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Reference ( gi|1 ) : CTGTAAGGAT--C-CCTCC---CACTTACTGT-T-GAAAAGA-AT--G-TGA--ATGGCCTACT-ATCT--CT---------A-TAT----A-GGAAAAT-----CC----ACTCGCCC-C-CA-ATT-TC--T-TAC-TAA------ATAT--A-T---ATT-----AG--G-T----AAT----T-C--GAA-----TA-AACA-ATCGAAAGAGTATCGGA-----AAATATCG---AA--CAG-ACC-CTACTT-TATGGCGGGCTTG-A-AT----------TTCT---------TAG----GGT-GG-GCCT-----CATAGGGGTC--CC--A---C---TC-C-CAATT--ACTGTG-TAAAA--GATG-G-AAT---G--G--ATGGTAT-C-TATC--GTCT--------GAA------G-TAT-AGGA-ACT--CCACTCCCC-C-A-T-TTC--T-A-C-T-AT--ATCAGAT-ATA-T-T----A--A-AC--T-G----G--T-A-ATTT-AT--CG---AA--------T-A-AA-C-AT-CGGG-----TTCTT--------GG---A-A-TATCGAA------GCCC----CTTAC--T-TAGGGG-GC--TG--AAA----------T-T-TCTA--------------GGGT--GG-G-CT-C-TA--GG-G--CTC--CCCA--CTC-C--CA--TTTACGGTGAAAAAA-GATA-GTGGAGGT------TACG-TATCATGCT-T---CA--T-GA-GATAT--------G-----GAAAT--CCACTCCCCCCATTT---C--TACACTAAT---TAA-TATT-AGATTATGTCAGAGTCTTACAAAGTTCGAAA--ATT--------AT--AAAC-A-TCG-GCG-----TTCCGG-A-----AAATA-ATCGAAAGACCCCTTA-ACTT------AGTAGGGCTCCTGAAAT--TTCTA--------------GGGTTGGGCCTCT-A-G----G-GTCCCTC--TTCC---C--TTATC-TTGGT-TGATAAAGAT---ATCCGG-TGATGGTA-ACTATCT--CTAGTA-------T------AGAA-AAT------CCA------CTCC---CTCCATT---TCGT-C------ACTATA--TA------ATA-TTAT----GG--TGTAA-AAT-T----CGAA---T-A---ACATGCCGAGG-----TTCT-------G-G-AC-ATATCGA--TGACCTCT----CTACTGT-AGGAGGC-TGAAA-T----------TT-----TA-GGT-GAA--------TAGTGCTCTTAG-G-G--TC---CACT-ACCTCT--T-TACTGT---G-AAAAGATGGGTTGATGGTTGAACTGATAGC----GTACTAGAGAGTAAGTCAAGTATAGGAAAATCACAAATCC-CTCCCAC-----CT-ATT---TGA---ACTAC-CTAA-T--AT----------CT--TA-A-G-A--T-----TAG-G-T-AA---TT-C-G---AA-------T-A-AA-C-A-TCG--------GGATC---TCG-GAAATGATGACGAAGACGACTCCGTCTACTT---AGGG-A-C-TG-------AAAAT--TTCT---------TAG-G------TA-GGCCTCTAAGAGGGGT---C----C--C---CT-C---CAC--TAATAATGT--GA--AAA--GA-TGG-T-----GA---TA-G--ACT-ATCT-CATA-------AAT----A-------------T-AG-G--------A-AT--C-----CACT-CC-CCC----CAAT--ATAT---AATA-----AC---T--TATA---T-AATAT-T-T----AG-----G-T-A--AATT-----CG-AA---TA---AAACATTCGGG-T---TTTG-GGAGT----AATATC-GAAGACCCC-TACTT--A----GGGG---G-------ATCT-A-AA--T---T-C-TA-G------G-G--GGG-CCA--TC-GTGGTT----GGG----TCAC-C-ACC---TC----TTACCCGT--GAC-AAAGA-T--GG-TGAT-G-TA-AC-T-ATCT--C---T----TG---AGAAT---A-G-AA-AT--C-----CA-CTCC-CCC--C-ATT--TA----C-TAC-TAT-T-A-TA------ATATT-----AGGTAAAGTT----CG-AAT-A-AA-CA-TCGGGTTC------CG-G-A-AATATCGGA-GACCTATA
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gi|19 : tcTAGGGGT--C-CCTTC---CCCTTACAGT---GAAAAGA-TG--G-TGA---TGG--TACT-ATCT--CT---------
gi|6 : aaatatcgaaggccactacttagggggctggaatttctagggtggtgttcTAAAGGT--CACCTAC---C-TTCACTGT---GATAA-A-AT--GATGATGATACCCTA------T--CT---------A-GTT----T-GCGAGAT-----CC----ACTC--TC-C-CG-ATA-T---T-TAC-TAC--------------T---ATT-----AG--GGT----AAT---------GAA-----AAGAACA--TCGA----GT-TGTGA-----GAA-ATTG---AA----G-TCC-CCAACC-CA--G-GGACATGTA-AT----------TTCT----------AG----GAT-GG-GA-T-----CCTAGGGGTCA-CC--A---A---CC-----ACC--ACTGT--TAAAA--AA---A-AAT---GGTG--ATGGTA--C-CATC---TCT----------A------G-TTT-ACGA-GAT--GCGCTCCCC-
gi|7 : ataattccggataaagatataacagtttcgaagacccagggacctgaaaatattagggtggggtcctagtggtcacctccagccactgtttatttgtgagatctgctttaacgatttatactttactctattaggataagcaaaatgaacattgggttaagagacatcgaaatcccccaccaaggggcctggaatccTAGGTGT--C-CCCTC---CA-TTACTGTGT-AAAATGG-TT--G-AGA--------TAAT-ATCT--TT---------G-TTT----A-GGAGATT-----GC-------CGCCC-C-GG-TTTATA--T-TACATTA------ATAC--A-TTGTATT-----AG--G-T----TAT----TCC--AAA-----TA-AACC-ATCGagatttt
gi|17 : aggcaatcagattttggaacgcagttcgaagtttgcaattcactattcaaaagtgaactgaatctagaacgcagttcgcaattcaaaaaactaaaacagtatatatgtatatttaaaaaccatatatgtgggcacgtgtgcatacacatttgcacatgtatgctcgtgcacacacgtgtttttttctcacccatatgagaaacacataaattataatgtaaagtataataaaatcgttcgtagatatcgaagtgccctacttagggggttgaaatttctaggtggggtctTAGGGGT--CATCTCC---CA-TTACTGT-TAGAAAAGG-----G-TGA--TTG---TACT-ATCT--TC---------A-GTT----G-AGGAGAT-----C--------TGCTC-C-CG-ATT-TCTAT-TAT-TTG------ATAT---------TT-----GG--T-T----AAT----C-A--CAA-----TA-AACggatca
gi|2 : gtccAGGGTTAC-CCCTC---CA-TTATTGT---GAAAA----T--G-TTT--TTTTGCTACT-ATCT--CTT--------G-TTT----A-CGAGA-T-----CC----GCTC--CC-C-CG-GTT-TC--TATTC-TAC------A-----A-T---ATT-----AG--G-TTACTACT----C-C--TAA-----TA-AACG-TT-----GGGT-TCGGA-----AA-TATTA---AAGTC----CC-CTACTC----AGGGAGCTCA-A-AT----------TTCT----------AC----GGT-GG-GG-T-----AGTAGGGGTC--AC--A---CACCCC-C-CCATT--GCTGTG-AAAAA--AATG-G---T---G-----ATGGTA--C-TATC---TCT----------A------G-TTG-AGGA-GAT--TCACTCCCC-CGA-G-TTC--T-A-C-T-CT--AT---A--ACA-T-T----A----------G----G--TTA-ATC------CG---AA--------C-A-AA-C-AT-CGGG-----TTC----------GG---A-AATATCGAA------GTCC----CTTAC--T-CAAGGG-AC--TG--AAA----------T-T-TGTA--------------GGGT--TG-G-TT-C-ttcgggt
gi|3 : aggctgggattttcAT--C-CCTCT---CACC-ACTGT-T-GAAA--A-ATG-G-TGA--TTTGCC-ACA-ATCT--GT---------T-TGT--------GAAGT-----C------CTCTTCC-C-GA-ATC-TT--T-AAC-TAT------AAGT--A-T----TT-----AG--G-T----TAT----T-CCATAA-----TA-AACG-ATCG-------GTCGG-------GATATCG---A----AGTTCC-CTACT----CAG-GGGC-TG-ACAT-------------C---------TAG----TG--GG-GTCT-------TAGG---T--CA--A---C---TC-C---ATT--ATT-TC-CAAAA--T-TG-T-CAC------------GTA--C-TATC---TCT----------A------G-TG--ACGA-GAT--CAGCTCCCC-G-A-T-TTCCTT-A-C-T-AT--A---------A-T-T----A--ATAC--T-A----GGTT-A-AT----C--CA---AA--------T-A-AA-C-TT-CGGG-----TTC----------GG---AGA-TATCGAT------GTCC----ccccgatatctactatatgatactaggttaatccgaataaacatcgggtgtggaaatatccaagtttccctactcagtgggttaaaatttgtagggtggggtcttaggggtcactcccaattatcgtgaagaaatggtgatgtttctctctctagtagaggagttccgcacccccgatttctactatattagggtgtgatgtttctacctctagtagaggagttccgctcccccgatagctaatatattagggtaagctaaataaacatcgggttcagaaataccgaagtcccctactcacggggctgaactttctagcgtgggggcctatgggtcccccctattacgcgtagaaaatgggtgatggtactatcatctagttgaggaagatccgctcgccccgattttatactaatata
gi|20 : caaagtgtgaatctatgatttggaacgccatccgcagttttacaaaaacagtgaactgccaaataaaacgacatgcttcgctatctcaatatatttgacgccctgcggtgactcacatgtatctctgaacatgtgcctctttcttcacccatatgaaaaacctaaatattatacatggttaaagtaaaataaacttgggtccgcagaattgaagtccttaccgaggctgaaattcgaggtttggtctaggggtttc-CCTTC---C-TTCACTGT---GAAAAGA-TG--G-TGA---TGGTACACT-CTCA--CT---------AGTAT----A-GGAGA-T-----CC----ACT--CCC-C-CA-ATA-T---G-TAC-TAT------ATAT----T---ATT-----AG--GTT----AAT----T-C--Gtattca
gi|16 : CCCC---TACTT-TTAT-T-ACGAAGATAT--GGTGA---TGG--TACT-ATTT--TTC--------G-TGT----A-GGAGA-T-----CC----A---GCCCGCACA-ATT-TG--T--AC-TA----------T--A-T---ATT-----A
gi|4 : ggctgaaatttctagggtagggtcctaggcgt--G-TGA---TGG--TACT-TCCC--CT---------AGTAG----A-GGA----------T----ATACGCTC-C-CA-AGTATT--C-TAC-TAT------ATA---A-T---ATT-----TG--GAT----AAT----C-C--ATA-----TA-AACA--TCGG----GT-TCGGA-----AA-TATCG---AA----G-TCTTCTACTCAGATAGC-----TG-A-AA----------TTTC---------TAG----CAT-GG-GGTC-----CA-ATGGGTCATCC------C---GC-C-TAAT---ACCGT---AAAATTGATG---------------ATGGTA--C-AATC---TCT----------A------G-TTG-AGGA-GAT--CCGCTCCCC-C-A-T-TTC--T-A-A-T-AT--AT--AAT-A---------------AT--T-G----G--TTA-ATC------CG---AA--------G-A-AA-C-GT-CGGG-----GTC----------GGT--A-A-TATTGAA------GTCC----CCTAC--T-CAGGGA-GC--TG--AAA----------T-A-TCTG--------------GGGTG-GG-G-GT-C-TA--AG-G--GT-----CA--CCC-G--CA---TTACTGTGAAA-----ATA-ATGG------------CA--ATGGTGCT-A---TA--TCTA-G---T--------T-----GAGAT--CTGCTCCCCCGATTT---C--T--ACTACA---TAA-TATC-AGGTT-----------------AATCCGA---------------AT--AAAC-A-TCA-G-G-----TTCAG--------AAAT--ATCGAAGTGTCCT----ACTA------AG--GGG---CTGAAAT--TTTTA---------------GGTTGGGGTTCT-A-G----G-Gttaggttaa
gi|9 : aa--G-TGA--ATGTCC-ACT-CTTC--CTCACCAATGGA-TAT----G-GAAAAA-------C----ACTTA-------A-ATT--------A---AA------ATGG--G-T---AT------AG--C-T----AA-----------AA-----TA-AAAC-ATCGA----GT-TCCGG-----AAATATCG---AA----G-GCC-CTACTT-TAT---GGGCTGA-A-AT----------TTCT-----------A----GGT-GG-GTC------CA---GGGCC--C-------C---TCAC-CA--T--ACTGTG--AAAA--AA-----AAT---GATG--ATGGTA--C-TATC---TCC--------G--------------------CT--CCG---CCC-C-G-A-TTCAGG-A-C-T-AT--A----AT-A----------A--A-A--------------------------CG---AA--------T-A-AA-C-A--CGG--------CTC--------GGA--A-A-TATCGAAG-----GCCCTGGGCTTAA--TGTAGGGG-AC--T---ATG----------T-T-TCTA--------------GGGT--Ggtcacccagcataactttga
gi|11 : ataaatgccatgcacatatacatgGA--ATGG--TACTCATCT--CT---------A-GAT----A-GGAAATT-----CCC---ACTC--CC-C-CA---T-TT--G-TAC----------ATATTGA-T---ATT-----AG--G-T----AAT----T-T--GAA-----TA-AAAC-ATCG---GGG--TCG-------AAATATCGGAAGA--GAG-ACC-C-ACTA-TAttaaattt
gi|21 : acaccttacgccagattggacCCC-C-CA-ATT-TG--T--AC-AAT------ATATT-A-T---AT-------G--T-T----AAT----T-C--GAA-----TA-AAC--ATCG---GATTA---AA-----AAATACCG---AA---AA-CCC-CTACT----TAGGGGGCTatacagcacagatgataatacttaaaaattcaatcttagaaaagtggtgagccgtgcaaattttctttaggtgggtcatggggtgccgcatcccggttactattgtaaaatgtgtattgtggt
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gi|8 : aggcaatcagattttggaacgcagttcgaagtttgcaattcactattcaaaagtgaactgaatctagaacgcagttcgcaattcaaaaaactaaaacagtatatatgtatatttaaaaaccatatatgtgggcacgtgtgcatacacatttgcacatgtatgctcgtgcacacacgtgtttttttctcacccatatgagaaacacataaattataatgtaaagtataataaaatcgttcgt-----AAATATCG---AA----G-GCC-CCAACT-TA-GG-GGGCTAA-A-AT----------TTC----------TAG----GGT-GGAGTCT-----TATGGa
gi|3 : cggaaataccgaaggccccaacttaggggacagaatattctagggtgtggtcctaggggtccctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacatcgggttcagGGCT-G-A-AA----------TTCG----------AG----GTT-TG-GTCT--------AGGGGTT--TC--ATCCC---TC-T-CA-CC--ACTGT--TGAAA--AATG-G--------------TGATTTGC-CACA--ATCT--------G----------TTT-GTGA-AGT--CCTCTTCCC-G-AAT-CTT--T-AAC-T-AT--A--AG-T-AT--T-T----A----------G----G--T-T-ATTCCAT-------AA--------T-A-AA-CGAT-CGG---------TC--------GG---G-A-TATCGAA------GTTC----CCTAC--T-CA-GGG-GC--TG--ACA--------------TCTA----------------GT--GG-G-GT-CTTA--GG---------TCAA--CTC-CATTA--TTTCC--------AA-AAT---T----GT------CACG-TACTAT-CT-C---TA----GT-GAC----------------GAGAT--CAGCT-CCCCGATTT---CCTTACTATAAT---TAA-TACT-AGGTTA
gi|16 : caaagtgtgaatctatgatttggaacgccatccgcagttttacaaaaacagtgaactgccaaataaaacgacatgcttcgctatctcaatatatttgacgccctgcggtgactcacatgtatctctgaacatgtgcctctttcttcacccatatgaaaaacctaaatattatacatggttaaagtaaaataaacttgggtccgcagaattgaagtccttaccgaGGCTGA-A-AT----------TTCT----------AG----GGTAGG-G--T-----CCTAGGCGTC--CCCTA---C---TT-T-TA-TT--AC-------GAA--GAT-----AT---G--GTGATGGTA--C-TATT--TTTC--------G----------TGT-AGGA-GAT--CCAGCCCGCAC-AAT-TTG--T-A-C-T-AT--AT---AT--TA-T-T----A--atccaaataaacttcgggttcggagatatcgatgtcctattca
gi|2 : AG----GCT-GG-GATT-----TTCAGGGTTA--CC--C---C---TC-C---ATT--ATTGTG-AAAAT--GTT------T---T--T--TTGCTA--C-TATC---TCT--------T--------G-TTT-ACGA-GAT--CCGCTCCCC-C-GGT-TTC--T-A-T-T-CT--A-CA----ATA-T-T----A--G-GT--T-A----C--T-A-CTC------CT---AA--------T-A-AA-C-GT-TGGG-----TTC----------GG---A-AATATTAAA------GTCC----CCTAC--T-CAGGGA-GC--TC--AAA----------T-T-TCTA--------------CGGT--GG-G-GTAG-TA--GG-G--GTCA-CACACCCCC-C--CA---TTGCTGTGAAAAAA--ATG-GTGATGG-------TAC--TATC-T-CT------------A-GTTGA--------G-----GAGAT--TCACTCCCCCGAGTT---C--TACTCTA-----TAA-CATT-AGGTT-----------------AATCCGA---------------AC--AAAC-A-TCG-G-G-----TTC--G-G-----AAAT--ATCGAA--GTCCCTT--ACTC------A--AGGG--ACTGAAAT--TTGTA--------------GGGTTGGggttaa
gi|6 : -GG-GCCTGGAATCCTAAAGGTC--AC------C---TA-C-C--TTC-ACTGTGATAAAAT-GATG---------------ATGATAC-CCTATC-----T----------A------G-TTT-GCGA-GAT--CCACTCTCC-CGA-T-ATT--T-A-C-T-AC-----------TA-T-T----A--G-------G----G--T-A-AT--------G---AA--------A-AGAA-C-AT-CGAG-----TTGTG--------AG---A-A--ATTGAA------GTCC----CCAAC--C-CAGGGA-CA--TG--TAA----------T-T-TCTA--------------GGAT--GG-G-ATCC-TA--GG-G--GTCA-CCAA--CCA-C--CA--CT---GTTAAAAAAA-AATG-GTGATGGT------ACCA-TCTC-TAGT-T---TA--C-GA-GATG-----------------------CGCTCCCCAGATTT---ttcccccgatatctactatatgatactaggttaatccgaataaacatcgggtgtggaaatatccaagtttccctactcagtgggttaaaatttgtagggtggggtcttaggggtcactcccaattatcgtgaagaaatggtgatgtttctctctctagtagaggagttccgcacccccgatttctactatattagggtgtgatgtttctacctctagtagaggagttccgctcccccgatagctaatatattagggtaagctaaataaacatcgggttcagaaataccgaagtcccctactcacggggctgaactttctagcgtgggggcctatgggtcccccctattacgcgtagaaaatgggtgatggtactatcatctagttgaggaagatccgctcgccccgattttatactaatata
gi|17 : ataattccggataaagatataacagtttcgaagacccagggacctgaaaatattagggtggggtcctagtggtcacctccagccactgtttatttgtgagatctgctttaacgatttatactttactctattaggataagcaaaatgaacattgggttaagagacatcgaaatcccccaccaagT-----CCTAGGGGTC--AT------C---TC-C-CA-TT--ACTGT--TAGAA--AAGG-G---T---G-----ATTGTA--C-TATC--TTC-----------A------G-TTG-AGGA-GAT--CTGCTCCCG---A-T-TTC--T-A-T-T-AT--TT--GAT-AT---------------T--T-G----G--T-T-A----AT--CAC--AA--------T-A-AA-C-TT-CGGG-----Tt
gi|5 : gTAGGGGTC--CC------C---TCGCGCGCTT--A-TGTG-GAAAAT-GATAAG-TGT---G--G--GTACTAT-C-TACCTAGTATTTTAATGGGAAATTTTCG-CCT-AGGA-G-T--CC-CCCCCC-C-A-T-TTC--T-A-C-TAATGGATTATATAATA-T-TTTCAG--A-GCTGT-G----A--T-A-ATT---T--CG---AAGTGTATG-T-A-TA-T-AT-CAAG-----TTTTTCGGATTCGGA---A-A-TATCAAA------GGCC----CCTACTTT-TAGGGG-GT--TG--GGATATCAAGATGT-T-TCTAACTATGTGTAGACCGGGTTGGG-G-CT-C-TA--GG-----TC--CC----CTC-C--CGGTTCTACTGTG--AAAA-GAT---TG------------ATG-TACTAT-CT-TTAGTA--C-GAGGGTTT--------GA----GTAATG-CCACT-CCCCCA-TT---C--TACAT---------A-TAGG-AGA----GACA----CTTAGGAAGGT---AA--ATTTTCGGCGAAT--AAAC-ATTCG-GGGTCAGTTTGTGGTA-----TAAT--ATCG-AAGGCCCCT---ACTT------AG
gi|10 : tc--A---C---TC-C-CA-TC--ATTGTG--AAAA--AACG-C-AACCCGGT-G--ATGGTA--C-TATC---TCT----------A------G-T-T-GTG--------CAT----C-C-A-T-TTT--T-----T-GT---TCAAAT-GCA-C-T----A--C-TC--TTG----G--T-------------G---AG--------T-G-AA-C-TT-TGGG-----TT--T--------GG---A-AATACCAAATAACTCGCCC-------------TAGGGC--C--TA--AAA----------T-T-TCGA--------------GGGT--gggtgcggtggaaaatgtatcgcgggtgtgct
gi|20 : attagtggtaaTC--ACTGTG--AAAA--GATG-G---T---G-----ATGGTACAC-TCTC--A-CT----------A------G-TAT-AGGA-GAT--CCACTCCCC-CAA-T-ATG--T-A-C-T-AT--AT---AT--TA-T-T----A--aaaatattagtggtgaactcgtaccactgaaaaaatggtgatggtactttctctaatttgtggtggagatctgtccctctaatgcttggtcataaatcattag
gi|11 : ccttcctA--GATT-G-GAC---G--A--ATGGTAC-T-CATC---TCT----------A------G--AT-AGGA-AATTCCCACTCCCC-C-A-T-TTG--T-A-C---AT--ATTG----ATA-T-T----A----------G----G--T-A-ATTT------G---AA--------TAA-AA-C-AT-CGGG-----GTC----------GA---A-A-TATCGGA------ggttaattcg
gi|4 : acaccttacgcc--G--ATGGTA--C-T-TC--CCCT----------A------G-TAG-AGGA-TAT--ACGCTCCCA-A-G-TATTC--T-A-C-T-AT--AT---A--ATA-T-T-------------T-G----GA-T-A-ATCC-AT--------A--------T-A-AA-C-AT-CGGG-----TTC----------GG---A-AATATCGAA------GTCT----TCTAC--T-CAGATA-GC--TG--AAA----------T-T-TCTA--------------GCAT--GG-G-GT-C-CAATGG-G---TC--ATCC--CGC-C--TA---ATACCGT-AAAATT-GATG-ATGG----------TACA--ATC-T-CT------------A-GTTGA--------G-----GAGAT--CCGCT-CCCCCATTT---C--TA-A-TATA---TAA-TAAT-TGGTT-----------------AATCCGAAG-----------------AAAC-G-TCG-GGG-----T--CGG-------TAAT--ATTG-AAGTCCCCT---ACTC------AG-GGAG---CTGAAAT--ATCTG--------------GGG-TGGGGGTCTAA-G----G-GTCACCC----GC---A--TTA---CTG---TGA-AAATA----AT--GG-CAATGGT--GCTATAT--CTAGTT-------G------AG----AT------CTG------CTCC---CCCGATT---TC---T------ACTACA--TA------ATA-TCA-----GG--T-T---AAT-C----CGAA---TAA---ACAT-C--AGG-----TTC--------A-G-AA-ATATCGAAGTG---TC-----CTAC--T-AAGGGGC-TGAAATT----------TT-----TA-GGT------------TGGGGTTCTAGG-G-G--TC---agagagacccactataatacagcacagatgataatacttaaaaattcaatcttagaaaagtggtgagccgtgcaaattttctttaggtgggtcatggggtgccgcatcccggttactattgtaaaatgtgtattgtggt
gi|21 : aagtCCCC-A-A-T-TTG--T-A-C-----------AAT-ATA-T-T----A--T-A---T-G----T--T-A-ATT------CG---AA--------T-A-AA-C-AT-CGGA-----TTAA---------AA---A-A-TACCGAA------AACC----CCTAC--T-TAGGGG-GC--TG--acccagcataactttga
gi|7 : c-T-TTC--TCA-C-CCAT--ATGAGAA-ACA-CAT----A--A-AT--T-ATAATG--T-A-AAGT-AT-------AA--------T-A-AA---AT-CG-------TTCGT--------AG---A---TATCGAA------GTGC----CCTAC--T-TAGGGG-GT--TG--AAA----------T-T-TCTA---------------GGT--GG-G-GT-CTTA--GG-T--GTC--CCC-----T-C--CA---TTACTGTGTAAA----ATG-GTTGAGAT------AA---TATCTTTGT-T---TA--G-GA-GAT-T--------G------------CCG---CCCCGGTTTATAT--TACATTAATACATTG-TATT-AGGTTATTCCAAA
gi|12 : aggcaatcagattttggaacgcagttcgaagtttgcaattcactattcaaaagtgaactgaatctagaacgcagttcgcaattcaaaaaactaaaacagtatatatgtatatttaaaaaccatatatgtgggcacgtgtgcatacacatttgcacatgtatgctcgtgcacacacgtgttttCATAT-GTG-T-G----A--A-AC--A-C----C--T-A-ATTT-ATATCG---AAACACAAAAT-A-AA-C-AT-CGGG-----ATCGC--------AG---A---CATCGAA------ATCC----CCTAC--A-CAGGGA-TC--TG--AAA----------T-G-TCTT--------------GGGTG-GG-G-TT-T-TA--AG-G--GTCA-CTTA--CCA-C--CA--CT---GTCGAAAAAtaaaccatcgggatca
gi|9 : aatgcacatataattatttgtgcaggtgagcgcacgcgtatcttctcgccT-AAA-T-T----A--A-AA--T-G----GG-T-ATAGCT-A----A---AA--------T-A-AAAC-AT-CGAG-----TTCCG--------GA---A-A-TATCGAA------GGCC----C-TAC--T-TTATGG-GC--TG--AAA----------T-T-TCTA---------------GGT--GG-G--T-C-CA--GG-G--CCC--CTCA------C--CA----TACTGTGAAAAAA-AATG-ATGATGG-------TAC--TATCtggttatgataccaattctagtttgcaagatcagccccccacttttt
gi|3 : ataaatgccatgcacatatacatggtgaatgtccactcttcctcaccaatggatatggaaaaacact-ATA-T-T----A--T-ACA-T-G----G--TTA-AAGT-A----A---AA--------T-A-AA-C--T-TGGG-----TCCGC--------AG---A-A-T--TGAA------GTCC-----TTAC--C----GAG-GC--TG--AAA----------T-T--CGA--------------GGTT--TG-G--T-C-TA--GG-GGTTTCATCCCT--CTCAC--CA--CT---GTTGAAAAA--------TGGTGAT------T---------TGCC-A---CA--------ATCT--------GTTTGTGAAGT--CCTCTTCCCGAATCT---T--TA-ACTA-----TAAGTATTTAGGTTATTCCA------TA-------------------------AT--AAACGA-TCG-G--------TCGGG-A--------TA--TCGAA-GTTCCCT---ACTC------AG--GGGCT---GACAT----CTA--------------GTG--GGGTCT-T-A-G----G------TCAACTCC---A--TTATT-TC-------CAAAATT---GTCACG-T--------ACTATCT--CTAGTG--------------ACGA-GAT------CAG------CTCC---C-CGATT---TCCT-T------ACTATAATTA------ATA-CTA-----GG--T-T---AAT-C----CAAA---T-A---A-ACTTCG-GG-----TTC--------G-G-AG-ATATCGA--TGTCCTtccgctccgccccgattcaggactataataaaacgaataaacacggctcggaaatatcgaaggccctgggcttaatgtaggggactatgtttctagggtgttaaattt
gi|6 : caaagtgtgaatctatgatttggaacgccatccgcagttttacaaaaacagtgaactgccaaataaaacgacatgcttcgctatctcaatatatttgacgccctgcggtgactcacatgtatctctgaacatgtgcctctttcttcacccatatgaaaaacctaa---AA--------T-G-AA-C-AT-TGGG-----TTA----------AG---AGA-CATCGAA------ATCC----CCCAC--C-AAGGGG-CC--TG--GAA----------T-C--CTA-------------------------------A--AG-G--TCA--CCTA--CC---------TTCACTGTGATAAAATGATG-ATGA----------TACCCTATC-TAGT-T---TG--C-GA-GAT-----------------------CCACTCTCCCGATAT---T--TAC---------TAC-TATT-AGG----------GT-------AAT--GAAA--A--------------GAAC-A-TCG-A-G-----TTGTGA-G-----AAAT----TGAA-GTCCCC--A-ACCC------AG--GGAC--ATGTAAT--TTCTA--------------GGATGGGATC-CT-A-G----G-GGTCACC--AACC---A--CCA-C-T--GT-TAAAAAAAA----AT--GG-TGATGGTA--CCATCT--CTAGTT-------T------ACGA-GAT------GCG------CTCC---Cattca
gi|18 : ataattccggataaagatataacagtttcgaagacccagggacctgaaaatattagggtggggtcctagtggtcacctccagccactgtttatttgtgagatctgctttaacgatttatactttactctattaggataagcaa--------T-A-AA-C-AT-CGGG-------CTA--------GG---A-AATATCAAA------GGAC----CCTAC--T-TAGGGG-AC--AG--AAA----------A-T-TCTA--------------GGGT--GG-GTTT-T-TA--GC-G--GTC--CC----CTT-C--TA---TTACTGTG--AAAA-GATG-GTGcagatttt
gi|8 : -AA-C-AT-CGGG-----TTCA---------GA---A-A-TATCGAA------GGCC----CCAAC--T-TAGGGG-GC--TA--AAA----------T-T-TCTA--------------GGGT--GG-A-GT-C-Tatgg
gi|19 : cggaaataccgaaggccccaacttaggggacagaatattctagggtgtggtcctaggggtccctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn---A-A-TATCGAA------GGCC----ACTAC--T-TAGGGG-GC--TG--GAA----------T-T-TCTA--------------GGGT--GGTG-TT-C-TA--GG-G--GTC--CC----TTC-C--C---CTTACAGTG--AAAA-GATG-GTGATGG-------TAC--TATCtatgg
gi|16 : aG-GC--TG--AAA----------T-T-TCTA--------------GGGTA-GG-G-TC-C-TA--GGCG--TCC--CCTA--CTT-T--TA---TTACG-------AA-GATA--TGGTGAT--------GG-TACTATTTT-T---CG--T-G----TA---------G-----GAGAT--CCAGCCCGCACAATT------TGTACTATA---TAT-TATT-AGGTTAtct
gi|5 : T-C-TA--GG-G--GTC--CCCT--CGC-G--CG--CTTATG-TGGAAAAT-GATAAGTGTGGGTACTATCTACC-TAGTAT-TT-T---AA--T-GG-GAAATTTTCGCCTA-----GGAGT--CC--CCCCCCCATTT---C--TAC--TAATGGATTA-TATA-ATATT-T-TCAGAGCTGTGATAATTTCGAAG--TGT--------ATGTATAT-A-TCAAGTT-----TTTCGG-ATTCGGAAATA--TC-AAAGGCCCCT---ACTTTTAGGGGGTTGGGATATCAAGATGTTTCTAACTATGTGTAGACCGGGTTGGGGCTCT-A------G-GTCC--C--CTCC---CGGTTCTA-CTG---TGA-AAAGAT----------TGAT-GT--ACTATCT--TTAGTACGAGGGTT------TGAGTAATG-----CCA------CTCC---C-CCATT------C-T------AC-ATA--TAGGAGAGACACTTA-----GGAAGGTAA-ATT-TTCGGCGAA---TAA---ACAT-TCGGGGTCAGTTTGT-------G-GTATAATATCGA--AGGC--CC----CTACT-T-AGGGGa
gi|17 : -C-TA--GG-G--GTC--ATC----TC-C--CA--TT-ACTGTTAGAAAA-G------GGTGAT------T--G-TACTAT-CT-T---CAGTT-GA-G------------------GAGAT--CTGCTCCCG--ATTT---C--T--ATTATT---TGA-TATT-TGGTTAtgcggtggaaaatgtatcgcgggtgtgct
gi|20 : gtc--CTT-C--C---TTCACTGTGAAAA---GATG-GTGATGGT---------------ACACTCT---CA--C-TA-G-TATA-------G-----GAGAT--CCACTCCCCCAATAT---G--TACTATA-----TAT-TATT-AGGTTAatcacaataaacttcgggt
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gi|2 : acaccttacgccagattggacgaatggtactcatctct-----GAGAT--CCGCTCCCCCGGTTT---C--TATTCTA-----CAA-TATT-AGGTTAC----------TAC----TCCTAA---------------T--AAAC-G-TTG-G-G-----TTC--G-G-----AAATA-TT--AAAGTCCCCT---ACTC------AG-GGAGCTC---AAAT--TTCTA--------------CGGTGGGG----T-A-GTAGGG-GTCACACA-CCCC---C--CCAT---TGCTGTGAAAAAAAT-------GG-TGATGGTA--CTATCT--CTAGTT-------G------AGGA-GAT------TCA------CTCC---CCCGAGT---TC---T------ACTCTA--TA------ACA-TTA-----GG--T-T---AAT-C----CGAA---CAA---ACAT--CG-GG-----TTC--------G-G-AA-ATATCGA--AGTCC-CT-----TACT-C-AAGGGAC-TGAAA-T----------TTG----TA-GGgagacccactataatacagcacagatgataatacttaaaaattcaatcttagaaaagtggtgagccgtgcaaattttctttaggtgggtcatggggtgccgcatcccggttactattgtaaaatgtgtattgtggt
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gi|20 : gtcC--TTCC---T--TCAC---TG---TGA-AAAGAT-------GG-TGATGGTACACTCTCA--CTAGTA-------T------AGGA-GAT------CCA------CTCC---CCCAATA---T-GT--------ACTATA--TA------TTA-TTA-----GG--T-T---AAT-T----CGtcacaataaacttcgggt
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gi|9 : aggcaatcagattttggaacgcagttcgaagtttgcaattcactattcaaaagtgaactgaatctagaacgcagttcgcaattcaaaaaactaaaacagtatatatgtatatttaaaaaccatatatgtgggcacgtgtgcatacacatttgcacatgtatgctcgtgcacacacgtgtttttttctcacccatatgagaaacAT----GG---GTAT-AGC-T----AAAA---T-A---AAACATCGAG------TTCC-------G-G-AA-ATATCGA--AGGCC-------CTACTTT-ATG-GGC-TGAAA-T----------TTC----TA-GGT-GG-----------GTCC----AG-G-G--CC---CCTC-ACCA------TACTGT---G-AAAAAAAATGATGATGGTa
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gi|12 : aggctgggattttcagggttacccctccattattgtgaaaatgtttttttgctactatctcttgtttacgTCT-CGCCCAT-----AT-GTG---TGA---AACAC-CTAA-TTTAT----------AT--CG-A-A-A--C---------A-C-AA------------AA-------T-A-AA-C-A-TCG--------GGATC---GCA-GACAT-----CGAAA-----TCC-CCTACAC---AGGG-ATC-TG--------AAAT--GTCT---------TGG-G------TG-GGGTTTTAA---GGGT---C----A--C---TTAC---CAC-----CACTGT--CG--AAA--AA-TGG-T-----TA---Tttggttcccccgatatctactatatgatactaggttaatccgaataaacatcgggtgtggaaatatccaagtttccctactcagtgggttaaaatttgtagggtggggtcttaggggtcactcccaattatcgtgaagaaatggtgatgtttctctctctagtagaggagttccgcacccccgatttctactatattagggtgtgatgtttctacctctagtagaggagttccgctcccccgatagctaatatattagggtaagctaaataaacatcgggttcagaaataccgaagtcccctactcacggggctgaactttctagcgtgggggcctatgggtcccccctattacgcgtagaaaatgggtgatggtactatcatctagttgaggaagatccgctcgccccgattttatactaatata
gi|5 : aatgcacatataattatttgtgcaggtgagcgcacgcgtatctCC-CCCCCATTT---CT-ACTAA-TGG---ATTAT-ATAA-T--AT----------TT--TC-A-G-AGCT-----GTG-A-T-AA---TTTC-G---AAGTGTATGT-A-TA-T-A-TCAAGTTTTTCGGAT----TCG-GAAAT-AT--CAAAGGC----CC--CTACTTTTAGGGG-G-T-TGGGATATCAAGATGTTTCTAACTATGTGTAG-ACCGGGTTG-GGGCTCTA-----GGT---C----C--C---CT-C---C-CGGTTCTACTGT--GA--AAA--GA-T---T-----GA---TG-T--ACT-ATCT---TT-------AGT----A-------------CGAG-GGTTTGAGTA-ATG-C-----CACT-CC-CCCATT-CTAC--ATAT---AGGAGAGACAC---T--TAGG--------A---------AG-----G-T-A--AATTTTCGGCG-AA---TA---AA-CATTCGGGGTCAGTTTGTGGTAT----AATATC-GAAGGCCCC-TACTT--A----GGGG---gataccaattctagtttgcaagatcagccccccacttttt
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gi|19 : cggaaataccgaaggccccaacttaggggacagaatattctagggtgtggtcctaggggtccctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCTACTT---AGGG-GGC-TG-------GAA-T--TTCT---------AGG-G------TG-GTGTTCTA---GGGGT---C----C--C---TT-C---CCC--TTACA--GT--GA--AAA--GA-TGG-T-----GA---TG-GT-ACT-ATCT-Cagtcttatgg
gi|16 : aaatatcgaaggccaG-G-C-TG-------AAA-T--TTCT---------AGG-G------TA-GGGTCCT---AGGCGT---C----C--C---CT------AC--TTTTATTAC--GA--AGA--TA-TGG-T-----GA---TG-GT-ACT-ATTT---TT-------CGT----G-------------T-AG-G--------AGAT--C-----CAGC-CC-GCA----CAAT--TTGT---A-------------C--TATA---T-ATTA--T-T----AG-----G-T-T--AAt
gi|5 : AGGGGT---C----C--C---CT-CGCGCGC--T--TA-TGT--GG--AAA---A-TGA-T-----AAGTGTG-GGTACT-ATCTACCTAGTATTTTAAT----GGGAAATTTTCGCCT-AG-G--------A-GT--C-----C----CC-CCC----CCAT--TTCT---ACTA-----ATGGAT--TATA---T-AATAT-T-TTCAGAGCTGTGA-T-A--ATTT-----CG-AAGTGTATGTATATATCAAGT-T---TTTC-GGATTCGGAAATATC-AAAGGCCCC-TACTTTTA----GGGG---GTTGGGATATCA-A-GA--TGTTT-C-TA-ACTATGTG-T--AGA-CCGGGTT-GGGGCTCT--AGG----TCCC-C-TCCCGGTT----CTACT-GT--GA--AAAGA-T-----TGAT-G-TA--C-T-ATCT--T---TAGTACG---AGGGTTTGA-G-TA-ATG-C-----CA-CTC--CCC--C-ATT--------C-TAC--A--T-A-TAGGAGAGACACTTAGGAAGGTAAATTTTCGGCG-AAT-A-AA-CATTCGGGGTCAGTTTGTG-GTATAATATCGAA-GGCC
gi|17 : tctAGGGGT---C----A--T---CT-C-----C--CATTACTGTTAGA--AAA--G---GG-T-----GA---TT-GT-ACT-ATCT---TC-------AGT----T-------------G-AG-G--------AGAT--C-----TGCT-----CC----CGAT--TTCT---A-------------T--TATT---T-GATAT-T-T-----G-----G-T-T--AATC-----AC-AA---T----AAAC-TTCGGG-T---cctacttaggggtgcggtggaaaatgtatcgcgggtgtgct
gi|2 : gtcctGGGTTA-C----C--C---CT-C---CAT--TA-T--TGT--GA--AAA-----TGT-TTTTTTGC---TA-----CT-ATCT-CTTG---------T----T-------------T-AC-G--------AGAT--C-----CGCT-CC-CCC-----GGT--TTCT---A-------------T--TCTA---C-AATAT-T------AG-----G-TTACTACTC-----CT-AA---TA---AA-CGTT-GGG-T---TC---GGA------AATATT-AAAGTCCCC-TACTC--A----GGGA---G-------CTCA-A-AT--T---T-C-TACG------GTG--GGG------TA-GTAG------GGG----TCACAC-ACC---CCCCCATTGCT-GT--GAA-AAAAA-T--GG-TGAT-G-GT-AC-T-ATCT--C---TAGT-TG---AG--------G-AG-AT--T-----CA-CTCC-CCC--G-AGT--T-----C-TAC-T-C-T-A-TA------ACATT-----AGGTTAA-TC----CG-AAC-A-AA-CA-TCGGGTT-------CG-G-A-AATATCGAA-GTCC
gi|6 : aggctgggattttca--C---CT-T---CAC--TG-TGAT-----A--AAAT-GA-TGA-T-----GA---TA-C--CCT-ATCT------------AGT----T-------------T-GC-G--------AGAT--C-----CACT-CT-CCC-----GAT--AT-------------------T--TAC----T-ACTAT-T-A----GG-----G-T-A--A--------TG-AA---AA---GAACAT-CGAG-T---TGTG-AGAA--------ATT-GAAGTCCCC-AACCC--A----GGGA---C-------ATGT-A-AT--T---T-C-TA-G------G-AT-GGG---A--TC-CTAG------GGG----TCAC-C-AAC---CA----CCA-CTGTTAAAA-AAAAA-T--GG-TGAT-G-GT-AC-C-ATCT--C---T---------AGTTT---ACG-AG-AT--G-----CG-CTCC-CCA--G-ATT--Tcttactcaagggactgaaatttgtagggttggttcccccgatatctactatatgatactaggttaatccgaataaacatcgggtgtggaaatatccaagtttccctactcagtgggttaaaatttgtagggtggggtcttaggggtcactcccaattatcgtgaagaaatggtgatgtttctctctctagtagaggagttccgcacccccgatttctactatattagggtgtgatgtttctacctctagtagaggagttccgctcccccgatagctaatatattagggtaagctaaataaacatcgggttcagaaataccgaagtcccctactcacggggctgaactttctagcgtgggggcctatgggtcccccctattacgcgtagaaaatgggtgatggtactatcatctagttgaggaagatccgctcgccccgattttatactaatata
gi|20 : ataattccggataaagatataacagtttcgaagacccagggacctgaaaatattagggtggggtcctagtggtcacctccagccactgtttatttgtgagatctgctttaacgatttatactttactctattaggataagcaaaatgaacattgggttaagagacatcgaaatcccccaccaaggggcctggaatcctaaaggtcaccta--C---CT-T---CAC--T------GT--GA--AAA--GA-TGG-T-----GA---TG-GT-ACA-CTCT-CACT-------AGT----A-------------T-AG-G--------AGAT--C-----CACT--C-CCC----CAAT--ATGT---A-------------C--TATA---T-ATTA--T-T----AG-----G-T-T--AATT-----CG-t
gi|11 : ccttA-TGG-T----------------ACTCATCT-C-TA-------GAT----A---------------GG-A--------A-ATTCC-----CACT-CC-CCC------AT--TTGT---A---------C---A--TAT----T-GATAT-T------AG-----G-T-A--A-TT-----TG-AA---TA---AAACATCGGGG-T---C-----GA------AATATCGGAAGA
gi|22 : acaccttacgccagattggacgaT-CTTA-------GAT------------------T-AG-G--------A-AT--CTTCCCCCCC-CC-CCT----CATT--GTAT---GAT-------C---TACTATA---T-AATAT-T------AG-----G-T-A--AATT-----CG-AA---TA---TAAAATTgagacccactataatacagcacagatgataatacttaaaaattcaatcttagaaaagtggtgagccgtgcaaattttctttaggtgggtcatggggtgccgcatcccggttactattgtaaaatgtgtattgtggt
gi|9 : -CATA-------TAC----A-------------T-GGTG--------A-ATGTC-----CACT-CT-TCCTCACCAATGGATATGGAAAAAC----AC---T--TAAA---TTAAAAT--------GG-----G-T-AT-AGCT-----AA-AA---TA---AAACAT-CGAG-T---TCCG-GAA-------ATATC-GAAGGCCC--TACTTT-A----TGGG-------------CT-G-AAATT---T-C-TA-G------G-T--GGGTCCA---------------GGGCCCCTCAC-C-A------------TACT-GT--GAA-AAAAAAT--GA-TGAT-G-GT-AC-T-ATC---------------------------------T--C-----CG-CTCCGCCC--CGATT--CA----G-GAC-----T-A-TA------ATA-----------AAA-------CG-AAT-A-AA-CA--CGGCT--------CG-G-A-AATATCGAA-GGCC
gi|7 : ataaatgccatgcaCT-CA-CCC------AT--ATGA---GA-A-----AC-------ACA---T-AA-AT-TAT----AAT----G-T-A--AAGT-----AT-AA---TA---AAA---TCG--------TTC-GTAG------ATATC-GAAGTGCCC-TACTT--A----GGGG---G--------TTG-A-AAT-T---T-C-TA-G------GTG--GGG-TC----------TT----AGG----TGTC-C--CC---TCCA--TTA-CTGT--G-T-AAA-A-T--GGTTGAG-A-TA-A--T-ATCT------T----TGTTTAG--------G-AG-AT--------TG-CCGC-CCC--G-GTTTATA----T-TAC--AT-TAA-TACATT--GTATT-----AGGT-TATTC----CA-AAT-A-AACCA-TCGGGATC------ctgggcttaatgtaggggactatgtttctagggtgttaaattt
gi|21 : aggcaatcagattttggaacgcagttcgaagtttgcaattcactattcaaaagtgaactgaatctagaacgcagttcgcaattcaaaaaactaaaacagtatatatgtatatttaaaaaccatatatgtgggcacgtgtgcatacacatttgcacatgtatgctcgtgcacacacgtgtttttttC-CCC----CAAT--TTGT---A-CA-----A-------TATA---T-TATAT---------------G-T-T--AATT-----CG-AA---TA---AA-CAT-CGGA-T---T-----AAAA----AATACC-GAAAACCCC-TACTT--A----GGGG---G-------a
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gi|8 : tAACAT-CGGG-T---TC-----AGA----AATATC-GAAGGCCCC-AACTT--A----GGGG---G---------CT-A-AAATT---T-C-TA-G------G-G--TGG-g
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gi|19 : attagtggtaaactcccatcattgtgaaaaaacgcaacccggtgatggtactatctctagttgtgcatccattttttgttcaaatgcactactcttggtgagtg----AATATC-GAAGGCCAC-TACTT--A----GGGG---G-------CTGG-A-AT--T---T-C-TA-G------G-G--TGG-TGT--TC--TAG------GGG----TCCC-T-TCC---CC----TTA-CAGT--GA--AAAGA-T--GG-TGAT-G-GT-AC-T-ATCT--C---T----aatttgtggtggagatctgtccctctaatgcttggtcataaatcattag
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4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-361 ) : NNNTAGGGGTCCCCTC---CACTTACTGTTGAAAA----GANTGTGA-TGG--TACTATCT--CTA----TNTA--GGAAAAT-----CC----ACTCGCCCCCG-ATT-TNTTACTAN------ATATA-TATT-----AG--G-TAAT----TCGAA---------TAAACNA------TCGG----GT-TCGGAAAATATCGAA--GNCC-C-TAC-TT-ATAGGGGGCTGGAAT----------TTCT---------TAG----GGT-GGGNCTC-TAGGGGT--C--CC---CTC-CCAATT---ACTGTG-AAAAGAT--GGA-TG--GATGGTA-CT-ATC-TCT--A--------GTTTAGGAGAT--CCGCTC--CCCC-A-TTTC--TACTATA--T--A----AT-ATA-TTA--AACTGG--T-AATCT----CGAATAAA-CA-TCGGGTTC--GG----------AA-TATCGAAGTC-CC----CT--ACTTAGGGGGCTGAAATTTCTAGGGT-G-GGNT-C-TAGGGGTC-CCCACTCCCAC-TTAC-TGTGAAAAAAGATGGTGGTGGTTACGTATCAT-CT--TTACGAGAT-T--GGAGATCCGCTC-CCCCGATTTCTACACTA-T-TAATATTAGGTTAT----------CATAAA-TCCGAAAAT---AAACATCGG-GTTCCGGA--AA---ATAA-----TCGAAG-GNCCCCT--ACTTAG-GGGGCTC-TGAAATTTCTAGGGTTGGGTCTCTA-G-G-GTC--CCCCTNCCN----TTAT-TTG--TGA-AAAGATAT--GGTGATGGTA-ACTATCTCTAGTTTAGGAGATCCGCTCCCCCC-----ATT------TC-TTACTATATAATATTA-GGT-TAAAATTCGAATAACAT-TCG-GGTTC-GGAAATATCGAAGGCC-CCCTACT-TAGGGGGCTGAAATTTCTAGGTG-GTGGTGNTCTTAGGGTCCCCTNCCNCTTTACTGTGAAAAGATGG--TGATGGTTG-ACT-AT--CNTACT----------TT-AGTATAGGAGATTCNC--ATCCCTCCCACCCATTTGA---ACTA-C-TAATATNTTA-ANATTAGGT--AATTCGAATA-AACATCGGG-TCTCGGAAAT-AT--CGAAG----CTCC-CCTACTTAGGGG-C-TGAAAATTTCTAGGGTGGGGTTCTA--AGGGGTC----CCCT-C-CACT-A-TACTGT---GAAAAGATG-------G-TGAT--GGTACTATCTC-TAAGTNTAGGAG-AT--CCGCTCCCCCCGA-TNTNTA--AACTTATA-TAATAT------T-TAGGTNAATCCG-AATAAAACATTCGGGTTC--GGAG-AATATCGAAGNCCCCTACTTAGGGGG-TCTAAATTCTAGGGGG------GT-----TGG-TGGGTCACCNCC--TCTTA-CCG-TGA-AAAAATGGTGATGGTACTATCTC----TTGAG-ATAGAGATCCGCTCCCCCGATTTGC-TACTATTA-TAATATTAGGTNAA-TTCGAATAAACATCGGGTT-CGGAAATATCGAAGGCCTAT
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gi|7 : ataaTCTCACCCATATGAGAAAC-A-CATAA-ATTATA-ATGTAAAGT--A--T--AATA-AA-ATCG----TTCGTAGAT-AT--CGAAG-----TGC-CCTACTTAGGGG-G-TTGAAATTTCTA-GGTGGGG-TCTT--AGGTGTC----CCCT-C-CAT----TACTGT---GTAAA-ATG-------GTTGA---GATAATATCTT-T--GTTTAGGAG-ATTGCCG----CCCCGG-TTTATA-----TTACATTAATACATTGTAT-TAGGTTATTCCA-AATAAACCA-TCGGGATC--agatttt
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gi|9 : cggaaataccgaaggccccaacttaggggacagaatattctagggtgtggtcctaggggtccctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAA---------TAAAACA------TCGA----GT-TCCGGAAATATCGAA--GGCC-C-TACTTT-AT---GGGCTGAAAT----------TTCT-----------A----GGT-GGG--TC-CAGGG----C--CC---CTCACCA--T---ACTGTG-AAAAAA----AA-TGATGATGGTA-CT-ATC-------------------------T--CCGCTCCGCCCC-G-ATTCAGGAC--TA--T--A----AT-A-----A--AA-----------------CGAATAAA-CA-C--GGCTC--GGA---------AA-TATCGAAGGC-CCTGGGCTTAATGTAGGGGACT-ATGTTTCTAGGGT-G-tatgg
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|14 ): GGCAATCGGATTTTGGAACGCAGTTCGCAATTCACTATTCAAAAGTGAACTGCATTCTAGAACGCAGTTCGCCATTCAAAAAGTAAAACAGTATATAGTGCATCATTAATACACATATATGTGGGCACGTGTGCATTCACATGGTGTACATGTATGCTCGTGCACACACGTGCCTCTTCTCACCCATATATGAGAAACACATAAATTATAATGGT
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gi|22 : TCT-TAGATTAGGA-ATCTTCCCCCCCCCCCTCATTGTATGATC-T-ACTATATAATATTA-GGT---A--AATTCGAAT-A
gi|25 : GGTAAA-GTAAAATAAACACCGGGCT-CGGAAATATCGAtaaaatt
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4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|7 : ataattccggataaagatataacagtttcgaagacccagggacctgaaaatattagggtggggtcctagtggtcacctccagccactgtttatttgtTCTCACCCATATG-----AGAAAC-A-CATAA-ATTA-TA-ATG--TAA--AG--TATAATAAA-ATCG----TTCGTAGAT-AT--CGAAG-----TGC-CCTACTTAGGGG-G-TTGAAATTTCTA-GGTGGGG-TCTT--AGGTGTCCC----CT-C-CA-T---TACTGT---G-TAAAATG-------GTTGA---GATAATATCTT-T--GTT-TAGGAGATTGCCG----CCCCGG-TTTAT---A--TTA-CATTAATACATTGTAT-TAGGTTATTCCA-AATAAACCA-TCGGGATC--agatttt
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gi|9 : cggaaataccgaaggccccaacttaggggacagaatattctagggtgtggtcctaggggtccctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAA------ATGG--GTAT----AG----C-TAA--------A---------ATAAAACA------TCGA----GT-TCCGGAAATATCGAA--GG-CC-CTACTT--T-AT-GGGCTGAAA----------TTTCT-----------A---GG--TGGG--TC-CAGGG----C--CC---CTCACCA---T---ACTGTG-AAAAAA----AA-TGATGATGGTA-CTATC-------------------------T-CCGCTCCGCCCCG-AT-T-CAGGACTATAAT--A----A-----------------AA-------CGAATAAACA-C--GGCTC--GG--------A-AATATCGAAGGC-CCTGGGCTTAATGTAGGGGACT-ATGTTTCTAGGGT-Gtatgg
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|14 ): GGCAATCGGATTTTGGAACGCAGTTCGCAATTCACTATTCAAAAGTGAACTGCATTCTAGAACGCAGTTCGCCATTCAAAAAGTAAAACAGTATATAGTGCATCATTAATACACATATATGTGGGCACGTGTGCATTCACATGGTGTACATGTATGCTCGTGCACACACGTGCCTCTTCTCACCCATATATGAGAAACACATAAATTATAATGGT
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gi|2 : GTTC--CCCCGA-TATC--TACTAT-AT--G----ATAC---TAGG--T---T-AA--T-C---CG---AATAAACAT-CGGGTGT--GG--------A-AATATCCAAGTTTCC----CT--ACTCAGTGGGTTAAAATTTGTAGGGT-GGG-GT-CTTAGGGGT----CA--CTCCCAATT-AT-CGTGAAGAA--ATGGTGATGTTT-C---TC-T-CT-CTA-GTAGA-----GGAGTTCCGCAC-CCCCG-----ATT------TCTACTATA-T-TAccgatatctactatatgatactaggttaatccgaataaacatcgggtgtggaaatatccaagtttccctactcagtgggttaaaatttgtagggtggggtcttaggggtcactcccaattatcgtgaagaaatggtgatgtttctctctctagtagaggagttccgcacccccgatttctactatattagggtgtgatgtttctacctctagtagaggagttccgctcccccgatagctaatatattagggtaagctaaataaacatcgggttcagaaataccgaagtcccctactcacggggctgaactttctagcgtgggggcctatgggtcccccctattacgcgtagaaaatgggtgatggtactatcatctagttgaggaagatccgctcgccccgattttatactaatata
gi|2 : aggctgggattttcagggttacccctccattattgtgaaaatgtttttttgctactatctcttgtttacgagatccgctcccccggtttctattctacaatattaggttactactcctaataaacgttgggttcggaaatattaaagtcccctactcagggagctcaaatttctacggtggggtagtaggggtcacacacccccccattgctgtgaaaaaaatggtgatggtactatctctagttgaggagattcactcccccgagttctactctataacattaggttaatccgaacaaacatcgggttcggaaatatcgaagtcccttactcaagggactgaaatttgtagggttgAGGAGT--T--CCGCACCCCCGATTTCTACTAT-------ATTAGGG-TGT-GATGTTT-CTACC-TCT--AGTA-GAGG-----AG--TT-CCGCTC--CCCCGA-T---------AG-CT--A----ATATA-TTAGG-----GT-AA--G-CT---A---AATAAACAT-CGGGTTC--AG--------A-AATACCGAAGTC-CC----CT--ACTCACGGGGCTGAACTTTCTAGCGTGGGG-GC-C-TATGGGTC-C-----CCCCT-ATT-ACGCGTAGAAAATG--GGTGATGG-TAC-TATCAT-CTAGTT-G-AG------GAAGATCCGCTCGCCCCG-----ATT------T-TATACTA-A-TAgggtgtgatgtttctacctctagtagaggagttccgctcccccgatagctaatatattagggtaagctaaataaacatcgggttcagaaataccgaagtcccctactcacggggctgaactttctagcgtgggggcctatgggtcccccctattacgcgtagaaaatgggtgatggtactatcatctagttgaggaagatccgctcgccccgattttatactaatata
gi|20 : aggctgggattttcagggttacccctccattattgtgaaaatgtttttttgctactatctcttgtttacgagatccgctcccccggtttctattctacaatattaggttactactcctaataaacgttgggttcggaaatattaaagtcccctactcagggagctcaaatttctacggtggggtagtaggggtcacacacccccccattgctgtgaaaaaaatggtgatggtactatctctagttgaggagattcactcccccgagttctactctataacattaggttaatccgaacaaacatcgggttcggaaatatcgaagtcccttactcaagggactgaaatttgtagggttggttcccccgatatctactatatgatactaggttaatccgaataaacatcgggtgtggaaatatccaagtttccctactcagtgggttaaaatttgtagggtggggtcttaggggtcactcccaattatcgtgaagaaatggtgatgtttctctctctagtagCCTTCC----TTCAC-T-G--TGA-AAAGAT----GGTGATGGTACACTCTCACTAGTATAGGAGATCCACTCCCCCAATA------T-GT-ACTATATATTATTA-GGT-T----AATTCGta
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gi|22 : -AGAT-T--AGGAATCTTCCC-CCCCCCCCTCATTGTATGATCTAC--TA-TATAATATTAGGTAA-----------------ATTCGAA-----TA
gi|22 : tcttCCCCCCCCCTCATTGTATGATC-T-ACTATATAATATTA-GGT---A--AATTCGAAT-Ataaaatt
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gi|3 : atCACCCATATG-----A---AAAA-CCTAA-ATAT-TATACA--TGGTTAAAGTAAAATAAAC-TTGGG-TC-CGCAGA--AT--TGAAG-----TCC-T-TACCGAGG---C-TGAAA--TTCGAGGTTTGG--TCTA---GGGGTTTCATCCCT-CTCA-CC-A--CTGT---TGAAAAATG-------G-TGATTTGCCACAATCT-----GTT-TGTGAAGT--CC--TCTTCCCGAATCTTTAA----CTA-TA--AGTAT------T-TAGGTTATTCCATAATAAA-CGATCGG--TC--GGG--A-TATCGAAGTTCCCTACTCAGGGG--C-TGACAT-CTAGTGGG------GTC--T-----TAGGTCAAC-TCCATTATTTCC------AAAATTGTCACG-TA--CTATCT--C----TAGTG-ACG-AGATCAGCTCCCC-GATTTCCTTACTATAATTAATACTAGGTTAA-TCCAAATAAACTTCGGGTT-CGGAGATATCGATGTCCTAT
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gi|6 : tcTTCCGGATAAAGATATAACAGTTTCGAAG-ACCC----------A--GGGA-CCTGAAAATATTAGGGTGGGGTC-CTA-GTG-GTCACCTCCAGCCACTGTTTAT-TTG--TGA-GAtgcggtggaaaatgtatcgcgggtgtgct
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gi|6 : ataattccggataaagatataacagttGAGATCTGCTTTAACGATT------T-AT-ACTTTACTCTATTA-GGA-TAAGCAA----AATGAACAT--TG-GGTTA-AGAGACATCGAAATCCCCC--ACC-AAGGGGCCTGGAAT-CCTA----------------AAGGTCACCTACCT--TCACTGTGATAAAATGA--TGATGAT-------AC--CCTATCTAG-------------TTTGCGAGATCCAC-----TCTCCCG---ATATT-----T---ACTA-C-TA-----T-TA-G------GGTAA--TGAAAAGAACATCGAG-TTGTG-AGAA-AT--TGAAG-----TCC-CCAACCCAGGGA-CATGTAA-TTTCTAGGATGGGATCCTA---GGGGTCAC----CAAC-CA-CC-A--CTGTTAAAAAAAAATG-------G-TGAT--GGTACCATCTC-T-AGTT-TACGAGAT--GCGCTCCCCccaacccagggacatgtaatttctaggatgggatcctaggggtcaccaaccaccactgttaaaaaaaaatggtgatggtaccatctctagtttacgagatgcgctccccagatttt
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finalCons : NNNTAGGGGTCCCCCCGCGCGCTTACTGTNGAAAATGATGAGTGTGA-TGG--TACT-ATCT--CTAGTAT----A-GGAAAAT-----CCTA-----CTCGCCCCCAATT-TCNTACTAA------ATAGA---TATT-----AG--G-TAAT----TCGAA---------TAAANCA------TCGG----GT-TCGGAAAATATCGAA--GGCC-C-TACTTA---GG-GGGCTGGAAT----------TTCTAG--------------GGT-GGGGTTC-TAGGGGT--C--CC---CTCCCATT----ACTGTG-AAAAGATGATG-------ATGGTA-CTATC-TCT--AGTN-GAGG-----AG--AT-CCGCTC--CCCCGA-T-TC--TACTAT-ATAATANTTGGTTAATCCG------------------------AATAAACAT-CGGGTTC--GG--------A-AATATCGAAGNC-CC----CT--ACTTAGGGGGCTGAAATTTCTAGGGT-GGG-GT-C-TAGGGGTCA------CCCCC-ATT-AC-CGTGAAAAAA-ATGGTGATGGTNCTATCTCTAGTTGAG-------------GAGATCCGCTC-CCCCG-----ATT------TCTACACTA-T-TAATATTAGGTTA-----------------ATCCGAA-----TAAACATCGG-GTTCCGGA--AA---ATAA-----TCGAAG-GTCCCCT--ACTNAG--GGGA-CCTGAAATTTCTAGGGTTGGGTCTCTA-G-G-GT--CCCCCTNCC----TTTAT-TTG--TGA-AAAGATAT--GGTGATGGTA-ACTATCTCTAGTATAGGAGATCCGCTCCCCCCATTTG-------T-ACTATATANTATTA-GGTTA----AATTCGAAT-AACATGCCGAGGTTNTGGANACATCGANGNCCCCCCTACCGNAGGGGNCTGGAATTCCTAGGTGAATAGTGCTCTTAGGGTCNNCTACCTCTTCACTGTGANAAGATGGGTTGATGGTTGAACTGACAGCNTATCTAGAGAGTAAGTCAAGTNTGNGAGANCCACAAATCCCTCCCGCCCATATGGAAACACTATTATANCGTAAG---------------------TAAAATAAACATCGGGTT--CGCAGAN-AT--CGAAGTCCCC------TACCCAGGGACC-TGAAAATTTCTAGGGTGGGGTTCTA---GGGGTCNC----CT-C-CA-CCA---CTGT---GAAAAAATG-------G-TGATGGT--ACTATCTCTA--GTT-TGCGAGAT--CCGCTCCCCCGA--TNTATACTACTNTATA--------------T-TAGGTTANTCCA-AATAAAACATTCGGGTTC--GGA--AATATCGAAGNCCCCTACCTAGGGG--CCTGAAAT-CTAGAGGG------GTC--NG----TGGGTCAAC-CCTCTTAC--CCGTGA-AAAAATGGTGATGNTA--CTATCT--C----TTGCG-ACGGAGATCCGCTCCCCCNATTTACTTACTATTAT-AATACTAGGTAAAG-TNAAATAAACATCGGGTT-CGGAAATATCGAAGTCCTAT
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|5 : aaTAGGGGTCCCCTCGCGCGCTTA-TGTGGAAAATGATAAGTGTG---GG--TACT-ATCTACCTAGTATTTTAATGGGAAATTTTCGCCTAGGAGTCCC-CCCCCCATT-TC-TACTAATGGATTATATAATATTTTCAGAGCTG-TGATAATTTCGAAGTGTATGTATATATCAAGTTTTTCGG----AT-TCGG-AAATATCAAA--GGCC-C-CTA-CTTTT---AGGGGGTTGGGATATCAAGATGT-TTCT-AACTATGTGTAGACCGGGTTGGGGCTC-TA--GGT--C--CC---CTC-CC-GGTTCT---ACTGT--G--AAAAGAT----TG-AT-GTA-CTATC-TTT--AGTACGAGGGTTTGAGTAATGCCACTC--CCCC-A-T-T-C--TAC-ATAT---AGGAGAGACACT----TAGGAAGGTAA--A-TTTTCGGCGAATAAACATTCGGGGTC--AGTTTGTGGTATAATATCGAAGGC-CC----CT--ACTTAGGGGagcataactttga
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4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|14 ): GGCAATCGGATTTTGGAACGCAGTTCGCAATTCACTATTCAAAAGTGAACTGCATTCTAGAACGCAGTTCGCCATTCAAAAAGTAAAACAGTATATAGTGCATCATTAATACACATATATGTGGGCACGTGTGCATTCACATGGTGTACATGTATGCTCGTGCACACACGTGCCTCTTCTCACCCATATATGAGAAACACATAAATTATAATGGT
Unaligned ( gi|23 ): ATTTTGAAACGCAATTCGTAGTTCACTATTCGCAATTTAGTTGTAACTTGCATTCCATAACGCAATTCGCAATTCAAA
Unaligned ( gi|24 ): GGCGATCAGACTTTGGAACGCAGTTTGCAGTTCGCAATTCA