lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             11111111111111111111111111111111111111                                                                   1111111111111                                                                             
lowQualScore                  :                                                                                        1111111111              1                              55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555                           22222                                   3333333333333                                 111              222222222222222      1111111111          555555555555555555555555555555555                 1111      22222      44444444444444444444444444444444444444444444444444444   111111                     111              2222222222          55555555555              1111111   333333333333333333333333    11   2222222222222222       111111    22  11         222   111          11      555555555555555555555       33333         33      11               3333333333        6666666     11             2     44444            1111111111111111                 33333            444444444      22               111111       3333333   1111             11111   11111111   222222          11  1111                      33333333333333333         1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111     1111    111  1111111        111  33333333333333333333        1       111111            11111111     333    11111   333333333333       55555555555555555                    111111    11        11111   22     111         111111    11  11              22    44444444444444              222       11     2222     11111111         111   11       11  33333                  111                   2222222        111             66666666666666666     1111       1        1       111          2222222      11    666666666666666666666666666666       1111         11            11        2               444       2222222222222222222    44444444444444444444444444444444          33333333333        11111                  77777777777777777777777777777          1        1           222       1    1  22222   1  2222        11111    1        444444444   111   111          11  11             111     1       11   1  11         11   11   33333333      333333333    999999999999999999999999999999999999999     1111     11   11111                  11                111                         2222222222     111       1          111    1      88888888888         2222    1    22      2    222           6666666666666666       11    1   1   11    22222222222222    111     11    222        1  1     111     1  33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333          2222     444444      1   1                  33                22     1         2222        2       2        2     22                    1          2    1           22   2    55555         2                  2                           1                                1  1             1                                      222      1     1   2        2    2222      8888888888      1       1                    2222              11       2        1   2   333     1    2      4444444          333      11    2          777777   1                          4      444444      4    11        4                                   777               11111111111111111111111111111111111111            2                       2               2              1111111111111     4      1   2    1       2           22   2     6666666      1   4       
lowQualScore                  :                                                                                     3  3333333333   2   2  444 3 2 22  2 2  4  2 2     333    55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555    555  2 2 88888888  2 6 22222  4  777777  55555     5555   5555 4444444444444    444 2 77 2  999 2 2    444 2 333 5  9999 555  222222222222222  33  2222222222   77     444444444444444444444444444444444       22 33  0  9999 2  2 66666 1    55555555555555555555555555555555555555555555555555555   444444 0  55 3 7  3  3  7  222    3 55 3  3 2222222222     88   00000000000  7   3 3   3 1111111   222222222222222222222222  3 22 3 0000000000000000    1  888888    88  11  4 4 8  444   888  88888   44      999999999999999999999   5   88888 5       22   5  55        5  1   4444444444        6666666     77 6    3 7    3     33333 6      5   7777777777777777      5  999     44444      5     666666666      99   44          888888     6 9999999   4444  6    6  6  99999   99999999   111111  99  6   33  4444 6       6          1 22222222222222222      6  6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666     7777    555  4444444   1 6  333  11111111111111111111        6    6  444444   6        66666666 6   777    66666   222222222222     6 22222222222222222 6        6 3    6  999999 6  88 6      22222   77     888  88     222222    11  33   8    8  6  44    00000000000000     8        222  99   11     3333   8 66666666    1  8 444   11       11  44444            8  8  444 0 8       1   8   6666666    8 3 444             55555555555555555   3 5555   8   6        0   6   444 8  8 88  6666666 4    11    777777777777777777777777777777     1 3333  1      77    8       77        0   1      1    555       1111111111111111111  1 44444444444444444444444444444444          66666666666  8     33333    8        888  33333333333333333333333333333          0        0  2        777   3   0    0  66666   0  1111        88888    0    2   111111111   777   444  6     3 11  11     0 8     444     6  55   11   1  33  8      11   11   33333333      222222222    333333333333333333333333333333333333333   0 4444     88   77777          6       11  8             555  8                      8888888888     777       0          555    7      55555555555       7 8888    3    00      6    333           3333333333333333       33    0   0   11    77777777777777    777     88    333        3  7   6 666     3  66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666       6  8888     000000      3   3    7        7    00           1    55     5         1111     6  0       0    2   0     66                  6 5     6  6 0    5           77   0 2  77777         0           2      0         2                 5  2                             7  5        3    5              3   3                6  555      3     3   0        0  4 5555      6666666666 3    5     3 7        6           4444              99       0        5   0   555     5    0      4444444          888    4 88    0 3        111111   5 77                4      0      111111      0    22  6     0                          6    6   111            6  66666666666666666666666666666666666666            0                       0      4        0              0000000000000     0      5   0    5       0           77   0     5555555      5   0       
lowQualScore                  :                                                                                     .  ..........   .   .  ... . . ..  . .  .  . .     ...    ................................................................................    ...  . . ........  . . .....  .  ......  .....     ....   .... .............    ... . .. .  ... . .    ... . ... .  .... ...  ...............  ..  ..........   ..     .................................       .. ..  .  .... .  . ..... .    .....................................................   ...... .  .. . .  .  .  .  ...    . .. .  . ..........     ..   ...........  .   . .   . .......   ........................  . .. . ................    .  ......    ..  ..  . . .  ...   ...  .....   ..      .....................   .   ..... .       ..   .  ..        .  .   ..........        .......     .. .    . .    .     ..... .      .   ................      .  ...     .....      .     .........      ..   ..          ......     . .......   ....  .    .  .  .....   ........   ......  ..  .   ..  .... .       .          . .................      .  ...............................................................................     ....    ...  .......   . .  ...  ....................        .    .  ......   .        ........ .   ...    .....   ............     . ................. .        . .    .  ...... .  .. .      .....   ..     ...  ..     ......    ..  ..   .    .  .  ..    ..............     .        ...  ..   ..     ....   . ........    .  . ...   ..       ..  .....            .  .  ... . .       .   .   .......    . . ...             .................   . ....   .   .        .   .   ... .  . ..  ....... .    ..    ..............................     . ....  .      ..    .       ..        .   .      .    ...       ...................  . ................................          ...........  .     .....    .        ...  .............................          .        .  .        ...   .   .    .  .....   .  ....        .....    .    .   .........   ...   ...  .     . ..  ..     . .     ...     .  ..   ..   .  ..  .      ..   ..   ........      .........    .......................................   . ....     ..   .....          .       ..  .             ...  .                      ..........     ...       .          ...    .      ...........       . ....    .    ..      .    ...           ................       ..    .   .   ..    ..............    ...     ..    ...        .  .   . ...     .  ............................................................................................       .  ....     ......      .   .    .        .    ..           .    ..     .         ....     .  .       .    .   .     ..                  . .     .  . .    .           ..   . .  .....         .           .      .         .                 .  .                             .  .        .    .              .   .                .  ...      .     .   .        .  . ....      .......... .    .     . .        .           ....              ..       .        .   .   ...     .    .      .......          ...    . ..    . .        ......   . ..                .      .      ......      .    ..  .     .                          .    .   ...            .  ......................................            .                       .      .        .              .............     .      .   .    .       .           ..   .     .......      .   .       
lowQualScore                  :                                                                                     3  4444444444   4   2  222 3 1 99  1 1  2  1 1     777    88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888    888  1 1 66666666  2 7 22222  7  444444  99999     0000   3333 0000000000000    111 4 99 4  444 5 5    444 5 666 3  5555 000  999999999999999  11  5555555555   99     444444444444444444444444444444444       88 77  1  0000 7  7 00000 9    00000000000000000000000000000000000000000000000000000   111111 2  00 6 3  6  6  3  777    6 00 6  6 3333333333     66   22222222222  3   6 6   6 8888888   444444444444444444444444  6 33 6 8888888888888888    3  555555    55  00  0 0 0  444   444  11111   44      999999999999999999999   0   55555 0       33   7  77        7  9   1111111111        1111111     55 7    2 3    3     88888 7      0   9999999999999999      7  444     00000      7     666666666      22   88          333333     7 0000000   5555  7    7  7  77777   33333333   777777  22  7   77  2222 7       7          0 77777777777777777      7  4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444     9999    000  3333333   8 7  888  66666666666666666666        0    7  000000   7        88888888 7   333    77777   777777777777     7 22222222222222222 7        7 2    7  222222 7  33 7      11111   00     000  88     000000    00  66   0    0  0  44    00000000000000     0        000  44   00     2222   0 22222222    0  0 000   00       00  00000            0  0  000 6 0       4   0   0000000    0 2 000             22222222222222222   2 0000   0   0        8   6   000 0  0 66  0000000 4    00    666666666666666666666666666666     4 0000  4      44    0       44        0   4      4    000       7777777777777777777  0 55555555555555555555555555555555          22222222222  0     22222    0        555  00000000000000000000000000000          0        0  5        888   2   0    0  00000   0  2222        55555    0    5   000000000   555   000  5     2 00  00     8 0     000     0  88   00   8  00  0      00   00   00000000      000000000    444444444444444444444444444444444444444   8 8888     66   88888          0       00  0             555  0                      8888888888     555       0          222    0      11111111111       3 3333    3    77      7    777           2222222222222222       88    0   0   22    22222222222222    555     33    333        3  0   0 777     3  00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000       0  3333     000000      3   3    3        3    77           0    55     5         0000     0  0       0    5   0     00                  0 5     0  0 0    5           55   0 5  00000         0           5      0         5                 0  5                             0  5        0    0              0   0                0  777      3     3   0        0  0 5555      0000000000 0    0     0 0        0           5555              55       0        5   0   000     0    0      5555555          555    0 00    0 0        555555   0 00                0      0      000000      0    00  0     0                          0    0   000            0  00000000000000000000000000000000000000            0                       0      0        0              0000000000000     0      5   0    5       0           55   0     0000000      0   0       
consensus                     :                                                                            GGTAAGTAA-GT--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT---------TACAAAG---A------------TA-TA--------------------CAT-AA-T-C---A-TA-----GAAGA---AA-G-A------T-CA-T-C-AA--AT-GA--T---AG-----ATAAA----GTA----A--N-TAACA----AAGT---T-A--T-GA---T-A-AATC---A-AA--T-TT-C--T---CA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TA--------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAAN-T-AA-CA---ACTGTCA-----CA-T-CA-TTA--CT-C--A-----T-A---GGC-CAA---AT-A---AAT------TTTT--C-T-CT-AT-TA-CA---CAGG-T--T-TA-T----------AAAGT--TTT---T-ATA-NCAA-GTG-T-TCA-T-------GGAT-----TT--CTA-----TG-AA-TG-G--T-T----------T--C--TTAGATGTT---TGGTATTGC--TG-T-A-CAG--TCA--AATG-TA-AAAA-TGGAAT-T------CA-TC-TTCAA--CAC-AGTC-A--G-ACTTGCAG-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCATTTAANTTG--TGTTTTTG-NGTA--ACGCCC-AGTTTCAATAGCC-AAAGA-ATGAG-AACTGATTCTGAAAANTTG-----T-AAAACA-TTT--CAAGACCTTGAGGATT-ACGAATTTAC-TGGAAAATA-TTTTTTCTCTACAGAATCTTG-TTTTG-A-A---T-AAT--GCAT-ATGT-TC-GCAAGT-TTG-CCAC---ATT-G----TT--TG-TCCG-CA----A-TGTCTGA-AAGTGTACTACA----------C---C--GTGAAT-AT-----TTA-------A--AATC---------GCTCATG---TAA----AC---------TA-T-AG---T---------AACAA----TTGA-T-AC--A----ATANT-TT--TAT--------C--ATG--TA--TAGAACAT-TGTA-TA-T--C-TAA-CTTATTCA---A----A-ATA---AATG-----AAT----G-------CTACT-AN-T--------------C-AACTACTT-TTGTTG-TT------A-TC--A-TACAAT-ACA-TTGT-TTTCA-T-ATA-CAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-GAAT-CTACAA-GGGG---A----------ATCTA-AAATTCTT---CG-TAAA--TATTTAA--AAC-A---G--C-TTTTTAT-A---ACA--TCAAAAT--ACATA-TGGGAATCGACCA-AG-TT---CAC-CTACAATAGCT-TGA-------TTTG-AGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---AATA-TATATTCGAGAGNTTTAATG---T-GC-A-TTT-------TNTCGC--AATA--ATA------TTT---ATTAAA-GA---NTTTTCTA-T--ACAATAATCAGGGCG-TTTGACGG-AACTTGTATCTGTATTTATTGTTCCC-CCCAAATTTCACATGCAT-A-AA-G-CAGT-ACT----G-G-T-------TTA----ACTG-TATGATCATA----CAAA---GT-GTATC--AG-GGTA-TGTATTTTNGGTT---T--AATA-TTCCAAAAC-----AC--TTGACTAGTT-TAAAATAA-GCNTTTAAGGCTCTTTTTGTA-AAGA-TCC-AA-TTG-AC----AACATGTG-A---AGGA-GCCTGATG--A-G-TAAAAA---CAATT-CCCAGATATT--TG--TACGATG-ACACT---TGTTC-GATGATT--TGATTTT-TA-TAGAAA--AAC--TTTTT-A----TCTGAT---------TTTT-C-------------A------CA---------------AAATA-T--GACAAT-TTT----TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AG-ATAGGCAATATTT-A-TG-ACAATAGCATTCAAGCTTTTTTAATACAT---CGCTG---AGGCCCT-CCCTCGGTTTCGGAAATTAACACTGA---A--TCATCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAG-GATGTG-TCACCTAATTTT--GCCGGA-------TCATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATCGA--TTAA---TATTTTAA-AAAGGTTT-G-ACTTA-GGT-------TTA--CCTCCC----TGTCTAA-ACG--------CC-ACCNTTAGG-----TTCAAATG-AACTCG-AAGTTT-AT--------TTCGGAGTTT----TACAG--AT--ATTATG-TTT-GCCATGTACATACTCTTGA-ATGACTTTATAGAAGGGCCCCTTTATGTCAAGCCTGTGTGCAGCCTTGTGTAGAAAGANCTGAAATGTAAAACGGTGTCAAAGGCCTTAGAAAAATCAACACAAGCAAACGTACAATTGCTGGAANTTA-ATCATTTGTATATTTTTTGAATAANGGTTCTAAAGTATAAANATGTGGTCACTGGTTCTGGCNTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTTATAATGTTGTTNGAGTCCAAGTAGTTTCGTANCCTNGTATTCAGTATGCTATTAA--ATACTTT-GGATA-AGCAAAGAAGTTGATNGTTANTCCTCTATA---GTANTNTGATGGGTCANAAGGGCTATCATTCTTATGAATNGNTTTTGATAAAGCCTGTNTCCCACTCCCTTTGGGTATTCTGCCAACAGAGGACAACGACAAGTTACATGTAGACAATTTACAAGCANATGTGGTAANAATATGTGNTACGNCGGCTNNCAACATCTCATTTTCANTGCCAT-CTAATCGCAGCTTGATTTATTATCTTTCAGATGTTTTTATTGCATCAATGATTTTCTTTTCTTTAATTG-A-TAAATCTAACGAAGT-AATG--TTGATATTTCTGCTGACTTGGACAATAAATCTTCAAAATATTTAATTCTGGGTATCAAATTTACTAGTCAATACNGAACAATGTTTGTAAAATGATTTACACCCATTGTTCACTAGATATCTTAATCGGACTAATCTTGCGGATTGCTGACTGATTCAAAACCCTTTCAAGAGTTTCCAG-TATGATA
Reference ( gi|2 )            :                                                                            GGTAAGTAA-GT--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT---------TACAAAG---A------------TA-TA--------------------CAT-AA-C-C---A-CA-----GAAGA---AA-G-A------C-CA-T-C-AC--AT-GA--T---AG-----ATAAA----GTA----A--T-TAA-A----AAGT---T-A--T-GA---T-A-AATC---A-AA--T-TT-C--T---CA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TA--------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAAA-T-AA-CA---ACTGTCA---G-CA-T-CG-TTA--CT-C--A-----T-A---G---CAA---A--A---AAT------TTTT--C-T-CT-AT-TA-CA---CAGG-T--T-TA-T----------AAAGT--TTT---CAATA-ACAA-GTA-T-TCA-T-------GGAT-----TT--CTA-----TG-A--TG-G--T-T----------T--C--TTAGATGTT---TGGTATTGC--TG-T-A-CAC--TCA--GATG-TA-AAAA-TGGAAT-T------C--TC-TT-AA--CAC-AGT--A--G-ACTTGCAGGACA-CT--ACATTTTC-TCTCATTTAAATTG--TGTTTTTG-GTTAGTACGCCCCAGTTTCAATAGCCCAAAGATATG-G-AACTGATTCTGAAAATTTG-----T-AAAACA-TTT--CAAGACCTTCAGGATT-ACGAATTTACATGAAAAATATTTTTTTCTCTACAGAATTTTG-TTTTG-ATA---C-AAT--GAAT-ATGT-TC-GCAAGT-TTG-CCAC---ATT-G----TT--TG-TCTT-CA----A-TGTCTGA-AAGTGTACTACA----------C---C--ATGAAT-AT-----TTA-------A--AATC---------GTCCAT----TAA----AC---------TA-T-AG---T---------AACAA----TTGA-T-AC--A----ATAAT-TT--CAT--------C--ATG--TA--TAGAACAT-TGTA-TA-T--C-TAA-CTTATTCA---A----A-ATAT-TAATG-----AAT----G-------CTACT-AG-T--------------C-AACTACTT-TTGTTG-TT------A-TC--A-TACAAT-ACA-TTG--TTTCA-T-ATA-CAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-GAAT-CTACAG-GGGG---A----------ATCTA-AAATTCTT---CG-TAAA--TATTTTA--AAC-A---G--C-TTTTTAT-A---ACA--TCAAAAT--AC-TA-TGGGAATCGACCA-AG-TT---CAC-CTACAATAGCT-TGA-------TTTG-AGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---AATA-TAT-TTCAAGAATTTTTATG---T-GC-A-TTT-------TTTCGC--AGTA--GTA------TTT---ATTAAA-AAG--TTTTTCTA-T--ACAATAATCCAGGCG-TTTGACGG-AACTTGTA-CTGTATTTATTGTTCCCACCCAAATTTCACATGCAT-A-AA-G-CAGT-ACT----G-G-T-------TTA----GCTGCTATGATCATA----CAAA---GT-GTATC--AG-GGTG-TGTATTTTTGGTT---T--AATA-TTCCGAAACCAAAAAC--TTGACTAGTT-TAAAATAA-GCCTTTAAGGCTCTTTTTGTA-AAGA-TC--AA-TTG-AC----AACATGTG-A---AGGA-GCCTGATG--A-G-T--AAA---CAATT-CCCAGATATT--TG--TACGATG-ACACT---TGTTC-GATGATT--TGAATTG-TA-TAGAAA--AAC--TTT---A----TCTGAT---------TTTT-C-------------A------CA---------------AAATA-T--GACAAT-TTT----TTGTCTTTCTGGGGTTGAC--AG-ATAGGCAATATTT-A-TG-ACAATAGCATTCAAGCTTTTTT-ATACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCAGTTTCGAAAATAAACACT-----A--TT-TCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAG-GATGGT-TCACCTAATTT---G-TGGA-------TTATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AATGGTCT-G-ACTTA-GGT-------TTA--TCTCCCG---CGTCTAA-A----------CC-ACCTTTAGG-----TTCAAATGAAACTCGTAAGTTT-AT--------TTTGGAGCTT----TACAG--AT--ATTATG-TTT-GCCATGTACATACTCTTGG-ATGACTTTATAAAAAGGTCCCTTTATGTCAAGT-TG-GTGCAACC-TGTGTAG-AAGAGCTG-AATGTGAAACAGTATCAAAGGCCTTGGAAAAATTAATA-AAGCAAACATACAATT--TGG-ACTTAAAT-ATTTGTATA-TTTTTGAATAAGGGTTCT-AAGTATAAACATGTGGTCACTGGTTCTGGCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTAATAATATTGTTAGAGTCCAAGTAGTTTTGTAACCTTGTATTCAGTATGCTATCAA--ATACTTT-GGATA-AGC-AAGAAGTT-ATTGTTATTCCTCTATACTAGTAGTTTGATGGGTCATATGGGCTATCGTTTTTATGAATAGG-TTTAATAAAGCCTATTTTCCATT-CCTTTGGGTATT-TGC---CAGAAGACAA-GACAAG----AT-TAAATAATTT-T-AGCATATGTGGT-AAAATATATG--AC-TTGGCTTTCAACATCTCATTTTTAATGCCATCCTAATC-CAGC-TGATTT-TTATTCTTTAGATG-TTTTATTGCATCAATGATTTTCTTTTTTTTAGTTGTACTAAATCTAACGAGGTAAATGTTTTGAT-TTTCT--T--CTTGG-CAAGTAAT-TTCAAAATATTT-ATTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAG-TATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGACT--TTC-AAACT-------GAGTTTCCAGTTATGATA
gi|5                          :                                                                            GGTAAGTAA--T--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TTCG-GG-CC----GAGG----CATA--------CACAAAG---A-------------A-TAAGAGTTGAGAAGTTCAATTTCAT-AAAT-C---A-TAA----GAAGAG--AA-G-A------T-TA-T-C-AA--ATTGA------AG-----ATAAA-----TA----A--A-TAC-A----AGGTCTAT-A--T-GAA--T-A-AATC---A-AC--T-CT-CCTT---CATCC------------ATA-GT----------GAG--CAGCT------ATACTA--------GT-ATCAGTAAG-TTGGCAA-AA--TTTT-AAA-T-AA-C----ACTGTC----G-CA-TCCA-TTG--CT-C--AATATTT-A---AAGCCCA---ATTA---AAT------TTTT--CAT-CT-AT-TA-CA---CAGG-T--T-TA-CTAA-------AAAGT--TCT---T-AT--AC-A-GTG-T-TCA-T-------GGAT-----TT---GA-----TG-A--AG-G--T-T----------T-----TTAG-TGTT---C--TA-TGC--TA-TAA-CAG--TCA--AATATTA-ACAATTAGAATGT------CAATC-TTCAA--CAC-AGTC-A--G-ACTTACA-AACA-CT--ACATTTTC-TCTCATTTAACT----TGTCTTTG-G-TA--ACAGCCCAGTTTC-GTAG-CCAAAGA-ATG-ACAACTGA-TCTG-AAATTTG-----T-AAAACA-TTG--CCA-ACGTAGAGGTTT-ACGAA--TACGTG-AAAATA-ATCTTTCTCTACATAAACTTGATTTTGAATAGCCT-AAT--GCAT-ATGTGTCGGC--GT-TTG---AA---ATT-GC---TT--TGTTCTG-CA----A-TGGCGGA----TGTCCTA-A----------C---C--ATGAATAAT-----TTA-------A--CAT-----------TCTATGG--TAACTTCAT---------T--T-AG---T---------AACAA----TT-A-TAAC--ATTACATACTGTT--TAT--------CTAATG--TA--TAGCACATATGTA-TA-TACT-TAA-CTTATTCA---A----A-ATA---AATGAAATCAAT----T-------CTACT-AT-C--------------C-CACTACTTGTTGTTGATT------ATTC--ACTACAATGAGA-TTGT-TTTCA-CAATA-CAGCA--T-TATCTC--AATTACT-GAAT-TCTCA--GGGG---A----------ATCTA-AAATTCTTG--TG-TAAAATTATTTAA--AACTA---G--C-TTTTAATAA---ACA--T-AAAAT--A
gi|1                          :                                                                            aGTAAGTAAAGT--TA----A-TTTTATTCTCCGAA-T-T--TT-G-GG-CCAC-GAAGG---GCAT----------ACAA-G---A------------TA-TA--------------------AA--AA-A-C---A-CA-----GAAGA---AA-G-T------G-CA-T-CCAA--AT-GA--TGA-AG-----ATAAA----GTA----A--A-TAACA----AAGT---T-A--T-GAA--T-A-AATC---A-AT--T-TT-C--T---CA---------------ATT-G-----------GAG--CAGCT------ATACTT--------GT-A-------GATTGGCAA-AT--TTCTCAACCT-AA-AC---ACTGTCA-----CA-TTCGATTA--CT-CCAA-----T-A---AGC-CAA---A--T---AAT------TTTT--C-T-CTGATCTA-CA----AGG-T--T-TAAT----------AAAGT--TTT---TTAAA-ACAA-A-G-T-TCAAT-------GGAT-----T---CTA-----TG-AA-TG-G--T-T----------TGTC--TTAAATGTG---TG-TAT-GC--TG-T-A-CAA--TCA--AATG-TA-AAA--TGGAATGT------CA-TC-TTCAA--CAC-AGTC-A--G-ACTTGCAG-ACAGCT--ACATTTTC-TCTCATT--ACTTG--TGTTTTTGTGTTAA-ACGCCCGAGTTTCAATAGCCAACAGA-ATGAG-AACTAATTCT-AAAATTTG-----TAAAAACATTTT--CAAGA-CTTGAGGATT-AC-AATCT-----GAAAATA--TTTTTCTCTACAGAATCTT--TTTTG-A-A---CTAATGGGAATAATGT-TC-GC-AGTGTTG-CCAC---ATTGG----TT--TG-TCCTGCA----A-TGTCTGA-AAGTGTACTACA----------C---CCAGTGAA--AT-----T---------A--AATC---------GCTCATGC--T-A----ACTT-------TA-T-AG---T---------AACAAT---TTGATT-ACGGA----ATATT-TTTATAT--------C--ATG--TA--TAGAACATCTGTA-TAGT--C-TAAGCTTATTCA---A----ACATA---AATG-----AGA----G-------CTACT-AGTT--------------C-AACTACTT-TGTTTG-TT------A-TCGAA-TACAAT-ACAGTTG--TTTCATT-ATATCAGCA--TAT-TCTT--AA-GAAT-GAAT-CTACAG-GGGGCGAA----------ATCTA-AAATTCTT---CGAAAAA--TATTTAA--AAC-A---G--CGTTTTTAT-AAACACA--TCAAAAT--AC--A-TAGGAATCGACCA-AGTTT---CAC-CTACAATAGCT-TGA-------TTTG-A-G---CCTTTTTAGGTACAG--------A------CCA-A---AATA-TAT-TTCAAGAATTTTAATG---TGGCAA-TTT-------TTTCGC--AGTAACATG------TTT---ATTAAA-GAC--GTTTTCTAGT--ACAATAATCAGGGCGTTTTGACGG-AACTTGTATCTGTATTTATTGTTC---CCCAAATTTCACATGCATAA-AA-G-CAGTAACT----GTGTT-------TTA----ACTG-TATGATCATA----C--A---GTCGTATC--AG-GGTG-TGTATTTTTGGTTA--T--AAT--TTCCAAAAC-----ACTTTTGACTAGTT-TAAAATAAGGCCTTTAAGGC---TTTTGTAGAAGA-TCCAAA-TTG-AC----AACATGTGTA---AGGAGGCCTGATG--AGG-TAAAAA---CAATTGCCCAGATA-T--TG--TACGATGAACACT---TGTTCTGA--ATT--TGATTTT-TA-TAGAAA--AACTTTTT---A----TCTGAT---------TTTT-T-------------A------CAACGTTTTTTCTACAGAAATATT--GACAA--TTT----TTGTCTTTCTGAGGTTGACCAGG-ATAGGCAAAATTTGA-TG-ACAATAGCATTCAAGCCTTTTTAATACAC---CGCTGTGAAGGCCCTCCCCTCGGTTTAG-AAATTAACACTAA---A--TCATCAGCAT-C----AACATAACA---TTAAGAGATGGTGTCACCTATTTT---GCCGGA-------TTATCAT--TATC-GTCGAAAA-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAATATTATTTTAA-AAAGGTTTGG-ACTTA-GG--------TTA--CCTCCC----TGTCTTA-ACAC-------CC-ACACTTA-G-----TTCAAATG-AACTCGTAAGTTTGAT--------TTTGGAGTTT----TAGAG---T--ATTATGTTTT-GCCATGTACATAC-CTTGA-TTGACTTTATAAAAGG--CCCTTTATGTCAAGTCTGTGTGCAGCCTTGTGTAGAAAGAGCTGAAATGT--AACGGTATCAAAGGCCTTAG-AAAATCAACACAAGC-AACATACAATTGCTGGAACTT--AT-ATTTGTATATTTTTTGAATAAGGGTTCTAAAGTATAAACATGTGGTCACTGGTTCT-GCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTTAT-ATATTGTTAGAGT-CAAGTAGTTTCGTACCTTTGTATTCAGTATGCTATTAA--ATACTTT-GGAAATAGCAAAGAAGTTGATTGTTAATCCTCTATA-----ATTTTGAT-GGTCATAAGGGCTATCATTTTTATGAATAGGTTTTAATAAAGCCTA-TTTCCATTCCCTTTGGG-ATTCTGCCAACAGAA-ACAACGACAAG----AT-TAAACAATTTATAAGCATATGTGGTAAAAATATATGT-ACATCGG-TTTCAACATCTCATTTTTAATGCCAT-CTAATCGCAGCTTGATTTATTATCTTTCAGATGTTTTTATTGCATCAATGATTTTCTTTTCTTTAATTG-A-TAAATCTAACGAAGT-AATG--TTGATATTTCTGCTGACTTGGACAATAAATCTTCAAAATATTTAATTCTGGGTATCAAATTTACTAATCAATACTGAATAATGTTTGTAAAATGATTTACACCCATTGTTCACTAGATATCTT-ATCGGACT-ATCTTGCGGATTGCTGATTGATTC-AAATTCTTTCAAAAGTTT-CAG-TATGgt
gi|4                          :                                                                           aaGTAAGTAA-GT---A----A-TTT-ATT-TCC--AAT-T--TT-G-GG-TC-C-AGAGG---GCATACAAAGAA-TACAGAGTTCA------------TG-TA--------------------CAT-AAGT-C---A-TA-----AAA-A---GA-G-A------T-TA-T-CCAA--AT-GA--T---AG-----ATAAA----GTA----A--AATAACA----AAGT---T-A--T-GA---T-A-AATC---A-AC--T-TTTC--T---CA---------------ATT-GT----------G------------------------------T-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T-AA-CA----CTGTCA-----CA-TTCA-TTA--CT-C--A-----T-AA--G---CCA---A--A---TAT------TTTTTTC-T-CT-AT-TG-CA---TGGG-T--T-TA-T----------AAAGT--TCT---TA-TA-CAAA-GTG-T-TCA-T-------GGAT-----T---CTA-----TG-AA-TG-G--T-T----------T--TCTTTAG-TGTT----GGTAT-GC--TG-T-A-CAG--TAA--AATA-TA-AAA--TGGAAT-T------CA-TC-TTCAA--CAC-AGTC-A--G-ACTTGCAG-ACA-CT--ACATTTTT-T-----------TG--TGTGTGTG---TA--ACGCCC-AGTTTCCATAGCC-AAAGA-ATGAG-AACTGA----------------------AACA-TTA--CAAGAC-TTGAGGATT-ACGAATT-AC-TGAAAAATACTTTT--CTCTTCAGAATCTTG-TTTTG-A-A---T-AAT--GCAT-ATGT-TC-GCA-GT-TTG-CCAC---ATT-G----TT--TG-TCTG-CA----A-TGTCTGA-AAGTGTACTACA----------C---C--ATGAAT-AT-----TTA-------A--A-TC---------GCTCATG---TAA----CT---------TA-TTAG---T---------AACAA----TTGA-T-AC--A----ATAGT-TT--TAT--------C--ATG--TA--TAAAACAC-TGTA-TA-T--T-TAA-CTTATTCA---A----A-ATA--TAATG-----AAT----G-------CTACT-AA-TC-------------C-AAATGCTT-TTGTTG-TT------A-TC--A-TACAAT-ACA-TTGT-TTTCA-T-ATA-CAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-AATT-CTACA--GGGG---A----------ATCTA-AAATTCTT---CG-TAAA--TAATTAA--AAC-A---G--C-TCTTTAT-A---ACA--TCAAAAT--ACATA--GGGAATCGACCA-AG-TT---CAC-CTACAATAGCT-TGA-------ATTG-AGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---TATA-TAT-TTCAAGAA-TTTTATG---T-GC-ATTTT-------TTTTGC--AGTAC-AT-------TTT---ATTAAA-GAA--GTTTTCTA-T--ACAATAATCAGGGCG-TTTGACGA-AACTTGTATCTGTATTTATTGTTCC--CCCAAATTCCACATGCAT-A-AG-G-CAGT-ACT----G-G-T-------TTA----ACTG-TATGGTCATA----C-AA---GT-GTATC--AG-GATA-TGTATTTTAGGTT---T--AATATTTCCAAAAC-----AC--TTGGCTAGTT-TAAAATAA-GCATTTAAGGCT-TTTTTGTA-AAGA-TC--AA-ATG-AC----AACATGTG-A---AGGA-GCCTGATG--A-GATAAAAA---CAATC-CCCAGATATT--TG--TACGATG-ACACT---TGTTC-GATGATC--TGATTTGTTA-TAGAAATTTTT--TTT---A----TCTGATTTTTTACCGTTTT-C-------------A------CA---------------AAATA-T--GACAA--TTT----TTGTCTTTTTGAGGTTGAC--AG-ATAGGCAATATTT------ACAATgcat
gi|32                         :                                                                             GTAAGTAA-TT--TT----T-TTT--TT-TCA--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGGGG---GAATACAAAGAA-TACAGAGTTTA------------TC-TA--------------------CATAAA-T-C---A-TA-----GAAGA---GA-G-A------T-TA-T-C-
gi|12                         :                                                                             aTAAGTAA-GT--TA----T-TTT-ATT-TCC--AAT-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT--------------AA---A------------TA-TA--------------------CAT-AAAC-C---A-CA-----GAAGA---G--G-A------C-CA-T-CCAA--AT-GA--T---AG-----ATAAA----GTA----A--A-TAACA----AAGT---T-A--T-GA---T-A-AATC---A-AA--T-TTTC--T---CA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TAT-------GT-A---------TTGGCAA-AA--TTTTC-AA-T-AA-C----ACTGTCA-----CATT-CA-TTA--CT-C--A-----T-A---AGC-CAA---A--T---AATA-----TTTT--C-T-CT-AT-TA-CA---CAGG-T--T-TA-T----------AAAGT--TTT---T-ATA-CAAA-GTA-T-TCA-T-------GGA------TT--CTA-----TG-A--TG-GT-T-T----------T--C--TTAGATG-T---TGGTA-TGC--TG-T-A-CAA--CCA--AATG-T--AAAA-TGGTAT-T------CA-TC-TTCAA--CACAAGTCCA--G-ACTTGCA-GACA-CT--ACATTTTC-TCTCACTT-ACTTG--TGTTTTTG-caa
gi|3                          :                                                                              TAAGTAA-GTAATATCTTA-TTT-ATT-TCC--AAT-T--TT-G-GG-CC-C-AG-GG---GCAT----------ACAA-G---A------------TA-TAAC------------------CAT-AA-A-CTCAA-CA-----GAAGA---AGTGCA------T-C--T-C-AA--AT-GA--T---AG-----ATAAA----GTA----A--CATAACAT---AAGT---T-A--T-GGGACT-C-ACTCACAA-AA--T-TT----T---CATGACACAGTACACTGATT-GTTACCTGATACGAG--CAGCT------GCA-TACACTCACTGT-A-------G-TTGGCAA-AATTTTTTCAAT-TAAA-CAC--ACGTTCA-----CATT-CA-TTA--CT-C--A-----TAA---G---CCA---A--A---CATCCACGATTTT--C-TCCT-AT-TA-AA---CAGG-TGATATA-TACCTCCGATAAAAGTA-TTT-----AT--ACAA-GTA-TATCA-TCATACAAGGA------TT--CTATTGTGTA-A--TGTG--T-TTATAAAATTAT--C--TTAAATG-T---TGGTA-TGC--TG-T-A-Ct
gi|30                         :                                                                   acccacgggtaTAAGTAA-GT---A----A-TTC-ATT-TTC--A-AAT--TT-G-GG-CC-C-AGAGA---GCATACAGAGAA-TACAGAGTTCA------------TA-TA--------------------CATGAA-T-A---A-TA-----AAAGA---AT-G-A------T-TA-T-C-CA--AA-GA--T---AG-----ATAAA----Gcggcatcaattcatggctacaaacaaatggaacttggaaacattctcccaaacagcgtcagtacttaaccgatactcgacactaccaatggtttaaacattcttttaaatctattttatctatctcaataatgtttccttgctgtaggacgcccggacgcagggaatttcaataaatgcctataagaaatgaaggctcttggatgatgagagagaactgattcatatttaccccacaacgattatttgtattccaaaaacttactaaatgaaacaattgccaagacttgaggattcacgaattactcgaaaatatttttcctctacagaatcttgttttgaaatgaatgaatatgttcgcagttttgccaccacattgggggttaatggtcgcaatgtctgaaagtgtactacaaatgccgcacctgcgaataattattaatcgctcatagcgtggactttaattaaaagataaacaagtttttgacacaattattccattgttcaatcatgactaattagaacattgtaatatcctaacttatttaacaaaaatatataatgaatggcggtaactgtagtatctttccacaaaataactaatttgttgttcactatatcctatacactcaattgattttcagtatacagcagttctcttgaaataatcgaatctacaaaggggaatctaaaattctcttccgaaaatattgtacgaacataagatctttttataacatcaaaatttacatagtggaattcgaccaagtttttcacgctacaataaatctgaagacccttttggaggtatcctttttatgtacaagtaacctacaaatattatttcaagagactttatgttttgcatttggtttaatcttacaatagcagtacattttattaaagaagaccttttctatacacaataaatggacaggggcccaaacgttgtatat
gi|15                         :                                                                             cTAAGTAA-GT---A----A-TTT-----TCA--A-T-T--TT-G-GG-GT-G-AGAGG---GCAT---------CATACAA---A------------TA---------------------------AA-T-C---A----------------GA-G-T------T-CC-TGT-AC--AT-GT--T---AT-----CTAAAAGGCGTATAATA--T-TAA-ATTACAAGT---TTA--T-GA---T-ATAAT----A-AACTT-TT-C--C---CC---------------ATA-AT----------GAA--CAGCTCTAGAGATA-TA--------GGGA-------A-TTGGCAA-AA--TTTCC-AT-T-AA-CA---TC-GTCA-----CA-T-C
gi|25                         :                                                                            aaTAAATAA-GA--AA----AGTTT-ATT-CCA--A-T-T--TT-G-GG-CC-CAAGAGG---GCAT---------AATAGAA---G------------TATTA--------------------TTT-AA-A-A---A-CATTCATGAAGA---AA-G-A------acacaagtctatgtataactataaaatattcatggactct
gi|10                         :                                                                         agtttaAAGTAA-AT--T--------TT-ATA-TCA--A-T-A--TT-T-GG-CC-C-AG------GCAT---------AACAAAG---A------------TA-TA--------------------CAT-AA-A-C---AACAA----GAAGA---AA---A------C-CA-TTC-ACCAAT-GA--T---AG-----ATAAC----GTA----A--C-TAACA----AAGT---T-AA-T-GA---T-A-AATC---A-AAATT-TT-C--T---CA---------------ATT-GT----------GAGAGCAGCT-------TA-TATTAAT---GT-A-------G-TTGGACA-AA--TT----AG-T-AA-TC---GCTGTCACATGTCA-T-CT-TTATACTGC--A-----T-AAAAG---CAA---TT-A---AAT------TATT--C-T-CT-AT-TAACATACCAAG-T--T-TA-T----------AA-GT--TTT---TA-TA-CAAA-GTA-T-TCA-T-------GGAT-----T---CTA-----TG-AAATG-G--T-T----------T--T--CTTGATGTT----AGTAT-GCCATG-T-AACACAATCAATGATG--A-AAAA-TGGAAT-TAACATGC--TTATC-AAAGCAC-AGT--ACAG-ACTTGCAG-ACA-CTTAACATTTTC-TCACATTTACAT-G--TGTTTTTG-TGTA--ACGCC--A---TCAA-AGCC-AAAGA-ATGAG-AACTGGTTCTGAAATATGG-----T-AAAACA-TTT--CAAGA-CTTGAGGATT-ATGAAaatgtccaaaaagaaggaagaaattattttttacaatattataacatacatggatgtgg
gi|9                          :                                                                        taagctaAAGTAA-AT--T--------TT-ATA-TCA--A-T-A--TT-T-GG-CC-C-AG------GCAT---------AACAAAG---A------------TA-TA--------------------CAT-AA-A-C---AACAA----GAAGA---AA---A------C-CA-TTC-ACCAAT-GA--T---AG-----ATAAC----GTA----A--C-TAACA----AAGT---T-AA-T-GA---T-A-AATC---A-AAATT-TT-C--T---CA---------------ATT-GT----------GAGAGCAGCT-------TA-TATTAAT---GT-A-------G-TTGGACA-AA--TT----AG-T-AA-TC---GCTGTCACATGTCA-T-CT-TTATACTGC--A-----T-AAAAG---CAA---TT-A---AAT------TATT--C-T-CT-AT-TAACATACCAAG-T--T-TA-T----------AA-GT--TTT---TA-TA-CAAA-GTA-T-TCA-T-------GGAT-----T---CTA-----TG-AAATG-G--T-T----------T--T--CTTGATGTT----AGTAT-GCCATG-T-AACACAATCAATGATG--A-AAAA-TGGAAT-TAACATGC--TTATC-AAAGCAC-AGT--ACAG-ACTTGCAG-ACA-CTTAACATTTTC-TCACATTTACAT-G--TGTTTTTG-TGTA--ACGCC--A---TCAA-AGCC-AAAGA-ATGAG-AACTGGTTCTGAAATATGG-----T-AAAACA-TTT--CAAGA-CTTGAGGATT-ATGAAaa
gi|26                         :                                                                           taagctaTAA-GT--TA----A-TTC-ATT-TTC--A-A-AAATT-GCGG-CC-C-AGAGGAATGCAT---------TACAGAG---A------------TA-TAAGGTTCAAATA---------CAG-AA-T-A---A-TA-----AAAGA---AT-G-A------T-TT-C-C-AA--AA-GA--T---AG-----ATAAA----GTA----G--A-TGG-A----ATGT---G-ATTT-GG---T-C-AATC---A-aa
gi|14                         :                                                                                     aga--TA----A-TTT--TT-TCC--A-A-T--TT-T-TG-CC-C-AGAGG---GCAT----------ACAAAG---A------------TA-TA--------------------CAT-AAAC-C---A-CA-----GAAGA---AA-G-A------C-CA-T-CCAA--AT-GA--T---AG-----ATAAA----GTA----A--AATAACA----AAGT---T-A--T-GA---T-A-AATC---A-AA--T-TTTC--T---CA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TAATTTAT--GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTC-AA-T-AA-C----ACTGTCA-----CATT-CA-TTA--CT-C--A-----T-A---AGC-CAA---AT-A---AAT------TTTT--C-T-CT-AT-TA-CA---CAGG-T--T-T--C----------AAAGT--TTT-----ATACAAAA-GTA-T-TCA-T-------GGATCTATATT--CTA-----TGAA--TG-GT-T-T----------T--C--TTAGATG-T---TGGT
gi|22                         :                                                                                 aaggtag--TA----A-TTT-ATT-TCA--AAT-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCATAACATGGAATACAGAGTTCA------------TA-TG--------------------CATGAA-T-C---A-TG-----AAAGT------G-A------T-CAAT-C-AA--A----------AG-----AT--------CA----A--T---A-A----AATT---T-A--C-GA---T-A-AATC---A-AC--TCTT-C--T---CT---------------ATA-AT----------GAG--CA----------------------------------------CAA------TTTCCTG-T-AA-C----ACCGTCA---A-AT-T-CG-TTA--CT-C--A-----T-A---g
gi|16                         :                                                                                    gtacatgA----G-TTT-ATT-CCA--A-T-T--TT-G-GGCCC-C-AAAGG---GCAT---------AATAGAA---G------------TA------------------------AC-AG-CTC---A-TA------AAGA---AA-G-AAATGTCC-CA-A-A-AA--AT-GAAGT---GG-----GAAAA----G---------T-TAA-A----ATAT---C-A--T-G------G-AATC---ACAA--C-TT-
gi|36                         : aaagaaaataaatttgagaaaaaatatcaattttgaaataagaaaataaaatttggaaatattcattatgatatctataggtgtaaagataatata-TTT-ATT-CCA--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---ACA----------TATAAAA---G------------TA-acatgtatgtgg
gi|27                         :                                                                                              acacgTT-ATT-TCC--AAT-T--TT-G-GC-CC-C-A-AGG---GCAA---------TA-AAAG---AATACCAGGTTCACA-TA--------------------CAT-AAAT-C---A-TA-----AAAGAGCTAA-C-A------T-TA-T-CTAA--AT-GA--T---AGATACTATAAA----ATA----A--C-----A----AGGT---T-A--T-atgatagttttataaagttgaaaacatatct
gi|42                         :                                                                                        aagtagtattaaagtaT-TCC--AAT-T--TT-G-GGTCC-C-AGAGG---GCAT---------c
gi|13                         :                                                                                                                  -T--TT-G-GA-CC-C-AGAGT---GCAT----------ACAAAG---A-------------A-TA--------------------CAT-AG-TTC---A-TA-------------AA-T-A------CACA-T-C-AT--AA-AA--A---TG-----ATAAA----GTA----A--TATAA-CC---AGGT---T-A--T-GA---T-A-AATC---T-AT--T-TT-T--TTTTCA---------------ATA-GT----------GAG--CAGCT------A------------------------A-TT-------A--TTGTCAA--T-AA-CA----CTGTCA-----CA-TTCA-TTA--CT-C--A-----T-A---AGC-CAA---AT-A---ACT------TTTT--C-T-CT-AT-TA-CA---TATG-T--T-TA-T----------AAAGTAATT------AT--ACAAGGTG-T-TTA-T-------GAA------CT--CTA-----TGAA--TG-G--TGC----------C--C--TTAGGTG-T---TGGTA-TGC--TA-T-A-CAG--TCA--AATA-TACAAAA-TGGAAA-T------CATCC-TC-AA--CAC-AGTC-A--G-Aaatatactcaa
gi|28                         :                                                                                                                                                          gAAAG---A------------TA-TA--------------------CAT-AA-------------------------A-G-A------C-CA-T-CCAA--AT-GA--TTATAG-----ATAAA----GTA----AGAT-TAC-A----AAGT---T-A--T-GA---TTA-AATC---A-AA--T-TT-CC-T---CA---------------ATTTGT----------GAG--CAGCT------ATA-tgcgtgcgcacgcctgcat
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                           -AA-T-C---A-TA-----AAAGA---GA-G-A------T-TA-T-C-CC--AAAGA--T---AG-----GTAAC----GTG----A---------------------------AA---T-A-ACT----------T-TT-C--T---CA---------------GTA-AT----------GAA--CAGCT------ATA-T-------------------------GCGT-AA--TTTTC-AA-T-GA-CA---gttgtgtgttaaattgg
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                 attagatg-A----AAGT---T-A--TAGA---T-A-A-TC---A-AT--TGTT-C--T---CA---------------TTT-GT----------GAG--CAG-T------ATA-TA---------T-A-------G-TTGGCAA------TTTCAA--T-AAGCATTCAC-ATTA-----CA-T-TA-TCA--CT-A--A-------A---G---CCA---A--ATACAAT------TTCT--T-TACT-AT-TA-CA---CAGGTT--T-TA-T----------AAATT--TTTTGCCTAT--ACAA-GTATT-TCA-T-------GGAT-----TCTGCT------TGAA--TG-GTTT-T----------T--C--TTA-ATG-T---TGGTATGGC--TGTT-A-CA---TCA--AATG-TA-AAAttgt
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AGCT------ATA-TAT-------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTC-AG-T-AA-C----GCTGTCA-----CATT-CA-TTA--CT-C--A-----T-A---
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TGGCAACGA--TTTT--AA-T-AA-CA----CCGTCA-----CT-T-CA-TTG--CTTC--A-----T-A---G---CCAGGTA--A---AGT------T-------------------------GT-T--T-TA-T----------CAAAT--TCT------TA-TCAATGTG-T-TCA-A-------GGA----------CTGG----TG-AA-TG-G--T-T----------TT-C--GTACA-GTTGAATGATAT-AC--AA-T-A-CAG--TCA---AT--TA-CAA--TGGAAT-T------CA-TC-TT-A---CAA-AGTTCA--GCATTTACAG-ACA-GT--GCATTTTCTTTTCAT----ATTACCCGTTTTTG-agcc
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     acCCCCAGTTTAAATAGCCAAAAGATG-A-G-AACTGATTATG-AAATTTA-----G-AAAACA-TTG--CAAGAC---GAGGATT-GCGAA-TTAC-TGAAAAATG---TTTTCTCTACAGAA------------ATG---C-A---------ATGT-TC-GCCAGT-TTGTCCA----ATT-G-----T--TG-TCTG-CA----ATTGCCTGA-AAGTGTACTACA----------CCTTC--ATGAAT-AT-----TTCTCTTTTTA--AATCT--------ATCAGA----TAA----TT---------TATT-AG---T---------AACAA----T
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        taATTCCAAAAACTTACTAAAT-GAAACA-ATTGCCAAGAC-TTGAGGATTCACGAATT-AC-TCGAAAATATTTTTC-CTCTACAGAATCTTG-TTTTG-AAA---TGAAT--GAAT-ATGT-TC-GCAGTT-TTG-CCACCACATT-GGGGGTTAATG-GTCG-CA----A-TGTCTGA-AAGTGTACTACAAATGCCGCACC---T--GCGAAT-AA-----TTA-------TT-AATC---------GCTCATAGCGTGG----AC---------TT-T-AA---TTAAAAGATAAACAAGTTTTTGA-C-AC--A----ATTAT-TC--CATTGTTCAATC--ATGACTAATTAGAACAT-TGTAATA-T--CCTAA-CTTATTTA---ACAAAA-ATATATAATG-----AAT----GGCGGTAACTG-T-AG-TATCTTTCCACAAAAT-AACTAATT-T-GTTG-TTCACTATA-TCCTA-TACACT-CAA-TTGATTTTCAGT-ATA-CAGCAGTT-C-TCTTGAAA-TAATCGAAT-CTACAAAGGGG---A----------ATCTA-AAATTCTCTTCCG-AAAA--TATTGTACGAAC-ATAAGATC-TTTTTAT-A---ACA--TCAAAATTTACATAGTGGAATTCGACCA-AG-TTTTTCACGCTACAATAAATCTGAAGACCCTTTTGGAGGTATCCTTTTTATGTAC----------AAGTAACCTACA---AATATTAT-TTCAAGAGACTTTATGTTTT-GC-A-TTTGGTTTAATCTTAC--AATA--GCAGTACATTTT---ATTAAAGAAGACCTTTTCTA-TACACAATAAata
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                             acccacgggtataagtaagtaatatcttatttatttccaattttgggcccaggggcatacaagatataaccataaactcaacagaagaagtgcatctcaaatgatagataaagtaacataacataagttatgggactcactcacaaaattttcatgacacagtacactgattgttacctgatacgagcagctgcatacactcactgtagttggcaaaattttttcaattaaacacacgttcacattcattactcataagccaaacatccacgattttctcctattaaacaggtgatatatacctccgataaaagtatttatacaagtatatcatcatacaaggattctattgtgtaatgtgtttataaaattatcttaaatgttggtatgctgtaccggcatcaattcatggctacaaacaaatggaacttggaaacattctcccaaacagcgtcagtacttaaccgatactcgacactaccaatggtttaaacattcttttaaatctattttatctatctcaataatgtttccttgctgtaggacgcccggacgcagggaatttcaataaatgcctataagaaatgaaggctcttggatgatgagagagaactgattcatatttaccccacaacgattatttgtTTTTTCCCTTGAAAAGCTTC-TTTTG-A-A---T-AAT--CCGT-ATGT-TC-GTAA-C-TTG-TC------CT-T----TT--CA-TTTT-TAGCACA-T-TCTGACAAAT-TACTTTG----------C---C--ATACAT-GTACATATTA-------ATAAATCTTTTTCTAAGTTCAT----TAA----ACACTTTTGATTG-T-AGATCT---------GAAAC----TTGA---AA--A----A-GAT-GT--TAT--------C--GC--------AGGA------TA-TG-C--C-AAG-TTGATTCAGTAA----A-A-----AATA-----AAC----A-------CTGCTCAA-C--------------C-AACAATTC-TTTTTG-TT------A-TC--A-TTCAAA-A----------TCA-T-AT---------T-T-TCTT--GA--AGT-GCACACT-CAA-GCAA---AGTATCATTTGATTTATGAATGTGT---TG-TAAA--TATTT----AAC-A---G--T-ATTGGAT-A---AGGTTTCAATAT--AT-AA-TGGATGCCTACCT-AA-TT---CCC-CCATAACTGCA-TAG-------TTTG-AAG---CTTTCTTATGTACCCCCCGGTGTA------CCCCA---CATA-TGTACTTGAGAGTTTTAATG---T-GA-A-GTT-------TATCAC--TATAT-ATA------TTTTTCATTGAG-------TTTTCAA-T--ATTATAATTTGGTCT-CTTAACAATAGCAGATT-CTGAATTTATAATTC---CCCAAATTTCACTTCCAT-ATAACA-CAAT-A------G-G-T-------TTT----ATTG-TGTGATCAatggacaggggcccaaacgttgtatat
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aggta-T-AG---T---------AACAA----TTGA-T-AC--A----ATAAT-Taaaagatgcaacaaaatgccggcatt
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             atgtaacttatTA-TA-T--T-TAA-CTTATTCA---A----A-ATAT--AATG-----AATCAATG-------CTACT-AC-T--------------CCAACTACTT-TTGTTG-TT------A-TC--A-TACAAT-AC
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ATAGAGCATAA-TT---CCC-CCATAACTGTT-TGG-------TTTG-AGG---TCTTCTTGTGTAT----------T------CCATATAGAGTA-TGTACTTGAGGGGTTTAATG---T-GA-A-GTT-------TATCACTAAATA--TGA------TTC---ATGGA-------CTTTTCAA-C--ATTATAATTTGGGCT-CTTTACATCAGCAGGTT-TTGAATTTGTAGTTTCC---CAAATT--------AC-A-AA-A-CA----------G-G-T-------TTT----ACAG-TGTGATAAAA----AAAAAAGAT-GCAAC--AA-AATACTGGAATTTGGCCT---TGCAAT--TTCAAAAAC-----AT--TTAATTAATT-TAAAGAAA-GCATTCAAACCAC-GCTTATA-CAGG-TCT-TG-TTG-ACAATTAACATATA-ATCCAAAG-GCAT--TG--A-A-T--ATA---CCA---CGTAAATATTAATGAATAAAA-G-ACAATGAATGTTC-TAT--TTCCTTATCTT-TA-TAAACA--AAT--TTT---AAGTTTCTTAC---------CTTTGC-------------ATTCTTGTA---------------AAA-------AAAAT-GTTGTCCTTGTCTTTTTCAAATTAAC--AG-AGAGACAATGTTT-A-T
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gATAATCAGGGCG-TTTGACGG-AACTTGTA-cata
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ACTTGTATCTGTATTTATTGTTCCC---CAAAT-----------------G-CAGT-ACTTACCG-G-T-------TGA----CCTG-TATGATCATA----C-AA---GT-GTATC--A--GGTA-TGCATTtc
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CAT-A-AA-GGCAGT-ACT----G-G-TCCGTTCGTTACATTACTGATATGATCATAACACCAAG---TT-GTATCTCAGCGGTG-TGTACTTTT--TTCGCT--AATA-TTTC-----CAAAACC--TTGACTAGCTCTAAAATAA-GCCTTTAAGGCTCTTTT-GTA-AAGAATC--AAATTGGAC----AACATGTG-A---AGGA-GCCTGATGCAG-G-T--AAAAAACAATT-CC-AGAGATT--TG--TACGATG-ACACT---TGTTCAGATGATT--TGATTTT-TAATAGAAA--AAC--TTTTTTA----TCTGAT---------TTTT-CTTACCGTTTTTTTA------CA---------------GAATA-TATGACAATGTTT----TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGAATAGGCAATATTT-ACTGAACATCAGCATTCAAGCTTTTTTAATACATACCCGCTG---AGCCCCT-CCCTCGGTTTTCAGAATTAACACTGAAAAA--TCATCAGCATACCACGACTA-AACACATTTAAGCGATGTG-TCACCTAATTTTGCG-CGGGATAATATTTATCATTATATCAGTC-GGACAATAG-ATATCTGGTTCAGGATCCATGTCGAGTTTAT---TATTTTAACAAAGGTTT-G-ACTTACGGTACTTCTGTTACTCCTCCCGGGCTGTTTAG-ACGACTCCACTCC-ACCGTTAAGGCCTTTCCACATGAAATTCG-AAGTTT-ATATCTGTTGTTCGGAGTTTGTGGTACAGTTATTAATTATG-TTTGGCCA-GTACATACTCTTGACATGACTTTATAGA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  T--TG--TACGATG-ACACT---TGTTC-GATGATT--TGAATTG-TA-TAGAAA--AAC--TTTTT-A----TCTGAT---------TTTT-C-------------A------CA---------------AAATA-T--GACAAT-TTT-----TGTCTTTCTGAGGTTGAC--AG-ATAGGCAATATTT-A-TG-ACAATAGCATTCAAGCTTTTTT-ATACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCAGTTTCAGAAATTAACACT-----tgtaattcatcggccattcatcgtttcacttctagtcgaagttgtgtcgcaagccttgtg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -TG-ATAGTAGCGTTCAAGCTTTTTT--------------G---AAGTCTT-CCTTCAGTTTCAGAAATTAACACT-----AAGTCATCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAA-GATGTG-TCACCTAATTTT--GCTGGA-------TCATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TC--------TC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AAAGATTT-GGACTTA-GGT-------C-G--TCTCCC----TGTCTAACA----------CCCACCTT-AGG-----TTCAAAT--------------T-AT--------TTTGAAGTTT----TACAG--AC--AGTATG-TTT-GCCATGTACATACTTTTG--ATGACTTTATAGAAAGGCCCCTT-ATGTCAAGC-TG-ATGCAGCC-TGTGTAG-AAGATCTG-AATGTAAAACAGTGTCAAAAGCCTTAGAAAAATCAACA-AAGCAAACGTATAATT--TGG-AATTA--TCATTTGTATA-TTTTTGAATAACGGTTCT-AAGTATAAAAATGTGGTCACTAGTTCTGGCTTTTGGTTGAAAACCAATTTGAACTTTATTTATAATGTTGTTCGAGTCCAAGTAGTTTTGTAACCTGGTATTCAGTATGCTATTAAATATACTTTGGGATA-
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     caaaattagg-TCACCTAATTTT--GCTGGA-------TCATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAGAA----TGGT---AGATT---ATt
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aTCAGTATGCTATTAC---TCCTTT-GGATA-AGC-AAGAAGTT-ATAG---TTCTTCT------GTAATGTGATGGGTCAGAAGGACTATCATT
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GGGCTATCATTCTTATGAATTAC-TTTGATAAAGCCTGTATCCCACT-CCTTTGAATATT-TGC---CAGAGGACAA-GATAAATTACATGTAGATAATTT-C-AGCAAA--TGGT-ACAATATGTGGTACGGTGGCTAGTAACATTTCATTTTCATTG
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tcagacaAAAATATTT-ATTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAGATATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGACT--TTCAAAACC-------GAGTTTCCAG-TATGATA
5 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): TTCCAATTGGGTCGCTGTGCCCCAGAGCGCGCAAGAACTAATAGGAGAGACCGTACTTAACAGTTGAGAAAGAATGTCCCAAAAAAAAGAAGTGCGGAAAAGTGACTAAGATTTCAAGTACAGAGTGCGTAATCACAAACTCTAACAT
Unaligned ( gi|29 ): CACAGGTTTCAGACATTTCATTATTTTATCCCACCCAAACATGCTTGATTTATTATTTTTTAGCTTTGTCACGGCAGAGATTATTTCCTTTTCTATATTTCCTAACG
Unaligned ( gi|35 ): AAGGGTATTCAGAACAAGAATGACATGGGAACATAAAGAAATAAAGTAAAATAAACAGGGAAAAACATCCAGATG
Unaligned ( gi|38 ): AATAAATTTGGAAATAAAATATCAATTTTGAAATAAAGAAAATAAATTTGAAATATTCATTATGATA
Unaligned ( gi|39 ): TATTTTTCCCTTGAAAAGCTTCTTTTGAATAGGCCTAATCCATATGTTCGTAACTTGCCCTT






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        1111111111111                                                                             
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                1111111111              1                              44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444      1111                                      1                          111                                          111              222222222222222      1111111111          444444444444444444444444444444444                   11     222         2222     11111                  11111        11111                      111              2222222222          1111    11              1111111   2222222222                    2222222222222        111111    22  11     111          111   22222222               222222        111111  11        1                      11                 111111                       11                                             11111          111     22               1              1                    11         33333333                    111     111   11111   222222      11111                       11111   33333333333333333          333333333     2222222222     1111     333333333333333        222222222     1111     11     1111  111111                                 1         11            1111         222    11111   22222222222222      222222222222                   111111     11                                                                 11     33333333333333            111         11            111                111                  11               111                      111111         111             55555555555555555     111       22                111     1   2222222            3333333333333           222222                                             111                    11                   111     1111111    222222222222222    1          22222222222                      111           11   11          222222   11                              111              1         1111          111             11  1                                          111     1                                2222222222          222222222    5555555555555555555555555555555555     11     11                                          111                         11     111     111                                2222              2222    1    11      2   1                 11   2222222       11                    1111    111     111     11    111        1        1 1     1  4444444444444     2222 1       1  666666666     1     22222       2222222222      1  33333333          2222     222222      1   1                   11               11              22222         2        2        2   1                                2                33       22222              2               2                                                                                                                  111      1     1            2      11      3333333                 1                                          1   1              2   222    1     2      4444444          3333            22        2   111        1          1           1    111  1                       11                                  22222222      1     1   222    11     11111     1        111          11                      2               2              0000000000000                2            2           33      6666666666          1       
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             3  0000000000   2   2  555 0 2 22  2 2  4  2 2     333    77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777   8  3333  7777 33 4444   555  222 4444  2  77 4 55  77   666      2   4  333     2    444  4 2  999 2 999999    444 2 222 5  8888 444  111111111111111   2  1111111111   77     222222222222222222222222222222222       2  33     3 55 2   222      2  0000 66  44444    8 33 77777 33 44444        11111 1      3 3  3  3  6  111     44 3 3 3 0000000000        3 0000 3  77  3    3 3  3 0000000   5555555555   6  555  6  3 6 3 3333333333333     0  444444    44  00   3 666  9999    666   00000000 55    4     8 222222  4 8   888888  11   4  4 2   8 55   4    4   8  66        5  0   5 000000      0  1  99999  6   55 4    1 5    5  5   5          11   77  33   22222     5    222     00         5     5    888       1     5    0     3   00     5 5 22222222     66   5   5  5  333 5   333   22222   000000  77  11111   5 5       5         44444   33333333333333333      5   666666666     3333333333     3333   0 777777777777777 5  888 000000000     0000  5  11  77 2222  666666 6 5   99  99 99   99  99        3   5   5 33    5       2222 77  5   999    44444   44444444444444    5 777777777777       77 5      5 666666  5  55 5      5 4 6   6   99   666  7     99 666    99  99   6    6  3 44     11111111111111     6      111  6      55    6  6    888  99 6       6  111   99     99   11 88            6  111  6   6           6   999999   99    111             22222222222222222   1 111     4 22   0    1   7   111  6  3   1111111 1    99    2222222222222    1    6 111111    6   9999         3        6   888        000               9  6 77     6666666    5  111     6666666 5  000000000000000    1          44444444444  6     99 77    6    111    1 5  8 11   88  8       000000   11        8         8 1         666  0   8    8  3  88  8  7777        8 444     8       11  6 0  999  0  8  3       99  99        6    111     3   2   99      6   6            2222222222   99  6  666666666    0000000000000000000000000000000000     55     44   99                   99   6            111   6                     66     444     444       8          77            8888    3       3 1111    0    33      0   0         0    0  44   6666666       11    8   8    8    8 7777    444     444  2  33    777        0        0 0     0  2222222222222     1111 0       0  555555555     0   6 55555       6666666666      0  66666666  2       1111     555555      0   0    3        3     99             0 00     7        88888         3        3  1     3   2    0  0             7          3    7   0       00    88 22222              3      1        3       1                 6  1                                7  0     1    6          0   1   1                   777      0     0   7 7      3  1   33      5555555  1 1    6     1 0            0        1 88  88         0 1 2   2   6      7   3   111    2     3      9999999  0 0     4444   1   7    11     0  7   333  6 22  0          0  2 1      3    777  3  7      7    0   0    44                            3  1  55555555      0     3   555    44     99999     0   55   222          44                      3      1        3              5555555555555     7      7   3    7       3     0     00   7  3333333333      6   3       
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .  ..........   .   .  ... . . ..  . .  .  . .     ...    ..............................................................   .  ....  .... .. ....   ...  ... ....  .  .. . ..  ..   ...      .   .  ...     .    ...  . .  ... . ......    ... . ... .  .... ...  ...............   .  ..........   ..     .................................       .  ..     . .. .   ...      .  .... ..  .....    . .. ..... .. .....        ..... .      . .  .  .  .  ...     .. . . . ..........        . .... .  ..  .    . .  . .......   ..........   .  ...  .  . . . .............     .  ......    ..  ..   . ...  ....    ...   ........ ..    .     . ......  . .   ......  ..   .  . .   . ..   .    .   .  ..        .  .   . ......      .  .  .....  .   .. .    . .    .  .   .          ..   ..  ..   .....     .    ...     ..         .     .    ...       .     .    .     .   ..     . . ........     ..   .   .  .  ... .   ...   .....   ......  ..  .....   . .       .         .....   .................      .   .........     ..........     ....   . ............... .  ... .........     ....  .  ..  .. ....  ...... . .   ..  .. ..   ..  ..        .   .   . ..    .       .... ..  .   ...    .....   ..............    . ............       .. .      . ......  .  .. .      . . .   .   ..   ...  .     .. ...    ..  ..   .    .  . ..     ..............     .      ...  .      ..    .  .    ...  .. .       .  ...   ..     ..   .. ..            .  ...  .   .           .   ......   ..    ...             .................   . ...     . ..   .    .   .   ...  .  .   ....... .    ..    .............    .    . ......    .   ....         .        .   ...        ...               .  . ..     .......    .  ...     ....... .  ...............    .          ...........  .     .. ..    .    ...    . .  . ..   ..  .       ......   ..        .         . .         ...  .   .    .  .  ..  .  ....        . ...     .       ..  . .  ...  .  .  .       ..  ..        .    ...     .   .   ..      .   .            ..........   ..  .  .........    ..................................     ..     ..   ..                   ..   .            ...   .                     ..     ...     ...       .          ..            ....    .       . ....    .    ..      .   .         .    .  ..   .......       ..    .   .    .    . ....    ...     ...  .  ..    ...        .        . .     .  .............     .... .       .  .........     .   . .....       ..........      .  ........  .       ....     ......      .   .    .        .     ..             . ..     .        .....         .        .  .     .   .    .  .             .          .    .   .       ..    .. .....              .      .        .       .                 .  .                                .  .     .    .          .   .   .                   ...      .     .   . .      .  .   ..      .......  . .    .     . .            .        . ..  ..         . . .   .   .      .   .   ...    .     .      .......  . .     ....   .   .    ..     .  .   ...  . ..  .          .  . .      .    ...  .  .      .    .   .    ..                            .  .  ........      .     .   ...    ..     .....     .   ..   ...          ..                      .      .        .              .............     .      .   .    .       .     .     ..   .  ..........      .   .       
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             1  8888888888   2   1  555 5 0 88  0 0  0  0 0     555    88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888   0  5555  2222 11 2222   555  888 2222  1  11 7 88  22   999      2   7  666     4    111  7 4  444 5 777777    444 5 222 0  2222 777  333333333333333   7  7777777777   33     111111111111111111111111111111111       5  44     1 77 5   555      7  7777 33  33333    6 99 11111 99 77777        77777 4      3 3  3  3  7  777     66 3 3 3 4444444444        3 4444 3  44  3    3 3  3 8888888   1111111111   7  888  7  3 7 3 9999999999999     4  888888    33  00   6 444  0000    444   55555555 00    0     0 555555  0 0   000000  00   0  0 0   0 55   0    0   0  55        0  5   0 666666      1  0  33333  7   77 3    4 0    7  7   7          00   66  22   55555     0    111     66         0     5    222       7     0    8     2   66     0 0 88888888     99   0   0  0  999 0   888   99999   777777  99  44444   7 7       7         33333   11111111111111111      7   666666666     6666666666     2222   2 888888888888888 0  888 000000000     6666  7  66  99 1111  444444 6 7   22  22 22   22  22        3   7   7 66    7       1111 99  7   333    33333   44444444444444    7 777777777777       99 7      7 444444  7  77 7      7 3 7   7   22   888  3     22 888    22  88   7    7  5 00     88888888888888     7      777  7      88    7  7    333  22 7       7  777   22     22   66 66            7  777  7   7           7   222222   22    777             88888888888888888   0 777     2 22   7    0   8   777  7  3   7777777 0    22    2222222222222    7    7 888888    7   3333         7        7   777        000               3  7 55     2222222    7  777     4444444 7  333333333333333    4          00000000000  7     22 77    7    777    0 0  0 00   66  0       888888   00        0         0 0         222  8   0    0  2  88  0  0000        0 000     0       00  0 8  444  8  0  2       22  22        7    777     3   5   22      7   7            5555555555   22  7  777777777    0000000000000000000000000000000000     88     00   22                   22   7            555   7                     22     000     000       0          88            0000    2       2 2222    0    22      0   0         8    8  44   0000000       00    0   0    0    0 0000    000     000  0  88    555        0        0 0     0  2222222222222     2222 0       0  222222222     8   5 00000       2222222222      0  22222222  0       2222     555555      0   0    2        2     88             7 33     3        77777         7        7  0     7   3    7  7             3          3    3   7       00    33 00000              7      0        7       0                 7  0                                3  7     0    7          7   0   0                   000      0     0   3 3      3  0   00      3333333  0 0    7     0 0            7        0 33  00         7 0 0   0   7      3   3   000    0     3      7777777  7 7     3333   0   3    33     7  0   777  7 00  0          0  0 0      3    777  3  3      3    7   7    00                            5  2  88888888      0     3   000    77     33333     7   33   000          77                      7      0        7              7777777777777     3      3   3    3       3     7     33   3  3333333333      7   3       
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GGTAAGTAA-GT--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT---------TACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--T-CA-T--A-GA----AGA---AA-G-A----TC-AT--C-A--AAT-GAT---AGATAA-AGT-AA-A-TAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A------AATC---A-AA--T-TT-C--T---CA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TA--------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T-AACA-ACTGTCA-CA-T--C--AT-----TACT-C--A-----T--A--A--GCCAAATA-----AATTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-T----------AAAGTTTT-T----A-TACNAA-GTAT-T-CA-T-------GGAT-----TT--CTA-TG---AA-TG-G-T-T----------T--CTTAGATGTT---TGGTATTGC--TGT-A---CAG---TCAA---ATG----T-A-A--AAAT-GGAAT-T------CA-T-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-GCAG-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCAT-TTAACTTGTGTTTTTGTGT--A--AC-GCCC-AGTTTCAATAGCC-AA-AGA-ATGAGAACTGATTCTGAAAATTTG-----TAAAA-CATTT--CAAGACCTTGAGGATT-ACGAATTTAC-TGGAAAATATTTTTT-CTCTACAGAATCTTG-TTTTG-A-A------T-AATGC--ATA-TGT-TC-GCAAGT-TTG---CCA----CATT----G-TT--TG-TCC-GCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---C--GTGAAT-ATTTAT------AAATC---------GCTCAT---GTAAAC---------T--AT-T-AG---T---------AACAA----TT-GAT-AC--A----AT------ANT-TTT--AT--C--ATG--TA--TAGAACAT-TGT-ATA-T--CTAA-CTTATTC----A--AA-ATAT--AATG-----AAT----GC--------TACT-A---NT-C-----AACTACT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACA-TTG-TTT--TCA-T-ATACAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-GAAT-CTAC-AAGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TT-CGTAAA--TATT-TA-AAAC---AG--C-TTTTTAT-AA---CAT--CAAAA--TACATA-TGGGAATCGACCA-AG---TT-CAC-CTACAATAGCT-TGA------TTT--GAGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---AATATATA-TTCGAGAGTTTTAATG---TG-CA-TTT-------TNTCGC--AGTA-ATA------T--TTATTAAAG-A----N-TTTT-CTA-T--ACAATAATCNGGGCGTTT-GACGG-AACTTGTA---TCTGTATTTATTGTTCCC-CCCAAATTTCACATGCATA-AA-G-CAGTA-CT----G-GT-------TT-A----ACTG-TATGATCATA----CAAA---GT-GTATC--AG-GGTG-TGTA---TTTTNGGTT-T--AATA-TT-CCAAAAC-----ACTT--GACTAGTT-TAAAATAAG-CCTTTAAGGCTCTTTTTGTA-AAGA-TCNAA-TTG-AC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATG--AG-TAAAAA-CAATT-CCCAGATATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATT--TGATTT-TTA-TAGAAAAACTTT-------TT-ATC--TG-AT---------TTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAAT-TTT--TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-A-TGA-CAATAGCATTCAAGCTTTTTTAATACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCGGTTTCAGAAATTAACACTA---AATCATCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAG-GAT-GTGTCACCTAATTTTGC-CGGA-------TTATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AAAGGTTT-G-ACTTA-GGT-------TTA--CCTCC----C-TGTCTAA-ACG--------CCACCNTTAGG-----TTCAAATG-AA-CTCGTAAGTTT-AT--------TTTGGAGTTT----TACAG--AT--ATTATG-TTT-GCCATGTACATACTCTTGA-ATGACTTTATAGAAAGGCCCCTTTATGTCAAGT-TG-GTGCAGCCT-GTGTAGAA-GAGCTGAA-TGTGAAACGGTATCAAAGGCCTTAGAAAAATCAACA-AAGCAAACGTACAATT--TGGAACTTAA-TATTTGTATATTTTT-GAATAAGGGTTCTAA-GTATAAACATGTGGTCACTGGTTCTGGCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTTATAATATTGTTAGAGTCCAAGTAGTTTCGTAACCTTGTATTCAGTATGCTATTAA--ATACTTT-GGATA-AGCAAAGAAGTT-ATTGTTA-TCCTCTA---TAGTANTTTGATGGGTCANA-AGGGCTATCATTTTTATGAATAGGTTTTAATAAAGCCTATTTCCCACTCCCTTTGGGTATT-TGCCA-CAGAGGACAA-GACAAG----AT-TAAATAATTT-CAAGCATATGTGGTAA-AATATATG-TACGTCGGCTTTCA-ACATCTCATT-TTTAATGCCAT-CTAATCGCA-GCTTGATTTATTATTTTTTAGATGTTTTTATTGCATCGATGATTTTCTTTTCTNTAATTG-A-TAAATCTAAC-GAAGT-AATG--TTGATATTTCTGCTGACTTGGACAANNAATCTTCAAAATATTTAATTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAGATATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGACT--TTCAAAACCCT-----GAGTTTCCAG-TATGATA
Reference ( family-3541 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GGTAAGTAA-GT--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT---------TACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--T-CA-T--A-GA----AGA---AA-G-A----TC-AT--C-A--AAT-GAT---AGATAA-AGT-AA-N-TAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A------AATC---A-AA--T-TT-C--T---CA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TA--------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAAN-T-AACA-ACTGTCA-CA-T--C--AT-----TACT-C--A-----T--A--G--GCCAAATA-----AATTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-T----------AAAGTTTT-T----A-TANCAA-GTGT-T-CA-T-------GGAT-----TT--CTA-TG---AA-TG-G-T-T----------T--CTTAGATGTT---TGGTATTGC--TGT-A---CAG---TCAA---ATG----T-A-A--AAAT-GGAAT-T------CA-T-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-GCAG-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCAT-TTAANTTGTGTTTTTGNGT--A--AC-GCCC-AGTTTCAATAGCC-AA-AGA-ATGAGAACTGATTCTGAAAANTTG-----TAAAA-CATTT--CAAGACCTTGAGGATT-ACGAATTTAC-TGGAAAATATTTTTT-CTCTACAGAATCTTG-TTTTG-A-A------T-AATGC--ATA-TGT-TC-GCAAGT-TTG---CCA----CATT----G-TT--TG-TCC-GCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---C--GTGAAT-ATTTA-------AAATC---------GCTCAT---GTAAAC---------T--A--T-AG---T---------AACAA----TT-GAT-AC--A----AT------ANT-TTT--AT--C--ATG--TA--TAGAACAT-TGT-ATA-T--CTAA-CTTATTC----A--AA-ATA---AATG-----AAT----GC--------TACT-A---NT-C-----AACTACT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACA-TTG-TTT--TCA-T-ATACAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-GAAT-CTAC-AAGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TT-CGTAAA--TATT-TA-AAAC---AG--C-TTTTTAT-AA---CAT--CAAAA--TACATA-TGGGAATCGACCA-AG---TT-CAC-CTACAATAGCT-TGA------TTT--GAGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---AATATATA-TTCGAGAGNTTTAATG---TG-CA-TTT-------TNTCGC--AATA-ATA------T--TTATTAAAG-A----N-TTTT-CTA-T--ACAATAATCAGGGCGTTT-GACGG-AACTTGTA---TCTGTATTTATTGTTCCC-CCCAAATTTCACATGCATA-AA-G-CAGTA-CT----G-GT-------TT-A----ACTG-TATGATCATA----CAAA---GT-GTATC--AG-GGTA-TGTA---TTTTNGGTT-T--AATA-TT-CCAAAAC-----ACTT--GACTAGTT-TAAAATAAG-CNTTTAAGGCTCTTTTTGTA-AAGA-TCCAA-TTG-AC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATG--AG-TAAAAA-CAATT-CCCAGATATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATT--TGATTT-TTA-TAGAAAAACTTT-------TT-ATC--TG-AT---------TTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAAT-TTT--TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-A-TGA-CAATAGCATTCAAGCTTTTTTAATACAT---CGCTG---AGGCCCT-CCCTCGGTTTCGGAAATTAACACTG---AATCATCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAG-GAT-GTGTCACCTAATTTTGC-CGGA-------TCATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATCGA--TTAA---TATTTTAA-AAAGGTTT-G-ACTTA-GGT-------TTA--CCTCC----C-TGTCTAA-ACG--------CCACCNTTAGG-----TTCAAATG-AA-CTCG-AAGTTT-AT--------TTCGGAGTTT----TACAG--AT--ATTATG-TTT-GCCATGTACATACTCTTGA-ATGACTTTATAGAAGGGCCCCTTTATGTCAAGCCTGTGTGCAGCCTTGTGTAGAAAGANCTGAAATGTAAAACGGTGTCAAAGGCCTTAGAAAAATCAACACAAGCAAACGTACAATTGCTGGAANTTAATCATTTGTATATTTTTTGAATAANGGTTCTAAAGTATAAANATGTGGTCACTGGTTCTGGCNTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTTATAATGTTGTTNGAGTCCAAGTAGTTTCGTANCCTNGTATTCAGTATGCTATTAA--ATACTTT-GGATA-AGCAAAGAAGTTGATNGTTANTCCTCTA---TAGTANTNTGATGGGTCANA-AGGGCTATCATTCTTATGAATNGNTTTTGATAAAGCCTGTNTCCCACTCCCTTTGGGTATTCTGCCAACAGAGGACAACGACAAGTTACATGTAGACAATTTACAAGCANATGTGGTAANAATATGTGNTACGNCGGCTNNCA-ACATCTCATT-TTCANTGCCAT-CTAATCGCA-GCTTGATTTATTATCTTTCAGATGTTTTTATTGCATCAATGATTTTCTTTTCTTTAATTG-A-TAAATCTAAC-GAAGT-AATG--TTGATATTTCTGCTGACTTGGACAATAAATCTTCAAAATATTTAATTCTGGGTATCAAATTTACTAGTCAATACNGAACAATGTTTGTAAAATGATTTACACCCATTGTTCACTAGATATCTTAATCGGACTAATCTTGCGGATTGCTGACTGATTCAAAACCCTTTCAAGAGTTTCCAG-TATGATA
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GTAAGTAAAGT--TA----A-TTTTATTCTCCGAA-T-T--TT-G-GG-CCAC-GAAGG---GCAT----------ACAA-G------------ATAT---------A--------------------AAA-AA----CA-C--A-GA----AGA---AA-G-T----GC-AT--CCA--AAT-GATGA-AGATAA-AGT-AA-A-TAACA-AAGT---TA-T-GAA--T-A------AATC---A-AT--T-TT-C--T---CA---------------ATT-G-----------GAG--CAGCT------ATACTT--------GT-A-------GATTGGCAA-AT--TTCTCAACCT-AAAC-ACTGTCA-CA-T--TCGAT-----TACT-CCAA-----T--A--A--GCCAAATA-----A-TTTTTC-T-CTGATCTA-CA----AGGT--T-T-AAT----------AAAGTTTT-TT---A-AAACAA-A-GT-T-CAAT-------GGAT-----T---CTA-TG---AA-TG-G-T-T----------TGTCTTAAATGTG---TG-TAT-GC--TGT-A---CAA---TCAA---ATG----T-A-A--AA-T-GGAATGT------CA-T-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-GCAG-ACAGCT--ACATTTTC-TCTCAT-T--ACTTGTGTTTTTGTGTTAA--AC-GCCCGAGTTTCAATAGCC-AACAGA-ATGAGAACTAATTCT-AAAATTTG-----TAAAAACATTTT-CAAGAC-TTGAGGATT-AC-AATCT-----GAAAATATTTTT--CTCTACAGAATCTT--TTTTG-A-AC-----T-AATGGGAATAATGT-TC-GCA-GTGTTG---CCA----CATT----GGTT--TG-TCCTGCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---CCAGTGAA--ATT---------AAATC---------GCTCAT---GCTAAC---------TTTA--T-AG---T---------AACAA----TTTGATTACGGA----AT------ATT-TTT--ATATC--ATG--TA--TAGAACATCTGT-ATAGT--CTAAGCTTATTC----A--AACATA---AATG-----AGA----GC--------TACT-A---GTTC-----AACTACT--T-TGTTTG-T------TA-TCGAA-TACAAT-ACAGTTG-TTTCATTA-T-AT-CAGCA--TAT-TCTT--AA-GAAT-GAAT-CTAC-AGGGGGCGAA----------ATCTA-AAATTC---TT-CGAAAAA-TATT-TA-AAAC---AG--CGTTTTTAT-AAACACAT--CAAAA--TACATA---GGAATCGACCA-AG---TTTCAC-CTACAATAGCT-TGA------TTT--GAG----CCTTTTTAGGTAC----------AGA----CCA-A---AATATAT--TTCAAGAATTTTAATG---TGGCAATTT-------TTTCGC--AGTA-ACA------TGTTTATTAAAG-A----CGTTTT-CTAGT--ACAATAATCAGGGCGTTTTGACGG-AACTTGTA---TCTGTATTTATTGTTCCC-C--AAATTTCACATGCATA-AAAG-CAGTAACT----GTGT-------TTTA----ACTG-TATGATCATA----CA-----GTCGTATC--AG-GGTG-TGTA---TTTTTGGTTAT--AAT--TT-CCAAAAC-----ACTTTTGACTAGTT-TAAAATAAGGCCTTTAAGGCT---TTTGTAGAAGA-TCCAAATTG-AC----AACATGTGTA---AGGAGGCCTGATG--AGGTAAAAA-CAATTGCCCAGATATT---G--TACGATGAACACT---TGTTCTGA--ATT--TGATTT-TTA-TAGAAAAACTTT-------TT-ATC--TG-AT---------TTTT-T-------------ACAACGTTTTTTCTACAGAAATATT-GACAAT-TTT--T-GTCTTTCTGAGGTTGACCAGGA-TAGGCAAAATTTGA-TGA-CAATAGCATTCAAGCCTTTTTAATACAC---CGCTGTGAAGGCCCTCCCCTCGGTTT-AGAAATTAACACTA---AATCATCAGCAT-C----AACATAACA---TTAAGAGATGGTGTCACCT-ATTTTGC-CGGA-------TTATCAT--TATC-GTCGAAAA-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAATATTATTTTAA-AAAGGTTTGG-ACTTA-GG--------TTA--CCTCC----C-TGTCTTA-ACAC-------CCACACTTA-G-----TTCAAATG-AA-CTCGTAAGTTTGAT--------TTTGGAGTTT----TAGAG---T--ATTATGTTTT-GCCATGTACATAC-CTTGA-TTGACTTTATAAAAGG--CCCTTTATGTCAAGTCTGTGTGCAGCCTTGTGTAGAAAGAGCTGAAATGT--AACGGTATCAAAGGCCTTAG-AAAATCAACACAAGC-AACATACAATTGCTGGAACTTA--TATTTGTATATTTTTTGAATAAGGGTTCTAAAGTATAAACATGTGGTCACTGGTTCT-GCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTTAT-ATATTGTTAGAGT-CAAGTAGTTTCGTACCTTTGTATTCAGTATGCTATTAA--ATACTTT-GGAAATAGCAAAGAAGTTGATTGTTAATCCTCTA---TA--ATTTTGAT-GGTCATA-AGGGCTATCATTTTTATGAATAGGTTTTAATAAAGCCTATTT-CCATTCCCTTTGGG-ATTCTGCCAACAGA-AACAACGACAAG----AT-TAAACAATTTATAAGCATATGTGGTAAAAATATATG-TACATCGG-TTTCA-ACATCTCATT-TTTAATGCCAT-CTAATCGCA-GCTTGATTTATTATCTTTCAGATGTTTTTATTGCATCAATGATTTTCTTTTCTTTAATTG-A-TAAATCTAAC-GAAGT-AATG--TTGATATTTCTGCTGACTTGGACAATAAATCTTCAAAATATTTAATTCTGGGTATCAAATTTACTAATCAATACTGAATAATGTTTGTAAAATGATTTACACCCATTGTTCACTAGATATCTT-ATCGGACT-ATCTTGCGGATTGCTGATTGATTC-AAATTCTTTCAAAAGTTT-CAG-TATG
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aaAAGTAA-AT--T--------TT-ATA-TCA--A-T-A--TT-T-GG-CC-C-AG------GCAT---------AACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--A-CA-ACAA-GA----AGA---AA---A----CC-ATT-C-ACCAAT-GAT---AGATAA-CGT-AA-C-TAACA-AAGT---TAAT-GA---T-A------AATC---A-AAATT-TT-C--T---CA---------------ATT-GT----------GAGAGCAGCT-------TA-TATTAAT---GT-A-------G-TTGGACA-AA--TT----AG-T-AATC-GCTGTCA-CA-TGTC--ATCTTTATACTGC--A-----T--A--AAAGC-AATTA-----AATTATTC-T-CT-AT-TAACATACCAAGT--T-T-A-T----------AA-GTTTT-T----A-TACAAA-GTAT-T-CA-T-------GGAT-----T---CTA-TG---AAATG-G-T-T----------T--TCTTGATGTT----AGTAT-GCCATGT-AACACAA---TCAATG-ATG------A-A--AAAT-GGAAT-TAA----CA-TGCTTATC---AAAGCAC-AG-TACAG-A--CTT-GCAG-ACA-CTTAACATTTTC-TCACAT-TTACAT-GTGTTTTTGTGT--A--AC-GCC--A---TCAA-AGCC-AA-AGA-ATGAGAACTGGTTCTGAAATATGG-----TAAAA-CATTT--CAAGA-CTTGAGGATT-ATGAAgcat
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        taagctaATAGAGCATAA---TT-CCC-CCATAACTGTT-TGG------TTT--GAGG---TCTTCTTGTGTAT----------T------CCATATAGAGTATGTA-CTTGAGGGGTTTAATG---TG-AA-GTT-------TATCACTAAATA-TGA------T--TCAT---GG-A----C-TTTT-CAA-C--ATTATAATTTGGGCTCTT-TACATCAGCAGGT----TTTGAATTTGTAGTTTCC-C--AAATT--------ACA-AA-A-CA----------G-GT-------TT-T----ACAG-TGTGATAAAA----AAAAAAGAT-GCAAC--AA-AATACTGGA---ATTTGGCCT-TGCAAT--TT-CAAAAAC-----ATTT--AATTAATT-TAAAGAAAG-CATTCAAACCAC-GCTTATA-CAGG-TCTTG-TTG-ACAATTAACATATA-ATCCAAAGG-CAT--TG--AA-T-ATAC-CA----CGTAAATATTAATGAATAAAA-GA-CAATGAATGTTC-TAT--TTCCTTATCT-TTA-TAAACAAATTTTAAGTTTCTT-ACCTTTGCAT---------TCTTGT-------------AAAA---------------AAAAT--G----T-TGTCCTTGTCTTTTTCAAATTAAC--AGA-GAGACAATGTTT-A-Taa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gTAAGTAA-GT--TA----T-TTT-ATT-TCC--AAT-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT--------------AA------------ATAT---------A--------------------CAT-AAA-C-CA-C--A-GA----AGA---G--G-A----CC-AT--CCA--AAT-GAT---AGATAA-AGT-AA-A-TAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A------AATC---A-AA--T-TTTC--T---CA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TAT-------GT-A---------TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T-AACA--CTGTCA-CA-TT-C--AT-----TACT-C--A-----T--A--A--GCCAAATA-----ATATTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-T----------AAAGTTTT-T----A-TACAAA-GTAT-T-CA-T-------GGA------TT--CTA-TG----A-TG-GTT-T----------T--CTTAGATG-T---TGGTA-TGC--TGT-A---CAA---CCAA---ATG----T---A--AAAT-GGTAT-T------CA-T-CTT--C---AA--CACAAG-TCCAG-A--CTT-GCAG-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCAC-TT-ACTTGTGTTTTTGcata
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -T--TT-G-GA-CC-C-AGAGT---GCAT----------ACAAAG------------A-AT---------A--------------------CAT-AG--TTCA-T--A--A----ATA---CA-C-A----TC-AT--A-A--AA---AT----GATAA-AGT-AA-TATAACC-AGGT---TA-T-GA---T-A------AATC---T-AT--T-TT-T--TTTTCA---------------ATA-GT----------GAG--CAGC----------------------T-A-------A-TT-------A--TTGTCAA--T-AAC--ACTGTCA-CATT--C--AT-----TACT-C--A-----T--A--A--GCCAAATA-----ACTTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---TATGT--T-T-A-T----------AAAGTAAT-T----A-TACAAG-GTGT-T-TA-T-------GAA------CT--CTA-TG---AA-TG-G-TGC----------C--CTTAGGTG-T---TGGTA-TGC--TAT-A---CAG---TCAA---ATA----T-ACA--AAAT-GGAAA-T------CA-T-CCT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-ATGCGT-GCGC-ACGCCT--GCATt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               g--TA----A-TTT--TT-TCC--A-A-T--TT-T-TG-CC-C-AGAGG---GCAT----------ACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AAA-C-CA-C--A-GA----AGA---AA-G-A----CC-AT--CCA--AAT-GAT---AGATAA-AGT-AA-AATAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A------AATC---A-AA--T-TTTC--T---CA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TAATTTAT--GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T-AACA--CTGTCA-CA-TT-C--AT-----TACT-C--A-----T--A--A--GCCAAATA-----AATTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T---C----------AAAGTTTTAT----A-CAA-AA-GTAT-T-CA-T-------GGATCTATATT--CTA-TG---AA-TG-GTT-T----------T--CTTAGATG-T---TGGT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aaggtagTAAGTAA-GT---A----A-TTT-----TCA--A-T-T--TT-G-GG-GT-G-AGAGG---GCAT---------CATACAA------------ATA-----------------------------------AA--T-CA-G--A-GTTCCTGTA---CA-T-G----TT-AT--CTA--AAA-GGC---GTATAATATT-AA-A-TTACA-AGTT---TA-T-GA---T-AT-----AAT----A-AACTT-TT-C--C---CC---------------ATA-AT----------GAA--CAGCTCTAGAGATA-TA--------GGGA-------A-TTGGCAA-AA--TTTCC-AT-T-AACA-TC-GTCA-CA-T--C--Ag
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aaA----G-TTT-ATT-CCA--A-T-T--TT-G-GGCCC-C-AAAGG---GCAT---------AATAGAA------------GTA----------A--------------------CA--GC--T-CA-T--A--A----AGA---AA-G-AAATGTC--C--C-A--AA--------AAATGA-AGT-GG-G--A--A-AAGT---TA-A-AA---T-ATCATGGAATC---ACAA--C-TT-cacaagtctatgtataactataaaatattcatggactct
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aaagaaaataaatttgagaaaaaatatcaattttgaaataagaaaataaaatttggaaatattcattatgatatctataggtgtaaagataatataCCC-AGTTTAAATAGCC-AA-AAG-ATGAGAACTGATTATG-AAATTTA-----GAAAA-CATTG--CAAGAC---GAGGATT-GCGAA-TTAC-TGAAAAATG--TTTT-CTCTACAGA------------------------AATGC--A-A-TGT-TC-GCCAGT-TTGT--CCA-----ATT----G--T--TG-TCT-GCA-ATTGCCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------CCTTC--ATGAAT-ATTTCTCTTTTTAAATC---------TATCAG---ATAATT---------T--AT-T-AG---T---------AACAA----Tacatgtatgtgg
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tacA-AAGT---TA-TAGA---T-A------A-TC---A-AT--TGTT-C--T---CA---------------TTT-GT----------GAG--CAG-T------ATA-TA---------T-A-------G-TTGGCAA------TTTCAAT-A-AGCA---T-TCA-CA-TTAC--AT-----TA-T-C--A-----CTAA--A--GCCAAATAC----AATTTCTT-TACT-AT-TA-CA---CAGGT--T-TTA-T----------AAATTTTT-TGCCTA-TA-CAA-GTAT-TTCA-T-------GGAT-----TCTGCT--TG---AA-TG-G-T-T----------TTTCTTA-ATGTT----GGTATGGC--TGTTA---CA----TCAA---ATG----T-A-A--AAata
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TGGCAACGA--TTTT--AA-T-AACA--CCGTCA-CT-T--C--AT-----TGCTTC--A-----T--A--G---CCAGGTA-----AAGTT----------------------GTT--T-T-A-T----------CAAATTCT-T----A-T--CAATGTGT-T-CA-A-------GGA----------CTGGTG---AA-TG-G-T-T----------TT-CGTACA-GTTGAATGATAT-AC--AAT-A---CAG---TCAA---TT---------A--CAAT-GGAAT-T------CA-T-CTT-------A--CAA-AGTT-CAGCA--TTT-ACAG-ACA-GT--GCATTTTCTTTTCATATTACC---CGTTTTTG
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  acGGTAAGTAA-GT--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT---------TACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--C-CA-C--A-GA----AGA---AA-G-A----CC-AT--C-A--CAT-GAT---AGATAA-AGT-AA-T-TAA-A-AAGT---TA-T-GA---T-A------AATC---A-AA--T-TT-C--T---CA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TA--------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAAA-T-AACA-ACTGTCAGCA-T--C--GT-----TACT-C--A-----T--A--G----CAAA-A-----AATTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-T----------AAAGTTTT-C----AATAACAA-GTAT-T-CA-T-------GGAT-----TT--CTA-TG---A--TG-G-T-T----------T--CTTAGATGTT---TGGTATTGC--TGT-A---CAC---TCAG---ATG----T-A-A--AAAT-GGAAT-T------C--T-CTT------AA--CAC-AG-T--AG-A--CTT-GCAGGACA-CT--ACATTTTC-TCTCAT-TTAAATTGTGTTTTTGGTT--AGTAC-GCCCCAGTTTCAATAGCCCAA-AGATATG-GAACTGATTCTGAAAATTTG-----TAAAA-CATTT--CAAGACCTTCAGGATT-ACGAATTTACATGAAAAATATTTTTTTCTCTACAGAATTTTG-TTTTG-ATA------C-AATGA--ATA-TGT-TC-GCAAGT-TTG---CCA----CATT----G-TT--TG-TCT-TCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---C--ATGAAT-ATTTA-------AAATC---------GTCCAT----TAAAC---------T--A--T-AG---T---------AACAA----TT-GAT-AC--A----AT------AAT-TTC--AT--C--ATG--TA--TAGAACAT-TGT-ATA-T--CTAA-CTTATTC----A--AA-ATATT-AATG-----AAT----GC--------TACT-A---GT-C-----AACTACT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACA-TTG-TTT---CA-T-ATACAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-GAAT-CTAC-AGGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TT-CGTAAA--TATT-TT-AAAC---AG--C-TTTTTAT-AA---CAT--CAAAA--TAC-TA-TGGGAATCGACCA-AG---TT-CAC-CTACAATAGCT-TGA------TTT--GAGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---AATATAT--TTCAAGAATTTTTATG---TG-CA-TTT-------TTTCGC--AGTA-GTA------T--TTATTAAAA-A----G-TTTTTCTA-T--ACAATAATCCAGGCGTTT-GACGG-AACTTGTA----CTGTATTTATTGTTCCCACCCAAATTTCACATGCATA-AA-G-CAGTA-CT----G-GT-------TT-A----GCTGCTATGATCATA----CAAA---GT-GTATC--AG-GGTG-TGTA---TTTTTGGTT-T--AATA-TT-CCGAAACCAAAAACTT--GACTAGTT-TAAAATAAG-CCTTTAAGGCTCTTTTTGTA-AAGA-TC-AA-TTG-AC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATG--AG-TAAA---CAATT-CCCAGATATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATT--TGAATT-GTA-TAGAAAAACTTT----------ATC--TG-AT---------TTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAAT-TTT--TTGTCTTTCTGGGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-A-TGA-CAATAGCATTCAAGCTTTTTTA-TACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCAGTTTCGAAAATAAACACT-----ATT-TCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAG-GAT-GGTTCACCTAATTT-GT--GGA-------TTATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AATGGTCT-G-ACTTA-GGT-------TTA--TCTCC----CGCGTCTAA-AC----------CACCTTTAGG-----TTCAAATG-AAACTCGTAAGTTT-AT--------TTTGGAGCTT----TACAG--AT--ATTATG-TTT-GCCATGTACATACTCTTGG-ATGACTTTATAAAAAGGTCCCTTTATGTCAAGT-TG-GTGCAACCT-GTGTAGAA-GAGCTGAA-TGTGAAACAGTATCAAAGGCCTTGGAAAAATTAATA-AAGCAAACATACAATT--TGGA-CTTAAATATTTGTATATTTTT-GAATAAGGGTTCTAA-GTATAAACATGTGGTCACTGGTTCTGGCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTAATAATATTGTTAGAGTCCAAGTAGTTTTGTAACCTTGTATTCAGTATGCTATCAA--ATACTTT-GGATA-AGC-AAGAAGTT-ATTGTTATTCCTCTATACTAGTAGTTTGATGGGTCATA-TGGGCTATCGTTTTTATGAATAGG-TTTAATAAAGCCTATTTTCCA-TTCCTTTGGGTATT-TGC---CAGAAGACAA-GACAAG----AT-TAAATAATTT--TAGCATATGTGGTAA-AATATATG--AC-TTGGCTTTCA-ACATCTCATT-TTTAATGCCATCCTAATC-CA-GC-TGATTT-TTATTCTTTAGATG-TTTTATTGCATCAATGATTTTCTTTTTTTTAGTTGTACTAAATCTAAC-GAGGTAAATGTTTTGAT-TTTCT--T--CTTGG-CAAGTAAT-TTCAAAATATTT-ATTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAG-TATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGACT--TTCAAA---CT-----GAGTTTCCAGTTATGATA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTTTTGTAATCG-A-TA--TGTAGCTGTAGT-AAT---CTGA-ACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--AAAATATTTA-TTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAGATATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGACT--TTCAAAACC-------GAGTTTCCAG-TATGATA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        T--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATT--TGAATT-GTA-TAGAAAAACTTT-------TT-ATC--TG-AT---------TTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAA--TTT--TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-A-TGA-CAATAGCATTCAAGCTTTTTT-ATACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCAGTTTCAGAAATTAACACT
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                --TA----A-TTT-ATT-TCA--AAT-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCATAACATGGAATACAGAGTTC---------ATAT---------G--------------------CATGAA--T-CA-T--G-AA----AG-----T-G-A----TCAAT--C-A--AAA-GAT---CAATAA-AAT---------------T---TA-C-GA---T-A------AATC---A-AC--TCTT-C--T---CT---------------ATA-AT----------GAG--CA----------------------------------------CAA------TTTCCTG-T-AAC--ACCGTCA-AATT--C--GT-----TACT-C--A-----T--A--
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gtacatgTCAGACAGGGCTATCATTCTTATGAATTACTTT-GATAAAGCCTGTATCCCACTCC-TTTGAATATT-TGCCA---GAGGACAA-GATAAATTACATGTAGATAATTT-CA-GCAAATG--GTA-CAATATGTGGTACGGTGGCTAGTA-ACATTTCATT-TTCATTG
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TAAATAA-GA--AA----AGTTT-ATT-CCA--A-T-T--TT-G-GG-CC-CAAGAGG---GCAT---------AATAGAA------------GTATTATTTAAAAA--------------------CAT-----T-CA-T----GA----AGA---AA-G-A----
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    agtttaTAA-GT--TA----A-TTC-ATT-TTC--A-A-AAATT-GCGG-CC-C-AGAGGAATGCAT---------TACAGAG------------ATAT---------AAGGTTCAAATA---------CAG-AA--T-AA-T--A-AA----AGA---AT-G-A----TT-TC--C-A--AAA-GAT---AGATAA-AGT-AG-A-Taatgtccaaaaagaaggaagaaattattttttacaatattataacatacatggatgtgg
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        agaTT-ATT-TCCA-A-T-T--TT-G-GC-CC-C-A-AGG---GCAA---------TA-AAAGAATACCAGGTTCACAT---------A--------------------CATAAA--T-CA-T--A-AA----AGAGCTAA-C-A----TT-AT--CTA--AAT-GAT---AGATAC-TATAAA-A-TAACA-AGGT---TA-T-ggaatgtgatttggtcaatca
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aagtagtattaaagtaAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA-------------------------A-G-A----CC-AT--CCA--AAT-GATTATAGATAA-AGT-AA-GATTACA-AAGT---TA-T-GA---TTA------AATC---A-AA--T-TT-CC-T---CA---------------ATTTGT----------GAG--CAGCT------ATA-c
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TTTCAGACATTTCATTATTTTATCCCAC-CCAA--ACATGCTTGATTTATTATTTTTTAGCT-TTGTCACGGCAGAGATTATTTCCTTTTCTATATTT--------CCTAAC-Ggttgtgtgttaaattgg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cacaggTAAGTAA-GTAATATCTTA-TTT-ATT-TCC--AAT-T--TT-G-GG-CC-C-AG-GG---GCAT----------ACAA-G------------ATAT---------AAC------------------CAT-AAACT-CAAC--A-GA----AGA---AGTGCA----TC--T--C-A--AAT-GAT---AGATAA-AGT-AACA-TAACATAAGT---TA-T-GGGACT-C------ACTCACAA-AA--T-TT----T---CATGACACAGTACACTGATT-GTTACCTGATACGAG--CAGCT------GCA-TACACTCACTGT-A-------G-TTGGCAA-AATTTTTTCAAT-TAAACACACGTTCA-CATT--C--AT-----TACT-C--A-----T--A--A--GCCAAACATCCACGATTTTCT-C-CT-AT-TA-AA---CAGGTGATAT-A-TACCTCCGATAAAAGTATT-T----A-TA-CAA-GTATAT-CA-TCATACAAGGA------TT--CTATTGTGTAA-TGTG-T-TTATAAAATTAT--CTTAAATG-T---TGGTA-TGC--TGT-A---CCGGCATCAATTCATGGCTAC-A-AACAAAT-GGAAC-TTGGAAACA-T-TCT--CCCAAA--CAG-CG-T-CAGTA--CTTAACCG-ATA-CTCGACACT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            acccacgggtaATTCCAAAAACTTACTAAATGAAA-CAATTGCCAAGAC-TTGAGGATTCACGAATT-AC-TCGAAAATATTTTTC-CTCTACAGAATCTTG-TTTTGAA-A------TGAATGA--ATA-TGT-TC-GCAGTT-TTGCCACCA----CATTGGGGG-TTAATG-GTC-GCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACAAATGCCGCACC---T--GCGAAT-AATTAT------TAATC---------GCTCATAGCGTGGAC---------T--T--T-AA---TTAAAAGATAAACAAGTTTTT-GAC-AC--A----ATTATTCCATT-GTTCAAT--C--ATGACTAATTAGAACAT-TGTAATA-TC-CTAA-CTTATTTAACAA--AA-ATATATAATG-----AATG---GCGGTAACTGTAGT-ATCTTT-CCACAAAATAACTAAT-TTGTTG-TTCACTATA-TCCTA-TACACT-CAA-TTGATTT--TCAGT-ATACAGCAGTT-C-TCTTGAAA-TAATCGAAT-CTACAAAGGGG---A----------ATCTA-AAATTCTCTTC-CGAAAA--TATTGTACGAACATAAGATC-TTTTTAT-AA---CAT--CAAAATTTACATAGTGGAATTCGACCA-AGTTTTT-CACGCTACAATAAATCTGAAGACCCTTTTGGAGGTATCCTTTTTATGTAC----------AAGTAACCTACA---AATAT-TATTTCAAGAGACTTTATGTTTTG-CA-TTTGGTTTAATCTTAC--AATA-GCAGTACATT--TTATTAAAG-AAGACC-TTTT-CTA-TACACAATAAaccaatggtttaaacattcttttaaatctattttatctatctcaataatgtttccttgctgtaggacgcccggacgcagggaatttcaataaatgcctataagaaatgaaggctcttggatgatgagagagaactgattcatatttaccccacaacgattatttgtattccaaaaacttactaaatgaaacaattgccaagacttgaggattcacgaattactcgaaaatatttttcctctacagaatcttgttttgaaatgaatgaatatgttcgcagttttgccaccacattgggggttaatggtcgcaatgtctgaaagtgtactacaaatgccgcacctgcgaataattattaatcgctcatagcgtggactttaattaaaagataaacaagtttttgacacaattattccattgttcaatcatgactaattagaacattgtaatatcctaacttatttaacaaaaatatataatgaatggcggtaactgtagtatctttccacaaaataactaatttgttgttcactatatcctatacactcaattgattttcagtatacagcagttctcttgaaataatcgaatctacaaaggggaatctaaaattctcttccgaaaatattgtacgaacataagatctttttataacatcaaaatttacatagtggaattcgaccaagtttttcacgctacaataaatctgaagacccttttggaggtatcctttttatgtacaagtaacctacaaatattatttcaagagactttatgttttgcatttggtttaatcttacaatagcagtacattttattaaagaagaccttttctatacacaataaatggacaggggcccaaacgttgtatat
gi|30                         : acccacgggtataagtaagtaatatcttatttatttccaattttgggcccaggggcatacaagatataaccataaactcaacagaagaagtgcatctcaaatgatagataaagtaacataacataagttatgggactcactcacaaaattttcatgacacagtacactgattgttacctgatacgagcagctgcatacactcactgtagttggcaaaattttttcaattaaacacacgttcacattcattactcataagccaaacatccacgattttctcctattaaacaggtgatatatacctccgataaaagtatttatacaagtatatcatcatacaaggattctattgtgtaatgtgtttataaaattatcttaaatgttggtatgctgtaccggcatcaattcatggctacaaacaaatggaacttggaaacattctcccaaacagcgtcagtacttaaccgatactcgacactaccaatggtttaaacattcttttaaatctattttatctatctcaataatgtttccttgctgtaggacgcccggacgcagggaatttcaataaatgcctataagaaatgaaggctcttggatgatgagagagaactgattcatatttaccccacaacgattatttgtTAAGTAA-GT---A----A-TTC-ATT-TTC--A-AAT--TT-G-GG-CC-C-AGAGA---GCATACAGAGAA-TACAGAGTTC---------ATAT---------A--------------------CATGAA--T-AA-T--A-AA----AGA---AT-G-A----TT-AT--C-C--AAA-GAT---AGATAA-AGatggacaggggcccaaacgttgtatat
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       c-AA--T-CA-T--A-AA----AGA---GA-G-A----TT-ATCCC-A--AA--GAT---AGGTAA-CGTGAA-A-TAAC-----T-----------------------------------T-TT-C--T---CA---------------GTA-AT----------GAA--CAGCT------ATA-T-------------------------GCGT-AA--TTTTCAA--T-GACA-
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             attagatgGTAAGTAA-TT--TT----T-TTT--TT-TCA--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGGGG---GAATACAAAGAA-TACAGAGTTT---------ATCT---------A--------------------CATAAA--T-CA-T--A-GA----AGA---GA-G-A----TT-AT--C-C--AAttgt
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aACTTGTA---TCTGTATTTATTGTTCCC-C--AAAT----------------G-CAGTA-CTTACCG-GT-------TG-A----CCTG-TATGATCATA----C-AA---GT-GTATC--A--GGTA-TGCA---TT
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TCAGTATGCTATTAC---TCCTTT-GGATA-AGCAA-GAAGTT-ATAGTT---CTTCT------GTAATGTGATGGGTCAGA-AGGACTATCATT
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -TTT-ATT-CCA--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---ACA----------TATAAAA------------GTA
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               acacgT-ATA-T--TTAA-CTTATTC----A--AA-ATAT--AATG-----AATCAATGC--------TACT-A---CT-CC----AACTACT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACatgatagttttataaagttgaaaacatatct
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTTTT-CCCTTGAAAAGCTTC-TTTTG-A-ATAGGCCT-AATCC--ATA-TGT-TC-GTAA-C-TTG---CC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   taGTAAGTAA-GT---A----A-TTT-ATT-TCC--AAT-T--TT-G-GG-TC-C-AGAGG---GCATACAAAGAA-TACAGAGTTC---------ATGT---------A--------------------CAT-AAG-T-CA-T--A-AA----A-A---GA-G-A----TT-AT--CCA--AAT-GAT---AGATAA-AGT-AA-AATAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A------AATC---A-AC--T-TTTC--T---CA---------------ATT-GT----------G------------------------------T-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T-AACA--CTGTCA-CA-TT-C--AT-----TACT-C--A-----T--A--A--GCCAAATA-----TTTTTTTC-T-CT-AT-TG-CA---TGGGT--T-T-A-T----------AAAGTTCT-T----A-TACAAA-GTGT-T-CA-T-------GGA------TT--CTA-TG---AA-TG-G-T-T----------TTCTTTAG-TG-T---TGGTA-TGC--TGT-A---CAG---TAAA---ATA----T---A--AAAT-GGAAT-T------CA-T-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-GCAG-ACA-CT--ACATTTT-------------TTTGTG--TGTGTGT--A--AC-GCCC-AGTTTCCATAGCC-AA-AGA-ATGAGAACTG---------------------AAA-CATTA--CAAGA-CTTGAGGATT-ACGAA-TTAC-TGAAAAATA-CTTTT-CTCTTCAGAATCTTG-TTTTG-A-A------T-AATGC--ATA-TGT-TC-GC-AGT-TTG---CCA----CATT----G-TT--TG-TCT-GCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---C--ATGAAT-ATTT--------AAATC---------GCTCAT---GTAACT---------T--AT-T-AG---T---------AACAA----TT-GAT-AC--A----AT------AGT-TTT--AT--C--ATG--TA--TAAAACAC-TGT-ATA-T--TTAA-CTTATTC----A--AA-ATAT--AATG-----AAT----GC--------TACT-A---ATCC-----AAATGCT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACA-TTG-TTT--TCA-T-ATACAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-AATT-CTAC--AGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TT-CGTAAA--TAAT-TA-AAAC---AG--C-TCTTTAT-AA---CAT--CAAAA--TACATA--GGGAATCGACCA-AG---TT-CAC-CTACAATAGCT-TGA------ATT--GAGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---TATATAT--TTCAAGAATTTT-ATG---TG-CATTTT-------TTTTGC--AGTACAT-------T--TTATTAAAGAA----G-TTTT-CTA-T--ACAATAATCAGGGCGTTT-GACGA-AACTTGTA---TCTGTATTTATTGTT-CC-CCCAAATTCCACATGCATA-AG-G-CAGTA-CT----G-GT-------TT-A----ACTG-TATGGTCATA----C-AA---GT-GTATC--AG-GATA-TGTA---TTTTAGGTT-T--AATATTT-CCAAAAC-----ACTT--GGCTAGTT-TAAAATAAG-CATTTAAGGCT-TTTTTGTA-AAGA-TCAAA--TG-AC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATG--AGATAAAAA-CAATC-CCCAGATATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATC--TGATTTGTTA-TAGAAATTTTTT-------TT-ATC--TG-ATTTTTTACCGTTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAA--TTT--TTGTCTTTTTGAGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-----A-CAATctt
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AGCT------ATA-TAT-------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTC-AG-T-AAC--GCTGTCA-CATT--C--AT-----TACT-C--A-----T--A--A--GCC
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TCACCTAATTTTGC-TGGA-------TCATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAGAA----TGGT---AGATT---AT
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aT-TCC--AAT-T--TT-G-GGTCC-C-AGAGG---GCAT---------
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AT---GTAACT---------T--A--TTAG---T---------AACAA----TT-GAT-AC--A----AT------AAT-Taatatactcaa
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATAATCAGGGCGTTT-GACGG-AACTTGTA---TC
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GGTAAGTAA--T--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TTCG-GG-CC----GAGG----CATA--------CACAAAG------------A-AT---------AAGAGTTGAGAAGTTCAATTTCAT-AAA-T-CA-T--AAGA----AGAG--AA-G-A----TT-AT--C-A--AATTGA----AGATAA-A-T-AA-A-TA-CA-AGGTCTATA-T-GAA--T-A------AATC---A-AC--T-CT-CCTT---CATCC------------ATA-GT----------GAG--CAGCT------ATACTA--------GT-ATCAGTAAG-TTGGCAA-AA--TTTT-AAA-T-AACA--CTGTCG-CA-T--CC-AT-----TGCT-C--AATATTT--AAAG--CCCAATTA-----AATTTTTCAT-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-CTAA-------AAAGTTCT-T----A-TAC--A-GTGT-T-CA-T-------GGAT-----TT--G-A-TG---AA--G-G-T-T----------T---TTAG-TGTT---C--TAT-GC--TAT-AA--CAG---TCAA---ATA----TTA-A--CAATTAGAATGT------CAAT-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-ACAA-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCAT-TTAACTTGTCTTT---GGT--A--ACAGCCC-AGTTTC-GTAGCC-AA-AGA-ATGACAACTGA-TCTG-AAATTTG-----TAAAA-CATTG--CCA-ACGTAGAGGTTT-ACGAA--TAC-GTGAAAATAATCTTT-CTCTACATAAACTTGATTTTG-A-ATAGCC-T-AATGC--ATA-TGTGTCGGC--GT-TTG-----A----AATT----GCTT--TGTTCT-GCA-A-TGGCGGA----TGTCCT-----A-A----------C---C--ATGAATAATTTA-------ACATT----------CT-AT---GGTAAC---------TTCATTT-AG---T---------AACAA----TT--ATAAC--ATTACAT------ACTGTTT--AT--CTAATG--TA--TAGCACATATGT-ATA-TACTTAA-CTTATTC----A--AA-ATA---AATGAAATCAAT----TC--------TACT-A---TC-C-----CACTACT--TGTTGTTGAT------TATTC--ACTACAATGAGA-TTG-TTT--TCA-CAATACAGCA--T-TATCTC--AATTACT-GAAT-TCTC--AGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TTGTGTAAAATTATT-TA-AAACT--AG--C-TTTTAATAAA---CAT---AAAA--TA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aCATA-AA-GGCAGTA-CT----G-GTCCGTTCGTT-ACATTACTGATATGATCATAACACCAAG---TT-GTATCTCAGCGGTG-TGTACTTTTTTCG--C-T--AATA-TTTCCAAAAC------CTT--GACTAGCTCTAAAATAAG-CCTTTAAGGCTCTTTT-GTA-AAGAATCAAA-TTGGAC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATGCAGG-TAAAAAACAATT-CC-AGAGATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTCAGATGATT--TGATTT-TTAATAGAAAAACTTT-------TTTATC--TG-AT---------TTTT-CTTACCGTTTTTTTACAG---------------AATATATGACAATGTTT--TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGAATAGGCAATATTT-ACTGAACATCAGCATTCAAGCTTTTTTAATACATACCCGCTG---AGCCCCT-CCCTCGGTTTTCAGAATTAACACTGAAAAATCATCAGCATACCACGACTA-AACACATTTAAGCGAT-GTGTCACCTAATTTTGCGCGGGATAATATTTATCATTATATCAGTC-GGACAATAG-ATATCTGGTTCAGGATCCATGTCGAGTTTAT---TATTTTAACAAAGGTTT-G-ACTTACGGTACTTCTGTTACTCCTCCCGGGC-TGTTTAG-ACGACTCCACTCCACCGTTAAGGCCTTTCCACATGAAA-TTCG-AAGTTT-ATATCTGTTGTTCGGAGTTTGTGGTACAGTTATTAATTATG-TTTGGCCA-GTACATACTCTTGACATGACTTTATAGAgt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTTTT-CCCTTGAAAAGCTTC-TTTTG-A-A------T-AATCC--GTA-TGT-TC-GTAA-C-TTG---TCCTTTTCATT------TT--TA-----GCACA-T-TCTGACAAAT-TACTTTGCCATA----------CA--T--GTACAT-ATTAAT------AAATCTTTTTCTAAGTTCAT----TAAACACTTTTGATT--G--T-AGATCT---------GAAAC----TT-GA--AA--A----AG------A-T-GTT--AT--C--GC--------AGGA------T-ATG-C--CAAG-TTGATTC----AGTAA-A-A---AATA-----AAC----AC--------TGCTCA---AC-C-----AACAATT--C-TTTTTG-T------TA-TC--A-TTCAAA-A------------TCA-T-AT--------T-T-TCTT--GA--AGT-GCACACT-C-AAGCAA---AGTATCATTTGATTTATGAATGT---GT-TGTAAA--TATT-TA-A--C---AG--T-ATTGGAT-AA---GGTTTCAATA--TATA-A-TGGATGCCTACCT-AA---TT-CCC-CCATAACTGCA-TAG------TTT--GAAG---CTTTCTTATGTACCCCCCGGTGTA------CCCCA---CATATGTA-CTTGAGAGTTTTAATG---TG-AA-GTT-------TATCAC--TATATATA------T--TTTTCATTG-A----G-TTTT-CAA-T--ATTATAATTTGGTCTCTT-AAC---AA-TAGCAGATTCTGAATTTATAATT--C-CCCAAATTTCACTTCCATATAACA-CAATA-------G-GT-------TT-T----ATTG-TGTGATCAtgtaattcatcggccattcatcgtttcacttctagtcgaagttgtgtcgcaagccttgtg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aggta-TGA-TAGTAGCGTTCAAGCTTTTTT--------------G---AAGTCTT-CCTTCAGTTTCAGAAATTAACACTA---AGTCATCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAA-GAT-GTGTCACCTAATTTTGC-TGGA-------TCATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TC--------TC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AAAGATTT-GGACTTA-GGT-------C-G--TCTCC----C-TGTCTAACAC---------CCACC-TTAGG-----TTCAAAT---------------T-AT--------TTTGAAGTTT----TACAG--AC--AGTATG-TTT-GCCATGTACATACTTTTGA--TGACTTTATAGAAAGGCCCCTT-ATGTCAAGC-TG-ATGCAGCCT-GTGTAGAA-GATCTGAA-TGTAAAACAGTGTCAAAAGCCTTAGAAAAATCAACA-AAGCAAACGTATAATT--TGGAATT--ATCATTTGTATATTTTT-GAATAACGGTTCTAA-GTATAAAAATGTGGTCACTAGTTCTGGCTTTTGGTTGAAAACCAATTTGAACTTTATTTATAATGTTGTTCGAGTCCAAGTAGTTTTGTAACCTGGTATTCAGTATGCTATTAAATATACTTTGGGATA-aaaagatgcaacaaaatgccggcatt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             caaaattaggAAGTAA-AT--T--------TT-ATA-TCA--A-T-A--TT-T-GG-CC-C-AG------GCAT---------AACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--A-CA-ACAA-GA----AGA---AA---A----CC-ATT-C-ACCAAT-GAT---AGATAA-CGT-AA-C-TAACA-AAGT---TAAT-GA---T-A------AATC---A-AAATT-TT-C--T---CA---------------ATT-GT----------GAGAGCAGCT-------TA-TATTAAT---GT-A-------G-TTGGACA-AA--TT----AG-T-AATC-GCTGTCA-CA-TGTC--ATCTTTATACTGC--A-----T--A--AAAGC-AATTA-----AATTATTC-T-CT-AT-TAACATACCAAGT--T-T-A-T----------AA-GTTTT-T----A-TACAAA-GTAT-T-CA-T-------GGAT-----T---CTA-TG---AAATG-G-T-T----------T--TCTTGATGTT----AGTAT-GCCATGT-AACACAA---TCAATG-ATG------A-A--AAAT-GGAAT-TAA----CA-TGCTTATC---AAAGCAC-AG-TACAG-A--CTT-GCAG-ACA-CTTAACATTTTC-TCACAT-TTACAT-GTGTTTTTGTGT--A--AC-GCC--A---TCAA-AGCC-AA-AGA-ATGAGAACTGGTTCTGAAATATGG-----TAAAA-CATTT--CAAGA-CTTGAGGATT-ATGAAt
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): TTCCAATTGGGTCGCTGTGCCCCAGAGCGCGCAAGAACTAATAGGAGAGACCGTACTTAACAGTTGAGAAAGAATGTCCCAAAAAAAAGAAGTGCGGAAAAGTGACTAAGATTTCAAGTACAGAGTGCGTAATCACAAACTCTAACAT
Unaligned ( gi|35 ): AAGGGTATTCAGAACAAGAATGACATGGGAACATAAAGAAATAAAGTAAAATAAACAGGGAAAAACATCCAGATG
Unaligned ( gi|38 ): AATAAATTTGGAAATAAAATATCAATTTTGAAATAAAGAAAATAAATTTGAAATATTCATTATGATA






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                1111111111              1                              44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444      1111                                        1                                                    111             222222           222222222222222      1111111111          444444444444444444444444444444444                            222         2222     11111                               11111                      111              2222222222         1111     11             1111111   2222222222                    2222222222222        111111    22  11     111          111   22222222               222222        111111  11        1                      11                  11111                       11                                             11111          111     22               1              1                    11         33333333                    111     111   11111   222222      11111                       11111   33333333333333333         333333333            1111      1111      222222222     1111  11   111111111111111111       11                        1   222222     11            111    111   11    11111   22222222222222      222222222222                   111111     11                                                                 11     33333333333333            111         11            111                111                  11               111                      111111         111             55555555555555555     111       22                111     1   2222222    111111        2222222           222222                                             111                    11                   111     1111111    222222222222222    1          22222222222                      111           11   11          222222   11                              111                        1111          111             11  1                                          111     1                                2222222222          222222222    5555555555555555555555555555555555     11     11                                          111                         11     111     111                                 111               2222    1    11      2   1                 11   2222222       11                    1111    111     111     11    111        1        2      1  44444444   11     2222 1       666666666666     1     22222        2             1  33333333          2222     222222      1   1                  11                 1               1  1        1       1        1     1                                1                11        22           1                  1                                                                                                                    111      1     1            1      333      3333333                 1                     22222                 1   111            1   444    1     1      2222  1          333            1         1    1          1          1           1    111  1                       11                                  22222222      1     1   222    11     11111     1        111          11                      1               1              7777777777777                1            1           11      555555555          1       
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             3  0000000000   2   2  555 0 2 22  2 2  4  2 2     333    77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777   8  3333  7777 33 4444   555  222 555555  2  77 4 55  44  33 666      2   77  888     2    444  5 2  000 2 2    444  000000 5  5 66   111111111111111   2  1111111111   77     000000000000000000000000000000000       2  33       55 33  2 111      2  0000 66  44444    8 33 77777 33  88 44       11111 1      3 3  3  3  6  111     44 3 3 3 0000000000         1111 3   44    0 3 3  3 0000000   5555555555   6  555  6  3 6 3 3333333333333     0  444444    44  00   3 666  9999    666   00000000 55    4     8 222222  4 8   888888  11   4  4 2   8 55   4    4   8  66        5  0   5  77777         1  99999  6   55 4    1 5    5  5   5          11   77  22   22222     5    222     00         5     5    888       1     5    0     3   00     5 5 22222222     66   5   5  5  333 5   333   22222   000000  77  11111   5 5       5         44444   33333333333333333         444444444      0  5  0000   2  7777 5    000000000     0000  33   888888888888888888 1 5   88  99 99   99  99        3   222222   5 99    5   5   000    555   44    44444   44444444444444    5 777777777777       77 5      5 666666  5  55 5      5 4 6   6   99   666  7     99 666    99  99   6    6  3 44     11111111111111     6      111  6      55    6  6    888  99 6       6  111   99     99   11 88            6  111  6   6           6   999999   99    111             22222222222222222   1 111     4 22   0        7   111  6  3   1111111 1  999999  99    2222222    1    6 111111    6   9999         1        6   888        000               9  6 77     6666666    5  111     6666666 5  000000000000000    1          44444444444  6     99 77    6    111    1 5  8 11   88  8       000000   11        8         8           666  0   8    8  8  88  8  7777        8 444     8       11  6 0  999  0  8  3       99  99        6    111     3   2   99      6   6            2222222222   99  6  666666666    0000000000000000000000000000000000     55     44   99                   99   6            111   6                     66     444     444       8          8     0        444 44  3       3 1111    0    33      0   0         0    0  44   6666666       11    8   8    8    8 7777    444     444     33    777        0        0      0  88888888   33     1111 0       222222222222     0   6 55555      3 0  0   9      0  66666666          1111     555555      0   0    3        3    77           6     2   7           3  3        3       3        3     2    0                7          3    7   0       88   7 6  00           3                  3                           6                                   7             6          0                           777      0     0   7 7      3      444      5555555  1      6     1 0                     11111                 2   555        7   3   333    2     3      8888  3          777      7     3         3 7  2 0  6     0          0           3    777  3  7      7             44            0               1  1  55555555      0     3   555    44     99999     0   22   222          44                      3               3              3333333333333     7      7   3    7       3           88      777777777      6   3       
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .  ..........   .   .  ... . . ..  . .  .  . .     ...    ..............................................................   .  ....  .... .. ....   ...  ... ......  .  .. . ..  ..  .. ...      .   ..  ...     .    ...  . .  ... . .    ...  ...... .  . ..   ...............   .  ..........   ..     .................................       .  ..       .. ..  . ...      .  .... ..  .....    . .. ..... ..  .. ..       ..... .      . .  .  .  .  ...     .. . . . ..........         .... .   ..    . . .  . .......   ..........   .  ...  .  . . . .............     .  ......    ..  ..   . ...  ....    ...   ........ ..    .     . ......  . .   ......  ..   .  . .   . ..   .    .   .  ..        .  .   .  .....         .  .....  .   .. .    . .    .  .   .          ..   ..  ..   .....     .    ...     ..         .     .    ...       .     .    .     .   ..     . . ........     ..   .   .  .  ... .   ...   .....   ......  ..  .....   . .       .         .....   .................         .........      .  .  ....   .  .... .    .........     ....  ..   .................. . .   ..  .. ..   ..  ..        .   ......   . ..    .   .   ...    ...   ..    .....   ..............    . ............       .. .      . ......  .  .. .      . . .   .   ..   ...  .     .. ...    ..  ..   .    .  . ..     ..............     .      ...  .      ..    .  .    ...  .. .       .  ...   ..     ..   .. ..            .  ...  .   .           .   ......   ..    ...             .................   . ...     . ..   .        .   ...  .  .   ....... .  ......  ..    .......    .    . ......    .   ....         .        .   ...        ...               .  . ..     .......    .  ...     ....... .  ...............    .          ...........  .     .. ..    .    ...    . .  . ..   ..  .       ......   ..        .         .           ...  .   .    .  .  ..  .  ....        . ...     .       ..  . .  ...  .  .  .       ..  ..        .    ...     .   .   ..      .   .            ..........   ..  .  .........    ..................................     ..     ..   ..                   ..   .            ...   .                     ..     ...     ...       .          .     .        ... ..  .       . ....    .    ..      .   .         .    .  ..   .......       ..    .   .    .    . ....    ...     ...     ..    ...        .        .      .  ........   ..     .... .       ............     .   . .....      . .  .   .      .  ........          ....     ......      .   .    .        .    ..           .     .   .           .  .        .       .        .     .    .                .          .    .   .       ..   . .  ..           .                  .                           .                                   .             .          .                           ...      .     .   . .      .      ...      .......  .      .     . .                     .....                 .   ...        .   .   ...    .     .      ....  .          ...      .     .         . .  . .  .     .          .           .    ...  .  .      .             ..            .               .  .  ........      .     .   ...    ..     .....     .   ..   ...          ..                      .               .              .............     .      .   .    .       .           ..      .........      .   .       
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             1  8888888888   2   1  555 5 0 88  0 0  0  0 0     555    88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888   0  5555  2222 11 2222   555  888 888888  1  11 7 88  44  11 999      2   99  555     4    444  0 5  000 7 7    777  999999 3  3 33   333333333333333   7  7777777777   33     444444444444444444444444444444444       5  44       99 44  5 999      7  7777 33  33333    6 99 11111 99  55 22       77777 4      3 3  3  3  7  777     66 3 3 3 4444444444         7777 3   11    1 3 3  3 8888888   1111111111   7  888  7  3 7 3 9999999999999     4  888888    33  00   6 444  0000    444   55555555 00    0     0 555555  0 0   000000  00   0  0 0   0 55   0    0   0  55        0  5   0  44444         4  33333  7   77 3    4 0    7  7   7          00   66  99   55555     0    111     66         0     5    222       7     0    8     2   66     0 0 88888888     99   0   0  0  999 0   888   99999   777777  99  44444   7 7       7         33333   11111111111111111         999999999      4  0  1111   1  2222 0    000000000     6666  66   333333333333333333 0 7   33  22 22   22  22        3   111111   7 33    7   7   000    777   44    33333   44444444444444    7 777777777777       99 7      7 444444  7  77 7      7 3 7   7   22   888  3     22 888    22  88   7    7  5 00     88888888888888     7      777  7      88    7  7    333  22 7       7  777   22     22   66 66            7  777  7   7           7   222222   22    777             88888888888888888   0 777     2 22   7        8   777  7  3   7777777 0  222222  22    8888888    7    7 888888    7   3333         0        7   777        000               3  7 55     2222222    7  777     4444444 7  333333333333333    4          00000000000  7     22 77    7    777    0 0  0 00   66  0       888888   00        0         0           222  8   0    0  8  88  0  0000        0 000     0       00  0 8  444  8  0  2       22  22        7    777     3   5   22      7   7            5555555555   22  7  777777777    0000000000000000000000000000000000     88     00   22                   22   7            555   7                     22     000     000       0          0     8        000 00  2       2 2222    0    22      0   0         8    8  44   0000000       00    0   0    0    0 0000    000     000     88    555        0        0      0  00000000   88     2222 0       555555555555     8   5 00000      2 0  2   2      0  22222222          2222     555555      0   0    2        2    00           5     0   3           3  3        3       3        3     0    7                3          3    3   7       33   3 7  77           3                  3                           7                                   3             7          7                           000      0     0   3 3      3      000      3333333  0      7     0 0                     77777                 0   000        3   3   777    0     3      3333  3          777      3     3         3 3  0 7  7     0          0           3    777  3  3      3             00            7               0  2  88888888      0     3   000    77     33333     7   00   000          77                      3               3              3333333333333     3      3   3    3       3           33      333333333      7   3       
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GGTAAGTAA-GT--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT---------TACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--T-CA-T--A-GA----AGA---AA-G-A------TC-AT--C-A--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-A-TAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TA--------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T--AA-CA-ACTGTCA-CATT--C--AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----AATTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-T----------AAAGTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----TT--CTA-TG---AA-TG-G-T-T----------T--CTTAGATGTT---TGGTATTGC--TGT-A---CAG---TCAA---ATG----T-A-A--AAAT-GGAAT-T------CA-T-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-GCAG-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCAT-TTAACTTGTGTTTTTGTGT--A--AC-GCCC-AGTTTCAATAGCC-AA-AGA-ATGAGAACTGATTCTGAAAATTTG-----TAAAA-CATTT--CAAGACCTTGAGGATT-ACGAATTTAC-TGGAAAATATTTTTT-CTCTACAGAATCTTG-TTTTG-A-A------T-AATGC--ATA-TGT-TC-GCAAGT-TTG---CCA----CATT----G-TT--TG-TCC-GCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---C--GTGAATATTTA------TAAATCGCTC-AT---GTAANCT--A-T-TAGT---------AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------ANT-TTT--AT--C--ATG--TA--TAGAACAT-TGT------ATA-T--CTAA-CTT-ATT---CAAA---ATAT-AATG-----AAT----GC--------TACT-A---NT-C-----AACTACT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACA-TTG-TTT--TCA-T-ATACAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-GAAT-CTAC-AAGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TT-CGTAAA--TATT-TA-AAAC---AG--C-TTTTTAT-AA---CAT--CAAAA--TACATA-TGGGAATCGACCA-AG---TT-CAC-CTACAATAGCT-TGA------TTT--GAGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---AATATATA-TTCGAGAGTTTTAATG---TG-CA-TTT-------TNTC------GC--AGTACATAT--TTATTAAAG-A----N-TTTT-CTA-T--ACAATAATCNGGGCGTTT-GACGG-AACTTGTA---TCTGTATTTATTGTTCCC-CCCAAATTTCACATGCATA-AA-G-CAGTA-CT----G-GT-------TT-A----ACTG-TATGATCATA----CAAA---GT-GTATC--AG-GGTG-TGTA---TTTTNGGTT-T--AATA-TT-CCAAAAC-----ACTT--GACTAGTT-TAAAATAAG-CCTTTAAGGCTCTTTTTGTA-AAGA-TCNAA-TTG-AC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATG--AG-TAAAAA-CAATT-CCCAGATATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATT--TGATTT-TTA-TAGAAAAACTTT-------TT-ATC--TG-AT---------TTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAAT-TTT--TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-A-TGA-CAATAGCATTCAAGCTTTTTTAATACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCGGTTT-CAGAAATTAACACT---AAATCATCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAG-GAT-GTGTCACCTAATTTTGC-CGGA-------TTATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AAAGGTTTGGACTTA-GGT-------TTA--CCTCC----C-TGTCTAA-ACG--------CCACCNTTAGG-----TTCAAATGAAACTCGTAAGTTT-AT--------TTTGGAGTTT----TACAG--AT--ATTATG-TTT-GCCATGTACATACTCTTGA-ATGACTTTATAGAAAGGCCCCTTTATGTCAAGT-TG-GTGCAGCC-TGTGTAG-AAGAGCTG-AATGTGAAACGGTATCAAAGGCCTTAGAAAAATCAACA-AAGCAAACGTACAATT--TGGAACTT-AATATTTGTATA-TTTTTGAATAAGGGTTCT-AAGTATAAACATGTGGTCACTGGTTCTGGCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTTATAATATTGTTAGAGTCCAAGTAGTTTCGTAACCTTGTATTCAGTATGCTATTAA--ATACTTT-GGATA-AGCAAAGAAGTT-ATTGTT-A-TCCTCTA---TAGTANTTTGATGGGTCANA-AGGGCTATCATTTTTATGAAT-AGGCTTTAATAAAGCCTATTTCCCACTCCCTTTGGGTATT-TGC---CAGAGGACAA-GACAAG----AT-TAAATAATTT-T-AGCATATGTGGT-AAAATATAT-GTACGTCGGCTTTCA-ACATCTCATT-TTTAATGCCAT-CTAATCGCA-GCTTGATTTATTATTTTTTAGATGTTTTTATTGCATCGATGATTTTCTTTTCTNTAATTG-A-TAAATCTAAC-GAAGT-AATG--TTGATATTTCTGCTGACTTGGACAANNAATCTTCAAAATATTTAATTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAGATATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGACT--TTCAAA-CCCT----GAGTTTCCAG-TATGATA
Reference ( family-3541 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GGTAAGTAA-GT--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT---------TACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--T-CA-T--A-GA----AGA---AA-G-A------TC-AT--C-A--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-A-TAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TA--------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T--AA-CA-ACTGTCA-CA-T--C--AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----AATTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-T----------AAAGTTTTT----A-TAC-NAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----TT--CTA-TG---AA-TG-G-T-T----------T--CTTAGATGTT---TGGTATTGC--TGT-A---CAG---TCAA---ATG----T-A-A--AAAT-GGAAT-T------CA-T-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-GCAG-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCAT-TTAACTTGTGTTTTTGTGT--A--AC-GCCC-AGTTTCAATAGCC-AA-AGA-ATGAGAACTGATTCTGAAAATTTG-----TAAAA-CATTT--CAAGACCTTGAGGATT-ACGAATTTAC-TGGAAAATATTTTTT-CTCTACAGAATCTTG-TTTTG-A-A------T-AATGC--ATA-TGT-TC-GCAAGT-TTG---CCA----CATT----G-TT--TG-TCC-GCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---C--GTGAATATTTA------TAAATCGCTC-AT---GTAAACT--A-T-TAGT---------AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------ANT-TTT--AT--C--ATG--TA--TAGAACAT-TGT------ATA-T--CTAA-CTT-ATT---CAAA---ATAT-AATG-----AAT----GC--------TACT-A---NT-C-----AACTACT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACA-TTG-TTT--TCA-T-ATACAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-GAAT-CTAC-AAGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TT-CGTAAA--TATT-TA-AAAC---AG--C-TTTTTAT-AA---CAT--CAAAA--TACATA-TGGGAATCGACCA-AG---TT-CAC-CTACAATAGCT-TGA------TTT--GAGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---AATATATA-TTCGAGAGTTTTAATG---TG-CA-TTT-------TNTC------GC--AGTA-ATAT--TTATTAAAG-A----N-TTTT-CTA-T--ACAATAATCNGGGCGTTT-GACGG-AACTTGTA---TCTGTATTTATTGTTCCC-CCCAAATTTCACATGCATA-AA-G-CAGTA-CT----G-GT-------TT-A----ACTG-TATGATCATA----CAAA---GT-GTATC--AG-GGTG-TGTA---TTTTNGGTT-T--AATA-TT-CCAAAAC-----ACTT--GACTAGTT-TAAAATAAG-CCTTTAAGGCTCTTTTTGTA-AAGA-TCNAA-TTG-AC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATG--AG-TAAAAA-CAATT-CCCAGATATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATT--TGATTT-TTA-TAGAAAAACTTT-------TT-ATC--TG-AT---------TTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAAT-TTT--TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-A-TGA-CAATAGCATTCAAGCTTTTTTAATACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCGGTTT-CAGAAATTAACACT---AAATCATCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAG-GAT-GTGTCACCTAATTTTGC-CGGA-------TTATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AAAGGTTT-GACTTA-GGT-------TTA--CCTCC----C-TGTCTAA-ACG--------CCACCNTTAGG-----TTCAAATG-AACTCGTAAGTTT-AT--------TTTGGAGTTT----TACAG--AT--ATTATG-TTT-GCCATGTACATACTCTTGA-ATGACTTTATAGAAAGGCCCCTTTATGTCAAGT-TG-GTGCAGCC-TGTGTAG-AAGAGCTG-AATGTGAAACGGTATCAAAGGCCTTAGAAAAATCAACA-AAGCAAACGTACAATT--TGGAACTT-AATATTTGTATA-TTTTTGAATAAGGGTTCT-AAGTATAAACATGTGGTCACTGGTTCTGGCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTTATAATATTGTTAGAGTCCAAGTAGTTTCGTAACCTTGTATTCAGTATGCTATTAA--ATACTTT-GGATA-AGCAAAGAAGTT-ATTGTT-A-TCCTCTA---TAGTANTTTGATGGGTCANA-AGGGCTATCATTTTTATGAAT-AGGTTTTAATAAAGCCTATTTCCCACTCCCTTTGGGTATT-TGCC-ACAGAGGACAA-GACAAG----AT-TAAATAATTT-CAAGCATATGTGGT-AAAATATAT-GTACGTCGGCTTTCA-ACATCTCATT-TTTAATGCCAT-CTAATCGCA-GCTTGATTTATTATTTTTTAGATGTTTTTATTGCATCGATGATTTTCTTTTCTNTAATTG-A-TAAATCTAAC-GAAGT-AATG--TTGATATTTCTGCTGACTTGGACAANNAATCTTCAAAATATTTAATTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAGATATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGACT--TTCAAAACCCT----GAGTTTCCAG-TATGATA
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GTAAGTAAAGT--TA----A-TTTTATTCTCCGAA-T-T--TT-G-GG-CCAC-GAAGG---GCAT----------ACAA-G------------ATAT---------A--------------------AAA-AA----CA-C--A-GA----AGA---AA-G-T------GC-AT--CCA--AAT-GA--TGA-AGATAA-AGT--AA-A-TAACA-AAGT---TA-T-GAA--T-A-AATC---AA---T--T-TT-C--TCA---------------ATT-G-----------GAG--CAGCT------ATACTT--------GT-A-------GATTGGCAA-AT--TTCTCAACCT--AA-AC-ACTGTCA-CA-T--TCGAT-----TACT-CCAA-----T--AA--G--CCAAATA-----A-TTTTTC-T-CTGATCTA-CA----AGGT--T-T-AAT----------AAAGTTTTTTA--A-AAC-AAAGT---T-CAAT-------GGAT-----T---CTA-TG---AA-TG-G-T-T----------TGTCTTAAATGTG---TG-TAT-GC--TGT-A---CAA---TCAA---ATG----T-A-A--AA-T-GGAATGT------CA-T-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-GCAG-ACAGCT--ACATTTTC-TCTCAT-T--ACTTGTGTTTTTGTGTTAA--AC-GCCCGAGTTTCAATAGCC-AACAGA-ATGAGAACTAATTCT-AAAATTTG-----TAAAAACATTTT-CAAGAC-TTGAGGATT-AC-AATCT-----GAAAATATTTTT--CTCTACAGAATCTT--TTTTG-A-AC-----T-AATGGGAATAATGT-TC-GCA-GTGTTG---CCA----CATT----GGTT--TG-TCCTGCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---CCAGTGAA-ATT---------AAATCGCTC-AT---GCTAACT--T-TATAGT---------AACAA----TTT-GATTACGGA----AT------ATT-TTT--ATATC--ATG--TA--TAGAACATCTGT------ATAGT--CTAAGCTT-ATT---CAAAC--ATA--AATG-----AGA----GC--------TACT-A---GTTC-----AACTACT--T-TGTTTG-T------TA-TCGAA-TACAAT-ACAGTTG-TTTCATTA-T-AT-CAGCA--TAT-TCTT--AA-GAAT-GAAT-CTAC-AGGGGGCGAA----------ATCTA-AAATTC---TT-CGAAAAA-TATT-TA-AAAC---AG--CGTTTTTAT-AAACACAT--CAAAA--TACATA---GGAATCGACCA-AG---TTTCAC-CTACAATAGCT-TGA------TTT--GAG----CCTTTTTAGGTAC----------AGA----CCA-A---AATATAT--TTCAAGAATTTTAATG---TGGCAATTT-------TTTC------GC--AGTA-ACATGTTTATTAAAG-A----CGTTTT-CTAGT--ACAATAATCAGGGCGTTTTGACGG-AACTTGTA---TCTGTATTTATTGTTCCC-C--AAATTTCACATGCATA-AAAG-CAGTAACT----GTGT-------TTTA----ACTG-TATGATCATA----CA-----GTCGTATC--AG-GGTG-TGTA---TTTTTGGTTAT--AAT--TT-CCAAAAC-----ACTTTTGACTAGTT-TAAAATAAGGCCTTTAAGGCT---TTTGTAGAAGA-TCCAAATTG-AC----AACATGTGTA---AGGAGGCCTGATG--AGGTAAAAA-CAATTGCCCAGATATT---G--TACGATGAACACT---TGTTCTGA--ATT--TGATTT-TTA-TAGAAAAACTTT-------TT-ATC--TG-AT---------TTTT-T-------------ACAACGTTTTTTCTACAGAAATATT-GACAAT-TTT--T-GTCTTTCTGAGGTTGACCAGGA-TAGGCAAAATTTGA-TGA-CAATAGCATTCAAGCCTTTTTAATACAC---CGCTGTGAAGGCCCTCCCCTCGGTTT--AGAAATTAACACT---AAATCATCAGCAT-C----AACATAACA---TTAAGAGATGGTGTCACCT-ATTTTGC-CGGA-------TTATCAT--TATC-GTCGAAAA-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAATATTATTTTAA-AAAGGTTTGGACTTA-GG--------TTA--CCTCC----C-TGTCTTA-ACAC-------CCACACTTA-G-----TTCAAATG-AACTCGTAAGTTTGAT--------TTTGGAGTTT----TAGAG---T--ATTATGTTTT-GCCATGTACATAC-CTTGA-TTGACTTTATA-AAAGG-CCCTTTATGTCAAGTCTGTGTGCAGCCTTGTGTAGAAAGAGCTGAAATGT--AACGGTATCAAAGGCCTTAG-AAAATCAACACAAGC-AACATACAATTGCTGGAACTT--ATATTTGTATATTTTTTGAATAAGGGTTCTAAAGTATAAACATGTGGTCACTGGTTCT-GCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTTAT-ATATTGTTAGAGT-CAAGTAGTTTCGTACCTTTGTATTCAGTATGCTATTAA--ATACTTT-GGAAATAGCAAAGAAGTTGATTGTTAA-TCCTCTA---TA--ATTTTGAT-GGTCATA-AGGGCTATCATTTTTATGAAT-AGGTTTTAATAAAGCCTATTT-CCATTCCCTTTGGG-ATTCTGCCAACAGA-AACAACGACAAG----AT-TAAACAATTTATAAGCATATGTGGTAAAAATATAT-GTACATCGG-TTTCA-ACATCTCATT-TTTAATGCCAT-CTAATCGCA-GCTTGATTTATTATCTTTCAGATGTTTTTATTGCATCAATGATTTTCTTTTCTTTAATTG-A-TAAATCTAAC-GAAGT-AATG--TTGATATTTCTGCTGACTTGGACAATAAATCTTCAAAATATTTAATTCTGGGTATCAAATTTACTAATCAATACTGAATAATGTTTGTAAAATGATTTACACCCATTGTTCACTAGATATCTT-ATCGGACT-ATCTTGCGGATTGCTGATTGATTCAAATTCTTTCAAAAGTTT-CAG-TATG
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aaAAGTAA-AT--T--------TT-ATA-TCA--A-T-A--TT-T-GG-CC-C-AG------GCAT---------AACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--A-CA-ACAA-GA----AGA---AA---A------CC-ATT-C-ACCAAT-GA--T---AGATAA-CGT--AA-C-TAACA-AAGT---TAAT-GA---T-A-AATC---AA---AATT-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAGAGCAGCT-------TA-TATTAAT---GT-A-------G-TTGGACA-AA--TT---AG--T--AA-TC-GCTGTCA-CA-TGTC--ATCTTTATACTGC--A-----T--AAAAG--C-AATTA-----AATTATTC-T-CT-AT-TAACATACCAAGT--T-T-A-T----------AA-GTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----T---CTA-TG---AAATG-G-T-T----------T--TCTTGATGTT----AGTAT-GCCATGT-AACACAA---TCAATG-ATG------A-A--AAAT-GGAAT-TAA----CA-TGCTTATC---AAAGCAC-AG-TACAG-A--CTT-GCAG-ACA-CTTAACATTTTC-TCACAT-TTA-CATGTGTTTTTGTGT--A--AC-GCC--A---TCAA-AGCC-AA-AGA-ATGAGAACTGGTTCTGAAATATGG-----TAAAA-CATTT--CAAGA-CTTGAGGATT-ATGAAgcat
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        taagctaATAGAGCATAA---TT-CCC-CCATAACTGTT-TGG------TTT--GAGG---TCTTCTTGTGTAT----------T------CCATATAGAGTATGTA-CTTGAGGGGTTTAATG---TG-AA-GTT-------TATC------ACTAAATA-TGAT--TCAT---GG-A----C-TTTT-CAA-C--ATTATAATTTGGGCTCTT-TACATCAGCAGGT----TTTGAATTTGTAGTTTCC-C--AAATT--------ACA-AA-A-CA----------G-GT-------TT-T----ACAG-TGTGATAAAA----AAAAAAGAT-GCAAC--AA-AATACTGGA---ATTTGGCCT-TGCAAT--TT-CAAAAAC-----ATTT--AATTAATT-TAAAGAAAG-CATTCAAACCAC-GCTTATA-CAGG-TCTTG-TTG-ACAATTAACATATA-ATCCAAAGG-CAT--TG--AA-T-ATAC-CA----CGTAAATATTAATGAATAAAA-GA-CAATGAATGTTC-TAT--TTCCTTATCT-TTA-TAAACAAATTTTAAGTTTCTT-ACCTTTGCAT---------TCTTGT-------------AAAA---------------AAAAT--G----T-TGTCCTTGTCTTTTTCAAATTAAC--AGA-GAGACAATGTTT-A-Taa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gTAAGTAA-GT--TA----T-TTT-ATT-TCC--AAT-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT--------------AA------------ATAT---------A--------------------CAT-AAA-C-CA-C--A-GA----AGA---G--G-A------CC-AT--CCA--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-A-TAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TTTC--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TAT-------GT-A---------TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T--AA-C--ACTGTCA-CATT--C--AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----ATATTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-T----------AAAGTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGA------TT--CTA-TG----A-TG-GTT-T----------T--CTTAGATG-T---TGGTA-TGC--TGT-A---CAA---CCAA---ATG----T---A--AAAT-GGTAT-T------CA-T-CTT--C---AA--CACAAG-TCCAG-A--CTT-GCAG-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCAC-TT-ACTTGTGTTTTTGTcata
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -T--TT-G-GA-CC-C-AGAGT---GCAT----------ACAAAG------------A-AT---------A--------------------CAT-AG--TTCA-T--A--A----ATA---CA-C-A------TC-AT--A-A--AA---A--T----GATAA-AGT--AATA-TAACC-AGGT---TA-T-GA---T-A-AATC---TATTTT--T-TT-T--TCA---------------ATA-GT----------GAG--CAGC----------------------T-A-------A-TT-------A--TTGTCAA--T--AA-C--ACTGTCA-CATT--C--AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----ACTTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---TATGT--T-T-A-T----------AAAGTAATT----A-TAC-AAGGTGT-T-TA-T-------GAA------CT--CTA-TG---AA-TG-G-TGC----------C--CTTAGGTG-T---TGGTA-TGC--TAT-A---CAG---TCAA---ATA----T-ACA--AAAT-GGAAA-T------CA-T-CCT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-ATGCGT-GCGC-ACGCCT--GCAT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               g--TA----A-TTT--TT-TCC--A-A-T--TT-T-TG-CC-C-AGAGG---GCAT----------ACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AAA-C-CA-C--A-GA----AGA---AA-G-A------CC-AT--CCA--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-AATAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TTTC--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TAATTTAT--GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T--AA-C--ACTGTCA-CATT--C--AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----AATTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T---C----------AAAG-TTTT----A-TACAAAAGTAT-T-CA-T-------GGATCTATATT--CTA-TG---AA-TG-GTT-T----------T--CTTAGATG-T---TGGT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aaggtagTAAGTAA-GT---A----A-TTT-----TCA--A-T-T--TT-G-GG-GT-G-AGAGG---GCAT---------CATACAA------------ATA-----------------------------------AA--T-CA-G--A-GTTCCTGTA---CA-T-G------TT-AT--CTA--AAA-GG--C---GTATAATATT--AA-A-TTACA-AGTT---TA-T-GA---T-ATAAT----AA---ACTT-TT-C--CCC---------------ATA-AT----------GAA--CAGCTCTAGAGATA-TA--------GGGA-------A-TTGGCAA-AA--TTTCCAT--T--AA-CA-TC-GTCA-CA-T--C--Ag
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aaA----G-TTT-ATT-CCA--A-T-T--TT-G-GGCCC-C-AAAGG---GCAT---------AATAGAA------------GTA----------A--------------------CA--GC--T-CA-T--A--A----AGA---AA-G-AAATGTCCC-AA--A-A--AAT-GAAGT---GGGAAA-AGTTAAA-A-TATCA-cacaagtctatgtataactataaaatattcatggactct
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aaagaaaataaatttgagaaaaaatatcaattttgaaataagaaaataaaatttggaaatattcattatgatatctataggtgtaaagataatataCCC-AGTTTAAATAGCC-AA-AAG-ATGAGAACTGATTATG-AAATTTA-----GAAAA-CATTG--CAAGAC---GAGGATT-GCGAA-TTAC-TGAAAAATG--TTTT-CTCTACAGA------------------------AATGC--A-A-TGT-TC-GCCAGT-TTGT--CCA-----ATT----G--T--TG-TCT-GCA-ATTGCCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------CCTTC--ATGAATATTTCTCTTTTTAAATCTATC-AG---ATAATTT--A-T-TAGT---------AACAA----Ttggaatcacaacttacatgtatgtgg
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tacA-AAGT---TA-TAGA---T-A-A-TC---AA---T--TGTT-C--TCA---------------TTT-GT----------GAG--CAG-T------ATA-TA---------T-A-------G-TTGGCAA------TTTCAA--T--AAGCA---T-TCA-CA-TTAC--AT-----TA-T-C--A-----CTAAA--G--CCAAATAC----AATTTCTT-TACT-AT-TA-CA---CAGGT--T-TTA-T----------AAATTTTTTGCCTA-TAC--AAGTAT-TTCA-T-------GGAT-----TCTGCT--TG---AA-TG-G-T-T----------TTTCTTA-ATGTT----GGTATGGC--TGTTA---CA----TCAA---ATG----T-A-A--AAata
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TGGCAACGA--TTTT-AA--T--AA-CA--CCGTCA-CT-T--C--AT-----TGCTTC--A-----T--A---G--CCAGGTA-----AAGTT----------------------GTT--T-T-A-T----------CAAATTCTT----A-T-C-AATGTGT-T-CA-A-------GGA----------CTGGTG---AA-TG-G-T-T----------TT-CGTACA-GTTGAATGATAT-AC--AAT-A---CAG---TCAA---TT---------A--CAAT-GGAAT-T------CA-T-CTT-------A--CAA-AGTT-CAGCA--TTT-ACAG-ACA-GT--GCATTTTCTTTTCATATTACC---CGTTTTTG
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  acGGTAAGTAA-GT--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT---------TACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--C-CA-C--A-GA----AGA---AA-G-A------CC-AT--C-A--CAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-T-TAA-A-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TA--------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAAA-T--AA-CA-ACTGTCAGCA-T--C--GT-----TACT-C--A-----T--AG------CAAA-A-----AATTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-T----------AAAGTTTTC----AATAA-CAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----TT--CTA-TG---A--TG-G-T-T----------T--CTTAGATGTT---TGGTATTGC--TGT-A---CAC---TCAG---ATG----T-A-A--AAAT-GGAAT-T------C--T-CTT------AA--CAC-AG-T--AG-A--CTT-GCAGGACA-CT--ACATTTTC-TCTCAT-TTAAATTGTGTTTTTGGTT--AGTAC-GCCCCAGTTTCAATAGCCCAA-AGATATG-GAACTGATTCTGAAAATTTG-----TAAAA-CATTT--CAAGACCTTCAGGATT-ACGAATTTACATGAAAAATATTTTTTTCTCTACAGAATTTTG-TTTTG-ATA------C-AATGA--ATA-TGT-TC-GCAAGT-TTG---CCA----CATT----G-TT--TG-TCT-TCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---C--ATGAATATTTA-------AAATCGTCC-AT----TAAACT--A-T--AGT---------AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------AAT-TTC--AT--C--ATG--TA--TAGAACAT-TGT------ATA-T--CTAA-CTT-ATT---CAAA---ATATTAATG-----AAT----GC--------TACT-A---GT-C-----AACTACT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACA-TTG-TTT---CA-T-ATACAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-GAAT-CTAC-AGGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TT-CGTAAA--TATT-TT-AAAC---AG--C-TTTTTAT-AA---CAT--CAAAA--TAC-TA-TGGGAATCGACCA-AG---TT-CAC-CTACAATAGCT-TGA------TTT--GAGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---AATATAT--TTCAAGAATTTTTATG---TG-CA-TTT-------TTTC------GC--AGTA-GTAT--TTATTAAAA-A----G-TTTTTCTA-T--ACAATAATCCAGGCGTTT-GACGG-AACTTGTA----CTGTATTTATTGTTCCCACCCAAATTTCACATGCATA-AA-G-CAGTA-CT----G-GT-------TT-A----GCTGCTATGATCATA----CAAA---GT-GTATC--AG-GGTG-TGTA---TTTTTGGTT-T--AATA-TT-CCGAAACCAAAAACTT--GACTAGTT-TAAAATAAG-CCTTTAAGGCTCTTTTTGTA-AAGA-TC-AA-TTG-AC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATG--AG-TAAA---CAATT-CCCAGATATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATT--TGAATT-GTA-TAGAAAAACTTT----------ATC--TG-AT---------TTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAAT-TTT--TTGTCTTTCTGGGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-A-TGA-CAATAGCATTCAAGCTTTTTTA-TACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCAGTTT-CGAAAATAAACACT---A--TT-TCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAG-GAT-GGTTCACCTAATTT-GT--GGA-------TTATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AATGGTCT-GACTTA-GGT-------TTA--TCTCC----CGCGTCTAA-A----------CCACCTTTAGG-----TTCAAATGAAACTCGTAAGTTT-AT--------TTTGGAGCTT----TACAG--AT--ATTATG-TTT-GCCATGTACATACTCTTGG-ATGACTTTATAAAAAGGTCCCTTTATGTCAAGT-TG-GTGCAACC-TGTGTAG-AAGAGCTG-AATGTGAAACAGTATCAAAGGCCTTGGAAAAATTAATA-AAGCAAACATACAATT--TGG-ACTTAAATATTTGTATA-TTTTTGAATAAGGGTTCT-AAGTATAAACATGTGGTCACTGGTTCTGGCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTAATAATATTGTTAGAGTCCAAGTAGTTTTGTAACCTTGTATTCAGTATGCTATCAA--ATACTTT-GGATA-AGC-AAGAAGTT-ATTGTT-ATTCCTCTATACTAGTAGTTTGATGGGTCATA-TGGGCTATCGTTTTTATGAAT-AGG-TTTAATAAAGCCTATTTTCCA-TTCCTTTGGGTATT-TGC---CAGAAGACAA-GACAAG----AT-TAAATAATTT-T-AGCATATGTGGT-AAAATATAT-G-AC-TTGGCTTTCA-ACATCTCATT-TTTAATGCCATCCTAATC-CA-GC-TGATTT-TTATTCTTTAGATG-TTTTATTGCATCAATGATTTTCTTTTTTTTAGTTGTACTAAATCTAAC-GAGGTAAATGTTTTGAT-TTTCT--T--CTTGG-CAAGTAAT-TTCAAAATATTT-ATTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAG-TATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGACT--TTCAAA---CT----GAGTTTCCAGTTATGATA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTTTTGTAATCG-A-TA--TGTAGCTGTAGT-AAT---CTGA-ACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--AAAATATTTA-TTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAGATATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGACT--TTCAAAACC------GAGTTTCCAG-TATGATA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        T--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATT--TGAATT-GTA-TAGAAAAACTTT-------TT-ATC--TG-AT---------TTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAA--TTT--TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-A-TGA-CAATAGCATTCAAGCTTTTTT-ATACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCAGTTT-CAGAAATTAACACT---
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                --TA----A-TTT-ATT-TCA--AAT-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCATAACATGGAATACAGAGTTC---------ATAT---------G--------------------CATGAA--T-CA-T--G-AA----AG-----T-G-A------TCAAT--C-A--AAA-GA--T---CAATAA-AAT----------------T---TA-C-GA---T-A-AATC---AA---C--TCTT-C--TCT---------------ATA-AT----------GAG--CA-C------------------------------------------AA--TTTCCTG--T--AA-C--ACCGTCA-AATT--C--GT-----TACT-C--A-----T--A
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gtacatgTCAGACAGGGCTATCATTCTTATGAATTA--CTTTGATAAAGCCTGTATCCCACT-CCTTTGAATATT-TGC---CAGAGGACAA-GATAAATTACATGTAGATAATTT-C-AGCAAA--TGGT-ACAATATGTGGTACGGTGGCTAGTA-ACATTTCATT-TTCATTG
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TAAATAA-GA--AA----AGTTT-ATT-CCA--A-T-T--TT-G-GG-CC-CAAGAGG---GCAT---------AATAGAA------------GTATTATTTAAAAA--------------------CAT-----T-CA-T----GA----AGA---AA-G-A------
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    agtttaTAA-GT--TA----A-TTC-ATT-TTC--A-A-AAATT-GCGG-CC-C-AGAGGAATGCAT---------TACAGAG------------ATAT---------AAGGTTCAAATA---------CAG-AA--T-AA-T--A-AA----AGA---AT-G-A------TT-TC--C-A--AAA-GA--T---AGATAA-AGT--AG-A-Taatgtccaaaaagaaggaagaaattattttttacaatattataacatacatggatgtgg
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        agaTT-ATT-TCCA-A-T-T--TT-G-GC-CC-C-A-AGG---GCAA---------TA-AAAGAATACCAGGTTCACAT---------A--------------------CATAAA--T-CA-T--A-AA----AGAGCTAA-C-A------TT-AT--CTA--AAT-GA--T---AGATAC-TATA-AA-A-TAACA-AGGT---TA-T-ggaatgtgatttggtcaatca
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aagtagtattaaagtaAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA-------------------------A-G-A------CC-AT--CCA--AAT-GA--TTATAGATAA-AGT--AAGA-TTACA-AAGT---TA-T-GA---TTA-AATC---AA---A--T-TT-CC-TCA---------------ATTTGT----------GAG--CAGCT------ATA-c
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTTCAGACATTTCATTATTTTATCCCAC-CCAA--ACATGCTTGATTTATTATTTTTTAGCT-TTGTCACGGCAGAGATTATTTCCTTTTCTATATTT--------CCTAAC-Ggttgtgtgttaaattgg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cacaggTAAGTAA-GTAATATCTTA-TTT-ATT-TCC--AAT-T--TT-G-GG-CC-C-AG-GG---GCAT----------ACAA-G------------ATAT---------AAC------------------CAT-AAACT-CAAC--A-GA----AGA---AGTGCA------TC--T--C-A--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AACA-TAACATAAGT---TA-T-GGGACT-C-ACTCACAAA---A--T-TT----TCATGACACAGTACACTGATT-GTTACCTGATACGAG--CAGCT------GCA-TACACTCACTGT-A-------G-TTGGCAA-AATTTTTTCAA--TTAAA-CACACGTTCA-CATT--C--AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAACATCCACGATTTTCT-C-CT-AT-TA-AA---CAGGTGATAT-A-TACCTCCGATAAAAGTATTT----A-TAC--AAGTATAT-CA-TCATACAAGGA------TT--CTATTGTGTAA-TGTG-T-TTATAAAATTAT--CTTAAATG-T---TGGTA-TGC--TGT-A---CCGGCATCAATTCATGGCTAC-A-AACAAAT-GGAAC-TTGGAAACA-T-TCT--CCCAAA--CAG-CG-T-CAGTA--CTTAACCG-ATA-CTCGACACT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            acccacgggtaATTCCAAAAACTTACTAAATGAAA-CAATTGCCAAGAC-TTGAGGATTCACGAATT-AC-TCGAAAATATTTTTC-CTCTACAGAATCTTG-TTTTGAA-A------TGAATGA--ATA-TGT-TC-GCAGTT-TTGCCACCA----CATTGGGGG-TTAATG-GTC-GCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACAAATGCCGCACC---T--GCGAATAATTA------TTAATCGCTC-ATAGCGTGGACT----T-TAATTAAAAGATAAACAAGTTTTT--GAC-AC--A----ATTATTCCATT-GTTCAAT--C--ATGACTAATTAGAACAT-TGTA-----ATA-TC-CTAA-CTT-ATTTAACAAAAATATAT-AATG-----AATG---GCGGTAACTGTAGT-ATCTTT-CCACAAAATAACTAAT-TTGTTG-TTCACTATA-TCCTA-TACACT-CAA-TTGATTT--TCAGT-ATACAGCAGTT-C-TCTTGAAA-TAATCGAAT-CTACAAAGGGG---A----------ATCTA-AAATTCTCTTC-CGAAAA--TATTGTACGAACATAAGATC-TTTTTAT-AA---CAT--CAAAATTTACATAGTGGAATTCGACCA-AGTTTTT-CACGCTACAATAAATCTGAAGACCCTTTTGGAGGTATCCTTTTTATGTAC----------AAGTAACCTACA---AATAT-TATTTCAAGAGACTTTATGTTTTG-CA-TTTGGTTTAATCTTACAATAGC--AGTACAT-T--TTATTAAAG-AAGACC-TTTT-CTA-TACACAATAAaccaatggtttaaacattcttttaaatctattttatctatctcaataatgtttccttgctgtaggacgcccggacgcagggaatttcaataaatgcctataagaaatgaaggctcttggatgatgagagagaactgattcatatttaccccacaacgattatttgtattccaaaaacttactaaatgaaacaattgccaagacttgaggattcacgaattactcgaaaatatttttcctctacagaatcttgttttgaaatgaatgaatatgttcgcagttttgccaccacattgggggttaatggtcgcaatgtctgaaagtgtactacaaatgccgcacctgcgaataattattaatcgctcatagcgtggactttaattaaaagataaacaagtttttgacacaattattccattgttcaatcatgactaattagaacattgtaatatcctaacttatttaacaaaaatatataatgaatggcggtaactgtagtatctttccacaaaataactaatttgttgttcactatatcctatacactcaattgattttcagtatacagcagttctcttgaaataatcgaatctacaaaggggaatctaaaattctcttccgaaaatattgtacgaacataagatctttttataacatcaaaatttacatagtggaattcgaccaagtttttcacgctacaataaatctgaagacccttttggaggtatcctttttatgtacaagtaacctacaaatattatttcaagagactttatgttttgcatttggtttaatcttacaatagcagtacattttattaaagaagaccttttctatacacaataaatggacaggggcccaaacgttgtatat
gi|30                         : acccacgggtataagtaagtaatatcttatttatttccaattttgggcccaggggcatacaagatataaccataaactcaacagaagaagtgcatctcaaatgatagataaagtaacataacataagttatgggactcactcacaaaattttcatgacacagtacactgattgttacctgatacgagcagctgcatacactcactgtagttggcaaaattttttcaattaaacacacgttcacattcattactcataagccaaacatccacgattttctcctattaaacaggtgatatatacctccgataaaagtatttatacaagtatatcatcatacaaggattctattgtgtaatgtgtttataaaattatcttaaatgttggtatgctgtaccggcatcaattcatggctacaaacaaatggaacttggaaacattctcccaaacagcgtcagtacttaaccgatactcgacactaccaatggtttaaacattcttttaaatctattttatctatctcaataatgtttccttgctgtaggacgcccggacgcagggaatttcaataaatgcctataagaaatgaaggctcttggatgatgagagagaactgattcatatttaccccacaacgattatttgtTAAGTAA-GT---A----A-TTC-ATT-TTC--A-AAT--TT-G-GG-CC-C-AGAGA---GCATACAGAGAA-TACAGAGTTC---------ATAT---------A--------------------CATGAA--T-AA-T--A-AA----AGA---AT-G-A------TT-AT--C-C--AAA-GA--T---AGATAA-AGatggacaggggcccaaacgttgtatat
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       c-AA--T-CA-T--A-AA----AGA---GA-G-A------TT-ATCCC-A--AA--GA--T---AGGTAA-CGTG-AA-A-TAAC-----T--------------------------------T-TT-C--TCA---------------GTA-AT----------GAA--CAGCT------ATA-T-------------------------GCGT-AA--TTTTCAA--T--GA-CA-
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             attagatgGTAAGTAA-TT--TT----T-TTT--TT-TCA--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGGGG---GAATACAAAGAA-TACAGAGTTT---------ATCT---------A--------------------CATAAA--T-CA-T--A-GA----AGA---GA-G-A------TT-AT--C-C--AAttgt
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aACTTGTA---TCTGTATTTATTGTTCCC-C--AAAT----------------G-CAGTA-CTTACCG-GT-------TG-A----CCTG-TATGATCATA----C-AA---GT-GTATC--A--GGTA-TGCA---TT
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TCAGTATGCTATTAC---TCCTTT-GGATA-AGCAA-GAAGTT-ATAGTT----CTTCT------GTAATGTGATGGGTCAGA-AGGACTATCATT
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -TTT-ATT-CCA--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---ACA----------TATAAAA------------GTA
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           acacgT------ATA-T--TTAA-CTT-ATT---CAAA---ATAT-AATG-----AATCAATGC--------TACT-A---CT-CC----AACTACT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACatgatagttttataaagttgaaaacatatct
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTTTT-CCCTTGAAAAGCTTC-TTTTG-A-ATAGGCCT-AATCC--ATA-TGT-TC-GTAA-C-TTG---CC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   taGTAAGTAA-GT---A----A-TTT-ATT-TCC--AAT-T--TT-G-GG-TC-C-AGAGG---GCATACAAAGAA-TACAGAGTTC---------ATGT---------A--------------------CAT-AAG-T-CA-T--A-AA----A-A---GA-G-A------TT-AT--CCA--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-AATAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---CT-T-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------------------------------------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T--AA-C--ACTGTCA-CATT--C--AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----TTTTTTTC-T-CT-AT-TG-CA---TGGGT--T-T-A-T----------AAAGTTCTT----A-TAC-AAAGTGT-T-CA-T-------GGA------TT--CTA-TG---AA-TG-G-T-T----------TTCTTTAG-TG-T---TGGTA-TGC--TGT-A---CAG---TAAA---ATA----T---A--AAAT-GGAAT-T------CA-T-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-GCAG-ACA-CT--ACATTTT-------T-TTG---TGTG----TGTGT--A--AC-GCCC-AGTTTCCATAGCC-AA-AGA-ATGAGAACTG---------------------AAA-CATTA--CAAGA-CTTGAGGATT-ACGAA-TTAC-TGAAAAATA-CTTTT-CTCTTCAGAATCTTG-TTTTG-A-A------T-AATGC--ATA-TGT-TC-GC-AGT-TTG---CCA----CATT----G-TT--TG-TCT-GCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---C--ATGAATATT--------TAAATCGCTC-AT---GTAACTT--A-T-TAGT---------AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------AGT-TTT--AT--C--ATG--TA--TAAAACAC-TGT------ATA-T--TTAA-CTT-ATT---CAAA---ATAT-AATG-----AAT----GC--------TACT-A---ATCC-----AAATGCT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACA-TTG-TTT--TCA-T-ATACAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-AATT-CTAC--AGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TT-CGTAAA--TAAT-TA-AAAC---AG--C-TCTTTAT-AA---CAT--CAAAA--TACATA--GGGAATCGACCA-AG---TT-CAC-CTACAATAGCT-TGA------ATT--GAGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---TATATAT--TTCAAGAATTTT-ATG---TG-CATTTT-------TTTT------GC--AGTACAT-T--TTATTAAAGAA----G-TTTT-CTA-T--ACAATAATCAGGGCGTTT-GACGA-AACTTGTA---TCTGTATTTATTGTT-CC-CCCAAATTCCACATGCATA-AG-G-CAGTA-CT----G-GT-------TT-A----ACTG-TATGGTCATA----C-AA---GT-GTATC--AG-GATA-TGTA---TTTTAGGTT-T--AATATTT-CCAAAAC-----ACTT--GGCTAGTT-TAAAATAAG-CATTTAAGGCT-TTTTTGTA-AAGA-TCAAA--TG-AC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATG--AGATAAAAA-CAATC-CCCAGATATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATC--TGATTTGTTA-TAGAAATTTTTT-------TT-ATC--TG-ATTTTTTACCGTTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAA--TTT--TTGTCTTTTTGAGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-----A-CAATctt
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AGCT------ATA-TAT-------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAG--T--AA-C--GCTGTCA-CATT--C--AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CC
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TCACCTAATTTTGC-TGGA-------TCATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAGAA----TGGT---AGATT---AT
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aT-TCC--AAT-T--TT-G-GGTCC-C-AGAGG---GCAT---------
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -AT---GTAACTT--A-T-TAGT---------AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------AAT-Taatatactcaa
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATAATCAGGGCGTTT-GACGG-AACTTGTA---TC
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GGTAAGTAA--T--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TTCG-GG-CC----GAGG----CATA--------CACAAAG------------A-AT---------AAGAGTTGAGAAGTTCAATTTCAT-AAA-T-CA-T--AAGA----AGAG--AA-G-A------TT-AT--C-A--AATTGA------AGATAA-A-T--AA-A-TA-CA-AGGTCTATA-T-GAA--T-A-AATC---AA---C--T-CT-CCTTCATCC------------ATA-GT----------GAG--CAGCT------ATACTA--------GT-ATCAGTAAG-TTGGCAA-AA--TTTTAAA--T--AA-CA--CTGTCG-CA-T--CC-AT-----TGCT-C--AATATTT--AA--AGCCCAATTA-----AATTTTTCAT-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-CTAA-------AAAGTTCTT----A-TAC---AGTGT-T-CA-T-------GGAT-----TT--G-A-TG---AA--G-G-T-T----------T---TTAG-TGTT---C--TAT-GC--TAT-AA--CAG---TCAA---ATA----TTA-A--CAATTAGAATGT------CAAT-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-ACAA-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCAT-TTAACT--TGTCTTTG-GT--A--ACAGCCC-AGTTTC-GTAGCC-AA-AGA-ATGACAACTGA-TCTG-AAATTTG-----TAAAA-CATTG--CCA-ACGTAGAGGTTT-ACGAA--TAC-GTGAAAATAATCTTT-CTCTACATAAACTTGATTTTG-A-ATAGCC-T-AATGC--ATA-TGTGTCGGC--GT-TTG-----A----AATT----GCTT--TGTTCT-GCA-A-TGGCGGA----TGTCCT-----A-A----------C---C--ATGAATAATT-------TAA--CATTCTAT---GGTAACTTCATT-TAGT---------AACAA----TT---ATAAC--ATTACAT------ACTGTTT--AT--CTAATG--TA--TAGCACATATGT------ATA-TACTTAA-CTT-ATT---CAAA---ATA--AATGAAATCAAT----TC--------TACT-A---TC-C-----CACTACT--TGTTGTTGAT------TATTC--ACTACAATGAGA-TTG-TTT--TCA-CAATACAGCA--T-TATCTC--AATTACT-GAAT-TCTC--AGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TTGTGTAAAATTATT-TA-AAACT--AG--C-TTTTAATAAA---CAT---AAAA--TA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aCATA-AA-GGCAGTA-CT----G-GTCCGTTCGTT-ACATTACTGATATGATCATAACACCAAG---TT-GTATCTCAGCGGTG-TGTACTTTTTTCG--C-T--AATA-TTTCCAAAAC------CTT--GACTAGCTCTAAAATAAG-CCTTTAAGGCTCTTTT-GTA-AAGAATCAAA-TTGGAC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATGCAGG-TAAAAAACAATT-CC-AGAGATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTCAGATGATT--TGATTT-TTAATAGAAAAACTTT-------TTTATC--TG-AT---------TTTT-CTTACCGTTTTTTTACAG---------------AATATATGACAATGTTT--TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGAATAGGCAATATTT-ACTGAACATCAGCATTCAAGCTTTTTTAATACATACCCGCTG---AGCCCCT-CCCTCGGTTTTCAGAA-TTAACACTGAAAAATCATCAGCATACCACGACTA-AACACATTTAAGCGAT-GTGTCACCTAATTTTGCGCGGGATAATATTTATCATTATATCAGTC-GGACAATAG-ATATCTGGTTCAGGATCCATGTCGAGTTTAT---TATTTTAACAAAGGTTT-GACTTACGGTACTTCTGTTACTCCTCCCGGGC-TGTTTAG-ACGACTCCACTCCACCGTTAAGGCCTTTCCACATGAAATTCG-AAGTTT-ATATCTGTTGTTCGGAGTTTGTGGTACAGTTATTAATTATG-TTTGGCCA-GTACATACTCTTGACATGACTTTATAGAgt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTTTT-CCCTTGAAAAGCTTC-TTTTG-A-A------T-AATCC--GTA-TGT-TC-GTAA-C-TTG---TCCTTTTCATT------TT--TA-----GCACA-T-TCTGACAAAT-TACTTTGCCATA----------CA--T--GTACATATTAA------TAAATCTTTT--T---CTAAGTTC-A-T-TA-----------AACAC----TTTTGAT-T--------GT------AGA-TCTGAAA--C--TTG--AA--AAAGATGT-TATCGCAGGATA-TG-CCAA-GTTGATT---CAGT---AAAA-AATA-----AAC----AC--------TGCTCA---AC-C-----AACAATT--C-TTTTTG-T------TA-TC--A-TTCAAA-A------------TCA-T-AT--------T-T-TCTT--GA--AGT-GCACACT-C-AAGCAA---AGTATCATTTGATTTATGAATGT---GT-TGTAAA--TATT-TA-A--C---AG--T-ATTGGAT-AA---GGTTTCAATA--TATA-A-TGGATGCCTACCT-AA---TT-CCC-CCATAACTGCA-TAG------TTT--GAAG---CTTTCTTATGTACCCCCCGGTGTA------CCCCA---CATATGTA-CTTGAGAGTTTTAATG---TG-AA-GTT-------TATC------AC--TATATATAT--TTTTCATTG-A----G-TTTT-CAA-T--ATTATAATTTGGTCTCTT-AAC---AA-TAGCAGATTCTGAATTTATAATT--C-CCCAAATTTCACTTCCATATAACA-CAATA-------G-GT-------TT-T----ATTG-TGTGATCAtgtaattcatcggccattcatcgtttcacttctagtcgaagttgtgtcgcaagccttgtg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aggta-TGA-TAGTAGCGTTCAAGCTTTTTT--------------G---AAGTCTT-CCTTCAGTTT-CAGAAATTAACACT---AAGTCATCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAA-GAT-GTGTCACCTAATTTTGC-TGGA-------TCATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----T--------CTC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AAAGATTTGGACTTA-GG--------TCG--TCTCC----C-TGTCTAACAC---------CCACC-TTAGG-----TTCAAA--------------TT-AT--------TTTGAAGTTT----TACAG--AC--AGTATG-TTT-GCCATGTACATACTTTTG--ATGACTTTATAGAAAGGCCCC-TTATGTCAAGC-TG-ATGCAGCC-TGTGTAG-AAGATCTG-AATGTAAAACAGTGTCAAAAGCCTTAGAAAAATCAACA-AAGCAAACGTATAATT--TGGAA-TT-ATCATTTGTATA-TTTTTGAATAACGGTTCT-AAGTATAAAAATGTGGTCACTAGTTCTGGCTTTTGGTTGAAAACCAATTTGAACTTTATTTATAATGTTGTTCGAGTCCAAGTAGTTTTGTAACCTGGTATTCAGTATGCTATTAAATATACTTTGGGATA-aaaagatgcaacaaaatgccggcatt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             caaaattaggAAGTAA-AT--T--------TT-ATA-TCA--A-T-A--TT-T-GG-CC-C-AG------GCAT---------AACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--A-CA-ACAA-GA----AGA---AA---A------CC-ATT-C-ACCAAT-GA--T---AGATAA-CGT--AA-C-TAACA-AAGT---TAAT-GA---T-A-AATC---AA---AATT-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAGAGCAGCT-------TA-TATTAAT---GT-A-------G-TTGGACA-AA--TT---AG--T--AA-TC-GCTGTCA-CA-TGTC--ATCTTTATACTGC--A-----T--AAAAG--C-AATTA-----AATTATTC-T-CT-AT-TAACATACCAAGT--T-T-A-T----------AA-GTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----T---CTA-TG---AAATG-G-T-T----------T--TCTTGATGTT----AGTAT-GCCATGT-AACACAA---TCAATG-ATG------A-A--AAAT-GGAAT-TAA----CA-TGCTTATC---AAAGCAC-AG-TACAG-A--CTT-GCAG-ACA-CTTAACATTTTC-TCACAT-TTA-CATGTGTTTTTGTGT--A--AC-GCC--A---TCAA-AGCC-AA-AGA-ATGAGAACTGGTTCTGAAATATGG-----TAAAA-CATTT--CAAGA-CTTGAGGATT-ATGAAt
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): TTCCAATTGGGTCGCTGTGCCCCAGAGCGCGCAAGAACTAATAGGAGAGACCGTACTTAACAGTTGAGAAAGAATGTCCCAAAAAAAAGAAGTGCGGAAAAGTGACTAAGATTTCAAGTACAGAGTGCGTAATCACAAACTCTAACAT
Unaligned ( gi|35 ): AAGGGTATTCAGAACAAGAATGACATGGGAACATAAAGAAATAAAGTAAAATAAACAGGGAAAAACATCCAGATG
Unaligned ( gi|38 ): AATAAATTTGGAAATAAAATATCAATTTTGAAATAAAGAAAATAAATTTGAAATATTCATTATGATA






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                1111111111              1                              44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444      1111                                        1                                                    111             222222           222222222222222      1111111111          444444444444444444444444444444444                            222                 11111                               11111                      111              2222222222         1111                    1111111   2222222222                    2222222222222        111111    22  11     111          111   22222222               222222        111111  11        1                      11                  11111                       11                                             11111          111     22               1              1                    11         33333333                    111     111   11111   222222      11111                       11111   33333333333333333         333333333            1111      111      222222222     1111  11   111111111111111111       11                        1   222222     11            111    111   11    11111   22222222222222      222222222222                   111111     11                                                                 11     33333333333333            111         11            111                111                  11               111                      111111         111             55555555555555555     111       22                111     1   2222222    111111      11                222222                                             111               1                         111     1111111    222222222222222    1          22222222222                      111           11   11          222222   11                              111                        1111          111             11  1                                          111     1                                2222222222          222222222    5555555555555555555555555555555555     11     11                                          111                         11     111     111                                 111               2222    1    11      2   1                 11   2222222       11                    1111    111     111     11    111        1               1  4444444444444     2222 1       1  666666666     1     22222       11             1  33333333          2222     222222      1   1                   11                1               1  1        1       1        1     1                                1                11        22           1                  1                                                                                                                    111      1     1            1      333      3333333                 1                     22222                 1   1              1      1  1     1      2222  1          222            1         1    1          1          1           1    111  1                       11                                  22222222      1     1   222    11     11111     1        111          11                      1               1              7777777777777                1            1           11      555555555          1       
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             3  0000000000   2   2  555 0 2 22  2 2  4  2 2     333    77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777   8  3333  7777 33 4444   555  222 555555  2  77 4 55  44  33 666      2   77  888     2    444  5 2  000 2 2    444  000000 5  5 66   111111111111111   2  1111111111   77     000000000000000000000000000000000       2  33       55 33  2 222      2   5 2 2  44444    8 33 77777 33  88 44       11111 1      3 3  3  3  6  111     44 3 3 3 0000000000         1111 3   3  0  0 3 3  3 0000000   5555555555   6  555  6  3 6 3 3333333333333     0  444444    44  00   3 666  9999    666   00000000 55    4     8 222222  4 8   888888  11   4  4 2   8 55   4    4   8  66        5  0   5  77777         1  99999  6   55 4    1 5    5  5   5          11   77  22   22222     5    222     00         5     5    888       1     5    0     3   00     5 5 22222222     66   5   5  5  333 5   333   22222   000000  77  11111   5 5       5         44444   33333333333333333         444444444      0  5  5555   1  555 5    000000000     0000  33   888888888888888888 1 5   88  99 99   99  99        3   222222   5 99    5   5   000    555   44    44444   44444444444444    5 777777777777       77 5      5 666666  5  55 5      5 4 6   6   99   666  7     99 666    99  99   6    6  3 44     11111111111111     6      111  6      55    6  6    888  99 6       6  111   99     99   11 88            6  111  6   6           6   999999   99    111             22222222222222222   1 111     4 22   0        7   111  6  3   1111111 1  999999  3   11  9        6  6 111111    6   9999         1        6   888        000               5  6 6      6666666    5  111     6666666 5  000000000000000    1          44444444444  6     99 77    6    111    1 5  8 11   88  8       000000   11        8         8           666  0   8    8  8  88  8  7777        8 444     8       11  6 0  999  0  8  3       99  99        6    111     3   2   99      6   6            2222222222   99  6  666666666    0000000000000000000000000000000000     55     44   99                   99   6            111   6                     66     444     444       8          8     0        444 44  3       3 1111    0    33      0   0         0    0  44   6666666       11    8   8    8    8 7777    444     444     33    777        0        55     0  2222222222222     1111 0       0  555555555     0   6 55555       11  0   9      0  66666666          1111     555555      0   0    3        3     99          6     2     7         3  3        3       3        3     2    0                7          3    7   0       88   7 6  00           3                  3                           6                                   7             6          0                           777      0     0   7 7      3      444      5555555  1      6     1 0                     11111                 2   2   6      7   3      3  3     3      8888  3          222      7     3         3 7  2 0  6     0          0           3    777  3  7      7             44            0               1  1  55555555      0     3   555    44     99999     0   22   222          44                      3               3              3333333333333     7      7   3    7       3           88      444444444      6   3       
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .  ..........   .   .  ... . . ..  . .  .  . .     ...    ..............................................................   .  ....  .... .. ....   ...  ... ......  .  .. . ..  ..  .. ...      .   ..  ...     .    ...  . .  ... . .    ...  ...... .  . ..   ...............   .  ..........   ..     .................................       .  ..       .. ..  . ...      .   . . .  .....    . .. ..... ..  .. ..       ..... .      . .  .  .  .  ...     .. . . . ..........         .... .   .  .  . . .  . .......   ..........   .  ...  .  . . . .............     .  ......    ..  ..   . ...  ....    ...   ........ ..    .     . ......  . .   ......  ..   .  . .   . ..   .    .   .  ..        .  .   .  .....         .  .....  .   .. .    . .    .  .   .          ..   ..  ..   .....     .    ...     ..         .     .    ...       .     .    .     .   ..     . . ........     ..   .   .  .  ... .   ...   .....   ......  ..  .....   . .       .         .....   .................         .........      .  .  ....   .  ... .    .........     ....  ..   .................. . .   ..  .. ..   ..  ..        .   ......   . ..    .   .   ...    ...   ..    .....   ..............    . ............       .. .      . ......  .  .. .      . . .   .   ..   ...  .     .. ...    ..  ..   .    .  . ..     ..............     .      ...  .      ..    .  .    ...  .. .       .  ...   ..     ..   .. ..            .  ...  .   .           .   ......   ..    ...             .................   . ...     . ..   .        .   ...  .  .   ....... .  ......  .   ..  .        .  . ......    .   ....         .        .   ...        ...               .  . .      .......    .  ...     ....... .  ...............    .          ...........  .     .. ..    .    ...    . .  . ..   ..  .       ......   ..        .         .           ...  .   .    .  .  ..  .  ....        . ...     .       ..  . .  ...  .  .  .       ..  ..        .    ...     .   .   ..      .   .            ..........   ..  .  .........    ..................................     ..     ..   ..                   ..   .            ...   .                     ..     ...     ...       .          .     .        ... ..  .       . ....    .    ..      .   .         .    .  ..   .......       ..    .   .    .    . ....    ...     ...     ..    ...        .        ..     .  .............     .... .       .  .........     .   . .....       ..  .   .      .  ........          ....     ......      .   .    .        .     ..          .     .     .         .  .        .       .        .     .    .                .          .    .   .       ..   . .  ..           .                  .                           .                                   .             .          .                           ...      .     .   . .      .      ...      .......  .      .     . .                     .....                 .   .   .      .   .      .  .     .      ....  .          ...      .     .         . .  . .  .     .          .           .    ...  .  .      .             ..            .               .  .  ........      .     .   ...    ..     .....     .   ..   ...          ..                      .               .              .............     .      .   .    .       .           ..      .........      .   .       
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             1  8888888888   2   1  555 5 0 88  0 0  0  0 0     555    88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888   0  5555  2222 11 2222   555  888 888888  1  11 7 88  44  11 999      2   99  555     4    444  0 5  000 7 7    777  999999 3  3 33   333333333333333   7  7777777777   33     444444444444444444444444444444444       5  44       99 44  5 333      7   3 9 9  33333    6 99 11111 99  55 22       77777 4      3 3  3  3  7  777     66 3 3 3 4444444444         7777 3   3  5  1 3 3  3 8888888   1111111111   7  888  7  3 7 3 9999999999999     4  888888    33  00   6 444  0000    444   55555555 00    0     0 555555  0 0   000000  00   0  0 0   0 55   0    0   0  55        0  5   0  44444         4  33333  7   77 3    4 0    7  7   7          00   66  99   55555     0    111     66         0     5    222       7     0    8     2   66     0 0 88888888     99   0   0  0  999 0   888   99999   777777  99  44444   7 7       7         33333   11111111111111111         999999999      4  0  1111   0  444 0    000000000     6666  66   333333333333333333 0 7   33  22 22   22  22        3   111111   7 33    7   7   000    777   44    33333   44444444444444    7 777777777777       99 7      7 444444  7  77 7      7 3 7   7   22   888  3     22 888    22  88   7    7  5 00     88888888888888     7      777  7      88    7  7    333  22 7       7  777   22     22   66 66            7  777  7   7           7   222222   22    777             88888888888888888   0 777     2 22   7        8   777  7  3   7777777 0  222222  5   88  8        7  7 888888    7   3333         0        7   777        000               0  7 7      2222222    7  777     4444444 7  333333333333333    4          00000000000  7     22 77    7    777    0 0  0 00   66  0       888888   00        0         0           222  8   0    0  8  88  0  0000        0 000     0       00  0 8  444  8  0  2       22  22        7    777     3   5   22      7   7            5555555555   22  7  777777777    0000000000000000000000000000000000     88     00   22                   22   7            555   7                     22     000     000       0          0     8        000 00  2       2 2222    0    22      0   0         8    8  44   0000000       00    0   0    0    0 0000    000     000     88    555        0        00     0  2222222222222     2222 0       0  222222222     8   5 00000       88  2   2      0  22222222          2222     555555      0   0    2        2     88          5     0     3         3  3        3       3        3     0    7                3          3    3   7       33   3 7  77           3                  3                           7                                   3             7          7                           000      0     0   3 3      3      000      3333333  0      7     0 0                     33333                 0   0   7      3   3      3  3     3      3333  3          777      3     3         3 3  0 7  7     0          0           3    777  3  3      3             00            7               0  2  88888888      0     3   000    77     33333     7   00   000          77                      3               3              3333333333333     3      3   3    3       3           33      777777777      7   3       
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GGTAAGTAA-GT--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT---------TACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--T-CA-T--A-GA----AGA---AA-G-A------TC-AT--C-A--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-A-TAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TA--------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T--AA-CA-ACTGTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----AATTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-T----------AAAGTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----TT--CTA-TG---AA-TG-G-T-T----------T--CTTAGATGTT---TGGTATTGC--TGT-A---CAG---TCAA---ATG----T-A-A--AAAT-GGAAT-T------CA-T-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-GCAG-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCAT-TTAACTTGTGTTTTTGTGT--A--AC-GCCC-AGTTTCAATAGCC-AA-AGA-ATGAGAACTGATTCTGAAAATTTG-----TAAAA-CATTT--CAAGACCTTGAGGATT-ACGAATTTAC-TGGAAAATATTTTTT-CTCTACAGAATCTTG-TTTTG-A-A------T-AATGC--ATA-TGT-TC-GCAAGT-TTG---CCA----CATT----G-TT--TG-TCC-GCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---C--GTGAATATTTA------TAAATCGCTC-AT---GTAANTT-A-T-TAGT---------AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------ANT-TTT--AT--C--ATG--TA--TAGAACAT-TGT------ATA-T--CTAA-CTT-ATT---CAAA---ATAT-AATG-----AAT----GC--------TACT-A---NT-C-----AACTACT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACA-TTG-TTT--TCA-T-ATACAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-GAAT-CTAC-AAGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TT-CGTAAA--TATT-TA-AAAC---AG--C-TTTTTAT-AA---CAT--CAAAA--TACATA-TGGGAATCGACCA-AG---TT-CAC-CTACAATAGCT-TGA------TTT--GAGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---AATATATA-TTCGAGAGTTTTAATG---TG-CA-TTT-------TNTC------GCAGTA-CATATTTATTAA-AG-A----N-TTTT-CTA-T--ACAATAATCNGGGCGTTT-GACG-GAACTTGTA---TCTGTATTTATTGTTCCC-CCCAAATTTCACATGCATA-AA-G-CAGTA-CT----G-GT-------TT-A----ACTG-TATGATCATA----CAAA---GT-GTATC--AG-GGTG-TGTA---TTTTNGGTT-T--AATA-TT-CCAAAAC-----ACTT--GACTAGTT-TAAAATAAG-CCTTTAAGGCTCTTTTTGTA-AAGA-TCNAA-TTG-AC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATG--AG-TAAAAA-CAATT-CCCAGATATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATT--TGATTT-TTA-TAGAAAAACTTT-------TT-ATC--TG-AT---------TTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAAT-TTT--TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-A-TGA-CAATAGCATTCAAGCTTTTTTAATACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCGGTTT-CAGAAATTAACACT---AAATCATCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAG-GAT-GTGTCACCTAATTTTGC-CGGA-------TTATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AAAGGTTTGGACTTA-GGT-------TTA--CCTCC----C-TGTCTAA-ACG--------CCACCNTTAGG-----TTCAAATGAAACTCGTAAGTTT-AT--------TTTGGAGTTT----TACAG--AT--ATTATG-TTT-GCCATGTACATACTCTTGA-ATGACTTTATAGAAAGGCCCCTTTATGTCAAGT-TG-GTGCAGCC-TGTGTAG-AAGAGCTG-AATGTGAAACGGTATCAAAGGCCTTAGAAAAATCAACA-AAGCAAACGTACAATT--TGGAACTT-AATATTTGTATA-TTTTTGAATAAGGGTTCT-AAGTATAAACATGTGGTCACTGGTTCTGGCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTTATAATATTGTTAGAGTCCAAGTAGTTTCGTAACCTTGTATTCAGTATGCTATTAA--ATACTTT-GGATA-AGCAAAGAAGTT-ATTGTT-A-TCCTCTA---TAGTANTTTGATGGGTCANA-AGGGCTATCATTTTTATGAAT-AGGCTTTAATAAAGCCTATTTCCCACTCCCTTTGGGTATT-TGCCAG-AG-GACAA-GACAAG----AT-TAAATAATTT-T-AGCATATGTGGT-AAAATATAT-GTACGTCGGCTTTCA-ACATCTCATT-TTTAATGCCAT-CTAATCGCA-GCTTGATTTATTATTTTTTAGATGTTTTTATTGCATCGATGATTTTCTTTTCTNTAATTG-A-TAAATCTAAC-GAAGT-AATG--TTGATATTTCTGCTGACTTGGACAANNAATCTTCAAAATATTTAATTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAGATATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGACT--TTCAAA-CCT-----GAGTTTCCAG-TATGATA
Reference ( family-3541 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GGTAAGTAA-GT--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT---------TACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--T-CA-T--A-GA----AGA---AA-G-A------TC-AT--C-A--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-A-TAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TA--------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T--AA-CA-ACTGTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----AATTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-T----------AAAGTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----TT--CTA-TG---AA-TG-G-T-T----------T--CTTAGATGTT---TGGTATTGC--TGT-A---CAG---TCAA---ATG----T-A-A--AAAT-GGAAT-T------CA-T-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-GCAG-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCAT-TTAACTTGTGTTTTTGTGT--A--AC-GCCC-AGTTTCAATAGCC-AA-AGA-ATGAGAACTGATTCTGAAAATTTG-----TAAAA-CATTT--CAAGACCTTGAGGATT-ACGAATTTAC-TGGAAAATATTTTTT-CTCTACAGAATCTTG-TTTTG-A-A------T-AATGC--ATA-TGT-TC-GCAAGT-TTG---CCA----CATT----G-TT--TG-TCC-GCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---C--GTGAATATTTA------TAAATCGCTC-AT---GTAANCT-A-T-TAGT---------AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------ANT-TTT--AT--C--ATG--TA--TAGAACAT-TGT------ATA-T--CTAA-CTT-ATT---CAAA---ATAT-AATG-----AAT----GC--------TACT-A---NT-C-----AACTACT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACA-TTG-TTT--TCA-T-ATACAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-GAAT-CTAC-AAGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TT-CGTAAA--TATT-TA-AAAC---AG--C-TTTTTAT-AA---CAT--CAAAA--TACATA-TGGGAATCGACCA-AG---TT-CAC-CTACAATAGCT-TGA------TTT--GAGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---AATATATA-TTCGAGAGTTTTAATG---TG-CA-TTT-------TNTC------GCAGTA-CATATTTATTAA-AG-A----N-TTTT-CTA-T--ACAATAATCNGGGCGTTT-GACG-GAACTTGTA---TCTGTATTTATTGTTCCC-CCCAAATTTCACATGCATA-AA-G-CAGTA-CT----G-GT-------TT-A----ACTG-TATGATCATA----CAAA---GT-GTATC--AG-GGTG-TGTA---TTTTNGGTT-T--AATA-TT-CCAAAAC-----ACTT--GACTAGTT-TAAAATAAG-CCTTTAAGGCTCTTTTTGTA-AAGA-TCNAA-TTG-AC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATG--AG-TAAAAA-CAATT-CCCAGATATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATT--TGATTT-TTA-TAGAAAAACTTT-------TT-ATC--TG-AT---------TTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAAT-TTT--TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-A-TGA-CAATAGCATTCAAGCTTTTTTAATACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCGGTTT-CAGAAATTAACACT---AAATCATCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAG-GAT-GTGTCACCTAATTTTGC-CGGA-------TTATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AAAGGTTTGGACTTA-GGT-------TTA--CCTCC----C-TGTCTAA-ACG--------CCACCNTTAGG-----TTCAAATGAAACTCGTAAGTTT-AT--------TTTGGAGTTT----TACAG--AT--ATTATG-TTT-GCCATGTACATACTCTTGA-ATGACTTTATAGAAAGGCCCCTTTATGTCAAGT-TG-GTGCAGCC-TGTGTAG-AAGAGCTG-AATGTGAAACGGTATCAAAGGCCTTAGAAAAATCAACA-AAGCAAACGTACAATT--TGGAACTT-AATATTTGTATA-TTTTTGAATAAGGGTTCT-AAGTATAAACATGTGGTCACTGGTTCTGGCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTTATAATATTGTTAGAGTCCAAGTAGTTTCGTAACCTTGTATTCAGTATGCTATTAA--ATACTTT-GGATA-AGCAAAGAAGTT-ATTGTT-A-TCCTCTA---TAGTANTTTGATGGGTCANA-AGGGCTATCATTTTTATGAAT-AGGCTTTAATAAAGCCTATTTCCCACTCCCTTTGGGTATT-TGCCAG-AG-GACAA-GACAAG----AT-TAAATAATTT-T-AGCATATGTGGT-AAAATATAT-GTACGTCGGCTTTCA-ACATCTCATT-TTTAATGCCAT-CTAATCGCA-GCTTGATTTATTATTTTTTAGATGTTTTTATTGCATCGATGATTTTCTTTTCTNTAATTG-A-TAAATCTAAC-GAAGT-AATG--TTGATATTTCTGCTGACTTGGACAANNAATCTTCAAAATATTTAATTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAGATATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGACT--TTCAAACCCT-----GAGTTTCCAG-TATGATA
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GTAAGTAAAGT--TA----A-TTTTATTCTCCGAA-T-T--TT-G-GG-CCAC-GAAGG---GCAT----------ACAA-G------------ATAT---------A--------------------AAA-AA----CA-C--A-GA----AGA---AA-G-T------GC-AT--CCA--AAT-GA--TGA-AGATAA-AGT--AA-A-TAACA-AAGT---TA-T-GAA--T-A-AATC---AA---T--T-TT-C--TCA---------------ATT-G-----------GAG--CAGCT------ATACTT--------GT-A-------GATTGGCAA-AT--TTCTCAACCT--AA-AC-ACTGTCA-CAT-T-CGAT-----TACT-CCAA-----T--AA--G--CCAAATA-----A-TTTTTC-T-CTGATCTA-CA----AGGT--T-T-AAT----------AAAGTTTTTTA--A-AAC-AAAGT---T-CAAT-------GGAT-----T---CTA-TG---AA-TG-G-T-T----------TGTCTTAAATGTG---TG-TAT-GC--TGT-A---CAA---TCAA---ATG----T-A-A--AA-T-GGAATGT------CA-T-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-GCAG-ACAGCT--ACATTTTC-TCTCAT-T--ACTTGTGTTTTTGTGTTAA--AC-GCCCGAGTTTCAATAGCC-AACAGA-ATGAGAACTAATTCT-AAAATTTG-----TAAAAACATTTT-CAAGAC-TTGAGGATT-AC-AATCT-----GAAAATATTTTT--CTCTACAGAATCTT--TTTTG-A-AC-----T-AATGGGAATAATGT-TC-GCA-GTGTTG---CCA----CATT----GGTT--TG-TCCTGCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---CCAGTGAA-ATT---------AAATCGCTC-AT---GCTAACT-T-TATAGT---------AACAA----TTT-GATTACGGA----AT------ATT-TTT--ATATC--ATG--TA--TAGAACATCTGT------ATAGT--CTAAGCTT-ATT---CAAAC--ATA--AATG-----AGA----GC--------TACT-A---GTTC-----AACTACT--T-TGTTTG-T------TA-TCGAA-TACAAT-ACAGTTG-TTTCATTA-T-AT-CAGCA--TAT-TCTT--AA-GAAT-GAAT-CTAC-AGGGGGCGAA----------ATCTA-AAATTC---TT-CGAAAAA-TATT-TA-AAAC---AG--CGTTTTTAT-AAACACAT--CAAAA--TACATA---GGAATCGACCA-AG---TTTCAC-CTACAATAGCT-TGA------TTT--GAG----CCTTTTTAGGTAC----------AGA----CCA-A---AATATAT--TTCAAGAATTTTAATG---TGGCAATTT-------TTTC------GCAGTAACATGTTTATTAA-AG-A----CGTTTT-CTAGT--ACAATAATCAGGGCGTTTTGACG-GAACTTGTA---TCTGTATTTATTGTTCCC-C--AAATTTCACATGCATA-AAAG-CAGTAACT----GTGT-------TTTA----ACTG-TATGATCATA----CA-----GTCGTATC--AG-GGTG-TGTA---TTTTTGGTTAT--AAT--TT-CCAAAAC-----ACTTTTGACTAGTT-TAAAATAAGGCCTTTAAGGCT---TTTGTAGAAGA-TCCAAATTG-AC----AACATGTGTA---AGGAGGCCTGATG--AGGTAAAAA-CAATTGCCCAGATATT---G--TACGATGAACACT---TGTTCTGA--ATT--TGATTT-TTA-TAGAAAAACTTT-------TT-ATC--TG-AT---------TTTT-T-------------ACAACGTTTTTTCTACAGAAATATT-GACAAT-TTT--T-GTCTTTCTGAGGTTGACCAGGA-TAGGCAAAATTTGA-TGA-CAATAGCATTCAAGCCTTTTTAATACAC---CGCTGTGAAGGCCCTCCCCTCGGTTT--AGAAATTAACACT---AAATCATCAGCAT-C----AACATAACA---TTAAGAGATGGTGTCACCT-ATTTTGC-CGGA-------TTATCAT--TATC-GTCGAAAA-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAATATTATTTTAA-AAAGGTTTGGACTTA-GG--------TTA--CCTCC----C-TGTCTTA-ACAC-------CCACACTTA-G-----TTCAAATG-AACTCGTAAGTTTGAT--------TTTGGAGTTT----TAGAG---T--ATTATGTTTT-GCCATGTACATAC-CTTGA-TTGACTTTATA-AAAGG-CCCTTTATGTCAAGTCTGTGTGCAGCCTTGTGTAGAAAGAGCTGAAATGT--AACGGTATCAAAGGCCTTAG-AAAATCAACACAAGC-AACATACAATTGCTGGAACTT--ATATTTGTATATTTTTTGAATAAGGGTTCTAAAGTATAAACATGTGGTCACTGGTTCT-GCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTTAT-ATATTGTTAGAGT-CAAGTAGTTTCGTACCTTTGTATTCAGTATGCTATTAA--ATACTTT-GGAAATAGCAAAGAAGTTGATTGTTAA-TCCTCTA---TA--ATTTTGAT-GGTCATA-AGGGCTATCATTTTTATGAAT-AGGTTTTAATAAAGCCTATTT-CCATTCCCTTTGGG-ATTCTGCCAACAGAAACAACGACAAG----AT-TAAACAATTTATAAGCATATGTGGTAAAAATATAT-GTACATCGG-TTTCA-ACATCTCATT-TTTAATGCCAT-CTAATCGCA-GCTTGATTTATTATCTTTCAGATGTTTTTATTGCATCAATGATTTTCTTTTCTTTAATTG-A-TAAATCTAAC-GAAGT-AATG--TTGATATTTCTGCTGACTTGGACAATAAATCTTCAAAATATTTAATTCTGGGTATCAAATTTACTAATCAATACTGAATAATGTTTGTAAAATGATTTACACCCATTGTTCACTAGATATCTT-ATCGGACT-ATCTTGCGGATTGCTGATTGATTCAAATTCTTTCAAAAGTTT-CAG-TATG
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aaAAGTAA-AT--T--------TT-ATA-TCA--A-T-A--TT-T-GG-CC-C-AG------GCAT---------AACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--A-CA-ACAA-GA----AGA---AA---A------CC-ATT-C-ACCAAT-GA--T---AGATAA-CGT--AA-C-TAACA-AAGT---TAAT-GA---T-A-AATC---AA---AATT-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAGAGCAGCT-------TA-TATTAAT---GT-A-------G-TTGGACA-AA--TT---AG--T--AA-TC-GCTGTCA-CATGT-C-ATCTTTATACTGC--A-----T--AAAAG--C-AATTA-----AATTATTC-T-CT-AT-TAACATACCAAGT--T-T-A-T----------AA-GTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----T---CTA-TG---AAATG-G-T-T----------T--TCTTGATGTT----AGTAT-GCCATGT-AACACAA---TCAATG-ATG------A-A--AAAT-GGAAT-TAA----CA-TGCTTATC---AAAGCAC-AG-TACAG-A--CTT-GCAG-ACA-CTTAACATTTTC-TCACAT-TTA-CATGTGTTTTTGTGT--A--AC-GCC--A---TCAA-AGCC-AA-AGA-ATGAGAACTGGTTCTGAAATATGG-----TAAAA-CATTT--CAAGA-CTTGAGGATT-ATGAAgcat
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      taagctaATAGAGCATAA---TT-CCC-CCATAACTGTT-TGG------TTT--GAGG---TCTTCTTGTGTAT----------T------CCATATAGAGTATGTA-CTTGAGGGGTTTAATG---TG-AA-GTT-------TATC------AC--TA-AATA-TGATTCATGG-A----C-TTTT-CAA-C--ATTATAATTTGGGCTCTT-TACATCAGCAGGT----TTTGAATTTGTAGTT--T-CCCAAATT--------ACA-AA-A-CA----------G-GT-------TT-T----ACAG-TGTGATAAAA----AAAAAAGAT-GCAAC--AA-AATACTGGA---ATTTGGCCT-TGCAAT--TT-CAAAAAC-----ATTT--AATTAATT-TAAAGAAAG-CATTCAAACCAC-GCTTATA-CAGG-TCTTG-TTG-ACAATTAACATATA-ATCCAAAGG-CAT--TG--AA-T-ATAC-CA----CGTAAATATTAATGAATAAAA-GA-CAATGAATGTTC-TAT--TTCCTTATCT-TTA-TAAACAAATTTTAAGTTTCTT-ACCTTTGCAT---------TCTTGT-------------AAAA---------------AAAAT--G----T-TGTCCTTGTCTTTTTCAAATTAAC--AGA-GAGACAATGTTT-A-Taa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gTAAGTAA-GT--TA----T-TTT-ATT-TCC--AAT-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT--------------AA------------ATAT---------A--------------------CAT-AAA-C-CA-C--A-GA----AGA---G--G-A------CC-AT--CCA--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-A-TAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TTTC--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TAT-------GT-A---------TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T--AA-CA--CTGTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----ATATTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-T----------AAAGTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGA------TT--CTA-TG----A-TG-GTT-T----------T--CTTAGATG-T---TGGTA-TGC--TGT-A---CAA---CCAA---ATG----T---A--AAAT-GGTAT-T------CA-T-CTT--C---AA--CACAAG-TCCAG-A--CTT-GCAG-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCAC-TT-ACTTGTGTTTTTGTcata
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -T--TT-G-GA-CC-C-AGAGT---GCAT----------ACAAAG------------A-AT---------A--------------------CAT-AG--TTCA-T--A--A----ATA---CA-C-A------TC-AT--A-A--AA---A--T----GATAA-AGT--AATA-TAACC-AGGT---TA-T-GA---T-A-AATC---TATTTT--T-TT-T--TCA---------------ATA-GT----------GAG--CAGC----------------------T-A-------A-TT-------A--TTGTCAA--T--AA-C--ACTGTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----ACTTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---TATGT--T-T-A-T----------AAAGTAATT----A-TAC-AAGGTGT-T-TA-T-------GAA------CT--CTA-TG---AA-TG-G-TGC----------C--CTTAGGTG-T---TGGTA-TGC--TAT-A---CAG---TCAA---ATA----T-ACA--AAAT-GGAAA-T------CA-T-CCT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-ATGCGT-GCGC-ACGCCT--GCAT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               g--TA----A-TTT--TT-TCC--A-A-T--TT-T-TG-CC-C-AGAGG---GCAT----------ACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AAA-C-CA-C--A-GA----AGA---AA-G-A------CC-AT--CCA--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-AATAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TTTC--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TAATTTAT--GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T--AA-CA--CTGTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----AATTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T---C----------AAAG-TTTT----A-TACAAAAGTAT-T-CA-T-------GGATCTATATT--CTA-TG---AA-TG-GTT-T----------T--CTTAGATG-T---TGGT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aaggtagTAAGTAA-GT---A----A-TTT-----TCA--A-T-T--TT-G-GG-GT-G-AGAGG---GCAT---------CATACAA------------ATA-----------------------------------AA--T-CA-G--A-GTTCCTGTA---CA-T-G------TT-AT--CTA--AAA-GG--C---GTATAATATT--AA-A-TTACA-AGTT---TA-T-GA---T-ATAAT----AA---ACTT-TT-C--CCC---------------ATA-AT----------GAA--CAGCTCTAGAGATA-TA--------GGGA-------A-TTGGCAA-AA--TTTCCAT--T--AA-CA-TC-GTCA-CAT-g
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aaA----G-TTT-ATT-CCA--A-T-T--TT-G-GGCCC-C-AAAGG---GCAT---------AATAGAA------------GTA----------A--------------------CA--GC--T-CA-T--A--A----AGA---AA-G-AAATGTCCC-AA--A-A--AAT-GAAGT---GGGAAA-AGTTAAA-A-TATCA-cacacaagtctatgtataactataaaatattcatggactct
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aaagaaaataaatttgagaaaaaatatcaattttgaaataagaaaataaaatttggaaatattcattatgatatctataggtgtaaagataatataCCC-AGTTTAAATAGCC-AA-AAG-ATGAGAACTGATTATG-AAATTTA-----GAAAA-CATTG--CAAGAC---GAGGATT-GCGAA-TTAC-TGAAAAATG--TTTT-CTCTACAGA------------------------AATGC--A-A-TGT-TC-GCCAGT-TTGT--CCA-----ATT----G--T--TG-TCT-GCA-ATTGCCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------CCTTC--ATGAATATTTCTCTTTTTAAATCTATC-AG---ATAATTT-A-T-TAGT---------AACAA----Ttggaatcacaacttacatgtatgtgg
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tacA-AAGT---TA-TAGA---T-A-A-TC---AA---T--TGTT-C--TCA---------------TTT-GT----------GAG--CAG-T------ATA-TA---------T-A-------G-TTGGCAA------TTTCAA--T--AAGCA---T-TCA-CAT-TAC-AT-----TA-T-C--A-----CTAAA--G--CCAAATAC----AATTTCTT-TACT-AT-TA-CA---CAGGT--T-TTA-T----------AAATTTTTTGCCTA-TAC-AA-GTAT-TTCA-T-------GGAT-----TCTGCT--TG---AA-TG-G-T-T----------TTTCTTA-ATGTT----GGTATGGC--TGTTA---CA----TCAA---ATG----T-A-A--AAata
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TGGCAACGA--TTTT-AA--T--AA-CA--CCGTCA-C-T-T-C-AT-----TGCTTC--A-----T--A---G--CCAGGTA-----AAGTT----------------------GTT--T-T-A-T----------CAAATTCTT----A-T-C-AATGTGT-T-CA-A-------GGA----------CTGGTG---AA-TG-G-T-T----------TT-CGTACA-GTTGAATGATAT-AC--AAT-A---CAG---TCAA---TT---------A--CAAT-GGAAT-T------CA-T-CTT-------A--CAA-AGTT-CAGCA--TTT-ACAG-ACA-GT--GCATTTTCTTTTCATATTACC---CGTTTTTG
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  acGGTAAGTAA-GT--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT---------TACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--C-CA-C--A-GA----AGA---AA-G-A------CC-AT--C-A--CAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-T-TAA-A-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TA--------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAAA-T--AA-CA-ACTGTCAGCAT---C-GT-----TACT-C--A-----T--AG------CAAA-A-----AATTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-T----------AAAGTTTTC----AATAA-CAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----TT--CTA-TG---A--TG-G-T-T----------T--CTTAGATGTT---TGGTATTGC--TGT-A---CAC---TCAG---ATG----T-A-A--AAAT-GGAAT-T------C--T-CTT------AA--CAC-AG-T--AG-A--CTT-GCAGGACA-CT--ACATTTTC-TCTCAT-TTAAATTGTGTTTTTGGTT--AGTAC-GCCCCAGTTTCAATAGCCCAA-AGATATG-GAACTGATTCTGAAAATTTG-----TAAAA-CATTT--CAAGACCTTCAGGATT-ACGAATTTACATGAAAAATATTTTTTTCTCTACAGAATTTTG-TTTTG-ATA------C-AATGA--ATA-TGT-TC-GCAAGT-TTG---CCA----CATT----G-TT--TG-TCT-TCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---C--ATGAATATTTA-------AAATCGTCC-AT----TAAACT-A-T--AGT---------AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------AAT-TTC--AT--C--ATG--TA--TAGAACAT-TGT------ATA-T--CTAA-CTT-ATT---CAAA---ATATTAATG-----AAT----GC--------TACT-A---GT-C-----AACTACT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACA-TTG-TTT---CA-T-ATACAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-GAAT-CTAC-AGGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TT-CGTAAA--TATT-TT-AAAC---AG--C-TTTTTAT-AA---CAT--CAAAA--TAC-TA-TGGGAATCGACCA-AG---TT-CAC-CTACAATAGCT-TGA------TTT--GAGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---AATATAT--TTCAAGAATTTTTATG---TG-CA-TTT-------TTTC------GCAGTA--GTATTTATTAA-AA-A----G-TTTTTCTA-T--ACAATAATCCAGGCGTTT-GACG-GAACTTGTA----CTGTATTTATTGTTCCCACCCAAATTTCACATGCATA-AA-G-CAGTA-CT----G-GT-------TT-A----GCTGCTATGATCATA----CAAA---GT-GTATC--AG-GGTG-TGTA---TTTTTGGTT-T--AATA-TT-CCGAAACCAAAAACTT--GACTAGTT-TAAAATAAG-CCTTTAAGGCTCTTTTTGTA-AAGA-TC-AA-TTG-AC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATG--AG-TAAA---CAATT-CCCAGATATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATT--TGAATT-GTA-TAGAAAAACTTT----------ATC--TG-AT---------TTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAAT-TTT--TTGTCTTTCTGGGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-A-TGA-CAATAGCATTCAAGCTTTTTTA-TACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCAGTTT-CGAAAATAAACACT---A--TT-TCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAG-GAT-GGTTCACCTAATTT-GT--GGA-------TTATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AATGGTCTG-ACTTA-GGT-------TTA--TCTCC----CGCGTCTAA-AC----------CACCTTTAGG-----TTCAAATGAAACTCGTAAGTTT-AT--------TTTGGAGCTT----TACAG--AT--ATTATG-TTT-GCCATGTACATACTCTTGG-ATGACTTTATAAAAAGGTCCCTTTATGTCAAGT-TG-GTGCAACC-TGTGTAG-AAGAGCTG-AATGTGAAACAGTATCAAAGGCCTTGGAAAAATTAATA-AAGCAAACATACAATT--TGG-ACTTAAATATTTGTATA-TTTTTGAATAAGGGTTCT-AAGTATAAACATGTGGTCACTGGTTCTGGCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTAATAATATTGTTAGAGTCCAAGTAGTTTTGTAACCTTGTATTCAGTATGCTATCAA--ATACTTT-GGATA-AGC-AAGAAGTT-ATTGTT-ATTCCTCTATACTAGTAGTTTGATGGGTCATA-TGGGCTATCGTTTTTATGAAT-AGG-TTTAATAAAGCCTATTTTCCA-TTCCTTTGGGTATT-TGCCAG-AA-GACAA-GACAAG----AT-TAAATAATTT-T-AGCATATGTGGT-AAAATATAT-G-AC-TTGGCTTTCA-ACATCTCATT-TTTAATGCCATCCTAATC-CA-GC-TGATTT-TTATTCTTTAGATG-TTTTATTGCATCAATGATTTTCTTTTTTTTAGTTGTACTAAATCTAAC-GAGGTAAATGTTTTGAT-TTTCT--T--CTTGG-CAAGTAAT-TTCAAAATATTT-ATTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAG-TATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGACT--TTCAAA--CT-----GAGTTTCCAGTTATGATA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTTTTGTAATCG-A-TA--TGTAGCTGTAGT-AAT---CTGA-ACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--AAAATATTTA-TTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAGATATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGACT--TTCAAAACC------GAGTTTCCAG-TATGATA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    T--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATT--TGAATT-GTA-TAGAAAAACTTT-------TT-ATC--TG-AT---------TTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAA--TTT--TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-A-TGA-CAATAGCATTCAAGCTTTTTT-ATACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCAGTTT-CAGAAATTAACACT---
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                --TA----A-TTT-ATT-TCA--AAT-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCATAACATGGAATACAGAGTTC---------ATAT---------G--------------------CATGAA--T-CA-T--G-AA----AG-----T-G-A------TCAAT--C-A--AAA-GA--T---CAATAA-AAT----------------T---TA-C-GA---T-A-AATC---AA---C--TCTT-C--TCT---------------ATA-AT----------GAG--CA-C------------------------------------------AA--TTTCCTG--T--AA-C--ACCGTCA-AAT-T-C-GT-----TACT-C--A-----T--A
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gtacatgTCAGACAGGGCTATCATTCTTATGAATTA--CTTTGATAAAGCCTGTATCCCACTCC-TTTGAATATT-TGCCAG-AG-GACAA-GATAAATTACATGTAGATAATTT-C-AGCAAA--TGGT-ACAATATGTGGTACGGTGGCTAGTA-ACATTTCATT-TTCATTG
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TAAATAA-GA--AA----AGTTT-ATT-CCA--A-T-T--TT-G-GG-CC-CAAGAGG---GCAT---------AATAGAA------------GTATTATTTAAAAA--------------------CAT-----T-CA-T----GA----AGA---AA-G-A------
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    agtttaTAA-GT--TA----A-TTC-ATT-TTC--A-A-AAATT-GCGG-CC-C-AGAGGAATGCAT---------TACAGAG------------ATAT---------AAGGTTCAAATA---------CAG-AA--T-AA-T--A-AA----AGA---AT-G-A------TT-TC--C-A--AAA-GA--T---AGATAA-AGT--AG-A-Taatgtccaaaaagaaggaagaaattattttttacaatattataacatacatggatgtgg
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        agaTT-ATT-TCCA-A-T-T--TT-G-GC-CC-C-A-AGG---GCAA---------TA-AAAGAATACCAGGTTCACAT---------A--------------------CATAAA--T-CA-T--A-AA----AGAGCTAA-C-A------TT-AT--CTA--AAT-GA--T---AGATAC-TATA-AA-A-TAACA-AGGT---TA-T-ggaatgtgatttggtcaatca
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aagtagtattaaagtaAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA-------------------------A-G-A------CC-AT--CCA--AAT-GA--TTATAGATAA-AGT--AAGA-TTACA-AAGT---TA-T-GA---TTA-AATC---AA---A--T-TT-CC-TCA---------------ATTTGT----------GAG--CAGCT------ATA-c
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTTCAGACATTTCATTATTTTATCCCAC-CCAA--ACATGCTTGATTTATTATTTTTTAGCT-TTGTCACGGCAGAGATTATTTCCTTTTCTATATTT--------CCTAAC-Ggttgtgtgttaaattgg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cacaggTAAGTAA-GTAATATCTTA-TTT-ATT-TCC--AAT-T--TT-G-GG-CC-C-AG-GG---GCAT----------ACAA-G------------ATAT---------AAC------------------CAT-AAACT-CAAC--A-GA----AGA---AGTGCA------TC--T--C-A--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AACA-TAACATAAGT---TA-T-GGGACT-C-ACTCACAAA---A--T-TT----TCATGACACAGTACACTGATT-GTTACCTGATACGAG--CAGCT------GCA-TACACTCACTGT-A-------G-TTGGCAA-AATTTTTTCAA--TTAAA-CACACGTTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAACATCCACGATTTTCT-C-CT-AT-TA-AA---CAGGTGATAT-A-TACCTCCGATAAAAGTATTT----A-TAC--AAGTATAT-CA-TCATACAAGGA------TT--CTATTGTGTAA-TGTG-T-TTATAAAATTAT--CTTAAATG-T---TGGTA-TGC--TGT-A---CCGGCATCAATTCATGGCTAC-A-AACAAAT-GGAAC-TTGGAAACA-T-TCT--CCCAAA--CAG-CG-T-CAGTA--CTTAACCG-ATA-CTCGACACT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           acccacgggtaATTCCAAAAACTTACTAAATGAAA-CAATTGCCAAGAC-TTGAGGATTCACGAATT-AC-TCGAAAATATTTTTC-CTCTACAGAATCTTG-TTTTGAA-A------TGAATGA--ATA-TGT-TC-GCAGTT-TTGCCACCA----CATTGGGGG-TTAATG-GTC-GCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACAAATGCCGCACC---T--GCGAATAATTA------TTAATCGCTC-ATAGCGTGGACT---T-TAATTAAAAGATAAACAAGTTTTT--GAC-AC--A----ATTATTCCATT-GTTCAAT--C--ATGACTAATTAGAACAT-TGTA-----ATA-TC-CTAA-CTT-ATTTAACAAAAATATAT-AATG-----AATG---GCGGTAACTGTAGT-ATCTTT-CCACAAAATAACTAAT-TTGTTG-TTCACTATA-TCCTA-TACACT-CAA-TTGATTT--TCAGT-ATACAGCAGTT-C-TCTTGAAA-TAATCGAAT-CTACAAAGGGG---A----------ATCTA-AAATTCTCTTC-CGAAAA--TATTGTACGAACATAAGATC-TTTTTAT-AA---CAT--CAAAATTTACATAGTGGAATTCGACCA-AGTTTTT-CACGCTACAATAAATCTGAAGACCCTTTTGGAGGTATCCTTTTTATGTAC----------AAGTAACCTACA---AATAT-TATTTCAAGAGACTTTATGTTTTG-CA-TTTGGTTTAATCTTACAATAGCAGTA-CAT-TTTATTAA-AG-AAGACC-TTTT-CTA-TACACAATAAaccaatggtttaaacattcttttaaatctattttatctatctcaataatgtttccttgctgtaggacgcccggacgcagggaatttcaataaatgcctataagaaatgaaggctcttggatgatgagagagaactgattcatatttaccccacaacgattatttgtattccaaaaacttactaaatgaaacaattgccaagacttgaggattcacgaattactcgaaaatatttttcctctacagaatcttgttttgaaatgaatgaatatgttcgcagttttgccaccacattgggggttaatggtcgcaatgtctgaaagtgtactacaaatgccgcacctgcgaataattattaatcgctcatagcgtggactttaattaaaagataaacaagtttttgacacaattattccattgttcaatcatgactaattagaacattgtaatatcctaacttatttaacaaaaatatataatgaatggcggtaactgtagtatctttccacaaaataactaatttgttgttcactatatcctatacactcaattgattttcagtatacagcagttctcttgaaataatcgaatctacaaaggggaatctaaaattctcttccgaaaatattgtacgaacataagatctttttataacatcaaaatttacatagtggaattcgaccaagtttttcacgctacaataaatctgaagacccttttggaggtatcctttttatgtacaagtaacctacaaatattatttcaagagactttatgttttgcatttggtttaatcttacaatagcagtacattttattaaagaagaccttttctatacacaataaatggacaggggcccaaacgttgtatat
gi|30                         : acccacgggtataagtaagtaatatcttatttatttccaattttgggcccaggggcatacaagatataaccataaactcaacagaagaagtgcatctcaaatgatagataaagtaacataacataagttatgggactcactcacaaaattttcatgacacagtacactgattgttacctgatacgagcagctgcatacactcactgtagttggcaaaattttttcaattaaacacacgttcacattcattactcataagccaaacatccacgattttctcctattaaacaggtgatatatacctccgataaaagtatttatacaagtatatcatcatacaaggattctattgtgtaatgtgtttataaaattatcttaaatgttggtatgctgtaccggcatcaattcatggctacaaacaaatggaacttggaaacattctcccaaacagcgtcagtacttaaccgatactcgacactaccaatggtttaaacattcttttaaatctattttatctatctcaataatgtttccttgctgtaggacgcccggacgcagggaatttcaataaatgcctataagaaatgaaggctcttggatgatgagagagaactgattcatatttaccccacaacgattatttgtTAAGTAA-GT---A----A-TTC-ATT-TTC--A-AAT--TT-G-GG-CC-C-AGAGA---GCATACAGAGAA-TACAGAGTTC---------ATAT---------A--------------------CATGAA--T-AA-T--A-AA----AGA---AT-G-A------TT-AT--C-C--AAA-GA--T---AGATAA-AGatggacaggggcccaaacgttgtatat
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       c-AA--T-CA-T--A-AA----AGA---GA-G-A------TT-ATCCC-A--AA--GA--T---AGGTAA-CGTG-AA-A-TAAC-----T--------------------------------T-TT-C--TCA---------------GTA-AT----------GAA--CAGCT------ATA-T-------------------------GCGT-AA--TTTTCAA--T--GA-CA-
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             attagatgGTAAGTAA-TT--TT----T-TTT--TT-TCA--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGGGG---GAATACAAAGAA-TACAGAGTTT---------ATCT---------A--------------------CATAAA--T-CA-T--A-GA----AGA---GA-G-A------TT-AT--C-C--AAttgt
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aACTTGTA---TCTGTATTTATTGTTCCC-C--AAAT----------------G-CAGTA-CTTACCG-GT-------TG-A----CCTG-TATGATCATA----C-AA---GT-GTATC--A--GGTA-TGCA---TT
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TCAGTATGCTATTAC---TCCTTT-GGATA-AGCAA-GAAGTT-ATAGTT----CTTCT------GTAATGTGATGGGTCAGA-AGGACTATCATT
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -TTT-ATT-CCA--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---ACA----------TATAAAA------------GTA
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         acacgT------ATA-T--TTAA-CTT-ATT---CAAA---ATAT-AATG-----AATCAATGC--------TACT-A---CT-CC----AACTACT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACatgatagttttataaagttgaaaacatatct
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTTTT-CCCTTGAAAAGCTTC-TTTTG-A-ATAGGCCT-AATCC--ATA-TGT-TC-GTAA-C-TTG---CC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   taGTAAGTAA-GT---A----A-TTT-ATT-TCC--AAT-T--TT-G-GG-TC-C-AGAGG---GCATACAAAGAA-TACAGAGTTC---------ATGT---------A--------------------CAT-AAG-T-CA-T--A-AA----A-A---GA-G-A------TT-AT--CCA--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-AATAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---CT-T-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------------------------------------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T--AA-C--ACTGTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----TTTTTTTC-T-CT-AT-TG-CA---TGGGT--T-T-A-T----------AAAGTTCTT----A-TAC-AAAGTGT-T-CA-T-------GGA------TT--CTA-TG---AA-TG-G-T-T----------TTCTTTAG-TG-T---TGGTA-TGC--TGT-A---CAG---TAAA---ATA----T---A--AAAT-GGAAT-T------CA-T-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-GCAG-ACA-CT--ACATTTT-------T-TTG---TGTG----TGTGT--A--AC-GCCC-AGTTTCCATAGCC-AA-AGA-ATGAGAACTG---------------------AAA-CATTA--CAAGA-CTTGAGGATT-ACGAA-TTAC-TGAAAAATA-CTTTT-CTCTTCAGAATCTTG-TTTTG-A-A------T-AATGC--ATA-TGT-TC-GC-AGT-TTG---CCA----CATT----G-TT--TG-TCT-GCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---C--ATGAATATT--------TAAATCGCTC-AT---GTAACTT-A-T-TAGT---------AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------AGT-TTT--AT--C--ATG--TA--TAAAACAC-TGT------ATA-T--TTAA-CTT-ATT---CAAA---ATAT-AATG-----AAT----GC--------TACT-A---ATCC-----AAATGCT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACA-TTG-TTT--TCA-T-ATACAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-AATT-CTAC--AGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TT-CGTAAA--TAAT-TA-AAAC---AG--C-TCTTTAT-AA---CAT--CAAAA--TACATA--GGGAATCGACCA-AG---TT-CAC-CTACAATAGCT-TGA------ATT--GAGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---TATATAT--TTCAAGAATTTT-ATG---TG-CATTTT-------TTTT------GCAGTA-CAT-TTTATTAA-AGAA----G-TTTT-CTA-T--ACAATAATCAGGGCGTTT-GACG-AAACTTGTA---TCTGTATTTATTGTT-CC-CCCAAATTCCACATGCATA-AG-G-CAGTA-CT----G-GT-------TT-A----ACTG-TATGGTCATA----C-AA---GT-GTATC--AG-GATA-TGTA---TTTTAGGTT-T--AATATTT-CCAAAAC-----ACTT--GGCTAGTT-TAAAATAAG-CATTTAAGGCT-TTTTTGTA-AAGA-TCAAA--TG-AC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATG--AGATAAAAA-CAATC-CCCAGATATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATC--TGATTTGTTA-TAGAAATTTTTT-------TT-ATC--TG-ATTTTTTACCGTTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAA--TTT--TTGTCTTTTTGAGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-----A-CAATctt
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AGCT------ATA-TAT-------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAG--T--AA-C--GCTGTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CC
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TCACCTAATTTTGC-TGGA-------TCATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAGAA----TGGT---AGATT---AT
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aT-TCC--AAT-T--TT-G-GGTCC-C-AGAGG---GCAT---------
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -AT---GTAACTT-A-T-TAGT---------AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------AAT-Taatatactcaa
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATAATCAGGGCGTTT-GACG-GAACTTGTA---TC
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GGTAAGTAA--T--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TTCG-GG-CC----GAGG----CATA--------CACAAAG------------A-AT---------AAGAGTTGAGAAGTTCAATTTCAT-AAA-T-CA-T--AAGA----AGAG--AA-G-A------TT-AT--C-A--AATTGA------AGATAA-A-T--AA-A-TA-CA-AGGTCTATA-T-GAA--T-A-AATC---AA---C--T-CT-CCTTCATCC------------ATA-GT----------GAG--CAGCT------ATACTA--------GT-ATCAGTAAG-TTGGCAA-AA--TTTTAAA--T--AA-CA--CTGTCG-CAT-C-C-AT-----TGCT-C--AATATTT--AA--AGCCCAATTA-----AATTTTTCAT-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-CTAA-------AAAGTTCTT----A-TAC-A--GTGT-T-CA-T-------GGAT-----TT--G-A-TG---AA--G-G-T-T----------T---TTAG-TGTT---C--TAT-GC--TAT-AA--CAG---TCAA---ATA----TTA-A--CAATTAGAATGT------CAAT-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-ACAA-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCAT-TTAACT--TGTCTTTG-GT--A--ACAGCCC-AGTTTC-GTAGCC-AA-AGA-ATGACAACTGA-TCTG-AAATTTG-----TAAAA-CATTG--CCA-ACGTAGAGGTTT-ACGAA--TAC-GTGAAAATAATCTTT-CTCTACATAAACTTGATTTTG-A-ATAGCC-T-AATGC--ATA-TGTGTCGGC--GT-TTG-----A----AATT----GCTT--TGTTCT-GCA-A-TGGCGGA----TGTCCT-----A-A----------C---C--ATGAATAATT-------TAA--CATTCTATG--GTAACTTCATT-TAGT---------AACAA----TT---ATAAC--ATTACAT------ACTGTTT--AT--CTAATG--TA--TAGCACATATGT------ATA-TACTTAA-CTT-ATT---CAAA---ATA--AATGAAATCAAT----TC--------TACT-A---TC-C-----CACTACT--TGTTGTTGAT------TATTC--ACTACAATGAGA-TTG-TTT--TCA-CAATACAGCA--T-TATCTC--AATTACT-GAAT-TCTC--AGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TTGTGTAAAATTATT-TA-AAACT--AG--C-TTTTAATAAA---CAT---AAAA--TA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aCATA-AA-GGCAGTA-CT----G-GTCCGTTCGTT-ACATTACTGATATGATCATAACACCAAG---TT-GTATCTCAGCGGTG-TGTACTTTTTTCG--C-T--AATA-TTTCCAAAAC------CTT--GACTAGCTCTAAAATAAG-CCTTTAAGGCTCTTTT-GTA-AAGAATCAAA-TTGGAC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATGCAGG-TAAAAAACAATT-CC-AGAGATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTCAGATGATT--TGATTT-TTAATAGAAAAACTTT-------TTTATC--TG-AT---------TTTT-CTTACCGTTTTTTTACAG---------------AATATATGACAATGTTT--TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGAATAGGCAATATTT-ACTGAACATCAGCATTCAAGCTTTTTTAATACATACCCGCTG---AGCCCCT-CCCTCGGTTTTCAGAA-TTAACACTGAAAAATCATCAGCATACCACGACTA-AACACATTTAAGCGAT-GTGTCACCTAATTTTGCGCGGGATAATATTTATCATTATATCAGTC-GGACAATAG-ATATCTGGTTCAGGATCCATGTCGAGTTTAT---TATTTTAACAAAGGTTT-GACTTACGGTACTTCTGTTACTCCTCCCGGGC-TGTTTAG-ACGACTCCACTCCACCGTTAAGGCCTTTCCACATGAAATTCG-AAGTTT-ATATCTGTTGTTCGGAGTTTGTGGTACAGTTATTAATTATG-TTTGGCCA-GTACATACTCTTGACATGACTTTATAGAgt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTTTT-CCCTTGAAAAGCTTC-TTTTG-A-A------T-AATCC--GTA-TGT-TC-GTAA-C-TTG---TCCTTTTCATT------TT--TA-----GCACA-T-TCTGACAAAT-TACTTTGCCATA----------CA--T--GTACATATTAA------TAAATCTTTT--T---CTAAGTTCA-T-TA-----------AACAC----TTTTGAT-T--------GT------AGA-TCTGAAA--C--TTG--AA--AAAGATGT-TATCGCAGGATA-TG-CCAA-GTTGATT---CAGT---AAAA-AATA-----AAC----AC--------TGCTCA---AC-C-----AACAATT--C-TTTTTG-T------TA-TC--A-TTCAAA-A------------TCA-T-AT--------T-T-TCTT--GA--AGT-GCACACT-C-AAGCAA---AGTATCATTTGATTTATGAATGT---GT-TGTAAA--TATT-TA-A--C---AG--T-ATTGGAT-AA---GGTTTCAATA--TATA-A-TGGATGCCTACCT-AA---TT-CCC-CCATAACTGCA-TAG------TTT--GAAG---CTTTCTTATGTACCCCCCGGTGTA------CCCCA---CATATGTA-CTTGAGAGTTTTAATG---TG-AA-GTT-------TATC------ACTATA-TATATTTTTCAT-TG-A----G-TTTT-CAA-T--ATTATAATTTGGTCTCTT-AAC---AA-TAGCAGATTCTGAATTTATAATT--C-CCCAAATTTCACTTCCATATAACA-CAATA-------G-GT-------TT-T----ATTG-TGTGATCAtgtaattcatcggccattcatcgtttcacttctagtcgaagttgtgtcgcaagccttgtg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aggta-TGA-TAGTAGCGTTCAAGCTTTTTT--------------G---AAGTCTT-CCTTCAGTTT-CAGAAATTAACACT---AAGTCATCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAA-GAT-GTGTCACCTAATTTTGC-TGGA-------TCATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TC--------TC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AAAGATTTGGACTTA-GGT-------C-G--TCTCC----C-TGTCTAACAC---------CCACC-TTAGG-----TTCAAAT--------------T-AT--------TTTGAAGTTT----TACAG--AC--AGTATG-TTT-GCCATGTACATACTTTTGA--TGACTTTATAGAAAGGCCCCTT-ATGTCAAGC-TG-ATGCAGCC-TGTGTAG-AAGATCTG-AATGTAAAACAGTGTCAAAAGCCTTAGAAAAATCAACA-AAGCAAACGTATAATT--TGGAA-TT-ATCATTTGTATA-TTTTTGAATAACGGTTCT-AAGTATAAAAATGTGGTCACTAGTTCTGGCTTTTGGTTGAAAACCAATTTGAACTTTATTTATAATGTTGTTCGAGTCCAAGTAGTTTTGTAACCTGGTATTCAGTATGCTATTAAATATACTTTGGGATA-aaaagatgcaacaaaatgccggcatt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             caaaattaggAAGTAA-AT--T--------TT-ATA-TCA--A-T-A--TT-T-GG-CC-C-AG------GCAT---------AACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--A-CA-ACAA-GA----AGA---AA---A------CC-ATT-C-ACCAAT-GA--T---AGATAA-CGT--AA-C-TAACA-AAGT---TAAT-GA---T-A-AATC---AA---AATT-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAGAGCAGCT-------TA-TATTAAT---GT-A-------G-TTGGACA-AA--TT---AG--T--AA-TC-GCTGTCA-CATGT-C-ATCTTTATACTGC--A-----T--AAAAG--C-AATTA-----AATTATTC-T-CT-AT-TAACATACCAAGT--T-T-A-T----------AA-GTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----T---CTA-TG---AAATG-G-T-T----------T--TCTTGATGTT----AGTAT-GCCATGT-AACACAA---TCAATG-ATG------A-A--AAAT-GGAAT-TAA----CA-TGCTTATC---AAAGCAC-AG-TACAG-A--CTT-GCAG-ACA-CTTAACATTTTC-TCACAT-TTA-CATGTGTTTTTGTGT--A--AC-GCC--A---TCAA-AGCC-AA-AGA-ATGAGAACTGGTTCTGAAATATGG-----TAAAA-CATTT--CAAGA-CTTGAGGATT-ATGAAt
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): TTCCAATTGGGTCGCTGTGCCCCAGAGCGCGCAAGAACTAATAGGAGAGACCGTACTTAACAGTTGAGAAAGAATGTCCCAAAAAAAAGAAGTGCGGAAAAGTGACTAAGATTTCAAGTACAGAGTGCGTAATCACAAACTCTAACAT
Unaligned ( gi|35 ): AAGGGTATTCAGAACAAGAATGACATGGGAACATAAAGAAATAAAGTAAAATAAACAGGGAAAAACATCCAGATG
Unaligned ( gi|38 ): AATAAATTTGGAAATAAAATATCAATTTTGAAATAAAGAAAATAAATTTGAAATATTCATTATGATA






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                1111111111              1                              44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444      1111                                        1                                                    111             222222           222222222222222      1111111111          444444444444444444444444444444444                            222                 11111                               11111                      111              2222222222         1111                    1111111   2222222222                    2222222222222        111111    22  11     111          111   22222222               222222        111111  11        1                      11                  11111                       11                                             11111          111     22               1              1                    11         33333333                    111     111   11111   222222      11111                       11111   33333333333333333         333333333            22222       11     1111        1111  11   111111111111111111       11                        1   222222     11            111    111   11    11111   22222222222222      222222222222                   111111     11                                                                 11     33333333333333            111         11            111                111                  11               111                      111111         111             55555555555555555     111       22                111     1   2222222    111111      11                222222                                             111               1                         111     1111111    222222222222222    1          22222222222                      111           11   11          222222   11                              111                        1111          111             11  1                                          111     1                                2222222222          222222222    5555555555555555555555555555555555     11     11                                          111                         11     111     111                                 111               2222    1    11      2   1                 11   2222222       11                    1111    111     111     11    111        1               1  4444444444444     2222 1       1  666666666     1     22222       11             1  33333333          2222     222222      1   1                   11                1               1  1        1       1        1     1                                1                11        22           1                  1                                                                                                                    111      1     1            1      333      3333333                 1                     22222                 1   1              1      1  1     1      2222  1          222            1         1    1          1          1           1    111  1                       11                                  22222222      1     1   222    11     11111     1        111          11                      1               1              7777777777777                1            1           11      555555555          1       
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             3  0000000000   2   2  555 0 2 22  2 2  4  2 2     333    77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777   8  3333  7777 33 4444   555  222 555555  2  77 4 55  44  33 666      2   77  888     2    444  5 2  000 2 2    444  000000 5  5 66   111111111111111   2  1111111111   77     000000000000000000000000000000000       2  33       55 33  2 222      2   5 2 2  44444    8 33 77777 33  88 44       11111 1      3 3  3  3  6  111     44 3 3 3 0000000000         1111 3   3  0  0 3 3  3 0000000   5555555555   6  555  6  3 6 3 3333333333333     0  444444    44  00   3 666  9999    666   00000000 55    4     8 222222  4 8   888888  11   4  4 2   8 55   4    4   8  66        5  0   5  77777         1  99999  6   55 4    1 5    5  5   5          11   77  22   22222     5    222     00         5     5    888       1     5    0     3   00     5 5 22222222     66   5   5  5  333 5   333   22222   000000  77  11111   5 5       5         44444   33333333333333333         444444444      0  5  00000 5  1  66 5   0000  5     0000  33   888888888888888888 1 5   88  99 99   99  99        3   222222   5 99    5   5   000    555   44    44444   44444444444444    5 777777777777       77 5      5 666666  5  55 5      5 4 6   6   99   666  7     99 666    99  99   6    6  3 44     11111111111111     6      111  6      55    6  6    888  99 6       6  111   99     99   11 88            6  111  6   6           6   999999   99    111             22222222222222222   1 111     4 22   0        7   111  6  3   1111111 1  999999  3   11  9        6  6 111111    6   9999         1        6   888        000               5  6 6      6666666    5  111     6666666 5  000000000000000    1          44444444444  6     99 77    6    111    1 5  8 11   88  8       000000   11        8         8           666  0   8    8  8  88  8  7777        8 444     8       11  6 0  999  0  8  3       99  99        6    111     3   2   99      6   6            2222222222   99  6  666666666    0000000000000000000000000000000000     55     44   99                   99   6            111   6                     66     444     444       8          8     0        444 44  3       3 1111    0    33      0   0         0    0  44   6666666       11    8   8    8    8 7777    444     444     33    777        0        55     0  2222222222222     1111 0       0  555555555     0   6 55555       11  0   9      0  66666666          1111     555555      0   0    3        3     99          6     2     7         3  3        3       3        3     2    0                7          3    7   0       88   7 6  00           3                  3                           6                                   7             6          0                           777      0     0   7 7      3      444      5555555  1      6     1 0                     11111                 2   2   6      7   3      3  3     3      8888  3          222      7     3         3 7  2 0  6     0          0           3    777  3  7      7             44            0               1  1  55555555      0     3   555    44     99999     0   22   222          44                      3               3              3333333333333     7      7   3    7       3           88      333333333      6   3       
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .  ..........   .   .  ... . . ..  . .  .  . .     ...    ..............................................................   .  ....  .... .. ....   ...  ... ......  .  .. . ..  ..  .. ...      .   ..  ...     .    ...  . .  ... . .    ...  ...... .  . ..   ...............   .  ..........   ..     .................................       .  ..       .. ..  . ...      .   . . .  .....    . .. ..... ..  .. ..       ..... .      . .  .  .  .  ...     .. . . . ..........         .... .   .  .  . . .  . .......   ..........   .  ...  .  . . . .............     .  ......    ..  ..   . ...  ....    ...   ........ ..    .     . ......  . .   ......  ..   .  . .   . ..   .    .   .  ..        .  .   .  .....         .  .....  .   .. .    . .    .  .   .          ..   ..  ..   .....     .    ...     ..         .     .    ...       .     .    .     .   ..     . . ........     ..   .   .  .  ... .   ...   .....   ......  ..  .....   . .       .         .....   .................         .........      .  .  ..... .  .  .. .   ....  .     ....  ..   .................. . .   ..  .. ..   ..  ..        .   ......   . ..    .   .   ...    ...   ..    .....   ..............    . ............       .. .      . ......  .  .. .      . . .   .   ..   ...  .     .. ...    ..  ..   .    .  . ..     ..............     .      ...  .      ..    .  .    ...  .. .       .  ...   ..     ..   .. ..            .  ...  .   .           .   ......   ..    ...             .................   . ...     . ..   .        .   ...  .  .   ....... .  ......  .   ..  .        .  . ......    .   ....         .        .   ...        ...               .  . .      .......    .  ...     ....... .  ...............    .          ...........  .     .. ..    .    ...    . .  . ..   ..  .       ......   ..        .         .           ...  .   .    .  .  ..  .  ....        . ...     .       ..  . .  ...  .  .  .       ..  ..        .    ...     .   .   ..      .   .            ..........   ..  .  .........    ..................................     ..     ..   ..                   ..   .            ...   .                     ..     ...     ...       .          .     .        ... ..  .       . ....    .    ..      .   .         .    .  ..   .......       ..    .   .    .    . ....    ...     ...     ..    ...        .        ..     .  .............     .... .       .  .........     .   . .....       ..  .   .      .  ........          ....     ......      .   .    .        .     ..          .     .     .         .  .        .       .        .     .    .                .          .    .   .       ..   . .  ..           .                  .                           .                                   .             .          .                           ...      .     .   . .      .      ...      .......  .      .     . .                     .....                 .   .   .      .   .      .  .     .      ....  .          ...      .     .         . .  . .  .     .          .           .    ...  .  .      .             ..            .               .  .  ........      .     .   ...    ..     .....     .   ..   ...          ..                      .               .              .............     .      .   .    .       .           ..      .........      .   .       
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             1  8888888888   2   1  555 5 0 88  0 0  0  0 0     555    88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888   0  5555  2222 11 2222   555  888 888888  1  11 7 88  44  11 999      2   99  555     4    444  0 5  000 7 7    777  999999 3  3 33   333333333333333   7  7777777777   33     444444444444444444444444444444444       5  44       99 44  5 333      7   3 9 9  33333    6 99 11111 99  55 22       77777 4      3 3  3  3  7  777     66 3 3 3 4444444444         7777 3   3  5  1 3 3  3 8888888   1111111111   7  888  7  3 7 3 9999999999999     4  888888    33  00   6 444  0000    444   55555555 00    0     0 555555  0 0   000000  00   0  0 0   0 55   0    0   0  55        0  5   0  44444         4  33333  7   77 3    4 0    7  7   7          00   66  99   55555     0    111     66         0     5    222       7     0    8     2   66     0 0 88888888     99   0   0  0  999 0   888   99999   777777  99  44444   7 7       7         33333   11111111111111111         999999999      4  0  11111 0  0  99 0   6666  0     6666  66   333333333333333333 0 7   33  22 22   22  22        3   111111   7 33    7   7   000    777   44    33333   44444444444444    7 777777777777       99 7      7 444444  7  77 7      7 3 7   7   22   888  3     22 888    22  88   7    7  5 00     88888888888888     7      777  7      88    7  7    333  22 7       7  777   22     22   66 66            7  777  7   7           7   222222   22    777             88888888888888888   0 777     2 22   7        8   777  7  3   7777777 0  222222  5   88  8        7  7 888888    7   3333         0        7   777        000               0  7 7      2222222    7  777     4444444 7  333333333333333    4          00000000000  7     22 77    7    777    0 0  0 00   66  0       888888   00        0         0           222  8   0    0  8  88  0  0000        0 000     0       00  0 8  444  8  0  2       22  22        7    777     3   5   22      7   7            5555555555   22  7  777777777    0000000000000000000000000000000000     88     00   22                   22   7            555   7                     22     000     000       0          0     8        000 00  2       2 2222    0    22      0   0         8    8  44   0000000       00    0   0    0    0 0000    000     000     88    555        0        00     0  2222222222222     2222 0       0  222222222     8   5 00000       88  2   2      0  22222222          2222     555555      0   0    2        2     88          5     0     3         3  3        3       3        3     0    7                3          3    3   7       33   3 7  77           3                  3                           7                                   3             7          7                           000      0     0   3 3      3      000      3333333  0      7     0 0                     33333                 0   0   7      3   3      3  3     3      3333  3          777      3     3         3 3  0 7  7     0          0           3    777  3  3      3             00            7               0  2  88888888      0     3   000    77     33333     7   00   000          77                      3               3              3333333333333     3      3   3    3       3           33      000000000      7   3       
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GGTAAGTAA-GT--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT---------TACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--T-CA-T--A-GA----AGA---AA-G-A------TC-AT--C-A--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-A-TAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TA--------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T--AA-CA-ACTGTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----AATTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-T----------AAAGTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----TT--CTA-TG---AA-TG-G-T-T----------T--CTTAGATGTT---TGGTATTGC--TGT-A---CAG---TCAA---ATG----T-A-A--AAAT-GGAAT-T------CA-T-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-GCAG-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCAT-TTAACTTGTGTTTTTGTGT--A--AC-GCCC-AGTTTCAATAGCC-AA-AGA-ATGAGAACTGATTCTGAAAATTTG-----TAAAA-CATTT--CAAGACCTTGAGGATT-ACGAATTTAC-TGGAAAATATTTTTT-CTCTACAGAATCTTG-TTTTG-A-A------T-AATGC--ATA-TGT-TC-GCAAGT-TTG---CCA----CATT----G-TT--TG-TCC-GCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---C--GTGAATATTTA------TAAATCGCTC-AT---G-T-AACTT--A-TTA----GT-AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------ANT-TTT--AT--C--ATG--TA--TAGAACAT-TGT------ATA-T--CTAA-CTT-ATT---CAAA---ATAT-AATG-----AAT----GC--------TACT-A---NT-C-----AACTACT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACA-TTG-TTT--TCA-T-ATACAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-GAAT-CTAC-AAGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TT-CGTAAA--TATT-TA-AAAC---AG--C-TTTTTAT-AA---CAT--CAAAA--TACATA-TGGGAATCGACCA-AG---TT-CAC-CTACAATAGCT-TGA------TTT--GAGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---AATATATA-TTCGAGAGTTTTAATG---TG-CA-TTT-------TNTC------GCAGTA-CATATTTATTAA-AG-A----N-TTTT-CTA-T--ACAATAATCNGGGCGTTT-GACG-GAACTTGTA---TCTGTATTTATTGTTCCC-CCCAAATTTCACATGCATA-AA-G-CAGTA-CT----G-GT-------TT-A----ACTG-TATGATCATA----CAAA---GT-GTATC--AG-GGTG-TGTA---TTTTNGGTT-T--AATA-TT-CCAAAAC-----ACTT--GACTAGTT-TAAAATAAG-CCTTTAAGGCTCTTTTTGTA-AAGA-TCNAA-TTG-AC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATG--AG-TAAAAA-CAATT-CCCAGATATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATT--TGATTT-TTA-TAGAAAAACTTT-------TT-ATC--TG-AT---------TTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAAT-TTT--TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-A-TGA-CAATAGCATTCAAGCTTTTTTAATACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCGGTTT-CAGAAATTAACACT---AAATCATCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAG-GAT-GTGTCACCTAATTTTGC-CGGA-------TTATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AAAGGTTTGGACTTA-GGT-------TTA--CCTCC----C-TGTCTAA-ACG--------CCACCNTTAGG-----TTCAAATGAAACTCGTAAGTTT-AT--------TTTGGAGTTT----TACAG--AT--ATTATG-TTT-GCCATGTACATACTCTTGA-ATGACTTTATAGAAAGGCCCCTTTATGTCAAGT-TG-GTGCAGCC-TGTGTAG-AAGAGCTG-AATGTGAAACGGTATCAAAGGCCTTAGAAAAATCAACA-AAGCAAACGTACAATT--TGGAACTT-AATATTTGTATA-TTTTTGAATAAGGGTTCT-AAGTATAAACATGTGGTCACTGGTTCTGGCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTTATAATATTGTTAGAGTCCAAGTAGTTTCGTAACCTTGTATTCAGTATGCTATTAA--ATACTTT-GGATA-AGCAAAGAAGTT-ATTGTT-A-TCCTCTA---TAGTANTTTGATGGGTCANA-AGGGCTATCATTTTTATGAAT-AGGCTTTAATAAAGCCTATTTCCCACTCCCTTTGGGTATT-TGCCAG-AG-GACAA-GACAAG----AT-TAAATAATTT-T-AGCATATGTGGT-AAAATATAT-GTACGTCGGCTTTCA-ACATCTCATT-TTTAATGCCAT-CTAATCGCA-GCTTGATTTATTATTTTTTAGATGTTTTTATTGCATCGATGATTTTCTTTTCTNTAATTG-A-TAAATCTAAC-GAAGT-AATG--TTGATATTTCTGCTGACTTGGACAANNAATCTTCAAAATATTTAATTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAGATATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGACT--TTCAAA--CC-----GAGTTTCCAG-TATGATA
Reference ( family-3541 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GGTAAGTAA-GT--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT---------TACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--T-CA-T--A-GA----AGA---AA-G-A------TC-AT--C-A--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-A-TAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TA--------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T--AA-CA-ACTGTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----AATTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-T----------AAAGTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----TT--CTA-TG---AA-TG-G-T-T----------T--CTTAGATGTT---TGGTATTGC--TGT-A---CAG---TCAA---ATG----T-A-A--AAAT-GGAAT-T------CA-T-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-GCAG-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCAT-TTAACTTGTGTTTTTGTGT--A--AC-GCCC-AGTTTCAATAGCC-AA-AGA-ATGAGAACTGATTCTGAAAATTTG-----TAAAA-CATTT--CAAGACCTTGAGGATT-ACGAATTTAC-TGGAAAATATTTTTT-CTCTACAGAATCTTG-TTTTG-A-A------T-AATGC--ATA-TGT-TC-GCAAGT-TTG---CCA----CATT----G-TT--TG-TCC-GCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---C--GTGAATATTTA------TAAATCGCTC-AT---G-T-AANTT--A-TTA----GT-AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------ANT-TTT--AT--C--ATG--TA--TAGAACAT-TGT------ATA-T--CTAA-CTT-ATT---CAAA---ATAT-AATG-----AAT----GC--------TACT-A---NT-C-----AACTACT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACA-TTG-TTT--TCA-T-ATACAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-GAAT-CTAC-AAGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TT-CGTAAA--TATT-TA-AAAC---AG--C-TTTTTAT-AA---CAT--CAAAA--TACATA-TGGGAATCGACCA-AG---TT-CAC-CTACAATAGCT-TGA------TTT--GAGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---AATATATA-TTCGAGAGTTTTAATG---TG-CA-TTT-------TNTC------GCAGTA-CATATTTATTAA-AG-A----N-TTTT-CTA-T--ACAATAATCNGGGCGTTT-GACG-GAACTTGTA---TCTGTATTTATTGTTCCC-CCCAAATTTCACATGCATA-AA-G-CAGTA-CT----G-GT-------TT-A----ACTG-TATGATCATA----CAAA---GT-GTATC--AG-GGTG-TGTA---TTTTNGGTT-T--AATA-TT-CCAAAAC-----ACTT--GACTAGTT-TAAAATAAG-CCTTTAAGGCTCTTTTTGTA-AAGA-TCNAA-TTG-AC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATG--AG-TAAAAA-CAATT-CCCAGATATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATT--TGATTT-TTA-TAGAAAAACTTT-------TT-ATC--TG-AT---------TTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAAT-TTT--TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-A-TGA-CAATAGCATTCAAGCTTTTTTAATACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCGGTTT-CAGAAATTAACACT---AAATCATCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAG-GAT-GTGTCACCTAATTTTGC-CGGA-------TTATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AAAGGTTTGGACTTA-GGT-------TTA--CCTCC----C-TGTCTAA-ACG--------CCACCNTTAGG-----TTCAAATGAAACTCGTAAGTTT-AT--------TTTGGAGTTT----TACAG--AT--ATTATG-TTT-GCCATGTACATACTCTTGA-ATGACTTTATAGAAAGGCCCCTTTATGTCAAGT-TG-GTGCAGCC-TGTGTAG-AAGAGCTG-AATGTGAAACGGTATCAAAGGCCTTAGAAAAATCAACA-AAGCAAACGTACAATT--TGGAACTT-AATATTTGTATA-TTTTTGAATAAGGGTTCT-AAGTATAAACATGTGGTCACTGGTTCTGGCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTTATAATATTGTTAGAGTCCAAGTAGTTTCGTAACCTTGTATTCAGTATGCTATTAA--ATACTTT-GGATA-AGCAAAGAAGTT-ATTGTT-A-TCCTCTA---TAGTANTTTGATGGGTCANA-AGGGCTATCATTTTTATGAAT-AGGCTTTAATAAAGCCTATTTCCCACTCCCTTTGGGTATT-TGCCAG-AG-GACAA-GACAAG----AT-TAAATAATTT-T-AGCATATGTGGT-AAAATATAT-GTACGTCGGCTTTCA-ACATCTCATT-TTTAATGCCAT-CTAATCGCA-GCTTGATTTATTATTTTTTAGATGTTTTTATTGCATCGATGATTTTCTTTTCTNTAATTG-A-TAAATCTAAC-GAAGT-AATG--TTGATATTTCTGCTGACTTGGACAANNAATCTTCAAAATATTTAATTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAGATATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGACT--TTCAAA-CCT-----GAGTTTCCAG-TATGATA
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GTAAGTAAAGT--TA----A-TTTTATTCTCCGAA-T-T--TT-G-GG-CCAC-GAAGG---GCAT----------ACAA-G------------ATAT---------A--------------------AAA-AA----CA-C--A-GA----AGA---AA-G-T------GC-AT--CCA--AAT-GA--TGA-AGATAA-AGT--AA-A-TAACA-AAGT---TA-T-GAA--T-A-AATC---AA---T--T-TT-C--TCA---------------ATT-G-----------GAG--CAGCT------ATACTT--------GT-A-------GATTGGCAA-AT--TTCTCAACCT--AA-AC-ACTGTCA-CAT-T-CGAT-----TACT-CCAA-----T--AA--G--CCAAATA-----A-TTTTTC-T-CTGATCTA-CA----AGGT--T-T-AAT----------AAAGTTTTTTA--A-AAC-AAAGT---T-CAAT-------GGAT-----T---CTA-TG---AA-TG-G-T-T----------TGTCTTAAATGTG---TG-TAT-GC--TGT-A---CAA---TCAA---ATG----T-A-A--AA-T-GGAATGT------CA-T-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-GCAG-ACAGCT--ACATTTTC-TCTCAT-T--ACTTGTGTTTTTGTGTTAA--AC-GCCCGAGTTTCAATAGCC-AACAGA-ATGAGAACTAATTCT-AAAATTTG-----TAAAAACATTTT-CAAGAC-TTGAGGATT-AC-AATCT-----GAAAATATTTTT--CTCTACAGAATCTT--TTTTG-A-AC-----T-AATGGGAATAATGT-TC-GCA-GTGTTG---CCA----CATT----GGTT--TG-TCCTGCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---CCAGTGAA-ATT---------AAATCGCTC-AT---GCT-AACTT--T-ATA----GT-AACAA----TTT-GATTACGGA----AT------ATT-TTT--ATATC--ATG--TA--TAGAACATCTGT------ATAGT--CTAAGCTT-ATT---CAAAC--ATA--AATG-----AGA----GC--------TACT-A---GTTC-----AACTACT--T-TGTTTG-T------TA-TCGAA-TACAAT-ACAGTTG-TTTCATTA-T-AT-CAGCA--TAT-TCTT--AA-GAAT-GAAT-CTAC-AGGGGGCGAA----------ATCTA-AAATTC---TT-CGAAAAA-TATT-TA-AAAC---AG--CGTTTTTAT-AAACACAT--CAAAA--TACATA---GGAATCGACCA-AG---TTTCAC-CTACAATAGCT-TGA------TTT--GAG----CCTTTTTAGGTAC----------AGA----CCA-A---AATATAT--TTCAAGAATTTTAATG---TGGCAATTT-------TTTC------GCAGTAACATGTTTATTAA-AG-A----CGTTTT-CTAGT--ACAATAATCAGGGCGTTTTGACG-GAACTTGTA---TCTGTATTTATTGTTCCC-C--AAATTTCACATGCATA-AAAG-CAGTAACT----GTGT-------TTTA----ACTG-TATGATCATA----CA-----GTCGTATC--AG-GGTG-TGTA---TTTTTGGTTAT--AAT--TT-CCAAAAC-----ACTTTTGACTAGTT-TAAAATAAGGCCTTTAAGGCT---TTTGTAGAAGA-TCCAAATTG-AC----AACATGTGTA---AGGAGGCCTGATG--AGGTAAAAA-CAATTGCCCAGATATT---G--TACGATGAACACT---TGTTCTGA--ATT--TGATTT-TTA-TAGAAAAACTTT-------TT-ATC--TG-AT---------TTTT-T-------------ACAACGTTTTTTCTACAGAAATATT-GACAAT-TTT--T-GTCTTTCTGAGGTTGACCAGGA-TAGGCAAAATTTGA-TGA-CAATAGCATTCAAGCCTTTTTAATACAC---CGCTGTGAAGGCCCTCCCCTCGGTTT--AGAAATTAACACT---AAATCATCAGCAT-C----AACATAACA---TTAAGAGATGGTGTCACCT-ATTTTGC-CGGA-------TTATCAT--TATC-GTCGAAAA-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAATATTATTTTAA-AAAGGTTTGGACTTA-GG--------TTA--CCTCC----C-TGTCTTA-ACAC-------CCACACTTA-G-----TTCAAATG-AACTCGTAAGTTTGAT--------TTTGGAGTTT----TAGAG---T--ATTATGTTTT-GCCATGTACATAC-CTTGA-TTGACTTTATA-AAAGG-CCCTTTATGTCAAGTCTGTGTGCAGCCTTGTGTAGAAAGAGCTGAAATGT--AACGGTATCAAAGGCCTTAG-AAAATCAACACAAGC-AACATACAATTGCTGGAACTT--ATATTTGTATATTTTTTGAATAAGGGTTCTAAAGTATAAACATGTGGTCACTGGTTCT-GCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTTAT-ATATTGTTAGAGT-CAAGTAGTTTCGTACCTTTGTATTCAGTATGCTATTAA--ATACTTT-GGAAATAGCAAAGAAGTTGATTGTTAA-TCCTCTA---TA--ATTTTGAT-GGTCATA-AGGGCTATCATTTTTATGAAT-AGGTTTTAATAAAGCCTATTT-CCATTCCCTTTGGG-ATTCTGCCAACAGAAACAACGACAAG----AT-TAAACAATTTATAAGCATATGTGGTAAAAATATAT-GTACATCGG-TTTCA-ACATCTCATT-TTTAATGCCAT-CTAATCGCA-GCTTGATTTATTATCTTTCAGATGTTTTTATTGCATCAATGATTTTCTTTTCTTTAATTG-A-TAAATCTAAC-GAAGT-AATG--TTGATATTTCTGCTGACTTGGACAATAAATCTTCAAAATATTTAATTCTGGGTATCAAATTTACTAATCAATACTGAATAATGTTTGTAAAATGATTTACACCCATTGTTCACTAGATATCTT-ATCGGACT-ATCTTGCGGATTGCTGATTGATTCAAATTCTTTCAAAAGTTT-CAG-TATG
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aaAAGTAA-AT--T--------TT-ATA-TCA--A-T-A--TT-T-GG-CC-C-AG------GCAT---------AACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--A-CA-ACAA-GA----AGA---AA---A------CC-ATT-C-ACCAAT-GA--T---AGATAA-CGT--AA-C-TAACA-AAGT---TAAT-GA---T-A-AATC---AA---AATT-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAGAGCAGCT-------TA-TATTAAT---GT-A-------G-TTGGACA-AA--TT---AG--T--AA-TC-GCTGTCA-CATGT-C-ATCTTTATACTGC--A-----T--AAAAG--C-AATTA-----AATTATTC-T-CT-AT-TAACATACCAAGT--T-T-A-T----------AA-GTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----T---CTA-TG---AAATG-G-T-T----------T--TCTTGATGTT----AGTAT-GCCATGT-AACACAA---TCAATG-ATG------A-A--AAAT-GGAAT-TAA----CA-TGCTTATC---AAAGCAC-AG-TACAG-A--CTT-GCAG-ACA-CTTAACATTTTC-TCACAT-TTA-CATGTGTTTTTGTGT--A--AC-GCC--A---TCAA-AGCC-AA-AGA-ATGAGAACTGGTTCTGAAATATGG-----TAAAA-CATTT--CAAGA-CTTGAGGATT-ATGAAgcat
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    taagctaATAGAGCATAA---TT-CCC-CCATAACTGTT-TGG------TTT--GAGG---TCTTCTTGTGTAT----------T------CCATATAGAGTATGTA-CTTGAGGGGTTTAATG---TG-AA-GTT-------TATC------AC--TA-AATA-TGATTCATGG-A----C-TTTT-CAA-C--ATTATAATTTGGGCTCTT-TACATCAGCAGGT----TTTGAATTTGTAGTT--T-CCCAAATT--------ACA-AA-A-CA----------G-GT-------TT-T----ACAG-TGTGATAAAA----AAAAAAGAT-GCAAC--AA-AATACTGGA---ATTTGGCCT-TGCAAT--TT-CAAAAAC-----ATTT--AATTAATT-TAAAGAAAG-CATTCAAACCAC-GCTTATA-CAGG-TCTTG-TTG-ACAATTAACATATA-ATCCAAAGG-CAT--TG--AA-T-ATAC-CA----CGTAAATATTAATGAATAAAA-GA-CAATGAATGTTC-TAT--TTCCTTATCT-TTA-TAAACAAATTTTAAGTTTCTT-ACCTTTGCAT---------TCTTGT-------------AAAA---------------AAAAT--G----T-TGTCCTTGTCTTTTTCAAATTAAC--AGA-GAGACAATGTTT-A-Taa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gTAAGTAA-GT--TA----T-TTT-ATT-TCC--AAT-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT--------------AA------------ATAT---------A--------------------CAT-AAA-C-CA-C--A-GA----AGA---G--G-A------CC-AT--CCA--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-A-TAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TTTC--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TAT-------GT-A---------TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T--AA-CA--CTGTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----ATATTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-T----------AAAGTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGA------TT--CTA-TG----A-TG-GTT-T----------T--CTTAGATG-T---TGGTA-TGC--TGT-A---CAA---CCAA---ATG----T---A--AAAT-GGTAT-T------CA-T-CTT--C---AA--CACAAG-TCCAG-A--CTT-GCAG-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCAC-TT-ACTTGTGTTTTTGTcata
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -T--TT-G-GA-CC-C-AGAGT---GCAT----------ACAAAG------------A-AT---------A--------------------CAT-AG--TTCA-T--A--A----ATA---CA-C-A------TC-AT--A-A--AA---A--T----GATAA-AGT--AATA-TAACC-AGGT---TA-T-GA---T-A-AATC---TATTTT--T-TT-T--TCA---------------ATA-GT----------GAG--CAGC----------------------T-A-------A-TT-------A--TTGTCAA--T--AA-C--ACTGTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----ACTTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---TATGT--T-T-A-T----------AAAGTAATT----A-TAC-AAGGTGT-T-TA-T-------GAA------CT--CTA-TG---AA-TG-G-TGC----------C--CTTAGGTG-T---TGGTA-TGC--TAT-A---CAG---TCAA---ATA----T-ACA--AAAT-GGAAA-T------CA-T-CCT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-ATGCGT-GCGC-ACGCCT--GCAT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               g--TA----A-TTT--TT-TCC--A-A-T--TT-T-TG-CC-C-AGAGG---GCAT----------ACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AAA-C-CA-C--A-GA----AGA---AA-G-A------CC-AT--CCA--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-AATAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TTTC--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TAATTTAT--GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T--AA-CA--CTGTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----AATTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T---C----------AAAG-TTTT----A-TACAAAAGTAT-T-CA-T-------GGATCTATATT--CTA-TG---AA-TG-GTT-T----------T--CTTAGATG-T---TGGT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aaggtagTAAGTAA-GT---A----A-TTT-----TCA--A-T-T--TT-G-GG-GT-G-AGAGG---GCAT---------CATACAA------------ATA-----------------------------------AA--T-CA-G--A-GTTCCTGTA---CA-T-G------TT-AT--CTA--AAA-GG--C---GTATAATATT--AA-A-TTACA-AGTT---TA-T-GA---T-ATAAT----AA---ACTT-TT-C--CCC---------------ATA-AT----------GAA--CAGCTCTAGAGATA-TA--------GGGA-------A-TTGGCAA-AA--TTTCCAT--T--AA-CA-TC-GTCA-CAT-g
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aaA----G-TTT-ATT-CCA--A-T-T--TT-G-GGCCC-C-AAAGG---GCAT---------AATAGAA------------GTA----------A--------------------CA--GC--T-CA-T--A--A----AGA---AA-G-AAATGTCCC-AA--A-A--AAT-GAAGT---GGGAAA-AGTTAAA-A-TATCA-cacacaagtctatgtataactataaaatattcatggactct
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aaagaaaataaatttgagaaaaaatatcaattttgaaataagaaaataaaatttggaaatattcattatgatatctataggtgtaaagataatataCCC-AGTTTAAATAGCC-AA-AAG-ATGAGAACTGATTATG-AAATTTA-----GAAAA-CATTG--CAAGAC---GAGGATT-GCGAA-TTAC-TGAAAAATG--TTTT-CTCTACAGA------------------------AATGC--A-A-TGT-TC-GCCAGT-TTGT--CCA-----ATT----G--T--TG-TCT-GCA-ATTGCCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------CCTTC--ATGAATATTTCTCTTTTTAAATCTATC-AG---A-T-AATTT--A-TTA----GT-AACAA----Ttggaatcacaacttacatgtatgtgg
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tacA-AAGT---TA-TAGA---T-A-A-TC---AA---T--TGTT-C--TCA---------------TTT-GT----------GAG--CAG-T------ATA-TA---------T-A-------G-TTGGCAA------TTTCAA--T--AAGCA---T-TCA-CAT-TAC-AT-----TA-T-C--A-----CTAAA--G--CCAAATAC----AATTTCTT-TACT-AT-TA-CA---CAGGT--T-TTA-T----------AAATTTTTTGCCTA-TAC-AA-GTAT-TTCA-T-------GGAT-----TCTGCT--TG---AA-TG-G-T-T----------TTTCTTA-ATGTT----GGTATGGC--TGTTA---CA----TCAA---ATG----T-A-A--AAata
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TGGCAACGA--TTTT-AA--T--AA-CA--CCGTCA-C-T-T-C-AT-----TGCTTC--A-----T--A---G--CCAGGTA-----AAGTT----------------------GTT--T-T-A-T----------CAAATTCTT----A-T-C-AATGTGT-T-CA-A-------GGA----------CTGGTG---AA-TG-G-T-T----------TT-CGTACA-GTTGAATGATAT-AC--AAT-A---CAG---TCAA---TT---------A--CAAT-GGAAT-T------CA-T-CTT-------A--CAA-AGTT-CAGCA--TTT-ACAG-ACA-GT--GCATTTTCTTTTCATATTACC---CGTTTTTG
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  acGGTAAGTAA-GT--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT---------TACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--C-CA-C--A-GA----AGA---AA-G-A------CC-AT--C-A--CAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-T-TAA-A-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TA--------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAAA-T--AA-CA-ACTGTCAGCAT---C-GT-----TACT-C--A-----T--AG------CAAA-A-----AATTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-T----------AAAGTTTTC----AATAA-CAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----TT--CTA-TG---A--TG-G-T-T----------T--CTTAGATGTT---TGGTATTGC--TGT-A---CAC---TCAG---ATG----T-A-A--AAAT-GGAAT-T------C--T-CTT------AA--CAC-AG-T--AG-A--CTT-GCAGGACA-CT--ACATTTTC-TCTCAT-TTAAATTGTGTTTTTGGTT--AGTAC-GCCCCAGTTTCAATAGCCCAA-AGATATG-GAACTGATTCTGAAAATTTG-----TAAAA-CATTT--CAAGACCTTCAGGATT-ACGAATTTACATGAAAAATATTTTTTTCTCTACAGAATTTTG-TTTTG-ATA------C-AATGA--ATA-TGT-TC-GCAAGT-TTG---CCA----CATT----G-TT--TG-TCT-TCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---C--ATGAATATTTA-------AAATCGTCC-AT-----T-AAACT--A-T-A----GT-AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------AAT-TTC--AT--C--ATG--TA--TAGAACAT-TGT------ATA-T--CTAA-CTT-ATT---CAAA---ATATTAATG-----AAT----GC--------TACT-A---GT-C-----AACTACT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACA-TTG-TTT---CA-T-ATACAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-GAAT-CTAC-AGGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TT-CGTAAA--TATT-TT-AAAC---AG--C-TTTTTAT-AA---CAT--CAAAA--TAC-TA-TGGGAATCGACCA-AG---TT-CAC-CTACAATAGCT-TGA------TTT--GAGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---AATATAT--TTCAAGAATTTTTATG---TG-CA-TTT-------TTTC------GCAGTA--GTATTTATTAA-AA-A----G-TTTTTCTA-T--ACAATAATCCAGGCGTTT-GACG-GAACTTGTA----CTGTATTTATTGTTCCCACCCAAATTTCACATGCATA-AA-G-CAGTA-CT----G-GT-------TT-A----GCTGCTATGATCATA----CAAA---GT-GTATC--AG-GGTG-TGTA---TTTTTGGTT-T--AATA-TT-CCGAAACCAAAAACTT--GACTAGTT-TAAAATAAG-CCTTTAAGGCTCTTTTTGTA-AAGA-TC-AA-TTG-AC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATG--AG-TAAA---CAATT-CCCAGATATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATT--TGAATT-GTA-TAGAAAAACTTT----------ATC--TG-AT---------TTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAAT-TTT--TTGTCTTTCTGGGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-A-TGA-CAATAGCATTCAAGCTTTTTTA-TACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCAGTTT-CGAAAATAAACACT---A--TT-TCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAG-GAT-GGTTCACCTAATTT-GT--GGA-------TTATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AATGGTCTG-ACTTA-GGT-------TTA--TCTCC----CGCGTCTAA-AC----------CACCTTTAGG-----TTCAAATGAAACTCGTAAGTTT-AT--------TTTGGAGCTT----TACAG--AT--ATTATG-TTT-GCCATGTACATACTCTTGG-ATGACTTTATAAAAAGGTCCCTTTATGTCAAGT-TG-GTGCAACC-TGTGTAG-AAGAGCTG-AATGTGAAACAGTATCAAAGGCCTTGGAAAAATTAATA-AAGCAAACATACAATT--TGG-ACTTAAATATTTGTATA-TTTTTGAATAAGGGTTCT-AAGTATAAACATGTGGTCACTGGTTCTGGCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTAATAATATTGTTAGAGTCCAAGTAGTTTTGTAACCTTGTATTCAGTATGCTATCAA--ATACTTT-GGATA-AGC-AAGAAGTT-ATTGTT-ATTCCTCTATACTAGTAGTTTGATGGGTCATA-TGGGCTATCGTTTTTATGAAT-AGG-TTTAATAAAGCCTATTTTCCA-TTCCTTTGGGTATT-TGCCAG-AA-GACAA-GACAAG----AT-TAAATAATTT-T-AGCATATGTGGT-AAAATATAT-G-AC-TTGGCTTTCA-ACATCTCATT-TTTAATGCCATCCTAATC-CA-GC-TGATTT-TTATTCTTTAGATG-TTTTATTGCATCAATGATTTTCTTTTTTTTAGTTGTACTAAATCTAAC-GAGGTAAATGTTTTGAT-TTTCT--T--CTTGG-CAAGTAAT-TTCAAAATATTT-ATTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAG-TATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGACT--TTCAAA--CT-----GAGTTTCCAGTTATGATA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTTTTGTAATCG-A-TA--TGTAGCTGTAGT-AAT---CTGA-ACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--AAAATATTTA-TTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAGATATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGACT--TTCAAA-ACC-----GAGTTTCCAG-TATGATA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  T--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATT--TGAATT-GTA-TAGAAAAACTTT-------TT-ATC--TG-AT---------TTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAA--TTT--TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-A-TGA-CAATAGCATTCAAGCTTTTTT-ATACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCAGTTT-CAGAAATTAACACT---
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                --TA----A-TTT-ATT-TCA--AAT-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCATAACATGGAATACAGAGTTC---------ATAT---------G--------------------CATGAA--T-CA-T--G-AA----AG-----T-G-A------TCAAT--C-A--AAA-GA--T---CAATAA-AAT----------------T---TA-C-GA---T-A-AATC---AA---C--TCTT-C--TCT---------------ATA-AT----------GAG--CA-C------------------------------------------AA--TTTCCTG--T--AA-C--ACCGTCA-AAT-T-C-GT-----TACT-C--A-----T--A
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gtacatgTCAGACAGGGCTATCATTCTTATGAATTA--CTTTGATAAAGCCTGTATCCCACTCC-TTTGAATATT-TGCCAG-AG-GACAA-GATAAATTACATGTAGATAATTT-C-AGCAAA--TGGT-ACAATATGTGGTACGGTGGCTAGTA-ACATTTCATT-TTCATTG
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TAAATAA-GA--AA----AGTTT-ATT-CCA--A-T-T--TT-G-GG-CC-CAAGAGG---GCAT---------AATAGAA------------GTATTATTTAAAAA--------------------CAT-----T-CA-T----GA----AGA---AA-G-A------
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    agtttaTAA-GT--TA----A-TTC-ATT-TTC--A-A-AAATT-GCGG-CC-C-AGAGGAATGCAT---------TACAGAG------------ATAT---------AAGGTTCAAATA---------CAG-AA--T-AA-T--A-AA----AGA---AT-G-A------TT-TC--C-A--AAA-GA--T---AGATAA-AGT--AG-A-Taatgtccaaaaagaaggaagaaattattttttacaatattataacatacatggatgtgg
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        agaTT-ATT-TCCA-A-T-T--TT-G-GC-CC-C-A-AGG---GCAA---------TA-AAAGAATACCAGGTTCACAT---------A--------------------CATAAA--T-CA-T--A-AA----AGAGCTAA-C-A------TT-AT--CTA--AAT-GA--T---AGATAC-TATA-AA-A-TAACA-AGGT---TA-T-ggaatgtgatttggtcaatca
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aagtagtattaaagtaAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA-------------------------A-G-A------CC-AT--CCA--AAT-GA--TTATAGATAA-AGT--AAGA-TTACA-AAGT---TA-T-GA---TTA-AATC---AA---A--T-TT-CC-TCA---------------ATTTGT----------GAG--CAGCT------ATA-c
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTTCAGACATTTCATTATTTTATCCCAC-CCAA--ACATGCTTGATTTATTATTTTTTAGCT-TTGTCACGGCAGAGATTATTTCCTTTTCTATATTT--------CCTAAC-Ggttgtgtgttaaattgg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cacaggTAAGTAA-GTAATATCTTA-TTT-ATT-TCC--AAT-T--TT-G-GG-CC-C-AG-GG---GCAT----------ACAA-G------------ATAT---------AAC------------------CAT-AAACT-CAAC--A-GA----AGA---AGTGCA------TC--T--C-A--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AACA-TAACATAAGT---TA-T-GGGACT-C-ACTCACAAA---A--T-TT----TCATGACACAGTACACTGATT-GTTACCTGATACGAG--CAGCT------GCA-TACACTCACTGT-A-------G-TTGGCAA-AATTTTTTCAA--TTAAA-CACACGTTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAACATCCACGATTTTCT-C-CT-AT-TA-AA---CAGGTGATAT-A-TACCTCCGATAAAAGTATTT----A-TAC--AAGTATAT-CA-TCATACAAGGA------TT--CTATTGTGTAA-TGTG-T-TTATAAAATTAT--CTTAAATG-T---TGGTA-TGC--TGT-A---CCGGCATCAATTCATGGCTAC-A-AACAAAT-GGAAC-TTGGAAACA-T-TCT--CCCAAA--CAG-CG-T-CAGTA--CTTAACCG-ATA-CTCGACACT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           acccacgggtaATTCCAAAAACTTACTAAATGAAA-CAATTGCCAAGAC-TTGAGGATTCACGAATT-AC-TCGAAAATATTTTTC-CTCTACAGAATCTTG-TTTTGAA-A------TGAATGA--ATA-TGT-TC-GCAGTT-TTGCCACCA----CATTGGGGG-TTAATG-GTC-GCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACAAATGCCGCACC---T--GCGAATAATTA------TTAATCGCTC-ATAGCG-TGGACTTTAA-TTAAAAGATAAACAAGTTTTT--GAC-AC--A----ATTATTCCATT-GTTCAAT--C--ATGACTAATTAGAACAT-TGTA-----ATA-TC-CTAA-CTT-ATTTAACAAAAATATAT-AATG-----AATG---GCGGTAACTGTAGT-ATCTTT-CCACAAAATAACTAAT-TTGTTG-TTCACTATA-TCCTA-TACACT-CAA-TTGATTT--TCAGT-ATACAGCAGTT-C-TCTTGAAA-TAATCGAAT-CTACAAAGGGG---A----------ATCTA-AAATTCTCTTC-CGAAAA--TATTGTACGAACATAAGATC-TTTTTAT-AA---CAT--CAAAATTTACATAGTGGAATTCGACCA-AGTTTTT-CACGCTACAATAAATCTGAAGACCCTTTTGGAGGTATCCTTTTTATGTAC----------AAGTAACCTACA---AATAT-TATTTCAAGAGACTTTATGTTTTG-CA-TTTGGTTTAATCTTACAATAGCAGTA-CAT-TTTATTAA-AG-AAGACC-TTTT-CTA-TACACAATAAaccaatggtttaaacattcttttaaatctattttatctatctcaataatgtttccttgctgtaggacgcccggacgcagggaatttcaataaatgcctataagaaatgaaggctcttggatgatgagagagaactgattcatatttaccccacaacgattatttgtattccaaaaacttactaaatgaaacaattgccaagacttgaggattcacgaattactcgaaaatatttttcctctacagaatcttgttttgaaatgaatgaatatgttcgcagttttgccaccacattgggggttaatggtcgcaatgtctgaaagtgtactacaaatgccgcacctgcgaataattattaatcgctcatagcgtggactttaattaaaagataaacaagtttttgacacaattattccattgttcaatcatgactaattagaacattgtaatatcctaacttatttaacaaaaatatataatgaatggcggtaactgtagtatctttccacaaaataactaatttgttgttcactatatcctatacactcaattgattttcagtatacagcagttctcttgaaataatcgaatctacaaaggggaatctaaaattctcttccgaaaatattgtacgaacataagatctttttataacatcaaaatttacatagtggaattcgaccaagtttttcacgctacaataaatctgaagacccttttggaggtatcctttttatgtacaagtaacctacaaatattatttcaagagactttatgttttgcatttggtttaatcttacaatagcagtacattttattaaagaagaccttttctatacacaataaatggacaggggcccaaacgttgtatat
gi|30                         : acccacgggtataagtaagtaatatcttatttatttccaattttgggcccaggggcatacaagatataaccataaactcaacagaagaagtgcatctcaaatgatagataaagtaacataacataagttatgggactcactcacaaaattttcatgacacagtacactgattgttacctgatacgagcagctgcatacactcactgtagttggcaaaattttttcaattaaacacacgttcacattcattactcataagccaaacatccacgattttctcctattaaacaggtgatatatacctccgataaaagtatttatacaagtatatcatcatacaaggattctattgtgtaatgtgtttataaaattatcttaaatgttggtatgctgtaccggcatcaattcatggctacaaacaaatggaacttggaaacattctcccaaacagcgtcagtacttaaccgatactcgacactaccaatggtttaaacattcttttaaatctattttatctatctcaataatgtttccttgctgtaggacgcccggacgcagggaatttcaataaatgcctataagaaatgaaggctcttggatgatgagagagaactgattcatatttaccccacaacgattatttgtTAAGTAA-GT---A----A-TTC-ATT-TTC--A-AAT--TT-G-GG-CC-C-AGAGA---GCATACAGAGAA-TACAGAGTTC---------ATAT---------A--------------------CATGAA--T-AA-T--A-AA----AGA---AT-G-A------TT-AT--C-C--AAA-GA--T---AGATAA-AGatggacaggggcccaaacgttgtatat
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       c-AA--T-CA-T--A-AA----AGA---GA-G-A------TT-ATCCC-A--AA--GA--T---AGGTAA-CGTG-AA-A-TAAC-----T--------------------------------T-TT-C--TCA---------------GTA-AT----------GAA--CAGCT------ATA-T-------------------------GCGT-AA--TTTTCAA--T--GA-CA-
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             attagatgGTAAGTAA-TT--TT----T-TTT--TT-TCA--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGGGG---GAATACAAAGAA-TACAGAGTTT---------ATCT---------A--------------------CATAAA--T-CA-T--A-GA----AGA---GA-G-A------TT-AT--C-C--AAttgt
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aACTTGTA---TCTGTATTTATTGTTCCC-C--AAAT----------------G-CAGTA-CTTACCG-GT-------TG-A----CCTG-TATGATCATA----C-AA---GT-GTATC--A--GGTA-TGCA---TT
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TCAGTATGCTATTAC---TCCTTT-GGATA-AGCAA-GAAGTT-ATAGTT----CTTCT------GTAATGTGATGGGTCAGA-AGGACTATCATT
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -TTT-ATT-CCA--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---ACA----------TATAAAA------------GTA
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       acacgT------ATA-T--TTAA-CTT-ATT---CAAA---ATAT-AATG-----AATCAATGC--------TACT-A---CT-CC----AACTACT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACatgatagttttataaagttgaaaacatatct
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTTTT-CCCTTGAAAAGCTTC-TTTTG-A-ATAGGCCT-AATCC--ATA-TGT-TC-GTAA-C-TTG---CC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   taGTAAGTAA-GT---A----A-TTT-ATT-TCC--AAT-T--TT-G-GG-TC-C-AGAGG---GCATACAAAGAA-TACAGAGTTC---------ATGT---------A--------------------CAT-AAG-T-CA-T--A-AA----A-A---GA-G-A------TT-AT--CCA--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-AATAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---CT-T-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------------------------------------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T--AA-C--ACTGTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----TTTTTTTC-T-CT-AT-TG-CA---TGGGT--T-T-A-T----------AAAGTTCTT----A-TAC-AAAGTGT-T-CA-T-------GGA------TT--CTA-TG---AA-TG-G-T-T----------TTCTTTAG-TG-T---TGGTA-TGC--TGT-A---CAG---TAAA---ATA----T---A--AAAT-GGAAT-T------CA-T-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-GCAG-ACA-CT--ACATTTT-------T-TTG---TGTG----TGTGT--A--AC-GCCC-AGTTTCCATAGCC-AA-AGA-ATGAGAACTG---------------------AAA-CATTA--CAAGA-CTTGAGGATT-ACGAA-TTAC-TGAAAAATA-CTTTT-CTCTTCAGAATCTTG-TTTTG-A-A------T-AATGC--ATA-TGT-TC-GC-AGT-TTG---CCA----CATT----G-TT--TG-TCT-GCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---C--ATGAATATT--------TAAATCGCTC-AT---G-T-AACTT--A-TTA----GT-AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------AGT-TTT--AT--C--ATG--TA--TAAAACAC-TGT------ATA-T--TTAA-CTT-ATT---CAAA---ATAT-AATG-----AAT----GC--------TACT-A---ATCC-----AAATGCT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACA-TTG-TTT--TCA-T-ATACAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-AATT-CTAC--AGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TT-CGTAAA--TAAT-TA-AAAC---AG--C-TCTTTAT-AA---CAT--CAAAA--TACATA--GGGAATCGACCA-AG---TT-CAC-CTACAATAGCT-TGA------ATT--GAGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---TATATAT--TTCAAGAATTTT-ATG---TG-CATTTT-------TTTT------GCAGTA-CAT-TTTATTAA-AGAA----G-TTTT-CTA-T--ACAATAATCAGGGCGTTT-GACG-AAACTTGTA---TCTGTATTTATTGTT-CC-CCCAAATTCCACATGCATA-AG-G-CAGTA-CT----G-GT-------TT-A----ACTG-TATGGTCATA----C-AA---GT-GTATC--AG-GATA-TGTA---TTTTAGGTT-T--AATATTT-CCAAAAC-----ACTT--GGCTAGTT-TAAAATAAG-CATTTAAGGCT-TTTTTGTA-AAGA-TCAAA--TG-AC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATG--AGATAAAAA-CAATC-CCCAGATATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATC--TGATTTGTTA-TAGAAATTTTTT-------TT-ATC--TG-ATTTTTTACCGTTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAA--TTT--TTGTCTTTTTGAGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-----A-CAATctt
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AGCT------ATA-TAT-------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAG--T--AA-C--GCTGTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CC
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TCACCTAATTTTGC-TGGA-------TCATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAGAA----TGGT---AGATT---AT
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aT-TCC--AAT-T--TT-G-GGTCC-C-AGAGG---GCAT---------
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -AT---G-T-AACTT--A-TTA----GT-AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------AAT-Taatatactcaa
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATAATCAGGGCGTTT-GACG-GAACTTGTA---TC
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GGTAAGTAA--T--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TTCG-GG-CC----GAGG----CATA--------CACAAAG------------A-AT---------AAGAGTTGAGAAGTTCAATTTCAT-AAA-T-CA-T--AAGA----AGAG--AA-G-A------TT-AT--C-A--AATTGA------AGATAA-A-T--AA-A-TA-CA-AGGTCTATA-T-GAA--T-A-AATC---AA---C--T-CT-CCTTCATCC------------ATA-GT----------GAG--CAGCT------ATACTA--------GT-ATCAGTAAG-TTGGCAA-AA--TTTTAAA--T--AA-CA--CTGTCG-CAT-C-C-AT-----TGCT-C--AATATTT--AA--AGCCCAATTA-----AATTTTTCAT-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-CTAA-------AAAGTTCTT----A-TAC-A--GTGT-T-CA-T-------GGAT-----TT--G-A-TG---AA--G-G-T-T----------T---TTAG-TGTT---C--TAT-GC--TAT-AA--CAG---TCAA---ATA----TTA-A--CAATTAGAATGT------CAAT-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-ACAA-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCAT-TTAACT--TGTCTTTG-GT--A--ACAGCCC-AGTTTC-GTAGCC-AA-AGA-ATGACAACTGA-TCTG-AAATTTG-----TAAAA-CATTG--CCA-ACGTAGAGGTTT-ACGAA--TAC-GTGAAAATAATCTTT-CTCTACATAAACTTGATTTTG-A-ATAGCC-T-AATGC--ATA-TGTGTCGGC--GT-TTG-----A----AATT----GCTT--TGTTCT-GCA-A-TGGCGGA----TGTCCT-----A-A----------C---C--ATGAATAATT-------TAA--CATTCTATG--G-T-AACTTC-ATTTA----GT-AACAA----TT---ATAAC--ATTACAT------ACTGTTT--AT--CTAATG--TA--TAGCACATATGT------ATA-TACTTAA-CTT-ATT---CAAA---ATA--AATGAAATCAAT----TC--------TACT-A---TC-C-----CACTACT--TGTTGTTGAT------TATTC--ACTACAATGAGA-TTG-TTT--TCA-CAATACAGCA--T-TATCTC--AATTACT-GAAT-TCTC--AGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TTGTGTAAAATTATT-TA-AAACT--AG--C-TTTTAATAAA---CAT---AAAA--TA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aCATA-AA-GGCAGTA-CT----G-GTCCGTTCGTT-ACATTACTGATATGATCATAACACCAAG---TT-GTATCTCAGCGGTG-TGTACTTTTTTCG--C-T--AATA-TTTCCAAAAC------CTT--GACTAGCTCTAAAATAAG-CCTTTAAGGCTCTTTT-GTA-AAGAATCAAA-TTGGAC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATGCAGG-TAAAAAACAATT-CC-AGAGATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTCAGATGATT--TGATTT-TTAATAGAAAAACTTT-------TTTATC--TG-AT---------TTTT-CTTACCGTTTTTTTACAG---------------AATATATGACAATGTTT--TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGAATAGGCAATATTT-ACTGAACATCAGCATTCAAGCTTTTTTAATACATACCCGCTG---AGCCCCT-CCCTCGGTTTTCAGAA-TTAACACTGAAAAATCATCAGCATACCACGACTA-AACACATTTAAGCGAT-GTGTCACCTAATTTTGCGCGGGATAATATTTATCATTATATCAGTC-GGACAATAG-ATATCTGGTTCAGGATCCATGTCGAGTTTAT---TATTTTAACAAAGGTTT-GACTTACGGTACTTCTGTTACTCCTCCCGGGC-TGTTTAG-ACGACTCCACTCCACCGTTAAGGCCTTTCCACATGAAATTCG-AAGTTT-ATATCTGTTGTTCGGAGTTTGTGGTACAGTTATTAATTATG-TTTGGCCA-GTACATACTCTTGACATGACTTTATAGAgt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTTTT-CCCTTGAAAAGCTTC-TTTTG-A-A------T-AATCC--GTA-TGT-TC-GTAA-C-TTG---TCCTTTTCATT------TT--TA-----GCACA-T-TCTGACAAAT-TACTTTGCCATA----------CA--T--GTACATATTAA------TAAATCTTTT--T---C-T-AAGTTC-A-TTA-------AACAC----TTTTGAT-T--------GT------AGA-TCTGAAA--C--TTG--AA--AAAGATGT-TATCGCAGGATA-TG-CCAA-GTTGATT---CAGT---AAAA-AATA-----AAC----AC--------TGCTCA---AC-C-----AACAATT--C-TTTTTG-T------TA-TC--A-TTCAAA-A------------TCA-T-AT--------T-T-TCTT--GA--AGT-GCACACT-C-AAGCAA---AGTATCATTTGATTTATGAATGT---GT-TGTAAA--TATT-TA-A--C---AG--T-ATTGGAT-AA---GGTTTCAATA--TATA-A-TGGATGCCTACCT-AA---TT-CCC-CCATAACTGCA-TAG------TTT--GAAG---CTTTCTTATGTACCCCCCGGTGTA------CCCCA---CATATGTA-CTTGAGAGTTTTAATG---TG-AA-GTT-------TATC------ACTATA-TATATTTTTCAT-TG-A----G-TTTT-CAA-T--ATTATAATTTGGTCTCTT-AAC---AA-TAGCAGATTCTGAATTTATAATT--C-CCCAAATTTCACTTCCATATAACA-CAATA-------G-GT-------TT-T----ATTG-TGTGATCAtgtaattcatcggccattcatcgtttcacttctagtcgaagttgtgtcgcaagccttgtg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aggta-TGA-TAGTAGCGTTCAAGCTTTTTT--------------G---AAGTCTT-CCTTCAGTTT-CAGAAATTAACACT---AAGTCATCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAA-GAT-GTGTCACCTAATTTTGC-TGGA-------TCATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TC--------TC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AAAGATTTGGACTTA-GGT-------C-G--TCTCC----C-TGTCTAACAC---------CCACC-TTAGG-----TTCAAAT--------------T-AT--------TTTGAAGTTT----TACAG--AC--AGTATG-TTT-GCCATGTACATACTTTTGA--TGACTTTATAGAAAGGCCCCTT-ATGTCAAGC-TG-ATGCAGCC-TGTGTAG-AAGATCTG-AATGTAAAACAGTGTCAAAAGCCTTAGAAAAATCAACA-AAGCAAACGTATAATT--TGGAA-TT-ATCATTTGTATA-TTTTTGAATAACGGTTCT-AAGTATAAAAATGTGGTCACTAGTTCTGGCTTTTGGTTGAAAACCAATTTGAACTTTATTTATAATGTTGTTCGAGTCCAAGTAGTTTTGTAACCTGGTATTCAGTATGCTATTAAATATACTTTGGGATA-aaaagatgcaacaaaatgccggcatt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             caaaattaggAAGTAA-AT--T--------TT-ATA-TCA--A-T-A--TT-T-GG-CC-C-AG------GCAT---------AACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--A-CA-ACAA-GA----AGA---AA---A------CC-ATT-C-ACCAAT-GA--T---AGATAA-CGT--AA-C-TAACA-AAGT---TAAT-GA---T-A-AATC---AA---AATT-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAGAGCAGCT-------TA-TATTAAT---GT-A-------G-TTGGACA-AA--TT---AG--T--AA-TC-GCTGTCA-CATGT-C-ATCTTTATACTGC--A-----T--AAAAG--C-AATTA-----AATTATTC-T-CT-AT-TAACATACCAAGT--T-T-A-T----------AA-GTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----T---CTA-TG---AAATG-G-T-T----------T--TCTTGATGTT----AGTAT-GCCATGT-AACACAA---TCAATG-ATG------A-A--AAAT-GGAAT-TAA----CA-TGCTTATC---AAAGCAC-AG-TACAG-A--CTT-GCAG-ACA-CTTAACATTTTC-TCACAT-TTA-CATGTGTTTTTGTGT--A--AC-GCC--A---TCAA-AGCC-AA-AGA-ATGAGAACTGGTTCTGAAATATGG-----TAAAA-CATTT--CAAGA-CTTGAGGATT-ATGAAt
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): TTCCAATTGGGTCGCTGTGCCCCAGAGCGCGCAAGAACTAATAGGAGAGACCGTACTTAACAGTTGAGAAAGAATGTCCCAAAAAAAAGAAGTGCGGAAAAGTGACTAAGATTTCAAGTACAGAGTGCGTAATCACAAACTCTAACAT
Unaligned ( gi|35 ): AAGGGTATTCAGAACAAGAATGACATGGGAACATAAAGAAATAAAGTAAAATAAACAGGGAAAAACATCCAGATG
Unaligned ( gi|38 ): AATAAATTTGGAAATAAAATATCAATTTTGAAATAAAGAAAATAAATTTGAAATATTCATTATGATA






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                1111111111              1                              44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444      1111                                        1                                                    111             222222           222222222222222      1111111111          444444444444444444444444444444444                            222                 11111                               11111                      111              2222222222         1111                    1111111   2222222222                    2222222222222        111111    22  11     111          111   22222222               222222        111111  11        1                      11                  11111                       11                                             11111          111     22               1              1                    11         33333333                    111     111   11111   222222      11111                       11111   33333333333333333         333333333            22222       11     1111        1111  11   111111111111111111       11                        1   222222     11            111    111   11    11111   22222222222222      222222222222                   111111     11                                                                 11     33333333333333            111         11            111                111                  11               111                      111111         111             55555555555555555     111       22                111     1   2222222    111111      11                222222                                             111               1                         111     1111111    222222222222222    1          22222222222                      111           11   11          222222   11                              111                        1111          111             11  1                                          111     1                                2222222222          222222222    5555555555555555555555555555555555     11     11                                          111                         11     111     111                                 111               2222    1    11      2   1                 11   2222222       11                    1111    111     111     11    111        1               1  4444444444444     2222 1       1  666666666     1     22222       11             1  33333333          2222     222222      1   1                   11                1               1  1        1       1        1     1                                1                11        22           1                  1                                                                                                                    111      1     1            1      333      3333333                 1                     22222                 1   1              1      1  1     1      2222  1          222            1         1    1          1          1           1    111  1                       11                                  22222222      1     1   222    11     11111     1        111          11                      1               1              7777777777777                1            1         666666666666     1   11          1       
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             3  0000000000   2   2  555 0 2 22  2 2  4  2 2     333    77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777   8  3333  7777 33 4444   555  222 555555  2  77 4 55  44  33 666      2   77  888     2    444  5 2  000 2 2    444  000000 5  5 66   111111111111111   2  1111111111   77     000000000000000000000000000000000       2  33       55 33  2 222      2   5 2 2  44444    8 33 77777 33  88 44       11111 1      3 3  3  3  6  111     44 3 3 3 0000000000         1111 3   3  0  0 3 3  3 0000000   5555555555   6  555  6  3 6 3 3333333333333     0  444444    44  00   3 666  9999    666   00000000 55    4     8 222222  4 8   888888  11   4  4 2   8 55   4    4   8  66        5  0   5  77777         1  99999  6   55 4    1 5    5  5   5          11   77  22   22222     5    222     00         5     5    888       1     5    0     3   00     5 5 22222222     66   5   5  5  333 5   333   22222   000000  77  11111   5 5       5         44444   33333333333333333         444444444      0  5  00000 5     66 5   0000  5     0000  33   888888888888888888 1 5   88  99 99   99  99        3   222222   5 99    5   5   000    555   44    44444   44444444444444    5 777777777777       77 5      5 666666  5  55 5      5 4 6   6   99   666  7     99 666    99  99   6    6  3 44     11111111111111     6      111  6      55    6  6    888  99 6       6  111   99     99   11 88            6  111  6   6           6   999999   99    111             22222222222222222   1 111     4 22   0        7   111  6  3   1111111 1  999999  3   11  9        6  6 111111    6   9999         1        6   888        000               5  6 6      6666666    5  111     6666666 5  000000000000000    1          44444444444  6     99 77    6    111    1 5  8 11   88  8       000000   11        8         8           666  0   8    8  8  88  8  7777        8 444     8       11  6 0  999  0  8  3       99  99        6    111     3   2   99      6   6            2222222222   99  6  666666666    0000000000000000000000000000000000     55     44   99                   99   6            111   6                     66     444     444       8          8     0        444 44  3       3 1111    0    33      0   0         0    0  44   6666666       11    8   8    8    8 7777    444     444     33    777        0        55     0  2222222222222     1111 0       0  555555555     0   6 55555       11  0   9      0  66666666          1111     555555      0   0    3        3     99          6     2     7         3  3        3       3        3     2    0                7          3    7   0       88   7 6  00           3                  3                           6                                   7             6          0                           777      0     0   7 7      3      444      5555555  1      6     1 0                     11111                 2   2   6      7   3      3  3     3      8888  3          222      7     3         3 7  2 0  6     0          0           3    777  3  7      7             44            0               1  1  55555555      0     3   555    44     99999     0   22   222          44                      3               3              3333333333333     7      7   3    7       3         888888888888     3   00      6   3       
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .  ..........   .   .  ... . . ..  . .  .  . .     ...    ..............................................................   .  ....  .... .. ....   ...  ... ......  .  .. . ..  ..  .. ...      .   ..  ...     .    ...  . .  ... . .    ...  ...... .  . ..   ...............   .  ..........   ..     .................................       .  ..       .. ..  . ...      .   . . .  .....    . .. ..... ..  .. ..       ..... .      . .  .  .  .  ...     .. . . . ..........         .... .   .  .  . . .  . .......   ..........   .  ...  .  . . . .............     .  ......    ..  ..   . ...  ....    ...   ........ ..    .     . ......  . .   ......  ..   .  . .   . ..   .    .   .  ..        .  .   .  .....         .  .....  .   .. .    . .    .  .   .          ..   ..  ..   .....     .    ...     ..         .     .    ...       .     .    .     .   ..     . . ........     ..   .   .  .  ... .   ...   .....   ......  ..  .....   . .       .         .....   .................         .........      .  .  ..... .     .. .   ....  .     ....  ..   .................. . .   ..  .. ..   ..  ..        .   ......   . ..    .   .   ...    ...   ..    .....   ..............    . ............       .. .      . ......  .  .. .      . . .   .   ..   ...  .     .. ...    ..  ..   .    .  . ..     ..............     .      ...  .      ..    .  .    ...  .. .       .  ...   ..     ..   .. ..            .  ...  .   .           .   ......   ..    ...             .................   . ...     . ..   .        .   ...  .  .   ....... .  ......  .   ..  .        .  . ......    .   ....         .        .   ...        ...               .  . .      .......    .  ...     ....... .  ...............    .          ...........  .     .. ..    .    ...    . .  . ..   ..  .       ......   ..        .         .           ...  .   .    .  .  ..  .  ....        . ...     .       ..  . .  ...  .  .  .       ..  ..        .    ...     .   .   ..      .   .            ..........   ..  .  .........    ..................................     ..     ..   ..                   ..   .            ...   .                     ..     ...     ...       .          .     .        ... ..  .       . ....    .    ..      .   .         .    .  ..   .......       ..    .   .    .    . ....    ...     ...     ..    ...        .        ..     .  .............     .... .       .  .........     .   . .....       ..  .   .      .  ........          ....     ......      .   .    .        .     ..          .     .     .         .  .        .       .        .     .    .                .          .    .   .       ..   . .  ..           .                  .                           .                                   .             .          .                           ...      .     .   . .      .      ...      .......  .      .     . .                     .....                 .   .   .      .   .      .  .     .      ....  .          ...      .     .         . .  . .  .     .          .           .    ...  .  .      .             ..            .               .  .  ........      .     .   ...    ..     .....     .   ..   ...          ..                      .               .              .............     .      .   .    .       .         ............     .   ..      .   .       
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             1  8888888888   2   1  555 5 0 88  0 0  0  0 0     555    88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888   0  5555  2222 11 2222   555  888 888888  1  11 7 88  44  11 999      2   99  555     4    444  0 5  000 7 7    777  999999 3  3 33   333333333333333   7  7777777777   33     444444444444444444444444444444444       5  44       99 44  5 333      7   3 9 9  33333    6 99 11111 99  55 22       77777 4      3 3  3  3  7  777     66 3 3 3 4444444444         7777 3   3  5  1 3 3  3 8888888   1111111111   7  888  7  3 7 3 9999999999999     4  888888    33  00   6 444  0000    444   55555555 00    0     0 555555  0 0   000000  00   0  0 0   0 55   0    0   0  55        0  5   0  44444         4  33333  7   77 3    4 0    7  7   7          00   66  99   55555     0    111     66         0     5    222       7     0    8     2   66     0 0 88888888     99   0   0  0  999 0   888   99999   777777  99  44444   7 7       7         33333   11111111111111111         999999999      4  0  11111 0     99 0   6666  0     6666  66   333333333333333333 0 7   33  22 22   22  22        3   111111   7 33    7   7   000    777   44    33333   44444444444444    7 777777777777       99 7      7 444444  7  77 7      7 3 7   7   22   888  3     22 888    22  88   7    7  5 00     88888888888888     7      777  7      88    7  7    333  22 7       7  777   22     22   66 66            7  777  7   7           7   222222   22    777             88888888888888888   0 777     2 22   7        8   777  7  3   7777777 0  222222  5   88  8        7  7 888888    7   3333         0        7   777        000               0  7 7      2222222    7  777     4444444 7  333333333333333    4          00000000000  7     22 77    7    777    0 0  0 00   66  0       888888   00        0         0           222  8   0    0  8  88  0  0000        0 000     0       00  0 8  444  8  0  2       22  22        7    777     3   5   22      7   7            5555555555   22  7  777777777    0000000000000000000000000000000000     88     00   22                   22   7            555   7                     22     000     000       0          0     8        000 00  2       2 2222    0    22      0   0         8    8  44   0000000       00    0   0    0    0 0000    000     000     88    555        0        00     0  2222222222222     2222 0       0  222222222     8   5 00000       88  2   2      0  22222222          2222     555555      0   0    2        2     88          5     0     3         3  3        3       3        3     0    7                3          3    3   7       33   3 7  77           3                  3                           7                                   3             7          7                           000      0     0   3 3      3      000      3333333  0      7     0 0                     33333                 0   0   7      3   3      3  3     3      3333  3          777      3     3         3 3  0 7  7     0          0           3    777  3  3      3             00            7               0  2  88888888      0     3   000    77     33333     7   00   000          77                      3               3              3333333333333     3      3   3    3       3         333333333333     3   33      7   3       
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GGTAAGTAA-GT--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT---------TACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--T-CA-T--A-GA----AGA---AA-G-A------TC-AT--C-A--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-A-TAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TA--------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T--AA-CA-ACTGTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----AATTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-T----------AAAGTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----TT--CTA-TG---AA-TG-G-T-T----------T--CTTAGATGTT---TGGTATTGC--TGT-A---CAG---TCAA---ATG----T-A-A--AAAT-GGAAT-T------CA-T-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-GCAG-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCAT-TTAACTTGTGTTTTTGTGT--A--AC-GCCC-AGTTTCAATAGCC-AA-AGA-ATGAGAACTGATTCTGAAAATTTG-----TAAAA-CATTT--CAAGACCTTGAGGATT-ACGAATTTAC-TGGAAAATATTTTTT-CTCTACAGAATCTTG-TTTTG-A-A------T-AATGC--ATA-TGT-TC-GCAAGT-TTG---CCA----CATT----G-TT--TG-TCC-GCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---C--GTGAATATTTA------TAAATCGCTC-AT---G-T-AACTT--A-TTA----GT-AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------ANT-TTT--AT--C--ATG--TA--TAGAACAT-TGT------ATA-T--CTAA-CTT-ATT---CAAA---ATAT-AATG-----AAT----GC--------TACT-A---NT-C-----AACTACT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACA-TTG-TTT--TCA-T-ATACAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-GAAT-CTAC-AAGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TT-CGTAAA--TATT-TA-AAAC---AG--C-TTTTTAT-AA---CAT--CAAAA--TACATA-TGGGAATCGACCA-AG---TT-CAC-CTACAATAGCT-TGA------TTT--GAGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---AATATATA-TTCGAGAGTTTTAATG---TG-CA-TTT-------TNTC------GCAGTA-CATATTTATTAA-AG-A----N-TTTT-CTA-T--ACAATAATCNGGGCGTTT-GACG-GAACTTGTA---TCTGTATTTATTGTTCCC-CCCAAATTTCACATGCATA-AA-G-CAGTA-CT----G-GT-------TT-A----ACTG-TATGATCATA----CAAA---GT-GTATC--AG-GGTG-TGTA---TTTTNGGTT-T--AATA-TT-CCAAAAC-----ACTT--GACTAGTT-TAAAATAAG-CCTTTAAGGCTCTTTTTGTA-AAGA-TCNAA-TTG-AC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATG--AG-TAAAAA-CAATT-CCCAGATATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATT--TGATTT-TTA-TAGAAAAACTTT-------TT-ATC--TG-AT---------TTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAAT-TTT--TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-A-TGA-CAATAGCATTCAAGCTTTTTTAATACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCGGTTT-CAGAAATTAACACT---AAATCATCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAG-GAT-GTGTCACCTAATTTTGC-CGGA-------TTATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AAAGGTTTGGACTTA-GGT-------TTA--CCTCC----C-TGTCTAA-ACG--------CCACCNTTAGG-----TTCAAATGAAACTCGTAAGTTT-AT--------TTTGGAGTTT----TACAG--AT--ATTATG-TTT-GCCATGTACATACTCTTGA-ATGACTTTATAGAAAGGCCCCTTTATGTCAAGT-TG-GTGCAGCC-TGTGTAG-AAGAGCTG-AATGTGAAACGGTATCAAAGGCCTTAGAAAAATCAACA-AAGCAAACGTACAATT--TGGAACTT-AATATTTGTATA-TTTTTGAATAAGGGTTCT-AAGTATAAACATGTGGTCACTGGTTCTGGCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTTATAATATTGTTAGAGTCCAAGTAGTTTCGTAACCTTGTATTCAGTATGCTATTAA--ATACTTT-GGATA-AGCAAAGAAGTT-ATTGTT-A-TCCTCTA---TAGTANTTTGATGGGTCANA-AGGGCTATCATTTTTATGAAT-AGGCTTTAATAAAGCCTATTTCCCACTCCCTTTGGGTATT-TGCCAG-AG-GACAA-GACAAG----AT-TAAATAATTT-T-AGCATATGTGGT-AAAATATAT-GTACGTCGGCTTTCA-ACATCTCATT-TTTAATGCCAT-CTAATCGCA-GCTTGATTTATTATTTTTTAGATGTTTTTATTGCATCGATGATTTTCTTTTCTNTAATTG-A-TAAATCTAAC-GAAGT-AATG--TTGATATTTCTGCTGACTTGGACAANNAATCTTCAAAATATTTAATTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAGATATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGA------------CTTTC-AAACCGAGTTTCCAG-TATGATA
Reference ( family-3541 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GGTAAGTAA-GT--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT---------TACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--T-CA-T--A-GA----AGA---AA-G-A------TC-AT--C-A--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-A-TAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TA--------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T--AA-CA-ACTGTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----AATTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-T----------AAAGTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----TT--CTA-TG---AA-TG-G-T-T----------T--CTTAGATGTT---TGGTATTGC--TGT-A---CAG---TCAA---ATG----T-A-A--AAAT-GGAAT-T------CA-T-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-GCAG-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCAT-TTAACTTGTGTTTTTGTGT--A--AC-GCCC-AGTTTCAATAGCC-AA-AGA-ATGAGAACTGATTCTGAAAATTTG-----TAAAA-CATTT--CAAGACCTTGAGGATT-ACGAATTTAC-TGGAAAATATTTTTT-CTCTACAGAATCTTG-TTTTG-A-A------T-AATGC--ATA-TGT-TC-GCAAGT-TTG---CCA----CATT----G-TT--TG-TCC-GCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---C--GTGAATATTTA------TAAATCGCTC-AT---G-T-AACTT--A-TTA----GT-AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------ANT-TTT--AT--C--ATG--TA--TAGAACAT-TGT------ATA-T--CTAA-CTT-ATT---CAAA---ATAT-AATG-----AAT----GC--------TACT-A---NT-C-----AACTACT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACA-TTG-TTT--TCA-T-ATACAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-GAAT-CTAC-AAGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TT-CGTAAA--TATT-TA-AAAC---AG--C-TTTTTAT-AA---CAT--CAAAA--TACATA-TGGGAATCGACCA-AG---TT-CAC-CTACAATAGCT-TGA------TTT--GAGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---AATATATA-TTCGAGAGTTTTAATG---TG-CA-TTT-------TNTC------GCAGTA-CATATTTATTAA-AG-A----N-TTTT-CTA-T--ACAATAATCNGGGCGTTT-GACG-GAACTTGTA---TCTGTATTTATTGTTCCC-CCCAAATTTCACATGCATA-AA-G-CAGTA-CT----G-GT-------TT-A----ACTG-TATGATCATA----CAAA---GT-GTATC--AG-GGTG-TGTA---TTTTNGGTT-T--AATA-TT-CCAAAAC-----ACTT--GACTAGTT-TAAAATAAG-CCTTTAAGGCTCTTTTTGTA-AAGA-TCNAA-TTG-AC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATG--AG-TAAAAA-CAATT-CCCAGATATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATT--TGATTT-TTA-TAGAAAAACTTT-------TT-ATC--TG-AT---------TTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAAT-TTT--TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-A-TGA-CAATAGCATTCAAGCTTTTTTAATACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCGGTTT-CAGAAATTAACACT---AAATCATCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAG-GAT-GTGTCACCTAATTTTGC-CGGA-------TTATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AAAGGTTTGGACTTA-GGT-------TTA--CCTCC----C-TGTCTAA-ACG--------CCACCNTTAGG-----TTCAAATGAAACTCGTAAGTTT-AT--------TTTGGAGTTT----TACAG--AT--ATTATG-TTT-GCCATGTACATACTCTTGA-ATGACTTTATAGAAAGGCCCCTTTATGTCAAGT-TG-GTGCAGCC-TGTGTAG-AAGAGCTG-AATGTGAAACGGTATCAAAGGCCTTAGAAAAATCAACA-AAGCAAACGTACAATT--TGGAACTT-AATATTTGTATA-TTTTTGAATAAGGGTTCT-AAGTATAAACATGTGGTCACTGGTTCTGGCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTTATAATATTGTTAGAGTCCAAGTAGTTTCGTAACCTTGTATTCAGTATGCTATTAA--ATACTTT-GGATA-AGCAAAGAAGTT-ATTGTT-A-TCCTCTA---TAGTANTTTGATGGGTCANA-AGGGCTATCATTTTTATGAAT-AGGCTTTAATAAAGCCTATTTCCCACTCCCTTTGGGTATT-TGCCAG-AG-GACAA-GACAAG----AT-TAAATAATTT-T-AGCATATGTGGT-AAAATATAT-GTACGTCGGCTTTCA-ACATCTCATT-TTTAATGCCAT-CTAATCGCA-GCTTGATTTATTATTTTTTAGATGTTTTTATTGCATCGATGATTTTCTTTTCTNTAATTG-A-TAAATCTAAC-GAAGT-AATG--TTGATATTTCTGCTGACTTGGACAANNAATCTTCAAAATATTTAATTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAGATATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGA------------CTTTC-AAACCGAGTTTCCAG-TATGATA
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GTAAGTAAAGT--TA----A-TTTTATTCTCCGAA-T-T--TT-G-GG-CCAC-GAAGG---GCAT----------ACAA-G------------ATAT---------A--------------------AAA-AA----CA-C--A-GA----AGA---AA-G-T------GC-AT--CCA--AAT-GA--TGA-AGATAA-AGT--AA-A-TAACA-AAGT---TA-T-GAA--T-A-AATC---AA---T--T-TT-C--TCA---------------ATT-G-----------GAG--CAGCT------ATACTT--------GT-A-------GATTGGCAA-AT--TTCTCAACCT--AA-AC-ACTGTCA-CAT-T-CGAT-----TACT-CCAA-----T--AA--G--CCAAATA-----A-TTTTTC-T-CTGATCTA-CA----AGGT--T-T-AAT----------AAAGTTTTTTA--A-AAC-AAAGT---T-CAAT-------GGAT-----T---CTA-TG---AA-TG-G-T-T----------TGTCTTAAATGTG---TG-TAT-GC--TGT-A---CAA---TCAA---ATG----T-A-A--AA-T-GGAATGT------CA-T-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-GCAG-ACAGCT--ACATTTTC-TCTCAT-T--ACTTGTGTTTTTGTGTTAA--AC-GCCCGAGTTTCAATAGCC-AACAGA-ATGAGAACTAATTCT-AAAATTTG-----TAAAAACATTTT-CAAGAC-TTGAGGATT-AC-AATCT-----GAAAATATTTTT--CTCTACAGAATCTT--TTTTG-A-AC-----T-AATGGGAATAATGT-TC-GCA-GTGTTG---CCA----CATT----GGTT--TG-TCCTGCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---CCAGTGAA-ATT---------AAATCGCTC-AT---GCT-AACTT--T-ATA----GT-AACAA----TTT-GATTACGGA----AT------ATT-TTT--ATATC--ATG--TA--TAGAACATCTGT------ATAGT--CTAAGCTT-ATT---CAAAC--ATA--AATG-----AGA----GC--------TACT-A---GTTC-----AACTACT--T-TGTTTG-T------TA-TCGAA-TACAAT-ACAGTTG-TTTCATTA-T-AT-CAGCA--TAT-TCTT--AA-GAAT-GAAT-CTAC-AGGGGGCGAA----------ATCTA-AAATTC---TT-CGAAAAA-TATT-TA-AAAC---AG--CGTTTTTAT-AAACACAT--CAAAA--TACATA---GGAATCGACCA-AG---TTTCAC-CTACAATAGCT-TGA------TTT--GAG----CCTTTTTAGGTAC----------AGA----CCA-A---AATATAT--TTCAAGAATTTTAATG---TGGCAATTT-------TTTC------GCAGTAACATGTTTATTAA-AG-A----CGTTTT-CTAGT--ACAATAATCAGGGCGTTTTGACG-GAACTTGTA---TCTGTATTTATTGTTCCC-C--AAATTTCACATGCATA-AAAG-CAGTAACT----GTGT-------TTTA----ACTG-TATGATCATA----CA-----GTCGTATC--AG-GGTG-TGTA---TTTTTGGTTAT--AAT--TT-CCAAAAC-----ACTTTTGACTAGTT-TAAAATAAGGCCTTTAAGGCT---TTTGTAGAAGA-TCCAAATTG-AC----AACATGTGTA---AGGAGGCCTGATG--AGGTAAAAA-CAATTGCCCAGATATT---G--TACGATGAACACT---TGTTCTGA--ATT--TGATTT-TTA-TAGAAAAACTTT-------TT-ATC--TG-AT---------TTTT-T-------------ACAACGTTTTTTCTACAGAAATATT-GACAAT-TTT--T-GTCTTTCTGAGGTTGACCAGGA-TAGGCAAAATTTGA-TGA-CAATAGCATTCAAGCCTTTTTAATACAC---CGCTGTGAAGGCCCTCCCCTCGGTTT--AGAAATTAACACT---AAATCATCAGCAT-C----AACATAACA---TTAAGAGATGGTGTCACCT-ATTTTGC-CGGA-------TTATCAT--TATC-GTCGAAAA-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAATATTATTTTAA-AAAGGTTTGGACTTA-GG--------TTA--CCTCC----C-TGTCTTA-ACAC-------CCACACTTA-G-----TTCAAATG-AACTCGTAAGTTTGAT--------TTTGGAGTTT----TAGAG---T--ATTATGTTTT-GCCATGTACATAC-CTTGA-TTGACTTTATA-AAAGG-CCCTTTATGTCAAGTCTGTGTGCAGCCTTGTGTAGAAAGAGCTGAAATGT--AACGGTATCAAAGGCCTTAG-AAAATCAACACAAGC-AACATACAATTGCTGGAACTT--ATATTTGTATATTTTTTGAATAAGGGTTCTAAAGTATAAACATGTGGTCACTGGTTCT-GCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTTAT-ATATTGTTAGAGT-CAAGTAGTTTCGTACCTTTGTATTCAGTATGCTATTAA--ATACTTT-GGAAATAGCAAAGAAGTTGATTGTTAA-TCCTCTA---TA--ATTTTGAT-GGTCATA-AGGGCTATCATTTTTATGAAT-AGGTTTTAATAAAGCCTATTT-CCATTCCCTTTGGG-ATTCTGCCAACAGAAACAACGACAAG----AT-TAAACAATTTATAAGCATATGTGGTAAAAATATAT-GTACATCGG-TTTCA-ACATCTCATT-TTTAATGCCAT-CTAATCGCA-GCTTGATTTATTATCTTTCAGATGTTTTTATTGCATCAATGATTTTCTTTTCTTTAATTG-A-TAAATCTAAC-GAAGT-AATG--TTGATATTTCTGCTGACTTGGACAATAAATCTTCAAAATATTTAATTCTGGGTATCAAATTTACTAATCAATACTGAATAATGTTTGTAAAATGATTTACACCCATTGTTCACTAGATATCTT-ATCGGACT-ATCTTGCGGATTGCTGATTGATTCAAATTCTTTC-AAA---AGTTT-CAG-TATG
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aaAAGTAA-AT--T--------TT-ATA-TCA--A-T-A--TT-T-GG-CC-C-AG------GCAT---------AACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--A-CA-ACAA-GA----AGA---AA---A------CC-ATT-C-ACCAAT-GA--T---AGATAA-CGT--AA-C-TAACA-AAGT---TAAT-GA---T-A-AATC---AA---AATT-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAGAGCAGCT-------TA-TATTAAT---GT-A-------G-TTGGACA-AA--TT---AG--T--AA-TC-GCTGTCA-CATGT-C-ATCTTTATACTGC--A-----T--AAAAG--C-AATTA-----AATTATTC-T-CT-AT-TAACATACCAAGT--T-T-A-T----------AA-GTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----T---CTA-TG---AAATG-G-T-T----------T--TCTTGATGTT----AGTAT-GCCATGT-AACACAA---TCAATG-ATG------A-A--AAAT-GGAAT-TAA----CA-TGCTTATC---AAAGCAC-AG-TACAG-A--CTT-GCAG-ACA-CTTAACATTTTC-TCACAT-TTA-CATGTGTTTTTGTGT--A--AC-GCC--A---TCAA-AGCC-AA-AGA-ATGAGAACTGGTTCTGAAATATGG-----TAAAA-CATTT--CAAGA-CTTGAGGATT-ATGAAgcat
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    taagctaATAGAGCATAA---TT-CCC-CCATAACTGTT-TGG------TTT--GAGG---TCTTCTTGTGTAT----------T------CCATATAGAGTATGTA-CTTGAGGGGTTTAATG---TG-AA-GTT-------TATC------AC--TA-AATA-TGATTCATGG-A----C-TTTT-CAA-C--ATTATAATTTGGGCTCTT-TACATCAGCAGGT----TTTGAATTTGTAGTT--T-CCCAAATT--------ACA-AA-A-CA----------G-GT-------TT-T----ACAG-TGTGATAAAA----AAAAAAGAT-GCAAC--AA-AATACTGGA---ATTTGGCCT-TGCAAT--TT-CAAAAAC-----ATTT--AATTAATT-TAAAGAAAG-CATTCAAACCAC-GCTTATA-CAGG-TCTTG-TTG-ACAATTAACATATA-ATCCAAAGG-CAT--TG--AA-T-ATAC-CA----CGTAAATATTAATGAATAAAA-GA-CAATGAATGTTC-TAT--TTCCTTATCT-TTA-TAAACAAATTTTAAGTTTCTT-ACCTTTGCAT---------TCTTGT-------------AAAA---------------AAAAT--G----T-TGTCCTTGTCTTTTTCAAATTAAC--AGA-GAGACAATGTTT-A-Taa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gTAAGTAA-GT--TA----T-TTT-ATT-TCC--AAT-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT--------------AA------------ATAT---------A--------------------CAT-AAA-C-CA-C--A-GA----AGA---G--G-A------CC-AT--CCA--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-A-TAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TTTC--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TAT-------GT-A---------TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T--AA-CA--CTGTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----ATATTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-T----------AAAGTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGA------TT--CTA-TG----A-TG-GTT-T----------T--CTTAGATG-T---TGGTA-TGC--TGT-A---CAA---CCAA---ATG----T---A--AAAT-GGTAT-T------CA-T-CTT--C---AA--CACAAG-TCCAG-A--CTT-GCAG-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCAC-TT-ACTTGTGTTTTTGTcata
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -T--TT-G-GA-CC-C-AGAGT---GCAT----------ACAAAG------------A-AT---------A--------------------CAT-AG--TTCA-T--A--A----ATA---CA-C-A------TC-AT--A-A--AA---A--T----GATAA-AGT--AATA-TAACC-AGGT---TA-T-GA---T-A-AATC---TATTTT--T-TT-T--TCA---------------ATA-GT----------GAG--CAGC----------------------T-A-------A-TT-------A--TTGTCAA--T--AA-C--ACTGTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----ACTTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---TATGT--T-T-A-T----------AAAGTAATT----A-TAC-AAGGTGT-T-TA-T-------GAA------CT--CTA-TG---AA-TG-G-TGC----------C--CTTAGGTG-T---TGGTA-TGC--TAT-A---CAG---TCAA---ATA----T-ACA--AAAT-GGAAA-T------CA-T-CCT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-ATGCGT-GCGC-ACGCCT--GCAT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               g--TA----A-TTT--TT-TCC--A-A-T--TT-T-TG-CC-C-AGAGG---GCAT----------ACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AAA-C-CA-C--A-GA----AGA---AA-G-A------CC-AT--CCA--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-AATAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TTTC--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TAATTTAT--GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T--AA-CA--CTGTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----AATTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T---C----------AAAG-TTTT----A-TACAAAAGTAT-T-CA-T-------GGATCTATATT--CTA-TG---AA-TG-GTT-T----------T--CTTAGATG-T---TGGT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aaggtagTAAGTAA-GT---A----A-TTT-----TCA--A-T-T--TT-G-GG-GT-G-AGAGG---GCAT---------CATACAA------------ATA-----------------------------------AA--T-CA-G--A-GTTCCTGTA---CA-T-G------TT-AT--CTA--AAA-GG--C---GTATAATATT--AA-A-TTACA-AGTT---TA-T-GA---T-ATAAT----AA---ACTT-TT-C--CCC---------------ATA-AT----------GAA--CAGCTCTAGAGATA-TA--------GGGA-------A-TTGGCAA-AA--TTTCCAT--T--AA-CA-TC-GTCA-CAT-g
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aaA----G-TTT-ATT-CCA--A-T-T--TT-G-GGCCC-C-AAAGG---GCAT---------AATAGAA------------GTA----------A--------------------CA--GC--T-CA-T--A--A----AGA---AA-G-AAATGTCCC-AA--A-A--AAT-GAAGT---GGGAAA-AGTTAAA-A-TATCA-cacacaagtctatgtataactataaaatattcatggactct
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aaagaaaataaatttgagaaaaaatatcaattttgaaataagaaaataaaatttggaaatattcattatgatatctataggtgtaaagataatataCCC-AGTTTAAATAGCC-AA-AAG-ATGAGAACTGATTATG-AAATTTA-----GAAAA-CATTG--CAAGAC---GAGGATT-GCGAA-TTAC-TGAAAAATG--TTTT-CTCTACAGA------------------------AATGC--A-A-TGT-TC-GCCAGT-TTGT--CCA-----ATT----G--T--TG-TCT-GCA-ATTGCCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------CCTTC--ATGAATATTTCTCTTTTTAAATCTATC-AG---A-T-AATTT--A-TTA----GT-AACAA----Ttggaatcacaacttacatgtatgtgg
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tacA-AAGT---TA-TAGA---T-A-A-TC---AA---T--TGTT-C--TCA---------------TTT-GT----------GAG--CAG-T------ATA-TA---------T-A-------G-TTGGCAA------TTTCAA--T--AAGCA---T-TCA-CAT-TAC-AT-----TA-T-C--A-----CTAAA--G--CCAAATAC----AATTTCTT-TACT-AT-TA-CA---CAGGT--T-TTA-T----------AAATTTTTTGCCTA-TAC-AA-GTAT-TTCA-T-------GGAT-----TCTGCT--TG---AA-TG-G-T-T----------TTTCTTA-ATGTT----GGTATGGC--TGTTA---CA----TCAA---ATG----T-A-A--AAata
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TGGCAACGA--TTTT-AA--T--AA-CA--CCGTCA-C-T-T-C-AT-----TGCTTC--A-----T--A---G--CCAGGTA-----AAGTT----------------------GTT--T-T-A-T----------CAAATTCTT----A-T-C-AATGTGT-T-CA-A-------GGA----------CTGGTG---AA-TG-G-T-T----------TT-CGTACA-GTTGAATGATAT-AC--AAT-A---CAG---TCAA---TT---------A--CAAT-GGAAT-T------CA-T-CTT-------A--CAA-AGTT-CAGCA--TTT-ACAG-ACA-GT--GCATTTTCTTTTCATATTACC---CGTTTTTG
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  acGGTAAGTAA-GT--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT---------TACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--C-CA-C--A-GA----AGA---AA-G-A------CC-AT--C-A--CAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-T-TAA-A-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TA--------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAAA-T--AA-CA-ACTGTCAGCAT---C-GT-----TACT-C--A-----T--AG------CAAA-A-----AATTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-T----------AAAGTTTTC----AATAA-CAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----TT--CTA-TG---A--TG-G-T-T----------T--CTTAGATGTT---TGGTATTGC--TGT-A---CAC---TCAG---ATG----T-A-A--AAAT-GGAAT-T------C--T-CTT------AA--CAC-AG-T--AG-A--CTT-GCAGGACA-CT--ACATTTTC-TCTCAT-TTAAATTGTGTTTTTGGTT--AGTAC-GCCCCAGTTTCAATAGCCCAA-AGATATG-GAACTGATTCTGAAAATTTG-----TAAAA-CATTT--CAAGACCTTCAGGATT-ACGAATTTACATGAAAAATATTTTTTTCTCTACAGAATTTTG-TTTTG-ATA------C-AATGA--ATA-TGT-TC-GCAAGT-TTG---CCA----CATT----G-TT--TG-TCT-TCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---C--ATGAATATTTA-------AAATCGTCC-AT-----T-AAACT--A-T-A----GT-AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------AAT-TTC--AT--C--ATG--TA--TAGAACAT-TGT------ATA-T--CTAA-CTT-ATT---CAAA---ATATTAATG-----AAT----GC--------TACT-A---GT-C-----AACTACT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACA-TTG-TTT---CA-T-ATACAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-GAAT-CTAC-AGGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TT-CGTAAA--TATT-TT-AAAC---AG--C-TTTTTAT-AA---CAT--CAAAA--TAC-TA-TGGGAATCGACCA-AG---TT-CAC-CTACAATAGCT-TGA------TTT--GAGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---AATATAT--TTCAAGAATTTTTATG---TG-CA-TTT-------TTTC------GCAGTA--GTATTTATTAA-AA-A----G-TTTTTCTA-T--ACAATAATCCAGGCGTTT-GACG-GAACTTGTA----CTGTATTTATTGTTCCCACCCAAATTTCACATGCATA-AA-G-CAGTA-CT----G-GT-------TT-A----GCTGCTATGATCATA----CAAA---GT-GTATC--AG-GGTG-TGTA---TTTTTGGTT-T--AATA-TT-CCGAAACCAAAAACTT--GACTAGTT-TAAAATAAG-CCTTTAAGGCTCTTTTTGTA-AAGA-TC-AA-TTG-AC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATG--AG-TAAA---CAATT-CCCAGATATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATT--TGAATT-GTA-TAGAAAAACTTT----------ATC--TG-AT---------TTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAAT-TTT--TTGTCTTTCTGGGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-A-TGA-CAATAGCATTCAAGCTTTTTTA-TACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCAGTTT-CGAAAATAAACACT---A--TT-TCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAG-GAT-GGTTCACCTAATTT-GT--GGA-------TTATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AATGGTCTG-ACTTA-GGT-------TTA--TCTCC----CGCGTCTAA-AC----------CACCTTTAGG-----TTCAAATGAAACTCGTAAGTTT-AT--------TTTGGAGCTT----TACAG--AT--ATTATG-TTT-GCCATGTACATACTCTTGG-ATGACTTTATAAAAAGGTCCCTTTATGTCAAGT-TG-GTGCAACC-TGTGTAG-AAGAGCTG-AATGTGAAACAGTATCAAAGGCCTTGGAAAAATTAATA-AAGCAAACATACAATT--TGG-ACTTAAATATTTGTATA-TTTTTGAATAAGGGTTCT-AAGTATAAACATGTGGTCACTGGTTCTGGCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTAATAATATTGTTAGAGTCCAAGTAGTTTTGTAACCTTGTATTCAGTATGCTATCAA--ATACTTT-GGATA-AGC-AAGAAGTT-ATTGTT-ATTCCTCTATACTAGTAGTTTGATGGGTCATA-TGGGCTATCGTTTTTATGAAT-AGG-TTTAATAAAGCCTATTTTCCA-TTCCTTTGGGTATT-TGCCAG-AA-GACAA-GACAAG----AT-TAAATAATTT-T-AGCATATGTGGT-AAAATATAT-G-AC-TTGGCTTTCA-ACATCTCATT-TTTAATGCCATCCTAATC-CA-GC-TGATTT-TTATTCTTTAGATG-TTTTATTGCATCAATGATTTTCTTTTTTTTAGTTGTACTAAATCTAAC-GAGGTAAATGTTTTGAT-TTTCT--T--CTTGG-CAAGTAAT-TTCAAAATATTT-ATTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAG-TATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGA------------CTTTC-AAACTGAGTTTCCAGTTATGATA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTTTTGTAATCG-A-TA--TGTAGCTGTAGT-AAT---CTGA-ACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--AAAATATTTA-TTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAGATATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGA------------CTTTCAAAACCGAGTTTCCAG-TATGATA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  T--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATT--TGAATT-GTA-TAGAAAAACTTT-------TT-ATC--TG-AT---------TTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAA--TTT--TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-A-TGA-CAATAGCATTCAAGCTTTTTT-ATACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCAGTTT-CAGAAATTAACACT---
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                --TA----A-TTT-ATT-TCA--AAT-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCATAACATGGAATACAGAGTTC---------ATAT---------G--------------------CATGAA--T-CA-T--G-AA----AG-----T-G-A------TCAAT--C-A--AAA-GA--T---CAATAA-AAT----------------T---TA-C-GA---T-A-AATC---AA---C--TCTT-C--TCT---------------ATA-AT----------GAG--CA-C------------------------------------------AA--TTTCCTG--T--AA-C--ACCGTCA-AAT-T-C-GT-----TACT-C--A-----T--A
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gtacatgTCAGACAGGGCTATCATTCTTATGAATTA--CTTTGATAAAGCCTGTATCCCACTCC-TTTGAATATT-TGCCAG-AG-GACAA-GATAAATTACATGTAGATAATTT-C-AGCAAA--TGGT-ACAATATGTGGTACGGTGGCTAGTA-ACATTTCATT-TTCATTG
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TAAATAA-GA--AA----AGTTT-ATT-CCA--A-T-T--TT-G-GG-CC-CAAGAGG---GCAT---------AATAGAA------------GTATTATTTAAAAA--------------------CAT-----T-CA-T----GA----AGA---AA-G-A------
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    agtttaTAA-GT--TA----A-TTC-ATT-TTC--A-A-AAATT-GCGG-CC-C-AGAGGAATGCAT---------TACAGAG------------ATAT---------AAGGTTCAAATA---------CAG-AA--T-AA-T--A-AA----AGA---AT-G-A------TT-TC--C-A--AAA-GA--T---AGATAA-AGT--AG-A-Taatgtccaaaaagaaggaagaaattattttttacaatattataacatacatggatgtgg
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        agaTT-ATT-TCCA-A-T-T--TT-G-GC-CC-C-A-AGG---GCAA---------TA-AAAGAATACCAGGTTCACAT---------A--------------------CATAAA--T-CA-T--A-AA----AGAGCTAA-C-A------TT-AT--CTA--AAT-GA--T---AGATAC-TATA-AA-A-TAACA-AGGT---TA-T-ggaatgtgatttggtcaatca
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aagtagtattaaagtaAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA-------------------------A-G-A------CC-AT--CCA--AAT-GA--TTATAGATAA-AGT--AAGA-TTACA-AAGT---TA-T-GA---TTA-AATC---AA---A--T-TT-CC-TCA---------------ATTTGT----------GAG--CAGCT------ATA-c
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTTCAGACATTTCATTATTTTATCCCAC-CCAA--ACATGCTTGATTTATTATTTTTTAGCT-TTGTCACGGCAGAGATTATTTCCTTTTCTATATTT--------CCTAAC-Ggttgtgtgttaaattgg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cacaggTAAGTAA-GTAATATCTTA-TTT-ATT-TCC--AAT-T--TT-G-GG-CC-C-AG-GG---GCAT----------ACAA-G------------ATAT---------AAC------------------CAT-AAACT-CAAC--A-GA----AGA---AGTGCA------TC--T--C-A--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AACA-TAACATAAGT---TA-T-GGGACT-C-ACTCACAAA---A--T-TT----TCATGACACAGTACACTGATT-GTTACCTGATACGAG--CAGCT------GCA-TACACTCACTGT-A-------G-TTGGCAA-AATTTTTTCAA--TTAAA-CACACGTTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAACATCCACGATTTTCT-C-CT-AT-TA-AA---CAGGTGATAT-A-TACCTCCGATAAAAGTATTT----A-TAC--AAGTATAT-CA-TCATACAAGGA------TT--CTATTGTGTAA-TGTG-T-TTATAAAATTAT--CTTAAATG-T---TGGTA-TGC--TGT-A---CCGGCATCAATTCATGGCTAC-A-AACAAAT-GGAAC-TTGGAAACA-T-TCT--CCCAAA--CAG-CG-T-CAGTA--CTTAACCG-ATA-CTCGACACT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           acccacgggtaATTCCAAAAACTTACTAAATGAAA-CAATTGCCAAGAC-TTGAGGATTCACGAATT-AC-TCGAAAATATTTTTC-CTCTACAGAATCTTG-TTTTGAA-A------TGAATGA--ATA-TGT-TC-GCAGTT-TTGCCACCA----CATTGGGGG-TTAATG-GTC-GCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACAAATGCCGCACC---T--GCGAATAATTA------TTAATCGCTC-ATAGCG-TGGACTTTAA-TTAAAAGATAAACAAGTTTTT--GAC-AC--A----ATTATTCCATT-GTTCAAT--C--ATGACTAATTAGAACAT-TGTA-----ATA-TC-CTAA-CTT-ATTTAACAAAAATATAT-AATG-----AATG---GCGGTAACTGTAGT-ATCTTT-CCACAAAATAACTAAT-TTGTTG-TTCACTATA-TCCTA-TACACT-CAA-TTGATTT--TCAGT-ATACAGCAGTT-C-TCTTGAAA-TAATCGAAT-CTACAAAGGGG---A----------ATCTA-AAATTCTCTTC-CGAAAA--TATTGTACGAACATAAGATC-TTTTTAT-AA---CAT--CAAAATTTACATAGTGGAATTCGACCA-AGTTTTT-CACGCTACAATAAATCTGAAGACCCTTTTGGAGGTATCCTTTTTATGTAC----------AAGTAACCTACA---AATAT-TATTTCAAGAGACTTTATGTTTTG-CA-TTTGGTTTAATCTTACAATAGCAGTA-CAT-TTTATTAA-AG-AAGACC-TTTT-CTA-TACACAATAAaccaatggtttaaacattcttttaaatctattttatctatctcaataatgtttccttgctgtaggacgcccggacgcagggaatttcaataaatgcctataagaaatgaaggctcttggatgatgagagagaactgattcatatttaccccacaacgattatttgtattccaaaaacttactaaatgaaacaattgccaagacttgaggattcacgaattactcgaaaatatttttcctctacagaatcttgttttgaaatgaatgaatatgttcgcagttttgccaccacattgggggttaatggtcgcaatgtctgaaagtgtactacaaatgccgcacctgcgaataattattaatcgctcatagcgtggactttaattaaaagataaacaagtttttgacacaattattccattgttcaatcatgactaattagaacattgtaatatcctaacttatttaacaaaaatatataatgaatggcggtaactgtagtatctttccacaaaataactaatttgttgttcactatatcctatacactcaattgattttcagtatacagcagttctcttgaaataatcgaatctacaaaggggaatctaaaattctcttccgaaaatattgtacgaacataagatctttttataacatcaaaatttacatagtggaattcgaccaagtttttcacgctacaataaatctgaagacccttttggaggtatcctttttatgtacaagtaacctacaaatattatttcaagagactttatgttttgcatttggtttaatcttacaatagcagtacattttattaaagaagaccttttctatacacaataaatggacaggggcccaaacgttgtatat
gi|30                         : acccacgggtataagtaagtaatatcttatttatttccaattttgggcccaggggcatacaagatataaccataaactcaacagaagaagtgcatctcaaatgatagataaagtaacataacataagttatgggactcactcacaaaattttcatgacacagtacactgattgttacctgatacgagcagctgcatacactcactgtagttggcaaaattttttcaattaaacacacgttcacattcattactcataagccaaacatccacgattttctcctattaaacaggtgatatatacctccgataaaagtatttatacaagtatatcatcatacaaggattctattgtgtaatgtgtttataaaattatcttaaatgttggtatgctgtaccggcatcaattcatggctacaaacaaatggaacttggaaacattctcccaaacagcgtcagtacttaaccgatactcgacactaccaatggtttaaacattcttttaaatctattttatctatctcaataatgtttccttgctgtaggacgcccggacgcagggaatttcaataaatgcctataagaaatgaaggctcttggatgatgagagagaactgattcatatttaccccacaacgattatttgtTAAGTAA-GT---A----A-TTC-ATT-TTC--A-AAT--TT-G-GG-CC-C-AGAGA---GCATACAGAGAA-TACAGAGTTC---------ATAT---------A--------------------CATGAA--T-AA-T--A-AA----AGA---AT-G-A------TT-AT--C-C--AAA-GA--T---AGATAA-AGatggacaggggcccaaacgttgtatat
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       c-AA--T-CA-T--A-AA----AGA---GA-G-A------TT-ATCCC-A--AA--GA--T---AGGTAA-CGTG-AA-A-TAAC-----T--------------------------------T-TT-C--TCA---------------GTA-AT----------GAA--CAGCT------ATA-T-------------------------GCGT-AA--TTTTCAA--T--GA-CA-
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             attagatgGTAAGTAA-TT--TT----T-TTT--TT-TCA--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGGGG---GAATACAAAGAA-TACAGAGTTT---------ATCT---------A--------------------CATAAA--T-CA-T--A-GA----AGA---GA-G-A------TT-AT--C-C--AAttgt
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aACTTGTA---TCTGTATTTATTGTTCCC-C--AAAT----------------G-CAGTA-CTTACCG-GT-------TG-A----CCTG-TATGATCATA----C-AA---GT-GTATC--A--GGTA-TGCA---TT
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TCAGTATGCTATTAC---TCCTTT-GGATA-AGCAA-GAAGTT-ATAGTT----CTTCT------GTAATGTGATGGGTCAGA-AGGACTATCATT
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -TTT-ATT-CCA--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---ACA----------TATAAAA------------GTA
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       acacgT------ATA-T--TTAA-CTT-ATT---CAAA---ATAT-AATG-----AATCAATGC--------TACT-A---CT-CC----AACTACT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACatgatagttttataaagttgaaaacatatct
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTTTT-CCCTTGAAAAGCTTC-TTTTG-A-ATAGGCCT-AATCC--ATA-TGT-TC-GTAA-C-TTG---CC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   taGTAAGTAA-GT---A----A-TTT-ATT-TCC--AAT-T--TT-G-GG-TC-C-AGAGG---GCATACAAAGAA-TACAGAGTTC---------ATGT---------A--------------------CAT-AAG-T-CA-T--A-AA----A-A---GA-G-A------TT-AT--CCA--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-AATAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---CT-T-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------------------------------------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T--AA-C--ACTGTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----TTTTTTTC-T-CT-AT-TG-CA---TGGGT--T-T-A-T----------AAAGTTCTT----A-TAC-AAAGTGT-T-CA-T-------GGA------TT--CTA-TG---AA-TG-G-T-T----------TTCTTTAG-TG-T---TGGTA-TGC--TGT-A---CAG---TAAA---ATA----T---A--AAAT-GGAAT-T------CA-T-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-GCAG-ACA-CT--ACATTTT-------T-TTG---TGTG----TGTGT--A--AC-GCCC-AGTTTCCATAGCC-AA-AGA-ATGAGAACTG---------------------AAA-CATTA--CAAGA-CTTGAGGATT-ACGAA-TTAC-TGAAAAATA-CTTTT-CTCTTCAGAATCTTG-TTTTG-A-A------T-AATGC--ATA-TGT-TC-GC-AGT-TTG---CCA----CATT----G-TT--TG-TCT-GCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---C--ATGAATATT--------TAAATCGCTC-AT---G-T-AACTT--A-TTA----GT-AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------AGT-TTT--AT--C--ATG--TA--TAAAACAC-TGT------ATA-T--TTAA-CTT-ATT---CAAA---ATAT-AATG-----AAT----GC--------TACT-A---ATCC-----AAATGCT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACA-TTG-TTT--TCA-T-ATACAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-AATT-CTAC--AGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TT-CGTAAA--TAAT-TA-AAAC---AG--C-TCTTTAT-AA---CAT--CAAAA--TACATA--GGGAATCGACCA-AG---TT-CAC-CTACAATAGCT-TGA------ATT--GAGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---TATATAT--TTCAAGAATTTT-ATG---TG-CATTTT-------TTTT------GCAGTA-CAT-TTTATTAA-AGAA----G-TTTT-CTA-T--ACAATAATCAGGGCGTTT-GACG-AAACTTGTA---TCTGTATTTATTGTT-CC-CCCAAATTCCACATGCATA-AG-G-CAGTA-CT----G-GT-------TT-A----ACTG-TATGGTCATA----C-AA---GT-GTATC--AG-GATA-TGTA---TTTTAGGTT-T--AATATTT-CCAAAAC-----ACTT--GGCTAGTT-TAAAATAAG-CATTTAAGGCT-TTTTTGTA-AAGA-TCAAA--TG-AC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATG--AGATAAAAA-CAATC-CCCAGATATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATC--TGATTTGTTA-TAGAAATTTTTT-------TT-ATC--TG-ATTTTTTACCGTTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAA--TTT--TTGTCTTTTTGAGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-----A-CAATctt
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AGCT------ATA-TAT-------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAG--T--AA-C--GCTGTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CC
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TCACCTAATTTTGC-TGGA-------TCATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAGAA----TGGT---AGATT---AT
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aT-TCC--AAT-T--TT-G-GGTCC-C-AGAGG---GCAT---------
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -AT---G-T-AACTT--A-TTA----GT-AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------AAT-Taatatactcaa
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATAATCAGGGCGTTT-GACG-GAACTTGTA---TC
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GGTAAGTAA--T--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TTCG-GG-CC----GAGG----CATA--------CACAAAG------------A-AT---------AAGAGTTGAGAAGTTCAATTTCAT-AAA-T-CA-T--AAGA----AGAG--AA-G-A------TT-AT--C-A--AATTGA------AGATAA-A-T--AA-A-TA-CA-AGGTCTATA-T-GAA--T-A-AATC---AA---C--T-CT-CCTTCATCC------------ATA-GT----------GAG--CAGCT------ATACTA--------GT-ATCAGTAAG-TTGGCAA-AA--TTTTAAA--T--AA-CA--CTGTCG-CAT-C-C-AT-----TGCT-C--AATATTT--AA--AGCCCAATTA-----AATTTTTCAT-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-CTAA-------AAAGTTCTT----A-TAC-A--GTGT-T-CA-T-------GGAT-----TT--G-A-TG---AA--G-G-T-T----------T---TTAG-TGTT---C--TAT-GC--TAT-AA--CAG---TCAA---ATA----TTA-A--CAATTAGAATGT------CAAT-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-ACAA-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCAT-TTAACT--TGTCTTTG-GT--A--ACAGCCC-AGTTTC-GTAGCC-AA-AGA-ATGACAACTGA-TCTG-AAATTTG-----TAAAA-CATTG--CCA-ACGTAGAGGTTT-ACGAA--TAC-GTGAAAATAATCTTT-CTCTACATAAACTTGATTTTG-A-ATAGCC-T-AATGC--ATA-TGTGTCGGC--GT-TTG-----A----AATT----GCTT--TGTTCT-GCA-A-TGGCGGA----TGTCCT-----A-A----------C---C--ATGAATAATT-------TAA--CATTCTATG--G-T-AACTTC-ATTTA----GT-AACAA----TT---ATAAC--ATTACAT------ACTGTTT--AT--CTAATG--TA--TAGCACATATGT------ATA-TACTTAA-CTT-ATT---CAAA---ATA--AATGAAATCAAT----TC--------TACT-A---TC-C-----CACTACT--TGTTGTTGAT------TATTC--ACTACAATGAGA-TTG-TTT--TCA-CAATACAGCA--T-TATCTC--AATTACT-GAAT-TCTC--AGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TTGTGTAAAATTATT-TA-AAACT--AG--C-TTTTAATAAA---CAT---AAAA--TA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aCATA-AA-GGCAGTA-CT----G-GTCCGTTCGTT-ACATTACTGATATGATCATAACACCAAG---TT-GTATCTCAGCGGTG-TGTACTTTTTTCG--C-T--AATA-TTTCCAAAAC------CTT--GACTAGCTCTAAAATAAG-CCTTTAAGGCTCTTTT-GTA-AAGAATCAAA-TTGGAC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATGCAGG-TAAAAAACAATT-CC-AGAGATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTCAGATGATT--TGATTT-TTAATAGAAAAACTTT-------TTTATC--TG-AT---------TTTT-CTTACCGTTTTTTTACAG---------------AATATATGACAATGTTT--TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGAATAGGCAATATTT-ACTGAACATCAGCATTCAAGCTTTTTTAATACATACCCGCTG---AGCCCCT-CCCTCGGTTTTCAGAA-TTAACACTGAAAAATCATCAGCATACCACGACTA-AACACATTTAAGCGAT-GTGTCACCTAATTTTGCGCGGGATAATATTTATCATTATATCAGTC-GGACAATAG-ATATCTGGTTCAGGATCCATGTCGAGTTTAT---TATTTTAACAAAGGTTT-GACTTACGGTACTTCTGTTACTCCTCCCGGGC-TGTTTAG-ACGACTCCACTCCACCGTTAAGGCCTTTCCACATGAAATTCG-AAGTTT-ATATCTGTTGTTCGGAGTTTGTGGTACAGTTATTAATTATG-TTTGGCCA-GTACATACTCTTGACATGACTTTATAGAgt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTTTT-CCCTTGAAAAGCTTC-TTTTG-A-A------T-AATCC--GTA-TGT-TC-GTAA-C-TTG---TCCTTTTCATT------TT--TA-----GCACA-T-TCTGACAAAT-TACTTTGCCATA----------CA--T--GTACATATTAA------TAAATCTTTT--T---C-T-AAGTTC-A-TTA-------AACAC----TTTTGAT-T--------GT------AGA-TCTGAAA--C--TTG--AA--AAAGATGT-TATCGCAGGATA-TG-CCAA-GTTGATT---CAGT---AAAA-AATA-----AAC----AC--------TGCTCA---AC-C-----AACAATT--C-TTTTTG-T------TA-TC--A-TTCAAA-A------------TCA-T-AT--------T-T-TCTT--GA--AGT-GCACACT-C-AAGCAA---AGTATCATTTGATTTATGAATGT---GT-TGTAAA--TATT-TA-A--C---AG--T-ATTGGAT-AA---GGTTTCAATA--TATA-A-TGGATGCCTACCT-AA---TT-CCC-CCATAACTGCA-TAG------TTT--GAAG---CTTTCTTATGTACCCCCCGGTGTA------CCCCA---CATATGTA-CTTGAGAGTTTTAATG---TG-AA-GTT-------TATC------ACTATA-TATATTTTTCAT-TG-A----G-TTTT-CAA-T--ATTATAATTTGGTCTCTT-AAC---AA-TAGCAGATTCTGAATTTATAATT--C-CCCAAATTTCACTTCCATATAACA-CAATA-------G-GT-------TT-T----ATTG-TGTGATCAtgtaattcatcggccattcatcgtttcacttctagtcgaagttgtgtcgcaagccttgtg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aggta-TGA-TAGTAGCGTTCAAGCTTTTTT--------------G---AAGTCTT-CCTTCAGTTT-CAGAAATTAACACT---AAGTCATCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAA-GAT-GTGTCACCTAATTTTGC-TGGA-------TCATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TC--------TC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AAAGATTTGGACTTA-GGT-------C-G--TCTCC----C-TGTCTAACAC---------CCACC-TTAGG-----TTCAAAT--------------T-AT--------TTTGAAGTTT----TACAG--AC--AGTATG-TTT-GCCATGTACATACTTTTGA--TGACTTTATAGAAAGGCCCCTT-ATGTCAAGC-TG-ATGCAGCC-TGTGTAG-AAGATCTG-AATGTAAAACAGTGTCAAAAGCCTTAGAAAAATCAACA-AAGCAAACGTATAATT--TGGAA-TT-ATCATTTGTATA-TTTTTGAATAACGGTTCT-AAGTATAAAAATGTGGTCACTAGTTCTGGCTTTTGGTTGAAAACCAATTTGAACTTTATTTATAATGTTGTTCGAGTCCAAGTAGTTTTGTAACCTGGTATTCAGTATGCTATTAAATATACTTTGGGATA-aaaagatgcaacaaaatgccggcatt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             caaaattaggAAGTAA-AT--T--------TT-ATA-TCA--A-T-A--TT-T-GG-CC-C-AG------GCAT---------AACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--A-CA-ACAA-GA----AGA---AA---A------CC-ATT-C-ACCAAT-GA--T---AGATAA-CGT--AA-C-TAACA-AAGT---TAAT-GA---T-A-AATC---AA---AATT-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAGAGCAGCT-------TA-TATTAAT---GT-A-------G-TTGGACA-AA--TT---AG--T--AA-TC-GCTGTCA-CATGT-C-ATCTTTATACTGC--A-----T--AAAAG--C-AATTA-----AATTATTC-T-CT-AT-TAACATACCAAGT--T-T-A-T----------AA-GTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----T---CTA-TG---AAATG-G-T-T----------T--TCTTGATGTT----AGTAT-GCCATGT-AACACAA---TCAATG-ATG------A-A--AAAT-GGAAT-TAA----CA-TGCTTATC---AAAGCAC-AG-TACAG-A--CTT-GCAG-ACA-CTTAACATTTTC-TCACAT-TTA-CATGTGTTTTTGTGT--A--AC-GCC--A---TCAA-AGCC-AA-AGA-ATGAGAACTGGTTCTGAAATATGG-----TAAAA-CATTT--CAAGA-CTTGAGGATT-ATGAAt
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): TTCCAATTGGGTCGCTGTGCCCCAGAGCGCGCAAGAACTAATAGGAGAGACCGTACTTAACAGTTGAGAAAGAATGTCCCAAAAAAAAGAAGTGCGGAAAAGTGACTAAGATTTCAAGTACAGAGTGCGTAATCACAAACTCTAACAT
Unaligned ( gi|35 ): AAGGGTATTCAGAACAAGAATGACATGGGAACATAAAGAAATAAAGTAAAATAAACAGGGAAAAACATCCAGATG
Unaligned ( gi|38 ): AATAAATTTGGAAATAAAATATCAATTTTGAAATAAAGAAAATAAATTTGAAATATTCATTATGATA






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                1111111111              1                              44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444      1111                                        1                                                    111             222222           222222222222222      1111111111          444444444444444444444444444444444                            222                 11111                               11111                      111              2222222222         1111                    1111111   2222222222                    2222222222222        111111    22  11     111          111   22222222               222222        111111  11        1                      11                  11111                       11                                             11111          111     22               1              1                    11         33333333                    111     111   11111   222222      11111                       11111   33333333333333333         333333333            22222       11     1111        1111  11   111111111111111111       11                        1   222222     11            111    111   11    11111   22222222222222      222222222222                   111111     11                                                                 11     33333333333333            111         11            111                111                  11               111                      111111         111             55555555555555555     111       22                111     1   2222222    111111      11                222222                                             111               1                         111     1111111    222222222222222    1          22222222222                      111           11   11          222222   11                              111                        1111          111             11  1                                          111     1                                2222222222          222222222    5555555555555555555555555555555555     11     11                                          111                         11     111     111                                 111               2222    1    11      2   1                 11   2222222       11                    1111    111     111     11    111        1               1  4444444444444     2222 1       1  666666666     1     22222       11             1  33333333          2222     222222      1   1                   11                1               1  1        1       1        1     1                                1                11        22           1                  1                                                                                                                    111      1     1            1      333      3333333                 1                     22222                 1   1              1      1  1     1      2222  1          222            1         1    1          1          1           1    111  1                       11                                  22222222      1     1   222    11     11111     1        111          11                      1               1              7777777777777                1            1         666666666666     1   11          1       
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             3  0000000000   2   2  555 0 2 22  2 2  4  2 2     333    77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777   8  3333  7777 33 4444   555  222 555555  2  77 4 55  44  33 666      2   77  888     2    444  5 2  000 2 2    444  000000 5  5 66   111111111111111   2  1111111111   77     000000000000000000000000000000000       2  33       55 33  2 222      2   5 2 2  44444    8 33 77777 33  88 44       11111 1      3 3  3  3  6  111     44 3 3 3 0000000000         1111 3   3  0  0 3 3  3 0000000   5555555555   6  555  6  3 6 3 3333333333333     0  444444    44  00   3 666  9999    666   00000000 55    4     8 222222  4 8   888888  11   4  4 2   8 55   4    4   8  66        5  0   5  77777         1  99999  6   55 4    1 5    5  5   5          11   77  22   22222     5    222     00         5     5    888       1     5    0     3   00     5 5 22222222     66   5   5  5  333 5   333   22222   000000  77  11111   5 5       5         44444   33333333333333333         444444444      0  5  00000 5     66 5   0000  5     0000  33   888888888888888888 1 5   88  99 99   99  99        3   222222   5 99    5   5   000    555   44    44444   44444444444444    5 777777777777       77 5      5 666666  5  55 5      5 4 6   6   99   666  7     99 666    99  99   6    6  3 44     11111111111111     6      111  6      55    6  6    888  99 6       6  111   99     99   11 88            6  111  6   6           6   999999   99    111             22222222222222222   1 111     4 22   0        7   111  6  3   1111111 1  999999  3   11  9        6  6 111111    6   9999         1        6   888        000               5  6 6      6666666    5  111     6666666 5  000000000000000    1          44444444444  6     99 77    6    111    1 5  8 11   88  8       000000   11        8         8           666  0   8    8  8  88  8  7777        8 444     8       11  6 0  999  0  8  3       99  99        6    111     3   2   99      6   6            2222222222   99  6  666666666    0000000000000000000000000000000000     55     44   99                   99   6            111   6                     66     444     444       8          8     0        444 44  3       3 1111    0    33      0   0         0    0  44   6666666       11    8   8    8    8 7777    444     444     33    777        0        55     0  2222222222222     1111 0       0  555555555     0   6 55555       11  0   9      0  66666666          1111     555555      0   0    3        3     99          6     2     7         3  3        3       3        3     2    0                7          3    7   0       88   7 6  00           3                  3                           6                                   7             6          0                           777      0     0   7 7      3      444      5555555  1      6     1 0                     11111                 2   2   6      7   3      3  3     3      8888  3          222      7     3         3 7  2 0  6     0          0           3    777  3  7      7             44            0               1  1  55555555      0     3   555    44     99999     0   22   222          44                      3               3              3333333333333     7      7   3    7       3         888888888888     3   00      6   3       
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .  ..........   .   .  ... . . ..  . .  .  . .     ...    ..............................................................   .  ....  .... .. ....   ...  ... ......  .  .. . ..  ..  .. ...      .   ..  ...     .    ...  . .  ... . .    ...  ...... .  . ..   ...............   .  ..........   ..     .................................       .  ..       .. ..  . ...      .   . . .  .....    . .. ..... ..  .. ..       ..... .      . .  .  .  .  ...     .. . . . ..........         .... .   .  .  . . .  . .......   ..........   .  ...  .  . . . .............     .  ......    ..  ..   . ...  ....    ...   ........ ..    .     . ......  . .   ......  ..   .  . .   . ..   .    .   .  ..        .  .   .  .....         .  .....  .   .. .    . .    .  .   .          ..   ..  ..   .....     .    ...     ..         .     .    ...       .     .    .     .   ..     . . ........     ..   .   .  .  ... .   ...   .....   ......  ..  .....   . .       .         .....   .................         .........      .  .  ..... .     .. .   ....  .     ....  ..   .................. . .   ..  .. ..   ..  ..        .   ......   . ..    .   .   ...    ...   ..    .....   ..............    . ............       .. .      . ......  .  .. .      . . .   .   ..   ...  .     .. ...    ..  ..   .    .  . ..     ..............     .      ...  .      ..    .  .    ...  .. .       .  ...   ..     ..   .. ..            .  ...  .   .           .   ......   ..    ...             .................   . ...     . ..   .        .   ...  .  .   ....... .  ......  .   ..  .        .  . ......    .   ....         .        .   ...        ...               .  . .      .......    .  ...     ....... .  ...............    .          ...........  .     .. ..    .    ...    . .  . ..   ..  .       ......   ..        .         .           ...  .   .    .  .  ..  .  ....        . ...     .       ..  . .  ...  .  .  .       ..  ..        .    ...     .   .   ..      .   .            ..........   ..  .  .........    ..................................     ..     ..   ..                   ..   .            ...   .                     ..     ...     ...       .          .     .        ... ..  .       . ....    .    ..      .   .         .    .  ..   .......       ..    .   .    .    . ....    ...     ...     ..    ...        .        ..     .  .............     .... .       .  .........     .   . .....       ..  .   .      .  ........          ....     ......      .   .    .        .     ..          .     .     .         .  .        .       .        .     .    .                .          .    .   .       ..   . .  ..           .                  .                           .                                   .             .          .                           ...      .     .   . .      .      ...      .......  .      .     . .                     .....                 .   .   .      .   .      .  .     .      ....  .          ...      .     .         . .  . .  .     .          .           .    ...  .  .      .             ..            .               .  .  ........      .     .   ...    ..     .....     .   ..   ...          ..                      .               .              .............     .      .   .    .       .         ............     .   ..      .   .       
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             1  8888888888   2   1  555 5 0 88  0 0  0  0 0     555    88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888   0  5555  2222 11 2222   555  888 888888  1  11 7 88  44  11 999      2   99  555     4    444  0 5  000 7 7    777  999999 3  3 33   333333333333333   7  7777777777   33     444444444444444444444444444444444       5  44       99 44  5 333      7   3 9 9  33333    6 99 11111 99  55 22       77777 4      3 3  3  3  7  777     66 3 3 3 4444444444         7777 3   3  5  1 3 3  3 8888888   1111111111   7  888  7  3 7 3 9999999999999     4  888888    33  00   6 444  0000    444   55555555 00    0     0 555555  0 0   000000  00   0  0 0   0 55   0    0   0  55        0  5   0  44444         4  33333  7   77 3    4 0    7  7   7          00   66  99   55555     0    111     66         0     5    222       7     0    8     2   66     0 0 88888888     99   0   0  0  999 0   888   99999   777777  99  44444   7 7       7         33333   11111111111111111         999999999      4  0  11111 0     99 0   6666  0     6666  66   333333333333333333 0 7   33  22 22   22  22        3   111111   7 33    7   7   000    777   44    33333   44444444444444    7 777777777777       99 7      7 444444  7  77 7      7 3 7   7   22   888  3     22 888    22  88   7    7  5 00     88888888888888     7      777  7      88    7  7    333  22 7       7  777   22     22   66 66            7  777  7   7           7   222222   22    777             88888888888888888   0 777     2 22   7        8   777  7  3   7777777 0  222222  5   88  8        7  7 888888    7   3333         0        7   777        000               0  7 7      2222222    7  777     4444444 7  333333333333333    4          00000000000  7     22 77    7    777    0 0  0 00   66  0       888888   00        0         0           222  8   0    0  8  88  0  0000        0 000     0       00  0 8  444  8  0  2       22  22        7    777     3   5   22      7   7            5555555555   22  7  777777777    0000000000000000000000000000000000     88     00   22                   22   7            555   7                     22     000     000       0          0     8        000 00  2       2 2222    0    22      0   0         8    8  44   0000000       00    0   0    0    0 0000    000     000     88    555        0        00     0  2222222222222     2222 0       0  222222222     8   5 00000       88  2   2      0  22222222          2222     555555      0   0    2        2     88          5     0     3         3  3        3       3        3     0    7                3          3    3   7       33   3 7  77           3                  3                           7                                   3             7          7                           000      0     0   3 3      3      000      3333333  0      7     0 0                     33333                 0   0   7      3   3      3  3     3      3333  3          777      3     3         3 3  0 7  7     0          0           3    777  3  3      3             00            7               0  2  88888888      0     3   000    77     33333     7   00   000          77                      3               3              3333333333333     3      3   3    3       3         333333333333     3   33      7   3       
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GGTAAGTAA-GT--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT---------TACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--T-CA-T--A-GA----AGA---AA-G-A------TC-AT--C-A--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-A-TAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TA--------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T--AA-CA-ACTGTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----AATTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-T----------AAAGTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----TT--CTA-TG---AA-TG-G-T-T----------T--CTTAGATGTT---TGGTATTGC--TGT-A---CAG---TCAA---ATG----T-A-A--AAAT-GGAAT-T------CA-T-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-GCAG-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCAT-TTAACTTGTGTTTTTGTGT--A--AC-GCCC-AGTTTCAATAGCC-AA-AGA-ATGAGAACTGATTCTGAAAATTTG-----TAAAA-CATTT--CAAGACCTTGAGGATT-ACGAATTTAC-TGGAAAATATTTTTT-CTCTACAGAATCTTG-TTTTG-A-A------T-AATGC--ATA-TGT-TC-GCAAGT-TTG---CCA----CATT----G-TT--TG-TCC-GCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---C--GTGAATATTTA------TAAATCGCTC-AT---G-T-AACTT--A-TTA----GT-AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------ANT-TTT--AT--C--ATG--TA--TAGAACAT-TGT------ATA-T--CTAA-CTT-ATT---CAAA---ATAT-AATG-----AAT----GC--------TACT-A---NT-C-----AACTACT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACA-TTG-TTT--TCA-T-ATACAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-GAAT-CTAC-AAGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TT-CGTAAA--TATT-TA-AAAC---AG--C-TTTTTAT-AA---CAT--CAAAA--TACATA-TGGGAATCGACCA-AG---TT-CAC-CTACAATAGCT-TGA------TTT--GAGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---AATATATA-TTCGAGAGTTTTAATG---TG-CA-TTT-------TNTC------GCAGTA-CATATTTATTAA-AG-A----N-TTTT-CTA-T--ACAATAATCNGGGCGTTT-GACG-GAACTTGTA---TCTGTATTTATTGTTCCC-CCCAAATTTCACATGCATA-AA-G-CAGTA-CT----G-GT-------TT-A----ACTG-TATGATCATA----CAAA---GT-GTATC--AG-GGTG-TGTA---TTTTNGGTT-T--AATA-TT-CCAAAAC-----ACTT--GACTAGTT-TAAAATAAG-CCTTTAAGGCTCTTTTTGTA-AAGA-TCNAA-TTG-AC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATG--AG-TAAAAA-CAATT-CCCAGATATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATT--TGATTT-TTA-TAGAAAAACTTT-------TT-ATC--TG-AT---------TTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAAT-TTT--TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-A-TGA-CAATAGCATTCAAGCTTTTTTAATACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCGGTTT-CAGAAATTAACACT---AAATCATCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAG-GAT-GTGTCACCTAATTTTGC-CGGA-------TTATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AAAGGTTTGGACTTA-GGT-------TTA--CCTCC----C-TGTCTAA-ACG--------CCACCNTTAGG-----TTCAAATGAAACTCGTAAGTTT-AT--------TTTGGAGTTT----TACAG--AT--ATTATG-TTT-GCCATGTACATACTCTTGA-ATGACTTTATAGAAAGGCCCCTTTATGTCAAGT-TG-GTGCAGCC-TGTGTAG-AAGAGCTG-AATGTGAAACGGTATCAAAGGCCTTAGAAAAATCAACA-AAGCAAACGTACAATT--TGGAACTT-AATATTTGTATA-TTTTTGAATAAGGGTTCT-AAGTATAAACATGTGGTCACTGGTTCTGGCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTTATAATATTGTTAGAGTCCAAGTAGTTTCGTAACCTTGTATTCAGTATGCTATTAA--ATACTTT-GGATA-AGCAAAGAAGTT-ATTGTT-A-TCCTCTA---TAGTANTTTGATGGGTCANA-AGGGCTATCATTTTTATGAAT-AGGCTTTAATAAAGCCTATTTCCCACTCCCTTTGGGTATT-TGCCAG-AG-GACAA-GACAAG----AT-TAAATAATTT-T-AGCATATGTGGT-AAAATATAT-GTACGTCGGCTTTCA-ACATCTCATT-TTTAATGCCAT-CTAATCGCA-GCTTGATTTATTATTTTTTAGATGTTTTTATTGCATCGATGATTTTCTTTTCTNTAATTG-A-TAAATCTAAC-GAAGT-AATG--TTGATATTTCTGCTGACTTGGACAANNAATCTTCAAAATATTTAATTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAGATATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGA------------CTTTC-AAACCGAGTTTCCAG-TATGATA
Reference ( family-3541 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GGTAAGTAA-GT--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT---------TACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--T-CA-T--A-GA----AGA---AA-G-A------TC-AT--C-A--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-A-TAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TA--------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T--AA-CA-ACTGTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----AATTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-T----------AAAGTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----TT--CTA-TG---AA-TG-G-T-T----------T--CTTAGATGTT---TGGTATTGC--TGT-A---CAG---TCAA---ATG----T-A-A--AAAT-GGAAT-T------CA-T-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-GCAG-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCAT-TTAACTTGTGTTTTTGTGT--A--AC-GCCC-AGTTTCAATAGCC-AA-AGA-ATGAGAACTGATTCTGAAAATTTG-----TAAAA-CATTT--CAAGACCTTGAGGATT-ACGAATTTAC-TGGAAAATATTTTTT-CTCTACAGAATCTTG-TTTTG-A-A------T-AATGC--ATA-TGT-TC-GCAAGT-TTG---CCA----CATT----G-TT--TG-TCC-GCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---C--GTGAATATTTA------TAAATCGCTC-AT---G-T-AACTT--A-TTA----GT-AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------ANT-TTT--AT--C--ATG--TA--TAGAACAT-TGT------ATA-T--CTAA-CTT-ATT---CAAA---ATAT-AATG-----AAT----GC--------TACT-A---NT-C-----AACTACT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACA-TTG-TTT--TCA-T-ATACAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-GAAT-CTAC-AAGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TT-CGTAAA--TATT-TA-AAAC---AG--C-TTTTTAT-AA---CAT--CAAAA--TACATA-TGGGAATCGACCA-AG---TT-CAC-CTACAATAGCT-TGA------TTT--GAGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---AATATATA-TTCGAGAGTTTTAATG---TG-CA-TTT-------TNTC------GCAGTA-CATATTTATTAA-AG-A----N-TTTT-CTA-T--ACAATAATCNGGGCGTTT-GACG-GAACTTGTA---TCTGTATTTATTGTTCCC-CCCAAATTTCACATGCATA-AA-G-CAGTA-CT----G-GT-------TT-A----ACTG-TATGATCATA----CAAA---GT-GTATC--AG-GGTG-TGTA---TTTTNGGTT-T--AATA-TT-CCAAAAC-----ACTT--GACTAGTT-TAAAATAAG-CCTTTAAGGCTCTTTTTGTA-AAGA-TCNAA-TTG-AC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATG--AG-TAAAAA-CAATT-CCCAGATATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATT--TGATTT-TTA-TAGAAAAACTTT-------TT-ATC--TG-AT---------TTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAAT-TTT--TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-A-TGA-CAATAGCATTCAAGCTTTTTTAATACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCGGTTT-CAGAAATTAACACT---AAATCATCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAG-GAT-GTGTCACCTAATTTTGC-CGGA-------TTATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AAAGGTTTGGACTTA-GGT-------TTA--CCTCC----C-TGTCTAA-ACG--------CCACCNTTAGG-----TTCAAATGAAACTCGTAAGTTT-AT--------TTTGGAGTTT----TACAG--AT--ATTATG-TTT-GCCATGTACATACTCTTGA-ATGACTTTATAGAAAGGCCCCTTTATGTCAAGT-TG-GTGCAGCC-TGTGTAG-AAGAGCTG-AATGTGAAACGGTATCAAAGGCCTTAGAAAAATCAACA-AAGCAAACGTACAATT--TGGAACTT-AATATTTGTATA-TTTTTGAATAAGGGTTCT-AAGTATAAACATGTGGTCACTGGTTCTGGCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTTATAATATTGTTAGAGTCCAAGTAGTTTCGTAACCTTGTATTCAGTATGCTATTAA--ATACTTT-GGATA-AGCAAAGAAGTT-ATTGTT-A-TCCTCTA---TAGTANTTTGATGGGTCANA-AGGGCTATCATTTTTATGAAT-AGGCTTTAATAAAGCCTATTTCCCACTCCCTTTGGGTATT-TGCCAG-AG-GACAA-GACAAG----AT-TAAATAATTT-T-AGCATATGTGGT-AAAATATAT-GTACGTCGGCTTTCA-ACATCTCATT-TTTAATGCCAT-CTAATCGCA-GCTTGATTTATTATTTTTTAGATGTTTTTATTGCATCGATGATTTTCTTTTCTNTAATTG-A-TAAATCTAAC-GAAGT-AATG--TTGATATTTCTGCTGACTTGGACAANNAATCTTCAAAATATTTAATTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAGATATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGA------------CTTTC-AAACCGAGTTTCCAG-TATGATA
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GTAAGTAAAGT--TA----A-TTTTATTCTCCGAA-T-T--TT-G-GG-CCAC-GAAGG---GCAT----------ACAA-G------------ATAT---------A--------------------AAA-AA----CA-C--A-GA----AGA---AA-G-T------GC-AT--CCA--AAT-GA--TGA-AGATAA-AGT--AA-A-TAACA-AAGT---TA-T-GAA--T-A-AATC---AA---T--T-TT-C--TCA---------------ATT-G-----------GAG--CAGCT------ATACTT--------GT-A-------GATTGGCAA-AT--TTCTCAACCT--AA-AC-ACTGTCA-CAT-T-CGAT-----TACT-CCAA-----T--AA--G--CCAAATA-----A-TTTTTC-T-CTGATCTA-CA----AGGT--T-T-AAT----------AAAGTTTTTTA--A-AAC-AAAGT---T-CAAT-------GGAT-----T---CTA-TG---AA-TG-G-T-T----------TGTCTTAAATGTG---TG-TAT-GC--TGT-A---CAA---TCAA---ATG----T-A-A--AA-T-GGAATGT------CA-T-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-GCAG-ACAGCT--ACATTTTC-TCTCAT-T--ACTTGTGTTTTTGTGTTAA--AC-GCCCGAGTTTCAATAGCC-AACAGA-ATGAGAACTAATTCT-AAAATTTG-----TAAAAACATTTT-CAAGAC-TTGAGGATT-AC-AATCT-----GAAAATATTTTT--CTCTACAGAATCTT--TTTTG-A-AC-----T-AATGGGAATAATGT-TC-GCA-GTGTTG---CCA----CATT----GGTT--TG-TCCTGCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---CCAGTGAA-ATT---------AAATCGCTC-AT---GCT-AACTT--T-ATA----GT-AACAA----TTT-GATTACGGA----AT------ATT-TTT--ATATC--ATG--TA--TAGAACATCTGT------ATAGT--CTAAGCTT-ATT---CAAAC--ATA--AATG-----AGA----GC--------TACT-A---GTTC-----AACTACT--T-TGTTTG-T------TA-TCGAA-TACAAT-ACAGTTG-TTTCATTA-T-AT-CAGCA--TAT-TCTT--AA-GAAT-GAAT-CTAC-AGGGGGCGAA----------ATCTA-AAATTC---TT-CGAAAAA-TATT-TA-AAAC---AG--CGTTTTTAT-AAACACAT--CAAAA--TACATA---GGAATCGACCA-AG---TTTCAC-CTACAATAGCT-TGA------TTT--GAG----CCTTTTTAGGTAC----------AGA----CCA-A---AATATAT--TTCAAGAATTTTAATG---TGGCAATTT-------TTTC------GCAGTAACATGTTTATTAA-AG-A----CGTTTT-CTAGT--ACAATAATCAGGGCGTTTTGACG-GAACTTGTA---TCTGTATTTATTGTTCCC-C--AAATTTCACATGCATA-AAAG-CAGTAACT----GTGT-------TTTA----ACTG-TATGATCATA----CA-----GTCGTATC--AG-GGTG-TGTA---TTTTTGGTTAT--AAT--TT-CCAAAAC-----ACTTTTGACTAGTT-TAAAATAAGGCCTTTAAGGCT---TTTGTAGAAGA-TCCAAATTG-AC----AACATGTGTA---AGGAGGCCTGATG--AGGTAAAAA-CAATTGCCCAGATATT---G--TACGATGAACACT---TGTTCTGA--ATT--TGATTT-TTA-TAGAAAAACTTT-------TT-ATC--TG-AT---------TTTT-T-------------ACAACGTTTTTTCTACAGAAATATT-GACAAT-TTT--T-GTCTTTCTGAGGTTGACCAGGA-TAGGCAAAATTTGA-TGA-CAATAGCATTCAAGCCTTTTTAATACAC---CGCTGTGAAGGCCCTCCCCTCGGTTT--AGAAATTAACACT---AAATCATCAGCAT-C----AACATAACA---TTAAGAGATGGTGTCACCT-ATTTTGC-CGGA-------TTATCAT--TATC-GTCGAAAA-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAATATTATTTTAA-AAAGGTTTGGACTTA-GG--------TTA--CCTCC----C-TGTCTTA-ACAC-------CCACACTTA-G-----TTCAAATG-AACTCGTAAGTTTGAT--------TTTGGAGTTT----TAGAG---T--ATTATGTTTT-GCCATGTACATAC-CTTGA-TTGACTTTATA-AAAGG-CCCTTTATGTCAAGTCTGTGTGCAGCCTTGTGTAGAAAGAGCTGAAATGT--AACGGTATCAAAGGCCTTAG-AAAATCAACACAAGC-AACATACAATTGCTGGAACTT--ATATTTGTATATTTTTTGAATAAGGGTTCTAAAGTATAAACATGTGGTCACTGGTTCT-GCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTTAT-ATATTGTTAGAGT-CAAGTAGTTTCGTACCTTTGTATTCAGTATGCTATTAA--ATACTTT-GGAAATAGCAAAGAAGTTGATTGTTAA-TCCTCTA---TA--ATTTTGAT-GGTCATA-AGGGCTATCATTTTTATGAAT-AGGTTTTAATAAAGCCTATTT-CCATTCCCTTTGGG-ATTCTGCCAACAGAAACAACGACAAG----AT-TAAACAATTTATAAGCATATGTGGTAAAAATATAT-GTACATCGG-TTTCA-ACATCTCATT-TTTAATGCCAT-CTAATCGCA-GCTTGATTTATTATCTTTCAGATGTTTTTATTGCATCAATGATTTTCTTTTCTTTAATTG-A-TAAATCTAAC-GAAGT-AATG--TTGATATTTCTGCTGACTTGGACAATAAATCTTCAAAATATTTAATTCTGGGTATCAAATTTACTAATCAATACTGAATAATGTTTGTAAAATGATTTACACCCATTGTTCACTAGATATCTT-ATCGGACT-ATCTTGCGGATTGCTGATTGATTCAAATTCTTTC-AAA---AGTTT-CAG-TATG
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aaAAGTAA-AT--T--------TT-ATA-TCA--A-T-A--TT-T-GG-CC-C-AG------GCAT---------AACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--A-CA-ACAA-GA----AGA---AA---A------CC-ATT-C-ACCAAT-GA--T---AGATAA-CGT--AA-C-TAACA-AAGT---TAAT-GA---T-A-AATC---AA---AATT-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAGAGCAGCT-------TA-TATTAAT---GT-A-------G-TTGGACA-AA--TT---AG--T--AA-TC-GCTGTCA-CATGT-C-ATCTTTATACTGC--A-----T--AAAAG--C-AATTA-----AATTATTC-T-CT-AT-TAACATACCAAGT--T-T-A-T----------AA-GTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----T---CTA-TG---AAATG-G-T-T----------T--TCTTGATGTT----AGTAT-GCCATGT-AACACAA---TCAATG-ATG------A-A--AAAT-GGAAT-TAA----CA-TGCTTATC---AAAGCAC-AG-TACAG-A--CTT-GCAG-ACA-CTTAACATTTTC-TCACAT-TTA-CATGTGTTTTTGTGT--A--AC-GCC--A---TCAA-AGCC-AA-AGA-ATGAGAACTGGTTCTGAAATATGG-----TAAAA-CATTT--CAAGA-CTTGAGGATT-ATGAAgcat
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    taagctaATAGAGCATAA---TT-CCC-CCATAACTGTT-TGG------TTT--GAGG---TCTTCTTGTGTAT----------T------CCATATAGAGTATGTA-CTTGAGGGGTTTAATG---TG-AA-GTT-------TATC------AC--TA-AATA-TGATTCATGG-A----C-TTTT-CAA-C--ATTATAATTTGGGCTCTT-TACATCAGCAGGT----TTTGAATTTGTAGTT--T-CCCAAATT--------ACA-AA-A-CA----------G-GT-------TT-T----ACAG-TGTGATAAAA----AAAAAAGAT-GCAAC--AA-AATACTGGA---ATTTGGCCT-TGCAAT--TT-CAAAAAC-----ATTT--AATTAATT-TAAAGAAAG-CATTCAAACCAC-GCTTATA-CAGG-TCTTG-TTG-ACAATTAACATATA-ATCCAAAGG-CAT--TG--AA-T-ATAC-CA----CGTAAATATTAATGAATAAAA-GA-CAATGAATGTTC-TAT--TTCCTTATCT-TTA-TAAACAAATTTTAAGTTTCTT-ACCTTTGCAT---------TCTTGT-------------AAAA---------------AAAAT--G----T-TGTCCTTGTCTTTTTCAAATTAAC--AGA-GAGACAATGTTT-A-Taa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gTAAGTAA-GT--TA----T-TTT-ATT-TCC--AAT-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT--------------AA------------ATAT---------A--------------------CAT-AAA-C-CA-C--A-GA----AGA---G--G-A------CC-AT--CCA--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-A-TAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TTTC--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TAT-------GT-A---------TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T--AA-CA--CTGTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----ATATTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-T----------AAAGTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGA------TT--CTA-TG----A-TG-GTT-T----------T--CTTAGATG-T---TGGTA-TGC--TGT-A---CAA---CCAA---ATG----T---A--AAAT-GGTAT-T------CA-T-CTT--C---AA--CACAAG-TCCAG-A--CTT-GCAG-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCAC-TT-ACTTGTGTTTTTGTcata
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -T--TT-G-GA-CC-C-AGAGT---GCAT----------ACAAAG------------A-AT---------A--------------------CAT-AG--TTCA-T--A--A----ATA---CA-C-A------TC-AT--A-A--AA---A--T----GATAA-AGT--AATA-TAACC-AGGT---TA-T-GA---T-A-AATC---TATTTT--T-TT-T--TCA---------------ATA-GT----------GAG--CAGC----------------------T-A-------A-TT-------A--TTGTCAA--T--AA-C--ACTGTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----ACTTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---TATGT--T-T-A-T----------AAAGTAATT----A-TAC-AAGGTGT-T-TA-T-------GAA------CT--CTA-TG---AA-TG-G-TGC----------C--CTTAGGTG-T---TGGTA-TGC--TAT-A---CAG---TCAA---ATA----T-ACA--AAAT-GGAAA-T------CA-T-CCT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-ATGCGT-GCGC-ACGCCT--GCAT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               g--TA----A-TTT--TT-TCC--A-A-T--TT-T-TG-CC-C-AGAGG---GCAT----------ACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AAA-C-CA-C--A-GA----AGA---AA-G-A------CC-AT--CCA--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-AATAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TTTC--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TAATTTAT--GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T--AA-CA--CTGTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----AATTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T---C----------AAAG-TTTT----A-TACAAAAGTAT-T-CA-T-------GGATCTATATT--CTA-TG---AA-TG-GTT-T----------T--CTTAGATG-T---TGGT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aaggtagTAAGTAA-GT---A----A-TTT-----TCA--A-T-T--TT-G-GG-GT-G-AGAGG---GCAT---------CATACAA------------ATA-----------------------------------AA--T-CA-G--A-GTTCCTGTA---CA-T-G------TT-AT--CTA--AAA-GG--C---GTATAATATT--AA-A-TTACA-AGTT---TA-T-GA---T-ATAAT----AA---ACTT-TT-C--CCC---------------ATA-AT----------GAA--CAGCTCTAGAGATA-TA--------GGGA-------A-TTGGCAA-AA--TTTCCAT--T--AA-CA-TC-GTCA-CAT-g
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aaA----G-TTT-ATT-CCA--A-T-T--TT-G-GGCCC-C-AAAGG---GCAT---------AATAGAA------------GTA----------A--------------------CA--GC--T-CA-T--A--A----AGA---AA-G-AAATGTCCC-AA--A-A--AAT-GAAGT---GGGAAA-AGTTAAA-A-TATCA-cacacaagtctatgtataactataaaatattcatggactct
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aaagaaaataaatttgagaaaaaatatcaattttgaaataagaaaataaaatttggaaatattcattatgatatctataggtgtaaagataatataCCC-AGTTTAAATAGCC-AA-AAG-ATGAGAACTGATTATG-AAATTTA-----GAAAA-CATTG--CAAGAC---GAGGATT-GCGAA-TTAC-TGAAAAATG--TTTT-CTCTACAGA------------------------AATGC--A-A-TGT-TC-GCCAGT-TTGT--CCA-----ATT----G--T--TG-TCT-GCA-ATTGCCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------CCTTC--ATGAATATTTCTCTTTTTAAATCTATC-AG---A-T-AATTT--A-TTA----GT-AACAA----Ttggaatcacaacttacatgtatgtgg
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tacA-AAGT---TA-TAGA---T-A-A-TC---AA---T--TGTT-C--TCA---------------TTT-GT----------GAG--CAG-T------ATA-TA---------T-A-------G-TTGGCAA------TTTCAA--T--AAGCA---T-TCA-CAT-TAC-AT-----TA-T-C--A-----CTAAA--G--CCAAATAC----AATTTCTT-TACT-AT-TA-CA---CAGGT--T-TTA-T----------AAATTTTTTGCCTA-TAC-AA-GTAT-TTCA-T-------GGAT-----TCTGCT--TG---AA-TG-G-T-T----------TTTCTTA-ATGTT----GGTATGGC--TGTTA---CA----TCAA---ATG----T-A-A--AAata
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TGGCAACGA--TTTT-AA--T--AA-CA--CCGTCA-C-T-T-C-AT-----TGCTTC--A-----T--A---G--CCAGGTA-----AAGTT----------------------GTT--T-T-A-T----------CAAATTCTT----A-T-C-AATGTGT-T-CA-A-------GGA----------CTGGTG---AA-TG-G-T-T----------TT-CGTACA-GTTGAATGATAT-AC--AAT-A---CAG---TCAA---TT---------A--CAAT-GGAAT-T------CA-T-CTT-------A--CAA-AGTT-CAGCA--TTT-ACAG-ACA-GT--GCATTTTCTTTTCATATTACC---CGTTTTTG
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  acGGTAAGTAA-GT--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT---------TACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--C-CA-C--A-GA----AGA---AA-G-A------CC-AT--C-A--CAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-T-TAA-A-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TA--------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAAA-T--AA-CA-ACTGTCAGCAT---C-GT-----TACT-C--A-----T--AG------CAAA-A-----AATTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-T----------AAAGTTTTC----AATAA-CAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----TT--CTA-TG---A--TG-G-T-T----------T--CTTAGATGTT---TGGTATTGC--TGT-A---CAC---TCAG---ATG----T-A-A--AAAT-GGAAT-T------C--T-CTT------AA--CAC-AG-T--AG-A--CTT-GCAGGACA-CT--ACATTTTC-TCTCAT-TTAAATTGTGTTTTTGGTT--AGTAC-GCCCCAGTTTCAATAGCCCAA-AGATATG-GAACTGATTCTGAAAATTTG-----TAAAA-CATTT--CAAGACCTTCAGGATT-ACGAATTTACATGAAAAATATTTTTTTCTCTACAGAATTTTG-TTTTG-ATA------C-AATGA--ATA-TGT-TC-GCAAGT-TTG---CCA----CATT----G-TT--TG-TCT-TCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---C--ATGAATATTTA-------AAATCGTCC-AT-----T-AAACT--A-T-A----GT-AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------AAT-TTC--AT--C--ATG--TA--TAGAACAT-TGT------ATA-T--CTAA-CTT-ATT---CAAA---ATATTAATG-----AAT----GC--------TACT-A---GT-C-----AACTACT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACA-TTG-TTT---CA-T-ATACAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-GAAT-CTAC-AGGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TT-CGTAAA--TATT-TT-AAAC---AG--C-TTTTTAT-AA---CAT--CAAAA--TAC-TA-TGGGAATCGACCA-AG---TT-CAC-CTACAATAGCT-TGA------TTT--GAGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---AATATAT--TTCAAGAATTTTTATG---TG-CA-TTT-------TTTC------GCAGTA--GTATTTATTAA-AA-A----G-TTTTTCTA-T--ACAATAATCCAGGCGTTT-GACG-GAACTTGTA----CTGTATTTATTGTTCCCACCCAAATTTCACATGCATA-AA-G-CAGTA-CT----G-GT-------TT-A----GCTGCTATGATCATA----CAAA---GT-GTATC--AG-GGTG-TGTA---TTTTTGGTT-T--AATA-TT-CCGAAACCAAAAACTT--GACTAGTT-TAAAATAAG-CCTTTAAGGCTCTTTTTGTA-AAGA-TC-AA-TTG-AC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATG--AG-TAAA---CAATT-CCCAGATATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATT--TGAATT-GTA-TAGAAAAACTTT----------ATC--TG-AT---------TTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAAT-TTT--TTGTCTTTCTGGGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-A-TGA-CAATAGCATTCAAGCTTTTTTA-TACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCAGTTT-CGAAAATAAACACT---A--TT-TCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAG-GAT-GGTTCACCTAATTT-GT--GGA-------TTATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AATGGTCTG-ACTTA-GGT-------TTA--TCTCC----CGCGTCTAA-AC----------CACCTTTAGG-----TTCAAATGAAACTCGTAAGTTT-AT--------TTTGGAGCTT----TACAG--AT--ATTATG-TTT-GCCATGTACATACTCTTGG-ATGACTTTATAAAAAGGTCCCTTTATGTCAAGT-TG-GTGCAACC-TGTGTAG-AAGAGCTG-AATGTGAAACAGTATCAAAGGCCTTGGAAAAATTAATA-AAGCAAACATACAATT--TGG-ACTTAAATATTTGTATA-TTTTTGAATAAGGGTTCT-AAGTATAAACATGTGGTCACTGGTTCTGGCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTAATAATATTGTTAGAGTCCAAGTAGTTTTGTAACCTTGTATTCAGTATGCTATCAA--ATACTTT-GGATA-AGC-AAGAAGTT-ATTGTT-ATTCCTCTATACTAGTAGTTTGATGGGTCATA-TGGGCTATCGTTTTTATGAAT-AGG-TTTAATAAAGCCTATTTTCCA-TTCCTTTGGGTATT-TGCCAG-AA-GACAA-GACAAG----AT-TAAATAATTT-T-AGCATATGTGGT-AAAATATAT-G-AC-TTGGCTTTCA-ACATCTCATT-TTTAATGCCATCCTAATC-CA-GC-TGATTT-TTATTCTTTAGATG-TTTTATTGCATCAATGATTTTCTTTTTTTTAGTTGTACTAAATCTAAC-GAGGTAAATGTTTTGAT-TTTCT--T--CTTGG-CAAGTAAT-TTCAAAATATTT-ATTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAG-TATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGA------------CTTTC-AAACTGAGTTTCCAGTTATGATA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTTTTGTAATCG-A-TA--TGTAGCTGTAGT-AAT---CTGA-ACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--AAAATATTTA-TTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAGATATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGA------------CTTTCAAAACCGAGTTTCCAG-TATGATA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  T--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATT--TGAATT-GTA-TAGAAAAACTTT-------TT-ATC--TG-AT---------TTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAA--TTT--TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-A-TGA-CAATAGCATTCAAGCTTTTTT-ATACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCAGTTT-CAGAAATTAACACT---
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                --TA----A-TTT-ATT-TCA--AAT-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCATAACATGGAATACAGAGTTC---------ATAT---------G--------------------CATGAA--T-CA-T--G-AA----AG-----T-G-A------TCAAT--C-A--AAA-GA--T---CAATAA-AAT----------------T---TA-C-GA---T-A-AATC---AA---C--TCTT-C--TCT---------------ATA-AT----------GAG--CA-C------------------------------------------AA--TTTCCTG--T--AA-C--ACCGTCA-AAT-T-C-GT-----TACT-C--A-----T--A
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gtacatgTCAGACAGGGCTATCATTCTTATGAATTA--CTTTGATAAAGCCTGTATCCCACTCC-TTTGAATATT-TGCCAG-AG-GACAA-GATAAATTACATGTAGATAATTT-C-AGCAAA--TGGT-ACAATATGTGGTACGGTGGCTAGTA-ACATTTCATT-TTCATTG
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TAAATAA-GA--AA----AGTTT-ATT-CCA--A-T-T--TT-G-GG-CC-CAAGAGG---GCAT---------AATAGAA------------GTATTATTTAAAAA--------------------CAT-----T-CA-T----GA----AGA---AA-G-A------
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    agtttaTAA-GT--TA----A-TTC-ATT-TTC--A-A-AAATT-GCGG-CC-C-AGAGGAATGCAT---------TACAGAG------------ATAT---------AAGGTTCAAATA---------CAG-AA--T-AA-T--A-AA----AGA---AT-G-A------TT-TC--C-A--AAA-GA--T---AGATAA-AGT--AG-A-Taatgtccaaaaagaaggaagaaattattttttacaatattataacatacatggatgtgg
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        agaTT-ATT-TCCA-A-T-T--TT-G-GC-CC-C-A-AGG---GCAA---------TA-AAAGAATACCAGGTTCACAT---------A--------------------CATAAA--T-CA-T--A-AA----AGAGCTAA-C-A------TT-AT--CTA--AAT-GA--T---AGATAC-TATA-AA-A-TAACA-AGGT---TA-T-ggaatgtgatttggtcaatca
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aagtagtattaaagtaAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA-------------------------A-G-A------CC-AT--CCA--AAT-GA--TTATAGATAA-AGT--AAGA-TTACA-AAGT---TA-T-GA---TTA-AATC---AA---A--T-TT-CC-TCA---------------ATTTGT----------GAG--CAGCT------ATA-c
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTTCAGACATTTCATTATTTTATCCCAC-CCAA--ACATGCTTGATTTATTATTTTTTAGCT-TTGTCACGGCAGAGATTATTTCCTTTTCTATATTT--------CCTAAC-Ggttgtgtgttaaattgg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cacaggTAAGTAA-GTAATATCTTA-TTT-ATT-TCC--AAT-T--TT-G-GG-CC-C-AG-GG---GCAT----------ACAA-G------------ATAT---------AAC------------------CAT-AAACT-CAAC--A-GA----AGA---AGTGCA------TC--T--C-A--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AACA-TAACATAAGT---TA-T-GGGACT-C-ACTCACAAA---A--T-TT----TCATGACACAGTACACTGATT-GTTACCTGATACGAG--CAGCT------GCA-TACACTCACTGT-A-------G-TTGGCAA-AATTTTTTCAA--TTAAA-CACACGTTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAACATCCACGATTTTCT-C-CT-AT-TA-AA---CAGGTGATAT-A-TACCTCCGATAAAAGTATTT----A-TAC--AAGTATAT-CA-TCATACAAGGA------TT--CTATTGTGTAA-TGTG-T-TTATAAAATTAT--CTTAAATG-T---TGGTA-TGC--TGT-A---CCGGCATCAATTCATGGCTAC-A-AACAAAT-GGAAC-TTGGAAACA-T-TCT--CCCAAA--CAG-CG-T-CAGTA--CTTAACCG-ATA-CTCGACACT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           acccacgggtaATTCCAAAAACTTACTAAATGAAA-CAATTGCCAAGAC-TTGAGGATTCACGAATT-AC-TCGAAAATATTTTTC-CTCTACAGAATCTTG-TTTTGAA-A------TGAATGA--ATA-TGT-TC-GCAGTT-TTGCCACCA----CATTGGGGG-TTAATG-GTC-GCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACAAATGCCGCACC---T--GCGAATAATTA------TTAATCGCTC-ATAGCG-TGGACTTTAA-TTAAAAGATAAACAAGTTTTT--GAC-AC--A----ATTATTCCATT-GTTCAAT--C--ATGACTAATTAGAACAT-TGTA-----ATA-TC-CTAA-CTT-ATTTAACAAAAATATAT-AATG-----AATG---GCGGTAACTGTAGT-ATCTTT-CCACAAAATAACTAAT-TTGTTG-TTCACTATA-TCCTA-TACACT-CAA-TTGATTT--TCAGT-ATACAGCAGTT-C-TCTTGAAA-TAATCGAAT-CTACAAAGGGG---A----------ATCTA-AAATTCTCTTC-CGAAAA--TATTGTACGAACATAAGATC-TTTTTAT-AA---CAT--CAAAATTTACATAGTGGAATTCGACCA-AGTTTTT-CACGCTACAATAAATCTGAAGACCCTTTTGGAGGTATCCTTTTTATGTAC----------AAGTAACCTACA---AATAT-TATTTCAAGAGACTTTATGTTTTG-CA-TTTGGTTTAATCTTACAATAGCAGTA-CAT-TTTATTAA-AG-AAGACC-TTTT-CTA-TACACAATAAaccaatggtttaaacattcttttaaatctattttatctatctcaataatgtttccttgctgtaggacgcccggacgcagggaatttcaataaatgcctataagaaatgaaggctcttggatgatgagagagaactgattcatatttaccccacaacgattatttgtattccaaaaacttactaaatgaaacaattgccaagacttgaggattcacgaattactcgaaaatatttttcctctacagaatcttgttttgaaatgaatgaatatgttcgcagttttgccaccacattgggggttaatggtcgcaatgtctgaaagtgtactacaaatgccgcacctgcgaataattattaatcgctcatagcgtggactttaattaaaagataaacaagtttttgacacaattattccattgttcaatcatgactaattagaacattgtaatatcctaacttatttaacaaaaatatataatgaatggcggtaactgtagtatctttccacaaaataactaatttgttgttcactatatcctatacactcaattgattttcagtatacagcagttctcttgaaataatcgaatctacaaaggggaatctaaaattctcttccgaaaatattgtacgaacataagatctttttataacatcaaaatttacatagtggaattcgaccaagtttttcacgctacaataaatctgaagacccttttggaggtatcctttttatgtacaagtaacctacaaatattatttcaagagactttatgttttgcatttggtttaatcttacaatagcagtacattttattaaagaagaccttttctatacacaataaatggacaggggcccaaacgttgtatat
gi|30                         : acccacgggtataagtaagtaatatcttatttatttccaattttgggcccaggggcatacaagatataaccataaactcaacagaagaagtgcatctcaaatgatagataaagtaacataacataagttatgggactcactcacaaaattttcatgacacagtacactgattgttacctgatacgagcagctgcatacactcactgtagttggcaaaattttttcaattaaacacacgttcacattcattactcataagccaaacatccacgattttctcctattaaacaggtgatatatacctccgataaaagtatttatacaagtatatcatcatacaaggattctattgtgtaatgtgtttataaaattatcttaaatgttggtatgctgtaccggcatcaattcatggctacaaacaaatggaacttggaaacattctcccaaacagcgtcagtacttaaccgatactcgacactaccaatggtttaaacattcttttaaatctattttatctatctcaataatgtttccttgctgtaggacgcccggacgcagggaatttcaataaatgcctataagaaatgaaggctcttggatgatgagagagaactgattcatatttaccccacaacgattatttgtTAAGTAA-GT---A----A-TTC-ATT-TTC--A-AAT--TT-G-GG-CC-C-AGAGA---GCATACAGAGAA-TACAGAGTTC---------ATAT---------A--------------------CATGAA--T-AA-T--A-AA----AGA---AT-G-A------TT-AT--C-C--AAA-GA--T---AGATAA-AGatggacaggggcccaaacgttgtatat
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       c-AA--T-CA-T--A-AA----AGA---GA-G-A------TT-ATCCC-A--AA--GA--T---AGGTAA-CGTG-AA-A-TAAC-----T--------------------------------T-TT-C--TCA---------------GTA-AT----------GAA--CAGCT------ATA-T-------------------------GCGT-AA--TTTTCAA--T--GA-CA-
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             attagatgGTAAGTAA-TT--TT----T-TTT--TT-TCA--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGGGG---GAATACAAAGAA-TACAGAGTTT---------ATCT---------A--------------------CATAAA--T-CA-T--A-GA----AGA---GA-G-A------TT-AT--C-C--AAttgt
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aACTTGTA---TCTGTATTTATTGTTCCC-C--AAAT----------------G-CAGTA-CTTACCG-GT-------TG-A----CCTG-TATGATCATA----C-AA---GT-GTATC--A--GGTA-TGCA---TT
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TCAGTATGCTATTAC---TCCTTT-GGATA-AGCAA-GAAGTT-ATAGTT----CTTCT------GTAATGTGATGGGTCAGA-AGGACTATCATT
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -TTT-ATT-CCA--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---ACA----------TATAAAA------------GTA
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       acacgT------ATA-T--TTAA-CTT-ATT---CAAA---ATAT-AATG-----AATCAATGC--------TACT-A---CT-CC----AACTACT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACatgatagttttataaagttgaaaacatatct
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTTTT-CCCTTGAAAAGCTTC-TTTTG-A-ATAGGCCT-AATCC--ATA-TGT-TC-GTAA-C-TTG---CC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   taGTAAGTAA-GT---A----A-TTT-ATT-TCC--AAT-T--TT-G-GG-TC-C-AGAGG---GCATACAAAGAA-TACAGAGTTC---------ATGT---------A--------------------CAT-AAG-T-CA-T--A-AA----A-A---GA-G-A------TT-AT--CCA--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-AATAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---CT-T-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------------------------------------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T--AA-C--ACTGTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----TTTTTTTC-T-CT-AT-TG-CA---TGGGT--T-T-A-T----------AAAGTTCTT----A-TAC-AAAGTGT-T-CA-T-------GGA------TT--CTA-TG---AA-TG-G-T-T----------TTCTTTAG-TG-T---TGGTA-TGC--TGT-A---CAG---TAAA---ATA----T---A--AAAT-GGAAT-T------CA-T-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-GCAG-ACA-CT--ACATTTT-------T-TTG---TGTG----TGTGT--A--AC-GCCC-AGTTTCCATAGCC-AA-AGA-ATGAGAACTG---------------------AAA-CATTA--CAAGA-CTTGAGGATT-ACGAA-TTAC-TGAAAAATA-CTTTT-CTCTTCAGAATCTTG-TTTTG-A-A------T-AATGC--ATA-TGT-TC-GC-AGT-TTG---CCA----CATT----G-TT--TG-TCT-GCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---C--ATGAATATT--------TAAATCGCTC-AT---G-T-AACTT--A-TTA----GT-AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------AGT-TTT--AT--C--ATG--TA--TAAAACAC-TGT------ATA-T--TTAA-CTT-ATT---CAAA---ATAT-AATG-----AAT----GC--------TACT-A---ATCC-----AAATGCT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACA-TTG-TTT--TCA-T-ATACAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-AATT-CTAC--AGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TT-CGTAAA--TAAT-TA-AAAC---AG--C-TCTTTAT-AA---CAT--CAAAA--TACATA--GGGAATCGACCA-AG---TT-CAC-CTACAATAGCT-TGA------ATT--GAGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---TATATAT--TTCAAGAATTTT-ATG---TG-CATTTT-------TTTT------GCAGTA-CAT-TTTATTAA-AGAA----G-TTTT-CTA-T--ACAATAATCAGGGCGTTT-GACG-AAACTTGTA---TCTGTATTTATTGTT-CC-CCCAAATTCCACATGCATA-AG-G-CAGTA-CT----G-GT-------TT-A----ACTG-TATGGTCATA----C-AA---GT-GTATC--AG-GATA-TGTA---TTTTAGGTT-T--AATATTT-CCAAAAC-----ACTT--GGCTAGTT-TAAAATAAG-CATTTAAGGCT-TTTTTGTA-AAGA-TCAAA--TG-AC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATG--AGATAAAAA-CAATC-CCCAGATATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATC--TGATTTGTTA-TAGAAATTTTTT-------TT-ATC--TG-ATTTTTTACCGTTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAA--TTT--TTGTCTTTTTGAGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-----A-CAATctt
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AGCT------ATA-TAT-------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAG--T--AA-C--GCTGTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CC
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TCACCTAATTTTGC-TGGA-------TCATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAGAA----TGGT---AGATT---AT
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aT-TCC--AAT-T--TT-G-GGTCC-C-AGAGG---GCAT---------
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -AT---G-T-AACTT--A-TTA----GT-AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------AAT-Taatatactcaa
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATAATCAGGGCGTTT-GACG-GAACTTGTA---TC
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GGTAAGTAA--T--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TTCG-GG-CC----GAGG----CATA--------CACAAAG------------A-AT---------AAGAGTTGAGAAGTTCAATTTCAT-AAA-T-CA-T--AAGA----AGAG--AA-G-A------TT-AT--C-A--AATTGA------AGATAA-A-T--AA-A-TA-CA-AGGTCTATA-T-GAA--T-A-AATC---AA---C--T-CT-CCTTCATCC------------ATA-GT----------GAG--CAGCT------ATACTA--------GT-ATCAGTAAG-TTGGCAA-AA--TTTTAAA--T--AA-CA--CTGTCG-CAT-C-C-AT-----TGCT-C--AATATTT--AA--AGCCCAATTA-----AATTTTTCAT-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-CTAA-------AAAGTTCTT----A-TAC-A--GTGT-T-CA-T-------GGAT-----TT--G-A-TG---AA--G-G-T-T----------T---TTAG-TGTT---C--TAT-GC--TAT-AA--CAG---TCAA---ATA----TTA-A--CAATTAGAATGT------CAAT-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-ACAA-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCAT-TTAACT--TGTCTTTG-GT--A--ACAGCCC-AGTTTC-GTAGCC-AA-AGA-ATGACAACTGA-TCTG-AAATTTG-----TAAAA-CATTG--CCA-ACGTAGAGGTTT-ACGAA--TAC-GTGAAAATAATCTTT-CTCTACATAAACTTGATTTTG-A-ATAGCC-T-AATGC--ATA-TGTGTCGGC--GT-TTG-----A----AATT----GCTT--TGTTCT-GCA-A-TGGCGGA----TGTCCT-----A-A----------C---C--ATGAATAATT-------TAA--CATTCTATG--G-T-AACTTC-ATTTA----GT-AACAA----TT---ATAAC--ATTACAT------ACTGTTT--AT--CTAATG--TA--TAGCACATATGT------ATA-TACTTAA-CTT-ATT---CAAA---ATA--AATGAAATCAAT----TC--------TACT-A---TC-C-----CACTACT--TGTTGTTGAT------TATTC--ACTACAATGAGA-TTG-TTT--TCA-CAATACAGCA--T-TATCTC--AATTACT-GAAT-TCTC--AGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TTGTGTAAAATTATT-TA-AAACT--AG--C-TTTTAATAAA---CAT---AAAA--TA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aCATA-AA-GGCAGTA-CT----G-GTCCGTTCGTT-ACATTACTGATATGATCATAACACCAAG---TT-GTATCTCAGCGGTG-TGTACTTTTTTCG--C-T--AATA-TTTCCAAAAC------CTT--GACTAGCTCTAAAATAAG-CCTTTAAGGCTCTTTT-GTA-AAGAATCAAA-TTGGAC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATGCAGG-TAAAAAACAATT-CC-AGAGATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTCAGATGATT--TGATTT-TTAATAGAAAAACTTT-------TTTATC--TG-AT---------TTTT-CTTACCGTTTTTTTACAG---------------AATATATGACAATGTTT--TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGAATAGGCAATATTT-ACTGAACATCAGCATTCAAGCTTTTTTAATACATACCCGCTG---AGCCCCT-CCCTCGGTTTTCAGAA-TTAACACTGAAAAATCATCAGCATACCACGACTA-AACACATTTAAGCGAT-GTGTCACCTAATTTTGCGCGGGATAATATTTATCATTATATCAGTC-GGACAATAG-ATATCTGGTTCAGGATCCATGTCGAGTTTAT---TATTTTAACAAAGGTTT-GACTTACGGTACTTCTGTTACTCCTCCCGGGC-TGTTTAG-ACGACTCCACTCCACCGTTAAGGCCTTTCCACATGAAATTCG-AAGTTT-ATATCTGTTGTTCGGAGTTTGTGGTACAGTTATTAATTATG-TTTGGCCA-GTACATACTCTTGACATGACTTTATAGAgt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTTTT-CCCTTGAAAAGCTTC-TTTTG-A-A------T-AATCC--GTA-TGT-TC-GTAA-C-TTG---TCCTTTTCATT------TT--TA-----GCACA-T-TCTGACAAAT-TACTTTGCCATA----------CA--T--GTACATATTAA------TAAATCTTTT--T---C-T-AAGTTC-A-TTA-------AACAC----TTTTGAT-T--------GT------AGA-TCTGAAA--C--TTG--AA--AAAGATGT-TATCGCAGGATA-TG-CCAA-GTTGATT---CAGT---AAAA-AATA-----AAC----AC--------TGCTCA---AC-C-----AACAATT--C-TTTTTG-T------TA-TC--A-TTCAAA-A------------TCA-T-AT--------T-T-TCTT--GA--AGT-GCACACT-C-AAGCAA---AGTATCATTTGATTTATGAATGT---GT-TGTAAA--TATT-TA-A--C---AG--T-ATTGGAT-AA---GGTTTCAATA--TATA-A-TGGATGCCTACCT-AA---TT-CCC-CCATAACTGCA-TAG------TTT--GAAG---CTTTCTTATGTACCCCCCGGTGTA------CCCCA---CATATGTA-CTTGAGAGTTTTAATG---TG-AA-GTT-------TATC------ACTATA-TATATTTTTCAT-TG-A----G-TTTT-CAA-T--ATTATAATTTGGTCTCTT-AAC---AA-TAGCAGATTCTGAATTTATAATT--C-CCCAAATTTCACTTCCATATAACA-CAATA-------G-GT-------TT-T----ATTG-TGTGATCAtgtaattcatcggccattcatcgtttcacttctagtcgaagttgtgtcgcaagccttgtg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aggta-TGA-TAGTAGCGTTCAAGCTTTTTT--------------G---AAGTCTT-CCTTCAGTTT-CAGAAATTAACACT---AAGTCATCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAA-GAT-GTGTCACCTAATTTTGC-TGGA-------TCATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TC--------TC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AAAGATTTGGACTTA-GGT-------C-G--TCTCC----C-TGTCTAACAC---------CCACC-TTAGG-----TTCAAAT--------------T-AT--------TTTGAAGTTT----TACAG--AC--AGTATG-TTT-GCCATGTACATACTTTTGA--TGACTTTATAGAAAGGCCCCTT-ATGTCAAGC-TG-ATGCAGCC-TGTGTAG-AAGATCTG-AATGTAAAACAGTGTCAAAAGCCTTAGAAAAATCAACA-AAGCAAACGTATAATT--TGGAA-TT-ATCATTTGTATA-TTTTTGAATAACGGTTCT-AAGTATAAAAATGTGGTCACTAGTTCTGGCTTTTGGTTGAAAACCAATTTGAACTTTATTTATAATGTTGTTCGAGTCCAAGTAGTTTTGTAACCTGGTATTCAGTATGCTATTAAATATACTTTGGGATA-aaaagatgcaacaaaatgccggcatt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             caaaattaggAAGTAA-AT--T--------TT-ATA-TCA--A-T-A--TT-T-GG-CC-C-AG------GCAT---------AACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--A-CA-ACAA-GA----AGA---AA---A------CC-ATT-C-ACCAAT-GA--T---AGATAA-CGT--AA-C-TAACA-AAGT---TAAT-GA---T-A-AATC---AA---AATT-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAGAGCAGCT-------TA-TATTAAT---GT-A-------G-TTGGACA-AA--TT---AG--T--AA-TC-GCTGTCA-CATGT-C-ATCTTTATACTGC--A-----T--AAAAG--C-AATTA-----AATTATTC-T-CT-AT-TAACATACCAAGT--T-T-A-T----------AA-GTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----T---CTA-TG---AAATG-G-T-T----------T--TCTTGATGTT----AGTAT-GCCATGT-AACACAA---TCAATG-ATG------A-A--AAAT-GGAAT-TAA----CA-TGCTTATC---AAAGCAC-AG-TACAG-A--CTT-GCAG-ACA-CTTAACATTTTC-TCACAT-TTA-CATGTGTTTTTGTGT--A--AC-GCC--A---TCAA-AGCC-AA-AGA-ATGAGAACTGGTTCTGAAATATGG-----TAAAA-CATTT--CAAGA-CTTGAGGATT-ATGAAt


blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .  AATATCTTA    .   .  CA  A A AA  C C  C  . A     AAT    ACACAAAGAATAAGAGTTGAGAAGTTCAATTT                                 G  ACT   ACA  AG TCCT   GCT  TGC AATGTC  A  CC C CC  TT  AG TAT      T   TA  TA      T    CTA  A A  GAC T T    ACA  TTTT   G  T CT   TGACACAGTACACTG   T  TACCTGATAC   AG     GCATACACTCACTGTAG                       C  TT       A  TA  G ACA      G   G A .  CTTTA    G .  ATATT TA  AA GC       TCCAC A      A A  .  .  A  TAC     GA A T . ACCTCCGATA         GCCT A   A       A T  . CATACAA   TCTATATT     G  TGT  A  T T G TATAAAATTAT          TTGAAT    TG  CA   T ACA  GGCA    TTC   GCTACA   AC    T     G TGGAAA  A G   CCCA    AG   A  T A   C TG   A    G   C  TA        T      A  AAATT         T  AGT    A   CC G    A T    C  .   T          GT   GA  TA   CTAAA     .    TGC     CC         C     T    ATG       T     T          T   GA     A T TAGGCCT      .    .   G  G  CAG .   CCA   TTTTC   GGGGG   AA  TTCT    C T       C         TTGCC   AATGCCGCACCT              TCTCTTTTT         T  AGCG  G     TA T   AAAG  A     GTTT  TT   ACAATTATTCC        A G   CA  .  TA   AC  AT        A   CGCAGG   . AC    .   G   TAA    AAT   TT    AAATC   GGCGGTAACTG       C TCTTTCCACAA        AA G      A TCACTA  T  CT C      G C .   A   .    GT   A     GT TA     GA  TT   C    A  A AA     AGTATCATTTG        T      TCT  G      AT    G  C    ATA  AT .       A  .     TT     TT   AT GT            T  TTT  .   G           C   AGACCC   TG    TAT             CCCCCGGTGTA         T TAG     G AT            A   TTT  .  T   GGTTTAA A  ACAATA  A   A   A        T  A AGACC     T   TAC          T        .   ATC        GAT               C  A C      TCACATG    T  GG      CTTACC  .  CCGTTCGTTACATT     C          ACACCAAG     .     TC GC    C    CTT    G C  . GC   AT  T       CAAAAA   .         C         .           CTT      .    A  T  T   G  AATT        . TCC     .       CA  A    AAA     .  T       AA  AA        .    GAA     A   G   CC      G   A            AAGTTTCTT    TT  C  TTTTTACCG    CTTACCGTTTTTTTACAG                     AT     TG   CC                   .    A            AC    A                     AA     ACC     .         .          T              GAA AA  A       A CACG    .    CA      C   .                 GC   ATAATAT       TA    A   .    A    A TATC    TCA     CAT     GT    .          C        GG     C  TACTTCTGTTACT     CGGG G       C  GACTCCACT     T   G GCCTT       GA      T      .  ATCTGTTG          GTGG     TTATTA      .   G    T        T     CA          A     T     T         .  .        .       .        .     G                     A          .    A           .    A C  AA           .                  .                           G                                   A             C                                      ATA      G     .   A A      .      AT       ATACTAG  G      G     T C                     AGG                   T   C   C      T   .      .  .     .      TTAC  G          T        T     .         G T  G    C     G          A           C    TC   T  T      A             G                             T  G  GTACTAAA      T     A   GTT    T      NNNNN     N   GT   TT           A                       .               .              .                 A      A   .    A       .         .                A   CT      C   T
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .  AAAG         .   .  A   A . .   . .  T  . .     .      AACATGGAATACAGAGTTCATATG                                         A  AC    ACA  G  .      G    G   .       .  T  C CC  T   .  .        .   A   AA      .    .    A .  A   . .    .    AAT    C  T C    TCC               .  .            AG     ATACTAGTATCAGTAAG                       .  .        .  .   . CG       .   G . .  CTTTA    T .  .     .   AA .        C     T      . .  .  .  A  TAC     .  . . . TAA                .    .   .       . .  . .         TTCTG        T  .    A  . T . TTT                  TTT       TT  CA   . ACA  A       TG    TAC      .     .     . AA      . G   ATC     AG   .  . C   T .    .    .   .  CG        .      .  ACAT          T  A      .   C  G    A T    .  .   .          AT   GA  AT   .         .    T       CG         .     T    TG        T     .          T   G      . . TAGCCT       .    .   .  .  AAG .   T     C       GC      .   TCT     . .       .         .       CCTTC                     TAT               .  GG    .     C  .   .     .     .     .    AACATTACAT         T .   GA  .  .    .   .         .   A        . C     .   .   .      .     T     .       CAATGC            . CTCC               .  .      . .       .  .  .      . A .   .   .    CA   A     .  T      .   T    .    .  A A      A                  .      .    .      .     .  .    T    .  .       .  .     .      .    AT T             .  .    .   .           .   .        .     .               AAGTAAC             C .       A A             T   .    .  .   .       T  .       A   C   A        .  . C         .   C            C        .   GG         .                 C  . C      CCACATG    .  CA      CT      .  TTT                A          AAAAAAG      .     .  A     .    .      T G  . .    A   .       A        .         .         .           CTT      .    .  A  T   .  .           . .       .       .   .    AC      .  C       .   .         .    .       .   G   .       .   .            TTT          .   .  .            GTAAAA                                 .      T    .                    .    .            A     .                     A      .       .         .          .              .   AG  A       A .       .    A       .   .                 T    .             .     .   .    .    . .       .       .       .     .          .        G      .  TTTA              .    .       .  .             G   A .           GA      .      .  .                 .        AT          .   .    T        T     A           G     C     .         .  .        .       .        .     A                     A          .    A           .    . .  A            .                  .                           G                                   A             C                                      A        .     .   . .      .      .        G        A      G     G .                     TAC                   C   .   .      T   .      .  .     .      .     .          C        .     .         . .  .    C     .          .           .    A    .  .      .             T                             G  A  GATA          .     .   .      A      T         .   NN   NN           A                       .               .              .                 .      A   .    A       .         .                .   CC      C   .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .  TAT          .   .  C   A . .   . .  .  . .     .      TACAGAGATATAAGGTTCAAATA                                          G  TT    AC   G  .      .    C   .       .  T  T .   T   .  .        .   G   GA      .    .    . .  .   . .    .    ACT    .  . .    .                 .  .            .      CTAGAGATATAGGGAA                        .  .        .  .   . AT       .   . . .  .        G .  .     .   .  .        .     C      . .  .  .  .  .       .  . . . .                  .    .   .       . .  . .         TTT          .  .    .  . . . TTC                  TTC       T   .    . A    A       TG    TTA      .     .     . AA      . .   ATC     .    .  . A   . .    .    .   .  TA        .      .  ACTT          G  A      .   C  G    A T    .  .   .          AT   AA  AT   .         .    G       C          .     .    TC        A     .          G   G      . . TG           .    .   .  .  AGT .   .     C       G       .   TCT     . .       .         .       CAT                       AAT               .  A     .     C  .   .     .     .     .    ACAAT              G .   .   .  .    .   .         .   .        . G     .   .   .      .     T     .       GC                . ATCC               .  .      . .       .  .  .      . C .   .   .    T    A     .  C      .   T    .    .  A A      A                  .      .    .      .     .  .    .    .  .       .  .     .      .    T  T             .  .    .   .           .   .        .     .               T                   C .       A A             T   .    .  .   .       C  .       A   C   A        .  . G         .   T            A        .   GA         .                 .  . C      TCACTTC    .  A       CT      .  TTA                .          CAAA         .     .  G     .    .      A G  . .    A   .       A        .         .         .           CG       .    .  A  T   .  .           . .       .       .   .    AA      .  C       .   .         .    .       .   G   .       .   .            TT           .   .  .            CACAA                                  .      T    .                    .    .            A     .                     A      .       .         .          .              .   .   .       A .       .    A       .   .                 T    .             .     .   .    .    . .       .       .       .     .          .        G      .  TCG               .    .       .  .             .   G .           .       .      .  .                 .        AC          .   .    .        T     .           G                                                                                                                                                                                                                                                                         .        .     .                                                  G .                                                                                                                                               .          .                                                                           A  T  .             .                                                                                                                                                                                                    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .  TAA          .   .  C   A . .   . .  .  . .     .      TAAAAGAATACCAGGTTCACATA                                          A  AC    C    G  .      .    G   .       .  .  T .   T   .  .        .   .   CA      .    .    . .  .   . .    .    AAT    .  . .    .                 .  .            .      ATATAATTTATGTAG                         .  .        .  .   . AA       .   . . .  .        . .  .     .   .  .        .     A      . .  .  .  .  .       .  . . . .                  .    .   .       . .  . .         TTT          .  .    .  . . . TT                   TT        T   .    . .    G       .     TA       .     .     . .       . .   C       .    .  . .   . .    .    .   .  .         .      .  AACT          T  A      .   C  G    C T    .  .   .          AT   GA  AC   .         .    T       C          .     .    TG        .     .          T   C      . . C            .    .   .  .  AA  .   .     C       G       .   GTC     . .       .         .       CC                        TA                .  G     .     .  .   .     .     .     .    ACAAT              A .   .   .  .    .   .         .   .        . .     .   .   .      .     T     .       GC                . GTC                .  .      . .       .  .  .      . C .   .   .    T    A     .  T      .   T    .    .  T .      A                  .      .    .      .     .  .    .    .  .       .  .     .      .    A  .             .  .    .   .           .   .        .     .               A                   C .       G .             A   .    .  .   .       T  .       T   T   .        .  . G         .   T            A        .   GG         .                 .  . C      .          .  G       CT      .  TGA                .          CAA          .     .  G     .    .      C .  . .    .   .       .        .         .         .           TT       .    .  .  .   .  .           . .       .       .   .    .       .  .       .   .         .    .       .   G   .       .   .            TT           .   .  .            CACAA                                  .      .    .                    .    .            A     .                     .      .       .         .          .              .                                                            .    .             .     .   .    .    . .       .       .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .  TAA          .   .  A   A . .   . .  .  . .     .      ACAGAGAATACAGAGTTCATATA                                          .  GT    T    G  .      .    T   .       .  .  C .   A   .  .        .   .   AA      .    .    . .  .   . .    .    CT     .  . .    .                 .  .            .      TATATTAATGTAG                           .  .        .  .   . CG       .   . . .  .        . .  .     .   .  .        .     A      . .  .  .  .  .       .  . . . .                  .    .   .       . .  . .         TT           .  .    .  . . . T                    TT        T   .    . .    G       .     TA       .     .     . .       . .   C       .    .  . .   . .    .    .   .  .         .      .  ACAT          T  A      .   .  .    A .    .  .   .          GT   G   AT   .         .    A       C          .     .    GT        .     .          A   G      . . T            .    .   .  .  AG  .   .     A       G       .   TCT     . .       .         .       CC                        TT                .  G     .     .  .   .     .     .     .    ACAAT              C .   .   .  .    .   .         .   .        . .     .   .   .      .     A     .       TC                . TCC                .  .      . .       .  .  .      . G .   .   .    T    .     .  T      .   .    .    .  . .      A                  .      .    .      .     .  .    .    .  .       .  .     .      .                     .  .    .   .           .   .        .     .               A                   C .       . .             .   .    .  .   .       A  .       .   .   .        .  . G         .   T            T        .   .          .                 .  . .      .          .  G       .       .  TTA                .          CAA          .     .  .     .    .                                                                                                                                                            .   .         .    .       .   .   .       .   .            .            .   .  .            CACAA                                  .      .    .                    .    .            .     .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .  TAA          .   .  A   . . .   . .  .  . .     .      ACAAAGAATACAGAGTTTATCTA                                          .  AT    C    G  .      .    G   .       .  .  C .   T   .  .        .   .   C       .    .    . .  .   . .    .    A      .  . .    .                 .  .            .      TATATTAATGTAG                           .  .        .  .   . A        .   . . .  .        . .  .     .   .  .        .     A      . .  .  .  .  .       .  . . . .                  .    .   .       . .  . .         TT           .  .    .  . . . T                    TT        T   .    . .    C       .     A        .     .     . .       . .   C       .    .  . .   . .    .    .   .  .         .      .  ACC           .             .  .    . .    .  .   .          A    G   TA   .         .    G       C          .                          .          G   C      . . T            .    .   .  .  AA  .   .     .       .       .   .       . .       .         .       CC                        T                 .  C     .     .  .   .     .     .     .    TGT                G .                                 .        . .     .   .   .      .     .     .       AC                . ACC                .  .      . .       .  .  .      . .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            .                                        .  G       .       .  TTT                .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .  TAA          .   .  C   . . .   . .  .  . .     .      ACAAAGAATACAGAGTTCATGTA                                          .  A     G    A  .      .    G   .       .  .  . .   T   .  .        .   .   A       .    .    . .  .   . .    .    A      .  . .    .                 .  .            .      ATATATGTAG                              .  .        .  .   . A        .   . . .  .        . .  .     .   .  .        .     A      . .  .  .  .  .       .  . . . .                  .    .   .       . .  . .         CT           .  .    .  . . . C                    TT        T   .    . .    G       .     T        .     .     . .       . .   C       .    .  . .   . .    .    .   .  .         .      .  GT                                                           .    .   .    .         .    T       C          .                          .          .   .      . . .            .    .   .  .  G   .   .                                                                                                         .  .     .     .  .   .     .     .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .  TTT          .   .  A   . . .   . .  .  . .     .      AATAGAAGTATTATTTAAAAA                                            .  T     T    G  .      .    G   .       .  .  . .   A   .  .        .   .   A       .    .    . .  .   . .    .    T      .  . .    .                 .  .            .      ATATATGTA                               .  .        .  .   . A        .   . . .  .        . .  .     .   .  .        .     A      . .  .  .  .  .       .  . . . .                  .    .   .       . .  . .         TT           .  .    .  . . . T                    TT        T   .    . .    G       .     T        .     .     . .       . .   .       .    .  . .   . .    .    .   .  .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .  TAA          .   .  A   . . .   . .  .  . .     .      AACAAAGATATA                                                     .  T     C    A  .      .    G   .       .  .  . .   A   .  .        .   .   A       .    .    . .  .   . .    .    A      .  . .    .                 .  .            .      ATATAGTAG                               .  .        .  .   . A        .   . . .  .        . .  .     .   .  .        .     T      . .  .  .  .  .       .  . . . .                  .    .   .       . .  . .         TT           .  .    .  . . . T                    TT        T   .    . .    A       .     A        .     .     . .       . .   .       .    .  . .   . .    .    .   .  .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .  AA           .   .  C   . . .   . .  .  . .     .      TACAAAGATATA                                                     .  C     T    A  .      .    G   .       .  .  . .   T   .  .        .   .   T       .    .    . .  .   . .    .    C      .  . .    .                 .  .            .      ATATATAG                                .  .        .  .   . A        .   . . .  .        . .  .     .   .  .        .     A      . .  .  .  .  .       .  . . . .                  .    .   .       . .  . .         TT           .  .    .  . . . T                    TT        T   .    . .    .       .     .        .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .  AA           .   .  C   . . .   . .  .  . .     .      ACAAGATATAAC                                                     .  T     T    G  .      .    C   .       .  .  . .   T   .  .        .   .   A       .    .    . .  .   . .    .    A      .  . .    .                 .  .            .      ATAT                                    .  .        .  .   . A        .   . . .  .        . .  .     .   .  .        .     A      . .  .  .  .  .       .  . . . .                  .    .   .       . .  . .         .            .  .    .  . . . T                    TT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .  AA           .   .  C   . . .   . .  .  . .     .      AACAAAGATATA                                                     .  T     T    A  .      .    G   .       .  .  . .   T   .  .        .   .   A       .    .    . .  .   . .    .    A      .  . .    .                 .  .            .      GTAG                                    .  .        .  .   . A        .   . . .  .        . .  .     .   .  .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                T            .   .  A   . . .   . .  .  . .     .      ACAAAGATATA                                                      .  T     T    A  .      .    G   .       .  .  . .   A   .  .        .   .   A       .    .    . .  .   . .    .    C      .  . .    .                 .  .            .      TAA                                     .  .        .  .   . G        .   . . .  .        . .  .     .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                T            .   .  A   . . .   . .  .  . .     .      AATAGAAGTAA                                                      .  T     T    G  .      .    G   .       .  .  . .   T   .  .        .   .   A       .    .    . .  .   . .    .    .      .  . .    .                 .  .            .      .                                       .  .        .  .   . A        .   .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .   .  C   . . .   . .  .  . .     .      ACAAAGAATA                                                       .  T     T    A  .      .    G   .       .  .  . .   T   .  .        .   .   C       .    .    . .                                                                                                                    .  .        .  .   .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .   .  C   . . .   . .  .  . .     .      CATACAAATA                                                       .  T     T    G  .      .    G   .       .  .  . .   .   .  .        .   .   .       .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .   .  C   . . .   . .  .  . .     .      AAATATA                                                          .  T     T    .  .      .    G   .       .  .  . .   .   .  .        .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 .  A   . . .   . .  .  . .     .                                                                       .  A     T    .  .      .    .   .       .  .  . .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          . .   . .  .  . .     .                                                                       .  .     .    .  .      .    .   .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              


blockSeqCons                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    C**                                                                                                    T***                                                     ***                                     ***                                                                       ATATATGTAG***********************                   **       A**                            **                                                                                      ****                                                            T************        TT****                                  TA******                                                                                                           A****      C*                                    GA                      N**                           TN*                            G*         T*******     **             AG*                   G*****      TCT**                               CC***************         TAT******            G****                                **   ACAAT*************           **                                                        ***   T*                                TCC*********                              **                    **                 T**                              A*************                        **                               ***               AT T*                                                                       A****************               A*                                                   C*                G*****        T***                                                                             G**     CT*****    TTA************               CAAA*******                                         A*                   **                              CTT                 T*                                                                                                                                                            CACAA*****************************     **     T*                        **                A**                         A*             ***
originalCons                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GGTAAGTAA-GT--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT---------TACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--T-CA-T--A-GA----AGA---AA-G-A------TC-AT--C-A--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-A-TAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TA--------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T--AA-CA-ACTGTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----AATTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-T----------AAAGTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----TT--CTA-TG---AA-TG-G-T-T----------T--CTTAGATGTT---TGGTATTGC--TGT-A---CAG---TCAA---ATG----T-A-A--AAAT-GGAAT-T------CA-T-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-GCAG-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCAT-TTAACTTGTGTTTTTGTGT--A--AC-GCCC-AGTTTCAATAGCC-AA-AGA-ATGAGAACTGATTCTGAAAATTTG-----TAAAA-CATTT--CAAGACCTTGAGGATT-ACGAATTTAC-TGGAAAATATTTTTT-CTCTACAGAATCTTG-TTTTG-A-A------T-AATGC--ATA-TGT-TC-GCAAGT-TTG---CCA----CATT----G-TT--TG-TCC-GCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---C--GTGAATATTTA------TAAATCGCTC-AT---G-T-AACTT--A-TTA----GT-AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------ANT-TTT--AT--C--ATG--TA--TAGAACAT-TGT------ATA-T--CTAA-CTT-ATT---CAAA---ATAT-AATG-----AAT----GC--------TACT-A---NT-C-----AACTACT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACA-TTG-TTT--TCA-T-ATACAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-GAAT-CTAC-AAGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TT-CGTAAA--TATT-TA-AAAC---AG--C-TTTTTAT-AA---CAT--CAAAA--TACATA-TGGGAATCGACCA-AG---TT-CAC-CTACAATAGCT-TGA------TTT--GAGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---AATATATA-TTCGAGAGTTTTAATG---TG-CA-TTT-------TNTC------GCAGTA-CATATTTATTAA-AG-A----N-TTTT-CTA-T--ACAATAATCNGGGCGTTT-GACG-GAACTTGTA---TCTGTATTTATTGTTCCC-CCCAAATTTCACATGCATA-AA-G-CAGTA-CT----G-GT-------TT-A----ACTG-TATGATCATA----CAAA---GT-GTATC--AG-GGTG-TGTA---TTTTNGGTT-T--AATA-TT-CCAAAAC-----ACTT--GACTAGTT-TAAAATAAG-CCTTTAAGGCTCTTTTTGTA-AAGA-TCNAA-TTG-AC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATG--AG-TAAAAA-CAATT-CCCAGATATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATT--TGATTT-TTA-TAGAAAAACTTT-------TT-ATC--TG-AT---------TTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAAT-TTT--TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-A-TGA-CAATAGCATTCAAGCTTTTTTAATACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCGGTTT-CAGAAATTAACACT---AAATCATCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAG-GAT-GTGTCACCTAATTTTGC-CGGA-------TTATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AAAGGTTTGGACTTA-GGT-------TTA--CCTCC----C-TGTCTAA-ACG--------CCACCNTTAGG-----TTCAAATGAAACTCGTAAGTTT-AT--------TTTGGAGTTT----TACAG--AT--ATTATG-TTT-GCCATGTACATACTCTTGA-ATGACTTTATAGAAAGGCCCCTTTATGTCAAGT-TG-GTGCAGCC-TGTGTAG-AAGAGCTG-AATGTGAAACGGTATCAAAGGCCTTAGAAAAATCAACA-AAGCAAACGTACAATT--TGGAACTT-AATATTTGTATA-TTTTTGAATAAGGGTTCT-AAGTATAAACATGTGGTCACTGGTTCTGGCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTTATAATATTGTTAGAGTCCAAGTAGTTTCGTAACCTTGTATTCAGTATGCTATTAA--ATACTTT-GGATA-AGCAAAGAAGTT-ATTGTT-A-TCCTCTA---TAGTANTTTGATGGGTCANA-AGGGCTATCATTTTTATGAAT-AGGCTTTAATAAAGCCTATTTCCCACTCCCTTTGGGTATT-TGCCAG-AG-GACAA-GACAAG----AT-TAAATAATTT-T-AGCATATGTGGT-AAAATATAT-GTACGTCGGCTTTCA-ACATCTCATT-TTTAATGCCAT-CTAATCGCA-GCTTGATTTATTATTTTTTAGATGTTTTTATTGCATCGATGATTTTCTTTTCTNTAATTG-A-TAAATCTAAC-GAAGT-AATG--TTGATATTTCTGCTGACTTGGACAANNAATCTTCAAAATATTTAATTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAGATATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGA------------CTTTC-AAACCGAGTTTCCAG-TATGATA
finalCons                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GGTAAGTAA-GT--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT---------TACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AAT---CA-T--A-GA----AGA---AA-G-A------TC-AT--C-A--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-A-TAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCTATATATGTAG-----------------------TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T--AA-CA--CTGTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----AATTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-T----------AAAGTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----TT--CTA-TG---AA-TG-G-T-TT------------CTTAGATGTT----GGTATTGC--TGT-A---CAG---TCAA---ATGTA------A--AAAT-GGAAT-T------CA-T-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-GCAG-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCAT-TTAACTTGTGTTTTTGTGTA----AC-GCCC-AGTTTCAATAGCC-AA-AGA-ATGAGAACTGATTCTGAAAATTTG-----TAAAA-CATTN--CAAGACCTTGAGGATT-ACGAATTTACTN-GAAAATATTTTTT-CTCTACAGAATCTTG-TTTTG-A-AT-------AATGC--ATA-TGT-TC-GCAG-T-TTG---CCA----CATTG-----TT--TGTCT--GCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACACC---------------GTGAATATTTAT------AAATCGCTC-ATG----T-AACTT--A-TTA----GT-AACAA----TT--GATACAAT-------------ANT-TTT--AT--C--ATG--TA--TAGAACAT-TGT------ATA-T--CTAA-CTT-ATT---CAAA---ATAT-AATG-----AAT----GC--------TACT-ATCC---------AACTACT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACA-TTG-TTT--TCA-T-ATACAGCA--TT--TCTT--AA-TAAT-GAAT-CTAC-AAGGGGA-------------ATCTA-AAATTC---TT-CGTAAA--TATT-TA-AAAC---AG--C-TTTTTAT-AA---CAT--CAAAA--TACATAT-GGGAATCGACCA-AG---TT-CAC-CTACAATAGCT-TGA------TTT--GAGG---CCTTTTTATGTACA----------------CCACA---AATATATA-TTCGAGAGTTTTAATG---TG-CA-TTT-------TNTC------GCAGTAC-ATATTTATTAA-AG-AG-----TTTT-CTAT---ACAATAATCNGGGCGTTT-GACG-GAACTTGTA---TCTGTATTTATTGTTCCC-CCCAAATTTCACATGCATA-AAG--CAGTACT-----G-GTTTA------------ACTG-TATGATCATACAAA-------GT-GTATC--AG-GGTG-TGTA---TTTTNGGTT-T--AATA-TT-CCAAAAC-----ACTT--GACTAGTT-TAAAATAAG-CCTTTAAGGCTCTTTTTGTA-AAGA-TCNAAT-TG-AC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATG--AG-TAAAAA-CAATT-CCCAGATATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATT--TGATTT-TTA-TAGAAAAACTTT-------TT-ATC--TG-AT---------TTTTCACAA-----------------------------AATAT--GACAAT-TTT--TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTTA--TGA-CAATAGCATTCAAGCTTTTTTA-TACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCGGTTT-CAGAAATTAACACT---AAATCATCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAG-GAT-GTGTCACCTAATTTTGC-CGGA-------TTATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AAAGGTTTGGACTTA-GGT-------TTA--CCTCC----C-TGTCTAA-ACG--------CCACCNTTAGG-----TTCAAATGAAACTCGTAAGTTT-AT--------TTTGGAGTTT----TACAG--AT--ATTATG-TTT-GCCATGTACATACTCTTGA-ATGACTTTATAGAAAGGCCCCTTTATGTCAAGT-TG-GTGCAGCC-TGTGTAG-AAGAGCTG-AATGTGAAACGGTATCAAAGGCCTTAGAAAAATCAACA-AAGCAAACGTACAATT--TGGAACTT-AATATTTGTATA-TTTTTGAATAAGGGTTCT-AAGTATAAACATGTGGTCACTGGTTCTGGCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTTATAATATTGTTAGAGTCCAAGTAGTTTCGTAACCTTGTATTCAGTATGCTATTAA--ATACTTT-GGATA-AGCAAAGAAGTT-ATTGTT-A-TCCTCTA---TAGTANTTTGATGGGTCANA-AGGGCTATCATTTTTATGAAT-AGGCTTTAATAAAGCCTATTTCCCACTCCCTTTGGGTATT-TGCCAG-AG-GACAA-GACAAG----AT-TAAATAATTT-T-AGCATATGTGGT-AAAATATAT-GTACGTCGGCTTTCA-ACATCTCATT-TTTAATGCCAT-CTAATCGCA-GCTTGATTTATTATTTTTTAGATGTTTTTATTGCATCGATGATTTTCTTTTCTNTAATTG-A-TAAATCTAAC-GAAGT-AATG--TTGATATTTCTGCTGACTTGGACAANNAATCTTCAAAATATTTAATTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAGATATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGA------------CTTTC-AAACCGAGTTTCCAG-TATGATA
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): TTCCAATTGGGTCGCTGTGCCCCAGAGCGCGCAAGAACTAATAGGAGAGACCGTACTTAACAGTTGAGAAAGAATGTCCCAAAAAAAAGAAGTGCGGAAAAGTGACTAAGATTTCAAGTACAGAGTGCGTAATCACAAACTCTAACAT
Unaligned ( gi|35 ): AAGGGTATTCAGAACAAGAATGACATGGGAACATAAAGAAATAAAGTAAAATAAACAGGGAAAAACATCCAGATG
Unaligned ( gi|38 ): AATAAATTTGGAAATAAAATATCAATTTTGAAATAAAGAAAATAAATTTGAAATATTCATTATGATA






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                1111111111              1                              44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444      1111                                       11                                                    111             111111           222222222222222      1111111111          111111   222222222222222222                                                       11111                               11111                      111              2222222222         1111                    1111111   2222222222                    2222222222222                   22  11     111          111   22222222               222222        111111  11        1                      11                  11111                       11                                             11111                   22               1              1                    11         22222222222222                          1111     11111   222222                                  11111   33333333333333333         333333333            22222       11     1111        1111  11   111111111111111111       11                        1   222222     11            111    111   11    11111   22222222222222    111   22222222                   111111     11                                                                 11     33333333333333            111         11            111                111                  11               111                      111111         111             55555555555555555     111       22                111     1   2222222    111111      11                111111                                             111               1                         111     1111111    222222222222222    1          22222222222                      111           11   11          222222   11                              111                        1111          111             11  1                                          111     1                                2222222222          222222222    5555555555555555555555555555555555     11                                                 111                         111     111     111                                 111               2222    1    11      2   1                 11   2222222       11                    1111    111     111     11    111        1               1  4444444444444     2222 1       1  666666666     1     22222       11             1  33333333          2222     222222      1   1                   11                1               1  1        1       1        1     1                                1                11        22           1                  1                                                                                                                    111      1     1            1      333      3333333                 1                     22222                 1   1              1      1  1     1      2222  1          222            1         1    1          1          1           1    111  1                       11                                  22222222      1     1   222    11     11111     1        111          11                      1               1              7777777777777                1            1         666666666666     1   11          1       
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             3  0000000000   2   2  555 0 2 22  2 2  4  2 2     333    77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777   8  3333  7777 33 4444   555  222 555555  2  4 77 55  44  33 666      2   77  888     2    444  5 2  000 2 2    444  888888 5  8888   111111111111111   2  1111111111   77     222222   888888888888888888   333       2  33       2 777  7  2 2  2   2   5 2 2  44444    8 33 77777 33  88 44       11111 1      3 3  3  3  6  111     44 3 3 3 0000000000         1111 3   3  0  0 3 3  3 0000000   5555555555   6  555  6  3 6 3 3333333333333     0    3  7777  44  00   3 666  9999    666   00000000 55    4     8 222222  4 8   888888  11   4  4 2   8 55   4    4   8  66        5  0   5  77777         1  99999  6   55 4    1 5    5  5   5          11   77  22   22222     5  5  66 5    00         5     5    999       1     5    0     3   00     5 5 33333333333333    66   5   5   5  5  5  0000 5   22222   000000  77  8888    5 5       5         44444   33333333333333333         444444444      0  5  00000 5     66 5   0000  5     0000  33   888888888888888888 1 5   88  99 99   99  99        3   222222   5 99    5   5   000    555   44    44444   44444444444444    333   00000000       77 5      5 666666  5  55 5      5 4 6   6   99   666  7     99 666    99  99   6    6  3 44     11111111111111     6      111  6      55    6  6    888  99 6       6  111   99     99   11 88            6  111  6   6           6   999999   99    111             22222222222222222   1 111     4 22   0        7   111  6  3   1111111 1  999999  3   11  9        6  6 777777    6   9999         1        6   888        000               5  6 6      6666666    5  111     6666666 5  000000000000000    1          44444444444  6     99 77    6    111    1 5  8 11   88  8       000000   11        8         8           666  0   8    8  8  88  8  7777        8 444     8       11  6 0  999  0  8  3       99  99        6    111     3   2   99      6   6            2222222222   99  6  666666666    0000000000000000000000000000000000     55      6   99                   99   6            111   6                     666     444     444       8          8     0        444 44  3       3 1111    0    33      0   0         0    0  44   6666666       11    8   8    8    8 7777    444     444     33    777        0        55     0  2222222222222     1111 0       0  555555555     0   6 55555       11  0   9      0  66666666          1111     555555      0   0    3        3     99          6     2     7         3  3        3       3        3     2    0                7          3    7   0       88   7 6  00           3                  3                           6                                   7             6          0                           777      0     0   7 7      3      444      5555555  1      6     1 0                     11111                 2   2   6      7   3      3  3     3      8888  3          222      7     3         3 7  2 0  6     0          0           3    777  3  7      7             44            0               1  1  55555555      0     3   555    44     99999     0   22   222          44                      3               3              3333333333333     7      7   3    7       3         888888888888     3   00      6   3       
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .  ..........   .   .  ... . . ..  . .  .  . .     ...    ..............................................................   .  ....  .... .. ....   ...  ... ......  .  . .. ..  ..  .. ...      .   ..  ...     .    ...  . .  ... . .    ...  ...... .  ....   ...............   .  ..........   ..     ......   ..................   ...       .  ..       . ...  .  . .  .   .   . . .  .....    . .. ..... ..  .. ..       ..... .      . .  .  .  .  ...     .. . . . ..........         .... .   .  .  . . .  . .......   ..........   .  ...  .  . . . .............     .    .  ....  ..  ..   . ...  ....    ...   ........ ..    .     . ......  . .   ......  ..   .  . .   . ..   .    .   .  ..        .  .   .  .....         .  .....  .   .. .    . .    .  .   .          ..   ..  ..   .....     .  .  .. .    ..         .     .    ...       .     .    .     .   ..     . . ..............    ..   .   .   .  .  .  .... .   .....   ......  ..  ....    . .       .         .....   .................         .........      .  .  ..... .     .. .   ....  .     ....  ..   .................. . .   ..  .. ..   ..  ..        .   ......   . ..    .   .   ...    ...   ..    .....   ..............    ...   ........       .. .      . ......  .  .. .      . . .   .   ..   ...  .     .. ...    ..  ..   .    .  . ..     ..............     .      ...  .      ..    .  .    ...  .. .       .  ...   ..     ..   .. ..            .  ...  .   .           .   ......   ..    ...             .................   . ...     . ..   .        .   ...  .  .   ....... .  ......  .   ..  .        .  . ......    .   ....         .        .   ...        ...               .  . .      .......    .  ...     ....... .  ...............    .          ...........  .     .. ..    .    ...    . .  . ..   ..  .       ......   ..        .         .           ...  .   .    .  .  ..  .  ....        . ...     .       ..  . .  ...  .  .  .       ..  ..        .    ...     .   .   ..      .   .            ..........   ..  .  .........    ..................................     ..      .   ..                   ..   .            ...   .                     ...     ...     ...       .          .     .        ... ..  .       . ....    .    ..      .   .         .    .  ..   .......       ..    .   .    .    . ....    ...     ...     ..    ...        .        ..     .  .............     .... .       .  .........     .   . .....       ..  .   .      .  ........          ....     ......      .   .    .        .     ..          .     .     .         .  .        .       .        .     .    .                .          .    .   .       ..   . .  ..           .                  .                           .                                   .             .          .                           ...      .     .   . .      .      ...      .......  .      .     . .                     .....                 .   .   .      .   .      .  .     .      ....  .          ...      .     .         . .  . .  .     .          .           .    ...  .  .      .             ..            .               .  .  ........      .     .   ...    ..     .....     .   ..   ...          ..                      .               .              .............     .      .   .    .       .         ............     .   ..      .   .       
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             1  8888888888   2   1  555 5 0 88  0 0  0  0 0     555    88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888   0  5555  2222 11 2222   555  888 888888  1  2 66 88  44  11 999      2   99  555     4    444  0 5  000 7 7    777  333333 3  7777   333333333333333   7  7777777777   33     222222   444444444444444444   222       4  22       5 888  5  5 5  5   7   3 9 9  33333    6 99 11111 99  55 22       77777 4      3 3  3  3  7  777     66 3 3 3 4444444444         7777 3   3  5  1 3 3  3 8888888   1111111111   7  888  7  3 7 3 9999999999999     4    3  1111  33  00   6 444  0000    444   55555555 00    0     0 555555  0 0   000000  00   0  0 0   0 55   0    0   0  55        0  5   0  44444         4  33333  7   77 3    4 0    7  7   7          00   66  99   55555     0  0  00 0    66         0     5    000       7     0    8     2   66     0 0 88888888888888    99   0   0   0  0  0  6666 0   99999   777777  99  7777    7 7       7         33333   11111111111111111         999999999      4  0  11111 0     99 0   6666  0     6666  66   333333333333333333 0 7   33  22 22   22  22        3   111111   7 33    7   7   000    777   44    33333   44444444444444    999   77777777       99 7      7 444444  7  77 7      7 3 7   7   22   888  3     22 888    22  88   7    7  5 00     88888888888888     7      777  7      88    7  7    333  22 7       7  777   22     22   66 66            7  777  7   7           7   222222   22    777             88888888888888888   0 777     2 22   7        8   777  7  3   7777777 0  222222  5   88  8        7  7 777777    7   3333         0        7   777        000               0  7 7      2222222    7  777     4444444 7  333333333333333    4          00000000000  7     22 77    7    777    0 0  0 00   66  0       888888   00        0         0           222  8   0    0  8  88  0  0000        0 000     0       00  0 8  444  8  0  2       22  22        7    777     3   5   22      7   7            5555555555   22  7  777777777    0000000000000000000000000000000000     88      7   22                   22   7            555   7                     888     000     000       0          0     8        000 00  2       2 2222    0    22      0   0         8    8  44   0000000       00    0   0    0    0 0000    000     000     88    555        0        00     0  2222222222222     2222 0       0  222222222     8   5 00000       88  2   2      0  22222222          2222     555555      0   0    2        2     88          5     0     3         3  3        3       3        3     0    7                3          3    3   7       33   3 7  77           3                  3                           7                                   3             7          7                           000      0     0   3 3      3      000      3333333  0      7     0 0                     33333                 0   0   7      3   3      3  3     3      3333  3          777      3     3         3 3  0 7  7     0          0           3    777  3  3      3             00            7               0  2  88888888      0     3   000    77     33333     7   00   000          77                      3               3              3333333333333     3      3   3    3       3         333333333333     3   33      7   3       
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GGTAAGTAA-GT--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT---------TACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--T-CA-T--A-GA----AGA---AA-G-A------TC-AT-CC-A--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-A-TAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA----T--A-------T--GTA-G-TTGGCAA-AA--TTTTCAA-T---AA-CA-C-TG-TCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----AATTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-T----------AAAGTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----TT--CTA-TG---AA-TG-G-T-T----------T--CTTAGATGTT-GG----TATTGC--TGT-A---CAG---TCAA---ATG----T-A-A--AAAT-GGAAT-T------CA-T-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-GCAG-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCAT-TTAACTTGTGTTTTTGTGT--A--AC-GCCC-AGTTTCAATAGCC-AA-AGA-ATGAGAACTGATTCTGAAAATTTG-----TAAAA-CA-TTN-C-AAGACCTTGAGGATT-ACGAATTTAC-TGGAAAATATTTTTT-CTCTACAGAATCTTG-TTTTG-A-A-----T-A------ATGC--ATA-TGT-TCG-CA-GT-TT----G-CCA----CATT----G-TT--TG-TC-TGCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---C--GTGAATATTTA------TAAATCGCTC-AT---G-T-AACTT--A-TTA----GT-AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------ANT-TTT--AT--C--ATG--TA--TAGAACAT-TGT------ATA-T--CTAA-CTT-ATT---CAAA---ATAT-AATG-----AAT----GC--------TACT-A-TCC--------AACTACT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACA-TTG-TTT--TCA-T-ATACAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-GAAT-CTAC-AAGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TT-CGTAAA--TATT-TA-AAAC---AG--C-TTTTTAT-AA---CAT--CAAAA--TACATA-TGGGAATCGACCA-AG---TT-CAC-CTACAATAGCT-TGA------TTT--GAGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---AATATATA-TTCGAGAGTTTTAATG---TG-CA-TTT-------TNTC------GCAGTA-CATATTTATTAA-AG-A-G----TTTT-CTA-T--ACAATAATCNGGGCGTTT-GACG-GAACTTGTA---TCTGTATTTATTGTTCCC-CCCAAATTTCACATGCATA-AA-G-CAGTA-CT----G-GT-------TT-A----ACTG-TATGATCATA----CAAA---GT-GTATC--AG-GGTG-TGTA---TTTTNGGTT-T--AATA-TT-CCAAAAC-----ACTT--GACTAGTT-TAAAATAAG-CCTTTAAGGCTCTTTTTGTA-AAGA-TCNAA-TTG-AC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATG--AG-TAAAAA-CAATT-CCCAGATATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATT--TGATTT-TTA-TAGAAAAACTTT-------TT-ATC--TG-AT---------TTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAAT-TTT--TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-A-TGA-CAATAGCATTCAAGCTTTTTT-A-TACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCGGTTT-CAGAAATTAACACT---AAATCATCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAG-GAT-GTGTCACCTAATTTTGC-CGGA-------TTATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AAAGGTTTGGACTTA-GGT-------TTA--CCTCC----C-TGTCTAA-ACG--------CCACCNTTAGG-----TTCAAATGAAACTCGTAAGTTT-AT--------TTTGGAGTTT----TACAG--AT--ATTATG-TTT-GCCATGTACATACTCTTGA-ATGACTTTATAGAAAGGCCCCTTTATGTCAAGT-TG-GTGCAGCC-TGTGTAG-AAGAGCTG-AATGTGAAACGGTATCAAAGGCCTTAGAAAAATCAACA-AAGCAAACGTACAATT--TGGAACTT-AATATTTGTATA-TTTTTGAATAAGGGTTCT-AAGTATAAACATGTGGTCACTGGTTCTGGCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTTATAATATTGTTAGAGTCCAAGTAGTTTCGTAACCTTGTATTCAGTATGCTATTAA--ATACTTT-GGATA-AGCAAAGAAGTT-ATTGTT-A-TCCTCTA---TAGTANTTTGATGGGTCANA-AGGGCTATCATTTTTATGAAT-AGGCTTTAATAAAGCCTATTTCCCACTCCCTTTGGGTATT-TGCCAG-AG-GACAA-GACAAG----AT-TAAATAATTT-T-AGCATATGTGGT-AAAATATAT-GTACGTCGGCTTTCA-ACATCTCATT-TTTAATGCCAT-CTAATCGCA-GCTTGATTTATTATTTTTTAGATGTTTTTATTGCATCGATGATTTTCTTTTCTNTAATTG-A-TAAATCTAAC-GAAGT-AATG--TTGATATTTCTGCTGACTTGGACAANNAATCTTCAAAATATTTAATTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAGATATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGA------------CTTTC-AAACCGAGTTTCCAG-TATGATA
Reference ( family-3541 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GGTAAGTAA-GT--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT---------TACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--T-CA-T--A-GA----AGA---AA-G-A------TC-AT-C--A--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-A-TAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA----T--A-------T--GTA-G-TTGGCAA-AA--TTTTCAA-T---AA-CA-C-TG-TCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----AATTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-T----------AAAGTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----TT--CTA-TG---AA-TG-G-T-T----------T--CTTAGATGTT-GG----TATTGC--TGT-A---CAG---TCAA---ATG----T-A-A--AAAT-GGAAT-T------CA-T-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-GCAG-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCAT-TTAACTTGTGTTTTTGTGT--A--AC-GCCC-AGTTTCAATAGCC-AA-AGA-ATGAGAACTGATTCTGAAAATTTG-----TAAAA-CA-TTN-C-AAGACCTTGAGGATT-ACGAATTTAC-TNGAAAATATTTTTT-CTCTACAGAATCTTG-TTTTG-A-A-----T-A------ATGC--ATA-TGT-TCG-CA-GT-TT----G-CCA----CATT----G-TT--TG-TC-TGCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---C--GTGAATATTTA------TAAATCGCTC-AT---G-T-AACTT--A-TTA----GT-AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------ANT-TTT--AT--C--ATG--TA--TAGAACAT-TGT------ATA-T--CTAA-CTT-ATT---CAAA---ATAT-AATG-----AAT----GC--------TACT-A-TCC--------AACTACT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACA-TTG-TTT--TCA-T-ATACAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-GAAT-CTAC-AAGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TT-CGTAAA--TATT-TA-AAAC---AG--C-TTTTTAT-AA---CAT--CAAAA--TACATA-TGGGAATCGACCA-AG---TT-CAC-CTACAATAGCT-TGA------TTT--GAGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---AATATATA-TTCGAGAGTTTTAATG---TG-CA-TTT-------TNTC------GCAGTA-CATATTTATTAA-AG-A-G----TTTT-CTA-T--ACAATAATCNGGGCGTTT-GACG-GAACTTGTA---TCTGTATTTATTGTTCCC-CCCAAATTTCACATGCATA-AA-G-CAGTA-CT----G-GT-------TT-A----ACTG-TATGATCATA----CAAA---GT-GTATC--AG-GGTG-TGTA---TTTTNGGTT-T--AATA-TT-CCAAAAC-----ACTT--GACTAGTT-TAAAATAAG-CCTTTAAGGCTCTTTTTGTA-AAGA-TCNAA-TTG-AC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATG--AG-TAAAAA-CAATT-CCCAGATATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATT--TGATTT-TTA-TAGAAAAACTTT-------TT-ATC--TG-AT---------TTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAAT-TTT--TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-A-TGA-CAATAGCATTCAAGCTTTTTT-A-TACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCGGTTT-CAGAAATTAACACT---AAATCATCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAG-GAT-GTGTCACCTAATTTTGC-CGGA-------TTATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AAAGGTTTGGACTTA-GGT-------TTA--CCTCC----C-TGTCTAA-ACG--------CCACCNTTAGG-----TTCAAATGAAACTCGTAAGTTT-AT--------TTTGGAGTTT----TACAG--AT--ATTATG-TTT-GCCATGTACATACTCTTGA-ATGACTTTATAGAAAGGCCCCTTTATGTCAAGT-TG-GTGCAGCC-TGTGTAG-AAGAGCTG-AATGTGAAACGGTATCAAAGGCCTTAGAAAAATCAACA-AAGCAAACGTACAATT--TGGAACTT-AATATTTGTATA-TTTTTGAATAAGGGTTCT-AAGTATAAACATGTGGTCACTGGTTCTGGCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTTATAATATTGTTAGAGTCCAAGTAGTTTCGTAACCTTGTATTCAGTATGCTATTAA--ATACTTT-GGATA-AGCAAAGAAGTT-ATTGTT-A-TCCTCTA---TAGTANTTTGATGGGTCANA-AGGGCTATCATTTTTATGAAT-AGGCTTTAATAAAGCCTATTTCCCACTCCCTTTGGGTATT-TGCCAG-AG-GACAA-GACAAG----AT-TAAATAATTT-T-AGCATATGTGGT-AAAATATAT-GTACGTCGGCTTTCA-ACATCTCATT-TTTAATGCCAT-CTAATCGCA-GCTTGATTTATTATTTTTTAGATGTTTTTATTGCATCGATGATTTTCTTTTCTNTAATTG-A-TAAATCTAAC-GAAGT-AATG--TTGATATTTCTGCTGACTTGGACAANNAATCTTCAAAATATTTAATTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAGATATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGA------------CTTTC-AAACCGAGTTTCCAG-TATGATA
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GTAAGTAAAGT--TA----A-TTTTATTCTCCGAA-T-T--TT-G-GG-CCAC-GAAGG---GCAT----------ACAA-G------------ATAT---------A--------------------AAA-AA----CA-C--A-GA----AGA---AA-G-T------GC-AT-CC-A--AAT-GA--TGA-AGATAA-AGT--AA-A-TAACA-AAGT---TA-T-GAA--T-A-AATC---AA---T--T-TT-C--TCA---------------ATT-G-----------GAG--CAGCT------ATA----C--T-------T--GTA-GATTGGCAA-AT--TTCTCAA-CCTAAA-CA-C-TG-TCA-CAT-T-CGAT-----TACT-CCAA-----T--AA--G--CCAAATA-----A-TTTTTC-T-CTGATCTA-CA----AGGT--T-T-AAT----------AAAGTTTTTTA--A-AAC-AAAGT---T-CAAT-------GGAT-----T---CTA-TG---AA-TG-G-T-T----------TGTCTTAAATGTG-TG----TAT-GC--TGT-A---CAA---TCAA---ATG----T-A-A--AA-T-GGAATGT------CA-T-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-GCAG-ACAGCT--ACATTTTC-TCTCAT-T--ACTTGTGTTTTTGTGTTAA--AC-GCCCGAGTTTCAATAGCC-AACAGA-ATGAGAACTAATTCT-AAAATTTG-----TAAAAACA-TTTTC-AAGAC-TTGAGGATT-AC-AATCT-----GAAAATATTTTT--CTCTACAGAATCTT--TTTTG-A-AC----T-A------ATGGGAATAATGT-TCG-CA-GTGTT----G-CCA----CATT----GGTT--TG-TCCTGCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---CCAGTGAA-ATT---------AAATCGCTC-AT---GCT-AACTT--T-ATA----GT-AACAA----TTT-GATTACGGA----AT------ATT-TTT--ATATC--ATG--TA--TAGAACATCTGT------ATAGT--CTAAGCTT-ATT---CAAAC--ATA--AATG-----AGA----GC--------TACT-AGTTC--------AACTACT--T-TGTTTG-T------TA-TCGAA-TACAAT-ACAGTTG-TTTCATTA-T-AT-CAGCA--TAT-TCTT--AA-GAAT-GAAT-CTAC-AGGGGGCGAA----------ATCTA-AAATTC---TT-CGAAAAA-TATT-TA-AAAC---AG--CGTTTTTAT-AAACACAT--CAAAA--TACATA---GGAATCGACCA-AG---TTTCAC-CTACAATAGCT-TGA------TTT--GAG----CCTTTTTAGGTAC----------AGA----CCA-A---AATATAT--TTCAAGAATTTTAATG---TGGCAATTT-------TTTC------GCAGTAACATGTTTATTAA-AG-ACG----TTTT-CTAGT--ACAATAATCAGGGCGTTTTGACG-GAACTTGTA---TCTGTATTTATTGTTCCC-C--AAATTTCACATGCATA-AAAG-CAGTAACT----GTGT-------TTTA----ACTG-TATGATCATA----CA-----GTCGTATC--AG-GGTG-TGTA---TTTTTGGTTAT--AAT--TT-CCAAAAC-----ACTTTTGACTAGTT-TAAAATAAGGCCTTTAAGGCT---TTTGTAGAAGA-TCCAAATTG-AC----AACATGTGTA---AGGAGGCCTGATG--AGGTAAAAA-CAATTGCCCAGATATT---G--TACGATGAACACT---TGTTCTGA--ATT--TGATTT-TTA-TAGAAAAACTTT-------TT-ATC--TG-AT---------TTTT-T-------------ACAACGTTTTTTCTACAGAAATATT-GACAAT-TTT--T-GTCTTTCTGAGGTTGACCAGGA-TAGGCAAAATTTGA-TGA-CAATAGCATTCAAGCCTTTTTAA-TACAC---CGCTGTGAAGGCCCTCCCCTCGGTTT--AGAAATTAACACT---AAATCATCAGCAT-C----AACATAACA---TTAAGAGATGGTGTCACCT-ATTTTGC-CGGA-------TTATCAT--TATC-GTCGAAAA-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAATATTATTTTAA-AAAGGTTTGGACTTA-GG--------TTA--CCTCC----C-TGTCTTA-ACAC-------CCACACTTA-G-----TTCAAATG-AACTCGTAAGTTTGAT--------TTTGGAGTTT----TAGAG---T--ATTATGTTTT-GCCATGTACATAC-CTTGA-TTGACTTTATA-AAAGG-CCCTTTATGTCAAGTCTGTGTGCAGCCTTGTGTAGAAAGAGCTGAAATGT--AACGGTATCAAAGGCCTTAG-AAAATCAACACAAGC-AACATACAATTGCTGGAACTT--ATATTTGTATATTTTTTGAATAAGGGTTCTAAAGTATAAACATGTGGTCACTGGTTCT-GCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTTAT-ATATTGTTAGAGT-CAAGTAGTTTCGTACCTTTGTATTCAGTATGCTATTAA--ATACTTT-GGAAATAGCAAAGAAGTTGATTGTTAA-TCCTCTA---TA--ATTTTGAT-GGTCATA-AGGGCTATCATTTTTATGAAT-AGGTTTTAATAAAGCCTATTT-CCATTCCCTTTGGG-ATTCTGCCAACAGAAACAACGACAAG----AT-TAAACAATTTATAAGCATATGTGGTAAAAATATAT-GTACATCGG-TTTCA-ACATCTCATT-TTTAATGCCAT-CTAATCGCA-GCTTGATTTATTATCTTTCAGATGTTTTTATTGCATCAATGATTTTCTTTTCTTTAATTG-A-TAAATCTAAC-GAAGT-AATG--TTGATATTTCTGCTGACTTGGACAATAAATCTTCAAAATATTTAATTCTGGGTATCAAATTTACTAATCAATACTGAATAATGTTTGTAAAATGATTTACACCCATTGTTCACTAGATATCTT-ATCGGACT-ATCTTGCGGATTGCTGATTGATTCAAATTCTTTC-AAA---AGTTT-CAG-TATG
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aaAAGTAA-AT--T--------TT-ATA-TCA--A-T-A--TT-T-GG-CC-C-AG------GCAT---------AACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--A-CA-ACAA-GA----AGA---AA---A------CC-ATTC--ACCAAT-GA--T---AGATAA-CGT--AA-C-TAACA-AAGT---TAAT-GA---T-A-AATC---AA---AATT-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAGAGCAGCTT-----ATA----TTAA-------T--GTA-G-TTGGACA-AA--TT---AG-T---AATCG-C-TG-TCA-CATGT-C-ATCTTTATACTGC--A-----T--AAAAG--C-AATTA-----AATTATTC-T-CT-AT-TAACATACCAAGT--T-T-A-T----------AA-GTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----T---CTA-TG---AAATG-G-T-T----------T--TCTTGATGTT-AG----TAT-GCCATGT-AACACAA---TCAATG-ATG------A-A--AAAT-GGAAT-TAA----CA-TGCTTATC---AAAGCAC-AG-TACAG-A--CTT-GCAG-ACA-CTTAACATTTTC-TCACAT-TTA-CATGTGTTTTTGTGT--A--AC-GCC--A---TCAA-AGCC-AA-AGA-ATGAGAACTGGTTCTGAAATATGG-----TAAAA-CA-TTT-C-AAGA-CTTGAGGATT-ATGAAgcat
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              taagctaATAGAGCATAA---TT-CCC-CCATAACTGTT-TGG------TTT--GAGG---TCTTCTTGTGTAT----------T------CCATATAGAGTATGTA-CTTGAGGGGTTTAATG---TG-AA-GTT-------TATC------AC--TA-AATA-TGATTCATGG-A-C----TTTT-CAA-C--ATTATAATTTGGGCTCTT-TACATCAGCAGGT----TTTGAATTTGTAGTT--T-CCCAAATT--------ACA-AA-A-CA----------G-GT-------TT-T----ACAG-TGTGATAAAA----AAAAAAGAT-GCAAC--AA-AATACTGGA---ATTTGGCCT-TGCAAT--TT-CAAAAAC-----ATTT--AATTAATT-TAAAGAAAG-CATTCAAACCAC-GCTTATA-CAGG-TCTTG-TTG-ACAATTAACATATA-ATCCAAAGG-CAT--TG--AA-T-ATAC-CA----CGTAAATATTAATGAATAAAA-GA-CAATGAATGTTC-TAT--TTCCTTATCT-TTA-TAAACAAATTTTAAGTTTCTT-ACCTTTGCAT---------TCTTGT-------------AAAA---------------AAAAT--G----T-TGTCCTTGTCTTTTTCAAATTAAC--AGA-GAGACAATGTTT-A-Taa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gTAAGTAA-GT--TA----T-TTT-ATT-TCC--AAT-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT--------------AA------------ATAT---------A--------------------CAT-AAA-C-CA-C--A-GA----AGA---G--G-A------CC-AT-CC-A--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-A-TAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TTTC--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA----T--A-------T--GTA---TTGGCAA-AA--TTTTCAA-T---AA-CA-C-TG-TCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----ATATTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-T----------AAAGTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGA------TT--CTA-TG----A-TG-GTT-T----------T--CTTAGATGTT-GG----TA-TGC--TGT-A---CAA---CCAA---ATG----T---A--AAAT-GGTAT-T------CA-T-CTT--C---AA--CACAAG-TCCAG-A--CTT-GCAG-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCAC-TT-ACTTGTGTTTTTGTcata
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -T--TT-G-GA-CC-C-AGAGT---GCAT----------ACAAAG------------A-AT---------A--------------------CAT-AG--TTCA-T--A--A----ATA---CA-C-A------TC-AT-A--A--AA---A--T----GATAA-AGT--AATA-TAACC-AGGT---TA-T-GA---T-A-AATC---TATTTT--T-TT-T--TCA---------------ATA-GT----------GAG--CAGC-----------------------------TA-A-TT-------A--TTGTCAA-T---AA-CA-C-TG-TCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----ACTTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---TATGT--T-T-A-T----------AAAGTAATT----A-TAC-AAGGTGT-T-TA-T-------GAA------CT--CTA-TG---AA-TG-G-TGC----------C--CTTAGGTGTT-GG----TA-TGC--TAT-A---CAG---TCAA---ATA----T-ACA--AAAT-GGAAA-T------CA-T-CCT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-ATGCGT-GCGC-ACGCCT--GCAT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               g--TA----A-TTT--TT-TCC--A-A-T--TT-T-TG-CC-C-AGAGG---GCAT----------ACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AAA-C-CA-C--A-GA----AGA---AA-G-A------CC-AT-CC-A--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-AATAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TTTC--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA----T--AATTTA--T--GTA-G-TTGGCAA-AA--TTTTCAA-T---AA-CA-C-TG-TCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----AATTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T---C----------AAAG-TTTT----A-TACAAAAGTAT-T-CA-T-------GGATCTATATT--CTA-TG---AA-TG-GTT-T----------T--CTTAGATGTT-GG----T
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aaggtagTAAGTAA-GT---A----A-TTT-----TCA--A-T-T--TT-G-GG-GT-G-AGAGG---GCAT---------CATACAA------------ATA-----------------------------------AA--T-CA-G--A-GTTCCTGTA---CA-T-G------TT-AT-CT-A--AAA-GG--C---GTATAATATT--AA-A-TTACA-AGTT---TA-T-GA---T-ATAAT----AA---ACTT-TT-C--CCC---------------ATA-AT----------GAA--CAGCTCTAGAGATA----T--A-------G--GGA-A-TTGGCAA-AA--TTTCCAT-T---AA-CA-T-CG-TCA-CAT-g
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aaA----G-TTT-ATT-CCA--A-T-T--TT-G-GGCCC-C-AAAGG---GCAT---------AATAGAA------------GTA----------A--------------------CA--GC--T-CA-T--A--A----AGA---AA-G-AAATGTCCC-AA-A--A--AAT-GAAGT---GGGAAA-AGTTAAA-A-TATCA-cacacaagtctatgtataactataaaatattcatggactct
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aaagaaaataaatttgagaaaaaatatcaattttgaaataagaaaataaaatttggaaatattcattatgatatctataggtgtaaagataatataCCC-AGTTTAAATAGCC-AA-AAG-ATGAGAACTGATTATG-AAATTTA-----GAAAA-CA-TTG-C-AAGAC---GAGGATT-GCGAA-TTAC-TGAAAAATG--TTTT-CTCTACAGA-----------------------A------ATGC--A-A-TGT-TCGCCA-GT-TT----GTCCA-----ATT----G--T--TG-TC-TGCA-ATTGCCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------CCTTC--ATGAATATTTCTCTTTTTAAATCTATC-AG---A-T-AATTT--A-TTA----GT-AACAA----Ttggaatcacaacttacatgtatgtgg
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tacA-AAGT---TA-TAGA---T-A-A-TC---AA---T--TGTT-C--TCA---------------TTT-GT----------GAG--CAG---------TA----T--A-------T--ATA-G-TTGGCAA------TTTCAA-T---AAGCA-T-T---CA-CAT-TAC-AT-----TA-T-C--A-----CTAAA--G--CCAAATAC----AATTTCTT-TACT-AT-TA-CA---CAGGT--T-TTA-T----------AAATTTTTTGCCTA-TAC-AA-GTAT-TTCA-T-------GGAT-----TCTGCT--TG---AA-TG-G-T-T----------TTTCTTA-ATGTT-GG----TATGGC--TGTTA---CA----TCAA---ATG----T-A-A--AAata
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TGGCAACGA--TTTT-AA-T---AA-CA-C-CG-TCA-C-T-T-C-AT-----TGCTTC--A-----T--A---G--CCAGGTA-----AAGTT----------------------GTT--T-T-A-T----------CAAATTCTT----A-T-C-AATGTGT-T-CA-A-------GGA----------CTGGTG---AA-TG-G-T-T----------TT-CGTACA-GTT-GAATGATAT-AC--AAT-A---CAG---TCAA---TT---------A--CAAT-GGAAT-T------CA-T-CTT-------A--CAA-AGTT-CAGCA--TTT-ACAG-ACA-GT--GCATTTTCTTTTCATATTACC---CGTTTTTG
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  acGGTAAGTAA-GT--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT---------TACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--C-CA-C--A-GA----AGA---AA-G-A------CC-AT-C--A--CAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-T-TAA-A-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA----T--A----------GTA-G-TTGGCAA-AA--TTTTCAAAT---AA-CAAC-TG-TCAGCAT---C-GT-----TACT-C--A-----T--AG------CAAA-A-----AATTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-T----------AAAGTTTTC----AATAA-CAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----TT--CTA-TG---A--TG-G-T-T----------T--CTTAGATGTTTGG----TATTGC--TGT-A---CAC---TCAG---ATG----T-A-A--AAAT-GGAAT-T------C--T-CTT------AA--CAC-AG-T--AG-A--CTT-GCAGGACA-CT--ACATTTTC-TCTCAT-TTAAATTGTGTTTTTGGTT--AGTAC-GCCCCAGTTTCAATAGCCCAA-AGATATG-GAACTGATTCTGAAAATTTG-----TAAAA-CA-TTT-C-AAGACCTTCAGGATT-ACGAATTTACATGAAAAATATTTTTTTCTCTACAGAATTTTG-TTTTG-ATA-----C-A------ATGA--ATA-TGT-TCG-CAAGT-TT----G-CCA----CATT----G-TT--TG-TC-TTCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---C--ATGAATATTTA-------AAATCGTCC-AT-----T-AAACT--A-T-A----GT-AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------AAT-TTC--AT--C--ATG--TA--TAGAACAT-TGT------ATA-T--CTAA-CTT-ATT---CAAA---ATATTAATG-----AAT----GC--------TACT-A-GTC--------AACTACT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACA-TTG-TTT---CA-T-ATACAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-GAAT-CTAC-AGGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TT-CGTAAA--TATT-TT-AAAC---AG--C-TTTTTAT-AA---CAT--CAAAA--TAC-TA-TGGGAATCGACCA-AG---TT-CAC-CTACAATAGCT-TGA------TTT--GAGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---AATATAT--TTCAAGAATTTTTATG---TG-CA-TTT-------TTTC------GCAGTA--GTATTTATTAA-AA-A-G----TTTTTCTA-T--ACAATAATCCAGGCGTTT-GACG-GAACTTGTA----CTGTATTTATTGTTCCCACCCAAATTTCACATGCATA-AA-G-CAGTA-CT----G-GT-------TT-A----GCTGCTATGATCATA----CAAA---GT-GTATC--AG-GGTG-TGTA---TTTTTGGTT-T--AATA-TT-CCGAAACCAAAAACTT--GACTAGTT-TAAAATAAG-CCTTTAAGGCTCTTTTTGTA-AAGA-TC-AA-TTG-AC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATG--AG-TAAA---CAATT-CCCAGATATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATT--TGAATT-GTA-TAGAAAAACTTT----------ATC--TG-AT---------TTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAAT-TTT--TTGTCTTTCTGGGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-A-TGA-CAATAGCATTCAAGCTTTTTT-A-TACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCAGTTT-CGAAAATAAACACT---A--TT-TCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAG-GAT-GGTTCACCTAATTT-GT--GGA-------TTATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AATGGTCTG-ACTTA-GGT-------TTA--TCTCC----CGCGTCTAA-AC----------CACCTTTAGG-----TTCAAATGAAACTCGTAAGTTT-AT--------TTTGGAGCTT----TACAG--AT--ATTATG-TTT-GCCATGTACATACTCTTGG-ATGACTTTATAAAAAGGTCCCTTTATGTCAAGT-TG-GTGCAACC-TGTGTAG-AAGAGCTG-AATGTGAAACAGTATCAAAGGCCTTGGAAAAATTAATA-AAGCAAACATACAATT--TGG-ACTTAAATATTTGTATA-TTTTTGAATAAGGGTTCT-AAGTATAAACATGTGGTCACTGGTTCTGGCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTAATAATATTGTTAGAGTCCAAGTAGTTTTGTAACCTTGTATTCAGTATGCTATCAA--ATACTTT-GGATA-AGC-AAGAAGTT-ATTGTT-ATTCCTCTATACTAGTAGTTTGATGGGTCATA-TGGGCTATCGTTTTTATGAAT-AGG-TTTAATAAAGCCTATTTTCCA-TTCCTTTGGGTATT-TGCCAG-AA-GACAA-GACAAG----AT-TAAATAATTT-T-AGCATATGTGGT-AAAATATAT-G-AC-TTGGCTTTCA-ACATCTCATT-TTTAATGCCATCCTAATC-CA-GC-TGATTT-TTATTCTTTAGATG-TTTTATTGCATCAATGATTTTCTTTTTTTTAGTTGTACTAAATCTAAC-GAGGTAAATGTTTTGAT-TTTCT--T--CTTGG-CAAGTAAT-TTCAAAATATTT-ATTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAG-TATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGA------------CTTTC-AAACTGAGTTTCCAGTTATGATA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTTTTGTAATCG-A-TA--TGTAGCTGTAGT-AAT---CTGA-ACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--AAAATATTTA-TTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAGATATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGA------------CTTTCAAAACCGAGTTTCCAG-TATGATA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            T--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATT--TGAATT-GTA-TAGAAAAACTTT-------TT-ATC--TG-AT---------TTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAAT-TTT---TGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-A-TGA-CAATAGCATTCAAGCTTTTTT-A-TACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCAGTTT-CAGAAATTAACACT---
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                --TA----A-TTT-ATT-TCA--AAT-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCATAACATGGAATACAGAGTTC---------ATAT---------G--------------------CATGAA--T-CA-T--G-AA----AG-----T-G-A------TCAAT-C--A--AAA-GA--T---CAATAA-AAT----------------T---TA-C-GA---T-A-AATC---AA---C--TCTT-C--T-----------------------------------------CT------ATA-------A-------T--G-------AGCAC-AA--TTTCCTG-T---AA-CA-C-CG-TCA-AAT-T-C-GT-----TACT-C--A-----T--A
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gtacatgTCAGACAGGGCTATCATTCTTATGAATTA--CTTTGATAAAGCCTGTATCCCACTCC-TTTGAATATT-TGCCAG-AG-GACAA-GATAAATTACATGTAGATAATTT-C-AGCAAA--TGGT-ACAATATGTGGTACGGTGGCTAGTA-ACATTTCATT-TTCATTG
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TAAATAA-GA--AA----AGTTT-ATT-CCA--A-T-T--TT-G-GG-CC-CAAGAGG---GCAT---------AATAGAA------------GTATTATTTAAAAA--------------------CAT-----T-CA-T----GA----AGA---AA-G-A------
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    agtttaTAA-GT--TA----A-TTC-ATT-TTC--A-A-AAATT-GCGG-CC-C-AGAGGAATGCAT---------TACAGAG------------ATAT---------AAGGTTCAAATA---------CAG-AA--T-AA-T--A-AA----AGA---AT-G-A------TT-TC-C--A--AAA-GA--T---AGATAA-AGT--AG-A-Taatgtccaaaaagaaggaagaaattattttttacaatattataacatacatggatgtgg
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        agaTT-ATT-TCCA-A-T-T--TT-G-GC-CC-C-A-AGG---GCAA---------TA-AAAGAATACCAGGTTCACAT---------A--------------------CATAAA--T-CA-T--A-AA----AGAGCTAA-C-A------TT-AT-CT-A--AAT-GA--T---AGATAC-TATA-AA-A-TAACA-AGGT---TA-T-ggaatgtgatttggtcaatca
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aagtagtattaaagtaAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA-------------------------A-G-A------CC-AT-CC-A--AAT-GA--TTATAGATAA-AGT--AAGA-TTACA-AAGT---TA-T-GA---TTA-AATC---AA---A--T-TT-CC-TCA---------------ATTTGT----------GAG--CAGCT------ATAGT--T--G-------T--GT--G-TT----A-AA--TTc
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTTCAGACATTTCATTATTTTATCCCAC-CCAA--ACATGCTTGATTTATTATTTTTTAGCT-TTGTCACGGCAGAGATTATTTCCTTTTCTATATTT--------CCTAAC-Ggg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cacaggTAAGTAA-GTAATATCTTA-TTT-ATT-TCC--AAT-T--TT-G-GG-CC-C-AG-GG---GCAT----------ACAA-G------------ATAT---------AAC------------------CAT-AAACT-CAAC--A-GA----AGA---AGTGCA------TC--T-C--A--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AACA-TAACATAAGT---TA-T-GGGACT-C-ACTCACAAA---A--T-TT----TCATGACACAGTACACTGATT-GTTACCTGATACGAG--CAGCT------GCA----T--ACACTCACT--GTA-G-TTGGCAA-AATTTTTTCAA-TTA-AA-CA-CACGTTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAACATCCACGATTTTCT-C-CT-AT-TA-AA---CAGGTGATAT-A-TACCTCCGATAAAAGTATTT----A-TAC--AAGTATAT-CA-TCATACAAGGA------TT--CTATTGTGTAA-TGTG-T-TTATAAAATTAT--CTTAAATGTT-GG----TA-TGC--TGT-A---CCGGCATCAATTCATGGCTAC-A-AACAAAT-GGAAC-TTGGAAACA-T-TCT--CCCAAA--CAG-CG-T-CAGTA--CTTAACCG-ATA-CTCGACACT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             acccacgggtaATTCCAAAAACTTACTAAATGAAA-CAATTG-CCAAGAC-TTGAGGATTCACGAATT-AC-TCGAAAATATTTTTC-CTCTACAGAATCTTG-TTTTGAA-A-----TGA------ATGA--ATA-TGT-TCG-CA-GT-TTTGCCA-CCA----CATTGGGGG-TTAATG-GT-CGCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACAAATGCCGCACC---T--GCGAATAATTA------TTAATCGCTC-ATAGCG-TGGACTTTAA-TTAAAAGATAAACAAGTTTTT--GAC-AC--A----ATTATTCCATT-GTTCAAT--C--ATGACTAATTAGAACAT-TGTA-----ATA-TC-CTAA-CTT-ATTTAACAAAAATATAT-AATG-----AATG---GCGGTAACTGTAGT-A-TCTTTCCACAAAATAACTAAT-TTGTTG-TTCACTATA-TCCTA-TACACT-CAA-TTGATTT--TCAGT-ATACAGCAGTT-C-TCTTGAAA-TAATCGAAT-CTACAAAGGGG---A----------ATCTA-AAATTCTCTTC-CGAAAA--TATTGTACGAACATAAGATC-TTTTTAT-AA---CAT--CAAAATTTACATAGTGGAATTCGACCA-AGTTTTT-CACGCTACAATAAATCTGAAGACCCTTTTGGAGGTATCCTTTTTATGTAC----------AAGTAACCTACA---AATAT-TATTTCAAGAGACTTTATGTTTTG-CA-TTTGGTTTAATCTTACAATAGCAGTA-CAT-TTTATTAA-AG-A-AGACCTTTT-CTA-TACACAATAAaccaatggtttaaacattcttttaaatctattttatctatctcaataatgtttccttgctgtaggacgcccggacgcagggaatttcaataaatgcctataagaaatgaaggctcttggatgatgagagagaactgattcatatttaccccacaacgattatttgtattccaaaaacttactaaatgaaacaattgccaagacttgaggattcacgaattactcgaaaatatttttcctctacagaatcttgttttgaaatgaatgaatatgttcgcagttttgccaccacattgggggttaatggtcgcaatgtctgaaagtgtactacaaatgccgcacctgcgaataattattaatcgctcatagcgtggactttaattaaaagataaacaagtttttgacacaattattccattgttcaatcatgactaattagaacattgtaatatcctaacttatttaacaaaaatatataatgaatggcggtaactgtagtatctttccacaaaataactaatttgttgttcactatatcctatacactcaattgattttcagtatacagcagttctcttgaaataatcgaatctacaaaggggaatctaaaattctcttccgaaaatattgtacgaacataagatctttttataacatcaaaatttacatagtggaattcgaccaagtttttcacgctacaataaatctgaagacccttttggaggtatcctttttatgtacaagtaacctacaaatattatttcaagagactttatgttttgcatttggtttaatcttacaatagcagtacattttattaaagaagaccttttctatacacaataaatggacaggggcccaaacgttgtatat
gi|30                         : acccacgggtataagtaagtaatatcttatttatttccaattttgggcccaggggcatacaagatataaccataaactcaacagaagaagtgcatctcaaatgatagataaagtaacataacataagttatgggactcactcacaaaattttcatgacacagtacactgattgttacctgatacgagcagctgcatacactcactgtagttggcaaaattttttcaattaaacacacgttcacattcattactcataagccaaacatccacgattttctcctattaaacaggtgatatatacctccgataaaagtatttatacaagtatatcatcatacaaggattctattgtgtaatgtgtttataaaattatcttaaatgttggtatgctgtaccggcatcaattcatggctacaaacaaatggaacttggaaacattctcccaaacagcgtcagtacttaaccgatactcgacactaccaatggtttaaacattcttttaaatctattttatctatctcaataatgtttccttgctgtaggacgcccggacgcagggaatttcaataaatgcctataagaaatgaaggctcttggatgatgagagagaactgattcatatttaccccacaacgattatttgtTAAGTAA-GT---A----A-TTC-ATT-TTC--A-AAT--TT-G-GG-CC-C-AGAGA---GCATACAGAGAA-TACAGAGTTC---------ATAT---------A--------------------CATGAA--T-AA-T--A-AA----AGA---AT-G-A------TT-AT-C--C--AAA-GA--T---AGATAA-AGatggacaggggcccaaacgttgtatat
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       c-AA--T-CA-T--A-AA----AGA---GA-G-A------TT-AT-CCCA--AA--GA--T---AGGTAA-CGTG-AA-A-TAAC-------------------------T------------T-TT-C--TCA---------------GTA-AT----------GAA--CAGCT------ATA----T--G-------C--GT------------AA--TTTTCAA-T---GA-CA-T-TG-T
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             attagatgGTAAGTAA-TT--TT----T-TTT--TT-TCA--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGGGG---GAATACAAAGAA-TACAGAGTTT---------ATCT---------A--------------------CATAAA--T-CA-T--A-GA----AGA---GA-G-A------TT-AT-C--C--AA
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aACTTGTA---TCTGTATTTATTGTTCCC-C--AAAT----------------G-CAGTA-CTTACCG-GT-------TG-A----CCTG-TATGATCATA----C-AA---GT-GTATC--A--GGTA-TGCA---TT
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TCAGTATGCTATTAC---TCCTTT-GGATA-AGCAA-GAAGTT-ATAGTT----CTTCT------GTAATGTGATGGGTCAGA-AGGACTATCATT
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -TTT-ATT-CCA--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---ACA----------TATAAAA------------GTA
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 acacgT------ATA-T--TTAA-CTT-ATT---CAAA---ATAT-AATG-----AATCAATGC--------TACT-ACTCC--------AACTACT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACatgatagttttataaagttgaaaacatatct
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TTTTT-CCCTTGAAAAGCTTC-TTTTG-A-A-----T-AGGCCTAATCC--ATA-TGT-TCG-TA-AC-TT----G-CC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   taGTAAGTAA-GT---A----A-TTT-ATT-TCC--AAT-T--TT-G-GG-TC-C-AGAGG---GCATACAAAGAA-TACAGAGTTC---------ATGT---------A--------------------CAT-AAG-T-CA-T--A-AA----A-A---GA-G-A------TT-AT-CC-A--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-AATAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---C--T-TTTC--TCA---------------ATT-GT----------G-------------------------------------TA-G-TTGGCAA-AA--TTTTCAA-T---AA-CA-C-TG-TCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----TTTTTTTC-T-CT-AT-TG-CA---TGGGT--T-T-A-T----------AAAGTTCTT----A-TAC-AAAGTGT-T-CA-T-------GGA------TT--CTA-TG---AA-TG-G-T-T----------TTCTTTAG-TGTT-GG----TA-TGC--TGT-A---CAG---TAAA---ATA----T---A--AAAT-GGAAT-T------CA-T-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-GCAG-ACA-CT--ACATTTT-------T-TTG---TGTG----TGTGT--A--AC-GCCC-AGTTTCCATAGCC-AA-AGA-ATGAGAACTG---------------------AAA-CA-TTA-C-AAGA-CTTGAGGATT-ACGAA-TTAC-TGAAAAATA-CTTTT-CTCTTCAGAATCTTG-TTTTG-A-A-----T-A------ATGC--ATA-TGT-TCG-CA-GT-TT----G-CCA----CATT----G-TT--TG-TC-TGCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---C--ATGAATATT--------TAAATCGCTC-AT---G-T-AACTT--A-TTA----GT-AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------AGT-TTT--AT--C--ATG--TA--TAAAACAC-TGT------ATA-T--TTAA-CTT-ATT---CAAA---ATAT-AATG-----AAT----GC--------TACTAA-TCC--------AAATGCT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACA-TTG-TTT--TCA-T-ATACAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-AATT-CTAC--AGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TT-CGTAAA--TAAT-TA-AAAC---AG--C-TCTTTAT-AA---CAT--CAAAA--TACATA--GGGAATCGACCA-AG---TT-CAC-CTACAATAGCT-TGA------ATT--GAGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---TATATAT--TTCAAGAATTTT-ATG---TG-CATTTT-------TTTT------GCAGTA-CAT-TTTATTAA-AGAA-G----TTTT-CTA-T--ACAATAATCAGGGCGTTT-GACG-AAACTTGTA---TCTGTATTTATTGTT-CC-CCCAAATTCCACATGCATA-AG-G-CAGTA-CT----G-GT-------TT-A----ACTG-TATGGTCATA----C-AA---GT-GTATC--AG-GATA-TGTA---TTTTAGGTT-T--AATATTT-CCAAAAC-----ACTT--GGCTAGTT-TAAAATAAG-CATTTAAGGCT-TTTTTGTA-AAGA-TCAAA--TG-AC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATG--AGATAAAAA-CAATC-CCCAGATATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATC--TGATTTGTTA-TAGAAATTTTTT-------TT-ATC--TG-ATTTTTTACCGTTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAA--TTT--TTGTCTTTTTGAGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-----A-CAATctt
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AGCT------ATA----T--A-------T--GTA-G-TTGGCAA-AA--TTTTCAG-T---AA-CG-C-TG-TCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CC
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TCACCTAATTTTGC-TGGA-------TCATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAGAA----TGGT---AGATT---AT
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aT-TCC--AAT-T--TT-G-GGTCC-C-AGAGG---GCAT---------
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -AT---G-T-AACTT--A-TTA----GT-AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------AAT-Taatatactcaa
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATAATCAGGGCGTTT-GACG-GAACTTGTA---TC
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GGTAAGTAA--T--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TTCG-GG-CC----GAGG----CATA--------CACAAAG------------A-AT---------AAGAGTTGAGAAGTTCAATTTCAT-AAA-T-CA-T--AAGA----AGAG--AA-G-A------TT-AT-C--A--AATTGA------AGATAA-A-T--AA-A-TA-CA-AGGTCTATA-T-GAA--T-A-AATC---AA---C--T-CT-CCTTCATCC------------ATA-GT----------GAG--CAGCT------ATACTAGT--A-------TCAGTAAG-TTGGCAA-AA--TTTTAAA-T---AA-CA-C-TG-TCG-CAT-C-C-AT-----TGCT-C--AATATTT--AA--AGCCCAATTA-----AATTTTTCAT-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-CTAA-------AAAGTTCTT----A-TAC-A--GTGT-T-CA-T-------GGAT-----TT--G-A-TG---AA--G-G-T-T----------T---TTAG-TGTT-C-----TAT-GC--TAT-AA--CAG---TCAA---ATA----TTA-A--CAATTAGAATGT------CAAT-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-ACAA-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCAT-TTAACT--TGTCTTTG-GT--A--ACAGCCC-AGTTTC-GTAGCC-AA-AGA-ATGACAACTGA-TCTG-AAATTTG-----TAAAA-CA-TTG-C-CA-ACGTAGAGGTTT-ACGAA--TAC-GTGAAAATAATCTTT-CTCTACATAAACTTGATTTTG-A-ATAGCCT-A------ATGC--ATA-TGTGTCG-GC-GT-TT----G---A----AATT----GCTT--TGTTC-TGCA-A-TGGCGGA----TGTCCT-----A-A----------C---C--ATGAATAATT-------TAA--CATTCTATG--G-T-AACTTC-ATTTA----GT-AACAA----TT---ATAAC--ATTACAT------ACTGTTT--AT--CTAATG--TA--TAGCACATATGT------ATA-TACTTAA-CTT-ATT---CAAA---ATA--AATGAAATCAAT----TC--------TACT-A-TCC--------CACTACT--TGTTGTTGAT------TATTC--ACTACAATGAGA-TTG-TTT--TCA-CAATACAGCA--T-TATCTC--AATTACT-GAAT-TCTC--AGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TTGTGTAAAATTATT-TA-AAACT--AG--C-TTTTAATAAA---CAT---AAAA--TA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aCATA-AA-GGCAGTA-CT----G-GTCCGTTCGTT-ACATTACTGATATGATCATAACACCAAG---TT-GTATCTCAGCGGTG-TGTACTTTTTTCG--C-T--AATA-TTTCCAAAAC------CTT--GACTAGCTCTAAAATAAG-CCTTTAAGGCTCTTTT-GTA-AAGAATCAAA-TTGGAC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATGCAGG-TAAAAAACAATT-CC-AGAGATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTCAGATGATT--TGATTT-TTAATAGAAAAACTTT-------TTTATC--TG-AT---------TTTT-CTTACCGTTTTTTTACAG---------------AATATATGACAATGTTT--TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGAATAGGCAATATTT-ACTGAACATCAGCATTCAAGCTTTTTT-AATACATACCCGCTG---AGCCCCT-CCCTCGGTTTTCAGAA-TTAACACTGAAAAATCATCAGCATACCACGACTA-AACACATTTAAGCGAT-GTGTCACCTAATTTTGCGCGGGATAATATTTATCATTATATCAGTC-GGACAATAG-ATATCTGGTTCAGGATCCATGTCGAGTTTAT---TATTTTAACAAAGGTTT-GACTTACGGTACTTCTGTTACTCCTCCCGGGC-TGTTTAG-ACGACTCCACTCCACCGTTAAGGCCTTTCCACATGAAATTCG-AAGTTT-ATATCTGTTGTTCGGAGTTTGTGGTACAGTTATTAATTATG-TTTGGCCA-GTACATACTCTTGACATGACTTTATAGAgt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TTTTT-CCCTTGAAAAGCTTC-TTTTG-A-A-----T-A------ATCC--GTA-TGT-TCG-TA-AC-TT----G-TCCTTTTCATT------TT--TA-----GCACA-T-TCTGACAAAT-TACTTTGCCATA----------CA--T--GTACATATTAA------TAAATCTTTT--T---C-T-AAGTTC-A-TTA-------AACAC----TTTTGAT-T--------GT------AGA-TCTGAAA--C--TTG--AA--AAAGATGT-TATCGCAGGATA-TG-CCAA-GTTGATT---CAGT---AAAA-AATA-----AAC----AC--------TGCTCA-ACC--------AACAATT--C-TTTTTG-T------TA-TC--A-TTCAAA-A------------TCA-T-AT--------T-T-TCTT--GA--AGT-GCACACT-C-AAGCAA---AGTATCATTTGATTTATGAATGT---GT-TGTAAA--TATT-TA-A--C---AG--T-ATTGGAT-AA---GGTTTCAATA--TATA-A-TGGATGCCTACCT-AA---TT-CCC-CCATAACTGCA-TAG------TTT--GAAG---CTTTCTTATGTACCCCCCGGTGTA------CCCCA---CATATGTA-CTTGAGAGTTTTAATG---TG-AA-GTT-------TATC------ACTATA-TATATTTTTCAT-TG-A-G----TTTT-CAA-T--ATTATAATTTGGTCTCTT-AAC---AA-TAGCAGATTCTGAATTTATAATT--C-CCCAAATTTCACTTCCATATAACA-CAATA-------G-GT-------TT-T----ATTG-TGTGATCAtgtaattcatcggccattcatcgtttcacttctagtcgaagttgtgtcgcaagccttgtg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aggta-TGA-TAGTAGCGTTCAAGCTTTTTT---------------G---AAGTCTT-CCTTCAGTTT-CAGAAATTAACACT---AAGTCATCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAA-GAT-GTGTCACCTAATTTTGC-TGGA-------TCATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TC--------TC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AAAGATTTGGACTTA-GGT-------C-G--TCTCC----C-TGTCTAACAC---------CCACC-TTAGG-----TTCAAAT--------------T-AT--------TTTGAAGTTT----TACAG--AC--AGTATG-TTT-GCCATGTACATACTTTTGA--TGACTTTATAGAAAGGCCCCTT-ATGTCAAGC-TG-ATGCAGCC-TGTGTAG-AAGATCTG-AATGTAAAACAGTGTCAAAAGCCTTAGAAAAATCAACA-AAGCAAACGTATAATT--TGGAA-TT-ATCATTTGTATA-TTTTTGAATAACGGTTCT-AAGTATAAAAATGTGGTCACTAGTTCTGGCTTTTGGTTGAAAACCAATTTGAACTTTATTTATAATGTTGTTCGAGTCCAAGTAGTTTTGTAACCTGGTATTCAGTATGCTATTAAATATACTTTGGGATA-aaaagatgcaacaaaatgccggcatt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             caaaattaggAAGTAA-AT--T--------TT-ATA-TCA--A-T-A--TT-T-GG-CC-C-AG------GCAT---------AACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--A-CA-ACAA-GA----AGA---AA---A------CC-ATTC--ACCAAT-GA--T---AGATAA-CGT--AA-C-TAACA-AAGT---TAAT-GA---T-A-AATC---AA---AATT-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAGAGCAGCTT-----ATA----TTAA-------T--GTA-G-TTGGACA-AA--TT---AG-T---AATCG-C-TG-TCA-CATGT-C-ATCTTTATACTGC--A-----T--AAAAG--C-AATTA-----AATTATTC-T-CT-AT-TAACATACCAAGT--T-T-A-T----------AA-GTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----T---CTA-TG---AAATG-G-T-T----------T--TCTTGATGTT-AG----TAT-GCCATGT-AACACAA---TCAATG-ATG------A-A--AAAT-GGAAT-TAA----CA-TGCTTATC---AAAGCAC-AG-TACAG-A--CTT-GCAG-ACA-CTTAACATTTTC-TCACAT-TTA-CATGTGTTTTTGTGT--A--AC-GCC--A---TCAA-AGCC-AA-AGA-ATGAGAACTGGTTCTGAAATATGG-----TAAAA-CA-TTT-C-AAGA-CTTGAGGATT-ATGAAt
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): TTCCAATTGGGTCGCTGTGCCCCAGAGCGCGCAAGAACTAATAGGAGAGACCGTACTTAACAGTTGAGAAAGAATGTCCCAAAAAAAAGAAGTGCGGAAAAGTGACTAAGATTTCAAGTACAGAGTGCGTAATCACAAACTCTAACAT
Unaligned ( gi|35 ): AAGGGTATTCAGAACAAGAATGACATGGGAACATAAAGAAATAAAGTAAAATAAACAGGGAAAAACATCCAGATG
Unaligned ( gi|38 ): AATAAATTTGGAAATAAAATATCAATTTTGAAATAAAGAAAATAAATTTGAAATATTCATTATGATA