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blockSeqs                     :            .  . . .    .  .        . .   .      .       .


blockSeqCons                  :                                          ***
originalCons                  :  CTTTTGATTT-AT-A-A---TT-TT---CTTTGC-A---A---TTGG-CATGTTA-ATCTG
finalCons                     :  CTTTTGATTT-AT-A-A---TT-TT---CTTTGC-A---A---TTGG-CATGTTA-ATCTG





Alignments
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lowQualScore                  :            .  . . ...  .  ...      . ... ...    .       .     
lowQualScore                  :            0  5 5 666  5  666      5 999 777    5       5     
consensus                     :  CTTTTGATTT-AT-A-A---TT-TT---CTTTGC-A---A---TTGG-CATGTTA-ATCTG
Reference ( family-4960 )     :  CTTTTGATTT-AT-A-A---TT-TT---CTTTGC-A---A---TTGG-CATGTTA-ATCTG
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gi|6                          :  CTTTTGATTT-ATTG-A---TT-TT---CTTTGC-A---AA--TTGG-CATGTTA-ATCT
gi|7                          :    TTTGATTT-AC-A-A---TT-TT---CGTTGC-A---A---TTGG-AATGTTACATCTG
gi|8                          :  caTTTGATTT-AG-A-A---TT-TT---CTTTGC-A---ATATTTGG-CATGTTA-ATCTG
gi|9                          :  CTTTTGATTT-AT-A-A---TA-TT---CTTTGCAA---A---TTGG-CATGTTA-ATCT