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Reference ( gi|1 )            :    ACTAAAAGCCGA-----GTA-G-GT-CCAGGGT-AT---AG-A--TTAAT--T-A-T--AT-T---G----------TGATGGT----------G----------CGGCC-GC----------CA-CT------G-T-A-A--T--T--------A-T----T----G--T--CGGCC---G--CC-----A----------------------CT--TT--A---------------AT-TTAAA-TG-G--C-G-GCC--GC-CA-C-T-----T--A---T------TAT-CCTCT---G-T--GGC--GG---C-G--C--C----A----C----AT---A---TTA--T--C----T------G-----C---A--CC------GC-----------C------C----------T---T--G----TT-ATC--------T-G---G-C--G-GC--C--GC-C--A-------------------------A--C----A----AA-T---T-A-AC-T----G-G--CGG-C-CG-C----GCCA--G----A--TAA-----G---A--T-T---A--A---G-T-----G----------GGC-GTC----C-G-CC-----------A-C-----A-----T--A---AT-T---TA-A--CTA-GC-GG-CGT-G-------CCA---C-----ACTT---A----T----TA----T-TG-GGC--C-----GG--CG--C----G-C-------A--T-A-AT-A-A--T-T--A-A-T-CT-----G-----C--GGCT---G-CCA-------C-T-T------A---T------C--A--TC----T---G----GC--G--GC-C-G-C----CA----TAT--A-------------T-AA-A--T----T--A-AC----T---G--C--CGAC-C---G--C-C------A--------C---T-T--A-----T--A--T----C----T----G---GC-G-G--C-C----G-C---G--CA-T-ATA-GA---A------AT--T--A----A-----------T-----------G-----CG----G-C---C-GCCA----G--A--T---G-----AAT---T--T-AA-G---T--G-C-G--C---G-CC----GCCAG--------C---A----T--A----T--A-A---G----T------G--CGG--C---GC-CA-C---T-ATAA-A--AT-T-T-A--TC----C--C-AC-G-G----CTG----C----AG--T----T-AA--T-TGTAATTA---T--G---GT-CG-CC-G--CCA-A---T-------A-A----T--A---A-T---G----CG--A--CCGCC----AG--A---T--A----A---T---A---A-------T------G-G-C-G----G-TCG-C--------A----G--T--A--A---AT-T---A-A---GT--G-GC--G--CCGT-----C-CACAT-AAA-T-T-A-AG-CA-----GGCGG-CC-G-CC-A----TA-TAA------AT-T-AT----------AT--T-A----A-TT--CTA-ATACCCTGG-AC-CCACC
gi|4                          :    ACTGTAAGCCG------GTATG-GT-GCAGGGTTAT---AG-AATTTAAT----A-T--AT-T---T----------ATATGGC----------A-----------GGCC-GC-----------A-TT------A-T-A-A--T--T--------AAC----T----G--G--CGGCC---G--CC-----AGAAATAATTTTTAGTGGCCTGCCC--TT--A---------------AT-TTCAT-GG-G--C-G-GCCCAGCTCA-T-T-----TT-A---T------TAT-C---------T--GGC--GG---C-T--C--TGTGAA----CTA--AT---T---TTA--TGTC----T------G-----TGCGA--CC------GC-----------CA-----C----------T---T--A----TT-ATG--------T-G---G-C--G-GC--C--AC-C--A-------------------------C--T----T----TA-T---T-A-GT-TCTTAG-G--CGGGC-CG-C----ACTT--T----G--TAA-----T------T-T---A--T---A-C-----T----------GGC-GTC----CCG-TC-----------A-C-----T-----T--A---AT-T---TA-A--CTG-GC-AG-C-C-G-------C-----C-----ACTT---A----TA---TA----T-TC-GGC--
gi|6                          :       AGAAGCCG------GTA-G-GTGCTAGGAT-AT---AG-AA-TTCATA-T-A-T--AT-T-----------------TAGT----------G------------GTC-GC----------CA-CT--------T-A-A--TC-T--------A-TG---T----G--G--CGGCC---G--CC-----A----------------------GT--T---A---------------AT-TTGAA-TA-G--C-G-GCC--GC-CA-G-A-----TGAA---T------TA-----AA---G-T--GGC--G--------------------------------A---TTG--T--------------------C---A--C--------------------------------------T---T--A----TT-ATC--------T-G---G-C--G-GT--C--GC-C--A-------------------------
gi|38                         :    tacAGAAGCCG------GTA-G-GTGCCAGGGT-AT---AG-A--cttcatttaac
gi|11                         : aacatacAAAGCCG------GTA-GCGTGCCAGGGT-AT---AGAA--TTAA---T-A-T--TT-C---A----------TG-TGG-----------G----------CGGTT-GC----------TA-CT--------T-A-GATT--T--------A-TG---T----G--C--GAGCC---G--CC-----A----------------------TA--TA--A---------------AT-T--AC-TG-C--C-C-GCC--GC-CA-
gi|15                         :    acggAAAGCCG------GTA-G-GT-TCCAGGT-AC---TA-T--TCAAC--T-A-C--AA-T---G----------TAATGTT----------CATTTATCTTTCAGCC-AC----------GA-CT--------T-G-A--T--T-----------------------T--CGACC---G--CT-----A----------------------CT--T---A---------------AT-TTGTA-TG-G--C-G-GCC--GC-Cagataaatttaagtgcgcg
gi|28                         :       gAAAGCCG------GTA-G-GTGCCAGGGT-CT---AG-A--
gi|3                          :   tgtacgAAGCCG------GTA-G-GTGCCAGGGT-ATTAGAA-A--TTAATA-T-A-TTTAT-T---G----------TG---------------G----------CGGCCCGC----------CA-CT--------T-A-A--T--T--------AAC----T----G--G--CGGCC---G--CC-----A----------------------CT--T-------------------AT-TTATC-TG-G--C-G-GCC--GC-CAGC-A-----T--A---A------TAA-AATTTAAAG-T--GGC--GG---CCG--C--C----A----CTCTAAT---G---TTA--C--T----T------G-----T---G--GC------GCGTCGACGGCCAC------C----------T---T--A----TT-ATT--------------G-C--G-GC-----GC-C--AGAT----------------------A--T----A----AAGT---TGA-AC-T----G-G--CGG-C----C----GCCA--A----A--AAAT----A---A--T-TG--A--A---G-T----------------GAC-GGC----CGG-CC-----------A-A-----ACT---T--A---AT-T---TA-A--CTG-GC-GACCCC-G-------CCA-----------TT---A----T----TA----T-TG-GGC--G-----AC--CG--C------C-------ACTT-A----A-A--T-T--T-A-T-GTGTG--G-----C--GGCC---G-CCA-------CTT-T------A---T------T--T--TTG---T---G----GC--GGCGC-T-G-C----CA----C-T--T-------------T-AA-T--TGGTAT--G-AT----T---G--G--CGGC-C---G--C-C------A--------ggcggctaactggcggccgc
gi|2                          :     acggAAGCCG------GTA-T-GC-CAAGGGT-AT---AG-A----AAT--T-AAT--AT-T--------------T-ATGTG----------G----------CTGTC-GC----------CA-C-----------A-A--C--T--------A-G----T----G--G--CGGCC---G--CC--------------------------------TTGAA---------------AA-TTAAG-TG-G--C-G-GCC--GC-TA-C-T-----T--AAATT------TAT-----T---GCT--GGC--GG---C-C--C--C----A----C----TT---A-----A--T------------------------------------------------------------------------------TT-AAC--------T-G---G-C--G-GC--C--GC-C--A-------------------------A--C----T----AA-----T-A-AG-T----G-G--CGG-C----C----GCCA--G----T--TAAAAAACA---A--T-TAA-A--A---G-T----------------GGC-GGT----C-G-CC-----------A-G-----A-----T--A---AA-T---GATG--TTG-GC--G-CCC-G-------CCA---CTTAAAATTT---A----T----T-----T-CT-GGC--G-----GA--CA--C------C-------A--T---AT-A-A--TAT--A-----CT-----G-----G--CGTT---G-CCA-------G-A-T------A---A------C--A---G----T---G----GC-----GC-C-G-C-----------AC--A-------------T-AA-A--T----T--A-A-----G---G--G--CGGC-C---G--C-C------A--------C---A-T--A-----G--A--T----agttatcttctctctctctc
gi|12                         :    tacggAAGCCGGTACATGTA-G-CTGCCAGGGT-AT---AG-A--TTA------A-T--AT-T---T----------AGGTG------------G----------CGGTC-GC----------CA-CT------T-T------T--T--------A-TC---T----G--G--CGGCT---G--CC-----A-----------------------G--AT--A---------------A---TGAG-TG-G--C-A-GCC--AC-CA-C-T-----T------T------TAG-TTTAT---A-T--GGC--GGT--C-G--C--acttaattctatagggaagtcgaggtaggtgccagggtaggagaattgataattatatctcggggccgccacttatttatgtgggaccgccag
gi|21                         :      cggAAGCCG------GTT-G-GTGCCAGGGT-AT---AGAA--TTAA---T-A-T--AT-T--------------T-ATGTG----------G----------CGGCC-GA----------CA-C-------A-T-AGA--T--TA-------A-C----T----G--G--CGGCC---G--
gi|22                         :   gtactgAAGCCG------GTAAG-GTGCCAGGGT-AT---AG-A--TTAAT--T-A-T---T-T---A----------T-CTG------------G----------CGGCC-GC----------CA-TT------
gi|27                         :   ctacggAAACCG------GTA-G-GTGCCAGGGT-AT---TGAA--TTAA---T-A-T---T-T---A----------TG-TG------------G----------CGGCC-GC----------ttggcataataaatat
gi|14                         :    tacggAAGTCG------GTA-G-GTGCCAGGGT-AT---AGAA--TCAGT--T-A----AT-TTAAG----------TGGCGGTAATTTGTATGG----------CGGCC-GC----------CA---------GATAA-A--T--T--------A-C----G----G--T--AAG---------------A---------------------------T--A---------------AA-TTAAC-TG-G--C-G-GCC--GC-CA-
gi|7                          :      ctgAAGCCG------GTA-G-GTGCCAGGGT-ATC--AGAA--TTA------A-T--AT-T---GGCGGCCCGATTGATAAT----------G----------C--CC-GCAAAACTTATTCA-CTCCTGGCG-G-A-A--T--T--------A-C----T----G--GCACGCCC---G--CC-----A-----------------------T--AT--A---------------AA-TTAAC-TG-GTAC-G-GCC--G
gi|30                         :       ggAAGCCGA------TA-G-GTGCCAGGGT-AT---AGAA--TTAA---T-A-T--AT-T---aagccaagaataatattatagctggcggcc
gi|35                         :     actgAAGCCG------GTA-G-GTGCCAGGGT-AT---AGAA--TTAA---T-A-T--AT-tatatggc
gi|32                         :      cggAAGCCG------GTA-G-GTGCCAGGGT-AT---AGAA--TTAAT--A-A-T--
gi|34                         :     actgAAGCCG------GTA-G-GTGCCAGGGT-AT---AG-AATTTAAT--tta
gi|33                         :    tactgAAACCG------GTA-G-GTGCCAGAGT-AT---AGAA--TTAAT--a
gi|37                         :   gtacggAAGACG------GTA-G-GTGCCAGGGT-AT---AGAA--TTAAa
gi|23                         :                    acgg-G-GTGCCAGGGC-AT---AG-A----AATAAT-A-T--AT-T--------------T-ATGTG----------G----------CGGCC-GC----------CA-
gi|9                          :                    ctgaaactactCAGGGT-AT---A------TAAT--TGA-T--AT-T---CAT--------TTATGTG----------G----------TAGTC-GT----------TA-CT--------T-C-A--T--T----------T----T----A--C--TTGCG---G--C------------------------------T--TT--A---------------AT-TTAAC-TA-G--C-G-ACC--TT-CA-C-T-----T--A---T------TAT-Cgataaatgtaagtggt
gi|2                          :           tacggaagctgggaggtgccaggggT-AT---AG-AA-TTAAG--T-A-T--CTAT---G----------TG---------------G----------CGGCC-GC----------C--CT--------T-A-A--T--T--------T-A----T----G--TG-CGG-C---G--CC-----A----------------------CTG-TT--ATCTGGCAACGCCAGTATATTATA-TG-G--T-G-TCC--GC-CA-G-A-----A--A---TA-----AAT-TTTAA---G-T--GGCG-GG---C-G--C--C----AACATC----AT-------TTA--T--C----TG-----G-----CG--A--CC------GC-----------CA-----CTTTTAA----T---T--GTTTTTT-AAC--------T-G---G-C--G-GC--C--GC-C----------------------------A--C----T----TA-T---T-A-GT-T----G-G--CGG-C----C----GCCA--G----T--TAA---------A--T-T---A--A---G-T-----G----------GG--G-C----C-G-CC-----------AGCA----A-----TA-A---AT-T---TA-A--GTA-GC-GG-C-C-G-------C-----C-----ACTTA--A----T----TT----T-CA-AGG--C-----GG--C---C----G-C----------C-A-CT-A-G--T-T--G-----TG-----G-----C--GACA---G-CCA-------C-A-T------A---tggaggtcgc
gi|4                          :            tacggaagccggtatgccaagggtatagaaattaatattAGT--T-A-A--AT-TAA-G----------TGACGG------------------------GAC-GC----------CA-GT------A-T-A-AA-T--T--------A-CAAAGT----G-----CGGCCC--G--CCTAAGAA----------------------CT------A---------------AT---AAAGTG-G--T-G-GCC--GC-CA-C-A-----T--A---A------TA------A---G-T--GGC--GGT--C-G--CA-CAG--A----C----ATAAAA---TTA--G--T----T------------C---A--CA------G-------------------------------------------------------------------A-GC--C--GC-C--AG------------------------A--TAATAA----AA-T---G-A-GC-T----G-----GG-C-CG-C-----CC--------A--TGA-----A---A--T-T---A--A-----------G----------GGCAG--------G-CC-----------A-CTAAAAA-----T--T---AT-T---T-----CTG-GC-GG-C-C-G-------CCAGT-T-----AATT---A----T----AA----T-GC-GGC--C-----TG--C---C----A-T-------A--TAA-AT-ATA--T-T--A-A-gggaagtcgaggtaggtgccagggtaggagaattgataattatatctcggggccgccacttatttatgtgggaccgccag
gi|20                         :                                                 actgtaagccggtatggtgcagggttatagaatGATGG----------------------CGGTC-GC----------CA-CT------T-T------T--T--------A-TC---T----G--C--CGGCT---G--CC-----A------------------------------G---------------AT----AA-TGAG--T-GCACC--AC-CA-C-T-----T--A-----------AT-GTTAT---A-T--GGC--GT---C-G--C--ggcagccgccacttatatattcggc
gi|12                         :                                                                                    TGGT----------G------------GCT-GC----------CA-CT------C-----A--T--T--------A-TC---T----G--G--CAGCC---G--CC-----A----------------------GA--TA--A---------------A----AAG-TG-G--C-G-ACC--GC-CA-C-C-----T--A---ctaa
gi|13                         :                                              cggaagccggtacatgtagctgccagggtatagattaatatt----------G----------CGGTC-GC----------CA-----------T-A-------T--------A-C----T----G--G--CGGCC---G--CC-----A----------------------GA--TA--A---------------AT-TGAAG-TG-G--C-G-GCC--GC-CA-C-cttttagtttatatggcggtcgc
gi|6                          :                          catataagttaagtggcggccgccacttattaggcctatctggtggcctcacatattatctg----------G----------CGACC-GC----------CA---------GAT-A-A--T--A--------A-G----T----G--A--CAATC---G--CC-----A----------------------CT--TT--A---------------AT-TCATC-TG-G--C-G-GCC--GC-TA-T-T-----CAAA---T------TAA-C---------T--GGC--GGC--C-G--C--C----A----C----AT---A---a
gi|8                          :                          tacagaagccggtaggtgctaggatatagaattcatatatatttagtggtcgccacttaatc----------G----------CGGTT-GC----------CA---------GCT-A-A--T--T--------C-A----T----A--T---GGCTAATG--CC-----A----------------------AT--TA--G---------------AT-CTATA-TG-A--C-G-GCC--GC-CG-G-T-----T--A---T------G-----TCT---A-TCAAGC--GG---C-------C----AT---C----AT---T---TTA--T--T----C-----------------------------------------------------------------------T-ATA--------A-G---G-C--G-GC--A--GC-G--A-------------------------A--TT---A----AA-T---T-A-AG-T----G-G--CAA----A-C----GTCA--C----A--CA------G---A--T-T---A--A---G-T-----G----------cacttcatttaac
gi|14                         :                                                                                        ----------G----------CGGCC-GC----------CA-GT--------T-A-A--T--T---------------T----A--T--C----------TT-----A----------------------CC--GT--A---------------AT-TTATC-TG-G--C-G-GCC--GC-CA-cacttaa
gi|21                         :                                         ctgaagtcggtaggtgccagggtatagaatcagttaatttaagtggcggtaatttgta----------CGGCC-GC----------CA-GT--------T-A-A--TC-T--------A-TG---T----G--T--CGGCC---G--CC-----A----------------------CA--TA--A---------------AT-ATAca
gi|26                         :                                                               gtactgaagccggttggtgccagggtatagaattaa----------CGACC-GT----------CA-CT--------T-G-A--T--TTATTTGGTA-T----T----G--G--CGACC---G--TC-----A----------------------CT--T---A---------------AT-TTAA
gi|7                          :                                                                                                            agGGCC-GC----------CAGCT------A-T-A-A--TATT--------A-T----TCTTGGCTT--CGGCC---GTACC-----A----------------------GT--T---A---------------AT-TTATA-TG-G--C-G-GGCGTGC-CA-G-T-----A--A---T------Ttcagataaatga
gi|3                          :                            ggaagccggtaggtgccagggtatcagaattaatattggcggcccgattgataatgcccgcaaaacttattcactcctggcggGCC-GC----------CA-CA------A-A-A-A--T--A--------AAG----T----G--G--CGGCC---G--CC-----A----------------------CACATA--A---------------AT-TTAAG-TG-G--C-G-GTC--GC-CC-A-A-----T--A---A------TA----------A-T--GGC--GGGGTC-G--C--C----AGT--T----AA---A---TTAAGT--T----T------G---------G--CC------GG-----------C------CGTCACTTCAAT---T--A----TT-TTT--------T-G---G-C--G-GC--C--GC-C--A-------------------------GTTC----A----AC-TTTAT-A-TC-T----G-G--C-G-C-CG-C----AATA-------A--TAA-----G-------------------G-T-----G----------GCC-GTCGACGC-G-CC-----------A-C-----AAG---T--A---ACAT---TAGA--GTG-GC-GG-C-C-G-------CCA---C------TTT---AAATTT----TA----T-TA-TGC--T-----GG--CGGCC----G-C-------C--A-G-AT-A-A--A-T--A-A-G-TG-----G-----C--GGCC---G-CCA-------G-T-TA-----A---T------T--A--AG----T---G----GCG-G--GC-C-G-C----CA----CA---A-------------T-AA-A--T----
gi|16                         :                                                                             acggaagccggtaggtgccagggtattagaaattaatatC----------CA-CT--------T-A-A--T--T--------T-C----T----G-----CGGTC---G--CC-----A----------------------CA--T---G---------------AT-TTAAT-TG-T--C-G--CC--GC-CA-T-T-----T--A---T------TAT-C---------T--GGC--GGC--C-G--T--C----A----T----AT---gctgccactttaattggtatgattggcggccgccaagttatcttctctctctctc
gi|8                          :                                                                                                   tcggccatccattttttc----------CA-CT--------T-A-A--TC-T--------G-TG---T----G--A--CGTTT---G--CC-----A----------------------CT--T---A---------------AT-TTAAT-TC-G--C-T-GCC--GC----C-T-----T--A---T------tataagtggcg
gi|13                         :                                                                                                                                                                  ----T----G--G--CGGCC---G--CC-----A----------------------CT--TC--A---------------AT-TTATC-TG-G--C-G-GCC--GC-CA---G-----T--A------------------T---A-T--GGC--GAC--C-G--C--C----A----G----AT---A---ATA--T--G----T------GAGGC-C---A--CCAGATAGGC-----------C---------------------T--A----AT-AAG--------T-G---G-C--G-GC--C--GC-C----------------------------A--C------------T---T-A-AC-T----agaataaaatgatggccgcttgatagacataaccggcggccgtcatatagatctaattggcattagccatatgaattagctggcaaccgccacttaa
gi|16                         :                                                                                                                                                                      catata--T--CGGCC---AT-CC-----A----------------------TT--TT-------------------T-TCATA-TG-A--C-G-GCC--GC-CA-G-A-----T--A---A------TA------A---A-T--GGC--GG---C-G----------A----C----A----A---TTA---------------------------A------------------------------------------------A----TC-ATG--------T-G---G-C--G-AC--C--GC------------------------------A--G----A----AA-T---T-A-AG-T----G-G--ca
gi|21                         :                                                                                                                                                                               --CGGCC---G--CC-----A----------------------GT--T---A---------------AT-CTATG-TG-T--C-G-GCC--GC-CA-C-A-----T--A---tataagtggcg
gi|23                         :                                                                                                                                                gtactgaagccggttggtgccagggtatagaattaatatatt--CC-----A----------------------CT--TA--C---------------AT-TTATC-TG-G--C-G-GCC--GC-CA-CATAAATAT--A---T------TAT--TTCT---A-T--GCCCTGG---C-A--C--C----A----
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                  ctgaaactac--TT--A---------------AT-TTATA-TG-G--C-G-GCT--GG-CA-C-T-----T--A-----------AT-T---------T--GGCT-GG---C-GATCTGC----A----C----TT---AAT-TTA--T--A----T------G-----G---AGGCC------AT-----------C------A----------G---T--G----CT-TTC--------T-AATAG-C--G-AC--C--GC-C--A-------------------------A--T----T----AT-T---C-A-AC-T----t
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                           caacgggcgatcgcttc--TT--C---------------AT-TTAAC-TG-G--C-G-GCA--GT-CA------------A---T------CAA-TCTAT---G-T--GGC--GG---C-T--C--C----ctccttctcaaaacgaaagagatgtgcaatttgtgtaacatcc
gi|25                         :                                                                                                                                                                                       tacgggaggcggtaggtgctagggtatacaattgata--TT--C---------------AT-TTAAC-TG-G--T-G-GCT--GC-CA-C-T-----T--A---ta
gi|13                         :                                                                                                                                                                                           actgaagtctgtagacgcaaaggtatagcattgataT--A---------------AG-TTAAG-TG-G--C-G-GCC--GC-CA-C-T-----T--A---T------TAGGCCTAT---C-T--GGT--GG---C-C--T--C----A----C----AT---A---TTA--T-----------------------------------------------------------------------------------C--------T-G---G-C--G-GT--C--GC-C--A---------------------------------------------T-ATAC-T----G-G--CGG-C-CG-C------CA--G----A--TAA---------A--T-TG--A--A---G-T----------------GGC-GGC----C-G-CC-----------A-C-----A-----attta
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                               cata---------------AT-ATAAG-TG-G--C-G-GCT--GC-CA-G-T-----T--AAA-T------TAA---------G-T--GAC--GGGA-C-G--C--C----AG---T----AT---AAA-TTA-----CAAAGT------G-----C---GGCCC------GC-----------CTAAGAAC----------T---A--A----TA-AAG--------T-G---G-T--G-GC--C--GC-C----------------------------A--C----A----TA-A---T-A-AG-T----G-G--CGG-T-CG-C----A-CA--GAC--A--TAA-----A---A--T-T------A---G-TTCACAG----------AG----C----C-G-CC-----------A-G-----A-----T--A---AT-A---AA-A--TGA-GCTGG-----G-------CCG---C-----CCATGAAA----T----TA------AG-GGC--A-----GG--C---C----A-C----------T-A-AA-A-A--T-T--ATT-T-CTG----G-----C--GGCC---G-CCA-------G-T-TA-----A---T------T--A--TA----A---T----GC--G--GC-CTG-C----CA----TATAAA-------------T-AT-A--T----T--A-A
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                  actgtaagccggtatggtgcagggttatagaat---------------AT-TTATA-TG-G--CAG-GCC--GC--A---T-----T--A---T------AAT-TAACT---G-----GC--GG---CCG--C--C----A----G----AA---A---TAA--T--T----TTTAGTGG-----C------CT------GC-----------C------C----------T---T--A----AT-TTCA-------T-G---GGC--G-GC--CCAGCTC--A-------------------------T--T----T----TA-T---T-A-TC-T----G-G--CGG-C-TC-T----GTGA--A----C--TAA-----T---T--T-T---A--T---G-TCT---G----------TGC-GAC----C-G-CC-----------A-C-----T-----T--A------T---TA-T--GTG-GC-GG-C-C-A-------CCA---C------TTT---A----T----TAGTTCT-TA-GGC--G-----GG--C---C----G-C-------ACTT-T-GT-A-A--T-T--T-A-TACT-----GG----C--GTCCC--G-TCA-------C-T-T------AAT-T------T--A--AC----T---G----GC--A--GC-C-G-C----CACT--TAT--A-------------T-Aattcggc
gi|12                         :                                                                                                                                                                                           actgtaagccggtatggtgcagggttatagaatttaatat---------------AT-TTAGG-TG-G--C-G-GTC--GC-CA-C-T-----T--T---T------TAT-C---------T--GGC--GG---CTG--C--C----A----G----AT---A---ATG--A--G----T------GGCAGCC---A--CC------AC-----------T------T----------T---T--AGT--TT-ATA--------T-G---G-C--G-GT--C--GC-ttcggc
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                  cggaagccggtacatgtagctgccagggtatagattaatA-TG-G--C-G-GTC--GC-CA-C-T-----T--T---T------TAT-C---------T--GCC--GG---CTG--C--C----A----G----AT---A---ATG--A--G----T------G-----C---A--CC------AC-----------CA-----C----------TTAAT--G----TT-ATA--------T-G---G-C--G-
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                           gcga--C-G-GCC--GC-CA-G-T-----T--A-----------AT-C-TAT---G-T--GTC--GG---CCG--C--C----A----C----AT---A---cctaa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                             gtactgaagccggttggtgccagggtatagaattaatatattC--GC-CA-C-T-----T--A---TACCACTTAA-TTTCT---G-C--GGT-------C-G--C--C----A----C----AT---GAT-TTA--A--T----T------GT----C---G--CC------GC-----------CA-----T----------T---T--A----TT-ATC--------T-G---G-C--G-GC--C--GT-C--AT------------------------A--T----G----AA-A---A-A-AT-G----G-A--TGG-C-CG-
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                           t-CA-C-T-----T--A-----------AT-C-TGT---G-T--GAC--GT---TTG--C--C----A----C----TT---AAT-TTAA-T--T----C------G-----CT--G--CC------GC-----------C-----------------------------TT-ATAGAATAAAAT-G---A-T--G-GC--C--GC-TT-G-------------------------A--T----A----GA-CA--T-A-AC-C----G-G--CGG-C----C----GTCA--T----A--T-A-----G---A--T-C---T--A---A-T-----T----------GGC-ATT----A-G-CC-----------A-T-----A-----T--G---AA-T---TA-G--CTG-GC-AA-C-C-G-------CCA---C-----
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                               tacggaagccggtatgccaagggtatagaaaT---G-T--GGC--GGC--C-G--C--C----A----CTTCAAT-------TTA--T--C----TG-----G-----CG--G--CC------GC-----------C------------------------A----GT-ATA--------T-G---G-C--G-AC--C--GC-C--AG------------------------A--T----A----A------T-A----T----GTG--AGG-C----C----ACCA--G----A--TAG-----GCCTA--A-T---A--A---G-T----------------GGC-GGC----C-G-CC-----------A-C-----T-----T--A---AC-T---TA-cttaattctatagggaagtcgaggtaggtgccagggtaggagaattgataattatatctcggggccgccacttatttatgtgggaccgccag
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          acggaagccggtaggtgccagggtattagaaattaatatatttattgtggcggc--CC------GC-----------CA-----C----------T---T--CAAT-TT-ATC--------T-G---G-C--G-GC--C--GC-C--A-------------------------G--T----A-----------T-A----T----G-G--CGA-C----C----GCCA--G----A--TAA-----T---A--T------------G-T-----G----------AG--G-C----C-A-CC-----------A-G-----A-----T--AG--GC-C---TA-A--TAA-GT-GG-CG--G-------CCGC--C-----ACTT---AAC--T----TA----T-ctttaattggtatgattggcggccgccaagttatcttctctctctctc
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 acggaaagccggtagcgtgccagggtatag----------T---T--T----TC-ATA--------T-G---A-C--G-GC--C--GC-C--AG------------------------A--T----A----A------T-A-AA-T----G-G--CG-----G-C----GACA-------A--TTA-----A---A--T-C---A--T---G-T----------------GGC-GAC----C-G-Ccg
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tcggccatccatt--G----TT-AAG--------T-G---G-C--G-GC--C--GC-C--ACTTATTAGGCCTATCTGGTGGCCTCA--C----A----TA-T---T-A-TC-T----G-G--CGG-T----C----GCCA--T----A--T-----------A--C-T-----------------------------GGC-GGC----C-G-CC-----------A-G-----A-----TA-A---AT-T---GA-A--GTG-GC-GG-C-C-G-------CCA---C-----Aagaaattaagtggtataagtggcg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          catataa----TT-ATA--------T-G---G-CA-G-GC--C--GC----A-------------------------T--T----AT---AA-T---T-A-AC-T----G-G--CGG-C-CG-C------CA--G----AAATAA-----T---T--T-T---T--A---G-T-----G----------G----CC----T-G-CC-------------C-----T-----T--A---AT-T---TC-A--TGG-GC-GG-C-----------CCAGCTC-----ATTTT--A----T----TA----T-CT-GGC--------GG--CT--CT---G-T-------G--A-A-CT-A-A--T-TTTATG-T-CT-----GTG---C--GACC---G-CCA-------C-T-T------A---T------T--A--TG----T---G----GC--G--GC-C-A-C----CAC---TTT--A-------------T-TA-G--T----T-----C----TTAGG--C--GGGC-C---G--CACTTTGTAA--------T---T-T--A-----T--A-------C----T----G---GC-G-T--C-C------C---GT-CA-C-TT---A---A------TT--T--A----A-----------CTG---------G-----CA----G-C---C-GCCA----
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       actgtaagccggtatggtgcagggttatagaatttaatatat----TT-ATG--------T-G-----C--GAGC--C--GC-C--AT------------------------A--T----A----AA-T---T-A--C-T----G-C--CCG-C-CG-C-----CAA--G----A--TAA-----A---T--T-T---A--A---G-T-----G----------CGC-Gcttatatattcggc
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                acggaaagccggtagcgtgccagggtatagaattaatatttcatgtgggcggttgctacttagat----TT-ATG--------T-G---G-C--G-GC--C--GA-C--AC------------------------A--T----A----GA-T---T-A-AC-T----G-G--CGG-C-CG-
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gtactgaagccggttggtgccagggtatagaattaatatat----TT-ATC--------T-G---G-C--G-GC--C--GC-C--A-------------------------
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ctacggaagccggtaaggtgccagggtatagattaattat----TT-ATC--------T-G---G-C--G-GC--C--GC-C--AC------------------------A--T----A----AA-T---ttttggcataataaatat
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ctgaaactactggtgccagggcatagaaataatat----TT-ATG--------T-G---G-C--G-GC--C--GC-C--AG------------------------A--T----A----AA-TG--T-A-AG-T----G-G--atgtaagtggt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ctgaaactactggtgccagggcatagaaataatatat----TT-GTA--------T-G---G-C--G-GC--C--GC-C--AGATAAATTACGGTAAG---------A--T----A----AA-T---T-A-AC-T----G-G--CGG-C-CG-C----t
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ctgaagtcggtaggtgccagggtatagaatcagttaatttaagtggcggtaat----TT-A-C--------T-G---G-CACG-CC--C--GC-C--AT------------------------A--T----A----AA-T---T-A-AC-T----G-GTACGG-C-CGAA----GCCAAGA----A--TAA-----T---A--T-T---AT-A---G-C-----T----------GGC-GGC----C-ca
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ggaagccggtaggtgccagggtatcagaattaatattggcggcccgattgataatgcccgcaaaacttattcactcctggcggaaC--------T-G---G-C--G-GT--C---C-C--AC------------------------A--T----A----AA-T-----A-AG-T----G-G--CGG-C-CC-C----G--A--G----A--TAT-----A---A--T-T---ATCA---A-T-----TCTCCTACCCTGGC-ACC----T-A-CCTCGACTTCCCTA-T-----A-----G--A---AT-TAAGTA-T--CTATGT-GG-CG--G-------CCG---C-----CCTT---AAT--T----TA----TGTG------C-----GG--CG--C------C-------A--C----T-G----T-T--A---T-CT-----GG----C--AAC----G-CCA-------G-TAT------A---T------T--A--TA----T---G----GT--G--TC-C-G-C----CA----GAA--A-------------T-AA-ATTT----T--A-AG----T---G--G--CGGG-C---G--C-C------AACAT----C---A-T--T-----T--A--T----C----T----G---GC-G-A--C-C----G-C------CA-C-TTT-TA---ATTGTTTTT--T--A----A-----------CTG---------G-----CG----G-C---C-GCCA----C--T--T----------AT---T-----A-G---TTGG-C-G------G-CC----GCCAG--------TTAAA----T-------T--A-A---G----T------G--GGGC-C---GC-CAGC---A-AT-A-A--AT-T-T-A--AG----T--A-GC-G-G----CCGC---C----AC--T----T-AA--T-T-T--TCA---A--G---GC-GG-CC-G--CCA-C---T-------A-G----T--T---G-TG--G----CG--A--CAGCC----AC--A---T--A----A---
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tacggaagccggtatgccaagggtatagaaattaatat--------T-G---G-C--A-GCGCC--GC-C--AC------------------------A--A----A----AA-T---A-A-AG-T----G-G--CGG-C-CG-C----CACA--C----A--TAA-----A---T--T-T---A--A---G-T----------------GGC-GGT----C-G-CC-----------C-A-----A-----T--A---A------TA-A---TG-GC-GG-GGTCG-------C-----C-----AGTTAA-A----T----TAAG--T-TT-GGC--C-----GG--C---C----GTC-------A--C-T-TC-A-A--T-T--A-T-T-TTTTG--G-----C--GGCC---G-CCAGTTCAACT-T-T------A---T---------A--TC----T---G----GC-----GC-C-G-C----AA----TA---A-------------T-AA-G--G----T--G-GC----C---G--T--CGACGC---G--C-C------A--------CAAGT-A--A-----C--A--T----TAGAGT----G---GC-G-G--C-C----G-C------CACT-TTA-AA---T------TT--T--ATT--A-----------TGCTG-------G-----CG----G-C---C-GCCA----G--A--T---A-----AA-------T-AA-G---TG-G-C-G------G-CC----GCCAG--------TTA-A----T-------T--A-A---G----TG-----G--CGGGCC---GC-CA-C---A-ATAA-A--
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   acggaagccggtaggtgccagggtattagaaattaatata--------T-G---G-C--G-GC--C--GC-C--A-------------------------AT-C----ATACCAA-T---T-A-AAGT----G-G--CAG-C-GC-C----GCCA--C----A---AA-----A---A--T-A---A--A---G-T-----G----------G-C-GGC----C-G-CC-----------A-C-----A-----C--ATAAAT-T---TA-A--GTG-GC-GG-T-C-G-------CC----C-----AATA---A----T----AA----T----GGC--G-----GGGTCG--C------C-------AGTT-A-A----A--T-T--A-AGT-TT-----GGC---C--GGCC---G-TCA-------C-T-TCA----A---T------T--A--TT----TTTTG----GC--G--GC-C-G-C----CA---------G-------------T-------T----C--A-AC----T-------------------------------------------T-T--A-----T--A--T----C----T----G---GC-G----C-C----G-C---A-------ATA-A---------------T--A----A-----------G-----------G-----TG----G-C---C-GTC---------------G-----A----------------------C-G--C---G-CC----ACAAGTAA-----C---A----T-------T--AGA---G----T------GG-CGG--CC--GC-CA-C---T-TTAA-A--TT-T-T-A--T--------T-A----------TG----C--------------------------------T--G---GC-GG-CC-G--CCAGA---TA------A-A----T--A---AGTG--G----CG--G--CCGCC----AG--T---T--A----A---TTA-A---G-------T------G-G-C-GGGCCG-CCA-C--------A----A--T--A--A---AT-ctttaattggtatgattggcggccgccaagttatcttctctctctctc
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   g-G---G-C--G-GC--C--GC-C--AT------------------------A--C----A----AA-T---T-A-AG-T----A-G--CGG-T-CG-tcctaa
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      caacg----A----AA-T---G-A-AG-T----G-G--CGA-C-CG-C------CA--G----A--TAA--------------T---A--A---G-T----------------GAC-AAT----C-G-CC-----------A-CT----T-----T--A---AT-T---CA-T--CTG-GC-GG-C-C-G-------C--------------T---A----T----T------------------------------------C-------A---------A-A--T-T--A-A-C-TG-----G-----C--GGCC---G-CCA-------C-A-TAG----A---T------T--A--AG----T---G----GC--G--AC-C-A-CTAAATA----TAT--A-------------T-GA-A--T----T--atctgcacttaatttatatggaggccatcagtgctttctaatagcgaccgccaattattcaactctccttctcaaaacgaaagagatgtgcaatttgtgtaacatcc
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tacagaagccggtaggtgctaggatatag----A----AA-T---T-A-AG-T----G-A--CGG-T-CG-CCAATACCA--A----A--TAA---------A--T-C---A--A---G-T----------------GAC-GGT----C-G-TC-----------A-G-----A-----T--A---Aaac
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  agtt-T---T-A-TC-T----G-A--CGA-C-CGTC----ACTT--G----A--TT------T---A--T-T---T--G---G-T-----ATT--------GGC-GAC----C-G-TC-----------A-C-----T-----T--A---AT-T---TA-A--CTatga
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -T----G-G--CGG-C-CG-C------CA--G----A--TAA---------A--TGT---A--A---G-T-----G----------Gatga
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ctgaaactactggtgccagggcatagaaataatatatttatg-C----GCCA--GCT--A--TAA-----T---A--T-T---A--T---TCT-----T----------GGC-TTC----G-G-CC-----------G-T-----ACCAGTT--A---AT-T---TA-T--ATG-GC-GGGCGT-G-------CCA----------------G----T----AA----T-TC-CGC--CA----GG--AG--T----G--------------A-AT-A-A--G-T------T-TT-----G-----C--GG-----G--CA---------T-T------A---T------C--A--AT----C---G--------G--GC-C-G-C----CA-----AT--A-------------T-TA-A--T----T--t
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ggaagccggtaggtgccagggtatcagCA--T----A--TAA-----G------T-T---A--A---G-T-----G----------G-C-GGC----C-G-CC-----------A-C-----T-----T--A------T---TA-GGCCTA-TCTGG-TG--G-------CCT---C-----ACAT---A----T----TA----T-CT-GGC--G-----GT--CG--C------C-------A--T---AT-A---------------CTG----G-----C--GGCC---G-CCA-------G-A-T------AAATT------G--A--AG----T---G----GC--G--GC-C-G-C----CA----CAgcc
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ---A--T-T---T--A---G-T-----G----------G-----T----C-G-CC-----------A-C-----T-----T--A---AT-C---TA-T--GTG-GC-GG-C-C-G-------CCA---G-------TT---A----A----T-----T-TG-AATAGC-----GG--C---C----G-C-------C--A-G-ATGA-A--T-T--A-A-A-GT-----GG----C--GATT---G-TCA-------C-T-T------A---T------T--A--TC----T---G----GC--G--GT-C-G-C----CA----
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tacagaagccggtaggtgctaggatatagaattcatatat--T-T---A--ATCTG-T-----GT---------GAC-GTT----T-G-CC-----------A-C-----T-----T--A---AT-T---TA-A--TTC-GC------T-G-------CCG---C------CTT---A----TAGAATA----A-AA-TGA--T-----GG--C---C----G-C-------T--T-G-AT-AGA--CAT--A-A-C-CG-----G-----C--GGCC---G-TCA-------T-A-T------AGA-T------CTAA--T-----T---G----GC--A--TT-A-G-C----CA----TAT--G----------------A-A--T----T--A-GC----T---G--G--CAAC-C---G--C-C------A--------C---T-T--A-----cttcatttaac
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    cac-----G----------GGC-GAT----C-G-CT-----------T-C-----T-----T--A---AT-T---TA-T--ATG-GC-GG-C-T-G---------G---C-----ACTT---A----------A----T-TT-GGC--T-----GG--CG---------------------------------------A-T-CT-----G------------------CA-------C-T-T------AAT-T------T--A--TA----T---G----GA--G--GC-C-A-T----CAGTGCTTT--C-------------T-AA---------T--A-G---------------CGAC-C---G--C-C------A--------A---T-T--A-----T--a
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    caacGC-GGT----C-G-CC-----------A-C-----A-----T--G---AT-T---TA-A--TTG-TC-GC-CGC---------------C-----ATTT---A----T----TA----TCTG-G----C-----GG--C---C----GTC-------A--T-A-tcaactctccttctcaaaacgaaagagatgtgcaatttgtgtaacatcc
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tcggccatccattttttcaC-----------A-T-----A-----T--A---AG-T---TA-A--GTG-GC-GG-C-C-G-------CCA---C-----------------T----TA----T-TA-GGC--CTATCTGG--TG-------G-C-------C--T-C-AC-ATA--T-T--A---T-CT-----GG----C--GGTC---G-CCA-----------T------A---T---------A---C----T---G----GC--G--GC-C-G-C----CA----GAT--A----------------A-A--T----TG-A-AG----T---G--G--CGGC-C---G--C-C------A--------C---agaaattaagtggtataagtggcg
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            -----T--A---AT-T---TA-A--CTA-GC-GA-C-----------CTT---C-----ACTT---A----T----TA----TCTG-Ga
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tacggaagctgggaggtgccaggggcagggtatataattgatattcatttatgtggtagtcgttacttcattttacttgcggcttTG-GC-GG-C-C-G-------CCA---CTTCA-ATTT---A----T----C-------TG-G----C-----GG--C---C----G-C----------C-A-GT-A------T--A------T-----GG----C--GACC---G-CCA-------G-A-T------A---A------T--A--TG----T---G----A---G--GC-C-A-C----CA----GAT--AGGCC---------T-AA---------T--A-AG----T---G--G--CGGC-C---G--C-C------A--------C---T-T--A-----aggtcgc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    catataagtA---T-----ATTT---A----T-----A----T----GGC--A-----GG--C---C----G-C-------A--T-T-AT-A-A--T-T--A-A-C-TG-----G-----C--GGCC---G-CCA-------G-A-A------A---T------A--ATTTT----T---A----GT--G--GC-CTG-C----CC----T------------------T-AA-T--T----T--C-AT----G---G--G--CGGC-CCA-G--CTC------AT-------T---T-T--AT----T--A--T----C----T----G---GC-G-G--C------------------T-CTG-TG---A------AC--T--A----ATTTTATGTCTGT-----------G-----CG----A-C---C-GCCA----C--T--T---A-----------T--T-AT-G---TG-G-C-G------G-CC----ACCAC--------T---T----T--A----T--T-A---G----TTCTTAGG--CGGGCC---G--CA-C---T-TTGT-A--AT-T-T-A--TA----C-----T-G-GCGTCCCGT---C----AC--T----T-AA--T-T-TAAC-----T--G---GC-AG-CC-G--CCA-C---T-------T-A----T--AT--A-T---T----CG--G--Cca
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        actgtaagccggtatggtgcagggttatagaatttaat---C-----ACTT---AA---T----TT----C-TGCGGT--C-----G---C---C----A-C-------A--T-G-AT------T-T--A-A-T--T-----G-----T--CGCC---G-CCA-------T-T-T------A---T------T--A--TC----T---G----GC--G--GC-C-G-T----CA----TATGAA-------------A-AA-A--T----G--G-AT----G---G--C--CGA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ----T----TA----T-TG-TGG--C-----GG--CC--C----G-C----------C-A-CTTA-A--T-T--A-A-C-TG-----G-----C--GGCC---G-CCA-------C-T-T------AT--T------T--A--TC----T---G----GC--G--GC-C-G-C----CAG---CATA-A-------------TAAA-A--T----TTAA-AG----T---G--G--CGGC-C---G--C-C------A--------C---TCT--AATGT-T--ACTT----G----T----G---GC-GCG--T-C----GAC---GGCCA-C-CT-------T------AT--T--A----T-----------T-----------G-----CG----G-----C-GCCA----G--A--TATAA-----AGT---T--G-AA-C---TG-G-C-G------G-CC----GCCAA--------A---A----A--A----T--A-A---T----T------G--AAG--T---G----------------------------------------AC-G-G----CCGGC--C----AAACT----T-AA--T-T-TAACTG---G--C---GA-CC-CC-G--CCA-T---T-------A-T----T--A---T-TGG-G----CG--A--CCGCC----AC--T---T--A----AATTT---ATGTG-------T------G-G-C-G----G-CCG-C--------C----ACTT--T--A---TT-T---T-T---GT--G-GC--G--GCGCTG---C-CACTT-TAA-T-T---GG-TATGATTGGCGG-CC-G-CC----------AA------GT-T-AT----------CT--T-gtataagtggcg
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           acggaagccggtaggtgccagggtattagaaattaatatatGC--C-----AG--GG--T----A-T-------A--G-A-ATCA-G--T-T--A-A-T-TTAA---G-----T--GGCG---G-TAA-------T-T-T------G---T---------A--T---------G----GC--G--GC-C-G-C----CA----GAT--AAATTACGGTAAGAT-AA-A--T----T--A-AC----T---G--G--CGGC-C---G--C-C------A--------ctctctctctc
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ctgaagtcggtaggt--C-----GA--CG--C------C-------A--T-A--T-A-ACAT-T--A-A-G-TG-----G-----T--GG-T---G-C-A-------C-T-C------A---T------T--A--TC----T---G----GC--A--GC-C-G-G----CA----GAT--A---------------AA------------A-AG----T---G--G--CGAC-C---G--C-C------A--------
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        g-----GG--CGACC----G-CCAG----A--T-A-AT-A-A--G-T--G-A----------------C--AATC---G-CCA-------C-T-TTA----A---TT-----C--A--TC----T---G----GC--G--GC-C-G-C----------TAT--T-------------C-AA-A--T----T--A-AC----T---G--G--CGGC-C---G--C-C------A--------C---A-T--A-----G--A--T----TAAG-T----G---GC-G-A--C-C----A-CTAAA--TA-T-ATA-TG---A------AT--T--tcctaa
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tacagaagccggtaggtgctaggatatag--CG--C----G-C-------ACTT-A-A----A--T-T--T-A-T-CTTG---G-----C--GGCG---G-GCA-------G-T-A------A---T------TT-A--TA----T---G----GC--G--GCTC-G-C-----------AC--A-------------T-AA-A--TC---T--A-AG----T---A--G--CAAC-C---G--C-C------acttcatttaac
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             acggaaagccggtagcgtgccagggtatagaattaatatttcatgtg-C-------A--T-A--T-A-AG-T-T--A-A-G-TG-----G-----C--GGCC---G-CCA-------C-T-T------A---TTAGGCCT--A--TC----T---G----GT--G--GC-C---T----CA----CAT---------------------A--T----T--A-TC----T---G--G--CGGT-C---G--C-C------A--------------T--A-----T--A-------C----T----G---GC-G-G--C-C----G-C------CA-G-AT---A---A------AT--TGAA----G-----------TG----------G-----CG----G-C---C-GCCA----
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      --T-A-AT-A-T--T-T--A------T-----G-----T--GGCT---G-TCG-------C-C--------A----------C--A--AC----TAGTG----GC--G--GC-C-G-C----CT----TG---A---------------AA-A--T----T--A-AG----T---G--G--CGGC-C---G--C-T------A--------C---T-T--AAATT-T--A--TTG--C----T----G---GC-G-G--C-C----C-C---A--CT-T-A--------A------TT--T--A----A-----------CTG---------G-----CG----G-C---C-GCCA----A--C--T---A-----A--------T-AA-G---T--G---G--C---GGCC----GCCAGTTAAAAAAC---AAT--T--A----A--A-A---G----T------GG-CGGT-C---GC-CA-G-----ATAA-ATGATGT-T-G--GC----G--C-CC-G------C------C----AC--T----T-AAAAT-T-TATTTC---T--G---GC-GG-AC-A--CCATA---T-------A-A----T--A--------------------------------------------------T---A---C-------T------G-G-C-G------TTG-C----------------C--A--G---AT-A---ACA---GT--G-GC--G--CCG--------CACAT-AAA-T-T-A-AG--------GGCGG-CC-G-CC-A----CA-TAG------A--T-AC-----------T--T-A----A-TT--CTA-ca
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tacggaagccggtatgccaagggtatagaaat--T-A-AT-A-T--T-T--A-G-G-TG-----G-----C--GGTC---G-CCA-------C-T-T------T---T------T--A--TC----T---G----GC--G--GC-T-G-C----CA----GAT--A---------------A----------T--G-AG----T---G--G--CAGC-C---A--C-C------A--------CTT-T-T--AGTT--T--A--T----A----T----G---GC-G-G--T-C----G-C---tagggaagtcgaggtaggtgccagggtaggagaattgataattatatctcggggccgccacttatttatgtgggaccgccag
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   cggaagccggtacatgtagctgccagggtatagat--T-A-AT-A-T--T-T--C-A-T-GT-----GGG---C--GGTT---G-CTA-------C-T-T------AGATT------T--A--TG----T---G-----C--GA-GC-C-G-C----C------AT--A-------------T-AA-A--T----T----AC----T---G--C--CCGC-C---G--C-C------A--------
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        acggaaagccggtagcgtgccagggtatagaat-A-AT-A-A--T-T--G------------G-----C--GGTC---G-CTA---------T-T------A---GAAAG--C--A---C----T---G----AT--G--GC-C-T-C----CA----TAT------------------AA-A--T----T--A-AG----T---G--C--AGAT-C---G--C-C------A--------G---C-C--A-----A--A--T----TAAG-T----G---CC-A-G--C-C----G-C------CA-T-AT---A---A------AT--T--A----A-----------GAA---------G-----CG----A-T---C-GCCagataaatttaagtgcgcg
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        caacgT-A-A--T-T--T-A-A-CTA----G-----C--GACC---T-TCA-------C-T-T------A---T------T--A--TC----T---G----GA--G--GT-C-G-C----caactctccttctcaaaacgaaagagatgtgcaatttgtgtaacatcc
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tacggaagctgggaggtgccaggggcagggtatataattgatattcatttatgtggtagtcgttacttcattttacttgcggcttT-A-A--T-T--C-A-T-AT-----G---------GCTAATG-CCA-------A-T-T------AGA-T------CT-A--TA----T---G----AC--G--GC-C-G-C----CGGT--TAT--G-------------T-CT-A--T----C--A-A---------G-----CGGC-C---A--T-C------AT-------T---T-T--A-----T-----T----C----TATAAG---GC-G-G--C-A----G-C---G--AA-T--T---A---A------AT--T--A----A-----------------------G-----TG----G-CAAAC-GTCA----C--A--C---A-----GA----T--T-AA-G---T--G-
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  --T-T--A-A-T-CTATGTGG-----C--GGCC---G-CCA-------G-T-T------A-------------A--TT----T---GAATAGC--G--GC-C-G-C----C------AG--A-------------T-GA-A--T----TA-A-AG----T---G--G--CGAT-T---G--T-C------A--------C---T-T--AT----T--A--T----C----T----G---GC-G-G--T-C----G-C---gctggcaaccgccacttaa
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tacagaagccggtaggtgctaggatatagaattcatatatatttagtggtcgccac--T-T--A-A-T-CT-----GTGTGAC--GTTT---G-CCA-------C-T-T------AAT-T------T--A--AT----T---C----GC--T--GC-C-G-C----CT----TAT--A---------------GA-A--T----A--A-AA----T---G--A--TGGC-C---G--C-TTGATAGA--------C--------A-----T--A--A----C----C----G---GC-G-G--C-C----G-T------CA-T-ATA-GATCTA------AT--T--G----------------------------G-----CA----T-T---A-GCCA----T--A--T---G-----AAT---T-----A-GC--T--G---G--CA--A-CC----GCCAcacttcatttaac
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cac-----G-----C--GGCC---G-CCA-------C-T-TCA----A---T------TT-A--TC----T---G----GC--G--GC-C-G-C----CA-----GT--A-------------T-A---------------------T---G--G--CGAC-C---G--C-C------AG-------A---T-A--A-----T--A--T----G----T----G---A--G-G--C-C----A-C------CA-G-ATA-GGCCTA------AT--A--A----G-----------TG----------G-----CG----G-C---C-GCCA----cttaa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    catataagttaag-----G-----T--GGCT---G-CCA-------C-T-C------A---T------T--A--TC----T---G----GC--A--GC-C-G-C----CA----GAT--A---------------AA------------A-AG----T---G--G--CGAC-C---G--C-C------A--------C---C-T--A-----A--A--T----caca
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cggaagccggtacatgtagctgccagggtatagattaat-----G-----C--GATC---G-CTT-------C-T-T------AAT-T------T--A--TA----T---G----GC--G--GC-T-G-G----CA----C-T----------------T-AA-T--T----T--G-GC----T---G--G--CGAT-C---T--G-C------A--------C---T-T--AATT--T--A--T----A----T----G---GA-G-G--C-CATCAG-T---G--C--T-TT---------------C--T--A----A-----------TA----------G-----CG----A-C---C-GCCA----cacttttagtttatatggcggtcgc
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           caacgg-----G-----C--GGTC---G-CCA-------C-T-T------T---T------T--A--TC----T---G----CC--G--GC-T-G-C----CA----GAT--A---------------A----------T--G-AG----T---G--C----AC-C---A--C-C------A--------C---T-T--AATGT-T--A--T----A----T----G---GC-G-attattcaactctccttctcaaaacgaaagagatgtgcaatttgtgtaacatcc
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gcga-----C--GGCC---ATCCA-------T-T-T------T---TT-----C--A--TA----T---G----AC--G--GC-C-G-C----CA----GATA-A-------------T-AA-A------------------T---G--G--CGG--C---G--A-C------A--------A---T-T--A-----A--A--T----CATG-T----G---GC-G-A--C-C----G-C-------------A-GA---A------AT--T--A----A-----------catcctaa
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      t-----C--GGCC---G-CCA-------G-T-T------AA--T------CT-A--TG----T---G----TC--G--GC-C-G-C----CA----CATAAA-------------T-AT-A--T----T--A-AT----T---gtggtataagtggcg
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gtactgaagccggttggtgccagggtatagT---A-CCA-------C-T-T------A---A------T--T--TC----T---G-----C--G--GT-C-G-C----CA----CATG-A-------------T-------T----T--A-AT----T---G--T--CG-C-C---G--C-C------A--------T---T-T--A-----TT-A--T----C----T----G---GC-G-G--C-C----G-T------CA-T-ATG-AA---A------A------A----A-----------T-----------GGA---TG----G-C---C-G
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      t-CCA-------C-T-T------ACATT------T--A--TC----T---G----GC--G--GC-C-G-C----CA----CATAAA-------------T-AT-A--T----T--A-taagtggcg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ctgaaactactggtgccagggcatagaaaA-------T-T-T------A---T------------TG----T---G----GC--G--GC-CCG-C----CA----CTT--A------------------A--T----T--A-AC----T---G--G--CGGC-C---G--C-C------A--------C---T-T--ATT---T--A--T----C----T----G---GC-G-G--C-C----G-CCA-G--CA-TAATA-AA---A------TT--T--A----AAG---------TG----------G-----CG----G-C---C-GCCACTCTA--A--T---GT----TAC---T--T----G---TG-G-C-G--C---G-TCGACGGCCAC--------C---T----T--A----T--T-A---T----T------G--CGG--C---GC-CAGA---T-ATAA-A--GT-T-G-A--AC----T--G-GC-G-G----CCG----CCAAAAA--A----T-AA--T-TGAAGTGA---C--G---GC-CG----G--CCA-AACTT-------A-ATT--T--A---A-CTG-G----CG--ACCCCGCC--------A---T--T----A---T---T---A-------TTG----G-G-C-G----A-CCG-C--------C----ACTT--A--A---AT-T---T-ATGTGT--G-GCG-G--CCG------C-CACt
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            acggaagccggtaggtgccagggtattagaaattaatat-T-T------A---T------TT-A--TC----T---G----GC--G--GC-C-G-C----CA----Ttttatttttgtggcggcgctgccactttaattggtatgattggcggccgccaagttatcttctctctctctc
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ctacggaagccggtaaggtgccagggtatagattaa-T------A---T------CT-A--TG----T---G----GC--G--GC-C-G-C----CC----T------------------T-AA-T--T----T--A-TG----T---G--C--GG---C---G--C-C------A--------C---T-G--T-----T--A--T----C----T----G---GC-A-A--C------G-C------CAGT-ATA--------------T--T--AT---A-----------T-----------GG----TG----T-C---C-GCCA----G--AAAT---A-----AAT---T--TTAA-G---T--GGC-GGGC---G-CC----AACAT--------C---A----T--T----T--A-T---C----T------GG-CGA--CC--GC-CA-C---T-TTTA-A--TTGT-T-T--TT----T--A-ACTG-G----CGG----C----CG--C----C-AC--T-T---ATTAGT-T--G---GC-GG-CC-G--CCA-G---TTA-----A-A----TTAA---G-T---G----GG--G--CCGCC----AGCAA---T--A----AATTT---A---AG------T------A-G-C-G----G-CCG-CC-------A----C--T--T--A---AT-TTTCA-A---G-----GC--GG-CCG------C-CAC-T-AG--T-T----G-T------GGCGA-CA-G-CC-A----CA-TAA------AT---------------AT--T-A----A-TT--TCT-ATACCCTTG-GC-ATACCtttggcataataaatat
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tacggaagcc---T------T--A--TG----T---G----GC--G--GC-C-G-------A----CAC--A-------------T-AG-A--T----T--A-AC----T---G--G--CGGC-C---G--cttaattctatagggaagtcgaggtaggtgccagggtaggagaattgataattatatctcggggccgccacttatttatgtgggaccgccag
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gtactgaagccggttggtgccagggtatagaattaatatatC----T---G----GCACG--CC-C-G-C----CA----TAT------------------AA-A--T----T--A-AC----T---GGTA--CGGC-CGAAG--C-C------AAGAATAATA---T-T--A-----T--A--G----C----T----G---GC-G-G--C-C----
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ggaagccggtaggtgccagggtatcagaattaatattggcggcccgattgataatgcccgcaaaacttattcactcctggcggaatta----T---G----GC--G--GC-C-G-C----CA----CAC--A-------------T-AA-A--T----TT-A-AG----T---G--G--CGGT-C---G--C-CC-----A--------A---T-A--A-----T--A-------A----T----G---GC-G-GGGT-C----G-C------CA-G-TTA------A------AT--T--A----AGTT--------T-----------GGC---CG----G-C---C-GTCACTTCA--A--T---T-----ATT---T--T-TT-G------G-C-G------G-CC----GCCAGTT------C---AACTTT--A----T--A----------T------C--TGG--C---GC-CG-C---A-ATAATA--AG-G-T-G--GC----CGTCGAC-GCG----CCA----C----AA--G----T-AA--C-----ATTAGAGT--G---GC-GG-CC-G--CCA-C---TTTA----A-A----T--T---T-T----------------------------A---T--T----A---T---G---C-------T------G-G-C-G----G-CCG-CC-------A----GA-T--A--A---AT-----A-A---GT--G-GC--GG-CCG------C-CA-GT-TAA-T-T-A-AG-T------GGCGGGCC-G-CC-A----CAATAA------AT---AT----------AT--T-A----ATTT--CTA-ATACCCTGGCAC-CTACC
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       acggaagcc----T---G----GC--G--GC-C-G-C----CA----CTT--A-------------T-TA-GGCC----T--A-TC----T---G--G--TGGC-C------T-C------A--------C---A-T--A-----TT-A--T----C----T----G---GC-G-G--T-C----G-C------CA-T-ATA--------------C--T--G----------------------------G-----CG----G-C---C-GCCA----G--A--T---A-----AAT---T--G-AA-G---TG-G-C-G------G-CC----GCCActttatttttgtggcggcgctgccactttaattggtatgattggcggccgccaagttatcttctctctctctc
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   catataagttaag----T---G----GC--G--GC-C-G-C----CA----C-T--T-------------C-AA-T--T----T--A-TC----T---G--G--CGGC-C---G--C-C------A-----------------G-----T--A--T----A----T----G---GC-G-A--C-C----G-C------CA-G-ATA--A---T------AT----------G-----------T-----------G-----AG----G-C---C-ACCA----G--A--T---AGGCCTAA-------T-AA-G---TG-G-C-G------G-CC----GCCAca
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   catataagttaag----T---G----GC--G--AC-C-G-C----CA----GAT--A------------------A--T-------A-AG----T---G--A--CAAT-C---G--C-C------A--------C---T-TTAA-----TTCA--T----C----T----G---GC-G-G--C-C----G-C---------T-ATT-CA---A------AT--T--A----A-----------CTG---------G-----CG----G-C---C-GCCA----C--A--T---A-----GA----T--T-AA-G---T--G---G--C---GACC----ACTAA------------A----T--A----T--A-ca
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tacagaagccggtaggtgctaggatatagaattcata----T---G----GC--G--GC-C-G-C----CA-----GT----------------T-AA-T--T----T--A-TC----T---T-------AC-C---G--T-A------A--------T---T-T--A-----T----------C----T----G---GC-G-G--C-C----G-C------CA-T-AC---A---A------AT--T--A------------------------------------------C---C-GCCA----C--T--T---A-----AAT---T--cttcatttaac
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               actgtaagccggtatggtgcagggttatagaatttaatatat----GC--G--AC-C-G-C----C------AT--A-------------T-AA-A--C----TAAA-AG----T---G--G--TGGC-T---G--C-C------A--------C---T-C--AT----T--A--T----C----T----G---GC-A-G--C-C----G-C------CA-G-ATA-AA---A------AG--T--G----------------------------G-----CG----A-C---C-GCCA----C--C--T---A-----AATA--T--T-AA-actttgtaatttatactggcgtcccgtcacttaatttaactggcagccgccacttatatattcggc
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             cggaagccggtacatgtagctgccagggtataga--G--GC-C-G-C----CA----GCT--A-------------T-AATA--T----T--ATTC----TTG-G--CTTCGGC-C---GTAC-C------A--------G---T-T--AATT--T--A--T----A----T----G---GC-G-G--G-C----G-T---G--C-----CA-GT---A------AT--T---------------------------------------------C---C-GCCA----GGAG--T---G-----AA-------T-AA-GTTTT--G-C-G-----------------GG--------C---AT---T--A----T--C-A---A----T---------CGGGCC---GC-CA-A---T-ATTA-A--TT-C-TGA--TA----C--C-CT-G-G----C
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ggaagccggtaggt-C-G-C----CA----TAT--A---------------AC-A--T----T--A-AG----T---G--G--TGGT-----G--C--------A--------C---T-C--A-----TT-A--T----C----T----G---GC-A-G--C-C----G-----G--CA-G-ATA-AA---A------AG--T--G----------------------------G-----CG----A-C---C-GCCA----
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             actgtaagccggtat----CA----TAT--A-------------T-A-----T----T--T-AG----T---G-------GT-C---G--C-C------A--------C---T-T--AATC--T--A--T----G----T----G---GC-G-G--C-C----G-C------CA-G-TTA-------------AT--TTGA----A-----------TA----------G-----CG----G-C---C-GCCA----G--A--T---G-----AAT---T--A-AA-G---T--G---G--C---GATT----GTCA---------C---T----T--A----T--T-ATCTG-----------G--CGGT-C---GC-CA-C---T-
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tacagaagccggtaggtgctaggatatagaatt-------------T-AA-T--T----T--A-AC----T---A--G--CGAC-C---T--T-C------A--------C---T-T--AT----T--A--T----C----T----G---GA-G-G--T-C----G-C---tcatttaac
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tacggaagctgggaggtgccaggggcagggtatataattgatattcatttatgtggtagtcgttacttcattttacttgcggctt-------------T-AA-T--T----T--A-AG----T---G--G--CG-------G--T-A------A--------T---T-T--G-----T--A--T--------------G---GC-G-G--C-C----G-C------CA-G-AT---A---A------AT--T--A----------------------------------CG------------GTAA----G--A--T---A-----AA----T--T-AA-C---TG-G-C-G------G-CC----GCCA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ctgaagtcggtaggtgccagggtatagaatcagt----T--A-AT----T---G--G--CGGT-C---G--C-T------A------------T-T--A-----G--A--AAGCAC----T----G---AT-G-G--C-C----T-C------CA-T-ATA------A------AT--T--A----AG----------T-----------G-----CA----GAT---C-GCCA----G--C--C---A-----AAT---T----AA-G---T--G-C-C--A---G-CC----GC-----------C---A----T--A----T--A-A---A----T------
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         caacgggcgatcgcttctta----T---G--G--CGGT-C---G--C-C------A--------CT--T-T--T-----T--A--T----C----T----G---CC-G-G--C-T----G-C------CA-G-AT-------A------AT--G--A----G-----------T-----------G-----C-----A-C---C-ACCA-------C--T---T-----AATG--T--T-AT-A---T--G---G--C---G-TC----GCttcaactctccttctcaaaacgaaagagatgtgcaatttgtgtaacatcc
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         --CGGT-T---G--C-T------A--------C---T-T--A-----G--A--T----T----T----ATGTGC-GAG--C-C----G-C------CA-T-ATA------A------AT--T--A----C-----------T-----------G-----CCC---G-C---C-GCCAA---G--A--T---A-----AAT---T--T-AA-G---T--G-C-G--C---G-tcctaa
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        acggaaagccggtagcgtgccagggtatagaattaatatttcatgtggg--CGGC-C---G--C-C------A--------G---T-T--AATC--T--A--T----G----T----G---TC-G-G--C-C----G-C------CA-C-ATA-AAT--AT-----AT--T--A----A-----------T-----------
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gtactgaagccggttggtgccagggtataga--C-C------A--------C---T-T--ACATT-T--A--T----C----T----G---GC-G-G--C-C----G-C------CA-C-ATA-AA---T------AT--
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ctgaaactactggtgccagggcatagaaataat------A--------T---T-T--A-----T--A--T--------------G---GCAG-G--C-C----G-C---A--T--T-ATA-------------AT--T--A----A-----------CTG---------G-----CG----G-C---C-GCCA----G--AAAT---A-----ATT---T--T-TA-G---T--G---G--C-----CT----GCC----------C---T----T--AATTTC--A-T---G----G------G--CGG--CCCAGCTCA-T---T-TTA--------T-T-A--TC----T--G-GC-G-G----CT-----C----TG--TGAACT-AA--T-T----TTA---T--GTCTGTGCGACC-G--CCA-C---T-------T-A----T--T---A-T---G----TG--G--CGGCC----ACC-ACTTT--A----T---T---A---G-------TTCTTA-G-G-C-G----GGCCG-C--------ACTTTG--T--A--A---TT-T---ATA---CT--G-GC--GTCCCGT-----C--ACTT-AAT-T-T-A-A--CT-----GGCAG-CC-G-CC-ACT--TA-TAT------AT-T-t
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      actgtaagccggtatggtgcagggttatagaatttaatat-T--A-----T--A--T----T----T----A---GT-G-G--T-C----G-C------CA-C-TTA-------------AT--C--T----A-----------T-----------GTGG--CG----G-C---C-GCCA----G-----T---T-----AAT---T--T-GA-A---TA-G-C-G------G-CC----GCCAG------------A----TGAA----TTAA-A---G----TG-----G--CGAT-T---GT-CA-C---T--TA--------T-T-A--TC----T--G-GC-G-G----TCGC---C----AC--T----T-CA--T-T-TAAcggc
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ctgaaacta----G---GC-G-G--T-T----G-C------TA-C-TTA-GA---T-------T--T--AT---G-----------T-----------G-----CGA---G-C---C-GCCA----T--A--T---A-----AAT---T-----A-C---T--G-C-C--C---G-CC----GCCAA--------G---A----T--AAATTT--A-A---G----T------G--CGgt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            acggaaagccggtagcgtgccagggtatagaattaatatttcatgtg-T-ATA-GA---A-------T--T--A----A-----------TATTTCATGTGGG-----CG----G-T---T-GCTA----C--T--T---A-----GAT---T--T-AT-G---T--G-C-G--A---G-CC----GC-----------C---A----T--A----T--A-A---ATTACT------GCCCGC--C---GC-CA-A---G-AT-A-A--AT-T-T-A--cg
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           acggaaagccggtagcgtgccaggg---A------AT--T--T----C-----------T-----------G-----CG----G-T---C-GCCA----C--A--T---G-----A-T---T--T-AA-T---T--G-T----C---G-CC----GCCAagtgcgcg
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tcggccatccattttttcatatgacggccgccagataataaa--A----A-----------T-----------GG----CG----G-C---C-GCCA----G--A--T---A-----AATAA-T--T-AA-aagtggtataagtggcg
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ctacggaagccggtaaggtgccagggtataga-----------G-----CG----G-C---C-GCCA----C--T--T---C-----AAT---T--T-AT-C---TG-G-C-G------G-CC----GCCAG--------T---A----T--A----T--G-----------------G--CGAC-C---GC-CA-----G-ATAA-T--ATGT-G-A--GG----C--C-AC---------------C----AG--A----T-AG--G-CCTAATAAG--T--G---GC-GG-CC-G--CCA-ttggcataataaatat
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      catataagttaag-----CG----G-C---C-GCCA----G-----T---T-----AAT---C--T-AT-G---T--GTC-G------G-CC----GCCA---------C---A----T--A----caca
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gtactgaagccggttggtgccagggtatagaattaatatatt-AA-G---T--G---G--C---GACC----GCCAG------------A----T--AA---T--A-A---G----T------GA-CAAT-C---GC-CA-C---T-TT---A--AT-T-C-A--TC----T--G-GC-G-G----CCG----C----TA--T----T-CA-------AATTAAC-T--G---GC-GG-CC-G--CCACA---T-------AGA----TTAA---G-TG--G----CG--A--CCACT----AA--A---T--AT---A---T---A---
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tacagaagccggtaggtgctaggatatagaattca--------C---A----T--A----T--A-A---G----TTAAGTGG--CGG--CC--GC-CA-C---TTATTA-G--GC-C-T-A--TC----T--G-GT-G-G----CCT----C----AC----------A--T-----ATTA---TCTG---GC-GG-TC-G--CCATA---T-------A-C----T--G---------G----CG--G--CCGCC----AG--A---TA-A----A---TTGAA---G-------T------G-G-C-G----G-CCG-C--------catttaac
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ----T--A----T--A-T---G-----------G--CGG--CT--GG-CA-C---T--TAA-----T-T-T-G--GC----T--G-GC-G-AT---CTG----C----AC--T----T-AA--T-T-TA--TA---T--G---GA-GG-CC-A--TCA-G---TGCTTTCTA-A----T--A---------G----CG--A--CCGCC----Acaca
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         caacgggcgatcgcttcttaatt----T--A-A---G----T------GG-CGG--TT--GC-CAGC---T-A-------AT-T-C-A--T----------AT-G-G----CTAATGCC----AA--T----T-AG--A-TCTA--TA---T--G---AC-GG-CC-G--CCG-G---T-------T-A----T--GTCTA-TCAAG----CG--G--CCATC----AT--T---TT-ATTCTA---T---A---A--------------G-G-C-G----G-CAG-CGA------A----T--T--A--A---AT-T---A-A---GT--G-GCA-A--ACGT-------CACAC-AGA-T-T-A-AG-attattcaactctccttctcaaaacgaaagagatgtgcaatttgtgtaacatcc
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ca--C---GC-CA-C---TTATAC-C--AC-T-T-AATTT----C--T-GC-G-G----TCG----CC---AC--A----T-GA--T-T-TAATT-----------GT-CG-CC-G--CCA-T---T-------T-A----T--T---A-TCTGG----CG--G--CCGTC----AT--A---TGAA----A---A---A---A-------T------G-GAT-G----G-CCG-a
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              t--C---GC-CAGC---T-ATAA-T--AT-T-A-T--TCTTGGC--T-TC-G-G----CCGTAC-C----AG--T----T-AA--T-T-TA--TA---T--G---GC-GG-GC-GTGCCA-G---T-------A-A----T--------T---------------CCGCC----AG--G----------------------------------------------------------------A----G--T--G--A---AT-----A-A---GT--T-TT--G--CGG---------GCAT-TA--T-C-A-AT-CG-----GGC----C-G-CC-A---------------------AT----------AT--T-A----A-TT--CTG-ATACCCTGGCAC-CTACC
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ggaagccC-G-G----CCG----CC---AC--T----TCAA--T-T-TA--TC---T--G---GC-GG-CC-G--CCA-G---T-------A------T--A---T-G---G----CG--A--CCGCC----AG--A---T--A----A---T---A-----------T------GTG-A-G----G-CCA-C----------------C--A--G---AT-------A---G---------G--CC-------------T-AA----T-A-AG-T------GGCGG-CC-G-CC-A----CT-TAA------CT-T-AT----------AT--gcc
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          c----C----AC--T----T-AA--TCTGTG-TGA---C--G---TT-TG-CC-A--CT------T-------A-A----TTTA---A-T---T----CGCTG--CCGCCTTATAG--AA--T--A----A-------A---A-------T------G-A-T-G----G-CCG-CTT------G----A--T--A--G---ACAT---A-A---CC--G-GC--GG-CCGT-----C--ATAT-AGA-T-C-T-AA-TT-----GGCAT-TA-G-CC-A----TA-TGA------AT-T-Accaca
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ----C----AG--T----T-AA--T-T-TAA-------------GT-GG-CG-G--TAA-T---T-------T-G----T--A---T-G---G----CG--G--CCGCC----AG--A---T--A------------A---A-------T------T-A-C-G----G-T---A--------A----GA-T--A--A---AT-T---A-A---CT--G-GCG-G--CCGC-----C-gctggcaaccgccacttaa
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ctgaagtcggtaggtgccagggtatagaat----AG--T----T-GA-----ATAATTGG--C--G---GT-CG-CT-A--TTA-G---A-------A-AGCACT--G---A-T---G--------G--CCTCC----AT--A---T--A----AAT-T---A---A-------G------T-G-C-A----GATCG-CC-------A----G--CC-A--A---AT-T---A-A---GT--G-CCA-G--CCG------C-CATAT-AAA-T-T-A-AG--A-----AGCGA-TC-G-CC-a
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tacagaagccggtaggtgctaggatatagaattcataTA---T--G---AC-GG-CC-G--CCAGA---T-------A-A----T--A---AAT---GGCGGCG--A--CAATT----AA--A---T--C----A---T---G-----------T------G-G-C-G----A-CCG-C--------A----G-----A--A---AT-T---A-A---GT--G-Gcttcatttaac
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tcggccatccattttttca---T--G---GT-GG-CT-G--CCA-C---T-------C-A----T--T---A-TCTGG----CA--G--CCGCC----AG--A---T--A----A---A---A---AG------T------G-G-C-G----A-CCG-C--------tataagtggcg
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cggaagccggtacatgtagctgccagggtatagattaatatttaggtg---A-T---GA---CG--G--CCGCC----AG--A---T--A----A---TA--A---A-------T------G-G-C-G----G-CGA-C--------A----AT-T--A--A---AT-C---A-T---GT--G-GC--GA-CCG----------CAG-AAA-T-T-A-AG-cttttagtttatatggcggtcgc
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tcggccatccattttttcat---G----CG--G--TCGCC----A-------T--A--------T---A---C-------T------G-G-C-G----G-CCG-CC-------A----GA-T--A--A---AT-TG--A-A---GT--G-GCG-G--CCG------C-CACAtggtataagtggcg
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      catataagttaagtggcggccgccacttattaggcctatctggtggcctcacatattatctg---G----CG--G--CCGCC----AC--T---T--A----T---T---A---GGCCTATCT------G-G-T-G----G-CCT-C--------A-------C--A--T---AT-T---A-T---CT--G-GC--G----GT-----C-GCCAT-ATA-C-T-------------GGCGG-CC-G-CC-A----GA-TAA------AT-T-
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     catataagttaagtg---G----CG--A--CCGCC----AT--A---T--A----AAC-T---A---A-------A------A-G-T-G----G-TGG-C--------T----G--C--C--ACTCAT-T---A-T---CT--G-GCA-G--CCG------C-CAGAT-AAA-----A-AG-T------GGCGA-CC-G-CC-A----CC-TAA-----------AT----------AT--T-A----A--T--CT--ATACCCTGG-gaagtggcggccgccaca
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cggaagccggtacatgtagctg---G----CG--A--CCTCC----AG--A---T--A----A---T---A---AG------T------G-A-A-G----G-TCG-CT-------A----GT-T--A--A---AT-T---A-A---A---------G--CCG--------CAAGTAAAA-T-G-A-AG-TA------ACGA-CT-A-CC-A----CA-TAA------AT-GAAT----------AT--C-A----A-TT--AT--ATACCCTG
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tacggaagctgggaggtgccagggg---G----CG--G--CCGCC----AT--A---C--A----AAT-T---A---AG------T------A-G-C-G----G-TCG---------------------A--A---AT-C---A-A---GT--
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gaaagccggtaggttccaggtactattcaactacaatgtaatgttcatttatctttcagccacg---G----CG--A--C-GCC----AT--A---T--A----ACATT---A---AG------T------G-G-T-G----G-T-G-C--------A----C--T--C--A----T-T---A-T---CT--G-GCA-G--CCGG-----C--AGAT-AAA-----A-AG-T------GGCGA-CC-G-CC-A----Tc
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ---A---G-------T------G-A-C-G----G-TCG-CCAATACCAA----A--T--A--A---AT-C---A-A---GT--G-ACG-G--TCGT-------CAGAT-AAA-T-cctaa
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           agttaaatta---A-------T------G-G-C-G----G-CCG-CC-------A----GA-T--A--A---AT-T---A-------------------CGG-----T-AAGAT-AAA-T-T-A-A--CT-----GGCGG-CC-G-CC-A----ga
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ctgaagtcggtaggtgccagggtatagaatcagttaatttaagtggcggtaatttgt-------T------G-G-C-G----G-TCG-C--------C----A--T--A--T---AC-T-------------G-GC--GG-CCG------C-CAGAT-AAA-T-TGA-AG-T------GGCGG-CC-G-CC-A----CA-
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             catataagttaagtggcggccgccacttattaggcctatctggtggcctcacatattatc-------T------G-G-C-G----G-CCG-CC-------A----G--T--T--A---AT-T---T-A----T--C-TT--A--CCGT--------------AA-T-T-T-AT-CT-----GGCGG-CC-G-CC-A----TA-CAA------AT-T-ACCGCCACTTAAAT--T-AACTGA-TT--CT--ATACCCTGGCAC-CTACC
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ctgaagtc------G-G-C-G----G---G-C--------A----G--T--A--A---TT-T---A-T---AT--G-GC--G--GC-T-----CGCACAT-AAA-TCT-A-AG-TA------GCAA-CC-GCCC-A----CA-TGA------A----AT----------AT--T-A----A-TT--CT--ATACCCTGGCACGCTACC
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       acggaaagcc------G-G-C-G----G-TTG-C--------T----ACTT--A--G---AT-T---T-AT--GT--GCGA--G--CCG------C-CATAT-AAA-T-T-A----CT-----GCCCG-CC-G-CCAA----GA-TAA------AT-T-gccaagataaatttaagtgcgcg
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  acggaaagccggtagcgtgccagggtatagaattaatatttcatgtg------G-G-C-G----G-CCG-C--------C----A--T--ACAA---AT-T---A-A---GT--A-GC--G----GT-----C-----G-AAA-T-C-A-AGTC-------GTGG-CT-G-AA-A----GA-TAAATGAACAT-T-AC----------ATTGT-A----G-TTGAATA-GTACCTGGA-AC-CTACCtaagtgcgcg
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gaaagcc-G-C-G----G-TCG-CC-------AC---A--T--G--A---TT-T---A-A---TT--G-TC--G--CCG------C-CATTT-A---T-T-A--T-CT-----GGCGG-CC-G-TC-A----TA-TGA------A
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tcggccatccatttt--T--A--A---AT-T---A-A---GT--G-ACG-G--TCGCCAATAC-CAAAT-AAA-T-C-A-AG-T------GACGG-TC-G-TC-A----GA-TAA------AT-agaaattaagtggtataagtggcg
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          agt--A---AG-T---A-A---GT--G--CTGG--CTGC-----C-CA-AT-AAAGT-T-A-A--CA-----GGCAG-TC-G-CC-AGGAATA-TGA------AT---------------AT--T-A----A-TT--CTATATACCATAGCAC-CGACga
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aagccaT-T---A-T---GT--G-GC--GG-CCG------A-CACAT-AGA-T-T-A-A--CT-----GGCGG-CC-G-atctgtcaagtatattttaactggctgctgccattta
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gtactgaagccggttggtgccagggtatagaattaatatat-T---A-A---GA--G-GT--A--ACGA-----C-CACAT-AAT-A-C-A-AG-T------GGCGG-CC-G-GA-A----AA-TAA------AT-TGAT----------AT--T-G----G-TT--TT--CCATCTTGGCAC-TTACC
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ctacggaagct--G-GA--G--CCG------C-CACAT-AGA-T-T-G-AT-T------GACTG-CC-G-CC-A----GT-TAA------AT-GAAT----------AT--C-A----A-TT--GT--ATACCCTAGCAC-CTACCtt
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tacgggaggc-----C-CACTT-ACA-T-T-T-AT-CT-----GGCGG-CC-G-CC-A----CA-TAA------A--T-AT----------AT--T-A----T-TT--CT--ATGCCCTGGCAC-Cta
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          actgaagtctgtagacgca-----GGCGG-CC-G-CC-A----TA-CAA------AT-T-A
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gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gtactgaagcc-G-CC-A----TA-TAA------AT---AT----------AT--T-A----A-TT--CT--ATACCCTGGCAC-CTATCacacatagattaactggcggccg
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              actgaagcc-TAA------AT-T-AT--------------T-A----A-TT--CT--ATACCCTGGCAC-CTACC
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          actgaagcc-T-AT----------AT--T-A----A-TT--CT--ATACCCTGGCAC-CTACC
7 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): CGTATTTGAATAACAAGAATGTATAAATCTATCAAGCTTTAGCTTATAGATAAAGCACTTGCGTTATGTTAACAAATGGAATG
Unaligned ( gi|24 ): CGGTCGTCATCTAATCCATGTGGCGGCTGCTACATCAATTTCGTTGCGGACTCCATTTGAATTAAGGT
Unaligned ( gi|29 ): TACGGAAGCCGGTAGGTGCCAAGGATACTGAATTAATTATTTTATGTGGGG
Unaligned ( gi|31 ): CTGAAATGTGCAATAATAAAGTTGTATATAAGTACATACATCATG
Unaligned ( gi|36 ): TTAACATGTACTGAAGCCGGTAGGTGCCAGGGTAT
Unaligned ( gi|39 ): TCTACGGAAGCCGGTAGGTGACAGGGTATAGA
Unaligned ( gi|40 ): TTCTACGGAAGCCGGTAGGTGCAAGGGTATAG






Alignments
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lowQualScore                  :                          2      1   3 1      1   555555 1 1  55 1  4  2  333333 33 666 44 1111111111111111111111111111111111111111111 3       77  4 99  77 4  4 1         44444444444444444444444444444444444444444444  4     1  4      66  4  0    999999999999999999999      6 6  7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777   6  2          55555  5  5  1  1 22222222   5   4  2222   999  000000000000000000    888 6   99  1   1   8       00000     555555555    8 0 8   8  555   22222222222222222222222222    0    6  3   888888888888     99       44 333333333333333333   1     0          000     111   6     6  5  222  222  8 8 22222       0 88            3   6       5 4  00000    5    3     3      4   88     2222      777  1      8  44444        99  3333333333333333333333333  66      555555555555555555555555555555555555555555555555    3   88    111  3 6 3         2   000          2 77     555 3          6            3     
lowQualScore                  :                          .      .   . .      .   ...... . .  .. .  .  .  ...... .. ... .. ........................................... .       ..  . ..  .. .  . .         ............................................  .     .  .      ..  .  .    .....................      . .  ..........................................................   .  .          .....  .  .  .  . ........   .   .  ....   ...  ..................    ... .   ..  .   .   .       .....     .........    . . .   .  ...   ..........................    .    .  .   ............     ..       .. ..................   .     .          ...     ...   .     .  .  ...  ...  . . .....       . ..            .   .       . .  .....    .    .     .      .   ..     ....      ...  .      .  .....        ..  .........................  ..      ................................................    .   ..    ...  . . .         .   ...          . ..     ... .          .            .     
lowQualScore                  :                          7      8   6 8      8   222222 8 8  22 9  7  4  888888 99 555 22 1111111111111111111111111111111111111111111 6       55  0 55  55 0  0 0         00000000000000000000000000000000000000000000  0     0  0      11  4  0    555555555555555555555      7 7  7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777   7  5          77777  7  7  4  0 99999999   7   3  1111   000  000000000000000000    777 7   22  0   0   0       44444     222222222    0 8 0   0  555   88888888888888888888888888    2    7  3   000000000000     22       77 444444444444444444   0     2          777     777   7     7  6  222  000  0 0 22222       0 33            3   7       0 0  00000    5    3     3      0   00     5555      555  0      0  00000        22  0000000000000000000000000  99      333333333333333333333333333333333333333333333333    6   77    444  3 2 1         9   333          7 77     111 3          7            3     
consensus                     :                      ACCGGAAGCCG-GTA-G-GTGCCA-GGG------T-A-TA--G-AA-TT-AA---T-TA--T--AT--TGTG--------------------ATG-G-GCG-----------G-CCGCCACT-TA-A--TT--A-CT-GGCGGCCGCCA----------------------CTT----------------T--AA-TTTAANTG-GCGGCC--GC-CA-CTTA---TT---A--TCT-T---G-TGGCGG-CCCC----AC----ATA-TTA----TC--T-GC-G-CC-GC-----------C-CT--TAT-TAT-CTGGCGGCCGCCA---A-TA-AA-TT-AAGT--------GGC-GGCCGC----GCCAGATA------A-ATT--AAGT-GGCG-GCC-GCC--ACNTAATTTA-ACTGGCGG--C-CGCCA-C-----ACTTAT-TAT-TGG-GCCGNCGC-CA--T-AATAA---TTAAT-CT---GCGGCCGCC-AC-TTA-TTATN------TGGCG--GCCGCCACAT-ATA-A------NT----TAACTGGCGGCCGCCACTTA-T-ATCTG---GCG-GCCGC-CATAT-A-AAATTAA-T-G--CG-GCCGCCA-G--ATAAATTTAAGT-GCGCGCCGCCAGCNTAATTTTCAAGTGCGG-CGCCA-CTATAANATTNNTCCCGGCTTCGGCCG---CANTTAATT-TAATTATGGCGGCCG--CC------AN-T-AAT--AA----TGACG--GCCGCC--ANATA---A--T---A-A---T------GGCGG-CCG-C-A-GT--AAAT-TAA-GTGGC-G-CC-G-C-CACATAAAT-TAAGC-GGCGGCCGCC-ACATAAAT---A-TATTAATTCT-ATACCCTGGCAC-CTACC
Reference ( family-3983 )     :                      ACCGAAAGCCG-GTA-G-GTGCCA-GGG------T-A-TA--G-AA-TT-AA---T-TA--T--AT--TGTG--------------------ATG-G-GCG-----------G-CCGCCACT-TA-A--TT--A-CT-GNCGGCCGCCA----------------------CTT----------------T--AA-TTTAANTG-GCGGCC--GC-CA-CTTA---TT---A--TCT-T---G-TGGCGG-CGCC----AC----ATA-TTA----TN--T-GC-G-CC-GC-----------C-CT--TAT-TAT-CTGGCGGCCGCCA---A-TA-AA-TT-AANT--------GGC-GGCCGC----GCCAGATA------A-ATT--AAGTGGGCG-GCC-GCC--ACNTAATTTA-ACTGGCGG--C-CGCCA-C-----ACTTAT-TAT-TGG-GCCGGCGCGCA--T-AATAA---TTAAT-CT---GCGGCCGCC-AC-TTA-TTATN------TGGCG--GCCGCCANAT-ATA-A------AT----TAANTGGCGGCCGCCACTTA-T-ATCTG---GCG-GCCGC-CATAT-A-AAATTAA-T-G--CG-GCCGCCA-G--ATAAATTTAAGT-GCGCGCCGCCAGCATA-----TAAGTGCGG-CGCCA-CTATAAAATTTATCCCG----CGGCCG---CANTTAATT-TAATTATGGCGGCCG--CC------AN-T-AAT--AA----TG-CG--GCCGCC--ANATA---A--T---A-A---T------GGCGG-CCG-C-A-GT--AAAT-TAA-GTGGC-G-CC-G-C-CACATAAAT-TAAGC-GGCGGCCGCC-ACATAAAT-T-A-TATTAATTCT-ATACCCTGGCAC-CTACC
gi|1                          :                      ACTAAAAGCCGAGTA-G-GT-CCA-GGG------T-A-TA--G-A--TT-AA---T-TA--T--AT--TGTG--------------------ATG-GTGCG-----------G-CCGCCACTGTA-A--TT--A-TT-GTCGGCCGCCA----------------------CTT----------------T--AA-TTTAAATG-GCGGCC--GC-CA-CTTA---TT---A--TCC-TCT-G-TGGCGG-CGCC----AC----ATA-TTA----TC--T-GC-A-CC-GC-----------C-CT--TGT-TAT-CTGGCGGCCGCCA---A-CA-AA-TT-AACT--------GGC-GGCCGC----GCCAGATA------AGATT--AAGTGGGCG-TCC-GCC--ACATAATTTA-ACTAGCGG--CGTGCCA-C-----ACTTAT-TAT-TGG-GCCGGCGCGCA--T-AATAA---TTAAT-CT---GCGGCTGCC-AC-TTA-TCATC------TGGCG--GCCGCCATAT-ATA-A------AT----TAACTGCCGACCGCCACTTA-T-ATCTG---GCG-GCCGCGCATAT-AGAAATTAA-T-G--CG-GCCGCCA-G--ATGAATTTAAGT-GCGCGCCGCCAGCATA-----TAAGTGCGG-CGCCA-CTATAAAATTTATCCCA----CGGCTG---CAGTTAATTGTAATTATGGTCGCCG--CC------AA-T-AAT--AA----TG-CG--ACCGCC--AGATA---A--T---A-A---T------GGCGG-TCG-C-A-GT--AAAT-TAA-GTGGC-G-CC-GTC-CACATAAAT-TAAGCAGGCGGCCGCC-ATATAAAT-T-A-TATTAATTCTAATACCCTGG-AC-CCACC
gi|10                         :                           AAGCCA-GTC-G-GTGCTA-TGG------T-A-TATAG-AA-TT-AATATT-CA--T--AT--TCC----------------------T--G-GCG-----------A-CTGCCTGT-TA-ACTTT--A-TTGGGCAGCCAGCA----------------------CTTACTTATCTGTCAAGTAT--AT-TTTAACTG-GCTGCT--GC-CA-TTTA---
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    acggaaagccggtagcgtgccagggtatagaattaatatttcatgtgG-CG--ACCGCC--ATATA---AACT---A-AAAGT------GGTGG-CTG-C-C-AC--TCAT-TAT-CTGGCAG-CC-G-C-CAGATAAA---AAGT-GGCGACCGCC-ACCTAAAT------ATTAAT-CT-ATACCCTGGCAG-CTAC
gi|13                         :                                                                                                                                                                                     cggaagccggtacat----------------T--AA-GTTAAGTG-GCGGCC--GC-CA-CTTA---TT---AGGCCTAT---C-TGGTGG-CCTC----AC----ATA-TTA----TC--TGGCGG-TC-GC-----------C------A--TATACTGGCGGCCGCCAG--A-TA-AA-TTGAAGT--------GGC-GGCCGC----
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cataG-CG--GCCGCC--AGTTA---A--T---TTA---T--------C---TTA-C-C-GT--AATT-TAT-CTGGC-GGCC-G-C-CATACAAAT-TA---------CCGCC-ACTTAAAT-T-A--ACTGATTCT-ATACCCTGGCAC-CTACCcaca
gi|15                         :                 ctgaagtcGAAAGCCG-GTA-G-GTTCCA-GG-----------TA--C-TA-TTCAA---C-TA--C--AA--TGTA--------------------ATG-T-TCATTTATCTTTCAG-CCACGACT-TG-A--TT--------TCGACCGCTA----------------------CTT-------------------AA-TTTGTATG-GCGGCC--GC-Cca
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CC-AC-TTA-ATTTC------TG-CG--GTCGCCACATGAT----------T----TAATTGTCG-CCGCCATTTA-TTATCTG---GCG-GCCGT-CATATGA-AAA--AA-T-GGATG-GCCG
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  t-TAA-GAGGT-A-AC-GAC-CACATAATA-CAAGT-GGCGGCCGGA-AAATAAAT-TGA-TATTGGTTTT-CCATCTTGGCAC-TTACCtataagtggcg
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ctacggaagctGGA-G-CC-G-C-CACATAGAT-TGATT-GACTGCCGCC-AGTTAAAT-G-AATATCAATTGT-ATACCCTAGCAC-CTACCtt
gi|2                          :              tacgggaggcCGGAAGCCG-GTA----TGCCAAGGG------T-A-TA--G-AAATT-AA---T--A--T---T--TATG---------------------TG-G--CT-----------G-TCGCCAC---A-A--CT--A-GT-GGCGGCCGCC-------------------------T----------------TGAAA-ATTAAGTG-GCGGCC--GC-TA-CTTAAATTT---A----T-T---GCTGGCGG-CCCC----AC----TTA---A----T----------------------------------T-TAA-CTGGCGGCCGCCA---ACTA-A---T-AAGT--------GGC-GGC--C----GCCAGTTAAAAAACA-ATTAAAAGT-GGCG-GTC-GCC--AGATAAATGATGTTGGCGC--C-CGCCA-CTTAAAATTTAT-T-T-CTG-GCGGACAC-CA--T--ATAA---T--ATACT---GGCGTTGCC-AG-ATA-ACA-G------TGGC---GCCGC---AC-ATA-A------AT----TAAG-GGCGGCCGCCACATA-G-ATta
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                              taTG-GCGGTC---C-CA-CATAAA-TA---A----------G-TGGCGG-CCCCGAG-AT----ATAATTA----TCAAT-TC-T-CCTAC-----------C-CTGGCACCTAC-CT--CGACTTCCCT--A-TAGAA-TT-AAGTATCTATGTGGC-GGCCGC----CCT---TA------A-TTT--A--TGTGCG-G-C-GCC--ACT---GTTA-TCTGGCAA----CGCCAGT-----A--TAT-TATATGGTGTC--CGC-CA--GAAATAAATTTTAAG-TG---GCGGGCGCCAACATCATTTATC------TGGCG--ACCGCCACTT-TTA-ATTGTTTTT----TAACTGGCGGCCGCCACTTATT-AGTTG---GCG-GCCGC-CA-GT-T-AAATTAAGT-G--GG-GCCGCCA-GCAATAAATTTAAGTAGCG-GCCGCCA-CTTAATTTTCAAG-GCGGCCGCCA-CTAacttaattctatagggaagtcgaggtaggtgccagggtaggagaattgataattatatctcggggccgccacttatttatgtgggaccgccag
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tacggaagccggtatgccaagggtatagaaattaatatttatgtggctgtcgccacaacCGCCATAT-A-A-C------AT----TAAGTGGTGGT-GC-ACTCA-TTATCTG---GCA-GCCGG-CAGAT-A-AAA--AG-TGG--CG-ACCGCCA-g
gi|21                         :                       gcgaAAGCCG-GTT-G-GTGCCA-GGG------T-A-TA--G-AA-TT-AA-----TA--T--AT--T-T---------------------ATGTG-GCG-----------G-CCGACACA-TAGA--TTA-A-CT-GGCGGCCGtcctaa
gi|22                         :                  gtactgCGGAAGCCG-GTAAG-GTGCCA-GGG------T-A-TA--G--A-TT-AA---T-TA--T---T--TAT----------------------CT-G-GCG-----------G-CCGCCATT-T
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cta-AT-TTA-TTATGCCAAAATGGCG--GCCGCCAGAT-AAATA------AT----TAAtggcataataaatat
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ctacggaagccggtaaggtgccagggtataga-C-CACTTACAT-TTATCTGGCGGCCGCC-ACATAAAT---A-TATTATTTCT-ATGCCCTGGCAC-at
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ctgaaactactTA---A--TTCAA-A---T------GGAGT-CCG-C-A-ACG-AAAT-TGATGTAGCAG-CC-G-C-CACATGGAT-TAGAT-GACGACCGt
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TAAAT-TAAGT-GGCAGCCACC-AGTTAAAT-GAA-TATCAATGCT-ATACCTTTGCGT-CTACaggt
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          actgaagtct-TA-AA-TT-AAGT--------GAC-GGTCGCCAATACCAAATA------A-ATC--AAGT-GACG-GTC-GTC--AGATAA
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     agtGCGGCCGCC-ACATAAAT------ATTAATTCA-ATACCCTGGCAC-CTACCatga
gi|28                         :              tacggaaaccCGAAAGCCG-GTA-G-GTGCCA-GGG------T-C-TA--G-A
gi|29                         :                    tgtaCGGAAGCCG-GTA-G-GTGCCA-AGG--------A-TACTG-AA-TT-AA---T-TA--T--TT--TATG---------------------TG-G-Gggcggctaactggcggccgc
gi|3                          :                      taCGGAAGCCG-GTA-G-GTGCCA-GGG------T-ATTA--GAAA-TT-AA---TATATTT--AT--TGT-------------------------G-GCG-----------GCCCGCCACT-TA-A--TTA-A-CT-GGCGGCCGCCA----------------------CTT--------------------A-TTTATCTG-GCGGCC--GC-CAGCATA---ATAAAA--T-T-TAAAG-TGGCGGCCGCC----ACTCTAATG-TTA----CT--T-GT-G-GC-GCGTCGACGGCCAC-CT--TAT-TAT-T--GCGG-CGCCAGATA-TA-AAGTTGAACT--------GGC-GGC--C----GCCAAAAAAT----A-ATTG-AAGT-GACG-GCCGGCCAAACTTAATTTA-ACTGGCGACCC-CGCCA---------TTAT-TAT-TGG-GCGACCGC-CACTT-A--AA---TTTAT-GTGTGGCGGCCGCC-ACTTTATTTTTG------TGGCGGCGCTGCCAC-T-TTA-A------TTGGTATGATTGGCGGCCGCCAg
gi|30                         :                          aAAGCCG-ATA-G-GTGCCA-GGG------T-A-TA--G-AA-TT-AA-----TA--T--AT--Tagttatcttctctctctctc
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          actgGCC-ATATAAAT---A-TATTAATTCT-ATACCCTGGCAC-CTATCtatatggc
gi|32                         :                  actgaagccAAGCCG-GTA-G-GTGCCA-GGG------T-A-TA--G-AA-TT-AA---T-AA--T--
gi|33                         :                    actgCGGAAACCG-GTA-G-GTGCCA-GAG------T-A-TA--G-AA-TT-AA---T-tta
gi|34                         :                        gtaAAGCCG-GTA-G-GTGCCA-GGG------T-A-TA--G-AATTT-AA---T-a
gi|35                         :                   tactgCGGAAGCCG-GTA-G-GTGCCA-GGG------T-A-TA--G-AA-TT-AA-----TA--T--AT--a
gi|36                         :                           AAGCCG-GTA-G-GTGCCA-GGG------T-A-T
gi|37                         :           ttaacatgtactgCGGAAGACG-GTA-G-GTGCCA-GGG------T-A-TA--G-AA-TT-AA---
gi|38                         :                          aAAGCCG-GTA-G-GTGCCA-GGG------T-A-TA--G-A
gi|39                         :               aacatacagCGGAAGCCG-GTA-G-GTGACA-GGG------T-A-TA--G-A
gi|4                          :                  tctaACTGTAAGCCG-GTATG-GTGC-A-GGG------TTA-TA--G-AA-TT-TA---A-TA--T--AT--TTAT--------------------ATG-G-CAG-----------G-CCG-CATTATA-A--TTA-A-CT-GGCGGCCGCCAGAAATAATTTTTAGTGGCCTGCCCT----------------T--AA-TTTCATGG-GCGGCCCAGCTCATTTTA---TT---A--TC--------TGGCGG-CTCTGTGAACTA--ATT-TTATGTCTG--T-GC-GACC-GC-----------CACT--TAT-TAT-GTGGCGGCCACCA---C-TT-TA-TT-AGTTCTTA----GGCGGGCCGC----ACTTTGTA------A-TTT--ATACTGGCGTCCC-GTC--ACTTAATTTA-ACTGGCAG--C-CGC---C-----ACTTATATAT-TCG-GC
gi|40                         :                        CGGAAGCCG-GTA-G-GTGCAA-GGG------T-A-TA--G-
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttcta-TAATT--GGCGGTCG--CT------AT-T-AGA--AAGCACTGATG--GCCTCC--ATATA---AATT---A-A---G------TGCAGATCG-CCA-GCC-AAAT-TAA-GTGCCAG-CC-G-C-CATATAAAT-TAAGA-AGCGATCGCC-
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          caacgTGGCGACCG--CC------AGAT-AAT--AAG---TGACA--ATCGCC--ACTT-------T---A-A---TTCATCTGGCGG-CCG-C-T-ATTCAAAT-TAA-CTGGC-GGCC-G-C-CACATAGAT-TAAGT-GGCGACCAC-----TAAATAT-A-TATGAATTCT-ATATCCTAGCAC-CTACCttcaactctccttctcaaaacgaaagagatgtgcaatttgtgtaacatcc
gi|6                          :                                                                                                           tacagaagcc-G-GCG-----------A-TTGTCACT-TA----TT--ATCT-GGCGGTCGCCA----------------------CTT----------------C---A-TTTAActtcatttaac
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tacagaagccggtaggtgctaggatatagaattcatatatatttagtggtcgccacttaatctatgtggcggccgccagttaatttgaatagcggccgccagatgaattaaagt-CGCCAGCTATAATATTATTCTTGGCTTCGGCCGTACCAGTTAATT-TA--TATGGCGGGCGTGCC------AG-T-AAT--------T-------CCGCC--A------------------------------GG-------A-GT--GAAT--AA-GTTTT-G-CG-G-G-CAT-TA--T-CAATC-GG--GCCGCC-A----------A-TATTAATTCTGATACCCTGGCAC-CTACCc
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ggaagcc---CACTTAATC-TG--TGTGACGTTTG--CC------AC-TTAATTTAA----TT-CGCTGCCGCCTTATAGA---A--T---A-AAA-T------GATGG-CCG-C----------T-TGA--TAG------------ACATAAC------C-GGCGGCCGTC-ATATAGAT-gcc
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ---CACTTAATT-TAATTC--GCTGCCG--CCTTATAGAA-T-AA---AA----TGATG--GCCGCT--TGATAGACA--T---A-A---CC-----GGCGG-CCGTC-ATAT--AGATCTAA-TTGGC-A-TTAG-C-CATATGAAT-TAGCT-GGCAACCGCC-ACTTAActaattggcattagccatatgaattagctggcaaccgccacttaa
gi|9                          : cacttaatctgtgtgacgtttgcCGGAAGCTG-GGA-G-GTGCCA-GGGGCAGGGT-A-TA--T-AA-TT-GA---T--A--TTCAT--T-T---------------------ATGTG-GTA-----------G-TCGTTACT-TC-A--TTTTA-CT-TGCGGC----------------------------TT----------------T--AA-TTTAACTA-GCGACC--TT-CA-CTTA---TT---A--TCT-
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 taTA-A------TT----TAACTAGCGACCTTCACTTATT-ATCTG---GAG-GTCGC-ggaggtcgc
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): CGTATTTGAATAACAAGAATGTATAAATCTATCAAGCTTTAGCTTATAGATAAAGCACTTGCGTTATGTTAACAAATGGAATG
Unaligned ( gi|31 ): CTGAAATGTGCAATAATAAAGTTGTATATAAGTACATACATCATG






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lowQualScore                  :                                 8   6 8      8   222222 8  8 22   1  4  777777  444 22 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333    2    7  11111111111 6          88888888888888888888888888888888888888888888888888  6666666    66  6      55  0  4  6666  666   66666666666          777777777777777777777777777777777777777777777   7  5     0    77777  7  7  4    00000000   7      888888888888888888888   88 7    33  7    7   22 0   0   0       4 2222    222222222    0 8 0   0  555   0  22222222222222222222222    2     000   6666666     00        5 2   77 666666   3     2          777     777   7     7  6  222  000  0 0 22222       0 33            3   7       0 0  55555    5    3     3      0   00     5555      333  0      0  2  88       00   000000 00   6666666  6  2      55555555555555555555555555  4  0   999999999    4   66    0 0  0 3 6         3    44          1 77    5555           3            6     
consensus                     :                      ACCGGAAGCCG-GTA-G-GTGCCA-GGG------T-AT-A--GAA-TT-AA---T-TAT--AT--TGTG--------------------ATG-G-------------------GCG-----------GCCGCCACT-TA-A--TT--A-CT-GGCGGCCGCC-----A----------------------CTT----------------T--AA-T-----TTAAN-TG-GCGGCC--GC-CA-CT----TA---TTA--TCT-T--G-TGGCGGCCCC----AC--ATA-TTA--TC--T-GC-G---CC-GCC-CT--TAT-TAT-CTGGCGGCCGCCA---A-TA-AA-TT-AAGT--------GGC-GGCCGC----GCCAGATA------A--ATT--A-AGTGG-CG-GCCG-CCA--CNTAATTTA-ACTGGCGGC-C--GCCA-C-----ACTTAT-TAT-TGG-GCCGNCGC-CA--TAA-TAA---TTAAT-CT---GCGGCCGCCA-C-TTA-TT-ATCTGGCG--GCCGCCACATNTAAT-T------TAACTGGCGGCCGCCACTTA-TTATCTG---GCG-GCCGC-CATAT-A-AAATTAA-T-G--CG-GCCGCCA-G--ATAAATTTAAGT-GCGCGCCGCCAGCNTAATTTTCAAGTGCGG-CGCCA-CTATAANATTNNTCCCGGCTTCGGCCG---CAGTTAATT-TAATTATGGCGGCC--GCC------AG-TAATAAG---TGACGACCGCCANATA---A--T---AA---T------GGCGG-CCG-C-A-GT--AAAT-TAA-GTGGC-G-CC-G-C-CACATAAAT-TAAGC-GGCGGCCGCC-ACATAAA-T--ATATTAATTCT-ATACCCTGGCAC-CTACC
Reference ( family-3983 )     :                      ACCGGAAGCCG-GTA-G-GTGCCA-GGG------T-AT-A--GAA-TT-AA---T-TAT--AT--TGTG--------------------ATG-G-------------------GCG-----------GCCGCCACT-TA-A--TT--A-CT-GGCGGCCGCC-----A----------------------CTT----------------T--AA-T-----TTAAN-TG-GCGGCC--GC-CA-CT----TA---TTA--TCT-T--G-TGGCGGCCCC----AC--ATA-TTA--TC--T-GC-G---CC-GCC-CT--TAT-TAT-CTGGCGGCCGCCA---A-TA-AA-TT-AAGT--------GGC-GGCCGC----GCCAGATA------A--ATT--A-AGTGG-CG-GCCG-CCA--CNTAATTTA-ACTGGCGGC-C--GCCA-C-----ACTTAT-TAT-TGG-GCCGNCGC-CA--TAA-TAA---TTAAT-CT---GCGGCCGCCA-C-TTA-TT-ATNTGGCG--GCCGCCACATATAAN-T------TAACTGGCGGCCGCCACTTA-T-ATCTG---GCG-GCCGC-CATAT-A-AAATTAA-T-G--CG-GCCGCCA-G--ATAAATTTAAGT-GCGCGCCGCCAGCNTAATTTTCAAGTGCGG-CGCCA-CTATAANATTNNTCCCGGCTTCGGCCG---CANTTAATT-TAATTATGGCGGCC--GCC------AN-TAATAA----TGACGGCCGCCANATA---A--T---AA---T------GGCGG-CCG-C-A-GT--AAAT-TAA-GTGGC-G-CC-G-C-CACATAAAT-TAAGC-GGCGGCCGCC-ACATAAA-T--ATATTAATTCT-ATACCCTGGCAC-CTACC
gi|1                          :                      ACTAAAAGCCGAGTA-G-GT-CCA-GGG------T-AT-A--GA--TT-AA---T-TAT--AT--TGTG--------------------ATG-GT------------------GCG-----------GCCGCCACTGTA-A--TT--A-TT-GTCGGCCGCC-----A----------------------CTT----------------T--AA-T-----TTAAA-TG-GCGGCC--GC-CA-CT----TA---TTA--TCC-TCTG-TGGCGGCGCC----AC--ATA-TTA--TC--T-GC-A---CC-GCC-CT--TGT-TAT-CTGGCGGCCGCCA---A-CA-AA-TT-AACT--------GGC-GGCCGC----GCCAGATA------AG-ATT--A-AGTGGGCG-TCCG-CCA--CATAATTTA-ACTAGCGGCGT--GCCA-C-----ACTTAT-TAT-TGG-GCCGGCGCGCA--TAA-TAA---TTAAT-CT---GCGGCTGCCA-C-TTA-TC-ATCTGGCG--GCCGCCATATATAAA-T------TAACTGCCGACCGCCACTTA-T-ATCTG---GCG-GCCGCGCATAT-AGAAATTAA-T-G--CG-GCCGCCA-G--ATGAATTTAAGT-GCGCGCCGCCAGCATA-----TAAGTGCGG-CGCCA-CTATAAAATTTATCCCA----CGGCTG---CAGTTAATTGTAATTATGGTCGCC--GCC------AA-TAATAA----TG-CGACCGCCAGATA---A--T---AA---T------GGCGG-TCG-C-A-GT--AAAT-TAA-GTGGC-G-CC-GTC-CACATAAAT-TAAGCAGGCGGCCGCC-ATATAAATT--ATATTAATTCTAATACCCTGG-AC-CCACC
gi|10                         :                           AAGCCA-GTC-G-GTGCTA-TGG------T-AT-ATAGAA-TT-AATATT-CAT--AT--TCC----------------------T--G-------------------GCG-----------ACTGCCTGT-TA-ACTTT--A-TTGGGCAGCCAGC-----A----------------------CTTACTTATCTGTCAAGTAT--AT-T-----TTAAC-TG-GCTGCT--GC-CA-TT----TA---
gi|11                         :                      ACGGAAAGCCG-GTA-GCGTGCCA-GGG------T-AT-A--GAA-TT-AA---T--AT--TTCATGTGGGCGGTTGCTACTTAGATTTATG-T-------------------GCGA----------GCCGCCATA-TA-AA-TT--A-CT-GCCCGCCGCC-----A----------------------AGA----------------T--AAAT-----TTAAG-TGCGCG
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gi|14                         :                      cataGAAGTCG-GTA-G-GTGCCA-GGG------T-AT-A--GAA-TC-AG---T-TA---AT--T------------------------TA-A-------------------GTG-----------GCGGTAATT-TG-----T--A--T-GGCGGCCGCCAGATAA----------------------ATTACGGTAAGA-------T--AA-A-----TTAAC-TG-GCGGCC--GC-CA-caca
gi|15                         :                       ctGAAAGCCG-GTA-G-GTTCCA-GG----------T-A--CTA-TTCAA---C-TAC--AA--TGTA--------------------ATG-T-------------------TCATTTATCTTTCAGCCACGACT-TG-A--TT-----T---CGACCGCT-----A----------------------CTT-------------------AA-T-----TTGTA-TG-GCGGCC--GC-C
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CCA-C-TTA-AT-TTCTG-CG--GTCGCCACATG--AT-T------TAATTGTCG-CCGCCATTTA-TTATCTG---GCG-GCCGT-CATATGA-AAA--AA-T-GGATG-GCCG
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             t-TAA-GAGGT-A-AC-GAC-CACATAATA-CAAGT-GGCGGCCGGA-AAATAAA-TTGATATTGGTTTT-CCATCTTGGCAC-TTACCtataagtggcg
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ctacggaagctGGA-G-CC-G-C-CACATAGAT-TGATT-GACTGCCGCC-AGTTAAA-TGAATATCAATTGT-ATACCCTAGCAC-CTACCtt
gi|2                          :              tacgggaggcCGGAAGCCG-GTA----TGCCAAGGG------T-AT-A--GAAATT-AA---T--AT---T--TATG---------------------TG-G--------------------CT-----------GTCGCCAC---A-A--CT--A-GT-GGCGGCCGCC------------------------------T----------------TGAAA-A-----TTAAG-TG-GCGGCC--GC-TA-CT----TAAATTTA----T-T--GCTGGCGGCCCC----AC--TTA---A--T-------------------------T-TAA-CTGGCGGCCGCCA---ACTA-A---T-AAGT--------GGC-GGC--C----GCCAGTTAAAAAACA--ATTAAA-AGTGG-CG-GTCG-CCA--GATAAATGATGTTGGCGCC-C--GCCA-CTTAAAATTTAT-T-T-CTG-GCGGACAC-CA--T-A-TAA---T--ATACT---GGCGTTGCCA-G-ATA-AC-A-GTGG------CGCCGCACATAAA-T------TAA-GGGCGGCCGCCACATA-G-ATta
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                      ta-TG-GCGGTC---C-CA-CA----TAAA-TAA---------G-TGGCGGCCCCGAG-AT--ATAATTA--TCAAT-TC-T---CCTACC-CTGGCACCTAC-CT--CGACTTCCCT--A-TAGAA-TT-AAGTATCTATGTGGC-GGCCGC----CCT---TA------A--TTT--A-TGTG--CG-GC-G-CCA--CTG---TTA-TCTGGCAAC----GCCAGT-----A--TAT-TATATGGTGTC--CGC-CA--GAAATAAATTTTAAG-TG---GCGGGCGCCAACATCA-TTTATCTGGCG--ACCGCCACTTTTAAT-TGTTTTTTAACTGGCGGCCGCCACTTA-TTAGTTG---GCG-GCCGC-CA-GT-T-AAATTAAGT-G--GG-GCCGCCA-GCAATAAATTTAAGTAGCG-GCCGCCA-CTTAATTTTCAAG-GCGGCCGCCA-CTAacttaattctatagggaagtcgaggtaggtgccagggtaggagaattgataattatatctcggggccgccacttatttatgtgggaccgccag
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tacggaagccggtatgccaagggtatagaaattaatatttatgtggctgtcgccacaacCATATAACAT------TAAGTGGTGGT-GC-ACTCA-TTATCTG---GCA-GCCGG-CAGAT-A-AAA--AG-TGG--CG-ACCGCCA-g
gi|21                         :                   gcgacgcGAAGCCG-GTT-G-GTGCCA-GGG------T-AT-A--GAA-TT-AA-----TAT--AT--T-T---------------------ATGTG-------------------GCG-----------GCCGACACA-TAGA--TTA-A-CT-GGCGGCCGtcctaa
gi|22                         :                   gtactCGGAAGCCG-GTAAG-GTGCCA-GGG------T-AT-A--G-A-TT-AA---T-TAT---T--TAT----------------------CT-G-------------------GCG-----------GCCGCCATT-T
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            cta-C-CACTTACAT-TTATCTGGCGGCCGCC-ACATAAA-T--ATATTATTTCT-ATGCCCTGGCAC-tggcataataaatat
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ctgaaactactTA---A--TTCAAA---T------GGAGT-CCG-C-A-ACG-AAAT-TGATGTAGCAG-CC-G-C-CACATGGAT-TAGAT-GACGACCGt
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TAAAT-TAAGT-GGCAGCCACC-AGTTAAA-TGAATATCAATGCT-ATACCTTTGCGT-CTACaggt
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     actgaagtct-TA-AA-TT-AAGT--------GAC-GGTCGCCAATACCAAATA------A--ATC--A-AGTGA-CG-GTCG-TCA--GATAA
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                agtGCGGCCGCC-ACATAAA-T--AT--TAATTCA-ATACCCTGGCAC-CTACCatga
gi|28                         :              tacggaaaccCGAAAGCCG-GTA-G-GTGCCA-GGG------T-CT-A--GA
gi|29                         :                    tgtaCGGAAGCCG-GTA-G-GTGCCA-AGG--------AT-ACTGAA-TT-AA---T-TAT--TT--TATG---------------------TG-G-------------------Gggcggctaactggcggccgc
gi|3                          :                      taCGGAAGCCG-GTA-G-GTGCCA-GGG------T-ATTA--GAAATT-AA---TATATTTAT--TGTG--------------------GCG-GCCCGCCACTTAATTAACTGGCG-----------GCCGCCACT-TA-T--TT--ATCT-GGCGGCCGCC-----A----------------------GCA----------------T--AA-TAAAATTTAAAGTG-GCGGCC--GC-CA-CTCTAATG---TTA---CT-T--G-TGGCGCGTCG----AC--G-----------------G---CC-ACC--T--TAT-TAT-T--GCGGC-GCCAGATA-TA-AAGTTGAACT--------GGC-GGCCGC------CAAAAA------ATAATTG-A-AGTGA-CG-GCCGGCCAAACTTAATTTA-ACTGGCGAC-CCCGCCA---------TTAT-TAT-TGG-GCGACCGC-CACTTA---AA---TTTAT-GTGTGGCGGCCGCCA-CTTTATTT-TTGTGGCGGCGCTGCCAC-TTTAAT-TGGTA--TGATTGGCGGCCGCCAg
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aGCC-ATATAAA-T--ATATTAATTCT-ATACCCTGGCAC-CTATCagttatcttctctctctctc
gi|32                         :                 actgaagccGAAGCCG-GTA-G-GTGCCA-GGG------T-AT-A--GAA-TT-AA---T-AAT--
gi|33                         :                     actCGGAAACCG-GTA-G-GTGCCA-GAG------T-AT-A--GAA-TT-AA---T-tta
gi|34                         :                       gtaGAAGCCG-GTA-G-GTGCCA-GGG------T-AT-A--GAATTT-AA---T-a
gi|35                         :                    tactCGGAAGCCG-GTA-G-GTGCCA-GGG------T-AT-A--GAA-TT-AA-----TAT--AT--a
gi|36                         :                          GAAGCCG-GTA-G-GTGCCA-GGG------T-AT-
gi|37                         :            ttaacatgtactCGGAAGACG-GTA-G-GTGCCA-GGG------T-AT-A--GAA-TT-AA---
gi|38                         :                       aCAGAAGCCG-GTA-G-GTGCCA-GGG------T-AT-A--GA
gi|39                         :                  aacataCGGAAGCCG-GTA-G-GTGACA-GGG------T-AT-A--GA
gi|4                          :                  tctaACTGTAAGCCG-GTATG-GTGC-A-GGG------TTAT-A--GAA-TT-TA---A-TAT--AT--TTAT--------------------ATG-G-------------------CAG-----------GCCG-CATTATA-A--TTA-A-CT-GGCGGCCGCC-----AGAAATAATTTTTAGTGGCCTGCCCT----------------T--AA-T-----TTCAT-GG-GCGGCCCAGCTCATTT----TA---TTA--TC-------TGGCGGCTCTGTGAACTAATT-TTATGTC--T-GT-GCGACC-GCCACT--TAT-TAT-GTGGCGGCCACCA---C-TT-TA-TT--AGTTCTTA---GGCGGGCCGC----ACTTTGTA------A--TTT--ATACTGG-CGTCCCG-TCA--CTTAATTTA-ACTGGCAGC-C--GC---C-----ACTTATATAT-TCG-GC
gi|40                         :                        CGGAAGCCG-GTA-G-GTGCAA-GGG------T-AT-A--G
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ttcta-TAATT--GGCGGTC--GCT------AT-TAGAAAGCACTGATGGCCTCCATATA---AATT---AA---G------TGCAGATCG-CCA-GCC-AAAT-TAA-GTGCCAG-CC-G-C-CATATAAAT-TAAGA-AGCGATCGCC-
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             caacgTGGCGACC--GCC------AGATAATAAG---TGACAATCGCCACTT-------T---AA---TTCATCTGGCGG-CCG-C-T-ATTCAAAT-TAA-CTGGC-GGCC-G-C-CACATAGAT-TAAGT-GGCGACCACT-AAAT--A-T--ATATGAATTCT-ATATCCTAGCAC-CTACCttcaactctccttctcaaaacgaaagagatgtgcaatttgtgtaacatcc
gi|6                          :                                                                                                        tacagaagcc-G-------------------GCG-----------ATTGTCACT-TA----TT--ATCT-GGCGGTCGCC-----A----------------------CTT----------------C---A-T-----TTAActtcatttaac
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tacagaagccggtaggtgctaggatatagaattcatatatatttagtggtcgccacttaatctatgtggcggccgccagttaatttgaatagcggccgccagatgaattaaagt-CGCCAGCTATAATATTATTCTTGGCTTCGGCCGTACCAGTTAATT-TA--TATGGCGGGCGTGCC------AG-TAAT------T-----CCGCCA--------------------------GG----------A-GT--GAA--TAA-GTTTT-G-CG-G-G-CAT-T--AT-CAATC-G--GGCCGCC-A----------ATATTAATTCTGATACCCTGGCAC-CTACCc
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ggaagcc---CACTTAATT-TAATTC--GCTGCC--GCCTTATAGAA-TAA-AA----TGATGGCCGCTTGATAGACA--T---AA---CC-----GGCGG-CCGTC-ATAT--AGATCTAA-TTGGC-A-TTAG-C-CATATGAAT-TAGCT-GGCAACCGCC-ACTTAAgcc
gi|9                          : cacttaatctgtgtgacgtttgcCGGAAGCTG-GGA-G-GTGCCA-GGGGCAGGGT-AT-A--TAA-TT-GA---T--ATTCAT--T-T---------------------ATGTG-------------------GTA-----------GTCGTTACT-TC-A--TTTTA-CT-TGCGGC---------------------------------TT----------------T--AA-T-----TTAAC-TA-GCGACC--TT-CA-CT----TA---TTA--TCT-
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        taTAAT-T------TAACTAGCGACCTTCACTTATT-ATCTG---GAG-GTCGC-ggaggtcgc
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-3983 )     :                      ACCGGAAGCCG-GTA-GGTGCCAGGG------T-A-TA--G-AA-TT-AA---T-TA--T--ATTGTGATG-G-GCG-----------G-CCGCCACT-TA-A--TT--ACT-GGCGGCCGCC-----A----------------------CTT----------------TAATTTAANTGGCGGCC--GC-CA-CTTA--TT---A--TCT-T---GTGGCGGCC-CC----AC----ATA-TTA--TC--T-GC-G---CC-GC-----------C-CT--TAT-TAT-CTGGCGGCCGCCA---ATA-AA-TT-AAGT--------GGC-GGCCGC----GCCAGATA--A-ATT-A-AGT-GGCG-GCC-GCC--ACNTAATTTAACTGGCGG--C-CGCCA-CACTTAT-TAT-TGG-GCCGNCGC-CA--TAA-TAA---TTAATCT---GCGGCCGCCA-C-TTATT-ATC-TGGCG--GCCGCCACATNTAAT-T------TAACTGGCGGCCGCCACTTA---TTAT--C----TGGCG-GCCGC-CATAT-A-A--AAT-TAA-T-G--CG-GCCGCCA-G--ATAAATTTAA--GT-GCGCGCCGCCAGCNTAATTTTCAAGTGCGG-CGCCA-CTATAANATTNNTCCCGGCTTCGGCCG---CAGTTAATT-TAATTATGGCGGCC--GCC----AG-TAATAAG---TGACGACCGCC----ANATA---A--T---AA------T-GGCGG-CCG-C-A-G--T--AAAT-TAA--G-TGGC-GCC-G-C-CACATAAAT-TAAGC-GGCGGCCGCC-ACATAAA-T--ATATTAATTCT-ATACCCTGGCAC-CTACC
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gi|10                         :                           AAGCCA-GTC-GGTGCTATGG------T-A-TATAG-AA-TT-AATATT-CA--T--ATTCC--T--G-GCG-----------A-CTGCCTGT-TA-ACTTT--ATTGGGCAGCCAGC-----A----------------------CTTACTTATCTGTCAAGTATATTTTAACTGGCTGCT--GC-CA-TTTA--
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ------T-GGCGG-CGGGC-A-G--T--AATT-TAT--A-TGGC-GGC-T-CGCACATAAATCTAAGT-AGCAACCGCCCACATGAA----ATATTAATTCT-ATACCCTGGCACGCTACC
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              acggaaagccGGCGGTTGCTACTTAGATTTAT--G----TG-CGAGCCGC-CATAT-A-A--A-T-TAC-T-G--CCCGCCGCCAAG--ATAAATTTAA--GT-GCGCGagataaatttaagtgcgcg
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           acggaaagccggtagcgtgccagggtatagaattaatatttcatgtgCGACCGCC----ATATA---AACT---AAAAG---T-GGTGG-CTG-C-C-A--C--TCAT-TAT--C-TGGCAGCC-G-C-CAGATAAA---AAGT-GGCGACCGCC-ACCTAA-----ATATTAA-TCT-ATACCCTGGCAG-CTAC
gi|13                         :                                                                                                                                                                 cggaagccggtacat----------------TAAGTTAAGTGGCGGCC--GC-CA-CTTA--TT---AGGCCTAT---CTGGTGGCC-TC----AC----ATA-TTA--TC--TGGCGG---TC-GC-----------C------A--TATACTGGCGGCCGCCAG--ATA-AA-TTGAAGT--------GGC-GGCCGC----c
gi|14                         :                      cataGAAGTCG-GTA-GGTGCCAGGG------T-A-TA--G-AA-TC-AG---T-TA-----ATT----TA-A-GTG-----------G-CGGTAATT-TG-----T--A-T-GGCGGCCGCCAGATAA----------------------ATTACGGTAAGA-------TAAATTAACTGGCGGCC--GC-CA-caca
gi|15                         :                       ctGAAAGCCG-GTA-GGTTCCAGG-----------TA--C-TA-TTCAA---C-TA--C--AATGTAATG-T-TCATTTATCTTTCAG-CCACGACT-TG-A--TT----T---CGACCGCT-----A----------------------CTT-----------------AATTTGTATGGCGGCC--GC-C
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CCA-C-TTAAT-TTC-TG-CG--GTCGCCACATG--AT-T------TAATTGTCG-CCGCCATTTA---TTAT--C----TGGCG-GCCGT-CATATGA-A--AA---AA-T-GGATG-GCCG
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      t-TAA--G-AGGT-AAC-GAC-CACATAATA-CAAGT-GGCGGCCGGA-AAATAAA-TTGATATTGGTTTT-CCATCTTGGCAC-TTACCtataagtggcg
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ctacggaagctGGA-GCC-G-C-CACATAGAT-TGATT-GACTGCCGCC-AGTTAAA-TGAATATCAATTGT-ATACCCTAGCAC-CTACCtt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tacgggaggcATT-TA--TGTGGCTGTC--GCC----A--CAACTAG---TGGCGGCCGCCTTGAAAAT-------T---AAG-----T-GGCGG-CCG-C-T-ACTT--AAAT-TTATTGCTGGC-GGC-C-C-CACTTAATT-TAACT-GGCGGCCGCC-Ata
gi|2                          :                                                                                                                                                                     tacggaagccggtatgccaagggtatagaaattaatTGGCGGTC---C-CA-CATAAATA---A----------GTGGCGGCC-CCGAG-AT----ATAATTA--TCAAT-TC-T---CCTAC-----------C-CTGGCACCTAC-CT--CGACTTCCCT--ATAGAA-TT-AAGTATCTATGTGGC-GGCCGC----CCT---TA--A-TTT-A-TGT-G-CG-GC--GCC--ACTG---TTATCTGGCAA--C--GCCAGTA--TAT-TATATGGTGTC--CGC-CA--GAAATAAATTTTAAGTG---GCGGGCGCCAACATCATTTATC-TGGCG--ACCGCCACTTTTAAT-TGTTTTTTAACTGGCGGCCGCCACTTA---TTAG--T----TGGCG-GCCGC-CA-GT-T-A--AAT-TAAGT-G--GG-GCCGCCA-GCAATAAATTTAA--GTAGCG-GCCGCCA-CTTAATTTTCAAG-GCGGCCGCCA-CTAactaataagtggcggccgccagttaaaaaacaattaaaagtggcggtcgccagataaatgatgttggcgcccgccacttaaaatttatttctggcggacaccatataatatactggcgttgccagataacagtggcgccgcacataaattaagggcggccgccacatagatacttaattctatagggaagtcgaggtaggtgccagggtaggagaattgataattatatctcggggccgccacttatttatgtgggaccgccag
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tacggaagccggtatgccaagggtatagaaattaatatttatgtggctgtcgccacaacCATATAACAT------TAAGTGGTGGT-GC-ACTCA---TTAT--C----TGGCA-GCCGG-CAGAT-A-A--AA---AG-TGG--CG-ACCGCCA-g
gi|21                         :                   gcgacgcGAAGCCG-GTT-GGTGCCAGGG------T-A-TA--G-AA-TT-AA-----TA--T--ATT-T-ATGTG-GCG-----------G-CCGACACA-TAGA--TTA-ACT-GGCGGCCGtcctaa
gi|22                         :                   gtactCGGAAGCCG-GTAAGGTGCCAGGG------T-A-TA--G--A-TT-AA---T-TA--T---TTAT--CT-G-GCG-----------G-CCGCCATT-T
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ctaATTTA---TTATGCCAAAATGGCG-GCCGC-CAGAT-A-AATAAT-TAA-T-tggcataataaatat
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ctacggaagccggtaaggtgccagggtatag-C-CACTTACAT-TTATCTGGCGGCCGCC-ACATAAA-T--ATATTATTTCT-ATGCCCTGGCAC-at
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ctgaaactactTA---A--TTCAAA------T-GGAGT-CCG-C-A-A--CG-AAAT-TGAT-G-TAGCAGCC-G-C-CACATGGAT-TAGAT-GACGACCGt
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TAAAT-TAAGT-GGCAGCCACC-AGTTAAA-TGAATATCAATGCT-ATACCTTTGCGT-CTACaggt
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                actgaagtctTA-AA-TT-AAGT--------GAC-GGTCGCCAATACCAAATA--A-ATC-A-AGT-GACG-GTC-GTC--AGATAA
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          agtGCGGCCGCC-ACATAAA-T--AT--TAATTCA-ATACCCTGGCAC-CTACCatga
gi|28                         :              tacggaaaccCGAAAGCCG-GTA-GGTGCCAGGG------T-C-TA--G-A
gi|29                         :                    tgtaCGGAAGCCG-GTA-GGTGCCAAGG--------A-TACTG-AA-TT-AA---T-TA--T--TTTATG-TG-G-Gggcggctaactggcggccgc
gi|3                          :                      taCGGAAGCCG-GTA-GGTGCCAGGG------T-ATTA--GAAA-TT-AA---TATATTT--ATTGT-----G-GCG-----------GCCCGCCACT-TA-A--TTA-ACT-GGCGGCCGCC-----A----------------------CTT------------------ATTTATCTGGCGGCC--GC-CAGCATA--ATAAAA--T-T-TAAAGTGGCGGCCGCC----ACTCTAATG-TTA--CT--T-GT-G---GC-GCGTCGACGGCCAC-CT--TAT-TAT-T--GCGG-CGCCAGATATA-AAGTTGAACT--------GGC-GGC--C----GCCAAAAAATA-ATTGA-AGT-GACG-GCCGGCCAAACTTAATTTAACTGGCGACCC-CGCCA----TTAT-TAT-TGG-GCGACCGC-CACTTA---AA---TTTATGTGTGGCGGCCGCCA-CTTTATT-TTTGTGGCGGCGCTGCCAC-TTTAAT-TGGTA--TGATTGGCGGCCGCCAA--G---TTAT--C----Tg
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aGCC-ATATAAA-T--ATATTAATTCT-ATACCCTGGCAC-CTATCtctctctctctc
gi|32                         :                 actgaagccGAAGCCG-GTA-GGTGCCAGGG------T-A-TA--G-AA-TT-AA---T-AA--T--
gi|33                         :                     actCGGAAACCG-GTA-GGTGCCAGAG------T-A-TA--G-AA-TT-AA---T-tta
gi|34                         :                       gtaGAAGCCG-GTA-GGTGCCAGGG------T-A-TA--G-AATTT-AA---T-a
gi|35                         :                    tactCGGAAGCCG-GTA-GGTGCCAGGG------T-A-TA--G-AA-TT-AA-----TA--T--ATa
gi|36                         :                          GAAGCCG-GTA-GGTGCCAGGG------T-A-T
gi|37                         :            ttaacatgtactCGGAAGACG-GTA-GGTGCCAGGG------T-A-TA--G-AA-TT-AA---
gi|38                         :                       aCAGAAGCCG-GTA-GGTGCCAGGG------T-A-TA--G-A
gi|39                         :                  aacataCGGAAGCCG-GTA-GGTGACAGGG------T-A-TA--G-A
gi|4                          :                  tctaACTGTAAGCCG-GTATGGTGC-AGGG------TTA-TA--G-AA-TT-TA---A-TA--T--ATTTATATG-G-CAG-----------G-CCG-CATTATA-A--TTA-ACT-GGCGGCCGCC-----AGAAATAATTTTTAGTGGCCTGCCCT----------------TAATTTCATGGGCGGCCCAGCTCATTTTA--TT---A--TC-------TGGCGGCT-CTGTGAACTA--ATT-TTATGTC--T-GT-GCGACC-GC-----------CACT--TAT-TAT-GTGGCGGCCACCA---CTT-TA-TT--AGTTCTTA---GGCGGGCCGC----ACTTTGTA--A-TTT-ATACT-GGCGTCCC-GTC--ACTTAATTTAACTGGCAG--C-CGC---CACTTATATAT-TCG-GC
gi|40                         :                        CGGAAGCCG-GTA-GGTGCAAGGG------T-A-TA--G-
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ttcta-TAATT--GGCGGTC--GCT----AT-TAGAAAGCACTGATGGCCTCC----ATATA---AATT---AA------G-TGCAGATCG-CCA-G--CC-AAAT-TAA--G-TGCCAGCC-G-C-CATATAAAT-TAAGA-AGCGATCGCC-
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      caacgGTTAAAT-GAA--GTGGCGACC--GCC----AGATAATAAG---TGACAATCGCC----ACTT-------T---AATTCATCT-GGCGG-CCG-C-T-A--TTCAAAT-TAA--C-TGGCGGCC-G-C-CACATAGAT-TAAGT-GGCGACCACT-AAAT--A-T--ATATGAATTCT-ATATCCTAGCAC-CTACCttcaactctccttctcaaaacgaaagagatgtgcaatttgtgtaacatcc
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tacagaagcc-CGCCAGCTATAATATTATTCTTGGCTTCGGCCGTACCAGTTAATT-TA--TATGGCGGGCGTGCC----AG-TAAT------T-----CCGCC----A------------------------GG----------A-G--T--GAA--TAA--G-TTTT-GCG-G-G-CAT-T--AT-CAATC-G--GGCCGCC-A----------ATATTAATTCTGATACCCTGGCAC-CTACC
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ta-TAA---TTTAACTA--GCGACCTTCA-C-TTATT-ATC-TGGAG--GTCGCggaggtcgc
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): CGTATTTGAATAACAAGAATGTATAAATCTATCAAGCTTTAGCTTATAGATAAAGCACTTGCGTTATGTTAACAAATGGAATG
Unaligned ( gi|31 ): CTGAAATGTGCAATAATAAAGTTGTATATAAGTACATACATCATG






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Reference ( family-3983 )     :                      ACCGGAAGCCG-GTA-GGTGCCAGGG------T-AT-A--GAA-TT-AAT-TAT--ATT-GT--------------------A-T---G-G----------------------GCG-----------GCCGCCACT--TA-A--TT--A-CT-GGCGGCC-GCC-----ACTT----------------TAAT-----TTAAC-TGGCGGCC--GC-CACT----T-A--TTA--TC--T-TGTGGCG-GCCCCG--GACTA-TA-TTAT--C--T-GC-GC---C-GCC-CT--TAT-TAT--C----TGGCGGCCGCCAGATA---AATT-AAGT--------GGC-GGCCGC----GCCAAATAA--ATT-A-AGT-GGCG-GCCG-CCA--CTTAATTTAACTGGCGG--C-CGCCA-CACTTAT-TAT-TG--G-GCC-G--CGC-CA--TAA-TAA--TTNA--NCTGGCGGCCGCCA-C-TTATT-ATC-TGGCG--GCCGCCACATNTAAT-T------TAANTGGCGGCCGCCACTTA---TTAT--C----TGGCG-GCCGC-CATAT-A-A--AAT-TAA-T-G--CG-GCCGCCA-G--ATAAATTTAA--GT-GCGCGCCGCCAGCNTAATTTTCAAGTGCGG-CGCCA-CTATAANATTNNTCCCGGCTTCGGCCG---CAGTTAATT-TAATTGTGGCGGCC--GCC----AG-TAATAAG---TGACGGCCGCC----ANATA---A--T---AA---T------GGCGG-CCG-C-A-G--T--AAAT-TAA--G-TGGC-G-CC-G-C-CA-CATAAAT-TAAG-T-GGCGGCCGCC-ACATAAA-T--ATATTAATTCT-ATACCCTGGCAC-CTACC
gi|1                          :                      ACTAAAAGCCGAGTA-GGT-CCAGGG------T-AT-A--GA--TT-AAT-TAT--ATT-GTG-------------------A-T---G-GT---------------------GCG-----------GCCGCCACTG-TA-A--TT--A-TT-GTCGGCC-GCC-----ACTT----------------TAAT-----TTAAA-TGGCGGCC--GC-CACT----T-A--TTA--TCCTC-TGTGGCG-GCGCC----AC-A-TA-TTAT--C--T-GC-AC---C-GCC-CT--TGT-TAT--C----TGGCGGCCGCCA-ACA---AATT-AACT--------GGC-GGCCGC----GCCAGATAAG-ATT-A-AGTGGGCG-TCCG-CCA--CATAATTTAACTAGCGG--CGTGCCA-CACTTAT-TAT-TG--G-GCCGG--CGCGCA--TAA-TAA--TTAA--TCT-GCGGCTGCCA-C-TTATC-ATC-TGGCG--GCCGCCATATATAAA-T------TAACTGCCGACCGCCACTTA----TAT--C----TGGCG-GCCGCGCATAT-AGA--AAT-TAA-T-G--CG-GCCGCCA-G--ATGAATTTAA--GT-GCGCGCCGCCAGCATA-----TAAGTGCGG-CGCCA-CTATAAAATTTATCCCA----CGGCTG---CAGTTAATTGTAATTATGGTCGCC--GCC----AA-TAATAA----TG-CGACCGCC----AGATA---A--T---AA---T------GGCGG-TCG-C-A-G--T--AAAT-TAA--G-TGGC-G-CC-GTC-CA-CATAAAT-TAAG-CAGGCGGCCGCC-ATATAAATT--ATATTAATTCTAATACCCTGG-AC-CCACC
gi|10                         :                           AAGCCA-GTC-GGTGCTATGG------T-AT-ATAGAA-TT-AA--TAT---TC-AT--------------------A-TTCCT-G----------------------GCG-----------ACTGCCTGT--TA-ACTTT--A-TTGGGCAGCC-AGC-----ACTTACTTATCTGTCAAGTATATT-----TTAAC-TGGCTGCT--GC-CATT----T-A--
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ---T------GGCGG-CGGGC-A-G--T--AATT-TAT--A-TGGC-G-GC-T-CGCA-CATAAATCTAAG-T-AGCAACCGCCCACATGAA----ATATTAATTCT-ATACCCTGGCACGCTACC
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gi|14                         :                      cataGAAGTCG-GTA-GGTGCCAGGG------T-AT-A--GAA-TC-AGT-TA---ATT-------------------------T---A-A----------------------GTG-----------GCGGTAATT--TG-----T--A--T-GGCGGCC-GCCAGATAAATTACGGTAAGA-------TAAA-----TTAAC-TGGCGGCC--GC-CAcaca
gi|15                         :                       ctGAAAGCCG-GTA-GGTTCCAGG----------T-A--CTA-TTCAAC-TAC--AAT-GT--------------------AAT---G-T----------------------TCATTTATCTTTCAGCCACGACT--TG-A--TT-----T---CGACC-GCT-----ACTT-----------------AAT-----TTGTA-TGGCGGCC--GC-C
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CCA-C-TTAAT-TTC-TG-CG--GTCGCCACATG--AT-T------TAATTGTCG-CCGCCATTTA---TTAT--C----TGGCG-GCCGT-CATATGA-A--AA---AA-T-GGATG-GCCG
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          t-TAA--G-AGGT-A-AC-GAC-CA-CATAATA-CAAG-T-GGCGGCCGGA-AAATAAA-TTGATATTGGTTTT-CCATCTTGGCAC-TTACCtataagtggcg
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ctacggaagctGGA-G-CC-G-C-CA-CATAGAT-TGAT-T-GACTGCCGCC-AGTTAAA-TGAATATCAATTGT-ATACCCTAGCAC-CTACCtt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tacgggaggcATT-TA--TGTGGCTGTC--GCC----A--CAACTAG---TGGCGGCCGCCTTGAAAAT-------T---AAG--T------GGCGG-CCG-C-T-ACTT--AAAT-TTATTGCTGGC-G-GC-C-C-CA-CTTAATT-TAAC-T-GGCGGCCGCC-Ata
gi|2                          :                                                                                                                                                                                            tacggaagccggtatgccaagggtatagaaattaatC-TGGCGGTC---C-CACA----T-AAATAA---------GTGGCG-GCCCCG--AGATA-TAATTAT--CAAT-TC-TC---CTACC-CTGGCACCTAC--C----T--CGACTTCCCTATAG--AATT-AAGTATCTATGTGGC-GGCCGC----CCTTAAT-----TT-A-TGT-G-CG-GC-G-CCA--CTG---TTATCTGGCAA--C--GCCAGTA--TAT-TATATG--GTGTC----CGC-CA--GAAATAAATTTTA--AGTGGCGGGCGCCAACATCATTTATC-TGGCG--ACCGCCACTTTTAAT-TGTTTTTTAACTGGCGGCCGCCACTTA---TTAG--T----TGGCG-GCCGC-CA-GT-T-A--AAT-TAAGT-G--GG-GCCGCCA-GCAATAAATTTAA--GTAGCG-GCCGCCA-CTTAATTTTCAAG-GCGGCCGCCA-CTAactaataagtggcggccgccagttaaaaaacaattaaaagtggcggtcgccagataaatgatgttggcgcccgccacttaaaatttatttctggcggacaccatataatatactggcgttgccagataacagtggcgccgcacataaattaagggcggccgccacatagatacttaattctatagggaagtcgaggtaggtgccagggtaggagaattgataattatatctcggggccgccacttatttatgtgggaccgccag
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tacggaagccggtatgccaagggtatagaaattaatatttatgtggctgtcgccacaacCATATAACAT------TAAGTGGTGGT-GC-ACTCA---TTAT--C----TGGCA-GCCGG-CAGAT-A-A--AA---AG-TGG--CG-ACCGCCA-
gi|21                         :                   gcgacgcGAAGCCG-GTT-GGTGCCAGGG------T-AT-A--GAA-TT-AA--TAT--ATT--T--------------------A-T---GTG----------------------GCG-----------GCCGACACA--TAGA--TTA-A-CT-GGCGGCC-Gtcctaa
gi|22                         :                   gtactCGGAAGCCG-GTAAGGTGCCAGGG------T-AT-A--G-A-TT-AAT-TAT---TT-AT--------------------C-T-----G----------------------GCG-----------GCCGCCATT--T
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ctaATTTA---TTATGCCAAAATGGCG-GCCGC-CAGAT-A-AATAAT-TAA-T-tggcataataaatat
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                           ctacggaagccggtaaggtgccagggtatagT--TAT-TATGCCAAAATGGCGGCCGCCAGATA---AATat
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ctacggaagccggtaaggtgccagggtatagattaatt-C-CA-CTTACAT-TTATCT-GGCGGCCGCC-ACATAAA-T--ATATTATTTCT-ATGCCCTGGCAC-atat
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ctgaaactactTA---A--TTCAAA---T------GGAGT-CCG-C-A-A--CG-AAAT-TGAT-G-TAGCAG-CC-G-C-CA-CATGGAT-TAGA-T-GACGACCGt
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TAAAT-TAAG-T-GGCAGCCACC-AGTTAAA-TGAATATCAATGCT-ATACCTTTGCGT-CTACaggt
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            actgaagtctAGTTA---AATT-AAGT--------GAC-GGTCGCCAATACCAAATAA--ATC-A-AGT-GACG-GTCG-TCA--
gi|27                         :                        CGGAAACCG-GTA-GGTGCCAGGG------T-AT-T--GAA-TT-A----AT--ATT--T--------------------A-T---GTG----------------------GCG-----------GCCGCgataaatga
gi|28                         :                      taCGAAAGCCG-GTA-GGTGCCAGGG------T-CT-A--GAG-GC-GGC-TA---ACT-------------------------------G----------------------GCG-----------GCCGC
gi|29                         :                    tgtaCGGAAGCCG-GTA-GGTGCCAAGG--------AT-ACTGAA-TT-AAT-TAT--TTT-AT--------------------G-T---G-G----------------------G
gi|3                          :                      taCGGAAGCCG-GTA-GGTGCCAGGG------T-ATTA--GAAATT-AATATATTTATT-GTGGCGGCCCGCCACTTAATTAA-C---T-G----------------------GCG-----------GCCGCCACT--TA-T--TT--ATCT-GGCGGCC-GCC-----AGCA----------------TAATAAAATTTAAAGTGGCGGCC--GC-CACTCTAAT-G--TTA---C--T-TGTGGCGCGTC-----GAC-----------------G--GC---C-ACC--T--TAT-TAT--T------GCGGC-GCCAGATATAAAGTTGAACT--------GGC-GGCCGC------CAAAAAATAATTGA-AGT-GACG-GCCGGCCAAACTTAATTTAACTGGCGACCC-CGCCA----TTAT-TAT-TG--G-G-C-GACCGC-CACTTA---AA--TTTATGTGTGGCGGCCGCCA-CTTTATT-TTTGTGGCGGCGCTGCCAC-TTTAAT-TGGTA--TGATTGGCGGCCGCCAA--G---TTAT--C----Tg
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aGCC-ATATAAA-T--ATATTAATTCT-ATACCCTGGCAC-CTATCtctctctctctc
gi|32                         :                 actgaagccGAAGCCG-GTA-GGTGCCAGGG------T-AT-A--GAA-TT-AAT-AAT--
gi|33                         :                     actCGGAAACCG-GTA-GGTGCCAGAG------T-AT-A--GAA-TT-AAT-tta
gi|34                         :                       gtaGAAGCCG-GTA-GGTGCCAGGG------T-AT-A--GAATTT-AAT-a
gi|35                         :                    tactCGGAAGCCG-GTA-GGTGCCAGGG------T-AT-A--GAA-TT-AA--TAT--ATa
gi|36                         :                          GAAGCCG-GTA-GGTGCCAGGG------T-AT-
gi|37                         :            ttaacatgtactCGGAAGACG-GTA-GGTGCCAGGG------T-AT-A--GAA-TT-AA
gi|38                         :                       aCAGAAGCCG-GTA-GGTGCCAGGG------T-AT-A--GA
gi|39                         :                  aacataCGGAAGCCG-GTA-GGTGACAGGG------T-AT-A--GA
gi|4                          :                  tctaACTGTAAGCCG-GTATGGTGC-AGGG------TTAT-A--GAA-TT-TAA-TAT--ATTTAT--------------------A-T---G-GCAGGCCGCATTATAATTAACTGGCG-----------GCCGCCAGAAATA-A--TT--T-TT-AGTGGCCTGCC-------CT----------------TAAT-----TTCAT-GGGCGGCCCAGCTCATT----TTA--TTA--TC--T----GGCG-GCTCTGTGAACTAATT-TTATGTC--T-GT-GCGACC-GCCACT--TAT-TAT--G----TGGCGGCCACCA-CTT---TATT--AGTTCTTA---GGCGGGCCGC----ACTTTGTAA--TTT-ATACT-GGCGTCCCG-TCA--CTTAATTTAACTGGCAG--C-CGC---CACTTATATAT-TC--G-GC
gi|40                         :                        CGGAAGCCG-GTA-GGTGCAAGGG------T-AT-A--G
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ttcta-TAATTG--GCGGTC--GCT----AT-TAGAAAGCACTGATGGCCTCC----ATATA---AATT---AA---G------TGCAGATCG-CCA-G--CC-AAAT-TAA--G-TGCCAG-CC-G-C-CA-TATAAAT-TAAG-A-AGCGATCGCC-
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        caacgGTTAAAT-GAA--GTGGCGACC--GCC----AGATAATAAG---TGACAATCGCC----ACTT-------T---AA---TTCATCTGGCGG-CCG-C-T-A--TTCAAAT-TAA--C-TGGC-GGCC-G-C-CA-CATAGAT-TAAG-T-GGCGACCACT-AAAT--A-T--ATATGAATTCT-ATATCCTAGCAC-CTACCttcaactctccttctcaaaacgaaagagatgtgcaatttgtgtaacatcc
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tacagaagcc-CGCCAGCTATAATATTATTCTTGGCTTCGGCCGTACCAGTTAATT-TA--TATGGCGGGCGTGCC----AG-TAAT------T-----CCGCC----A--------------------------GG----------A-G--T--GAA--TAA--G-TTTT-G-CG-G-G-CATTATCAAT-CG--------GGCCGCC-A----------ATATTAATTCTGATACCCTGGCAC-CTACC
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ggaagccCACTTAAT-C------TGTGTGACGTTTGCCACTTAAT-TTAA--T----TCGCT-GCCGC-CTTAT-A-G--AATAAAA-T-GA-TG-GCCGCTT-G--ATAGACATAACCG--GCG-GCCGTCAgcc
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ---CACTTAATT-TAATTC--GCTGCC--GCCTTATAG--AATAAAA--TGATGGCCGCT----TGATAGACA--T---AA---CC-----GGCGG-CCGTC-ATA--T--AGATCTAA--T-TGGC-A-TTAG-C-CA-TATGAAT-TAGC-T-GGCAACCGCC-ACTTAAtatagatctaattggcattagccatatgaattagctggcaaccgccacttaa
gi|9                          : cacttaatctgtgtgacgtttgcCGGAAGCTG-GGA-GGTGCCAGGGGCAGGGT-AT-A--TAA-TT-GAT--ATTCATT--T--------------------A-T---GTG----------------------GTA-----------GTCGTTACT--TC-A--TTTTA-CT-TGCGGC------------TT----------------TAAT-----TTAAC-TAGCGACC--TT-CACT----T-A--TTA--TC--T-
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                taTTAATTTAACTAGCGA--C-CTT---CACTTAT-TATCTGGAG-GTC-G--Cggaggtcgc
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|31 ): CTGAAATGTGCAATAATAAAGTTGTATATAAGTACATACATCATG






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consensus                     :                      ACCGGAAGCCG-GTA-G-GTGCCAGGG------T-AT-A--GAA-TT-AAT-----------------------TAT--ATT-GT--------------------A-T---G-G----------------------GCG-----------GCCGCCACT--TA-A--TT--A-CT-GGCGGCC-GCC-----ANTT----------------TAA-T-----TTAAN-TG-GCGGCC--GC-CACT----T-A--TTA--TC--T-TGTGGCGGCNCCG--AACTA-TA-TTAT--C--T-GC-GC---C-GCC-CT--TAT-TAT--C----TGGCGGCCGCCAGATA---AATT-AAGT--------GGC-GGCCGC----GCCAAATAA--ATT-A-AGT-GGCG-GCCG-CCA--CTTAATTTAACTGGCGA--C-CGCCA-CACTTAT-TAT-TG--G-GCC-G--CGC-CA--TAA-TAA--TTTA--TGTGGCGGCCGCCA-C-TTATTT-TC-TGGCG--GCCGCCACATNTAAT-T------TAANTGGCGGCCGCCACTTA---TTAT--C----TGGCG-GCCGC-CATAT-A-A--AAT-TAA-T-G--CG-GCCGCCA-G--ATAAATTTAA--GT-GCGCGCCGCCAGCNTAATTTTCAAGTGCGG-CGCCA-CTATAANATTNNTCCCGGCTTCGGCCG---CAGTTAATT-TAATTGTGGCGGCC--GCC----AG-TAAT-AAG---TGACGGCCGCC----ANATA---A--T---AA---T------GGCGG-CCG-C-A-G--T--AAAT-TAA--G-TGGC-G-CC-G-C-CA-CATAAAT-TAAG-T-GGCGGCCGCC-ANNTAAA-T--ATATTAATTCT-ATACCCTGGCAC-CTACC
Reference ( family-3983 )     :                      ACCGGAAGCCG-GTA-G-GTGCCAGGG------T-AT-A--GAA-TT-AAT-----------------------TAT--ATT-GT--------------------A-T---G-G----------------------GCG-----------GCCGCCACT--TA-A--TT--A-CT-GGCGGCC-GCC-----ACTT----------------TAA-T-----TTAAN-TG-GCGGCC--GC-CACT----T-A--TTA--TC--T-TGTGGCGGCCCCG--AACTA-TA-TTAT--C--T-GC-GC---C-GCC-CT--TAT-TAT--C----TGGCGGCCGCCAGATA---AATT-AAGT--------GGC-GGCCGC----GCCAAATAA--ATT-A-AGT-GGCG-GCCG-CCA--CTTAATTTAACTGGCGA--C-CGCCA-CACTTAT-TAT-TG--G-GCC-G--CGC-CA--TAA-TAA--TTTA--TGTGGCGGCCGCCA-C-TTATTN-TC-TGGCG--GCCGCCACATNTAAT-T------TAANTGGCGGCCGCCACTTA---TTAT--C----TGGCG-GCCGC-CATAT-A-A--AAT-TAA-T-G--CG-GCCGCCA-G--ATAAATTTAA--GT-GCGCGCCGCCAGCNTAATTTTCAAGTGCGG-CGCCA-CTATAANATTNNTCCCGGCTTCGGCCG---CAGTTAATT-TAATTGTGGCGGCC--GCC----AG-TAAT-AAG---TGACGGCCGCC----ANATA---A--T---AA---T------GGCGG-CCG-C-A-G--T--AAAT-TAA--G-TGGC-G-CC-G-C-CA-CATAAAT-TAAG-T-GGCGGCCGCC-ANATAAA-T--ATATTAATTCT-ATACCCTGGCAC-CTACC
gi|1                          :                      ACTAAAAGCCGAGTA-G-GT-CCAGGG------T-AT-A--GA--TT-AAT-----------------------TAT--ATT-GTG-------------------A-T---G-GT---------------------GCG-----------GCCGCCACTG-TA-A--TT--A-TT-GTCGGCC-GCC-----ACTT----------------TAA-T-----TTAAA-TG-GCGGCC--GC-CACT----T-A--TTA--TCCTC-TGTGGCGGCGCC----AC-A-TA-TTAT--C--T-GC-AC---C-GCC-CT--TGT-TAT--C----TGGCGGCCGCCA-ACA---AATT-AACT--------GGC-GGCCGC----GCCAGATAAG-ATT-A-AGTGGGCG-TCCG-CCA--CATAATTTAACTAGCGG--CGTGCCA-CACTTAT-TAT-TG--G-GCCGG--CGCGCA--TAA-TAA--TTAA--TCT-GCGGCTGCCA-C-TTATCA-TC-TGGCG--GCCGCCATATATAAA-T------TAACTGCCGACCGCCACTTA----TAT--C----TGGCG-GCCGCGCATAT-AGA--AAT-TAA-T-G--CG-GCCGCCA-G--ATGAATTTAA--GT-GCGCGCCGCCAGCATA-----TAAGTGCGG-CGCCA-CTATAAAATTTATCCCA----CGGCTG---CAGTTAATTGTAATTATGGTCGCC--GCC----AA-TAAT-AA----TG-CGACCGCC----AGATA---A--T---AA---T------GGCGG-TCG-C-A-G--T--AAAT-TAA--G-TGGC-G-CC-GTC-CA-CATAAAT-TAAG-CAGGCGGCCGCC-ATATAAATT--ATATTAATTCTAATACCCTGG-AC-CCACC
gi|10                         :                           AAGCCA-GTC-G-GTGCTATGG------T-AT-ATAGAA-TT-AA------------------------TAT---TC-AT--------------------A-TTCCT-G----------------------GCG-----------ACTGCCTGT--TA-ACTTT--A-TTGGGCAGCC-AGC-----ACTTACTTATCTGTCAAGTATAT-T-----TTAAC-TG-GCTGCT--GC-CATT----T-A--
gi|11                         :                      ACGGAAAGCCG-GTA-GCGTGCCAGGG------T-AT-A--GAA-TT-AATATTTCATGTGGGCGGTTGCTACTTAG--ATT--T--------------------A-T---G-T----------------------GCGA----------GCCGCCATA--TA-AA-TT--A-CT-GCCCGCC-GCC-----AAGA----------------TAAAT-----TTAAG-TGCGCG
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ---T------GGCGG-CGGGC-A-G--T--AATT-TAT--A-TGGC-G-GC-T-CGCA-CATAAATCTAAG-T-AGCAACCGCCCACATGAA----ATATTAATTCT-ATACCCTGGCACGCTACC
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        acggaaagccGGCGGTTGCTACTTAGATTTAT--G----TG-CGAGCCGC-CATAT-A-A--A-T-TAC-T-G--CCCGCCGCCAAG--ATAAATTTAA--GT-GCGCGagataaatttaagtgcgcg
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      acggaaagccggtagcgtgccagggtatagaattaatatttcatgtgCGACCGCC----ATATA---AACT---AAAAGT------GGTGG-CTG-C-C-A--C--TCAT-TAT--C-TGGCAG-CC-G-C-CA-GATAAA---AAG-T-GGCGACCGCC-ACCTAA-----ATATTAA-TCT-ATACCCTGGCAG-CTAC
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                           cggaagccggtacat----------------TAA-G-----TTAAG-TG-GCGGCC--GC-CACT----T-A--TTAGGCC--TATCTGGTGGCCTC----AC-A-TA-TTAT--C--TGGCGGT---C-GCC------A--TATA-C----TGGCGGCCGCCAGATA---AATTGAAGT--------GGC-GGCCGC----c
gi|14                         :                      cataGAAGTCG-GTA-G-GTGCCAGGG------T-AT-A--GAA-TC-AGT-----------------------TA---ATT-------------------------T---A-A----------------------GTG-----------GCGGTAATT--TG-----T--A--T-GGCGGCC-GCCAGATAAATTACGGTAAGA-------TAA-A-----TTAAC-TG-GCGGCC--GC-CAcaca
gi|15                         :                       ctGAAAGCCG-GTA-G-GTTCCAGG----------T-A--CTA-TTCAAC-----------------------TAC--AAT-GT--------------------AAT---G-T----------------------TCATTTATCTTTCAGCCACGACT--TG-A--TT-----T---CGACC-GCT-----ACTT-----------------AA-T-----TTGTA-TG-GCGGCC--GC-C
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CCA-C-TTAATT-TC-TG-CG--GTCGCCACATG--AT-T------TAATTGTCG-CCGCCATTTA---TTAT--C----TGGCG-GCCGT-CATATGA-A--AA---AA-T-GGATG-GCCG
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   t-TAA--G-AGGT-A-AC-GAC-CA-CATAATA-CAAG-T-GGCGGCCGGA-AAATAAA-TTGATATTGGTTTT-CCATCTTGGCAC-TTACCtataagtggcg
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ctacggaagctGGA-G-CC-G-C-CA-CATAGAT-TGAT-T-GACTGCCGCC-AGTTAAA-TGAATATCAATTGT-ATACCCTAGCAC-CTACCtt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tacgggaggcATT-TA--TGTGGCTGTC--GCC----A--CAAC-TAG---TGGCGGCCGCCTTGAAAAT-------T---AAG--T------GGCGG-CCG-C-T-ACTT--AAAT-TTATTGCTGGC-G-GC-C-C-CA-CTTAATT-TAAC-T-GGCGGCCGCC-AACTAAta
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                     tacggaagccggtatgccaagggtatagaaattaat-TG-GCGGTC---C-CACA----T-AAATAA---------GTGGCGGCCCCG--AGATA-TAATTAT--CAAT-TC-TC---CTACC-CTGGCACCTAC--C----T--CGACTTCCCTATAG--AATT-AAGTATCTATGTGGC-GGCCGC----CCTTAAT-----TT-A-TGT-G-CG-GC-G-CCA--CTG---TTATCTGGCAA--C--GCCAGTA--TAT-TATATG--GTGTC----CGC-CA--GAAATAAATTTTA--AGTGGCGGGCGCCAACATCATTTATC-TGGCG--ACCGCCACTTTTAAT-TGTTTTTTAACTGGCGGCCGCCACTTA---TTAG--T----TGGCG-GCCGC-CA-GT-T-A--AAT-TAAGT-G--GG-GCCGCCA-GCAATAAATTTAA--GTAGCG-GCCGCCA-CTTAATTTTCAAG-GCGGCCGCCA-CTAtaagtggcggccgccagttaaaaaacaattaaaagtggcggtcgccagataaatgatgttggcgcccgccacttaaaatttatttctggcggacaccatataatatactggcgttgccagataacagtggcgccgcacataaattaagggcggccgccacatagatacttaattctatagggaagtcgaggtaggtgccagggtaggagaattgataattatatctcggggccgccacttatttatgtgggaccgccag
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tacggaagccggtatgccaagggtatagaaattaatatttatgtggctgtcgccacaacCATATAACAT------TAAGTGGTGGT-GC-ACTCA---TTAT--C----TGGCA-GCCGG-CAGAT-A-A--AA---AG-TGG--CG-ACCGCCA-g
gi|21                         :                   gcgacgcGAAGCCG-GTT-G-GTGCCAGGG------T-AT-A--GAA-TT-AA------------------------TAT--ATT--T--------------------A-T---GTG----------------------GCG-----------GCCGACACA--TAGA--TTA-A-CT-GGCGGCC-Gtcctaa
gi|22                         :                   gtactCGGAAGCCG-GTAAG-GTGCCAGGG------T-AT-A--G-A-TT-AAT-----------------------TAT---TT-AT--------------------C-T-----G----------------------GCG-----------GCCGCCATT--T
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ctaATTTA---TTATGCCAAAATGGCG-GCCGC-CAGAT-A-AATAAT-TAA-T-tggcataataaatat
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ctacggaagccggtaaggtgccagggtatagT--TAT-TATGCCAAAATGGCGGCCGCCAGATA---AATat
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ctacggaagccggtaaggtgccagggtatagattaatt-C-CA-CTTACAT-TTATCT-GGCGGCCGCC-ACATAAA-T--ATATTATTTCT-ATGCCCTGGCAC-atat
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ctgaaactactTA---A--TTCAAA---T------GGAGT-CCG-C-A-A--CG-AAAT-TGAT-G-TAGCAG-CC-G-C-CA-CATGGAT-TAGA-T-GACGACCGt
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TAAAT-TAAG-T-GGCAGCCACC-AGTTAAA-TGAATATCAATGCT-ATACCTTTGCGT-CTACaggt
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    actgaagtctAGTTA---AATT-AAGT--------GAC-GGTCGCCAATACCAAATAA--ATC-A-AGT-GACG-GTCG-TCA--
gi|27                         :                        CGGAAACCG-GTA-G-GTGCCAGGG------T-AT-T--GAA-TT-A--------------------------AT--ATT--T--------------------A-T---GTG----------------------GCG-----------GCCGCgataaatga
gi|28                         :                      taCGAAAGCCG-GTA-G-GTGCCAGGG------T-CT-A--GAG-GC-GGC-----------------------TA---ACT-------------------------------G----------------------GCG-----------GCCGC
gi|29                         :                    tgtaCGGAAGCCG-GTA-G-GTGCCAAGG--------AT-ACTGAA-TT-AAT-----------------------TAT--TTT-AT--------------------G-T---G-G----------------------G
gi|3                          :                      taCGGAAGCCG-GTA-G-GTGCCAGGG------T-ATTA--GAAATT-AATA----------------------TATTTATT-GTGGCGGCCCGCCACTTAATTAA-C---T-G----------------------GCG-----------GCCGCCACT--TA-T--TT--ATCT-GGCGGCC-GCC-----AGCA----------------TAA-TAAAATTTAAAGTG-GCGGCC--GC-CACTCTAAT-G--TTA---C--T-TGTGGCG-CGTCG--A-----------------C-G--GC---C-ACC--T--TAT-TAT--T------GCGGC-GCCAGATATAAAGTTGAACT--------GGC-GGCCGC------CAAAAAATAATTGA-AGT-GACG-GCCGGCCAAACTTAATTTAACTGGCGACCC-CGCCA----TTAT-TAT-TG--G-G-C-GACCGC-CACTTA---AA--TTTATGTGTGGCGGCCGCCA-CTTTATTT-TTGTGGCGGCGCTGCCAC-TTTAAT-TGGTA--TGATTGGCGGCCGCCAA--G---TTAT--C----Tg
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gi|33                         :                     actCGGAAACCG-GTA-G-GTGCCAGAG------T-AT-A--GAA-TT-AAT-----------------------tta
gi|34                         :                       gtaGAAGCCG-GTA-G-GTGCCAGGG------T-AT-A--GAATTT-AAT-----------------------a
gi|35                         :                    tactCGGAAGCCG-GTA-G-GTGCCAGGG------T-AT-A--GAA-TT-AA------------------------TAT--ATa
gi|36                         :                          GAAGCCG-GTA-G-GTGCCAGGG------T-AT-
gi|37                         :            ttaacatgtactCGGAAGACG-GTA-G-GTGCCAGGG------T-AT-A--GAA-TT-AA
gi|38                         :                       aCAGAAGCCG-GTA-G-GTGCCAGGG------T-AT-A--GA
gi|39                         :                  aacataCGGAAGCCG-GTA-G-GTGACAGGG------T-AT-A--GA
gi|4                          :                  tctaACTGTAAGCCG-GTATG-GTGC-AGGG------TTAT-A--GAA-TT-TAA-----------------------TAT--ATTTAT--------------------A-T---G-GCAGGCCGCATTATAATTAACTGGCG-----------GCCGCCAGAAATA-A--TT--T-TT-AGTGGCCTGCC-------CT----------------TAA-T-----TTCAT-GG-GCGGCCCAGCTCATT----TTA--TTA--TC--T----GGCGGCTCTGTGAACTAATT-TTATGTC--T-GT-GCGACC-GCCACT--TAT-TAT--G----TGGCGGCCACCA-CTT---TATT--AGTTCTTA---GGCGGGCCGC----ACTTTGTAA--TTT-ATACT-GGCGTCCCG-TCA--CTTAATTTAACTGGCAG--C-CGC---CACTTATATAT-TC--G-GC
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ttcta-TAATTG--GCGGTC--GCT----AT-TAGA-AAGCACTGATGGCCTCC----ATATA---AATT---AA---G------TGCAGATCG-CCA-G--CC-AAAT-TAA--G-TGCCAG-CC-G-C-CA-TATAAAT-TAAG-A-AGCGATCGCC-
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                caacgGTTAAAT-GAA--GTGGCGACC--GCC----AGATAAT-AAG---TGACAATCGCC----ACTT-------T---AA---TTCATCTGGCGG-CCG-C-T-A--TTCAAAT-TAA--C-TGGC-GGCC-G-C-CA-CATAGAT-TAAG-T-GGCGACCACT-AAAT--A-T--ATATGAATTCT-ATATCCTAGCAC-CTACCttcaactctccttctcaaaacgaaagagatgtgcaatttgtgtaacatcc
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tacagaagcc-CGCCAGCTATAATATTATTCTTGGCTTCGGCCGTACCAGTTAATT-TA--TATGGCGGGCGTGCC----AG-TAAT-------T-----CCGCC----A--------------------------GG----------A-G--T--GAA--TAA--G-TTTT-G-CG-G-G-CATTATCAAT-CG--------GGCCGCC-A----------ATATTAATTCTGATACCCTGGCAC-CTACC
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ---CACTTAATT-TAAT--TCGCTGCC--GCCTTATAG--AATAAAA---TGATGGCCGCT----TGATAGACA--T---AAC--C------GGCGG-CCGTC-ATA--T--AGATCTAA--T-TGGC-A-TTAG-C-CA-TATGAAT-TAGC-T-GGCAACCGCC-ACTTAAtatagatctaattggcattagccatatgaattagctggcaaccgccacttaa
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        taTTAATTTAACTAGCGA--C-CTT---CACTTAT-TATCTGGAG-GTC-G--Cggaggtcgc
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): CGTATTTGAATAACAAGAATGTATAAATCTATCAAGCTTTAGCTTATAGATAAAGCACTTGCGTTATGTTAACAAATGGAATG
Unaligned ( gi|31 ): CTGAAATGTGCAATAATAAAGTTGTATATAAGTACATACATCATG






Alignments
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lowQualScore                  :                                 1   3 1         555555 1  1 55   4  2  99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999   66666666666        999  1111  33333 44      3   333333333333333333333333333333333333    44  3      55  4    2222 5 77   222222222        1  3333333333333333333333333333333 8   22222  88   888888888     1    7   555    3    00000000   6      55555  1   0 000  8 8   8 6  8    8   11   0             3333333333333    8   6  11 8 6 6666   3  999999   88    88   6          0 0      0  0  2  33        6 11   8 000000   1     1 1  1     000    5555555     6     6  7  888 99  7   6 6 22222       0 88            3   6       5 1  77777    5    3     3      1   22     3333      333         8  44444       11   7777  88   6666666  5  2      22222222222222222222222222  0  4   111111111    4   4     111  3 6 3  3       3    3 3          3 66    8888           8            4     
lowQualScore                  :                                 .   . .         ...... .  . ..   .  .  ......................................................................................   ...........        ...  ....  ..... ..      .   ....................................    ..  .      ..  .    .... . ..   .........        .  ............................... .   .....  ..   .........     .    .   ...    .    ........   .      .....  .   . ...  . .   . .  .    .   ..   .             .............    .   .  .. . . ....   .  ......   ..    ..   .          . .      .  .  .  ..        . ..   . ......   .     . .  .     ...    .......     .     .  .  ... ..  .   . . .....       . ..            .   .       . .  .....    .    .     .      .   ..     ....      ...         .  .....       ..   ....  ..   .......  .  .      ..........................  .  .   .........    .   .     ...  . . .  .       .    . .          . ..    ....           .            .     
lowQualScore                  :                                 8   6 8         222222 8  8 22   4  2  66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666   44444444444        555  5555  66666 22      6   555555555555555555555555555555555555    33  6      55  0    1111 7 99   111111111        0  2222222222222222222222222222222 0   22222  33   555555555     0    9   777    3    88888888   7      66666  4   8 000  0 0   0 4  0    0   00   8             0000000000000    0   0  00 0 4 2222   3  000000   33    33   7          0 0      0  0  5  88        0 88   0 000000   0     0 0  0     000    9999999     7     7  2  777 22  3   7 7 22222       0 33            3   7       0 0  55555    5    3     3      0   00     5555      333         0  22222       00   0000  88   8888888  6  2      55555555555555555555555555  1  4   333333333    0   0     111  6 7 3  3       1    1 1          1 44    5555           0            0     
consensus                     :                      ACCGGAAGCCG-GTA-G-GTGCCAGGG------T-AT-A--GAA-TT-AAT-----------------------TAT--ATT-GT--------------------A-T---G-G----------------------GCG-----------GCCGCCACT--TA-A--TT--A-CT-GGCGGCC-GCC-----ACTT----------------TA-A-T-----TTAAN-TG-GCGGCC--GC-CACT----T-A--TTA--TC--T-TGTGGCGGCNCCG--AACTA-TA-TTAT--C--T-GC-GC---C-GCC-CT--TAT-TAT--C----TGGCGGCCGCCAGATA---AATT-AAGT--------GGC-GGCCGC----GCCAAATAA--ATT-A-AGT-GGCG-GCCG-CCA--CTTAATTTAACTGGCGA--C-CGCCA-CACTTAT-TAT-TG--G-GCC-G--CGC-CA--TAA-TAA--TTTA--TGTGGCGGCCGCCA-C-TTATTT-TC-TGGCG--GCCGCCACATNTAAT-TG-T---TAACTGGCGGCCGCCACTTA---TTAT--C----TGGCG-GCCGC-CATAT-A-A--AATTAA-T-G--CG-GCCGCCA-G--ATAAATTTAAGT-GCGCGCCGCCAGCNTAATTTTCAAGTGCGG-CGCCA-CTATAANATTNNTCCCGGCTTCGGCCG---CAGTTAATT-TAATTGTGGCGGCC--GCC----AG-TAAT-AAG---TGACGACCGCCANATA---A--T---AA---T------GGCGG-CCG-C-A-GC--AAAT-TAA-GTGGC-G-CC-G-C-CA-CATAAAT-TAAG-T-GGCGGCCGCC-ACNTAAA-T--ATATTAATTCT-ATACCCTGGCAC-CTACC
Reference ( family-3983 )     :                      ACCGGAAGCCG-GTA-G-GTGCCAGGG------T-AT-A--GAA-TT-AAT-----------------------TAT--ATT-GT--------------------A-T---G-G----------------------GCG-----------GCCGCCACT--TA-A--TT--A-CT-GGCGGCC-GCC-----ANTT----------------TA-A-T-----TTAAN-TG-GCGGCC--GC-CACT----T-A--TTA--TC--T-TGTGGCGGCNCCG--AACTA-TA-TTAT--C--T-GC-GC---C-GCC-CT--TAT-TAT--C----TGGCGGCCGCCAGATA---AATT-AAGT--------GGC-GGCCGC----GCCAAATAA--ATT-A-AGT-GGCG-GCCG-CCA--CTTAATTTAACTGGCGA--C-CGCCA-CACTTAT-TAT-TG--G-GCC-G--CGC-CA--TAA-TAA--TTTA--TGTGGCGGCCGCCA-C-TTATTT-TC-TGGCG--GCCGCCACATNTAAT-T------TAANTGGCGGCCGCCACTTA---TTAT--C----TGGCG-GCCGC-CATAT-A-A--AATTAA-T-G--CG-GCCGCCA-G--ATAAATTTAAGT-GCGCGCCGCCAGCNTAATTTTCAAGTGCGG-CGCCA-CTATAANATTNNTCCCGGCTTCGGCCG---CAGTTAATT-TAATTGTGGCGGCC--GCC----AG-TAAT-AAG---TGACGGCCGCCANATA---A--T---AA---T------GGCGG-CCG-C-A-GT--AAAT-TAA-GTGGC-G-CC-G-C-CA-CATAAAT-TAAG-T-GGCGGCCGCC-ANNTAAA-T--ATATTAATTCT-ATACCCTGGCAC-CTACC
gi|1                          :                      ACTAAAAGCCGAGTA-G-GT-CCAGGG------T-AT-A--GA--TT-AAT-----------------------TAT--ATT-GTG-------------------A-T---G-GT---------------------GCG-----------GCCGCCACTG-TA-A--TT--A-TT-GTCGGCC-GCC-----ACTT----------------TA-A-T-----TTAAA-TG-GCGGCC--GC-CACT----T-A--TTA--TCCTC-TGTGGCGGCGCC----AC-A-TA-TTAT--C--T-GC-AC---C-GCC-CT--TGT-TAT--C----TGGCGGCCGCCA-ACA---AATT-AACT--------GGC-GGCCGC----GCCAGATAAG-ATT-A-AGTGGGCG-TCCG-CCA--CATAATTTAACTAGCGG--CGTGCCA-CACTTAT-TAT-TG--G-GCCGG--CGCGCA--TAA-TAA--TTAA--TCT-GCGGCTGCCA-C-TTATCA-TC-TGGCG--GCCGCCATATATAAA-T------TAACTGCCGACCGCCACTTA----TAT--C----TGGCG-GCCGCGCATAT-AGA--AATTAA-T-G--CG-GCCGCCA-G--ATGAATTTAAGT-GCGCGCCGCCAGCATA-----TAAGTGCGG-CGCCA-CTATAAAATTTATCCCA----CGGCTG---CAGTTAATTGTAATTATGGTCGCC--GCC----AA-TAAT-AA----TG-CGACCGCCAGATA---A--T---AA---T------GGCGG-TCG-C-A-GT--AAAT-TAA-GTGGC-G-CC-GTC-CA-CATAAAT-TAAG-CAGGCGGCCGCC-ATATAAATT--ATATTAATTCTAATACCCTGG-AC-CCACC
gi|10                         :                           AAGCCA-GTC-G-GTGCTATGG------T-AT-ATAGAA-TT-AA------------------------TAT---TC-AT--------------------A-TTCCT-G----------------------GCG-----------ACTGCCTGT--TA-ACTTT--A-TTGGGCAGCC-AGC-----ACTTACTTATCTGTCAAGTATA-T-T-----TTAAC-TG-GCTGCT--GC-CATT----T-A--
gi|11                         :                      ACGGAAAGCCG-GTA-GCGTGCCAGGG------T-AT-A--GAA-TT-AATATTTCATGTGGGCGGTTGCTACTTAG--ATT--T--------------------A-T---G-T----------------------GCGA----------GCCGCCATA--TA-AA-TT--A-CT-GCCCGCC-GCC-----AAGA----------------TA-AAT-----TTAAG-TGCGCG
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ---T------GGCGG-CGGGC-A-GT--AATT-TAT-ATGGC-G-GC-T-CGCA-CATAAATCTAAG-T-AGCAACCGCCCACATGAA----ATATTAATTCT-ATACCCTGGCACGCTACC
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         acggaaagccGGCGGTTGCTACTTAGATTTAT--G----TG-CGAGCCGC-CATAT-A-A--A-TTAC-T-G--CCCGCCGCCAAG--ATAAATTTAAGT-GCGCGagataaatttaagtgcgcg
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    acggaaagccggtagcgtgccagggtatagaattaatatttcatgtgCGACCGCCATATA---AACT---AAAAGT------GGTGG-CTG-C-C-AC--TCAT-TAT-CTGGCAG-CC-G-C-CA-GATAAA---AAG-T-GGCGACCGCC-ACCTAA-----ATATTAA-TCT-ATACCCTGGCAG-CTAC
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                           cggaagccggtacat----------------TA-A-G-----TTAAG-TG-GCGGCC--GC-CACT----T-A--TTAGGCC--TATCTGGTGGCCTC----AC-A-TA-TTAT--C--TGGCGGT---C-GCC------A--TATA-C----TGGCGGCCGCCAGATA---AATTGAAGT--------GGC-GGCCGC----c
gi|14                         :                      cataGAAGTCG-GTA-G-GTGCCAGGG------T-AT-A--GAA-TC-AGT-----------------------TA---ATT-------------------------T---A-A----------------------GTG-----------GCGGTAATT--TG-----T--A--T-GGCGGCC-GCCAGATAAATTACGGTAAGA-------TA-A-A-----TTAAC-TG-GCGGCC--GC-CAcaca
gi|15                         :                       ctGAAAGCCG-GTA-G-GTTCCAGG----------T-A--CTA-TTCAAC-----------------------TAC--AAT-GT--------------------AAT---G-T----------------------TCATTTATCTTTCAGCCACGACT--TG-A--TT-----T---CGACC-GCT-----ACTT-----------------A-A-T-----TTGTA-TG-GCGGCC--GC-C
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CCA-C-TTAATT-TC-TG-CG--GTCGCCACATG--AT-T------TAATTGTCG-CCGCCATTTA---TTAT--C----TGGCG-GCCGT-CATATGA-A--AA--AA-T-GGATG-GCCG
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           t-TAA-GAGGT-A-AC-GAC-CA-CATAATA-CAAG-T-GGCGGCCGGA-AAATAAA-TTGATATTGGTTTT-CCATCTTGGCAC-TTACCtataagtggcg
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ctacggaagctGGA-G-CC-G-C-CA-CATAGAT-TGAT-T-GACTGCCGCC-AGTTAAA-TGAATATCAATTGT-ATACCCTAGCAC-CTACCtt
gi|2                          :                                                                                                                            tacgggaggc-G----------------------GCG-----------GCCGCCAC---TA-G--TT--G--T-GGCGACA-GCC-----ACAT----------------AA-A-TA----TTAAT-Tta
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tacggaagccggtatgccaagggtataga---T------GGCTG-TCG-C-C-AC--AACT---A-GTGGC-GGCC-G-C-CT-TGAAAAT-TAAG-T-GGCGGCCGCT-ACTTAAA-T--TTATTttgaaaattaagtggcggccgctacttaaatttattgctggcggccccacttaatttaactggcggccgccaactaataagtggcggccgccagttaaaaaacaattaaaagtggcggtcgccagataaatgatgttggcgcccgccacttaaaatttatttctggcggacaccatataatatactggcgttgccagataacagtggcgccgcacataaattaagggcggccgccacatagatacttaattctatagggaagtcgaggtaggtgccagggtaggagaattgataattatatctcggggccgccacttatttatgtgggaccgccag
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                               tacggaagccggtatgccaagggtatagaaattaatatttatg-TG-GCGGTC---C-CACA----T-AAATAA---------GTGGCGGCCCCG--AGATA-TAATTAT--CAAT-TC-TC---CTACC-CTGGCACCTAC--C----T--CGACTTCCCTATAG--AATT-AAGTATCTATGTGGC-GGCCGC----CCTTAAT-----TT-A-TGT-G-CG-GC-G-CCA--CTG---TTATCTGGCAA--C--GCCAGTA--TAT-TATATG--GTGTC----CGC-CA--GAAATAAATTTTA--AGTGGCGGGCGCCAACATCATTTATC-TGGCG--ACCGCCACTTTTAAT-TGTTTTTTAACTGGCGGCCGCCACTTA---TTAG--T----TGGCG-GCCGC-CA-GT-T-A--AATTAAGT-G--GG-GCCGCCA-GCAATAAATTTAAGTAGCG-GCCGCCA-CTTAATTTTCAAG-GCGGCCGCCA-CTAgctggcggccccacttaatttaactggcggccgccaactaataagtggcggccgccagttaaaaaacaattaaaagtggcggtcgccagataaatgatgttggcgcccgccacttaaaatttatttctggcggacaccatataatatactggcgttgccagataacagtggcgccgcacataaattaagggcggccgccacatagatacttaattctatagggaagtcgaggtaggtgccagggtaggagaattgataattatatctcggggccgccacttatttatgtgggaccgccag
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tacggaagccggtatgccaagggtatagaaattaatatttatgtggctgtcgccacaacCATATAACAT------TAAGTGGTGGT-GC-ACTCA---TTAT--C----TGGCA-GCCGG-CAGAT-A-A--AA--AG-TGG--CG-ACCGCCA-g
gi|21                         :                   gcgacgcGAAGCCG-GTT-G-GTGCCAGGG------T-AT-A--GAA-TT-AA------------------------TAT--ATT--T--------------------A-T---GTG----------------------GCG-----------GCCGACACA--TAGA--TTA-A-CT-GGCGGCC-Gtcctaa
gi|22                         :                   gtactCGGAAGCCG-GTAAG-GTGCCAGGG------T-AT-A--G-A-TT-AAT-----------------------TAT---TT-AT--------------------C-T-----G----------------------GCG-----------GCCGCCATT--T
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ctaATTTA---TTATGCCAAAATGGCG-GCCGC-CAGAT-A-AATAATTAA-T-tggcataataaatat
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ctacggaagccggtaaggtgccagggtatagT--TAT-TATGCCAAAATGGCGGCCGCCAGATA---AATat
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ctacggaagccggtaaggtgccagggtatagattaatt-C-CA-CTTACAT-TTATCT-GGCGGCCGCC-ACATAAA-T--ATATTATTTCT-ATGCCCTGGCAC-atat
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ctgaaactactTA---A--TTCAAA---T------GGAGT-CCG-C-A-ACG-AAAT-TGATGTAGCAG-CC-G-C-CA-CATGGAT-TAGA-T-GACGACCGt
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TAAAT-TAAG-T-GGCAGCCACC-AGTTAAA-TGAATATCAATGCT-ATACCTTTGCGT-CTACaggt
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     actgaagtctAGTTA---AATT-AAGT--------GAC-GGTCGCCAATACCAAATAA--ATC-A-AGT-GACG-GTCG-TCA--
gi|27                         :                        CGGAAACCG-GTA-G-GTGCCAGGG------T-AT-T--GAA-TT-A--------------------------AT--ATT--T--------------------A-T---GTG----------------------GCG-----------GCCGCgataaatga
gi|28                         :                      taCGAAAGCCG-GTA-G-GTGCCAGGG------T-CT-A--GAG-GC-GGC-----------------------TA---ACT-------------------------------G----------------------GCG-----------GCCGC
gi|29                         :                    tgtaCGGAAGCCG-GTA-G-GTGCCAAGG--------AT-ACTGAA-TT-AAT-----------------------TAT--TTT-AT--------------------G-T---G-G----------------------G
gi|3                          :                      taCGGAAGCCG-GTA-G-GTGCCAGGG------T-ATTA--GAAATT-AATA----------------------TATTTATT-GTGGCGGCCCGCCACTTAATTAA-C---T-G----------------------GCG-----------GCCGCCACT--TA-T--TT--ATCT-GGCGGCC-GCC-----AGCA----------------TA-A-TAAAATTTAAAGTG-GCGGCC--GC-CACTCTAAT-G--TTA---C--T-TGTGGCG-CGTCG--A-----------------C-G--GC---C-ACC--T--TAT-TAT--T------GCGGC-GCCAGATATAAAGTTGAACT--------GGC-GGCCGC------CAAAAAATAATTGA-AGT-GACG-GCCGGCCAAACTTAATTTAACTGGCGACCC-CGCCA----TTAT-TAT-TG--G-G-C-GACCGC-CACTTA---AA--TTTATGTGTGGCGGCCGCCA-CTTTATTT-TTGTGGCGGCGCTGCCAC-TTTAAT-TGGTA--TGATTGGCGGCCGCCAA--G---TTAT--C----Tg
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aGCC-ATATAAA-T--ATATTAATTCT-ATACCCTGGCAC-CTATCtctctctctctc
gi|32                         :                 actgaagccGAAGCCG-GTA-G-GTGCCAGGG------T-AT-A--GAA-TT-AAT-----------------------AAT--
gi|33                         :                     actCGGAAACCG-GTA-G-GTGCCAGAG------T-AT-A--GAA-TT-AAT-----------------------tta
gi|34                         :                       gtaGAAGCCG-GTA-G-GTGCCAGGG------T-AT-A--GAATTT-AAT-----------------------a
gi|35                         :                    tactCGGAAGCCG-GTA-G-GTGCCAGGG------T-AT-A--GAA-TT-AA------------------------TAT--ATa
gi|36                         :                          GAAGCCG-GTA-G-GTGCCAGGG------T-AT-
gi|37                         :            ttaacatgtactCGGAAGACG-GTA-G-GTGCCAGGG------T-AT-A--GAA-TT-AA
gi|38                         :                       aCAGAAGCCG-GTA-G-GTGCCAGGG------T-AT-A--GA
gi|39                         :                  aacataCGGAAGCCG-GTA-G-GTGACAGGG------T-AT-A--GA
gi|4                          :                  tctaACTGTAAGCCG-GTATG-GTGC-AGGG------TTAT-A--GAA-TT-TAA-----------------------TAT--ATTTAT--------------------A-T---G-GCAGGCCGCATTATAATTAACTGGCG-----------GCCGCCAGAAATA-A--TT--T-TT-AGTGGCCTGCC-------CT----------------TA-A-T-----TTCAT-GG-GCGGCCCAGCTCATT----TTA--TTA--TC--T----GGCGGCTCTGTGAACTAATT-TTATGTC--T-GT-GCGACC-GCCACT--TAT-TAT--G----TGGCGGCCACCA-CTT---TATT--AGTTCTTA---GGCGGGCCGC----ACTTTGTAA--TTT-ATACT-GGCGTCCCG-TCA--CTTAATTTAACTGGCAG--C-CGC---CACTTATATAT-TC--G-GC
gi|40                         :                        CGGAAGCCG-GTA-G-GTGCAAGGG------T-AT-A--G
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ttcta-TAATTG--GCGGTC--GCT----AT-TAGA-AAGCACTGATGGCCTCCATATA---AATT---AA---G------TGCAGATCG-CCA-GCC-AAAT-TAA-GTGCCAG-CC-G-C-CA-TATAAAT-TAAG-A-AGCGATCGCC-
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              caacgGTTAAAT-GAA--GTGGCGACC--GCC----AGATAAT-AAG---TGACAATCGCCACTT-------T---AA---TTCATCTGGCGG-CCG-C-T-ATTCAAAT-TAA-CTGGC-GGCC-G-C-CA-CATAGAT-TAAG-T-GGCGACCACT-AAAT--A-T--ATATGAATTCT-ATATCCTAGCAC-CTACCttcaactctccttctcaaaacgaaagagatgtgcaatttgtgtaacatcc
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tacagaagcc-CGCCAGCTATAATATTATTCTTGGCTTCGGCCGTACCAGTTAATT-TA--TATGGCGGGCGTGCC----AG-TAAT-------T-----CCGCCA--------------------------GG----------A-GT--GAA--TAA-GTTTT-G-CG-G-G-CATTATCAAT-CG--------GGCCGCC-A----------ATATTAATTCTGATACCCTGGCAC-CTACC
gi|8                          :                                                                                                ggaagccT-GT--------------------G-T---G-A-----------------------CG-----------TTTGCCACT--TA-A--TTTAA-TT-CGCTGCC-GCC------TTA----------------TAGA-A-----TAAAA-TG-ATGGCC--GC-gcc
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     cacttaatc---CACTTAATT-TAAT--TCGCTGCC--GCCTTATAG--AATAAAA---TGATGGCCGCTTGATAGACA--T---AAC--C------GGCGG-CCGTC-ATAT--AGATCTAA-TTGGC-A-TTAG-C-CA-TATGAAT-TAGC-T-GGCAACCGCC-ACTTAAttgatagacataaccggcggccgtcatatagatctaattggcattagccatatgaattagctggcaaccgccacttaa
gi|9                          : cacttaatctgtgtgacgtttgcCGGAAGCTG-GGA-G-GTGCCAGGGGCAGGGT-AT-A--TAA-TT-GAT------------------------ATTCATT--T--------------------A-T---GTG----------------------GTA-----------GTCGTTACT--TC-A--TTTTA-CT-TGCGGC------------TT----------------TA-A-T-----TTAAC-TA-GCGACC--TT-CACT----T-A--TTA--TC--T-
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         taTTAATTTAACTAGCGA--C-CTT---CACTTAT-TATCTGGAG-GTC-G--Cggaggtcgc
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|31 ): CTGAAATGTGCAATAATAAAGTTGTATATAAGTACATACATCATG






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consensus                     :                         ACCGGAAGCCG-GTA-GGTGCCAGGG------T-AT-A--GAA-TT-AAT-TAT--A-TT-AT--------------------A-T---G-G----------------------GCG-----------GCCGCCACT--TA-A--TT--A-CT-GGCGGCC-GCC-----ACTT----------------TAAT-----TTAAN-TGGCGGCC--GC-CACT----T-A--TTA--TC--T-TGTGGCGGCNCCG--AACTA-TA-TTAT--C--T-GC-GC---C-GCC-CT--TAT-TAT--C----TGGCGGCCGCCAGATA---AATT-AAGT--------GGC-GGCCGC----GCCAAATAA--ATT-A-AGT-GGCG-GCCG-CCA--CTTAATTTAACTGGCGA--C-CGCCA-CACTTAT-TAT-TG--G-GCC-G--CGC-CA--TAA-TAA--TTTA--TGTGGCGGCCGCCA-C-TTATTT-TC-TGGCG--GCCGCCACATNTAATTGTT----A--ACTGGCGGCCGCCACTTA---TTAT--C----TGGCG-GCCGC-CATAT-A-A--AATTAA-T-G--CG-GCCGCCA-G--ATAAATTTAAGT-GCGCGCCGCCAGCNTAATTTTCAAGTGCGG-CGCCA-CTATAANATTNNTCCCGGCTTCGGCCG---CAGTTAATT-TAATTGTGGCGGCC--GCC----AG-TAATAAG---TGACGACCGCCANATA---A--T---AA---T------GGCGG-CCG-C-A-G--C-AAAT-TAA-GTGGC-G-CC-G-C-CA-CATAAAT-TAAG-T-GGCGGCCGCC-ACNTAAA-T--ATATTAATTCT-ATACCCTGGCAC-CTACC
Reference ( family-3983 )     :                         ACCGGAAGCCG-GTA-GGTGCCAGGG------T-AT-A--GAA-TT-AAT-TAT--A-TT-GT--------------------A-T---G-G----------------------GCG-----------GCCGCCACT--TA-A--TT--A-CT-GGCGGCC-GCC-----ACTT----------------TAAT-----TTAAN-TGGCGGCC--GC-CACT----T-A--TTA--TC--T-TGTGGCGGCNCCG--AACTA-TA-TTAT--C--T-GC-GC---C-GCC-CT--TAT-TAT--C----TGGCGGCCGCCAGATA---AATT-AAGT--------GGC-GGCCGC----GCCAAATAA--ATT-A-AGT-GGCG-GCCG-CCA--CTTAATTTAACTGGCGA--C-CGCCA-CACTTAT-TAT-TG--G-GCC-G--CGC-CA--TAA-TAA--TTTA--TGTGGCGGCCGCCA-C-TTATTT-TC-TGGCG--GCCGCCACATNTAATTGTT----A--ACTGGCGGCCGCCACTTA---TTAT--C----TGGCG-GCCGC-CATAT-A-A--AATTAA-T-G--CG-GCCGCCA-G--ATAAATTTAAGT-GCGCGCCGCCAGCNTAATTTTCAAGTGCGG-CGCCA-CTATAANATTNNTCCCGGCTTCGGCCG---CAGTTAATT-TAATTGTGGCGGCC--GCC----AG-TAATAAG---TGACGACCGCCANATA---A--T---AA---T------GGCGG-CCG-C-A-G--C-AAAT-TAA-GTGGC-G-CC-G-C-CA-CATAAAT-TAAG-T-GGCGGCCGCC-ACNTAAA-T--ATATTAATTCT-ATACCCTGGCAC-CTACC
gi|1                          :                         ACTAAAAGCCGAGTA-GGT-CCAGGG------T-AT-A--GA--TT-AAT-TAT--A-TT-GTG-------------------A-T---G-GT---------------------GCG-----------GCCGCCACTG-TA-A--TT--A-TT-GTCGGCC-GCC-----ACTT----------------TAAT-----TTAAA-TGGCGGCC--GC-CACT----T-A--TTA--TCCTC-TGTGGCGGCGCC----AC-A-TA-TTAT--C--T-GC-AC---C-GCC-CT--TGT-TAT--C----TGGCGGCCGCCA-ACA---AATT-AACT--------GGC-GGCCGC----GCCAGATAAG-ATT-A-AGTGGGCG-TCCG-CCA--CATAATTTAACTAGCGG--CGTGCCA-CACTTAT-TAT-TG--G-GCCGG--CGCGCA--TAA-TAA--TTAA--TCT-GCGGCTGCCA-C-TTATCA-TC-TGGCG--GCCGCCATATATAA--ATT----A--ACTGCCGACCGCCACTTA----TAT--C----TGGCG-GCCGCGCATAT-AGA--AATTAA-T-G--CG-GCCGCCA-G--ATGAATTTAAGT-GCGCGCCGCCAGCATA-----TAAGTGCGG-CGCCA-CTATAAAATTTATCCCA----CGGCTG---CAGTTAATTGTAATTATGGTCGCC--GCC----AA-TAATAA----TG-CGACCGCCAGATA---A--T---AA---T------GGCGG-TCG-C-A-G--T-AAAT-TAA-GTGGC-G-CC-GTC-CA-CATAAAT-TAAG-CAGGCGGCCGCC-ATATAAATT--ATATTAATTCTAATACCCTGG-AC-CCACC
gi|10                         :                              AAGCCA-GTC-GGTGCTATGG------T-AT-ATAGAA-TT-AA--TAT----TC-AT--------------------A-TTCCT-G----------------------GCG-----------ACTGCCTGT--TA-ACTTT--A-TTGGGCAGCC-AGC-----ACTTACTTATCTGTCAAGTATATT-----TTAAC-TGGCTGCT--GC-CATT----T-A--
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ---T------GGCGG-CGGGC-A-G--T-AATT-TAT-ATGGC-G-GC-T-CGCA-CATAAATCTAAG-T-AGCAACCGCCCACATGAA----ATATTAATTCT-ATACCCTGGCACGCTACC
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    acggaaagccGGCGGTTGCTACTTAGATTTAT--G----TG-CGAGCCGC-CATAT-A-A--A-TTAC-T-G--CCCGCCGCCAAG--ATAAATTTAAGT-GCGCGagataaatttaagtgcgcg
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              acggaaagccggtagcgtgccagggtatagaattaatatttcatgtgCGACCGCCATATA---AACT---AAAAGT------GGTGG-CTG-C-C-A--C-TCAT-TAT-CTGGCAG-CC-G-C-CA-GATAAA---AAG-T-GGCGACCGCC-ACCTAA-----ATATTAA-TCT-ATACCCTGGCAG-CTAC
gi|13                         :                                                                                                                                                                                        cggaagccggtacat----------------TAAG-----TTAAG-TGGCGGCC--GC-CACT----T-A--TTAGGCC--TATCTGGTGGCCTC----AC-A-TA-TTAT--C--TGGCGGT---C-GCC------A--TATA-C----TGGCGGCCGCCAGATA---AATTGAAGT--------GGC-GGCCGC----c
gi|14                         :                         cataGAAGTCG-GTA-GGTGCCAGGG------T-AT-A--GAA-TC-AGT-TA---A-TT-------------------------T---A-A----------------------GTG-----------GCGGTAATT--TG-----T--A--T-GGCGGCC-GCCAGATAAATTACGGTAAGA-------TAAA-----TTAAC-TGGCGGCC--GC-CAcaca
gi|15                         :                          ctGAAAGCCG-GTA-GGTTCCAGG----------T-A--CTA-TTCAAC-TAC--A-AT-GT--------------------AAT---G-T----------------------TCATTTATCTTTCAGCCACGACT--TG-A--TT-----T---CGACC-GCT-----ACTT-----------------AAT-----TTGTA-TGGCGGCC--GC-C
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CCA-C-TTAATT-TC-TG-CG--GTCGCCACATG--ATT--T----A--ATTGTCG-CCGCCATTTA---TTAT--C----TGGCG-GCCGT-CATATGA-A--AA--AA-T-GGATG-GCCG
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      t-TAA-GAGGT-A-AC-GAC-CA-CATAATA-CAAG-T-GGCGGCCGGA-AAATAAA-TTGATATTGGTTTT-CCATCTTGGCAC-TTACCtataagtggcg
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ctacggaagctGGA-G-CC-G-C-CA-CATAGAT-TGAT-T-GACTGCCGCC-AGTTAAA-TGAATATCAATTGT-ATACCCTAGCAC-CTACCtt
gi|2                          :                                                                                                         tacgggaggc-G----------------------GCG-----------GCCGCCAC---TA-G--TT--G--T-GGCGACA-GCC-----ACAT----------------AAATA----TTAAT-Tta
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tacggaagccggtatgccaagggtataga---T------GGCTG-TCG-C-C-A--C-AACT---A-GTGGC-GGCC-G-C-CT-TGAAAAT-TAAG-T-GGCGGCCGCT-ACTTAAA-T--TTATTttgaaaattaagtggcggccgctacttaaatttattgctggcggccccacttaatttaactggcggccgccaactaataagtggcggccgccagttaaaaaacaattaaaagtggcggtcgccagataaatgatgttggcgcccgccacttaaaatttatttctggcggacaccatataatatactggcgttgccagataacagtggcgccgcacataaattaagggcggccgccacatagatacttaattctatagggaagtcgaggtaggtgccagggtaggagaattgataattatatctcggggccgccacttatttatgtgggaccgccag
gi|2                          :                                                                                                                                                                                          tacggaagccggtatgccaagggtatagaaattaatatttatg-TGGCGGTC---C-CACA----T-AAATAA---------GTGGCGGCCCCG--AGATA-TAATTAT--CAAT-TC-TC---CTACC-CTGGCACCTAC--C----T--CGACTTCCCTATAG--AATT-AAGTATCTATGTGGC-GGCCGC----CCTTAAT-----TT-A-TGT-G-CG-GC-G-CCA--CTG---TTATCTGGCAA--C--GCCAGTA--TAT-TATATG--GTGTC----CGC-CA--GAAATAAATTTTA--AGTGGCGGGCGCCAACATCATTTATC-TGGCG--ACCGCCACTTTTAATTGTTTTTTA--ACTGGCGGCCGCCACTTA---TTAG--T----TGGCG-GCCGC-CA-GT-T-A--AATTAAGT-G--GG-GCCGCCA-GCAATAAATTTAAGTAGCG-GCCGCCA-CTTAATTTTCAAG-GCGGCCGCCA-CTAgctggcggccccacttaatttaactggcggccgccaactaataagtggcggccgccagttaaaaaacaattaaaagtggcggtcgccagataaatgatgttggcgcccgccacttaaaatttatttctggcggacaccatataatatactggcgttgccagataacagtggcgccgcacataaattaagggcggccgccacatagatacttaattctatagggaagtcgaggtaggtgccagggtaggagaattgataattatatctcggggccgccacttatttatgtgggaccgccag
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tacggaagccggtatgccaagggtatagaaattaatatttatgtggctgtcgccacaacCATATAAC-ATT----A--AGTGGTGGT-GC-ACTCA---TTAT--C----TGGCA-GCCGG-CAGAT-A-A--AA--AG-TGG--CG-ACCGCCA-g
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gcgacgc-GCA-CT--CAT-TAT--C----TGGCAGCCGGCAGATA---AA---AAGT--------GGC-GACCGC----tcctaa
gi|21                         : gcgacgccatataacattaagtggtggtGAAGCCG-GTT-GGTGCCAGGG------T-AT-A--GAA-TT-AA--TAT--A-TT--T--------------------A-T---GTG----------------------GCG-----------GCCGACACA--TAGA--TTA-A-CT-GGCGGCC-Gcatcctaa
gi|22                         :                      gtactCGGAAGCCG-GTAAGGTGCCAGGG------T-AT-A--G-A-TT-AAT-TAT----TT-AT--------------------C-T-----G----------------------GCG-----------GCCGCCATT--T
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ctaATTTA---TTATGCCAAAATGGCG-GCCGC-CAGAT-A-AATAATTAA-T-tggcataataaatat
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                              ctacggaagccggtaaggtgccagggtatagT--TAT-TATGCCAAAATGGCGGCCGCCAGATA---AATat
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ctacggaagccggtaaggtgccagggtatagattaatt-C-CA-CTTACAT-TTATCT-GGCGGCCGCC-ACATAAA-T--ATATTATTTCT-ATGCCCTGGCAC-atat
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ctgaaactactTA---A--TTCAAA---T------GGAGT-CCG-C-A-A--CGAAAT-TGATGTAGCAG-CC-G-C-CA-CATGGAT-TAGA-T-GACGACCGt
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TAAAT-TAAG-T-GGCAGCCACC-AGTTAAA-TGAATATCAATGCT-ATACCTTTGCGT-CTACaggt
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               actgaagtctAGTTA---AATT-AAGT--------GAC-GGTCGCCAATACCAAATAA--ATC-A-AGT-GACG-GTCG-TCA--
gi|27                         :                           CGGAAACCG-GTA-GGTGCCAGGG------T-AT-T--GAA-TT-A----AT--A-TT--T--------------------A-T---GTG----------------------GCG-----------GCCGCgataaatga
gi|28                         :                         taCGAAAGCCG-GTA-GGTGCCAGGG------T-CT-A--GAG-GC-GGC-TA---A-CT-------------------------------G----------------------GCG-----------GCCGC
gi|29                         :                       tgtaCGGAAGCCG-GTA-GGTGCCAAGG--------AT-ACTGAA-TT-AAT-TAT--T-TT-AT--------------------G-T---G-G----------------------G
gi|3                          :                         taCGGAAGCCG-GTA-GGTGCCAGGG------T-ATTA--GAAATT-AATATATTTA-TT-GTGGCGGCCCGCCACTTAATTAA-C---T-G----------------------GCG-----------GCCGCCACT--TA-T--TT--ATCT-GGCGGCC-GCC-----AGCA----------------TAATAAAATTTAAAGTGGCGGCC--GC-CACTCTAAT-G--TTA---C--T-TGTGGCG-CGTCG--A-----------------C-G--GC---C-ACC--T--TAT-TAT--T------GCGGC-GCCAGATATAAAGTTGAACT--------GGC-GGCCGC------CAAAAAATAATTGA-AGT-GACG-GCCGGCCAAACTTAATTTAACTGGCGACCC-CGCCA----TTAT-TAT-TG--G-G-C-GACCGC-CACTTA---AA--TTTATGTGTGGCGGCCGCCA-CTTTATTT-TTGTGGCGGCGCTGCCAC-TTTAATTGGT----ATGATTGGCGGCCGCCAA--G---TTAT--C----Tg
gi|30                         :                            aGAAGCCG-ATA-GGTGCCAGGG------T-AT-A--GAA-TT-AA--TAT--ATTT-AT--------------------A-T---G-G----------------------tctctctctctc
gi|32                         :                          actGAAGCCG-GTA-GGTGCCAGGG------T-AT-A--GAA-TT-AAT-AAT--c
gi|33                         :                        actCGGAAACCG-GTA-GGTGCCAGAG------T-AT-A--GAA-TT-AAT-tta
gi|34                         :                          gtaGAAGCCG-GTA-GGTGCCAGGG------T-AT-A--GAATTT-AAT-a
gi|35                         :                       tactCGGAAGCCG-GTA-GGTGCCAGGG------T-AT-A--GAA-TT-AA--TAT--A-Ta
gi|36                         :                             GAAGCCG-GTA-GGTGCCAGGG------T-AT-
gi|37                         :               ttaacatgtactCGGAAGACG-GTA-GGTGCCAGGG------T-AT-A--GAA-TT-AA
gi|38                         :                          aCAGAAGCCG-GTA-GGTGCCAGGG------T-AT-A--GA
gi|39                         :                     aacataCGGAAGCCG-GTA-GGTGACAGGG------T-AT-A--GA
gi|4                          :                     tctaACTGTAAGCCG-GTATGGTGC-AGGG------TTAT-A--GAA-TT-TAA-TAT--A-TTTAT--------------------A-T---G-GCAGGCCGCATTATAATTAACTGGCG-----------GCCGCCAGAAATA-A--TT--T-TT-AGTGGCCTGCC-------CT----------------TAAT-----TTCAT-GGGCGGCCCAGCTCATT----TTA--TTA--TC--T----GGCGGCTCTGTGAACTAATT-TTATGTC--T-GT-GCGACC-GCCACT--TAT-TAT--G----TGGCGGCCACCA-CTT---TATT--AGTTCTTA---GGCGGGCCGC----ACTTTGTAA--TTT-ATACT-GGCGTCCCG-TCA--CTTAATTTAACTGGCAG--C-CGC---CACTTATATAT-TC--G-GC
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ttcta-TAATTG--GCGGTC--GCT----AT-TAGAAAGCACTGATGGCCTCCATATA---AATT---AA---G------TGCAGATCG-CCA-G--CCAAAT-TAA-GTGCCAG-CC-G-C-CA-TATAAAT-TAAG-A-AGCGATCGCC-
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|31 ): CTGAAATGTGCAATAATAAAGTTGTATATAAGTACATACATCATG






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Reference ( family-3983 )     :                         ACCGGAAGCCG-GTA-G-GTGCCAGGG------T-A---------T-A--GAA-T-TAAT---TAT--A-TT-AT-AT---G----------------------G----------------------GCGGCCGCCACT--TA-A--TT--A-CT-G-GCG-GCC-GCC-----ACTT----------------TAAT-----TTAAN-TGGCGGCC--GC-CACT----T-A--TTA--TC--T-TGTGGCGGCNCCG--AACTA-TA-TTAT--C--T-GC-GC---C-GCC-CT--TAT-TAT--C----TGGCGGCCGCCAGATA---AATT-AAGT--------GGC-GGCCGC----GCCAAATAA--ATT-A-AGT-GGCG-GCCG-CCA--CTTAATTTAACTGGCGA--C-CGCCA-CACTTAT-TAT-TG--G-GCC-G--CGC-CA--TAA-TAA--TTTA--TGTGGCGGCCGCCA-C-TTATTT-TC-TGGCG--GCCGCCACATNTAATTGTT----A--ACTGGCGGCCGCCACTTA---TTAT--C----TGGCG-GCCGC-CATAT-A-A--AATTAA-T-G--CG-GCCGCCA-G--ATAAATTTAAGT-GCGCGCCGCCAGCNTAATTTTCAAGTGCGG-CGCCA-CTATAANATTNNTCCCGGCTTCGGCCG---CAGTTAATT-TAATTGTGGCGGCC--GCC----AG-TAATAAG---TGACGACCGCCANATA---A--T---AA---T------GGCGG-CCG-C-A-G--C-AAAT-TAA-GTGGC-G-CC-G-CCA-CATAAATTAAG-T-GGCGGCCGCCACNTAAA-T--ATATTAATTCT-ATACCCTGGCACCTACC
gi|1                          :                         ACTAAAAGCCGAGTA-G-GT-CCAGGG------T-A---------T-A--GA--T-TAAT---TAT--A-TT-GTGAT---G----------------------GT---------------------GCGGCCGCCACTG-TA-A--TT--A-TT-G-TCG-GCC-GCC-----ACTT----------------TAAT-----TTAAA-TGGCGGCC--GC-CACT----T-A--TTA--TCCTC-TGTGGCGGCGCC----AC-A-TA-TTAT--C--T-GC-AC---C-GCC-CT--TGT-TAT--C----TGGCGGCCGCCA-ACA---AATT-AACT--------GGC-GGCCGC----GCCAGATAAG-ATT-A-AGTGGGCG-TCCG-CCA--CATAATTTAACTAGCGG--CGTGCCA-CACTTAT-TAT-TG--G-GCCGG--CGCGCA--TAA-TAA--TTAA--TCT-GCGGCTGCCA-C-TTATCA-TC-TGGCG--GCCGCCATATATAA--ATT----A--ACTGCCGACCGCCACTTA----TAT--C----TGGCG-GCCGCGCATAT-AGA--AATTAA-T-G--CG-GCCGCCA-G--ATGAATTTAAGT-GCGCGCCGCCAGCATA-----TAAGTGCGG-CGCCA-CTATAAAATTTATCCCA----CGGCTG---CAGTTAATTGTAATTATGGTCGCC--GCC----AA-TAATAA----TG-CGACCGCCAGATA---A--T---AA---T------GGCGG-TCG-C-A-G--T-AAAT-TAA-GTGGC-G-CC-GTCCA-CATAAATTAAG-CAGGCGGCCGCCATATAAATT--ATATTAATTCTAATACCCTGG-ACCCACC
gi|10                         :                              AAGCCA-GTC-G-GTGCTATGG------T-A---------T-ATAGAA-T-TAA----TAT----TC-AT-ATTCCT----------------------G----------------------GCGACTGCCTGT--TA-ACTTT--A-TTGG-GCA-GCC-AGC-----ACTTACTTATCTGTCAAGTATATT-----TTAAC-TGGCTGCT--GC-CATT----T-A--
gi|11                         :                         ACGGAAAGCCG-GTA-GCGTGCCAGGG------T-A---------T-A--GAA-T-TAA----TAT--T-TC-AT-GT---G----------------------G----------------------GCGGTTGCTACT--TAGA--TT--T-AT-GTGCGAGCC-GCC-----ATAT----------------AAAT-----T--AC-TGCCCGCC--GC-CA
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GGCGGTTGCTACTTAGATTTAT--G----TG-CGAGCCGC-CATAT-A-A--A-TTAC-T-G--CCCGCCGCCAAG--ATAAATTTAAGT-GCGCGagataaatttaagtgcgcg
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gi|14                         :                         cataGAAGTCG-GTA-G-GTGCCAGGG------T-A---------T-A--GAA-T-CAGT---TA---A-TT-----T---A----------------------A----------------------GTGGCGGTAATT--TG-----T--A--T-G-GCG-GCC-GCCAGATAAATTACGGTAAGA-------TAAA-----TTAAC-TGGCGGCC--GC-CAcaca
gi|15                         :                          ctGAAAGCCG-GTA-G-GTTCCAGG-------T-ACTATTCAACT-A--CAA-TGTAATGTTCAT----TT-AT-CT---T----------------------T-----------------------CAGCCACGACT--TG-A--TT-----T----CG-ACC-GCT-----ACTT-----------------AAT-----TTGTA-TGGCGGCC--GC-C
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CCA-C-TTAATT-TC-TG-CG--GTCGCCACATG--ATT--T----A--ATTGTCG-CCGCCATTTA---TTAT--C----TGGCG-GCCGT-CATATGA-A--AA--AA-T-GGATG-GCCG
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          t-TAA-GAGGT-A-AC-GACCA-CATAATACAAG-T-GGCGGCCGGAAAATAAA-TTGATATTGGTTTT-CCATCTTGGCACTTACCtataagtggcg
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ctacggaagctGGA-G-CC-G-CCA-CATAGATTGAT-T-GACTGCCGCCAGTTAAA-TGAATATCAATTGT-ATACCCTAGCACCTACCtt
gi|2                          :                                                                                                 tacgggaggc----------------------G----------------------GCGGCCGCCAC---TA-G--TT--G--T-G-GCG-ACA-GCC-----ACAT----------------AAATA----TTAAT-Tta
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tacggaagccggtatgccaagggtataga---T------GGCTG-TCG-C-C-A--C-AACT---A-GTGGC-GGCC-G-CCT-TGAAAATTAAG-T-GGCGGCCGCTACTTAAA-T--TTATTttgaaaattaagtggcggccgctacttaaatttattgctggcggccccacttaatttaactggcggccgccaactaataagtggcggccgccagttaaaaaacaattaaaagtggcggtcgccagataaatgatgttggcgcccgccacttaaaatttatttctggcggacaccatataatatactggcgttgccagataacagtggcgccgcacataaattaagggcggccgccacatagatacttaattctatagggaagtcgaggtaggtgccagggtaggagaattgataattatatctcggggccgccacttatttatgtgggaccgccag
gi|2                          :                                                                                                                                                                                              tacggaagccggtatgccaagggtatagaaattaatatttatg-TGGCGGTC---C-CACA----T-AAATAA---------GTGGCGGCCCCG--AGATA-TAATTAT--CAAT-TC-TC---CTACC-CTGGCACCTAC--C----T--CGACTTCCCTATAG--AATT-AAGTATCTATGTGGC-GGCCGC----CCTTAAT-----TT-A-TGT-G-CG-GC-G-CCA--CTG---TTATCTGGCAA--C--GCCAGTA--TAT-TATATG--GTGTC----CGC-CA--GAAATAAATTTTA--AGTGGCGGGCGCCAACATCATTTATC-TGGCG--ACCGCCACTTTTAATTGTTTTTTA--ACTGGCGGCCGCCACTTA---TTAG--T----TGGCG-GCCGC-CA-GT-T-A--AATTAAGT-G--GG-GCCGCCA-GCAATAAATTTAAGTAGCG-GCCGCCA-CTTAATTTTCAAG-GCGGCCGCCA-CTAgctggcggccccacttaatttaactggcggccgccaactaataagtggcggccgccagttaaaaaacaattaaaagtggcggtcgccagataaatgatgttggcgcccgccacttaaaatttatttctggcggacaccatataatatactggcgttgccagataacagtggcgccgcacataaattaagggcggccgccacatagatacttaattctatagggaagtcgaggtaggtgccagggtaggagaattgataattatatctcggggccgccacttatttatgtgggaccgccag
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tacggaagccggtatgccaagggtatagaaattaatatttatgtggctgtcgccacaacCATATAAC-ATT----A--AGTGGTGGT-GC-ACTCA---TTAT--C----TGGCA-GCCGG-CAGAT-A-A--AA--AG-TGG--CG-ACCGCCA-g
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gcgacgc-GCA-CT--CAT-TAT--C----TGGCAGCCGGCAGATA---AA---AAGT--------GGC-GACCGC----tcctaa
gi|21                         : gcgacgccatataacattaagtggtggtGAAGCCG-GTT-G-GTGCCAGGG------T-A---------T-A--GAA-T-TAA----TAT--A-TT--T-AT---GT---------------------G----------------------GCGGCCGACACA--TAGA--TTA-A-CT-G-GCG-GCC-Gcatcctaa
gi|22                         :                      gtactCGGAAGCCG-GTAAG-GTGCCAGGG------T-A---------T-A--G-A-T-TAAT---TAT----TT-AT-CT--------------------------G----------------------GCGGCCGCCATT--T
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ctaATTTA---TTATGCCAAAATGGCG-GCCGC-CAGAT-A-AATAATTAA-T-tggcataataaatat
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ctacggaagccggtaaggtgccagggtatagT--TAT-TATGCCAAAATGGCGGCCGCCAGATA---AATat
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ctacggaagccggtaaggtgccagggtatagattaatt-CCA-CTTACATTTATCT-GGCGGCCGCCACATAAA-T--ATATTATTTCT-ATGCCCTGGCACCatat
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ctgaaactactTA---A--TTCAAA---T------GGAGT-CCG-C-A-A--CGAAAT-TGATGTAGCAG-CC-G-CCA-CATGGATTAGA-T-GACGACCGt
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TAAATTAAG-T-GGCAGCCACCAGTTAAA-TGAATATCAATGCT-ATACCTTTGCGTCTACaggt
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   actgaagtctAGTTA---AATT-AAGT--------GAC-GGTCGCCAATACCAAATAA--ATC-A-AGT-GACG-GTCG-TCA--
gi|27                         :                           CGGAAACCG-GTA-G-GTGCCAGGG------T-A---------T-T--GAA-T-TAA----TAT----TT-AT-GT--------------------------G----------------------GCGGCCGCgataaatga
gi|28                         :                         taCGAAAGCCG-GTA-G-GTGCCAGGG------T-C---------T-A--GAG-G-CGGC---TA---A-CT--------------------------------G----------------------GCGGCCGC
gi|29                         :                       tgtaCGGAAGCCG-GTA-G-GTGCCAAGG--------A---------T-ACTGAA-T-TAAT---TAT--T-TT-AT-GT---G----------------------G----------------------G
gi|3                          :                         taCGGAAGCCG-GTA-G-GTGCCAGGG------T-A---------TTA--GAAAT-TAATA--TAT----TT-ATTGT---G----------------------GCGGCCCGCCACTTAATTAACTGGCGGCCGCCACT--TA-T--TT--ATCT-G-GCG-GCC-GCC-----AGCA----------------TAATAAAATTTAAAGTGGCGGCC--GC-CACTCTAAT-G--TTA---C--T-TGTGGCG-CGTCG--A-----------------C-G--GC---C-ACC--T--TAT-TAT--T------GCGGC-GCCAGATATAAAGTTGAACT--------GGC-GGCCGC------CAAAAAATAATTGA-AGT-GACG-GCCGGCCAAACTTAATTTAACTGGCGACCC-CGCCA----TTAT-TAT-TG--G-G-C-GACCGC-CACTTA---AA--TTTATGTGTGGCGGCCGCCA-CTTTATTT-TTGTGGCGGCGCTGCCAC-TTTAATTGGT----ATGATTGGCGGCCGCCAA--G---TTAT--C----Tg
gi|30                         :                            aGAAGCCG-ATA-G-GTGCCAGGG------T-A---------T-A--GAA-T-TAA----TAT--ATTT-AT-AT---G----------------------G----------------------tctctctctctc
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gi|33                         :                        actCGGAAACCG-GTA-G-GTGCCAGAG------T-A---------T-A--GAA-T-TAAT---
gi|34                         :                          gtaGAAGCCG-GTA-G-GTGCCAGGG------T-A---------T-A--GAATT-TAAT---a
gi|35                         :                       tactCGGAAGCCG-GTA-G-GTGCCAGGG------T-A---------T-A--GAA-T-TAA----TAT--A-Ta
gi|36                         :                             GAAGCCG-GTA-G-GTGCCAGGG------T-A---------T-
gi|37                         :               ttaacatgtactCGGAAGACG-GTA-G-GTGCCAGGG------T-A---------T-A--GAA-T-TAA
gi|38                         :                          aCAGAAGCCG-GTA-G-GTGCCAGGG------T-A---------T-A--GA
gi|39                         :                     aacataCGGAAGCCG-GTA-G-GTGACAGGG------T-A---------T-A--GA
gi|4                          :                     tctaACTGTAAGCCG-GTATG-GTGC-AGGG------TTA---------T-A--GAA-T-TTAA---TAT--A-TTTAT-AT---GGCAGGCCGCATTATAATTAACTG----------------------GCGGCCGCCAGAAATA-A--TT--T-TT-A-GTG-GCCTGCC-------CT----------------TAAT-----TTCAT-GGGCGGCCCAGCTCATT----TTA--TTA--TC--T----GGCGGCTCTGTGAACTAATT-TTATGTC--T-GT-GCGACC-GCCACT--TAT-TAT--G----TGGCGGCCACCA-CTT---TATT--AGTTCTTA---GGCGGGCCGC----ACTTTGTAA--TTT-ATACT-GGCGTCCCG-TCA--CTTAATTTAACTGGCAG--C-CGC---CACTTATATAT-TC--G-GC
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ttcta-TAATTG--GCGGTC--GCT----AT-TAGAAAGCACTGATGGCCTCCATATA---AATT---AA---G------TGCAGATCG-CCA-G--CCAAAT-TAA-GTGCCAG-CC-G-CCA-TATAAATTAAG-A-AGCGATCGCC
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       taTTAATTTAACTAGCGA--C-CTT---CACTTAT-TATCTGGAG-GTC-G--Cggaggtcgc
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|31 ): CTGAAATGTGCAATAATAAAGTTGTATATAAGTACATACATCATG






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Reference ( family-3983 )     :                         ACCGGAAGCCG-GTA-G-GTGCCAGGG------T-A---------T-A--GAA-T-TAAT---TAT--A-TT-AT-AT---G----------------------G----------------------GCGGCCGCCACT--TA-A--TT--A-CT-G-GCG-GCC-GCC-----ACTT----------------TAAT-----TTAAN-TGGCGGCC--GC-CACT----T-A--TTA--TC--T-TGTGGCGGCNCCG--AACTA-TA-TTAT--C--T-GC-GC---C-GCC-CT--TAT-TAT--C----TGGCGGCCGCCAGATA---AATT-AAGT--------GGC-GGCCGC----GCCAAATAA--ATT-A-AGT-GGCG-GCCG-CCA--CTTAATTTAACTGGCGA--C-CGCCA-CACTTAT-TAT-TG--G-GCC-G--CGC-CA--TAA-TAA--TTTA--TGTGGCGGCCGCCA-C-TTATTT-TC-TGGCG--GCCGCCACATNTAATTGTT----A--ACTGGCGGCCGCCACTTA---TTAT--C----TGGCG-GCCGC-CATAT-A-A--AATTAA-T-G--CG-GCCGCCA-G--ATAAATTTAAGT-GCGCGCCGCCAGCNTAATTTTCAAGTGCGG-CGCCA-CTATAANATTNNTCCCGGCTTCGGCCG---CAGTTAATT-TAATTGTGGCGGCC--GCC----AG-TAAT-AAG---TGACGACCGCC----ANATA---A--T---AA---T------GGCGG-CCG-CA-A--C--AAAT-TAA--G-TGGC-G-CC-G-CCA-CATAAATTAAG-T-GGCGGCCGCCANNTAAA-T--ATATTAATTCT-ATACCCTGGCACCTACC
gi|1                          :                         ACTAAAAGCCGAGTA-G-GT-CCAGGG------T-A---------T-A--GA--T-TAAT---TAT--A-TT-GTGAT---G----------------------GT---------------------GCGGCCGCCACTG-TA-A--TT--A-TT-G-TCG-GCC-GCC-----ACTT----------------TAAT-----TTAAA-TGGCGGCC--GC-CACT----T-A--TTA--TCCTC-TGTGGCGGCGCC----AC-A-TA-TTAT--C--T-GC-AC---C-GCC-CT--TGT-TAT--C----TGGCGGCCGCCA-ACA---AATT-AACT--------GGC-GGCCGC----GCCAGATAAG-ATT-A-AGTGGGCG-TCCG-CCA--CATAATTTAACTAGCGG--CGTGCCA-CACTTAT-TAT-TG--G-GCCGG--CGCGCA--TAA-TAA--TTAA--TCT-GCGGCTGCCA-C-TTATCA-TC-TGGCG--GCCGCCATATATAA--ATT----A--ACTGCCGACCGCCACTTA----TAT--C----TGGCG-GCCGCGCATAT-AGA--AATTAA-T-G--CG-GCCGCCA-G--ATGAATTTAAGT-GCGCGCCGCCAGCATA-----TAAGTGCGG-CGCCA-CTATAAAATTTATCCCA----CGGCTG---CAGTTAATTGTAATTATGGTCGCC--GCC----AA-TAAT-AA----TG-CGACCGCC----AGATA---A--T---AA---T------GGCGG-TCG-CA-G--T--AAAT-TAA--G-TGGC-G-CC-GTCCA-CATAAATTAAG-CAGGCGGCCGCCATATAAATT--ATATTAATTCTAATACCCTGG-ACCCACC
gi|10                         :                              AAGCCA-GTC-G-GTGCTATGG------T-A---------T-ATAGAA-T-TAA----TAT----TC-AT-ATTCCT----------------------G----------------------GCGACTGCCTGT--TA-ACTTT--A-TTGG-GCA-GCC-AGC-----ACTTACTTATCTGTCAAGTATATT-----TTAAC-TGGCTGCT--GC-CATT----T-A--
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CCA-C-TTAATT-TC-TG-CG--GTCGCCACATG--ATT--T----A--ATTGTCG-CCGCCATTTA---TTAT--C----TGGCG-GCCGT-CATATGA-A--AA--AA-T-GGATG-GCCG
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               t-TAA--G-AGGT-A-AC-GACCA-CATAATACAAG-T-GGCGGCCGGAAAATAAA-TTGATATTGGTTTT-CCATCTTGGCACTTACCtataagtggcg
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ctacggaagctGGA-G-CC-G-CCA-CATAGATTGAT-T-GACTGCCGCCAGTTAAA-TGAATATCAATTGT-ATACCCTAGCACCTACCtt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tacgggaggcATT-TA--TGTGGCTGTC--GCC----A--CAAC-TAG---TGGCGGCCGCCTTGAAAAT-------T---AAG--T------GGCGG-CCG-CT-A--CTTAAAT-TTATTGCTGGC-G-GC-C-CCA-CTTAATTTAAC-T-GGCGGCCGCCAACTAAta
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                     tacggaagccggtatgccaagggtatagaaattaat-TGGCGGTC---C-CACA----T-AAATAA---------GTGGCGGCCCCG--AGATA-TAATTAT--CAAT-TC-TC---CTACC-CTGGCACCTAC--C----T--CGACTTCCCTATAG--AATT-AAGTATCTATGTGGC-GGCCGC----CCTTAAT-----TT-A-TGT-G-CG-GC-G-CCA--CTG---TTATCTGGCAA--C--GCCAGTA--TAT-TATATG--GTGTC----CGC-CA--GAAATAAATTTTA--AGTGGCGGGCGCCAACATCATTTATC-TGGCG--ACCGCCACTTTTAATTGTTTTTTA--ACTGGCGGCCGCCACTTA---TTAG--T----TGGCG-GCCGC-CA-GT-T-A--AATTAAGT-G--GG-GCCGCCA-GCAATAAATTTAAGTAGCG-GCCGCCA-CTTAATTTTCAAG-GCGGCCGCCA-CTAtaagtggcggccgccagttaaaaaacaattaaaagtggcggtcgccagataaatgatgttggcgcccgccacttaaaatttatttctggcggacaccatataatatactggcgttgccagataacagtggcgccgcacataaattaagggcggccgccacatagatacttaattctatagggaagtcgaggtaggtgccagggtaggagaattgataattatatctcggggccgccacttatttatgtgggaccgccag
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tacggaagccggtatgccaagggtatagaaattaatatttatgtggctgtcgccacaacCATATAAC-ATT----A--AGTGGTGGT-GC-ACTCA---TTAT--C----TGGCA-GCCGG-CAGAT-A-A--AA--AG-TGG--CG-ACCGCCA-g
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gcgacgc-GCA-CT--CAT-TAT--C----TGGCAGCCGGCAGATA---AA---AAGT--------GGC-GACCGC----tcctaa
gi|21                         : gcgacgccatataacattaagtggtggtGAAGCCG-GTT-G-GTGCCAGGG------T-A---------T-A--GAA-T-TAA----TAT--A-TT--T-AT---GT---------------------G----------------------GCGGCCGACACA--TAGA--TTA-A-CT-G-GCG-GCC-Gcatcctaa
gi|22                         :                      gtactCGGAAGCCG-GTAAG-GTGCCAGGG------T-A---------T-A--G-A-T-TAAT---TAT----TT-AT-CT--------------------------G----------------------GCGGCCGCCATT--T
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ctaATTTA---TTATGCCAAAATGGCG-GCCGC-CAGAT-A-AATAATTAA-T-tggcataataaatat
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ctacggaagccggtaaggtgccagggtatagT--TAT-TATGCCAAAATGGCGGCCGCCAGATA---AATat
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ctacggaagccggtaaggtgccagggtatagattaatt-CCA-CTTACATTTATCT-GGCGGCCGCCACATAAA-T--ATATTATTTCT-ATGCCCTGGCACCatat
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ctgaaactactTA---A--TTCAAA---T------GGAGT-CCG-CA-A--CG-AAAT-TGAT-G-TAGCAG-CC-G-CCA-CATGGATTAGA-T-GACGACCGt
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TAAATTAAG-T-GGCAGCCACCAGTTAAA-TGAATATCAATGCT-ATACCTTTGCGTCTACaggt
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   actgaagtctAGTTA---AATT-AAGT--------GAC-GGTCGCCAATACCAAATAA--ATC-A-AGT-GACG-GTCG-TCA--
gi|27                         :                           CGGAAACCG-GTA-G-GTGCCAGGG------T-A---------T-T--GAA-T-TAA----TAT----TT-AT-GT--------------------------G----------------------GCGGCCGCgataaatga
gi|28                         :                         taCGAAAGCCG-GTA-G-GTGCCAGGG------T-C---------T-A--GAG-G-CGGC---TA---A-CT--------------------------------G----------------------GCGGCCGC
gi|29                         :                       tgtaCGGAAGCCG-GTA-G-GTGCCAAGG--------A---------T-ACTGAA-T-TAAT---TAT--T-TT-AT-GT---G----------------------G----------------------G
gi|3                          :                         taCGGAAGCCG-GTA-G-GTGCCAGGG------T-A---------TTA--GAAAT-TAATA--TAT----TT-ATTGT---G----------------------GCGGCCCGCCACTTAATTAACTGGCGGCCGCCACT--TA-T--TT--ATCT-G-GCG-GCC-GCC-----AGCA----------------TAATAAAATTTAAAGTGGCGGCC--GC-CACTCTAAT-G--TTA---C--T-TGTGGCG-CGTCG--A-----------------C-G--GC---C-ACC--T--TAT-TAT--T------GCGGC-GCCAGATATAAAGTTGAACT--------GGC-GGCCGC------CAAAAAATAATTGA-AGT-GACG-GCCGGCCAAACTTAATTTAACTGGCGACCC-CGCCA----TTAT-TAT-TG--G-G-C-GACCGC-CACTTA---AA--TTTATGTGTGGCGGCCGCCA-CTTTATTT-TTGTGGCGGCGCTGCCAC-TTTAATTGGT----ATGATTGGCGGCCGCCAA--G---TTAT--C----Tg
gi|30                         :                            aGAAGCCG-ATA-G-GTGCCAGGG------T-A---------T-A--GAA-T-TAA----TAT--ATTT-AT-AT---G----------------------G----------------------tctctctctctc
gi|32                         :                          actGAAGCCG-GTA-G-GTGCCAGGG------T-A---------T-A--GAA-T-TAAT---AAT----TT-Ac
gi|33                         :                        actCGGAAACCG-GTA-G-GTGCCAGAG------T-A---------T-A--GAA-T-TAAT---
gi|34                         :                          gtaGAAGCCG-GTA-G-GTGCCAGGG------T-A---------T-A--GAATT-TAAT---a
gi|35                         :                       tactCGGAAGCCG-GTA-G-GTGCCAGGG------T-A---------T-A--GAA-T-TAA----TAT--A-Ta
gi|36                         :                             GAAGCCG-GTA-G-GTGCCAGGG------T-A---------T-
gi|37                         :               ttaacatgtactCGGAAGACG-GTA-G-GTGCCAGGG------T-A---------T-A--GAA-T-TAA
gi|38                         :                          aCAGAAGCCG-GTA-G-GTGCCAGGG------T-A---------T-A--GA
gi|39                         :                     aacataCGGAAGCCG-GTA-G-GTGACAGGG------T-A---------T-A--GA
gi|4                          :                     tctaACTGTAAGCCG-GTATG-GTGC-AGGG------TTA---------T-A--GAA-T-TTAA---TAT--A-TTTAT-AT---GGCAGGCCGCATTATAATTAACTG----------------------GCGGCCGCCAGAAATA-A--TT--T-TT-A-GTG-GCCTGCC-------CT----------------TAAT-----TTCAT-GGGCGGCCCAGCTCATT----TTA--TTA--TC--T----GGCGGCTCTGTGAACTAATT-TTATGTC--T-GT-GCGACC-GCCACT--TAT-TAT--G----TGGCGGCCACCA-CTT---TATT--AGTTCTTA---GGCGGGCCGC----ACTTTGTAA--TTT-ATACT-GGCGTCCCG-TCA--CTTAATTTAACTGGCAG--C-CGC---CACTTATATAT-TC--G-GC
gi|40                         :                           CGGAAGCCG-GTA-G-GTGCAAGGG------T-A---------T-A--G
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ttcta-TAATTG--GCGGTC--GCT----AT-TAGA-AAGCACTGATGGCCTCC----ATATA---AATT---AA---G------TGCAGATCG-CC-AGCC--AAAT-TAA--G-TGCCAG-CC-G-CCA-TATAAATTAAG-A-AGCGATCGCC
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             caacgGTTAAAT-GAA--GTGGCGACC--GCC----AGATAAT-AAG---TGACAATCGCC----ACTT-------T---AA---TTCATCTGGCGG-CCG-CT-ATTC--AAAT-TAA--C-TGGC-GGCC-G-CCA-CATAGATTAAG-T-GGCGACCACTAAAT--A-T--ATATGAATTCT-ATATCCTAGCACCTACCttcaactctccttctcaaaacgaaagagatgtgcaatttgtgtaacatcc
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tacagaagcc-CGCCAGCTATAATATTATTCTTGGCTTCGGCCGTACCAGTTAATT-TA--TATGGCGGGCGTGCC----AG-TAAT-------T-----CCGCC----AGG------------AG---T------G----------A-A--T--AAGT-T------TTGC-G----G-GCATTATCAATCG--------GGCCGCCA----------ATATTAATTCTGATACCCTGGCACCTACC
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ggaagcc---CACTTAATT-TAAT--TCGCTGCC--GCCTTATAG--AATAAAA---TGATGGCCGCT----TGATAGACA--T---AAC--C------GGCGG-CCGTCATA--T--AGATCTAA--T-TGGC-A-TTAG-CCA-TATGAATTAGC-T-GGCAACCGCCACTTAAgcc
gi|9                          :    cacttaatctgtgtgacgtttgcCGGAAGCTG-GGA-G-GTGCCAGGGGCAGGGT-A---------T-A--TAA-T-TGAT----ATTCA-TT--T-AT---GT---------------------G----------------------GTAGTCGTTACT--TC-A--TTTTA-CT-T-GCG-GC------------TT----------------TAAT-----TTAAC-TAGCGACC--TT-CACT----T-A--TTA--TC--T-
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       taTTAATTTAACTAGCGA--C-CTT---CACTTAT-TATCTGGAG-GTC-G--Cggaggtcgc


blockSeqs                     :                                    .   A C         GCAGGG T CTATTCAAC T TA   A G   TATATTTATTGTGGCGGCCCGCCACTTAATTAACTG                                            AA  ACT   TTACTT      A   T   ACTTACTTATCTGTCAAGTA         AAAAT    AG        CA  T    CTAA T AA   GGCCTAT          C  GTGAACTAATTTTATGTCTGTGCGAC      T   CTGG   CC   GCCAAAA            G   TAA    G    ATCTATGT   G      CAATA  T     TAA  G T   . A  T    G   AA                 CGCCAGTA         A   A  GA T T GAC    .  GAAA     AT    TG   G          A A      A  G  G  GC        A TT  TTGTTTTTTA   T     G T  T     GAT    GCCAAAA     A     .  T  GA  AT  T   G G GATG        A CA            A   C       . T  ATTTT    .    C     G      T   AT     GCTT      TAC         .  ATT     T   GT   TTATAGAATAAAA       G        ATATAAACTAAAAGT                     A   T TACTT       C A TTGC    A GC A A   T          TC .           CC   ATTG            G
blockSeqs                     :                                    .   T .         .      . .         . CT   T .   ATATATTTATATGGCAGGCCGCATTATAATTAACTG                                            .   GA    ATTGG       .   .   AGATAAATTACGGTAAGA           .        C         .   .    .    . .    CTT              C  GAGATATAATTATCAATTCTC           .   ACT    T    AC                 T   G      G    TCTTA      .      C      A     A    . .   . A  .    .   .                  CCCCGCCA         .   C  .  . C G      .  CTTA     .     .    G          . T      .  .  G  .         T AT  TTGGTATG     C     G C  C     .      G           .     .  T  A   .   T   . . CCC         . .             .   .                          .     .                           .           .  AT      G   .    ATTAGAAAGCAC        A        ACTTTAATTCATCT                      .   . CAGCC       . A TG      A C  . .   .          G  .           AA   ATGA            .
blockSeqs                     :                                    .   . .         .      . .         . .    . .   TGTTCATTTATCTTT                                                                 .   GA    TATGT       .   .   ATAT                         .        C         .   .    .    . .    TCT              G  ACATATTATCTGGCGGT               .   CT     T    C                  G   .      .    .          .      A      A     T    . .   . G  .    .   .                  CCGCCAC          .   .  .  . T .                                        . .      .  .  .  .         A TT  CATTA        G     G C  C     .      C           .     .  G  T   .   T   . . GG          .                                                                                            .  T       G   .    AGATAATAAG          A        TGATAGACATAACC                      .   . TATTC       . T C       A A  . .   .          G  .           GT   ATGA            .
blockSeqs                     :                                    .   . .         .      . .         . .    . .   TATTCATATTCCTG                                                                  .   A     AACTG       .   .   ACTT                         .        G         .   .    .    . .    .                T  GACGGC                          .   T      T    C                  G   .      .    .          .      .      T     .    . .   . .  .    .   .                  CCTTCAC          .   .  .  . .                                                                      . G   TTTA         T     G C  C     .      T           .     .  G  A   .   .   . . CG                                                                                                       .  A       G   .    ACAACTAG            A        TTGAAAATTAAGT                       .   . AACG        . G G       . C  . .   .          T  .           AC   AT              .
blockSeqs                     :                                    .   . .         .      . .         . .    . .   TATTCATTTATGTG                                                                  .   T     ATCTG       .   .   AGCA                         .        C         .   .    .    . .                                                        .   .      T    T                  G   .      .    .          .                                                                                                                                                                                            . .  .     .      C           .     .  .  A   .   .   . .                                                                                                          .  T       T   .    AGTAAT              .        ATATAAATTAAG                        .   . ATAT        . A G       . G  . .   .          C  .           CA   AT              .
blockSeqs                     :                                    .   . .         .      . .         . .    . .   TTATTTTATGTGG                                                                   .   A     TTTA        .   .   CT                           .        A         .   .    .    . .                                                                   .    G                  G   .      .    .          .                                                                                                                                                                                                       .      C                                                                                                                                                                                                 AGGAGT                              .   . CAC         . A C       . C  . .   .          A  .           GT   .               .
blockSeqs                     :                                    .   . .         .      . .         . .    . .   TATATTTATATGG                                                                   .   A     ATG         .   .   TT                           .        T         .   .                                                                                                       .   .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           .   . AAT         . A T       . C  . .   .          G  .           AA   .               .
blockSeqs                     :                                    .   . .         .      . .         . .    . .   TATTTCATGTGG                                                                    .   .     T           .   .                                .        C         .   .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         . . .       . T  . .   .          G  .           CT                    
blockSeqs                     :                                    .   . .         .      . .         . .    . .   TATATTTATGTG                                                                    .                                                                             .   .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     . .  . .   .          G  .           .                     
blockSeqs                     :                                    .   . .         .      . .         . .    . .   TTATTTATCTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .   .          C  .                                 
blockSeqs                     :                                    .   . .         .      . .         . .    . .   TATTTATGTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .  .                                 
blockSeqs                     :                                    .   . .         .      . .         . .    . .   TTAATTTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          
blockSeqs                     :                                    .   . .         .      . .         . .    . .   CTAACTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            
blockSeqs                     :                                    .   . .         .      . .         . .    . .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|31 ): CTGAAATGTGCAATAATAAAGTTGTATATAAGTACATACATCATG






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lowQualScore                  :                      8   6 8         222222 8  8 22   4    7   9999  77777777777777777777777777777777 9          7777777777  1111     0   0   555555555555555555555555555    6  0        55  0     0 666   999999999      7 77  555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555    1111111111111111     7  888 4    0    66666666   0      6666   5555555555555  7 7   7 4  22222   00    2             22222    55555   0   0   0 5 3333   3  000000   33    33   7          0 0      0  0  5  88        8 22  888888888888       2          777    2222222     0     0  6  222222 66   0  22222       7777            3   7       0 0  55555    5    3     3      0   00     5555      000       4 00 6666      4 00    22    888888  6  2      7777    6   333      2   4444444     0 3333    6666  3   66         3 3           33    2222      4     33333333333                
consensus                     :           ACCGGAAGCCG-GTA-G-GTGCCAGGG------T-AT-A--GAA-TTAATTAT--A-TT-AT-AT---G----------------------G-GCGGCCGCCACT--TA-A--TTAT-CTGGCG-GCC-GCC-----A-CTT----------------TAATTTAACTGGCGGCC--GC-CACTT-A---TTA---TCTG--TGGCGG-CN-CCG---G-------AC--ATA-TT---ATC---TGG-CGGCCGCC-CT----TAT-TA--T--C----T----GG--------CGGC----------------CGCCAGAT---A-AATT-AAGT--------GGC-GGCCGC----GCC---ANAT-A--A-TT-A-AGT-GGCG-GCC-GCC--ACTTAATTTAACTGGCGG--C-CGCCAC--T-TAT-TAT-TGG-GCC-G--CGC-CA--TAA-TAA--TTTA--TGTGGCGGCCGCCA-C-TTATTT-TC-TGGCG--GCCGCCACATNTAATTGTT----A--ACTGGCGGCCGCCACTTA---TTAT--C----TGGCG-GCCGC-CATAT-A-A--AATTAA-TG--CG-GCCGCCA-G--ATAAATTTAAGT-GCGCGCCGCCAGCNTAATTTTCAAGTGCGG-CGCCA-CTATAANATTNNTCCCGGCTTCGGCCGTACCAGTTAATT-TA--TGTGGCGGCC--GCCAG-TAATAAG---TGACGACCGCCA--NATAAATTAAG--TGGCGGCCGCCA--C--AAATTAA--G-TGGC-G-CCG-CCACATAAATTAAG-T-GGCGGCCGCCANNTAAA-T--ATATTA-ATTCT-A---------TACCCTGGCACCTACC
Reference ( family-3983 )     :           ACCGGAAGCCG-GTA-G-GTGCCAGGG------T-AT-A--GAA-TTAATTAT--A-TT-AT-AT---G----------------------G-GCGGCCGCCACT--TA-A--TTAT-CTGGCG-GCC-GCC-----A-CTT----------------TAATTTAANTGGCGGCC--GC-CACTT-A---TTA---CCTG--TGGCGG-CN-CCG---G-------AC--AT--TT---ATC---TGN-CGGCCGCC-CT----TAT-TA--T--C----T----GG--------CGGC----------------CGCCAGAT---A-AATT-AAGT--------GGC-GGCCGC----GCC---AAAT-A--A-TT-A-AGT-GGCG-GCC-GCC--ACTTAATTTAACTGGCGA--C-CGCCA---T-TAT-TAT-TGG-GCC-G--CGC-CA--TAA-TAA--TTTA--TGTGGCGGCCGCCA-C-TTATTT-TC-TGGCG--GCCGCCACATNTAATTGTT----A--ACTGGCGGCCGCCACTTA---TTAT--C----TGGCG-GCCGC-CATAT-A-A--AATTAA-TG--CG-GCCGCCA-G--ATAAATTTAAGT-GCGCGCCGCCAGCNTAATTTTCAAGTGCGG-CGCCA-CTATAANATTNNTCCCGGCTTCGGCCG---CAGTTAATT-TA--TGTGGCGGCC--GCCAG-TAATAAG---TGACGGCCGCCA--CGTAAATTAAGANTGGCGGCCGCNA--C--AAATTAA--G-TGGC-G-CCG-CCACATAAATTAAG-T-GGCGGCCGCCANNTAAA-T--ATATTA-ATTCT-A---------TACCCTGGCACCTACC
gi|1                          :           ACTAAAAGCCGAGTA-G-GT-CCAGGG------T-AT-A--GA--TTAATTAT--A-TT-GTGAT---G----------------------GTGCGGCCGCCACTG-TA-A--TTAT--TGTCG-GCC-GCC-----A-CTT----------------TAATTTAAATGGCGGCC--GC-CACTT-A---TTATCCTCTG--TGGCGG-CG-CC------------AC--ATA-TT---ATC---TGC---ACCGCC-CT----TGT-TA--T--C----T----GG--------CGGC----------------CGCCA-AC---A-AATT-AACT--------GGC-GGCCGC----GCC---AGAT-AAGA-TT-A-AGTGGGCG-TCC-GCC--ACATAATTTAACTAGCGG--CGTGCCACACT-TAT-TAT-TGG-GCCGG--CGCGCA--TAA-TAA--TTAA--TCT-GCGGCTGCCA-C-TTATCA-TC-TGGCG--GCCGCCATATATAA--ATT----A--ACTGCCGACCGCCACTTA----TAT--C----TGGCG-GCCGCGCATAT-AGA--AATTAA-TG--CG-GCCGCCA-G--ATGAATTTAAGT-GCGCGCCGCCAGCATA-----TAAGTGCGG-CGCCA-CTATAAAATTTATCCCA----CGGCTG---CAGTTAATTGTAATTATGGTCGCC--GCCAA-TAATAA----TG-CGACCGCCA--GATAA--TAA---TGGCGGTCGCAG--T--AAATTAA--G-TGGC-G-CCGTCCACATAAATTAAG-CAGGCGGCCGCCATATAAATT--ATATTA-ATTCTAA---------TACCCTGG-ACCCACC
gi|10                         :                AAGCCA-GTC-G-GTGCTATGG------T-AT-ATAGAA-TTAA-TAT----TC-AT-ATTCCT----------------------G-GCGACTGCCTGT--TA-ACTTTAT-TGGGCA-GCC-AGC-----A-CTTACTTATCTGTCAAGTATATTTTAACTGGCTGCT--GC-CATTT-A---
gi|11                         :           ACGGAAAGCCG-GTA-GCGTGCCAGGG------T-AT-A--GAA-TTAA-TAT--T-TC-AT-GT---G----------------------G-GCGGTTGCTACT--TA-GATTTAT-GT-GCGAGCC-GCC-----A-TAT----------------AAATT--ACTGCCCGCC--GC-CA
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GGCGGTTGCTACTTAGATTTAT--G----TG-CGAGCCGC-CATAT-A-A--A-TTAC-TG--CCCGCCGCCAAG--ATAAATTTAAGT-GCGCGagataaatttaagtgcgcg
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gaaagccCCA-C-TTAATT-TC-TG-CG--GTCGCCACATG--ATT--T----A--ATTGTCG-CCGCCATTTA---TTAT--C----TGGCG-GCCGT-CATATGA-A--AA--AA-TGGATG-GCCG
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tTAA--G-AGGT-A-ACGACCACATAATACAAG-T-GGCGGCCGGAAAATAAA-TTGATATTG-GTTTT-C---------CATCTTGGCACTTACCtataagtggcg
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ctacggaagctGGA-G-CCG-CCACATAGATTGAT-T-GACTGCCGCCAGTTAAA-TGAATATCA-ATTGT-A---------TACCCTAGCACCTACCtt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tacgggaggcATT-TA--TGTGGCTGTC--GCCA--CAACTAG---TGGCGGCCGCCT--TGAAAATTAAG--TGGCGGCCGCTA--CTTAAATTTATTGCTGGC-G-GCC-CCACTTAATTTAAC-T-GGCGGCCGCCAACTAAta
gi|2                          :                                                                                                                                              tacggaagccggtatgccaagggtatagaaattaatTGGCGGTC---C-CACAT-AAA-TAA------G--TGGCGG-CC-CCGA--G-------AT--ATAATT---ATCAATTCT-C--CTACC-CTGG--CACCTA--C--C----T--------------CGAC----------------TTCCCTAT---AGAATT-AAGTATCTATGTGGC-GGCCGC----CCT---TAAT------TT-A-TGT-G-CG-GC--GCC--ACTG---TTATCTGGCAA--C--GCCAG--TATAT-TATATGGTGTC----CGC-CA--GAAATAAATTTTA--AGTGGCGGGCGCCAACATCATTTATC-TGGCG--ACCGCCACTTTTAATTGTTTTTTA--ACTGGCGGCCGCCACTTA---TTAG--T----TGGCG-GCCGC-CA-GT-T-A--AATTAAGTG--GG-GCCGCCA-GCAATAAATTTAAGTAGCG-GCCGCCA-CTTAATTTTCAAG-GCGGCCGCCA-CTAtaagtggcggccgccagttaaaaaacaattaaaagtggcggtcgccagataaatgatgttggcgcccgccacttaaaatttatttctggcggacaccatataatatactggcgttgccagataacagtggcgccgcacataaattaagggcggccgccacatagatacttaattctatagggaagtcgaggtaggtgccagggtaggagaattgataattatatctcggggccgccacttatttatgtgggaccgccag
gi|20                         :                                                                                                                                                            tacggaagccggtatgccaagggtatagaaattaatatttatgtggctgtcgccacaacGCGA-CG-CCATATA-------AC--AT--TA---AG----TGG-TGGT-GCA-CT----CAT-TA--T--C----T----GG--------CAGC----------------CGGCAGAT---A-AA---AAGT--------GGC-GACCGC----g
gi|21                         :               GAAGCCG-GTT-G-GTGCCAGGG------T-AT-A--GAA-TTAA-TAT--A-TT--T-AT---GT---------------------G-GCGGCCGACACA--TAGA--TTAA-CTGGCG-GCC-Gcatcctaa
gi|22                         :        gtactCGGAAGCCG-GTAAG-GTGCCAGGG------T-AT-A--G-A-TTAATTAT----TT-AT-CT--------------------------G-GCGGCCGCCATT--T
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ctaATTTA---TTATGCCAAAATGGCG-GCCGC-CAGAT-A-AATAATTAA-Ttggcataataaatat
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                               ctacggaagccggtaaggtgccagggtatagT----TAT-TA--TGCCAAAAT----GG--------CGGC----------------CGCCAGAT---A-AATat
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ctacggaagccggtaaggtgccagggtatagattaatt-CCACTTACATTTATCT-GGCGGCCGCCACATAAA-T--ATATTA-TTTCT-A---------TGCCCTGGCACCatat
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ctgaaactactAATTCA-AATGGAGTCCGCAA--CG-AAATTGAT-G-TAGCAG-CCG-CCACATGGATTAGA-T-GACGACCGt
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TAAATTAAG-T-GGCAGCCACCAGTTAAA-TGAATATCA-ATGCT-A---------TACCTTTGCGTCTACaaggt
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                actgaagtctAGTT---A-AATT-AAGT--------GAC-GGTCGCCAATACC---AAATAA--A-TC-A-AGT-GACG-GTC-GTC--A
gi|27                         :             CGGAAACCG-GTA-G-GTGCCAGGG------T-AT-T--GAA-TTAA-TAT----TT-AT-GT--------------------------G-GCGGCCGCgataaatga
gi|28                         :           taCGAAAGCCG-GTA-G-GTGCCAGGG------T-CT-A--GAG-GCGGCTA---A-CT--------------------------------G-GCGGCCGC
gi|29                         :         tgtaCGGAAGCCG-GTA-G-GTGCCAAGG--------AT-ACTGAA-TTAATTAT--T-TT-AT-GT---G----------------------G-G
gi|3                          :           taCGGAAGCCG-GTA-G-GTGCCAGGG------T-ATTA--GAAATTAAT-AT--A-TT--T-AT---T----------------------G---------------------------TGGCG-GCCCGCC-----A-CTT-----------------AATT-AACTGGCGGCC--GC-CACTT-AT--TTA---TC----TGGCGGCCG-CCA---GCATAATAAA--AT--TTA--AAG---TGG-CGGCCGCCACTCTAATGT-TACTT--G----T----GGCGCGTCGACGGCCACCTTATTATTGCGGCGCCAGATATAA-AGTTGAACT--------GGC-GGC--C----GCCAAAAAAT-A--A-TTGA-AGT-GACG-GCCGGCCAAACTTAATTTAACTGGCGACCC-CGCCA---T-TAT-TAT-TGG-G-C-GACCGC-CACTTA---AA--TTTATGTGTGGCGGCCGCCA-CTTTATTT-TTGTGGCGGCGCTGCCAC-TTTAATTGGT----ATGATTGGCGGCCGCCAA--G---TTAT--C----Tg
gi|30                         :              aGAAGCCG-ATA-G-GTGCCAGGG------T-AT-A--GAA-TTAA-TAT--ATTT-AT-AT---G----------------------G-tctctctctctc
gi|32                         :            actGAAGCCG-GTA-G-GTGCCAGGG------T-AT-A--GAA-TTAATAAT----TT-Ac
gi|33                         :          actCGGAAACCG-GTA-G-GTGCCAGAG------T-AT-A--GAA-TTAAT
gi|34                         :            gtaGAAGCCG-GTA-G-GTGCCAGGG------T-AT-A--GAATTTAATa
gi|35                         :         tactCGGAAGCCG-GTA-G-GTGCCAGGG------T-AT-A--GAA-TTAA-TAT--A-Ta
gi|36                         :               GAAGCCG-GTA-G-GTGCCAGGG------T-AT-
gi|37                         : ttaacatgtactCGGAAGACG-GTA-G-GTGCCAGGG------T-AT-A--GAA-TTAA
gi|38                         :            aCAGAAGCCG-GTA-G-GTGCCAGGG------T-AT-A--GA
gi|39                         :       aacataCGGAAGCCG-GTA-G-GTGACAGGG------T-AT-A--GA
gi|4                          :       tctaACTGTAAGCCG-GTATG-GTGC-AGGG------TTAT-A--GAA-TTTAATAT--A-TTTAT-AT---GGCAGGCCGCATTATAATTAACTG-GCGGCCGCCAGAAATA-A--TT-T-TTAGTG-GCCTGCC--------CT----------------TAATTTCATGGGCGGCCCAGCTCATTTTA---TTA---TCTG----GCGG-CT-CTGTG-A-------ACTAAT--TTTATGTC---TGTGCGACCGCCACT----TAT-TA--T--G----T----GG--------CGGC----------------CACCA-CT---T-TATT--AGTTCTTA---GGCGGGCCGC----ACT---TTGT-A--ATTT-ATACT-GGCGTCCC-GTC--ACTTAATTTAACTGGCAG--C-CGCCAC--T-TATATAT-TCG-GC
gi|40                         :             CGGAAGCCG-GTA-G-GTGCAAGGG------T-AT-A--G
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ttctaAGTTGAAT-AA--T-TGGCGGTC--GCTAT-TAGAAAGCACTGATGGCCTCCA--TATAAATTAAG--TGCAGATCGCCAGCC--AAATTAA--G-TGCCAG-CCG-CCATATAAATTAAG-A-AGCGATCGCC
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            caacgGTTAAAT-GA--AGTGGCGACC--GCCAGATAATAAG---TGACAATCGCCA--CTTTAATTCAT-CTGGCGGCCGCTATTC--AAATTAA--C-TGGC-GGCCG-CCACATAGATTAAG-T-GGCGACCACTAAAT--A-T--ATATGA-ATTCT-A---------TATCCTAGCACCTACCctccttctcaaaacgaaagagatgtgcaatttgtgtaacatcc
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tacagaagcc-CGCCAGCTATAATATTATTCTTGGCTTCGGCCGTACCAGTTAATT-TA--TATGGCGGGCGTGCCAG-TAAT------T-----CCGCCAGGAGTGAA-TAAGTTTTGCGG--GC---------ATT-------------------------ATCAAT-C-GG--GCCGCCA----------ATATTA-ATTCTGA---------TACCCTGGCACCTACC
gi|8                          :                                                                                                                           ggaagccTGGCG-GTT-GCC-----AGCT------------------AATTCATATGGCTAAT--GC-CAATT-AGATCTA-----TA--TGACGG-CCGCCG---GTT-----AT--GT--CT---ATC---AAG-CGGCCATC-AT----T-T-TA--TT-C----TATAAGG--------CGGC----------------AGCGAATT---A-AATT-AAGT--------GGC-AA--AC----GTC---ACAC-AG-A-TT-A-AGT-Ggcc
gi|9                          :             CGGAAGCTG-GGA-G-GTGCCAGGGGCAGGGT-AT-A--TAA-TTGAT-ATTCA-TT--T-AT---GT---------------------G-GTAGTCGTTACT--TC-A--TTTTACTTGCG-GC-------------TT----------------TAATTTAACTAGCGACC--TT-CACTT-A---TTA---TCTG--cttaa
gi|9                          :                                                                                                     ta-GCGACCTTCACT--TA----TTAT-CTGGAG-GTC-GCgaggtcgc
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): CGTATTTGAATAACAAGAATGTATAAATCTATCAAGCTTTAGCTTATAGATAAAGCACTTGCGTTATGTTAACAAATGGAATG
Unaligned ( gi|31 ): CTGAAATGTGCAATAATAAAGTTGTATATAAGTACATACATCATG