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gi|14 : attttacacctgatctaccccacgcatctcaaaattagtcgaaattaacacctttgaaaccacgctcccaattcacggatccttgattttgttaaacaaacaactaatgtgttgttttttaaaacttaccccgccatacggaaaagtctgacaaacaacgaattattccccttgcgtttaaaacgcattgacaatatcTTGAACACCAATTTTTGTGGATTT----CGTT--GA-AGACCTCAACAACGAAGTTAAATGGTCATC-GA-AGTTT-G-GTGC-TT---CT--G-AT-A-GAAAAC-TT-CCT--CTT-CTTG-CTCTG-TCATTGTCCA-TGA-TCGTGAGCAA---TCAA--TACATGTATAATGAAACCTTTTAC--GGTAAgggtaaattcagaaatttgcataaagaatttgataagtttaaactaataaatatattgtcaataaacatggagtaagatttttatcattgcattaaatattacactttacatggaaaattcatcgatctcacgtattaactcagcaaatatcgcttattctgtcacatgtatcgtaatagagtccattaaataattatattattccaatatgtacatgcattttacaaagataa
gi|22 : cagtggtttcatcagtattcgTTGAACACCATTTTTCGTGGATTCTACCCGTTTGAA-TGACCGCAACC-CGAATTCAAATGTTCA-C-GA-AGTTT-G-GTG--TT---CT--G-AT-A-GAG----TTTCCT--GTT-CTTG-CTCCG-TCG--GTCCA-CGA-CCATGAGCGA---TTAA--TACAAG--TAATGGAACTTTTTCC--GGTAAacataactaattgaggcattaaacattattaattagactacacttccgatagatgtacaaagtcattactatcaataattattaaaagcaaaaatcgggctcggatttcacatacagatttttttctgcattgaaatataaatgcgcgagatgttccgatagatgtaccactgtgatttttttttatggtaggcatccacgaatttatgtatccacgaaac
gi|34 : atcattatttcgATTTTCGTGGATTT----CGTT--GA-AGACCTCAACTACAAATTCAAATGTTCATC-AA-AGTTT-G-GTG--CT---actt
gi|21 : TT--GAATGAC-GCAACCACGAATTCAA-TGTTCAAC-GATCGTTT-G-GTG--TTTC-T---GCAT-A-GAA-----TTTCT--GTT-CTTG-CTTCG-TCATTGTCCA-CGA-CCGTGAGCGA---TC-A--TACA-AAGTAATGAA---CTTTCC--GGTAA
gi|10 : aaatgaatacacaaaatgcataaacaaaaacatcagtatcaactt--GA-TGATCGCAACTAC-AATTCAAATGTTCAAC-GA-AGTTT-G-ATG--TT---TAT-G-AT-A-GAAGAT-TTTCCT--GTT-CTTG-CTTCG-TCATTGTCCA-CGA-CCGTGAACGA---TCAA--TACATGTGTAATGAAACTTTTTCT--GATAAACTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNN--------NNNNNCAT----G------------A-A--AAAAAAAAT--C------GCTGTT--CATAAAC-TTTTACTGGTTTATTT--AATATTCTAATCAA-CGATGTCA---A---ATTA-CCAT---GTAA-GAAGCCA-TACCA---CCTGT-----------A----CA-A------T-ATACTTT-A-TAATCGGACT-A-A-TT---TTTC--AC-T----CTCC----TGAAC-ACAAT--------GGGGC-------G-CCGAGTGGTAGAT----------TTT-ACAC---CTGATCT----------AC--------C-------CCAAGGCATCTCAA-AATTAGT--CAA------------AATTTACACCTTTG-A----AA-CCCCGCTCCCAA--------AT---------T-TT-GTT-A----AACA--AA--CATC---------TAAGGTGTG-G----TT-----AA---TT-----------ACC--------CCG-CATGCTG-A-AT-------------A---------------GTGCT-GAC----AA--AAactatgtg
gi|18 : TTCAAATGTTCAACCGA-AGTTTCG-GTG--TT---TCT-G-AT-A-GAAG-T-TTTCCT--GTT-CTT--CTTCGTTCATTGGCCA-CGA-C--CGGGCGA---TCAAC-TACAAGTAT-ATGAAACTTTTTTCCGGGTAAtttcataaaattacataaaaaattgataagtttaaacttaataaactggtaccgtatatgatttatattgtaataaacaatgagcaagagttttattattgccttaaatattacatgtgcatgaaatcatcgatctcgcgtttaactcagcaatatatcttattctgtcacatgtatgtaatagagtcccaatatgtacatgaagtttacaaagatgtcattgaattgtgcgtaagacaactaaggattgc
gi|3 : AATGTTTAAC-GA-AGTTT-G-GTGGTTT---CT--G-AT-A-GAATAT-TTTCCA--GTA-CTTGGCTCCG-TCATTGTCCA-CGA-CCGTGAGCGA---TCAAA-TACATGTATAATGAAACTTTTTCC--GGTAAAACTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNN-G----CAT----G------------A-AGAAAAAA---T--C------GCTGTT--CATAAAA-TTTTACTGGATTATTT--AATTTTCTAATCAA-CGATGTCA---A---ATTA-CCAT---GTAA-GAAGCCAATACCG---C-TGT-----------A----CG-A------T-ATACTTT-G-CAATCGGACT-A-A-TT---TTTC--AC-T----CTCC----TGAAC-ACAAT--------GGGGC-------G-CCGAGTGGTAGAT----------ATT-ACCA---CTGATCT----------AC--------C-------C--GCGCATCTCAA-AATTAGT--CGA------------AATTCACACCTTTGAA----AA-TCACGAT-CCAATTCA-CGGATCCTT-G-ATT-TT-GTT-A----AACA--AA--CAAC---------TAATGTGTT-G----TT------A---TT-----------ACC--------CCG-CATGCTG-A-AT-------------A---------------GTGCT-GAC----AA--AA--GAATT-ATT-CC-CCTTGCGGTTTAAAAA-------------------------C-------------GC-TT-----GACC----AAT-------AT-----CG-AAG--TAGAA---ATCG--CG---TT-TT--A-T----TC---------GT-C----GAAG-ATACAA-------TCAC--C--GAAT---AA--GGT---AAA--------ATT-TCATGAA--A-TTACA-TG-AA-AA--TTTGA-T-AA----GTTTAA-AA-CTTAATAAAT--------------A-T--T---AT-----TGT-AA--ATAA--------CA--AT-G-AG--TA--AAAGTTTG--ATT-ATT-GCCTTAAATATTA-CA-TGTACATG-AAA---TCATCGA-G-CCC-----ACGT-TTAAC-----TC--AGCAAAATAT--C-TTATTTCT----GTCACATGTATG-CAA--T-AG-AGT-CA-TTAA--A--C--A----TTA-T---TCCAAT-----ATG-T----ACATGAAGTTT-TACAAA-TA-TATCATTAATTGTA-CG-----------TAAGCAC--AACT-AGGATTG---CA--TTG-A------------AATAGA--AA---G-CAAGAGA-CGTTT----C-G-----ATTTGA------TGAAC-CAATTGTGATTTT---TTTTTTCA-CGGTGGattatgtgatttactcccagtatcccacgcttttggcatgagactcgccgcgtcaaacgcatctccatgccccggcgacgcggaaacccgcatagaaaaac
gi|2 : AATGTATAAC-GA-AGTTT-GCGTGGTTT---CT--G-AT-A-GAA-ATATTTCGCAAGTA-CTTGGCTCCG-TCATTGTCCAACGA-CCGTGAGCGA---TCAAA-TACATGTATAATGAAACTTTTTCC--GGTAAACTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNN--------N----NNNNNNNG------------A-A--AAAAA---T--C------GCTGTT--CATAAAAATTTTACTGGATTATTT--AATTTTCTAATCAAACGATGTCA---A---ATTA-CCAT---GTAA-GAAGCCAATACCG---C-TGT-----------A----CG-A------TTATACTTTTG-CAATCGGACTTA-A-TT---TT-TCAAC-T----CTCC----TGAAC-ACAAT--------GGG-C-------G-CCGAGTGGTAGAT----------ATT-ACACA--CTGATCT----------AC--------C-------CG---GCATCTCAAGAATTAGT--CGA------------AATTCACACCTT-G-A----AA-TCACGATCCCA-TTCA--GGATCCTT-G-A-T-TTTGTT-A----AACG--AAACCAAC---------TAATGTGTTTG----TT-----AA---TT-----------ACC----------G-CATGCTG-A-AT-------------A---------------GTGCT-GAC-----A--AAC-GAATTGATT-CC-CCTTGCGGTTT-AAAC-------------------------A-------------GC-TT-----GACC----AAT-------AT-----CGAAAG--TAGAA---ATCG--CG---CT-TT--A-T----TC---------GT-CGAAAGATA-C---AA-------TCAC--C--GAAT-AGAA--GGT---AAA--------A-T-TCATGAA--A-TTACA-TG--A-AA--TTTGA-T-AA----GTTTTAAAA-CTTAATAAA---------------T-A--T---AT-----TGT-AA--TAAA--------CA--AT-G-AG--TA--AAAGTTTTGGATT-ATT-GCCTTAAATATTACCA-TGTACATGAAAA---TCATCGA-TGCCC-----ACGT-TTAAC-----TCTAGGCAAAATATTCT-TTATTTCT----GTCACATGTATG-CGAATT-AGAAGT-CAGTTAA--A--C--A----TTA-T---TCCAAT-----ATGTT----ACATGAAGTTT-TACAAA-TA-TATCATTAAATTGTACG-----------TAAGCAC--AACT-AGGATTG---CA--TTG-C------------AAGATAG-AA--AGTCAAGAGA-CGTTT----C-G-----ATTTGA-------GAACTCAA-TGTGATTTT---TTTTTTCAACGGTGGGCccctcaccacgaatttacgtatccacgaaaacagtgatttttggctgatccacgaaattgatgccacgaatattgatgaaacaacagta
gi|7 : ATGTTCAAC-GA-AGTTT-G-GTG--TT---TCT-G-AT-A-GAAGAT-TTTCCT--GTT-CTTG-CTCCG-TCATTGTCCA-CGA-CTGTGAGTGA---TCAA--TACATGTATAATGAAACTTTTTCC--GGTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---AAAC--------G----CAT----G------------A-A--AAAAA---T--C------GCTGTT--CATAAAA-TTTTACTGGGTATTTT--AATTTTGTAATCAA-CGATGTCA---A---ATTACC-AT---GTAA-GAAGCCA-TACCA---CCTGT-----------A----CA-A------T-ATACTTT-G-CAATCAGACT-A-ATTT---TT-C--AC-T----CTCC----TGAAC-ACAAT--------GGGGC-------G-GCGAGTGGTAGAT----------TTT-ACAC---CTGATCT----------AC--------C-------CC-ACGCATCTCAA-AATTAGT--CGA------------AATTCACACCTTTG-A----AA-CCATGCTCCC-ATTCA-CGGATCCCT-G-A-T-TT-GTT-A----AACA--AA--CAAC---------TAATGTGTT-G----TT-----AA---TT-----------ACC--------CCG-CATGCTG-A-AT-------------A---------------GTGCT-GAC----AA--AAC-AAATT-ATT-CC-CCTTGC-GTTT-AAAA-------------------------C-------------GC-TT-----GACC----AAT-------ATA----TGAAAG--TAGAA---ATCG--CG---TT-AT--A-T----TC---------AT-C----GATG-ATACAA-------TCGC--C--GAAT-A-AA--GGT---AAA--------ATT-TCATGAA--A-TTACA-TG-AA-AA--TTTGA-T-AA----GTTTA--AA-CTTAATAAA---------------A-T--T---AT-----TGT-AA--TAAA--------CA--AT-G-AG--TA--AGAG-TTT--ATTAA-T-GCCTTAAATATTA-CA-TGTACATG-AAA---TCATCGA-T-CTC-----ACGT-TTAAT-----TC--AGCAAAATAT--C-TTA-TTCT----GTCACATGTATT-TAA--T-AG-AGT-CA-TTAA--A--A--C----TTA-T---TCCAAT-----ATG-T----ACATGAAG-TT-TACAAA-GA-TAT------------CG-----------TAAG-AC--AA-TAAGGATTG---CA--TTG-A------------AATATA--AA--TG-CAAGAGA-CG-TTC---C-G-----A-TTGA------TGAAC-CAA-TGTGATTTT---TTTTTCA--CGGTGGGCctcaccacgatttacgtatccacgaaacagtgatttttggccatgatccacgaaaattgaatgcacggaatattgactgaaacacaca
gi|6 : ATGTTCAAC-GA-AGGTT-G-GTG--TT---TCT-G-AT-A-GAAGAT-TTTCCT--GTT-C
gi|8 : ATGTTCAAT-GA-AGTTT-G-GTG--TTTCTC-----AT-A-GAAGAT-TTTCCT--GTT-CTTC-CTCAG-TAATTGGCAA-CGA-CCGTGAGCAA---TCAA--TACATGTATAATGAAACTTTTTCC--GGTAAACTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNN----G----CAT----G------------ACA--AAAAA---T--C------GCTGTTAACATAAAA-TTTTACTGGGTTATTT--AATTTTCTAATCAA-CAATGTCA---C---ATTA-CCAT---GTAA-GAAGCCA-TACCA---CCTGT-----------A----CC-A------T-ATACTTC-G-TAATCGGACT-A-T-AT---TA-C--AC-T----CTCC----TGAAC-ACAAT--------GGGGC-------T-CCGAGTGGTAGAT----------TTT-ACAC---TTGATCT----------AC--------C-------CC-TCGCATATCAA-AATTAGT--CGA------------AATTCACACCTTTG-A----AA-CCACGCTCCCAATTCT-CGGATCCTT-G-A-TACT-GTT-A----AACA--AA--CAAC---------TTATGTGCT-G----TT-----AA---TT-----------ACC--------CCG-CATGCTA-A-ATACTCGATCGATTCA---------------GTGCT-GAC----AA--AAC-GAATT-ATT-CC-CCTTGCGGTTT-AAAA-------------------------A-------------AT-TCAA---GACT----AAT-------AT-----CAAAAG--TAGAA---AACG--CG---TT-TT--A-T----TC---------GA-A----GAAG-ATACAA-------TTGA--T--GAAT-A-AA--GAT---AAA--------ATT-TCATGAA--A-TTACA-TG-AA-AT--TTTAA-T-AA----GTTTA--AA-TTTAATAAAT--------------ATT--T---AT-----TGT-AA--TAAA--------CA--AT-T-GGTATA--AGCGTTTT--ATT-A-TGGCCTGAAATATTC-CA-TGTACATG-AAA---TCATCGA-T-CTG-----ACGT-TTAAC-----TC--AGTAAAATAT--C-TGA-TTCT----GTCACATGTATG-TAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacctcacgcgagggtaacgcatgaaaaaaatcgctgttcataaatttaattttctaatcaacgatgtcaaattaccatgtacaaagccataccacctgtacaatatactttgcaatcggactaatttttcactctcctgaacacaatggggcgccgagtggtagattttacacctgatctaccccatgcatctcaaaattagtcgaaattcacacctttgaaaccacgctcccaattcacggatccttgattttgttaaacaaagaactaacgtgttgttaattaccccgcatgctgaaatagtgctgacaaaacgaattattccccttgcggtttaaaacctcttgaccaaatatcgaaagtagaaatcgcgttttattcgtcgaagatacaatcgccaataaaagagtaagatttcatgaattacatgaaaatttgataaggttaaacttaataaatattattgtaataagatggagtaagagttcagtttattaaatcatcgactctcacgtttaaactcagcaaaatatacttagagtgcattaaagtgtttatctgtccaatatgtacatgaagtttacaaagatatcattaaattgtacgtaagacaactaaggattgcattgaaatataaatgcaagagacgttccgattgatgaaccaatgtgatttttttttcatggtgggcctc
gi|5 : TGTTCAAC-GA-AGTTT-G-GTG--TT---TCT-G-AT-A-GAAAAT-TTTCCT--GTT-CTTG-CTCCG-TCATTGTCCA-CGA-ACATGAGCGATG-TCAA--AATAC---TAA-GAAACCCTTTCC--GGTAAACTTATGTGATATCCCGAACGCTTTTTGGCATGAGACTCACCGCCACTTTGTTCTTAATAGCATCTCCG---AATCCCCGCGCGG----CAT----GGGTAACGCAATGA-A--AAAAA---T--CAAAAAAACT-TT--CATAAAA-TTTTACGGGGTTATTT--AATTTTCTAATCAA-CGATGTCA---A---ATTACC-AT---GTAA-GAAGCCA-TACCA---CCTGT-----------A----CA-A------T-ATACTGT-G-CAATCGGACT-A-ATTT---TT-C--AC-TCTAGCTCC----TGAAC-ACAAT--------GGGGC-------G-CCGAGTGGTAGAT----------TTT-ATGC---CTGATCT----------AC--------C-------CA-ACGCATCTCAA-AATTAGT--CGA------------AATTCACACCTTTG-A----AA-CCACGCTCCCAATTCA-CGGATCCTT-G-ATT-TT-GTT-A----AACG-------AAC---------TAATGTGTT-G----TT-----AA---TT-----------ACC--------CTG-CATGCTG-A-AT-------------A---------------GTGCT-GAC----AA--ACC-GAATT-ATT-CC-CCTTGCGGTTT-AAAA-------------------------C-------------GC-TT-----GATC----AAT-------TT-----CGAAAA--TAGAA---ATCT--CG---TT-TT--A-T----TC---------GT-C----GAAG-ATACAA-------TTGC--C--GAAT-A-AA--GGT---AAA--------ATT-TCATGAA--A-TTACA-TG-AA-AA--TTTGA-T-AA----GTTTA--AA-CTTAATAAAT--------------A-T--T---AT-----TGT-AA--TAAA--------CA--AT-G-AG--TA--AGAGTTTT--ATT-ATT-GCCTTAAATAATA-CA-TGT-------AA---TTA---------------AC-------------TC--AGCAAAATAT--C-TTA-TTCT----GTCACATGTATG-TAA--T-AG-AGT-CA-TTAA--A--C--A----TTA-T---TCCAAT-----ATG-T----ACATGAAG-TT-TACAAA-GA-TATCATTAAATTGTACG-----------TAAG-AC--AACTAAGGATTG---CA--TTG-A------------AATATA--AA--TG-CAAGAGA-CG-TTC---C-T-----A-TGGA------TAGAG-CAA-TGTGATTTT---TTTTTTCA-CGGTGGGC
gi|19 : TGTT--AC-GA--GTTT-G-GTG--TT---TT--G-ATCA-GAAG-T-TTTTCT--GTT--TTG-CTTCG-TC-TTGTCC---GA-C-GTGAGCGGCAGTCAAATTACA-GTA-AATGAACTTTTTTCC--GGT
gi|28 : TTCAAC-GA-AGTTT-G-GTG--TT---TCT-G-AT-A-GAGGAT-TTTCCT--GTT-CTTG-TTCCG-CCATTGTCCA-CGA-CTGTG------------------TGTATAATGGAACTTTTCCC--GGTAAtaaacttatgtgatatctttccagtatgcccacacgcttttaagctatgaggactcgcgcttttttttcaacgcgaatctccg
gi|24 : A-AGTTT-G-GTG--TT---TCT-G-AT-A-GAAGAT-TTTCCT--CTT-CTTG-CTCCG-TCATTGTCCA-CGA-CAGTGAGCGA---TCAA--TACATGTATAATGAAACGTTTCCC--GGTAAtc
gi|15 : -GTG--TT---TCTGG-AT-ATGAGGAT-TTTCCT--GTTTCTTG-TTCCG-TCATTGTC-A-CGAACCGTGAGCGA---T-AA--TACATG-ATAAT-AAACTTTTTCC--GGTAACTTATGTGAATTCACACGCTTTTGACATGAGAGTCACGCTTTTCCAATGCAATCTCCGATCTCCGCGCGGGTAAAC--------G-----AT----G------------A-A--AAGAA---T--C------GCTGTT--CATGNNN-NNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNN-TAAT------ATTTTACTGG---GTTA-CCAT---GTAA-GAAGCCA-TACCA---CCTGT-----------A----CA-A------T-ATACTTT-G-CAATCGGACT-A-A-TT---TT-TT-AC-T----CTAC----TGAAC-ACAAT--------GGCGA-------G-CCGAGTGGTAGAT----------TTT-ACAC---CTGATCT----------AT--------C-------CT-GCGCATCTCAA-AATTAGT--CGA------------AATTCACACacttatgtgatacccacgcttttggcatgagactcacgct
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gi|6 : AAC--------G----CAT----G------------A-A--AAAAA---T--C------GCTGTT--CATAA---------------ATTT--AATTTTCTAATCAA-CGATGTCA---A---ATTACC-AT---GTAC-AAAGCCA-TACCA---CCTGT-----------A----CA-A------T-ATACTTT-G-CAATCGGACT-A-ATTT---TT-C--AC-T----CTCC----TGAAC-ACAAT--------GGGGC-------G-CCGAGTGGTAGAT----------TTT-ACAC---CTGATCT----------AC--------C-------CC-ATGCATCTCAA-AATTAGT--CGA------------AATTCACACCTTTG-A----AA-CCACGCTCCCAATTCA-CGGATCCTT-G-ATT-TT-GTT-A----AACA--AA--GAAC---------TAACGTGTT-G----TT-----AA---TT-----------ACC--------CCG-CATGCTGAA-AT-------------A---------------GTGCT-GAC----AA--AAC-GAATT-ATT-CC-CCTTGCGGTTT-AAAAC------------------------C-------------TC-TT-----GACCA---AAT-------AT-----CGAAAG--TAGAA---ATCG--CG---TT-TT--A-T----TC---------GT-C----GAAG-ATACAA-------TCGC--C---AAT-A-AAAGAGT---AAG--------ATT-TCATG-A--A-TTACA-TG-AA-AA--TTTGA-T-AA----GGTTA--AA-CTTAATAAAT--------------A-T--T---AT-----TGT-AA--TAA----------G--ATGG-AG--TA--AGAGTTCA--GTT-------------TATT--------------AAA---TCATCGACT-CTC-----ACGT-TTAAAC----TC--AGCAAAATA------TA-CT------------------------T-AG-AGTGCA-TTAA--AGTG--T----TTA-TCTGTCCAAT-----ATG-T----ACATGAAG-TT-TACAAA-GA-TATCATTAAATTGTACG-----------TAAG-AC--AACTAAGGATTG---CA--TTG-A------------AATATA--AA--TG-CAAGAGA-CG-TTC---C-G-----A-TTGA------TGAAC-CAA-TGTGATTTT---TTTTTCA--TGGTGGGCa
gi|32 : atgttcaacgaaggttggtgtttctgatagaagattttcctgttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacctcacgcgagggt--------G----CAT----T------------A-A--AAAAA---TTTC------GCTGTT--CCAAAAA-TTGTAAGTGGTTATTT--TCTTTTCT-------TGATGTCA---A---ATTATC-AA---GTAA-AAActc
gi|31 : CTGTT--CA-AACA-TTTTATTGGATTATTT-------TCTATTCAA-CAATGTCA---A---ATTA-CTAT---ATAA-GAAGCCA-AACCA---CATGT----------------CA-A------
gi|1 : ctT--CATAAAA-TAATGCTAA--TATTTCTAATTC-G-AATC----GATGTCA---ATACATTA-T-ACACAGTAAAGAAGCCA-TACCAATACCTGT-----------A----CACAC-----T-ATACTTT-GGCAATTCGACT-ACA-TTATATT-C--AC-TT---CTCCCACATGAATTACTATCTTATTTCGCGGCTTTGCATGCGCGAGTTGCAGATAATCAGTTCATTT-ATACATCCTGATCTCA--------AC--------CTGTCGAACC-ACATA-CTCAA-AATTAGTACCGATTGGAGTCCCATAATTCACACCTCTA-ATTTTAA-C---GCTCCAACTTCAAC--ATCCAT-GCA-T-TT-GTTTA----AACA--AA--CAAC---------TAATGTGTT-A----CTTAATGAA---TT-----------ACCATTGGGCACCG-CATGCTG-ATAT-------------A---------------GTGTTCGACGTATAA--TGCGAAGTT-ATTACCACCTTGCGGTTA-AAAG-------------------------A-------------GC-ATACACAGACCTACTAATGACTCCCATGAGCGTAAAGA--GAGAATACACCG--CAATCTT-ACGAA-T----TC---------GT-C----GAAG-ATACAA-------TCGCGTCTGAAATAA-AA--GGT---AAA--------ATTATCATGAACGA-TTACA-TG-AACAAGGGGTGA-T-AAAAGTGTTTAG-AA-CTTAATGAA---------------A-TAAT---ATAAGTCCGT-AATTTAAAATGGTATGCAAGAT-GAAG--TAGGAGAGTTTT---TT-A-T----TTAAAT-----------------------TCATCCAGT-CTCTGCAAACCT-TTAAAGACCTTT--A-CAGAACA------CA-TTCTTAGAGTCCAATG------AA--T-AA-AAA-AA-TAAC--A--ATCC----TCATT---TCCAATTTATAATA-TGATAACATGAAG-TTATACAAA-GA-TATTCTATGAATA--CGGATATGTACTTTGAA-ACATAACTAAAAATTGGCTCATTTTG-GAGGGAGGAGATAAATATA--AACTTG-CAA-AGATCG-TTTTCCC-GGATGTA-TTGAGTCGTGCGAAC-CAA--GTGATTTTTTCTTTTTTA--CGGTG
gi|26 : cttgatgctaaatctcacgatcttatgtggctatgagactctgctctgcttttctgttcacaatagcatcatatcagcacacgaatctctacgtgcgagttacaaccttctgcaatgaaatataatatatattcgaccgTGTA-TCAA-CGATGACA---A---ATTATT-GT---GCAA-GAAGCCA-Tcccattccacaagatatatttacgtcaatcagcgaacacagattgac
gi|11 : ttttatttgatatattcttacaATCAA-TGATGACC---A---ATTA-CTGT---GTAA-GAAGCCA-TGTC----CTTGTCATTTTTTAATAGTCCCA-AGCACTGT-GTACATT-G-CAATCAGATT-A-A-TT---TT-CC-AC-T----CTTC----TGAAA-AC--------------------------CAGGTGGTAGAT----------TTTCACAC---CTGATCTGATTGGAAGTACTGGCNNNNN-------NN-NNNNNNNNNNN-NNNNNNN--NNN------------NNTTCACACCTTTG-A----AAACCATGATCTTGTTTTA-TGGATTCTT-G-ATT-TT-GTT-A----AATA--AA--CAACAATTACCAGTAATGTGTA-G----TT-----AA---TTAACTTCACTAAACC--------CTG-CATGCTT-T-AT-------------ACTT------------GTGCT-gtgttttgggtttttttcagtcccaagcactgcatatgttgtaaatctgact
gi|35 : accattcaaatttttttatggtatactcttTT-A-CAATCAGACT-A-A-TT---TT-CT-AC-T----CTTC----TGAAtcaagggtcaatgttctctatcatagtattttaatattagggaagataactctcacacttctattgtgaaaaacgaaagtagaaaccgtgttgtatttcaaaaatgtacagtcgctgaataaaatggtaaaatttcacgaaatacattgaaaaattaattaagtttaaacgtaataaatgttattgtaattaaataataagttacaaaggca
gi|9 : gcactgtgtatgACT-A--------TT-C--ACAT----TTCC----TGAAC-ACAAT--------GGGGC-------G-CCGAGTGGTAGAT----------ATT-ACAC---CTGATCT----------AC--------C-------CC-GCGCATCTCAA-AATTAGT--CGA------------AATTCACACCTTTG-A----AA-TCACGATCCCAATTCA-CGGATCCTT-G-A-T-TTTGTT-A----AACA--AA--CAAC---------TAATGTGTT-G----TT-----AA---TT-----------ACC--------CCG-CATGCTG-A-AT-------------A---------------GTGCT-GAC----AA--AAC-GAATT-ATT-CC-CCTTGCGGTTT-AAAA-------------------------C-------------GC-TT-----GACC----AAT-------AT-----CGAAAG--TAGAA---ATCG--CG---TT-TT--A-T----TC---------GT-C----GAAG-ATACAA-------TCAC--C--GAAT-A-GA--GGT---AAA--------ATT-TCATGAA--A-TTACA-TG-AA-AA--TTTGA-T-AA----GTTTA--AA-CTTAATAAAT--------------A-T--T---AT-----TGT-AA--TAAA--------CA--AT-G-AG--TA--AAAGTTTG--ATT---T-GCCTTAAATATTA-CA-TGTACATGAAAA---TCATCGA----CC-----ACGT-TTAAC-----TC--AGCAAAATAT--CTTTATTTCT----GTCACATGTATG-CAA--T-AG-AGT-CA-TTAA--A--C--A----TTA-T---TCCAAT-----ATG-T----TCATGAGT-TT-TACAAA-TAGTATCATTAATTGTA-CG-----------TAAGCAC--AAC---GGATTG---CA--TTGCA------------AATAGA--AA--GT-CAAGAGA-CT-TT----C-G-----ATTTGA------TGAAC-CAATTGTGATTTT---TTTTTTCAACGGTGGGC
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4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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consensus : TTTATTCGGCGATTGTATCATCGATGAATATAACGCGATTTCTACTTTCG----ACACCAATTTTCGTGGATTT----CGTT--GA-TGACCGCAACCACGAATTCAAATGTTCAAC-GA-AGTTT-G-GTG-TTTCTG-AT-A-GAAGAT-TTTCCT--GTT-CTTG-CTCCG-TCATTGTCCA-CGA-CCGTGAGCG---AT--CAA--TACATGTATAATGAAACTTTTTCC--GG-TAAA-CTTATGTGA-TNCNCNC---GCNTCTNNC-----NNGCGNGNNACNCNCCGC--CAATNCG-ATCT------------CCGATCCCCG----CGCG---A-------AA---C------G----CA-T----GA-A--AA---AAAT--CG------CTGTT--CATAAAA-TTTTACTGGGTTATTTAAT---TTTCTA-----AT-CAA--CGATGTCA---A---ATTAC-CAT-GTAA-GAAGCCA-TACCA---CCTGT-----------A----CA-A------T-ATACTTT-G-CAATCGGACT-A-A-TT---TT-C--AC-T-CT----CC----TGAAC-ACAAT--------GGGGC-------GC-CGAGTGGTAGAT----------TTT-ACAC---CTGATCT----------AC--------CC--C--G---CGCAT-CTCAA-AATTAGT--CGA------------AATTCACACCTTTGAAA-CC---ACGCTCCCAATTCA-CGGAT-CCTTG-ATTTTGTTA-AACA-----AA--CAAC---------TAATGTGTT-G----TT-----AA---TT-----------ACC--------CCG-CATGCTG-A-AT-------------A---------------GTGCT-GAC----AA--AACGAA-TT-ATT-CC-CCTTGCGGTTT-AAA-------------------------A-C-------------GC-TT-----GACC----AAT-------AT---CG-AAAG--TAGAA---ATCGCG-T-TNT-----ATTCGTCG--AAGA--TACA----ATCGC--C--GAAT-A-AA--GGT---AAA--------ATT-TCATGAA--A-TTACA-TG-AA-AA--TTTGA-T-AA----GTTT--A-AAC----TTAAT-AAA-----------TA-T------TAT-----TGT-AA--TAAA--------CA--AT-G-AG--TA--AGAGTTTT--ATTATTGCCTTAAATATTA-CA-TGTACATG-AAA---TCATCGA-T-CTC-----ACGT-TT-AA----CTC--AGCAAAATAT--C-TTA-TTCT----GTCACATGTAT-GTAA--T-AG-AGT-CA-TTAA------A--CA----TTA-T---------------TCCAAT-----A--TG-T----ACATGAAG-T--T-TAC-A--AAGA-TATCAT-TAAA--------T-------TG----TACGTAAG-A---CAACTAAGGATT-------G---CA--TTG------------AAATATA--AA--TGCAAGAGA-CGTT---CCG-----A-TTGA------TGAAC-CAA-TGTGATTTTT--TTTTT-CACGGTGGGC
Reference ( family-454 ) : TTTATTCGGCGATTGTATCTTCGACGAATAAAACGCGATTTCTACTTTCG----ATACCAATTTTCGTGGATTT----CGTT--GA-TGACCGCAACCACGAATTCAAATGTTCAAC-GA-AGTTT-G-GTG-TTTCTG-AT-A-GAAGAT-TTTCCT--GTT-CTTG-CTCCG-TCATTGTCCA-CGA-CCGTGAGCG---AT--CAA--TACATGTATAATGAAACTTTTTCC--GG-TAAA-CTTNNNNGA-TNCNCNC---GNCNCTNNC-----NNGNGNGNNACNCNCCNC--CANTNCG-NTCT------------CNGNNNCNCG----CGCG---A-------AA---C------G----CA-T----GA-A--AA---AAAT--CG------CTGTT--CATAAAA-TTTTACTGGGTTATTTAAT---TTTCTA-----AT-CAA--CGATGTCA---A---ATTAC-CAT-GTAA-GAAGCCA-TACCA---CCTGT-----------A----CA-A------T-ATACTTT-G-CAATCGGACT-A-A-TT---TT-C--AC-T-CT----CC----TGAAC-ACAAT--------GGGGC-------GC-CGAGTGGTAGAT----------TTT-ACAC---CTGATCT----------AC--------CC--C--G---CGCAT-CTCAA-AATTAGT--CGA------------AATTCACACCTTTGAAA-CC---ACGCTCCCAATTCA-CGGAT-CCTTG-ATTTTGTTA-AACA-----AA--CAAC---------TAATGTGTT-G----TT-----AA---TT-----------ACC--------CCG-CATGCTG-A-AT-------------A---------------GTGCT-GAC----AA--AACGAA-TT-ATT-CC-CCTTGCGGTTT-AAA-------------------------A-C-------------GC-TT-----GACC----AAT-------AT---CG-AAAG--TAGAA---ATCGCG-T-TNT-----ATTCGTCG--ANGA--TACA----ATCGC--C--GAAT-A-AA--GGT---AAA--------ATT-TCATGAA--A-TTACA-TG-AA-AA--TTTGA-T-AA----GTTT--A-AAC----TTAAT-AAA-----------TA-T------TAT-----TGT-AA--TAAA--------CA--AT-G-AG--TA--AGAGTTTT--ATTATTGCCTTAAATATTA-CA-TGTACATG-AAA---TCATCGA-T-CTC-----ACGT-TT-AA----CTC--AGCAAAATAT--C-TTA-TTCT----GTCACATGTAT-GTAA--T-AG-AGT-CA-TTAA------A--CA----TTA-T---------------TCCAAT-----A--TG-T----ACATGAAG-T--T-TAC-A--AAGA-TATCAT-TAAA--------T-------TG----T-CGTAAG-A---CAACTAAGGATT-------G---CA--TTG------------AAATATA--AA--TGCAAGAGA-CGTT---CCG-----A-TTGA------TGAAC-CAA-TGTGATTTTT--TTTTT-NACGGTGGGC
gi|1 : T--CATAAAA-T---AATG------CTAATA--TTTCTA-----ATTCGAATCGATGTCA---ATACATTATACACAGTAAAGAAGCCA-TACCAATACCTGT-----------A----CACAC-----T-ATACTTT-GGCAATTCGACT-ACA-TTATATT-C--AC-TTCT----CCCACATGAATTACTATCTTATTTCGCGGCTTTGCATGCGCGAGTTGCAGATAATCAGTTCATTT-ATACATCCTGATCTCA--------AC--------CTGTC--GAACCACATACTCAA-AATTAGTACCGATTGGAGTCCCATAATTCACACCTCT--AA-TTTTAACGCTCCAACTTCAAC--AT-CCATGCATTTGTTTA-AACA-----AA--CAAC---------TAATGTGTT-A----CTTAATGAA---TT-----------ACCATTGGGCACCG-CATGCTG-ATAT-------------A---------------GTGTTCGACGTATAA--TGCGAAGTT-ATTACCACCTTGCGGTTA-AAA-------------------------G-A-------------GC-ATACACAGACCTACTAATGACTCCCATGAGCGTAAAGA-GAGAATACACCGCA-A-TCTTACGAATTCGTCG--AAGA--TACA----ATCGCGTCTGAAATAA-AA--GGT---AAA--------ATTATCATGAACGA-TTACA-TG-AACAAGGGGTGA-T-AAAAGTGTTT--AGAAC----TTAATGAAA-----------TA-A------TATAAGTCCGT-AATTTAAAATGGTATGCAAGAT-GAAG--TAGGAGAGTTTT---TTAT----TTAAAT-----------------------TCATCCAGT-CTCTGCAAACCT-TT-AAAGACCTT--TACAGAACA------CA-TTCTTAGAGTC-CA---AT-G-AA--T-AA-AAA-AA-T--A------A--CAATCCTCATT---------------TCCAATTTATAA--TA-TGATAACATGAAG-T--TATAC-A--AAGA-TATTCTATGAA--------TACGGATATGTACTT-TGAAAC-A---TAACTAAAAATT-------GGCTCATTTTGGAGGGAGGAGATAAATATA--AACTTGCAA-AGATCGTTTTCCCGGATGTA-TTGAGTCGTGCGAAC-CAA--GTGATTTTTTCTTTTT-TACGGTG
gi|10 : cttgatgctaaatctcacgatcttatgtggctatgagactctgctctgcttttctgttcacaatagcatcatatcagcacacgaatctctacgtgcgagttacaaccttctgcaatgaaatataatatatattcgaccg--GA-TGATCGCAACTAC-AATTCAAATGTTCAAC-GA-AGTTT-G-ATG-TTTATG-AT-A-GAAGAT-TTTCCT--GTT-CTTG-CTTCG-TCATTGTCCA-CGA-CCGTGAACG---AT--CAA--TACATGTGTAATGAAACTTTTTCT--GA-TAAA-CTTNNNNNN-NNNNNNN---NNNNNNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN-NNNN------------NNNNNNNNNN----NNNN---N-------NN---N------NNNNNCA-T----GA-A--AAAAAAAAT--CG------CTGTT--CATAAAC-TTTTACTGGTTTATTTAAT---ATTCTA-----AT-CAA--CGATGTCA---A---ATTAC-CAT-GTAA-GAAGCCA-TACCA---CCTGT-----------A----CA-A------T-ATACTTT-A-TAATCGGACT-A-ATTT---TT-C--AC-T-CT----CC----TGAAC-ACAAT--------GGGGC-------GC-CGAGTGGTAGAT----------TTT-ACAC---CTGATCT----------AC--------CC--CAAG----GCAT-CTCAA-AATTAGT--CAA------------AATTTACACCTTTGAAA-CC---CCGCTCCCAA-----------------ATTTTGTTA-AACA-----AA--CATC---------TAAGGTGTG-G----TT-----AA---TT-----------ACC--------CCG-CATGCTG-A-AT-------------A---------------GTGCT-GAC----AA--AAcccattccacaagatatatttacgtcaatcagcgaacacagattgac
gi|10 : GC--T--GAAT-A-GT--GCTGACAAA--------ATT-TCATAAA--A-TTACA-TA-AA-AA--ATTGA-T-AA----GTTT--A-AAC----TTAAT-AAACTGGTACCGTATA-TGATTTATAT-----TGT-AA--TAAA--------CA--AT-G-AG--CA--AGAGTTTT--ATTATTGCCTTAAATATTA-CA-TGTGCATG-AAA---TCATCGA-T-CTC-----GCGT-TT-AA----CTC--AGCAATATAT--C-TTA-TTCT----GTCACATGTAT-GTAA--T-AG-AGT-C------------------------------------------CCAAT-----A--TG-T----ACATGAAG-T--T-TAC-A--AAGA-TGTCAT-TGAA--------T-------TG----TGCGTAAG-A---CAACTAAGGATT-------G---Ctttcataaaattacataaaaaattgataagtttaaacttaataaactggtaccgtatatgatttatattgtaataaacaatgagcaagagttttattattgccttaaatattacatgtgcatgaaatcatcgatctcgcgtttaactcagcaatatatcttattctgtcacatgtatgtaatagagtcccaatatgtacatgaagtttacaaagatgtcattgaattgtgcgtaagacaactaaggattgc
gi|11 : gatgatcgcaactacaattcaaatgttcaacgaagtttgatgtttatgatagaagattttcctgttcttgcttcgtcattgtccacgaccgtgaacgatcaatacatgtgtaatgaaactttttctgataaacttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgaaaaaaaaaatcgctgttcataaacttttactggtttatttaatattctaatcaacgatgtcaaattaccatgtaagaagccataccacctgtacaatatactttataatcggactaatttttcactctcctgaacacaatggggcgccgagtggtagattttacacctgatctaccccaaggcatctcaaaattagtcaaaatttacacctttgaaaccccgctcccaaattttgttaaacaaacatctaaggtgtggttaattaccccgcatTCTT-----AT-CAA--TGATGACC---A---ATTAC-TGT-GTAA-GAAGCCA-TGTC----CTTGTCATTTTTTAATAGTCCCA-AGCACTGT-GTACATT-G-CAATCAGATT-A-A-TT---TT-CC-AC-T-CT----TC----TGAA----AA----------------------C-CAGGTGGTAGAT----------TTTCACAC---CTGATCTGATTGGAAGTACTGGCNNNNNN--N--N---NNNNN-NNNNN-NNNNNNN--NNN------------NNTTCACACCTTTGAAAACC---ATGATCTTGTTTTA-TGGAT-TCTTG-ATTTTGTTA-AATA-----AA--CAACAATTACCAGTAATGTGTA-G----TT-----AA---TTAACTTCACTAAACC--------CTG-CATGCTT-T-AT-------------ACTT------------GTGCT-
gi|11 : accattcaaatttttttatggtatac---CG-AAAG--TAGAA---ACCGTG-T-TGT-----ATT--TCA--AAAATGTACA----GTCGC--T--GAAT-A-AAATGGT---AAA--------ATT-TCACGAA--A--TACATTG-AA-AA--ATTAATT-AA----GTTT--A-AAC----GTAAT-AAA-----------TG-T------TAT-----TGT-AAT-TAAA--------TA--AT-A-AG--Ttcaagggtcaatgttctctatcatagtattttaatattagggaagataactctcacacttctattgtgaaaaacgaaagtagaaaccgtgttgtatttcaaaaatgtacagtcgctgaataaaatggtaaaatttcacgaaatacattgaaaaattaattaagtttaaacgtaataaatgttattgtaattaaataataagttacaaaggca
gi|12 : accattcaaatttttttatggtatactcttatcaatgatgaccaattactgtgtaagaagccatgtccttgtcattttttaatagtcccaagcactgtgtacattgcaatcagattaattttccactcttctgaaaaccaggtggtagattttcacacctgatctgattggaagtactggcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcacacctttgaaaaccatgatcttgttttatggattcttgattttgttaaataaacaacaattaccagtaatgtgtagttaattaacttcactaaaccctgcatgctttatacttgtgcttcaagggtcaatgttctctatcatagtattttaatattagggaagataactctcacacttctattgtgaaaaaAT----------TTT-ACAC---CTGATCT----------AC--------CC--C--A---CGCAT-CTCAA-AATTAGT--CGA------------AATTAACACCTTTGAAA-CC---ACGCTCCCAATTCA-CGGAT-CCTTG-ATTTTGTTA-AACA-----AA--CAAC---------TAATGTGTT-GTTTTTT-----AAAACTT-----------ACC--------CCGCCATACGG-A-AA-------------A---------------GT-CT-GAC----AAACAACGAA-TT-ATT-CC-CCTTGC-GTTT-AAA-------------------------A-C-------------GCATT-----GA-C----AAT-------AT---C--AAAG--TAGAA---ATCGCG-T-T-T-----ATTCGTC---AAGA--TA-A----AT----------------G--GGT---AAA----------T-TCA-GAA--ATTTGCA-TA-AAGAA--TTTGA-T-AA----GTTT--A-AAC-----TAAT-AAA-----------TA--------TAT-----TGTCAA--TAAA--------CA--TG-G-AG--TA--AGATTTTT--ATCATTGCATTAAATATTA-CACTTTACATG-GAAAATTCATCGA-T-CTC-----ACGTATT-AA----CTC--AGC-AAATATCGC-TTA-TTCT----GTCACATGTATCGTAA--T-AG-AGTCCA-TTAAATAATTA--TA----TTA-T---------------TCCAAT-----A--TG-T----ACATGCAT-T--T-TAC-A--AAGA-TAtacaaaggca
gi|13 : G-CATGCTG-A-AT-------------ACTTGATCGATTCAGAGTGCA-AAC----AA--AACGAA-T--AT----------CGGTTT-AAA-------------------------A-CAAGATAATCTCACGC-TT-----AACC----AAA-------AT---AG-AAAA--TAGAA---ATCGCG-T-TGT-----ATTCGAAA--AAAAA-TATA----GTCGC--T--GAAT-A-AA--GGT---AAA--------ATT-TCATGAA--A-TTACA-TG-AA-AA--TTGAA-TAAA----GTTT--A-AACGATGTTAAT-a
gi|13 : A-TTCT----GTCACTTGTAT-GTAA--T-AA-AGG-CA-TTAA------A--CA----TCA-T---------------TCCGAT-----A--TG-T----AT-----G-T--T-TAC-A--AAGA-T--------AA--------G-------TG------CAT---------------GGACT-------T---CA--TTG------------AAATATACCAA--TGtttgcctatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgattctgtcacttgtatgtaataaaggcattaaacatcattccgatatgtatgtttacaaagataagtgcatggacttcattgaaatataccaatgtcattttttttcacggtgggcat
gi|13 : gcatgctgaatacttgatcgattcagagtgcaaacaaaacgaatatcggtttaaaacaagataatctcacgcttaaccaaaatagaaaatagaaatcgcgttgtattcgaaaaaaaatatagtcgctgaataaaggtaaaatttcatgaaattacatgaaaattgaataaagtttaaacgatgttaattttgcctatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntg------------AAAGATA--AG--TGCATG-GA-C-TT---C-------A-TTGAAA----TATAC-CAA-TGTCATTTTT--TTT---CACGGTGGGCtcattttttttcacggtgggcat
gi|14 : gcatgctgaatacttgatcgattcagagtgcaaacaaaacgaatatcggtttaaaacaagataatctcacgcttaaccaaaatagaaaatagaaatcgcgttgtattcgaaaaaaaatatagtcgctgaataaaggtaaaatttcatgaaattacatgaaaattgaataaagtttaaacgatgttaattttgcctatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgattctgtcacttgtatgtaataaaggcattaaacatcattccgatatgtatgtttac----ACACCAATTTTTGTGGATTT----CGTT--GA-AGACCTCAACAACGAAGTTAAATGGTCATC-GA-AGTTT-G-GTG-CTTCTG-AT-A-GAAAAC-TT-CCT--CTT-CTTG-CTCTG-TCATTGTCCA-TGA-TCGTGAGCA---AT--CAA--TACATGTATAATGAAACCTTTTAC--GG-TAAA-Cat
gi|14 : cagtggtttcatcagtattcgttgaTAA--T-TG-AGG-CA-TTAA------A--CA----TTA-TTAATTAGACTACACTTCCGAT-----AGATG-T----ACA--AAG-TCAT-TACTATCAATA--ATTAT-TAAAAGCAAAAAT-------CGGGC-T-CG---G-ATTTCACATACAGATTTTTTTCTG---CA--TTG------------AAATATA--AA--TGCGCGAGA-TGTT---CCG-----A-TAGA------TGTAC-CAC-TGTGATTTTT--TTTT---ATGGTAGGCataactaattgaggcattaaacattattaattagactacacttccgatagatgtacaaagtcattactatcaataattattaaaagcaaaaatcgggctcggatttcacatacagatttttttctgcattgaaatataaatgcgcgagatgttccgatagatgtaccactgtgatttttttttatggtaggcatccacgaatttatgtatccacgaaac
gi|15 : cagtggtttcatcagtattcgttgaacaccaatttttgtggatttcgttgaagacctcaacaacgaagttaaatggtcatcgaagtttggtgcttctgatagaaaacttcctcttcttgctctgtcattgtccatgatcgtgagcaatcaatacatgtataatgaaaccttttacggtaaacataac-GTG-TTTCTGGAT-ATGAGGAT-TTTCCT--GTTTCTTG-TTCCG-TCATTGTC-A-CGAACCGTGAGCG---AT---AA--TACATG-ATAAT-AAACTTTTTCC--GG-TAA--CTTATGTGAATTCACAC---GCTTTTGAC-----ATGAGAGTCACGCTTTTC--CAATGCA-ATCT------------CCGATCTCCG----CGCGGGTA-------AA---C------G-----A-T----GA-A--AA---GAAT--CG------CTGTT--CATGNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNN-TA-----AT--------ATTTTACTGG---GTTAC-CAT-GTAA-GAAGCCA-TACCA---CCTGT-----------A----CA-A------T-ATACTTT-G-CAATCGGACT-A-A-TT---TT-TT-AC-T-CT----AC----TGAAC-ACAAT--------GGCGA-------GC-CGAGTGGTAGAT----------TTT-ACAC---CTGATCT----------AT--------CC--T--G---CGCAT-CTCAA-AATTAGT--CGA------------AATTCACACatccacgaatttatgtatccacgaaac
gi|16 : CA-TGGATTCCTTG-ATTTTGTTAGAATAATACCAA--CAAT---------TAATGTGCT-AGTT-TT-----AA---TT-----------AAC--------TTT-CA--CTG-A-A
gi|16 : ta-------------------------A-C-------------AC-TT-----GGTC----AAA-------AG---CG-AAAAATTAGAA---ACCGTGGT-TGT-----CTTCGAAA--AAAA--TATACGATGTCAC--TT-GAAT-A-AA--GGT---AAA---------TT-TCATGAA--A-T-ACACTGTAATAA--TTTAAGT-AA----GTTT--A-AAC----GTAAT-AAA-----------TG-T------TAT-----TGT-AA--TACA--------TA--AT-A-Accctgcatctctataatcttgtttattaaaggataagctttgggtcaatgtataaaattcagatgccattactattaggaagaaatctctcacacttggtcaaaagcgaaaaattagaaaccgtggttgtcttcgaaaaaaatatacgatgtcacttgaataaaggtaaatttcatgaaatacactgtaataatttaagtaagtttaaacgtaataaatgttattgtaatacataataa
gi|17 : tacatggattccttgattttgttagaataataccaacaattaatgtgctagttttaattaactttcactgaaccctgcatctctataatcttgtttattaaaggataagctttgggtcaatgtataaaattcagatgccattactattaggaagaaatctctc-GTAA--TTAG-AGT-CA-TTAA------A--CA----TTA-T---------------TCCAAT-----A--TG-T----ACATGAAG-T--T-TACAA--AAGA-TAT--T-TAAA--------T-------TG----TACGTAAG-A---CAACTAAGGATT-------G---CA--TTG------------AAATATA--AA--TGCAAGAGA-CGTT---CCG-----A-TTGA------TGAAC-CAA-TGTTATTTTT--TTTTT-CACGGCGGGC
gi|18 : TTCAAATGTTCAACCGA-AGTTTCG-GTG-TTTCTG-AT-A-GAAG-T-TTTCCT--GTT-CTT--CTTCGTTCATTGGCCA-CGA-CC--GGGCG---AT--CAAC-TACAAGTAT-ATGAAACTTTTTTCCGGG-TAAA--TTATGTGA-TTTACTCCCAGTATCCCACGCTTTTGGCATGAGACTCGCCGCGTCAA-ACGCATCT------------CCATGCCCCGGCGACGCG---G-------AAACCC------G----CA-T----AG-A--AA---AActcatccagaatttacgtatccacaaacagtgattttagctgatccacgaaaatttgatgccgcacgcccacgaatattgatgaaaccacagt
gi|19 : TGTT--AC-GA--GTTT-G-GTG-TTT-TG-ATCA-GAAG-T-TTTTCT--GTT--TTG-CTTCG-TC-TTGTC---CGA--CGTGAGCGGCAGT--CAAATTACA-GTA-AATGAACTTTTTTCC--GGTTAAA-CTTATGTGA-Tc
gi|2 : AATGTATAAC-GA-AGTTT-GCGTGGTTTCTG-AT-A-GAA-ATATTTCGCAAGTA-CTTGGCTCCG-TCATTGTCCAACGA-CCGTGAGCG---AT--CAAA-TACATGTATAATGAAACTTTTTCC--GG-TAAA-CTTANNNNN-NNNNNNN---NNNNNNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN-NNNN------------NNNNNNNNNN----NNNN---N-------NN---N------N----NN-NNNNNGA-A--AA---AAAT--CG------CTGTT--CATAAAAATTTTACTGGATTATTTAAT---TTTCTA-----AT-CAAA-CGATGTCA---A---ATTAC-CAT-GTAA-GAAGCCAATACCG---C-TGT-----------A----CG-A------TTATACTTTTG-CAATCGGACTTA-A-TT---TT-TCAAC-T-CT----CC----TGAAC-ACAAT--------GGG-C-------GC-CGAGTGGTAGAT----------ATT-ACACA--CTGATCT----------AC--------CC-----G----GCAT-CTCAAGAATTAGT--CGA------------AATTCACACCTT-GAAA-TC---ACGATCCCA-TTCA--GGAT-CCTTG-ATTTTGTTA-AACG-----AAACCAAC---------TAATGTGTTTG----TT-----AA---TT-----------ACC----------G-CATGCTG-A-AT-------------A---------------GTGCT-GAC-----A--AACGAA-TTGATT-CC-CCTTGCGGTTT-AAA-------------------------C-A-------------GC-TT-----GACC----AAT-------AT---CG-AAAG--TAGAA---ATCGCG-C-TTT-----ATTCGTCGA-AAGA--TACA----ATCAC--C--GAAT-AGAA--GGT---AAA--------A-T-TCATGAA--A-TTACA-TG--A-AA--TTTGA-T-AA----GTTTTAA-AAC----TTAAT-AAA-----------TA--------TAT-----TGT-AA--TAAA--------CA--AT-G-AG--TA--AAAGTTTTGGATTATTGCCTTAAATATTACCA-TGTACATGAAAA---TCATCGA-TGCCC-----ACGT-TT-AA----CTCTAGGCAAAATATTCT-TTATTTCT----GTCACATGTAT-GCGAATT-AGAAGT-CAGTTAA------A--CA----TTA-T---------------TCCAAT-----A--TGTT----ACATGAAGTT--T-TAC-A--AATA-TATCAT-TAAA--------T-------TG----TACGTAAGCA---CAACT-AGGATT-------G---CA--TTGCA----------AGATAGA--AA--GTCAAGAGA-CGTT---TCG-----ATTTGA-------GAACTCAA-TGTGATTTTT--TTTTTCAACGGTGGGCatctttccagtatgcccacacgcttttaagctatgaggactcgcgcttttttttcaacgcgaatctccg
gi|20 : ACAAA-TT-ATT-CC-CCATGTGGTTT-AAAACGACAGTAAAAGGGAAGATAACTCA-C-------------GG-TA-----GATC----AAA-------AT---CG-AAAG--TAGAA---ATCGCG-A-TGT-----ATTTGAAA--AAGA--TACA----ATCGC--T--GAAT-A-AA--G----------------------ATGAA--A-TTACA-TG-AA-AA--TTTAA-T-AA----GTTT--A-AAC----ATAAT-AAA-----------TG-T------TAT-----TGT-AA--TAAA--------TG--AT-G-AG--Tctcaccacgatttacgtatccacgaaacagtgatttttggccatgatccacgaaaattgaatgcacggaatattgactgaaacacaca
gi|21 : TT--GAATGAC-GCAACCACGAATTCAA-TGTTCAAC-GATCGTTT-G-GTG-TTTCTGCAT-A-GAA-----TTTCT--GTT-CTTG-CTTCG-TCATTGTCCA-CGA-CCGTGAGCG---AT--C-A--TACA-AAGTAATGAA---CTTTCC--GG-TAAA-CTt
gi|22 : aaatgaatacacaaaatgcataaacaaaaacatcagtatcaacttTTTCGTTGAACACCATTTTTCGTGGATTCTACCCGTTTGAA-TGACCGCAACC-CGAATTCAAATGTTCA-C-GA-AGTTT-G-GTG-TT-CTG-AT-A-GAG----TTTCCT--GTT-CTTG-CTCCG-TCG--GTCCA-CGA-CCATGAGCG---AT--TAA--TACAAG--TAATGGAACTTTTTCC--GG-TAAA-CTTatgtg
gi|23 : atcattaAATAAA--AA--TGCAAGAGA-CGTT---CCG-----A-TTGA------TGAAC-CAA-TGTGG--GTT--TTTTT-CGCGGTGGGC
gi|24 : A-AGTTT-G-GTG-TTTCTG-AT-A-GAAGAT-TTTCCT--CTT-CTTG-CTCCG-TCATTGTCCA-CGA-CAGTGAGCG---AT--CAA--TACATGTATAATGAAACGTTTCCC--GG-TAAA-CTTATGTGA-TACCCAC---GCTTTTGGC-----ATGAGACTCACGCctcatccacgaatttacgtatccacgaaacagtgatttttgcctgatccatgaagattgatgcccatcaatattgatgaaaccacagt
gi|25 : -----GACC----AAA-------AT---CG-AAAG--TAGAA---ATCGCG-T-TTT-----ATT--------------ACA----GTCGC--T--GAAT-A-AA--GGT---AAATTAGCAACATT-GAAAGAA--A-TTACA-TG-AA-AA--TTTTA-T-TT----GTTT--A-AAC----TTAAT-AAA-----------TA-T------TAT-----TGT-AA--TAAt
gi|26 : TTATTTGATATATTCTTACATGTAT-CAA--CGATGACA---A---ATTAT-TGT-GCAA-GAAGCCA-T
gi|27 : tt-------------GC-AT-----GACC----AAA-------AT---CG-AAAG--TAGAA---ATCGCA-A-TGT-----ATTTGAAA--AATA--TACA----GTCAC--T--GAAT-A-AA--GGT---AAA--------ATT-TCAAGAA--A-TTACA-TG-AA-AA--TCTGA-T-AA----ATTgtgttttgggtttttttcagtcccaagcactgcatatgttgtaaatctgact
gi|28 : TTCAAC-GA-AGTTT-G-GTG-TTTCTG-AT-A-GAGGAT-TTTCCT--GTT-CTTG-TTCCG-CCATTGTCCA-CGA-CTGTG--------------------TGTATAATGGAACTTTTCCC--GG-TAAc
gi|3 : AATGTTTAAC-GA-AGTTT-G-GTGGTTTCTG-AT-A-GAATAT-TTTCCA--GTA-CTTGGCTCCG-TCATTGTCCA-CGA-CCGTGAGCG---AT--CAAA-TACATGTATAATGAAACTTTTTCC--GG-TAAAACTTNNNNNN-NNNNNNN---NNNNNNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN-NNNN------------NNNNNNNNNN----NNNN---N-------NN---NNNNNNNG----CA-T----GA-AGAAA---AAAT--CG------CTGTT--CATAAAA-TTTTACTGGATTATTTAAT---TTTCTA-----AT-CAA--CGATGTCA---A---ATTAC-CAT-GTAA-GAAGCCAATACCG---C-TGT-----------A----CG-A------T-ATACTTT-G-CAATCGGACT-A-A-TT---TTTC--AC-T-CT----CC----TGAAC-ACAAT--------GGGGC-------GC-CGAGTGGTAGAT----------ATT-ACCA---CTGATCT----------AC--------CC-----G---CGCAT-CTCAA-AATTAGT--CGA------------AATTCACACCTTTGAAAATC---ACGATCC-AATTCA-CGGAT-CCTTG-ATTTTGTTA-AACA-----AA--CAAC---------TAATGTGTT-G----TT-----A----TT-----------ACC--------CCG-CATGCTG-A-AT-------------A---------------GTGCT-GAC----AA--AA-GAA-TT-ATT-CC-CCTTGCGGTTTAAAA-------------------------A-C-------------GC-TT-----GACC----AAT-------AT---CG--AAG--TAGAA---ATCGCG-T-TTT-----ATTCGTCG--AAGA--TACA----ATCAC--C--GAAT---AA--GGT---AAA--------ATT-TCATGAA--A-TTACA-TG-AA-AA--TTTGA-T-AA----GTTTA-A-AAC----TTAAT-AAA-----------TA-T------TAT-----TGT-AA--ATAA--------CA--AT-G-AG--TA--AAAGTTTG--ATTATTGCCTTAAATATTA-CA-TGTACATG-AAA---TCATCGA-G-CCC-----ACGT-TT-AA----CTC--AGCAAAATAT--C-TTATTTCT----GTCACATGTAT-GCAA--T-AG-AGT-CA-TTAA------A--CA----TTA-T---------------TCCAAT-----A--TG-T----ACATGAAGTT--T-TAC-A--AATA-TATCAT-T-AA--------T-------TG----TACGTAAGCA---CAACT-AGGATT-------G---CA--TTG------------AAATAGA--AA---GCAAGAGA-CGTT---TCG-----ATTTGA------TGAAC-CAATTGTGATTTTT--TTTTT-CACGGTGGtc
gi|30 : G-AAAG--AGGAA---TTCAGA-TGTTT-----ATATGTAGTNACGG--TACA----ATCGC--C--GAGA-A-AA--GGT---AAC--------ATT-TCATGAA--A-TTACA-TG-AA-Accctcaccacgaatttacgtatccacgaaaacagtgatttttggctgatccacgaaattgatgccacgaatattgatgaaacaacagta
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Reference ( family-454 ) : TTTATTCGGCGATTGTATCATCGATGAATATAACGCGATTTCTACTTTCG----ACACCAATTTTCGTGGATTT----CGTT--GA-TGACCGCAACCACGAATTCAAATGTTCAAC-GA-AGTTT-G-GTG-TTTCTG-AT-A-GAAGAT-TTTCCT--GTT-CTTG-CTCCG-TCATTGTCCA-CGA-CCGTGAGCGA---T--CAA--TACATGTATAATGAAACTTTTTCC--GGT-AAA-CTTATGTGA-TNCNCN---C---GCNTCTNNC-----NNGCGNGNNACNCNCCGC--CAATNCG-----------ATCTCCGA-T-CCCCG----CGCG---A-------AA---C------G----CA-T----GA-A--AA---AAAT--CG------CTGTT--CATAAAA-TTTTACTGGGTTATTTAAT---TTTCTA-----AT-CAA--CGATGTCA---A---ATTAC-CAT-GTAA-GAAGCCA-TACCA---CCTGT-----------A----CA-A------T-ATACTTT-G-CAATCGGACT-A-A-TT---TT-C--AC-T-CT----CC----TGAAC-ACAAT--------GGGGC-------GC-CGAGTGGTAGAT----------TTT-ACAC---CTGATCT----------AC--------CC--C--G---CGCAT-CTCAA-AATTAGT--CGA------------AATTCACACCTTTGAAA-CC---ACGCTCCCAATTCA-CGGAT-CCTTG-ATTTTGTTA-AACA-----AA--CAAC---------TAATGTGTT-G----TT-----AA---TT-----------ACC--------CCG-CATGCTG-A-AT-------------A---------------GTGCT-GAC----AA--AACGAA-TT-ATT-CC-CCTTGCGGTTT-AAA-------------------------A-C-------------GC-TT-----GACC----AAT-------AT---CG-AAAG--TAGAA---ATCGCG-T-TNT-----ATTCGTCG--AAGA-T--ACA----ATCGC--C--GAAT-A-AA--GGT---AAA--------ATT-TCATGAA--A-TTACA-T-G-AA-AA--TTTGA-T-AA----GTTT--A-AAC----TTAAT-AAA-----------TA-T------TAT-----TGT-AA--TAAA--------CA--AT-G-AG--TA--AGAGTTTT--ATTATTGCCTTAAATATTA-CA-TGTACATG-AAA---TCATCGA-T-CTC-----ACGT-TT-AA----CTC--AGCAAAATAT--C-TTA-TTCT----GTCACATGTAT-GTAA--T-AG-AGT-CA-TTAA------A--CA----TTA-T---T---------------CCAAT-----A--TG-T----ACATGAAG-T--T-TACAAA-GA-TATCAT-TAA--AT-------TGTACGT---AAG-A---------------CAACTAAGGATT-------G---CA--TTG------------AAATATAAA--TGCAAGAGA-CGTT---CCG-----A-TTGA------TGAAC-CAA-TGTGATTTTT--TTTTTC-ACGGTGGGC
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gi|10 : GC--T--GAAT-A-GT--GCTGACAAA--------ATT-TCATAAA--A-TTACA-T-A-AA-AA--ATTGA-T-AA----GTTT--A-AAC----TTAAT-AAACTGGTACCGTATA-TGATTTATAT-----TGT-AA--TAAA--------CA--AT-G-AG--CA--AGAGTTTT--ATTATTGCCTTAAATATTA-CA-TGTGCATG-AAA---TCATCGA-T-CTC-----GCGT-TT-AA----CTC--AGCAATATAT--C-TTA-TTCT----GTCACATGTAT-GTAA--T-AG-AGT-C---------------------------------------------CCAAT-----A--TG-T----ACATGAAG-T--T-TACAAA-GA-TGTCAT-TGA--AT-------TGTGCGT---AAG-A---------------CAACTAAGGATT-------G---Ctttcataaaattacataaaaaattgataagtttaaacttaataaactggtaccgtatatgatttatattgtaataaacaatgagcaagagttttattattgccttaaatattacatgtgcatgaaatcatcgatctcgcgtttaactcagcaatatatcttattctgtcacatgtatgtaatagagtcccaatatgtacatgaagtttacaaagatgtcattgaattgtgcgtaagacaactaaggattgc
gi|11 : gatgatcgcaactacaattcaaatgttcaacgaagtttgatgtttatgatagaagattttcctgttcttgcttcgtcattgtccacgaccgtgaacgatcaatacatgtgtaatgaaactttttctgataaacttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgaaaaaaaaaatcgctgttcataaacttttactggtttatttaatattctaatcaacgatgtcaaattaccatgtaagaagccataccacctgtacaatatactttataatcggactaatttttcactctcctgaacacaatggggcgccgagtggtagattttacacctgatctaccccaaggcatctcaaaattagtcaaaatttacacctttgaaaccccgctcccaaattttgttaaacaaacatctaaggtgtggttaattaccccgcatTCTT-----AT-CAA--TGATGACC---A---ATTAC-TGT-GTAA-GAAGCCA-TGTC----CTTGTCATTTTTTAATAGTCCCA-AGCACTGT-GTACATT-G-CAATCAGATT-A-A-TT---TT-CC-AC-T-CT----TC----TGAA----AA----------------------C-CAGGTGGTAGAT----------TTTCACAC---CTGATCTGATTGGAAGTACTGGCNNNNNN--N--N---NNNNN-NNNNN-NNNNNNN--NNN------------NNTTCACACCTTTGAAAACC---ATGATCTTGTTTTA-TGGAT-TCTTG-ATTTTGTTA-AATA-----AA--CAACAATTACCAGTAATGTGTA-G----TT-----AA---TTAACTTCACTAAACC--------CTG-CATGCTT-T-AT-------------ACTT------------GTGCT-
gi|11 : accattcaaatttttttatggtatac---CG-AAAG--TAGAA---ACCGTG-T-TGT-----ATT--TCA--AAAA-TGTACA----GTCGC--T--GAAT-A-AAATGGT---AAA--------ATT-TCACGAA--A-T-ACA-TTG-AA-AA--ATTAA-TTAA----GTTT--A-AAC----GTAAT-AAA-----------TG-T------TAT-----TGT-AAT-TAAA--------TA--AT-A-AG--Ttcaagggtcaatgttctctatcatagtattttaatattagggaagataactctcacacttctattgtgaaaaacgaaagtagaaaccgtgttgtatttcaaaaatgtacagtcgctgaataaaatggtaaaatttcacgaaatacattgaaaaattaattaagtttaaacgtaataaatgttattgtaattaaataataagttacaaaggca
gi|12 : accattcaaatttttttatggtatactcttatcaatgatgaccaattactgtgtaagaagccatgtccttgtcattttttaatagtcccaagcactgtgtacattgcaatcagattaattttccactcttctgaaaaccaggtggtagattttcacacctgatctgattggaagtactggcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcacacctttgaaaaccatgatcttgttttatggattcttgattttgttaaataaacaacaattaccagtaatgtgtagttaattaacttcactaaaccctgcatgctttatacttgtgcttcaagggtcaatgttctctatcatagtattttaatattagggaagataactctcacacttctattgtgaaaaaAT----------TTT-ACAC---CTGATCT----------AC--------CC--C--A---CGCAT-CTCAA-AATTAGT--CGA------------AATTAACACCTTTGAAA-CC---ACGCTCCCAATTCA-CGGAT-CCTTG-ATTTTGTTA-AACA-----AA--CAAC---------TAATGTGTT-GTTTTTT-----AAAACTT-----------ACC--------CCGCCATACGG-A-AA-------------A---------------GT-CT-GAC----AAACAACGAA-TT-ATT-CC-CCTTGC-GTTT-AAA-------------------------A-C-------------GCATT-----GA-C----AAT-------AT---C--AAAG--TAGAA---ATCGCG-T-T-T-----ATTCGTC---AAGA-T--A-A----AT----------------G--GGT---AAA----------T-TCA-GAA--ATTTGCA-T-A-AAGAA--TTTGA-T-AA----GTTT--A-AAC-----TAAT-AAA-----------TA--------TAT-----TGTCAA--TAAA--------CA--TG-G-AG--TA--AGATTTTT--ATCATTGCATTAAATATTA-CACTTTACATG-GAAAATTCATCGA-T-CTC-----ACGTATT-AA----CTC--AGC-AAATATCGC-TTA-TTCT----GTCACATGTATCGTAA--T-AG-AGTCCA-TTAAATAATTA--TA----TTA-T---T---------------CCAAT-----A--TG-T----ACATGCAT-T--T-TACAAA-GA-TAtacaaaggca
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gi|14 : gcatgctgaatacttgatcgattcagagtgcaaacaaaacgaatatcggtttaaaacaagataatctcacgcttaaccaaaatagaaaatagaaatcgcgttgtattcgaaaaaaaatatagtcgctgaataaaggtaaaatttcatgaaattacatgaaaattgaataaagtttaaacgatgttaattttgcctatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntg----ACACCAATTTTTGTGGATTT----CGTT--GA-AGACCTCAACAACGAAGTTAAATGGTCATC-GA-AGTTT-G-GTG-CTTCTG-AT-A-GAAAAC-TT-CCT--CTT-CTTG-CTCTG-TCATTGTCCA-TGA-TCGTGAGCAA---T--CAA--TACATGTATAATGAAACCTTTTAC--GGT-AAA-CATAat
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gi|15 : cagtggtttcatcagtattcgttgaacaccaatttttgtggatttcgttgaagacctcaacaacgaagttaaatggtcatcgaagtttggtgcttctgatagaaaacttcctcttcttgctctgtcattgtccatgatcgtgagcaatcaatacatgtataatgaaaccttttacggtaaacataac-GTG-TTTCTGGAT-ATGAGGAT-TTTCCT--GTTTCTTG-TTCCG-TCATTGTC-A-CGAACCGTGAGCGA---T---AA--TACATG-ATAAT-AAACTTTTTCC--GGT-AA--CTTATGTGAATTCACA---C---GCTTTTGAC-----ATGAGAGTCACGCTTTTC--CAATGCA-----------ATCTCCGA-T-CTCCG----CGCGGGTA-------AA---C------G-----A-T----GA-A--AA---GAAT--CG------CTGTT--CATGNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNN-TA-----AT--------ATTTTACTGG---GTTAC-CAT-GTAA-GAAGCCA-TACCA---CCTGT-----------A----CA-A------T-ATACTTT-G-CAATCGGACT-A-A-TT---TT-TT-AC-T-CT----AC----TGAAC-ACAAT--------GGCGA-------GC-CGAGTGGTAGAT----------TTT-ACAC---CTGATCT----------AT--------CC--T--G---CGCAT-CTCAA-AATTAGT--CGA------------AATTCACACatccacgaatttatgtatccacgaaac
gi|16 : CA-TGGATTCCTTG-ATTTTGTTAGAATAATACCAA--CAAT---------TAATGTGCT-AGTT-TT-----AA---TT-----------AAC--------TTT-CA--CTG-A-A
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gi|17 : tacatggattccttgattttgttagaataataccaacaattaatgtgctagttttaattaactttcactgaaccctgcatctctataatcttgtttattaaaggataagctttgggtcaatgtataaaattcagatgccattactattaggaagaaatctctc-GTAA--TTAG-AGT-CA-TTAA------A--CA----TTA-T---T---------------CCAAT-----A--TG-T----ACATGAAG-T--T-TACAAAAGA-TAT--T-TAA--AT-------TGTACGT---AAG-A---------------CAACTAAGGATT-------G---CA--TTG------------AAATATAAA--TGCAAGAGA-CGTT---CCG-----A-TTGA------TGAAC-CAA-TGTTATTTTT--TTTTTC-ACGGCGGGC
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gi|22 : aaatgaatacacaaaatgcataaacaaaaacatcagtatcaacttTTTCGTTGAACACCATTTTTCGTGGATTCTACCCGTTTGAA-TGACCGCAACC-CGAATTCAAATGTTCA-C-GA-AGTTT-G-GTG-TT-CTG-AT-A-GAG----TTTCCT--GTT-CTTG-CTCCG-TCG--GTCCA-CGA-CCATGAGCGA---T--TAA--TACAAG--TAATGGAACTTTTTCC--GGT-AAA-CTT
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gi|26 : TTATTTGATATATTCTTACATGTAT-CAA--CGATGACA---A---ATTAT-TGT-GCAA-GAAGCCA-T
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Reference ( family-454 ) : TTTATTCGGCGATTGTATCATCGATGAATATAACGCGATTTCTACTTTCG----ACACCAATTTTCGTGGATTT----CGTT--GA-TGACCGCAACCACGAATTCAAATGTTCAAC-GA-AGTTT-G-GTG-TTTCTG-AT-A-GAAGAT-TTTCCT--GTT-CTTG-CTCCG-TCATTGTCCA-CGA-CCGTGAGCGA---T--CAA--TACATGTATAATGAAACTTTTTCC--GGT-AAA-CTTATGTGA-T---------------NCNCN---CGCTTTT-NGCATGCGNGNNACNCNCCGC--------CAATNCG-----------ATCTCCGA-T-CCCCG----CGCG---A-------AA---C------G----CA-T----GA-A--AA---AAAT--CG------CTGTT--CATAAAA-TTTTACTGGGTTATTTAAT---TTTCTA-----AT-CAA--CGATGTCA---A---ATTAC-CAT-GTAA-GAAGCCA-TACCA---CCTGT-----------A----CA-A------T-ATACTTT-G-CAATCGGACT-A-A-TT---TT-C--AC-T-CT----CC----TGAAC-ACAAT--------GGGGC-------GC-CGAGTGGTAGAT----------TTT-ACAC---CTGATCT----------AC--------CC--C--G---CGCAT-CTCAA-AATTAGT--CGA------------AATTCACACCTTTGAAA-CC---ACGCTCCCAATTCA-CGGAT-CCTTG-ATTTTGTTA-AACA-----AA--CAAC---------TAATGTGTT-G----TT-----AA---TT-----------ACC--------CCG-CATGCTG-A-AT-------------A---------------GTGCT-GAC----AA--AACGAA-TT-ATT-CC-CCTTGCGGTTT-AAA-------------------------A-C-------------GC-TT-----GACC----AAT-------AT---CG-AAAG--TAGAA---ATCGCG-T-TNT-----ATTCGTCG--AAGA-T--ACA----ATCGC--C--GAAT-A-AA--GGT---AAA--------ATT-TCATGAA--A-TTACA-T-G-AA-AA--TTTGA-T-AA----GTTT--A-AAC----TTAAT-AAA-----------TA-T------TAT-----TGT-AA--TAAA--------CA--AT-G-AG--TA--AGAGTTTT--ATTATTGCCTTAAATATTA-CA-TGTACATG-AAA---TCATCGA-T-CTC-----ACGT-TT-AA----CTC--AGCAAAATAT--C-TTA-TTCT----GTCACATGTAT-GTAA--T-AG-AGT-CA-TTAA------A--CA----TTA-T---T---------------CCAAT-----A--TG-T----ACATGAAG-T--T-TACAAA-GA-TATCAT-TAA--AT-------TGTACGT---AAG-A---------------CAACTAAGGATT-------G---CA--TTG------------AAATATAAA--TGCAAGAGA-CGTT---CCG-----A-TTGA------TGAAC-CAA-TGTGATTTTT--TTTTTC-ACGGTGGGC
gi|1 : T--CATAAAA-T---AATG------CTAATA--TTTCTA-----ATTCGAATCGATGTCA---ATACATTATACACAGTAAAGAAGCCA-TACCAATACCTGT-----------A----CACAC-----T-ATACTTT-GGCAATTCGACT-ACA-TTATATT-C--AC-TTCT----CCCACATGAATTACTATCTTATTTCGCGGCTTTGCATGCGCGAGTTGCAGATAATCAGTTCATTT-ATACATCCTGATCTCA--------AC--------CTGTC--GAACCACATACTCAA-AATTAGTACCGATTGGAGTCCCATAATTCACACCTCT--AA-TTTTAACGCTCCAACTTCAAC--AT-CCATGCATTTGTTTA-AACA-----AA--CAAC---------TAATGTGTT-A----CTTAATGAA---TT-----------ACCATTGGGCACCG-CATGCTG-ATAT-------------A---------------GTGTTCGACGTATAA--TGCGAAGTT-ATTACCACCTTGCGGTTA-AAA-------------------------G-A-------------GC-ATACACAGACCTACTAATGACTCCCATGAGCGTAAAGA-GAGAATACACCGCA-A-TCTTACGAATTCGTCG--AAGA-T--ACA----ATCGCGTCTGAAATAA-AA--GGT---AAA--------ATTATCATGAACGA-TTACA-T-G-AACAAGGGGTGA-T-AAAAGTGTTT--AGAAC----TTAATGAAA-----------TA-A------TATAAGTCCGT-AATTTAAAATGGTATGCAAGAT-GAAG--TAGGAGAGTTTT---TTAT----TTAAAT-----------------------TCATCCAGT-CTCTGCAAACCT-TT-AAAGACCTT--TACAGAACA------CA-TTCTTAGAGTC-CA---AT-G-AA--T-AA-AAA-AA-T--A------A--CAATCCTCATT---T---------------CCAATTTATAA--TA-TGATAACATGAAG-T--TATACAAA-GA-TATTCTATGA--ATACGGATATGTACTTTGAAAC-A---------------TAACTAAAAATT-------GGCTCATTTTGGAGGGAGGAGATAAATATAAACTTGCAA-AGATCGTTTTCCCGGATGTA-TTGAGTCGTGCGAAC-CAA--GTGATTTTTTCTTTTTT-ACGGTG
gi|10 : cttgatgctaaatctcacgatcttatgtggctatgagactctgctctgcttttctgttcacaatagcatcatatcagcacacgaatctctacgtgcgagttacaaccttctgcaatgaaatataatatatattcgaccg--GA-TGATCGCAACTAC-AATTCAAATGTTCAAC-GA-AGTTT-G-ATG-TTTATG-AT-A-GAAGAT-TTTCCT--GTT-CTTG-CTTCG-TCATTGTCCA-CGA-CCGTGAACGA---T--CAA--TACATGTGTAATGAAACTTTTTCT--GAT-AAA-CTTNNNNNN-N---------------NNNNN---NNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--------NNNNNNN-----------NNNNNNNN-N-NNNNN----NNNN---N-------NN---N------NNNNNCA-T----GA-A--AAAAAAAAT--CG------CTGTT--CATAAAC-TTTTACTGGTTTATTTAAT---ATTCTA-----AT-CAA--CGATGTCA---A---ATTAC-CAT-GTAA-GAAGCCA-TACCA---CCTGT-----------A----CA-A------T-ATACTTT-A-TAATCGGACT-A-ATTT---TT-C--AC-T-CT----CC----TGAAC-ACAAT--------GGGGC-------GC-CGAGTGGTAGAT----------TTT-ACAC---CTGATCT----------AC--------CC--CAAG----GCAT-CTCAA-AATTAGT--CAA------------AATTTACACCTTTGAAA-CC---CCGCTCCCAA-----------------ATTTTGTTA-AACA-----AA--CATC---------TAAGGTGTG-G----TT-----AA---TT-----------ACC--------CCG-CATGCTG-A-AT-------------A---------------GTGCT-GAC----AA--AAcccattccacaagatatatttacgtcaatcagcgaacacagattgac
gi|10 : GC--T--GAAT-A-GT--GCTGACAAA--------ATT-TCATAAA--A-TTACA-T-A-AA-AA--ATTGA-T-AA----GTTT--A-AAC----TTAAT-AAACTGGTACCGTATA-TGATTTATAT-----TGT-AA--TAAA--------CA--AT-G-AG--CA--AGAGTTTT--ATTATTGCCTTAAATATTA-CA-TGTGCATG-AAA---TCATCGA-T-CTC-----GCGT-TT-AA----CTC--AGCAATATAT--C-TTA-TTCT----GTCACATGTAT-GTAA--T-AG-AGT-C---------------------------------------------CCAAT-----A--TG-T----ACATGAAG-T--T-TACAAA-GA-TGTCAT-TGA--AT-------TGTGCGT---AAG-A---------------CAACTAAGGATT-------G---Ctttcataaaattacataaaaaattgataagtttaaacttaataaactggtaccgtatatgatttatattgtaataaacaatgagcaagagttttattattgccttaaatattacatgtgcatgaaatcatcgatctcgcgtttaactcagcaatatatcttattctgtcacatgtatgtaatagagtcccaatatgtacatgaagtttacaaagatgtcattgaattgtgcgtaagacaactaaggattgc
gi|11 : gatgatcgcaactacaattcaaatgttcaacgaagtttgatgtttatgatagaagattttcctgttcttgcttcgtcattgtccacgaccgtgaacgatcaatacatgtgtaatgaaactttttctgataaacttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgaaaaaaaaaatcgctgttcataaacttttactggtttatttaatattctaatcaacgatgtcaaattaccatgtaagaagccataccacctgtacaatatactttataatcggactaatttttcactctcctgaacacaatggggcgccgagtggtagattttacacctgatctaccccaaggcatctcaaaattagtcaaaatttacacctttgaaaccccgctcccaaattttgttaaacaaacatctaaggtgtggttaattaccccgcatTCTT-----AT-CAA--TGATGACC---A---ATTAC-TGT-GTAA-GAAGCCA-TGTC----CTTGTCATTTTTTAATAGTCCCA-AGCACTGT-GTACATT-G-CAATCAGATT-A-A-TT---TT-CC-AC-T-CT----TC----TGAA----AA----------------------C-CAGGTGGTAGAT----------TTTCACAC---CTGATCTGATTGGAAGTACTGGCNNNNNN--N--N---NNNNN-NNNNN-NNNNNNN--NNN------------NNTTCACACCTTTGAAAACC---ATGATCTTGTTTTA-TGGAT-TCTTG-ATTTTGTTA-AATA-----AA--CAACAATTACCAGTAATGTGTA-G----TT-----AA---TTAACTTCACTAAACC--------CTG-CATGCTT-T-AT-------------ACTT------------GTGCT-
gi|11 : accattcaaatttttttatggtatac---CG-AAAG--TAGAA---ACCGTG-T-TGT-----ATT--TCA--AAAA-TGTACA----GTCGC--T--GAAT-A-AAATGGT---AAA--------ATT-TCACGAA--A-T-ACA-TTG-AA-AA--ATTAA-TTAA----GTTT--A-AAC----GTAAT-AAA-----------TG-T------TAT-----TGT-AAT-TAAA--------TA--AT-A-AG--Ttcaagggtcaatgttctctatcatagtattttaatattagggaagataactctcacacttctattgtgaaaaacgaaagtagaaaccgtgttgtatttcaaaaatgtacagtcgctgaataaaatggtaaaatttcacgaaatacattgaaaaattaattaagtttaaacgtaataaatgttattgtaattaaataataagttacaaaggca
gi|12 : accattcaaatttttttatggtatactcttatcaatgatgaccaattactgtgtaagaagccatgtccttgtcattttttaatagtcccaagcactgtgtacattgcaatcagattaattttccactcttctgaaaaccaggtggtagattttcacacctgatctgattggaagtactggcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcacacctttgaaaaccatgatcttgttttatggattcttgattttgttaaataaacaacaattaccagtaatgtgtagttaattaacttcactaaaccctgcatgctttatacttgtgcttcaagggtcaatgttctctatcatagtattttaatattagggaagataactctcacacttctattgtgaaaaaAT----------TTT-ACAC---CTGATCT----------AC--------CC--C--A---CGCAT-CTCAA-AATTAGT--CGA------------AATTAACACCTTTGAAA-CC---ACGCTCCCAATTCA-CGGAT-CCTTG-ATTTTGTTA-AACA-----AA--CAAC---------TAATGTGTT-GTTTTTT-----AAAACTT-----------ACC--------CCGCCATACGG-A-AA-------------A---------------GT-CT-GAC----AAACAACGAA-TT-ATT-CC-CCTTGC-GTTT-AAA-------------------------A-C-------------GCATT-----GA-C----AAT-------AT---C--AAAG--TAGAA---ATCGCG-T-T-T-----ATTCGTC---AAGA-T--A-A----AT----------------G--GGT---AAA----------T-TCA-GAA--ATTTGCA-T-A-AAGAA--TTTGA-T-AA----GTTT--A-AAC-----TAAT-AAA-----------TA--------TAT-----TGTCAA--TAAA--------CA--TG-G-AG--TA--AGATTTTT--ATCATTGCATTAAATATTA-CACTTTACATG-GAAAATTCATCGA-T-CTC-----ACGTATT-AA----CTC--AGC-AAATATCGC-TTA-TTCT----GTCACATGTATCGTAA--T-AG-AGTCCA-TTAAATAATTA--TA----TTA-T---T---------------CCAAT-----A--TG-T----ACATGCAT-T--T-TACAAA-GA-TAtacaaaggca
gi|13 : G-CATGCTG-A-AT-------------ACTTGATCGATTCAGAGTGCA-AAC----AA--AACGAA-T--AT----------CGGTTT-AAA-------------------------A-CAAGATAATCTCACGC-TT-----AACC----AAA-------AT---AG-AAAA--TAGAA---ATCGCG-T-TGT-----ATTCGAAA--AAAAAT--ATA----GTCGC--T--GAAT-A-AA--GGT---AAA--------ATT-TCATGAA--A-TTACA-T-G-AA-AA--TTGAA-TAAA----GTTT--A-AACGATGTTAAT-a
gi|13 : A-TTCT----GTCACTTGTAT-GTAA--T-AA-AGG-CA-TTAA------A--CA----TCA-T---T---------------CCGAT-----A--TG-T----AT-----G-T--T-TACAAA-GA-TA--A-----------------GTGCAT------------------------------GGACT-------T---CA--TTG------------AAATATA---------------------CCA-----A-T--------------------GTCATT--T--TTTTTC-ACGGTGGGCtttgcctatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgattctgtcacttgtatgtaataaaggcattaaacatcattccgatatgtatgtttacaaagataagtgcatggacttcattgaaatataccaatgtcattttttttcacggtgggcat
gi|14 : gcatgctgaatacttgatcgattcagagtgcaaacaaaacgaatatcggtttaaaacaagataatctcacgcttaaccaaaatagaaaatagaaatcgcgttgtattcgaaaaaaaatatagtcgctgaataaaggtaaaatttcatgaaattacatgaaaattgaataaagtttaaacgatgttaattttgcctatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntg----ACACCAATTTTTGTGGATTT----CGTT--GA-AGACCTCAACAACGAAGTTAAATGGTCATC-GA-AGTTT-G-GTG-CTTCTG-AT-A-GAAAAC-TT-CCT--CTT-CTTG-CTCTG-TCATTGTCCA-TGA-TCGTGAGCAA---T--CAA--TACATGTATAATGAAACCTTTTAC--GGT-AAA-CATAat
gi|14 : cagtggtttcatcagtattcgttgaTAA--T-TG-AGG-CA-TTAA------A--CA----TTA-T---TAATTAGACTACACTTCCGAT-----AGATG-T----ACA--AAG-TCAT-TAC-------TATCAA-TAATTAT-------TAAAAGC---AAA-AATCGGGCTCGGATTTCACATACAGATTTTTTTCTG---CA--TTG------------AAATATAAA--TGCGCGAGA-TGTT---CCG-----A-TAGA------TGTAC-CAC-TGTGATTTTT--TTTT---ATGGTAGGCactaattgaggcattaaacattattaattagactacacttccgatagatgtacaaagtcattactatcaataattattaaaagcaaaaatcgggctcggatttcacatacagatttttttctgcattgaaatataaatgcgcgagatgttccgatagatgtaccactgtgatttttttttatggtaggcatccacgaatttatgtatccacgaaac
gi|15 : cagtggtttcatcagtattcgttgaacaccaatttttgtggatttcgttgaagacctcaacaacgaagttaaatggtcatcgaagtttggtgcttctgatagaaaacttcctcttcttgctctgtcattgtccatgatcgtgagcaatcaatacatgtataatgaaaccttttacggtaaacataac-GTG-TTTCTGGAT-ATGAGGAT-TTTCCT--GTTTCTTG-TTCCG-TCATTGTC-A-CGAACCGTGAGCGA---T---AA--TACATG-ATAAT-AAACTTTTTCC--GGT-AA--CTTATGTGAAT---------------TCACA---CGCTTTT-GACATGAGAGTCACGCTTTTC--------CAATGCA-----------ATCTCCGA-T-CTCCG----CGCGGGTA-------AA---C------G-----A-T----GA-A--AA---GAAT--CG------CTGTT--CATGNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNN-TA-----AT--------ATTTTACTGG---GTTAC-CAT-GTAA-GAAGCCA-TACCA---CCTGT-----------A----CA-A------T-ATACTTT-G-CAATCGGACT-A-A-TT---TT-TT-AC-T-CT----AC----TGAAC-ACAAT--------GGCGA-------GC-CGAGTGGTAGAT----------TTT-ACAC---CTGATCT----------AT--------CC--T--G---CGCAT-CTCAA-AATTAGT--CGA------------AATTCACACatccacgaatttatgtatccacgaaac
gi|16 : CA-TGGATTCCTTG-ATTTTGTTAGAATAATACCAA--CAAT---------TAATGTGCT-AGTT-TT-----AA---TT-----------AAC--------TTT-CA--CTG-A-A
gi|16 : ta-------------------------A-C-------------AC-TT-----GGTC----AAA-------AG---CG-AAAAATTAGAA---ACCGTGGT-TGT-----CTTCGAAA--AAAA-T--ATACGATGTCAC--TT-GAAT-A-AA--GGT---AAA---------TT-TCATGAA--A-T-ACACT-GTAATAA--TTTAAGT-AA----GTTT--A-AAC----GTAAT-AAA-----------TG-T------TAT-----TGT-AA--TACA--------TA--AT-A-Accctgcatctctataatcttgtttattaaaggataagctttgggtcaatgtataaaattcagatgccattactattaggaagaaatctctcacacttggtcaaaagcgaaaaattagaaaccgtggttgtcttcgaaaaaaatatacgatgtcacttgaataaaggtaaatttcatgaaatacactgtaataatttaagtaagtttaaacgtaataaatgttattgtaatacataataa
gi|17 : tacatggattccttgattttgttagaataataccaacaattaatgtgctagttttaattaactttcactgaaccctgcatctctataatcttgtttattaaaggataagctttgggtcaatgtataaaattcagatgccattactattaggaagaaatctctc-GTAA--TTAG-AGT-CA-TTAA------A--CA----TTA-T---T---------------CCAAT-----A--TG-T----ACATGAAG-T--T-TACAAAAGA-TAT--T-TAA--AT-------TGTACGT---AAG-A---------------CAACTAAGGATT-------G---CA--TTG------------AAATATAAA--TGCAAGAGA-CGTT---CCG-----A-TTGA------TGAAC-CAA-TGTTATTTTT--TTTTTC-ACGGCGGGC
gi|18 : TTCAAATGTTCAACCGA-AGTTTCG-GTG-TTTCTG-AT-A-GAAG-T-TTTCCT--GTT-CTT--CTTCGTTCATTGGCCA-CGA-CC--GGGCGA---T--CAAC-TACAAGTAT-ATGAAACTTTTTTCCGGGT-AAA--TTATGTGA-TTTACTCCCAGTA---TCCCA---CGCTTTT-GGCAT----GAGACTCGCCGCGT------CAA-ACGC----------ATCTCC-A-TGCCCCGGCGACGCG---G-------AAACCC------G----CA-T----AG-A--AA---AActcatccagaatttacgtatccacaaacagtgattttagctgatccacgaaaatttgatgccgcacgcccacgaatattgatgaaaccacagt
gi|19 : TGTT--AC-GA--GTTT-G-GTG-TTT-TG-ATCA-GAAG-T-TTTTCT--GTT--TTG-CTTCG-TC-TTGTCC---GA-C-GTGAGCGGCAGT--CAAATTACA-GTA-AATGAACTTTTTTCC--GGTTAAA-CTTATGTGA-TATCTTTCCAGTATGCCCACA---CGCTTTTAAGC-TATGAG-GACTCG-CGCTTTTTTTTCAACGCGA----------ATCTCCGc
gi|2 : AATGTATAAC-GA-AGTTT-GCGTGGTTTCTG-AT-A-GAA-ATATTTCGCAAGTA-CTTGGCTCCG-TCATTGTCCAACGA-CCGTGAGCGA---T--CAAA-TACATGTATAATGAAACTTTTTCC--GGT-AAA-CTTANNNNN-N---------------NNNNN---NNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--------NNNNNNN-----------NNNNNNNN-N-NNNNN----NNNN---N-------NN---N------N----NN-NNNNNGA-A--AA---AAAT--CG------CTGTT--CATAAAAATTTTACTGGATTATTTAAT---TTTCTA-----AT-CAAA-CGATGTCA---A---ATTAC-CAT-GTAA-GAAGCCAATACCG---C-TGT-----------A----CG-A------TTATACTTTTG-CAATCGGACTTA-A-TT---TT-TCAAC-T-CT----CC----TGAAC-ACAAT--------GGG-C-------GC-CGAGTGGTAGAT----------ATT-ACACA--CTGATCT----------AC--------CC-----G----GCAT-CTCAAGAATTAGT--CGA------------AATTCACACCTT-GAAA-TC---ACGATCCCA-TTCA--GGAT-CCTTG-ATTTTGTTA-AACG-----AAACCAAC---------TAATGTGTTTG----TT-----AA---TT-----------ACC----------G-CATGCTG-A-AT-------------A---------------GTGCT-GAC-----A--AACGAA-TTGATT-CC-CCTTGCGGTTT-AAA-------------------------C-A-------------GC-TT-----GACC----AAT-------AT---CG-AAAG--TAGAA---ATCGCG-C-TTT-----ATTCGTCGA-AAGA-T--ACA----ATCAC--C--GAAT-AGAA--GGT---AAA--------A-T-TCATGAA--A-TTACA-T-G--A-AA--TTTGA-T-AA----GTTTTAA-AAC----TTAAT-AAA-----------TA--------TAT-----TGT-AA--TAAA--------CA--AT-G-AG--TA--AAAGTTTTGGATTATTGCCTTAAATATTACCA-TGTACATGAAAA---TCATCGA-TGCCC-----ACGT-TT-AA----CTCTAGGCAAAATATTCT-TTATTTCT----GTCACATGTAT-GCGAATT-AGAAGT-CAGTTAA------A--CA----TTA-T---T---------------CCAAT-----A--TGTT----ACATGAAGTT--T-TACAAA-TA-TATCAT-TAA--AT-------TGTACGT---AAGCA---------------CAACT-AGGATT-------G---CA--TTGCA----------AGATAGAAA--GTCAAGAGA-CGTT---TCG-----ATTTGA-------GAACTCAA-TGTGATTTTT--TTTTTCAACGGTGGGC
gi|20 : ACAAA-TT-ATT-CC-CCATGTGGTTT-AAAACGACAGTAAAAGGGAAGATAACTCA-C-------------GG-TA-----GATC----AAA-------AT---CG-AAAG--TAGAA---ATCGCG-A-TGT-----ATTTGAAA--AAGA-T--ACA----ATCGC--T--GAAT-A-AA--G----------------------ATGAA--A-TTACA-T-G-AA-AA--TTTAA-T-AA----GTTT--A-AAC----ATAAT-AAA-----------TG-T------TAT-----TGT-AA--TAAA--------TG--AT-G-AG--Tctcaccacgatttacgtatccacgaaacagtgatttttggccatgatccacgaaaattgaatgcacggaatattgactgaaacacaca
gi|21 : TT--GAATGAC-GCAACCACGAATTCAA-TGTTCAAC-GATCGTTT-G-GTG-TTTCTGCAT-A-GAA-----TTTCT--GTT-CTTG-CTTCG-TCATTGTCCA-CGA-CCGTGAGCGA---T--C-A--TACA-AAGTAATGAA---CTTTCC--GGT-AAA-C-TATGTGt
gi|22 : aaatgaatacacaaaatgcataaacaaaaacatcagtatcaacttTTTCGTTGAACACCATTTTTCGTGGATTCTACCCGTTTGAA-TGACCGCAACC-CGAATTCAAATGTTCA-C-GA-AGTTT-G-GTG-TT-CTG-AT-A-GAG----TTTCCT--GTT-CTTG-CTCCG-TCG--GTCCA-CGA-CCATGAGCGA---T--TAA--TACAAG--TAATGGAACTTTTTCC--GGT-AAA-CTT
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lowQualScore : 3333 2222 22 7 0 7 5 5 4 7 0 5 5 11 5 44 5 3 7 5 5 444 44 99 0 9 77 7 9 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 7777 6 7777 6 00 444 55 555555 66 3 2 555 11111 9 88 000 000 9 9 9 2 888 8 0000000000000000 3 999999 6 3 3 1 1 2 444 2 55 1 1 5555 5555 3 11111111 8888888 3 5555555555 1 555 7777777777 22222222 555555555 1 1 22 888888888888 7 888 1 1 1 1 77777 22 333333333 1 9999 77777 444 66666666666 22222222 9 9 9 55555555555555555555555555555 1 1111 66 3 3 3 3 3 33333333333333333333333333333333333333333 9 33333 3333 7777777 999 4 66 111 4 4 3 99999 44 66 4 22 0000 88888 2 2 11 999 11111111 2 11 2 2 2 2 7 22 4 4 7777 66 4 0000 4 222222222222222222222 22222 5 99 77777777 77 7 7 99 00 00 6 6 3 444 777 11111 6 6 7777 00 00 6 0 1111 1 22 1 1 2 1 999999999999999 1 444 222222222222222 77777 22 1 5555 2 22 1 1 1 666666666666666666 888 88888888888888888 2 8888888 888 00 333333333333 777 3 888 33333 0 666666 3 7 2 66 7
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Reference ( family-454 ) : TTTATTCGGCGATTGTATCATCGATGAATATAACGCGATTTCTACTTTCG----ACACCAATTTTCGTGGATTT----CGTT--GA-TGACCGCAACCACGAATTCAAATGTTCAAC-GA-AGTTT-G-GTG-TTTCTG-AT-A-GAAGAT-TTTCCT--GTT-CTTG-CTCCG-TCATTGTCCA-CGA-CCGTGAGCGA---T--CAA--TACATGTATAATGAAACTTTTTCC--GGT-AAA-CTTATGTGA-T------------NCC---------------C---ACGCTTTT-GGCATGNGAGNGACTCGCCGC--------C-A-----------AC-GCG-ATCTCCGA-T-CCCCG----CGCG---A-------AA---C------G----CA-T----GA-A--AA---AAAT--CG------CTGTT--CATAAAA-TTTTACTGGGTTATTTAAT---TTTCTA-----AT-CAA--CGATGTCA---A---ATTAC-CAT-GTAA-GAAGCCA-TACCA---CCTGT-----------A----CA-A------T-ATACTTT-G-CAATCGGACT-A-A-TT---TT-C--AC-T-CT----CC----TGAAC-ACAAT--------GGGGC-------GC-CGAGTGGTAGAT----------TTT-ACAC---CTGATCT----------AC--------CC--C--G---CGCAT-CTCAA-AATTAGT--CGA------------AATTCACACCTTTGAAA-CC---ACGCTCCCAATTCA-CGGAT-CCTTG-ATTTTGTTA-AACA-----AA--CAAC---------TAATGTGTT-G----TT-----AA---TT-----------ACC--------CCG-CATGCTG-A-AT-------------A---------------GTGCT-GAC----AA--AACGAA-TT-ATT-CC-CCTTGCGGTTT-AAA-------------------------A-C-------------GC-TT-----GACC----AAT-------AT---CG-AAAG--TAGAA---ATCGCG-T-TNT-----ATTCGTCG--AAGA-T--ACA----ATCGC--C--GAAT-A-AA--GGT---AAA--------ATT-TCATGAA--A-TTACA-T-G-AA-AA--TTTGA-T-AA----GTTT--A-AAC----TTAAT-AAA-----------TA-T------TAT-----TGT-AA--TAAA--------CA--AT-G-AG--TA--AGAGTTTT--ATTATTGCCTTAAATATTA-CA-TGTACATG-AAA---TCATCGA-T-CTC-----ACGT-TT-AA----CTC--AGCAAAATAT--C-TTA-TTCT----GTCACATGTAT-GTAA--T-AG-AGT-CA-TTAA------A--CA----TTA-T---T---------------CCAAT-----A--TG-T----ACATGAAG-T--T-TACAAA-GA-TATCAT-TAA--AT-------TGTACGT---AAG-A---------------CAACTAAGGATT-------G---CA--TTG------------AAATATAAA--TGCAAGAGA-CGTT---CCG-----A-TTGA------TGAAC-CAA-TGTGATTTTT--TTTTTC-ACGGTGGGC
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gi|10 : cttgatgctaaatctcacgatcttatgtggctatgagactctgctctgcttttctgttcacaatagcatcatatcagcacacgaatctctacgtgcgagttacaaccttctgcaatgaaatataatatatattcgaccg--GA-TGATCGCAACTAC-AATTCAAATGTTCAAC-GA-AGTTT-G-ATG-TTTATG-AT-A-GAAGAT-TTTCCT--GTT-CTTG-CTTCG-TCATTGTCCA-CGA-CCGTGAACGA---T--CAA--TACATGTGTAATGAAACTTTTTCT--GAT-AAA-CTTNNNNNN-N------------NNN---------------N---NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--------N-N-----------NN-NNN-NNNNNNNN-N-NNNNN----NNNN---N-------NN---N------NNNNNCA-T----GA-A--AAAAAAAAT--CG------CTGTT--CATAAAC-TTTTACTGGTTTATTTAAT---ATTCTA-----AT-CAA--CGATGTCA---A---ATTAC-CAT-GTAA-GAAGCCA-TACCA---CCTGT-----------A----CA-A------T-ATACTTT-A-TAATCGGACT-A-ATTT---TT-C--AC-T-CT----CC----TGAAC-ACAAT--------GGGGC-------GC-CGAGTGGTAGAT----------TTT-ACAC---CTGATCT----------AC--------CC--CAAG----GCAT-CTCAA-AATTAGT--CAA------------AATTTACACCTTTGAAA-CC---CCGCTCCCAA-----------------ATTTTGTTA-AACA-----AA--CATC---------TAAGGTGTG-G----TT-----AA---TT-----------ACC--------CCG-CATGCTG-A-AT-------------A---------------GTGCT-GAC----AA--AAcccattccacaagatatatttacgtcaatcagcgaacacagattgac
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gi|11 : gatgatcgcaactacaattcaaatgttcaacgaagtttgatgtttatgatagaagattttcctgttcttgcttcgtcattgtccacgaccgtgaacgatcaatacatgtgtaatgaaactttttctgataaacttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgaaaaaaaaaatcgctgttcataaacttttactggtttatttaatattctaatcaacgatgtcaaattaccatgtaagaagccataccacctgtacaatatactttataatcggactaatttttcactctcctgaacacaatggggcgccgagtggtagattttacacctgatctaccccaaggcatctcaaaattagtcaaaatttacacctttgaaaccccgctcccaaattttgttaaacaaacatctaaggtgtggttaattaccccgcatTCTT-----AT-CAA--TGATGACC---A---ATTAC-TGT-GTAA-GAAGCCA-TGTC----CTTGTCATTTTTTAATAGTCCCA-AGCACTGT-GTACATT-G-CAATCAGATT-A-A-TT---TT-CC-AC-T-CT----TC----TGAA----AA----------------------C-CAGGTGGTAGAT----------TTTCACAC---CTGATCTGATTGGAAGTACTGGCNNNNNN--N--N---NNNNN-NNNNN-NNNNNNN--NNN------------NNTTCACACCTTTGAAAACC---ATGATCTTGTTTTA-TGGAT-TCTTG-ATTTTGTTA-AATA-----AA--CAACAATTACCAGTAATGTGTA-G----TT-----AA---TTAACTTCACTAAACC--------CTG-CATGCTT-T-AT-------------ACTT------------GTGCT-
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gi|12 : accattcaaatttttttatggtatactcttatcaatgatgaccaattactgtgtaagaagccatgtccttgtcattttttaatagtcccaagcactgtgtacattgcaatcagattaattttccactcttctgaaaaccaggtggtagattttcacacctgatctgattggaagtactggcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcacacctttgaaaaccatgatcttgttttatggattcttgattttgttaaataaacaacaattaccagtaatgtgtagttaattaacttcactaaaccctgcatgctttatacttgtgcttcaagggtcaatgttctctatcatagtattttaatattagggaagataactctcacacttctattgtgaaaaaAT----------TTT-ACAC---CTGATCT----------AC--------CC--C--A---CGCAT-CTCAA-AATTAGT--CGA------------AATTAACACCTTTGAAA-CC---ACGCTCCCAATTCA-CGGAT-CCTTG-ATTTTGTTA-AACA-----AA--CAAC---------TAATGTGTT-GTTTTTT-----AAAACTT-----------ACC--------CCGCCATACGG-A-AA-------------A---------------GT-CT-GAC----AAACAACGAA-TT-ATT-CC-CCTTGC-GTTT-AAA-------------------------A-C-------------GCATT-----GA-C----AAT-------AT---C--AAAG--TAGAA---ATCGCG-T-T-T-----ATTCGTC---AAGA-T--A-A----AT----------------G--GGT---AAA----------T-TCA-GAA--ATTTGCA-T-A-AAGAA--TTTGA-T-AA----GTTT--A-AAC-----TAAT-AAA-----------TA--------TAT-----TGTCAA--TAAA--------CA--TG-G-AG--TA--AGATTTTT--ATCATTGCATTAAATATTA-CACTTTACATG-GAAAATTCATCGA-T-CTC-----ACGTATT-AA----CTC--AGC-AAATATCGC-TTA-TTCT----GTCACATGTATCGTAA--T-AG-AGTCCA-TTAAATAATTA--TA----TTA-T---T---------------CCAAT-----A--TG-T----ACATGCAT-T--T-TACAAA-GA-TAtacaaaggca
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gi|13 : A-TTCT----GTCACTTGTAT-GTAA--T-AA-AGG-CA-TTAA------A--CA----TCA-T---T---------------CCGAT-----A--TG-T----AT-----G-T--T-TACAAA-GA-TA--A-----------------GTGCAT------------------------------GGACT-------T---CA--TTG------------AAATATA---------------------CCA-----A-T--------------------GTCATT--T--TTTTTC-ACGGTGGGCtttgcctatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgattctgtcacttgtatgtaataaaggcattaaacatcattccgatatgtatgtttacaaagataagtgcatggacttcattgaaatataccaatgtcattttttttcacggtgggcat
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gi|15 : cagtggtttcatcagtattcgttgaacaccaatttttgtggatttcgttgaagacctcaacaacgaagttaaatggtcatcgaagtttggtgcttctgatagaaaacttcctcttcttgctctgtcattgtccatgatcgtgagcaatcaatacatgtataatgaaaccttttacggtaaacataac-GTG-TTTCTGGAT-ATGAGGAT-TTTCCT--GTTTCTTG-TTCCG-TCATTGTC-A-CGAACCGTGAGCGA---T---AA--TACATG-ATAAT-AAACTTTTTCC--GGT-AA--CTTATGTGAAT------------TCA---------------C---ACGCTTTT-GACATGAGAGTCACGCTTTTC--------C-A-----------AT-GCA-ATCTCCGA-T-CTCCG----CGCGGGTA-------AA---C------G-----A-T----GA-A--AA---GAAT--CG------CTGTT--CATGNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNN-TA-----AT--------ATTTTACTGG---GTTAC-CAT-GTAA-GAAGCCA-TACCA---CCTGT-----------A----CA-A------T-ATACTTT-G-CAATCGGACT-A-A-TT---TT-TT-AC-T-CT----AC----TGAAC-ACAAT--------GGCGA-------GC-CGAGTGGTAGAT----------TTT-ACAC---CTGATCT----------AT--------CC--T--G---CGCAT-CTCAA-AATTAGT--CGA------------AATTCACACatccacgaatttatgtatccacgaaac
gi|16 : CA-TGGATTCCTTG-ATTTTGTTAGAATAATACCAA--CAAT---------TAATGTGCT-AGTT-TT-----AA---TT-----------AAC--------TTT-CA--CTG-A-A
gi|16 : ta-------------------------A-C-------------AC-TT-----GGTC----AAA-------AG---CG-AAAAATTAGAA---ACCGTGGT-TGT-----CTTCGAAA--AAAA-T--ATACGATGTCAC--TT-GAAT-A-AA--GGT---AAA---------TT-TCATGAA--A-T-ACACT-GTAATAA--TTTAAGT-AA----GTTT--A-AAC----GTAAT-AAA-----------TG-T------TAT-----TGT-AA--TACA--------TA--AT-A-Accctgcatctctataatcttgtttattaaaggataagctttgggtcaatgtataaaattcagatgccattactattaggaagaaatctctcacacttggtcaaaagcgaaaaattagaaaccgtggttgtcttcgaaaaaaatatacgatgtcacttgaataaaggtaaatttcatgaaatacactgtaataatttaagtaagtttaaacgtaataaatgttattgtaatacataataa
gi|17 : tacatggattccttgattttgttagaataataccaacaattaatgtgctagttttaattaactttcactgaaccctgcatctctataatcttgtttattaaaggataagctttgggtcaatgtataaaattcagatgccattactattaggaagaaatctctc-GTAA--TTAG-AGT-CA-TTAA------A--CA----TTA-T---T---------------CCAAT-----A--TG-T----ACATGAAG-T--T-TACAAAAGA-TAT--T-TAA--AT-------TGTACGT---AAG-A---------------CAACTAAGGATT-------G---CA--TTG------------AAATATAAA--TGCAAGAGA-CGTT---CCG-----A-TTGA------TGAAC-CAA-TGTTATTTTT--TTTTTC-ACGGCGGGC
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gi|19 : TGTT--AC-GA--GTTT-G-GTG-TTT-TG-ATCA-GAAG-T-TTTTCT--GTT--TTG-CTTCG-TC-TTGTCC---GA-C-GTGAGCGGCAGT--CAAATTACA-GTA-AATGAACTTTTTTCC--GGTTAAA-CTTATGTGA-T------------ATCTTTCCAGTATGCCCAC---ACGCTTTTAAGC-TATGAG-GACTCG-CGCTTTTTTTTC-A-----------AC-GCGAATCTCCGc
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gi|21 : TT--GAATGAC-GCAACCACGAATTCAA-TGTTCAAC-GATCGTTT-G-GTG-TTTCTGCAT-A-GAA-----TTTCT--GTT-CTTG-CTTCG-TCATTGTCCA-CGA-CCGTGAGCGA---T--C-A--TACA-AAGTAATGAA---CTTTCC--GGT-AAA-C-TATGTGt
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lowQualScore : .... .... .. . . . . . . . . . . .. . .. . . . . . ... .. .. . . .. . . .................................... . . .......................................................................................... .... . .... . .. ... .. ...... .. . . ... ..... . .. ... ... . . . . ... . ................ . ...... . . . . . . ... . .. . . .... .... . ........ ....... . .......... . ... .......... ........ ......... . . .. ............ . ... . . . . ..... .. ......... . .... ..... ... ........... ........ . . . ............................. . .... .. . . . . . ......................................... . ..... .... ....... ... . .. ... . . . ..... .. .. . .. .... ..... . . .. ... ........ . .. . . . . . .. . . .... .. . .... . ..................... ..... . .. ........ .. . . .. .. .. . . . ... ... ..... . . .... .. .. . . .... . .. . . . . ............... . ... ............... ..... .. . .... . .. . . . .................. ... ................. . ....... ... .. ............ ... . ... ..... . ...... . . . .. .
lowQualScore : 3333 2222 22 7 0 7 5 5 4 7 0 5 5 11 5 44 5 3 7 5 5 444 44 99 0 9 77 7 9 000000000000000000000000000000000000 3 6 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 7777 6 7777 6 00 444 55 555555 66 3 2 555 11111 9 88 000 000 9 9 9 2 888 8 0000000000000000 3 999999 6 3 3 1 1 2 444 2 55 1 1 5555 5555 3 11111111 8888888 3 5555555555 1 555 7777777777 22222222 555555555 1 1 22 888888888888 7 888 1 1 1 1 77777 22 333333333 1 9999 77777 444 66666666666 22222222 9 9 9 55555555555555555555555555555 1 1111 66 3 3 3 3 3 33333333333333333333333333333333333333333 9 33333 3333 7777777 999 4 66 111 4 4 3 99999 44 66 4 22 0000 88888 2 2 11 999 11111111 2 11 2 2 2 2 7 22 4 4 7777 66 4 0000 4 222222222222222222222 22222 5 99 77777777 77 7 7 99 00 00 6 6 3 444 777 11111 6 6 7777 00 00 6 0 1111 1 22 1 1 2 1 999999999999999 1 444 222222222222222 77777 22 1 5555 2 22 1 1 1 666666666666666666 888 88888888888888888 2 8888888 888 00 333333333333 777 3 888 33333 0 666666 3 7 2 66 7
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gi|11 : gatgatcgcaactacaattcaaatgttcaacgaagtttgatgtttatgatagaagattttcctgttcttgcttcgtcattgtccacgaccgtgaacgatcaatacatgtgtaatgaaactttttctgataaacttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgaaaaaaaaaatcgctgttcataaacttttactggtttatttaatattctaatcaacgatgtcaaattaccatgtaagaagccataccacctgtacaatatactttataatcggactaatttttcactctcctgaacacaatggggcgccgagtggtagattttacacctgatctaccccaaggcatctcaaaattagtcaaaatttacacctttgaaaccccgctcccaaattttgttaaacaaacatctaaggtgtggttaattaccccgcatTCTT-----AT-CAA--TGATGACC---A---ATTAC-TGT-GTAA-GAAGCCA-TGTC----CTTGTCATTTTTTAATAGTCCCA-AGCACTGT-GTACATT-G-CAATCAGATT-A-A-TT---TT-CC-AC-T-CT----TC----TGAA----AA----------------------C-CAGGTGGTAGAT----------TTTCACAC---CTGATCTGATTGGAAGTACTGGCNNNNNN--N--N---NNNNN-NNNNN-NNNNNNN--NNN------------NNTTCACACCTTTGAAAACC---ATGATCTTGTTTTA-TGGAT-TCTTG-ATTTTGTTA-AATA-----AA--CAACAATTACCAGTAATGTGTA-G----TT-----AA---TTAACTTCACTAAACC--------CTG-CATGCTT-T-AT-------------ACTT------------GTGCT-
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gi|12 : accattcaaatttttttatggtatactcttatcaatgatgaccaattactgtgtaagaagccatgtccttgtcattttttaatagtcccaagcactgtgtacattgcaatcagattaattttccactcttctgaaaaccaggtggtagattttcacacctgatctgattggaagtactggcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcacacctttgaaaaccatgatcttgttttatggattcttgattttgttaaataaacaacaattaccagtaatgtgtagttaattaacttcactaaaccctgcatgctttatacttgtgcttcaagggtcaatgttctctatcatagtattttaatattagggaagataactctcacacttctattgtgaaaaaAT----------TTT-ACAC---CTGATCT----------AC--------CC--C--A---CGCAT-CTCAA-AATTAGT--CGA------------AATTAACACCTTTGAAA-CC---ACGCTCCCAATTCA-CGGAT-CCTTG-ATTTTGTTA-AACA-----AA--CAAC---------TAATGTGTT-GTTTTTT-----AAAACTT-----------ACC--------CCGCCATACGG-A-AA-------------A---------------GT-CT-GAC----AAACAACGAA-TT-ATT-CC-CCTTGC-GTTT-AAA-------------------------A-C-------------GCATT-----GA-C----AAT-------AT---C--AAAG--TAGAA---ATCGCG-T-T-T-----ATTCGTC---AAGA-T--A-A----AT----------------G--GGT---AAA----------T-TCA-GAA--ATTTGCA-T-A-AAGAA--TTTGA-T-AA----GTTT--A-AAC-----TAAT-AAA-----------TA--------TAT-----TGTCAA--TAAA--------CA--TG-G-AG--TA--AGATTTTT--ATCATTGCATTAAATATTA-CACTTTACATG-GAAAATTCATCGA-T-CTC-----ACGTATT-AA----CTC--AGC-AAATATCGC-TTA-TTCT----GTCACATGTATCGTAA--T-AG-AGTCCA-TTAAATAATTA--TA----TTA-T---T---------------CCAAT-----A--TG-T----ACATGCAT-T--T-TACAAA-GA-TAtacaaaggca
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gi|13 : A-TTCT----GTCACTTGTAT-GTAA--T-AA-AGG-CA-TTAA------A--CA----TCA-T---T---------------CCGAT-----A--TG-T----AT-----G-T--T-TACAAA-GA-TA--A-----------------GTGCAT------------------------------GGACT-------T---CA--TTG------------AAATATA---------------------CCA-----A-T--------------------GTCATT--T--TTTTTC-ACGGTGGGCtttgcctatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgattctgtcacttgtatgtaataaaggcattaaacatcattccgatatgtatgtttacaaagataagtgcatggacttcattgaaatataccaatgtcattttttttcacggtgggcat
gi|14 : gcatgctgaatacttgatcgattcagagtgcaaacaaaacgaatatcggtttaaaacaagataatctcacgcttaaccaaaatagaaaatagaaatcgcgttgtattcgaaaaaaaatatagtcgctgaataaaggtaaaatttcatgaaattacatgaaaattgaataaagtttaaacgatgttaattttgcctatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntg----ACACCAATTTTTGTGGATTT----CGTT--GA-AGACCTCAACAACGAAGTTAAATGGTCATC-GA-AGTTT-G-GTG-CTTCTG-AT-A-GAAAAC-TT-CCT--CTT-CTTG-CTCTG-TCATTGTCCA-TGA-TCGTGAGCAA---T--CAA--TACATGTATAATGAAACCTTTTAC--GGT-AAA-CATAat
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gi|15 : cagtggtttcatcagtattcgttgaacaccaatttttgtggatttcgttgaagacctcaacaacgaagttaaatggtcatcgaagtttggtgcttctgatagaaaacttcctcttcttgctctgtcattgtccatgatcgtgagcaatcaatacatgtataatgaaaccttttacggtaaacataac-GTG-TTTCTGGAT-ATGAGGAT-TTTCCT--GTTTCTTG-TTCCG-TCATTGTC-A-CGAACCGTGAGCGA---T---AA--TACATG-ATAAT-AAACTTTTTCC--GGT-AA--CTTATGTGAAT------------TCA---------------C---ACGCTTTT-GAC-ATGAGAGTCACGCTTTTC--------C-A-----------AT-GCA-ATCTCCGA-T-CTCCG----CGCGGGTA-------AA---C------G-----A-T----GA-A--AA---GAAT--CG------CTGTT--CATGNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNN-TA-----AT--------ATTTTACTGG---GTTAC-CAT-GTAA-GAAGCCA-TACCA---CCTGT-----------A----CA-A------T-ATACTTT-G-CAATCGGACT-A-A-TT---TT-TT-AC-T-CT----AC----TGAAC-ACAAT--------GGCGA-------GC-CGAGTGGTAGAT----------TTT-ACAC---CTGATCT----------AT--------CC--T--G---CGCAT-CTCAA-AATTAGT--CGA------------AATTCACACatccacgaatttatgtatccacgaaac
gi|16 : CA-TGGATTCCTTG-ATTTTGTTAGAATAATACCAA--CAAT---------TAATGTGCT-AGTT-TT-----AA---TT-----------AAC--------TTT-CA--CTG-A-A
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gi|17 : tacatggattccttgattttgttagaataataccaacaattaatgtgctagttttaattaactttcactgaaccctgcatctctataatcttgtttattaaaggataagctttgggtcaatgtataaaattcagatgccattactattaggaagaaatctctc-GTAA--TTAG-AGT-CA-TTAA------A--CA----TTA-T---T---------------CCAAT-----A--TG-T----ACATGAAG-T--T-TACAAAAGA-TAT--T-TAA--AT-------TGTACGT---AAG-A---------------CAACTAAGGATT-------G---CA--TTG------------AAATATAAA--TGCAAGAGA-CGTT---CCG-----A-TTGA------TGAAC-CAA-TGTTATTTTT--TTTTTC-ACGGCGGGC
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gi|21 : TT--GAATGAC-GCAACCACGAATTCAA-TGTTCAAC-GATCGTTT-G-GTG-TTTCTGCAT-A-GAA-----TTTCT--GTT-CTTG-CTTCG-TCATTGTCCA-CGA-CCGTGAGCGA---T--C-A--TACA-AAGTAATGAA---CTTTCC--GGT-AAA-C-TATGTGt
gi|22 : aaatgaatacacaaaatgcataaacaaaaacatcagtatcaacttTTTCGTTGAACACCATTTTTCGTGGATTCTACCCGTTTGAA-TGACCGCAACC-CGAATTCAAATGTTCA-C-GA-AGTTT-G-GTG-TT-CTG-AT-A-GAG----TTTCCT--GTT-CTTG-CTCCG-TCG--GTCCA-CGA-CCATGAGCGA---T--TAA--TACAAG--TAATGGAACTTTTTCC--GGT-AAA-CTT
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lowQualScore : 8888 1111 99 6 1 2 2 2 2 4 5 2 2 33 2 33 2 5 2 2 2 444 33 00 2 0 33 2 2 222222222222222222222222222222222222 7 3 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 7777 3 7777 3 55 666 55 000000 44 3 1 888 77777 2 66 555 555 2 2 2 6 555 1 8888888888888888 3 222222 3 3 3 3 3 9 555 6 33 3 3 6666 6666 3 22222222 0000000 3 3333333333 3 888 7777777777 11111111 444444444 3 3 44 555555555555 6 555 3 3 3 3 77777 44 222222222 3 1111 77777 555 44444444444 11111111 2 2 2 22222222222222222222222222222 3 7777 44 3 3 3 3 3 99999999999999999999999999999999999999999 2 00000 8888 8888888 666 2 55 444 2 2 3 55555 00 55 55 5555 66666 2 2 66 333 88888888 2 33 2 4 2 6 33 4 2 4444 55 2 5555 2 222222222222222222222 66666 2 55 99999999 33 2 2 33 55 55 3 3 7 666 000 99999 3 3 7777 55 00 3 0 7777 3 44 3 3 6 3 999999999999999 3 555 999999999999999 77777 44 3 6666 6 44 3 3 3 000000000000000000 555 33333333333333333 3 0000000 555 55 777777777777 555 3 555 88888 0 999999 3 6 3 44 6
lowQualScore : .... .... .. . . . . . . . . . . .. . .. . . . . . ... .. .. . . .. . . .................................... . . .......................................................................................... .... . .... . .. ... .. ...... .. . . ... ..... . .. ... ... . . . . ... . ................ . ...... . . . . . . ... . .. . . .... .... . ........ ....... . .......... . ... .......... ........ ......... . . .. ............ . ... . . . . ..... .. ......... . .... ..... ... ........... ........ . . . ............................. . .... .. . . . . . ......................................... . ..... .... ....... ... . .. ... . . . ..... .. .. .. .... ..... . . .. ... ........ . .. . . . . .. . . .... .. . .... . ..................... ..... . .. ........ .. . . .. .. .. . . . ... ... ..... . . .... .. .. . . .... . .. . . . . ............... . ... ............... ..... .. . .... . .. . . . .................. ... ................. . ....... ... .. ............ ... . ... ..... . ...... . . . .. .
lowQualScore : 3333 2222 22 7 0 7 5 5 4 7 0 5 5 11 5 44 5 3 7 5 5 444 44 99 0 9 77 7 9 000000000000000000000000000000000000 3 6 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 7777 6 7777 6 00 444 55 555555 66 3 2 555 11111 9 88 000 000 9 9 9 2 888 8 0000000000000000 3 999999 6 3 3 1 1 2 444 2 55 1 1 5555 5555 3 11111111 8888888 3 5555555555 1 555 7777777777 22222222 555555555 1 1 22 888888888888 7 888 1 1 1 1 77777 22 333333333 1 9999 77777 444 66666666666 22222222 9 9 9 55555555555555555555555555555 1 1111 66 3 3 3 3 3 33333333333333333333333333333333333333333 9 33333 3333 7777777 999 4 66 111 4 4 3 99999 44 66 66 0000 88888 2 2 11 999 11111111 2 11 2 4 2 7 22 7 2 7777 66 4 0000 4 222222222222222222222 22222 5 99 77777777 77 7 7 99 00 00 6 6 3 444 777 11111 6 6 7777 00 00 6 0 1111 1 22 1 1 2 1 999999999999999 1 444 222222222222222 77777 22 1 5555 2 22 1 1 1 666666666666666666 888 88888888888888888 2 8888888 888 00 333333333333 777 3 888 33333 0 666666 3 7 2 66 7
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Reference ( family-454 ) : TTTATTCGGCGATTGTATCATCGATGAATATAACGCGATTTCTACTTTCG----ACACCAATTTTCGTGGATTT----CGTT--GA-TGACCGCAACCACGAATTCAAATGTTCAAC-GA-AGTTT-G-GTG-TTTCTG-AT-A-GAAGAT-TTTCCT--GTT-CTTG-CTCCG-TCATTGTCCA-CGA-CCGTGAGCGA---T--CAA--TACATGTATAATGAAACTTTTTCC--GGT-AAA-CTTATGTGA-T------------NCC---------------C---ACGCTTTT-GGC-ATGAGAGTGACTCGCCGC--------C-A-----------AC-GCG-ATCTCCGA-T-CCCCG----CGCG---A-------AA---C------G----CA-T----GA-A--AA---AAAT--CG------CTGTT--CATAAAA-TTTTACTGGGTTATTTAAT---TTTCTA-----AT-CAA--CGATGTCA---A---ATTAC-CAT-GTAA-GAAGCCA-TACCA---CCTGT-----------A----CA-A------T-ATACTTT-G-CAATCGGACT-A-A-TT---TT-C--AC-T-CT----CC----TGAAC-ACAAT--------GGGGC-------GC-CGAGTGGTAGAT----------TTT-ACAC---CTGATCT----------AC--------CC--C--G---CGCAT-CTCAA-AATTAGT--CGA------------AATTCACACCTTTGAAA-CC---ACGCTCCCAATTCA-CGGAT-CCTTG-ATTTTGTTA-AACA-----AA--CAAC---------TAATGTGTT-G----TT-----AA---TT-----------ACC--------CCG-CATGCTG-A-AT-------------A---------------GTGCT-GAC----AA--AACGAA-TT-ATT-CC-CCTTGCGGTTT-AAA-------------------------A-C-------------GC-TT-----GACC----AAT-------AT---CG-AAAG--TAGAA---ATCGCG-T-TNT-----ATTCGTCG--AAGA--TACA----ATCGC--C--GAAT-A-AA--GGT---AAA--------ATT-TCATGAA--A-TTACA-TG-AA-AA--TTTGA-T-AA----GTTT--A-AAC----TTAAT-AAA-----------TA-T------TAT-----TGT-AA--TAAA--------CA--AT-G-AG--TA--AGAGTTTT--ATTATTGCCTTAAATATTA-CA-TGTACATG-AAA---TCATCGA-T-CTC-----ACGT-TT-AA----CTC--AGCAAAATAT--C-TTA-TTCT----GTCACATGTAT-GTAA--T-AG-AGT-CA-TTAA------A--CA----TTA-T---T---------------CCAAT-----A--TG-T----ACATGAAG-T--T-TACAAA-GA-TATCAT-TAA--AT-------TGTACGT---AAG-A---------------CAACTAAGGATT-------G---CA--TTG------------AAATATAAA--TGCAAGAGA-CGTT---CCG-----A-TTGA------TGAAC-CAA-TGTGATTTTT--TTTTTC-ACGGTGGGC
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gi|11 : gatgatcgcaactacaattcaaatgttcaacgaagtttgatgtttatgatagaagattttcctgttcttgcttcgtcattgtccacgaccgtgaacgatcaatacatgtgtaatgaaactttttctgataaacttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgaaaaaaaaaatcgctgttcataaacttttactggtttatttaatattctaatcaacgatgtcaaattaccatgtaagaagccataccacctgtacaatatactttataatcggactaatttttcactctcctgaacacaatggggcgccgagtggtagattttacacctgatctaccccaaggcatctcaaaattagtcaaaatttacacctttgaaaccccgctcccaaattttgttaaacaaacatctaaggtgtggttaattaccccgcatTCTT-----AT-CAA--TGATGACC---A---ATTAC-TGT-GTAA-GAAGCCA-TGTC----CTTGTCATTTTTTAATAGTCCCA-AGCACTGT-GTACATT-G-CAATCAGATT-A-A-TT---TT-CC-AC-T-CT----TC----TGAA----AA----------------------C-CAGGTGGTAGAT----------TTTCACAC---CTGATCTGATTGGAAGTACTGGCNNNNNN--N--N---NNNNN-NNNNN-NNNNNNN--NNN------------NNTTCACACCTTTGAAAACC---ATGATCTTGTTTTA-TGGAT-TCTTG-ATTTTGTTA-AATA-----AA--CAACAATTACCAGTAATGTGTA-G----TT-----AA---TTAACTTCACTAAACC--------CTG-CATGCTT-T-AT-------------ACTT------------GTGCT-
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gi|13 : A-TTCT----GTCACTTGTAT-GTAA--T-AA-AGG-CA-TTAA------A--CA----TCA-T---T---------------CCGAT-----A--TG-T----AT-----G-T--T-TACAAA-GA-TA--A-----------------GTGCAT------------------------------GGACT-------T---CA--TTG------------AAATATA---------------------CCA-----A-T--------------------GTCATT--T--TTTTTC-ACGGTGGGCtttgcctatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgattctgtcacttgtatgtaataaaggcattaaacatcattccgatatgtatgtttacaaagataagtgcatggacttcattgaaatataccaatgtcattttttttcacggtgggcat
gi|14 : gcatgctgaatacttgatcgattcagagtgcaaacaaaacgaatatcggtttaaaacaagataatctcacgcttaaccaaaatagaaaatagaaatcgcgttgtattcgaaaaaaaatatagtcgctgaataaaggtaaaatttcatgaaattacatgaaaattgaataaagtttaaacgatgttaattttgcctatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntg----ACACCAATTTTTGTGGATTT----CGTT--GA-AGACCTCAACAACGAAGTTAAATGGTCATC-GA-AGTTT-G-GTG-CTTCTG-AT-A-GAAAAC-TT-CCT--CTT-CTTG-CTCTG-TCATTGTCCA-TGA-TCGTGAGCAA---T--CAA--TACATGTATAATGAAACCTTTTAC--GGT-AAA-CATAat
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gi|15 : cagtggtttcatcagtattcgttgaacaccaatttttgtggatttcgttgaagacctcaacaacgaagttaaatggtcatcgaagtttggtgcttctgatagaaaacttcctcttcttgctctgtcattgtccatgatcgtgagcaatcaatacatgtataatgaaaccttttacggtaaacataac-GTG-TTTCTGGAT-ATGAGGAT-TTTCCT--GTTTCTTG-TTCCG-TCATTGTC-A-CGAACCGTGAGCGA---T---AA--TACATG-ATAAT-AAACTTTTTCC--GGT-AA--CTTATGTGAAT------------TCA---------------C---ACGCTTTT-GAC-ATGAGAGTCACGCTTTTC--------C-A-----------AT-GCA-ATCTCCGA-T-CTCCG----CGCGGGTA-------AA---C------G-----A-T----GA-A--AA---GAAT--CG------CTGTT--CATGNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNN-TA-----AT--------ATTTTACTGG---GTTAC-CAT-GTAA-GAAGCCA-TACCA---CCTGT-----------A----CA-A------T-ATACTTT-G-CAATCGGACT-A-A-TT---TT-TT-AC-T-CT----AC----TGAAC-ACAAT--------GGCGA-------GC-CGAGTGGTAGAT----------TTT-ACAC---CTGATCT----------AT--------CC--T--G---CGCAT-CTCAA-AATTAGT--CGA------------AATTCACACatccacgaatttatgtatccacgaaac
gi|16 : CA-TGGATTCCTTG-ATTTTGTTAGAATAATACCAA--CAAT---------TAATGTGCT-AGTT-TT-----AA---TT-----------AAC--------TTT-CA--CTG-A-A
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gi|17 : tacatggattccttgattttgttagaataataccaacaattaatgtgctagttttaattaactttcactgaaccctgcatctctataatcttgtttattaaaggataagctttgggtcaatgtataaaattcagatgccattactattaggaagaaatctctc-GTAA--TTAG-AGT-CA-TTAA------A--CA----TTA-T---T---------------CCAAT-----A--TG-T----ACATGAAG-T--T-TACAAAAGA-TAT--T-TAA--AT-------TGTACGT---AAG-A---------------CAACTAAGGATT-------G---CA--TTG------------AAATATAAA--TGCAAGAGA-CGTT---CCG-----A-TTGA------TGAAC-CAA-TGTTATTTTT--TTTTTC-ACGGCGGGC
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lowQualScore : 8888 1111 99 6 1 2 2 2 2 4 5 2 2 33 2 33 2 5 2 2 2 444 33 00 2 0 33 2 2 222222222222222222222222222222222222 7 3 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 7777 3 7777 3 55 666 55 000000 44 3 1 888 77777 2 66 555 555 2 2 2 6 555 1 8888888888888888 3 222222 3 3 3 3 3 9 555 6 33 3 3 6666 6666 3 22222222 0000000 3 3333333333 3 888 7777777777 11111111 444444444 3 3 44 555555555555 6 555 3 3 3 3 77777 44 222222222 3 1111 77777 555 44444444444 11111111 2 2 2 22222222222222222222222222222 3 7777 44 3 3 3 3 3 99999999999999999999999999999999999999999 2 00000 8888 8888888 666 2 55 444 2 2 3 55555 00 55 55 5555 66666 2 2 66 333 88888888 2 33 2 4 2 6 33 4 2 4444 55 2 5555 2 222222222222222222222 66666 2 55 99999999 33 2 2 33 55 55 3 3 7 666 000 99999 3 3 7777 55 00 3 0 7777 3 44 3 3 6 3 999999999999999 3 555 999999999999999 77777 44 3 6666 6 44 3 3 3 000000000000000000 555 33333333333333333 3 0000000 555 55 777777777777 555 3 555 88888 0 999999 3 6 3 44 6
lowQualScore : .... .... .. . . . . . . . . . . .. . .. . . . . . ... .. .. . . .. . . .................................... . . .......................................................................................... .... . .... . .. ... .. ...... .. . . ... ..... . .. ... ... . . . . ... . ................ . ...... . . . . . . ... . .. . . .... .... . ........ ....... . .......... . ... .......... ........ ......... . . .. ............ . ... . . . . ..... .. ......... . .... ..... ... ........... ........ . . . ............................. . .... .. . . . . . ......................................... . ..... .... ....... ... . .. ... . . . ..... .. .. .. .... ..... . . .. ... ........ . .. . . . . .. . . .... .. . .... . ..................... ..... . .. ........ .. . . .. .. .. . . . ... ... ..... . . .... .. .. . . .... . .. . . . . ............... . ... ............... ..... .. . .... . .. . . . .................. ... ................. . ....... ... .. ............ ... . ... ..... . ...... . . . .. .
lowQualScore : 3333 2222 22 7 0 7 5 5 4 7 0 5 5 11 5 44 5 3 7 5 5 444 44 99 0 9 77 7 9 000000000000000000000000000000000000 3 6 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 7777 6 7777 6 00 444 55 555555 66 3 2 555 11111 9 88 000 000 9 9 9 2 888 8 0000000000000000 3 999999 6 3 3 1 1 2 444 2 55 1 1 5555 5555 3 11111111 8888888 3 5555555555 1 555 7777777777 22222222 555555555 1 1 22 888888888888 7 888 1 1 1 1 77777 22 333333333 1 9999 77777 444 66666666666 22222222 9 9 9 55555555555555555555555555555 1 1111 66 3 3 3 3 3 33333333333333333333333333333333333333333 9 33333 3333 7777777 999 4 66 111 4 4 3 99999 44 66 66 0000 88888 2 2 11 999 11111111 2 11 2 4 2 7 22 7 2 7777 66 4 0000 4 222222222222222222222 22222 5 99 77777777 77 7 7 99 00 00 6 6 3 444 777 11111 6 6 7777 00 00 6 0 1111 1 22 1 1 2 1 999999999999999 1 444 222222222222222 77777 22 1 5555 2 22 1 1 1 666666666666666666 888 88888888888888888 2 8888888 888 00 333333333333 777 3 888 33333 0 666666 3 7 2 66 7
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Reference ( family-454 ) : TTTATTCGGCGATTGTATCATCGATGAATATAACGCGATTTCTACTTTCG----ACACCAATTTTCGTGGATTT----CGTT--GA-TGACCGCAACCACGAATTCAAATGTTCAAC-GA-AGTTT-G-GTG-TTTCTG-AT-A-GAAGAT-TTTCCT--GTT-CTTG-CTCCG-TCATTGTCCA-CGA-CCGTGAGCGA---T--CAA--TACATGTATAATGAAACTTTTTCC--GGT-AAA-CTTATGTGA-T------------NCC---------------C---ACGCTTTT-GGC-ATGAGAGTGACTCGCCGC--------C-A-----------AC-GCG-ATCTCCGA-T-CCCCG----CGCG---A-------AA---C------G----CA-T----GA-A--AA---AAAT--CG------CTGTT--CATAAAA-TTTTACTGGGTTATTTAAT---TTTCTA-----AT-CAA--CGATGTCA---A---ATTAC-CAT-GTAA-GAAGCCA-TACCA---CCTGT-----------A----CA-A------T-ATACTTT-G-CAATCGGACT-A-A-TT---TT-C--AC-T-CT----CC----TGAAC-ACAAT--------GGGGC-------GC-CGAGTGGTAGAT----------TTT-ACAC---CTGATCT----------AC--------CC--C--G---CGCAT-CTCAA-AATTAGT--CGA------------AATTCACACCTTTGAAA-CC---ACGCTCCCAATTCA-CGGAT-CCTTG-ATTTTGTTA-AACA-----AA--CAAC---------TAATGTGTT-G----TT-----AA---TT-----------ACC--------CCG-CATGCTG-A-AT-------------A---------------GTGCT-GAC----AA--AACGAA-TT-ATT-CC-CCTTGCGGTTT-AAA-------------------------A-C-------------GC-TT-----GACC----AAT-------AT---CG-AAAG--TAGAA---ATCGCG-T-TNT-----ATTCGTCG--AAGA--TACA----ATCGC--C--GAAT-A-AA--GGT---AAA--------ATT-TCATGAA--A-TTACA-TG-AA-AA--TTTGA-T-AA----GTTT--A-AAC----TTAAT-AAA-----------TA-T------TAT-----TGT-AA--TAAA--------CA--AT-G-AG--TA--AGAGTTTT--ATTATTGCCTTAAATATTA-CA-TGTACATG-AAA---TCATCGA-T-CTC-----ACGT-TT-AA----CTC--AGCAAAATAT--C-TTA-TTCT----GTCACATGTAT-GTAA--T-AG-AGT-CA-TTAA------A--CA----TTA-T---T---------------CCAAT-----A--TG-T----ACATGAAG-T--T-TACAAA-GA-TATCAT-TAA--AT-------TGTACGT---AAG-A---------------CAACTAAGGATT-------G---CA--TTG------------AAATATAAA--TGCAAGAGA-CGTT---CCG-----A-TTGA------TGAAC-CAA-TGTGATTTTT--TTTTTC-ACGGTGGGC
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gi|11 : gatgatcgcaactacaattcaaatgttcaacgaagtttgatgtttatgatagaagattttcctgttcttgcttcgtcattgtccacgaccgtgaacgatcaatacatgtgtaatgaaactttttctgataaacttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgaaaaaaaaaatcgctgttcataaacttttactggtttatttaatattctaatcaacgatgtcaaattaccatgtaagaagccataccacctgtacaatatactttataatcggactaatttttcactctcctgaacacaatggggcgccgagtggtagattttacacctgatctaccccaaggcatctcaaaattagtcaaaatttacacctttgaaaccccgctcccaaattttgttaaacaaacatctaaggtgtggttaattaccccgcatTCTT-----AT-CAA--TGATGACC---A---ATTAC-TGT-GTAA-GAAGCCA-TGTC----CTTGTCATTTTTTAATAGTCCCA-AGCACTGT-GTACATT-G-CAATCAGATT-A-A-TT---TT-CC-AC-T-CT----TC----TGAA----AA----------------------C-CAGGTGGTAGAT----------TTTCACAC---CTGATCTGATTGGAAGTACTGGCNNNNNN--N--N---NNNNN-NNNNN-NNNNNNN--NNN------------NNTTCACACCTTTGAAAACC---ATGATCTTGTTTTA-TGGAT-TCTTG-ATTTTGTTA-AATA-----AA--CAACAATTACCAGTAATGTGTA-G----TT-----AA---TTAACTTCACTAAACC--------CTG-CATGCTT-T-AT-------------ACTT------------GTGCT-
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gi|13 : A-TTCT----GTCACTTGTAT-GTAA--T-AA-AGG-CA-TTAA------A--CA----TCA-T---T---------------CCGAT-----A--TG-T----AT-----G-T--T-TACAAA-GA-TA--A-----------------GTGCAT------------------------------GGACT-------T---CA--TTG------------AAATATA---------------------CCA-----A-T--------------------GTCATT--T--TTTTTC-ACGGTGGGCtttgcctatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgattctgtcacttgtatgtaataaaggcattaaacatcattccgatatgtatgtttacaaagataagtgcatggacttcattgaaatataccaatgtcattttttttcacggtgggcat
gi|14 : gcatgctgaatacttgatcgattcagagtgcaaacaaaacgaatatcggtttaaaacaagataatctcacgcttaaccaaaatagaaaatagaaatcgcgttgtattcgaaaaaaaatatagtcgctgaataaaggtaaaatttcatgaaattacatgaaaattgaataaagtttaaacgatgttaattttgcctatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntg----ACACCAATTTTTGTGGATTT----CGTT--GA-AGACCTCAACAACGAAGTTAAATGGTCATC-GA-AGTTT-G-GTG-CTTCTG-AT-A-GAAAAC-TT-CCT--CTT-CTTG-CTCTG-TCATTGTCCA-TGA-TCGTGAGCAA---T--CAA--TACATGTATAATGAAACCTTTTAC--GGT-AAA-CATAat
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gi|15 : cagtggtttcatcagtattcgttgaacaccaatttttgtggatttcgttgaagacctcaacaacgaagttaaatggtcatcgaagtttggtgcttctgatagaaaacttcctcttcttgctctgtcattgtccatgatcgtgagcaatcaatacatgtataatgaaaccttttacggtaaacataac-GTG-TTTCTGGAT-ATGAGGAT-TTTCCT--GTTTCTTG-TTCCG-TCATTGTC-A-CGAACCGTGAGCGA---T---AA--TACATG-ATAAT-AAACTTTTTCC--GGT-AA--CTTATGTGAAT------------TCA---------------C---ACGCTTTT-GAC-ATGAGAGTCACGCTTTTC--------C-A-----------AT-GCA-ATCTCCGA-T-CTCCG----CGCGGGTA-------AA---C------G-----A-T----GA-A--AA---GAAT--CG------CTGTT--CATGNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNN-TA-----AT--------ATTTTACTGG---GTTAC-CAT-GTAA-GAAGCCA-TACCA---CCTGT-----------A----CA-A------T-ATACTTT-G-CAATCGGACT-A-A-TT---TT-TT-AC-T-CT----AC----TGAAC-ACAAT--------GGCGA-------GC-CGAGTGGTAGAT----------TTT-ACAC---CTGATCT----------AT--------CC--T--G---CGCAT-CTCAA-AATTAGT--CGA------------AATTCACACatccacgaatttatgtatccacgaaac
gi|16 : CA-TGGATTCCTTG-ATTTTGTTAGAATAATACCAA--CAAT---------TAATGTGCT-AGTT-TT-----AA---TT-----------AAC--------TTT-CA--CTG-A-A
gi|16 : ta-------------------------A-C-------------AC-TT-----GGTC----AAA-------AG---CG-AAAAATTAGAA---ACCGTGGT-TGT-----CTTCGAAA--AAAA--TATACGATGTCAC--TT-GAAT-A-AA--GGT---AAA---------TT-TCATGAA--A-T-ACACTGTAATAA--TTTAAGT-AA----GTTT--A-AAC----GTAAT-AAA-----------TG-T------TAT-----TGT-AA--TACA--------TA--AT-A-Accctgcatctctataatcttgtttattaaaggataagctttgggtcaatgtataaaattcagatgccattactattaggaagaaatctctcacacttggtcaaaagcgaaaaattagaaaccgtggttgtcttcgaaaaaaatatacgatgtcacttgaataaaggtaaatttcatgaaatacactgtaataatttaagtaagtttaaacgtaataaatgttattgtaatacataataa
gi|17 : tacatggattccttgattttgttagaataataccaacaattaatgtgctagttttaattaactttcactgaaccctgcatctctataatcttgtttattaaaggataagctttgggtcaatgtataaaattcagatgccattactattaggaagaaatctctc-GTAA--TTAG-AGT-CA-TTAA------A--CA----TTA-T---T---------------CCAAT-----A--TG-T----ACATGAAG-T--T-TACAAAAGA-TAT--T-TAA--AT-------TGTACGT---AAG-A---------------CAACTAAGGATT-------G---CA--TTG------------AAATATAAA--TGCAAGAGA-CGTT---CCG-----A-TTGA------TGAAC-CAA-TGTTATTTTT--TTTTTC-ACGGCGGGC
gi|18 : TTCAAATGTTCAACCGA-AGTTTCG-GTG-TTTCTG-AT-A-GAAG-T-TTTCCT--GTT-CTT--CTTCGTTCATTGGCCA-CGA-CC--GGGCGA---T--CAAC-TACAAGTAT-ATGAAACTTTTTTCCGGGT-AAA--TTATGTGA-TTTACTCCCAGTATCC---------------C---ACGCTTTT-GGC-ATGA----GACTCGCCGCGT------CAA-----------AC-GC--ATCTCC-A-TGCCCCGGCGACGCG---G-------AAACCC------G----CA-T----AG-A--AA---AActcatccagaatttacgtatccacaaacagtgattttagctgatccacgaaaatttgatgccgcacgcccacgaatattgatgaaaccacagt
gi|19 : TGTT--AC-GA--GTTT-G-GTG-TTT-TG-ATCA-GAAG-T-TTTTCT--GTT--TTG-CTTCG-TC-TTGTCC---GA-C-GTGAGCGGCAGT--CAAATTACA-GTA-AATGAACTTTTTTCC--GGTTAAA-CTTATGTGA-T------------ATCTTTCCAGTATGCCCAC---ACGCTTTTAAGCTATGAG---GACTCG-CGCTTTTTTTTC-A-----------AC-GCGAATCTCCGc
gi|2 : AATGTATAAC-GA-AGTTT-GCGTGGTTTCTG-AT-A-GAA-ATATTTCGCAAGTA-CTTGGCTCCG-TCATTGTCCAACGA-CCGTGAGCGA---T--CAAA-TACATGTATAATGAAACTTTTTCC--GGT-AAA-CTTANNNNN-N------------NNN---------------N---NNNNNNNN-NNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN--------N-N-----------NN-NNN-NNNNNNNN-N-NNNNN----NNNN---N-------NN---N------N----NN-NNNNNGA-A--AA---AAAT--CG------CTGTT--CATAAAAATTTTACTGGATTATTTAAT---TTTCTA-----AT-CAAA-CGATGTCA---A---ATTAC-CAT-GTAA-GAAGCCAATACCG---C-TGT-----------A----CG-A------TTATACTTTTG-CAATCGGACTTA-A-TT---TT-TCAAC-T-CT----CC----TGAAC-ACAAT--------GGG-C-------GC-CGAGTGGTAGAT----------ATT-ACACA--CTGATCT----------AC--------CC-----G----GCAT-CTCAAGAATTAGT--CGA------------AATTCACACCTT-GAAA-TC---ACGATCCCA-TTCA--GGAT-CCTTG-ATTTTGTTA-AACG-----AAACCAAC---------TAATGTGTTTG----TT-----AA---TT-----------ACC----------G-CATGCTG-A-AT-------------A---------------GTGCT-GAC-----A--AACGAA-TTGATT-CC-CCTTGCGGTTT-AAA-------------------------C-A-------------GC-TT-----GACC----AAT-------AT---CG-AAAG--TAGAA---ATCGCG-C-TTT-----ATTCGTCGA-AAGA--TACA----ATCAC--C--GAAT-AGAA--GGT---AAA--------A-T-TCATGAA--A-TTACA-TG--A-AA--TTTGA-T-AA----GTTTTAA-AAC----TTAAT-AAA-----------TA--------TAT-----TGT-AA--TAAA--------CA--AT-G-AG--TA--AAAGTTTTGGATTATTGCCTTAAATATTACCA-TGTACATGAAAA---TCATCGA-TGCCC-----ACGT-TT-AA----CTCTAGGCAAAATATTCT-TTATTTCT----GTCACATGTAT-GCGAATT-AGAAGT-CAGTTAA------A--CA----TTA-T---T---------------CCAAT-----A--TGTT----ACATGAAGTT--T-TACAAA-TA-TATCAT-TAA--AT-------TGTACGT---AAGCA---------------CAACT-AGGATT-------G---CA--TTGCA----------AGATAGAAA--GTCAAGAGA-CGTT---TCG-----ATTTGA-------GAACTCAA-TGTGATTTTT--TTTTTCAACGGTGGGC
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gi|21 : TT--GAATGAC-GCAACCACGAATTCAA-TGTTCAAC-GATCGTTT-G-GTG-TTTCTGCAT-A-GAA-----TTTCT--GTT-CTTG-CTTCG-TCATTGTCCA-CGA-CCGTGAGCGA---T--C-A--TACA-AAGTAATGAA---CTTTCC--GGT-AAA-C-TATGTGt
gi|22 : aaatgaatacacaaaatgcataaacaaaaacatcagtatcaacttTTTCGTTGAACACCATTTTTCGTGGATTCTACCCGTTTGAA-TGACCGCAACC-CGAATTCAAATGTTCA-C-GA-AGTTT-G-GTG-TT-CTG-AT-A-GAG----TTTCCT--GTT-CTTG-CTCCG-TCG--GTCCA-CGA-CCATGAGCGA---T--TAA--TACAAG--TAATGGAACTTTTTCC--GGT-AAA-CTT
gi|23 : atcattaAATAAAAA--TGCAAGAGA-CGTT---CCG-----A-TTGA------TGAAC-CAA-TGTGG--GTT--TTTTTC-GCGGTGGGC
gi|24 : A-AGTTT-G-GTG-TTTCTG-AT-A-GAAGAT-TTTCCT--CTT-CTTG-CTCCG-TCATTGTCCA-CGA-CAGTGAGCGA---T--CAA--TACATGTATAATGAAACGTTTCCC--GGT-AAA-CTTATGTGA-T------------ACC---------------C---ACGCTTTT-GGC-ATGAGActcatccacgaatttacgtatccacgaaacagtgatttttgcctgatccatgaagattgatgcccatcaatattgatgaaaccacagt
gi|25 : -----GACC----AAA-------AT---CG-AAAG--TAGAA---ATCGCG-T-TTT-----ATT--------------ACA----GTCGC--T--GAAT-A-AA--GGT---AAATTAGCAACATT-GAAAGAA--A-TTACA-TG-AA-AA--TTTTA-T-TT----GTTT--A-AAC----TTAAT-AAA-----------TA-T------TAT-----TGT-AA--TAActcacgct
gi|26 : TTATTTGATATATTCTTACATGTAT-CAA--CGATGACA---A---ATTAT-TGT-GCAA-GAAGCCA-T
gi|27 : tt-------------GC-AT-----GACC----AAA-------AT---CG-AAAG--TAGAA---ATCGCA-A-TGT-----ATTTGAAA--AATA--TACA----GTCAC--T--GAAT-A-AA--GGT---AAA--------ATT-TCAAGAA--A-TTACA-TG-AA-AA--TCTGA-T-AA----ATTgtgttttgggtttttttcagtcccaagcactgcatatgttgtaaatctgact
gi|28 : TTCAAC-GA-AGTTT-G-GTG-TTTCTG-AT-A-GAGGAT-TTTCCT--GTT-CTTG-TTCCG-CCATTGTCCA-CGA-CTGTG--------------------TGTATAATGGAACTTTTCCC--GGT-AAc
gi|3 : AATGTTTAAC-GA-AGTTT-G-GTGGTTTCTG-AT-A-GAATAT-TTTCCA--GTA-CTTGGCTCCG-TCATTGTCCA-CGA-CCGTGAGCGA---T--CAAA-TACATGTATAATGAAACTTTTTCC--GGT-AAAACTTNNNNNN-N------------NNN---------------N---NNNNNNNN-NNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN--------N-N-----------NN-NNN-NNNNNNNN-N-NNNNN----NNNN---N-------NN---NNNNNNNG----CA-T----GA-AGAAA---AAAT--CG------CTGTT--CATAAAA-TTTTACTGGATTATTTAAT---TTTCTA-----AT-CAA--CGATGTCA---A---ATTAC-CAT-GTAA-GAAGCCAATACCG---C-TGT-----------A----CG-A------T-ATACTTT-G-CAATCGGACT-A-A-TT---TTTC--AC-T-CT----CC----TGAAC-ACAAT--------GGGGC-------GC-CGAGTGGTAGAT----------ATT-ACCA---CTGATCT----------AC--------CC-----G---CGCAT-CTCAA-AATTAGT--CGA------------AATTCACACCTTTGAAAATC---ACGATCC-AATTCA-CGGAT-CCTTG-ATTTTGTTA-AACA-----AA--CAAC---------TAATGTGTT-G----TT-----A----TT-----------ACC--------CCG-CATGCTG-A-AT-------------A---------------GTGCT-GAC----AA--AA-GAA-TT-ATT-CC-CCTTGCGGTTTAAAA-------------------------A-C-------------GC-TT-----GACC----AAT-------AT---CG--AAG--TAGAA---ATCGCG-T-TTT-----ATTCGTCG--AAGA--TACA----ATCAC--C--GAAT---AA--GGT---AAA--------ATT-TCATGAA--A-TTACA-TG-AA-AA--TTTGA-T-AA----GTTTA-A-AAC----TTAAT-AAA-----------TA-T------TAT-----TGT-AA--ATAA--------CA--AT-G-AG--TA--AAAGTTTG--ATTATTGCCTTAAATATTA-CA-TGTACATG-AAA---TCATCGA-G-CCC-----ACGT-TT-AA----CTC--AGCAAAATAT--C-TTATTTCT----GTCACATGTAT-GCAA--T-AG-AGT-CA-TTAA------A--CA----TTA-T---T---------------CCAAT-----A--TG-T----ACATGAAGTT--T-TACAAA-TA-TATCAT-T-A--AT-------TGTACGT---AAGCA---------------CAACT-AGGATT-------G---CA--TTG------------AAATAGAAA---GCAAGAGA-CGTT---TCG-----ATTTGA------TGAAC-CAATTGTGATTTTT--TTTTTC-ACGGTGGtc
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gi|7 : atgttcaacgaaggttggtgtttctgatagaagattttcctgttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaATGTTCAAC-GA-AGTTT-G-GTG-TTTCTG-AT-A-GAAGAT-TTTCCT--GTT-CTTG-CTCCG-TCATTGTCCA-CGA-CTGTGAGTGA---T--CAA--TACATGTATAATGAAACTTTTTCC--GGT-AAN-NNNNNNNNN-N------------NNN---------------N---NNNNNNNN-NNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN--------N-N-----------NN-NNN-NNNNNNNN-N-NNNNN----NNNN---A-------AA---C------G----CA-T----GA-A--AA---AAAT--CG------CTGTT--CATAAAA-TTTTACTGGGTATTTTAAT---TTTGTA-----AT-CAA--CGATGTCA---A---ATTAC-CAT-GTAA-GAAGCCA-TACCA---CCTGT-----------A----CA-A------T-ATACTTT-G-CAATCAGACT-A-ATTT---TT-C--AC-T-CT----CC----TGAAC-ACAAT--------GGGGC-------GG-CGAGTGGTAGAT----------TTT-ACAC---CTGATCT----------AC--------CC--C--A---CGCAT-CTCAA-AATTAGT--CGA------------AATTCACACCTTTGAAA-CC---ATGCTCCC-ATTCA-CGGAT-CCCTG-A-TTTGTTA-AACA-----AA--CAAC---------TAATGTGTT-G----TT-----AA---TT-----------ACC--------CCG-CATGCTG-A-AT-------------A---------------GTGCT-GAC----AA--AACAAA-TT-ATT-CC-CCTTGC-GTTT-AAA-------------------------A-C-------------GC-TT-----GACC----AAT-------ATA--TG-AAAG--TAGAA---ATCGCG-T-TAT-----ATTCATCG--ATGA--TACA----ATCGC--C--GAAT-A-AA--GGT---AAA--------ATT-TCATGAA--A-TTACA-TG-AA-AA--TTTGA-T-AA----GTTT--A-AAC----TTAAT-AAA------------A-T------TAT-----TGT-AA--TAAA--------CA--AT-G-AG--TA--AGAG-TTT--ATTAATGCCTTAAATATTA-CA-TGTACATG-AAA---TCATCGA-T-CTC-----ACGT-TT-AA----TTC--AGCAAAATAT--C-TTA-TTCT----GTCACATGTAT-TTAA--T-AG-AGT-CA-TTAA------A--AC----TTA-T---T---------------CCAAT-----A--TG-T----ACATGAAG-T--T-TACAAA-GA-TAT----------------------CGT---AAG-A---------------CAA-TAAGGATT-------G---CA--TTG------------AAATATAAA--TGCAAGAGA-CGTT---CCG-----A-TTGA------TGAAC-CAA-TGTGA-TTTT--TTTTTC-ACGGTGGGCctc
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blockSeqs : . . A . . . . . . . . GA . . . . . . . . . A T . . . ATTCAC . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . A A . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . TG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . AC . . . . . . . . . . T . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TGT . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . ACA . . . . . . . . . . . . CATTAAAT . CA A . . . . T . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . G . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . A . . . NNNNN . . GAGTCACGCTTTTCCAATGCAATCTCCGATCTCCGCGCGGGTAAAC . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . C A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . AC . . . . . . . . . . G . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TGT . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . ACA . . . . . . . . . . . . CATTAAAT . A A . . . . T . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . . . . . . . GA . . . . . . . . . . T . . . TACCC . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . C A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . CA . . . . . . . . . . T . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TAT . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . ACA . . . . . . . . . . . . CATTAAT . A A . . . . T . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . T . . . NNNNN . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAC . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . C A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . AC . . . . . . . . . . G . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TAT . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . ACA . . . . . . . . . . . . CATTAAT . A A . . . . T . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . . . . . . . GA . . . . . . . . . . T . . . NNNNN . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAC . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . C A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . AC . . . . . . . . . . T . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TGT . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . AAC . . . . . . . . . . . . TTAAAT . A . . . . . T . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . . . . . . . GA . . . . . . . . . . T . . . NNNNN . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . C A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . AC . . . . . . . . . . T . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TAT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ACA . . . . . . . . . . . . A . A . . . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . GA . . . . . . . . . . C . . . NNNNN . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . AC . . . . . . . . . . A . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TAT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AAC . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . G . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . T . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TAT . . . . . . . . . . . . . . . . ACA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . G . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . AC . . . . . . . . . . T . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons : **** *** *** ** *** *** ****** *** **** ******** ******* ********** *** ********** CG******* ** ************ *** ***** ******** **** ***** **** ******* *** ** *** ***** C**** ** ** **** ***** ** ******** ** ** T** ***** **** **** ACA************ ***** **** CATTAAAT********** *** *** ** ************ T** *** ***** ****** **
originalCons : TTTATTCGGCGATTGTATCATCGATGAATATAACGCGATTTCTACTTTCG----ACACCAATTTTCGTGGATTT----CGTT--GA-TGACCGCAACCACGAATTCAAATGTTCAAC-GA-AGTTT-G-GTG-TTTCTG-AT-A-GAAGAT-TTTCCT--GTT-CTTG-CTCCG-TCATTGTCCA-CGA-CCGTGAGCGA---T--CAA--TACATGTATAATGAAACTTTTTCC--GGT-AAA-CTTATGTGA-T------------NCC---------------C---ACGCTTTT-GGC-ATGAGAGTGACTCGCCGC--------C-A-----------AC-GCG-ATCTCCGA-T-CCCCG----CGCG---A-------AA---C------G----CA-T----GA-A--AA---AAAT--CG------CTGTT--CATAAAA-TTTTACTGGGTTATTTAAT---TTTCTA-----AT-CAA--CGATGTCA---A---ATTAC-CAT-GTAA-GAAGCCA-TACCA---CCTGT-----------A----CA-A------T-ATACTTT-G-CAATCGGACT-A-A-TT---TT-C--AC-T-CT----CC----TGAAC-ACAAT--------GGGGC-------GC-CGAGTGGTAGAT----------TTT-ACAC---CTGATCT----------AC--------CC--C--G---CGCAT-CTCAA-AATTAGT--CGA------------AATTCACACCTTTGAAA-CC---ACGCTCCCAATTCA-CGGAT-CCTTG-ATTTTGTTA-AACA-----AA--CAAC---------TAATGTGTT-G----TT-----AA---TT-----------ACC--------CCG-CATGCTG-A-AT-------------A---------------GTGCT-GAC----AA--AACGAA-TT-ATT-CC-CCTTGCGGTTT-AAA-------------------------A-C-------------GC-TT-----GACC----AAT-------AT---CG-AAAG--TAGAA---ATCGCG-T-TNT-----ATTCGTCG--AAGA--TACA----ATCGC--C--GAAT-A-AA--GGT---AAA--------ATT-TCATGAA--A-TTACA-TG-AA-AA--TTTGA-T-AA----GTTT--A-AAC----TTAAT-AAA-----------TA-T------TAT-----TGT-AA--TAAA--------CA--AT-G-AG--TA--AGAGTTTT--ATTATTGCCTTAAATATTA-CA-TGTACATG-AAA---TCATCGA-T-CTC-----ACGT-TT-AA----CTC--AGCAAAATAT--C-TTA-TTCT----GTCACATGTAT-GTAA--T-AG-AGT-CA-TTAA------A--CA----TTA-T---T---------------CCAAT-----A--TG-T----ACATGAAG-T--T-TACAAA-GA-TATCAT-TAA--AT-------TGTACGT---AAG-A---------------CAACTAAGGATT-------G---CA--TTG------------AAATATAAA--TGCAAGAGA-CGTT---CCG-----A-TTGA------TGAAC-CAA-TGTGATTTTT--TTTTTC-ACGGTGGGC
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|29 ): GCCACGAATTTTACGTATCCACGAAACATGTTGGAATTTTTTCTGATCCACGAAAATTGAATGCCCAAGATATTGATGAAACAC
Unaligned ( gi|33 ): ATTAGAATCGATGTCACAGTACTTATTACTCACAGACTACAAAAACTATACCAAACCTGCAGACACTATA
Unaligned ( gi|36 ): GATCCACGAAAATTGATGCCCACGAATATGATGAAACCACAGT
Alignments
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Reference ( family-454 ) : TTTATTCGGCGATTGTATCATCGATGAATATAACGCGATTTCTACTTTCG----ACACCAATTTTCGTGGATTT----CGTT--GA-TGACCGCAACCACGAATTCAAATGTTCAAC-GA-AGTTT-G-GTG-TTTCTG-AT-A-GAAGAT-TTTCCT--GTT-CTTG-CTCCG-TCATTGTCCA-CGA-CCGTGAGCGA---T--CAA--TACATGTATAATGAAACTTTTTCC--GGT-AAA-CTTATGTGA-T------------NCC---------------C---ACGCTTTT-GGC-ATGAGAGTGACTCGCCGC--------C-A-----------AC-GCG-ATCTCCGA-T-CCCCG----CGCG---A-------AA---C------G----CA-T----GA-A--AA---AAAT--CG------CTGTT--CATAAAA-TTTTACTGGGTTATTTAAT---TTTCTA-----AT-CAA--CGATGTCA---A---ATTAC-CAT-GTAA-GAAGCCA-TACCA---CCTGT-----------A----CA-A------T-ATACTTT-G-CAATCGGACT-A-A-TT---TT-C--AC-T-CT----CC----TGAAC-ACAAT--------GGGGC-------GC-CGAGTGGTAGAT----------TTT-ACAC---CTGATCT----------AC--------CC--C--G---CGCAT-CTCAA-AATTAGT--CGA------------AATTCACACCTTTGAAA-CC---ACGCTCCCAATTCA-CGGAT-CCTTG-ATTTTGTTA-AACA-----AA--CAAC---------TAATGTGTT-G----TT-----AA---TT-----------ACC--------CCG-CATGCTG-A-AT-------------A---------------GTGCT-GAC----AA--AACGAA-TT-ATT-CC-CCTTGCGGTTT-AAA-------------------------A-C-------------GC-TT-----GACC----AAT-------AT---CG-AAAG--TAGAA---ATCGCG-T-TNT-----ATTCGTCG--AAGA--TACA----ATCGC--C--GAAT-A-AA--GGT---AAA--------ATT-TCATGAA--A-TTACA-TG-AA-AA--TTTGA-T-AA----GTTT--A-AAC----TTAAT-AAA-----------TA-T------TAT-----TGT-AA--TAAA--------CA--AT-G-AG--TA--AGAGTTTT--ATTATTGCCTTAAATATTA-CA-TGTACATG-AAA---TCATCGA-T-CTC-----ACGT-TT-AA----CTC--AGCAAAATAT--C-TTA-TTCT----GTCACATGTAT-GTAA--T-AG-AGT-CA-TTAA------A--CA----TTA-T---T---------------CCAAT-----A--TG-T----ACATGAAG-T--T-TACAAA-GA-TATCAT-TAA--AT-------TGTACGT---AAG-A---------------CAACTAAGGATT-------G---CA--TTG------------AAATATAAA--TGCAAGAGA-CGTT---CCG-----A-TTGA------TGAAC-CAA-TGTGATTTTT--TTTTTC-ACGGTGGGC
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gi|11 : gatgatcgcaactacaattcaaatgttcaacgaagtttgatgtttatgatagaagattttcctgttcttgcttcgtcattgtccacgaccgtgaacgatcaatacatgtgtaatgaaactttttctgataaacttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgaaaaaaaaaatcgctgttcataaacttttactggtttatttaatattctaatcaacgatgtcaaattaccatgtaagaagccataccacctgtacaatatactttataatcggactaatttttcactctcctgaacacaatggggcgccgagtggtagattttacacctgatctaccccaaggcatctcaaaattagtcaaaatttacacctttgaaaccccgctcccaaattttgttaaacaaacatctaaggtgtggttaattaccccgcatTCTT-----AT-CAA--TGATGACC---A---ATTAC-TGT-GTAA-GAAGCCA-TGTC----CTTGTCATTTTTTAATAGTCCCA-AGCACTGT-GTACATT-G-CAATCAGATT-A-A-TT---TT-CC-AC-T-CT----TC----TGAA----AA----------------------C-CAGGTGGTAGAT----------TTTCACAC---CTGATCTGATTGGAAGTACTGGCNNNNNN--N--N---NNNNN-NNNNN-NNNNNNN--NNN------------NNTTCACACCTTTGAAAACC---ATGATCTTGTTTTA-TGGAT-TCTTG-ATTTTGTTA-AATA-----AA--CAACAATTACCAGTAATGTGTA-G----TT-----AA---TTAACTTCACTAAACC--------CTG-CATGCTT-T-AT-------------ACTT------------GTGCT-
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gi|12 : accattcaaatttttttatggtatactcttatcaatgatgaccaattactgtgtaagaagccatgtccttgtcattttttaatagtcccaagcactgtgtacattgcaatcagattaattttccactcttctgaaaaccaggtggtagattttcacacctgatctgattggaagtactggcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcacacctttgaaaaccatgatcttgttttatggattcttgattttgttaaataaacaacaattaccagtaatgtgtagttaattaacttcactaaaccctgcatgctttatacttgtgcttcaagggtcaatgttctctatcatagtattttaatattagggaagataactctcacacttctattgtgaaaaaAT----------TTT-ACAC---CTGATCT----------AC--------CC--C--A---CGCAT-CTCAA-AATTAGT--CGA------------AATTAACACCTTTGAAA-CC---ACGCTCCCAATTCA-CGGAT-CCTTG-ATTTTGTTA-AACA-----AA--CAAC---------TAATGTGTT-GTTTTTT-----AAAACTT-----------ACC--------CCGCCATACGG-A-AA-------------A---------------GT-CT-GAC----AAACAACGAA-TT-ATT-CC-CCTTGC-GTTT-AAA-------------------------A-C-------------GCATT-----GA-C----AAT-------AT---C--AAAG--TAGAA---ATCGCG-T-T-T-----ATTCGTC---AAGA--TA-A----AT----------------G--GGT---AAA----------T-TCA-GAA--ATTTGCA-TA-AAGAA--TTTGA-T-AA----GTTT--A-AAC-----TAAT-AAA-----------TA--------TAT-----TGTCAA--TAAA--------CA--TG-G-AG--TA--AGATTTTT--ATCATTGCATTAAATATTA-CACTTTACATG-GAAAATTCATCGA-T-CTC-----ACGTATT-AA----CTC--AGC-AAATATCGC-TTA-TTCT----GTCACATGTATCGTAA--T-AG-AGTCCA-TTAAATAATTA--TA----TTA-T---T---------------CCAAT-----A--TG-T----ACATGCAT-T--T-TACAAA-GA-TAtacaaaggca
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gi|14 : gcatgctgaatacttgatcgattcagagtgcaaacaaaacgaatatcggtttaaaacaagataatctcacgcttaaccaaaatagaaaatagaaatcgcgttgtattcgaaaaaaaatatagtcgctgaataaaggtaaaatttcatgaaattacatgaaaattgaataaagtttaaacgatgttaattttgcctatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntg----ACACCAATTTTTGTGGATTT----CGTT--GA-AGACCTCAACAACGAAGTTAAATGGTCATC-GA-AGTTT-G-GTG-CTTCTG-AT-A-GAAAAC-TT-CCT--CTT-CTTG-CTCTG-TCATTGTCCA-TGA-TCGTGAGCAA---T--CAA--TACATGTATAATGAAACCTTTTAC--GGT-AAA-CATAat
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gi|15 : cagtggtttcatcagtattcgttgaacaccaatttttgtggatttcgttgaagacctcaacaacgaagttaaatggtcatcgaagtttggtgcttctgatagaaaacttcctcttcttgctctgtcattgtccatgatcgtgagcaatcaatacatgtataatgaaaccttttacggtaaacataac-GTG-TTTCTGGAT-ATGAGGAT-TTTCCT--GTTTCTTG-TTCCG-TCATTGTC-A-CGAACCGTGAGCGA---T---AA--TACATG-ATAAT-AAACTTTTTCC--GGT-AA--CTTATGTGAAT------------TCA---------------C---ACGCTTTT-GAC-ATGAGAGTCACGCTTTTC--------C-A-----------AT-GCA-ATCTCCGA-T-CTCCG----CGCGGGTA-------AA---C------G-----A-T----GA-A--AA---GAAT--CG------CTGTT--CATGNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNN-TA-----AT--------ATTTTACTGG---GTTAC-CAT-GTAA-GAAGCCA-TACCA---CCTGT-----------A----CA-A------T-ATACTTT-G-CAATCGGACT-A-A-TT---TT-TT-AC-T-CT----AC----TGAAC-ACAAT--------GGCGA-------GC-CGAGTGGTAGAT----------TTT-ACAC---CTGATCT----------AT--------CC--T--G---CGCAT-CTCAA-AATTAGT--CGA------------AATTCACACatccacgaatttatgtatccacgaaac
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gi|17 : tacatggattccttgattttgttagaataataccaacaattaatgtgctagttttaattaactttcactgaaccctgcatctctataatcttgtttattaaaggataagctttgggtcaatgtataaaattcagatgccattactattaggaagaaatctctc-GTAA--TTAG-AGT-CA-TTAA------A--CA----TTA-T---T---------------CCAAT-----A--TG-T----ACATGAAG-T--T-TACAAAAGA-TAT--T-TAA--AT-------TGTACGT---AAG-A---------------CAACTAAGGATT-------G---CA--TTG------------AAATATAAA--TGCAAGAGA-CGTT---CCG-----A-TTGA------TGAAC-CAA-TGTTATTTTT--TTTTTC-ACGGCGGGC
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gi|25 : -----GACC----AAA-------AT---CG-AAAG--TAGAA---ATCGCG-T-TTT-----ATT--------------ACA----GTCGC--T--GAAT-A-AA--GGT---AAATTAGCAACATT-GAAAGAA--A-TTACA-TG-AA-AA--TTTTA-T-TT----GTTT--A-AAC----TTAAT-AAA-----------TA-T------TAT-----TGT-AA--TAActcacgct
gi|26 : TTATTTGATATATTCTTACATGTAT-CAA--CGATGACA---A---ATTAT-TGT-GCAA-GAAGCCA-T
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gi|28 : TTCAAC-GA-AGTTT-G-GTG-TTTCTG-AT-A-GAGGAT-TTTCCT--GTT-CTTG-TTCCG-CCATTGTCCA-CGA-CTGTG--------------------TGTATAATGGAACTTTTCCC--GGT-AAc
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