lowQualScore                  :                                           111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     
lowQualScore                  :                   3                       333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333                                                                                                   33333                                                   11                                                                                                                         11111111                                                                          1111111111111111111111111     11111                                                              111111                                           2222222222                                                         444444444444444            111111111     111111111111                                   4444444444444444444                                      2222           2222222222                                                                                                   11111111111111                       222222222                                            11111111        111111111111                                                                                     
lowQualScore                  :                   2 55    3         2     777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 66   2  1 1 88  5 88888    33  3 9999999 1   1  1  1  22  7777 1 888888888  1  44    1 66666666   22222 3 22 1  33  666666666 4  22 1 22     55 1 1     1 66   444  1 88  22 22  1 3    1  444 1  1 4444 11  8888888 22 4444 1  555  44 1 1 1 777 2 444 1  1  1  8888  2 11  222     00000000 1 222   1 2222 11  2 5555 55  1  222  1 222 33 1  33   33 333333   222   6666666666666666666666666 2   66666   1   1 5555555 4    444  33   33    6666    1   33333 2  1  777777 1  0 333333 11   22  888888 222  1 11 333 8888888888 1  99999999999999    1  11 2 33 4444444   5555 1 1 1 2  000000000000000 1  1 33333 666666666  1  777777777777  2 11   1 222 666666 33 333 11 11 3333333333333333333    4444   2 1 1  1  5555 4 1 44 33   2222   22   1  0000000000 222 55555 11  11 1 1 5  11 1   2 1  1 22 1  0 777   22  1   33  9999   444    44  1  1  555555 1  66666666666666  1 1 22  1  1 2       777777777 1 1  666  1 22    1 3  3 33 33333   77777  22222222 444 22 000000000000  3333   1 666 1   22 66 5 888  222    55 8888 9999  44   5555 1 1 1      333  2     
lowQualScore                  :                   . ..    .         .     ............................................................................................................... ..   .  . . ..  . .....    ..  . ....... .   .  .  .  ..  .... . .........  .  ..    . ........   ..... . .. .  ..  ......... .  .. . ..     .. . .     . ..   ...  . ..  .. ..  . .    .  ... .  . .... ..  ....... .. .... .  ...  .. . . . ... . ... .  .  .  ....  . ..  ...     ........ . ...   . .... ..  . .... ..  .  ...  . ... .. .  ..   .. ......   ...   ......................... .   .....   .   . ....... .    ...  ..   ..    ....    .   ..... .  .  ...... .  . ...... ..   ..  ...... ...  . .. ... .......... .  ..............    .  .. . .. .......   .... . . . .  ............... .  . ..... .........  .  ............  . ..   . ... ...... .. ... .. .. ...................    ....   . . .  .  .... . . .. ..   ....   ..   .  .......... ... ..... ..  .. . . .  .. .   . .  . .. .  . ...   ..  .   ..  ....   ...    ..  .  .  ...... .  ..............  . . ..  .  . .       ......... . .  ...  . ..    . .  . .. .....   .....  ........ ... .. ............  ....   . ... .   .. .. . ...  ...    .. .... ....  ..   .... . . .      ...  .     
lowQualScore                  :                   9 66    4         4     222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 33   0  9 8 66  5 22222    11  6 1111111 8   8  7  7  44  4444 7 777777777  7  00    7 33333333   99999 5 44 6  88  444444444 8  22 6 22     22 5 5     5 66   888  5 00  00 00  5 0    5  111 5  5 6666 99  2222222 00 5555 4  444  88 4 4 4 222 8 555 4  4  4  1111  8 99  000     99999999 4 444   3 8888 88  7 5555 88  3  333  3 111 11 3  11   00 333333   222   8888888888888888888888888 6   99999   3   3 7777777 0    222  33   22    0000    3   33333 7  3  999999 3  5 777777 88   44  999999 333  3 88 555 0000000000 3  55555555555555    3  88 6 11 2222222   3333 3 3 3 6  777777777777777 3  3 22222 555555555  3  777777777777  7 88   3 333 222222 22 777 88 88 3333333333333333333    8888   8 4 4  4  7777 1 4 77 33   8888   00   4  9999999999 333 77777 88  88 3 3 3  99 4   8 4  5 00 5  6 555   00  5   55  3333   111    11  5  5  777777 5  33333333333333  4 4 00  4  4 8       333333333 7 4  666  4 00    4 0  0 55 77777   88888  66666666 222 11 777777777777  3333   5 111 5   33 22 0 555  999    66 8888 4444  11   4444 8 8 8      555  0     
consensus                     :        AAGGTAGGTCCCT--ACTCGACAAAATTT-TGTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGA----C--ATA-TA-C-C--CC-T-----TCTA-TCA-T--T-GT-A-AAA-TT-TC-AC--CT----G-A---------CA-TC--AATA-T--------TTT-GCA-G-A--T-AT--CA---------A-CA--C-A--ATAGG--A-A-AGCAA-AA-TAA---TT-T--CA--T--AA-T-CTGT-TT---A-TT-T----A--TCA------C--A----T-AT---TA--C-G-T-T---A-A-C-A-AA-TC-AA----TA-T--TTA--GTGTT-AC-----T-T---TCA-T----C--AA-T----T--AA-CT---CA-C-A-A--A-GA--TGA--AA-----ATT---GGT-------------------------G-GTG--A--AAG-TGT-A-------C-AAAA---TG--AAA--AATT----CGCA-ATT-----A-TT-ACA-----A-AAAT------T--ACA-TAT------T---TT-T--G---G-GC-------A-TA-T------------TTTC-GT--A-A--T-------TTC----A-T-G-T-TTA-----A--------C-CA-C-----C---------TT-TT-----------TTT-C--TTC-T---T------T--A---G--A--AT-----A--T-TA----G-ATTT----ACA-T-C-TG-TT----G-C-A--T--TTG----AAA--AGT-ATA---------A---A-----A--AA--A-T-A-TA--G-CAC-T-TT-A--C-TGGC--TTTT--TT-TTC--TT----TGT---ACAG--CT-TC-TG------T-AA-C-A-T-----G--TA-T-A--CC-CC-C-TTATCGGTC----ATCAAT-TA--CTA-TA-AACT-T-CA-C--T-----GAA-----AA--------G---T--T-A---AG-G---AA----ATA-T-G-T-TTC--T--T-T---AA---AATA--A----T----AG--CAA----A-G-T-AACTGT---AT-TTGTT
Reference ( gi|5 )            :        AAGGTAGGTCC-T--ACTCAACAAAATTT-TGTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----C--ATA-TA-C-C--CC-T-----TCTA-TCA-T--T-AT-A-AAA-TT-TC-AC--CT----G-A---------CA-TC--AATA-T--------TTTTGCC-G-A--T-AT--CA---------A-CA--C-A--ATAGG--A-A-AGCAA-AAATAA---TT-T--CA--T--AA-T-CTGT-TT---A-TT-T----A--TCG------C--A----T-AT---TA--C-G-T-T---A-A-C-A-AA-TC-AA----TA-T--TTA--GTGTT-TC-----T-T---TCA-T----C--AA-T----T--AA-CT---CA-C-A-A--A-GA--TGA--AA-----ATT---GGT-------------------------G-GTG--C--AAG-TGT-A-------C-AAAA---TG--AAA--AATT----CGCA-ATT-----A-TT-ACA-----A-AAAT------T--ACA-CAT------T---TT-T--G---G-G--------A-TA-T------------TTTC-GT--A-A--T-------TTC----A-T-G-T-TT------A--------C-CA-C-----C---------TT-TT-----------CTT-C--TTC-T---T------T--A---G--A--A------A--T-TA----ACATTT----ACA-T-C-TG-TT----G-C-A--T--TTG---AAAA--AGT-ATG---------A---A-----A--AA--A-T-A-TA--G-CAC-T-TT-A--C-TGGC--TTTT--TT-TTC--TT----TGT---ACAG--CT-TC-TG------T-AA-G-A-T-----G--TA-T-A--CC-CC-C-TTATCGGTC---AATCAAT-TA--TTA-TA-AACT-T-CA-C--T-----GAA-----AA--------G---T--T-A---AG-A---AA----ATA-T-G-T-TTC--T--T-T---AA---AATA--A----T----AG--CAA----A-G-T-AACTGT---AT-TTGTT
gi|3                          :        AAGGTAGGTCCCT--ACTCAACAAAATTT-TGTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----C--ATA-TA-C-C--CC-T-----TCTA-TCA-T----AT-A-AAAATT-TC-AC--CT----G-A---------CA-TC--A-TA-T--------TTTTGCC-G-A--T-AT--CA-----------CA--C-A--ATAGG--A-A-AGC-A-AAATAA---TT-T--CA--T--AA-T-CTGT-TT---ATTT-T----A--TCG------C--A----T-AT---TA--C-G-T-T---A-A-C-A-AA-TC-AA----TA-T--TTA--GTGTT-TC-----T-T---TCA-T----C--AA-A----C--TA-CT---CA-C-A-A--A-GA--TGA--AA-----ATT---GGT-------------------------G-GTG--C--AAG-TGT-AC------C-AAAA---TGA-AAA--AATT----CGCA-ATT-----A-TT-AAC-----A-AAAT------T--ACA-CAT------T---TT-T--G---G-G--------A-TA-T------------TTTC-GT--A-T--T-------TTC----A-T-G-T-TTA-----A--------C-CA-C-----C---------TT-TT-----------CTT-C--TTC-T---T------T--A---G--AATA------A--T-T-----AC-TTT----ACA-T-C-TG-TT----G-C-A--T--TTG---AAAA--AGT-ATG---------A---A-----A--AA--A-T-A-TA--G-CAC-TCTT-A--C-TGGC--TTTT--TT-TTC--TT----TGT---ACAG--CT-TC-TG------T-AA-G-A-T-----G--TA-T-A--CC-CC-C-TTAATGGTC----ATCAAT-TA--TTA-T--AACT-T-CA-C--T-----GAA-----AA--------G---T--T-A---AG-A---AA----ATA-T-G-T-TTC--T--T-TA--AA---AATA--A----T----AG--CAA----A-G-T-AACT-T---GT-TTGTT
gi|9                          :        AAGGTAGGTCCCT--ACTCA-CAAAATTT--GTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NNGACA-TA-C-C--CC-T--------------------------A-TT-TC-AC--CC----G-A---------CA-TC--A-TA-T--------TTT-GC--A-A--T-AT--CA---------AACA--C-A--ATAAG--G-A-AGCAA-AA-TAA---TT-T--CA--T--AA-T-CTGT-TT---A-TT-T----A--TCA------C--A----T-AT---TA--CAG-T-T---A-A-C-A-AA-TC-AA----TA-T--TTA--GTGTT-AC-----T-T---TCA-T----C--AA-T----T--AA-CT---CA-C-A-A--AAGA--TGA--AA-----ATC---AGT-------------------------G-GTG--A--AAG-TGT-A-------C-AAAA---TG--AAA--AATT----CGCA-ATT-----A-TT-AC--------AAAT------T--ACA-TAT------T---TT-T--G---G-GC-------A-TATT------------TTTC-GT--ATT--T-------TTC----A-T-T-T-TTA-----A--------C-CA-C-----CT--------TT-TT-----------TTT-C--TTC-T---T------TAAA---G--A--AT-----A--T-TA----G-ATTT----ACA-T-C-TG-TT----G-C-A--T--TCG----AAA--AGT-AT----------A---A-----A--AA--A-T-A-TA--G-CAC---TT-A--C-TGGC---TTT--TT-TTC--TT----TGT---ACAG--CT-TC-TG------T-AA-C-A-T-----GTATA-T-A--CC-CC-C-TTATTGGTC--------AT-TA--CTA-TA-AACT-T-CA-C--T-----G-G-----AA--------G---T--T-A---AG-G---AA----ATA-T---T-TTC--T--T-T---GA---AAT---A----T----AG--CAA----A-G-T-AACTGT---ATATTATTtgt
gi|4                          :       tAAGGTAGGCCCCT--ATTCGACAAAATTT-TGTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGAC--ATA-TA-C-C--CC-TC----TTTA-TCC-T--T-GT-ATAGA-TT-TCCAC--CT----G-A---------CA-TC--AATA-T--------TTT-GCA-G-A--T-TT--CA---------A-CA--C-A---TAGG--A-C-AGCAA-AATTAA---TT-T--CA--T--AA-T-CTGT-TA---T-TT-T----T--TCA------T--A----T-ATA--TA--C-G-C-T---A-GGC-A-AG-C---A----TA-T--TTA--GTGTA-AC-----AAT---TCA-T----C--AA-C----T--AA-TT---CAAC-A-A--A-GG--TGA--AA-----ATT---GGT-------------------------G-GTG--A--AAA-TGT-A-------C-AAAA---TG--AAA--AATT----CGCA-ATT-----A-TT-AC------A-AAAT------T--ACA-TAT------T---TT-T--G---G-GC-------A-T--T------------TTTC-TT--A-A--T-------TTC----A-T-G-T-TTA-----A--------C-CA-C-----C---------TT-TT-----------TTT-C--TTT-C---T------T--A---G--A--AT-----A--T-TA----G-ATTT----ACA-T-C-TG-TT----G-C-A--T--TTG-----CA--AGT-ATA---------A---A-----A--AA--A-T-A-TA--G-CAC-T-TT-A--C-TGGC---TTG--TT-TTC--TT----TGT---ACAG--CT-TC-TG------T-AA-C-A-T-----G--TA-T-A--CC-CC-C-TTCTCGG-------TCAAT-TA--CTA-TA-AACT-T-CA-C--T-----GAA-----AA--------AT--T--T-A---AG-G---AA----ATG-T-G-T-TTG--T--T-TTAAAA---AATA--A----T-----G--CAA----A-G-T-AACTGT---AT-TTGtggtc
gi|1                          :        AAGGTAGGTCCCT--ACTCGACAAAG-TT-TGTTT
gi|11                         :        AAGGTAGGTCCCT--ACTCGACAAAATTTGTGTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacacataccgcccttctaccattttacaatttcacctgatatcaatattttgcagattgcaacacttaggaaagccaaaataatttcataatcgttttatttatcaacatattacgtaacacaatcaaattagagttactttcatcaattaatctcacaacaagatgaaaattggtgggtgaaggacaaaatgaaaattcgcaattattacaaattaccattttttggggaaattatcgtaatttcaatgtttaactaccgttttttttttttcttcttttagaaatgttagactttacatctgttgccattttgaaaaagtaaaaaaattaacgtactttacttggcttttttctttgtacagcttctgtaaccatgtactgccccttacgtctaattactataactttcacgtgaagttaaggaaatatgtttctttaaaataatataggccaaagtaactgtatttgtttgtt
gi|33                         :        AAGGTAGGCCCCT--ACTCGACAAAATTT-TGTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGA-C--ATA-TA-C-C--CC-CC----TTTA-TCC-T--T-GT-A-AAA-TT-TC-AC--CT----G-A---------CA-TCT-AATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttatgcaccccttctactcattgtaaaattatcacctgacattaatatttgcgatatcgacgtaataggaaagcaaaactaaaatttacataatctgtttattttctgcacatatattaacaattaacaaatcgatatttgtgtttctttcaatcaattaactcaccaagatttgaaaatgagtgatgaaagtgtacaaaaaggaaaaaattgcaattattacaaatacatatttctgggcaattttttctaatttttcatgtgttttaataaacaccttatttcttcttaagaatattagatttacatcttgttcgacatatttaaagtataaaaaaagtatagcacttgactgactttttttccatatttacaagtcctctgtaacatgttatacccccttacggtcaattacttatagaaact
gi|52                         :       tAAGGTAGGTCCCT--ACTCAACAAAATTT-TGTTtctattctgtaaa
gi|50                         :       aAAGATAGGTCCCT--ACTCGACAAAATTT-TGTTT
gi|53                         :        AAGGTAGGCCCCT--ATTCGACAAAATTT-TGTTTa
gi|49                         :        AAAATAGGTCC-TT-ACTCGACAAAATTT-TGTTT
gi|30                         :        tAGGTAGGTCC-CTAACTGGACAAAATTT-TTTTa
gi|12                         :          GGTAGGTCCCT--ACTCGACAAAATTT-TGTTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagaaccatatacccttctatcatgtaaaaatttcccctgatacaatattttgcagatatcaacacaataggaaccacaaaaatttcataatcctgtttatttaa
gi|29                         :          GGTAGGCCCCT--ACTCGACAAAATTT-TGTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGA-C--ATA-TA-C-C--CCCT-----TTTA-TCC-T--T-GT-A-AAA-TT-TC-AC--CT----G-A---------CA-TC--AATA-T--------TTT-GCA-G-A--T-AT--CA---------A-CA--C-A--ATAGG--A-A-AGCAA-AA-TAA---TT-T--TA--T--AA-T-CTTT-TT---A-TT-C----A--TCA------T--A----T-AT---TA--T-G-T-T---A-A-C-A-AA-GC-AA----TA-T--Tnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttatgcccccttctatcattgtaaaatttcacctgacatcaatattttgcagatatcgacgtaataggaaagcaaaataaatttcataatctgtttatttatcacatattacattaacaaatcgatatttagtgtttctttcatcaattaactcaccaagatgaaaaatggtgatgaaagtgtacaaaaggaaaaatttgcaattattacaaaattacatattttctgggcatattttcgtaatttcatgtttaataaacaccttttttcttcttaagaatattagatttacatctgttgcatttaaaagtataaaaaatatagcacttgactgactttttttcattttacaggctctgtaacatattatacccccttatcggtcaatttactataaacttcactgaaaa
gi|31                         :          GGTAGGTCCCT--ACTCGACAAAATTT-TTTT
gi|51                         :          GGTAGGTCCCT--GCTCGACAAAATTT-TGTTTgtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagaagacatatacccctttatcatgtaaaatttccctgacatcaatattttggcagaatatcaacacaaataggaagcaaatattcataatctgttatttatc
gi|10                         :        tatGTAGGCCCCT--ACTCGACAAAATTT-TGTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGA-C--ATA-TA-C-C--CCCT-----TTTA-TCC-A--T-GT-A-AAA-TT-TC-AC--CT----G-A---------CA-TC--AATA-T--------TTT-GCA-G-A--T-AT--CA---------A-CA--C-A--ATAGG--A-A-AGCAA-AA-TAA---TT-T--CA--T--TA-T-CTGT-TT---A-TT-T----A--TCA------T--A----T-AT---TA--C-G-T-T---A-A-C-A-AA-GC-AG----TA-T--TTA--GTGTT-AC-----T-T---TCA-T----C--AG-T----T--GA-TT---CG-C-A-A--A-GG--TGA--AA-----ATT---GGT-------------------------G-GTA-----AAA-TGT-A-------C-AAAA-------A-------T----CGCA-ATT-------TT-ACA-----A-AA--------T--ACAGTA-------T---TT-T--G---G-C--------A-GA--------------TTTC-TT--A-A--T-------TTC----A-T-G-T-TT------A--------A-CA-C-----C---------TT-TT-----------TTT-C--TTC-T---TAAA---T--A------A--A------A--T-TA----G-ATTT----ACATT-C-TG-TT----G-C-A--T--TTG----AAA--AGT-ATA---------A---A-----A--AA--A-T-A-TA--C-CAC---TT-A--C-TGGC----TT--TT-TTC--TT----TGT---ACAG--CT-TC-TG------T-AA-T-A-TG----G--TA-T-A--CC-CC-C-TTATCG--C--------AT-TA--CTA-TA-AACT-T-CA-C--T-----GAA-----AA--------T---T--T-----AG-G---AA----ATG-T-G-T-TTG--T--T-TAA-AA---AATA--AT---T----AG--CAA----A-G-T-AA-TGC---AT-TTGTT
gi|2                          :                 CT-T--ACTCGACAAAGTTT-TGTTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGA----CT-ACA-TA-C-CACCC-T-----TCTA--CA-T--T-TTTA-CGA-TT----AC--CT----G-AG--------TA-TC--AATA-T--------TTT-GCA-G-A--T-TT--CA---------A-CA--C-A--TTAGG--A-A-AGCAA-AA-TAA---TT-T--CA--T--AA-T-C-GT-TT---A-TT-T----A--TCG------C--A----T-AT---T---C-G-T-T---A-A-C-A-AA-TC-AA----TA-T--TTA--GAGT---A-----A-T---TTA-C----C--AA-T----TT-AA-CTTCACA-C-A-A--C-GA--TGA--AA-----ATT---GGT-------------------------G-GTG--A--AAG-TGT-A-------C-AAAA---T---AAA--AATT----CGCATAT--------TT-AC------A-AAAT------T--ACA-TAT------T---TT-T--G---GTA--------A-TA-T------------TTTC-GA--C-A--T-------TTC----A-T-G-T-TTA-----A--------C-CA-C-----C---------AT-TT-----------TTT-C---TC-T---T------A--AC--G--A--AT-----G--T-TA----G-ATTT----ACA-T---TG-CT----G-G-A--T--TTG----AAA--AGT-ATA---------A---A-----A--AA--A-T-AGTA--G-TACTT-TT-A--C-TGGC--TTTT--TT-TCT--CT----TGT---ACAG--CT-TC-TGC-----C-AA-----------G--TA-T-A--CC-CC-CTTTATCGGTC----ACCATT-TACCCCA-T--AACT-T-CA-C--T-----GAA-----AATTTTTTATA---T--T-ATATAG-G---CA----ATA-T-GTT-TTC--T--TCT---AA---AATA--A----TTATAAGC-CAA----A-G-T-AACTGT---AT-TT
gi|16                         :                                                                                                                                                      ----C--ATAATA-C-C--CCCT-----TCTA-TCA-T--T-GT-A-AA---T-TC-AC--CT----G-A---------CA-TA--AATA-T--------TT------G-AAAT-AT--CA---------A-CA--C-A--ATCG---A-A-TGCAA-A--TAA---TT-T--CA--T--AA-C-CTGT-TT---A-T-----------CA------C--A----T-AT---------G-T-T---A-A-A-A-AA-TC-GA----TA-T--TTA--GTTTT-TC-----T-T---TCA-T----C--AA-T----T--AA-CT---CA-C-A-T--A-GA--TG---AA-----ACT---GAT-------------------------G-GTG--A--AAG-TGT-A-------C-AAAA---TG--AAA--AATT----CGCA-ATT-----A-TT-AC--------AAAT------T--ACA-TAT------T---TT-G--G---G-GCAAAGTTAA-TA-T------------TTTC-GT--A-A--T-------TTC----A-T-G-T-TTA-----A--------C-CA-T-----C---------TT-TT-----------TTT-C--TTT-T---T------C--A---G--A--AT-----A--T-TA----G-ATTT----ACG-T-C-TG-TT----G-C-A--T--TTG----AAA--AGT-AT----------A---A-----A--AA--A-T-A-GA--G-CAC-T-TT-A--C-TGGC---TTT--TT-TTC--TT----TGT---ACAG--CT-TC--G------T-AA-C-A-T-----G--TA-T-A---C-CC-C-TTGTCGG-------TCAAT-TA--CTA-TA-AACT-T-CA-A--T-----GAA-----AA--------G---G--G-C---AG-G---AA----ATA-T-G---TTC--T--G-T---AA---AATA--A----T----AG--CAA----A-G-T-AACTGT---AT-TTGTTt
gi|1                          :                                                                                                                                                      ----C--ACA-TA-C-CGCCC-T-----TCTA-CCA-T--T-TT-A-CAA-TT-TC-AC--CT----G-A---------TA-TC--AATA-T--------TTT-GCA-G-A--T-TG--CA---------A-CA--C-T---TAGG--A-A-AGCCA-AAATAA---TT-T--CA--T--AA-T-CGTT-TT---A-TT-T----A--TCAA-----C--A----T-AT---TA--C-G-T-----A-A-C-ACAA-TC-AA-----A-T--T-A--GAGTT-AC-----T-T---TCA-T----C--AA-T----T--AATCT---CA-C-A-ACAA-GA--TGA--AA-----ATT---GGTG------------------------G-GTG--A--AGG-----A-------C-AAAA---TG---AA--AATT----CGCA-ATT-----A-TT-AC--------AAAT------T--AC--CAT------T---TT-TTGG---G-G--------A-AA-T------------TATC-GT--A-A--T-------TTCA---A-T-G-T-TTA-----A--------C-TA-C-----CGTTTTT---TT-TT-----------TTT-C--TTCTT---T------T--A---G--A--A------ATGT-TAG---AC-TTT----ACA-T-C-TG-TT----GCC-AT-T--TTG---AAAA--AGT-A-----------A---A-----A--AA--A-T---TAACG-TAC-T-TT-A--CTTGGC----TT--TT-TTC--TT----TGT---ACAG--CT-TC-TG------T-AACC-A-T-----G--TA-C-T--GC-CC-C-TTAC--GTC------TAAT-TA--CTA-TA-ACTT-T-CA-CG-T-----G-------AA--------G---T--T-A---AG-G---AA----ATA-T-G-T-TTC--T--T-T---AA---AATAATA----T----AGGCCAA----A-G-T-AACTGT---AT-TTGTTtgtt
gi|13                         : aaggtaggtccctactcgacaaagtttgtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnna----C--ATA-C--C-C--CC-T-----TCTA-CCAAT--T-GT-A-CAA-AA-TC-AC--CT----T-AATACTATTGTA-TC--AATA-T--------TTTTGA--G-A--T-AT--CA---------A-CA--C-A--ATAGA--A-A-AGCAA-AT-TAA---TT-T--CA--T--AA-T-C-GT-TT---A-TTCT----A--TCA------C--A----TCAT---TA--C-G-T-T---A-A-C-A-AA-TC-AA----TA-T--T-A--GTGTT-AC-----T-T---TCA-T----C--AA-T----T--AA-CT---CA-CCA-A--A-GA--TGA--AA-----ATT---GGTT------------------------G-GTG--A--AAG-TGT-A-------A-AAAA---TG--AAA--AATT----CGCA-ATT-----A-TT-ACC-----A-AAAT------T--ACA-TAT------T---TC-T--T---G-GTC------A-TAGT------------TTTC-GTTGA-A--T-------TTC----A-T-G-T-TGAGA---A--------C-CA-C-----CTATT-----TT-TT-----------TTT-C--TTT-T---T------T--A---GGTA--A------A--TGTT----AGATTT----A-A---C-TG-TT----G-C-A--T--TTG----AAA--AGT-AAA---------ACATA-----A--AA--A-T-ATTA--GTTAC-T-TT-A--C-T-GC--TTTT--TT-CT---TT----TGT---ACAG--CT-TCTTG------T-AA-C-A-T-----G--TA-T-A--CC-CC-C-TTATCGGTC----ATCCAT-TA--CTA-T--AACT-TGCACC--T-----GAA-----AA--------G---T--T------GTT---AT----ATA-T-A-TCTTC--TAAC-T---AATCTAATGT-A----T----AG--CAAT---A-GAT-AACTGT---AT-TTGTTtgtt
gi|31                         :                                                                                                                                                    aa----C--ATA-TA-C-C--CC-T-----T-TA-TCA-T----GT-A-AAA-TT-TC--C--CT----G-A---------CA-TC--AATA-T--------TTTGGCA-GAA--T-AT--CA---------A-CA--CAA--ATAGG----A-AGC---AAATA-----T-T--CA--T--AA-T-CTG--TT---A-TT-T----A--TCtgtt
gi|30                         : ggtaggtccctactcgacaaaatttttttgtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagaaga----C--ATA-TA-C-C--C--T-----TCTA-TCA-TG-T-A--A-AAA-TT-TC-CC--CT----G-A---------TA--C--AATA-T--------TTT-GCA-G-A--T-AT--CA---------A-CA--C-A--ATAGG----A-ACCAC-AAA-AA---TT-T--CA--T--AA-TCCTGT-TT---A-TT-T----A--
gi|11                         :     aggtaggtccctaactggacaaaatttttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagaac--ATG-CA-C-C--CC-T-----TCTACTCA-T--T-GT-A-AAA-TTATC-AC--CT----G-A---------CA-TT--AATA-T--------TT--GC--G-A--T-AT--CG---------A-CG--T-A--ATAGG--A-A-AGCAA-AACTAAAA-TT-TA-CA--T--AA-T-CTGT-TT---A-TT-T----T--CTG------C--ACATAT-AT---TAA-C-AAT-T---A-A-C-A-AA-TC-GA----TA-T--TT---GTGTT-TC-----T-T---TCAAT----C--AA-T----T--AA-CT---CA-C-C-A--A-GATTTGA--AA-----ATG---AGT-------------------------G-ATG--A--AAG-TGT-A-------CAAAAA---GG--AAA--AAAT----TGCA-ATT-----A-TT-ACA-----A-A---------T--ACA-TAT------T---TC-T--G---G-GCA------A-TT-T------------TTTC--T--A-ATTT-------TTC----A-T-G-TGTTTTAATAA--------A-CA-C-----C---------TT-AT------------TT-C--TTC-T---T------A--A---G--A--AT-----A--T-TA----G-ATTT----ACA-T-CTTG-TTCGACA-T-A--T--TT------AA--AGT-ATA---------A---A-----A--AA--AGT-A-TA--G-CAC-T-TG-A--C-TGAC--TTTT--TT-TCCA-TA----TTT---ACAAGTCC-TC-TG------T-AA-C-A-T-----GT-TA-T-A--CC-CC-C-TTA-CGGTC---AATTACT-TA---TA-GA-AACT-a
gi|14                         :    aaggtaggtccctactcgacaaaatttgtgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattt--ATG-TA-C-C--CC-G-----TCTA-TCG-T--T-TT-A-ACA-TT-TC-AT--CA----A-A---------CA-TC--AATAAT--------TTTCGCA-G-A--T-CT--TA---------A-CA--C-A--ATATA--A-A-AG--A-AAATAA---CC-T--TA--T--AA-T-CTGTGTT---A-TT-T----ACTTCA------C--A----T-GT---TAG-T-G-T-T---A-A---A-AA-TG-AA----TA-T--TTA--GTGTT-AC-----T-TCTATCA-T----C--AC-T----TGTAA-CT---CA-C-A-A--A-AA--TGA--AA-----GTT---GGT-------------------------G-GTA--A--AAA-TGT-A-------C-AAAATT-TG---AA--AATT----CGCA-TTT-----A-TTCATA-----A-AAAT------T--G-A-CATG-----T---TT-T--A---A-C--------A-TA--------------TTTC-GT--A-T--T-------TAC----A-T-G-T-TT------ATC------C-TA-C-----C---------TT-TT------------TT-C--TTC-T---T------T--A---A--A--A------A--T-GA----GAATTT----ACA-T-C-TG-TA----G-T-AATT--TTG----AAA--AGT-A-----------A---A-----A--AA--A-T-ACTA--G-CAC---TC-A--C-GGGC--TTTT--TT-TTC--TT----TGC---ACAG--CT-TA-TA------T-AC-A-ATT-----T--TA-T-A--CCAAC-G-TTATCGGT--------AATGTA--CTT-TA-AACT-T-AA-C--A-----CAA-----AA--------G---T--T-AT--CG-A---AT----GTA-T---T-TAC--TA-TGT---AA---AGCA--A----T----AG--CAA----
gi|37                         :                                                                                                                                                          g--ATA-TATC-C--CC-T-----TCTA-TCA-T--T-AT-A-CAA-CT-TC-AT--CT----G-A---------CA-TC--AATA----------GTTTGCA-G-A--T-AT--AA---------A-CA--C-G--ATAGA--A-A-AGC-A-AACTAT---TT-T--TA--C--AA-T-CTGT-TT---A-TT-T----A--TCA------C--A----T-AT---TA--T-G-T-TTAAA-A-A-A-AA-TC-AT----TT-T--TTT--GTGTT-AC-----T-A---TTA-T----T--AA-T----T--AA-CT---CA-C-A-A--A-GT--TGA--AA-----ATT---AGgatcttatgatttgtacttta
gi|8                          :                                                                                                                                                              TA-TA-C-C--CC-CATTAATTTA-ACAGTGGT-AT-A-AAA-TT-AC-ACTACC----G-A---------CG-TCTCAACA-TGTAAAATGTTTAGCA-GTA--T-AT--AA---------A-CAAAC-AGAATAGGTGACA-AGCTA-AGATAAAAATTAT--CAATTGAAA-T-CTGT-TCTAGA-TT-CTTCAA--TTA------C--AA---T-AT---TA--C-T-T-T---A-A-C-A-AA-TC-AA----TT-T--TTATAGTGCT-TTATACTT-T---TCA-TATTAC--AAAT----T--AA-AC---CA-A-ACA--A-TA--TTATTAT-----ATTTTTGGTT------------------------G-GTG--A--TAA-TGC-ATGCTACCC-AAAA---TGTAAAAT-AATTTTTCCTCA-ATT-----AATT-ACACTATAA-AAAT------T--ACG-AAT------TAATCT-T--GCGTA-G--------A--A-T------------TTTC-GT--ATA--T-------TACTTAGA-T-G-TATT------AAAACGCAGC-CC-C-----A---------TT-TT-----------TTT-C--TAT-T---TCTGACAT--AATCG--A--AGCGC--A--T-TG----ACACC-----ACA-T-C--G-TTC---G-C-GG-T--CTG---CAAG--AGTTATA---------A---ACCCGAATTAA--G-T-A-TG--C-CAC-A-T--A--C-TGCC--GTTTACTT-TCC--GA----GGTC--ACA----T-TA-TG------TCAA-GCACT-----G--AAAT-A--GC-CC-CGCTATCGGTC------TACT-TA--CTA-TATAACTCT-CA-C--T-----CAACAATCAA--------G---T--T-A---AG-GATTAA----ATA-TGG-T-TTC--T--TAT---AA---AATA--A----T----GC--CAA----C-C-T-AAC
gi|15                         :                                                                                                                                                               A-TA-CAC--CC-T-----TCTA-TAG-T--T-AT-G-AAA-TT--C-AC--CT----ATA---------TAATC--AATA-A--------TTTTGC--A-A--T-AT--CA---------A-CA--C-A--ATAGG--A-A-AACAC-AAATAA---TT-T--CT--G--AAGTACTGT-TTT--A-TT-T----A--TCA------A--C----T-AT---TA--T-G-T-T---A-AAC-A-AA-TC-AAAAA-TA-T--TTA--GTGTT-AC-----T-T---TCA-T----C--AAATA---T--AA-TT---CA-C-A-A--A-GA--TGA--AA-----AT----GGT-------------------------G-GTGAAC--AAG-TGT-A-------C-AAAAAGTCG--AAA--CATTT---CGCA-ATT-----AATT-ACA-----A-CAAA------T--ACA-TAT------T---TT-T--G---G-GC-------A-TA-T------------TTTC-GT--A-A--T-------TTC----A-T-G-T-TT------AA-------C-CA-C-----C---------TT-TT-----------TTTTC--ATC-T---T------T--A---G--A--AT-----A--T-TA----G-ATTT----ACA-T-C-TG-TT----G-C-A--T--TTG---AAAA---GT-ATA---------A---A-----A--AATAA-T-A-TA--G-CAC-T-TT-A--C-TGG---TTTT--TT-TTC--TT----TGT---ACAA--C--------------------A-T-----G--TA-T-A--CC-CC-C-TTATCGGTC---AAT-----TA--CTA-TA-AACT-T-CA-C--T-----GAA-----AA--------G---T--T-ATA-AG-G---AA----ATA-T-G-T-TTC--T--T-T---AA---AATA--A----T----AG--CAA----A-G-T-AACTGT---AT-TTGTTggcgtaatt
gi|7                          :                                                                                                                                                               A-TA-C-CA-CT-T-----TCTA--CA-T--T-TTTA-CAA-TT-TC-AC--CTTTTTG-A---------TA-TT--AATA-T--------TTT-GCAAG-A--T-AT--CA---------ATCA--C-A--TTAGGG-A-A-AGCAA-A--TAA---TT-TT-CA--T--AA-T-CTGT-TT---A-TT-T----A--TCA------C--A----T-AT---TA--C-G-T-T---ATA-C-A-AA-TC-AA----TATT--TTA--GAGTT-ACT----T-T---TCA-T----C-----C----T--TA-CT---CC-T-C-A--A-GA--TGA--A--------T---GGT-------------------------GAGTG--A--AAG-TGT-A-------CTAAAA---TG--ATA--AATT----CGCA-ATT-----A-TT-AC--------TAAT------T--A-A-CATA-----T---TT-T--G---G-T--------T-TA---------------TTC-GT--A-A--T-------TTC----A-T-G-T-TTTA----A--------C-CA-C-----C---------AT-TT-----------TTT-C--TTC-T---T------T--A---G--A--ATGT---AGTT-TA----ACAT----------T-C-TG-AT----GCC-A--T--TTG-----AA--AGT-AT--------------A-----A--AA--A-T-A-TA--G-TAC-T-TT-A--C-TG-----CTT--TT-TTC--TTA---TGT----CAG--CT-TC-TG------T--A-C-A-T-----G--TA-T-A-----CC-C-TT-TCGGTC---A---AGT-TC--CTA-T--AACT-T-C--C--T-----GAAAT---AA--------G---T--TAA---AG-G---AA----ATA-T---T-TTC--T--T-T---AA---TATA--ATTATT----AG--CAA----A-G-T-AACTGT---AT-TTGTTtgttct
gi|6                          :                     ggtaggatccctactcgcaagttttgtttataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacagctcA-TA-C-CA-CT-T-----TCTA--CA-T--T-TTTA-CAA-TT-TC-AC--CTTTTTG-A---------TA-TT--AATA-T--------TTT-GCAAG-A--T-AT--CA---------ATCA--C-A--TTAGGG-A-A-AGCAA-A--TAA---TT-TT-CA--T--AA-T-CTGT-TT---A-TT-T----A--TCA------C--A----T-AT---TA--C-G-T-T---ATA-C-A-AA-TC-AA----TATT--TTA--GAGTT-ACT----T-T---TCA-T----C-----C----T--TA-CT---CC-T-C-A--A-GA--TGA--A--------T---GGT-------------------------GAGTG--A--AAG-TGT-A-------CTAAAA---TG--ATA--AATT----CGCA-ATT-----A-TT-AC--------TAAT------T--A-A-CATA-----T---TT-T--G---G-T--------T-TA---------------TTC-GT--A-A--T-------TTC----A-T-G-T-TTTA----A--------C-CA-C-----C---------AT-TT-----------TTT-C--TTC-T---T------T--A---G--A--ATGT---AGTT-TA----ACAT----------T-C-TG-AT----GCC-A--T--TTG-----AA--AGT-AT--------------A-----A--AA--A-T-A-TA--G-TAC-T-TT-A--C-TG-----CTT--TT-TTC--TTA---TGT----CAG--CT-TC-TG------T--A-C-A-T-----G--TA-T-A-----CC-C-TT-TCGGTC---A---AGT-TC--CTA-T--AACT-T-C--C--T-----GAAAT---AA--------G---T--TAA---AG-G---AA----ATA-T---T-TTC--T--T-T---AA---TATA--ATTATT----AG--CAA----A-G-T-AACTGT---AT-TTGTTttgttc
gi|28                         :                     ggtaggatccctactcgcaagttttgtttataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacagctcA-TA-C-C--CC-T-----TCTA-TCA-T--TTGT-A-AAA-TT--C-AC--CC----G-A---------CA-TC--GATA-T--------TTT-GC--A-A--TCATT-CA---------A-CA--C-A--ATAGG--A-AGAGCAAGAAATAA---TT-T--CA--T--AA-T-CTGT-TT---A-TT-T----A--TCA------C--A----T-AT---TA--C-G---T---A-A-C-A-AATTC-AATATTTA-T--TTA--GTAAT-AC-----T-T---TCA-T----C--AA-TACAAT--GA-CT---CA-C-A-A--A-GA--TGAT-AA-----ATT---GGT-------------------------G-GTG-----AAG-TGT-A-------C-AAA-----G--AAA--AAGT----CG-A-A-T-----A-TT-A-A-----A-AAAT------T--ACA-TAT------T---TT-T--G---G-G--------A-TA-T------------TTT--GT----A--C-------TTC----A-T-G-T-TTTA----A--------C-CA------------------T-TT-----------TTT-C--TTC-T---T------T--A---G--A--G------A--TATC----A-ATTTAC--ACA-T-C-AG-TT----G-CAA--T--TTG-----AA--AGT-ATA---------A---T-----A--AA--A-T-A-Tttgttc
gi|12                         :                                                                                                                                                                  a-C-C--CC-T-----TCTA-TCA-T--T-GT-A-AAA-TT-TC-AC--CT----G-A---------CA-TC--AATA-T--------TTT-GCA-G-A--T-AT--CG---------A-CG--T-A--ATAGG--A-A-AGCAA-AATAAA---TT-T--CA--T--AA-T-CTGT-TT---A-TT-T----A--TCA------C--A----T-AT---TA--C-A-T-T---A-A-C-A-AA-TC-GA----TA-T--TTA--GTGTT-TC-----T-T---TCA-T----C--AA-T----T--AA-CT---CA-C-C-A--A-GA--TGA--AA-----AAT---GGT-------------------------G-ATG--A--AAG-TGT-A-------C-AAAA---GG--AAA--AATT----TGCA-ATT-----A-TT-AC------A-AAAT------T--ACA-TAT------T---TTCT--G---G-GC-------A-TA-T------------TTTC-GT--A-A--T-------TTC----A-T-G-T-TTAATA--A--------A-CA-C-----C---------TT-TT------------TT-C--TTC-T---T------A--A---G--A--AT-----A--T-TA----G-ATTT----ACA-T-C-TG-TT----G-C-A--T--TT-----AAA--AGT-AT----------A---A-----A--AA--A-T-A-TA--G-CAC-T-TG-A--C-TGAC--TTTT--TT-TCA--TT----T-T---ACAG--GC-TC-TG------T-AA-C-A-T-----AT-TA-T-A--CC-CC-C-TTATCGGTC---AAT---T-TA--CTA-TA-AACT-T-CA-C--T-----GAA-----AA--------gag
gi|17                         :                ggtaggtccctactcgacaaaattttgtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttatgc-C--CC-T-----TTT--TTA-T--C-AA-A-CAA-TT-TT-AA--CC----A-A---------AA-TC--AATA-G--------TTT-GCA-G-A--T-CT--CA---------A-CA--A-A--ATACT--A-A-CGCAA-AA-TAA---TT-TT-CA-----AA-T-TCGC-TT---A-CG-T----A--TCA------T--A----T-AC---AA--C-A-T-TTTGA-A---A-AA-TT-CA----TA-T--TTA--GTGTC-TG-----T-T---TCA-T----T--AA-A----T--AA-CT---TA-A-A-A--A-TA--TAG--AA-----TTT---GTT-------------------------G-GGG--G--AAA-TGT-A-------T----------------------------------------TT-GTA-----A-AATT------T--A-A-CAG------T---GT-T--G---ATC--------A-TA-T------------TTTC-GT--G-A--T-------ATC----ATT-G-C-TA------A--------C-CA-T-----A---------TA-AT-----------TTT-C--ATC-T---T------T--A---G--A--AACATATA--T-TG----GC-TTT----ACT-T-G-TG-TT----G-C-T--T--TTT---AAA-----T-GTT---------A---A-----G--AT--A-T-A-TA--A-CAC-T-TC-A--------------------------------T---A-AA--C--TC-TG------T-AA-A-----------------------CC-C-TCAT--GTT---CATCA---------C-TA-ACCT-T-CAGC--TTGGAAGAA-----AAT-------G---T--T-A---TG-A---AA----ATA-C-A-A-TTC--T--T-C----A---GATAG-A----T----AG--CGA----A-G-T-AAC------AT-TTTTT
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                         ca-TC-CC--TT----G-A---------AA-TC--AACA-T--------TTT-GCA-G-A--T-CT--CA---------A-CA--C-A--ATACT--A-A-AACAA-AATTGA---TT-----A--A--AA-C---AT-TA---A-TT-T----A--TCA------TTAA----C-AA---TA--T-A-T-T---G-A-A-A-AA-T---A----TA-TCATTG--GTGTC-AC-----T-T---TTA-T----T--AA-T----T--AA-CT---CA-T-A-A--A-GA--TGA--AA-----ATC----GT-------------------------T-GCG--A--AAA-TGT-A-------C--TAT---TG--GAA--AGTT----T--------------TT-CCA-----A-AAATGCACTGT--AC--CATCTGAGAT---TT-T--G---GAA--------A-TA-TACTATCTGAAAATCTC-GC--A-A--TTATAAAATTCG---A-CAG-T-TTTG----G--------A-CA-T-----A---------TT-TTTGGTGA-----TTT-CATTTC-TTGTT------T--A---T--A--AT-----A--T-TG----A-ATTT----ACA-C-C-TG-TT----T-C-A--T--TTG---GA----------G---------A---A-----A--AA------A-TA--G-CAC-T-Tcat
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                      A-TC--AATA-T--------TTT-GC--A-A--T-ATTCCACTGAAAAGGA-CA--C-A--AT-TA--A-A-AACAA-AA-TAA---TT-TAACA--T--A--T-CTGT-TT---A-TT-TT---A--TCGACAATAC--A----T-GTATTTATTC-G-T-T---A-A-CCG-AA-TC-AAA---TA-T--T----GTGTT-TG-----T-T---TCA-T----CTTAA-TA---T--AA-CT---CA-C-A-A--A-GAA-TGA--AA-----ATT---GGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGG-ATG--A--AAG-TGT-A-------C-AAAA---TG--AAA--AATC----CGCA-ATT-----A-TT-AC------A-AAAT------T--ACA-TAT------T---TT-T--G---G-GC-------A-TA-A------------TTTC-GT--A-A--A-------TTT----T-T-G-T-TTA-----A--------C-CA-C-----C---------TA-TT-----------TTT-C--TTC-T---T------T--A---G--A--AT-----A--T-TA----G-ATTT----ACA-T-A-TG-TT----G-C-A--T--TTG----AAA--AGT-AT----------A---A-----T--AA--G-T-A-TA--G-CGC-T-TT-A--C-TGGC--TT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                      tt-AT--CA---------A-CA--C-A--ATAGG--A-A-AGCAA-A--CTA---TT-T--CA--T--AA-T--------------------------G------C--------------TA--C-G-T-T---A-A-C-A-AA-GC-AA----TA-T--TTA--GTGTT-AA-----T-C---TCA-T----C--AA-T----T--AA-CT---C------------A--TAA--A--------------------------------------------G--C---------------------------TG--AAA--ATTT----CGCA-ATT-----A-TT-ACA-----A-AA-T------T--GCA-TAT------T---TT-T--G---G-GC-------A-TA-T------------TTTC-GT--A-A--T-------TTC----A-C-G-T-TC------AA-------C-CA-C-----C---------TT-TTTTTTTTTTCTTCTT-C--TTC-T---T------T--A---A--A--AT-----A--T-TA----G-ATTT----ACA-T-C-TG-AT----G-C-A--T--TTG---AAAA---GT-AT----------A---A-----A--AA--A-T-A-TA--G-CAC-T-TT-A--C-TGGC--TTTT--TT-CTC--TCTCTATGT---ACAG--CT-TC-TG------T-AA-C-A-T-----G--TA-T-A--CC-CC-C-TTATCGG-------TCAAT-TA--CTA-TA-AACT-T-CA-C--T-----GAA-----AA--------G---T--T-A---AG-G---AA----ATT-T-G-T-TTC--T--T-T---AA---AATG--A----T----AG--CAA----A-A-T-AACTGT---AT-TTGTT
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                        -AT--CA---------A-CA--C-A--ATAGG--A-A-AGCAA----CTA---TT-T--CA--T--AA-T--------------------------G------C--------------TA--C-G-T-T---A-A-C-A-AA-GC-AA----TA-T--TTA--GTGTT-AA-----T-C---TCA-T----C--AA-T----T--AA-CT---C------------A--TAA--A--------------------------------------------G--C---------------------------TG--AAA--ATTT----CGCA-ATT-----A-TT-AC------A-AAAT------T--GCA-TAT------T---TT-T--G---G-GC-------A-TA-T------------TTTC-GT--A-A--T-------TTC----A-C-G-T-TCA-----A--------C-CA-C-----CTTTTTTTTTTT-TT-----------CTT-C--TTC-T---T------T--A---A--A--T------A--T-TA------ATTT----ACA-T-C-TG-AT----G-C-A--T--TTG----AAA--AGT-AT--------------A-----A--AA--A-T-A-TA--G-CAC-T-TT-A--C-TGGC--TTTT--TT-CTC--TCTCTATGT---ACAG--CT-TC-TG------T-AA-C-A-T-----G-----T-A--CC-CC-C-TTATCGG-------TCAAT-TA--CTA-TA-AACT-T-CA-C--T-----GAA-----AA--------G---T--T-A---AG-G---AA----AT--T-T-T-TTC--T--T-T---AA---AATG--A----T----AG--CAA----A-A-T-AACTGT---AT-TTGTTtattct
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GA--A-A-AGCAA-AA-TAA---TT-T--TA--C--AA-T-CTGT-TT---A-AT-T----A--TCA------C--A----T-TTA--TA--T-G-T-TTTTA-A-A-A-AT-TC-AT----TA-T--TTA--GCGTT-AC-----T-T---TCA-T----C--AG-T----T--AA-CT---CA-C------------------------------GAT-------------------------G-GTG--A--AAG-TGT-T-------C-ACAA---TG--AAA--AATT----CGCA-ATT-----A-TT-AC--------AAAT------G--AGA-CAT------T---TT-T--G---G-G--------CTTA-T------------TTTC-TT--C-A--T-------TTC----A-T-G-C-TTA-----A--------C-CA-C-----C---------TT-CT-----------TTT-C--TTC-T---T------T--A---G--A--AT-----A--T-TA----G-ATTT----ACA-T-C-TG-TT----G-C-A--T--TTGAAAAAAA--AAT-ATATATATATATA---ATAT--A--AT--A-T-A-TA--G-CAC-T-TC-A--C-CGCC--------TT-TTC--TT----TGT---TCGA--CT-TC-TGTATTTAT-AA-T-A-A-----G--TA-T-A--CC-CC-A-ATATCGAGC----ACCAA--CA--T---TA-AACG-T-GA-A--A-----AAA-----AAAAT-----G---T--T-T---TG-G---AA----ATT-T-G-A-TTCAGT--T-T----A---AATA--A----T----tattct
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 --CA--T--AA-T-CTGT-TT---A-TT-T----A--TTA------C--A----T-AT---TA--C-T-T-T---A-A-C-A-AA-TC-AA----TT-T--TTA--GTGCT-AC-----T-T---TCA-T----C--AA-T----T--AA-CT---CA-C-A-A--A-GG--TTA--AA-----ATT---GGT-------------------------G-GTG--A--AAG-TGT-A-------C-AAAA---TG--AAA--ATTT----CACA-ATT-----A-TT-AC------A-AAAT------T--ACA-TAT------T---TT-T--G---G-GT-------A-TA-T------------TTTC-GT--A-A--A-------TTC----A-T-G-T-TTA-----A--------C-CA-C-----C---------CT-TT-----------TTT-C--TTC-T---T------TA-A---A--A--A------A--T-TA----tattaaatt
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    --TCA------C--A----T-AC---TA--C-G-T-T---A-A---A-CA-TCCGA----TA-T--TT---TTATT-TT-----T-T---TC--T----C--AA-T-------AA-CT---CA-C-C-A--A-GA--TGA--AA-----ATT---GGT-------------------------G-GTG-----AAG-TGT-A-------C-AATA---AG--AAT--AATT----CGCA-ATT-----A-TT-AGC-----A-AGAT------T--ACA-TAA------T---TT-T--G---G-GGC------A-TA-T------------TTTC-GT--A-A--T-------TTC----A-T-G-T-TTA-----A--------C-CA-C-----CT--------TT-TT-----------TTT-C--TTC-T---T------T--A---G--A--AT-----A--T-TA----G-ATTT----ACA-T-T-TG-TT----A-C-A--T--TTG----AAA--AGT-ATG-------------A-----A--AA--A-T-A-TA----CAC-T-TG-A--C-TGAC--TTTT--TT-TTC--AT----TTT---A------T-TC------------------------------------------------GGTC---AATTATT-AA--TGA-AA-AACT-T-CA-C--T-----GAA-----AT--------G---T--T-----AG-G---CA----CCA-T-T-C-TTC-----T-T---AA---AACC--A----T----AG--CAA----A-G-A-AACTGT---AT-TTGTTg
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    --TCA------C--A----T-AC---TA--C-G-T-T---A---C-A-AC-TC-GA----TA-T--TT---GTGTT-TT-----T-T---TCA-T----C--AA-T----TG-AA-CT---CA-C-C-A----GA--TGA--AA------TT---G-T-------------------------G-GTG--A--AGG-T-----------C-AATA----G--AGA--AAT-----CGCA-AAT-----T-TT-ACA-----A-GA-T------T--ACA-TAT------T---TT-G--G---G-GC-------A-TA-T------------TTTCCGT--A-A--T-------T-C----A-T-G-T-TT------AA-------C-CA-C-----C---------TT-TT-----------TTTTC--TTC-T---T------T--A---G--A--A------A--TATA----G-ATTT----ACAAT-T-TG-TTA---G-C-A--T--TT-----AAA--AGT-A-----------G---A-----A--AA--A-T-A-TA--G-CAC-T-TTGA--C-TGAC--TT-------TTT--TT----T------CA----T-T--------------------------------------------TTATCG--------TCAAT-TA--TTAATA-AACT-TTCA-C--T-----GAA-----AT--------G---T--T-A---GG-GC--AA----ATA-T-G-C-TTC--TTAT-T---AA------A--A----T----AG--CAA----ATG-TAAACTGT---AA-TTGTTtggtttc
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ----T-AT---TA--C-G-TGT---A-A---A-AA-GC-AAT---TA-T--TTG--GTGTTATT-----T-T---TC--T----C--CA-T----TG-AA-CT---CA-T-A-A--A-GG--TGA--AAAATATATT---GAT-------------------------A-GTG-----AAGTTGT-A-------C-CAAA---Ttgtt
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -G-T-T---A-A-C-A-AA-TC-TA----TA-A--TTT--GTGTT-TC-----T-T---TCA-T----C--AA-T----T--AA-CT---CA-C-C-A--A-tgaca
gi|48                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  C-----T-T---TCA-T----C--AA-C----T--AA-TT---CA-C-A-A--A-GG--TGA--AA-----ATT---GGT-------------------------G-GTG--
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                A-T----G--AA-T----C--AA-CT---GA-T-A-AG-A-GG--TGA--AA-----A------GC-------------------------G-TTG--CCAAAA-TGTTA-------C-CAGA---TA--AAATAAATTTC--CG-A-ATTTAATAA-TC-ATA-----AGAAAT------T--GGA-CAA------G---TC-T--G---T-G--------A-TA-C-----------------------A--T-------TCC----A-T-G-G-CT------AAA------CACA-CATAAACAG-------TT-TT-----------CTT----------------------A---G--A--AT-----A--T-TA----ATATT-----ATA-TTC-TG-TT----G-A-A--A--TT-----AAA--AGT--TA---------A---A-----G--CA--A-T-A-TC--G-CAC-T-TT-AAAC-AGAT--TTTC--TTCTTC--TT----TGTACGACAGTACTATC-TG------T-AA-T-A-CATTAGG--TA-TAA--CC-CCAC-TCAT-GATCGGAAATCACG-T----------AACC-T-CA-CTTT-----GAA-----AAAAAT----G---T--T------------------ATA-T-G-A-TTC--T--T-TC--AG---AAAA--A----T----AG--CTA----A-G-T-GACTGC---AT-aa
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -A-A--A-GA--TAG--A--------T---GGT-------------------------A-GTG--A--AAG-TGT-A-------C-GATA---TG--AAA--ATTT----TGCA-ATC-----A-TT-ATA-----A-AA-T------T--AGA-CAT------T---TT-C--G---G-GC-------A-TA-T------------TGTC-GT--T-A--T-------TTC----A-T-G-T-TTA-----A--------T-CA-C-----C---------TTCTT-----------TTT-C--TTG-T---T------T--A---G------------A--T-TAGAGCAAATTT----ACA-T-A-AG-TT----A-A-A--TA-TTG---AAAAGTAAT-AAT---------A---A-----A--GA--A-T-A-------CACTT-TT-A--C-TGGT--TTTT--T-------------------------CT-TC-TG------T-AA-C-A-T-----G--TA-C-A--CC-CT-C-TTATCAG-------TCAAT-TA--CT--TA-AATT-T-C------------AA-----CA--------G--------A---AA-A---AA----ATATT-A-T-ATT--T--T-T---AA---AA-A--A----T----AA--CAA----A-G-T-att
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              acccgctatgcattcgtctgtgttaagcaatgcaagcatgactggtaaatctgaaatatattcatacacatacacaatcataatataggtagA--TGA--AA-----A-T---AAT-------------------------C-GT---C---AG-TTT----------------------------ATT------TA-ATT-----A----ACA-----A-AAAT------TGAACA-TATC-----T---TT-T--G---A-GCTTAT---A-TA-T------------TTTT-GC--A-AT-T-------TTC----A-T-GAT-TA------A--------C-CA-C-----C---------TT-AT-----------GTT-C--TTC-T---T------T--A---G--A--C------A--T-CATCT-ATATCTCTAAACG-T-C-TGTTT----G-T-G--TCATTG----AAA--AGT-ATA---------A---A-----A--AA--A-TAA-TA--T-CCC-T-Tgggtctaattttttgttt
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ataccctttctatcaaaaaattgcaacgtcaatgctagatttgcaatcatccacataggaaagcaaacataattacaatgctgtttatttttaatcacatattacgttcagcaaaatcaagtatgttggagtagttatcgttcattaactcacaaaagatgaagaatatgggtgcgtgaaagtgtacttaccA--AA-----ATT---GGT-------------------------G-GTG--A--AAT-TGT-A-------C-AGTA---TG--AAA--AA-T----AGCA-GTT-----A-TT-AC------A-AAAT------T--ACA-TAT------T---TT-C--GT--G-C--------A-TA-A------------TTTC-GT--A-A--T-------TTC----A-T-G-T-TTA-----A--------C-CA-C-----ctttt
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    A--AATC----CGCA-ATT-----A-TT-ACA-----A-AA-T------T--ATA-TAT------T---T-----------------------------------------C-GT--A-A--T-------TTC----A-T-G-T-TTTTAAC-A--------C-CAAC-----T---------TT-TT-----------TTT-C--TAC-T---G------T--A---G--A--AT-----A--T-TA----G-ATTT----ACA-T-C-TG-TT----G-C-A--T--TTG---AAAA---GT-ATA---------A---A-----A--GA--A-T-A-TA--G-CAC-T-TT-T--C-TGGCTTTTTT--TT-TTC--TA----TGT---ACAG--CT-TC-TG------T-AA-C-A-T-----G--T
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             gtgataaaacttaattattatgt-----A-AAAT------T--ACA-TAT------T---TT-T--T---G-GC-------A-TA-T------------TTTC-GT--A-A--T-------TTC----A-T-G-T-TT------AA-------C-CA-C-----C---------TT-TT-----------TTT-C--TTC-C---T------T--A---G--A--AT-----A--T-TA----G-ATCT----ACA-T-C-TG-TT----G-C-T--T--TTg
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       c---------A---A-----A--AA--A-T-A-TA--G-CAC-T-TT-A--C-TGAC--TTTT--TT-TTCCCTT----TGT---ACAG--CT-TC-CG------T-AA-C-A-T-----G--TA-T-A--CC-CC---TTATCG-T------TCAAT-TA--CTA-TA-A-CT-T-CA-C--T-----GAA-----AA--------G---T--T-A---AG-G---AA----ATG-T-G-T-TTC--T--T-T---AA---AATA--A----TTAA-AG--CAA----A-G-T-AACTGT---AT-TTCTTtttctgtgtacagcttctgtaacatgtatatacccccttatctgtcatttactataattcattgaaaagttaaggaaactcatatgtg
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ---------A---A-----A--AA--A-T-AATT--G-CAC-T-TC-A--C-CGAC--TTTT--TC-TT----------GT---ATGA--CC-TC-TG------T-AA-T-A-G-----G--TA-T-AATCC-CT-A-TTATCGATC----ACCAAC-C---T---TA-AACT-T-AA----------AAA-----AA--------GAAATAAT-A---TG-A---AA----ATA-T-A-T-Ttgttcc
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aaaaaaaTTT--TT-TTC--TG----TGT---ACAG--CT-TC-TG------T-AA-C-A-T-----GTATA-T-A--CC-CC-C-TTATCTGTC----AT---T-TA--CTA-TA-A--T-T-CA-T--T-----GAA-----AA--------G---T--T-A---AG-G---AAACTCATA-T-G-T-aatctatattactaaattaa
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             caaaattacatattttttggcatattttcgtaatttcatgtttaaccacctttttttcttccttagaatattagatctacatctgttgc-A-T-----G--TA-T-A--CC-CC-C-TTATCGGGC---AGCCTAT--A--TAA-TA-AACT-T-CA-C--T-----GAA-----CA--------G---T--T-A---A----------------------TTC--T--T-T---AA---GATA--A----T----AG--CAATAATA-G-T-AATTGTATAAT-TTGTTg
gi|54                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ac-T-----G--TA-T-A--CC-CC-C-TTATCGGTC---AATTAtgatc
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           C-CC-C-TTATCGGTC---AAT-----TA--CTA-TA-A-CT-T-CA-A--T-----GAA-----AA--------G---T--T-A---AG-G---AA----ATG-T-G-T-TTC--T--G-T---AA---AATA--A----TTAA-AG--CAA----A-G-T-AACTGT---AT-TTGTTctat