAAACG----AAT--AA-----TTGC----G--AACATG---GATTCC--TTACAAAAAA--TACTTGTA
gi|14 : cgcgcatgcaataatcatcataatacacacattgatcttttctattgatatcaactacaaatgtatCTT-----A-T-------ACA-A---A-AG-CG-T--TGA--TAATA-G----TTTTA--A--T----A---TATCGTC--AAA-T-----G-A--A-TTAA-A-GAG--AT-CA--TCT-----AAC-CA--------CCGA-GCTCCA--AA---TTG---AA-T----------------------------------------------------------------------------ATTGA-TG----CGCGCGTC-A-AC--T-G-A-AT--T---T----T--G-----G-GAGCA--AT-------------A-----ACTT-A-----ATTGA--T-GCG-CGC-A-----TC-A---A--ATCAA--G-T-----AT-T----TC-TCTCTGAC--ATCAGT-TGAA---T-TA--G-----T-GC--G-T--GAA---T---C-----A----ATT------C-----AAacgttttttaaaactcatc
gi|15 : tctttagctgaattgttgctttctttaaaagtgcgctTCTTT-----A-T-------ATA-A---A-AA-CG-T--TGT--AAATA-A----TTA--------------------TTT--AA--------G-A--A----A-G-GAG-----TA---CA-----AAT-CATTT-A-TTCCAG-GCTCCA--AA---TTG---AA-TT-T-T----T--GAGA------AA-T-----A--AT--G----------C---A-AC--CA--C------------ATTGA-TG----CGCGCATC-A-AG--T-A-C-AT--T---G-A--T--C-----A----CA--------------------------G-A-----ACTGA--T-G----------------A---A----CA-----T-----AT-T----GC-TCT----C--GTCAATGTGAA---T-TA--A-----T-GCATG-CATGCA---T---C-----A----ATG------C-----TATTCTTT-----CGC-G--T----A-------ATG-----A-CCGAATTGATG--
gi|16 : ATTCCCT-----A-T-------ATA-A---ATAG-CG-T--TGA--AAA-A-A----TTA-AGCA--G--------TATCTTC--TTT-T-----T-ATTA-TAAA-A-GAATTATTCACTTTA-----AAT--ATTT-A-TACCGA-ACATCA--AA---TTA---AA-TT-T-TA--AC--GAGC------AA-T-----A--AT--T----------C---C-AC--TC--ACACT--------ATTGATTA----AACACATCAA-A---T-G-A-A---G---A-A--T--G-----ATGAGGA--AT-------------A-----ATTATA-----ATTAA--T-GTG-CATGA-----TTAA---A--ATGAA--T-TTATTAAT-T----GT-TCT----atgtcttcaattg
gi|17 : atgta-----AT-T----AC-TTT----C--TTCACT-TGAA---T-TG--T-----A-GC--G-T--GCA---T---C-----A----ATT------C-----AA----TG-----C-A-G--A----A-------ATA-----A-ATGAATC-AT---TGCTC--T-----TCAACT--GAATT-AT--T-----------------GAAA------GGAAGAAA-A-----ttcaaatgg
gi|17 : ctctgaagtaaa--ATT--G------TA--G-CGT-G----C----AT---CAA-TT-CA--A----------T--G-----C---AGA-------------------AAT-AAATG--A-----------------AT--C-------AT--TGC---TC--T---TC---AAC-T----G-AATTATT---G--cagcaattctttttggaaagagaacctaatatatttataatttgacatatcttcaacatacccacgtttgaattattgatctgtttgaattgttggtctctttaaaagaatt
gi|18 : ctctgaagtaaaattactttcttcacttgaATTCCTT-----G-C-------ACA-A---A--G-CG-T--AGT--AAAAA-ACCCTTTA-A--A-------A---TATCTTT--AGT-TTACCGGTA--A-TTGA-A-GAG--AT-CA--TAA-----A-----------TACCGA-GCTGCA--AA---CGA---AA-TT-T-T---GC--GGGC------AA-------A--AT--T----------T---T-AT--CA--T------------ATTGA-TA----CAAGCATC-A-A---TTG-A-AT--T---G-A--T--C-----A-GAGCA--AT-------------AG----ACT--A-----ATTAA--T-GCG-CAC-A-----TC-A---A--ATCAA--C-C-----AT-T----GT-TCC----C--ATCAAC-TGAA-----TA--A-----T-CC--G-C--aaaggaagaaaacagcaattctttttggaaagagaacctaatatatttataatttgacatatcttcaacatacccacgtttgaattattgatctgtttgaattgttggtctctttaaaagaatt
gi|19 : taTTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AG-CA-T--TGT--AAATG-A----TTA-A--A--G----A---TATCTTC--AAT-T-----G-A--A-TTAA-A-TGG--AT-AA--TTA-----AAT-CATTT-A-TACC-A-CCTGCA--AA---TTC---AA-TC-C-T---GC--A---------AA-T-----A--GT--T----------C---C-A----A--A----------------A-TG----CGTGCATT-C-A---T-----AT--T---A----------------AGCA--AT-------------
gi|2 : ctatttgaaatatagtttatataattagggatatcgttatgtgccctctttcaaagaatgaatgggtgcatccatTATTCCTT-----A-T-------ACG-A---A-AT-CG-T--TGT--AAATA-A----TTA-A--A--AGAC-A---CATCTTC--AAC-T-----G-A--A-TCAA-A-AGA--AT-CA--TAA-----AAT-CATTT-A-TATCGA-TCTCCA--AA---TTG---AA-TT-T-T---GC--GAGC------AA-T-----A--AT--T----------C---A-GC--CA--A------------TTTGA-TG----GCAACATC-A-A---T-A-T-AT--T---AGA--A--G-----A-GAGTA--AT-------------A-----CTTA-A-----TTTGA--T-GCA-TGC-A-----TC-A---T--TTCAA--T-T-----AT-T----GT-TCA----CT-AT-ATT-TCAA---T-GG--A-----T-GT--A-T--ACA---T---C-----A----ATT------C-----AAATATTC-----CCC-G--C----A-------ACA-----A-TTCAATTGATG--TGTTT--A-----TCAAAT--CATTT-AT--TG---TC----------CGCAA------TGAAAAAA-A-----AA-A-----TTGATGCGCGGG--CA---AA-TC-----AATTACTGG-GCGCAA-TAATT---CAG--ATT--G------T---G-CGC-G----C----AT---CAA-TT-CA--CT---------T--G-----A---TGA-------GA---G----C-AAT-AATTG--A-----------------CT--T------GATG-AGC---AC--A---TC---AAT-T----G-AGTTATT---C--A--------GCA---CAAT--AA-----TT------G--AAC-TG--CCA-ATA--TT-TGAATTATTTACGTGTATGCTT
gi|20 : CCTT-----C-T-------ACA-ATATA-AG-CG-A--TGT--AAATA-A----TCA-A--A--G----A---TATATTC--AAT-T-----G-A--A-TCAA-A-GAG--AT-CA--TCA-----AAC-CATTT-A-TACCGA-GCTCCA--AA---TGC---AA-TT-T-T---GC--AAGC------AA-T-----A--AT--T---------------------G--A------------ATTGA-TG----AGAG---C-A-A---T-G-A-GA--G---A-G--T--T-----A-GATTA--ATCATTACTCTCTTGA-----ATTG-A-----ATTCA--G-GCG-CAC-A-----TA-A---A--AT-AA--T-T-----
gi|21 : ttatgcgcgcattgttgA-T-----T--AT--T----------CGAAC-AT--CA--T------------TTTAA-TG----CGTGCATC-A---------------T---A-T--T--G-----T-GCGCA--AT-------------A-----ATTG-A-----ATTGA--T-GCG-CGA-A-----TC-C---A--ATTGA--T-T-----AT-T----GC-CTT----T--GTCAAT-TGAA---T-T------------------------------------------TT------C-----AAATATTG-----CGC-G--C----A-------ATAT----A-TTt
gi|22 : cggtgtgaataagaagtatcagaaagctagaaagtattcaatctataacaaaatgcattattgatA---AA-TC-----AGTAACTGC-TCTCCA-CAATTGAACAA--ATT---------------CGC-G----C----GT---CAA-AT-CA--AA---------T--GGATCAA---TGA-------GA---A----C-AAT-AATTC--A-----------------AT--T------GATG-CGC---GC--A---TC---AAA-T----C-AATTATT---G--G--------GTG---CAAT--CA------T------G--AACATG--TAACATC--TT-CAAATAATTttgcatttttattttc
gi|23 : tttccatcgaagcaccaaataaaggttgaagttaacttgg--A------------ATTGA-TG----CGCGCTAC-A-A---T-GCA-GT--T---G-A--A--A-----A-CAGCA--AT-------------A-----CTTC-A-----A-TGA--T-ATA--GCAA-----TC--------ATCAA--T-T-----aattggtgagcacaaat
gi|23 : T---------T--G-----A---AGA-------GA---GAGCTC-TAT-AATTC--T-----------------AT--T------GCTG-CACCACGC--A---GC---TAT-T----G-AATTGAT---G--C--------GCGCTACAATGCAG-----TT------GAAAAC-AG--CAATA-C--TT-C-AATGATATAcaatagctgcgtggtgcagcaatagaattatagagctctctcttcaacacaatcaatatcattataatttgattgaatacgttcttttcgagagagcaactatataattagagagatatttttaactc
gi|24 : aattgatgattgc--T-T-----AT-T----GTGTGT----A--AT-AAC-TGAA---T-TG--A-----T-GT--G-C--GCA---T---C-----G----AAT------C-----AATTCCTG-----CGCTGATC----A-------TCA-----T-TTCAATTGATG--CATGT--A-----T--------------T--TG---TC----------AG--A------TGAAAGAA-A-----GA-AGTAACTTGAAGCATAC---------A-TC-----AATTACTGT-GTGCAG-TAATT---T-G--ATTA-A------T---G-CAT-G----C----AT---CAA-AT-CAGCAT---------T--G-----C---T-------------------CTAGTCAACTG--A-----------------AT--T------GATG-cacaatcaatatcattataatttgattgaatacgttcttttcgagagagcaactatataattagagagatatttttaactc
gi|25 : ATTCTTT-----A-T-------ACA-A---A--T-CG-T--TTT--AAATA-A----TTA-A--A--G----A---TATCTTC--GAT-T------------TT------AG--CT-TG--TAA-----AGT-------------GA-GCGACA--AA---TTGATTAA-TT-T-T---AC--TGGC------A--------A--AT--T----------C---C-AC--CA--A------------ATTTA-TG----CGTGCATC-A-A---T-ag
gi|26 : taattgaatatctctctggttgaattgaattgttgttctgtctaaaagatatagcgcttgcatta-GAG--AT-CA--TAG-----AAT-AATTT-G-CGTCAA-GCTCTA--AA---GTA---AA-TT-C-T---GA--GATC------AA-T-----G--GT--T----------C---C-AT--CA--T------------AATGT-TG----CGCTCATC-A-G---T------------------T--G-------GAGTT--AT-------------A-----A--G-A------TTGA--T-GCG-CGC-A-----TC-A---A--ATCAA--T-T-----AT-T----GT-TCC----C--ATCAAC-TGAA---T-TA--A-----C-GC--G-C--GCA---T---C-----ATG--ATT------------AATTATTGATTTACTC-G-----------------------A-TTGAAtg
gi|27 : TATTCCT------A-T-------ACA-A---A-AAACG-TAATTT--TAATG-A----TTA-ATGC--G----A---TTCCTTC--GAT-T-----A-A--A-TCAGCA-TAG--AT-CA--TGA-----A-T-CATTT-A-TACCGA-GCTCTA--AAGACGCA---AATTT-T-T---GCT-GAGC------AA-T-----A--AT--T----------C---C-AT--CA--gagaat
gi|28 : attatgcgcacataat--GAGC------AA-T-----A--AT--T----------C---C-AC--CA--C------------ATTAA-TG----AGTACGCC-ATA---T-G-A-AT--T---C-A--T--G-----A-GAGCA--AT-------------A-----ATT---------TTAA--T-GCA-CAG-T-----TC-A---A--GTTAA--T-T-----AT-T----GC-C----------TCAAT-TAAA---T-TA--A-----T-GC--T-C--CCA---T---C-----A----ATccacgggttccactcacattgga
gi|28 : AGC------AA-T-----A--AT--TTATGTAATGCC---C-ACAGTA--T------------ATTGA-TG----GGAGCATT-A-A---T------T--T---A-A--TT-G-----A-G-GCA--AT-------------A-----ATTA-A-----CTTGA--A-CTG-TGC-A-----TT-A---A--A---A--T-T-----AT-T----GC-TCT----C--ATGAAT-TCAT---A-TG--G-----C-GT--A-C--TCA---T---T-----A----ATG------TGGTGGAATTATTG-----CTC-atactgtgggcattacataaattattgctgttttcaactgaacttaatgc
gi|28 : -G----C----AT---TAAGTT-CA--GT---------T--G-----A---AAA-------CA---G----C-AAT-AATTT--ATGTAATGCCCACAGTATAT--T------GATG-GGA---GC--A---TT---AAT-T----T-A---ATT---G--A--------G-G---CAAT--AATTAACTT------G--AAC-TG--TGgttttcaactgaacttaatgc
gi|29 : gagcaataattccaccacattaatgagtacgccatatgaattcatgagagcaataattttaatgCCGT-----A-T-------GCA-A---A-GG-CA-T--TGT--ACATA-A--------------------------CCTC--AAT-C-----A-A--A-CTAA-A-GAG--AT-AA--TTA-----AAT-CATTC-A-TACTGA-GCTTGA--AA---TTG---AA-TA-T-T---TC--GAGC------AA-T-----A--GT--T----------C---C-AC--CA--C------------ATTAC-CG----CGCGCATC-A-ATG-T-G-A-AT--T---A-A--C--G-----
gi|29 : -G----C----AT---TAA-TT-CA--AA---------G--G-----A---AGA-------GG---A----C-GTT-AATTC--AC----------------AT--T------GATG-CGC---GC--G---GT---AATGTGGTGG-AACTATT---G--C--------TCG---AAAT---A-----TT------C--AAT-TT--CAAGCTCAGTA-TGAATGATTTAtcctcttcctttgaattaatgcatg
gi|3 : ccgtatgcaaaggcattgtacataacctcaatcaaactaaagagataatATTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AG-CG-T--TGT--AAATA-A---------------------------------AT-------G-A--A----------G--AT-CA--TCA-----AAT-CATTT-A-TTCCAA-GCTCCA--AA---TGC---AA-TT-C-T---GC--GGGC------AA-C-----A--TT--T----------C---C-AC--AA--C------------ATAGA-TA----CGCGCATC-A-T---G-G-A-AT--T---G-A--T--C-----A-GAGCA--AT-------------A-----ATTG-A-----AATAA--T-GCG-CGC-G-----TA-A---A--ATCAAATT-T-----AT-T----GT-TTG----C--ATTGA--TCAA---T-TG--AACTAGT-GC--G-C--GCA---TG--G-----A----ATA------C------TTTCTTG-----TTT-T--C----A-------TCA-----A-TTGACTAGAT----GCGC--A-----TCAAAT--CAATC-CT--TGCTCTC----------TTCAA------TTAAATTA-T-----TA-A-----TTTAT----------A---GA-TT-----AATTAGTGG-GAGCAA-TATTT-----G--ATTTAA------T---G-CGT-G----T----AT---TAA-TC-CA--GT---------T--A-----C---AGT-------GT---G----C-AAT-AATCA--G-----------------AT--T------GATG-atg
gi|30 : tgatatctttaattgaattcttgctctctttcaaaaagattgagacacgcatta------------ATTGA-TG----CACGCTT--------T-T-A-A-------A-A--T--A-----A-GAGCA--AT-------------G-----ACTG-A-----GTTTA--T-GTG-TGC-A-----TC-A---A--ATCAA--T-T-----CT-T----GC-TCT----C--ATCAGT-CGAA---T-TG--A-----T-GA--G-T--GCG---T---C-----A----ATT------C-----AACTG-TG-------C-G--C----A-------AAA-----ACTTGAatataatttcagataaataaaggtatcttcaattaatttggtt
gi|31 : cATTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AT-CG-T--TGT--AAATA-A----TTA-A--A--G----A---TATCT-----------------------AA-G-GA-----------AA-----GAT-CATTT-A-TACCA-----CCA--CA---TTA---A-------T---GC--GCGC------AT-C-----A--AT--T----------ttaaagtttgactccat
gi|31 : cattc-----------------AT--T------AATG-CGC---GC--A---TC---AAT-T----G-AATCAgaatcacaggtatgaataacaggtctctgaattttaatcaa
gi|32 : cattcattccttatacaaaatcgttgtaaataattaaagatatctaaggaaagatcatttataccaccacATCCT----AT-C-----G-A--A-TTAA-A-GAT--AT-CA--TTA-----AAA-TATTT-A-TACCGA-GCATTA--AA---TAA---AA-TT-T-T---GC--GAAC------AA-T-----A--AT--T----------C---A-AC--TA--C------------ATTAA-TG----CGAGTATT-A-A---T-T-AGAT--T---A-A--T--G-----A-GAGCcaggtatgaataacaggtctctgaattttaatcaa
gi|33 : tctttaaaaagaatgtttaATTCATT-----G-T-------ATA-A---A-AG-CG-T--TGT--AAAGA-A----TTT-A--A--G----A---TATC---------------------------A-GAG--AT-CA--TTA-----AAT-CATTT-A-TACCGA-GCACTA--AA---TTA---GA-TT-T-T---GC--GAGC------AA-T-----A--AT--T----------C---C-AC--CA--C------------ATTCA-TT----CACGCAT--------T-A-A-AT--C---A-A--T--
gi|34 : cattg-A-GGG--GT-CA--TCA-----ACT-CATTT-A-TACCGA-GCTCCA--AA---TTA---AA-TA-TATACAGC--GAGCTTATAGAA-T-----A--AT--T----------C---C-AC--CA--C------------ATTGA-TG----CGCGCATC-C-A---T-G-A-AT--T---A-A--T--G-----C-GCGCA--AT-------------A-----AT
gi|34 : --AC---------T--G-----A---TGA-------TA---G----T-AAT-GATT---------------------AT--T------G----CGC---GC--A---TT---AAT-T------CATGGAT---G--C--------GCG---CATC--AA-----Tcattactatcatcagt
gi|35 : aggggtcatcaactcatttataccgagctccaaattaaatatatacagcgagcttatagaataattccaccacAATT---TCG--ATT--GAATTTTT---G-CGC-G----T----AT---CAA-TT-CA--ATGATCGTATTT--G-----A---AGA-------GA---G----C-AGC-AATTG--G-----------------AT--T------T-TG-TGC---GC--A---TC----AT-T----G-A
gi|35 : -CGC-A-----TT-G---A--TTGAA--T-T-----GT-T----GA-TAT-------AGCA---TCAA---T--G--A-----T-GC--G-C--ACA-------A-----A----ATC------C-----AATTGCTG-----CTC-T--CTTCAA-------ATACGATCA-TTGAATTGATA--CGCGC--AAAAATTC-AAT--CGAtgctatatcaacaattcaatcaatgcggatcgacagtaat
gi|36 : aattATTCCTTTAAGTA-T-------ACA-A---A-AG-CG-T--TGT--AAATA-T----CTA-A--A--A----A---CATCTTC--GAT-T-----G-T--A-T-AA-A-GAG--AT-TA--TTA-----AGT-CATTT-A-Tgatcgacagtaat
gi|37 : catgattggagtcagttgctctatatatatatggtcgcatta-A----TTG-A--T--G----A---TATCTTC--AAA-T-----G-A--A-TT-A-A-GAG--AT-AA--CTATTCATAAT-TATTC-A-T--------TGCATTAA---CTG---AA-TTAT-T---GA--TAGC------AA-T-----A--ATTAT----------C---T-GC--TG--A------------ATTGA-TG----CG
gi|38 : aaaccattgggaattgtc-T-----A--AT--T----------C---C-AC--------------------TTGA-TG----AGTACAAC-A-A---T-G-A-A---T---A-A--T-----------AGCA--AT-------------ct
gi|38 : aattctagtatctaaaAA-T-----GA-A-----TTG-TG-GCGCG--CATTCAT-TC-----AACTAACGCAGGGCAAATAATT---CAC--TTC--A------T---G-CAC-G---------AT---TAA-TTCCA--CT---------T--G-----A---TGA-------GT---A----C-AAC-AA-TG--A-----------------AT--atcgtgcatgaagtgaattatttgccctgcgttagttgaatgaatgcgcgccacaattcatt
gi|39 : aattctagtatctaaaattgctatt-TACCGA-ACTCCA--AA---TTA---AACTT-T-T---GC--GATC------AA-A-----A--AT--T----------C---C-AG--CT--ATT----------ATTAA-TG----GATGCATC-A-GT--T-A-A-AG--T---A-A--T--G-----A-GAGCA--ATA------------A-----ATT--------ATAAA--T-ACG-CGC-T-----TC-A---A--ATCAG--C-T-----A
gi|4 : TATTCCTT-----A-T-------ACG-A---A-AT-CG-T--GTT--AAATA-A----TTA-A--A--AGGACA---CATCTTC--AAC-T-----G-A--A-TCAA-AAGAA--AT-CA--TAA-----AAT-CATTT-A-TATCGA-TCTCCA--AA---TTG---AA-TT-T-----GC--GAGC------AA-T-----A--AT--T----------C-----AG--CA--A------------TTTGA-TG----GCAACATC-A-A---T-A-T-AT--TTAGA-A-----G-----A-GAGTA--AT-------------A-----CTTA-A-----TTTGAGAT-GCAATGC-A-----TC-A---T--TTCAA--T-T-----AT-T----GT-TCA----CT-AT-ATT-TCAA---T-GG--A-----T-GT--A-T--ACA---T---C-----A----ATT------C-----AAATATTC-----CCC-G--C----A-------ACA-----A-TTCAATTGATG--TG-GTTTA-----TCAAAT--CATTT-AT--TG---TC----------CGCAA------TGAAAAAA-A------A-A-----TTGATGCGCGGG--CA---AA-TC-----AA-TACTG--GCGCAA-TAATTC--CAG--ATT--G------T-----CGCGG----C----AT---CAA-TT-CA--CT---------T--G-----A---TGA-------GGTATG----C-AAT-AATTG--A-----------------CT--T------GATG-AGC---AC--A---TC---AAT-T----G-AGTTATTTCAG--C--------AC----CAAT--AA-----TT------G---AC-TG--CAATATT--Tcc
gi|40 : tgaagtgcagtTTCCTT-----A-T-------AGA-A---A-GG-TG-T--TGT--AAATA-A----TTA-A--A--G----A---TATCTT---AAT-T-----G-A--A-TTAA---GAG--ATACG--T-A-----AAT-CATTT-A-TATCGA-GCGTTA--AA---TTA---AT-TT-T-T---GC--GAGC------AA-T-----AATAT--T----------C---C-Aga
gi|41 : AC-AATTG--A-----------------AT--T------CATG-CTC---TC------T------T-T----G-AA--AAT---G--C--------GCG---CCAT--AA-----TT------
gi|41 : ATTCCCA-----A-T-------AGA-A---A-AG-CA-A--TGT--AAATA-A----TCA-------G----A---CATCTTC--AAT-T-----G-A--A-TCAA-A-GAG--AT-CA--TTA-----AAT-CATTcccaatagaaaagcaatgtaaataatcagacatcttcaattgaatcaaagagatcattaaatcatt
gi|42 : acaattgaattcatgctctctttgaaaatgcgcgccata-G----C----AT---TAA-TT-CA--CT---------T--G-----A---TGA-------TA---G----C-AAT-AGTTG--A-----------------TT--T------GATG-CCC---GT--A---TC---AAT-TCAAGG-AATTATT---G--C--------TCG---CAAT--AT-----TTCTTTCAA--AAC-T---CGATAT-------AAATAAT-----TGTATG
gi|43 : tC-----AATTATTGC-GCGCAT-TAATT----AA--ATG--GA-----T---G-CGC-G----CT---ATGTACAA-CT-CA--AT---------T--G-----AATTACA-------GC---G----C-AAC-AATTC--A-----------------ATGAT------CATG-CAC---ATTAA---TT---AAT-T----G-AATTATT---
gi|44 : AATT----AG--ATT--G------T---A-ACT-G----A----AT---CAG-TT-CG--AT---------T--G-----A---AGA-------GA---G----C-AGT-AATTG--A-----------------AT--T------ATTG-CGC---GC--ATTTTC---AAT-T----G-
gi|44 : --ATT--G------T---T-TGC------------T---GAA-TT-C----T---------T--G-----A---AGT-------TG---G----C-AAT----TG--A-----------------A----------AATG-CGC---GC--A---AT---AAT-T----C-AATTACT---G--C--------TCT---CTTC--AA-----TC------G--AAC-TG--ccaacttcaagaattcagcaaacaattaaa
gi|45 : aattagattgtaactgaatT---CAGGAATTA-G------T---G-TGC-G----C----AT---CAA-TT-CT--TT---------TAAA-----A---AGA-------GA---G----G-AAT-AAATC--A-----------------AT--T------taaa
gi|46 : ttcaacatatccacaactgaatcggtgatctttta--AT---------T--G-----A---AGA-------GC---A----C-ATT-AATTC--A-----------------AT--TTTTATTAATG-AGC---AC--A---TC---AAT-T----C-TATTATA---C--T--------GCG---CAAT--GA-----TT------G--AAA-TGA-TGATATC--TT-CAAAtacaaa
gi|47 : AATA---CAT--AAT--A------T---A-CGC-G----C----AT---TA--TT-CA--GT---------T--A-----A---ATA-------CT---C----T-TATCAATTC--A-----------------GT--T------GATG-CGC---GC--ATCTTC---AAT-T----GCAATTgcat
gi|47 : tcttcagatcaccaA--T-ACG-CGC-A-----TT-A---T---TCAG--T-T-----AAAT----AC-TCT----T--ATCAAT-TCAG---T-TG--A-----T-GC--G-C--GCA---T---C-----------TT------C-----AATT
gi|48 : tcttcagatcaccaaattgcTCCTT-----G-C-------TCT-A---A-AG-CA-T--TGT--AAATA-A----TTA-A--A--G----A---TATCCTC--AGT-T-----C-A--G-TTAT-T-GAG--AT-C---------------------A-TACCGA-GCTCCA--AA---TGC---AA-CT-T-T---GC--attatgtatt
gi|49 : gC-G----C----AT---CAA-TT-AA--AT---------T--G-----A---TAT-------GA---A------AAT-AATTG--A-----------------TT--T------GATGTCGT---TC--A---TC---AAT-T----A-AAATCTT---GCAC--------GCA---CAAT--AG-----TT------G--Aag
gi|5 : aTATTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AA-CG-TAATTT--TAATG-A----TTA-A-----G----A---TTCCTTC--GAT-T-----A-A--A-TCAG-A-TAG--AT-CA--TGA-----AAT-CATTT-A-TACCGA-GCTCAA--AA---CGC---AA-TT-T-T---GC--GAGC------AA-T-----A--AT--T----------C---C-AT--CACCACGGGTCCATCACATTGA-TG----CGCGTATT-G-A---T-C-A-AT--G---A-AATT--G-----A-GAGCAT-AT-------------ATATATATAG-AGAGGGATGAA--T-ATG-AAC-A-----TC-A---G--ATCAA--T-T-----TT-T----GC-TCT----C--ATCATT-GGAA---C-TA--G-----T-GC--G-C--AAAATTT---T-----ACCTGATT------T-----ACGCATT-------TA-G--C----A-------ATA-----A-TTGATTTGATG--CGCGT-----------AAT--TGA-T-AT--T------------------CAA------ATAAAAAA-A-----GA-G-----TTTATta
gi|50 : attgatgcgcacatat-CG-T--TGT--AAATA-A----ATT-A--A--G----A---TAACTTC--AGT---------A--A-T----------------------------T-TATTT-A-AATCAA-GCTCCA--GT---TTA---GA-TT-C-A---GC--GAGC------AAGT-----A--AT--T----------C---C-aaatgttaatt
gi|52 : --T-GCT-TGC-A-----TC-A---A--TTCAG--T-T-----AT-T----GC-TCT----TTAATCAAT-TCAA---T-GG--A-----C-GT--G-T--GCA---T---C-----A----AT
gi|55 : taacatATTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AG-CT-T--TG
gi|56 : gctctctttagaaagaactaatgcgcatcgcta-----AAT-CATTT-A-TAC-GA-GCATTA--GG---TCA---GA-TT-T-T---GC--ATGC------AA-T-----A--AT--T----------T---C-AC--g
gi|57 : ttTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-AT-CT-T--TGT--AAATA-A----TTA-A--A--G----A---T
gi|6 : ttcattgtaATTCCTT-----A-T-------ACA-A---A-A--TG-T--TGTGTAAATA-A----CTA-A--AAAG----A---TATCTTC--CATAG-----G-A--A-TTAA-A-G-T--AT-CA--TTA-----AAT--ATTT-ATTACCAAGGCCTTA--AA---TTA---AATTT-T-T---GT--GAGC------AA-TAATTGA--AT--T----------C---C-A----A--A------------ATTAA-TATGATCATGCATA-A-A---TCA-A-ATC-T---A-A--T--GCAGAAA-GACTAATAT-------------A-----ATTG-A-----AATAA--T-GCC-CAC-A-----TT-T---A--ATGAA--TCT-----AT-TCAAAAC-TCT----CG-GTCAAT-TGAA---T-TC--A-----T-GT--GAC--ACA---T---T-----A----A
gi|7 : tttttaattcaacagttattccacaatttgaattaaattaaatgttctctttcaattgaattattgctgtcttttaatgaattaA-TG----CGCACATT-A-A---------ATCCT---A-A--GAAG-----G-GAGCA--AT-------------A-----ATTG-A-----TTTTA--T-GCG-CTC-AATCCTTC-AATGA--AGCGAT-T-T-----AA-T----GC-TTT----C--AGGAAT-TCAA---T-TG--T-----T-TC--T-C--TCG-------C-----A----A--------------AACTACAG-----TTCGG--T----AG------ACA--------TAATTTGATG--ATCTC--T-----TCAATT--CAATTGATGATG---TCTTTAAACATTCGCAAACTTTTTG--TAAA-A-----GATA-----TTAATGCATGCA--CA---CC-TC-----ATTTTTT----------TAA------AG--A------------------GA-G----C----AA---CAA-TT-CA--GT---------T--A-----A---AGG-------TA---T----C-ATT-AATTAGTA-----------------GT--T------GATaagattattgtct
gi|7 : attcaacatCTT-----T-T-------ACA-A---A-AA-GT-T--TGC--GAATG-T----TTA-A--A--G----A---CATCATC--AAT-T-----G-A--A-TTGA-A-GAG--AT-CA--TCA-----AAT-TATGT-C-TACCGA-ACT------G---T-----AG-TT-T-T---GCGAGAGA------AA-C-----A--AT--T---------------------G--A------------ATTCC-TG----AAAGCAT--------T-A-A-AT--C---G-C--T------------------T-------------C-----ATTG-AAGG--ATTGA------G-CGC-A-----TA-A---A--ATCAA--T-T-----AT-T----GC-TCC----C--TTC----TTAGGATT-TA--A-----T-GT--G-C--GCA---TATAC-----ATGT-AAT------C-----CATAATTA-----CTT-T--C----C-------ACA-----A-TTGCAGTGCAG--TGCAC--A-----atacatgtaatccataattactttccacaattgcagtgcagtgcacaatgcaat
gi|8 : attcaacatatcaactactaattaatgatacctttaactgaattgttgctctctttaaaaaaatgaggtgtgcatgcattaatatTT-----A-T-------ATACA---A-AT-CG-T--TGT--TAATG-A----TTT-A--A--G----A---TATCT-C--AGT-T-----G-A--A-TCAA-A-GAG--AT-CA--TAG-----AAT-AATTT-G-CGTCAA-GCTCTA--AA---GTA---AA-TT-C-T---A---GATC------AA-T-----G--GT--T----------C---C-AT--CA--A------------AATGT-TG----CGGCTATC-A-G---T-G---------------------------GAGTT--AT-------------A-----A--G-A------TTGA--T-GCG-CCA-A-----TC-A---A--ATCAA--T-T-----A--T----GT-TCC----C--ATCAAC-TGAA---T-TAC-A-----CAGC--G-C--GCA---T---C-----ATG--ATT------------AATTATTGATTTACTC-G-----------------------A-TTGAATatgcaat
gi|8 : ctttaatagaactgctactctttaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaattA-A-----GA-------TTGATGCGC-CAATCA---AA-TC-----AATTA-TGT-TCCCAT-CAACT---GA---ATT--A------CACAG-CGC-G----C----AT---CA--------------------T--G-----A---T-----------------------T-AATT---------------------AT--T------GATT-TAC-----------TC---GAT-T----G-AATGA-----G--A--------ATG---CAA---AC-----TT------G--AAT-TAAACGATATC--CT-CAAATAATgagaatgcaaacttgaattaaacgatatcctcaaataatg
gi|9 : ctttaatagaactgctactctttaaaagaaattgatacgcgcatttttaaaattttatatacaaatcgttgttaatgatttaagatatctcagttgaatcaaagagatcatagaataatttgcgtcaagctctaaagtaaattctagatcaatggttccatcaaaatgttgcggctatcagtggagttat-A-AT--T---G-A--T--A-----A-GAACA--AT-------------A-----ATTG-A-----CTT---------------------T-A---A--TTCAA--C-C-----AT-T----GT-TCT----C--ATCATT-TTAA-----TG--A-----T-GC--A-T--GCA---T---T-----ATTGTGTTG-----G-----GATTACTG-----CTC-G--C----AAAATGGTACA-----A-ATGATTTCATGATTGCTC--GATT--TCAACTGAAGA-T-AT--TT---TT----------AATCA------TG-TATAA-A-----GA-A-----TTAACGCTCGCA--CC---AATTC-----TTTTAAAGA-AAGCAA-AAATT---CA---ATT---------------CG--A----A----AT---C-A-TT-----AT---------T--A-----G---AAATATCTTTAA---T----C-AAT-AATCA--A-----------------AT--T------GAAG-AGA---GC--A---AT---AAT-T----C-TATTATT---G--C--------CCG---CATT--TA-----TT------A--AAC-g
gi|9 : ttg-T--TAT--ACATG-A----TTA-A--A--A----A---TATCTTC--AGT-T-----G-A--AATCGA---GCA--AT-CA--TGA-----AAT-CATTT-G-TACC-----------------------A-TT-T-T---GC--GAGC------AG-T-----A--AT--C----------C---C-AA--CA--C------------AATAA-TG----CATGCATC-A-T---T-A-A-AA--T---G-A--T--G-----A-GAACA--AT-------------G-----GTTG-A-----ATTA----------------------A---A--GTCAA--T-T-----AT-T----GT-TCT----T--ATCAAT-Tgagtacgc
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|51 ): AGTGCTAGCGATATATTCAATTCCACACATCCACAACTGAATTAATGATCTCTTCAATCATCAA
Unaligned ( gi|53 ): ATGATCTCTTTAACGTTGAATTGTTAATCTCTTTAAGAAAAATGGATGCGTGCATTGATTC
Unaligned ( gi|54 ): TGTATTCATTGAATTATCGATGACATTAATTATCATGCTTAATTGATACGCGCTAA
Unaligned ( gi|58 ): AACGTATCCTCAAATAATGAAAGAATCTTCGTTATATAATT
Unaligned ( gi|59 ): TATCCAGAACTGAATTAATTATCTTTTTAATT
Unaligned ( gi|60 ): AGTATTCAAATAATGAGACCAAGAAATGATT