lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 1111 2222 22222222 4444444444444444444 222 111111 22 5555555555 22222222 11 111111 11111111 2222222222 1 111 1111111 222222222222222222 111111 1 2222222 11 4444444444444 5555555555555555555555555555555 1 3333 1 333 2 2222 1 666666666666666666666666666666666 22 111 2222 222 1 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 333333333333333333 111111 3333 111111 111 1 1 1 2 4444444444444444 1 1111 1 1 33 1 222 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000 222 3333333333 11 111 1 3333 111 1 3333333 1 1 5555555555555555555 1 33 2 2 222 111 222 1111 1 222222222 55555555555555555 222 1 333333333333333 222 444444444 111111 22222 8888888888888888888888888888888888 22222222 1111111111 11 1 222 2222 33333333333333 1 111 33333333 3333333 111 33333333333 111 222 1 111 3333333 1111111111 11111 1 2222 111 1 1 444444444 333333333333333 22222222222 11 111 11 222222222 111 1 22 11 11111 1111 11111111111111111111111111111 11111111111111111111111 222222222222222222222222222222222222222222 3 55555555555555555555555555555555 2222222222222 11 55555555555555555555555555555
lowQualScore : 8 3 777 4 11 7777 8 6666 4 22222222 4 4 4444444444444444444 000 777 999999 0 00 0000000000 44444444 3 2 00 3 000000 8 777 3 99999999 3 4444444444 44 3 2 6666 6666 000 555 6 4444444 3 5 999999999999999999 33 888888 2 6 44 1111111 3 00 1111111111111 5 77 6 5555555555555555555555555555555 1 8 6 4444 8 8 6 8 666 4 8 9999 0 1 3 666666666666666666666666666666666 22 444 5555 111 8 8 5 1 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 222222222222222222 222222 5 444 77 0 3333 77 999999 000 1 6 6 3 6 6 3 6 6 4 8 0 6666666666666666 8 6 7777 8 0 6 0 8 8 55 6 5 77 5 1 8 5 000 5 5 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444 5 5 000 5 77 1111111111 55 5 555 5 1 2222 5 5 4 000 77 1 7777777 1 77 1 5555555555555555555 2 0 66 6 6 000 000 555 5 8888 5 5 1 222222222 22222222222222222 555 1 5 5 333333333333333 666 77 5 111 77 5 5 555555555 999999 5 5 00000 1111111111111111111111111111111111 5 00000000 8 6666666666 55 1 77 555 5 77 4444 33333333333333 5 1 000 2 33333333 4444444 555 99999999999 5 000 77 6 8 66 333 3 66 000 5 6 2222222 9999999999 22222 0 2222 66 5 5 5 66 66 666 66 0 0 555555555 5 5 5 66 5 555555555555555 8 22222222222 33 5 666 11 000000000 777 0 66 5 5 66 0 5 66 4 66 8 33 00 55 44 666 3 44 55555 6 3 3333 444 777777 444 333 2 4 2 2 99999999999999999999999999999 888 22 444444 66 22 2 55555 1 44 1 5 1 22222222222222222222222 1 4 22 444 2 444444444444444444444444444444444444444444 3333 9999999999 555 2 555 3 6666 22 22 1 55555555555555555555555555555555 222 33 1 99999 77 8888888888888 999999 1 33 55 44444444444444444444444444444 6
lowQualScore : . . ... . .. .... . .... . ........ . . ................... ... ... ...... . .. .......... ........ . . .. . ...... . ... . ........ . .......... .. . . .... .... ... ... . ....... . . .................. .. ...... . . .. ....... . .. ............. . .. . ............................... . . . .... . . . . ... . . .... . . . ................................. .. ... .... ... . . . . .................................................................................... .................. ...... . ... .. . .... .. ...... ... . . . . . . . . . . . . ................ . . .... . . . . . . .. . . .. . . . . ... . . ....................................................... . . ... . .. .......... .. . ... . . .... . . . ... .. . ....... . .. . ................... . . .. . . ... ... ... . .... . . . ......... ................. ... . . . ............... ... .. . ... .. . . ......... ...... . . ..... .................................. . ........ . .......... .. . .. ... . .. .... .............. . . ... . ........ ....... ... ........... . ... .. . . .. ... . .. ... . . ....... .......... ..... . .... .. . . . .. .. ... .. . . ......... . . . .. . ............... . ........... .. . ... .. ......... ... . .. . . .. . . .. . .. . .. .. .. .. ... . .. ..... . . .... ... ...... ... ... . . . . ............................. ... .. ...... .. .. . ..... . .. . . . ....................... . . .. ... . .......................................... .... .......... ... . ... . .... .. .. . ................................ ... .. . ..... .. ............. ...... . .. .. ............................. .
lowQualScore : 9 4 000 0 00 0000 0 5555 0 00000000 0 0 9999999999999999999 000 888 111111 1 66 0000000000 00000000 6 6 00 6 555555 0 777 0 11111111 3 2222222222 22 1 3 5555 4444 888 444 2 2222222 1 7 999999999999999999 99 000000 3 7 66 7777777 6 33 1111111111111 7 99 7 1111111111111111111111111111111 8 0 0 2222 0 0 0 0 000 0 0 8888 8 4 6 222222222222222222222222222222222 00 000 0000 000 0 7 7 4 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 777777777777777777 888888 7 000 99 7 7777 99 111111 000 4 7 7 3 7 7 3 7 7 0 0 6 4444444444444444 0 0 0000 0 6 0 8 0 0 88 7 7 44 7 4 4 7 000 7 7 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444 7 7 000 7 99 0000000000 77 7 999 7 4 1111 7 7 3 000 99 4 1111111 4 99 4 8888888888888888888 0 0 77 7 7 000 000 777 7 1111 7 7 4 444444444 11111111111111111 777 4 7 7 999999999999999 000 99 7 444 99 7 7 777777777 333333 7 7 00000 9999999999999999999999999999999999 7 00000000 9 7777777777 77 4 11 777 7 99 3333 44444444444444 7 4 000 1 33333333 0000000 777 11111111111 0 000 99 6 9 11 333 3 11 222 0 2 5555555 1111111111 55555 0 0000 99 0 0 0 99 99 000 99 0 0 000000000 0 0 0 99 0 444444444444444 8 55555555555 88 0 000 99 000000000 555 0 99 0 0 99 1 0 99 4 11 9 22 00 00 66 999 3 66 00000 7 3 5555 777 222222 111 777 1 0 0 0 33333333333333333333333333333 111 22 444444 88 00 9 33333 4 88 4 7 4 00000000000000000000000 4 3 00 888 8 333333333333333333333333333333333333333333 3333 1111111111 444 9 000 5 5555 11 11 5 77777777777777777777777777777777 777 77 5 99999 00 2222222222222 555555 7 11 33 44444444444444444444444444444 0
consensus : NNGCTTAAAAC-ATAATTGT---T-ACGCAA--TCC----TTTGT-TA----TT-T-C-G----G-TT-GTTA----------TAT-A-CA-TAAAA---T---CCA--T---GTAAATA-TTA----------AAAACAAT---CCAATAAGTTACCT--G-TA--CG--TGTCC-AATAAGTT--TAAAAA---T-G--TG-TCCATTN--T------TAAA--C-T-T----AT---T---GG---AC-A----G--T-TATT-G---T-C----AA------CT--TATT------GGACA-GTGC-C--AG-------GT-AAACGNATAAAA---AG-G-----CA-GA--AGAT-GCGTTT-------T----CACACAACAAG--TTTAAGAGAT-TTTTAATCTTTATA-A-TAACTA-CGAAATTTGTCTAC-AAGTAGTTAACATCTGAGACCGCCAAGCGACCGAAAAATCTC-----A--------TTG--GTCGT---TAC----CAC--CAC-ATCACATTATG-AA-CTTCTNT----TCG-----------ATTCAGAAA---CAT-------CTCC-----A---------CATA--TG-CT-------C----AATTTTTTTTT--AT-GTT---------TTCCCTA---GCAT-CTTCGGA--TTCACATT-TCATT--TTTTTC---AC---TTCCTT-G-AA-T-GATTTCACT-GAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATCTT-GGGT-TATT--TTG--CGTGA-AGTTAT-GAACGGACTGCTGTATG----ATCT-ATGTCCAGTTTTTTTCAGTAATGAGTTG-TTCAT-CTACT-CCAG-C-ATCG-TA-CAGTCTTG-TGGCTGC-AGTGG---CA-CG-TAA----GA-----GAA------ATGGT---------------CT------------T-TG-AAT---CCTGCCT-GTTCAC--A-------T--AGCT--CGGCGAC-GGT-TTT-CTGT-AAAACATG----AA-C-ACC---AA--C-GGG-------TGCATCTG-CATA--CC-GAATGA--TCC---GNANACTGATGCTAC-TTTTCTAATACTAGAA---GTTA---G---GCTTC-AT-A--T-C-AGCA-TTCT--------CCTTC-----TC-T--AT---ATCAA---GAACA-TCA-C-TG----AG---AA----C-G-TTA--TC-G---GT--ATT-T-A---------CAC-----TTTC-AC-TCTC-----ATCCCTATA---A-TTTT----G-AT-T-G--------CG-CGAGA-------AAANTG--C-T-----CTCTCCATCAGAGGA--ACT-CATGTTT-GTAT--TGA-TTC--AATGG----TGAAA----G-TG---A--A-TGAATA---TTNAA--TGA---TTTCAA-GT---TTT---ATAGACC----------TTTA---GA--ACTTACCTG-A--AACTG---TCC-AATA--AGT-A-A-AACA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-C--C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTGTT-GG--GA-TAT-TTAT--------A-A-ACA-G--CT-T----TA---C-C---TGGNAG--A--------GG--A-CAC-TTATGAA--GACAA---------TGG---AT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--A-TTTTGAC--TGGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATACAAA---GGA------GAT---AAT---GT-T-T-T-AA--G--------T--------A---G-G--TA-N-AA--GCCT-C---AAA--C--TG-T--A--C-A--T-T-C-T-----------G--T-------GA-G-AGA--AAG---AACTGA-T------C--TC----G------GCCC-------T--AC-G--GGC-CTCG----------A---T-C---AGTT-C----T--TT--C-TC-T-----C------A-C---AG---------A---A--T-GT----A--CAG------T-TTTN-GGCTT-A----TATC-CTTTACTT--AAACA------CCA-----TTGCATTG-AATATTGGATA
Reference ( gi|4 ) : TAGCTTAAAAC-ATAATTGT---T-ACGCAA--TCC----TTTGT-TA----TT-T-C-G----G-TT-GTTA----------TAT-G-CA-TAAAA---T---CCA--T---GTAAAT--TTA----------AAAACAAT---CCAATAAGTTACCT--G-TA--CG--TGTCC-AATAAGTT--TAGAAA---T-G--TG-TCCATTA--T------TAAA--C-T-T----AT---T---GG---AC-A----G--T-TATT-G---T-C----AA------CT--TATT------GGACA-GTGC-C--AG-------GT-AAACGAATAAAA---AG-G-----CA-GA--AGAT-GCGTTT-------T----CACACAA-AAG--T-----AAAT-TTT-AATCT--A-A-A-TAAC-A-CGAA---TGTC-AC-AAGTAG--AACATCTGAGACCAC------ACCG-AAA---TC-----A--------TTG--GTCGT---TAC----CAC--CAC-ATCACATTATG-AA-CTTCTCT----TTG-----------ATTCAGAAA---CAT-------CTCC-----A---------CAT---TG-CT-------C----AATTTTTTTTT--AT-GTT---------TTCCTTA---GCAT-CTTTGGA--TTCAC--T-TCATT--TTTTTC---AC---TTCCTT-G-AA-T-GATTTCACT-GAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATCTT-GG-T-TATT--T-G--CATGA-AGTTAT-GAACGGACTGCTG-ATG----ATCT-ATGTCCAG-TTTTTTCAGTAATGAGTTG-TTCAT-CTAC--CCAG-C-ATCA-TA-CAGTCTTG-TGGCTAC-AGTGG---CA-CG-TA-----GA-----GAT------ATGGT---------------CT------------T-TG-AAT---CCTGCCT-GTTCAC--A-------T--AGCT--TGGCGAC-GAT-TTT-CTGT-AAAACATG----AA-C-ACC---AA--C-GGG-------TGCATCTG-CATA--CC-GAAT-A--TCC---GAAAA--GATGTCAC-TTT--TAA-ACT-GAA---GTTA---G---GCTTC-AT-A--T-C-AGCA-TTCT--------CCTTT-----TC-T--AT---ATCAA---GAACA-TCA-C-TG----AG---AA----C-G-TTA--TC-G---GT--ATT-T-A---------CAC-----TTTC-AC-TCTC-----ATCCCTA-A---A-TTTT----G-AT-T-G--------TG-TGAGG-------AAAATG--C-T-----CTCTCCATCAGAGGA--ACT-CATGTTT-GTA---TGA-TTC--AATGG----TGAAA----G-TG---A--A-TGACTA---TTTAA--TGA---TTTCAA-G----TTT---ATAGACC----------TTTA---GA--ACTTACCTG-A--AACTG---TCC-AATA--AGT-A-A-AACA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-C--C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTG-T-GG--GA-TAT-TTA---------A-A-ACA-G--CT-T----TA---C-C---TGGCAG--A--------GG--A-CAC-TGATGAA--GACAA---------TGG---AT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--A-TTTTGAC-TTGGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATACAAA---GGA------GAT---AAT---GT-T-T-T-AA--G--------T--------A---G-G--TA-G-AA--GCCT-C---AAA--C--TG-T--A--C-A--T-T-C-T-----------G--T-------AA-G-AGA--AAG---AACTGA-T------C--TC----G------GCCC-------T--AC-G--GGC-CTCG----------A---T-C---AGTTGC----T--TT--C-T--T-----C------A-C---A----------A---A--T-GT----A--CAG------T-TGTC-GGCTT-A----TATC-CTTTACTT--AAACA------CCA-----TTGCATTGCAGGGTTGGGTA
gi|28 : GTTTAAAAC-ATGATTGT---G-ACGTAA--ACC----TT--T-TG----TT-T-G-A----A-TT-GT
gi|9 : CTTAAAAC-ATAATTGT---T-ACGCAA--TCC----TTTGT-TA----TT-TTC-G----G-TT-GTTA----------TAT-GGCA-TAAAA---T---CCA--T---GTCAAT--TTA----------AAAACAAT---CCAATAAGCTACCT--G-TA--CG--TGTCC-AATAAGTT--TAGAAA---T-G--TG-TCCATTA--T------TAAA--C-T-T----AT---T---GG---AC-A----G--T-TATT-G---T-C----AA------CT--TATT------GGACA-GTGC-C--AG-------GT-AAACGGATAAAA---AG-A-----CA-GA--AGAT-GCGTTTG------T----CAAACAG-AAG--T-----AAAT-TGT-AATTT--A-A-A-TAAC-A-TGAA---TGTC-AC-AGGTAG--AACATCTGAGACCAC------ACTGAAAA---TC-----ATTCATTATTTG--GTCGT---TACTCGTTACCACAC-ATCACATTTAG-AA-CTTCAAT----TTG-----------A--AAGACA---AATTGTTATGTTCT-----A---------TA----TG---------------AATTTCTCTTT--AT--TCAGAGGCACATTCAAAA---ACAT-CTCCAAA--TT-GC--T-TAATT--TTTTTTATGAT---TTCCTT-ccatactatag
gi|20 : CTCAAAAC-ATTTTTGT---T-ACGTTA--TCT----TTTGT-TA----TT-T-TAG----G-CT-TTTA----------TAT-A-GA-CGAGAG--T---CCAGCC---GTA--T--TTA----------AAA------------T--GTTACCT--A-TA--GG--TGTatcagcatcttctgattcacatttcattttttcacttcctggaatgatttcactaattttcacaagctgggcattttgggttcttttgtatgaatggactgccgatgatctatgtccagtttttcagtaatgagttgttcatctactccagcatcgtacagtcttgtggctgcagtggcacgtagagaatggtttgtaaaatggcatttgaatcctgcctgttcacatagctcggcgacggttttctgtaaaacatgaacacaacgggtgcatctgcataccaggatgatgatgtacta
gi|13 : tgtgaacatttaaatcccTTATAAC-ATAATTAT---T-ATGCAA--TCC----TTTGT-TAT---TT-T-T-G----GTTT-GTTG-----------AT-A-GA-TAAAA---T---CCA--T---TTAAAT--
gi|25 : attTTAAAAC-ATAATTGT---T-ACGCAA--TCC----TTTAT-------TT-T-C-G----G-TT-GTTA----------TATAG-CA-TATAA---T---CCaagtaggatagaagcctcaaactatacattctgtaagagaaagaactgatctcggccctacgggcttcgatcagttctttctctcacagaatgtaccgttttcggcttatatcctttactgaaaataaatgcattaaagttaccaagatgcgttgactgcgtgata
gi|3 : gggcaTAAAAC-ATAATTGT---TGACGCAA--TCC----TTTGT-TAAT--TT-T-C-G----G-TT-GTTA----------TATAG-CA-ATAAA---T---CCA--T---GTAAAT--TTC----------AAAACAAT---CCAATAAGTT-CCT--G-TAAGCG--TGTCCCAATAAGTT--TAGAAAA--T-G--TG-TCCATTA--T------TAA---C-T-T----AT---T---GG---AC-A----G--T-TATT-G---C-------A------CT--TATT------G-ACA--TGT-C--AG-------GTTAAACGA-TAAAA---AG-G-----CAAGA--AGATTGCGTTG-------T----CAC-CAA-AAG--T-----AAAT-TTT-AATCC--T-A-A-TAAC-AACGCA---TGTCCACCAAGTA----AC-TCTGAGACCAC------ACCG-AAA----------A--------TCGACGTCGTACCCAC----CCC--CACCATCACATTATGAAA-CTTCTC-----TTG-----------ATTCAGAAC---CAT-------CTCC-----A---------CAT---TG-CTTAAAATGC----GATTTTTTTTT--AT-GTT---------TTCC-TA---GCATCCTTTGGACTTCCAC--CATCTTTCCTTTTTC---ACCTATCCCTT-GCAACT-GATCTACCTCGATCTTT-CCCTCAGCTGGG--TCTT-GC-TACATTTCT-GCTCGCGAGAGTTATGGAACGGACTGCTG-ATGGAGAATCTAATCTCCAGTTTTTTTCAGTAATGAGTTGTTTCATGCTACTTCCAGCC-ATCG-TA-CAGTTTTG-TGGCTACAAGTGG---CACCGCTT-----GA-----GAA------ATGTC---------------CT------------T-TGAAAT---CCCGCCT-GTTCACGAA-------T--AGCT--TGGTGACGGGG-TTT-CTGTAAAAACATG----AA-C-ACC---AACTC-GGG-------TG-ATCTG-CATA--CC-GAAT-ATGTCCGAAGAAAA--GATGTCACTTTT--TAA-ACT-GAA---GTTA---GC--GCTTC-AT-A--T-C-AG-A-TTCT--------CCTTC-----TC-T--AT---ATCAA---G-ACA-TCA-CATG----AG---AA----CTG-TTA--TC-G---GT--ATT-T-A---------CAC-----TTTC-AC-TCTCT----ATTCC--------------------T-T-G--------CG-TGAGA-------CAAATG--C-T-----CTCTCCATCAGAGGATCACTCCATGTTG-GTA---TGA-TTC--AATGG----TGAAA----G-TG---A--A---A-TA---TTTAA---GA---TTTCAA-AGTT-TTT---ATAGACC-----------TTA---GA--A-TTACTAA-A--AACTG---TCC--ATA--AGTAA-A-AACA-------AAA------G---AA-----C-AGCTT-C--CCAAA-GAC--GG-TTTGGTT--ATGT-T-GG--GAGTAT-TTA---------AGA-ACA-G--CT-T----T----C-C---TGGCAAGCA--------GG--A-CCT-TTATGAA--GACAA---------TGG---AT-TAATCA-G-GAA--AC-T-AA--AA-TC--T-TTTTGAC-CTGGAGGTGAT--A--GTT--AT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATACAA-----GA------GAT---AAT---GT-T-T-TAAA--G--------T--------A---G-GA-TA-G-AA--G-CT-C---AAA--C--TG-T--A--C-A--T-T-C-TG----------G--T-------AA-GAAGA--AAG---AACTGA-T---------TC----G------G-CC-------T--AC-G--GGC-CTCG----------AC--T-C---AGTT-C----T--TT--C-TC-T-----C------A-C---G----------A---A--T-GT----A--CAG------T-TTTC-GGCTT-A----TATC-CT
gi|2 : cTAAGACCATA--TGT---T-ACGCAACATCCAATCTTTGTATAAATTTT-T-C-GTGTAG-TT-GTTAACTCTGTACCTAT-A-CGCTAAGACATT---CCA--TAATGTGAATATTTATAAATGAGGCAAAA-AATTGCCCAATAA-TTACCTTTG-TA--CG--TGTCC-AATAAGTT--TAAAAACAAT-G--TG-TCCATTG--CAGTTTCTACA--C-TAT----AT---TTGAGA---ACTA----G--T-TATTAG---TAC----AAAATGACTT--TATTTATCTGAGACAAGTGC-C--AGTGTTGTCAT-ATACAGATAAA-----T-GTTTTTCA-TG--AGAT-GCGTTT-------TGTCACACACAACAAG--TTTAAGAGAT-TTTTAATCTTTATA-A-TAACTA-CGAAATTTGTCTAC-AAGTTATTAACATCAG-GACAGCCAAGCGACCG-AAAATCTC-----A--------TTG--GTCGT---TAC----CAC---AC-ATCACATTATG-AAACTTCTACATAATCG-----------ATTCAGAAAATGCAT-------CTTCTCCATA---------CATA--TAACT-------CTAAAAATTTTTTTTC--GTTGTT---------TTCCCTA---GCAT-CTTTGGG--TTCACATT-TCATT--TTTT-C---AC---TTCCTTTG-AA-TCGATTTCACT-GAT-TTTTCAC-AAGCTGGGCATCTT-GGGT-TATT--TTG--CATGA-AGTTAT-GAACGGACTGCTGTATG----ATCT-A-GTCCAG-TTTTTTCAGTAATGAGTTG-TTCAT-CTACT-CCAG-C-ATCA-TA-CAGTCTTGTTGGC-AC-AGTGGATATA-CG-TGATAGTGA-----GAA------ATGGTA--------------CT------------T-TG-TATTTCCCTGCCT-GTTCAC--A-------TTAGGCTTCTGGCGAC-GA--TTT-CTGT-AAAACATGTATAGA-C-ACC---AA--CTGAGAGAGTTATGCATCTGCCATA--CCGGAATGA--TCC---GTATACTAATGCTAC-TTTTCTAATACTAGAAAGTATTA---GGTTGCTTC-AT-ATCT-C-AGCA-TTCT--------CCTTTATTAATCTT--ATTA-GTCAATGTGAACATTCA-C-TGTGCTAG---AAACTTC-A-GTA--TC-GC--GT--ATT-T-ATGCGTACAGCAC------TTC-AC-TCTC-----ATCCCTATATATA-TTCTCTCCG-ATAT-GCTGGTAGATG-CAAAA-------AAATTGTCC-T-----TTTTCCATCAGAGGA--ACT-CATGTTT-GTATTTTGA-TTC--AATGGTTATTGAAAAGTTG-TGCGTACTA-TGACTA---TTTAAT-TGAT--TTTCAA-GT---TTT---ATAGACC-----------TTA---GA--ACTTACCTGTA--AACTACTTTCCTAATA--AGT-T-A-AACATACACACAAA------GAAGAG-----CGAGCTTCC--C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTGTT-GG--GA-TATATTATAATGCCACA-A-ACA-G--CT-TATGATG---C-CTTGTGGCAG--A--------GGATA-CAC-TTATTGA--GACAA---------TGGCGCAT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--ATTTTTGAC--TGGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATCG----CATAT-AT-TTAAATACAAA---GGA------GAT---AAT---GT-T-T-T-AA--G--------T--------A---G-GGATA-G-AA--GCCT-C---AAACCC--TGCT--A--C-AT-T-T-C-T-----------GTTT-------TA-G-AGA--AAG---TAAT---T------C--TC----GTATTCAGGCC-------T--ACTGACGGC-CTCG----------A---T-C---AGCTTCCCTTT--CT--C-T--T-----CCCTCTGA-CAG-A----------A---A--T-GTTTTGACTCAG------TATGTC-GGCT
gi|1 : aTAAGACCATA--TGT---T-ACGCAACATCCAATCTTTGTATAAATTTT-T-C-GTGTAG-TT-GTTAACTCTGTACCTAT-A-CGCTAAGACATT---CCA--TAATGTGAATATTTATAAATGAGGCAAAA-AATTGCCCAATAA-TTACCTTTG-TA--CG--TGTCC-AATAAGTT--TAAAAACAAT-G--TG-TCCATTG--CAGTTTCTACA--C-TAT----AT---TTGAGA---ACTA----G--T-TATTAG---TAC----AAAATGACTT--TATTTATCTGAGACAAGTGC-C--AGTGTTGTCAT-ATACAGATAAA-----T-GTTTTTCA-TG--AGAT-GCGTTT-------TGTCACACACAACAAG--TTTAAGAGAT-TTTTAATCTTTATA-A-TAACTA-CGAAATTTGTCTAC-AAGTTATTAACATCAG-GACAGCCAAGCGACCG-AAAATCTC-----A--------TTG--GTCGT---TAC----CAC---AC-ATCACATTATG-AAACTTCTACATAATCG-----------ATTCAGAAAATGCAT-------CTTCTCCATA---------CATA--TAACT-------CTAAAAATTTTTTTTC--GTTGTT---------TTCCCTA---GCAT-CTTTGGG--TTCACATT-TCATT--TTTT-C---AC---TTCCTTTG-AA-TCGATTTCACT-GAT-TTTTCAC-AAGCTGGGCATCTT-GGGT-TATT--TTG--CATGA-AGTTAT-GAACGGACTGCTGTATG----ATCT-A-GTCCAG-TTTTTTCAGTAATGAGTTG-TTCAT-CTACT-CCAG-C-ATCA-TA-CAGTCTTGTTGGC-AC-AGTGGATATA-CG-TGATAGTGA-----GAA------ATGGTA--------------CT------------T-TG-TATTTCCCTGCCT-GTTCAC--A-------TTAGGCTTCTGGCGAC-GA--TTT-CTGT-AAAACATGTATAGA-C-ACC---AA--CTGAGAGAGTTATGCATCTGCCATA--CCGGAATGA--TCC---GTATACTAATGCTAC-TTTTCTAATACTAGAAAGTATTA---GGTTGCTTC-AT-ATCT-C-AGCA-TTCT--------CCTTTATTAATCTT--ATTA-GTCAATGTGAACATTCA-C-TGTGCTAG---AAACTTC-A-GTA--TC-GC--GT--ATT-T-ATGCGTACAGCAC------TTC-AC-TCTC-----ATCCCTATATATA-TTCTCTCCG-ATAT-GCTGGTAGATG-CAAAA-------AAATTGTCC-T-----TTTTCCATCAGAGGA--ACT-CATGTTT-GTATTTTGA-TTC--AATGGTTATTGAAAAGTTG-TGCGTACTA-TGACTA---TTTAAT-TGAT--TTTCAA-GT---TTT---ATAGACC-----------TTA---GA--ACTTACCTGTA--AACTACTTTCCTAATA--AGT-T-A-AACATACACACAAA------GAAGAG-----CGAGCTTCC--C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTGTT-GG--GA-TATATTATAATGCCACA-A-ACA-G--CT-TATGATG---C-CTTGTGGCAG--A--------GGATA-CAC-TTATTGA--GACAA---------TGGCGCAT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--ATTTTTGAC--TGGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATCG----CATAT-AT-TTAAATACAAA---GGA------GAT---AAT---GT-T-T-T-AA--G--------T--------A---G-GGATA-G-AA--GCCT-C---AAACCC--TGCT--A--C-AT-T-T-C-T-----------GTTT-------TA-G-AGA--AAG---TAAT---T------C--TC----GTATTCAGGCC-------T--ACTGACGGC-CTCG----------A---T-C---AGCTTCCCTTT--CT--C-T--T-----CCCTCTGA-CAG-A----------A---A--T-GTTTTGACTCAG------TATGTC-GGCTgtgagtatccatggctacagtg
gi|10 : aTATAAC-ATAATTAT---T-ATGCAA--TCC----TTTGT-TA----TT-T-TTG----G-TTTGTTG-----------AT-A-GA-TAAAA---T---CCA--T---TTAAATAATTA----------AAAACAAT---CCAATAAGTTACCT--G-TA--CGCATGTCC--ACAAATT--TAGAAA---T-AGTTGTTCCATTAGTT------TAAGATCGT-T----ATCTCT---GA---GT-ACCACG--TCTATT-GTGCT-C----AA------CTAGT-TT------AGACA-GTGC-CTTAG-------GT-AAAGGTATATAA---AGTA-----CA-GATTAGAT-GCATTTTAGGTTGT----CTC-CAA-CAGATT-----ACATATTT-AATCT--A-ATATTAGC-A-TGAAT--TGTC-AA-AGGTAG--AACATCTTGAACCAC------ACTGAAAA---TCCGTCTA--------TTGGAGTTGT---TACG---CAC--CAC-AT---ACT-TG-AA-CTTCgtgagtatccatggctacagtg
gi|12 : ATTGTAAAT-GTGTAA--TCA----TTTAT-TA----TTCT-A-A----G-CT-TTGA----------TAT----A-TAAAA---TAGTCTG--C---CTACAT--TTA----------AAA---------C-----GTTACCT--G-TA--GG--TATCC-AATACGTT--GACAAT---TAA--TG-TCCATTA--T------------C-T-TTCAGAA---T---GG---AC-A----GTAT-TATT-G---C-C----AA------CA--TATTG-----GGACA-GTGC-C--AG-------GT-AAaattttgaaaagacaattcgttatgtttatttgaatttctcttgattcagaggcacattcataaacataacataactgcttaatttttttttcaatatcagcatctcatttttcacttccttgaatgatttcactgattttcacaagctgggcatcttgggttcttttgtatgaacggactgctgaagatctatgtccagtttttttcagtaatgagtt
gi|12 : ctatatttaaagAAACA-T---CTAATAA-TTACCT--GGCA--C---TGTCCCAATATGTTGGCAATAA---T-AC-TG-TCCATTC--T------GAAA--G-A-T----AA---T---GG---AC-A----T--T-AATT-G---T-C----AA------CG--TATT------GGATA-CCTA-C--AG-------GT--AACGTTTTAAATGTAG-G-----CA-GA--ttattagatgtttacaggttgcctgaaaacaagagaaaaagatgatgcatttgtttaaacataaacaaattcaattctaaat
gi|9 : ctatatttaaagattgtaaatgtgtaatcatttattattctaagctttgatatataaaatagT---CCAATAAGTTGACA--A-TA--AC--TGTCC-AATAAGTT--TAATAA---T-G--GA-CACATTT--C------TAAA--C-T-T----AT---T---GG---AC-A----C--G-TACA-G---G-T----AG------CT--TATT------GGAacaggttgcctgaaaacaagagaaaaagatgatgcatttgtttaaacataaacaaattcaattctaaat
gi|3 : cttaaaacataattgttacgcaatcctttgttattttcggttgttatatggcataaaatccatgtcaatttaaaaacaaCAATAAGTG--CA--A-TA--AC--TGTCC-AATAAGTT---AATAA---T-G--GA-CACATTT--TC-----TAAA--C-T-T----AT---T---GGGACAC-G----C--T-TACA-G-----G----AA------CT--TATT------GGAcagtgccaggtaaacggataaaaagacagaagatgcgtttgtcaaacagaagtaaattgtaatttaaataacatgaatgtcacaggtagaacatctgagaccacactgaaaatcattcattatttggtcgttactcgttaccacacatcacatttagaacttcaatttgaaagacaaattgttatgttctatatgaatttctctttattcagaggcacattcaaaaacatctccaaattgcttaattttttttatgatttccttatcagcatcttctgattcacatttcattttttcacttcctggaatgatttcactaattttcacaagctgggcattttgggttcttttgtatgaatggactgccgatgatctatgtccagtttttcagtaatgagttgttcatctactccagcatcgtacagtcttgtggctgcagtggcacgtagagaatggtttgtaaaatggcatttgaatcctgcctgttcacatagctcggcgacggttttctgtaaaacatgaacacaacgggtgcatctgcataccaggatgatgatgtacta
gi|23 : ctaaaacataattgttgacgcaatcctttgttaattttcggttgttatatagcaataaatccatgtaaatttcaaaacaaAAAAAGTTGCCT--G-TA--GG--TGTCC-AATAAGTG--GACAAT---T-AC-TG-TACATTA--T------Tacatgtcaggttaaacgataaaaaggcaagaagattgcgttgtcaccaaaagtaaattttaatcctaataacaacgcatgtccaccaagtaactctgagaccacaccgaaaatcgacgtcgtacccacccccaccatcacattatgaaacttctcttgattcagaaccatctccacattgcttaaaatgcgatttttttttatgttttcctagcatcctttggacttccaccatctttcctttttcacctatcccttgcaactgatctacctcgatctttccctcagctgggtcttgctacatttctgctcgcgagagttatggaacggactgctgatggagaatctaatctccagtttttttcagtaatgagttgtttcatgctacttccagccatcgtacagttttgtggctacaagtggcaccgcttgagaaatgtcctttgaaatcccgcctgttcacgaatagcttggtgacggggtttctgtaaaaacatgaacaccaactcgggtgatctgcataccgaatatgtccgaagaaaagatgtcactttttaaactgaagttagcgcttcatatcagattctccttctctatatcaagacatcacatgagaactgttatcggtatttacactttcactctctattccttgcgtgagacaaatgctctctccatcagaggatcactccatgttggtatgattcaatggtgaaagtgaaatatttaagatttcaaagtttttatagaccttagaattactaaaaactgtccataagtaaaaacaaaagaacagcttcccaaagacggtttggttatgttgggagtatttaagaacagctttcctggcaagcaggacctttatgaagacaatggattaatcaggaaactaaaatctttttgacctggaggtgatagttatactatccaatattaatacaagagataatgttttaaagtaggatagaagctcaaactgtacattctggtaagaagaaagaactgattcggcctacgggcctcgactcagttctttctctcacgaatgtacagttttcggcttatatcct
gi|15 : tgtactt---T-G--TT-TCTTTTG--T------TTAA--C-T-T----AT---T---GG---AC-A----G--T-Ttataacaatggagagt
gi|23 : atttttatcttttcaaaaacattatctcctttgtattgatattggatagtatcaggtaatctagttaaaatgattttatgtttcctataatccattgtcttcataagtgtcctctttcaagtaaagctgttttaaataacccaacaataaaaaccagtcttgcgaagc-TCCATTG--T------TATA--A-A-T----AA---T---GT---AC-A----G--T-AATT-G---T-C----CA------CT--TATT------GGACA-tcag
gi|2 : tgtacttaaaaagttgcctgtaggAAA--C-TGC----AA---T---GG---AC-A---------CATT-G---T-TTTTAAA------CT--TATT------GGACACGTACAA--AG-------GT-AAgagt
gi|1 : ataagaccatatgttacgcaacatccaatctttgtataaatttttcgtgtagttgttaactctgtacctatacgctaagacattccataatgtgaatatttataaatgaggcaaaaaattgcccaataaAAA--C-TGC----AA---T---GG---AC-A---------CATT-G---T-TTTTAAA------CT--TATT------GGACACGTACAA--AG-------GT-AActacactatatttgagaactagttattagtacaaaatgactttatttatctgagacaagtgccagtgttgtcatatacagataaatgtttttcatgagatgcgttttgtcacacacaacaagtttaagagatttttaatctttataataactacgaaatttgtctacaagttattaacatcaggacagccaagcgaccgaaaatctcattggtcgttaccacacatcacattatgaaacttctacataatcgattcagaaaatgcatcttctccatacatataactctaaaaattttttttcgttgttttccctagcatctttgggttcacatttcattttttcacttcctttgaatcgatttcactgatttttcacaagctgggcatcttgggttattttgcatgaagttatgaacggactgctgtatgatctagtccagttttttcagtaatgagttgttcatctactccagcatcatacagtcttgttggcacagtggatatacgtgatagtgagaaatggtactttgtatttccctgcctgttcacattaggcttctggcgacgatttctgtaaaacatgtatagacaccaactgagagagttatgcatctgccataccggaatgatccgtatactaatgctacttttctaatactagaaagtattaggttgcttcatatctcagcattctcctttattaatcttattagtcaatgtgaacattcactgtgctagaaacttcagtatcgcgtatttatgcgtacagcacttcactctcatccctatatatattctctccgatatgctggtagatgcaaaaaaattgtcctttttccatcagaggaactcatgtttgtattttgattcaatggttattgaaaagttgtgcgtactatgactatttaattgattttcaagttttatagaccttagaacttacctgtaaactactttcctaataagttaaacatacacacaaagaagagcgagcttcccaagactggtttttattgttgggatatattataatgccacaaacagcttatgatgccttgtggcagaggatacacttattgagacaatggcgcattataggaaacataaaatcatttttgactggattacctgatactatcgcatatatttaaatacaaaggagataatgttttaagtagggatagaagcctcaaaccctgctacatttctgttttagagaaagtaattctcgtattcaggcctactgacggcctcgatcagcttccctttctcttccctctgacagaaatgttttgactcagtatgtcggctgtgagtatccatggctacagtg
gi|7 : ataagaccatatgttacgcaacatccaatctttgtataaatttttcgtgtagttgttaactctgtacctatacgctaagacattccataatgtgaatatttataaatgaggcaaaaaattgcccaataaTT-G---T-T----TA------CT--TATT------GGACA-GTTT-C--AG-------GT-AActacactatatttgagaactagttattagtacaaaatgactttatttatctgagacaagtgccagtgttgtcatatacagataaatgtttttcatgagatgcgttttgtcacacacaacaagtttaagagatttttaatctttataataactacgaaatttgtctacaagttattaacatcaggacagccaagcgaccgaaaatctcattggtcgttaccacacatcacattatgaaacttctacataatcgattcagaaaatgcatcttctccatacatataactctaaaaattttttttcgttgttttccctagcatctttgggttcacatttcattttttcacttcctttgaatcgatttcactgatttttcacaagctgggcatcttgggttattttgcatgaagttatgaacggactgctgtatgatctagtccagttttttcagtaatgagttgttcatctactccagcatcatacagtcttgttggcacagtggatatacgtgatagtgagaaatggtactttgtatttccctgcctgttcacattaggcttctggcgacgatttctgtaaaacatgtatagacaccaactgagagagttatgcatctgccataccggaatgatccgtatactaatgctacttttctaatactagaaagtattaggttgcttcatatctcagcattctcctttattaatcttattagtcaatgtgaacattcactgtgctagaaacttcagtatcgcgtatttatgcgtacagcacttcactctcatccctatatatattctctccgatatgctggtagatgcaaaaaaattgtcctttttccatcagaggaactcatgtttgtattttgattcaatggttattgaaaagttgtgcgtactatgactatttaattgattttcaagttttatagaccttagaacttacctgtaaactactttcctaataagttaaacatacacacaaagaagagcgagcttcccaagactggtttttattgttgggatatattataatgccacaaacagcttatgatgccttgtggcagaggatacacttattgagacaatggcgcattataggaaacataaaatcatttttgactggattacctgatactatcgcatatatttaaatacaaaggagataatgttttaagtagggatagaagcctcaaaccctgctacatttctgttttagagaaagtaattctcgtattcaggcctactgacggcctcgatcagcttccctttctcttccctctgacagaaatgttttgactcagtatgtcggctgtgagtatccatggctacagtg
gi|15 : ggcactttggaggccttagtgatcgttttggtaaagatagtgacaagatggcagaatgtgaagagacaacaatcaatgtatgtaaaggatataagccgaaaactgtacattctgtgagagaaagaactgatcgaggcccgtagggccgagatcagttctttctcttacagaatgtacagtttgaagcttctatcctacttaaaacattatctcctttgtattaatattggatagtatcaggtaagccagttaaaatgatttatccattgtcttcataagtgtcctctcccaggtaaagctgttttgaatacttcaacaataaaaaccattcttgtgaagctgtttcttTT-G---T-TT---AA------CT--TATT------GGACA-GTTT-C--AG-------gttctaaggtctataaacattgaaatcatttaatattcattcactttcatcattgaatcatacaaacatgagttcctctgatggagagagcatttttctaacgcaatcaaaattttagggacgagagtgaaagtgtaaataccgataacgttctcagtgatgttcttgattagagaaggtgtatgctgatatgaagcctaactaaggcaagtataatcatgagttttacatgcatttgacatttaatgcaggcttatatttttgcaaacactaattctgttcactttttttatatttcaggccagaaaatggcaattgtgacgcactatactgagacaactcaaatatagtacatcatcatcctggtatgcagatgcacccgttgtgttcatgttttacagaaaaccgtcgccgagctatgtgaacaggcaggattcaaatgccattttacaaaccattctctacgtgccactgcagccacaagactgtacgatgctggagtagatgaacaactcatt
gi|29 : atttttatcttttcaaaaacattatctcctttgtattgatattggatagtatcaggtaatctagttaaaatgattttatgtttcctataatccattgtcttcataagtgtcctctttcaagtaaagctgttttaaataacccaacaataaaaaccagtcttgcgaagctgtttctt------GGACA-GTGC-C--AG-------GT-AAACATATAAAA---AG-A-----CA-GA--AGAT-GCGTTTG------T----CAAAC
gi|10 : ATT-TG-AA-TTTCTCT----T-G-----------ATTCAGAGG---CAC-------ATTC-----ATAAACATAACATAACTG-CT-------T----AATTTTTTTTTCAAT-ATC---------------A---GCAT-CT-----------------CATT--TT--TC---AC---TTCCTT-G-AA-T-GATTTCACT-GAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATCTTGGG-T-TCTT--T------TG-----TAT-GAACGGACTGCTG-AAG----ATCT-ATGTCCAGTTTTTTTCAGTAATGAGTT
gi|9 : tataacataattattatgcaatcctttgttatttttggtttgttgatagataaaatccatttaaataattaaaaacaatccaataagttacctgtacgcatgtccacaaatttagaaatagttgttccattagtttaagatcgttatctctgagtaccacgtctattgtgctcaactagtttagacagtgccttaggtaaaggtatataaagtacagattagatgcattttaggttgtctccaacagattacatatttaatctaatattagcatgaattgtcaaaggtagaacatcttgaaccacactgaaaatccgtctattggagttgttacgcaccacatacttgaacttcaattttgaaaagacaattcgttatgtttTATG-AA-TTTCTCT----TTATTCAGAGGCACATTCAAAAA---CAT-------CTCC-----A---------AAT---TG-CT-------T----AATTTTTTTT---AT-GAT---------TTCCTTATCAGCAT-CTTCTGA--TTCACATT-TCATT--TTTT-C---AC---TTCCTG-G-AA-T-GATTTCACT-AAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATTTT-GGGT-TCTT--T------TG-----TAT-GAATGGACTGCCG-ATG----ATCT-ATGTCCAG-TTTTT-CAGTAATGAGTTG-TTCAT-CTACT-CCAG-C-ATCG-TA-CAGTCTTG-TGGCTGC-AGTGG---CA-CG-TA-----GA-----GA-------ATGGT---------------TTGTAAAATGGCATT-TG-AAT---CCTGCCT-GTTCAC--A-------T--AGCT--CGGCGAC-GGT-TTT-CTGT-AAAACATG----AA-C-A-C---AA--C-GGG-------TGCATCTG-CATA--CC-
gi|22 : cttaaaacataattgttacgcaatcctttgttattttcggttgttatatggcataaaatccatgtcaatttaaaaacaatccaataagctacctgtacgtgtccaataagtttagaaatgtgtccattattaaacttattggacagttattgtcaacttattggacagtgccaggtaaacggataaaaagacagaagatgcgtttgtcaaacagaagtaaattgtaatttaaataacatgaatgtcacaggtagaacatctgagaccacactgaaaatcattcattatttggtcgttactcgttaccacacatcacatttagaacttcaatttgaaagacaaattgttatgttctaA---GCAT-CTTCTGA--TTCACATT-TCATT--TTT--C---AC---GTCCTT-G-AA-T-GTTTTCACT-GAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATCTT-Gaggatgatgatgtacta
gi|7 : AATGAGTTG-TTCAT-CTACT-CCAG-C-ATCG-TA-CAGTCTTG-TGGCTGC-AGTGG---CA-CG-TA-----GA-----GA-------ATGGT---------------TTGTAAAATGGCATT-TG-AAT---CCTGCCT-GTTCAC--A-------T--AGCT--CGGCGAC-GGT-TTT-CTGT-AAAACATG----AA-C-A-C---AA--C-GGG-------TGCATCTG-CATA--CC-
gi|6 : ggcactttggaggccttagtgatcgttttggtaaagatagtgacaagatggcagaatgtgaagagacaacaatcaatgtatgtaaaggatataagccgaaaactgtacattctgtgagagaaagaactgatcgaggcccgtagggccgagatcagttctttctcttacagaatgtacagtttgaagcttctatcctacttaaaacattatctcctttgtattaatattggatagtatcaggtaagccagttaaaatgatttatccattgtcttcataagtgtcctctcccaggtaaagctgttttgaatacttcaacaataaaaaccattcttgtgaagctgtttcttttgtttacttattggacagtttcaggtaagttctaaggtctataaacattgaaatcatttaatattcattcactttcatcattgaatcatacaaacatgagttcctctgatggagagagcatttttctaacgcaatcaaaattttagggacgagagtgaaagtgtaaataccgataacgttctcagtgatgttcttgattagagaaggtgtatgctgatatgaagcctaactaaggcaagtataatcatgagttttacatgcatttgacatttaatgcaggcttatatttttgcaaacactaattctgttcactttttttatatttcaggccagaaaatggcaattgtgacgcactatactgagacaactcaaatatagtacatcatcatcct--CCAG-CTATCGGTA-CAGTCTTG-GGGCGGC-ACGGG---CA-CG-TA-----GATGAATGGTTTGTAAATGGC---------------CT------------TGTG-AAT---CCTGCCTCGTTCAC--A-------TG-AGCT--TGGCG-C-GGTGTTC-CTGT-AAAACATG----AACC-ACC---AA--C-GGG-------T-CATCT--CATACGCC-GA------------GAGAT--GATGTTGC-TT
gi|8 : aaggatataagccgaaaactgtaattgctggtgagagaaagaactgattcgaggccgtaagggcgagagtcagttcttttcttacagaatcgtacagctttgaggcttcctatcctacttaaaaactatctctttatattatagattggatagtttcagtaatccagttcaaaatgatttttatgtgattcctatacatccattgtcgtttcctaaagtgtccactcccaaagtaaaaaactgtttataaatacctcaataataaaaacccagtcttgtgaaagctgttctttttgttcttattaattggacagtttcaggtaatttctaagggtctattaaaaactgaaagctcatttaactgtattcattcactttcaccattgaatccataaacatgagttgtccgctgatggagagacgcatttcctcacgcaatcaaatttgagatgagagtcgaaagtgtacaataccggataacgttctcctcagctgatgttcttggtcacaaagcaggagaattgctgcataatgaggcctaactagggcaagtataattcagagttttacgcatgactttgcatttaatgcaggctccgtatatttttcgccaaataactatttctcgttgcacttttgctatatttcaggggccagaaaatgggatgtgcacgctctatacctaccaccgacagagacactcaaatact-ATCG-TAACAGTCT-G-TGGCTGC-AGTGG---CA-CG-TAA----GA-----GA-------ATGGTTTGTAGTAAATGTGCCT------------T-TG-AAT---CCTGC-T-GTTCAC--ACTCATTAT--AGCT--TGGCGAC-GGT-TTTCCTGTAAAAACATGAC--AA-CAACCAAAAA--C--GG-------TGCATCTG-CATA--CC-agccatgttcaatgaacctctcctta
gi|7 : aaggatataagccgaaaactgtacattcttgagagaaagaactgatcgagcccgtaagggccgagatcagttctttctcttacaagatatgtacagtttgaggcttctatcctacttaaaacattatctccattatattaatattggatagtatcagttaattccagttaaaatgatttttatgtttccttatatatccattgtctttcctaagtgtccactcccaagttaaaactgtttaaatacctcaataataaaaacccagtctggaagctgtttcttttgtttattattgggacagtttcagtaatttctaaggtctataaaacttgaaaaattcattttaatattcatttcactttaccattgaatcatacaacatgagttccgctgatggatgaagcattttcctcaccgcaatcaaaattagggatgagagtgaaattgtaaaataccgatttaacgtctccagtgatgttctttgatacaaagcagggatgctgatatgaagcctaactaagccaagatataatatgtagtttacatggcatttgacattttaatgcaggcttttatatattttttcgcaaaaactatttctgttcacctttttctatatttcaaggccagaaaattgcaaatgtgacgcctctattacctacgagaacactcaatatcagaacatcatctgcctA---GTTA---G---GCTTC-AT-A--T-C-AGCA-TACA--------CCTTC-----TC-T--A----ATCAA---GAACA-TCA-C-TG----AG---AA----C-G-TTA--TC-G---GT--ATT-T-A---------CAC-----TTTC-AC-TCTC-----GTCCCTA-A---AATTTT----G-AT-T-G--------CG-TTAGA-------AAAATG--C-T-----CTCTCCATCAGAGGA--ACT-CATGTTT-GTA---TGA-TTC--AATGA----TGAAA----G-TG---A--A-TGAATA---TTAAA--TGA---TTTCAATG----TTT---ATAGACC----------TT-A---GA--ACTTACCTG-A--AACTG---TCC-AATA--AGT-A-A-A-CA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-CA-C--AA-GAAT-GG-TTT--TT--ATTG-T-TG--AAGTAT-TCA---------A-A-ACA-G--CT-T----TA---C-C---TGGGAG--A--------GG--A-CAC-TTATGAA--GACAA---------TGG---AT---------------------A--AA-TC--A-TTTTAAC--TGGC--T--T--A--CCT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATACAAA---GGA------GAT---AAT---GT-T-T-T-AA--G--------T--------A---G-GA-TA-G-AA--GCTT-C---AAA--C--TG-T--A--C-A--T-T-C-T-----------G--T-------AA-G-AGA--AAG---AACTGA-T------C--TC----G------GCCC-------T--AC-G--GGC-CTCG----------A---T-C---AGTT-C----T--TT--C-TC-T-----C------A-C---AG---------A---A--T-GT----A--CAG------T-TTTC-GGCTT-A----TATC-CTTTACAT--A-----------CA-----TTG-ATTG
gi|8 : ggcactttggaggccttagtgatcgttttggtaaagatagtgacaagatggcagaatgtgaagagacaaA---GTTA---G---GCTTC-AT-A--T-C-AGCA-TCC----------CTGC-----TT-T--GT---ATCAAA--GAACA-TCA-C-TG----GA---GA----C-G-TTAAATC-G---GT--ATT-TTA---------CAA-----TTTC-AC-TCTC-----ATCCCTA-A-----TTTT----G-AT-T-G--------CGGTGAGG-------AAAATG--C-T-----TCATCCATCAGCGGA--ACT-CATGTT--GTA---TGA-TTC--AATGG----T-AAA----G-TG---A--AATGAATA---TTAAAA-TGAATTTTTCAA-G----TTTT--ATAGACC----------TT-A---GA--AATTAC-TG-A--AACTG---TCCCAATA--A-T-A-A-A-CA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-C--C--A--GACT-GGGTTT--TT--ATTA-TTGA--GG-TAT-TTA---------A-A--CA-G--TT-T----TAA--C-T---TGGGAG--T--------GG--A-CAC-TTAGGAAA-GACAA---------TGG---ATATA--TAAG-GAA--ACAT-AA--AAATC--A-TTTTAAC-TGGAA--T--T--A--ACT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATATAAT---GGA------GAT---AAT---GT-T-T-T-AA--G--------T--------A---G-GA-TA-G-AA--GCCT-C---AAA--C--TG-T--A--C-A--TAT-C-TT----------G--T-------AA-G-AGA--AAG---AACTGA-T------C--TC----G------GCCC-------TT-AC-G--GGC--TCG----------A---T-C---AGTT-C----T--TT--C-TC-T-----C------A-A---G----------A---A--T-GT----A--CAG------T-TTTC-GGCTT-A----TATC-CTTaaggcaagtataatcatgagttttacatgcatttgacatttaatgcaggcttatatttttgcaaacactaattctgttcactttttttatatttcaggccagaaaatggcaattgtgacgcactatactgagacaactcaaatatagtacatcatcatcctggtatgcagatgcacccgttgtgttcatgttttacagaaaaccgtcgccgagctatgtgaacaggcaggattcaaatgccattttacaaaccattctctacgtgccactgcagccacaagactgtacgatgctggagtagatgaacaactcatt
gi|6 : A---GTTA---G---GCCTC-ATTA--TGC-AGCAATTCT--------CCTGC-----TT-T--GTG--ACCAA---GAACA-TCAGC-TG----AGGAGAA----C-G-TTA--TCCG---GT--ATTGT-A---------CAC-----TTTCGAC-TCTC-----ATCTC-A-A---A-TTT-----G-AT-T-G--------CG-TGAGG-------AAA-TG--CGT-----CTCTCCATCAGCGGACAACT-CATGTTT-ATG----GA-TTC--AATGG----TGAAA----G-TG---A--A-TGAATACAGTTAAA--TGAGC-TTTCA--G----TTTTTAATAGACC----------CTTA---GA--AATTACCTG-A--AACTG---TCC-AATT--AAT-A-AGAACA-------AAA------AG--AA-----C-AGCTT-TCAC--AA-GACTGGG-TTT--TT--ATTATT-GA--GG-TAT-TTAT--------A-A-ACA-GTTTT-T----TA---CTT---TGGGAG--T--------GG--A-CACTTTAGGAAACGACAA---------TGG---ATGTA--TA-G-GAATCACATAAA--AA-TC--A-TTTTGAA-CTGGA--T--T--A---CT-GAA--ACTATC-----CA-AT-CTAT--AATATAAA----GA------GAT---AGT----T-T-T-T-AA--G--------T--------A---G-GA-TAGG-AA--GCCT-C---AAAG-C--TG-T--A--CGA--T-T-C-T-----------G--T-------AA-G-A-A--AAG---AACTGACT------C--TC----G------CCCT-------T--AC----GGC-CTCGA---------A---T-C---AGTT-C----T--TT--C-TC-T-----C------ACC---AGC--------A---A--T--T----A--CAG------T-TTTC-GGCTT-A----TATC-CTTaagccaagatataatatgtagtttacatggcatttgacattttaatgcaggcttttatatattttttcgcaaaaactatttctgttcacctttttctatatttcaaggccagaaaattgcaaatgtgacgcctctattacctacgagaacactcaatatcagaacatcatctgcctggtatgcagatgcaccgtttttggttgttgtcatgtttttacaggaaaaccgtcgccaagctataatgagtgtgaacagcaggattcaaaggcacatttactacaaaccattctcttacgtgccactgcagccacagactgttacgat
gi|5 : A---GTTAAAGG---ACTTCCATTA--T-CCAGCACTTCTAACAATTATCTTG-----TC-TCAATGTAATCA----GAACA-TCA-C-TG----AGT--AA----C-GGTTA--TC-GTCAGTTTATT-T-A---------CACACTTTTTTC-TCATCTCGTGCAATCACCATA---A-TTTT----ACAT-TTG--------CG-TGAGACGGTTACAAACTG--C-TACCATCTCTCAAGCAGAG-A--ACTACATGTTTGGTAT--TGAGTTCAGAAT-G----TGAAA----GATGA--A--A-TGAATA---TCTAAATTGA---TTTCAG-ATGTTTTT---ATAGGACAACGTCTTGATTTATGGGAATATTTACCTG-ATTAACTGGATTCC-GATAGGAGT-ATA-ACCA-------AAACATAATGA--AATCAATC-AGCTC-A--C--AAGGACT-GG-ATT--TTCAATTG-T-AGGTGA-TAT-TTA---------A-AGACATG--TTCT----TACATC-C---TGG-AG--ATCTTTGTGAG--ACCACTTTAGGAA--GACAAATGCGTTTTTGT---AC-TA--TG-GAAAA--ACAG-AATTAA-TCATA-TTCTAACATTGGGACT--T--AGGCCTCGCA--ATTATCATATGCA-ATCAT-G--AATATACATATGTA------TGTATAAAT---GT-TGTAT-AA--GTATAGAGAT--------A---A-G--TA-T-AG--GCCTCC---AAA--C--TG-------C-A--T-TGC-TTACTAGCTCAAG--T-------AAGG-AGA--AAG---AACTGA-T------C--TC----G------G-CC-------T--AC-G--GGCTCTCG----------AT--T-C---AGTT-C----TTCTT--C-TGCT-----C------A-CCAGA----------A---AT-T-GT----A--CAG------T-T-T---GC-T-A----CGTC-CTTTACTC--Aagggcaagtataattcagagttttacgcatgactttgcatttaatgcaggctccgtatatttttcgccaaataactatttctcgttgcacttttgctatatttcaggggccagaaaatgggatgtgcacgctctatacctaccaccgacagagacactcaaatactaagcaacatcatctctcggcgtatgagatgacccgttggtggttcatgttttacaggaacaccgcgccaagctcatgtgaacgaggcaggattcacaaggccatttacaaaccattcatctacgtgcccgtgccgccccaagactgtaccgatagctggagccatgttcaatgaacctctcctta
gi|9 : ctatgatgtaaaagggaTTACCTG-G--CACTG---TCC-AATA--AGT-aggcaagtataatttaagagtttttacatggcatttgacaacttaaaagcatatgctaggcttatttattctggcataaaatctatgtttgcgctgttttccaaacttttatgctatatttttcaggctcagaacatggcaatgatgaacgcaactatcacctgagaagaacttcaaatatatacgtacaagcattggtcatcaatgtctatctggtatgcgatgaccgttggtgtccttttcttccag
gi|15 : cttaaaacataattgttacgcaatcctttgttattttcggttgttatatggcataaaatccatgtcaatttaaaaacaatccaataagctacctgtacgtgtccaataagtttagaaatgtgtccattattaaacttattggacagttattgtcaCTG-A--AACTG---TCC-AATA--AGT-T-A-AACA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-CG-C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTG-TTGG--GT-TAT-TTA---------A-A-ACA-G--CT-T----TA---C-T---TGAAAG--A--------GG--A-CAC-TTATGAA--GACAA---------TGG---AT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--A-TTTTAAC--TAGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-C--AATACAAA---GGA------GAT---AAT---GT-T-T-T-acggataaaaagacagaagatgcgtttgtcaaacagaagtaaattgtaatttaaataacatgaatgtcacaggtagaacatctgagaccacactgaaaatcattcattatttggtcgttactcgttaccacacatcacatttagaacttcaatttgaaagacaaattgttatgttctatatgaatttctctttattcagaggcacattcaaaaacatctccaaattgcttaattttttttatgatttccttatcagcatcttctgattcacatttcattttttcacttcctggaatgatttcactaattttcacaagctgggcattttgggttcttttgtatgaatggactgccgatgatctatgtccagtttttcagtaatgagttgttcatctactccagcatcgtacagtcttgtggctgcagtggcacgtagagaatggtttgtaaaatggcatttgaatcctgcctgttcacatagctcggcgacggttttctgtaaaacatgaacacaacgggtgcatctgcataccaggatgatgatgtacta
gi|13 : atttttatcttttcaA-TT--A-TTTAAA---TGGA--T--TTTA--TCT--ATCAACAAAC-----CA-AA-AA-T--AA--CAAA---GGATTGCATAAT---AATTATGT-T-A-T-AAAAG--------T--------A---G-GA-TA-G-AA--GCCT-C---AAA--C--TA-T--A--C-A--T-T-C-T-----------G--T-------AA-G-AGA--AAG---AACTGA-T------C--TC----G------GCCC-------T--AC-G--GGC-TTCG----------A---T-C---AGTT-C----T--TT--C-TC-T-----C------A-C---AG---------A---A--T-GT----A--CCG------T-TTTC-GGCTT-A----TATC-CTTTACTG--AAA-A------TAA-----ATGCATT
gi|18 : --T--T--A--TAT-GAT--G-TATC------A-AT-AT-TTGAATACA----------------C---AAT---GC-T-T-T-AA--C--------TCCATAGCAA---G-G--TA-T-TA--GCCT-G---AAA--C--TG-T--C--C-A--T-T-C-T-----------T--T-------GA-G-AGA--AAG---AACTAA-T------C--TC----G------GCCTG------T--A--G--GGC-Caaagttaccaagatgcgttgactgcgtgata
gi|16 : tttaattacatgtatttcc--T--T--A--TCT-GAT--TCCACC-----CC-AC-AT---------AAA---GAA------AAG---CAT---GT-T-T-T-AA--T--------T--------A---A-G---A-G-AAAAGCCA-C---AAA--C--TA-T--C--A-A--C-T-C-T-----------G--T-------GA-A-AGA--AAG---AACTAA---------------------------------------------------A----------A---T-T---AGTTCT----T--TT--T-C--T-----C------A-C---AG---------A---A--T-GG----A--CAG------C-GTTT-GGCCT-T----TCAC-TTTTACAT--Aaa
gi|11 : ac--A--CCT-GGG--CCTGTC-----CA-TT-TT-T--AGAACAAA---A-A------TGC---AAC---GT-T-T-T-CA--G--------T--------T---GCA--TA-T-TA--ACCT-A---AAA--T--TG-T--C--C-A--T-T-C-T-----------G--T-------GA-G-AGA--AAG---AACTAA-TATTAGCC--TTACGGG------GTCC-------T--AC-G--GGC-CTTG----------A---T-C---GATT-C----T--TT--C-TC-T-----C------A-CA--A----------A---A--T-GA----A--TAG------T-T-------TT------TATC-CTGTACTT--AAACA---------------TGCATTacaaaa
gi|5 : ggttta-T--GATGTAAA---AGG------GAT---GA----GT-A-----AA--G--------G--------A---C-G--TA-G----------C---AAA--C--TG-T--A--C-AATT-T-C-TG----------G--T-------GA-GCAGAAGAAG---AACTGA--------A--TC----GAGA---GCCCG------T--A-----GGC-CGAG----------A---T-C---AGTT-C----T--TT--C-T--C-----CTT----A-CTTGAGCTAGTAAGCA---A--T-G--------CAGT-----T-TGGA-GGCCT-ATACTTATCTCTATACTT--ATACA------ACA-----TTtaccaatgtcaataggtttcatattacatgtgtttgtaaatctctcaccaatactatttcttactttctttttaacatccaagttgt
gi|19 : ctaACAAA---AGA------TGC---ACT---AG-T-C-T-AA--G--------T--------A---G-GA-TA-T-AA--GCAC-A---AAA--C--TA-TCTATCC-A--T-T-C-T-----------G--T-------GA-GGAAA--AAG---AATTAA-T------C--AC----A------ACCT-------T--AC-G--GAC-CTTG----------A---T-C---AGTTtatacatacatatgtatattcatgattgcatatgataattgcgaggcctaagtcccaatgttagaatatgattaattctgtttttccatagtacaaaaacgcatttgtcttcctaaagtggtctcacaaagatctccaggatgtaagaacatgtctttaaatatcacctacaattgaaaatccagtccttgtgagctgattgatttcattatgttttggttatactcctatcggaatccagttaatcaggtaaatattcccataaatcaagacgttgtcctataaaaacatctgaaatcaatttagatattcatttcatctttcacattctgaactcaataccaaacatgtagttctctgcttgagagatggtagcagtttgtaaccgtctcacgcaaatgtaaaattatggtgattgcacgagatgagaaaaaagtgtgtaaataaactgacgataaccgttactcagtgatgttctgattacattgagacaagataattgttagaagtgctggataatggaagtcctttaactaggcaagtataatttaagagtttttacatggcatttgacaacttaaaagcatatgctaggcttatttattctggcataaaatctatgtttgcgctgttttccaaacttttatgctatatttttcaggctcagaacatggcaatgatgaacgcaactatcacctgagaagaacttcaaatatatacgtacaagcattggtcatcaatgtctatctggtatgcgatgaccgttggtgtccttttcttccag
gi|21 : aacgaaaacaacaCGAA---GAA------G-C---AGT---AT-G-T-A-AA--G---------------------G-A--TA-T-AA--GCCT-C---AAA--C--TG-T--A--C-
gi|14 : ggcacttgcggccgtataagggaccgccatttttaaaagatcgtatccgacagatatttgg------GAT---AAT---GT-TGT-T-GAT-G--------C--------A---T-G--TA-TTAA--GC-T-C---AAA--C--TG-C-----C-G--T-T-CCT-----------A--T-------GA-G-AGA--AAG---AACTGA-T------C--TT----A------GTCC-------T--AT-G--GCA-ATTG----------A---T-C---AGTT-C----T--TT--C-TC-T-----C------A-T---G----------A---A--T-GG----A--CGT------T-TG-A-GGCTT-A----TATC-TTTTnc
gi|7 : ttgcatgactatgaa---AAT---GTAT-G-T-AA--------------------A---G-GA-TA-T-AA--GCCG-A---AAA--C--TG-T--A--C-A--T-T-C-T-----------G--T-------GA-G-AGA--AAG---AACTGA-T------C--GA----G------GCCCG------T--A--G--GGC-CGAG----------A---T-C---AGTT-C----T--TT--C-TC-T-----T------A-C---AG---------A---A--T-GT----A--CAG------T-TTGA-AGCTT-C----TATC-C--TACTT--AAAatatataaaggttgtgattccaacgatgacattattcaatgatggaccaacagttttgtgtattgcacatgcattgtttgatctgaagagaa
gi|11 : ggcactttggaggccttagtgatcgttttggtaaagatagtgacaagatggcagaatgtgaagagacaacaatcAT---GT-T-T---AA--G--------T--------ACA-G-G---A-T-AA-----------AAA--C--TA-T--T--C-A--T-T-T-T-----------G--T-------GA-G-AGA--AAG---AATCGA-T------C--AA----G------GCCCG------T--A--G--GAC-CCCGTAAGGCTAATA---T-T---AGTT-C----T--TT--C-TC-T-----C------A-C---AG---------A---A--T-GG----A--CAA------T-TTTA-GGTTA-A----TATG-C--AACTG--AAA-A-------CG-----TTGCATTacattatctcctttgtattaatattggatagtatcaggtaagccagttaaaatgatttatccattgtcttcataagtgtcctctcccaggtaaagctgttttgaatacttcaacaataaaaaccattcttgtgaagctgtttcttttgtttacttattggacagtttcaggtaagttctaaggtctataaacattgaaatcatttaatattcattcactttcatcattgaatcatacaaacatgagttcctctgatggagagagcatttttctaacgcaatcaaaattttagggacgagagtgaaagtgtaaataccgataacgttctcagtgatgttcttgattagagaaggtgtatgctgatatgaagcctaactaaggcaagtataatcatgagttttacatgcatttgacatttaatgcaggcttatatttttgcaaacactaattctgttcactttttttatatttcaggccagaaaatggcaattgtgacgcactatactgagacaactcaaatatagtacatcatcatcctggtatgcagatgcacccgttgtgttcatgttttacagaaaaccgtcgccgagctatgtgaacaggcaggattcaaatgccattttacaaaccattctctacgtgccactgcagccacaagactgtacgatgctggagtagatgaacaactcatt
gi|13 : ggtttaacctgggcctgtccatttttagaacaaaT---AT-T-T-T-CA--G--------T--------AAAGG-A--TA-T-AA--GCCG-A---AAA--C--GG-T--A--C-A--T-T-C-T-----------G--T-------GA-G-AGA--AAG---AACTGA-T------C--GA----A------GCCCG------T--A--G--GGC-CGAG----------A---T-C---AGTT-C----T--TT--C-TC-T-----T------A-C---AG---------A---A--T-GT----A--TAG------T-TTGA-GGCTT-C----TATC-C--TACTT--gcatttaccaatgtcaataggtttcatattacatgtgtttgtaaatctctcaccaatactatttcttactttctttttaacatccaagttgt
gi|27 : attatttaaatggattttatctatcaacaaaccaaaaataacaaaggattgcataataattatgttataa-T-T-AT--G--------T--------A---AAG--TA-A-AA--G--T-CGAAAAA--C--TG-T--C--C-A--T-T-T-T-----------G--T-------GC-G-AGA--AAG---AACTGA-T------aatgcattaaagttaccaagatgcgttgactgcgtgata
gi|14 : --------A---G-A--TA-T-AA--GCCT-C---AAA--C---G-T--C--C-A--T-T-C-------------A--T-------GA-G-AGA--AAG---AACTGA-T------CAATT-----------GCCA-------T--A--G--GAC-TAAG----------A---T-C---AGTT-C----T--TT--C-TC-T-----C------A-T---AGG--------A---A--C-G-----G--CAG------T-T-TG-AGCTT-A----a
gi|16 : ttgcatgactatgaaaaa--------A---A-G--TG-A-AA--GGC--C---AAA--CGCTG-T--C--C-A--T-T-C-T-----------G--T-------GA-G-AAA--AAG---AACTAA-T------T---------------------------------------------------------T-T---AGTT-C----T--TT--CTT--T-----C------A-C---A----------G---AGTT-G-----A--TAGT-----T-TGT--GGCTT------T-TC-TCTTAATT--AAAatacatgcatcaacaacattatcatatataaaggttgtgattccaacgatgacattattcaatgatggaccaacagttttgtgtattgcacatgcattgtttgatctgaagagaa
gi|3 : actatgtaa---G-A--TA-T-AA--GCCG-A---AAA--C--TG-T--A--C-A--T-T-C-------------G--T-------GA-G-AGA--AAG---AACTGAGT------C--GA----G------GCCCG------T--A-----GGC---CGA---------A---T-C---AGTT-C----T--TT--C-T--T-----CTT----A-CCA-G----------A---A--T-GT----A--CAG------T-T-TG-AGCTT-C----TATC-C--TACTTTAAAACA------TTATCTC-TTGTATT--AATATTGGATAacatgcttttctttatgtggggtggaatcagataaacaaaa
gi|8 : ctaaaacataattgttgacgcaatcctttgttaattttcggttgttatatagcaataaatccatgtaaatttcaaaacaatccaataagttcctgtaagcgtgtcccaataagtttagaaaatgtgtccattattaacttattggacagttattgcacttattgacatgtcaggttaaacgataaaaaggcaagaagattgcgttgtcaccaaaagtaaattttaatcctaataacaacgcatgtccaccaagtaactctgagaccacaccgaaaatcgacgtcgtacccacccccaccatcacattatgaaacttctcttgattcagaaccatctccacattgcttaaaatgcgatttttttttatgttttcctagcatcctttggacttccaccatctttcctttttcacctatcccttgcaactgatctacctcgatctttccctcagctgggtcttgctacatttctgctcgcgagagttatggaacggactgctgatggagaatctaatctccagtttttttcagtaatgagttgtttcatgctacttccagccatcgtacagttttgtggctacaagtggcaccgcttgagaaatgtcctttgaaatcccgcctgttcacgaatagcttggtgacggggtttctgtaaaaacatgaacaccaactcgggtgatctgcataccgaatatgtccgaagaaaagatgtcactttttaaactgaagttagcgcttcatatcagattctccttctctatatcaagacatcacatgagaactgttatcggtatttacactttcactctctattccttgcgtgagacaaatgctctctccatcagaggatcactccatgttggtatgattcaatggtgaaagtgaaatatttaagatttcaaagtttttatagaccttagaattactaaaaactgtccataagtaaaaacaaaagaacagcttcccaaagacggtttggttatgttgggagtatttaagaacagctttcctggcaagcaggacctttatgaagacaatggattaatcaggaaactaaaatctttttgacctggaggtgatagttatac---G-A--TA-T-AA--GCCG-A---AAA--C--TG-T--A--C-A--T-T-C-T--------------T-------GA-G-AGA--AAG---AACTGA-T------C--GA----G------CCCG-------T--AA-G--GGC-CGAG----------A---T-C---AGTT-C----T--TT--C-TC-T-----T------A-C---A----------AGATA--T-GT----A--CAG------T-TTGA-GGCTT-C----TATC-C--TACTTA-AAACATTATCTCCA-----TTATATT--AATATTGGATAct
gi|6 : aag---G-A--TA-T-AA--GCCG-A---AAA--C--TG-T--A----A--T-TGC-T-----------GG-T-------GA-G-AGA--AAG---AACTGA-T---------TCGA--G------GCCG-------T--AA-G--GG----CG----------AGAGT-C---AGTTCT----T--TT--C-T--T------------A-C---AG---------A---A--TCGT----A--CAGCT----T-TG-A-GGCTTCC----TATC-C--TACTT--AAAAA------CTATCTCTTTATATTATA-GATTGGATAgtatcagttaattccagttaaaatgatttttatgtttccttatatatccattgtctttcctaagtgtccactcccaagttaaaactgtttaaatacctcaataataaaaacccagtctggaagctgtttcttttgtttattattgggacagtttcagtaatttctaaggtctataaaacttgaaaaattcattttaatattcatttcactttaccattgaatcatacaacatgagttccgctgatggatgaagcattttcctcaccgcaatcaaaattagggatgagagtgaaattgtaaaataccgatttaacgtctccagtgatgttctttgatacaaagcagggatgctgatatgaagcctaactaagccaagatataatatgtagtttacatggcatttgacattttaatgcaggcttttatatattttttcgcaaaaactatttctgttcacctttttctatatttcaaggccagaaaattgcaaatgtgacgcctctattacctacgagaacactcaatatcagaacatcatctgcctggtatgcagatgcaccgtttttggttgttgtcatgtttttacaggaaaaccgtcgccaagctataatgagtgtgaacagcaggattcaaaggcacatttactacaaaccattctcttacgtgccactgcagccacagactgttacgat
gi|17 : aag-AA--GACC-G---AAAT-C--TG-C--C--C-A--T-T-C-T-----------G--T-------GA-G-AGA--AAG---AATTCA-G------C--TC----gtttcagtaatccagttcaaaatgatttttatgtgattcctatacatccattgtcgtttcctaaagtgtccactcccaaagtaaaaaactgtttataaatacctcaataataaaaacccagtcttgtgaaagctgttctttttgttcttattaattggacagtttcaggtaatttctaagggtctattaaaaactgaaagctcatttaactgtattcattcactttcaccattgaatccataaacatgagttgtccgctgatggagagacgcatttcctcacgcaatcaaatttgagatgagagtcgaaagtgtacaataccggataacgttctcctcagctgatgttcttggtcacaaagcaggagaattgctgcataatgaggcctaactagggcaagtataattcagagttttacgcatgactttgcatttaatgcaggctccgtatatttttcgccaaataactatttctcgttgcacttttgctatatttcaggggccagaaaatgggatgtgcacgctctatacctaccaccgacagagacactcaaatactaagcaacatcatctctcggcgtatgagatgacccgttggtggttcatgttttacaggaacaccgcgccaagctcatgtgaacgaggcaggattcacaaggccatttacaaaccattcatctacgtgcccgtgccgccccaagactgtaccgatagctggagccatgttcaatgaacctctcctta
gi|2 : catcactacatgtatgtacaggagaT-C---AAA-----------A--C-A--T-TTC-T-----------G--TCAGAGGGAA-G-AGA--AAGGGAAGCTGA-T------C--GA----G------GCCG-------TCAGT-A--GGC-CTGA----------A---TACGAGAATTAC----T--TT--C-T--CTAAAAC------A-G---A----------A---A--T-GT----AG-CAGGGT---T-TG-A-GGCTT-C----TATC-C-CTACTT--AAAtatcgtatcaagccagctaaagtcaagtacatgtactttttccagtacaacaactctggagtttgaa
gi|1 : ataagaccatatgttacgcaacatccaatctttgtataaatttttcgtgtagttgttaactctgtacctatacgctaagacattccataatgtgaatatttataaatgaggcaaaaaattgcccaataattacctttgtacgtgtccaataagtttaaaaacaatgtgtccattgcagtttctacactatatttgagaactagttattagtacaaaatgactttatttatctgagacaagtgccagtgttgtcatatacagataaatgtttttcatgagatgcgttttgtcacacacaacaagtttaagagatttttaatctttataataactacgaaatttgtctacaagttattaacatcaggacagccaagcgaccgaaaatctcattggtcgttaccacacatcacattatgaaacttctacataatcgattcagaaaatgcatcttctccatacatataactctaaaaattttttttcgttgttttccctagcatctttgggttcacatttcattttttcacttcctttgaatcgatttcactgatttttcacaagctgggcatcttgggttattttgcatgaagttatgaacggactgctgtatgatctagtccagttttttcagtaatgagttgttcatctactccagcatcatacagtcttgttggcacagtggatatacgtgatagtgagaaatggtactttgtatttccctgcctgttcacattaggcttctggcgacgatttctgtaaaacatgtatagacaccaactgagagagttatgcatctgccataccggaatgatccgtatactaatgctacttttctaatactagaaagtattaggttgcttcatatctcagcattctcctttattaatcttattagtcaatgtgaacattcactgtgctagaaacttcagtatcgcgtatttatgcgtacagcacttcactctcatccctatatatattctctccgatatgctggtagatgcaaaaaaattgtcctttttccatcagaggaactcatgtttgtattttgattcaatggttattgaaaagttgtgcgtactatgactatttaattgattttcaagttttatagaccttagaacttacctgtaaactactttcctaataagttaaacatacacacaaagaagagcgagcttcccaagactggtttttattgttgggatatattataatgccacaaacagcttatgatgccttgtggcagaggatacacttattgagacaatggcgcattataggaaacataaaatcatttttgactggattacctgatactatcgcatatatttaaatacaaaggagataatgtT-C---AAA-----------A--C-A--T-TTC-T-----------G--TCAGAGGGAA-G-AGA--AAGGGAAGCTGA-T------C--GA----G------GCCG-------TCAGT-A--GGC-CTGA----------A---TACGAGAATTAC----T--TT--C-T--CTAAAAC------A-G---A----------A---A--T-GT----AG-CAGGGT---T-TG-A-GGCTT-C----TATC-C-CTACTT--AAActcagtatgtcggctgtgagtatccatggctacagtg
gi|30 : ataagaccatatgttacgcaacatccaatctttgtataaatttttcgtgtagttgttaactctgtacctatacgctaagacattccataatgtgaatatttataaatgaggcaaaaaattgcccaataattacctttgtacgtgtccaataagtttaaaaacaatgtgtccattgcagtttctacactatatttgagaactagttattagtacaaaatgactttatttatctgagacaagtgccagtgttgtcatatacagataaatgtttttcatgagatgcgttttgtcacacacaacaagtttaagagatttttaatctttataataactacgaaatttgtctacaagttattaacatcaggacagccaagcgaccgaaaatctcattggtcgttaccacacatcacattatgaaacttctacataatcgattcagaaaatgcatcttctccatacatataactctaaaaattttttttcgttgttttccctagcatctttgggttcacatttcattttttcacttcctttgaatcgatttcactgatttttcacaagctgggcatcttgggttattttgcatgaagttatgaacggactgctgtatgatctagtccagttttttcagtaatgagttgttcatctactccagcatcatacagtcttgttggcacagtggatatacgtgatagtgagaaatggtactttgtatttccctgcctgttcacattaggcttctggcgacgatttctgtaaaacatgtatagacaccaactgagagagttatgcatctgccataccggaatgatccgtatactaatgctacttttctaatactagaaagtattaggttgcttcatatctcagcattctcctttattaatcttattagtcaatgtgaacattcactgtgctagaaacttcagtatcgcgtatttatgcgtacagcacttcactctcatccctatatatattctctccgatatgctggtagatgcaaaaaaattgtcctttttccatcagaggaactcatgtttgtattttgattcaatggttattgaaaagttgtgcgtactatgactatttaattgattttcaagttttatagaccttagaacttacctgtaaactactttcctaataagttaaacatacacacaaagaagagcgagcttcccaagactggtttttattgttgggatatattataatgccacaaacagcttatgatgccttgtggcagaggatacacttattgagacaatggcgcattataggaaacataaaatcatttttgactggattacctgatactatcgcatatatttaaatacaaaggagataatgt--C--TG-T--C--C-T--T-T-C-T-----------G--T-------AA-G-AGA--AAG---AACTGA-T------C--GA----G------GCCctcagtatgtcggctgtgagtatccatggctacagtg
gi|26 : -A--T-T-C-T-----------G--T-------A--G-AGA--AAG---AACCGA-T------A--TC----G------GACTTGCAATGT--AC-G--TGC-CTCG----------A---C-C---AGTT
gi|19 : ---AACTGA-T------C--AA----G------GTCCG------T--A--A--GGT-TGTG----------A---T-T---AATT-C----T--TTTTC-C--T-----C------A-C---AG---------A---A--T-GG----A--TAGATAGTTT-TGT---GCTT-A----TATC-C--TACTT--AG--A------CTA-----GTGCAT
gi|18 : aacgaaaacaacaacaaaag--TT----G------GCCC-------T--AC-A--GGC-CGAG----------A---T-T---AGTT-C----T--TT--C-TC-T-----C------A-A---AG---------A---A--T-GG----A--CAG------T-T-TCAGGCTA-A----TA-C-CTT
gi|30 : tttaattacatgtatttccttatatgatgtatcaatatttgaatacacaatgctttaactccatagc--GGC-CTCG----------A---T-C---AGTT-C----T--TT--C-TC-T-----T------A-C---AG---------A---A--A-GG----A--CAG------
gi|27 : ----------A---T-C---AGTT-C----T--TT--C-T--CG----C------A-CA--A----------A---A--T-GG----A--CAGT-----T-TTTC-GACTT-T----TA---CTTTACAT--AA
gi|21 : -GT----A--CAG------T-TTGA-GGCTT-A----TATC-CTTTACAT--Aa
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): GATGACATTAGTGATGAAACAGCAGTTTTGTGTATTCATAATATGCATTATTTGATGTGAAGGGA
Alignments
lowQualScore : 11 1111 2222 22222222 3333333333 11111 111 111 4444444444444444 111 11 22222222 3333333333333333333333333333333333 111111 1 11111 222222 333333 3333333 3333333 444444444444 1 33333333 11111 1 333 1 333 555555 1 333333333333333 11 111 222222222 1 444444444444444444 3333 77777777777777777777777777777777777777 222222222222222222 1 1 1 111 22222222 2 1111 11 1 111111 1 1 111 8888888888888888888888888888888888888888888 11 111 2222222222 111 11 2222 111 2222222 3333333333 111 22222 222 111 1 111 222 11 111 33333333333333 222 1 222222222222222 1 111 444444444 111111 11111 33333333333333333333333333333333 1111111 22222222 11 2222 2222 2222 222222 22 222 1111 33333333333 222 1 2222222 111111 111111111 1111 555555555 222222222222222 11111111 11 11 111111111 111 11 11 11111 1111 22222222222222222222222222 11 11111111111111 11111111111111111 111 222222 22222
lowQualScore : 8 3 777 4 11 7777 8 2222 4 00000000 4 5555555555 4 66666 4 555 66 66 777 6 0000000000000000 777 1 22 66 66 5 77 11111111 4 9999999999999999999999999999999999 111111 66 5 0 33333 888888 0 66 000000 8 66 2222222 5 6 5 1111111 5 77 5 555555555555 5 5 11111111 44444 9 333 8 6 000 9 0 777777 5 000000000000000 88 111 444444444 6 6 0 5 1 555555555555555555 2222 66666666666666666666666666666666666666 555555555555555555 8 888 5 22 66 77 8 0 888 888 0 5 5 1 5 1 5 5 111 77777777 6 3 4444 44 5 5 5 666666 5 0 5 5 0 6 5 777 5 6666666666666666666666666666666666666666666 5 00 5 5 777 5 66 6666666666 555 66 4 4 4 5555 4 4 1 777 666 8888888 1 8 66 0000000000 77 7 1 333 6 22222 222 444 1 555 000 0 4 11 4 222 66 4 33333333333333 222 0 5 5 555555555555555 0 66 5 888 66 5 5 000000000 555555 5 5 77777 77777777777777777777777777777777 77 6666666 5 11111111 66 66 5 5 11 3333 5 66 1111 1111 5 777777 5 888 1 11 555 5555 66 33333333333 3 888 66 4 8 66 333 3 66 99 4 4 8888888 222222 444444444 8 8888 66 4 4 4 66 66 4 4 8 000000000 4 66 4 777777777777777 1 66666666 66 22 8 00 777777777 555 8 66 4 4 66 4 66 4 66 8 4 33 22 44 44 555 3 44 33333 6 3 3333 444 777777 444 444 5 2 33 66666666666666666666666666 666 2 00 8888888 2 5 2 2 5 55555555555555 4 2 5 0 2 777777 5555 66666666666666666 7777 2 2 5 000 33 2 6 3 44 1 2 5 5 0 111111 2 33333 6
lowQualScore : . . ... . .. .... . .... . ........ . .......... . ..... . ... .. .. ... . ................ ... . .. .. .. . .. ........ . .................................. ...... .. . . ..... ...... . .. ...... . .. ....... . . . ....... . .. . ............ . . ........ ..... . ... . . ... . . ...... . ............... .. ... ......... . . . . . .................. .... ...................................... .................. . ... . .. .. .. . . ... ... . . . . . . . . ... ........ . . .... .. . . . ...... . . . . . . . ... . ........................................... . .. . . ... . .. .......... ... .. . . . .... . . . ... ... ....... . . .. .......... .. . . ... . ..... ... ... . ... ... . . .. . ... .. . .............. ... . . . ............... . .. . ... .. . . ......... ...... . . ..... ................................ .. ....... . ........ .. .. . . .. .... . .. .... .... . ...... . ... . .. ... .... .. ........... . ... .. . . .. ... . .. .. . . ....... ...... ......... . .... .. . . . .. .. . . . ......... . .. . ............... . ........ .. .. . .. ......... ... . .. . . .. . .. . .. . . .. .. .. .. ... . .. ..... . . .... ... ...... ... ... . . .. .......................... ... . .. ....... . . . . . .............. . . . . . ...... .... ................. .... . . . ... .. . . . .. . . . . . ...... . ..... .
lowQualScore : 9 4 000 0 00 0000 0 5555 0 44444444 0 0000000000 0 44444 0 666 11 99 555 9 8888888888888888 555 1 22 11 11 0 66 44444444 4 3333333333333333333333333333333333 666666 99 0 0 55555 888888 4 99 000000 9 99 5555555 0 6 0 1111111 7 99 7 333333333333 0 0 88888888 77777 8 777 0 7 222 8 7 333333 5 555555555555555 33 777 333333333 7 5 0 0 0 999999999999999999 1111 77777777777777777777777777777777777777 000000000000000000 9 888 0 55 99 00 1 1 888 888 0 7 7 4 7 4 7 7 777 77777777 7 7 2222 00 5 7 7 444444 7 0 0 0 0 2 0 555 0 2222222222222222222222222222222222222222222 0 44 0 0 555 0 99 0000000000 888 22 4 4 4 0000 4 4 1 888 111 9999999 1 9 11 6666666666 33 5 0 888 7 00000 555 222 7 666 000 8 0 00 0 222 11 4 66666666666666 555 0 0 0 000000000000000 0 99 0 888 99 0 0 000000000 888888 0 0 55555 88888888888888888888888888888888 00 2222222 9 22222222 99 99 0 0 22 2222 0 99 2222 2222 0 222222 0 888 0 99 666 8888 99 11111111111 2 888 99 5 9 11 333 3 11 66 4 4 9999999 888888 111111111 9 4444 11 4 4 4 11 11 4 4 9 888888888 4 11 4 222222222222222 0 11111111 11 22 9 66 888888888 666 9 11 4 4 11 4 11 4 11 9 0 55 55 66 22 666 1 22 88888 2 1 5555 777 222222 444 444 0 5 44 33333333333333333333333333 000 7 00 6666666 5 3 7 7 3 44444444444444 1 7 3 9 7 777777 7777 88888888888888888 2222 5 5 0 666 77 7 2 1 22 4 9 1 4 8 555555 5 88888 0
consensus : NNGCTTAAAAC-ATAATTGT---T-ACGCAA--TCC----TTTGT-TA----TT-T-C-G----GTT-GTTA----------TAT-A-C-A-T-AAAA---T--CCA--T---GTNAATA-TT----AA------AAACAAT---CCAATAAGTTACCT--GTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTA-GAAA---T-G--TG-TCCATT--AT------TAAA--C-T-T----AT---T---GGAC-A----G--T-TATT-G---T-CAA------CTTA--TT------GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAACGGATAAAAAG-G-----CA-GA--AGAT-GCGTTT-------T----CACACAACAAGTTTAAGAGATTTTTAATCTTTATAATAAC-ACGAA--TTGTCTAC-AAGTAG--AACATCTGAGACCGC------ACCGAAAA---ATC--TCA----TTG--GTCGT---TAC----CAC--CAC-ATCACATTATG-AA-CTTCTCT----TCG-----------ATTCAGAAA-TG-CATCTCC-----A---------CATA--T-GCT-------C----AATTTTTTTTT--A-TGTT---------TTCCCTA---GCATC-TTCGGATT--CAC-ATTTCATTTTTTTC---ACTT---CC-TTG-AA-T-GATTTCACT-GA-T-TTTCAC-AAGCTGGGCATCTTGGGTTA---TTTTGC--ATGA-AGTTATG-AACGGACTGCTG-ATG----ATCTA-TGTCCAGTTTTTTTCAGTAATGAGTTGTT-CAT-CTA------CT-CCAGC-ATCG-TA-CAGTCTTG-TGGCTGCA-GTGG---CAC-GTA-A----GA---------G---------AA-------------ATG-GC-CTT-TGAA-T---CCTGCCT-GTTCAC--A-------T--AGCT--TGGCGACGGT-TTT-CTGT-AAAA-CATG----AA-C-ACC---AAC--GGG-------TGCATCTG-CATA--CCG----GA---ATG-ATCCGNANACT-GA-TG-C---TACTTTT-C-TA-ATACTAGAA---GTTAG---GCTTCAT-A--T-CAGCA---TTCT--CCT-TC-----TC-TAT---ATCAA---GAACA-TCA-C-TG----AG---AA----C-GTTA--T-CG---G--TATT-T-A---------CAC-----TTTC-AC-TCTC-----ATCCCTA-A---ATTTT----G-A-T-TGC--------G-CGAGA-------AAAATG--C-----TCTCTCCATCAGAGG--A--ACT-C-ATGTTT-GTA--TTGA-TTC--AATGG----TGAAA----G-TG---A--A-TGAATA---TTTAA--TGA---TTTCAAG---TTTT--ATAGACC----------TTTA---GA--ACTTACCTG-A--AACTG---TCC-AATA--AGTA-A-AA-CA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-C--C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTGTTGG-GA-TAT-TTA---------AAACA-G--CT-T----TA---C-C---TGGNA--------G--AGG--ACAC-TTATGAA--GACAA---------TGG---AT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--A-TTTTG-AC--TGGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA--G--------T--------AG-GA-TA-G-AAGCCT-CAAA--CTG-T--A--C-A-T-T-C-T-----------G--TGA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCC-------TAC-G--GGC-CTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTCA-CAG-AA--TGTACAG-TTTTCGGCTTATATCCTTTACNTAAACACCATTGCATTG-AGGGTTGGGTA
Reference ( family-455 ) : NNGCTTAAAAC-ATAATTGT---T-ACGCAA--TCC----TTTGT-TA----TT-T-C-G----GTT-GTTA----------TAT-A-C-A-T-AAAA---T--CCA--T---GTAAATA-TT----AA------AAACAAT---CCAATAAGTTACCT--GTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTA-AAAA---T-G--TG-TCCATT--NT------TAAA--C-T-T----AT---T---GGAC-A----G--T-TATT-G---T-CAA------CTTA--TT------GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAACGNATAAAAAG-G-----CA-GA--AGAT-GCGTTT-------T----CACACAACAAGTTTAAGAGATTTTTAATCTTTATAATAACTACGAAATTTGTCTAC-AAGTAGTTAACATCTGAGACCGCCAAGCGACCGAAAA---ATC--TCA----TTG--GTCGT---TAC----CAC--CAC-ATCACATTATG-AA-CTTCTNT----TCG-----------ATTCAGAAA----CATCTCC-----A---------CATA--T-GCT-------C----AATTTTTTTTT--A-TGTT---------TTCCCTA---GCATC-TTCGGATT--CAC-ATTTCATTTTTTTC---ACTT---CC-TTG-AA-T-GATTTCACT-GA-T-TTTCAC-AAGCTGGGCATCTTGGGTTA---TTTTGC--GTGA-AGTTATG-AACGGACTGCTGTATG----ATCTA-TGTCCAGTTTTTTTCAGTAATGAGTTGTT-CAT-CTA------CT-CCAGC-ATCG-TA-CAGTCTTG-TGGCTGCA-GTGG---CAC-GTA-A----GA---------G---------AA-------------ATG-GT-CTT-TGAA-T---CCTGCCT-GTTCAC--A-------T--AGCT--CGGCGACGGT-TTT-CTGT-AAAA-CATG----AA-C-ACC---AAC--GGG-------TGCATCTG-CATA--CC-----GA---ATG-ATCCGNANACT-GA-TG-C---TACTTTT-C-TA-ATACTAGAA---GTTAG---GCTTCAT-A--T-CAGCA---TTCT--CCT-TC-----TC-TAT---ATCAA---GAACA-TCA-C-TG----AG---AA----C-GTTA--T-CG---G--TATT-T-A---------CAC-----TTTC-AC-TCTC-----ATCCCTATA---ATTTT----G-A-T-TGC--------G-CGAGA-------AAANTG--C-----TCTCTCCATCAGAGG--A--ACT-C-ATGTTT-GTA--TTGA-TTC--AATGG----TGAAA----G-TG---A--A-TGAATA---TTNAA--TGA---TTTCAAG---TTTT--ATAGACC----------TTTA---GA--ACTTACCTG-A--AACTG---TCC-AATA--AGTA-A-AA-CA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-C--C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTGTTGG-GA-TAT-TTAT--------AAACA-G--CT-T----TA---C-C---TGGNA--------G--AGG--ACAC-TTATGAA--GACAA---------TGG---AT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--A-TTTTG-AC--TGGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA--G--------T--------AG-G--TA-N-AAGCCT-CAAA--CTG-T--A--C-A-T-T-C-T-----------G--TGA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCC-------TAC-G--GGC-CTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTCA-CAG-AA--TGTACAG-TTTTNGGCTTATATCCTTTACTTAAACACCATTGCATTG-AATATTGGATA
gi|1 : TAAGACCATA--TGT---T-ACGCAACATCCAATCTTTGTATAAATTTT-T-C-GTGTAGTT-GTTAACTCTGTACCTAT-A-C-GCT-AAGACATT--CCA--TAATGTGAATA-TTTATAAATGAGGCAAAAAATTGCCCAATAA-TTACCTTTGTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTA-AAAACAAT-G--TG-TCCATT--GCAGTTTCTACA--C-TAT----AT---TTGAGAACTA----G--T-TATTAG---TACAAAATGACTTTA--TTTATCTGAGACAAGTGCC--AGTGTTGTCAT-ATACAGATAAA--T-GTTTTTCA-TG--AGAT-GCGTTT-------TGTCACACACAACAAGTTTAAGAGATTTTTAATCTTTATAATAACTACGAAATTTGTCTAC-AAGTTATTAACATCAG-GACAGCCAAGCGACCG-AAA---ATC--TCA----TTG--GTCGT---TAC----CA---CAC-ATCACATTATGAAA-CTTCTACATAATCG-----------ATTCAGAAAATG-CATCTTCTCCATA---------CATA--TAACT-------CTAAAAATTTTTTTTC--GTTGTT---------TTCCCTA---GCATC-TTTGGGTT--CAC-ATTTCA-TTTTTTC---ACTT---CCTTTG-AA-TCGATTTCACT-GATT-TTTCAC-AAGCTGGGCATCTTGGGTTA---TTTTGC--ATGA-AGTTATG-AACGGACTGCTGTATG----ATCTA--GTCCAG-TTTTTTCAGTAATGAGTTGTT-CAT-CTA------CT-CCAGC-ATCA-TA-CAGTCTTGTTGGC-ACA-GTGGATATAC-GTG-ATAGTGA---------G---------AA-------------ATG-GTACTT-TGTA-TTTCCCTGCCT-GTTCAC--A-------TTAGGCTTCTGGCGACGA--TTT-CTGT-AAAA-CATGTATAGA-C-ACC---AACT-GAGAGAGTTATGCATCTGCCATA--CCG----GA---ATG-ATCCGTATACT-AA-TG-C---TACTTTT-C-TA-ATACTAGAAAGTATTAGGTTGCTTCAT-ATCT-CAGCA---TTCT--CCT-TTATTAATCTTATTA-GTCAATGTGAACATTCA-C-TGTGCTAG---AAACTTC-AGTA--T-CGC--G--TATT-T-ATGCGTACAGCAC------TTC-AC-TCTC-----ATCCCTATATATATTCTCTCCG-A-TATGCTGGTAGATG-CAAAA-------AAATTGTCC-----TTTTTCCATCAGAGG--A--ACT-C-ATGTTT-GTATTTTGA-TTC--AATGGTTATTGAAAAGTTG-TGCGTACTA-TGACTA---TTTAAT-TGAT--TTTCAAG---TTTT--ATAGACC-----------TTA---GA--ACTTACCTGTA--AACTACTTTCCTAATA--AGTT-A-AA-CATACACACAAA------GAAGAG-----CGAGCTTCC--C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTGTTGG-GA-TATATTATAATGCCACAAACA-G--CT-TATGATG---C-CTTGTGGCA--------G--AGGATACAC-TTATTGA--GACAA---------TGGCGCAT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--ATTTTTG-AC--TGGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATCG----CATAT-AT-TTAAATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA--G--------T--------AG-GGATA-G-AAGCCT-CAAACCCTGCT--A--C-ATT-T-C-T-----------GTTTTA-G-AGAAAGTAAT---T------CTC----GTATTCAGGCC-------TACTGACGGC-CTCG-A-TCAGCTTCCCT--TTCT-CT
gi|10 : aTATAAC-ATAATTAT---T-ATGCAA--TCC----TTTGT-TA----TT-T-TTG----GTTTGTTG-----------AT-A-G-A-T-AAAA---T--CCA--T---TTAAATAATT----AA------AAACAAT---CCAATAAGTTACCT--GTA--CGCATGTCC--ACAAATTTA-GAAA---T-AGTTGTTCCATTAGTT------TAAGATCGT-T----ATCTCT---GAGT-ACCACG--TCTATT-GTGCT-CAA------C-TAGTTT------AGACA-GTGCCTTAG-------GT-AAAGGTATATAAAGTA-----CA-GATTAGAT-GCATTTTAGGTTGT----CTC-CAACAGATT----ACATATTTAATC-TAATATTAGC-ATGAA--TTGTC-AA-AGGTAG--AACATCTTGAACCAC------ACTGAAAATCCGTC--T-A----TTGGAGTTGT---TACG---CAC--CAC-AT---ACT-TG-AA-CTTCtccctctgacagaaatgttttgactcagtatgtcggctgtgagtatccatggctacagtg
gi|10 : ATT-TG-AA-TTTCTCT----T-G-----------ATTCAGAGG----CACATTC-----ATAAACATAACATAACT-GCT-------T----AATTTTTTTTTCAA-TAT---------------CA---GCATC--------T--CA----------TTTTTC---ACTT---CC-TTG-AA-T-GATTTCACT-GA-T-TTTCAC-AAGCTGGGCATCTTGGGTTC---TTTTG-----------TATG-AACGGACTGCTG-AAG----ATCTA-TGTCCAGTTTTTTTCAGTAATGAGTTaattttgaaaagacaattcgttatgtttatttgaatttctcttgattcagaggcacattcataaacataacataactgcttaatttttttttcaatatcagcatctcatttttcacttccttgaatgatttcactgattttcacaagctgggcatcttgggttcttttgtatgaacggactgctgaagatctatgtccagtttttttcagtaatgagtt
gi|11 : tataacataattattatgcaatcctttgttatttttggtttgttgatagataaaatccatttaaataattaaaaacaatccaataagttacctgtacgcatgtccacaaatttagaaatagttgttccattagtttaagatcgttatctctgagtaccacgtctattgtgctcaactagtttagacagtgccttaggtaaaggtatataaagtacagattagatgcattttaggttgtctccaacagattacatatttaatctaatattagcatgaattgtcaaaggtagaacatcttgaaccacactgaaaatccgtctattggagttgttacgcaccacatacttgaacttcaattttgaaaagacaattcgttatgttt--A--CCT-GGG--CCTGTC-----CA-TT-TT-T--AGAACAAA---A-A------TGC---AAC---GTT-T-T--CA--G--------T--------TGCA--TA-T-TAACCT-AAAA--TTG-T--C--C-A-T-T-C-T-----------G--TGA-G-AGAAAGAACTAA-TATTAGCCTTACGGG------GTCC-------TAC-G--GGC-CTTG-A-TCGATT---CT--TTCT-CTCA-CAA-AA--TGAATAG-TTTT-------TATCCTGTACTTAAACA----TGCATT
gi|12 : ggtttaATTGTAAAT-GTGTAA--TCA----TTTAT-TA----TTCT-A-A----GCT-TTGA----------TAT-A-----T-AAAA---TAGTC---T---GCCTACA-TT----TA------AAAC-------------GTTACCT--GTA--GG--TATCC-AATACGTTGA-CAAT---TAA--TG-TCCATT--AT------------C-T-TTCAGAA---T---GGAC-A----GTAT-TATT-G---C-CAA------CATA--TTG-----GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAtaccaatgtcaataggtttcatattacatgtgtttgtaaatctctcaccaatactatttcttactttctttttaacatccaagttgt
gi|13 : ctatatttaaagTTTA-AA--TGGA--T--TTTA--TCT--ATCAACAAAC-----CA-AA-AA-T--AA--CAAA---GGATTGCATAAT---AATTATGTT-A-T--AAAAG--------T--------AG-GA-TA-G-AAGCCT-CAAA--CTA-T--A--C-A-T-T-C-T-----------G--TAA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCC-------TAC-G--GGC-TTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTCA-CAG-AA--TGTACCG-TTTTCGGCTTATATCCTTTACTGAAA-ATAAATGCATTA-AAttattagatgtttacaggttgcctgaaaacaagagaaaaagatgatgcatttgtttaaacataaacaaattcaattctaaat
gi|14 : atta------GAT---AAT---GTTGT-T--GAT-G--------C--------AT-G--TA-TTAAGC-T-CAAA--CTG-C-----C-G-T-T-CCT-----------A--TGA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTT----A------GTCC-------TAT-G--GCA-ATTG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTCA-T-G-AA--TGGAC-G-TTTGAGGCTTATATCTTTTgttaccaagatgcgttgactgcgtgata
gi|15 : ttgcatgactatgaaCTG-A--AACTG---TCC-AATA--AGTT-A-AA-CA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-CG-C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTGTTGG-GT-TAT-TTA---------AAACA-G--CT-T----TA---C-T---TGAAA--------G--AGG--ACAC-TTATGAA--GACAA---------TGG---AT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--A-TTTTA-AC--TAGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-C--AATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-TTGAA--A-----------------AG-A--TA-A-AAatatataaaggttgtgattccaacgatgacattattcaatgatggaccaacagttttgtgtattgcacatgcattgtttgatctgaagagaa
gi|16 : at--T--T--A--TCT-GAT--TCCACC-----CC-AC-AT---------AAA---GAA------AAG---CAT---GTT-T-T--AA--T--------T--------AA-GA-GA-A-AAGCCA-CAAA--CTA-T--C--A-A-C-T-C-T-----------G--TGA-A-AGAAAGAACTAA-----------------------------------------------A-A-TTAGTT---CT--TTTT-CTCA-CAG-AA--TGGACAG-CGTTTGGCCTTTCACTTTTACATA
gi|17 : acAATT---CT--TTCT-CTCA-CAG-AA--TGGGCAG-ATTTCGGTCTTTCTCCTGTACATAacaaaa
gi|18 : catcactacatg--T--T--A--TAT-GAT--G-TATC------A-AT-AT-TTGAATACA----------------C---AAT---GCT-T-T--AA--C--------TCCATAGCAAG-G--TA-T-TAGCCT-GAAA--CTG-T--C--C-A-T-T-C-T-----------T--TGA-G-AGAAAGAACTAA-T------CTC----G------GCCTG------TA--G--GGC-Ccagctctatcgtatcaagccagctaaagtcaagtacatgtactttttccagtacaacaactctggagtttgaa
gi|19 : tttaattacatgtatttccACAAA---AGA------TGC---ACT---AGT-C-T--AA--G--------T--------AG-GA-TA-T-AAGCAC-AAAA--CTA-TCTATCC-A-T-T-C-T-----------G--TGA-GGAAAAAGAATTAA-T------CAC----A------ACCT-------TAC-G--GAC-CTTG-A-TCAGTT---aa
gi|2 : aacgaaaacaacaTAAGACCATA--TGT---T-ACGCAACATCCAATCTTTGTATAAATTTT-T-C-GTGTAGTT-GTTAACTCTGTACCTAT-A-C-GCT-AAGACATT--CCA--TAATGTGAATA-TTTATAAATGAGGCAAAAAATTGCCCAATAA-TTACCTTTGTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTA-AAAACAAT-G--TG-TCCATT--GCAGTTTCTACA--C-TAT----AT---TTGAGAACTA----G--T-TATTAG---TACAAAATGACTTTA--TTTATCTGAGACAAGTGCC--AGTGTTGTCAT-ATACAGATAAA--T-GTTTTTCA-TG--AGAT-GCGTTT-------TGTCACACACAACAAGTTTAAGAGATTTTTAATCTTTATAATAACTACGAAATTTGTCTAC-AAGTTATTAACATCAG-GACAGCCAAGCGACCG-AAA---ATC--TCA----TTG--GTCGT---TAC----CA---CAC-ATCACATTATGAAA-CTTCTACATAATCG-----------ATTCAGAAAATG-CATCTTCTCCATA---------CATA--TAACT-------CTAAAAATTTTTTTTC--GTTGTT---------TTCCCTA---GCATC-TTTGGGTT--CAC-ATTTCA-TTTTTTC---ACTT---CCTTTG-AA-TCGATTTCACT-GATT-TTTCAC-AAGCTGGGCATCTTGGGTTA---TTTTGC--ATGA-AGTTATG-AACGGACTGCTGTATG----ATCTA--GTCCAG-TTTTTTCAGTAATGAGTTGTT-CAT-CTA------CT-CCAGC-ATCA-TA-CAGTCTTGTTGGC-ACA-GTGGATATAC-GTG-ATAGTGA---------G---------AA-------------ATG-GTACTT-TGTA-TTTCCCTGCCT-GTTCAC--A-------TTAGGCTTCTGGCGACGA--TTT-CTGT-AAAA-CATGTATAGA-C-ACC---AACT-GAGAGAGTTATGCATCTGCCATA--CCG----GA---ATG-ATCCGTATACT-AA-TG-C---TACTTTT-C-TA-ATACTAGAAAGTATTAGGTTGCTTCAT-ATCT-CAGCA---TTCT--CCT-TTATTAATCTTATTA-GTCAATGTGAACATTCA-C-TGTGCTAG---AAACTTC-AGTA--T-CGC--G--TATT-T-ATGCGTACAGCAC------TTC-AC-TCTC-----ATCCCTATATATATTCTCTCCG-A-TATGCTGGTAGATG-CAAAA-------AAATTGTCC-----TTTTTCCATCAGAGG--A--ACT-C-ATGTTT-GTATTTTGA-TTC--AATGGTTATTGAAAAGTTG-TGCGTACTA-TGACTA---TTTAAT-TGAT--TTTCAAG---TTTT--ATAGACC-----------TTA---GA--ACTTACCTGTA--AACTACTTTCCTAATA--AGTT-A-AA-CATACACACAAA------GAAGAG-----CGAGCTTCC--C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTGTTGG-GA-TATATTATAATGCCACAAACA-G--CT-TATGATG---C-CTTGTGGCA--------G--AGGATACAC-TTATTGA--GACAA---------TGGCGCAT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--ATTTTTG-AC--TGGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATCG----CATAT-AT-TTAAATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA--G--------T--------AG-GGATA-G-AAGCCT-CAAACCCTGCT--A--C-ATT-T-C-T-----------GTTTTA-G-AGAAAGTAAT---T------CTC----GTATTCAGGCC-------TACTGACGGC-CTCG-A-TCAGCTTCCCT--TTCT-CT
gi|20 : aCTCAAAAC-ATTTTTGT---T-ACGTTA--TCT----TTTGT-TA----TT-T-TAG----GCT-TTTA----------TAT-A-G-A-CGAGAG---T--CCAGCC---GT--AT--TT----AA----------AAT----------GTTACCT--ATA--GG--TGTtccctctgacagaaatgttttgactcagtatgtcggctgtgagtatccatggctacagtg
gi|21 : tgtgaacatttaaatcccCGAA---GAA------G-C---AGT---ATG-T-A--AA--G------------------G-A--TA-T-AAGCCT-CAAA--CTG-T--A--C-
gi|21 : ggcacttgcggccgtataagggaccgccatttttaaaagatcgtatccgacagatatttggGTACAG-TTTGAGGCTTATATCCTTTACATAnc
gi|22 : ggcacttgcggccgtataagggaccgccatttttaaaagatcgtatccgacagatatttggcgaagaagcagA---GCATC-TTCTGATT--CAC-ATTTCATTTTT--C---ACGT---CC-TTG-AA-T-GTTTTCACT-GA-T-TTTCAC-AAGCTGGGCATCTTGnc
gi|23 : AAAAAGTTGCCT--GTA--GG--TGTCC-AATAAGTGGA-CAAT---T-AC-TG-TACATT--AT------T
gi|23 : tgtactt-TCCATT--GT------TATA--A-A-T----AA---T---GTAC-A----G--T-AATT-G---T-CCA------CTTA--TT------GGACA-tataacaatggagagt
gi|25 : tgtacttaaaaagttgcctgtaggTTAAAAC-ATAATTGT---T-ACGCAA--TCC----TTTAT-------TT-T-C-G----GTT-GTTA----------TAT-AGC-A-T-ATAA---T--CCgagt
gi|26 : gggca-A-T-T-C-T-----------G--T-A-G-AGAAAGAACCGA-T------ATC----G------GACTTGCAATGTAC-G--TGC-CTCG-A-CCAGTT---
gi|27 : -A-TCAGTT---CT--TTCT-CGCA-CAA-AA--TGGACAGTTTTTCGACTTTTA--CTTTACATAA
gi|28 : GTTTAAAAC-ATGATTGT---G-ACGTAA--ACC----TT--T-TG----TT-T-G-A----ATT-GTC-----------CAT-A-CTA-T-Aa
gi|29 : ------GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAACATATAAAAAG-A-----CA-GA--AGAT-GCGTTTG------T----CAAACg
gi|3 : TAAAAC-ATAATTGT---TGACGCAA--TCC----TTTGT-TAAT--TT-T-C-G----GTT-GTTA----------TAT-AGC-A-A-TAAA---T--CCA--T---GTAAAT--TT----CA------AAACAAT---CCAATAAGTT-CCT--GTAAGCG--TGTCCCAATAAGTTTAGAAAA---T-G--TG-TCCATT--AT------TAA---C-T-T----AT---T---GGAC-A----G--T-TATT-G---C---A------CTTA--TT------G-ACA--TGTC--AG-------GTTAAACG-ATAAAAAG-G-----CAAGA--AGATTGCGTTG-------T----CAC-CAA-AAGT-----AAATTTT-AATCCT---AATAACAACGCA---TGTCCACCAAGTA----AC-TCTGAGACCAC------ACCGAAAA---------------TCGACGTCGTACCCAC----CCC--CACCATCACATTATG-AAACTTCTCT----T-G-----------ATTCAGAAC----CATCTCC-----A---------CAT---T-GCTTAAAATGC----GATTTTTTTTT--A-TGTT---------TTCC-TA---GCATCCTTTGGACTTCCACCATCTTTCCTTTTTC---ACCTATCCC-TTGCAACT-GATCTACCTCGA-TCTTTCCCTCAGCTGGG--TCTTG--CTACATTTCTGCTCGCGAGAGTTATGGAACGGACTGCTG-ATGGAGAATCTAATCTCCAGTTTTTTTCAGTAATGAGTTGTTTCATGCTA------CTTCCAGCCATCG-TA-CAGTTTTG-TGGCTACAAGTGG---CACCGCT-T----GA---------G---------AA-------------ATG-TC-CTT-TGAAAT---CCCGCCT-GTTCACGAA-------T--AGCT--TGGTGACGGGGTTT-CTGT-AAAAACATG----AA-C-ACC---AACTCGGG-------TG-ATCTG-CATA--CC-----GA---ATATGTCCGAAGAAAAGA-TG-T---CACTTTT---TA-A-ACT-GAA---GTTAGC--GCTTCAT-A--T-CAG-A---TTCT--CCT-TC-----TC-TAT---ATCAA---GA-CA-TCA-CATG----AG---AA----CTGTTA--T-CG---G--TATT-T-A---------CAC-----TTTC-AC-TCTCT----ATTCCT---------------------TGC--------G-TGAGA-------CAAATG--C-----TCTCTCCATCAGAGG--ATCACT-CCATGTTG-GTA--T-GA-TTC--AATGG----TGAAA----G-TG---A--A----ATA---TTTAA---GA---TTTCAAAGT-TTTT--ATAGACC----------TT-A---GA--A-TTACTAA-A--AACTG---TCC-A-TA--AGTA-A-AAACA-------AAA------GA--A------C-AGCTT-C--CCAAA-GAC--GG-TTTGGTT--AT-GTTGG-GAGTAT-TTAA--------GAACA-G--CT-T----T----C-C---TGGCA--------AGCAGG--ACCT-TTATGAA--GACAA---------TGG---AT-TAATCA-G-GAA--AC-T-AA--AA-TC--T-TTTTG-ACC-TGGAGGTGAT--A--GTT--AT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATACAA-----GA------GAT---AAT---GTT-T-T--AAA-G--------T--------AG-GA-TA-G-AAGC-T-CAAA--CTG-T--A--C-A-T-T-C-TG----------G--TAA-GAAGAAAGAACTGA-T-------TC----G------G-CC-------TAC-G--GGC-CTCG-ACTCAGTT---CT--TTCT-CTCA-C-G-AA--TGTACAG-TTTTCGGCTTATATCCT
gi|30 : c--GGC-CTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTTA-CAG-AA--AGGACAG-
gi|4 : GCTTAAAAC-ATAATTGT---T-ACGCAA--TCC----TTTGT-TA----TT-T-C-G----GTT-GTTA----------TAT-G-C-A-T-AAAA---T--CCA--T---GTAAAT--TT----AA------AAACAAT---CCAATAAGTTACCT--GTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTA-GAAA---T-G--TG-TCCATT--AT------TAAA--C-T-T----AT---T---GGAC-A----G--T-TATT-G---T-CAA------CTTA--TT------GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAACGAATAAAAAG-G-----CA-GA--AGAT-GCGTTT-------T----CACACAA-AAG--TAAA----TTTTAATC--TA-AATAAC-ACGAA---TGTC-AC-AAGTAG--AACATCTGAGACCAC------ACCGAAA---------TCA----TTG--GTCGT---TAC----CAC--CAC-ATCACATTATG-AA-CTTCTCT----TTG-----------ATTCAGAAA----CATCTCC-----A---------CAT---T-GCT-------C----AATTTTTTTTT--A-TGTT---------TTCCTTA---GCATC-TTTGGATT--CAC---TTCATTTTTTTC---ACTT---CC-TTG-AA-T-GATTTCACT-GA-T-TTTCAC-AAGCTGGGCATCTT-GGTTA----TTTGC--ATGA-AGTTATG-AACGGACTGCTG-ATG----ATCTA-TGTCCAG-TTTTTTCAGTAATGAGTTGTT-CAT-CTA------C--CCAGC-ATCA-TA-CAGTCTTG-TGGCTACA-GTGG---CAC-GT--A----GA---------G---------AT-------------ATG-GT-CTT-TGAA-T---CCTGCCT-GTTCAC--A-------T--AGCT--TGGCGACGAT-TTT-CTGT-AAAA-CATG----AA-C-ACC---AAC--GGG-------TGCATCTG-CATA--CC-----GA---AT--ATCCGAAAA---GA-TG-T---CACTTT----TA-A-ACT-GAA---GTTAG---GCTTCAT-A--T-CAGCA---TTCT--CCT-TT-----TC-TAT---ATCAA---GAACA-TCA-C-TG----AG---AA----C-GTTA--T-CG---G--TATT-T-A---------CAC-----TTTC-AC-TCTC-----ATCCCTA-A---ATTTT----G-A-T-TGT--------G-TGAGG-------AAAATG--C-----TCTCTCCATCAGAGG--A--ACT-C-ATGTTT-GTA---TGA-TTC--AATGG----TGAAA----G-TG---A--A-TGACTA---TTTAA--TGA---TTTCAAG----TTT--ATAGACC----------TTTA---GA--ACTTACCTG-A--AACTG---TCC-AATA--AGTA-A-AA-CA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-C--C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTG-TGG-GA-TAT-TTA---------AAACA-G--CT-T----TA---C-C---TGGCA--------G--AGG--ACAC-TGATGAA--GACAA---------TGG---AT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--A-TTTTG-ACT-TGGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA--G--------T--------AG-G--TA-G-AAGCCT-CAAA--CTG-T--A--C-A-T-T-C-T-----------G--TAA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCC-------TAC-G--GGC-CTCG-A-TCAGTTG--CT--TTCT--TCA-CA--AA--TGTACAG-TTGTCGGCTTATATCCTTTACTTAAACACCATTGCATTGCAGGGTTGGGTA
gi|5 : taCTTC-T-A--A-CA--A---TTAT--CTTGTC-----TC-AATGTAATCA----GAACA-TCA-C-TG----AGT--AA----CGGTTA--T-CGTCAGTTTATT-T-A---------CACACTTTTTTC-TCATCTCGTGCAATCACCATA---ATTTT----ACATT-TGC--------G-TGAGACGGTTACAAACTG--CTACCATCTCTCAAGCAGA-G--A--ACTAC-ATGTTTGGTA--TTGAGTTCAGAAT-G----TGAAA----GATGA--A--A-TGAATA---TCTAAATTGA---TTTCAGATGTTTTT--ATAGGACAACGTCTTGATTTATGGGAATATTTACCTG-ATTAACTGGATTCC-GATAGGAGTATA-AC-CA-------AAACATAATGA--AATCAATC-AGCTC-A--C--AAGGACT-GG-ATT--TTCAATTGTAGGTGA-TAT-TTAA--------AGACATG--TTCT----TACATC-C---TGGAGATCTTTGTG--AGA--CCACTTTAGGAA--GACAAATGCGTTTTTGT---AC-TA--TG-GAAAA--ACAG-AATTAA-TCATA-TTCTA-ACATTGGGACT--T--AGGCCTCGCA--ATTATCATATGCA-ATCAT-G--AATATACATATGTA------TGTATAAAT---GTTGTAT--AA--GTATAGAGAT--------AA-G--TA-T-AGGCCTCCAAA--CTG-------C-A-T-TGC-TTACTAGCTCAAG--TAAGG-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------G-CC-------TAC-G--GGCTCTCG-ATTCAGTT---CTTCTTCTGCTCACCAG-AAATTGTACAG-TTT---GC-TACGTCCTTTACTCA
gi|5 : ctatgatgtaaaaggga-CTGG-AAGA-AAAG----GA-C-ACC---AAC---GG-------T-CATC-G-CATA--CC-----AG---AT------AGACATT-GA-TGACCAATGCTTGTACGTATATATTTGAA---GTT------CTTC------T-CAGtgctggataatggaagtcctttaactaggcaagtataatttaagagtttttacatggcatttgacaacttaaaagcatatgctaggcttatttattctggcataaaatctatgtttgcgctgttttccaaacttttatgctatatttttcaggctcagaacatggcaatgatgaacgcaactatcacctgagaagaacttcaaatatatacgtacaagcattggtcatcaatgtctatctggtatgcgatgaccgttggtgtccttttcttccag
gi|6 : ctatgatgtaaaagggatgagtaaaggacgtagcaaactgtacaatttctggtgagcagaagaagaactgaatcgagagcccgtaggccgagatcagttctttctccttacttgagctagtaagcaatgcagtttggaggcctatacttatctctatacttatacaacatttatacatacatatgtatattcatgattgcatatgataattgcgaggcctaagtcccaatgttagaatatgattaattctgtttttccatagtacaaaaacgcatttgtcttcctaaagtggtctcacaaagatctccaggatgtaagaacatgtctttaaatatcacctacaattgaaaatccagtccttgtgagctgattgatttcattatgttttggttatactcctatcggaatccagttaatcaggtaaatattcccataaatcaagacgttgtcctataaaaacatctgaaatcaatttagatattcatttcatctttcacattctgaactcaataccaaacatgtagttctctgcttgagagatggtagcagtttgtaaccgtctcacgcaaatgtaaaattatggtgattgcacgagatgagaaaaaagtgtgtaaataaactgacgataaccgttactcagtgatgttctgattacattgagacaagataattgttagaagtgctggataatggaagtcctttaactaggcaagtataatttaagagtttttacatggcatttgacaacttaaaagcatatgctaggcttatttattctggcataaaatctatgtttgcgctgttttccaaacttttatgctatatttttcaggctcagaacatggcaatgatgaacgcaactatcacA---GTTAG---GCCTCATTA--TGCAGCAA--TTCT--CCT-GC-----TT-TGTG--ACCAA---GAACA-TCAGC-TG----AGGAGAA----C-GTTA--TCCG---G--TATTGT-A---------CAC-----TTTCGAC-TCTC-----ATCTC---A---AATTT----G-A-T-TGC--------G-TGAGG-------AAA-TG--CG----TCTCTCCATCAGCGGACA--ACT-C-ATGTT---TA--TGGA-TTC--AATGG----TGAAA----G-TG---A--A-TGAATACAGTTAAA--TGAGC-TTTC-AG---TTTTTAATAGACC----------CTTA---GA--AATTACCTG-A--AACTG---TCC-AATT--AATA-AGAA-CA-------AAA------AG--AA-----C-AGCTT-TCAC--AA-GACTGGG-TTT--TT--ATTATTGA-GG-TAT-TTAT--------AAACA-GTTTT-T----TA---CTT---TGGGA--------G--TGG--ACACTTTAGGAAACGACAA---------TGG---ATGTA--TA-G-GAATCACATAAA--AA-TC--A-TTTTGAAC--TGGA--T--T--A---CT-GAA--ACTATC-----CA-AT-CTAT--AATATAAA----GA------GAT---AGT----TT-T-T--AA--G--------T--------AG-GA-TAGG-AAGCCT-CAAAG-CTG-T--A--CGA-T-T-C-T-----------G--TAA-G-A-AAAGAACTGACT------CTC----G------CCCT-------TAC----GGC-CTCGAA-TCAGTT---CT--TTCT-CTCACCAGCAA--T-TACAG-TTTTCGGCTTATATCCTT
gi|6 : TAAGGAGAGGTT-CAT-TGAACATGGCT-CCAGCTATCGGTA-CAGTCTTG-GGGCGGCA-CGGG---CAC-GTA-GAT--GA---------ATGGTTTGT-AA-------------ATG-GC-CTTGTGAA-T---CCTGCCTCGTTCAC--A-------TG-AGCT--TGGCG-CGGTGTTC-CTGT-AAAA-CATG----AACC-ACC---AAC--GGG-------T-CATCT--CATACGCC-----GAGAGATG-ATagggcaagtataattcagagttttacgcatgactttgcatttaatgcaggctccgtatatttttcgccaaataactatttctcgttgcacttttgctatatttcaggggccagaaaatgggatgtgcacgctctatacctaccaccgacagagacactcaaatactaagcaacatcatctctcggcgtatgagatgacccgttggtggttcatgttttacaggaacaccgcgccaagctcatgtgaacgaggcaggattcacaaggccatttacaaaccattcatctacgtgcccgtgccgccccaagactgtaccgatagctggagccatgttcaatgaacctctcctta
gi|7 : aaggatataagccgaaaactgtaattgctggtgagagaaagaactgattcgaggccgtaagggcgagagtcagttcttttcttacagaatcgtacagctttgaggcttcctatcctacttaaaaactatctctttatattatagattggatagtttcagtaatccagttcaaaatgatttttatgtgattcctatacatccattgtcgtttcctaaagtgtccactcccaaagtaaaaaactgtttataaatacctcaataataaaaacccagtcttgtgaaagctgttctttttgttcttattaattggacagtttcaggtaatttctaagggtctattaaaaactgaaagctcatttaactgtattcattcactttcaccattgaatccataaacatgagttgtccgctgatggagagacgcatttcctcacgcaatcaaatttgagatgagagtcgaaagtgtacaataccggataacgttctcctcagctgatgttcttggtcacaaagcaggagaattgctgcataatgaggcctaactagggcaagtataattcagagttttacgcatgactttgcatttaatgcaggctccgtatatttttcgccaaataactatttctcgttgcacttttgctatatttcaggggccagaaaatgggatgtgcacgctctatacctaccaccgacagagacactcaaatactaagcaacA---GTTAG---GCTTCAT-A--T-CAGCA---TACA--CCT-TC-----TC-TA----ATCAA---GAACA-TCA-C-TG----AG---AA----C-GTTA--T-CG---G--TATT-T-A---------CAC-----TTTC-AC-TCTC-----GTCCCTAAA---ATTTT----G-A-T-TGC--------G-TTAGA-------AAAATG--C-----TCTCTCCATCAGAGG--A--ACT-C-ATGTTT-GTA---TGA-TTC--AATGA----TGAAA----G-TG---A--A-TGAATA---TTAAA--TGA---TTTCAAT---GTTT--ATAGACC-----------TTA---GA--ACTTACCTG-A--AACTG---TCC-AATA--AGT--A-AA-CA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-CA-C--AA-GAAT-GG-TTT--TT--ATTGTTGA-AG-TAT-TCA---------AAACA-G--CT-T----TA---C-C---TGGGA--------G--AGG--ACAC-TTATGAA--GACAA---------TGG---AT---------------------A--AA-TC--A-TTTTA-AC--TGGC--T--T--A--CCT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA--G--------T--------AG-GA-TA-G-AAGCTT-CAAA--CTG-T--A--C-A-T-T-C-T-----------G--TAA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCC-------TAC-G--GGC-CTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTCA-CAG-AA--TGTACAG-TTTTCGGCTTATATCCTTTACATA-----CATTG-ATTG-
gi|7 : ggcactttggaggccttagtgatcgttttggtaaagatagtgacaagatggcagaatgtgaagagacaaAATGAGTTGTT-CAT-CTA------CT-CCAGC-ATCG-TA-CAGTCTTG-TGGCTGCA-GTGG---CAC-GTAGA----GA---------ATGGTTTGTAAA-------------ATG-GC-ATT-TGAA-T---CCTGCCT-GTTCAC--A-------T--AGCT--CGGCGACGGT-TTT-CTGT-AAAA-CATG----AA-C-A-C---AAC--GGG-------TGCATCTG-CATA--CCA----GG---ATG-ATaaggcaagtataatcatgagttttacatgcatttgacatttaatgcaggcttatatttttgcaaacactaattctgttcactttttttatatttcaggccagaaaatggcaattgtgacgcactatactgagacaactcaaatatagtacatcatcatcctggtatgcagatgcacccgttgtgttcatgttttacagaaaaccgtcgccgagctatgtgaacaggcaggattcaaatgccattttacaaaccattctctacgtgccactgcagccacaagactgtacgatgctggagtagatgaacaactcatt
gi|8 : ggcactttggaggccttagtgatcgttttggtaaagatagtgacaagatggcagaatgtgaagagacaacaatcaatgtatgtaaaggatataagccgaaaactgtacattctgtgagagaaagaactgatcgaggcccgtagggccgagatcagttctttctcttacagaatgtacagtttgaagcttctatcctacttaaaacattatctcctttgtattaatattggatagtatcaggtaagccagttaaaatgatttatccattgtcttcataagtgtcctctcccaggtaaagctgttttgaatacttcaacaataaaaaccattcttgtgaagctgtttcttttgtttacttattggacagtttcaggtaagttctaaggtctataaacattgaaatcatttaatattcattcactttcatcattgaatcatacaaacatgagttcctctgatggagagagcatttttctaacgcaatcaaaattttagggacgagagtgaaagtgtaaataccgataacgttctcagtgatgttcttgattagagaaggtgtatgctgatatgaagcctaactaaggcaagtataatcatgagttttacatgcatttgacatttaatgcaggcttatatttttgcaaacactaattctgttcactttttttatatttcaggccagaaaatggcaattgtgacgcactatactgagacaactcaaatatagtacatcA---GTTAG---GCTTCAT-A--T-CAGCA---TCC----CT-GC-----TT-TGT---ATCAAA--GAACA-TCA-C-TG----GA---GA----C-GTTAAAT-CG---G--TATT-TTA---------CAA-----TTTC-AC-TCTC-----ATCCCTA-----ATTTT----G-A-T-TGC--------GGTGAGG-------AAAATG--C-----TTCATCCATCAGCGG--A--ACT-C-ATGTT--GTA--T-GA-TTC--AATGG----T-AAA----G-TG---A--AATGAATA---TTAAAA-TGAATTTTTCAAG---TTTT--ATAGACC----------TT-A---GA--AATTAC-TG-A--AACTG---TCCCAATA--A-TA-A-A--CA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-C--C--A--GACT-GGGTTT--TT--ATTATTGA-GG-TAT-TTA----------AACA-G--TT-T----TAA--C-T---TGGGA--------G--TGG--ACAC-TTAGGAAA-GACAA---------TGG---ATATA--TAAG-GAA--ACAT-AA--AAATC--A-TTTTA-AC--TGGAA-T--T--A--ACT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATATAAT---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA--G--------T--------AG-GA-TA-G-AAGCCT-CAAA--CTG-T--A--C-A-TAT-CTT-----------G--TAA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCCT------TAC-G--GG--CTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTCA--AG-AA--TGTACAG-TTTTCGGCTTATATCCTT
gi|8 : -ATCG-TAACAGTCT-G-TGGCTGCA-GTGG---CAC-GTA-A----GA---------G---------AATGGTTTGTAGTAAATGTGC-CTT-TGAA-T---CCTGC-T-GTTCAC--ACTCATTAT--AGCT--TGGCGACGGT-TTTCCTGTAAAAA-CATGAC--AA-CAACCAAAAAC---GG-------TGCATCTG-CATA--CCAGGCAGATG-ATG-TTCTG-ATATT-GAGTG--------TTCT-CGTAGGTAATAG--------AG---GCGTCAC-A--T-TTGCAATTTTCTGGCCT-Taagccaagatataatatgtagtttacatggcatttgacattttaatgcaggcttttatatattttttcgcaaaaactatttctgttcacctttttctatatttcaaggccagaaaattgcaaatgtgacgcctctattacctacgagaacactcaatatcagaacatcatctgcctggtatgcagatgcaccgtttttggttgttgtcatgtttttacaggaaaaccgtcgccaagctataatgagtgtgaacagcaggattcaaaggcacatttactacaaaccattctcttacgtgccactgcagccacagactgttacgat
gi|9 : aaggatataagccgaaaactgtacattcttgagagaaagaactgatcgagcccgtaagggccgagatcagttctttctcttacaagatatgtacagtttgaggcttctatcctacttaaaacattatctccattatattaatattggatagtatcagttaattccagttaaaatgatttttatgtttccttatatatccattgtctttcctaagtgtccactcccaagttaaaactgtttaaatacctcaataataaaaacccagtctggaagctgtttcttttgtttattattgggacagtttcagtaatttctaaggtctataaaacttgaaaaattcattttaatattcatttcactttaccattgaatcatacaacatgagttccgctgatggatgaagcattttcctcaccgcaatcaaaattagggatgagagtgaaattgtaaaataccgatttaacgtctccagtgatgttctttgatacaaagcagggatgctgatatgaagcctaactaagccaagatataatatgtagtttacatggcatttgacattttaatgcaggcttttatatattttttcgcaaaaactatttctgttcacctttttctatatttcCTTAAAAC-ATAATTGT---T-ACGCAA--TCC----TTTGT-TA----TT-TTC-G----GTT-GTTA----------TATGG-C-A-T-AAAA---T--CCA--T---GTCAAT--TT----AA------AAACAAT---CCAATAAGCTACCT--GTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTA-GAAA---T-G--TG-TCCATT--AT------TAAA--C-T-T----AT---T---GGAC-A----G--T-TATT-G---T-CAA------CTTA--TT------GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAACGGATAAAAAG-A-----CA-GA--AGAT-GCGTTTG------T----CAAACAG-AAG--TAAA----TTGTAA--TTTA-AATAAC-ATGAA---TGTC-AC-AGGTAG--AACATCTGAGACCAC------ACTG-AAA---ATCATTCATTATTTG--GTCGT---TACTCGTTACCACAC-ATCACATTTAG-AA-CTTCAAT----TTG-----------AAAGACAAATTGTTATGTTC---------------TATA--T-G--------------AATTTCTCTTT--A-T-TCAGAGGCACATTCAAAA---ACATC-TCCAAATT------GCTTAATTTTTTTTATGATTT---CC-TT
gi|9 : TATG-AA-TTTCTCT----TTATTCAGAGGCACATTCAAAAA----CATCTCC-----A---------AAT---T-GCT-------T----AATTTTTTTT---A-TGAT---------TTCCTTATCAGCATC-TTCTGATT--CAC-ATTTCATTTTTT-C---ACTT---CC-TGG-AA-T-GATTTCACT-AA-T-TTTCAC-AAGCTGGGCATTTTGGGTTC---TTTTG-----------TATG-AATGGACTGCCG-ATG----ATCTA-TGTCCAGTTTT--TCAGTAATGAGTTGTT-CAT-CTA------CT-CCAGC-ATCG-TA-CAGTCTTG-TGGCTGCA-GTGG---CAC-GTAGA----GAATGGTTTGTA---------AA-------------ATG-GC-ATT-TGAA-T---CCTGCCT-GTTCAC--A-------T--AGCT--CGGCGACGGT-TTT-CTGT-AAAA-CATG----AA-C-A-C---AAC--GGG-------TGCATCTG-CATA--CCA----GG---ATG-ATatcagcatcttctgattcacatttcattttttcacttcctggaatgatttcactaattttcacaagctgggcattttgggttcttttgtatgaatggactgccgatgatctatgtccagtttttcagtaatgagttgttcatctactccagcatcgtacagtcttgtggctgcagtggcacgtagagaatggtttgtaaaatggcatttgaatcctgcctgttcacatagctcggcgacggttttctgtaaaacatgaacacaacgggtgcatctgcataccaggatgatgatgtacta
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): GATGACATTAGTGATGAAACAGCAGTTTTGTGTATTCATAATATGCATTATTTGATGTGAAGGGA
Alignments
lowQualScore : 11 1111 2222 22222222 3333333333 11111 222 111 11 444444444444 111 11 22222222 333333333333333333333333333333333 111111 1 11111 222222 333333 3333333 3333333 444444444444 1 33333333 1 222 1 222 333333 444444444444444 11 111 2222 111 1 222222 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 111 2222222222222 11111 1 1 1 111 22222222 1 1111 11 1 111111 1 1 111 8888888888888888888888888888888888888888888 1 111 2222222222 11 11 2222 11 3333333 1 11111 111 111 111 1 111 222 11 111 33333333333333 222 1 222222222222222 111 444444444 111111 11111 55555555555555555555555555555555 1111111 11 11111 11 2222 2222 2222 222222 22 222 1111 2222222222222 222 1 2222222 111111 111111111 1111 444444444 222222222222222 11111111 11 11 111111111 111 11 11 11111 1111 1111111 111 11 1111111 11111111111111 11111111111111111 111 1111111 11111 222222 1
lowQualScore : 8 3 777 4 11 7777 8 2222 4 00000000 4 5555555555 4 66666 000 66 777 1 44 111111111111 3 777 1 22 66 66 5 0 66666666 4 888888888888888888888888888888888 111111 66 5 0 33333 888888 0 66 000000 8 66 2222222 5 6 5 1111111 5 77 5 555555555555 5 5 11111111 9 7 3 999 8 6 222 9 0 888888 666666666666666 88 111 0000 555 6 6 5 0 666666 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 000 8888888888888 8 888 5 22 66 77 33333 888 0 5 5 1 5 5 1 5 111 22222222 6 3 4444 44 5 5 5 666666 5 0 5 5 0 6 5 777 5 6666666666666666666666666666666666666666666 5 0 5 5 777 5 66 6666666666 33 66 5 5 5 8888 5 5 2 888 66 2222222 0 66 77 55555 66 1 1 777 8 88 333 222 0 0 777 222 4 22 4 222 66 4 33333333333333 222 0 5 5 555555555555555 5 5 66 5 888 66 5 5 000000000 555555 5 5 77777 11111111111111111111111111111111 77 6666666 6 33 5 22222 33 5 5 55 3333 5 66 1111 1111 5 777777 5 888 0 11 555 5555 66 7777777777777 888 66 4 8 66 333 3 66 99 4 4 8888888 222222 444444444 8 8888 66 4 4 4 66 66 4 4 8 000000000 4 4 4 66 4 777777777777777 1 66666666 66 22 8 00 777777777 555 8 66 4 4 66 4 66 4 66 8 4 33 22 44 44 555 3 44 33333 6 3 3333 555 777777 444 444 5 2 66 5555555 000 2 888888 2 00 0000000 2 5 2 2 5 55555555555555 4 2 5 0 2 777777 5555 66666666666666666 7777 2 2 5 000 33 2 7777777 5 8 33 00000 66 2 5 1 0 111111 2 3
lowQualScore : . . ... . .. .... . .... . ........ . .......... . ..... ... .. ... . .. ............ . ... . .. .. .. . . ........ . ................................. ...... .. . . ..... ...... . .. ...... . .. ....... . . . ....... . .. . ............ . . ........ . . . ... . . ... . . ...... ............... .. ... .... ... . . . . ...... ......................................................... ... ............. . ... . .. .. .. ..... ... . . . . . . . . ... ........ . . .... .. . . . ...... . . . . . . . ... . ........................................... . . . . ... . .. .......... .. .. . . . .... . . . ... .. ....... . .. .. ..... .. . . ... . .. ... ... . . ... ... . .. . ... .. . .............. ... . . . ............... . . .. . ... .. . . ......... ...... . . ..... ................................ .. ....... . .. . ..... .. . . .. .... . .. .... .... . ...... . ... . .. ... .... .. ............. ... .. . . .. ... . .. .. . . ....... ...... ......... . .... .. . . . .. .. . . . ......... . . . .. . ............... . ........ .. .. . .. ......... ... . .. . . .. . .. . .. . . .. .. .. .. ... . .. ..... . . .... ... ...... ... ... . . .. ....... ... . ...... . .. ....... . . . . . .............. . . . . . ...... .... ................. .... . . . ... .. . ....... . . .. ..... .. . . . . ...... . .
lowQualScore : 9 4 000 0 00 0000 0 5555 0 44444444 0 0000000000 0 44444 000 11 555 0 44 555555555555 2 555 1 22 11 11 0 2 44444444 4 333333333333333333333333333333333 666666 99 0 0 55555 888888 4 99 000000 9 99 5555555 0 6 0 1111111 7 99 7 333333333333 0 0 88888888 8 3 3 777 0 7 000 8 7 333333 888888888888888 33 777 8888 888 7 5 0 7 444444 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111 6666666666666 9 888 0 55 99 00 11111 888 0 7 7 4 7 7 4 7 777 88888888 7 3 2222 00 5 7 7 444444 7 0 0 0 0 2 0 555 0 2222222222222222222222222222222222222222222 0 0 0 0 555 0 99 0000000000 88 22 0 0 0 1111 0 0 5 888 99 5555555 0 99 22 44444 99 0 0 222 0 22 888 666 6 8 555 555 4 22 4 222 11 4 66666666666666 555 0 0 0 000000000000000 0 0 99 0 888 99 0 0 000000000 888888 0 0 55555 11111111111111111111111111111111 00 2222222 6 88 0 55555 88 0 0 11 2222 0 99 2222 2222 0 222222 0 888 8 99 666 8888 99 4444444444444 888 99 5 9 11 333 3 11 66 4 4 9999999 888888 111111111 9 4444 11 4 4 4 11 11 4 4 9 000000000 4 4 4 11 4 222222222222222 0 11111111 11 22 9 66 888888888 666 9 11 4 4 11 4 11 4 11 9 0 55 55 66 22 666 1 22 88888 2 1 5555 000 777777 777 777 3 7 33 0000000 000 7 222222 9 77 5555555 7 3 7 7 3 44444444444444 1 7 3 9 7 777777 7777 88888888888888888 2222 5 5 0 666 77 7 3333333 3 0 77 88888 99 5 3 0 8 555555 5 3
consensus : NNGCTTAAAAC-ATAATTGT---T-ACGCAA--TCC----TTTGT-TA----TT-T-C-G----GTT-GTTA----------TAT-A-C-A-TAAAA---T--CCAT---GTNAATA-TT----AA------AAACAAT---CCAATAAGTTACCT--GTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTAGAAA---T-G--TG-TCCATTA--T------TAAA--C-T-T----AT---T---GGAC-A----G--T-TATT-G---T-CAA------CTTA--TT------GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAACGGATAAAAAG-G-----CA-GA--AGAT-GCGTTT-------T----CACACAACAAGTTTAAGAGATTTTTAATCTTTATAATAAC-ACGAA--TTGTCTAC-AAGTAG--AACATCTGAGACCGC------ACCGAAAA----TC--TCA----TTG--GTCGT---TAC----CAC--CAC-ATCACATTATGAAACTTCTCT----TCGATTCAGA----------AA-CG-CATCTC-----C-----ACATA--TG-CT-------C----AATTTTTTTTT--AT-GTT---------TTCCCTA---GCATC-TTCGGATT--CAC-ATTTCATTTTTTTC---ACTT---CCTT-G-AA-T-GATTTCACT-GAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATCTTGGGTTA---TTTTGC--ATGA-AGTTATG-AACGGACTGCTG-ATG----ATCTA-TGTCCAGTTTTTTTCAGTAATGAGTTGTT-CAT-CTA------CT-CCAGC-ATCG-TA-CAGTCTTG-TGGCTGCA-GTGG---CAC-GTA-A----GA---------G---------AA-------------ATG-GC-CTT-TGAA-T---CCTGCCT-GTTCAC--A-------T--AGCT--TGGCGACGGT-TTT-CTGT-AAAA-CATG----AA-C-ACC---AACT-GGG-------TGCATCTG-CATA--CCG-G---A-ATGA--TCCGNATACT-GA-TGCCACTTTTC-TA-ATACTAGAA---GTTAG---GCTTCAT-A--T-CAGCA---TTCT--CCT-TC-----TC-TAT---ATCAA---GAACA-TCA-C-TG----AG---AA----C-G-TTA--TC-G---GT--ATT-T-A---------CAC-----TTTC-AC-TCTC-----ATCCCTATA---A-TTTT----G-AT-T-GC--------G-CGAGA-------AAAATG--C-T-----CTCTCCATCAGAGGA--ACT-C-ATGTTT-GTA--TTGA-TTC--AATGG----TGAAA----G-TG---A--A-TGAATA---TTTAA--TGA---TTTCAAG---TTTT--ATAGACC----------TTTA---GA--ACTTACCTG-A--AACTG---TCC-AATA--AGTA-A-AA-CA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-C--C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTGTTGG-GA-TAT-TTA---------A-A-ACA-G--CT-T----TA---C-C---TGGNA--------G--AGG--ACAC-TTATGAA--GACAA---------TGG---AT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--A-TTTTG-AC--TGGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTA---GG-ATA-G----AAGCCT-CAAA--CTG-T--A--C-A-T-T-C-T-----------G--TGA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCC-------TAC-G--GGC-CTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A-CAG-AA--TGT----A--CAG-T-TTTCGGCTTATATCCTTTACNTAAACACCATTGCATTG-AGGGTTGGGTA
Reference ( family-455 ) : NNGCTTAAAAC-ATAATTGT---T-ACGCAA--TCC----TTTGT-TA----TT-T-C-G----GTT-GTTA----------TAT-A-C-A-TAAAA---T--CCAT---GTNAATA-TT----AA------AAACAAT---CCAATAAGTTACCT--GTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTAGAAA---T-G--TG-TCCATTA--T------TAAA--C-T-T----AT---T---GGAC-A----G--T-TATT-G---T-CAA------CTTA--TT------GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAACGGATAAAAAG-G-----CA-GA--AGAT-GCGTTT-------T----CACACAACAAGTTTAAGAGATTTTTAATCTTTATAATAAC-ACGAA--TTGTCTAC-AAGTAG--AACATCTGAGACCGC------ACCGAAAA---ATC--TCA----TTG--GTCGT---TAC----CAC--CAC-ATCACATTATGAA-CTTCTCT----TCGATTCAGA----------AA-TG-CATCTC-----C-----ACATA--TG-CT-------C----AATTTTTTTTT--AT-GTT---------TTCCCTA---GCATC-TTCGGATT--CAC-ATTTCATTTTTTTC---ACTT---CCTT-G-AA-T-GATTTCACT-GAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATCTTGGGTTA---TTTTGC--ATGA-AGTTATG-AACGGACTGCTG-ATG----ATCTA-TGTCCAGTTTTTTTCAGTAATGAGTTGTT-CAT-CTA------CT-CCAGC-ATCG-TA-CAGTCTTG-TGGCTGCA-GTGG---CAC-GTA-A----GA---------G---------AA-------------ATG-GC-CTT-TGAA-T---CCTGCCT-GTTCAC--A-------T--AGCT--TGGCGACGGT-TTT-CTGT-AAAA-CATG----AA-C-ACC---AAC--GGG-------TGCATCTG-CATA--CCG-G---A-ATGA--TCCGNANACT-GA-TGCTACTTTTC-TA-ATACTAGAA---GTTAG---GCTTCAT-A--T-CAGCA---TTCT--CCT-TC-----TC-TAT---ATCAA---GAACA-TCA-C-TG----AG---AA----C-G-TTA--TC-G---GT--ATT-T-A---------CAC-----TTTC-AC-TCTC-----ATCCCTA-A---A-TTTT----G-AT-T-GC--------G-CGAGA-------AAAATG--C-T-----CTCTCCATCAGAGGA--ACT-C-ATGTTT-GTA--TTGA-TTC--AATGG----TGAAA----G-TG---A--A-TGAATA---TTTAA--TGA---TTTCAAG---TTTT--ATAGACC----------TTTA---GA--ACTTACCTG-A--AACTG---TCC-AATA--AGTA-A-AA-CA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-C--C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTGTTGG-GA-TAT-TTA---------A-A-ACA-G--CT-T----TA---C-C---TGGNA--------G--AGG--ACAC-TTATGAA--GACAA---------TGG---AT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--A-TTTTG-AC--TGGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTA---GG-ATA-G----AAGCCT-CAAA--CTG-T--A--C-A-T-T-C-T-----------G--TGA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCC-------TAC-G--GGC-CTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A-CAG-AA--TGT----A--CAG-T-TTTCGGCTTATATCCTTTACNTAAACACCATTGCATTG-AGGGTTGGGTA
gi|1 : TAAGACCATA--TGT---T-ACGCAACATCCAATCTTTGTATAAATTTT-T-C-GTGTAGTT-GTTAACTCTGTACCTAT-A-C-GCTAAGACATT--CCATAATGTGAATA-TTTATAAATGAGGCAAAAAATTGCCCAATAA-TTACCTTTGTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTAAAAACAAT-G--TG-TCCATTG--CAGTTTCTACA--C-TAT----AT---TTGAGAACTA----G--T-TATTAG---TACAAAATGACTTTA--TTTATCTGAGACAAGTGCC--AGTGTTGTCAT-ATACAGATAAA--T-GTTTTTCA-TG--AGAT-GCGTTT-------TGTCACACACAACAAGTTTAAGAGATTTTTAATCTTTATAATAACTACGAAATTTGTCTAC-AAGTTATTAACATCAG-GACAGCCAAGCGACCGAAAA----TC--TCA----TTG--GTCGT---TAC----CAC---AC-ATCACATTATGAAACTTCTACATAATCGATTCAGA----------AAATG-CATCTT-----CTCCATACATA--TAACT-------CTAAAAATTTTTTTTC--GTTGTT---------TTCCCTA---GCATC-TTTGGGTT--CAC-ATTTCATTTTTT-C---ACTT---CCTTTG-AA-TCGATTTCACT-GAT-TTTTCAC-AAGCTGGGCATCTTGGGTTA---TTTTGC--ATGA-AGTTATG-AACGGACTGCTGTATG----ATCTA--GTCCAG-TTTTTTCAGTAATGAGTTGTT-CAT-CTA------CT-CCAGC-ATCA-TA-CAGTCTTGTTGGC-ACA-GTGGATATAC-GTG-ATAGTGA---------G---------AA-------------ATG-GTACTT-TGTA-TTTCCCTGCCT-GTTCAC--A-------TTAGGCTTCTGGCGACGA--TTT-CTGT-AAAA-CATGTATAGA-C-ACC---AACT-GAGAGAGTTATGCATCTGCCATA--CCG-G---A-ATGA--TCCGTATACT-AA-TGCTACTTTTC-TA-ATACTAGAAAGTATTAGGTTGCTTCAT-ATCT-CAGCA---TTCT--CCT-TTATTAATCTTATTA-GTCAATGTGAACATTCA-C-TGTGCTAG---AAACTTC-A-GTA--TC-GC--GT--ATT-T-ATGCGTACAGCAC------TTC-AC-TCTC-----ATCCCTATATATA-TTCTCTCCG-ATAT-GCTGGTAGATG-CAAAA-------AAATTGTCC-T-----TTTTCCATCAGAGGA--ACT-C-ATGTTT-GTATTTTGA-TTC--AATGGTTATTGAAAAGTTG-TGCGTACTA-TGACTA---TTTAAT-TGAT--TTTCAAG---TTTT--ATAGACC-----------TTA---GA--ACTTACCTGTA--AACTACTTTCCTAATA--AGTT-A-AA-CATACACACAAA------GAAGAG-----CGAGCTTCC--C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTGTTGG-GA-TATATTATAATGCCACA-A-ACA-G--CT-TATGATG---C-CTTGTGGCA--------G--AGGATACAC-TTATTGA--GACAA---------TGGCGCAT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--ATTTTTG-AC--TGGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATCG----CATAT-AT-TTAAATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTAG--GG-ATA-G----AAGCCT-CAAACCCTGCT--A--C-ATT-T-C-T-----------GTTTTA-G-AGAAAGTAAT---T------CTC----GTATTCAGGCC-------TACTGACGGC-CTCG-A-TCAGCTTCCCT--TTCT-CTTCCCTCTGA-CAGAAA--TGTTTTGACTCAG-TATGTCGGCT
gi|10 : aTATAAC-ATAATTAT---T-ATGCAA--TCC----TTTGT-TA----TT-T-TTG----GTTTGTTG-----------AT-A-G-A-TAAAA---T--CCAT---TTAAATAATT----AA------AAACAAT---CCAATAAGTTACCT--GTA--CGCATGTCC--ACAAATTTAGAAA---T-AGTTGTTCCATTAGTT------TAAGATCGT-T----ATCTCT---GAGT-ACCACG--TCTATT-GTGCT-CAA------C-TAGTTT------AGACA-GTGCCTTAG-------GT-AAAGGTATATAAAGTA-----CA-GATTAGAT-GCATTTTAGGTTGT----CTC-CAACAGATT----ACATATTTAATC-TAATATTAGC-ATGAA--TTGTC-AA-AGGTAG--AACATCTTGAACCAC------ACTGAAAATCCGTC--T-A----TTGGAGTTGT---TACG---CAC--CAC-AT---ACT-TGAA-CTTCgtgagtatccatggctacagtg
gi|10 : ATT-TGAA-TTTCTCT----T-GATTCAGA----------GG-CA-CAT-TCATAAACATA--ACATAACTG-CT-------T----AATTTTTTTTTCAAT-AT---------------CA---GCATC--------T--CA----------TTTTTC---ACTT---CCTT-G-AA-T-GATTTCACT-GAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATCTTGGGTTC---TTTTG-----------TATG-AACGGACTGCTG-AAG----ATCTA-TGTCCAGTTTTTTTCAGTAATGAGTTaattttgaaaagacaattcgttatgtttatttgaatttctcttgattcagaggcacattcataaacataacataactgcttaatttttttttcaatatcagcatctcatttttcacttccttgaatgatttcactgattttcacaagctgggcatcttgggttcttttgtatgaacggactgctgaagatctatgtccagtttttttcagtaatgagtt
gi|11 : tataacataattattatgcaatcctttgttatttttggtttgttgatagataaaatccatttaaataattaaaaacaatccaataagttacctgtacgcatgtccacaaatttagaaatagttgttccattagtttaagatcgttatctctgagtaccacgtctattgtgctcaactagtttagacagtgccttaggtaaaggtatataaagtacagattagatgcattttaggttgtctccaacagattacatatttaatctaatattagcatgaattgtcaaaggtagaacatcttgaaccacactgaaaatccgtctattggagttgttacgcaccacatacttgaacttcaattttgaaaagacaattcgttatgttt--A--CCT-GGG--CCTGTC-----CA-TT-TT-T--AGAACAAA---A-A------TGC---AAC---GTT-T-T--CA-------GTT---GC-ATA-T----TAACCT-AAAA--TTG-T--C--C-A-T-T-C-T-----------G--TGA-G-AGAAAGAACTAA-TATTAGCCTTACGGG------GTCC-------TAC-G--GGC-CTTG-A-TCGATT---CT--TTCT-CTC-------A-CAA-AA--TGA----A--TAG-T-TTT-------TATCCTGTACTTAAACA----TGCATT
gi|12 : ggtttaATTGTAAAT-GTGTAA--TCA----TTTAT-TA----TTCT-A-A----GCT-TTGA----------TAT-A-----TAAAA---TAGTC-T---GCCTACA-TT----TA------AAAC-------------GTTACCT--GTA--GG--TATCC-AATACGTTGACAAT---TAA--TG-TCCATTA--T------------C-T-TTCAGAA---T---GGAC-A----GTAT-TATT-G---C-CAA------CATA--TTG-----GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAtaccaatgtcaataggtttcatattacatgtgtttgtaaatctctcaccaatactatttcttactttctttttaacatccaagttgt
gi|13 : ctatatttaaagTTTA-AA--TGGA--T--TTTA--TCT--ATCAACAAAC-----CA-AA-AA-T--AA--CAAA---GGATTGCATAAT---AATTATGTT-A-T--AAAA-----GTA---GG-ATA-G----AAGCCT-CAAA--CTA-T--A--C-A-T-T-C-T-----------G--TAA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCC-------TAC-G--GGC-TTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A-CAG-AA--TGT----A--CCG-T-TTTCGGCTTATATCCTTTACTGAAA-ATAAATGCATTA-AAGttattagatgtttacaggttgcctgaaaacaagagaaaaagatgatgcatttgtttaaacataaacaaattcaattctaaat
gi|14 : atta------GAT---AAT---GTTGT-T--GAT------GCA---TGTAT--T----AAGC-T-CAAA--CTG-C-----C-G-T-T-CCT-----------A--TGA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTT----A------GTCC-------TAT-G--GCA-ATTG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A-T-G-AA--TGG----A--C-G-T-TTGAGGCTTATATCTTTTttaccaagatgcgttgactgcgtgata
gi|15 : ttgcatgactatgaaCTG-A--AACTG---TCC-AATA--AGTT-A-AA-CA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-CG-C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTGTTGG-GT-TAT-TTA---------A-A-ACA-G--CT-T----TA---C-T---TGAAA--------G--AGG--ACAC-TTATGAA--GACAA---------TGG---AT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--A-TTTTA-AC--TAGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-C--AATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-TTGAA---------A---AG-ATA-A----AAatatataaaggttgtgattccaacgatgacattattcaatgatggaccaacagttttgtgtattgcacatgcattgtttgatctgaagagaa
gi|16 : at--T--T--A--TCT-GAT--TCCACC-----CC-AC-AT---------AAA---GAA------AAG---CAT---GTT-T-T--AA-------TTA---AG-AGA-A----AAGCCA-CAAA--CTA-T--C--A-A-C-T-C-T-----------G--TGA-A-AGAAAGAACTAA-----------------------------------------------A-A-TTAGTT---CT--TTTT-CTC-------A-CAG-AA--TGG----A--CAG-C-GTTTGGCCTTTCACTTTTACATA
gi|17 : acAATT---CT--TTCT-CTC-------A-CAG-AA--TGG----G--CAG-A-TTTCGGTCTTTCTCCTGTACATAacaaaa
gi|18 : catcactacatg--T--T--A--TAT-GAT--G-TATC------A-AT-AT-TTGAATACA----------------C---AAT---GCT-T-T--AACTCCATAGCA---AG-GTA-T----TAGCCT-GAAA--CTG-T--C--C-A-T-T-C-T-----------T--TGA-G-AGAAAGAACTAA-T------CTC----G------GCCTG------TA--G--GGC-Ccagctctatcgtatcaagccagctaaagtcaagtacatgtactttttccagtacaacaactctggagtttgaa
gi|19 : tttaattacatgtatttccACAAA---AGA------TGC---ACT---AGT-C-T--AA-------GTA---GG-ATA-T----AAGCAC-AAAA--CTA-TCTATCC-A-T-T-C-T-----------G--TGA-GGAAAAAGAATTAA-T------CAC----A------ACCT-------TAC-G--GAC-CTTG-A-TCAGTT---aa
gi|2 : aacgaaaacaacaTAAGACCATA--TGT---T-ACGCAACATCCAATCTTTGTATAAATTTT-T-C-GTGTAGTT-GTTAACTCTGTACCTAT-A-C-GCTAAGACATT--CCATAATGTGAATA-TTTATAAATGAGGCAAAAAATTGCCCAATAA-TTACCTTTGTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTAAAAACAAT-G--TG-TCCATTG--CAGTTTCTACA--C-TAT----AT---TTGAGAACTA----G--T-TATTAG---TACAAAATGACTTTA--TTTATCTGAGACAAGTGCC--AGTGTTGTCAT-ATACAGATAAA--T-GTTTTTCA-TG--AGAT-GCGTTT-------TGTCACACACAACAAGTTTAAGAGATTTTTAATCTTTATAATAACTACGAAATTTGTCTAC-AAGTTATTAACATCAG-GACAGCCAAGCGACCGAAAA----TC--TCA----TTG--GTCGT---TAC----CAC---AC-ATCACATTATGAAACTTCTACATAATCGATTCAGA----------AAATG-CATCTT-----CTCCATACATA--TAACT-------CTAAAAATTTTTTTTC--GTTGTT---------TTCCCTA---GCATC-TTTGGGTT--CAC-ATTTCATTTTTT-C---ACTT---CCTTTG-AA-TCGATTTCACT-GAT-TTTTCAC-AAGCTGGGCATCTTGGGTTA---TTTTGC--ATGA-AGTTATG-AACGGACTGCTGTATG----ATCTA--GTCCAG-TTTTTTCAGTAATGAGTTGTT-CAT-CTA------CT-CCAGC-ATCA-TA-CAGTCTTGTTGGC-ACA-GTGGATATAC-GTG-ATAGTGA---------G---------AA-------------ATG-GTACTT-TGTA-TTTCCCTGCCT-GTTCAC--A-------TTAGGCTTCTGGCGACGA--TTT-CTGT-AAAA-CATGTATAGA-C-ACC---AACT-GAGAGAGTTATGCATCTGCCATA--CCG-G---A-ATGA--TCCGTATACT-AA-TGCTACTTTTC-TA-ATACTAGAAAGTATTAGGTTGCTTCAT-ATCT-CAGCA---TTCT--CCT-TTATTAATCTTATTA-GTCAATGTGAACATTCA-C-TGTGCTAG---AAACTTC-A-GTA--TC-GC--GT--ATT-T-ATGCGTACAGCAC------TTC-AC-TCTC-----ATCCCTATATATA-TTCTCTCCG-ATAT-GCTGGTAGATG-CAAAA-------AAATTGTCC-T-----TTTTCCATCAGAGGA--ACT-C-ATGTTT-GTATTTTGA-TTC--AATGGTTATTGAAAAGTTG-TGCGTACTA-TGACTA---TTTAAT-TGAT--TTTCAAG---TTTT--ATAGACC-----------TTA---GA--ACTTACCTGTA--AACTACTTTCCTAATA--AGTT-A-AA-CATACACACAAA------GAAGAG-----CGAGCTTCC--C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTGTTGG-GA-TATATTATAATGCCACA-A-ACA-G--CT-TATGATG---C-CTTGTGGCA--------G--AGGATACAC-TTATTGA--GACAA---------TGGCGCAT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--ATTTTTG-AC--TGGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATCG----CATAT-AT-TTAAATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTAG--GG-ATA-G----AAGCCT-CAAACCCTGCT--A--C-ATT-T-C-T-----------GTTTTA-G-AGAAAGTAAT---T------CTC----GTATTCAGGCC-------TACTGACGGC-CTCG-A-TCAGCTTCCCT--TTCT-CTTCCCTCTGA-CAGAAA--TGTTTTGACTCAG-TATGTCGGCT
gi|20 : aCTCAAAAC-ATTTTTGT---T-ACGTTA--TCT----TTTGT-TA----TT-T-TAG----GCT-TTTA----------TAT-A-G-A-CGAGAG--T--CCA----GCCG-TA-TT----TA------AAAT-------------GTTACCT--ATA--GG--TGTgtgagtatccatggctacagtg
gi|21 : tgtgaacatttaaatcccGT----A--CAG-T-TTGAGGCTTATATCCTTTACATA
gi|22 : ggcacttgcggccgtataagggaccgccatttttaaaagatcgtatccgacagatatttggcgaagaagcagA---GCATC-TTCTGATT--CAC-ATTTCATTTTT--C---ACGT---CCTT-G-AA-T-GTTTTCACT-GAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATCTTGnc
gi|23 : AAAAAGTTGCCT--GTA--GG--TGTCC-AATAAGTGGACAAT---T-AC-TG-TACATTA--T------T
gi|23 : tgtactt-TCCATTG--T------TATA--A-A-T----AA---T---GTAC-A----G--T-AATT-G---T-CCA------CTTA--TT------GGACA-tataacaatggagagt
gi|25 : tgtacttaaaaagttgcctgtaggTTAAAAC-ATAATTGT---T-ACGCAA--TCC----TTTAT-------TT-T-C-G----GTT-GTTA----------TAT-AGC-A-TATAA---T--CCgagt
gi|26 : gggca-A-T-T-C-T-----------G--T-A-G-AGAAAGAACCGA-T------ATC----G------GACTTGCAATGTAC-G--TGC-CTCG-A-CCAGTT---
gi|27 : -A-TCAGTT---CT--TTCT-CGC-------A-CAA-AA--TGG----A--CAGTT-TTTCGACTTTTA--CTTTACATAA
gi|28 : GTTTAAAAC-ATGATTGT---G-ACGTAA--ACC----TT--T-TG----TT-T-G-A----ATT-GTC-----------CAT-A-CTA-TAa
gi|29 : ------GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAACATATAAAAAG-A-----CA-GA--AGAT-GCGTTTG------T----CAAACg
gi|3 : TAAAAC-ATAATTGT---TGACGCAA--TCC----TTTGT-TAAT--TT-T-C-G----GTT-GTTA----------TAT-AGC-A-ATAAA---T--CCAT---GTAAAT--TT----CA------AAACAAT---CCAATAAGTT-CCT--GTAAGCG--TGTCCCAATAAGTTTAGAAAA--T-G--TG-TCCATTA--T------TAA---C-T-T----AT---T---GGAC-A----G--T-TATT-G---C---A------CTTA--TT------G-ACA--TGTC--AG-------GTTAAACG-ATAAAAAG-G-----CAAGA--AGATTGCGTTG-------T----CAC-CAA-AAGT-----AAATTTT-AATCCTAATAACAAC-GCA-----TGTCCACCAAGTA----AC-TCTGAGACCAC------ACCGAAAA---------------TCGACGTCGTACCCAC----CCC--CACCATCACATTATGAAACTTCTCT----T-GATTCAGA----------AC----CATCTC-----C-----ACAT---TG-CTTAAAATGC----GATTTTTTTTT--AT-GTT---------TTCC-TA---GCATCCTTTGGACTTCCACCATCTTTCCTTTTTC---ACCTATCCCTT-GCAACT-GATCTACCTCGATCTTT-CCCTCAGCTGGG--TCTTG--CTACATTTCTGCTCGCGAGAGTTATGGAACGGACTGCTG-ATGGAGAATCTAATCTCCAGTTTTTTTCAGTAATGAGTTGTTTCATGCTA------CTTCCAGCCATCG-TA-CAGTTTTG-TGGCTACAAGTGG---CACCGCT-T----GA---------G---------AA-------------ATG-TC-CTT-TGAAAT---CCCGCCT-GTTCACGAA-------T--AGCT--TGGTGACGGGGTTT-CTGT-AAAAACATG----AA-C-ACC---AACTCGGG-------TG-ATCTG-CATA--CCG-A---ATATG---TCCGAAGAAAAGA-TGTCACTTTT--TA-A-ACT-GAA---GTTAGC--GCTTCAT-A--T-CAG-A---TTCT--CCT-TC-----TC-TAT---ATCAA---GA-CA-TCA-CATG----AG---AA----CTG-TTA--TC-G---GT--ATT-T-A---------CAC-----TTTC-AC-TCTCT----ATTCCT---------------------T-GC--------G-TGAGA-------CAAATG--C-T-----CTCTCCATCAGAGGATCACT-CCATGTTG-GTA--T-GA-TTC--AATGG----TGAAA----G-TG---A--A----ATA---TTTAA---GA---TTTCAAAGT-TTTT--ATAGACC----------TT-A---GA--A-TTACTAA-A--AACTG---TCC-A-TA--AGTA-A-AAACA-------AAA------GA--A------C-AGCTT-C--CCAAA-GAC--GG-TTTGGTT--AT-GTTGG-GAGTAT-TTA---------AGA-ACA-G--CT-T----T----C-C---TGGCA--------AGCAGG--ACCT-TTATGAA--GACAA---------TGG---AT-TAATCA-G-GAA--AC-T-AA--AA-TC--T-TTTTG-ACC-TGGAGGTGAT--A--GTT--AT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATACAA-----GA------GAT---AAT---GTT-T-TA-AA-------GTA---GG-ATA-G----AAG-CT-CAAA--CTG-T--A--C-A-T-T-C-TG----------G--TAA-GAAGAAAGAACTGA-T-------TC----G------G-CC-------TAC-G--GGC-CTCG-ACTCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A-C-G-AA--TGT----A--CAG-T-TTTCGGCTTATATCCT
gi|30 : c--GGC-CTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTT-------A-CAG-AA--AGG----A--CAG-
gi|4 : GCTTAAAAC-ATAATTGT---T-ACGCAA--TCC----TTTGT-TA----TT-T-C-G----GTT-GTTA----------TAT-G-C-A-TAAAA---T--CCAT---GTAAAT--TT----AA------AAACAAT---CCAATAAGTTACCT--GTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTAGAAA---T-G--TG-TCCATTA--T------TAAA--C-T-T----AT---T---GGAC-A----G--T-TATT-G---T-CAA------CTTA--TT------GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAACGAATAAAAAG-G-----CA-GA--AGAT-GCGTTT-------T----CACACAA-AAG--TAAA----TTTTAATC--TA-AATAAC-ACGAA---TGTC-AC-AAGTAG--AACATCTGAGACCAC------ACCGAAA---------TCA----TTG--GTCGT---TAC----CAC--CAC-ATCACATTATGAA-CTTCTCT----TTGATTCAGA----------AA----CATCTC-----C-----ACAT---TG-CT-------C----AATTTTTTTTT--AT-GTT---------TTCCTTA---GCATC-TTTGGATT--CAC---TTCATTTTTTTC---ACTT---CCTT-G-AA-T-GATTTCACT-GAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATCTT-GGTTA----TTTGC--ATGA-AGTTATG-AACGGACTGCTG-ATG----ATCTA-TGTCCAG-TTTTTTCAGTAATGAGTTGTT-CAT-CTA------C--CCAGC-ATCA-TA-CAGTCTTG-TGGCTACA-GTGG---CAC-GT--A----GA---------G---------AT-------------ATG-GT-CTT-TGAA-T---CCTGCCT-GTTCAC--A-------T--AGCT--TGGCGACGAT-TTT-CTGT-AAAA-CATG----AA-C-ACC---AAC--GGG-------TGCATCTG-CATA--CC--G---A-AT-A--TCCGAAAA---GA-TGTCACTTT---TA-A-ACT-GAA---GTTAG---GCTTCAT-A--T-CAGCA---TTCT--CCT-TT-----TC-TAT---ATCAA---GAACA-TCA-C-TG----AG---AA----C-G-TTA--TC-G---GT--ATT-T-A---------CAC-----TTTC-AC-TCTC-----ATCCCTA-A---A-TTTT----G-AT-T-GT--------G-TGAGG-------AAAATG--C-T-----CTCTCCATCAGAGGA--ACT-C-ATGTTT-GTA---TGA-TTC--AATGG----TGAAA----G-TG---A--A-TGACTA---TTTAA--TGA---TTTCAAG----TTT--ATAGACC----------TTTA---GA--ACTTACCTG-A--AACTG---TCC-AATA--AGTA-A-AA-CA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-C--C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTG-TGG-GA-TAT-TTA---------A-A-ACA-G--CT-T----TA---C-C---TGGCA--------G--AGG--ACAC-TGATGAA--GACAA---------TGG---AT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--A-TTTTG-ACT-TGGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTA---GG--TA-G----AAGCCT-CAAA--CTG-T--A--C-A-T-T-C-T-----------G--TAA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCC-------TAC-G--GGC-CTCG-A-TCAGTTG--CT--TTCT--TC-------A-CA--AA--TGT----A--CAG-T-TGTCGGCTTATATCCTTTACTTAAACACCATTGCATTGCAGGGTTGGGTA
gi|5 : taCTTC-T-A--A-CA--A---TTAT--CTTGTC-----TC-AATGTAATCA----GAACA-TCA-C-TG----AGT--AA----C-GGTTA--TC-GTCAGTTTATT-T-A---------CACACTTTTTTC-TCATCTCGTGCAATCACCATA---A-TTTT----ACAT-TTGC--------G-TGAGACGGTTACAAACTG--C-TACCATCTCTCAAGCAGAG-A--ACTAC-ATGTTTGGTA--TTGAGTTCAGAAT-G----TGAAA----GATGA--A--A-TGAATA---TCTAAATTGA---TTTCAGATGTTTTT--ATAGGACAACGTCTTGATTTATGGGAATATTTACCTG-ATTAACTGGATTCC-GATAGGAGTATA-AC-CA-------AAACATAATGA--AATCAATC-AGCTC-A--C--AAGGACT-GG-ATT--TTCAATTGTAGGTGA-TAT-TTA---------A-AGACATG--TTCT----TACATC-C---TGGAGATCTTTGTG--AGA--CCACTTTAGGAA--GACAAATGCGTTTTTGT---AC-TA--TG-GAAAA--ACAG-AATTAA-TCATA-TTCTA-ACATTGGGACT--T--AGGCCTCGCA--ATTATCATATGCA-ATCAT-G--AATATACATATGTA------TGTATAAAT---GTTGTAT--AA-------GTATAGAG-ATA-AGTATAGGCCTCCAAA--CTG-------C-A-T-TGC-TTACTAGCTCAAG--TAAGG-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------G-CC-------TAC-G--GGCTCTCG-ATTCAGTT---CTTCTTCTGCTC-------ACCAG-AAATTGT----A--CAG-T-TT---GC-TACGTCCTTTACTCA
gi|6 : ctatgatgtaaaagggaA---GTTAG---GCCTCATTA--TGCAGCAA--TTCT--CCT-GC-----TT-TGTG--ACCAA---GAACA-TCAGC-TG----AGGAGAA----C-G-TTA--TCCG---GT--ATTGT-A---------CAC-----TTTCGAC-TCTC-----ATCTC-A-A---A-TTT-----G-AT-T-GC--------G-TGAGG-------AAA-TG--CGT-----CTCTCCATCAGCGGACAACT-C-ATGTTT---A--TGGA-TTC--AATGG----TGAAA----G-TG---A--A-TGAATACAGTTAAA--TGAGC-TTTC-AG---TTTTTAATAGACC----------CTTA---GA--AATTACCTG-A--AACTG---TCC-AATT--AATA-AGAA-CA-------AAA------AG--AA-----C-AGCTT-TCAC--AA-GACTGGG-TTT--TT--ATTATTGA-GG-TAT-TTAT--------A-A-ACA-GTTTT-T----TA---CTT---TGGGA--------G--TGG--ACACTTTAGGAAACGACAA---------TGG---ATGTA--TA-G-GAATCACATAAA--AA-TC--A-TTTTGAAC--TGGA--T--T--A---CT-GAA--ACTATC-----CA-AT-CTAT--AATATAAA----GA------GAT---AGT----TT-T-T--AA-------GTA---GG-ATAGG----AAGCCT-CAAAG-CTG-T--A--CGA-T-T-C-T-----------G--TAA-G-A-AAAGAACTGACT------CTC----G------CCCT-------TAC----GGC-CTCGAA-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------ACCAGCAA--T-T----A--CAG-T-TTTCGGCTTATATCCTTtgctggataatggaagtcctttaactaggcaagtataatttaagagtttttacatggcatttgacaacttaaaagcatatgctaggcttatttattctggcataaaatctatgtttgcgctgttttccaaacttttatgctatatttttcaggctcagaacatggcaatgatgaacgcaactatcacctgagaagaacttcaaatatatacgtacaagcattggtcatcaatgtctatctggtatgcgatgaccgttggtgtccttttcttccag
gi|6 : TAAGGAGAGGTT-CAT-TGAACATGGCT-CCAGCTATCGGTA-CAGTCTTG-GGGCGGCA-CGGG---CAC-GTA-GAT--GA---------ATGGTTTGT-AA-------------ATG-GC-CTTGTGAA-T---CCTGCCTCGTTCAC--A-------TG-AGCT--TGGCG-CGGTGTTC-CTGT-AAAA-CATG----AACC-ACC---AAC--GGG-------T-CATCT--CATACGCCGAG---AGATGA--Tagggcaagtataattcagagttttacgcatgactttgcatttaatgcaggctccgtatatttttcgccaaataactatttctcgttgcacttttgctatatttcaggggccagaaaatgggatgtgcacgctctatacctaccaccgacagagacactcaaatactaagcaacatcatctctcggcgtatgagatgacccgttggtggttcatgttttacaggaacaccgcgccaagctcatgtgaacgaggcaggattcacaaggccatttacaaaccattcatctacgtgcccgtgccgccccaagactgtaccgatagctggagccatgttcaatgaacctctcctta
gi|7 : aaggatataagccgaaaactgtaattgctggtgagagaaagaactgattcgaggccgtaagggcgagagtcagttcttttcttacagaatcgtacagctttgaggcttcctatcctacttaaaaactatctctttatattatagattggatagtttcagtaatccagttcaaaatgatttttatgtgattcctatacatccattgtcgtttcctaaagtgtccactcccaaagtaaaaaactgtttataaatacctcaataataaaaacccagtcttgtgaaagctgttctttttgttcttattaattggacagtttcaggtaatttctaagggtctattaaaaactgaaagctcatttaactgtattcattcactttcaccattgaatccataaacatgagttgtccgctgatggagagacgcatttcctcacgcaatcaaatttgagatgagagtcgaaagtgtacaataccggataacgttctcctcagctgatgttcttggtcacaaagcaggagaattgctgcataatgaggcctaactagggcaagtataattcagagttttacgcatgactttgcatttaatgcaggctccgtatatttttcgccaaataactatttctcgttgcacttttgctatatttcaggggccagaaaatgggatgtgcacgctctatacctaccaccgacagagacactcaaatactaagcaacA---GTTAG---GCTTCAT-A--T-CAGCA---TACA--CCT-TC-----TC-TA----ATCAA---GAACA-TCA-C-TG----AG---AA----C-G-TTA--TC-G---GT--ATT-T-A---------CAC-----TTTC-AC-TCTC-----GTCCCTA-A---AATTTT----G-AT-T-GC--------G-TTAGA-------AAAATG--C-T-----CTCTCCATCAGAGGA--ACT-C-ATGTTT-GTA--T-GA-TTC--AATGA----TGAAA----G-TG---A--A-TGAATA---TTAAA--TGA---TTTCAAT---GTTT--ATAGACC----------TT-A---GA--ACTTACCTG-A--AACTG---TCC-AATA--AGT--A-AA-CA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-CA-C--AA-GAAT-GG-TTT--TT--ATTGTTGA-AG-TAT-TCA---------A-A-ACA-G--CT-T----TA---C-C---TGGGA--------G--AGG--ACAC-TTATGAA--GACAA---------TGG---AT---------------------A--AA-TC--A-TTTTA-AC--TGGC--T--T--A--CCT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTA---GG-ATA-G----AAGCTT-CAAA--CTG-T--A--C-A-T-T-C-T-----------G--TAA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCC-------TAC-G--GGC-CTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A-CAG-AA--TGT----A--CAG-T-TTTCGGCTTATATCCTTTACATA-----CATTG-ATTG-
gi|7 : ggcactttggaggccttagtgatcgttttggtaaagatagtgacaagatggcagaatgtgaagagacaaAATGAGTTGTT-CAT-CTA------CT-CCAGC-ATCG-TA-CAGTCTTG-TGGCTGCA-GTGG---CAC-GTAGA----GA---------ATGGTTTGTAAA-------------ATG-GC-ATT-TGAA-T---CCTGCCT-GTTCAC--A-------T--AGCT--CGGCGACGGT-TTT-CTGT-AAAA-CATG----AA-C-A-C---AAC--GGG-------TGCATCTG-CATA--CCA-G---G-ATGA--Taaggcaagtataatcatgagttttacatgcatttgacatttaatgcaggcttatatttttgcaaacactaattctgttcactttttttatatttcaggccagaaaatggcaattgtgacgcactatactgagacaactcaaatatagtacatcatcatcctggtatgcagatgcacccgttgtgttcatgttttacagaaaaccgtcgccgagctatgtgaacaggcaggattcaaatgccattttacaaaccattctctacgtgccactgcagccacaagactgtacgatgctggagtagatgaacaactcatt
gi|8 : ggcactttggaggccttagtgatcgttttggtaaagatagtgacaagatggcagaatgtgaagagacaacaatcaatgtatgtaaaggatataagccgaaaactgtacattctgtgagagaaagaactgatcgaggcccgtagggccgagatcagttctttctcttacagaatgtacagtttgaagcttctatcctacttaaaacattatctcctttgtattaatattggatagtatcaggtaagccagttaaaatgatttatccattgtcttcataagtgtcctctcccaggtaaagctgttttgaatacttcaacaataaaaaccattcttgtgaagctgtttcttttgtttacttattggacagtttcaggtaagttctaaggtctataaacattgaaatcatttaatattcattcactttcatcattgaatcatacaaacatgagttcctctgatggagagagcatttttctaacgcaatcaaaattttagggacgagagtgaaagtgtaaataccgataacgttctcagtgatgttcttgattagagaaggtgtatgctgatatgaagcctaactaaggcaagtataatcatgagttttacatgcatttgacatttaatgcaggcttatatttttgcaaacactaattctgttcactttttttatatttcaggccagaaaatggcaattgtgacgcactatactgagacaactcaaatatagtacatcA---GTTAG---GCTTCAT-A--T-CAGCA---TCC----CT-GC-----TT-TGT---ATCAAA--GAACA-TCA-C-TG----GA---GA----C-G-TTAAATC-G---GT--ATT-TTA---------CAA-----TTTC-AC-TCTC-----ATCCCTA-A-----TTTT----G-AT-T-GC--------GGTGAGG-------AAAATG--C-T-----TCATCCATCAGCGGA--ACT-C-ATGTT--GTA--T-GA-TTC--AATGG----T-AAA----G-TG---A--AATGAATA---TTAAAA-TGAATTTTTCAAG---TTTT--ATAGACC----------TT-A---GA--AATTAC-TG-A--AACTG---TCCCAATA--A-TA-A-A--CA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-C--C--A--GACT-GGGTTT--TT--ATTATTGA-GG-TAT-TTA---------A-A--CA-G--TT-T----TAA--C-T---TGGGA--------G--TGG--ACAC-TTAGGAAA-GACAA---------TGG---ATATA--TAAG-GAA--ACAT-AA--AAATC--A-TTTTA-AC--TGGAA-T--T--A--ACT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATATAAT---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTA---GG-ATA-G----AAGCCT-CAAA--CTG-T--A--C-A-TAT-CTT-----------G--TAA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCCT------TAC-G--GG--CTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A--AG-AA--TGT----A--CAG-T-TTTCGGCTTATATCCTT
gi|8 : -ATCG-TAACAGTCT-G-TGGCTGCA-GTGG---CAC-GTA-A----GA---------G---------AATGGTTTGTAGTAAATGTGC-CTT-TGAA-T---CCTGC-T-GTTCAC--ACTCATTAT--AGCT--TGGCGACGGT-TTTCCTGTAAAAA-CATGAC--AA-CAACCAAAAAC---GG-------TGCATCTG-CATA--CCA-GGCAG-ATGATGTTCTGATATT-GAGTG----TTCTCGTAGGTAATAG--------AG---GCGTCAC-A--T-TTGCAATTTTCTGGCCT-Taagccaagatataatatgtagtttacatggcatttgacattttaatgcaggcttttatatattttttcgcaaaaactatttctgttcacctttttctatatttcaaggccagaaaattgcaaatgtgacgcctctattacctacgagaacactcaatatcagaacatcatctgcctggtatgcagatgcaccgtttttggttgttgtcatgtttttacaggaaaaccgtcgccaagctataatgagtgtgaacagcaggattcaaaggcacatttactacaaaccattctcttacgtgccactgcagccacagactgttacgat
gi|9 : aaggatataagccgaaaactgtacattcttgagagaaagaactgatcgagcccgtaagggccgagatcagttctttctcttacaagatatgtacagtttgaggcttctatcctacttaaaacattatctccattatattaatattggatagtatcagttaattccagttaaaatgatttttatgtttccttatatatccattgtctttcctaagtgtccactcccaagttaaaactgtttaaatacctcaataataaaaacccagtctggaagctgtttcttttgtttattattgggacagtttcagtaatttctaaggtctataaaacttgaaaaattcattttaatattcatttcactttaccattgaatcatacaacatgagttccgctgatggatgaagcattttcctcaccgcaatcaaaattagggatgagagtgaaattgtaaaataccgatttaacgtctccagtgatgttctttgatacaaagcagggatgctgatatgaagcctaactaagccaagatataatatgtagtttacatggcatttgacattttaatgcaggcttttatatattttttcgcaaaaactatttctgttcacctttttctatatttcCTTAAAAC-ATAATTGT---T-ACGCAA--TCC----TTTGT-TA----TT-TTC-G----GTT-GTTA----------TATGG-C-A-TAAAA---T--CCAT---GTCAAT--TT----AA------AAACAAT---CCAATAAGCTACCT--GTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTAGAAA---T-G--TG-TCCATTA--T------TAAA--C-T-T----AT---T---GGAC-A----G--T-TATT-G---T-CAA------CTTA--TT------GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAACGGATAAAAAG-A-----CA-GA--AGAT-GCGTTTG------T----CAAACAG-AAG--TAAA----TTGTAA--TTTA-AATAAC-ATGAA---TGTC-AC-AGGTAG--AACATCTGAGACCAC------ACTG-AAA---ATCATTCATTATTTG--GTCGT---TACTCGTTACCACAC-ATCACATTTAGAA-CTTCAAT----TTGAAAGACA----------AATTGTTATGTT-----C------TATA--TG---------------AATTTCTCTTT--AT--TCAGAGGCACATTCAAAA---ACATC-TCCAAATT------GCTTAATTTTTTTTATGATTT---CCTT-
gi|9 : TATGAA-TTTCTCT----TT-ATTCAGAGGCACATTCAAA-AA-CATCTC-----C-----AAAT---TG-CT-------T----AATTTTTTTT---AT-GAT---------TTCCTTATCAGCATC-TTCTGATT--CAC-ATTTCATTTTTT-C---ACTT---CCTG-G-AA-T-GATTTCACT-AAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATTTTGGGTTC---TTTTG-----------TATG-AATGGACTGCCG-ATG----ATCTA-TGTCCAGTTTT--TCAGTAATGAGTTGTT-CAT-CTA------CT-CCAGC-ATCG-TA-CAGTCTTG-TGGCTGCA-GTGG---CAC-GTAGA----GAATGGTTTGTA---------AA-------------ATG-GC-ATT-TGAA-T---CCTGCCT-GTTCAC--A-------T--AGCT--CGGCGACGGT-TTT-CTGT-AAAA-CATG----AA-C-A-C---AAC--GGG-------TGCATCTG-CATA--CCA-G---G-ATGA--Tatcagcatcttctgattcacatttcattttttcacttcctggaatgatttcactaattttcacaagctgggcattttgggttcttttgtatgaatggactgccgatgatctatgtccagtttttcagtaatgagttgttcatctactccagcatcgtacagtcttgtggctgcagtggcacgtagagaatggtttgtaaaatggcatttgaatcctgcctgttcacatagctcggcgacggttttctgtaaaacatgaacacaacgggtgcatctgcataccaggatgatgatgtacta
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): GATGACATTAGTGATGAAACAGCAGTTTTGTGTATTCATAATATGCATTATTTGATGTGAAGGGA
Alignments
lowQualScore : 11 1111 2222 22222222 3333333333 11111 111 111 11 444444444444 111 11 22222222 333333333333333333333333333333333 111111 1 11111 222222 333333 3333333 3333333 444444444444 1 33333333 1 222 1 222 333333 2222222222 11 111 2222 111 2222 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111 2222222222222 11111 1 1 1 111 22222222 1 1111 11 1 111111 1 1 111 8888888888888888888888888888888888888888888 1 111 2222222222 11 11 22222 44444444444444444 11111 111 1111111 222 111 1 111 222 11 111 33333333333333 222 1 222222222222222 1 111 444444444 111111 11111 33333333333333333333333333333333 11111111 22222222 11 2222 2222 2222 222222 22 222 1111 33333333333 222 1 2222222 111111 111111111 1111 444444444 222222222222222 11111111 11 11 111111111 111 11 11 11111 1111 1111111 111 11 1111111 11111111111111 11111111111111111 111 1111111 11111 222222 1
lowQualScore : 8 3 777 4 11 7777 8 2222 4 00000000 4 5555555555 4 66666 4 555 66 777 11 44 111111111111 3 777 1 22 66 66 5 0 66666666 4 888888888888888888888888888888888 111111 66 5 0 33333 888888 0 66 000000 8 66 2222222 5 6 5 1111111 5 77 5 555555555555 5 5 11111111 9 7 3 999 8 6 222 9 0 888888 7777777777 88 111 0000 555 6 5 0 3 1111 8 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 000 8888888888888 8 888 5 22 66 77 33333 888 0 5 5 1 5 5 1 5 111 22222222 6 3 4444 44 5 5 5 666666 5 0 5 5 0 6 5 777 5 6666666666666666666666666666666666666666666 5 0 5 5 777 5 66 6666666666 33 66 4 4 4 00000 4 3 22222222222222222 1 8 66 77 22222 66 1 1 333 6 6666666 222 444 1 555 000 0 4 11 4 222 66 4 33333333333333 222 0 5 5 555555555555555 0 66 5 888 66 5 5 000000000 555555 5 5 77777 77777777777777777777777777777777 77 77777777 0 11111111 66 66 5 5 11 3333 5 66 1111 1111 5 777777 5 888 0 11 555 5555 66 33333333333 3 888 66 4 8 66 333 3 66 99 4 4 8888888 222222 444444444 8 8888 66 4 4 4 66 66 4 4 8 000000000 4 4 4 66 4 777777777777777 1 66666666 66 22 8 00 777777777 555 8 66 4 4 66 4 66 4 66 8 4 33 22 44 44 555 3 44 33333 6 3 3333 555 777777 444 444 5 2 66 5555555 000 2 888888 2 00 0000000 2 5 2 2 5 55555555555555 4 2 5 0 2 777777 5555 66666666666666666 7777 2 2 5 000 33 2 7777777 5 8 33 00000 66 2 5 1 0 111111 2 3
lowQualScore : . . ... . .. .... . .... . ........ . .......... . ..... . ... .. ... .. .. ............ . ... . .. .. .. . . ........ . ................................. ...... .. . . ..... ...... . .. ...... . .. ....... . . . ....... . .. . ............ . . ........ . . . ... . . ... . . ...... .......... .. ... .... ... . . . . .... . ......................................................... ... ............. . ... . .. .. .. ..... ... . . . . . . . . ... ........ . . .... .. . . . ...... . . . . . . . ... . ........................................... . . . . ... . .. .......... .. .. . . . ..... . . ................. . . .. .. ..... .. . . ... . ....... ... ... . ... ... . . .. . ... .. . .............. ... . . . ............... . .. . ... .. . . ......... ...... . . ..... ................................ .. ........ . ........ .. .. . . .. .... . .. .... .... . ...... . ... . .. ... .... .. ........... . ... .. . . .. ... . .. .. . . ....... ...... ......... . .... .. . . . .. .. . . . ......... . . . .. . ............... . ........ .. .. . .. ......... ... . .. . . .. . .. . .. . . .. .. .. .. ... . .. ..... . . .... ... ...... ... ... . . .. ....... ... . ...... . .. ....... . . . . . .............. . . . . . ...... .... ................. .... . . . ... .. . ....... . . .. ..... .. . . . . ...... . .
lowQualScore : 9 4 000 0 00 0000 0 5555 0 44444444 0 0000000000 0 44444 0 666 11 555 44 44 555555555555 2 555 1 22 11 11 0 2 44444444 4 333333333333333333333333333333333 666666 99 0 0 55555 888888 4 99 000000 9 99 5555555 0 6 0 1111111 7 99 7 333333333333 0 0 88888888 8 3 3 777 0 7 000 8 7 333333 5555555555 33 777 8888 888 7 0 1 2 2222 5 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 111 6666666666666 9 888 0 55 99 00 11111 888 0 7 7 4 7 7 4 7 777 88888888 7 3 2222 00 5 7 7 444444 7 0 0 0 0 2 0 555 0 2222222222222222222222222222222222222222222 0 0 0 0 555 0 99 0000000000 88 22 4 4 4 33333 4 9 44444444444444444 1 9 11 11 77777 11 0 8 888 7 5555555 555 222 7 666 000 8 0 00 0 222 11 4 66666666666666 555 0 0 0 000000000000000 0 99 0 888 99 0 0 000000000 888888 0 0 55555 88888888888888888888888888888888 00 11111111 5 22222222 99 99 0 0 22 2222 0 99 2222 2222 0 222222 0 888 8 99 666 8888 99 11111111111 2 888 99 5 9 11 333 3 11 66 4 4 9999999 888888 111111111 9 4444 11 4 4 4 11 11 4 4 9 000000000 4 4 4 11 4 222222222222222 0 11111111 11 22 9 66 888888888 666 9 11 4 4 11 4 11 4 11 9 0 55 55 66 22 666 1 22 88888 2 1 5555 000 777777 777 777 3 7 33 0000000 000 7 222222 9 77 5555555 7 3 7 7 3 44444444444444 1 7 3 9 7 777777 7777 88888888888888888 2222 5 5 0 666 77 7 3333333 3 0 77 88888 99 5 3 0 8 555555 5 3
consensus : NNGCTTAAAAC-ATAATTGT---T-ACGCAA--TCC----TTTGT-TA----TT-T-C-G----GTT-GTTA----------TAT-A-C-A-T-AAAA---T--CCAT---GTNAATA-TT----AA------AAACAAT---CCAATAAGTTACCT--GTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTAGAAA---T-G--TG-TCCATTA--T------TAAA--C-T-T----AT---T---GGAC-A----G--T-TATT-G---T-CAA------CTTA--TT------GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAACGGATAAAAAG-G-----CA-GA--AGAT-GCGTTT-------T----CACACAACAAGTTTAAGAGATTTTTAATCTTTATAATAAC-ACGAA--TTGTCTAC-AAGTAG--AACATCTGAGACCGC------ACCGAAAATC--TC-A----TTG--GTCGT---TAC----CAC--CAC-ATCACATTATGAAACTTCTCT----TCGATTCAGA----------AA-CG-CATCTC-----C-----ACATA--TG-CT-------C----AATTTTTTTTT--AT-GTT---------TTCCCTA---GCATC-TTCGGATT--CAC-ATTTCATTTTTTTC---ACTT---CCTT-G-AA-T-GATTTCACT-GAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATCTTGGGTTA---TTTTGC--ATGA-AGTTATG-AACGGACTGCTG-ATG----ATCTA-TGTCCAGTTTTTTTCAGTAATGAGTTGTT-CAT-CTA------CT-CCAGC-ATCG-TA-CAGTCTTG-TGGCTGCA-GTGG---CAC-GTA-A----GA---------G---------AA-------------ATG-GC-CTT-TGAA-T---CCTGCCT-GTTCAC--A-------T--AGCT--TGGCGACGGT-TTT-CTGT-AAAA-CATG----AA-CACCAAC--G-----GG-------TGCATCTG-CATA--CCG-G---A-ATGA--TCCGNANACT-GA-TG-CCA---CTTTT-C-TA-ATACTAGAA---GTTAG---GCTTCAT-A--T-CAGCA---TTCT--CCT-TC-----TC-TAT---ATCAA---GAACA-TCA-C-TG----AG---AA----C-GTTA--T-CG---G--TATT-T-A---------CAC-----TTTC-AC-TCTC-----ATCCCTA-A---ATTTT----G-A-T-TGC--------G-CGAGA-------AAAATG--C-----TCTCTCCATCAGAGG--A--ACT-C-ATGTTT-GTA--TTGA-TTC--AATGG----TGAAA----G-TG---A--A-TGAATA---TTTAA--TGA---TTTCAAG---TTTT--ATAGACC----------TTTA---GA--ACTTACCTG-A--AACTG---TCC-AATA--AGTA-A-AA-CA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-C--C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTGTTGG-GA-TAT-TTA---------A-A-ACA-G--CT-T----TA---C-C---TGGNA--------G--AGG--ACAC-TTATGAA--GACAA---------TGG---AT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--A-TTTTG-AC--TGGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTA---GG-ATA-G----AAGCCT-CAAA--CTG-T--A--C-A-T-T-C-T-----------G--TGA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCC-------TAC-G--GGC-CTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A-CAG-AA--TGT----A--CAG-T-TTTCGGCTTATATCCTTTACNTAAACACCATTGCATTG-AGGGTTGGGTA
Reference ( family-455 ) : NNGCTTAAAAC-ATAATTGT---T-ACGCAA--TCC----TTTGT-TA----TT-T-C-G----GTT-GTTA----------TAT-A-C-A-T-AAAA---T--CCAT---GTNAATA-TT----AA------AAACAAT---CCAATAAGTTACCT--GTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTAGAAA---T-G--TG-TCCATTA--T------TAAA--C-T-T----AT---T---GGAC-A----G--T-TATT-G---T-CAA------CTTA--TT------GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAACGGATAAAAAG-G-----CA-GA--AGAT-GCGTTT-------T----CACACAACAAGTTTAAGAGATTTTTAATCTTTATAATAAC-ACGAA--TTGTCTAC-AAGTAG--AACATCTGAGACCGC------ACCGAAAATC--TC-A----TTG--GTCGT---TAC----CAC--CAC-ATCACATTATGAAACTTCTCT----TCGATTCAGA----------AA-CG-CATCTC-----C-----ACATA--TG-CT-------C----AATTTTTTTTT--AT-GTT---------TTCCCTA---GCATC-TTCGGATT--CAC-ATTTCATTTTTTTC---ACTT---CCTT-G-AA-T-GATTTCACT-GAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATCTTGGGTTA---TTTTGC--ATGA-AGTTATG-AACGGACTGCTG-ATG----ATCTA-TGTCCAGTTTTTTTCAGTAATGAGTTGTT-CAT-CTA------CT-CCAGC-ATCG-TA-CAGTCTTG-TGGCTGCA-GTGG---CAC-GTA-A----GA---------G---------AA-------------ATG-GC-CTT-TGAA-T---CCTGCCT-GTTCAC--A-------T--AGCT--TGGCGACGGT-TTT-CTGT-AAAA-CATG----AA-CACCAACT-G-----GG-------TGCATCTG-CATA--CCG-G---A-ATGA--TCCGNATACT-GA-TG-CCA---CTTTT-C-TA-ATACTAGAA---GTTAG---GCTTCAT-A--T-CAGCA---TTCT--CCT-TC-----TC-TAT---ATCAA---GAACA-TCA-C-TG----AG---AA----C-GTTA--T-CG---G--TATT-T-A---------CAC-----TTTC-AC-TCTC-----ATCCCTATA---ATTTT----G-A-T-TGC--------G-CGAGA-------AAAATG--C-----TCTCTCCATCAGAGG--A--ACT-C-ATGTTT-GTA--TTGA-TTC--AATGG----TGAAA----G-TG---A--A-TGAATA---TTTAA--TGA---TTTCAAG---TTTT--ATAGACC----------TTTA---GA--ACTTACCTG-A--AACTG---TCC-AATA--AGTA-A-AA-CA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-C--C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTGTTGG-GA-TAT-TTA---------A-A-ACA-G--CT-T----TA---C-C---TGGNA--------G--AGG--ACAC-TTATGAA--GACAA---------TGG---AT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--A-TTTTG-AC--TGGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTA---GG-ATA-G----AAGCCT-CAAA--CTG-T--A--C-A-T-T-C-T-----------G--TGA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCC-------TAC-G--GGC-CTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A-CAG-AA--TGT----A--CAG-T-TTTCGGCTTATATCCTTTACNTAAACACCATTGCATTG-AGGGTTGGGTA
gi|1 : TAAGACCATA--TGT---T-ACGCAACATCCAATCTTTGTATAAATTTT-T-C-GTGTAGTT-GTTAACTCTGTACCTAT-A-C-GCT-AAGACATT--CCATAATGTGAATA-TTTATAAATGAGGCAAAAAATTGCCCAATAA-TTACCTTTGTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTAAAAACAAT-G--TG-TCCATTG--CAGTTTCTACA--C-TAT----AT---TTGAGAACTA----G--T-TATTAG---TACAAAATGACTTTA--TTTATCTGAGACAAGTGCC--AGTGTTGTCAT-ATACAGATAAA--T-GTTTTTCA-TG--AGAT-GCGTTT-------TGTCACACACAACAAGTTTAAGAGATTTTTAATCTTTATAATAACTACGAAATTTGTCTAC-AAGTTATTAACATCAG-GACAGCCAAGCGACCGAAAATC--TC-A----TTG--GTCGT---TAC----CAC---AC-ATCACATTATGAAACTTCTACATAATCGATTCAGA----------AAATG-CATCTT-----CTCCATACATA--TAACT-------CTAAAAATTTTTTTTC--GTTGTT---------TTCCCTA---GCATC-TTTGGGTT--CAC-ATTTCATTTTTT-C---ACTT---CCTTTG-AA-TCGATTTCACT-GAT-TTTTCAC-AAGCTGGGCATCTTGGGTTA---TTTTGC--ATGA-AGTTATG-AACGGACTGCTGTATG----ATCTA--GTCCAG-TTTTTTCAGTAATGAGTTGTT-CAT-CTA------CT-CCAGC-ATCA-TA-CAGTCTTGTTGGC-ACA-GTGGATATAC-GTG-ATAGTGA---------G---------AA-------------ATG-GTACTT-TGTA-TTTCCCTGCCT-GTTCAC--A-------TTAGGCTTCTGGCGACGA--TTT-CTGT-AAAA-CATGTATAGA-CACCAACT-G-----AGAGAGTTATGCATCTGCCATA--CCG-G---A-ATGA--TCCGTATACT-AA-TG-CTA---CTTTT-C-TA-ATACTAGAAAGTATTAGGTTGCTTCAT-ATCT-CAGCA---TTCT--CCT-TTATTAATCTTATTA-GTCAATGTGAACATTCA-C-TGTGCTAG---AAACTTC-AGTA--T-CGC--G--TATT-T-ATGCGTACAGCAC------TTC-AC-TCTC-----ATCCCTATATATATTCTCTCCG-A-TATGCTGGTAGATG-CAAAA-------AAATTGTCC-----TTTTTCCATCAGAGG--A--ACT-C-ATGTTT-GTATTTTGA-TTC--AATGGTTATTGAAAAGTTG-TGCGTACTA-TGACTA---TTTAAT-TGAT--TTTCAAG---TTTT--ATAGACC-----------TTA---GA--ACTTACCTGTA--AACTACTTTCCTAATA--AGTT-A-AA-CATACACACAAA------GAAGAG-----CGAGCTTCC--C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTGTTGG-GA-TATATTATAATGCCACA-A-ACA-G--CT-TATGATG---C-CTTGTGGCA--------G--AGGATACAC-TTATTGA--GACAA---------TGGCGCAT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--ATTTTTG-AC--TGGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATCG----CATAT-AT-TTAAATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTAG--GG-ATA-G----AAGCCT-CAAACCCTGCT--A--C-ATT-T-C-T-----------GTTTTA-G-AGAAAGTAAT---T------CTC----GTATTCAGGCC-------TACTGACGGC-CTCG-A-TCAGCTTCCCT--TTCT-CTTCCCTCTGA-CAGAAA--TGTTTTGACTCAG-TATGTCGGCT
gi|10 : aTATAAC-ATAATTAT---T-ATGCAA--TCC----TTTGT-TA----TT-T-TTG----GTTTGTTG-----------AT-A-G-A-T-AAAA---T--CCAT---TTAAATAATT----AA------AAACAAT---CCAATAAGTTACCT--GTA--CGCATGTCC--ACAAATTTAGAAA---T-AGTTGTTCCATTAGTT------TAAGATCGT-T----ATCTCT---GAGT-ACCACG--TCTATT-GTGCT-CAA------C-TAGTTT------AGACA-GTGCCTTAG-------GT-AAAGGTATATAAAGTA-----CA-GATTAGAT-GCATTTTAGGTTGT----CTC-CAACAGATT----ACATATTTAATC-TAATATTAGC-ATGAA--TTGTC-AA-AGGTAG--AACATCTTGAACCAC------ACTGAAAATCCGTCTA----TTGGAGTTGT---TACG---CAC--CAC-AT---ACT-TGAA------CT----TCAATTTTGA----------AA-gtgagtatccatggctacagtg
gi|10 : AATTTCTCT----T-GATTCAGA----------GG-CA-CAT-TCATAAACATA--ACATAACTG-CT-------T----AATTTTTTTTTCAAT-AT---------------CA---GCATC--------T--CA----------TTTTTC---ACTT---CCTT-G-AA-T-GATTTCACT-GAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATCTTGGGTTC---TTTTG-----------TATG-AACGGACTGCTG-AAG----ATCTA-TGTCCAGTTTTTTTCAGTAATGAGTTagacaattcgttatgtttatttgaatttctcttgattcagaggcacattcataaacataacataactgcttaatttttttttcaatatcagcatctcatttttcacttccttgaatgatttcactgattttcacaagctgggcatcttgggttcttttgtatgaacggactgctgaagatctatgtccagtttttttcagtaatgagtt
gi|11 : tataacataattattatgcaatcctttgttatttttggtttgttgatagataaaatccatttaaataattaaaaacaatccaataagttacctgtacgcatgtccacaaatttagaaatagttgttccattagtttaagatcgttatctctgagtaccacgtctattgtgctcaactagtttagacagtgccttaggtaaaggtatataaagtacagattagatgcattttaggttgtctccaacagattacatatttaatctaatattagcatgaattgtcaaaggtagaacatcttgaaccacactgaaaatccgtctattggagttgttacgcaccacatacttgaacttcaattttgaaaagacaattcgttatgtttatttg--A--CCT-GGG--CCTGTC-----CA-TT-TT-T--AGAACAAA---A-A------TGC---AAC---GTT-T-T--CA-------GTT---GC-ATA-T----TAACCT-AAAA--TTG-T--C--C-A-T-T-C-T-----------G--TGA-G-AGAAAGAACTAA-TATTAGCCTTACGGG------GTCC-------TAC-G--GGC-CTTG-A-TCGATT---CT--TTCT-CTC-------A-CAA-AA--TGA----A--TAG-T-TTT-------TATCCTGTACTTAAACA----TGCATT
gi|12 : ggtttaATTGTAAAT-GTGTAA--TCA----TTTAT-TA----TTCT-A-A----GCT-TTGA----------TAT-A-----T-AAAA---TAGTC-T---GCCTACA-TT----TA------AAAC-------------GTTACCT--GTA--GG--TATCC-AATACGTTGACAAT---TAA--TG-TCCATTA--T------------C-T-TTCAGAA---T---GGAC-A----GTAT-TATT-G---C-CAA------CATA--TTG-----GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAtaccaatgtcaataggtttcatattacatgtgtttgtaaatctctcaccaatactatttcttactttctttttaacatccaagttgt
gi|13 : ctatatttaaagTTTA-AA--TGGA--T--TTTA--TCT--ATCAACAAAC-----CA-AA-AA-T--AA--CAAA---GGATTGCATAAT---AATTATGTT-A-T--AAAA-----GTA---GG-ATA-G----AAGCCT-CAAA--CTA-T--A--C-A-T-T-C-T-----------G--TAA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCC-------TAC-G--GGC-TTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A-CAG-AA--TGT----A--CCG-T-TTTCGGCTTATATCCTTTACTGAAA-ATAAATGCATTA-AAGttattagatgtttacaggttgcctgaaaacaagagaaaaagatgatgcatttgtttaaacataaacaaattcaattctaaat
gi|14 : atta------GAT---AAT---GTTGT-T--GAT------GCA---TGTAT--T----AAGC-T-CAAA--CTG-C-----C-G-T-T-CCT-----------A--TGA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTT----A------GTCC-------TAT-G--GCA-ATTG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A-T-G-AA--TGG----A--C-G-T-TTGAGGCTTATATCTTTTttaccaagatgcgttgactgcgtgata
gi|15 : ttgcatgactatgaaCTG-A--AACTG---TCC-AATA--AGTT-A-AA-CA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-CG-C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTGTTGG-GT-TAT-TTA---------A-A-ACA-G--CT-T----TA---C-T---TGAAA--------G--AGG--ACAC-TTATGAA--GACAA---------TGG---AT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--A-TTTTA-AC--TAGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-C--AATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-TTGAA---------A---AG-ATA-A----AAatatataaaggttgtgattccaacgatgacattattcaatgatggaccaacagttttgtgtattgcacatgcattgtttgatctgaagagaa
gi|16 : at--T--T--A--TCT-GAT--TCCACC-----CC-AC-AT---------AAA---GAA------AAG---CAT---GTT-T-T--AA-------TTA---AG-AGA-A----AAGCCA-CAAA--CTA-T--C--A-A-C-T-C-T-----------G--TGA-A-AGAAAGAACTAA-----------------------------------------------A-A-TTAGTT---CT--TTTT-CTC-------A-CAG-AA--TGG----A--CAG-C-GTTTGGCCTTTCACTTTTACATA
gi|17 : acAATT---CT--TTCT-CTC-------A-CAG-AA--TGG----G--CAG-A-TTTCGGTCTTTCTCCTGTACATAacaaaa
gi|18 : catcactacatg--T--T--A--TAT-GAT--G-TATC------A-AT-AT-TTGAATACA----------------C---AAT---GCT-T-T--AACTCCATAGCA---AG-GTA-T----TAGCCT-GAAA--CTG-T--C--C-A-T-T-C-T-----------T--TGA-G-AGAAAGAACTAA-T------CTC----G------GCCTG------TA--G--GGC-Ccagctctatcgtatcaagccagctaaagtcaagtacatgtactttttccagtacaacaactctggagtttgaa
gi|19 : tttaattacatgtatttccACAAA---AGA------TGC---ACT---AGT-C-T--AA-------GTA---GG-ATA-T----AAGCAC-AAAA--CTA-TCTATCC-A-T-T-C-T-----------G--TGA-GGAAAAAGAATTAA-T------CAC----A------ACCT-------TAC-G--GAC-CTTG-A-TCAGTT---aa
gi|2 : aacgaaaacaacaTAAGACCATA--TGT---T-ACGCAACATCCAATCTTTGTATAAATTTT-T-C-GTGTAGTT-GTTAACTCTGTACCTAT-A-C-GCT-AAGACATT--CCATAATGTGAATA-TTTATAAATGAGGCAAAAAATTGCCCAATAA-TTACCTTTGTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTAAAAACAAT-G--TG-TCCATTG--CAGTTTCTACA--C-TAT----AT---TTGAGAACTA----G--T-TATTAG---TACAAAATGACTTTA--TTTATCTGAGACAAGTGCC--AGTGTTGTCAT-ATACAGATAAA--T-GTTTTTCA-TG--AGAT-GCGTTT-------TGTCACACACAACAAGTTTAAGAGATTTTTAATCTTTATAATAACTACGAAATTTGTCTAC-AAGTTATTAACATCAG-GACAGCCAAGCGACCGAAAATC--TC-A----TTG--GTCGT---TAC----CAC---AC-ATCACATTATGAAACTTCTACATAATCGATTCAGA----------AAATG-CATCTT-----CTCCATACATA--TAACT-------CTAAAAATTTTTTTTC--GTTGTT---------TTCCCTA---GCATC-TTTGGGTT--CAC-ATTTCATTTTTT-C---ACTT---CCTTTG-AA-TCGATTTCACT-GAT-TTTTCAC-AAGCTGGGCATCTTGGGTTA---TTTTGC--ATGA-AGTTATG-AACGGACTGCTGTATG----ATCTA--GTCCAG-TTTTTTCAGTAATGAGTTGTT-CAT-CTA------CT-CCAGC-ATCA-TA-CAGTCTTGTTGGC-ACA-GTGGATATAC-GTG-ATAGTGA---------G---------AA-------------ATG-GTACTT-TGTA-TTTCCCTGCCT-GTTCAC--A-------TTAGGCTTCTGGCGACGA--TTT-CTGT-AAAA-CATGTATAGA-CACCAACT-G-----AGAGAGTTATGCATCTGCCATA--CCG-G---A-ATGA--TCCGTATACT-AA-TG-CTA---CTTTT-C-TA-ATACTAGAAAGTATTAGGTTGCTTCAT-ATCT-CAGCA---TTCT--CCT-TTATTAATCTTATTA-GTCAATGTGAACATTCA-C-TGTGCTAG---AAACTTC-AGTA--T-CGC--G--TATT-T-ATGCGTACAGCAC------TTC-AC-TCTC-----ATCCCTATATATATTCTCTCCG-A-TATGCTGGTAGATG-CAAAA-------AAATTGTCC-----TTTTTCCATCAGAGG--A--ACT-C-ATGTTT-GTATTTTGA-TTC--AATGGTTATTGAAAAGTTG-TGCGTACTA-TGACTA---TTTAAT-TGAT--TTTCAAG---TTTT--ATAGACC-----------TTA---GA--ACTTACCTGTA--AACTACTTTCCTAATA--AGTT-A-AA-CATACACACAAA------GAAGAG-----CGAGCTTCC--C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTGTTGG-GA-TATATTATAATGCCACA-A-ACA-G--CT-TATGATG---C-CTTGTGGCA--------G--AGGATACAC-TTATTGA--GACAA---------TGGCGCAT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--ATTTTTG-AC--TGGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATCG----CATAT-AT-TTAAATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTAG--GG-ATA-G----AAGCCT-CAAACCCTGCT--A--C-ATT-T-C-T-----------GTTTTA-G-AGAAAGTAAT---T------CTC----GTATTCAGGCC-------TACTGACGGC-CTCG-A-TCAGCTTCCCT--TTCT-CTTCCCTCTGA-CAGAAA--TGTTTTGACTCAG-TATGTCGGCT
gi|20 : aCTCAAAAC-ATTTTTGT---T-ACGTTA--TCT----TTTGT-TA----TT-T-TAG----GCT-TTTA----------TAT-A-G-A-CGAGAG---T--CCA----GCC-GTA-TT----TA------AAAT-------------GTTACCT--ATA--GG--TGTgtgagtatccatggctacagtg
gi|21 : tgtgaacatttaaatcccGT----A--CAG-T-TTGAGGCTTATATCCTTTACATA
gi|22 : ggcacttgcggccgtataagggaccgccatttttaaaagatcgtatccgacagatatttggcgaagaagcagA---GCATC-TTCTGATT--CAC-ATTTCATTTTT--C---ACGT---CCTT-G-AA-T-GTTTTCACT-GAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATCTTGnc
gi|23 : AAAAAGTTGCCT--GTA--GG--TGTCC-AATAAGTGGACAAT---T-AC-TG-TACATTA--T------T
gi|23 : tgtactt-TCCATTG--T------TATA--A-A-T----AA---T---GTAC-A----G--T-AATT-G---T-CCA------CTTA--TT------GGACA-tataacaatggagagt
gi|25 : tgtacttaaaaagttgcctgtaggTTAAAAC-ATAATTGT---T-ACGCAA--TCC----TTTAT-------TT-T-C-G----GTT-GTTA----------TAT-AGC-A-T-ATAA---T--CCgagt
gi|26 : gggca-A-T-T-C-T-----------G--T-A-G-AGAAAGAACCGA-T------ATC----G------GACTTGCAATGTAC-G--TGC-CTCG-A-CCAGTT---
gi|27 : -A-TCAGTT---CT--TTCT-CGC-------A-CAA-AA--TGG----A--CAGTT-TTTCGACTTTTA--CTTTACATAA
gi|28 : GTTTAAAAC-ATGATTGT---G-ACGTAA--ACC----TT--T-TG----TT-T-G-A----ATT-GTC-----------CAT-A-CTA-T-Aa
gi|29 : ------GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAACATATAAAAAG-A-----CA-GA--AGAT-GCGTTTG------T----CAAACg
gi|3 : TAAAAC-ATAATTGT---TGACGCAA--TCC----TTTGT-TAAT--TT-T-C-G----GTT-GTTA----------TAT-AGC-A-A-TAAA---T--CCAT---GTAAAT--TT----CA------AAACAAT---CCAATAAGTT-CCT--GTAAGCG--TGTCCCAATAAGTTTAGAAAA--T-G--TG-TCCATTA--T------TAA---C-T-T----AT---T---GGAC-A----G--T-TATT-G---C---A------CTTA--TT------G-ACA--TGTC--AG-------GTTAAACG-ATAAAAAG-G-----CAAGA--AGATTGCGTTG-------T----CAC-CAA-AAGT-----AAATTTT-AATCCTAATAACAAC-GCA-----TGTCCACCAAGTA----AC-TCTGAGACCAC------ACCGAAAATC------------GACGTCGTACCCAC----CCC--CACCATCACATTATGAAACTTCTCT----T-GATTCAGA----------A--C--CATCTC-----C-----ACAT---TG-CTTAAAATGC----GATTTTTTTTT--AT-GTT---------TTCC-TA---GCATCCTTTGGACTTCCACCATCTTTCCTTTTTC---ACCTATCCCTT-GCAACT-GATCTACCTCGATCTTT-CCCTCAGCTGGG--TCTTG--CTACATTTCTGCTCGCGAGAGTTATGGAACGGACTGCTG-ATGGAGAATCTAATCTCCAGTTTTTTTCAGTAATGAGTTGTTTCATGCTA------CTTCCAGCCATCG-TA-CAGTTTTG-TGGCTACAAGTGG---CACCGCT-T----GA---------G---------AA-------------ATG-TC-CTT-TGAAAT---CCCGCCT-GTTCACGAA-------T--AGCT--TGGTGACGGGGTTT-CTGT-AAAAACATG----AA-CACCAACTCG-----GG-------TG-ATCTG-CATA--CCG-A---ATATG---TCCGAAGAAAAGA-TG-TCA---CTTTT---TA-A-ACT-GAA---GTTAGC--GCTTCAT-A--T-CAG-A---TTCT--CCT-TC-----TC-TAT---ATCAA---GA-CA-TCA-CATG----AG---AA----CTGTTA--T-CG---G--TATT-T-A---------CAC-----TTTC-AC-TCTCT----ATTCCT---------------------TGC--------G-TGAGA-------CAAATG--C-----TCTCTCCATCAGAGG--ATCACT-CCATGTTG-GTA--T-GA-TTC--AATGG----TGAAA----G-TG---A--A----ATA---TTTAA---GA---TTTCAAAGT-TTTT--ATAGACC----------TT-A---GA--A-TTACTAA-A--AACTG---TCC-A-TA--AGTA-A-AAACA-------AAA------GA--A------C-AGCTT-C--CCAAA-GAC--GG-TTTGGTT--AT-GTTGG-GAGTAT-TTA---------AGA-ACA-G--CT-T----T----C-C---TGGCA--------AGCAGG--ACCT-TTATGAA--GACAA---------TGG---AT-TAATCA-G-GAA--AC-T-AA--AA-TC--T-TTTTG-ACC-TGGAGGTGAT--A--GTT--AT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATACAA-----GA------GAT---AAT---GTT-T-TA-AA-------GTA---GG-ATA-G----AAG-CT-CAAA--CTG-T--A--C-A-T-T-C-TG----------G--TAA-GAAGAAAGAACTGA-T-------TC----G------G-CC-------TAC-G--GGC-CTCG-ACTCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A-C-G-AA--TGT----A--CAG-T-TTTCGGCTTATATCCT
gi|30 : c--GGC-CTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTT-------A-CAG-AA--AGG----A--CAG-
gi|4 : GCTTAAAAC-ATAATTGT---T-ACGCAA--TCC----TTTGT-TA----TT-T-C-G----GTT-GTTA----------TAT-G-C-A-T-AAAA---T--CCAT---GTAAAT--TT----AA------AAACAAT---CCAATAAGTTACCT--GTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTAGAAA---T-G--TG-TCCATTA--T------TAAA--C-T-T----AT---T---GGAC-A----G--T-TATT-G---T-CAA------CTTA--TT------GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAACGAATAAAAAG-G-----CA-GA--AGAT-GCGTTT-------T----CACACAA-AAG--TAAA----TTTTAATC--TA-AATAAC-ACGAA---TGTC-AC-AAGTAG--AACATCTGAGACCAC------ACCGAAA-----TC-A----TTG--GTCGT---TAC----CAC--CAC-ATCACATTATG-AACTTCTCT----TTGATTCAGA----------AA----CATCTC-----C-----ACAT---TG-CT-------C----AATTTTTTTTT--AT-GTT---------TTCCTTA---GCATC-TTTGGATT--CAC---TTCATTTTTTTC---ACTT---CCTT-G-AA-T-GATTTCACT-GAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATCTT-GGTTA----TTTGC--ATGA-AGTTATG-AACGGACTGCTG-ATG----ATCTA-TGTCCAG-TTTTTTCAGTAATGAGTTGTT-CAT-CTA------C--CCAGC-ATCA-TA-CAGTCTTG-TGGCTACA-GTGG---CAC-GT--A----GA---------G---------AT-------------ATG-GT-CTT-TGAA-T---CCTGCCT-GTTCAC--A-------T--AGCT--TGGCGACGAT-TTT-CTGT-AAAA-CATG----AA-CACCAAC--G-----GG-------TGCATCTG-CATA--CC--G---A-AT-A--TCCGAAAA---GA-TG-TCA---CTTT----TA-A-ACT-GAA---GTTAG---GCTTCAT-A--T-CAGCA---TTCT--CCT-TT-----TC-TAT---ATCAA---GAACA-TCA-C-TG----AG---AA----C-GTTA--T-CG---G--TATT-T-A---------CAC-----TTTC-AC-TCTC-----ATCCCTA-A---ATTTT----G-A-T-TGT--------G-TGAGG-------AAAATG--C-----TCTCTCCATCAGAGG--A--ACT-C-ATGTTT-GTA---TGA-TTC--AATGG----TGAAA----G-TG---A--A-TGACTA---TTTAA--TGA---TTTCAAG----TTT--ATAGACC----------TTTA---GA--ACTTACCTG-A--AACTG---TCC-AATA--AGTA-A-AA-CA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-C--C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTG-TGG-GA-TAT-TTA---------A-A-ACA-G--CT-T----TA---C-C---TGGCA--------G--AGG--ACAC-TGATGAA--GACAA---------TGG---AT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--A-TTTTG-ACT-TGGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTA---GG--TA-G----AAGCCT-CAAA--CTG-T--A--C-A-T-T-C-T-----------G--TAA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCC-------TAC-G--GGC-CTCG-A-TCAGTTG--CT--TTCT--TC-------A-CA--AA--TGT----A--CAG-T-TGTCGGCTTATATCCTTTACTTAAACACCATTGCATTGCAGGGTTGGGTA
gi|5 : taCTTC-T-A--A-CA--A---TTAT--CTTGTC-----TC-AATGTAATCA----GAACA-TCA-C-TG----AGT--AA----CGGTTA--T-CGTCAGTTTATT-T-A---------CACACTTTTTTC-TCATCTCGTGCAATCACCATA---ATTTT----ACATT-TGC--------G-TGAGACGGTTACAAACTG--CTACCATCTCTCAAGCAGA-G--A--ACTAC-ATGTTTGGTA--TTGAGTTCAGAAT-G----TGAAA----GATGA--A--A-TGAATA---TCTAAATTGA---TTTCAGATGTTTTT--ATAGGACAACGTCTTGATTTATGGGAATATTTACCTG-ATTAACTGGATTCC-GATAGGAGTATA-AC-CA-------AAACATAATGA--AATCAATC-AGCTC-A--C--AAGGACT-GG-ATT--TTCAATTGTAGGTGA-TAT-TTA---------A-AGACATG--TTCT----TACATC-C---TGGAGATCTTTGTG--AGA--CCACTTTAGGAA--GACAAATGCGTTTTTGT---AC-TA--TG-GAAAA--ACAG-AATTAA-TCATA-TTCTA-ACATTGGGACT--T--AGGCCTCGCA--ATTATCATATGCA-ATCAT-G--AATATACATATGTA------TGTATAAAT---GTTGTAT--AA-------GTATAGAG-ATA-AGTATAGGCCTCCAAA--CTG-------C-A-T-TGC-TTACTAGCTCAAG--TAAGG-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------G-CC-------TAC-G--GGCTCTCG-ATTCAGTT---CTTCTTCTGCTC-------ACCAG-AAATTGT----A--CAG-T-TT---GC-TACGTCCTTTACTCA
gi|5 : ctatgatgtaaaaggga-CTGG-AAGA-AAAG----GA-CACCAAC--------GG-------T-CATC-G-CATA--CCA-G---A---------TAGACATT-GA-TGACCAATGCTTGTACGTATATATTTGAA---GTT------CTTC------T-CAGtgctggataatggaagtcctttaactaggcaagtataatttaagagtttttacatggcatttgacaacttaaaagcatatgctaggcttatttattctggcataaaatctatgtttgcgctgttttccaaacttttatgctatatttttcaggctcagaacatggcaatgatgaacgcaactatcacctgagaagaacttcaaatatatacgtacaagcattggtcatcaatgtctatctggtatgcgatgaccgttggtgtccttttcttccag
gi|6 : ctatgatgtaaaagggatgagtaaaggacgtagcaaactgtacaatttctggtgagcagaagaagaactgaatcgagagcccgtaggccgagatcagttctttctccttacttgagctagtaagcaatgcagtttggaggcctatacttatctctatacttatacaacatttatacatacatatgtatattcatgattgcatatgataattgcgaggcctaagtcccaatgttagaatatgattaattctgtttttccatagtacaaaaacgcatttgtcttcctaaagtggtctcacaaagatctccaggatgtaagaacatgtctttaaatatcacctacaattgaaaatccagtccttgtgagctgattgatttcattatgttttggttatactcctatcggaatccagttaatcaggtaaatattcccataaatcaagacgttgtcctataaaaacatctgaaatcaatttagatattcatttcatctttcacattctgaactcaataccaaacatgtagttctctgcttgagagatggtagcagtttgtaaccgtctcacgcaaatgtaaaattatggtgattgcacgagatgagaaaaaagtgtgtaaataaactgacgataaccgttactcagtgatgttctgattacattgagacaagataattgttagaagtgctggataatggaagtcctttaactaggcaagtataatttaagagtttttacatggcatttgacaacttaaaagcatatgctaggcttatttattctggcataaaatctatgtttgcgctgttttccaaacttttatgctatatttttcaggctcagaacatggcaatgatgaacgcaactatcacA---GTTAG---GCCTCATTA--TGCAGCAA--TTCT--CCT-GC-----TT-TGTG--ACCAA---GAACA-TCAGC-TG----AGGAGAA----C-GTTA--TCCG---G--TATTGT-A---------CAC-----TTTCGAC-TCTC-----ATCTC---A---AATTT----G-A-T-TGC--------G-TGAG--------GAAATG--CG----TCTCTCCATCAGCGGACA--ACT-C-ATGTT---TA--TGGA-TTC--AATGG----TGAAA----G-TG---A--A-TGAATACAGTTAAA--TGAGC-TTTC-AG---TTTTTAATAGACC----------CTTA---GA--AATTACCTG-A--AACTG---TCC-AATT--AATA-AGAA-CA-------AAA------AG--AA-----C-AGCTT-TCAC--AA-GACTGGG-TTT--TT--ATTATTGA-GG-TAT-TTAT--------A-A-ACA-GTTTT-T----TA---CTT---TGGGA--------G--TGG--ACACTTTAGGAAACGACAA---------TGG---ATGTA--TA-G-GAATCACATAAA--AA-TC--A-TTTTGAAC--TGGA--T--T--A---CT-GAA--ACTATC-----CA-AT-CTAT--AATATAAA----GA------GAT---AGT----TT-T-T--AA-------GTA---GG-ATAGG----AAGCCT-CAAAG-CTG-T--A--CGA-T-T-C-T-----------G--TAA-G-A-AAAGAACTGACT------CTC----G------CCCT-------TAC----GGC-CTCGAA-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------ACCAGCAA--T-T----A--CAG-T-TTTCGGCTTATATCCTT
gi|6 : TAAGGAGAGGTT-CAT-TGAACATGGCT-CCAGCTATCGGTA-CAGTCTTG-GGGCGGCA-CGGG---CAC-GTA-GAT--GA---------ATGGTTTGT-AA-------------ATG-GC-CTTGTGAA-T---CCTGCCTCGTTCAC--A-------TG-AGCT--TGGCG-CGGTGTTC-CTGT-AAAA-CATG----AACCACCAAC--G-----GG-------T-CATCT--CATACGCCGAG---AGATGA--Tagggcaagtataattcagagttttacgcatgactttgcatttaatgcaggctccgtatatttttcgccaaataactatttctcgttgcacttttgctatatttcaggggccagaaaatgggatgtgcacgctctatacctaccaccgacagagacactcaaatactaagcaacatcatctctcggcgtatgagatgacccgttggtggttcatgttttacaggaacaccgcgccaagctcatgtgaacgaggcaggattcacaaggccatttacaaaccattcatctacgtgcccgtgccgccccaagactgtaccgatagctggagccatgttcaatgaacctctcctta
gi|7 : aaggatataagccgaaaactgtaattgctggtgagagaaagaactgattcgaggccgtaagggcgagagtcagttcttttcttacagaatcgtacagctttgaggcttcctatcctacttaaaaactatctctttatattatagattggatagtttcagtaatccagttcaaaatgatttttatgtgattcctatacatccattgtcgtttcctaaagtgtccactcccaaagtaaaaaactgtttataaatacctcaataataaaaacccagtcttgtgaaagctgttctttttgttcttattaattggacagtttcaggtaatttctaagggtctattaaaaactgaaagctcatttaactgtattcattcactttcaccattgaatccataaacatgagttgtccgctgatggagagacgcatttcctcacgcaatcaaatttgagatgagagtcgaaagtgtacaataccggataacgttctcctcagctgatgttcttggtcacaaagcaggagaattgctgcataatgaggcctaactagggcaagtataattcagagttttacgcatgactttgcatttaatgcaggctccgtatatttttcgccaaataactatttctcgttgcacttttgctatatttcaggggccagaaaatgggatgtgcacgctctatacctaccaccgacagagacactcaaatactaagcaacA---GTTAG---GCTTCAT-A--T-CAGCA---TACA--CCT-TC-----TC-TA----ATCAA---GAACA-TCA-C-TG----AG---AA----C-GTTA--T-CG---G--TATT-T-A---------CAC-----TTTC-AC-TCTC-----GTCCCTAAA---ATTTT----G-A-T-TGC--------G-TTAGA-------AAAATG--C-----TCTCTCCATCAGAGG--A--ACT-C-ATGTTT-GTA---TGA-TTC--AATGA----TGAAA----G-TG---A--A-TGAATA---TTAAA--TGA---TTTCAAT---GTTT--ATAGACC-----------TTA---GA--ACTTACCTG-A--AACTG---TCC-AATA--AGT--A-AA-CA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-CA-C--AA-GAAT-GG-TTT--TT--ATTGTTGA-AG-TAT-TCA---------A-A-ACA-G--CT-T----TA---C-C---TGGGA--------G--AGG--ACAC-TTATGAA--GACAA---------TGG---AT---------------------A--AA-TC--A-TTTTA-AC--TGGC--T--T--A--CCT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTA---GG-ATA-G----AAGCTT-CAAA--CTG-T--A--C-A-T-T-C-T-----------G--TAA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCC-------TAC-G--GGC-CTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A-CAG-AA--TGT----A--CAG-T-TTTCGGCTTATATCCTTTACATA-----CATTG-ATTG-
gi|7 : ggcactttggaggccttagtgatcgttttggtaaagatagtgacaagatggcagaatgtgaagagacaaAATGAGTTGTT-CAT-CTA------CT-CCAGC-ATCG-TA-CAGTCTTG-TGGCTGCA-GTGG---CAC-GTAGA----GA---------ATGGTTTGTAAA-------------ATG-GC-ATT-TGAA-T---CCTGCCT-GTTCAC--A-------T--AGCT--CGGCGACGGT-TTT-CTGT-AAAA-CATG----AA-CA-CAAC--G-----GG-------TGCATCTG-CATA--CCA-G---G-ATGA--Taaggcaagtataatcatgagttttacatgcatttgacatttaatgcaggcttatatttttgcaaacactaattctgttcactttttttatatttcaggccagaaaatggcaattgtgacgcactatactgagacaactcaaatatagtacatcatcatcctggtatgcagatgcacccgttgtgttcatgttttacagaaaaccgtcgccgagctatgtgaacaggcaggattcaaatgccattttacaaaccattctctacgtgccactgcagccacaagactgtacgatgctggagtagatgaacaactcatt
gi|8 : ggcactttggaggccttagtgatcgttttggtaaagatagtgacaagatggcagaatgtgaagagacaacaatcaatgtatgtaaaggatataagccgaaaactgtacattctgtgagagaaagaactgatcgaggcccgtagggccgagatcagttctttctcttacagaatgtacagtttgaagcttctatcctacttaaaacattatctcctttgtattaatattggatagtatcaggtaagccagttaaaatgatttatccattgtcttcataagtgtcctctcccaggtaaagctgttttgaatacttcaacaataaaaaccattcttgtgaagctgtttcttttgtttacttattggacagtttcaggtaagttctaaggtctataaacattgaaatcatttaatattcattcactttcatcattgaatcatacaaacatgagttcctctgatggagagagcatttttctaacgcaatcaaaattttagggacgagagtgaaagtgtaaataccgataacgttctcagtgatgttcttgattagagaaggtgtatgctgatatgaagcctaactaaggcaagtataatcatgagttttacatgcatttgacatttaatgcaggcttatatttttgcaaacactaattctgttcactttttttatatttcaggccagaaaatggcaattgtgacgcactatactgagacaactcaaatatagtacatcA---GTTAG---GCTTCAT-A--T-CAGCA---TCC----CT-GC-----TT-TGT---ATCAAA--GAACA-TCA-C-TG----GA---GA----C-GTTAAAT-CG---G--TATT-TTA---------CAA-----TTTC-AC-TCTC-----ATCCCTA-----ATTTT----G-A-T-TGC--------GGTGAGG-------AAAATG--C-----TTCATCCATCAGCGG--A--ACT-C-ATGTT--GTA--T-GA-TTC--AATGG----T-AAA----G-TG---A--AATGAATA---TTAAAA-TGAATTTTTCAAG---TTTT--ATAGACC----------TT-A---GA--AATTAC-TG-A--AACTG---TCCCAATA--A-TA-A-A--CA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-C--C--A--GACT-GGGTTT--TT--ATTATTGA-GG-TAT-TTA---------A-A--CA-G--TT-T----TAA--C-T---TGGGA--------G--TGG--ACAC-TTAGGAAA-GACAA---------TGG---ATATA--TAAG-GAA--ACAT-AA--AAATC--A-TTTTA-AC--TGGAA-T--T--A--ACT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATATAAT---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTA---GG-ATA-G----AAGCCT-CAAA--CTG-T--A--C-A-TAT-CTT-----------G--TAA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCCT------TAC-G--GG--CTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A--AG-AA--TGT----A--CAG-T-TTTCGGCTTATATCCTT
gi|8 : -ATCG-TAACAGTCT-G-TGGCTGCA-GTGG---CAC-GTA-A----GA---------G---------AATGGTTTGTAGTAAATGTGC-CTT-TGAA-T---CCTGC-T-GTTCAC--ACTCATTAT--AGCT--TGGCGACGGT-TTTCCTGTAAAAA-CATG-----A-CAACAACC-AAAAACGG-------TGCATCTG-CATA--CCA-GGCAG-ATGATGTTCTGATATT-GAGTG--------TTCT-CGTAGGTAATAG--------AG---GCGTCAC-A--T-TTGCAATTTTCTGGCCT-Taagccaagatataatatgtagtttacatggcatttgacattttaatgcaggcttttatatattttttcgcaaaaactatttctgttcacctttttctatatttcaaggccagaaaattgcaaatgtgacgcctctattacctacgagaacactcaatatcagaacatcatctgcctggtatgcagatgcaccgtttttggttgttgtcatgtttttacaggaaaaccgtcgccaagctataatgagtgtgaacagcaggattcaaaggcacatttactacaaaccattctcttacgtgccactgcagccacagactgttacgat
gi|9 : aaggatataagccgaaaactgtacattcttgagagaaagaactgatcgagcccgtaagggccgagatcagttctttctcttacaagatatgtacagtttgaggcttctatcctacttaaaacattatctccattatattaatattggatagtatcagttaattccagttaaaatgatttttatgtttccttatatatccattgtctttcctaagtgtccactcccaagttaaaactgtttaaatacctcaataataaaaacccagtctggaagctgtttcttttgtttattattgggacagtttcagtaatttctaaggtctataaaacttgaaaaattcattttaatattcatttcactttaccattgaatcatacaacatgagttccgctgatggatgaagcattttcctcaccgcaatcaaaattagggatgagagtgaaattgtaaaataccgatttaacgtctccagtgatgttctttgatacaaagcagggatgctgatatgaagcctaactaagccaagatataatatgtagtttacatggcatttgacattttaatgcaggcttttatatattttttcgcaaaaactatttctgttcacctttttctatatttcCTTAAAAC-ATAATTGT---T-ACGCAA--TCC----TTTGT-TA----TT-TTC-G----GTT-GTTA----------TATGG-C-A-T-AAAA---T--CCAT---GTCAAT--TT----AA------AAACAAT---CCAATAAGCTACCT--GTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTAGAAA---T-G--TG-TCCATTA--T------TAAA--C-T-T----AT---T---GGAC-A----G--T-TATT-G---T-CAA------CTTA--TT------GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAACGGATAAAAAG-A-----CA-GA--AGAT-GCGTTTG------T----CAAACAG-AAG--TAAA----TTGTAA--TTTA-AATAAC-ATGAA---TGTC-AC-AGGTAG--AACATCTGAGACCAC------ACTGAAAATCATTC-ATTATTTG--GTCGT---TACTCGTTACCACAC-ATCACATT-TAGAACTTCAAT----TTGAAAGACA----------AATTGTTATGTT-----C------TATA--TG---------------AATTTCTCTTT--AT--TCAGAGGCACATTCAAAA---ACATC-TCCAAATT------GCTTAATTTTTTTTATGATTT---CCTT-
gi|9 : TATGAA-TTTCTCT----TT-ATTCAGAGGCACATTCAAA-AA-CATCTC-----C-----AAAT---TG-CT-------T----AATTTTTTTT---AT-GAT---------TTCCTTATCAGCATC-TTCTGATT--CAC-ATTTCATTTTTT-C---ACTT---CCTG-G-AA-T-GATTTCACT-AAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATTTTGGGTTC---TTTTG-----------TATG-AATGGACTGCCG-ATG----ATCTA-TGTCCAGTTTT--TCAGTAATGAGTTGTT-CAT-CTA------CT-CCAGC-ATCG-TA-CAGTCTTG-TGGCTGCA-GTGG---CAC-GTAGA----GAATGGTTTGTA---------AA-------------ATG-GC-ATT-TGAA-T---CCTGCCT-GTTCAC--A-------T--AGCT--CGGCGACGGT-TTT-CTGT-AAAA-CATG----AA-CA-CAAC--G-----GG-------TGCATCTG-CATA--CCA-G---G-ATGA--Tatcagcatcttctgattcacatttcattttttcacttcctggaatgatttcactaattttcacaagctgggcattttgggttcttttgtatgaatggactgccgatgatctatgtccagtttttcagtaatgagttgttcatctactccagcatcgtacagtcttgtggctgcagtggcacgtagagaatggtttgtaaaatggcatttgaatcctgcctgttcacatagctcggcgacggttttctgtaaaacatgaacacaacgggtgcatctgcataccaggatgatgatgtacta
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): GATGACATTAGTGATGAAACAGCAGTTTTGTGTATTCATAATATGCATTATTTGATGTGAAGGGA
Alignments
lowQualScore : 11 1111 2222 22222222 3333333333 11111 222 111 11 444444444444 111 11 22222222 333333333333333333333333333333333 111111 1 11111 222222 333333 3333333 3333333 444444444444 1 33333333 1 222 1 222 333333 2222222222 11 111 2222 111 2222 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111 2222222222222 11111 1 1 1 111 22222222 1 1111 11 1 111111 1 1 111 8888888888888888888888888888888888888888888 1 111 2222222222 11 11 2222 111 2222222 11111 111 1111111 222 111 1 111 222 11 111 33333333333333 222 1 222222222222222 111 444444444 111111 11111 55555555555555555555555555555555 1111111 11 11111 11 2222 2222 2222 222222 22 222 1111 2222222222222 222 1 2222222 111111 111111111 1111 444444444 222222222222222 11111111 11 11 111111111 111 11 11 11111 1111 1111111 111 11 1111111 11111111111111 11111111111111111 111 1111111 11111 222222 1
lowQualScore : 8 3 777 4 11 7777 8 2222 4 00000000 4 5555555555 4 66666 000 66 777 1 44 111111111111 3 777 1 22 66 66 5 0 66666666 4 888888888888888888888888888888888 111111 66 5 0 33333 888888 0 66 000000 8 66 2222222 5 6 5 1111111 5 77 5 555555555555 5 5 11111111 9 7 3 999 8 6 222 9 0 888888 7777777777 88 111 0000 555 6 5 0 3 1111 8 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 000 8888888888888 8 888 5 22 66 77 33333 888 0 5 5 1 5 5 1 5 111 22222222 6 3 4444 44 5 5 5 666666 5 0 5 5 0 6 5 777 5 6666666666666666666666666666666666666666666 5 0 5 5 777 5 66 6666666666 33 66 4 4 4 5555 4 4 1 777 666 8888888 1 8 66 77 22222 66 1 1 333 6 6666666 222 444 1 555 000 0 4 11 4 222 66 4 33333333333333 222 0 5 5 555555555555555 5 5 66 5 888 66 5 5 000000000 555555 5 5 77777 11111111111111111111111111111111 77 6666666 6 33 5 22222 33 5 5 55 3333 5 66 1111 1111 5 777777 5 888 0 11 555 5555 66 7777777777777 888 66 4 8 66 333 3 66 99 4 4 8888888 222222 444444444 8 8888 66 4 4 4 66 66 4 4 8 000000000 4 4 4 66 4 777777777777777 1 66666666 66 22 8 00 777777777 555 8 66 4 4 66 4 66 4 66 8 4 33 22 44 44 555 3 44 33333 6 3 3333 555 777777 444 444 5 2 66 5555555 000 2 888888 2 00 0000000 2 5 2 2 5 55555555555555 4 2 5 0 2 777777 5555 66666666666666666 7777 2 2 5 000 33 2 7777777 5 8 33 00000 66 2 5 1 0 111111 2 3
lowQualScore : . . ... . .. .... . .... . ........ . .......... . ..... ... .. ... . .. ............ . ... . .. .. .. . . ........ . ................................. ...... .. . . ..... ...... . .. ...... . .. ....... . . . ....... . .. . ............ . . ........ . . . ... . . ... . . ...... .......... .. ... .... ... . . . . .... . ......................................................... ... ............. . ... . .. .. .. ..... ... . . . . . . . . ... ........ . . .... .. . . . ...... . . . . . . . ... . ........................................... . . . . ... . .. .......... .. .. . . . .... . . . ... ... ....... . . .. .. ..... .. . . ... . ....... ... ... . ... ... . . .. . ... .. . .............. ... . . . ............... . . .. . ... .. . . ......... ...... . . ..... ................................ .. ....... . .. . ..... .. . . .. .... . .. .... .... . ...... . ... . .. ... .... .. ............. ... .. . . .. ... . .. .. . . ....... ...... ......... . .... .. . . . .. .. . . . ......... . . . .. . ............... . ........ .. .. . .. ......... ... . .. . . .. . .. . .. . . .. .. .. .. ... . .. ..... . . .... ... ...... ... ... . . .. ....... ... . ...... . .. ....... . . . . . .............. . . . . . ...... .... ................. .... . . . ... .. . ....... . . .. ..... .. . . . . ...... . .
lowQualScore : 9 4 000 0 00 0000 0 5555 0 44444444 0 0000000000 0 44444 000 11 555 0 44 555555555555 2 555 1 22 11 11 0 2 44444444 4 333333333333333333333333333333333 666666 99 0 0 55555 888888 4 99 000000 9 99 5555555 0 6 0 1111111 7 99 7 333333333333 0 0 88888888 8 3 3 777 0 7 000 8 7 333333 5555555555 33 777 8888 888 7 0 1 2 2222 5 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 111 6666666666666 9 888 0 55 99 00 11111 888 0 7 7 4 7 7 4 7 777 88888888 7 3 2222 00 5 7 7 444444 7 0 0 0 0 2 0 555 0 2222222222222222222222222222222222222222222 0 0 0 0 555 0 99 0000000000 88 22 4 4 4 0000 4 4 1 888 111 9999999 1 9 11 11 77777 11 0 0 888 7 5555555 555 222 7 666 000 8 0 00 0 222 11 4 66666666666666 555 0 0 0 000000000000000 0 0 99 0 888 99 0 0 000000000 888888 0 0 55555 11111111111111111111111111111111 00 2222222 6 88 0 55555 88 0 0 11 2222 0 99 2222 2222 0 222222 0 888 8 99 666 8888 99 4444444444444 888 99 5 9 11 333 3 11 66 4 4 9999999 888888 111111111 9 4444 11 4 4 4 11 11 4 4 9 000000000 4 4 4 11 4 222222222222222 0 11111111 11 22 9 66 888888888 666 9 11 4 4 11 4 11 4 11 9 0 55 55 66 22 666 1 22 88888 2 1 5555 000 777777 777 777 3 7 33 0000000 000 7 222222 9 77 5555555 7 3 7 7 3 44444444444444 1 7 3 9 7 777777 7777 88888888888888888 2222 5 5 0 666 77 7 3333333 3 0 77 88888 99 5 3 0 8 555555 5 3
consensus : NNGCTTAAAAC-ATAATTGT---T-ACGCAA--TCC----TTTGT-TA----TT-T-C-G----GTT-GTTA----------TAT-A-C-A-TAAAA---T--CCAT---GTNAATA-TT----AA------AAACAAT---CCAATAAGTTACCT--GTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTAGAAA---T-G--TG-TCCATTA--T------TAAA--C-T-T----AT---T---GGAC-A----G--T-TATT-G---T-CAA------CTTA--TT------GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAACGGATAAAAAG-G-----CA-GA--AGAT-GCGTTT-------T----CACACAACAAGTTTAAGAGATTTTTAATCTTTATAATAAC-ACGAA--TTGTCTAC-AAGTAG--AACATCTGAGACCGC------ACCGAAAATC--TC-A----TTG--GTCGT---TAC----CAC--CAC-ATCACATTATGAAACTTCTCT----TCGATTCAGA----------AA-CG-CATCTC-----C-----ACATA--TG-CT-------C----AATTTTTTTTT--AT-GTT---------TTCCCTA---GCATC-TTCGGATT--CAC-ATTTCATTTTTTTC---ACTT---CCTT-G-AA-T-GATTTCACT-GAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATCTTGGGTTA---TTTTGC--ATGA-AGTTATG-AACGGACTGCTG-ATG----ATCTA-TGTCCAGTTTTTTTCAGTAATGAGTTGTT-CAT-CTA------CT-CCAGC-ATCG-TA-CAGTCTTG-TGGCTGCA-GTGG---CAC-GTA-A----GA---------G---------AA-------------ATG-GC-CTT-TGAA-T---CCTGCCT-GTTCAC--A-------T--AGCT--TGGCGACGGT-TTT-CTGT-AAAA-CATG----AA-C-ACC---AAC--GGG-------TGCATCTG-CATA--CCG-G---A-ATGA--TCCGNANACT-GA-TG-CCA---CTTTT-C-TA-ATACTAGAA---GTTAG---GCTTCAT-A--T-CAGCA---TTCT--CCT-TC-----TC-TAT---ATCAA---GAACA-TCA-C-TG----AG---AA----C-G-TTA--TC-G---GT--ATT-T-A---------CAC-----TTTC-AC-TCTC-----ATCCCTATA---A-TTTT----G-AT-T-GC--------G-CGAGA-------AAAATG--C-T-----CTCTCCATCAGAGGA--ACT-C-ATGTTT-GTA--TTGA-TTC--AATGG----TGAAA----G-TG---A--A-TGAATA---TTTAA--TGA---TTTCAAG---TTTT--ATAGACC----------TTTA---GA--ACTTACCTG-A--AACTG---TCC-AATA--AGTA-A-AA-CA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-C--C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTGTTGG-GA-TAT-TTA---------A-A-ACA-G--CT-T----TA---C-C---TGGNA--------G--AGG--ACAC-TTATGAA--GACAA---------TGG---AT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--A-TTTTG-AC--TGGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTA---GG-ATA-G----AAGCCT-CAAA--CTG-T--A--C-A-T-T-C-T-----------G--TGA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCC-------TAC-G--GGC-CTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A-CAG-AA--TGT----A--CAG-T-TTTCGGCTTATATCCTTTACNTAAACACCATTGCATTG-AGGGTTGGGTA
Reference ( family-455 ) : NNGCTTAAAAC-ATAATTGT---T-ACGCAA--TCC----TTTGT-TA----TT-T-C-G----GTT-GTTA----------TAT-A-C-A-TAAAA---T--CCAT---GTNAATA-TT----AA------AAACAAT---CCAATAAGTTACCT--GTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTAGAAA---T-G--TG-TCCATTA--T------TAAA--C-T-T----AT---T---GGAC-A----G--T-TATT-G---T-CAA------CTTA--TT------GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAACGGATAAAAAG-G-----CA-GA--AGAT-GCGTTT-------T----CACACAACAAGTTTAAGAGATTTTTAATCTTTATAATAAC-ACGAA--TTGTCTAC-AAGTAG--AACATCTGAGACCGC------ACCGAAAATC--TC-A----TTG--GTCGT---TAC----CAC--CAC-ATCACATTATGAAACTTCTCT----TCGATTCAGA----------AA-CG-CATCTC-----C-----ACATA--TG-CT-------C----AATTTTTTTTT--AT-GTT---------TTCCCTA---GCATC-TTCGGATT--CAC-ATTTCATTTTTTTC---ACTT---CCTT-G-AA-T-GATTTCACT-GAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATCTTGGGTTA---TTTTGC--ATGA-AGTTATG-AACGGACTGCTG-ATG----ATCTA-TGTCCAGTTTTTTTCAGTAATGAGTTGTT-CAT-CTA------CT-CCAGC-ATCG-TA-CAGTCTTG-TGGCTGCA-GTGG---CAC-GTA-A----GA---------G---------AA-------------ATG-GC-CTT-TGAA-T---CCTGCCT-GTTCAC--A-------T--AGCT--TGGCGACGGT-TTT-CTGT-AAAA-CATG----AA-C-ACC---AAC--GGG-------TGCATCTG-CATA--CCG-G---A-ATGA--TCCGNANACT-GA-TG-CCA---CTTTT-C-TA-ATACTAGAA---GTTAG---GCTTCAT-A--T-CAGCA---TTCT--CCT-TC-----TC-TAT---ATCAA---GAACA-TCA-C-TG----AG---AA----C-G-TTA--TC-G---GT--ATT-T-A---------CAC-----TTTC-AC-TCTC-----ATCCCTA-A---A-TTTT----G-AT-T-GC--------G-CGAGA-------AAAATG--C-T-----CTCTCCATCAGAGGA--ACT-C-ATGTTT-GTA--TTGA-TTC--AATGG----TGAAA----G-TG---A--A-TGAATA---TTTAA--TGA---TTTCAAG---TTTT--ATAGACC----------TTTA---GA--ACTTACCTG-A--AACTG---TCC-AATA--AGTA-A-AA-CA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-C--C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTGTTGG-GA-TAT-TTA---------A-A-ACA-G--CT-T----TA---C-C---TGGNA--------G--AGG--ACAC-TTATGAA--GACAA---------TGG---AT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--A-TTTTG-AC--TGGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTA---GG-ATA-G----AAGCCT-CAAA--CTG-T--A--C-A-T-T-C-T-----------G--TGA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCC-------TAC-G--GGC-CTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A-CAG-AA--TGT----A--CAG-T-TTTCGGCTTATATCCTTTACNTAAACACCATTGCATTG-AGGGTTGGGTA
gi|1 : TAAGACCATA--TGT---T-ACGCAACATCCAATCTTTGTATAAATTTT-T-C-GTGTAGTT-GTTAACTCTGTACCTAT-A-C-GCTAAGACATT--CCATAATGTGAATA-TTTATAAATGAGGCAAAAAATTGCCCAATAA-TTACCTTTGTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTAAAAACAAT-G--TG-TCCATTG--CAGTTTCTACA--C-TAT----AT---TTGAGAACTA----G--T-TATTAG---TACAAAATGACTTTA--TTTATCTGAGACAAGTGCC--AGTGTTGTCAT-ATACAGATAAA--T-GTTTTTCA-TG--AGAT-GCGTTT-------TGTCACACACAACAAGTTTAAGAGATTTTTAATCTTTATAATAACTACGAAATTTGTCTAC-AAGTTATTAACATCAG-GACAGCCAAGCGACCGAAAATC--TC-A----TTG--GTCGT---TAC----CAC---AC-ATCACATTATGAAACTTCTACATAATCGATTCAGA----------AAATG-CATCTT-----CTCCATACATA--TAACT-------CTAAAAATTTTTTTTC--GTTGTT---------TTCCCTA---GCATC-TTTGGGTT--CAC-ATTTCATTTTTT-C---ACTT---CCTTTG-AA-TCGATTTCACT-GAT-TTTTCAC-AAGCTGGGCATCTTGGGTTA---TTTTGC--ATGA-AGTTATG-AACGGACTGCTGTATG----ATCTA--GTCCAG-TTTTTTCAGTAATGAGTTGTT-CAT-CTA------CT-CCAGC-ATCA-TA-CAGTCTTGTTGGC-ACA-GTGGATATAC-GTG-ATAGTGA---------G---------AA-------------ATG-GTACTT-TGTA-TTTCCCTGCCT-GTTCAC--A-------TTAGGCTTCTGGCGACGA--TTT-CTGT-AAAA-CATGTATAGA-C-ACC---AACT-GAGAGAGTTATGCATCTGCCATA--CCG-G---A-ATGA--TCCGTATACT-AA-TG-CTA---CTTTT-C-TA-ATACTAGAAAGTATTAGGTTGCTTCAT-ATCT-CAGCA---TTCT--CCT-TTATTAATCTTATTA-GTCAATGTGAACATTCA-C-TGTGCTAG---AAACTTC-A-GTA--TC-GC--GT--ATT-T-ATGCGTACAGCAC------TTC-AC-TCTC-----ATCCCTATATATA-TTCTCTCCG-ATAT-GCTGGTAGATG-CAAAA-------AAATTGTCC-T-----TTTTCCATCAGAGGA--ACT-C-ATGTTT-GTATTTTGA-TTC--AATGGTTATTGAAAAGTTG-TGCGTACTA-TGACTA---TTTAAT-TGAT--TTTCAAG---TTTT--ATAGACC-----------TTA---GA--ACTTACCTGTA--AACTACTTTCCTAATA--AGTT-A-AA-CATACACACAAA------GAAGAG-----CGAGCTTCC--C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTGTTGG-GA-TATATTATAATGCCACA-A-ACA-G--CT-TATGATG---C-CTTGTGGCA--------G--AGGATACAC-TTATTGA--GACAA---------TGGCGCAT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--ATTTTTG-AC--TGGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATCG----CATAT-AT-TTAAATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTAG--GG-ATA-G----AAGCCT-CAAACCCTGCT--A--C-ATT-T-C-T-----------GTTTTA-G-AGAAAGTAAT---T------CTC----GTATTCAGGCC-------TACTGACGGC-CTCG-A-TCAGCTTCCCT--TTCT-CTTCCCTCTGA-CAGAAA--TGTTTTGACTCAG-TATGTCGGCT
gi|10 : aTATAAC-ATAATTAT---T-ATGCAA--TCC----TTTGT-TA----TT-T-TTG----GTTTGTTG-----------AT-A-G-A-TAAAA---T--CCAT---TTAAATAATT----AA------AAACAAT---CCAATAAGTTACCT--GTA--CGCATGTCC--ACAAATTTAGAAA---T-AGTTGTTCCATTAGTT------TAAGATCGT-T----ATCTCT---GAGT-ACCACG--TCTATT-GTGCT-CAA------C-TAGTTT------AGACA-GTGCCTTAG-------GT-AAAGGTATATAAAGTA-----CA-GATTAGAT-GCATTTTAGGTTGT----CTC-CAACAGATT----ACATATTTAATC-TAATATTAGC-ATGAA--TTGTC-AA-AGGTAG--AACATCTTGAACCAC------ACTGAAAATCCGTCTA----TTGGAGTTGT---TACG---CAC--CAC-AT---ACT-TGAA------CT----TCAATTTTGA----------AA-gtgagtatccatggctacagtg
gi|10 : AATTTCTCT----T-GATTCAGA----------GG-CA-CAT-TCATAAACATA--ACATAACTG-CT-------T----AATTTTTTTTTCAAT-AT---------------CA---GCATC--------T--CA----------TTTTTC---ACTT---CCTT-G-AA-T-GATTTCACT-GAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATCTTGGGTTC---TTTTG-----------TATG-AACGGACTGCTG-AAG----ATCTA-TGTCCAGTTTTTTTCAGTAATGAGTTagacaattcgttatgtttatttgaatttctcttgattcagaggcacattcataaacataacataactgcttaatttttttttcaatatcagcatctcatttttcacttccttgaatgatttcactgattttcacaagctgggcatcttgggttcttttgtatgaacggactgctgaagatctatgtccagtttttttcagtaatgagtt
gi|11 : tataacataattattatgcaatcctttgttatttttggtttgttgatagataaaatccatttaaataattaaaaacaatccaataagttacctgtacgcatgtccacaaatttagaaatagttgttccattagtttaagatcgttatctctgagtaccacgtctattgtgctcaactagtttagacagtgccttaggtaaaggtatataaagtacagattagatgcattttaggttgtctccaacagattacatatttaatctaatattagcatgaattgtcaaaggtagaacatcttgaaccacactgaaaatccgtctattggagttgttacgcaccacatacttgaacttcaattttgaaaagacaattcgttatgtttatttg--A--CCT-GGG--CCTGTC-----CA-TT-TT-T--AGAACAAA---A-A------TGC---AAC---GTT-T-T--CA-------GTT---GC-ATA-T----TAACCT-AAAA--TTG-T--C--C-A-T-T-C-T-----------G--TGA-G-AGAAAGAACTAA-TATTAGCCTTACGGG------GTCC-------TAC-G--GGC-CTTG-A-TCGATT---CT--TTCT-CTC-------A-CAA-AA--TGA----A--TAG-T-TTT-------TATCCTGTACTTAAACA----TGCATT
gi|12 : ggtttaATTGTAAAT-GTGTAA--TCA----TTTAT-TA----TTCT-A-A----GCT-TTGA----------TAT-A-----TAAAA---TAGTC-T---GCCTACA-TT----TA------AAAC-------------GTTACCT--GTA--GG--TATCC-AATACGTTGACAAT---TAA--TG-TCCATTA--T------------C-T-TTCAGAA---T---GGAC-A----GTAT-TATT-G---C-CAA------CATA--TTG-----GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAtaccaatgtcaataggtttcatattacatgtgtttgtaaatctctcaccaatactatttcttactttctttttaacatccaagttgt
gi|13 : ctatatttaaagTTTA-AA--TGGA--T--TTTA--TCT--ATCAACAAAC-----CA-AA-AA-T--AA--CAAA---GGATTGCATAAT---AATTATGTT-A-T--AAAA-----GTA---GG-ATA-G----AAGCCT-CAAA--CTA-T--A--C-A-T-T-C-T-----------G--TAA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCC-------TAC-G--GGC-TTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A-CAG-AA--TGT----A--CCG-T-TTTCGGCTTATATCCTTTACTGAAA-ATAAATGCATTA-AAGttattagatgtttacaggttgcctgaaaacaagagaaaaagatgatgcatttgtttaaacataaacaaattcaattctaaat
gi|14 : atta------GAT---AAT---GTTGT-T--GAT------GCA---TGTAT--T----AAGC-T-CAAA--CTG-C-----C-G-T-T-CCT-----------A--TGA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTT----A------GTCC-------TAT-G--GCA-ATTG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A-T-G-AA--TGG----A--C-G-T-TTGAGGCTTATATCTTTTttaccaagatgcgttgactgcgtgata
gi|15 : ttgcatgactatgaaCTG-A--AACTG---TCC-AATA--AGTT-A-AA-CA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-CG-C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTGTTGG-GT-TAT-TTA---------A-A-ACA-G--CT-T----TA---C-T---TGAAA--------G--AGG--ACAC-TTATGAA--GACAA---------TGG---AT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--A-TTTTA-AC--TAGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-C--AATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-TTGAA---------A---AG-ATA-A----AAatatataaaggttgtgattccaacgatgacattattcaatgatggaccaacagttttgtgtattgcacatgcattgtttgatctgaagagaa
gi|16 : at--T--T--A--TCT-GAT--TCCACC-----CC-AC-AT---------AAA---GAA------AAG---CAT---GTT-T-T--AA-------TTA---AG-AGA-A----AAGCCA-CAAA--CTA-T--C--A-A-C-T-C-T-----------G--TGA-A-AGAAAGAACTAA-----------------------------------------------A-A-TTAGTT---CT--TTTT-CTC-------A-CAG-AA--TGG----A--CAG-C-GTTTGGCCTTTCACTTTTACATA
gi|17 : acAATT---CT--TTCT-CTC-------A-CAG-AA--TGG----G--CAG-A-TTTCGGTCTTTCTCCTGTACATAacaaaa
gi|18 : catcactacatg--T--T--A--TAT-GAT--G-TATC------A-AT-AT-TTGAATACA----------------C---AAT---GCT-T-T--AACTCCATAGCA---AG-GTA-T----TAGCCT-GAAA--CTG-T--C--C-A-T-T-C-T-----------T--TGA-G-AGAAAGAACTAA-T------CTC----G------GCCTG------TA--G--GGC-Ccagctctatcgtatcaagccagctaaagtcaagtacatgtactttttccagtacaacaactctggagtttgaa
gi|19 : tttaattacatgtatttccACAAA---AGA------TGC---ACT---AGT-C-T--AA-------GTA---GG-ATA-T----AAGCAC-AAAA--CTA-TCTATCC-A-T-T-C-T-----------G--TGA-GGAAAAAGAATTAA-T------CAC----A------ACCT-------TAC-G--GAC-CTTG-A-TCAGTT---aa
gi|2 : aacgaaaacaacaTAAGACCATA--TGT---T-ACGCAACATCCAATCTTTGTATAAATTTT-T-C-GTGTAGTT-GTTAACTCTGTACCTAT-A-C-GCTAAGACATT--CCATAATGTGAATA-TTTATAAATGAGGCAAAAAATTGCCCAATAA-TTACCTTTGTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTAAAAACAAT-G--TG-TCCATTG--CAGTTTCTACA--C-TAT----AT---TTGAGAACTA----G--T-TATTAG---TACAAAATGACTTTA--TTTATCTGAGACAAGTGCC--AGTGTTGTCAT-ATACAGATAAA--T-GTTTTTCA-TG--AGAT-GCGTTT-------TGTCACACACAACAAGTTTAAGAGATTTTTAATCTTTATAATAACTACGAAATTTGTCTAC-AAGTTATTAACATCAG-GACAGCCAAGCGACCGAAAATC--TC-A----TTG--GTCGT---TAC----CAC---AC-ATCACATTATGAAACTTCTACATAATCGATTCAGA----------AAATG-CATCTT-----CTCCATACATA--TAACT-------CTAAAAATTTTTTTTC--GTTGTT---------TTCCCTA---GCATC-TTTGGGTT--CAC-ATTTCATTTTTT-C---ACTT---CCTTTG-AA-TCGATTTCACT-GAT-TTTTCAC-AAGCTGGGCATCTTGGGTTA---TTTTGC--ATGA-AGTTATG-AACGGACTGCTGTATG----ATCTA--GTCCAG-TTTTTTCAGTAATGAGTTGTT-CAT-CTA------CT-CCAGC-ATCA-TA-CAGTCTTGTTGGC-ACA-GTGGATATAC-GTG-ATAGTGA---------G---------AA-------------ATG-GTACTT-TGTA-TTTCCCTGCCT-GTTCAC--A-------TTAGGCTTCTGGCGACGA--TTT-CTGT-AAAA-CATGTATAGA-C-ACC---AACT-GAGAGAGTTATGCATCTGCCATA--CCG-G---A-ATGA--TCCGTATACT-AA-TG-CTA---CTTTT-C-TA-ATACTAGAAAGTATTAGGTTGCTTCAT-ATCT-CAGCA---TTCT--CCT-TTATTAATCTTATTA-GTCAATGTGAACATTCA-C-TGTGCTAG---AAACTTC-A-GTA--TC-GC--GT--ATT-T-ATGCGTACAGCAC------TTC-AC-TCTC-----ATCCCTATATATA-TTCTCTCCG-ATAT-GCTGGTAGATG-CAAAA-------AAATTGTCC-T-----TTTTCCATCAGAGGA--ACT-C-ATGTTT-GTATTTTGA-TTC--AATGGTTATTGAAAAGTTG-TGCGTACTA-TGACTA---TTTAAT-TGAT--TTTCAAG---TTTT--ATAGACC-----------TTA---GA--ACTTACCTGTA--AACTACTTTCCTAATA--AGTT-A-AA-CATACACACAAA------GAAGAG-----CGAGCTTCC--C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTGTTGG-GA-TATATTATAATGCCACA-A-ACA-G--CT-TATGATG---C-CTTGTGGCA--------G--AGGATACAC-TTATTGA--GACAA---------TGGCGCAT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--ATTTTTG-AC--TGGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATCG----CATAT-AT-TTAAATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTAG--GG-ATA-G----AAGCCT-CAAACCCTGCT--A--C-ATT-T-C-T-----------GTTTTA-G-AGAAAGTAAT---T------CTC----GTATTCAGGCC-------TACTGACGGC-CTCG-A-TCAGCTTCCCT--TTCT-CTTCCCTCTGA-CAGAAA--TGTTTTGACTCAG-TATGTCGGCT
gi|20 : aCTCAAAAC-ATTTTTGT---T-ACGTTA--TCT----TTTGT-TA----TT-T-TAG----GCT-TTTA----------TAT-A-G-A-CGAGAG--T--CCA----GCCG-TA-TT----TA------AAAT-------------GTTACCT--ATA--GG--TGTgtgagtatccatggctacagtg
gi|21 : tgtgaacatttaaatcccGT----A--CAG-T-TTGAGGCTTATATCCTTTACATA
gi|22 : ggcacttgcggccgtataagggaccgccatttttaaaagatcgtatccgacagatatttggcgaagaagcagA---GCATC-TTCTGATT--CAC-ATTTCATTTTT--C---ACGT---CCTT-G-AA-T-GTTTTCACT-GAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATCTTGnc
gi|23 : AAAAAGTTGCCT--GTA--GG--TGTCC-AATAAGTGGACAAT---T-AC-TG-TACATTA--T------T
gi|23 : tgtactt-TCCATTG--T------TATA--A-A-T----AA---T---GTAC-A----G--T-AATT-G---T-CCA------CTTA--TT------GGACA-tataacaatggagagt
gi|25 : tgtacttaaaaagttgcctgtaggTTAAAAC-ATAATTGT---T-ACGCAA--TCC----TTTAT-------TT-T-C-G----GTT-GTTA----------TAT-AGC-A-TATAA---T--CCgagt
gi|26 : gggca-A-T-T-C-T-----------G--T-A-G-AGAAAGAACCGA-T------ATC----G------GACTTGCAATGTAC-G--TGC-CTCG-A-CCAGTT---
gi|27 : -A-TCAGTT---CT--TTCT-CGC-------A-CAA-AA--TGG----A--CAGTT-TTTCGACTTTTA--CTTTACATAA
gi|28 : GTTTAAAAC-ATGATTGT---G-ACGTAA--ACC----TT--T-TG----TT-T-G-A----ATT-GTC-----------CAT-A-CTA-TAa
gi|29 : ------GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAACATATAAAAAG-A-----CA-GA--AGAT-GCGTTTG------T----CAAACg
gi|3 : TAAAAC-ATAATTGT---TGACGCAA--TCC----TTTGT-TAAT--TT-T-C-G----GTT-GTTA----------TAT-AGC-A-ATAAA---T--CCAT---GTAAAT--TT----CA------AAACAAT---CCAATAAGTT-CCT--GTAAGCG--TGTCCCAATAAGTTTAGAAAA--T-G--TG-TCCATTA--T------TAA---C-T-T----AT---T---GGAC-A----G--T-TATT-G---C---A------CTTA--TT------G-ACA--TGTC--AG-------GTTAAACG-ATAAAAAG-G-----CAAGA--AGATTGCGTTG-------T----CAC-CAA-AAGT-----AAATTTT-AATCCTAATAACAAC-GCA-----TGTCCACCAAGTA----AC-TCTGAGACCAC------ACCGAAAATC------------GACGTCGTACCCAC----CCC--CACCATCACATTATGAAACTTCTCT----T-GATTCAGA----------A--C--CATCTC-----C-----ACAT---TG-CTTAAAATGC----GATTTTTTTTT--AT-GTT---------TTCC-TA---GCATCCTTTGGACTTCCACCATCTTTCCTTTTTC---ACCTATCCCTT-GCAACT-GATCTACCTCGATCTTT-CCCTCAGCTGGG--TCTTG--CTACATTTCTGCTCGCGAGAGTTATGGAACGGACTGCTG-ATGGAGAATCTAATCTCCAGTTTTTTTCAGTAATGAGTTGTTTCATGCTA------CTTCCAGCCATCG-TA-CAGTTTTG-TGGCTACAAGTGG---CACCGCT-T----GA---------G---------AA-------------ATG-TC-CTT-TGAAAT---CCCGCCT-GTTCACGAA-------T--AGCT--TGGTGACGGGGTTT-CTGT-AAAAACATG----AA-C-ACC---AACTCGGG-------TG-ATCTG-CATA--CCG-A---ATATG---TCCGAAGAAAAGA-TG-TCA---CTTTT---TA-A-ACT-GAA---GTTAGC--GCTTCAT-A--T-CAG-A---TTCT--CCT-TC-----TC-TAT---ATCAA---GA-CA-TCA-CATG----AG---AA----CTG-TTA--TC-G---GT--ATT-T-A---------CAC-----TTTC-AC-TCTCT----ATTCCT---------------------T-GC--------G-TGAGA-------CAAATG--C-T-----CTCTCCATCAGAGGATCACT-CCATGTTG-GTA--T-GA-TTC--AATGG----TGAAA----G-TG---A--A----ATA---TTTAA---GA---TTTCAAAGT-TTTT--ATAGACC----------TT-A---GA--A-TTACTAA-A--AACTG---TCC-A-TA--AGTA-A-AAACA-------AAA------GA--A------C-AGCTT-C--CCAAA-GAC--GG-TTTGGTT--AT-GTTGG-GAGTAT-TTA---------AGA-ACA-G--CT-T----T----C-C---TGGCA--------AGCAGG--ACCT-TTATGAA--GACAA---------TGG---AT-TAATCA-G-GAA--AC-T-AA--AA-TC--T-TTTTG-ACC-TGGAGGTGAT--A--GTT--AT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATACAA-----GA------GAT---AAT---GTT-T-TA-AA-------GTA---GG-ATA-G----AAG-CT-CAAA--CTG-T--A--C-A-T-T-C-TG----------G--TAA-GAAGAAAGAACTGA-T-------TC----G------G-CC-------TAC-G--GGC-CTCG-ACTCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A-C-G-AA--TGT----A--CAG-T-TTTCGGCTTATATCCT
gi|30 : c--GGC-CTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTT-------A-CAG-AA--AGG----A--CAG-
gi|4 : GCTTAAAAC-ATAATTGT---T-ACGCAA--TCC----TTTGT-TA----TT-T-C-G----GTT-GTTA----------TAT-G-C-A-TAAAA---T--CCAT---GTAAAT--TT----AA------AAACAAT---CCAATAAGTTACCT--GTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTAGAAA---T-G--TG-TCCATTA--T------TAAA--C-T-T----AT---T---GGAC-A----G--T-TATT-G---T-CAA------CTTA--TT------GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAACGAATAAAAAG-G-----CA-GA--AGAT-GCGTTT-------T----CACACAA-AAG--TAAA----TTTTAATC--TA-AATAAC-ACGAA---TGTC-AC-AAGTAG--AACATCTGAGACCAC------ACCGAAA-----TC-A----TTG--GTCGT---TAC----CAC--CAC-ATCACATTATG-AACTTCTCT----TTGATTCAGA----------AA----CATCTC-----C-----ACAT---TG-CT-------C----AATTTTTTTTT--AT-GTT---------TTCCTTA---GCATC-TTTGGATT--CAC---TTCATTTTTTTC---ACTT---CCTT-G-AA-T-GATTTCACT-GAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATCTT-GGTTA----TTTGC--ATGA-AGTTATG-AACGGACTGCTG-ATG----ATCTA-TGTCCAG-TTTTTTCAGTAATGAGTTGTT-CAT-CTA------C--CCAGC-ATCA-TA-CAGTCTTG-TGGCTACA-GTGG---CAC-GT--A----GA---------G---------AT-------------ATG-GT-CTT-TGAA-T---CCTGCCT-GTTCAC--A-------T--AGCT--TGGCGACGAT-TTT-CTGT-AAAA-CATG----AA-C-ACC---AAC--GGG-------TGCATCTG-CATA--CC--G---A-AT-A--TCCGAAAA---GA-TG-TCA---CTTT----TA-A-ACT-GAA---GTTAG---GCTTCAT-A--T-CAGCA---TTCT--CCT-TT-----TC-TAT---ATCAA---GAACA-TCA-C-TG----AG---AA----C-G-TTA--TC-G---GT--ATT-T-A---------CAC-----TTTC-AC-TCTC-----ATCCCTA-A---A-TTTT----G-AT-T-GT--------G-TGAGG-------AAAATG--C-T-----CTCTCCATCAGAGGA--ACT-C-ATGTTT-GTA---TGA-TTC--AATGG----TGAAA----G-TG---A--A-TGACTA---TTTAA--TGA---TTTCAAG----TTT--ATAGACC----------TTTA---GA--ACTTACCTG-A--AACTG---TCC-AATA--AGTA-A-AA-CA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-C--C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTG-TGG-GA-TAT-TTA---------A-A-ACA-G--CT-T----TA---C-C---TGGCA--------G--AGG--ACAC-TGATGAA--GACAA---------TGG---AT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--A-TTTTG-ACT-TGGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTA---GG--TA-G----AAGCCT-CAAA--CTG-T--A--C-A-T-T-C-T-----------G--TAA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCC-------TAC-G--GGC-CTCG-A-TCAGTTG--CT--TTCT--TC-------A-CA--AA--TGT----A--CAG-T-TGTCGGCTTATATCCTTTACTTAAACACCATTGCATTGCAGGGTTGGGTA
gi|5 : taCTTC-T-A--A-CA--A---TTAT--CTTGTC-----TC-AATGTAATCA----GAACA-TCA-C-TG----AGT--AA----C-GGTTA--TC-GTCAGTTTATT-T-A---------CACACTTTTTTC-TCATCTCGTGCAATCACCATA---A-TTTT----ACAT-TTGC--------G-TGAGACGGTTACAAACTG--C-TACCATCTCTCAAGCAGAG-A--ACTAC-ATGTTTGGTA--TTGAGTTCAGAAT-G----TGAAA----GATGA--A--A-TGAATA---TCTAAATTGA---TTTCAGATGTTTTT--ATAGGACAACGTCTTGATTTATGGGAATATTTACCTG-ATTAACTGGATTCC-GATAGGAGTATA-AC-CA-------AAACATAATGA--AATCAATC-AGCTC-A--C--AAGGACT-GG-ATT--TTCAATTGTAGGTGA-TAT-TTA---------A-AGACATG--TTCT----TACATC-C---TGGAGATCTTTGTG--AGA--CCACTTTAGGAA--GACAAATGCGTTTTTGT---AC-TA--TG-GAAAA--ACAG-AATTAA-TCATA-TTCTA-ACATTGGGACT--T--AGGCCTCGCA--ATTATCATATGCA-ATCAT-G--AATATACATATGTA------TGTATAAAT---GTTGTAT--AA-------GTATAGAG-ATA-AGTATAGGCCTCCAAA--CTG-------C-A-T-TGC-TTACTAGCTCAAG--TAAGG-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------G-CC-------TAC-G--GGCTCTCG-ATTCAGTT---CTTCTTCTGCTC-------ACCAG-AAATTGT----A--CAG-T-TT---GC-TACGTCCTTTACTCA
gi|5 : ctatgatgtaaaaggga-CTGG-AAGA-AAAG----GA-C-ACC---AAC---GG-------T-CATC-G-CATA--CCA-G---A---------TAGACATT-GA-TGACCAATGCTTGTACGTATATATTTGAA---GTT------CTTC------T-CAGtgctggataatggaagtcctttaactaggcaagtataatttaagagtttttacatggcatttgacaacttaaaagcatatgctaggcttatttattctggcataaaatctatgtttgcgctgttttccaaacttttatgctatatttttcaggctcagaacatggcaatgatgaacgcaactatcacctgagaagaacttcaaatatatacgtacaagcattggtcatcaatgtctatctggtatgcgatgaccgttggtgtccttttcttccag
gi|6 : ctatgatgtaaaagggatgagtaaaggacgtagcaaactgtacaatttctggtgagcagaagaagaactgaatcgagagcccgtaggccgagatcagttctttctccttacttgagctagtaagcaatgcagtttggaggcctatacttatctctatacttatacaacatttatacatacatatgtatattcatgattgcatatgataattgcgaggcctaagtcccaatgttagaatatgattaattctgtttttccatagtacaaaaacgcatttgtcttcctaaagtggtctcacaaagatctccaggatgtaagaacatgtctttaaatatcacctacaattgaaaatccagtccttgtgagctgattgatttcattatgttttggttatactcctatcggaatccagttaatcaggtaaatattcccataaatcaagacgttgtcctataaaaacatctgaaatcaatttagatattcatttcatctttcacattctgaactcaataccaaacatgtagttctctgcttgagagatggtagcagtttgtaaccgtctcacgcaaatgtaaaattatggtgattgcacgagatgagaaaaaagtgtgtaaataaactgacgataaccgttactcagtgatgttctgattacattgagacaagataattgttagaagtgctggataatggaagtcctttaactaggcaagtataatttaagagtttttacatggcatttgacaacttaaaagcatatgctaggcttatttattctggcataaaatctatgtttgcgctgttttccaaacttttatgctatatttttcaggctcagaacatggcaatgatgaacgcaactatcacA---GTTAG---GCCTCATTA--TGCAGCAA--TTCT--CCT-GC-----TT-TGTG--ACCAA---GAACA-TCAGC-TG----AGGAGAA----C-G-TTA--TCCG---GT--ATTGT-A---------CAC-----TTTCGAC-TCTC-----ATCTC-A-A---A-TTT-----G-AT-T-GC--------G-TGAGG-------AAA-TG--CGT-----CTCTCCATCAGCGGACAACT-C-ATGTTT---A--TGGA-TTC--AATGG----TGAAA----G-TG---A--A-TGAATACAGTTAAA--TGAGC-TTTC-AG---TTTTTAATAGACC----------CTTA---GA--AATTACCTG-A--AACTG---TCC-AATT--AATA-AGAA-CA-------AAA------AG--AA-----C-AGCTT-TCAC--AA-GACTGGG-TTT--TT--ATTATTGA-GG-TAT-TTAT--------A-A-ACA-GTTTT-T----TA---CTT---TGGGA--------G--TGG--ACACTTTAGGAAACGACAA---------TGG---ATGTA--TA-G-GAATCACATAAA--AA-TC--A-TTTTGAAC--TGGA--T--T--A---CT-GAA--ACTATC-----CA-AT-CTAT--AATATAAA----GA------GAT---AGT----TT-T-T--AA-------GTA---GG-ATAGG----AAGCCT-CAAAG-CTG-T--A--CGA-T-T-C-T-----------G--TAA-G-A-AAAGAACTGACT------CTC----G------CCCT-------TAC----GGC-CTCGAA-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------ACCAGCAA--T-T----A--CAG-T-TTTCGGCTTATATCCTT
gi|6 : TAAGGAGAGGTT-CAT-TGAACATGGCT-CCAGCTATCGGTA-CAGTCTTG-GGGCGGCA-CGGG---CAC-GTA-GAT--GA---------ATGGTTTGT-AA-------------ATG-GC-CTTGTGAA-T---CCTGCCTCGTTCAC--A-------TG-AGCT--TGGCG-CGGTGTTC-CTGT-AAAA-CATG----AACC-ACC---AAC--GGG-------T-CATCT--CATACGCCGAG---AGATGA--Tagggcaagtataattcagagttttacgcatgactttgcatttaatgcaggctccgtatatttttcgccaaataactatttctcgttgcacttttgctatatttcaggggccagaaaatgggatgtgcacgctctatacctaccaccgacagagacactcaaatactaagcaacatcatctctcggcgtatgagatgacccgttggtggttcatgttttacaggaacaccgcgccaagctcatgtgaacgaggcaggattcacaaggccatttacaaaccattcatctacgtgcccgtgccgccccaagactgtaccgatagctggagccatgttcaatgaacctctcctta
gi|7 : aaggatataagccgaaaactgtaattgctggtgagagaaagaactgattcgaggccgtaagggcgagagtcagttcttttcttacagaatcgtacagctttgaggcttcctatcctacttaaaaactatctctttatattatagattggatagtttcagtaatccagttcaaaatgatttttatgtgattcctatacatccattgtcgtttcctaaagtgtccactcccaaagtaaaaaactgtttataaatacctcaataataaaaacccagtcttgtgaaagctgttctttttgttcttattaattggacagtttcaggtaatttctaagggtctattaaaaactgaaagctcatttaactgtattcattcactttcaccattgaatccataaacatgagttgtccgctgatggagagacgcatttcctcacgcaatcaaatttgagatgagagtcgaaagtgtacaataccggataacgttctcctcagctgatgttcttggtcacaaagcaggagaattgctgcataatgaggcctaactagggcaagtataattcagagttttacgcatgactttgcatttaatgcaggctccgtatatttttcgccaaataactatttctcgttgcacttttgctatatttcaggggccagaaaatgggatgtgcacgctctatacctaccaccgacagagacactcaaatactaagcaacA---GTTAG---GCTTCAT-A--T-CAGCA---TACA--CCT-TC-----TC-TA----ATCAA---GAACA-TCA-C-TG----AG---AA----C-G-TTA--TC-G---GT--ATT-T-A---------CAC-----TTTC-AC-TCTC-----GTCCCTA-A---AATTTT----G-AT-T-GC--------G-TTAGA-------AAAATG--C-T-----CTCTCCATCAGAGGA--ACT-C-ATGTTT-GTA--T-GA-TTC--AATGA----TGAAA----G-TG---A--A-TGAATA---TTAAA--TGA---TTTCAAT---GTTT--ATAGACC----------TT-A---GA--ACTTACCTG-A--AACTG---TCC-AATA--AGT--A-AA-CA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-CA-C--AA-GAAT-GG-TTT--TT--ATTGTTGA-AG-TAT-TCA---------A-A-ACA-G--CT-T----TA---C-C---TGGGA--------G--AGG--ACAC-TTATGAA--GACAA---------TGG---AT---------------------A--AA-TC--A-TTTTA-AC--TGGC--T--T--A--CCT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTA---GG-ATA-G----AAGCTT-CAAA--CTG-T--A--C-A-T-T-C-T-----------G--TAA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCC-------TAC-G--GGC-CTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A-CAG-AA--TGT----A--CAG-T-TTTCGGCTTATATCCTTTACATA-----CATTG-ATTG-
gi|7 : ggcactttggaggccttagtgatcgttttggtaaagatagtgacaagatggcagaatgtgaagagacaaAATGAGTTGTT-CAT-CTA------CT-CCAGC-ATCG-TA-CAGTCTTG-TGGCTGCA-GTGG---CAC-GTAGA----GA---------ATGGTTTGTAAA-------------ATG-GC-ATT-TGAA-T---CCTGCCT-GTTCAC--A-------T--AGCT--CGGCGACGGT-TTT-CTGT-AAAA-CATG----AA-C-A-C---AAC--GGG-------TGCATCTG-CATA--CCA-G---G-ATGA--Taaggcaagtataatcatgagttttacatgcatttgacatttaatgcaggcttatatttttgcaaacactaattctgttcactttttttatatttcaggccagaaaatggcaattgtgacgcactatactgagacaactcaaatatagtacatcatcatcctggtatgcagatgcacccgttgtgttcatgttttacagaaaaccgtcgccgagctatgtgaacaggcaggattcaaatgccattttacaaaccattctctacgtgccactgcagccacaagactgtacgatgctggagtagatgaacaactcatt
gi|8 : ggcactttggaggccttagtgatcgttttggtaaagatagtgacaagatggcagaatgtgaagagacaacaatcaatgtatgtaaaggatataagccgaaaactgtacattctgtgagagaaagaactgatcgaggcccgtagggccgagatcagttctttctcttacagaatgtacagtttgaagcttctatcctacttaaaacattatctcctttgtattaatattggatagtatcaggtaagccagttaaaatgatttatccattgtcttcataagtgtcctctcccaggtaaagctgttttgaatacttcaacaataaaaaccattcttgtgaagctgtttcttttgtttacttattggacagtttcaggtaagttctaaggtctataaacattgaaatcatttaatattcattcactttcatcattgaatcatacaaacatgagttcctctgatggagagagcatttttctaacgcaatcaaaattttagggacgagagtgaaagtgtaaataccgataacgttctcagtgatgttcttgattagagaaggtgtatgctgatatgaagcctaactaaggcaagtataatcatgagttttacatgcatttgacatttaatgcaggcttatatttttgcaaacactaattctgttcactttttttatatttcaggccagaaaatggcaattgtgacgcactatactgagacaactcaaatatagtacatcA---GTTAG---GCTTCAT-A--T-CAGCA---TCC----CT-GC-----TT-TGT---ATCAAA--GAACA-TCA-C-TG----GA---GA----C-G-TTAAATC-G---GT--ATT-TTA---------CAA-----TTTC-AC-TCTC-----ATCCCTA-A-----TTTT----G-AT-T-GC--------GGTGAGG-------AAAATG--C-T-----TCATCCATCAGCGGA--ACT-C-ATGTT--GTA--T-GA-TTC--AATGG----T-AAA----G-TG---A--AATGAATA---TTAAAA-TGAATTTTTCAAG---TTTT--ATAGACC----------TT-A---GA--AATTAC-TG-A--AACTG---TCCCAATA--A-TA-A-A--CA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-C--C--A--GACT-GGGTTT--TT--ATTATTGA-GG-TAT-TTA---------A-A--CA-G--TT-T----TAA--C-T---TGGGA--------G--TGG--ACAC-TTAGGAAA-GACAA---------TGG---ATATA--TAAG-GAA--ACAT-AA--AAATC--A-TTTTA-AC--TGGAA-T--T--A--ACT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATATAAT---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTA---GG-ATA-G----AAGCCT-CAAA--CTG-T--A--C-A-TAT-CTT-----------G--TAA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCCT------TAC-G--GG--CTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A--AG-AA--TGT----A--CAG-T-TTTCGGCTTATATCCTT
gi|8 : -ATCG-TAACAGTCT-G-TGGCTGCA-GTGG---CAC-GTA-A----GA---------G---------AATGGTTTGTAGTAAATGTGC-CTT-TGAA-T---CCTGC-T-GTTCAC--ACTCATTAT--AGCT--TGGCGACGGT-TTTCCTGTAAAAA-CATGAC--AA-CAACCAAAAAC---GG-------TGCATCTG-CATA--CCA-GGCAG-ATGATGTTCTGATATT-GAGTG--------TTCT-CGTAGGTAATAG--------AG---GCGTCAC-A--T-TTGCAATTTTCTGGCCT-Taagccaagatataatatgtagtttacatggcatttgacattttaatgcaggcttttatatattttttcgcaaaaactatttctgttcacctttttctatatttcaaggccagaaaattgcaaatgtgacgcctctattacctacgagaacactcaatatcagaacatcatctgcctggtatgcagatgcaccgtttttggttgttgtcatgtttttacaggaaaaccgtcgccaagctataatgagtgtgaacagcaggattcaaaggcacatttactacaaaccattctcttacgtgccactgcagccacagactgttacgat
gi|9 : aaggatataagccgaaaactgtacattcttgagagaaagaactgatcgagcccgtaagggccgagatcagttctttctcttacaagatatgtacagtttgaggcttctatcctacttaaaacattatctccattatattaatattggatagtatcagttaattccagttaaaatgatttttatgtttccttatatatccattgtctttcctaagtgtccactcccaagttaaaactgtttaaatacctcaataataaaaacccagtctggaagctgtttcttttgtttattattgggacagtttcagtaatttctaaggtctataaaacttgaaaaattcattttaatattcatttcactttaccattgaatcatacaacatgagttccgctgatggatgaagcattttcctcaccgcaatcaaaattagggatgagagtgaaattgtaaaataccgatttaacgtctccagtgatgttctttgatacaaagcagggatgctgatatgaagcctaactaagccaagatataatatgtagtttacatggcatttgacattttaatgcaggcttttatatattttttcgcaaaaactatttctgttcacctttttctatatttcCTTAAAAC-ATAATTGT---T-ACGCAA--TCC----TTTGT-TA----TT-TTC-G----GTT-GTTA----------TATGG-C-A-TAAAA---T--CCAT---GTCAAT--TT----AA------AAACAAT---CCAATAAGCTACCT--GTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTAGAAA---T-G--TG-TCCATTA--T------TAAA--C-T-T----AT---T---GGAC-A----G--T-TATT-G---T-CAA------CTTA--TT------GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAACGGATAAAAAG-A-----CA-GA--AGAT-GCGTTTG------T----CAAACAG-AAG--TAAA----TTGTAA--TTTA-AATAAC-ATGAA---TGTC-AC-AGGTAG--AACATCTGAGACCAC------ACTGAAAATCATTC-ATTATTTG--GTCGT---TACTCGTTACCACAC-ATCACATT-TAGAACTTCAAT----TTGAAAGACA----------AATTGTTATGTT-----C------TATA--TG---------------AATTTCTCTTT--AT--TCAGAGGCACATTCAAAA---ACATC-TCCAAATT------GCTTAATTTTTTTTATGATTT---CCTT-
gi|9 : TATGAA-TTTCTCT----TT-ATTCAGAGGCACATTCAAA-AA-CATCTC-----C-----AAAT---TG-CT-------T----AATTTTTTTT---AT-GAT---------TTCCTTATCAGCATC-TTCTGATT--CAC-ATTTCATTTTTT-C---ACTT---CCTG-G-AA-T-GATTTCACT-AAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATTTTGGGTTC---TTTTG-----------TATG-AATGGACTGCCG-ATG----ATCTA-TGTCCAGTTTT--TCAGTAATGAGTTGTT-CAT-CTA------CT-CCAGC-ATCG-TA-CAGTCTTG-TGGCTGCA-GTGG---CAC-GTAGA----GAATGGTTTGTA---------AA-------------ATG-GC-ATT-TGAA-T---CCTGCCT-GTTCAC--A-------T--AGCT--CGGCGACGGT-TTT-CTGT-AAAA-CATG----AA-C-A-C---AAC--GGG-------TGCATCTG-CATA--CCA-G---G-ATGA--Tatcagcatcttctgattcacatttcattttttcacttcctggaatgatttcactaattttcacaagctgggcattttgggttcttttgtatgaatggactgccgatgatctatgtccagtttttcagtaatgagttgttcatctactccagcatcgtacagtcttgtggctgcagtggcacgtagagaatggtttgtaaaatggcatttgaatcctgcctgttcacatagctcggcgacggttttctgtaaaacatgaacacaacgggtgcatctgcataccaggatgatgatgtacta
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): GATGACATTAGTGATGAAACAGCAGTTTTGTGTATTCATAATATGCATTATTTGATGTGAAGGGA
Alignments
lowQualScore : 11 1111 2222 22222222 3333333333 11111 111 111 11 444444444444 111 11 22222222 333333333333333333333333333333333 111111 1 11111 222222 333333 3333333 3333333 444444444444 1 33333333 1 222 1 222 333333 2222222222 11 111 2222 111 2222 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111 2222222222222 11111 1 1 1 111 22222222 1 1111 11 1 111111 1 1 111 8888888888888888888888888888888888888888888 1 111 2222222222 11 11 2222 111 2222222 11111 111 1111111 222 111 1 111 222 11 111 33333333333333 222 1 222222222222222 1 111 444444444 111111 11111 33333333333333333333333333333333 11111111 22222222 11 2222 2222 2222 222222 22 222 1111 33333333333 222 1 2222222 111111 111111111 1111 444444444 222222222222222 11111111 11 11 111111111 111 11 11 11111 1111 1111111 111 11 1111111 11111111111111 11111111111111111 111 1111111 11111 222222 1
lowQualScore : 8 3 777 4 11 7777 8 2222 4 00000000 4 5555555555 4 66666 4 555 66 777 11 44 111111111111 3 777 1 22 66 66 5 0 66666666 4 888888888888888888888888888888888 111111 66 5 0 33333 888888 0 66 000000 8 66 2222222 5 6 5 1111111 5 77 5 555555555555 5 5 11111111 9 7 3 999 8 6 222 9 0 888888 7777777777 88 111 0000 555 6 5 0 3 1111 8 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 000 8888888888888 8 888 5 22 66 77 33333 888 0 5 5 1 5 5 1 5 111 22222222 6 3 4444 44 5 5 5 666666 5 0 5 5 0 6 5 777 5 6666666666666666666666666666666666666666666 5 0 5 5 777 5 66 6666666666 33 66 4 4 4 5555 4 4 1 777 666 8888888 1 8 66 77 22222 66 1 1 333 6 6666666 222 444 1 555 000 0 4 11 4 222 66 4 33333333333333 222 0 5 5 555555555555555 0 66 5 888 66 5 5 000000000 555555 5 5 77777 77777777777777777777777777777777 77 77777777 0 11111111 66 66 5 5 11 3333 5 66 1111 1111 5 777777 5 888 0 11 555 5555 66 33333333333 3 888 66 4 8 66 333 3 66 99 4 4 8888888 222222 444444444 8 8888 66 4 4 4 66 66 4 4 8 000000000 4 4 4 66 4 777777777777777 1 66666666 66 22 8 00 777777777 555 8 66 4 4 66 4 66 4 66 8 4 33 22 44 44 555 3 44 33333 6 3 3333 555 777777 444 444 5 2 66 5555555 000 2 888888 2 00 0000000 2 5 2 2 5 55555555555555 4 2 5 0 2 777777 5555 66666666666666666 7777 2 2 5 000 33 2 7777777 5 8 33 00000 66 2 5 1 0 111111 2 3
lowQualScore : . . ... . .. .... . .... . ........ . .......... . ..... . ... .. ... .. .. ............ . ... . .. .. .. . . ........ . ................................. ...... .. . . ..... ...... . .. ...... . .. ....... . . . ....... . .. . ............ . . ........ . . . ... . . ... . . ...... .......... .. ... .... ... . . . . .... . ......................................................... ... ............. . ... . .. .. .. ..... ... . . . . . . . . ... ........ . . .... .. . . . ...... . . . . . . . ... . ........................................... . . . . ... . .. .......... .. .. . . . .... . . . ... ... ....... . . .. .. ..... .. . . ... . ....... ... ... . ... ... . . .. . ... .. . .............. ... . . . ............... . .. . ... .. . . ......... ...... . . ..... ................................ .. ........ . ........ .. .. . . .. .... . .. .... .... . ...... . ... . .. ... .... .. ........... . ... .. . . .. ... . .. .. . . ....... ...... ......... . .... .. . . . .. .. . . . ......... . . . .. . ............... . ........ .. .. . .. ......... ... . .. . . .. . .. . .. . . .. .. .. .. ... . .. ..... . . .... ... ...... ... ... . . .. ....... ... . ...... . .. ....... . . . . . .............. . . . . . ...... .... ................. .... . . . ... .. . ....... . . .. ..... .. . . . . ...... . .
lowQualScore : 9 4 000 0 00 0000 0 5555 0 44444444 0 0000000000 0 44444 0 666 11 555 44 44 555555555555 2 555 1 22 11 11 0 2 44444444 4 333333333333333333333333333333333 666666 99 0 0 55555 888888 4 99 000000 9 99 5555555 0 6 0 1111111 7 99 7 333333333333 0 0 88888888 8 3 3 777 0 7 000 8 7 333333 5555555555 33 777 8888 888 7 0 1 2 2222 5 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 111 6666666666666 9 888 0 55 99 00 11111 888 0 7 7 4 7 7 4 7 777 88888888 7 3 2222 00 5 7 7 444444 7 0 0 0 0 2 0 555 0 2222222222222222222222222222222222222222222 0 0 0 0 555 0 99 0000000000 88 22 4 4 4 0000 4 4 1 888 111 9999999 1 9 11 11 77777 11 0 0 888 7 5555555 555 222 7 666 000 8 0 00 0 222 11 4 66666666666666 555 0 0 0 000000000000000 0 99 0 888 99 0 0 000000000 888888 0 0 55555 88888888888888888888888888888888 00 11111111 5 22222222 99 99 0 0 22 2222 0 99 2222 2222 0 222222 0 888 8 99 666 8888 99 11111111111 2 888 99 5 9 11 333 3 11 66 4 4 9999999 888888 111111111 9 4444 11 4 4 4 11 11 4 4 9 000000000 4 4 4 11 4 222222222222222 0 11111111 11 22 9 66 888888888 666 9 11 4 4 11 4 11 4 11 9 0 55 55 66 22 666 1 22 88888 2 1 5555 000 777777 777 777 3 7 33 0000000 000 7 222222 9 77 5555555 7 3 7 7 3 44444444444444 1 7 3 9 7 777777 7777 88888888888888888 2222 5 5 0 666 77 7 3333333 3 0 77 88888 99 5 3 0 8 555555 5 3
consensus : NNGCTTAAAAC-ATAATTGT---T-ACGCAA--TCC----TTTGT-TA----TT-T-C-G----GTT-GTTA----------TAT-A-C-A-T-AAAA---T--CCAT---GTNAATA-TT----AA------AAACAAT---CCAATAAGTTACCT--GTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTAGAAA---T-G--TG-TCCATTA--T------TAAA--C-T-T----AT---T---GGAC-A----G--T-TATT-G---T-CAA------CTTA--TT------GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAACGGATAAAAAG-G-----CA-GA--AGAT-GCGTTT-------T----CACACAACAAGTTTAAGAGATTTTTAATCTTTATAATAAC-ACGAA--TTGTCTAC-AAGTAG--AACATCTGAGACCGC------ACCGAAAATC--TC-A----TTG--GTCGT---TAC----CAC--CAC-ATCACATTATGAAACTTCTCT----TCGATTCAGA----------AA-CG-CATCTC-----C-----ACATA--TG-CT-------C----AATTTTTTTTT--AT-GTT---------TTCCCTA---GCATC-TTCGGATT--CAC-ATTTCATTTTTTTC---ACTT---CCTT-G-AA-T-GATTTCACT-GAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATCTTGGGTTA---TTTTGC--ATGA-AGTTATG-AACGGACTGCTG-ATG----ATCTA-TGTCCAGTTTTTTTCAGTAATGAGTTGTT-CAT-CTA------CT-CCAGC-ATCG-TA-CAGTCTTG-TGGCTGCA-GTGG---CAC-GTA-A----GA---------G---------AA-------------ATG-GC-CTT-TGAA-T---CCTGCCT-GTTCAC--A-------T--AGCT--TGGCGACGGT-TTT-CTGT-AAAA-CATG----AA-C-ACC---AAC--GGG-------TGCATCTG-CATA--CCG-G---A-ATGA--TCCGNANACT-GA-TG-CCA---CTTTT-C-TA-ATACTAGAA---GTTAG---GCTTCAT-A--T-CAGCA---TTCT--CCT-TC-----TC-TAT---ATCAA---GAACA-TCA-C-TG----AG---AA----C-GTTA--T-CG---G--TATT-T-A---------CAC-----TTTC-AC-TCTC-----ATCCCTA-A---ATTTT----G-A-T-TGC--------G-CGAGA-------AAAATG--C-----TCTCTCCATCAGAGG--A--ACT-C-ATGTTT-GTA--TTGA-TTC--AATGG----TGAAA----G-TG---A--A-TGAATA---TTTAA--TGA---TTTCAAG---TTTT--ATAGACC----------TTTA---GA--ACTTACCTG-A--AACTG---TCC-AATA--AGTA-A-AA-CA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-C--C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTGTTGG-GA-TAT-TTA---------A-A-ACA-G--CT-T----TA---C-C---TGGNA--------G--AGG--ACAC-TTATGAA--GACAA---------TGG---AT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--A-TTTTG-AC--TGGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTA---GG-ATA-G----AAGCCT-CAAA--CTG-T--A--C-A-T-T-C-T-----------G--TGA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCC-------TAC-G--GGC-CTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A-CAG-AA--TGT----A--CAG-T-TTTCGGCTTATATCCTTTACNTAAACACCATTGCATTG-AGGGTTGGGTA
Reference ( family-455 ) : NNGCTTAAAAC-ATAATTGT---T-ACGCAA--TCC----TTTGT-TA----TT-T-C-G----GTT-GTTA----------TAT-A-C-A-T-AAAA---T--CCAT---GTNAATA-TT----AA------AAACAAT---CCAATAAGTTACCT--GTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTAGAAA---T-G--TG-TCCATTA--T------TAAA--C-T-T----AT---T---GGAC-A----G--T-TATT-G---T-CAA------CTTA--TT------GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAACGGATAAAAAG-G-----CA-GA--AGAT-GCGTTT-------T----CACACAACAAGTTTAAGAGATTTTTAATCTTTATAATAAC-ACGAA--TTGTCTAC-AAGTAG--AACATCTGAGACCGC------ACCGAAAATC--TC-A----TTG--GTCGT---TAC----CAC--CAC-ATCACATTATGAAACTTCTCT----TCGATTCAGA----------AA-CG-CATCTC-----C-----ACATA--TG-CT-------C----AATTTTTTTTT--AT-GTT---------TTCCCTA---GCATC-TTCGGATT--CAC-ATTTCATTTTTTTC---ACTT---CCTT-G-AA-T-GATTTCACT-GAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATCTTGGGTTA---TTTTGC--ATGA-AGTTATG-AACGGACTGCTG-ATG----ATCTA-TGTCCAGTTTTTTTCAGTAATGAGTTGTT-CAT-CTA------CT-CCAGC-ATCG-TA-CAGTCTTG-TGGCTGCA-GTGG---CAC-GTA-A----GA---------G---------AA-------------ATG-GC-CTT-TGAA-T---CCTGCCT-GTTCAC--A-------T--AGCT--TGGCGACGGT-TTT-CTGT-AAAA-CATG----AA-C-ACC---AAC--GGG-------TGCATCTG-CATA--CCG-G---A-ATGA--TCCGNANACT-GA-TG-CCA---CTTTT-C-TA-ATACTAGAA---GTTAG---GCTTCAT-A--T-CAGCA---TTCT--CCT-TC-----TC-TAT---ATCAA---GAACA-TCA-C-TG----AG---AA----C-GTTA--T-CG---G--TATT-T-A---------CAC-----TTTC-AC-TCTC-----ATCCCTATA---ATTTT----G-A-T-TGC--------G-CGAGA-------AAAATG--C-----TCTCTCCATCAGAGG--A--ACT-C-ATGTTT-GTA--TTGA-TTC--AATGG----TGAAA----G-TG---A--A-TGAATA---TTTAA--TGA---TTTCAAG---TTTT--ATAGACC----------TTTA---GA--ACTTACCTG-A--AACTG---TCC-AATA--AGTA-A-AA-CA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-C--C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTGTTGG-GA-TAT-TTA---------A-A-ACA-G--CT-T----TA---C-C---TGGNA--------G--AGG--ACAC-TTATGAA--GACAA---------TGG---AT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--A-TTTTG-AC--TGGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTA---GG-ATA-G----AAGCCT-CAAA--CTG-T--A--C-A-T-T-C-T-----------G--TGA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCC-------TAC-G--GGC-CTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A-CAG-AA--TGT----A--CAG-T-TTTCGGCTTATATCCTTTACNTAAACACCATTGCATTG-AGGGTTGGGTA
gi|1 : TAAGACCATA--TGT---T-ACGCAACATCCAATCTTTGTATAAATTTT-T-C-GTGTAGTT-GTTAACTCTGTACCTAT-A-C-GCT-AAGACATT--CCATAATGTGAATA-TTTATAAATGAGGCAAAAAATTGCCCAATAA-TTACCTTTGTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTAAAAACAAT-G--TG-TCCATTG--CAGTTTCTACA--C-TAT----AT---TTGAGAACTA----G--T-TATTAG---TACAAAATGACTTTA--TTTATCTGAGACAAGTGCC--AGTGTTGTCAT-ATACAGATAAA--T-GTTTTTCA-TG--AGAT-GCGTTT-------TGTCACACACAACAAGTTTAAGAGATTTTTAATCTTTATAATAACTACGAAATTTGTCTAC-AAGTTATTAACATCAG-GACAGCCAAGCGACCGAAAATC--TC-A----TTG--GTCGT---TAC----CAC---AC-ATCACATTATGAAACTTCTACATAATCGATTCAGA----------AAATG-CATCTT-----CTCCATACATA--TAACT-------CTAAAAATTTTTTTTC--GTTGTT---------TTCCCTA---GCATC-TTTGGGTT--CAC-ATTTCATTTTTT-C---ACTT---CCTTTG-AA-TCGATTTCACT-GAT-TTTTCAC-AAGCTGGGCATCTTGGGTTA---TTTTGC--ATGA-AGTTATG-AACGGACTGCTGTATG----ATCTA--GTCCAG-TTTTTTCAGTAATGAGTTGTT-CAT-CTA------CT-CCAGC-ATCA-TA-CAGTCTTGTTGGC-ACA-GTGGATATAC-GTG-ATAGTGA---------G---------AA-------------ATG-GTACTT-TGTA-TTTCCCTGCCT-GTTCAC--A-------TTAGGCTTCTGGCGACGA--TTT-CTGT-AAAA-CATGTATAGA-C-ACC---AACT-GAGAGAGTTATGCATCTGCCATA--CCG-G---A-ATGA--TCCGTATACT-AA-TG-CTA---CTTTT-C-TA-ATACTAGAAAGTATTAGGTTGCTTCAT-ATCT-CAGCA---TTCT--CCT-TTATTAATCTTATTA-GTCAATGTGAACATTCA-C-TGTGCTAG---AAACTTC-AGTA--T-CGC--G--TATT-T-ATGCGTACAGCAC------TTC-AC-TCTC-----ATCCCTATATATATTCTCTCCG-A-TATGCTGGTAGATG-CAAAA-------AAATTGTCC-----TTTTTCCATCAGAGG--A--ACT-C-ATGTTT-GTATTTTGA-TTC--AATGGTTATTGAAAAGTTG-TGCGTACTA-TGACTA---TTTAAT-TGAT--TTTCAAG---TTTT--ATAGACC-----------TTA---GA--ACTTACCTGTA--AACTACTTTCCTAATA--AGTT-A-AA-CATACACACAAA------GAAGAG-----CGAGCTTCC--C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTGTTGG-GA-TATATTATAATGCCACA-A-ACA-G--CT-TATGATG---C-CTTGTGGCA--------G--AGGATACAC-TTATTGA--GACAA---------TGGCGCAT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--ATTTTTG-AC--TGGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATCG----CATAT-AT-TTAAATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTAG--GG-ATA-G----AAGCCT-CAAACCCTGCT--A--C-ATT-T-C-T-----------GTTTTA-G-AGAAAGTAAT---T------CTC----GTATTCAGGCC-------TACTGACGGC-CTCG-A-TCAGCTTCCCT--TTCT-CTTCCCTCTGA-CAGAAA--TGTTTTGACTCAG-TATGTCGGCT
gi|10 : aTATAAC-ATAATTAT---T-ATGCAA--TCC----TTTGT-TA----TT-T-TTG----GTTTGTTG-----------AT-A-G-A-T-AAAA---T--CCAT---TTAAATAATT----AA------AAACAAT---CCAATAAGTTACCT--GTA--CGCATGTCC--ACAAATTTAGAAA---T-AGTTGTTCCATTAGTT------TAAGATCGT-T----ATCTCT---GAGT-ACCACG--TCTATT-GTGCT-CAA------C-TAGTTT------AGACA-GTGCCTTAG-------GT-AAAGGTATATAAAGTA-----CA-GATTAGAT-GCATTTTAGGTTGT----CTC-CAACAGATT----ACATATTTAATC-TAATATTAGC-ATGAA--TTGTC-AA-AGGTAG--AACATCTTGAACCAC------ACTGAAAATCCGTCTA----TTGGAGTTGT---TACG---CAC--CAC-AT---ACT-TGAA------CT----TCAATTTTGA----------AA-gtgagtatccatggctacagtg
gi|10 : AATTTCTCT----T-GATTCAGA----------GG-CA-CAT-TCATAAACATA--ACATAACTG-CT-------T----AATTTTTTTTTCAAT-AT---------------CA---GCATC--------T--CA----------TTTTTC---ACTT---CCTT-G-AA-T-GATTTCACT-GAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATCTTGGGTTC---TTTTG-----------TATG-AACGGACTGCTG-AAG----ATCTA-TGTCCAGTTTTTTTCAGTAATGAGTTagacaattcgttatgtttatttgaatttctcttgattcagaggcacattcataaacataacataactgcttaatttttttttcaatatcagcatctcatttttcacttccttgaatgatttcactgattttcacaagctgggcatcttgggttcttttgtatgaacggactgctgaagatctatgtccagtttttttcagtaatgagtt
gi|11 : tataacataattattatgcaatcctttgttatttttggtttgttgatagataaaatccatttaaataattaaaaacaatccaataagttacctgtacgcatgtccacaaatttagaaatagttgttccattagtttaagatcgttatctctgagtaccacgtctattgtgctcaactagtttagacagtgccttaggtaaaggtatataaagtacagattagatgcattttaggttgtctccaacagattacatatttaatctaatattagcatgaattgtcaaaggtagaacatcttgaaccacactgaaaatccgtctattggagttgttacgcaccacatacttgaacttcaattttgaaaagacaattcgttatgtttatttg--A--CCT-GGG--CCTGTC-----CA-TT-TT-T--AGAACAAA---A-A------TGC---AAC---GTT-T-T--CA-------GTT---GC-ATA-T----TAACCT-AAAA--TTG-T--C--C-A-T-T-C-T-----------G--TGA-G-AGAAAGAACTAA-TATTAGCCTTACGGG------GTCC-------TAC-G--GGC-CTTG-A-TCGATT---CT--TTCT-CTC-------A-CAA-AA--TGA----A--TAG-T-TTT-------TATCCTGTACTTAAACA----TGCATT
gi|12 : ggtttaATTGTAAAT-GTGTAA--TCA----TTTAT-TA----TTCT-A-A----GCT-TTGA----------TAT-A-----T-AAAA---TAGTC-T---GCCTACA-TT----TA------AAAC-------------GTTACCT--GTA--GG--TATCC-AATACGTTGACAAT---TAA--TG-TCCATTA--T------------C-T-TTCAGAA---T---GGAC-A----GTAT-TATT-G---C-CAA------CATA--TTG-----GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAtaccaatgtcaataggtttcatattacatgtgtttgtaaatctctcaccaatactatttcttactttctttttaacatccaagttgt
gi|13 : ctatatttaaagTTTA-AA--TGGA--T--TTTA--TCT--ATCAACAAAC-----CA-AA-AA-T--AA--CAAA---GGATTGCATAAT---AATTATGTT-A-T--AAAA-----GTA---GG-ATA-G----AAGCCT-CAAA--CTA-T--A--C-A-T-T-C-T-----------G--TAA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCC-------TAC-G--GGC-TTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A-CAG-AA--TGT----A--CCG-T-TTTCGGCTTATATCCTTTACTGAAA-ATAAATGCATTA-AAGttattagatgtttacaggttgcctgaaaacaagagaaaaagatgatgcatttgtttaaacataaacaaattcaattctaaat
gi|14 : atta------GAT---AAT---GTTGT-T--GAT------GCA---TGTAT--T----AAGC-T-CAAA--CTG-C-----C-G-T-T-CCT-----------A--TGA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTT----A------GTCC-------TAT-G--GCA-ATTG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A-T-G-AA--TGG----A--C-G-T-TTGAGGCTTATATCTTTTttaccaagatgcgttgactgcgtgata
gi|15 : ttgcatgactatgaaCTG-A--AACTG---TCC-AATA--AGTT-A-AA-CA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-CG-C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTGTTGG-GT-TAT-TTA---------A-A-ACA-G--CT-T----TA---C-T---TGAAA--------G--AGG--ACAC-TTATGAA--GACAA---------TGG---AT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--A-TTTTA-AC--TAGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-C--AATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-TTGAA---------A---AG-ATA-A----AAatatataaaggttgtgattccaacgatgacattattcaatgatggaccaacagttttgtgtattgcacatgcattgtttgatctgaagagaa
gi|16 : at--T--T--A--TCT-GAT--TCCACC-----CC-AC-AT---------AAA---GAA------AAG---CAT---GTT-T-T--AA-------TTA---AG-AGA-A----AAGCCA-CAAA--CTA-T--C--A-A-C-T-C-T-----------G--TGA-A-AGAAAGAACTAA-----------------------------------------------A-A-TTAGTT---CT--TTTT-CTC-------A-CAG-AA--TGG----A--CAG-C-GTTTGGCCTTTCACTTTTACATA
gi|17 : acAATT---CT--TTCT-CTC-------A-CAG-AA--TGG----G--CAG-A-TTTCGGTCTTTCTCCTGTACATAacaaaa
gi|18 : catcactacatg--T--T--A--TAT-GAT--G-TATC------A-AT-AT-TTGAATACA----------------C---AAT---GCT-T-T--AACTCCATAGCA---AG-GTA-T----TAGCCT-GAAA--CTG-T--C--C-A-T-T-C-T-----------T--TGA-G-AGAAAGAACTAA-T------CTC----G------GCCTG------TA--G--GGC-Ccagctctatcgtatcaagccagctaaagtcaagtacatgtactttttccagtacaacaactctggagtttgaa
gi|19 : tttaattacatgtatttccACAAA---AGA------TGC---ACT---AGT-C-T--AA-------GTA---GG-ATA-T----AAGCAC-AAAA--CTA-TCTATCC-A-T-T-C-T-----------G--TGA-GGAAAAAGAATTAA-T------CAC----A------ACCT-------TAC-G--GAC-CTTG-A-TCAGTT---aa
gi|2 : aacgaaaacaacaTAAGACCATA--TGT---T-ACGCAACATCCAATCTTTGTATAAATTTT-T-C-GTGTAGTT-GTTAACTCTGTACCTAT-A-C-GCT-AAGACATT--CCATAATGTGAATA-TTTATAAATGAGGCAAAAAATTGCCCAATAA-TTACCTTTGTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTAAAAACAAT-G--TG-TCCATTG--CAGTTTCTACA--C-TAT----AT---TTGAGAACTA----G--T-TATTAG---TACAAAATGACTTTA--TTTATCTGAGACAAGTGCC--AGTGTTGTCAT-ATACAGATAAA--T-GTTTTTCA-TG--AGAT-GCGTTT-------TGTCACACACAACAAGTTTAAGAGATTTTTAATCTTTATAATAACTACGAAATTTGTCTAC-AAGTTATTAACATCAG-GACAGCCAAGCGACCGAAAATC--TC-A----TTG--GTCGT---TAC----CAC---AC-ATCACATTATGAAACTTCTACATAATCGATTCAGA----------AAATG-CATCTT-----CTCCATACATA--TAACT-------CTAAAAATTTTTTTTC--GTTGTT---------TTCCCTA---GCATC-TTTGGGTT--CAC-ATTTCATTTTTT-C---ACTT---CCTTTG-AA-TCGATTTCACT-GAT-TTTTCAC-AAGCTGGGCATCTTGGGTTA---TTTTGC--ATGA-AGTTATG-AACGGACTGCTGTATG----ATCTA--GTCCAG-TTTTTTCAGTAATGAGTTGTT-CAT-CTA------CT-CCAGC-ATCA-TA-CAGTCTTGTTGGC-ACA-GTGGATATAC-GTG-ATAGTGA---------G---------AA-------------ATG-GTACTT-TGTA-TTTCCCTGCCT-GTTCAC--A-------TTAGGCTTCTGGCGACGA--TTT-CTGT-AAAA-CATGTATAGA-C-ACC---AACT-GAGAGAGTTATGCATCTGCCATA--CCG-G---A-ATGA--TCCGTATACT-AA-TG-CTA---CTTTT-C-TA-ATACTAGAAAGTATTAGGTTGCTTCAT-ATCT-CAGCA---TTCT--CCT-TTATTAATCTTATTA-GTCAATGTGAACATTCA-C-TGTGCTAG---AAACTTC-AGTA--T-CGC--G--TATT-T-ATGCGTACAGCAC------TTC-AC-TCTC-----ATCCCTATATATATTCTCTCCG-A-TATGCTGGTAGATG-CAAAA-------AAATTGTCC-----TTTTTCCATCAGAGG--A--ACT-C-ATGTTT-GTATTTTGA-TTC--AATGGTTATTGAAAAGTTG-TGCGTACTA-TGACTA---TTTAAT-TGAT--TTTCAAG---TTTT--ATAGACC-----------TTA---GA--ACTTACCTGTA--AACTACTTTCCTAATA--AGTT-A-AA-CATACACACAAA------GAAGAG-----CGAGCTTCC--C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTGTTGG-GA-TATATTATAATGCCACA-A-ACA-G--CT-TATGATG---C-CTTGTGGCA--------G--AGGATACAC-TTATTGA--GACAA---------TGGCGCAT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--ATTTTTG-AC--TGGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATCG----CATAT-AT-TTAAATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTAG--GG-ATA-G----AAGCCT-CAAACCCTGCT--A--C-ATT-T-C-T-----------GTTTTA-G-AGAAAGTAAT---T------CTC----GTATTCAGGCC-------TACTGACGGC-CTCG-A-TCAGCTTCCCT--TTCT-CTTCCCTCTGA-CAGAAA--TGTTTTGACTCAG-TATGTCGGCT
gi|20 : aCTCAAAAC-ATTTTTGT---T-ACGTTA--TCT----TTTGT-TA----TT-T-TAG----GCT-TTTA----------TAT-A-G-A-CGAGAG---T--CCA----GCC-GTA-TT----TA------AAAT-------------GTTACCT--ATA--GG--TGTgtgagtatccatggctacagtg
gi|21 : tgtgaacatttaaatcccGT----A--CAG-T-TTGAGGCTTATATCCTTTACATA
gi|22 : ggcacttgcggccgtataagggaccgccatttttaaaagatcgtatccgacagatatttggcgaagaagcagA---GCATC-TTCTGATT--CAC-ATTTCATTTTT--C---ACGT---CCTT-G-AA-T-GTTTTCACT-GAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATCTTGnc
gi|23 : AAAAAGTTGCCT--GTA--GG--TGTCC-AATAAGTGGACAAT---T-AC-TG-TACATTA--T------T
gi|23 : tgtactt-TCCATTG--T------TATA--A-A-T----AA---T---GTAC-A----G--T-AATT-G---T-CCA------CTTA--TT------GGACA-tataacaatggagagt
gi|25 : tgtacttaaaaagttgcctgtaggTTAAAAC-ATAATTGT---T-ACGCAA--TCC----TTTAT-------TT-T-C-G----GTT-GTTA----------TAT-AGC-A-T-ATAA---T--CCgagt
gi|26 : gggca-A-T-T-C-T-----------G--T-A-G-AGAAAGAACCGA-T------ATC----G------GACTTGCAATGTAC-G--TGC-CTCG-A-CCAGTT---
gi|27 : -A-TCAGTT---CT--TTCT-CGC-------A-CAA-AA--TGG----A--CAGTT-TTTCGACTTTTA--CTTTACATAA
gi|28 : GTTTAAAAC-ATGATTGT---G-ACGTAA--ACC----TT--T-TG----TT-T-G-A----ATT-GTC-----------CAT-A-CTA-T-Aa
gi|29 : ------GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAACATATAAAAAG-A-----CA-GA--AGAT-GCGTTTG------T----CAAACg
gi|3 : TAAAAC-ATAATTGT---TGACGCAA--TCC----TTTGT-TAAT--TT-T-C-G----GTT-GTTA----------TAT-AGC-A-A-TAAA---T--CCAT---GTAAAT--TT----CA------AAACAAT---CCAATAAGTT-CCT--GTAAGCG--TGTCCCAATAAGTTTAGAAAA--T-G--TG-TCCATTA--T------TAA---C-T-T----AT---T---GGAC-A----G--T-TATT-G---C---A------CTTA--TT------G-ACA--TGTC--AG-------GTTAAACG-ATAAAAAG-G-----CAAGA--AGATTGCGTTG-------T----CAC-CAA-AAGT-----AAATTTT-AATCCTAATAACAAC-GCA-----TGTCCACCAAGTA----AC-TCTGAGACCAC------ACCGAAAATC------------GACGTCGTACCCAC----CCC--CACCATCACATTATGAAACTTCTCT----T-GATTCAGA----------A--C--CATCTC-----C-----ACAT---TG-CTTAAAATGC----GATTTTTTTTT--AT-GTT---------TTCC-TA---GCATCCTTTGGACTTCCACCATCTTTCCTTTTTC---ACCTATCCCTT-GCAACT-GATCTACCTCGATCTTT-CCCTCAGCTGGG--TCTTG--CTACATTTCTGCTCGCGAGAGTTATGGAACGGACTGCTG-ATGGAGAATCTAATCTCCAGTTTTTTTCAGTAATGAGTTGTTTCATGCTA------CTTCCAGCCATCG-TA-CAGTTTTG-TGGCTACAAGTGG---CACCGCT-T----GA---------G---------AA-------------ATG-TC-CTT-TGAAAT---CCCGCCT-GTTCACGAA-------T--AGCT--TGGTGACGGGGTTT-CTGT-AAAAACATG----AA-C-ACC---AACTCGGG-------TG-ATCTG-CATA--CCG-A---ATATG---TCCGAAGAAAAGA-TG-TCA---CTTTT---TA-A-ACT-GAA---GTTAGC--GCTTCAT-A--T-CAG-A---TTCT--CCT-TC-----TC-TAT---ATCAA---GA-CA-TCA-CATG----AG---AA----CTGTTA--T-CG---G--TATT-T-A---------CAC-----TTTC-AC-TCTCT----ATTCCT---------------------TGC--------G-TGAGA-------CAAATG--C-----TCTCTCCATCAGAGG--ATCACT-CCATGTTG-GTA--T-GA-TTC--AATGG----TGAAA----G-TG---A--A----ATA---TTTAA---GA---TTTCAAAGT-TTTT--ATAGACC----------TT-A---GA--A-TTACTAA-A--AACTG---TCC-A-TA--AGTA-A-AAACA-------AAA------GA--A------C-AGCTT-C--CCAAA-GAC--GG-TTTGGTT--AT-GTTGG-GAGTAT-TTA---------AGA-ACA-G--CT-T----T----C-C---TGGCA--------AGCAGG--ACCT-TTATGAA--GACAA---------TGG---AT-TAATCA-G-GAA--AC-T-AA--AA-TC--T-TTTTG-ACC-TGGAGGTGAT--A--GTT--AT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATACAA-----GA------GAT---AAT---GTT-T-TA-AA-------GTA---GG-ATA-G----AAG-CT-CAAA--CTG-T--A--C-A-T-T-C-TG----------G--TAA-GAAGAAAGAACTGA-T-------TC----G------G-CC-------TAC-G--GGC-CTCG-ACTCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A-C-G-AA--TGT----A--CAG-T-TTTCGGCTTATATCCT
gi|30 : c--GGC-CTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTT-------A-CAG-AA--AGG----A--CAG-
gi|4 : GCTTAAAAC-ATAATTGT---T-ACGCAA--TCC----TTTGT-TA----TT-T-C-G----GTT-GTTA----------TAT-G-C-A-T-AAAA---T--CCAT---GTAAAT--TT----AA------AAACAAT---CCAATAAGTTACCT--GTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTAGAAA---T-G--TG-TCCATTA--T------TAAA--C-T-T----AT---T---GGAC-A----G--T-TATT-G---T-CAA------CTTA--TT------GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAACGAATAAAAAG-G-----CA-GA--AGAT-GCGTTT-------T----CACACAA-AAG--TAAA----TTTTAATC--TA-AATAAC-ACGAA---TGTC-AC-AAGTAG--AACATCTGAGACCAC------ACCGAAA-----TC-A----TTG--GTCGT---TAC----CAC--CAC-ATCACATTATG-AACTTCTCT----TTGATTCAGA----------AA----CATCTC-----C-----ACAT---TG-CT-------C----AATTTTTTTTT--AT-GTT---------TTCCTTA---GCATC-TTTGGATT--CAC---TTCATTTTTTTC---ACTT---CCTT-G-AA-T-GATTTCACT-GAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATCTT-GGTTA----TTTGC--ATGA-AGTTATG-AACGGACTGCTG-ATG----ATCTA-TGTCCAG-TTTTTTCAGTAATGAGTTGTT-CAT-CTA------C--CCAGC-ATCA-TA-CAGTCTTG-TGGCTACA-GTGG---CAC-GT--A----GA---------G---------AT-------------ATG-GT-CTT-TGAA-T---CCTGCCT-GTTCAC--A-------T--AGCT--TGGCGACGAT-TTT-CTGT-AAAA-CATG----AA-C-ACC---AAC--GGG-------TGCATCTG-CATA--CC--G---A-AT-A--TCCGAAAA---GA-TG-TCA---CTTT----TA-A-ACT-GAA---GTTAG---GCTTCAT-A--T-CAGCA---TTCT--CCT-TT-----TC-TAT---ATCAA---GAACA-TCA-C-TG----AG---AA----C-GTTA--T-CG---G--TATT-T-A---------CAC-----TTTC-AC-TCTC-----ATCCCTA-A---ATTTT----G-A-T-TGT--------G-TGAGG-------AAAATG--C-----TCTCTCCATCAGAGG--A--ACT-C-ATGTTT-GTA---TGA-TTC--AATGG----TGAAA----G-TG---A--A-TGACTA---TTTAA--TGA---TTTCAAG----TTT--ATAGACC----------TTTA---GA--ACTTACCTG-A--AACTG---TCC-AATA--AGTA-A-AA-CA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-C--C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTG-TGG-GA-TAT-TTA---------A-A-ACA-G--CT-T----TA---C-C---TGGCA--------G--AGG--ACAC-TGATGAA--GACAA---------TGG---AT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--A-TTTTG-ACT-TGGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTA---GG--TA-G----AAGCCT-CAAA--CTG-T--A--C-A-T-T-C-T-----------G--TAA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCC-------TAC-G--GGC-CTCG-A-TCAGTTG--CT--TTCT--TC-------A-CA--AA--TGT----A--CAG-T-TGTCGGCTTATATCCTTTACTTAAACACCATTGCATTGCAGGGTTGGGTA
gi|5 : taCTTC-T-A--A-CA--A---TTAT--CTTGTC-----TC-AATGTAATCA----GAACA-TCA-C-TG----AGT--AA----CGGTTA--T-CGTCAGTTTATT-T-A---------CACACTTTTTTC-TCATCTCGTGCAATCACCATA---ATTTT----ACATT-TGC--------G-TGAGACGGTTACAAACTG--CTACCATCTCTCAAGCAGA-G--A--ACTAC-ATGTTTGGTA--TTGAGTTCAGAAT-G----TGAAA----GATGA--A--A-TGAATA---TCTAAATTGA---TTTCAGATGTTTTT--ATAGGACAACGTCTTGATTTATGGGAATATTTACCTG-ATTAACTGGATTCC-GATAGGAGTATA-AC-CA-------AAACATAATGA--AATCAATC-AGCTC-A--C--AAGGACT-GG-ATT--TTCAATTGTAGGTGA-TAT-TTA---------A-AGACATG--TTCT----TACATC-C---TGGAGATCTTTGTG--AGA--CCACTTTAGGAA--GACAAATGCGTTTTTGT---AC-TA--TG-GAAAA--ACAG-AATTAA-TCATA-TTCTA-ACATTGGGACT--T--AGGCCTCGCA--ATTATCATATGCA-ATCAT-G--AATATACATATGTA------TGTATAAAT---GTTGTAT--AA-------GTATAGAG-ATA-AGTATAGGCCTCCAAA--CTG-------C-A-T-TGC-TTACTAGCTCAAG--TAAGG-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------G-CC-------TAC-G--GGCTCTCG-ATTCAGTT---CTTCTTCTGCTC-------ACCAG-AAATTGT----A--CAG-T-TT---GC-TACGTCCTTTACTCA
gi|5 : ctatgatgtaaaaggga-CTGG-AAGA-AAAG----GA-C-ACC---AAC---GG-------T-CATC-G-CATA--CCA-G---A---------TAGACATT-GA-TGACCAATGCTTGTACGTATATATTTGAA---GTT------CTTC------T-CAGtgctggataatggaagtcctttaactaggcaagtataatttaagagtttttacatggcatttgacaacttaaaagcatatgctaggcttatttattctggcataaaatctatgtttgcgctgttttccaaacttttatgctatatttttcaggctcagaacatggcaatgatgaacgcaactatcacctgagaagaacttcaaatatatacgtacaagcattggtcatcaatgtctatctggtatgcgatgaccgttggtgtccttttcttccag
gi|6 : ctatgatgtaaaagggatgagtaaaggacgtagcaaactgtacaatttctggtgagcagaagaagaactgaatcgagagcccgtaggccgagatcagttctttctccttacttgagctagtaagcaatgcagtttggaggcctatacttatctctatacttatacaacatttatacatacatatgtatattcatgattgcatatgataattgcgaggcctaagtcccaatgttagaatatgattaattctgtttttccatagtacaaaaacgcatttgtcttcctaaagtggtctcacaaagatctccaggatgtaagaacatgtctttaaatatcacctacaattgaaaatccagtccttgtgagctgattgatttcattatgttttggttatactcctatcggaatccagttaatcaggtaaatattcccataaatcaagacgttgtcctataaaaacatctgaaatcaatttagatattcatttcatctttcacattctgaactcaataccaaacatgtagttctctgcttgagagatggtagcagtttgtaaccgtctcacgcaaatgtaaaattatggtgattgcacgagatgagaaaaaagtgtgtaaataaactgacgataaccgttactcagtgatgttctgattacattgagacaagataattgttagaagtgctggataatggaagtcctttaactaggcaagtataatttaagagtttttacatggcatttgacaacttaaaagcatatgctaggcttatttattctggcataaaatctatgtttgcgctgttttccaaacttttatgctatatttttcaggctcagaacatggcaatgatgaacgcaactatcacA---GTTAG---GCCTCATTA--TGCAGCAA--TTCT--CCT-GC-----TT-TGTG--ACCAA---GAACA-TCAGC-TG----AGGAGAA----C-GTTA--TCCG---G--TATTGT-A---------CAC-----TTTCGAC-TCTC-----ATCTC---A---AATTT----G-A-T-TGC--------G-TGAG--------GAAATG--CG----TCTCTCCATCAGCGGACA--ACT-C-ATGTT---TA--TGGA-TTC--AATGG----TGAAA----G-TG---A--A-TGAATACAGTTAAA--TGAGC-TTTC-AG---TTTTTAATAGACC----------CTTA---GA--AATTACCTG-A--AACTG---TCC-AATT--AATA-AGAA-CA-------AAA------AG--AA-----C-AGCTT-TCAC--AA-GACTGGG-TTT--TT--ATTATTGA-GG-TAT-TTAT--------A-A-ACA-GTTTT-T----TA---CTT---TGGGA--------G--TGG--ACACTTTAGGAAACGACAA---------TGG---ATGTA--TA-G-GAATCACATAAA--AA-TC--A-TTTTGAAC--TGGA--T--T--A---CT-GAA--ACTATC-----CA-AT-CTAT--AATATAAA----GA------GAT---AGT----TT-T-T--AA-------GTA---GG-ATAGG----AAGCCT-CAAAG-CTG-T--A--CGA-T-T-C-T-----------G--TAA-G-A-AAAGAACTGACT------CTC----G------CCCT-------TAC----GGC-CTCGAA-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------ACCAGCAA--T-T----A--CAG-T-TTTCGGCTTATATCCTT
gi|6 : TAAGGAGAGGTT-CAT-TGAACATGGCT-CCAGCTATCGGTA-CAGTCTTG-GGGCGGCA-CGGG---CAC-GTA-GAT--GA---------ATGGTTTGT-AA-------------ATG-GC-CTTGTGAA-T---CCTGCCTCGTTCAC--A-------TG-AGCT--TGGCG-CGGTGTTC-CTGT-AAAA-CATG----AACC-ACC---AAC--GGG-------T-CATCT--CATACGCCGAG---AGATGA--Tagggcaagtataattcagagttttacgcatgactttgcatttaatgcaggctccgtatatttttcgccaaataactatttctcgttgcacttttgctatatttcaggggccagaaaatgggatgtgcacgctctatacctaccaccgacagagacactcaaatactaagcaacatcatctctcggcgtatgagatgacccgttggtggttcatgttttacaggaacaccgcgccaagctcatgtgaacgaggcaggattcacaaggccatttacaaaccattcatctacgtgcccgtgccgccccaagactgtaccgatagctggagccatgttcaatgaacctctcctta
gi|7 : aaggatataagccgaaaactgtaattgctggtgagagaaagaactgattcgaggccgtaagggcgagagtcagttcttttcttacagaatcgtacagctttgaggcttcctatcctacttaaaaactatctctttatattatagattggatagtttcagtaatccagttcaaaatgatttttatgtgattcctatacatccattgtcgtttcctaaagtgtccactcccaaagtaaaaaactgtttataaatacctcaataataaaaacccagtcttgtgaaagctgttctttttgttcttattaattggacagtttcaggtaatttctaagggtctattaaaaactgaaagctcatttaactgtattcattcactttcaccattgaatccataaacatgagttgtccgctgatggagagacgcatttcctcacgcaatcaaatttgagatgagagtcgaaagtgtacaataccggataacgttctcctcagctgatgttcttggtcacaaagcaggagaattgctgcataatgaggcctaactagggcaagtataattcagagttttacgcatgactttgcatttaatgcaggctccgtatatttttcgccaaataactatttctcgttgcacttttgctatatttcaggggccagaaaatgggatgtgcacgctctatacctaccaccgacagagacactcaaatactaagcaacA---GTTAG---GCTTCAT-A--T-CAGCA---TACA--CCT-TC-----TC-TA----ATCAA---GAACA-TCA-C-TG----AG---AA----C-GTTA--T-CG---G--TATT-T-A---------CAC-----TTTC-AC-TCTC-----GTCCCTAAA---ATTTT----G-A-T-TGC--------G-TTAGA-------AAAATG--C-----TCTCTCCATCAGAGG--A--ACT-C-ATGTTT-GTA---TGA-TTC--AATGA----TGAAA----G-TG---A--A-TGAATA---TTAAA--TGA---TTTCAAT---GTTT--ATAGACC-----------TTA---GA--ACTTACCTG-A--AACTG---TCC-AATA--AGT--A-AA-CA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-CA-C--AA-GAAT-GG-TTT--TT--ATTGTTGA-AG-TAT-TCA---------A-A-ACA-G--CT-T----TA---C-C---TGGGA--------G--AGG--ACAC-TTATGAA--GACAA---------TGG---AT---------------------A--AA-TC--A-TTTTA-AC--TGGC--T--T--A--CCT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTA---GG-ATA-G----AAGCTT-CAAA--CTG-T--A--C-A-T-T-C-T-----------G--TAA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCC-------TAC-G--GGC-CTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A-CAG-AA--TGT----A--CAG-T-TTTCGGCTTATATCCTTTACATA-----CATTG-ATTG-
gi|7 : ggcactttggaggccttagtgatcgttttggtaaagatagtgacaagatggcagaatgtgaagagacaaAATGAGTTGTT-CAT-CTA------CT-CCAGC-ATCG-TA-CAGTCTTG-TGGCTGCA-GTGG---CAC-GTAGA----GA---------ATGGTTTGTAAA-------------ATG-GC-ATT-TGAA-T---CCTGCCT-GTTCAC--A-------T--AGCT--CGGCGACGGT-TTT-CTGT-AAAA-CATG----AA-C-A-C---AAC--GGG-------TGCATCTG-CATA--CCA-G---G-ATGA--Taaggcaagtataatcatgagttttacatgcatttgacatttaatgcaggcttatatttttgcaaacactaattctgttcactttttttatatttcaggccagaaaatggcaattgtgacgcactatactgagacaactcaaatatagtacatcatcatcctggtatgcagatgcacccgttgtgttcatgttttacagaaaaccgtcgccgagctatgtgaacaggcaggattcaaatgccattttacaaaccattctctacgtgccactgcagccacaagactgtacgatgctggagtagatgaacaactcatt
gi|8 : ggcactttggaggccttagtgatcgttttggtaaagatagtgacaagatggcagaatgtgaagagacaacaatcaatgtatgtaaaggatataagccgaaaactgtacattctgtgagagaaagaactgatcgaggcccgtagggccgagatcagttctttctcttacagaatgtacagtttgaagcttctatcctacttaaaacattatctcctttgtattaatattggatagtatcaggtaagccagttaaaatgatttatccattgtcttcataagtgtcctctcccaggtaaagctgttttgaatacttcaacaataaaaaccattcttgtgaagctgtttcttttgtttacttattggacagtttcaggtaagttctaaggtctataaacattgaaatcatttaatattcattcactttcatcattgaatcatacaaacatgagttcctctgatggagagagcatttttctaacgcaatcaaaattttagggacgagagtgaaagtgtaaataccgataacgttctcagtgatgttcttgattagagaaggtgtatgctgatatgaagcctaactaaggcaagtataatcatgagttttacatgcatttgacatttaatgcaggcttatatttttgcaaacactaattctgttcactttttttatatttcaggccagaaaatggcaattgtgacgcactatactgagacaactcaaatatagtacatcA---GTTAG---GCTTCAT-A--T-CAGCA---TCC----CT-GC-----TT-TGT---ATCAAA--GAACA-TCA-C-TG----GA---GA----C-GTTAAAT-CG---G--TATT-TTA---------CAA-----TTTC-AC-TCTC-----ATCCCTA-----ATTTT----G-A-T-TGC--------GGTGAGG-------AAAATG--C-----TTCATCCATCAGCGG--A--ACT-C-ATGTT--GTA--T-GA-TTC--AATGG----T-AAA----G-TG---A--AATGAATA---TTAAAA-TGAATTTTTCAAG---TTTT--ATAGACC----------TT-A---GA--AATTAC-TG-A--AACTG---TCCCAATA--A-TA-A-A--CA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-C--C--A--GACT-GGGTTT--TT--ATTATTGA-GG-TAT-TTA---------A-A--CA-G--TT-T----TAA--C-T---TGGGA--------G--TGG--ACAC-TTAGGAAA-GACAA---------TGG---ATATA--TAAG-GAA--ACAT-AA--AAATC--A-TTTTA-AC--TGGAA-T--T--A--ACT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATATAAT---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTA---GG-ATA-G----AAGCCT-CAAA--CTG-T--A--C-A-TAT-CTT-----------G--TAA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCCT------TAC-G--GG--CTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A--AG-AA--TGT----A--CAG-T-TTTCGGCTTATATCCTT
gi|8 : -ATCG-TAACAGTCT-G-TGGCTGCA-GTGG---CAC-GTA-A----GA---------G---------AATGGTTTGTAGTAAATGTGC-CTT-TGAA-T---CCTGC-T-GTTCAC--ACTCATTAT--AGCT--TGGCGACGGT-TTTCCTGTAAAAA-CATGAC--AA-CAACCAAAAAC---GG-------TGCATCTG-CATA--CCA-GGCAG-ATGATGTTCTGATATT-GAGTG--------TTCT-CGTAGGTAATAG--------AG---GCGTCAC-A--T-TTGCAATTTTCTGGCCT-Taagccaagatataatatgtagtttacatggcatttgacattttaatgcaggcttttatatattttttcgcaaaaactatttctgttcacctttttctatatttcaaggccagaaaattgcaaatgtgacgcctctattacctacgagaacactcaatatcagaacatcatctgcctggtatgcagatgcaccgtttttggttgttgtcatgtttttacaggaaaaccgtcgccaagctataatgagtgtgaacagcaggattcaaaggcacatttactacaaaccattctcttacgtgccactgcagccacagactgttacgat
gi|9 : aaggatataagccgaaaactgtacattcttgagagaaagaactgatcgagcccgtaagggccgagatcagttctttctcttacaagatatgtacagtttgaggcttctatcctacttaaaacattatctccattatattaatattggatagtatcagttaattccagttaaaatgatttttatgtttccttatatatccattgtctttcctaagtgtccactcccaagttaaaactgtttaaatacctcaataataaaaacccagtctggaagctgtttcttttgtttattattgggacagtttcagtaatttctaaggtctataaaacttgaaaaattcattttaatattcatttcactttaccattgaatcatacaacatgagttccgctgatggatgaagcattttcctcaccgcaatcaaaattagggatgagagtgaaattgtaaaataccgatttaacgtctccagtgatgttctttgatacaaagcagggatgctgatatgaagcctaactaagccaagatataatatgtagtttacatggcatttgacattttaatgcaggcttttatatattttttcgcaaaaactatttctgttcacctttttctatatttcCTTAAAAC-ATAATTGT---T-ACGCAA--TCC----TTTGT-TA----TT-TTC-G----GTT-GTTA----------TATGG-C-A-T-AAAA---T--CCAT---GTCAAT--TT----AA------AAACAAT---CCAATAAGCTACCT--GTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTAGAAA---T-G--TG-TCCATTA--T------TAAA--C-T-T----AT---T---GGAC-A----G--T-TATT-G---T-CAA------CTTA--TT------GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAACGGATAAAAAG-A-----CA-GA--AGAT-GCGTTTG------T----CAAACAG-AAG--TAAA----TTGTAA--TTTA-AATAAC-ATGAA---TGTC-AC-AGGTAG--AACATCTGAGACCAC------ACTGAAAATCATTC-ATTATTTG--GTCGT---TACTCGTTACCACAC-ATCACATT-TAGAACTTCAAT----TTGAAAGACA----------AATTGTTATGTT-----C------TATA--TG---------------AATTTCTCTTT--AT--TCAGAGGCACATTCAAAA---ACATC-TCCAAATT------GCTTAATTTTTTTTATGATTT---CCTT-
gi|9 : TATGAA-TTTCTCT----TT-ATTCAGAGGCACATTCAAA-AA-CATCTC-----C-----AAAT---TG-CT-------T----AATTTTTTTT---AT-GAT---------TTCCTTATCAGCATC-TTCTGATT--CAC-ATTTCATTTTTT-C---ACTT---CCTG-G-AA-T-GATTTCACT-AAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATTTTGGGTTC---TTTTG-----------TATG-AATGGACTGCCG-ATG----ATCTA-TGTCCAGTTTT--TCAGTAATGAGTTGTT-CAT-CTA------CT-CCAGC-ATCG-TA-CAGTCTTG-TGGCTGCA-GTGG---CAC-GTAGA----GAATGGTTTGTA---------AA-------------ATG-GC-ATT-TGAA-T---CCTGCCT-GTTCAC--A-------T--AGCT--CGGCGACGGT-TTT-CTGT-AAAA-CATG----AA-C-A-C---AAC--GGG-------TGCATCTG-CATA--CCA-G---G-ATGA--Tatcagcatcttctgattcacatttcattttttcacttcctggaatgatttcactaattttcacaagctgggcattttgggttcttttgtatgaatggactgccgatgatctatgtccagtttttcagtaatgagttgttcatctactccagcatcgtacagtcttgtggctgcagtggcacgtagagaatggtttgtaaaatggcatttgaatcctgcctgttcacatagctcggcgacggttttctgtaaaacatgaacacaacgggtgcatctgcataccaggatgatgatgtacta
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): GATGACATTAGTGATGAAACAGCAGTTTTGTGTATTCATAATATGCATTATTTGATGTGAAGGGA
Alignments
lowQualScore : 11 1111 2222 22222222 3333333333 11111 222 111 11 444444444444 111 11 22222222 333333333333333333333333333333333 111111 1 11111 222222 333333 3333333 3333333 444444444444 1 33333333 1 222 1 222 333333 2222222222 11 111 2222 111 2222 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111 2222222222222 11111 1 1 1 111 22222222 1 1111 11 1 111111 1 1 111 8888888888888888888888888888888888888888888 1 111 2222222222 11 11 2222 111 2222222 11111 111 1111111 222 111 1 111 222 11 111 33333333333333 222 1 222222222222222 111 444444444 111111 11111 55555555555555555555555555555555 1111111 11 11111 11 2222 2222 2222 222222 22 222 1111 2222222222222 222 1 2222222 111111 111111111 1111 444444444 222222222222222 11111111 11 11 111111111 111 11 11 11111 1111 1111111 111 11 1111111 11111111111111 11111111111111111 111 1111111 11111 222222 1
lowQualScore : 8 3 777 4 11 7777 8 2222 4 00000000 4 5555555555 4 66666 000 66 777 1 44 111111111111 3 777 1 22 66 66 5 0 66666666 4 888888888888888888888888888888888 111111 66 5 0 33333 888888 0 66 000000 8 66 2222222 5 6 5 1111111 5 77 5 555555555555 5 5 11111111 9 7 3 999 8 6 222 9 0 888888 7777777777 88 111 0000 555 6 5 0 3 1111 8 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 000 8888888888888 8 888 5 22 66 77 33333 888 0 5 5 1 5 5 1 5 111 22222222 6 3 4444 44 5 5 5 666666 5 0 5 5 0 6 5 777 5 6666666666666666666666666666666666666666666 5 0 5 5 777 5 66 6666666666 33 66 4 4 4 5555 4 4 1 777 666 8888888 1 8 66 77 22222 66 1 1 333 6 6666666 222 444 1 555 000 0 4 11 4 222 66 4 33333333333333 222 0 5 5 555555555555555 5 5 66 5 888 66 5 5 000000000 555555 5 5 77777 11111111111111111111111111111111 77 6666666 6 33 5 22222 33 5 5 55 3333 5 66 1111 1111 5 777777 5 888 0 11 555 5555 66 7777777777777 888 66 4 8 66 333 3 66 99 4 4 8888888 222222 444444444 8 8888 66 4 4 4 66 66 4 4 8 000000000 4 4 4 66 4 777777777777777 1 66666666 66 22 8 00 777777777 555 8 66 4 4 66 4 66 4 66 8 4 33 22 44 44 555 3 44 33333 6 3 3333 555 777777 444 444 5 2 66 5555555 000 2 888888 2 00 0000000 2 5 2 2 5 55555555555555 4 2 5 0 2 777777 5555 66666666666666666 7777 2 2 5 000 33 2 7777777 5 8 33 00000 66 2 5 1 0 111111 2 3
lowQualScore : . . ... . .. .... . .... . ........ . .......... . ..... ... .. ... . .. ............ . ... . .. .. .. . . ........ . ................................. ...... .. . . ..... ...... . .. ...... . .. ....... . . . ....... . .. . ............ . . ........ . . . ... . . ... . . ...... .......... .. ... .... ... . . . . .... . ......................................................... ... ............. . ... . .. .. .. ..... ... . . . . . . . . ... ........ . . .... .. . . . ...... . . . . . . . ... . ........................................... . . . . ... . .. .......... .. .. . . . .... . . . ... ... ....... . . .. .. ..... .. . . ... . ....... ... ... . ... ... . . .. . ... .. . .............. ... . . . ............... . . .. . ... .. . . ......... ...... . . ..... ................................ .. ....... . .. . ..... .. . . .. .... . .. .... .... . ...... . ... . .. ... .... .. ............. ... .. . . .. ... . .. .. . . ....... ...... ......... . .... .. . . . .. .. . . . ......... . . . .. . ............... . ........ .. .. . .. ......... ... . .. . . .. . .. . .. . . .. .. .. .. ... . .. ..... . . .... ... ...... ... ... . . .. ....... ... . ...... . .. ....... . . . . . .............. . . . . . ...... .... ................. .... . . . ... .. . ....... . . .. ..... .. . . . . ...... . .
lowQualScore : 9 4 000 0 00 0000 0 5555 0 44444444 0 0000000000 0 44444 000 11 555 0 44 555555555555 2 555 1 22 11 11 0 2 44444444 4 333333333333333333333333333333333 666666 99 0 0 55555 888888 4 99 000000 9 99 5555555 0 6 0 1111111 7 99 7 333333333333 0 0 88888888 8 3 3 777 0 7 000 8 7 333333 5555555555 33 777 8888 888 7 0 1 2 2222 5 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 111 6666666666666 9 888 0 55 99 00 11111 888 0 7 7 4 7 7 4 7 777 88888888 7 3 2222 00 5 7 7 444444 7 0 0 0 0 2 0 555 0 2222222222222222222222222222222222222222222 0 0 0 0 555 0 99 0000000000 88 22 4 4 4 0000 4 4 1 888 111 9999999 1 9 11 11 77777 11 0 0 888 7 5555555 555 222 7 666 000 8 0 00 0 222 11 4 66666666666666 555 0 0 0 000000000000000 0 0 99 0 888 99 0 0 000000000 888888 0 0 55555 11111111111111111111111111111111 00 2222222 6 88 0 55555 88 0 0 11 2222 0 99 2222 2222 0 222222 0 888 8 99 666 8888 99 4444444444444 888 99 5 9 11 333 3 11 66 4 4 9999999 888888 111111111 9 4444 11 4 4 4 11 11 4 4 9 000000000 4 4 4 11 4 222222222222222 0 11111111 11 22 9 66 888888888 666 9 11 4 4 11 4 11 4 11 9 0 55 55 66 22 666 1 22 88888 2 1 5555 000 777777 777 777 3 7 33 0000000 000 7 222222 9 77 5555555 7 3 7 7 3 44444444444444 1 7 3 9 7 777777 7777 88888888888888888 2222 5 5 0 666 77 7 3333333 3 0 77 88888 99 5 3 0 8 555555 5 3
consensus : NNGCTTAAAAC-ATAATTGT---T-ACGCAA--TCC----TTTGT-TA----TT-T-C-G----GTT-GTTA----------TAT-A-C-A-TAAAA---T--CCAT---GTNAATA-TT----AA------AAACAAT---CCAATAAGTTACCT--GTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTAGAAA---T-G--TG-TCCATTA--T------TAAA--C-T-T----AT---T---GGAC-A----G--T-TATT-G---T-CAA------CTTA--TT------GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAACGGATAAAAAG-G-----CA-GA--AGAT-GCGTTT-------T----CACACAACAAGTTTAAGAGATTTTTAATCTTTATAATAAC-ACGAA--TTGTCTAC-AAGTAG--AACATCTGAGACCGC------ACCGAAAATC--TC-A----TTG--GTCGT---TAC----CAC--CAC-ATCACATTATGAAACTTCTCT----TCGATTCAGA----------AA-CG-CATCTC-----C-----ACATA--TG-CT-------C----AATTTTTTTTT--AT-GTT---------TTCCCTA---GCATC-TTCGGATT--CAC-ATTTCATTTTTTTC---ACTT---CCTT-G-AA-T-GATTTCACT-GAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATCTTGGGTTA---TTTTGC--ATGA-AGTTATG-AACGGACTGCTG-ATG----ATCTA-TGTCCAGTTTTTTTCAGTAATGAGTTGTT-CAT-CTA------CT-CCAGC-ATCG-TA-CAGTCTTG-TGGCTGCA-GTGG---CAC-GTA-A----GA---------G---------AA-------------ATG-GC-CTT-TGAA-T---CCTGCCT-GTTCAC--A-------T--AGCT--TGGCGACGGT-TTT-CTGT-AAAA-CATG----AA-C-ACC---AAC--GGG-------TGCATCTG-CATA--CCG-G---A-ATGA--TCCGNANACT-GA-TG-CCA---CTTTT-C-TA-ATACTAGAA---GTTAG---GCTTCAT-A--T-CAGCA---TTCT--CCT-TC-----TC-TAT---ATCAA---GAACA-TCA-C-TG----AG---AA----C-G-TTA--TC-G---GT--ATT-T-A---------CAC-----TTTC-AC-TCTC-----ATCCCTATA---A-TTTT----G-AT-T-GC--------G-CGAGA-------AAAATG--C-T-----CTCTCCATCAGAGGA--ACT-C-ATGTTT-GTA--TTGA-TTC--AATGG----TGAAA----G-TG---A--A-TGAATA---TTTAA--TGA---TTTCAAG---TTTT--ATAGACC----------TTTA---GA--ACTTACCTG-A--AACTG---TCC-AATA--AGTA-A-AA-CA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-C--C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTGTTGG-GA-TAT-TTA---------A-A-ACA-G--CT-T----TA---C-C---TGGNA--------G--AGG--ACAC-TTATGAA--GACAA---------TGG---AT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--A-TTTTG-AC--TGGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTA---GG-ATA-G----AAGCCT-CAAA--CTG-T--A--C-A-T-T-C-T-----------G--TGA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCC-------TAC-G--GGC-CTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A-CAG-AA--TGT----A--CAG-T-TTTCGGCTTATATCCTTTACNTAAACACCATTGCATTG-AGGGTTGGGTA
Reference ( family-455 ) : NNGCTTAAAAC-ATAATTGT---T-ACGCAA--TCC----TTTGT-TA----TT-T-C-G----GTT-GTTA----------TAT-A-C-A-TAAAA---T--CCAT---GTNAATA-TT----AA------AAACAAT---CCAATAAGTTACCT--GTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTAGAAA---T-G--TG-TCCATTA--T------TAAA--C-T-T----AT---T---GGAC-A----G--T-TATT-G---T-CAA------CTTA--TT------GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAACGGATAAAAAG-G-----CA-GA--AGAT-GCGTTT-------T----CACACAACAAGTTTAAGAGATTTTTAATCTTTATAATAAC-ACGAA--TTGTCTAC-AAGTAG--AACATCTGAGACCGC------ACCGAAAATC--TC-A----TTG--GTCGT---TAC----CAC--CAC-ATCACATTATGAAACTTCTCT----TCGATTCAGA----------AA-CG-CATCTC-----C-----ACATA--TG-CT-------C----AATTTTTTTTT--AT-GTT---------TTCCCTA---GCATC-TTCGGATT--CAC-ATTTCATTTTTTTC---ACTT---CCTT-G-AA-T-GATTTCACT-GAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATCTTGGGTTA---TTTTGC--ATGA-AGTTATG-AACGGACTGCTG-ATG----ATCTA-TGTCCAGTTTTTTTCAGTAATGAGTTGTT-CAT-CTA------CT-CCAGC-ATCG-TA-CAGTCTTG-TGGCTGCA-GTGG---CAC-GTA-A----GA---------G---------AA-------------ATG-GC-CTT-TGAA-T---CCTGCCT-GTTCAC--A-------T--AGCT--TGGCGACGGT-TTT-CTGT-AAAA-CATG----AA-C-ACC---AAC--GGG-------TGCATCTG-CATA--CCG-G---A-ATGA--TCCGNANACT-GA-TG-CCA---CTTTT-C-TA-ATACTAGAA---GTTAG---GCTTCAT-A--T-CAGCA---TTCT--CCT-TC-----TC-TAT---ATCAA---GAACA-TCA-C-TG----AG---AA----C-G-TTA--TC-G---GT--ATT-T-A---------CAC-----TTTC-AC-TCTC-----ATCCCTA-A---A-TTTT----G-AT-T-GC--------G-CGAGA-------AAAATG--C-T-----CTCTCCATCAGAGGA--ACT-C-ATGTTT-GTA--TTGA-TTC--AATGG----TGAAA----G-TG---A--A-TGAATA---TTTAA--TGA---TTTCAAG---TTTT--ATAGACC----------TTTA---GA--ACTTACCTG-A--AACTG---TCC-AATA--AGTA-A-AA-CA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-C--C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTGTTGG-GA-TAT-TTA---------A-A-ACA-G--CT-T----TA---C-C---TGGNA--------G--AGG--ACAC-TTATGAA--GACAA---------TGG---AT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--A-TTTTG-AC--TGGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTA---GG-ATA-G----AAGCCT-CAAA--CTG-T--A--C-A-T-T-C-T-----------G--TGA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCC-------TAC-G--GGC-CTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A-CAG-AA--TGT----A--CAG-T-TTTCGGCTTATATCCTTTACNTAAACACCATTGCATTG-AGGGTTGGGTA
gi|1 : TAAGACCATA--TGT---T-ACGCAACATCCAATCTTTGTATAAATTTT-T-C-GTGTAGTT-GTTAACTCTGTACCTAT-A-C-GCTAAGACATT--CCATAATGTGAATA-TTTATAAATGAGGCAAAAAATTGCCCAATAA-TTACCTTTGTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTAAAAACAAT-G--TG-TCCATTG--CAGTTTCTACA--C-TAT----AT---TTGAGAACTA----G--T-TATTAG---TACAAAATGACTTTA--TTTATCTGAGACAAGTGCC--AGTGTTGTCAT-ATACAGATAAA--T-GTTTTTCA-TG--AGAT-GCGTTT-------TGTCACACACAACAAGTTTAAGAGATTTTTAATCTTTATAATAACTACGAAATTTGTCTAC-AAGTTATTAACATCAG-GACAGCCAAGCGACCGAAAATC--TC-A----TTG--GTCGT---TAC----CAC---AC-ATCACATTATGAAACTTCTACATAATCGATTCAGA----------AAATG-CATCTT-----CTCCATACATA--TAACT-------CTAAAAATTTTTTTTC--GTTGTT---------TTCCCTA---GCATC-TTTGGGTT--CAC-ATTTCATTTTTT-C---ACTT---CCTTTG-AA-TCGATTTCACT-GAT-TTTTCAC-AAGCTGGGCATCTTGGGTTA---TTTTGC--ATGA-AGTTATG-AACGGACTGCTGTATG----ATCTA--GTCCAG-TTTTTTCAGTAATGAGTTGTT-CAT-CTA------CT-CCAGC-ATCA-TA-CAGTCTTGTTGGC-ACA-GTGGATATAC-GTG-ATAGTGA---------G---------AA-------------ATG-GTACTT-TGTA-TTTCCCTGCCT-GTTCAC--A-------TTAGGCTTCTGGCGACGA--TTT-CTGT-AAAA-CATGTATAGA-C-ACC---AACT-GAGAGAGTTATGCATCTGCCATA--CCG-G---A-ATGA--TCCGTATACT-AA-TG-CTA---CTTTT-C-TA-ATACTAGAAAGTATTAGGTTGCTTCAT-ATCT-CAGCA---TTCT--CCT-TTATTAATCTTATTA-GTCAATGTGAACATTCA-C-TGTGCTAG---AAACTTC-A-GTA--TC-GC--GT--ATT-T-ATGCGTACAGCAC------TTC-AC-TCTC-----ATCCCTATATATA-TTCTCTCCG-ATAT-GCTGGTAGATG-CAAAA-------AAATTGTCC-T-----TTTTCCATCAGAGGA--ACT-C-ATGTTT-GTATTTTGA-TTC--AATGGTTATTGAAAAGTTG-TGCGTACTA-TGACTA---TTTAAT-TGAT--TTTCAAG---TTTT--ATAGACC-----------TTA---GA--ACTTACCTGTA--AACTACTTTCCTAATA--AGTT-A-AA-CATACACACAAA------GAAGAG-----CGAGCTTCC--C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTGTTGG-GA-TATATTATAATGCCACA-A-ACA-G--CT-TATGATG---C-CTTGTGGCA--------G--AGGATACAC-TTATTGA--GACAA---------TGGCGCAT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--ATTTTTG-AC--TGGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATCG----CATAT-AT-TTAAATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTAG--GG-ATA-G----AAGCCT-CAAACCCTGCT--A--C-ATT-T-C-T-----------GTTTTA-G-AGAAAGTAAT---T------CTC----GTATTCAGGCC-------TACTGACGGC-CTCG-A-TCAGCTTCCCT--TTCT-CTTCCCTCTGA-CAGAAA--TGTTTTGACTCAG-TATGTCGGCT
gi|10 : aTATAAC-ATAATTAT---T-ATGCAA--TCC----TTTGT-TA----TT-T-TTG----GTTTGTTG-----------AT-A-G-A-TAAAA---T--CCAT---TTAAATAATT----AA------AAACAAT---CCAATAAGTTACCT--GTA--CGCATGTCC--ACAAATTTAGAAA---T-AGTTGTTCCATTAGTT------TAAGATCGT-T----ATCTCT---GAGT-ACCACG--TCTATT-GTGCT-CAA------C-TAGTTT------AGACA-GTGCCTTAG-------GT-AAAGGTATATAAAGTA-----CA-GATTAGAT-GCATTTTAGGTTGT----CTC-CAACAGATT----ACATATTTAATC-TAATATTAGC-ATGAA--TTGTC-AA-AGGTAG--AACATCTTGAACCAC------ACTGAAAATCCGTCTA----TTGGAGTTGT---TACG---CAC--CAC-AT---ACT-TGAA------CT----TCAATTTTGA----------AA-gtgagtatccatggctacagtg
gi|10 : AATTTCTCT----T-GATTCAGA----------GG-CA-CAT-TCATAAACATA--ACATAACTG-CT-------T----AATTTTTTTTTCAAT-AT---------------CA---GCATC--------T--CA----------TTTTTC---ACTT---CCTT-G-AA-T-GATTTCACT-GAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATCTTGGGTTC---TTTTG-----------TATG-AACGGACTGCTG-AAG----ATCTA-TGTCCAGTTTTTTTCAGTAATGAGTTagacaattcgttatgtttatttgaatttctcttgattcagaggcacattcataaacataacataactgcttaatttttttttcaatatcagcatctcatttttcacttccttgaatgatttcactgattttcacaagctgggcatcttgggttcttttgtatgaacggactgctgaagatctatgtccagtttttttcagtaatgagtt
gi|11 : tataacataattattatgcaatcctttgttatttttggtttgttgatagataaaatccatttaaataattaaaaacaatccaataagttacctgtacgcatgtccacaaatttagaaatagttgttccattagtttaagatcgttatctctgagtaccacgtctattgtgctcaactagtttagacagtgccttaggtaaaggtatataaagtacagattagatgcattttaggttgtctccaacagattacatatttaatctaatattagcatgaattgtcaaaggtagaacatcttgaaccacactgaaaatccgtctattggagttgttacgcaccacatacttgaacttcaattttgaaaagacaattcgttatgtttatttg--A--CCT-GGG--CCTGTC-----CA-TT-TT-T--AGAACAAA---A-A------TGC---AAC---GTT-T-T--CA-------GTT---GC-ATA-T----TAACCT-AAAA--TTG-T--C--C-A-T-T-C-T-----------G--TGA-G-AGAAAGAACTAA-TATTAGCCTTACGGG------GTCC-------TAC-G--GGC-CTTG-A-TCGATT---CT--TTCT-CTC-------A-CAA-AA--TGA----A--TAG-T-TTT-------TATCCTGTACTTAAACA----TGCATT
gi|12 : ggtttaATTGTAAAT-GTGTAA--TCA----TTTAT-TA----TTCT-A-A----GCT-TTGA----------TAT-A-----TAAAA---TAGTC-T---GCCTACA-TT----TA------AAAC-------------GTTACCT--GTA--GG--TATCC-AATACGTTGACAAT---TAA--TG-TCCATTA--T------------C-T-TTCAGAA---T---GGAC-A----GTAT-TATT-G---C-CAA------CATA--TTG-----GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAtaccaatgtcaataggtttcatattacatgtgtttgtaaatctctcaccaatactatttcttactttctttttaacatccaagttgt
gi|13 : ctatatttaaagTTTA-AA--TGGA--T--TTTA--TCT--ATCAACAAAC-----CA-AA-AA-T--AA--CAAA---GGATTGCATAAT---AATTATGTT-A-T--AAAA-----GTA---GG-ATA-G----AAGCCT-CAAA--CTA-T--A--C-A-T-T-C-T-----------G--TAA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCC-------TAC-G--GGC-TTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A-CAG-AA--TGT----A--CCG-T-TTTCGGCTTATATCCTTTACTGAAA-ATAAATGCATTA-AAGttattagatgtttacaggttgcctgaaaacaagagaaaaagatgatgcatttgtttaaacataaacaaattcaattctaaat
gi|14 : atta------GAT---AAT---GTTGT-T--GAT------GCA---TGTAT--T----AAGC-T-CAAA--CTG-C-----C-G-T-T-CCT-----------A--TGA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTT----A------GTCC-------TAT-G--GCA-ATTG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A-T-G-AA--TGG----A--C-G-T-TTGAGGCTTATATCTTTTttaccaagatgcgttgactgcgtgata
gi|15 : ttgcatgactatgaaCTG-A--AACTG---TCC-AATA--AGTT-A-AA-CA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-CG-C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTGTTGG-GT-TAT-TTA---------A-A-ACA-G--CT-T----TA---C-T---TGAAA--------G--AGG--ACAC-TTATGAA--GACAA---------TGG---AT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--A-TTTTA-AC--TAGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-C--AATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-TTGAA---------A---AG-ATA-A----AAatatataaaggttgtgattccaacgatgacattattcaatgatggaccaacagttttgtgtattgcacatgcattgtttgatctgaagagaa
gi|16 : at--T--T--A--TCT-GAT--TCCACC-----CC-AC-AT---------AAA---GAA------AAG---CAT---GTT-T-T--AA-------TTA---AG-AGA-A----AAGCCA-CAAA--CTA-T--C--A-A-C-T-C-T-----------G--TGA-A-AGAAAGAACTAA-----------------------------------------------A-A-TTAGTT---CT--TTTT-CTC-------A-CAG-AA--TGG----A--CAG-C-GTTTGGCCTTTCACTTTTACATA
gi|17 : acAATT---CT--TTCT-CTC-------A-CAG-AA--TGG----G--CAG-A-TTTCGGTCTTTCTCCTGTACATAacaaaa
gi|18 : catcactacatg--T--T--A--TAT-GAT--G-TATC------A-AT-AT-TTGAATACA----------------C---AAT---GCT-T-T--AACTCCATAGCA---AG-GTA-T----TAGCCT-GAAA--CTG-T--C--C-A-T-T-C-T-----------T--TGA-G-AGAAAGAACTAA-T------CTC----G------GCCTG------TA--G--GGC-Ccagctctatcgtatcaagccagctaaagtcaagtacatgtactttttccagtacaacaactctggagtttgaa
gi|19 : tttaattacatgtatttccACAAA---AGA------TGC---ACT---AGT-C-T--AA-------GTA---GG-ATA-T----AAGCAC-AAAA--CTA-TCTATCC-A-T-T-C-T-----------G--TGA-GGAAAAAGAATTAA-T------CAC----A------ACCT-------TAC-G--GAC-CTTG-A-TCAGTT---aa
gi|2 : aacgaaaacaacaTAAGACCATA--TGT---T-ACGCAACATCCAATCTTTGTATAAATTTT-T-C-GTGTAGTT-GTTAACTCTGTACCTAT-A-C-GCTAAGACATT--CCATAATGTGAATA-TTTATAAATGAGGCAAAAAATTGCCCAATAA-TTACCTTTGTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTAAAAACAAT-G--TG-TCCATTG--CAGTTTCTACA--C-TAT----AT---TTGAGAACTA----G--T-TATTAG---TACAAAATGACTTTA--TTTATCTGAGACAAGTGCC--AGTGTTGTCAT-ATACAGATAAA--T-GTTTTTCA-TG--AGAT-GCGTTT-------TGTCACACACAACAAGTTTAAGAGATTTTTAATCTTTATAATAACTACGAAATTTGTCTAC-AAGTTATTAACATCAG-GACAGCCAAGCGACCGAAAATC--TC-A----TTG--GTCGT---TAC----CAC---AC-ATCACATTATGAAACTTCTACATAATCGATTCAGA----------AAATG-CATCTT-----CTCCATACATA--TAACT-------CTAAAAATTTTTTTTC--GTTGTT---------TTCCCTA---GCATC-TTTGGGTT--CAC-ATTTCATTTTTT-C---ACTT---CCTTTG-AA-TCGATTTCACT-GAT-TTTTCAC-AAGCTGGGCATCTTGGGTTA---TTTTGC--ATGA-AGTTATG-AACGGACTGCTGTATG----ATCTA--GTCCAG-TTTTTTCAGTAATGAGTTGTT-CAT-CTA------CT-CCAGC-ATCA-TA-CAGTCTTGTTGGC-ACA-GTGGATATAC-GTG-ATAGTGA---------G---------AA-------------ATG-GTACTT-TGTA-TTTCCCTGCCT-GTTCAC--A-------TTAGGCTTCTGGCGACGA--TTT-CTGT-AAAA-CATGTATAGA-C-ACC---AACT-GAGAGAGTTATGCATCTGCCATA--CCG-G---A-ATGA--TCCGTATACT-AA-TG-CTA---CTTTT-C-TA-ATACTAGAAAGTATTAGGTTGCTTCAT-ATCT-CAGCA---TTCT--CCT-TTATTAATCTTATTA-GTCAATGTGAACATTCA-C-TGTGCTAG---AAACTTC-A-GTA--TC-GC--GT--ATT-T-ATGCGTACAGCAC------TTC-AC-TCTC-----ATCCCTATATATA-TTCTCTCCG-ATAT-GCTGGTAGATG-CAAAA-------AAATTGTCC-T-----TTTTCCATCAGAGGA--ACT-C-ATGTTT-GTATTTTGA-TTC--AATGGTTATTGAAAAGTTG-TGCGTACTA-TGACTA---TTTAAT-TGAT--TTTCAAG---TTTT--ATAGACC-----------TTA---GA--ACTTACCTGTA--AACTACTTTCCTAATA--AGTT-A-AA-CATACACACAAA------GAAGAG-----CGAGCTTCC--C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTGTTGG-GA-TATATTATAATGCCACA-A-ACA-G--CT-TATGATG---C-CTTGTGGCA--------G--AGGATACAC-TTATTGA--GACAA---------TGGCGCAT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--ATTTTTG-AC--TGGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATCG----CATAT-AT-TTAAATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTAG--GG-ATA-G----AAGCCT-CAAACCCTGCT--A--C-ATT-T-C-T-----------GTTTTA-G-AGAAAGTAAT---T------CTC----GTATTCAGGCC-------TACTGACGGC-CTCG-A-TCAGCTTCCCT--TTCT-CTTCCCTCTGA-CAGAAA--TGTTTTGACTCAG-TATGTCGGCT
gi|20 : aCTCAAAAC-ATTTTTGT---T-ACGTTA--TCT----TTTGT-TA----TT-T-TAG----GCT-TTTA----------TAT-A-G-A-CGAGAG--T--CCA----GCCG-TA-TT----TA------AAAT-------------GTTACCT--ATA--GG--TGTgtgagtatccatggctacagtg
gi|21 : tgtgaacatttaaatcccGT----A--CAG-T-TTGAGGCTTATATCCTTTACATA
gi|22 : ggcacttgcggccgtataagggaccgccatttttaaaagatcgtatccgacagatatttggcgaagaagcagA---GCATC-TTCTGATT--CAC-ATTTCATTTTT--C---ACGT---CCTT-G-AA-T-GTTTTCACT-GAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATCTTGnc
gi|23 : AAAAAGTTGCCT--GTA--GG--TGTCC-AATAAGTGGACAAT---T-AC-TG-TACATTA--T------T
gi|23 : tgtactt-TCCATTG--T------TATA--A-A-T----AA---T---GTAC-A----G--T-AATT-G---T-CCA------CTTA--TT------GGACA-tataacaatggagagt
gi|25 : tgtacttaaaaagttgcctgtaggTTAAAAC-ATAATTGT---T-ACGCAA--TCC----TTTAT-------TT-T-C-G----GTT-GTTA----------TAT-AGC-A-TATAA---T--CCgagt
gi|26 : gggca-A-T-T-C-T-----------G--T-A-G-AGAAAGAACCGA-T------ATC----G------GACTTGCAATGTAC-G--TGC-CTCG-A-CCAGTT---
gi|27 : -A-TCAGTT---CT--TTCT-CGC-------A-CAA-AA--TGG----A--CAGTT-TTTCGACTTTTA--CTTTACATAA
gi|28 : GTTTAAAAC-ATGATTGT---G-ACGTAA--ACC----TT--T-TG----TT-T-G-A----ATT-GTC-----------CAT-A-CTA-TAa
gi|29 : ------GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAACATATAAAAAG-A-----CA-GA--AGAT-GCGTTTG------T----CAAACg
gi|3 : TAAAAC-ATAATTGT---TGACGCAA--TCC----TTTGT-TAAT--TT-T-C-G----GTT-GTTA----------TAT-AGC-A-ATAAA---T--CCAT---GTAAAT--TT----CA------AAACAAT---CCAATAAGTT-CCT--GTAAGCG--TGTCCCAATAAGTTTAGAAAA--T-G--TG-TCCATTA--T------TAA---C-T-T----AT---T---GGAC-A----G--T-TATT-G---C---A------CTTA--TT------G-ACA--TGTC--AG-------GTTAAACG-ATAAAAAG-G-----CAAGA--AGATTGCGTTG-------T----CAC-CAA-AAGT-----AAATTTT-AATCCTAATAACAAC-GCA-----TGTCCACCAAGTA----AC-TCTGAGACCAC------ACCGAAAATC------------GACGTCGTACCCAC----CCC--CACCATCACATTATGAAACTTCTCT----T-GATTCAGA----------A--C--CATCTC-----C-----ACAT---TG-CTTAAAATGC----GATTTTTTTTT--AT-GTT---------TTCC-TA---GCATCCTTTGGACTTCCACCATCTTTCCTTTTTC---ACCTATCCCTT-GCAACT-GATCTACCTCGATCTTT-CCCTCAGCTGGG--TCTTG--CTACATTTCTGCTCGCGAGAGTTATGGAACGGACTGCTG-ATGGAGAATCTAATCTCCAGTTTTTTTCAGTAATGAGTTGTTTCATGCTA------CTTCCAGCCATCG-TA-CAGTTTTG-TGGCTACAAGTGG---CACCGCT-T----GA---------G---------AA-------------ATG-TC-CTT-TGAAAT---CCCGCCT-GTTCACGAA-------T--AGCT--TGGTGACGGGGTTT-CTGT-AAAAACATG----AA-C-ACC---AACTCGGG-------TG-ATCTG-CATA--CCG-A---ATATG---TCCGAAGAAAAGA-TG-TCA---CTTTT---TA-A-ACT-GAA---GTTAGC--GCTTCAT-A--T-CAG-A---TTCT--CCT-TC-----TC-TAT---ATCAA---GA-CA-TCA-CATG----AG---AA----CTG-TTA--TC-G---GT--ATT-T-A---------CAC-----TTTC-AC-TCTCT----ATTCCT---------------------T-GC--------G-TGAGA-------CAAATG--C-T-----CTCTCCATCAGAGGATCACT-CCATGTTG-GTA--T-GA-TTC--AATGG----TGAAA----G-TG---A--A----ATA---TTTAA---GA---TTTCAAAGT-TTTT--ATAGACC----------TT-A---GA--A-TTACTAA-A--AACTG---TCC-A-TA--AGTA-A-AAACA-------AAA------GA--A------C-AGCTT-C--CCAAA-GAC--GG-TTTGGTT--AT-GTTGG-GAGTAT-TTA---------AGA-ACA-G--CT-T----T----C-C---TGGCA--------AGCAGG--ACCT-TTATGAA--GACAA---------TGG---AT-TAATCA-G-GAA--AC-T-AA--AA-TC--T-TTTTG-ACC-TGGAGGTGAT--A--GTT--AT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATACAA-----GA------GAT---AAT---GTT-T-TA-AA-------GTA---GG-ATA-G----AAG-CT-CAAA--CTG-T--A--C-A-T-T-C-TG----------G--TAA-GAAGAAAGAACTGA-T-------TC----G------G-CC-------TAC-G--GGC-CTCG-ACTCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A-C-G-AA--TGT----A--CAG-T-TTTCGGCTTATATCCT
gi|30 : c--GGC-CTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTT-------A-CAG-AA--AGG----A--CAG-
gi|4 : GCTTAAAAC-ATAATTGT---T-ACGCAA--TCC----TTTGT-TA----TT-T-C-G----GTT-GTTA----------TAT-G-C-A-TAAAA---T--CCAT---GTAAAT--TT----AA------AAACAAT---CCAATAAGTTACCT--GTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTAGAAA---T-G--TG-TCCATTA--T------TAAA--C-T-T----AT---T---GGAC-A----G--T-TATT-G---T-CAA------CTTA--TT------GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAACGAATAAAAAG-G-----CA-GA--AGAT-GCGTTT-------T----CACACAA-AAG--TAAA----TTTTAATC--TA-AATAAC-ACGAA---TGTC-AC-AAGTAG--AACATCTGAGACCAC------ACCGAAA-----TC-A----TTG--GTCGT---TAC----CAC--CAC-ATCACATTATG-AACTTCTCT----TTGATTCAGA----------AA----CATCTC-----C-----ACAT---TG-CT-------C----AATTTTTTTTT--AT-GTT---------TTCCTTA---GCATC-TTTGGATT--CAC---TTCATTTTTTTC---ACTT---CCTT-G-AA-T-GATTTCACT-GAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATCTT-GGTTA----TTTGC--ATGA-AGTTATG-AACGGACTGCTG-ATG----ATCTA-TGTCCAG-TTTTTTCAGTAATGAGTTGTT-CAT-CTA------C--CCAGC-ATCA-TA-CAGTCTTG-TGGCTACA-GTGG---CAC-GT--A----GA---------G---------AT-------------ATG-GT-CTT-TGAA-T---CCTGCCT-GTTCAC--A-------T--AGCT--TGGCGACGAT-TTT-CTGT-AAAA-CATG----AA-C-ACC---AAC--GGG-------TGCATCTG-CATA--CC--G---A-AT-A--TCCGAAAA---GA-TG-TCA---CTTT----TA-A-ACT-GAA---GTTAG---GCTTCAT-A--T-CAGCA---TTCT--CCT-TT-----TC-TAT---ATCAA---GAACA-TCA-C-TG----AG---AA----C-G-TTA--TC-G---GT--ATT-T-A---------CAC-----TTTC-AC-TCTC-----ATCCCTA-A---A-TTTT----G-AT-T-GT--------G-TGAGG-------AAAATG--C-T-----CTCTCCATCAGAGGA--ACT-C-ATGTTT-GTA---TGA-TTC--AATGG----TGAAA----G-TG---A--A-TGACTA---TTTAA--TGA---TTTCAAG----TTT--ATAGACC----------TTTA---GA--ACTTACCTG-A--AACTG---TCC-AATA--AGTA-A-AA-CA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-C--C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTG-TGG-GA-TAT-TTA---------A-A-ACA-G--CT-T----TA---C-C---TGGCA--------G--AGG--ACAC-TGATGAA--GACAA---------TGG---AT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--A-TTTTG-ACT-TGGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTA---GG--TA-G----AAGCCT-CAAA--CTG-T--A--C-A-T-T-C-T-----------G--TAA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCC-------TAC-G--GGC-CTCG-A-TCAGTTG--CT--TTCT--TC-------A-CA--AA--TGT----A--CAG-T-TGTCGGCTTATATCCTTTACTTAAACACCATTGCATTGCAGGGTTGGGTA
gi|5 : taCTTC-T-A--A-CA--A---TTAT--CTTGTC-----TC-AATGTAATCA----GAACA-TCA-C-TG----AGT--AA----C-GGTTA--TC-GTCAGTTTATT-T-A---------CACACTTTTTTC-TCATCTCGTGCAATCACCATA---A-TTTT----ACAT-TTGC--------G-TGAGACGGTTACAAACTG--C-TACCATCTCTCAAGCAGAG-A--ACTAC-ATGTTTGGTA--TTGAGTTCAGAAT-G----TGAAA----GATGA--A--A-TGAATA---TCTAAATTGA---TTTCAGATGTTTTT--ATAGGACAACGTCTTGATTTATGGGAATATTTACCTG-ATTAACTGGATTCC-GATAGGAGTATA-AC-CA-------AAACATAATGA--AATCAATC-AGCTC-A--C--AAGGACT-GG-ATT--TTCAATTGTAGGTGA-TAT-TTA---------A-AGACATG--TTCT----TACATC-C---TGGAGATCTTTGTG--AGA--CCACTTTAGGAA--GACAAATGCGTTTTTGT---AC-TA--TG-GAAAA--ACAG-AATTAA-TCATA-TTCTA-ACATTGGGACT--T--AGGCCTCGCA--ATTATCATATGCA-ATCAT-G--AATATACATATGTA------TGTATAAAT---GTTGTAT--AA-------GTATAGAG-ATA-AGTATAGGCCTCCAAA--CTG-------C-A-T-TGC-TTACTAGCTCAAG--TAAGG-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------G-CC-------TAC-G--GGCTCTCG-ATTCAGTT---CTTCTTCTGCTC-------ACCAG-AAATTGT----A--CAG-T-TT---GC-TACGTCCTTTACTCA
gi|5 : ctatgatgtaaaaggga-CTGG-AAGA-AAAG----GA-C-ACC---AAC---GG-------T-CATC-G-CATA--CCA-G---A---------TAGACATT-GA-TGACCAATGCTTGTACGTATATATTTGAA---GTT------CTTC------T-CAGtgctggataatggaagtcctttaactaggcaagtataatttaagagtttttacatggcatttgacaacttaaaagcatatgctaggcttatttattctggcataaaatctatgtttgcgctgttttccaaacttttatgctatatttttcaggctcagaacatggcaatgatgaacgcaactatcacctgagaagaacttcaaatatatacgtacaagcattggtcatcaatgtctatctggtatgcgatgaccgttggtgtccttttcttccag
gi|6 : ctatgatgtaaaagggatgagtaaaggacgtagcaaactgtacaatttctggtgagcagaagaagaactgaatcgagagcccgtaggccgagatcagttctttctccttacttgagctagtaagcaatgcagtttggaggcctatacttatctctatacttatacaacatttatacatacatatgtatattcatgattgcatatgataattgcgaggcctaagtcccaatgttagaatatgattaattctgtttttccatagtacaaaaacgcatttgtcttcctaaagtggtctcacaaagatctccaggatgtaagaacatgtctttaaatatcacctacaattgaaaatccagtccttgtgagctgattgatttcattatgttttggttatactcctatcggaatccagttaatcaggtaaatattcccataaatcaagacgttgtcctataaaaacatctgaaatcaatttagatattcatttcatctttcacattctgaactcaataccaaacatgtagttctctgcttgagagatggtagcagtttgtaaccgtctcacgcaaatgtaaaattatggtgattgcacgagatgagaaaaaagtgtgtaaataaactgacgataaccgttactcagtgatgttctgattacattgagacaagataattgttagaagtgctggataatggaagtcctttaactaggcaagtataatttaagagtttttacatggcatttgacaacttaaaagcatatgctaggcttatttattctggcataaaatctatgtttgcgctgttttccaaacttttatgctatatttttcaggctcagaacatggcaatgatgaacgcaactatcacA---GTTAG---GCCTCATTA--TGCAGCAA--TTCT--CCT-GC-----TT-TGTG--ACCAA---GAACA-TCAGC-TG----AGGAGAA----C-G-TTA--TCCG---GT--ATTGT-A---------CAC-----TTTCGAC-TCTC-----ATCTC-A-A---A-TTT-----G-AT-T-GC--------G-TGAGG-------AAA-TG--CGT-----CTCTCCATCAGCGGACAACT-C-ATGTTT---A--TGGA-TTC--AATGG----TGAAA----G-TG---A--A-TGAATACAGTTAAA--TGAGC-TTTC-AG---TTTTTAATAGACC----------CTTA---GA--AATTACCTG-A--AACTG---TCC-AATT--AATA-AGAA-CA-------AAA------AG--AA-----C-AGCTT-TCAC--AA-GACTGGG-TTT--TT--ATTATTGA-GG-TAT-TTAT--------A-A-ACA-GTTTT-T----TA---CTT---TGGGA--------G--TGG--ACACTTTAGGAAACGACAA---------TGG---ATGTA--TA-G-GAATCACATAAA--AA-TC--A-TTTTGAAC--TGGA--T--T--A---CT-GAA--ACTATC-----CA-AT-CTAT--AATATAAA----GA------GAT---AGT----TT-T-T--AA-------GTA---GG-ATAGG----AAGCCT-CAAAG-CTG-T--A--CGA-T-T-C-T-----------G--TAA-G-A-AAAGAACTGACT------CTC----G------CCCT-------TAC----GGC-CTCGAA-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------ACCAGCAA--T-T----A--CAG-T-TTTCGGCTTATATCCTT
gi|6 : TAAGGAGAGGTT-CAT-TGAACATGGCT-CCAGCTATCGGTA-CAGTCTTG-GGGCGGCA-CGGG---CAC-GTA-GAT--GA---------ATGGTTTGT-AA-------------ATG-GC-CTTGTGAA-T---CCTGCCTCGTTCAC--A-------TG-AGCT--TGGCG-CGGTGTTC-CTGT-AAAA-CATG----AACC-ACC---AAC--GGG-------T-CATCT--CATACGCCGAG---AGATGA--Tagggcaagtataattcagagttttacgcatgactttgcatttaatgcaggctccgtatatttttcgccaaataactatttctcgttgcacttttgctatatttcaggggccagaaaatgggatgtgcacgctctatacctaccaccgacagagacactcaaatactaagcaacatcatctctcggcgtatgagatgacccgttggtggttcatgttttacaggaacaccgcgccaagctcatgtgaacgaggcaggattcacaaggccatttacaaaccattcatctacgtgcccgtgccgccccaagactgtaccgatagctggagccatgttcaatgaacctctcctta
gi|7 : aaggatataagccgaaaactgtaattgctggtgagagaaagaactgattcgaggccgtaagggcgagagtcagttcttttcttacagaatcgtacagctttgaggcttcctatcctacttaaaaactatctctttatattatagattggatagtttcagtaatccagttcaaaatgatttttatgtgattcctatacatccattgtcgtttcctaaagtgtccactcccaaagtaaaaaactgtttataaatacctcaataataaaaacccagtcttgtgaaagctgttctttttgttcttattaattggacagtttcaggtaatttctaagggtctattaaaaactgaaagctcatttaactgtattcattcactttcaccattgaatccataaacatgagttgtccgctgatggagagacgcatttcctcacgcaatcaaatttgagatgagagtcgaaagtgtacaataccggataacgttctcctcagctgatgttcttggtcacaaagcaggagaattgctgcataatgaggcctaactagggcaagtataattcagagttttacgcatgactttgcatttaatgcaggctccgtatatttttcgccaaataactatttctcgttgcacttttgctatatttcaggggccagaaaatgggatgtgcacgctctatacctaccaccgacagagacactcaaatactaagcaacA---GTTAG---GCTTCAT-A--T-CAGCA---TACA--CCT-TC-----TC-TA----ATCAA---GAACA-TCA-C-TG----AG---AA----C-G-TTA--TC-G---GT--ATT-T-A---------CAC-----TTTC-AC-TCTC-----GTCCCTA-A---AATTTT----G-AT-T-GC--------G-TTAGA-------AAAATG--C-T-----CTCTCCATCAGAGGA--ACT-C-ATGTTT-GTA--T-GA-TTC--AATGA----TGAAA----G-TG---A--A-TGAATA---TTAAA--TGA---TTTCAAT---GTTT--ATAGACC----------TT-A---GA--ACTTACCTG-A--AACTG---TCC-AATA--AGT--A-AA-CA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-CA-C--AA-GAAT-GG-TTT--TT--ATTGTTGA-AG-TAT-TCA---------A-A-ACA-G--CT-T----TA---C-C---TGGGA--------G--AGG--ACAC-TTATGAA--GACAA---------TGG---AT---------------------A--AA-TC--A-TTTTA-AC--TGGC--T--T--A--CCT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTA---GG-ATA-G----AAGCTT-CAAA--CTG-T--A--C-A-T-T-C-T-----------G--TAA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCC-------TAC-G--GGC-CTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A-CAG-AA--TGT----A--CAG-T-TTTCGGCTTATATCCTTTACATA-----CATTG-ATTG-
gi|7 : ggcactttggaggccttagtgatcgttttggtaaagatagtgacaagatggcagaatgtgaagagacaaAATGAGTTGTT-CAT-CTA------CT-CCAGC-ATCG-TA-CAGTCTTG-TGGCTGCA-GTGG---CAC-GTAGA----GA---------ATGGTTTGTAAA-------------ATG-GC-ATT-TGAA-T---CCTGCCT-GTTCAC--A-------T--AGCT--CGGCGACGGT-TTT-CTGT-AAAA-CATG----AA-C-A-C---AAC--GGG-------TGCATCTG-CATA--CCA-G---G-ATGA--Taaggcaagtataatcatgagttttacatgcatttgacatttaatgcaggcttatatttttgcaaacactaattctgttcactttttttatatttcaggccagaaaatggcaattgtgacgcactatactgagacaactcaaatatagtacatcatcatcctggtatgcagatgcacccgttgtgttcatgttttacagaaaaccgtcgccgagctatgtgaacaggcaggattcaaatgccattttacaaaccattctctacgtgccactgcagccacaagactgtacgatgctggagtagatgaacaactcatt
gi|8 : ggcactttggaggccttagtgatcgttttggtaaagatagtgacaagatggcagaatgtgaagagacaacaatcaatgtatgtaaaggatataagccgaaaactgtacattctgtgagagaaagaactgatcgaggcccgtagggccgagatcagttctttctcttacagaatgtacagtttgaagcttctatcctacttaaaacattatctcctttgtattaatattggatagtatcaggtaagccagttaaaatgatttatccattgtcttcataagtgtcctctcccaggtaaagctgttttgaatacttcaacaataaaaaccattcttgtgaagctgtttcttttgtttacttattggacagtttcaggtaagttctaaggtctataaacattgaaatcatttaatattcattcactttcatcattgaatcatacaaacatgagttcctctgatggagagagcatttttctaacgcaatcaaaattttagggacgagagtgaaagtgtaaataccgataacgttctcagtgatgttcttgattagagaaggtgtatgctgatatgaagcctaactaaggcaagtataatcatgagttttacatgcatttgacatttaatgcaggcttatatttttgcaaacactaattctgttcactttttttatatttcaggccagaaaatggcaattgtgacgcactatactgagacaactcaaatatagtacatcA---GTTAG---GCTTCAT-A--T-CAGCA---TCC----CT-GC-----TT-TGT---ATCAAA--GAACA-TCA-C-TG----GA---GA----C-G-TTAAATC-G---GT--ATT-TTA---------CAA-----TTTC-AC-TCTC-----ATCCCTA-A-----TTTT----G-AT-T-GC--------GGTGAGG-------AAAATG--C-T-----TCATCCATCAGCGGA--ACT-C-ATGTT--GTA--T-GA-TTC--AATGG----T-AAA----G-TG---A--AATGAATA---TTAAAA-TGAATTTTTCAAG---TTTT--ATAGACC----------TT-A---GA--AATTAC-TG-A--AACTG---TCCCAATA--A-TA-A-A--CA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-C--C--A--GACT-GGGTTT--TT--ATTATTGA-GG-TAT-TTA---------A-A--CA-G--TT-T----TAA--C-T---TGGGA--------G--TGG--ACAC-TTAGGAAA-GACAA---------TGG---ATATA--TAAG-GAA--ACAT-AA--AAATC--A-TTTTA-AC--TGGAA-T--T--A--ACT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATATAAT---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTA---GG-ATA-G----AAGCCT-CAAA--CTG-T--A--C-A-TAT-CTT-----------G--TAA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCCT------TAC-G--GG--CTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A--AG-AA--TGT----A--CAG-T-TTTCGGCTTATATCCTT
gi|8 : -ATCG-TAACAGTCT-G-TGGCTGCA-GTGG---CAC-GTA-A----GA---------G---------AATGGTTTGTAGTAAATGTGC-CTT-TGAA-T---CCTGC-T-GTTCAC--ACTCATTAT--AGCT--TGGCGACGGT-TTTCCTGTAAAAA-CATGAC--AA-CAACCAAAAAC---GG-------TGCATCTG-CATA--CCA-GGCAG-ATGATGTTCTGATATT-GAGTG--------TTCT-CGTAGGTAATAG--------AG---GCGTCAC-A--T-TTGCAATTTTCTGGCCT-Taagccaagatataatatgtagtttacatggcatttgacattttaatgcaggcttttatatattttttcgcaaaaactatttctgttcacctttttctatatttcaaggccagaaaattgcaaatgtgacgcctctattacctacgagaacactcaatatcagaacatcatctgcctggtatgcagatgcaccgtttttggttgttgtcatgtttttacaggaaaaccgtcgccaagctataatgagtgtgaacagcaggattcaaaggcacatttactacaaaccattctcttacgtgccactgcagccacagactgttacgat
gi|9 : aaggatataagccgaaaactgtacattcttgagagaaagaactgatcgagcccgtaagggccgagatcagttctttctcttacaagatatgtacagtttgaggcttctatcctacttaaaacattatctccattatattaatattggatagtatcagttaattccagttaaaatgatttttatgtttccttatatatccattgtctttcctaagtgtccactcccaagttaaaactgtttaaatacctcaataataaaaacccagtctggaagctgtttcttttgtttattattgggacagtttcagtaatttctaaggtctataaaacttgaaaaattcattttaatattcatttcactttaccattgaatcatacaacatgagttccgctgatggatgaagcattttcctcaccgcaatcaaaattagggatgagagtgaaattgtaaaataccgatttaacgtctccagtgatgttctttgatacaaagcagggatgctgatatgaagcctaactaagccaagatataatatgtagtttacatggcatttgacattttaatgcaggcttttatatattttttcgcaaaaactatttctgttcacctttttctatatttcCTTAAAAC-ATAATTGT---T-ACGCAA--TCC----TTTGT-TA----TT-TTC-G----GTT-GTTA----------TATGG-C-A-TAAAA---T--CCAT---GTCAAT--TT----AA------AAACAAT---CCAATAAGCTACCT--GTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTAGAAA---T-G--TG-TCCATTA--T------TAAA--C-T-T----AT---T---GGAC-A----G--T-TATT-G---T-CAA------CTTA--TT------GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAACGGATAAAAAG-A-----CA-GA--AGAT-GCGTTTG------T----CAAACAG-AAG--TAAA----TTGTAA--TTTA-AATAAC-ATGAA---TGTC-AC-AGGTAG--AACATCTGAGACCAC------ACTGAAAATCATTC-ATTATTTG--GTCGT---TACTCGTTACCACAC-ATCACATT-TAGAACTTCAAT----TTGAAAGACA----------AATTGTTATGTT-----C------TATA--TG---------------AATTTCTCTTT--AT--TCAGAGGCACATTCAAAA---ACATC-TCCAAATT------GCTTAATTTTTTTTATGATTT---CCTT-
gi|9 : TATGAA-TTTCTCT----TT-ATTCAGAGGCACATTCAAA-AA-CATCTC-----C-----AAAT---TG-CT-------T----AATTTTTTTT---AT-GAT---------TTCCTTATCAGCATC-TTCTGATT--CAC-ATTTCATTTTTT-C---ACTT---CCTG-G-AA-T-GATTTCACT-AAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATTTTGGGTTC---TTTTG-----------TATG-AATGGACTGCCG-ATG----ATCTA-TGTCCAGTTTT--TCAGTAATGAGTTGTT-CAT-CTA------CT-CCAGC-ATCG-TA-CAGTCTTG-TGGCTGCA-GTGG---CAC-GTAGA----GAATGGTTTGTA---------AA-------------ATG-GC-ATT-TGAA-T---CCTGCCT-GTTCAC--A-------T--AGCT--CGGCGACGGT-TTT-CTGT-AAAA-CATG----AA-C-A-C---AAC--GGG-------TGCATCTG-CATA--CCA-G---G-ATGA--Tatcagcatcttctgattcacatttcattttttcacttcctggaatgatttcactaattttcacaagctgggcattttgggttcttttgtatgaatggactgccgatgatctatgtccagtttttcagtaatgagttgttcatctactccagcatcgtacagtcttgtggctgcagtggcacgtagagaatggtttgtaaaatggcatttgaatcctgcctgttcacatagctcggcgacggttttctgtaaaacatgaacacaacgggtgcatctgcataccaggatgatgatgtacta
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): GATGACATTAGTGATGAAACAGCAGTTTTGTGTATTCATAATATGCATTATTTGATGTGAAGGGA
Alignments
lowQualScore : 11 1111 2222 22222222 3333333333 11111 111 111 11 444444444444 111 11 22222222 333333333333333333333333333333333 111111 1 11111 222222 333333 3333333 3333333 444444444444 1 33333333 1 222 1 222 333333 2222222222 11 111 2222 111 2222 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111 2222222222222 11111 1 1 1 111 22222222 1 1111 11 1 111111 1 1 111 8888888888888888888888888888888888888888888 1 111 2222222222 11 11 2222 111 2222222 11111 111 1111111 222 111 1 111 222 11 111 33333333333333 222 1 222222222222222 1 111 444444444 111111 11111 33333333333333333333333333333333 11111111 22222222 11 2222 2222 2222 222222 22 222 1111 33333333333 222 1 2222222 111111 111111111 1111 444444444 222222222222222 11111111 11 11 111111111 111 11 11 11111 1111 1111111 111 11 1111111 11111111111111 11111111111111111 111 1111111 11111 222222 1
lowQualScore : 8 3 777 4 11 7777 8 2222 4 00000000 4 5555555555 4 66666 4 555 66 777 11 44 111111111111 3 777 1 22 66 66 5 0 66666666 4 888888888888888888888888888888888 111111 66 5 0 33333 888888 0 66 000000 8 66 2222222 5 6 5 1111111 5 77 5 555555555555 5 5 11111111 9 7 3 999 8 6 222 9 0 888888 7777777777 88 111 0000 555 6 5 0 3 1111 8 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 000 8888888888888 8 888 5 22 66 77 33333 888 0 5 5 1 5 5 1 5 111 22222222 6 3 4444 44 5 5 5 666666 5 0 5 5 0 6 5 777 5 6666666666666666666666666666666666666666666 5 0 5 5 777 5 66 6666666666 33 66 4 4 4 5555 4 4 1 777 666 8888888 1 8 66 77 22222 66 1 1 333 6 6666666 222 444 1 555 000 0 4 11 4 222 66 4 33333333333333 222 0 5 5 555555555555555 0 66 5 888 66 5 5 000000000 555555 5 5 77777 77777777777777777777777777777777 77 77777777 0 11111111 66 66 5 5 11 3333 5 66 1111 1111 5 777777 5 888 0 11 555 5555 66 33333333333 3 888 66 4 8 66 333 3 66 99 4 4 8888888 222222 444444444 8 8888 66 4 4 4 66 66 4 4 8 000000000 4 4 4 66 4 777777777777777 1 66666666 66 22 8 00 777777777 555 8 66 4 4 66 4 66 4 66 8 4 33 22 44 44 555 3 44 33333 6 3 3333 555 777777 444 444 5 2 66 5555555 000 2 888888 2 00 0000000 2 5 2 2 5 55555555555555 4 2 5 0 2 777777 5555 66666666666666666 7777 2 2 5 000 33 2 7777777 5 8 33 00000 66 2 5 1 0 111111 2 3
lowQualScore : . . ... . .. .... . .... . ........ . .......... . ..... . ... .. ... .. .. ............ . ... . .. .. .. . . ........ . ................................. ...... .. . . ..... ...... . .. ...... . .. ....... . . . ....... . .. . ............ . . ........ . . . ... . . ... . . ...... .......... .. ... .... ... . . . . .... . ......................................................... ... ............. . ... . .. .. .. ..... ... . . . . . . . . ... ........ . . .... .. . . . ...... . . . . . . . ... . ........................................... . . . . ... . .. .......... .. .. . . . .... . . . ... ... ....... . . .. .. ..... .. . . ... . ....... ... ... . ... ... . . .. . ... .. . .............. ... . . . ............... . .. . ... .. . . ......... ...... . . ..... ................................ .. ........ . ........ .. .. . . .. .... . .. .... .... . ...... . ... . .. ... .... .. ........... . ... .. . . .. ... . .. .. . . ....... ...... ......... . .... .. . . . .. .. . . . ......... . . . .. . ............... . ........ .. .. . .. ......... ... . .. . . .. . .. . .. . . .. .. .. .. ... . .. ..... . . .... ... ...... ... ... . . .. ....... ... . ...... . .. ....... . . . . . .............. . . . . . ...... .... ................. .... . . . ... .. . ....... . . .. ..... .. . . . . ...... . .
lowQualScore : 9 4 000 0 00 0000 0 5555 0 44444444 0 0000000000 0 44444 0 666 11 555 44 44 555555555555 2 555 1 22 11 11 0 2 44444444 4 333333333333333333333333333333333 666666 99 0 0 55555 888888 4 99 000000 9 99 5555555 0 6 0 1111111 7 99 7 333333333333 0 0 88888888 8 3 3 777 0 7 000 8 7 333333 5555555555 33 777 8888 888 7 0 1 2 2222 5 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 111 6666666666666 9 888 0 55 99 00 11111 888 0 7 7 4 7 7 4 7 777 88888888 7 3 2222 00 5 7 7 444444 7 0 0 0 0 2 0 555 0 2222222222222222222222222222222222222222222 0 0 0 0 555 0 99 0000000000 88 22 4 4 4 0000 4 4 1 888 111 9999999 1 9 11 11 77777 11 0 0 888 7 5555555 555 222 7 666 000 8 0 00 0 222 11 4 66666666666666 555 0 0 0 000000000000000 0 99 0 888 99 0 0 000000000 888888 0 0 55555 88888888888888888888888888888888 00 11111111 5 22222222 99 99 0 0 22 2222 0 99 2222 2222 0 222222 0 888 8 99 666 8888 99 11111111111 2 888 99 5 9 11 333 3 11 66 4 4 9999999 888888 111111111 9 4444 11 4 4 4 11 11 4 4 9 000000000 4 4 4 11 4 222222222222222 0 11111111 11 22 9 66 888888888 666 9 11 4 4 11 4 11 4 11 9 0 55 55 66 22 666 1 22 88888 2 1 5555 000 777777 777 777 3 7 33 0000000 000 7 222222 9 77 5555555 7 3 7 7 3 44444444444444 1 7 3 9 7 777777 7777 88888888888888888 2222 5 5 0 666 77 7 3333333 3 0 77 88888 99 5 3 0 8 555555 5 3
consensus : NNGCTTAAAAC-ATAATTGT---T-ACGCAA--TCC----TTTGT-TA----TT-T-C-G----GTT-GTTA----------TAT-A-C-A-T-AAAA---T--CCAT---GTNAATA-TT----AA------AAACAAT---CCAATAAGTTACCT--GTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTAGAAA---T-G--TG-TCCATTA--T------TAAA--C-T-T----AT---T---GGAC-A----G--T-TATT-G---T-CAA------CTTA--TT------GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAACGGATAAAAAG-G-----CA-GA--AGAT-GCGTTT-------T----CACACAACAAGTTTAAGAGATTTTTAATCTTTATAATAAC-ACGAA--TTGTCTAC-AAGTAG--AACATCTGAGACCGC------ACCGAAAATC--TC-A----TTG--GTCGT---TAC----CAC--CAC-ATCACATTATGAAACTTCTCT----TCGATTCAGA----------AA-CG-CATCTC-----C-----ACATA--TG-CT-------C----AATTTTTTTTT--AT-GTT---------TTCCCTA---GCATC-TTCGGATT--CAC-ATTTCATTTTTTTC---ACTT---CCTT-G-AA-T-GATTTCACT-GAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATCTTGGGTTA---TTTTGC--ATGA-AGTTATG-AACGGACTGCTG-ATG----ATCTA-TGTCCAGTTTTTTTCAGTAATGAGTTGTT-CAT-CTA------CT-CCAGC-ATCG-TA-CAGTCTTG-TGGCTGCA-GTGG---CAC-GTA-A----GA---------G---------AA-------------ATG-GC-CTT-TGAA-T---CCTGCCT-GTTCAC--A-------T--AGCT--TGGCGACGGT-TTT-CTGT-AAAA-CATG----AA-C-ACC---AAC--GGG-------TGCATCTG-CATA--CCG-G---A-ATGA--TCCGNANACT-GA-TG-CCA---CTTTT-C-TA-ATACTAGAA---GTTAG---GCTTCAT-A--T-CAGCA---TTCT--CCT-TC-----TC-TAT---ATCAA---GAACA-TCA-C-TG----AG---AA----C-GTTA--T-CG---G--TATT-T-A---------CAC-----TTTC-AC-TCTC-----ATCCCTA-A---ATTTT----G-A-T-TGC--------G-CGAGA-------AAAATG--C-----TCTCTCCATCAGAGG--A--ACT-C-ATGTTT-GTA--TTGA-TTC--AATGG----TGAAA----G-TG---A--A-TGAATA---TTTAA--TGA---TTTCAAG---TTTT--ATAGACC----------TTTA---GA--ACTTACCTG-A--AACTG---TCC-AATA--AGTA-A-AA-CA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-C--C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTGTTGG-GA-TAT-TTA---------A-A-ACA-G--CT-T----TA---C-C---TGGNA--------G--AGG--ACAC-TTATGAA--GACAA---------TGG---AT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--A-TTTTG-AC--TGGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTA---GG-ATA-G----AAGCCT-CAAA--CTG-T--A--C-A-T-T-C-T-----------G--TGA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCC-------TAC-G--GGC-CTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A-CAG-AA--TGT----A--CAG-T-TTTCGGCTTATATCCTTTACNTAAACACCATTGCATTG-AGGGTTGGGTA
Reference ( family-455 ) : NNGCTTAAAAC-ATAATTGT---T-ACGCAA--TCC----TTTGT-TA----TT-T-C-G----GTT-GTTA----------TAT-A-C-A-T-AAAA---T--CCAT---GTNAATA-TT----AA------AAACAAT---CCAATAAGTTACCT--GTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTAGAAA---T-G--TG-TCCATTA--T------TAAA--C-T-T----AT---T---GGAC-A----G--T-TATT-G---T-CAA------CTTA--TT------GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAACGGATAAAAAG-G-----CA-GA--AGAT-GCGTTT-------T----CACACAACAAGTTTAAGAGATTTTTAATCTTTATAATAAC-ACGAA--TTGTCTAC-AAGTAG--AACATCTGAGACCGC------ACCGAAAATC--TC-A----TTG--GTCGT---TAC----CAC--CAC-ATCACATTATGAAACTTCTCT----TCGATTCAGA----------AA-CG-CATCTC-----C-----ACATA--TG-CT-------C----AATTTTTTTTT--AT-GTT---------TTCCCTA---GCATC-TTCGGATT--CAC-ATTTCATTTTTTTC---ACTT---CCTT-G-AA-T-GATTTCACT-GAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATCTTGGGTTA---TTTTGC--ATGA-AGTTATG-AACGGACTGCTG-ATG----ATCTA-TGTCCAGTTTTTTTCAGTAATGAGTTGTT-CAT-CTA------CT-CCAGC-ATCG-TA-CAGTCTTG-TGGCTGCA-GTGG---CAC-GTA-A----GA---------G---------AA-------------ATG-GC-CTT-TGAA-T---CCTGCCT-GTTCAC--A-------T--AGCT--TGGCGACGGT-TTT-CTGT-AAAA-CATG----AA-C-ACC---AAC--GGG-------TGCATCTG-CATA--CCG-G---A-ATGA--TCCGNANACT-GA-TG-CCA---CTTTT-C-TA-ATACTAGAA---GTTAG---GCTTCAT-A--T-CAGCA---TTCT--CCT-TC-----TC-TAT---ATCAA---GAACA-TCA-C-TG----AG---AA----C-GTTA--T-CG---G--TATT-T-A---------CAC-----TTTC-AC-TCTC-----ATCCCTATA---ATTTT----G-A-T-TGC--------G-CGAGA-------AAAATG--C-----TCTCTCCATCAGAGG--A--ACT-C-ATGTTT-GTA--TTGA-TTC--AATGG----TGAAA----G-TG---A--A-TGAATA---TTTAA--TGA---TTTCAAG---TTTT--ATAGACC----------TTTA---GA--ACTTACCTG-A--AACTG---TCC-AATA--AGTA-A-AA-CA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-C--C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTGTTGG-GA-TAT-TTA---------A-A-ACA-G--CT-T----TA---C-C---TGGNA--------G--AGG--ACAC-TTATGAA--GACAA---------TGG---AT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--A-TTTTG-AC--TGGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTA---GG-ATA-G----AAGCCT-CAAA--CTG-T--A--C-A-T-T-C-T-----------G--TGA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCC-------TAC-G--GGC-CTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A-CAG-AA--TGT----A--CAG-T-TTTCGGCTTATATCCTTTACNTAAACACCATTGCATTG-AGGGTTGGGTA
gi|1 : TAAGACCATA--TGT---T-ACGCAACATCCAATCTTTGTATAAATTTT-T-C-GTGTAGTT-GTTAACTCTGTACCTAT-A-C-GCT-AAGACATT--CCATAATGTGAATA-TTTATAAATGAGGCAAAAAATTGCCCAATAA-TTACCTTTGTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTAAAAACAAT-G--TG-TCCATTG--CAGTTTCTACA--C-TAT----AT---TTGAGAACTA----G--T-TATTAG---TACAAAATGACTTTA--TTTATCTGAGACAAGTGCC--AGTGTTGTCAT-ATACAGATAAA--T-GTTTTTCA-TG--AGAT-GCGTTT-------TGTCACACACAACAAGTTTAAGAGATTTTTAATCTTTATAATAACTACGAAATTTGTCTAC-AAGTTATTAACATCAG-GACAGCCAAGCGACCGAAAATC--TC-A----TTG--GTCGT---TAC----CAC---AC-ATCACATTATGAAACTTCTACATAATCGATTCAGA----------AAATG-CATCTT-----CTCCATACATA--TAACT-------CTAAAAATTTTTTTTC--GTTGTT---------TTCCCTA---GCATC-TTTGGGTT--CAC-ATTTCATTTTTT-C---ACTT---CCTTTG-AA-TCGATTTCACT-GAT-TTTTCAC-AAGCTGGGCATCTTGGGTTA---TTTTGC--ATGA-AGTTATG-AACGGACTGCTGTATG----ATCTA--GTCCAG-TTTTTTCAGTAATGAGTTGTT-CAT-CTA------CT-CCAGC-ATCA-TA-CAGTCTTGTTGGC-ACA-GTGGATATAC-GTG-ATAGTGA---------G---------AA-------------ATG-GTACTT-TGTA-TTTCCCTGCCT-GTTCAC--A-------TTAGGCTTCTGGCGACGA--TTT-CTGT-AAAA-CATGTATAGA-C-ACC---AACT-GAGAGAGTTATGCATCTGCCATA--CCG-G---A-ATGA--TCCGTATACT-AA-TG-CTA---CTTTT-C-TA-ATACTAGAAAGTATTAGGTTGCTTCAT-ATCT-CAGCA---TTCT--CCT-TTATTAATCTTATTA-GTCAATGTGAACATTCA-C-TGTGCTAG---AAACTTC-AGTA--T-CGC--G--TATT-T-ATGCGTACAGCAC------TTC-AC-TCTC-----ATCCCTATATATATTCTCTCCG-A-TATGCTGGTAGATG-CAAAA-------AAATTGTCC-----TTTTTCCATCAGAGG--A--ACT-C-ATGTTT-GTATTTTGA-TTC--AATGGTTATTGAAAAGTTG-TGCGTACTA-TGACTA---TTTAAT-TGAT--TTTCAAG---TTTT--ATAGACC-----------TTA---GA--ACTTACCTGTA--AACTACTTTCCTAATA--AGTT-A-AA-CATACACACAAA------GAAGAG-----CGAGCTTCC--C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTGTTGG-GA-TATATTATAATGCCACA-A-ACA-G--CT-TATGATG---C-CTTGTGGCA--------G--AGGATACAC-TTATTGA--GACAA---------TGGCGCAT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--ATTTTTG-AC--TGGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATCG----CATAT-AT-TTAAATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTAG--GG-ATA-G----AAGCCT-CAAACCCTGCT--A--C-ATT-T-C-T-----------GTTTTA-G-AGAAAGTAAT---T------CTC----GTATTCAGGCC-------TACTGACGGC-CTCG-A-TCAGCTTCCCT--TTCT-CTTCCCTCTGA-CAGAAA--TGTTTTGACTCAG-TATGTCGGCT
gi|10 : aTATAAC-ATAATTAT---T-ATGCAA--TCC----TTTGT-TA----TT-T-TTG----GTTTGTTG-----------AT-A-G-A-T-AAAA---T--CCAT---TTAAATAATT----AA------AAACAAT---CCAATAAGTTACCT--GTA--CGCATGTCC--ACAAATTTAGAAA---T-AGTTGTTCCATTAGTT------TAAGATCGT-T----ATCTCT---GAGT-ACCACG--TCTATT-GTGCT-CAA------C-TAGTTT------AGACA-GTGCCTTAG-------GT-AAAGGTATATAAAGTA-----CA-GATTAGAT-GCATTTTAGGTTGT----CTC-CAACAGATT----ACATATTTAATC-TAATATTAGC-ATGAA--TTGTC-AA-AGGTAG--AACATCTTGAACCAC------ACTGAAAATCCGTCTA----TTGGAGTTGT---TACG---CAC--CAC-AT---ACT-TGAA------CT----TCAATTTTGA----------AA-gtgagtatccatggctacagtg
gi|10 : AATTTCTCT----T-GATTCAGA----------GG-CA-CAT-TCATAAACATA--ACATAACTG-CT-------T----AATTTTTTTTTCAAT-AT---------------CA---GCATC--------T--CA----------TTTTTC---ACTT---CCTT-G-AA-T-GATTTCACT-GAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATCTTGGGTTC---TTTTG-----------TATG-AACGGACTGCTG-AAG----ATCTA-TGTCCAGTTTTTTTCAGTAATGAGTTagacaattcgttatgtttatttgaatttctcttgattcagaggcacattcataaacataacataactgcttaatttttttttcaatatcagcatctcatttttcacttccttgaatgatttcactgattttcacaagctgggcatcttgggttcttttgtatgaacggactgctgaagatctatgtccagtttttttcagtaatgagtt
gi|11 : tataacataattattatgcaatcctttgttatttttggtttgttgatagataaaatccatttaaataattaaaaacaatccaataagttacctgtacgcatgtccacaaatttagaaatagttgttccattagtttaagatcgttatctctgagtaccacgtctattgtgctcaactagtttagacagtgccttaggtaaaggtatataaagtacagattagatgcattttaggttgtctccaacagattacatatttaatctaatattagcatgaattgtcaaaggtagaacatcttgaaccacactgaaaatccgtctattggagttgttacgcaccacatacttgaacttcaattttgaaaagacaattcgttatgtttatttg--A--CCT-GGG--CCTGTC-----CA-TT-TT-T--AGAACAAA---A-A------TGC---AAC---GTT-T-T--CA-------GTT---GC-ATA-T----TAACCT-AAAA--TTG-T--C--C-A-T-T-C-T-----------G--TGA-G-AGAAAGAACTAA-TATTAGCCTTACGGG------GTCC-------TAC-G--GGC-CTTG-A-TCGATT---CT--TTCT-CTC-------A-CAA-AA--TGA----A--TAG-T-TTT-------TATCCTGTACTTAAACA----TGCATT
gi|12 : ggtttaATTGTAAAT-GTGTAA--TCA----TTTAT-TA----TTCT-A-A----GCT-TTGA----------TAT-A-----T-AAAA---TAGTC-T---GCCTACA-TT----TA------AAAC-------------GTTACCT--GTA--GG--TATCC-AATACGTTGACAAT---TAA--TG-TCCATTA--T------------C-T-TTCAGAA---T---GGAC-A----GTAT-TATT-G---C-CAA------CATA--TTG-----GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAtaccaatgtcaataggtttcatattacatgtgtttgtaaatctctcaccaatactatttcttactttctttttaacatccaagttgt
gi|13 : ctatatttaaagTTTA-AA--TGGA--T--TTTA--TCT--ATCAACAAAC-----CA-AA-AA-T--AA--CAAA---GGATTGCATAAT---AATTATGTT-A-T--AAAA-----GTA---GG-ATA-G----AAGCCT-CAAA--CTA-T--A--C-A-T-T-C-T-----------G--TAA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCC-------TAC-G--GGC-TTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A-CAG-AA--TGT----A--CCG-T-TTTCGGCTTATATCCTTTACTGAAA-ATAAATGCATTA-AAGttattagatgtttacaggttgcctgaaaacaagagaaaaagatgatgcatttgtttaaacataaacaaattcaattctaaat
gi|14 : atta------GAT---AAT---GTTGT-T--GAT------GCA---TGTAT--T----AAGC-T-CAAA--CTG-C-----C-G-T-T-CCT-----------A--TGA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTT----A------GTCC-------TAT-G--GCA-ATTG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A-T-G-AA--TGG----A--C-G-T-TTGAGGCTTATATCTTTTttaccaagatgcgttgactgcgtgata
gi|15 : ttgcatgactatgaaCTG-A--AACTG---TCC-AATA--AGTT-A-AA-CA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-CG-C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTGTTGG-GT-TAT-TTA---------A-A-ACA-G--CT-T----TA---C-T---TGAAA--------G--AGG--ACAC-TTATGAA--GACAA---------TGG---AT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--A-TTTTA-AC--TAGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-C--AATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-TTGAA---------A---AG-ATA-A----AAatatataaaggttgtgattccaacgatgacattattcaatgatggaccaacagttttgtgtattgcacatgcattgtttgatctgaagagaa
gi|16 : at--T--T--A--TCT-GAT--TCCACC-----CC-AC-AT---------AAA---GAA------AAG---CAT---GTT-T-T--AA-------TTA---AG-AGA-A----AAGCCA-CAAA--CTA-T--C--A-A-C-T-C-T-----------G--TGA-A-AGAAAGAACTAA-----------------------------------------------A-A-TTAGTT---CT--TTTT-CTC-------A-CAG-AA--TGG----A--CAG-C-GTTTGGCCTTTCACTTTTACATA
gi|17 : acAATT---CT--TTCT-CTC-------A-CAG-AA--TGG----G--CAG-A-TTTCGGTCTTTCTCCTGTACATAacaaaa
gi|18 : catcactacatg--T--T--A--TAT-GAT--G-TATC------A-AT-AT-TTGAATACA----------------C---AAT---GCT-T-T--AACTCCATAGCA---AG-GTA-T----TAGCCT-GAAA--CTG-T--C--C-A-T-T-C-T-----------T--TGA-G-AGAAAGAACTAA-T------CTC----G------GCCTG------TA--G--GGC-Ccagctctatcgtatcaagccagctaaagtcaagtacatgtactttttccagtacaacaactctggagtttgaa
gi|19 : tttaattacatgtatttccACAAA---AGA------TGC---ACT---AGT-C-T--AA-------GTA---GG-ATA-T----AAGCAC-AAAA--CTA-TCTATCC-A-T-T-C-T-----------G--TGA-GGAAAAAGAATTAA-T------CAC----A------ACCT-------TAC-G--GAC-CTTG-A-TCAGTT---aa
gi|2 : aacgaaaacaacaTAAGACCATA--TGT---T-ACGCAACATCCAATCTTTGTATAAATTTT-T-C-GTGTAGTT-GTTAACTCTGTACCTAT-A-C-GCT-AAGACATT--CCATAATGTGAATA-TTTATAAATGAGGCAAAAAATTGCCCAATAA-TTACCTTTGTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTAAAAACAAT-G--TG-TCCATTG--CAGTTTCTACA--C-TAT----AT---TTGAGAACTA----G--T-TATTAG---TACAAAATGACTTTA--TTTATCTGAGACAAGTGCC--AGTGTTGTCAT-ATACAGATAAA--T-GTTTTTCA-TG--AGAT-GCGTTT-------TGTCACACACAACAAGTTTAAGAGATTTTTAATCTTTATAATAACTACGAAATTTGTCTAC-AAGTTATTAACATCAG-GACAGCCAAGCGACCGAAAATC--TC-A----TTG--GTCGT---TAC----CAC---AC-ATCACATTATGAAACTTCTACATAATCGATTCAGA----------AAATG-CATCTT-----CTCCATACATA--TAACT-------CTAAAAATTTTTTTTC--GTTGTT---------TTCCCTA---GCATC-TTTGGGTT--CAC-ATTTCATTTTTT-C---ACTT---CCTTTG-AA-TCGATTTCACT-GAT-TTTTCAC-AAGCTGGGCATCTTGGGTTA---TTTTGC--ATGA-AGTTATG-AACGGACTGCTGTATG----ATCTA--GTCCAG-TTTTTTCAGTAATGAGTTGTT-CAT-CTA------CT-CCAGC-ATCA-TA-CAGTCTTGTTGGC-ACA-GTGGATATAC-GTG-ATAGTGA---------G---------AA-------------ATG-GTACTT-TGTA-TTTCCCTGCCT-GTTCAC--A-------TTAGGCTTCTGGCGACGA--TTT-CTGT-AAAA-CATGTATAGA-C-ACC---AACT-GAGAGAGTTATGCATCTGCCATA--CCG-G---A-ATGA--TCCGTATACT-AA-TG-CTA---CTTTT-C-TA-ATACTAGAAAGTATTAGGTTGCTTCAT-ATCT-CAGCA---TTCT--CCT-TTATTAATCTTATTA-GTCAATGTGAACATTCA-C-TGTGCTAG---AAACTTC-AGTA--T-CGC--G--TATT-T-ATGCGTACAGCAC------TTC-AC-TCTC-----ATCCCTATATATATTCTCTCCG-A-TATGCTGGTAGATG-CAAAA-------AAATTGTCC-----TTTTTCCATCAGAGG--A--ACT-C-ATGTTT-GTATTTTGA-TTC--AATGGTTATTGAAAAGTTG-TGCGTACTA-TGACTA---TTTAAT-TGAT--TTTCAAG---TTTT--ATAGACC-----------TTA---GA--ACTTACCTGTA--AACTACTTTCCTAATA--AGTT-A-AA-CATACACACAAA------GAAGAG-----CGAGCTTCC--C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTGTTGG-GA-TATATTATAATGCCACA-A-ACA-G--CT-TATGATG---C-CTTGTGGCA--------G--AGGATACAC-TTATTGA--GACAA---------TGGCGCAT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--ATTTTTG-AC--TGGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATCG----CATAT-AT-TTAAATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTAG--GG-ATA-G----AAGCCT-CAAACCCTGCT--A--C-ATT-T-C-T-----------GTTTTA-G-AGAAAGTAAT---T------CTC----GTATTCAGGCC-------TACTGACGGC-CTCG-A-TCAGCTTCCCT--TTCT-CTTCCCTCTGA-CAGAAA--TGTTTTGACTCAG-TATGTCGGCT
gi|20 : aCTCAAAAC-ATTTTTGT---T-ACGTTA--TCT----TTTGT-TA----TT-T-TAG----GCT-TTTA----------TAT-A-G-A-CGAGAG---T--CCA----GCC-GTA-TT----TA------AAAT-------------GTTACCT--ATA--GG--TGTgtgagtatccatggctacagtg
gi|21 : tgtgaacatttaaatcccGT----A--CAG-T-TTGAGGCTTATATCCTTTACATA
gi|22 : ggcacttgcggccgtataagggaccgccatttttaaaagatcgtatccgacagatatttggcgaagaagcagA---GCATC-TTCTGATT--CAC-ATTTCATTTTT--C---ACGT---CCTT-G-AA-T-GTTTTCACT-GAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATCTTGnc
gi|23 : AAAAAGTTGCCT--GTA--GG--TGTCC-AATAAGTGGACAAT---T-AC-TG-TACATTA--T------T
gi|23 : tgtactt-TCCATTG--T------TATA--A-A-T----AA---T---GTAC-A----G--T-AATT-G---T-CCA------CTTA--TT------GGACA-tataacaatggagagt
gi|25 : tgtacttaaaaagttgcctgtaggTTAAAAC-ATAATTGT---T-ACGCAA--TCC----TTTAT-------TT-T-C-G----GTT-GTTA----------TAT-AGC-A-T-ATAA---T--CCgagt
gi|26 : gggca-A-T-T-C-T-----------G--T-A-G-AGAAAGAACCGA-T------ATC----G------GACTTGCAATGTAC-G--TGC-CTCG-A-CCAGTT---
gi|27 : -A-TCAGTT---CT--TTCT-CGC-------A-CAA-AA--TGG----A--CAGTT-TTTCGACTTTTA--CTTTACATAA
gi|28 : GTTTAAAAC-ATGATTGT---G-ACGTAA--ACC----TT--T-TG----TT-T-G-A----ATT-GTC-----------CAT-A-CTA-T-Aa
gi|29 : ------GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAACATATAAAAAG-A-----CA-GA--AGAT-GCGTTTG------T----CAAACg
gi|3 : TAAAAC-ATAATTGT---TGACGCAA--TCC----TTTGT-TAAT--TT-T-C-G----GTT-GTTA----------TAT-AGC-A-A-TAAA---T--CCAT---GTAAAT--TT----CA------AAACAAT---CCAATAAGTT-CCT--GTAAGCG--TGTCCCAATAAGTTTAGAAAA--T-G--TG-TCCATTA--T------TAA---C-T-T----AT---T---GGAC-A----G--T-TATT-G---C---A------CTTA--TT------G-ACA--TGTC--AG-------GTTAAACG-ATAAAAAG-G-----CAAGA--AGATTGCGTTG-------T----CAC-CAA-AAGT-----AAATTTT-AATCCTAATAACAAC-GCA-----TGTCCACCAAGTA----AC-TCTGAGACCAC------ACCGAAAATC------------GACGTCGTACCCAC----CCC--CACCATCACATTATGAAACTTCTCT----T-GATTCAGA----------A--C--CATCTC-----C-----ACAT---TG-CTTAAAATGC----GATTTTTTTTT--AT-GTT---------TTCC-TA---GCATCCTTTGGACTTCCACCATCTTTCCTTTTTC---ACCTATCCCTT-GCAACT-GATCTACCTCGATCTTT-CCCTCAGCTGGG--TCTTG--CTACATTTCTGCTCGCGAGAGTTATGGAACGGACTGCTG-ATGGAGAATCTAATCTCCAGTTTTTTTCAGTAATGAGTTGTTTCATGCTA------CTTCCAGCCATCG-TA-CAGTTTTG-TGGCTACAAGTGG---CACCGCT-T----GA---------G---------AA-------------ATG-TC-CTT-TGAAAT---CCCGCCT-GTTCACGAA-------T--AGCT--TGGTGACGGGGTTT-CTGT-AAAAACATG----AA-C-ACC---AACTCGGG-------TG-ATCTG-CATA--CCG-A---ATATG---TCCGAAGAAAAGA-TG-TCA---CTTTT---TA-A-ACT-GAA---GTTAGC--GCTTCAT-A--T-CAG-A---TTCT--CCT-TC-----TC-TAT---ATCAA---GA-CA-TCA-CATG----AG---AA----CTGTTA--T-CG---G--TATT-T-A---------CAC-----TTTC-AC-TCTCT----ATTCCT---------------------TGC--------G-TGAGA-------CAAATG--C-----TCTCTCCATCAGAGG--ATCACT-CCATGTTG-GTA--T-GA-TTC--AATGG----TGAAA----G-TG---A--A----ATA---TTTAA---GA---TTTCAAAGT-TTTT--ATAGACC----------TT-A---GA--A-TTACTAA-A--AACTG---TCC-A-TA--AGTA-A-AAACA-------AAA------GA--A------C-AGCTT-C--CCAAA-GAC--GG-TTTGGTT--AT-GTTGG-GAGTAT-TTA---------AGA-ACA-G--CT-T----T----C-C---TGGCA--------AGCAGG--ACCT-TTATGAA--GACAA---------TGG---AT-TAATCA-G-GAA--AC-T-AA--AA-TC--T-TTTTG-ACC-TGGAGGTGAT--A--GTT--AT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATACAA-----GA------GAT---AAT---GTT-T-TA-AA-------GTA---GG-ATA-G----AAG-CT-CAAA--CTG-T--A--C-A-T-T-C-TG----------G--TAA-GAAGAAAGAACTGA-T-------TC----G------G-CC-------TAC-G--GGC-CTCG-ACTCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A-C-G-AA--TGT----A--CAG-T-TTTCGGCTTATATCCT
gi|30 : c--GGC-CTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTT-------A-CAG-AA--AGG----A--CAG-
gi|4 : GCTTAAAAC-ATAATTGT---T-ACGCAA--TCC----TTTGT-TA----TT-T-C-G----GTT-GTTA----------TAT-G-C-A-T-AAAA---T--CCAT---GTAAAT--TT----AA------AAACAAT---CCAATAAGTTACCT--GTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTAGAAA---T-G--TG-TCCATTA--T------TAAA--C-T-T----AT---T---GGAC-A----G--T-TATT-G---T-CAA------CTTA--TT------GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAACGAATAAAAAG-G-----CA-GA--AGAT-GCGTTT-------T----CACACAA-AAG--TAAA----TTTTAATC--TA-AATAAC-ACGAA---TGTC-AC-AAGTAG--AACATCTGAGACCAC------ACCGAAA-----TC-A----TTG--GTCGT---TAC----CAC--CAC-ATCACATTATG-AACTTCTCT----TTGATTCAGA----------AA----CATCTC-----C-----ACAT---TG-CT-------C----AATTTTTTTTT--AT-GTT---------TTCCTTA---GCATC-TTTGGATT--CAC---TTCATTTTTTTC---ACTT---CCTT-G-AA-T-GATTTCACT-GAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATCTT-GGTTA----TTTGC--ATGA-AGTTATG-AACGGACTGCTG-ATG----ATCTA-TGTCCAG-TTTTTTCAGTAATGAGTTGTT-CAT-CTA------C--CCAGC-ATCA-TA-CAGTCTTG-TGGCTACA-GTGG---CAC-GT--A----GA---------G---------AT-------------ATG-GT-CTT-TGAA-T---CCTGCCT-GTTCAC--A-------T--AGCT--TGGCGACGAT-TTT-CTGT-AAAA-CATG----AA-C-ACC---AAC--GGG-------TGCATCTG-CATA--CC--G---A-AT-A--TCCGAAAA---GA-TG-TCA---CTTT----TA-A-ACT-GAA---GTTAG---GCTTCAT-A--T-CAGCA---TTCT--CCT-TT-----TC-TAT---ATCAA---GAACA-TCA-C-TG----AG---AA----C-GTTA--T-CG---G--TATT-T-A---------CAC-----TTTC-AC-TCTC-----ATCCCTA-A---ATTTT----G-A-T-TGT--------G-TGAGG-------AAAATG--C-----TCTCTCCATCAGAGG--A--ACT-C-ATGTTT-GTA---TGA-TTC--AATGG----TGAAA----G-TG---A--A-TGACTA---TTTAA--TGA---TTTCAAG----TTT--ATAGACC----------TTTA---GA--ACTTACCTG-A--AACTG---TCC-AATA--AGTA-A-AA-CA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-C--C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTG-TGG-GA-TAT-TTA---------A-A-ACA-G--CT-T----TA---C-C---TGGCA--------G--AGG--ACAC-TGATGAA--GACAA---------TGG---AT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--A-TTTTG-ACT-TGGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTA---GG--TA-G----AAGCCT-CAAA--CTG-T--A--C-A-T-T-C-T-----------G--TAA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCC-------TAC-G--GGC-CTCG-A-TCAGTTG--CT--TTCT--TC-------A-CA--AA--TGT----A--CAG-T-TGTCGGCTTATATCCTTTACTTAAACACCATTGCATTGCAGGGTTGGGTA
gi|5 : taCTTC-T-A--A-CA--A---TTAT--CTTGTC-----TC-AATGTAATCA----GAACA-TCA-C-TG----AGT--AA----CGGTTA--T-CGTCAGTTTATT-T-A---------CACACTTTTTTC-TCATCTCGTGCAATCACCATA---ATTTT----ACATT-TGC--------G-TGAGACGGTTACAAACTG--CTACCATCTCTCAAGCAGA-G--A--ACTAC-ATGTTTGGTA--TTGAGTTCAGAAT-G----TGAAA----GATGA--A--A-TGAATA---TCTAAATTGA---TTTCAGATGTTTTT--ATAGGACAACGTCTTGATTTATGGGAATATTTACCTG-ATTAACTGGATTCC-GATAGGAGTATA-AC-CA-------AAACATAATGA--AATCAATC-AGCTC-A--C--AAGGACT-GG-ATT--TTCAATTGTAGGTGA-TAT-TTA---------A-AGACATG--TTCT----TACATC-C---TGGAGATCTTTGTG--AGA--CCACTTTAGGAA--GACAAATGCGTTTTTGT---AC-TA--TG-GAAAA--ACAG-AATTAA-TCATA-TTCTA-ACATTGGGACT--T--AGGCCTCGCA--ATTATCATATGCA-ATCAT-G--AATATACATATGTA------TGTATAAAT---GTTGTAT--AA-------GTATAGAG-ATA-AGTATAGGCCTCCAAA--CTG-------C-A-T-TGC-TTACTAGCTCAAG--TAAGG-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------G-CC-------TAC-G--GGCTCTCG-ATTCAGTT---CTTCTTCTGCTC-------ACCAG-AAATTGT----A--CAG-T-TT---GC-TACGTCCTTTACTCA
gi|5 : ctatgatgtaaaaggga-CTGG-AAGA-AAAG----GA-C-ACC---AAC---GG-------T-CATC-G-CATA--CCA-G---A---------TAGACATT-GA-TGACCAATGCTTGTACGTATATATTTGAA---GTT------CTTC------T-CAGtgctggataatggaagtcctttaactaggcaagtataatttaagagtttttacatggcatttgacaacttaaaagcatatgctaggcttatttattctggcataaaatctatgtttgcgctgttttccaaacttttatgctatatttttcaggctcagaacatggcaatgatgaacgcaactatcacctgagaagaacttcaaatatatacgtacaagcattggtcatcaatgtctatctggtatgcgatgaccgttggtgtccttttcttccag
gi|6 : ctatgatgtaaaagggatgagtaaaggacgtagcaaactgtacaatttctggtgagcagaagaagaactgaatcgagagcccgtaggccgagatcagttctttctccttacttgagctagtaagcaatgcagtttggaggcctatacttatctctatacttatacaacatttatacatacatatgtatattcatgattgcatatgataattgcgaggcctaagtcccaatgttagaatatgattaattctgtttttccatagtacaaaaacgcatttgtcttcctaaagtggtctcacaaagatctccaggatgtaagaacatgtctttaaatatcacctacaattgaaaatccagtccttgtgagctgattgatttcattatgttttggttatactcctatcggaatccagttaatcaggtaaatattcccataaatcaagacgttgtcctataaaaacatctgaaatcaatttagatattcatttcatctttcacattctgaactcaataccaaacatgtagttctctgcttgagagatggtagcagtttgtaaccgtctcacgcaaatgtaaaattatggtgattgcacgagatgagaaaaaagtgtgtaaataaactgacgataaccgttactcagtgatgttctgattacattgagacaagataattgttagaagtgctggataatggaagtcctttaactaggcaagtataatttaagagtttttacatggcatttgacaacttaaaagcatatgctaggcttatttattctggcataaaatctatgtttgcgctgttttccaaacttttatgctatatttttcaggctcagaacatggcaatgatgaacgcaactatcacA---GTTAG---GCCTCATTA--TGCAGCAA--TTCT--CCT-GC-----TT-TGTG--ACCAA---GAACA-TCAGC-TG----AGGAGAA----C-GTTA--TCCG---G--TATTGT-A---------CAC-----TTTCGAC-TCTC-----ATCTC---A---AATTT----G-A-T-TGC--------G-TGAG--------GAAATG--CG----TCTCTCCATCAGCGGACA--ACT-C-ATGTT---TA--TGGA-TTC--AATGG----TGAAA----G-TG---A--A-TGAATACAGTTAAA--TGAGC-TTTC-AG---TTTTTAATAGACC----------CTTA---GA--AATTACCTG-A--AACTG---TCC-AATT--AATA-AGAA-CA-------AAA------AG--AA-----C-AGCTT-TCAC--AA-GACTGGG-TTT--TT--ATTATTGA-GG-TAT-TTAT--------A-A-ACA-GTTTT-T----TA---CTT---TGGGA--------G--TGG--ACACTTTAGGAAACGACAA---------TGG---ATGTA--TA-G-GAATCACATAAA--AA-TC--A-TTTTGAAC--TGGA--T--T--A---CT-GAA--ACTATC-----CA-AT-CTAT--AATATAAA----GA------GAT---AGT----TT-T-T--AA-------GTA---GG-ATAGG----AAGCCT-CAAAG-CTG-T--A--CGA-T-T-C-T-----------G--TAA-G-A-AAAGAACTGACT------CTC----G------CCCT-------TAC----GGC-CTCGAA-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------ACCAGCAA--T-T----A--CAG-T-TTTCGGCTTATATCCTT
gi|6 : TAAGGAGAGGTT-CAT-TGAACATGGCT-CCAGCTATCGGTA-CAGTCTTG-GGGCGGCA-CGGG---CAC-GTA-GAT--GA---------ATGGTTTGT-AA-------------ATG-GC-CTTGTGAA-T---CCTGCCTCGTTCAC--A-------TG-AGCT--TGGCG-CGGTGTTC-CTGT-AAAA-CATG----AACC-ACC---AAC--GGG-------T-CATCT--CATACGCCGAG---AGATGA--Tagggcaagtataattcagagttttacgcatgactttgcatttaatgcaggctccgtatatttttcgccaaataactatttctcgttgcacttttgctatatttcaggggccagaaaatgggatgtgcacgctctatacctaccaccgacagagacactcaaatactaagcaacatcatctctcggcgtatgagatgacccgttggtggttcatgttttacaggaacaccgcgccaagctcatgtgaacgaggcaggattcacaaggccatttacaaaccattcatctacgtgcccgtgccgccccaagactgtaccgatagctggagccatgttcaatgaacctctcctta
gi|7 : aaggatataagccgaaaactgtaattgctggtgagagaaagaactgattcgaggccgtaagggcgagagtcagttcttttcttacagaatcgtacagctttgaggcttcctatcctacttaaaaactatctctttatattatagattggatagtttcagtaatccagttcaaaatgatttttatgtgattcctatacatccattgtcgtttcctaaagtgtccactcccaaagtaaaaaactgtttataaatacctcaataataaaaacccagtcttgtgaaagctgttctttttgttcttattaattggacagtttcaggtaatttctaagggtctattaaaaactgaaagctcatttaactgtattcattcactttcaccattgaatccataaacatgagttgtccgctgatggagagacgcatttcctcacgcaatcaaatttgagatgagagtcgaaagtgtacaataccggataacgttctcctcagctgatgttcttggtcacaaagcaggagaattgctgcataatgaggcctaactagggcaagtataattcagagttttacgcatgactttgcatttaatgcaggctccgtatatttttcgccaaataactatttctcgttgcacttttgctatatttcaggggccagaaaatgggatgtgcacgctctatacctaccaccgacagagacactcaaatactaagcaacA---GTTAG---GCTTCAT-A--T-CAGCA---TACA--CCT-TC-----TC-TA----ATCAA---GAACA-TCA-C-TG----AG---AA----C-GTTA--T-CG---G--TATT-T-A---------CAC-----TTTC-AC-TCTC-----GTCCCTAAA---ATTTT----G-A-T-TGC--------G-TTAGA-------AAAATG--C-----TCTCTCCATCAGAGG--A--ACT-C-ATGTTT-GTA---TGA-TTC--AATGA----TGAAA----G-TG---A--A-TGAATA---TTAAA--TGA---TTTCAAT---GTTT--ATAGACC-----------TTA---GA--ACTTACCTG-A--AACTG---TCC-AATA--AGT--A-AA-CA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-CA-C--AA-GAAT-GG-TTT--TT--ATTGTTGA-AG-TAT-TCA---------A-A-ACA-G--CT-T----TA---C-C---TGGGA--------G--AGG--ACAC-TTATGAA--GACAA---------TGG---AT---------------------A--AA-TC--A-TTTTA-AC--TGGC--T--T--A--CCT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTA---GG-ATA-G----AAGCTT-CAAA--CTG-T--A--C-A-T-T-C-T-----------G--TAA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCC-------TAC-G--GGC-CTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A-CAG-AA--TGT----A--CAG-T-TTTCGGCTTATATCCTTTACATA-----CATTG-ATTG-
gi|7 : ggcactttggaggccttagtgatcgttttggtaaagatagtgacaagatggcagaatgtgaagagacaaAATGAGTTGTT-CAT-CTA------CT-CCAGC-ATCG-TA-CAGTCTTG-TGGCTGCA-GTGG---CAC-GTAGA----GA---------ATGGTTTGTAAA-------------ATG-GC-ATT-TGAA-T---CCTGCCT-GTTCAC--A-------T--AGCT--CGGCGACGGT-TTT-CTGT-AAAA-CATG----AA-C-A-C---AAC--GGG-------TGCATCTG-CATA--CCA-G---G-ATGA--Taaggcaagtataatcatgagttttacatgcatttgacatttaatgcaggcttatatttttgcaaacactaattctgttcactttttttatatttcaggccagaaaatggcaattgtgacgcactatactgagacaactcaaatatagtacatcatcatcctggtatgcagatgcacccgttgtgttcatgttttacagaaaaccgtcgccgagctatgtgaacaggcaggattcaaatgccattttacaaaccattctctacgtgccactgcagccacaagactgtacgatgctggagtagatgaacaactcatt
gi|8 : ggcactttggaggccttagtgatcgttttggtaaagatagtgacaagatggcagaatgtgaagagacaacaatcaatgtatgtaaaggatataagccgaaaactgtacattctgtgagagaaagaactgatcgaggcccgtagggccgagatcagttctttctcttacagaatgtacagtttgaagcttctatcctacttaaaacattatctcctttgtattaatattggatagtatcaggtaagccagttaaaatgatttatccattgtcttcataagtgtcctctcccaggtaaagctgttttgaatacttcaacaataaaaaccattcttgtgaagctgtttcttttgtttacttattggacagtttcaggtaagttctaaggtctataaacattgaaatcatttaatattcattcactttcatcattgaatcatacaaacatgagttcctctgatggagagagcatttttctaacgcaatcaaaattttagggacgagagtgaaagtgtaaataccgataacgttctcagtgatgttcttgattagagaaggtgtatgctgatatgaagcctaactaaggcaagtataatcatgagttttacatgcatttgacatttaatgcaggcttatatttttgcaaacactaattctgttcactttttttatatttcaggccagaaaatggcaattgtgacgcactatactgagacaactcaaatatagtacatcA---GTTAG---GCTTCAT-A--T-CAGCA---TCC----CT-GC-----TT-TGT---ATCAAA--GAACA-TCA-C-TG----GA---GA----C-GTTAAAT-CG---G--TATT-TTA---------CAA-----TTTC-AC-TCTC-----ATCCCTA-----ATTTT----G-A-T-TGC--------GGTGAGG-------AAAATG--C-----TTCATCCATCAGCGG--A--ACT-C-ATGTT--GTA--T-GA-TTC--AATGG----T-AAA----G-TG---A--AATGAATA---TTAAAA-TGAATTTTTCAAG---TTTT--ATAGACC----------TT-A---GA--AATTAC-TG-A--AACTG---TCCCAATA--A-TA-A-A--CA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-C--C--A--GACT-GGGTTT--TT--ATTATTGA-GG-TAT-TTA---------A-A--CA-G--TT-T----TAA--C-T---TGGGA--------G--TGG--ACAC-TTAGGAAA-GACAA---------TGG---ATATA--TAAG-GAA--ACAT-AA--AAATC--A-TTTTA-AC--TGGAA-T--T--A--ACT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATATAAT---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTA---GG-ATA-G----AAGCCT-CAAA--CTG-T--A--C-A-TAT-CTT-----------G--TAA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCCT------TAC-G--GG--CTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A--AG-AA--TGT----A--CAG-T-TTTCGGCTTATATCCTT
gi|8 : -ATCG-TAACAGTCT-G-TGGCTGCA-GTGG---CAC-GTA-A----GA---------G---------AATGGTTTGTAGTAAATGTGC-CTT-TGAA-T---CCTGC-T-GTTCAC--ACTCATTAT--AGCT--TGGCGACGGT-TTTCCTGTAAAAA-CATGAC--AA-CAACCAAAAAC---GG-------TGCATCTG-CATA--CCA-GGCAG-ATGATGTTCTGATATT-GAGTG--------TTCT-CGTAGGTAATAG--------AG---GCGTCAC-A--T-TTGCAATTTTCTGGCCT-Taagccaagatataatatgtagtttacatggcatttgacattttaatgcaggcttttatatattttttcgcaaaaactatttctgttcacctttttctatatttcaaggccagaaaattgcaaatgtgacgcctctattacctacgagaacactcaatatcagaacatcatctgcctggtatgcagatgcaccgtttttggttgttgtcatgtttttacaggaaaaccgtcgccaagctataatgagtgtgaacagcaggattcaaaggcacatttactacaaaccattctcttacgtgccactgcagccacagactgttacgat
gi|9 : aaggatataagccgaaaactgtacattcttgagagaaagaactgatcgagcccgtaagggccgagatcagttctttctcttacaagatatgtacagtttgaggcttctatcctacttaaaacattatctccattatattaatattggatagtatcagttaattccagttaaaatgatttttatgtttccttatatatccattgtctttcctaagtgtccactcccaagttaaaactgtttaaatacctcaataataaaaacccagtctggaagctgtttcttttgtttattattgggacagtttcagtaatttctaaggtctataaaacttgaaaaattcattttaatattcatttcactttaccattgaatcatacaacatgagttccgctgatggatgaagcattttcctcaccgcaatcaaaattagggatgagagtgaaattgtaaaataccgatttaacgtctccagtgatgttctttgatacaaagcagggatgctgatatgaagcctaactaagccaagatataatatgtagtttacatggcatttgacattttaatgcaggcttttatatattttttcgcaaaaactatttctgttcacctttttctatatttcCTTAAAAC-ATAATTGT---T-ACGCAA--TCC----TTTGT-TA----TT-TTC-G----GTT-GTTA----------TATGG-C-A-T-AAAA---T--CCAT---GTCAAT--TT----AA------AAACAAT---CCAATAAGCTACCT--GTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTAGAAA---T-G--TG-TCCATTA--T------TAAA--C-T-T----AT---T---GGAC-A----G--T-TATT-G---T-CAA------CTTA--TT------GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAACGGATAAAAAG-A-----CA-GA--AGAT-GCGTTTG------T----CAAACAG-AAG--TAAA----TTGTAA--TTTA-AATAAC-ATGAA---TGTC-AC-AGGTAG--AACATCTGAGACCAC------ACTGAAAATCATTC-ATTATTTG--GTCGT---TACTCGTTACCACAC-ATCACATT-TAGAACTTCAAT----TTGAAAGACA----------AATTGTTATGTT-----C------TATA--TG---------------AATTTCTCTTT--AT--TCAGAGGCACATTCAAAA---ACATC-TCCAAATT------GCTTAATTTTTTTTATGATTT---CCTT-
gi|9 : TATGAA-TTTCTCT----TT-ATTCAGAGGCACATTCAAA-AA-CATCTC-----C-----AAAT---TG-CT-------T----AATTTTTTTT---AT-GAT---------TTCCTTATCAGCATC-TTCTGATT--CAC-ATTTCATTTTTT-C---ACTT---CCTG-G-AA-T-GATTTCACT-AAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATTTTGGGTTC---TTTTG-----------TATG-AATGGACTGCCG-ATG----ATCTA-TGTCCAGTTTT--TCAGTAATGAGTTGTT-CAT-CTA------CT-CCAGC-ATCG-TA-CAGTCTTG-TGGCTGCA-GTGG---CAC-GTAGA----GAATGGTTTGTA---------AA-------------ATG-GC-ATT-TGAA-T---CCTGCCT-GTTCAC--A-------T--AGCT--CGGCGACGGT-TTT-CTGT-AAAA-CATG----AA-C-A-C---AAC--GGG-------TGCATCTG-CATA--CCA-G---G-ATGA--Tatcagcatcttctgattcacatttcattttttcacttcctggaatgatttcactaattttcacaagctgggcattttgggttcttttgtatgaatggactgccgatgatctatgtccagtttttcagtaatgagttgttcatctactccagcatcgtacagtcttgtggctgcagtggcacgtagagaatggtttgtaaaatggcatttgaatcctgcctgttcacatagctcggcgacggttttctgtaaaacatgaacacaacgggtgcatctgcataccaggatgatgatgtacta
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): GATGACATTAGTGATGAAACAGCAGTTTTGTGTATTCATAATATGCATTATTTGATGTGAAGGGA
Alignments
lowQualScore : 11 1111 2222 22222222 3333333333 11111 222 111 11 444444444444 111 11 22222222 333333333333333333333333333333333 111111 1 11111 222222 333333 3333333 3333333 444444444444 1 33333333 1 222 1 222 333333 2222222222 11 111 2222 111 2222 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111 2222222222222 11111 1 1 1 111 22222222 1 1111 11 1 111111 1 1 111 8888888888888888888888888888888888888888888 1 111 2222222222 11 11 2222 111 2222222 11111 111 1111111 222 111 1 111 222 11 111 33333333333333 222 1 222222222222222 111 444444444 111111 11111 55555555555555555555555555555555 1111111 11 11111 11 2222 2222 2222 222222 22 222 1111 2222222222222 222 1 2222222 111111 111111111 1111 444444444 222222222222222 11111111 11 11 111111111 111 11 11 11111 1111 1111111 111 11 1111111 11111111111111 11111111111111111 111 1111111 11111 222222 1
lowQualScore : 8 3 777 4 11 7777 8 2222 4 00000000 4 5555555555 4 66666 000 66 777 1 44 111111111111 3 777 1 22 66 66 5 0 66666666 4 888888888888888888888888888888888 111111 66 5 0 33333 888888 0 66 000000 8 66 2222222 5 6 5 1111111 5 77 5 555555555555 5 5 11111111 9 7 3 999 8 6 222 9 0 888888 7777777777 88 111 0000 555 6 5 0 3 1111 8 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 000 8888888888888 8 888 5 22 66 77 33333 888 0 5 5 1 5 5 1 5 111 22222222 6 3 4444 44 5 5 5 666666 5 0 5 5 0 6 5 777 5 6666666666666666666666666666666666666666666 5 0 5 5 777 5 66 6666666666 33 66 4 4 4 5555 4 4 1 777 666 8888888 1 8 66 77 22222 66 1 1 333 6 6666666 222 444 1 555 000 0 4 11 4 222 66 4 33333333333333 222 0 5 5 555555555555555 5 5 66 5 888 66 5 5 000000000 555555 5 5 77777 11111111111111111111111111111111 77 6666666 6 33 5 22222 33 5 5 55 3333 5 66 1111 1111 5 777777 5 888 0 11 555 5555 66 7777777777777 888 66 4 8 66 333 3 66 99 4 4 8888888 222222 444444444 8 8888 66 4 4 4 66 66 4 4 8 000000000 4 4 4 66 4 777777777777777 1 66666666 66 22 8 00 777777777 555 8 66 4 4 66 4 66 4 66 8 4 33 22 44 44 555 3 44 33333 6 3 3333 555 777777 444 444 5 2 66 5555555 000 2 888888 2 00 0000000 2 5 2 2 5 55555555555555 4 2 5 0 2 777777 5555 66666666666666666 7777 2 2 5 000 33 2 7777777 5 8 33 00000 66 2 5 1 0 111111 2 3
lowQualScore : . . ... . .. .... . .... . ........ . .......... . ..... ... .. ... . .. ............ . ... . .. .. .. . . ........ . ................................. ...... .. . . ..... ...... . .. ...... . .. ....... . . . ....... . .. . ............ . . ........ . . . ... . . ... . . ...... .......... .. ... .... ... . . . . .... . ......................................................... ... ............. . ... . .. .. .. ..... ... . . . . . . . . ... ........ . . .... .. . . . ...... . . . . . . . ... . ........................................... . . . . ... . .. .......... .. .. . . . .... . . . ... ... ....... . . .. .. ..... .. . . ... . ....... ... ... . ... ... . . .. . ... .. . .............. ... . . . ............... . . .. . ... .. . . ......... ...... . . ..... ................................ .. ....... . .. . ..... .. . . .. .... . .. .... .... . ...... . ... . .. ... .... .. ............. ... .. . . .. ... . .. .. . . ....... ...... ......... . .... .. . . . .. .. . . . ......... . . . .. . ............... . ........ .. .. . .. ......... ... . .. . . .. . .. . .. . . .. .. .. .. ... . .. ..... . . .... ... ...... ... ... . . .. ....... ... . ...... . .. ....... . . . . . .............. . . . . . ...... .... ................. .... . . . ... .. . ....... . . .. ..... .. . . . . ...... . .
lowQualScore : 9 4 000 0 00 0000 0 5555 0 44444444 0 0000000000 0 44444 000 11 555 0 44 555555555555 2 555 1 22 11 11 0 2 44444444 4 333333333333333333333333333333333 666666 99 0 0 55555 888888 4 99 000000 9 99 5555555 0 6 0 1111111 7 99 7 333333333333 0 0 88888888 8 3 3 777 0 7 000 8 7 333333 5555555555 33 777 8888 888 7 0 1 2 2222 5 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 111 6666666666666 9 888 0 55 99 00 11111 888 0 7 7 4 7 7 4 7 777 88888888 7 3 2222 00 5 7 7 444444 7 0 0 0 0 2 0 555 0 2222222222222222222222222222222222222222222 0 0 0 0 555 0 99 0000000000 88 22 4 4 4 0000 4 4 1 888 111 9999999 1 9 11 11 77777 11 0 0 888 7 5555555 555 222 7 666 000 8 0 00 0 222 11 4 66666666666666 555 0 0 0 000000000000000 0 0 99 0 888 99 0 0 000000000 888888 0 0 55555 11111111111111111111111111111111 00 2222222 6 88 0 55555 88 0 0 11 2222 0 99 2222 2222 0 222222 0 888 8 99 666 8888 99 4444444444444 888 99 5 9 11 333 3 11 66 4 4 9999999 888888 111111111 9 4444 11 4 4 4 11 11 4 4 9 000000000 4 4 4 11 4 222222222222222 0 11111111 11 22 9 66 888888888 666 9 11 4 4 11 4 11 4 11 9 0 55 55 66 22 666 1 22 88888 2 1 5555 000 777777 777 777 3 7 33 0000000 000 7 222222 9 77 5555555 7 3 7 7 3 44444444444444 1 7 3 9 7 777777 7777 88888888888888888 2222 5 5 0 666 77 7 3333333 3 0 77 88888 99 5 3 0 8 555555 5 3
consensus : NNGCTTAAAAC-ATAATTGT---T-ACGCAA--TCC----TTTGT-TA----TT-T-C-G----GTT-GTTA----------TAT-A-C-A-TAAAA---T--CCAT---GTNAATA-TT----AA------AAACAAT---CCAATAAGTTACCT--GTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTAGAAA---T-G--TG-TCCATTA--T------TAAA--C-T-T----AT---T---GGAC-A----G--T-TATT-G---T-CAA------CTTA--TT------GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAACGGATAAAAAG-G-----CA-GA--AGAT-GCGTTT-------T----CACACAACAAGTTTAAGAGATTTTTAATCTTTATAATAAC-ACGAA--TTGTCTAC-AAGTAG--AACATCTGAGACCGC------ACCGAAAATC--TC-A----TTG--GTCGT---TAC----CAC--CAC-ATCACATTATGAAACTTCTCT----TCGATTCAGA----------AA-CG-CATCTC-----C-----ACATA--TG-CT-------C----AATTTTTTTTT--AT-GTT---------TTCCCTA---GCATC-TTCGGATT--CAC-ATTTCATTTTTTTC---ACTT---CCTT-G-AA-T-GATTTCACT-GAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATCTTGGGTTA---TTTTGC--ATGA-AGTTATG-AACGGACTGCTG-ATG----ATCTA-TGTCCAGTTTTTTTCAGTAATGAGTTGTT-CAT-CTA------CT-CCAGC-ATCG-TA-CAGTCTTG-TGGCTGCA-GTGG---CAC-GTA-A----GA---------G---------AA-------------ATG-GC-CTT-TGAA-T---CCTGCCT-GTTCAC--A-------T--AGCT--TGGCGACGGT-TTT-CTGT-AAAA-CATG----AA-C-ACC---AAC--GGG-------TGCATCTG-CATA--CCG-G---A-ATGA--TCCGNANACT-GA-TG-CCA---CTTTT-C-TA-ATACTAGAA---GTTAG---GCTTCAT-A--T-CAGCA---TTCT--CCT-TC-----TC-TAT---ATCAA---GAACA-TCA-C-TG----AG---AA----C-G-TTA--TC-G---GT--ATT-T-A---------CAC-----TTTC-AC-TCTC-----ATCCCTATA---A-TTTT----G-AT-T-GC--------G-CGAGA-------AAAATG--C-T-----CTCTCCATCAGAGGA--ACT-C-ATGTTT-GTA--TTGA-TTC--AATGG----TGAAA----G-TG---A--A-TGAATA---TTTAA--TGA---TTTCAAG---TTTT--ATAGACC----------TTTA---GA--ACTTACCTG-A--AACTG---TCC-AATA--AGTA-A-AA-CA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-C--C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTGTTGG-GA-TAT-TTA---------A-A-ACA-G--CT-T----TA---C-C---TGGNA--------G--AGG--ACAC-TTATGAA--GACAA---------TGG---AT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--A-TTTTG-AC--TGGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTA---GG-ATA-G----AAGCCT-CAAA--CTG-T--A--C-A-T-T-C-T-----------G--TGA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCC-------TAC-G--GGC-CTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A-CAG-AA--TGT----A--CAG-T-TTTCGGCTTATATCCTTTACNTAAACACCATTGCATTG-AGGGTTGGGTA
Reference ( family-455 ) : NNGCTTAAAAC-ATAATTGT---T-ACGCAA--TCC----TTTGT-TA----TT-T-C-G----GTT-GTTA----------TAT-A-C-A-TAAAA---T--CCAT---GTNAATA-TT----AA------AAACAAT---CCAATAAGTTACCT--GTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTAGAAA---T-G--TG-TCCATTA--T------TAAA--C-T-T----AT---T---GGAC-A----G--T-TATT-G---T-CAA------CTTA--TT------GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAACGGATAAAAAG-G-----CA-GA--AGAT-GCGTTT-------T----CACACAACAAGTTTAAGAGATTTTTAATCTTTATAATAAC-ACGAA--TTGTCTAC-AAGTAG--AACATCTGAGACCGC------ACCGAAAATC--TC-A----TTG--GTCGT---TAC----CAC--CAC-ATCACATTATGAAACTTCTCT----TCGATTCAGA----------AA-CG-CATCTC-----C-----ACATA--TG-CT-------C----AATTTTTTTTT--AT-GTT---------TTCCCTA---GCATC-TTCGGATT--CAC-ATTTCATTTTTTTC---ACTT---CCTT-G-AA-T-GATTTCACT-GAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATCTTGGGTTA---TTTTGC--ATGA-AGTTATG-AACGGACTGCTG-ATG----ATCTA-TGTCCAGTTTTTTTCAGTAATGAGTTGTT-CAT-CTA------CT-CCAGC-ATCG-TA-CAGTCTTG-TGGCTGCA-GTGG---CAC-GTA-A----GA---------G---------AA-------------ATG-GC-CTT-TGAA-T---CCTGCCT-GTTCAC--A-------T--AGCT--TGGCGACGGT-TTT-CTGT-AAAA-CATG----AA-C-ACC---AAC--GGG-------TGCATCTG-CATA--CCG-G---A-ATGA--TCCGNANACT-GA-TG-CCA---CTTTT-C-TA-ATACTAGAA---GTTAG---GCTTCAT-A--T-CAGCA---TTCT--CCT-TC-----TC-TAT---ATCAA---GAACA-TCA-C-TG----AG---AA----C-G-TTA--TC-G---GT--ATT-T-A---------CAC-----TTTC-AC-TCTC-----ATCCCTA-A---A-TTTT----G-AT-T-GC--------G-CGAGA-------AAAATG--C-T-----CTCTCCATCAGAGGA--ACT-C-ATGTTT-GTA--TTGA-TTC--AATGG----TGAAA----G-TG---A--A-TGAATA---TTTAA--TGA---TTTCAAG---TTTT--ATAGACC----------TTTA---GA--ACTTACCTG-A--AACTG---TCC-AATA--AGTA-A-AA-CA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-C--C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTGTTGG-GA-TAT-TTA---------A-A-ACA-G--CT-T----TA---C-C---TGGNA--------G--AGG--ACAC-TTATGAA--GACAA---------TGG---AT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--A-TTTTG-AC--TGGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTA---GG-ATA-G----AAGCCT-CAAA--CTG-T--A--C-A-T-T-C-T-----------G--TGA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCC-------TAC-G--GGC-CTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A-CAG-AA--TGT----A--CAG-T-TTTCGGCTTATATCCTTTACNTAAACACCATTGCATTG-AGGGTTGGGTA
gi|1 : TAAGACCATA--TGT---T-ACGCAACATCCAATCTTTGTATAAATTTT-T-C-GTGTAGTT-GTTAACTCTGTACCTAT-A-C-GCTAAGACATT--CCATAATGTGAATA-TTTATAAATGAGGCAAAAAATTGCCCAATAA-TTACCTTTGTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTAAAAACAAT-G--TG-TCCATTG--CAGTTTCTACA--C-TAT----AT---TTGAGAACTA----G--T-TATTAG---TACAAAATGACTTTA--TTTATCTGAGACAAGTGCC--AGTGTTGTCAT-ATACAGATAAA--T-GTTTTTCA-TG--AGAT-GCGTTT-------TGTCACACACAACAAGTTTAAGAGATTTTTAATCTTTATAATAACTACGAAATTTGTCTAC-AAGTTATTAACATCAG-GACAGCCAAGCGACCGAAAATC--TC-A----TTG--GTCGT---TAC----CAC---AC-ATCACATTATGAAACTTCTACATAATCGATTCAGA----------AAATG-CATCTT-----CTCCATACATA--TAACT-------CTAAAAATTTTTTTTC--GTTGTT---------TTCCCTA---GCATC-TTTGGGTT--CAC-ATTTCATTTTTT-C---ACTT---CCTTTG-AA-TCGATTTCACT-GAT-TTTTCAC-AAGCTGGGCATCTTGGGTTA---TTTTGC--ATGA-AGTTATG-AACGGACTGCTGTATG----ATCTA--GTCCAG-TTTTTTCAGTAATGAGTTGTT-CAT-CTA------CT-CCAGC-ATCA-TA-CAGTCTTGTTGGC-ACA-GTGGATATAC-GTG-ATAGTGA---------G---------AA-------------ATG-GTACTT-TGTA-TTTCCCTGCCT-GTTCAC--A-------TTAGGCTTCTGGCGACGA--TTT-CTGT-AAAA-CATGTATAGA-C-ACC---AACT-GAGAGAGTTATGCATCTGCCATA--CCG-G---A-ATGA--TCCGTATACT-AA-TG-CTA---CTTTT-C-TA-ATACTAGAAAGTATTAGGTTGCTTCAT-ATCT-CAGCA---TTCT--CCT-TTATTAATCTTATTA-GTCAATGTGAACATTCA-C-TGTGCTAG---AAACTTC-A-GTA--TC-GC--GT--ATT-T-ATGCGTACAGCAC------TTC-AC-TCTC-----ATCCCTATATATA-TTCTCTCCG-ATAT-GCTGGTAGATG-CAAAA-------AAATTGTCC-T-----TTTTCCATCAGAGGA--ACT-C-ATGTTT-GTATTTTGA-TTC--AATGGTTATTGAAAAGTTG-TGCGTACTA-TGACTA---TTTAAT-TGAT--TTTCAAG---TTTT--ATAGACC-----------TTA---GA--ACTTACCTGTA--AACTACTTTCCTAATA--AGTT-A-AA-CATACACACAAA------GAAGAG-----CGAGCTTCC--C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTGTTGG-GA-TATATTATAATGCCACA-A-ACA-G--CT-TATGATG---C-CTTGTGGCA--------G--AGGATACAC-TTATTGA--GACAA---------TGGCGCAT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--ATTTTTG-AC--TGGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATCG----CATAT-AT-TTAAATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTAG--GG-ATA-G----AAGCCT-CAAACCCTGCT--A--C-ATT-T-C-T-----------GTTTTA-G-AGAAAGTAAT---T------CTC----GTATTCAGGCC-------TACTGACGGC-CTCG-A-TCAGCTTCCCT--TTCT-CTTCCCTCTGA-CAGAAA--TGTTTTGACTCAG-TATGTCGGCT
gi|10 : aTATAAC-ATAATTAT---T-ATGCAA--TCC----TTTGT-TA----TT-T-TTG----GTTTGTTG-----------AT-A-G-A-TAAAA---T--CCAT---TTAAATAATT----AA------AAACAAT---CCAATAAGTTACCT--GTA--CGCATGTCC--ACAAATTTAGAAA---T-AGTTGTTCCATTAGTT------TAAGATCGT-T----ATCTCT---GAGT-ACCACG--TCTATT-GTGCT-CAA------C-TAGTTT------AGACA-GTGCCTTAG-------GT-AAAGGTATATAAAGTA-----CA-GATTAGAT-GCATTTTAGGTTGT----CTC-CAACAGATT----ACATATTTAATC-TAATATTAGC-ATGAA--TTGTC-AA-AGGTAG--AACATCTTGAACCAC------ACTGAAAATCCGTCTA----TTGGAGTTGT---TACG---CAC--CAC-AT---ACT-TGAA------CT----TCAATTTTGA----------AA-gtgagtatccatggctacagtg
gi|10 : AATTTCTCT----T-GATTCAGA----------GG-CA-CAT-TCATAAACATA--ACATAACTG-CT-------T----AATTTTTTTTTCAAT-AT---------------CA---GCATC--------T--CA----------TTTTTC---ACTT---CCTT-G-AA-T-GATTTCACT-GAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATCTTGGGTTC---TTTTG-----------TATG-AACGGACTGCTG-AAG----ATCTA-TGTCCAGTTTTTTTCAGTAATGAGTTagacaattcgttatgtttatttgaatttctcttgattcagaggcacattcataaacataacataactgcttaatttttttttcaatatcagcatctcatttttcacttccttgaatgatttcactgattttcacaagctgggcatcttgggttcttttgtatgaacggactgctgaagatctatgtccagtttttttcagtaatgagtt
gi|11 : tataacataattattatgcaatcctttgttatttttggtttgttgatagataaaatccatttaaataattaaaaacaatccaataagttacctgtacgcatgtccacaaatttagaaatagttgttccattagtttaagatcgttatctctgagtaccacgtctattgtgctcaactagtttagacagtgccttaggtaaaggtatataaagtacagattagatgcattttaggttgtctccaacagattacatatttaatctaatattagcatgaattgtcaaaggtagaacatcttgaaccacactgaaaatccgtctattggagttgttacgcaccacatacttgaacttcaattttgaaaagacaattcgttatgtttatttg--A--CCT-GGG--CCTGTC-----CA-TT-TT-T--AGAACAAA---A-A------TGC---AAC---GTT-T-T--CA-------GTT---GC-ATA-T----TAACCT-AAAA--TTG-T--C--C-A-T-T-C-T-----------G--TGA-G-AGAAAGAACTAA-TATTAGCCTTACGGG------GTCC-------TAC-G--GGC-CTTG-A-TCGATT---CT--TTCT-CTC-------A-CAA-AA--TGA----A--TAG-T-TTT-------TATCCTGTACTTAAACA----TGCATT
gi|12 : ggtttaATTGTAAAT-GTGTAA--TCA----TTTAT-TA----TTCT-A-A----GCT-TTGA----------TAT-A-----TAAAA---TAGTC-T---GCCTACA-TT----TA------AAAC-------------GTTACCT--GTA--GG--TATCC-AATACGTTGACAAT---TAA--TG-TCCATTA--T------------C-T-TTCAGAA---T---GGAC-A----GTAT-TATT-G---C-CAA------CATA--TTG-----GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAtaccaatgtcaataggtttcatattacatgtgtttgtaaatctctcaccaatactatttcttactttctttttaacatccaagttgt
gi|13 : ctatatttaaagTTTA-AA--TGGA--T--TTTA--TCT--ATCAACAAAC-----CA-AA-AA-T--AA--CAAA---GGATTGCATAAT---AATTATGTT-A-T--AAAA-----GTA---GG-ATA-G----AAGCCT-CAAA--CTA-T--A--C-A-T-T-C-T-----------G--TAA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCC-------TAC-G--GGC-TTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A-CAG-AA--TGT----A--CCG-T-TTTCGGCTTATATCCTTTACTGAAA-ATAAATGCATTA-AAGttattagatgtttacaggttgcctgaaaacaagagaaaaagatgatgcatttgtttaaacataaacaaattcaattctaaat
gi|14 : atta------GAT---AAT---GTTGT-T--GAT------GCA---TGTAT--T----AAGC-T-CAAA--CTG-C-----C-G-T-T-CCT-----------A--TGA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTT----A------GTCC-------TAT-G--GCA-ATTG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A-T-G-AA--TGG----A--C-G-T-TTGAGGCTTATATCTTTTttaccaagatgcgttgactgcgtgata
gi|15 : ttgcatgactatgaaCTG-A--AACTG---TCC-AATA--AGTT-A-AA-CA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-CG-C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTGTTGG-GT-TAT-TTA---------A-A-ACA-G--CT-T----TA---C-T---TGAAA--------G--AGG--ACAC-TTATGAA--GACAA---------TGG---AT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--A-TTTTA-AC--TAGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-C--AATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-TTGAA---------A---AG-ATA-A----AAatatataaaggttgtgattccaacgatgacattattcaatgatggaccaacagttttgtgtattgcacatgcattgtttgatctgaagagaa
gi|16 : at--T--T--A--TCT-GAT--TCCACC-----CC-AC-AT---------AAA---GAA------AAG---CAT---GTT-T-T--AA-------TTA---AG-AGA-A----AAGCCA-CAAA--CTA-T--C--A-A-C-T-C-T-----------G--TGA-A-AGAAAGAACTAA-----------------------------------------------A-A-TTAGTT---CT--TTTT-CTC-------A-CAG-AA--TGG----A--CAG-C-GTTTGGCCTTTCACTTTTACATA
gi|17 : acAATT---CT--TTCT-CTC-------A-CAG-AA--TGG----G--CAG-A-TTTCGGTCTTTCTCCTGTACATAacaaaa
gi|18 : catcactacatg--T--T--A--TAT-GAT--G-TATC------A-AT-AT-TTGAATACA----------------C---AAT---GCT-T-T--AACTCCATAGCA---AG-GTA-T----TAGCCT-GAAA--CTG-T--C--C-A-T-T-C-T-----------T--TGA-G-AGAAAGAACTAA-T------CTC----G------GCCTG------TA--G--GGC-Ccagctctatcgtatcaagccagctaaagtcaagtacatgtactttttccagtacaacaactctggagtttgaa
gi|19 : tttaattacatgtatttccACAAA---AGA------TGC---ACT---AGT-C-T--AA-------GTA---GG-ATA-T----AAGCAC-AAAA--CTA-TCTATCC-A-T-T-C-T-----------G--TGA-GGAAAAAGAATTAA-T------CAC----A------ACCT-------TAC-G--GAC-CTTG-A-TCAGTT---aa
gi|2 : aacgaaaacaacaTAAGACCATA--TGT---T-ACGCAACATCCAATCTTTGTATAAATTTT-T-C-GTGTAGTT-GTTAACTCTGTACCTAT-A-C-GCTAAGACATT--CCATAATGTGAATA-TTTATAAATGAGGCAAAAAATTGCCCAATAA-TTACCTTTGTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTAAAAACAAT-G--TG-TCCATTG--CAGTTTCTACA--C-TAT----AT---TTGAGAACTA----G--T-TATTAG---TACAAAATGACTTTA--TTTATCTGAGACAAGTGCC--AGTGTTGTCAT-ATACAGATAAA--T-GTTTTTCA-TG--AGAT-GCGTTT-------TGTCACACACAACAAGTTTAAGAGATTTTTAATCTTTATAATAACTACGAAATTTGTCTAC-AAGTTATTAACATCAG-GACAGCCAAGCGACCGAAAATC--TC-A----TTG--GTCGT---TAC----CAC---AC-ATCACATTATGAAACTTCTACATAATCGATTCAGA----------AAATG-CATCTT-----CTCCATACATA--TAACT-------CTAAAAATTTTTTTTC--GTTGTT---------TTCCCTA---GCATC-TTTGGGTT--CAC-ATTTCATTTTTT-C---ACTT---CCTTTG-AA-TCGATTTCACT-GAT-TTTTCAC-AAGCTGGGCATCTTGGGTTA---TTTTGC--ATGA-AGTTATG-AACGGACTGCTGTATG----ATCTA--GTCCAG-TTTTTTCAGTAATGAGTTGTT-CAT-CTA------CT-CCAGC-ATCA-TA-CAGTCTTGTTGGC-ACA-GTGGATATAC-GTG-ATAGTGA---------G---------AA-------------ATG-GTACTT-TGTA-TTTCCCTGCCT-GTTCAC--A-------TTAGGCTTCTGGCGACGA--TTT-CTGT-AAAA-CATGTATAGA-C-ACC---AACT-GAGAGAGTTATGCATCTGCCATA--CCG-G---A-ATGA--TCCGTATACT-AA-TG-CTA---CTTTT-C-TA-ATACTAGAAAGTATTAGGTTGCTTCAT-ATCT-CAGCA---TTCT--CCT-TTATTAATCTTATTA-GTCAATGTGAACATTCA-C-TGTGCTAG---AAACTTC-A-GTA--TC-GC--GT--ATT-T-ATGCGTACAGCAC------TTC-AC-TCTC-----ATCCCTATATATA-TTCTCTCCG-ATAT-GCTGGTAGATG-CAAAA-------AAATTGTCC-T-----TTTTCCATCAGAGGA--ACT-C-ATGTTT-GTATTTTGA-TTC--AATGGTTATTGAAAAGTTG-TGCGTACTA-TGACTA---TTTAAT-TGAT--TTTCAAG---TTTT--ATAGACC-----------TTA---GA--ACTTACCTGTA--AACTACTTTCCTAATA--AGTT-A-AA-CATACACACAAA------GAAGAG-----CGAGCTTCC--C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTGTTGG-GA-TATATTATAATGCCACA-A-ACA-G--CT-TATGATG---C-CTTGTGGCA--------G--AGGATACAC-TTATTGA--GACAA---------TGGCGCAT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--ATTTTTG-AC--TGGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATCG----CATAT-AT-TTAAATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTAG--GG-ATA-G----AAGCCT-CAAACCCTGCT--A--C-ATT-T-C-T-----------GTTTTA-G-AGAAAGTAAT---T------CTC----GTATTCAGGCC-------TACTGACGGC-CTCG-A-TCAGCTTCCCT--TTCT-CTTCCCTCTGA-CAGAAA--TGTTTTGACTCAG-TATGTCGGCT
gi|20 : aCTCAAAAC-ATTTTTGT---T-ACGTTA--TCT----TTTGT-TA----TT-T-TAG----GCT-TTTA----------TAT-A-G-A-CGAGAG--T--CCA----GCCG-TA-TT----TA------AAAT-------------GTTACCT--ATA--GG--TGTgtgagtatccatggctacagtg
gi|21 : tgtgaacatttaaatcccGT----A--CAG-T-TTGAGGCTTATATCCTTTACATA
gi|22 : ggcacttgcggccgtataagggaccgccatttttaaaagatcgtatccgacagatatttggcgaagaagcagA---GCATC-TTCTGATT--CAC-ATTTCATTTTT--C---ACGT---CCTT-G-AA-T-GTTTTCACT-GAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATCTTGnc
gi|23 : AAAAAGTTGCCT--GTA--GG--TGTCC-AATAAGTGGACAAT---T-AC-TG-TACATTA--T------T
gi|23 : tgtactt-TCCATTG--T------TATA--A-A-T----AA---T---GTAC-A----G--T-AATT-G---T-CCA------CTTA--TT------GGACA-tataacaatggagagt
gi|25 : tgtacttaaaaagttgcctgtaggTTAAAAC-ATAATTGT---T-ACGCAA--TCC----TTTAT-------TT-T-C-G----GTT-GTTA----------TAT-AGC-A-TATAA---T--CCgagt
gi|26 : gggca-A-T-T-C-T-----------G--T-A-G-AGAAAGAACCGA-T------ATC----G------GACTTGCAATGTAC-G--TGC-CTCG-A-CCAGTT---
gi|27 : -A-TCAGTT---CT--TTCT-CGC-------A-CAA-AA--TGG----A--CAGTT-TTTCGACTTTTA--CTTTACATAA
gi|28 : GTTTAAAAC-ATGATTGT---G-ACGTAA--ACC----TT--T-TG----TT-T-G-A----ATT-GTC-----------CAT-A-CTA-TAa
gi|29 : ------GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAACATATAAAAAG-A-----CA-GA--AGAT-GCGTTTG------T----CAAACg
gi|3 : TAAAAC-ATAATTGT---TGACGCAA--TCC----TTTGT-TAAT--TT-T-C-G----GTT-GTTA----------TAT-AGC-A-ATAAA---T--CCAT---GTAAAT--TT----CA------AAACAAT---CCAATAAGTT-CCT--GTAAGCG--TGTCCCAATAAGTTTAGAAAA--T-G--TG-TCCATTA--T------TAA---C-T-T----AT---T---GGAC-A----G--T-TATT-G---C---A------CTTA--TT------G-ACA--TGTC--AG-------GTTAAACG-ATAAAAAG-G-----CAAGA--AGATTGCGTTG-------T----CAC-CAA-AAGT-----AAATTTT-AATCCTAATAACAAC-GCA-----TGTCCACCAAGTA----AC-TCTGAGACCAC------ACCGAAAATC------------GACGTCGTACCCAC----CCC--CACCATCACATTATGAAACTTCTCT----T-GATTCAGA----------A--C--CATCTC-----C-----ACAT---TG-CTTAAAATGC----GATTTTTTTTT--AT-GTT---------TTCC-TA---GCATCCTTTGGACTTCCACCATCTTTCCTTTTTC---ACCTATCCCTT-GCAACT-GATCTACCTCGATCTTT-CCCTCAGCTGGG--TCTTG--CTACATTTCTGCTCGCGAGAGTTATGGAACGGACTGCTG-ATGGAGAATCTAATCTCCAGTTTTTTTCAGTAATGAGTTGTTTCATGCTA------CTTCCAGCCATCG-TA-CAGTTTTG-TGGCTACAAGTGG---CACCGCT-T----GA---------G---------AA-------------ATG-TC-CTT-TGAAAT---CCCGCCT-GTTCACGAA-------T--AGCT--TGGTGACGGGGTTT-CTGT-AAAAACATG----AA-C-ACC---AACTCGGG-------TG-ATCTG-CATA--CCG-A---ATATG---TCCGAAGAAAAGA-TG-TCA---CTTTT---TA-A-ACT-GAA---GTTAGC--GCTTCAT-A--T-CAG-A---TTCT--CCT-TC-----TC-TAT---ATCAA---GA-CA-TCA-CATG----AG---AA----CTG-TTA--TC-G---GT--ATT-T-A---------CAC-----TTTC-AC-TCTCT----ATTCCT---------------------T-GC--------G-TGAGA-------CAAATG--C-T-----CTCTCCATCAGAGGATCACT-CCATGTTG-GTA--T-GA-TTC--AATGG----TGAAA----G-TG---A--A----ATA---TTTAA---GA---TTTCAAAGT-TTTT--ATAGACC----------TT-A---GA--A-TTACTAA-A--AACTG---TCC-A-TA--AGTA-A-AAACA-------AAA------GA--A------C-AGCTT-C--CCAAA-GAC--GG-TTTGGTT--AT-GTTGG-GAGTAT-TTA---------AGA-ACA-G--CT-T----T----C-C---TGGCA--------AGCAGG--ACCT-TTATGAA--GACAA---------TGG---AT-TAATCA-G-GAA--AC-T-AA--AA-TC--T-TTTTG-ACC-TGGAGGTGAT--A--GTT--AT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATACAA-----GA------GAT---AAT---GTT-T-TA-AA-------GTA---GG-ATA-G----AAG-CT-CAAA--CTG-T--A--C-A-T-T-C-TG----------G--TAA-GAAGAAAGAACTGA-T-------TC----G------G-CC-------TAC-G--GGC-CTCG-ACTCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A-C-G-AA--TGT----A--CAG-T-TTTCGGCTTATATCCT
gi|30 : c--GGC-CTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTT-------A-CAG-AA--AGG----A--CAG-
gi|4 : GCTTAAAAC-ATAATTGT---T-ACGCAA--TCC----TTTGT-TA----TT-T-C-G----GTT-GTTA----------TAT-G-C-A-TAAAA---T--CCAT---GTAAAT--TT----AA------AAACAAT---CCAATAAGTTACCT--GTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTAGAAA---T-G--TG-TCCATTA--T------TAAA--C-T-T----AT---T---GGAC-A----G--T-TATT-G---T-CAA------CTTA--TT------GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAACGAATAAAAAG-G-----CA-GA--AGAT-GCGTTT-------T----CACACAA-AAG--TAAA----TTTTAATC--TA-AATAAC-ACGAA---TGTC-AC-AAGTAG--AACATCTGAGACCAC------ACCGAAA-----TC-A----TTG--GTCGT---TAC----CAC--CAC-ATCACATTATG-AACTTCTCT----TTGATTCAGA----------AA----CATCTC-----C-----ACAT---TG-CT-------C----AATTTTTTTTT--AT-GTT---------TTCCTTA---GCATC-TTTGGATT--CAC---TTCATTTTTTTC---ACTT---CCTT-G-AA-T-GATTTCACT-GAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATCTT-GGTTA----TTTGC--ATGA-AGTTATG-AACGGACTGCTG-ATG----ATCTA-TGTCCAG-TTTTTTCAGTAATGAGTTGTT-CAT-CTA------C--CCAGC-ATCA-TA-CAGTCTTG-TGGCTACA-GTGG---CAC-GT--A----GA---------G---------AT-------------ATG-GT-CTT-TGAA-T---CCTGCCT-GTTCAC--A-------T--AGCT--TGGCGACGAT-TTT-CTGT-AAAA-CATG----AA-C-ACC---AAC--GGG-------TGCATCTG-CATA--CC--G---A-AT-A--TCCGAAAA---GA-TG-TCA---CTTT----TA-A-ACT-GAA---GTTAG---GCTTCAT-A--T-CAGCA---TTCT--CCT-TT-----TC-TAT---ATCAA---GAACA-TCA-C-TG----AG---AA----C-G-TTA--TC-G---GT--ATT-T-A---------CAC-----TTTC-AC-TCTC-----ATCCCTA-A---A-TTTT----G-AT-T-GT--------G-TGAGG-------AAAATG--C-T-----CTCTCCATCAGAGGA--ACT-C-ATGTTT-GTA---TGA-TTC--AATGG----TGAAA----G-TG---A--A-TGACTA---TTTAA--TGA---TTTCAAG----TTT--ATAGACC----------TTTA---GA--ACTTACCTG-A--AACTG---TCC-AATA--AGTA-A-AA-CA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-C--C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTG-TGG-GA-TAT-TTA---------A-A-ACA-G--CT-T----TA---C-C---TGGCA--------G--AGG--ACAC-TGATGAA--GACAA---------TGG---AT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--A-TTTTG-ACT-TGGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTA---GG--TA-G----AAGCCT-CAAA--CTG-T--A--C-A-T-T-C-T-----------G--TAA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCC-------TAC-G--GGC-CTCG-A-TCAGTTG--CT--TTCT--TC-------A-CA--AA--TGT----A--CAG-T-TGTCGGCTTATATCCTTTACTTAAACACCATTGCATTGCAGGGTTGGGTA
gi|5 : taCTTC-T-A--A-CA--A---TTAT--CTTGTC-----TC-AATGTAATCA----GAACA-TCA-C-TG----AGT--AA----C-GGTTA--TC-GTCAGTTTATT-T-A---------CACACTTTTTTC-TCATCTCGTGCAATCACCATA---A-TTTT----ACAT-TTGC--------G-TGAGACGGTTACAAACTG--C-TACCATCTCTCAAGCAGAG-A--ACTAC-ATGTTTGGTA--TTGAGTTCAGAAT-G----TGAAA----GATGA--A--A-TGAATA---TCTAAATTGA---TTTCAGATGTTTTT--ATAGGACAACGTCTTGATTTATGGGAATATTTACCTG-ATTAACTGGATTCC-GATAGGAGTATA-AC-CA-------AAACATAATGA--AATCAATC-AGCTC-A--C--AAGGACT-GG-ATT--TTCAATTGTAGGTGA-TAT-TTA---------A-AGACATG--TTCT----TACATC-C---TGGAGATCTTTGTG--AGA--CCACTTTAGGAA--GACAAATGCGTTTTTGT---AC-TA--TG-GAAAA--ACAG-AATTAA-TCATA-TTCTA-ACATTGGGACT--T--AGGCCTCGCA--ATTATCATATGCA-ATCAT-G--AATATACATATGTA------TGTATAAAT---GTTGTAT--AA-------GTATAGAG-ATA-AGTATAGGCCTCCAAA--CTG-------C-A-T-TGC-TTACTAGCTCAAG--TAAGG-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------G-CC-------TAC-G--GGCTCTCG-ATTCAGTT---CTTCTTCTGCTC-------ACCAG-AAATTGT----A--CAG-T-TT---GC-TACGTCCTTTACTCA
gi|5 : ctatgatgtaaaaggga-CTGG-AAGA-AAAG----GA-C-ACC---AAC---GG-------T-CATC-G-CATA--CCA-G---A---------TAGACATT-GA-TGACCAATGCTTGTACGTATATATTTGAA---GTT------CTTC------T-CAGtgctggataatggaagtcctttaactaggcaagtataatttaagagtttttacatggcatttgacaacttaaaagcatatgctaggcttatttattctggcataaaatctatgtttgcgctgttttccaaacttttatgctatatttttcaggctcagaacatggcaatgatgaacgcaactatcacctgagaagaacttcaaatatatacgtacaagcattggtcatcaatgtctatctggtatgcgatgaccgttggtgtccttttcttccag
gi|6 : ctatgatgtaaaagggatgagtaaaggacgtagcaaactgtacaatttctggtgagcagaagaagaactgaatcgagagcccgtaggccgagatcagttctttctccttacttgagctagtaagcaatgcagtttggaggcctatacttatctctatacttatacaacatttatacatacatatgtatattcatgattgcatatgataattgcgaggcctaagtcccaatgttagaatatgattaattctgtttttccatagtacaaaaacgcatttgtcttcctaaagtggtctcacaaagatctccaggatgtaagaacatgtctttaaatatcacctacaattgaaaatccagtccttgtgagctgattgatttcattatgttttggttatactcctatcggaatccagttaatcaggtaaatattcccataaatcaagacgttgtcctataaaaacatctgaaatcaatttagatattcatttcatctttcacattctgaactcaataccaaacatgtagttctctgcttgagagatggtagcagtttgtaaccgtctcacgcaaatgtaaaattatggtgattgcacgagatgagaaaaaagtgtgtaaataaactgacgataaccgttactcagtgatgttctgattacattgagacaagataattgttagaagtgctggataatggaagtcctttaactaggcaagtataatttaagagtttttacatggcatttgacaacttaaaagcatatgctaggcttatttattctggcataaaatctatgtttgcgctgttttccaaacttttatgctatatttttcaggctcagaacatggcaatgatgaacgcaactatcacA---GTTAG---GCCTCATTA--TGCAGCAA--TTCT--CCT-GC-----TT-TGTG--ACCAA---GAACA-TCAGC-TG----AGGAGAA----C-G-TTA--TCCG---GT--ATTGT-A---------CAC-----TTTCGAC-TCTC-----ATCTC-A-A---A-TTT-----G-AT-T-GC--------G-TGAGG-------AAA-TG--CGT-----CTCTCCATCAGCGGACAACT-C-ATGTTT---A--TGGA-TTC--AATGG----TGAAA----G-TG---A--A-TGAATACAGTTAAA--TGAGC-TTTC-AG---TTTTTAATAGACC----------CTTA---GA--AATTACCTG-A--AACTG---TCC-AATT--AATA-AGAA-CA-------AAA------AG--AA-----C-AGCTT-TCAC--AA-GACTGGG-TTT--TT--ATTATTGA-GG-TAT-TTAT--------A-A-ACA-GTTTT-T----TA---CTT---TGGGA--------G--TGG--ACACTTTAGGAAACGACAA---------TGG---ATGTA--TA-G-GAATCACATAAA--AA-TC--A-TTTTGAAC--TGGA--T--T--A---CT-GAA--ACTATC-----CA-AT-CTAT--AATATAAA----GA------GAT---AGT----TT-T-T--AA-------GTA---GG-ATAGG----AAGCCT-CAAAG-CTG-T--A--CGA-T-T-C-T-----------G--TAA-G-A-AAAGAACTGACT------CTC----G------CCCT-------TAC----GGC-CTCGAA-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------ACCAGCAA--T-T----A--CAG-T-TTTCGGCTTATATCCTT
gi|6 : TAAGGAGAGGTT-CAT-TGAACATGGCT-CCAGCTATCGGTA-CAGTCTTG-GGGCGGCA-CGGG---CAC-GTA-GAT--GA---------ATGGTTTGT-AA-------------ATG-GC-CTTGTGAA-T---CCTGCCTCGTTCAC--A-------TG-AGCT--TGGCG-CGGTGTTC-CTGT-AAAA-CATG----AACC-ACC---AAC--GGG-------T-CATCT--CATACGCCGAG---AGATGA--Tagggcaagtataattcagagttttacgcatgactttgcatttaatgcaggctccgtatatttttcgccaaataactatttctcgttgcacttttgctatatttcaggggccagaaaatgggatgtgcacgctctatacctaccaccgacagagacactcaaatactaagcaacatcatctctcggcgtatgagatgacccgttggtggttcatgttttacaggaacaccgcgccaagctcatgtgaacgaggcaggattcacaaggccatttacaaaccattcatctacgtgcccgtgccgccccaagactgtaccgatagctggagccatgttcaatgaacctctcctta
gi|7 : aaggatataagccgaaaactgtaattgctggtgagagaaagaactgattcgaggccgtaagggcgagagtcagttcttttcttacagaatcgtacagctttgaggcttcctatcctacttaaaaactatctctttatattatagattggatagtttcagtaatccagttcaaaatgatttttatgtgattcctatacatccattgtcgtttcctaaagtgtccactcccaaagtaaaaaactgtttataaatacctcaataataaaaacccagtcttgtgaaagctgttctttttgttcttattaattggacagtttcaggtaatttctaagggtctattaaaaactgaaagctcatttaactgtattcattcactttcaccattgaatccataaacatgagttgtccgctgatggagagacgcatttcctcacgcaatcaaatttgagatgagagtcgaaagtgtacaataccggataacgttctcctcagctgatgttcttggtcacaaagcaggagaattgctgcataatgaggcctaactagggcaagtataattcagagttttacgcatgactttgcatttaatgcaggctccgtatatttttcgccaaataactatttctcgttgcacttttgctatatttcaggggccagaaaatgggatgtgcacgctctatacctaccaccgacagagacactcaaatactaagcaacA---GTTAG---GCTTCAT-A--T-CAGCA---TACA--CCT-TC-----TC-TA----ATCAA---GAACA-TCA-C-TG----AG---AA----C-G-TTA--TC-G---GT--ATT-T-A---------CAC-----TTTC-AC-TCTC-----GTCCCTA-A---AATTTT----G-AT-T-GC--------G-TTAGA-------AAAATG--C-T-----CTCTCCATCAGAGGA--ACT-C-ATGTTT-GTA--T-GA-TTC--AATGA----TGAAA----G-TG---A--A-TGAATA---TTAAA--TGA---TTTCAAT---GTTT--ATAGACC----------TT-A---GA--ACTTACCTG-A--AACTG---TCC-AATA--AGT--A-AA-CA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-CA-C--AA-GAAT-GG-TTT--TT--ATTGTTGA-AG-TAT-TCA---------A-A-ACA-G--CT-T----TA---C-C---TGGGA--------G--AGG--ACAC-TTATGAA--GACAA---------TGG---AT---------------------A--AA-TC--A-TTTTA-AC--TGGC--T--T--A--CCT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTA---GG-ATA-G----AAGCTT-CAAA--CTG-T--A--C-A-T-T-C-T-----------G--TAA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCC-------TAC-G--GGC-CTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A-CAG-AA--TGT----A--CAG-T-TTTCGGCTTATATCCTTTACATA-----CATTG-ATTG-
gi|7 : ggcactttggaggccttagtgatcgttttggtaaagatagtgacaagatggcagaatgtgaagagacaaAATGAGTTGTT-CAT-CTA------CT-CCAGC-ATCG-TA-CAGTCTTG-TGGCTGCA-GTGG---CAC-GTAGA----GA---------ATGGTTTGTAAA-------------ATG-GC-ATT-TGAA-T---CCTGCCT-GTTCAC--A-------T--AGCT--CGGCGACGGT-TTT-CTGT-AAAA-CATG----AA-C-A-C---AAC--GGG-------TGCATCTG-CATA--CCA-G---G-ATGA--Taaggcaagtataatcatgagttttacatgcatttgacatttaatgcaggcttatatttttgcaaacactaattctgttcactttttttatatttcaggccagaaaatggcaattgtgacgcactatactgagacaactcaaatatagtacatcatcatcctggtatgcagatgcacccgttgtgttcatgttttacagaaaaccgtcgccgagctatgtgaacaggcaggattcaaatgccattttacaaaccattctctacgtgccactgcagccacaagactgtacgatgctggagtagatgaacaactcatt
gi|8 : ggcactttggaggccttagtgatcgttttggtaaagatagtgacaagatggcagaatgtgaagagacaacaatcaatgtatgtaaaggatataagccgaaaactgtacattctgtgagagaaagaactgatcgaggcccgtagggccgagatcagttctttctcttacagaatgtacagtttgaagcttctatcctacttaaaacattatctcctttgtattaatattggatagtatcaggtaagccagttaaaatgatttatccattgtcttcataagtgtcctctcccaggtaaagctgttttgaatacttcaacaataaaaaccattcttgtgaagctgtttcttttgtttacttattggacagtttcaggtaagttctaaggtctataaacattgaaatcatttaatattcattcactttcatcattgaatcatacaaacatgagttcctctgatggagagagcatttttctaacgcaatcaaaattttagggacgagagtgaaagtgtaaataccgataacgttctcagtgatgttcttgattagagaaggtgtatgctgatatgaagcctaactaaggcaagtataatcatgagttttacatgcatttgacatttaatgcaggcttatatttttgcaaacactaattctgttcactttttttatatttcaggccagaaaatggcaattgtgacgcactatactgagacaactcaaatatagtacatcA---GTTAG---GCTTCAT-A--T-CAGCA---TCC----CT-GC-----TT-TGT---ATCAAA--GAACA-TCA-C-TG----GA---GA----C-G-TTAAATC-G---GT--ATT-TTA---------CAA-----TTTC-AC-TCTC-----ATCCCTA-A-----TTTT----G-AT-T-GC--------GGTGAGG-------AAAATG--C-T-----TCATCCATCAGCGGA--ACT-C-ATGTT--GTA--T-GA-TTC--AATGG----T-AAA----G-TG---A--AATGAATA---TTAAAA-TGAATTTTTCAAG---TTTT--ATAGACC----------TT-A---GA--AATTAC-TG-A--AACTG---TCCCAATA--A-TA-A-A--CA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-C--C--A--GACT-GGGTTT--TT--ATTATTGA-GG-TAT-TTA---------A-A--CA-G--TT-T----TAA--C-T---TGGGA--------G--TGG--ACAC-TTAGGAAA-GACAA---------TGG---ATATA--TAAG-GAA--ACAT-AA--AAATC--A-TTTTA-AC--TGGAA-T--T--A--ACT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATATAAT---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTA---GG-ATA-G----AAGCCT-CAAA--CTG-T--A--C-A-TAT-CTT-----------G--TAA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCCT------TAC-G--GG--CTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A--AG-AA--TGT----A--CAG-T-TTTCGGCTTATATCCTT
gi|8 : -ATCG-TAACAGTCT-G-TGGCTGCA-GTGG---CAC-GTA-A----GA---------G---------AATGGTTTGTAGTAAATGTGC-CTT-TGAA-T---CCTGC-T-GTTCAC--ACTCATTAT--AGCT--TGGCGACGGT-TTTCCTGTAAAAA-CATGAC--AA-CAACCAAAAAC---GG-------TGCATCTG-CATA--CCA-GGCAG-ATGATGTTCTGATATT-GAGTG--------TTCT-CGTAGGTAATAG--------AG---GCGTCAC-A--T-TTGCAATTTTCTGGCCT-Taagccaagatataatatgtagtttacatggcatttgacattttaatgcaggcttttatatattttttcgcaaaaactatttctgttcacctttttctatatttcaaggccagaaaattgcaaatgtgacgcctctattacctacgagaacactcaatatcagaacatcatctgcctggtatgcagatgcaccgtttttggttgttgtcatgtttttacaggaaaaccgtcgccaagctataatgagtgtgaacagcaggattcaaaggcacatttactacaaaccattctcttacgtgccactgcagccacagactgttacgat
gi|9 : aaggatataagccgaaaactgtacattcttgagagaaagaactgatcgagcccgtaagggccgagatcagttctttctcttacaagatatgtacagtttgaggcttctatcctacttaaaacattatctccattatattaatattggatagtatcagttaattccagttaaaatgatttttatgtttccttatatatccattgtctttcctaagtgtccactcccaagttaaaactgtttaaatacctcaataataaaaacccagtctggaagctgtttcttttgtttattattgggacagtttcagtaatttctaaggtctataaaacttgaaaaattcattttaatattcatttcactttaccattgaatcatacaacatgagttccgctgatggatgaagcattttcctcaccgcaatcaaaattagggatgagagtgaaattgtaaaataccgatttaacgtctccagtgatgttctttgatacaaagcagggatgctgatatgaagcctaactaagccaagatataatatgtagtttacatggcatttgacattttaatgcaggcttttatatattttttcgcaaaaactatttctgttcacctttttctatatttcCTTAAAAC-ATAATTGT---T-ACGCAA--TCC----TTTGT-TA----TT-TTC-G----GTT-GTTA----------TATGG-C-A-TAAAA---T--CCAT---GTCAAT--TT----AA------AAACAAT---CCAATAAGCTACCT--GTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTAGAAA---T-G--TG-TCCATTA--T------TAAA--C-T-T----AT---T---GGAC-A----G--T-TATT-G---T-CAA------CTTA--TT------GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAACGGATAAAAAG-A-----CA-GA--AGAT-GCGTTTG------T----CAAACAG-AAG--TAAA----TTGTAA--TTTA-AATAAC-ATGAA---TGTC-AC-AGGTAG--AACATCTGAGACCAC------ACTGAAAATCATTC-ATTATTTG--GTCGT---TACTCGTTACCACAC-ATCACATT-TAGAACTTCAAT----TTGAAAGACA----------AATTGTTATGTT-----C------TATA--TG---------------AATTTCTCTTT--AT--TCAGAGGCACATTCAAAA---ACATC-TCCAAATT------GCTTAATTTTTTTTATGATTT---CCTT-
gi|9 : TATGAA-TTTCTCT----TT-ATTCAGAGGCACATTCAAA-AA-CATCTC-----C-----AAAT---TG-CT-------T----AATTTTTTTT---AT-GAT---------TTCCTTATCAGCATC-TTCTGATT--CAC-ATTTCATTTTTT-C---ACTT---CCTG-G-AA-T-GATTTCACT-AAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATTTTGGGTTC---TTTTG-----------TATG-AATGGACTGCCG-ATG----ATCTA-TGTCCAGTTTT--TCAGTAATGAGTTGTT-CAT-CTA------CT-CCAGC-ATCG-TA-CAGTCTTG-TGGCTGCA-GTGG---CAC-GTAGA----GAATGGTTTGTA---------AA-------------ATG-GC-ATT-TGAA-T---CCTGCCT-GTTCAC--A-------T--AGCT--CGGCGACGGT-TTT-CTGT-AAAA-CATG----AA-C-A-C---AAC--GGG-------TGCATCTG-CATA--CCA-G---G-ATGA--Tatcagcatcttctgattcacatttcattttttcacttcctggaatgatttcactaattttcacaagctgggcattttgggttcttttgtatgaatggactgccgatgatctatgtccagtttttcagtaatgagttgttcatctactccagcatcgtacagtcttgtggctgcagtggcacgtagagaatggtttgtaaaatggcatttgaatcctgcctgttcacatagctcggcgacggttttctgtaaaacatgaacacaacgggtgcatctgcataccaggatgatgatgtacta
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): GATGACATTAGTGATGAAACAGCAGTTTTGTGTATTCATAATATGCATTATTTGATGTGAAGGGA
Alignments
lowQualScore : 11 1111 2222 22222222 3333333333 11111 111 111 11 444444444444 111 11 22222222 333333333333333333333333333333333 111111 1 11111 222222 333333 3333333 3333333 444444444444 1 33333333 1 222 1 222 333333 2222222222 11 111 2222 111 2222 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111 2222222222222 11111 1 1 1 111 22222222 1 1111 11 1 111111 1 1 111 8888888888888888888888888888888888888888888 1 111 2222222222 11 11 2222 111 2222222 11111 111 1111111 222 111 1 111 222 11 111 33333333333333 222 1 222222222222222 1 111 444444444 111111 11111 33333333333333333333333333333333 11111111 22222222 11 2222 2222 2222 222222 22 222 1111 33333333333 222 1 2222222 111111 111111111 1111 444444444 222222222222222 11111111 11 11 111111111 111 11 11 11111 1111 1111111 111 11 1111111 11111111111111 11111111111111111 111 1111111 11111 222222 1
lowQualScore : 8 3 777 4 11 7777 8 2222 4 00000000 4 5555555555 4 66666 4 555 66 777 11 44 111111111111 3 777 1 22 66 66 5 0 66666666 4 888888888888888888888888888888888 111111 66 5 0 33333 888888 0 66 000000 8 66 2222222 5 6 5 1111111 5 77 5 555555555555 5 5 11111111 9 7 3 999 8 6 222 9 0 888888 7777777777 88 111 0000 555 6 5 0 3 1111 8 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 000 8888888888888 8 888 5 22 66 77 33333 888 0 5 5 1 5 5 1 5 111 22222222 6 3 4444 44 5 5 5 666666 5 0 5 5 0 6 5 777 5 6666666666666666666666666666666666666666666 5 0 5 5 777 5 66 6666666666 33 66 4 4 4 5555 4 4 1 777 666 8888888 1 8 66 77 22222 66 1 1 333 6 6666666 222 444 1 555 000 0 4 11 4 222 66 4 33333333333333 222 0 5 5 555555555555555 0 66 5 888 66 5 5 000000000 555555 5 5 77777 77777777777777777777777777777777 77 77777777 0 11111111 66 66 5 5 11 3333 5 66 1111 1111 5 777777 5 888 0 11 555 5555 66 33333333333 3 888 66 4 8 66 333 3 66 99 4 4 8888888 222222 444444444 8 8888 66 4 4 4 66 66 4 4 8 000000000 4 4 4 66 4 777777777777777 1 66666666 66 22 8 00 777777777 555 8 66 4 4 66 4 66 4 66 8 4 33 22 44 44 555 3 44 33333 6 3 3333 555 777777 444 444 5 2 66 5555555 000 2 888888 2 00 0000000 2 5 2 2 5 55555555555555 4 2 5 0 2 777777 5555 66666666666666666 7777 2 2 5 000 33 2 7777777 5 8 33 00000 66 2 5 1 0 111111 2 3
lowQualScore : . . ... . .. .... . .... . ........ . .......... . ..... . ... .. ... .. .. ............ . ... . .. .. .. . . ........ . ................................. ...... .. . . ..... ...... . .. ...... . .. ....... . . . ....... . .. . ............ . . ........ . . . ... . . ... . . ...... .......... .. ... .... ... . . . . .... . ......................................................... ... ............. . ... . .. .. .. ..... ... . . . . . . . . ... ........ . . .... .. . . . ...... . . . . . . . ... . ........................................... . . . . ... . .. .......... .. .. . . . .... . . . ... ... ....... . . .. .. ..... .. . . ... . ....... ... ... . ... ... . . .. . ... .. . .............. ... . . . ............... . .. . ... .. . . ......... ...... . . ..... ................................ .. ........ . ........ .. .. . . .. .... . .. .... .... . ...... . ... . .. ... .... .. ........... . ... .. . . .. ... . .. .. . . ....... ...... ......... . .... .. . . . .. .. . . . ......... . . . .. . ............... . ........ .. .. . .. ......... ... . .. . . .. . .. . .. . . .. .. .. .. ... . .. ..... . . .... ... ...... ... ... . . .. ....... ... . ...... . .. ....... . . . . . .............. . . . . . ...... .... ................. .... . . . ... .. . ....... . . .. ..... .. . . . . ...... . .
lowQualScore : 9 4 000 0 00 0000 0 5555 0 44444444 0 0000000000 0 44444 0 666 11 555 44 44 555555555555 2 555 1 22 11 11 0 2 44444444 4 333333333333333333333333333333333 666666 99 0 0 55555 888888 4 99 000000 9 99 5555555 0 6 0 1111111 7 99 7 333333333333 0 0 88888888 8 3 3 777 0 7 000 8 7 333333 5555555555 33 777 8888 888 7 0 1 2 2222 5 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 111 6666666666666 9 888 0 55 99 00 11111 888 0 7 7 4 7 7 4 7 777 88888888 7 3 2222 00 5 7 7 444444 7 0 0 0 0 2 0 555 0 2222222222222222222222222222222222222222222 0 0 0 0 555 0 99 0000000000 88 22 4 4 4 0000 4 4 1 888 111 9999999 1 9 11 11 77777 11 0 0 888 7 5555555 555 222 7 666 000 8 0 00 0 222 11 4 66666666666666 555 0 0 0 000000000000000 0 99 0 888 99 0 0 000000000 888888 0 0 55555 88888888888888888888888888888888 00 11111111 5 22222222 99 99 0 0 22 2222 0 99 2222 2222 0 222222 0 888 8 99 666 8888 99 11111111111 2 888 99 5 9 11 333 3 11 66 4 4 9999999 888888 111111111 9 4444 11 4 4 4 11 11 4 4 9 000000000 4 4 4 11 4 222222222222222 0 11111111 11 22 9 66 888888888 666 9 11 4 4 11 4 11 4 11 9 0 55 55 66 22 666 1 22 88888 2 1 5555 000 777777 777 777 3 7 33 0000000 000 7 222222 9 77 5555555 7 3 7 7 3 44444444444444 1 7 3 9 7 777777 7777 88888888888888888 2222 5 5 0 666 77 7 3333333 3 0 77 88888 99 5 3 0 8 555555 5 3
consensus : NNGCTTAAAAC-ATAATTGT---T-ACGCAA--TCC----TTTGT-TA----TT-T-C-G----GTT-GTTA----------TAT-A-C-A-T-AAAA---T--CCAT---GTNAATA-TT----AA------AAACAAT---CCAATAAGTTACCT--GTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTAGAAA---T-G--TG-TCCATTA--T------TAAA--C-T-T----AT---T---GGAC-A----G--T-TATT-G---T-CAA------CTTA--TT------GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAACGGATAAAAAG-G-----CA-GA--AGAT-GCGTTT-------T----CACACAACAAGTTTAAGAGATTTTTAATCTTTATAATAAC-ACGAA--TTGTCTAC-AAGTAG--AACATCTGAGACCGC------ACCGAAAATC--TC-A----TTG--GTCGT---TAC----CAC--CAC-ATCACATTATGAAACTTCTCT----TCGATTCAGA----------AA-CG-CATCTC-----C-----ACATA--TG-CT-------C----AATTTTTTTTT--AT-GTT---------TTCCCTA---GCATC-TTCGGATT--CAC-ATTTCATTTTTTTC---ACTT---CCTT-G-AA-T-GATTTCACT-GAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATCTTGGGTTA---TTTTGC--ATGA-AGTTATG-AACGGACTGCTG-ATG----ATCTA-TGTCCAGTTTTTTTCAGTAATGAGTTGTT-CAT-CTA------CT-CCAGC-ATCG-TA-CAGTCTTG-TGGCTGCA-GTGG---CAC-GTA-A----GA---------G---------AA-------------ATG-GC-CTT-TGAA-T---CCTGCCT-GTTCAC--A-------T--AGCT--TGGCGACGGT-TTT-CTGT-AAAA-CATG----AA-C-ACC---AAC--GGG-------TGCATCTG-CATA--CCG-G---A-ATGA--TCCGNANACT-GA-TG-CCA---CTTTT-C-TA-ATACTAGAA---GTTAG---GCTTCAT-A--T-CAGCA---TTCT--CCT-TC-----TC-TAT---ATCAA---GAACA-TCA-C-TG----AG---AA----C-GTTA--T-CG---G--TATT-T-A---------CAC-----TTTC-AC-TCTC-----ATCCCTA-A---ATTTT----G-A-T-TGC--------G-CGAGA-------AAAATG--C-----TCTCTCCATCAGAGG--A--ACT-C-ATGTTT-GTA--TTGA-TTC--AATGG----TGAAA----G-TG---A--A-TGAATA---TTTAA--TGA---TTTCAAG---TTTT--ATAGACC----------TTTA---GA--ACTTACCTG-A--AACTG---TCC-AATA--AGTA-A-AA-CA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-C--C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTGTTGG-GA-TAT-TTA---------A-A-ACA-G--CT-T----TA---C-C---TGGNA--------G--AGG--ACAC-TTATGAA--GACAA---------TGG---AT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--A-TTTTG-AC--TGGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTA---GG-ATA-G----AAGCCT-CAAA--CTG-T--A--C-A-T-T-C-T-----------G--TGA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCC-------TAC-G--GGC-CTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A-CAG-AA--TGT----A--CAG-T-TTTCGGCTTATATCCTTTACNTAAACACCATTGCATTG-AGGGTTGGGTA
Reference ( family-455 ) : NNGCTTAAAAC-ATAATTGT---T-ACGCAA--TCC----TTTGT-TA----TT-T-C-G----GTT-GTTA----------TAT-A-C-A-T-AAAA---T--CCAT---GTNAATA-TT----AA------AAACAAT---CCAATAAGTTACCT--GTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTAGAAA---T-G--TG-TCCATTA--T------TAAA--C-T-T----AT---T---GGAC-A----G--T-TATT-G---T-CAA------CTTA--TT------GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAACGGATAAAAAG-G-----CA-GA--AGAT-GCGTTT-------T----CACACAACAAGTTTAAGAGATTTTTAATCTTTATAATAAC-ACGAA--TTGTCTAC-AAGTAG--AACATCTGAGACCGC------ACCGAAAATC--TC-A----TTG--GTCGT---TAC----CAC--CAC-ATCACATTATGAAACTTCTCT----TCGATTCAGA----------AA-CG-CATCTC-----C-----ACATA--TG-CT-------C----AATTTTTTTTT--AT-GTT---------TTCCCTA---GCATC-TTCGGATT--CAC-ATTTCATTTTTTTC---ACTT---CCTT-G-AA-T-GATTTCACT-GAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATCTTGGGTTA---TTTTGC--ATGA-AGTTATG-AACGGACTGCTG-ATG----ATCTA-TGTCCAGTTTTTTTCAGTAATGAGTTGTT-CAT-CTA------CT-CCAGC-ATCG-TA-CAGTCTTG-TGGCTGCA-GTGG---CAC-GTA-A----GA---------G---------AA-------------ATG-GC-CTT-TGAA-T---CCTGCCT-GTTCAC--A-------T--AGCT--TGGCGACGGT-TTT-CTGT-AAAA-CATG----AA-C-ACC---AAC--GGG-------TGCATCTG-CATA--CCG-G---A-ATGA--TCCGNANACT-GA-TG-CCA---CTTTT-C-TA-ATACTAGAA---GTTAG---GCTTCAT-A--T-CAGCA---TTCT--CCT-TC-----TC-TAT---ATCAA---GAACA-TCA-C-TG----AG---AA----C-GTTA--T-CG---G--TATT-T-A---------CAC-----TTTC-AC-TCTC-----ATCCCTATA---ATTTT----G-A-T-TGC--------G-CGAGA-------AAAATG--C-----TCTCTCCATCAGAGG--A--ACT-C-ATGTTT-GTA--TTGA-TTC--AATGG----TGAAA----G-TG---A--A-TGAATA---TTTAA--TGA---TTTCAAG---TTTT--ATAGACC----------TTTA---GA--ACTTACCTG-A--AACTG---TCC-AATA--AGTA-A-AA-CA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-C--C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTGTTGG-GA-TAT-TTA---------A-A-ACA-G--CT-T----TA---C-C---TGGNA--------G--AGG--ACAC-TTATGAA--GACAA---------TGG---AT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--A-TTTTG-AC--TGGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTA---GG-ATA-G----AAGCCT-CAAA--CTG-T--A--C-A-T-T-C-T-----------G--TGA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCC-------TAC-G--GGC-CTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A-CAG-AA--TGT----A--CAG-T-TTTCGGCTTATATCCTTTACNTAAACACCATTGCATTG-AGGGTTGGGTA
gi|1 : TAAGACCATA--TGT---T-ACGCAACATCCAATCTTTGTATAAATTTT-T-C-GTGTAGTT-GTTAACTCTGTACCTAT-A-C-GCT-AAGACATT--CCATAATGTGAATA-TTTATAAATGAGGCAAAAAATTGCCCAATAA-TTACCTTTGTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTAAAAACAAT-G--TG-TCCATTG--CAGTTTCTACA--C-TAT----AT---TTGAGAACTA----G--T-TATTAG---TACAAAATGACTTTA--TTTATCTGAGACAAGTGCC--AGTGTTGTCAT-ATACAGATAAA--T-GTTTTTCA-TG--AGAT-GCGTTT-------TGTCACACACAACAAGTTTAAGAGATTTTTAATCTTTATAATAACTACGAAATTTGTCTAC-AAGTTATTAACATCAG-GACAGCCAAGCGACCGAAAATC--TC-A----TTG--GTCGT---TAC----CAC---AC-ATCACATTATGAAACTTCTACATAATCGATTCAGA----------AAATG-CATCTT-----CTCCATACATA--TAACT-------CTAAAAATTTTTTTTC--GTTGTT---------TTCCCTA---GCATC-TTTGGGTT--CAC-ATTTCATTTTTT-C---ACTT---CCTTTG-AA-TCGATTTCACT-GAT-TTTTCAC-AAGCTGGGCATCTTGGGTTA---TTTTGC--ATGA-AGTTATG-AACGGACTGCTGTATG----ATCTA--GTCCAG-TTTTTTCAGTAATGAGTTGTT-CAT-CTA------CT-CCAGC-ATCA-TA-CAGTCTTGTTGGC-ACA-GTGGATATAC-GTG-ATAGTGA---------G---------AA-------------ATG-GTACTT-TGTA-TTTCCCTGCCT-GTTCAC--A-------TTAGGCTTCTGGCGACGA--TTT-CTGT-AAAA-CATGTATAGA-C-ACC---AACT-GAGAGAGTTATGCATCTGCCATA--CCG-G---A-ATGA--TCCGTATACT-AA-TG-CTA---CTTTT-C-TA-ATACTAGAAAGTATTAGGTTGCTTCAT-ATCT-CAGCA---TTCT--CCT-TTATTAATCTTATTA-GTCAATGTGAACATTCA-C-TGTGCTAG---AAACTTC-AGTA--T-CGC--G--TATT-T-ATGCGTACAGCAC------TTC-AC-TCTC-----ATCCCTATATATATTCTCTCCG-A-TATGCTGGTAGATG-CAAAA-------AAATTGTCC-----TTTTTCCATCAGAGG--A--ACT-C-ATGTTT-GTATTTTGA-TTC--AATGGTTATTGAAAAGTTG-TGCGTACTA-TGACTA---TTTAAT-TGAT--TTTCAAG---TTTT--ATAGACC-----------TTA---GA--ACTTACCTGTA--AACTACTTTCCTAATA--AGTT-A-AA-CATACACACAAA------GAAGAG-----CGAGCTTCC--C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTGTTGG-GA-TATATTATAATGCCACA-A-ACA-G--CT-TATGATG---C-CTTGTGGCA--------G--AGGATACAC-TTATTGA--GACAA---------TGGCGCAT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--ATTTTTG-AC--TGGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATCG----CATAT-AT-TTAAATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTAG--GG-ATA-G----AAGCCT-CAAACCCTGCT--A--C-ATT-T-C-T-----------GTTTTA-G-AGAAAGTAAT---T------CTC----GTATTCAGGCC-------TACTGACGGC-CTCG-A-TCAGCTTCCCT--TTCT-CTTCCCTCTGA-CAGAAA--TGTTTTGACTCAG-TATGTCGGCT
gi|10 : aTATAAC-ATAATTAT---T-ATGCAA--TCC----TTTGT-TA----TT-T-TTG----GTTTGTTG-----------AT-A-G-A-T-AAAA---T--CCAT---TTAAATAATT----AA------AAACAAT---CCAATAAGTTACCT--GTA--CGCATGTCC--ACAAATTTAGAAA---T-AGTTGTTCCATTAGTT------TAAGATCGT-T----ATCTCT---GAGT-ACCACG--TCTATT-GTGCT-CAA------C-TAGTTT------AGACA-GTGCCTTAG-------GT-AAAGGTATATAAAGTA-----CA-GATTAGAT-GCATTTTAGGTTGT----CTC-CAACAGATT----ACATATTTAATC-TAATATTAGC-ATGAA--TTGTC-AA-AGGTAG--AACATCTTGAACCAC------ACTGAAAATCCGTCTA----TTGGAGTTGT---TACG---CAC--CAC-AT---ACT-TGAA------CT----TCAATTTTGA----------AA-gtgagtatccatggctacagtg
gi|10 : AATTTCTCT----T-GATTCAGA----------GG-CA-CAT-TCATAAACATA--ACATAACTG-CT-------T----AATTTTTTTTTCAAT-AT---------------CA---GCATC--------T--CA----------TTTTTC---ACTT---CCTT-G-AA-T-GATTTCACT-GAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATCTTGGGTTC---TTTTG-----------TATG-AACGGACTGCTG-AAG----ATCTA-TGTCCAGTTTTTTTCAGTAATGAGTTagacaattcgttatgtttatttgaatttctcttgattcagaggcacattcataaacataacataactgcttaatttttttttcaatatcagcatctcatttttcacttccttgaatgatttcactgattttcacaagctgggcatcttgggttcttttgtatgaacggactgctgaagatctatgtccagtttttttcagtaatgagtt
gi|11 : tataacataattattatgcaatcctttgttatttttggtttgttgatagataaaatccatttaaataattaaaaacaatccaataagttacctgtacgcatgtccacaaatttagaaatagttgttccattagtttaagatcgttatctctgagtaccacgtctattgtgctcaactagtttagacagtgccttaggtaaaggtatataaagtacagattagatgcattttaggttgtctccaacagattacatatttaatctaatattagcatgaattgtcaaaggtagaacatcttgaaccacactgaaaatccgtctattggagttgttacgcaccacatacttgaacttcaattttgaaaagacaattcgttatgtttatttg--A--CCT-GGG--CCTGTC-----CA-TT-TT-T--AGAACAAA---A-A------TGC---AAC---GTT-T-T--CA-------GTT---GC-ATA-T----TAACCT-AAAA--TTG-T--C--C-A-T-T-C-T-----------G--TGA-G-AGAAAGAACTAA-TATTAGCCTTACGGG------GTCC-------TAC-G--GGC-CTTG-A-TCGATT---CT--TTCT-CTC-------A-CAA-AA--TGA----A--TAG-T-TTT-------TATCCTGTACTTAAACA----TGCATT
gi|12 : ggtttaATTGTAAAT-GTGTAA--TCA----TTTAT-TA----TTCT-A-A----GCT-TTGA----------TAT-A-----T-AAAA---TAGTC-T---GCCTACA-TT----TA------AAAC-------------GTTACCT--GTA--GG--TATCC-AATACGTTGACAAT---TAA--TG-TCCATTA--T------------C-T-TTCAGAA---T---GGAC-A----GTAT-TATT-G---C-CAA------CATA--TTG-----GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAtaccaatgtcaataggtttcatattacatgtgtttgtaaatctctcaccaatactatttcttactttctttttaacatccaagttgt
gi|13 : ctatatttaaagTTTA-AA--TGGA--T--TTTA--TCT--ATCAACAAAC-----CA-AA-AA-T--AA--CAAA---GGATTGCATAAT---AATTATGTT-A-T--AAAA-----GTA---GG-ATA-G----AAGCCT-CAAA--CTA-T--A--C-A-T-T-C-T-----------G--TAA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCC-------TAC-G--GGC-TTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A-CAG-AA--TGT----A--CCG-T-TTTCGGCTTATATCCTTTACTGAAA-ATAAATGCATTA-AAGttattagatgtttacaggttgcctgaaaacaagagaaaaagatgatgcatttgtttaaacataaacaaattcaattctaaat
gi|14 : atta------GAT---AAT---GTTGT-T--GAT------GCA---TGTAT--T----AAGC-T-CAAA--CTG-C-----C-G-T-T-CCT-----------A--TGA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTT----A------GTCC-------TAT-G--GCA-ATTG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A-T-G-AA--TGG----A--C-G-T-TTGAGGCTTATATCTTTTttaccaagatgcgttgactgcgtgata
gi|15 : ttgcatgactatgaaCTG-A--AACTG---TCC-AATA--AGTT-A-AA-CA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-CG-C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTGTTGG-GT-TAT-TTA---------A-A-ACA-G--CT-T----TA---C-T---TGAAA--------G--AGG--ACAC-TTATGAA--GACAA---------TGG---AT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--A-TTTTA-AC--TAGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-C--AATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-TTGAA---------A---AG-ATA-A----AAatatataaaggttgtgattccaacgatgacattattcaatgatggaccaacagttttgtgtattgcacatgcattgtttgatctgaagagaa
gi|16 : at--T--T--A--TCT-GAT--TCCACC-----CC-AC-AT---------AAA---GAA------AAG---CAT---GTT-T-T--AA-------TTA---AG-AGA-A----AAGCCA-CAAA--CTA-T--C--A-A-C-T-C-T-----------G--TGA-A-AGAAAGAACTAA-----------------------------------------------A-A-TTAGTT---CT--TTTT-CTC-------A-CAG-AA--TGG----A--CAG-C-GTTTGGCCTTTCACTTTTACATA
gi|17 : acAATT---CT--TTCT-CTC-------A-CAG-AA--TGG----G--CAG-A-TTTCGGTCTTTCTCCTGTACATAacaaaa
gi|18 : catcactacatg--T--T--A--TAT-GAT--G-TATC------A-AT-AT-TTGAATACA----------------C---AAT---GCT-T-T--AACTCCATAGCA---AG-GTA-T----TAGCCT-GAAA--CTG-T--C--C-A-T-T-C-T-----------T--TGA-G-AGAAAGAACTAA-T------CTC----G------GCCTG------TA--G--GGC-Ccagctctatcgtatcaagccagctaaagtcaagtacatgtactttttccagtacaacaactctggagtttgaa
gi|19 : tttaattacatgtatttccACAAA---AGA------TGC---ACT---AGT-C-T--AA-------GTA---GG-ATA-T----AAGCAC-AAAA--CTA-TCTATCC-A-T-T-C-T-----------G--TGA-GGAAAAAGAATTAA-T------CAC----A------ACCT-------TAC-G--GAC-CTTG-A-TCAGTT---aa
gi|2 : aacgaaaacaacaTAAGACCATA--TGT---T-ACGCAACATCCAATCTTTGTATAAATTTT-T-C-GTGTAGTT-GTTAACTCTGTACCTAT-A-C-GCT-AAGACATT--CCATAATGTGAATA-TTTATAAATGAGGCAAAAAATTGCCCAATAA-TTACCTTTGTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTAAAAACAAT-G--TG-TCCATTG--CAGTTTCTACA--C-TAT----AT---TTGAGAACTA----G--T-TATTAG---TACAAAATGACTTTA--TTTATCTGAGACAAGTGCC--AGTGTTGTCAT-ATACAGATAAA--T-GTTTTTCA-TG--AGAT-GCGTTT-------TGTCACACACAACAAGTTTAAGAGATTTTTAATCTTTATAATAACTACGAAATTTGTCTAC-AAGTTATTAACATCAG-GACAGCCAAGCGACCGAAAATC--TC-A----TTG--GTCGT---TAC----CAC---AC-ATCACATTATGAAACTTCTACATAATCGATTCAGA----------AAATG-CATCTT-----CTCCATACATA--TAACT-------CTAAAAATTTTTTTTC--GTTGTT---------TTCCCTA---GCATC-TTTGGGTT--CAC-ATTTCATTTTTT-C---ACTT---CCTTTG-AA-TCGATTTCACT-GAT-TTTTCAC-AAGCTGGGCATCTTGGGTTA---TTTTGC--ATGA-AGTTATG-AACGGACTGCTGTATG----ATCTA--GTCCAG-TTTTTTCAGTAATGAGTTGTT-CAT-CTA------CT-CCAGC-ATCA-TA-CAGTCTTGTTGGC-ACA-GTGGATATAC-GTG-ATAGTGA---------G---------AA-------------ATG-GTACTT-TGTA-TTTCCCTGCCT-GTTCAC--A-------TTAGGCTTCTGGCGACGA--TTT-CTGT-AAAA-CATGTATAGA-C-ACC---AACT-GAGAGAGTTATGCATCTGCCATA--CCG-G---A-ATGA--TCCGTATACT-AA-TG-CTA---CTTTT-C-TA-ATACTAGAAAGTATTAGGTTGCTTCAT-ATCT-CAGCA---TTCT--CCT-TTATTAATCTTATTA-GTCAATGTGAACATTCA-C-TGTGCTAG---AAACTTC-AGTA--T-CGC--G--TATT-T-ATGCGTACAGCAC------TTC-AC-TCTC-----ATCCCTATATATATTCTCTCCG-A-TATGCTGGTAGATG-CAAAA-------AAATTGTCC-----TTTTTCCATCAGAGG--A--ACT-C-ATGTTT-GTATTTTGA-TTC--AATGGTTATTGAAAAGTTG-TGCGTACTA-TGACTA---TTTAAT-TGAT--TTTCAAG---TTTT--ATAGACC-----------TTA---GA--ACTTACCTGTA--AACTACTTTCCTAATA--AGTT-A-AA-CATACACACAAA------GAAGAG-----CGAGCTTCC--C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTGTTGG-GA-TATATTATAATGCCACA-A-ACA-G--CT-TATGATG---C-CTTGTGGCA--------G--AGGATACAC-TTATTGA--GACAA---------TGGCGCAT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--ATTTTTG-AC--TGGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATCG----CATAT-AT-TTAAATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTAG--GG-ATA-G----AAGCCT-CAAACCCTGCT--A--C-ATT-T-C-T-----------GTTTTA-G-AGAAAGTAAT---T------CTC----GTATTCAGGCC-------TACTGACGGC-CTCG-A-TCAGCTTCCCT--TTCT-CTTCCCTCTGA-CAGAAA--TGTTTTGACTCAG-TATGTCGGCT
gi|20 : aCTCAAAAC-ATTTTTGT---T-ACGTTA--TCT----TTTGT-TA----TT-T-TAG----GCT-TTTA----------TAT-A-G-A-CGAGAG---T--CCA----GCC-GTA-TT----TA------AAAT-------------GTTACCT--ATA--GG--TGTgtgagtatccatggctacagtg
gi|21 : tgtgaacatttaaatcccGT----A--CAG-T-TTGAGGCTTATATCCTTTACATA
gi|22 : ggcacttgcggccgtataagggaccgccatttttaaaagatcgtatccgacagatatttggcgaagaagcagA---GCATC-TTCTGATT--CAC-ATTTCATTTTT--C---ACGT---CCTT-G-AA-T-GTTTTCACT-GAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATCTTGnc
gi|23 : AAAAAGTTGCCT--GTA--GG--TGTCC-AATAAGTGGACAAT---T-AC-TG-TACATTA--T------T
gi|23 : tgtactt-TCCATTG--T------TATA--A-A-T----AA---T---GTAC-A----G--T-AATT-G---T-CCA------CTTA--TT------GGACA-tataacaatggagagt
gi|25 : tgtacttaaaaagttgcctgtaggTTAAAAC-ATAATTGT---T-ACGCAA--TCC----TTTAT-------TT-T-C-G----GTT-GTTA----------TAT-AGC-A-T-ATAA---T--CCgagt
gi|26 : gggca-A-T-T-C-T-----------G--T-A-G-AGAAAGAACCGA-T------ATC----G------GACTTGCAATGTAC-G--TGC-CTCG-A-CCAGTT---
gi|27 : -A-TCAGTT---CT--TTCT-CGC-------A-CAA-AA--TGG----A--CAGTT-TTTCGACTTTTA--CTTTACATAA
gi|28 : GTTTAAAAC-ATGATTGT---G-ACGTAA--ACC----TT--T-TG----TT-T-G-A----ATT-GTC-----------CAT-A-CTA-T-Aa
gi|29 : ------GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAACATATAAAAAG-A-----CA-GA--AGAT-GCGTTTG------T----CAAACg
gi|3 : TAAAAC-ATAATTGT---TGACGCAA--TCC----TTTGT-TAAT--TT-T-C-G----GTT-GTTA----------TAT-AGC-A-A-TAAA---T--CCAT---GTAAAT--TT----CA------AAACAAT---CCAATAAGTT-CCT--GTAAGCG--TGTCCCAATAAGTTTAGAAAA--T-G--TG-TCCATTA--T------TAA---C-T-T----AT---T---GGAC-A----G--T-TATT-G---C---A------CTTA--TT------G-ACA--TGTC--AG-------GTTAAACG-ATAAAAAG-G-----CAAGA--AGATTGCGTTG-------T----CAC-CAA-AAGT-----AAATTTT-AATCCTAATAACAAC-GCA-----TGTCCACCAAGTA----AC-TCTGAGACCAC------ACCGAAAATC------------GACGTCGTACCCAC----CCC--CACCATCACATTATGAAACTTCTCT----T-GATTCAGA----------A--C--CATCTC-----C-----ACAT---TG-CTTAAAATGC----GATTTTTTTTT--AT-GTT---------TTCC-TA---GCATCCTTTGGACTTCCACCATCTTTCCTTTTTC---ACCTATCCCTT-GCAACT-GATCTACCTCGATCTTT-CCCTCAGCTGGG--TCTTG--CTACATTTCTGCTCGCGAGAGTTATGGAACGGACTGCTG-ATGGAGAATCTAATCTCCAGTTTTTTTCAGTAATGAGTTGTTTCATGCTA------CTTCCAGCCATCG-TA-CAGTTTTG-TGGCTACAAGTGG---CACCGCT-T----GA---------G---------AA-------------ATG-TC-CTT-TGAAAT---CCCGCCT-GTTCACGAA-------T--AGCT--TGGTGACGGGGTTT-CTGT-AAAAACATG----AA-C-ACC---AACTCGGG-------TG-ATCTG-CATA--CCG-A---ATATG---TCCGAAGAAAAGA-TG-TCA---CTTTT---TA-A-ACT-GAA---GTTAGC--GCTTCAT-A--T-CAG-A---TTCT--CCT-TC-----TC-TAT---ATCAA---GA-CA-TCA-CATG----AG---AA----CTGTTA--T-CG---G--TATT-T-A---------CAC-----TTTC-AC-TCTCT----ATTCCT---------------------TGC--------G-TGAGA-------CAAATG--C-----TCTCTCCATCAGAGG--ATCACT-CCATGTTG-GTA--T-GA-TTC--AATGG----TGAAA----G-TG---A--A----ATA---TTTAA---GA---TTTCAAAGT-TTTT--ATAGACC----------TT-A---GA--A-TTACTAA-A--AACTG---TCC-A-TA--AGTA-A-AAACA-------AAA------GA--A------C-AGCTT-C--CCAAA-GAC--GG-TTTGGTT--AT-GTTGG-GAGTAT-TTA---------AGA-ACA-G--CT-T----T----C-C---TGGCA--------AGCAGG--ACCT-TTATGAA--GACAA---------TGG---AT-TAATCA-G-GAA--AC-T-AA--AA-TC--T-TTTTG-ACC-TGGAGGTGAT--A--GTT--AT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATACAA-----GA------GAT---AAT---GTT-T-TA-AA-------GTA---GG-ATA-G----AAG-CT-CAAA--CTG-T--A--C-A-T-T-C-TG----------G--TAA-GAAGAAAGAACTGA-T-------TC----G------G-CC-------TAC-G--GGC-CTCG-ACTCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A-C-G-AA--TGT----A--CAG-T-TTTCGGCTTATATCCT
gi|30 : c--GGC-CTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTT-------A-CAG-AA--AGG----A--CAG-
gi|4 : GCTTAAAAC-ATAATTGT---T-ACGCAA--TCC----TTTGT-TA----TT-T-C-G----GTT-GTTA----------TAT-G-C-A-T-AAAA---T--CCAT---GTAAAT--TT----AA------AAACAAT---CCAATAAGTTACCT--GTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTAGAAA---T-G--TG-TCCATTA--T------TAAA--C-T-T----AT---T---GGAC-A----G--T-TATT-G---T-CAA------CTTA--TT------GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAACGAATAAAAAG-G-----CA-GA--AGAT-GCGTTT-------T----CACACAA-AAG--TAAA----TTTTAATC--TA-AATAAC-ACGAA---TGTC-AC-AAGTAG--AACATCTGAGACCAC------ACCGAAA-----TC-A----TTG--GTCGT---TAC----CAC--CAC-ATCACATTATG-AACTTCTCT----TTGATTCAGA----------AA----CATCTC-----C-----ACAT---TG-CT-------C----AATTTTTTTTT--AT-GTT---------TTCCTTA---GCATC-TTTGGATT--CAC---TTCATTTTTTTC---ACTT---CCTT-G-AA-T-GATTTCACT-GAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATCTT-GGTTA----TTTGC--ATGA-AGTTATG-AACGGACTGCTG-ATG----ATCTA-TGTCCAG-TTTTTTCAGTAATGAGTTGTT-CAT-CTA------C--CCAGC-ATCA-TA-CAGTCTTG-TGGCTACA-GTGG---CAC-GT--A----GA---------G---------AT-------------ATG-GT-CTT-TGAA-T---CCTGCCT-GTTCAC--A-------T--AGCT--TGGCGACGAT-TTT-CTGT-AAAA-CATG----AA-C-ACC---AAC--GGG-------TGCATCTG-CATA--CC--G---A-AT-A--TCCGAAAA---GA-TG-TCA---CTTT----TA-A-ACT-GAA---GTTAG---GCTTCAT-A--T-CAGCA---TTCT--CCT-TT-----TC-TAT---ATCAA---GAACA-TCA-C-TG----AG---AA----C-GTTA--T-CG---G--TATT-T-A---------CAC-----TTTC-AC-TCTC-----ATCCCTA-A---ATTTT----G-A-T-TGT--------G-TGAGG-------AAAATG--C-----TCTCTCCATCAGAGG--A--ACT-C-ATGTTT-GTA---TGA-TTC--AATGG----TGAAA----G-TG---A--A-TGACTA---TTTAA--TGA---TTTCAAG----TTT--ATAGACC----------TTTA---GA--ACTTACCTG-A--AACTG---TCC-AATA--AGTA-A-AA-CA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-C--C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTG-TGG-GA-TAT-TTA---------A-A-ACA-G--CT-T----TA---C-C---TGGCA--------G--AGG--ACAC-TGATGAA--GACAA---------TGG---AT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--A-TTTTG-ACT-TGGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTA---GG--TA-G----AAGCCT-CAAA--CTG-T--A--C-A-T-T-C-T-----------G--TAA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCC-------TAC-G--GGC-CTCG-A-TCAGTTG--CT--TTCT--TC-------A-CA--AA--TGT----A--CAG-T-TGTCGGCTTATATCCTTTACTTAAACACCATTGCATTGCAGGGTTGGGTA
gi|5 : taCTTC-T-A--A-CA--A---TTAT--CTTGTC-----TC-AATGTAATCA----GAACA-TCA-C-TG----AGT--AA----CGGTTA--T-CGTCAGTTTATT-T-A---------CACACTTTTTTC-TCATCTCGTGCAATCACCATA---ATTTT----ACATT-TGC--------G-TGAGACGGTTACAAACTG--CTACCATCTCTCAAGCAGA-G--A--ACTAC-ATGTTTGGTA--TTGAGTTCAGAAT-G----TGAAA----GATGA--A--A-TGAATA---TCTAAATTGA---TTTCAGATGTTTTT--ATAGGACAACGTCTTGATTTATGGGAATATTTACCTG-ATTAACTGGATTCC-GATAGGAGTATA-AC-CA-------AAACATAATGA--AATCAATC-AGCTC-A--C--AAGGACT-GG-ATT--TTCAATTGTAGGTGA-TAT-TTA---------A-AGACATG--TTCT----TACATC-C---TGGAGATCTTTGTG--AGA--CCACTTTAGGAA--GACAAATGCGTTTTTGT---AC-TA--TG-GAAAA--ACAG-AATTAA-TCATA-TTCTA-ACATTGGGACT--T--AGGCCTCGCA--ATTATCATATGCA-ATCAT-G--AATATACATATGTA------TGTATAAAT---GTTGTAT--AA-------GTATAGAG-ATA-AGTATAGGCCTCCAAA--CTG-------C-A-T-TGC-TTACTAGCTCAAG--TAAGG-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------G-CC-------TAC-G--GGCTCTCG-ATTCAGTT---CTTCTTCTGCTC-------ACCAG-AAATTGT----A--CAG-T-TT---GC-TACGTCCTTTACTCA
gi|5 : ctatgatgtaaaaggga-CTGG-AAGA-AAAG----GA-C-ACC---AAC---GG-------T-CATC-G-CATA--CCA-G---A---------TAGACATT-GA-TGACCAATGCTTGTACGTATATATTTGAA---GTT------CTTC------T-CAGtgctggataatggaagtcctttaactaggcaagtataatttaagagtttttacatggcatttgacaacttaaaagcatatgctaggcttatttattctggcataaaatctatgtttgcgctgttttccaaacttttatgctatatttttcaggctcagaacatggcaatgatgaacgcaactatcacctgagaagaacttcaaatatatacgtacaagcattggtcatcaatgtctatctggtatgcgatgaccgttggtgtccttttcttccag
gi|6 : ctatgatgtaaaagggatgagtaaaggacgtagcaaactgtacaatttctggtgagcagaagaagaactgaatcgagagcccgtaggccgagatcagttctttctccttacttgagctagtaagcaatgcagtttggaggcctatacttatctctatacttatacaacatttatacatacatatgtatattcatgattgcatatgataattgcgaggcctaagtcccaatgttagaatatgattaattctgtttttccatagtacaaaaacgcatttgtcttcctaaagtggtctcacaaagatctccaggatgtaagaacatgtctttaaatatcacctacaattgaaaatccagtccttgtgagctgattgatttcattatgttttggttatactcctatcggaatccagttaatcaggtaaatattcccataaatcaagacgttgtcctataaaaacatctgaaatcaatttagatattcatttcatctttcacattctgaactcaataccaaacatgtagttctctgcttgagagatggtagcagtttgtaaccgtctcacgcaaatgtaaaattatggtgattgcacgagatgagaaaaaagtgtgtaaataaactgacgataaccgttactcagtgatgttctgattacattgagacaagataattgttagaagtgctggataatggaagtcctttaactaggcaagtataatttaagagtttttacatggcatttgacaacttaaaagcatatgctaggcttatttattctggcataaaatctatgtttgcgctgttttccaaacttttatgctatatttttcaggctcagaacatggcaatgatgaacgcaactatcacA---GTTAG---GCCTCATTA--TGCAGCAA--TTCT--CCT-GC-----TT-TGTG--ACCAA---GAACA-TCAGC-TG----AGGAGAA----C-GTTA--TCCG---G--TATTGT-A---------CAC-----TTTCGAC-TCTC-----ATCTC---A---AATTT----G-A-T-TGC--------G-TGAG--------GAAATG--CG----TCTCTCCATCAGCGGACA--ACT-C-ATGTT---TA--TGGA-TTC--AATGG----TGAAA----G-TG---A--A-TGAATACAGTTAAA--TGAGC-TTTC-AG---TTTTTAATAGACC----------CTTA---GA--AATTACCTG-A--AACTG---TCC-AATT--AATA-AGAA-CA-------AAA------AG--AA-----C-AGCTT-TCAC--AA-GACTGGG-TTT--TT--ATTATTGA-GG-TAT-TTAT--------A-A-ACA-GTTTT-T----TA---CTT---TGGGA--------G--TGG--ACACTTTAGGAAACGACAA---------TGG---ATGTA--TA-G-GAATCACATAAA--AA-TC--A-TTTTGAAC--TGGA--T--T--A---CT-GAA--ACTATC-----CA-AT-CTAT--AATATAAA----GA------GAT---AGT----TT-T-T--AA-------GTA---GG-ATAGG----AAGCCT-CAAAG-CTG-T--A--CGA-T-T-C-T-----------G--TAA-G-A-AAAGAACTGACT------CTC----G------CCCT-------TAC----GGC-CTCGAA-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------ACCAGCAA--T-T----A--CAG-T-TTTCGGCTTATATCCTT
gi|6 : TAAGGAGAGGTT-CAT-TGAACATGGCT-CCAGCTATCGGTA-CAGTCTTG-GGGCGGCA-CGGG---CAC-GTA-GAT--GA---------ATGGTTTGT-AA-------------ATG-GC-CTTGTGAA-T---CCTGCCTCGTTCAC--A-------TG-AGCT--TGGCG-CGGTGTTC-CTGT-AAAA-CATG----AACC-ACC---AAC--GGG-------T-CATCT--CATACGCCGAG---AGATGA--Tagggcaagtataattcagagttttacgcatgactttgcatttaatgcaggctccgtatatttttcgccaaataactatttctcgttgcacttttgctatatttcaggggccagaaaatgggatgtgcacgctctatacctaccaccgacagagacactcaaatactaagcaacatcatctctcggcgtatgagatgacccgttggtggttcatgttttacaggaacaccgcgccaagctcatgtgaacgaggcaggattcacaaggccatttacaaaccattcatctacgtgcccgtgccgccccaagactgtaccgatagctggagccatgttcaatgaacctctcctta
gi|7 : aaggatataagccgaaaactgtaattgctggtgagagaaagaactgattcgaggccgtaagggcgagagtcagttcttttcttacagaatcgtacagctttgaggcttcctatcctacttaaaaactatctctttatattatagattggatagtttcagtaatccagttcaaaatgatttttatgtgattcctatacatccattgtcgtttcctaaagtgtccactcccaaagtaaaaaactgtttataaatacctcaataataaaaacccagtcttgtgaaagctgttctttttgttcttattaattggacagtttcaggtaatttctaagggtctattaaaaactgaaagctcatttaactgtattcattcactttcaccattgaatccataaacatgagttgtccgctgatggagagacgcatttcctcacgcaatcaaatttgagatgagagtcgaaagtgtacaataccggataacgttctcctcagctgatgttcttggtcacaaagcaggagaattgctgcataatgaggcctaactagggcaagtataattcagagttttacgcatgactttgcatttaatgcaggctccgtatatttttcgccaaataactatttctcgttgcacttttgctatatttcaggggccagaaaatgggatgtgcacgctctatacctaccaccgacagagacactcaaatactaagcaacA---GTTAG---GCTTCAT-A--T-CAGCA---TACA--CCT-TC-----TC-TA----ATCAA---GAACA-TCA-C-TG----AG---AA----C-GTTA--T-CG---G--TATT-T-A---------CAC-----TTTC-AC-TCTC-----GTCCCTAAA---ATTTT----G-A-T-TGC--------G-TTAGA-------AAAATG--C-----TCTCTCCATCAGAGG--A--ACT-C-ATGTTT-GTA---TGA-TTC--AATGA----TGAAA----G-TG---A--A-TGAATA---TTAAA--TGA---TTTCAAT---GTTT--ATAGACC-----------TTA---GA--ACTTACCTG-A--AACTG---TCC-AATA--AGT--A-AA-CA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-CA-C--AA-GAAT-GG-TTT--TT--ATTGTTGA-AG-TAT-TCA---------A-A-ACA-G--CT-T----TA---C-C---TGGGA--------G--AGG--ACAC-TTATGAA--GACAA---------TGG---AT---------------------A--AA-TC--A-TTTTA-AC--TGGC--T--T--A--CCT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTA---GG-ATA-G----AAGCTT-CAAA--CTG-T--A--C-A-T-T-C-T-----------G--TAA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCC-------TAC-G--GGC-CTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A-CAG-AA--TGT----A--CAG-T-TTTCGGCTTATATCCTTTACATA-----CATTG-ATTG-
gi|7 : ggcactttggaggccttagtgatcgttttggtaaagatagtgacaagatggcagaatgtgaagagacaaAATGAGTTGTT-CAT-CTA------CT-CCAGC-ATCG-TA-CAGTCTTG-TGGCTGCA-GTGG---CAC-GTAGA----GA---------ATGGTTTGTAAA-------------ATG-GC-ATT-TGAA-T---CCTGCCT-GTTCAC--A-------T--AGCT--CGGCGACGGT-TTT-CTGT-AAAA-CATG----AA-C-A-C---AAC--GGG-------TGCATCTG-CATA--CCA-G---G-ATGA--Taaggcaagtataatcatgagttttacatgcatttgacatttaatgcaggcttatatttttgcaaacactaattctgttcactttttttatatttcaggccagaaaatggcaattgtgacgcactatactgagacaactcaaatatagtacatcatcatcctggtatgcagatgcacccgttgtgttcatgttttacagaaaaccgtcgccgagctatgtgaacaggcaggattcaaatgccattttacaaaccattctctacgtgccactgcagccacaagactgtacgatgctggagtagatgaacaactcatt
gi|8 : ggcactttggaggccttagtgatcgttttggtaaagatagtgacaagatggcagaatgtgaagagacaacaatcaatgtatgtaaaggatataagccgaaaactgtacattctgtgagagaaagaactgatcgaggcccgtagggccgagatcagttctttctcttacagaatgtacagtttgaagcttctatcctacttaaaacattatctcctttgtattaatattggatagtatcaggtaagccagttaaaatgatttatccattgtcttcataagtgtcctctcccaggtaaagctgttttgaatacttcaacaataaaaaccattcttgtgaagctgtttcttttgtttacttattggacagtttcaggtaagttctaaggtctataaacattgaaatcatttaatattcattcactttcatcattgaatcatacaaacatgagttcctctgatggagagagcatttttctaacgcaatcaaaattttagggacgagagtgaaagtgtaaataccgataacgttctcagtgatgttcttgattagagaaggtgtatgctgatatgaagcctaactaaggcaagtataatcatgagttttacatgcatttgacatttaatgcaggcttatatttttgcaaacactaattctgttcactttttttatatttcaggccagaaaatggcaattgtgacgcactatactgagacaactcaaatatagtacatcA---GTTAG---GCTTCAT-A--T-CAGCA---TCC----CT-GC-----TT-TGT---ATCAAA--GAACA-TCA-C-TG----GA---GA----C-GTTAAAT-CG---G--TATT-TTA---------CAA-----TTTC-AC-TCTC-----ATCCCTA-----ATTTT----G-A-T-TGC--------GGTGAGG-------AAAATG--C-----TTCATCCATCAGCGG--A--ACT-C-ATGTT--GTA--T-GA-TTC--AATGG----T-AAA----G-TG---A--AATGAATA---TTAAAA-TGAATTTTTCAAG---TTTT--ATAGACC----------TT-A---GA--AATTAC-TG-A--AACTG---TCCCAATA--A-TA-A-A--CA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-C--C--A--GACT-GGGTTT--TT--ATTATTGA-GG-TAT-TTA---------A-A--CA-G--TT-T----TAA--C-T---TGGGA--------G--TGG--ACAC-TTAGGAAA-GACAA---------TGG---ATATA--TAAG-GAA--ACAT-AA--AAATC--A-TTTTA-AC--TGGAA-T--T--A--ACT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATATAAT---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTA---GG-ATA-G----AAGCCT-CAAA--CTG-T--A--C-A-TAT-CTT-----------G--TAA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCCT------TAC-G--GG--CTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A--AG-AA--TGT----A--CAG-T-TTTCGGCTTATATCCTT
gi|8 : -ATCG-TAACAGTCT-G-TGGCTGCA-GTGG---CAC-GTA-A----GA---------G---------AATGGTTTGTAGTAAATGTGC-CTT-TGAA-T---CCTGC-T-GTTCAC--ACTCATTAT--AGCT--TGGCGACGGT-TTTCCTGTAAAAA-CATGAC--AA-CAACCAAAAAC---GG-------TGCATCTG-CATA--CCA-GGCAG-ATGATGTTCTGATATT-GAGTG--------TTCT-CGTAGGTAATAG--------AG---GCGTCAC-A--T-TTGCAATTTTCTGGCCT-Taagccaagatataatatgtagtttacatggcatttgacattttaatgcaggcttttatatattttttcgcaaaaactatttctgttcacctttttctatatttcaaggccagaaaattgcaaatgtgacgcctctattacctacgagaacactcaatatcagaacatcatctgcctggtatgcagatgcaccgtttttggttgttgtcatgtttttacaggaaaaccgtcgccaagctataatgagtgtgaacagcaggattcaaaggcacatttactacaaaccattctcttacgtgccactgcagccacagactgttacgat
gi|9 : aaggatataagccgaaaactgtacattcttgagagaaagaactgatcgagcccgtaagggccgagatcagttctttctcttacaagatatgtacagtttgaggcttctatcctacttaaaacattatctccattatattaatattggatagtatcagttaattccagttaaaatgatttttatgtttccttatatatccattgtctttcctaagtgtccactcccaagttaaaactgtttaaatacctcaataataaaaacccagtctggaagctgtttcttttgtttattattgggacagtttcagtaatttctaaggtctataaaacttgaaaaattcattttaatattcatttcactttaccattgaatcatacaacatgagttccgctgatggatgaagcattttcctcaccgcaatcaaaattagggatgagagtgaaattgtaaaataccgatttaacgtctccagtgatgttctttgatacaaagcagggatgctgatatgaagcctaactaagccaagatataatatgtagtttacatggcatttgacattttaatgcaggcttttatatattttttcgcaaaaactatttctgttcacctttttctatatttcCTTAAAAC-ATAATTGT---T-ACGCAA--TCC----TTTGT-TA----TT-TTC-G----GTT-GTTA----------TATGG-C-A-T-AAAA---T--CCAT---GTCAAT--TT----AA------AAACAAT---CCAATAAGCTACCT--GTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTAGAAA---T-G--TG-TCCATTA--T------TAAA--C-T-T----AT---T---GGAC-A----G--T-TATT-G---T-CAA------CTTA--TT------GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAACGGATAAAAAG-A-----CA-GA--AGAT-GCGTTTG------T----CAAACAG-AAG--TAAA----TTGTAA--TTTA-AATAAC-ATGAA---TGTC-AC-AGGTAG--AACATCTGAGACCAC------ACTGAAAATCATTC-ATTATTTG--GTCGT---TACTCGTTACCACAC-ATCACATT-TAGAACTTCAAT----TTGAAAGACA----------AATTGTTATGTT-----C------TATA--TG---------------AATTTCTCTTT--AT--TCAGAGGCACATTCAAAA---ACATC-TCCAAATT------GCTTAATTTTTTTTATGATTT---CCTT-
gi|9 : TATGAA-TTTCTCT----TT-ATTCAGAGGCACATTCAAA-AA-CATCTC-----C-----AAAT---TG-CT-------T----AATTTTTTTT---AT-GAT---------TTCCTTATCAGCATC-TTCTGATT--CAC-ATTTCATTTTTT-C---ACTT---CCTG-G-AA-T-GATTTCACT-AAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATTTTGGGTTC---TTTTG-----------TATG-AATGGACTGCCG-ATG----ATCTA-TGTCCAGTTTT--TCAGTAATGAGTTGTT-CAT-CTA------CT-CCAGC-ATCG-TA-CAGTCTTG-TGGCTGCA-GTGG---CAC-GTAGA----GAATGGTTTGTA---------AA-------------ATG-GC-ATT-TGAA-T---CCTGCCT-GTTCAC--A-------T--AGCT--CGGCGACGGT-TTT-CTGT-AAAA-CATG----AA-C-A-C---AAC--GGG-------TGCATCTG-CATA--CCA-G---G-ATGA--Tatcagcatcttctgattcacatttcattttttcacttcctggaatgatttcactaattttcacaagctgggcattttgggttcttttgtatgaatggactgccgatgatctatgtccagtttttcagtaatgagttgttcatctactccagcatcgtacagtcttgtggctgcagtggcacgtagagaatggtttgtaaaatggcatttgaatcctgcctgttcacatagctcggcgacggttttctgtaaaacatgaacacaacgggtgcatctgcataccaggatgatgatgtacta
blockSeqs : C A AAA G CA AATC A AATT C CGTGTA T ACTCTGTACC G CGC G CAT AG AAT AA AA TATAAATGAGGC A TGC G TT AG CA C CAATG T CAGTTTCTACACTATATTTGA ACCAC TA C A TGCT AATGAC GT TATCTG A TT TGTTGTC T T A GTTTTT A TT T TAGGTTGT A C TTTAAGAG T T T ATT T C ATT G CAAGCG ATTCATTAT GA ACC TCGT CAC C A A ATAA C AAATGCATCTTCTCCATACATATAACTCTAAA TCA TCAGAGGCACA C TCA C TG TC CA TTATG ATC T C C C C C T T CAT CTCGCGAG G T GAGA AT T T G ACATGG T C G A T T A ATA C AAGAGAATGGTTTGTAGTAA T A G A TTC C GA CTCATTAT TC GG C A A TATA C A C AAA TCG AGAGTTA G C CG GA GCAG TG T T AAA G ACCAATG ACG TAT A AGT GTT T TC G ATT GG G ATTAATCTTATTA TGT T G A TGCTAGAAACTT T AA C TCA TT G T TGCGTACAG ACTTTT G A GTGCA ATATATATTCTCTCCGATATGCTGGTAGAT GT ACGGTTAC CTACCA AC TC A C TG TTTT G AG TTAT AGTT A CGTACT A CAG AT ATT TGTT TA AACGTCTTGAT T TGG AT C T TT CTT T GG AT G A TACACAC CATAAT AATCAAT G TCA CA G G G GG CA T G A TAATGCCAC G G T TT C ATGATGCCTTG A ATCTTTGT GC AT T AC ATGCGTTTT CGC G AT A A TC A TT A AT T A AT GG GA TT GGC C CA ATATG T C TTG TAT TTGCAT ATA TAT G A TG CTCCATA TAG T AGTAT C CC TCTATC G T A G C TACTAGCTCAAG G G G C ATTAGC ACGG GACTTGCAATG TGAC T A C TCC TC G CCCTCTG C A AT TTTTG CT T A T CACCAT C C
blockSeqs : . A . . . . . AT . TTG . . . GCA . . . . CT A AA A . G . . . . TAGT . GTTTAAGATCGTTATCTCT TA . . . TA . . G . . . . G A TA . . . TGTCA A C TTAC C T . T C . G A . CGTCTA AC . G C . A A . C GGCACATTCATAAACATAACATAACTGCTT C TGTT T . . CT . A TC . . . . . . . . . . CATGA . . . T T . . . . T . . . T . . . AGATGAATGGTTTGTAA . . . . . . . TTA . TG . . . AC . . C . TG . G . . G AT . A G CT . CTA CG GGT T . C . . . A . . TCAATGTA A . . . AGGAGAA G . . C . . . . T . . T ATAATTTTACATTTGC C A TCC . . . . T TT . . . . . AA . . T GC GTT . T T . . C . . GAT C . T . . . . AGAG . CG . . . . . . . . . T . . . . . TACATCC C . . . T A . . A . . . . . . . . . . C AC . . C . . G . . TTA . . . . G . A AA G . GG . G CTA . . . . T GTT A . A . . . TATTCAGGCC G . . T G . . . C C . A . . . A ATAAA C .
blockSeqs : . T . . . . . . . TAG . . . CTA . . . . GA A TA A . G . . . . TAA . TCTTTCAGAAT A . . . C . . . . . . . T A A . . . GT A . TAAA T T . . . . G A . TCA . . . C . A A . T GGCACATTCAAAAACATCTCCAAATTGCTT T GTT A . . TG . A TC . . . . . . . . . . CATGA . . . T T . . . . . . . . G . . . AGAGAATGGTTTGTAAA . . . . . . . TG . T . . . . . . C . G . G . . G AG . A A TT . TCA C AT A . . . . . . . . TTTGTG . . . . AGTAA . . . . . . . . T . . . AAAATTTTGATTGC T A CG . . . . G TG . . . . . A . . A T T . T T . . T . . . . . T . . . . AA . CC . . . . . . . . . . . . . . . TACTT C . . . . . . . . . . . . . . . . . . T A . . T . . . . . AT . . . . . . . T . . T . . TC . . . . . GG G . . . . . GCCTG G . . . . . . . . . . T . . . A CAT .
blockSeqs : . A . . . . . . . TCG . . . GCA . . . . AA A TA A . G . . . . TAC . TTATAAATAAT A . . . T . . . . . . . A A G . . . GT A . TAAA . . . . . . G A . TCA . . . C . A A . T ACCATCTCCACATTGCTTAAAATGC T GTT T . . TG . G TC . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . T . . . AGAGAATGGTTTGTAAA . . . . . . . T . T . . . . . . C . G . G . . A A . G C TT . TCA . A . . . . . . . . . TCTAT . . . . AGAA . . . . . . . . T . . . AAATTTTGATTGT T G C . . . . T T . . . . . A . . . . T . C T . . A . . . . . A . . . . AA . CA . . . . . . . . . . . . . . . TAACT C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . T . . . . . . . . . . G . . TA . . . . . G G . . . . . GCCCT G . . . . . . . . . . G . . . A
blockSeqs : . A . . . . . . . AA . . . GA . . . . AA . CA A . G . . . . ATG . TTAAACTTATT A . . . C . . . . . . . G A G . . . T . . TAA . . . . . . . . . . . . . . . . A . T AATTGTTATGTTCTATATG T GAT . . . CA . A C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . GATAGTGAGAA . . . . . . . T . T . . . . . . C . G . G . . A A . G T . . . . A . . . . . . . . . TCTAT . . . . AGAA . . . . . . . . T . . . AAATTTGATTGC T A C . . . . T T . . . . . A . . . . G . T T . . C . . . . . A . . . . AA . C . . . . . . . . . . . . . . . TACT A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . T . . . . . . . . . . T . . TC . . . . . G G . . . . . GTCC G . . . . . . . . . . G . . . A
blockSeqs : . A . . . . . . . CG . . . GA . . . . CA . AA . . G . . . . TG . TTAAACTTATT A . . . T . . . . . . . . . A . . . T . . . . . AACATCTCCACATTGCTC . AT . . . CT . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . TTGAGAA . . . . . . . T . T . . . . . . C . G . G . . A A . . . . . . . . . TTTGT . . . . AGAA . . . . . . . . T . . . AATTTTGATTGC T G C . . . . . T . . . . . A . . . . T . . . . . A . . . . . A . . . . AA . C . . . . . . . . . . . . . . . TACC G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . C . . . . . . . . . . A . . TC . . . . . A G . . . . . GCCC G . . . . . . . . . . G . . . T
blockSeqs : . A . . . . . . . GA . . . CA . . . . C . AA . . G . . . . TG . TTAACTTATT A . . . T . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . AGAGAT . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . A G . . . . . . . . . TCTA . . . . GAGA . . . . . . . . . . . . TGC T . C . . . . . T . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . AA . A . . . . . . . . . . . . . . . TACC G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . T . . . . . . . . . . A . . TA . . . . . G T . . . . . GTCC G . . . . . . . . . . T . . . T
blockSeqs : . A . . . . . . . CG . . . CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . C . . . . . . . . . . . . . . . TCC G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . T . . . . . . . . . . T . . TA . . . . . T A . . . . . ACCT G . . . . . . . . . . G . . . A
blockSeqs : . . . . . . . . CG . . . . . . . . . . . . . C . . . . . G . . . . . . . . . . T . . TA . . . . . G A . . . . . GCCC G . . . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : . . . C . . . . . T . . . . . . . . . . G . . TA . . . . . G A . . . . . CCCT G . . . . . . . . . . G . . .
blockSeqs : . . . A . . . . . T . . . . . . . . . . G . . TA . . . . . G A . . . . . GCCC G . . . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . C . . . . . G A . . . . . GCC G . . . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . G . . . . . . . . G A . . . . . GCC . . . . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . G . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : . . . . T . .
blockSeqs : .
blockSeqCons : ** **** **** CG****** ********** CA*** *** *** A* NA********** *** ** TG****** TTANACNTANT********************** A***** T**** ****** ****** ******* G****** TGT********* TAAA**** *** G** ****** C** **** GTT********** T* *** AGAGAATGGTTTGTAAA************************** *** T********* ** T* **** G** ******* C** AT* *** *** ** TCTAT********* *** AGAA*********** *** ********* T***** AAATTTTGATTGC******************* C******* T*** **** **** A***** ** *** T********** *** ******* AA******* C*** ********* TACC*********** ** *** ***** T*** *** ** TA***** G************* GCCC************* G*** *** ******* T**** **
originalCons : NNGCTTAAAAC-ATAATTGT---T-ACGCAA--TCC----TTTGT-TA----TT-T-C-G----GTT-GTTA----------TAT-A-C-A-T-AAAA---T--CCAT---GTNAATA-TT----AA------AAACAAT---CCAATAAGTTACCT--GTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTAGAAA---T-G--TG-TCCATTA--T------TAAA--C-T-T----AT---T---GGAC-A----G--T-TATT-G---T-CAA------CTTA--TT------GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAACGGATAAAAAG-G-----CA-GA--AGAT-GCGTTT-------T----CACACAACAAGTTTAAGAGATTTTTAATCTTTATAATAAC-ACGAA--TTGTCTAC-AAGTAG--AACATCTGAGACCGC------ACCGAAAATC--TC-A----TTG--GTCGT---TAC----CAC--CAC-ATCACATTATGAAACTTCTCT----TCGATTCAGA----------AA-CG-CATCTC-----C-----ACATA--TG-CT-------C----AATTTTTTTTT--AT-GTT---------TTCCCTA---GCATC-TTCGGATT--CAC-ATTTCATTTTTTTC---ACTT---CCTT-G-AA-T-GATTTCACT-GAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATCTTGGGTTA---TTTTGC--ATGA-AGTTATG-AACGGACTGCTG-ATG----ATCTA-TGTCCAGTTTTTTTCAGTAATGAGTTGTT-CAT-CTA------CT-CCAGC-ATCG-TA-CAGTCTTG-TGGCTGCA-GTGG---CAC-GTA-A----GA---------G---------AA-------------ATG-GC-CTT-TGAA-T---CCTGCCT-GTTCAC--A-------T--AGCT--TGGCGACGGT-TTT-CTGT-AAAA-CATG----AA-C-ACC---AAC--GGG-------TGCATCTG-CATA--CCG-G---A-ATGA--TCCGNANACT-GA-TG-CCA---CTTTT-C-TA-ATACTAGAA---GTTAG---GCTTCAT-A--T-CAGCA---TTCT--CCT-TC-----TC-TAT---ATCAA---GAACA-TCA-C-TG----AG---AA----C-GTTA--T-CG---G--TATT-T-A---------CAC-----TTTC-AC-TCTC-----ATCCCTA-A---ATTTT----G-A-T-TGC--------G-CGAGA-------AAAATG--C-----TCTCTCCATCAGAGG--A--ACT-C-ATGTTT-GTA--TTGA-TTC--AATGG----TGAAA----G-TG---A--A-TGAATA---TTTAA--TGA---TTTCAAG---TTTT--ATAGACC----------TTTA---GA--ACTTACCTG-A--AACTG---TCC-AATA--AGTA-A-AA-CA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-C--C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTGTTGG-GA-TAT-TTA---------A-A-ACA-G--CT-T----TA---C-C---TGGNA--------G--AGG--ACAC-TTATGAA--GACAA---------TGG---AT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--A-TTTTG-AC--TGGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTA---GG-ATA-G----AAGCCT-CAAA--CTG-T--A--C-A-T-T-C-T-----------G--TGA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCC-------TAC-G--GGC-CTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A-CAG-AA--TGT----A--CAG-T-TTTCGGCTTATATCCTTTACNTAAACACCATTGCATTG-AGGGTTGGGTA
finalCons : NNGCTTAAAAC-ATAATTGT---T-ACGCAA--TCC----TTTGT-TA----TT-TCG------GTT-GTTA----------TAT-ACA---T-AAAA---T--CCAT---GTNAATA-TTNA----------AAACAAT---CCAATAAGTTACCT--GTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTAGAAATG------TG-TCCATTATTANACNTANT----------------------GGACA-----G--T-TATT-GT----CAA------CTTA--TT------GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAACGGATAAAAAGG------CA-GA--AGAT-GCGTTTTGT---------CACACAACAAGTAAA----ATTTTTAATCTTTATAATAAC-ACGAA---TGTCTAC-AAGTAG--AACATCTGAGACCGC------ACCGAAAATC--TC-A----TTG--GTCGT---TAC----CACC--AC-ATCACATTATGAAACTTCTCT----TCGATTCAGA----------AA-CG-CATCTC-----C-----ACATA--TG-CT-------C----AATTTTTTTTT--ATGTT----------TTCCCTA---GCATC-TTCGGATT--CAC-ATTTCATTTTTTTC---ACTT---CCTT-G-AA-T-GATTTCACT-GAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATCTTGGGTTA---TTTTGC--ATGA-AGTTATG-AACGGACTGCTG-ATG----ATCTAT-GTCCAGTTTTTTTCAGTAATGAGTTGTT-CAT-CTA------CT-CCAGC-ATCG-TA-CAGTCTTG-TGGCTGCA-GTGG---CAC-GTAGAGAATGGTTTGTAAA--------------------------ATG-GC-CTT-TGAA-T---CCTGCCT-GTTCAC--AT---------AGCT--TGGCGACGGT-TTT-CTGT-AAAA-CATG----AA-C-ACC---AACG--GG-------TGCATCTG-CATA--CCG-G---A-ATGA--TCCGNANACT-GA-TG-CCA---CTTTTC--TAAT-ACTAGAA---GTTAG---GCTTCAT-A--T-CAGCA---TTCT--CCT-TCTCTAT---------ATCAA---GAACA-TCA-C-TGAGAA-----------C-GTTA--T-CG---G--TATT-T-A---------CACT-----TTC-AC-TCTC-----ATCCCTAAATTTTGATTGC-------------------G-CGAGA-------AAAATGC-------TCTCTCCATCAGAGG--A--ACT-C-ATGTTT-GTAT---GA-TTC--AATGG----TGAAA----G-TGA-----A-TGAATA---TTTAA--TGA---TTTCAAG---TTTT--ATAGACCT----------TTA---GA--ACTTACCTG-A--AACTG---TCC-AATA--AGTA-A-AA-CA-------AAA------GAAA-------C-AGCTTC---C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTGTTGG-GA-TAT-TTA---------A-A-ACA-G--CT-TTACC-----------TGGNA--------G--AGG--ACAC-TTATGAA--GACAA---------TGG---AT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--A-TTTTG-AC--TGGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATC-----CA-AT-ATT---AATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTA---GG-ATA-G----AAGCCT-CAAA--CTGTA-----C-A-T-T-C-TG-------------TGA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----GGCCC-------------TACG---GGC-CTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A-CAG-AA--TGT----A--CAG-T-TTTCGGCTTATATCCTTTACNTAAACACCATTGCATTG-AGGGTTGGGTA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): GATGACATTAGTGATGAAACAGCAGTTTTGTGTATTCATAATATGCATTATTTGATGTGAAGGGA
Alignments
lowQualScore : 11 1111 2222 22222222 3333333333 11111 222 111 11 4444444444 111 11 22222222 33333333333333333333333333333 1 11111 222222 333333 3333333 3333333 11111 2222 333333333 1 333 1 222 333333 2222222222 11 111 2222 111 2222 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111 2222222222222 11111 1 1 1 111 22222222 1 1111 11 111111 1 111 11 11111111 1 111 22222222222 11 11 2222 11 2222222 1111111 1111111 22222222 1 111 222 11 111 33333333333333 222 1 222222222222222 111 444444444 111111 11111 44444444444444444444444444444444 1111111 11 11111 11 1 222 2222 2222 22222222 22 222 1111 33333333333 222 1 111 2222222 1111111111 11111 1111 444444444 222222222222222 11111111 11 11 111111111 111 11 11111 1111 1111111 111 11 1111111 11111111111111 11111111111111111 111 1111111 11111 222222 1
lowQualScore : 8 3 777 4 11 7777 8 2222 4 00000000 4 5555555555 4 66666 000 66 777 1 44 1 3333333333 3 777 1 22 66 66 5 0 66666666 4 88888888888888888888888888888 8 9999 66 4 0 33333 888888 0 66 000000 8 66 2222222 5 6 5 1111111 5 77 5 5 44444 5 6666 888888888 444 7 3 000 8 6 222 9 0 888888 7777777777 88 111 0000 555 6 5 9 1111 8 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 000 8888888888888 8 888 5 22 66 77 33333 888 0 5 5 1 5 5 1 5 2 111 22222222 6 3 4444 44 7 5 5 666666 5 5 5 5 5 0 6 5 777 11 5 3 77777777 5 0 5 5 777 5 33333333333 33 5 11 4 8 5555 4 4 1 777 66 00 8888888 1 8 66 4444444 66 1 77 7 6 6666666 66666666 1 555 000 0 4 11 4 222 66 4 33333333333333 222 0 5 5 555555555555555 5 5 66 5 888 66 5 5 000000000 555555 5 5 77777 5 88888888888888888888888888888888 77 6666666 6 33 5 22222 33 0 55 222 5 66 1111 1111 5 99999999 888 0 11 555 5555 66 99999999999 888 66 4 8 66 333 3 66 444 4 8888888 4444444444 11111 8 8888 66 4 4 4 66 66 4 4 8 000000000 4 4 4 66 4 777777777777777 1 66666666 66 22 8 00 777777777 555 8 66 4 4 66 4 66 4 66 8 4 4 99 22 44 44 555 3 44 33333 6 3 3333 555 777777 444 444 5 2 66 5555555 000 2 888888 2 00 0000000 2 5 2 2 5 55555555555555 4 2 5 0 2 777777 5555 66666666666666666 7777 2 2 5 000 33 2 7777777 5 8 33 00000 66 2 5 1 0 111111 2 3
lowQualScore : . . ... . .. .... . .... . ........ . .......... . ..... ... .. ... . .. . .......... . ... . .. .. .. . . ........ . ............................. . .... .. . . ..... ...... . .. ...... . .. ....... . . . ....... . .. . . ..... . .... ......... ... . . ... . . ... . . ...... .......... .. ... .... ... . . . .... . ......................................................... ... ............. . ... . .. .. .. ..... ... . . . . . . . . . ... ........ . . .... .. . . . ...... . . . . . . . . ... .. . . ........ . . . . ... . ........... .. . .. . . .... . . . ... .. .. ....... . . .. ....... .. . .. . . ....... ........ . ... ... . . .. . ... .. . .............. ... . . . ............... . . .. . ... .. . . ......... ...... . . ..... . ................................ .. ....... . .. . ..... .. . .. ... . .. .... .... . ........ ... . .. ... .... .. ........... ... .. . . .. ... . .. ... . ....... .......... ..... . .... .. . . . .. .. . . . ......... . . . .. . ............... . ........ .. .. . .. ......... ... . .. . . .. . .. . .. . . . .. .. .. .. ... . .. ..... . . .... ... ...... ... ... . . .. ....... ... . ...... . .. ....... . . . . . .............. . . . . . ...... .... ................. .... . . . ... .. . ....... . . .. ..... .. . . . . ...... . .
lowQualScore : 9 4 000 0 00 0000 0 5555 0 44444444 0 0000000000 0 44444 000 11 555 0 44 0 8888888888 2 555 1 22 11 11 0 2 44444444 4 33333333333333333333333333333 9 4444 11 4 0 55555 888888 4 99 000000 9 99 5555555 0 6 0 1111111 7 99 7 0 33333 0 8888 222222222 555 3 3 000 0 7 000 8 7 333333 5555555555 33 777 8888 888 7 0 4 2222 5 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 111 6666666666666 9 888 0 55 99 00 11111 888 0 7 7 4 7 7 4 7 5 777 88888888 7 3 2222 00 3 7 7 444444 7 7 0 0 0 0 2 0 555 22 0 9 44444444 0 0 0 0 555 0 99999999999 88 0 22 4 9 0000 4 4 1 888 11 00 9999999 1 9 11 4444444 11 0 77 8 7 5555555 88888888 7 666 000 8 0 00 0 222 11 4 66666666666666 555 0 0 0 000000000000000 0 0 99 0 888 99 0 0 000000000 888888 0 0 55555 1 11111111111111111111111111111111 00 2222222 6 88 0 55555 88 0 11 555 0 99 2222 2222 0 44444444 888 8 99 666 8888 99 22222222222 888 99 5 9 11 333 3 11 000 4 9999999 9999999999 11111 9 4444 11 4 4 4 11 11 4 4 9 000000000 4 4 4 11 4 222222222222222 0 11111111 11 22 9 66 888888888 666 9 11 4 4 11 4 11 4 11 9 0 0 55 55 66 22 666 1 22 88888 2 1 5555 000 777777 777 777 3 7 33 0000000 000 7 222222 9 77 5555555 7 3 7 7 3 44444444444444 1 7 3 9 7 777777 7777 88888888888888888 2222 5 5 0 666 77 7 3333333 3 0 77 88888 99 5 3 0 8 555555 5 3
consensus : NNGCTTAAAAC-ATAATTGT---T-ACGCAA--TCC----TTTGT-TA----TT-T-C-G----GTT-GTTA----------TAT-A-C-A-TAAAA---T--CCAT---GTNAATA-TTNA----------AAACAAT---CCAATAAGTTACCT--GTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTAGAAA---T-G--TG-TCCATTA--T------TANA--C-T-TA---TT---GGAC-A----G--T-TATT-G---T-CAA------CTTA--TT------GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAACGGATAAAAAG-G-----CA-GA--AGAT-GCGTT-----TTGTCACACA--ACAAGT----AAAATTTTTAATCTTTATAATAAC-ACGAA---TGTCTAC-AAGTAG--AACATCTGAGACCGC------ACCGAAAATC--TC-A----TTG--GTCGT---TAC----CAC--CAC-ATCACATTATGAAACTTCTCT----TCGATTCAGA----------AA-CG-CATCTC-----C-----ACATA--TG-CT-------C----AATTTTTTTTT--AT-GTT---------TTCCCTA---GCATC-TTCGGATT--CAC-ATTTCATTTTTTTC---ACTT---CCTT-G-AA-T-GATTTCACT-GAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATCTTGGGTTA---TTTTGC--ATGA-AGTTATG-AACGGACTGCTG-ATG----ATCTA-TGTCCAGTTTTTTTCAGTAATGAGTTG-TTCAT-CTA------C-TCCAG-C-ATCG-TA-CAGTCTTG-TGGCTGC-AGTGG---CACGT-AGA-GAATGGTTTGTG--AAATG-GC-CTT-TG-AAT---CCTGCCT-GTTCAC-------AT--AGCT--TGGCGAC-GGT-TTT-CTGT-AAAACATG----AA-C-ACC---AA--C-GGG-------TGCATCTG-CATA--CCG-G---A-ATGA--TCCGNA-NACTGA-TG-CCA---CTTTT-C-TA-ATACTAGAA---GTTAG---GCTTCAT-A--T-CAGCA---TTCT--CCT-TC-----TC-TAT---ATCAA---GAACA-TCA-C-TG----AG---AA----C-G-TTA--TC-G---GT--ATT-T-A---------CAC-----TTTC-AC-TCTC-----ATCCCTATA---A-TTTT----G-AT-T-GC--------G-CGAGA-------AAAATG--C-T-----CTCTCCATCAGAGGA--ACT-CATGTTT-GTAT--TGA-TTC--AATGG----TGAAA----G-TG---A--A-TGAATA---TTTAA--TGA---TTTCAAG---TTTT--ATAGACC----------TTTA---GA--ACTTACCTG-A--AACTG---TCC-AATA--AGT-A-A-AACA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-C--C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTGTTGG-GA-TAT-TTA---------A-A-ACA-G--CT-T----TA---C-C---TGGNA--------G--AGG--ACAC-TTATGAA--GACAA---------TGG---AT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--A-TTTTG-A-C--TGGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTA---GG-ATA-G----AAGCCT-CAAA--CTG-T--A--C-A-T-T-C-T-----------G--TGA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCC-------TAC-G--GGC-CTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A-CAG-AA--TGT----A--CAG-T-TTTCGGCTTATATCCTTTACNTAAACACCATTGCATTG-AGGGTTGGGTA
Reference ( family-455 ) : NNGCTTAAAAC-ATAATTGT---T-ACGCAA--TCC----TTTGT-TA----TT-T-C-G----GTT-GTTA----------TAT-A-C-A-TAAAA---T--CCAT---GTNAATA-TTNA----------AAACAAT---CCAATAAGTTACCT--GTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTAGAAA---T-G--TG-TCCATTA--T------TANA--C-N-TA---NT---GGAC-A----G--T-TATT-G---T-CAA------CTTA--TT------GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAACGGATAAAAAG-G-----CA-GA--AGAT-GCGTT-----TTGTCACACA--ACAAGT----AAAATTTTTAATCTTTATAATAAC-ACGAA---TGTCTAC-AAGTAG--AACATCTGAGACCGC------ACCGAAAATC--TC-A----TTG--GTCGT---TAC----CAC--CAC-ATCACATTATGAAACTTCTCT----TCGATTCAGA----------AA-CG-CATCTC-----C-----ACATA--TG-CT-------C----AATTTTTTTTT--AT-GTT---------TTCCCTA---GCATC-TTCGGATT--CAC-ATTTCATTTTTTTC---ACTT---CCTT-G-AA-T-GATTTCACT-GAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATCTTGGGTTA---TTTTGC--ATGA-AGTTATG-AACGGACTGCTG-ATG----ATCTA-TGTCCAGTTTTTTTCAGTAATGAGTTG-TTCAT-CTA------C-TCCAG-C-ATCG-TA-CAGTCTTG-TGGCTGC-AGTGG---CACGT-AGA-GAATGGTTTGTA--AAATG-GC-CTT-TG-AAT---CCTGCCT-GTTCAC-------AT--AGCT--TGGCGAC-GGT-TTT-CTGT-AAAACATG----AA-C-ACC---AA--C-GGG-------TGCATCTG-CATA--CCG-G---A-ATGA--TCCGNA-NACTGA-TG-CCA---CTTTT-C-TA-ATACTAGAA---GTTAG---GCTTCAT-A--T-CAGCA---TTCT--CCT-TC-----TC-TAT---ATCAA---GAACA-TCA-C-TG----AG---AA----C-G-TTA--TC-G---GT--ATT-T-A---------CAC-----TTTC-AC-TCTC-----ATCCCTA-A---A-TTTT----G-AT-T-GC--------G-CGAGA-------AAAATG--C-T-----CTCTCCATCAGAGGA--ACT-CATGTTT-GTA---TGA-TTC--AATGG----TGAAA----G-TG---A--A-TGAATA---TTTAA--TGA---TTTCAAG---TTTT--ATAGACC----------TTTA---GA--ACTTACCTG-A--AACTG---TCC-AATA--AGT-A-A-AACA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-C--C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTGTTGG-GA-TAT-TTA---------A-A-ACA-G--CT-T----TA---C-C---TGGNA--------G--AGG--ACAC-TTATGAA--GACAA---------TGG---AT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--A-TTTTG-A-C--TGGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTA---GG-ATA-G----AAGCCT-CAAA--CTG-T--A--C-A-T-T-C-T-----------G--TGA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCC-------TAC-G--GGC-CTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A-CAG-AA--TGT----A--CAG-T-TTTCGGCTTATATCCTTTACNTAAACACCATTGCATTG-AGGGTTGGGTA
gi|1 : TAAGACCATA--TGT---T-ACGCAACATCCAATCTTTGTATAAATTTT-T-C-GTGTAGTT-GTTAACTCTGTACCTAT-A-C-GCTAAGACATT--CCATAATGTGAATA-TTTATAAATGAGGCAAAAAATTGCCCAATAA-TTACCTTTGTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTAAAAACAAT-G--TG-TCCATTG--CAGTTTCTACA--C-TATA---TTTGAGAACTA----G--T-TATTAG---TACAAAATGACTTTA--TTTATCTGAGACAAGTGCC--AGTGTTGTCAT-ATACAGATAAA--T-GTTTTTCA-TG--AGAT-GCGTT-----TTGTCACACACAACAAGTTTAAGAGATTTTTAATCTTTATAATAACTACGAAATTTGTCTAC-AAGTTATTAACATCAG-GACAGCCAAGCGACCGAAAATC--TC-A----TTG--GTCGT---TAC----CAC---AC-ATCACATTATGAAACTTCTACATAATCGATTCAGA----------AAATG-CATCTT-----CTCCATACATA--TAACT-------CTAAAAATTTTTTTTC--GTTGTT---------TTCCCTA---GCATC-TTTGGGTT--CAC-ATTTCATTTTTT-C---ACTT---CCTTTG-AA-TCGATTTCACT-GAT-TTTTCAC-AAGCTGGGCATCTTGGGTTA---TTTTGC--ATGA-AGTTATG-AACGGACTGCTGTATG----ATCTA--GTCCAG-TTTTTTCAGTAATGAGTTG-TTCAT-CTA------C-TCCAG-C-ATCA-TA-CAGTCTTGTTGGC-AC-AGTGGATATACGT--GA-TAGTGA-----G--AAATG-GTACTT-TG-TATTTCCCTGCCT-GTTCAC-------ATTAGGCTTCTGGCGAC-GA--TTT-CTGT-AAAACATGTATAGA-C-ACC---AA--CTGAGAGAGTTATGCATCTGCCATA--CCG-G---A-ATGA--TCCGTA-TACTAA-TG-CTA---CTTTT-C-TA-ATACTAGAAAGTATTAGGTTGCTTCAT-ATCT-CAGCA---TTCT--CCT-TTATTAATCTTATTA-GTCAATGTGAACATTCA-C-TGTGCTAG---AAACTTC-A-GTA--TC-GC--GT--ATT-T-ATGCGTACAGCAC------TTC-AC-TCTC-----ATCCCTATATATA-TTCTCTCCG-ATAT-GCTGGTAGATG-CAAAA-------AAATTGTCC-T-----TTTTCCATCAGAGGA--ACT-CATGTTT-GTATTTTGA-TTC--AATGGTTATTGAAAAGTTG-TGCGTACTA-TGACTA---TTTAAT-TGAT--TTTCAAG---TTTT--ATAGACC-----------TTA---GA--ACTTACCTGTA--AACTACTTTCCTAATA--AGT-T-A-AACATACACACAAA------GAAGAG-----CGAGCTTCC--C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTGTTGG-GA-TATATTATAATGCCACA-A-ACA-G--CT-TATGATG---C-CTTGTGGCA--------G--AGGATACAC-TTATTGA--GACAA---------TGGCGCAT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--ATTTTTG-A-C--TGGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATCG----CATAT-AT-TTAAATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTAG--GG-ATA-G----AAGCCT-CAAACCCTGCT--A--C-ATT-T-C-T-----------GTTTTA-G-AGAAAGTAAT---T------CTC----GTATTCAGGCC-------TACTGACGGC-CTCG-A-TCAGCTTCCCT--TTCT-CTTCCCTCTGA-CAGAAA--TGTTTTGACTCAG-TATGTCGGCT
gi|10 : aTATAAC-ATAATTAT---T-ATGCAA--TCC----TTTGT-TA----TT-T-TTG----GTTTGTTG-----------AT-A-G-A-TAAAA---T--CCAT---TTAAATAATTAA----------AAACAAT---CCAATAAGTTACCT--GTA--CGCATGTCC--ACAAATTTAGAAA---T-AGTTGTTCCATTAGTT------TAAGATCGT-TATCTCT---GAGT-ACCACG--TCTATT-GTGCT-CAA------C-TAGTTT------AGACA-GTGCCTTAG-------GT-AAAGGTATATAAAGTA-----CA-GATTAGAT-GCATTTTAGGTTGTCTC-CA--ACAGAT----TACATATTTAATC-TAATATTAGC-ATGAAT--TGTC-AA-AGGTAG--AACATCTTGAACCAC------ACTGAAAATCCGTCTA----TTGGAGTTGT---TACG---CAC--CAC-AT---ACT-TGAA------CT----TCAATTTTGA----------AA-gtgagtatccatggctacagtg
gi|10 : AATTTCTCT----T-GATTCAGA----------GG-CA-CAT-TCATAAACATA--ACATAACTG-CT-------T----AATTTTTTTTTCAAT-AT---------------CA---GCATC--------T--CA----------TTTTTC---ACTT---CCTT-G-AA-T-GATTTCACT-GAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATCTTGGGTTC---TTTTG-----------TATG-AACGGACTGCTG-AAG----ATCTA-TGTCCAGTTTTTTTCAGTAATGAGTTagacaattcgttatgtttatttgaatttctcttgattcagaggcacattcataaacataacataactgcttaatttttttttcaatatcagcatctcatttttcacttccttgaatgatttcactgattttcacaagctgggcatcttgggttcttttgtatgaacggactgctgaagatctatgtccagtttttttcagtaatgagtt
gi|11 : tataacataattattatgcaatcctttgttatttttggtttgttgatagataaaatccatttaaataattaaaaacaatccaataagttacctgtacgcatgtccacaaatttagaaatagttgttccattagtttaagatcgttatctctgagtaccacgtctattgtgctcaactagtttagacagtgccttaggtaaaggtatataaagtacagattagatgcattttaggttgtctccaacagattacatatttaatctaatattagcatgaattgtcaaaggtagaacatcttgaaccacactgaaaatccgtctattggagttgttacgcaccacatacttgaacttcaattttgaaaagacaattcgttatgtttatttg--A--CCT-GGG--CCTGTC-----CA-TT-TT-T--AGAACAAA---A-A------TGC---AAC---GTT-T-T--CA-------GTT---GC-ATA-T----TAACCT-AAAA--TTG-T--C--C-A-T-T-C-T-----------G--TGA-G-AGAAAGAACTAA-TATTAGCCTTACGGG------GTCC-------TAC-G--GGC-CTTG-A-TCGATT---CT--TTCT-CTC-------A-CAA-AA--TGA----A--TAG-T-TTT-------TATCCTGTACTTAAACA----TGCATT
gi|12 : ggtttaATTGTAAAT-GTGTAA--TCA----TTTAT-TA----TTCT-A-A----GCT-TTGA----------TAT-A-----TAAAA---TAGTC-T---GCCTACA-TTTA----------AAAC-------------GTTACCT--GTA--GG--TATCC-AATACGTTGACAAT---TAA--TG-TCCATTA--T------CTTT--C-A-GA---AT---GGAC-A----GTAT-TATT-G---C-CAA------CATA--TTG-----GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAtaccaatgtcaataggtttcatattacatgtgtttgtaaatctctcaccaatactatttcttactttctttttaacatccaagttgt
gi|13 : ctatatttaaagTTTA-A-A--TGGA--T--TTTA--TCT--ATCAACAAAC-----CA-AA-AA-T--AA--CAAA---GGATTGCATAAT---AATTATGTT-A-T--AAAA-----GTA---GG-ATA-G----AAGCCT-CAAA--CTA-T--A--C-A-T-T-C-T-----------G--TAA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCC-------TAC-G--GGC-TTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A-CAG-AA--TGT----A--CCG-T-TTTCGGCTTATATCCTTTACTGAAA-ATAAATGCATTA-AAGttattagatgtttacaggttgcctgaaaacaagagaaaaagatgatgcatttgtttaaacataaacaaattcaattctaaat
gi|14 : atta------GAT---AAT---GTTGT-T--GAT------GCA---TGTAT--T----AAGC-T-CAAA--CTG-C-----C-G-T-T-CCT-----------A--TGA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTT----A------GTCC-------TAT-G--GCA-ATTG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A-T-G-AA--TGG----A--C-G-T-TTGAGGCTTATATCTTTTttaccaagatgcgttgactgcgtgata
gi|15 : ttgcatgactatgaaCTG-A--AACTG---TCC-AATA--AGT-T-A-AACA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-CG-C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTGTTGG-GT-TAT-TTA---------A-A-ACA-G--CT-T----TA---C-T---TGAAA--------G--AGG--ACAC-TTATGAA--GACAA---------TGG---AT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--A-TTTTA-A-C--TAGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-C--AATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-TTGAA---------A---AG-ATA-A----AAatatataaaggttgtgattccaacgatgacattattcaatgatggaccaacagttttgtgtattgcacatgcattgtttgatctgaagagaa
gi|16 : at--T--T--A--TCT-GAT--TCCACC-----CC-AC-AT---------AAA---GAA------AAG---CAT---GTT-T-T--AA-------TTA---AG-AGA-A----AAGCCA-CAAA--CTA-T--C--A-A-C-T-C-T-----------G--TGA-A-AGAAAGAACTAA-----------------------------------------------A-A-TTAGTT---CT--TTTT-CTC-------A-CAG-AA--TGG----A--CAG-C-GTTTGGCCTTTCACTTTTACATA
gi|17 : acAATT---CT--TTCT-CTC-------A-CAG-AA--TGG----G--CAG-A-TTTCGGTCTTTCTCCTGTACATAacaaaa
gi|18 : catcactacatg--T--T--A--TAT-GAT--G-TATC------A-AT-AT-TTGAATACA----------------C---AAT---GCT-T-T--AACTCCATAGCA---AG-GTA-T----TAGCCT-GAAA--CTG-T--C--C-A-T-T-C-T-----------T--TGA-G-AGAAAGAACTAA-T------CTC----G------GCCTG------TA--G--GGC-Ccagctctatcgtatcaagccagctaaagtcaagtacatgtactttttccagtacaacaactctggagtttgaa
gi|19 : tttaattacatgtatttccACAAA---AGA------TGC---ACT---AGT-C-T--AA-------GTA---GG-ATA-T----AAGCAC-AAAA--CTA-TCTATCC-A-T-T-C-T-----------G--TGA-GGAAAAAGAATTAA-T------CAC----A------ACCT-------TAC-G--GAC-CTTG-A-TCAGTT---aa
gi|2 : aacgaaaacaacaTAAGACCATA--TGT---T-ACGCAACATCCAATCTTTGTATAAATTTT-T-C-GTGTAGTT-GTTAACTCTGTACCTAT-A-C-GCTAAGACATT--CCATAATGTGAATA-TTTATAAATGAGGCAAAAAATTGCCCAATAA-TTACCTTTGTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTAAAAACAAT-G--TG-TCCATTG--CAGTTTCTACA--C-TATA---TTTGAGAACTA----G--T-TATTAG---TACAAAATGACTTTA--TTTATCTGAGACAAGTGCC--AGTGTTGTCAT-ATACAGATAAA--T-GTTTTTCA-TG--AGAT-GCGTT-----TTGTCACACACAACAAGTTTAAGAGATTTTTAATCTTTATAATAACTACGAAATTTGTCTAC-AAGTTATTAACATCAG-GACAGCCAAGCGACCGAAAATC--TC-A----TTG--GTCGT---TAC----CAC---AC-ATCACATTATGAAACTTCTACATAATCGATTCAGA----------AAATG-CATCTT-----CTCCATACATA--TAACT-------CTAAAAATTTTTTTTC--GTTGTT---------TTCCCTA---GCATC-TTTGGGTT--CAC-ATTTCATTTTTT-C---ACTT---CCTTTG-AA-TCGATTTCACT-GAT-TTTTCAC-AAGCTGGGCATCTTGGGTTA---TTTTGC--ATGA-AGTTATG-AACGGACTGCTGTATG----ATCTA--GTCCAG-TTTTTTCAGTAATGAGTTG-TTCAT-CTA------C-TCCAG-C-ATCA-TA-CAGTCTTGTTGGC-AC-AGTGGATATACGT--GA-TAGTGA-----G--AAATG-GTACTT-TG-TATTTCCCTGCCT-GTTCAC-------ATTAGGCTTCTGGCGAC-GA--TTT-CTGT-AAAACATGTATAGA-C-ACC---AA--CTGAGAGAGTTATGCATCTGCCATA--CCG-G---A-ATGA--TCCGTA-TACTAA-TG-CTA---CTTTT-C-TA-ATACTAGAAAGTATTAGGTTGCTTCAT-ATCT-CAGCA---TTCT--CCT-TTATTAATCTTATTA-GTCAATGTGAACATTCA-C-TGTGCTAG---AAACTTC-A-GTA--TC-GC--GT--ATT-T-ATGCGTACAGCAC------TTC-AC-TCTC-----ATCCCTATATATA-TTCTCTCCG-ATAT-GCTGGTAGATG-CAAAA-------AAATTGTCC-T-----TTTTCCATCAGAGGA--ACT-CATGTTT-GTATTTTGA-TTC--AATGGTTATTGAAAAGTTG-TGCGTACTA-TGACTA---TTTAAT-TGAT--TTTCAAG---TTTT--ATAGACC-----------TTA---GA--ACTTACCTGTA--AACTACTTTCCTAATA--AGT-T-A-AACATACACACAAA------GAAGAG-----CGAGCTTCC--C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTGTTGG-GA-TATATTATAATGCCACA-A-ACA-G--CT-TATGATG---C-CTTGTGGCA--------G--AGGATACAC-TTATTGA--GACAA---------TGGCGCAT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--ATTTTTG-A-C--TGGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATCG----CATAT-AT-TTAAATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTAG--GG-ATA-G----AAGCCT-CAAACCCTGCT--A--C-ATT-T-C-T-----------GTTTTA-G-AGAAAGTAAT---T------CTC----GTATTCAGGCC-------TACTGACGGC-CTCG-A-TCAGCTTCCCT--TTCT-CTTCCCTCTGA-CAGAAA--TGTTTTGACTCAG-TATGTCGGCT
gi|20 : aCTCAAAAC-ATTTTTGT---T-ACGTTA--TCT----TTTGT-TA----TT-T-TAG----GCT-TTTA----------TAT-A-G-A-CGAGAG--T--CCA----GCCG-TA-TTTA----------AAAT-------------GTTACCT--ATA--GG--TGTgtgagtatccatggctacagtg
gi|21 : tgtgaacatttaaatcccGT----A--CAG-T-TTGAGGCTTATATCCTTTACATA
gi|22 : ggcacttgcggccgtataagggaccgccatttttaaaagatcgtatccgacagatatttggcgaagaagcagA---GCATC-TTCTGATT--CAC-ATTTCATTTTT--C---ACGT---CCTT-G-AA-T-GTTTTCACT-GAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATCTTGnc
gi|23 : AAAAAGTTGCCT--GTA--GG--TGTCC-AATAAGTGGACAAT---T-AC-TG-TACATTAT-T------TATA----A-CA---AT---GGAG-A----G--T-
gi|23 : tgtactt-TCCATTG--T------TATA--A-A-TA---AT---GTAC-A----G--T-AATT-G---T-CCA------CTTA--TT------GGACA-
gi|25 : tgtacttaaaaagttgcctgtaggTTAAAAC-ATAATTGT---T-ACGCAA--TCC----TTTAT-------TT-T-C-G----GTT-GTTA----------TAT-AGC-A-TATAA---T--CCgagt
gi|26 : gggca-A-T-T-C-T-----------G--T-A-G-AGAAAGAACCGA-T------ATC----G------GACTTGCAATGTAC-G--TGC-CTCG-A-CCAGTT---
gi|27 : -A-TCAGTT---CT--TTCT-CGC-------A-CAA-AA--TGG----A--CAGTT-TTTCGACTTTTA--CTTTACATAA
gi|28 : GTTTAAAAC-ATGATTGT---G-ACGTAA--ACC----TT--T-TG----TT-T-G-A----ATT-GTC-----------CAT-A-CTA-TAa
gi|29 : ------GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAACATATAAAAAG-A-----CA-GA--AGAT-GCG-T-----TTGTCAAACg
gi|3 : TAAAAC-ATAATTGT---TGACGCAA--TCC----TTTGT-TAAT--TT-T-C-G----GTT-GTTA----------TAT-AGC-A-ATAAA---T--CCAT---GTAAAT--TTCA----------AAACAAT---CCAATAAGTT-CCT--GTAAGCG--TGTCCCAATAAGTTTAGAAAA--T-G--TG-TCCATTA--T------TA-A--C-T-TA---TT---GGAC-A----G--T-TATT-G---C---A------CTTA--TT------G-ACA--TGTC--AG-------GTTAAACG-ATAAAAAG-G-----CAAGA--AGATTGCGTT-------GTCAC-CA--A-AAGT----AAA--TTTTAATCCTAATAACAAC-GC--A---TGTCCACCAAGTA----AC-TCTGAGACCAC------ACCGAAAATC------------GACGTCGTACCCAC----CCC--CACCATCACATTATGAAACTTCTCT----T-GATTCAGA----------A--C--CATCTC-----C-----ACAT---TG-CTTAAAATGC----GATTTTTTTTT--AT-GTT---------TTCC-TA---GCATCCTTTGGACTTCCACCATCTTTCCTTTTTC---ACCTATCCCTT-GCAACT-GATCTACCTCGATCTTT-CCCTCAGCTGGG--TCTTG--CTACATTTCTGCTCGCGAGAGTTATGGAACGGACTGCTG-ATGGAGAATCTAATCTCCAGTTTTTTTCAGTAATGAGTTGTTTCATGCTA------CTTCCAGCC-ATCG-TA-CAGTTTTG-TGGCTACAAGTGG---CAC-----------CGCTTGAG--AAATG-TC-CTT-TGAAAT---CCCGCCT-GTTCACGA-----AT--AGCT--TGGTGACGGGG-TTT-CTGTAAAAACATG----AA-C-ACC---AACTC-GGG-------TG-ATCTG-CATA--CCG-A---ATATG---TCCGAAGAAAAGA-TG-TCA---CTTTT---TA-A-ACT-GAA---GTTAGC--GCTTCAT-A--T-CAG-A---TTCT--CCT-TC-----TC-TAT---ATCAA---G-ACA-TCA-CATG----AG---AA----CTG-TTA--TC-G---GT--ATT-T-A---------CAC-----TTTC-AC-TCTCT----ATTCC--------------------T-T-GC--------G-TGAGA-------CAAATG--C-T-----CTCTCCATCAGAGGATCACTCCATGTTG-GTA---TGA-TTC--AATGG----TGAAA----G-TG---A------AATA---TTTAA---GA---TTTCAAAGT-TTTT--ATAGACC-----------TTA---GA--A-TTACTAA-A--AACTG---TCC--ATA--AGTAA-A-AACA-------AAA------G---AA-----C-AGCTT-C--CCAAA-GAC--GG-TTTGGTT--A-TGTTGG-GAGTAT-TTA---------AGA-ACA-G--CT-T----T----C-C---TGGCA--------AGCAGG--ACCT-TTATGAA--GACAA---------TGG---AT-TAATCA-G-GAA--AC-T-AA--AA-TC--T-TTTTG-ACC--TGGAGGTGAT--A--GTT--AT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATACAA-----GA------GAT---AAT---GTT-T-TA-AA-------GTA---GG-ATA-G----AAG-CT-CAAA--CTG-T--A--C-A-T-T-C-TG----------G--TAA-GAAGAAAGAACTGA-T-------TC----G------G-CC-------TAC-G--GGC-CTCG-ACTCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A-C-G-AA--TGT----A--CAG-T-TTTCGGCTTATATCCT
gi|30 : c--GGC-CTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTT-------A-CAG-AA--AGG----A--CAG-
gi|4 : GCTTAAAAC-ATAATTGT---T-ACGCAA--TCC----TTTGT-TA----TT-T-C-G----GTT-GTTA----------TAT-G-C-A-TAAAA---T--CCAT---GTAAAT--TTAA----------AAACAAT---CCAATAAGTTACCT--GTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTAGAAA---T-G--TG-TCCATTA--T------TAAA--C-T-TA---TT---GGAC-A----G--T-TATT-G---T-CAA------CTTA--TT------GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAACGAATAAAAAG-G-----CA-GA--AGAT-GCGTT-----TT--CACACA--A-AAGT----AAA--TTTTAATCT--A-AATAAC-ACGAA---TGTC-AC-AAGTAG--AACATCTGAGACCAC------ACCGAAA-----TC-A----TTG--GTCGT---TAC----CAC--CAC-ATCACATTATGAA-CTTCTCT----TTGATTCAGA----------AA-C---ATCTC-----C-----ACAT---TG-CT-------C----AATTTTTTTTT--AT-GTT---------TTCCTTA---GCATC-TTTGGATT--CAC---TTCATTTTTTTC---ACTT---CCTT-G-AA-T-GATTTCACT-GAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATCTTGG-TTA---TTT-GC--ATGA-AGTTATG-AACGGACTGCTG-ATG----ATCTA-TGTCCAGTTTTTT-CAGTAATGAGTTG-TTCAT-CTA------C--CCAG-C-ATCA-TA-CAGTCTTG-TGGCTAC-AGTGG---CACGT-AGA-GA--------TA-----TG-GT-CTT-TG-AAT---CCTGCCT-GTTCAC-------AT--AGCT--TGGCGAC-GAT-TTT-CTGT-AAAACATG----AA-C-ACC---AA--C-GGG-------TGCATCTG-CATA--CCG-----A-AT-A--TCCGAA-AA--GA-TG-TCA---CTTTT----A-A-ACT-GAA---GTTAG---GCTTCAT-A--T-CAGCA---TTCT--CCT-TT-----TC-TAT---ATCAA---GAACA-TCA-C-TG----AG---AA----C-G-TTA--TC-G---GT--ATT-T-A---------CAC-----TTTC-AC-TCTC-----ATCCCTA-A---A-TTTT----G-AT-T-GT--------G-TGAGG-------AAAATG--C-T-----CTCTCCATCAGAGGA--ACT-CATGTTT-GTA---TGA-TTC--AATGG----TGAAA----G-TG---A--A-TGACTA---TTTAA--TGA---TTTCAAG----TTT--ATAGACC----------TTTA---GA--ACTTACCTG-A--AACTG---TCC-AATA--AGT-A-A-AACA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-C--C--AA-GACT-GG-TTT--TT--ATTG-TGG-GA-TAT-TTA---------A-A-ACA-G--CT-T----TA---C-C---TGGCA--------G--AGG--ACAC-TGATGAA--GACAA---------TGG---AT-TA--TA-G-GAA--ACAT-AA--AA-TC--A-TTTTG-A-CT-TGGA--T--T--A--CCT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTA---GG--TA-G----AAGCCT-CAAA--CTG-T--A--C-A-T-T-C-T-----------G--TAA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCC-------TAC-G--GGC-CTCG-A-TCAGTTG--CT--TTCT--TC-------A-CA--AA--TGT----A--CAG-T-TGTCGGCTTATATCCTTTACTTAAACACCATTGCATTGCAGGGTTGGGTA
gi|5 : taCTTC-T-A--A-CA--A---TTAT--CTTGTC-----TC-AATGTAATCA----GAACA-TCA-C-TG----AGT--AA----C-GGTTA--TC-GTCAGTTTATT-T-A---------CACACTTTTTTC-TCATCTCGTGCAATCACCATA---A-TTTT----ACAT-TTGC--------G-TGAGACGGTTACAAACTG--C-TACCATCTCTCAAGCAGAG-A--ACTACATGTTTGGTAT--TGAGTTCAGAAT-G----TGAAA----GATGA--A--A-TGAATA---TCTAAATTGA---TTTCAGATGTTTTT--ATAGGACAACGTCTTGATTTATGGGAATATTTACCTG-ATTAACTGGATTCC-GATAGGAGT-ATA-ACCA-------AAACATAATGA--AATCAATC-AGCTC-A--C--AAGGACT-GG-ATT--TTCAATTGTAGGTGA-TAT-TTA---------A-AGACATG--TTCT----TACATC-C---TGGAGATCTTTGTG--AGA--CCACTTTAGGAA--GACAAATGCGTTTTTGT---AC-TA--TG-GAAAA--ACAG-AATTAA-TCATA-TTCTA-A-CATTGGGACT--T--AGGCCTCGCA--ATTATCATATGCA-ATCAT-G--AATATACATATGTA------TGTATAAAT---GTTGTAT--AA-------GTATAGAG-ATA-AGTATAGGCCTCCAAA--CTG-------C-A-T-TGC-TTACTAGCTCAAG--TAAGG-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------G-CC-------TAC-G--GGCTCTCG-ATTCAGTT---CTTCTTCTGCTC-------ACCAG-AAATTGT----A--CAG-T-TT---GC-TACGTCCTTTACTCA
gi|5 : ctatgatgtaaaaggga-CTGG-AAGAAAAG----GA-C-ACC---AA--C--GG-------T-CATC-G-CATA--CCA-G---A---------TAGA-CATTGA-TGACCAATGCTTGTACGTATATATTTGAA---GTT------CTTC------T-CAGtgctggataatggaagtcctttaactaggcaagtataatttaagagtttttacatggcatttgacaacttaaaagcatatgctaggcttatttattctggcataaaatctatgtttgcgctgttttccaaacttttatgctatatttttcaggctcagaacatggcaatgatgaacgcaactatcacctgagaagaacttcaaatatatacgtacaagcattggtcatcaatgtctatctggtatgcgatgaccgttggtgtccttttcttccag
gi|6 : ctatgatgtaaaagggatgagtaaaggacgtagcaaactgtacaatttctggtgagcagaagaagaactgaatcgagagcccgtaggccgagatcagttctttctccttacttgagctagtaagcaatgcagtttggaggcctatacttatctctatacttatacaacatttatacatacatatgtatattcatgattgcatatgataattgcgaggcctaagtcccaatgttagaatatgattaattctgtttttccatagtacaaaaacgcatttgtcttcctaaagtggtctcacaaagatctccaggatgtaagaacatgtctttaaatatcacctacaattgaaaatccagtccttgtgagctgattgatttcattatgttttggttatactcctatcggaatccagttaatcaggtaaatattcccataaatcaagacgttgtcctataaaaacatctgaaatcaatttagatattcatttcatctttcacattctgaactcaataccaaacatgtagttctctgcttgagagatggtagcagtttgtaaccgtctcacgcaaatgtaaaattatggtgattgcacgagatgagaaaaaagtgtgtaaataaactgacgataaccgttactcagtgatgttctgattacattgagacaagataattgttagaagtgctggataatggaagtcctttaactaggcaagtataatttaagagtttttacatggcatttgacaacttaaaagcatatgctaggcttatttattctggcataaaatctatgtttgcgctgttttccaaacttttatgctatatttttcaggctcagaacatggcaatgatgaacgcaactatcacA---GTTAG---GCCTCATTA--TGCAGCAA--TTCT--CCT-GC-----TT-TGTG--ACCAA---GAACA-TCAGC-TG----AGGAGAA----C-G-TTA--TCCG---GT--ATTGT-A---------CAC-----TTTCGAC-TCTC-----ATCTC-A-A---A-TTT-----G-AT-T-GC--------G-TGAGG-------AAA-TG--CGT-----CTCTCCATCAGCGGACAACT-CATGTTT-ATG----GA-TTC--AATGG----TGAAA----G-TG---A--A-TGAATACAGTTAAA--TGAGC-TTTCA-G---TTTTTAATAGACC----------CTTA---GA--AATTACCTG-A--AACTG---TCC-AATT--AAT-A-AGAACA-------AAA------AG--AA-----C-AGCTT-TCAC--AA-GACTGGG-TTT--TT--ATTATTGA-GG-TAT-TTAT--------A-A-ACA-GTTTT-T----TA---CTT---TGGGA--------G--TGG--ACACTTTAGGAAACGACAA---------TGG---ATGTA--TA-G-GAATCACATAAA--AA-TC--A-TTTTGAA-C--TGGA--T--T--A---CT-GAA--ACTATC-----CA-AT-CTAT--AATATAAA----GA------GAT---AGT----TT-T-T--AA-------GTA---GG-ATAGG----AAGCCT-CAAAG-CTG-T--A--CGA-T-T-C-T-----------G--TAA-G-A-AAAGAACTGACT------CTC----G------CCCT-------TAC----GGC-CTCGAA-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------ACCAGCAA--T-T----A--CAG-T-TTTCGGCTTATATCCTT
gi|6 : TAAGGAGAGG-TTCAT-TGAACATGGC-TCCAG-CTATCGGTA-CAGTCTTG-GGGCGGC-ACGGG---CACGT-AGATGAATGGTTTGT---AAATG-GC-CTTGTG-AAT---CCTGCCTCGTTCAC-------ATG-AGCT--TGGCG-C-GGTGTTC-CTGT-AAAACATG----AACC-ACC---AA--C-GGG-------T-CATCT--CATACGCCGAG---AGATGA--Tagggcaagtataattcagagttttacgcatgactttgcatttaatgcaggctccgtatatttttcgccaaataactatttctcgttgcacttttgctatatttcaggggccagaaaatgggatgtgcacgctctatacctaccaccgacagagacactcaaatactaagcaacatcatctctcggcgtatgagatgacccgttggtggttcatgttttacaggaacaccgcgccaagctcatgtgaacgaggcaggattcacaaggccatttacaaaccattcatctacgtgcccgtgccgccccaagactgtaccgatagctggagccatgttcaatgaacctctcctta
gi|7 : aaggatataagccgaaaactgtaattgctggtgagagaaagaactgattcgaggccgtaagggcgagagtcagttcttttcttacagaatcgtacagctttgaggcttcctatcctacttaaaaactatctctttatattatagattggatagtttcagtaatccagttcaaaatgatttttatgtgattcctatacatccattgtcgtttcctaaagtgtccactcccaaagtaaaaaactgtttataaatacctcaataataaaaacccagtcttgtgaaagctgttctttttgttcttattaattggacagtttcaggtaatttctaagggtctattaaaaactgaaagctcatttaactgtattcattcactttcaccattgaatccataaacatgagttgtccgctgatggagagacgcatttcctcacgcaatcaaatttgagatgagagtcgaaagtgtacaataccggataacgttctcctcagctgatgttcttggtcacaaagcaggagaattgctgcataatgaggcctaactagggcaagtataattcagagttttacgcatgactttgcatttaatgcaggctccgtatatttttcgccaaataactatttctcgttgcacttttgctatatttcaggggccagaaaatgggatgtgcacgctctatacctaccaccgacagagacactcaaatactaagcaacA---GTTAG---GCTTCAT-A--T-CAGCA---TACA--CCT-TC-----TC-TA----ATCAA---GAACA-TCA-C-TG----AG---AA----C-G-TTA--TC-G---GT--ATT-T-A---------CAC-----TTTC-AC-TCTC-----GTCCCTA-A---AATTTT----G-AT-T-GC--------G-TTAGA-------AAAATG--C-T-----CTCTCCATCAGAGGA--ACT-CATGTTT-GTA---TGA-TTC--AATGA----TGAAA----G-TG---A--A-TGAATA---TTAAA--TGA---TTTCAAT---GTTT--ATAGACC-----------TTA---GA--ACTTACCTG-A--AACTG---TCC-AATA--AGT---A-AACA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-CA-C--AA-GAAT-GG-TTT--TT--ATTGTTGA-AG-TAT-TCA---------A-A-ACA-G--CT-T----TA---C-C---TGGGA--------G--AGG--ACAC-TTATGAA--GACAA---------TGG---AT---------------------A--AA-TC--A-TTTTA-A-C--TGGC--T--T--A--CCT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATACAAA---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTA---GG-ATA-G----AAGCTT-CAAA--CTG-T--A--C-A-T-T-C-T-----------G--TAA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCC-------TAC-G--GGC-CTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A-CAG-AA--TGT----A--CAG-T-TTTCGGCTTATATCCTTTACATA-----CATTG-ATTG-
gi|7 : ggcactttggaggccttagtgatcgttttggtaaagatagtgacaagatggcagaatgtgaagagacaaAATGAGTTG-TTCAT-CTA------C-TCCAG-C-ATCG-TA-CAGTCTTG-TGGCTGC-AGTGG---CACGT-AGA-GAATGGTTTGTA--AAATG-GC-ATT-TG-AAT---CCTGCCT-GTTCAC-------AT--AGCT--CGGCGAC-GGT-TTT-CTGT-AAAACATG----AA-C-A-C---AA--C-GGG-------TGCATCTG-CATA--CCA-G---G-ATGA--Taaggcaagtataatcatgagttttacatgcatttgacatttaatgcaggcttatatttttgcaaacactaattctgttcactttttttatatttcaggccagaaaatggcaattgtgacgcactatactgagacaactcaaatatagtacatcatcatcctggtatgcagatgcacccgttgtgttcatgttttacagaaaaccgtcgccgagctatgtgaacaggcaggattcaaatgccattttacaaaccattctctacgtgccactgcagccacaagactgtacgatgctggagtagatgaacaactcatt
gi|8 : ggcactttggaggccttagtgatcgttttggtaaagatagtgacaagatggcagaatgtgaagagacaacaatcaatgtatgtaaaggatataagccgaaaactgtacattctgtgagagaaagaactgatcgaggcccgtagggccgagatcagttctttctcttacagaatgtacagtttgaagcttctatcctacttaaaacattatctcctttgtattaatattggatagtatcaggtaagccagttaaaatgatttatccattgtcttcataagtgtcctctcccaggtaaagctgttttgaatacttcaacaataaaaaccattcttgtgaagctgtttcttttgtttacttattggacagtttcaggtaagttctaaggtctataaacattgaaatcatttaatattcattcactttcatcattgaatcatacaaacatgagttcctctgatggagagagcatttttctaacgcaatcaaaattttagggacgagagtgaaagtgtaaataccgataacgttctcagtgatgttcttgattagagaaggtgtatgctgatatgaagcctaactaaggcaagtataatcatgagttttacatgcatttgacatttaatgcaggcttatatttttgcaaacactaattctgttcactttttttatatttcaggccagaaaatggcaattgtgacgcactatactgagacaactcaaatatagtacatcA---GTTAG---GCTTCAT-A--T-CAGCA---TCC----CT-GC-----TT-TGT---ATCAAA--GAACA-TCA-C-TG----GA---GA----C-G-TTAAATC-G---GT--ATT-TTA---------CAA-----TTTC-AC-TCTC-----ATCCCTA-A-----TTTT----G-AT-T-GC--------GGTGAGG-------AAAATG--C-T-----TCATCCATCAGCGGA--ACT-CATGTT--GTA---TGA-TTC--AATGG----T-AAA----G-TG---A--AATGAATA---TTAAAA-TGAATTTTTCAAG---TTTT--ATAGACC----------TT-A---GA--AATTAC-TG-A--AACTG---TCCCAATA--A-T-A-A-A-CA-------AAA------GA--AA-----C-AGCTT-C--C--A--GACT-GGGTTT--TT--ATTATTGA-GG-TAT-TTA---------A-A--CA-G--TT-T----TAA--C-T---TGGGA--------G--TGG--ACAC-TTAGGAAA-GACAA---------TGG---ATATA--TAAG-GAA--ACAT-AA--AAATC--A-TTTTA-A-C--TGGAA-T--T--A--ACT-GAT--ACTATC-----CA-AT-AT-T--AATATAAT---GGA------GAT---AAT---GTT-T-T--AA-------GTA---GG-ATA-G----AAGCCT-CAAA--CTG-T--A--C-A-TAT-CTT-----------G--TAA-G-AGAAAGAACTGA-T------CTC----G------GCCCT------TAC-G--GG--CTCG-A-TCAGTT---CT--TTCT-CTC-------A--AG-AA--TGT----A--CAG-T-TTTCGGCTTATATCCTT
gi|8 : -ATCG-TAACAGTCT-G-TGGCTGC-AGTGG---CACGTAAGA-GAATGGTTTGTAGTAAATGTGC-CTT-TG-AAT---CCTG-CT-GTTCACACTCATTAT--AGCT--TGGCGAC-GGT-TTTCCTGTAAAAACATGAC--AA-CAACCAAAAA--C--GG-------TGCATCTG-CATA--CCA-GGCAG-ATGATGTTCTGA-TATTGAGTG--------TTCT-CGTAGGTAATAG--------AG---GCGTCAC-A--T-TTGCAATTTTCTGGCCT-Taagccaagatataatatgtagtttacatggcatttgacattttaatgcaggcttttatatattttttcgcaaaaactatttctgttcacctttttctatatttcaaggccagaaaattgcaaatgtgacgcctctattacctacgagaacactcaatatcagaacatcatctgcctggtatgcagatgcaccgtttttggttgttgtcatgtttttacaggaaaaccgtcgccaagctataatgagtgtgaacagcaggattcaaaggcacatttactacaaaccattctcttacgtgccactgcagccacagactgttacgat
gi|9 : aaggatataagccgaaaactgtacattcttgagagaaagaactgatcgagcccgtaagggccgagatcagttctttctcttacaagatatgtacagtttgaggcttctatcctacttaaaacattatctccattatattaatattggatagtatcagttaattccagttaaaatgatttttatgtttccttatatatccattgtctttcctaagtgtccactcccaagttaaaactgtttaaatacctcaataataaaaacccagtctggaagctgtttcttttgtttattattgggacagtttcagtaatttctaaggtctataaaacttgaaaaattcattttaatattcatttcactttaccattgaatcatacaacatgagttccgctgatggatgaagcattttcctcaccgcaatcaaaattagggatgagagtgaaattgtaaaataccgatttaacgtctccagtgatgttctttgatacaaagcagggatgctgatatgaagcctaactaagccaagatataatatgtagtttacatggcatttgacattttaatgcaggcttttatatattttttcgcaaaaactatttctgttcacctttttctatatttcCTTAAAAC-ATAATTGT---T-ACGCAA--TCC----TTTGT-TA----TT-TTC-G----GTT-GTTA----------TATGG-C-A-TAAAA---T--CCAT---GTCAAT--TTAA----------AAACAAT---CCAATAAGCTACCT--GTA--CG--TGTCC-AATAAGTTTAGAAA---T-G--TG-TCCATTA--T------TAAA--C-T-TA---TT---GGAC-A----G--T-TATT-G---T-CAA------CTTA--TT------GGACA-GTGCC--AG-------GT-AAACGGATAAAAAG-A-----CA-GA--AGAT-GCG-T-----TTGTCAAACA--G-AAGT----AAA--TTGTAA--TTTA-AATAAC-ATGAA---TGTC-AC-AGGTAG--AACATCTGAGACCAC------ACTGAAAATCATTC-ATTATTTG--GTCGT---TACTCGTTACCACAC-ATCACATT-TAGAACTTCAAT----TTGAAAGACA----------AATTGTTATGTT-----C------TATA--TG---------------AATTTCTCTTT--AT--TCAGAGGCACATTCAAAA---ACATC-TCCAAATT------GCTTAATTTTTTTTATGATTT---CCTT-
gi|9 : TATGAA-TTTCTCT----TT-ATTCAGAGGCACATTCAAA-AA-CATCTC-----C-----AAAT---TG-CT-------T----AATTTTTTTT---AT-GAT---------TTCCTTATCAGCATC-TTCTGATT--CAC-ATTTCATTTTTT-C---ACTT---CCTG-G-AA-T-GATTTCACT-AAT-TTT-CAC-AAGCTGGGCATTTTGGGTTC---TTTTG-----------TATG-AATGGACTGCCG-ATG----ATCTA-TGTCCAGTTTT--TCAGTAATGAGTTG-TTCAT-CTA------C-TCCAG-C-ATCG-TA-CAGTCTTG-TGGCTGC-AGTGG---CACGT-AGA-GAATGGTTTGTA--AAATG-GC-ATT-TG-AAT---CCTGCCT-GTTCAC-------AT--AGCT--CGGCGAC-GGT-TTT-CTGT-AAAACATG----AA-C-A-C---AA--C-GGG-------TGCATCTG-CATA--CCA-G---G-ATGA--Tatcagcatcttctgattcacatttcattttttcacttcctggaatgatttcactaattttcacaagctgggcattttgggttcttttgtatgaatggactgccgatgatctatgtccagtttttcagtaatgagttgttcatctactccagcatcgtacagtcttgtggctgcagtggcacgtagagaatggtttgtaaaatggcatttgaatcctgcctgttcacatagctcggcgacggttttctgtaaaacatgaacacaacgggtgcatctgcataccaggatgatgatgtacta
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): GATGACATTAGTGATGAAACAGCAGTTTTGTGTATTCATAATATGCATTATTTGATGTGAAGGGA