lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 6666666666 1 3 555555555555555555555555555555 555 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 3333333333333333 2 1 11 66666666666666666666666666666666 1 1111 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2 2222222 11111111 1 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 1 5555555555555555555555555555555555555555555555555555 11 111 111111111 555555555555555555555555555555555555 3333 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 22 77777777777 2222 444444 2 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1 33 222222 11111111 222 22222222 6666666 555555555555 22 11 11111 66666666
lowQualScore : 11 0000000000 2 2 44 88 777777777 444444444444444444444444444444 3 3 9 777 3 2 77 8 555 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 777 4 2222222222222222 777 8888 8888 8 8 6 44 77777777777777777777777777777777 4 2 4 9999 4 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 5 8 4 55 1111111 4 4 33333333 1 3 1 4 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 3 88 3 3 4444444 7777777777777777777777777777777777777777777777777777 555 3 3 33 3 3 333 44 3 44 6666 222222222 6666 2 33 2 333333333333333333333333333333333333 7 33 666 33 9999 6 333 6666 99 2 2 4 33 333 2 22 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 2 4 3 6 22 88888888888 22 2 2 2 333 99 1111 77 333333 55 7 2 2 6666 3 3 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 0 6 6 55 4 7 0 0 3 22 44 44 555555 44444444 777 3 44 1 77777777 0000000 8 999999999999 8 2 777777 11 8888888 11 8888888 2 77777 2 33333333 33
lowQualScore : .. .......... . . .. .. ......... .............................. . . . ... . . .. . ... ................................................................................................................................................................... ... . ................ ... .... .... . . . .. ................................ . . . .... . ..................................................................................... . . . .. ....... . . ........ . . . . ................................................................................................. . .. . . ....... .................................................... ... . . .. . . ... .. . .. .... ......... .... . .. . .................................... . .. ... .. .... . ... .... .. . . . .. ... . .. .......................................................... . . . . .. ........... .. . . . ... .. .... .. ...... .. . . . .... . . ..................................................................................... . . . .. . . . . . .. .. .. ...... ........ ... . .. . ........ ....... . ............ . . ...... .. ....... .. ....... . ..... . ........ ..
lowQualScore : 99 1111111111 2 8 66 55 888888888 555555555555555555555555555555 1 1 2 222 1 5 99 6 000 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 000 0 5555555555555555 000 5555 5555 0 9 8 55 44444444444444444444444444444444 0 0 0 0000 0 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 1 9 4 33 3333333 4 4 33333333 6 3 1 4 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 3 88 3 3 8888888 7777777777777777777777777777777777777777777777777777 888 3 3 88 1 3 888 66 1 22 1111 333333333 1111 9 99 7 777777777777777777777777777777777777 5 44 999 44 1111 2 999 9999 22 2 1 2 11 777 1 99 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1 2 1 0 44 77777777777 99 1 1 1 777 22 4444 55 111111 66 1 4 2 5555 1 3 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 2 0 7 00 4 3 9 3 6 66 22 22 888888 99999999 333 1 22 5 77777777 8888888 0 111111111111 0 7 777777 00 1111111 00 7777777 7 66666 7 33333333 99
consensus : CAACAAANAATACGGG-TCTTGT--GTTTTCT-CAAG--AAG--A---A-----TT----A------GN-----A-----------C-GGA-G-CGGAT--ATTT-ACGA--TG-TACATGT---ATAC--ACAN-T----G-GTATC-T-GGT-A--TCA----CATGCCA--CGT-GC-G---AGTAATACCTG-T--ACCTGGTC--TTGTC--AAAACAAAGG----------ATTA-T-TCTA-ATC----CT--CTCAAT---TTAG---TATG-TGTG-C----TGCTCTGT---C-CA----------AAAA--CTATCG---AAGTTT----GACAAC----TTATCG-GA-AAGGTATAG-TTCT------------GTCT-NA---TCATG--NGTTTTCAACT-A-TAC-ATTTTG-AT-AATGC-ATTGG--GAGAATG---GACTACACAACAGA-CT-TCGA--ACTAAAACCGAGATT-GATGCG-AATTGG--ATG-CGT-TTTATCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGCCTTAAATTCTGG-T-ATC-CGC--CC---GACT-CAA-TAT-T--T-TCACACCCTT-TTTGC-TA-ACGTCCAAGCTTAGGAAANAT-CTAG-GGA-C-------TC------T-----------A---------------ATTC-------------A--AAC-CCTTCGA-ATTTGC-A-TGGATTAAACAA--TG--TTCTCTTT-T-AA-ACA-CCGCGCCGATCTAATATATTT-TACC---G--AA---TTAGCGGA-C-AC--AAACCT-TTCGA--AT-TTG--C-G--TGGA---------TT----TT-A--CAA-TG--------------A------ATT---TA-------A-GA--AAA---GT--TGAT--GAATNA---A----AAT--GG-TTCTT-T-A-TA---T-T--TTGA-G-----AA-------------AA------------------AAAAA---A-----AATATA-AC-GGC-ACGCCACAT-GTC--AT-GCT--A-CTA-TCA-TTTGG---AAAAAT-ATATN-A--TTTA-CTAT-CG--TC-TCA-T-GGAA----ATAA-ATA-AAAT--------ATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCAATTTTGAATGGAAACCAATCTTCAAT--AGTG-ACAT-GATT-TTT-ATATAA--TTC--TGAA-GA-GGTATTGATAT---AATACCT-GAACTA-TC--GCA--AN-A--CATTAAC--ACG-CACTGTT-CC-T-TCGTGAT--TCCAAC-AT-A------CAGG-TA-------TA--CA-------TA-TATTATATTT---TG-TGCT--TTAT-ACTAAA--CGCTAGT
Reference ( gi|1 ) : CAACAAACAATACGGACTCTTGCCAGTGTTCTACAAG--AAG--A---A-----TT----A------GA-----A-----------C-GGA-G-CGGACCGATTT-ACGA--TG-TACATGT---ATAC-TACATGTA--GG-GTATC-T-GGT-G--T-A----CAT------CGT-GC-G-TTAG--ATACCTG-T--ACCTGGTCG-TTGTC--AAAACAAAGA----------ATTA-T-TCTA-ATCAA-ACT--CTCAAG---TTAG---TAT--TAT--T----TGCTCTGT---C-CA----------AAAA-ACTATCG---AAGTTT----GACAAC----TTATCGTGA-AACGTATAG-TTCT------------CTCT-TA---TCATG-AAGGTTTCAACT-A-TAC-ATTGTG-AT-ATTGC-ATTGG--GAGAATG---AATCATACAACAGATCTATCGACCACTAAAACTGAGATT-ACTCCGAAATTGGCAATATCGTATTTATCCTTTTCTCCTCTGCTCGACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGCCTTAAATACTGG-T-ATC-CGC--CC---GACT-CAA-TAT-T--T-TCACACCTTT-TTTGC-TAGACGTCCAAGCTTAGGAAACAT-CTAG-GGA-C-------TC------T-----------A---------------AT---------------A--AAC-CCTTCGA-ATTTGC-A-TGGATTAAACAA--TG--TTCTCTTT-TAAA-ACA-CCG-GCCGA-CTAATATATTT-TACC--TA--AA---TTAGCGGA-C-AC--AAACCT-TCCAA--AT-TTG--C-G--TGGA---------TT----TT-A--CAA-TG--------------A------ATT---T--------A-GA--AAA---GT--TGG---GAATGA---A----AAT--GG-TTTTT-T-A-CA---T-T--TTGA-G---AAAA-------------AA------------------AAAAA---A-----AATATA-AC-GAC-ACGCCACATCGTCA-ATAGCT--A-CTA-TCA-TTTGG---AAAAAT-ATATT-A--TTTACCTATGCG--TC-TCA-TAGGAA----ATAA-ATA-AAATGATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCAGTCTTCCAT--AGTG-ACAT-GATT-TTTGATATAA--TTC--TGAA-GA-G-TATTGATAT---AATACTTTGAACTA-TC--GCA--AC-A--CATTAATCAACG-CACTGTT-CC-TGTTTTGATGATCCAAC-AT-A------CAGC-TA-------TA--CA-------TA-TATTATATGT---TG-TGCTAATTATAACTAAA--CGCTAGT
gi|17 : CAACAA-CAATACGGG-TCTTGT--GTTTTCT-CAAG--AAG--A---A-----TT----A------GA-----------------C-GGA-G-CGGAT-------------------ATGT---ATAC--ACAAGTATCGG-GTACA-T-GTA-T--T-A----CATGCCA--CGT-GC-G---AGTAATACCTG-T--ACCTGTT---TTGTC--AAAACAAAGG----------AT-A-T--CTA-ATCA---CTG-CTAAAT---TTAG----AT--TATGTC----TGCTCTGT---C-CA----------AAA---CTATCG---AAGTTT----GATAAC----TTATCG-GA-AAGGTATAG-TTCTG-----------CTCT-AA---TCATG--AGCTTTCAACT-A-TAC-ATTTTG-AT-A-TGCGATTGG----GAATG---A--TATAC-ACAGA-CT-TCGA--AC-AAAACTTA-ATTGGATGCG-AATTGG--ATG-CGT-TTTATC
gi|2 : aAACAAAGCATACGGG-TCTTGT--GTTTTCT-CAAG--AAG--A---------TT----A------GA-----------------C-GGA-G-CGGATT-ATTT-ACGA--TG-TACATGT--------TACA-------A-GTATCAT-GGT-AT-T-A----CATGCA---CGT-GC-G---AGTAATA-CTG-T--ACCTG--TA-TTGTC---AAACAAGG-------------TA---TCTAGAT----ACTG-CTC-AT---TTAG----AT--TAC--TGTCATGCTCTGT---C--------------AAA-ACTATCG---AAG-TT----GACA------TTA---TGG-AAGGTATAG-TT-T------------GTCT-AAT--TCAT---CGATTTCAACT-A-TACTATTTTGAAT-AATGG-ATTGG--GAagtcttgt
gi|13 : aAACAAAAAGTACGG--TCTTGT--GTTTTCT-CAAG--AAG--A---A-----TT----A------GT-----A-----------C-GGA-GGCGGAT--ATTT-AC-A--TGCTACATGT---ATAC--ACAACT-------TATC-T-GGT-A--TTA----CATGCCAC-CGT-GC-G---AGTAATACC-G-TTAACCCAGT---TTGTC--AAA-CAAAGG----------AT-A-T--CTA-ATC----CTTGCTCAAT---TTAGATATATG-TGT--C----TGCCTTGT---C-CA----------AAAA---CATCG---AAGTTT----GACAAC----TTATCG-GA-AAGGTATAGTTTCT------------GCCT-CAAATCCATG--CGTTTTCAACT-ATTAC-ATT-TT-AT-AATGC--------------G---GACTACACA--AGA-CT-TCGA--ACTAAA--CGAGATT-attacttcgaactaagctgaattggatgcgttttaatcatacttgtaccaatacatgatcgaagttgtgcatgagtttctccatattgacacagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcttcgtcctaaatctggatatctgccgatcaatattttcacactttttttgctaacgtcgcctaggaactcctagggacatagatttcttttgtttgacgaaaaaaccttcgaatttgcaatggattaaaacatgtttttttacacgacgatctaatatattttacctagaattagcgacacaaacttccaatttgcgtggattttacatgtttaagaaaatgttgatgattgaaatggttttttaacatatttgagaaaaaaactatacgaaacgtaacatgttatagtactacatttggaaaatattaatttatatctgtctcatgagaataagataaaatatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaatcttcatagtgaacatattttataattctgaagaggtattgaattaatattgaactatgaaacttaacacagcatggttcctttgtgatccaacatacggtacatatattatttttgtgctttactaacgct
gi|12 : aAACAAAAAGTACGG--TCTTGT--GTTTTCT-CAAG--AAG--A---A-----TT----A------GT-----A-----------C-GGA-GGCGGAT--ATTT-AC-A--TGCTACATGT---ATAC--ACAACT-------TATC-T-GGT-A--TTA----CATGCCAC-CGT-GC-G---AGTAATACC-G-TTAACCCAGT---TTGTC--AAA-CAAAGG----------AT-A-T--CTA-ATC----CTTGCTCAAT---TTAGATATATG-TGT--C----TGCCTTGT---C-CA----------AAAA---CATCG---AAGTTT----GACAAC----TTATCG-GA-AAGGTATAGTTTCT------------GCCT-CAAATCCATG--CGTTTTCAACT-ATTAC-ATT-TT-AT-AATGC--------------G---GACTACACA--AGA-CT-TCGA--ACTAAA--CGAGATT-ggatgccgtcttatcattcttgtacaaacaatacatgcatctaagttagctgcatcggatttcctcaatatcaactgacatag
gi|11 : aAACAAAAAGTACGG--TCTTGT--GTTTTCT-CAAG--AAG--A---A-----TT----A------GT-----A-----------C-GGA-GGCGGAT--ATTT-AC-A--TGCTACATGT---ATAC--ACAACT-------TATC-T-GGT-A--TTA----CATGCCAC-CGT-GC-G---AGTAATACC-G-TTAACCCAGT---TTGTC--AAA-CAAAGG----------AT-A-T--CTA-ATC----CTTGCTCAAT---TTAGATATATG-TGT--C----TGCCTTGT---C-CA----------AAAA---CATCG---AAGTTT----GACAAC----TTATCG-GA-AAGGTATAGTTTCT------------GCCT-CAAATCCATG--CGTTTTCAACT-ATTAC-ATT-TT-AT-AATGC--------------G---GACTACACA--AGA-CT-TCGA--ACTAAA--CGAGATT-ggatgccgtcttatcattcttgtacaaacaatacatgcatctaagttagctgcatcggatttcctcaatatcaactgacatag
gi|26 : aAACAA-CAACACGGG-TCTTGT--GTTTTCT-CAAG--AAC--A---A-----TTCCTCG------GA-----ATCAATTAGG--C-GGA-G-CGGAT--ATTT-ACGA--TG-TACATGT---ACA-------------A-GTATC-A-GGT-AT-T-A----CATGCCA--CGT-GC-G---AGTAATACCTG-T--ACCTG--TA-TTGTC--AAAACAAAGG----------ATTggatgccgtcttatcattcttgtacaaacaatacatgcatctaagttagctgcatcggatttcctcaatatcaactgacatag
gi|25 : aaAACAA-CAACACAGGGTCT-GCT-GTTTTCT-CAAG--AAC--A---A-----TT----ACCTTCGGA-----ATCAAATATAGGC-GGA-G-CGGAT--ATTTTACGA--TG-TACA--T---ATGT-CACA-------A-GTATC-A-GGTAA--T-A----CATGCCA--CGT-GC-G--CAGTAATACCTT-T--ACCTG--TA-TTGTC--AAAACAAAGtgctttcgaataca
gi|3 : aAAACAACACG---TCTTGTT--TGT-CTTCAAG--AAG--A---AATTCCTT----G------GATCTATA-----------CCGAA-G-CGGAT--ATT--ACGAACTG-TACAT-------AC--ACAAGTA--TCCGTATC-A-CAT-G--CCA----CAG------C----C-G---AG--TTACCTG-T--ACCTG-TC--TTGTC--CAAACAAAGATTGCTTTCGCACTAATATCTA-ATCA---CT--GTTAAT---ATAG---AAT--TATG-TG---TGCATTGT---T-CT----------CAAA--CTAT-G---AAGTTT----GACAA-----TTATCG-GA-TA-GTATAT-TTCT-------------TCT-AA---TCATATGAGTTTTCAACT-A-TAT--TTTTG-AT-AT-G--ATAGG--GATAAgtatttgctc
gi|28 : aaGTTTTCTACAAAGAAAG--AGATA-----TT----GTT----AA-----A-----------C-GGAAG-CGGAAATATCT-TCGAATTG--ACTTGTTNNNNNN-NNNNNNNN--NN-NNNNN-N-NNN-N--N-N----NNN------NNN-NC-G-TT---------TG-T--AACTG-TC--TTGTC--AAAACAAAGA------------TA---TCTA-ATC---ACTG-CTCAAT---TTAG---aacacacgaccactggatctttatcagtcttgtacacacatatcaattggccgtattatttcgtttaaaaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccccttaactggatatcgccgacttcaatatagttcacaccattttcctagacgtcgagctaaaaatagagactcattctttattgcgaaccttcgacatttcatggattacgcgccgatcttgtttatacccagaattagcgacacaaccattcgaatttgcttggataccagtgcttttatgtaaaatttaagaaaagttaatgaattaaattggttctttatatttattgaacataaaattacgttataattagaaaaaaaatataacgcacgcacatgttctactatatttggaaaaaatattaatttgtatcgtttctcatgca
gi|19 : ttgtTTCT-CAAG--AAG--A---A-----TTT---A------GG-----A-----------C-GGA-G-CGGATC--TCT---GA--TG-TACATGT---ATAG-TA-ACACC--AA-GTATCTT-GGT-GCCT-ATTACCATGACCA-CGT-GCGG-GTA---ATACCTGTT--ACCGTGCCT-TGGTCAAAAAACAAAGG----------A-TA-G-TCTA-ATCACTGCT--TTCCAGTATTTAA---TATAATGT--TCC--TGCTCTGTATCC-CACACATATTACAAAATACT-CCGAACAAGCTCTGTAGACAACCAGTTTATATCGA-AAAGTATA--TTCTG-----------CTCT-AA---GCATG-A---TTTCAACTGA-TAC-ATTAT--AT-Aat
gi|23 : gttttAG--AAATCA---A-----TT----A------GG-----------------T-GGG-G-CGGAT--ATTT-ACGA--TG-TAC-------ATAC--ACAT--------GTATC-T-GGT-T--TCA----CATGCCA--CGT-GC-G---AGT-ATACTTG-T--ACCT-GTC--TTTTT--AAAACAAAGG----------ATTg
gi|29 : agaaagcacgggcgtagtattttttaacagcaattcttAG--AAATCA---A-----TT----A------GG-----------------T-GGG-G-CGGAT--ATTT-ACGA--TG-TAC-------ATAC--ACATGTA--TG-----C-T-GGT-T--TCA----CATGCCCAACGTGGC-GAGTAA--ATA-CTG-T--ACCT-GTCGCTTTTT--AAAACAAAGtgctttaggtgtgtatatctcccagttgattcgaggaatagaagatt
gi|15 : aagaaagcacgggcgtagtattttttaacagcaattctt--A---A-----TT----A------GG-------------------GGA-G-CAGAT--ATTT-ACGA--TG-CACATGC---ATA-------------G-GTATC-TTGGA-A--TCA----CATGCCG--CGT-GC-G---AGTAATACCT-----ACCTG-TC--TTGTC--AAAATAAAG------------TCA----CTA------------CTCAAT---TTAG----AT--TATGTC----TGTTCTGC---T-CA----------AAA---CTATCG---AAGTTG----AACAAT----TTATCG-GATAATG-ATAT-TTGT-------------TCC-TA---TCATG-AATA-CTCAACT-A-T----TTG-G-AT-A-TGCGATTGG----AAATA---A--CATGC-ACGGA--CATCGA--AC-AAAACT-AAATT-
gi|34 : aaaaaagaagcacaggccttctattttctcaaggacaagtccttggaatcGA--TG-TACATGT---ATACATACATggatgcgttttctccgccatgtacacgcatatcgaagtaggccgtgtgatttcctcaaatatcacacaca
gi|21 : atcattctaagtcggttttaaattacctgaactatcacattacataaacactgttcctttgtgatttcaatataAT--TATGTC----TGTTCTGT---C-CA----------AAA----TATCG---AAGTT-------CAAC----TTAACAGGATAAAGGAT---TTGT-------------TCTATA----CATG-A---TCTCAA-T-A-----ATTGTG-ATAATTAT-ATGCGATGAGTATGTATGATCATAtctattttgtacttatcctacacgct
gi|47 : agataaccctaccagttttagaa----TGCTATGT---CTCA----------AA----CTATCG---AAGTTT----GACAAC----TTATCGggcttcaaaacaaaacgaatgggtgtgttttctctatcttgtgcacaacaatatgatatcgaaagtaggccgtttgaagctcctcaat
gi|4 : caagtttcagGTATAG-TTCTTCTTAGCACTATCTCT-AA---TCA-G-GAGTTTTCAACC-A-TAT-ATTTTG-AT-A-TGCGATT----AAGAAT----AAT-ATAC-ACGGA-CT-TCGA--AC-AAAACTGA
gi|2 : aaCGTCCTAAAT-CTGGAT-ATC-TGC--C----GA-T-CAA-TAT-T--T-TCACACTTTT-TTTGC-TA-ACGTC---GCCTAGGAA-CTC-CTAG-GGA-CATAGATTTC------TTTTGTTTGACGA---------------A----------------A--AAA-CCTTCGA-ATTTGC-AATGGATTAAAACA--TG--TTTTTTT-------ACA-C---GACGATCTAATATATTT-TACC--TAG-AA---TTAGC-GA-C-AC--AAA-CT-TCC-A--AT-TTG--C-G--TGGA---------TT----TT-A--C-A-TG----------------------TT---TA-------A-GA--AAAT--GT--TGA---TGATTG---A----AAT--GG-TTTTT-TAA-CA---TAT--TTGA-G----------------------------------------AAAAA---A-----ACTAT--AC-GAA-ACGTAACAT-GTT--ATAG-T--A-CTA--CA-TTTGG---AAA----ATATTAA--TTTA--TATCTG--TC-TCA-T-GAGA----ATAAGATA-AAAT--------ATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAATCTT-CAT--AGTGAACAT--ATT-T----TATAA--TTC--TGAA-GAGG-TATTGAATT---AATA--TTGAACTA-T---GAA--AC------TTAA-CACAG-CATGGTT-CC----TTTG-TGATCCAAC-AT-A------CGG-----------TA--CA-------TA-TATTAT-TTT---TG-TGCT--TT---ACT-AA--CGCTatgaatgtcgtttctatcagtctttgttacacacatatcctgaaattgtcgtagaaccttcatcatcaactctctcgtctccccttctcctcgtcaatctctctccctctctctcttctccatcccctcctccctcctcctcgtgctctgcccttaaatctcggtatttgcggtagactcaagtattcctcacacctttggctagacgccaagcttagagaactcggggacctaattccttttgtggcgaaaaacgccttcgaatttggatggattaacaaattttctttcttaaacgcaccgattgaatatatttaccaaacatttagcgtacacaaccctgttcgaccatctttcaatgaattggcattacaatgttctttctattaaagaataaaaatggttgattgaagtaaatagttttctatatttggggggggggggggcacggcggacatcacgacggccacgcccacattgttacctatcatttgaaaaaaaaaaatttactgagtcgtctcatggaaataaa
gi|5 : aaacaaagcatacgggtcttgtgttttctcaagaagattagacggagcggattatttacgatgtacatgttacaagtatcatggtattacatgcacgtgcgagtaatactgtacctgtattgtcaaacaaggtatctagatactgctcatttagattactgtcatgctctgtcaaaactatcgaagttgacattatggaaggtatagtttgtctaattcatcgatttcaactatactattttgaataatggattgggaattacttcgaactaagctgaattggatgcgttttaatcatacttgtaccaatacatgatcgaagttgtgcatgagtttctccatattgacacagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcttGCCTTACAT-CTG--T-ATC-TTC--TCTCTGACT-CA----T-T--TATCGTATCTTA-TTC-------CATATAA--TTAGGGAATATTCTTT-TG--T-------TC------G-----------A---------------AA---------------AC-AAC-CCTTCGA-ATTTGCTA-TGGATTAA-CA---TA--T-----------------CCG-ATCAA--TAATATATTT--ACC--TAGAAA---TTAGCGGAGC-AC--AAACCT-TCCAA--TT-CTG--C-G--TGGA---------TT----TA-A--CAA-TG--------------A------ATTAAAG--------A-GA--AAA---GTAGTAT---GATGGA---A----AAT--GT-TTCTT-T-A-TAAATT-T--TTGA-G------A-------------AA------------------AAAAA---A-----AATATA-AC-GAC-ACG-CACAT-GTCT-ATAGCTTAA-CTATTCA-TTTGG---AAAAA--ATATT-A--ATTAC--AT-CG--TC-TCA-T-GGAA----ATAA-TTA-
gi|4 : CCTTAAATCTCGG-T-ATT-TGCGGTA---GACT-CAAGTAT-T--CCTCACACCTTT-G--GC-TAGACG-CCAAGCTTAGAGAAC-T-C-GG-GGA-C--------C------T-----------A---------------ATTCCTTTTGTGGCGAAA--AACGCCTTCGA-ATTTGG-A-TGGATTAACAAA--TT--TTCTTTCT-TAAACGCA-CCG-ATTG----AATATA-TT-TACC---A--AACATTTAGCGTA-C-AC--AACCCTGTTCGACCATCTTT--CAA--TGAA---------TTGGCATT-A--CAA-TG--------------T------TCT---TTCTATTAAA-GAATAAA---AA--TGGTT-GATTGAAGTA----AAT--AG-TTTTC-T-A-TA---T-T--TGGG-G---GGGG-------------GG------------------GGGGC---ACGGCGGACATC-AC-GAC-G-GCCACGCC--CACATTGTT--ACCTA-TCA-TTTGA---AAAAAA-AAA---A--TTTACTGAGTCG--TC-TCA-T-GGAA----ATAA-Atatatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctagcttcttggtgcgagctaacactcgccatcatccccacgatccattaagtgactgattttatataaatctctgaaagaggtcataactagtcgcatcaagcattaacacgcactgctccctgtgatctccaacattacaggagatacatatattatatttatgtgcttatactaaaaccgctagta
gi|3 : aagtatagttcttcttagcactatctctaatcaggagttttcaaccatatattttgatatgcgattaagaataatatacacggacttcgaacaaaactgaatgaatgtcgtttctatcagtctttgttacacacatatcctgaaattgtcgtagaaccttcatcatcaactctctcgtctccccttctcctcgtcaatctctctccctctctctcttctccatcccctcctccctcctcctcgtgctctgcCCTTAA---CTGGAT-ATC--GC--C----GACTTCAA-TATAG--T-TCACACCATT-TTC-C-TAGACGTC-GAGCT----AAAAAT---AG-AGA-C-------TCATTCTTT-----------A---------------TT---------------GCGAAC-C-TTCGACATTT-C-A-TGGATTA--------------------------CG-C---GCCGATCT----TGTTTATACC--CAG-AA---TTAGCG-A-C-AC--AA-CCA-TTCGA--AT-TTG--C-T--TGGATACCAGTGCTT----TT-ATGTAA-----------------A------ATT---TA-------A-GA--AAA---GT--TAAT--GAATTA---A----ATT--GG-TTCTT-T-A-TA---T-TTATTGA-ACATAAAATTACGTTATAATTAG------------------AAAAA---A-----AATATA-AC-G-C-ACG-CACAT-GTT------CT--A-CTA-T-A-TTTGG---AAAAA--ATATTAA--TTTG--TAT-CGTTTC-TCA-T
gi|10 : aaaaacaacacgtcttgtttgtcttcaagaagaaattccttggatctataccgaagcggatattacgaactgtacatacacaagtatccgtatcacatgccacagccgagttacctgtacctgtcttgtccaaacaaagattgctttcgcactaatatctaatcactgttaatatagaattatgtgtgcattgttctcaaactatgaagtttgacaattatcggatagtatatttcttctaatcatatgagttttcaactatatttttgatatgatagggataaaacacacgaccactggatctttatcagtcttgtacacacatatcaattggccgtattatttcgtttaaaaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccCTTAAAT-CTGG-TTATCTCGC--C----GACT-AAA-TAT-AAAT-TAACACATTT-TTTGCCTAG-----TAAACTC-GGCGACCC-CTAA-TTC-C-------TT------T-----------T---------------GTTGCGA----------A--AAC-CCTTCGA-ATTTGC-A-AGGATTAAATAAATTGAATCCTGTTTCTTAA-ACA-CCC-GCCGATCTAATATACTT-TACC--AG--GA---ATAGCGGA-TAAC--AACCCT-TCC----AC-TTGCTC-G--TGGA---------TT----TT-A--CAG-TG--------------A------ATT---TAA------A-GA--AAA---GT--TG------ATGA---ATATTAAT--GG-TGTTTAT-A-T----T-T--TTG-----------------------AA------------------AAAAT---A-----AATATA-AC-GGC--CGCT-CAT-GT------G-T--A-CAA-TCA-TTTAG---AAAAAA-ATATT-AC-TTTACgca
gi|8 : TTAAATTCTGG-T-ACT-CGC--CC---GACT-CAA-TTA-T--T-TCACACCCTTGTTTGC-T------------TTAGGAAAAAT-CTAG-GGAAC-------TT------T-----------A---------------ATTCTTTTGTGCG----A--AAA-CCTTCGA--TTTGCCA-TGGATTAAACAA--TG--CTCTCTTT-TTAA-ACATTCGCGCCGATCTAAT-----------------AA---TTAGCGGA-C-ACAAAAACCT-TTCCA--AT-TTG--C-A--TGGA---------TT----TT-A--CAA-TG--------------A------ATT---TA-------A-GA--AAA---GT--TGAT--GAATGA---A----AATGCGA-TTTTT-T-A-CA---T-T--TTGA-G-----------------------------------------AAAA---A-----AATATA-AC-GACAACGGCACAT-GTCT-AT-GCT--A-CTA-TCA-TTTGG---AAAAAT-AT-TA-A--TTTA-CGATTCG--TCTTCA-T-GGAA----ATAA-ATA-AAtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaattcaatggaaaaaaacccttttcaaaatgacatgagttttatataatttcgtgaagagatattatacatt
gi|7 : TTAAATTCTGG-T-ACT-CGC--CC---GACT-CAA-TTA-T--T-TCACACCCTTGTTTGC-T------------TTAGGAAAAAT-CTAG-GGAAC-------TT------T-----------A---------------ATTCTTTTGTGCG----A--AAA-CCTTCGA--TTTGCCA-TGGATTAAACAA--TG--CTCTCTTT-TTAA-ACATTCGCGCCGATCTAAT-----------------AA---TTAGCGGA-C-ACAAAAACCT-TTCCA--AT-TTG--C-A--TGGA---------TT----TT-A--CAA-TG--------------A------ATT---TA-------A-GA--AAA---GT--TGAT--GAATGA---A----AATGCGA-TTTTT-T-A-CA---T-T--TTGA-G-----------------------------------------AAAA---A-----AATATA-AC-GACAACGGCACAT-GTCT-AT-GCT--A-CTA-TCA-TTTGG---AAAAAT-AT-TA-A--TTTA-CGATTCG--TCTTCA-T-GGAA----ATAA-ATA-AAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccaatcttcaataggacattgaattttatataattctgaaagaggtattgatataatacttgaactatcgcacaaacattaacacgcactgttgcctttgtgattcaaccatacaggtatatacatatattatattttgtgctttatactaaacgcttag
gi|6 : TTAAATTCTGG-T-ACT-CGC--CC---GACT-CAA-TTA-T--T-TCACACCCTTGTTTGC-T------------TTAGGAAAAAT-CTAG-GGAAC-------TT------T-----------A---------------ATTCTTTTGTGCG----A--AAA-CCTTCGA--TTTGCCA-TGGATTAAACAA--TG--CTCTCTTT-TTAA-ACATTCGCGCCGATCTAAT-----------------AA---TTAGCGGA-C-ACAAAAACCT-TTCCA--AT-TTG--C-A--TGGA---------TT----TT-A--CAA-TG--------------A------ATT---TA-------A-GA--AAA---GT--TGAT--GAATGA---A----AATGCGA-TTTTT-T-A-CA---T-T--TTGA-G-----------------------------------------AAAA---A-----AATATA-AC-GACAACGGCACAT-GTCT-AT-GCT--A-CTA-TCA-TTTGG---AAAAAT-AT-TA-A--TTTA-CGATTCG--TCTTCA-T-GGAA----ATAA-ATA-AAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccaatcttcaataggacattgaattttatataattctgaaagaggtattgatataatacttgaactatcgcacaaacattaacacgcactgttgcctttgtgattcaaccatacaggtatatacatatattatattttgtgctttatactaaacgcttag
gi|9 : TAG-T-ATC-CTCG-CC---GACT-AAA-TAT-T--G-T----------TGTGC-TA-ACGTCCAAGTTTAGGAAA--T-TCGG-GAA-C-------TC------T-----------AGTTCTTTTGTTGCATAT---------------A--AAC-CCTTCGA-TTTTGC-A-TGGATTAAACAA--TGC-TTCTTTCT-T-AA-ACA-ACGCGTCGATCTAAT-TATTTGTACT--AG--AA---TTAGCGGA-C-AC--AACCCT-TT-----GT-TTT--T-GATTGGA---------TT----TTAA--CAAGTGTTGTTTATTTGAAAA------ATTA--G--------A-GA--AAA---GT--TAGTATAAATTA---AG---AAT--GG-TTCGT-T-ATTA---T-T--CTAA-G---AGTA-------------AT------------------ATAGT---ATT---AGTATATACAGCC-ACG-CACAT-GT-------CT--A-TTA-TCA-TTTGGAAAAAAAATAATATA-AG-TCCACC-A-GCG--T--TCA-GAGG-A----ATAA-ATA-AAGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccaatcttcaataggacattgaattttatataattctgaaagaggtattgatataatacttgaactatcgcacaaacattaacacgcactgttgcctttgtgattcaaccatacaggtatatacatatattatattttgtgctttatactaaacgcttag
gi|24 : actTCCAAGCTTAGGAAAC-T-C-AG-GGA-C-------TC------T-----------A---------------CTTC-------------A--AAC-CCTTCGA-ATTTGC-A-TGGATTACACAA--TG--CTCTTTCT-T-AA-ACA-CCGTGTCGATCTAATATATTT-TACCCATA--AA----TAGCGGA-C-A---ATATCC-TTCGA--AT-TTG--C-G--TGGA---------TT----TT-A--CAA-TG--------------atactatgtctaacgtgatagaacaataggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntccattttcaatggaaaaactttcaatagtgaaatgatttgaggaggtatta
gi|22 : AT-TTAGCGGA-C-------AC------------------------------------------------------AGC-CCTTTGA-ATTTGC-G-TGGGTTTTACAA--TG--T--TCTTT-TAAA-ttctggtgaataagaacataagtt
gi|20 : tgaaacaggtctctgtgtctaatatttttaccctg---------------A--AAC-CCTTCGA-ATTTGC-A-TGGATTA--------------------------CG-C---GCCGA-TCTAT-TGTTT-TACC--CAG-AA---TTAGCGGA-C-AC---AACCA-TTCGA--AT-TTG--C-T--TGGA---------TT----TT-A--CCA-TGTGCTTTTATTTAAAA------ATT---TA-------A-GA--AAA---GT--TAAT--GAATTA---A----ATT--GG-TTCTT-T-A-TA---T-T--TTGA-A---ATAA-------------AATATAACGTTTATAATTAGAAATA---A-----AATATA-AC-GGC-ACG-CACAT-GT-------CT--A-CTA-TCA-TTTGG---AAAAA--ATATTAA--TTTA-GTAT-CG--TC-TCA-Ttaagaaaagttcatgaattaaaatggttttctatattttgaaaatatatatatataacggcacgcacatgtctactatcgtttggaaaaatattaatttactatcgtctca
gi|22 : gaa-CTAATAT-TTT-TACCC-TG--AT---TTAGCGGA-C-AC--AGCCCT-TT-GA--AT-TTG--C-G--TGGG---------TT----TT-A--CAA-TGTTCTTTT-------A------AAT---A--------A-GA--AAA---GT--TCAT--GAATTA---A----AAT--GG-TTTTC-T-A-TA---T-T--TTG--------AA-------------AA------------------TATAT---A-----TATATA-AC-GGC-ACG-CACAT-GT-------CT--A-CTA-TCG-TTTGG---AAAAAT-AT-TA-A--TTTA-CTAT-CG--TC-TCA-g
gi|38 : tgaaacaggtctctgtgtT-TTG--C-G--TGGA---------TT----TT-A--CAA-TG--------------TTCTTTTATT---C--------A--A--TCA---TT--TAA---AAA--A---A----AAC--GT-TTCTT-T-A-TG---T-T--TTGA-------------------------------------------AAAATTTA-----GATATA-AC-GAC-ACG-CACAT-GTCT-AT
gi|37 : T----TT-A--CAA-TG--------------A------ATT---T--------AAGA--AAA---GT--TGAT--GACTGA---A----AAT--GA-TTTTT-TTA-CA---T-T--GTGA-G---AAAA-------------AA------------------A---------------TATA-AC-GAC-AGGC-ACAT-GTCT-ATAGCT--A-CTA-TCA-TTTGG---AAAcatt
gi|14 : -TA--------------A------ATT---T--------AAGT--AAA---GT--TGAT--GGATTA---A----AAC--GG-TTCTT-T-A-TA---T-T--TTGA-A---AAAA-------------A---------------------------A-----AATATA-AT-GGC-ACG-TATAT-GT-------CT--A-CTA-TCT-GGTGG---AAAAAT-ATA-A-A--TTTA-CTAT-CG--TC-TCG-T-GGAA----ATAA-ATT-AGAT
gi|18 : ct--------------A------ATT---T--------ACGA--AAA---GT--TTAT--GAACCA---A----AAT--GG-TTCTT-T-A-TA---T-T--TTGA-atatatatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaaaaactttcaatagtgataggatttatataattctgaagaggtattaaaatacctgatctatcgaacaacattaacacgtactgttcctttgtgattccaacatagaggtatgcatacagtgtatattatgttttgtgtctatactaaacgctagt
gi|35 : tt--------A-GA--AAATATGT--TG-----AAT-----A----AAT--GGGTTCTT-T-A-CA---T-T--T------------------------------------------------------------GTAT---C-G-C-ACGC-ACAT-GTC-------T--A-CTA-TCA-TTTGG---AAAACC-AAATTGA--TTTA-CTAT-TG--TC-TCACTA--AA----ATAA-ATT-AAAacggcacgcatatttgggaaaaataaatttactatagccttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgaaatcttttaatagtgacataattctgaaaagatatttagaatacgtgaactctcatgcaacatgaacaccgctccttcgtgattcaacaaacaggtac
gi|39 : aatgAATTA---A----AAT--GG-TTCTT-T-A-TA---T-T--TTG-------AAA-------------TA------------------TATAT---A-----TATATA-AC-AGC-ACG-CACATT-T-------CT--A-CTA-TCA-TTTGT---AAAAAT-AT-TT-A--TTTA-CTAT-CG--TC-TCA-TGG
gi|16 : A---A----AAT--GG-TTCTT-T-A-TA---T-T--T-------------------------AA------------------AAAAA---A-----TATATA-AC-GGC-ACGC-ACAT-GTC-------T--A-CTA-CCT-TGTGG---AAAAAT-AT-TA-A--TTTAC-TAT-CG--TG-TCA-TGAAAATTAAATAA-ATATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCAATTTTGAATGGAAA--AACTTTCAAT--AGTG-ACAT-GATT-TT--ATATAA--TTC--TGAA-GAGG-TATTAA-AT-----TACCT--GACTA-TC--G-A--ACAA--CATTAAC--ACGCCACTGTT-CC-T-TTGTGAT--TCC----------------------------TA--CA-------TATTATTAT-T-T---TGATGC---TTAT-ACTAAG--CGCTAG
gi|40 : tTCTT-T-A-TA---T-T--TTGATG---AAAA-----------------------------------AAA---A-----AATATA-AC-AGC-ACG-CACA---------AGT-----CTA-TCA-TTTGG---AAAATT-TCA---A--ATTACC-AT-CG--TC-TCA-T-GGAA----ATAA-ATA-c
gi|41 : AAA---A-----TATATA-ACTGGC-ACGC-ACAT-GTC-------------TA-TCA-TTTGG---AAA----ATATT-AATTTTAACTAATCGC-TA-TCA-TGGAAT----ATCA-ATA-g
gi|43 : gcgaattaacattctAC-ACGC-ACAT-GTCT-ATAGCT--A-ATG-TCATTTTGA---AAAAAA-ATATTAA--TTTA-CTAT-CG------AA-TAAGAT----ATAA-TTA-
gi|8 : ACCAATCTTCAAT--AG-G-ACATTGAAT-TTT-ATATAA--TTC--TGAAAGA-GGTATTGATAT---AATACTT-GAACTA-TC--GCAC-AA-A--CATTAAC--ACG-CACTGTTGCC-T---TTG-TGATTCAACCAT-A------CAGG-TA-------TATACA-------TA-TATTATATTT---TG-TGCT--TTAT-ACTAAA--CGCTt
gi|7 : ttaaattctggtactcgcccgactcaattatttcacacccttgtttgctttaggaaaaatctagggaactttaattcttttgtgcgaaaaccttcgatttgccatggattaaacaatgctctctttttaaacattcgcgccgatctaataattagcggacacaaaaacctttccaatttgcatggattttacaatgaatttaagaaaagttgatgaatgaaaatgcgattttttacattttgagaaaaaaatataacgacaacggcacatgtctatgctactatcatttggaaaaatattaatttacgattcgtcttcatggaaataaataaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACCAATCTTCAAT--AG-G-ACATTGAAT-TTT-ATATAA--TTC--TGAAAGA-GGTATTGATAT---AATACTT-GAACTA-TC--GCAC-AA-A--CATTAAC--ACG-CACTGTTGCC-T---TTG-TGATTCAACCAT-A------CAGG-TA-------TATACA-------TA-TATTATATTT---TG-TGCT--TTAT-ACTAAA--CGCTtag
gi|6 : ttaaattctggtactcgcccgactcaattatttcacacccttgtttgctttaggaaaaatctagggaactttaattcttttgtgcgaaaaccttcgatttgccatggattaaacaatgctctctttttaaacattcgcgccgatctaataattagcggacacaaaaacctttccaatttgcatggattttacaatgaatttaagaaaagttgatgaatgaaaatgcgattttttacattttgagaaaaaaatataacgacaacggcacatgtctatgctactatcatttggaaaaatattaatttacgattcgtcttcatggaaataaataaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACCAATCTTCAAT--AG-G-ACATTGAAT-TTT-ATATAA--TTC--TGAAAGA-GGTATTGATAT---AATACTT-GAACTA-TC--GCAC-AA-A--CATTAAC--ACG-CACTGTTGCC-T---TTG-TGATTCAACCAT-A------CAGG-TA-------TATACA-------TA-TATTATATTT---TG-TGCT--TTAT-ACTAAA--CGCTtag
gi|27 : ttaaattctggtactcgcccgactcaattatttcacacccttgtttgctttaggaaaaatctagggaactttaattcttttgtgcgaaaaccttcgatttgccatggattaaacaatgctctctttttaaacattcgcgccgatctaataattagcggacacaaaaacctttccaatttgcatggattttacaatgaatttaagaaaagttgatgaatgaaaatgcgattttttacattttgagaaaaaaatataacgacaacggcacatgtctatgctactatcatttggaaaaatattaatttacgattcgtcttcatggaaataaataaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACCAATCTTCAAG--TGTGTACAT--ATTGTTTTA-ATAA--T-C--TGAG-AG-G-TATTGATAT---AATACTTGGAACTA-TC--GCATTA--A--CATTAA-CTAC--CCCTGTT-CC---TTTGGAT--TTCAAC-AT-A------CAGG-TA-------TA--CA-------T--TATTATATTT---TG--GC---TTAT-ACTAAA--CGCTAGTtag
gi|10 : aaTTTCAA--AATG-ACAT-GAGT-TTT-ATATAA--TTTCGTGAA-GA-GATATT-ATAC---Aa
gi|14 : cttaaatctggttatctcgccgactaaatataaattaacacattttttgcctagtaaactcggcgacccctaattccttttgttgcgaaaacccttcgaatttgcaaggattaaataaattgaatcctgtttcttaaacacccgccgatctaatatactttaccaggaatagcggataacaacccttccacttgctcgtggattttacagtgaatttaaagaaaagttgatgaatattaatggtgtttatatttttgaaaaaataaatataacggccgctcatgtgtacaatcatttagaaaaaaatattactttactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaattcaatggaaaaaaaccctTTCAAT--AGTG-ATAG-GATT-T---ATATAA--TTC--TGAA-GA-GGTATTAA------AATACCT-GATCTA-TC--G-A--AC-AA-CATTAAC--ACG-TACTGTT-CC-T-TTGTGAT--TCCAAC-AT-A------GAGG-TA-------TG--CATACAGTGTA-TATTATGTTT---TG-TGT---CTAT-ACTAAA--CGCTAGTtt
gi|5 : cttaaatttaagtaaagttgatggattaaaacggttctttatattttgaaaaaaaaaatataatggcacgtatatgtctactatctggtggaaaaatataaatttactatcgtctcgtggaaataaattagatatatatatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaaaaactTCCATTAAGTG-AC-T-GATT-TT--ATATAAATCTC--TGAAAGA-G--------GT---CATA------ACTAGTC--GCA--TC-AAGCATTAAC--ACG-CACTGCT-CCCTGT---GATC-TCCAAC-ATTA------CAGGAGA-------TA--CA-------TA-TATTATATTTA--TG-TGC---TTAT-ACTAAAACCGCTAGT
gi|31 : gccttacatctgtatcttctctctgactcatttatcgtatcttattccatataattagggaatattcttttgttcgaaaacaacccttcgaatttgctatggattaacatatccgatcaataatatatttacctagaaattagcggagcacaaaccttccaattctgcgtggatttaacaatgaattaaagagaaaagtagtatgatggaaaatgtttctttataaatttttgagaaaaaaaaaaatataacgacacgcacatgtctatagcttaactattcatttggaaaaaatattaattacatcgtctcatggaaataattatatatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctagcttcttggtgcgagctaacactcgccatcatccccacgaAT--AGTG-ACAT-GATT-TT--ATAGAA--TTT--TAAA-GA-GGTATGAA------AATACCT-GAACTA-TT--GCA--CA-A--CATTAAC--ACG-TACTGTT-CC-T-CTGTGAT--TCCAAC-AT-A------GAGG-TA-------TA--CA-------TA-TATTATATTC---TG-TGC---TTAT-ACTAAA--CGCTAGa
gi|30 : ccatatAT--AGTG-ACAT-GATT-TT--ATATAA--TTA--TGAA-TA-GGTATTAA------AATACCA-GAATTA-TC--GCA--CA-A--CATTAA-------CACTGTT-CC-T-TCGTAAT--TCCAAT-AT-A------GAGG-TACCGATAATA--CA-------TA-CTTTATATTT---TG-TGCTTATC----CTAAA--CGCT
gi|18 : cacttttaTGACATAA--TTC--TGAA-AA-GATATT--TAG---AATAC-GTGAACTC-TCATGCA-----A--CATGAA-------CACCGCT-CC----TTCG-TGATTCAAC-AA-A------CAGG-TA-------
gi|36 : ttaatttacgaaaagtttatgaaccaaaatggttctttatattttgaacggcacgcatatttgggaaaaataaatttactatagccttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgaaatcttttaatagAA--TTC--TGAA-TACA-TATAGGTATTTAAATACCT-AAATTA-TC-------AC-A--CATTAA-------CACTGTT-CC-T-TCGTGAT--TCTAAC-TT-G------GAGG-TA-------TT--CA-------TA-CGTTATATTT---TA-TACTTATc
gi|34 : cTGAACTA-TC--ACA--TT-A--CATAAA-------CACTGTT-CC-T-TTGTGAT--TTCAAT-AT-AGATGTACATG-TA-------TA--CA-------TA-CATTCTATTT---TG-TACTTATC----CTACA--CGCTc
gi|45 : atcattctaagtcggttttaaattaccACG-CACTGT---C-TGT---GAT--TCCAAC-AT-A------CAG--TA-------TA--CA-------TA--AT-ATATTT---TG-TGCT-----TAACTAAA--CGCTAG
gi|44 : aacG-TACTCTT-CC-T-TCGTGAT--TCCAAC-GC-A------GAGG-CA-------TG--CA-------TA-TGTTATATTG---TG-TGCT---TATA-CTAAA--CGCTAG
gi|50 : A-------TA--CA-------TA-TATTATATTTTAATG-TGT---TTAT-ACTAAA--CGCTAGT
6 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|32 ): TCAATATTTTCAAGTTAGGAAAAGTTGATGACTTCAAATTTATATTTTGAACGAAATATAACGGCTCGCTAATGTATACTATCGTCTGAAAAAAACCCCAAAACAAAATAATTTACTGTATCGTTTC
Unaligned ( gi|33 ): TACTATCGTCTCATGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG
Unaligned ( gi|42 ): CGAACAAAGTTGAACATTGGATGATTATTCGTATTCTTGTATTAACACGTATCGAAGTAGGTTTTATGACTTTCTTAAATATC
Unaligned ( gi|46 ): ACAAAACAAAAAACGCGCCATTTTTTTCTCAAGAACAATTCCTTGAAATC
Unaligned ( gi|48 ): TTTCTCAAGAAGGATTCCTTGGAATCAATAGGCGGAGCGGATTTTTAC
Unaligned ( gi|49 ): CAATTTTCAATGGATACTTTCAATATTGACATGATTTTATATAATT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1 4444444 11 222 11 111 4444444444444444444 33333333 444444444444444 2222222222222 111111 1 3333333333333333333333 1 1 888888888888888888888888888888 555555555555 11 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 1 1111111 1 555555555555 11111 222222222222222222 0000000000000 1111111 1 333333333333333333333 3333 111 111111111 444444444444444444444 666666666666666666666666666666666666666666666 222 44444444 222222222222222222 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 11 1 1111 1111111111111 1111111111 111
lowQualScore : 66 4 4 33 44 5 888 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 2 0 66 33 2 2 77 8 0 0 66 7777777 2 666 888888 6666 3 2 2 33 8 2 66 66 5 2 11 444 00 2 000 4444444444444444444 3 66666666 3 55 3 444444444444444 55 666 2222222222222 6666 4 666 7777 000000 3 777 4 2 0 2222222222222222222222 55 6666 3 0 3 99 0 555555555555555555555555555555 4 4 66 9 333333333333 5 88 11 8 8 0 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 4 8 4 4 7777777 4 4 1 4 8888 6 2 666666666666 77777 3 222222222222222222 3 3333333333333 0000000 88 3 3 22 44 111111111111111111111 44 6666 66 8888 555 3 3 888 3 4 44 2 33 2 000000000 5555 2 33 2 555555555555555555555 2 33 2 77777 55 2 3 2 88 4 1 1 1 1 555 1 22 777777777777777777777777777777777777777777777 777777777 1 333 55555 1 1 1 3 5 333 1 88888888 22 1 1 1 333 000000000000000000 88 22 1 44444 5 1 1 44 6 22 2 444 66 2 2 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1 66 3 555 3 1 5 8 1 3 33 22 0 33 33 0 4 6 5555 33 2 555 2 33 9999 555 66666 66 1111111111111 7 2 4 55 999999 6666666666 8888888 2 2 444 2 888 2 33
lowQualScore : .. . . .. .. . ... .................................................................... . . .. .. . . .. . . . .. ....... . ... ...... .... . . . .. . . .. .. . . .. ... .. . ... ................... . ........ . .. . ............... .. ... ............. .... . ... .... ...... . ... . . . ...................... .. .... . . . .. . .............................. . . .. . ............ . .. .. . . . ..................................................................................... . . . . ....... . . . . .... . . ............ ..... . .................. . ............. ....... .. . . .. .. ..................... .. .... .. .... ... . . ... . . .. . .. . ......... .... . .. . ..................... . .. . ..... .. . . . .. . . . . . ... . .. ............................................. ......... . ... ..... . . . . . ... . ........ .. . . . ... .................. .. .. . ..... . . . .. . .. . ... .. . . ..................................................................................... . .. . ... . . . . . . .. .. . .. .. . . . .... .. . ... . .. .... ... ..... .. ............. . . . .. ...... .......... ....... . . ... . ... . ..
lowQualScore : 77 0 0 11 66 3 333 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 7 7 33 77 7 5 99 6 1 9 88 6666666 9 888 222222 1111 5 9 9 99 6 9 88 11 0 9 88 111 11 9 666 7777777777777777777 6 44444444 6 00 6 222222222222222 00 444 9999999999999 3333 4 444 7777 555555 6 000 0 0 9 9999999999999999999999 00 5555 6 9 6 00 6 999999999999999999999999999999 4 4 11 0 222222222222 0 88 00 0 0 6 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 6 0 0 0 2222222 0 0 2 0 4444 4 0 444444444444 11111 6 333333333333333333 6 3333333333333 0000000 88 3 3 22 66 111111111111111111111 22 8888 55 3333 444 1 1 666 1 0 22 9 99 9 777777777 7777 7 77 5 111111111111111111111 2 11 2 88888 33 2 1 0 22 0 8 8 8 8 000 8 55 777777777777777777777777777777777777777777777 000000000 7 000 11111 7 7 7 3 0 222 7 22222222 33 7 7 7 000 111111111111111111 00 55 8 77777 5 9 9 55 0 88 4 111 88 9 9 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 6 00 4 444 1 5 3 0 1 7 77 55 7 22 44 0 3 8 5555 33 9 000 9 99 0000 000 77777 33 3333333333333 5 5 7 99 777777 9999999999 1111111 5 5 444 5 999 7 77
consensus : CAACAAANAA-TAC-GGG-TCTTGT--GTTTTCT-CAAG---AA----------G-----------A---A-----T----T----A------GG-----A-----------C-GGA-GCGGA--T--ATTT-ACGA--TG-TACATGTATAC--ACAA------GTAT-C-T-G------GT----ATTAC-ATG-CC--A-CGT-GCG--AGT-AATACCTG-T--ACCT---GTC-TT-GTC--AAAACAAAGGATT------------A--TCTA-ATCA---CT--CT-CA--ATTT-AGA---TAT-GTG-TG-C--TGCTCTGT---C-CA----------AAA--A-CTATCG---AAGTTT----GACAACT------TATCG-G---A-AAGGTATAG-TTCT-----G-------TCTNA---TC--ATGA-GTTTTCAACT-A-TAC-ATTTTG-ATAATGC-AT-TGGGA-GA--ATGGACTAC-ACG-ACAGA-CT-TCGA--ACTAAAACCGAGATTGGATGC-GAA-TTGG--ATG-CGT-TTTATCCTTTTCTCCTCTGCTCGACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGCCTTAAAT-CTGG-T-ATC-CGC--CC---GACT-CAA-TAT-T--T-TCACACCCTT-TTTGCTA-ACGTCCAAGCTTAGGAAANATCTAGG-GA-C---------TC-----TAATT-CTTTTG---G----AAA-----C-CCTTCGA-ATTTGC-A-TGGATTAAACAA--TG--TTCTCTT--TT-AAACAC-CGCGCCGATC--TAATATATTT-TACCCA-GAA---TTAGCGGA-C-ACAAA--CCT-TTCGA--AT-TTG--C-GTGGAT---------T----TT-AC--AA-TG--------------A------ATTT-A--AGAA-AA-----GTTG--A-TGAATNAA-AAT--GG-TTCT-TT-A-T-A---T-T--TTGA-G-----AAA---------------A------------------AA---------A-A---A----AAT-ATA-AC-GG-C-ACG-CCACAT-GTC-AT-GC-T--A-CTA-TCATTT-GG---AAAAAT----------ATA-TA-A--TTT--A-C--T--A-T-C-G--TC-T--CAT-G---GAA--AT-AA-ATAAAAT--------ATATATAT-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTC--------------CCAATTTTCAATGGAAACCAATC---TTC-AATAGTG-ACA-TGATT--TTT-ATATAA--TTC--TG-AAGAGGTATTGATAT---AATAC-CT-GAA---CTA-TC--GCA--AAAC---ATT-----AAC--A---------C-G-CACTGTT-CCT-TCGTGAT--TCCAACA------TACAGG--T-------ATACA-------TATATTA-TATTT-T---G-TGCT--TTAT-ACTAAA--CGCTAGT
Reference ( family-365 ) : CAACAAANAA-TAC-GGG-TCTTGT--GTTTTCT-CAAG---AA----------G-----------A---A-----T----T----A------GN-----A-----------C-GGA-GCGGA--T--ATTT-ACGA--TG-TACATGTATAC--ACAN-T--G-GTAT-C-T-G------GT----ATCAC-ATG-CC--A-CGT-GCG--AGT-AATACCTG-T--ACCTG--GTC-TT-GTC--AAAACAAAGGATT------------AT-TCTA-ATC----CT--CT-CA--ATTT-AG----TAT-GTG-TG-C--TGCTCTGT---C-CA----------AAA--A-CTATCG---AAGTTT----GACAACT------TATCG-G---A-AAGGTATAG-TTCT-----G-------TCTNA---TC--ATGN-GTTTTCAACT-A-TAC-ATTTTG-ATAATGC-AT-TGGGA-GA--ATGGACTAC-ACA-ACAGA-CT-TCGA--ACTAAAACCGAGATT-GATGC-GAA-TTGG--ATG-CGT-TTTATCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGCCTTAAATTCTGG-T-ATC-CGC--CC---GACT-CAA-TAT-T--T-TCACACCCTT-TTTGCTA-ACGTCCAAGCTTAGGAAANATCTAGG-GA-C---------TC-----TAATT-C-------------AAA-----C-CCTTCGA-ATTTGC-A-TGGATTAAACAA--TG--TTCTCTT--TT-AAACAC-CGCGCCGATC--TAATATATTT-TACC---GAA---TTAGCGGA-C-ACAAA--CCT-TTCGA--AT-TTG--C-GTGGAT---------T----TT-AC--AA-TG--------------A------ATTT-A--AGAA-AA-----GTTG--A-TGAATNAA-AAT--GG-TTCT-TT-A-T-A---T-T--TTGA-G---A-AAA---------------A------------------AA---------A-A---A----AAT-ATA-AC-GG-C-ACG-CCACAT-GTC-AT-GC-T--A-CTA-TCATTT-GG---AAAAAT----------ATA-TN-A--TTT--A-C--T--A-T-C-G--TC-T--CAT-G---GAA--AT-AA-ATAAAAT--------ATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--------------CCAATTTTGAATGGAAACCAATC---TTC-AATAGTG-ACA-TGATT--TTT-ATATAA--TTC--TG-AAGAGGTATTGATAT---AATAC-CT-GAA---CTA-TC--GCA--ANAC---ATT-----AAC--A---------C-G-CACTGTT-CCT-TCGTGAT--TCCAACA------TACAGG--T-------ATACA-------TATATTA-TATTT-T---G-TGCT--TTAT-ACTAAA--CGCTAGT
gi|1 : CAACAAACAA-TAC-GGACTCTTGCCAGTGTTCTACAAG---AA----------G-----------A---A-----T----T----A------GA-----A-----------C-GGA-GCGGA--CCGATTT-ACGA--TG-TACATGTATACT-ACATGTAGG-GTAT-C-T-G------GT----GT-AC-AT--------CGT-GCGTTAG---ATACCTG-T--ACCTG--GTCGTT-GTC--AAAACAAAGAATT------------AT-TCTA-ATCAAA-CT--CT-CA--AGTT-AG----TAT--TA-T--T--TGCTCTGT---C-CA----------AAA--AACTATCG---AAGTTT----GACAACT------TATCGTG---A-AACGTATAG-TTCT-----C-------TCTTA---TC--ATGAAGGTTTCAACT-A-TAC-ATTGTG-ATATTGC-AT-TGGGA-GA--ATGAATCAT-ACA-ACAGATCTATCGACCACTAAAACTGAGATT-ACTCC-GAAATTGGCAATATCGTATTTATCCTTTTCTCCTCTGCTCGACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGCCTTAAATACTGG-T-ATC-CGC--CC---GACT-CAA-TAT-T--T-TCACACCTTT-TTTGCTAGACGTCCAAGCTTAGGAAACATCTAGG-GA-C---------TC-----TAAT----------------AAA-----C-CCTTCGA-ATTTGC-A-TGGATTAAACAA--TG--TTCTCTT--TTAAAACAC-CG-GCCGA-C--TAATATATTT-TACCT--AAA---TTAGCGGA-C-ACAAA--CCT-TCCAA--AT-TTG--C-GTGGAT---------T----TT-AC--AA-TG--------------A------ATTT----AGAA-AA-----GTTG--G--GAATGAA-AAT--GG-TTTT-TT-A-C-A---T-T--TTGA-GAA-A-AAA---------------A------------------AA---------A-A---A----AAT-ATA-AC-GA-C-ACG-CCACATCGTCAATAGC-T--A-CTA-TCATTT-GG---AAAAAT----------ATA-TT-A--TTT--ACC--T--A-TGC-G--TC-T--CATAG---GAA--AT-AA-ATAAAATGATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--------------NNNNNNNNNNNNNNNNACCAGTC---TTC-CATAGTG-ACA-TGATT--TTTGATATAA--TTC--TG-AAGA-GTATTGATAT---AATACTTT-GAA---CTA-TC--GCA--ACAC---ATT-----AATCAA---------C-G-CACTGTT-CCTGTTTTGATGATCCAACA------TACAGC--T-------ATACA-------TATATTA-TATGT-T---G-TGCTAATTATAACTAAA--CGCTAGT
gi|10 : CTTAAAT-CTGG-TTATCTCGC--C----GACT-AAA-TAT-AAAT-TAACACATTT-TTTGCC-------------TAGTAAA---CTCGGCGA-C---------CCC----TAATT-CCTTTTGTTGCGA-AAA-----C-CCTTCGA-ATTTGC-A-AGGATTAAATAAATTGAATCCTGTTTCTT-AAACAC-C-CGCCGATC--TAATATACTT-TACCAG-GAA----TAGCGGA-TAACAAC--CCT-TCC----AC-TTGCTC-GTGGAT---------T----TT-AC--AG-TG--------------A------ATTTAA--AGAA-AA-----GTTG--A-TGAATATT-AAT--GG--TGT-TT-A-T-AT--T-T--TTG---------AA---------------A------------------AA---------A-T---A----AAT-ATA-AC-GG-C--CG-C-------TC-AT-GTGT--A-CAA-TCATTT-AG---AAAAAA----------ATA-TT-AC-TTT--A-C--T--A-
gi|10 : --------------CCAATTC--AATGGAAAAAAACCCTTTTC-AA-AATG-ACA-TGAGT--TTT-ATATAA--TTTCGTG-AAGAGATATT-ATAC---Annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaattcaatggaaaaaaacccttttcaaaatgacatgagttttatataatttcgtgaagagatattatacatt
gi|11 : cttaaatctggttatctcgccgactaaatataaattaacacattttttgcctagtaaactcggcgacccctaattccttttgttgcgaaaacccttcgaatttgcaaggattaaataaattgaatcctgtttcttaaacacccgccgatctaatatactttaccaggaatagcggataacaacccttccacttgctcgtggattttacagtgaatttaaagaaaagttgatgaatattaatggtgtttatatttttgaaaaaataaatataacggccgctcatgtgtacaatcatttagaaaaaaatattactttactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAACAAAAAG-TAC-GG--TCTTGT--GTTTTCT-CAAG---AA----------G-----------A---A-----T----T----A------GT-----A-----------C-GGAGGCGGA--T--ATTT-AC-A--TGCTACATGTATAC--ACAA-C----TTAT-C-T-G------GT----ATTAC-ATG-CC--ACCGT-GCG--AGT-AATACC-G-TTAACCCA--GT--TT-GTC---AAACAAAGGA-T------------A--TCTA-ATC----CTTGCT-CA--ATTT-AGA---TAT-ATG-TGTC--TGCCTTGT---C-CA----------AAA--A-C-ATCG---AAGTTT----GACAACT------TATCG-G---A-AAGGTATAGTTTCT-----G-------CCTCAAATCC--ATGC-GTTTTCAACT-ATTAC-ATTTT--ATAATGC----------------GGACTAC-ACA---AGA-CT-TCGA--ACTAAA--CGAGATTGGATGC-tt
gi|12 : aAACAAAAAG-TAC-GG--TCTTGT--GTTTTCT-CAAG---AA----------G-----------A---A-----T----T----A------GT-----A-----------C-GGAGGCGGA--T--ATTT-AC-A--TGCTACATGTATAC--ACAA-C----TTAT-C-T-G------GT----ATTAC-ATG-CC--ACCGT-GCG--AGT-AATACC-G-TTAACCCA--GT--TT-GTC---AAACAAAGGA-T------------A--TCTA-ATC----CTTGCT-CA--ATTT-AGA---TAT-ATG-TGTC--TGCCTTGT---C-CA----------AAA--A-C-ATCG---AAGTTT----GACAACT------TATCG-G---A-AAGGTATAGTTTCT-----G-------CCTCAAATCC--ATGC-GTTTTCAACT-ATTAC-ATTTT--ATAATGC----------------GGACTAC-ACA---AGA-CT-TCGA--ACTAAA--CGAGATTGGATGC-cgtcttatcattcttgtacaaacaatacatgcatctaagttagctgcatcggatttcctcaatatcaactgacatag
gi|13 : aAACAAAAAG-TAC-GG--TCTTGT--GTTTTCT-CAAG---AA----------G-----------A---A-----T----T----A------GT-----A-----------C-GGAGGCGGA--T--ATTT-AC-A--TGCTACATGTATAC--ACAA-C----TTAT-C-T-G------GT----ATTAC-ATG-CC--ACCGT-GCG--AGT-AATACC-G-TTAACCCA--GT--TT-GTC---AAACAAAGGA-T------------A--TCTA-ATC----CTTGCT-CA--ATTT-AGA---TAT-ATG-TGTC--TGCCTTGT---C-CA----------AAA--A-C-ATCG---AAGTTT----GACAACT------TATCG-G---A-AAGGTATAGTTTCT-----G-------CCTCAAATCC--ATGC-GTTTTCAACT-ATTAC-ATTTT--ATAATGC----------------GGACTAC-ACA---AGA-CT-TCGA--ACTAAA--CGAGATTGGATGC-cgtcttatcattcttgtacaaacaatacatgcatctaagttagctgcatcggatttcctcaatatcaactgacatag
gi|14 : a-TA--------------A------ATTT-A--AGTA-AA-----GTTG--A-TGGATTAA-AAC--GG-TTCT-TT-A-T-A---T-T--TTG---------AA---------------A------------------AA---------A-A---A----AAT-ATA-AT-GG-C-ACG--TATAT-GT------C-T--A-CTA-TCTGGT-GG---AAAAAT----------ATA--A-A--TTT--A-C--T--A-T-C-G--TC-T--CGT-G---GAA--AT-AA-ATTAGAT--------ATATATATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNN-NNNNNNG-GAA-AAACT--TTC-A-ATAG--T-------GATAGG-ATTTATAT---AAT-T-CT-GAAGAGGTA-TT--AAA--ATACCTGATCTATCGAAC--AACATTAACAC-G-TACTGTT-CCT-TTGTGAT--TCCAACA------TAGAGG--T-------ATGCATACAGTGTATATTA-TGTTT-T---G-TG-T--CTAT-ACTAAA--CGCTAGTcgtcttatcattcttgtacaaacaatacatgcatctaagttagctgcatcggatttcctcaatatcaactgacatag
gi|15 : ctAAAAAAGAAGCAC-AGG-CCTTCT--ATTTTCT-CAAGGACAA----------GTCCTTGGAATCA---A-----T----T----A------GG-------------------GGA-GCAGA--T--ATTT-ACGA--TG-CACATGCATA-----------G-GTAT-C-TTG------GA----ATCAC-ATG-CC--G-CGT-GCG--AGT-AATACC---T--ACCT---GTC-TT-GTC--AAAATAAAG--TC------------A---CTA------------CT-CA--ATTT-AGAT--TAT-GT-----C--TGTTCTGC---T-C-----------AAA--A-CTATCG---AAGTTG----AACAATT------TATCG-G---ATAATG-ATAT-TTGT-------------TCCTA---TC--ATGA-ATACTCAACT-------ATTTGG-AT-ATGCGAT-TGG---AA--ATA----AC-ATGCACGGA-CA-TCGA--AC-AAAAC------------T-AAA-TTGG--ATG-CGT-TTTCTC
gi|16 : AA-AAT--GG-TTCT-TT-A-T-A---T-T--T-----------AA---------------A------------------AA---------A-A---A----TAT-ATA-AC-GG-C-ACG-C-ACAT-GTC-------T--A-CTA-CCTTGT-GG---AAAAAT----------AT--TA-A--TTT--A-C--T--A-T-C-G--TG-T--CAT-G---AAA--ATTAA-ATAAA-T--------ATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCAATTTTGAATGGAAA--AACT---TTC-AATAGTG-ACA-TGATT--TT--ATATAA--TTC--TG-AAGAGGTATTAA-AT-----TAC-CT-G-A---CTA-TC--GAA--CAAC---ATT-----AAC--A---------C-GCCACTGTT-CCT-TTGTGAT--TCC----------TAC--------------------------ATATTATTATTT-T---GATGC---TTAT-ACTAAG--CGCTAGcgccatgtacacgcatatcgaagtaggccgtgtgatttcctcaaatatcacacaca
gi|17 : tCAACAA-CAA-TAC-GGG-TCTTGT--GTTTTCT-CAAG---AA----------G-----------A---A-----T----T----A------G------A-----------C-GGA-GCGGA--T-------------------ATGTATAC--ACAA------GTAT-C-G-GGTACATGT----ATTAC-ATG-CC--A-CGT-GCG--AGT-AATACCTG-T--ACCT---GTT-TT-GTC--AAAACAAAGGA-T------------A--TCTA-ATCA---CTG-CT-AA--ATTT-AGAT--TAT-GT-----C--TGCTCTGT---C-C-----------AAA--A-CTATCG---AAGTTT----GATAACT------TATCG-G---A-AAGGTATAG-TTCT-----GC------TCTAA---TC--ATGA-GCTTTCAACT-A-TAC-ATTTTG-AT-ATGCGAT-TGG---GA--ATGA--TAT-AC--ACAGA-CT-TCGA--AC-AAAACTTA-ATTGGATGC-GAA-TTGG--ATG-CGT-TTTATCc
gi|18 : a--------------A------ATTT-A--CGAA-AA-----GTTT--A-TGAACCAA-AAT--GG-TTCT-TT-A-T-A---T-T--TTG-------------------------------------------------------------------------A-AC-GG-C-ACG----CAT----------------------ATTT-GG---GAAAA-----------ATA--A-A--TTT--A-C--T--A-T-A-G--CC-T--agtcttgt
gi|18 : ttAATC---TTTTAATAGTG-ACA-T--------------AA--TTC--TG-AAAAGATATT--TAG---AATAC-GT-GAA---CTC-TCATGCA--A--C---ATG-----AAC--A---------C------CGCT-CCT-TCGTGAT--T-CAACA------AACAGG--T-------Atnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgaaatcttttaatagtgacataattctgaaaagatatttagaatacgtgaactctcatgcaacatgaacaccgctccttcgtgattcaacaaacaggtac
gi|19 : ttaatttacgaaaagtttatgaaccaaaatggttctttatattttgaacggcacgcatatttgggaaaaataaatttactatagccttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgaGT--TTTTTCT-CAAG---AA----------G-----------A---A-----T----TT---A------GG-----A-----------C-GGA-GCGGA--T--CTCT---GA--TG-TACATGTATAGTAACAC-C--AAGTAT-C-TTG------GTGCCTATTACCATGACC--A-CGT-GCG--GGT-AATACCTGTT--ACCGT--GCC-TTGGTCAAAAAACAAAGGA-T------------AG-TCTA-ATCACTGCT--TTCCAGTATTT-AA----TATAATGTTC-C--TGCTCTGTATCC-CACACATATTACAAAATA-CT-CCGAACAAGCTCTGTAGACAACCAGTTTATATC--G---A-AAAGTATA--TTCT-----GC------TCTAA---GC--ATGA---TTTCAACTGA-TAC-ATTc
gi|2 : AACAAAGCA-TAC-GGG-TCTTGT--GTTTTCT-CAAG---AA----------G---------------A-----T----T----A------G------A-----------C-GGA-GCGGAT-T--ATTT-ACGA--TG-TACATGT-TAC--A-------A-GTAT-CAT-G------GT----ATTAC-ATG--C--A-CGT-GCG--AGT-AATA-CTG-T--ACCT---GTA-TT-GTC---AAACAAGG---T------------A--TCTAGATA----CTG-CT-C---ATTT-AGAT--TAC--TG-TC-A--TGCTCTGT---C-------------AAA--A-CTATCG---AAG-TT----GACA--T------TAT---G---G-AAGGTATAG-TT-T-----G-------TCTAAT--TC--AT-C-GATTTCAACT-A-TACTATTTTGAATAATGG-AT-TGGGA---------ATT-----------A-CT-TCGA--ACTAA--------------GCTGAA-TTGG--ATG-CGT-TTTAatatag
gi|2 : aCGTCCTAAAT-CTGGAT-ATC-TGC--C----GA-T-CAA-TAT-T--T-TCACACTTTT-TTTGCTA-ACGTC---GCCTAGGAACT-CCTAGG-GA-CATAGATTTCTT-----TTGTT-TGACGAA-------AAA-----A-CCTTCGA-ATTTGC-AATGGATTAAAACA--TG--TTTTTTT-------ACAC----GACGATC--TAATATATTT-TACCTA-GAA---TTAGCG-A-C-ACAAA--C---TTCCA--AT-TTG--C-GTGGAT---------T----TT-AC---A-TG----------------------TTT-A--AGAA-AAT----GTTG--A-TG-ATTGA-AAT--GG-TTTT-TTAA-C-A---TAT--TTGA-G-----------------------A------------------AA---------A-A---A----ACT-AT--AC-GA-A-ACG-TAACAT-GTT-AT-AG-T--A-CTA--CATTT-GG----AAAAT----------AT--TA-A--TTT--A----T--A-T-CTG--TC-T--CAT-G---AGA--AT-AAGATAAAAT--------ATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNCAATC---TTC--ATAGTGAACA-T-ATT--T----TATAA--TTC--TG-AAGAGGTATTGAATT---AATA--TT-GAA---CTA-T-----G--AAAC----TT-----AAC--A---------CAG-CATGGTT-CCT-TTGTGA---TCCAACA------TACGG------------TACA-------TATATTA-T-TTT-T---G-TGCT--T--T-ACT-AA--CGCTatcatacttgtaccaatacatgatcgaagttgtgcatgagtttctccatattgacacagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcttcgtcctaaatctggatatctgccgatcaatattttcacactttttttgctaacgtcgcctaggaactcctagggacatagatttcttttgtttgacgaaaaaaccttcgaatttgcaatggattaaaacatgtttttttacacgacgatctaatatattttacctagaattagcgacacaaacttccaatttgcgtggattttacatgtttaagaaaatgttgatgattgaaatggttttttaacatatttgagaaaaaaactatacgaaacgtaacatgttatagtactacatttggaaaatattaatttatatctgtctcatgagaataagataaaatatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaatcttcatagtgaacatattttataattctgaagaggtattgaattaatattgaactatgaaacttaacacagcatggttcctttgtgatccaacatacggtacatatattatttttgtgctttactaacgct
gi|20 : aaacaaagcatacgggtcttgtgttttctcaagaagattagacggagcggattatttacgatgtacatgttacaagtatcatggtattacatgcacgtgcgagtaatactgtacctgtattgtcaaacaaggtatctagatactgctcatttagattactgtcatgctctgtcaaaactatcgaagttgacattatggaaggtatagtttgtctaattcatcgatttcaactatactattttgaataatggattgggaattacttcgaactaagctgaattggatgcgttttaatcatacttgtaccaatacatgatcgaagttgtgcatgagtttctccatattgacacagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctt-------------AAA-----C-CCTTCGA-ATTTGC-A-TGGATTA------------------------------CGCGCCGATC--TA-T-TGTTT-TACCCA-GAA---TTAGCGGA-C-ACAA---CCA-TTCGA--AT-TTG--C-TTGGAT---------T----TT-AC--CA-TGTGCTTTTATTTAAAA------ATTT-A--AGAA-AA-----GTTA--A-TGAATTAA-ATT--GG-TTCT-TT-A-T-A---T-T--TTGA-A---ATAAA---------------ATATAACGTTTATAATTAGAA---------ATA---A----AAT-ATA-AC-GG-C-ACG--CACAT-GT------C-T--A-CTA-TCATTT-GG---AAAAA-----------ATATTA-A--TTT--A-G--T--A-T-C-G--TC-T--CAT-G---
gi|21 : gaaTA-ACC----CT--AC-CA--GTTTTAGAAATTAT-GT-----C--TGTTCTGT---C-CA----------AAA-----TATCG---AAGTT-------CAACT------TAACA-GGATA-AAGGATTTG-TTCT-----A-------T---A----C--ATGA---TCTCAA-T-A-----ATTGTG-ATAAT-T-ATATGCGATGAGTATG---TATGATC-ATAGG-CT-TCAA--AACAAAA-------------C-GAA--TGG--GTG-TGT-TTTCTC
gi|22 : agaTC--TAATAT-TTT-TACCCT-GAT---TTAGCGGA-C-ACAGC--CCT-TT-GA--AT-TTG--C-GTGGGT---------T----TT-AC--AA-TGTTCTTTTA------A------AT---A--AGAA-AA-----GTTC--A-TGAATTAA-AAT--GG-TTTT-CT-A-T-A---T-T--TT---G---A-AAA---------------T------------------AT---------A-T---A----TAT-ATA-AC-GG-C-ACG--CACAT-GT------C-T--A-CTA-TCGTTT-GG---AAAAAT----------AT--TA-A--TTT--A-C--T--A-T-C-G--TC-T--CAtatcttgtgcacaacaatatgatatcgaaagtaggccgtttgaagctcctcaat
gi|23 : tgaaacaggtctctgtgTTCT-TA-G---AA----------ATC---------A---A-----T----T----A------GG-----------------T-GGG-GCGGA--T--ATTT-ACGA--TG-TACAT----AC--ACAT------GTAT-C-T-G------GT----TTCAC-ATG-CC--A-CGT-GCG--AGT--ATACTTG-T--ACCT---GTC-TT-TTT--AAAACAAAGGATT------------
gi|24 : agaaagcacgggcgtagtattttttaacagcaaTCCAAGCTTAGGAAAC-TC-AGG-GA-C---------TC-----TACTT-C-------------AAA-----C-CCTTCGA-ATTTGC-A-TGGATTACACAA--TG--CTCTTTC--TT-AAACAC-CGTGTCGATC--TAATATATTT-TACCCA-TAA---ATAGCGGA-C-A-ATA--TCC-TTCGA--AT-TTG--C-GTGGAT---------T----TT-AC--AA-TG--------------tgctttaggtgtgtatatctcccagttgattcgaggaatagaagatt
gi|25 : AACAA-CAA-CACAGGG-TCTGCT--GTTTTCT-CAAG---AA----------C-----------A---A-----T----T----ACCTTCGGA-----ATCAAATATAGGC-GGA-GCGGA--T--ATTTTACGA--TG-TACATATGT-C--ACAA------GTAT-C-A-G------GT----AATAC-ATG-CC--A-CGT-GCGC-AGT-AATACCTT-T--ACCT---GTA-TT-GTC--AAAACAAAGG--T------------AT-Tttctggtgaataagaacataagtt
gi|26 : aAACAA-CAA-CAC-GGG-TCTTGT--GTTTTCT-CAAG---AACAATTCCTCGG-----------A---A-----TCAATT----A------GG-----------------C-GGA-GCGGA--T--ATTT-ACGA--TG-TACATGTA------CAA------GTAT-C-A-G------GT----ATTAC-ATG-CC--A-CGT-GCG--AGT-AATACCTG-T--ACCT---GTA-TT-GTC--AAAACAAAGGATT------------tgctc
gi|27 : aaAAACCAATC---TTC-AAGTGTGTACA-T-ATTGTTTT-A-ATAA--T-C--TG-A-GAGGTATTGATAT---AATAC-TTGGAA---CTA-TC--GCAT-TAAC---ATT-----AACT-A---------C---CCCTGTT-CCT-TTG-GAT--TTCAACA------TACAGG--T-------ATACA-------T-TATTA-TATTT-T---G--GC---TTAT-ACTAAA--CGCTAGTtgctttcgaataca
gi|28 : TTGT--GTTTTCTACAAAGA-AA----------G-----------AGATA-----T----T----GTT----AA-----A-----------C-GGAAGCGGAAAT--ATCT-TCGAATTG--ACTTGTTNNN--NNNN-N--N-NNNN-N-N-N------NN----NNNNN-NNN-NN--N-NNN-NNN--CGT------TTG-T--AACTG---TC-TT-GTC--AAAACAAAGA--T------------A--TCTA-ATCA---CTG-CT-CA--ATTT-AG----a
gi|29 : TTCT-TA-G---AA----------ATC---------A---A-----T----T----A------GG-----------------T-GGG-GCGGA--T--ATTT-ACGA--TG-TAC----ATAC--ACAT------GTATGC-T-G------GT----TTCAC-ATG-CCCAA-CGTGGCG--AGTAAATA-CTG-T--ACCTGTCG-C-TT-TTT--AAAACAAAGat
gi|3 : aagaaagcacgggcgtagtattttttaacagcaaAAACAA-CAC-G---TCTTGT--TTGTCTT-CAAG---AA----------G-----------A---AATTCCT----T----G------GATCTATA-----------CCGAA-GCGGA--T--ATT--ACGAACTG-TACAT----AC--ACAA------GTAT-C-C-G-------T----ATCAC-ATG-CC--A-CAG-CCG--AGT---TACCTG-T--ACCT---GTC-TT-GTC--CAAACAAA-GATTGCTTTCGCACTAATATCTA-ATCA---CT--GT-TA--ATAT-AGAAT-TAT-GTG-TG-CATTGTTC--T---C--------------AA--A-CTAT-G---AAGTTT----GACAA-T------TATCG-G---A-TA-GTATAT-TTCT-------------TCTAA---TCATATGA-GTTTTCAACT-A-TAT--TTTTG-AT-ATG--AT-AGGGA-TA--A--AAC-AC-ACG-AC
gi|3 : aaCCTTAA---CTGGAT-ATC--GC--C----GACTTCAA-TATAG--T-TCACACCATT-TTC-CTAGACGTC-GAGCT----AAAAAT--AGA-GA-C---------TCATTCTTTATTGC-------------GAA-----C-C-TTCGACATTT-C-A-TGGATTA------------------------------CGCGCCGATC--T----TGTTTATACCCA-GAA---TTAGCG-A-C-ACAA---CCA-TTCGA--AT-TTG--C-TTGGATACCAGTGCTT----TT-ATGTAA-----------------A------ATTT-A--AGAA-AA-----GTTA--A-TGAATTAA-ATT--GG-TTCT-TT-A-T-A---T-TTATTGA-ACATA-AAATTACGTTATAATTAGA------------------AA---------A-A---A----AAT-ATA-AC--G-C-ACG--CACAT-GTT-----C-T--A-CTA-T-ATTT-GG---AAAAA-----------ATATTA-A--TTT--G----T--A-T-C-GTTTC-T--CAT-G---cactggatctttatcagtcttgtacacacatatcaattggccgtattatttcgtttaaaaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccccttaactggatatcgccgacttcaatatagttcacaccattttcctagacgtcgagctaaaaatagagactcattctttattgcgaaccttcgacatttcatggattacgcgccgatcttgtttatacccagaattagcgacacaaccattcgaatttgcttggataccagtgcttttatgtaaaatttaagaaaagttaatgaattaaattggttctttatatttattgaacataaaattacgttataattagaaaaaaaatataacgcacgcacatgttctactatatttggaaaaaatattaatttgtatcgtttctcatgca
gi|30 : aaaaacaacacgtcttgtttgtcttcaagaagaaattccttggatctataccgaagcggatattacgaactgtacatacacaagtatccgtatcacatgccacagccgagttacctgtacctgtcttgtccaaacaaagattgctttcgcactaatatctaatcactgttaatatagaattatgtgtgcattgttctcaaactatgaagtttgacaattatcggatagtatatttcttctaatcatatgagttttcaactatatttttgatatgatagggataaaacacacgaccactggatctttatcagtcttgtacacacatatcaattggccgtattatttcgtttaaaaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncc---TTT-AATAGTG-ACA-TGATT--TT--ATATAA--TTA--TG-AATAGGTATTAA------AATAC-CA-GAA---TTA-TC--GCA--CAAC---ATT-----AAC--A---------C------TGTT-CCT-TCGTAAT--TCCAATA------TAGAGG--TACCGATAATACA-------TACTTTA-TATTT-T---G-TGC---TTAT-CCTAAA--CGCTca
gi|31 : cactATAGTG-ACA-TGATT--TT--ATAGAA--TTT--TA-AAGAGGTATGAA------AATAC-CT-GAA---CTA-TT--GCA--CAAC---ATT-----AAC--A---------C-G-TACTGTT-CCT-CTGTGAT--TCCAACA------TAGAGG--T-------ATACA-------TATATTA-TATTC-T---G-TGC---TTAT-ACTAAA--CGCTAG
gi|32 : ccatat--------------A------AGTT-A--GGAA-AA-----GTTG--A-TGACTTCA-AAT----------TT-A-T-A---T-T--TTGA---------------------------------------------A---------C-G---A----AAT-ATA-AC-GG-C-TCG-CTA-AT-GT--AT-------A-CTA-TCGTCT-GA---AAAAAACCCCAAAACAAAA-TA-A--TTT--A-CTGT--A-T-C-G--TT-T--C
gi|34 : tcaatattttcATCA--TTC--TA-AGTCGGTTTTAA-AT-----TAC-CT-GAA---CTA-TC--ACA--TTAC---ATA-----AAC--A---------C------TGTT-CCT-TTGTGAT--TTCAATATAGATGTACATG--T-------ATACA-------TACATTC-TATTT-T---G-TAC---TTAT-CCTACA--CGCT
gi|35 : T-G--AGAA-AA-----TATG--T-TGAAT--A-AAT--GGGTTCT-TT-A-C-A---T-T--T----------------------------------------------------------------------GT-AT---C-G--C-ACG-C-ACAT-GTC-------T--A-CTA-TCATTT-GG---AAAACC----------AAA-TTGA--TTT--A-C--T--A-T-T-G--TC-T--CAC-T---AAA--AT-AA-ATTAAA
gi|36 : aaAA--TTC--TG-AATACATATAGGTATTTAAATAC-CT-AAA---TTA-TC-------ACAC---ATT-----AAC--A---------C------TGTT-CCT-TCGTGAT--TCTAACT------TGGAGG--T-------ATTCA-------TACGTTA-TATTT-T---A-TACT--T
gi|37 : c---------T----TT-AC--AA-TG--------------A------ATTT-A--AGAA-AA-----GTTG--A-TGACTGAA-AAT--GATTTTT-TT-A-C-A---T-T--GTGA-G------------------------------------------AA---------A-A---A----AAT-ATA-AC-GA-C-A-G-GCACAT-GTCTATAGC-T--A-CTA-TCATTT-GG---AAAatc
gi|38 : T-TTG--C-GTGGAT---------T----TT-AC--AA-TG--------------TTCTTTTATTC-A--ATCA---------TT-----TAAAAAAA-AAC--GT-TTCT-TT-A-T-G---T-T--TTG--------------------------A------------------AA---------A-ATTTA----GAT-ATA-AC-GA-C-ACG--CACAT-GT-------------CTA-TCATT
gi|39 : AATTAA-AAT--GG-TTCT-TT-A-T-A---T-T--TTGA-----A-ATA---------------T------------------AT---------A-T---A----TAT-ATA-AC-AG-C-ACG--CACAT------T-TC-T--A-CTA-TCATTT-GT---AAAAAT----------AT--TT-A--TTT--A-C--T--A-T-C-G--TC-T--CAT-G---G
gi|4 : AAGTATAG-TTCTTCTTAGCACTATCTCTAA---TC--AGGA-GTTTTCAACC-A-TAT-ATTTTG-AT-ATGCGAT-T--AA-GA--AT--AATAT-AC--ACGGA-CT-TCGA--AC-AAAACTGA
gi|4 : CCTTAAATCTCGG-T-ATT-TGCGGTA---GACT-CAAGTAT-T--CCTCACACC--T-TTGGCTAGACG-CCAAGCTTAGAGAAC-TC-GGG-GA-C----------C-----TAATT-CCTTTTGTGGCGAAAAA-----CGCCTTCGA-ATTTGG-A-TGGATTAACAAA--TT--TTCTTTC--TT-AAA----CGCACCGATT--GAATATA-TT-TACC---AAACATTTAGCGTA-C-ACAAC--CCTGTTCGACCATCTTT--CAATGAAT---------TGGCATT-AC--AA-TGTTCTTTC-------T------ATTA-A--AGAATAAAAATGGTTG--ATTGAAGT-A-AAT--AG-TTTT-CT-A-T-A---T-T--TGGG-G---G-GGG---------------G------------------GGGGGCACGGCG-G---A----CATCACG-AC-GGCC-ACGCCCACAT------T-GT-T--ACCTA-TCATTT-GA---AAAAAA----------AAA----A--TTT--A-C--TGAG-T-C-G--TC-T--CAT-G---GAA--AT-AA-Aatgaatgtcgtttctatcagtctttgttacacacatatcctgaaattgtcgtagaaccttcatcatcaactctctcgtctccccttctcctcgtcaatctctctccctctctctcttctccatcccctcctccctcctcctcgtgctctgcccttaaatctcggtatttgcggtagactcaagtattcctcacacctttggctagacgccaagcttagagaactcggggacctaattccttttgtggcgaaaaacgccttcgaatttggatggattaacaaattttctttcttaaacgcaccgattgaatatatttaccaaacatttagcgtacacaaccctgttcgaccatctttcaatgaattggcattacaatgttctttctattaaagaataaaaatggttgattgaagtaaatagttttctatatttggggggggggggggcacggcggacatcacgacggccacgcccacattgttacctatcatttgaaaaaaaaaaatttactgagtcgtctcatggaaataaa
gi|40 : aagtatagttcttcttagcactatctctaatcaggagttttcaaccatatattttgatatgcgattaagaataatatacacggacttcgaacaaaactgaatgaatgtcgtttctatcagtctttgttacacacatatcctgaaattgtcgtagaaccttcatcatcaactctctcgtctccccttctcctcgtcaatctctctccctctctctcttctccatcccctcctccctcctcctcgtgctctgcTCT-TT-A-T-A---T-T--TTGATG---A-AAA---------------A------------------AA---------A-A---A------T-ATA-AC-AG-C-ACG-C-ACAA-GTC-------------TA-TCATTT-GG---AAAATT----------TCA----A--ATT--A-C--C--A-T-C-G--TC-T--CAT-G---GAA--AT-AA-ATA
gi|41 : A---------A-A---A----TAT-ATA-ACTGG-C-ACG-C-ACAT-GTC-------------TA-TCATTT-GG----AAAAT----------AT--TA-A--TTTTAA-C--TA-A-T-C-GC-TA-T--CAT-G---GAAT-AT-CA-ATAg
gi|43 : gcgaattaacattct-C-ACG-C-ACAT-GTCTATAGC-T--A-ATG-TCATTTTGA---AAAAAA----------ATA-TT-AA-TTT--A-C--T--A-T-C-G--
gi|44 : a-G-TACTCTT-CCT-TCGTGAT--TCCAACG------CAGAGG--C-------ATGCA-------TATGTTA-TATTG-T---G-TGC---TTAT-ACTAAA--CGCTAGaataagatataattat
gi|45 : -----AAC--A---------C-G-CACTGT---CT---GTGAT--TCCAACA------TACA-G--T-------ATACA-------TA-A-TA-TATTT-T---G-TGC---TTA--ACTAAA--CGCTAG
gi|47 : --TGCTATGT---CTCA----------AA-----CTATCG---AAGTTT----GACAACT------TATCG-
gi|48 : caagtttcagTTTCT-CAAG---AA----------G-----------G---A-----T----TCCTTG------GA-----ATCAATAGG---C-GGA-GCGGA--T--TTTT-AC
gi|49 : CAATTTTCAATGGATACT-------TTC-AATATTG-ACA-TGA-T--TTT-ATATAA--TT
gi|5 : GCCTTACAT-CTG--T-ATC-TTC--TCTCTGACT-CA----T-T--TATCGTATCTTA-TTC------CATATAA--TTAGGGAATATT--------C---------TT-----TTGTT-C-------------GAAAACAAC-CCTTCGA-ATTTGCTA-TGGATTAA-CA---TA--T----------------------CCGATCAATAATATATTT--ACCTAGAAA---TTAGCGGAGC-ACAAA--CCT-TCCAA--TT-CTG--C-GTGGAT---------T----TA-AC--AA-TG--------------A------ATTA-AAGAGAA-AA-----GTAGT-A-TGATGGAA-AAT--GT-TTCT-TT-A-T-AAATT-T--TTGA-G-----AAA---------------A------------------AA---------A-A---A----AAT-ATA-AC-GA-C-ACG--CACAT-GTCTATAGC-TTAA-CTATTCATTT-GG---AAAAA-----------ATA-TT-A--ATT--A-C-----A-T-C-G--TC-T--CAT-G---GAA--AT-AA-TTA
gi|5 : AGTG-AC--TGATT--TT--ATATAAATCTC--TGAAAGAGGT-----CAT-------------AA---CTAGTC--GCATCAAGC---ATT-----AAC--A---------C-G-CACTGCT-CCC-T-GTGATC-TCCAACAT-----TACAGGA-G-------ATACA-------TATATTA-TATTTAT---G-TGC---TTAT-ACTAAAACCGCTAGTtatatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctagcttcttggtgcgagctaacactcgccatcatccccacgatccattaagtgactgattttatataaatctctgaaagaggtcataactagtcgcatcaagcattaacacgcactgctccctgtgatctccaacattacaggagatacatatattatatttatgtgcttatactaaaaccgctagta
gi|50 : gccttacatctgtatcttctctctgactcatttatcgtatcttattccatataattagggaatattcttttgttcgaaaacaacccttcgaatttgctatggattaacatatccgatcaataatatatttacctagaaattagcggagcacaaaccttccaattctgcgtggatttaacaatgaattaaagagaaaagtagtatgatggaaaatgtttctttataaatttttgagaaaaaaaaaaatataacgacacgcacatgtctatagcttaactattcatttggaaaaaatattaattacatcgtctcatggaaataattatatatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctagcttcttggtgcgagctaacactcgccatcatccccacgatccatta-------ATACA-------TATATTA-TATTT-TAATG-TG-T--TTAT-ACTAAA--CGCTAGTa
gi|6 : TTAAATTCTGG-T-ACT-CGC--CC---GACT-CAA-TTA-T--T-TCACACCCTTGTTTGCT------------TTAGGAAAAATCTAGG-GAAC---------TT-----TAATT-CTTTTGTGCG----AAA-----A-CCTTCGA--TTTGCCA-TGGATTAAACAA--TG--CTCTCTT--TTTAAACATTCGCGCCGATC--TAATA---------------A---TTAGCGGA-C-ACAAAAACCT-TTCCA--AT-TTG--C-ATGGAT---------T----TT-AC--AA-TG--------------A------ATTT-A--AGAA-AA-----GTTG--A-TGAATGAA-AATGCGA-TTTT-TT-A-C-A---T-T--TTGA-G------------------------------------------AA---------A-A---A----AAT-ATA-AC-GA-CAACG-GCACAT-GTCTAT-GC-T--A-CTA-TCATTT-GG---AAAAAT----------AT--TA-A--TTT--A-C--G--ATT-C-G--TCTT--CAT-G---GAA--AT-AA-ATAAA-------------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--------------NNNNNNNNNNNNNNNNACCAATC---TTC-AATAG-G-ACATTGAAT--TTT-ATATAA--TTC--TGAAAGAGGTATTGATAT---AATAC-TT-GAA---CTA-TC--GCAC-AAAC---ATT-----AAC--A---------C-G-CACTGTTGCCT-TTGTGAT--TCAACCA------TACAGGTAT-------ATACA-------TATATTA-TATTT-T---G-TGCT--TTAT-ACTAAA--CGCTa
gi|7 : TTAAATTCTGG-T-ACT-CGC--CC---GACT-CAA-TTA-T--T-TCACACCCTTGTTTGCT------------TTAGGAAAAATCTAGG-GAAC---------TT-----TAATT-CTTTTGTGCG----AAA-----A-CCTTCGA--TTTGCCA-TGGATTAAACAA--TG--CTCTCTT--TTTAAACATTCGCGCCGATC--TAATA---------------A---TTAGCGGA-C-ACAAAAACCT-TTCCA--AT-TTG--C-ATGGAT---------T----TT-AC--AA-TG--------------A------ATTT-A--AGAA-AA-----GTTG--A-TGAATGAA-AATGCGA-TTTT-TT-A-C-A---T-T--TTGA-G------------------------------------------AA---------A-A---A----AAT-ATA-AC-GA-CAACG-GCACAT-GTCTAT-GC-T--A-CTA-TCATTT-GG---AAAAAT----------AT--TA-A--TTT--A-C--G--ATT-C-G--TCTT--CAT-G---GAA--AT-AA-ATAAA-------------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--------------NNNNNNNNNNNNNNNNACCAATC---TTC-AATAG-G-ACATTGAAT--TTT-ATATAA--TTC--TGAAAGAGGTATTGATAT---AATAC-TT-GAA---CTA-TC--GCAC-AAAC---ATT-----AAC--A---------C-G-CACTGTTGCCT-TTGTGAT--TCAACCA------TACAGGTAT-------ATACA-------TATATTA-TATTT-T---G-TGCT--TTAT-ACTAAA--CGCTtag
gi|8 : TTAAATTCTGG-T-ACT-CGC--CC---GACT-CAA-TTA-T--T-TCACACCCTTGTTTGCT------------TTAGGAAAAATCTAGG-GAAC---------TT-----TAATT-CTTTTGTGCG----AAA-----A-CCTTCGA--TTTGCCA-TGGATTAAACAA--TG--CTCTCTT--TTTAAACATTCGCGCCGATC--TAATA---------------A---TTAGCGGA-C-ACAAAAACCT-TTCCA--AT-TTG--C-ATGGAT---------T----TT-AC--AA-TG--------------A------ATTT-A--AGAA-AA-----GTTG--A-TGAATGAA-AATGCGA-TTTT-TT-A-C-A---T-T--TTGA-G------------------------------------------AA---------A-A---A----AAT-ATA-AC-GA-CAACG-GCACAT-GTCTAT-GC-T--A-CTA-TCATTT-GG---AAAAAT----------AT--TA-A--TTT--A-C--G--ATT-C-G--TCTT--CAT-G---GAA--AT-AA-ATAAA-------------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--------------NNNNNNNNNNNNNNNNACCAATC---TTC-AATAG-G-ACATTGAAT--TTT-ATATAA--TTC--TGAAAGAGGTATTGATAT---AATAC-TT-GAA---CTA-TC--GCAC-AAAC---ATT-----AAC--A---------C-G-CACTGTTGCCT-TTGTGAT--TCAACCA------TACAGGTAT-------ATACA-------TATATTA-TATTT-T---G-TGCT--TTAT-ACTAAA--CGCTtag
gi|9 : TAG-T-ATC-CTCG-CC---GACT-AAA-TAT-T--G-T----------TGTGCTA-ACGTCCAAGTTTAGGAAAT-TC-GGG-AA-C---------TC-----TAGTT-CTTTTGTTGCATATAAA-----C-CCTTCGA-TTTTGC-A-TGGATTAAACAA--TGC-TTCTTTC--TT-AAACAA-CGCGTCGATC--TAAT-TATTTGTACTA--GAA---TTAGCGGA-C-ACAAC--CCT-TT-GT--TT-TTG--A-TTGGAT---------T----TTAAC--AAGTGTTGTTTATTTGAAAA------ATTA-G--AGAA-AA-----GTTAGTA-TAAATTAAGAAT--GG-TTCG-TT-ATT-A---T-T--CTAA-G---A-GTA---------------A------------------TA---------T-A---GTATTAGT-ATATAC-AGCC-ACG--CACAT-GT------C-T--A-TTA-TCATTT-GGAAAAAAAATA---------ATA-TA-AG-TCC--A-C--C--A-G-C-G--T--T--CAG-A---GGA--AT-AA-ATAAAGT--------ATtag
gi|9 : actTCTATT-A-TCA---T-T--T----G---G-AAA---------------A------------------AA---------A-A---T----AAT-ATA-A------------------GTC-------C--A-CCA-GCGTTC-AG---AGGAAT----------AAA-TA-AAGTAT--A-C--T--A-T---G--TC-TAACGT-GATAGAACAAT-AG-GNNNNNN--------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTC--------------C--ATTTTCAATGGAAA--AACT---TTC-AATAGTG-AAA-TGATT-------------------TG-AGGAGGTATTactatgtctaacgtgatagaacaataggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntccattttcaatggaaaaactttcaatagtgaaatgatttgaggaggtatta
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): TACTATCGTCTCATGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG
Unaligned ( gi|42 ): CGAACAAAGTTGAACATTGGATGATTATTCGTATTCTTGTATTAACACGTATCGAAGTAGGTTTTATGACTTTCTTAAATATC
Unaligned ( gi|46 ): ACAAAACAAAAAACGCGCCATTTTTTTCTCAAGAACAATTCCTTGAAATC
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1111111 11 111 3333333333333333333 111 33 111 111 22 11111111111 111111 1 3333333333333333333333 1 1 888888888888888888888888888888 2222 666666666666666 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 2 1111 1 555555555555 11 1 777777777777777777777777 111111 1 3333333333333333333333 111 111111111 444444444444444444444 5555555555555555555555555555555555555555555 222 44444444 22222222222222222 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 11 1 1111111 222 1111111111 111
lowQualScore : 66 4 4 33 44 5 888 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 2 8 66 33 2 2 77 8 0 2222222 2 2 77777 8 2 666 888888 6666 2 2 33 8 2 66 44 5 2 11 2 666666 2 000 0000000000000000000 4 111 66 777 55 111 5 444 4 44 55 666 3 88888888888 8888 4 666 7777 000000 3 777 4 0 2222222222222222222222 88 999 3 0 3 99 0 888888888888888888888888888888 4 4 66 9 0000 1 0 444444444444444 6 8 2 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 0 4 8 4 4 1111 4 4 7777 4 6 3 444444444444 77 6 3 0 5555 0 111111111111111111111111 000000 88 3 3 22 44 1111111111111111111111 44 6666 66 777 6 3 3 888 3 4 44 2 33 2 000000000 5555 2 33 2 555555555555555555555 2 33 2 77777 55 2 3 2 88 4 1 1 1 555 1 22 9999999999999999999999999999999999999999999 333 44444 44444 1 1 1 3 5 333 1 99999999 22 1 1 1 333 22222222222222222 44 22 1 44444 5 1 1 44 6 22 2 333 66 66666 2 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1 1 77 555 0 5 8 1 33 33 777777 33 33 0 3 1111111 33 2 2 222 66 999 7 2 4 55 999999 6666666666 8888888 2 2 444 2 888 2 33
lowQualScore : .. . . .. .. . ... ........................................................................ . . .. .. . . .. . . ....... . . ..... . . ... ...... .... . . .. . . .. .. . . .. . ...... . ... ................... . ... .. ... .. ... . ... . .. .. ... . ........... .... . ... .... ...... . ... . . ...................... .. ... . . . .. . .............................. . . .. . .... . . ............... . . . ................................................................. . . . . . .... . . .... . . . ............ .. . . . .... . ........................ ...... .. . . .. .. ...................... .. .... .. ... . . . ... . . .. . .. . ......... .... . .. . ..................... . .. . ..... .. . . . .. . . . . ... . .. ........................................... ... ..... ..... . . . . . ... . ........ .. . . . ... ................. .. .. . ..... . . . .. . .. . ... .. ..... . ..................................................................................... . . .. ... . . . . .. .. ...... .. .. . . ....... .. . . ... .. ... . . . .. ...... .......... ....... . . ... . ... . ..
lowQualScore : 77 0 0 11 66 3 333 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 7 0 33 77 7 5 99 6 1 0000000 9 9 11111 6 9 888 222222 1111 9 9 99 6 9 88 33 0 9 88 9 888888 9 666 1111111111111111111 0 222 55 000 55 444 7 222 0 55 00 444 6 00000000000 5555 4 444 7777 555555 6 000 0 9 9999999999999999999999 66 888 6 9 6 00 6 777777777777777777777777777777 4 4 11 0 4444 9 8 444444444444444 7 8 2 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 4 9 4 4 8888 4 4 1111 4 4 3 666666666666 99 5 6 9 3333 4 999999999999999999999999 888888 88 3 3 22 66 1111111111111111111111 22 8888 55 000 2 1 1 666 1 0 22 9 99 9 777777777 7777 7 77 5 111111111111111111111 2 11 2 88888 33 2 1 0 22 0 8 8 8 000 8 55 4444444444444444444444444444444444444444444 000 33333 33333 7 7 7 3 0 222 7 33333333 33 7 7 7 000 55555555555555555 33 55 8 77777 5 9 9 55 0 88 2 999 33 77777 7 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 9 9 00 444 8 3 0 1 77 33 222222 22 44 0 7 5555555 33 9 9 111 33 111 5 5 7 99 777777 9999999999 1111111 5 5 444 5 999 7 77
consensus : CAACAAANAA-TAC-GGG-TCTTGT--GTTTTCT-CAAG---AA----------G-----------A---A-----T----T-------------A-----GGA------------CGGA-G-CGGA--T--ATTT-ACGA--TG-TACATGTATA----C-AC-A-----AGT-AT-C-T-G------GT----ATTAC-ATG-CC--AC-GT-GCG--AGT-AATACCTG-T--ACC-TG-T--C-TT-GTC--AAAACAAAGG-ATT--------------AT-CTAATCA--CTG-CT---CA--ATTTAGA---TAT-A-TG-TG-C--TGCTCTGT---C-CA----------AAA--A-CTATCG---AAGTTT----GACAACT------TATCG-G---A-AAGGTATAG-TTCT-----G-------TCTNA---TCAT--GA-GTTTTCAACT-A-TAC-ATTTTG-ATAATGC-AT-TGGGA-GA--ATGGACTAC-ACG-ACAGA-CT-TCGA--ACTAAAACCGAGATTGGATGC-GAA-TTGG--ATG-CGT-CTTATCATTCTCTCCTCTGCTCGACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGCCTTAAAT-CT-GG-T-ATC-CGC--CCGACT-CAA-TAT-T--T-TCACACCCTT-TTTGCTA-ACGTCCAAGCTTAGGAAANATCTAGG-GA-C-TC-TAATTCTTT--T------GT-C-----G-----AAA----C-CCTTCGA-ATTTGC-A-TGGATTAAACAA--TG--TTCTCTTT--T-AAA-CAC-CGCGCCGATC--TAATATATTT-TACCCAGAA-TTAGCGGA-C-ACAAA--CCT-TTCGA--AT-TTG--C-GTGGAT---------T----TT-AC--AA-TG--------------A------ATTT-A--AGAA-AA-----GTTG--A-TGAATNAA-AAT--GG-TTCT-TT-A-TA---T-T--TTGAG---AAA----------------AAA----------------AA---A-----AA-----T-ATA-AC-GG-C-ACG--CACAT-GTC-AT-GC-T--A-CTA-TCATTT-GG---AAAAAT----------ATA-T-AA--TTT--A-C--T--A-T-C-G--TC-T--CAT-G---GAA--AT-----AA-ATA----------AAAT---------AT-A-TATGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCCAATTTTCAATGGAAACCAATC---TTCAATAGTG-ACA-TGATT--TTT-ATA------TAA--TTC--TG-AAGAGGTATTGATAT---AATAC-CT-GAACTA-TCGCA--NAACATTAAC--AC-G-CACTGTT-CCT-TCGTGAT--TCCAACA------TACAGG--T-------ATACA-------TATATTA-TATTT-T---G-TGCT--TTAT-ACTAAA--CGCTAGT
Reference ( family-365 ) : CAACAAANAA-TAC-GGG-TCTTGT--GTTTTCT-CAAG---AA----------G-----------A---A-----T----T-------------A-----GGA------------CGGA-G-CGGA--T--ATTT-ACGA--TG-TACATGTATA----C-AC-A-----AGT-AT-C-T-G------GT----ATTAC-ATG-CC--AC-GT-GCG--AGT-AATACCTG-T--ACC-TG-T--C-TT-GTC--AAAACAAAGG-ATT--------------AT-CTAATCA--CT--CT---CA--ATTTAGA---TAT-G-TG-TG-C--TGCTCTGT---C-CA----------AAA--A-CTATCG---AAGTTT----GACAACT------TATCG-G---A-AAGGTATAG-TTCT-----G-------TCTNA---TCAT--GA-GTTTTCAACT-A-TAC-ATTTTG-ATAATGC-AT-TGGGA-GA--ATGGACTAC-ACG-ACAGA-CT-TCGA--ACTAAAACCGAGATTGGATGC-GAA-TTGG--ATG-CGT-TTTATCCTTTTCTCCTCTGCTCGACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGCCTTAAAT-CT-GG-T-ATC-CGC--CCGACT-CAA-TAT-T--T-TCACACCCTT-TTTGCTA-ACGTCCAAGCTTAGGAAANATCTAGG-GA-C-TC-TAATTCTTT--T------G--------G-----AAA----C-CCTTCGA-ATTTGC-A-TGGATTAAACAA--TG--TTCTCTTT--T-AAA-CAC-CGCGCCGATC--TAATATATTT-TACCCAGAA-TTAGCGGA-C-ACAAA--CCT-TTCGA--AT-TTG--C-GTGGAT---------T----TT-AC--AA-TG--------------A------ATTT-A--AGAA-AA-----GTTG--A-TGAATNAA-AAT--GG-TTCT-TT-A-TA---T-T--TTGAG---AAA----------------AAA----------------AA---A-----AA-----T-ATA-AC-GG-C-ACG-CCACAT-GTC-AT-GC-T--A-CTA-TCATTT-GG---AAAAAT----------ATA-T-AA--TTT--A-C--T--A-T-C-G--TC-T--CAT-G---GAA--AT-----AA-ATA----------AAAT---------AT-A-TATATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCCCAATTTTCAATGGAAACCAATC---TTCAATAGTG-ACA-TGATT--TTT-ATA------TAA--TTC--TG-AAGAGGTATTGATAT---AATAC-CT-GAACTA-TCGCA--AAACATTAAC--AC-G-CACTGTT-CCT-TCGTGAT--TCCAACA------TACAGG--T-------ATACA-------TATATTA-TATTT-T---G-TGCT--TTAT-ACTAAA--CGCTAGT
gi|1 : CAACAAACAA-TAC-GGACTCTTGCCAGTGTTCTACAAG---AA----------G-----------A---A-----T----T-------------A-----GAA------------CGGA-G-CGGA--CCGATTT-ACGA--TG-TACATGTATA----CTAC-ATGTAGGGT-AT-C-T-G------GT----GT-AC-AT-------C-GT-GCGTTAG---ATACCTG-T--ACC-TGGT--CGTT-GTC--AAAACAAAGA-ATT--------------ATTCTAATCAAACT--CT---CA--AGTTAG----TAT---TA-T--T--TGCTCTGT---C-CA----------AAA--AACTATCG---AAGTTT----GACAACT------TATCGTG---A-AACGTATAG-TTCT-----C-------TCTTA---TCAT--GAAGGTTTCAACT-A-TAC-ATTGTG-ATATTGC-AT-TGGGA-GA--ATGAATCAT-ACA-ACAGATCTATCGACCACTAAAACTGAGATTAC-TCC-GAAATTGGCAATATCGTATTTATCCTTTTCTCCTCTGCTCGACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGCCTTAAATACT-GG-T-ATC-CGC--CCGACT-CAA-TAT-T--T-TCACACCTTT-TTTGCTAGACGTCCAAGCTTAGGAAACATCTAGG-GA-C-TC-TAAT-----------------------------AAA----C-CCTTCGA-ATTTGC-A-TGGATTAAACAA--TG--TTCTCTTT--T-AAAACAC-CG-GCCGA-C--TAATATATTT-TACCTA-AA-TTAGCGGA-C-ACAAA--CCT-TCCAA--AT-TTG--C-GTGGAT---------T----TT-AC--AA-TG--------------A------ATTT----AGAA-AA-----GTTG--G--GAATGAA-AAT--GG-TTTT-TT-A-CA---T-T--TTGAGAAAAAA----------------AAA----------------AA---A-----AA-----T-ATA-AC-GA-C-ACG-CCACATCGTCAATAGC-T--A-CTA-TCATTT-GG---AAAAAT----------ATA-T-TA--TTT--ACC--T--A-TGC-G--TC-T--CATAG---GAA--AT-----AA-ATA----------AAATGATNNNNNNNN-N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCAGTC---TTCCATAGTG-ACA-TGATT--TTTGATA------TAA--TTC--TG-AAGA-GTATTGATAT---AATACTTT-GAACTA-TCGCA--ACACATTAATCAAC-G-CACTGTT-CCTGTTTTGATGATCCAACA------TACAGC--T-------ATACA-------TATATTA-TATGT-T---G-TGCTAATTATAACTAAA--CGCTAGT
gi|10 : CTTAAAT-CT-GG-TTATCTCGC--C-GACT-AAA-TAT-AAAT-TAACACATTT-TTTGCC-------------TAGTAAA---CTCGGCGA-C-CCCTAATTCCTT--TTGTTGCG--------A-----AAA----C-CCTTCGA-ATTTGC-A-AGGATTAAATAAATTGAATCCTGTTTCTT-AAA-CAC-C-CGCCGATC--TAATATACTT-TACCAGGAA--TAGCGGA-TAACAAC--CCT-TCC----AC-TTGCTC-GTGGAT---------T----TT-AC--AG-TG--------------A------ATTTAA--AGAA-AA-----GTTG--A-TGAATATT-AAT--GG--TGT-TT-A-TAT--T-T--TTG------AA----------------AAA----------------AT---A-----AA-----T-ATA-AC-GG-C--CG-C-------TC-AT-GTGT--A-CAA-TCATTT-AG---AAAAAA----------ATATT-AC--TTT--A-C--T--A-
gi|10 : CCAATT--CAATGGAAAAAAACCCTTTTCAA-AATG-ACA-TGAGT--TTT-ATA------TAA--TTTCGTG-AAGAGATATT-ATAC---Annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaattcaatggaaaaaaacccttttcaaaatgacatgagttttatataatttcgtgaagagatattatacatt
gi|11 : cttaaatctggttatctcgccgactaaatataaattaacacattttttgcctagtaaactcggcgacccctaattccttttgttgcgaaaacccttcgaatttgcaaggattaaataaattgaatcctgtttcttaaacacccgccgatctaatatactttaccaggaatagcggataacaacccttccacttgctcgtggattttacagtgaatttaaagaaaagttgatgaatattaatggtgtttatatttttgaaaaaataaatataacggccgctcatgtgtacaatcatttagaaaaaaatattactttactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAACAAAAAG-TAC-GG--TCTTGT--GTTTTCT-CAAG---AA----------G-----------A---A-----T----T-------------A-----GTA------------CGGA-GGCGGA--T--ATTT-AC-A--TGCTACATGTATA----C-AC-A-----ACTTAT-C-T-G------GT----ATTAC-ATG-CC--ACCGT-GCG--AGT-AATACC-G-TTAACC-CA-G--T-TT-GTC---AAACAAAGG-A-T--------------AT-CTAATC---CTTGCT---CA--ATTTAGA---TAT-A-TG-TGTC--TGCCTTGT---C-CA----------AAA--A-C-ATCG---AAGTTT----GACAACT------TATCG-G---A-AAGGTATAGTTTCT-----G-------CCTCAAATCCAT--GC-GTTTTCAACT-ATTAC-ATTTT--ATAATGC----------------GGACTAC-ACA---AGA-CT-TCGA--ACTAAA--CGAGATTGGATGC---------------CGT-CTTATCATTCTtt
gi|12 : aAACAAAAAG-TAC-GG--TCTTGT--GTTTTCT-CAAG---AA----------G-----------A---A-----T----T-------------A-----GTA------------CGGA-GGCGGA--T--ATTT-AC-A--TGCTACATGTATA----C-AC-A-----ACTTAT-C-T-G------GT----ATTAC-ATG-CC--ACCGT-GCG--AGT-AATACC-G-TTAACC-CA-G--T-TT-GTC---AAACAAAGG-A-T--------------AT-CTAATC---CTTGCT---CA--ATTTAGA---TAT-A-TG-TGTC--TGCCTTGT---C-CA----------AAA--A-C-ATCG---AAGTTT----GACAACT------TATCG-G---A-AAGGTATAGTTTCT-----G-------CCTCAAATCCAT--GC-GTTTTCAACT-ATTAC-ATTTT--ATAATGC----------------GGACTAC-ACA---AGA-CT-TCGA--ACTAAA--CGAGATTGGATGC---------------CGT-CTTATCATTCTtgtacaaacaatacatgcatctaagttagctgcatcggatttcctcaatatcaactgacatag
gi|13 : aAACAAAAAG-TAC-GG--TCTTGT--GTTTTCT-CAAG---AA----------G-----------A---A-----T----T-------------A-----GTA------------CGGA-GGCGGA--T--ATTT-AC-A--TGCTACATGTATA----C-AC-A-----ACTTAT-C-T-G------GT----ATTAC-ATG-CC--ACCGT-GCG--AGT-AATACC-G-TTAACC-CA-G--T-TT-GTC---AAACAAAGG-A-T--------------AT-CTAATC---CTTGCT---CA--ATTTAGA---TAT-A-TG-TGTC--TGCCTTGT---C-CA----------AAA--A-C-ATCG---AAGTTT----GACAACT------TATCG-G---A-AAGGTATAGTTTCT-----G-------CCTCAAATCCAT--GC-GTTTTCAACT-ATTAC-ATTTT--ATAATGC----------------GGACTAC-ACA---AGA-CT-TCGA--ACTAAA--CGAGATTGGATGC---------------CGT-CTTATCATTCTtgtacaaacaatacatgcatctaagttagctgcatcggatttcctcaatatcaactgacatag
gi|14 : a-TA--------------A------ATTT-A--AGTA-AA-----GTTG--A-TGGATTAA-AAC--GG-TTCT-TT-A-TA---T-T--TTG------AA----------------AAA----------------AA---A-----AA-----T-ATA-AT-GG-C-ACG--TATAT-GT------C-T--A-CTA-TCTGGT-GG---AAAAAT----------ATA---AA--TTT--A-C--T--A-T-C-G--TC-T--CGT-G---GAA--AT-----AA-ATT----------AGAT---------AT-A-TATATtgtacaaacaatacatgcatctaagttagctgcatcggatttcctcaatatcaactgacatag
gi|14 : ctGGAAA--AACT---TTCAATAGTG-ATA-GGATT--T---ATA------TAA--TTC--TG-AAGAGGTATTAA------AATAC-CT-GATCTA-TCGAA--CAACATTAAC--AC-G-TACTGTT-CCT-TTGTGAT--TCCAACA------TAGAGG--T-------ATGCATACAGTGTATATTA-TGTTT-T---G-TG-T--CTAT-ACTAAA--CGCTAGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaaaaactttcaatagtgataggatttatataattctgaagaggtattaaaatacctgatctatcgaacaacattaacacgtactgttcctttgtgattccaacatagaggtatgcatacagtgtatattatgttttgtgtctatactaaacgctagt
gi|15 : cttaaatttaagtaaagttgatggattaaaacggttctttatattttgaaaaaaaaaatataatggcacgtatatgtctactatctggtggaaaaatataaatttactatcgtctcgtggaaataaattagatatatatatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAAAAAGAAGCAC-AGG-CCTTCT--ATTTTCT-CAAGGACAA----------GTCCTTGGAATCA---A-----T----T-------------A-----GG--------------GGA-G-CAGA--T--ATTT-ACGA--TG-CACATG--------C-AT-A-----GGT-AT-C-TTG------GA----ATCAC-ATG-CC--GC-GT-GCG--AGT-AATACC---T--ACC-TG-T--C-TT-GTC--AAAATAAAG--------------------------TCA--CTA-CT---CA--ATTTAGA---T-T-A-TG-T--C--TGTTCTGC---T-C-----------AAA--A-CTATCG---AAGTTG----AACAATT------TATCG-G---ATAATG-ATAT-TTGT-------------TCCTA---TCAT--GA-ATACTCAACT-------ATTTGG-AT-ATGCGAT-TGG---AA--ATA----AC-ATGCACGGA-CA-TCGA--AC-AAAACT-AAATTGGATGC-G
gi|16 : AA-AAT--GG-TTCT-TT-A-TA---T-T--T--------AA----------------AAA----------------AA---A-----TA-----T-ATA-AC-GG-C-ACG-C-ACAT-GTC-------T--A-CTA-CCTTGT-GG---AAAAAT----------AT--T-AA--TTT--A-C--T--A-T-C-G--TG-T--CAT-G---AAA--ATTAAATAA-ATATNNNNNNNNNNNNN---------NN-N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCAATTTTGAATGGAAA--AACT---TTCAATAGTG-ACA-TGATT--TT--ATA------TAA--TTC--TG-AAGAGGTATTAA-AT-----TAC-CT-G-ACTA-TCGAA--CAACATTAAC--AC-GCCACTGTT-CCT-TTGTGAT--TCC----------TAC--------------------------ATATTATTATTT-T---GATGC---TTAT-ACTAAG--CGCTAGttttctccgccatgtacacgcatatcgaagtaggccgtgtgatttcctcaaatatcacacaca
gi|17 : tCAACAA-CAA-TAC-GGG-TCTTGT--GTTTTCT-CAAG---AA----------G-----------A---A-----T----T-------------A------GA------------CGGA-G-CGGA--T-------------------ATGTATA----C-AC-A-----AGT-AT-C-G-GGTACATGT----ATTAC-ATG-CC--AC-GT-GCG--AGT-AATACCTG-T--ACC-TG-T--T-TT-GTC--AAAACAAAGG-A-T--------------AT-CTAATCA--CTG-CT---AA--ATTTAGA---T-T-A-TG-T--C--TGCTCTGT---C-C-----------AAA--A-CTATCG---AAGTTT----GATAACT------TATCG-G---A-AAGGTATAG-TTCT-----GC------TCTAA---TCAT--GA-GCTTTCAACT-A-TAC-ATTTTG-AT-ATGCGAT-TGG---GA--ATGA--TAT-AC--ACAGA-CT-TCGA--AC-AAAACTTA-ATTGGATGC-GAA-TTGG--ATG-CGT-TTTATCc
gi|18 : a--------------A------ATTT-A--CGAA-AA-----GTTT--A-TGAACCAA-AAT--GG-TTCT-TT-A-TA---T-T--TTG-----------------------------------------------------------------A-AC-GG-C-ACG----CAT----------------------ATTT-GG---GAAAA-----------ATA---AA--TTT--A-C--T--A-T-A-G--CC-T--T-------NNN--NN-----NN-NNN----------NNNN---------NN-N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNGTG-AAA-T-CTT--TTA-ATAGTGACATAA--TTC--TG-AAAAGATATT--TAG---AATAC-GT-GAACTC-TCATG--CAACATGAA--------CACCGCT-CCT-TCGTGAT--T-CAACA------AACAGG--T-------Aagtcttgt
gi|19 : ttGT--TTTTTCT-CAAG---AA----------G-----------A---A-----T----TT------------A-----GGA------------CGGA-G-CGGA--T--CTCT---GA--TG-TACATGTATAGTAAC-ACCA-----AGT-AT-C-TTG------GTGCCTATTACCATGACC--AC-GT-GCG--GGT-AATACCTGTT--ACCGTG-C--C-TTGGTCAAAAAACAAAGG-ATA--------------GT-CTAATCA--CTG-CTTTCCAGTATTTA-A---TATAA-TGTTC-C--TGCTCTGTATCC-CACACATATTACAAAATA-CT-CCGAACAAGCTCTGTAGACAACCAGTTTATATC--G---A-AAAGTATA--TTCT-----GC------TCTAA---GCAT--GA---TTTCAACTGA-TAC-ATTc
gi|2 : AACAAAGCA-TAC-GGG-TCTTGT--GTTTTCT-CAAG---AA----------G---------------A-----T----T-------------A------GA------------CGGA-G-CGGAT-T--ATTT-ACGA--TG-TACATGT-------T-AC-A-----AGT-AT-CAT-G------GT----ATTAC-ATG--C--AC-GT-GCG--AGT-AATA-CTG-T--ACC-TG-T--A-TT-GTC---AAACAAGG----T--------------AT-CTAGATA--CTG-CT---C---ATTTAGA---T-T-ACTG-TC-A--TGCTCTGT---C-------------AAA--A-CTATCG---AAG-TT----GACA--T------TAT---G---G-AAGGTATAG-TT-T-----G-------TCTAAT--TCATC-GA---TTTCAACT-A-TACTATTTTGAATAATGG-AT-TGGGA---------ATT-----------A-CT-TCGA--ACTAA--------------GCTGAA-TTGG--ATG-CGT-TTTAatatag
gi|2 : aCGTCCTAAAT-CT-GGAT-ATC-TGC--C-GA-T-CAA-TAT-T--T-TCACACTTTT-TTTGCTA-ACGTC---GCCTAGGAACT-CCTAGG-GA-CATA-GATTTCTTT--T------GTTTGACGAA-----AAA----A-CCTTCGA-ATTTGC-AATGGATTAAAACA--TG--TTTTTTT-------A-CAC----GACGATC--TAATATATTT-TACCTAGAA-TTAGC-GA-C-ACAAA--C---TTCCA--AT-TTG--C-GTGGAT---------T----TT-AC---A-TG----------------------TTT-A--AGAA-AAT----GTTG--A-TG-ATTGA-AAT--GG-TTTT-TTAA-CA---TAT--TTGAG----------------------AAA----------------AA---A-----AC-----T-AT--AC-GA-A-ACG-TAACAT-GTT-AT-AG-T--A-CTA--CATTT-GG----AAAAT----------AT--T-AA--TTT--A----T--A-T-CTG--TC-T--CAT-G---AGA--AT-----AAGATA----------AAAT---------ATNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAATC---TTC-ATAGTGAACA-T-ATT--T----TA------TAA--TTC--TG-AAGAGGTATTGAATT---AATA--TT-GAACTA-T---G--AAAC-TTAAC--ACAG-CATGGTT-CCT-TTGTGA---TCCAACA------TACGG------------TACA-------TATATTA-T-TTT-T---G-TGCT--T--T-ACT-AA--CGCTatcatacttgtaccaatacatgatcgaagttgtgcatgagtttctccatattgacacagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcttcgtcctaaatctggatatctgccgatcaatattttcacactttttttgctaacgtcgcctaggaactcctagggacatagatttcttttgtttgacgaaaaaaccttcgaatttgcaatggattaaaacatgtttttttacacgacgatctaatatattttacctagaattagcgacacaaacttccaatttgcgtggattttacatgtttaagaaaatgttgatgattgaaatggttttttaacatatttgagaaaaaaactatacgaaacgtaacatgttatagtactacatttggaaaatattaatttatatctgtctcatgagaataagataaaatatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaatcttcatagtgaacatattttataattctgaagaggtattgaattaatattgaactatgaaacttaacacagcatggttcctttgtgatccaacatacggtacatatattatttttgtgctttactaacgct
gi|20 : aaacaaagcatacgggtcttgtgttttctcaagaagattagacggagcggattatttacgatgtacatgttacaagtatcatggtattacatgcacgtgcgagtaatactgtacctgtattgtcaaacaaggtatctagatactgctcatttagattactgtcatgctctgtcaaaactatcgaagttgacattatggaaggtatagtttgtctaattcatcgatttcaactatactattttgaataatggattgggaattacttcgaactaagctgaattggatgcgttttaatcatacttgtaccaatacatgatcgaagttgtgcatgagtttctccatattgacacagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctt-----AAA----C-CCTTCGA-ATTTGC-A-TGGATTA-------------------------------CGCGCCGATC--TA-T-TGTTT-TACCCAGAA-TTAGCGGA-C-ACAA---CCA-TTCGA--AT-TTG--C-TTGGAT---------T----TT-AC--CA-TGTGCTTTTATTTAAAA------ATTT-A--AGAA-AA-----GTTA--A-TGAATTAA-ATT--GG-TTCT-TT-A-TA---T-T--TTGAA---ATA----------------AAATATAACGTTTATAATTAG---A-----AATAAAAT-ATA-AC-GG-C-ACG--CACAT-GT------C-T--A-CTA-TCATTT-GG---AAAAA-----------ATATT-AA--TTT--A-G--T--A-T-C-G--TC-T--CAT-G---
gi|21 : gaaTTTAGAAATTAT-G-T-----C--TGTTCTGT---C-CA----------AAA-----TATCG---AAGTT-------CAACT------TAACA-GGATA-AAGGATTTG-TTCT-----A-------T---A----CAT--GA---TCTCAA-T-A-----ATTGTG-ATAAT-T-ATATGCGATGAGTATG---TATGATC-ATAGG-CT-TCAA--AACAAAAC---GAATGGGTGT-G
gi|22 : agataaccctaccagtTC--TAATAT-TTT-TACCCTGAT-TTAGCGGA-C-ACAGC--CCT-TT-GA--AT-TTG--C-GTGGGT---------T----TT-AC--AA-TGTTCTTTTA------A------AT---A--AGAA-AA-----GTTC--A-TGAATTAA-AAT--GG-TTTT-CT-A-TA---T-T--TTGA----AAA----------------TAT----------------AT---A-----TA-----T-ATA-AC-GG-C-ACG--CACAT-GT------C-T--A-CTA-TCGTTT-GG---AAAAAT----------AT--T-AA--TTT--A-C--T--A-T-C-G--TC-T--CAttttctctatcttgtgcacaacaatatgatatcgaaagtaggccgtttgaagctcctcaat
gi|23 : tgaaacaggtctctgtgTTCT-TA-G---AA----------ATC---------A---A-----T----T-------------A-----GG-------------TGGG-G-CGGA--T--ATTT-ACGA--TG-TACAT----A----C-AC-A-----TGT-AT-C-T-G------GT----TTCAC-ATG-CC--AC-GT-GCG--AGT--ATACTTG-T--ACC-TG-T--C-TT-TTT--AAAACAAAGG-ATT--------------
gi|24 : agaaagcacgggcgtagtattttttaacagcaaTCCAAGCTTAGGAAAC-TC-AGG-GA-C-TC-TACTTC---------------------------AAA----C-CCTTCGA-ATTTGC-A-TGGATTACACAA--TG--CTCTTTCT--T-AAA-CAC-CGTGTCGATC--TAATATATTT-TACCCATAA-ATAGCGGA-C-A-ATA--TCC-TTCGA--AT-TTG--C-GTGGAT---------T----TT-AC--AA-TG--------------tgctttaggtgtgtatatctcccagttgattcgaggaatagaagatt
gi|25 : AACAA-CAA-CACAGGG-TCTGCT--GTTTTCT-CAAG---AA----------C-----------A---A-----T----T-------------ACCTTCGGAATCAAATATAGGCGGA-G-CGGA--T--ATTTTACGA--TG-TACATATGT-----C-AC-A-----AGT-AT-C-A-G------GT----AATAC-ATG-CC--AC-GT-GCGC-AGT-AATACCTT-T--ACC-TG-T--A-TT-GTC--AAAACAAAGGTATT--------------ttctggtgaataagaacataagtt
gi|26 : aAACAA-CAA-CAC-GGG-TCTTGT--GTTTTCT-CAAG---AACAATTCCTCGG-----------A---A-----TCAATT-------------A-----GG-------------CGGA-G-CGGA--T--ATTT-ACGA--TG-TACATGTA---------C-A-----AGT-AT-C-A-G------GT----ATTAC-ATG-CC--AC-GT-GCG--AGT-AATACCTG-T--ACC-TG-T--A-TT-GTC--AAAACAAAGG-ATT--------------tgctc
gi|27 : aaAAACCAATC---TTCAAGTGTGTACA-T-ATTGTTTT-A-A------TAA--T-C--TG-A-GAGGTATTGATAT---AATAC-TTGGAACTA-TCGCAT-TAACATTAACT-AC---CCCTGTT-CCT-TTG-GAT--TTCAACA------TACAGG--T-------ATACA-------T-TATTA-TATTT-T---G--GC---TTAT-ACTAAA--CGCTAGTtgctttcgaataca
gi|28 : TTGT--GTTTTCTACAAAGA-AA----------G-----------AGATA-----T----T-------------GTT---AAA------------CGGAAG-CGGAAAT--ATCT-TCGAATTG--ACTTGT-TN----N-NN-N-----NNN-NN-N-N-N------NN----NNNNN-NNN-NN--NN-NN-NNN--NNN-CGT--TTG-T--AAC-TG-T--C-TT-GTC--AAAACAAAGA---T--------------AT-CTAATCA--CTG-CT---CA--ATTTAGA---Ta
gi|29 : TTCT-TA-G---AA----------ATC---------A---A-----T----T-------------A-----GG-------------TGGG-G-CGGA--T--ATTT-ACGA--TG-TAC----ATA----C-AC-A-----TGT-ATGC-T-G------GT----TTCAC-ATG-CCCAAC-GTGGCG--AGTAAATA-CTG-T--ACC-TG-TCGC-TT-TTT--AAAACAAAG
gi|3 : aagaaagcacgggcgtagtattttttaacagcaaAAACAA-CAC-G---TCTTGT--TTGTCTT-CAAG---AA----------G-----------A---AATTCCT----T-------------------GGATCTATAC-----CGAA-G-CGGA--T--ATT--ACGAACTG-TACAT----A----C-AC-A-----AGT-AT-C-C-G-------T----ATCAC-ATG-CC--AC-AG-CCG--AGT---TACCTG-T--ACC-TG-T--C-TT-GTC--CAAACAAAG--ATTGCTTTCGCACTAATAT-CTAATCA--CT--GT---TA--ATATAGAAT-TAT-G-TG-TG-CATTGTTCT-------CA----------AA-----CTAT-G---AAGTTT----GACAA-T------TATCG-G---A-TAG-TATAT-TTCT-------------TCTAA---TCATATGA-GTTTTCAACT-A-TAT--TTTTG-AT-ATG--AT-AGGGA-TA--A--AAC-AC-ACG-AC
gi|3 : aaCCTTAA---CT-GGAT-ATC--GC--C-GACTTCAA-TATAG--T-TCACACCATT-TTC-CTAGACGTC-GAGCT----AAAAAT--AGA-GA-C-TC---ATTCTTTATT------GC-------G-----AA-------CCTTCGACATTT-C-A-TGGATTA-------------------------------CGCGCCGATC--T----TGTTTATACCCAGAA-TTAGCG-A-C-ACAA---CCA-TTCGA--AT-TTG--C-TTGGATACCAGTGCTT----TT-ATGTAA-----------------A------ATTT-A--AGAA-AA-----GTTA--A-TGAATTAA-ATT--GG-TTCT-TT-A-TA---T-TTATTGAACATAAAATTACGTTATAATTAGAAA----------------AA---A-----AA-----T-ATA-AC--G-C-ACG--CACAT-GTT-----C-T--A-CTA-T-ATTT-GG---AAAAA-----------ATATT-AA--TTT--G----T--A-T-C-GTTTC-T--CAT-G---cactggatctttatcagtcttgtacacacatatcaattggccgtattatttcgtttaaaaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccccttaactggatatcgccgacttcaatatagttcacaccattttcctagacgtcgagctaaaaatagagactcattctttattgcgaaccttcgacatttcatggattacgcgccgatcttgtttatacccagaattagcgacacaaccattcgaatttgcttggataccagtgcttttatgtaaaatttaagaaaagttaatgaattaaattggttctttatatttattgaacataaaattacgttataattagaaaaaaaatataacgcacgcacatgttctactatatttggaaaaaatattaatttgtatcgtttctcatgca
gi|30 : aaaaacaacacgtcttgtttgtcttcaagaagaaattccttggatctataccgaagcggatattacgaactgtacatacacaagtatccgtatcacatgccacagccgagttacctgtacctgtcttgtccaaacaaagattgctttcgcactaatatctaatcactgttaatatagaattatgtgtgcattgttctcaaactatgaagtttgacaattatcggatagtatatttcttctaatcatatgagttttcaactatatttttgatatgatagggataaaacacacgaccactggatctttatcagtcttgtacacacatatcaattggccgtattatttcgtttaaaaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncc---TTTAATAGTG-ACA-TGATT--TT--ATA------TAA--TTA--TG-AATAGGTATTAA------AATAC-CA-GAATTA-TCGCA--CAACATTAAC--AC------TGTT-CCT-TCGTAAT--TCCAATA------TAGAGG--TACCGATAATACA-------TACTTTA-TATTT-T---G-TGC---TTAT-CCTAAA--CGCTca
gi|31 : cactATAGTG-ACA-TGATT--TT--ATA------GAA--TTT--TA-AAGAGGTATGAA------AATAC-CT-GAACTA-TTGCA--CAACATTAAC--AC-G-TACTGTT-CCT-CTGTGAT--TCCAACA------TAGAGG--T-------ATACA-------TATATTA-TATTC-T---G-TGC---TTAT-ACTAAA--CGCTAG
gi|32 : ccatat--------------A------AGTT-A--GGAA-AA-----GTTG--A-TGACTTCA-AAT----------TT-A-TA---T-T--TTGA-------------------------A----------------CG---A-----AA-----T-ATA-AC-GG-C-TCG-CTA-AT-GT--AT-------A-CTA-TCGTCT-GA---AAAAAACCCCAAAACAAAA-T-AA--TTT--A-CTGT--A-T-C-G--TT-T--C
gi|34 : tcaatattttcA------TCA--TTC--TA-AGTCGGTTTTAA-AT-----TAC-CT-GAACTA-TCACA--TTACATAAAC--AC------TGTT-CCT-TTGTGAT--TTCAATATAGATGTACATG--T-------ATACA-------TACATTC-TATTT-T---G-TAC---TTAT-CCTACA--CGCT
gi|35 : T-G--AGAA-AA-----TATG--T-TGAAT--A-AAT--GGGTTCT-TT-A-CA---T-T--T---------------------------------------------------------G-----T-AT---C-G--C-ACG-C-ACAT-GTC-------T--A-CTA-TCATTT-GG---AAAACC----------AAA-TTGA--TTT--A-C--T--A-T-T-G--TC-T--CAC-T---AAA--AT-----AA-ATT----------AAA
gi|36 : aaAA--TTC--TG-AATACATATAGGTATTTAAATAC-CT-AAATTA-TCACA-----CATTAAC--AC------TGTT-CCT-TCGTGAT--TCTAACT------TGGAGG--T-------ATTCA-------TACGTTA-TATTT-T---A-TACT--T
gi|37 : c---------T----TT-AC--AA-TG--------------A------ATTT-A--AGAA-AA-----GTTG--A-TGACTGAA-AAT--GATTTTT-TT-A-CA---T-T--GTGAG-----------------------AA----------------AA---A-----AA-----T-ATA-AC-GA-C-A-G-GCACAT-GTCTATAGC-T--A-CTA-TCATTT-GG---AAAatc
gi|38 : T-TTG--C-GTGGAT---------T----TT-AC--AA-TG--------------TTCTTTTATTC-A--ATCA---------TT-----TAAAAAAA-AAC--GT-TTCT-TT-A-TG---T-T--TTG------------------------AAA----------------AATTTA-----GA-----T-ATA-AC-GA-C-ACG--CACAT-GT-------------CTA-TCATT
gi|39 : AATTAA-AAT--GG-TTCT-TT-A-TA---T-T--TTGAA---ATA----------------TAT----------------AT---A-----TA-----T-ATA-AC-AG-C-ACG--CACAT------T-TC-T--A-CTA-TCATTT-GT---AAAAAT----------AT--T-TA--TTT--A-C--T--A-T-C-G--TC-T--CAT-G---G
gi|4 : AAGTATAG-TTCTTCTTAGCACTATCTCTAA---TCAG--GA-GTTTTCAACC-A-TAT-ATTTTG-AT-ATGCGAT-T--AA-GA--AT--AATAT-AC--ACGGA-CT-TCGA--AC-AAAACTGAA--TGAATG
gi|4 : CCTTAAAT-CTCGG-T-ATT-TGCGGTAGACT-CAAGTAT-T--CCTCACACC--T-TTGGCTAGACG-CCAAGCTTAGAGAAC-TC-GGG-GA-C--C-TAATTCCTT--TTGT---G--------GCGAA-AAA----CGCCTTCGA-ATTTGG-A-TGGATTAACAAA--TT--TTCTTTCT--T-AAA-----CGCACCGATT--GAATATA-TT-TACCAAACATTTAGCGTA-C-ACAAC--CCTGTTCGACCATCTTT--CAATGAAT---------TGGCATT-AC--AA-TGTTCTTTC-------T------ATTA-A--AGAATAAAAATGGTTG--ATTGAAGT-A-AAT--AG-TTTT-CT-A-TA---T-T--TGGGG---GGG----------------GGGGGGGCACGGC------GG---A-----CA-----TCACG-AC-GGCC-ACGCCCACAT------T-GT-T--ACCTA-TCATTT-GA---AAAAA-----------A-A-A-AA--TTT--A-C--TGAG-T-C-G--TC-T--CAT-G---GAA--AT-----AA-Atcgtttctatcagtctttgttacacacatatcctgaaattgtcgtagaaccttcatcatcaactctctcgtctccccttctcctcgtcaatctctctccctctctctcttctccatcccctcctccctcctcctcgtgctctgcccttaaatctcggtatttgcggtagactcaagtattcctcacacctttggctagacgccaagcttagagaactcggggacctaattccttttgtggcgaaaaacgccttcgaatttggatggattaacaaattttctttcttaaacgcaccgattgaatatatttaccaaacatttagcgtacacaaccctgttcgaccatctttcaatgaattggcattacaatgttctttctattaaagaataaaaatggttgattgaagtaaatagttttctatatttggggggggggggggcacggcggacatcacgacggccacgcccacattgttacctatcatttgaaaaaaaaaaatttactgagtcgtctcatggaaataaa
gi|40 : aagtatagttcttcttagcactatctctaatcaggagttttcaaccatatattttgatatgcgattaagaataatatacacggacttcgaacaaaactgaatgaatgtcgtttctatcagtctttgttacacacatatcctgaaattgtcgtagaaccttcatcatcaactctctcgtctccccttctcctcgtcaatctctctccctctctctcttctccatcccctcctccctcctcctcgtgctctgcTCT-TT-A-TA---T-T--TTGAT---GAA----------------AAA----------------AA---A-----AA-----T-ATA-AC-AG-C-ACG--CACAA-GT-------------CTA-TCATTT-GG----AAAAT-----------TT-C-AA--ATT--A-C--C--A-T-C-G--TC-T--CAT-G---GAA--AT-----AA-ATA----------
gi|41 : A----------------AA---A-----TA-----T-ATA-ACTGG-C-ACG-C-ACAT-GTC-------------TA-TCATTT-GG----AAAAT----------AT--T-AA--TTTTAA-C--TA-A-T-C-GC-TA-T--CAT-G---GAAT-AT-----CA-ATA----------g
gi|43 : gcgaattaacattct-C-ACG-C-ACAT-GTCTATAGC-T--A-ATG-TCATTTTGA---AAAAAA----------ATA-TTAA--TTT--A-C--T--A-T-C-G--
gi|44 : a-G-TACTCTT-CCT-TCGTGAT--TCCAACG------CAGAGG--C-------ATGCA-------TATGTTA-TATTG-T---G-TGC---TTAT-ACTAAA--CGCTAGaataagatataattat
gi|45 : AAC--AC-G-CACTGT---CT---GTGAT--TCCAACA------TACA-G--T-------ATACA-------TA-A-TA-TATTT-T---G-TGC---TTA--ACTAAA--CGCTAG
gi|47 : --TGCTATGT---CTCA----------AA-----CTATCG---AAGTTT----GACAACT------TATCG-
gi|48 : caagtttcagTTTCT-CAAG---AA----------G-----------G---A-----T----TCCTTGGAATCAATA-----GG-------------CGGA-G-CGGA--T--TTTT-AC
gi|49 : CAATTTTCAATGGATACT-------TTCAATATTG-ACA-TGA-T--TTT-ATA------TAA--TT
gi|5 : TAGG-GA-A-T----ATTCTTT--T------GTTC-----G-----AAAACAAC-CCTTCGA-ATTTGCTA-TGGATTAA-CA---TA--T-----------------------CCGATCAATAATATATTT--ACCTAGAAATTAGCGGAGC-ACAAA--CCT-TCCAA--TT-CTG--C-GTGGAT---------T----TA-AC--AA-TG--------------A------ATTA-AAGAGAA-AA-----GTAGT-A-TGATGGAA-AAT--GT-TTCT-TT-A-TAAATT-T--TTGAG---AAA----------------AAA----------------AA---A-----AA-----T-ATA-AC-GA-C-ACG--CACAT-GTCTATAGC-TTAA-CTATTCATTT-GG---AAAAA-----------ATA-T-TA--ATT--A-C-----A-T-C-G--TC-T--CAT-G---GAA--AT-----AA-TT-------------AT---------AT-A-T
gi|5 : gccttacatctgtatcttctctctgactcatttatcgtatcttattccatataatAGTG-AC--TGATT--TT--ATA------TAAATCTC--TGAAAGAGGT-----CAT-------------AACTAGTCGCATCAAGCATTAAC--AC-G-CACTGCT-CCC-T-GTGATC-TCCAACAT-----TACAGGA-G-------ATACA-------TATATTA-TATTTAT---G-TGC---TTAT-ACTAAAACCGCTAGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctagcttcttggtgcgagctaacactcgccatcatccccacgatccattaagtgactgattttatataaatctctgaaagaggtcataactagtcgcatcaagcattaacacgcactgctccctgtgatctccaacattacaggagatacatatattatatttatgtgcttatactaaaaccgctagta
gi|50 : gccttacatctgtatcttctctctgactcatttatcgtatcttattccatataattagggaatattcttttgttcgaaaacaacccttcgaatttgctatggattaacatatccgatcaataatatatttacctagaaattagcggagcacaaaccttccaattctgcgtggatttaacaatgaattaaagagaaaagtagtatgatggaaaatgtttctttataaatttttgagaaaaaaaaaaatataacgacacgcacatgtctatagcttaactattcatttggaaaaaatattaattacatcgtctcatggaaataattatatatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctagcttcttggtgcgagctaacactcgccatcatccccacgatccatta-------ATACA-------TATATTA-TATTT-TAATG-TG-T--TTAT-ACTAAA--CGCTAGTa
gi|6 : TTAAATTCT-GG-T-ACT-CGC--CCGACT-CAA-TTA-T--T-TCACACCCTTGTTTGCT------------TTAGGAAAAATCTAGG-GAAC-TT-TAATTCTTT--T------GTGC-----G-----AAA----A-CCTTCGA--TTTGCCA-TGGATTAAACAA--TG--CTCTCTTT--TTAAA-CATTCGCGCCGATC--TAATA--------------A-TTAGCGGA-C-ACAAAAACCT-TTCCA--AT-TTG--C-ATGGAT---------T----TT-AC--AA-TG--------------A------ATTT-A--AGAA-AA-----GTTG--A-TGAATGAA-AATGCGA-TTTT-TT-A-CA---T-T--TTGAG-----------------------AA----------------AA---A-----AA-----T-ATA-AC-GA-CAACG-GCACAT-GTCTAT-GC-T--A-CTA-TCATTT-GG---AAAAAT----------AT--T-AA--TTT--A-C--G--ATT-C-G--TCTT--CAT-G---GAA--AT-----AA-ATA----------AA---------------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCAATC---TTCAATAG-G-ACATTGAAT--TTT-ATA------TAA--TTC--TGAAAGAGGTATTGATAT---AATAC-TT-GAACTA-TCGCAC-AAACATTAAC--AC-G-CACTGTTGCCT-TTGTGAT--TCAACCA------TACAGGTAT-------ATACA-------TATATTA-TATTT-T---G-TGCT--TTAT-ACTAAA--CGCTa
gi|7 : TTAAATTCT-GG-T-ACT-CGC--CCGACT-CAA-TTA-T--T-TCACACCCTTGTTTGCT------------TTAGGAAAAATCTAGG-GAAC-TT-TAATTCTTT--T------GTGC-----G-----AAA----A-CCTTCGA--TTTGCCA-TGGATTAAACAA--TG--CTCTCTTT--TTAAA-CATTCGCGCCGATC--TAATA--------------A-TTAGCGGA-C-ACAAAAACCT-TTCCA--AT-TTG--C-ATGGAT---------T----TT-AC--AA-TG--------------A------ATTT-A--AGAA-AA-----GTTG--A-TGAATGAA-AATGCGA-TTTT-TT-A-CA---T-T--TTGAG-----------------------AA----------------AA---A-----AA-----T-ATA-AC-GA-CAACG-GCACAT-GTCTAT-GC-T--A-CTA-TCATTT-GG---AAAAAT----------AT--T-AA--TTT--A-C--G--ATT-C-G--TCTT--CAT-G---GAA--AT-----AA-ATA----------AA---------------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCAATC---TTCAATAG-G-ACATTGAAT--TTT-ATA------TAA--TTC--TGAAAGAGGTATTGATAT---AATAC-TT-GAACTA-TCGCAC-AAACATTAAC--AC-G-CACTGTTGCCT-TTGTGAT--TCAACCA------TACAGGTAT-------ATACA-------TATATTA-TATTT-T---G-TGCT--TTAT-ACTAAA--CGCTtag
gi|8 : TTAAATTCT-GG-T-ACT-CGC--CCGACT-CAA-TTA-T--T-TCACACCCTTGTTTGCT------------TTAGGAAAAATCTAGG-GAAC-TT-TAATTCTTT--T------GTGC-----G-----AAA----A-CCTTCGA--TTTGCCA-TGGATTAAACAA--TG--CTCTCTTT--TTAAA-CATTCGCGCCGATC--TAATA--------------A-TTAGCGGA-C-ACAAAAACCT-TTCCA--AT-TTG--C-ATGGAT---------T----TT-AC--AA-TG--------------A------ATTT-A--AGAA-AA-----GTTG--A-TGAATGAA-AATGCGA-TTTT-TT-A-CA---T-T--TTGAG-----------------------AA----------------AA---A-----AA-----T-ATA-AC-GA-CAACG-GCACAT-GTCTAT-GC-T--A-CTA-TCATTT-GG---AAAAAT----------AT--T-AA--TTT--A-C--G--ATT-C-G--TCTT--CAT-G---GAA--AT-----AA-ATA----------AA---------------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCAATC---TTCAATAG-G-ACATTGAAT--TTT-ATA------TAA--TTC--TGAAAGAGGTATTGATAT---AATAC-TT-GAACTA-TCGCAC-AAACATTAAC--AC-G-CACTGTTGCCT-TTGTGAT--TCAACCA------TACAGGTAT-------ATACA-------TATATTA-TATTT-T---G-TGCT--TTAT-ACTAAA--CGCTtag
gi|9 : T-AG-T-ATC-CTCG-CCGACT-AAA-TAT-T--G-T----------TGTGCTA-ACGTCCAAGTTTAGGAAAT-TC-GGG-AA-C-TC-TAGTTCTTT--T------GTT------GCATATAAA----C-CCTTCGA-TTTTGC-A-TGGATTAAACAA--TGC-TTCTTTCT--T-AAA-CAA-CGCGTCGATC--TAAT-TATTTGTA-CTAGAA-TTAGCGGA-C-ACAAC--CCT-TT-GT--TT-TTG--A-TTGGAT---------T----TTAAC--AAGTGTTGTTTATTTGAAAA------ATTA-G--AGAA-AA-----GTTAGTA-TAAATTAAGAAT--GG-TTCG-TT-ATTA---T-T--CTAAG---AGT----------------AAT----------------AT---AGTATTAG-----T-ATATAC-AGCC-ACG--CACAT-GT------C-T--A-TTA-TCATTT-GGAAAAAAAATA---------ATA-T-AAG-TCC--A-C--C--A-G-C-G--T--T--CAG-A---GGA--AT-----AA-ATA----------AAGT---------AT-ACTATGTtag
gi|9 : actTCTATT-A-TC---A-T--TTG-G---AAA----------------AAA----------------AA---T-----AA-----T-ATA-A------------------GTC-------C--A-CCA-GCGTTC-AG---AGGAAT----------AAA-T-AAAGTAT--A-C--T--A-T---G--TC-TAACGT-GATAGAACAAT-----AG-GNN----------NNNN---------NN-N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCCA-TTTTCAATGGAAA--AACT---TTCAATAGTG-AAA-TGATT-------------------------TG-AGGAGGTATTctaacgtgatagaacaataggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntccattttcaatggaaaaactttcaatagtgaaatgatttgaggaggtatta
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): TACTATCGTCTCATGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG
Unaligned ( gi|42 ): CGAACAAAGTTGAACATTGGATGATTATTCGTATTCTTGTATTAACACGTATCGAAGTAGGTTTTATGACTTTCTTAAATATC
Unaligned ( gi|46 ): ACAAAACAAAAAACGCGCCATTTTTTTCTCAAGAACAATTCCTTGAAATC
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1111111 11 333333333333333333 22 22222222222 111111 1 3333333333333333333333 1 1 888888888888888888888888888888 2222 666666666666666 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 2 1 11 11 1 5555555555 11 1 33333333333 2222222 1 3333333333333333333333 111 111111111 444444444444444444444 5555555555555555555555555555555555555555555 5555555 2222222222222222 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 11 1 1111111 111 1111111111 111
lowQualScore : 66 4 4 33 44 5 888 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 2 8 66 33 2 2 77 8 0 2222222 2 2 77777 8 2 666 888888 6666 2 2 33 8 2 66 44 5 44 2 666666 2 6 33 111111111111111111 4 55 777 55 8 8 4 4 77 666 3 00000000000 6666 4 666 7777 000000 3 777 4 2 0 2222222222222222222222 55 3 999 3 0 3 99 0 888888888888888888888888888888 4 4 66 9 0000 1 0 444444444444444 6 6 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 0 4 3 4 00 3 4 4 00 4 6 3 1 0000000000 77 6 3 4 3 1 3 3 55 33333333333 0000000 88 3 3 22 44 1111111111111111111111 44 6666 66 777 6 3 3 888 3 4 44 2 33 2 000000000 5555 2 33 2 555555555555555555555 2 33 2 77777 55 2 3 2 88 4 1 1 1 555 1 22 9999999999999999999999999999999999999999999 333 44444 44444 1 1 1 3 5 5 1 1 1 3333333 22 1 1 1 333 2222222222222222 3 44 22 1 44444 5 1 1 44 6 22 2 333 66 66666 2 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1 1 77 555 0 5 8 1 33 33 777777 33 33 0 3 1111111 33 2 2 999 66 999 7 2 4 55 999999 6666666666 8888888 2 2 444 2 888 2 33
lowQualScore : .. . . .. .. . ... ........................................................................ . . .. .. . . .. . . ....... . . ..... . . ... ...... .... . . .. . . .. .. . .. . ...... . . .. .................. . .. ... .. . . . . .. ... . ........... .... . ... .... ...... . ... . . . ...................... .. . ... . . . .. . .............................. . . .. . .... . . ............... . . ................................................................. . . . . .. . . . .. . . . . .......... .. . . . . . . . .. ........... ....... .. . . .. .. ...................... .. .... .. ... . . . ... . . .. . .. . ......... .... . .. . ..................... . .. . ..... .. . . . .. . . . . ... . .. ........................................... ... ..... ..... . . . . . . . . . ....... .. . . . ... ................ . .. .. . ..... . . . .. . .. . ... .. ..... . .................................................................................... . . .. ... . . . . .. .. ...... .. .. . . ....... .. . . ... .. ... . . . .. ...... .......... ....... . . ... . ... . ..
lowQualScore : 77 0 0 11 66 3 333 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 7 0 33 77 7 5 99 6 1 0000000 9 9 11111 6 9 888 222222 1111 9 9 99 6 9 88 33 0 66 9 888888 9 7 99 444444444444444444 0 55 000 55 3 0 0 0 00 444 6 44444444444 3333 4 444 7777 555555 6 000 0 0 9 9999999999999999999999 00 6 888 6 9 6 00 6 777777777777777777777777777777 4 4 11 0 4444 9 8 444444444444444 7 7 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 4 3 4 66 9 4 4 66 4 4 3 1 2222222222 99 5 6 5 6 2 6 6 00 44444444444 0000000 88 3 3 22 66 1111111111111111111111 22 8888 55 000 2 1 1 666 1 0 22 9 99 9 777777777 7777 7 77 5 111111111111111111111 2 11 2 88888 33 2 1 0 22 0 8 8 8 000 8 55 4444444444444444444444444444444444444444444 000 33333 33333 7 7 7 3 0 0 7 7 7 1111111 33 7 7 7 000 7777777777777777 6 33 55 8 77777 5 9 9 55 0 88 2 999 33 77777 7 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 9 9 00 444 8 3 0 1 77 33 222222 22 44 0 7 5555555 33 9 9 111 33 111 5 5 7 99 777777 9999999999 1111111 5 5 444 5 999 7 77
consensus : CAACAAANAA-TAC-GGG-TCTTGT--GTTTTCT-CAAG---AA----------G-----------A---A-----T----T-------------A-----GGA------------CGGA-G-CGGA--T--ATTT-ACGA--TG-TACATGTATA----C-AC-A-----AGT-AT-C-T-G------GT----ATTAC-ATG-CC--A-CGT-GCG--AGT-AATACCTGT--ACC-TG-T--C-TTG-TCAAAA--CAAAGG-AT--------------TAT-CTAATCA--CTGCT---CA--ATTTAGATAT-A-TG-TG-CTGCTCTGT---C-CA----------AAA--A-CTATCG---AAGTTT----GACAACT------TATCG-G---A-AAGGTATAG-TTCT-----G-------TCTNA---TC--AT-GA-GTTTTCAACT-A-TAC-ATTTTG-ATAATGC-AT-TGGGA-GA--ATGGACTAC-ACG-ACAGA-CT-TCGA--ACTAAAACCGAGATTGGATGC-GAA-TTGG--ATG-CGT-CTT-ATCATTCTCTCCTCTGCTCGACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGCCTTAAAT-CT-GG-TATC-CGC--CCGACT-CAA-TAT--TT-TCACACCCTT-TTTGCTA-ACGTCCAAGCTTAGGAAANATCTAGG-GA-C-TCTAATT-C-TTT--TGTG---CG-----AAA----C--CCTTCGA-ATTTGC-A-TGGATTAAACAA--TG--TTCTCTT--TT-AAA-CAC-CGCGCCGATC--TAATATATTT-TACCCAGAA-TTAGCGGA-C-ACAAA--CCT-TTCGA--AT-TTG--C-GTGGAT---------T----TT-AC--AA-TG--------------A------ATTT-AAGA--A-AA-----GTTG--A-TGAATNAA-AAT--GG-TTCT-TT-A-TA---T-T--TTGAG---AAA----------------AAA----------------AA---A-----AA-----T-ATA-AC-GG-C-AC-G-C-ACAT-GTC-AT-GCT--A-CTA-TCATTT-GG---AAAAA----------T-ATA-T-AA--TTT--A-C--T--A-T-C-G--TC-T--CAT-G---GAA--AT-----AA-ATA----------AAAT---------AT-A-TATGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCCAATTTTCAATGGAAACCAATC---TTCAATAGTG-ACA-TGATT--TTT-ATA------TAA--TTC--TG-AAGAGGTATTGATAT---AATAC-CT-GAACTA-TCGCA--NAACATTAAC--AC-G-CACTGTT-CCT-TCGTGAT--TCCAACA------TACAGG--T-------ATACA-------TATATTA-TATTT-T---G-TGCT--TTAT-ACTAAA--CGCTAGT
Reference ( family-365 ) : CAACAAANAA-TAC-GGG-TCTTGT--GTTTTCT-CAAG---AA----------G-----------A---A-----T----T-------------A-----GGA------------CGGA-G-CGGA--T--ATTT-ACGA--TG-TACATGTATA----C-AC-A-----AGT-AT-C-T-G------GT----ATTAC-ATG-CC--A-CGT-GCG--AGT-AATACCTGT--ACC-TG-T--C-TTG-TCAAAA--CAAAGG-AT--------------TAT-CTAATCA--CTGCT---CA--ATTTAGATAT-A-TG-TG-CTGCTCTGT---C-CA----------AAA--A-CTATCG---AAGTTT----GACAACT------TATCG-G---A-AAGGTATAG-TTCT-----G-------TCTNA---TC--AT-GA-GTTTTCAACT-A-TAC-ATTTTG-ATAATGC-AT-TGGGA-GA--ATGGACTAC-ACG-ACAGA-CT-TCGA--ACTAAAACCGAGATTGGATGC-GAA-TTGG--ATG-CGT-CTT-ATCATTCTCTCCTCTGCTCGACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGCCTTAAAT-CT-GG-TATC-CGC--CCGACT-CAA-TAT--TT-TCACACCCTT-TTTGCTA-ACGTCCAAGCTTAGGAAANATCTAGG-GA-C-TCTAATT-C-TTT--TGT----CG-----AAA----C--CCTTCGA-ATTTGC-A-TGGATTAAACAA--TG--TTCTCTT--TT-AAA-CAC-CGCGCCGATC--TAATATATTT-TACCCAGAA-TTAGCGGA-C-ACAAA--CCT-TTCGA--AT-TTG--C-GTGGAT---------T----TT-AC--AA-TG--------------A------ATTT-AAGA--A-AA-----GTTG--A-TGAATNAA-AAT--GG-TTCT-TT-A-TA---T-T--TTGAG---AAA----------------AAA----------------AA---A-----AA-----T-ATA-AC-GG-C-AC-G-C-ACAT-GTC-AT-GCT--A-CTA-TCATTT-GG---AAAAA----------T-ATA-T-AA--TTT--A-C--T--A-T-C-G--TC-T--CAT-G---GAA--AT-----AA-ATA----------AAAT---------AT-A-TATGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCCAATTTTCAATGGAAACCAATC---TTCAATAGTG-ACA-TGATT--TTT-ATA------TAA--TTC--TG-AAGAGGTATTGATAT---AATAC-CT-GAACTA-TCGCA--NAACATTAAC--AC-G-CACTGTT-CCT-TCGTGAT--TCCAACA------TACAGG--T-------ATACA-------TATATTA-TATTT-T---G-TGCT--TTAT-ACTAAA--CGCTAGT
gi|1 : CAACAAACAA-TAC-GGACTCTTGCCAGTGTTCTACAAG---AA----------G-----------A---A-----T----T-------------A-----GAA------------CGGA-G-CGGA--CCGATTT-ACGA--TG-TACATGTATA----CTAC-ATGTAGGGT-AT-C-T-G------GT----GT-AC-AT--------CGT-GCGTTAG---ATACCTGT--ACC-TGGT--CGTTG-TCAAAA--CAAAGA-AT--------------TATTCTAATCAAACT-CT---CA--AGTTAG-TAT---TA-T--TTGCTCTGT---C-CA----------AAA--AACTATCG---AAGTTT----GACAACT------TATCGTG---A-AACGTATAG-TTCT-----C-------TCTTA---TC--AT-GAAGGTTTCAACT-A-TAC-ATTGTG-ATATTGC-AT-TGGGA-GA--ATGAATCAT-ACA-ACAGATCTATCGACCACTAAAACTGAGATTAC-TCC-GAAATTGGCAATATCGTATTT-ATCCTTTTCTCCTCTGCTCGACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGCCTTAAATACT-GG-TATC-CGC--CCGACT-CAA-TAT--TT-TCACACCTTT-TTTGCTAGACGTCCAAGCTTAGGAAACATCTAGG-GA-C-TCTAAT-----------------------AAA----C--CCTTCGA-ATTTGC-A-TGGATTAAACAA--TG--TTCTCTT--TT-AAAACAC-CG-GCCGA-C--TAATATATTT-TACCTA-AA-TTAGCGGA-C-ACAAA--CCT-TCCAA--AT-TTG--C-GTGGAT---------T----TT-AC--AA-TG--------------A------ATTT--AGA--A-AA-----GTTG--G--GAATGAA-AAT--GG-TTTT-TT-A-CA---T-T--TTGAGAAAAAA----------------AAA----------------AA---A-----AA-----T-ATA-AC-GA-C-AC-GCC-ACATCGTCAATAGCT--A-CTA-TCATTT-GG---AAAAA----------T-ATA-T-TA--TTT--ACC--T--A-TGC-G--TC-T--CATAG---GAA--AT-----AA-ATA----------AAATGATNNNNNNNN-N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCAGTC---TTCCATAGTG-ACA-TGATT--TTTGATA------TAA--TTC--TG-AAGA-GTATTGATAT---AATACTTT-GAACTA-TCGCA--ACACATTAATCAAC-G-CACTGTT-CCTGTTTTGATGATCCAACA------TACAGC--T-------ATACA-------TATATTA-TATGT-T---G-TGCTAATTATAACTAAA--CGCTAGT
gi|10 : CTTAAAT-CT-GGTTATCTCG---CCGACT-AAA-TATAAAT-TAACACATTT-TTT-------------GCCTAGTAAA---CTCGGCGACC-CCTAATTCC-TTT--TGT----TGCGA--AAA----C--CCTTCGA-ATTTGC-A-AGGATTAAATAAATTGAATCCTGTTTCTT-AAA-CAC-C-CGCCGATC--TAATATACTT-TACCAGGAA--TAGCGGA-TAACAAC--CCT-TCC----AC-TTGCTC-GTGGAT---------T----TT-AC--AG-TG--------------A------ATTTAAAGA--A-AA-----GTTG--A-TGAATATT-AAT--GG--TGT-TT-A-TAT--T-T--TTG------AA----------------AAA----------------AT---A-----AA-----T-ATA-AC-GG-C--C-G-C-TCAT-G----T-G-T--A-CAA-TCATTT-AG---AAAAA----------A-ATATT-AC--TTT--A-C--T--A-
gi|10 : CCAATT--CAATGGAAAAAAACCCTTTTCAA-AATG-ACA-TGAGT--TTT-ATA------TAA--TTTCGTG-AAGAGATATT-ATAC---Annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaattcaatggaaaaaaacccttttcaaaatgacatgagttttatataatttcgtgaagagatattatacatt
gi|11 : cttaaatctggttatctcgccgactaaatataaattaacacattttttgcctagtaaactcggcgacccctaattccttttgttgcgaaaacccttcgaatttgcaaggattaaataaattgaatcctgtttcttaaacacccgccgatctaatatactttaccaggaatagcggataacaacccttccacttgctcgtggattttacagtgaatttaaagaaaagttgatgaatattaatggtgtttatatttttgaaaaaataaatataacggccgctcatgtgtacaatcatttagaaaaaaatattactttactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAACAAAAAG-TAC-GG--TCTTGT--GTTTTCT-CAAG---AA----------G-----------A---A-----T----T-------------A-----GTA------------CGGA-GGCGGA--T--ATTT-AC-A--TGCTACATGTATA----C-AC-A-----ACTTAT-C-T-G------GT----ATTAC-ATG-CC--ACCGT-GCG--AGT-AATACC-GTTAACC-CA-G--T-TTG-TC-AAA--CAAAGG-A---------------TAT-CTAATCC--TTGCT---CA--ATTTAGATAT-A-TG-TGTCTGCCTTGT---C-CA----------AAA--A-C-ATCG---AAGTTT----GACAACT------TATCG-G---A-AAGGTATAGTTTCT-----G-------CCTCAAATCC--AT-GC-GTTTTCAACT-ATTAC-ATTTT--ATAATGC----------------GGACTAC-ACA---AGA-CT-TCGA--ACTAAA--CGAGATTGGATGC---------------CGT-CTT-ATCATTCTtt
gi|12 : aAACAAAAAG-TAC-GG--TCTTGT--GTTTTCT-CAAG---AA----------G-----------A---A-----T----T-------------A-----GTA------------CGGA-GGCGGA--T--ATTT-AC-A--TGCTACATGTATA----C-AC-A-----ACTTAT-C-T-G------GT----ATTAC-ATG-CC--ACCGT-GCG--AGT-AATACC-GTTAACC-CA-G--T-TTG-TC-AAA--CAAAGG-A---------------TAT-CTAATCC--TTGCT---CA--ATTTAGATAT-A-TG-TGTCTGCCTTGT---C-CA----------AAA--A-C-ATCG---AAGTTT----GACAACT------TATCG-G---A-AAGGTATAGTTTCT-----G-------CCTCAAATCC--AT-GC-GTTTTCAACT-ATTAC-ATTTT--ATAATGC----------------GGACTAC-ACA---AGA-CT-TCGA--ACTAAA--CGAGATTGGATGC---------------CGT-CTT-ATCATTCTtgtacaaacaatacatgcatctaagttagctgcatcggatttcctcaatatcaactgacatag
gi|13 : aAACAAAAAG-TAC-GG--TCTTGT--GTTTTCT-CAAG---AA----------G-----------A---A-----T----T-------------A-----GTA------------CGGA-GGCGGA--T--ATTT-AC-A--TGCTACATGTATA----C-AC-A-----ACTTAT-C-T-G------GT----ATTAC-ATG-CC--ACCGT-GCG--AGT-AATACC-GTTAACC-CA-G--T-TTG-TC-AAA--CAAAGG-A---------------TAT-CTAATCC--TTGCT---CA--ATTTAGATAT-A-TG-TGTCTGCCTTGT---C-CA----------AAA--A-C-ATCG---AAGTTT----GACAACT------TATCG-G---A-AAGGTATAGTTTCT-----G-------CCTCAAATCC--AT-GC-GTTTTCAACT-ATTAC-ATTTT--ATAATGC----------------GGACTAC-ACA---AGA-CT-TCGA--ACTAAA--CGAGATTGGATGC---------------CGT-CTT-ATCATTCTtgtacaaacaatacatgcatctaagttagctgcatcggatttcctcaatatcaactgacatag
gi|14 : a-TA--------------A------ATTT-AAGT--A-AA-----GTTG--A-TGGATTAA-AAC--GG-TTCT-TT-A-TA---T-T--TTG------AA----------------AAA----------------AA---A-----AA-----T-ATA-AT-GG-C-AC-G-T-ATAT-GT------CT--A-CTA-TCTGGT-GG---AAAAA----------T-ATA---AA--TTT--A-C--T--A-T-C-G--TC-T--CGT-G---GAA--AT-----AA-ATT----------AGAT---------AT-A-TATATtgtacaaacaatacatgcatctaagttagctgcatcggatttcctcaatatcaactgacatag
gi|14 : ctGGAAA--AACT---TTCAATAGTG-ATA-GGATT--T---ATA------TAA--TTC--TG-AAGAGGTATTAA------AATAC-CT-GATCTA-TCGAA--CAACATTAAC--AC-G-TACTGTT-CCT-TTGTGAT--TCCAACA------TAGAGG--T-------ATGCATACAGTGTATATTA-TGTTT-T---G-TG-T--CTAT-ACTAAA--CGCTAGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaaaaactttcaatagtgataggatttatataattctgaagaggtattaaaatacctgatctatcgaacaacattaacacgtactgttcctttgtgattccaacatagaggtatgcatacagtgtatattatgttttgtgtctatactaaacgctagt
gi|15 : cttaaatttaagtaaagttgatggattaaaacggttctttatattttgaaaaaaaaaatataatggcacgtatatgtctactatctggtggaaaaatataaatttactatcgtctcgtggaaataaattagatatatatatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAAAAAGAAGCAC-AGG-CCTTCT--ATTTTCT-CAAGGACAA----------GTCCTTGGAATCA---A-----T----T-------------A-----GG--------------GGA-G-CAGA--T--ATTT-ACGA--TG-CACATG--------C-AT-A-----GGT-AT-C-TTG------GA----ATCAC-ATG-CC--G-CGT-GCG--AGT-AATACC--T--ACC-TG-T--C-TTG-TCAAAA--TAAAG--------------------------TCA--CTACT---CA--ATTTAGAT-T-A-TG-T--CTGTTCTGC---T-C-----------AAA--A-CTATCG---AAGTTG----AACAATT------TATCG-G---ATAATG-ATAT-TTGT-------------TCCTA---TC--AT-GA-ATACTCAACT-------ATTTGG-AT-ATGCGAT-TGG---AA--ATA----AC-ATGCACGGA-CA-TCGA--AC-AAAACT-AAATTGGATGC-G
gi|16 : AA-AAT--GG-TTCT-TT-A-TA---T-T--T--------AA----------------AAA----------------AA---A-----TA-----T-ATA-AC-GG-C-AC-G-C-ACAT-GTC------T--A-CTA-CCTTGT-GG---AAAAA----------T-AT--T-AA--TTT--A-C--T--A-T-C-G--TG-T--CAT-G---AAA--ATTAAATAA-ATATNNNNNNNNNNNNN---------NN-N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCAATTTTGAATGGAAA--AACT---TTCAATAGTG-ACA-TGATT--TT--ATA------TAA--TTC--TG-AAGAGGTATTAA-AT-----TAC-CT-G-ACTA-TCGAA--CAACATTAAC--AC-GCCACTGTT-CCT-TTGTGAT--TCC----------TAC--------------------------ATATTATTATTT-T---GATGC---TTAT-ACTAAG--CGCTAGttttctccgccatgtacacgcatatcgaagtaggccgtgtgatttcctcaaatatcacacaca
gi|17 : tCAACAA-CAA-TAC-GGG-TCTTGT--GTTTTCT-CAAG---AA----------G-----------A---A-----T----T-------------A------GA------------CGGA-G-CGGA--T-------------------ATGTATA----C-AC-A-----AGT-AT-C-G-GGTACATGT----ATTAC-ATG-CC--A-CGT-GCG--AGT-AATACCTGT--ACC-TG-T--T-TTG-TCAAAA--CAAAGG-A---------------TAT-CTAATCA--CTGCT---AA--ATTTAGAT-T-A-TG-T--CTGCTCTGT---C-C-----------AAA--A-CTATCG---AAGTTT----GATAACT------TATCG-G---A-AAGGTATAG-TTCT-----GC------TCTAA---TC--AT-GA-GCTTTCAACT-A-TAC-ATTTTG-AT-ATGCGAT-TGG---GA--ATGA--TAT-AC--ACAGA-CT-TCGA--AC-AAAACTTA-ATTGGATGC-GAA-TTGG--ATG-CGT-TTT-ATCAGTCTc
gi|18 : a--------------A------ATTT-ACGA--A-AA-----GTTT--A-TGAACCAA-AAT--GG-TTCT-TT-A-TA---T-T--TTG-----------------------------------------------------------------A-AC-GG-C-AC-G-C-ATAT----------------------TTG-GG---AAAAA----------T-A-----AA--TTT--A-C--T--A-T-A-G--CC-T--T-------NNN--NN-----NN-NNN----------NNNN---------NN-N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNGTG-AAA-T-CTT--TTA-ATAGTGACATAA--TTC--TG-AAAAGATATT--TAG---AATAC-GT-GAACTC-TCATG--CAACATGAA--------CACCGCT-CCT-TCGTGAT--T-CAACA------AACAGG--T-------Atgt
gi|19 : ttGT--TTTTTCT-CAAG---AA----------G-----------A---A-----T----TT------------A-----GGA------------CGGA-G-CGGA--T--CTCT---GA--TG-TACATGTATAGTAAC-ACCA-----AGT-AT-C-TTG------GTGCCTATTACCATGACC--A-CGT-GCG--GGT-AATACCTGTT-ACCGTG-C--C-TTGGTCAAAAAACAAAGG-AT--------------AGT-CTAATCA--CTGCTTTCCAGTATTTA-ATATAA-TGTTC-CTGCTCTGTATCC-CACACATATTACAAAATA-CT-CCGAACAAGCTCTGTAGACAACCAGTTTATATC--G---A-AAAGTATA--TTCT-----GC------TCTAA---GC--AT-GA---TTTCAACTGA-TAC-ATTc
gi|2 : AACAAAGCA-TAC-GGG-TCTTGT--GTTTTCT-CAAG---AA----------G---------------A-----T----T-------------A------GA------------CGGA-G-CGGAT-T--ATTT-ACGA--TG-TACATGT-------T-AC-A-----AGT-AT-CAT-G------GT----ATTAC-ATG--C--A-CGT-GCG--AGT-AATA-CTGT--ACC-TG-T--A-TTG-TC-AAA--CAAGG------------------TAT-CTAGATA--CTGCT---C---ATTTAGAT-T-ACTG-TC-ATGCTCTGT---C-------------AAA--A-CTATCG---AAG-TT----GACA--T------TAT---G---G-AAGGTATAG-TT-T-----G-------TCTAAT--TC--ATCGA---TTTCAACT-A-TACTATTTTGAATAATGG-AT-TGGGA---------ATT-----------A-CT-TCGA--ACTAA--------------GCTGAA-TTGG--ATG-CGT-TTTAATCATACTatatag
gi|2 : aCGTCCTAAAT-CT-GGATATC-TGC--C-GA-T-CAA-TAT--TT-TCACACTTTT-TTTGCTA-ACGTC---GCCTAGGAACT-CCTAGG-GA-CATAGATTT-C-TTT--TGTTTGACG-----AAA----AAACCTTCGA-ATTTGC-AATGGATTAAAACA--TG--TTTTTTT-------A-CAC----GACGATC--TAATATATTT-TACCTAGAA-TTAGC-GA-C-ACAAA--C---TTCCA--AT-TTG--C-GTGGAT---------T----TT-AC---A-TG----------------------TTT-AAGA--A-AAT----GTTG--A-TG-ATTGA-AAT--GG-TTTT-TTAA-CA---TAT--TTGAG----------------------AAA----------------AA---A-----AC-----T-AT--AC-GA-A-AC-G-TAACAT-GTT-AT-AGT--A-CTA--CATTT-GG----AAAA----------T-AT--T-AA--TTT--A----T--A-T-CTG--TC-T--CAT-G---AGA--AT-----AAGATA----------AAAT---------ATNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAATC---TTC-ATAGTGAACA-T-ATT--T----TA------TAA--TTC--TG-AAGAGGTATTGAATT---AATA--TT-GAACTA-T---G--AAAC-TTAAC--ACAG-CATGGTT-CCT-TTGTGA---TCCAACA------TACGG------------TACA-------TATATTA-T-TTT-T---G-TGCT--T--T-ACT-AA--CGCTtgtaccaatacatgatcgaagttgtgcatgagtttctccatattgacacagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcttcgtcctaaatctggatatctgccgatcaatattttcacactttttttgctaacgtcgcctaggaactcctagggacatagatttcttttgtttgacgaaaaaaccttcgaatttgcaatggattaaaacatgtttttttacacgacgatctaatatattttacctagaattagcgacacaaacttccaatttgcgtggattttacatgtttaagaaaatgttgatgattgaaatggttttttaacatatttgagaaaaaaactatacgaaacgtaacatgttatagtactacatttggaaaatattaatttatatctgtctcatgagaataagataaaatatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaatcttcatagtgaacatattttataattctgaagaggtattgaattaatattgaactatgaaacttaacacagcatggttcctttgtgatccaacatacggtacatatattatttttgtgctttactaacgct
gi|20 : aaacaaagcatacgggtcttgtgttttctcaagaagattagacggagcggattatttacgatgtacatgttacaagtatcatggtattacatgcacgtgcgagtaatactgtacctgtattgtcaaacaaggtatctagatactgctcatttagattactgtcatgctctgtcaaaactatcgaagttgacattatggaaggtatagtttgtctaattcatcgatttcaactatactattttgaataatggattgggaattacttcgaactaagctgaattggatgcgttttaatcatacttgtaccaatacatgatcgaagttgtgcatgagtttctccatattgacacagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctt-----AAA----C--CCTTCGA-ATTTGC-A-TGGATTA-------------------------------CGCGCCGATC--TA-T-TGTTT-TACCCAGAA-TTAGCGGA-C-ACAA---CCA-TTCGA--AT-TTG--C-TTGGAT---------T----TT-AC--CA-TGTGCTTTTATTTAAAA------ATTT-AAGA--A-AA-----GTTA--A-TGAATTAA-ATT--GG-TTCT-TT-A-TA---T-T--TTGAA---ATA----------------AAATATAACGTTTATAATTAG---A-----AATAAAAT-ATA-AC-GG-C-AC-G-C-ACAT-GT------CT--A-CTA-TCATTT-GG---AAAAA------------ATATT-AA--TTT--A-G--T--A-T-C-G--TC-T--CAT-G---
gi|21 : gaaTTTAGAAATTA-TG-T--CTGTTCTGT---C-CA----------AAA-----TATCG---AAGTT-------CAACT------TAACA-GGATA-AAGGATTTG-TTCT-----A-------T---A----C--AT-GA---TCTCAA-T-A-----ATTGTG-ATAAT-T-ATATGCGATGAGTATG---TATGATC-ATAGG-CT-TCAA--AACAAAAC---GAATGGGTGT-G
gi|22 : agataaccctaccagtTC--TAATAT-TTT-TACCCTGAT-TTAGCGGA-C-ACAGC--CCT-TT-GA--AT-TTG--C-GTGGGT---------T----TT-AC--AA-TGTTCTTTTA------A------AT---AAGA--A-AA-----GTTC--A-TGAATTAA-AAT--GG-TTTT-CT-A-TA---T-T--TTGA----AAA----------------TAT----------------AT---A-----TA-----T-ATA-AC-GG-C-AC-G-C-ACAT-GT------CT--A-CTA-TCGTTT-GG---AAAAA----------T-AT--T-AA--TTT--A-C--T--A-T-C-G--TC-T--CAttttctctatcttgtgcacaacaatatgatatcgaaagtaggccgtttgaagctcctcaat
gi|23 : tgaaacaggtctctgtgTTCT-TA-G---AA----------ATC---------A---A-----T----T-------------A-----GG-------------TGGG-G-CGGA--T--ATTT-ACGA--TG-TACAT----A----C-AC-A-----TGT-AT-C-T-G------GT----TTCAC-ATG-CC--A-CGT-GCG--AGT--ATACTTGT--ACC-TG-T--C-TTT-TTAAAA--CAAAGG-AT--------------T
gi|24 : agaaagcacgggcgtagtattttttaacagcaaTCCAAGCTTAGGAAAC-TC-AGG-GA-C-TCTACTT-C--------------------AAA----C--CCTTCGA-ATTTGC-A-TGGATTACACAA--TG--CTCTTTC--TT-AAA-CAC-CGTGTCGATC--TAATATATTT-TACCCATAA-ATAGCGGA-C-A-ATA--TCC-TTCGA--AT-TTG--C-GTGGAT---------T----TT-AC--AA-TG--------------tgctttaggtgtgtatatctcccagttgattcgaggaatagaagatt
gi|25 : AACAA-CAA-CACAGGG-TCTGCT--GTTTTCT-CAAG---AA----------C-----------A---A-----T----T-------------ACCTTCGGAATCAAATATAGGCGGA-G-CGGA--T--ATTTTACGA--TG-TACATATGT-----C-AC-A-----AGT-AT-C-A-G------GT----AATAC-ATG-CC--A-CGT-GCGC-AGT-AATACCTTT--ACC-TG-T--A-TTG-TCAAAA--CAAAGGTAT--------------Tttctggtgaataagaacataagtt
gi|26 : aAACAA-CAA-CAC-GGG-TCTTGT--GTTTTCT-CAAG---AACAATTCCTCGG-----------A---A-----TCAATT-------------A-----GG-------------CGGA-G-CGGA--T--ATTT-ACGA--TG-TACATGTA---------C-A-----AGT-AT-C-A-G------GT----ATTAC-ATG-CC--A-CGT-GCG--AGT-AATACCTGT--ACC-TG-T--A-TTG-TCAAAA--CAAAGG-AT--------------Ttgctc
gi|27 : aaAAACCAATC---TTCAAGTGTGTACA-T-ATTGTTTT-A-A------TAA--T-C--TG-A-GAGGTATTGATAT---AATAC-TTGGAACTA-TCGCAT-TAACATTAACT-AC---CCCTGTT-CCT-TTG-GAT--TTCAACA------TACAGG--T-------ATACA-------T-TATTA-TATTT-T---G--GC---TTAT-ACTAAA--CGCTAGTtgctttcgaataca
gi|28 : TTGT--GTTTTCTACAAAGA-AA----------G-----------AGATA-----T----T-------------GTT---AAA------------CGGAAG-CGGAAAT--ATCT-TCGAATTG--ACTTGT-TN----N-NN-N-----NNN-NN-N-N-N------NN----NNNNN-NNN-NN--N-NNN-NNN--NNN-CGT--TTGT--AAC-TG-T--C-TTG-TCAAAA--CAAAGA-----------------TAT-CTAATCA--CTGCT---CA--ATTTAGATa
gi|29 : TTCT-TA-G---AA----------ATC---------A---A-----T----T-------------A-----GG-------------TGGG-G-CGGA--T--ATTT-ACGA--TG-TAC----ATA----C-AC-A-----TGT-ATGC-T-G------GT----TTCAC-ATG-CCCAA-CGTGGCG--AGTAAATA-CTGT--ACC-TG-TCGC-TTT-TTAAAA--CAAAG
gi|3 : aagaaagcacgggcgtagtattttttaacagcaaAAACAA-CAC-G---TCTTGT--TTGTCTT-CAAG---AA----------G-----------A---AATTCCT----T-------------------GGATCTATAC-----CGAA-G-CGGA--T--ATT--ACGAACTG-TACAT----A----C-AC-A-----AGT-AT-C-C-G-------T----ATCAC-ATG-CC--A-CAG-CCG--AGT---TACCTGT--ACC-TG-T--C-TTG-TCCAAA--CAAA-G-ATTGCTTTCGCACTAATAT-CTAATCA--CTG-T---TA--ATATAGAATT-A-TG-TG--TGCATTGT---T-CT----------CAA--A-CTAT-G---AAGTTT----GACAA-T------TATCG-G---A-TA-GTATAT-TTCT-------------TCTAA---TCATAT-GA-GTTTTCAACT-A-TAT--TTTTG-AT-ATG--AT-AGGGA-TA--A--AAC-AC-ACG-AC
gi|3 : aaCCTTAA---CT-GGATATC--GC--C-GACTTCAA-TATA-GT-TCACACCATT-TTC-CTAGACGTC-GAGCT----AAAAAT--AGA-GA-C-TC--ATT-C-TTTATTG-----CG-----AA--------CCTTCGACATTT-C-A-TGGATTA-------------------------------CGCGCCGATC--T----TGTTTATACCCAGAA-TTAGCG-A-C-ACAA---CCA-TTCGA--AT-TTG--C-TTGGATACCAGTGCTT----TT-ATGTAA-----------------A------ATTT-AAGA--A-AA-----GTTA--A-TGAATTAA-ATT--GG-TTCT-TT-A-TA---T-TTATTGAACATAAAATTACGTTATAATTAGAAA----------------AA---A-----AA-----T-ATA-AC--G-C-AC-G-C-ACAT-GTT-----CT--A-CTA-T-ATTT-GG---AAAAA------------ATATT-AA--TTT--G----T--A-T-C-GTTTC-T--CAT-G---cactggatctttatcagtcttgtacacacatatcaattggccgtattatttcgtttaaaaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccccttaactggatatcgccgacttcaatatagttcacaccattttcctagacgtcgagctaaaaatagagactcattctttattgcgaaccttcgacatttcatggattacgcgccgatcttgtttatacccagaattagcgacacaaccattcgaatttgcttggataccagtgcttttatgtaaaatttaagaaaagttaatgaattaaattggttctttatatttattgaacataaaattacgttataattagaaaaaaaatataacgcacgcacatgttctactatatttggaaaaaatattaatttgtatcgtttctcatgca
gi|30 : aaaaacaacacgtcttgtttgtcttcaagaagaaattccttggatctataccgaagcggatattacgaactgtacatacacaagtatccgtatcacatgccacagccgagttacctgtacctgtcttgtccaaacaaagattgctttcgcactaatatctaatcactgttaatatagaattatgtgtgcattgttctcaaactatgaagtttgacaattatcggatagtatatttcttctaatcatatgagttttcaactatatttttgatatgatagggataaaacacacgaccactggatctttatcagtcttgtacacacatatcaattggccgtattatttcgtttaaaaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncc---TTTAATAGTG-ACA-TGATT--TT--ATA------TAA--TTA--TG-AATAGGTATTAA------AATAC-CA-GAATTA-TCGCA--CAACATTAAC--AC------TGTT-CCT-TCGTAAT--TCCAATA------TAGAGG--TACCGATAATACA-------TACTTTA-TATTT-T---G-TGC---TTAT-CCTAAA--CGCTca
gi|31 : cactATAGTG-ACA-TGATT--TT--ATA------GAA--TTT--TA-AAGAGGTATGAA------AATAC-CT-GAACTA-TTGCA--CAACATTAAC--AC-G-TACTGTT-CCT-CTGTGAT--TCCAACA------TAGAGG--T-------ATACA-------TATATTA-TATTC-T---G-TGC---TTAT-ACTAAA--CGCTAG
gi|32 : ccatat--------------A------AGTT-AGGA--A-AA-----GTTG--A-TGACTTCA-AAT----------TT-A-TA---T-T--TTG-------------------------AA----------------CG---A-----AA-----T-ATA-AC-GG-C-TC-G-C-TAAT-GT--A----T--A-CTA-TCGTCT-GA---AAAAAACCCCAAAACA-AAA-T-AA--TTT--A-CTGT--A-T-C-G--TT-T--C
gi|34 : tcaatattttcA------TCA--TTC--TA-AGTCGGTTTTAA-AT-----TAC-CT-GAACTA-TCACA--TTACATAAAC--AC------TGTT-CCT-TTGTGAT--TTCAATATAGATGTACATG--T-------ATACA-------TACATTC-TATTT-T---G-TAC---TTAT-CCTACA--CGCT
gi|35 : T-GAGA--A-AA-----TATG--T-TGAAT--A-AAT--GGGTTCT-TT-A-CA---T-T--T---------------------------------------------------------G-----T-AT---C-G--C-AC-G-C-ACAT-GTC------T--A-CTA-TCATTT-GG---AAAAC----------C-AAA-TTGA--TTT--A-C--T--A-T-T-G--TC-T--CAC-T---AAA--AT-----AA-ATT----------AAA
gi|36 : aaAA--TTC--TG-AATACATATAGGTATTTAAATAC-CT-AAATTA-TCACA-----CATTAAC--AC------TGTT-CCT-TCGTGAT--TCTAACT------TGGAGG--T-------ATTCA-------TACGTTA-TATTT-T---A-TACT--T
gi|37 : c---------T----TT-AC--AA-TG--------------A------ATTT-AAGA--A-AA-----GTTG--A-TGACTGAA-AAT--GATTTTT-TT-A-CA---T-T--GTGAG-----------------------AA----------------AA---A-----AA-----T-ATA-AC-GA-C-AG-G-C-ACAT-GTCTATAGCT--A-CTA-TCATTT-GG---AAAatc
gi|38 : T-TTG--C-GTGGAT---------T----TT-AC--AA-TG--------------TTCTTTTATTC-AATC--A---------TT-----TAAAAAAA-AAC--GT-TTCT-TT-A-TG---T-T--TTGA------------------------AA----------------AATTTA-----GA-----T-ATA-AC-GA-C-AC-G-C-ACAT-GT------------CTA-TCATT
gi|39 : AATTAA-AAT--GG-TTCT-TT-A-TA---T-T--TTGAA---ATA----------------TAT----------------AT---A-----TA-----T-ATA-AC-AG-C-AC-G-C-ACAT------T-TCT--A-CTA-TCATTT-GT---AAAAA----------T-AT--T-TA--TTT--A-C--T--A-T-C-G--TC-T--CAT-G---G
gi|4 : AAGTATAG-TTCTTCTTAGCACTATCTCTAA---TC--AG-GA-GTTTTCAACC-A-TAT-ATTTTG-AT-ATGCGAT-T--AA-GA--AT--AATAT-AC--ACGGA-CT-TCGA--AC-AAAACTGAA--TGAATG
gi|4 : CCTTAAAT-CTCGG-TATT-TGCGGTAGACT-CAAGTAT--TCCTCACACC--T-TTGGCTAGACG-CCAAGCTTAGAGAAC-TC-GGG-GA-C--CTAATT-CCTTT--TGTGG--CG-----AAAAA--CG-CCTTCGA-ATTTGG-A-TGGATTAACAAA--TT--TTCTTTC--TT-AAA-----CGCACCGATT--GAATATA-TT-TACCAAACATTTAGCGTA-C-ACAAC--CCTGTTCGACCATCTTT--CAATGAAT---------TGGCATT-AC--AA-TGTTCTTTC-------T------ATTA-AAGA--ATAAAAATGGTTG--ATTGAAGT-A-AAT--AG-TTTT-CT-A-TA---T-T--TGGGG---GGG----------------GGGGGGGCACGGC------GG---A-----CA-----TCACG-AC-GGCC-AC-G-C-CCAC-AT---T-GTT--ACCTA-TCATTT-GA---AAAAA------------A-A-A-AA--TTT--A-C--TGAG-T-C-G--TC-T--CAT-G---GAA--AT-----AA-Atcgtttctatcagtctttgttacacacatatcctgaaattgtcgtagaaccttcatcatcaactctctcgtctccccttctcctcgtcaatctctctccctctctctcttctccatcccctcctccctcctcctcgtgctctgcccttaaatctcggtatttgcggtagactcaagtattcctcacacctttggctagacgccaagcttagagaactcggggacctaattccttttgtggcgaaaaacgccttcgaatttggatggattaacaaattttctttcttaaacgcaccgattgaatatatttaccaaacatttagcgtacacaaccctgttcgaccatctttcaatgaattggcattacaatgttctttctattaaagaataaaaatggttgattgaagtaaatagttttctatatttggggggggggggggcacggcggacatcacgacggccacgcccacattgttacctatcatttgaaaaaaaaaaatttactgagtcgtctcatggaaataaa
gi|40 : aagtatagttcttcttagcactatctctaatcaggagttttcaaccatatattttgatatgcgattaagaataatatacacggacttcgaacaaaactgaatgaatgtcgtttctatcagtctttgttacacacatatcctgaaattgtcgtagaaccttcatcatcaactctctcgtctccccttctcctcgtcaatctctctccctctctctcttctccatcccctcctccctcctcctcgtgctctgcTCT-TT-A-TA---T-T--TTGAT---GAA----------------AAA----------------AA---A-----AA-----T-ATA-AC-AG-C-AC-G-C-ACAA-GT------------CTA-TCATTT-GG----AAAA----------T--TT-C-AA--ATT--A-C--C--A-T-C-G--TC-T--CAT-G---GAA--AT-----AA-ATA----------
gi|41 : A----------------AA---A-----TA-----T-ATA-ACTGG-C-AC-G-C-ACAT-GTC------------TA-TCATTT-GG----AAAA----------T-AT--T-AA--TTTTAA-C--TA-A-T-C-GC-TA-T--CAT-G---GAAT-AT-----CA-ATA----------g
gi|43 : gcgaattaacattct-C-AC-G-C-ACAT-GTCTATAGCT--A-ATG-TCATTTTGA---AAAAA----------A-ATA-TTAA--TTT--A-C--T--A-T-C-G--
gi|44 : a-G-TACTCTT-CCT-TCGTGAT--TCCAACG------CAGAGG--C-------ATGCA-------TATGTTA-TATTG-T---G-TGC---TTAT-ACTAAA--CGCTAGaataagatataattat
gi|45 : AAC--AC-G-CACTGT---CT---GTGAT--TCCAACA------TACA-G--T-------ATACA-------TA-A-TA-TATTT-T---G-TGC---TTA--ACTAAA--CGCTAG
gi|47 : TGCTATGT---CTCA----------AA-----CTATCG---AAGTTT----GACAACT------TATCG-
gi|48 : caagtttcagTTTCT-CAAG---AA----------G-----------G---A-----T----TCCTTGGAATCAATA-----GG-------------CGGA-G-CGGA--T--TTTT-AC
gi|49 : CAATTTTCAATGGATACT-------TTCAATATTG-ACA-TGA-T--TTT-ATA------TAA--TT
gi|5 : TAGG-GA-A-T---ATT-C-TTT--TGTT---CG-----AAAACAAC--CCTTCGA-ATTTGCTA-TGGATTAA-CA---TA--T-----------------------CCGATCAATAATATATTT--ACCTAGAAATTAGCGGAGC-ACAAA--CCT-TCCAA--TT-CTG--C-GTGGAT---------T----TA-AC--AA-TG--------------A------ATTA-AAGAGAA-AA-----GTAGT-A-TGATGGAA-AAT--GT-TTCT-TT-A-TAAATT-T--TTGAG---AAA----------------AAA----------------AA---A-----AA-----T-ATA-AC-GA-C-AC-G-C-ACAT-GTCTATAGCTTAA-CTATTCATTT-GG---AAAAA------------ATA-T-TA--ATT--A-C-----A-T-C-G--TC-T--CAT-G---GAA--AT-----AA-TT-------------AT---------AT-A-T
gi|5 : gccttacatctgtatcttctctctgactcatttatcgtatcttattccatataatAGTG-AC--TGATT--TT--ATA------TAAATCTC--TGAAAGAGGT-----CAT-------------AACTAGTCGCATCAAGCATTAAC--AC-G-CACTGCT-CCC-T-GTGATC-TCCAACAT-----TACAGGA-G-------ATACA-------TATATTA-TATTTAT---G-TGC---TTAT-ACTAAAACCGCTAGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctagcttcttggtgcgagctaacactcgccatcatccccacgatccattaagtgactgattttatataaatctctgaaagaggtcataactagtcgcatcaagcattaacacgcactgctccctgtgatctccaacattacaggagatacatatattatatttatgtgcttatactaaaaccgctagta
gi|50 : gccttacatctgtatcttctctctgactcatttatcgtatcttattccatataattagggaatattcttttgttcgaaaacaacccttcgaatttgctatggattaacatatccgatcaataatatatttacctagaaattagcggagcacaaaccttccaattctgcgtggatttaacaatgaattaaagagaaaagtagtatgatggaaaatgtttctttataaatttttgagaaaaaaaaaaatataacgacacgcacatgtctatagcttaactattcatttggaaaaaatattaattacatcgtctcatggaaataattatatatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctagcttcttggtgcgagctaacactcgccatcatccccacgatccatta-------ATACA-------TATATTA-TATTT-TAATG-TG-T--TTAT-ACTAAA--CGCTAGTa
gi|6 : TTAAATTCT-GG-TACT-CGC--CCGACT-CAA-TTA--TT-TCACACCCTTGTTTGCT------------TTAGGAAAAATCTAGG-GAAC-TTTAATT-C-TTT--TGTG---CG-----AAA----A--CCTTCGA--TTTGCCA-TGGATTAAACAA--TG--CTCTCTT--TTTAAA-CATTCGCGCCGATC--TAATA--------------A-TTAGCGGA-C-ACAAAAACCT-TTCCA--AT-TTG--C-ATGGAT---------T----TT-AC--AA-TG--------------A------ATTT-AAGA--A-AA-----GTTG--A-TGAATGAA-AATGCGA-TTTT-TT-A-CA---T-T--TTGAG-----------------------AA----------------AA---A-----AA-----T-ATA-AC-GA-CAACGG-C-ACAT-GTCTAT-GCT--A-CTA-TCATTT-GG---AAAAA----------T-AT--T-AA--TTT--A-C--G--ATT-C-G--TCTT--CAT-G---GAA--AT-----AA-ATA----------AA---------------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCAATC---TTCAATAG-G-ACATTGAAT--TTT-ATA------TAA--TTC--TGAAAGAGGTATTGATAT---AATAC-TT-GAACTA-TCGCAC-AAACATTAAC--AC-G-CACTGTTGCCT-TTGTGAT--TCAACCA------TACAGGTAT-------ATACA-------TATATTA-TATTT-T---G-TGCT--TTAT-ACTAAA--CGCTa
gi|7 : TTAAATTCT-GG-TACT-CGC--CCGACT-CAA-TTA--TT-TCACACCCTTGTTTGCT------------TTAGGAAAAATCTAGG-GAAC-TTTAATT-C-TTT--TGTG---CG-----AAA----A--CCTTCGA--TTTGCCA-TGGATTAAACAA--TG--CTCTCTT--TTTAAA-CATTCGCGCCGATC--TAATA--------------A-TTAGCGGA-C-ACAAAAACCT-TTCCA--AT-TTG--C-ATGGAT---------T----TT-AC--AA-TG--------------A------ATTT-AAGA--A-AA-----GTTG--A-TGAATGAA-AATGCGA-TTTT-TT-A-CA---T-T--TTGAG-----------------------AA----------------AA---A-----AA-----T-ATA-AC-GA-CAACGG-C-ACAT-GTCTAT-GCT--A-CTA-TCATTT-GG---AAAAA----------T-AT--T-AA--TTT--A-C--G--ATT-C-G--TCTT--CAT-G---GAA--AT-----AA-ATA----------AA---------------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCAATC---TTCAATAG-G-ACATTGAAT--TTT-ATA------TAA--TTC--TGAAAGAGGTATTGATAT---AATAC-TT-GAACTA-TCGCAC-AAACATTAAC--AC-G-CACTGTTGCCT-TTGTGAT--TCAACCA------TACAGGTAT-------ATACA-------TATATTA-TATTT-T---G-TGCT--TTAT-ACTAAA--CGCTtag
gi|8 : TTAAATTCT-GG-TACT-CGC--CCGACT-CAA-TTA--TT-TCACACCCTTGTTTGCT------------TTAGGAAAAATCTAGG-GAAC-TTTAATT-C-TTT--TGTG---CG-----AAA----A--CCTTCGA--TTTGCCA-TGGATTAAACAA--TG--CTCTCTT--TTTAAA-CATTCGCGCCGATC--TAATA--------------A-TTAGCGGA-C-ACAAAAACCT-TTCCA--AT-TTG--C-ATGGAT---------T----TT-AC--AA-TG--------------A------ATTT-AAGA--A-AA-----GTTG--A-TGAATGAA-AATGCGA-TTTT-TT-A-CA---T-T--TTGAG-----------------------AA----------------AA---A-----AA-----T-ATA-AC-GA-CAACGG-C-ACAT-GTCTAT-GCT--A-CTA-TCATTT-GG---AAAAA----------T-AT--T-AA--TTT--A-C--G--ATT-C-G--TCTT--CAT-G---GAA--AT-----AA-ATA----------AA---------------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCAATC---TTCAATAG-G-ACATTGAAT--TTT-ATA------TAA--TTC--TGAAAGAGGTATTGATAT---AATAC-TT-GAACTA-TCGCAC-AAACATTAAC--AC-G-CACTGTTGCCT-TTGTGAT--TCAACCA------TACAGGTAT-------ATACA-------TATATTA-TATTT-T---G-TGCT--TTAT-ACTAAA--CGCTtag
gi|9 : T-AG-TATC-CTCG-CCGACT-AAA-TAT--TG-T----------TGTGCTA-ACGTCCAAGTTTAGGAAAT-TC-GGG-AA-C-TCTAGTT-C-TTT--TGT----TGCATATAAA----C--CCTTCGA-TTTTGC-A-TGGATTAAACAA--TGC-TTCTTTC--TT-AAA-CAA-CGCGTCGATC--TAAT-TATTTGTA-CTAGAA-TTAGCGGA-C-ACAAC--CCT-TT-GT--TT-TTG--A-TTGGAT---------T----TTAAC--AAGTGTTGTTTATTTGAAAA------ATTA-GAGA--A-AA-----GTTAGTA-TAAATTAAGAAT--GG-TTCG-TT-ATTA---T-T--CTAAG---AGT----------------AAT----------------AT---AGTATTAG-----T-ATATAC-AGCC-AC-G-C-ACAT-GT------CT--A-TTA-TCATTT-GGAAAAAAAA----------TAATA-T-AAG-TCC--A-C--C--A-G-C-G--T--T--CAG-A---GGA--AT-----AA-ATA----------AAGT---------AT-ACTATGTtag
gi|9 : actTCTATT-A-TC---A-T--TTG-G---AAA----------------AAA----------------AA---T-----AA-----T-ATA-A-------------------GTC------C--A-CCA-GCGTTC-AG---AGGAA----------T-AAA-T-AAAGTAT--A-C--T--A-T---G--TC-TAACGT-GATAGAACAAT-----AG-GNN----------NNNN---------NN-N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCCA-TTTTCAATGGAAA--AACT---TTCAATAGTG-AAA-TGATT-------------------------TG-AGGAGGTATTctaacgtgatagaacaataggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntccattttcaatggaaaaactttcaatagtgaaatgatttgaggaggtatta
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): TACTATCGTCTCATGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG
Unaligned ( gi|42 ): CGAACAAAGTTGAACATTGGATGATTATTCGTATTCTTGTATTAACACGTATCGAAGTAGGTTTTATGACTTTCTTAAATATC
Unaligned ( gi|46 ): ACAAAACAAAAAACGCGCCATTTTTTTCTCAAGAACAATTCCTTGAAATC
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1111111 11 333333333333333333 22 22222222222 111111 1 3333333333333333333333 1 1 888888888888888888888888888888 2222 666666666666666 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 2 1111 1 555555555555 11 1 11111 2222222 1 3333333333333333333333 111 111111111 444444444444444444444 5555555555555555555555555555555555555555555 5555555 2222222222222222 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 11 1 1111111 111 1111111111 111
lowQualScore : 66 4 4 33 44 5 888 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 2 8 66 33 2 2 77 8 0 2222222 2 2 77777 8 2 666 888888 6666 2 2 33 8 2 66 44 5 44 2 666666 2 6 33 111111111111111111 4 55 777 55 8 8 4 4 77 666 3 00000000000 6666 4 666 7777 000000 3 777 4 2 0 2222222222222222222222 55 3 999 3 0 3 99 0 888888888888888888888888888888 4 4 66 9 0000 1 0 444444444444444 6 6 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 0 4 8 4 4 1111 4 4 7777 4 6 3 444444444444 77 6 3 0 5555 7 55555 555 3333333 88 3 3 22 44 1111111111111111111111 44 6666 66 777 6 3 3 888 3 4 44 2 33 2 000000000 5555 2 33 2 555555555555555555555 2 33 2 77777 55 2 3 2 88 4 1 1 1 555 1 22 9999999999999999999999999999999999999999999 333 44444 44444 1 1 1 3 5 5 1 1 1 3333333 22 1 1 1 333 2222222222222222 3 44 22 1 44444 5 1 1 44 6 22 2 333 66 66666 2 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1 1 77 555 0 5 8 1 33 33 777777 33 33 0 3 1111111 33 2 2 999 66 999 7 2 4 55 999999 6666666666 8888888 2 2 444 2 888 2 33
lowQualScore : .. . . .. .. . ... ........................................................................ . . .. .. . . .. . . ....... . . ..... . . ... ...... .... . . .. . . .. .. . .. . ...... . . .. .................. . .. ... .. . . . . .. ... . ........... .... . ... .... ...... . ... . . . ...................... .. . ... . . . .. . .............................. . . .. . .... . . ............... . . ................................................................. . . . . . .... . . .... . . . ............ .. . . . .... . ..... ... ....... .. . . .. .. ...................... .. .... .. ... . . . ... . . .. . .. . ......... .... . .. . ..................... . .. . ..... .. . . . .. . . . . ... . .. ........................................... ... ..... ..... . . . . . . . . . ....... .. . . . ... ................ . .. .. . ..... . . . .. . .. . ... .. ..... . .................................................................................... . . .. ... . . . . .. .. ...... .. .. . . ....... .. . . ... .. ... . . . .. ...... .......... ....... . . ... . ... . ..
lowQualScore : 77 0 0 11 66 3 333 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 7 0 33 77 7 5 99 6 1 0000000 9 9 11111 6 9 888 222222 1111 9 9 99 6 9 88 33 0 66 9 888888 9 7 99 444444444444444444 0 55 000 55 3 0 0 0 00 444 6 44444444444 3333 4 444 7777 555555 6 000 0 0 9 9999999999999999999999 00 6 888 6 9 6 00 6 777777777777777777777777777777 4 4 11 0 4444 9 8 444444444444444 7 7 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 4 9 4 4 8888 4 4 1111 4 4 3 666666666666 99 5 6 9 3333 3 55555 888 3333333 88 3 3 22 66 1111111111111111111111 22 8888 55 000 2 1 1 666 1 0 22 9 99 9 777777777 7777 7 77 5 111111111111111111111 2 11 2 88888 33 2 1 0 22 0 8 8 8 000 8 55 4444444444444444444444444444444444444444444 000 33333 33333 7 7 7 3 0 0 7 7 7 1111111 33 7 7 7 000 7777777777777777 6 33 55 8 77777 5 9 9 55 0 88 2 999 33 77777 7 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 9 9 00 444 8 3 0 1 77 33 222222 22 44 0 7 5555555 33 9 9 111 33 111 5 5 7 99 777777 9999999999 1111111 5 5 444 5 999 7 77
consensus : CAACAAANAA-TAC-GGG-TCTTGT--GTTTTCT-CAAG---AA----------G-----------A---A-----T----T-------------A-----GGA------------CGGA-G-CGGA--T--ATTT-ACGA--TG-TACATGTATA----C-AC-A-----AGT-AT-C-T-G------GT----ATTAC-ATG-CC--A-CGT-GCG--AGT-AATACCTGT--ACC-TG-T--C-TTG-TCAAAA--CAAAGG-AT--------------TAT-CTAATCA--CTGCT---CA--ATTTAGATAT-A-TG-TG-CTGCTCTGT---C-CA----------AAA--A-CTATCG---AAGTTT----GACAACT------TATCG-G---A-AAGGTATAG-TTCT-----G-------TCTNA---TC--AT-GA-GTTTTCAACT-A-TAC-ATTTTG-ATAATGC-AT-TGGGA-GA--ATGGACTAC-ACG-ACAGA-CT-TCGA--ACTAAAACCGAGATTGGATGC-GAA-TTGG--ATG-CGT-CTT-ATCATTCTCTCCTCTGCTCGACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGCCTTAAAT-CT-GG-T-ATC-CGC--CCGACT-CAA-TAT-T--T-TCACACCCTT-TTTGCTA-ACGTCCAAGCTTAGGAAANATCTAGG-GA-C-TC-TAATTC-TTTTGT---G-CG---AAA----C--CCTTCGA-ATTTGC-A-TGGATTAAACAA--TG--TTCTCTTT--T-AAA-CAC-CGCGCCGATC--TAATATATTT-TACCCAGAA-TTAGCGGA-C-ACAAA--CCT-TTCGA--AT-TTG--C-GTGGAT---------T----TT-AC--AA-TG--------------A------ATTT-AAGA--A-AA-----GTTG--A-TGAATNAA-AAT--GG-TTCT-TT-A-TA---T-T--TTGAG---AAA----------------AAA----------------AA---A-----AA-----T-ATA-AC-GG-C-AC-G-C-ACAT-GTC-AT-GCT--A-CTA-TCATTT-GG---AAAAA----------T-ATA-T-AA--TTT--A-C--T--A-T-C-G--TC-T--CAT-G---GAA--AT-----AA-ATA----------AAAT---------AT-A-TATGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCCAATTTTCAATGGAAACCAATC---TTCAATAGTG-ACA-TGATT--TTT-ATA------TAA--TTC--TG-AAGAGGTATTGATAT---AATAC-CT-GAACTA-TCGCA--NAACATTAAC--AC-G-CACTGTT-CCT-TCGTGAT--TCCAACA------TACAGG--T-------ATACA-------TATATTA-TATTT-T---G-TGCT--TTAT-ACTAAA--CGCTAGT
Reference ( family-365 ) : CAACAAANAA-TAC-GGG-TCTTGT--GTTTTCT-CAAG---AA----------G-----------A---A-----T----T-------------A-----GGA------------CGGA-G-CGGA--T--ATTT-ACGA--TG-TACATGTATA----C-AC-A-----AGT-AT-C-T-G------GT----ATTAC-ATG-CC--A-CGT-GCG--AGT-AATACCTGT--ACC-TG-T--C-TTG-TCAAAA--CAAAGG-AT--------------TAT-CTAATCA--CTGCT---CA--ATTTAGATAT-A-TG-TG-CTGCTCTGT---C-CA----------AAA--A-CTATCG---AAGTTT----GACAACT------TATCG-G---A-AAGGTATAG-TTCT-----G-------TCTNA---TC--AT-GA-GTTTTCAACT-A-TAC-ATTTTG-ATAATGC-AT-TGGGA-GA--ATGGACTAC-ACG-ACAGA-CT-TCGA--ACTAAAACCGAGATTGGATGC-GAA-TTGG--ATG-CGT-CTT-ATCATTCTCTCCTCTGCTCGACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGCCTTAAAT-CT-GG-T-ATC-CGC--CCGACT-CAA-TAT-T--T-TCACACCCTT-TTTGCTA-ACGTCCAAGCTTAGGAAANATCTAGG-GA-C-TC-TAATTC-TTTTGT---G-CG---AAA----C--CCTTCGA-ATTTGC-A-TGGATTAAACAA--TG--TTCTCTTT--T-AAA-CAC-CGCGCCGATC--TAATATATTT-TACCCAGAA-TTAGCGGA-C-ACAAA--CCT-TTCGA--AT-TTG--C-GTGGAT---------T----TT-AC--AA-TG--------------A------ATTT-AAGA--A-AA-----GTTG--A-TGAATNAA-AAT--GG-TTCT-TT-A-TA---T-T--TTGAG---AAA----------------AAA----------------AA---A-----AA-----T-ATA-AC-GG-C-AC-G-C-ACAT-GTC-AT-GCT--A-CTA-TCATTT-GG---AAAAA----------T-ATA-T-AA--TTT--A-C--T--A-T-C-G--TC-T--CAT-G---GAA--AT-----AA-ATA----------AAAT---------AT-A-TATGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCCAATTTTCAATGGAAACCAATC---TTCAATAGTG-ACA-TGATT--TTT-ATA------TAA--TTC--TG-AAGAGGTATTGATAT---AATAC-CT-GAACTA-TCGCA--NAACATTAAC--AC-G-CACTGTT-CCT-TCGTGAT--TCCAACA------TACAGG--T-------ATACA-------TATATTA-TATTT-T---G-TGCT--TTAT-ACTAAA--CGCTAGT
gi|1 : CAACAAACAA-TAC-GGACTCTTGCCAGTGTTCTACAAG---AA----------G-----------A---A-----T----T-------------A-----GAA------------CGGA-G-CGGA--CCGATTT-ACGA--TG-TACATGTATA----CTAC-ATGTAGGGT-AT-C-T-G------GT----GT-AC-AT--------CGT-GCGTTAG---ATACCTGT--ACC-TGGT--CGTTG-TCAAAA--CAAAGA-AT--------------TATTCTAATCAAACT-CT---CA--AGTTAG-TAT---TA-T--TTGCTCTGT---C-CA----------AAA--AACTATCG---AAGTTT----GACAACT------TATCGTG---A-AACGTATAG-TTCT-----C-------TCTTA---TC--AT-GAAGGTTTCAACT-A-TAC-ATTGTG-ATATTGC-AT-TGGGA-GA--ATGAATCAT-ACA-ACAGATCTATCGACCACTAAAACTGAGATTAC-TCC-GAAATTGGCAATATCGTATTT-ATCCTTTTCTCCTCTGCTCGACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGCCTTAAATACT-GG-T-ATC-CGC--CCGACT-CAA-TAT-T--T-TCACACCTTT-TTTGCTAGACGTCCAAGCTTAGGAAACATCTAGG-GA-C-TC-TAAT-------------------AAA----C--CCTTCGA-ATTTGC-A-TGGATTAAACAA--TG--TTCTCTTT--T-AAAACAC-CG-GCCGA-C--TAATATATTT-TACCTA-AA-TTAGCGGA-C-ACAAA--CCT-TCCAA--AT-TTG--C-GTGGAT---------T----TT-AC--AA-TG--------------A------ATTT--AGA--A-AA-----GTTG--G--GAATGAA-AAT--GG-TTTT-TT-A-CA---T-T--TTGAGAAAAAA----------------AAA----------------AA---A-----AA-----T-ATA-AC-GA-C-AC-GCC-ACATCGTCAATAGCT--A-CTA-TCATTT-GG---AAAAA----------T-ATA-T-TA--TTT--ACC--T--A-TGC-G--TC-T--CATAG---GAA--AT-----AA-ATA----------AAATGATNNNNNNNN-N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCAGTC---TTCCATAGTG-ACA-TGATT--TTTGATA------TAA--TTC--TG-AAGA-GTATTGATAT---AATACTTT-GAACTA-TCGCA--ACACATTAATCAAC-G-CACTGTT-CCTGTTTTGATGATCCAACA------TACAGC--T-------ATACA-------TATATTA-TATGT-T---G-TGCTAATTATAACTAAA--CGCTAGT
gi|10 : CTTAAAT-CT-GG-TTATCTCGC--C-GACT-AAA-TAT-AAAT-TAACACATTT-TTTGCC-------------TAGTAAA---CTCGGCGA-C-CCCTAATTCCTTTTGTT--G-CG---AAAA---C--CCTTCGA-ATTTGC-A-AGGATTAAATAAATTGAATCCTGTTTCTT-AAA-CAC-C-CGCCGATC--TAATATACTT-TACCAGGAA--TAGCGGA-TAACAAC--CCT-TCC----AC-TTGCTC-GTGGAT---------T----TT-AC--AG-TG--------------A------ATTTAAAGA--A-AA-----GTTG--A-TGAATATT-AAT--GG--TGT-TT-A-TAT--T-T--TTG------AA----------------AAA----------------AT---A-----AA-----T-ATA-AC-GG-C--C-G-C-TCAT-G----T-G-T--A-CAA-TCATTT-AG---AAAAA----------A-ATATT-AC--TTT--A-C--T--A-
gi|10 : CCAATT--CAATGGAAAAAAACCCTTTTCAA-AATG-ACA-TGAGT--TTT-ATA------TAA--TTTCGTG-AAGAGATATT-ATAC---Annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaattcaatggaaaaaaacccttttcaaaatgacatgagttttatataatttcgtgaagagatattatacatt
gi|11 : cttaaatctggttatctcgccgactaaatataaattaacacattttttgcctagtaaactcggcgacccctaattccttttgttgcgaaaacccttcgaatttgcaaggattaaataaattgaatcctgtttcttaaacacccgccgatctaatatactttaccaggaatagcggataacaacccttccacttgctcgtggattttacagtgaatttaaagaaaagttgatgaatattaatggtgtttatatttttgaaaaaataaatataacggccgctcatgtgtacaatcatttagaaaaaaatattactttactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAACAAAAAG-TAC-GG--TCTTGT--GTTTTCT-CAAG---AA----------G-----------A---A-----T----T-------------A-----GTA------------CGGA-GGCGGA--T--ATTT-AC-A--TGCTACATGTATA----C-AC-A-----ACTTAT-C-T-G------GT----ATTAC-ATG-CC--ACCGT-GCG--AGT-AATACC-GTTAACC-CA-G--T-TTG-TC-AAA--CAAAGG-A---------------TAT-CTAATCC--TTGCT---CA--ATTTAGATAT-A-TG-TGTCTGCCTTGT---C-CA----------AAA--A-C-ATCG---AAGTTT----GACAACT------TATCG-G---A-AAGGTATAGTTTCT-----G-------CCTCAAATCC--AT-GC-GTTTTCAACT-ATTAC-ATTTT--ATAATGC----------------GGACTAC-ACA---AGA-CT-TCGA--ACTAAA--CGAGATTGGATGC---------------CGT-CTT-ATCATTCTtt
gi|12 : aAACAAAAAG-TAC-GG--TCTTGT--GTTTTCT-CAAG---AA----------G-----------A---A-----T----T-------------A-----GTA------------CGGA-GGCGGA--T--ATTT-AC-A--TGCTACATGTATA----C-AC-A-----ACTTAT-C-T-G------GT----ATTAC-ATG-CC--ACCGT-GCG--AGT-AATACC-GTTAACC-CA-G--T-TTG-TC-AAA--CAAAGG-A---------------TAT-CTAATCC--TTGCT---CA--ATTTAGATAT-A-TG-TGTCTGCCTTGT---C-CA----------AAA--A-C-ATCG---AAGTTT----GACAACT------TATCG-G---A-AAGGTATAGTTTCT-----G-------CCTCAAATCC--AT-GC-GTTTTCAACT-ATTAC-ATTTT--ATAATGC----------------GGACTAC-ACA---AGA-CT-TCGA--ACTAAA--CGAGATTGGATGC---------------CGT-CTT-ATCATTCTtgtacaaacaatacatgcatctaagttagctgcatcggatttcctcaatatcaactgacatag
gi|13 : aAACAAAAAG-TAC-GG--TCTTGT--GTTTTCT-CAAG---AA----------G-----------A---A-----T----T-------------A-----GTA------------CGGA-GGCGGA--T--ATTT-AC-A--TGCTACATGTATA----C-AC-A-----ACTTAT-C-T-G------GT----ATTAC-ATG-CC--ACCGT-GCG--AGT-AATACC-GTTAACC-CA-G--T-TTG-TC-AAA--CAAAGG-A---------------TAT-CTAATCC--TTGCT---CA--ATTTAGATAT-A-TG-TGTCTGCCTTGT---C-CA----------AAA--A-C-ATCG---AAGTTT----GACAACT------TATCG-G---A-AAGGTATAGTTTCT-----G-------CCTCAAATCC--AT-GC-GTTTTCAACT-ATTAC-ATTTT--ATAATGC----------------GGACTAC-ACA---AGA-CT-TCGA--ACTAAA--CGAGATTGGATGC---------------CGT-CTT-ATCATTCTtgtacaaacaatacatgcatctaagttagctgcatcggatttcctcaatatcaactgacatag
gi|14 : a-TA--------------A------ATTT-AAGT--A-AA-----GTTG--A-TGGATTAA-AAC--GG-TTCT-TT-A-TA---T-T--TTG------AA----------------AAA----------------AA---A-----AA-----T-ATA-AT-GG-C-AC-G-T-ATAT-GT------CT--A-CTA-TCTGGT-GG---AAAAA----------T-ATA---AA--TTT--A-C--T--A-T-C-G--TC-T--CGT-G---GAA--AT-----AA-ATT----------AGAT---------AT-A-TATATtgtacaaacaatacatgcatctaagttagctgcatcggatttcctcaatatcaactgacatag
gi|14 : ctGGAAA--AACT---TTCAATAGTG-ATA-GGATT--T---ATA------TAA--TTC--TG-AAGAGGTATTAA------AATAC-CT-GATCTA-TCGAA--CAACATTAAC--AC-G-TACTGTT-CCT-TTGTGAT--TCCAACA------TAGAGG--T-------ATGCATACAGTGTATATTA-TGTTT-T---G-TG-T--CTAT-ACTAAA--CGCTAGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaaaaactttcaatagtgataggatttatataattctgaagaggtattaaaatacctgatctatcgaacaacattaacacgtactgttcctttgtgattccaacatagaggtatgcatacagtgtatattatgttttgtgtctatactaaacgctagt
gi|15 : cttaaatttaagtaaagttgatggattaaaacggttctttatattttgaaaaaaaaaatataatggcacgtatatgtctactatctggtggaaaaatataaatttactatcgtctcgtggaaataaattagatatatatatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAAAAAGAAGCAC-AGG-CCTTCT--ATTTTCT-CAAGGACAA----------GTCCTTGGAATCA---A-----T----T-------------A-----GG--------------GGA-G-CAGA--T--ATTT-ACGA--TG-CACATG--------C-AT-A-----GGT-AT-C-TTG------GA----ATCAC-ATG-CC--G-CGT-GCG--AGT-AATACC--T--ACC-TG-T--C-TTG-TCAAAA--TAAAG--------------------------TCA--CTACT---CA--ATTTAGAT-T-A-TG-T--CTGTTCTGC---T-C-----------AAA--A-CTATCG---AAGTTG----AACAATT------TATCG-G---ATAATG-ATAT-TTGT-------------TCCTA---TC--AT-GA-ATACTCAACT-------ATTTGG-AT-ATGCGAT-TGG---AA--ATA----AC-ATGCACGGA-CA-TCGA--AC-AAAACT-AAATTGGATGC-G
gi|16 : AA-AAT--GG-TTCT-TT-A-TA---T-T--T--------AA----------------AAA----------------AA---A-----TA-----T-ATA-AC-GG-C-AC-G-C-ACAT-GTC------T--A-CTA-CCTTGT-GG---AAAAA----------T-AT--T-AA--TTT--A-C--T--A-T-C-G--TG-T--CAT-G---AAA--ATTAAATAA-ATATNNNNNNNNNNNNN---------NN-N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCAATTTTGAATGGAAA--AACT---TTCAATAGTG-ACA-TGATT--TT--ATA------TAA--TTC--TG-AAGAGGTATTAA-AT-----TAC-CT-G-ACTA-TCGAA--CAACATTAAC--AC-GCCACTGTT-CCT-TTGTGAT--TCC----------TAC--------------------------ATATTATTATTT-T---GATGC---TTAT-ACTAAG--CGCTAGttttctccgccatgtacacgcatatcgaagtaggccgtgtgatttcctcaaatatcacacaca
gi|17 : tCAACAA-CAA-TAC-GGG-TCTTGT--GTTTTCT-CAAG---AA----------G-----------A---A-----T----T-------------A------GA------------CGGA-G-CGGA--T-------------------ATGTATA----C-AC-A-----AGT-AT-C-G-GGTACATGT----ATTAC-ATG-CC--A-CGT-GCG--AGT-AATACCTGT--ACC-TG-T--T-TTG-TCAAAA--CAAAGG-A---------------TAT-CTAATCA--CTGCT---AA--ATTTAGAT-T-A-TG-T--CTGCTCTGT---C-C-----------AAA--A-CTATCG---AAGTTT----GATAACT------TATCG-G---A-AAGGTATAG-TTCT-----GC------TCTAA---TC--AT-GA-GCTTTCAACT-A-TAC-ATTTTG-AT-ATGCGAT-TGG---GA--ATGA--TAT-AC--ACAGA-CT-TCGA--AC-AAAACTTA-ATTGGATGC-GAA-TTGG--ATG-CGT-TTT-ATCAGTCTc
gi|18 : a--------------A------ATTT-ACGA--A-AA-----GTTT--A-TGAACCAA-AAT--GG-TTCT-TT-A-TA---T-T--TTG-----------------------------------------------------------------A-AC-GG-C-AC-G-C-ATAT----------------------TTG-GG---AAAAA----------T-A-----AA--TTT--A-C--T--A-T-A-G--CC-T--T-------NNN--NN-----NN-NNN----------NNNN---------NN-N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNGTG-AAA-T-CTT--TTA-ATAGTGACATAA--TTC--TG-AAAAGATATT--TAG---AATAC-GT-GAACTC-TCATG--CAACATGAA--------CACCGCT-CCT-TCGTGAT--T-CAACA------AACAGG--T-------Atgt
gi|19 : ttGT--TTTTTCT-CAAG---AA----------G-----------A---A-----T----TT------------A-----GGA------------CGGA-G-CGGA--T--CTCT---GA--TG-TACATGTATAGTAAC-ACCA-----AGT-AT-C-TTG------GTGCCTATTACCATGACC--A-CGT-GCG--GGT-AATACCTGTT-ACCGTG-C--C-TTGGTCAAAAAACAAAGG-AT--------------AGT-CTAATCA--CTGCTTTCCAGTATTTA-ATATAA-TGTTC-CTGCTCTGTATCC-CACACATATTACAAAATA-CT-CCGAACAAGCTCTGTAGACAACCAGTTTATATC--G---A-AAAGTATA--TTCT-----GC------TCTAA---GC--AT-GA---TTTCAACTGA-TAC-ATTc
gi|2 : AACAAAGCA-TAC-GGG-TCTTGT--GTTTTCT-CAAG---AA----------G---------------A-----T----T-------------A------GA------------CGGA-G-CGGAT-T--ATTT-ACGA--TG-TACATGT-------T-AC-A-----AGT-AT-CAT-G------GT----ATTAC-ATG--C--A-CGT-GCG--AGT-AATA-CTGT--ACC-TG-T--A-TTG-TC-AAA--CAAGG------------------TAT-CTAGATA--CTGCT---C---ATTTAGAT-T-ACTG-TC-ATGCTCTGT---C-------------AAA--A-CTATCG---AAG-TT----GACA--T------TAT---G---G-AAGGTATAG-TT-T-----G-------TCTAAT--TC--ATCGA---TTTCAACT-A-TACTATTTTGAATAATGG-AT-TGGGA---------ATT-----------A-CT-TCGA--ACTAA--------------GCTGAA-TTGG--ATG-CGT-TTTAATCATACTatatag
gi|2 : aCGTCCTAAAT-CT-GGAT-ATC-TGC--C-GA-T-CAA-TAT-T--T-TCACACTTTT-TTTGCTA-ACGTC---GCCTAGGAACT-CCTAGG-GA-CATA-GATTTC-TTTTGTTTGA-CG---AAA----AAACCTTCGA-ATTTGC-AATGGATTAAAACA--TG--TTTTTTT-------A-CAC----GACGATC--TAATATATTT-TACCTAGAA-TTAGC-GA-C-ACAAA--C---TTCCA--AT-TTG--C-GTGGAT---------T----TT-AC---A-TG----------------------TTT-AAGA--A-AAT----GTTG--A-TG-ATTGA-AAT--GG-TTTT-TTAA-CA---TAT--TTGAG----------------------AAA----------------AA---A-----AC-----T-AT--AC-GA-A-AC-G-TAACAT-GTT-AT-AGT--A-CTA--CATTT-GG----AAAA----------T-AT--T-AA--TTT--A----T--A-T-CTG--TC-T--CAT-G---AGA--AT-----AAGATA----------AAAT---------ATNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAATC---TTC-ATAGTGAACA-T-ATT--T----TA------TAA--TTC--TG-AAGAGGTATTGAATT---AATA--TT-GAACTA-T---G--AAAC-TTAAC--ACAG-CATGGTT-CCT-TTGTGA---TCCAACA------TACGG------------TACA-------TATATTA-T-TTT-T---G-TGCT--T--T-ACT-AA--CGCTtgtaccaatacatgatcgaagttgtgcatgagtttctccatattgacacagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcttcgtcctaaatctggatatctgccgatcaatattttcacactttttttgctaacgtcgcctaggaactcctagggacatagatttcttttgtttgacgaaaaaaccttcgaatttgcaatggattaaaacatgtttttttacacgacgatctaatatattttacctagaattagcgacacaaacttccaatttgcgtggattttacatgtttaagaaaatgttgatgattgaaatggttttttaacatatttgagaaaaaaactatacgaaacgtaacatgttatagtactacatttggaaaatattaatttatatctgtctcatgagaataagataaaatatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaatcttcatagtgaacatattttataattctgaagaggtattgaattaatattgaactatgaaacttaacacagcatggttcctttgtgatccaacatacggtacatatattatttttgtgctttactaacgct
gi|20 : aaacaaagcatacgggtcttgtgttttctcaagaagattagacggagcggattatttacgatgtacatgttacaagtatcatggtattacatgcacgtgcgagtaatactgtacctgtattgtcaaacaaggtatctagatactgctcatttagattactgtcatgctctgtcaaaactatcgaagttgacattatggaaggtatagtttgtctaattcatcgatttcaactatactattttgaataatggattgggaattacttcgaactaagctgaattggatgcgttttaatcatacttgtaccaatacatgatcgaagttgtgcatgagtttctccatattgacacagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctt---AAA----C--CCTTCGA-ATTTGC-A-TGGATTA-------------------------------CGCGCCGATC--TA-T-TGTTT-TACCCAGAA-TTAGCGGA-C-ACAA---CCA-TTCGA--AT-TTG--C-TTGGAT---------T----TT-AC--CA-TGTGCTTTTATTTAAAA------ATTT-AAGA--A-AA-----GTTA--A-TGAATTAA-ATT--GG-TTCT-TT-A-TA---T-T--TTGAA---ATA----------------AAATATAACGTTTATAATTAG---A-----AATAAAAT-ATA-AC-GG-C-AC-G-C-ACAT-GT------CT--A-CTA-TCATTT-GG---AAAAA------------ATATT-AA--TTT--A-G--T--A-T-C-G--TC-T--CAT-G---
gi|21 : gaaTTTAGAAATTA-TG-T--CTGTTCTGT---C-CA----------AAA-----TATCG---AAGTT-------CAACT------TAACA-GGATA-AAGGATTTG-TTCT-----A-------T---A----C--AT-GA---TCTCAA-T-A-----ATTGTG-ATAAT-T-ATATGCGATGAGTATG---TATGATC-ATAGG-CT-TCAA--AACAAAAC---GAATGGGTGT-G
gi|22 : agataaccctaccagtTC--TAATAT-TTT-TACCCTGAT-TTAGCGGA-C-ACAGC--CCT-TT-GA--AT-TTG--C-GTGGGT---------T----TT-AC--AA-TGTTCTTTTA------A------AT---AAGA--A-AA-----GTTC--A-TGAATTAA-AAT--GG-TTTT-CT-A-TA---T-T--TTGA----AAA----------------TAT----------------AT---A-----TA-----T-ATA-AC-GG-C-AC-G-C-ACAT-GT------CT--A-CTA-TCGTTT-GG---AAAAA----------T-AT--T-AA--TTT--A-C--T--A-T-C-G--TC-T--CAttttctctatcttgtgcacaacaatatgatatcgaaagtaggccgtttgaagctcctcaat
gi|23 : tgaaacaggtctctgtgTTCT-TA-G---AA----------ATC---------A---A-----T----T-------------A-----GG-------------TGGG-G-CGGA--T--ATTT-ACGA--TG-TACAT----A----C-AC-A-----TGT-AT-C-T-G------GT----TTCAC-ATG-CC--A-CGT-GCG--AGT--ATACTTGT--ACC-TG-T--C-TTT-TTAAAA--CAAAGG-AT--------------T
gi|24 : agaaagcacgggcgtagtattttttaacagcaaTCCAAGCTTAGGAAAC-TC-AGG-GA-C-TC-TACTTC-----------------AAA----C--CCTTCGA-ATTTGC-A-TGGATTACACAA--TG--CTCTTTCT--T-AAA-CAC-CGTGTCGATC--TAATATATTT-TACCCATAA-ATAGCGGA-C-A-ATA--TCC-TTCGA--AT-TTG--C-GTGGAT---------T----TT-AC--AA-TG--------------tgctttaggtgtgtatatctcccagttgattcgaggaatagaagatt
gi|25 : AACAA-CAA-CACAGGG-TCTGCT--GTTTTCT-CAAG---AA----------C-----------A---A-----T----T-------------ACCTTCGGAATCAAATATAGGCGGA-G-CGGA--T--ATTTTACGA--TG-TACATATGT-----C-AC-A-----AGT-AT-C-A-G------GT----AATAC-ATG-CC--A-CGT-GCGC-AGT-AATACCTTT--ACC-TG-T--A-TTG-TCAAAA--CAAAGGTAT--------------Tttctggtgaataagaacataagtt
gi|26 : aAACAA-CAA-CAC-GGG-TCTTGT--GTTTTCT-CAAG---AACAATTCCTCGG-----------A---A-----TCAATT-------------A-----GG-------------CGGA-G-CGGA--T--ATTT-ACGA--TG-TACATGTA---------C-A-----AGT-AT-C-A-G------GT----ATTAC-ATG-CC--A-CGT-GCG--AGT-AATACCTGT--ACC-TG-T--A-TTG-TCAAAA--CAAAGG-AT--------------Ttgctc
gi|27 : aaAAACCAATC---TTCAAGTGTGTACA-T-ATTGTTTT-A-A------TAA--T-C--TG-A-GAGGTATTGATAT---AATAC-TTGGAACTA-TCGCAT-TAACATTAACT-AC---CCCTGTT-CCT-TTG-GAT--TTCAACA------TACAGG--T-------ATACA-------T-TATTA-TATTT-T---G--GC---TTAT-ACTAAA--CGCTAGTtgctttcgaataca
gi|28 : TTGT--GTTTTCTACAAAGA-AA----------G-----------AGATA-----T----T-------------GTT---AAA------------CGGAAG-CGGAAAT--ATCT-TCGAATTG--ACTTGT-TN----N-NN-N-----NNN-NN-N-N-N------NN----NNNNN-NNN-NN--N-NNN-NNN--NNN-CGT--TTGT--AAC-TG-T--C-TTG-TCAAAA--CAAAGA-----------------TAT-CTAATCA--CTGCT---CA--ATTTAGATa
gi|29 : TTCT-TA-G---AA----------ATC---------A---A-----T----T-------------A-----GG-------------TGGG-G-CGGA--T--ATTT-ACGA--TG-TAC----ATA----C-AC-A-----TGT-ATGC-T-G------GT----TTCAC-ATG-CCCAA-CGTGGCG--AGTAAATA-CTGT--ACC-TG-TCGC-TTT-TTAAAA--CAAAG
gi|3 : aagaaagcacgggcgtagtattttttaacagcaaAAACAA-CAC-G---TCTTGT--TTGTCTT-CAAG---AA----------G-----------A---AATTCCT----T-------------------GGATCTATAC-----CGAA-G-CGGA--T--ATT--ACGAACTG-TACAT----A----C-AC-A-----AGT-AT-C-C-G-------T----ATCAC-ATG-CC--A-CAG-CCG--AGT---TACCTGT--ACC-TG-T--C-TTG-TCCAAA--CAAA-G-ATTGCTTTCGCACTAATAT-CTAATCA--CTG-T---TA--ATATAGAATT-A-TG-TG--TGCATTGT---T-CT----------CAA--A-CTAT-G---AAGTTT----GACAA-T------TATCG-G---A-TA-GTATAT-TTCT-------------TCTAA---TCATAT-GA-GTTTTCAACT-A-TAT--TTTTG-AT-ATG--AT-AGGGA-TA--A--AAC-AC-ACG-AC
gi|3 : aaCCTTAA---CT-GGAT-ATC--GC--C-GACTTCAA-TATAG--T-TCACACCATT-TTC-CTAGACGTC-GAGCT----AAAAAT--AGA-GA-C-TC---ATTC-TTTATT---G-CG---AA--------CCTTCGACATTT-C-A-TGGATTA-------------------------------CGCGCCGATC--T----TGTTTATACCCAGAA-TTAGCG-A-C-ACAA---CCA-TTCGA--AT-TTG--C-TTGGATACCAGTGCTT----TT-ATGTAA-----------------A------ATTT-AAGA--A-AA-----GTTA--A-TGAATTAA-ATT--GG-TTCT-TT-A-TA---T-TTATTGAACATAAAATTACGTTATAATTAGAAA----------------AA---A-----AA-----T-ATA-AC--G-C-AC-G-C-ACAT-GTT-----CT--A-CTA-T-ATTT-GG---AAAAA------------ATATT-AA--TTT--G----T--A-T-C-GTTTC-T--CAT-G---cactggatctttatcagtcttgtacacacatatcaattggccgtattatttcgtttaaaaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccccttaactggatatcgccgacttcaatatagttcacaccattttcctagacgtcgagctaaaaatagagactcattctttattgcgaaccttcgacatttcatggattacgcgccgatcttgtttatacccagaattagcgacacaaccattcgaatttgcttggataccagtgcttttatgtaaaatttaagaaaagttaatgaattaaattggttctttatatttattgaacataaaattacgttataattagaaaaaaaatataacgcacgcacatgttctactatatttggaaaaaatattaatttgtatcgtttctcatgca
gi|30 : aaaaacaacacgtcttgtttgtcttcaagaagaaattccttggatctataccgaagcggatattacgaactgtacatacacaagtatccgtatcacatgccacagccgagttacctgtacctgtcttgtccaaacaaagattgctttcgcactaatatctaatcactgttaatatagaattatgtgtgcattgttctcaaactatgaagtttgacaattatcggatagtatatttcttctaatcatatgagttttcaactatatttttgatatgatagggataaaacacacgaccactggatctttatcagtcttgtacacacatatcaattggccgtattatttcgtttaaaaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncc---TTTAATAGTG-ACA-TGATT--TT--ATA------TAA--TTA--TG-AATAGGTATTAA------AATAC-CA-GAATTA-TCGCA--CAACATTAAC--AC------TGTT-CCT-TCGTAAT--TCCAATA------TAGAGG--TACCGATAATACA-------TACTTTA-TATTT-T---G-TGC---TTAT-CCTAAA--CGCTca
gi|31 : cactATAGTG-ACA-TGATT--TT--ATA------GAA--TTT--TA-AAGAGGTATGAA------AATAC-CT-GAACTA-TTGCA--CAACATTAAC--AC-G-TACTGTT-CCT-CTGTGAT--TCCAACA------TAGAGG--T-------ATACA-------TATATTA-TATTC-T---G-TGC---TTAT-ACTAAA--CGCTAG
gi|32 : ccatat--------------A------AGTT-AGGA--A-AA-----GTTG--A-TGACTTCA-AAT----------TT-A-TA---T-T--TTG-------------------------AA----------------CG---A-----AA-----T-ATA-AC-GG-C-TC-G-C-TAAT-GT--A----T--A-CTA-TCGTCT-GA---AAAAAACCCCAAAACA-AAA-T-AA--TTT--A-CTGT--A-T-C-G--TT-T--C
gi|34 : tcaatattttcA------TCA--TTC--TA-AGTCGGTTTTAA-AT-----TAC-CT-GAACTA-TCACA--TTACATAAAC--AC------TGTT-CCT-TTGTGAT--TTCAATATAGATGTACATG--T-------ATACA-------TACATTC-TATTT-T---G-TAC---TTAT-CCTACA--CGCT
gi|35 : T-GAGA--A-AA-----TATG--T-TGAAT--A-AAT--GGGTTCT-TT-A-CA---T-T--T---------------------------------------------------------G-----T-AT---C-G--C-AC-G-C-ACAT-GTC------T--A-CTA-TCATTT-GG---AAAAC----------C-AAA-TTGA--TTT--A-C--T--A-T-T-G--TC-T--CAC-T---AAA--AT-----AA-ATT----------AAA
gi|36 : aaAA--TTC--TG-AATACATATAGGTATTTAAATAC-CT-AAATTA-TCACA-----CATTAAC--AC------TGTT-CCT-TCGTGAT--TCTAACT------TGGAGG--T-------ATTCA-------TACGTTA-TATTT-T---A-TACT--T
gi|37 : c---------T----TT-AC--AA-TG--------------A------ATTT-AAGA--A-AA-----GTTG--A-TGACTGAA-AAT--GATTTTT-TT-A-CA---T-T--GTGAG-----------------------AA----------------AA---A-----AA-----T-ATA-AC-GA-C-AG-G-C-ACAT-GTCTATAGCT--A-CTA-TCATTT-GG---AAAatc
gi|38 : T-TTG--C-GTGGAT---------T----TT-AC--AA-TG--------------TTCTTTTATTC-AATC--A---------TT-----TAAAAAAA-AAC--GT-TTCT-TT-A-TG---T-T--TTGA------------------------AA----------------AATTTA-----GA-----T-ATA-AC-GA-C-AC-G-C-ACAT-GT------------CTA-TCATT
gi|39 : AATTAA-AAT--GG-TTCT-TT-A-TA---T-T--TTGAA---ATA----------------TAT----------------AT---A-----TA-----T-ATA-AC-AG-C-AC-G-C-ACAT------T-TCT--A-CTA-TCATTT-GT---AAAAA----------T-AT--T-TA--TTT--A-C--T--A-T-C-G--TC-T--CAT-G---G
gi|4 : AAGTATAG-TTCTTCTTAGCACTATCTCTAA---TC--AG-GA-GTTTTCAACC-A-TAT-ATTTTG-AT-ATGCGAT-T--AA-GA--AT--AATAT-AC--ACGGA-CT-TCGA--AC-AAAACTGAA--TGAATG
gi|4 : CCTTAAAT-CTCGG-T-ATT-TGCGGTAGACT-CAAGTAT-T--CCTCACACC--T-TTGGCTAGACG-CCAAGCTTAGAGAAC-TC-GGG-GA-C--C-TAATTCCTTTTGT---GGCG---AAAAA--CG-CCTTCGA-ATTTGG-A-TGGATTAACAAA--TT--TTCTTTCT--T-AAA-----CGCACCGATT--GAATATA-TT-TACCAAACATTTAGCGTA-C-ACAAC--CCTGTTCGACCATCTTT--CAATGAAT---------TGGCATT-AC--AA-TGTTCTTTC-------T------ATTA-AAGA--ATAAAAATGGTTG--ATTGAAGT-A-AAT--AG-TTTT-CT-A-TA---T-T--TGGGG---GGG----------------GGGGGGGCACGGC------GG---A-----CA-----TCACG-AC-GGCC-AC-G-C-CCAC-AT---T-GTT--ACCTA-TCATTT-GA---AAAAA------------A-A-A-AA--TTT--A-C--TGAG-T-C-G--TC-T--CAT-G---GAA--AT-----AA-Atcgtttctatcagtctttgttacacacatatcctgaaattgtcgtagaaccttcatcatcaactctctcgtctccccttctcctcgtcaatctctctccctctctctcttctccatcccctcctccctcctcctcgtgctctgcccttaaatctcggtatttgcggtagactcaagtattcctcacacctttggctagacgccaagcttagagaactcggggacctaattccttttgtggcgaaaaacgccttcgaatttggatggattaacaaattttctttcttaaacgcaccgattgaatatatttaccaaacatttagcgtacacaaccctgttcgaccatctttcaatgaattggcattacaatgttctttctattaaagaataaaaatggttgattgaagtaaatagttttctatatttggggggggggggggcacggcggacatcacgacggccacgcccacattgttacctatcatttgaaaaaaaaaaatttactgagtcgtctcatggaaataaa
gi|40 : aagtatagttcttcttagcactatctctaatcaggagttttcaaccatatattttgatatgcgattaagaataatatacacggacttcgaacaaaactgaatgaatgtcgtttctatcagtctttgttacacacatatcctgaaattgtcgtagaaccttcatcatcaactctctcgtctccccttctcctcgtcaatctctctccctctctctcttctccatcccctcctccctcctcctcgtgctctgcTCT-TT-A-TA---T-T--TTGAT---GAA----------------AAA----------------AA---A-----AA-----T-ATA-AC-AG-C-AC-G-C-ACAA-GT------------CTA-TCATTT-GG----AAAA----------T--TT-C-AA--ATT--A-C--C--A-T-C-G--TC-T--CAT-G---GAA--AT-----AA-ATA----------
gi|41 : A----------------AA---A-----TA-----T-ATA-ACTGG-C-AC-G-C-ACAT-GTC------------TA-TCATTT-GG----AAAA----------T-AT--T-AA--TTTTAA-C--TA-A-T-C-GC-TA-T--CAT-G---GAAT-AT-----CA-ATA----------g
gi|43 : gcgaattaacattct-C-AC-G-C-ACAT-GTCTATAGCT--A-ATG-TCATTTTGA---AAAAA----------A-ATA-TTAA--TTT--A-C--T--A-T-C-G--
gi|44 : a-G-TACTCTT-CCT-TCGTGAT--TCCAACG------CAGAGG--C-------ATGCA-------TATGTTA-TATTG-T---G-TGC---TTAT-ACTAAA--CGCTAGaataagatataattat
gi|45 : AAC--AC-G-CACTGT---CT---GTGAT--TCCAACA------TACA-G--T-------ATACA-------TA-A-TA-TATTT-T---G-TGC---TTA--ACTAAA--CGCTAG
gi|47 : TGCTATGT---CTCA----------AA-----CTATCG---AAGTTT----GACAACT------TATCG-
gi|48 : caagtttcagTTTCT-CAAG---AA----------G-----------G---A-----T----TCCTTGGAATCAATA-----GG-------------CGGA-G-CGGA--T--TTTT-AC
gi|49 : CAATTTTCAATGGATACT-------TTCAATATTG-ACA-TGA-T--TTT-ATA------TAA--TT
gi|5 : TAGG-GA-A-T----ATTC-TTTTGT---T-CG---AAAACAAC--CCTTCGA-ATTTGCTA-TGGATTAA-CA---TA--T-----------------------CCGATCAATAATATATTT--ACCTAGAAATTAGCGGAGC-ACAAA--CCT-TCCAA--TT-CTG--C-GTGGAT---------T----TA-AC--AA-TG--------------A------ATTA-AAGAGAA-AA-----GTAGT-A-TGATGGAA-AAT--GT-TTCT-TT-A-TAAATT-T--TTGAG---AAA----------------AAA----------------AA---A-----AA-----T-ATA-AC-GA-C-AC-G-C-ACAT-GTCTATAGCTTAA-CTATTCATTT-GG---AAAAA------------ATA-T-TA--ATT--A-C-----A-T-C-G--TC-T--CAT-G---GAA--AT-----AA-TT-------------AT---------AT-A-T
gi|5 : gccttacatctgtatcttctctctgactcatttatcgtatcttattccatataatAGTG-AC--TGATT--TT--ATA------TAAATCTC--TGAAAGAGGT-----CAT-------------AACTAGTCGCATCAAGCATTAAC--AC-G-CACTGCT-CCC-T-GTGATC-TCCAACAT-----TACAGGA-G-------ATACA-------TATATTA-TATTTAT---G-TGC---TTAT-ACTAAAACCGCTAGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctagcttcttggtgcgagctaacactcgccatcatccccacgatccattaagtgactgattttatataaatctctgaaagaggtcataactagtcgcatcaagcattaacacgcactgctccctgtgatctccaacattacaggagatacatatattatatttatgtgcttatactaaaaccgctagta
gi|50 : gccttacatctgtatcttctctctgactcatttatcgtatcttattccatataattagggaatattcttttgttcgaaaacaacccttcgaatttgctatggattaacatatccgatcaataatatatttacctagaaattagcggagcacaaaccttccaattctgcgtggatttaacaatgaattaaagagaaaagtagtatgatggaaaatgtttctttataaatttttgagaaaaaaaaaaatataacgacacgcacatgtctatagcttaactattcatttggaaaaaatattaattacatcgtctcatggaaataattatatatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctagcttcttggtgcgagctaacactcgccatcatccccacgatccatta-------ATACA-------TATATTA-TATTT-TAATG-TG-T--TTAT-ACTAAA--CGCTAGTa
gi|6 : TTAAATTCT-GG-T-ACT-CGC--CCGACT-CAA-TTA-T--T-TCACACCCTTGTTTGCT------------TTAGGAAAAATCTAGG-GAAC-TT-TAATTC-TTTTGT---G-CG---AAA----A--CCTTCGA--TTTGCCA-TGGATTAAACAA--TG--CTCTCTTT--TTAAA-CATTCGCGCCGATC--TAATA--------------A-TTAGCGGA-C-ACAAAAACCT-TTCCA--AT-TTG--C-ATGGAT---------T----TT-AC--AA-TG--------------A------ATTT-AAGA--A-AA-----GTTG--A-TGAATGAA-AATGCGA-TTTT-TT-A-CA---T-T--TTGAG-----------------------AA----------------AA---A-----AA-----T-ATA-AC-GA-CAACGG-C-ACAT-GTCTAT-GCT--A-CTA-TCATTT-GG---AAAAA----------T-AT--T-AA--TTT--A-C--G--ATT-C-G--TCTT--CAT-G---GAA--AT-----AA-ATA----------AA---------------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCAATC---TTCAATAG-G-ACATTGAAT--TTT-ATA------TAA--TTC--TGAAAGAGGTATTGATAT---AATAC-TT-GAACTA-TCGCAC-AAACATTAAC--AC-G-CACTGTTGCCT-TTGTGAT--TCAACCA------TACAGGTAT-------ATACA-------TATATTA-TATTT-T---G-TGCT--TTAT-ACTAAA--CGCTa
gi|7 : TTAAATTCT-GG-T-ACT-CGC--CCGACT-CAA-TTA-T--T-TCACACCCTTGTTTGCT------------TTAGGAAAAATCTAGG-GAAC-TT-TAATTC-TTTTGT---G-CG---AAA----A--CCTTCGA--TTTGCCA-TGGATTAAACAA--TG--CTCTCTTT--TTAAA-CATTCGCGCCGATC--TAATA--------------A-TTAGCGGA-C-ACAAAAACCT-TTCCA--AT-TTG--C-ATGGAT---------T----TT-AC--AA-TG--------------A------ATTT-AAGA--A-AA-----GTTG--A-TGAATGAA-AATGCGA-TTTT-TT-A-CA---T-T--TTGAG-----------------------AA----------------AA---A-----AA-----T-ATA-AC-GA-CAACGG-C-ACAT-GTCTAT-GCT--A-CTA-TCATTT-GG---AAAAA----------T-AT--T-AA--TTT--A-C--G--ATT-C-G--TCTT--CAT-G---GAA--AT-----AA-ATA----------AA---------------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCAATC---TTCAATAG-G-ACATTGAAT--TTT-ATA------TAA--TTC--TGAAAGAGGTATTGATAT---AATAC-TT-GAACTA-TCGCAC-AAACATTAAC--AC-G-CACTGTTGCCT-TTGTGAT--TCAACCA------TACAGGTAT-------ATACA-------TATATTA-TATTT-T---G-TGCT--TTAT-ACTAAA--CGCTtag
gi|8 : TTAAATTCT-GG-T-ACT-CGC--CCGACT-CAA-TTA-T--T-TCACACCCTTGTTTGCT------------TTAGGAAAAATCTAGG-GAAC-TT-TAATTC-TTTTGT---G-CG---AAA----A--CCTTCGA--TTTGCCA-TGGATTAAACAA--TG--CTCTCTTT--TTAAA-CATTCGCGCCGATC--TAATA--------------A-TTAGCGGA-C-ACAAAAACCT-TTCCA--AT-TTG--C-ATGGAT---------T----TT-AC--AA-TG--------------A------ATTT-AAGA--A-AA-----GTTG--A-TGAATGAA-AATGCGA-TTTT-TT-A-CA---T-T--TTGAG-----------------------AA----------------AA---A-----AA-----T-ATA-AC-GA-CAACGG-C-ACAT-GTCTAT-GCT--A-CTA-TCATTT-GG---AAAAA----------T-AT--T-AA--TTT--A-C--G--ATT-C-G--TCTT--CAT-G---GAA--AT-----AA-ATA----------AA---------------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCAATC---TTCAATAG-G-ACATTGAAT--TTT-ATA------TAA--TTC--TGAAAGAGGTATTGATAT---AATAC-TT-GAACTA-TCGCAC-AAACATTAAC--AC-G-CACTGTTGCCT-TTGTGAT--TCAACCA------TACAGGTAT-------ATACA-------TATATTA-TATTT-T---G-TGCT--TTAT-ACTAAA--CGCTtag
gi|9 : T-AG-T-ATC-CTCG-CCGACT-AAA-TAT-T--G-T----------TGTGCTA-ACGTCCAAGTTTAGGAAAT-TC-GGG-AA-C-TC-TAGTTC-TTTTGTT--G-CATATAAA----C--CCTTCGA-TTTTGC-A-TGGATTAAACAA--TGC-TTCTTTCT--T-AAA-CAA-CGCGTCGATC--TAAT-TATTTGTA-CTAGAA-TTAGCGGA-C-ACAAC--CCT-TT-GT--TT-TTG--A-TTGGAT---------T----TTAAC--AAGTGTTGTTTATTTGAAAA------ATTA-GAGA--A-AA-----GTTAGTA-TAAATTAAGAAT--GG-TTCG-TT-ATTA---T-T--CTAAG---AGT----------------AAT----------------AT---AGTATTAG-----T-ATATAC-AGCC-AC-G-C-ACAT-GT------CT--A-TTA-TCATTT-GGAAAAAAAA----------TAATA-T-AAG-TCC--A-C--C--A-G-C-G--T--T--CAG-A---GGA--AT-----AA-ATA----------AAGT---------AT-ACTATGTtag
gi|9 : actTCTATT-A-TC---A-T--TTG-G---AAA----------------AAA----------------AA---T-----AA-----T-ATA-A-------------------GTC------C--A-CCA-GCGTTC-AG---AGGAA----------T-AAA-T-AAAGTAT--A-C--T--A-T---G--TC-TAACGT-GATAGAACAAT-----AG-GNN----------NNNN---------NN-N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCCA-TTTTCAATGGAAA--AACT---TTCAATAGTG-AAA-TGATT-------------------------TG-AGGAGGTATTctaacgtgatagaacaataggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntccattttcaatggaaaaactttcaatagtgaaatgatttgaggaggtatta
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): TACTATCGTCTCATGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG
Unaligned ( gi|42 ): CGAACAAAGTTGAACATTGGATGATTATTCGTATTCTTGTATTAACACGTATCGAAGTAGGTTTTATGACTTTCTTAAATATC
Unaligned ( gi|46 ): ACAAAACAAAAAACGCGCCATTTTTTTCTCAAGAACAATTCCTTGAAATC
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1111111 11 333333333333333333 22 22222222222 111111 1 3333333333333333333333 1 1 888888888888888888888888888888 2222 666666666666666 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 2 1111 1 555555555555 11 1 11111 2222222 1 3333333333333333333333 111 111111111 444444444444444444444 5555555555555555555555555555555555555555555 5555555 2222222222222222 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 11 1 1111111 111 1111111111 111
lowQualScore : 66 4 4 33 44 5 888 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 2 8 66 33 2 2 77 8 0 2222222 2 2 77777 8 2 666 888888 6666 2 2 33 8 2 66 44 5 44 2 666666 2 6 33 111111111111111111 4 55 777 55 8 8 4 4 77 666 3 00000000000 6666 4 666 7777 000000 3 777 4 2 0 2222222222222222222222 55 3 999 3 0 3 99 0 888888888888888888888888888888 4 4 66 9 0000 1 0 444444444444444 6 6 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 0 4 8 4 4 1111 4 4 7777 4 6 3 444444444444 77 6 3 0 5555 7 55555 555 3333333 88 3 3 22 44 1111111111111111111111 44 6666 66 777 6 3 3 888 3 4 44 2 33 2 000000000 5555 2 33 2 555555555555555555555 2 33 2 77777 55 2 3 2 88 4 1 1 1 555 1 22 9999999999999999999999999999999999999999999 333 44444 44444 1 1 1 3 5 5 1 1 1 3333333 22 1 1 1 333 2222222222222222 3 44 22 1 44444 5 1 1 44 6 22 2 333 66 66666 2 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1 1 77 555 0 5 8 1 33 33 777777 33 33 0 3 1111111 33 2 2 999 66 999 7 2 4 55 999999 6666666666 8888888 2 2 444 2 888 2 33
lowQualScore : .. . . .. .. . ... ........................................................................ . . .. .. . . .. . . ....... . . ..... . . ... ...... .... . . .. . . .. .. . .. . ...... . . .. .................. . .. ... .. . . . . .. ... . ........... .... . ... .... ...... . ... . . . ...................... .. . ... . . . .. . .............................. . . .. . .... . . ............... . . ................................................................. . . . . . .... . . .... . . . ............ .. . . . .... . ..... ... ....... .. . . .. .. ...................... .. .... .. ... . . . ... . . .. . .. . ......... .... . .. . ..................... . .. . ..... .. . . . .. . . . . ... . .. ........................................... ... ..... ..... . . . . . . . . . ....... .. . . . ... ................ . .. .. . ..... . . . .. . .. . ... .. ..... . .................................................................................... . . .. ... . . . . .. .. ...... .. .. . . ....... .. . . ... .. ... . . . .. ...... .......... ....... . . ... . ... . ..
lowQualScore : 77 0 0 11 66 3 333 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 7 0 33 77 7 5 99 6 1 0000000 9 9 11111 6 9 888 222222 1111 9 9 99 6 9 88 33 0 66 9 888888 9 7 99 444444444444444444 0 55 000 55 3 0 0 0 00 444 6 44444444444 3333 4 444 7777 555555 6 000 0 0 9 9999999999999999999999 00 6 888 6 9 6 00 6 777777777777777777777777777777 4 4 11 0 4444 9 8 444444444444444 7 7 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 4 9 4 4 8888 4 4 1111 4 4 3 666666666666 99 5 6 9 3333 3 55555 888 3333333 88 3 3 22 66 1111111111111111111111 22 8888 55 000 2 1 1 666 1 0 22 9 99 9 777777777 7777 7 77 5 111111111111111111111 2 11 2 88888 33 2 1 0 22 0 8 8 8 000 8 55 4444444444444444444444444444444444444444444 000 33333 33333 7 7 7 3 0 0 7 7 7 1111111 33 7 7 7 000 7777777777777777 6 33 55 8 77777 5 9 9 55 0 88 2 999 33 77777 7 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 9 9 00 444 8 3 0 1 77 33 222222 22 44 0 7 5555555 33 9 9 111 33 111 5 5 7 99 777777 9999999999 1111111 5 5 444 5 999 7 77
consensus : CAACAAANAA-TAC-GGG-TCTTGT--GTTTTCT-CAAG---AA----------G-----------A---A-----T----T-------------A-----GGA------------CGGA-G-CGGA--T--ATTT-ACGA--TG-TACATGTATA----C-AC-A-----AGT-AT-C-T-G------GT----ATTAC-ATG-CC--A-CGT-GCG--AGT-AATACCTGT--ACC-TG-T--C-TTG-TCAAAA--CAAAGG-AT--------------TAT-CTAATCA--CTGCT---CA--ATTTAGATAT-A-TG-TG-CTGCTCTGT---C-CA----------AAA--A-CTATCG---AAGTTT----GACAACT------TATCG-G---A-AAGGTATAG-TTCT-----G-------TCTNA---TC--AT-GA-GTTTTCAACT-A-TAC-ATTTTG-ATAATGC-AT-TGGGA-GA--ATGGACTAC-ACG-ACAGA-CT-TCGA--ACTAAAACCGAGATTGGATGC-GAA-TTGG--ATG-CGT-CTT-ATCATTCTCTCCTCTGCTCGACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGCCTTAAAT-CT-GG-T-ATC-CGC--CCGACT-CAA-TAT-T--T-TCACACCCTT-TTTGCTA-ACGTCCAAGCTTAGGAAANATCTAGG-GA-C-TC-TAATTC-TTTTGT---G-CG---AAA----C--CCTTCGA-ATTTGC-A-TGGATTAAACAA--TG--TTCTCTTT--T-AAA-CAC-CGCGCCGATC--TAATATATTT-TACCCAGAA-TTAGCGGA-C-ACAAA--CCT-TTCGA--AT-TTG--C-GTGGAT---------T----TT-AC--AA-TG--------------A------ATTT-AAGA--A-AA-----GTTG--A-TGAATNAA-AAT--GG-TTCT-TT-A-TA---T-T--TTGAG---AAA----------------AAA----------------AA---A-----AA-----T-ATA-AC-GG-C-AC-G-C-ACAT-GTC-AT-GCT--A-CTA-TCATTT-GG---AAAAA----------T-ATA-T-AA--TTT--A-C--T--A-T-C-G--TC-T--CAT-G---GAA--AT-----AA-ATA----------AAAT---------AT-A-TATGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCCAATTTTCAATGGAAACCAATC---TTCAATAGTG-ACA-TGATT--TTT-ATA------TAA--TTC--TG-AAGAGGTATTGATAT---AATAC-CT-GAACTA-TCGCA--NAACATTAAC--AC-G-CACTGTT-CCT-TCGTGAT--TCCAACA------TACAGG--T-------ATACA-------TATATTA-TATTT-T---G-TGCT--TTAT-ACTAAA--CGCTAGT
Reference ( family-365 ) : CAACAAANAA-TAC-GGG-TCTTGT--GTTTTCT-CAAG---AA----------G-----------A---A-----T----T-------------A-----GGA------------CGGA-G-CGGA--T--ATTT-ACGA--TG-TACATGTATA----C-AC-A-----AGT-AT-C-T-G------GT----ATTAC-ATG-CC--A-CGT-GCG--AGT-AATACCTGT--ACC-TG-T--C-TTG-TCAAAA--CAAAGG-AT--------------TAT-CTAATCA--CTGCT---CA--ATTTAGATAT-A-TG-TG-CTGCTCTGT---C-CA----------AAA--A-CTATCG---AAGTTT----GACAACT------TATCG-G---A-AAGGTATAG-TTCT-----G-------TCTNA---TC--AT-GA-GTTTTCAACT-A-TAC-ATTTTG-ATAATGC-AT-TGGGA-GA--ATGGACTAC-ACG-ACAGA-CT-TCGA--ACTAAAACCGAGATTGGATGC-GAA-TTGG--ATG-CGT-CTT-ATCATTCTCTCCTCTGCTCGACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGCCTTAAAT-CT-GG-T-ATC-CGC--CCGACT-CAA-TAT-T--T-TCACACCCTT-TTTGCTA-ACGTCCAAGCTTAGGAAANATCTAGG-GA-C-TC-TAATTC-TTTTGT---G-CG---AAA----C--CCTTCGA-ATTTGC-A-TGGATTAAACAA--TG--TTCTCTTT--T-AAA-CAC-CGCGCCGATC--TAATATATTT-TACCCAGAA-TTAGCGGA-C-ACAAA--CCT-TTCGA--AT-TTG--C-GTGGAT---------T----TT-AC--AA-TG--------------A------ATTT-AAGA--A-AA-----GTTG--A-TGAATNAA-AAT--GG-TTCT-TT-A-TA---T-T--TTGAG---AAA----------------AAA----------------AA---A-----AA-----T-ATA-AC-GG-C-AC-G-C-ACAT-GTC-AT-GCT--A-CTA-TCATTT-GG---AAAAA----------T-ATA-T-AA--TTT--A-C--T--A-T-C-G--TC-T--CAT-G---GAA--AT-----AA-ATA----------AAAT---------AT-A-TATGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCCAATTTTCAATGGAAACCAATC---TTCAATAGTG-ACA-TGATT--TTT-ATA------TAA--TTC--TG-AAGAGGTATTGATAT---AATAC-CT-GAACTA-TCGCA--NAACATTAAC--AC-G-CACTGTT-CCT-TCGTGAT--TCCAACA------TACAGG--T-------ATACA-------TATATTA-TATTT-T---G-TGCT--TTAT-ACTAAA--CGCTAGT
gi|1 : CAACAAACAA-TAC-GGACTCTTGCCAGTGTTCTACAAG---AA----------G-----------A---A-----T----T-------------A-----GAA------------CGGA-G-CGGA--CCGATTT-ACGA--TG-TACATGTATA----CTAC-ATGTAGGGT-AT-C-T-G------GT----GT-AC-AT--------CGT-GCGTTAG---ATACCTGT--ACC-TGGT--CGTTG-TCAAAA--CAAAGA-AT--------------TATTCTAATCAAACT-CT---CA--AGTTAG-TAT---TA-T--TTGCTCTGT---C-CA----------AAA--AACTATCG---AAGTTT----GACAACT------TATCGTG---A-AACGTATAG-TTCT-----C-------TCTTA---TC--AT-GAAGGTTTCAACT-A-TAC-ATTGTG-ATATTGC-AT-TGGGA-GA--ATGAATCAT-ACA-ACAGATCTATCGACCACTAAAACTGAGATTAC-TCC-GAAATTGGCAATATCGTATTT-ATCCTTTTCTCCTCTGCTCGACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGCCTTAAATACT-GG-T-ATC-CGC--CCGACT-CAA-TAT-T--T-TCACACCTTT-TTTGCTAGACGTCCAAGCTTAGGAAACATCTAGG-GA-C-TC-TAAT-------------------AAA----C--CCTTCGA-ATTTGC-A-TGGATTAAACAA--TG--TTCTCTTT--T-AAAACAC-CG-GCCGA-C--TAATATATTT-TACCTA-AA-TTAGCGGA-C-ACAAA--CCT-TCCAA--AT-TTG--C-GTGGAT---------T----TT-AC--AA-TG--------------A------ATTT--AGA--A-AA-----GTTG--G--GAATGAA-AAT--GG-TTTT-TT-A-CA---T-T--TTGAGAAAAAA----------------AAA----------------AA---A-----AA-----T-ATA-AC-GA-C-AC-GCC-ACATCGTCAATAGCT--A-CTA-TCATTT-GG---AAAAA----------T-ATA-T-TA--TTT--ACC--T--A-TGC-G--TC-T--CATAG---GAA--AT-----AA-ATA----------AAATGATNNNNNNNN-N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCAGTC---TTCCATAGTG-ACA-TGATT--TTTGATA------TAA--TTC--TG-AAGA-GTATTGATAT---AATACTTT-GAACTA-TCGCA--ACACATTAATCAAC-G-CACTGTT-CCTGTTTTGATGATCCAACA------TACAGC--T-------ATACA-------TATATTA-TATGT-T---G-TGCTAATTATAACTAAA--CGCTAGT
gi|10 : CTTAAAT-CT-GG-TTATCTCGC--C-GACT-AAA-TAT-AAAT-TAACACATTT-TTTGCC-------------TAGTAAA---CTCGGCGA-C-CCCTAATTCCTTTTGTT--G-CG---AAAA---C--CCTTCGA-ATTTGC-A-AGGATTAAATAAATTGAATCCTGTTTCTT-AAA-CAC-C-CGCCGATC--TAATATACTT-TACCAGGAA--TAGCGGA-TAACAAC--CCT-TCC----AC-TTGCTC-GTGGAT---------T----TT-AC--AG-TG--------------A------ATTTAAAGA--A-AA-----GTTG--A-TGAATATT-AAT--GG--TGT-TT-A-TAT--T-T--TTG------AA----------------AAA----------------AT---A-----AA-----T-ATA-AC-GG-C--C-G-C-TCAT-G----T-G-T--A-CAA-TCATTT-AG---AAAAA----------A-ATATT-AC--TTT--A-C--T--A-
gi|10 : CCAATT--CAATGGAAAAAAACCCTTTTCAA-AATG-ACA-TGAGT--TTT-ATA------TAA--TTTCGTG-AAGAGATATT-ATAC---Annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaattcaatggaaaaaaacccttttcaaaatgacatgagttttatataatttcgtgaagagatattatacatt
gi|11 : cttaaatctggttatctcgccgactaaatataaattaacacattttttgcctagtaaactcggcgacccctaattccttttgttgcgaaaacccttcgaatttgcaaggattaaataaattgaatcctgtttcttaaacacccgccgatctaatatactttaccaggaatagcggataacaacccttccacttgctcgtggattttacagtgaatttaaagaaaagttgatgaatattaatggtgtttatatttttgaaaaaataaatataacggccgctcatgtgtacaatcatttagaaaaaaatattactttactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAACAAAAAG-TAC-GG--TCTTGT--GTTTTCT-CAAG---AA----------G-----------A---A-----T----T-------------A-----GTA------------CGGA-GGCGGA--T--ATTT-AC-A--TGCTACATGTATA----C-AC-A-----ACTTAT-C-T-G------GT----ATTAC-ATG-CC--ACCGT-GCG--AGT-AATACC-GTTAACC-CA-G--T-TTG-TC-AAA--CAAAGG-A---------------TAT-CTAATCC--TTGCT---CA--ATTTAGATAT-A-TG-TGTCTGCCTTGT---C-CA----------AAA--A-C-ATCG---AAGTTT----GACAACT------TATCG-G---A-AAGGTATAGTTTCT-----G-------CCTCAAATCC--AT-GC-GTTTTCAACT-ATTAC-ATTTT--ATAATGC----------------GGACTAC-ACA---AGA-CT-TCGA--ACTAAA--CGAGATTGGATGC---------------CGT-CTT-ATCATTCTtt
gi|12 : aAACAAAAAG-TAC-GG--TCTTGT--GTTTTCT-CAAG---AA----------G-----------A---A-----T----T-------------A-----GTA------------CGGA-GGCGGA--T--ATTT-AC-A--TGCTACATGTATA----C-AC-A-----ACTTAT-C-T-G------GT----ATTAC-ATG-CC--ACCGT-GCG--AGT-AATACC-GTTAACC-CA-G--T-TTG-TC-AAA--CAAAGG-A---------------TAT-CTAATCC--TTGCT---CA--ATTTAGATAT-A-TG-TGTCTGCCTTGT---C-CA----------AAA--A-C-ATCG---AAGTTT----GACAACT------TATCG-G---A-AAGGTATAGTTTCT-----G-------CCTCAAATCC--AT-GC-GTTTTCAACT-ATTAC-ATTTT--ATAATGC----------------GGACTAC-ACA---AGA-CT-TCGA--ACTAAA--CGAGATTGGATGC---------------CGT-CTT-ATCATTCTtgtacaaacaatacatgcatctaagttagctgcatcggatttcctcaatatcaactgacatag
gi|13 : aAACAAAAAG-TAC-GG--TCTTGT--GTTTTCT-CAAG---AA----------G-----------A---A-----T----T-------------A-----GTA------------CGGA-GGCGGA--T--ATTT-AC-A--TGCTACATGTATA----C-AC-A-----ACTTAT-C-T-G------GT----ATTAC-ATG-CC--ACCGT-GCG--AGT-AATACC-GTTAACC-CA-G--T-TTG-TC-AAA--CAAAGG-A---------------TAT-CTAATCC--TTGCT---CA--ATTTAGATAT-A-TG-TGTCTGCCTTGT---C-CA----------AAA--A-C-ATCG---AAGTTT----GACAACT------TATCG-G---A-AAGGTATAGTTTCT-----G-------CCTCAAATCC--AT-GC-GTTTTCAACT-ATTAC-ATTTT--ATAATGC----------------GGACTAC-ACA---AGA-CT-TCGA--ACTAAA--CGAGATTGGATGC---------------CGT-CTT-ATCATTCTtgtacaaacaatacatgcatctaagttagctgcatcggatttcctcaatatcaactgacatag
gi|14 : a-TA--------------A------ATTT-AAGT--A-AA-----GTTG--A-TGGATTAA-AAC--GG-TTCT-TT-A-TA---T-T--TTG------AA----------------AAA----------------AA---A-----AA-----T-ATA-AT-GG-C-AC-G-T-ATAT-GT------CT--A-CTA-TCTGGT-GG---AAAAA----------T-ATA---AA--TTT--A-C--T--A-T-C-G--TC-T--CGT-G---GAA--AT-----AA-ATT----------AGAT---------AT-A-TATATtgtacaaacaatacatgcatctaagttagctgcatcggatttcctcaatatcaactgacatag
gi|14 : ctGGAAA--AACT---TTCAATAGTG-ATA-GGATT--T---ATA------TAA--TTC--TG-AAGAGGTATTAA------AATAC-CT-GATCTA-TCGAA--CAACATTAAC--AC-G-TACTGTT-CCT-TTGTGAT--TCCAACA------TAGAGG--T-------ATGCATACAGTGTATATTA-TGTTT-T---G-TG-T--CTAT-ACTAAA--CGCTAGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaaaaactttcaatagtgataggatttatataattctgaagaggtattaaaatacctgatctatcgaacaacattaacacgtactgttcctttgtgattccaacatagaggtatgcatacagtgtatattatgttttgtgtctatactaaacgctagt
gi|15 : cttaaatttaagtaaagttgatggattaaaacggttctttatattttgaaaaaaaaaatataatggcacgtatatgtctactatctggtggaaaaatataaatttactatcgtctcgtggaaataaattagatatatatatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAAAAAGAAGCAC-AGG-CCTTCT--ATTTTCT-CAAGGACAA----------GTCCTTGGAATCA---A-----T----T-------------A-----GG--------------GGA-G-CAGA--T--ATTT-ACGA--TG-CACATG--------C-AT-A-----GGT-AT-C-TTG------GA----ATCAC-ATG-CC--G-CGT-GCG--AGT-AATACC--T--ACC-TG-T--C-TTG-TCAAAA--TAAAG--------------------------TCA--CTACT---CA--ATTTAGAT-T-A-TG-T--CTGTTCTGC---T-C-----------AAA--A-CTATCG---AAGTTG----AACAATT------TATCG-G---ATAATG-ATAT-TTGT-------------TCCTA---TC--AT-GA-ATACTCAACT-------ATTTGG-AT-ATGCGAT-TGG---AA--ATA----AC-ATGCACGGA-CA-TCGA--AC-AAAACT-AAATTGGATGC-G
gi|16 : AA-AAT--GG-TTCT-TT-A-TA---T-T--T--------AA----------------AAA----------------AA---A-----TA-----T-ATA-AC-GG-C-AC-G-C-ACAT-GTC------T--A-CTA-CCTTGT-GG---AAAAA----------T-AT--T-AA--TTT--A-C--T--A-T-C-G--TG-T--CAT-G---AAA--ATTAAATAA-ATATNNNNNNNNNNNNN---------NN-N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCAATTTTGAATGGAAA--AACT---TTCAATAGTG-ACA-TGATT--TT--ATA------TAA--TTC--TG-AAGAGGTATTAA-AT-----TAC-CT-G-ACTA-TCGAA--CAACATTAAC--AC-GCCACTGTT-CCT-TTGTGAT--TCC----------TAC--------------------------ATATTATTATTT-T---GATGC---TTAT-ACTAAG--CGCTAGttttctccgccatgtacacgcatatcgaagtaggccgtgtgatttcctcaaatatcacacaca
gi|17 : tCAACAA-CAA-TAC-GGG-TCTTGT--GTTTTCT-CAAG---AA----------G-----------A---A-----T----T-------------A------GA------------CGGA-G-CGGA--T-------------------ATGTATA----C-AC-A-----AGT-AT-C-G-GGTACATGT----ATTAC-ATG-CC--A-CGT-GCG--AGT-AATACCTGT--ACC-TG-T--T-TTG-TCAAAA--CAAAGG-A---------------TAT-CTAATCA--CTGCT---AA--ATTTAGAT-T-A-TG-T--CTGCTCTGT---C-C-----------AAA--A-CTATCG---AAGTTT----GATAACT------TATCG-G---A-AAGGTATAG-TTCT-----GC------TCTAA---TC--AT-GA-GCTTTCAACT-A-TAC-ATTTTG-AT-ATGCGAT-TGG---GA--ATGA--TAT-AC--ACAGA-CT-TCGA--AC-AAAACTTA-ATTGGATGC-GAA-TTGG--ATG-CGT-TTT-ATCAGTCTc
gi|18 : a--------------A------ATTT-ACGA--A-AA-----GTTT--A-TGAACCAA-AAT--GG-TTCT-TT-A-TA---T-T--TTG-----------------------------------------------------------------A-AC-GG-C-AC-G-C-ATAT----------------------TTG-GG---AAAAA----------T-A-----AA--TTT--A-C--T--A-T-A-G--CC-T--T-------NNN--NN-----NN-NNN----------NNNN---------NN-N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNGTG-AAA-T-CTT--TTA-ATAGTGACATAA--TTC--TG-AAAAGATATT--TAG---AATAC-GT-GAACTC-TCATG--CAACATGAA--------CACCGCT-CCT-TCGTGAT--T-CAACA------AACAGG--T-------Atgt
gi|19 : ttGT--TTTTTCT-CAAG---AA----------G-----------A---A-----T----TT------------A-----GGA------------CGGA-G-CGGA--T--CTCT---GA--TG-TACATGTATAGTAAC-ACCA-----AGT-AT-C-TTG------GTGCCTATTACCATGACC--A-CGT-GCG--GGT-AATACCTGTT-ACCGTG-C--C-TTGGTCAAAAAACAAAGG-AT--------------AGT-CTAATCA--CTGCTTTCCAGTATTTA-ATATAA-TGTTC-CTGCTCTGTATCC-CACACATATTACAAAATA-CT-CCGAACAAGCTCTGTAGACAACCAGTTTATATC--G---A-AAAGTATA--TTCT-----GC------TCTAA---GC--AT-GA---TTTCAACTGA-TAC-ATTc
gi|2 : AACAAAGCA-TAC-GGG-TCTTGT--GTTTTCT-CAAG---AA----------G---------------A-----T----T-------------A------GA------------CGGA-G-CGGAT-T--ATTT-ACGA--TG-TACATGT-------T-AC-A-----AGT-AT-CAT-G------GT----ATTAC-ATG--C--A-CGT-GCG--AGT-AATA-CTGT--ACC-TG-T--A-TTG-TC-AAA--CAAGG------------------TAT-CTAGATA--CTGCT---C---ATTTAGAT-T-ACTG-TC-ATGCTCTGT---C-------------AAA--A-CTATCG---AAG-TT----GACA--T------TAT---G---G-AAGGTATAG-TT-T-----G-------TCTAAT--TC--ATCGA---TTTCAACT-A-TACTATTTTGAATAATGG-AT-TGGGA---------ATT-----------A-CT-TCGA--ACTAA--------------GCTGAA-TTGG--ATG-CGT-TTTAATCATACTatatag
gi|2 : aCGTCCTAAAT-CT-GGAT-ATC-TGC--C-GA-T-CAA-TAT-T--T-TCACACTTTT-TTTGCTA-ACGTC---GCCTAGGAACT-CCTAGG-GA-CATA-GATTTC-TTTTGTTTGA-CG---AAA----AAACCTTCGA-ATTTGC-AATGGATTAAAACA--TG--TTTTTTT-------A-CAC----GACGATC--TAATATATTT-TACCTAGAA-TTAGC-GA-C-ACAAA--C---TTCCA--AT-TTG--C-GTGGAT---------T----TT-AC---A-TG----------------------TTT-AAGA--A-AAT----GTTG--A-TG-ATTGA-AAT--GG-TTTT-TTAA-CA---TAT--TTGAG----------------------AAA----------------AA---A-----AC-----T-AT--AC-GA-A-AC-G-TAACAT-GTT-AT-AGT--A-CTA--CATTT-GG----AAAA----------T-AT--T-AA--TTT--A----T--A-T-CTG--TC-T--CAT-G---AGA--AT-----AAGATA----------AAAT---------ATNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAATC---TTC-ATAGTGAACA-T-ATT--T----TA------TAA--TTC--TG-AAGAGGTATTGAATT---AATA--TT-GAACTA-T---G--AAAC-TTAAC--ACAG-CATGGTT-CCT-TTGTGA---TCCAACA------TACGG------------TACA-------TATATTA-T-TTT-T---G-TGCT--T--T-ACT-AA--CGCTtgtaccaatacatgatcgaagttgtgcatgagtttctccatattgacacagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcttcgtcctaaatctggatatctgccgatcaatattttcacactttttttgctaacgtcgcctaggaactcctagggacatagatttcttttgtttgacgaaaaaaccttcgaatttgcaatggattaaaacatgtttttttacacgacgatctaatatattttacctagaattagcgacacaaacttccaatttgcgtggattttacatgtttaagaaaatgttgatgattgaaatggttttttaacatatttgagaaaaaaactatacgaaacgtaacatgttatagtactacatttggaaaatattaatttatatctgtctcatgagaataagataaaatatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaatcttcatagtgaacatattttataattctgaagaggtattgaattaatattgaactatgaaacttaacacagcatggttcctttgtgatccaacatacggtacatatattatttttgtgctttactaacgct
gi|20 : aaacaaagcatacgggtcttgtgttttctcaagaagattagacggagcggattatttacgatgtacatgttacaagtatcatggtattacatgcacgtgcgagtaatactgtacctgtattgtcaaacaaggtatctagatactgctcatttagattactgtcatgctctgtcaaaactatcgaagttgacattatggaaggtatagtttgtctaattcatcgatttcaactatactattttgaataatggattgggaattacttcgaactaagctgaattggatgcgttttaatcatacttgtaccaatacatgatcgaagttgtgcatgagtttctccatattgacacagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctt---AAA----C--CCTTCGA-ATTTGC-A-TGGATTA-------------------------------CGCGCCGATC--TA-T-TGTTT-TACCCAGAA-TTAGCGGA-C-ACAA---CCA-TTCGA--AT-TTG--C-TTGGAT---------T----TT-AC--CA-TGTGCTTTTATTTAAAA------ATTT-AAGA--A-AA-----GTTA--A-TGAATTAA-ATT--GG-TTCT-TT-A-TA---T-T--TTGAA---ATA----------------AAATATAACGTTTATAATTAG---A-----AATAAAAT-ATA-AC-GG-C-AC-G-C-ACAT-GT------CT--A-CTA-TCATTT-GG---AAAAA------------ATATT-AA--TTT--A-G--T--A-T-C-G--TC-T--CAT-G---
gi|21 : gaaTTTAGAAATTA-TG-T--CTGTTCTGT---C-CA----------AAA-----TATCG---AAGTT-------CAACT------TAACA-GGATA-AAGGATTTG-TTCT-----A-------T---A----C--AT-GA---TCTCAA-T-A-----ATTGTG-ATAAT-T-ATATGCGATGAGTATG---TATGATC-ATAGG-CT-TCAA--AACAAAAC---GAATGGGTGT-G
gi|22 : agataaccctaccagtTC--TAATAT-TTT-TACCCTGAT-TTAGCGGA-C-ACAGC--CCT-TT-GA--AT-TTG--C-GTGGGT---------T----TT-AC--AA-TGTTCTTTTA------A------AT---AAGA--A-AA-----GTTC--A-TGAATTAA-AAT--GG-TTTT-CT-A-TA---T-T--TTGA----AAA----------------TAT----------------AT---A-----TA-----T-ATA-AC-GG-C-AC-G-C-ACAT-GT------CT--A-CTA-TCGTTT-GG---AAAAA----------T-AT--T-AA--TTT--A-C--T--A-T-C-G--TC-T--CAttttctctatcttgtgcacaacaatatgatatcgaaagtaggccgtttgaagctcctcaat
gi|23 : tgaaacaggtctctgtgTTCT-TA-G---AA----------ATC---------A---A-----T----T-------------A-----GG-------------TGGG-G-CGGA--T--ATTT-ACGA--TG-TACAT----A----C-AC-A-----TGT-AT-C-T-G------GT----TTCAC-ATG-CC--A-CGT-GCG--AGT--ATACTTGT--ACC-TG-T--C-TTT-TTAAAA--CAAAGG-AT--------------T
gi|24 : agaaagcacgggcgtagtattttttaacagcaaTCCAAGCTTAGGAAAC-TC-AGG-GA-C-TC-TACTTC-----------------AAA----C--CCTTCGA-ATTTGC-A-TGGATTACACAA--TG--CTCTTTCT--T-AAA-CAC-CGTGTCGATC--TAATATATTT-TACCCATAA-ATAGCGGA-C-A-ATA--TCC-TTCGA--AT-TTG--C-GTGGAT---------T----TT-AC--AA-TG--------------tgctttaggtgtgtatatctcccagttgattcgaggaatagaagatt
gi|25 : AACAA-CAA-CACAGGG-TCTGCT--GTTTTCT-CAAG---AA----------C-----------A---A-----T----T-------------ACCTTCGGAATCAAATATAGGCGGA-G-CGGA--T--ATTTTACGA--TG-TACATATGT-----C-AC-A-----AGT-AT-C-A-G------GT----AATAC-ATG-CC--A-CGT-GCGC-AGT-AATACCTTT--ACC-TG-T--A-TTG-TCAAAA--CAAAGGTAT--------------Tttctggtgaataagaacataagtt
gi|26 : aAACAA-CAA-CAC-GGG-TCTTGT--GTTTTCT-CAAG---AACAATTCCTCGG-----------A---A-----TCAATT-------------A-----GG-------------CGGA-G-CGGA--T--ATTT-ACGA--TG-TACATGTA---------C-A-----AGT-AT-C-A-G------GT----ATTAC-ATG-CC--A-CGT-GCG--AGT-AATACCTGT--ACC-TG-T--A-TTG-TCAAAA--CAAAGG-AT--------------Ttgctc
gi|27 : aaAAACCAATC---TTCAAGTGTGTACA-T-ATTGTTTT-A-A------TAA--T-C--TG-A-GAGGTATTGATAT---AATAC-TTGGAACTA-TCGCAT-TAACATTAACT-AC---CCCTGTT-CCT-TTG-GAT--TTCAACA------TACAGG--T-------ATACA-------T-TATTA-TATTT-T---G--GC---TTAT-ACTAAA--CGCTAGTtgctttcgaataca
gi|28 : TTGT--GTTTTCTACAAAGA-AA----------G-----------AGATA-----T----T-------------GTT---AAA------------CGGAAG-CGGAAAT--ATCT-TCGAATTG--ACTTGT-TN----N-NN-N-----NNN-NN-N-N-N------NN----NNNNN-NNN-NN--N-NNN-NNN--NNN-CGT--TTGT--AAC-TG-T--C-TTG-TCAAAA--CAAAGA-----------------TAT-CTAATCA--CTGCT---CA--ATTTAGATa
gi|29 : TTCT-TA-G---AA----------ATC---------A---A-----T----T-------------A-----GG-------------TGGG-G-CGGA--T--ATTT-ACGA--TG-TAC----ATA----C-AC-A-----TGT-ATGC-T-G------GT----TTCAC-ATG-CCCAA-CGTGGCG--AGTAAATA-CTGT--ACC-TG-TCGC-TTT-TTAAAA--CAAAG
gi|3 : aagaaagcacgggcgtagtattttttaacagcaaAAACAA-CAC-G---TCTTGT--TTGTCTT-CAAG---AA----------G-----------A---AATTCCT----T-------------------GGATCTATAC-----CGAA-G-CGGA--T--ATT--ACGAACTG-TACAT----A----C-AC-A-----AGT-AT-C-C-G-------T----ATCAC-ATG-CC--A-CAG-CCG--AGT---TACCTGT--ACC-TG-T--C-TTG-TCCAAA--CAAA-G-ATTGCTTTCGCACTAATAT-CTAATCA--CTG-T---TA--ATATAGAATT-A-TG-TG--TGCATTGT---T-CT----------CAA--A-CTAT-G---AAGTTT----GACAA-T------TATCG-G---A-TA-GTATAT-TTCT-------------TCTAA---TCATAT-GA-GTTTTCAACT-A-TAT--TTTTG-AT-ATG--AT-AGGGA-TA--A--AAC-AC-ACG-AC
gi|3 : aaCCTTAA---CT-GGAT-ATC--GC--C-GACTTCAA-TATAG--T-TCACACCATT-TTC-CTAGACGTC-GAGCT----AAAAAT--AGA-GA-C-TC---ATTC-TTTATT---G-CG---AA--------CCTTCGACATTT-C-A-TGGATTA-------------------------------CGCGCCGATC--T----TGTTTATACCCAGAA-TTAGCG-A-C-ACAA---CCA-TTCGA--AT-TTG--C-TTGGATACCAGTGCTT----TT-ATGTAA-----------------A------ATTT-AAGA--A-AA-----GTTA--A-TGAATTAA-ATT--GG-TTCT-TT-A-TA---T-TTATTGAACATAAAATTACGTTATAATTAGAAA----------------AA---A-----AA-----T-ATA-AC--G-C-AC-G-C-ACAT-GTT-----CT--A-CTA-T-ATTT-GG---AAAAA------------ATATT-AA--TTT--G----T--A-T-C-GTTTC-T--CAT-G---cactggatctttatcagtcttgtacacacatatcaattggccgtattatttcgtttaaaaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccccttaactggatatcgccgacttcaatatagttcacaccattttcctagacgtcgagctaaaaatagagactcattctttattgcgaaccttcgacatttcatggattacgcgccgatcttgtttatacccagaattagcgacacaaccattcgaatttgcttggataccagtgcttttatgtaaaatttaagaaaagttaatgaattaaattggttctttatatttattgaacataaaattacgttataattagaaaaaaaatataacgcacgcacatgttctactatatttggaaaaaatattaatttgtatcgtttctcatgca
gi|30 : aaaaacaacacgtcttgtttgtcttcaagaagaaattccttggatctataccgaagcggatattacgaactgtacatacacaagtatccgtatcacatgccacagccgagttacctgtacctgtcttgtccaaacaaagattgctttcgcactaatatctaatcactgttaatatagaattatgtgtgcattgttctcaaactatgaagtttgacaattatcggatagtatatttcttctaatcatatgagttttcaactatatttttgatatgatagggataaaacacacgaccactggatctttatcagtcttgtacacacatatcaattggccgtattatttcgtttaaaaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncc---TTTAATAGTG-ACA-TGATT--TT--ATA------TAA--TTA--TG-AATAGGTATTAA------AATAC-CA-GAATTA-TCGCA--CAACATTAAC--AC------TGTT-CCT-TCGTAAT--TCCAATA------TAGAGG--TACCGATAATACA-------TACTTTA-TATTT-T---G-TGC---TTAT-CCTAAA--CGCTca
gi|31 : cactATAGTG-ACA-TGATT--TT--ATA------GAA--TTT--TA-AAGAGGTATGAA------AATAC-CT-GAACTA-TTGCA--CAACATTAAC--AC-G-TACTGTT-CCT-CTGTGAT--TCCAACA------TAGAGG--T-------ATACA-------TATATTA-TATTC-T---G-TGC---TTAT-ACTAAA--CGCTAG
gi|32 : ccatat--------------A------AGTT-AGGA--A-AA-----GTTG--A-TGACTTCA-AAT----------TT-A-TA---T-T--TTG-------------------------AA----------------CG---A-----AA-----T-ATA-AC-GG-C-TC-G-C-TAAT-GT--A----T--A-CTA-TCGTCT-GA---AAAAAACCCCAAAACA-AAA-T-AA--TTT--A-CTGT--A-T-C-G--TT-T--C
gi|34 : tcaatattttcA------TCA--TTC--TA-AGTCGGTTTTAA-AT-----TAC-CT-GAACTA-TCACA--TTACATAAAC--AC------TGTT-CCT-TTGTGAT--TTCAATATAGATGTACATG--T-------ATACA-------TACATTC-TATTT-T---G-TAC---TTAT-CCTACA--CGCT
gi|35 : T-GAGA--A-AA-----TATG--T-TGAAT--A-AAT--GGGTTCT-TT-A-CA---T-T--T---------------------------------------------------------G-----T-AT---C-G--C-AC-G-C-ACAT-GTC------T--A-CTA-TCATTT-GG---AAAAC----------C-AAA-TTGA--TTT--A-C--T--A-T-T-G--TC-T--CAC-T---AAA--AT-----AA-ATT----------AAA
gi|36 : aaAA--TTC--TG-AATACATATAGGTATTTAAATAC-CT-AAATTA-TCACA-----CATTAAC--AC------TGTT-CCT-TCGTGAT--TCTAACT------TGGAGG--T-------ATTCA-------TACGTTA-TATTT-T---A-TACT--T
gi|37 : c---------T----TT-AC--AA-TG--------------A------ATTT-AAGA--A-AA-----GTTG--A-TGACTGAA-AAT--GATTTTT-TT-A-CA---T-T--GTGAG-----------------------AA----------------AA---A-----AA-----T-ATA-AC-GA-C-AG-G-C-ACAT-GTCTATAGCT--A-CTA-TCATTT-GG---AAAatc
gi|38 : T-TTG--C-GTGGAT---------T----TT-AC--AA-TG--------------TTCTTTTATTC-AATC--A---------TT-----TAAAAAAA-AAC--GT-TTCT-TT-A-TG---T-T--TTGA------------------------AA----------------AATTTA-----GA-----T-ATA-AC-GA-C-AC-G-C-ACAT-GT------------CTA-TCATT
gi|39 : AATTAA-AAT--GG-TTCT-TT-A-TA---T-T--TTGAA---ATA----------------TAT----------------AT---A-----TA-----T-ATA-AC-AG-C-AC-G-C-ACAT------T-TCT--A-CTA-TCATTT-GT---AAAAA----------T-AT--T-TA--TTT--A-C--T--A-T-C-G--TC-T--CAT-G---G
gi|4 : AAGTATAG-TTCTTCTTAGCACTATCTCTAA---TC--AG-GA-GTTTTCAACC-A-TAT-ATTTTG-AT-ATGCGAT-T--AA-GA--AT--AATAT-AC--ACGGA-CT-TCGA--AC-AAAACTGAA--TGAATG
gi|4 : CCTTAAAT-CTCGG-T-ATT-TGCGGTAGACT-CAAGTAT-T--CCTCACACC--T-TTGGCTAGACG-CCAAGCTTAGAGAAC-TC-GGG-GA-C--C-TAATTCCTTTTGT---GGCG---AAAAA--CG-CCTTCGA-ATTTGG-A-TGGATTAACAAA--TT--TTCTTTCT--T-AAA-----CGCACCGATT--GAATATA-TT-TACCAAACATTTAGCGTA-C-ACAAC--CCTGTTCGACCATCTTT--CAATGAAT---------TGGCATT-AC--AA-TGTTCTTTC-------T------ATTA-AAGA--ATAAAAATGGTTG--ATTGAAGT-A-AAT--AG-TTTT-CT-A-TA---T-T--TGGGG---GGG----------------GGGGGGGCACGGC------GG---A-----CA-----TCACG-AC-GGCC-AC-G-C-CCAC-AT---T-GTT--ACCTA-TCATTT-GA---AAAAA------------A-A-A-AA--TTT--A-C--TGAG-T-C-G--TC-T--CAT-G---GAA--AT-----AA-Atcgtttctatcagtctttgttacacacatatcctgaaattgtcgtagaaccttcatcatcaactctctcgtctccccttctcctcgtcaatctctctccctctctctcttctccatcccctcctccctcctcctcgtgctctgcccttaaatctcggtatttgcggtagactcaagtattcctcacacctttggctagacgccaagcttagagaactcggggacctaattccttttgtggcgaaaaacgccttcgaatttggatggattaacaaattttctttcttaaacgcaccgattgaatatatttaccaaacatttagcgtacacaaccctgttcgaccatctttcaatgaattggcattacaatgttctttctattaaagaataaaaatggttgattgaagtaaatagttttctatatttggggggggggggggcacggcggacatcacgacggccacgcccacattgttacctatcatttgaaaaaaaaaaatttactgagtcgtctcatggaaataaa
gi|40 : aagtatagttcttcttagcactatctctaatcaggagttttcaaccatatattttgatatgcgattaagaataatatacacggacttcgaacaaaactgaatgaatgtcgtttctatcagtctttgttacacacatatcctgaaattgtcgtagaaccttcatcatcaactctctcgtctccccttctcctcgtcaatctctctccctctctctcttctccatcccctcctccctcctcctcgtgctctgcTCT-TT-A-TA---T-T--TTGAT---GAA----------------AAA----------------AA---A-----AA-----T-ATA-AC-AG-C-AC-G-C-ACAA-GT------------CTA-TCATTT-GG----AAAA----------T--TT-C-AA--ATT--A-C--C--A-T-C-G--TC-T--CAT-G---GAA--AT-----AA-ATA----------
gi|41 : A----------------AA---A-----TA-----T-ATA-ACTGG-C-AC-G-C-ACAT-GTC------------TA-TCATTT-GG----AAAA----------T-AT--T-AA--TTTTAA-C--TA-A-T-C-GC-TA-T--CAT-G---GAAT-AT-----CA-ATA----------g
gi|43 : gcgaattaacattct-C-AC-G-C-ACAT-GTCTATAGCT--A-ATG-TCATTTTGA---AAAAA----------A-ATA-TTAA--TTT--A-C--T--A-T-C-G--
gi|44 : a-G-TACTCTT-CCT-TCGTGAT--TCCAACG------CAGAGG--C-------ATGCA-------TATGTTA-TATTG-T---G-TGC---TTAT-ACTAAA--CGCTAGaataagatataattat
gi|45 : AAC--AC-G-CACTGT---CT---GTGAT--TCCAACA------TACA-G--T-------ATACA-------TA-A-TA-TATTT-T---G-TGC---TTA--ACTAAA--CGCTAG
gi|47 : TGCTATGT---CTCA----------AA-----CTATCG---AAGTTT----GACAACT------TATCG-
gi|48 : caagtttcagTTTCT-CAAG---AA----------G-----------G---A-----T----TCCTTGGAATCAATA-----GG-------------CGGA-G-CGGA--T--TTTT-AC
gi|49 : CAATTTTCAATGGATACT-------TTCAATATTG-ACA-TGA-T--TTT-ATA------TAA--TT
gi|5 : TAGG-GA-A-T----ATTC-TTTTGT---T-CG---AAAACAAC--CCTTCGA-ATTTGCTA-TGGATTAA-CA---TA--T-----------------------CCGATCAATAATATATTT--ACCTAGAAATTAGCGGAGC-ACAAA--CCT-TCCAA--TT-CTG--C-GTGGAT---------T----TA-AC--AA-TG--------------A------ATTA-AAGAGAA-AA-----GTAGT-A-TGATGGAA-AAT--GT-TTCT-TT-A-TAAATT-T--TTGAG---AAA----------------AAA----------------AA---A-----AA-----T-ATA-AC-GA-C-AC-G-C-ACAT-GTCTATAGCTTAA-CTATTCATTT-GG---AAAAA------------ATA-T-TA--ATT--A-C-----A-T-C-G--TC-T--CAT-G---GAA--AT-----AA-TT-------------AT---------AT-A-T
gi|5 : gccttacatctgtatcttctctctgactcatttatcgtatcttattccatataatAGTG-AC--TGATT--TT--ATA------TAAATCTC--TGAAAGAGGT-----CAT-------------AACTAGTCGCATCAAGCATTAAC--AC-G-CACTGCT-CCC-T-GTGATC-TCCAACAT-----TACAGGA-G-------ATACA-------TATATTA-TATTTAT---G-TGC---TTAT-ACTAAAACCGCTAGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctagcttcttggtgcgagctaacactcgccatcatccccacgatccattaagtgactgattttatataaatctctgaaagaggtcataactagtcgcatcaagcattaacacgcactgctccctgtgatctccaacattacaggagatacatatattatatttatgtgcttatactaaaaccgctagta
gi|50 : gccttacatctgtatcttctctctgactcatttatcgtatcttattccatataattagggaatattcttttgttcgaaaacaacccttcgaatttgctatggattaacatatccgatcaataatatatttacctagaaattagcggagcacaaaccttccaattctgcgtggatttaacaatgaattaaagagaaaagtagtatgatggaaaatgtttctttataaatttttgagaaaaaaaaaaatataacgacacgcacatgtctatagcttaactattcatttggaaaaaatattaattacatcgtctcatggaaataattatatatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctagcttcttggtgcgagctaacactcgccatcatccccacgatccatta-------ATACA-------TATATTA-TATTT-TAATG-TG-T--TTAT-ACTAAA--CGCTAGTa
gi|6 : TTAAATTCT-GG-T-ACT-CGC--CCGACT-CAA-TTA-T--T-TCACACCCTTGTTTGCT------------TTAGGAAAAATCTAGG-GAAC-TT-TAATTC-TTTTGT---G-CG---AAA----A--CCTTCGA--TTTGCCA-TGGATTAAACAA--TG--CTCTCTTT--TTAAA-CATTCGCGCCGATC--TAATA--------------A-TTAGCGGA-C-ACAAAAACCT-TTCCA--AT-TTG--C-ATGGAT---------T----TT-AC--AA-TG--------------A------ATTT-AAGA--A-AA-----GTTG--A-TGAATGAA-AATGCGA-TTTT-TT-A-CA---T-T--TTGAG-----------------------AA----------------AA---A-----AA-----T-ATA-AC-GA-CAACGG-C-ACAT-GTCTAT-GCT--A-CTA-TCATTT-GG---AAAAA----------T-AT--T-AA--TTT--A-C--G--ATT-C-G--TCTT--CAT-G---GAA--AT-----AA-ATA----------AA---------------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCAATC---TTCAATAG-G-ACATTGAAT--TTT-ATA------TAA--TTC--TGAAAGAGGTATTGATAT---AATAC-TT-GAACTA-TCGCAC-AAACATTAAC--AC-G-CACTGTTGCCT-TTGTGAT--TCAACCA------TACAGGTAT-------ATACA-------TATATTA-TATTT-T---G-TGCT--TTAT-ACTAAA--CGCTa
gi|7 : TTAAATTCT-GG-T-ACT-CGC--CCGACT-CAA-TTA-T--T-TCACACCCTTGTTTGCT------------TTAGGAAAAATCTAGG-GAAC-TT-TAATTC-TTTTGT---G-CG---AAA----A--CCTTCGA--TTTGCCA-TGGATTAAACAA--TG--CTCTCTTT--TTAAA-CATTCGCGCCGATC--TAATA--------------A-TTAGCGGA-C-ACAAAAACCT-TTCCA--AT-TTG--C-ATGGAT---------T----TT-AC--AA-TG--------------A------ATTT-AAGA--A-AA-----GTTG--A-TGAATGAA-AATGCGA-TTTT-TT-A-CA---T-T--TTGAG-----------------------AA----------------AA---A-----AA-----T-ATA-AC-GA-CAACGG-C-ACAT-GTCTAT-GCT--A-CTA-TCATTT-GG---AAAAA----------T-AT--T-AA--TTT--A-C--G--ATT-C-G--TCTT--CAT-G---GAA--AT-----AA-ATA----------AA---------------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCAATC---TTCAATAG-G-ACATTGAAT--TTT-ATA------TAA--TTC--TGAAAGAGGTATTGATAT---AATAC-TT-GAACTA-TCGCAC-AAACATTAAC--AC-G-CACTGTTGCCT-TTGTGAT--TCAACCA------TACAGGTAT-------ATACA-------TATATTA-TATTT-T---G-TGCT--TTAT-ACTAAA--CGCTtag
gi|8 : TTAAATTCT-GG-T-ACT-CGC--CCGACT-CAA-TTA-T--T-TCACACCCTTGTTTGCT------------TTAGGAAAAATCTAGG-GAAC-TT-TAATTC-TTTTGT---G-CG---AAA----A--CCTTCGA--TTTGCCA-TGGATTAAACAA--TG--CTCTCTTT--TTAAA-CATTCGCGCCGATC--TAATA--------------A-TTAGCGGA-C-ACAAAAACCT-TTCCA--AT-TTG--C-ATGGAT---------T----TT-AC--AA-TG--------------A------ATTT-AAGA--A-AA-----GTTG--A-TGAATGAA-AATGCGA-TTTT-TT-A-CA---T-T--TTGAG-----------------------AA----------------AA---A-----AA-----T-ATA-AC-GA-CAACGG-C-ACAT-GTCTAT-GCT--A-CTA-TCATTT-GG---AAAAA----------T-AT--T-AA--TTT--A-C--G--ATT-C-G--TCTT--CAT-G---GAA--AT-----AA-ATA----------AA---------------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCAATC---TTCAATAG-G-ACATTGAAT--TTT-ATA------TAA--TTC--TGAAAGAGGTATTGATAT---AATAC-TT-GAACTA-TCGCAC-AAACATTAAC--AC-G-CACTGTTGCCT-TTGTGAT--TCAACCA------TACAGGTAT-------ATACA-------TATATTA-TATTT-T---G-TGCT--TTAT-ACTAAA--CGCTtag
gi|9 : T-AG-T-ATC-CTCG-CCGACT-AAA-TAT-T--G-T----------TGTGCTA-ACGTCCAAGTTTAGGAAAT-TC-GGG-AA-C-TC-TAGTTC-TTTTGTT--G-CATATAAA----C--CCTTCGA-TTTTGC-A-TGGATTAAACAA--TGC-TTCTTTCT--T-AAA-CAA-CGCGTCGATC--TAAT-TATTTGTA-CTAGAA-TTAGCGGA-C-ACAAC--CCT-TT-GT--TT-TTG--A-TTGGAT---------T----TTAAC--AAGTGTTGTTTATTTGAAAA------ATTA-GAGA--A-AA-----GTTAGTA-TAAATTAAGAAT--GG-TTCG-TT-ATTA---T-T--CTAAG---AGT----------------AAT----------------AT---AGTATTAG-----T-ATATAC-AGCC-AC-G-C-ACAT-GT------CT--A-TTA-TCATTT-GGAAAAAAAA----------TAATA-T-AAG-TCC--A-C--C--A-G-C-G--T--T--CAG-A---GGA--AT-----AA-ATA----------AAGT---------AT-ACTATGTtag
gi|9 : actTCTATT-A-TC---A-T--TTG-G---AAA----------------AAA----------------AA---T-----AA-----T-ATA-A-------------------GTC------C--A-CCA-GCGTTC-AG---AGGAA----------T-AAA-T-AAAGTAT--A-C--T--A-T---G--TC-TAACGT-GATAGAACAAT-----AG-GNN----------NNNN---------NN-N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCCA-TTTTCAATGGAAA--AACT---TTCAATAGTG-AAA-TGATT-------------------------TG-AGGAGGTATTctaacgtgatagaacaataggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntccattttcaatggaaaaactttcaatagtgaaatgatttgaggaggtatta
blockSeqs : AA G A G . A GAC CAATTACCTTCGGAATCAAATATAGG A G AA . T G AT C ATAGTAA . C . T G TT GTACAT GCCT C A CA C G C AA T TA G TCGC G A AA GATTGCTTTCGCACTAA . . TTC GT A A C T GT ATC T ACACATATTAC ATA T AAC TGTA AGTTTA . GAT T G T TCTTAGCACTATCTCTAAT AT C GT G T T GA A ATATGCGATGAGTATGTATGATCAT . . . T ACTT G TGAATTGGATG . A T C A T T GGTA T G AAA C T G AGACGTCGAGC AA T C A CCC C TTGA TAT ACAAC CA T A AA AT AATCCTGTTTCTTAAACAC AA ATAC AT AGG T G A AAA G C CC C CT A ACCAGTGCT GGCA A GT G TGCTTTTATTTAAAA A GA T AAATG GT T A G GC G A A T AAT A TA AACATAAAATTACGTTATAATTAGAAA TTT GTATT TAAAA C T T C A G . A . CTATAGC TA C T T AAA ACCCCAAAACAAAA T AG TA . TGT T . T TT T AA . ATA CA TAAAT G TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN A T AA CTT A T G GT T GTGACA AT CG A A TATTTAA C G G TCA T GC G . T C TAGATG TACCGATA TACAGTG T A AAT A T . AC
blockSeqs : AA . . G . . GA CAATTCCTCGGAATCAATTAGG . G T . . G AC C ATA . . . T . TT . . . . . C . . A T TA . GT . A . GTAT . . . . A T . . GT . . A A T . . . . . . G T GCCTCAAATC . . GT . T . G A ATAGGGATAAAACACACGAC . . . T ACTG G GAATTGGATG . . T . A . . GCC . . AG . T G AGACGCCAAGC AA T . A ATA C TG . AACG A C . AA . CTCTCTTTTTAAACATT . ATAT GT TAG A . . AAA . G . . . . . . . . . TTGTTTATTTGAAAA . . . T T . T . GC T . . . T . . AAATAAAATATAACGTTTATAATT . . . . . . C A G . . . CTATAGC . . . . . AATAT T G . . TGA T . . C T . . . T . . AAATATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN A N NN . T T T . A . . . A A TACA C . . TT . AG G . T . T TAT . . . . . T . .
blockSeqs : AA . . G . . . GGATTCCTTGGAATCAATAGG . G . . . G . C ATA . . . T . AT . . . . . C . . A T TA . GT . A . GAT . . . . A . . . GT . . A A T . . . . . . G T GCCTCAAATC . . GT . T . G A GATTGGAAATAACATGCAC . . . T ACT G . . . T . . . . CC . . T . A G AACGTCCAAGT AA T . A TC . GG . AAA A C . CA . CTCTCTTTTTAAACATT . ATAT T CAG . . . AAA . G . . . . . . . . . TTCTTTTAA . . . . . . C . GC . . . . . . . GGGGGGGGGGGGCACGGC . . . . . . . A G . . . CTATAGC . . . . . TAATA . . . . TA T . . . T . . . . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN N N NC . . T T . T . . . A G TAGA G . . CA . G G . C . . TAT . . . . . T . .
blockSeqs : AG . . G . . . GAAATTCCTTGGATCTATAC . . . . . G . . ATA . . . . . T . . . . . . . . A T T . GT . A . GAT . . . . A . . . C . . A A T . . . . . . T . GCCTCAAATC . . AT . . . G A GATTGGGAATGATATACAC . . . T CG A . . . . . . . . CC . . T . C . AACGTCGC AA T . . TC . TG . AC A C . AC . CTCTCTTTTTAAACATT . ATAT T CTG . . . C . G . . . . . . . . . TTCTTTCT . . . . . . T . . . . . . . . . AAATATAT . . . . . . . . . . . . CTATGC . . . . . TATA . . . . T . . . . . . . . . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN N T CC . . . T . T . . . A G ATTA T . . CA . G . . T . . TAT . . . . . T . .
blockSeqs : AG . . G . . . GTCCTTGGAATCAATTAGG . . . . . G . . ATA . . . . . T . . . . . . . . A T . . TC . A . GAT . . . . A . . . C . . A A T . . . . . . G . GCTCTAAT . . GC . . . G A GATTAAGAATAATATACAC . . . C CG G . . . . . . . . CC . . T . C . . T T . . TT . G . C A . . AA . CTTCTTTCTTAAACAA . TGT T CAT . . . A . G . . . . . . . . . TTCTTTT . . . . . . T . . . . . . . . . ATGAAAAA . . . . . . . . . . . . CTATGC . . . . . ATAT . . . . T . . . . . . . . . . . AANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN A N CT . . . T . T . . . . A TATA T . . CA . G . . T . . AG . . . . . T . .
blockSeqs : AC . . . . . . GAGATATTGTTAAA . . . . . G . . ATA . . . . . T . . . . . . . . A T . . TT . A . GA . . . . T . . . G . . T A T . . . . . . A . GCTCTAAG . . GT . . . G . GGACTACACA . . . . CG A . . . . . C . . T . C . . C T . . TT . T . C A . . AA . CTCTTTCTTAAACAC . ATT T CAG . . . C . G . . . . . . . . . A . . . . . . T . . . . . . . . . AGAAAAAA . . . . . . . . . . . . CTATGC . . . . . ATAT . . . . T . . . . . . . . . . . AANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN N N CC . . . T . T . . . . A TATA C . . C . G . . C . . T . . . . . T . .
blockSeqs : C . . . . . . GAATTTAGGA . . . . . G . . GT . . . . . G . . . . . . . . A T . . CC . A . GA . . . . . . . . . . . A A T . . . . . . G . GTCTAATT . . GT . . . . . GGACTACACA . . . . AC . . . . . . C . . T . . . . C . . . TT . G . A A . . AA . TTCTTTCTTAAA . TGT T AAA . . . A . A . . . . . . . . . A . . . . . . T . . . . . . . . . AGAGTAAT . . . . . . . . . . . . TATAG . . . . . CAAA . . . . T . . . . . . . . . . . AANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN N N CC . . . T . T . . . . A TATA C . . C . G . . T . . T . . . . . T . .
blockSeqs : C . . . . . . ATCAATTAGG . . . . . G . . TN . . . . . T . . . . . . . . A T . . TA . A . GA . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . G . TCCTAT . . . . . . . . GGACTACACA . . . . . . . . . . C . . T . . . . T . . . TC . G . A T . . AA . TTTTTTTACAC . ATA T TAG . . . C . C . . . . . . . . . A . . . . . . T . . . . . . . . . AAAATAT . . . . . . . . . . . . TTC . . . . . AATA . . . . T . . . . . . . . . . . N T CC . . . T . . . . . . G TATA C . . C . G . . T . . T . . . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . . ATCAATTAGG . . . . . G . . A . . . . . A . . . . . . . . A T . . TC . C . GA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . TCTAAT . . . . . . . . ATTGGGAATT . . . . C . G . A . . . A . T . TAT . TAG . . . A . C . . . . . . . . . A . . . . . . G . . . . . . . . . GAAAAAA . . . . . . . . . . . . TGT . . . . . TAAA . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . G CAT C . . A . G . . C . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . . GAATTAGTA . . . . . . . . A . . . . . A . . . . . . . . A . . . TA . . . A . . . . . . . . . . . ATA . . . . . . . . . T . . . C . . . . . . . A . . . . . C . C . . . . . . . . . A . . . . . . A . . . . . . . . . AAAAA . . . . . . . . . . . . TG . . . . . TAT . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . G AT T . . C . G . . C . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . . GAATTAGTA . . . . . . . . A . . . . . N . . . . . . . . C . . . TA . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . G . . . . . . . . . A . . . . . . T . . . . . . . . . AAAAA . . . . . . . . . . . . TC . . . . . TAT . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . G AT T . . C . . . . T . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . GAATTAGTA . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . TC . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . T . . . . . . . . . AAAAA . . . . . . . . . . . . C . . . . . TAT . . . . T . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . A T . . T . . . . T . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . GAATTAGA . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . TC . . . . . . . . . . . A . . . . . . G . . . . . . . . . AGAAA . . . . . . . . . . . . C . . . . . TAT . . . . T . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . A . . . . . . . . T . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . GATTAGA . . . . . . . . . . A . . . . . . G . . . . . . . . . AGAA . . . . . . . . . . . . C . . . . . TTT . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . G . . . . . . . . . AGAA . . . . . . . . . . . . C . . . . . TAT . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . . . . . . . AGAA . . . . . . . . . . . . A . . . . . ATA . . . . G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T . . . . . . . . . AGAA . . . . . . . . . . . . C . . . . . TAT . . . . G . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . AAA . . . . . . . . . . . . C . . . . . TAT . . . . G . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . C . . . . . TAT . . . . C . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . TA . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqCons : G* ** ** ***** ** A* TC**** GA**************** ** GC A*** GCCTCAAT************** GT* GATTGGGAATGACATACACA********** ** ACCG *************** CC** AACGCG****** G**** CTCTTTTTTAAACA******** ATAT CAG AAAAA************************************** C****** TAT************* T* C* ** ** ***
originalCons : CAACAAANAA-TAC-GGG-TCTTGT--GTTTTCT-CAAG---AA----------G-----------A---A-----T----T-------------A-----GGA------------CGGA-G-CGGA--T--ATTT-ACGA--TG-TACATGTATA----C-AC-A-----AGT-AT-C-T-G------GT----ATTAC-ATG-CC--A-CGT-GCG--AGT-AATACCTGT--ACC-TG-T--C-TTG-TCAAAA--CAAAGG-AT--------------TAT-CTAATCA--CTGCT---CA--ATTTAGATAT-A-TG-TG-CTGCTCTGT---C-CA----------AAA--A-CTATCG---AAGTTT----GACAACT------TATCG-G---A-AAGGTATAG-TTCT-----G-------TCTNA---TC--AT-GA-GTTTTCAACT-A-TAC-ATTTTG-ATAATGC-AT-TGGGA-GA--ATGGACTAC-ACG-ACAGA-CT-TCGA--ACTAAAACCGAGATTGGATGC-GAA-TTGG--ATG-CGT-CTT-ATCATTCTCTCCTCTGCTCGACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGCCTTAAAT-CT-GG-T-ATC-CGC--CCGACT-CAA-TAT-T--T-TCACACCCTT-TTTGCTA-ACGTCCAAGCTTAGGAAANATCTAGG-GA-C-TC-TAATTC-TTTTGT---G-CG---AAA----C--CCTTCGA-ATTTGC-A-TGGATTAAACAA--TG--TTCTCTTT--T-AAA-CAC-CGCGCCGATC--TAATATATTT-TACCCAGAA-TTAGCGGA-C-ACAAA--CCT-TTCGA--AT-TTG--C-GTGGAT---------T----TT-AC--AA-TG--------------A------ATTT-AAGA--A-AA-----GTTG--A-TGAATNAA-AAT--GG-TTCT-TT-A-TA---T-T--TTGAG---AAA----------------AAA----------------AA---A-----AA-----T-ATA-AC-GG-C-AC-G-C-ACAT-GTC-AT-GCT--A-CTA-TCATTT-GG---AAAAA----------T-ATA-T-AA--TTT--A-C--T--A-T-C-G--TC-T--CAT-G---GAA--AT-----AA-ATA----------AAAT---------AT-A-TATGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCCAATTTTCAATGGAAACCAATC---TTCAATAGTG-ACA-TGATT--TTT-ATA------TAA--TTC--TG-AAGAGGTATTGATAT---AATAC-CT-GAACTA-TCGCA--NAACATTAAC--AC-G-CACTGTT-CCT-TCGTGAT--TCCAACA------TACAGG--T-------ATACA-------TATATTA-TATTT-T---G-TGCT--TTAT-ACTAAA--CGCTAGT
finalCons : CAACAAANAA-TAC-GGG-TCTTGT--GTTTTCT-CAAG---AA----------G-----------A---A-----T----T-------------A-----GGA------------CGGA-G-CGGA--T--ATTT-ACGA--TG-TACATGTATA----C-AC-A-----AGT-AT-C-T-G------GT----ATTAC-ATG-CC--A-CGT-GCG--AGTA-ATACCTGT--ACC-TGTC----TTG-TCAAAA--CAAAGGA----------------TAT-CTAATCA--CTGCT---CA--ATTTAGATAT-A-TG-TGCCTGCTCTGT---C-CA----------AAAA---CTATCG---AAGTTT----GACAACT------TATCG-G---A-AAGGTATAG-TTCTGCCTCAAT--------------C--AT-GAGT-TTTCAACT-A-TAC-ATTTTG-ATAATGCGATTGGGAATGACATACACA----------AGA-CT-TCGA--ACTAAAACCGAGATTGGATGC---------------CGT-CTT-ATCATTCTCTCCTCTGCTCGACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGCCTTAAAT-CT-GG-T-ATC-CGCCC--GACT-CAA-TAT-T--T-TCACACCCTT-TTTGCTAACGCG------TTAGGAAANATCTAGG-GA-C-TC-TAATTC-TTTTGTG----CG---AAA----C--CCTTCGA-ATTTGC-A-TGGATTAAACAA--TGCTCTTTTTTAAACA--------CGCGCCGATC--TAATATATTT-TACCCAGAA-TTAGCGGA-C-ACAAA--CCT-TTCGA--AT-TTG--C-GTGGAT---------T----TT-AC--AA-TG--------------A------ATTT-AAGA--A-AA-----GTTG--A-TGAATNAA-AAT--GG-TTCT-TT-A-TA---T-T--TTGAAAAA--------------------------------------AA---A-----AA-----T-ATA-AC-GG-C-AC-G-C-ACAT-GTC------T--A-CTA-TCATTT-GG---AAAAATAT-------------T-AA--TTT--A-C--T--A-T-C-G--TC-T--CAT-G---GAA--AT-----AA-ATA----------AAAT---------AT-A-TATGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCCAATTTTCAATGGAAACCAATC---TTCAATAGTG-ACA-TGATT--TTT-ATA------TAA--TTC--TG-AAGAGGTATTGATAT---AATACC-T-GAACTA-TCGCA--NAACATTAAC--AC-G-CACTGTT-CCT-TCGTGAT--TCCAACA------TACAGG--T-------ATACA-------TATATTA-TATTT-T---G-TGC---TTAT-ACTAAA--CGCTAGT
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): TACTATCGTCTCATGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG
Unaligned ( gi|42 ): CGAACAAAGTTGAACATTGGATGATTATTCGTATTCTTGTATTAACACGTATCGAAGTAGGTTTTATGACTTTCTTAAATATC
Unaligned ( gi|46 ): ACAAAACAAAAAACGCGCCATTTTTTTCTCAAGAACAATTCCTTGAAATC
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1111111 11 111 111111111111111 1 11 22222222222 111111 1 3333333333333333333333 1 111111 22222222222222222 11 3333333333333333333333333333333 1 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1 1111111 1 7777777777777 11 1 11111 2222222 1 3333333333333333333333333 111 111111111 444444444444444444444 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 2222222222222222222222222222 22222222222222222222 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 11 1 1111111 111 11 111
lowQualScore : 66 4 4 33 44 5 888 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 2 8 66 33 2 2 77 8 0 2222222 2 2 77777 8 2 666 888888 6666 2 2 33 8 2 66 44 5 2 11 2 666666 2 000 666666666666666 3 3 3 55 777 55 0 4 4 77 666 3 00000000000 6666 4 666 7777 000000 3 777 4 2 0 0000000000000000000000 55 3 999 3 0 3 99 555555 77777777777777777 66 4 4 66 9 2222222222222222222222222222222 66 5 55 4 4 3 2 4 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 7 4 8 4 4 7777777 4 4 1 4 8888 6 2 7777777777777 444 55 55 6 3 0 5555 7 55555 555 3333333 88 3 3 22 3 44 4444444444444444444444444 44 6666 66 777 6 3 3 888 3 4 44 2 33 2 000000000 5555 2 33 2 555555555555555555555 2 33 2 77777 55 2 3 2 88 4 1 1 1 1 555 1 22 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1 1 1 0000000000000000000000000000 5 5 44 1 1 1 1 99999999999999999999 444 444 77 555555 555 88888888888 22 1 1 22 1 44444 5 1 1 44 6 22 2 333 66 66666 2 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1 1 77 555 0 5 8 1 33 33 777777 33 33 0 3 1111111 33 2 2 999 66 999 7 2 4 55 2 777777 22 7777777 8888888 2 2 444 2 111 2 33
lowQualScore : .. . . .. .. . ... ........................................................................ . . .. .. . . .. . . ....... . . ..... . . ... ...... .... . . .. . . .. .. . . .. . ...... . ... ............... . . . .. ... .. . . . .. ... . ........... .... . ... .... ...... . ... . . . ...................... .. . ... . . . .. ...... ................. .. . . .. . ............................... .. . .. . . . . . ................................................................. . . . . . ....... . . . . .... . . ............. ... .. .. . . . .... . ..... ... ....... .. . . .. . .. ......................... .. .... .. ... . . . ... . . .. . .. . ......... .... . .. . ..................... . .. . ..... .. . . . .. . . . . . ... . .. ................................................................. . . . ............................ . . .. . . . . .................... ... ... .. ...... ... ........... .. . . .. . ..... . . . .. . .. . ... .. ..... . .................................................................................... . . .. ... . . . . .. .. ...... .. .. . . ....... .. . . ... .. ... . . . .. . ...... .. ....... ....... . . ... . ... . ..
lowQualScore : 77 0 0 11 66 3 333 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 7 0 33 77 7 5 99 6 1 0000000 9 9 11111 6 9 888 222222 1111 9 9 99 6 9 88 33 0 9 88 9 888888 9 666 999999999999999 1 6 6 55 000 55 7 0 0 11 444 6 44444444444 3333 4 444 7777 555555 6 000 0 0 9 3333333333333333333333 00 6 888 6 9 6 00 777777 66666666666666666 00 4 4 11 0 9999999999999999999999999999999 11 8 11 4 4 7 5 0 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 8 0 0 0 0 2222222 0 0 2 0 4444 4 0 2222222222222 111 00 55 5 6 9 3333 3 55555 888 3333333 88 3 3 22 3 66 3333333333333333333333333 22 8888 55 000 2 1 1 666 1 0 22 9 99 9 777777777 7777 7 77 5 111111111111111111111 2 11 2 88888 33 2 1 0 22 0 8 8 8 8 000 8 55 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 7 7 7 2222222222222222222222222222 0 0 00 7 7 7 7 44444444444444444444 666 666 66 000000 777 66666666666 55 8 8 55 8 77777 5 9 9 55 0 88 2 999 33 77777 7 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 9 9 00 444 8 3 0 1 77 33 222222 22 44 0 7 5555555 33 9 9 111 33 111 5 5 7 99 5 222222 88 6666666 1111111 5 5 444 5 999 5 77
consensus : CAACAAANAA-TAC-GGG-TCTTGT--GTTTTCT-CAAG---AA----------G-----------A---A-----T----T-------------A-----GGA------------CGGA-G-CGGA--T--ATTT-ACGA--TG-TACATGTATA----C-AC-A-----AGT-AT-C-T-G------GT----ATTAC-ATG-CC--AC-GT-GCG--AGT-AATACCTG-T--ACC-TG-T--C-TT-GTC--AAAACAAAG--------------GAT-A-T-CTAATCA--CTGCT---CA--ATTTAGATAT-A-TGTGTCTGCTCTGT---C-CA----------AAA--A-CTATCG---AAGTTT----GACAACT------TATCG-G---A-AAGGTATAG-TTCT-----GC-----CTC-AA--T-C--AT-GA-GTTTTCAACT-A-TAC-ATTTTG-ATA-----ATGCGATTGGGA--ATGA--CATACACA-AGA-CT-TCGA--ACTAAAAC-----------CGAGATT-----------GG--ATGCCGT-TT-T-ATCATTCTNTCCTNTGCNCGACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGCCTTAAAT-CT-GG-T-ATC-CGC--CC---GACT-CAA-TAT-T--T-TCACACCCTT-TTTGCTA-ACG-C----G-T-T-AGG--AAANATCTAGG-GA-C-TC-TAATTC-TTTTGT---G-CG---AAA----C--CCTTCGA-ATTTGC-A-TGGATTAAACA-A--TG----C-TCT-TTCTTAAA-C-A--CGCGCCGATC--TAATATATTT-TACCCAGAA-TTAGCGGA-C-ACAAA--CCT-TTCGA--AT-TTG--C-GTGGAT---------T----TT-AC--AA-TG--------------A------ATTT-A--AGAA-AA-----GTTG--A-TGAATNAA-AAT--GG-TTCT-TT-A-T-A---T-T--TTG------A---A----------------------AA-A-------------AA-A-------A---AT-ATA-AC-G--------------------------G-C-AC-G--C-ACA-T-G-T------C----T--------A---CTA---TCATTTGG--AAA------A---AT-----------A--T-TAATT-T--A-C--T--A-T-C-G--TC-T--CAT-G---GAA--AT-----AA-ATA----------AAAT---------AT-A-TATGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCCAATTTTCAATGGAAACCAATC---TTCAATAGTG-ACA-TGATT--TTT-ATA------TAA--TTC--TG-AAGAGGTATTGATAT---AATAC-CT-GAACTA-TCGCA--NAACATTAAC--AC-G-CACTGTT-CCT-TCGTGAT--TCCAACA-TA------CAGG--TA-------TACA-------TATATTA-TATTT-T---G-TGC---TTAT-ACTAAA--CGCTAGT
Reference ( family-365 ) : CAACAAANAA-TAC-GGG-TCTTGT--GTTTTCT-CAAG---AA----------G-----------A---A-----T----T-------------A-----GGA------------CGGA-G-CGGA--T--ATTT-ACGA--TG-TACATGTATA----C-AC-A-----AGT-AT-C-T-G------GT----ATTAC-ATG-CC--AC-GT-GCG--AGT-AATACCTG-T--ACC-TG-T--C-TT-GTC--AAAACAAAG--------------GAT-A-T-CTAATCA--CTGCT---CA--ATTTAGATAT-A-TGTGCCTGCTCTGT---C-CA----------AAA--A-CTATCG---AAGTTT----GACAACT------TATCG-G---A-AAGGTATAG-TTCT-----GC-----CTC-AA--T-C--AT-GA-GTTTTCAACT-A-TAC-ATTTTG-ATA-----ATGCGATTGGGA--ATGA--CATACACA-AGA-CT-TCGA--ACTAAAAC-----------CGAGATT-----------GG--ATGCCGT-CT-T-ATCATTCTCTCCTCTGCTCGACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGCCTTAAAT-CT-GG-T-ATC-CGC--CC---GACT-CAA-TAT-T--T-TCACACCCTT-TTTGCTA-ACG-C----G-T-T-AGG--AAANATCTAGG-GA-C-TC-TAATTC-TTTTGT---G-CG---AAA----C--CCTTCGA-ATTTGC-A-TGGATTAAACA-A--TG----C-TCT-TTTTTAAA-C-A--CGCGCCGATC--TAATATATTT-TACCCAGAA-TTAGCGGA-C-ACAAA--CCT-TTCGA--AT-TTG--C-GTGGAT---------T----TT-AC--AA-TG--------------A------ATTT-A--AGAA-AA-----GTTG--A-TGAATNAA-AAT--GG-TTCT-TT-A-T-A---T-T--TTG------A---A----------------------AA-A-------------AA-A-------A---AT-ATA-AC-G--------------------------G-C-AC-G--C-ACA-T-G-T------C----T--------A---CTA---TCATTTGG--AAA------A---AT-----------A--T-TAATT-T--A-C--T--A-T-C-G--TC-T--CAT-G---GAA--AT-----AA-ATA----------AAAT---------AT-A-TATGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCCAATTTTCAATGGAAACCAATC---TTCAATAGTG-ACA-TGATT--TTT-ATA------TAA--TTC--TG-AAGAGGTATTGATAT---AATAC-CT-GAACTA-TCGCA--NAACATTAAC--AC-G-CACTGTT-CCT-TCGTGAT--TCCAACA-TA------CAGG--TA-------TACA-------TATATTA-TATTT-T---G-TGC---TTAT-ACTAAA--CGCTAGT
gi|1 : CAACAAACAA-TAC-GGACTCTTGCCAGTGTTCTACAAG---AA----------G-----------A---A-----T----T-------------A-----GAA------------CGGA-G-CGGA--CCGATTT-ACGA--TG-TACATGTATA----CTAC-ATGTAGGGT-AT-C-T-G------GT----GT-AC-AT-------C-GT-GCGTTAG---ATACCTG-T--ACC-TGGT--CGTT-GTC--AAAACAAAG--------------AATTA-TTCTAATCAAACT-CT---CA--AGTTAG---T-A-T-TATTTGCTCTGT---C-CA----------AAA--AACTATCG---AAGTTT----GACAACT------TATCGTG---A-AACGTATAG-TTCT-----CT-----CTT-A---T-C--AT-GAAGGTTTCAACT-A-TAC-ATTGTG-ATA-----TTGC-ATTGGGAGAATGAATCATACAAC-AGATCTATCGACCACTAAAAC-----------TGAGATTACTCCGAAATTGGCAATATCGTATT-T-ATCCTTTTCTCCTCTGCTCGACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGCCTTAAATACT-GG-T-ATC-CGC--CC---GACT-CAA-TAT-T--T-TCACACCTTT-TTTGCTAGACG-TCCAAGCT-T-AGG--AAACATCTAGG-GA-C-TC-TAAT-------------------AAA----C--CCTTCGA-ATTTGC-A-TGGATTAAACA-A--TG----T-TCT-CTTTTAAAAC-A--CCGGCCGA-C--TAATATATTT-TACCTA-AA-TTAGCGGA-C-ACAAA--CCT-TCCAA--AT-TTG--C-GTGGAT---------T----TT-AC--AA-TG--------------A------ATTT----AGAA-AA-----GTTG--G--GAATGAA-AAT--GG-TTTT-TT-A-C-A---T-T--TTGAGAAAAA---A----------------------AA-A-------------AA-A-------A---AT-ATA-AC-G--------------------------A-C-AC-GC-C-ACA-TCG-TCAATAGC----T--------A---CTA---TCATTTGG--AAA------A---AT-----------A--TATTATT-T--ACC--T--A-TGC-G--TC-T--CATAG---GAA--AT-----AA-ATA----------AAATGATNNNNNNNN-N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCAGTC---TTCCATAGTG-ACA-TGATT--TTTGATA------TAA--TTC--TG-AAGA-GTATTGATAT---AATACTTT-GAACTA-TCGCA--ACACATTAATCAAC-G-CACTGTT-CCTGTTTTGATGATCCAACA-TA------CAGC--TA-------TACA-------TATATTA-TATGT-T---G-TGCTAATTATAACTAAA--CGCTAGT
gi|10 : CTTAAAT-CT-GG-TTATCTCGC--C----GACT-AAA-TAT-AAAT-TAACACATTT-TTTGCC---------------T-AGT--AAA---CTCGGCGA-C-CCCTAATTCCTTTTGTT--G-CG---AAAA---C--CCTTCGA-ATTTGC-A-AGGATTAAATA-AATTGAATCC-TGT-TTCTTAAA-C-A--CCCGCCGATC--TAATATACTT-TACCAGGAA--TAGCGGA-TAACAAC--CCT-TCC----AC-TTGCTC-GTGGAT---------T----TT-AC--AG-TG--------------A------ATTTAA--AGAA-AA-----GTTG--A-TGAATATT-AAT--GG--TGT-TT-A-T-AT--T-T--TTG------A---A----------------------AA-A-------------AT-A-------A---AT-ATA-AC-G--------------------------G-C--C-G--C-TCA-T-G-T------G----T--------A---CAA---TCATTTAGAAAAA------A---AT-----------A--T-TACTT-T--A-C--T--A-
gi|10 : CCAATT--CAATGGAAAAAAACCCTTTTCAA-AATG-ACA-TGAGT--TTT-ATA------TAA--TTTCGTG-AAGAGATATT-ATAC---Annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaattcaatggaaaaaaacccttttcaaaatgacatgagttttatataatttcgtgaagagatattatacatt
gi|11 : cttaaatctggttatctcgccgactaaatataaattaacacattttttgcctagtaaactcggcgacccctaattccttttgttgcgaaaacccttcgaatttgcaaggattaaataaattgaatcctgtttcttaaacacccgccgatctaatatactttaccaggaatagcggataacaacccttccacttgctcgtggattttacagtgaatttaaagaaaagttgatgaatattaatggtgtttatatttttgaaaaaataaatataacggccgctcatgtgtacaatcatttagaaaaaaatattactttactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAACAAAAAG-TAC-GG--TCTTGT--GTTTTCT-CAAG---AA----------G-----------A---A-----T----T-------------A-----GTA------------CGGA-GGCGGA--T--ATTT-AC-A--TGCTACATGTATA----C-AC-A-----ACTTAT-C-T-G------GT----ATTAC-ATG-CC--ACCGT-GCG--AGT-AATACC-G-TTAACC-CA-G--T-TT-GTC---AAACAAAG--------------GAT-A-T-CTAATCC--TTGCT---CA--ATTTAGATAT-A-TGTGTCTGCCTTGT---C-CA----------AAA--A-C-ATCG---AAGTTT----GACAACT------TATCG-G---A-AAGGTATAGTTTCT-----GC-----CTC-AAATC-C--AT-GC-GTTTTCAACT-ATTAC-ATTTT--ATA-----ATGCG-----------GA--C-TACACA-AGA-CT-TCGA--ACTAAA-------------CGAGATT-----------GG--ATGCCGT-CT-T-ATCATTCTtt
gi|12 : aAACAAAAAG-TAC-GG--TCTTGT--GTTTTCT-CAAG---AA----------G-----------A---A-----T----T-------------A-----GTA------------CGGA-GGCGGA--T--ATTT-AC-A--TGCTACATGTATA----C-AC-A-----ACTTAT-C-T-G------GT----ATTAC-ATG-CC--ACCGT-GCG--AGT-AATACC-G-TTAACC-CA-G--T-TT-GTC---AAACAAAG--------------GAT-A-T-CTAATCC--TTGCT---CA--ATTTAGATAT-A-TGTGTCTGCCTTGT---C-CA----------AAA--A-C-ATCG---AAGTTT----GACAACT------TATCG-G---A-AAGGTATAGTTTCT-----GC-----CTC-AAATC-C--AT-GC-GTTTTCAACT-ATTAC-ATTTT--ATA-----ATGCG-----------GA--C-TACACA-AGA-CT-TCGA--ACTAAA-------------CGAGATT-----------GG--ATGCCGT-CT-T-ATCATTCTtgtacaaacaatacatgcatctaagttagctgcatcggatttcctcaatatcaactgacatag
gi|13 : aAACAAAAAG-TAC-GG--TCTTGT--GTTTTCT-CAAG---AA----------G-----------A---A-----T----T-------------A-----GTA------------CGGA-GGCGGA--T--ATTT-AC-A--TGCTACATGTATA----C-AC-A-----ACTTAT-C-T-G------GT----ATTAC-ATG-CC--ACCGT-GCG--AGT-AATACC-G-TTAACC-CA-G--T-TT-GTC---AAACAAAG--------------GAT-A-T-CTAATCC--TTGCT---CA--ATTTAGATAT-A-TGTGTCTGCCTTGT---C-CA----------AAA--A-C-ATCG---AAGTTT----GACAACT------TATCG-G---A-AAGGTATAGTTTCT-----GC-----CTC-AAATC-C--AT-GC-GTTTTCAACT-ATTAC-ATTTT--ATA-----ATGCG-----------GA--C-TACACA-AGA-CT-TCGA--ACTAAA-------------CGAGATT-----------GG--ATGCCGT-CT-T-ATCATTCTtgtacaaacaatacatgcatctaagttagctgcatcggatttcctcaatatcaactgacatag
gi|14 : a-TA--------------A------ATTT-A--AGTA-AA-----GTTG--A-TGGATTAA-AAC--GG-TTCT-TT-A-T-A---T-T--TTG------A---A----------------------AA-A-------------AA-A-------A---AT-ATA-AT-G--------------------------G-C-AC-G--T-ATA-T-G-T------C----T--------A---CTA---TCTGGTGG--AAA------A---AT-----------A--T-AAATT-T--A-C--T--A-T-C-G--TC-T--CGT-G---GAA--AT-----AA-ATT----------AGAT---------AT-A-TATATtgtacaaacaatacatgcatctaagttagctgcatcggatttcctcaatatcaactgacatag
gi|14 : ctGGAAA--AACT---TTCAATAGTG-ATA-GGATT--T---ATA------TAA--TTC--TG-AAGAGGTATTAA------AATAC-CT-GATCTA-TCGAA--CAACATTAAC--AC-G-TACTGTT-CCT-TTGTGAT--TCCAACA-TA------GAGG--TA-------TGCATACAGTGTATATTA-TGTTT-T---G-TGT---CTAT-ACTAAA--CGCTAGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaaaaactttcaatagtgataggatttatataattctgaagaggtattaaaatacctgatctatcgaacaacattaacacgtactgttcctttgtgattccaacatagaggtatgcatacagtgtatattatgttttgtgtctatactaaacgctagt
gi|15 : cttaaatttaagtaaagttgatggattaaaacggttctttatattttgaaaaaaaaaatataatggcacgtatatgtctactatctggtggaaaaatataaatttactatcgtctcgtggaaataaattagatatatatatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAAAAAGAAGCAC-AGG-CCTTCT--ATTTTCT-CAAGGACAA----------GTCCTTGGAATCA---A-----T----T-------------A-----GG--------------GGA-G-CAGA--T--ATTT-ACGA--TG-CACATG--------C-AT-A-----GGT-AT-C-TTG------GA----ATCAC-ATG-CC--GC-GT-GCG--AGT-AATACC---T--ACC-TG-T--C-TT-GTC--AAAATAAAG--------------------------TCA--CTACT---CA--ATTTAGAT-T-A-TGT--CTGTTCTGC---T-C-----------AAA--A-CTATCG---AAGTTG----AACAATT------TATCG-G---ATAATG-ATAT-TTGT-----TC-----CT---A--T-C--AT-GA-ATACTCAACT-------ATTTGG-AT------ATGCGATTGGAA--ATAA--CATGCAC--GGA-CA-TCGA--AC-AAAAC-----------T-AAATT-----------GG--ATG-CGT-TT-T-CTC
gi|16 : AA-AAT--GG-TTCT-TT-A-T-A---T-T--T--------A---A----------------------AA-A-------------AA-A-------T---AT-ATA-AC-G--------------------------G-C-AC-G--C-ACA-T-G-T------C----T--------A---CTA---CCTTGTGG--AAA------A---AT-----------A--T-TAATT-T--A-C--T--A-T-C-G--TG-T--CAT-G---AAA--ATTAAATAA-ATATNNNNNNNNNNNNN---------NN-N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCAATTTTGAATGGAAA--AACT---TTCAATAGTG-ACA-TGATT--TT--ATA------TAA--TTC--TG-AAGAGGTATTAA-AT-----TAC-CT-G-ACTA-TCGAA--CAACATTAAC--AC-GCCACTGTT-CCT-TTGTGAT--TCC-----TA------C--------------------------ATATTATTATTT-T---GATGC---TTAT-ACTAAG--CGCTAGcgccatgtacacgcatatcgaagtaggccgtgtgatttcctcaaatatcacacaca
gi|17 : tCAACAA-CAA-TAC-GGG-TCTTGT--GTTTTCT-CAAG---AA----------G-----------A---A-----T----T-------------A------GA------------CGGA-G-CGGA--T-------------------ATGTATA----C-AC-A-----AGT-AT-C-G-GGTACATGT----ATTAC-ATG-CC--AC-GT-GCG--AGT-AATACCTG-T--ACC-TG-T--T-TT-GTC--AAAACAAAG--------------GAT-A-T-CTAATCA--CTGCT---AA--ATTTAGAT-T-A-TGT--CTGCTCTGT---C-C-----------AAA--A-CTATCG---AAGTTT----GATAACT------TATCG-G---A-AAGGTATAG-TTCT-----GC-----TCT-AA--T-C--AT-GA-GCTTTCAACT-A-TAC-ATTTTG-AT------ATGCGATTGGGA--ATGA--TATACAC--AGA-CT-TCGA--AC-AAAACTTAATTGGATGCGA-ATT-----------GG--ATG-CGT-TT-T-ATCAGTCTc
gi|18 : a--------------A------ATTT-A--CGAA-AA-----GTTT--A-TGAACCAA-AAT--GG-TTCT-TT-A-T-A---T-T--TTG----------------------------------------------------------------------A-AC-G--------------------------G-C-AC-G--C-ATA-T-------------------------------------TTGGG--AAA------A---AT-----------A-----AATT-T--A-C--T--A-T-A-G--CC-T--T-------NNN--NN-----NN-NNN----------NNNN---------NN-N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNGTG-AAA-T-CTT--TTA-ATAGTGACATAA--TTC--TG-AAAAGATATT--TAG---AATAC-GT-GAACTC-TCATG--CAACATGAA--------CACCGCT-CCT-TCGTGAT--T-CAACA-AA------CAGG--TA-------tgt
gi|19 : ttGT--TTTTTCT-CAAG---AA----------G-----------A---A-----T----TT------------A-----GGA------------CGGA-G-CGGA--T--CTCT---GA--TG-TACATGTATAGTAAC-ACCA-----AGT-AT-C-TTG------GTGCCTATTACCATGACC--AC-GT-GCG--GGT-AATACCTGTT--ACCGTG-C--C-TTGGTCAAAAAACAAAG--------------GAT-AGT-CTAATCA--CTGCTTTCCAGTATTTA-ATATAA-TGTTCCTGCTCTGTATCC-CACACATATTACAAAATA-CT-CCGAACAAGCTCTGTAGACAACCAGTTTATATC--G---A-AAAGTATA--TTCT-----GC-----TCT-AA--G-C--AT-GA---TTTCAACTGA-TAC-ATTc
gi|2 : AACAAAGCA-TAC-GGG-TCTTGT--GTTTTCT-CAAG---AA----------G---------------A-----T----T-------------A------GA------------CGGA-G-CGGAT-T--ATTT-ACGA--TG-TACATGT-------T-AC-A-----AGT-AT-CAT-G------GT----ATTAC-ATG--C--AC-GT-GCG--AGT-AATA-CTG-T--ACC-TG-T--A-TT-GTC---AAACAA----------------GGT-A-T-CTAGATA--CTGCT---C---ATTTAGAT-T-ACTGT-CATGCTCTGT---C-------------AAA--A-CTATCG---AAG-TT----GACA--T------TAT---G---G-AAGGTATAG-TT-T-----GT-----CTA-AT--T-C--ATCGA---TTTCAACT-A-TACTATTTTGAATA-----ATG-GATTGGGA--AT------T--------A-CT-TCGA--ACT-AAGC-----------TGA-ATT-----------GG--ATG-CGT-TT-TAATCATACTatatag
gi|2 : aCGTCCTAAAT-CT-GGAT-ATC-TGC--C----GA-T-CAA-TAT-T--T-TCACACTTTT-TTTGCTA-ACGTC----G-CCT-AGG--AACT-CCTAGG-GA-CATA-GATTTC-TTTTGTTTGA-CG---AAA----AAACCTTCGA-ATTTGC-AATGGATTAAAAC-A--TG----T-TTT-TTT--------A--CACGACGATC--TAATATATTT-TACCTAGAA-TTAGC-GA-C-ACAAA--C---TTCCA--AT-TTG--C-GTGGAT---------T----TT-AC---A-TG----------------------TTT-A--AGAA-AAT----GTTG--A-TG-ATTGA-AAT--GG-TTTT-TTAA-C-A---TAT--TTG------A---G----------------------AA-A-------------AA-A-------A---CT-AT--AC-G--------------------------A-A-AC-G--TAACA-T-G-T------TATAGT--------A---CTA----CATTTGG---AA------A---AT-----------A--T-TAATT-T--A----T--A-T-CTG--TC-T--CAT-G---AGA--AT-----AAGATA----------AAAT---------ATNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAATC---TTC-ATAGTGAACA-T-ATT--T----TA------TAA--TTC--TG-AAGAGGTATTGAATT---AATA--TT-GAACTA-T---G--AAAC-TTAAC--ACAG-CATGGTT-CCT-TTGTGA---TCCAACA-TA------CGG------------TACA-------TATATTA-T-TTT-T---G-TGC---TT-T-ACT-AA--CGCTtgtaccaatacatgatcgaagttgtgcatgagtttctccatattgacacagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcttcgtcctaaatctggatatctgccgatcaatattttcacactttttttgctaacgtcgcctaggaactcctagggacatagatttcttttgtttgacgaaaaaaccttcgaatttgcaatggattaaaacatgtttttttacacgacgatctaatatattttacctagaattagcgacacaaacttccaatttgcgtggattttacatgtttaagaaaatgttgatgattgaaatggttttttaacatatttgagaaaaaaactatacgaaacgtaacatgttatagtactacatttggaaaatattaatttatatctgtctcatgagaataagataaaatatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaatcttcatagtgaacatattttataattctgaagaggtattgaattaatattgaactatgaaacttaacacagcatggttcctttgtgatccaacatacggtacatatattatttttgtgctttactaacgct
gi|20 : aaacaaagcatacgggtcttgtgttttctcaagaagattagacggagcggattatttacgatgtacatgttacaagtatcatggtattacatgcacgtgcgagtaatactgtacctgtattgtcaaacaaggtatctagatactgctcatttagattactgtcatgctctgtcaaaactatcgaagttgacattatggaaggtatagtttgtctaattcatcgatttcaactatactattttgaataatggattgggaattacttcgaactaagctgaattggatgcgttttaatcatacttgtaccaatacatgatcgaagttgtgcatgagtttctccatattgacacagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctt---AAA----C--CCTTCGA-ATTTGC-A-TGGATTA----------------------------------CGCGCCGATC--TA-T-TGTTT-TACCCAGAA-TTAGCGGA-C-ACAA---CCA-TTCGA--AT-TTG--C-TTGGAT---------T----TT-AC--CA-TGTGCTTTTATTTAAAA------ATTT-A--AGAA-AA-----GTTA--A-TGAATTAA-ATT--GG-TTCT-TT-A-T-A---T-T--TTG---------------------------------AA-A-------------TA-A-------A---AT-ATA-AC-GTTTATAATTAGAAATAAAATATAACGG-C-AC-G--C-ACA-T-G-T------C----T--------A---CTA---TCATTTGGA-AAA------A---AT-----------A--T-TAATT-T--A-G--T--A-T-C-G--TC-T--CAT-G---
gi|21 : gaaTTTAGAAAT---TATGTCTGTTCTGT---C-CA----------AAA-----TATCG---AAGTT-------CAACT------TAACA-GGATA-AAGGATTTG-TTCT-----------------A--TAC--AT-GA---TCTCAA-T-A-----ATTGTG-ATAATTATATGCGA-TGAGT--ATG---TATGATCATAGG-CT-TCAA--AACAAAAC--------------GAAT-----------GG--GTG-TGT-TT-T-----CTCTATCTTGTGCACAACA
gi|22 : agataaccctaccagtTC--TAATAT-TTT-TACCCTGAT-TTAGCGGA-C-ACAGC--CCT-TT-GA--AT-TTG--C-GTGGGT---------T----TT-AC--AA-TGTTCTTTTA------A------AT---A--AGAA-AA-----GTTC--A-TGAATTAA-AAT--GG-TTTT-CT-A-T-A---T-T--TTG------A---A----------------------AA-T-------------AT-AT------AT--AT-ATA-AC-G--------------------------G-C-AC-G--C-ACA-T-G-T------C----T--------A---CTA---TCGTTTGG--AAA------A---AT-----------A--T-TAATT-T--A-C--T--A-T-C-G--TC-T--CAatatgatatcgaaagtaggccgtttgaagctcctcaat
gi|23 : tgaaacaggtctctgtgTTCT-TA-G---AA----------ATC---------A---A-----T----T-------------A-----GG-------------TGGG-G-CGGA--T--ATTT-ACGA--TG-TACAT----A----C-AC-A-----TGT-AT-C-T-G------GT----TTCAC-ATG-CC--AC-GT-GCG--AGT--ATACTTG-T--ACC-TG-T--C-TT-TTT--AAAACAAAG--------------GAT-
gi|24 : agaaagcacgggcgtagtattttttaacagcaa-T-T-AGG--AAAC-TC-AGG-GA-C-TC-TACTTC-----------------AAA----C--CCTTCGA-ATTTGC-A-TGGATTACACA-A--TG----C-TCT-TTCTTAAA-C-AC-CGTGTCGATC--TAATATATTT-TACCCATAA-ATAGCGGA-C-A-ATA--TCC-TTCGA--AT-TTG--C-GTGGAT---------T----TT-AC--AA-TG--------------ttgctttaggtgtgtatatctcccagttgattcgaggaatagaagatt
gi|25 : tccaagcAACAA-CAA-CACAGGG-TCTGCT--GTTTTCT-CAAG---AA----------C-----------A---A-----T----T-------------ACCTTCGGAATCAAATATAGGCGGA-G-CGGA--T--ATTTTACGA--TG-TACATATGT-----C-AC-A-----AGT-AT-C-A-G------GT----AATAC-ATG-CC--AC-GT-GCGC-AGT-AATACCTT-T--ACC-TG-T--A-TT-GTC--AAAACAAAG--------------G-T-A-T-TTttctggtgaataagaacataagtt
gi|26 : aAACAA-CAA-CAC-GGG-TCTTGT--GTTTTCT-CAAG---AACAATTCCTCGG-----------A---A-----TCAATT-------------A-----GG-------------CGGA-G-CGGA--T--ATTT-ACGA--TG-TACATGTA---------C-A-----AGT-AT-C-A-G------GT----ATTAC-ATG-CC--AC-GT-GCG--AGT-AATACCTG-T--ACC-TG-T--A-TT-GTC--AAAACAAAG--------------GAT-gctc
gi|27 : aaAAACCAATC---TTCAAGTGTGTACA-T-ATTGTTTT-A-A------TAA--T-C--TG-A-GAGGTATTGATAT---AATAC-TTGGAACTA-TCGCAT-TAACATTAACT-AC---CCCTGTT-CCT-TTG-GAT--TTCAACA-TA------CAGG--TA-------TACA-------T-TATTA-TATTT-T---G--GC---TTAT-ACTAAA--CGCTAGTttgctttcgaataca
gi|28 : TTGT--GTTTTCTACAAAGA-AA----------G-----------AGATA-----T----T-------------GTT---AAA------------CGGAAG-CGGAAAT--ATCT-TCGAATTG--ACTTGT-TN----N-NN-N-----NNN-NN-N-N-N------NN----NNNNN-NNN-NN--NN-NN-NNN--NNN-CGT--TTG-T--AAC-TG-T--C-TT-GTC--AAAACAAAG---------------AT-A-T-CTAATCA--CTGCT---CA--ATTTAGATa
gi|29 : TTCT-TA-G---AA----------ATC---------A---A-----T----T-------------A-----GG-------------TGGG-G-CGGA--T--ATTT-ACGA--TG-TAC----ATA----C-AC-A-----TGT-ATGC-T-G------GT----TTCAC-ATG-CCCAAC-GTGGCG--AGTAAATA-CTG-T--ACC-TG-TCGC-TT-TTT--AAAACAAAG--------------
gi|3 : aagaaagcacgggcgtagtattttttaacagcaaAAACAA-CAC-G---TCTTGT--TTGTCTT-CAAG---AA----------G-----------A---AATTCCT----T-------------------GGATCTATAC-----CGAA-G-CGGA--T--ATT--ACGAACTG-TACAT----A----C-AC-A-----AGT-AT-C-C-G-------T----ATCAC-ATG-CC--AC-AG-CCG--AGT---TACCTG-T--ACC-TG-T--C-TT-GTC--CAAACAAAGATTGCTTTCGCACTAAT-A-T-CTAATCA--CTG-T---TA--ATATAGAATT-A-TGTG--TGCATTGT---T-CT----------CAA--A-CTAT-G---AAGTTT----GACAA-T------TATCG-G---A-TA-GTATAT-TTCT------T-----CT--AA--T-CATAT-GA-GTTTTCAACT-A-TAT--TTTTG-ATA--------TGATAGGG---ATAA--AACACACG-A
gi|3 : aaCCTTAA---CT-GGAT-ATC--GC--C----GACTTCAA-TATAG--T-TCACACCATT-TTC-CTA-G-A-C----G-T-C-GAGCTAAAAAT--AGA-GA-C-TC---ATTC-TTTATT---G-CG---AA--------CCTTCGACATTT-C-A-TGGATTA----------------------------------CGCGCCGATC--T----TGTTTATACCCAGAA-TTAGCG-A-C-ACAA---CCA-TTCGA--AT-TTG--C-TTGGATACCAGTGCTT----TT-ATGTAA-----------------A------ATTT-A--AGAA-AA-----GTTA--A-TGAATTAA-ATT--GG-TTCT-TT-A-T-A---T-TTATTG------A---ACATAAAATTACGTTATAATTAGAA-A-------------AA-A-------A---AT-ATA-AC----------------------------G-C-AC-G--C-ACA-T-GTT------C----T--------A---CTA---T-ATTTGGA-AAA------A---AT-----------A--T-TAATT-T--G----T--A-T-C-GTTTC-T--CAT-G---ccactggatctttatcagtcttgtacacacatatcaattggccgtattatttcgtttaaaaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccccttaactggatatcgccgacttcaatatagttcacaccattttcctagacgtcgagctaaaaatagagactcattctttattgcgaaccttcgacatttcatggattacgcgccgatcttgtttatacccagaattagcgacacaaccattcgaatttgcttggataccagtgcttttatgtaaaatttaagaaaagttaatgaattaaattggttctttatatttattgaacataaaattacgttataattagaaaaaaaatataacgcacgcacatgttctactatatttggaaaaaatattaatttgtatcgtttctcatgca
gi|30 : aaaaacaacacgtcttgtttgtcttcaagaagaaattccttggatctataccgaagcggatattacgaactgtacatacacaagtatccgtatcacatgccacagccgagttacctgtacctgtcttgtccaaacaaagattgctttcgcactaatatctaatcactgttaatatagaattatgtgtgcattgttctcaaactatgaagtttgacaattatcggatagtatatttcttctaatcatatgagttttcaactatatttttgatatgatagggataaaacacacgaccactggatctttatcagtcttgtacacacatatcaattggccgtattatttcgtttaaaaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncc---TTTAATAGTG-ACA-TGATT--TT--ATA------TAA--TTA--TG-AATAGGTATTAA------AATAC-CA-GAATTA-TCGCA--CAACATTAAC--AC------TGTT-CCT-TCGTAAT--TCCAATA-TA------GAGG--TACCGATAATACA-------TACTTTA-TATTT-T---G-TGC---TTAT-CCTAAA--CGCTca
gi|31 : cactATAGTG-ACA-TGATT--TT--ATA------GAA--TTT--TA-AAGAGGTATGAA------AATAC-CT-GAACTA-TTGCA--CAACATTAAC--AC-G-TACTGTT-CCT-CTGTGAT--TCCAACA-TA------GAGG--TA-------TACA-------TATATTA-TATTC-T---G-TGC---TTAT-ACTAAA--CGCTAG
gi|32 : ccatat--------------A------AGTT-A--GGAA-AA-----GTTG--A-TGACTTCA-AAT----------TT-A-T-A---T-T--TTG------A---A----------------------CG-A-------------AA--------------T-ATA-AC-G--------------------------G-C-TC-G--C-TAA-T-G-T------A----T--------A---CTA---TCGTCTGA--AAA------A---AACCCCAAAACAAA--A-TAATT-T--A-CTGT--A-T-C-G--TT-T--C
gi|34 : tcaatattttcA------TCA--TTC--TA-AGTCGGTTTTAA-AT-----TAC-CT-GAACTA-TCACA--TTACATAAAC--AC------TGTT-CCT-TTGTGAT--TTCAATA-TAGATGTACATG--TA-------TACA-------TACATTC-TATTT-T---G-TAC---TTAT-CCTACA--CGCT
gi|35 : T-G--AGAA-AA-----TATG--T-TGAAT--A-AAT--GGGTTCT-TT-A-C-A---T-T--T-------------------------------------------------------------------GT-AT---C-G----------------------------C-AC-G--C-ACA-T-G-T------C----T--------A---CTA---TCATTTGG--AAA------ACC-AA-----------A--T-TGATT-T--A-C--T--A-T-T-G--TC-T--CAC-T---AAA--AT-----AA-ATT----------AAA
gi|36 : aaAA--TTC--TG-AATACATATAGGTATTTAAATAC-CT-AAATTA-TCACA-----CATTAAC--AC------TGTT-CCT-TCGTGAT--TCTAACT-TG------GAGG--TA-------TTCA-------TACGTTA-TATTT-T---A-TAC---TTAT-
gi|37 : c---------T----TT-AC--AA-TG--------------A------ATTT-A--AGAA-AA-----GTTG--A-TGACTGAA-AAT--GATTTTT-TT-A-C-A---T-T--GTG----------A----------------------GA-A-------------AA-A-------A---AT-ATA-AC-G--------------------------A-C-AG-G--C-ACA-T-G-TCTATAGC----T--------A---CTA---TCATTTGG--AAA------c
gi|38 : T-TTG--C-GTGGAT---------T----TT-AC--AA-TG--------------TTCTTTTATTC-A--ATCA---------TT-----TAAAAAAA-AAC--GT-TTCT-TT-A-T-G---T-T--TTG------A---A----------------------AA-A-------------TTTA-------G---AT-ATA-AC-G--------------------------A-C-AC-G--C-ACA-T-G-T------------------------CTA---TCATT
gi|39 : AATTAA-AAT--GG-TTCT-TT-A-T-A---T-T--TTG------A---A----------------------AT-A-------------TA-T-------ATATAT-ATA-AC-A--------------------------G-C-AC-G--C-ACA-T-T-T------C----T--------A---CTA---TCATTTGT--AAA------A---AT-----------A--T-TTATT-T--A-C--T--A-T-C-G--TC-T--CAT-G---G
gi|4 : AAGTATAG-TTCTTCTTAGCACTATCTCTAA--T-C--AG-GA-GTTTTCAACC-A-TAT-ATTTTG-AT------ATGCGATTAAGA--ATAA--TATACAC--GGA-CT-TCGA--AC-AAAAC-----------TGAA--T-----------GA--ATGTCGT-TTCT-ATCAGTCTTT
gi|4 : CCTTAAAT-CTCGG-T-ATT-TGCGGTA---GACT-CAAGTAT-T--CCTCACACC--T-TTGGCTAGACG-CCAA-GCT-T-AGA--GAAC-TC-GGG-GA-C--C-TAATTCCTTTTGT---GGCG---AAAAA--CG-CCTTCGA-ATTTGG-A-TGGATTAACAA-A--TT----T-TCT-TTCTTAA----A--CGCACCGATT--GAATATA-TT-TACCAAACATTTAGCGTA-C-ACAAC--CCTGTTCGACCATCTTT--CAATGAAT---------TGGCATT-AC--AA-TGTTCTTTC-------T------ATTA-A--AGAATAAAAATGGTTG--ATTGAAGT-A-AAT--AG-TTTT-CT-A-T-A---T-T--TGG------G---G----------------------GG-GGGGGGGGCACGGCGG-A-------C---ATCACG-AC-G--------------------------GCC-AC-GCCC-ACATT-G-T-----------T--------AC--CTA---TCATTTGA--AAA------A---A------------A--A-AAATT-T--A-C--TGAG-T-C-G--TC-T--CAT-G---GAA--AT-----AA-Agttacacacatatcctgaaattgtcgtagaaccttcatcatcaactctctcgtctccccttctcctcgtcaatctctctccctctctctcttctccatcccctcctccctcctcctcgtgctctgcccttaaatctcggtatttgcggtagactcaagtattcctcacacctttggctagacgccaagcttagagaactcggggacctaattccttttgtggcgaaaaacgccttcgaatttggatggattaacaaattttctttcttaaacgcaccgattgaatatatttaccaaacatttagcgtacacaaccctgttcgaccatctttcaatgaattggcattacaatgttctttctattaaagaataaaaatggttgattgaagtaaatagttttctatatttggggggggggggggcacggcggacatcacgacggccacgcccacattgttacctatcatttgaaaaaaaaaaatttactgagtcgtctcatggaaataaa
gi|40 : aagtatagttcttcttagcactatctctaatcaggagttttcaaccatatattttgatatgcgattaagaataatatacacggacttcgaacaaaactgaatgaatgtcgtttctatcagtctttgttacacacatatcctgaaattgtcgtagaaccttcatcatcaactctctcgtctccccttctcctcgtcaatctctctccctctctctcttctccatcccctcctccctcctcctcgtgctctgcTCT-TT-A-T-A---T-T--TTG------ATGAA----------------------AA-A-------------AA-A-------A---AT-ATA-AC-A--------------------------G-C-AC-G--C-ACA-A-G-T------------------------CTA---TCATTTGG---AA------A---AT-----------T--T-CAAAT-T--A-C--C--A-T-C-G--TC-T--CAT-G---GAA--AT-----AA-ATA----------
gi|41 : -A-------------AA-A-------T---AT-ATA-ACTG--------------------------G-C-AC-G--C-ACA-T-G-T------------------------CTA---TCATTTGG---AA------A---AT-----------A--T-TAATT-TTAA-C--TA-A-T-C-GC-TA-T--CAT-G---GAAT-AT-----CA-ATA----------g
gi|43 : gcgaattaacattct-C-AC-G--C-ACA-T-G-T------C----T--------ATAGCTAATGTCATTTTG--AAA------AAAAAT-----------A--T-TAATT-T--A-C--T--A-T-C-G--
gi|44 : a-G-TACTCTT-CCT-TCGTGAT--TCCAACG-CA------GAGG--CA-------TGCA-------TATGTTA-TATTG-T---G-TGC---TTAT-ACTAAA--CGCTAGaataagatataattat
gi|45 : AAC--AC-G-CACTGT---CT---GTGAT--TCCAACA-TA------CAG---TA-------TACA-------TA-AT-A-TATTT-T---G-TGC---TTA--ACTAAA--CGCTAG
gi|47 : TGCTATGT---CTCA----------AA-----CTATCG---AAGTTT----GACAACT------TATCG-
gi|48 : caagtttcagTTTCT-CAAG---AA----------G-----------G---A-----T----TCCTTGGAATCAATA-----GG-------------CGGA-G-CGGA--T--TTTT-AC
gi|49 : CAATTTTCAATGGATACT-------TTCAATATTG-ACA-TGA-T--TTT-ATA------TAA--TT
gi|5 : GCCTTACAT-CT-G--T-ATC-TTC--TCTCTGACT-CA----T-T--TATCGTATCTTA-TTC---------C----A-T----------ATAATTAGG-GA-A-T----ATTC-TTTTGT---T-CG---AAAACAAC--CCTTCGA-ATTTGCTA-TGGATTAA-CATA--T-----------------------------CCGATCAATAATATATTT--ACCTAGAAATTAGCGGAGC-ACAAA--CCT-TCCAA--TT-CTG--C-GTGGAT---------T----TA-AC--AA-TG--------------A------ATTA-AAGAGAA-AA-----GTAGT-A-TGATGGAA-AAT--GT-TTCT-TT-A-T-AAATT-T--TTGAGA---A---A----------------------AA-A-------------AA-A-------A---AT-ATA-AC-G--------------------------A-C-AC-G--C-ACA-T-G-T------C----TATAGCTTAA---CTAT--TCATTTGGA-AAA------A---AT-----------A--T-TAA-T-T--A-C-----A-T-C-G--TC-T--CAT-G---GAA--AT-----AA-TT-------------AT---------AT-A-T
gi|5 : AGTG-AC--TGATT--TT--ATA------TAAATCTC--TGAAAGAGGT-----CAT-------------AACTAGTCGCATCAAGCATTAAC--AC-G-CACTGCT-CCC-T-GTGATC-TCCAACATTA------CAGGA-GA-------TACA-------TATATTA-TATTTAT---G-TGC---TTAT-ACTAAAACCGCTAGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctagcttcttggtgcgagctaacactcgccatcatccccacgatccattaagtgactgattttatataaatctctgaaagaggtcataactagtcgcatcaagcattaacacgcactgctccctgtgatctccaacattacaggagatacatatattatatttatgtgcttatactaaaaccgctagta
gi|50 : gccttacatctgtatcttctctctgactcatttatcgtatcttattccatataattagggaatattcttttgttcgaaaacaacccttcgaatttgctatggattaacatatccgatcaataatatatttacctagaaattagcggagcacaaaccttccaattctgcgtggatttaacaatgaattaaagagaaaagtagtatgatggaaaatgtttctttataaatttttgagaaaaaaaaaaatataacgacacgcacatgtctatagcttaactattcatttggaaaaaatattaattacatcgtctcatggaaataattatatatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctagcttcttggtgcgagctaacactcgccatcatccccacgatccattaA-------TACA-------TATATTA-TATTT-TAATG-TGT---TTAT-ACTAAA--CGCTAGTa
gi|6 : TTAAATTCT-GG-T-ACT-CGC--CC---GACT-CAA-TTA-T--T-TCACACCCTTGTTTGCT-------------T-T-AGG--AAAAATCTAGG-GAAC-TT-TAATTC-TTTTGT---G-CG---AAA----A--CCTTCGA--TTTGCCA-TGGATTAAACA-A--TG----C-TCTCTTTTTAAA-C-ATTCGCGCCGATC--TAATA--------------A-TTAGCGGA-C-ACAAAAACCT-TTCCA--AT-TTG--C-ATGGAT---------T----TT-AC--AA-TG--------------A------ATTT-A--AGAA-AA-----GTTG--A-TGAATGAA-AATGCGA-TTTT-TT-A-C-A---T-T--TTG----------A----------------------GA-A-------------AA-A-------A---AT-ATA-AC-G--------------------------A-CAACGG--C-ACA-T-G-TCTATG-C----T--------A---CTA---TCATTTGG--AAA------A---AT-----------A--T-TAATT-T--A-C--G--ATT-C-G--TCTT--CAT-G---GAA--AT-----AA-ATA----------AA---------------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCAATC---TTCAATAG-G-ACATTGAAT--TTT-ATA------TAA--TTC--TGAAAGAGGTATTGATAT---AATAC-TT-GAACTA-TCGCAC-AAACATTAAC--AC-G-CACTGTTGCCT-TTGTGAT--TCAACCA-TA------CAGGTATA-------TACA-------TATATTA-TATTT-T---G-TGCT--TTAT-ACTAAA--CGCTa
gi|7 : TTAAATTCT-GG-T-ACT-CGC--CC---GACT-CAA-TTA-T--T-TCACACCCTTGTTTGCT-------------T-T-AGG--AAAAATCTAGG-GAAC-TT-TAATTC-TTTTGT---G-CG---AAA----A--CCTTCGA--TTTGCCA-TGGATTAAACA-A--TG----C-TCTCTTTTTAAA-C-ATTCGCGCCGATC--TAATA--------------A-TTAGCGGA-C-ACAAAAACCT-TTCCA--AT-TTG--C-ATGGAT---------T----TT-AC--AA-TG--------------A------ATTT-A--AGAA-AA-----GTTG--A-TGAATGAA-AATGCGA-TTTT-TT-A-C-A---T-T--TTG----------A----------------------GA-A-------------AA-A-------A---AT-ATA-AC-G--------------------------A-CAACGG--C-ACA-T-G-TCTATG-C----T--------A---CTA---TCATTTGG--AAA------A---AT-----------A--T-TAATT-T--A-C--G--ATT-C-G--TCTT--CAT-G---GAA--AT-----AA-ATA----------AA---------------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCAATC---TTCAATAG-G-ACATTGAAT--TTT-ATA------TAA--TTC--TGAAAGAGGTATTGATAT---AATAC-TT-GAACTA-TCGCAC-AAACATTAAC--AC-G-CACTGTTGCCT-TTGTGAT--TCAACCA-TA------CAGGTATA-------TACA-------TATATTA-TATTT-T---G-TGCT--TTAT-ACTAAA--CGCTtag
gi|8 : TTAAATTCT-GG-T-ACT-CGC--CC---GACT-CAA-TTA-T--T-TCACACCCTTGTTTGCT-------------T-T-AGG--AAAAATCTAGG-GAAC-TT-TAATTC-TTTTGT---G-CG---AAA----A--CCTTCGA--TTTGCCA-TGGATTAAACA-A--TG----C-TCTCTTTTTAAA-C-ATTCGCGCCGATC--TAATA--------------A-TTAGCGGA-C-ACAAAAACCT-TTCCA--AT-TTG--C-ATGGAT---------T----TT-AC--AA-TG--------------A------ATTT-A--AGAA-AA-----GTTG--A-TGAATGAA-AATGCGA-TTTT-TT-A-C-A---T-T--TTG----------A----------------------GA-A-------------AA-A-------A---AT-ATA-AC-G--------------------------A-CAACGG--C-ACA-T-G-TCTATG-C----T--------A---CTA---TCATTTGG--AAA------A---AT-----------A--T-TAATT-T--A-C--G--ATT-C-G--TCTT--CAT-G---GAA--AT-----AA-ATA----------AA---------------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCAATC---TTCAATAG-G-ACATTGAAT--TTT-ATA------TAA--TTC--TGAAAGAGGTATTGATAT---AATAC-TT-GAACTA-TCGCAC-AAACATTAAC--AC-G-CACTGTTGCCT-TTGTGAT--TCAACCA-TA------CAGGTATA-------TACA-------TATATTA-TATTT-T---G-TGCT--TTAT-ACTAAA--CGCTtag
gi|9 : T-AG-T-ATC-CTCG-CC---GACT-AAA-TAT-T--G-T----------TGTGCTA-ACG-TCCAAG-T-TTAGG--AAAT-TC-GGG-AA-C-TC-TAGTTC-TTTTGTT--G-CATATAAA----C--CCTTCGA-TTTTGC-A-TGGATTAAACA-A--TG----CTTCT-TTCTTAAA-CAA--CGCGTCGATC--TAAT-TATTTGTA-CTAGAA-TTAGCGGA-C-ACAAC--CCT-TT-GT--TT-TTG--A-TTGGAT---------T----TTAAC--AAGTGTTGTTTATTTGAAAA------ATTA-G--AGAA-AA-----GTTAGTA-TAAATTAAGAAT--GG-TTCG-TT-ATT-A---T-T--CTA------A---G----------------------AGTA-------------AT-ATAGTATTA---GT-ATATAC-A--------------------------GCC-AC-G--C-ACA-T-G-T------C----T--------A---TTA---TCATTTGG--AAAAAAAATA---AT-----------A--T-AAGTC-C--A-C--C--A-G-C-G--T--T--CAG-A---GGA--AT-----AA-ATA----------AAGT---------AT-ACTATGTtag
gi|9 : actTCTATT-A-TCA---T-T--TGG------A---A----------------------AA-A-------------AA-AT------A---AT-ATA-A-----------------------------------------------G-T------C----C--------A---CCA---GCGTTCAG--AGG------A---AT-----------AAAT-AAAGTAT--A-C--T--A-T---G--TC-TAACGT-GATAGAACAAT-----AG-GNN----------NNNN---------NN-N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCCA-TTTTCAATGGAAA--AACT---TTCAATAGTG-AAA-TGATT-------------------------TG-AGGAGGTATTctaacgtgatagaacaataggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntccattttcaatggaaaaactttcaatagtgaaatgatttgaggaggtatta
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): TACTATCGTCTCATGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG
Unaligned ( gi|42 ): CGAACAAAGTTGAACATTGGATGATTATTCGTATTCTTGTATTAACACGTATCGAAGTAGGTTTTATGACTTTCTTAAATATC
Unaligned ( gi|46 ): ACAAAACAAAAAACGCGCCATTTTTTTCTCAAGAACAATTCCTTGAAATC