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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-404 ) : CTGAAATTTTACGTCTTC-GT-GCTGCTTTTCGGTGGA-TC-TTCA-AT-GGAACCA-TT--T--A--A---CGGTATCTCT--TA---TAAAA---T---T--TTCC--A-A--TGG-CAA-A-CCG---A-G-AAA-CTTT-T--ACACCTTC-T--GA-T-TC--TG--TCAA-T----A-TG-CT--C-T-CT-A--T--TTGAACGA
gi|1 : CTGAAATTTTA-GTCTTC-GT-GC-GCTTT-CGGTGGA-T--TTCA-CT-GGAAC-A-TT--A--A--A---CGGTATC-CG--TA---TAAAA---G---T--TTTC--A-A--TGG-C-A-A-CCG---T-G-AAA-CTCT-T--TCACGCTC-TGCGA-TGTC--TG--TCAT-G----A-TG-CT--T-T-CC-A--T--TT-AACGA
gi|10 : caaaagttattttaattcatagcttctactaagttctcatttggaaatatttatttatatttttcttatttcgctatttcctaataattatgacaaaccgccaaacaagaaattgaaatcattggttataagattgattgctattaatacacagtgcatatagcgttcggtcctatgaactctattgtctctCTGAAATTTTACGTCTTC-GT-GCTGCTTTTCGGTGGA-TC-TTCA-AT-GGAACCA-TT--T--A--A---CGGTATCTCT--TA---TAAAT---T---T--TTCC--A-A--TGG-CAA-A-CCG---T-G-AAA-CTTT-T--ACACCTTT-T--GA-T-TC--TG--TCAA-T----A-TG-CT--T-A-CT-A-----TTGAACGA
gi|11 : GCGGA-TCATTGA-AC-AGAGTGAATT--T--A--AGAGCGGTATCCCTCCTA---TAAAAAATTA--T--TTCC--A-A--TGG-CAA-AACCGTGGACG-AGATCTTT-TTAACACCTTC-T--GA-T-TC--TG--TTCA-TATTAA-TG-CTTAC-TACT-ATTT--TTGAACGA
gi|12 : GAAATTTTACGTCTTC-AT-GCTG-GTTTCGGTGAA-TC-TTCA-AT-GGAACCA-TT--TA-A--A---TGGTATCTCC--TA---TGAAA---T---T--TTCC--A-A--TGA-CAA-A-CCG---A-G-AAA----------------C-T--GA-T-TT--TA--TCAA-T----A-TG-CT--C-T-CT-A--T--TTGCACGAg
gi|13 : tgtctctcg-TTCA-AT-GGATCCA-TT--T--A--AA--CAGTATTTCT--TA---TAAAA---AAAAT--TTCC--A-A--TGG-CAA-A-CCG---A-G-AAA--TTT-T--ACACCTTC-T--GA-T-TC--TG--TGAA-T----A-TG-CT--C-T-TT-A--A--TTGAACGAa
gi|14 : CA-AT-GGAACCA-TT--T--A--AA--CGGTATCTCT--TA---TAAAA---G---TCCTTCC--A-T--CGG-T-A-A-CTG---A-G-AAA-CTTT-TA-ACCCCTTC-G--GA-T-TC--TG--TCAAGT----ACTG-CT--C-T-CT-A--T--TTGAACGAa
gi|15 : -TTCA-AT-GGAACCA-TT--T--A--AA--CGGTATCTCT--TA---TAAAA---T---C--TTCC--A-A--TGG-TAA-A-CTG---A-G-AAA-CTTT-T--ACACCTTC-G--GA-T-TC--TG--TCAA-T----A-TG-CT--C-T-CT-A--T--TTGAACGAa
gi|16 : -TTCA-AT-GGAACGA-TT--TT-A--A---CGGTATCTCT--T----CAAA--------T--TTCC--A-A--TGG-CAA-A-CCG---T-G-AAA-CTTT-T--ACACCTTC-T--GATT-TC--TA--TCAA-T----A-TG-CT--T-A-CT-T--A--TTGAACGAa
gi|17 : -TTCACAT-GGAACCA-CT--TTAA--A---CG--ATCTC----A---TAAAA---T---T--TTCC--A-A--TGA-C-A-A-CAG---A-G-GAA-AATT-T--ACA-CTTC-T--GA-T-TC--TG--TCAA-T----ATTG-CT--C-T-CT-A--T--TTGAACGAa
gi|18 : T--T--A--A---CGGTATCTCT--TA---TAAAA---TAA-T--TTTC--A-A--TGG-CAA-A-CTG---A-GAAAA-AGTT-T--ACAACTTC-T--GA-T-TCTGTG--TCAA------A-TG-CT--T-T-CT-A--T--TTGAACGAa
gi|19 : aA-TT--G--A--A---CGATATCTCT--TA---TAAAA---T---T--TTCC--A-A--TGG-CAA-A-CCG---A-G-AAA-CTTT-T--ACACCTTT-T--GA-T-TC--TG--TCAA-T----A-TG-CT--T-T-CT-A-----TTGAACGAa
gi|2 : gccaCTGAAATTTTA-ATCTTCGGT-GCTGC-TTTCGGTGGATTC-TTCA-AT-GGGACCA-TT--T--AACA---CGGTATCTCT--AA---TAAAA---T---T--TTCCTAA-A--TGGCCAACA-CCG---T-G-AAA-CTTT-T--ACACCTTCTT--GA-T-TC--TG--TCAA-T----A-TG-AC--A-TACT-A--T--TTGAACGAa
gi|20 : agctattatattaattatattttgtcgcttaaattttccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatctaattgtctctA-TT--T--A--A---ACGTATCTCT--TA---TAAAA---T---T--T-CC--A-A--TGG-CAA-A-CCG---A-G-AAA-CTTT-T--ACATCTTC-T--GA-T-TC--TG--TCAA-T----A-TG-CT--T-T-CT-A--T--TTGAACGA
gi|21 : --A--A---AGGTATCTCT--TA---TAAAA---T---T--GTCC--A-T--TGG-CAA-A-CTG---A-G-AAA-TGTT-T--AGACCTTC-T--GA-T-TC--TA--TTGA-T----A-TA-TT--C-T-CT-A--T--TTGCACGAa
gi|22 : a--A--G---CAGTATCTC----A---TAAAA---T---T--TTCC--A-A--TGG-CAA-A-CTG---A-G-AAG-TTTT-T--ACACCATC-T--GA-T-TC--TA--TCAA-T----A-TG-TT--C-T-CT-A--T--TTGTACGAa
gi|23 : aGTATTTCT--TA---TAAAA---T---T--CCCC--A-T--TGA-CAA-A-ACG---A-G-AAA-CTTT-T--ACACCCTT-T--GA----C--TGATTCAA-T----C-TA-CT--C-T-TT-C--T--TTGa
gi|24 : aatGTATTTCT--TA---TAAAA---T---T--CCCC--A-T--TGA-CAA-A-ACG---A-G-AAA-CTTT-T--ACACCCTT-T--GA----C--TGATTCAA-T----C-TA-CT--C-T-TT-C--T--TTGccgaa
gi|25 : aat--A--A---CGGTGTCTCT--TG---TAAAA---T---T--TT-C--A-A--TGG-CAA-A-TCG---A-G-AGA-TTccgaa
gi|3 : aaataCTGAA--TTTAC-TCTTC--T-GCTGCTTT-CGGTGGA-TC-TTCA-AT-GGAACCA-TT--TA-A--A---CGGTATC-CC--TA---TAAAA---A---T--TTCC--A-A--TGG-CAA-A-CCG---T-G-AAA-CTTT-T----ACCTTC-T--GA-T-TC--TG--TCAA-A----A-TG-TT--A---CT-AT-T--TTGAACGA
gi|4 : tagctagttatattaatatattttgtcgctaatttcctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttaattgtctctCTGAAATTTTACGTCTTC-GT-GCTGCTTT-CGGTG-A-TC-TTCA-AT-GGA-CCA-TT--T--A--AA--CGGTATCTCTC-TA---TAAA----T---T--TTCC--A----TGG-CAA-A-CTT---C-G-AAA-CTTT-T--ACACCTTC-T--GA-T-TC--TG--TCAA-T----A-TG-CT--T-A-CT-A--T--TTGAACGA
gi|5 : tagctattatattaattatatttgtcgctaatttcctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctaattgtctctCTGAAATTTTACGTCTTCCGTAGCTGCGTTTCGGTGGA-TC-TTTA-AT-GGAACCA-TT--T--AATA---CGGTACTTCC-------TAAAA---T---T--TCAT--A-A--TGG-CAA-A-CCG---T-G-AAA-CTTTGT--ACACC-TC-T--GA-T-TC--GG--TCAA-T----A-TG--T--C-TACTAA--T--TTGAACGA
gi|7 : ttaattatattttgtcgctatttcctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctaatgtctctCTGAAACTTTA-GTCT-C-GT-GCTGCTT--CGGTGGA-TC-TTCA-ATTGGAACCA-TTGTT--A--AAC-CGGTATCTCC--TA----AAAA---T---T--TTCC--A-A--TGGGCAA-A-CCG---T-G-AAA-CTTT-TT-AC-CTTTC-T--GA-T-TC--TG--TCAACT----A-TGACT--TAC-CT-A--TTCTTGAACGA
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Unaligned ( gi|6 ): CAAAAGTTCATTTGAGACACGCTCCCATGTAAGTTGCCTTACATAGCTATTATATATATATTTTTGCCGTAATTTCTTAATACAAAACGCAACACGGAATGATTGAAGAAGTGCATATGGATAGATTTATGTAAGATTTGATGATATTAGAATATGTGCATATACGTGGTTATGCTTTTTTTTTTGTTTGTCTCTGGAAGTTTTTACGATGTTTTTCGTGAGTTTTCGGTGGTTTCACTGGCTATTTAAACGG