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7 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-3981 )     :    NTTTTTTTTTTA---ATAATTCTTTATTTTTTG-TA--T-TT-T-GTA--CA-TACATATAT--AT-ATAA----AC-A-C--A-CAATCAT--TCGCACCCACAT------T-CA------TACTGTG-CACCTT--ATA-CA-ACG-CAGC-A-AT-TATTTTAGTTTTCACTAATAA-CATA------------A-GAAT-ATTAATACTGTAATTAATAAAGAA--GACATAT-CTAG----AAAAAATATA----ATGT--TA----CTTAAGAATGTTAAAATAGG--TTTTTCAACAAACTAAA-TATCAAAAACANTATC-ATATAGTGTCCATTTACTAAGAG-TT--TTGGATTTAC-TTTGGAAAGCATTTN-CACAGTA-TTTTTCCAATATTTCTATAATGCTTAAACAAATTAA-CTGCCTCGGAAAATT-TTG---GCCT--TTAAGAC-CTTGTG-AT---CTATG---AATAATANATGAACCTTTTTGCTAAATAGAATAAG-AAAATTT-C-TAAACA-CTTCCCC--GTAACATTTGCCAAGTAATACAATTCTTTTT-GAA--T-CTTGTAATCCTTTTCAACAGCACTGTACCATTTTACAAAATCTCCCCAAAGGCCNGGGTGATTANTACAATCATAAATATATAATGAGAATTGTTGTTCTCGATGTTCACTAATCTTAACTAAAGAAGCATGAAAGCATTTGNTCTAATTGTCAAACNACAAGTTATTATGGCAGTTTGGTGAAGGGTAGAAAGTAGTTTTTTGTAGCAATGTANACGACCNCATANGNATTGAATATT
gi|1                          :     TTTTTTTTTTA---ATAATTCTTTATTTTTTG-TA--C------ATA--CAATATATATAT--AT-ATAA----AC-A-C--A-CATCCATGTTC-CACCCACAT------TACA------TACTGTGGCACCTTGAATA-CA-AC--CA-C-A-AT-TATTTTG--TTTCACTAATAA--ATA------------A-GAAT-ATTAATACTGTAATTAATAAAGAA--GACATATCCTAGAAAAAAAAAATATA----ATGT--TATAACCTTAAGAATG-----ATAGGTTTTTTTCAACAAACTAAA-TATCAAAAACATTATC-ATATAGGGTCCATTTACTAAGAG-TT--TTGGA--TAC-TTTAGAAAGCATTTA-CACAATA-TTTTTTCAATATTTCTATAATGTTTAAACAAATTAA-TGGCATCAAGAAATT-TTG---G-GT--TTAA-AC-CTTGGG-ACTTGCCATA---AAT-ATA-ATGGCCTTTTTTGCTTAATAGAATAAGAAAAATTT-C-TAAA-A-CTTCCCCA-GTAACATTTGCCAAGTAATACAATTCTTTTT-GAA--T-CTTGTAATCCTTTTCAACAGCACTGTACGATTTTACAAAATCTCCCCAAAGGCTAGGGTGA-TAATACAATCATAAA-ATATAATGAGAATTG--GTTCTCGATGTTCACTAATCTTAACTAAAGAAGCATGAAAGCATTTGGTC--ATT-TCAAACAATAAGTTATTATGGCAGTTT-ATGAAGGATAGAAAGTAGTTTTTTGTAGCAATGTAAACGACCTCATAAGTATT-AATATT
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gi|15                         : caacTTTTTTTTTTATTTATAATTCTTTA-TTTTTG-TA--TCTT-T-GTA--CA-TACATATAT--AT-ATAA----ACAA-C--A-CAATCAT--TCACACCCACAT------T-Ca
gi|2                          :           TTTTA----TAATTATTT-TATTTTG-TAATT-TT-T-GTA--CA-TA-ATATAT--ATTATAA----AC-A-C--A-CAATCAT--TCACTACCACAT------T-CA------TACTGTG--ACCTT--ATA-AA-ACG-CAGC-ACAT-TATTTTAGTTTTCACTAATGA-CATA------------AAGAATCGTTAATACT-TGATTTATAAAGAA--GAAATAT-CTAG----AAAAAATATA----ATGT--TA----CTTAAGAATGTTAAA-TAGG--TTTTT----------AA-TATCAAAACCA---TC-ATATAGTGTCCATTTACTAAGAG-TT--TTGGATTTAC-TGTTGAAAGCATTTAACACAATA-TTTTTC-AATATTT-TATA-TGTTTAAACAAATTAA-TGGCATCGGAAATTTGTTG---GGTT--TTATAACACTTCGG-GT---CT-TGCCTAATTATATATG---CTTTTTGCTAAATAGAATAAG-AAATTTT-CATAAACA-TT---CA--GTAACATTT--CAAGTC-TACAATTCTTTTTCGAACAT-CTTGTAATCCTTTTCAACAGCACTGTACCATTTTACAAAATCTCCCCAAAGGCCTAGGTGATTATTACAAT-ATAAATATAT----AGAATTGTTATTCT-----TTCAC--ATTT--AC-AAAGAAG------AACATTTGCTCTAATTGT----CTACAAGT--TTA----AGTTTGGTGA---GT-GAAAG-AG--TTTTGTAGCAATGTACACAA--GTATACGGATTGAATATTtt
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gi|5                          :       TTTTTTTTA----TAATTCTTTATTTTT-G-TA--T-TT-T-GTA--CA-TACATATAT--AT-ATAA----AC-AAC--AACAATCAT--TTGCACCCACAT------T-CA------TACTGTG-CACCTT--ATA-CA--C--CAGC-A-AT-TATTT--GTTTTCACTAAT---CATA------------A-GAAT-ATTAATACTGTAATTAATAAAGAA--GACATAT-CTAG----AAAAAAT-TA----ATGT--TA----CTTAAGAATGTTAAAATAGG--TTTTTCAACAAACTAAACTA-AAAAAACATTATC-AT-TAGTGTCCATTTACTAAGAG-TT--TTGGA-TTAC-TTTGGAAAGCATTTA-CACAATA-TTTTT-CAATATTTCTATAATGTTTAAACAAATTAA-C
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GG--TTTTCCATCA--CT----TGTTATACATAATATC-ATATTTTG-CCATTTGTTAGGAT-TTGTTTAGATTTAC-ATTTAATTACATTTT-CAAAGCA-AATTTCCG-TATTTCTATAATACTTCAATAAATTCA-CTGTCTCGAAAAAAT-TTG---GCCTAATT---AC-CTTATG-AT---CTA-G---AATAATAAATTAACCTTa
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tgatttagcttgatgcacatACAATATC-ATATACTGACCATTTACTAAATA-TT--TTTGTTTTAC-ATTGAAACACATTTT-CACAGTA-TTTTTCC-ATATTTCTGTAATACTTAAATAAATTCA-CTGCCTTAAAAAATG-TTG---GCCT--T--AGAC-CTTTTA-AT---CTAT----AATAATATATGAACTTT


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6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|16 ): TTTTTTATAATATATTAATGTTTTATTTTTAGACATTTATGTAAACATAATATACACATATGACATTACAC
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Unaligned ( gi|14 ): TAGCACACGACAGCCAATATACCTTATGATGCACAGTAAAAAAAAAAAAGATAGAAAAAAAAAAGATATTAATACTTTGAATCAGTATCAGTAT
Unaligned ( gi|16 ): TTTTTTATAATATATTAATGTTTTATTTTTAGACATTTATGTAAACATAATATACACATATGACATTACAC
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