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lowQualScore                  :       ..     . .  . ...  ..    .     .  .  ..    .... . . .  .... . .......   .. .  .    . .  .     ....... .... ..  .....  . .    .... ..    ..  ....................... ..  ..  ..      .. ... . .  ....   .  .... ....  . ..   .......  .   .  .. .    . ..... .   ...... .  .   . . . ..  ...........   .  .   ...     .   ..    ......     ..   . ..  ............................................................................ ..      .. . . .   .  .  .. .. .  ..........................................     ...    .    .  .   ....   .  ..  .  ......   .  ..    ....  .  .....  .      ..   .  .    ......................................    .  ..     .........        
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Reference ( gi|2 )            :   AAAT--TATCT-C-GA-T---TA--TGAAAGGCAA-AT-CT--TGCT----C-T-C-TC---CT-T-------ACA--C-AG-TTAA-T-TAAACACA----C--A--C-A--TT-CA--AAAT-GTCA--T-C--AATA--CA-T---C--TA-C----C--C---T--GC--TTTCTCTGTC--T---G-T-AA-T--ATT-AG----G-AA-TT-A--TGT--C-G--TG-TTT-TG--T-AGAT-G---T-A-CAT-C-C--T-GT-GAA-C-A-G--GG--G-----T--TTC-AG-TTTCA-ATGTG-CAA--CACG----GAGGTTT--CAG-C--TC---C----------A--A-T--------------C----TAAA------------CCG---T-TG--A----T---T--CCCTCG--TAT-C-AGC-AG-TG--G--A-ATGG-GCACAAAATCAC-ACGTAGA---AAAAC-CAAAGTCT-TATGGC---TGTCAAAGC-CC-AAAT-GAAAT-TCG-TC-ACGTCGGGGAC-AA--AGTT--G-TATCG--A--CT-GCATGG--GCG-TA-GGAGAATGGGGGGGGGGGG---G-GGGGGGTAA--A-ACACTTGCC-CC--CCCCC-----C---TTTCAAAA
gi|1                          :   AAATGCTATCT-CCGA-TCACTA--TGAC--GCAA-AT-CT--TGCTA---C-T-CATC---AC-T-------ACA--C-AT-TTAACT-TACACACA----C--ATCC-A--TTTCACTACATCGCTA--T-TCAAATAA-CACT---C--TG-TAGTTC--C---T--TC--TTATCCTGTCGCT---G---AA-T--ATT-AG----GCAA-TTCA--TGT--C-GACTG-TCT-TG--T-AGAG-C---T-G-CAT-C-CATT-GT-GA--C-A-G--GGCAG-----T--TTC-AGCTTTCT-ATGTG-CAA--ACCG----GCGGTTT--CAG-CGTCC---C----------AGCA-T--------------CA---TAAAC-----------CCG---TATG--ATCATT---C--CCCTCGTTTGT-C-AGC-AGCTG--GCAA-ATGG-TCAC-AATTCCC-ACGTAGACGCAAAACACAGAGTTTCTATTGCGCATGTCAAACC-CCAAAAT-G-AAT-TCT-TCAAC------GAC--A--AGTT----TGTCG--A--CT-GCATGG--A-G-TA-GGA---------CGAGGGG---G-AACGGATAA--A-TCCCTCGCC-C
gi|9                          : tgcAAT--AATCT-C-GA-T---TA--TGGA-GGCAA-AT-CT--TGCT----C-T-C-TC---CT-T-------A-A--C-AG-TTAA-T-TATACACA----C--A--C-A--TT-TC--AAAT-GTCA--G-C--AATA--CA-T---C--TATC----C--T---T--GC--TT--TCTGTT--T---G-T-AA-T--ATT-AG----G--A-TT-A--TGT--C-G--TG-TTT-TG--T-AGAT-G---T-A-CAT-C-CA-T-GT-GAA-C-AGG--GG--G-----T--TTC-AG-TTTTC-ATGTG-CAA--CACG----G-GGTTT--CAG-C--TC---C----------C--ATT--------------C----TAAAATCAATATAATTCTG---T-TG--A----TA--T--CCCTCG--TTT-C-AGC-AG-TG--G--A-AATG-GCACAAAACC---------------------AAGTC--TATGGC---TGTCAAAGC-CC-AAAT-GAA---TCGTTC-AC------GA--AA--AGTT--G-TACCattttcacaaaaacagtcctacgc
gi|6                          :    AAT--TATCT-C-GA-T---TA--TGAAGGCCAA-AT-CT--TGCT----C---C-TC---CT-T-------ACA--C-AGATTAAGT-TACACACA----C--A--C-A--TT-CA--AATT-GTTA--T-C--AATA--CA-T---C--TATC----C--T---T--GC--TT--TCTGTT--T---GTT-AA-T--ATT-AG----G--A-TT-A--TGTA-C-G--TG-TTT-TGGTT-AG-T-G---T-A-CAT-T-CA-T-GT-GAA-C-AGG--GG--G-----T--TTC-AG-TTTTC-ATGT--CAA--CACG----GGG--TT--CAG-C--TC---CCATTCTGA--A--A-T--------------CAATATAAATT----------CTG---T-TGATA----T---T--CCCTCG--TTT-C-AGC-AG-TG--G--A-AT-G-GCAC-------------------AAAAC-CCAAGTCC-TATAGCT--TGTCAACGC-CCAAAAA-GAATT-TCG-TC-AC------GAC-AA--TGTT--GTTACCG--A--CT-G-ATGG--GCG-TA-GGAGATTGTGAGGGG
gi|4                          :   cAGT--TATCT-C-GA-T---TA--TGAAAGGCAA-ATATT--TGCT----CGT-C-TC----T-T-------ACA--CTAG-TTAA-TATACACACAT---C--A--C-A--TT-CA--AA-T-GTCA----C--AATA--CA-T---C--TA-C----A--C---TTGGC--TT--TCTGTC--T---G-T-AA-T--ATT-AG----G--A-TT-A--TGT----G--TGTTTT-TG--T-AGAT-G---T-A-CAT-C-A--T-GT--AA-C-A-GGTGG--G-----TGCTTCGAG-TTCTACATGTG-CAA--CACG------GGTTT--CAG-C--TCT--C----------A--A-T--------------A----TAAA-------------CG---T-TG--A----TTA-T--TCCTC---T-T-C-AGC--G-TG--G--ACATGG-CC-----ATCACAACGTGCA---AAAAC-C-TAGTC--TATGGA----GTCAAAGA-CC-AAATCGAAAT-TCG-TC-AC------GAC-AA--AGTTTGA-TAT-G--A--CTAGCATGG--G-G-TA---AGGAT----------GA---T-GGGGGATAA--A-A---TTACC-CC--TCCCT-----T---TTTCAAAc
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gi|10                         :  gcAAT--TA-CT-C-CA-T---AA--TGAC-GGCAGTGTGTT--TGCT----C-T-C-TT---TT-T-------ACA--C-AG-TTAG-C-TACATACA----A--A--T-C--TT-TT--AAAT-ACCA--T-C--AATA--CA-T---T--AA-C----C--C---T--TG--TTT-TCTGTC--T---C-T-AA-G--ATC-TG----G--A-TT-A--T-C--C-C--TG-CTCATT--T-AGA--G---C-A------------GG-G-----A-G--GG--G-----G--GTC-AG-TTTC--ATGTG-TAA--TACG----G-GGTTT--CAATC--TC---C----------C--ATT--------------C----TAAAATGAATATAATTCTG---T-TAATA----T---T--CCCTTA--TTC-C-AGC-AG-TA--G--A-AT-T-CCACAATAACAC-AC-----------------------TATGGC---TCTCCAAAC-CC-AAA---ATAT-AC------CGTCAGGG-C-AG--AGGT--G-
gi|8                          :     AT--GATCT-C-AA-T---AA--TGAA-GTCAG-TT-CT--TACT----C-T-C-TT---CT-T-------ACA--C-AG-TTAA-T-CATATACA----C--A--T-A--CT-TC--AATC-CTCA--T-C--AATA--CA-T---T--AA-C----C--T---T--GC--TT--TCTGCC--T---G-T-AA-G--ATT-AG----G--A-TT-A--TATACC-A--AA-ATT-AG--T-AAGT-G---C-A-CAT-C-TA-T-GT-GAG-C-A-G--GGA-G-----T--TTC-AG-TTTC--ATATG-TAA--TAC-----GAGGTTT--CAA-C--TC---C----------C--ATT--------------C----TAAAATAAACATAATTCTG---T-TAATA----T---T--CCATCG--TTT-C-TGT-GG-TA--G--A-AT-G-GCAC--AATGAC-ACGCAGA---AAATC---GAGTC--TATGGC---CGTCCAAAC-CC-AAAA-GA
gi|5                          :     AT--TATCT-C-CG-T---TA--T--ACGGCAA-GA-CT--CGCTGCACC-T-CCTC---CT-TTAATCTAATA--C----CTAT-T-TACCCATATGTTC--A--TTA--TT-CA--AACT-GTCAGCT-C--AAC---CA-T---CCTCA-C----T--CATTT--ACAGTCTCTCTGTT--TAACG-TCGG-T--CTT-AAGTGTG-AATTT-T--TGT--T-A--TT-TTT-CG--T-AGAT-GACAT-A-CAT-A------GT-GAA-C-A-C--AG--A-----T--TTC--G-TTC---ATGTG-CAA--C-CA----GCGGTTT--CAG-C--TCTCTC----------A--A-TAGACATCATTCTACC----TAAT------------CTG---T-TG--A----TA--T--CCCTCG--TTT-C-AGCAAG-TG--AC-A-ATGG----CAA---C--------------AAAC-CAATGTCT-TA-GGC---TGTC-AAGC-CA-AAA---GAAT-TCGATC--C------GAC-AAGCGGAT--G-TA-CGCTA--CT-GCATGGGTGCG-TA--GAGAtgtcaggagaaatg
gi|15                         :   tgcT--TATCT-C-GA-T---TA--TGAA-GGCAA-AT-CT--TGCT----C-T-C-TC---CT-T-------ACA--C-AG-TTAA-T---AACACAG---T--A--C-A--T
gi|3                          :              -C-GA-T---TAAGTGACGGGCAA-AG-CTGGTGCT----C-T-C-TCGGCTT-T-------ACAAGC-AG-TTAA-T-TACACA-A----CCAA--C-A--TTTCA--AAGT-GTCA--TACG-AATA--CA-TAATCG-TA-T----CGCT---T--GC--TTTCTC-GTT--T---G-T-AAGT--ATTCAG----G-TG-TCGA--TGT----G--TG-TTT-TG--T-AGATTG---G-A-CAG-CGCA-T-GTCGAA-CGA-G--GG--GAGCGTT--TTC-AG-TTTCA-TGGTG-CAAGCCACG----G-GGTTTTACAG-C--TC---CCCTATCGTTGA--A-TGCAATAGG------C----TACATGGT--------CTGTGAT-TG--A----TAC-T--CCCTCG--T-T-T-AGC-AG-TG--G--A-ATGGTGCACGAA---------TA-A---ATAGC-TATAG------CGG-----GTCA---CGCC-AAAA-GTAATATC--TC-AC-T----GACGAA--AATT--G-TACCG--A---T-GCATGG--GCG-TA-AGGATATGGAGGGGGCGGG---G-gtaattactgtatcgcctgtttcaaatattcagattttttctccatgcttt
gi|13                         :                                         -CT--TGTT----C-TTC-TC---TTCT-------ACA--C-AG-TTAA-T-TGCATACA-------A--A-A--TT-CA--ATAC-TTCA--T-C--AATGACCA-C---CGGCA-C----A--T---T--GC--TTGCT-GGTC--T---G-T-GC-T--ATT-AG----G--A-TT-A--TAC--C-A--Ttgca
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tcacatatgcttctcgaattgacactctagacgcaggatagtcatG---T-TG--A----TAT-T--CCATCG--TTT-C-AGC-TG-TG--G--A-ATGG--CACAA--TCAC-AAGTACA---AAA-C-CAA-GTCT--ATGGC---TGTCCAAGC-CC-AAAA-G-AAT-TCG-TC-A------AGAC-AA--AGTT--acagtcctatgcc
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ctcccattctaaaatcactatacaatatgtaattttT-GCATAA--GCG-TA-GGAGCAGGGGGAGGGGGGG---G-GGGGGG-AAGGG-GCATGTGCCACC--CCCCC-----CCA-CTTCAAAAtt
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gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               a-GCATGG--GCG-TA-GGA-ACCGGGGGAGGGGGG---ATGGGAGGTAA--------TTGCC-CC--CCCCC-----C---g
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATGG--GCGGTA-GGAGC-CGGGGGTGGGGGGCATG-GGGGGGCAA--A--CA--TGCC-CC--CCCCCCCGCAC---TTTCAAAcc
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2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|12 ): AACAAATTGTACACACACGCACACACACATCATATCCTGACTGTTCGGTAGCAGGTGTAGGATGTCTGTGTCGTGTTGAGTGTGTAGATGTACTAGTGCCATGACATGTGATTGGCTAGTTTACAATCGCAACGTTCCCCTCCTAAGGATGCTCACTAATACTCTTATGATTCTCCGTTGTTTCAGCAGTG
Unaligned ( gi|23 ): TTACATGGGCGTTAGGAGCCATGGCGGGCACTGCC






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Reference ( family-4436 )     :                                            AAAT--TATCT-C-GA-T---TA--TG-A-A-GGC-AA-AT-CT--TGCT----C-T-C-TC---CT-T-------ACA--C-AG-TTAA-T-TACACACA----C--A--C-A--TT-CA--AAAT-GTCA--T-C--AATA--C---A-TC--TAC----CC---T--GC--TTTCTCTGT-C--T---GT-AA-T--A--T-T-AG----G--A--T---T--A--TGT--C-G--TG-TT---T-TG--T-AGA-TGT-A-C--AT-C-CAT-GT-GAA-C-A-G--GG--G-----T--T--TC-AG-TTT--C-AT-GTG-CAA--CACG----G-GG-TTT--CAG--C-TCCC---------A-------A----------T--------C----TA----------A--A--NTC----------CG---T-TGA-T-A--T--CCC-TCGTTT--C-AGC-AG-TG--G--A-ATGG-GCACAAAATCAC-ACGTA--AA----AAAC-CAAAGTCT-TATGGC---T-GTCAAAGC-CCAAA-N-GAAAT-TCG-TC-AC------GAC-AA--AGTT--G-TAC-CGA--CT-GCATGG--GCG-TA-GGAGCACGGGGGGGGGGGG---G-GGGGGGC-A--AA--CACNTGCC-CC--CCCCC-----C--TTTCAAAA
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gi|11                         :                                             AAT--TATCTTC-GAAT---TA--TGGA-A-TGC-AA-AT-CT--CGCT----C-T-C-TC---TT-TA------ACA--C-AG-TTAAGT-TACACAC-----C--A--C-ATTTT-CG--AAAT-CTCA--T-CA-AATA--T---AGTC--TTC----CCTT-T--GC--TTTC-CTGT-A--T---GT-AA-T--T--G-T-AG----G--AT-T---T--AGTTAT--CTG--TG-TT---T-TG--T-AAA-TGTGA-C--AT-C-CATGGT-GAA-C-AGG--GG--G-----T--T--TC-AG--TT--C-AT-GTGCCAA--CACGACGTG-GGTTTT--CAG--C-TCCCTTTAA----A-------A----------T--------CAATATA----------G--AT-TTC----------TG---T-TGA-T-ATGT--TCC-TCGTTT--CAAGC-AG-TGTAA--A-AT-G-ACACATAATCGC-AC
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gi|2                          :                                           aAAAT--TATCT-C-GA-T---TA--TG-A-AAGGC-AA-AT-CT--TGCT----C-T-C-TC---CT-T-------ACA--C-AG-TTAA-T-TAAACACA----C--A--C-A--TT-CA--AAAT-GTCA--T-C--AATA--C---A-TC--TAC----CC---T--GC--TTTCTCTGT-C--T---GT-AA-T--A--T-T-AG----GA-A--T---T--A--TGT--C-G--TG-TT---T-TG--T-AGA-TGT-A-C--AT-C-C-T-GT-GAA-C-A-G--GG--G-----T--T--TC-AG-TTT--CAAT-GTG-CAA--CACG----GAGG-TTT--CAG--C-T-CC---------A-------A----------T--------C----TA----------A--A----C----------CG---T-TGA-T----T--CCC-TCGTAT--C-AGC-AG-TG--G--A-ATGG-GCACAAAATCAC-ACGTAG-AA----AAAC-CAAAGTCT-TATGGC---T-GTCAAAGC-CCAAA-T-GAAAT-TCG-TC-ACGTCGGGGAC-AA--AGTT--G-TAT-CGA--CT-GCATGG--GCG-TA-GGAGAATGGGGGGGGGGGG---G-GGGGGGTAA--AA--CACTTGCC-CC--CCCCC-----C--TTTCAAAAg
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATGG--GCG-TAAGGAGCATGGGGGG--------------------------CACATGCC-CC--CCCCC-----C--
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -GCATGG--GCG-TA-GGAAC-CGGGGGAGGGGGG---ATGGGAGGT-A--A------TTGCC-CC--CCCCC-----C--cctcacactttcaaaa
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gi|3                          :                                                       -C-GA-T---TAAGTG-ACG-GGC-AA-AG-CTGGTGCT----C-T-C-TCGGCTT-T-------ACAAGC-AG-TTAA-T-TACACA-A----CCAA--C-AT-TT-CA--AAGT-GTCA--TACG-AATA--CATAA-TCG-TATCG--CT---T--GC--TTTCTC-GT-T--T---GT-AAGT--A--T-TCAG----G--T--G---TCGA--TGT----G--TG-TT---T-TG--T-AGATTGG-A-C--AG-CGCAT-GTCGAA-CGA-G--GG--GAGCGTT--T--TC-AG-TTT--C-ATGGTG-CAAGCCACG----G-GG-TTTTACAG--C-TCCCCTATCGTTGA-------A----------TGCAATAGGC----TA----------C--ATGGTC----------TGTGAT-TGA-T-AC-T--CCC-TCGTTT----AGC-AG-TG--G--A-ATGGTGCACGAA---------TA--AA----TAGC-TATAG------CGG------GTCA---CGCCAAA-A-GTAATATC--TC-ACT-----GACGAA--AATT--G-TAC-CGA---T-GCATGG--GCG-TA-AGGATATGGAGGGGGCGGG---G-
gi|4                          :                                             AGT--TATCT-C-GA-T---TA--TG-A-AAGGC-AA-ATATT--TGCT----CGT-C-TC----T-T-------ACA--CTAG-TTAA-TATACACACAT---C--A--C-A--TT-CA--AA-T-GTCA----C--AATA--C---A-TC--TAC----AC---TTGGC--TTTCT--GT-C--T---GT-AA-T--A--T-T-AG----G--A--T---T--A--TGT----G--TGTTT---T-TG--T-AGA-TGT-A-C--AT---CAT-GT--AA-C-A-GGTGG--G-----TGCT--TCGAG-TTCTAC-AT-GTG-CAA--CAC-----G-GG-TTT--CAG--C-TCTC---------A-------A----------T--------A----TA----------A--A---------------CG---T-TGATT-A--T--TCC-TC--TT--C-AGC--G-TG--G--ACATGG-CC-----ATCACAACGTGC-AA----AAAC-C-TAGTC--TATGGA-----GTCAAAGA-CCAAATC-GAAAT-TCG-TC-AC------GAC-AA--AGTTTGA-TA--TGA--CTAGCATGG--G-G-TA-------------AGGATGA---T-GGGGGAT-A--AA---A-TTACC-CC--TCCCT-----T--TTTCAAAtgca
gi|5                          :                                            gcAT--TATCT-C-CG-T---TA--T--A-C-GGC-AA-GA-CT--CGCTGCACC-T-CCTC---CT-TTAATCTAATA--C----CTAT-T-TACCCATATGTTC--A--TTA--TT-CA--AACT-GTCAGCT-C--AAC---C---A-TCCTCAC----TCATTT--ACAGTCTCTCTGT-T--TAACGTCGG-T--C--T-T-AAGTGTG--AATT---T--T--TGT--T-A--TT-TT---T-CG--T-AGA-TG--A-C--AT-A-CATAGT-GAA-C-A-C--AG--A-----T--T--TC-G---TT--C-AT-GTG-CAA--CCAG----C-GG-TTT--CAGCTC-TCTC---------A-------ATAGACATCATT--------C----TA----------CCTA--ATC----------TG---T-TGA-T-A--T--CCC-TCGTTT--C-AGCAAG-TG--AC-A-ATGG----CAA---C----------------AAAC-CAATGTCT-TA-GGC---T-GTCAAG---CCAAA-A-G-AAT-TCGATC--C------GAC-AAGCGGAT--G-TACGCTA--CT-GCATGGGTGCG-TA-Gcaacagtcctacgc
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|23 ): TTACATGGGCGTTAGGAGCCATGGCGGGCACTGCC






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Reference ( family-4436 )     :                                            AAAT--TATCT-C-GA-T---TA--TG-A-A-GGC-AA-AT-CT--TGCT----C-T-C-TC---CT-T-------ACA--C-AG-TTAA-T-TACACACA----C--A--C-A--TT-CA--AAAT-GTCA--T-C--AATA--C---A-TC--TAC----CC---T--GC--TTTCTCTGT-C--T---GT-AA-T--A--T-T-AG----G--A--T---T--A--TGT--C-G--TG-TT---T-TG--T-AGA-TGT-A-C--AT-C-CAT-GT-GAA-C-A-G--GG--G-----T--T--TC-AG-TTT--C-AT-GTG-CAA--CACG----G-GG-TTT--CAG--C-T-CCC---------A-------A----------T--------C----TA----------A--A--NTC----------CG---T-TGA-T-A--T--CCC-TCG-TTT--C-AGC-AG-TG--G--A-ATGG-GCACAAAATCAC-ACGT--A-AA----AAAC-CAAAGTCT-TATGGC---T-GTCAAAGC-CCAAA-A-GAAAT-TCG-TC-AC------GAC-AA--AGTT--G-TAC-CGA--CT-GCATGG--GCG-TA-GGAGCACGGGGGGGGGGGG---G-GGGGGGC-AAACGCNT--G-----CCCC--CCCCC-----CTTTCAAAA
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gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ATGG--GCGGTA-GGAGC-CGGGGGTGGGGGGCATG-GGGGGGC-AAAC--AT--G-----CCCC--CCCCCCCGCACTTTCAAA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          T-ACATGG--GCG-TA-GGAGTA------GGGGGGG---G-GGGGGGC-AGAGGCAT--A--------T--CCCCC-----CTTTCAAAA
gi|2                          :                                           aAAAT--TATCT-C-GA-T---TA--TG-A-AAGGC-AA-AT-CT--TGCT----C-T-C-TC---CT-T-------ACA--C-AG-TTAA-T-TAAACACA----C--A--C-A--TT-CA--AAAT-GTCA--T-C--AATA--C---A-TC--TAC----CC---T--GC--TTTCTCTGT-C--T---GT-AA-T--A--T-T-AG----GA-A--T---T--A--TGT--C-G--TG-TT---T-TG--T-AGA-TGT-A-C--AT-C-C-T-GT-GAA-C-A-G--GG--G-----T--T--TC-AG-TTT--CAAT-GTG-CAA--CACG----GAGG-TTT--CAG--C-T--CC---------A-------A----------T--------C----TA----------A--A----C----------CG---T-TGA-T----T--CCC-TCG-TAT--C-AGC-AG-TG--G--A-ATGG-GCACAAAATCAC-ACGT--AGAA----AAAC-CAAAGTCT-TATGGC---T-GTCAAAGC-CCAAA-T-GAAAT-TCG-TC-ACGTCGGGGAC-AA--AGTT--G-TAT-CGA--CT-GCATGG--GCG-TA-GGAGAATGGGGGGGGGGGG---G-GGGGGGTAAAACACTT--G-----CCCC--CCCCC-----CTTTCAAAAg
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ATGG--GCG-TAAGGAGCATGGGGGG----------------------CACAT--G-----CCCC--CCCCC-----CT
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           -GCATGG--GCG-TA-GGAAC-CGGGGGAGGGGGG---ATGGGAGGT-AATTGC----------CCCC--CCCCC-----cctcacactttcaaaa
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ATGG--GCG-TA-GGAGCA----------------G-GGGGGGC-AAGTGCCCCCA-----CCCCACCCCCC-----CTTTCCAAAc
gi|3                          :                                                       -C-GA-T---TAAGTG-ACG-GGC-AA-AG-CTGGTGCT----C-T-C-TCGGCTT-T-------ACAAGC-AG-TTAA-T-TACACA-A----CCAA--C-AT-TT-CA--AAGT-GTCA--TACG-AATA--CATAA-TCG-TATCG--CT---T--GC--TTTCTC-GT-T--T---GT-AAGT--A--T-TCAG----G--T--G---TCGA--TGT----G--TG-TT---T-TG--T-AGATTGG-A-C--AG-CGCAT-GTCGAA-CGA-G--GG--GAGCGTT--T--TC-AG-TTT--C-ATGGTG-CAAGCCACG----G-GG-TTTTACAG--C-T-CCCCTATCGTTGA-------A----------TGCAATAGGC----TA----------C--ATGGTC----------TGTGAT-TGA-T-AC-T--CCC-TCG-TTT----AGC-AG-TG--G--A-ATGGTGCACGAA---------T--A-AA----TAGC-TATAG------CGG------GTCA---CGCCAAA-A-GTAATATC--TC-ACT-----GACGAA--AATT--G-TAC-CGA---T-GCATGG--GCG-TA-AGGATATGGAGGGGGCGGG---G-
gi|4                          :                                             AGT--TATCT-C-GA-T---TA--TG-A-AAGGC-AA-ATATT--TGCT----CGT-C-TC----T-T-------ACA--CTAG-TTAA-TATACACACAT---C--A--C-A--TT-CA--AA-T-GTCA----C--AATA--C---A-TC--TAC----AC---TTGGC--TTTCT--GT-C--T---GT-AA-T--A--T-T-AG----G--A--T---T--A--TGT----G--TGTTT---T-TG--T-AGA-TGT-A-C--AT---CAT-GT--AA-C-A-GGTGG--G-----TGCT--TCGAG-TTCTAC-AT-GTG-CAA--CAC-----G-GG-TTT--CAG--C-T-CTC---------A-------A----------T--------A----TA----------A--A---------------CG---T-TGATT-A--T--TCC-TC---TT--C-AGC--G-TG--G--ACATGG-CC-----ATCACAACGT--GCAA----AAAC-C-TAGTC--TATGGA-----GTCAAAGA-CCAAATC-GAAAT-TCG-TC-AC------GAC-AA--AGTTTGA-TA--TGA--CTAGCATGG--G-G-TA-------------AGGATGA---T-GGGGGAT-AAA--ATT--A-----CCCC--TCCCT-----TTTTCAAAtgca
gi|5                          :                                            gcAT--TATCT-C-CG-T---TA--T--A-C-GGC-AA-GA-CT--CGCTGCACC-T-CCTC---CT-TTAATCTAATA--C----CTAT-T-TACCCATATGTTC--A--TTA--TT-CA--AACT-GTCAGCT-C--AAC---C---A-TCCTCAC----TCATTT--ACAGTCTCTCTGT-T--TAACGTCGG-T--C--T-T-AAGTGTG--AATT---T--T--TGT--T-A--TT-TT---T-CG--T-AGA-TG--A-C--AT-A-CATAGT-GAA-C-A-C--AG--A-----T--T--TC-G---TT--C-AT-GTG-CAA--CCAG----C-GG-TTT--CAGCTC-T-CTC---------A-------ATAGACATCATT--------C----TA----------CCTA--ATC----------TG---T-TGA-T-A--T--CCC-TCG-TTT--C-AGCAAG-TG--AC-A-ATGG----CAA---C-----------------AAAC-CAATGTCT-TA-GGC---T-GTCAAG---CCAAA-A-G-AAT-TCGATC--C------GAC-AAGCGGAT--G-TACGCTA--CT-GCATGGGTGCG-TA-Gcaacagtcctacgc
gi|6                          :                                          tgcAAT--TATCT-C-GA-T---TA--TG-A-A-GGCCAA-AT-CT--TGCT----C---C-TC---CT-T-------ACA--C-AGATTAAGT-TACACACA----C--A--C-A--TT-CA--AATT-GTTA--T-C--AATA--C---A-TC--TAT----CC---TT-GC--TTTCT--GT-T--T---GTTAA-T--A--T-T-AG----G--A--T---T--A--TGTA-C-G--TG-TT---T-TGGTT-AG--TGT-A-C--AT-T-CAT-GT-GAA-C-A-G--GG--GG----T--T--TC-AG-TTTT-C-AT-GT--CAA--CACG----G-GG-TT---CAG--C-T-CCC---------ATTCTGAAA----------T--------CAATATA----------A--A--TTC----------TG---T-TGA-T-A--TT-CCC-TCG-TTT--C-AGC-AG-TG--G--A-ATGG------------C-AC-------A----AAAC-CCAAGTCC-TATAGC---TTGTCAACGC-CCAAA-AAGAATT-TCG-TC-AC------GAC-AA--TGTT--GTTAC-CGA--CT-G-ATGG--GCG-TA-GGAG-ATTGTGAGGGGaga
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                              cC---C--GC--TTTCT--GT-C--T---GT-AAATCAA--T-T-AG----G--A--T---T--A--TGT--C-G--TG-TT---T--G--TCAGA-TGT-AAC--ATAC-CAT-GT-GAAAC-A-G--GG--G--------------GG-TTT--C-AT-GTG-CAA--CACG----G-GG-TTT--CAG--C-TCCCC---------A-------A----------T--------C----TA----------A--A----C----------CG---T-TGA-TCA--C--TCC-TCGTTTT--C-AGC-AG-TG--G--A-AT-G-GCAC--AATCAC-ACGTAGA-AA----AAAC---AAGTC--TATGGC---T-GTCAAAGC-ACCAA-A-G-AAT-TCG-TC-AC------GAC-AA--AGTT--G-TGT-CGGACCT-GCATGG--GCG-TA-GGAG-AT-----GGGGGGG---G-GGGGGAT-AAA---AT--------CCCT--CCCCC-----TTTTCAAAAc
gi|8                          : tcacatatgcttctcgaattgacactctagacgcaggatagtcatAT--GATCT-C-AA-T---AA--TG-A-A-GTC-AG-TT-CT--TACT----C-T-C-TT---CT-T-------ACA--C-AG-TTAA-T-CATATACA----C--A--T-A--CT-TC--AATC-CTCA--T-C--AATA--C---A-TT--AAC----CT---T--GC--TT--TCTGC-C--T---GT-AA-G--A--T-T-AG----G--A--T---T--A--TATACC-A--AA-AT---T-AG--T-AAG-TGC-A-C--AT-C-TAT-GT-GAG-C-A-G--GGA-G-----T--T--TC-AG-TTT--C-AT-ATG-TAA--TACG----A-GG-TTT--CAA--C-T-CCC---------A-------T----------T--------C----TAAAATAAACATA--A--TTC----------TG---T-TAA-T-A--T--TCCATCG-TTT--C-TGT-GG-TA--G--A-AT-G-GCAC--AATGAC-ACGC--A-GA----AAAT-C-GAGTC--TATGGC---C-GTCCAAAC-CCAAA-A-GA-----TG-TC-AG------GAG-AA--Aacagtcctatgcc
gi|9                          :                                             AAT--AATCT-C-GA-T---TA--TG-G-A-GGC-AA-AT-CT--TGCT----C-T-C-TC---CT-T-------A-A--C-AG-TTAA-T-TATACACA----C--A--C-A--TT-TC--AAAT-GTCA--G-C--AATA--C---A-TC--TAT----CC---TT-GC--TTTCT--GT-T--T---GT-AA-T--A--T-T-AG----G--A--T---T--A--TGT--C-G--TG-TT---T-TG--T-AGA-TGT-A-C--AT-C-CAT-GT-GAA-C-A-G--GG--GG----T--T--TC-AG-TTTT-C-AT-GTG-CAA--CACG----G-GG-TTT--CAG--C-T-CCC---------A-------T----------T--------C----TA----------A--A--ATCAATATAATTCTG---T-TGA-T-A--T--CCC-TCG-TTT--C-AGC-AG-TG--G--A-AATG-GCACAAAACCA------------------------AGTCT--ATGGC---T-GTCAAAGC-CCAAA-T-GAA---TCGTTC-AC------GA--AA--AGTT--G-TAC-Ctg
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|23 ): TTACATGGGCGTTAGGAGCCATGGCGGGCACTGCC






Alignments
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lowQualScore                  :                                                55     6 6  6 444  00  6 888   6  6  7  66    4444 3 3 7  4444 3 2222222   66 3  3    2 1        2222222 66 3 99  3  66  7 3    0000000    99 888 7  88888888888888888  22  5  22  1 22 444  2  2222 22 1 1  5555 66666 444 33 22   3333 22  3  888 7  66 3   3   3 3 66  777   0  3   3 3 7 66  22222222222 66  3  3   66 7  3   3   66    222222  3   66   99 3 3   44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 444 1   2 2222 33   2   1   22 1   1  1  22 99 3  444444444444444444444444444444444444444444444     00000      0 6     222 44444   3  6  111111   6  00    55 4  44   99  0      99   9  9    55555555       444 6      44   6666666666666    55     00000         
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Reference ( family-4436 )     :                                            AAAT--TATCT-C-GA-T---TA--TG-A-A-GGC-AA-AT-CT--TGCT----C-T-C-TC---CT-T-------ACA--C-AG-TTAA-T-TACACACA----C--A--C-A--TT-CA--AAAT-GTCA--T-C--AATA--C---A-TC--TAC----CC---T--GC--TTTCTCTGT-C--T---GT-AA-T--A--T-T-AG----G--A--T---T--A--TGT--C-G--TG-TT---T-TG--T-AGA-TGT-A-C--AT-C-CAT-GT-GAA-C-A-G--GG--G-----T--T--TC-AG-TTT--C-AT-GTG-CAA--CACG----G-GG-TTT--CAG--C-T-CCC---------A-------A----------T--------C----TA----------A--A--NTC----------CG---T-TGA-T-A--T--CCC-TCG-TTT--C-AGC-AG-TG--G--A-ATGG-GCACAAAATCAC-ACGT--A-AA----AAAC-CAAAGTCT-TATGGC---T-GTCAAAGC-CCAAA-A-GAAAT-TCG-TC-AC------GAC-AA--AGTT--G-TAC-CGA--CT-GCATGG--GCG-TA-GGAGCACGGGGGGGGGGGG---G-GGGGGGC-AAACGCNT--G-----CCCC--CCCCC-----CTTTCAAAA
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gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          T-GCATAA--GCG-TA-GGAGCAGGGGGAGGGGGGG---G-GGGGGGA-AGGGGCAT--GTGCCACCCC--CCCCC-----ACTTCAAAAgtgaagaggggcaaaagtatgctatctcttcttctttttt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ATGG--GCGGTA-GGAGC-CGGGGGTGGGGGGCATG-GGGGGGC-AAAC--AT--G-----CCCC--CCCCCCCGCACTTTCAAA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          T-ACATGG--GCG-TA-GGAGTA------GGGGGGG---G-GGGGGGC-AGAGGCAT--A--------T--CCCCC-----CTTTCAAAA
gi|2                          :                                           aAAAT--TATCT-C-GA-T---TA--TG-A-AAGGC-AA-AT-CT--TGCT----C-T-C-TC---CT-T-------ACA--C-AG-TTAA-T-TAAACACA----C--A--C-A--TT-CA--AAAT-GTCA--T-C--AATA--C---A-TC--TAC----CC---T--GC--TTTCTCTGT-C--T---GT-AA-T--A--T-T-AG----GA-A--T---T--A--TGT--C-G--TG-TT---T-TG--T-AGA-TGT-A-C--AT-C-C-T-GT-GAA-C-A-G--GG--G-----T--T--TC-AG-TTT--CAAT-GTG-CAA--CACG----GAGG-TTT--CAG--C-T--CC---------A-------A----------T--------C----TA----------A--A----C----------CG---T-TGA-T----T--CCC-TCG-TAT--C-AGC-AG-TG--G--A-ATGG-GCACAAAATCAC-ACGT--AGAA----AAAC-CAAAGTCT-TATGGC---T-GTCAAAGC-CCAAA-T-GAAAT-TCG-TC-ACGTCGGGGAC-AA--AGTT--G-TAT-CGA--CT-GCATGG--GCG-TA-GGAGAATGGGGGGGGGGGG---G-GGGGGGTAAAACACTT--G-----CCCC--CCCCC-----CTTTCAAAAg
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ATGG--GCG-TAAGGAGCATGGGGGG----------------------CACAT--G-----CCCC--CCCCC-----CT
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           -GCATGG--GCG-TA-GGAAC-CGGGGGAGGGGGG---ATGGGAGGT-AATTGC----------CCCC--CCCCC-----cctcacactttcaaaa
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ATGG--GCG-TA-GGAGCA----------------G-GGGGGGC-AAGTGCCCCCA-----CCCCACCCCCC-----CTTTCCAAAc
gi|3                          :                                                       -C-GA-T---TAAGTG-ACG-GGC-AA-AG-CTGGTGCT----C-T-C-TCGGCTT-T-------ACAAGC-AG-TTAA-T-TACACA-A----CCAA--C-AT-TT-CA--AAGT-GTCA--TACG-AATA--CATAA-TCG-TATCG--CT---T--GC--TTTCTC-GT-T--T---GT-AAGT--A--T-TCAG----G--T--G---TCGA--TGT----G--TG-TT---T-TG--T-AGATTGG-A-C--AG-CGCAT-GTCGAA-CGA-G--GG--GAGCGTT--T--TC-AG-TTT--C-ATGGTG-CAAGCCACG----G-GG-TTTTACAG--C-T-CCCCTATCGTTGA-------A----------TGCAATAGGC----TA----------C--ATGGTC----------TGTGAT-TGA-T-AC-T--CCC-TCG-TTT----AGC-AG-TG--G--A-ATGGTGCACGAA---------T--A-AA----TAGC-TATAG------CGG------GTCA---CGCCAAA-A-GTAATATC--TC-ACT-----GACGAA--AATT--G-TAC-CGA---T-GCATGG--GCG-TA-AGGATATGGAGGGGGCGGG---G-
gi|4                          :                                             AGT--TATCT-C-GA-T---TA--TG-A-AAGGC-AA-ATATT--TGCT----CGT-C-TC----T-T-------ACA--CTAG-TTAA-TATACACACAT---C--A--C-A--TT-CA--AA-T-GTCA----C--AATA--C---A-TC--TAC----AC---TTGGC--TTTCT--GT-C--T---GT-AA-T--A--T-T-AG----G--A--T---T--A--TGT----G--TGTTT---T-TG--T-AGA-TGT-A-C--AT---CAT-GT--AA-C-A-GGTGG--G-----TGCT--TCGAG-TTCTAC-AT-GTG-CAA--CAC-----G-GG-TTT--CAG--C-T-CTC---------A-------A----------T--------A----TA----------A--A---------------CG---T-TGATT-A--T--TCC-TC---TT--C-AGC--G-TG--G--ACATGG-CC-----ATCACAACGT--GCAA----AAAC-C-TAGTC--TATGGA-----GTCAAAGA-CCAAATC-GAAAT-TCG-TC-AC------GAC-AA--AGTTTGA-TA--TGA--CTAGCATGG--G-G-TA-------------AGGATGA---T-GGGGGAT-AAA--ATT--A-----CCCC--TCCCT-----TTTTCAAAtgca
gi|5                          :                                            gcAT--TATCT-C-CG-T---TA--T--A-C-GGC-AA-GA-CT--CGCTGCACC-T-CCTC---CT-TTAATCTAATA--C----CTAT-T-TACCCATATGTTC--A--TTA--TT-CA--AACT-GTCAGCT-C--AAC---C---A-TCCTCAC----TCATTT--ACAGTCTCTCTGT-T--TAACGTCGG-T--C--T-T-AAGTGTG--AATT---T--T--TGT--T-A--TT-TT---T-CG--T-AGA-TG--A-C--AT-A-CATAGT-GAA-C-A-C--AG--A-----T--T--TC-G---TT--C-AT-GTG-CAA--CCAG----C-GG-TTT--CAGCTC-T-CTC---------A-------ATAGACATCATT--------C----TA----------CCTA--ATC----------TG---T-TGA-T-A--T--CCC-TCG-TTT--C-AGCAAG-TG--AC-A-ATGG----CAA---C-----------------AAAC-CAATGTCT-TA-GGC---T-GTCAAG---CCAAA-A-G-AAT-TCGATC--C------GAC-AAGCGGAT--G-TACGCTA--CT-GCATGGGTGCG-TA-Gcaacagtcctacgc
gi|6                          :                                          tgcAAT--TATCT-C-GA-T---TA--TG-A-A-GGCCAA-AT-CT--TGCT----C---C-TC---CT-T-------ACA--C-AGATTAAGT-TACACACA----C--A--C-A--TT-CA--AATT-GTTA--T-C--AATA--C---A-TC--TAT----CC---TT-GC--TTTCT--GT-T--T---GTTAA-T--A--T-T-AG----G--A--T---T--A--TGTA-C-G--TG-TT---T-TGGTT-AG--TGT-A-C--AT-T-CAT-GT-GAA-C-A-G--GG--GG----T--T--TC-AG-TTTT-C-AT-GT--CAA--CACG----G-GG-TT---CAG--C-T-CCC---------ATTCTGAAA----------T--------CAATATA----------A--A--TTC----------TG---T-TGA-T-A--TT-CCC-TCG-TTT--C-AGC-AG-TG--G--A-ATGG------------C-AC-------A----AAAC-CCAAGTCC-TATAGC---TTGTCAACGC-CCAAA-AAGAATT-TCG-TC-AC------GAC-AA--TGTT--GTTAC-CGA--CT-G-ATGG--GCG-TA-GGAG-ATTGTGAGGGGaga
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                              cC---C--GC--TTTCT--GT-C--T---GT-AAATCAA--T-T-AG----G--A--T---T--A--TGT--C-G--TG-TT---T--G--TCAGA-TGT-AAC--ATAC-CAT-GT-GAAAC-A-G--GG--G--------------GG-TTT--C-AT-GTG-CAA--CACG----G-GG-TTT--CAG--C-TCCCC---------A-------A----------T--------C----TA----------A--A----C----------CG---T-TGA-TCA--C--TCC-TCGTTTT--C-AGC-AG-TG--G--A-AT-G-GCAC--AATCAC-ACGTAGA-AA----AAAC---AAGTC--TATGGC---T-GTCAAAGC-ACCAA-A-G-AAT-TCG-TC-AC------GAC-AA--AGTT--G-TGT-CGGACCT-GCATGG--GCG-TA-GGAG-AT-----GGGGGGG---G-GGGGGAT-AAA---AT--------CCCT--CCCCC-----TTTTCAAAAc
gi|8                          : tcacatatgcttctcgaattgacactctagacgcaggatagtcatAT--GATCT-C-AA-T---AA--TG-A-A-GTC-AG-TT-CT--TACT----C-T-C-TT---CT-T-------ACA--C-AG-TTAA-T-CATATACA----C--A--T-A--CT-TC--AATC-CTCA--T-C--AATA--C---A-TT--AAC----CT---T--GC--TT--TCTGC-C--T---GT-AA-G--A--T-T-AG----G--A--T---T--A--TATACC-A--AA-AT---T-AG--T-AAG-TGC-A-C--AT-C-TAT-GT-GAG-C-A-G--GGA-G-----T--T--TC-AG-TTT--C-AT-ATG-TAA--TACG----A-GG-TTT--CAA--C-T-CCC---------A-------T----------T--------C----TAAAATAAACATA--A--TTC----------TG---T-TAA-T-A--T--TCCATCG-TTT--C-TGT-GG-TA--G--A-AT-G-GCAC--AATGAC-ACGC--A-GA----AAAT-C-GAGTC--TATGGC---C-GTCCAAAC-CCAAA-A-GA-----TG-TC-AG------GAG-AA--Aacagtcctatgcc
gi|9                          :                                             AAT--AATCT-C-GA-T---TA--TG-G-A-GGC-AA-AT-CT--TGCT----C-T-C-TC---CT-T-------A-A--C-AG-TTAA-T-TATACACA----C--A--C-A--TT-TC--AAAT-GTCA--G-C--AATA--C---A-TC--TAT----CC---TT-GC--TTTCT--GT-T--T---GT-AA-T--A--T-T-AG----G--A--T---T--A--TGT--C-G--TG-TT---T-TG--T-AGA-TGT-A-C--AT-C-CAT-GT-GAA-C-A-G--GG--GG----T--T--TC-AG-TTTT-C-AT-GTG-CAA--CACG----G-GG-TTT--CAG--C-T-CCC---------A-------T----------T--------C----TA----------A--A--ATCAATATAATTCTG---T-TGA-T-A--T--CCC-TCG-TTT--C-AGC-AG-TG--G--A-AATG-GCACAAAACCA------------------------AGTCT--ATGGC---T-GTCAAAGC-CCAAA-T-GAA---TCGTTC-AC------GA--AA--AGTT--G-TAC-Ctg


blockSeqs                     :                                                .      T .  A .    AG  G AA    C  T  G  GG    GCAC G T C  GGCT C TAATCTA   AG T  A    G A        TGTTC   .  T TT  .  .   A .    TACG       AC ATA G  CTCACTCATTT        AG     CT  T .  AAC  C  ATCA GG G C  GTGT AAT   GTC CG GT   ACC  .   T  GAG A  GT C   T   G A TA  GC    G  C   A G G GT  GAGCGTT     GG  G  .   TA A  G   C   GC    ACGTG   T   TA   CT . C   CTATCGTTGAATGCAATAGGCTACATGGTCT                                            TGA .   T ATG  T    A   T   .  A   A  .  TA C  C  GGGCACAAAATCACACGTAGAAAAACCAAAGTCTT               TT         A G     TC  TAATA   A  .  GTCGGG   G  GC    TG T  CG   AC  A      GT   G  A    CAGGGGGA       CAT T      TA   GGCATGTGCCA      AC     CCGCA
blockSeqs                     :                                                .      . .  . .    .   . CG    .  .  A  .     .    . . .  T    . A         .  .  .    G .        CCA     .  . T   .  .   A .    GCTC       .  .   .  GTATCGCTT          .      CT  . .  .    T  GT   .  . .  .    AT    .   .  .    CT   .   .  .   G  .  .   .   . . .   CG    A  .   . . T .   GTGC        .   .  .   A  .  .   .   .     GA      .   .    T  . .   AATAGACATCATTCTACCTAATCT                                                   .   .   T AT   .    A   .   .  .   .  .  .  .  .  GGCACAATCACACGTAGAAAAAACAAGTCT                    T          G .     AA  AAAT    T  .  T        .  .     .  .  T    .   .      .    .  .    AATGGGGG       .   .      A    TGCCCCCA         .      .    
blockSeqs                     :                                                .      . .  . .    .   . AA    .  .  .  .     .    . . .  T    . .         .  .  .    . .        TC      .  . .   .  .   A .    TCA        .  .   .  TTCCCTTT           .      CT  . .  .    .  G    .  . .  .    AA    .   .  .    AC   .   .  .   .  .  .   .   . . .   AC    .  .   . . . .   GGT         .   .  .   T  .  .   .   .     G       .   .    .  . .   ATTCTGAAATCAATATAAATTCT                                                    .   .   . AC   .    .   .   .  .   .  .  .  .  .  GGCACAATCACAAGTACAAAACCAAGTCT                     T          G .     A   AAAT    .  .  .        .  .     .  .  C    .   .      .    .  .    CATGGGGG       .   .      C    GGCATA           .      .    
blockSeqs                     :                                                .      . .  . .    .   . C     .  .  .  .     .    . . .  T    . .         .  .  .    . .        A       .  . .   .  .   A .    TC         .  .   .  GGCACATT           .      CT  . .  .    .  T    .  . .  .    A     .   .  .    C    .   .  .   .  .  .   .   . . .   C     .  .   . . . .   AGT         .   .  .   T  .  .   .   .     G       .   .    .  . .   ATTCTAAAATGAATATAATTCT                                                     .   .   . CA   .    .   .   .  .   .  .  .  .  .  GGCCATCACAACGTGCAAAAACCTAGTCT                     T          G .     A   AATT    .  .  .        .  .     .  .  C    .   .      .    .  .    TATGGAGG       .   .      C    CACTTG           .      .    
blockSeqs                     :                                                .      . .  . .    .   . A     .  .  .  .     .    . . .  C    . .         .  .  .    . .        C       .  . .   .  .   G .    TC         .  .   .  TACACTTG           .      CT  . .  .    .  C    .  . .  .    A     .   .  .    C    .   .  .   .  .  .   .   . . .   C     .  .   . . . .   GGT         .   .  .   .  .  .   .   .     G       .   .    .  . .   TTTAAAATCAATATAGATTTCT                                                     .   .   . C    .    .   .   .  .   .  .  .  .  .  GGCACAATGACACGCAGAAAATCGAGTCT                     T          G .     T   ATA     .  .  .        .  .     .  .  T    .   .      .    .  .    CCGGGGG        .   .      T    CACATG           .      .    
blockSeqs                     :                                                .      . .  . .    .   . A     .  .  .  .     .    . . .  C    . .         .  .  .    . .        C       .  . .   .  .   C .    TC         .  .   .  ATATCCT            .      CT  . .  .    .  T    .  . .  .    A     .   .  .    C    .   .  .   .  .  .   .   . . .   A     .  .   . . . .   GG          .   .  .   .  .  .   .   .     C       .   .    .  . .   ATTCTAAAATAAACATAATTCT                                                     .   .   . A    .    .   .   .  .   .  .  .  .  .  GGTGCACGAATAAATAGCTATAG                           T          G .     A   AAT     .  .  .        .  .     .  .  C    .   .      .    .  .    CCGGGGG        .   .      C    CATG             .      .    
blockSeqs                     :                                                .      . .  . .    .   . C     .  .  .  .     .    . . .  C    . .         .  .  .    . .        C       .  . .   .  .   T .    TC         .  .   .  TATCCTT            .      G   . .  .    .  T    .  . .  .    T     .   .  .    C    .   .  .   .  .  .   .   . . .   T     .  .   . . . .   GT          .   .  .   .  .  .   .   .     G       .   .    .  . .   ATTCTAAAATCAATATAATTCT                                                     .   .   . A    .    .   .   .  .   .  .  .  .  .  GGCAACAAACCAATGTCTT                               C          A .     A   AAT     .  .  .        .  .     .  .  .        .      .    .  .    ATTGTGA        .   .      T    ATTA             .      .    
blockSeqs                     :                                                .      . .  . .    .   . A     .  .  .  .     .    . . .  C    . .         .  .  .    . .        C       .  . .   .  .   T .    TC         .  .   .  TATCCTT            .      C   . .  .    .  T    .  . .  .    A     .   .  .    T    .   .  .   .  .  .   .   . . .   C     .  .   . . . .   AT          .   .  .   .  .  .   .   .     G       .   .    .  . .   AAGGATGCTCACTAATACTCT                                                      .   .   . A    .    .   .   .  .   .  .  .  .  .  GGCACAAAACCCAAGTCCT                               T          G .     A   AAT     .  .  .        .  .     .  .           .      .    .  .    CC             .   .      T    TGC              .      .    
blockSeqs                     :                                                .      . .  . .    .   . A     .  .  .  .     .    . . .  C    . .         .  .  .    . .        C       .  . .   .  .   A .    GC         .  .   .  AACCCT             .      .   . .  .    .  T    .  . .  .    A     .   .  .    C    .   .  .   .  .  .   .   . . .   C     .  .   . . . .   GT          .   .  .   .  .  .   .   .     A       .   .    .  . .   AATCTAAACC                                                                 .   .   . A    .    .   .   .  .   .  .  .  .  .  TGGCACAAAACCAAGTCT                                .          . .     A   AA      .  .  .        .  .     .              .      .    .  .    TA             .   .      .    AT               .      .    
blockSeqs                     :                                                       . .  . .    .   . A     .  .  .  .     .    . . .  C    . .         .  .  .    . .        C       .  . .   .  .   . .    C          .  .   .  TACCCT             .      .   . .  .    .  T    .  . .  .    A     .   .  .    C    .   .  .   .  .  .   .   . . .   .     .  .   . . . .   AT          .   .  .   .  .  .   .   .     G       .   .    .  . .   AATCTAAACC                                                                 .   .   . A    .    .   .   .  .   .  .  .  .  .  TCCACAATAACACACT                                  .          . .     T   A       .  .  .        .  .                           .    .  .    CA             .   .                                        
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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consensus                     :                                              AAAT--TATCT-C-GA-T---TA--TG-A-A-GGC-AA-AT-CT--TGCT----C-T-C-TC---CT-T-------ACA--C-AG-TTAA-T-TACACACA----C--A--C-A--TT-CA--AAAT-GTCA--T-C--AATA--C---A-TC-T--AC----C-C--TTG-C--TTTCTCTGTC--T---G-T-AA-T--A--T-T-AGG-----A-T---T--A--T-GT--C-G--TG-TT---T-TG--T-AGA-TGT-A-C--AT-C-CA-T-GT-GAA-C-A-G--GG--G-----T--T--TC-AG-TTT--C-AT-GTG-CAA--CACG----G-GG-TTT--CAG-C-TCCC---------A---AT----------C----TA----------A--A--TTCCG---T-TGA-T-A--T--CCC-TCGTT--T-C-AGC-AG-TG--G--A-AT-G--G-CAC-AA---T----ACA--GTA----NAAAAC-C-A-A-G--T-C-TATGGC---TGTCAAAGC-CC-AAA--A-G-AA-T-TCG-TC-AC------GAC-AA--AGTT--G-TAC-CGA--CT-GCATGG--GCG-TA-GGAGCACGGGGGGGGGGGG---G-GGGGGGC-AAACGC----A-TG-----CCCCCCCCC-----C---TTTCAAAA
Reference ( family-4436 )     :                                              AAAT--TATCT-C-GA-T---TA--TG-A-A-GGC-AA-AT-CT--TGCT----C-T-C-TC---CT-T-------ACA--C-AG-TTAA-T-TACACACA----C--A--C-A--TT-CA--AAAT-GTCA--T-C--AATA--C---A-TC-T--AC----C-C--TTG-C--TTTCTCTGTC--T---G-T-AA-T--A--T-T-AGG-----A-T---T--A--T-GT--C-G--TG-TT---T-TG--T-AGA-TGT-A-C--AT-C-CA-T-GT-GAA-C-A-G--GG--G-----T--T--TC-AG-TTT--C-AT-GTG-CAA--CACG----G-GG-TTT--CAG-C-TCCC---------A---AT----------C----TA----------A--A--NTCCG---T-TGA-T-A--T--CCC-TCGTT--T-C-AGC-AG-TG--G--A-AT-G--G-CAC-AA---T----ACA--GTA----NAAAAC-C-A-A-G--T-C-TATGGC---TGTCAAAGC-CC-AAA--A-G-AA-T-TCG-TC-AC------GAC-AA--AGTT--G-TAC-CGA--CT-GCATGG--GCG-TA-GGAGCACGGGGGGGGGGGG---G-GGGGGGC-AAACGC----A-TG-----CCCCCCCCC-----C---TTTCAAAA
gi|1                          :                                              AAATGCTATCT-CCGA-TCACTA--TG-A-C-G-C-AA-AT-CT--TGCTA---C-T-CATC---AC-T-------ACA--C-AT-TTAACT-TACACACA----C--ATCC-A--TTTCACTACATCGCTA--T-TCAAATAA-C---ACTC-T--GTAGTTC-C--TT--C--TTATCCTGTCGCT---G---AA-T--A--T-T-AGGCA---A-T---TC-A--T-GT--C-GACTG-TC---T-TG--T-AGA-GCT-G-C--AT-C-CATT-GT-G-A-C-A-G--GGCAG-----T--T--TC-AGCTTT--CTAT-GTG-CAA--ACCG----GCGG-TTT--CAG-CGTCCC---------AGC-AT----------CA---TA----------A--A--C-CCG---TATGA-TCA--TTCCCC-TCGTTTGT-C-AGC-AGCTG--GCAA-AT-G--GTCAC-AA---TTCCCAC---GTAGACGCAAAACAC-AGA-GTTT-C-TATTGCGCATGTCAAACC-CC-AAA--ATG-AA-T-TCT-TCAAC------GAC-AA--GTTT--G-T---CGA--CT-GCATGG--A-G-TA-GG---ACGAGGGGG
gi|10                         :                                            tgcAAT--TA-CT-C-CA-T---AA--TG-A-C-GGC-AGTGTGTT--TGCT----C-T-C-TT---TT-T-------ACA--C-AG-TTAG-C-TACATACA----A--A--T-C--TT-TT--AAAT-ACCA--T-C--AATA--C---A-TT-A--AC----C-C--TTG-T--TTTCT--GTC--T---C-T-AA-G--A--T-C-TGG-----A-T---T--A--T-CC--C----TG-CT---CATT--T-AGA-----G-C--A---------GG-GA------G--GG--G-----G--G--TC-AG-TTT--C-AT-GTG-TAA--TACG----G-GG-TTT--CAATC-TCCC---------A---TT----------C----TAAAATGAATATA--A--TTCTG---T-TAA-T-AT-T--CCC-TTATT--C-C-AGC-AG-TA--G--A-AT-T--C-CAC-AA---T----A------A----CA-----C-A--------C-TATGGC---TCTCCAAAC-CC-AAA--A-T-AT-A-CCG-TC-AG------GGC-AG--AGGT--G-aacggataaatccctcgcccattttcacaaaaacagtcctacgc
gi|11                         :                                               AAT--TATCTTC-GAAT---TA--TGGA-A-TGC-AA-AT-CT--CGCT----C-T-C-TC---TT-TA------ACA--C-AG-TTAAGT-TACACAC-----C--A--C-ATTTT-CG--AAAT-CTCA--T-CA-AATA--T---AGTC-T--TC----C-CT-TTG-C--TTTC-CTGTA--T---G-T-AA-T--T--G-T-AGG-----ATT---T--AGTT-AT--CTG--TG-TT---T-TG--T-AAA-TGTGA-C--AT-C-CA-TGGT-GAA-C-AGG--GG--G-----T--T--TC-AG--TT--C-AT-GTGCCAA--CACGACGTG-GGTTTT--CAG-C-TCCCTTTAA----A---AT----------CAATATA----------G--AT-TTCTG---T-TGA-T-ATGT--TCC-TCGTT--T-CAAGC-AG-TGTAA--A-AT-G--A-CAC-A
gi|12                         :                                                                                                                                    gcAA-T-TGTACACA----C--A--C-G-----CA---------CA--C-----ACA--C---A-TCAT--AT----C-C--TGA-C--TGT-----TC--G---G-T-AG-C--AGGTGT-AGG-----A-TGTCT--G--T-GT--C-G--TG-TTGAGTGTG--T-AGA-TGT-A-CTAGTGC-CA-T-G----A-C-ATG--TG--A-----T--TGGCT-AG-TTTA-C-AA-TCG-CAA--C----------G-TTC--C-C-C-TCCT---------AAGGATGCTCA-----C----TA----------AT-A--CTCTT---A-TGATT-C--T--CCG-TTGTT--T-C-AGC-AG-TG--taatcgcac
gi|13                         :                                                                                   aaca-CT--TGTT----C-TTC-TC---TTCT-------ACA--C-AG-TTAA-T-TGCATACA-------A--A-A--TT-CA--ATAC-TTCA--T-C--AATGACC---A-CC-G--GCA---C-A--TTG-C--TTGCT-GGTC--T---G-T-GC-T--A--T-T-AGG-----A-T---T--A--T-AC--C-A--T
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    cccgataaatgacgtcagc----------A--A--TTTTG---T-TGA-T-A--T--TCCATCGTT--T-C-AGC-TG-TG--G--A-AT-G--G-CAC-AA---TC---ACAA-GTA----CAAAAC-C-A-A-G--T-C-TATGGC---TGTCCAAGC-CC-AAA--A-G-AA-T-TCG-TC-AA------GAC-AA--AGTT--aaataatatgttactctatat
gi|15                         :                   ctcccattctaaaatcactatacaatatgtT--TATCT-C-GA-T---TA--TG-A-A-GGC-AA-AT-CT--TGCT----C-T-C-TC---CT-T-------ACA--C-AG-TTAA-T-AACACAtt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATGG--GCG-TA-GGAGC-CGGGGGGGGGGG-----------------CAT----A-TG-----CCCCCCCCC-----CCCTTTTCAAAgtacatgtaattactgtatcgcctgtttcaaatattcagattttttctccatgcttt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               T-GCATAA--GCG-TA-GGAGCAGGGGGAGGGGGGG---G-GGGGGGA-AGGGGC----A-TGTGCCACCCCCCCCC-----A---CTTCAAAAgtgaagaggggcaaaagtatgctatctcttcttctttttt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATGG--GCGGTA-GGAGC-CGGGGGTGGGGGGCATG-GGGGGGC-AAAC------A-TG-----CCCCCCCCCCCGCAC---TTTCAAA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               T-ACATGG--GCG-TA-GGAGTA------GGGGGGG---G-GGGGGGC-AGAGGC----A-TA--------TCCCCC-----C---TTTCAAAA
gi|2                          :                                             aAAAT--TATCT-C-GA-T---TA--TG-A-AAGGC-AA-AT-CT--TGCT----C-T-C-TC---CT-T-------ACA--C-AG-TTAA-T-TAAACACA----C--A--C-A--TT-CA--AAAT-GTCA--T-C--AATA--C---A-TC-T--AC----C-C---TG-C--TTTCTCTGTC--T---G-T-AA-T--A--T-T-AGGA----A-T---T--A--T-GT--C-G--TG-TT---T-TG--T-AGA-TGT-A-C--AT-C-C--T-GT-GAA-C-A-G--GG--G-----T--T--TC-AG-TTT--CAAT-GTG-CAA--CACG----GAGG-TTT--CAG-C-T-CC---------A---AT----------C----TA----------A--A----CCG---T-TGA-T----T--CCC-TCGTA--T-C-AGC-AG-TG--G--A-ATGG--G-CAC-AAAATC----ACAC-GTAG---AAAAAC-CAA-A-G--T-CTTATGGC---TGTCAAAGC-CC-AAA--T-GAAA-T-TCG-TC-ACGTCGGGGAC-AA--AGTT--G-TAT-CGA--CT-GCATGG--GCG-TA-GGAGAATGGGGGGGGGGGG---G-GGGGGGTAAAACAC----T-TG-----CCCCCCCCC-----C---TTTCAAAAg
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATGG--GCG-TAAGGAGCATGGGGGG----------------------CAC----A-TG-----CCCCCCCCC-----C---
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -GCATGG--GCG-TA-GGAAC-CGGGGGAGGGGGG---ATGGGAGGT-AATTGC-------------CCCCCCCCC-----C---cctcacactttcaaaa
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATGG--GCG-TA-GGAGCA----------------G-GGGGGGC-AAGTGCCCCCA-CC-----CCACCCCCC-----C---TTTCCAAAc
gi|3                          :                                                         -C-GA-T---TAAGTG-ACG-GGC-AA-AG-CTGGTGCT----C-T-C-TCGGCTT-T-------ACAAGC-AG-TTAA-T-TACACA-A----CCAA--C-AT-TT-CA--AAGT-GTCA--TACG-AATA--CATAA-TCGT--AT----CGC--TTG-C--TTTCTC-GTT--T---G-T-AAGT--A--T-TCAGG-----T-G---TCGA--T-GT----G--TG-TT---T-TG--T-AGATTGG-A-C--AG-CGCA-T-GTCGAA-CGA-G--GG--GAGCGTT--T--TC-AG-TTT--C-ATGGTG-CAAGCCACG----G-GG-TTTTACAG-C-TCCCCTATCGTTGA---ATGCAATAGG--C----TA----------C--ATGGTCTGTGAT-TGA-T-AC-T--CCC-TCGTT--T---AGC-AG-TG--G--A-AT-GGTG-CACGAA---T----A-A--ATA----G-----------------C-TATAGCG--GGTCA---CGCC-AAA--A-GTAA-TATC--TC-ACT-----GACGAA--AATT--G-TAC-CGA---T-GCATGG--GCG-TA-AGGATATGGAGGGGGCGGG---G-
gi|4                          :                                               AGT--TATCT-C-GA-T---TA--TG-A-AAGGC-AA-ATATT--TGCT----CGT-C-TC----T-T-------ACA--CTAG-TTAA-TATACACACAT---C--A--C-A--TT-CA--AA-T-GTCA----C--AATA--C---A-TC-T--AC----A-C--TTGGC--TTTCT--GTC--T---G-T-AA-T--A--T-T-AGG-----A-T---T--A--T-GT----G--TGTTT---T-TG--T-AGA-TGT-A-C--AT---CA-T-GT--AA-C-A-GGTGG--G-----TGCT--TCGAG-TTCTAC-AT-GTG-CAA--CAC-----G-GG-TTT--CAG-C-TCTC---------A---AT----------A----TA----------A--A-----CG---T-TGATT-A--T--TCC-TC--T--T-C-AGC--G-TG--G--ACAT-G--G-C-C-AT---C----ACAACGTGC---AAAAAC-C-T-A-G--T-C-TATGGA----GTCAAAGA-CC-AAATCG-A-AA-T-TCG-TC-AC------GAC-AA--AGTTTGA-TA--TGA--CTAGCATGG--G-G-TA-------------AGGATGA---T-GGGGGAT-AAA-------ATTA-----CCCCTCCCT-----T---TTTCAAAtgca
gi|5                          :                                              gcAT--TATCT-C-CG-T---TA--T--A-C-GGC-AA-GA-CT--CGCTGCACC-T-CCTC---CT-TTAATCTAATA--C----CTAT-T-TACCCATATGTTC--A--TTA--TT-CA--AACT-GTCAGCT-C--AAC---C---A-TC-CTCAC----T-CATTTA-CAGTCTCTCTGTT--TAACG-TCGG-T--C--T-T-AAGTGTGAA-T---T--T--TTGT--T-A--TT-TT---T-CG--T-AGA-TG--A-C--AT-A-CA-TAGT-GAA-C-A-C--AG--A-----T--T--TC-G---TT--C-AT-GTG-CAA--CCAG----C-GG-TTT--CAG-C-TCTCTC-------A---ATAGACATCATTC----TA----------CCTA--ATCTG---T-TGA-T-A--T--CCC-TCGTT--T-C-AGCAAG-TG--AC-A-AT-G--G-CA------------AC------------AAAC-C-A-ATG--T-C-TTAGGC---TGTCAAG---CC-AAA--A-G-AA-T-TCGATC--C------GAC-AAGCGGAT--G-TACGCTA--CT-GCATGGGTGCG-TA-Gcaacagtcctacgc
gi|6                          :                                            tgcAAT--TATCT-C-GA-T---TA--TG-A-A-GGCCAA-AT-CT--TGCT----C---C-TC---CT-T-------ACA--C-AGATTAAGT-TACACACA----C--A--C-A--TT-CA--AATT-GTTA--T-C--AATA--C---A-TC-T--AT----C-C--TTG-C--TT--TCTGTT--T---GTT-AA-T--A--T-T-AGG-----A-T---T--A--T-GTA-C-G--TG-TT---T-TGGTT-AG--TGT-A-C--AT-T-CA-T-GT-GAA-C-AGG--GG--G-----T--T--TC-AGTTTT--C-AT-GT--CAA--CACG----G-GG--TT--CAG-C-TCCCATTCTGA--A---AT----------CAATATA----------A--A--TTCTG---T-TGA-T-AT-T--CCC-TCGTT--T-C-AGC-AG-TG--G--A-AT-G--G-CAC-A----------------------AAACC-C-A-A-G--TCC-TATAGCT--TGTCAACGC-CCAAAA--A-G-AATT-TCG-TC-AC------GAC-AA--TGTT--GTTAC-CGA--CT-G-ATGG--GCG-TA-GGAG-ATTGTGAGGGGaga
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                       cG-C--TTTCT--GTC--T---G-T-AAATCAA--T-T-AGG-----A-T---T--A--T-GT--C-G--TG-TT---T--G--TCAGA-TGT-AAC--ATAC-CA-T-GT-GAAAC-A-G--GG--G--------------GG-TTT--C-AT-GTG-CAA--CACG----G-GG-TTT--CAG-C-TCCCC--------A---AT----------C----TA----------A--A----CCG---T-TGA-TCA--C--TCC-TCGTT--TTC-AGC-AG-TG--G--A-AT-G--G-CAC-AA---TC---ACAC-GTA----GAAAAAAC-A-A-G--T-C-TATGGC---TGTCAAAGC-AC-CAA--A-G-AA-T-TCG-TC-AC------GAC-AA--AGTT--G-TGT-CGGACCT-GCATGG--GCG-TA-GGAG-AT-----GGGGGGG---G-GGGGGAT-AAA-------A-T------CCCTCCCCC-----T---TTTCAAAAc
gi|8                          : tcacatatgcttctcgaattgacactctagacgcaggatagtcatccAT--GATCT-C-AA-T---AA--TG-A-A-GTC-AG-TT-CT--TACT----C-T-C-TT---CT-T-------ACA--C-AG-TTAA-T-CATATACA----C--A--T-A--CT-TC--AATC-CTCA--T-C--AATA--C---A-T--T--AA----C-C--TTG-C--TT--TCTGCC--T---G-T-AA-G--A--T-T-AGG-----A-T---T--A--T-ATACC-A--AA-AT---T-AG--T-AAG-TGC-A-C--AT-C-TA-T-GT-GAG-C-A-G--GGA-G-----T--T--TC-AG-TTT--C-AT-ATG-TAA--TACG----A-GG-TTT--CAA-C-TCCC---------A---TT----------C----TAAAATAAACATA--A--TTCTG---T-TAA-T-A--T--TCCATCGTT--T-C-TGT-GG-TA--G--A-AT-G--G-CAC-AA---TG---ACAC-GCA----GAAAAT-C-G-A-G--T-C-TATGGC---CGTCCAAAC-CC-AAA--A-G-A-----TG-TC-AG------GAG-AA--Aacagtcctatgcc
gi|9                          :                                               AAT--AATCT-C-GA-T---TA--TG-G-A-GGC-AA-AT-CT--TGCT----C-T-C-TC---CT-T-------A-A--C-AG-TTAA-T-TATACACA----C--A--C-A--TT-TC--AAAT-GTCA--G-C--AATA--C---A-TC-T--AT----C-C--TTG-C--TT--TCTGTT--T---G-T-AA-T--A--T-T-AGG-----A-T---T--A--T-GT--C-G--TG-TT---T-TG--T-AGA-TGT-A-C--AT-C-CA-T-GT-GAA-C-AGG--GG--G-----T--T--TC-AGTTTT--C-AT-GTG-CAA--CACG----G-GG-TTT--CAG-C-TCCC---------A---TT----------C----TAAAATCAATATA--A--TTCTG---T-TGA-T-A--T--CCC-TCGTT--T-C-AGC-AG-TG--GA-A-AT-G--G-CAC------------------------AAAAC-C-A-A-G--T-C-TATGGC---TGTCAAAGC-CC-AAA--T-G-AA---TCGTTC-AC------GA--AA--AGTT--G-TAC-Ctg
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|23 ): TTACATGGGCGTTAGGAGCCATGGCGGGCACTGCC