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Reference ( gi|3 ) : AACACTTCTAGT-AT-A--C----CA-GTC-CCCAAAA-T-ATGG-CGCTAAAATAAG-TCCCGCCGAA-G-GCA-TTT--AA-GC---TT----A-T-G---TA---TA-C-GATCAC--GTGA-GC-GA-T-CA------A--------TT---------A-------AA---------ACG-------AC-----AA----A-----AAAATCGCAAAA-TTAAG-CCC--AAAA-C-TGAA-CTCCTT-GAGC---AAAATGAGGTT-T------------A-A---AA---AATGTTTTTTT--AAAAACA-GTTTCCT--AAATCAAAAAG-AAAAACA----GAA-TG-----CAAAAA--GA----C----GTAACTGTTTA-TGTTC-CAAAAAAAATAG-A------TC----------T------TTATA------AAATAGTCA-CGTGT-GTGTTATTTTACGTCATTC--TC-CTGA-TTAACCACGTCACTGATGTTCATAC-AAGTAAACTGT-AAGTCAC-TTGAGA-TTGAGAAAAAAAAATGTGGATT--CTTCTTATTTT-AC-GATG--AA-TA-TTTTAGCA-----CA---------T-GCAGCATTC---AA------GA---TTTT---TT---TC-----------T-ACA--AAA-A-A-TT-G---T-A--A----T-TATGGACA---TAGA--GT----AGCTCACAG---ATACTT---------TGAA-----A--TGTG--------CACTA-GCTG-TCCC-AAC-ATCACTAGATTCTAGT------AC--TGTA--CG--TAGT-CTGTA---CTTTAATTAAAAATA-TTTT---------GA-----A-TGC----A------T------C------GT-ATGCTTTGTTTAGCTTGAA-TT--C-CAGG--C-GCTGC-C--CCCAAGACC-CCGC--T-T----A-ATCAC---G-TC-T-TATGCCAAAA-CGCC-GCT-A--GG----------AA---T-TA--TT-ACAAGAACTTC---AA-GTCTTGAC--GAAGCATG-----A--T----AGCCTA--CTGTATATATGTT-----GTATC----ATC-ATAA-TTTATTTATTTTAA-CTTTAATAACATGGTTCAACTCGCA----TG-ATCATATTGTCTTGTCGG--GGGCTG-CCG-CC-ACTAAAACCC-CGC-TTA-AT--T-A---GCTC--------AAA-CGCC-ACTGAGCTTTC--TTT-T-CAATTTT-TA--TT-A-------CAC---GAAACA-T-------TGGAGAGTTTCACGGCTCAA-TCAGCAT-CCA-AGGTG-AAAATAC-AAATGG-CGGTG--TGTTTAAATTCCGC----------TT-AGCAACAGCAAGGGGATCGAATAACTG-T----ACA--CG--CA----------GTCAC--ATGCT-ACTGGG-GACCCGCATAC
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gi|53 : -A--C----CG-GTC-ACCAAAA-T-ATGG-CGCTAAAATAAacggccatactagaaact
gi|54 : ----CG-GTC-CCCAAAA-T-ATGG-CGCTAAAATAAG-T
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gi|32 : cG-TCC--AAAA-T-ACAA-CTCCTT-GAGC---AAAAT----TT-TTTTTTTTATATAA-A---AA---AATGTTTTTTT--AAAG-CA-GTTTT-T--GAATTGAAAAG-AAAAACATACAGAA-CG-----CAAAAA--GA----C----GTAaggc
gi|48 : GAA-CTCCTT-GAGC---AAAATGAGTTT-T------------A-A---AA---A----CTTTTT--Att
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Reference ( family-4782 ) : AACACTTCTAGT-AT-AC----CG-GTC---CCCAAAA-T-ATGG-CGCTAAAATAAG-TGCCGCCGAA-G-GCGGTTNA-G---C---TT----A-TA---TA---TA-C-GATCGC--G--TGA-GC-GA-T-CG------A---------TT---------A-------AA---------A--CGG-----C----AAA-----A-------AAAT-CGCAAAA-TTAAG-CCC--AAAA-T-TGAA-CTCCTT-GAGC---AAAAT-GAGGTTT------------AAAAA---AC-GT----------TTTTTT--AAAAACA-GTTTTTT--AAATTAAAAAG-AAAA----ACAGA---------A-NGCAAAAA--GAC----GTAACTGTTTA-TGTT-C-CAAAATAGATAGAA-T-C------T----TTAC------GAAATAGTCA-CGTGT-GTGTTGTTTTACGTCATTC--TC-CTGATTATCCACGTCACTGATGTTCATGC-AAGTAAACTG-TAAGTCAC-TTGAGA-TTGAG--AAAAAAACGCGGAT--TCTTCTTATTTT-AC-GAT-G--AA-TA-TTTTAGCA-NA-----------T------A------------CAGCA-TTC-GGGA-----TT-TT-TTT--C-----------T-ACA--AAAAC--T-T-G---T-AA----T-TAT---CGACA--TGGA--GTGGCT----CACGG---A---------TACTTCGAA-----ATGTG---C---G------GCTG-TCCC-AAC-ATCACTAGG-CCT--------AGTAC--TG--TA--C---G-TA--CTGTA---CTTTNATTAAAAATATTTTC--------A----TATAT------A------TC------GT-ATGCCTTGTTCAGCTT-GAC-TT--C-CGGGCGCTGC-C-CCCAAGNCC-CCGC--T-T----A-ATCA-CTTG-TC-T-TATGCCAAAA-CGCC-GCT-A--GGAA---T-TA--TT-ACACG-A-ACTTCAA--CT-TGACGAAGCAT------G-----A--T----AGCCT--NCTGTATATATGTT--GTAT-ATC-AT-A--TTTATTTATTTTAA-CTTTAATAACATGGTTCAACTCACA----TG-ATCATATTGTCTTGTCGG--GGGCTG-CCGCCC-CC--AAGCCC----CCGC-T-T--AAT-T---ACGCTC-AAACGCC-GCTGGGCTTTC--TTTT-CGATTTTTA--TT-A-------CACGAAACA-T-------TGGCGAGTTTCACGGC----C---TCAGCAT-CCA-AGGCG-AAAATGC-AAATGG-CGGTG--TGTTTACATTCCGC----------TT-AGCAACGGCAAGGG----G--AATA-ACTGTT----CACGCACA--------GTCGC-G-TGCT-ACTGGG-GACCGGCATAC
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gi|17 : TTTTAGT-AT-GC----CG-GTC---CCCAtaaaaactt
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gi|20 : tttaaatgcaatcaactcatgaacccctcatggtttTTTTAGT-AT-GC----CG-GTC---CCCAAtaaaaccttc
gi|21 : tttaaatgcaatcaactcatgaacccctcatggtttgccctcaagcccacactacattatgctcaaacactactgggctctcttaggcgagttccaagtctcggcatccaaggtgaaaatacaaatggcagtgtgtttacattccgcttagcaacagcaaggggaataactgctcatccacagtcgcaATTATCCACGTCACTGATGTTCATGT---------TA-CAAATCAC-TTGAGG-TTGAG--AAATAA-CGCTGAT--TCT---TATTTT-AC-GAT-G--GA-TA-TTTTAGTA-AA-----------T------A------------CAGCA-TTC-GGGA-----AA-TT-TTT--CT----------T-ACA--AAAA---T-T-G---T-AAAATTT-TAT---CGACA--TAGA--GTAGCT----CACGG---A---------GAATTCGAA-----ATGGG---C----------GCTG-TCCC-AAC-ATCACTA--------------------------A--C---G-T----TA-A---CTTTTATTAAAAATAccttc
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lowQualScore : 7 3 4444 6 888 2 4 2 5 7 9 7 6666666666 1111 9 444 444 1 1 22 22 3 33 9 9 33333333333333333333333333333333333 444444444 99 33333333333 0000000000000 222 7 5 44 5 5 1 4 111 5 888888888888 5 444 111 4 66666666666 44 5 66666 77 7 77 777 1 1 5555 66 00 7777 99 0 0 999 8888 444444 4 4 99 0 2 4 1 4 4 4 9999 9 55 6 3 6 6 00 88 6 8888888888888888888888888888888888 1 1 44444444 1 22 1 77777777777 22 888 1 2 0000000000000 444 66 22 5555 444 4444444444 77777 444 7777777777 9 9 9 5 111111111111111111111111111111111111 5 444 2 444 444 888888888888888888888888888888888888888888 3 3 3 555 0 55 0 5555 0 0 8 0 0 0 9 88 4 9999 666666666666 2222222 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 7 1 1 2222 1 22222 9 9 9 8 99 9 7 77 7777 3 5 44 5 999 7 9 99 1 4 22 1 0000000 1 0000000 000000000 5 0 7 7 7 77 3333333333 7 6666 44 5 7777 11111111 2 2 4 5
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Reference ( family-4782 ) : AACACTTCTAGT-AT-AC----CG-GTC---CCCAAAA-T-ATGG-CGCTAAAATAAG-TGCCGCCGAA-G-GCGGTTTA--G---C---TT----A-TA---TA---TA-C-GATCGC--G--TGA-GC-GA-T-CG------A---------TT---------A-------AA---------A--CGG-----C----AAA-----A-------AAA--TCGCAAAA-TTAAG-CCC--AAAA-T-TGAA-CTCCTT-GAGC---AAAAT-GAGGTTT------------A-A---AA---AATGT----------T--TT-TTT----AAAAAC--A-GT--TTTTT--AAATTAAAAAG-AAAA----ACAGAA-NGCAAAAA--GAC----GTAACTGTTTA-TGTT-CCAAAATAGATCGAATCCGTT-T--TT------ACGAAATAGTCA-CGTGT-GTGTTATTTTACGTCATTC--TC-CTGATTATCCACGTCACTGATGTTCATGC-AAGTAAACTG-TAAGTCA-CTTGAGA-TTGAG---AAAAAACGCGGAT--TCTTCTTATTTT-AC-GAT-G--AA-TA-TTTTAGCA-NA-----------T------A------------CAGCA-TTC-GGGA-----TT-TT-TTT--C-T-----------ACA--AAAAC--T-T-G---T-AA----T-TAT---CGACA--TGGA--GTGGCT----CACGG---A---------TACTTCGAA-----ATGTG---C---G------GCTG-TCCCAA-C-ATCACTAGG-CCT--------AGTAC--TG--TAC---G-TA--CTGTA---CTTTTA-TT---AAAAA---TATTTTC--------A----T---ATAT------A------TC------GT-ATGCCTTGTTCAGCTT-GAC-TTGCCAGGCGCTGC-C-CCCAAGACC-CCGC--T-T----A-ATCA-CTTG-TC-T-TATGCCAAAA-CGCC-GCT-A--GGAA---T-TA--TT-ACACG-------AACTTCA--A----CGA-GAAGCAT------GA--T----AGCCT--TC--TGTAT--A--TATG---GT-TAT--CAT----A----TT-TATTTATTTT-AA-CTTTAATAACATGGTTCAACTCACA----TG-ATCATATTGTCTTGTCGG--GGGCTG-CCGCCC-CC--AAGCCC----CCGC-T-T--AAT-T---ACGCTC-AAACGCC-GCTGGGCTTTC--TTTT-CGATTTTTA--TT-A-------CACGAAACA-T-------TGGCGAGTTTCACGGC----C---TCAGCAT-CCA-AGGCG-AAAATGC-AAATGG-CGGTG--TGTTTACATTCCGC----------TT-AGCAACGGCAAGGG----G--AATA-ACTGTT----CACGCACA--------GTCGC-G-TGCT-ACTGGG-GACCGGCATAC
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gi|17 : TTTTAGT-AT-GC----CG-GTC---CCCAtaaaaactt
gi|18 : ttaactttaaaatggttcaactcacacgatcatcttgtcttgtcgggggctgccgcccccaagcccccgcttaattacgctcaaacgctgctggactttcttttcgatttttattagaaacattgacgagtttcacggctcagcatccacaggcgaaaatgcaaatggtggtgtgtctacattccgcttagcaacgacaaggggagtaactgttcacgcacagtccgactgtcgcgtgctacACACTTCTAGT-AT-AC----CG-ATC---CCCAAAA-T-ATGA-CGCTAAAATCAG-TGCCGCCGAA-G-GCGGTTTA--C---C---TT----A-TA---TA---TA-C-GATCGC--G--GGA-GC-GA-T-CG------ATTAAATCG-TT---------A-------AA---------A--CGG-----C-----AA-----A-------AAA--TCTCAAAA-TTAAG-CCC--AAAA-T-TGAA-TTCCTT-CAGC----AAAT-GGGGTTT------------A-A---AA---AA-G------------------------AAAAAC--A-G------------ATT-----------------------GCAAAAA--GAC----GT-ACTGTTTA-TGTT-CCAAATTAGATAGAATGCGTTGT--TT------ACGAAATAGTCA-CTTGT-GTactt
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gi|20 : GCCC-TC--AAGCCC----ACAC-T-A--CAT-T---ATGCTC-AAACACT-ACTGGGCTCTC--T----------------T-A--------------------------GGCGAGTTCCA-AGT----C---TCGGCAT-CCA-AGGTG-AAAATAC-AAATGG-CAGTG--TGTTTACATTCCGC----------TT-AGCAACAGCAAGGG----G--AATA-ACTGCT----CATCCACA--------GTCGC--------ATTGGG-GACCGGCATACtagaaact
gi|20 : tttaaatgcaatcaactcatgaacccctcatggtttTTTTAGT-AT-GC----CG-GTC---CCCAAtaaaaccttc
gi|21 : tttaaatgcaatcaactcatgaacccctcatggtttgccctcaagcccacactacattatgctcaaacactactgggctctcttaggcgagttccaagtctcggcatccaaggtgaaaatacaaatggcagtgtgtttacattccgcttagcaacagcaaggggaataactgctcatccacagtcgcaATTATCCACGTCACTGATGTTCATGT---------TA-CAAATCA-CTTGAGG-TTGAG---AAATAACGCTGAT--TCT---TATTTT-AC-GAT-G--GA-TA-TTTTAGTA-AA-----------T------A------------CAGCA-TTC-GGGA-----AA-TT-TTT--CTT-----------ACA--AAAA---T-T-G---T-AAAATTT-TAT---CGACA--TAGA--GTAGCT----CACGG---A---------GAATTCGAA-----ATGGG---C----------GCTG-TCCCAA-C-ATCACTA--------------------------AC---G-T----TA-A---CTTTTA-TT---AAAAA---TAccttc
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lowQualScore : 7 3 4444 6 888 2 4 2 5 7 9 7 6666666666 1111 9 444 444 1 1 22 22 3 33 9 9 33333333333333333333333333333333333 444444444 99 33333333333 0000000000000 222 7 5 44 5 5 1 4 111 5 888888888888 5 444 111 4 66666666666 44 5 66666 77 7 77 000 1 1 5555 66 00 7777 44 0 0 2 888 444444 4 4 99 0 2 4 1 4 4 4 9999 9 7 55 6 3 6 6 00 88 6 8888888888888888888888888888888888 1 1 44444444 1 22 1 77777777777 22 888 1 2 0000000000000 444 66 22 5555 444 4444444444 77777 444 7777777777 9 9 9 5 111111111111111111111111111111111111 5 444 2 444 444 99999999999999999999999999 77777 5555 1 3 3 555 0 55 0 5555 0 0 8 0 0 0 9 88 4 9999 666666666666 2222222 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 7 1 1 2222 1 22222 9 9 9 8 99 9 7 77 7777 3 5 44 5 999 7 9 99 1 4 22 1 0000000 1 0000000 000000000 5 0 7 7 7 77 3333333333 7 6666 44 5 7777 11111111 2 2 4 5
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Reference ( family-4782 ) : AACACTTCTAGT-AT-AC----CG-GTC---CCCAAAA-T-ATGG-CGCTAAAATAAG-TGCCGCCGAA-G-GCGGTTTA--G---C---TT----A-TA---TA---TA-C-GATCGC--G--TGA-GC-GA-T-CG------A---------TT---------A-------AA---------A--CGG-----C----AAA-----A-------AAA--TCGCAAAA-TTAAG-CCC--AAAA-T-TGAA-CTCCTT-GAGC---AAAAT-GAGGTTT------------A-A---AA---AATGT----------T--TT-TTT----AAAAAC--A-GT--TTTTT--AAATTAAAAAG-AAAAACA----GAA-NGCAAAAA--GAC----GTAACTGTTTA-TGTT-CCAAAATAGATCGAATCCG-TTGTTTAC------GAAATAGTCA-CGTGT-GTGTTATTTTACGTCATTC--TC-CTGATTATCCACGTCACTGATGTTCATGC-AAGTAAACTG-TAAGTCAC-TTGAGA-TTGAG---AAAAAACGCGGAT--TCTTCTTATTTT-AC-GAT-G--AA-TA-TTTTAGCA-NA-----------T------A------------CAGCA-TTC-GGGA-----TT-TT-TTT--C-T-----------ACA--AAAAC--T-T-G---T-AA----T-TAT---CGACA--TGGA--GTGGCT----CACGG---A---------TACTTCGAA-----ATGTG---C---G------GCTG-TCCCAA-C-ATCACTAGG-CCT--------AGTAC--TG--TAC---G-TA--CTGTA---CTTTTA-TT---AAAAA---TATTTTC---A---T-----A--TAT-------AT-----TC----GT-ATGCCTTGTTCAGCTT-GAC-TTGCCAGGCGCTGC-C-CCCAAGACC-CCGC--T-T----A-ATCA-CTTG-TC-T-TATGCCAAAA-CGCC-GCT-A--GGAA---T-TA--TT-ACACG-------AACTTCAA-----GA-GAAGCAT------GA--T----AGCCT--TC--TGTAT--A--TATG---GT-TAT--CAT----A----TT-TATTTATTTT-AA-CTTTAATAACATGGTTCAACTCACA----TG-ATCATATTGTCTTGTCGG--GGGCTG-CCGCCC-CC--AAGCCC----CCGC-T-T--AAT-T---ACGCTC-AAACGCC-GCTGGGCTTTC--TTTT-CGATTTTTA--TT-A-------CACGAAACA-T-------TGGCGAGTTTCACGGC----C---TCAGCAT-CCA-AGGCG-AAAATGC-AAATGG-CGGTG--TGTTTACATTCCGC----------TT-AGCAACGGCAAGGG----G--AATA-ACTGTT----CACGCACA--------GTCGC-G-TGCT-ACTGGG-GACCGGCATAC
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gi|17 : TTTTAGT-AT-GC----CG-GTC---CCCAtaaaaactt
gi|18 : ttaactttaaaatggttcaactcacacgatcatcttgtcttgtcgggggctgccgcccccaagcccccgcttaattacgctcaaacgctgctggactttcttttcgatttttattagaaacattgacgagtttcacggctcagcatccacaggcgaaaatgcaaatggtggtgtgtctacattccgcttagcaacgacaaggggagtaactgttcacgcacagtccgactgtcgcgtgctacACACTTCTAGT-AT-AC----CG-ATC---CCCAAAA-T-ATGA-CGCTAAAATCAG-TGCCGCCGAA-G-GCGGTTTA--C---C---TT----A-TA---TA---TA-C-GATCGC--G--GGA-GC-GA-T-CG------ATTAAATCG-TT---------A-------AA---------A--CGG-----C-----AA-----A-------AAA--TCTCAAAA-TTAAG-CCC--AAAA-T-TGAA-TTCCTT-CAGC----AAAT-GGGGTTT------------A-A---AA---AA-G------------------------AAAAAC--A-G------------ATT-----------------------GCAAAAA--GAC----GT-ACTGTTTA-TGTT-CCAAATTAGATAGAATGCG-TTGTTTAC------GAAATAGTCA-CTTGT-GTactt
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gi|20 : tttaaatgcaatcaactcatgaacccctcatggtttTTTTAGT-AT-GC----CG-GTC---CCCAAtaaaaccttc
gi|21 : tttaaatgcaatcaactcatgaacccctcatggtttgccctcaagcccacactacattatgctcaaacactactgggctctcttaggcgagttccaagtctcggcatccaaggtgaaaatacaaatggcagtgtgtttacattccgcttagcaacagcaaggggaataactgctcatccacagtcgcaATTATCCACGTCACTGATGTTCATGT---------TA-CAAATCAC-TTGAGG-TTGAG---AAATAACGCTGAT--TCT---TATTTT-AC-GAT-G--GA-TA-TTTTAGTA-AA-----------T------A------------CAGCA-TTC-GGGA-----AA-TT-TTT--CTT-----------ACA--AAAA---T-T-G---T-AAAATTT-TAT---CGACA--TAGA--GTAGCT----CACGG---A---------GAATTCGAA-----ATGGG---C----------GCTG-TCCCAA-C-ATCACTA--------------------------AC---G-T----TA-A---CTTTTA-TT---AAAAA---TAccttc
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lowQualScore : 7 3 4444 6 888 2 4 2 5 7 9 7 6666666666 1111 9 444 444 1 1 22 22 3 33 9 9 33333333333333333333333333333333333 444444444 99 33333333333 0000000000000 222 7 5 44 5 5 1 4 111 5 888888888888 5 444 111 4 66666666666 44 5 66666 77 7 77 000 1 1 5555 66 00 7777 44 0 0 2 888 444444 4 4 99 0 2 4 1 4 4 4 9999 9 7 55 6 3 6 6 00 88 6 8888888888888888888888888888888888 1 1 44444444 1 22 1 77777777777 22 888 1 2 22222222222 55 444 66 22 5555 444 4444444444 77777 444 7777777777 9 9 9 5 000000000000000000000000000000000000 4 444 2 444 444 11111111111111111111111111111111111111 1 3 6 6 555 0 55 0 5555 0 0 8 0 0 0 9 88 4 9999 666666666666 2222222 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 7 1 1 2222 1 22222 9 9 9 8 99 9 7 77 7777 3 5 44 5 999 7 9 99 1 4 22 1 0000000 1 0000000 000000000 5 0 7 7 7 77 3333333333 7 6666 44 5 7777 11111111 2 2 4 5
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Reference ( family-4782 ) : AACACTTCTAGT-AT-AC----CG-GTC---CCCAAAA-T-ATGG-CGCTAAAATAAG-TGCCGCCGAA-G-GCGGTTTA--G---C---TT----A-TA---TA---TA-C-GATCGC--G--TGA-GC-GA-T-CG------A---------TT---------A-------AA---------A--CGG-----C----AAA-----A-------AAA--TCGCAAAA-TTAAG-CCC--AAAA-T-TGAA-CTCCTT-GAGC---AAAAT-GAGGTTT------------A-A---AA---AATGT----------T--TT-TTT----AAAAAC--A-GT--TTTTT--AAATTAAAAAG-AAAAACA----GAA-NGCAAAAA--GAC----GTAACTGTTTA-TGTT-CCAAAATAGATCGAATCCG-TTGTTTAC------GAAATAGTCA-CGTGT-GTGTTATTTTACGTCATTC--TC-CTGATTATCCACGTCACTGATGTTCATGC-AAGTAAACTG-TAAGTCAC-TTGAGA-TTGAG---AAAAAACGCGGAT--TCTTCTTATTTT-AC-GAT-G--AA-TA-TTTTAGCA-NA-----------T------A------------CAGCA-TTC-GGGA-----TT-TT-TTT--C-T-----------ACA--AAAAC--T-T-G---T-AA----T-TAT---CGACA--TGGA--GTGGCT----CACGG---A---------TACTTCGAA-----ATGTG---C---G------GCTG-TCCCAA-C-ATCACTAGG-CCT--------AGTAC--TG--TAC---G-TA--CTGTA---CTTTTA-TT---AAAAATA---TTTT-C------A---T-----ATA----T-T---AT-----TCGT-ATGCCTTGTTCAGCTT-GAC-TT-GCCAGGCGCTGC-C-CCCAAGACC-CCGC--T-T----A-ATCA-CTTG-TC-T-TATGCCAAAA-CGCC-GCT-A--GGAA---T-TA--TT-ACACG-------AACTTCA------GA-GAAGCAT------GA--T----AGCCT--TC--TGTAT--A--TATG---GT-TAT--CAT----A----TT-TATTTATTTT-AA-CTTTAATAACATGGTTCAACTCACA----TG-ATCATATTGTCTTGTCGG--GGGCTG-CCGCCC-CC--AAGCCC----CCGC-T-T--AAT-T---ACGCTC-AAACGCC-GCTGGGCTTTC--TTTT-CGATTTTTA--TT-A-------CACGAAACA-T-------TGGCGAGTTTCACGGC----C---TCAGCAT-CCA-AGGCG-AAAATGC-AAATGG-CGGTG--TGTTTACATTCCGC----------TT-AGCAACGGCAAGGG----G--AATA-ACTGTT----CACGCACA--------GTCGC-G-TGCT-ACTGGG-GACCGGCATAC
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gi|14 : TTCTAGT-AT-GC----CG-GTC---CCCAtagaaacttcc
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gi|17 : TTTTAGT-AT-GC----CG-GTC---CCCAtaaaaactt
gi|18 : ttaactttaaaatggttcaactcacacgatcatcttgtcttgtcgggggctgccgcccccaagcccccgcttaattacgctcaaacgctgctggactttcttttcgatttttattagaaacattgacgagtttcacggctcagcatccacaggcgaaaatgcaaatggtggtgtgtctacattccgcttagcaacgacaaggggagtaactgttcacgcacagtccgactgtcgcgtgctacACACTTCTAGT-AT-AC----CG-ATC---CCCAAAA-T-ATGA-CGCTAAAATCAG-TGCCGCCGAA-G-GCGGTTTA--C---C---TT----A-TA---TA---TA-C-GATCGC--G--GGA-GC-GA-T-CG------ATTAAATCG-TT---------A-------AA---------A--CGG-----C-----AA-----A-------AAA--TCTCAAAA-TTAAG-CCC--AAAA-T-TGAA-TTCCTT-CAGC----AAAT-GGGGTTT------------A-A---AA---AA-G------------------------AAAAAC--A-G------------ATT-----------------------GCAAAAA--GAC----GT-ACTGTTTA-TGTT-CCAAATTAGATAGAATGCG-TTGTTTAC------GAAATAGTCA-CTTGT-GTactt
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gi|20 : GCCC-TC--AAGCCC----ACAC-T-A--CAT-T---ATGCTC-AAACACT-ACTGGGCTCTC--T----------------T-A--------------------------GGCGAGTTCCA-AGT----C---TCGGCAT-CCA-AGGTG-AAAATAC-AAATGG-CAGTG--TGTTTACATTCCGC----------TT-AGCAACAGCAAGGG----G--AATA-ACTGCT----CATCCACA--------GTCGC--------ATTGGG-GACCGGCATACtagaaact
gi|20 : tttaaatgcaatcaactcatgaacccctcatggtttTTTTAGT-AT-GC----CG-GTC---CCCAAtaaaaccttc
gi|21 : tttaaatgcaatcaactcatgaacccctcatggtttgccctcaagcccacactacattatgctcaaacactactgggctctcttaggcgagttccaagtctcggcatccaaggtgaaaatacaaatggcagtgtgtttacattccgcttagcaacagcaaggggaataactgctcatccacagtcgcaATTATCCACGTCACTGATGTTCATGT---------TA-CAAATCAC-TTGAGG-TTGAG---AAATAACGCTGAT--TCT---TATTTT-AC-GAT-G--GA-TA-TTTTAGTA-AA-----------T------A------------CAGCA-TTC-GGGA-----AA-TT-TTT--CTT-----------ACA--AAAA---T-T-G---T-AAAATTT-TAT---CGACA--TAGA--GTAGCT----CACGG---A---------GAATTCGAA-----ATGGG---C----------GCTG-TCCCAA-C-ATCACTA--------------------------AC---G-T----TA-A---CTTTTA-TT---AAAAATA---ccttc
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Reference ( family-4782 ) : AACACTTCTAGT-AT-AC----CG-GTC---CCCAAAA-T-ATGG-CGCTAAAATAAG-TGCCGCCGAA-G-GCGGTTTA--G---C---TT----A-TA---TA---TA-C-GATCGC--G--TGA-GC-GA-T-CG------A---------TT---------A-------AA---------A--CGG-----C----AAA-----A-------AAA--TCGCAAAA-TTAAG-CCC--AAAA-T-TGAA-CTCCTT-GAGC---AAAATGAGGTT-T------------A-A---AA---AATGT----------T--TT-TTT----AAAAAC--A-GT--TTTTT--AAATTAAAAAG-AAAA----ACAGAA-NGCAAAAA--GAC----GTAACTGTTTA-TGTT-CCAAAATAGATCGAATCCG-TTGTTTAC------GAAATAGTCA-CGTGT-GTGTTATTTTACGTCATTC--TC-CTGATTATCCACGTCACTGATGTTCATGC-AAGTAAACTGT-AAGTCAC-TTGAGA-TTGAG---AAAAAACGCGGATT--CTTCTTATTTT-AC-GATG--AA-TA-TTTTAGCAN--------A----T------A------------CAGCATTC-GGGA-----TT-TT-TTTC--T-----------ACA--AAAAC--T-T-G---T-AA----T-TAT---CGACA--TGGA--GTGGCT----CACGG---ATACTT---------CGAA-----ATGTG---C---G------GCTG-TCCCAA-C-ATCACTAGG-CCT--------AGTAC--TG--TAC---G-TA--CTGTA---CTTTTA-TT---AAAAATA---TTTTC------A---T-----ATAT--TTAATTCGT-ATGCCTTGTTCAGCTT-GAC-TT-GCCAGGCGCTGC-C-CCCAAGACC-CCGC--T-T----A-ATCA-CTTG-TC-T-TATGCCAAAA-CGCC-GCT-A--GGAA---T-TA--TT-ACACG-------AACTTCA------GA-GAAGCAT------GA--T----AGCCT--TC--TGTAT--A--TATG---GT-TAT--CAT----A----TT-TATTTATTTT-AA-CTTTAATAACATGGTTCAACTCACA----TG-ATCATATTGTCTTGTCGG--GGGCTG-CCGCCC-CC--AAGCCC----CCGC-T-T--AAT-T---ACGCTC-AAACGCC-GCTGGGCTTTC--TTTT-CGATTTTTA--TT-A-------CACGAAACA-T-------TGGCGAGTTTCACGGC----C---TCAGCAT-CCA-AGGCG-AAAATGC-AAATGG-CGGTG--TGTTTACATTCCGC----------TT-AGCAACGGCAAGGG----G--AATA-ACTGTT----CACGCACA--------GTCGC-G-TGCT-ACTGGG-GACCGGCATAC
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gi|14 : TTCTAGT-AT-GC----CG-GTC---CCCAtagaaacttcc
gi|15 : ttacacgaacttcaagaagcagatactgagtcttctgtttattcattttaactttaacatgttcaactcacaagatcatcttggctgtcgggggctgccgcctcaagcccccgcttaattacgctcaaaacgccgctgggctttcttttcgatttttattacacgaatcattgacgagtttcacgactcagcatcccacaggcgaaaatgcaaatggcggtgtttacattccgcttagcaatggcaaggggagtaactgttcacgcacagtcgcgtgctacT--CAT----A--------ATTTTTTTT-TA-CGTGGATAAC----TT--ACTCA---------ATCATATTGCCTTGTCAG--GGA-TG-CTGCCC-CC--AAGCCC----CCAC-T-T--A---C---ATGCTC-AAACGCT-GCTGGACTTTC--TTTT-CAATTTTT---TA-A-------CATGAAACA-TATAGCATTGGCGAGTTTCACGGC----C----CAGCAT-CCG-AGGCA-GAAATGC-AAATGG-CGGTG--TATTTACATTCCAT----------TT-A------GCAAGGG----G--AATA-ACTGCT----CATGCACA--------ATCGC-G-TGCT-ATGGGG-GGCTTGGATACacttcc
gi|16 : aatcaacaagCTTCTAGTTATTAC----CGCGTC---CCCAAAA-TTATGG-CGCTAAAATC---TGCCGCCGAA-GCGCGTTTTA--AATCT---TT----T-TA---TA---TA-C-GATCGC--G--TGA-GC-GA-T-CG------ATT-------TT---------AAATCGTTAA---------A--CGG-----C-----AA-----A-------AAT--TCGCAAAATTTAAG-CCC--AAAA-TATGAA-CTCCTTGGAGCCAAAAAAT-AAGTT-T------------A-A---AA---TATG-----------T--TT-TTG----AAATAC--A-GT--TTTTT--GAATTAGAAAGAAAAA----ACAGAATTGCCAAAATGAAC----ATACGTATTTA-TGTTCCCAAAATAGATCGtagaaactt
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gi|17 : TTTTAGT-AT-GC----CG-GTC---CCCAtaaaaactt
gi|18 : ttaactttaaaatggttcaactcacacgatcatcttgtcttgtcgggggctgccgcccccaagcccccgcttaattacgctcaaacgctgctggactttcttttcgatttttattagaaacattgacgagtttcacggctcagcatccacaggcgaaaatgcaaatggtggtgtgtctacattccgcttagcaacgacaaggggagtaactgttcacgcacagtccgactgtcgcgtgctacACACTTCTAGT-AT-AC----CG-ATC---CCCAAAA-T-ATGA-CGCTAAAATCAG-TGCCGCCGAA-G-GCGGTTTA--C---C---TT----A-TA---TA---TA-C-GATCGC--G--GGA-GC-GA-T-CG------ATTAAATCG-TT---------A-------AA---------A--CGG-----C-----AA-----A-------AAA--TCTCAAAA-TTAAG-CCC--AAAA-T-TGAA-TTCCTT-CAGC----AAATGGGGTT-T------------A-A---AA---AA-G------------------------AAAAAC--A-G------------ATT-----------------------GCAAAAA--GAC----GT-ACTGTTTA-TGTT-CCAAATTAGATAGAATGCG-TTGTTTAC------GAAATAGTCA-CTTGT-GTactt
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gi|20 : GCCC-TC--AAGCCC----ACAC-T-A--CAT-T---ATGCTC-AAACACT-ACTGGGCTCTC--T----------------T-A--------------------------GGCGAGTTCCA-AGT----C---TCGGCAT-CCA-AGGTG-AAAATAC-AAATGG-CAGTG--TGTTTACATTCCGC----------TT-AGCAACAGCAAGGG----G--AATA-ACTGCT----CATCCACA--------GTCGC--------ATTGGG-GACCGGCATACtagaaact
gi|20 : tttaaatgcaatcaactcatgaacccctcatggtttTTTTAGT-AT-GC----CG-GTC---CCCAAtaaaaccttc
gi|21 : tttaaatgcaatcaactcatgaacccctcatggtttgccctcaagcccacactacattatgctcaaacactactgggctctcttaggcgagttccaagtctcggcatccaaggtgaaaatacaaatggcagtgtgtttacattccgcttagcaacagcaaggggaataactgctcatccacagtcgcaATTATCCACGTCACTGATGTTCATGT---------TAC-AAATCAC-TTGAGG-TTGAG---AAATAACGCTGATT--CT---TATTTT-AC-GATG--GA-TA-TTTTAGTAA--------A----T------A------------CAGCATTC-GGGA-----AA-TT-TTTCT-T-----------ACA--AAAA---T-T-G---T-AAAATTT-TAT---CGACA--TAGA--GTAGCT----CACGG---AGAATT---------CGAA-----ATGGG---C----------GCTG-TCCCAA-C-ATCACTA--------------------------AC---G-T----TA-A---CTTTTA-TT---AAAAATA---ccttc
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Reference ( family-4782 ) : AACACTTCTAGT-AT-AC----CG-GTC---CCCAAAA-T-ATGG-CGCTAAAATAAG-TGCCGCCGAA-G-GCGGTTTA--G---C---TT----A-TA---TA---TA-C-GATCGC--G--TGA-GC-GA-T-CG------A---------TT---------A-------AA---------A--CGG-----C----AAA-----A-------AAA--TCGCAAAA-TTAAG-CCC--AAAA-T-TGAA-CTCCTT-GAGC---AAAATGAGGTT-T------------A-A---AA---AATGT----------T--TT-TTT----AAAAAC--A-GT--TTTTT--AAATTAAAAAG-AAAA----ACAGAA-NGCAAAAA--GAC----GTAACTGTTTA-TGTT-CCAAAATAGATCGAATCCG-TTGTTTAC------GAAATAGTCA-CGTGT-GTGTTATTTTACGTCATTC--TC-CTGATTATCCACGTCACTGATGTTCATGC-AAGTAAACTGT-AAGTCAC-TTGAGA-TTGAG---AAAAAACGCGGATT--CTTCTTATTTT-AC-GATG--AA-TA-TTTTAGCAN--------A----T------A------------CAGCATTC-GGGA-----TT-TT-TTTC--T-----------ACA--AAAAC--T-T-G---T-AA----T-TAT---CGACA--TGGA--GTGGCT----CACGG---ATACTT---------CGAA-----ATGTG---C---G------GCTG-TCCCAA-C-ATCACTAGG-CCT--------AGTAC--TG--TAC---G-TA--CTGTA---CTTTTA-TT---AAAAATA---TTTTC------A---T-----ATAT--TTAATTCGT-ATGCCTTGTTCAGCTT-GAC-TT-GCCAGGCGCTGC-C-CCCAAGACC-CCGC--T-T----A-ATCA-CTTG-TC-T-TATGCCAAAA-CGCC-GCT-A--GGAA---T-TA--TT-ACACG-------AACTTCA------GA-GAAGCAT------GA--T----AGCCT--TC--TGTAT--A--TATG---GT-TAT--CAT----A----TT-TATTTATTTT-AA-CTTTAATAACATGGTTCAACTCACA----TG-ATCATATTGTCTTGTCGG--GGGCTG-CCGCCC-CC--AAGCCC----CCGC-T-T--AAT-T---ACGCTC-AAACGCC-GCTGGGCTTTC--TTTT-CGATTTTTA--TT-A-------CACGAAACA-T-------TGGCGAGTTTCACGGC----C---TCAGCAT-CCA-AGGCG-AAAATGC-AAATGG-CGGTG--TGTTTACATTCCGC----------TT-AGCAACGGCAAGGG----G--AATA-ACTGTT----CACGCACA--------GTCGC-G-TGCT-ACTGGG-GACCGGCATAC
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gi|14 : TTCTAGT-AT-GC----CG-GTC---CCCAtagaaacttcc
gi|15 : ttacacgaacttcaagaagcagatactgagtcttctgtttattcattttaactttaacatgttcaactcacaagatcatcttggctgtcgggggctgccgcctcaagcccccgcttaattacgctcaaaacgccgctgggctttcttttcgatttttattacacgaatcattgacgagtttcacgactcagcatcccacaggcgaaaatgcaaatggcggtgtttacattccgcttagcaatggcaaggggagtaactgttcacgcacagtcgcgtgctacT--CAT----A--------ATTTTTTTT-TA-CGTGGATAAC----TT--ACTCA---------ATCATATTGCCTTGTCAG--GGA-TG-CTGCCC-CC--AAGCCC----CCAC-T-T--A---C---ATGCTC-AAACGCT-GCTGGACTTTC--TTTT-CAATTTTT---TA-A-------CATGAAACA-TATAGCATTGGCGAGTTTCACGGC----C----CAGCAT-CCG-AGGCA-GAAATGC-AAATGG-CGGTG--TATTTACATTCCAT----------TT-A------GCAAGGG----G--AATA-ACTGCT----CATGCACA--------ATCGC-G-TGCT-ATGGGG-GGCTTGGATACacttcc
gi|16 : aatcaacaagCTTCTAGTTATTAC----CGCGTC---CCCAAAA-TTATGG-CGCTAAAATC---TGCCGCCGAA-GCGCGTTTTA--AATCT---TT----T-TA---TA---TA-C-GATCGC--G--TGA-GC-GA-T-CG------ATT-------TT---------AAATCGTTAA---------A--CGG-----C-----AA-----A-------AAT--TCGCAAAATTTAAG-CCC--AAAA-TATGAA-CTCCTTGGAGCCAAAAAAT-AAGTT-T------------A-A---AA---TATG-----------T--TT-TTG----AAATAC--A-GT--TTTTT--GAATTAGAAAGAAAAA----ACAGAATTGCCAAAATGAAC----ATACGTATTTA-TGTTCCCAAAATAGATCGtagaaactt
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gi|17 : TTTTAGT-AT-GC----CG-GTC---CCCAtaaaaactt
gi|18 : ttaactttaaaatggttcaactcacacgatcatcttgtcttgtcgggggctgccgcccccaagcccccgcttaattacgctcaaacgctgctggactttcttttcgatttttattagaaacattgacgagtttcacggctcagcatccacaggcgaaaatgcaaatggtggtgtgtctacattccgcttagcaacgacaaggggagtaactgttcacgcacagtccgactgtcgcgtgctacACACTTCTAGT-AT-AC----CG-ATC---CCCAAAA-T-ATGA-CGCTAAAATCAG-TGCCGCCGAA-G-GCGGTTTA--C---C---TT----A-TA---TA---TA-C-GATCGC--G--GGA-GC-GA-T-CG------ATTAAATCG-TT---------A-------AA---------A--CGG-----C-----AA-----A-------AAA--TCTCAAAA-TTAAG-CCC--AAAA-T-TGAA-TTCCTT-CAGC----AAATGGGGTT-T------------A-A---AA---AA-G------------------------AAAAAC--A-G------------ATT-----------------------GCAAAAA--GAC----GT-ACTGTTTA-TGTT-CCAAATTAGATAGAATGCG-TTGTTTAC------GAAATAGTCA-CTTGT-GTactt
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gi|20 : GCCC-TC--AAGCCC----ACAC-T-A--CAT-T---ATGCTC-AAACACT-ACTGGGCTCTC--T----------------T-A--------------------------GGCGAGTTCCA-AGT----C---TCGGCAT-CCA-AGGTG-AAAATAC-AAATGG-CAGTG--TGTTTACATTCCGC----------TT-AGCAACAGCAAGGG----G--AATA-ACTGCT----CATCCACA--------GTCGC--------ATTGGG-GACCGGCATACtagaaact
gi|20 : tttaaatgcaatcaactcatgaacccctcatggtttTTTTAGT-AT-GC----CG-GTC---CCCAAtaaaaccttc
gi|21 : tttaaatgcaatcaactcatgaacccctcatggtttgccctcaagcccacactacattatgctcaaacactactgggctctcttaggcgagttccaagtctcggcatccaaggtgaaaatacaaatggcagtgtgtttacattccgcttagcaacagcaaggggaataactgctcatccacagtcgcaATTATCCACGTCACTGATGTTCATGT---------TAC-AAATCAC-TTGAGG-TTGAG---AAATAACGCTGATT--CT---TATTTT-AC-GATG--GA-TA-TTTTAGTAA--------A----T------A------------CAGCATTC-GGGA-----AA-TT-TTTCT-T-----------ACA--AAAA---T-T-G---T-AAAATTT-TAT---CGACA--TAGA--GTAGCT----CACGG---AGAATT---------CGAA-----ATGGG---C----------GCTG-TCCCAA-C-ATCACTA--------------------------AC---G-T----TA-A---CTTTTA-TT---AAAAATA---ccttc
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gi|27 : gaacgtctcaacatccaaggcaaaaatgctaatggcaatgtgcttccattcagcttaatttcttttagcaatggcaaggggatcaactgctctgacatgcacagtcacgtgataaCACTTCTAGT-AT-AC----CG-GTC---CCCAAAA-T-ATGG-CGCTAAAATAAG-TGCCGCCGAA-G-GCGGTTTA--G---C---TT----A-TA---TA---TA-C-GAACGC--G--TGA-GC-GA-T-CG------A---------TT---------A-------AT---------T--CGT-----T----AAA-----ACGATAACAAA--TCGCAAAA-TTAAT-CAC--AAAA-T-TGAA-aaactt
gi|28 : AAGATTAG-GGACGC---A-G-GCGGTTTA--G---T---T--------A---TA---TA-C-GATCGC--G--TGA-GC-GA-T-CG------A---------TT---------ACGTG---NA---------G--CGATCGATT----AAATCATTA-------AAA--CGGCAAAA-TTAAG-CCC--AAAA-T-T-AA-CTCCTT-GAGC---AAAATGAGTTT-
gi|29 : ---T-AA----T-TAT---CGACA--TGGA--GTGGCT----CACGG---A--------------CG--------TGTG---C---G---------G-TCCCAA-C-ATCACTA----------------TAC--------------------GTA---CTTTTATTT---AAAAAAA---CTTTCAT----A---T-----ATAT--TTCATTCGT-ATGACTTGTTCAGCTT-GAC-TT-GC
gi|3 : AACACTTCTAGT-AT-AC----CA-GTC---CCCAAAA-T-ATGG-CGCTAAAATAAG-TCCCGCCGAA-G-GCATTTAA--G---C---TT----A-TG---TA---TA-C-GATCAC--G--TGA-GC-GA-T-CA------A---------TT---------A-------AA---------A--CGA-----C----AAA-----A-------AAA--TCGCAAAA-TTAAG-CCC--AAAA-C-TGAA-CTCCTT-GAGC---AAAATGAGGTT-T------------A-A---AA---AATGT----------T--TT-TTT----AAAAAC--A-GT--TTCCT--AAATCAAAAAG-AAAA----ACAGAA-TGCAAAAA--GAC----GTAACTGTTTA-TGTT-CCAAAAAAAATAG-ATC------TTTAT------AAAATAGTCA-CGTGT-GTGTTATTTTACGTCATTC--TC-CTGATTAACCACGTCACTGATGTTCATAC-AAGTAAACTGT-AAGTCAC-TTGAGA-TTGAGAAAAAAAAATGTGGATT--CTTCTTATTTT-AC-GATG--AA-TA-TTTTAGCAC--------A----T------G------------CAGCATTC-AAGA-----TT-TT-TTTC--T-----------ACA--AAAAA--T-T-G---T-AA----T-TAT---GGACA--TAGA--GTAGCT----CACAG---ATACTT---------TGAA-----ATGTG---CACTA------GCTG-TCCCAA-C-ATCACTAGATTCT--------AGTAC--TG--TAC---G-TAGTCTGTA---CTTTAA-TT---AAAAATA---TTTTG------A-----------AT--GCA--TCGT-ATGCTTTGTTTAGCTT-GAA-TT--CCAGGCGCTGC-C-CCCAAGACC-CCGC--T-T----A-ATCA-C--G-TC-T-TATGCCAAAA-CGCC-GCT-A--GGAA---T-TA--TT-ACAAG-------AACTTCAAGTCTTGACGAAGCAT------GA--T----AGCCT--AC--TGTAT--A--TATG---TTGTAT--CATCATAA----TT-TATTTATTTT-AA-CTTTAATAACATGGTTCAACTCGCA----TG-ATCATATTGTCTTGTCGG--GGGCTG-CCGCCA-CT--AAAACC----CCGC-T-T--AAT-T---A-GCTC-AAACGCC-ACTGAGCTTTC--TTTT-CAATTTTTA--TT-A-------CACGAAACA-T-------TGGAGAGTTTCACGGC----TCAATCAGCAT-CCA-AGGTG-AAAATAC-AAATGG-CGGTG--TGTTTAAATTCCGC----------TT-AGCAACAGCAAGGGGATCG--AATA-ACTGTA----CACG--CA--------GTCAC-A-TGCT-ACTGGG-GACCCGCATAC
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gi|30 : TTCTAGT-AT-GC----CG-GTC---CCCAtagaaact
gi|31 : agcatccacaggcgaaaatgcaaatggcgttgtgtttacattccgcttagcaacggcaaggggagtaactgttcacgcacagtcgcgtgctacAT-CCA-TGGCG-AAAATGC-AAATGG-CAGTG--TGTTTACATTCCGC----------TT-AGTAATGGCAAGGG----G--AATA-ACTGTT----CACGCACA--------GTCAC-G-TGCT-ACTGGG-GACCGGCATACact
gi|31 : TTCTAGT-AT-GC----CG-GTC---CCCAtagaaactt
gi|32 : atccatggcgaaaatgcaaatggcagtgtgtttacattccgcttagtaatggcaaggggaataactgttcacgcacagtcacgtgctacG-TCC--AAAA-T-ACAA-CTCCTT-GAGC---AAAAT----TT-TTTTTTTTATATAA-A---AA---AATGT----------T--TT-TTT-----AAAGC--A-G---TTTTT--GAATTGAAAAG-AAAAACATACAGAA-CGCAAAAA--GAC----GTAactt
gi|33 : A--GTGGCG----TACGG---ATACCT---------CGAACCACAATGTT---C---G-------CTG-TCCGAA-G-ATCACTAGG-CGT--------AG-AC---GCCTAG---G--A--CTGTA---CTTTTA-TT---AAAAATA---TTTTT------A---T-----ATAT--TTAATCCAT-ATtt
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gi|35 : A-T-CG----------------TT---------A-------AA---------A--CGG-----CCCCAAAA-----A-------AAA--TCGCAAAA-TGAAG-CCC--AAAT-T-TAAA-CTCCTC-GAGC---AAAATGAGGTT-T------------A-A---A--------T----------T--TT-TTT---------------T--TT------AATTAAAAAG-AAAA----ACAGAA-
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gi|39 : gACATATCTGGT-AT-AC----CG-GTC---CCCAAAA-T-ATGG-CGCTAAAGTAAA-AACCGCCAAA-G-GTGGCGTA--G---T---GT----A-T
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gi|4 : AACATGGTTCAACTCACA----TG-ATAATATTG-------------GCTG-CCGCCC-CC--AAGCCC----CCGC-T-T--AAT-T---ACGCTC-AAACGCC-GCTGGGATTTC--TTTT-CGATTTTTA--TT-A-------CACGAAACA-T-------TGACGAGTTTCGCGGC--------TCAGCAT-CCT-AGGCG-AAAATGC-AAAGGT-CGGTG--TGTTTACATTCCGC----------TT-AGCAACGGCAAGGG----A--AATA-ACTGTT----CACGCACA--------GTCGC-G-TGCT-ACTGGG-GACCGGCATACcaactcacatgataatattggctgccgcccccaagcccccgcttaattacgctcaaacgccgctgggatttcttttcgatttttattacacgaaacattgacgagtttcgcggctcagcatcctaggcgaaaatgcaaaggtcggtgtgtttacattccgcttagcaacggcaagggaaataactgttcacgcacagtcgcgtgctactggggaccggcatactagaaac
gi|4 : ttaaaaaatgtgttttttttattttttaaaaacagttttttaacttaaaaagaaaaacgtaattcaaaacgacgtactgtttatgttccaaaatagatcgaatccgttgtttacaaaatagtcacgtgtgcgctactttacgtcattctcctgattatccacgtcactgatattcatgcaagtgacttgagattgagaaaaaacgcggattcttcttattttacgatgaagattttagcatatgcagcatttgggattttttttctacaaaaacgacatggagtggctcacggatacttcgaaaagtgtgcagtcccaacatcgctaggcctagtacgtacttttattaaaaatactttcatatatatttaattcgtatgacttgttcagcttgactttccaggcgctgctcccaagaccccgcttaatcacttgtcataagccaaaatcgcccctaggatttattacaccaacttcaagaagcatgatctaacattctgtataTTCTAGT-AT-GC----CG-GTC---CCCAtagaaac
gi|40 : ttaaaaaatgtgttttttttattttttaaaaacagttttttaacttaaaaagaaaaacgtaattcaaaacgacgtactgtttatgttccaaaatagatcgaatccgttgtttacaaaatagtcacgtgtgcgctactttacgtcattctcctgattatccacgtcactgatattcatgcaagtgacttgagattgagaaaaaacgcggattcttcttattttacgatgaagattttagcatatgcagcatttgggattttttttctacaaaaacgacatggagtggctcacggatacttcgaaaagtgtgcagtcccaacatcgctaggcctagtacgtacttttattaaaaatactttcatatatatttaattcgtatgacttgttcagcttgactttccaggcgctgctcccaagaccccgcttaatcacttgtcataagccaaaatcgcccctaggatttattacaccaacttcaagaagcatgatctaacattctgtataaacatggttcaactcacatgataatattggctgccgcccccaagcccccgcttaattacgctcaaacgccgctgggatttcttttcgatttttattacacgaaacattgacgagtttcgcggctcagcatcctaggcgaaaatgcaaaggtcggtgtgtttacattccgcttagcaacggcaagggaaataactgttcacgcacagtcgcgtgctacTTACGTTCCAT----------CT-AACAACGGCAAAGG----G--AATA-ACTGTT----CACGCACA--------GTCGC-A-TGCT-Aac
gi|41 : -TA--CTGTA---CTTTTA-TT---AAAAATA---TTTTC------ATG-T-----ACAT--TTAATTTGT-ATGCCTTGTTCAGCTT-tacaagaaacttgc
gi|42 : aGGCAAGGG----A--AATA-ACTGTT----CACGCACA--------GTCGC-G-TGCT-ACTGGGAGACCGGCATAC
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gi|45 : A-T-CG----------------TT---------A-------AA---------A--TGG-----C----AAA-----T-------AA---TCGCAAAA-TTAAG-CCC--AAAA-T-TGAA-CTC
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gi|48 : ggGAA-CTCCTT-GAGC---AAAATGAGTTT-T------------A-A---AA---A--------------C--TT-TTT----A
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gi|5 : t-CGTGT-GTATTATTTTACGTCATTC--TC-CTGATGATCCACGTCACTGAT
gi|5 : GATT--CTTCTTATTTT-AT-GATG--AA-CA-TTTTAGAAA--------A----T------A------------CAGCATTT-GGGAACATTTT-TTATTTT--T-----------ACA--AAAAC--T-T-G---T-GA----T-TAT---CGACA--TGGA--GTGGCT----CACGG---ATACTTGAATTACTTCGAA-----ATGTG---C---G-------CTG-TCCCAA-C-ATCACTAGG-C----------------------AT---GATA--CTGTA---CTTTTA-TT---AAATATA---TTTTC------A---T-----ATATATTTAAATCGT-ATCCCTTGTTCAGTTT-GAC-TT-GCCAGGCGCTGC-T-CCCAAAACT-CTGC--T-TTTAAA-ATCA-TTTG-TC-T-TATGCCAAAC-CGAT-GCT-A--AGAA---T-TA--TT-TCACG-------AACTTCA-------A-GAAGCAT------GA--T----AGCCT--TC--TGCA------------------------------------TATTTATTTT-AA-CTTT-AT--CATAGTTTAACTCACA----TG-ATCATATTGTCATGTCGG--GGGCTG-CCGCCC-CC--AAGCTC----CCGC-T-T--AAT-T---ATGCTC-AAACTCC-ACTGGGCTTTC--TTTT-CGATTTTTA--TT-A-------CATGAAACA-T-------TGACGACCTTCACGG-----C---TCAGTAT-TTA-AGGCG-AAAATGC-AAATGC-CGGTG--TATTTACATTCCGC----------TT-AGCAACGGCAAGGG----G--AATA-ACTGTT----CACGCACA--------GTCGC-G-TGCT-ACTGGG-GACCGGCATACtcttcttattttatgatgaacattttagaaaatacagcatttgggaacattttttatttttacaaaaacttgtgattatcgacatggagtggctcacggatacttgaattacttcgaaatgtgcgctgtcccaacatcactaggcatgatactgtacttttattaaatatattttcatatatatttaaatcgtatcccttgttcagtttgacttgccaggcgctgctcccaaaactctgcttttaaaatcatttgtcttatgccaaaccgatgctaagaattatttcacgaacttcaagaagcatgatagccttctgcatatttattttaactttatcatagtttaactcacatgatcatattgtcatgtcgggggctgccgcccccaagctcccgcttaattatgctcaaactccactgggctttcttttcgatttttattacatgaaacattgacgaccttcacggctcagtatttaaggcgaaaatgcaaatgccggtgtatttacattccgcttagcaacggcaaggggaataactgttcacgcacagtcgcgtgctactggggaccggcatactagaaactt
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gi|50 : cgtgtgtattattttacgtcattctcctgatgatccacgtcactgattcttcttattttatgatgaacattttagaaaatacagcatttgggaacattttttatttttacaaaaacttgtgattatcgacatggagtggctcacggatacttgaattacttcgaaatgtgcgctgtcccaacatcactaggcatgatactgtacttttattaaatatattttcatatatatttaaatcgtatcccttgttcagtttgacttgccaggcgctgctcccaaaactctgcttttaaaatcatttgtcttatgccaaaccgatgctaagaattatttcacgaacttcaagaagcatgatagccttctgcatatttattttaactttatcatagtttaactcacatgatcatattgtcatgtcgggggctgccgcccccaagctcccgcttaattatgctcaaactccactgggctttcttttcgatttttattacatgaaacattgacgaccttcacggctcagtatttaaggcgaaaatgcaaatgccggtgtatttacattccgcttagcaacggcaaggggaataactgttcacgcacagtcgcgtgctacA-T-------TGGCGAGTTTCACGGC----C----CGGCAT-CCG-AGGactt
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gi|9 : T-G--GGAACTTT-TT--TT-ACACG-------AACTTCA-------A-GAAGCA-------GA--T----A-------C--TG-----------A---GT-CTT--C-T----G----TT-TATTCATTTT-AA-CTT---TAACAT-GTTCAACTCACA----AG-ATCATCTTGGC-TGTCGG--GGGCTG-CCG-CC-TC--AAGCCC----CCGC-T-T--AAT-T---ACGCTCAAAACGCC-GCTGGGCTTTC--Tcaagaagcagatactgagtcttctgtttattcattttaactttaacatgttcaactcacaagatcatcttggctgtcgggggctgccgcctcaagcccccgcttaattacgctcaaaacgccgctgggctttct
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Reference ( family-4782 ) : AACACTTCTAGT-AT-AC----CG-GTC---CCCAAAA-T-ATGG-CGCTAAAATAAG-TGCCGCCGAA-G-GCGGTTTA--G---C---TT----A-TA---TA---TA-C-GATCGC--G--TGA-GC-GA-T-CG------A---------TT---------A-------AA---------A--CGG-----C----AAA-----A-------AAA--TCGCAAAA-TTAAG-CCC--AAAA-T-TGAA-CTCCTT-GAGC---AAAAT-GAGGTTT------------A-A---AA---AATGT----------T--TT-TTT----AAAAAC--A-GT--TTTTT--AAATTAAAAAG-AAAA----ACAGAA-NGCAAAAA--GAC----GTAACTGTTTA-TGTT-CCAAAATAGATCGAATCCG-TTGTTTAC------GAAATAGTCA-CGTGT-GTGTTATTTTACGTCATTC--TC-CTGATTATCCACGTCACTGATGTTCATGC-AAGTAAACTG-TAAGTCAC-TTGAGA-TTGAG---AAAAAACGCGGAT--TCTTCTTATTTT-AC-GAT-G--AA-TA-TTTTAGCA-NA-----------T------A------------CAGCA-TTC-GGGA-----TT-TT-TTT--C-----------T-ACA--AAAAC--T-T-G--T-GA----T-TAT---CGACA--TGGA--GTGGCT----CACGG---ATACT---------TCGAA-----ATG----------TG-C----G-----CTG-TCC-C-AAC-ATCACTAGG-C--------CT--------A---GTA-----------C--TGT--A---------------CT---TTTA-TT---AAAAATA---TTTTC---A----T---ATATATTTAATTCGT-ATGCCTTGTTCAGCTT-GAC-TT-GCCAGGCGCTGC-C-CCCAAGACC-CCGC--T-T----A-ATCA-CTTG-TC-T-TATGCCAAAA-CGCC-GCT-A--GGAA---T-TA--TT-ACACG-------AACTTCA------GA-GAAGCAT------GA--T----AGCCT--TC--TGTAT--A--TATG---GT-TAT--CAT----A----TT-TATTTATTTT-AA-CTTTA--AACATGGTTCAACTCACA----TG-ATCATATTGTCTTGTCGG--GGGCTG-CCGCCC-CC--AAGCCC----CCGC-T-T--AAT--T--ACGCTC-AAACGCC-GCTGGGCTTTC--TTTT-CGATTTTTA--TT-A-------CACGAAACA-T-------TGGCGAGTTTCACGGC-----TCAGCAT-CCA-AGGCG-AAAATGC-AAATGG-CGGTG--TGTTTACATTCCGC----------TT-AGCAACGGCAAGGG----G--AATA-ACTGTT----CACGCACA--------GTCGC-G-TGCT-ACTGGG-GACCGGCATAC
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gi|14 : --TT-ACACG-------AACTTCA-------A-GAAGCA-------GA--T----A-------C--TG-----------A---GT-CTT--C-T----G----TT-TATTCATTTT-AA-CTTT---AACAT-GTTCAACTCACA----AG-ATCATCTTGGC-TGTCGG--GGGCTG-CCG-CC-TC--AAGCCC----CCGC-T-T--AAT--T--ACGCTCAAAACGCC-GCTGGGCTTTC--TTTT-CGATTTTTA--TT-A-------CACGAATCA-T-------TGACGAGTTTCACGAC-----TCAGCATCCCACAGGCG-AAAATGC-AAATGG-CG--G--TGTTTACATTCCGC----------TT-AGCAATGGCAAGGG----G--AGTA-ACTGTT----CACGCACA--------GTCGC-G-TGCT-ACTGGG-GACCGGCATACtagaaaattcc
gi|14 : TTCTAGT-AT-GC----CG-GTC---CCCAtagaaacttcc
gi|15 : ttacacgaacttcaagaagcagatactgagtcttctgtttattcattttaactttaacatgttcaactcacaagatcatcttggctgtcgggggctgccgcctcaagcccccgcttaattacgctcaaaacgccgctgggctttcttttcgatttttattacacgaatcattgacgagtttcacgactcagcatcccacaggcgaaaatgcaaatggcggtgtttacattccgcttagcaatggcaaggggagtaactgttcacgcacagtcgcgtgctacT--CAT----A--------ATTT--TTT-----TTTA----CGTGGAT-AACTTACT----CA-ATCATATTGCCTTGTCAG--GGA-TG-CTGCCC-CC--AAGCCC----CCAC-T-T--A----C--ATGCTC-AAACGCT-GCTGGACTTTC--TTTT-CAATTTTT---TA-A-------CATGAAACA-TATAGCATTGGCGAGTTTCACGGC-----CCAGCAT-CCG-AGGCA-GAAATGC-AAATGG-CGGTG--TATTTACATTCCAT----------TT-A------GCAAGGG----G--AATA-ACTGCT----CATGCACA--------ATCGC-G-TGCT-ATGGGG-GGCTTGGATACacttcc
gi|16 : aatcaacaagCTTCTAGTTATTAC----CGCGTC---CCCAAAA-TTATGG-CGCTAAAATC---TGCCGCCGAA-GCGCGTTTTA--AATCT---TT----T-TA---TA---TA-C-GATCGC--G--TGA-GC-GA-T-CG------ATT-------TT---------AAATCGTTAA---------A--CGG-----C-----AA-----A-------AAT--TCGCAAAATTTAAG-CCC--AAAA-TATGAA-CTCCTTGGAGCCAAAAAAT--AAGTTT------------A-A---AA---TATG-----------T--TT-TTG----AAATAC--A-GT--TTTTT--GAATTAGAAAGAAAAA----ACAGAATTGCCAAAATGAAC----ATACGTATTTA-TGTTCCCAAAATAGATCGtagaaactt
gi|17 : acTT-AA-CTTTA--AA-ATGGTTCAACTCACA----CG-ATCATCTTGTCTTGTCGG--GGGCTG-CCGCCC-CC--AAGCCC----CCGC-T-T--AAT--T--ACGCTC-AAACGCT-GCTGGACTTTC--TTTT-CGATTTTTA--TT-A----------GAAACA-T-------TGACGAGTTTCACGGC-----TCAGCAT-CCACAGGCG-AAAATGC-AAATGG-TGGTG--TGTCTACATTCCGC----------TT-AGCAACGACAAGGG----G--AGTA-ACTGTT----CACGCACAGTCCGACTGTCGC-G-TGCT-ACTGGG-GACCGGCATACg
gi|17 : TTTTAGT-AT-GC----CG-GTC---CCCAtaaaaactt
gi|18 : ttaactttaaaatggttcaactcacacgatcatcttgtcttgtcgggggctgccgcccccaagcccccgcttaattacgctcaaacgctgctggactttcttttcgatttttattagaaacattgacgagtttcacggctcagcatccacaggcgaaaatgcaaatggtggtgtgtctacattccgcttagcaacgacaaggggagtaactgttcacgcacagtccgactgtcgcgtgctacACACTTCTAGT-AT-AC----CG-ATC---CCCAAAA-T-ATGA-CGCTAAAATCAG-TGCCGCCGAA-G-GCGGTTTA--C---C---TT----A-TA---TA---TA-C-GATCGC--G--GGA-GC-GA-T-CG------ATTAAATCG-TT---------A-------AA---------A--CGG-----C-----AA-----A-------AAA--TCTCAAAA-TTAAG-CCC--AAAA-T-TGAA-TTCCTT-CAGC----AAAT-GGGGTTT------------A-A---AA---AA-G------------------------AAAAAC--A-G------------ATT-----------------------GCAAAAA--GAC----GT-ACTGTTTA-TGTT-CCAAATTAGATAGAATGCG-TTGTTTAC------GAAATAGTCA-CTTGT-GTactt
gi|19 : CACTTCTAGT-AT-AC----CT-GTT---CCCAAAA-A-ATGG-CGCTATAATAAG-TGCTGACGAA-G-GTGGGTT-------T---TT----T-T----------------TCGC--GATTAA-G-----T-CG----------------TT---------A-------AA---------A--CGG-----T----AAAAAT--A-------AAA--TCGCAAAG-TTAAG-CCC--AAAC-T-TGAA-TTCCTT-GTG----AAAAT----ATTT------------ATACATAATCTAATGT----------TGATCGCTTAAAGAAAAACAGA-GTAATTTTT--AAA--AAAAA
gi|2 : acGT-ATTAC----CG-GTC---CCCAAAAAT-ATGGGCGCTAAAATAAGGTGCCGCGAAG-G-GCGGTTTA----------CT----A-TA---TA---TA-CCGATCGCATG--TGA-GC-GA-T-CG------A---------TT---------A-------AATCGTTTAAAA--CGG-----C----AAA-----A-------AAA--TCGCAAAAATTAAGGCCC--AAAAGT-TGAA-CTCCTT-GAGC---AAAATGGGGGTGT------------A-A---AA---AACG-----------T--TT-TAT----AAAAAC--A-GT--TTTTTTAAAATTGAAAAG-AAAA----ACAGAA-AGCAAATT--GAC----GT-ACTGTTTA-TGTT-CCAAAATAGATCGAATCCGCTTGCTTAC------GAAATAGTCA-C--GT-GTGTTGTTTTAC-TCATTC--TCGCTGATTA-CCACGTCACCGATGTTCATGCTAAGTAAACGGTTAAGTCAC-TTGAGA--TGAG---AAAAAACGCGGATTATCTTCTTATTTT-AC-GATGG--AA-TA-TTTTAGCATTACAGATTAGGCCT------A------------CAACATTTT-GGGA-----TT-TT-TTTTCT-----------T-ACA--CAAAC--T-T-G--C-G-----T-TAT---CGACA--TGGA--GTGGCT----CACGG---ATACT---------TCGAA-----ATG----------TG-C----G-----CTG-TCC-C-AAC-ATCACTAGG-C--------CCA-------A---GTA-----------C--TGC--A---------------CT---ATTATTT---AAAAATA---TTTTCTTTAT---T---TTATATTTAATTCGT-ATGCCTTATTCAGCTTGGAC-TT-GTCAGACGCTGC-T-CCCAAG-CC-CCGC--TAT----ATATCA-CTTG-TC-TCTATTCCAAA---TTC-GCC-C--GG------------T-ACACG-------AA-TTCA-------A-GAAGCA-------GA--TACTGAGCCT--TC--TGT---------------T-TAT-----------------------TTTT-AA-CTTTA--AGAATGGTTCAACTCACA----CG-ATCAT-TTGTCTTGTCGG--GGCTTG--CGCCC-CC--AAGCCC----CCGCTT-T--AAT--T--ACGC-C-AAACGCC-GCTGGGCTTTC--TTTT-TTATTTTTA--TT-AGGCCTACCACGAAACACT-------TGACGAG-TTCACGGC-----TCAGCAG-CCACAGGCGAAAAATGC-AAAT-G-CGTTAATTGTGTACATTCCGCTT--------TT-AGCAACGGCAAGGG----AGTAGTATACTGTT-----ACGCACA--------GTCGC-G-TGCT-ACT-GG-GACGGCCATACatgcctaatggttatttcgtaaaataaataaggcatttaaaa
gi|20 : GCCC-TC--AAGCCC----ACAC-T-A--CAT--T--ATGCTC-AAACACT-ACTGGGCTCTC--T----------------T-A--------------------------GGCGAGTTCCAAGTC-----TCGGCAT-CCA-AGGTG-AAAATAC-AAATGG-CAGTG--TGTTTACATTCCGC----------TT-AGCAACAGCAAGGG----G--AATA-ACTGCT----CATCCACA--------GTCGC--------ATTGGG-GACCGGCATACtagaaact
gi|20 : tttaaatgcaatcaactcatgaacccctcatggtttTTTTAGT-AT-GC----CG-GTC---CCCAAtaaaaccttc
gi|21 : tttaaatgcaatcaactcatgaacccctcatggtttgccctcaagcccacactacattatgctcaaacactactgggctctcttaggcgagttccaagtctcggcatccaaggtgaaaatacaaatggcagtgtgtttacattccgcttagcaacagcaaggggaataactgctcatccacagtcgcaATTATCCACGTCACTGATGTTCATGT---------TA-CAAATCAC-TTGAGG-TTGAG---AAATAACGCTGAT--TCTT---ATTTT-AC-GAT-G--GA-TA-TTTTAGTA-AA-----------T------A------------CAGCA-TTC-GGGA-----AA-TT-TTT--C-----------TTACA--AAAA---T-T-G--T-AAAATTT-TAT---CGACA--TAGA--GTAGCT----CACGG---AGAAT---------TCGAA-----ATG----------GG-C----G-----CTG-TCC-C-AAC-ATCACTA----------------------------A-----------C---GTTAA---------------CT---TTTA-TT---AAAAATA---ccttc
gi|22 : aCACTTCTAGT-TT-AC----CG-GTC---CCCAAAA-T-ATGG-CGCTAAA-TAAG-GGGCGCCGA--G-GCGGTTTA--G---C---TT----A-TA---TA---TA-C-AATTGC--G--TGA-GT-GA-T-CG------ATTAAATCGGTT---------A-------AA---------A--CGG-----C------A-----A-------AAA--TCGCAAAA-TTAAG-CCC---AAA-T-TGAA-CTCCTT-GAGC----AAAT-GAGGTTT--------------A---AA---AATGT----------T--TT-TTA----AAAAAC--A-GT--TTTTC--AA
gi|23 : -T--AAT--TT-ACGCTT-AAACGCC-GCTGG-CTTAC--TTTTTCGATTTTCA--TTGA-------CACGAA-CA-T-------TGACGAGCTTCACGG------TCAGCAT-CCA-AGGCG-AAAATGC-AAATGG-CGGTG--TGTTTA-ATTCTAA----------TTCAGCAACGGCAA-GG----G--AATA-ATTGTT----TACGGCCA--------GTCGC-G-
gi|24 : acatggtagaattggcttcaggtgtacaaAAA-T-ATGG-CGCTAAA-TAAG-GGGCGCCGAA-G-GCGGTTTA--G---C---TT----A-TA---TA---TA-C-AATTGC--G--TGA-GT-GAGT-CG------A---------TT---------G-------AA---------ATGCGT-----T----AAA-----ACGC----AAAATTCGCAAAAGTTAAA-GCC--AAAA-T-TGAA-CTCCTT-GAGC---AAAAT-GAGGTTT--------------A---AA---AATGT----------T--TT-TTA----AAAAAC--A-GT--TTTTC--AAA
gi|25 : -T-ATGG-CGCTAAAATAAG-TGCCGCCGAA-G-GCG--TTA--G---CCCTTC----A-TAAATTAATCTA-C-GATCGC--G--TGAAGC-GA-TTCG------A---------TTTAATTCGTTA-------AA---------A--CGG-----C----AAC-----A-------AA---TCGCAAAT-TTAAG-CCC--AAAA-T-TGAA-CTCCTT-G-GC---AA
gi|26 : cagtatACGTC-----TCAACAT-CCA-AGGCA-AAAATGC-TAATGG-CAATG--TGCTTCCATTCAGCTTAATTTCTTTT-AGCAATGGCAAGGG----G--ATCA-ACTGCTCTGACATGCACA--------GTCAC-G-TGATAATTGGG-GACCGGCATGC
gi|26 : gaTTCTAGC-AT-GC----CG-GTC---CCCAAtagaaaaactt
gi|27 : gaacgtctcaacatccaaggcaaaaatgctaatggcaatgtgcttccattcagcttaatttcttttagcaatggcaaggggatcaactgctctgacatgcacagtcacgtgataaCACTTCTAGT-AT-AC----CG-GTC---CCCAAAA-T-ATGG-CGCTAAAATAAG-TGCCGCCGAA-G-GCGGTTTA--G---C---TT----A-TA---TA---TA-C-GAACGC--G--TGA-GC-GA-T-CG------A---------TT---------A-------AT---------T--CGT-----T----AAA-----ACGATAACAAA--TCGCAAAA-TTAAT-CAC--AAAA-T-TGAA-aaactt
gi|28 : AAGATTAG-GGACGC---A-G-GCGGTTTA--G---T---T--------A---TA---TA-C-GATCGC--G--TGA-GC-GA-T-CG------A---------TT---------ACGTG---NA---------G--CGATCGATT----AAATCATTA-------AAA--CGGCAAAA-TTAAG-CCC--AAAA-T-T-AA-CTCCTT-GAGC---AAAAT-GAGTTT
gi|29 : --T-AA----T-TAT---CGACA--TGGA--GTGGCT----CACGG---A--------------CG--------TG----------TG-C----G-------G-TCC-C-AAC-ATCACTA---------------------------TA-----------C---GT--A---------------CT---TTTA-TTT--AAAAAAA---CTTTC---A----T---ATATATTTCATTCGT-ATGACTTGTTCAGCTT-GAC-TT-GC
gi|3 : AACACTTCTAGT-AT-AC----CA-GTC---CCCAAAA-T-ATGG-CGCTAAAATAAG-TCCCGCCGAA-G-GCATTTAA--G---C---TT----A-TG---TA---TA-C-GATCAC--G--TGA-GC-GA-T-CA------A---------TT---------A-------AA---------A--CGA-----C----AAA-----A-------AAA--TCGCAAAA-TTAAG-CCC--AAAA-C-TGAA-CTCCTT-GAGC---AAAAT-GAGGTTT------------A-A---AA---AATGT----------T--TT-TTT----AAAAAC--A-GT--TTCCT--AAATCAAAAAG-AAAA----ACAGAA-TGCAAAAA--GAC----GTAACTGTTTA-TGTT-CCAAAAAAAATAG-ATC------TTTAT------AAAATAGTCA-CGTGT-GTGTTATTTTACGTCATTC--TC-CTGATTAACCACGTCACTGATGTTCATAC-AAGTAAACTG-TAAGTCAC-TTGAGA-TTGAGAAAAAAAAATGTGGAT--TCTTCTTATTTT-AC-GAT-G--AA-TA-TTTTAGCA-CA-----------T------G------------CAGCA-TTC-AAGA-----TT-TT-TTT--C-----------T-ACA--AAAAA--T-T-G--T-AA----T-TAT---GGACA--TAGA--GTAGCT----CACAG---ATACT---------TTGAA-----ATG----------TG-CACTAG-----CTG-TCC-C-AAC-ATCACTAGATT--------CT--------A---GTACTGTACGTAGTC--TGT--A---------------CT---TTAA-TT---AAAAATA---TTTTG---A--------ATGCA------TCGT-ATGCTTTGTTTAGCTT-GAA-TT--CCAGGCGCTGC-C-CCCAAGACC-CCGC--T-T----A-ATCA-C--G-TC-T-TATGCCAAAA-CGCC-GCT-A--GGAA---T-TA--TT-ACAAG-------AACTTCAAGTCTTGACGAAGCAT------GA--T----AGCCT--AC--TGTAT--A--TATG---TTGTAT--CATCATAA----TT-TATTTATTTT-AA-CTTTAATAACATGGTTCAACTCGCA----TG-ATCATATTGTCTTGTCGG--GGGCTG-CCGCCA-CT--AAAACC----CCGC-T-T--AAT--T--A-GCTC-AAACGCC-ACTGAGCTTTC--TTTT-CAATTTTTA--TT-A-------CACGAAACA-T-------TGGAGAGTTTCACGGCTCAA-TCAGCAT-CCA-AGGTG-AAAATAC-AAATGG-CGGTG--TGTTTAAATTCCGC----------TT-AGCAACAGCAAGGGGATCG--AATA-ACTGTA----CACG--CA--------GTCAC-A-TGCT-ACTGGG-GACCCGCATAC
gi|30 : AGCAT-CCACAGGCG-AAAATGC-AAATGG-CGTTG--TGTTTACATTCCGC----------TT-AGCAACGGCAAGGG----G--AGTA-ACTGTT----CACGCACA--------GTCGC-G-TGCT-ACTGGG-GACCGGCATAC
gi|30 : TTCTAGT-AT-GC----CG-GTC---CCCAtagaaact
gi|31 : agcatccacaggcgaaaatgcaaatggcgttgtgtttacattccgcttagcaacggcaaggggagtaactgttcacgcacagtcgcgtgctacAT-CCA-TGGCG-AAAATGC-AAATGG-CAGTG--TGTTTACATTCCGC----------TT-AGTAATGGCAAGGG----G--AATA-ACTGTT----CACGCACA--------GTCAC-G-TGCT-ACTGGG-GACCGGCATACact
gi|31 : TTCTAGT-AT-GC----CG-GTC---CCCAtagaaactt
gi|32 : atccatggcgaaaatgcaaatggcagtgtgtttacattccgcttagtaatggcaaggggaataactgttcacgcacagtcacgtgctacG-TCC--AAAA-T-ACAA-CTCCTT-GAGC---AAAAT-----TTTTTTTTTTATATAA-A---AA---AATGT----------T--TT-TTT-----AAAGC--A-G---TTTTT--GAATTGAAAAG-AAAAACATACAGAA-CGCAAAAA--GAC----GTAactt
gi|33 : A--GTGGCG----TACGG---ATACC---------TCGAACCACAATG----------TT-C----G-----CTG-TCC-G-AAG-ATCACTAGG-CGTAGACGCCT--------A---GGA-----------C--TGT--A---------------CT---TTTA-TT---AAAAATA---TTTT---------T---ATATATTTAATCCAT-ATtt
gi|34 : A-CTCCTT-GAGC---AAAAT-GAGGTTT------------A-A---AA---AACGT----------T--TA-T-------AAAAC--A-GT--TTTTT--AAATTGAAAAG-AAAA----ACAGAA-AGCAAATT--GAC----GT-ACTGTTTA-TGTT-CCAAAATAGATC
gi|35 : A-T-CG----------------TT---------A-------AA---------A--CGG-----CCCCAAAA-----A-------AAA--TCGCAAAA-TGAAG-CCC--AAAT-T-TAAA-CTCCTC-GAGC---AAAAT-GAGGTTT------------A-A---A--------T----------T--TT-TTT---------------T--TT------AATTAAAAAG-AAAA----ACAGAA-
gi|36 : aaTGC-AAGTAAACTG-TAAGTCAC-TTGAGA-TTGGG---TAAAAA-GTGGAT--TCTTCTTA---T-AC-----------------TAG---TA-----------T------A------------CAGCA-TTC-CGGAAT---TT-TT-TTT--T-----------T-AC---AAAACTTT-T-G--T-AA----T-TAT---
gi|37 : AA-----C-------AAA--TCGCAAAA-TTAAG-CCC--AAAA-T-T----CTCTTT-GAGC---AAAAT-GAGGTTT------------A-A---AA---AAGGT----------T--TT-TTT----AAAAAA--G-GT--TTTTT--AAATTAAAAAG-AAAA----ACA
gi|38 : cAGCACTTCTAGT-AT-AC----CA-ACC---CCCAAAA-T-ATGG-CACTAAAATAAG-TGTCTTC----G-GCAGTTTA--G---C---TTACACA-TG---TA---TA-C-GATCGC--G--TGaggc
gi|39 : gACATATCTGGT-AT-AC----CG-GTC---CCCAAAA-T-ATGG-CGCTAAAGTAAA-AACCGCCAAA-G-GTGGCGTA--G---T---GT----A-T
gi|4 : TT------------A-A---AA---AATGTGTTTTTTTTAT--TT-TTT----AAAAAC--A-GT--TTTTT--AACTTAAAAAG-AAAA----ACGTAA-TTCAAAAC--GAC----GTA-CTGTTTA-TGTT-CCAAAATAGATCGAATCCG-TTGTTTAC------AAAATAGTCA-CGTGT-GCGCTACTTTACGTCATTC--TC-CTGATTATCCACGTCACTGATATTCATGC-AAGTG------------AC-TTGAGA-TTGAG---AAAAAACGCGGAT--TCTTCTTATTTT-AC-GAT-G--AA-GA-TTTTAGCA-TA-----------T------G------------CAGCA-TTT-GGGAT----TT-TT-TTT--C-----------T-ACA--AAAA--------------------------CGACA--TGGA--GTGGCT----CACGG---ATACT---------TCGAA-----AAG----------TG-T----G-----CAG-TCC-C-AAC-ATCGCTAGG-C--------CT--------A---GTA-----------C---GT--A---------------CT---TTTA-TT---AAAAATA---CTTTC---A----T---ATATATTTAATTCGT-ATGACTTGTTCAGCTT-GAC-TT-TCCAGGCGCTGC-T-CCCAAGACC-CCGC--T-T----A-ATCA-CTTG-TC-A-TAAGCCAAAATCGCC-CCT-A--GGAT---T-TA--TT-ACACC-------AACTTCA-------A-GAAGCAT------GATCT----AACAT--TC--TGTATAAA--CATG---GT-Tgagc
gi|4 : TA--AACATGGTTCAACTCACA----TG-ATAATATTG-------------GCTG-CCGCCC-CC--AAGCCC----CCGC-T-T--AAT--T--ACGCTC-AAACGCC-GCTGGGATTTC--TTTT-CGATTTTTA--TT-A-------CACGAAACA-T-------TGACGAGTTTCGCGGC-----TCAGCAT-CCT-AGGCG-AAAATGC-AAAGGT-CGGTG--TGTTTACATTCCGC----------TT-AGCAACGGCAAGGG----A--AATA-ACTGTT----CACGCACA--------GTCGC-G-TGCT-ACTGGG-GACCGGCATACcaactcacatgataatattggctgccgcccccaagcccccgcttaattacgctcaaacgccgctgggatttcttttcgatttttattacacgaaacattgacgagtttcgcggctcagcatcctaggcgaaaatgcaaaggtcggtgtgtttacattccgcttagcaacggcaagggaaataactgttcacgcacagtcgcgtgctactggggaccggcatactagaaac
gi|4 : ttaaaaaatgtgttttttttattttttaaaaacagttttttaacttaaaaagaaaaacgtaattcaaaacgacgtactgtttatgttccaaaatagatcgaatccgttgtttacaaaatagtcacgtgtgcgctactttacgtcattctcctgattatccacgtcactgatattcatgcaagtgacttgagattgagaaaaaacgcggattcttcttattttacgatgaagattttagcatatgcagcatttgggattttttttctacaaaaacgacatggagtggctcacggatacttcgaaaagtgtgcagtcccaacatcgctaggcctagtacgtacttttattaaaaatactttcatatatatttaattcgtatgacttgttcagcttgactttccaggcgctgctcccaagaccccgcttaatcacttgtcataagccaaaatcgcccctaggatttattacaccaacttcaagaagcatgatctaacattctgtaTTCTAGT-AT-GC----CG-GTC---CCCAtagaaac
gi|40 : ttaaaaaatgtgttttttttattttttaaaaacagttttttaacttaaaaagaaaaacgtaattcaaaacgacgtactgtttatgttccaaaatagatcgaatccgttgtttacaaaatagtcacgtgtgcgctactttacgtcattctcctgattatccacgtcactgatattcatgcaagtgacttgagattgagaaaaaacgcggattcttcttattttacgatgaagattttagcatatgcagcatttgggattttttttctacaaaaacgacatggagtggctcacggatacttcgaaaagtgtgcagtcccaacatcgctaggcctagtacgtacttttattaaaaatactttcatatatatttaattcgtatgacttgttcagcttgactttccaggcgctgctcccaagaccccgcttaatcacttgtcataagccaaaatcgcccctaggatttattacaccaacttcaagaagcatgatctaacattctgtataaacatggttcaactcacatgataatattggctgccgcccccaagcccccgcttaattacgctcaaacgccgctgggatttcttttcgatttttattacacgaaacattgacgagtttcgcggctcagcatcctaggcgaaaatgcaaaggtcggtgtgtttacattccgcttagcaacggcaagggaaataactgttcacgcacagtcgcgtgctacTTACGTTCCAT----------CT-AACAACGGCAAAGG----G--AATA-ACTGTT----CACGCACA--------GTCGC-A-TGCT-Aac
gi|41 : TA-----------C--TGT--A---------------CT---TTTA-TT---AAAAATA---TTTTC---A----T---GTACATTTAATTTGT-ATGCCTTGTTCAGCTT-tacaagaaacttgc
gi|42 : aGGCAAGGG----A--AATA-ACTGTT----CACGCACA--------GTCGC-G-TGCT-ACTGGGAGACCGGCATAC
gi|43 : CTGTT----CA--CACA--------GTCACTGTTGCT-AATGGG-AACCAGCATtag
gi|44 : CACTTCTAGT-AT-A------G-GCTACACCCAAAA-T-A-GG--GCTAAAATAAG-TGCCGCCGAA-tactagaaaactgtcc
gi|45 : A-T-CG----------------TT---------A-------AA---------A--TGG-----C----AAA-----T-------AA---TCGCAAAA-TTAAG-CCC--AAAA-T-TGAA-CTC
gi|46 : taaTT----CACGTACA--------GTCGC-A-TTC--AATGGG-AACCGGCATAC
gi|47 : AACACTTTTAGT-AT-AC----TG-GTC---CCCAAAA-T-ATGG-TGCTAtaggaaacttt
gi|48 : ggGAA-CTCCTT-GAGC---AAAAT-GAGTTTT------------A-A---AA---A--------------C--TT-TTT----A
gi|49 : ----G-----CTG-TCC-C-AAC-ATCACTAGG-C--------CT--------A---GTA-----------CAATGT--A---------------C
gi|5 : t-CGTGT-GTATTATTTTACGTCATTC--TC-CTGATGATCCACGTCACTGAT
gi|5 : GAT--TCTTCTTATTTT-AT-GAT-G--AA-CA-TTTTAGAA-AA-----------T------A------------CAGCA-TTT-GGGAACATTTT-TTATTT--T-----------T-ACA--AAAAC--T-T-G--T-GA----T-TAT---CGACA--TGGA--GTGGCT----CACGG---ATACTTGAATTACTTCGAA-----ATG----------TG-C----G-----CTG-TCC-C-AAC-ATCACTAGG-C--------AT--------G---ATA-----------C--TGT--A---------------CT---TTTA-TT---AAATATA---TTTTC---A----T---ATATATTTAAATCGT-ATCCCTTGTTCAGTTT-GAC-TT-GCCAGGCGCTGC-T-CCCAAAACT-CTGC--T-TTTAAA-ATCA-TTTG-TC-T-TATGCCAAAC-CGAT-GCT-A--AGAA---T-TA--TT-TCACG-------AACTTCA-------A-GAAGCAT------GA--T----AGCCT--TC--TGCA------------------------------------TATTTATTTT-AA-CTTT---ATCATAGTTTAACTCACA----TG-ATCATATTGTCATGTCGG--GGGCTG-CCGCCC-CC--AAGCTC----CCGC-T-T--AAT--T--ATGCTC-AAACTCC-ACTGGGCTTTC--TTTT-CGATTTTTA--TT-A-------CATGAAACA-T-------TGACGACCTTCACGGC-----TCAGTAT-TTA-AGGCG-AAAATGC-AAATGC-CGGTG--TATTTACATTCCGC----------TT-AGCAACGGCAAGGG----G--AATA-ACTGTT----CACGCACA--------GTCGC-G-TGCT-ACTGGG-GACCGGCATACtcttcttattttatgatgaacattttagaaaatacagcatttgggaacattttttatttttacaaaaacttgtgattatcgacatggagtggctcacggatacttgaattacttcgaaatgtgcgctgtcccaacatcactaggcatgatactgtacttttattaaatatattttcatatatatttaaatcgtatcccttgttcagtttgacttgccaggcgctgctcccaaaactctgcttttaaaatcatttgtcttatgccaaaccgatgctaagaattatttcacgaacttcaagaagcatgatagccttctgcatatttattttaactttatcatagtttaactcacatgatcatattgtcatgtcgggggctgccgcccccaagctcccgcttaattatgctcaaactccactgggctttcttttcgatttttattacatgaaacattgacgaccttcacggctcagtatttaaggcgaaaatgcaaatgccggtgtatttacattccgcttagcaacggcaaggggaataactgttcacgcacagtcgcgtgctactggggaccggcatactagaaactt
gi|5 : cgtgtgtattattttacgtcattctcctgatgatccacgtcactTTCTAGT-AT-GC----CG-GTC---CCCAtagaaactt
gi|50 : cgtgtgtattattttacgtcattctcctgatgatccacgtcactgattcttcttattttatgatgaacattttagaaaatacagcatttgggaacattttttatttttacaaaaacttgtgattatcgacatggagtggctcacggatacttgaattacttcgaaatgtgcgctgtcccaacatcactaggcatgatactgtacttttattaaatatattttcatatatatttaaatcgtatcccttgttcagtttgacttgccaggcgctgctcccaaaactctgcttttaaaatcatttgtcttatgccaaaccgatgctaagaattatttcacgaacttcaagaagcatgatagccttctgcatatttattttaactttatcatagtttaactcacatgatcatattgtcatgtcgggggctgccgcccccaagctcccgcttaattatgctcaaactccactgggctttcttttcgatttttattacatgaaacattgacgaccttcacggctcagtatttaaggcgaaaatgcaaatgccggtgtatttacattccgcttagcaacggcaaggggaataactgttcacgcacagtcgcgtgctacA-T-------TGGCGAGTTTCACGGC-----CCGGCAT-CCG-AGGactt
gi|51 : ataAACACTTCTAGT-AT-AC----CA-GTC---CCCAA
gi|52 : attggTTCTAGT-AT-GC----CG-GTC---CCCA
gi|53 : c-AC----CG-GTC---ACCAAAA-T-ATGG-CGCTAAAATAAacttcccttt
gi|54 : ----CG-GTC---CCCAAAA-T-ATGG-CGCTAAAATAAG-T
gi|55 : TTCTAGT-TT-AC----CG-GTC---CCCAAAA-T-ATGG-CG
gi|56 : AA-CTCCTT-GAGC---AAAAT-GAGGTTT------------A-A---AG---A
gi|6 : CCAAAA-TTACGG-CGCTAAAATAAG-TGCCGCCGAA-G-GCGGTT-A--G---C---TT----A-TA---TA---TA-C-GATCGC--G--TGA-G--GA-T-CGTTAATCA---------TT---------A-------AA---------A--CGG-----C----AAA-----A-------AA---TCGCAAAAATTAAG-CCC--AAA--T-TGAA-CT---T-GAGC---AAA-T-GAGGTTTT-----------A-A---AA---AATGT----------T--TT-TT-----AAAAAC--A-GT--TTTT---AAATCAAAA-G-AAAA----A-AGAA-AGCAAAAA--GAC----GTA-CTGTTTAATGTT-CAAAATTAGATCGAAATCG-TTGCTTAC------GAAATAGTCAACGTGT-GTGTTGTTTTACGTCATTC--TCTCTGATTATCCACGTCACTGATGTTCATGT-AAGTAAACCG-TAAGTCAC-TTGAGA-TTGAG-----ATAACGTCGAT--T-TTCTTATTTTAAC-GAT-G--AAGTA-TTTTAGCA-TA-----------T------ATTATATGGCCTCCAACA-CTT-GGAA------T-TT-TTT--C-----------T-ACACGAAAAC--T-T-A--T-AA----T-TAT---CGTCA--TGGA--GTGGCT----CACAG---ATACT---------TCGAA-----ATG----------TG-C----G-----CTG-TCC-C-AAC-ATCACTAGG-C--------CT--------A---GTA-----------C--TGT--A---------------CT---ATTA-TT---AAAAATA---TTTTC---ATATTT---ATATATCTAATTTGT-ATGCCTTATTCAGCTT-GAC-TT-GCCAGACGCTGC-T-CCCAAGACC-CCGCTTT-T----T-ATCA-CTTG-TC-T-AATTCCAAAT-CGC
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gi|8 : AGCA-AA-----------T------A------------CAGCA-TTC-AGGA-----AA-TT-TTT--C-----------T-ATA--AAAAC--T-T-GCAT-TA----A-TAT---CGCCA--TATA--CTAGCT----CACAG---ACACT---------TTGAA-----AGG----------GG-C----GTCATGCTC-TCC-C-AAC-AT--------------------------------TA-----------C--TG-------------------CT---TTTA-TT---TAAAATACTATTTTC---A----TTGCACATATTTAATTCAT-ATGCCTTGTTCAGCTT-GAC-TTTGCCGGGCACTGC-C-CCCAAGACC-CCGC--T-T----A-ATCA-CTTG-TC-T-TATGCCCAAA-CGTC-GCT-G--GGAA---T-TG--T----GCG-------AACTT--------GATGAATCAT------G---T----AGC---------G---------ATG---CTGTAT--CAT----A----TT-T-TT--TTTT-AA-CTTT---AACATGGTTTAACTCACA----TG-ATCATATTGCCTTGTCAG--GGACTG-CTGCCT-CC--AAGCCC----CCGC-T-T--AAT--T--ACG----------------------C--TTTT-CGA-TTTTA--TT-A-------CACGttttttaccgatcttatatacacgttgactcacttgagattttactgtcca
gi|9 : AAG-AAAA----ACAGAA-AGCCAAAA--GAC----GTA-CTGTTTA-TGTT-CCAAAATAGATCGAATCTG-TTGCT-AT------GAAATAGTCA-CGTGT-GTGTTGTTTTACGTCATTC--TC-CTGATTATCCACGGCACTGATGTTCATGT-AAGTAAACTG-TAAGTCAC-TTGAGA-TTGAG---AAAAAACGCGGAT--T-TTCTTATTTT-AC-GAT-G--AA--A-TTTTAGCA-TG-----------CAACCTAA------------CAACA-TTT-GGGA-----AC-TT-TTT--T-----------T-ACA--CGAAC--T-T-tg
gi|9 : T-G--GGAACTTT-TT--TT-ACACG-------AACTTCA-------A-GAAGCA-------GA--T----A-------C--TG-----------A---GT-CTT--C-T----G----TT-TATTCATTTT-AA-CTTT---AACAT-GTTCAACTCACA----AG-ATCATCTTGGC-TGTCGG--GGGCTG-CCG-CC-TC--AAGCCC----CCGC-T-T--AAT--T--ACGCTCAAAACGCC-GCTGGGCTTTC--Tcaagaagcagatactgagtcttctgtttattcattttaactttaacatgttcaactcacaagatcatcttggctgtcgggggctgccgcctcaagcccccgcttaattacgctcaaaacgccgctgggctttct