lowQualScore                  :                                                                     11      1111                                                                                                1               1111    1111111111111111111111  3333333333333333333333333333333                    111111111                                   11                                                           222                                                1                                                                                                                                                                                       
lowQualScore                  :     2  22    3   1   1  222 22    4444 1 22 1  1 1   11  0 1    0   11  4 1 0000 1 66  22222 0 6666  0    0 0 0   444 222  2 1   55 1    11       333 2  1   222   3333333      0       11 1    5555    3333333333333333333333  8888888888888888888888888888888 1 2 1    444 1  11 111111111    1 1 1 1 2   1 4444   2222 1    55   555555   1 4    88  33 3   1 6  1 1 1 1    1 1   1 777  111      3   1 7777       1  1          222  1   2 1   11  2 2    444 1 1 1   1  5555555  11      444    33 666666 11 33333    1   1    1    11   1   33 222   3   1 11 1 88  2           88888  666666  4444 333333    1  1      1  2     
lowQualScore                  :     .  ..    .   .   .  ... ..    .... . .. .  . .   ..  . .    .   ..  . . .... . ..  ..... . ....  .    . . .   ... ...  . .   .. .    ..       ... .  .   ...   .......      .       .. .    ....    ......................  ............................... . . .    ... .  .. .........    . . . . .   . ....   .... .    ..   ......   . .    ..  .. .   . .  . . . .    . .   . ...  ...      .   . ....       .  .          ...  .   . .   ..  . .    ... . . .   .  .......  ..      ...    .. ...... .. .....    .   .    .    ..   .   .. ...   .   . .. . ..  .           .....  ......  .... ......    .  .      .  .     
lowQualScore                  :     9  22    1   5   5  666 00    6666 5 00 5  1 0   22  9 7    9   55  3 7 5555 1 33  33333 9 4444  9    9 9 9   777 222  5 1   44 1    66       222 4  2   222   7777777      8       88 3    9999    6666666666666666666666  9999999999999999999999999999999 3 7 3    222 3  88 222222222    3 3 3 3 7   3 7777   8888 3    66   777777   3 3    88  33 2   4 4  4 4 4 0    5 5   5 000  333      0   5 2222       4  4          333  3   6 9   88  6 6    888 3 3 3   3  7777777  88      888    11 777777 88 22222    3   3    2    77   2   00 222   8   2 77 2 44  5           99999  888888  7777 555555    2  2      3  7     
consensus                     :   TTCGA--CACT-CGT-CAG-AA---T--TTTG----A-C--T-CG-C-CAT--TC-G-GGCA-ACC-GAA-A-T-A--CTG-ATC-----T-T--A-GG-TTGC-C-C-GAA---C---GG-A-TTT--C-AGGT--TGCCCAA---A-CA-AAA--ATAT--G-A--AACGAA-AGAACTT--C-AAAT--G-TATTA---------------------TT-----------------------T-CTA---A-A-T-CTAT---T-GC--ACTTC--T--TTTT-C-A-G-T-TTC-A----AAT----A-GGAAA-TGT------ATT-TTAATT-CTT--TTCAC-ATTA-T-T-TTCATT-T-GTA-T---TC--TTATTTC-AAA-T----AAATAGA-AA-TTATTCTGAC---AA-TCC-AAACT--CG-T-CACC---A-G-G-TCG-TC-------AT--TTGGGC---GAGC--T---A--T--G-----TTAA-CAA-ACAG-GTCG--TCA-AAA--T---TCA-CAT-C--A-G-GGT-GGAAATGGCGA-----GG------TG----A------CGAG-TG-CGAATG-TC-GAACC
Reference ( gi|8 )            :   TTTGA--CACT-CGT-CAG-AA---T--TTTG----A-C--T-CG-C-CAT--TC-G-GGCA-ACC-GAA-A-T-A--CTG-ATC-----T-T--A-GG-TTGC-C-C-GAA---C---GG-A-TTT--C-AGGT--TGCCCAA---A-CA-AAA--ATAT--G-A--AACAAACAGAACTT--C-AAAT--T-TATTA---------------------TT-----------------------T-ATT---A-A-T-CTAT---T-GC--ACTTC--T--TTTT-C-A-G-T-TTC-A----AAT----A-GGAAT-TGT------ATT-TTAATT-TTT--TTCAC-ACTA-T-T-TCCATT-T-GTA-T---TC--ATATTTC-AAA-T----AAATAGA-AA-TTATTCTGAC---AA-TCC-ATACT--CG-T-CACC---A-G-G-TCG-TC-------AT--TTGGGC---GAGC--T---G--T--G-----TTAA-CAA-ACAG-GTCG--TCA-AAA--T---TCA-CAT-C--A-G-AGT-GGAAATGGCGA-----GG------TG----A------CGAG-TG-CGAATG-TC-GAACC
gi|12                         :   TTCGA--CACT-CGT-CAG-AA---T--TTTG----A-C--T-CG-C-CAT--TC-G-GGCA-ACC-AAA-A-T-A--CTG-ATC-----T-T--A-GG-TTGC-C-C-GAA---C---GG-A-TTT--C-AGGT--TGCCCAA---A-CA-AAA--ATAT--G-A--AACAAACAGAACTT--C-AAAT--G-TATTT---------------------TT-----------------------T-CTA---A-A-T-CTAT---T-GC--ACTTC--T--TTTT-C-A-G-T-TTC-A----AAT----A-GGAAA-TCT------ATT-T--------------AC-ATTA-T-T-TCCATT-T-GTA-T---TC--TTATTTC-AAA-T----AAATAGA-AA-TTATTCTGAC---AA-TCC-TAACT--CA-T-CACC---A-G-G-TCA-TC-------AT--TTGGGC---GAGC--T---G--T--G-----TTAA-CAA-ACAG-GTCG--TCA-AAA--T---TTC-CAT-C--A-G-GGT-GGAAGTGGCGA-----GG------TG----A------CGAG-TG-CGAATG-TC-GAACC
gi|4                          :   TTCGA--CCCT-CGT-CAG-AA---T--TTTG----A-C--T-CG-C-TAT--TT-G-GGCA-ACC-GAA-A-T-A--CTG-ATC-----T-T--A-GG-TTGA-C-C-GAA---C---GG-A-TTT--C-AGGT--TGCCCAA---A-CA-AAA--ATAT--G-A--AACAAACAGAACTT--C-AAAT--G-TATTA---------------------TT-----------------------T-CTA---A-A-T-CTAT---T-GC--ACTTC--T--TTTT-C-A-G-T-TTC-A----AAT----A--GAAG-TGTTATTTAATT-TTAATT-CTT--TTCAC-ATTA-T-T-TCCATT-T-GTA-T---TC--TTATTTC-AAA-T----AAATAGA-AA-TTATTCTGAC---AA-TCC-AAACT--GG-T-CACC---A-G-G-TCG-TC-------AT--CTGGGC---GAGC--T---G--T--------TTAA-CAA-ACAG-GTCA--TCA-AAA--T---TCA-CAT-C--A-G-GGTGGGAAATGGCGAAGAGCGG------TG----A------CGAG-TG-CGAATG-TC-GAACC
gi|7                          :   TTCGA--CACT-CGT-CAG-AA---A--TTTG----A-C--T-CG-C-CAT--TC-G-GGCA-ACC-GAA-A-T-A--CTG-AAC-----T-T--A-GG-TTGC-C-T-GAA---C---AG-A-TTT--C-AGGT--TGCCCAA---C-CA-AAA--ATAT--G-AGAAACAAAAAGAACTT--C-AAAT--G-TATTA---------------------TA-----------------------T-CTA---A-A-T-CTAT---T-GC--ATTTC--T--TTTT-C-A-G-T-TTC-A----AAT----A-GGAAA-TGT------ATT-TTAATT-CTT--TTCAC-ATTA-T-T-TTCATT-T-GTA-T---TC--TTATTTC-AAA-T----AAATAGA-AA-TTATTCTGAC---AA-TCC-AAACT--CG-T-CATC---A-G-G-TTG-TG-------AT--TTGGGC---GAGC--T---A--T--G-----TTAA-CAA-ACAG-GTCG--TCA-AAA--T---TCA-CAT-C--A-G-GGT-GGAAATGGCGA-----AG------TG----A------CGAG-TG-CGAAAG-TC-GAACCc
gi|10                         :  gTTCGA--CACT-CGT-CAG-AA---T--TTTG----A-C--T-CG-C-CAT--TC-G-GGCA-ACC-AAA-A-T-A--CTG-ATC-----T-T--A-GG-TTGC-C-C-GAA---C---GG-A-TTT--C-AGGT--TGCCCAA---A-CA-AAA--ATAT--G-A--AACAAACAGAACTT--C-AAAT--G-TATTT---------------------TT-----------------------T-CTA---A-A-T-CTAT---T-GC--ACTTT--T--TTTTTC-A-G-T-TTC-A----AAT----A-GGAAA-TCT------ATT-T--------------AC-ATTA-T-T-TCCATT-T-GTA-T---TC--TTATTTC-AAA-T----AAATAGA-AA-TTATTCTGAC---AA-TCC-TAACT--CG-T-CACC---A-G-G-TCA-TC-------AT--TTGGGC---GAGC--T---G--T--G-----TTAA-CAA-ACAG-GTCG--TCA-AAA--T---TTC-CAT-C--A-G-GGT-GGAAGTGGCGA-----GG------TG----A------CGAG-TG-CGAATG-TC-GAACC
gi|11                         :  gTTCGA--CACT-CGT-CAG-AA---T--TTTG----A-C--T-CG-C-CAT--TC-G-GGCA-ACC-AAA-A-T-A--CTG-ATC-----T-T--A-GG-TTGC-C-C-TAA---C---GG-A-TTT--C-AGGT--TGCCCAA---A-CA-AAA---TAT--G-A--AACAAACAGAACTT--C-AAAT--G-TATTT---------------------TT-----------------------T-CTA---A-A-T-CTAT---T-GC--ACTTC--T--TTTT-C-A-G-T-TTC-A----AAT----A-GGAAA-TCT------ATT-T--------------AC-ATTA-T-T-TCCATT-T-GTA-T---TC--TTATTTC-AAA-T----AAATAGA-AA-TTATTCTGAC---AA-TCC-TAACT--CG-T-CACC---A-G-G-TCA-TC-------AT--TTGGGC---AAGC--T---G--T--G-----TTAA-CAA-ACAG-GTCG--TCA-AAA--T---TTC-CAT-T--A-G-GGT-AGAAATGGCGA-----GG------TG----A------CGAG-TG-CGAATG-TC-GAACCc
gi|15                         :  gTTCGA--CACT-CGT-CAG-AA---A--TTTG----A-C--T-CG-C-TAT--TC-G-GGCA-ACC-GAA-A-T-A--CTG-ATC-----T-T--A-GG-TTGC-C-C-GAA---C---GG-A-TTT--C-AGGT--T--CCAA---A-CA-AAA--A-----------------AGGACTT--C-AAAT--G-TATTA---------------------TT-----------------------T-CTA---A-A-T-CTAT---T-GC--ATTTC--T--TTTT-C-A-G-T-TTC-A----AAT----A-GGAAA-TGT------ATT-TTAATT-CTT--TTCAC-ATTA-T-T-TCCATT-T-GTA-T---TC--TTATTTC-AAA-T----AAATAGA-AA-TTATTCTGAC---AA-TCC-AAGCT--CG-T-CA-C---A-G-G-TTG-TC-------AT--TTGGGC---GAGC--T---A--T--G-----TTAA-CAA-ACAG-GTCG--TCA-AAA--T---TCA-GAT-C--A-G-GGT-GGAAATGGAGA-----GG------TG----A------CGAG-TG-CGAATG-TC-GAACCc
gi|13                         :   TTCGA--CACT-CGT-CAG-AA---T--TTTG----A-C--T-CG-C-CAT--TC-G-GGCA-ACC-AAA-A-C-A--CTG-ATC-----T-C--A-GG-TTGC-C-C-GAA---C---AG-A-TTT--C-AGGT--TGCCCAA---A-CA-AAA--ATAA--G-A--AACAAAAACAACTT--C-AAAT--G-TATTA---------------------TT-----------------------T-CTA---A-A-T-CT------------------T--TTTT-C-A-G-T-TTC-A----AAT----A-GGAAA-TGT------ATT-TTAATT-CTT--TTCAC-ATTA-T-T-TTCATT-T-GTA-T---TC--TTATTTC-AAA-T----AAATAGA-AA-TTATTCTGAA---AA-TCC-AAACT--CG-T-CACC---A-G-G-TTG-TC-------AT--TTGGGC----AGC--T---A--T--A-----TTAA-CAA-ACAG-GTCG--TCA-AAA--T---TCA-CAT-C--A-G-GGT-GGAAATGGCGA-----AG------TG----A------CGAG-TG-CGAATG-TC-GAAC
gi|9                          :   TTCGA--CACT-CGT-CAG-AA---T--TTGG----A-C--T-CA-C-CAT--TC-G-GGCA-ACC-TGA-G-T-A--CTG-ATC-----T-C--A-GG-TTGC-C-C-GAA---T---GA-A-TTT--C-AGGT--TGCTCAA---A-TA-AAA--ATAC--G-C--AACAAAAAGAACTT--C-AAAC--A-TATTA---------------------TT-----------------------T-CTA---A-A-T-CGAT---T-GC--ATTTA--T--TTTT-C-A-G-T-TTC-A----GAT----A-GGAAA-TAT------ATT-TTAATT-CTT--TTCAC-GTTA-T-T-TTCATT-T-GTA-T---TC--TTATTTC-AAA-T----AAATAGA-AA--TATTTTGAC---AA-TCC-AAACT--CG-T-CACC---A-G-G-TTG-TC-------AT--TTGGGC---AAGC--T---A--T--G-----TTAA-GAA-ACAG-GTCG--TCA-TAA--A---TGA-CAT-C--A-G-GGT-GGAAATGGCGA-----GG------TG----A------CGAG-TG-TGAATA-TC-AA
gi|1                          :  gTTCGA--CACT-CGT-CAG-AA---T--TTGG----A-C--T-CG-C-CAT--TT-G-GGCA-ACC-TAA-A-C-A--CTG-ATC-----T-C--A-GG-TTGC-C-T-GAA---C---GG-A-TTT--C-AGGT--CGTCCAA---A-CA-AAT--ATTT--A-A--AACGAAAAGAACCT--C-AAAT--A-TATTA---------------------TTAAATTGGTACCGTATATTATTTAT-ATTCTAA-A-T-CTAT---T-GC--ATTTA--T--TTTT-C-A-G-T-TTC-A----AAT----A-GGAAA-TGT------ATT-TTA-TT-CTT--TTCAC-GTTA-T-T-------------------C--TTATTTC-AAA-A----AAATAGA-AA-TTATTCTGAA---AA-TCC-AAACT--CG-T-TACG---A-G-G-TTG-TC-------AT--TTGGGC---GAGC--T---A--T--G-----TTAA-CAA-ACGT-GTCA--TCA-AAA--T---TCA-CAT-C--A-G-GGT-GGAAATGGTGA-----GG------TG----A------CGAG-TG-TGAATG-TC-GAACC
gi|18                         : ggTTCGA--CACT-CAT-CAG-A----T--TTGG----A-C--T-CG-C-CAT--TC-G-GGCA-ACC-GAA-G-T-A--CTG-ATT-----T-C--A-GG-TTGC-C-C-GAA---C---GG-A-TTT--C-AGGT--TGTCCAA---A-C--------------------CAAAAAGAACTT--C-AAAT--G-TAT-A---------------------CT-----------------------T-CTA---A-A-T-CTAT---T-GC--A----------TTT-C-A-T-T-TTC-A----AAT----T-GGAAT--GT------ATT-TTAATT-CTT--T-CAC-ATTA-T-T-TTTATT---GTA-T---TC--TTATTTC-AAA-T----AATTAGA-AA-TTATTCTGAC---AA-TCG-ATACT--CG-T-CACCA--A-G-G-TGA-TC-------AT--TTGGGT---GAGC--T---A--T--G-----TTAA-CAT-ACAG-GTCG--TC--AAA--T---TCA-GAT-C--A-G-GGT-GGAAATTGCGA-----GG------TG----A------CGAG-TG-TGAATG-TC-GAACCc
gi|16                         :  aTTCGA--CACT-CGT-CAG-AA---T--GTGG----A-C--T-CG-C-CAT--TC-G-GGCA-ACC-TAA-G-T-A--ATG-ATC-----T-C--A-GG-TTGC-C-C-GAA---C---GA-A-TTT--C-AGGT--TTCCCAA---A-CA-AAA--ATAT--G-A--AACGAAAAGAACTT--C-AAAC--A-TATCA---------------------TT-----------------------T-CTA---A-A-T-CTATAATT-GC--A--------------------T-TTC-A----AAT----A-GGAAA-TGT------ATT-TTAATT-CTT--TTCAC-GTTA-T-T-TTCATT-T-GTA-TAATTC--TTATTTC-AAA-T----AAATAGA-AA-TTATTTTGAC---AA-TCC-AAACT--CG-T-CACC---A-G-G-TTG-TC-------AT--TTTGGC---GAGCTAT---A--T--G-----TTAA-CAA-ACAG-GTCG--TTA-GAC--T---TCA-CAT-C--A-G-GGT-GGAAATGGCGA-----GG------TA----T------CGA
gi|14                         : ggTTCGA--CACT-CGT-CAG-AA---T--TTTG----ATC--TGCG-CTCAT--CT-C-GGCATACA-AAA-A-T-A--C---ATC-----T-TG-A-GGATTGC-C-C-GAA---C---GG-A-TTT--C-AGGT--TACCCAAT--A-CA-AAA--ATAT--G-A--AACAAACAGAACTT--C-AAAT--G-TATT----------------------TT-----------------------T-CTTA--A-A-T-CTAT---T-GC--ACTTC-----TTCT-C-A-G-T-TTC-A----AAT----A-GGA---TCT------ATT-T--------------AT-A-TA-T-T-TCAATT-T-GTA-T---TC--TTATTTC-AAA-T----AAATAG--AA-TTATTCTGAC---AA-CCT-A-ACT--TG-T-CACC---A-G-G-TCA-TC-------AT--TTGGGC---GAGC--T---G--T--G------TAA-CAA-ACAG-GTCG--TCA-AAAATT---TCA-ATT-C--A-G--GT--GAAGTGGCGA-----GG------TG----A------CGAG-TG-CGAATG-TC-GAACCa
gi|6                          :  gTTCGA--CACT-CGT-CAA-AA---T--TTGG----A-C--T-CG-C-CAT--TC-G-GCAA-ACT-TAACG-T-AAGC-G-ATC-----C------AG-TTGC-C-C-GAA---CA--GG-A-TTT--C-AGGT--TGCCCAA---A-CA-AAACAATAT--G-A--AATGAA-AGCCTTT--C-AAATAATATATTA---------------------AT-----------------------T--TT---A-A-A-CTAT---TAGT--GCTTA--A--TTTT-C-A-G-TCTTC-A----AAT----A-AGAAA-TGT------ATT-TAAATT-CTT--T---C-ACCA-TGC-TTCATT-T-TAA-T---TC---TATT-C-AAA-T----AAATAAA-AAATTATC--GAC---AA-TCC-AAACA--CA-T-CAAC---A-G-G-TTG-TC-------CA--TTGGGC---GAGCC-T---A--T--G-----TTAA-CAA-ATAG--TCG--TCA-AA---T---TCA-CAT-CCAACG-GGT-GGAAATGGCGA-----GG------TG----A------CGAG-AG-CGAATG-TC-GAACC
gi|3                          :  gTTCGAATCAC--CGT-CAG---------TTCGTGGTA-C--T-CT-G-CAT--TCCG-GGC---CC-TAA-G-T-A--CTG-TTC-----T-TCAA-GG-TTGC-C---GAA---C---GG-AATTT--C-AG-T--TGCCCAA---A-CA-AAA--ATAA--G-A--AATGAA-AGAACTT--C-AAAT--A-TAT-A---------------------TT-----------------------C-ATTTCTA-A-T-CTAACA-T-GC--ATATT--A--TTTT-C-A-G-C-TTC-A----ACT----A-GGAACATGT------ATT-CT-------T--TCCAC-GTTA-T-T-TTCATT-T-GTA-T---TG--CTATTTC-AGA-T----AAATAGC-AA-TTAATTCGACAAAAA-TCC-AAACT--CG-T-CACCG--A-G-G-TCG-TCA------ATTATTGGGCA--GAGC--T---A--T--G-----TTAATCAA-ACTG-GTCG--TCA-TAA--T---TCA-CATCC--A-G-GGTGGGAAATGGCGA-----GG------TG----A------CGAG-TG-TGAATT-TC-CGACCc
gi|2                          :  gTTCGA--CACTTCAT-CAG-AA---C--TTTGG---A-C--T-CG-C-CAT--TT-A-TGCA--CC-TAA-G-T-A---TG-AT------T-C--ACGA-ATGCAC-C-GAA---C---AA-A-TTT--C-AG-T--TGCCCAA---AACA-AAA--ATAG--GCA--AACGAACAGAACTT--C-AAAC--A--ATTA---------------------TT-----------------------T-CTA---A-AAT-CTAT---T-GC--AATTG--TATTTTT-CGA-GCT-TTC-A----AAT----A-GGAAA--GT------ATC-TTA--T-CTT--TTCAC-GTTA-T-T-TTGCTT-T-GTA-T---TC--TTATTTC-AAA-T----TAATAAG-AA-ATATTTT-AC---AACTCC-AAACT--CG-TCCACC---A-G-GTTTG-TCATTTCTGAT--TTGGGC---AAGC--T---A--T--G-----TTAA-CAATACAGCGTCG--TCA-GAA--A---TCA-CAT-C--A-GCGGT-G--AATGACGACG---GG------TG-----------CG-G-TG-TGAAGG-TC-GAACC
gi|5                          :  gTTCGA--CACTGCG--CAG-AA---T--TTTG----A-CGTT-CGGC-CAT--TC-TCGGCA-ACC-GAA-C-TCA--C-G-ATC-----T-T--A-G--TTGC-C-C-GAA---C---GG-A-TTT--C-AGGTGCCGCCTAATGTA-CA-AAA--ATCT--------ATGAAC-GAACTT--C-AGAG--T-AATTAG--------------------TC-----------------------T-AAT---A-G-T-ATAT---T-GC--ACTTC--T--TTTT-C-A-G-TGTTC-AGA--AAT----A-GGAAA-TGG------ATT---AATT-CTTA-TTTAC---TA-T-TATTCATT-TTGTA-T---TT--TGATTTC-AAA-TT---AAATAGG-AA-TTATTCTTAC---AA-TCC-AAATTGTCG-G-CACCGAAA-G-G-TCG-TC-------AT--TTGGGCC--GGGC--TAATG--T--A-----TTTA-CAA-ACAG-GTCG--TCA-ATA--A---GCA-CAT-C--A-G-GGT--GAAAT------------------------A------AGAG-T--CGAATGTTC-GAACC
gi|24                         : ggTTCGA--CACT-AGT-CAGGAA---A--TTTG----A-C--T-CG-C-TAT--TT-G-GGCA-ACC-GAA-A-T-A--CTG-ATC-----TCT--A-GT-ATGC-C-C-GAA-------GG-A-TTT--CAAGGT--TGCACAA---A-GC-AAA--ATATTGA-A--AACAAA-AGAACTT--C-AAA---T-TATTA---------------------TTC----------------------T-A-----A-A-T-CTAT---T-GC--AATCT--T--TTTT-C-A-G-T-TTC-A----AA-----A-GGAAGATGT------ATTGTTAATT-CTT--TTCAC-GTTATT-T-TCTATTGT-TTA-T---TC--TTATTTC-AAA-TATTAAAATAGAGAA-GTATTCTGAC---TA-TCC-AAACT--CG-T-CATC---A-G-G-
gi|28                         : ggTTCGA--CAAC-CGT-CAG-AA---T--TTTG----A-C--T-CG-C-CAT--TC-GTGGCA-ACC-AAA-AAT-A--CCG-ATC-----T-T--A-G--TTGC-C-C-GAAA--C---GA-A-TTT--C-AGGT--TGCC-AA---A-CA-AAA--ATAT--G-A--AGCAAACAGAACTT--C-AAAT--G-TA-TA---------------------TC-----------------------T-CTA---AGA-T-CTAT---T-GCAAACTTC--T--TTTT-C-A-G-T-TTC-A----AAT----A-GGAAA-TGT------ATT-TCAATT-CTTTGTTTACAATTA-T-T-g
gi|34                         :  gTTTGA--CAC-------AG-AA---T--TTGG----A-C--T-CG-C-CAT--CC-G-AGCA-ACC-TAC-G-T-A--CGG-ATC-----T-C--A-GG-TTGC-C-C-GAA---T---GG-A-TTT--C-AGGT--TG-CCAA---A-C--AAA--ATAT--G-G--AACAAAAAGGACCT--C-AAAT--
gi|32                         : ggTTTGA--CACT-CCT-TAG-AA---T--TCTG----A-C--T-CA-C-TAT--TG-G-GTTA-ACC-TAG-A-T-A--CTG-ACC-----T-T--G-GG-TTGC-C-C-AAA---CAGGAG-A-TTT--T-A
gi|36                         : gtTTTGA--CACT-CAT-CAG-AA---T--TTAG----A-C----------AT--AC-G-T--------------T-A---TG-ATA-----T-C--A-GG-TTGT-C-A-GAA---T---GG-A-TAT--C-AGGT--TACCCAA---A-CATAAA--AGAT--C-A--AACAAaaggaattattgcatacctacctcagttccttgcacacatatcattttt
gi|38                         : ggTTCGA--CACT-CGT-CAG-AAATTTGATTTG----A-C--T-TG-C-CAT--TC-G-GGCA-ACC-GAA-A-T-
gi|19                         :  ggTTGA--CACT-CGT-CAG-A----T--TTTG----A-C--T-CA-C-CAT--TC-G-G-CA-ACC-AAA-A-T-A--CTG-ATC-----T-T--A-GG-TTGC-C-C-GAA---C---GG-A-TTT--C-AGGT--TGCCCAA---A-CA-AAA--ATAT--G-A--AACAAACAGA-CTT--C-AAAT--G-TATT----------------------TT-----------------------T-CTA---A-A-T-CTAT---T-GC--ACTTC--T--TTTT-C-A-G-T-TTC-A----A-T----A-GGAAA-TCT------ATT-T--------------AC-ATTA-T-T-TCCATT-T-GTA-T---TC--TTATTTC-AAA-T----AAATAGG-AA-TTATTCTGAC---AA-TCC-TAACT--CG-T-CACC---A-G-G-TCA-TC-------AT--TTGGGC---GAGC--T---G--T--G-----TTAA-CAA-ACAG-GTCG--TCA-AAA--T---TTC-CAT-C--A-G-GGT-GGAAGTGGCGA-----GG------TG----A------CGAG-TG-CG
gi|17                         :  ggTTCA--CACT-CGTTCAG-AA---T--TTTG----A-A--T-CG-C-CATCGTG-G-AGCT-ACA-AAA-T-T-A--CTG--TC-----T-TG-A-GG-TTGC-C---GAA---C---GG-A-TTT--C-AGGT--TGCCCAA-----CA-AAA--ATAT--G-A--AACAAACAGAACTT--CGAAAT--G-CATT----------------------TT-----------------------T-TTA---A-A-T-CTAT---T-GC--ACTTC--T--TTTT-C-A-G-T-TTCAA----AAC----A-GGAAA-TCT------ATT-T--------------AC-ATTA-T-T-TCCATT-T-GTA-T---TC---TATTTC-AAA-T----AAATAGA-AA-TTATTCTGAC---AA-TCC-AAACT--C--T-CA-C---A-GCG-TCATTC-------AT--TTGGGC---GAGC---------T--G-----TTAA-CAA-ACAG-GTCG--TCA-AAA--T---T---TAT-C--A-G-GGT-GGAAGT-GCGA-----GG------T-----A------CGAG-T--CGAATG-TC-GAAC
gi|31                         :      gg--CACA-CAT-CAT-AA---T--TTTG----A-C--T-CG-C-CAT--TC-A-GACA-ACC-AAA-G-T-A--CTG-ATC-----T-T--A-GG-TTGC-C-T-GAA---C---AG-A-TTT--C-AGGT--TGCCCAA---A-CA-AAA--ATAT--G-A--AG-AAAAAGAACTA--C-AAAT--G-TATTA---------------------TT-----------------------T-CTA---A-A-T-CTAT---T-GC--ATTTC--T--
gi|20                         :           tgT-CGT-CAG-AA---T--TCGG----A-C--C-CA-C-CAT--TC-G-GGCA-ACC-GAA-G-T-A--CTG-ATT-----T-C--A-GG-GTGC-C-C-GAA---C---AG-A-TTT--C-AGGT--TGCCCAA---A-CA-AAA--A------------------GAACTT--C-AAAT--G-TATTA---------------------TT-----------------------T-CTA---A-A-T-CTAT---T-GC--A----------TTT-C-A-T-T-TTC-A----AAT----A-GGAAA-TGT------ATT-TTAATT-CTT--TTCAC-ATTA-T-T-TTTATT-T-ATA-T---TC--TTATTTC-AAA-T----AATTAGA-AA-TTATTCTGAC---AA-TCG-ATACT--CG-T-CACC---A-G-G-TCG-TC-------AT--TTGGGC---GATC--T---A--T--G-----TTGT-CAT-ACAG-GTCG--TCA-ATA--T---TCA-GAT-C--A-G-GGT-GGAAATGGCGA-----GG------TG----A------CAAG-TG-TGAATG-TC-GAACC
gi|42                         :                 T-CAG-AA---T--TTGG----A-C--T-TG-C-CAT--TC-G-GGCA-ACC-GAA-G-T-A--
gi|12                         :                                                -C-CGT--TC-G-GGCA-ACC-TAAGA-T----CAGTATT-----T-T----GG-TTGC-C-C-GAA---T---GG-
gi|10                         :                     ttcgacactcgtcagaattttgactcg-C-CGT--TC-G-GGCA-ACC-TAAGA-T----CAGTATT-----T-T----GG-TTGC-C-C-GAA---T---GG-atttcaggttgcccaaacaaaaatatgaaacaaacagaacttcaaatgtattttttctaaatctattgcacttctttttcagtttcaaataggaaatctatttacattatttccatttgtattcttatttcaaataaatagaaattattctgacaatcctaactcatcaccaggtcatcatttgggcgagctgtgttaacaaacaggtcgtcaaaatttccatcagggtggaagtggcgaggtgacgagtgcgaatgtcgaacc
gi|11                         :                    gttcgacactcgtcagaattttgactcg-C-CGT--TA-G-GGCA-ACC-TAAGA-T----CAGTATT-----T-T----GG-TTGC-C-C-GAA---T---GG-atttcaggttgcccaaacaaaaatatgaaacaaacagaacttcaaatgtattttttctaaatctattgcactttttttttcagtttcaaataggaaatctatttacattatttccatttgtattcttatttcaaataaatagaaattattctgacaatcctaactcgtcaccaggtcatcatttgggcgagctgtgttaacaaacaggtcgtcaaaatttccatcagggtggaagtggcgaggtgacgagtgcgaatgtcgaaccc
gi|15                         :                    gttcgacactcgtcagaattttgactcg-C-CGT--TC-G-GGCA-ACC-TAA----------G-ATCAGTATT-T--C-GG-TTGC-C-C-GAA---atttcaggttgcccaaacaaaatatgaaacaaacagaacttcaaatgtattttttctaaatctattgcacttctttttcagtttcaaataggaaatctatttacattatttccatttgtattcttatttcaaataaatagaaattattctgacaatcctaactcgtcaccaggtcatcatttgggcaagctgtgttaacaaacaggtcgtcaaaatttccattagggtagaaatggcgaggtgacgagtgcgaatgtcgaaccc
gi|19                         :                  ttcgacactcgtcagaaatttgactcgcta-C-CGT--TC-G-GGCA-ACC-TAAGA-TCA--GT--ATT-----T-T----GG-TTG--C-C-GAA---T---GG-atttcaggttccaaacaaaaaaggacttcaaatgtattatttctaaatctattgcatttctttttcagtttcaaataggaaatgtattttaattcttttcacattatttccatttgtattcttatttcaaataaatagaaattattctgacaatccaagctcgtcacaggttgtcatttgggcgagctatgttaacaaacaggtcgtcaaaattcagatcagggtggaaatggagaggtgacgagtgcgaatgtcgaacc
gi|21                         :                     ggttgacactcgtcagattttgactca-C-CAT--TC-G-GGCA-ACCTGAG-A-TCA--GTA-CTT-----T-T----GG-TTGC-C-C-GAA---T---Gatttcaggttgcccaaacaaaaatatgaaacaaacagacttcaaatgtatttttctaaatctattgcacttctttttcagtttcaataggaaatctatttacattatttccatttgtattcttatttcaaataaataggaattattctgacaatcctaactcgtcaccaggtcatcatttgggcgagctgtgttaacaaacaggtcgtcaaaatttccatcagggtggaagtggcgaggtgacgagtgcg
gi|1                          :                                                -C-CGT--TC-A-GGCA-ACCTGAG-A-TCA--GTG---T-----T-T--A-GG-TTGC-C-C-AAA---T---GG-tttcaggttgcccaaacaaaaatatgaaacgaaaagaacttcaaatatatatttttaatctattgcatttatttttcagtttcaaataagaaatgtattttaattcttttcacgttattttaatttgtatttcttatttcaaataaatagaaattattctgacattccaactcgtcccaggttgtcatttgggtgagctatgttaacaaacgggtcgccaaaatcacatcagattggaaatggcgaggtgacgagtgtgaatgtcgaa
gi|18                         :                   ggttcgacactcgtcagaatttggactcg-C-CGT--TC-G-GGCA-ACCTGAA-A-T----CAG-TAC-----T-T--C-GG-TTGC-C-C-GAA---T---GG-atttcaggtcgtccaaacaaatatttaaaacgaaaagaacctcaaatatattattaaattggtaccgtatattatttatattctaaatctattgcatttatttttcagtttcaaataggaaatgtattttattcttttcacgttattcttatttcaaaaaaatagaaattattctgaaaatccaaactcgttacgaggttgtcatttgggcgagctatgttaacaaacgtgtcatcaaaattcacatcagggtggaaatggtgaggtgacgagtgtgaatgtcgaaccc
gi|34                         :                     attcgacactcatcagatttggactcg-C-CAT--TC-G-GGCA-ACCTGAG-A-T----CCG-TAC-----G-T--A-GG-TTGC-T-C-GGA---T---GG-atttcaggttgtccaaaccaaaaagaacttcaaatgtatacttctaaatctattgcatttcattttcaaattggaatgtattttaattctttcacattatttttattgtattcttatttcaaataattagaaattattctgacaatcgatactcgtcaccaaggtgatcatttgggtgagctatgttaacatacaggtcgtcaaattcagatcagggtggaaattgcgaggtgacgagtgtgaatgtcgaacc
gi|9                          :                          ggtttgacacagaatttggactcg-CAT--TC-G-GGCA-ACCTGAG-A-T----CAG-TAC-----T-C--A-GG-TTGC-C-C-GAA---T---GG-atttcaggttgccaaacaaaatatggaacaaaaaggacctcaaat
gi|21                         :                      gttcgacactcgtcagaatttggactca-CAT--TC-G-GGCA-ACC-AAA-AGT-A--CTG-ATC-----T-C--A-GG-TTGC-C-C-GAA---T---GG---TTT--C-AGGT--TGCCCAA---A-CA-AAA--ATAT--G-A--AACGAAAAGAACTT--C-AAAT--A-TAT-A---------------------TT-----------------------T--TT---A-A-T-CTAT---T-GC--ATTTA--T--TTTT-C-A-G-T-TTC-A----AAT----A-AGAAA-TGT------ATT-TTAATT-CTT--TTCAC-GTTA-T-T-TTAATT-T-GTATT---TC--TTATTTC-AAA-T----AAATAGA-AA-TTATTCTGAC---AT-TCC-A-ACT--CG-T-C-CC---A-G-G-TTG-TC-------AT--TTGGGT---GAGC--T---A--T--G-----TTAA-CAA-ACGG-GTCG--CCA-AAA------TCA-CAT-C--A-G-ATT-GGAAATGGCGA-----GG------TG----A------CGAG-TG-TGAATG-TC-GAAaatttcaggttgctcaaataaaaatacgcaacaaaaagaacttcaaacatattatttctaaatcgattgcatttatttttcagtttcagataggaaatatattttaattcttttcacgttattttcatttgtattcttatttcaaataaatagaaatattttgacaatccaaactcgtcaccaggttgtcatttgggcaagctatgttaagaaacaggtcgtcataaatgacatcagggtggaaatggcgaggtgacgagtgtgaatatcaa
gi|16                         :                                                  -CGT--TC-G-GGCA-ACCTGAG-A-TCA--TTA---C-----T-T--A-GG-TTGC-C-C-GAA---T---GG-
gi|4                          :                        ggttcgacactcgtcagaatgtggactcgT--TT-G-GGCA-ACCTGAA-A-T----CCG---------T-T--C-GG-TCAA-C-C-TAAGATC---AGTA-TTT--C--GGT--TGCCCAA---A-TA-aatttcaggtttcccaaacaaaaatatgaaacgaaaagaacttcaaacatatcatttctaaatctataattgcatttcaaataggaaatgtattttaattcttttcacgttattttcatttgtataattcttatttcaaataaatagaaattattttgacaatccaaactcgtcaccaggttgtcattttggcgagctatatgttaacaaacaggtcgttagacttcacatcagggtggaaatggcgaggtatcgaa
gi|7                          :                         ttcgaccctcgtcagaattttgactcgcT--TC-A-GGCA-ACC-TAA-G-T-T--CAGTAT------T-T--C-GG-TTGC-C-C-GAA---T---GG-caaaaatatgaaacaaacagaacttcaaatgtattatttctaaatctattgcacttctttttcagtttcaaatagaagtgttatttaattttaattcttttcacattatttccatttgtattcttatttcaaataaatagaaattattctgacaatccaaactggtcaccaggtcgtcatctgggcgagctgtttaacaaacaggtcatcaaaattcacatcagggtgggaaatggcgaagagcggtgacgagtgcgaatgtcgaaccc
gi|13                         :                         gttcgacactcgtcagaaatttgactcgT--TC-G-GGCA-ACCTGAG-A-TCA--GTG--TT-----T-T----GG-TTGC-C-C-GAA---T---GG-cagatttcaggttgcccaaccaaaaatatgagaaacaaaaagaacttcaaatgtattatatctaaatctattgcatttctttttcagtttcaaataggaaatgtattttaattcttttcacattattttcatttgtattcttatttcaaataaatagaaattattctgacaatccaaactcgtcatcaggttgtgatttgggcgagctatgttaacaaacaggtcgtcaaaattcacatcagggtggaaatggcgaagtgacgagtgcgaaagtcgaacc
gi|20                         :                          ttcgacactcgtcagaattttgactcgT--TC-G-GGCA-CCCTGAA-A-T----CAG-TAC-----T-T--C-GG-TTGC-C-C-GAA---T---GG-cagatttcaggttgcccaaacaaaaataagaaacaaaaacaacttcaaatgtattatttctaaatcttttttcagtttcaaataggaaatgtattttaattcttttcacattattttcatttgtattcttatttcaaataaatagaaattattctgaaaatccaaactcgtcaccaggttgtcatttgggcagctatattaacaaacaggtcgtcaaaattcacatcagggtggaaatggcgaagtgacgagtgcgaatgtcgaac
gi|20                         :                                  tcgtcagaattcggacccaT--TT-G-GGCA-ACCTGAA-A-T----CTG---------T-T--C-GG-GCAC-C-CTGAAAT-C---AGTA-CTT--C--GGT--TGCCCGA---A-cagatttcaggttgcccaaacaaaaagaacttcaaatgtattatttctaaatctattgcatttcattttcaaataggaaatgtattttaattcttttcacattatttttatttatattcttatttcaaataattagaaattattctgacaatcgatactcgtcaccaggtcgtcatttgggcgatctatgttgtcatacaggtcgtcaatattcagatcagggtggaaatggcgaggtgacaagtgtgaatgtcgaacc
gi|28                         :                               tcgtcagaattcggacccaccaT--TC-G-GGCA-ACT-AAG-A-T----CGGTATT-----T-T--T-GG-TTGC-CAC-GAA---T---GG-caaaaagaacttcaaatgtattatttctaaatctattgcatttcattttcaaataggaaatgtattttaattcttttcacattatttttatttatattcttatttcaaataattagaaattattctgacaatcgatactcgtcaccaggtcgtcatttgggcgatctatgttgtcatacaggtcgtcaatattcagatcagggtggaaatggcgaggtgacaagtgtgaatgtcgaacc
gi|7                          :                          gttcgacaaccgtcagaattttgactcg--TT-G-GGCA-ACCTGAA-A-T----CTG-TTC----------A-GG-CAAC-C-T-AAGTT-C---AGTA-TTT--C--GGT--TGCCCGA---A-acgaatttcaggttgccaaacaaaaatatgaagcaaacagaacttcaaatgtatatctctaagatctattgcaaacttctttttcagtttcaaataggaaatgtatttcaattctttgtttacaattatt
gi|23                         :                                                                          gttcgacactcgtcagaaatttgactcgccaGC-C-C-AAA---C---GG-A-TTT--C-AGGT--TGCCTAA---AACA-AAA--ATAC--A-A--AA---A-AGAACTT--C----T--C-TATT----------------------TT-----------------------T-A-----A-A-T-CTAT---T-GC--ATTTC--T--TTTT-C-A-G-T-TTC-A----AAT----A-GGAAA-TGT------ATT-TTAATT-CTT--TTCAC-ACTA-T-T-TTCATT-T-GTA-T---TC--TTATTTC-AGA-TTAT-AAGTAGA-AA-TTATTCTGAC---AA-TCC-ATGCT--CG-T-CACC---A-G-G-TTG-TT-------GT--TTGGGC---GAGC--T---A--T--G-----TTAA-CAA-ACAG-GTCG--TCG-AAA--T---TCA-CAT-T--A-G-GGT-GGAAATGTCGA-----GG------TG----A------CGAG-GA-TGAATG-TC-AAACCccaaaaatatgagaaacaaaaagaacttcaaatgtattatatctaaatctattgcatttctttttcagtttcaaataggaaatgtattttaattcttttcacattattttcatttgtattcttatttcaaataaatagaaattattctgacaatccaaactcgtcatcaggttgtgatttgggcgagctatgttaacaaacaggtcgtcaaaattcacatcagggtggaaatggcgaagtgacgagtgcgaaagtcgaacc
gi|22                         :                                                                                                                  A---C---GG-A-TTTTGC-AGGT--TGTCCAA---A-CA-AAA---------------------GAACTT----AAAT--G-TATTA---------------------TT-----------------------TCA-----A-A-T-CTAT---T-GC--A----------TTT-C-A-T-T-TTC-A----AAT----T-GGAAA-TGT------ATT-TTTAAT-TCT--TTCAC-ATT--T-T-TTTATT-T-GTA-T---TCTGATATTTCAAAA-T----AATTAGA-AA--TATTCTG-C---AA-TCG-ATATT--CGTT-CACC---A-G-G-TCA----------AT--CTTGGT---GAGC--T---A--T--------TTAA-ATC-ACAG-GTCG--TCATAAAC-T---TCA-GAT-C--A-G-GG--GGAAATGCCGA-----GGGT----TGCAT-A------CGAG-TG-TGAATG-TC-GAACCc
gi|25                         :                                                                    ctcacacaaaatttgtgcaatgacttgtccagatactttacaggtat---C---GG-A-TTTT-C-AGGT--TGTCCAA---A-CA-AAA---------------------GAACTT----AAAT--G-TATTA---------------------TT-----------------------TCA-----A-A-T-CTAT---T-GC--A----------TTT-C-A-T-T-TTC-A----AAT----T-GGAAT--GT------ATT-TTAATTCTTT--TTCAC-ATTA-T-T-TTTATT-T-GTA-TA--TC--TTTTTTCAAAA-T----AATTAGA-AA--TATTCTGAC---AA-TCCGATATT--CG-T-CACC---A-G-G-TCA-TC--------T--TT-GGT---GAGC--T---A--T--G-----TTAA-AAT-ACAG-GTCG--TT--AAA--T---TCAGAAT-C--A-G-GGT-GGAAATGCCGA-----TG------GG----ATTGTAGCGAG-TG-TGAATG-TC-GAACCc
gi|27                         :                                                                                                                       ---GG-A-TTTG-C-AGGT--T-TCCAA---A-CA-AAA---------------------GAACTT----AAAT--G-TATTA---------------------TT-----------------------TCA-----A-A-T-CTAT---T-GC--A----------TTT-C-A-T-T-TTC-A----AAT----TTGGAAA-TGT------ATT-TTAATT-CTT--T-CAC-ATTA-T-T-TTTATT-T-GTA-TA--TCTGAT-TTTC-AAA-T----AATTAGA-AA-T-ATTCTG-C---AA-TCG-ATATT--CG-TTCACC---A-G-G-TAA-TC-------AT--TTGGGT---GAGC--T---A--T--------TTAA--AT-ACAG-GTCG--TCA-AAC--T---TCAGAAT-C--A-G-GG--GGAAATTGCGA-----GGGATTGCTA----A------CGAG-TG-TGAATG-TC-GAACCc
gi|26                         :                                                                                                                       ---GG-A-TTTTGC-AGGT--TGTCCAA---A-CA-AAA---------------------GAACTT----AAAT--G-TATTA---------------------TT-----------------------TCA-----A-A-TACTAT---T-GC--A----------TTT-C-A-T-T-TTC-A----AAT----T-GGAAT--GT------ATT-TTAATT-CTT--T-CAC-ATTA-T-T-TTTATT-T-GTA-TA--TCT-ATATTTC-AAAAT----AATTAGA-AA-T-ATTCTGAC---AA-TCCGATATT--CGTT-CACC---ACG-G-T-A-TC-------AT--T--GGT---GAGC--T---A--T--G-----TTAA-ATC-ACAG-GTCG--T---AAA--T---TCAGAAT-C--A-G-GG--GGAAAT-GCGA-----GGAT----TGCTATG------CGAG-TG-TGAATG-TC-GAACCct
gi|30                         :                                                                                                                       ---GG-A-TTT--C-AGGT--TGCCCAA---A-CA-TAA--CAAT--C-A--AACAAA-AG-ACTTTAT-AAAC--A-TATTACTGTGTGTTTTTTTTTGTTTTTT-----------------------T-TTT---A-ACT-CTAT---T-GC--ATTTC--A--ATGT-T-A-G-T-TTC-AACAGAATCTTAA-TGAAT-C-T------ATT----ATT-GTT--TTCAC-c
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                             ---A-A-T-CTAT---T-GC--ACTTCCAT--TTTT-C-AAG-T-TTC-A----AAT----A-GGAAA-TGTTC----ATT-TCAAtgtcactcatgttct
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                         gaatatatgtctaaC--T--TTTT-C-A-G-T-TTC-A----AAT----A-CGAAA-TGT------ATT-TTAATT-CTT--TTCAC-ATTA-T-T-TTCATT-T-GTA-A---TC--TTATTTC-AGT-T----AAATAGA-AA-TTATTCTAAT---AA-TCC-AAACT--CG-T-CACC---A-G-G-TTG-TC-------AT--TTGGGC---GAAC--T---A--T--G-----TTAA-CAA-ACAG-GTCG--TCA-AAA--A---TCA-CAT-C--C-G-GGT-GGAAA-------------------TG----A------CAAG-TG-CGAATG-TC-GAACCcatta
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AAA-AA-ATATTTTGAC---AA-TCC-AAACT--CG-T-CACC---A-G-G-TTG-TA-------AT--TTGGGC---GA----T---T--C--G-----TTAG--AA-ACAG--TCGGGTCA-AAA--A----CA-CAT-C--A-G-GGT-GGAAATGGCGA-----GG------TG----A------CGAG-TG-TGAATA-TC-GAc
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           caaTTC-GAC---A--TTC-ACACT--CG-T-CACC---------TCG-CC-------AT--TT--CC---AATC--T---GA-T--GTGATTTTGG-CGA-CCCG-TTTG--TTA-ACA--TAGCTCA-C-C-C------------AAATGACAACCT--GG-------G----A------CGAG-TT-GGAATG-TCAGAA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                       cattcgggcaaccaaaagtactgatctcaggttgcccgaatggtttcaggttgcccaaacaaaaatatgaaacgaaaagaacttcaaatatatatttttaatctattgcatttatttttcagtttcaaataagaaatgtattttaattcttttcacgttattttaatttgtatttcttatttcaaataaatagaaattaTTC-GAC---A--TTC-ACACT--TG-T-CACC---------TCG-CC-------AT--TTCCACCCTGATC--T---GAAT--A-----TTGA-CGA-CCTG-TATG--ACA-ACA--T-----A-GAT-C-------GC-CCAAATGACGACCT--GG------TG----A------CGAG-TATCGATTG-TCAGAA
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                          tcgtcagaattcggacccaccattcgggcaaccgaagtactgatttcagggtgcccgaacagatttcaggttgcccaaacaaaaagaacttcaaatgtattatttctaaatctattgcatttcattttcaaataggaaatgtattttaattcttttcacattatttttatttatattcttatttcaaataattagaaattaAC---AA-TCC-AAACT--TG-T-CACC---A-G-G-TC-----------AT--TTGAGC---AAGC--T---A--T--G-----TTAA-CAA-ACAG-GTCG--TCA-AAT--T---TCA-CAT-C--A-G-GGT-GGAAATGG-----------------------------CGAG-TG-CGAATG-TC-GAACCcc
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              C---GACC--T---G--TTTG-----TTAA-CAT-ATAG-CTCG--CCA-AAA--T---
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                     ggttcgacactcgtcagaatgtggactcgccattcgggcaacctaagtaatgatctcaggttgcccgaacgaatttcaggtttcccaaacaaaaatatgaaacgaaaagaacttcaaacatatcatttctaaatctataattgcatttcaaataggaaatgtattttaattcttttcacgttattttcatttgtataattcttatttcaaataaatagaaattattttgacaatccaaactcgtcaccaggttgtc-GTCG--TCA-AAA--T---TCA-CAT-C--A-G-GGT-GGAAA-------------------TA----A------CGAG-TG-CGAATG-TC-GAACCttagacttcacatcagggtggaaatggcgaggtatcgaa
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            -CAT-C--A-G-GGT-GGAAATGGCGA-----AG------TG----A------CGAGTTG-CGAAc
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                actcgtA-----GG------TG----A------CGAG-TG-CGAATG-TC-GAACC

Unaligned ( gi|41 ): GCAATATAGAGCTATGGTTTGATGCTTACTTCGGTCTTT

lowQualScore                  :                                                                                                                                                                         111                     1111111111111111111111111   1111111111111111111111                              11111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           
lowQualScore                  :           22    3   1   1  222 22    4444 1 22 1  1 1   11  1 2    1   3  222 1 22       1 55 1  1    1     1 333   1   55 1    11       333 2  1   222   3333 11   66  333 1     11 1     222  5555555555555555555555555   1111111111111111111111 1 11     33 2 1   11 222 1   11111111111    1 1 1 1 2   1 11    1   2222 2    555555 1  1 44       33  1   2     1    1   1 1   1 666   33  1    2   1 7777       1  11         222  1     2   11  4 1    555 1 1 1 0 1  5555555  11      2    33  222      1   1    1    11   1   33    3   1 11 1 1   2           44444  777777  4444 333333    1        1       
lowQualScore                  :           ..    .   .   .  ... ..    .... . .. .  . .   ..  . .    .   .  ... . ..       . .. .  .    .     . ...   .   .. .    ..       ... .  .   ...   .... ..   ..  ... .     .. .     ...  .........................   ...................... . ..     .. . .   .. ... .   ...........    . . . . .   . ..    .   .... .    ...... .  . ..       ..  .   .     .    .   . .   . ...   ..  .    .   . ....       .  ..         ...  .     .   ..  . .    ... . . . . .  .......  ..      .    ..  ...      .   .    .    ..   .   ..    .   . .. . .   .           .....  ......  .... ......    .        .       
lowQualScore                  :           11    0   4   4  555 00    5555 4 00 4  4 4   99  4 8    4   3  999 4 00       5 00 5  5    4     3 333   2   88 2    77       444 5  2   666   1111 77   00  777 3     88 3     333  7777777777777777777777777   5555555555555555555555 3 88     11 6 3   88 333 3   22222222222    3 3 3 3 6   3 88    3   7777 6    555555 3  3 33       22  3   7     3    4   4 4   4 666   33  4    9   4 0000       4  88         333  3     7   88  0 3    000 3 3 3 1 4  9999999  99      8    33  444      4   4    3    88   3   22    9   3 88 3 3   6           88888  000000  8888 666666    3        4       
consensus                     :      TTCGA--CACT-CGT-CAG-AA---T--TTTG----A-C--T-CG-C-CAT--TC-G-GGCA-ACCGAA-A-T-A--CTGATCT-T--A-GG-TTGC-CCGAA-C---GGA-TTT--C-AGGT--TGCCCAA---A-CA-AAA--ATAT--G-A--AAC-GAA-A-G-AACTT--C-AAATG---TA-------------------------TTA----------------------T-T--TCTAA--A-T-CTA--T---T-GCA--CTTC--T--TTTT-C-A-G-T-TTC-A--AATA-GGA----A-ATGT------A-TT-T-TAATTCTT--TT-CAC-ATTAT-TTTC-ATT-T-GTA-T---TCT--TA-TTTC-AAA-T----AAATAGA-AA-TTATTCTGAC---AA-TCCAA-ACT--CG-T-CACC---A-G-G-TCG-TC-------AT--TTGGGC-GAGC--TA---TGTTAA-CAA-ACAG-GTCG--TCA-AAA--TTCA-CAT-C--A-G-GGT-GGAAATGGCGA-----GG------TG----A------CGAG-TGCGAATG-TCGAACC
Reference ( family-4596 )     :      TTCGA--CACT-CGT-CAG-AA---T--TTTG----A-C--T-CG-C-CAT--TC-G-GGCA-ACCGAA-A-T-A--CTGATCT-T--A-GG-TTGC-CCGAA-C---GGA-TTT--C-AGGT--TGCCCAA---A-CA-AAA--ATAT--G-A--AAC-GAA-A-G-AACTT--C-AAATG---TA-------------------------TTA----------------------T-T--TCTAA--A-T-CTA--T---T-GCA--CTTC--T--TTTT-C-A-G-T-TTC-A--AATA-GGA----A-ATGT------A-TT-T-TAATTCTT--TT-CAC-ATTAT-TTTC-ATT-T-GTA-T---TCT--TA-TTTC-AAA-T----AAATAGA-AA-TTATTCTGAC---AA-TCCAA-ACT--CG-T-CACC---A-G-G-TCG-TC-------AT--TTGGGC-GAGC--TA---TGTTAA-CAA-ACAG-GTCG--TCA-AAA--TTCA-CAT-C--A-G-GGT-GGAAATGGCGA-----GG------TG----A------CGAG-TGCGAATG-TCGAACC
gi|1                          :      TTCGA--CACT-CGT-CAG-AA---T--TTGG----A-C--T-CG-C-CAT--TT-G-GGCA-ACCTAA-A-C-A--CTGATCT-C--A-GG-TTGC-CTGAA-C---GGA-TTT--C-AGGT--CGTCCAA---A-CA-AAT--ATTT--A-A--AAC-GAA-AAG-AACCT--C-AAATA---TATTATTAAATTGGTACCGTATATTATTTA----------------------TAT--TCTAA--A-T-CTA--T---T-GCA--TTTA--T--TTTT-C-A-G-T-TTC-A--AATA-GGA----A-ATGT------A-TT-T-TA-TTCTT--TT-CAC-GTTAT-T-------------------CT--TA-TTTC-AAA-A----AAATAGA-AA-TTATTCTGAA---AA-TCCAA-ACT--CG-T-TACG---A-G-G-TTG-TC-------AT--TTGGGC-GAGC--TA---TGTTAA-CAA-ACGT-GTCA--TCA-AAA--TTCA-CAT-C--A-G-GGT-GGAAATGGTGA-----GG------TG----A------CGAG-TGTGAATG-TCGAACC
gi|10                         :    ggTTCGA--CACT-CGT-CAG-AA---T--TTTG----A-C--T-CG-C-CAT--TC-G-GGCA-ACCAAA-A-T-A--CTGATCT-T--A-GG-TTGC-CCGAA-C---GGA-TTT--C-AGGT--TGCCCAA---A-CA-AAA--ATAT--G-A--AAC-AAACA-G-AACTT--C-AAATG---TA-------------------------TTT----------------------T-T--TCTAA--A-T-CTA--T---T-GCA--CTTT--T--TTTTTC-A-G-T-TTC-A--AATA-GGA----A-ATCT------A-TT-T---------------AC-ATTAT-TTCC-ATT-T-GTA-T---TCT--TA-TTTC-AAA-T----AAATAGA-AA-TTATTCTGAC---AA-TCCTA-ACT--CG-T-CACC---A-G-G-TCA-TC-------AT--TTGGGC-GAGC--TG---TGTTAA-CAA-ACAG-GTCG--TCA-AAA--TTTC-CAT-C--A-G-GGT-GGAAGTGGCGA-----GG------TG----A------CGAG-TGCGAATG-TCGAACCc
gi|11                         :     gTTCGA--CACT-CGT-CAG-AA---T--TTTG----A-C--T-CG-C-CAT--TC-G-GGCA-ACCAAA-A-T-A--CTGATCT-T--A-GG-TTGC-CCTAA-C---GGA-TTT--C-AGGT--TGCCCAA---A-CA-AAA---TAT--G-A--AAC-AAACA-G-AACTT--C-AAATG---TA-------------------------TTT----------------------T-T--TCTAA--A-T-CTA--T---T-GCA--CTTC--T--TTTT-C-A-G-T-TTC-A--AATA-GGA----A-ATCT------A-TT-T---------------AC-ATTAT-TTCC-ATT-T-GTA-T---TCT--TA-TTTC-AAA-T----AAATAGA-AA-TTATTCTGAC---AA-TCCTA-ACT--CG-T-CACC---A-G-G-TCA-TC-------AT--TTGGGC-AAGC--TG---TGTTAA-CAA-ACAG-GTCG--TCA-AAA--TTTC-CAT-T--A-G-GGT-AGAAATGGCGA-----GG------TG----A------CGAG-TGCGAATG-TCGAACCc
gi|12                         :     gTTCGA--CACT-CGT-CAG-AA---T--TTTG----A-C--T-CG-C-CAT--TC-G-GGCA-ACCAAA-A-T-A--CTGATCT-T--A-GG-TTGC-CCGAA-C---GGA-TTT--C-AGGT--TGCCCAA---A-CA-AAA--ATAT--G-A--AAC-AAACA-G-AACTT--C-AAATG---TA-------------------------TTT----------------------T-T--TCTAA--A-T-CTA--T---T-GCA--CTTC--T--TTTT-C-A-G-T-TTC-A--AATA-GGA----A-ATCT------A-TT-T---------------AC-ATTAT-TTCC-ATT-T-GTA-T---TCT--TA-TTTC-AAA-T----AAATAGA-AA-TTATTCTGAC---AA-TCCTA-ACT--CA-T-CACC---A-G-G-TCA-TC-------AT--TTGGGC-GAGC--TG---TGTTAA-CAA-ACAG-GTCG--TCA-AAA--TTTC-CAT-C--A-G-GGT-GGAAGTGGCGA-----GG------TG----A------CGAG-TGCGAATG-TCGAACCc
gi|13                         :      TTCGA--CACT-CGT-CAG-AA---T--TTTG----A-C--T-CG-C-CAT--TC-G-GGCA-ACCAAA-A-C-A--CTGATCT-C--A-GG-TTGC-CCGAA-C---AGA-TTT--C-AGGT--TGCCCAA---A-CA-AAA--ATAA--G-A--AAC-AAA-A-ACAACTT--C-AAATG---TA-------------------------TTA----------------------T-T--TCTAA--A-T-CT--------------------T--TTTT-C-A-G-T-TTC-A--AATA-GGA----A-ATGT------A-TT-T-TAATTCTT--TT-CAC-ATTAT-TTTC-ATT-T-GTA-T---TCT--TA-TTTC-AAA-T----AAATAGA-AA-TTATTCTGAA---AA-TCCAA-ACT--CG-T-CACC---A-G-G-TTG-TC-------AT--TTGGGC--AGC--TA---TATTAA-CAA-ACAG-GTCG--TCA-AAA--TTCA-CAT-C--A-G-GGT-GGAAATGGCGA-----AG------TG----A------CGAG-TGCGAATG-TCGAAC
gi|14                         :      TTCGA--CACT-CGT-CAG-AA---T--TTTG----ATC--TGCG-CTCAT--CT-C-GGCATACAAAA-A-T-A--C--ATCT-TG-A-GGATTGC-CCGAA-C---GGA-TTT--C-AGGT--TACCCAAT--A-CA-AAA--ATAT--G-A--AAC-AAACA-G-AACTT--C-AAATG---TA-------------------------TTT----------------------T-T--CTTAA--A-T-CTA--T---T-GCA--CTTC-----TTCT-C-A-G-T-TTC-A--AATA-GGA---------------------------TCTA--TT-TAT-A-TAT-TTCA-ATT-T-GTA-T---TCT--TA-TTTC-AAA-T----AAATAG--AA-TTATTCTGAC---AA--CCTA-ACT--TG-T-CACC---A-G-G-TCA-TC-------AT--TTGGGC-GAGC--TG---TG-TAA-CAA-ACAG-GTCG--TCA-AAAATTTCA-ATT-C--A---GGT--GAAGTGGCGA-----GG------TG----A------CGAG-TGCGAATG-TCGAACC
gi|15                         :     gTTCGA--CACT-CGT-CAG-AA---A--TTTG----A-C--T-CG-C-TAT--TC-G-GGCA-ACCGAA-A-T-A--CTGATCT-T--A-GG-TTGC-CCGAA-C---GGA-TTT--C-AGGT--T--CCAA---A-CA-AAA--A------------------A-G-GACTT--C-AAATG---TA-------------------------TTA----------------------T-T--TCTAA--A-T-CTA--T---T-GCA--TTTC--T--TTTT-C-A-G-T-TTC-A--AATA-GGA----A-ATGT------A-TT-T-TAATTCTT--TT-CAC-ATTAT-TTCC-ATT-T-GTA-T---TCT--TA-TTTC-AAA-T----AAATAGA-AA-TTATTCTGAC---AA-TCCAA-GCT--CG-T-CA-C---A-G-G-TTG-TC-------AT--TTGGGC-GAGC--TA---TGTTAA-CAA-ACAG-GTCG--TCA-AAA--TTCA-GAT-C--A-G-GGT-GGAAATGGAGA-----GG------TG----A------CGAG-TGCGAATG-TCGAACC
gi|16                         :      TTCGA--CACT-CGT-CAG-AA---T--GTGG----A-C--T-CG-C-CAT--TC-G-GGCA-ACCTAA-G-T-A--ATGATCT-C--A-GG-TTGC-CCGAA-C---GAA-TTT--C-AGGT--TTCCCAA---A-CA-AAA--ATAT--G-A--AAC-GAA-AAG-AACTT--C-AAACA---TA-------------------------TCA----------------------T-T--TCTAA--A-T-CTA--TAATT-GCA----------------------T-TTC-A--AATA-GGA----A-ATGT------A-TT-T-TAATTCTT--TT-CAC-GTTAT-TTTC-ATT-T-GTA-TAATTCT--TA-TTTC-AAA-T----AAATAGA-AA-TTATTTTGAC---AA-TCCAA-ACT--CG-T-CACC---A-G-G-TTG-TC-------AT--TTTGGC-GAGCTATA---TGTTAA-CAA-ACAG-GTCG--TTA-GAC--TTCA-CAT-C--A-G-GGT-GGAAATGGCGA-----GG------TA----T------CGA
gi|17                         :    ggTTC-A--CACT-CGTTCAG-AA---T--TTTG----A-A--T-CG-C-CATCGTG-G-AGCT-ACAAAA-T-T-A--CTG-TCT-TG-A-GG-TTGC-C-GAA-C---GGA-TTT--C-AGGT--TGCCC-A---A-CA-AAA--ATAT--G-A--AAC-AAACA-G-AACTT--CGAAATG---CA-------------------------TT-----------------------T-T--TTTAA--A-T-CTA--T---T-GCA--CTTC--T--TTTT-C-A-G-T-TTCAA--AACA-GGA----A-ATCT------A-TT-T---------------AC-ATTAT-TTCC-ATT-T-GTA-T---TC---TA-TTTC-AAA-T----AAATAGA-AA-TTATTCTGAC---AA-TCCAA-ACT--C--T-CA-C---A-GCG-TCATTC-------AT--TTGGGC-GAGC-------TGTTAA-CAA-ACAG-GTCG--TCA-AAA--TT---TAT-C--A-G-GGT-GGAAGT-GCGA-----GG------T-----A------CGAG-T-CGAATG-TCGAACa
gi|18                         :    ggTTCGA--CACT-CAT-CAG-A----T--TTGG----A-C--T-CG-C-CAT--TC-G-GGCA-ACCGAA-G-T-A--CTGATTT-C--A-GG-TTGC-CCGAA-C---GGA-TTT--C-AGGT--TGTCCAA---A-CC-AA-------------------AA-A-G-AACTT--C-AAATG---TA--------------------------TA----------------------C-T--TCTAA--A-T-CTA--T---T-GCA------------TTT-C-A-T-T-TTC-A--AATT-GG-----A-ATGT------A-TT-T-TAATTC-T--TT-CAC-ATTAT-TTTT-A-T-T-GTA-T---TCT--TA-TTTC-AAA-T----AATTAGA-AA-TTATTCTGAC---AA-TCGAT-ACT--CG-T-CACCA--A-G-G-TGA-TC-------AT--TTGGGT-GAGC--TA---TGTTAA-CAT-ACAG-GTCG--TC--AAA--TTCA-GAT-C--A-G-GGT-GGAAATTGCGA-----GG------TG----A------CGAG-TGTGAATG-TCGAACC
gi|19                         :      aTTGA--CACT-CGT-CAG-A----T--TTTG----A-C--T-CA-C-CAT--TC-G-G-CA-ACCAAA-A-T-A--CTGATCT-T--A-GG-TTGC-CCGAA-C---GGA-TTT--C-AGGT--TGCCCAA---A-CA-AAA--ATAT--G-A--AAC-AAA-C-A-GACTT--C-AAATG---TA-------------------------TT-----------------------T-T--TCTAA--A-T-CTA--T---T-GCA--CTTC--T--TTTT-C-A-G-T-TTC-A--A-TA-GGA----A-ATCT------A-TT-T---------------AC-ATTAT-TTCC-ATT-T-GTA-T---TCT--TA-TTTC-AAA-T----AAATAGG-AA-TTATTCTGAC---AA-TCCTA-ACT--CG-T-CACC---A-G-G-TCA-TC-------AT--TTGGGC-GAGC--TG---TGTTAA-CAA-ACAG-GTCG--TCA-AAA--TTTC-CAT-C--A-G-GGT-GGAAGTGGCGA-----GG------TG----A------CGAG-TGCG
gi|2                          :    ggTTCGA--CACTTCAT-CAG-AA---C--TTTGG---A-C--T-CG-C-CAT--TT-A-TGCA--CCTAA-G-T-A---TGAT-T-C--ACGA-ATGCACCGAA-C---AAA-TTT--C-AG-T--TGCCCAA---AACA-AAA--ATAG--GCA--AAC-GAACA-G-AACTT--C-AAACA----A-------------------------TTA----------------------T-T--TCTAA--AAT-CTA--T---T-GCA--ATTG--TATTTTT-CGA-GCT-TTC-A--AATA-GGA----A-A-GT------A-TC-T-TA--TCTT--TT-CAC-GTTAT-TTTG-CTT-T-GTA-T---TCT--TA-TTTC-AAA-T----TAATAAG-AA-ATATTTT-AC---AACTCCAA-ACT--CG-TCCACC---A-G-GTTTG-TCATTTCTGAT--TTGGGC-AAGC--TA---TGTTAA-CAATACAGCGTCG--TCA-GAA--ATCA-CAT-C--A-GCGGT-G--AATGACGACG---GG------TG-----------CG-G-TGTGAAGG-TCGAACC
gi|20                         :               gT-CGT-CAG-AA---T--TCGG----A-C--C-CA-C-CAT--TC-G-GGCA-ACCGAA-G-T-A--CTGATTT-C--A-GG-GTGC-CCGAA-C---AGA-TTT--C-AGGT--TGCCCAA---A-CA-A--------------------AA-A-G-AACTT--C-AAATG---TA-------------------------TTA----------------------T-T--TCTAA--A-T-CTA--T---T-GCA------------TTT-C-A-T-T-TTC-A--AATA-GGA----A-ATGT------A-TT-T-TAATTCTT--TT-CAC-ATTAT-TTTT-ATT-T-ATA-T---TCT--TA-TTTC-AAA-T----AATTAGA-AA-TTATTCTGAC---AA-TCGAT-ACT--CG-T-CACC---A-G-G-TCG-TC-------AT--TTGGGC-GATC--TA---TGTTGT-CAT-ACAG-GTCG--TCA-ATA--TTCA-GAT-C--A-G-GGT-GGAAATGGCGA-----GG------TG----A------CAAG-TGTGAATG-TCGAACC
gi|21                         :                                                     -CAT--TC-G-GGCA-ACCAAA-AGT-A--CTGATCT-C--A-GG-TTGC-CCGAA-T---GG--TTT--C-AGGT--TGCCCAA---A-CA-AAA--ATAT--G-A--AAC-GAA-AAG-AACTT--C-AAATA---TA-------------------------T-A----------------------T-T--TTTAA----T-CTA--T---T-GCA--TTTA--T--TTTT-C-A-G-T-TTC-A--AATA-AGA----A-ATGT------A-TT-T-TAATTCTT--TT-CAC-GTTAT-TTTA-ATT-T-GTATT---TCT--TA-TTTC-AAA-T----AAATAGA-AA-TTATTCTGAC---AT-TCC-A-ACT--CG-T-C-CC---A-G-G-TTG-TC-------AT--TTGGGT-GAGC--TA---TGTTAA-CAA-ACGG-GTCG--CCA-AAA---TCA-CAT-C--A-G-ATT-GGAAATGGCGA-----GG------TG----A------CGAG-TGTGAATG-TCGAA
gi|22                         :                                                                                                            A-C---GGA-TTTTGC-AGGT--TGTCCAA---A-CA-AAA-----------------------G-AACTT----AAATG---TA-------------------------TTA----------------------T-T--TC-AA--A-T-CTA--T---T-GCA------------TTT-C-A-T-T-TTC-A--AATT-GGA----A-ATGT------ATTT-T-TAATTC-T--TT-CAC-ATT-T-TTTT-ATT-T-GTA-T---TCTGATA-TTTCAAAA-T----AATTAGA-AA--TATTCTG-C---AA-TCGAT-ATT--CGTT-CACC---A-G-G-TCA----------AT--CTTGGT-GAGC--TA---T-TTAA-ATC-ACAG-GTCG--TCATAAAC-TTCA-GAT-C--A-G-GG--GGAAATGCCGA-----GGGT----TGCAT-A------CGAG-TGTGAATG-TCGAACC
gi|23                         :                                                      ctcacacaaaatttgtgcaatgacttgtccagatactttacaggtatGC-CCAAA-C---GGA-TTT--C-AGGT--TGCCTAA---AACA-AAA--ATAC--A-A--AA----A-A-G-AACTT--C---------T--------------------------CTA----------------------T-T--TTTAA--A-T-CTA--T---T-GCA--TTTC--T--TTTT-C-A-G-T-TTC-A--AATA-GGA----A-ATGT------A-TT-T-TAATTCTT--TT-CAC-ACTAT-TTTC-ATT-T-GTA-T---TCT--TA-TTTC-AGA-TTAT-AAGTAGA-AA-TTATTCTGAC---AA-TCCAT-GCT--CG-T-CACC---A-G-G-TTG-TT-------GT--TTGGGC-GAGC--TA---TGTTAA-CAA-ACAG-GTCG--TCG-AAA--TTCA-CAT-T--A-G-GGT-GGAAATGTCGA-----GG------TG----A------CGAG-GATGAATG-TCAAACCc
gi|24                         :      TTCGA--CACT-AGT-CAGGAA---A--TTTG----A-C--T-CG-C-TAT--TT-G-GGCA-ACCGAA-A-T-A--CTGATCTCT--A-GT-ATGC-CCGAA-----GGA-TTT--CAAGGT--TGCACAA---A-GC-AAA--ATATTGA-A--AAC-AAA-A-G-AACTT--C-AAAT----TA-------------------------TTA------------------------T--TCTAA--A-T-CTA--T---T-GCA--ATCT--T--TTTT-C-A-G-T-TTC-A--AA-A-GGA----AGATGT------A-TTGT-TAATTCTT--TT-CAC-GTTAT-TTTCTATTGT-TTA-T---TCT--TA-TTTC-AAA-TATTAAAATAGAGAA-GTATTCTGAC---TA-TCCAA-ACT--CG-T-CATC---A-G-G-c
gi|25                         :                                                                                                           gg-C---GGA-TTTT-C-AGGT--TGTCCAA---A-CA-AAA-----------------------G-AACTT----AAATG---TA-------------------------TTA----------------------T-T--TC-AA--A-T-CTA--T---T-GCA------------TTT-C-A-T-T-TTC-A--AATT-GGA----A--TGT------A-TT-T-TAATTCTT--TTTCAC-ATTAT-TTTT-ATT-T-GTA-TA--TCT--TT-TTTC-AAAAT----AATTAGA-AA-T-ATTCTGAC---AA-TCCGATATT--CG-T-CACC---A-G-G-TCA-TC--------T--TTGG-T-GAGC--TA---TGTTAA-AAT-ACAG-GTCG--TT--AAA--TTCAGAAT-C--A-G-GGT-GGAAATGCCGA-----TG------GG----ATTGTAGCGAG-TGTGAATG-TCGAACCg
gi|26                         :                                                                                                               ---GGA-TTTTGC-AGGT--TGTCCAA---A-CA-AAA-----------------------G-AACTT----AAATG---TA-------------------------TTA----------------------T-T--TC-AA--A-TACTA--T---T-GCA------------TTT-C-A-T-T-TTC-A--AATT-GG-----A-ATGT------A-TT-T-TAATTC-T--TT-CAC-ATTAT-TTTT-ATT-T-GTA-TA--TCTA-TA-TTTCAAAA-T----AATTAGA-AA--TATTCTGAC---AA-TCCGATATT--CGTT-CACC---ACG-G-T-A-TC-------AT--T--GGT-GAGC--TA---TGTTAA-ATC-ACAG-GTCG--T---AAA--TTCAGAAT-C--A-G-GG--GGAAAT-GCGA-----GGAT----TGCTATG------CGAG-TGTGAATG-TCGAACCc
gi|27                         :                                                                                                               ---GGA-TTTG-C-AGGT--T-TCCAA---A-CA-AAA-----------------------G-AACTT----AAATG---TA-------------------------TTA----------------------T-T--TC-AA--A-T-CTA--T---T-GCA------------TTT-C-A-T-T-TTC-A--AATTTGGA----A-ATGT------A-TT-T-TAATTCTT--T--CAC-ATTAT-TTTT-ATT-T-GTA-TA--TCT--GATTTTC-AAA-T----AATTAGA-AA--TATTCTG-C---AA-TCGAT-ATT--CGTT-CACC---A-G-G-TAA-TC-------AT--TTGGGT-GAGC--TA---T-TTAA--AT-ACAG-GTCG--TCA-AAC--TTCAGAAT-C--A-G-GG--GGAAATTGCGA-----GGGATTGCTA----A------CGAG-TGTGAATG-TCGAACCc
gi|28                         :      TTCGA--CAAC-CGT-CAG-AA---T--TTTG----A-C--T-CG-C-CAT--TC-GTGGCA-ACCAAA-AAT-A--CCGATCT-T--A-G--TTGC-CCGAAAC---GAA-TTT--C-AGGT--TGCC-AA---A-CA-AAA--ATAT--G-A--AGC-AAACA-G-AACTT--C-AAATG---TA-------------------------T-A----------------------T-C--TCTAAG-A-T-CTA--T---T-GCAAACTTC--T--TTTT-C-A-G-T-TTC-A--AATA-GGA----A-ATGT------A-TT-T-CAATTCTTTGTT-TACAATTAT-Tct
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                     gC--T--TTTT-C-A-G-T-TTC-A--AATA-CGA----A-ATGT------A-TT-T-TAATTCTT--TT-CAC-ATTAT-TTTC-ATT-T-GTA-A---TCT--TA-TTTC-AGT-T----AAATAGA-AA-TTATTCTAAT---AA-TCCAA-ACT--CG-T-CACC---A-G-G-TTG-TC-------AT--TTGGGC-GAAC--TA---TGTTAA-CAA-ACAG-GTCG--TCA-AAA--ATCA-CAT-C--C-G-GGT-GGAAA-------------------TG----A------CAAG-TGCGAATG-TCGAACC
gi|3                          :      TTCGAATCAC--CGT-CAG---------TTCGTGGTA-C--T-CT-G-CAT--TCCG-GGC---CCTAA-G-T-A--CTGTTCT-TCAA-GG-TTGC-C-GAA-C---GGAATTT--C-AG-T--TGCCCAA---A-CA-AAA--ATAA--G-A--AAT-GAA-A-G-AACTT--C-AAATA---TATAT----------------------TCA----------------------T-T--TCT-A--A-T-CTAACA---T-GCA--TATT--A--TTTT-C-A-G-C-TTC-A--ACTA-GGA----ACATGT---------------ATTCTT--TC-CAC-GTTAT-TTTC-ATT-T-GTA-T---TGC--TA-TTTC-AGA-T----AAATAGC-AA-TTAATTCGACAAAAA-TCCAA-ACT--CG-T-CACCG--A-G-G-TCG-TCA------ATTATTGGGCAGAGC--TA---TGTTAATCAA-ACTG-GTCG--TCA-TAA--TTCA-CATCC--A-G-GGTGGGAAATGGCGA-----GG------TG----A------CGAG-TGTGAATT-TCCGACCc
gi|30                         :                                                                                                              g---GGA-TTT--C-AGGT--TGCCCAA---A-CA-TAA--CAAT--C-A--AAC-AAA-A-G--ACTTTAT-AAACA---TA-------------------------TTACTGTGTGTTTTTTTTTGTTTTTT-T--TTTAA--C-T-CTA--T---T-GCA--TTTC--A--ATGT-T-A-G-T-TTC----AACA-GAATCTTA-ATGA------A-TC-TATTATTGTT--TT-CAC-------TGTC-ACT-C-ATG-T---TCT--
gi|31                         :           --CACA-CAT-CAT-AA---T--TTTG----A-C--T-CG-C-CAT--TC-A-GACA-ACCAAA-G-T-A--CTGATCT-T--A-GG-TTGC-CTGAA-C---AGA-TTT--C-AGGT--TGCCCAA---A-CA-AAA--ATAT--G-A--AGA-AAA-A-G-AACTA--C-AAATG---TA-------------------------TTA----------------------T-T--TCTAA--A-T-CTA--T---T-GCA--TTTC--T--
gi|32                         :    tgTTTGA--CACT-CCT-TAG-AA---T--TCTG----A-C--T-CA-C-TAT--TG-G-GTTA-ACCTAG-A-T-A--CTGACCT-T--G-GG-TTGC-CCAAA-CAGGAGA-TTT--T-A
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gtAAA-AA-ATATTTTGAC---AA-TCCAA-ACT--CG-T-CACC---A-G-G-TTG-TA-------AT--TTGGGC-GA----TT---CGTTAG--AA-ACAG--TCGGGTCA-AAA--A-CA-CAT-C--A-G-GGT-GGAAATGGCGA-----GG------TG----A------CGAG-TGTGAATA-TCGAaaggaattattgcatacctacctcagttccttgcacacatatcattttt
gi|34                         :   caaTTTGA--CAC-------AG-AA---T--TTGG----A-C--T-CG-C-CAT--CC-G-AGCA-ACCTAC-G-T-A--CGGATCT-C--A-GG-TTGC-CCGAA-T---GGA-TTT--C-AGGT--TG-CCAA---A-C--AAA--ATAT--G-G--AACAAAA-A-G-GACCT--C-AAAT
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ggAC---AA-TCCAA-ACT--TG-T-CACC---A-G-G-TC-----------AT--TTGAGC-AAGC--TA---TGTTAA-CAA-ACAG-GTCG--TCA-AAT--TTCA-CAT-C--A-G-GGT-GGAAATGG-----------------------------CGAG-TGCGAATG-TCGAACC
gi|36                         :      TTTGA--CACT-CAT-CAG-AA---T--TTAG----A-C----------AT--AC-G-T-------------T-A---TGATAT-C--A-GG-TTGT-CAGAA-T---GGA-TAT--C-AGGT--TACCCAA---A-CATAAA--AGAT--C-A--AAC-AA
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                         ggTA----------------------T-G--TCTAA--AAT-CTA--T---T-GCA--CTTCCAT--TTTT-C-AAG-T-TTC-A--AATA-GGA----A-ATGTTC----A-TT-T-CAA
gi|38                         : gaataTTCGA--CACT-CGT-CAG-AAATTTGATTTG----A-C--T-TG-C-CAT--TC-G-GGCA-ACCGAA-A-T-catta
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gg-GTCG--TCA-AAA--TTCA-CAT-C--A-G-GGT-GGAAA-------------------TA----A------CGAG-TGCGAATG-TCGAACC
gi|4                          :      TTCGA--CCCT-CGT-CAG-AA---T--TTTG----A-C--T-CG-C-TAT--TT-G-GGCA-ACCGAA-A-T-A--CTGATCT-T--A-GG-TTGA-CCGAA-C---GGA-TTT--C-AGGT--TGCCCAA---A-CA-AAA--ATAT--G-A--AAC-AAACA-G-AACTT--C-AAATG---TA-------------------------TTA----------------------T-T--TCTAA--A-T-CTA--T---T-GCA--CTTC--T--TTTT-C-A-G-T-TTC-A--AATA-G-A----A-GTGTTATTTAA-TT-T-TAATTCTT--TT-CAC-ATTAT-TTCC-ATT-T-GTA-T---TCT--TA-TTTC-AAA-T----AAATAGA-AA-TTATTCTGAC---AA-TCCAA-ACT--GG-T-CACC---A-G-G-TCG-TC-------AT--CTGGGC-GAGC--TG---T-TTAA-CAA-ACAG-GTCA--TCA-AAA--TTCA-CAT-C--A-G-GGTGGGAAATGGCGAAGAGCGG------TG----A------CGAG-TGCGAATG-TCGAACCc
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -CAT-C--A-G-GGT-GGAAATGGCGA-----AG------TG----A------CGAGTTGCGAAc
gi|42                         :              actcgtT-CAG-AA---T--TTGG----A-C--T-TG-C-CAT--TC-G-GGCA-ACCGAA-G-T-A--
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       A-----GG------TG----A------CGAG-TGCGAATG-TCGAACC
gi|5                          :      TTCGA--CACTGCG--CAG-AA---T--TTTG----A-CGTT-CGGC-CAT--TC-TCGGCA-ACCGAA-C-TCA--C-GATCT-T--A-G--TTGC-CCGAA-C---GGA-TTT--C-AGGTGCCGCCTAATGTA-CA-AAA--ATCT--------AT-GAA-C-G-AACTT--C-AGA-G---TA---------------------------A----------------------T-TAGTCTAATAG-T-ATA--T---T-GCA--CTTC--T--TTTT-C-A-G-TGTTC-AGAAATA-GGA----A-ATGG------A-TT----AATTCTTA-TT-TACTATTAT-T--C-ATT-TTGTA-T---TTT--GA-TTTC-AAA-TT---AAATAGG-AA-TTATTCTTAC---AA-TCCAA-ATTGTCG-G-CACCGAAA-G-G-TCG-TC-------AT--TTGGGCCGGGC--TAATGTATTTA-CAA-ACAG-GTCG--TCA-ATA--AGCA-CAT-C--A-G-GGT--GAAAT------------------------A------AGAG-T-CGAATGTTCGAACCct
gi|6                          :    ggTTCGA--CACT-CGT-CAA-AA---T--TTGG----A-C--T-CG-C-CAT--TC-G-GCAA-ACTTAACG-T-AAGC-GATCC------AG-TTGC-CCGAA-CA--GGA-TTT--C-AGGT--TGCCCAA---A-CA-AAACAATAT--G-A--AAT-GAA-A-G-CCTTT--C-AAATAATATA-------------------------TTA----------------------A-T--TTTAA--A---CTA--T---TAGTG--CTTA--A--TTTT-C-A-G-TCTTC-A--AATA-AGA----A-ATGT------A-TT-T-AAATTCTT--T----C-ACCATGCTTC-ATT-T-TAA-T---TCT---A-TT-C-AAA-T----AAATAAA-AAATTATC--GAC---AA-TCCAA-ACA--CA-T-CAAC---A-G-G-TTG-TC-------CA--TTGGGC-GAGCC-TA---TGTTAA-CAA-ATAG--TCG--TCA-AA---TTCA-CAT-CCAACG-GGT-GGAAATGGCGA-----GG------TG----A------CGAG-AGCGAATG-TCGAACC
gi|7                          :     gTTCGA--CACT-CGT-CAG-AA---A--TTTG----A-C--T-CG-C-CAT--TC-G-GGCA-ACCGAA-A-T-A--CTGAACT-T--A-GG-TTGC-CTGAA-C---AGA-TTT--C-AGGT--TGCCCAA---C-CA-AAA--ATAT--G-AGAAAC-AAA-AAG-AACTT--C-AAATG---TA-------------------------TTA----------------------T-A--TCTAA--A-T-CTA--T---T-GCA--TTTC--T--TTTT-C-A-G-T-TTC-A--AATA-GGA----A-ATGT------A-TT-T-TAATTCTT--TT-CAC-ATTAT-TTTC-ATT-T-GTA-T---TCT--TA-TTTC-AAA-T----AAATAGA-AA-TTATTCTGAC---AA-TCCAA-ACT--CG-T-CATC---A-G-G-TTG-TG-------AT--TTGGGC-GAGC--TA---TGTTAA-CAA-ACAG-GTCG--TCA-AAA--TTCA-CAT-C--A-G-GGT-GGAAATGGCGA-----AG------TG----A------CGAG-TGCGAAAG-TCGAACCc
gi|8                          :     gTTTGA--CACT-CGT-CAG-AA---T--TTTG----A-C--T-CG-C-CAT--TC-G-GGCA-ACCGAA-A-T-A--CTGATCT-T--A-GG-TTGC-CCGAA-C---GGA-TTT--C-AGGT--TGCCCAA---A-CA-AAA--ATAT--G-A--AAC-AAACA-G-AACTT--C-AAATT---TA-------------------------TTA----------------------T-T--TATTA--A-T-CTA--T---T-GCA--CTTC--T--TTTT-C-A-G-T-TTC-A--AATA-GGA----A-TTGT------A-TT-T-TAATTTTT--TT-CAC-ACTAT-TTCC-ATT-T-GTA-T---TCA--TA-TTTC-AAA-T----AAATAGA-AA-TTATTCTGAC---AA-TCCAT-ACT--CG-T-CACC---A-G-G-TCG-TC-------AT--TTGGGC-GAGC--TG---TGTTAA-CAA-ACAG-GTCG--TCA-AAA--TTCA-CAT-C--A-G-AGT-GGAAATGGCGA-----GG------TG----A------CGAG-TGCGAATG-TCGAACC
gi|9                          :      TTCGA--CACT-CGT-CAG-AA---T--TTGG----A-C--T-CA-C-CAT--TC-G-GGCA-ACCTGA-G-T-A--CTGATCT-C--A-GG-TTGC-CCGAA-T---GAA-TTT--C-AGGT--TGCTCAA---A-TA-AAA--ATAC--G-C--AAC-AAA-AAG-AACTT--C-AAACA---TA-------------------------TTA----------------------T-T--TCTAA--A-T-CGA--T---T-GCA--TTTA--T--TTTT-C-A-G-T-TTC-A--GATA-GGA----A-ATAT------A-TT-T-TAATTCTT--TT-CAC-GTTAT-TTTC-ATT-T-GTA-T---TCT--TA-TTTC-AAA-T----AAATAGA-AA--TATTTTGAC---AA-TCCAA-ACT--CG-T-CACC---A-G-G-TTG-TC-------AT--TTGGGC-AAGC--TA---TGTTAA-GAA-ACAG-GTCG--TCA-TAA--ATGA-CAT-C--A-G-GGT-GGAAATGGCGA-----GG------TG----A------CGAG-TGTGAATA-TCAA