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gi|13 : agcgcaacgtattt---T---A-TTATTCCA--T-GTAT--G--AT--A----CTC-C---AAC--CAA----GC-AC----ATCC-A-TCCTTTGAAAA------CTGA-CTCATGCGC-AGT-----T-TATAA-----------------------------------------CTCTC-----GTA--GAATGCA-GCGT--TA--T-T-----------G--GGAA-----GAATTTA-A-ATAT-CACA--AT-ACGTCAAATAA-GA--GTTG----AAA---CT-CT--CCGTTCGAG----T
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gi|25 : ATTGCT-AC----CA-CACTA-ACCCCA-----GTA--GAAAA-A-GGGT--TA--G-T-------------------------GTT------GGTTCATG--AT-ACATT-CATAA-GA--GTTG----ACAG-TTT-CT--TCGTAT-A-----TTG-CAACT-CGG-G-TACTCCGAGTGCGatcggcccgagttcttttggttca
gi|19 : -TACTA-ACCCTC-----GTA--GAAGGCA-GGGT--TA--G-TT----------G--GATA-----CAGTTCA-A-AGAT-CACA--A-----------AATGA--GTTG----AAAC-TCT-CC--CCGTTC-AG----TTG-CAACTCCGA-G-TAGCTCGAGTTCATACTTGGGTACGAAT
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gi|21 : CA-GGAT--CA--GGTA----------G--C-TA-----GCATTGA-A-ATGT-CACA--AT-ACGACACGTGA-TA--GCTG----AAAC-TCG-CT--CCAATC-GG----TTA-T-ACTTCCA-G-TA-TTCA-------ACCCGAGTACGAACCGcccaacta
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gi|41 : ----TTG-CAACT-CGG-G-TTGCCCAAGTTTGTACTTGGGT
2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|37 ): ACTTTATGTTTTGACATATTCAACGACCAATTATTTTGGCGTTCG
Unaligned ( gi|38 ): GATAGCCGAGTCCGTACTCGTCTATGTCGAGTAAATC
Alignments
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Reference ( family-3862 ) : ACGACTTCGGTT-CGTACCCGAGTTAG-TA--GGGTAG------------AT-ATTC-CAA---T---C---T---T---T---G-TTACTCCCNTGTATN--AT--A-CTCC-AAC--CAA----TCAC----AT-CC-A-TCGTTTGAAAA------CTGA-CACATGCGC-AGT-A-CCAT-TACAAGA-CCG-----ACAT-AT---TGCT-ACCN-CAC----TA-ACCCT--CGTAGAA-----GGCA-GG-GT--TA--GT----------CGGGTA-----GAGTTCA-A-ANGTCACA--AT-ACGTCACATAA-GA--GTTG----AAAC-TCTCT--CCGT-TCG-G----TTG-CAACTCCGGGT--AGCTCGAGTTCGTACTCGAGTACGAATCGA
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consensus : ACGACTTCGGTT-CGTACCCGAGTTAG-TA--GGGTAGAT-ATTC-CA----AT-CTTCTTTGTTACTCCCNTGTATA--AT--A-CTCC-AAC--CAA----TCAC----AT-CC-AT-CGTTTGAAAA------CTGA-CACATGCGCA-GT-A-CCAT-TACAAGA-CCG-----ACAT-AT---TGCT-ACC-ACAC----TA-ACCCTCGTAGAA-----GGCA-GG-GT--TA--GT----------CGGGTA-----GAGTTCA-A-ANGTCACA--AT-ACGTCACATAA-GA--GTTG----AAAC-TCTCT--CCGT-TCG-G----TTG-CAACTCCGGGT--AGCTCGAGTTCGTACTCGAGTACGAACCGA
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gi|29 : tttctcacactcagatacttgtaagtCGACTTTAGTT-CGTACCCGAGTTAG-TA--GGGTAGATAATTC-CA----AT-CTTTTTTGTTACTCCCATGTATA--GT--A-CT
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|37 ): ACTTTATGTTTTGACATATTCAACGACCAATTATTTTGGCGTTCG
Unaligned ( gi|38 ): GATAGCCGAGTCCGTACTCGTCTATGTCGAGTAAATC