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consensus : CATG---GGA-G-------A-CG--A-A-----TTC-TAA-CA--A-CAC-T-T----TT-T--CTCC--------------CC-GTA--A--A----TA-TAA---A-CT-TT-----GTT-TC-A-TATA-CT-CC-T-C-A-T-AA----AA--A---T--T--A--TT--TT---A---AAA-AAT---TA-ACG-----ACGNT---ATTT-AC-C--CT--A-AG-AA-A---T-C-GAA-G-TG---C-AA-A-G-GT---A------CTC-----A-AA-A-TGGA-AA---T--TC-G-----TT---------AC-------------CCG----AT--TATCGT----T---C-C-T-G----A-TTC-CC--CG--A-ATT-TG-TG--A----C-GT--C--AC---A-AGAGAC--CAC-AA-T-CTG-TA---T-A-----G--TG-A---A------T-CA--A--AA-T--A-------------A-----GA---------------CG-------------A---T----TTA-T-C-T--C-G-CAA---TT-T-GA-GGAG-T-TTTTG---G-ATGA-GGG--CC---CGAG--TT-T--AT-T-N----TATGA-----G--GAT-----CTCAC--GG--TGAACCC-A-TAATTA---ATA-------CA--A-CT---------A-C--C--A-----AC-A----T--TTTTCA-TCG--GTG------G-A----CG---AACAAAAA-G----AC-----------TG--TC---AAG-A--TC-CTA-ATT-AA---T-TC--A-TTCCGAACCTG-TG-T-CAAAT-AAT---TCCGACTGGCT
Reference ( gi|11 ) : CATG---GGA-G-------A-CG--A-A-----TTC-TAA-CA--A-CAC-T-T----TT-T--CTCC--------------CC-GTA--A--A----TA-TAA---A-CT-TT-----GTT-GC-A-TATA-CT-CC-T-C-A-T-AA----AA--A---T--T--A--TT--TT---A---AAA-AAT---TA-ACG-----ACGTT---ATTT-AC-C--CT--A-AG-AA-A---T-C-GAA-G-TG---C-AA-A-G-GT---A------CTC-----A-AA-A-TGGA-AA---T--TC-G-----TT---------AC-------------CCG----AT--TATCGT----T---C-C-T-G----A-TTC-TC--CG--A-ATT-TG-TG--A----C-GT--C--AC---A-AGAGAC--CAC-AA-T-CTG-TA---C-A-----G--TG-A---A------T-CA--A--AA-T----------------A-----GA---------------CG-------------A---T----TTA-T-C-T--C-G-CAA---TT-T-GA-GGAG-T-TTTTG---A-ACGA-GGG--CTAAACGGGGACT-T--AT-T-T----T---------G--GATG----TTCAC--CA--TGAACCC-A-TAATTA---ATA-------CA--A-TT---------A-C--C--A-----AC------T--TTTTCA-TTG--GTG------G-A----CG---AAC------G----AC-----------TG--TC---AAG-A--TC-CTA-ATT-AA---T-TC--A-TTCCGAACCTG-TG-T-CAAAT-AAT---TCCGACTGGCT
gi|10 : CATG---GGA-A-------A-CGT-A-A-----TTC-TAA-CA--G-CAC-T-T----TT-T--CTTC--------------CC-GTA--A--A----TA---A---A-CT-TT-----GTT-TC-A-TATA-CT-CC-T-CAA-T-AA----AA--A---T--T--A--TT--TT-------AAA-AAT---TA-ACG-----ACGTT---A-TT-AC-C--CT--A-AG-AA-A---T-C-GAA-G-TG---C-AA-A---GT---A------CTC-----A-AA-A-TGGA-AA---T--TC-G-----TT---------AC-------------CCG----AT--TGTCG-----T---C-C-T-G----A-TTC-TCTTCG--A-ATT-TG-TG--A----C-GT--C--AC---A-AG-GAC--CAC--A-T-CTA-TA---T-A-----G--TG-A---A------T-CA--A--AA-TAAACGCATTGCACA--A-----GA---------------CG-------------A---T----TTA-T---T--C-C-TAA---TT-T-GA-GGAG-T-TTTTG-----ATGAGGGG--CC---CGAG--TT-T--AT-T-TGTA-T---------GAAGAT-----CTCAC--GG--TGAACCC-A-TAATTA---ATA-------CA--A-CT---------A-C--CAAA-----ACTA----T--TTTTCA-TTG--GTG------G-A----CG---AACAAAAA-G----AC-----------TG--TC---AAG-A--TC-CTATAGT-AA---T-TC--A-TTCCGAACCTG-TG-T-CCAAT-AAT---T
gi|9 : CATG---GGAAG-------A-CG--A-A-----TTC-TAA-CA--AACAC-T-T----TT-T--CTCC--------------CCCGTA--A--A----TA-TAA---A-CT-TT-----GTT--C-A-TATA-CT--C-T-C-A-TAAA----AA--A---T--T--A--TT--GTAA-A---AAA-AAT---T--ACG-----ACGTT---ATTT-AC-C--CT--C-AGAAA-A---T-C-GAA-G--G---C-AATT-G-GT---A------CTC-----A-AA-A-TGGA-AA---TG-TC-G-----TT---------A--------------CCG----AT--TAC--T----T---C-C-T-G----A-TTA-TT--TG--A-ATT-TG-AT--A----C-GT-----AC---A-AGAGAC--CAC-AA-TCCTG-TA---T-------G--TG-A---A------T-TC--A--AA-TTAAAACGCATGCACAAA-----GA---------------CG-------------AT--T----TTA-T-C-T--C-GCCAA---TT-T-GA--GAG----TTTG---G-ATGA-GGGGCCC---CGGG--TT-T--AT-T-G----TATGCA----G--GGT-----CTCAC--GG--TGAACCC-A-TAA-TA---ATA-------CA--A-CT---------A-C--C--A-----AA------TA-TTTTCA-TTG--GTG------G-A----CG---AACAAAAAGG----AC-----------TG--TC---AAG----TCACTA-ATC-AA---T-TC--A-TTCCGAACCTG-TG-T-CAAAT-AA----TCCGACT
gi|13 : tCATA---GGA-G-------A-CG--A-A-----TTC-TAT-AA--A-CACAT-T----CT-T--CTCC--------------C---TA--AT-A----TA-AAA---A-CT-TTTTTTTGTT-TC-A-TATA-CT-CC-T-C-A-T-AA----AA--A---T--T--A--TTATTT---A---AAA-A-----TA-ATG-----ACGAT---ATTT-AC-C--CT--A-AG-AA-A---T-C-GAA-G-TG---C-AA-A-G-GT---A------CTC-----A-AA-AATGGA-AA---T--TC-A-----TT---------AC-------------CCG----AT--TATCGT----T---C-C-T-G----A-TTG-CC--CT--A-ATT-TG-TG--A----C-GT--C--AC---A--GAGAC--CAC-AA-T-CTG-TA---T-A-----G--TG-A---A------T-CA--ATAAA-CGCAGCACA--------A-----GA---------------CG-------------A---T----TTA-T-C-T--C-G-CAA---TT-T-GA-GAGG-A-TTTTG---G-ATGA-GGGGCCT------GAGTT-T--GT-T-G----TATGA-----G--GAT-----CTCAC--TG--TGAACCC-A-TAATTA---ATG-------CA--A-CT---------G-C--
gi|6 : CATGTGTGGA-G-------AGCG--A--------TT-TAA-CA--AACAC-T-T----TT-TTTCTCC--------------CC-GTTTTA--G----TGGTTA---A-CT-TT-----GTT-TC-AGTA-A-CTTCC-TGC-A-T-AA----GA------T--T--A--TT--TT---A---ACA-GTT---AA-ACG-----ACGGT---GTT---C-C--CT--A-AG-AA-----T-C-T---G-TG---C-AA-A-C-GT---A------CC--------AA-A-TGGA-AT---TC-TC-G-----TT---------TA-------------CCGCTGTAT--TATCGT----A---G-C-T-G----G-CT--TC--CG--ATGTT-TT-TGG-A----C-TTT-C--AC---CTAAAGAC--CAC-AA-T-CTG-TA---T-------GTTTG-A---ATTGCTCT-CAATA--AA-T----------------GCCATTGG---------------CA-------------AGCTT----TTC-T-C-TGGC-T-CAG---TA-T----GGAG-T-TTTTGCATG-ATGA-GGG--C---GCGG----T-T--ATAT-T----TATAGTATGAG--GATT----CTCAC--GGT-TGAA-CC-A-T-ATTC---ATA-------CAACA-CT---------A-C--T--A----------------TTTTAA-TAT--GTG------GTAT---CGT--AAC------A----ACAAAGAA-----TG--TC---AAG-A--TC-T---ATT--A---T-TC--A-TT-CGAACTGG-T--T-CAA---AAT---TCCGACTGGC
gi|1 : CATG---GGA-GCATAAAAA-CG--A-AAAAAATTC-TAA-CACAA-CAA-TGT----TTAT--CTTCAAACAATTTACATACC-GTA--A--AATATTA-TGATACA-TG-TT-----GTT-TC-A-TATA-CTTCC-T-C-A-A-AAGAAAAA--A---A--T--A--TT--TA---ACACAAC-AATATATA-ACACACGAACGTT---ATCT-AC-C--CTTCA-AG-AATACT-T-CTGAA-G-TGGATG-AA-A-G-GTAACA------CTTATCCAA-AA-A-TGGA-AGTTTT--TC-GAGATATTAG-------ACTTCTTAACATCTGCCG----AT--TATCGT----T---CGC-T-GAGAAA-TCT-TC--CG--A-ATT-TG-TGA-A----C-GT--CAAACACAA-AGAGCT--CTC-AA-T-
gi|18 : ggttCACA---GAA-G-------A-CG--A-T-----GTT-TAA-CA--A-TAC-T-T----T----------------------------------------A-TCA---C-CT-TT-----GTT-TC-A-TAGA-CT-CG-T-C-A-T-CA----AC--A---T-----ACCTT--TT---T---AAG-AAT---TA-ACA-----ACGGT---ATTT-AG-T--CT--A-AG-TA-G---A-A-GAA-A-TG---C-CA-A-G-AA---A------CAC-----A-GA-A-TAGA-AA---C--TCCG-----TT---------AC-------------CCA----CT--TGTCGT----T---G-C-T-G----A-TTC-CT--CG--A-ATT-TT-TG--A----C-GT--C--AT---A-AGAGGC--AAC-TA-C-ATG-TA---acaaagtcgtgtatattgtagaacatacaaaaaataaaccatgcaacaacaggaattgattttcgtcggcaatttgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaggagtgttttggatgaggggcccgagtttattgtatgaggatctcgcggtgaacccataattaatacaactaccaactatttttcattggtggacgaacaaaaagactaagaagatcctaagtaattcattccgaacctg
gi|29 : tCATG---GGA-A-------A-CG--A---------------CA--A-CAC-T-T----TT-T--CTCC--------------CC-GTA--A--A----TA-TAA---A-CT-t
gi|28 : ggtCATG---GGA-G-------A-CG--A-A-----TTC-TAA-CA--A-CAC-T-T----TT-T--NNNN--------------NN-CT---A--A----TA-CAA---
gi|27 : aggcCACA---GGA-A-------A-CG--A-T-----TTT-CAA-CA--A-TA--T-T----TT-T--CTTT--------------CT-ATA--A--T----TA-TCA---A-TT-TA-----GTT-TC-A-TGGA-CT-CC-T-C-A-C-AA----AA--A---TG-C--C--TT--TT---G---AAA-A
gi|15 : ATG---GGA-G-------A-CG--A-A-----TTC-TGA-CA--A--A--T-T----TT-T--CTCC--------------C--GTT--A--A----TA-TAA---A-AT-TT-----GTT-TC-A-TA-A-CT-CCCT-C-AAT-AA----AA--A---T-----A--TT--TA---A---AAA-AAAA--TC-ACG-----ACGTTTC-ATTT-AC-C--CT--A-AG-AA-A---T-C-GAA-G-TG---C-AA-AAG-GT---A------CTC-----A-AA-AATGGA-AAA--T--TC-G-----TT---------AC-------------CCA----AT--TATCGT----T---C-C-CCG----A-TTC-TC--CG--A--TT-TG-TG--A----C-GT--C--AC---A-AGAGAC--CAC-AAAT-CTG-TA---T-A-----G--TG-A---A------T-CA--A--AA-T----------------A-----AA---------------CGCAATCCACAAACGA---T----TTA-T-C-T--C-G-CAA---TT-T-GA-GGAG-T-GTATA---G-ATGA-GGG--t
gi|2 : ATG---GGA-G-------A-CGTGA-A-----TTC-TAA-TAG-A-CACAC-T----TT-T--CTCC--------------CC-GTT--ATGA----TA-TAA---A-CT-T------GTT-TCGA-TATT-AT-CCGT-C-A-T-AA----AA--A---T--TGTA--TTG-TT---A---AAATAAT---TAGACG-----ACGTTTATGTTT-AAGC--CT--A-AG-AA-A---T-C-GAA-G-TG---C-AA-A-G-GT---A------CT------G-AA-A-TGGACAA---TTGTC-G-----TT---------AT-------------CCG----TTGATATCGT----TCTGC-T-T-G----AGTTCGTC--CG--A-ATT-TG-TG--A----C-GTG-C--A----A-AGA-ACAGTAC-AA-T-TGG-TA---T-GAC---G--TG-A---A------T-CA--A--AG-TATAATCGCATGCACA-A-----GA---------------CG-------------T---T----TTACT-CTT--C-GCCAA---TTCT-GA-GGTG---TTTTG---G-ATAA-GGGGCCC---CGAG---T-T--AT-T-TGTTAT---------G--AGGA----ATCTC--CGGTTGAACCC-A-TAATTAAT-ATA-------CA--A-CT---------A-C--T--ATCTTGAC------T--GTTTAA-TTG--ATGACTCGAG-A----TC---AAT------AAAGTAC-----------TG--TC---ACGAA--TG-TCA-GGT--A---T-TCATA-TTCCGAA-CGG-TG-T-CAAATCAAT---T--GACTgccc
gi|8 : tTG---GGA-G-------A-CG--G-------TTC-TAA-CA--A-CAC-T-T----TT-T--C-CT--------------CC-GTT--A--A----TA-TAA---A-CTCTT-----GTT-TC-A-TATAGCT-CC-T-C-T-T-AA----A-------T--T--A--TT--TT---A---AAA---T---TA-ACG-----ACGTT---ATT--AC-C--CT--A-AG-AA-A---T-C-GAA-G-TG---C-AA-A-G-GT---A------CTC-----ACAA-A-TGGA-AA---T--TC-G-----TT---------ACG------------CCG----AT--TATCGT----T---C-C-T-G------CTC-TC--CG--A-ATT-TG-TG--A----C-GT--C--AC---A-AGAG-C--CAC-AA-T-CTG-TAATTA-A-----G--TG-A---A------T-CA--A--AAGT----------------A-----AA---------------CGCAATGCACAAGC-A---T----TTA-TCC-T--C-G-CAA---TT-T--A-GGAGTT-TTTTG---G-ATGA-AGG--CGGTCCGAG--TT-T--AT-T-G----TATGA-----G--GATC----TCAAC--GG--TGAACCC-A-TAATTA---ATA-------CA--A-CT---------A-C--T--------AC------TA-TTTTAA-TTG--ATG------G-A----CG---AACAAAAA-G----AC-----------TG--TC---AAG-A--TC-TTA-ATTCAA---T-TC--A-TTCTGAACCTG-T--T-C-AAT-AAT---T-CGAATGGCTt
gi|7 : cac---GGA-G-------T-AG--A-A-----TTC-TAA-CA--A-CAC-T-T----TT-T--CTCC--------------CC-GTA--A--A----TA-TAA---A-CT-TT-----GTT-TC-A-T-TA-CT-CC-T-C-A-T-AA----AA------T--T--A--TT--TT---A---AAA-AAT---TA-ACG-----ACGTT---ATTT-AC-C--CT--A--G-AA-A---T-C-GAA-GCTG---C-AA-A-TCGT---A------CTC-----A-AA-AATGGA-AA---T--TC-G-----TT---------AC-------------CCG----AT--TATCGT----T---C-C-T-G----A-TTC-TC--CG--A-ATT-TGTTG--A----C-GT--C--AC---A-AGAACC--CAC-AACT-CTG-TA---T-A-----G--TG-A---A------T-CA--A--AA-T----------------A-----AAGCATGCAACAAAGACCG-------------A---T----TTA-T-C-T--C-G-CAA----T-T-GATGGAG-T-TTTTG---G-ATGA-GGG--C----CCGAGTTC-T--AT-T-G----TATGAG----G--GATC----CTCAC--GG--TGAA-TC-A-TAATTA---A-A-------AA--A-CT---------A-C--C--G-----AC------T--TTTTTC-TTGAAGTG------G-A----CGA--AACAATAA-G----AC-----------TGA-TC---AAC-A--TC-CTAGAGT-AA---T-TC--A-TTCCGAACC---TG-T-CAAATAAAT---TCCGACTGGCTg
gi|4 : ---GGA---------A-CG--ATA-----TTC-TAA-CA--A-CAC-T-TATCTTT-T--CTCC--------------CC-ATT--A--A----TA-TAA---AACT-TT-----GTG-TC-A-TATA-CT-CC-TTC-A-T-AA----AA--A---T--T--A--TT--T----A---AAA-AAT---TA-ACG-----ACGTTA--ATTT-A--C--CT--A-AG-AA-A---TAC-GAA-G-TG---C-AA-A-G-GT---A------CTT-----C-AA-C-TGGG-AAAT-T--TC-G-----TT---------AC-------------CCGA---AT--TATTGT----T---C-CTT-G----A-TTC--C--CG--A-ATT-TG-TG--A----CAGT--C--AC---A-AGAGAC--C-C-A----CTG-TA---T-A-----G--TG-A---A------TCCA--A--AA-TCGAACGCTATGCACCAA-----GA---------------CGAT-----------A---T----TTACT-C-T--TGG-CAA---TT-T-GA-GGAG-T-TTTTG---G-ATGA-GGG--C----CCTCGATT-TA-AC-T-C----T---------G--TATGAGGATCCACGGCG--CGAAACC-A-TAATTA---ATA-------CA--A-CT---------A-CCTC--A-----TA------T--ATTTTA-ATG--ATG------G-A----CG---AA------------ACAAAAAGGGAAGTG--TCCA-AAG-A--T--CTA-AT---A---T-TC--A-TCTC-AACCTG-TGCT-CAAAT-AATTTGTCCGAATGGg
gi|26 : at---GAA-G-------A-CG--A-T-----TTC-TAA-CA--A-TAC-C-G----TG-T--CGCC--------------CC--T-----------TA-TCG---G-CT-TT-----GTT-CC-A-CAGA-CT-CC-T-C-A-T-AA----AA--A---A--T--A--TT--TT---T---AAA-A
gi|5 : aaaggtgaaaGA-G-------AACG--A-A-----TTC-TAAACA--A-CAC-T-T----TT-T--CTCC--------------C--GTT--A--A----TA-TAA---A-AC-TT-----GTT-TC---TATATCT-CC-T-C-A-T-AA----AA--AA--T--T--A--TT--TTTAAA---AAA-AAA---TA-ACG-----ACGTT---ATTT-AC-CTCCT--A-AG-AA-A---T-C-GAA-G-TG---CAAA-A-G-GT---A------CTC-------AA-A-TGGA-AA---T--TC-G-----TT---------AC-------------CCG----AT--TATCGT----T---C-C-T-G----A-TTC-TC--CG--A-ATTATG-TGAAA----C-GT--C--AC---A-AGAGAA--CAC-AA-T-CTGTTA---TAA-----G--TGAA---A------T-CA--A--AA-TAAACGCATGCACA---A-----GA---------------CG-------------A---T----TTA-T-C-T--C-G-CAA---TT-T-----GAG-T-TTTTG---G-ATGA-GGG--CC--CCGAG--TT-T--AT-T-G----TATGA-----G--GAT-----CTCAC--GGT-TGAACCCAA-TAATTA---ATA--------A--A-CT---------A-C--C--CT----ACTA----T--TTTTTA-TTG--ATG------G-A----CG---AACAAAAA-G----GC-----------TG--TCCA-AAG-ATTTC-CTA-ATT-AA---T-TCATA-TTCCG-ACCTG-TG-T-CAAAT-AAT---TCCGACTGGCT
gi|23 : -G-------A-CG--A-A-----TTC-TAA-CA--A-CAC-T-T----TT-T--CTCC--------------CT-ATA--A--A----TA-TAA---A-CT--------GTT-TC-A-TATA-CT-CC-C-G-A-T-AA----AA--A---T--T--A--TT--TT---A---AAAAAAT---TA-ACG-----ACGTA---ATTT-AC-C--CA--A-AG-AA-A---T-C-GAA-G-TG---C-AA-A-G-GT---ga
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gi|22 : ggttcatgggagcataaaaacgaaaaaaattctaacacaacaatgtttatcttcaaacaatttacataccgtaaaatattatgatacatgttgtttcatatacttcctcaaaagaaaaaaatatttaacacaacaatatataacacacgaacgttatctacccttcaagaatacttctgaagtggatgaaaggtaacacttatccaaaaatggaagtttttcgagatattagacttcttaacatctgccgattatcgttcgctgagaaatcttccgaatttgtgaacgtcaaacacaaagagctctcaatacaaagtcgtgtatattgtagaacatacaaaaaataaaccatgcaacaacaggaattgattttcgtcggcaatttgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaATC----TTCAC--GG--TAAACAC-AATAATTA---ATA-------CAC-ACTT---------A-C--T--A----------------TTTTCAATTG--ATG------G-A----CG---AACAAAAA-G----AT-----------TG--TC---AAG-A--TC-CTA-ATT-AA---TGTC--A-TTCTGAACCTGCTG-TCCAAAT-AAT---T-CGACTAG
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Reference ( family-4063 ) : CATG---GGA-G-------A-CG--A-A-----TTC-TAA-CA--A-CAC-T-T----TT-T--CTCC--------------CC-GTA--A--A----TA-TAA---A-CT-TT-----GTTT-C-A-TATA-C-T-CC-T-C-A----TAAAA--A-T---T--AT--T--T--T---A---AAA-AA--T---TA-AC-----GACGNT---A-TTT-AC-C--CT--A-AGAA-A---T-C-GAA-G-TG---CAAA-GGT---A------CTC-----A-AA-A-TGGA-AA---T--TC-G-----TT---------AC-------------CCG----A-T--TATCGT----T---C-C-T-G----A-TTC-CC--CG--A-ATT-TG-TG-A----C-GT--C--AC---A-AGAGAC--CAC-A-----A-TC-TGT-AT--A--G--TGA---A----TC-A-A-A--------------A-T---------------AA------------G------------A-CG------------A---T----TT-A-T-C-T--CG-C-AA---TT-TGA-GG-AG-T-TTTTG---G-ATGA-GGG---C---C---C---G-A----G--TT-TA---TT--NT-ATG-A-GG-A-T-CT-C-ACG--G-TGAACCC-A-TAATTA--AT---ACA--ACT---------A-CC--A--A---C---A-----T-T-TTTCA-TCG--GTGG-A----C----G-AACAA-AAA-G---ACTG-TC--AAG-A--TC-CTA-ATT-AA---T-TC--ATTCCGAACCTG-TG-T-CAAAT-AAT---TCCGACTGGCT
gi|1 : CATG---GGA-GCATAAAAA-CG--A-AAAAAATTC-TAA-CACAA-CAA-TGT----TTAT--CTTCAAACAATTTACATACC-GTA--A--AATATTA-TGATACA-TG-TT-----GTTT-C-A-TATA-CTT-CC-T-C-AAAAGAAAAA--A-A---T--AT--T--T--A---ACACAAC-AA--TATATA-ACACACGAACGTT---A-TCT-AC-C--CTTCA-AGAATACT-T-CTGAA-G-TGGATGAAA-GGTAACA------CTTATCCAA-AA-A-TGGA-AGTTTT--TC-GAGATATTAG-------ACTTCTTAACATCTGCCG----A-T--TATCGT----T---CGC-T-GAGAAA-TCT-TC--CG--A-ATT-TG-TGAA----C-GT--CAAACACAA-AGAGCT--CTC-A-----A-T
gi|1 : ggttA-GG-AG-TGTTTTG---G-ATGA-GGGG--C---C---C---G-A----G--TT-TA---TT--GT-ATG-A-GG-A-T-CT-C-GCG--G-TGAACCC-A-TAATTA--AT---ACA--ACT---------A-CC--A--A---CT--A-----T-T-TTTCA-TTG--GTGG-A----C----G-AACAA-AAA-G---ACTA-AG--AAG-A--TC-CTA-AGT-AA---T-TC--ATTCCGAACCTG-acaaagtcgtgtatattgtagaacatacaaaaaataaaccatgcaacaacaggaattgattttcgtcggcaatttgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaggagtgttttggatgaggggcccgagtttattgtatgaggatctcgcggtgaacccataattaatacaactaccaactatttttcattggtggacgaacaaaaagactaagaagatcctaagtaattcattccgaacctg
gi|10 : ggttcatgggagcataaaaacgaaaaaaattctaacacaacaatgtttatcttcaaacaatttacataccgtaaaatattatgatacatgttgtttcatatacttcctcaaaagaaaaaaatatttaacacaacaatatataacacacgaacgttatctacccttcaagaatacttctgaagtggatgaaaggtaacacttatccaaaaatggaagtttttcgagatattagacttcttaacatctgccgattatcgttcgctgagaaatcttccgaatttgtgaacgtcaaacacaaagagctctcaatacaaagtcgtgtatattgtagaacatacaaaaaataaaccatgcaacaacaggaattgattttcgtcggcaatttgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaCATG---GGA-A-------A-CGT-A-A-----TTC-TAA-CA--G-CAC-T-T----TT-T--CTTC--------------CC-GTA--A--A----TA---A---A-CT-TT-----GTTT-C-A-TATA-C-T-CC-T-CAA----TAAAA--A-T---T--AT--T--T--T-------AAA-AA--T---TA-AC-----GACGTT---A--TT-AC-C--CT--A-AGAA-A---T-C-GAA-G-TG---CAAA--GT---A------CTC-----A-AA-A-TGGA-AA---T--TC-G-----TT---------AC-------------CCG----A-T--TGTCG-----T---C-C-T-G----A-TTC-TCTTCG--A-ATT-TG-TG-A----C-GT--C--AC---A-AG-GAC--CAC-------A-TC-TAT-AT--A--G--TGA---A----TC-A-A-A--------------A-TAAACGCATTGCAC--AA------------G------------A-CG------------A---T----TT-A-T---T--CC-T-AA---TT-TGA-GG-AG-T-TTTT----G-ATGAGGGG---C---C---C---G-A----G--TT-TAT--TT--GT-ATG-A-AG-A-T-CT-C-ACG--G-TGAACCC-A-TAATTA--AT---ACA--ACT---------A-CC--A--AAACT---A-----T-T-TTTCA-TTG--GTGG-A----C----G-AACAA-AAA-G---ACTG-TC--AAG-A--TC-CTATAGT-AA---T-TC--ATTCCGAACCTG-TG-T-CCAAT-AAT---T
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gi|12 : --A-A-----TTCATAG-GAG-A-TAC-C-T----TT-T--CTCC--------------CC-GTA--A--A----CA-TTG---A-CT-TTT----GTTT-G-A-TATA-C-T-CC-T-C-A----TAAGA--A-TATTT--TT--T--T--T---A---AA------T---TA-AT-----GGCGAT---A-CAT-AC-C--CT--G-AGAA-A---T-T-GAA-T-TG---CAAA-GGT---A------CTC-----A-AA-A-TCAA-AA---T--TT-G-----TT---------AC-------------CCG----A-T--TATCGCTTAAT---T-C-T-G----A-TTT-GC--CG--A-ATT-TG-TT-A----C-GA--C--AC---A-AGAGAC--CAC-A-----A-TC-TGT-AT--T--G--TGA---A----TC-A-A-T--------------A-TGAAAGCATGCAC---AA------------A------------A-CA------------A---T----TG-A-T-T-T--CG-C-AA---CT-TGG-GG-AG-A-TTTTG---G-ATGAGGGG---C---C---T---G-A----G--TT-CA---AT--GT-ATG-G-GG-A-T-AT-C-AC-----TGAACCC-A-TAATTC--AT---GCT--ACTGCTAGCCACA-CC--A--A---CT--A-----T-T-TTTCA-TCG--GAGG-A----C----
gi|13 : CATA---GGA-G-------A-CG--A-A-----TTC-TAT-AA--A-CACAT-T----CT-T--CTCC--------------C---TA--AT-A----TA-AAA---A-CT-TTTTTTTGTTT-C-A-TATA-C-T-CC-T-C-A----TAAAA--A-T---T--ATTAT--T--T---A---AAA-A-------TA-AT-----GACGAT---A-TTT-AC-C--CT--A-AGAA-A---T-C-GAA-G-TG---CAAA-GGT---A------CTCA----A-AA-A-TGGA-AA---T--TC-A-----TT---------AC-------------CCG----A-T--TATCGT----T---C-C-T-G----A-TTG-CC--CT--A-ATT-TG-TG-A----C-GT--C--AC-----AGAGAC--CAC-A-----A-TC-TGT-AT--A--G--TGA---A----TC-A-ATAAACGCAGC------A-C---------------AA------------G------------A-CG------------A---T----TT-A-T-C-T--CG-C-AA---TT-TGA-GA-GG-A-TTTTG---G-ATGAGGGG---C---C---T---G-A----G--TT-TG---TT--GT-ATG-A-GG-A-T-CT-C-ACT--G-TGAACCC-A-TAATTA--AT---GCA--ACT---------G-C
gi|14 : -T--TTTC--------------CC-GTA--AC-A----T--TGA---T-TT-TT-----GTTTGC-A-TA-A-C-T-CT-----A----TAAGA--A-T------AT--T--T--T---T---TTA-AA--T---TA-AT-----GGCGAT---A-CAT-AC-C--CT--AGAGAA-A---T-T-GAA-T-TG---CAAA-GGT---A------CT------A-AA-A-T-GC-AA---T--TT-G-----TT---------CC-------------TCG----A-T--TATCGCTTAAT---T-C-T-G----A-TT--CG--CG--A-ATT-TG-TT-A----C-GTG-A--AC---A---AGGC--CACTA-----A-TC-TGT-AT--T--G--TGATATA----TG-G-G-A--------------G-C---------------TG------------G------------A-CT------------A---TACGATT-A-----T--TG-C-AA---CT-TG--GG-GG-A-TTGTG---G-A-GA-GGGGTTC---C---T---GTA----G--T-------TT--GT-ACG-A-GG-A-T-AT-C-AC-----TG-ATCC-A-TAATT---ATGCAACA--GCT---------AGCC--A--A---C---AACTATT-T-TTTCA-TCG--GAGG-A----C----G-A
gi|15 : aATG---GGA-G-------A-CG--A-A-----TTC-TGA-CA--A--A--T-T----TT-T--CTCC--------------C--GTT--A--A----TA-TAA---A-AT-TT-----GTTT-C-A-TA-A-C-T-CCCT-C-AA---TAAAA--A-T------AT--T--T--A---A---AAA-AA--AA--TC-AC-----GACGTTTC-A-TTT-AC-C--CT--A-AGAA-A---T-C-GAA-G-TG---CAAAAGGT---A------CTC-----A-AA-AATGGA-AAA--T--TC-G-----TT---------AC-------------CCA----A-T--TATCGT----T---C-C-CCG----A-TTC-TC--CG--A--TT-TG-TG-A----C-GT--C--AC---A-AGAGAC--CAC-A-----AATC-TGT-AT--A--G--TGA---A----TC-A-A-A--------------A-T---------------AA------------ACGCAATCCACAAA-CG------------A---T----TT-A-T-C-T--CG-C-AA---TT-TGA-GG-AG-T-GTATA---G-ATGA-GGG---G---C---C---
gi|16 : --T--T---A---AAT-AA--T----A-AC-----GCCGAT---A-TTT-AC-C--C---A-CGAA-A---T-C-AAA-G-CA---CAGA-GGT---AGGCCTACTC-----G-AA-A-TGGA-TT---T--TT-C-----TTTT-------AC-------------TTG----A-T--TATCGT----T---C-C-T-G----A-TTT-CC--TG--G-ATT-TA-TG-A----C-GTAAT--AT---A-AGAGAC--CAC-A-----A-TC-T----------------------------------------------------------------------------------------------G------------A---T----TT-G-T-T-T--CG-C-AA---AT---G-GG-AG-------A---A-AT-----A---C---C---C---G-T----G--TT-TG---TT--GT-ATG-A-GG-A-T-AT-C-ACT--T-TTAACCC-A-AAATTG--AT---GCA--ATT---------G-AC--A--GC--C---A------------CA-TCA--GCTA-T----C----G-AACAA-c
gi|17 : G-A----C-GC--C--AC---A-AGAGAC--CAC-A-----A-TC-TGT-AT--A--A----A---A----GC-GTG-C--------------A-C---------------AA------------G------------G-CG------------A---T----TT-A-T-C-T--CG-C-AA---CT-T----------------------TGG-GAA---C------------------G--TT-T-------------G-A-GG-A-T-AT-C-ACT--A-TGAACCC-A-TGATTA--AT---GTA--TCTGTCAGGC--A-CC--ACAA---CT--A-----T-T-TTTCA-TCG--GAGG-A----C----A-GTTAA-AAA-G-----TA-TC--AAG-A--TC-CTA-ATT-AA---T-TC--ATTCCGAACTTG-TG-T-CAAAT-GAT---TCTGACTGGCctttaaaaagt
gi|18 : CACA---GAA-G-------A-CG--A-T-----GTT-TAA-CA--A-TAC-T-T----T----------------------------------------A-TCA---C-CT-TT-----GTTT-C-A-TAGA-C-T-CG-T-C-A----TCAAC--A-TA--C--CT--T--T--T---T---AAG-AA--T---TA-AC-----AACGGT---A-TTT-AG-T--CT--A-AGTA-G---A-A-GAA-A-TG---CCAA-GAA---A------CAC-----A-GA-A-TAGA-AA---C--TCCG-----TT---------AC-------------CCA----C-T--TGTCGT----T---G-C-T-G----A-TTC-CT--CG--A-ATT-TT-TG-A----C-GT--C--AT---A-AGAGGC--AAC-T-----A-CA-TGT-AT--
gi|19 : t-T----TT-T--TTCT--------------CC-GTA--A--T----TA-TCA---A-CT-TT-----ATTT-C-A-TAGA-C-T-CG-T-C-A----TGAAA--A-TAG-T--AT--TGTT--T---G---AAA-TA--T----A-AT-----GAGAAT---A-TCT-AT-T--AT--A-AGTA-A---T-C-GAA-G-TG---CGAA-GGT---A------CTT-----A-GA-A-AAAC-AA---A--TC-G-----T-----------C-------------CCG----A-T--TATCGT----T---C-C-C-G----A-CTC-CC--CG--A-ATT-TG-TG-A----C-GT--C--AT---A-
gi|2 : ATG---GGA-G-------A-CGTGA-A-----TTC-TAA-TAG-A-CACAC-T----TT-T--CTCC--------------CC-GTT--ATGA----TA-TAA---A-CT-T------GTTT-CGA-TATT-A-T-CCGT-C-A----TAAAA--A-T---TGTAT--TG-T--T---A---AAATAA--T---TAGAC-----GACGTTTATG-TTT-AAGC--CT--A-AGAA-A---T-C-GAA-G-TG---CAAA-GGT---A------CT------G-AA-A-TGGACAA---TTGTC-G-----TT---------AT-------------CCG----T-TGATATCGT----TCTGC-T-T-G----AGTTCGTC--CG--A-ATT-TG-TG-A----C-GTG-C--A----A-AGA-ACAGTAC-A-----A-TT-GGT-AT--GACG--TGA---A----TC-A-A-AGTATAATCGCATGCA-C---------------AA------------G------------A-CG------------T---T----TT-ACT-CTT--CGCC-AA---TTCTGA-GG-TG---TTTTG---G-ATAA-GGGGC-C---C---C---G-A----G---T-TA---TTTGTT-ATG-A-GGAA-T-CT-C--CG--GTTGAACCC-A-TAATTAATAT---ACA--ACT---------A-CT--A--T---CTTGA-----C-TGTTTAA-TTG--AT-G-A----CTCGAG-ATCAATAAA-GT--ACTG-TC--ACGAA--TG-TCA-GGT--A---T-TCATATTCCGAA-CGG-TG-T-CAAATCAAT---T--GACTttattctgaagatcccatgtctctgt
gi|20 : tT-----GTTT-C-A-TATA-C-T-CT-T-C-A----TAAAA--A-T---T--AT--T--TAGA---A---AAA-AA--T------AT-----GACGAT---A-TTT-GC-C--CA--A-AGAA-A---T-T-GAA-G-CG---CAAA-TGT---A------ATT-----A-AA-A-TGAA-AA---T--TC-G-----TT---------AC-------------CCG----A-T--CATTGT----T---C-C-T-G----A-TTC-CC--CG--A-ATT-TG-TG-A----C-AT--C--AC---A-AGt
gi|21 : T---A-TTT-AC-T--CT--A-AGAA-A---T-C-GAA-G-TG---CAAA-GAT---A------CTCG----A-AA-A-TGGA-CA---T--TC-G-----TA---------AC-------------CCG----A-T--TATCGT----T---C-T-T-G----A-TTC-CC--CA--A-AAT-TG-TG-A----C-GT--C--AC---A-
gi|22 : a-A-T-CTTC-ACG--G-TAAACAC-AATAATTA--AT---ACAC-ACTT--------A-CT--A------------------T-TTTCAATTG--ATGG-A----C----G-AACAA-AAA-G---ATTG-TC--AAG-A--TC-CTA-ATT-AA---TGTC--ATTCTGAACCTGCTG-TCCAAAT-AAT---T-CGACTAGttctgtatataaaggatgcacaaggcgattt
gi|23 : -G-------A-CG--A-A-----TTC-TAA-CA--A-CAC-T-T----TT-T--CTCC--------------CT-ATA--A--A----TA-TAA---A-CT--------GTTT-C-A-TATA-C-T-CC-C-G-A----TAAAA--A-T---T--AT--T--T--T---A---AAAAAA--T---TA-AC-----GACGTA---A-TTT-AC-C--CA--A-AGAA-A---T-C-GAA-G-TG---CAAA-GGT---gttt
gi|24 : T-T--CTCC--------------CC-GTA--A--A----TA-TAA---A-CT-TT-----GTTT-C-A-TTTA-C-T-CC-T-C-A----TATAA--A-T---T--AT--T--T--T---T---AAA-AA-------A-A----------AT---A-TTT-AC-C--CA--A-AGAA-A---T-C-AAA-G-TG---CAAA-GGT---A------CTC-----A-AA-A-
gi|25 : -T-G----A-TTC-CC--CG--A-ATT-TG-TG-A----C-GT--C--AC---A-AGAG------------------------T--T--G--TGA---A----TC-A-A-A--------------A-T---------------AA------------A------------AGCAGGC---------A---C----TT-A-T-C-T--CG-C-AA---CT-TGG-GGGAG-T-TTTTA---G-ATGAGGGG---C---C---T---G-A----G--TT-T
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gi|27 : aaaggtgaaaCACA---GGA-A-------A-CG--A-T-----TTT-CAA-CA--A-TA--T-T----TT-T--CTTT--------------CT-ATA--A--T----TA-TCA---A-TT-TA-----GTTT-C-A-TGGA-C-T-CC-T-C-A----CAAAA--A-TG--C--CT--T--T--T---G---AAA-A
gi|28 : CATG---GGA-G-------A-CG--A-A-----TTC-TAA-CA--A-CAC-T-T----TT-T--NNNN--------------NN-CT---A--A----TA-CAA---t
gi|29 : aggcCATG---GGA-A-------A-CG--A---------------CA--A-CAC-T-T----TT-T--CTCC--------------CC-GTA--A--A----TA-TAA---A-CT-
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gi|5 : atGA-G-------AACG--A-A-----TTC-TAAACA--A-CAC-T-T----TT-T--CTCC--------------C--GTT--A--A----TA-TAA---A-AC-TT-----GTTT-CTA-TAT--C-T-CC-T-C-A----TAAAA--AAT---T--AT--T--T--TTAAA---AAA-AA--A---TA-AC-----GACGTT---A-TTT-AC-CTCCT--A-AGAA-A---T-C-GAA-G-TG---CAAAAGGT---A------CTC-----A-AA---TGGA-AA---T--TC-G-----TT---------AC-------------CCG----A-T--TATCGT----T---C-C-T-G----A-TTC-TC--CG--A-ATTATG-TG-AAA--C-GT--C--AC---A-AGAGAA--CAC-A-----A-TC-TGTTAT--AA-G--TGA---AA---TC-A-A-A--------------A-T---------------AAACGCATGCACAAG------------A-CG------------A---T----TT-A-T-C-T--CG-C-AA---TT-TGA-G-----T-TTTTG---G-ATGA-GGG---C---C---CC--G-A----G--TT-TA---TT--GT-ATG-A-GG-A-T-CT-C-ACG--GTTGAACCCAA-TAATTA--AT---A-A--ACT---------A-CCCTA--C---T---A-----T-T-TTTTA-TTG--ATGG-A----C----G-AACAA-AAA-G---GCTG-TCCAAAG-ATTTC-CTA-ATT-AA---T-TCATATTCCG-ACCTG-TG-T-CAAAT-AAT---TCCGACTGGCT
gi|6 : CATGTGTGGA-G-------AGCG--A--------TT-TAA-CA--AACAC-T-T----TT-TTTCTCC--------------CC-GTTTTA--G----TGGTTA---A-CT-TT-----GTTT-C-AGTA-A-C-TTCC-TGC-A----TAAGA----T---T--AT--T--T--T---A---ACA-GT--T---AA-AC-----GACGGT---G-TT---C-C--CT--A-AGAA-----T-C-T---G-TG---CAAA-CGT---A------CC--------AA-A-TGGA-AT---TC-TC-G-----TT---------TA-------------CCGCTGTA-T--TATCGT----A---G-C-T-G----G-CTT-CC---G--ATGTT-TT-TGGA----C-TTT-C--AC---CTAAAGAC--CAC-A-----A-TC-TGT-AT-----GTTTGA---ATTGCTC-T-C-A--------------A-T---------------AAATGCCATT----G------------G-CA------------AGCTT----TT-C-T-C-TGGCT-C-AG---TA-T---GG-AG-T-TTTTGCATG-ATGA-GGG---C---G---C---G-GTTATA--TT-TA---TA--GT-ATG-A-GG-ATT-CT-C-ACG--GTTGAA-CC-A-T-ATTC--AT---ACAACACT---------A-CT--A------------------T-TTTAA-TAT--GTGGTAT---C----GTAACAACAAA-G---AATG-TC--AAG-A--TC-T---ATT--A---T-TC--ATT-CGAACTGG-T--T-CAA---AAT---TCCGACTGGCga
gi|7 : ---GGA-G-------T-AG--A-A-----TTC-TAA-CA--A-CAC-T-T----TT-T--CTCC--------------CC-GTA--A--A----TA-TAA---A-CT-TT-----GTTT-C-A-T-TA-C-T-CC-T-C-A----T-AAA--A-T---T--AT--T--T--T---A---AAA-AA--T---TA-AC-----GACGTT---A-TTT-AC-C--CT----AGAA-A---T-C-GAA-GCTG---CAAATCGT---A------CTCA----A-AA-A-TGGA-AA---T--TC-G-----TT---------AC-------------CCG----A-T--TATCGT----T---C-C-T-G----A-TTC-TC--CG--A-ATT-TGTTG-A----C-GT--C--AC---A-AGAACC--CAC-A-----ACTC-TGT-AT--A--G--TGA---A----TC-A-A-A--------------A-TAAAGCATGCAACA--AA------------G------------ACCG------------A---T----TT-A-T-C-T--CG-C-AA----T-TGATGG-AG-T-TTTTG---G-ATGA-GGG---C---C---C---G-A----G--TTCTA---TT--GT-ATG-AGGG-A-TCCT-C-ACG--G-TGAA-TC-A-TAATTA--A----AAA--ACT---------A-CC--G--A---C---T-----T-T-TTTC--TTGAAGTGG-A----C----GAAACAA-TAA-G---ACTGATC--AAC-A--TC-CTAGAGT-AA---T-TC--ATTCCGAACC---TG-T-CAAATAAAT---TCCGACTGGCT
gi|8 : TG---GGA-G-------A-CG--G-------TTC-TAA-CA--A-CAC-T-T----TT-T--C-CT--------------CC-GTT--A--A----TA-TAA---A-CTCTT-----GTTT-C-A-TATAGC-T-CC-T-C-T----TAAA-----T---T--AT--T--T--T---A---AAA-----T---TA-AC-----GACGTT---A-TT--AC-C--CT--A-AGAA-A---T-C-GAA-G-TG---CAAA-GGT---A------CTC-----ACAA-A-TGGA-AA---T--TC-G-----TT---------ACG------------CCG----A-T--TATCGT----T---C-C-T-G------CTC-TC--CG--A-ATT-TG-TG-A----C-GT--C--AC---A-AGAG-C--CAC-A-----A-TC-TGTAATTAA--G--TGA---A----TC-A-A-A--------------AGT---------------AA-------------------------A-CGCAATGCACAAGCA---T----TT-A-TCC-T--CG-C-AA---TT-T-A-GG-AGTT-TTTTG---G-ATGA-AGG---CGGTC---C---G-A----G--TT-TA---TT--GT-ATG-A-GG-A-T-CT-CAACG--G-TGAACCC-A-TAATTA--AT---ACA--ACT---------A-CT--A--C---T---A-------T-TTTAA-TTG--ATGG-A----C----G-AACAA-AAA-G---ACTG-TC--AAG-A--TC-TTA-ATTCAA---T-TC--ATTCTGAACCTG-T--T-C-AAT-AAT---T-CGAATGGCTg
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consensus : CATG---GGA-G-------A-CG--A-A-----TTC-TAA-CA--A-CAC-T-T----TT-T--CTCC--------------CC-GTA--A--A----TA-TAA---A-CT-TT-----GTTT-C-A-TATA-C-T-CC-T-C-A----TAAAA--A-T---T--AT--T--T--T---A---AAA-AA--T---TA-AC-----GACGNT---A-TTT-AC-C--CT--A-AGAA-A---T-C-GAA-G-TG---CAAA-GGT---A------CTC-----A-AA-A-TGGA-AA---T--TC-G-----TT---------AC-------------CCG----A-T--TATCGT----T---C-C-T-G----A-TTC-CC--CG--A-ATT-TG-TG-A----C-GT--C--AC---A-AGAGAC--C-----AC-A-----A--TC-TGT-AT--A--G--TGA---A----TC-A-A-A--------------A-T---------------AA------------G------------A-CG------------A---T----TT-A-T-C-T--CG-C-AA---TT-TGA-GG-AG-T-TTTTG---G-ATGA-GGG---C---C---C---G-A----G--TT-TA---TTG-T-ATG-A-GG-A-T-CT-C-ACG--G-TGAACCC-A-TAATTA--AT---ACA--ACT---------A-CC--A--A---C---A-----T-T-TTTCA-TCG--GTGG-A----C----G-AACAA-AAA-G---ACTG-TC--AAG-A--TC-CTA-ATT-AA---T-TC--ATTCCGAACCTG-TG-T-CAAAT-AAT---TCCGACTGGCT
Reference ( family-4063 ) : CATG---GGA-G-------A-CG--A-A-----TTC-TAA-CA--A-CAC-T-T----TT-T--CTCC--------------CC-GTA--A--A----TA-TAA---A-CT-TT-----GTTT-C-A-TATA-C-T-CC-T-C-A----TAAAA--A-T---T--AT--T--T--T---A---AAA-AA--T---TA-AC-----GACGNT---A-TTT-AC-C--CT--A-AGAA-A---T-C-GAA-G-TG---CAAA-GGT---A------CTC-----A-AA-A-TGGA-AA---T--TC-G-----TT---------AC-------------CCG----A-T--TATCGT----T---C-C-T-G----A-TTC-CC--CG--A-ATT-TG-TG-A----C-GT--C--AC---A-AGAGAC--C-----AC-A-----A--TC-TGT-AT--A--G--TGA---A----TC-A-A-A--------------A-T---------------AA------------G------------A-CG------------A---T----TT-A-T-C-T--CG-C-AA---TT-TGA-GG-AG-T-TTTTG---G-ATGA-GGG---C---C---C---G-A----G--TT-TA---TTG-T-ATG-A-GG-A-T-CT-C-ACG--G-TGAACCC-A-TAATTA--AT---ACA--ACT---------A-CC--A--A---C---A-----T-T-TTTCA-TCG--GTGG-A----C----G-AACAA-AAA-G---ACTG-TC--AAG-A--TC-CTA-ATT-AA---T-TC--ATTCCGAACCTG-TG-T-CAAAT-AAT---TCCGACTGGCT
gi|1 : CATG---GGA-GCATAAAAA-CG--A-AAAAAATTC-TAA-CACAA-CAA-TGT----TTAT--CTTCAAACAATTTACATACC-GTA--A--AATATTA-TGATACA-TG-TT-----GTTT-C-A-TATA-CTT-CC-T-C-AAAAGAAAAA--A-A---T--AT--T--T--A---ACACAAC-AA--TATATA-ACACACGAACGTT---A-TCT-AC-C--CTTCA-AGAATACT-T-CTGAA-G-TGGATGAAA-GGTAACA------CTTATCCAA-AA-A-TGGA-AGTTTT--TC-GAGATATTAG-------ACTTCTTAACATCTGCCG----A-T--TATCGT----T---CGC-T-GAGAAA-TCT-TC--CG--A-ATT-TG-TGAA----C-GT--CAAACACAA-AGAGCT--CTCAATAC-A-----AAGTCGTGT-AT--A--T--TG
gi|1 : ggttA-GG-AG-TGTTTTG---G-ATGA-GGGG--C---C---C---G-A----G--TT-TA---TTG-T-ATG-A-GG-A-T-CT-C-GCG--G-TGAACCC-A-TAATTA--AT---ACA--ACT---------A-CC--A--A---CT--A-----T-T-TTTCA-TTG--GTGG-A----C----G-AACAA-AAA-G---ACTA-AG--AAG-A--TC-CTA-AGT-AA---T-TC--ATTCCGAACCTG-tagaacatacaaaaaataaaccatgcaacaacaggaattgattttcgtcggcaatttgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaggagtgttttggatgaggggcccgagtttattgtatgaggatctcgcggtgaacccataattaatacaactaccaactatttttcattggtggacgaacaaaaagactaagaagatcctaagtaattcattccgaacctg
gi|10 : ggttcatgggagcataaaaacgaaaaaaattctaacacaacaatgtttatcttcaaacaatttacataccgtaaaatattatgatacatgttgtttcatatacttcctcaaaagaaaaaaatatttaacacaacaatatataacacacgaacgttatctacccttcaagaatacttctgaagtggatgaaaggtaacacttatccaaaaatggaagtttttcgagatattagacttcttaacatctgccgattatcgttcgctgagaaatcttccgaatttgtgaacgtcaaacacaaagagctctcaatacaaagtcgtgtatattgtagaacatacaaaaaataaaccatgcaacaacaggaattgattttcgtcggcaatttgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaCATG---GGA-A-------A-CGT-A-A-----TTC-TAA-CA--G-CAC-T-T----TT-T--CTTC--------------CC-GTA--A--A----TA---A---A-CT-TT-----GTTT-C-A-TATA-C-T-CC-T-CAA----TAAAA--A-T---T--AT--T--T--T-------AAA-AA--T---TA-AC-----GACGTT---A--TT-AC-C--CT--A-AGAA-A---T-C-GAA-G-TG---CAAA--GT---A------CTC-----A-AA-A-TGGA-AA---T--TC-G-----TT---------AC-------------CCG----A-T--TGTCG-----T---C-C-T-G----A-TTC-TCTTCG--A-ATT-TG-TG-A----C-GT--C--AC---A-AG-GAC--C-----AC-------A--TC-TAT-AT--A--G--TGA---A----TC-A-A-A--------------A-TAAACGCATTGCAC--AA------------G------------A-CG------------A---T----TT-A-T---T--CC-T-AA---TT-TGA-GG-AG-T-TTTT----G-ATGAGGGG---C---C---C---G-A----G--TT-TAT--TTG-T-ATG-A-AG-A-T-CT-C-ACG--G-TGAACCC-A-TAATTA--AT---ACA--ACT---------A-CC--A--AAACT---A-----T-T-TTTCA-TTG--GTGG-A----C----G-AACAA-AAA-G---ACTG-TC--AAG-A--TC-CTATAGT-AA---T-TC--ATTCCGAACCTG-TG-T-CCAAT-AAT---T
gi|11 : CATG---GGA-G-------A-CG--A-A-----TTC-TAA-CA--A-CAC-T-T----TT-T--CTCC--------------CC-GTA--A--A----TA-TAA---A-CT-TT-----GTTG-C-A-TATA-C-T-CC-T-C-A----TAAAA--A-T---T--AT--T--T--T---A---AAA-AA--T---TA-AC-----GACGTT---A-TTT-AC-C--CT--A-AGAA-A---T-C-GAA-G-TG---CAAA-GGT---A------CTC-----A-AA-A-TGGA-AA---T--TC-G-----TT---------AC-------------CCG----A-T--TATCGT----T---C-C-T-G----A-TTC-TC--CG--A-ATT-TG-TG-A----C-GT--C--AC---A-AGAGAC--C-----AC-A-----A--TC-TGT-AC--A--G--TGA---A----TC-A-A-A--------------A-T----------------A------------G------------A-CG------------A---T----TT-A-T-C-T--CG-C-AA---TT-TGA-GG-AG-T-TTTTG---A-ACGA-GGG---C---TAAAC---G-G----GGACT-TA---TTT-T-------GG-A-TGTT-C-ACC--A-TGAACCC-A-TAATTA--AT---ACA--ATT---------A-CC--A--A---C---------T-T-TTTCA-TTG--GTGG-A----C----G-AAC-------G---ACTG-TC--AAG-A--TC-CTA-ATT-AA---T-TC--ATTCCGAACCTG-TG-T-CAAAT-AAT---TCCGACTGGCT
gi|12 : --A-A-----TTCATAG-GAG-A-TAC-C-T----TT-T--CTCC--------------CC-GTA--A--A----CA-TTG---A-CT-TTT----GTTT-G-A-TATA-C-T-CC-T-C-A----TAAGA--A-TATTT--TT--T--T--T---A---AA------T---TA-AT-----GGCGAT---A-CAT-AC-C--CT--G-AGAA-A---T-T-GAA-T-TG---CAAA-GGT---A------CTC-----A-AA-A-TCAA-AA---T--TT-G-----TT---------AC-------------CCG----A-T--TATCGCTTAAT---T-C-T-G----A-TTT-GC--CG--A-ATT-TG-TT-A----C-GA--C--AC---A-AGAGAC--C-----AC-A-----A--TC-TGT-AT--T--G--TGA---A----TC-A-A-T--------------A-TGAAAGCATGCAC---AA------------A------------A-CA------------A---T----TG-A-T-T-T--CG-C-AA---CT-TGG-GG-AG-A-TTTTG---G-ATGAGGGG---C---C---T---G-A----G--TT-CA---ATG-T-ATG-G-GG-A-T-AT-C-AC-----TGAACCC-A-TAATTC--AT---GCT--ACTGCTAGCCACA-CC--A--A---CT--A-----T-T-TTTCA-TCG--GAGG-A----C----
gi|13 : CATA---GGA-G-------A-CG--A-A-----TTC-TAT-AA--A-CACAT-T----CT-T--CTCC--------------C---TA--AT-A----TA-AAA---A-CT-TTTTTTTGTTT-C-A-TATA-C-T-CC-T-C-A----TAAAA--A-T---T--ATTAT--T--T---A---AAA-A-------TA-AT-----GACGAT---A-TTT-AC-C--CT--A-AGAA-A---T-C-GAA-G-TG---CAAA-GGT---A------CTCA----A-AA-A-TGGA-AA---T--TC-A-----TT---------AC-------------CCG----A-T--TATCGT----T---C-C-T-G----A-TTG-CC--CT--A-ATT-TG-TG-A----C-GT--C--AC-----AGAGAC--C-----AC-A-----A--TC-TGT-AT--A--G--TGA---A----TC-A-ATAAACGCAGC------A-C---------------AA------------G------------A-CG------------A---T----TT-A-T-C-T--CG-C-AA---TT-TGA-GA-GG-A-TTTTG---G-ATGAGGGG---C---C---T---G-A----G--TT-TG---TTG-T-ATG-A-GG-A-T-CT-C-ACT--G-TGAACCC-A-TAATTA--AT---GCA--ACT---------G-C
gi|14 : -T--TTTC--------------CC-GTA--AC-A----T--TGA---T-TT-TT-----GTTTGC-A-TA-A-C-T-CT-----A----TAAGA--A-T------AT--T--T--T---T---TTA-AA--T---TA-AT-----GGCGAT---A-CAT-AC-C--CT--AGAGAA-A---T-T-GAA-T-TG---CAAA-GGT---A------CT------A-AA-A-T-GC-AA---T--TT-G-----TT---------CC-------------TCG----A-T--TATCGCTTAAT---T-C-T-G----A-TT--CG--CG--A-ATT-TG-TT-A----C-GTG-A--AC---A---AGGC--C-----ACTA-----A--TC-TGT-AT--T--G--TGATATA----TG-G-G-A--------------G-C---------------TG------------G------------A-CT------------A---TACGATT-A-----T--TG-C-AA---CT-TG--GG-GG-A-TTGTG---G-A-GA-GGGGTTC---C---T---GTA----G--T-------TTG-T-ACG-A-GG-A-T-AT-C-AC-----TG-ATCC-A-TAATT---ATGCAACA--GCT---------AGCC--A--A---C---AACTATT-T-TTTCA-TCG--GAGG-A----C----G-A
gi|15 : aATG---GGA-G-------A-CG--A-A-----TTC-TGA-CA--A--A--T-T----TT-T--CTCC--------------C--GTT--A--A----TA-TAA---A-AT-TT-----GTTT-C-A-TA-A-C-T-CCCT-C-AA---TAAAA--A-T------AT--T--T--A---A---AAA-AA--AA--TC-AC-----GACGTTTC-A-TTT-AC-C--CT--A-AGAA-A---T-C-GAA-G-TG---CAAAAGGT---A------CTC-----A-AA-AATGGA-AAA--T--TC-G-----TT---------AC-------------CCA----A-T--TATCGT----T---C-C-CCG----A-TTC-TC--CG--A--TT-TG-TG-A----C-GT--C--AC---A-AGAGAC--C-----AC-A-----AA-TC-TGT-AT--A--G--TGA---A----TC-A-A-A--------------A-T---------------AA------------ACGCAATCCACAAA-CG------------A---T----TT-A-T-C-T--CG-C-AA---TT-TGA-GG-AG-T-GTATA---G-ATGA-GGG---G---C---C---
gi|16 : --T--T---A---AAT-AA--T----A-AC-----GCCGAT---A-TTT-AC-C--C---A-CGAA-A---T-C-AAA-G-CA---CAGA-GGT---AGGCCTACTC-----G-AA-A-TGGA-TT---T--TT-C-----TTTT-------AC-------------TTG----A-T--TATCGT----T---C-C-T-G----A-TTT-CC--TG--G-ATT-TA-TG-A----C-GTAAT--AT---A-AGAGAC--C-----AC-A-----A--TC-T----------------------------------------------------------------------------------------------G------------A---T----TT-G-T-T-T--CG-C-AA---AT---G-GG-AG-------A---A-AT-----A---C---C---C---G-T----G--TT-TG---TTG-T-ATG-A-GG-A-T-AT-C-ACT--T-TTAACCC-A-AAATTG--AT---GCA--ATT---------G-AC--A--GC--C---A------------CA-TCA--GCTA-T----C----G-AACAA-c
gi|17 : G-A----C-GC--C--AC---A-AGAGAC--C-----AC-A-----A--TC-TGT-AT--A--A----A---A----GC-GTG-C--------------A-C---------------AA------------G------------G-CG------------A---T----TT-A-T-C-T--CG-C-AA---CT-T----------------------TGG-GAA---C------------------G--TT-T------------G-A-GG-A-T-AT-C-ACT--A-TGAACCC-A-TGATTA--AT---GTA--TCTGTCAGGC--A-CC--ACAA---CT--A-----T-T-TTTCA-TCG--GAGG-A----C----A-GTTAA-AAA-G-----TA-TC--AAG-A--TC-CTA-ATT-AA---T-TC--ATTCCGAACTTG-TG-T-CAAAT-GAT---TCTGACTGGCctttaaaaagt
gi|18 : CACA---GAA-G-------A-CG--A-T-----GTT-TAA-CA--A-TAC-T-T----T----------------------------------------A-TCA---C-CT-TT-----GTTT-C-A-TAGA-C-T-CG-T-C-A----TCAAC--A-TA--C--CT--T--T--T---T---AAG-AA--T---TA-AC-----AACGGT---A-TTT-AG-T--CT--A-AGTA-G---A-A-GAA-A-TG---CCAA-GAA---A------CAC-----A-GA-A-TAGA-AA---C--TCCG-----TT---------AC-------------CCA----C-T--TGTCGT----T---G-C-T-G----A-TTC-CT--CG--A-ATT-TT-TG-A----C-GT--C--AT---A-AGAGGC--A-----AC-T-----A--CA-TGT-AT--
gi|19 : t-T----TT-T--TTCT--------------CC-GTA--A--T----TA-TCA---A-CT-TT-----ATTT-C-A-TAGA-C-T-CG-T-C-A----TGAAA--A-TAG-T--AT--TGTT--T---G---AAA-TA--T----A-AT-----GAGAAT---A-TCT-AT-T--AT--A-AGTA-A---T-C-GAA-G-TG---CGAA-GGT---A------CTT-----A-GA-A-AAAC-AA---A--TC-G-----T-----------C-------------CCG----A-T--TATCGT----T---C-C-C-G----A-CTC-CC--CG--A-ATT-TG-TG-A----C-GT--C--AT---A-
gi|2 : ATG---GGA-G-------A-CGTGA-A-----TTC-TAA-TAG-A-CACAC-T----TT-T--CTCC--------------CC-GTT--ATGA----TA-TAA---A-CT-T------GTTT-CGA-TATT-A-T-CCGT-C-A----TAAAA--A-T---TGTAT--TG-T--T---A---AAATAA--T---TAGAC-----GACGTTTATG-TTT-AAGC--CT--A-AGAA-A---T-C-GAA-G-TG---CAAA-GGT---A------CT------G-AA-A-TGGACAA---TTGTC-G-----TT---------AT-------------CCG----T-TGATATCGT----TCTGC-T-T-G----AGTTCGTC--CG--A-ATT-TG-TG-A----C-GTG-C--A----A-AGA-ACAGT-----AC-A-----A--TT-GGT-AT--GACG--TGA---A----TC-A-A-AGTATAATCGCATGCA-C---------------AA------------G------------A-CG------------T---T----TT-ACT-CTT--CGCC-AA---TTCTGA-GG-TG---TTTTG---G-ATAA-GGGGC-C---C---C---G-A----G--TT-AT---TTGTT-ATG-A-GGAA-T-CT-C--CG--GTTGAACCC-A-TAATTAATAT---ACA--ACT---------A-CT--A--T---CTTGA-----C-TGTTTAA-TTG--AT-G-A----CTCGAG-ATCAATAAA-GT--ACTG-TC--ACGAA--TG-TCA-GGT--A---T-TCATATTCCGAA-CGG-TG-T-CAAATCAAT---T--GACTttattctgaagatcccatgtctctgt
gi|20 : tT-----GTTT-C-A-TATA-C-T-CT-T-C-A----TAAAA--A-T---T--AT--T--TAGA---A---AAA-AA--T------AT-----GACGAT---A-TTT-GC-C--CA--A-AGAA-A---T-T-GAA-G-CG---CAAA-TGT---A------ATT-----A-AA-A-TGAA-AA---T--TC-G-----TT---------AC-------------CCG----A-T--CATTGT----T---C-C-T-G----A-TTC-CC--CG--A-ATT-TG-TG-A----C-AT--C--AC---A-AGt
gi|21 : T---A-TTT-AC-T--CT--A-AGAA-A---T-C-GAA-G-TG---CAAA-GAT---A------CTCG----A-AA-A-TGGA-CA---T--TC-G-----TA---------AC-------------CCG----A-T--TATCGT----T---C-T-T-G----A-TTC-CC--CA--A-AAT-TG-TG-A----C-GT--C--AC---A-
gi|22 : a-A-T-CTTC-ACG--G-TAAACAC-AATAATTA--AT---ACAC-ACTT--------A-CT--A------------------T-TTTCAATTG--ATGG-A----C----G-AACAA-AAA-G---ATTG-TC--AAG-A--TC-CTA-ATT-AA---TGTC--ATTCTGAACCTGCTG-TCCAAAT-AAT---T-CGACTAGttctgtatataaaggatgcacaaggcgattt
gi|23 : -G-------A-CG--A-A-----TTC-TAA-CA--A-CAC-T-T----TT-T--CTCC--------------CT-ATA--A--A----TA-TAA---A-CT--------GTTT-C-A-TATA-C-T-CC-C-G-A----TAAAA--A-T---T--AT--T--T--T---A---AAAAAA--T---TA-AC-----GACGTA---A-TTT-AC-C--CA--A-AGAA-A---T-C-GAA-G-TG---CAAA-GGT---gttt
gi|24 : T-T--CTCC--------------CC-GTA--A--A----TA-TAA---A-CT-TT-----GTTT-C-A-TTTA-C-T-CC-T-C-A----TATAA--A-T---T--AT--T--T--T---T---AAA-AA-------A-A----------AT---A-TTT-AC-C--CA--A-AGAA-A---T-C-AAA-G-TG---CAAA-GGT---A------CTC-----A-AA-A-
gi|25 : -T-G----A-TTC-CC--CG--A-ATT-TG-TG-A----C-GT--C--AC---A-AGAG------------------------------T--T--G--TGA---A----TC-A-A-A--------------A-T---------------AA------------A------------AGCAGGC---------A---C----TT-A-T-C-T--CG-C-AA---CT-TGG-GGGAG-T-TTTTA---G-ATGAGGGG---C---C---T---G-A----G--TT-T
gi|26 : ---GAA-G-------A-CG--A-T-----TTC-TAA-CA--A-TAC-C-G----TG-T--CGCC--------------CC--T-----------TA-TCG---G-CT-TT-----GTTC-C-A-CAGA-C-T-CC-T-C-A----TAAAA--A-A---T--AT--T--T--T---T---AAA-A
gi|27 : aaaggtgaaaCACA---GGA-A-------A-CG--A-T-----TTT-CAA-CA--A-TA--T-T----TT-T--CTTT--------------CT-ATA--A--T----TA-TCA---A-TT-TA-----GTTT-C-A-TGGA-C-T-CC-T-C-A----CAAAA--A-TG--C--CT--T--T--T---G---AAA-A
gi|28 : CATG---GGA-G-------A-CG--A-A-----TTC-TAA-CA--A-CAC-T-T----TT-T--NNNN--------------NN-CT---A--A----TA-CAA---t
gi|29 : aggcCATG---GGA-A-------A-CG--A---------------CA--A-CAC-T-T----TT-T--CTCC--------------CC-GTA--A--A----TA-TAA---A-CT-
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gi|7 : ---GGA-G-------T-AG--A-A-----TTC-TAA-CA--A-CAC-T-T----TT-T--CTCC--------------CC-GTA--A--A----TA-TAA---A-CT-TT-----GTTT-C-A-T-TA-C-T-CC-T-C-A----T-AAA--A-T---T--AT--T--T--T---A---AAA-AA--T---TA-AC-----GACGTT---A-TTT-AC-C--CT----AGAA-A---T-C-GAA-GCTG---CAAATCGT---A------CTCA----A-AA-A-TGGA-AA---T--TC-G-----TT---------AC-------------CCG----A-T--TATCGT----T---C-C-T-G----A-TTC-TC--CG--A-ATT-TGTTG-A----C-GT--C--AC---A-AGAACC--C-----AC-A-----AC-TC-TGT-AT--A--G--TGA---A----TC-A-A-A--------------A-TAAAGCATGCAACA--AA------------G------------ACCG------------A---T----TT-A-T-C-T--CG-C-AA----T-TGATGG-AG-T-TTTTG---G-ATGA-GGG---C---C---C---G-A----G--TTCTA---TTG-T-ATG-AGGG-A-TCCT-C-ACG--G-TGAA-TC-A-TAATTA--A----AAA--ACT---------A-CC--G--A---C---T-----T-T-TTTC--TTGAAGTGG-A----C----GAAACAA-TAA-G---ACTGATC--AAC-A--TC-CTAGAGT-AA---T-TC--ATTCCGAACC---TG-T-CAAATAAAT---TCCGACTGGCT
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gi|9 : cacCATG---GGAAG-------A-CG--A-A-----TTC-TAA-CA--AACAC-T-T----TT-T--CTCC--------------CCCGTA--A--A----TA-TAA---A-CT-TT-----GTT--C-A-TATA-C-T-C--T-C-A----TAAAA--AAT---T--AT--T--G--T---A---AAA-AAAAT---TA--C-----GACGTT---A-TTT-AC-C--CT--C-AGAA-AA--T-C-GAA-G--G---CAATTGGT---A------CTC-----A-AA-A-TGGA-AA---TG-TC-G-----TT---------AC-------------C-G----A-T--TAC--T----T---C-C-T-G----A-TTA-TT--TG--A-ATT-TG-AT-A----C-GT-----AC---A-AGAGAC--C-----AC-A-----A--TCCTGT-AT-----G--TGA---A----TT-C-A-A--------------A-TTAAAACGCATGCACAAA------------G------------A-CG------------A---T----TTTA-T-C-T--CG-CCAA---TT-TGA-G--AG-T-TT--G---G-ATGA-GGGGC-C---C---C---G-G----G--TT-TA---TTG-T-ATGCA-GG-G-T-CT-C-ACG--G-TGAACCC-A-TAAT-A--AT---ACA--ACT---------A-CC--A--A-------A-----TAT-TTTCA-TTG--GTGG-A----C----G-AACAA-AAAGG---ACTG-TC--AAG----TCACTA-ATC-AA---T-TC--ATTCCGAACCTG-TG-T-CAAAT-AA----TCCGACTg
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Reference ( family-4063 ) : CATG---GGA-G-------A-CG--A-A-----TTC-TAA-CA--A-CAC-T-T----TT-T--CTCC--------------CC-GTA--A--A----TA-TAA---A-CT-TT-----GTTT-C-A-TATA-C-T-CC-T-C-A----TAAAA--A-T---T--AT--T--T--T---A---AAA-AA--T---TA-AC-----GACGNT---A-TTT-AC-C--CT--A-AGAA-A---T-C-GAA-G-TG---CAAA-GGT---A------CTC-----A-AA-A-TGGA-AA---T--TC-G-----TT---------AC-------------CCG----A-T--TATCGT----T---C-C-T-G----A-TTC-CC--CG--A-ATT-TG-TG-A----C-GT--C--AC---A-AGAGAC--C-----AC-A-----A--TC-TGT-AT--A--G--TGA---A----TC-A-A-A--------------A-T---------------AA------------G------------A-CG------------A---T----TT-A-T-C-T--CG-C-AA---TT-TGA-GG-AG-T-TTTTG---G-ATGA-GGG---C---C---C---G-A----G--TT-TA---TTG-T-ATG-A-GG-A-T-CT-C-ACG--G-TGAACCC-A-TAATTA--AT---ACA--ACT---------A-CC--A--A---C---A-----T-T-TTTCA-TCG--GTGG-A----C----G-AACAA-AAA-G---ACTG-TC--AAG-A--TC-CTA-ATT-AA---T-TC--ATTCCGAACCTG-TG-T-CAAAT-AAT---TCCGACTGGCT
gi|1 : CATG---GGA-GCATAAAAA-CG--A-AAAAAATTC-TAA-CACAA-CAA-TGT----TTAT--CTTCAAACAATTTACATACC-GTA--A--AATATTA-TGATACA-TG-TT-----GTTT-C-A-TATA-CTT-CC-T-C-AAAAGAAAAA--A-A---T--AT--T--T--A---ACACAAC-AA--TATATA-ACACACGAACGTT---A-TCT-AC-C--CTTCA-AGAATACT-T-CTGAA-G-TGGATGAAA-GGTAACA------CTTATCCAA-AA-A-TGGA-AGTTTT--TC-GAGATATTAG-------ACTTCTTAACATCTGCCG----A-T--TATCGT----T---CGC-T-GAGAAA-TCT-TC--CG--A-ATT-TG-TGAA----C-GT--CAAACACAA-AGAGCT--CTCAATAC-A-----AAGTCGTGT-AT--A--T--TG
gi|1 : ggttA-GG-AG-TGTTTTG---G-ATGA-GGGG--C---C---C---G-A----G--TT-TA---TTG-T-ATG-A-GG-A-T-CT-C-GCG--G-TGAACCC-A-TAATTA--AT---ACA--ACT---------A-CC--A--A---CT--A-----T-T-TTTCA-TTG--GTGG-A----C----G-AACAA-AAA-G---ACTA-AG--AAG-A--TC-CTA-AGT-AA---T-TC--ATTCCGAACCTG-tagaacatacaaaaaataaaccatgcaacaacaggaattgattttcgtcggcaatttgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaggagtgttttggatgaggggcccgagtttattgtatgaggatctcgcggtgaacccataattaatacaactaccaactatttttcattggtggacgaacaaaaagactaagaagatcctaagtaattcattccgaacctg
gi|10 : ggttcatgggagcataaaaacgaaaaaaattctaacacaacaatgtttatcttcaaacaatttacataccgtaaaatattatgatacatgttgtttcatatacttcctcaaaagaaaaaaatatttaacacaacaatatataacacacgaacgttatctacccttcaagaatacttctgaagtggatgaaaggtaacacttatccaaaaatggaagtttttcgagatattagacttcttaacatctgccgattatcgttcgctgagaaatcttccgaatttgtgaacgtcaaacacaaagagctctcaatacaaagtcgtgtatattgtagaacatacaaaaaataaaccatgcaacaacaggaattgattttcgtcggcaatttgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaCATG---GGA-A-------A-CGT-A-A-----TTC-TAA-CA--G-CAC-T-T----TT-T--CTTC--------------CC-GTA--A--A----TA---A---A-CT-TT-----GTTT-C-A-TATA-C-T-CC-T-CAA----TAAAA--A-T---T--AT--T--T--T-------AAA-AA--T---TA-AC-----GACGTT---A--TT-AC-C--CT--A-AGAA-A---T-C-GAA-G-TG---CAAA--GT---A------CTC-----A-AA-A-TGGA-AA---T--TC-G-----TT---------AC-------------CCG----A-T--TGTCG-----T---C-C-T-G----A-TTC-TCTTCG--A-ATT-TG-TG-A----C-GT--C--AC---A-AG-GAC--C-----AC-------A--TC-TAT-AT--A--G--TGA---A----TC-A-A-A--------------A-TAAACGCATTGCAC--AA------------G------------A-CG------------A---T----TT-A-T---T--CC-T-AA---TT-TGA-GG-AG-T-TTTT----G-ATGAGGGG---C---C---C---G-A----G--TT-TAT--TTG-T-ATG-A-AG-A-T-CT-C-ACG--G-TGAACCC-A-TAATTA--AT---ACA--ACT---------A-CC--A--AAACT---A-----T-T-TTTCA-TTG--GTGG-A----C----G-AACAA-AAA-G---ACTG-TC--AAG-A--TC-CTATAGT-AA---T-TC--ATTCCGAACCTG-TG-T-CCAAT-AAT---T
gi|11 : CATG---GGA-G-------A-CG--A-A-----TTC-TAA-CA--A-CAC-T-T----TT-T--CTCC--------------CC-GTA--A--A----TA-TAA---A-CT-TT-----GTTG-C-A-TATA-C-T-CC-T-C-A----TAAAA--A-T---T--AT--T--T--T---A---AAA-AA--T---TA-AC-----GACGTT---A-TTT-AC-C--CT--A-AGAA-A---T-C-GAA-G-TG---CAAA-GGT---A------CTC-----A-AA-A-TGGA-AA---T--TC-G-----TT---------AC-------------CCG----A-T--TATCGT----T---C-C-T-G----A-TTC-TC--CG--A-ATT-TG-TG-A----C-GT--C--AC---A-AGAGAC--C-----AC-A-----A--TC-TGT-AC--A--G--TGA---A----TC-A-A-A--------------A-T----------------A------------G------------A-CG------------A---T----TT-A-T-C-T--CG-C-AA---TT-TGA-GG-AG-T-TTTTG---A-ACGA-GGG---C---TAAAC---G-G----GGACT-TA---TTT-T-------GG-A-TGTT-C-ACC--A-TGAACCC-A-TAATTA--AT---ACA--ATT---------A-CC--A--A---C---------T-T-TTTCA-TTG--GTGG-A----C----G-AAC-------G---ACTG-TC--AAG-A--TC-CTA-ATT-AA---T-TC--ATTCCGAACCTG-TG-T-CAAAT-AAT---TCCGACTGGCT
gi|12 : --A-A-----TTCATAG-GAG-A-TAC-C-T----TT-T--CTCC--------------CC-GTA--A--A----CA-TTG---A-CT-TTT----GTTT-G-A-TATA-C-T-CC-T-C-A----TAAGA--A-TATTT--TT--T--T--T---A---AA------T---TA-AT-----GGCGAT---A-CAT-AC-C--CT--G-AGAA-A---T-T-GAA-T-TG---CAAA-GGT---A------CTC-----A-AA-A-TCAA-AA---T--TT-G-----TT---------AC-------------CCG----A-T--TATCGCTTAAT---T-C-T-G----A-TTT-GC--CG--A-ATT-TG-TT-A----C-GA--C--AC---A-AGAGAC--C-----AC-A-----A--TC-TGT-AT--T--G--TGA---A----TC-A-A-T--------------A-TGAAAGCATGCAC---AA------------A------------A-CA------------A---T----TG-A-T-T-T--CG-C-AA---CT-TGG-GG-AG-A-TTTTG---G-ATGAGGGG---C---C---T---G-A----G--TT-CA---ATG-T-ATG-G-GG-A-T-AT-C-AC-----TGAACCC-A-TAATTC--AT---GCT--ACTGCTAGCCACA-CC--A--A---CT--A-----T-T-TTTCA-TCG--GAGG-A----C----
gi|13 : CATA---GGA-G-------A-CG--A-A-----TTC-TAT-AA--A-CACAT-T----CT-T--CTCC--------------C---TA--AT-A----TA-AAA---A-CT-TTTTTTTGTTT-C-A-TATA-C-T-CC-T-C-A----TAAAA--A-T---T--ATTAT--T--T---A---AAA-A-------TA-AT-----GACGAT---A-TTT-AC-C--CT--A-AGAA-A---T-C-GAA-G-TG---CAAA-GGT---A------CTCA----A-AA-A-TGGA-AA---T--TC-A-----TT---------AC-------------CCG----A-T--TATCGT----T---C-C-T-G----A-TTG-CC--CT--A-ATT-TG-TG-A----C-GT--C--AC-----AGAGAC--C-----AC-A-----A--TC-TGT-AT--A--G--TGA---A----TC-A-ATAAACGCAGC------A-C---------------AA------------G------------A-CG------------A---T----TT-A-T-C-T--CG-C-AA---TT-TGA-GA-GG-A-TTTTG---G-ATGAGGGG---C---C---T---G-A----G--TT-TG---TTG-T-ATG-A-GG-A-T-CT-C-ACT--G-TGAACCC-A-TAATTA--AT---GCA--ACT---------G-C
gi|14 : -T--TTTC--------------CC-GTA--AC-A----T--TGA---T-TT-TT-----GTTTGC-A-TA-A-C-T-CT-----A----TAAGA--A-T------AT--T--T--T---T---TTA-AA--T---TA-AT-----GGCGAT---A-CAT-AC-C--CT--AGAGAA-A---T-T-GAA-T-TG---CAAA-GGT---A------CT------A-AA-A-T-GC-AA---T--TT-G-----TT---------CC-------------TCG----A-T--TATCGCTTAAT---T-C-T-G----A-TT--CG--CG--A-ATT-TG-TT-A----C-GTG-A--AC---A---AGGC--C-----ACTA-----A--TC-TGT-AT--T--G--TGATATA----TG-G-G-A--------------G-C---------------TG------------G------------A-CT------------A---TACGATT-A-----T--TG-C-AA---CT-TG--GG-GG-A-TTGTG---G-A-GA-GGGGTTC---C---T---GTA----G--T-------TTG-T-ACG-A-GG-A-T-AT-C-AC-----TG-ATCC-A-TAATT---ATGCAACA--GCT---------AGCC--A--A---C---AACTATT-T-TTTCA-TCG--GAGG-A----C----G-A
gi|15 : aATG---GGA-G-------A-CG--A-A-----TTC-TGA-CA--A--A--T-T----TT-T--CTCC--------------C--GTT--A--A----TA-TAA---A-AT-TT-----GTTT-C-A-TA-A-C-T-CCCT-C-AA---TAAAA--A-T------AT--T--T--A---A---AAA-AA--AA--TC-AC-----GACGTTTC-A-TTT-AC-C--CT--A-AGAA-A---T-C-GAA-G-TG---CAAAAGGT---A------CTC-----A-AA-AATGGA-AAA--T--TC-G-----TT---------AC-------------CCA----A-T--TATCGT----T---C-C-CCG----A-TTC-TC--CG--A--TT-TG-TG-A----C-GT--C--AC---A-AGAGAC--C-----AC-A-----AA-TC-TGT-AT--A--G--TGA---A----TC-A-A-A--------------A-T---------------AA------------ACGCAATCCACAAA-CG------------A---T----TT-A-T-C-T--CG-C-AA---TT-TGA-GG-AG-T-GTATA---G-ATGA-GGG---G---C---C---
gi|16 : --T--T---A---AAT-AA--T----A-AC-----GCCGAT---A-TTT-AC-C--C---A-CGAA-A---T-C-AAA-G-CA---CAGA-GGT---AGGCCTACTC-----G-AA-A-TGGA-TT---T--TT-C-----TTTT-------AC-------------TTG----A-T--TATCGT----T---C-C-T-G----A-TTT-CC--TG--G-ATT-TA-TG-A----C-GTAAT--AT---A-AGAGAC--C-----AC-A-----A--TC-T----------------------------------------------------------------------------------------------G------------A---T----TT-G-T-T-T--CG-C-AA---AT---G-GG-AG-------A---A-AT-----A---C---C---C---G-T----G--TT-TG---TTG-T-ATG-A-GG-A-T-AT-C-ACT--T-TTAACCC-A-AAATTG--AT---GCA--ATT---------G-AC--A--GC--C---A------------CA-TCA--GCTA-T----C----G-AACAA-c
gi|17 : G-A----C-GC--C--AC---A-AGAGAC--C-----AC-A-----A--TC-TGT-AT--A--A----A---A----GC-GTG-C--------------A-C---------------AA------------G------------G-CG------------A---T----TT-A-T-C-T--CG-C-AA---CT-T----------------------TGG-GAA---C------------------G--TT-T------------G-A-GG-A-T-AT-C-ACT--A-TGAACCC-A-TGATTA--AT---GTA--TCTGTCAGGC--A-CC--ACAA---CT--A-----T-T-TTTCA-TCG--GAGG-A----C----A-GTTAA-AAA-G-----TA-TC--AAG-A--TC-CTA-ATT-AA---T-TC--ATTCCGAACTTG-TG-T-CAAAT-GAT---TCTGACTGGCctttaaaaagt
gi|18 : CACA---GAA-G-------A-CG--A-T-----GTT-TAA-CA--A-TAC-T-T----T----------------------------------------A-TCA---C-CT-TT-----GTTT-C-A-TAGA-C-T-CG-T-C-A----TCAAC--A-TA--C--CT--T--T--T---T---AAG-AA--T---TA-AC-----AACGGT---A-TTT-AG-T--CT--A-AGTA-G---A-A-GAA-A-TG---CCAA-GAA---A------CAC-----A-GA-A-TAGA-AA---C--TCCG-----TT---------AC-------------CCA----C-T--TGTCGT----T---G-C-T-G----A-TTC-CT--CG--A-ATT-TT-TG-A----C-GT--C--AT---A-AGAGGC--A-----AC-T-----A--CA-TGT-AT--
gi|19 : t-T----TT-T--TTCT--------------CC-GTA--A--T----TA-TCA---A-CT-TT-----ATTT-C-A-TAGA-C-T-CG-T-C-A----TGAAA--A-TAG-T--AT--TGTT--T---G---AAA-TA--T----A-AT-----GAGAAT---A-TCT-AT-T--AT--A-AGTA-A---T-C-GAA-G-TG---CGAA-GGT---A------CTT-----A-GA-A-AAAC-AA---A--TC-G-----T-----------C-------------CCG----A-T--TATCGT----T---C-C-C-G----A-CTC-CC--CG--A-ATT-TG-TG-A----C-GT--C--AT---A-
gi|2 : ATG---GGA-G-------A-CGTGA-A-----TTC-TAA-TAG-A-CACAC-T----TT-T--CTCC--------------CC-GTT--ATGA----TA-TAA---A-CT-T------GTTT-CGA-TATT-A-T-CCGT-C-A----TAAAA--A-T---TGTAT--TG-T--T---A---AAATAA--T---TAGAC-----GACGTTTATG-TTT-AAGC--CT--A-AGAA-A---T-C-GAA-G-TG---CAAA-GGT---A------CT------G-AA-A-TGGACAA---TTGTC-G-----TT---------AT-------------CCG----T-TGATATCGT----TCTGC-T-T-G----AGTTCGTC--CG--A-ATT-TG-TG-A----C-GTG-C--A----A-AGA-ACAGT-----AC-A-----A--TT-GGT-AT--GACG--TGA---A----TC-A-A-AGTATAATCGCATGCA-C---------------AA------------G------------A-CG------------T---T----TT-ACT-CTT--CGCC-AA---TTCTGA-GG-TG---TTTTG---G-ATAA-GGGGC-C---C---C---G-A----G--TT-AT---TTGTT-ATG-A-GGAA-T-CT-C--CG--GTTGAACCC-A-TAATTAATAT---ACA--ACT---------A-CT--A--T---CTTGA-----C-TGTTTAA-TTG--AT-G-A----CTCGAG-ATCAATAAA-GT--ACTG-TC--ACGAA--TG-TCA-GGT--A---T-TCATATTCCGAA-CGG-TG-T-CAAATCAAT---T--GACTttattctgaagatcccatgtctctgt
gi|20 : tT-----GTTT-C-A-TATA-C-T-CT-T-C-A----TAAAA--A-T---T--AT--T--TAGA---A---AAA-AA--T------AT-----GACGAT---A-TTT-GC-C--CA--A-AGAA-A---T-T-GAA-G-CG---CAAA-TGT---A------ATT-----A-AA-A-TGAA-AA---T--TC-G-----TT---------AC-------------CCG----A-T--CATTGT----T---C-C-T-G----A-TTC-CC--CG--A-ATT-TG-TG-A----C-AT--C--AC---A-AGt
gi|21 : T---A-TTT-AC-T--CT--A-AGAA-A---T-C-GAA-G-TG---CAAA-GAT---A------CTCG----A-AA-A-TGGA-CA---T--TC-G-----TA---------AC-------------CCG----A-T--TATCGT----T---C-T-T-G----A-TTC-CC--CA--A-AAT-TG-TG-A----C-GT--C--AC---A-
gi|22 : a-A-T-CTTC-ACG--G-TAAACAC-AATAATTA--AT---ACAC-ACTT--------A-CT--A------------------T-TTTCAATTG--ATGG-A----C----G-AACAA-AAA-G---ATTG-TC--AAG-A--TC-CTA-ATT-AA---TGTC--ATTCTGAACCTGCTG-TCCAAAT-AAT---T-CGACTAGttctgtatataaaggatgcacaaggcgattt
gi|23 : -G-------A-CG--A-A-----TTC-TAA-CA--A-CAC-T-T----TT-T--CTCC--------------CT-ATA--A--A----TA-TAA---A-CT--------GTTT-C-A-TATA-C-T-CC-C-G-A----TAAAA--A-T---T--AT--T--T--T---A---AAAAAA--T---TA-AC-----GACGTA---A-TTT-AC-C--CA--A-AGAA-A---T-C-GAA-G-TG---CAAA-GGT---gttt
gi|24 : T-T--CTCC--------------CC-GTA--A--A----TA-TAA---A-CT-TT-----GTTT-C-A-TTTA-C-T-CC-T-C-A----TATAA--A-T---T--AT--T--T--T---T---AAA-AA-------A-A----------AT---A-TTT-AC-C--CA--A-AGAA-A---T-C-AAA-G-TG---CAAA-GGT---A------CTC-----A-AA-A-
gi|25 : -T-G----A-TTC-CC--CG--A-ATT-TG-TG-A----C-GT--C--AC---A-AGAG------------------------------T--T--G--TGA---A----TC-A-A-A--------------A-T---------------AA------------A------------AGCAGGC---------A---C----TT-A-T-C-T--CG-C-AA---CT-TGG-GGGAG-T-TTTTA---G-ATGAGGGG---C---C---T---G-A----G--TT-T
gi|26 : ---GAA-G-------A-CG--A-T-----TTC-TAA-CA--A-TAC-C-G----TG-T--CGCC--------------CC--T-----------TA-TCG---G-CT-TT-----GTTC-C-A-CAGA-C-T-CC-T-C-A----TAAAA--A-A---T--AT--T--T--T---T---AAA-A
gi|27 : aaaggtgaaaCACA---GGA-A-------A-CG--A-T-----TTT-CAA-CA--A-TA--T-T----TT-T--CTTT--------------CT-ATA--A--T----TA-TCA---A-TT-TA-----GTTT-C-A-TGGA-C-T-CC-T-C-A----CAAAA--A-TG--C--CT--T--T--T---G---AAA-A
gi|28 : CATG---GGA-G-------A-CG--A-A-----TTC-TAA-CA--A-CAC-T-T----TT-T--NNNN--------------NN-CT---A--A----TA-CAA---t
gi|29 : aggcCATG---GGA-A-------A-CG--A---------------CA--A-CAC-T-T----TT-T--CTCC--------------CC-GTA--A--A----TA-TAA---A-CT-
gi|3 : ggt--A----TA-TAG---A-----T-----GTGC-A-A-TTTG-C-T-CC-T-C-A----TAAAACCA-T---T--AT--T--T--A---A---AAA-AA-------A-AT-----GACGAT---A-TTTTAC-C--C---A-AGAA-AAAGG-C-GGATA-TGT--CCAA-GGT---A------CTC-----A-AATA-TTGG-AA---T--TCCG-----TTTTATCGAAGACA------------CCGTAT-A-TA-TATCGT----T---C-CCT-G----A-TTC-CC--TGTAA-GTT-TG-CG-GGACGC-GT--C--ACCA-A-AGAGAC--G-----AC-AGAAACA--T-------T--G--G--CGA---------C-A-A-A----------------------------------------------G------------A-CA------------AA--T----TT-A-TTC-T--CG-C-AACCCTA-TGA-GG-AG-T-ATTTG---CCATGA-GGG---G---G---CATTG-A-------TT-TG---TTG-TTATG-A-GG-A-TTCT-C-ACT--G-TGAGGCC---TAATTA--AT---GCA--A-T---------G-CT--G--AGC-T---A-----T-T-TTTCA-TCG--ATGG-CGCGCC----G-AACAA-AAG-A---ATCG-GA--AAG-A--TC-CTA-ATT-AAGTGT-TCA-ACTCCGAACCTG-TG-C-CAAA
gi|4 : tgtgaggagcactgaatcatctaaagcactcaattagatattgatatacaacactt---GGA---------A-CG--ATA-----TTC-TAA-CA--A-CAC-T-TATCTTT-T--CTCC--------------CC-ATT--A--A----TA-TAA---AACT-TT-----GTGT-C-A-TATA-C-T-CC-TTC-A----TAAAA--A-T---T--AT--T--T------A---AAA-AA--T---TA-AC-----GACGTT---AATTT-AC-C---T--A-AGAA-A---TAC-GAA-G-TG---CAAA-GGT---A------CTT-----C-AA-C-TGGG-AAAT-T--TC-G-----TT---------AC-------------CCG----AAT--TATTGT----T---C-C-TTG----A-TTC-CC---G--A-ATT-TG-TG-A----CAGT--C--AC---A-AGAGAC--C------C-A---------C-TGT-AT--A--G--TGA---A----TCCA-A-A--------------A-TCGAACGCTATGCACCAA------------G------------A-CG------------A---TAT--TT-ACT-C-T--TGGC-AA---TT-TGA-GG-AG-T-TTTTG---G-ATGA-GGG---C---CCT-C---G-A-------TT-TAACTCTG-T-ATG-A-GG-A-T-C--C-ACGGCG-CGAAACC-A-TAATTA--AT---ACA--ACT---------A-CCT-C--A---T---A-----T-A-TTTTA-ATG--ATGG-A----C----GAAACAA-AAA-GGGAAGTG-TCCAAAG-A--T--CTA-AT---A---T-TC--ATCTC-AACCTG-TGCT-CAAAT-AATTTGTCCGAATGGctgccactcggctga
gi|5 : atGA-G-------AACG--A-A-----TTC-TAAACA--A-CAC-T-T----TT-T--CTCC--------------C--GTT--A--A----TA-TAA---A-AC-TT-----GTTT-CTA-TAT--C-T-CC-T-C-A----TAAAA--AAT---T--AT--T--T--TTAAA---AAA-AA--A---TA-AC-----GACGTT---A-TTT-AC-CTCCT--A-AGAA-A---T-C-GAA-G-TG---CAAAAGGT---A------CTC-----A-AA---TGGA-AA---T--TC-G-----TT---------AC-------------CCG----A-T--TATCGT----T---C-C-T-G----A-TTC-TC--CG--A-ATTATG-TG-AAA--C-GT--C--AC---A-AGAGAA--C-----AC-A-----A--TC-TGTTAT--AA-G--TGA---AA---TC-A-A-A--------------A-T---------------AAACGCATGCACAAG------------A-CG------------A---T----TT-A-T-C-T--CG-C-AA---TT-TGA-G-----T-TTTTG---G-ATGA-GGG---C---C---CC--G-A----G--TT-TA---TTG-T-ATG-A-GG-A-T-CT-C-ACG--GTTGAACCCAA-TAATTA--AT---A-A--ACT---------A-CCCTA--C---T---A-----T-T-TTTTA-TTG--ATGG-A----C----G-AACAA-AAA-G---GCTG-TCCAAAG-ATTTC-CTA-ATT-AA---T-TCATATTCCG-ACCTG-TG-T-CAAAT-AAT---TCCGACTGGCT
gi|6 : CATGTGTGGA-G-------AGCG--A--------TT-TAA-CA--AACAC-T-T----TT-TTTCTCC--------------CC-GTTTTA--G----TGGTTA---A-CT-TT-----GTTT-C-AGTA-A-C-TTCC-TGC-A----TAAGA----T---T--AT--T--T--T---A---ACA-GT--T---AA-AC-----GACGGT---G-TT---C-C--CT--A-AGAA-----T-C-T---G-TG---CAAA-CGT---A------CC--------AA-A-TGGA-AT---TC-TC-G-----TT---------TA-------------CCGCTGTA-T--TATCGT----A---G-C-T-G----G-CTT-CC---G--ATGTT-TT-TGGA----C-TTT-C--AC---CTAAAGAC--C-----AC-A-----A--TC-TGT-AT-----GTTTGA---ATTGCTC-T-C-A--------------A-T---------------AAATGCCATT----G------------G-CA------------AGCTT----TT-C-T-C-TGGCT-C-AG---TA-T---GG-AG-T-TTTTGCATG-ATGA-GGG---C---G---C---G-GTTATA--TT-TA---TAG-T-ATG-A-GG-ATT-CT-C-ACG--GTTGAA-CC-A-T-ATTC--AT---ACAACACT---------A-CT--A------------------T-TTTAA-TAT--GTGGTAT---C----GTAACAACAAA-G---AATG-TC--AAG-A--TC-T---ATT--A---T-TC--ATT-CGAACTGG-T--T-CAA---AAT---TCCGACTGGCga
gi|7 : ---GGA-G-------T-AG--A-A-----TTC-TAA-CA--A-CAC-T-T----TT-T--CTCC--------------CC-GTA--A--A----TA-TAA---A-CT-TT-----GTTT-C-A-T-TA-C-T-CC-T-C-A----T-AAA--A-T---T--AT--T--T--T---A---AAA-AA--T---TA-AC-----GACGTT---A-TTT-AC-C--CT----AGAA-A---T-C-GAA-GCTG---CAAATCGT---A------CTCA----A-AA-A-TGGA-AA---T--TC-G-----TT---------AC-------------CCG----A-T--TATCGT----T---C-C-T-G----A-TTC-TC--CG--A-ATT-TGTTG-A----C-GT--C--AC---A-AGAACC--C-----AC-A-----AC-TC-TGT-AT--A--G--TGA---A----TC-A-A-A--------------A-TAAAGCATGCAACA--AA------------G------------ACCG------------A---T----TT-A-T-C-T--CG-C-AA----T-TGATGG-AG-T-TTTTG---G-ATGA-GGG---C---C---C---G-A----G--TTCTA---TTG-T-ATG-AGGG-A-TCCT-C-ACG--G-TGAA-TC-A-TAATTA--A----AAA--ACT---------A-CC--G--A---C---T-----T-T-TTTC--TTGAAGTGG-A----C----GAAACAA-TAA-G---ACTGATC--AAC-A--TC-CTAGAGT-AA---T-TC--ATTCCGAACC---TG-T-CAAATAAAT---TCCGACTGGCT
gi|8 : TG---GGA-G-------A-CG--G-------TTC-TAA-CA--A-CAC-T-T----TT-T--C-CT--------------CC-GTT--A--A----TA-TAA---A-CTCTT-----GTTT-C-A-TATAGC-T-CC-T-C-T----TAAA-----T---T--AT--T--T--T---A---AAA-----T---TA-AC-----GACGTT---A-TT--AC-C--CT--A-AGAA-A---T-C-GAA-G-TG---CAAA-GGT---A------CTC-----ACAA-A-TGGA-AA---T--TC-G-----TT---------ACG------------CCG----A-T--TATCGT----T---C-C-T-G------CTC-TC--CG--A-ATT-TG-TG-A----C-GT--C--AC---A-AGAG-C--C-----AC-A-----A--TC-TGTAATTAA--G--TGA---A----TC-A-A-A--------------AGT---------------AA-------------------------A-CGCAATGCACAAGCA---T----TT-A-TCC-T--CG-C-AA---TT-T-A-GG-AGTT-TTTTG---G-ATGA-AGG---CGGTC---C---G-A----G--TT-TA---TTG-T-ATG-A-GG-A-T-CT-CAACG--G-TGAACCC-A-TAATTA--AT---ACA--ACT---------A-CT--A--C---T---A-------T-TTTAA-TTG--ATGG-A----C----G-AACAA-AAA-G---ACTG-TC--AAG-A--TC-TTA-ATTCAA---T-TC--ATTCTGAACCTG-T--T-C-AAT-AAT---T-CGAATGGCTg
gi|9 : cacCATG---GGAAG-------A-CG--A-A-----TTC-TAA-CA--AACAC-T-T----TT-T--CTCC--------------CCCGTA--A--A----TA-TAA---A-CT-TT-----GTT--C-A-TATA-C-T-C--T-C-A----TAAAA--AAT---T--AT--T--G--T---A---AAA-AAAAT---TA--C-----GACGTT---A-TTT-AC-C--CT--C-AGAA-AA--T-C-GAA-G--G---CAATTGGT---A------CTC-----A-AA-A-TGGA-AA---TG-TC-G-----TT---------AC-------------C-G----A-T--TAC--T----T---C-C-T-G----A-TTA-TT--TG--A-ATT-TG-AT-A----C-GT-----AC---A-AGAGAC--C-----AC-A-----A--TCCTGT-AT-----G--TGA---A----TT-C-A-A--------------A-TTAAAACGCATGCACAAA------------G------------A-CG------------A---T----TTTA-T-C-T--CG-CCAA---TT-TGA-G--AG-T-TT--G---G-ATGA-GGGGC-C---C---C---G-G----G--TT-TA---TTG-T-ATGCA-GG-G-T-CT-C-ACG--G-TGAACCC-A-TAAT-A--AT---ACA--ACT---------A-CC--A--A-------A-----TAT-TTTCA-TTG--GTGG-A----C----G-AACAA-AAAGG---ACTG-TC--AAG----TCACTA-ATC-AA---T-TC--ATTCCGAACCTG-TG-T-CAAAT-AA----TCCGACTg
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blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . TA . TT . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . AC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . A . . . . . . ATGAAAGCATGCACAAAACA . . . . . . . . . . . . . A . . . GCCCC . G . . . . . . . . . . . GG . . . . . ACTATCTTGAC . . C . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . C
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . TT . TT . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . AC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . T . . . . . . ATAAACGCAATCCACAAACG . . . . . . . . . . . . . A . . . CCCTC . G . . . . . . . . . . . CA . . . . . GCTGAGCTAT . . C . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . C
blockSeqs : . . . . . T . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . AA . TT . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . AC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . A . . . . . . ATAAACGCATGCACAAGACG . . . . . . . . . . . . . T . . . GCCCC . G . . . . . . . . . . . TG . . . . . ACCCTACTAT . . T . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . TA . TT . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . CC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . T . . . . . . AGTAAACGCAATGCACAAGC . . . . . . . . . . . . . T . . . CCCC . G . . . . . . . . . . . TT . . . . . ACCTCATAT . . T . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . TT . TT . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . AC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . A . . . . . . AACGCAGCACAAGACG . . . . . . . . . . . . . T . . . CCC . G . . . . . . . . . . . TA . . . . . GACAGCCA . . C . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . TG . TT . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . AC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . A . . . . . . ATAAATGCCATTGGCA . . . . . . . . . . . . . T . . . CCT . G . . . . . . . . . . . GG . . . . . ACCGACTT . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . TA . AT . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . T . . . . . . ATAAAAGCAGGC . . . . . . . . . . . . . T . . . CCT . G . . . . . . . . . . . TG . . . . . ACCAAATA . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . TA . TA . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . AC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . G . . . . . . GCTGGACT . . . . . . . . . . . . . T . . . GCC . G . . . . . . . . . . . GG . . . . . ACCAACT . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . TT . TT . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . AC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . A . . . . . . ACAAGGCG . . . . . . . . . . . . . T . . . CCC . G . . . . . . . . . . . GG . . . . . ACTACTA . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . TT . TT . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . AC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . A . . . . . . ATAGACG . . . . . . . . . . . . . T . . . CCT . G . . . . . . . . . . . GG . . . . . TACTA . . T . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . TG . T . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . AC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . GACA . . . . . . . . . . . . . . . . . CGC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ACTA . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . AA . T . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . CCC . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . TA . T . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . AC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . TA . T . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TA . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TA . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A .
blockSeqCons : ******* A****** ** ************** **** *** **** TA******** TT***** ***** ** *** *** *** C***** *** ***** AC********************** **** ** *** ***** A******* T** CCC************ ACCANACTAT************************
originalCons : CATG---GGA-G-------A-CG--A-A-----TTC-TAA-CA--A-CAC-T-T----TT-T--CTCC--------------CC-GTA--A--A----TA-TAA---A-CT-TT-----GTTT-C-A-TATA-C-T-CC-T-C-A----TAAAA--A-T---T--AT--T--T--T---A---AAA-AA--T---TA-AC-----GACGNT---A-TTT-AC-C--CT--A-AGAA-A---T-C-GAA-G-TG---CAAA-GGT---A------CTC-----A-AA-A-TGGA-AA---T--TC-G-----TT---------AC-------------CCG----A-T--TATCGT----T---C-C-T-G----A-TTC-CC--CG--A-ATT-TG-TG-A----C-GT--C--AC---A-AGAGAC--C-----AC-A-----A--TC-TGT-AT--A--G--TGA---A----TC-A-A-A--------------A-T---------------AA------------G------------A-CG------------A---T----TT-A-T-C-T--CG-C-AA---TT-TGA-GG-AG-T-TTTTG---G-ATGA-GGG---C---C---C---G-A----G--TT-TA---TTG-T-ATG-A-GG-A-T-CT-C-ACG--G-TGAACCC-A-TAATTA--AT---ACA--ACT---------A-CC--A--A---C---A-----T-T-TTTCA-TCG--GTGG-A----C----G-AACAA-AAA-G---ACTG-TC--AAG-A--TC-CTA-ATT-AA---T-TC--ATTCCGAACCTG-TG-T-CAAAT-AAT---TCCGACTGGCT
finalCons : CATG---GGA-G-------A-CG--AA------TTC-TAA-CA--A-CAC-T-T----TT-T--CTCC--------------CC-GTA--A--A----TA-TAA---A-CT-TT-----GTTT-C-A-TATA-C-T-CC-T-C-A----TAAAA--A-T---T--AT--T--TTA--------AAA-AATT-----A-AC-----GACGNT---A-TTT-AC-C--CT--A-AGAA-A---T-C-GAA-G-TG---CAAA-GGT---A------CTC-----A-AA-A-TGGA-AA---T--TC-G-----TTAC----------------------CCG----A-T--TATCGT----T---C-C-T-G----A-TTC-CC--CG--A-ATT-TG-TG-A----C-GT--C--AC---A-AGAGAC--C-----AC-AA-------TC-TGT-AT--A--G--TGA---A----TC-A-A-A--------------A-T---------------AA------------G------------A-CG------------A---T----TT-A-T-C-T--CG-C-AA---TT-TGA-GG-AGT--TTTTG---G-ATGA-GGGCCC------------G-A----G--TT-TA---TTG-T-ATG-A-GG-A-T-CT-C-ACG--G-TGAACCC-A-TAATTA--AT---ACA--ACTACCANACTAT------------------------T-TTTCA-TCG--GTGG-A----C----G-AACAA-AAA-G---ACTG-TC--AAG-A--TC-CTA-ATT-AA---T-TC--ATTCCGAACCTG-TG-T-CAAAT-AAT---TCCGACTGGCT
Alignments
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lowQualScore : 1111111 11111111111111 111111 111111111111111111111111 11111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111 33333333333333333333 111 11
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lowQualScore : ... . ....... . .. ....... . . .. . . . .... . .. .............. . ... .. .... . ... . . ..... . . . . . . . . . . .... .. . ... .. .. .. .......... . ....... . ..... . ... . . . .. .. . . ... . . . . ... . ... ...... ...... . . . . ... .. . ..... ........................ .... . .. .... ... . . . .... . . .. .. . . . . .... . .. .. ... . . .. ..... . ........ . . ..... .. ... .... . . . ........................................................................... ... .... . . . . .. . . ... . . . . ... ... . . ............... . ....... . ... . . . . . . . . . ..... . . .. ... . .................... . .. . .. . .... .... . . ... . .. . .. . . .. ... . .. . . . . ... .
lowQualScore : 444 2 2222222 4 00 2222222 1 1 11 2 2 0 2222 8 55 77777777777777 8 111 99 7777 7 000 8 8 44444 8 6 8 0 8 8 8 6 6 8 7777 55 6 333 55 55 11 1111111111 5 7777777 9 88888 0 777 8 8 8 55 55 8 8 555 8 8 8 8 000 3 222 555555 777777 9 9 9 0 222 88 0 00000 222222222222222222222222 8888 0 88 5555 555 0 9 8 0000 9 9 66 66 9 9 9 6 4444 8 00 55 777 8 3 99 33333 1 22222222 2 2 00000 11 111 4444 4 4 4 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 555 2222 4 7 7 4 22 7 4 111 4 3 2 2 666 999 2 9 333333333333333 4 1111111 4 999 5 5 5 5 4 4 1 4 4 55555 4 7 22 111 4 99999999999999999999 5 88 6 44 5 8888 3333 0 7 555 1 55 1 22 1 2 55 444 1 55 1 3 3 3 444 0
consensus : CATG---GGA-G-------A-CG--A-A-----TTC-TAA-CA--A-CAC-T-T----TT-T--CTCC--------------CC-GTA--A--A----TA-TAA---A-CT-TT-----GTTT-C-A-TATA-C-T-CC-T-C-A----TAAAA--A-T---T--AT--T--T--T---A---AAA-AA--T---TA-AC-----GACGNT---A-TTT-AC-C--CT--A-AGAA-A---T-C-GAA-G-TG---CAAA-GGT---A------CTC-----A-AA-A-TGGA-AA---T--TC-G-----TT---------AC-------------CCG----A-T--TATCGT----T---C-C-T-G----A-TTC-CC--CG--A-ATT-TG-TG-A----C-GT--C--AC---A-AGAGAC--C-----AC-A-----A--TC-TGT-AT--A--G--TGA---A----TC-A-A-A--------------A-T---------------AA------------G------------A-CG------------A---T----TT-A-T-C-T--CG-C-AA---TT-TGA-GG-AG-T-TTTTG---G-ATGA-GGG---C---C---C---G-A----G--TT-TA---TTG-T-ATG-A-GG-A-T-CT-C-ACG--G-T-GAACCCA-TAATTA--AT---ACA-ACT---------A-CC-A----NA-CTA-TTTTTCATCG--GTGG-A----C----G-AACAA-AAAG---ACTG-TC--AAG-A--TC-CTA-ATT-AA---T-TC--ATTCCGAACCTG-TG-T-CAAAT-AAT---TCCGACTGGCT
Reference ( family-4063 ) : CATG---GGA-G-------A-CG--A-A-----TTC-TAA-CA--A-CAC-T-T----TT-T--CTCC--------------CC-GTA--A--A----TA-TAA---A-CT-TT-----GTTT-C-A-TATA-C-T-CC-T-C-A----TAAAA--A-T---T--AT--T--T--T---A---AAA-AA--T---TA-AC-----GACGNT---A-TTT-AC-C--CT--A-AGAA-A---T-C-GAA-G-TG---CAAA-GGT---A------CTC-----A-AA-A-TGGA-AA---T--TC-G-----TT---------AC-------------CCG----A-T--TATCGT----T---C-C-T-G----A-TTC-CC--CG--A-ATT-TG-TG-A----C-GT--C--AC---A-AGAGAC--C-----AC-A-----A--TC-TGT-AT--A--G--TGA---A----TC-A-A-A--------------A-T---------------AA------------G------------A-CG------------A---T----TT-A-T-C-T--CG-C-AA---TT-TGA-GG-AG-T-TTTTG---G-ATGA-GGG---C---C---C---G-A----G--TT-TA---TTG-T-ATG-A-GG-A-T-CT-C-ACG--G-T-GAACCCA-TAATTA--AT---ACA-ACT---------A-CC-A----NA-CTA-TTTTTCATCG--GTGG-A----C----G-AACAA-AAAG---ACTG-TC--AAG-A--TC-CTA-ATT-AA---T-TC--ATTCCGAACCTG-TG-T-CAAAT-AAT---TCCGACTGGCT
gi|1 : CATG---GGA-GCATAAAAA-CG--A-AAAAAATTC-TAA-CACAA-CAA-TGT----TTAT--CTTCAAACAATTTACATACC-GTA--A--AATATTA-TGATACA-TG-TT-----GTTT-C-A-TATA-CTT-CC-T-C-AAAAGAAAAA--A-A---T--AT--T--T--A---ACACAAC-AA--TATATA-ACACACGAACGTT---A-TCT-AC-C--CTTCA-AGAATACT-T-CTGAA-G-TGGATGAAA-GGTAACA------CTTATCCAA-AA-A-TGGA-AGTTTT--TC-GAGATATTAG-------ACTTCTTAACATCTGCCG----A-T--TATCGT----T---CGC-T-GAGAAA-TCT-TC--CG--A-ATT-TG-TGAA----C-GT--CAAACACAA-AGAGCT--CTCAATAC-A-----AAGTCGTGT-AT--A--T--TG
gi|1 : ggttA-GG-AG-TGTTTTG---G-ATGA-GGGG--C---C---C---G-A----G--TT-TA---TTG-T-ATG-A-GG-A-T-CT-C-GCG--G-T-GAACCCA-TAATTA--AT---ACA-ACT---------A-CC-A-----A-CTA-TTTTTCATTG--GTGG-A----C----G-AACAA-AAAG---ACTA-AG--AAG-A--TC-CTA-AGT-AA---T-TC--ATTCCGAACCTG-tagaacatacaaaaaataaaccatgcaacaacaggaattgattttcgtcggcaatttgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaggagtgttttggatgaggggcccgagtttattgtatgaggatctcgcggtgaacccataattaatacaactaccaactatttttcattggtggacgaacaaaaagactaagaagatcctaagtaattcattccgaacctg
gi|10 : ggttcatgggagcataaaaacgaaaaaaattctaacacaacaatgtttatcttcaaacaatttacataccgtaaaatattatgatacatgttgtttcatatacttcctcaaaagaaaaaaatatttaacacaacaatatataacacacgaacgttatctacccttcaagaatacttctgaagtggatgaaaggtaacacttatccaaaaatggaagtttttcgagatattagacttcttaacatctgccgattatcgttcgctgagaaatcttccgaatttgtgaacgtcaaacacaaagagctctcaatacaaagtcgtgtatattgtagaacatacaaaaaataaaccatgcaacaacaggaattgattttcgtcggcaatttgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaCATG---GGA-A-------A-CGT-A-A-----TTC-TAA-CA--G-CAC-T-T----TT-T--CTTC--------------CC-GTA--A--A----TA---A---A-CT-TT-----GTTT-C-A-TATA-C-T-CC-T-CAA----TAAAA--A-T---T--AT--T--T--T-------AAA-AA--T---TA-AC-----GACGTT---A--TT-AC-C--CT--A-AGAA-A---T-C-GAA-G-TG---CAAA--GT---A------CTC-----A-AA-A-TGGA-AA---T--TC-G-----TT---------AC-------------CCG----A-T--TGTCG-----T---C-C-T-G----A-TTC-TCTTCG--A-ATT-TG-TG-A----C-GT--C--AC---A-AG-GAC--C-----AC-------A--TC-TAT-AT--A--G--TGA---A----TC-A-A-A--------------A-TAAACGCATTGCAC--AA------------G------------A-CG------------A---T----TT-A-T---T--CC-T-AA---TT-TGA-GG-AG-T-TTTT----G-ATGAGGGG---C---C---C---G-A----G--TT-TAT--TTG-T-ATG-A-AG-A-T-CT-C-ACG--G-T-GAACCCA-TAATTA--AT---ACA-ACT---------A-CCAA----AA-CTA-TTTTTCATTG--GTGG-A----C----G-AACAA-AAAG---ACTG-TC--AAG-A--TC-CTATAGT-AA---T-TC--ATTCCGAACCTG-TG-T-CCAAT-AAT---T
gi|11 : CATG---GGA-G-------A-CG--A-A-----TTC-TAA-CA--A-CAC-T-T----TT-T--CTCC--------------CC-GTA--A--A----TA-TAA---A-CT-TT-----GTTG-C-A-TATA-C-T-CC-T-C-A----TAAAA--A-T---T--AT--T--T--T---A---AAA-AA--T---TA-AC-----GACGTT---A-TTT-AC-C--CT--A-AGAA-A---T-C-GAA-G-TG---CAAA-GGT---A------CTC-----A-AA-A-TGGA-AA---T--TC-G-----TT---------AC-------------CCG----A-T--TATCGT----T---C-C-T-G----A-TTC-TC--CG--A-ATT-TG-TG-A----C-GT--C--AC---A-AGAGAC--C-----AC-A-----A--TC-TGT-AC--A--G--TGA---A----TC-A-A-A--------------A-T----------------A------------G------------A-CG------------A---T----TT-A-T-C-T--CG-C-AA---TT-TGA-GG-AG-T-TTTTG---A-ACGA-GGG---C---TAAAC---G-G----GGACT-TA---TTT-T-------GG-A-TGTT-C-ACC--A-T-GAACCCA-TAATTA--AT---ACA-ATT---------A-CC-A-----A-C---TTTTTCATTG--GTGG-A----C----G-AAC------G---ACTG-TC--AAG-A--TC-CTA-ATT-AA---T-TC--ATTCCGAACCTG-TG-T-CAAAT-AAT---TCCGACTGGCT
gi|12 : --A-A-----TTCATAG-GAG-A-TAC-C-T----TT-T--CTCC--------------CC-GTA--A--A----CA-TTG---A-CT-TTT----GTTT-G-A-TATA-C-T-CC-T-C-A----TAAGA--A-TATTT--TT--T--T--T---A---AA------T---TA-AT-----GGCGAT---A-CAT-AC-C--CT--G-AGAA-A---T-T-GAA-T-TG---CAAA-GGT---A------CTC-----A-AA-A-TCAA-AA---T--TT-G-----TT---------AC-------------CCG----A-T--TATCGCTTAAT---T-C-T-G----A-TTT-GC--CG--A-ATT-TG-TT-A----C-GA--C--AC---A-AGAGAC--C-----AC-A-----A--TC-TGT-AT--T--G--TGA---A----TC-A-A-T--------------A-TGAAAGCATGCAC---AA------------A------------A-CA------------A---T----TG-A-T-T-T--CG-C-AA---CT-TGG-GG-AG-A-TTTTG---G-ATGAGGGG---C---C---T---G-A----G--TT-CA---ATG-T-ATG-G-GG-A-T-AT-C-AC-----T-GAACCCA-TAATTC--AT---GCT-ACTGCTAGCCACA-CC-A-----A-CTA-TTTTTCATCG--GAGG-A----C----
gi|13 : CATA---GGA-G-------A-CG--A-A-----TTC-TAT-AA--A-CACAT-T----CT-T--CTCC--------------C---TA--AT-A----TA-AAA---A-CT-TTTTTTTGTTT-C-A-TATA-C-T-CC-T-C-A----TAAAA--A-T---T--ATTAT--T--T---A---AAA-A-------TA-AT-----GACGAT---A-TTT-AC-C--CT--A-AGAA-A---T-C-GAA-G-TG---CAAA-GGT---A------CTCA----A-AA-A-TGGA-AA---T--TC-A-----TT---------AC-------------CCG----A-T--TATCGT----T---C-C-T-G----A-TTG-CC--CT--A-ATT-TG-TG-A----C-GT--C--AC-----AGAGAC--C-----AC-A-----A--TC-TGT-AT--A--G--TGA---A----TC-A-ATAAACGCAGC------A-C---------------AA------------G------------A-CG------------A---T----TT-A-T-C-T--CG-C-AA---TT-TGA-GA-GG-A-TTTTG---G-ATGAGGGG---C---C---T---G-A----G--TT-TG---TTG-T-ATG-A-GG-A-T-CT-C-ACT--G-T-GAACCCA-TAATTA--AT---GCA-ACT---------G-C
gi|14 : -T--TTTC--------------CC-GTA--AC-A----T--TGA---T-TT-TT-----GTTTGC-A-TA-A-C-T-CT-----A----TAAGA--A-T------AT--T--T--T---T---TTA-AA--T---TA-AT-----GGCGAT---A-CAT-AC-C--CT--AGAGAA-A---T-T-GAA-T-TG---CAAA-GGT---A------CT------A-AA-A-T-GC-AA---T--TT-G-----TT---------CC-------------TCG----A-T--TATCGCTTAAT---T-C-T-G----A-TT--CG--CG--A-ATT-TG-TT-A----C-GTG-A--AC---A---AGGC--C-----ACTA-----A--TC-TGT-AT--T--G--TGATATA----TG-G-G-A--------------G-C---------------TG------------G------------A-CT------------A---TACGATT-A-----T--TG-C-AA---CT-TG--GG-GG-A-TTGTG---G-A-GA-GGGGTTC---C---T---GTA----G--T-------TTG-T-ACG-A-GG-A-T-AT-C-AC-----T-G-ATCCA-TAATT---ATGCAACA-GCT---------AGCC-AAC--AA-CTATTTTTTCATCG--GAGG-A----C----G-A
gi|15 : aATG---GGA-G-------A-CG--A-A-----TTC-TGA-CA--A--A--T-T----TT-T--CTCC--------------C--GTT--A--A----TA-TAA---A-AT-TT-----GTTT-C-A-TA-A-C-T-CCCT-C-AA---TAAAA--A-T------AT--T--T--A---A---AAA-AA--AA--TC-AC-----GACGTTTC-A-TTT-AC-C--CT--A-AGAA-A---T-C-GAA-G-TG---CAAAAGGT---A------CTC-----A-AA-AATGGA-AAA--T--TC-G-----TT---------AC-------------CCA----A-T--TATCGT----T---C-C-CCG----A-TTC-TC--CG--A--TT-TG-TG-A----C-GT--C--AC---A-AGAGAC--C-----AC-A-----AA-TC-TGT-AT--A--G--TGA---A----TC-A-A-A--------------A-T---------------AA------------ACGCAATCCACAAA-CG------------A---T----TT-A-T-C-T--CG-C-AA---TT-TGA-GG-AG-T-GTATA---G-ATGA-GGG---G---C---C---
gi|16 : --T--T---A---AAT-AA--T----A-AC-----GCCGAT---A-TTT-AC-C--C---A-CGAA-A---T-C-AAA-G-CA---CAGA-GGT---AGGCCTACTC-----G-AA-A-TGGA-TT---T--TT-C-----TTTT-------AC-------------TTG----A-T--TATCGT----T---C-C-T-G----A-TTT-CC--TG--G-ATT-TA-TG-A----C-GTAAT--AT---A-AGAGAC--C-----AC-A-----A--TC-T----------------------------------------------------------------------------------------------G------------A---T----TT-G-T-T-T--CG-C-AA---AT---G-GG-AG-------A---A-AT-----A---C---C---C---G-T----G--TT-TG---TTG-T-ATG-A-GG-A-T-AT-C-ACT--T-T-TAACCCA-AAATTG--AT---GCA-ATT---------G-AC-A----G--CCA------CATCA--GCTA-T----C----G-AACAA-c
gi|17 : G-A----C-GC--C--AC---A-AGAGAC--C-----AC-A-----A--TC-TGT-AT--A--A----A---A----GC-GTG-C--------------A-C---------------AA------------G------------G-CG------------A---T----TT-A-T-C-T--CG-C-AA---CT-T----------------------TGG-GAA---C------------------G--TT-T------------G-A-GG-A-T-AT-C-ACT--A-T-GAACCCA-TGATTA--AT---GTA-TCTGTCAGGC--A-CC-A----CAACTA-TTTTTCATCG--GAGG-A----C----A-GTTAA-AAAG-----TA-TC--AAG-A--TC-CTA-ATT-AA---T-TC--ATTCCGAACTTG-TG-T-CAAAT-GAT---TCTGACTGGCctttaaaaagt
gi|18 : CACA---GAA-G-------A-CG--A-T-----GTT-TAA-CA--A-TAC-T-T----T----------------------------------------A-TCA---C-CT-TT-----GTTT-C-A-TAGA-C-T-CG-T-C-A----TCAAC--A-TA--C--CT--T--T--T---T---AAG-AA--T---TA-AC-----AACGGT---A-TTT-AG-T--CT--A-AGTA-G---A-A-GAA-A-TG---CCAA-GAA---A------CAC-----A-GA-A-TAGA-AA---C--TCCG-----TT---------AC-------------CCA----C-T--TGTCGT----T---G-C-T-G----A-TTC-CT--CG--A-ATT-TT-TG-A----C-GT--C--AT---A-AGAGGC--A-----AC-T-----A--CA-TGT-AT--
gi|19 : t-T----TT-T--TTCT--------------CC-GTA--A--T----TA-TCA---A-CT-TT-----ATTT-C-A-TAGA-C-T-CG-T-C-A----TGAAA--A-TAG-T--AT--TGTT--T---G---AAA-TA--T----A-AT-----GAGAAT---A-TCT-AT-T--AT--A-AGTA-A---T-C-GAA-G-TG---CGAA-GGT---A------CTT-----A-GA-A-AAAC-AA---A--TC-G-----T-----------C-------------CCG----A-T--TATCGT----T---C-C-C-G----A-CTC-CC--CG--A-ATT-TG-TG-A----C-GT--C--AT---A-
gi|2 : ATG---GGA-G-------A-CGTGA-A-----TTC-TAA-TAG-A-CACAC-T----TT-T--CTCC--------------CC-GTT--ATGA----TA-TAA---A-CT-T------GTTT-CGA-TATT-A-T-CCGT-C-A----TAAAA--A-T---TGTAT--TG-T--T---A---AAATAA--T---TAGAC-----GACGTTTATG-TTT-AAGC--CT--A-AGAA-A---T-C-GAA-G-TG---CAAA-GGT---A------CT------G-AA-A-TGGACAA---TTGTC-G-----TT---------AT-------------CCG----T-TGATATCGT----TCTGC-T-T-G----AGTTCGTC--CG--A-ATT-TG-TG-A----C-GTG-C--A----A-AGA-ACAGT-----AC-A-----A--TT-GGT-AT--GACG--TGA---A----TC-A-A-AGTATAATCGCATGCA-C---------------AA------------G------------A-CG------------T---T----TT-ACT-CTT--CGCC-AA---TTCTGA-GG-TG---TTTTG---G-ATAA-GGGGC-C---C---C---G-A----G--TT-AT---TTGTT-ATG-A-GGAA-T-CT-C--CG--GTT-GAACCCA-TAATTAATAT---ACA-ACT---------A-CT-ATCTTGA-CTG---TTTAATTG--AT-G-A----CTCGAG-ATCAATAAAGT--ACTG-TC--ACGAA--TG-TCA-GGT--A---T-TCATATTCCGAA-CGG-TG-T-CAAATCAAT---T--GACTttattctgaagatcccatgtctctgt
gi|20 : tT-----GTTT-C-A-TATA-C-T-CT-T-C-A----TAAAA--A-T---T--AT--T--TAGA---A---AAA-AA--T------AT-----GACGAT---A-TTT-GC-C--CA--A-AGAA-A---T-T-GAA-G-CG---CAAA-TGT---A------ATT-----A-AA-A-TGAA-AA---T--TC-G-----TT---------AC-------------CCG----A-T--CATTGT----T---C-C-T-G----A-TTC-CC--CG--A-ATT-TG-TG-A----C-AT--C--AC---A-AGt
gi|21 : T---A-TTT-AC-T--CT--A-AGAA-A---T-C-GAA-G-TG---CAAA-GAT---A------CTCG----A-AA-A-TGGA-CA---T--TC-G-----TA---------AC-------------CCG----A-T--TATCGT----T---C-T-T-G----A-TTC-CC--CA--A-AAT-TG-TG-A----C-GT--C--AC---A-
gi|22 : a-A-T-CTTC-ACG--G-T-AAACACAATAATTA--AT---ACACACT-------------------TA-CTA-TTTTCAATTG--ATGG-A----C----G-AACAA-AAAG---ATTG-TC--AAG-A--TC-CTA-ATT-AA---TGTC--ATTCTGAACCTGCTG-TCCAAAT-AAT---T-CGACTAGttctgtatataaaggatgcacaaggcgattt
gi|23 : -G-------A-CG--A-A-----TTC-TAA-CA--A-CAC-T-T----TT-T--CTCC--------------CT-ATA--A--A----TA-TAA---A-CT--------GTTT-C-A-TATA-C-T-CC-C-G-A----TAAAA--A-T---T--AT--T--T--T---A---AAAAAA--T---TA-AC-----GACGTA---A-TTT-AC-C--CA--A-AGAA-A---T-C-GAA-G-TG---CAAA-GGT---gttt
gi|24 : T-T--CTCC--------------CC-GTA--A--A----TA-TAA---A-CT-TT-----GTTT-C-A-TTTA-C-T-CC-T-C-A----TATAA--A-T---T--AT--T--T--T---T---AAA-AA-------A-A----------AT---A-TTT-AC-C--CA--A-AGAA-A---T-C-AAA-G-TG---CAAA-GGT---A------CTC-----A-AA-A-
gi|25 : -T-G----A-TTC-CC--CG--A-ATT-TG-TG-A----C-GT--C--AC---A-AGAG------------------------------T--T--G--TGA---A----TC-A-A-A--------------A-T---------------AA------------A------------AGCAGGC---------A---C----TT-A-T-C-T--CG-C-AA---CT-TGG-GGGAG-T-TTTTA---G-ATGAGGGG---C---C---T---G-A----G--TT-T
gi|26 : ---GAA-G-------A-CG--A-T-----TTC-TAA-CA--A-TAC-C-G----TG-T--CGCC--------------CC--T-----------TA-TCG---G-CT-TT-----GTTC-C-A-CAGA-C-T-CC-T-C-A----TAAAA--A-A---T--AT--T--T--T---T---AAA-A
gi|27 : aaaggtgaaaCACA---GGA-A-------A-CG--A-T-----TTT-CAA-CA--A-TA--T-T----TT-T--CTTT--------------CT-ATA--A--T----TA-TCA---A-TT-TA-----GTTT-C-A-TGGA-C-T-CC-T-C-A----CAAAA--A-TG--C--CT--T--T--T---G---AAA-A
gi|28 : CATG---GGA-G-------A-CG--A-A-----TTC-TAA-CA--A-CAC-T-T----TT-T--NNNN--------------NN-CT---A--A----TA-CAA---t
gi|29 : aggcCATG---GGA-A-------A-CG--A---------------CA--A-CAC-T-T----TT-T--CTCC--------------CC-GTA--A--A----TA-TAA---A-CT-
gi|3 : ggt--A----TA-TAG---A-----T-----GTGC-A-A-TTTG-C-T-CC-T-C-A----TAAAACCA-T---T--AT--T--T--A---A---AAA-AA-------A-AT-----GACGAT---A-TTTTAC-C--C---A-AGAA-AAAGG-C-GGATA-TGT--CCAA-GGT---A------CTC-----A-AATA-TTGG-AA---T--TCCG-----TTTTATCGAAGACA------------CCGTAT-A-TA-TATCGT----T---C-CCT-G----A-TTC-CC--TGTAA-GTT-TG-CG-GGACGC-GT--C--ACCA-A-AGAGAC--G-----AC-AGAAACA--T-------T--G--G--CGA---------C-A-A-A----------------------------------------------G------------A-CA------------AA--T----TT-A-TTC-T--CG-C-AACCCTA-TGA-GG-AG-T-ATTTG---CCATGA-GGG---G---G---CATTG-A-------TT-TG---TTG-TTATG-A-GG-A-TTCT-C-ACT--G-T-GAGGCC--TAATTA--AT---GCA-A-T---------G-CT-G----AG-CTA-TTTTTCATCG--ATGG-CGCGCC----G-AACAA-AAGA---ATCG-GA--AAG-A--TC-CTA-ATT-AAGTGT-TCA-ACTCCGAACCTG-TG-C-CAAA
gi|4 : tgtgaggagcactgaatcatctaaagcactcaattagatattgatatacaacactt---GGA---------A-CG--ATA-----TTC-TAA-CA--A-CAC-T-TATCTTT-T--CTCC--------------CC-ATT--A--A----TA-TAA---AACT-TT-----GTGT-C-A-TATA-C-T-CC-TTC-A----TAAAA--A-T---T--AT--T--T------A---AAA-AA--T---TA-AC-----GACGTT---AATTT-AC-C---T--A-AGAA-A---TAC-GAA-G-TG---CAAA-GGT---A------CTT-----C-AA-C-TGGG-AAAT-T--TC-G-----TT---------AC-------------CCG----AAT--TATTGT----T---C-C-TTG----A-TTC-CC---G--A-ATT-TG-TG-A----CAGT--C--AC---A-AGAGAC--C------C-A---------C-TGT-AT--A--G--TGA---A----TCCA-A-A--------------A-TCGAACGCTATGCACCAA------------G------------A-CG------------A---TAT--TT-ACT-C-T--TGGC-AA---TT-TGA-GG-AG-T-TTTTG---G-ATGA-GGG---C---CCT-C---G-A-------TT-TAACTCTG-T-ATG-A-GG-A-T-C--C-ACGGCG-C-GAAACCA-TAATTA--AT---ACA-ACT---------A-CC-T----CA--TA-TATTTTAATG--ATGG-A----C----GAAACAA-AAAGGGAAGTG-TCCAAAG-A--T--CTA-AT---A---T-TC--ATCTC-AACCTG-TGCT-CAAAT-AATTTGTCCGAATGGctgccactcggctga
gi|5 : atGA-G-------AACG--A-A-----TTC-TAAACA--A-CAC-T-T----TT-T--CTCC--------------C--GTT--A--A----TA-TAA---A-AC-TT-----GTTT-CTA-TAT--C-T-CC-T-C-A----TAAAA--AAT---T--AT--T--T--TTAAA---AAA-AA--A---TA-AC-----GACGTT---A-TTT-AC-CTCCT--A-AGAA-A---T-C-GAA-G-TG---CAAAAGGT---A------CTC-----A-AA---TGGA-AA---T--TC-G-----TT---------AC-------------CCG----A-T--TATCGT----T---C-C-T-G----A-TTC-TC--CG--A-ATTATG-TG-AAA--C-GT--C--AC---A-AGAGAA--C-----AC-A-----A--TC-TGTTAT--AA-G--TGA---AA---TC-A-A-A--------------A-T---------------AAACGCATGCACAAG------------A-CG------------A---T----TT-A-T-C-T--CG-C-AA---TT-TGA-G-----T-TTTTG---G-ATGA-GGG---C---C---CC--G-A----G--TT-TA---TTG-T-ATG-A-GG-A-T-CT-C-ACG--G-TTGAACCCAATAATTA--AT---A-A-ACT---------A-CC-C----TA-CTA-TTTTTTATTG--ATGG-A----C----G-AACAA-AAAG---GCTG-TCCAAAG-ATTTC-CTA-ATT-AA---T-TCATATTCCG-ACCTG-TG-T-CAAAT-AAT---TCCGACTGGCT
gi|6 : CATGTGTGGA-G-------AGCG--A--------TT-TAA-CA--AACAC-T-T----TT-TTTCTCC--------------CC-GTTTTA--G----TGGTTA---A-CT-TT-----GTTT-C-AGTA-A-C-TTCC-TGC-A----TAAGA----T---T--AT--T--T--T---A---ACA-GT--T---AA-AC-----GACGGT---G-TT---C-C--CT--A-AGAA-----T-C-T---G-TG---CAAA-CGT---A------CC--------AA-A-TGGA-AT---TC-TC-G-----TT---------TA-------------CCGCTGTA-T--TATCGT----A---G-C-T-G----G-CTT-CC---G--ATGTT-TT-TGGA----C-TTT-C--AC---CTAAAGAC--C-----AC-A-----A--TC-TGT-AT-----GTTTGA---ATTGCTC-T-C-A--------------A-T---------------AAATGCCATT----G------------G-CA------------AGCTT----TT-C-T-C-TGGCT-C-AG---TA-T---GG-AG-T-TTTTGCATG-ATGA-GGG---C---G---C---G-GTTATA--TT-TA---TAG-T-ATG-A-GG-ATT-CT-C-ACG--GTT-GAA-CCA-T-ATTC--AT---ACA-AC----------A-C-------TA-CTA--TTTTAATAT--GTGGTAT---C----GTAACAACAAAG---AATG-TC--AAG-A--TC-T---ATT--A---T-TC--ATT-CGAACTGG-T--T-CAA---AAT---TCCGACTGGCga
gi|7 : ---GGA-G-------T-AG--A-A-----TTC-TAA-CA--A-CAC-T-T----TT-T--CTCC--------------CC-GTA--A--A----TA-TAA---A-CT-TT-----GTTT-C-A-T-TA-C-T-CC-T-C-A----T-AAA--A-T---T--AT--T--T--T---A---AAA-AA--T---TA-AC-----GACGTT---A-TTT-AC-C--CT----AGAA-A---T-C-GAA-GCTG---CAAATCGT---A------CTCA----A-AA-A-TGGA-AA---T--TC-G-----TT---------AC-------------CCG----A-T--TATCGT----T---C-C-T-G----A-TTC-TC--CG--A-ATT-TGTTG-A----C-GT--C--AC---A-AGAACC--C-----AC-A-----AC-TC-TGT-AT--A--G--TGA---A----TC-A-A-A--------------A-TAAAGCATGCAACA--AA------------G------------ACCG------------A---T----TT-A-T-C-T--CG-C-AA----T-TGATGG-AG-T-TTTTG---G-ATGA-GGG---C---C---C---G-A----G--TTCTA---TTG-T-ATG-AGGG-A-TCCT-C-ACG--G-T-GAA-TCA-TAATTA--A----AAA-ACT---------A-CC------GA-CT--TTTTTC-TTGAAGTGG-A----C----GAAACAA-TAAG---ACTGATC--AAC-A--TC-CTAGAGT-AA---T-TC--ATTCCGAACC---TG-T-CAAATAAAT---TCCGACTGGCT
gi|8 : TG---GGA-G-------A-CG--G-------TTC-TAA-CA--A-CAC-T-T----TT-T--C-CT--------------CC-GTT--A--A----TA-TAA---A-CTCTT-----GTTT-C-A-TATAGC-T-CC-T-C-T----TAAA-----T---T--AT--T--T--T---A---AAA-----T---TA-AC-----GACGTT---A-TT--AC-C--CT--A-AGAA-A---T-C-GAA-G-TG---CAAA-GGT---A------CTC-----ACAA-A-TGGA-AA---T--TC-G-----TT---------ACG------------CCG----A-T--TATCGT----T---C-C-T-G------CTC-TC--CG--A-ATT-TG-TG-A----C-GT--C--AC---A-AGAG-C--C-----AC-A-----A--TC-TGTAATTAA--G--TGA---A----TC-A-A-A--------------AGT---------------AA-------------------------A-CGCAATGCACAAGCA---T----TT-A-TCC-T--CG-C-AA---TT-T-A-GG-AGTT-TTTTG---G-ATGA-AGG---CGGTC---C---G-A----G--TT-TA---TTG-T-ATG-A-GG-A-T-CT-CAACG--G-T-GAACCCA-TAATTA--AT---ACA-ACT---------A-C-------TA-CTA--TTTTAATTG--ATGG-A----C----G-AACAA-AAAG---ACTG-TC--AAG-A--TC-TTA-ATTCAA---T-TC--ATTCTGAACCTG-T--T-C-AAT-AAT---T-CGAATGGCTg
gi|9 : cacCATG---GGAAG-------A-CG--A-A-----TTC-TAA-CA--AACAC-T-T----TT-T--CTCC--------------CCCGTA--A--A----TA-TAA---A-CT-TT-----GTT--C-A-TATA-C-T-C--T-C-A----TAAAA--AAT---T--AT--T--G--T---A---AAA-AAAAT---TA--C-----GACGTT---A-TTT-AC-C--CT--C-AGAA-AA--T-C-GAA-G--G---CAATTGGT---A------CTC-----A-AA-A-TGGA-AA---TG-TC-G-----TT---------AC-------------C-G----A-T--TAC--T----T---C-C-T-G----A-TTA-TT--TG--A-ATT-TG-AT-A----C-GT-----AC---A-AGAGAC--C-----AC-A-----A--TCCTGT-AT-----G--TGA---A----TT-C-A-A--------------A-TTAAAACGCATGCACAAA------------G------------A-CG------------A---T----TTTA-T-C-T--CG-CCAA---TT-TGA-G--AG-T-TT--G---G-ATGA-GGGGC-C---C---C---G-G----G--TT-TA---TTG-T-ATGCA-GG-G-T-CT-C-ACG--G-T-GAACCCA-TAAT-A--AT---ACA-ACT---------A-CC-A----AA--TA-TTTT-CATTG--GTGG-A----C----G-AACAA-AAAGG--ACTG-TC--AAG----TCACTA-ATC-AA---T-TC--ATTCCGAACCTG-TG-T-CAAAT-AA----TCCGACTg