lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111 1111111111111
lowQualScore : 1111111111 1 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 22222 3333333333333 111 222222222222222 1111111111 555555555555555555555555555555555 1111 22222 44444444444444444444444444444444444444444444444444444 111111 111 2222222222 55555555555 1111111 333333333333333333333333 11 2222222222222222 111111 22 11 222 111 11 555555555555555555555 33333 33 11 3333333333 6666666 11 2 44444 1111111111111111 33333 444444444 22 111111 3333333 1111 11111 11111111 222222 11 1111 33333333333333333 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111 111 1111111 111 33333333333333333333 1 111111 11111111 333 11111 333333333333 55555555555555555 111111 11 11111 22 111 111111 11 11 22 44444444444444 222 11 2222 11111111 111 11 11 33333 111 2222222 111 66666666666666666 1111 1 1 111 2222222 11 666666666666666666666666666666 1111 11 11 2 444 2222222222222222222 44444444444444444444444444444444 33333333333 11111 77777777777777777777777777777 1 1 222 1 1 22222 1 2222 11111 1 444444444 111 111 11 11 111 1 11 1 11 11 11 33333333 333333333 999999999999999999999999999999999999999 1111 11 11111 11 111 2222222222 111 1 111 1 88888888888 2222 1 22 2 222 6666666666666666 11 1 1 11 22222222222222 111 11 222 1 1 111 1 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 2222 444444 1 1 33 22 1 2222 2 2 2 22 1 2 1 22 2 55555 2 2 1 1 1 1 222 1 1 2 2 2222 8888888888 1 1 2222 11 2 1 2 333 1 2 4444444 333 11 2 777777 1 4 444444 4 11 4 777 11111111111111111111111111111111111111 2 2 2 1111111111111 4 1 2 1 2 22 2 6666666 1 4
lowQualScore : 3 3333333333 2 2 444 3 2 22 2 2 4 2 2 333 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 555 2 2 88888888 2 6 22222 4 777777 55555 5555 5555 4444444444444 444 2 77 2 999 2 2 444 2 333 5 9999 555 222222222222222 33 2222222222 77 444444444444444444444444444444444 22 33 0 9999 2 2 66666 1 55555555555555555555555555555555555555555555555555555 444444 0 55 3 7 3 3 7 222 3 55 3 3 2222222222 88 00000000000 7 3 3 3 1111111 222222222222222222222222 3 22 3 0000000000000000 1 888888 88 11 4 4 8 444 888 88888 44 999999999999999999999 5 88888 5 22 5 55 5 1 4444444444 6666666 77 6 3 7 3 33333 6 5 7777777777777777 5 999 44444 5 666666666 99 44 888888 6 9999999 4444 6 6 6 99999 99999999 111111 99 6 33 4444 6 6 1 22222222222222222 6 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 7777 555 4444444 1 6 333 11111111111111111111 6 6 444444 6 66666666 6 777 66666 222222222222 6 22222222222222222 6 6 3 6 999999 6 88 6 22222 77 888 88 222222 11 33 8 8 6 44 00000000000000 8 222 99 11 3333 8 66666666 1 8 444 11 11 44444 8 8 444 0 8 1 8 6666666 8 3 444 55555555555555555 3 5555 8 6 0 6 444 8 8 88 6666666 4 11 777777777777777777777777777777 1 3333 1 77 8 77 0 1 1 555 1111111111111111111 1 44444444444444444444444444444444 66666666666 8 33333 8 888 33333333333333333333333333333 0 0 2 777 3 0 0 66666 0 1111 88888 0 2 111111111 777 444 6 3 11 11 0 8 444 6 55 11 1 33 8 11 11 33333333 222222222 333333333333333333333333333333333333333 0 4444 88 77777 6 11 8 555 8 8888888888 777 0 555 7 55555555555 7 8888 3 00 6 333 3333333333333333 33 0 0 11 77777777777777 777 88 333 3 7 6 666 3 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 6 8888 000000 3 3 7 7 00 1 55 5 1111 6 0 0 2 0 66 6 5 6 6 0 5 77 0 2 77777 0 2 0 2 5 2 7 5 3 5 3 3 6 555 3 3 0 0 4 5555 6666666666 3 5 3 7 6 4444 99 0 5 0 555 5 0 4444444 888 4 88 0 3 111111 5 77 4 0 111111 0 22 6 0 6 6 111 6 66666666666666666666666666666666666666 0 0 4 0 0000000000000 0 5 0 5 0 77 0 5555555 5 0
lowQualScore : . .......... . . ... . . .. . . . . . ... ................................................................................ ... . . ........ . . ..... . ...... ..... .... .... ............. ... . .. . ... . . ... . ... . .... ... ............... .. .......... .. ................................. .. .. . .... . . ..... . ..................................................... ...... . .. . . . . . ... . .. . . .......... .. ........... . . . . ....... ........................ . .. . ................ . ...... .. .. . . . ... ... ..... .. ..................... . ..... . .. . .. . . .......... ....... .. . . . . ..... . . ................ . ... ..... . ......... .. .. ...... . ....... .... . . . ..... ........ ...... .. . .. .... . . . ................. . ............................................................................... .... ... ....... . . ... .................... . . ...... . ........ . ... ..... ............ . ................. . . . . ...... . .. . ..... .. ... .. ...... .. .. . . . .. .............. . ... .. .. .... . ........ . . ... .. .. ..... . . ... . . . . ....... . . ... ................. . .... . . . . ... . . .. ....... . .. .............................. . .... . .. . .. . . . ... ................... . ................................ ........... . ..... . ... ............................. . . . ... . . . ..... . .... ..... . . ......... ... ... . . .. .. . . ... . .. .. . .. . .. .. ........ ......... ....................................... . .... .. ..... . .. . ... . .......... ... . ... . ........... . .... . .. . ... ................ .. . . .. .............. ... .. ... . . . ... . ............................................................................................ . .... ...... . . . . .. . .. . .... . . . . . .. . . . . . . .. . . ..... . . . . . . . . . . . . . ... . . . . . .... .......... . . . . . .... .. . . . ... . . ....... ... . .. . . ...... . .. . . ...... . .. . . . . ... . ...................................... . . . . ............. . . . . . .. . ....... . .
lowQualScore : 3 4444444444 4 2 222 3 1 99 1 1 2 1 1 777 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 888 1 1 66666666 2 7 22222 7 444444 99999 0000 3333 0000000000000 111 4 99 4 444 5 5 444 5 666 3 5555 000 999999999999999 11 5555555555 99 444444444444444444444444444444444 88 77 1 0000 7 7 00000 9 00000000000000000000000000000000000000000000000000000 111111 2 00 6 3 6 6 3 777 6 00 6 6 3333333333 66 22222222222 3 6 6 6 8888888 444444444444444444444444 6 33 6 8888888888888888 3 555555 55 00 0 0 0 444 444 11111 44 999999999999999999999 0 55555 0 33 7 77 7 9 1111111111 1111111 55 7 2 3 3 88888 7 0 9999999999999999 7 444 00000 7 666666666 22 88 333333 7 0000000 5555 7 7 7 77777 33333333 777777 22 7 77 2222 7 7 0 77777777777777777 7 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 9999 000 3333333 8 7 888 66666666666666666666 0 7 000000 7 88888888 7 333 77777 777777777777 7 22222222222222222 7 7 2 7 222222 7 33 7 11111 00 000 88 000000 00 66 0 0 0 44 00000000000000 0 000 44 00 2222 0 22222222 0 0 000 00 00 00000 0 0 000 6 0 4 0 0000000 0 2 000 22222222222222222 2 0000 0 0 8 6 000 0 0 66 0000000 4 00 666666666666666666666666666666 4 0000 4 44 0 44 0 4 4 000 7777777777777777777 0 55555555555555555555555555555555 22222222222 0 22222 0 555 00000000000000000000000000000 0 0 5 888 2 0 0 00000 0 2222 55555 0 5 000000000 555 000 5 2 00 00 8 0 000 0 88 00 8 00 0 00 00 00000000 000000000 444444444444444444444444444444444444444 8 8888 66 88888 0 00 0 555 0 8888888888 555 0 222 0 11111111111 3 3333 3 77 7 777 2222222222222222 88 0 0 22 22222222222222 555 33 333 3 0 0 777 3 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 3333 000000 3 3 3 3 77 0 55 5 0000 0 0 0 5 0 00 0 5 0 0 0 5 55 0 5 00000 0 5 0 5 0 5 0 5 0 0 0 0 0 777 3 3 0 0 0 5555 0000000000 0 0 0 0 0 5555 55 0 5 0 000 0 0 5555555 555 0 00 0 0 555555 0 00 0 0 000000 0 00 0 0 0 0 000 0 00000000000000000000000000000000000000 0 0 0 0 0000000000000 0 5 0 5 0 55 0 0000000 0 0
consensus : GGTAAGTAA-GT--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT---------TACAAAG---A------------TA-TA--------------------CAT-AA-T-C---A-TA-----GAAGA---AA-G-A------T-CA-T-C-AA--AT-GA--T---AG-----ATAAA----GTA----A--N-TAACA----AAGT---T-A--T-GA---T-A-AATC---A-AA--T-TT-C--T---CA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TA--------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAAN-T-AA-CA---ACTGTCA-----CA-T-CA-TTA--CT-C--A-----T-A---GGC-CAA---AT-A---AAT------TTTT--C-T-CT-AT-TA-CA---CAGG-T--T-TA-T----------AAAGT--TTT---T-ATA-NCAA-GTG-T-TCA-T-------GGAT-----TT--CTA-----TG-AA-TG-G--T-T----------T--C--TTAGATGTT---TGGTATTGC--TG-T-A-CAG--TCA--AATG-TA-AAAA-TGGAAT-T------CA-TC-TTCAA--CAC-AGTC-A--G-ACTTGCAG-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCATTTAANTTG--TGTTTTTG-NGTA--ACGCCC-AGTTTCAATAGCC-AAAGA-ATGAG-AACTGATTCTGAAAANTTG-----T-AAAACA-TTT--CAAGACCTTGAGGATT-ACGAATTTAC-TGGAAAATA-TTTTTTCTCTACAGAATCTTG-TTTTG-A-A---T-AAT--GCAT-ATGT-TC-GCAAGT-TTG-CCAC---ATT-G----TT--TG-TCCG-CA----A-TGTCTGA-AAGTGTACTACA----------C---C--GTGAAT-AT-----TTA-------A--AATC---------GCTCATG---TAA----AC---------TA-T-AG---T---------AACAA----TTGA-T-AC--A----ATANT-TT--TAT--------C--ATG--TA--TAGAACAT-TGTA-TA-T--C-TAA-CTTATTCA---A----A-ATA---AATG-----AAT----G-------CTACT-AN-T--------------C-AACTACTT-TTGTTG-TT------A-TC--A-TACAAT-ACA-TTGT-TTTCA-T-ATA-CAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-GAAT-CTACAA-GGGG---A----------ATCTA-AAATTCTT---CG-TAAA--TATTTAA--AAC-A---G--C-TTTTTAT-A---ACA--TCAAAAT--ACATA-TGGGAATCGACCA-AG-TT---CAC-CTACAATAGCT-TGA-------TTTG-AGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---AATA-TATATTCGAGAGNTTTAATG---T-GC-A-TTT-------TNTCGC--AATA--ATA------TTT---ATTAAA-GA---NTTTTCTA-T--ACAATAATCAGGGCG-TTTGACGG-AACTTGTATCTGTATTTATTGTTCCC-CCCAAATTTCACATGCAT-A-AA-G-CAGT-ACT----G-G-T-------TTA----ACTG-TATGATCATA----CAAA---GT-GTATC--AG-GGTA-TGTATTTTNGGTT---T--AATA-TTCCAAAAC-----AC--TTGACTAGTT-TAAAATAA-GCNTTTAAGGCTCTTTTTGTA-AAGA-TCC-AA-TTG-AC----AACATGTG-A---AGGA-GCCTGATG--A-G-TAAAAA---CAATT-CCCAGATATT--TG--TACGATG-ACACT---TGTTC-GATGATT--TGATTTT-TA-TAGAAA--AAC--TTTTT-A----TCTGAT---------TTTT-C-------------A------CA---------------AAATA-T--GACAAT-TTT----TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AG-ATAGGCAATATTT-A-TG-ACAATAGCATTCAAGCTTTTTTAATACAT---CGCTG---AGGCCCT-CCCTCGGTTTCGGAAATTAACACTGA---A--TCATCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAG-GATGTG-TCACCTAATTTT--GCCGGA-------TCATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATCGA--TTAA---TATTTTAA-AAAGGTTT-G-ACTTA-GGT-------TTA--CCTCCC----TGTCTAA-ACG--------CC-ACCNTTAGG-----TTCAAATG-AACTCG-AAGTTT-AT--------TTCGGAGTTT----TACAG--AT--ATTATG-TTT-GCCATGTACATACTCTTGA-ATGACTTTATAGAAGGGCCCCTTTATGTCAAGCCTGTGTGCAGCCTTGTGTAGAAAGANCTGAAATGTAAAACGGTGTCAAAGGCCTTAGAAAAATCAACACAAGCAAACGTACAATTGCTGGAANTTA-ATCATTTGTATATTTTTTGAATAANGGTTCTAAAGTATAAANATGTGGTCACTGGTTCTGGCNTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTTATAATGTTGTTNGAGTCCAAGTAGTTTCGTANCCTNGTATTCAGTATGCTATTAA--ATACTTT-GGATA-AGCAAAGAAGTTGATNGTTANTCCTCTATA---GTANTNTGATGGGTCANAAGGGCTATCATTCTTATGAATNGNTTTTGATAAAGCCTGTNTCCCACTCCCTTTGGGTATTCTGCCAACAGAGGACAACGACAAGTTACATGTAGACAATTTACAAGCANATGTGGTAANAATATGTGNTACGNCGGCTNNCAACATCTCATTTTCANTGCCAT-CTAATCGCAGCTTGATTTATTATCTTTCAGATGTTTTTATTGCATCAATGATTTTCTTTTCTTTAATTG-A-TAAATCTAACGAAGT-AATG--TTGATATTTCTGCTGACTTGGACAATAAATCTTCAAAATATTTAATTCTGGGTATCAAATTTACTAGTCAATACNGAACAATGTTTGTAAAATGATTTACACCCATTGTTCACTAGATATCTTAATCGGACTAATCTTGCGGATTGCTGACTGATTCAAAACCCTTTCAAGAGTTTCCAG-TATGATA
Reference ( gi|2 ) : GGTAAGTAA-GT--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT---------TACAAAG---A------------TA-TA--------------------CAT-AA-C-C---A-CA-----GAAGA---AA-G-A------C-CA-T-C-AC--AT-GA--T---AG-----ATAAA----GTA----A--T-TAA-A----AAGT---T-A--T-GA---T-A-AATC---A-AA--T-TT-C--T---CA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TA--------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAAA-T-AA-CA---ACTGTCA---G-CA-T-CG-TTA--CT-C--A-----T-A---G---CAA---A--A---AAT------TTTT--C-T-CT-AT-TA-CA---CAGG-T--T-TA-T----------AAAGT--TTT---CAATA-ACAA-GTA-T-TCA-T-------GGAT-----TT--CTA-----TG-A--TG-G--T-T----------T--C--TTAGATGTT---TGGTATTGC--TG-T-A-CAC--TCA--GATG-TA-AAAA-TGGAAT-T------C--TC-TT-AA--CAC-AGT--A--G-ACTTGCAGGACA-CT--ACATTTTC-TCTCATTTAAATTG--TGTTTTTG-GTTAGTACGCCCCAGTTTCAATAGCCCAAAGATATG-G-AACTGATTCTGAAAATTTG-----T-AAAACA-TTT--CAAGACCTTCAGGATT-ACGAATTTACATGAAAAATATTTTTTTCTCTACAGAATTTTG-TTTTG-ATA---C-AAT--GAAT-ATGT-TC-GCAAGT-TTG-CCAC---ATT-G----TT--TG-TCTT-CA----A-TGTCTGA-AAGTGTACTACA----------C---C--ATGAAT-AT-----TTA-------A--AATC---------GTCCAT----TAA----AC---------TA-T-AG---T---------AACAA----TTGA-T-AC--A----ATAAT-TT--CAT--------C--ATG--TA--TAGAACAT-TGTA-TA-T--C-TAA-CTTATTCA---A----A-ATAT-TAATG-----AAT----G-------CTACT-AG-T--------------C-AACTACTT-TTGTTG-TT------A-TC--A-TACAAT-ACA-TTG--TTTCA-T-ATA-CAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-GAAT-CTACAG-GGGG---A----------ATCTA-AAATTCTT---CG-TAAA--TATTTTA--AAC-A---G--C-TTTTTAT-A---ACA--TCAAAAT--AC-TA-TGGGAATCGACCA-AG-TT---CAC-CTACAATAGCT-TGA-------TTTG-AGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---AATA-TAT-TTCAAGAATTTTTATG---T-GC-A-TTT-------TTTCGC--AGTA--GTA------TTT---ATTAAA-AAG--TTTTTCTA-T--ACAATAATCCAGGCG-TTTGACGG-AACTTGTA-CTGTATTTATTGTTCCCACCCAAATTTCACATGCAT-A-AA-G-CAGT-ACT----G-G-T-------TTA----GCTGCTATGATCATA----CAAA---GT-GTATC--AG-GGTG-TGTATTTTTGGTT---T--AATA-TTCCGAAACCAAAAAC--TTGACTAGTT-TAAAATAA-GCCTTTAAGGCTCTTTTTGTA-AAGA-TC--AA-TTG-AC----AACATGTG-A---AGGA-GCCTGATG--A-G-T--AAA---CAATT-CCCAGATATT--TG--TACGATG-ACACT---TGTTC-GATGATT--TGAATTG-TA-TAGAAA--AAC--TTT---A----TCTGAT---------TTTT-C-------------A------CA---------------AAATA-T--GACAAT-TTT----TTGTCTTTCTGGGGTTGAC--AG-ATAGGCAATATTT-A-TG-ACAATAGCATTCAAGCTTTTTT-ATACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCAGTTTCGAAAATAAACACT-----A--TT-TCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAG-GATGGT-TCACCTAATTT---G-TGGA-------TTATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AATGGTCT-G-ACTTA-GGT-------TTA--TCTCCCG---CGTCTAA-A----------CC-ACCTTTAGG-----TTCAAATGAAACTCGTAAGTTT-AT--------TTTGGAGCTT----TACAG--AT--ATTATG-TTT-GCCATGTACATACTCTTGG-ATGACTTTATAAAAAGGTCCCTTTATGTCAAGT-TG-GTGCAACC-TGTGTAG-AAGAGCTG-AATGTGAAACAGTATCAAAGGCCTTGGAAAAATTAATA-AAGCAAACATACAATT--TGG-ACTTAAAT-ATTTGTATA-TTTTTGAATAAGGGTTCT-AAGTATAAACATGTGGTCACTGGTTCTGGCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTAATAATATTGTTAGAGTCCAAGTAGTTTTGTAACCTTGTATTCAGTATGCTATCAA--ATACTTT-GGATA-AGC-AAGAAGTT-ATTGTTATTCCTCTATACTAGTAGTTTGATGGGTCATATGGGCTATCGTTTTTATGAATAGG-TTTAATAAAGCCTATTTTCCATT-CCTTTGGGTATT-TGC---CAGAAGACAA-GACAAG----AT-TAAATAATTT-T-AGCATATGTGGT-AAAATATATG--AC-TTGGCTTTCAACATCTCATTTTTAATGCCATCCTAATC-CAGC-TGATTT-TTATTCTTTAGATG-TTTTATTGCATCAATGATTTTCTTTTTTTTAGTTGTACTAAATCTAACGAGGTAAATGTTTTGAT-TTTCT--T--CTTGG-CAAGTAAT-TTCAAAATATTT-ATTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAG-TATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGACT--TTC-AAACT-------GAGTTTCCAGTTATGATA
gi|5 : GGTAAGTAA--T--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TTCG-GG-CC----GAGG----CATA--------CACAAAG---A-------------A-TAAGAGTTGAGAAGTTCAATTTCAT-AAAT-C---A-TAA----GAAGAG--AA-G-A------T-TA-T-C-AA--ATTGA------AG-----ATAAA-----TA----A--A-TAC-A----AGGTCTAT-A--T-GAA--T-A-AATC---A-AC--T-CT-CCTT---CATCC------------ATA-GT----------GAG--CAGCT------ATACTA--------GT-ATCAGTAAG-TTGGCAA-AA--TTTT-AAA-T-AA-C----ACTGTC----G-CA-TCCA-TTG--CT-C--AATATTT-A---AAGCCCA---ATTA---AAT------TTTT--CAT-CT-AT-TA-CA---CAGG-T--T-TA-CTAA-------AAAGT--TCT---T-AT--AC-A-GTG-T-TCA-T-------GGAT-----TT---GA-----TG-A--AG-G--T-T----------T-----TTAG-TGTT---C--TA-TGC--TA-TAA-CAG--TCA--AATATTA-ACAATTAGAATGT------CAATC-TTCAA--CAC-AGTC-A--G-ACTTACA-AACA-CT--ACATTTTC-TCTCATTTAACT----TGTCTTTG-G-TA--ACAGCCCAGTTTC-GTAG-CCAAAGA-ATG-ACAACTGA-TCTG-AAATTTG-----T-AAAACA-TTG--CCA-ACGTAGAGGTTT-ACGAA--TACGTG-AAAATA-ATCTTTCTCTACATAAACTTGATTTTGAATAGCCT-AAT--GCAT-ATGTGTCGGC--GT-TTG---AA---ATT-GC---TT--TGTTCTG-CA----A-TGGCGGA----TGTCCTA-A----------C---C--ATGAATAAT-----TTA-------A--CAT-----------TCTATGG--TAACTTCAT---------T--T-AG---T---------AACAA----TT-A-TAAC--ATTACATACTGTT--TAT--------CTAATG--TA--TAGCACATATGTA-TA-TACT-TAA-CTTATTCA---A----A-ATA---AATGAAATCAAT----T-------CTACT-AT-C--------------C-CACTACTTGTTGTTGATT------ATTC--ACTACAATGAGA-TTGT-TTTCA-CAATA-CAGCA--T-TATCTC--AATTACT-GAAT-TCTCA--GGGG---A----------ATCTA-AAATTCTTG--TG-TAAAATTATTTAA--AACTA---G--C-TTTTAATAA---ACA--T-AAAAT--A
gi|1 : aGTAAGTAAAGT--TA----A-TTTTATTCTCCGAA-T-T--TT-G-GG-CCAC-GAAGG---GCAT----------ACAA-G---A------------TA-TA--------------------AA--AA-A-C---A-CA-----GAAGA---AA-G-T------G-CA-T-CCAA--AT-GA--TGA-AG-----ATAAA----GTA----A--A-TAACA----AAGT---T-A--T-GAA--T-A-AATC---A-AT--T-TT-C--T---CA---------------ATT-G-----------GAG--CAGCT------ATACTT--------GT-A-------GATTGGCAA-AT--TTCTCAACCT-AA-AC---ACTGTCA-----CA-TTCGATTA--CT-CCAA-----T-A---AGC-CAA---A--T---AAT------TTTT--C-T-CTGATCTA-CA----AGG-T--T-TAAT----------AAAGT--TTT---TTAAA-ACAA-A-G-T-TCAAT-------GGAT-----T---CTA-----TG-AA-TG-G--T-T----------TGTC--TTAAATGTG---TG-TAT-GC--TG-T-A-CAA--TCA--AATG-TA-AAA--TGGAATGT------CA-TC-TTCAA--CAC-AGTC-A--G-ACTTGCAG-ACAGCT--ACATTTTC-TCTCATT--ACTTG--TGTTTTTGTGTTAA-ACGCCCGAGTTTCAATAGCCAACAGA-ATGAG-AACTAATTCT-AAAATTTG-----TAAAAACATTTT--CAAGA-CTTGAGGATT-AC-AATCT-----GAAAATA--TTTTTCTCTACAGAATCTT--TTTTG-A-A---CTAATGGGAATAATGT-TC-GC-AGTGTTG-CCAC---ATTGG----TT--TG-TCCTGCA----A-TGTCTGA-AAGTGTACTACA----------C---CCAGTGAA--AT-----T---------A--AATC---------GCTCATGC--T-A----ACTT-------TA-T-AG---T---------AACAAT---TTGATT-ACGGA----ATATT-TTTATAT--------C--ATG--TA--TAGAACATCTGTA-TAGT--C-TAAGCTTATTCA---A----ACATA---AATG-----AGA----G-------CTACT-AGTT--------------C-AACTACTT-TGTTTG-TT------A-TCGAA-TACAAT-ACAGTTG--TTTCATT-ATATCAGCA--TAT-TCTT--AA-GAAT-GAAT-CTACAG-GGGGCGAA----------ATCTA-AAATTCTT---CGAAAAA--TATTTAA--AAC-A---G--CGTTTTTAT-AAACACA--TCAAAAT--AC--A-TAGGAATCGACCA-AGTTT---CAC-CTACAATAGCT-TGA-------TTTG-A-G---CCTTTTTAGGTACAG--------A------CCA-A---AATA-TAT-TTCAAGAATTTTAATG---TGGCAA-TTT-------TTTCGC--AGTAACATG------TTT---ATTAAA-GAC--GTTTTCTAGT--ACAATAATCAGGGCGTTTTGACGG-AACTTGTATCTGTATTTATTGTTC---CCCAAATTTCACATGCATAA-AA-G-CAGTAACT----GTGTT-------TTA----ACTG-TATGATCATA----C--A---GTCGTATC--AG-GGTG-TGTATTTTTGGTTA--T--AAT--TTCCAAAAC-----ACTTTTGACTAGTT-TAAAATAAGGCCTTTAAGGC---TTTTGTAGAAGA-TCCAAA-TTG-AC----AACATGTGTA---AGGAGGCCTGATG--AGG-TAAAAA---CAATTGCCCAGATA-T--TG--TACGATGAACACT---TGTTCTGA--ATT--TGATTTT-TA-TAGAAA--AACTTTTT---A----TCTGAT---------TTTT-T-------------A------CAACGTTTTTTCTACAGAAATATT--GACAA--TTT----TTGTCTTTCTGAGGTTGACCAGG-ATAGGCAAAATTTGA-TG-ACAATAGCATTCAAGCCTTTTTAATACAC---CGCTGTGAAGGCCCTCCCCTCGGTTTAG-AAATTAACACTAA---A--TCATCAGCAT-C----AACATAACA---TTAAGAGATGGTGTCACCTATTTT---GCCGGA-------TTATCAT--TATC-GTCGAAAA-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAATATTATTTTAA-AAAGGTTTGG-ACTTA-GG--------TTA--CCTCCC----TGTCTTA-ACAC-------CC-ACACTTA-G-----TTCAAATG-AACTCGTAAGTTTGAT--------TTTGGAGTTT----TAGAG---T--ATTATGTTTT-GCCATGTACATAC-CTTGA-TTGACTTTATAAAAGG--CCCTTTATGTCAAGTCTGTGTGCAGCCTTGTGTAGAAAGAGCTGAAATGT--AACGGTATCAAAGGCCTTAG-AAAATCAACACAAGC-AACATACAATTGCTGGAACTT--AT-ATTTGTATATTTTTTGAATAAGGGTTCTAAAGTATAAACATGTGGTCACTGGTTCT-GCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTTAT-ATATTGTTAGAGT-CAAGTAGTTTCGTACCTTTGTATTCAGTATGCTATTAA--ATACTTT-GGAAATAGCAAAGAAGTTGATTGTTAATCCTCTATA-----ATTTTGAT-GGTCATAAGGGCTATCATTTTTATGAATAGGTTTTAATAAAGCCTA-TTTCCATTCCCTTTGGG-ATTCTGCCAACAGAA-ACAACGACAAG----AT-TAAACAATTTATAAGCATATGTGGTAAAAATATATGT-ACATCGG-TTTCAACATCTCATTTTTAATGCCAT-CTAATCGCAGCTTGATTTATTATCTTTCAGATGTTTTTATTGCATCAATGATTTTCTTTTCTTTAATTG-A-TAAATCTAACGAAGT-AATG--TTGATATTTCTGCTGACTTGGACAATAAATCTTCAAAATATTTAATTCTGGGTATCAAATTTACTAATCAATACTGAATAATGTTTGTAAAATGATTTACACCCATTGTTCACTAGATATCTT-ATCGGACT-ATCTTGCGGATTGCTGATTGATTC-AAATTCTTTCAAAAGTTT-CAG-TATGgt
gi|4 : aaGTAAGTAA-GT---A----A-TTT-ATT-TCC--AAT-T--TT-G-GG-TC-C-AGAGG---GCATACAAAGAA-TACAGAGTTCA------------TG-TA--------------------CAT-AAGT-C---A-TA-----AAA-A---GA-G-A------T-TA-T-CCAA--AT-GA--T---AG-----ATAAA----GTA----A--AATAACA----AAGT---T-A--T-GA---T-A-AATC---A-AC--T-TTTC--T---CA---------------ATT-GT----------G------------------------------T-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T-AA-CA----CTGTCA-----CA-TTCA-TTA--CT-C--A-----T-AA--G---CCA---A--A---TAT------TTTTTTC-T-CT-AT-TG-CA---TGGG-T--T-TA-T----------AAAGT--TCT---TA-TA-CAAA-GTG-T-TCA-T-------GGAT-----T---CTA-----TG-AA-TG-G--T-T----------T--TCTTTAG-TGTT----GGTAT-GC--TG-T-A-CAG--TAA--AATA-TA-AAA--TGGAAT-T------CA-TC-TTCAA--CAC-AGTC-A--G-ACTTGCAG-ACA-CT--ACATTTTT-T-----------TG--TGTGTGTG---TA--ACGCCC-AGTTTCCATAGCC-AAAGA-ATGAG-AACTGA----------------------AACA-TTA--CAAGAC-TTGAGGATT-ACGAATT-AC-TGAAAAATACTTTT--CTCTTCAGAATCTTG-TTTTG-A-A---T-AAT--GCAT-ATGT-TC-GCA-GT-TTG-CCAC---ATT-G----TT--TG-TCTG-CA----A-TGTCTGA-AAGTGTACTACA----------C---C--ATGAAT-AT-----TTA-------A--A-TC---------GCTCATG---TAA----CT---------TA-TTAG---T---------AACAA----TTGA-T-AC--A----ATAGT-TT--TAT--------C--ATG--TA--TAAAACAC-TGTA-TA-T--T-TAA-CTTATTCA---A----A-ATA--TAATG-----AAT----G-------CTACT-AA-TC-------------C-AAATGCTT-TTGTTG-TT------A-TC--A-TACAAT-ACA-TTGT-TTTCA-T-ATA-CAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-AATT-CTACA--GGGG---A----------ATCTA-AAATTCTT---CG-TAAA--TAATTAA--AAC-A---G--C-TCTTTAT-A---ACA--TCAAAAT--ACATA--GGGAATCGACCA-AG-TT---CAC-CTACAATAGCT-TGA-------ATTG-AGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---TATA-TAT-TTCAAGAA-TTTTATG---T-GC-ATTTT-------TTTTGC--AGTAC-AT-------TTT---ATTAAA-GAA--GTTTTCTA-T--ACAATAATCAGGGCG-TTTGACGA-AACTTGTATCTGTATTTATTGTTCC--CCCAAATTCCACATGCAT-A-AG-G-CAGT-ACT----G-G-T-------TTA----ACTG-TATGGTCATA----C-AA---GT-GTATC--AG-GATA-TGTATTTTAGGTT---T--AATATTTCCAAAAC-----AC--TTGGCTAGTT-TAAAATAA-GCATTTAAGGCT-TTTTTGTA-AAGA-TC--AA-ATG-AC----AACATGTG-A---AGGA-GCCTGATG--A-GATAAAAA---CAATC-CCCAGATATT--TG--TACGATG-ACACT---TGTTC-GATGATC--TGATTTGTTA-TAGAAATTTTT--TTT---A----TCTGATTTTTTACCGTTTT-C-------------A------CA---------------AAATA-T--GACAA--TTT----TTGTCTTTTTGAGGTTGAC--AG-ATAGGCAATATTT------ACAATgcat
gi|32 : GTAAGTAA-TT--TT----T-TTT--TT-TCA--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGGGG---GAATACAAAGAA-TACAGAGTTTA------------TC-TA--------------------CATAAA-T-C---A-TA-----GAAGA---GA-G-A------T-TA-T-C-
gi|12 : aTAAGTAA-GT--TA----T-TTT-ATT-TCC--AAT-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT--------------AA---A------------TA-TA--------------------CAT-AAAC-C---A-CA-----GAAGA---G--G-A------C-CA-T-CCAA--AT-GA--T---AG-----ATAAA----GTA----A--A-TAACA----AAGT---T-A--T-GA---T-A-AATC---A-AA--T-TTTC--T---CA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TAT-------GT-A---------TTGGCAA-AA--TTTTC-AA-T-AA-C----ACTGTCA-----CATT-CA-TTA--CT-C--A-----T-A---AGC-CAA---A--T---AATA-----TTTT--C-T-CT-AT-TA-CA---CAGG-T--T-TA-T----------AAAGT--TTT---T-ATA-CAAA-GTA-T-TCA-T-------GGA------TT--CTA-----TG-A--TG-GT-T-T----------T--C--TTAGATG-T---TGGTA-TGC--TG-T-A-CAA--CCA--AATG-T--AAAA-TGGTAT-T------CA-TC-TTCAA--CACAAGTCCA--G-ACTTGCA-GACA-CT--ACATTTTC-TCTCACTT-ACTTG--TGTTTTTG-caa
gi|3 : TAAGTAA-GTAATATCTTA-TTT-ATT-TCC--AAT-T--TT-G-GG-CC-C-AG-GG---GCAT----------ACAA-G---A------------TA-TAAC------------------CAT-AA-A-CTCAA-CA-----GAAGA---AGTGCA------T-C--T-C-AA--AT-GA--T---AG-----ATAAA----GTA----A--CATAACAT---AAGT---T-A--T-GGGACT-C-ACTCACAA-AA--T-TT----T---CATGACACAGTACACTGATT-GTTACCTGATACGAG--CAGCT------GCA-TACACTCACTGT-A-------G-TTGGCAA-AATTTTTTCAAT-TAAA-CAC--ACGTTCA-----CATT-CA-TTA--CT-C--A-----TAA---G---CCA---A--A---CATCCACGATTTT--C-TCCT-AT-TA-AA---CAGG-TGATATA-TACCTCCGATAAAAGTA-TTT-----AT--ACAA-GTA-TATCA-TCATACAAGGA------TT--CTATTGTGTA-A--TGTG--T-TTATAAAATTAT--C--TTAAATG-T---TGGTA-TGC--TG-T-A-Ct
gi|30 : acccacgggtaTAAGTAA-GT---A----A-TTC-ATT-TTC--A-AAT--TT-G-GG-CC-C-AGAGA---GCATACAGAGAA-TACAGAGTTCA------------TA-TA--------------------CATGAA-T-A---A-TA-----AAAGA---AT-G-A------T-TA-T-C-CA--AA-GA--T---AG-----ATAAA----Gcggcatcaattcatggctacaaacaaatggaacttggaaacattctcccaaacagcgtcagtacttaaccgatactcgacactaccaatggtttaaacattcttttaaatctattttatctatctcaataatgtttccttgctgtaggacgcccggacgcagggaatttcaataaatgcctataagaaatgaaggctcttggatgatgagagagaactgattcatatttaccccacaacgattatttgtattccaaaaacttactaaatgaaacaattgccaagacttgaggattcacgaattactcgaaaatatttttcctctacagaatcttgttttgaaatgaatgaatatgttcgcagttttgccaccacattgggggttaatggtcgcaatgtctgaaagtgtactacaaatgccgcacctgcgaataattattaatcgctcatagcgtggactttaattaaaagataaacaagtttttgacacaattattccattgttcaatcatgactaattagaacattgtaatatcctaacttatttaacaaaaatatataatgaatggcggtaactgtagtatctttccacaaaataactaatttgttgttcactatatcctatacactcaattgattttcagtatacagcagttctcttgaaataatcgaatctacaaaggggaatctaaaattctcttccgaaaatattgtacgaacataagatctttttataacatcaaaatttacatagtggaattcgaccaagtttttcacgctacaataaatctgaagacccttttggaggtatcctttttatgtacaagtaacctacaaatattatttcaagagactttatgttttgcatttggtttaatcttacaatagcagtacattttattaaagaagaccttttctatacacaataaatggacaggggcccaaacgttgtatat
gi|15 : cTAAGTAA-GT---A----A-TTT-----TCA--A-T-T--TT-G-GG-GT-G-AGAGG---GCAT---------CATACAA---A------------TA---------------------------AA-T-C---A----------------GA-G-T------T-CC-TGT-AC--AT-GT--T---AT-----CTAAAAGGCGTATAATA--T-TAA-ATTACAAGT---TTA--T-GA---T-ATAAT----A-AACTT-TT-C--C---CC---------------ATA-AT----------GAA--CAGCTCTAGAGATA-TA--------GGGA-------A-TTGGCAA-AA--TTTCC-AT-T-AA-CA---TC-GTCA-----CA-T-C
gi|25 : aaTAAATAA-GA--AA----AGTTT-ATT-CCA--A-T-T--TT-G-GG-CC-CAAGAGG---GCAT---------AATAGAA---G------------TATTA--------------------TTT-AA-A-A---A-CATTCATGAAGA---AA-G-A------acacaagtctatgtataactataaaatattcatggactct
gi|10 : agtttaAAGTAA-AT--T--------TT-ATA-TCA--A-T-A--TT-T-GG-CC-C-AG------GCAT---------AACAAAG---A------------TA-TA--------------------CAT-AA-A-C---AACAA----GAAGA---AA---A------C-CA-TTC-ACCAAT-GA--T---AG-----ATAAC----GTA----A--C-TAACA----AAGT---T-AA-T-GA---T-A-AATC---A-AAATT-TT-C--T---CA---------------ATT-GT----------GAGAGCAGCT-------TA-TATTAAT---GT-A-------G-TTGGACA-AA--TT----AG-T-AA-TC---GCTGTCACATGTCA-T-CT-TTATACTGC--A-----T-AAAAG---CAA---TT-A---AAT------TATT--C-T-CT-AT-TAACATACCAAG-T--T-TA-T----------AA-GT--TTT---TA-TA-CAAA-GTA-T-TCA-T-------GGAT-----T---CTA-----TG-AAATG-G--T-T----------T--T--CTTGATGTT----AGTAT-GCCATG-T-AACACAATCAATGATG--A-AAAA-TGGAAT-TAACATGC--TTATC-AAAGCAC-AGT--ACAG-ACTTGCAG-ACA-CTTAACATTTTC-TCACATTTACAT-G--TGTTTTTG-TGTA--ACGCC--A---TCAA-AGCC-AAAGA-ATGAG-AACTGGTTCTGAAATATGG-----T-AAAACA-TTT--CAAGA-CTTGAGGATT-ATGAAaatgtccaaaaagaaggaagaaattattttttacaatattataacatacatggatgtgg
gi|9 : taagctaAAGTAA-AT--T--------TT-ATA-TCA--A-T-A--TT-T-GG-CC-C-AG------GCAT---------AACAAAG---A------------TA-TA--------------------CAT-AA-A-C---AACAA----GAAGA---AA---A------C-CA-TTC-ACCAAT-GA--T---AG-----ATAAC----GTA----A--C-TAACA----AAGT---T-AA-T-GA---T-A-AATC---A-AAATT-TT-C--T---CA---------------ATT-GT----------GAGAGCAGCT-------TA-TATTAAT---GT-A-------G-TTGGACA-AA--TT----AG-T-AA-TC---GCTGTCACATGTCA-T-CT-TTATACTGC--A-----T-AAAAG---CAA---TT-A---AAT------TATT--C-T-CT-AT-TAACATACCAAG-T--T-TA-T----------AA-GT--TTT---TA-TA-CAAA-GTA-T-TCA-T-------GGAT-----T---CTA-----TG-AAATG-G--T-T----------T--T--CTTGATGTT----AGTAT-GCCATG-T-AACACAATCAATGATG--A-AAAA-TGGAAT-TAACATGC--TTATC-AAAGCAC-AGT--ACAG-ACTTGCAG-ACA-CTTAACATTTTC-TCACATTTACAT-G--TGTTTTTG-TGTA--ACGCC--A---TCAA-AGCC-AAAGA-ATGAG-AACTGGTTCTGAAATATGG-----T-AAAACA-TTT--CAAGA-CTTGAGGATT-ATGAAaa
gi|26 : taagctaTAA-GT--TA----A-TTC-ATT-TTC--A-A-AAATT-GCGG-CC-C-AGAGGAATGCAT---------TACAGAG---A------------TA-TAAGGTTCAAATA---------CAG-AA-T-A---A-TA-----AAAGA---AT-G-A------T-TT-C-C-AA--AA-GA--T---AG-----ATAAA----GTA----G--A-TGG-A----ATGT---G-ATTT-GG---T-C-AATC---A-aa
gi|14 : aga--TA----A-TTT--TT-TCC--A-A-T--TT-T-TG-CC-C-AGAGG---GCAT----------ACAAAG---A------------TA-TA--------------------CAT-AAAC-C---A-CA-----GAAGA---AA-G-A------C-CA-T-CCAA--AT-GA--T---AG-----ATAAA----GTA----A--AATAACA----AAGT---T-A--T-GA---T-A-AATC---A-AA--T-TTTC--T---CA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TAATTTAT--GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTC-AA-T-AA-C----ACTGTCA-----CATT-CA-TTA--CT-C--A-----T-A---AGC-CAA---AT-A---AAT------TTTT--C-T-CT-AT-TA-CA---CAGG-T--T-T--C----------AAAGT--TTT-----ATACAAAA-GTA-T-TCA-T-------GGATCTATATT--CTA-----TGAA--TG-GT-T-T----------T--C--TTAGATG-T---TGGT
gi|22 : aaggtag--TA----A-TTT-ATT-TCA--AAT-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCATAACATGGAATACAGAGTTCA------------TA-TG--------------------CATGAA-T-C---A-TG-----AAAGT------G-A------T-CAAT-C-AA--A----------AG-----AT--------CA----A--T---A-A----AATT---T-A--C-GA---T-A-AATC---A-AC--TCTT-C--T---CT---------------ATA-AT----------GAG--CA----------------------------------------CAA------TTTCCTG-T-AA-C----ACCGTCA---A-AT-T-CG-TTA--CT-C--A-----T-A---g
gi|16 : gtacatgA----G-TTT-ATT-CCA--A-T-T--TT-G-GGCCC-C-AAAGG---GCAT---------AATAGAA---G------------TA------------------------AC-AG-CTC---A-TA------AAGA---AA-G-AAATGTCC-CA-A-A-AA--AT-GAAGT---GG-----GAAAA----G---------T-TAA-A----ATAT---C-A--T-G------G-AATC---ACAA--C-TT-
gi|36 : aaagaaaataaatttgagaaaaaatatcaattttgaaataagaaaataaaatttggaaatattcattatgatatctataggtgtaaagataatata-TTT-ATT-CCA--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---ACA----------TATAAAA---G------------TA-acatgtatgtgg
gi|27 : acacgTT-ATT-TCC--AAT-T--TT-G-GC-CC-C-A-AGG---GCAA---------TA-AAAG---AATACCAGGTTCACA-TA--------------------CAT-AAAT-C---A-TA-----AAAGAGCTAA-C-A------T-TA-T-CTAA--AT-GA--T---AGATACTATAAA----ATA----A--C-----A----AGGT---T-A--T-atgatagttttataaagttgaaaacatatct
gi|42 : aagtagtattaaagtaT-TCC--AAT-T--TT-G-GGTCC-C-AGAGG---GCAT---------c
gi|13 : -T--TT-G-GA-CC-C-AGAGT---GCAT----------ACAAAG---A-------------A-TA--------------------CAT-AG-TTC---A-TA-------------AA-T-A------CACA-T-C-AT--AA-AA--A---TG-----ATAAA----GTA----A--TATAA-CC---AGGT---T-A--T-GA---T-A-AATC---T-AT--T-TT-T--TTTTCA---------------ATA-GT----------GAG--CAGCT------A------------------------A-TT-------A--TTGTCAA--T-AA-CA----CTGTCA-----CA-TTCA-TTA--CT-C--A-----T-A---AGC-CAA---AT-A---ACT------TTTT--C-T-CT-AT-TA-CA---TATG-T--T-TA-T----------AAAGTAATT------AT--ACAAGGTG-T-TTA-T-------GAA------CT--CTA-----TGAA--TG-G--TGC----------C--C--TTAGGTG-T---TGGTA-TGC--TA-T-A-CAG--TCA--AATA-TACAAAA-TGGAAA-T------CATCC-TC-AA--CAC-AGTC-A--G-Aaatatactcaa
gi|28 : gAAAG---A------------TA-TA--------------------CAT-AA-------------------------A-G-A------C-CA-T-CCAA--AT-GA--TTATAG-----ATAAA----GTA----AGAT-TAC-A----AAGT---T-A--T-GA---TTA-AATC---A-AA--T-TT-CC-T---CA---------------ATTTGT----------GAG--CAGCT------ATA-tgcgtgcgcacgcctgcat
gi|31 : -AA-T-C---A-TA-----AAAGA---GA-G-A------T-TA-T-C-CC--AAAGA--T---AG-----GTAAC----GTG----A---------------------------AA---T-A-ACT----------T-TT-C--T---CA---------------GTA-AT----------GAA--CAGCT------ATA-T-------------------------GCGT-AA--TTTTC-AA-T-GA-CA---gttgtgtgttaaattgg
gi|18 : attagatg-A----AAGT---T-A--TAGA---T-A-A-TC---A-AT--TGTT-C--T---CA---------------TTT-GT----------GAG--CAG-T------ATA-TA---------T-A-------G-TTGGCAA------TTTCAA--T-AAGCATTCAC-ATTA-----CA-T-TA-TCA--CT-A--A-------A---G---CCA---A--ATACAAT------TTCT--T-TACT-AT-TA-CA---CAGGTT--T-TA-T----------AAATT--TTTTGCCTAT--ACAA-GTATT-TCA-T-------GGAT-----TCTGCT------TGAA--TG-GTTT-T----------T--C--TTA-ATG-T---TGGTATGGC--TGTT-A-CA---TCA--AATG-TA-AAAttgt
gi|40 : AGCT------ATA-TAT-------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTC-AG-T-AA-C----GCTGTCA-----CATT-CA-TTA--CT-C--A-----T-A---
gi|19 : TGGCAACGA--TTTT--AA-T-AA-CA----CCGTCA-----CT-T-CA-TTG--CTTC--A-----T-A---G---CCAGGTA--A---AGT------T-------------------------GT-T--T-TA-T----------CAAAT--TCT------TA-TCAATGTG-T-TCA-A-------GGA----------CTGG----TG-AA-TG-G--T-T----------TT-C--GTACA-GTTGAATGATAT-AC--AA-T-A-CAG--TCA---AT--TA-CAA--TGGAAT-T------CA-TC-TT-A---CAA-AGTTCA--GCATTTACAG-ACA-GT--GCATTTTCTTTTCAT----ATTACCCGTTTTTG-agcc
gi|17 : acCCCCAGTTTAAATAGCCAAAAGATG-A-G-AACTGATTATG-AAATTTA-----G-AAAACA-TTG--CAAGAC---GAGGATT-GCGAA-TTAC-TGAAAAATG---TTTTCTCTACAGAA------------ATG---C-A---------ATGT-TC-GCCAGT-TTGTCCA----ATT-G-----T--TG-TCTG-CA----ATTGCCTGA-AAGTGTACTACA----------CCTTC--ATGAAT-AT-----TTCTCTTTTTA--AATCT--------ATCAGA----TAA----TT---------TATT-AG---T---------AACAA----T
gi|3 : taATTCCAAAAACTTACTAAAT-GAAACA-ATTGCCAAGAC-TTGAGGATTCACGAATT-AC-TCGAAAATATTTTTC-CTCTACAGAATCTTG-TTTTG-AAA---TGAAT--GAAT-ATGT-TC-GCAGTT-TTG-CCACCACATT-GGGGGTTAATG-GTCG-CA----A-TGTCTGA-AAGTGTACTACAAATGCCGCACC---T--GCGAAT-AA-----TTA-------TT-AATC---------GCTCATAGCGTGG----AC---------TT-T-AA---TTAAAAGATAAACAAGTTTTTGA-C-AC--A----ATTAT-TC--CATTGTTCAATC--ATGACTAATTAGAACAT-TGTAATA-T--CCTAA-CTTATTTA---ACAAAA-ATATATAATG-----AAT----GGCGGTAACTG-T-AG-TATCTTTCCACAAAAT-AACTAATT-T-GTTG-TTCACTATA-TCCTA-TACACT-CAA-TTGATTTTCAGT-ATA-CAGCAGTT-C-TCTTGAAA-TAATCGAAT-CTACAAAGGGG---A----------ATCTA-AAATTCTCTTCCG-AAAA--TATTGTACGAAC-ATAAGATC-TTTTTAT-A---ACA--TCAAAATTTACATAGTGGAATTCGACCA-AG-TTTTTCACGCTACAATAAATCTGAAGACCCTTTTGGAGGTATCCTTTTTATGTAC----------AAGTAACCTACA---AATATTAT-TTCAAGAGACTTTATGTTTT-GC-A-TTTGGTTTAATCTTAC--AATA--GCAGTACATTTT---ATTAAAGAAGACCTTTTCTA-TACACAATAAata
gi|7 : acccacgggtataagtaagtaatatcttatttatttccaattttgggcccaggggcatacaagatataaccataaactcaacagaagaagtgcatctcaaatgatagataaagtaacataacataagttatgggactcactcacaaaattttcatgacacagtacactgattgttacctgatacgagcagctgcatacactcactgtagttggcaaaattttttcaattaaacacacgttcacattcattactcataagccaaacatccacgattttctcctattaaacaggtgatatatacctccgataaaagtatttatacaagtatatcatcatacaaggattctattgtgtaatgtgtttataaaattatcttaaatgttggtatgctgtaccggcatcaattcatggctacaaacaaatggaacttggaaacattctcccaaacagcgtcagtacttaaccgatactcgacactaccaatggtttaaacattcttttaaatctattttatctatctcaataatgtttccttgctgtaggacgcccggacgcagggaatttcaataaatgcctataagaaatgaaggctcttggatgatgagagagaactgattcatatttaccccacaacgattatttgtTTTTTCCCTTGAAAAGCTTC-TTTTG-A-A---T-AAT--CCGT-ATGT-TC-GTAA-C-TTG-TC------CT-T----TT--CA-TTTT-TAGCACA-T-TCTGACAAAT-TACTTTG----------C---C--ATACAT-GTACATATTA-------ATAAATCTTTTTCTAAGTTCAT----TAA----ACACTTTTGATTG-T-AGATCT---------GAAAC----TTGA---AA--A----A-GAT-GT--TAT--------C--GC--------AGGA------TA-TG-C--C-AAG-TTGATTCAGTAA----A-A-----AATA-----AAC----A-------CTGCTCAA-C--------------C-AACAATTC-TTTTTG-TT------A-TC--A-TTCAAA-A----------TCA-T-AT---------T-T-TCTT--GA--AGT-GCACACT-CAA-GCAA---AGTATCATTTGATTTATGAATGTGT---TG-TAAA--TATTT----AAC-A---G--T-ATTGGAT-A---AGGTTTCAATAT--AT-AA-TGGATGCCTACCT-AA-TT---CCC-CCATAACTGCA-TAG-------TTTG-AAG---CTTTCTTATGTACCCCCCGGTGTA------CCCCA---CATA-TGTACTTGAGAGTTTTAATG---T-GA-A-GTT-------TATCAC--TATAT-ATA------TTTTTCATTGAG-------TTTTCAA-T--ATTATAATTTGGTCT-CTTAACAATAGCAGATT-CTGAATTTATAATTC---CCCAAATTTCACTTCCAT-ATAACA-CAAT-A------G-G-T-------TTT----ATTG-TGTGATCAatggacaggggcccaaacgttgtatat
gi|43 : aggta-T-AG---T---------AACAA----TTGA-T-AC--A----ATAAT-Taaaagatgcaacaaaatgccggcatt
gi|37 : atgtaacttatTA-TA-T--T-TAA-CTTATTCA---A----A-ATAT--AATG-----AATCAATG-------CTACT-AC-T--------------CCAACTACTT-TTGTTG-TT------A-TC--A-TACAAT-AC
gi|11 : ATAGAGCATAA-TT---CCC-CCATAACTGTT-TGG-------TTTG-AGG---TCTTCTTGTGTAT----------T------CCATATAGAGTA-TGTACTTGAGGGGTTTAATG---T-GA-A-GTT-------TATCACTAAATA--TGA------TTC---ATGGA-------CTTTTCAA-C--ATTATAATTTGGGCT-CTTTACATCAGCAGGTT-TTGAATTTGTAGTTTCC---CAAATT--------AC-A-AA-A-CA----------G-G-T-------TTT----ACAG-TGTGATAAAA----AAAAAAGAT-GCAAC--AA-AATACTGGAATTTGGCCT---TGCAAT--TTCAAAAAC-----AT--TTAATTAATT-TAAAGAAA-GCATTCAAACCAC-GCTTATA-CAGG-TCT-TG-TTG-ACAATTAACATATA-ATCCAAAG-GCAT--TG--A-A-T--ATA---CCA---CGTAAATATTAATGAATAAAA-G-ACAATGAATGTTC-TAT--TTCCTTATCTT-TA-TAAACA--AAT--TTT---AAGTTTCTTAC---------CTTTGC-------------ATTCTTGTA---------------AAA-------AAAAT-GTTGTCCTTGTCTTTTTCAAATTAAC--AG-AGAGACAATGTTT-A-T
gi|44 : gATAATCAGGGCG-TTTGACGG-AACTTGTA-cata
gi|33 : ACTTGTATCTGTATTTATTGTTCCC---CAAAT-----------------G-CAGT-ACTTACCG-G-T-------TGA----CCTG-TATGATCATA----C-AA---GT-GTATC--A--GGTA-TGCATTtc
gi|6 : CAT-A-AA-GGCAGT-ACT----G-G-TCCGTTCGTTACATTACTGATATGATCATAACACCAAG---TT-GTATCTCAGCGGTG-TGTACTTTT--TTCGCT--AATA-TTTC-----CAAAACC--TTGACTAGCTCTAAAATAA-GCCTTTAAGGCTCTTTT-GTA-AAGAATC--AAATTGGAC----AACATGTG-A---AGGA-GCCTGATGCAG-G-T--AAAAAACAATT-CC-AGAGATT--TG--TACGATG-ACACT---TGTTCAGATGATT--TGATTTT-TAATAGAAA--AAC--TTTTTTA----TCTGAT---------TTTT-CTTACCGTTTTTTTA------CA---------------GAATA-TATGACAATGTTT----TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGAATAGGCAATATTT-ACTGAACATCAGCATTCAAGCTTTTTTAATACATACCCGCTG---AGCCCCT-CCCTCGGTTTTCAGAATTAACACTGAAAAA--TCATCAGCATACCACGACTA-AACACATTTAAGCGATGTG-TCACCTAATTTTGCG-CGGGATAATATTTATCATTATATCAGTC-GGACAATAG-ATATCTGGTTCAGGATCCATGTCGAGTTTAT---TATTTTAACAAAGGTTT-G-ACTTACGGTACTTCTGTTACTCCTCCCGGGCTGTTTAG-ACGACTCCACTCC-ACCGTTAAGGCCTTTCCACATGAAATTCG-AAGTTT-ATATCTGTTGTTCGGAGTTTGTGGTACAGTTATTAATTATG-TTTGGCCA-GTACATACTCTTGACATGACTTTATAGA
gi|21 : T--TG--TACGATG-ACACT---TGTTC-GATGATT--TGAATTG-TA-TAGAAA--AAC--TTTTT-A----TCTGAT---------TTTT-C-------------A------CA---------------AAATA-T--GACAAT-TTT-----TGTCTTTCTGAGGTTGAC--AG-ATAGGCAATATTT-A-TG-ACAATAGCATTCAAGCTTTTTT-ATACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCAGTTTCAGAAATTAACACT-----tgtaattcatcggccattcatcgtttcacttctagtcgaagttgtgtcgcaagccttgtg
gi|8 : -TG-ATAGTAGCGTTCAAGCTTTTTT--------------G---AAGTCTT-CCTTCAGTTTCAGAAATTAACACT-----AAGTCATCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAA-GATGTG-TCACCTAATTTT--GCTGGA-------TCATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TC--------TC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AAAGATTT-GGACTTA-GGT-------C-G--TCTCCC----TGTCTAACA----------CCCACCTT-AGG-----TTCAAAT--------------T-AT--------TTTGAAGTTT----TACAG--AC--AGTATG-TTT-GCCATGTACATACTTTTG--ATGACTTTATAGAAAGGCCCCTT-ATGTCAAGC-TG-ATGCAGCC-TGTGTAG-AAGATCTG-AATGTAAAACAGTGTCAAAAGCCTTAGAAAAATCAACA-AAGCAAACGTATAATT--TGG-AATTA--TCATTTGTATA-TTTTTGAATAACGGTTCT-AAGTATAAAAATGTGGTCACTAGTTCTGGCTTTTGGTTGAAAACCAATTTGAACTTTATTTATAATGTTGTTCGAGTCCAAGTAGTTTTGTAACCTGGTATTCAGTATGCTATTAAATATACTTTGGGATA-
gi|41 : caaaattagg-TCACCTAATTTT--GCTGGA-------TCATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAGAA----TGGT---AGATT---ATt
gi|34 : aTCAGTATGCTATTAC---TCCTTT-GGATA-AGC-AAGAAGTT-ATAG---TTCTTCT------GTAATGTGATGGGTCAGAAGGACTATCATT
gi|23 : GGGCTATCATTCTTATGAATTAC-TTTGATAAAGCCTGTATCCCACT-CCTTTGAATATT-TGC---CAGAGGACAA-GATAAATTACATGTAGATAATTT-C-AGCAAA--TGGT-ACAATATGTGGTACGGTGGCTAGTAACATTTCATTTTCATTG
gi|20 : tcagacaAAAATATTT-ATTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAGATATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGACT--TTCAAAACC-------GAGTTTCCAG-TATGATA
5 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): TTCCAATTGGGTCGCTGTGCCCCAGAGCGCGCAAGAACTAATAGGAGAGACCGTACTTAACAGTTGAGAAAGAATGTCCCAAAAAAAAGAAGTGCGGAAAAGTGACTAAGATTTCAAGTACAGAGTGCGTAATCACAAACTCTAACAT
Unaligned ( gi|29 ): CACAGGTTTCAGACATTTCATTATTTTATCCCACCCAAACATGCTTGATTTATTATTTTTTAGCTTTGTCACGGCAGAGATTATTTCCTTTTCTATATTTCCTAACG
Unaligned ( gi|35 ): AAGGGTATTCAGAACAAGAATGACATGGGAACATAAAGAAATAAAGTAAAATAAACAGGGAAAAACATCCAGATG
Unaligned ( gi|38 ): AATAAATTTGGAAATAAAATATCAATTTTGAAATAAAGAAAATAAATTTGAAATATTCATTATGATA
Unaligned ( gi|39 ): TATTTTTCCCTTGAAAAGCTTCTTTTGAATAGGCCTAATCCATATGTTCGTAACTTGCCCTT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111
lowQualScore : 1111111111 1 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 1111 1 111 111 222222222222222 1111111111 444444444444444444444444444444444 11 222 2222 11111 11111 11111 111 2222222222 1111 11 1111111 2222222222 2222222222222 111111 22 11 111 111 22222222 222222 111111 11 1 11 111111 11 11111 111 22 1 1 11 33333333 111 111 11111 222222 11111 11111 33333333333333333 333333333 2222222222 1111 333333333333333 222222222 1111 11 1111 111111 1 11 1111 222 11111 22222222222222 222222222222 111111 11 11 33333333333333 111 11 111 111 11 111 111111 111 55555555555555555 111 22 111 1 2222222 3333333333333 222222 111 11 111 1111111 222222222222222 1 22222222222 111 11 11 222222 11 111 1 1111 111 11 1 111 1 2222222222 222222222 5555555555555555555555555555555555 11 11 111 11 111 111 2222 2222 1 11 2 1 11 2222222 11 1111 111 111 11 111 1 1 1 1 4444444444444 2222 1 1 666666666 1 22222 2222222222 1 33333333 2222 222222 1 1 11 11 22222 2 2 2 1 2 33 22222 2 2 111 1 1 2 11 3333333 1 1 1 2 222 1 2 4444444 3333 22 2 111 1 1 1 111 1 11 22222222 1 1 222 11 11111 1 111 11 2 2 0000000000000 2 2 33 6666666666 1
lowQualScore : 3 0000000000 2 2 555 0 2 22 2 2 4 2 2 333 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 8 3333 7777 33 4444 555 222 4444 2 77 4 55 77 666 2 4 333 2 444 4 2 999 2 999999 444 2 222 5 8888 444 111111111111111 2 1111111111 77 222222222222222222222222222222222 2 33 3 55 2 222 2 0000 66 44444 8 33 77777 33 44444 11111 1 3 3 3 3 6 111 44 3 3 3 0000000000 3 0000 3 77 3 3 3 3 0000000 5555555555 6 555 6 3 6 3 3333333333333 0 444444 44 00 3 666 9999 666 00000000 55 4 8 222222 4 8 888888 11 4 4 2 8 55 4 4 8 66 5 0 5 000000 0 1 99999 6 55 4 1 5 5 5 5 11 77 33 22222 5 222 00 5 5 888 1 5 0 3 00 5 5 22222222 66 5 5 5 333 5 333 22222 000000 77 11111 5 5 5 44444 33333333333333333 5 666666666 3333333333 3333 0 777777777777777 5 888 000000000 0000 5 11 77 2222 666666 6 5 99 99 99 99 99 3 5 5 33 5 2222 77 5 999 44444 44444444444444 5 777777777777 77 5 5 666666 5 55 5 5 4 6 6 99 666 7 99 666 99 99 6 6 3 44 11111111111111 6 111 6 55 6 6 888 99 6 6 111 99 99 11 88 6 111 6 6 6 999999 99 111 22222222222222222 1 111 4 22 0 1 7 111 6 3 1111111 1 99 2222222222222 1 6 111111 6 9999 3 6 888 000 9 6 77 6666666 5 111 6666666 5 000000000000000 1 44444444444 6 99 77 6 111 1 5 8 11 88 8 000000 11 8 8 1 666 0 8 8 3 88 8 7777 8 444 8 11 6 0 999 0 8 3 99 99 6 111 3 2 99 6 6 2222222222 99 6 666666666 0000000000000000000000000000000000 55 44 99 99 6 111 6 66 444 444 8 77 8888 3 3 1111 0 33 0 0 0 0 44 6666666 11 8 8 8 8 7777 444 444 2 33 777 0 0 0 0 2222222222222 1111 0 0 555555555 0 6 55555 6666666666 0 66666666 2 1111 555555 0 0 3 3 99 0 00 7 88888 3 3 1 3 2 0 0 7 3 7 0 00 88 22222 3 1 3 1 6 1 7 0 1 6 0 1 1 777 0 0 7 7 3 1 33 5555555 1 1 6 1 0 0 1 88 88 0 1 2 2 6 7 3 111 2 3 9999999 0 0 4444 1 7 11 0 7 333 6 22 0 0 2 1 3 777 3 7 7 0 0 44 3 1 55555555 0 3 555 44 99999 0 55 222 44 3 1 3 5555555555555 7 7 3 7 3 0 00 7 3333333333 6 3
lowQualScore : . .......... . . ... . . .. . . . . . ... .............................................................. . .... .... .. .... ... ... .... . .. . .. .. ... . . ... . ... . . ... . ...... ... . ... . .... ... ............... . .......... .. ................................. . .. . .. . ... . .... .. ..... . .. ..... .. ..... ..... . . . . . . ... .. . . . .......... . .... . .. . . . . ....... .......... . ... . . . . ............. . ...... .. .. . ... .... ... ........ .. . . ...... . . ...... .. . . . . .. . . . .. . . . ...... . . ..... . .. . . . . . . .. .. .. ..... . ... .. . . ... . . . . .. . . ........ .. . . . ... . ... ..... ...... .. ..... . . . ..... ................. . ......... .......... .... . ............... . ... ......... .... . .. .. .... ...... . . .. .. .. .. .. . . . .. . .... .. . ... ..... .............. . ............ .. . . ...... . .. . . . . . .. ... . .. ... .. .. . . . .. .............. . ... . .. . . ... .. . . ... .. .. .. .. . ... . . . ...... .. ... ................. . ... . .. . . . ... . . ....... . .. ............. . . ...... . .... . . ... ... . . .. ....... . ... ....... . ............... . ........... . .. .. . ... . . . .. .. . ...... .. . . . ... . . . . .. . .... . ... . .. . . ... . . . .. .. . ... . . .. . . .......... .. . ......... .................................. .. .. .. .. . ... . .. ... ... . .. .... . . .... . .. . . . . .. ....... .. . . . . .... ... ... . .. ... . . . . ............. .... . . ......... . . ..... .......... . ........ . .... ...... . . . . .. . .. . ..... . . . . . . . . . . . .. .. ..... . . . . . . . . . . . . . ... . . . . . . .. ....... . . . . . . . .. .. . . . . . . . ... . . ....... . . .... . . .. . . ... . .. . . . . . ... . . . . . .. . . ........ . . ... .. ..... . .. ... .. . . . ............. . . . . . . .. . .......... . .
lowQualScore : 1 8888888888 2 1 555 5 0 88 0 0 0 0 0 555 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0 5555 2222 11 2222 555 888 2222 1 11 7 88 22 999 2 7 666 4 111 7 4 444 5 777777 444 5 222 0 2222 777 333333333333333 7 7777777777 33 111111111111111111111111111111111 5 44 1 77 5 555 7 7777 33 33333 6 99 11111 99 77777 77777 4 3 3 3 3 7 777 66 3 3 3 4444444444 3 4444 3 44 3 3 3 3 8888888 1111111111 7 888 7 3 7 3 9999999999999 4 888888 33 00 6 444 0000 444 55555555 00 0 0 555555 0 0 000000 00 0 0 0 0 55 0 0 0 55 0 5 0 666666 1 0 33333 7 77 3 4 0 7 7 7 00 66 22 55555 0 111 66 0 5 222 7 0 8 2 66 0 0 88888888 99 0 0 0 999 0 888 99999 777777 99 44444 7 7 7 33333 11111111111111111 7 666666666 6666666666 2222 2 888888888888888 0 888 000000000 6666 7 66 99 1111 444444 6 7 22 22 22 22 22 3 7 7 66 7 1111 99 7 333 33333 44444444444444 7 777777777777 99 7 7 444444 7 77 7 7 3 7 7 22 888 3 22 888 22 88 7 7 5 00 88888888888888 7 777 7 88 7 7 333 22 7 7 777 22 22 66 66 7 777 7 7 7 222222 22 777 88888888888888888 0 777 2 22 7 0 8 777 7 3 7777777 0 22 2222222222222 7 7 888888 7 3333 7 7 777 000 3 7 55 2222222 7 777 4444444 7 333333333333333 4 00000000000 7 22 77 7 777 0 0 0 00 66 0 888888 00 0 0 0 222 8 0 0 2 88 0 0000 0 000 0 00 0 8 444 8 0 2 22 22 7 777 3 5 22 7 7 5555555555 22 7 777777777 0000000000000000000000000000000000 88 00 22 22 7 555 7 22 000 000 0 88 0000 2 2 2222 0 22 0 0 8 8 44 0000000 00 0 0 0 0 0000 000 000 0 88 555 0 0 0 0 2222222222222 2222 0 0 222222222 8 5 00000 2222222222 0 22222222 0 2222 555555 0 0 2 2 88 7 33 3 77777 7 7 0 7 3 7 7 3 3 3 7 00 33 00000 7 0 7 0 7 0 3 7 0 7 7 0 0 000 0 0 3 3 3 0 00 3333333 0 0 7 0 0 7 0 33 00 7 0 0 0 7 3 3 000 0 3 7777777 7 7 3333 0 3 33 7 0 777 7 00 0 0 0 0 3 777 3 3 3 7 7 00 5 2 88888888 0 3 000 77 33333 7 33 000 77 7 0 7 7777777777777 3 3 3 3 3 7 33 3 3333333333 7 3
consensus : GGTAAGTAA-GT--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT---------TACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--T-CA-T--A-GA----AGA---AA-G-A----TC-AT--C-A--AAT-GAT---AGATAA-AGT-AA-A-TAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A------AATC---A-AA--T-TT-C--T---CA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TA--------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T-AACA-ACTGTCA-CA-T--C--AT-----TACT-C--A-----T--A--A--GCCAAATA-----AATTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-T----------AAAGTTTT-T----A-TACNAA-GTAT-T-CA-T-------GGAT-----TT--CTA-TG---AA-TG-G-T-T----------T--CTTAGATGTT---TGGTATTGC--TGT-A---CAG---TCAA---ATG----T-A-A--AAAT-GGAAT-T------CA-T-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-GCAG-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCAT-TTAACTTGTGTTTTTGTGT--A--AC-GCCC-AGTTTCAATAGCC-AA-AGA-ATGAGAACTGATTCTGAAAATTTG-----TAAAA-CATTT--CAAGACCTTGAGGATT-ACGAATTTAC-TGGAAAATATTTTTT-CTCTACAGAATCTTG-TTTTG-A-A------T-AATGC--ATA-TGT-TC-GCAAGT-TTG---CCA----CATT----G-TT--TG-TCC-GCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---C--GTGAAT-ATTTAT------AAATC---------GCTCAT---GTAAAC---------T--AT-T-AG---T---------AACAA----TT-GAT-AC--A----AT------ANT-TTT--AT--C--ATG--TA--TAGAACAT-TGT-ATA-T--CTAA-CTTATTC----A--AA-ATAT--AATG-----AAT----GC--------TACT-A---NT-C-----AACTACT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACA-TTG-TTT--TCA-T-ATACAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-GAAT-CTAC-AAGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TT-CGTAAA--TATT-TA-AAAC---AG--C-TTTTTAT-AA---CAT--CAAAA--TACATA-TGGGAATCGACCA-AG---TT-CAC-CTACAATAGCT-TGA------TTT--GAGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---AATATATA-TTCGAGAGTTTTAATG---TG-CA-TTT-------TNTCGC--AGTA-ATA------T--TTATTAAAG-A----N-TTTT-CTA-T--ACAATAATCNGGGCGTTT-GACGG-AACTTGTA---TCTGTATTTATTGTTCCC-CCCAAATTTCACATGCATA-AA-G-CAGTA-CT----G-GT-------TT-A----ACTG-TATGATCATA----CAAA---GT-GTATC--AG-GGTG-TGTA---TTTTNGGTT-T--AATA-TT-CCAAAAC-----ACTT--GACTAGTT-TAAAATAAG-CCTTTAAGGCTCTTTTTGTA-AAGA-TCNAA-TTG-AC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATG--AG-TAAAAA-CAATT-CCCAGATATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATT--TGATTT-TTA-TAGAAAAACTTT-------TT-ATC--TG-AT---------TTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAAT-TTT--TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-A-TGA-CAATAGCATTCAAGCTTTTTTAATACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCGGTTTCAGAAATTAACACTA---AATCATCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAG-GAT-GTGTCACCTAATTTTGC-CGGA-------TTATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AAAGGTTT-G-ACTTA-GGT-------TTA--CCTCC----C-TGTCTAA-ACG--------CCACCNTTAGG-----TTCAAATG-AA-CTCGTAAGTTT-AT--------TTTGGAGTTT----TACAG--AT--ATTATG-TTT-GCCATGTACATACTCTTGA-ATGACTTTATAGAAAGGCCCCTTTATGTCAAGT-TG-GTGCAGCCT-GTGTAGAA-GAGCTGAA-TGTGAAACGGTATCAAAGGCCTTAGAAAAATCAACA-AAGCAAACGTACAATT--TGGAACTTAA-TATTTGTATATTTTT-GAATAAGGGTTCTAA-GTATAAACATGTGGTCACTGGTTCTGGCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTTATAATATTGTTAGAGTCCAAGTAGTTTCGTAACCTTGTATTCAGTATGCTATTAA--ATACTTT-GGATA-AGCAAAGAAGTT-ATTGTTA-TCCTCTA---TAGTANTTTGATGGGTCANA-AGGGCTATCATTTTTATGAATAGGTTTTAATAAAGCCTATTTCCCACTCCCTTTGGGTATT-TGCCA-CAGAGGACAA-GACAAG----AT-TAAATAATTT-CAAGCATATGTGGTAA-AATATATG-TACGTCGGCTTTCA-ACATCTCATT-TTTAATGCCAT-CTAATCGCA-GCTTGATTTATTATTTTTTAGATGTTTTTATTGCATCGATGATTTTCTTTTCTNTAATTG-A-TAAATCTAAC-GAAGT-AATG--TTGATATTTCTGCTGACTTGGACAANNAATCTTCAAAATATTTAATTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAGATATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGACT--TTCAAAACCCT-----GAGTTTCCAG-TATGATA
Reference ( family-3541 ) : GGTAAGTAA-GT--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT---------TACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--T-CA-T--A-GA----AGA---AA-G-A----TC-AT--C-A--AAT-GAT---AGATAA-AGT-AA-N-TAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A------AATC---A-AA--T-TT-C--T---CA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TA--------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAAN-T-AACA-ACTGTCA-CA-T--C--AT-----TACT-C--A-----T--A--G--GCCAAATA-----AATTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-T----------AAAGTTTT-T----A-TANCAA-GTGT-T-CA-T-------GGAT-----TT--CTA-TG---AA-TG-G-T-T----------T--CTTAGATGTT---TGGTATTGC--TGT-A---CAG---TCAA---ATG----T-A-A--AAAT-GGAAT-T------CA-T-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-GCAG-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCAT-TTAANTTGTGTTTTTGNGT--A--AC-GCCC-AGTTTCAATAGCC-AA-AGA-ATGAGAACTGATTCTGAAAANTTG-----TAAAA-CATTT--CAAGACCTTGAGGATT-ACGAATTTAC-TGGAAAATATTTTTT-CTCTACAGAATCTTG-TTTTG-A-A------T-AATGC--ATA-TGT-TC-GCAAGT-TTG---CCA----CATT----G-TT--TG-TCC-GCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---C--GTGAAT-ATTTA-------AAATC---------GCTCAT---GTAAAC---------T--A--T-AG---T---------AACAA----TT-GAT-AC--A----AT------ANT-TTT--AT--C--ATG--TA--TAGAACAT-TGT-ATA-T--CTAA-CTTATTC----A--AA-ATA---AATG-----AAT----GC--------TACT-A---NT-C-----AACTACT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACA-TTG-TTT--TCA-T-ATACAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-GAAT-CTAC-AAGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TT-CGTAAA--TATT-TA-AAAC---AG--C-TTTTTAT-AA---CAT--CAAAA--TACATA-TGGGAATCGACCA-AG---TT-CAC-CTACAATAGCT-TGA------TTT--GAGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---AATATATA-TTCGAGAGNTTTAATG---TG-CA-TTT-------TNTCGC--AATA-ATA------T--TTATTAAAG-A----N-TTTT-CTA-T--ACAATAATCAGGGCGTTT-GACGG-AACTTGTA---TCTGTATTTATTGTTCCC-CCCAAATTTCACATGCATA-AA-G-CAGTA-CT----G-GT-------TT-A----ACTG-TATGATCATA----CAAA---GT-GTATC--AG-GGTA-TGTA---TTTTNGGTT-T--AATA-TT-CCAAAAC-----ACTT--GACTAGTT-TAAAATAAG-CNTTTAAGGCTCTTTTTGTA-AAGA-TCCAA-TTG-AC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATG--AG-TAAAAA-CAATT-CCCAGATATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATT--TGATTT-TTA-TAGAAAAACTTT-------TT-ATC--TG-AT---------TTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAAT-TTT--TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-A-TGA-CAATAGCATTCAAGCTTTTTTAATACAT---CGCTG---AGGCCCT-CCCTCGGTTTCGGAAATTAACACTG---AATCATCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAG-GAT-GTGTCACCTAATTTTGC-CGGA-------TCATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATCGA--TTAA---TATTTTAA-AAAGGTTT-G-ACTTA-GGT-------TTA--CCTCC----C-TGTCTAA-ACG--------CCACCNTTAGG-----TTCAAATG-AA-CTCG-AAGTTT-AT--------TTCGGAGTTT----TACAG--AT--ATTATG-TTT-GCCATGTACATACTCTTGA-ATGACTTTATAGAAGGGCCCCTTTATGTCAAGCCTGTGTGCAGCCTTGTGTAGAAAGANCTGAAATGTAAAACGGTGTCAAAGGCCTTAGAAAAATCAACACAAGCAAACGTACAATTGCTGGAANTTAATCATTTGTATATTTTTTGAATAANGGTTCTAAAGTATAAANATGTGGTCACTGGTTCTGGCNTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTTATAATGTTGTTNGAGTCCAAGTAGTTTCGTANCCTNGTATTCAGTATGCTATTAA--ATACTTT-GGATA-AGCAAAGAAGTTGATNGTTANTCCTCTA---TAGTANTNTGATGGGTCANA-AGGGCTATCATTCTTATGAATNGNTTTTGATAAAGCCTGTNTCCCACTCCCTTTGGGTATTCTGCCAACAGAGGACAACGACAAGTTACATGTAGACAATTTACAAGCANATGTGGTAANAATATGTGNTACGNCGGCTNNCA-ACATCTCATT-TTCANTGCCAT-CTAATCGCA-GCTTGATTTATTATCTTTCAGATGTTTTTATTGCATCAATGATTTTCTTTTCTTTAATTG-A-TAAATCTAAC-GAAGT-AATG--TTGATATTTCTGCTGACTTGGACAATAAATCTTCAAAATATTTAATTCTGGGTATCAAATTTACTAGTCAATACNGAACAATGTTTGTAAAATGATTTACACCCATTGTTCACTAGATATCTTAATCGGACTAATCTTGCGGATTGCTGACTGATTCAAAACCCTTTCAAGAGTTTCCAG-TATGATA
gi|1 : GTAAGTAAAGT--TA----A-TTTTATTCTCCGAA-T-T--TT-G-GG-CCAC-GAAGG---GCAT----------ACAA-G------------ATAT---------A--------------------AAA-AA----CA-C--A-GA----AGA---AA-G-T----GC-AT--CCA--AAT-GATGA-AGATAA-AGT-AA-A-TAACA-AAGT---TA-T-GAA--T-A------AATC---A-AT--T-TT-C--T---CA---------------ATT-G-----------GAG--CAGCT------ATACTT--------GT-A-------GATTGGCAA-AT--TTCTCAACCT-AAAC-ACTGTCA-CA-T--TCGAT-----TACT-CCAA-----T--A--A--GCCAAATA-----A-TTTTTC-T-CTGATCTA-CA----AGGT--T-T-AAT----------AAAGTTTT-TT---A-AAACAA-A-GT-T-CAAT-------GGAT-----T---CTA-TG---AA-TG-G-T-T----------TGTCTTAAATGTG---TG-TAT-GC--TGT-A---CAA---TCAA---ATG----T-A-A--AA-T-GGAATGT------CA-T-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-GCAG-ACAGCT--ACATTTTC-TCTCAT-T--ACTTGTGTTTTTGTGTTAA--AC-GCCCGAGTTTCAATAGCC-AACAGA-ATGAGAACTAATTCT-AAAATTTG-----TAAAAACATTTT-CAAGAC-TTGAGGATT-AC-AATCT-----GAAAATATTTTT--CTCTACAGAATCTT--TTTTG-A-AC-----T-AATGGGAATAATGT-TC-GCA-GTGTTG---CCA----CATT----GGTT--TG-TCCTGCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---CCAGTGAA--ATT---------AAATC---------GCTCAT---GCTAAC---------TTTA--T-AG---T---------AACAA----TTTGATTACGGA----AT------ATT-TTT--ATATC--ATG--TA--TAGAACATCTGT-ATAGT--CTAAGCTTATTC----A--AACATA---AATG-----AGA----GC--------TACT-A---GTTC-----AACTACT--T-TGTTTG-T------TA-TCGAA-TACAAT-ACAGTTG-TTTCATTA-T-AT-CAGCA--TAT-TCTT--AA-GAAT-GAAT-CTAC-AGGGGGCGAA----------ATCTA-AAATTC---TT-CGAAAAA-TATT-TA-AAAC---AG--CGTTTTTAT-AAACACAT--CAAAA--TACATA---GGAATCGACCA-AG---TTTCAC-CTACAATAGCT-TGA------TTT--GAG----CCTTTTTAGGTAC----------AGA----CCA-A---AATATAT--TTCAAGAATTTTAATG---TGGCAATTT-------TTTCGC--AGTA-ACA------TGTTTATTAAAG-A----CGTTTT-CTAGT--ACAATAATCAGGGCGTTTTGACGG-AACTTGTA---TCTGTATTTATTGTTCCC-C--AAATTTCACATGCATA-AAAG-CAGTAACT----GTGT-------TTTA----ACTG-TATGATCATA----CA-----GTCGTATC--AG-GGTG-TGTA---TTTTTGGTTAT--AAT--TT-CCAAAAC-----ACTTTTGACTAGTT-TAAAATAAGGCCTTTAAGGCT---TTTGTAGAAGA-TCCAAATTG-AC----AACATGTGTA---AGGAGGCCTGATG--AGGTAAAAA-CAATTGCCCAGATATT---G--TACGATGAACACT---TGTTCTGA--ATT--TGATTT-TTA-TAGAAAAACTTT-------TT-ATC--TG-AT---------TTTT-T-------------ACAACGTTTTTTCTACAGAAATATT-GACAAT-TTT--T-GTCTTTCTGAGGTTGACCAGGA-TAGGCAAAATTTGA-TGA-CAATAGCATTCAAGCCTTTTTAATACAC---CGCTGTGAAGGCCCTCCCCTCGGTTT-AGAAATTAACACTA---AATCATCAGCAT-C----AACATAACA---TTAAGAGATGGTGTCACCT-ATTTTGC-CGGA-------TTATCAT--TATC-GTCGAAAA-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAATATTATTTTAA-AAAGGTTTGG-ACTTA-GG--------TTA--CCTCC----C-TGTCTTA-ACAC-------CCACACTTA-G-----TTCAAATG-AA-CTCGTAAGTTTGAT--------TTTGGAGTTT----TAGAG---T--ATTATGTTTT-GCCATGTACATAC-CTTGA-TTGACTTTATAAAAGG--CCCTTTATGTCAAGTCTGTGTGCAGCCTTGTGTAGAAAGAGCTGAAATGT--AACGGTATCAAAGGCCTTAG-AAAATCAACACAAGC-AACATACAATTGCTGGAACTTA--TATTTGTATATTTTTTGAATAAGGGTTCTAAAGTATAAACATGTGGTCACTGGTTCT-GCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTTAT-ATATTGTTAGAGT-CAAGTAGTTTCGTACCTTTGTATTCAGTATGCTATTAA--ATACTTT-GGAAATAGCAAAGAAGTTGATTGTTAATCCTCTA---TA--ATTTTGAT-GGTCATA-AGGGCTATCATTTTTATGAATAGGTTTTAATAAAGCCTATTT-CCATTCCCTTTGGG-ATTCTGCCAACAGA-AACAACGACAAG----AT-TAAACAATTTATAAGCATATGTGGTAAAAATATATG-TACATCGG-TTTCA-ACATCTCATT-TTTAATGCCAT-CTAATCGCA-GCTTGATTTATTATCTTTCAGATGTTTTTATTGCATCAATGATTTTCTTTTCTTTAATTG-A-TAAATCTAAC-GAAGT-AATG--TTGATATTTCTGCTGACTTGGACAATAAATCTTCAAAATATTTAATTCTGGGTATCAAATTTACTAATCAATACTGAATAATGTTTGTAAAATGATTTACACCCATTGTTCACTAGATATCTT-ATCGGACT-ATCTTGCGGATTGCTGATTGATTC-AAATTCTTTCAAAAGTTT-CAG-TATG
gi|10 : aaAAGTAA-AT--T--------TT-ATA-TCA--A-T-A--TT-T-GG-CC-C-AG------GCAT---------AACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--A-CA-ACAA-GA----AGA---AA---A----CC-ATT-C-ACCAAT-GAT---AGATAA-CGT-AA-C-TAACA-AAGT---TAAT-GA---T-A------AATC---A-AAATT-TT-C--T---CA---------------ATT-GT----------GAGAGCAGCT-------TA-TATTAAT---GT-A-------G-TTGGACA-AA--TT----AG-T-AATC-GCTGTCA-CA-TGTC--ATCTTTATACTGC--A-----T--A--AAAGC-AATTA-----AATTATTC-T-CT-AT-TAACATACCAAGT--T-T-A-T----------AA-GTTTT-T----A-TACAAA-GTAT-T-CA-T-------GGAT-----T---CTA-TG---AAATG-G-T-T----------T--TCTTGATGTT----AGTAT-GCCATGT-AACACAA---TCAATG-ATG------A-A--AAAT-GGAAT-TAA----CA-TGCTTATC---AAAGCAC-AG-TACAG-A--CTT-GCAG-ACA-CTTAACATTTTC-TCACAT-TTACAT-GTGTTTTTGTGT--A--AC-GCC--A---TCAA-AGCC-AA-AGA-ATGAGAACTGGTTCTGAAATATGG-----TAAAA-CATTT--CAAGA-CTTGAGGATT-ATGAAgcat
gi|11 : taagctaATAGAGCATAA---TT-CCC-CCATAACTGTT-TGG------TTT--GAGG---TCTTCTTGTGTAT----------T------CCATATAGAGTATGTA-CTTGAGGGGTTTAATG---TG-AA-GTT-------TATCACTAAATA-TGA------T--TCAT---GG-A----C-TTTT-CAA-C--ATTATAATTTGGGCTCTT-TACATCAGCAGGT----TTTGAATTTGTAGTTTCC-C--AAATT--------ACA-AA-A-CA----------G-GT-------TT-T----ACAG-TGTGATAAAA----AAAAAAGAT-GCAAC--AA-AATACTGGA---ATTTGGCCT-TGCAAT--TT-CAAAAAC-----ATTT--AATTAATT-TAAAGAAAG-CATTCAAACCAC-GCTTATA-CAGG-TCTTG-TTG-ACAATTAACATATA-ATCCAAAGG-CAT--TG--AA-T-ATAC-CA----CGTAAATATTAATGAATAAAA-GA-CAATGAATGTTC-TAT--TTCCTTATCT-TTA-TAAACAAATTTTAAGTTTCTT-ACCTTTGCAT---------TCTTGT-------------AAAA---------------AAAAT--G----T-TGTCCTTGTCTTTTTCAAATTAAC--AGA-GAGACAATGTTT-A-Taa
gi|12 : gTAAGTAA-GT--TA----T-TTT-ATT-TCC--AAT-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT--------------AA------------ATAT---------A--------------------CAT-AAA-C-CA-C--A-GA----AGA---G--G-A----CC-AT--CCA--AAT-GAT---AGATAA-AGT-AA-A-TAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A------AATC---A-AA--T-TTTC--T---CA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TAT-------GT-A---------TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T-AACA--CTGTCA-CA-TT-C--AT-----TACT-C--A-----T--A--A--GCCAAATA-----ATATTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-T----------AAAGTTTT-T----A-TACAAA-GTAT-T-CA-T-------GGA------TT--CTA-TG----A-TG-GTT-T----------T--CTTAGATG-T---TGGTA-TGC--TGT-A---CAA---CCAA---ATG----T---A--AAAT-GGTAT-T------CA-T-CTT--C---AA--CACAAG-TCCAG-A--CTT-GCAG-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCAC-TT-ACTTGTGTTTTTGcata
gi|13 : -T--TT-G-GA-CC-C-AGAGT---GCAT----------ACAAAG------------A-AT---------A--------------------CAT-AG--TTCA-T--A--A----ATA---CA-C-A----TC-AT--A-A--AA---AT----GATAA-AGT-AA-TATAACC-AGGT---TA-T-GA---T-A------AATC---T-AT--T-TT-T--TTTTCA---------------ATA-GT----------GAG--CAGC----------------------T-A-------A-TT-------A--TTGTCAA--T-AAC--ACTGTCA-CATT--C--AT-----TACT-C--A-----T--A--A--GCCAAATA-----ACTTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---TATGT--T-T-A-T----------AAAGTAAT-T----A-TACAAG-GTGT-T-TA-T-------GAA------CT--CTA-TG---AA-TG-G-TGC----------C--CTTAGGTG-T---TGGTA-TGC--TAT-A---CAG---TCAA---ATA----T-ACA--AAAT-GGAAA-T------CA-T-CCT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-ATGCGT-GCGC-ACGCCT--GCATt
gi|14 : g--TA----A-TTT--TT-TCC--A-A-T--TT-T-TG-CC-C-AGAGG---GCAT----------ACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AAA-C-CA-C--A-GA----AGA---AA-G-A----CC-AT--CCA--AAT-GAT---AGATAA-AGT-AA-AATAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A------AATC---A-AA--T-TTTC--T---CA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TAATTTAT--GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T-AACA--CTGTCA-CA-TT-C--AT-----TACT-C--A-----T--A--A--GCCAAATA-----AATTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T---C----------AAAGTTTTAT----A-CAA-AA-GTAT-T-CA-T-------GGATCTATATT--CTA-TG---AA-TG-GTT-T----------T--CTTAGATG-T---TGGT
gi|15 : aaggtagTAAGTAA-GT---A----A-TTT-----TCA--A-T-T--TT-G-GG-GT-G-AGAGG---GCAT---------CATACAA------------ATA-----------------------------------AA--T-CA-G--A-GTTCCTGTA---CA-T-G----TT-AT--CTA--AAA-GGC---GTATAATATT-AA-A-TTACA-AGTT---TA-T-GA---T-AT-----AAT----A-AACTT-TT-C--C---CC---------------ATA-AT----------GAA--CAGCTCTAGAGATA-TA--------GGGA-------A-TTGGCAA-AA--TTTCC-AT-T-AACA-TC-GTCA-CA-T--C--Ag
gi|16 : aaA----G-TTT-ATT-CCA--A-T-T--TT-G-GGCCC-C-AAAGG---GCAT---------AATAGAA------------GTA----------A--------------------CA--GC--T-CA-T--A--A----AGA---AA-G-AAATGTC--C--C-A--AA--------AAATGA-AGT-GG-G--A--A-AAGT---TA-A-AA---T-ATCATGGAATC---ACAA--C-TT-cacaagtctatgtataactataaaatattcatggactct
gi|17 : aaagaaaataaatttgagaaaaaatatcaattttgaaataagaaaataaaatttggaaatattcattatgatatctataggtgtaaagataatataCCC-AGTTTAAATAGCC-AA-AAG-ATGAGAACTGATTATG-AAATTTA-----GAAAA-CATTG--CAAGAC---GAGGATT-GCGAA-TTAC-TGAAAAATG--TTTT-CTCTACAGA------------------------AATGC--A-A-TGT-TC-GCCAGT-TTGT--CCA-----ATT----G--T--TG-TCT-GCA-ATTGCCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------CCTTC--ATGAAT-ATTTCTCTTTTTAAATC---------TATCAG---ATAATT---------T--AT-T-AG---T---------AACAA----Tacatgtatgtgg
gi|18 : tacA-AAGT---TA-TAGA---T-A------A-TC---A-AT--TGTT-C--T---CA---------------TTT-GT----------GAG--CAG-T------ATA-TA---------T-A-------G-TTGGCAA------TTTCAAT-A-AGCA---T-TCA-CA-TTAC--AT-----TA-T-C--A-----CTAA--A--GCCAAATAC----AATTTCTT-TACT-AT-TA-CA---CAGGT--T-TTA-T----------AAATTTTT-TGCCTA-TA-CAA-GTAT-TTCA-T-------GGAT-----TCTGCT--TG---AA-TG-G-T-T----------TTTCTTA-ATGTT----GGTATGGC--TGTTA---CA----TCAA---ATG----T-A-A--AAata
gi|19 : TGGCAACGA--TTTT--AA-T-AACA--CCGTCA-CT-T--C--AT-----TGCTTC--A-----T--A--G---CCAGGTA-----AAGTT----------------------GTT--T-T-A-T----------CAAATTCT-T----A-T--CAATGTGT-T-CA-A-------GGA----------CTGGTG---AA-TG-G-T-T----------TT-CGTACA-GTTGAATGATAT-AC--AAT-A---CAG---TCAA---TT---------A--CAAT-GGAAT-T------CA-T-CTT-------A--CAA-AGTT-CAGCA--TTT-ACAG-ACA-GT--GCATTTTCTTTTCATATTACC---CGTTTTTG
gi|2 : acGGTAAGTAA-GT--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT---------TACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--C-CA-C--A-GA----AGA---AA-G-A----CC-AT--C-A--CAT-GAT---AGATAA-AGT-AA-T-TAA-A-AAGT---TA-T-GA---T-A------AATC---A-AA--T-TT-C--T---CA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TA--------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAAA-T-AACA-ACTGTCAGCA-T--C--GT-----TACT-C--A-----T--A--G----CAAA-A-----AATTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-T----------AAAGTTTT-C----AATAACAA-GTAT-T-CA-T-------GGAT-----TT--CTA-TG---A--TG-G-T-T----------T--CTTAGATGTT---TGGTATTGC--TGT-A---CAC---TCAG---ATG----T-A-A--AAAT-GGAAT-T------C--T-CTT------AA--CAC-AG-T--AG-A--CTT-GCAGGACA-CT--ACATTTTC-TCTCAT-TTAAATTGTGTTTTTGGTT--AGTAC-GCCCCAGTTTCAATAGCCCAA-AGATATG-GAACTGATTCTGAAAATTTG-----TAAAA-CATTT--CAAGACCTTCAGGATT-ACGAATTTACATGAAAAATATTTTTTTCTCTACAGAATTTTG-TTTTG-ATA------C-AATGA--ATA-TGT-TC-GCAAGT-TTG---CCA----CATT----G-TT--TG-TCT-TCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---C--ATGAAT-ATTTA-------AAATC---------GTCCAT----TAAAC---------T--A--T-AG---T---------AACAA----TT-GAT-AC--A----AT------AAT-TTC--AT--C--ATG--TA--TAGAACAT-TGT-ATA-T--CTAA-CTTATTC----A--AA-ATATT-AATG-----AAT----GC--------TACT-A---GT-C-----AACTACT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACA-TTG-TTT---CA-T-ATACAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-GAAT-CTAC-AGGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TT-CGTAAA--TATT-TT-AAAC---AG--C-TTTTTAT-AA---CAT--CAAAA--TAC-TA-TGGGAATCGACCA-AG---TT-CAC-CTACAATAGCT-TGA------TTT--GAGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---AATATAT--TTCAAGAATTTTTATG---TG-CA-TTT-------TTTCGC--AGTA-GTA------T--TTATTAAAA-A----G-TTTTTCTA-T--ACAATAATCCAGGCGTTT-GACGG-AACTTGTA----CTGTATTTATTGTTCCCACCCAAATTTCACATGCATA-AA-G-CAGTA-CT----G-GT-------TT-A----GCTGCTATGATCATA----CAAA---GT-GTATC--AG-GGTG-TGTA---TTTTTGGTT-T--AATA-TT-CCGAAACCAAAAACTT--GACTAGTT-TAAAATAAG-CCTTTAAGGCTCTTTTTGTA-AAGA-TC-AA-TTG-AC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATG--AG-TAAA---CAATT-CCCAGATATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATT--TGAATT-GTA-TAGAAAAACTTT----------ATC--TG-AT---------TTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAAT-TTT--TTGTCTTTCTGGGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-A-TGA-CAATAGCATTCAAGCTTTTTTA-TACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCAGTTTCGAAAATAAACACT-----ATT-TCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAG-GAT-GGTTCACCTAATTT-GT--GGA-------TTATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AATGGTCT-G-ACTTA-GGT-------TTA--TCTCC----CGCGTCTAA-AC----------CACCTTTAGG-----TTCAAATG-AAACTCGTAAGTTT-AT--------TTTGGAGCTT----TACAG--AT--ATTATG-TTT-GCCATGTACATACTCTTGG-ATGACTTTATAAAAAGGTCCCTTTATGTCAAGT-TG-GTGCAACCT-GTGTAGAA-GAGCTGAA-TGTGAAACAGTATCAAAGGCCTTGGAAAAATTAATA-AAGCAAACATACAATT--TGGA-CTTAAATATTTGTATATTTTT-GAATAAGGGTTCTAA-GTATAAACATGTGGTCACTGGTTCTGGCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTAATAATATTGTTAGAGTCCAAGTAGTTTTGTAACCTTGTATTCAGTATGCTATCAA--ATACTTT-GGATA-AGC-AAGAAGTT-ATTGTTATTCCTCTATACTAGTAGTTTGATGGGTCATA-TGGGCTATCGTTTTTATGAATAGG-TTTAATAAAGCCTATTTTCCA-TTCCTTTGGGTATT-TGC---CAGAAGACAA-GACAAG----AT-TAAATAATTT--TAGCATATGTGGTAA-AATATATG--AC-TTGGCTTTCA-ACATCTCATT-TTTAATGCCATCCTAATC-CA-GC-TGATTT-TTATTCTTTAGATG-TTTTATTGCATCAATGATTTTCTTTTTTTTAGTTGTACTAAATCTAAC-GAGGTAAATGTTTTGAT-TTTCT--T--CTTGG-CAAGTAAT-TTCAAAATATTT-ATTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAG-TATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGACT--TTCAAA---CT-----GAGTTTCCAGTTATGATA
gi|20 : TTTTTGTAATCG-A-TA--TGTAGCTGTAGT-AAT---CTGA-ACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--AAAATATTTA-TTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAGATATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGACT--TTCAAAACC-------GAGTTTCCAG-TATGATA
gi|21 : T--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATT--TGAATT-GTA-TAGAAAAACTTT-------TT-ATC--TG-AT---------TTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAA--TTT--TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-A-TGA-CAATAGCATTCAAGCTTTTTT-ATACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCAGTTTCAGAAATTAACACT
gi|22 : --TA----A-TTT-ATT-TCA--AAT-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCATAACATGGAATACAGAGTTC---------ATAT---------G--------------------CATGAA--T-CA-T--G-AA----AG-----T-G-A----TCAAT--C-A--AAA-GAT---CAATAA-AAT---------------T---TA-C-GA---T-A------AATC---A-AC--TCTT-C--T---CT---------------ATA-AT----------GAG--CA----------------------------------------CAA------TTTCCTG-T-AAC--ACCGTCA-AATT--C--GT-----TACT-C--A-----T--A--
gi|23 : gtacatgTCAGACAGGGCTATCATTCTTATGAATTACTTT-GATAAAGCCTGTATCCCACTCC-TTTGAATATT-TGCCA---GAGGACAA-GATAAATTACATGTAGATAATTT-CA-GCAAATG--GTA-CAATATGTGGTACGGTGGCTAGTA-ACATTTCATT-TTCATTG
gi|25 : TAAATAA-GA--AA----AGTTT-ATT-CCA--A-T-T--TT-G-GG-CC-CAAGAGG---GCAT---------AATAGAA------------GTATTATTTAAAAA--------------------CAT-----T-CA-T----GA----AGA---AA-G-A----
gi|26 : agtttaTAA-GT--TA----A-TTC-ATT-TTC--A-A-AAATT-GCGG-CC-C-AGAGGAATGCAT---------TACAGAG------------ATAT---------AAGGTTCAAATA---------CAG-AA--T-AA-T--A-AA----AGA---AT-G-A----TT-TC--C-A--AAA-GAT---AGATAA-AGT-AG-A-Taatgtccaaaaagaaggaagaaattattttttacaatattataacatacatggatgtgg
gi|27 : agaTT-ATT-TCCA-A-T-T--TT-G-GC-CC-C-A-AGG---GCAA---------TA-AAAGAATACCAGGTTCACAT---------A--------------------CATAAA--T-CA-T--A-AA----AGAGCTAA-C-A----TT-AT--CTA--AAT-GAT---AGATAC-TATAAA-A-TAACA-AGGT---TA-T-ggaatgtgatttggtcaatca
gi|28 : aagtagtattaaagtaAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA-------------------------A-G-A----CC-AT--CCA--AAT-GATTATAGATAA-AGT-AA-GATTACA-AAGT---TA-T-GA---TTA------AATC---A-AA--T-TT-CC-T---CA---------------ATTTGT----------GAG--CAGCT------ATA-c
gi|29 : TTTCAGACATTTCATTATTTTATCCCAC-CCAA--ACATGCTTGATTTATTATTTTTTAGCT-TTGTCACGGCAGAGATTATTTCCTTTTCTATATTT--------CCTAAC-Ggttgtgtgttaaattgg
gi|3 : cacaggTAAGTAA-GTAATATCTTA-TTT-ATT-TCC--AAT-T--TT-G-GG-CC-C-AG-GG---GCAT----------ACAA-G------------ATAT---------AAC------------------CAT-AAACT-CAAC--A-GA----AGA---AGTGCA----TC--T--C-A--AAT-GAT---AGATAA-AGT-AACA-TAACATAAGT---TA-T-GGGACT-C------ACTCACAA-AA--T-TT----T---CATGACACAGTACACTGATT-GTTACCTGATACGAG--CAGCT------GCA-TACACTCACTGT-A-------G-TTGGCAA-AATTTTTTCAAT-TAAACACACGTTCA-CATT--C--AT-----TACT-C--A-----T--A--A--GCCAAACATCCACGATTTTCT-C-CT-AT-TA-AA---CAGGTGATAT-A-TACCTCCGATAAAAGTATT-T----A-TA-CAA-GTATAT-CA-TCATACAAGGA------TT--CTATTGTGTAA-TGTG-T-TTATAAAATTAT--CTTAAATG-T---TGGTA-TGC--TGT-A---CCGGCATCAATTCATGGCTAC-A-AACAAAT-GGAAC-TTGGAAACA-T-TCT--CCCAAA--CAG-CG-T-CAGTA--CTTAACCG-ATA-CTCGACACT
gi|3 : acccacgggtaATTCCAAAAACTTACTAAATGAAA-CAATTGCCAAGAC-TTGAGGATTCACGAATT-AC-TCGAAAATATTTTTC-CTCTACAGAATCTTG-TTTTGAA-A------TGAATGA--ATA-TGT-TC-GCAGTT-TTGCCACCA----CATTGGGGG-TTAATG-GTC-GCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACAAATGCCGCACC---T--GCGAAT-AATTAT------TAATC---------GCTCATAGCGTGGAC---------T--T--T-AA---TTAAAAGATAAACAAGTTTTT-GAC-AC--A----ATTATTCCATT-GTTCAAT--C--ATGACTAATTAGAACAT-TGTAATA-TC-CTAA-CTTATTTAACAA--AA-ATATATAATG-----AATG---GCGGTAACTGTAGT-ATCTTT-CCACAAAATAACTAAT-TTGTTG-TTCACTATA-TCCTA-TACACT-CAA-TTGATTT--TCAGT-ATACAGCAGTT-C-TCTTGAAA-TAATCGAAT-CTACAAAGGGG---A----------ATCTA-AAATTCTCTTC-CGAAAA--TATTGTACGAACATAAGATC-TTTTTAT-AA---CAT--CAAAATTTACATAGTGGAATTCGACCA-AGTTTTT-CACGCTACAATAAATCTGAAGACCCTTTTGGAGGTATCCTTTTTATGTAC----------AAGTAACCTACA---AATAT-TATTTCAAGAGACTTTATGTTTTG-CA-TTTGGTTTAATCTTAC--AATA-GCAGTACATT--TTATTAAAG-AAGACC-TTTT-CTA-TACACAATAAaccaatggtttaaacattcttttaaatctattttatctatctcaataatgtttccttgctgtaggacgcccggacgcagggaatttcaataaatgcctataagaaatgaaggctcttggatgatgagagagaactgattcatatttaccccacaacgattatttgtattccaaaaacttactaaatgaaacaattgccaagacttgaggattcacgaattactcgaaaatatttttcctctacagaatcttgttttgaaatgaatgaatatgttcgcagttttgccaccacattgggggttaatggtcgcaatgtctgaaagtgtactacaaatgccgcacctgcgaataattattaatcgctcatagcgtggactttaattaaaagataaacaagtttttgacacaattattccattgttcaatcatgactaattagaacattgtaatatcctaacttatttaacaaaaatatataatgaatggcggtaactgtagtatctttccacaaaataactaatttgttgttcactatatcctatacactcaattgattttcagtatacagcagttctcttgaaataatcgaatctacaaaggggaatctaaaattctcttccgaaaatattgtacgaacataagatctttttataacatcaaaatttacatagtggaattcgaccaagtttttcacgctacaataaatctgaagacccttttggaggtatcctttttatgtacaagtaacctacaaatattatttcaagagactttatgttttgcatttggtttaatcttacaatagcagtacattttattaaagaagaccttttctatacacaataaatggacaggggcccaaacgttgtatat
gi|30 : acccacgggtataagtaagtaatatcttatttatttccaattttgggcccaggggcatacaagatataaccataaactcaacagaagaagtgcatctcaaatgatagataaagtaacataacataagttatgggactcactcacaaaattttcatgacacagtacactgattgttacctgatacgagcagctgcatacactcactgtagttggcaaaattttttcaattaaacacacgttcacattcattactcataagccaaacatccacgattttctcctattaaacaggtgatatatacctccgataaaagtatttatacaagtatatcatcatacaaggattctattgtgtaatgtgtttataaaattatcttaaatgttggtatgctgtaccggcatcaattcatggctacaaacaaatggaacttggaaacattctcccaaacagcgtcagtacttaaccgatactcgacactaccaatggtttaaacattcttttaaatctattttatctatctcaataatgtttccttgctgtaggacgcccggacgcagggaatttcaataaatgcctataagaaatgaaggctcttggatgatgagagagaactgattcatatttaccccacaacgattatttgtTAAGTAA-GT---A----A-TTC-ATT-TTC--A-AAT--TT-G-GG-CC-C-AGAGA---GCATACAGAGAA-TACAGAGTTC---------ATAT---------A--------------------CATGAA--T-AA-T--A-AA----AGA---AT-G-A----TT-AT--C-C--AAA-GAT---AGATAA-AGatggacaggggcccaaacgttgtatat
gi|31 : c-AA--T-CA-T--A-AA----AGA---GA-G-A----TT-ATCCC-A--AA--GAT---AGGTAA-CGTGAA-A-TAAC-----T-----------------------------------T-TT-C--T---CA---------------GTA-AT----------GAA--CAGCT------ATA-T-------------------------GCGT-AA--TTTTCAA--T-GACA-
gi|32 : attagatgGTAAGTAA-TT--TT----T-TTT--TT-TCA--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGGGG---GAATACAAAGAA-TACAGAGTTT---------ATCT---------A--------------------CATAAA--T-CA-T--A-GA----AGA---GA-G-A----TT-AT--C-C--AAttgt
gi|33 : aACTTGTA---TCTGTATTTATTGTTCCC-C--AAAT----------------G-CAGTA-CTTACCG-GT-------TG-A----CCTG-TATGATCATA----C-AA---GT-GTATC--A--GGTA-TGCA---TT
gi|34 : TCAGTATGCTATTAC---TCCTTT-GGATA-AGCAA-GAAGTT-ATAGTT---CTTCT------GTAATGTGATGGGTCAGA-AGGACTATCATT
gi|36 : -TTT-ATT-CCA--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---ACA----------TATAAAA------------GTA
gi|37 : acacgT-ATA-T--TTAA-CTTATTC----A--AA-ATAT--AATG-----AATCAATGC--------TACT-A---CT-CC----AACTACT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACatgatagttttataaagttgaaaacatatct
gi|39 : TTTTT-CCCTTGAAAAGCTTC-TTTTG-A-ATAGGCCT-AATCC--ATA-TGT-TC-GTAA-C-TTG---CC
gi|4 : taGTAAGTAA-GT---A----A-TTT-ATT-TCC--AAT-T--TT-G-GG-TC-C-AGAGG---GCATACAAAGAA-TACAGAGTTC---------ATGT---------A--------------------CAT-AAG-T-CA-T--A-AA----A-A---GA-G-A----TT-AT--CCA--AAT-GAT---AGATAA-AGT-AA-AATAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A------AATC---A-AC--T-TTTC--T---CA---------------ATT-GT----------G------------------------------T-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T-AACA--CTGTCA-CA-TT-C--AT-----TACT-C--A-----T--A--A--GCCAAATA-----TTTTTTTC-T-CT-AT-TG-CA---TGGGT--T-T-A-T----------AAAGTTCT-T----A-TACAAA-GTGT-T-CA-T-------GGA------TT--CTA-TG---AA-TG-G-T-T----------TTCTTTAG-TG-T---TGGTA-TGC--TGT-A---CAG---TAAA---ATA----T---A--AAAT-GGAAT-T------CA-T-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-GCAG-ACA-CT--ACATTTT-------------TTTGTG--TGTGTGT--A--AC-GCCC-AGTTTCCATAGCC-AA-AGA-ATGAGAACTG---------------------AAA-CATTA--CAAGA-CTTGAGGATT-ACGAA-TTAC-TGAAAAATA-CTTTT-CTCTTCAGAATCTTG-TTTTG-A-A------T-AATGC--ATA-TGT-TC-GC-AGT-TTG---CCA----CATT----G-TT--TG-TCT-GCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---C--ATGAAT-ATTT--------AAATC---------GCTCAT---GTAACT---------T--AT-T-AG---T---------AACAA----TT-GAT-AC--A----AT------AGT-TTT--AT--C--ATG--TA--TAAAACAC-TGT-ATA-T--TTAA-CTTATTC----A--AA-ATAT--AATG-----AAT----GC--------TACT-A---ATCC-----AAATGCT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACA-TTG-TTT--TCA-T-ATACAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-AATT-CTAC--AGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TT-CGTAAA--TAAT-TA-AAAC---AG--C-TCTTTAT-AA---CAT--CAAAA--TACATA--GGGAATCGACCA-AG---TT-CAC-CTACAATAGCT-TGA------ATT--GAGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---TATATAT--TTCAAGAATTTT-ATG---TG-CATTTT-------TTTTGC--AGTACAT-------T--TTATTAAAGAA----G-TTTT-CTA-T--ACAATAATCAGGGCGTTT-GACGA-AACTTGTA---TCTGTATTTATTGTT-CC-CCCAAATTCCACATGCATA-AG-G-CAGTA-CT----G-GT-------TT-A----ACTG-TATGGTCATA----C-AA---GT-GTATC--AG-GATA-TGTA---TTTTAGGTT-T--AATATTT-CCAAAAC-----ACTT--GGCTAGTT-TAAAATAAG-CATTTAAGGCT-TTTTTGTA-AAGA-TCAAA--TG-AC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATG--AGATAAAAA-CAATC-CCCAGATATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATC--TGATTTGTTA-TAGAAATTTTTT-------TT-ATC--TG-ATTTTTTACCGTTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAA--TTT--TTGTCTTTTTGAGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-----A-CAATctt
gi|40 : AGCT------ATA-TAT-------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTC-AG-T-AAC--GCTGTCA-CATT--C--AT-----TACT-C--A-----T--A--A--GCC
gi|41 : TCACCTAATTTTGC-TGGA-------TCATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAGAA----TGGT---AGATT---AT
gi|42 : aT-TCC--AAT-T--TT-G-GGTCC-C-AGAGG---GCAT---------
gi|43 : AT---GTAACT---------T--A--TTAG---T---------AACAA----TT-GAT-AC--A----AT------AAT-Taatatactcaa
gi|44 : ATAATCAGGGCGTTT-GACGG-AACTTGTA---TC
gi|5 : GGTAAGTAA--T--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TTCG-GG-CC----GAGG----CATA--------CACAAAG------------A-AT---------AAGAGTTGAGAAGTTCAATTTCAT-AAA-T-CA-T--AAGA----AGAG--AA-G-A----TT-AT--C-A--AATTGA----AGATAA-A-T-AA-A-TA-CA-AGGTCTATA-T-GAA--T-A------AATC---A-AC--T-CT-CCTT---CATCC------------ATA-GT----------GAG--CAGCT------ATACTA--------GT-ATCAGTAAG-TTGGCAA-AA--TTTT-AAA-T-AACA--CTGTCG-CA-T--CC-AT-----TGCT-C--AATATTT--AAAG--CCCAATTA-----AATTTTTCAT-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-CTAA-------AAAGTTCT-T----A-TAC--A-GTGT-T-CA-T-------GGAT-----TT--G-A-TG---AA--G-G-T-T----------T---TTAG-TGTT---C--TAT-GC--TAT-AA--CAG---TCAA---ATA----TTA-A--CAATTAGAATGT------CAAT-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-ACAA-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCAT-TTAACTTGTCTTT---GGT--A--ACAGCCC-AGTTTC-GTAGCC-AA-AGA-ATGACAACTGA-TCTG-AAATTTG-----TAAAA-CATTG--CCA-ACGTAGAGGTTT-ACGAA--TAC-GTGAAAATAATCTTT-CTCTACATAAACTTGATTTTG-A-ATAGCC-T-AATGC--ATA-TGTGTCGGC--GT-TTG-----A----AATT----GCTT--TGTTCT-GCA-A-TGGCGGA----TGTCCT-----A-A----------C---C--ATGAATAATTTA-------ACATT----------CT-AT---GGTAAC---------TTCATTT-AG---T---------AACAA----TT--ATAAC--ATTACAT------ACTGTTT--AT--CTAATG--TA--TAGCACATATGT-ATA-TACTTAA-CTTATTC----A--AA-ATA---AATGAAATCAAT----TC--------TACT-A---TC-C-----CACTACT--TGTTGTTGAT------TATTC--ACTACAATGAGA-TTG-TTT--TCA-CAATACAGCA--T-TATCTC--AATTACT-GAAT-TCTC--AGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TTGTGTAAAATTATT-TA-AAACT--AG--C-TTTTAATAAA---CAT---AAAA--TA
gi|6 : aCATA-AA-GGCAGTA-CT----G-GTCCGTTCGTT-ACATTACTGATATGATCATAACACCAAG---TT-GTATCTCAGCGGTG-TGTACTTTTTTCG--C-T--AATA-TTTCCAAAAC------CTT--GACTAGCTCTAAAATAAG-CCTTTAAGGCTCTTTT-GTA-AAGAATCAAA-TTGGAC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATGCAGG-TAAAAAACAATT-CC-AGAGATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTCAGATGATT--TGATTT-TTAATAGAAAAACTTT-------TTTATC--TG-AT---------TTTT-CTTACCGTTTTTTTACAG---------------AATATATGACAATGTTT--TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGAATAGGCAATATTT-ACTGAACATCAGCATTCAAGCTTTTTTAATACATACCCGCTG---AGCCCCT-CCCTCGGTTTTCAGAATTAACACTGAAAAATCATCAGCATACCACGACTA-AACACATTTAAGCGAT-GTGTCACCTAATTTTGCGCGGGATAATATTTATCATTATATCAGTC-GGACAATAG-ATATCTGGTTCAGGATCCATGTCGAGTTTAT---TATTTTAACAAAGGTTT-G-ACTTACGGTACTTCTGTTACTCCTCCCGGGC-TGTTTAG-ACGACTCCACTCCACCGTTAAGGCCTTTCCACATGAAA-TTCG-AAGTTT-ATATCTGTTGTTCGGAGTTTGTGGTACAGTTATTAATTATG-TTTGGCCA-GTACATACTCTTGACATGACTTTATAGAgt
gi|7 : TTTTT-CCCTTGAAAAGCTTC-TTTTG-A-A------T-AATCC--GTA-TGT-TC-GTAA-C-TTG---TCCTTTTCATT------TT--TA-----GCACA-T-TCTGACAAAT-TACTTTGCCATA----------CA--T--GTACAT-ATTAAT------AAATCTTTTTCTAAGTTCAT----TAAACACTTTTGATT--G--T-AGATCT---------GAAAC----TT-GA--AA--A----AG------A-T-GTT--AT--C--GC--------AGGA------T-ATG-C--CAAG-TTGATTC----AGTAA-A-A---AATA-----AAC----AC--------TGCTCA---AC-C-----AACAATT--C-TTTTTG-T------TA-TC--A-TTCAAA-A------------TCA-T-AT--------T-T-TCTT--GA--AGT-GCACACT-C-AAGCAA---AGTATCATTTGATTTATGAATGT---GT-TGTAAA--TATT-TA-A--C---AG--T-ATTGGAT-AA---GGTTTCAATA--TATA-A-TGGATGCCTACCT-AA---TT-CCC-CCATAACTGCA-TAG------TTT--GAAG---CTTTCTTATGTACCCCCCGGTGTA------CCCCA---CATATGTA-CTTGAGAGTTTTAATG---TG-AA-GTT-------TATCAC--TATATATA------T--TTTTCATTG-A----G-TTTT-CAA-T--ATTATAATTTGGTCTCTT-AAC---AA-TAGCAGATTCTGAATTTATAATT--C-CCCAAATTTCACTTCCATATAACA-CAATA-------G-GT-------TT-T----ATTG-TGTGATCAtgtaattcatcggccattcatcgtttcacttctagtcgaagttgtgtcgcaagccttgtg
gi|8 : aggta-TGA-TAGTAGCGTTCAAGCTTTTTT--------------G---AAGTCTT-CCTTCAGTTTCAGAAATTAACACTA---AGTCATCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAA-GAT-GTGTCACCTAATTTTGC-TGGA-------TCATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TC--------TC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AAAGATTT-GGACTTA-GGT-------C-G--TCTCC----C-TGTCTAACAC---------CCACC-TTAGG-----TTCAAAT---------------T-AT--------TTTGAAGTTT----TACAG--AC--AGTATG-TTT-GCCATGTACATACTTTTGA--TGACTTTATAGAAAGGCCCCTT-ATGTCAAGC-TG-ATGCAGCCT-GTGTAGAA-GATCTGAA-TGTAAAACAGTGTCAAAAGCCTTAGAAAAATCAACA-AAGCAAACGTATAATT--TGGAATT--ATCATTTGTATATTTTT-GAATAACGGTTCTAA-GTATAAAAATGTGGTCACTAGTTCTGGCTTTTGGTTGAAAACCAATTTGAACTTTATTTATAATGTTGTTCGAGTCCAAGTAGTTTTGTAACCTGGTATTCAGTATGCTATTAAATATACTTTGGGATA-aaaagatgcaacaaaatgccggcatt
gi|9 : caaaattaggAAGTAA-AT--T--------TT-ATA-TCA--A-T-A--TT-T-GG-CC-C-AG------GCAT---------AACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--A-CA-ACAA-GA----AGA---AA---A----CC-ATT-C-ACCAAT-GAT---AGATAA-CGT-AA-C-TAACA-AAGT---TAAT-GA---T-A------AATC---A-AAATT-TT-C--T---CA---------------ATT-GT----------GAGAGCAGCT-------TA-TATTAAT---GT-A-------G-TTGGACA-AA--TT----AG-T-AATC-GCTGTCA-CA-TGTC--ATCTTTATACTGC--A-----T--A--AAAGC-AATTA-----AATTATTC-T-CT-AT-TAACATACCAAGT--T-T-A-T----------AA-GTTTT-T----A-TACAAA-GTAT-T-CA-T-------GGAT-----T---CTA-TG---AAATG-G-T-T----------T--TCTTGATGTT----AGTAT-GCCATGT-AACACAA---TCAATG-ATG------A-A--AAAT-GGAAT-TAA----CA-TGCTTATC---AAAGCAC-AG-TACAG-A--CTT-GCAG-ACA-CTTAACATTTTC-TCACAT-TTACAT-GTGTTTTTGTGT--A--AC-GCC--A---TCAA-AGCC-AA-AGA-ATGAGAACTGGTTCTGAAATATGG-----TAAAA-CATTT--CAAGA-CTTGAGGATT-ATGAAt
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): TTCCAATTGGGTCGCTGTGCCCCAGAGCGCGCAAGAACTAATAGGAGAGACCGTACTTAACAGTTGAGAAAGAATGTCCCAAAAAAAAGAAGTGCGGAAAAGTGACTAAGATTTCAAGTACAGAGTGCGTAATCACAAACTCTAACAT
Unaligned ( gi|35 ): AAGGGTATTCAGAACAAGAATGACATGGGAACATAAAGAAATAAAGTAAAATAAACAGGGAAAAACATCCAGATG
Unaligned ( gi|38 ): AATAAATTTGGAAATAAAATATCAATTTTGAAATAAAGAAAATAAATTTGAAATATTCATTATGATA
Alignments
lowQualScore : 1111111111 1 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 1111 1 111 222222 222222222222222 1111111111 444444444444444444444444444444444 222 2222 11111 11111 111 2222222222 1111 11 1111111 2222222222 2222222222222 111111 22 11 111 111 22222222 222222 111111 11 1 11 11111 11 11111 111 22 1 1 11 33333333 111 111 11111 222222 11111 11111 33333333333333333 333333333 1111 1111 222222222 1111 11 111111111111111111 11 1 222222 11 111 111 11 11111 22222222222222 222222222222 111111 11 11 33333333333333 111 11 111 111 11 111 111111 111 55555555555555555 111 22 111 1 2222222 111111 2222222 222222 111 11 111 1111111 222222222222222 1 22222222222 111 11 11 222222 11 111 1111 111 11 1 111 1 2222222222 222222222 5555555555555555555555555555555555 11 11 111 11 111 111 111 2222 1 11 2 1 11 2222222 11 1111 111 111 11 111 1 2 1 44444444 11 2222 1 666666666666 1 22222 2 1 33333333 2222 222222 1 1 11 1 1 1 1 1 1 1 1 11 22 1 1 111 1 1 1 333 3333333 1 22222 1 111 1 444 1 1 2222 1 333 1 1 1 1 1 1 111 1 11 22222222 1 1 222 11 11111 1 111 11 1 1 7777777777777 1 1 11 555555555 1
lowQualScore : 3 0000000000 2 2 555 0 2 22 2 2 4 2 2 333 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 8 3333 7777 33 4444 555 222 555555 2 77 4 55 44 33 666 2 77 888 2 444 5 2 000 2 2 444 000000 5 5 66 111111111111111 2 1111111111 77 000000000000000000000000000000000 2 33 55 33 2 111 2 0000 66 44444 8 33 77777 33 88 44 11111 1 3 3 3 3 6 111 44 3 3 3 0000000000 1111 3 44 0 3 3 3 0000000 5555555555 6 555 6 3 6 3 3333333333333 0 444444 44 00 3 666 9999 666 00000000 55 4 8 222222 4 8 888888 11 4 4 2 8 55 4 4 8 66 5 0 5 77777 1 99999 6 55 4 1 5 5 5 5 11 77 22 22222 5 222 00 5 5 888 1 5 0 3 00 5 5 22222222 66 5 5 5 333 5 333 22222 000000 77 11111 5 5 5 44444 33333333333333333 444444444 0 5 0000 2 7777 5 000000000 0000 33 888888888888888888 1 5 88 99 99 99 99 3 222222 5 99 5 5 000 555 44 44444 44444444444444 5 777777777777 77 5 5 666666 5 55 5 5 4 6 6 99 666 7 99 666 99 99 6 6 3 44 11111111111111 6 111 6 55 6 6 888 99 6 6 111 99 99 11 88 6 111 6 6 6 999999 99 111 22222222222222222 1 111 4 22 0 7 111 6 3 1111111 1 999999 99 2222222 1 6 111111 6 9999 1 6 888 000 9 6 77 6666666 5 111 6666666 5 000000000000000 1 44444444444 6 99 77 6 111 1 5 8 11 88 8 000000 11 8 8 666 0 8 8 8 88 8 7777 8 444 8 11 6 0 999 0 8 3 99 99 6 111 3 2 99 6 6 2222222222 99 6 666666666 0000000000000000000000000000000000 55 44 99 99 6 111 6 66 444 444 8 8 0 444 44 3 3 1111 0 33 0 0 0 0 44 6666666 11 8 8 8 8 7777 444 444 33 777 0 0 0 88888888 33 1111 0 222222222222 0 6 55555 3 0 0 9 0 66666666 1111 555555 0 0 3 3 77 6 2 7 3 3 3 3 3 2 0 7 3 7 0 88 7 6 00 3 3 6 7 6 0 777 0 0 7 7 3 444 5555555 1 6 1 0 11111 2 555 7 3 333 2 3 8888 3 777 7 3 3 7 2 0 6 0 0 3 777 3 7 7 44 0 1 1 55555555 0 3 555 44 99999 0 22 222 44 3 3 3333333333333 7 7 3 7 3 88 777777777 6 3
lowQualScore : . .......... . . ... . . .. . . . . . ... .............................................................. . .... .... .. .... ... ... ...... . .. . .. .. .. ... . .. ... . ... . . ... . . ... ...... . . .. ............... . .......... .. ................................. . .. .. .. . ... . .... .. ..... . .. ..... .. .. .. ..... . . . . . . ... .. . . . .......... .... . .. . . . . ....... .......... . ... . . . . ............. . ...... .. .. . ... .... ... ........ .. . . ...... . . ...... .. . . . . .. . . . .. . . . ..... . ..... . .. . . . . . . .. .. .. ..... . ... .. . . ... . . . . .. . . ........ .. . . . ... . ... ..... ...... .. ..... . . . ..... ................. ......... . . .... . .... . ......... .... .. .................. . . .. .. .. .. .. . ...... . .. . . ... ... .. ..... .............. . ............ .. . . ...... . .. . . . . . .. ... . .. ... .. .. . . . .. .............. . ... . .. . . ... .. . . ... .. .. .. .. . ... . . . ...... .. ... ................. . ... . .. . . ... . . ....... . ...... .. ....... . . ...... . .... . . ... ... . . .. ....... . ... ....... . ............... . ........... . .. .. . ... . . . .. .. . ...... .. . . ... . . . . .. . .... . ... . .. . . ... . . . .. .. . ... . . .. . . .......... .. . ......... .................................. .. .. .. .. . ... . .. ... ... . . . ... .. . . .... . .. . . . . .. ....... .. . . . . .... ... ... .. ... . . . ........ .. .... . ............ . . ..... . . . . . ........ .... ...... . . . . .. . . . . . . . . . . . . . . .. . . .. . . . . . . ... . . . . . ... ....... . . . . ..... . ... . . ... . . .... . ... . . . . . . . . . . ... . . . .. . . . ........ . . ... .. ..... . .. ... .. . . ............. . . . . . .. ......... . .
lowQualScore : 1 8888888888 2 1 555 5 0 88 0 0 0 0 0 555 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0 5555 2222 11 2222 555 888 888888 1 11 7 88 44 11 999 2 99 555 4 444 0 5 000 7 7 777 999999 3 3 33 333333333333333 7 7777777777 33 444444444444444444444444444444444 5 44 99 44 5 999 7 7777 33 33333 6 99 11111 99 55 22 77777 4 3 3 3 3 7 777 66 3 3 3 4444444444 7777 3 11 1 3 3 3 8888888 1111111111 7 888 7 3 7 3 9999999999999 4 888888 33 00 6 444 0000 444 55555555 00 0 0 555555 0 0 000000 00 0 0 0 0 55 0 0 0 55 0 5 0 44444 4 33333 7 77 3 4 0 7 7 7 00 66 99 55555 0 111 66 0 5 222 7 0 8 2 66 0 0 88888888 99 0 0 0 999 0 888 99999 777777 99 44444 7 7 7 33333 11111111111111111 999999999 4 0 1111 1 2222 0 000000000 6666 66 333333333333333333 0 7 33 22 22 22 22 3 111111 7 33 7 7 000 777 44 33333 44444444444444 7 777777777777 99 7 7 444444 7 77 7 7 3 7 7 22 888 3 22 888 22 88 7 7 5 00 88888888888888 7 777 7 88 7 7 333 22 7 7 777 22 22 66 66 7 777 7 7 7 222222 22 777 88888888888888888 0 777 2 22 7 8 777 7 3 7777777 0 222222 22 8888888 7 7 888888 7 3333 0 7 777 000 3 7 55 2222222 7 777 4444444 7 333333333333333 4 00000000000 7 22 77 7 777 0 0 0 00 66 0 888888 00 0 0 222 8 0 0 8 88 0 0000 0 000 0 00 0 8 444 8 0 2 22 22 7 777 3 5 22 7 7 5555555555 22 7 777777777 0000000000000000000000000000000000 88 00 22 22 7 555 7 22 000 000 0 0 8 000 00 2 2 2222 0 22 0 0 8 8 44 0000000 00 0 0 0 0 0000 000 000 88 555 0 0 0 00000000 88 2222 0 555555555555 8 5 00000 2 0 2 2 0 22222222 2222 555555 0 0 2 2 00 5 0 3 3 3 3 3 3 0 7 3 3 3 7 33 3 7 77 3 3 7 3 7 7 000 0 0 3 3 3 000 3333333 0 7 0 0 77777 0 000 3 3 777 0 3 3333 3 777 3 3 3 3 0 7 7 0 0 3 777 3 3 3 00 7 0 2 88888888 0 3 000 77 33333 7 00 000 77 3 3 3333333333333 3 3 3 3 3 33 333333333 7 3
consensus : GGTAAGTAA-GT--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT---------TACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--T-CA-T--A-GA----AGA---AA-G-A------TC-AT--C-A--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-A-TAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TA--------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T--AA-CA-ACTGTCA-CATT--C--AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----AATTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-T----------AAAGTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----TT--CTA-TG---AA-TG-G-T-T----------T--CTTAGATGTT---TGGTATTGC--TGT-A---CAG---TCAA---ATG----T-A-A--AAAT-GGAAT-T------CA-T-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-GCAG-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCAT-TTAACTTGTGTTTTTGTGT--A--AC-GCCC-AGTTTCAATAGCC-AA-AGA-ATGAGAACTGATTCTGAAAATTTG-----TAAAA-CATTT--CAAGACCTTGAGGATT-ACGAATTTAC-TGGAAAATATTTTTT-CTCTACAGAATCTTG-TTTTG-A-A------T-AATGC--ATA-TGT-TC-GCAAGT-TTG---CCA----CATT----G-TT--TG-TCC-GCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---C--GTGAATATTTA------TAAATCGCTC-AT---GTAANCT--A-T-TAGT---------AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------ANT-TTT--AT--C--ATG--TA--TAGAACAT-TGT------ATA-T--CTAA-CTT-ATT---CAAA---ATAT-AATG-----AAT----GC--------TACT-A---NT-C-----AACTACT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACA-TTG-TTT--TCA-T-ATACAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-GAAT-CTAC-AAGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TT-CGTAAA--TATT-TA-AAAC---AG--C-TTTTTAT-AA---CAT--CAAAA--TACATA-TGGGAATCGACCA-AG---TT-CAC-CTACAATAGCT-TGA------TTT--GAGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---AATATATA-TTCGAGAGTTTTAATG---TG-CA-TTT-------TNTC------GC--AGTACATAT--TTATTAAAG-A----N-TTTT-CTA-T--ACAATAATCNGGGCGTTT-GACGG-AACTTGTA---TCTGTATTTATTGTTCCC-CCCAAATTTCACATGCATA-AA-G-CAGTA-CT----G-GT-------TT-A----ACTG-TATGATCATA----CAAA---GT-GTATC--AG-GGTG-TGTA---TTTTNGGTT-T--AATA-TT-CCAAAAC-----ACTT--GACTAGTT-TAAAATAAG-CCTTTAAGGCTCTTTTTGTA-AAGA-TCNAA-TTG-AC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATG--AG-TAAAAA-CAATT-CCCAGATATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATT--TGATTT-TTA-TAGAAAAACTTT-------TT-ATC--TG-AT---------TTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAAT-TTT--TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-A-TGA-CAATAGCATTCAAGCTTTTTTAATACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCGGTTT-CAGAAATTAACACT---AAATCATCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAG-GAT-GTGTCACCTAATTTTGC-CGGA-------TTATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AAAGGTTTGGACTTA-GGT-------TTA--CCTCC----C-TGTCTAA-ACG--------CCACCNTTAGG-----TTCAAATGAAACTCGTAAGTTT-AT--------TTTGGAGTTT----TACAG--AT--ATTATG-TTT-GCCATGTACATACTCTTGA-ATGACTTTATAGAAAGGCCCCTTTATGTCAAGT-TG-GTGCAGCC-TGTGTAG-AAGAGCTG-AATGTGAAACGGTATCAAAGGCCTTAGAAAAATCAACA-AAGCAAACGTACAATT--TGGAACTT-AATATTTGTATA-TTTTTGAATAAGGGTTCT-AAGTATAAACATGTGGTCACTGGTTCTGGCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTTATAATATTGTTAGAGTCCAAGTAGTTTCGTAACCTTGTATTCAGTATGCTATTAA--ATACTTT-GGATA-AGCAAAGAAGTT-ATTGTT-A-TCCTCTA---TAGTANTTTGATGGGTCANA-AGGGCTATCATTTTTATGAAT-AGGCTTTAATAAAGCCTATTTCCCACTCCCTTTGGGTATT-TGC---CAGAGGACAA-GACAAG----AT-TAAATAATTT-T-AGCATATGTGGT-AAAATATAT-GTACGTCGGCTTTCA-ACATCTCATT-TTTAATGCCAT-CTAATCGCA-GCTTGATTTATTATTTTTTAGATGTTTTTATTGCATCGATGATTTTCTTTTCTNTAATTG-A-TAAATCTAAC-GAAGT-AATG--TTGATATTTCTGCTGACTTGGACAANNAATCTTCAAAATATTTAATTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAGATATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGACT--TTCAAA-CCCT----GAGTTTCCAG-TATGATA
Reference ( family-3541 ) : GGTAAGTAA-GT--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT---------TACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--T-CA-T--A-GA----AGA---AA-G-A------TC-AT--C-A--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-A-TAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TA--------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T--AA-CA-ACTGTCA-CA-T--C--AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----AATTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-T----------AAAGTTTTT----A-TAC-NAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----TT--CTA-TG---AA-TG-G-T-T----------T--CTTAGATGTT---TGGTATTGC--TGT-A---CAG---TCAA---ATG----T-A-A--AAAT-GGAAT-T------CA-T-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-GCAG-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCAT-TTAACTTGTGTTTTTGTGT--A--AC-GCCC-AGTTTCAATAGCC-AA-AGA-ATGAGAACTGATTCTGAAAATTTG-----TAAAA-CATTT--CAAGACCTTGAGGATT-ACGAATTTAC-TGGAAAATATTTTTT-CTCTACAGAATCTTG-TTTTG-A-A------T-AATGC--ATA-TGT-TC-GCAAGT-TTG---CCA----CATT----G-TT--TG-TCC-GCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---C--GTGAATATTTA------TAAATCGCTC-AT---GTAAACT--A-T-TAGT---------AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------ANT-TTT--AT--C--ATG--TA--TAGAACAT-TGT------ATA-T--CTAA-CTT-ATT---CAAA---ATAT-AATG-----AAT----GC--------TACT-A---NT-C-----AACTACT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACA-TTG-TTT--TCA-T-ATACAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-GAAT-CTAC-AAGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TT-CGTAAA--TATT-TA-AAAC---AG--C-TTTTTAT-AA---CAT--CAAAA--TACATA-TGGGAATCGACCA-AG---TT-CAC-CTACAATAGCT-TGA------TTT--GAGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---AATATATA-TTCGAGAGTTTTAATG---TG-CA-TTT-------TNTC------GC--AGTA-ATAT--TTATTAAAG-A----N-TTTT-CTA-T--ACAATAATCNGGGCGTTT-GACGG-AACTTGTA---TCTGTATTTATTGTTCCC-CCCAAATTTCACATGCATA-AA-G-CAGTA-CT----G-GT-------TT-A----ACTG-TATGATCATA----CAAA---GT-GTATC--AG-GGTG-TGTA---TTTTNGGTT-T--AATA-TT-CCAAAAC-----ACTT--GACTAGTT-TAAAATAAG-CCTTTAAGGCTCTTTTTGTA-AAGA-TCNAA-TTG-AC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATG--AG-TAAAAA-CAATT-CCCAGATATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATT--TGATTT-TTA-TAGAAAAACTTT-------TT-ATC--TG-AT---------TTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAAT-TTT--TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-A-TGA-CAATAGCATTCAAGCTTTTTTAATACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCGGTTT-CAGAAATTAACACT---AAATCATCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAG-GAT-GTGTCACCTAATTTTGC-CGGA-------TTATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AAAGGTTT-GACTTA-GGT-------TTA--CCTCC----C-TGTCTAA-ACG--------CCACCNTTAGG-----TTCAAATG-AACTCGTAAGTTT-AT--------TTTGGAGTTT----TACAG--AT--ATTATG-TTT-GCCATGTACATACTCTTGA-ATGACTTTATAGAAAGGCCCCTTTATGTCAAGT-TG-GTGCAGCC-TGTGTAG-AAGAGCTG-AATGTGAAACGGTATCAAAGGCCTTAGAAAAATCAACA-AAGCAAACGTACAATT--TGGAACTT-AATATTTGTATA-TTTTTGAATAAGGGTTCT-AAGTATAAACATGTGGTCACTGGTTCTGGCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTTATAATATTGTTAGAGTCCAAGTAGTTTCGTAACCTTGTATTCAGTATGCTATTAA--ATACTTT-GGATA-AGCAAAGAAGTT-ATTGTT-A-TCCTCTA---TAGTANTTTGATGGGTCANA-AGGGCTATCATTTTTATGAAT-AGGTTTTAATAAAGCCTATTTCCCACTCCCTTTGGGTATT-TGCC-ACAGAGGACAA-GACAAG----AT-TAAATAATTT-CAAGCATATGTGGT-AAAATATAT-GTACGTCGGCTTTCA-ACATCTCATT-TTTAATGCCAT-CTAATCGCA-GCTTGATTTATTATTTTTTAGATGTTTTTATTGCATCGATGATTTTCTTTTCTNTAATTG-A-TAAATCTAAC-GAAGT-AATG--TTGATATTTCTGCTGACTTGGACAANNAATCTTCAAAATATTTAATTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAGATATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGACT--TTCAAAACCCT----GAGTTTCCAG-TATGATA
gi|1 : GTAAGTAAAGT--TA----A-TTTTATTCTCCGAA-T-T--TT-G-GG-CCAC-GAAGG---GCAT----------ACAA-G------------ATAT---------A--------------------AAA-AA----CA-C--A-GA----AGA---AA-G-T------GC-AT--CCA--AAT-GA--TGA-AGATAA-AGT--AA-A-TAACA-AAGT---TA-T-GAA--T-A-AATC---AA---T--T-TT-C--TCA---------------ATT-G-----------GAG--CAGCT------ATACTT--------GT-A-------GATTGGCAA-AT--TTCTCAACCT--AA-AC-ACTGTCA-CA-T--TCGAT-----TACT-CCAA-----T--AA--G--CCAAATA-----A-TTTTTC-T-CTGATCTA-CA----AGGT--T-T-AAT----------AAAGTTTTTTA--A-AAC-AAAGT---T-CAAT-------GGAT-----T---CTA-TG---AA-TG-G-T-T----------TGTCTTAAATGTG---TG-TAT-GC--TGT-A---CAA---TCAA---ATG----T-A-A--AA-T-GGAATGT------CA-T-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-GCAG-ACAGCT--ACATTTTC-TCTCAT-T--ACTTGTGTTTTTGTGTTAA--AC-GCCCGAGTTTCAATAGCC-AACAGA-ATGAGAACTAATTCT-AAAATTTG-----TAAAAACATTTT-CAAGAC-TTGAGGATT-AC-AATCT-----GAAAATATTTTT--CTCTACAGAATCTT--TTTTG-A-AC-----T-AATGGGAATAATGT-TC-GCA-GTGTTG---CCA----CATT----GGTT--TG-TCCTGCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---CCAGTGAA-ATT---------AAATCGCTC-AT---GCTAACT--T-TATAGT---------AACAA----TTT-GATTACGGA----AT------ATT-TTT--ATATC--ATG--TA--TAGAACATCTGT------ATAGT--CTAAGCTT-ATT---CAAAC--ATA--AATG-----AGA----GC--------TACT-A---GTTC-----AACTACT--T-TGTTTG-T------TA-TCGAA-TACAAT-ACAGTTG-TTTCATTA-T-AT-CAGCA--TAT-TCTT--AA-GAAT-GAAT-CTAC-AGGGGGCGAA----------ATCTA-AAATTC---TT-CGAAAAA-TATT-TA-AAAC---AG--CGTTTTTAT-AAACACAT--CAAAA--TACATA---GGAATCGACCA-AG---TTTCAC-CTACAATAGCT-TGA------TTT--GAG----CCTTTTTAGGTAC----------AGA----CCA-A---AATATAT--TTCAAGAATTTTAATG---TGGCAATTT-------TTTC------GC--AGTA-ACATGTTTATTAAAG-A----CGTTTT-CTAGT--ACAATAATCAGGGCGTTTTGACGG-AACTTGTA---TCTGTATTTATTGTTCCC-C--AAATTTCACATGCATA-AAAG-CAGTAACT----GTGT-------TTTA----ACTG-TATGATCATA----CA-----GTCGTATC--AG-GGTG-TGTA---TTTTTGGTTAT--AAT--TT-CCAAAAC-----ACTTTTGACTAGTT-TAAAATAAGGCCTTTAAGGCT---TTTGTAGAAGA-TCCAAATTG-AC----AACATGTGTA---AGGAGGCCTGATG--AGGTAAAAA-CAATTGCCCAGATATT---G--TACGATGAACACT---TGTTCTGA--ATT--TGATTT-TTA-TAGAAAAACTTT-------TT-ATC--TG-AT---------TTTT-T-------------ACAACGTTTTTTCTACAGAAATATT-GACAAT-TTT--T-GTCTTTCTGAGGTTGACCAGGA-TAGGCAAAATTTGA-TGA-CAATAGCATTCAAGCCTTTTTAATACAC---CGCTGTGAAGGCCCTCCCCTCGGTTT--AGAAATTAACACT---AAATCATCAGCAT-C----AACATAACA---TTAAGAGATGGTGTCACCT-ATTTTGC-CGGA-------TTATCAT--TATC-GTCGAAAA-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAATATTATTTTAA-AAAGGTTTGGACTTA-GG--------TTA--CCTCC----C-TGTCTTA-ACAC-------CCACACTTA-G-----TTCAAATG-AACTCGTAAGTTTGAT--------TTTGGAGTTT----TAGAG---T--ATTATGTTTT-GCCATGTACATAC-CTTGA-TTGACTTTATA-AAAGG-CCCTTTATGTCAAGTCTGTGTGCAGCCTTGTGTAGAAAGAGCTGAAATGT--AACGGTATCAAAGGCCTTAG-AAAATCAACACAAGC-AACATACAATTGCTGGAACTT--ATATTTGTATATTTTTTGAATAAGGGTTCTAAAGTATAAACATGTGGTCACTGGTTCT-GCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTTAT-ATATTGTTAGAGT-CAAGTAGTTTCGTACCTTTGTATTCAGTATGCTATTAA--ATACTTT-GGAAATAGCAAAGAAGTTGATTGTTAA-TCCTCTA---TA--ATTTTGAT-GGTCATA-AGGGCTATCATTTTTATGAAT-AGGTTTTAATAAAGCCTATTT-CCATTCCCTTTGGG-ATTCTGCCAACAGA-AACAACGACAAG----AT-TAAACAATTTATAAGCATATGTGGTAAAAATATAT-GTACATCGG-TTTCA-ACATCTCATT-TTTAATGCCAT-CTAATCGCA-GCTTGATTTATTATCTTTCAGATGTTTTTATTGCATCAATGATTTTCTTTTCTTTAATTG-A-TAAATCTAAC-GAAGT-AATG--TTGATATTTCTGCTGACTTGGACAATAAATCTTCAAAATATTTAATTCTGGGTATCAAATTTACTAATCAATACTGAATAATGTTTGTAAAATGATTTACACCCATTGTTCACTAGATATCTT-ATCGGACT-ATCTTGCGGATTGCTGATTGATTCAAATTCTTTCAAAAGTTT-CAG-TATG
gi|10 : aaAAGTAA-AT--T--------TT-ATA-TCA--A-T-A--TT-T-GG-CC-C-AG------GCAT---------AACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--A-CA-ACAA-GA----AGA---AA---A------CC-ATT-C-ACCAAT-GA--T---AGATAA-CGT--AA-C-TAACA-AAGT---TAAT-GA---T-A-AATC---AA---AATT-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAGAGCAGCT-------TA-TATTAAT---GT-A-------G-TTGGACA-AA--TT---AG--T--AA-TC-GCTGTCA-CA-TGTC--ATCTTTATACTGC--A-----T--AAAAG--C-AATTA-----AATTATTC-T-CT-AT-TAACATACCAAGT--T-T-A-T----------AA-GTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----T---CTA-TG---AAATG-G-T-T----------T--TCTTGATGTT----AGTAT-GCCATGT-AACACAA---TCAATG-ATG------A-A--AAAT-GGAAT-TAA----CA-TGCTTATC---AAAGCAC-AG-TACAG-A--CTT-GCAG-ACA-CTTAACATTTTC-TCACAT-TTA-CATGTGTTTTTGTGT--A--AC-GCC--A---TCAA-AGCC-AA-AGA-ATGAGAACTGGTTCTGAAATATGG-----TAAAA-CATTT--CAAGA-CTTGAGGATT-ATGAAgcat
gi|11 : taagctaATAGAGCATAA---TT-CCC-CCATAACTGTT-TGG------TTT--GAGG---TCTTCTTGTGTAT----------T------CCATATAGAGTATGTA-CTTGAGGGGTTTAATG---TG-AA-GTT-------TATC------ACTAAATA-TGAT--TCAT---GG-A----C-TTTT-CAA-C--ATTATAATTTGGGCTCTT-TACATCAGCAGGT----TTTGAATTTGTAGTTTCC-C--AAATT--------ACA-AA-A-CA----------G-GT-------TT-T----ACAG-TGTGATAAAA----AAAAAAGAT-GCAAC--AA-AATACTGGA---ATTTGGCCT-TGCAAT--TT-CAAAAAC-----ATTT--AATTAATT-TAAAGAAAG-CATTCAAACCAC-GCTTATA-CAGG-TCTTG-TTG-ACAATTAACATATA-ATCCAAAGG-CAT--TG--AA-T-ATAC-CA----CGTAAATATTAATGAATAAAA-GA-CAATGAATGTTC-TAT--TTCCTTATCT-TTA-TAAACAAATTTTAAGTTTCTT-ACCTTTGCAT---------TCTTGT-------------AAAA---------------AAAAT--G----T-TGTCCTTGTCTTTTTCAAATTAAC--AGA-GAGACAATGTTT-A-Taa
gi|12 : gTAAGTAA-GT--TA----T-TTT-ATT-TCC--AAT-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT--------------AA------------ATAT---------A--------------------CAT-AAA-C-CA-C--A-GA----AGA---G--G-A------CC-AT--CCA--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-A-TAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TTTC--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TAT-------GT-A---------TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T--AA-C--ACTGTCA-CATT--C--AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----ATATTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-T----------AAAGTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGA------TT--CTA-TG----A-TG-GTT-T----------T--CTTAGATG-T---TGGTA-TGC--TGT-A---CAA---CCAA---ATG----T---A--AAAT-GGTAT-T------CA-T-CTT--C---AA--CACAAG-TCCAG-A--CTT-GCAG-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCAC-TT-ACTTGTGTTTTTGTcata
gi|13 : -T--TT-G-GA-CC-C-AGAGT---GCAT----------ACAAAG------------A-AT---------A--------------------CAT-AG--TTCA-T--A--A----ATA---CA-C-A------TC-AT--A-A--AA---A--T----GATAA-AGT--AATA-TAACC-AGGT---TA-T-GA---T-A-AATC---TATTTT--T-TT-T--TCA---------------ATA-GT----------GAG--CAGC----------------------T-A-------A-TT-------A--TTGTCAA--T--AA-C--ACTGTCA-CATT--C--AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----ACTTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---TATGT--T-T-A-T----------AAAGTAATT----A-TAC-AAGGTGT-T-TA-T-------GAA------CT--CTA-TG---AA-TG-G-TGC----------C--CTTAGGTG-T---TGGTA-TGC--TAT-A---CAG---TCAA---ATA----T-ACA--AAAT-GGAAA-T------CA-T-CCT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-ATGCGT-GCGC-ACGCCT--GCAT
gi|14 : g--TA----A-TTT--TT-TCC--A-A-T--TT-T-TG-CC-C-AGAGG---GCAT----------ACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AAA-C-CA-C--A-GA----AGA---AA-G-A------CC-AT--CCA--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-AATAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TTTC--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TAATTTAT--GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T--AA-C--ACTGTCA-CATT--C--AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----AATTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T---C----------AAAG-TTTT----A-TACAAAAGTAT-T-CA-T-------GGATCTATATT--CTA-TG---AA-TG-GTT-T----------T--CTTAGATG-T---TGGT
gi|15 : aaggtagTAAGTAA-GT---A----A-TTT-----TCA--A-T-T--TT-G-GG-GT-G-AGAGG---GCAT---------CATACAA------------ATA-----------------------------------AA--T-CA-G--A-GTTCCTGTA---CA-T-G------TT-AT--CTA--AAA-GG--C---GTATAATATT--AA-A-TTACA-AGTT---TA-T-GA---T-ATAAT----AA---ACTT-TT-C--CCC---------------ATA-AT----------GAA--CAGCTCTAGAGATA-TA--------GGGA-------A-TTGGCAA-AA--TTTCCAT--T--AA-CA-TC-GTCA-CA-T--C--Ag
gi|16 : aaA----G-TTT-ATT-CCA--A-T-T--TT-G-GGCCC-C-AAAGG---GCAT---------AATAGAA------------GTA----------A--------------------CA--GC--T-CA-T--A--A----AGA---AA-G-AAATGTCCC-AA--A-A--AAT-GAAGT---GGGAAA-AGTTAAA-A-TATCA-cacaagtctatgtataactataaaatattcatggactct
gi|17 : aaagaaaataaatttgagaaaaaatatcaattttgaaataagaaaataaaatttggaaatattcattatgatatctataggtgtaaagataatataCCC-AGTTTAAATAGCC-AA-AAG-ATGAGAACTGATTATG-AAATTTA-----GAAAA-CATTG--CAAGAC---GAGGATT-GCGAA-TTAC-TGAAAAATG--TTTT-CTCTACAGA------------------------AATGC--A-A-TGT-TC-GCCAGT-TTGT--CCA-----ATT----G--T--TG-TCT-GCA-ATTGCCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------CCTTC--ATGAATATTTCTCTTTTTAAATCTATC-AG---ATAATTT--A-T-TAGT---------AACAA----Ttggaatcacaacttacatgtatgtgg
gi|18 : tacA-AAGT---TA-TAGA---T-A-A-TC---AA---T--TGTT-C--TCA---------------TTT-GT----------GAG--CAG-T------ATA-TA---------T-A-------G-TTGGCAA------TTTCAA--T--AAGCA---T-TCA-CA-TTAC--AT-----TA-T-C--A-----CTAAA--G--CCAAATAC----AATTTCTT-TACT-AT-TA-CA---CAGGT--T-TTA-T----------AAATTTTTTGCCTA-TAC--AAGTAT-TTCA-T-------GGAT-----TCTGCT--TG---AA-TG-G-T-T----------TTTCTTA-ATGTT----GGTATGGC--TGTTA---CA----TCAA---ATG----T-A-A--AAata
gi|19 : TGGCAACGA--TTTT-AA--T--AA-CA--CCGTCA-CT-T--C--AT-----TGCTTC--A-----T--A---G--CCAGGTA-----AAGTT----------------------GTT--T-T-A-T----------CAAATTCTT----A-T-C-AATGTGT-T-CA-A-------GGA----------CTGGTG---AA-TG-G-T-T----------TT-CGTACA-GTTGAATGATAT-AC--AAT-A---CAG---TCAA---TT---------A--CAAT-GGAAT-T------CA-T-CTT-------A--CAA-AGTT-CAGCA--TTT-ACAG-ACA-GT--GCATTTTCTTTTCATATTACC---CGTTTTTG
gi|2 : acGGTAAGTAA-GT--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT---------TACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--C-CA-C--A-GA----AGA---AA-G-A------CC-AT--C-A--CAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-T-TAA-A-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TA--------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAAA-T--AA-CA-ACTGTCAGCA-T--C--GT-----TACT-C--A-----T--AG------CAAA-A-----AATTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-T----------AAAGTTTTC----AATAA-CAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----TT--CTA-TG---A--TG-G-T-T----------T--CTTAGATGTT---TGGTATTGC--TGT-A---CAC---TCAG---ATG----T-A-A--AAAT-GGAAT-T------C--T-CTT------AA--CAC-AG-T--AG-A--CTT-GCAGGACA-CT--ACATTTTC-TCTCAT-TTAAATTGTGTTTTTGGTT--AGTAC-GCCCCAGTTTCAATAGCCCAA-AGATATG-GAACTGATTCTGAAAATTTG-----TAAAA-CATTT--CAAGACCTTCAGGATT-ACGAATTTACATGAAAAATATTTTTTTCTCTACAGAATTTTG-TTTTG-ATA------C-AATGA--ATA-TGT-TC-GCAAGT-TTG---CCA----CATT----G-TT--TG-TCT-TCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---C--ATGAATATTTA-------AAATCGTCC-AT----TAAACT--A-T--AGT---------AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------AAT-TTC--AT--C--ATG--TA--TAGAACAT-TGT------ATA-T--CTAA-CTT-ATT---CAAA---ATATTAATG-----AAT----GC--------TACT-A---GT-C-----AACTACT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACA-TTG-TTT---CA-T-ATACAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-GAAT-CTAC-AGGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TT-CGTAAA--TATT-TT-AAAC---AG--C-TTTTTAT-AA---CAT--CAAAA--TAC-TA-TGGGAATCGACCA-AG---TT-CAC-CTACAATAGCT-TGA------TTT--GAGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---AATATAT--TTCAAGAATTTTTATG---TG-CA-TTT-------TTTC------GC--AGTA-GTAT--TTATTAAAA-A----G-TTTTTCTA-T--ACAATAATCCAGGCGTTT-GACGG-AACTTGTA----CTGTATTTATTGTTCCCACCCAAATTTCACATGCATA-AA-G-CAGTA-CT----G-GT-------TT-A----GCTGCTATGATCATA----CAAA---GT-GTATC--AG-GGTG-TGTA---TTTTTGGTT-T--AATA-TT-CCGAAACCAAAAACTT--GACTAGTT-TAAAATAAG-CCTTTAAGGCTCTTTTTGTA-AAGA-TC-AA-TTG-AC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATG--AG-TAAA---CAATT-CCCAGATATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATT--TGAATT-GTA-TAGAAAAACTTT----------ATC--TG-AT---------TTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAAT-TTT--TTGTCTTTCTGGGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-A-TGA-CAATAGCATTCAAGCTTTTTTA-TACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCAGTTT-CGAAAATAAACACT---A--TT-TCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAG-GAT-GGTTCACCTAATTT-GT--GGA-------TTATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AATGGTCT-GACTTA-GGT-------TTA--TCTCC----CGCGTCTAA-A----------CCACCTTTAGG-----TTCAAATGAAACTCGTAAGTTT-AT--------TTTGGAGCTT----TACAG--AT--ATTATG-TTT-GCCATGTACATACTCTTGG-ATGACTTTATAAAAAGGTCCCTTTATGTCAAGT-TG-GTGCAACC-TGTGTAG-AAGAGCTG-AATGTGAAACAGTATCAAAGGCCTTGGAAAAATTAATA-AAGCAAACATACAATT--TGG-ACTTAAATATTTGTATA-TTTTTGAATAAGGGTTCT-AAGTATAAACATGTGGTCACTGGTTCTGGCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTAATAATATTGTTAGAGTCCAAGTAGTTTTGTAACCTTGTATTCAGTATGCTATCAA--ATACTTT-GGATA-AGC-AAGAAGTT-ATTGTT-ATTCCTCTATACTAGTAGTTTGATGGGTCATA-TGGGCTATCGTTTTTATGAAT-AGG-TTTAATAAAGCCTATTTTCCA-TTCCTTTGGGTATT-TGC---CAGAAGACAA-GACAAG----AT-TAAATAATTT-T-AGCATATGTGGT-AAAATATAT-G-AC-TTGGCTTTCA-ACATCTCATT-TTTAATGCCATCCTAATC-CA-GC-TGATTT-TTATTCTTTAGATG-TTTTATTGCATCAATGATTTTCTTTTTTTTAGTTGTACTAAATCTAAC-GAGGTAAATGTTTTGAT-TTTCT--T--CTTGG-CAAGTAAT-TTCAAAATATTT-ATTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAG-TATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGACT--TTCAAA---CT----GAGTTTCCAGTTATGATA
gi|20 : TTTTTGTAATCG-A-TA--TGTAGCTGTAGT-AAT---CTGA-ACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--AAAATATTTA-TTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAGATATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGACT--TTCAAAACC------GAGTTTCCAG-TATGATA
gi|21 : T--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATT--TGAATT-GTA-TAGAAAAACTTT-------TT-ATC--TG-AT---------TTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAA--TTT--TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-A-TGA-CAATAGCATTCAAGCTTTTTT-ATACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCAGTTT-CAGAAATTAACACT---
gi|22 : --TA----A-TTT-ATT-TCA--AAT-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCATAACATGGAATACAGAGTTC---------ATAT---------G--------------------CATGAA--T-CA-T--G-AA----AG-----T-G-A------TCAAT--C-A--AAA-GA--T---CAATAA-AAT----------------T---TA-C-GA---T-A-AATC---AA---C--TCTT-C--TCT---------------ATA-AT----------GAG--CA-C------------------------------------------AA--TTTCCTG--T--AA-C--ACCGTCA-AATT--C--GT-----TACT-C--A-----T--A
gi|23 : gtacatgTCAGACAGGGCTATCATTCTTATGAATTA--CTTTGATAAAGCCTGTATCCCACT-CCTTTGAATATT-TGC---CAGAGGACAA-GATAAATTACATGTAGATAATTT-C-AGCAAA--TGGT-ACAATATGTGGTACGGTGGCTAGTA-ACATTTCATT-TTCATTG
gi|25 : TAAATAA-GA--AA----AGTTT-ATT-CCA--A-T-T--TT-G-GG-CC-CAAGAGG---GCAT---------AATAGAA------------GTATTATTTAAAAA--------------------CAT-----T-CA-T----GA----AGA---AA-G-A------
gi|26 : agtttaTAA-GT--TA----A-TTC-ATT-TTC--A-A-AAATT-GCGG-CC-C-AGAGGAATGCAT---------TACAGAG------------ATAT---------AAGGTTCAAATA---------CAG-AA--T-AA-T--A-AA----AGA---AT-G-A------TT-TC--C-A--AAA-GA--T---AGATAA-AGT--AG-A-Taatgtccaaaaagaaggaagaaattattttttacaatattataacatacatggatgtgg
gi|27 : agaTT-ATT-TCCA-A-T-T--TT-G-GC-CC-C-A-AGG---GCAA---------TA-AAAGAATACCAGGTTCACAT---------A--------------------CATAAA--T-CA-T--A-AA----AGAGCTAA-C-A------TT-AT--CTA--AAT-GA--T---AGATAC-TATA-AA-A-TAACA-AGGT---TA-T-ggaatgtgatttggtcaatca
gi|28 : aagtagtattaaagtaAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA-------------------------A-G-A------CC-AT--CCA--AAT-GA--TTATAGATAA-AGT--AAGA-TTACA-AAGT---TA-T-GA---TTA-AATC---AA---A--T-TT-CC-TCA---------------ATTTGT----------GAG--CAGCT------ATA-c
gi|29 : TTTCAGACATTTCATTATTTTATCCCAC-CCAA--ACATGCTTGATTTATTATTTTTTAGCT-TTGTCACGGCAGAGATTATTTCCTTTTCTATATTT--------CCTAAC-Ggttgtgtgttaaattgg
gi|3 : cacaggTAAGTAA-GTAATATCTTA-TTT-ATT-TCC--AAT-T--TT-G-GG-CC-C-AG-GG---GCAT----------ACAA-G------------ATAT---------AAC------------------CAT-AAACT-CAAC--A-GA----AGA---AGTGCA------TC--T--C-A--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AACA-TAACATAAGT---TA-T-GGGACT-C-ACTCACAAA---A--T-TT----TCATGACACAGTACACTGATT-GTTACCTGATACGAG--CAGCT------GCA-TACACTCACTGT-A-------G-TTGGCAA-AATTTTTTCAA--TTAAA-CACACGTTCA-CATT--C--AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAACATCCACGATTTTCT-C-CT-AT-TA-AA---CAGGTGATAT-A-TACCTCCGATAAAAGTATTT----A-TAC--AAGTATAT-CA-TCATACAAGGA------TT--CTATTGTGTAA-TGTG-T-TTATAAAATTAT--CTTAAATG-T---TGGTA-TGC--TGT-A---CCGGCATCAATTCATGGCTAC-A-AACAAAT-GGAAC-TTGGAAACA-T-TCT--CCCAAA--CAG-CG-T-CAGTA--CTTAACCG-ATA-CTCGACACT
gi|3 : acccacgggtaATTCCAAAAACTTACTAAATGAAA-CAATTGCCAAGAC-TTGAGGATTCACGAATT-AC-TCGAAAATATTTTTC-CTCTACAGAATCTTG-TTTTGAA-A------TGAATGA--ATA-TGT-TC-GCAGTT-TTGCCACCA----CATTGGGGG-TTAATG-GTC-GCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACAAATGCCGCACC---T--GCGAATAATTA------TTAATCGCTC-ATAGCGTGGACT----T-TAATTAAAAGATAAACAAGTTTTT--GAC-AC--A----ATTATTCCATT-GTTCAAT--C--ATGACTAATTAGAACAT-TGTA-----ATA-TC-CTAA-CTT-ATTTAACAAAAATATAT-AATG-----AATG---GCGGTAACTGTAGT-ATCTTT-CCACAAAATAACTAAT-TTGTTG-TTCACTATA-TCCTA-TACACT-CAA-TTGATTT--TCAGT-ATACAGCAGTT-C-TCTTGAAA-TAATCGAAT-CTACAAAGGGG---A----------ATCTA-AAATTCTCTTC-CGAAAA--TATTGTACGAACATAAGATC-TTTTTAT-AA---CAT--CAAAATTTACATAGTGGAATTCGACCA-AGTTTTT-CACGCTACAATAAATCTGAAGACCCTTTTGGAGGTATCCTTTTTATGTAC----------AAGTAACCTACA---AATAT-TATTTCAAGAGACTTTATGTTTTG-CA-TTTGGTTTAATCTTACAATAGC--AGTACAT-T--TTATTAAAG-AAGACC-TTTT-CTA-TACACAATAAaccaatggtttaaacattcttttaaatctattttatctatctcaataatgtttccttgctgtaggacgcccggacgcagggaatttcaataaatgcctataagaaatgaaggctcttggatgatgagagagaactgattcatatttaccccacaacgattatttgtattccaaaaacttactaaatgaaacaattgccaagacttgaggattcacgaattactcgaaaatatttttcctctacagaatcttgttttgaaatgaatgaatatgttcgcagttttgccaccacattgggggttaatggtcgcaatgtctgaaagtgtactacaaatgccgcacctgcgaataattattaatcgctcatagcgtggactttaattaaaagataaacaagtttttgacacaattattccattgttcaatcatgactaattagaacattgtaatatcctaacttatttaacaaaaatatataatgaatggcggtaactgtagtatctttccacaaaataactaatttgttgttcactatatcctatacactcaattgattttcagtatacagcagttctcttgaaataatcgaatctacaaaggggaatctaaaattctcttccgaaaatattgtacgaacataagatctttttataacatcaaaatttacatagtggaattcgaccaagtttttcacgctacaataaatctgaagacccttttggaggtatcctttttatgtacaagtaacctacaaatattatttcaagagactttatgttttgcatttggtttaatcttacaatagcagtacattttattaaagaagaccttttctatacacaataaatggacaggggcccaaacgttgtatat
gi|30 : acccacgggtataagtaagtaatatcttatttatttccaattttgggcccaggggcatacaagatataaccataaactcaacagaagaagtgcatctcaaatgatagataaagtaacataacataagttatgggactcactcacaaaattttcatgacacagtacactgattgttacctgatacgagcagctgcatacactcactgtagttggcaaaattttttcaattaaacacacgttcacattcattactcataagccaaacatccacgattttctcctattaaacaggtgatatatacctccgataaaagtatttatacaagtatatcatcatacaaggattctattgtgtaatgtgtttataaaattatcttaaatgttggtatgctgtaccggcatcaattcatggctacaaacaaatggaacttggaaacattctcccaaacagcgtcagtacttaaccgatactcgacactaccaatggtttaaacattcttttaaatctattttatctatctcaataatgtttccttgctgtaggacgcccggacgcagggaatttcaataaatgcctataagaaatgaaggctcttggatgatgagagagaactgattcatatttaccccacaacgattatttgtTAAGTAA-GT---A----A-TTC-ATT-TTC--A-AAT--TT-G-GG-CC-C-AGAGA---GCATACAGAGAA-TACAGAGTTC---------ATAT---------A--------------------CATGAA--T-AA-T--A-AA----AGA---AT-G-A------TT-AT--C-C--AAA-GA--T---AGATAA-AGatggacaggggcccaaacgttgtatat
gi|31 : c-AA--T-CA-T--A-AA----AGA---GA-G-A------TT-ATCCC-A--AA--GA--T---AGGTAA-CGTG-AA-A-TAAC-----T--------------------------------T-TT-C--TCA---------------GTA-AT----------GAA--CAGCT------ATA-T-------------------------GCGT-AA--TTTTCAA--T--GA-CA-
gi|32 : attagatgGTAAGTAA-TT--TT----T-TTT--TT-TCA--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGGGG---GAATACAAAGAA-TACAGAGTTT---------ATCT---------A--------------------CATAAA--T-CA-T--A-GA----AGA---GA-G-A------TT-AT--C-C--AAttgt
gi|33 : aACTTGTA---TCTGTATTTATTGTTCCC-C--AAAT----------------G-CAGTA-CTTACCG-GT-------TG-A----CCTG-TATGATCATA----C-AA---GT-GTATC--A--GGTA-TGCA---TT
gi|34 : TCAGTATGCTATTAC---TCCTTT-GGATA-AGCAA-GAAGTT-ATAGTT----CTTCT------GTAATGTGATGGGTCAGA-AGGACTATCATT
gi|36 : -TTT-ATT-CCA--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---ACA----------TATAAAA------------GTA
gi|37 : acacgT------ATA-T--TTAA-CTT-ATT---CAAA---ATAT-AATG-----AATCAATGC--------TACT-A---CT-CC----AACTACT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACatgatagttttataaagttgaaaacatatct
gi|39 : TTTTT-CCCTTGAAAAGCTTC-TTTTG-A-ATAGGCCT-AATCC--ATA-TGT-TC-GTAA-C-TTG---CC
gi|4 : taGTAAGTAA-GT---A----A-TTT-ATT-TCC--AAT-T--TT-G-GG-TC-C-AGAGG---GCATACAAAGAA-TACAGAGTTC---------ATGT---------A--------------------CAT-AAG-T-CA-T--A-AA----A-A---GA-G-A------TT-AT--CCA--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-AATAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---CT-T-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------------------------------------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T--AA-C--ACTGTCA-CATT--C--AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----TTTTTTTC-T-CT-AT-TG-CA---TGGGT--T-T-A-T----------AAAGTTCTT----A-TAC-AAAGTGT-T-CA-T-------GGA------TT--CTA-TG---AA-TG-G-T-T----------TTCTTTAG-TG-T---TGGTA-TGC--TGT-A---CAG---TAAA---ATA----T---A--AAAT-GGAAT-T------CA-T-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-GCAG-ACA-CT--ACATTTT-------T-TTG---TGTG----TGTGT--A--AC-GCCC-AGTTTCCATAGCC-AA-AGA-ATGAGAACTG---------------------AAA-CATTA--CAAGA-CTTGAGGATT-ACGAA-TTAC-TGAAAAATA-CTTTT-CTCTTCAGAATCTTG-TTTTG-A-A------T-AATGC--ATA-TGT-TC-GC-AGT-TTG---CCA----CATT----G-TT--TG-TCT-GCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---C--ATGAATATT--------TAAATCGCTC-AT---GTAACTT--A-T-TAGT---------AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------AGT-TTT--AT--C--ATG--TA--TAAAACAC-TGT------ATA-T--TTAA-CTT-ATT---CAAA---ATAT-AATG-----AAT----GC--------TACT-A---ATCC-----AAATGCT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACA-TTG-TTT--TCA-T-ATACAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-AATT-CTAC--AGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TT-CGTAAA--TAAT-TA-AAAC---AG--C-TCTTTAT-AA---CAT--CAAAA--TACATA--GGGAATCGACCA-AG---TT-CAC-CTACAATAGCT-TGA------ATT--GAGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---TATATAT--TTCAAGAATTTT-ATG---TG-CATTTT-------TTTT------GC--AGTACAT-T--TTATTAAAGAA----G-TTTT-CTA-T--ACAATAATCAGGGCGTTT-GACGA-AACTTGTA---TCTGTATTTATTGTT-CC-CCCAAATTCCACATGCATA-AG-G-CAGTA-CT----G-GT-------TT-A----ACTG-TATGGTCATA----C-AA---GT-GTATC--AG-GATA-TGTA---TTTTAGGTT-T--AATATTT-CCAAAAC-----ACTT--GGCTAGTT-TAAAATAAG-CATTTAAGGCT-TTTTTGTA-AAGA-TCAAA--TG-AC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATG--AGATAAAAA-CAATC-CCCAGATATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATC--TGATTTGTTA-TAGAAATTTTTT-------TT-ATC--TG-ATTTTTTACCGTTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAA--TTT--TTGTCTTTTTGAGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-----A-CAATctt
gi|40 : AGCT------ATA-TAT-------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAG--T--AA-C--GCTGTCA-CATT--C--AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CC
gi|41 : TCACCTAATTTTGC-TGGA-------TCATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAGAA----TGGT---AGATT---AT
gi|42 : aT-TCC--AAT-T--TT-G-GGTCC-C-AGAGG---GCAT---------
gi|43 : -AT---GTAACTT--A-T-TAGT---------AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------AAT-Taatatactcaa
gi|44 : ATAATCAGGGCGTTT-GACGG-AACTTGTA---TC
gi|5 : GGTAAGTAA--T--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TTCG-GG-CC----GAGG----CATA--------CACAAAG------------A-AT---------AAGAGTTGAGAAGTTCAATTTCAT-AAA-T-CA-T--AAGA----AGAG--AA-G-A------TT-AT--C-A--AATTGA------AGATAA-A-T--AA-A-TA-CA-AGGTCTATA-T-GAA--T-A-AATC---AA---C--T-CT-CCTTCATCC------------ATA-GT----------GAG--CAGCT------ATACTA--------GT-ATCAGTAAG-TTGGCAA-AA--TTTTAAA--T--AA-CA--CTGTCG-CA-T--CC-AT-----TGCT-C--AATATTT--AA--AGCCCAATTA-----AATTTTTCAT-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-CTAA-------AAAGTTCTT----A-TAC---AGTGT-T-CA-T-------GGAT-----TT--G-A-TG---AA--G-G-T-T----------T---TTAG-TGTT---C--TAT-GC--TAT-AA--CAG---TCAA---ATA----TTA-A--CAATTAGAATGT------CAAT-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-ACAA-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCAT-TTAACT--TGTCTTTG-GT--A--ACAGCCC-AGTTTC-GTAGCC-AA-AGA-ATGACAACTGA-TCTG-AAATTTG-----TAAAA-CATTG--CCA-ACGTAGAGGTTT-ACGAA--TAC-GTGAAAATAATCTTT-CTCTACATAAACTTGATTTTG-A-ATAGCC-T-AATGC--ATA-TGTGTCGGC--GT-TTG-----A----AATT----GCTT--TGTTCT-GCA-A-TGGCGGA----TGTCCT-----A-A----------C---C--ATGAATAATT-------TAA--CATTCTAT---GGTAACTTCATT-TAGT---------AACAA----TT---ATAAC--ATTACAT------ACTGTTT--AT--CTAATG--TA--TAGCACATATGT------ATA-TACTTAA-CTT-ATT---CAAA---ATA--AATGAAATCAAT----TC--------TACT-A---TC-C-----CACTACT--TGTTGTTGAT------TATTC--ACTACAATGAGA-TTG-TTT--TCA-CAATACAGCA--T-TATCTC--AATTACT-GAAT-TCTC--AGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TTGTGTAAAATTATT-TA-AAACT--AG--C-TTTTAATAAA---CAT---AAAA--TA
gi|6 : aCATA-AA-GGCAGTA-CT----G-GTCCGTTCGTT-ACATTACTGATATGATCATAACACCAAG---TT-GTATCTCAGCGGTG-TGTACTTTTTTCG--C-T--AATA-TTTCCAAAAC------CTT--GACTAGCTCTAAAATAAG-CCTTTAAGGCTCTTTT-GTA-AAGAATCAAA-TTGGAC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATGCAGG-TAAAAAACAATT-CC-AGAGATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTCAGATGATT--TGATTT-TTAATAGAAAAACTTT-------TTTATC--TG-AT---------TTTT-CTTACCGTTTTTTTACAG---------------AATATATGACAATGTTT--TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGAATAGGCAATATTT-ACTGAACATCAGCATTCAAGCTTTTTTAATACATACCCGCTG---AGCCCCT-CCCTCGGTTTTCAGAA-TTAACACTGAAAAATCATCAGCATACCACGACTA-AACACATTTAAGCGAT-GTGTCACCTAATTTTGCGCGGGATAATATTTATCATTATATCAGTC-GGACAATAG-ATATCTGGTTCAGGATCCATGTCGAGTTTAT---TATTTTAACAAAGGTTT-GACTTACGGTACTTCTGTTACTCCTCCCGGGC-TGTTTAG-ACGACTCCACTCCACCGTTAAGGCCTTTCCACATGAAATTCG-AAGTTT-ATATCTGTTGTTCGGAGTTTGTGGTACAGTTATTAATTATG-TTTGGCCA-GTACATACTCTTGACATGACTTTATAGAgt
gi|7 : TTTTT-CCCTTGAAAAGCTTC-TTTTG-A-A------T-AATCC--GTA-TGT-TC-GTAA-C-TTG---TCCTTTTCATT------TT--TA-----GCACA-T-TCTGACAAAT-TACTTTGCCATA----------CA--T--GTACATATTAA------TAAATCTTTT--T---CTAAGTTC-A-T-TA-----------AACAC----TTTTGAT-T--------GT------AGA-TCTGAAA--C--TTG--AA--AAAGATGT-TATCGCAGGATA-TG-CCAA-GTTGATT---CAGT---AAAA-AATA-----AAC----AC--------TGCTCA---AC-C-----AACAATT--C-TTTTTG-T------TA-TC--A-TTCAAA-A------------TCA-T-AT--------T-T-TCTT--GA--AGT-GCACACT-C-AAGCAA---AGTATCATTTGATTTATGAATGT---GT-TGTAAA--TATT-TA-A--C---AG--T-ATTGGAT-AA---GGTTTCAATA--TATA-A-TGGATGCCTACCT-AA---TT-CCC-CCATAACTGCA-TAG------TTT--GAAG---CTTTCTTATGTACCCCCCGGTGTA------CCCCA---CATATGTA-CTTGAGAGTTTTAATG---TG-AA-GTT-------TATC------AC--TATATATAT--TTTTCATTG-A----G-TTTT-CAA-T--ATTATAATTTGGTCTCTT-AAC---AA-TAGCAGATTCTGAATTTATAATT--C-CCCAAATTTCACTTCCATATAACA-CAATA-------G-GT-------TT-T----ATTG-TGTGATCAtgtaattcatcggccattcatcgtttcacttctagtcgaagttgtgtcgcaagccttgtg
gi|8 : aggta-TGA-TAGTAGCGTTCAAGCTTTTTT--------------G---AAGTCTT-CCTTCAGTTT-CAGAAATTAACACT---AAGTCATCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAA-GAT-GTGTCACCTAATTTTGC-TGGA-------TCATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----T--------CTC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AAAGATTTGGACTTA-GG--------TCG--TCTCC----C-TGTCTAACAC---------CCACC-TTAGG-----TTCAAA--------------TT-AT--------TTTGAAGTTT----TACAG--AC--AGTATG-TTT-GCCATGTACATACTTTTG--ATGACTTTATAGAAAGGCCCC-TTATGTCAAGC-TG-ATGCAGCC-TGTGTAG-AAGATCTG-AATGTAAAACAGTGTCAAAAGCCTTAGAAAAATCAACA-AAGCAAACGTATAATT--TGGAA-TT-ATCATTTGTATA-TTTTTGAATAACGGTTCT-AAGTATAAAAATGTGGTCACTAGTTCTGGCTTTTGGTTGAAAACCAATTTGAACTTTATTTATAATGTTGTTCGAGTCCAAGTAGTTTTGTAACCTGGTATTCAGTATGCTATTAAATATACTTTGGGATA-aaaagatgcaacaaaatgccggcatt
gi|9 : caaaattaggAAGTAA-AT--T--------TT-ATA-TCA--A-T-A--TT-T-GG-CC-C-AG------GCAT---------AACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--A-CA-ACAA-GA----AGA---AA---A------CC-ATT-C-ACCAAT-GA--T---AGATAA-CGT--AA-C-TAACA-AAGT---TAAT-GA---T-A-AATC---AA---AATT-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAGAGCAGCT-------TA-TATTAAT---GT-A-------G-TTGGACA-AA--TT---AG--T--AA-TC-GCTGTCA-CA-TGTC--ATCTTTATACTGC--A-----T--AAAAG--C-AATTA-----AATTATTC-T-CT-AT-TAACATACCAAGT--T-T-A-T----------AA-GTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----T---CTA-TG---AAATG-G-T-T----------T--TCTTGATGTT----AGTAT-GCCATGT-AACACAA---TCAATG-ATG------A-A--AAAT-GGAAT-TAA----CA-TGCTTATC---AAAGCAC-AG-TACAG-A--CTT-GCAG-ACA-CTTAACATTTTC-TCACAT-TTA-CATGTGTTTTTGTGT--A--AC-GCC--A---TCAA-AGCC-AA-AGA-ATGAGAACTGGTTCTGAAATATGG-----TAAAA-CATTT--CAAGA-CTTGAGGATT-ATGAAt
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): TTCCAATTGGGTCGCTGTGCCCCAGAGCGCGCAAGAACTAATAGGAGAGACCGTACTTAACAGTTGAGAAAGAATGTCCCAAAAAAAAGAAGTGCGGAAAAGTGACTAAGATTTCAAGTACAGAGTGCGTAATCACAAACTCTAACAT
Unaligned ( gi|35 ): AAGGGTATTCAGAACAAGAATGACATGGGAACATAAAGAAATAAAGTAAAATAAACAGGGAAAAACATCCAGATG
Unaligned ( gi|38 ): AATAAATTTGGAAATAAAATATCAATTTTGAAATAAAGAAAATAAATTTGAAATATTCATTATGATA
Alignments
lowQualScore : 1111111111 1 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 1111 1 111 222222 222222222222222 1111111111 444444444444444444444444444444444 222 11111 11111 111 2222222222 1111 1111111 2222222222 2222222222222 111111 22 11 111 111 22222222 222222 111111 11 1 11 11111 11 11111 111 22 1 1 11 33333333 111 111 11111 222222 11111 11111 33333333333333333 333333333 1111 111 222222222 1111 11 111111111111111111 11 1 222222 11 111 111 11 11111 22222222222222 222222222222 111111 11 11 33333333333333 111 11 111 111 11 111 111111 111 55555555555555555 111 22 111 1 2222222 111111 11 222222 111 1 111 1111111 222222222222222 1 22222222222 111 11 11 222222 11 111 1111 111 11 1 111 1 2222222222 222222222 5555555555555555555555555555555555 11 11 111 11 111 111 111 2222 1 11 2 1 11 2222222 11 1111 111 111 11 111 1 1 4444444444444 2222 1 1 666666666 1 22222 11 1 33333333 2222 222222 1 1 11 1 1 1 1 1 1 1 1 11 22 1 1 111 1 1 1 333 3333333 1 22222 1 1 1 1 1 1 2222 1 222 1 1 1 1 1 1 111 1 11 22222222 1 1 222 11 11111 1 111 11 1 1 7777777777777 1 1 11 555555555 1
lowQualScore : 3 0000000000 2 2 555 0 2 22 2 2 4 2 2 333 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 8 3333 7777 33 4444 555 222 555555 2 77 4 55 44 33 666 2 77 888 2 444 5 2 000 2 2 444 000000 5 5 66 111111111111111 2 1111111111 77 000000000000000000000000000000000 2 33 55 33 2 222 2 5 2 2 44444 8 33 77777 33 88 44 11111 1 3 3 3 3 6 111 44 3 3 3 0000000000 1111 3 3 0 0 3 3 3 0000000 5555555555 6 555 6 3 6 3 3333333333333 0 444444 44 00 3 666 9999 666 00000000 55 4 8 222222 4 8 888888 11 4 4 2 8 55 4 4 8 66 5 0 5 77777 1 99999 6 55 4 1 5 5 5 5 11 77 22 22222 5 222 00 5 5 888 1 5 0 3 00 5 5 22222222 66 5 5 5 333 5 333 22222 000000 77 11111 5 5 5 44444 33333333333333333 444444444 0 5 5555 1 555 5 000000000 0000 33 888888888888888888 1 5 88 99 99 99 99 3 222222 5 99 5 5 000 555 44 44444 44444444444444 5 777777777777 77 5 5 666666 5 55 5 5 4 6 6 99 666 7 99 666 99 99 6 6 3 44 11111111111111 6 111 6 55 6 6 888 99 6 6 111 99 99 11 88 6 111 6 6 6 999999 99 111 22222222222222222 1 111 4 22 0 7 111 6 3 1111111 1 999999 3 11 9 6 6 111111 6 9999 1 6 888 000 5 6 6 6666666 5 111 6666666 5 000000000000000 1 44444444444 6 99 77 6 111 1 5 8 11 88 8 000000 11 8 8 666 0 8 8 8 88 8 7777 8 444 8 11 6 0 999 0 8 3 99 99 6 111 3 2 99 6 6 2222222222 99 6 666666666 0000000000000000000000000000000000 55 44 99 99 6 111 6 66 444 444 8 8 0 444 44 3 3 1111 0 33 0 0 0 0 44 6666666 11 8 8 8 8 7777 444 444 33 777 0 55 0 2222222222222 1111 0 0 555555555 0 6 55555 11 0 9 0 66666666 1111 555555 0 0 3 3 99 6 2 7 3 3 3 3 3 2 0 7 3 7 0 88 7 6 00 3 3 6 7 6 0 777 0 0 7 7 3 444 5555555 1 6 1 0 11111 2 2 6 7 3 3 3 3 8888 3 222 7 3 3 7 2 0 6 0 0 3 777 3 7 7 44 0 1 1 55555555 0 3 555 44 99999 0 22 222 44 3 3 3333333333333 7 7 3 7 3 88 444444444 6 3
lowQualScore : . .......... . . ... . . .. . . . . . ... .............................................................. . .... .... .. .... ... ... ...... . .. . .. .. .. ... . .. ... . ... . . ... . . ... ...... . . .. ............... . .......... .. ................................. . .. .. .. . ... . . . . ..... . .. ..... .. .. .. ..... . . . . . . ... .. . . . .......... .... . . . . . . . ....... .......... . ... . . . . ............. . ...... .. .. . ... .... ... ........ .. . . ...... . . ...... .. . . . . .. . . . .. . . . ..... . ..... . .. . . . . . . .. .. .. ..... . ... .. . . ... . . . . .. . . ........ .. . . . ... . ... ..... ...... .. ..... . . . ..... ................. ......... . . .... . ... . ......... .... .. .................. . . .. .. .. .. .. . ...... . .. . . ... ... .. ..... .............. . ............ .. . . ...... . .. . . . . . .. ... . .. ... .. .. . . . .. .............. . ... . .. . . ... .. . . ... .. .. .. .. . ... . . . ...... .. ... ................. . ... . .. . . ... . . ....... . ...... . .. . . . ...... . .... . . ... ... . . . ....... . ... ....... . ............... . ........... . .. .. . ... . . . .. .. . ...... .. . . ... . . . . .. . .... . ... . .. . . ... . . . .. .. . ... . . .. . . .......... .. . ......... .................................. .. .. .. .. . ... . .. ... ... . . . ... .. . . .... . .. . . . . .. ....... .. . . . . .... ... ... .. ... . .. . ............. .... . . ......... . . ..... .. . . . ........ .... ...... . . . . .. . . . . . . . . . . . . . . .. . . .. . . . . . . ... . . . . . ... ....... . . . . ..... . . . . . . . . .... . ... . . . . . . . . . . ... . . . .. . . . ........ . . ... .. ..... . .. ... .. . . ............. . . . . . .. ......... . .
lowQualScore : 1 8888888888 2 1 555 5 0 88 0 0 0 0 0 555 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0 5555 2222 11 2222 555 888 888888 1 11 7 88 44 11 999 2 99 555 4 444 0 5 000 7 7 777 999999 3 3 33 333333333333333 7 7777777777 33 444444444444444444444444444444444 5 44 99 44 5 333 7 3 9 9 33333 6 99 11111 99 55 22 77777 4 3 3 3 3 7 777 66 3 3 3 4444444444 7777 3 3 5 1 3 3 3 8888888 1111111111 7 888 7 3 7 3 9999999999999 4 888888 33 00 6 444 0000 444 55555555 00 0 0 555555 0 0 000000 00 0 0 0 0 55 0 0 0 55 0 5 0 44444 4 33333 7 77 3 4 0 7 7 7 00 66 99 55555 0 111 66 0 5 222 7 0 8 2 66 0 0 88888888 99 0 0 0 999 0 888 99999 777777 99 44444 7 7 7 33333 11111111111111111 999999999 4 0 1111 0 444 0 000000000 6666 66 333333333333333333 0 7 33 22 22 22 22 3 111111 7 33 7 7 000 777 44 33333 44444444444444 7 777777777777 99 7 7 444444 7 77 7 7 3 7 7 22 888 3 22 888 22 88 7 7 5 00 88888888888888 7 777 7 88 7 7 333 22 7 7 777 22 22 66 66 7 777 7 7 7 222222 22 777 88888888888888888 0 777 2 22 7 8 777 7 3 7777777 0 222222 5 88 8 7 7 888888 7 3333 0 7 777 000 0 7 7 2222222 7 777 4444444 7 333333333333333 4 00000000000 7 22 77 7 777 0 0 0 00 66 0 888888 00 0 0 222 8 0 0 8 88 0 0000 0 000 0 00 0 8 444 8 0 2 22 22 7 777 3 5 22 7 7 5555555555 22 7 777777777 0000000000000000000000000000000000 88 00 22 22 7 555 7 22 000 000 0 0 8 000 00 2 2 2222 0 22 0 0 8 8 44 0000000 00 0 0 0 0 0000 000 000 88 555 0 00 0 2222222222222 2222 0 0 222222222 8 5 00000 88 2 2 0 22222222 2222 555555 0 0 2 2 88 5 0 3 3 3 3 3 3 0 7 3 3 3 7 33 3 7 77 3 3 7 3 7 7 000 0 0 3 3 3 000 3333333 0 7 0 0 33333 0 0 7 3 3 3 3 3 3333 3 777 3 3 3 3 0 7 7 0 0 3 777 3 3 3 00 7 0 2 88888888 0 3 000 77 33333 7 00 000 77 3 3 3333333333333 3 3 3 3 3 33 777777777 7 3
consensus : GGTAAGTAA-GT--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT---------TACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--T-CA-T--A-GA----AGA---AA-G-A------TC-AT--C-A--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-A-TAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TA--------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T--AA-CA-ACTGTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----AATTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-T----------AAAGTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----TT--CTA-TG---AA-TG-G-T-T----------T--CTTAGATGTT---TGGTATTGC--TGT-A---CAG---TCAA---ATG----T-A-A--AAAT-GGAAT-T------CA-T-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-GCAG-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCAT-TTAACTTGTGTTTTTGTGT--A--AC-GCCC-AGTTTCAATAGCC-AA-AGA-ATGAGAACTGATTCTGAAAATTTG-----TAAAA-CATTT--CAAGACCTTGAGGATT-ACGAATTTAC-TGGAAAATATTTTTT-CTCTACAGAATCTTG-TTTTG-A-A------T-AATGC--ATA-TGT-TC-GCAAGT-TTG---CCA----CATT----G-TT--TG-TCC-GCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---C--GTGAATATTTA------TAAATCGCTC-AT---GTAANTT-A-T-TAGT---------AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------ANT-TTT--AT--C--ATG--TA--TAGAACAT-TGT------ATA-T--CTAA-CTT-ATT---CAAA---ATAT-AATG-----AAT----GC--------TACT-A---NT-C-----AACTACT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACA-TTG-TTT--TCA-T-ATACAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-GAAT-CTAC-AAGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TT-CGTAAA--TATT-TA-AAAC---AG--C-TTTTTAT-AA---CAT--CAAAA--TACATA-TGGGAATCGACCA-AG---TT-CAC-CTACAATAGCT-TGA------TTT--GAGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---AATATATA-TTCGAGAGTTTTAATG---TG-CA-TTT-------TNTC------GCAGTA-CATATTTATTAA-AG-A----N-TTTT-CTA-T--ACAATAATCNGGGCGTTT-GACG-GAACTTGTA---TCTGTATTTATTGTTCCC-CCCAAATTTCACATGCATA-AA-G-CAGTA-CT----G-GT-------TT-A----ACTG-TATGATCATA----CAAA---GT-GTATC--AG-GGTG-TGTA---TTTTNGGTT-T--AATA-TT-CCAAAAC-----ACTT--GACTAGTT-TAAAATAAG-CCTTTAAGGCTCTTTTTGTA-AAGA-TCNAA-TTG-AC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATG--AG-TAAAAA-CAATT-CCCAGATATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATT--TGATTT-TTA-TAGAAAAACTTT-------TT-ATC--TG-AT---------TTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAAT-TTT--TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-A-TGA-CAATAGCATTCAAGCTTTTTTAATACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCGGTTT-CAGAAATTAACACT---AAATCATCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAG-GAT-GTGTCACCTAATTTTGC-CGGA-------TTATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AAAGGTTTGGACTTA-GGT-------TTA--CCTCC----C-TGTCTAA-ACG--------CCACCNTTAGG-----TTCAAATGAAACTCGTAAGTTT-AT--------TTTGGAGTTT----TACAG--AT--ATTATG-TTT-GCCATGTACATACTCTTGA-ATGACTTTATAGAAAGGCCCCTTTATGTCAAGT-TG-GTGCAGCC-TGTGTAG-AAGAGCTG-AATGTGAAACGGTATCAAAGGCCTTAGAAAAATCAACA-AAGCAAACGTACAATT--TGGAACTT-AATATTTGTATA-TTTTTGAATAAGGGTTCT-AAGTATAAACATGTGGTCACTGGTTCTGGCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTTATAATATTGTTAGAGTCCAAGTAGTTTCGTAACCTTGTATTCAGTATGCTATTAA--ATACTTT-GGATA-AGCAAAGAAGTT-ATTGTT-A-TCCTCTA---TAGTANTTTGATGGGTCANA-AGGGCTATCATTTTTATGAAT-AGGCTTTAATAAAGCCTATTTCCCACTCCCTTTGGGTATT-TGCCAG-AG-GACAA-GACAAG----AT-TAAATAATTT-T-AGCATATGTGGT-AAAATATAT-GTACGTCGGCTTTCA-ACATCTCATT-TTTAATGCCAT-CTAATCGCA-GCTTGATTTATTATTTTTTAGATGTTTTTATTGCATCGATGATTTTCTTTTCTNTAATTG-A-TAAATCTAAC-GAAGT-AATG--TTGATATTTCTGCTGACTTGGACAANNAATCTTCAAAATATTTAATTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAGATATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGACT--TTCAAA-CCT-----GAGTTTCCAG-TATGATA
Reference ( family-3541 ) : GGTAAGTAA-GT--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT---------TACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--T-CA-T--A-GA----AGA---AA-G-A------TC-AT--C-A--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-A-TAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TA--------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T--AA-CA-ACTGTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----AATTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-T----------AAAGTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----TT--CTA-TG---AA-TG-G-T-T----------T--CTTAGATGTT---TGGTATTGC--TGT-A---CAG---TCAA---ATG----T-A-A--AAAT-GGAAT-T------CA-T-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-GCAG-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCAT-TTAACTTGTGTTTTTGTGT--A--AC-GCCC-AGTTTCAATAGCC-AA-AGA-ATGAGAACTGATTCTGAAAATTTG-----TAAAA-CATTT--CAAGACCTTGAGGATT-ACGAATTTAC-TGGAAAATATTTTTT-CTCTACAGAATCTTG-TTTTG-A-A------T-AATGC--ATA-TGT-TC-GCAAGT-TTG---CCA----CATT----G-TT--TG-TCC-GCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---C--GTGAATATTTA------TAAATCGCTC-AT---GTAANCT-A-T-TAGT---------AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------ANT-TTT--AT--C--ATG--TA--TAGAACAT-TGT------ATA-T--CTAA-CTT-ATT---CAAA---ATAT-AATG-----AAT----GC--------TACT-A---NT-C-----AACTACT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACA-TTG-TTT--TCA-T-ATACAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-GAAT-CTAC-AAGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TT-CGTAAA--TATT-TA-AAAC---AG--C-TTTTTAT-AA---CAT--CAAAA--TACATA-TGGGAATCGACCA-AG---TT-CAC-CTACAATAGCT-TGA------TTT--GAGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---AATATATA-TTCGAGAGTTTTAATG---TG-CA-TTT-------TNTC------GCAGTA-CATATTTATTAA-AG-A----N-TTTT-CTA-T--ACAATAATCNGGGCGTTT-GACG-GAACTTGTA---TCTGTATTTATTGTTCCC-CCCAAATTTCACATGCATA-AA-G-CAGTA-CT----G-GT-------TT-A----ACTG-TATGATCATA----CAAA---GT-GTATC--AG-GGTG-TGTA---TTTTNGGTT-T--AATA-TT-CCAAAAC-----ACTT--GACTAGTT-TAAAATAAG-CCTTTAAGGCTCTTTTTGTA-AAGA-TCNAA-TTG-AC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATG--AG-TAAAAA-CAATT-CCCAGATATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATT--TGATTT-TTA-TAGAAAAACTTT-------TT-ATC--TG-AT---------TTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAAT-TTT--TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-A-TGA-CAATAGCATTCAAGCTTTTTTAATACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCGGTTT-CAGAAATTAACACT---AAATCATCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAG-GAT-GTGTCACCTAATTTTGC-CGGA-------TTATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AAAGGTTTGGACTTA-GGT-------TTA--CCTCC----C-TGTCTAA-ACG--------CCACCNTTAGG-----TTCAAATGAAACTCGTAAGTTT-AT--------TTTGGAGTTT----TACAG--AT--ATTATG-TTT-GCCATGTACATACTCTTGA-ATGACTTTATAGAAAGGCCCCTTTATGTCAAGT-TG-GTGCAGCC-TGTGTAG-AAGAGCTG-AATGTGAAACGGTATCAAAGGCCTTAGAAAAATCAACA-AAGCAAACGTACAATT--TGGAACTT-AATATTTGTATA-TTTTTGAATAAGGGTTCT-AAGTATAAACATGTGGTCACTGGTTCTGGCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTTATAATATTGTTAGAGTCCAAGTAGTTTCGTAACCTTGTATTCAGTATGCTATTAA--ATACTTT-GGATA-AGCAAAGAAGTT-ATTGTT-A-TCCTCTA---TAGTANTTTGATGGGTCANA-AGGGCTATCATTTTTATGAAT-AGGCTTTAATAAAGCCTATTTCCCACTCCCTTTGGGTATT-TGCCAG-AG-GACAA-GACAAG----AT-TAAATAATTT-T-AGCATATGTGGT-AAAATATAT-GTACGTCGGCTTTCA-ACATCTCATT-TTTAATGCCAT-CTAATCGCA-GCTTGATTTATTATTTTTTAGATGTTTTTATTGCATCGATGATTTTCTTTTCTNTAATTG-A-TAAATCTAAC-GAAGT-AATG--TTGATATTTCTGCTGACTTGGACAANNAATCTTCAAAATATTTAATTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAGATATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGACT--TTCAAACCCT-----GAGTTTCCAG-TATGATA
gi|1 : GTAAGTAAAGT--TA----A-TTTTATTCTCCGAA-T-T--TT-G-GG-CCAC-GAAGG---GCAT----------ACAA-G------------ATAT---------A--------------------AAA-AA----CA-C--A-GA----AGA---AA-G-T------GC-AT--CCA--AAT-GA--TGA-AGATAA-AGT--AA-A-TAACA-AAGT---TA-T-GAA--T-A-AATC---AA---T--T-TT-C--TCA---------------ATT-G-----------GAG--CAGCT------ATACTT--------GT-A-------GATTGGCAA-AT--TTCTCAACCT--AA-AC-ACTGTCA-CAT-T-CGAT-----TACT-CCAA-----T--AA--G--CCAAATA-----A-TTTTTC-T-CTGATCTA-CA----AGGT--T-T-AAT----------AAAGTTTTTTA--A-AAC-AAAGT---T-CAAT-------GGAT-----T---CTA-TG---AA-TG-G-T-T----------TGTCTTAAATGTG---TG-TAT-GC--TGT-A---CAA---TCAA---ATG----T-A-A--AA-T-GGAATGT------CA-T-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-GCAG-ACAGCT--ACATTTTC-TCTCAT-T--ACTTGTGTTTTTGTGTTAA--AC-GCCCGAGTTTCAATAGCC-AACAGA-ATGAGAACTAATTCT-AAAATTTG-----TAAAAACATTTT-CAAGAC-TTGAGGATT-AC-AATCT-----GAAAATATTTTT--CTCTACAGAATCTT--TTTTG-A-AC-----T-AATGGGAATAATGT-TC-GCA-GTGTTG---CCA----CATT----GGTT--TG-TCCTGCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---CCAGTGAA-ATT---------AAATCGCTC-AT---GCTAACT-T-TATAGT---------AACAA----TTT-GATTACGGA----AT------ATT-TTT--ATATC--ATG--TA--TAGAACATCTGT------ATAGT--CTAAGCTT-ATT---CAAAC--ATA--AATG-----AGA----GC--------TACT-A---GTTC-----AACTACT--T-TGTTTG-T------TA-TCGAA-TACAAT-ACAGTTG-TTTCATTA-T-AT-CAGCA--TAT-TCTT--AA-GAAT-GAAT-CTAC-AGGGGGCGAA----------ATCTA-AAATTC---TT-CGAAAAA-TATT-TA-AAAC---AG--CGTTTTTAT-AAACACAT--CAAAA--TACATA---GGAATCGACCA-AG---TTTCAC-CTACAATAGCT-TGA------TTT--GAG----CCTTTTTAGGTAC----------AGA----CCA-A---AATATAT--TTCAAGAATTTTAATG---TGGCAATTT-------TTTC------GCAGTAACATGTTTATTAA-AG-A----CGTTTT-CTAGT--ACAATAATCAGGGCGTTTTGACG-GAACTTGTA---TCTGTATTTATTGTTCCC-C--AAATTTCACATGCATA-AAAG-CAGTAACT----GTGT-------TTTA----ACTG-TATGATCATA----CA-----GTCGTATC--AG-GGTG-TGTA---TTTTTGGTTAT--AAT--TT-CCAAAAC-----ACTTTTGACTAGTT-TAAAATAAGGCCTTTAAGGCT---TTTGTAGAAGA-TCCAAATTG-AC----AACATGTGTA---AGGAGGCCTGATG--AGGTAAAAA-CAATTGCCCAGATATT---G--TACGATGAACACT---TGTTCTGA--ATT--TGATTT-TTA-TAGAAAAACTTT-------TT-ATC--TG-AT---------TTTT-T-------------ACAACGTTTTTTCTACAGAAATATT-GACAAT-TTT--T-GTCTTTCTGAGGTTGACCAGGA-TAGGCAAAATTTGA-TGA-CAATAGCATTCAAGCCTTTTTAATACAC---CGCTGTGAAGGCCCTCCCCTCGGTTT--AGAAATTAACACT---AAATCATCAGCAT-C----AACATAACA---TTAAGAGATGGTGTCACCT-ATTTTGC-CGGA-------TTATCAT--TATC-GTCGAAAA-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAATATTATTTTAA-AAAGGTTTGGACTTA-GG--------TTA--CCTCC----C-TGTCTTA-ACAC-------CCACACTTA-G-----TTCAAATG-AACTCGTAAGTTTGAT--------TTTGGAGTTT----TAGAG---T--ATTATGTTTT-GCCATGTACATAC-CTTGA-TTGACTTTATA-AAAGG-CCCTTTATGTCAAGTCTGTGTGCAGCCTTGTGTAGAAAGAGCTGAAATGT--AACGGTATCAAAGGCCTTAG-AAAATCAACACAAGC-AACATACAATTGCTGGAACTT--ATATTTGTATATTTTTTGAATAAGGGTTCTAAAGTATAAACATGTGGTCACTGGTTCT-GCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTTAT-ATATTGTTAGAGT-CAAGTAGTTTCGTACCTTTGTATTCAGTATGCTATTAA--ATACTTT-GGAAATAGCAAAGAAGTTGATTGTTAA-TCCTCTA---TA--ATTTTGAT-GGTCATA-AGGGCTATCATTTTTATGAAT-AGGTTTTAATAAAGCCTATTT-CCATTCCCTTTGGG-ATTCTGCCAACAGAAACAACGACAAG----AT-TAAACAATTTATAAGCATATGTGGTAAAAATATAT-GTACATCGG-TTTCA-ACATCTCATT-TTTAATGCCAT-CTAATCGCA-GCTTGATTTATTATCTTTCAGATGTTTTTATTGCATCAATGATTTTCTTTTCTTTAATTG-A-TAAATCTAAC-GAAGT-AATG--TTGATATTTCTGCTGACTTGGACAATAAATCTTCAAAATATTTAATTCTGGGTATCAAATTTACTAATCAATACTGAATAATGTTTGTAAAATGATTTACACCCATTGTTCACTAGATATCTT-ATCGGACT-ATCTTGCGGATTGCTGATTGATTCAAATTCTTTCAAAAGTTT-CAG-TATG
gi|10 : aaAAGTAA-AT--T--------TT-ATA-TCA--A-T-A--TT-T-GG-CC-C-AG------GCAT---------AACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--A-CA-ACAA-GA----AGA---AA---A------CC-ATT-C-ACCAAT-GA--T---AGATAA-CGT--AA-C-TAACA-AAGT---TAAT-GA---T-A-AATC---AA---AATT-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAGAGCAGCT-------TA-TATTAAT---GT-A-------G-TTGGACA-AA--TT---AG--T--AA-TC-GCTGTCA-CATGT-C-ATCTTTATACTGC--A-----T--AAAAG--C-AATTA-----AATTATTC-T-CT-AT-TAACATACCAAGT--T-T-A-T----------AA-GTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----T---CTA-TG---AAATG-G-T-T----------T--TCTTGATGTT----AGTAT-GCCATGT-AACACAA---TCAATG-ATG------A-A--AAAT-GGAAT-TAA----CA-TGCTTATC---AAAGCAC-AG-TACAG-A--CTT-GCAG-ACA-CTTAACATTTTC-TCACAT-TTA-CATGTGTTTTTGTGT--A--AC-GCC--A---TCAA-AGCC-AA-AGA-ATGAGAACTGGTTCTGAAATATGG-----TAAAA-CATTT--CAAGA-CTTGAGGATT-ATGAAgcat
gi|11 : taagctaATAGAGCATAA---TT-CCC-CCATAACTGTT-TGG------TTT--GAGG---TCTTCTTGTGTAT----------T------CCATATAGAGTATGTA-CTTGAGGGGTTTAATG---TG-AA-GTT-------TATC------AC--TA-AATA-TGATTCATGG-A----C-TTTT-CAA-C--ATTATAATTTGGGCTCTT-TACATCAGCAGGT----TTTGAATTTGTAGTT--T-CCCAAATT--------ACA-AA-A-CA----------G-GT-------TT-T----ACAG-TGTGATAAAA----AAAAAAGAT-GCAAC--AA-AATACTGGA---ATTTGGCCT-TGCAAT--TT-CAAAAAC-----ATTT--AATTAATT-TAAAGAAAG-CATTCAAACCAC-GCTTATA-CAGG-TCTTG-TTG-ACAATTAACATATA-ATCCAAAGG-CAT--TG--AA-T-ATAC-CA----CGTAAATATTAATGAATAAAA-GA-CAATGAATGTTC-TAT--TTCCTTATCT-TTA-TAAACAAATTTTAAGTTTCTT-ACCTTTGCAT---------TCTTGT-------------AAAA---------------AAAAT--G----T-TGTCCTTGTCTTTTTCAAATTAAC--AGA-GAGACAATGTTT-A-Taa
gi|12 : gTAAGTAA-GT--TA----T-TTT-ATT-TCC--AAT-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT--------------AA------------ATAT---------A--------------------CAT-AAA-C-CA-C--A-GA----AGA---G--G-A------CC-AT--CCA--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-A-TAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TTTC--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TAT-------GT-A---------TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T--AA-CA--CTGTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----ATATTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-T----------AAAGTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGA------TT--CTA-TG----A-TG-GTT-T----------T--CTTAGATG-T---TGGTA-TGC--TGT-A---CAA---CCAA---ATG----T---A--AAAT-GGTAT-T------CA-T-CTT--C---AA--CACAAG-TCCAG-A--CTT-GCAG-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCAC-TT-ACTTGTGTTTTTGTcata
gi|13 : -T--TT-G-GA-CC-C-AGAGT---GCAT----------ACAAAG------------A-AT---------A--------------------CAT-AG--TTCA-T--A--A----ATA---CA-C-A------TC-AT--A-A--AA---A--T----GATAA-AGT--AATA-TAACC-AGGT---TA-T-GA---T-A-AATC---TATTTT--T-TT-T--TCA---------------ATA-GT----------GAG--CAGC----------------------T-A-------A-TT-------A--TTGTCAA--T--AA-C--ACTGTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----ACTTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---TATGT--T-T-A-T----------AAAGTAATT----A-TAC-AAGGTGT-T-TA-T-------GAA------CT--CTA-TG---AA-TG-G-TGC----------C--CTTAGGTG-T---TGGTA-TGC--TAT-A---CAG---TCAA---ATA----T-ACA--AAAT-GGAAA-T------CA-T-CCT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-ATGCGT-GCGC-ACGCCT--GCAT
gi|14 : g--TA----A-TTT--TT-TCC--A-A-T--TT-T-TG-CC-C-AGAGG---GCAT----------ACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AAA-C-CA-C--A-GA----AGA---AA-G-A------CC-AT--CCA--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-AATAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TTTC--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TAATTTAT--GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T--AA-CA--CTGTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----AATTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T---C----------AAAG-TTTT----A-TACAAAAGTAT-T-CA-T-------GGATCTATATT--CTA-TG---AA-TG-GTT-T----------T--CTTAGATG-T---TGGT
gi|15 : aaggtagTAAGTAA-GT---A----A-TTT-----TCA--A-T-T--TT-G-GG-GT-G-AGAGG---GCAT---------CATACAA------------ATA-----------------------------------AA--T-CA-G--A-GTTCCTGTA---CA-T-G------TT-AT--CTA--AAA-GG--C---GTATAATATT--AA-A-TTACA-AGTT---TA-T-GA---T-ATAAT----AA---ACTT-TT-C--CCC---------------ATA-AT----------GAA--CAGCTCTAGAGATA-TA--------GGGA-------A-TTGGCAA-AA--TTTCCAT--T--AA-CA-TC-GTCA-CAT-g
gi|16 : aaA----G-TTT-ATT-CCA--A-T-T--TT-G-GGCCC-C-AAAGG---GCAT---------AATAGAA------------GTA----------A--------------------CA--GC--T-CA-T--A--A----AGA---AA-G-AAATGTCCC-AA--A-A--AAT-GAAGT---GGGAAA-AGTTAAA-A-TATCA-cacacaagtctatgtataactataaaatattcatggactct
gi|17 : aaagaaaataaatttgagaaaaaatatcaattttgaaataagaaaataaaatttggaaatattcattatgatatctataggtgtaaagataatataCCC-AGTTTAAATAGCC-AA-AAG-ATGAGAACTGATTATG-AAATTTA-----GAAAA-CATTG--CAAGAC---GAGGATT-GCGAA-TTAC-TGAAAAATG--TTTT-CTCTACAGA------------------------AATGC--A-A-TGT-TC-GCCAGT-TTGT--CCA-----ATT----G--T--TG-TCT-GCA-ATTGCCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------CCTTC--ATGAATATTTCTCTTTTTAAATCTATC-AG---ATAATTT-A-T-TAGT---------AACAA----Ttggaatcacaacttacatgtatgtgg
gi|18 : tacA-AAGT---TA-TAGA---T-A-A-TC---AA---T--TGTT-C--TCA---------------TTT-GT----------GAG--CAG-T------ATA-TA---------T-A-------G-TTGGCAA------TTTCAA--T--AAGCA---T-TCA-CAT-TAC-AT-----TA-T-C--A-----CTAAA--G--CCAAATAC----AATTTCTT-TACT-AT-TA-CA---CAGGT--T-TTA-T----------AAATTTTTTGCCTA-TAC-AA-GTAT-TTCA-T-------GGAT-----TCTGCT--TG---AA-TG-G-T-T----------TTTCTTA-ATGTT----GGTATGGC--TGTTA---CA----TCAA---ATG----T-A-A--AAata
gi|19 : TGGCAACGA--TTTT-AA--T--AA-CA--CCGTCA-C-T-T-C-AT-----TGCTTC--A-----T--A---G--CCAGGTA-----AAGTT----------------------GTT--T-T-A-T----------CAAATTCTT----A-T-C-AATGTGT-T-CA-A-------GGA----------CTGGTG---AA-TG-G-T-T----------TT-CGTACA-GTTGAATGATAT-AC--AAT-A---CAG---TCAA---TT---------A--CAAT-GGAAT-T------CA-T-CTT-------A--CAA-AGTT-CAGCA--TTT-ACAG-ACA-GT--GCATTTTCTTTTCATATTACC---CGTTTTTG
gi|2 : acGGTAAGTAA-GT--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT---------TACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--C-CA-C--A-GA----AGA---AA-G-A------CC-AT--C-A--CAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-T-TAA-A-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TA--------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAAA-T--AA-CA-ACTGTCAGCAT---C-GT-----TACT-C--A-----T--AG------CAAA-A-----AATTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-T----------AAAGTTTTC----AATAA-CAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----TT--CTA-TG---A--TG-G-T-T----------T--CTTAGATGTT---TGGTATTGC--TGT-A---CAC---TCAG---ATG----T-A-A--AAAT-GGAAT-T------C--T-CTT------AA--CAC-AG-T--AG-A--CTT-GCAGGACA-CT--ACATTTTC-TCTCAT-TTAAATTGTGTTTTTGGTT--AGTAC-GCCCCAGTTTCAATAGCCCAA-AGATATG-GAACTGATTCTGAAAATTTG-----TAAAA-CATTT--CAAGACCTTCAGGATT-ACGAATTTACATGAAAAATATTTTTTTCTCTACAGAATTTTG-TTTTG-ATA------C-AATGA--ATA-TGT-TC-GCAAGT-TTG---CCA----CATT----G-TT--TG-TCT-TCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---C--ATGAATATTTA-------AAATCGTCC-AT----TAAACT-A-T--AGT---------AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------AAT-TTC--AT--C--ATG--TA--TAGAACAT-TGT------ATA-T--CTAA-CTT-ATT---CAAA---ATATTAATG-----AAT----GC--------TACT-A---GT-C-----AACTACT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACA-TTG-TTT---CA-T-ATACAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-GAAT-CTAC-AGGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TT-CGTAAA--TATT-TT-AAAC---AG--C-TTTTTAT-AA---CAT--CAAAA--TAC-TA-TGGGAATCGACCA-AG---TT-CAC-CTACAATAGCT-TGA------TTT--GAGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---AATATAT--TTCAAGAATTTTTATG---TG-CA-TTT-------TTTC------GCAGTA--GTATTTATTAA-AA-A----G-TTTTTCTA-T--ACAATAATCCAGGCGTTT-GACG-GAACTTGTA----CTGTATTTATTGTTCCCACCCAAATTTCACATGCATA-AA-G-CAGTA-CT----G-GT-------TT-A----GCTGCTATGATCATA----CAAA---GT-GTATC--AG-GGTG-TGTA---TTTTTGGTT-T--AATA-TT-CCGAAACCAAAAACTT--GACTAGTT-TAAAATAAG-CCTTTAAGGCTCTTTTTGTA-AAGA-TC-AA-TTG-AC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATG--AG-TAAA---CAATT-CCCAGATATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATT--TGAATT-GTA-TAGAAAAACTTT----------ATC--TG-AT---------TTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAAT-TTT--TTGTCTTTCTGGGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-A-TGA-CAATAGCATTCAAGCTTTTTTA-TACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCAGTTT-CGAAAATAAACACT---A--TT-TCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAG-GAT-GGTTCACCTAATTT-GT--GGA-------TTATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AATGGTCTG-ACTTA-GGT-------TTA--TCTCC----CGCGTCTAA-AC----------CACCTTTAGG-----TTCAAATGAAACTCGTAAGTTT-AT--------TTTGGAGCTT----TACAG--AT--ATTATG-TTT-GCCATGTACATACTCTTGG-ATGACTTTATAAAAAGGTCCCTTTATGTCAAGT-TG-GTGCAACC-TGTGTAG-AAGAGCTG-AATGTGAAACAGTATCAAAGGCCTTGGAAAAATTAATA-AAGCAAACATACAATT--TGG-ACTTAAATATTTGTATA-TTTTTGAATAAGGGTTCT-AAGTATAAACATGTGGTCACTGGTTCTGGCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTAATAATATTGTTAGAGTCCAAGTAGTTTTGTAACCTTGTATTCAGTATGCTATCAA--ATACTTT-GGATA-AGC-AAGAAGTT-ATTGTT-ATTCCTCTATACTAGTAGTTTGATGGGTCATA-TGGGCTATCGTTTTTATGAAT-AGG-TTTAATAAAGCCTATTTTCCA-TTCCTTTGGGTATT-TGCCAG-AA-GACAA-GACAAG----AT-TAAATAATTT-T-AGCATATGTGGT-AAAATATAT-G-AC-TTGGCTTTCA-ACATCTCATT-TTTAATGCCATCCTAATC-CA-GC-TGATTT-TTATTCTTTAGATG-TTTTATTGCATCAATGATTTTCTTTTTTTTAGTTGTACTAAATCTAAC-GAGGTAAATGTTTTGAT-TTTCT--T--CTTGG-CAAGTAAT-TTCAAAATATTT-ATTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAG-TATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGACT--TTCAAA--CT-----GAGTTTCCAGTTATGATA
gi|20 : TTTTTGTAATCG-A-TA--TGTAGCTGTAGT-AAT---CTGA-ACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--AAAATATTTA-TTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAGATATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGACT--TTCAAAACC------GAGTTTCCAG-TATGATA
gi|21 : T--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATT--TGAATT-GTA-TAGAAAAACTTT-------TT-ATC--TG-AT---------TTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAA--TTT--TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-A-TGA-CAATAGCATTCAAGCTTTTTT-ATACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCAGTTT-CAGAAATTAACACT---
gi|22 : --TA----A-TTT-ATT-TCA--AAT-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCATAACATGGAATACAGAGTTC---------ATAT---------G--------------------CATGAA--T-CA-T--G-AA----AG-----T-G-A------TCAAT--C-A--AAA-GA--T---CAATAA-AAT----------------T---TA-C-GA---T-A-AATC---AA---C--TCTT-C--TCT---------------ATA-AT----------GAG--CA-C------------------------------------------AA--TTTCCTG--T--AA-C--ACCGTCA-AAT-T-C-GT-----TACT-C--A-----T--A
gi|23 : gtacatgTCAGACAGGGCTATCATTCTTATGAATTA--CTTTGATAAAGCCTGTATCCCACTCC-TTTGAATATT-TGCCAG-AG-GACAA-GATAAATTACATGTAGATAATTT-C-AGCAAA--TGGT-ACAATATGTGGTACGGTGGCTAGTA-ACATTTCATT-TTCATTG
gi|25 : TAAATAA-GA--AA----AGTTT-ATT-CCA--A-T-T--TT-G-GG-CC-CAAGAGG---GCAT---------AATAGAA------------GTATTATTTAAAAA--------------------CAT-----T-CA-T----GA----AGA---AA-G-A------
gi|26 : agtttaTAA-GT--TA----A-TTC-ATT-TTC--A-A-AAATT-GCGG-CC-C-AGAGGAATGCAT---------TACAGAG------------ATAT---------AAGGTTCAAATA---------CAG-AA--T-AA-T--A-AA----AGA---AT-G-A------TT-TC--C-A--AAA-GA--T---AGATAA-AGT--AG-A-Taatgtccaaaaagaaggaagaaattattttttacaatattataacatacatggatgtgg
gi|27 : agaTT-ATT-TCCA-A-T-T--TT-G-GC-CC-C-A-AGG---GCAA---------TA-AAAGAATACCAGGTTCACAT---------A--------------------CATAAA--T-CA-T--A-AA----AGAGCTAA-C-A------TT-AT--CTA--AAT-GA--T---AGATAC-TATA-AA-A-TAACA-AGGT---TA-T-ggaatgtgatttggtcaatca
gi|28 : aagtagtattaaagtaAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA-------------------------A-G-A------CC-AT--CCA--AAT-GA--TTATAGATAA-AGT--AAGA-TTACA-AAGT---TA-T-GA---TTA-AATC---AA---A--T-TT-CC-TCA---------------ATTTGT----------GAG--CAGCT------ATA-c
gi|29 : TTTCAGACATTTCATTATTTTATCCCAC-CCAA--ACATGCTTGATTTATTATTTTTTAGCT-TTGTCACGGCAGAGATTATTTCCTTTTCTATATTT--------CCTAAC-Ggttgtgtgttaaattgg
gi|3 : cacaggTAAGTAA-GTAATATCTTA-TTT-ATT-TCC--AAT-T--TT-G-GG-CC-C-AG-GG---GCAT----------ACAA-G------------ATAT---------AAC------------------CAT-AAACT-CAAC--A-GA----AGA---AGTGCA------TC--T--C-A--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AACA-TAACATAAGT---TA-T-GGGACT-C-ACTCACAAA---A--T-TT----TCATGACACAGTACACTGATT-GTTACCTGATACGAG--CAGCT------GCA-TACACTCACTGT-A-------G-TTGGCAA-AATTTTTTCAA--TTAAA-CACACGTTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAACATCCACGATTTTCT-C-CT-AT-TA-AA---CAGGTGATAT-A-TACCTCCGATAAAAGTATTT----A-TAC--AAGTATAT-CA-TCATACAAGGA------TT--CTATTGTGTAA-TGTG-T-TTATAAAATTAT--CTTAAATG-T---TGGTA-TGC--TGT-A---CCGGCATCAATTCATGGCTAC-A-AACAAAT-GGAAC-TTGGAAACA-T-TCT--CCCAAA--CAG-CG-T-CAGTA--CTTAACCG-ATA-CTCGACACT
gi|3 : acccacgggtaATTCCAAAAACTTACTAAATGAAA-CAATTGCCAAGAC-TTGAGGATTCACGAATT-AC-TCGAAAATATTTTTC-CTCTACAGAATCTTG-TTTTGAA-A------TGAATGA--ATA-TGT-TC-GCAGTT-TTGCCACCA----CATTGGGGG-TTAATG-GTC-GCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACAAATGCCGCACC---T--GCGAATAATTA------TTAATCGCTC-ATAGCGTGGACT---T-TAATTAAAAGATAAACAAGTTTTT--GAC-AC--A----ATTATTCCATT-GTTCAAT--C--ATGACTAATTAGAACAT-TGTA-----ATA-TC-CTAA-CTT-ATTTAACAAAAATATAT-AATG-----AATG---GCGGTAACTGTAGT-ATCTTT-CCACAAAATAACTAAT-TTGTTG-TTCACTATA-TCCTA-TACACT-CAA-TTGATTT--TCAGT-ATACAGCAGTT-C-TCTTGAAA-TAATCGAAT-CTACAAAGGGG---A----------ATCTA-AAATTCTCTTC-CGAAAA--TATTGTACGAACATAAGATC-TTTTTAT-AA---CAT--CAAAATTTACATAGTGGAATTCGACCA-AGTTTTT-CACGCTACAATAAATCTGAAGACCCTTTTGGAGGTATCCTTTTTATGTAC----------AAGTAACCTACA---AATAT-TATTTCAAGAGACTTTATGTTTTG-CA-TTTGGTTTAATCTTACAATAGCAGTA-CAT-TTTATTAA-AG-AAGACC-TTTT-CTA-TACACAATAAaccaatggtttaaacattcttttaaatctattttatctatctcaataatgtttccttgctgtaggacgcccggacgcagggaatttcaataaatgcctataagaaatgaaggctcttggatgatgagagagaactgattcatatttaccccacaacgattatttgtattccaaaaacttactaaatgaaacaattgccaagacttgaggattcacgaattactcgaaaatatttttcctctacagaatcttgttttgaaatgaatgaatatgttcgcagttttgccaccacattgggggttaatggtcgcaatgtctgaaagtgtactacaaatgccgcacctgcgaataattattaatcgctcatagcgtggactttaattaaaagataaacaagtttttgacacaattattccattgttcaatcatgactaattagaacattgtaatatcctaacttatttaacaaaaatatataatgaatggcggtaactgtagtatctttccacaaaataactaatttgttgttcactatatcctatacactcaattgattttcagtatacagcagttctcttgaaataatcgaatctacaaaggggaatctaaaattctcttccgaaaatattgtacgaacataagatctttttataacatcaaaatttacatagtggaattcgaccaagtttttcacgctacaataaatctgaagacccttttggaggtatcctttttatgtacaagtaacctacaaatattatttcaagagactttatgttttgcatttggtttaatcttacaatagcagtacattttattaaagaagaccttttctatacacaataaatggacaggggcccaaacgttgtatat
gi|30 : acccacgggtataagtaagtaatatcttatttatttccaattttgggcccaggggcatacaagatataaccataaactcaacagaagaagtgcatctcaaatgatagataaagtaacataacataagttatgggactcactcacaaaattttcatgacacagtacactgattgttacctgatacgagcagctgcatacactcactgtagttggcaaaattttttcaattaaacacacgttcacattcattactcataagccaaacatccacgattttctcctattaaacaggtgatatatacctccgataaaagtatttatacaagtatatcatcatacaaggattctattgtgtaatgtgtttataaaattatcttaaatgttggtatgctgtaccggcatcaattcatggctacaaacaaatggaacttggaaacattctcccaaacagcgtcagtacttaaccgatactcgacactaccaatggtttaaacattcttttaaatctattttatctatctcaataatgtttccttgctgtaggacgcccggacgcagggaatttcaataaatgcctataagaaatgaaggctcttggatgatgagagagaactgattcatatttaccccacaacgattatttgtTAAGTAA-GT---A----A-TTC-ATT-TTC--A-AAT--TT-G-GG-CC-C-AGAGA---GCATACAGAGAA-TACAGAGTTC---------ATAT---------A--------------------CATGAA--T-AA-T--A-AA----AGA---AT-G-A------TT-AT--C-C--AAA-GA--T---AGATAA-AGatggacaggggcccaaacgttgtatat
gi|31 : c-AA--T-CA-T--A-AA----AGA---GA-G-A------TT-ATCCC-A--AA--GA--T---AGGTAA-CGTG-AA-A-TAAC-----T--------------------------------T-TT-C--TCA---------------GTA-AT----------GAA--CAGCT------ATA-T-------------------------GCGT-AA--TTTTCAA--T--GA-CA-
gi|32 : attagatgGTAAGTAA-TT--TT----T-TTT--TT-TCA--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGGGG---GAATACAAAGAA-TACAGAGTTT---------ATCT---------A--------------------CATAAA--T-CA-T--A-GA----AGA---GA-G-A------TT-AT--C-C--AAttgt
gi|33 : aACTTGTA---TCTGTATTTATTGTTCCC-C--AAAT----------------G-CAGTA-CTTACCG-GT-------TG-A----CCTG-TATGATCATA----C-AA---GT-GTATC--A--GGTA-TGCA---TT
gi|34 : TCAGTATGCTATTAC---TCCTTT-GGATA-AGCAA-GAAGTT-ATAGTT----CTTCT------GTAATGTGATGGGTCAGA-AGGACTATCATT
gi|36 : -TTT-ATT-CCA--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---ACA----------TATAAAA------------GTA
gi|37 : acacgT------ATA-T--TTAA-CTT-ATT---CAAA---ATAT-AATG-----AATCAATGC--------TACT-A---CT-CC----AACTACT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACatgatagttttataaagttgaaaacatatct
gi|39 : TTTTT-CCCTTGAAAAGCTTC-TTTTG-A-ATAGGCCT-AATCC--ATA-TGT-TC-GTAA-C-TTG---CC
gi|4 : taGTAAGTAA-GT---A----A-TTT-ATT-TCC--AAT-T--TT-G-GG-TC-C-AGAGG---GCATACAAAGAA-TACAGAGTTC---------ATGT---------A--------------------CAT-AAG-T-CA-T--A-AA----A-A---GA-G-A------TT-AT--CCA--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-AATAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---CT-T-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------------------------------------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T--AA-C--ACTGTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----TTTTTTTC-T-CT-AT-TG-CA---TGGGT--T-T-A-T----------AAAGTTCTT----A-TAC-AAAGTGT-T-CA-T-------GGA------TT--CTA-TG---AA-TG-G-T-T----------TTCTTTAG-TG-T---TGGTA-TGC--TGT-A---CAG---TAAA---ATA----T---A--AAAT-GGAAT-T------CA-T-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-GCAG-ACA-CT--ACATTTT-------T-TTG---TGTG----TGTGT--A--AC-GCCC-AGTTTCCATAGCC-AA-AGA-ATGAGAACTG---------------------AAA-CATTA--CAAGA-CTTGAGGATT-ACGAA-TTAC-TGAAAAATA-CTTTT-CTCTTCAGAATCTTG-TTTTG-A-A------T-AATGC--ATA-TGT-TC-GC-AGT-TTG---CCA----CATT----G-TT--TG-TCT-GCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---C--ATGAATATT--------TAAATCGCTC-AT---GTAACTT-A-T-TAGT---------AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------AGT-TTT--AT--C--ATG--TA--TAAAACAC-TGT------ATA-T--TTAA-CTT-ATT---CAAA---ATAT-AATG-----AAT----GC--------TACT-A---ATCC-----AAATGCT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACA-TTG-TTT--TCA-T-ATACAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-AATT-CTAC--AGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TT-CGTAAA--TAAT-TA-AAAC---AG--C-TCTTTAT-AA---CAT--CAAAA--TACATA--GGGAATCGACCA-AG---TT-CAC-CTACAATAGCT-TGA------ATT--GAGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---TATATAT--TTCAAGAATTTT-ATG---TG-CATTTT-------TTTT------GCAGTA-CAT-TTTATTAA-AGAA----G-TTTT-CTA-T--ACAATAATCAGGGCGTTT-GACG-AAACTTGTA---TCTGTATTTATTGTT-CC-CCCAAATTCCACATGCATA-AG-G-CAGTA-CT----G-GT-------TT-A----ACTG-TATGGTCATA----C-AA---GT-GTATC--AG-GATA-TGTA---TTTTAGGTT-T--AATATTT-CCAAAAC-----ACTT--GGCTAGTT-TAAAATAAG-CATTTAAGGCT-TTTTTGTA-AAGA-TCAAA--TG-AC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATG--AGATAAAAA-CAATC-CCCAGATATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATC--TGATTTGTTA-TAGAAATTTTTT-------TT-ATC--TG-ATTTTTTACCGTTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAA--TTT--TTGTCTTTTTGAGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-----A-CAATctt
gi|40 : AGCT------ATA-TAT-------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAG--T--AA-C--GCTGTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CC
gi|41 : TCACCTAATTTTGC-TGGA-------TCATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAGAA----TGGT---AGATT---AT
gi|42 : aT-TCC--AAT-T--TT-G-GGTCC-C-AGAGG---GCAT---------
gi|43 : -AT---GTAACTT-A-T-TAGT---------AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------AAT-Taatatactcaa
gi|44 : ATAATCAGGGCGTTT-GACG-GAACTTGTA---TC
gi|5 : GGTAAGTAA--T--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TTCG-GG-CC----GAGG----CATA--------CACAAAG------------A-AT---------AAGAGTTGAGAAGTTCAATTTCAT-AAA-T-CA-T--AAGA----AGAG--AA-G-A------TT-AT--C-A--AATTGA------AGATAA-A-T--AA-A-TA-CA-AGGTCTATA-T-GAA--T-A-AATC---AA---C--T-CT-CCTTCATCC------------ATA-GT----------GAG--CAGCT------ATACTA--------GT-ATCAGTAAG-TTGGCAA-AA--TTTTAAA--T--AA-CA--CTGTCG-CAT-C-C-AT-----TGCT-C--AATATTT--AA--AGCCCAATTA-----AATTTTTCAT-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-CTAA-------AAAGTTCTT----A-TAC-A--GTGT-T-CA-T-------GGAT-----TT--G-A-TG---AA--G-G-T-T----------T---TTAG-TGTT---C--TAT-GC--TAT-AA--CAG---TCAA---ATA----TTA-A--CAATTAGAATGT------CAAT-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-ACAA-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCAT-TTAACT--TGTCTTTG-GT--A--ACAGCCC-AGTTTC-GTAGCC-AA-AGA-ATGACAACTGA-TCTG-AAATTTG-----TAAAA-CATTG--CCA-ACGTAGAGGTTT-ACGAA--TAC-GTGAAAATAATCTTT-CTCTACATAAACTTGATTTTG-A-ATAGCC-T-AATGC--ATA-TGTGTCGGC--GT-TTG-----A----AATT----GCTT--TGTTCT-GCA-A-TGGCGGA----TGTCCT-----A-A----------C---C--ATGAATAATT-------TAA--CATTCTATG--GTAACTTCATT-TAGT---------AACAA----TT---ATAAC--ATTACAT------ACTGTTT--AT--CTAATG--TA--TAGCACATATGT------ATA-TACTTAA-CTT-ATT---CAAA---ATA--AATGAAATCAAT----TC--------TACT-A---TC-C-----CACTACT--TGTTGTTGAT------TATTC--ACTACAATGAGA-TTG-TTT--TCA-CAATACAGCA--T-TATCTC--AATTACT-GAAT-TCTC--AGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TTGTGTAAAATTATT-TA-AAACT--AG--C-TTTTAATAAA---CAT---AAAA--TA
gi|6 : aCATA-AA-GGCAGTA-CT----G-GTCCGTTCGTT-ACATTACTGATATGATCATAACACCAAG---TT-GTATCTCAGCGGTG-TGTACTTTTTTCG--C-T--AATA-TTTCCAAAAC------CTT--GACTAGCTCTAAAATAAG-CCTTTAAGGCTCTTTT-GTA-AAGAATCAAA-TTGGAC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATGCAGG-TAAAAAACAATT-CC-AGAGATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTCAGATGATT--TGATTT-TTAATAGAAAAACTTT-------TTTATC--TG-AT---------TTTT-CTTACCGTTTTTTTACAG---------------AATATATGACAATGTTT--TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGAATAGGCAATATTT-ACTGAACATCAGCATTCAAGCTTTTTTAATACATACCCGCTG---AGCCCCT-CCCTCGGTTTTCAGAA-TTAACACTGAAAAATCATCAGCATACCACGACTA-AACACATTTAAGCGAT-GTGTCACCTAATTTTGCGCGGGATAATATTTATCATTATATCAGTC-GGACAATAG-ATATCTGGTTCAGGATCCATGTCGAGTTTAT---TATTTTAACAAAGGTTT-GACTTACGGTACTTCTGTTACTCCTCCCGGGC-TGTTTAG-ACGACTCCACTCCACCGTTAAGGCCTTTCCACATGAAATTCG-AAGTTT-ATATCTGTTGTTCGGAGTTTGTGGTACAGTTATTAATTATG-TTTGGCCA-GTACATACTCTTGACATGACTTTATAGAgt
gi|7 : TTTTT-CCCTTGAAAAGCTTC-TTTTG-A-A------T-AATCC--GTA-TGT-TC-GTAA-C-TTG---TCCTTTTCATT------TT--TA-----GCACA-T-TCTGACAAAT-TACTTTGCCATA----------CA--T--GTACATATTAA------TAAATCTTTT--T---CTAAGTTCA-T-TA-----------AACAC----TTTTGAT-T--------GT------AGA-TCTGAAA--C--TTG--AA--AAAGATGT-TATCGCAGGATA-TG-CCAA-GTTGATT---CAGT---AAAA-AATA-----AAC----AC--------TGCTCA---AC-C-----AACAATT--C-TTTTTG-T------TA-TC--A-TTCAAA-A------------TCA-T-AT--------T-T-TCTT--GA--AGT-GCACACT-C-AAGCAA---AGTATCATTTGATTTATGAATGT---GT-TGTAAA--TATT-TA-A--C---AG--T-ATTGGAT-AA---GGTTTCAATA--TATA-A-TGGATGCCTACCT-AA---TT-CCC-CCATAACTGCA-TAG------TTT--GAAG---CTTTCTTATGTACCCCCCGGTGTA------CCCCA---CATATGTA-CTTGAGAGTTTTAATG---TG-AA-GTT-------TATC------ACTATA-TATATTTTTCAT-TG-A----G-TTTT-CAA-T--ATTATAATTTGGTCTCTT-AAC---AA-TAGCAGATTCTGAATTTATAATT--C-CCCAAATTTCACTTCCATATAACA-CAATA-------G-GT-------TT-T----ATTG-TGTGATCAtgtaattcatcggccattcatcgtttcacttctagtcgaagttgtgtcgcaagccttgtg
gi|8 : aggta-TGA-TAGTAGCGTTCAAGCTTTTTT--------------G---AAGTCTT-CCTTCAGTTT-CAGAAATTAACACT---AAGTCATCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAA-GAT-GTGTCACCTAATTTTGC-TGGA-------TCATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TC--------TC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AAAGATTTGGACTTA-GGT-------C-G--TCTCC----C-TGTCTAACAC---------CCACC-TTAGG-----TTCAAAT--------------T-AT--------TTTGAAGTTT----TACAG--AC--AGTATG-TTT-GCCATGTACATACTTTTGA--TGACTTTATAGAAAGGCCCCTT-ATGTCAAGC-TG-ATGCAGCC-TGTGTAG-AAGATCTG-AATGTAAAACAGTGTCAAAAGCCTTAGAAAAATCAACA-AAGCAAACGTATAATT--TGGAA-TT-ATCATTTGTATA-TTTTTGAATAACGGTTCT-AAGTATAAAAATGTGGTCACTAGTTCTGGCTTTTGGTTGAAAACCAATTTGAACTTTATTTATAATGTTGTTCGAGTCCAAGTAGTTTTGTAACCTGGTATTCAGTATGCTATTAAATATACTTTGGGATA-aaaagatgcaacaaaatgccggcatt
gi|9 : caaaattaggAAGTAA-AT--T--------TT-ATA-TCA--A-T-A--TT-T-GG-CC-C-AG------GCAT---------AACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--A-CA-ACAA-GA----AGA---AA---A------CC-ATT-C-ACCAAT-GA--T---AGATAA-CGT--AA-C-TAACA-AAGT---TAAT-GA---T-A-AATC---AA---AATT-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAGAGCAGCT-------TA-TATTAAT---GT-A-------G-TTGGACA-AA--TT---AG--T--AA-TC-GCTGTCA-CATGT-C-ATCTTTATACTGC--A-----T--AAAAG--C-AATTA-----AATTATTC-T-CT-AT-TAACATACCAAGT--T-T-A-T----------AA-GTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----T---CTA-TG---AAATG-G-T-T----------T--TCTTGATGTT----AGTAT-GCCATGT-AACACAA---TCAATG-ATG------A-A--AAAT-GGAAT-TAA----CA-TGCTTATC---AAAGCAC-AG-TACAG-A--CTT-GCAG-ACA-CTTAACATTTTC-TCACAT-TTA-CATGTGTTTTTGTGT--A--AC-GCC--A---TCAA-AGCC-AA-AGA-ATGAGAACTGGTTCTGAAATATGG-----TAAAA-CATTT--CAAGA-CTTGAGGATT-ATGAAt
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): TTCCAATTGGGTCGCTGTGCCCCAGAGCGCGCAAGAACTAATAGGAGAGACCGTACTTAACAGTTGAGAAAGAATGTCCCAAAAAAAAGAAGTGCGGAAAAGTGACTAAGATTTCAAGTACAGAGTGCGTAATCACAAACTCTAACAT
Unaligned ( gi|35 ): AAGGGTATTCAGAACAAGAATGACATGGGAACATAAAGAAATAAAGTAAAATAAACAGGGAAAAACATCCAGATG
Unaligned ( gi|38 ): AATAAATTTGGAAATAAAATATCAATTTTGAAATAAAGAAAATAAATTTGAAATATTCATTATGATA
Alignments
lowQualScore : 1111111111 1 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 1111 1 111 222222 222222222222222 1111111111 444444444444444444444444444444444 222 11111 11111 111 2222222222 1111 1111111 2222222222 2222222222222 111111 22 11 111 111 22222222 222222 111111 11 1 11 11111 11 11111 111 22 1 1 11 33333333 111 111 11111 222222 11111 11111 33333333333333333 333333333 22222 11 1111 1111 11 111111111111111111 11 1 222222 11 111 111 11 11111 22222222222222 222222222222 111111 11 11 33333333333333 111 11 111 111 11 111 111111 111 55555555555555555 111 22 111 1 2222222 111111 11 222222 111 1 111 1111111 222222222222222 1 22222222222 111 11 11 222222 11 111 1111 111 11 1 111 1 2222222222 222222222 5555555555555555555555555555555555 11 11 111 11 111 111 111 2222 1 11 2 1 11 2222222 11 1111 111 111 11 111 1 1 4444444444444 2222 1 1 666666666 1 22222 11 1 33333333 2222 222222 1 1 11 1 1 1 1 1 1 1 1 11 22 1 1 111 1 1 1 333 3333333 1 22222 1 1 1 1 1 1 2222 1 222 1 1 1 1 1 1 111 1 11 22222222 1 1 222 11 11111 1 111 11 1 1 7777777777777 1 1 11 555555555 1
lowQualScore : 3 0000000000 2 2 555 0 2 22 2 2 4 2 2 333 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 8 3333 7777 33 4444 555 222 555555 2 77 4 55 44 33 666 2 77 888 2 444 5 2 000 2 2 444 000000 5 5 66 111111111111111 2 1111111111 77 000000000000000000000000000000000 2 33 55 33 2 222 2 5 2 2 44444 8 33 77777 33 88 44 11111 1 3 3 3 3 6 111 44 3 3 3 0000000000 1111 3 3 0 0 3 3 3 0000000 5555555555 6 555 6 3 6 3 3333333333333 0 444444 44 00 3 666 9999 666 00000000 55 4 8 222222 4 8 888888 11 4 4 2 8 55 4 4 8 66 5 0 5 77777 1 99999 6 55 4 1 5 5 5 5 11 77 22 22222 5 222 00 5 5 888 1 5 0 3 00 5 5 22222222 66 5 5 5 333 5 333 22222 000000 77 11111 5 5 5 44444 33333333333333333 444444444 0 5 00000 5 1 66 5 0000 5 0000 33 888888888888888888 1 5 88 99 99 99 99 3 222222 5 99 5 5 000 555 44 44444 44444444444444 5 777777777777 77 5 5 666666 5 55 5 5 4 6 6 99 666 7 99 666 99 99 6 6 3 44 11111111111111 6 111 6 55 6 6 888 99 6 6 111 99 99 11 88 6 111 6 6 6 999999 99 111 22222222222222222 1 111 4 22 0 7 111 6 3 1111111 1 999999 3 11 9 6 6 111111 6 9999 1 6 888 000 5 6 6 6666666 5 111 6666666 5 000000000000000 1 44444444444 6 99 77 6 111 1 5 8 11 88 8 000000 11 8 8 666 0 8 8 8 88 8 7777 8 444 8 11 6 0 999 0 8 3 99 99 6 111 3 2 99 6 6 2222222222 99 6 666666666 0000000000000000000000000000000000 55 44 99 99 6 111 6 66 444 444 8 8 0 444 44 3 3 1111 0 33 0 0 0 0 44 6666666 11 8 8 8 8 7777 444 444 33 777 0 55 0 2222222222222 1111 0 0 555555555 0 6 55555 11 0 9 0 66666666 1111 555555 0 0 3 3 99 6 2 7 3 3 3 3 3 2 0 7 3 7 0 88 7 6 00 3 3 6 7 6 0 777 0 0 7 7 3 444 5555555 1 6 1 0 11111 2 2 6 7 3 3 3 3 8888 3 222 7 3 3 7 2 0 6 0 0 3 777 3 7 7 44 0 1 1 55555555 0 3 555 44 99999 0 22 222 44 3 3 3333333333333 7 7 3 7 3 88 333333333 6 3
lowQualScore : . .......... . . ... . . .. . . . . . ... .............................................................. . .... .... .. .... ... ... ...... . .. . .. .. .. ... . .. ... . ... . . ... . . ... ...... . . .. ............... . .......... .. ................................. . .. .. .. . ... . . . . ..... . .. ..... .. .. .. ..... . . . . . . ... .. . . . .......... .... . . . . . . . ....... .......... . ... . . . . ............. . ...... .. .. . ... .... ... ........ .. . . ...... . . ...... .. . . . . .. . . . .. . . . ..... . ..... . .. . . . . . . .. .. .. ..... . ... .. . . ... . . . . .. . . ........ .. . . . ... . ... ..... ...... .. ..... . . . ..... ................. ......... . . ..... . . .. . .... . .... .. .................. . . .. .. .. .. .. . ...... . .. . . ... ... .. ..... .............. . ............ .. . . ...... . .. . . . . . .. ... . .. ... .. .. . . . .. .............. . ... . .. . . ... .. . . ... .. .. .. .. . ... . . . ...... .. ... ................. . ... . .. . . ... . . ....... . ...... . .. . . . ...... . .... . . ... ... . . . ....... . ... ....... . ............... . ........... . .. .. . ... . . . .. .. . ...... .. . . ... . . . . .. . .... . ... . .. . . ... . . . .. .. . ... . . .. . . .......... .. . ......... .................................. .. .. .. .. . ... . .. ... ... . . . ... .. . . .... . .. . . . . .. ....... .. . . . . .... ... ... .. ... . .. . ............. .... . . ......... . . ..... .. . . . ........ .... ...... . . . . .. . . . . . . . . . . . . . . .. . . .. . . . . . . ... . . . . . ... ....... . . . . ..... . . . . . . . . .... . ... . . . . . . . . . . ... . . . .. . . . ........ . . ... .. ..... . .. ... .. . . ............. . . . . . .. ......... . .
lowQualScore : 1 8888888888 2 1 555 5 0 88 0 0 0 0 0 555 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0 5555 2222 11 2222 555 888 888888 1 11 7 88 44 11 999 2 99 555 4 444 0 5 000 7 7 777 999999 3 3 33 333333333333333 7 7777777777 33 444444444444444444444444444444444 5 44 99 44 5 333 7 3 9 9 33333 6 99 11111 99 55 22 77777 4 3 3 3 3 7 777 66 3 3 3 4444444444 7777 3 3 5 1 3 3 3 8888888 1111111111 7 888 7 3 7 3 9999999999999 4 888888 33 00 6 444 0000 444 55555555 00 0 0 555555 0 0 000000 00 0 0 0 0 55 0 0 0 55 0 5 0 44444 4 33333 7 77 3 4 0 7 7 7 00 66 99 55555 0 111 66 0 5 222 7 0 8 2 66 0 0 88888888 99 0 0 0 999 0 888 99999 777777 99 44444 7 7 7 33333 11111111111111111 999999999 4 0 11111 0 0 99 0 6666 0 6666 66 333333333333333333 0 7 33 22 22 22 22 3 111111 7 33 7 7 000 777 44 33333 44444444444444 7 777777777777 99 7 7 444444 7 77 7 7 3 7 7 22 888 3 22 888 22 88 7 7 5 00 88888888888888 7 777 7 88 7 7 333 22 7 7 777 22 22 66 66 7 777 7 7 7 222222 22 777 88888888888888888 0 777 2 22 7 8 777 7 3 7777777 0 222222 5 88 8 7 7 888888 7 3333 0 7 777 000 0 7 7 2222222 7 777 4444444 7 333333333333333 4 00000000000 7 22 77 7 777 0 0 0 00 66 0 888888 00 0 0 222 8 0 0 8 88 0 0000 0 000 0 00 0 8 444 8 0 2 22 22 7 777 3 5 22 7 7 5555555555 22 7 777777777 0000000000000000000000000000000000 88 00 22 22 7 555 7 22 000 000 0 0 8 000 00 2 2 2222 0 22 0 0 8 8 44 0000000 00 0 0 0 0 0000 000 000 88 555 0 00 0 2222222222222 2222 0 0 222222222 8 5 00000 88 2 2 0 22222222 2222 555555 0 0 2 2 88 5 0 3 3 3 3 3 3 0 7 3 3 3 7 33 3 7 77 3 3 7 3 7 7 000 0 0 3 3 3 000 3333333 0 7 0 0 33333 0 0 7 3 3 3 3 3 3333 3 777 3 3 3 3 0 7 7 0 0 3 777 3 3 3 00 7 0 2 88888888 0 3 000 77 33333 7 00 000 77 3 3 3333333333333 3 3 3 3 3 33 000000000 7 3
consensus : GGTAAGTAA-GT--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT---------TACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--T-CA-T--A-GA----AGA---AA-G-A------TC-AT--C-A--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-A-TAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TA--------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T--AA-CA-ACTGTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----AATTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-T----------AAAGTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----TT--CTA-TG---AA-TG-G-T-T----------T--CTTAGATGTT---TGGTATTGC--TGT-A---CAG---TCAA---ATG----T-A-A--AAAT-GGAAT-T------CA-T-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-GCAG-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCAT-TTAACTTGTGTTTTTGTGT--A--AC-GCCC-AGTTTCAATAGCC-AA-AGA-ATGAGAACTGATTCTGAAAATTTG-----TAAAA-CATTT--CAAGACCTTGAGGATT-ACGAATTTAC-TGGAAAATATTTTTT-CTCTACAGAATCTTG-TTTTG-A-A------T-AATGC--ATA-TGT-TC-GCAAGT-TTG---CCA----CATT----G-TT--TG-TCC-GCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---C--GTGAATATTTA------TAAATCGCTC-AT---G-T-AACTT--A-TTA----GT-AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------ANT-TTT--AT--C--ATG--TA--TAGAACAT-TGT------ATA-T--CTAA-CTT-ATT---CAAA---ATAT-AATG-----AAT----GC--------TACT-A---NT-C-----AACTACT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACA-TTG-TTT--TCA-T-ATACAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-GAAT-CTAC-AAGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TT-CGTAAA--TATT-TA-AAAC---AG--C-TTTTTAT-AA---CAT--CAAAA--TACATA-TGGGAATCGACCA-AG---TT-CAC-CTACAATAGCT-TGA------TTT--GAGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---AATATATA-TTCGAGAGTTTTAATG---TG-CA-TTT-------TNTC------GCAGTA-CATATTTATTAA-AG-A----N-TTTT-CTA-T--ACAATAATCNGGGCGTTT-GACG-GAACTTGTA---TCTGTATTTATTGTTCCC-CCCAAATTTCACATGCATA-AA-G-CAGTA-CT----G-GT-------TT-A----ACTG-TATGATCATA----CAAA---GT-GTATC--AG-GGTG-TGTA---TTTTNGGTT-T--AATA-TT-CCAAAAC-----ACTT--GACTAGTT-TAAAATAAG-CCTTTAAGGCTCTTTTTGTA-AAGA-TCNAA-TTG-AC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATG--AG-TAAAAA-CAATT-CCCAGATATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATT--TGATTT-TTA-TAGAAAAACTTT-------TT-ATC--TG-AT---------TTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAAT-TTT--TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-A-TGA-CAATAGCATTCAAGCTTTTTTAATACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCGGTTT-CAGAAATTAACACT---AAATCATCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAG-GAT-GTGTCACCTAATTTTGC-CGGA-------TTATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AAAGGTTTGGACTTA-GGT-------TTA--CCTCC----C-TGTCTAA-ACG--------CCACCNTTAGG-----TTCAAATGAAACTCGTAAGTTT-AT--------TTTGGAGTTT----TACAG--AT--ATTATG-TTT-GCCATGTACATACTCTTGA-ATGACTTTATAGAAAGGCCCCTTTATGTCAAGT-TG-GTGCAGCC-TGTGTAG-AAGAGCTG-AATGTGAAACGGTATCAAAGGCCTTAGAAAAATCAACA-AAGCAAACGTACAATT--TGGAACTT-AATATTTGTATA-TTTTTGAATAAGGGTTCT-AAGTATAAACATGTGGTCACTGGTTCTGGCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTTATAATATTGTTAGAGTCCAAGTAGTTTCGTAACCTTGTATTCAGTATGCTATTAA--ATACTTT-GGATA-AGCAAAGAAGTT-ATTGTT-A-TCCTCTA---TAGTANTTTGATGGGTCANA-AGGGCTATCATTTTTATGAAT-AGGCTTTAATAAAGCCTATTTCCCACTCCCTTTGGGTATT-TGCCAG-AG-GACAA-GACAAG----AT-TAAATAATTT-T-AGCATATGTGGT-AAAATATAT-GTACGTCGGCTTTCA-ACATCTCATT-TTTAATGCCAT-CTAATCGCA-GCTTGATTTATTATTTTTTAGATGTTTTTATTGCATCGATGATTTTCTTTTCTNTAATTG-A-TAAATCTAAC-GAAGT-AATG--TTGATATTTCTGCTGACTTGGACAANNAATCTTCAAAATATTTAATTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAGATATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGACT--TTCAAA--CC-----GAGTTTCCAG-TATGATA
Reference ( family-3541 ) : GGTAAGTAA-GT--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT---------TACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--T-CA-T--A-GA----AGA---AA-G-A------TC-AT--C-A--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-A-TAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TA--------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T--AA-CA-ACTGTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----AATTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-T----------AAAGTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----TT--CTA-TG---AA-TG-G-T-T----------T--CTTAGATGTT---TGGTATTGC--TGT-A---CAG---TCAA---ATG----T-A-A--AAAT-GGAAT-T------CA-T-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-GCAG-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCAT-TTAACTTGTGTTTTTGTGT--A--AC-GCCC-AGTTTCAATAGCC-AA-AGA-ATGAGAACTGATTCTGAAAATTTG-----TAAAA-CATTT--CAAGACCTTGAGGATT-ACGAATTTAC-TGGAAAATATTTTTT-CTCTACAGAATCTTG-TTTTG-A-A------T-AATGC--ATA-TGT-TC-GCAAGT-TTG---CCA----CATT----G-TT--TG-TCC-GCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---C--GTGAATATTTA------TAAATCGCTC-AT---G-T-AANTT--A-TTA----GT-AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------ANT-TTT--AT--C--ATG--TA--TAGAACAT-TGT------ATA-T--CTAA-CTT-ATT---CAAA---ATAT-AATG-----AAT----GC--------TACT-A---NT-C-----AACTACT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACA-TTG-TTT--TCA-T-ATACAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-GAAT-CTAC-AAGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TT-CGTAAA--TATT-TA-AAAC---AG--C-TTTTTAT-AA---CAT--CAAAA--TACATA-TGGGAATCGACCA-AG---TT-CAC-CTACAATAGCT-TGA------TTT--GAGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---AATATATA-TTCGAGAGTTTTAATG---TG-CA-TTT-------TNTC------GCAGTA-CATATTTATTAA-AG-A----N-TTTT-CTA-T--ACAATAATCNGGGCGTTT-GACG-GAACTTGTA---TCTGTATTTATTGTTCCC-CCCAAATTTCACATGCATA-AA-G-CAGTA-CT----G-GT-------TT-A----ACTG-TATGATCATA----CAAA---GT-GTATC--AG-GGTG-TGTA---TTTTNGGTT-T--AATA-TT-CCAAAAC-----ACTT--GACTAGTT-TAAAATAAG-CCTTTAAGGCTCTTTTTGTA-AAGA-TCNAA-TTG-AC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATG--AG-TAAAAA-CAATT-CCCAGATATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATT--TGATTT-TTA-TAGAAAAACTTT-------TT-ATC--TG-AT---------TTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAAT-TTT--TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-A-TGA-CAATAGCATTCAAGCTTTTTTAATACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCGGTTT-CAGAAATTAACACT---AAATCATCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAG-GAT-GTGTCACCTAATTTTGC-CGGA-------TTATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AAAGGTTTGGACTTA-GGT-------TTA--CCTCC----C-TGTCTAA-ACG--------CCACCNTTAGG-----TTCAAATGAAACTCGTAAGTTT-AT--------TTTGGAGTTT----TACAG--AT--ATTATG-TTT-GCCATGTACATACTCTTGA-ATGACTTTATAGAAAGGCCCCTTTATGTCAAGT-TG-GTGCAGCC-TGTGTAG-AAGAGCTG-AATGTGAAACGGTATCAAAGGCCTTAGAAAAATCAACA-AAGCAAACGTACAATT--TGGAACTT-AATATTTGTATA-TTTTTGAATAAGGGTTCT-AAGTATAAACATGTGGTCACTGGTTCTGGCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTTATAATATTGTTAGAGTCCAAGTAGTTTCGTAACCTTGTATTCAGTATGCTATTAA--ATACTTT-GGATA-AGCAAAGAAGTT-ATTGTT-A-TCCTCTA---TAGTANTTTGATGGGTCANA-AGGGCTATCATTTTTATGAAT-AGGCTTTAATAAAGCCTATTTCCCACTCCCTTTGGGTATT-TGCCAG-AG-GACAA-GACAAG----AT-TAAATAATTT-T-AGCATATGTGGT-AAAATATAT-GTACGTCGGCTTTCA-ACATCTCATT-TTTAATGCCAT-CTAATCGCA-GCTTGATTTATTATTTTTTAGATGTTTTTATTGCATCGATGATTTTCTTTTCTNTAATTG-A-TAAATCTAAC-GAAGT-AATG--TTGATATTTCTGCTGACTTGGACAANNAATCTTCAAAATATTTAATTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAGATATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGACT--TTCAAA-CCT-----GAGTTTCCAG-TATGATA
gi|1 : GTAAGTAAAGT--TA----A-TTTTATTCTCCGAA-T-T--TT-G-GG-CCAC-GAAGG---GCAT----------ACAA-G------------ATAT---------A--------------------AAA-AA----CA-C--A-GA----AGA---AA-G-T------GC-AT--CCA--AAT-GA--TGA-AGATAA-AGT--AA-A-TAACA-AAGT---TA-T-GAA--T-A-AATC---AA---T--T-TT-C--TCA---------------ATT-G-----------GAG--CAGCT------ATACTT--------GT-A-------GATTGGCAA-AT--TTCTCAACCT--AA-AC-ACTGTCA-CAT-T-CGAT-----TACT-CCAA-----T--AA--G--CCAAATA-----A-TTTTTC-T-CTGATCTA-CA----AGGT--T-T-AAT----------AAAGTTTTTTA--A-AAC-AAAGT---T-CAAT-------GGAT-----T---CTA-TG---AA-TG-G-T-T----------TGTCTTAAATGTG---TG-TAT-GC--TGT-A---CAA---TCAA---ATG----T-A-A--AA-T-GGAATGT------CA-T-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-GCAG-ACAGCT--ACATTTTC-TCTCAT-T--ACTTGTGTTTTTGTGTTAA--AC-GCCCGAGTTTCAATAGCC-AACAGA-ATGAGAACTAATTCT-AAAATTTG-----TAAAAACATTTT-CAAGAC-TTGAGGATT-AC-AATCT-----GAAAATATTTTT--CTCTACAGAATCTT--TTTTG-A-AC-----T-AATGGGAATAATGT-TC-GCA-GTGTTG---CCA----CATT----GGTT--TG-TCCTGCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---CCAGTGAA-ATT---------AAATCGCTC-AT---GCT-AACTT--T-ATA----GT-AACAA----TTT-GATTACGGA----AT------ATT-TTT--ATATC--ATG--TA--TAGAACATCTGT------ATAGT--CTAAGCTT-ATT---CAAAC--ATA--AATG-----AGA----GC--------TACT-A---GTTC-----AACTACT--T-TGTTTG-T------TA-TCGAA-TACAAT-ACAGTTG-TTTCATTA-T-AT-CAGCA--TAT-TCTT--AA-GAAT-GAAT-CTAC-AGGGGGCGAA----------ATCTA-AAATTC---TT-CGAAAAA-TATT-TA-AAAC---AG--CGTTTTTAT-AAACACAT--CAAAA--TACATA---GGAATCGACCA-AG---TTTCAC-CTACAATAGCT-TGA------TTT--GAG----CCTTTTTAGGTAC----------AGA----CCA-A---AATATAT--TTCAAGAATTTTAATG---TGGCAATTT-------TTTC------GCAGTAACATGTTTATTAA-AG-A----CGTTTT-CTAGT--ACAATAATCAGGGCGTTTTGACG-GAACTTGTA---TCTGTATTTATTGTTCCC-C--AAATTTCACATGCATA-AAAG-CAGTAACT----GTGT-------TTTA----ACTG-TATGATCATA----CA-----GTCGTATC--AG-GGTG-TGTA---TTTTTGGTTAT--AAT--TT-CCAAAAC-----ACTTTTGACTAGTT-TAAAATAAGGCCTTTAAGGCT---TTTGTAGAAGA-TCCAAATTG-AC----AACATGTGTA---AGGAGGCCTGATG--AGGTAAAAA-CAATTGCCCAGATATT---G--TACGATGAACACT---TGTTCTGA--ATT--TGATTT-TTA-TAGAAAAACTTT-------TT-ATC--TG-AT---------TTTT-T-------------ACAACGTTTTTTCTACAGAAATATT-GACAAT-TTT--T-GTCTTTCTGAGGTTGACCAGGA-TAGGCAAAATTTGA-TGA-CAATAGCATTCAAGCCTTTTTAATACAC---CGCTGTGAAGGCCCTCCCCTCGGTTT--AGAAATTAACACT---AAATCATCAGCAT-C----AACATAACA---TTAAGAGATGGTGTCACCT-ATTTTGC-CGGA-------TTATCAT--TATC-GTCGAAAA-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAATATTATTTTAA-AAAGGTTTGGACTTA-GG--------TTA--CCTCC----C-TGTCTTA-ACAC-------CCACACTTA-G-----TTCAAATG-AACTCGTAAGTTTGAT--------TTTGGAGTTT----TAGAG---T--ATTATGTTTT-GCCATGTACATAC-CTTGA-TTGACTTTATA-AAAGG-CCCTTTATGTCAAGTCTGTGTGCAGCCTTGTGTAGAAAGAGCTGAAATGT--AACGGTATCAAAGGCCTTAG-AAAATCAACACAAGC-AACATACAATTGCTGGAACTT--ATATTTGTATATTTTTTGAATAAGGGTTCTAAAGTATAAACATGTGGTCACTGGTTCT-GCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTTAT-ATATTGTTAGAGT-CAAGTAGTTTCGTACCTTTGTATTCAGTATGCTATTAA--ATACTTT-GGAAATAGCAAAGAAGTTGATTGTTAA-TCCTCTA---TA--ATTTTGAT-GGTCATA-AGGGCTATCATTTTTATGAAT-AGGTTTTAATAAAGCCTATTT-CCATTCCCTTTGGG-ATTCTGCCAACAGAAACAACGACAAG----AT-TAAACAATTTATAAGCATATGTGGTAAAAATATAT-GTACATCGG-TTTCA-ACATCTCATT-TTTAATGCCAT-CTAATCGCA-GCTTGATTTATTATCTTTCAGATGTTTTTATTGCATCAATGATTTTCTTTTCTTTAATTG-A-TAAATCTAAC-GAAGT-AATG--TTGATATTTCTGCTGACTTGGACAATAAATCTTCAAAATATTTAATTCTGGGTATCAAATTTACTAATCAATACTGAATAATGTTTGTAAAATGATTTACACCCATTGTTCACTAGATATCTT-ATCGGACT-ATCTTGCGGATTGCTGATTGATTCAAATTCTTTCAAAAGTTT-CAG-TATG
gi|10 : aaAAGTAA-AT--T--------TT-ATA-TCA--A-T-A--TT-T-GG-CC-C-AG------GCAT---------AACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--A-CA-ACAA-GA----AGA---AA---A------CC-ATT-C-ACCAAT-GA--T---AGATAA-CGT--AA-C-TAACA-AAGT---TAAT-GA---T-A-AATC---AA---AATT-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAGAGCAGCT-------TA-TATTAAT---GT-A-------G-TTGGACA-AA--TT---AG--T--AA-TC-GCTGTCA-CATGT-C-ATCTTTATACTGC--A-----T--AAAAG--C-AATTA-----AATTATTC-T-CT-AT-TAACATACCAAGT--T-T-A-T----------AA-GTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----T---CTA-TG---AAATG-G-T-T----------T--TCTTGATGTT----AGTAT-GCCATGT-AACACAA---TCAATG-ATG------A-A--AAAT-GGAAT-TAA----CA-TGCTTATC---AAAGCAC-AG-TACAG-A--CTT-GCAG-ACA-CTTAACATTTTC-TCACAT-TTA-CATGTGTTTTTGTGT--A--AC-GCC--A---TCAA-AGCC-AA-AGA-ATGAGAACTGGTTCTGAAATATGG-----TAAAA-CATTT--CAAGA-CTTGAGGATT-ATGAAgcat
gi|11 : taagctaATAGAGCATAA---TT-CCC-CCATAACTGTT-TGG------TTT--GAGG---TCTTCTTGTGTAT----------T------CCATATAGAGTATGTA-CTTGAGGGGTTTAATG---TG-AA-GTT-------TATC------AC--TA-AATA-TGATTCATGG-A----C-TTTT-CAA-C--ATTATAATTTGGGCTCTT-TACATCAGCAGGT----TTTGAATTTGTAGTT--T-CCCAAATT--------ACA-AA-A-CA----------G-GT-------TT-T----ACAG-TGTGATAAAA----AAAAAAGAT-GCAAC--AA-AATACTGGA---ATTTGGCCT-TGCAAT--TT-CAAAAAC-----ATTT--AATTAATT-TAAAGAAAG-CATTCAAACCAC-GCTTATA-CAGG-TCTTG-TTG-ACAATTAACATATA-ATCCAAAGG-CAT--TG--AA-T-ATAC-CA----CGTAAATATTAATGAATAAAA-GA-CAATGAATGTTC-TAT--TTCCTTATCT-TTA-TAAACAAATTTTAAGTTTCTT-ACCTTTGCAT---------TCTTGT-------------AAAA---------------AAAAT--G----T-TGTCCTTGTCTTTTTCAAATTAAC--AGA-GAGACAATGTTT-A-Taa
gi|12 : gTAAGTAA-GT--TA----T-TTT-ATT-TCC--AAT-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT--------------AA------------ATAT---------A--------------------CAT-AAA-C-CA-C--A-GA----AGA---G--G-A------CC-AT--CCA--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-A-TAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TTTC--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TAT-------GT-A---------TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T--AA-CA--CTGTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----ATATTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-T----------AAAGTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGA------TT--CTA-TG----A-TG-GTT-T----------T--CTTAGATG-T---TGGTA-TGC--TGT-A---CAA---CCAA---ATG----T---A--AAAT-GGTAT-T------CA-T-CTT--C---AA--CACAAG-TCCAG-A--CTT-GCAG-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCAC-TT-ACTTGTGTTTTTGTcata
gi|13 : -T--TT-G-GA-CC-C-AGAGT---GCAT----------ACAAAG------------A-AT---------A--------------------CAT-AG--TTCA-T--A--A----ATA---CA-C-A------TC-AT--A-A--AA---A--T----GATAA-AGT--AATA-TAACC-AGGT---TA-T-GA---T-A-AATC---TATTTT--T-TT-T--TCA---------------ATA-GT----------GAG--CAGC----------------------T-A-------A-TT-------A--TTGTCAA--T--AA-C--ACTGTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----ACTTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---TATGT--T-T-A-T----------AAAGTAATT----A-TAC-AAGGTGT-T-TA-T-------GAA------CT--CTA-TG---AA-TG-G-TGC----------C--CTTAGGTG-T---TGGTA-TGC--TAT-A---CAG---TCAA---ATA----T-ACA--AAAT-GGAAA-T------CA-T-CCT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-ATGCGT-GCGC-ACGCCT--GCAT
gi|14 : g--TA----A-TTT--TT-TCC--A-A-T--TT-T-TG-CC-C-AGAGG---GCAT----------ACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AAA-C-CA-C--A-GA----AGA---AA-G-A------CC-AT--CCA--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-AATAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TTTC--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TAATTTAT--GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T--AA-CA--CTGTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----AATTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T---C----------AAAG-TTTT----A-TACAAAAGTAT-T-CA-T-------GGATCTATATT--CTA-TG---AA-TG-GTT-T----------T--CTTAGATG-T---TGGT
gi|15 : aaggtagTAAGTAA-GT---A----A-TTT-----TCA--A-T-T--TT-G-GG-GT-G-AGAGG---GCAT---------CATACAA------------ATA-----------------------------------AA--T-CA-G--A-GTTCCTGTA---CA-T-G------TT-AT--CTA--AAA-GG--C---GTATAATATT--AA-A-TTACA-AGTT---TA-T-GA---T-ATAAT----AA---ACTT-TT-C--CCC---------------ATA-AT----------GAA--CAGCTCTAGAGATA-TA--------GGGA-------A-TTGGCAA-AA--TTTCCAT--T--AA-CA-TC-GTCA-CAT-g
gi|16 : aaA----G-TTT-ATT-CCA--A-T-T--TT-G-GGCCC-C-AAAGG---GCAT---------AATAGAA------------GTA----------A--------------------CA--GC--T-CA-T--A--A----AGA---AA-G-AAATGTCCC-AA--A-A--AAT-GAAGT---GGGAAA-AGTTAAA-A-TATCA-cacacaagtctatgtataactataaaatattcatggactct
gi|17 : aaagaaaataaatttgagaaaaaatatcaattttgaaataagaaaataaaatttggaaatattcattatgatatctataggtgtaaagataatataCCC-AGTTTAAATAGCC-AA-AAG-ATGAGAACTGATTATG-AAATTTA-----GAAAA-CATTG--CAAGAC---GAGGATT-GCGAA-TTAC-TGAAAAATG--TTTT-CTCTACAGA------------------------AATGC--A-A-TGT-TC-GCCAGT-TTGT--CCA-----ATT----G--T--TG-TCT-GCA-ATTGCCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------CCTTC--ATGAATATTTCTCTTTTTAAATCTATC-AG---A-T-AATTT--A-TTA----GT-AACAA----Ttggaatcacaacttacatgtatgtgg
gi|18 : tacA-AAGT---TA-TAGA---T-A-A-TC---AA---T--TGTT-C--TCA---------------TTT-GT----------GAG--CAG-T------ATA-TA---------T-A-------G-TTGGCAA------TTTCAA--T--AAGCA---T-TCA-CAT-TAC-AT-----TA-T-C--A-----CTAAA--G--CCAAATAC----AATTTCTT-TACT-AT-TA-CA---CAGGT--T-TTA-T----------AAATTTTTTGCCTA-TAC-AA-GTAT-TTCA-T-------GGAT-----TCTGCT--TG---AA-TG-G-T-T----------TTTCTTA-ATGTT----GGTATGGC--TGTTA---CA----TCAA---ATG----T-A-A--AAata
gi|19 : TGGCAACGA--TTTT-AA--T--AA-CA--CCGTCA-C-T-T-C-AT-----TGCTTC--A-----T--A---G--CCAGGTA-----AAGTT----------------------GTT--T-T-A-T----------CAAATTCTT----A-T-C-AATGTGT-T-CA-A-------GGA----------CTGGTG---AA-TG-G-T-T----------TT-CGTACA-GTTGAATGATAT-AC--AAT-A---CAG---TCAA---TT---------A--CAAT-GGAAT-T------CA-T-CTT-------A--CAA-AGTT-CAGCA--TTT-ACAG-ACA-GT--GCATTTTCTTTTCATATTACC---CGTTTTTG
gi|2 : acGGTAAGTAA-GT--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT---------TACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--C-CA-C--A-GA----AGA---AA-G-A------CC-AT--C-A--CAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-T-TAA-A-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TA--------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAAA-T--AA-CA-ACTGTCAGCAT---C-GT-----TACT-C--A-----T--AG------CAAA-A-----AATTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-T----------AAAGTTTTC----AATAA-CAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----TT--CTA-TG---A--TG-G-T-T----------T--CTTAGATGTT---TGGTATTGC--TGT-A---CAC---TCAG---ATG----T-A-A--AAAT-GGAAT-T------C--T-CTT------AA--CAC-AG-T--AG-A--CTT-GCAGGACA-CT--ACATTTTC-TCTCAT-TTAAATTGTGTTTTTGGTT--AGTAC-GCCCCAGTTTCAATAGCCCAA-AGATATG-GAACTGATTCTGAAAATTTG-----TAAAA-CATTT--CAAGACCTTCAGGATT-ACGAATTTACATGAAAAATATTTTTTTCTCTACAGAATTTTG-TTTTG-ATA------C-AATGA--ATA-TGT-TC-GCAAGT-TTG---CCA----CATT----G-TT--TG-TCT-TCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---C--ATGAATATTTA-------AAATCGTCC-AT-----T-AAACT--A-T-A----GT-AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------AAT-TTC--AT--C--ATG--TA--TAGAACAT-TGT------ATA-T--CTAA-CTT-ATT---CAAA---ATATTAATG-----AAT----GC--------TACT-A---GT-C-----AACTACT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACA-TTG-TTT---CA-T-ATACAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-GAAT-CTAC-AGGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TT-CGTAAA--TATT-TT-AAAC---AG--C-TTTTTAT-AA---CAT--CAAAA--TAC-TA-TGGGAATCGACCA-AG---TT-CAC-CTACAATAGCT-TGA------TTT--GAGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---AATATAT--TTCAAGAATTTTTATG---TG-CA-TTT-------TTTC------GCAGTA--GTATTTATTAA-AA-A----G-TTTTTCTA-T--ACAATAATCCAGGCGTTT-GACG-GAACTTGTA----CTGTATTTATTGTTCCCACCCAAATTTCACATGCATA-AA-G-CAGTA-CT----G-GT-------TT-A----GCTGCTATGATCATA----CAAA---GT-GTATC--AG-GGTG-TGTA---TTTTTGGTT-T--AATA-TT-CCGAAACCAAAAACTT--GACTAGTT-TAAAATAAG-CCTTTAAGGCTCTTTTTGTA-AAGA-TC-AA-TTG-AC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATG--AG-TAAA---CAATT-CCCAGATATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATT--TGAATT-GTA-TAGAAAAACTTT----------ATC--TG-AT---------TTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAAT-TTT--TTGTCTTTCTGGGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-A-TGA-CAATAGCATTCAAGCTTTTTTA-TACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCAGTTT-CGAAAATAAACACT---A--TT-TCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAG-GAT-GGTTCACCTAATTT-GT--GGA-------TTATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AATGGTCTG-ACTTA-GGT-------TTA--TCTCC----CGCGTCTAA-AC----------CACCTTTAGG-----TTCAAATGAAACTCGTAAGTTT-AT--------TTTGGAGCTT----TACAG--AT--ATTATG-TTT-GCCATGTACATACTCTTGG-ATGACTTTATAAAAAGGTCCCTTTATGTCAAGT-TG-GTGCAACC-TGTGTAG-AAGAGCTG-AATGTGAAACAGTATCAAAGGCCTTGGAAAAATTAATA-AAGCAAACATACAATT--TGG-ACTTAAATATTTGTATA-TTTTTGAATAAGGGTTCT-AAGTATAAACATGTGGTCACTGGTTCTGGCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTAATAATATTGTTAGAGTCCAAGTAGTTTTGTAACCTTGTATTCAGTATGCTATCAA--ATACTTT-GGATA-AGC-AAGAAGTT-ATTGTT-ATTCCTCTATACTAGTAGTTTGATGGGTCATA-TGGGCTATCGTTTTTATGAAT-AGG-TTTAATAAAGCCTATTTTCCA-TTCCTTTGGGTATT-TGCCAG-AA-GACAA-GACAAG----AT-TAAATAATTT-T-AGCATATGTGGT-AAAATATAT-G-AC-TTGGCTTTCA-ACATCTCATT-TTTAATGCCATCCTAATC-CA-GC-TGATTT-TTATTCTTTAGATG-TTTTATTGCATCAATGATTTTCTTTTTTTTAGTTGTACTAAATCTAAC-GAGGTAAATGTTTTGAT-TTTCT--T--CTTGG-CAAGTAAT-TTCAAAATATTT-ATTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAG-TATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGACT--TTCAAA--CT-----GAGTTTCCAGTTATGATA
gi|20 : TTTTTGTAATCG-A-TA--TGTAGCTGTAGT-AAT---CTGA-ACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--AAAATATTTA-TTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAGATATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGACT--TTCAAA-ACC-----GAGTTTCCAG-TATGATA
gi|21 : T--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATT--TGAATT-GTA-TAGAAAAACTTT-------TT-ATC--TG-AT---------TTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAA--TTT--TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-A-TGA-CAATAGCATTCAAGCTTTTTT-ATACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCAGTTT-CAGAAATTAACACT---
gi|22 : --TA----A-TTT-ATT-TCA--AAT-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCATAACATGGAATACAGAGTTC---------ATAT---------G--------------------CATGAA--T-CA-T--G-AA----AG-----T-G-A------TCAAT--C-A--AAA-GA--T---CAATAA-AAT----------------T---TA-C-GA---T-A-AATC---AA---C--TCTT-C--TCT---------------ATA-AT----------GAG--CA-C------------------------------------------AA--TTTCCTG--T--AA-C--ACCGTCA-AAT-T-C-GT-----TACT-C--A-----T--A
gi|23 : gtacatgTCAGACAGGGCTATCATTCTTATGAATTA--CTTTGATAAAGCCTGTATCCCACTCC-TTTGAATATT-TGCCAG-AG-GACAA-GATAAATTACATGTAGATAATTT-C-AGCAAA--TGGT-ACAATATGTGGTACGGTGGCTAGTA-ACATTTCATT-TTCATTG
gi|25 : TAAATAA-GA--AA----AGTTT-ATT-CCA--A-T-T--TT-G-GG-CC-CAAGAGG---GCAT---------AATAGAA------------GTATTATTTAAAAA--------------------CAT-----T-CA-T----GA----AGA---AA-G-A------
gi|26 : agtttaTAA-GT--TA----A-TTC-ATT-TTC--A-A-AAATT-GCGG-CC-C-AGAGGAATGCAT---------TACAGAG------------ATAT---------AAGGTTCAAATA---------CAG-AA--T-AA-T--A-AA----AGA---AT-G-A------TT-TC--C-A--AAA-GA--T---AGATAA-AGT--AG-A-Taatgtccaaaaagaaggaagaaattattttttacaatattataacatacatggatgtgg
gi|27 : agaTT-ATT-TCCA-A-T-T--TT-G-GC-CC-C-A-AGG---GCAA---------TA-AAAGAATACCAGGTTCACAT---------A--------------------CATAAA--T-CA-T--A-AA----AGAGCTAA-C-A------TT-AT--CTA--AAT-GA--T---AGATAC-TATA-AA-A-TAACA-AGGT---TA-T-ggaatgtgatttggtcaatca
gi|28 : aagtagtattaaagtaAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA-------------------------A-G-A------CC-AT--CCA--AAT-GA--TTATAGATAA-AGT--AAGA-TTACA-AAGT---TA-T-GA---TTA-AATC---AA---A--T-TT-CC-TCA---------------ATTTGT----------GAG--CAGCT------ATA-c
gi|29 : TTTCAGACATTTCATTATTTTATCCCAC-CCAA--ACATGCTTGATTTATTATTTTTTAGCT-TTGTCACGGCAGAGATTATTTCCTTTTCTATATTT--------CCTAAC-Ggttgtgtgttaaattgg
gi|3 : cacaggTAAGTAA-GTAATATCTTA-TTT-ATT-TCC--AAT-T--TT-G-GG-CC-C-AG-GG---GCAT----------ACAA-G------------ATAT---------AAC------------------CAT-AAACT-CAAC--A-GA----AGA---AGTGCA------TC--T--C-A--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AACA-TAACATAAGT---TA-T-GGGACT-C-ACTCACAAA---A--T-TT----TCATGACACAGTACACTGATT-GTTACCTGATACGAG--CAGCT------GCA-TACACTCACTGT-A-------G-TTGGCAA-AATTTTTTCAA--TTAAA-CACACGTTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAACATCCACGATTTTCT-C-CT-AT-TA-AA---CAGGTGATAT-A-TACCTCCGATAAAAGTATTT----A-TAC--AAGTATAT-CA-TCATACAAGGA------TT--CTATTGTGTAA-TGTG-T-TTATAAAATTAT--CTTAAATG-T---TGGTA-TGC--TGT-A---CCGGCATCAATTCATGGCTAC-A-AACAAAT-GGAAC-TTGGAAACA-T-TCT--CCCAAA--CAG-CG-T-CAGTA--CTTAACCG-ATA-CTCGACACT
gi|3 : acccacgggtaATTCCAAAAACTTACTAAATGAAA-CAATTGCCAAGAC-TTGAGGATTCACGAATT-AC-TCGAAAATATTTTTC-CTCTACAGAATCTTG-TTTTGAA-A------TGAATGA--ATA-TGT-TC-GCAGTT-TTGCCACCA----CATTGGGGG-TTAATG-GTC-GCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACAAATGCCGCACC---T--GCGAATAATTA------TTAATCGCTC-ATAGCG-TGGACTTTAA-TTAAAAGATAAACAAGTTTTT--GAC-AC--A----ATTATTCCATT-GTTCAAT--C--ATGACTAATTAGAACAT-TGTA-----ATA-TC-CTAA-CTT-ATTTAACAAAAATATAT-AATG-----AATG---GCGGTAACTGTAGT-ATCTTT-CCACAAAATAACTAAT-TTGTTG-TTCACTATA-TCCTA-TACACT-CAA-TTGATTT--TCAGT-ATACAGCAGTT-C-TCTTGAAA-TAATCGAAT-CTACAAAGGGG---A----------ATCTA-AAATTCTCTTC-CGAAAA--TATTGTACGAACATAAGATC-TTTTTAT-AA---CAT--CAAAATTTACATAGTGGAATTCGACCA-AGTTTTT-CACGCTACAATAAATCTGAAGACCCTTTTGGAGGTATCCTTTTTATGTAC----------AAGTAACCTACA---AATAT-TATTTCAAGAGACTTTATGTTTTG-CA-TTTGGTTTAATCTTACAATAGCAGTA-CAT-TTTATTAA-AG-AAGACC-TTTT-CTA-TACACAATAAaccaatggtttaaacattcttttaaatctattttatctatctcaataatgtttccttgctgtaggacgcccggacgcagggaatttcaataaatgcctataagaaatgaaggctcttggatgatgagagagaactgattcatatttaccccacaacgattatttgtattccaaaaacttactaaatgaaacaattgccaagacttgaggattcacgaattactcgaaaatatttttcctctacagaatcttgttttgaaatgaatgaatatgttcgcagttttgccaccacattgggggttaatggtcgcaatgtctgaaagtgtactacaaatgccgcacctgcgaataattattaatcgctcatagcgtggactttaattaaaagataaacaagtttttgacacaattattccattgttcaatcatgactaattagaacattgtaatatcctaacttatttaacaaaaatatataatgaatggcggtaactgtagtatctttccacaaaataactaatttgttgttcactatatcctatacactcaattgattttcagtatacagcagttctcttgaaataatcgaatctacaaaggggaatctaaaattctcttccgaaaatattgtacgaacataagatctttttataacatcaaaatttacatagtggaattcgaccaagtttttcacgctacaataaatctgaagacccttttggaggtatcctttttatgtacaagtaacctacaaatattatttcaagagactttatgttttgcatttggtttaatcttacaatagcagtacattttattaaagaagaccttttctatacacaataaatggacaggggcccaaacgttgtatat
gi|30 : acccacgggtataagtaagtaatatcttatttatttccaattttgggcccaggggcatacaagatataaccataaactcaacagaagaagtgcatctcaaatgatagataaagtaacataacataagttatgggactcactcacaaaattttcatgacacagtacactgattgttacctgatacgagcagctgcatacactcactgtagttggcaaaattttttcaattaaacacacgttcacattcattactcataagccaaacatccacgattttctcctattaaacaggtgatatatacctccgataaaagtatttatacaagtatatcatcatacaaggattctattgtgtaatgtgtttataaaattatcttaaatgttggtatgctgtaccggcatcaattcatggctacaaacaaatggaacttggaaacattctcccaaacagcgtcagtacttaaccgatactcgacactaccaatggtttaaacattcttttaaatctattttatctatctcaataatgtttccttgctgtaggacgcccggacgcagggaatttcaataaatgcctataagaaatgaaggctcttggatgatgagagagaactgattcatatttaccccacaacgattatttgtTAAGTAA-GT---A----A-TTC-ATT-TTC--A-AAT--TT-G-GG-CC-C-AGAGA---GCATACAGAGAA-TACAGAGTTC---------ATAT---------A--------------------CATGAA--T-AA-T--A-AA----AGA---AT-G-A------TT-AT--C-C--AAA-GA--T---AGATAA-AGatggacaggggcccaaacgttgtatat
gi|31 : c-AA--T-CA-T--A-AA----AGA---GA-G-A------TT-ATCCC-A--AA--GA--T---AGGTAA-CGTG-AA-A-TAAC-----T--------------------------------T-TT-C--TCA---------------GTA-AT----------GAA--CAGCT------ATA-T-------------------------GCGT-AA--TTTTCAA--T--GA-CA-
gi|32 : attagatgGTAAGTAA-TT--TT----T-TTT--TT-TCA--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGGGG---GAATACAAAGAA-TACAGAGTTT---------ATCT---------A--------------------CATAAA--T-CA-T--A-GA----AGA---GA-G-A------TT-AT--C-C--AAttgt
gi|33 : aACTTGTA---TCTGTATTTATTGTTCCC-C--AAAT----------------G-CAGTA-CTTACCG-GT-------TG-A----CCTG-TATGATCATA----C-AA---GT-GTATC--A--GGTA-TGCA---TT
gi|34 : TCAGTATGCTATTAC---TCCTTT-GGATA-AGCAA-GAAGTT-ATAGTT----CTTCT------GTAATGTGATGGGTCAGA-AGGACTATCATT
gi|36 : -TTT-ATT-CCA--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---ACA----------TATAAAA------------GTA
gi|37 : acacgT------ATA-T--TTAA-CTT-ATT---CAAA---ATAT-AATG-----AATCAATGC--------TACT-A---CT-CC----AACTACT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACatgatagttttataaagttgaaaacatatct
gi|39 : TTTTT-CCCTTGAAAAGCTTC-TTTTG-A-ATAGGCCT-AATCC--ATA-TGT-TC-GTAA-C-TTG---CC
gi|4 : taGTAAGTAA-GT---A----A-TTT-ATT-TCC--AAT-T--TT-G-GG-TC-C-AGAGG---GCATACAAAGAA-TACAGAGTTC---------ATGT---------A--------------------CAT-AAG-T-CA-T--A-AA----A-A---GA-G-A------TT-AT--CCA--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-AATAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---CT-T-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------------------------------------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T--AA-C--ACTGTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----TTTTTTTC-T-CT-AT-TG-CA---TGGGT--T-T-A-T----------AAAGTTCTT----A-TAC-AAAGTGT-T-CA-T-------GGA------TT--CTA-TG---AA-TG-G-T-T----------TTCTTTAG-TG-T---TGGTA-TGC--TGT-A---CAG---TAAA---ATA----T---A--AAAT-GGAAT-T------CA-T-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-GCAG-ACA-CT--ACATTTT-------T-TTG---TGTG----TGTGT--A--AC-GCCC-AGTTTCCATAGCC-AA-AGA-ATGAGAACTG---------------------AAA-CATTA--CAAGA-CTTGAGGATT-ACGAA-TTAC-TGAAAAATA-CTTTT-CTCTTCAGAATCTTG-TTTTG-A-A------T-AATGC--ATA-TGT-TC-GC-AGT-TTG---CCA----CATT----G-TT--TG-TCT-GCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---C--ATGAATATT--------TAAATCGCTC-AT---G-T-AACTT--A-TTA----GT-AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------AGT-TTT--AT--C--ATG--TA--TAAAACAC-TGT------ATA-T--TTAA-CTT-ATT---CAAA---ATAT-AATG-----AAT----GC--------TACT-A---ATCC-----AAATGCT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACA-TTG-TTT--TCA-T-ATACAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-AATT-CTAC--AGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TT-CGTAAA--TAAT-TA-AAAC---AG--C-TCTTTAT-AA---CAT--CAAAA--TACATA--GGGAATCGACCA-AG---TT-CAC-CTACAATAGCT-TGA------ATT--GAGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---TATATAT--TTCAAGAATTTT-ATG---TG-CATTTT-------TTTT------GCAGTA-CAT-TTTATTAA-AGAA----G-TTTT-CTA-T--ACAATAATCAGGGCGTTT-GACG-AAACTTGTA---TCTGTATTTATTGTT-CC-CCCAAATTCCACATGCATA-AG-G-CAGTA-CT----G-GT-------TT-A----ACTG-TATGGTCATA----C-AA---GT-GTATC--AG-GATA-TGTA---TTTTAGGTT-T--AATATTT-CCAAAAC-----ACTT--GGCTAGTT-TAAAATAAG-CATTTAAGGCT-TTTTTGTA-AAGA-TCAAA--TG-AC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATG--AGATAAAAA-CAATC-CCCAGATATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATC--TGATTTGTTA-TAGAAATTTTTT-------TT-ATC--TG-ATTTTTTACCGTTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAA--TTT--TTGTCTTTTTGAGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-----A-CAATctt
gi|40 : AGCT------ATA-TAT-------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAG--T--AA-C--GCTGTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CC
gi|41 : TCACCTAATTTTGC-TGGA-------TCATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAGAA----TGGT---AGATT---AT
gi|42 : aT-TCC--AAT-T--TT-G-GGTCC-C-AGAGG---GCAT---------
gi|43 : -AT---G-T-AACTT--A-TTA----GT-AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------AAT-Taatatactcaa
gi|44 : ATAATCAGGGCGTTT-GACG-GAACTTGTA---TC
gi|5 : GGTAAGTAA--T--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TTCG-GG-CC----GAGG----CATA--------CACAAAG------------A-AT---------AAGAGTTGAGAAGTTCAATTTCAT-AAA-T-CA-T--AAGA----AGAG--AA-G-A------TT-AT--C-A--AATTGA------AGATAA-A-T--AA-A-TA-CA-AGGTCTATA-T-GAA--T-A-AATC---AA---C--T-CT-CCTTCATCC------------ATA-GT----------GAG--CAGCT------ATACTA--------GT-ATCAGTAAG-TTGGCAA-AA--TTTTAAA--T--AA-CA--CTGTCG-CAT-C-C-AT-----TGCT-C--AATATTT--AA--AGCCCAATTA-----AATTTTTCAT-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-CTAA-------AAAGTTCTT----A-TAC-A--GTGT-T-CA-T-------GGAT-----TT--G-A-TG---AA--G-G-T-T----------T---TTAG-TGTT---C--TAT-GC--TAT-AA--CAG---TCAA---ATA----TTA-A--CAATTAGAATGT------CAAT-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-ACAA-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCAT-TTAACT--TGTCTTTG-GT--A--ACAGCCC-AGTTTC-GTAGCC-AA-AGA-ATGACAACTGA-TCTG-AAATTTG-----TAAAA-CATTG--CCA-ACGTAGAGGTTT-ACGAA--TAC-GTGAAAATAATCTTT-CTCTACATAAACTTGATTTTG-A-ATAGCC-T-AATGC--ATA-TGTGTCGGC--GT-TTG-----A----AATT----GCTT--TGTTCT-GCA-A-TGGCGGA----TGTCCT-----A-A----------C---C--ATGAATAATT-------TAA--CATTCTATG--G-T-AACTTC-ATTTA----GT-AACAA----TT---ATAAC--ATTACAT------ACTGTTT--AT--CTAATG--TA--TAGCACATATGT------ATA-TACTTAA-CTT-ATT---CAAA---ATA--AATGAAATCAAT----TC--------TACT-A---TC-C-----CACTACT--TGTTGTTGAT------TATTC--ACTACAATGAGA-TTG-TTT--TCA-CAATACAGCA--T-TATCTC--AATTACT-GAAT-TCTC--AGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TTGTGTAAAATTATT-TA-AAACT--AG--C-TTTTAATAAA---CAT---AAAA--TA
gi|6 : aCATA-AA-GGCAGTA-CT----G-GTCCGTTCGTT-ACATTACTGATATGATCATAACACCAAG---TT-GTATCTCAGCGGTG-TGTACTTTTTTCG--C-T--AATA-TTTCCAAAAC------CTT--GACTAGCTCTAAAATAAG-CCTTTAAGGCTCTTTT-GTA-AAGAATCAAA-TTGGAC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATGCAGG-TAAAAAACAATT-CC-AGAGATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTCAGATGATT--TGATTT-TTAATAGAAAAACTTT-------TTTATC--TG-AT---------TTTT-CTTACCGTTTTTTTACAG---------------AATATATGACAATGTTT--TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGAATAGGCAATATTT-ACTGAACATCAGCATTCAAGCTTTTTTAATACATACCCGCTG---AGCCCCT-CCCTCGGTTTTCAGAA-TTAACACTGAAAAATCATCAGCATACCACGACTA-AACACATTTAAGCGAT-GTGTCACCTAATTTTGCGCGGGATAATATTTATCATTATATCAGTC-GGACAATAG-ATATCTGGTTCAGGATCCATGTCGAGTTTAT---TATTTTAACAAAGGTTT-GACTTACGGTACTTCTGTTACTCCTCCCGGGC-TGTTTAG-ACGACTCCACTCCACCGTTAAGGCCTTTCCACATGAAATTCG-AAGTTT-ATATCTGTTGTTCGGAGTTTGTGGTACAGTTATTAATTATG-TTTGGCCA-GTACATACTCTTGACATGACTTTATAGAgt
gi|7 : TTTTT-CCCTTGAAAAGCTTC-TTTTG-A-A------T-AATCC--GTA-TGT-TC-GTAA-C-TTG---TCCTTTTCATT------TT--TA-----GCACA-T-TCTGACAAAT-TACTTTGCCATA----------CA--T--GTACATATTAA------TAAATCTTTT--T---C-T-AAGTTC-A-TTA-------AACAC----TTTTGAT-T--------GT------AGA-TCTGAAA--C--TTG--AA--AAAGATGT-TATCGCAGGATA-TG-CCAA-GTTGATT---CAGT---AAAA-AATA-----AAC----AC--------TGCTCA---AC-C-----AACAATT--C-TTTTTG-T------TA-TC--A-TTCAAA-A------------TCA-T-AT--------T-T-TCTT--GA--AGT-GCACACT-C-AAGCAA---AGTATCATTTGATTTATGAATGT---GT-TGTAAA--TATT-TA-A--C---AG--T-ATTGGAT-AA---GGTTTCAATA--TATA-A-TGGATGCCTACCT-AA---TT-CCC-CCATAACTGCA-TAG------TTT--GAAG---CTTTCTTATGTACCCCCCGGTGTA------CCCCA---CATATGTA-CTTGAGAGTTTTAATG---TG-AA-GTT-------TATC------ACTATA-TATATTTTTCAT-TG-A----G-TTTT-CAA-T--ATTATAATTTGGTCTCTT-AAC---AA-TAGCAGATTCTGAATTTATAATT--C-CCCAAATTTCACTTCCATATAACA-CAATA-------G-GT-------TT-T----ATTG-TGTGATCAtgtaattcatcggccattcatcgtttcacttctagtcgaagttgtgtcgcaagccttgtg
gi|8 : aggta-TGA-TAGTAGCGTTCAAGCTTTTTT--------------G---AAGTCTT-CCTTCAGTTT-CAGAAATTAACACT---AAGTCATCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAA-GAT-GTGTCACCTAATTTTGC-TGGA-------TCATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TC--------TC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AAAGATTTGGACTTA-GGT-------C-G--TCTCC----C-TGTCTAACAC---------CCACC-TTAGG-----TTCAAAT--------------T-AT--------TTTGAAGTTT----TACAG--AC--AGTATG-TTT-GCCATGTACATACTTTTGA--TGACTTTATAGAAAGGCCCCTT-ATGTCAAGC-TG-ATGCAGCC-TGTGTAG-AAGATCTG-AATGTAAAACAGTGTCAAAAGCCTTAGAAAAATCAACA-AAGCAAACGTATAATT--TGGAA-TT-ATCATTTGTATA-TTTTTGAATAACGGTTCT-AAGTATAAAAATGTGGTCACTAGTTCTGGCTTTTGGTTGAAAACCAATTTGAACTTTATTTATAATGTTGTTCGAGTCCAAGTAGTTTTGTAACCTGGTATTCAGTATGCTATTAAATATACTTTGGGATA-aaaagatgcaacaaaatgccggcatt
gi|9 : caaaattaggAAGTAA-AT--T--------TT-ATA-TCA--A-T-A--TT-T-GG-CC-C-AG------GCAT---------AACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--A-CA-ACAA-GA----AGA---AA---A------CC-ATT-C-ACCAAT-GA--T---AGATAA-CGT--AA-C-TAACA-AAGT---TAAT-GA---T-A-AATC---AA---AATT-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAGAGCAGCT-------TA-TATTAAT---GT-A-------G-TTGGACA-AA--TT---AG--T--AA-TC-GCTGTCA-CATGT-C-ATCTTTATACTGC--A-----T--AAAAG--C-AATTA-----AATTATTC-T-CT-AT-TAACATACCAAGT--T-T-A-T----------AA-GTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----T---CTA-TG---AAATG-G-T-T----------T--TCTTGATGTT----AGTAT-GCCATGT-AACACAA---TCAATG-ATG------A-A--AAAT-GGAAT-TAA----CA-TGCTTATC---AAAGCAC-AG-TACAG-A--CTT-GCAG-ACA-CTTAACATTTTC-TCACAT-TTA-CATGTGTTTTTGTGT--A--AC-GCC--A---TCAA-AGCC-AA-AGA-ATGAGAACTGGTTCTGAAATATGG-----TAAAA-CATTT--CAAGA-CTTGAGGATT-ATGAAt
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): TTCCAATTGGGTCGCTGTGCCCCAGAGCGCGCAAGAACTAATAGGAGAGACCGTACTTAACAGTTGAGAAAGAATGTCCCAAAAAAAAGAAGTGCGGAAAAGTGACTAAGATTTCAAGTACAGAGTGCGTAATCACAAACTCTAACAT
Unaligned ( gi|35 ): AAGGGTATTCAGAACAAGAATGACATGGGAACATAAAGAAATAAAGTAAAATAAACAGGGAAAAACATCCAGATG
Unaligned ( gi|38 ): AATAAATTTGGAAATAAAATATCAATTTTGAAATAAAGAAAATAAATTTGAAATATTCATTATGATA
Alignments
lowQualScore : 1111111111 1 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 1111 1 111 222222 222222222222222 1111111111 444444444444444444444444444444444 222 11111 11111 111 2222222222 1111 1111111 2222222222 2222222222222 111111 22 11 111 111 22222222 222222 111111 11 1 11 11111 11 11111 111 22 1 1 11 33333333 111 111 11111 222222 11111 11111 33333333333333333 333333333 22222 11 1111 1111 11 111111111111111111 11 1 222222 11 111 111 11 11111 22222222222222 222222222222 111111 11 11 33333333333333 111 11 111 111 11 111 111111 111 55555555555555555 111 22 111 1 2222222 111111 11 222222 111 1 111 1111111 222222222222222 1 22222222222 111 11 11 222222 11 111 1111 111 11 1 111 1 2222222222 222222222 5555555555555555555555555555555555 11 11 111 11 111 111 111 2222 1 11 2 1 11 2222222 11 1111 111 111 11 111 1 1 4444444444444 2222 1 1 666666666 1 22222 11 1 33333333 2222 222222 1 1 11 1 1 1 1 1 1 1 1 11 22 1 1 111 1 1 1 333 3333333 1 22222 1 1 1 1 1 1 2222 1 222 1 1 1 1 1 1 111 1 11 22222222 1 1 222 11 11111 1 111 11 1 1 7777777777777 1 1 666666666666 1 11 1
lowQualScore : 3 0000000000 2 2 555 0 2 22 2 2 4 2 2 333 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 8 3333 7777 33 4444 555 222 555555 2 77 4 55 44 33 666 2 77 888 2 444 5 2 000 2 2 444 000000 5 5 66 111111111111111 2 1111111111 77 000000000000000000000000000000000 2 33 55 33 2 222 2 5 2 2 44444 8 33 77777 33 88 44 11111 1 3 3 3 3 6 111 44 3 3 3 0000000000 1111 3 3 0 0 3 3 3 0000000 5555555555 6 555 6 3 6 3 3333333333333 0 444444 44 00 3 666 9999 666 00000000 55 4 8 222222 4 8 888888 11 4 4 2 8 55 4 4 8 66 5 0 5 77777 1 99999 6 55 4 1 5 5 5 5 11 77 22 22222 5 222 00 5 5 888 1 5 0 3 00 5 5 22222222 66 5 5 5 333 5 333 22222 000000 77 11111 5 5 5 44444 33333333333333333 444444444 0 5 00000 5 66 5 0000 5 0000 33 888888888888888888 1 5 88 99 99 99 99 3 222222 5 99 5 5 000 555 44 44444 44444444444444 5 777777777777 77 5 5 666666 5 55 5 5 4 6 6 99 666 7 99 666 99 99 6 6 3 44 11111111111111 6 111 6 55 6 6 888 99 6 6 111 99 99 11 88 6 111 6 6 6 999999 99 111 22222222222222222 1 111 4 22 0 7 111 6 3 1111111 1 999999 3 11 9 6 6 111111 6 9999 1 6 888 000 5 6 6 6666666 5 111 6666666 5 000000000000000 1 44444444444 6 99 77 6 111 1 5 8 11 88 8 000000 11 8 8 666 0 8 8 8 88 8 7777 8 444 8 11 6 0 999 0 8 3 99 99 6 111 3 2 99 6 6 2222222222 99 6 666666666 0000000000000000000000000000000000 55 44 99 99 6 111 6 66 444 444 8 8 0 444 44 3 3 1111 0 33 0 0 0 0 44 6666666 11 8 8 8 8 7777 444 444 33 777 0 55 0 2222222222222 1111 0 0 555555555 0 6 55555 11 0 9 0 66666666 1111 555555 0 0 3 3 99 6 2 7 3 3 3 3 3 2 0 7 3 7 0 88 7 6 00 3 3 6 7 6 0 777 0 0 7 7 3 444 5555555 1 6 1 0 11111 2 2 6 7 3 3 3 3 8888 3 222 7 3 3 7 2 0 6 0 0 3 777 3 7 7 44 0 1 1 55555555 0 3 555 44 99999 0 22 222 44 3 3 3333333333333 7 7 3 7 3 888888888888 3 00 6 3
lowQualScore : . .......... . . ... . . .. . . . . . ... .............................................................. . .... .... .. .... ... ... ...... . .. . .. .. .. ... . .. ... . ... . . ... . . ... ...... . . .. ............... . .......... .. ................................. . .. .. .. . ... . . . . ..... . .. ..... .. .. .. ..... . . . . . . ... .. . . . .......... .... . . . . . . . ....... .......... . ... . . . . ............. . ...... .. .. . ... .... ... ........ .. . . ...... . . ...... .. . . . . .. . . . .. . . . ..... . ..... . .. . . . . . . .. .. .. ..... . ... .. . . ... . . . . .. . . ........ .. . . . ... . ... ..... ...... .. ..... . . . ..... ................. ......... . . ..... . .. . .... . .... .. .................. . . .. .. .. .. .. . ...... . .. . . ... ... .. ..... .............. . ............ .. . . ...... . .. . . . . . .. ... . .. ... .. .. . . . .. .............. . ... . .. . . ... .. . . ... .. .. .. .. . ... . . . ...... .. ... ................. . ... . .. . . ... . . ....... . ...... . .. . . . ...... . .... . . ... ... . . . ....... . ... ....... . ............... . ........... . .. .. . ... . . . .. .. . ...... .. . . ... . . . . .. . .... . ... . .. . . ... . . . .. .. . ... . . .. . . .......... .. . ......... .................................. .. .. .. .. . ... . .. ... ... . . . ... .. . . .... . .. . . . . .. ....... .. . . . . .... ... ... .. ... . .. . ............. .... . . ......... . . ..... .. . . . ........ .... ...... . . . . .. . . . . . . . . . . . . . . .. . . .. . . . . . . ... . . . . . ... ....... . . . . ..... . . . . . . . . .... . ... . . . . . . . . . . ... . . . .. . . . ........ . . ... .. ..... . .. ... .. . . ............. . . . . . ............ . .. . .
lowQualScore : 1 8888888888 2 1 555 5 0 88 0 0 0 0 0 555 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0 5555 2222 11 2222 555 888 888888 1 11 7 88 44 11 999 2 99 555 4 444 0 5 000 7 7 777 999999 3 3 33 333333333333333 7 7777777777 33 444444444444444444444444444444444 5 44 99 44 5 333 7 3 9 9 33333 6 99 11111 99 55 22 77777 4 3 3 3 3 7 777 66 3 3 3 4444444444 7777 3 3 5 1 3 3 3 8888888 1111111111 7 888 7 3 7 3 9999999999999 4 888888 33 00 6 444 0000 444 55555555 00 0 0 555555 0 0 000000 00 0 0 0 0 55 0 0 0 55 0 5 0 44444 4 33333 7 77 3 4 0 7 7 7 00 66 99 55555 0 111 66 0 5 222 7 0 8 2 66 0 0 88888888 99 0 0 0 999 0 888 99999 777777 99 44444 7 7 7 33333 11111111111111111 999999999 4 0 11111 0 99 0 6666 0 6666 66 333333333333333333 0 7 33 22 22 22 22 3 111111 7 33 7 7 000 777 44 33333 44444444444444 7 777777777777 99 7 7 444444 7 77 7 7 3 7 7 22 888 3 22 888 22 88 7 7 5 00 88888888888888 7 777 7 88 7 7 333 22 7 7 777 22 22 66 66 7 777 7 7 7 222222 22 777 88888888888888888 0 777 2 22 7 8 777 7 3 7777777 0 222222 5 88 8 7 7 888888 7 3333 0 7 777 000 0 7 7 2222222 7 777 4444444 7 333333333333333 4 00000000000 7 22 77 7 777 0 0 0 00 66 0 888888 00 0 0 222 8 0 0 8 88 0 0000 0 000 0 00 0 8 444 8 0 2 22 22 7 777 3 5 22 7 7 5555555555 22 7 777777777 0000000000000000000000000000000000 88 00 22 22 7 555 7 22 000 000 0 0 8 000 00 2 2 2222 0 22 0 0 8 8 44 0000000 00 0 0 0 0 0000 000 000 88 555 0 00 0 2222222222222 2222 0 0 222222222 8 5 00000 88 2 2 0 22222222 2222 555555 0 0 2 2 88 5 0 3 3 3 3 3 3 0 7 3 3 3 7 33 3 7 77 3 3 7 3 7 7 000 0 0 3 3 3 000 3333333 0 7 0 0 33333 0 0 7 3 3 3 3 3 3333 3 777 3 3 3 3 0 7 7 0 0 3 777 3 3 3 00 7 0 2 88888888 0 3 000 77 33333 7 00 000 77 3 3 3333333333333 3 3 3 3 3 333333333333 3 33 7 3
consensus : GGTAAGTAA-GT--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT---------TACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--T-CA-T--A-GA----AGA---AA-G-A------TC-AT--C-A--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-A-TAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TA--------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T--AA-CA-ACTGTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----AATTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-T----------AAAGTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----TT--CTA-TG---AA-TG-G-T-T----------T--CTTAGATGTT---TGGTATTGC--TGT-A---CAG---TCAA---ATG----T-A-A--AAAT-GGAAT-T------CA-T-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-GCAG-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCAT-TTAACTTGTGTTTTTGTGT--A--AC-GCCC-AGTTTCAATAGCC-AA-AGA-ATGAGAACTGATTCTGAAAATTTG-----TAAAA-CATTT--CAAGACCTTGAGGATT-ACGAATTTAC-TGGAAAATATTTTTT-CTCTACAGAATCTTG-TTTTG-A-A------T-AATGC--ATA-TGT-TC-GCAAGT-TTG---CCA----CATT----G-TT--TG-TCC-GCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---C--GTGAATATTTA------TAAATCGCTC-AT---G-T-AACTT--A-TTA----GT-AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------ANT-TTT--AT--C--ATG--TA--TAGAACAT-TGT------ATA-T--CTAA-CTT-ATT---CAAA---ATAT-AATG-----AAT----GC--------TACT-A---NT-C-----AACTACT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACA-TTG-TTT--TCA-T-ATACAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-GAAT-CTAC-AAGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TT-CGTAAA--TATT-TA-AAAC---AG--C-TTTTTAT-AA---CAT--CAAAA--TACATA-TGGGAATCGACCA-AG---TT-CAC-CTACAATAGCT-TGA------TTT--GAGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---AATATATA-TTCGAGAGTTTTAATG---TG-CA-TTT-------TNTC------GCAGTA-CATATTTATTAA-AG-A----N-TTTT-CTA-T--ACAATAATCNGGGCGTTT-GACG-GAACTTGTA---TCTGTATTTATTGTTCCC-CCCAAATTTCACATGCATA-AA-G-CAGTA-CT----G-GT-------TT-A----ACTG-TATGATCATA----CAAA---GT-GTATC--AG-GGTG-TGTA---TTTTNGGTT-T--AATA-TT-CCAAAAC-----ACTT--GACTAGTT-TAAAATAAG-CCTTTAAGGCTCTTTTTGTA-AAGA-TCNAA-TTG-AC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATG--AG-TAAAAA-CAATT-CCCAGATATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATT--TGATTT-TTA-TAGAAAAACTTT-------TT-ATC--TG-AT---------TTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAAT-TTT--TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-A-TGA-CAATAGCATTCAAGCTTTTTTAATACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCGGTTT-CAGAAATTAACACT---AAATCATCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAG-GAT-GTGTCACCTAATTTTGC-CGGA-------TTATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AAAGGTTTGGACTTA-GGT-------TTA--CCTCC----C-TGTCTAA-ACG--------CCACCNTTAGG-----TTCAAATGAAACTCGTAAGTTT-AT--------TTTGGAGTTT----TACAG--AT--ATTATG-TTT-GCCATGTACATACTCTTGA-ATGACTTTATAGAAAGGCCCCTTTATGTCAAGT-TG-GTGCAGCC-TGTGTAG-AAGAGCTG-AATGTGAAACGGTATCAAAGGCCTTAGAAAAATCAACA-AAGCAAACGTACAATT--TGGAACTT-AATATTTGTATA-TTTTTGAATAAGGGTTCT-AAGTATAAACATGTGGTCACTGGTTCTGGCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTTATAATATTGTTAGAGTCCAAGTAGTTTCGTAACCTTGTATTCAGTATGCTATTAA--ATACTTT-GGATA-AGCAAAGAAGTT-ATTGTT-A-TCCTCTA---TAGTANTTTGATGGGTCANA-AGGGCTATCATTTTTATGAAT-AGGCTTTAATAAAGCCTATTTCCCACTCCCTTTGGGTATT-TGCCAG-AG-GACAA-GACAAG----AT-TAAATAATTT-T-AGCATATGTGGT-AAAATATAT-GTACGTCGGCTTTCA-ACATCTCATT-TTTAATGCCAT-CTAATCGCA-GCTTGATTTATTATTTTTTAGATGTTTTTATTGCATCGATGATTTTCTTTTCTNTAATTG-A-TAAATCTAAC-GAAGT-AATG--TTGATATTTCTGCTGACTTGGACAANNAATCTTCAAAATATTTAATTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAGATATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGA------------CTTTC-AAACCGAGTTTCCAG-TATGATA
Reference ( family-3541 ) : GGTAAGTAA-GT--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT---------TACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--T-CA-T--A-GA----AGA---AA-G-A------TC-AT--C-A--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-A-TAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TA--------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T--AA-CA-ACTGTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----AATTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-T----------AAAGTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----TT--CTA-TG---AA-TG-G-T-T----------T--CTTAGATGTT---TGGTATTGC--TGT-A---CAG---TCAA---ATG----T-A-A--AAAT-GGAAT-T------CA-T-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-GCAG-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCAT-TTAACTTGTGTTTTTGTGT--A--AC-GCCC-AGTTTCAATAGCC-AA-AGA-ATGAGAACTGATTCTGAAAATTTG-----TAAAA-CATTT--CAAGACCTTGAGGATT-ACGAATTTAC-TGGAAAATATTTTTT-CTCTACAGAATCTTG-TTTTG-A-A------T-AATGC--ATA-TGT-TC-GCAAGT-TTG---CCA----CATT----G-TT--TG-TCC-GCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---C--GTGAATATTTA------TAAATCGCTC-AT---G-T-AACTT--A-TTA----GT-AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------ANT-TTT--AT--C--ATG--TA--TAGAACAT-TGT------ATA-T--CTAA-CTT-ATT---CAAA---ATAT-AATG-----AAT----GC--------TACT-A---NT-C-----AACTACT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACA-TTG-TTT--TCA-T-ATACAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-GAAT-CTAC-AAGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TT-CGTAAA--TATT-TA-AAAC---AG--C-TTTTTAT-AA---CAT--CAAAA--TACATA-TGGGAATCGACCA-AG---TT-CAC-CTACAATAGCT-TGA------TTT--GAGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---AATATATA-TTCGAGAGTTTTAATG---TG-CA-TTT-------TNTC------GCAGTA-CATATTTATTAA-AG-A----N-TTTT-CTA-T--ACAATAATCNGGGCGTTT-GACG-GAACTTGTA---TCTGTATTTATTGTTCCC-CCCAAATTTCACATGCATA-AA-G-CAGTA-CT----G-GT-------TT-A----ACTG-TATGATCATA----CAAA---GT-GTATC--AG-GGTG-TGTA---TTTTNGGTT-T--AATA-TT-CCAAAAC-----ACTT--GACTAGTT-TAAAATAAG-CCTTTAAGGCTCTTTTTGTA-AAGA-TCNAA-TTG-AC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATG--AG-TAAAAA-CAATT-CCCAGATATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATT--TGATTT-TTA-TAGAAAAACTTT-------TT-ATC--TG-AT---------TTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAAT-TTT--TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-A-TGA-CAATAGCATTCAAGCTTTTTTAATACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCGGTTT-CAGAAATTAACACT---AAATCATCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAG-GAT-GTGTCACCTAATTTTGC-CGGA-------TTATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AAAGGTTTGGACTTA-GGT-------TTA--CCTCC----C-TGTCTAA-ACG--------CCACCNTTAGG-----TTCAAATGAAACTCGTAAGTTT-AT--------TTTGGAGTTT----TACAG--AT--ATTATG-TTT-GCCATGTACATACTCTTGA-ATGACTTTATAGAAAGGCCCCTTTATGTCAAGT-TG-GTGCAGCC-TGTGTAG-AAGAGCTG-AATGTGAAACGGTATCAAAGGCCTTAGAAAAATCAACA-AAGCAAACGTACAATT--TGGAACTT-AATATTTGTATA-TTTTTGAATAAGGGTTCT-AAGTATAAACATGTGGTCACTGGTTCTGGCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTTATAATATTGTTAGAGTCCAAGTAGTTTCGTAACCTTGTATTCAGTATGCTATTAA--ATACTTT-GGATA-AGCAAAGAAGTT-ATTGTT-A-TCCTCTA---TAGTANTTTGATGGGTCANA-AGGGCTATCATTTTTATGAAT-AGGCTTTAATAAAGCCTATTTCCCACTCCCTTTGGGTATT-TGCCAG-AG-GACAA-GACAAG----AT-TAAATAATTT-T-AGCATATGTGGT-AAAATATAT-GTACGTCGGCTTTCA-ACATCTCATT-TTTAATGCCAT-CTAATCGCA-GCTTGATTTATTATTTTTTAGATGTTTTTATTGCATCGATGATTTTCTTTTCTNTAATTG-A-TAAATCTAAC-GAAGT-AATG--TTGATATTTCTGCTGACTTGGACAANNAATCTTCAAAATATTTAATTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAGATATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGA------------CTTTC-AAACCGAGTTTCCAG-TATGATA
gi|1 : GTAAGTAAAGT--TA----A-TTTTATTCTCCGAA-T-T--TT-G-GG-CCAC-GAAGG---GCAT----------ACAA-G------------ATAT---------A--------------------AAA-AA----CA-C--A-GA----AGA---AA-G-T------GC-AT--CCA--AAT-GA--TGA-AGATAA-AGT--AA-A-TAACA-AAGT---TA-T-GAA--T-A-AATC---AA---T--T-TT-C--TCA---------------ATT-G-----------GAG--CAGCT------ATACTT--------GT-A-------GATTGGCAA-AT--TTCTCAACCT--AA-AC-ACTGTCA-CAT-T-CGAT-----TACT-CCAA-----T--AA--G--CCAAATA-----A-TTTTTC-T-CTGATCTA-CA----AGGT--T-T-AAT----------AAAGTTTTTTA--A-AAC-AAAGT---T-CAAT-------GGAT-----T---CTA-TG---AA-TG-G-T-T----------TGTCTTAAATGTG---TG-TAT-GC--TGT-A---CAA---TCAA---ATG----T-A-A--AA-T-GGAATGT------CA-T-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-GCAG-ACAGCT--ACATTTTC-TCTCAT-T--ACTTGTGTTTTTGTGTTAA--AC-GCCCGAGTTTCAATAGCC-AACAGA-ATGAGAACTAATTCT-AAAATTTG-----TAAAAACATTTT-CAAGAC-TTGAGGATT-AC-AATCT-----GAAAATATTTTT--CTCTACAGAATCTT--TTTTG-A-AC-----T-AATGGGAATAATGT-TC-GCA-GTGTTG---CCA----CATT----GGTT--TG-TCCTGCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---CCAGTGAA-ATT---------AAATCGCTC-AT---GCT-AACTT--T-ATA----GT-AACAA----TTT-GATTACGGA----AT------ATT-TTT--ATATC--ATG--TA--TAGAACATCTGT------ATAGT--CTAAGCTT-ATT---CAAAC--ATA--AATG-----AGA----GC--------TACT-A---GTTC-----AACTACT--T-TGTTTG-T------TA-TCGAA-TACAAT-ACAGTTG-TTTCATTA-T-AT-CAGCA--TAT-TCTT--AA-GAAT-GAAT-CTAC-AGGGGGCGAA----------ATCTA-AAATTC---TT-CGAAAAA-TATT-TA-AAAC---AG--CGTTTTTAT-AAACACAT--CAAAA--TACATA---GGAATCGACCA-AG---TTTCAC-CTACAATAGCT-TGA------TTT--GAG----CCTTTTTAGGTAC----------AGA----CCA-A---AATATAT--TTCAAGAATTTTAATG---TGGCAATTT-------TTTC------GCAGTAACATGTTTATTAA-AG-A----CGTTTT-CTAGT--ACAATAATCAGGGCGTTTTGACG-GAACTTGTA---TCTGTATTTATTGTTCCC-C--AAATTTCACATGCATA-AAAG-CAGTAACT----GTGT-------TTTA----ACTG-TATGATCATA----CA-----GTCGTATC--AG-GGTG-TGTA---TTTTTGGTTAT--AAT--TT-CCAAAAC-----ACTTTTGACTAGTT-TAAAATAAGGCCTTTAAGGCT---TTTGTAGAAGA-TCCAAATTG-AC----AACATGTGTA---AGGAGGCCTGATG--AGGTAAAAA-CAATTGCCCAGATATT---G--TACGATGAACACT---TGTTCTGA--ATT--TGATTT-TTA-TAGAAAAACTTT-------TT-ATC--TG-AT---------TTTT-T-------------ACAACGTTTTTTCTACAGAAATATT-GACAAT-TTT--T-GTCTTTCTGAGGTTGACCAGGA-TAGGCAAAATTTGA-TGA-CAATAGCATTCAAGCCTTTTTAATACAC---CGCTGTGAAGGCCCTCCCCTCGGTTT--AGAAATTAACACT---AAATCATCAGCAT-C----AACATAACA---TTAAGAGATGGTGTCACCT-ATTTTGC-CGGA-------TTATCAT--TATC-GTCGAAAA-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAATATTATTTTAA-AAAGGTTTGGACTTA-GG--------TTA--CCTCC----C-TGTCTTA-ACAC-------CCACACTTA-G-----TTCAAATG-AACTCGTAAGTTTGAT--------TTTGGAGTTT----TAGAG---T--ATTATGTTTT-GCCATGTACATAC-CTTGA-TTGACTTTATA-AAAGG-CCCTTTATGTCAAGTCTGTGTGCAGCCTTGTGTAGAAAGAGCTGAAATGT--AACGGTATCAAAGGCCTTAG-AAAATCAACACAAGC-AACATACAATTGCTGGAACTT--ATATTTGTATATTTTTTGAATAAGGGTTCTAAAGTATAAACATGTGGTCACTGGTTCT-GCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTTAT-ATATTGTTAGAGT-CAAGTAGTTTCGTACCTTTGTATTCAGTATGCTATTAA--ATACTTT-GGAAATAGCAAAGAAGTTGATTGTTAA-TCCTCTA---TA--ATTTTGAT-GGTCATA-AGGGCTATCATTTTTATGAAT-AGGTTTTAATAAAGCCTATTT-CCATTCCCTTTGGG-ATTCTGCCAACAGAAACAACGACAAG----AT-TAAACAATTTATAAGCATATGTGGTAAAAATATAT-GTACATCGG-TTTCA-ACATCTCATT-TTTAATGCCAT-CTAATCGCA-GCTTGATTTATTATCTTTCAGATGTTTTTATTGCATCAATGATTTTCTTTTCTTTAATTG-A-TAAATCTAAC-GAAGT-AATG--TTGATATTTCTGCTGACTTGGACAATAAATCTTCAAAATATTTAATTCTGGGTATCAAATTTACTAATCAATACTGAATAATGTTTGTAAAATGATTTACACCCATTGTTCACTAGATATCTT-ATCGGACT-ATCTTGCGGATTGCTGATTGATTCAAATTCTTTC-AAA---AGTTT-CAG-TATG
gi|10 : aaAAGTAA-AT--T--------TT-ATA-TCA--A-T-A--TT-T-GG-CC-C-AG------GCAT---------AACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--A-CA-ACAA-GA----AGA---AA---A------CC-ATT-C-ACCAAT-GA--T---AGATAA-CGT--AA-C-TAACA-AAGT---TAAT-GA---T-A-AATC---AA---AATT-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAGAGCAGCT-------TA-TATTAAT---GT-A-------G-TTGGACA-AA--TT---AG--T--AA-TC-GCTGTCA-CATGT-C-ATCTTTATACTGC--A-----T--AAAAG--C-AATTA-----AATTATTC-T-CT-AT-TAACATACCAAGT--T-T-A-T----------AA-GTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----T---CTA-TG---AAATG-G-T-T----------T--TCTTGATGTT----AGTAT-GCCATGT-AACACAA---TCAATG-ATG------A-A--AAAT-GGAAT-TAA----CA-TGCTTATC---AAAGCAC-AG-TACAG-A--CTT-GCAG-ACA-CTTAACATTTTC-TCACAT-TTA-CATGTGTTTTTGTGT--A--AC-GCC--A---TCAA-AGCC-AA-AGA-ATGAGAACTGGTTCTGAAATATGG-----TAAAA-CATTT--CAAGA-CTTGAGGATT-ATGAAgcat
gi|11 : taagctaATAGAGCATAA---TT-CCC-CCATAACTGTT-TGG------TTT--GAGG---TCTTCTTGTGTAT----------T------CCATATAGAGTATGTA-CTTGAGGGGTTTAATG---TG-AA-GTT-------TATC------AC--TA-AATA-TGATTCATGG-A----C-TTTT-CAA-C--ATTATAATTTGGGCTCTT-TACATCAGCAGGT----TTTGAATTTGTAGTT--T-CCCAAATT--------ACA-AA-A-CA----------G-GT-------TT-T----ACAG-TGTGATAAAA----AAAAAAGAT-GCAAC--AA-AATACTGGA---ATTTGGCCT-TGCAAT--TT-CAAAAAC-----ATTT--AATTAATT-TAAAGAAAG-CATTCAAACCAC-GCTTATA-CAGG-TCTTG-TTG-ACAATTAACATATA-ATCCAAAGG-CAT--TG--AA-T-ATAC-CA----CGTAAATATTAATGAATAAAA-GA-CAATGAATGTTC-TAT--TTCCTTATCT-TTA-TAAACAAATTTTAAGTTTCTT-ACCTTTGCAT---------TCTTGT-------------AAAA---------------AAAAT--G----T-TGTCCTTGTCTTTTTCAAATTAAC--AGA-GAGACAATGTTT-A-Taa
gi|12 : gTAAGTAA-GT--TA----T-TTT-ATT-TCC--AAT-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT--------------AA------------ATAT---------A--------------------CAT-AAA-C-CA-C--A-GA----AGA---G--G-A------CC-AT--CCA--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-A-TAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TTTC--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TAT-------GT-A---------TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T--AA-CA--CTGTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----ATATTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-T----------AAAGTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGA------TT--CTA-TG----A-TG-GTT-T----------T--CTTAGATG-T---TGGTA-TGC--TGT-A---CAA---CCAA---ATG----T---A--AAAT-GGTAT-T------CA-T-CTT--C---AA--CACAAG-TCCAG-A--CTT-GCAG-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCAC-TT-ACTTGTGTTTTTGTcata
gi|13 : -T--TT-G-GA-CC-C-AGAGT---GCAT----------ACAAAG------------A-AT---------A--------------------CAT-AG--TTCA-T--A--A----ATA---CA-C-A------TC-AT--A-A--AA---A--T----GATAA-AGT--AATA-TAACC-AGGT---TA-T-GA---T-A-AATC---TATTTT--T-TT-T--TCA---------------ATA-GT----------GAG--CAGC----------------------T-A-------A-TT-------A--TTGTCAA--T--AA-C--ACTGTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----ACTTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---TATGT--T-T-A-T----------AAAGTAATT----A-TAC-AAGGTGT-T-TA-T-------GAA------CT--CTA-TG---AA-TG-G-TGC----------C--CTTAGGTG-T---TGGTA-TGC--TAT-A---CAG---TCAA---ATA----T-ACA--AAAT-GGAAA-T------CA-T-CCT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-ATGCGT-GCGC-ACGCCT--GCAT
gi|14 : g--TA----A-TTT--TT-TCC--A-A-T--TT-T-TG-CC-C-AGAGG---GCAT----------ACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AAA-C-CA-C--A-GA----AGA---AA-G-A------CC-AT--CCA--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-AATAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TTTC--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TAATTTAT--GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T--AA-CA--CTGTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----AATTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T---C----------AAAG-TTTT----A-TACAAAAGTAT-T-CA-T-------GGATCTATATT--CTA-TG---AA-TG-GTT-T----------T--CTTAGATG-T---TGGT
gi|15 : aaggtagTAAGTAA-GT---A----A-TTT-----TCA--A-T-T--TT-G-GG-GT-G-AGAGG---GCAT---------CATACAA------------ATA-----------------------------------AA--T-CA-G--A-GTTCCTGTA---CA-T-G------TT-AT--CTA--AAA-GG--C---GTATAATATT--AA-A-TTACA-AGTT---TA-T-GA---T-ATAAT----AA---ACTT-TT-C--CCC---------------ATA-AT----------GAA--CAGCTCTAGAGATA-TA--------GGGA-------A-TTGGCAA-AA--TTTCCAT--T--AA-CA-TC-GTCA-CAT-g
gi|16 : aaA----G-TTT-ATT-CCA--A-T-T--TT-G-GGCCC-C-AAAGG---GCAT---------AATAGAA------------GTA----------A--------------------CA--GC--T-CA-T--A--A----AGA---AA-G-AAATGTCCC-AA--A-A--AAT-GAAGT---GGGAAA-AGTTAAA-A-TATCA-cacacaagtctatgtataactataaaatattcatggactct
gi|17 : aaagaaaataaatttgagaaaaaatatcaattttgaaataagaaaataaaatttggaaatattcattatgatatctataggtgtaaagataatataCCC-AGTTTAAATAGCC-AA-AAG-ATGAGAACTGATTATG-AAATTTA-----GAAAA-CATTG--CAAGAC---GAGGATT-GCGAA-TTAC-TGAAAAATG--TTTT-CTCTACAGA------------------------AATGC--A-A-TGT-TC-GCCAGT-TTGT--CCA-----ATT----G--T--TG-TCT-GCA-ATTGCCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------CCTTC--ATGAATATTTCTCTTTTTAAATCTATC-AG---A-T-AATTT--A-TTA----GT-AACAA----Ttggaatcacaacttacatgtatgtgg
gi|18 : tacA-AAGT---TA-TAGA---T-A-A-TC---AA---T--TGTT-C--TCA---------------TTT-GT----------GAG--CAG-T------ATA-TA---------T-A-------G-TTGGCAA------TTTCAA--T--AAGCA---T-TCA-CAT-TAC-AT-----TA-T-C--A-----CTAAA--G--CCAAATAC----AATTTCTT-TACT-AT-TA-CA---CAGGT--T-TTA-T----------AAATTTTTTGCCTA-TAC-AA-GTAT-TTCA-T-------GGAT-----TCTGCT--TG---AA-TG-G-T-T----------TTTCTTA-ATGTT----GGTATGGC--TGTTA---CA----TCAA---ATG----T-A-A--AAata
gi|19 : TGGCAACGA--TTTT-AA--T--AA-CA--CCGTCA-C-T-T-C-AT-----TGCTTC--A-----T--A---G--CCAGGTA-----AAGTT----------------------GTT--T-T-A-T----------CAAATTCTT----A-T-C-AATGTGT-T-CA-A-------GGA----------CTGGTG---AA-TG-G-T-T----------TT-CGTACA-GTTGAATGATAT-AC--AAT-A---CAG---TCAA---TT---------A--CAAT-GGAAT-T------CA-T-CTT-------A--CAA-AGTT-CAGCA--TTT-ACAG-ACA-GT--GCATTTTCTTTTCATATTACC---CGTTTTTG
gi|2 : acGGTAAGTAA-GT--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT---------TACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--C-CA-C--A-GA----AGA---AA-G-A------CC-AT--C-A--CAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-T-TAA-A-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TA--------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAAA-T--AA-CA-ACTGTCAGCAT---C-GT-----TACT-C--A-----T--AG------CAAA-A-----AATTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-T----------AAAGTTTTC----AATAA-CAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----TT--CTA-TG---A--TG-G-T-T----------T--CTTAGATGTT---TGGTATTGC--TGT-A---CAC---TCAG---ATG----T-A-A--AAAT-GGAAT-T------C--T-CTT------AA--CAC-AG-T--AG-A--CTT-GCAGGACA-CT--ACATTTTC-TCTCAT-TTAAATTGTGTTTTTGGTT--AGTAC-GCCCCAGTTTCAATAGCCCAA-AGATATG-GAACTGATTCTGAAAATTTG-----TAAAA-CATTT--CAAGACCTTCAGGATT-ACGAATTTACATGAAAAATATTTTTTTCTCTACAGAATTTTG-TTTTG-ATA------C-AATGA--ATA-TGT-TC-GCAAGT-TTG---CCA----CATT----G-TT--TG-TCT-TCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---C--ATGAATATTTA-------AAATCGTCC-AT-----T-AAACT--A-T-A----GT-AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------AAT-TTC--AT--C--ATG--TA--TAGAACAT-TGT------ATA-T--CTAA-CTT-ATT---CAAA---ATATTAATG-----AAT----GC--------TACT-A---GT-C-----AACTACT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACA-TTG-TTT---CA-T-ATACAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-GAAT-CTAC-AGGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TT-CGTAAA--TATT-TT-AAAC---AG--C-TTTTTAT-AA---CAT--CAAAA--TAC-TA-TGGGAATCGACCA-AG---TT-CAC-CTACAATAGCT-TGA------TTT--GAGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---AATATAT--TTCAAGAATTTTTATG---TG-CA-TTT-------TTTC------GCAGTA--GTATTTATTAA-AA-A----G-TTTTTCTA-T--ACAATAATCCAGGCGTTT-GACG-GAACTTGTA----CTGTATTTATTGTTCCCACCCAAATTTCACATGCATA-AA-G-CAGTA-CT----G-GT-------TT-A----GCTGCTATGATCATA----CAAA---GT-GTATC--AG-GGTG-TGTA---TTTTTGGTT-T--AATA-TT-CCGAAACCAAAAACTT--GACTAGTT-TAAAATAAG-CCTTTAAGGCTCTTTTTGTA-AAGA-TC-AA-TTG-AC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATG--AG-TAAA---CAATT-CCCAGATATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATT--TGAATT-GTA-TAGAAAAACTTT----------ATC--TG-AT---------TTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAAT-TTT--TTGTCTTTCTGGGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-A-TGA-CAATAGCATTCAAGCTTTTTTA-TACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCAGTTT-CGAAAATAAACACT---A--TT-TCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAG-GAT-GGTTCACCTAATTT-GT--GGA-------TTATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AATGGTCTG-ACTTA-GGT-------TTA--TCTCC----CGCGTCTAA-AC----------CACCTTTAGG-----TTCAAATGAAACTCGTAAGTTT-AT--------TTTGGAGCTT----TACAG--AT--ATTATG-TTT-GCCATGTACATACTCTTGG-ATGACTTTATAAAAAGGTCCCTTTATGTCAAGT-TG-GTGCAACC-TGTGTAG-AAGAGCTG-AATGTGAAACAGTATCAAAGGCCTTGGAAAAATTAATA-AAGCAAACATACAATT--TGG-ACTTAAATATTTGTATA-TTTTTGAATAAGGGTTCT-AAGTATAAACATGTGGTCACTGGTTCTGGCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTAATAATATTGTTAGAGTCCAAGTAGTTTTGTAACCTTGTATTCAGTATGCTATCAA--ATACTTT-GGATA-AGC-AAGAAGTT-ATTGTT-ATTCCTCTATACTAGTAGTTTGATGGGTCATA-TGGGCTATCGTTTTTATGAAT-AGG-TTTAATAAAGCCTATTTTCCA-TTCCTTTGGGTATT-TGCCAG-AA-GACAA-GACAAG----AT-TAAATAATTT-T-AGCATATGTGGT-AAAATATAT-G-AC-TTGGCTTTCA-ACATCTCATT-TTTAATGCCATCCTAATC-CA-GC-TGATTT-TTATTCTTTAGATG-TTTTATTGCATCAATGATTTTCTTTTTTTTAGTTGTACTAAATCTAAC-GAGGTAAATGTTTTGAT-TTTCT--T--CTTGG-CAAGTAAT-TTCAAAATATTT-ATTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAG-TATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGA------------CTTTC-AAACTGAGTTTCCAGTTATGATA
gi|20 : TTTTTGTAATCG-A-TA--TGTAGCTGTAGT-AAT---CTGA-ACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--AAAATATTTA-TTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAGATATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGA------------CTTTCAAAACCGAGTTTCCAG-TATGATA
gi|21 : T--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATT--TGAATT-GTA-TAGAAAAACTTT-------TT-ATC--TG-AT---------TTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAA--TTT--TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-A-TGA-CAATAGCATTCAAGCTTTTTT-ATACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCAGTTT-CAGAAATTAACACT---
gi|22 : --TA----A-TTT-ATT-TCA--AAT-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCATAACATGGAATACAGAGTTC---------ATAT---------G--------------------CATGAA--T-CA-T--G-AA----AG-----T-G-A------TCAAT--C-A--AAA-GA--T---CAATAA-AAT----------------T---TA-C-GA---T-A-AATC---AA---C--TCTT-C--TCT---------------ATA-AT----------GAG--CA-C------------------------------------------AA--TTTCCTG--T--AA-C--ACCGTCA-AAT-T-C-GT-----TACT-C--A-----T--A
gi|23 : gtacatgTCAGACAGGGCTATCATTCTTATGAATTA--CTTTGATAAAGCCTGTATCCCACTCC-TTTGAATATT-TGCCAG-AG-GACAA-GATAAATTACATGTAGATAATTT-C-AGCAAA--TGGT-ACAATATGTGGTACGGTGGCTAGTA-ACATTTCATT-TTCATTG
gi|25 : TAAATAA-GA--AA----AGTTT-ATT-CCA--A-T-T--TT-G-GG-CC-CAAGAGG---GCAT---------AATAGAA------------GTATTATTTAAAAA--------------------CAT-----T-CA-T----GA----AGA---AA-G-A------
gi|26 : agtttaTAA-GT--TA----A-TTC-ATT-TTC--A-A-AAATT-GCGG-CC-C-AGAGGAATGCAT---------TACAGAG------------ATAT---------AAGGTTCAAATA---------CAG-AA--T-AA-T--A-AA----AGA---AT-G-A------TT-TC--C-A--AAA-GA--T---AGATAA-AGT--AG-A-Taatgtccaaaaagaaggaagaaattattttttacaatattataacatacatggatgtgg
gi|27 : agaTT-ATT-TCCA-A-T-T--TT-G-GC-CC-C-A-AGG---GCAA---------TA-AAAGAATACCAGGTTCACAT---------A--------------------CATAAA--T-CA-T--A-AA----AGAGCTAA-C-A------TT-AT--CTA--AAT-GA--T---AGATAC-TATA-AA-A-TAACA-AGGT---TA-T-ggaatgtgatttggtcaatca
gi|28 : aagtagtattaaagtaAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA-------------------------A-G-A------CC-AT--CCA--AAT-GA--TTATAGATAA-AGT--AAGA-TTACA-AAGT---TA-T-GA---TTA-AATC---AA---A--T-TT-CC-TCA---------------ATTTGT----------GAG--CAGCT------ATA-c
gi|29 : TTTCAGACATTTCATTATTTTATCCCAC-CCAA--ACATGCTTGATTTATTATTTTTTAGCT-TTGTCACGGCAGAGATTATTTCCTTTTCTATATTT--------CCTAAC-Ggttgtgtgttaaattgg
gi|3 : cacaggTAAGTAA-GTAATATCTTA-TTT-ATT-TCC--AAT-T--TT-G-GG-CC-C-AG-GG---GCAT----------ACAA-G------------ATAT---------AAC------------------CAT-AAACT-CAAC--A-GA----AGA---AGTGCA------TC--T--C-A--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AACA-TAACATAAGT---TA-T-GGGACT-C-ACTCACAAA---A--T-TT----TCATGACACAGTACACTGATT-GTTACCTGATACGAG--CAGCT------GCA-TACACTCACTGT-A-------G-TTGGCAA-AATTTTTTCAA--TTAAA-CACACGTTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAACATCCACGATTTTCT-C-CT-AT-TA-AA---CAGGTGATAT-A-TACCTCCGATAAAAGTATTT----A-TAC--AAGTATAT-CA-TCATACAAGGA------TT--CTATTGTGTAA-TGTG-T-TTATAAAATTAT--CTTAAATG-T---TGGTA-TGC--TGT-A---CCGGCATCAATTCATGGCTAC-A-AACAAAT-GGAAC-TTGGAAACA-T-TCT--CCCAAA--CAG-CG-T-CAGTA--CTTAACCG-ATA-CTCGACACT
gi|3 : acccacgggtaATTCCAAAAACTTACTAAATGAAA-CAATTGCCAAGAC-TTGAGGATTCACGAATT-AC-TCGAAAATATTTTTC-CTCTACAGAATCTTG-TTTTGAA-A------TGAATGA--ATA-TGT-TC-GCAGTT-TTGCCACCA----CATTGGGGG-TTAATG-GTC-GCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACAAATGCCGCACC---T--GCGAATAATTA------TTAATCGCTC-ATAGCG-TGGACTTTAA-TTAAAAGATAAACAAGTTTTT--GAC-AC--A----ATTATTCCATT-GTTCAAT--C--ATGACTAATTAGAACAT-TGTA-----ATA-TC-CTAA-CTT-ATTTAACAAAAATATAT-AATG-----AATG---GCGGTAACTGTAGT-ATCTTT-CCACAAAATAACTAAT-TTGTTG-TTCACTATA-TCCTA-TACACT-CAA-TTGATTT--TCAGT-ATACAGCAGTT-C-TCTTGAAA-TAATCGAAT-CTACAAAGGGG---A----------ATCTA-AAATTCTCTTC-CGAAAA--TATTGTACGAACATAAGATC-TTTTTAT-AA---CAT--CAAAATTTACATAGTGGAATTCGACCA-AGTTTTT-CACGCTACAATAAATCTGAAGACCCTTTTGGAGGTATCCTTTTTATGTAC----------AAGTAACCTACA---AATAT-TATTTCAAGAGACTTTATGTTTTG-CA-TTTGGTTTAATCTTACAATAGCAGTA-CAT-TTTATTAA-AG-AAGACC-TTTT-CTA-TACACAATAAaccaatggtttaaacattcttttaaatctattttatctatctcaataatgtttccttgctgtaggacgcccggacgcagggaatttcaataaatgcctataagaaatgaaggctcttggatgatgagagagaactgattcatatttaccccacaacgattatttgtattccaaaaacttactaaatgaaacaattgccaagacttgaggattcacgaattactcgaaaatatttttcctctacagaatcttgttttgaaatgaatgaatatgttcgcagttttgccaccacattgggggttaatggtcgcaatgtctgaaagtgtactacaaatgccgcacctgcgaataattattaatcgctcatagcgtggactttaattaaaagataaacaagtttttgacacaattattccattgttcaatcatgactaattagaacattgtaatatcctaacttatttaacaaaaatatataatgaatggcggtaactgtagtatctttccacaaaataactaatttgttgttcactatatcctatacactcaattgattttcagtatacagcagttctcttgaaataatcgaatctacaaaggggaatctaaaattctcttccgaaaatattgtacgaacataagatctttttataacatcaaaatttacatagtggaattcgaccaagtttttcacgctacaataaatctgaagacccttttggaggtatcctttttatgtacaagtaacctacaaatattatttcaagagactttatgttttgcatttggtttaatcttacaatagcagtacattttattaaagaagaccttttctatacacaataaatggacaggggcccaaacgttgtatat
gi|30 : acccacgggtataagtaagtaatatcttatttatttccaattttgggcccaggggcatacaagatataaccataaactcaacagaagaagtgcatctcaaatgatagataaagtaacataacataagttatgggactcactcacaaaattttcatgacacagtacactgattgttacctgatacgagcagctgcatacactcactgtagttggcaaaattttttcaattaaacacacgttcacattcattactcataagccaaacatccacgattttctcctattaaacaggtgatatatacctccgataaaagtatttatacaagtatatcatcatacaaggattctattgtgtaatgtgtttataaaattatcttaaatgttggtatgctgtaccggcatcaattcatggctacaaacaaatggaacttggaaacattctcccaaacagcgtcagtacttaaccgatactcgacactaccaatggtttaaacattcttttaaatctattttatctatctcaataatgtttccttgctgtaggacgcccggacgcagggaatttcaataaatgcctataagaaatgaaggctcttggatgatgagagagaactgattcatatttaccccacaacgattatttgtTAAGTAA-GT---A----A-TTC-ATT-TTC--A-AAT--TT-G-GG-CC-C-AGAGA---GCATACAGAGAA-TACAGAGTTC---------ATAT---------A--------------------CATGAA--T-AA-T--A-AA----AGA---AT-G-A------TT-AT--C-C--AAA-GA--T---AGATAA-AGatggacaggggcccaaacgttgtatat
gi|31 : c-AA--T-CA-T--A-AA----AGA---GA-G-A------TT-ATCCC-A--AA--GA--T---AGGTAA-CGTG-AA-A-TAAC-----T--------------------------------T-TT-C--TCA---------------GTA-AT----------GAA--CAGCT------ATA-T-------------------------GCGT-AA--TTTTCAA--T--GA-CA-
gi|32 : attagatgGTAAGTAA-TT--TT----T-TTT--TT-TCA--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGGGG---GAATACAAAGAA-TACAGAGTTT---------ATCT---------A--------------------CATAAA--T-CA-T--A-GA----AGA---GA-G-A------TT-AT--C-C--AAttgt
gi|33 : aACTTGTA---TCTGTATTTATTGTTCCC-C--AAAT----------------G-CAGTA-CTTACCG-GT-------TG-A----CCTG-TATGATCATA----C-AA---GT-GTATC--A--GGTA-TGCA---TT
gi|34 : TCAGTATGCTATTAC---TCCTTT-GGATA-AGCAA-GAAGTT-ATAGTT----CTTCT------GTAATGTGATGGGTCAGA-AGGACTATCATT
gi|36 : -TTT-ATT-CCA--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---ACA----------TATAAAA------------GTA
gi|37 : acacgT------ATA-T--TTAA-CTT-ATT---CAAA---ATAT-AATG-----AATCAATGC--------TACT-A---CT-CC----AACTACT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACatgatagttttataaagttgaaaacatatct
gi|39 : TTTTT-CCCTTGAAAAGCTTC-TTTTG-A-ATAGGCCT-AATCC--ATA-TGT-TC-GTAA-C-TTG---CC
gi|4 : taGTAAGTAA-GT---A----A-TTT-ATT-TCC--AAT-T--TT-G-GG-TC-C-AGAGG---GCATACAAAGAA-TACAGAGTTC---------ATGT---------A--------------------CAT-AAG-T-CA-T--A-AA----A-A---GA-G-A------TT-AT--CCA--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-AATAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---CT-T-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------------------------------------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T--AA-C--ACTGTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----TTTTTTTC-T-CT-AT-TG-CA---TGGGT--T-T-A-T----------AAAGTTCTT----A-TAC-AAAGTGT-T-CA-T-------GGA------TT--CTA-TG---AA-TG-G-T-T----------TTCTTTAG-TG-T---TGGTA-TGC--TGT-A---CAG---TAAA---ATA----T---A--AAAT-GGAAT-T------CA-T-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-GCAG-ACA-CT--ACATTTT-------T-TTG---TGTG----TGTGT--A--AC-GCCC-AGTTTCCATAGCC-AA-AGA-ATGAGAACTG---------------------AAA-CATTA--CAAGA-CTTGAGGATT-ACGAA-TTAC-TGAAAAATA-CTTTT-CTCTTCAGAATCTTG-TTTTG-A-A------T-AATGC--ATA-TGT-TC-GC-AGT-TTG---CCA----CATT----G-TT--TG-TCT-GCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---C--ATGAATATT--------TAAATCGCTC-AT---G-T-AACTT--A-TTA----GT-AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------AGT-TTT--AT--C--ATG--TA--TAAAACAC-TGT------ATA-T--TTAA-CTT-ATT---CAAA---ATAT-AATG-----AAT----GC--------TACT-A---ATCC-----AAATGCT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACA-TTG-TTT--TCA-T-ATACAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-AATT-CTAC--AGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TT-CGTAAA--TAAT-TA-AAAC---AG--C-TCTTTAT-AA---CAT--CAAAA--TACATA--GGGAATCGACCA-AG---TT-CAC-CTACAATAGCT-TGA------ATT--GAGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---TATATAT--TTCAAGAATTTT-ATG---TG-CATTTT-------TTTT------GCAGTA-CAT-TTTATTAA-AGAA----G-TTTT-CTA-T--ACAATAATCAGGGCGTTT-GACG-AAACTTGTA---TCTGTATTTATTGTT-CC-CCCAAATTCCACATGCATA-AG-G-CAGTA-CT----G-GT-------TT-A----ACTG-TATGGTCATA----C-AA---GT-GTATC--AG-GATA-TGTA---TTTTAGGTT-T--AATATTT-CCAAAAC-----ACTT--GGCTAGTT-TAAAATAAG-CATTTAAGGCT-TTTTTGTA-AAGA-TCAAA--TG-AC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATG--AGATAAAAA-CAATC-CCCAGATATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATC--TGATTTGTTA-TAGAAATTTTTT-------TT-ATC--TG-ATTTTTTACCGTTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAA--TTT--TTGTCTTTTTGAGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-----A-CAATctt
gi|40 : AGCT------ATA-TAT-------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAG--T--AA-C--GCTGTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CC
gi|41 : TCACCTAATTTTGC-TGGA-------TCATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAGAA----TGGT---AGATT---AT
gi|42 : aT-TCC--AAT-T--TT-G-GGTCC-C-AGAGG---GCAT---------
gi|43 : -AT---G-T-AACTT--A-TTA----GT-AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------AAT-Taatatactcaa
gi|44 : ATAATCAGGGCGTTT-GACG-GAACTTGTA---TC
gi|5 : GGTAAGTAA--T--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TTCG-GG-CC----GAGG----CATA--------CACAAAG------------A-AT---------AAGAGTTGAGAAGTTCAATTTCAT-AAA-T-CA-T--AAGA----AGAG--AA-G-A------TT-AT--C-A--AATTGA------AGATAA-A-T--AA-A-TA-CA-AGGTCTATA-T-GAA--T-A-AATC---AA---C--T-CT-CCTTCATCC------------ATA-GT----------GAG--CAGCT------ATACTA--------GT-ATCAGTAAG-TTGGCAA-AA--TTTTAAA--T--AA-CA--CTGTCG-CAT-C-C-AT-----TGCT-C--AATATTT--AA--AGCCCAATTA-----AATTTTTCAT-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-CTAA-------AAAGTTCTT----A-TAC-A--GTGT-T-CA-T-------GGAT-----TT--G-A-TG---AA--G-G-T-T----------T---TTAG-TGTT---C--TAT-GC--TAT-AA--CAG---TCAA---ATA----TTA-A--CAATTAGAATGT------CAAT-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-ACAA-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCAT-TTAACT--TGTCTTTG-GT--A--ACAGCCC-AGTTTC-GTAGCC-AA-AGA-ATGACAACTGA-TCTG-AAATTTG-----TAAAA-CATTG--CCA-ACGTAGAGGTTT-ACGAA--TAC-GTGAAAATAATCTTT-CTCTACATAAACTTGATTTTG-A-ATAGCC-T-AATGC--ATA-TGTGTCGGC--GT-TTG-----A----AATT----GCTT--TGTTCT-GCA-A-TGGCGGA----TGTCCT-----A-A----------C---C--ATGAATAATT-------TAA--CATTCTATG--G-T-AACTTC-ATTTA----GT-AACAA----TT---ATAAC--ATTACAT------ACTGTTT--AT--CTAATG--TA--TAGCACATATGT------ATA-TACTTAA-CTT-ATT---CAAA---ATA--AATGAAATCAAT----TC--------TACT-A---TC-C-----CACTACT--TGTTGTTGAT------TATTC--ACTACAATGAGA-TTG-TTT--TCA-CAATACAGCA--T-TATCTC--AATTACT-GAAT-TCTC--AGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TTGTGTAAAATTATT-TA-AAACT--AG--C-TTTTAATAAA---CAT---AAAA--TA
gi|6 : aCATA-AA-GGCAGTA-CT----G-GTCCGTTCGTT-ACATTACTGATATGATCATAACACCAAG---TT-GTATCTCAGCGGTG-TGTACTTTTTTCG--C-T--AATA-TTTCCAAAAC------CTT--GACTAGCTCTAAAATAAG-CCTTTAAGGCTCTTTT-GTA-AAGAATCAAA-TTGGAC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATGCAGG-TAAAAAACAATT-CC-AGAGATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTCAGATGATT--TGATTT-TTAATAGAAAAACTTT-------TTTATC--TG-AT---------TTTT-CTTACCGTTTTTTTACAG---------------AATATATGACAATGTTT--TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGAATAGGCAATATTT-ACTGAACATCAGCATTCAAGCTTTTTTAATACATACCCGCTG---AGCCCCT-CCCTCGGTTTTCAGAA-TTAACACTGAAAAATCATCAGCATACCACGACTA-AACACATTTAAGCGAT-GTGTCACCTAATTTTGCGCGGGATAATATTTATCATTATATCAGTC-GGACAATAG-ATATCTGGTTCAGGATCCATGTCGAGTTTAT---TATTTTAACAAAGGTTT-GACTTACGGTACTTCTGTTACTCCTCCCGGGC-TGTTTAG-ACGACTCCACTCCACCGTTAAGGCCTTTCCACATGAAATTCG-AAGTTT-ATATCTGTTGTTCGGAGTTTGTGGTACAGTTATTAATTATG-TTTGGCCA-GTACATACTCTTGACATGACTTTATAGAgt
gi|7 : TTTTT-CCCTTGAAAAGCTTC-TTTTG-A-A------T-AATCC--GTA-TGT-TC-GTAA-C-TTG---TCCTTTTCATT------TT--TA-----GCACA-T-TCTGACAAAT-TACTTTGCCATA----------CA--T--GTACATATTAA------TAAATCTTTT--T---C-T-AAGTTC-A-TTA-------AACAC----TTTTGAT-T--------GT------AGA-TCTGAAA--C--TTG--AA--AAAGATGT-TATCGCAGGATA-TG-CCAA-GTTGATT---CAGT---AAAA-AATA-----AAC----AC--------TGCTCA---AC-C-----AACAATT--C-TTTTTG-T------TA-TC--A-TTCAAA-A------------TCA-T-AT--------T-T-TCTT--GA--AGT-GCACACT-C-AAGCAA---AGTATCATTTGATTTATGAATGT---GT-TGTAAA--TATT-TA-A--C---AG--T-ATTGGAT-AA---GGTTTCAATA--TATA-A-TGGATGCCTACCT-AA---TT-CCC-CCATAACTGCA-TAG------TTT--GAAG---CTTTCTTATGTACCCCCCGGTGTA------CCCCA---CATATGTA-CTTGAGAGTTTTAATG---TG-AA-GTT-------TATC------ACTATA-TATATTTTTCAT-TG-A----G-TTTT-CAA-T--ATTATAATTTGGTCTCTT-AAC---AA-TAGCAGATTCTGAATTTATAATT--C-CCCAAATTTCACTTCCATATAACA-CAATA-------G-GT-------TT-T----ATTG-TGTGATCAtgtaattcatcggccattcatcgtttcacttctagtcgaagttgtgtcgcaagccttgtg
gi|8 : aggta-TGA-TAGTAGCGTTCAAGCTTTTTT--------------G---AAGTCTT-CCTTCAGTTT-CAGAAATTAACACT---AAGTCATCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAA-GAT-GTGTCACCTAATTTTGC-TGGA-------TCATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TC--------TC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AAAGATTTGGACTTA-GGT-------C-G--TCTCC----C-TGTCTAACAC---------CCACC-TTAGG-----TTCAAAT--------------T-AT--------TTTGAAGTTT----TACAG--AC--AGTATG-TTT-GCCATGTACATACTTTTGA--TGACTTTATAGAAAGGCCCCTT-ATGTCAAGC-TG-ATGCAGCC-TGTGTAG-AAGATCTG-AATGTAAAACAGTGTCAAAAGCCTTAGAAAAATCAACA-AAGCAAACGTATAATT--TGGAA-TT-ATCATTTGTATA-TTTTTGAATAACGGTTCT-AAGTATAAAAATGTGGTCACTAGTTCTGGCTTTTGGTTGAAAACCAATTTGAACTTTATTTATAATGTTGTTCGAGTCCAAGTAGTTTTGTAACCTGGTATTCAGTATGCTATTAAATATACTTTGGGATA-aaaagatgcaacaaaatgccggcatt
gi|9 : caaaattaggAAGTAA-AT--T--------TT-ATA-TCA--A-T-A--TT-T-GG-CC-C-AG------GCAT---------AACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--A-CA-ACAA-GA----AGA---AA---A------CC-ATT-C-ACCAAT-GA--T---AGATAA-CGT--AA-C-TAACA-AAGT---TAAT-GA---T-A-AATC---AA---AATT-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAGAGCAGCT-------TA-TATTAAT---GT-A-------G-TTGGACA-AA--TT---AG--T--AA-TC-GCTGTCA-CATGT-C-ATCTTTATACTGC--A-----T--AAAAG--C-AATTA-----AATTATTC-T-CT-AT-TAACATACCAAGT--T-T-A-T----------AA-GTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----T---CTA-TG---AAATG-G-T-T----------T--TCTTGATGTT----AGTAT-GCCATGT-AACACAA---TCAATG-ATG------A-A--AAAT-GGAAT-TAA----CA-TGCTTATC---AAAGCAC-AG-TACAG-A--CTT-GCAG-ACA-CTTAACATTTTC-TCACAT-TTA-CATGTGTTTTTGTGT--A--AC-GCC--A---TCAA-AGCC-AA-AGA-ATGAGAACTGGTTCTGAAATATGG-----TAAAA-CATTT--CAAGA-CTTGAGGATT-ATGAAt
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): TTCCAATTGGGTCGCTGTGCCCCAGAGCGCGCAAGAACTAATAGGAGAGACCGTACTTAACAGTTGAGAAAGAATGTCCCAAAAAAAAGAAGTGCGGAAAAGTGACTAAGATTTCAAGTACAGAGTGCGTAATCACAAACTCTAACAT
Unaligned ( gi|35 ): AAGGGTATTCAGAACAAGAATGACATGGGAACATAAAGAAATAAAGTAAAATAAACAGGGAAAAACATCCAGATG
Unaligned ( gi|38 ): AATAAATTTGGAAATAAAATATCAATTTTGAAATAAAGAAAATAAATTTGAAATATTCATTATGATA
Alignments
lowQualScore : 1111111111 1 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 1111 1 111 222222 222222222222222 1111111111 444444444444444444444444444444444 222 11111 11111 111 2222222222 1111 1111111 2222222222 2222222222222 111111 22 11 111 111 22222222 222222 111111 11 1 11 11111 11 11111 111 22 1 1 11 33333333 111 111 11111 222222 11111 11111 33333333333333333 333333333 22222 11 1111 1111 11 111111111111111111 11 1 222222 11 111 111 11 11111 22222222222222 222222222222 111111 11 11 33333333333333 111 11 111 111 11 111 111111 111 55555555555555555 111 22 111 1 2222222 111111 11 222222 111 1 111 1111111 222222222222222 1 22222222222 111 11 11 222222 11 111 1111 111 11 1 111 1 2222222222 222222222 5555555555555555555555555555555555 11 11 111 11 111 111 111 2222 1 11 2 1 11 2222222 11 1111 111 111 11 111 1 1 4444444444444 2222 1 1 666666666 1 22222 11 1 33333333 2222 222222 1 1 11 1 1 1 1 1 1 1 1 11 22 1 1 111 1 1 1 333 3333333 1 22222 1 1 1 1 1 1 2222 1 222 1 1 1 1 1 1 111 1 11 22222222 1 1 222 11 11111 1 111 11 1 1 7777777777777 1 1 666666666666 1 11 1
lowQualScore : 3 0000000000 2 2 555 0 2 22 2 2 4 2 2 333 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 8 3333 7777 33 4444 555 222 555555 2 77 4 55 44 33 666 2 77 888 2 444 5 2 000 2 2 444 000000 5 5 66 111111111111111 2 1111111111 77 000000000000000000000000000000000 2 33 55 33 2 222 2 5 2 2 44444 8 33 77777 33 88 44 11111 1 3 3 3 3 6 111 44 3 3 3 0000000000 1111 3 3 0 0 3 3 3 0000000 5555555555 6 555 6 3 6 3 3333333333333 0 444444 44 00 3 666 9999 666 00000000 55 4 8 222222 4 8 888888 11 4 4 2 8 55 4 4 8 66 5 0 5 77777 1 99999 6 55 4 1 5 5 5 5 11 77 22 22222 5 222 00 5 5 888 1 5 0 3 00 5 5 22222222 66 5 5 5 333 5 333 22222 000000 77 11111 5 5 5 44444 33333333333333333 444444444 0 5 00000 5 66 5 0000 5 0000 33 888888888888888888 1 5 88 99 99 99 99 3 222222 5 99 5 5 000 555 44 44444 44444444444444 5 777777777777 77 5 5 666666 5 55 5 5 4 6 6 99 666 7 99 666 99 99 6 6 3 44 11111111111111 6 111 6 55 6 6 888 99 6 6 111 99 99 11 88 6 111 6 6 6 999999 99 111 22222222222222222 1 111 4 22 0 7 111 6 3 1111111 1 999999 3 11 9 6 6 111111 6 9999 1 6 888 000 5 6 6 6666666 5 111 6666666 5 000000000000000 1 44444444444 6 99 77 6 111 1 5 8 11 88 8 000000 11 8 8 666 0 8 8 8 88 8 7777 8 444 8 11 6 0 999 0 8 3 99 99 6 111 3 2 99 6 6 2222222222 99 6 666666666 0000000000000000000000000000000000 55 44 99 99 6 111 6 66 444 444 8 8 0 444 44 3 3 1111 0 33 0 0 0 0 44 6666666 11 8 8 8 8 7777 444 444 33 777 0 55 0 2222222222222 1111 0 0 555555555 0 6 55555 11 0 9 0 66666666 1111 555555 0 0 3 3 99 6 2 7 3 3 3 3 3 2 0 7 3 7 0 88 7 6 00 3 3 6 7 6 0 777 0 0 7 7 3 444 5555555 1 6 1 0 11111 2 2 6 7 3 3 3 3 8888 3 222 7 3 3 7 2 0 6 0 0 3 777 3 7 7 44 0 1 1 55555555 0 3 555 44 99999 0 22 222 44 3 3 3333333333333 7 7 3 7 3 888888888888 3 00 6 3
lowQualScore : . .......... . . ... . . .. . . . . . ... .............................................................. . .... .... .. .... ... ... ...... . .. . .. .. .. ... . .. ... . ... . . ... . . ... ...... . . .. ............... . .......... .. ................................. . .. .. .. . ... . . . . ..... . .. ..... .. .. .. ..... . . . . . . ... .. . . . .......... .... . . . . . . . ....... .......... . ... . . . . ............. . ...... .. .. . ... .... ... ........ .. . . ...... . . ...... .. . . . . .. . . . .. . . . ..... . ..... . .. . . . . . . .. .. .. ..... . ... .. . . ... . . . . .. . . ........ .. . . . ... . ... ..... ...... .. ..... . . . ..... ................. ......... . . ..... . .. . .... . .... .. .................. . . .. .. .. .. .. . ...... . .. . . ... ... .. ..... .............. . ............ .. . . ...... . .. . . . . . .. ... . .. ... .. .. . . . .. .............. . ... . .. . . ... .. . . ... .. .. .. .. . ... . . . ...... .. ... ................. . ... . .. . . ... . . ....... . ...... . .. . . . ...... . .... . . ... ... . . . ....... . ... ....... . ............... . ........... . .. .. . ... . . . .. .. . ...... .. . . ... . . . . .. . .... . ... . .. . . ... . . . .. .. . ... . . .. . . .......... .. . ......... .................................. .. .. .. .. . ... . .. ... ... . . . ... .. . . .... . .. . . . . .. ....... .. . . . . .... ... ... .. ... . .. . ............. .... . . ......... . . ..... .. . . . ........ .... ...... . . . . .. . . . . . . . . . . . . . . .. . . .. . . . . . . ... . . . . . ... ....... . . . . ..... . . . . . . . . .... . ... . . . . . . . . . . ... . . . .. . . . ........ . . ... .. ..... . .. ... .. . . ............. . . . . . ............ . .. . .
lowQualScore : 1 8888888888 2 1 555 5 0 88 0 0 0 0 0 555 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0 5555 2222 11 2222 555 888 888888 1 11 7 88 44 11 999 2 99 555 4 444 0 5 000 7 7 777 999999 3 3 33 333333333333333 7 7777777777 33 444444444444444444444444444444444 5 44 99 44 5 333 7 3 9 9 33333 6 99 11111 99 55 22 77777 4 3 3 3 3 7 777 66 3 3 3 4444444444 7777 3 3 5 1 3 3 3 8888888 1111111111 7 888 7 3 7 3 9999999999999 4 888888 33 00 6 444 0000 444 55555555 00 0 0 555555 0 0 000000 00 0 0 0 0 55 0 0 0 55 0 5 0 44444 4 33333 7 77 3 4 0 7 7 7 00 66 99 55555 0 111 66 0 5 222 7 0 8 2 66 0 0 88888888 99 0 0 0 999 0 888 99999 777777 99 44444 7 7 7 33333 11111111111111111 999999999 4 0 11111 0 99 0 6666 0 6666 66 333333333333333333 0 7 33 22 22 22 22 3 111111 7 33 7 7 000 777 44 33333 44444444444444 7 777777777777 99 7 7 444444 7 77 7 7 3 7 7 22 888 3 22 888 22 88 7 7 5 00 88888888888888 7 777 7 88 7 7 333 22 7 7 777 22 22 66 66 7 777 7 7 7 222222 22 777 88888888888888888 0 777 2 22 7 8 777 7 3 7777777 0 222222 5 88 8 7 7 888888 7 3333 0 7 777 000 0 7 7 2222222 7 777 4444444 7 333333333333333 4 00000000000 7 22 77 7 777 0 0 0 00 66 0 888888 00 0 0 222 8 0 0 8 88 0 0000 0 000 0 00 0 8 444 8 0 2 22 22 7 777 3 5 22 7 7 5555555555 22 7 777777777 0000000000000000000000000000000000 88 00 22 22 7 555 7 22 000 000 0 0 8 000 00 2 2 2222 0 22 0 0 8 8 44 0000000 00 0 0 0 0 0000 000 000 88 555 0 00 0 2222222222222 2222 0 0 222222222 8 5 00000 88 2 2 0 22222222 2222 555555 0 0 2 2 88 5 0 3 3 3 3 3 3 0 7 3 3 3 7 33 3 7 77 3 3 7 3 7 7 000 0 0 3 3 3 000 3333333 0 7 0 0 33333 0 0 7 3 3 3 3 3 3333 3 777 3 3 3 3 0 7 7 0 0 3 777 3 3 3 00 7 0 2 88888888 0 3 000 77 33333 7 00 000 77 3 3 3333333333333 3 3 3 3 3 333333333333 3 33 7 3
consensus : GGTAAGTAA-GT--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT---------TACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--T-CA-T--A-GA----AGA---AA-G-A------TC-AT--C-A--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-A-TAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TA--------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T--AA-CA-ACTGTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----AATTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-T----------AAAGTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----TT--CTA-TG---AA-TG-G-T-T----------T--CTTAGATGTT---TGGTATTGC--TGT-A---CAG---TCAA---ATG----T-A-A--AAAT-GGAAT-T------CA-T-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-GCAG-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCAT-TTAACTTGTGTTTTTGTGT--A--AC-GCCC-AGTTTCAATAGCC-AA-AGA-ATGAGAACTGATTCTGAAAATTTG-----TAAAA-CATTT--CAAGACCTTGAGGATT-ACGAATTTAC-TGGAAAATATTTTTT-CTCTACAGAATCTTG-TTTTG-A-A------T-AATGC--ATA-TGT-TC-GCAAGT-TTG---CCA----CATT----G-TT--TG-TCC-GCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---C--GTGAATATTTA------TAAATCGCTC-AT---G-T-AACTT--A-TTA----GT-AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------ANT-TTT--AT--C--ATG--TA--TAGAACAT-TGT------ATA-T--CTAA-CTT-ATT---CAAA---ATAT-AATG-----AAT----GC--------TACT-A---NT-C-----AACTACT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACA-TTG-TTT--TCA-T-ATACAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-GAAT-CTAC-AAGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TT-CGTAAA--TATT-TA-AAAC---AG--C-TTTTTAT-AA---CAT--CAAAA--TACATA-TGGGAATCGACCA-AG---TT-CAC-CTACAATAGCT-TGA------TTT--GAGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---AATATATA-TTCGAGAGTTTTAATG---TG-CA-TTT-------TNTC------GCAGTA-CATATTTATTAA-AG-A----N-TTTT-CTA-T--ACAATAATCNGGGCGTTT-GACG-GAACTTGTA---TCTGTATTTATTGTTCCC-CCCAAATTTCACATGCATA-AA-G-CAGTA-CT----G-GT-------TT-A----ACTG-TATGATCATA----CAAA---GT-GTATC--AG-GGTG-TGTA---TTTTNGGTT-T--AATA-TT-CCAAAAC-----ACTT--GACTAGTT-TAAAATAAG-CCTTTAAGGCTCTTTTTGTA-AAGA-TCNAA-TTG-AC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATG--AG-TAAAAA-CAATT-CCCAGATATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATT--TGATTT-TTA-TAGAAAAACTTT-------TT-ATC--TG-AT---------TTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAAT-TTT--TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-A-TGA-CAATAGCATTCAAGCTTTTTTAATACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCGGTTT-CAGAAATTAACACT---AAATCATCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAG-GAT-GTGTCACCTAATTTTGC-CGGA-------TTATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AAAGGTTTGGACTTA-GGT-------TTA--CCTCC----C-TGTCTAA-ACG--------CCACCNTTAGG-----TTCAAATGAAACTCGTAAGTTT-AT--------TTTGGAGTTT----TACAG--AT--ATTATG-TTT-GCCATGTACATACTCTTGA-ATGACTTTATAGAAAGGCCCCTTTATGTCAAGT-TG-GTGCAGCC-TGTGTAG-AAGAGCTG-AATGTGAAACGGTATCAAAGGCCTTAGAAAAATCAACA-AAGCAAACGTACAATT--TGGAACTT-AATATTTGTATA-TTTTTGAATAAGGGTTCT-AAGTATAAACATGTGGTCACTGGTTCTGGCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTTATAATATTGTTAGAGTCCAAGTAGTTTCGTAACCTTGTATTCAGTATGCTATTAA--ATACTTT-GGATA-AGCAAAGAAGTT-ATTGTT-A-TCCTCTA---TAGTANTTTGATGGGTCANA-AGGGCTATCATTTTTATGAAT-AGGCTTTAATAAAGCCTATTTCCCACTCCCTTTGGGTATT-TGCCAG-AG-GACAA-GACAAG----AT-TAAATAATTT-T-AGCATATGTGGT-AAAATATAT-GTACGTCGGCTTTCA-ACATCTCATT-TTTAATGCCAT-CTAATCGCA-GCTTGATTTATTATTTTTTAGATGTTTTTATTGCATCGATGATTTTCTTTTCTNTAATTG-A-TAAATCTAAC-GAAGT-AATG--TTGATATTTCTGCTGACTTGGACAANNAATCTTCAAAATATTTAATTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAGATATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGA------------CTTTC-AAACCGAGTTTCCAG-TATGATA
Reference ( family-3541 ) : GGTAAGTAA-GT--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT---------TACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--T-CA-T--A-GA----AGA---AA-G-A------TC-AT--C-A--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-A-TAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TA--------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T--AA-CA-ACTGTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----AATTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-T----------AAAGTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----TT--CTA-TG---AA-TG-G-T-T----------T--CTTAGATGTT---TGGTATTGC--TGT-A---CAG---TCAA---ATG----T-A-A--AAAT-GGAAT-T------CA-T-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-GCAG-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCAT-TTAACTTGTGTTTTTGTGT--A--AC-GCCC-AGTTTCAATAGCC-AA-AGA-ATGAGAACTGATTCTGAAAATTTG-----TAAAA-CATTT--CAAGACCTTGAGGATT-ACGAATTTAC-TGGAAAATATTTTTT-CTCTACAGAATCTTG-TTTTG-A-A------T-AATGC--ATA-TGT-TC-GCAAGT-TTG---CCA----CATT----G-TT--TG-TCC-GCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---C--GTGAATATTTA------TAAATCGCTC-AT---G-T-AACTT--A-TTA----GT-AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------ANT-TTT--AT--C--ATG--TA--TAGAACAT-TGT------ATA-T--CTAA-CTT-ATT---CAAA---ATAT-AATG-----AAT----GC--------TACT-A---NT-C-----AACTACT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACA-TTG-TTT--TCA-T-ATACAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-GAAT-CTAC-AAGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TT-CGTAAA--TATT-TA-AAAC---AG--C-TTTTTAT-AA---CAT--CAAAA--TACATA-TGGGAATCGACCA-AG---TT-CAC-CTACAATAGCT-TGA------TTT--GAGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---AATATATA-TTCGAGAGTTTTAATG---TG-CA-TTT-------TNTC------GCAGTA-CATATTTATTAA-AG-A----N-TTTT-CTA-T--ACAATAATCNGGGCGTTT-GACG-GAACTTGTA---TCTGTATTTATTGTTCCC-CCCAAATTTCACATGCATA-AA-G-CAGTA-CT----G-GT-------TT-A----ACTG-TATGATCATA----CAAA---GT-GTATC--AG-GGTG-TGTA---TTTTNGGTT-T--AATA-TT-CCAAAAC-----ACTT--GACTAGTT-TAAAATAAG-CCTTTAAGGCTCTTTTTGTA-AAGA-TCNAA-TTG-AC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATG--AG-TAAAAA-CAATT-CCCAGATATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATT--TGATTT-TTA-TAGAAAAACTTT-------TT-ATC--TG-AT---------TTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAAT-TTT--TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-A-TGA-CAATAGCATTCAAGCTTTTTTAATACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCGGTTT-CAGAAATTAACACT---AAATCATCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAG-GAT-GTGTCACCTAATTTTGC-CGGA-------TTATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AAAGGTTTGGACTTA-GGT-------TTA--CCTCC----C-TGTCTAA-ACG--------CCACCNTTAGG-----TTCAAATGAAACTCGTAAGTTT-AT--------TTTGGAGTTT----TACAG--AT--ATTATG-TTT-GCCATGTACATACTCTTGA-ATGACTTTATAGAAAGGCCCCTTTATGTCAAGT-TG-GTGCAGCC-TGTGTAG-AAGAGCTG-AATGTGAAACGGTATCAAAGGCCTTAGAAAAATCAACA-AAGCAAACGTACAATT--TGGAACTT-AATATTTGTATA-TTTTTGAATAAGGGTTCT-AAGTATAAACATGTGGTCACTGGTTCTGGCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTTATAATATTGTTAGAGTCCAAGTAGTTTCGTAACCTTGTATTCAGTATGCTATTAA--ATACTTT-GGATA-AGCAAAGAAGTT-ATTGTT-A-TCCTCTA---TAGTANTTTGATGGGTCANA-AGGGCTATCATTTTTATGAAT-AGGCTTTAATAAAGCCTATTTCCCACTCCCTTTGGGTATT-TGCCAG-AG-GACAA-GACAAG----AT-TAAATAATTT-T-AGCATATGTGGT-AAAATATAT-GTACGTCGGCTTTCA-ACATCTCATT-TTTAATGCCAT-CTAATCGCA-GCTTGATTTATTATTTTTTAGATGTTTTTATTGCATCGATGATTTTCTTTTCTNTAATTG-A-TAAATCTAAC-GAAGT-AATG--TTGATATTTCTGCTGACTTGGACAANNAATCTTCAAAATATTTAATTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAGATATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGA------------CTTTC-AAACCGAGTTTCCAG-TATGATA
gi|1 : GTAAGTAAAGT--TA----A-TTTTATTCTCCGAA-T-T--TT-G-GG-CCAC-GAAGG---GCAT----------ACAA-G------------ATAT---------A--------------------AAA-AA----CA-C--A-GA----AGA---AA-G-T------GC-AT--CCA--AAT-GA--TGA-AGATAA-AGT--AA-A-TAACA-AAGT---TA-T-GAA--T-A-AATC---AA---T--T-TT-C--TCA---------------ATT-G-----------GAG--CAGCT------ATACTT--------GT-A-------GATTGGCAA-AT--TTCTCAACCT--AA-AC-ACTGTCA-CAT-T-CGAT-----TACT-CCAA-----T--AA--G--CCAAATA-----A-TTTTTC-T-CTGATCTA-CA----AGGT--T-T-AAT----------AAAGTTTTTTA--A-AAC-AAAGT---T-CAAT-------GGAT-----T---CTA-TG---AA-TG-G-T-T----------TGTCTTAAATGTG---TG-TAT-GC--TGT-A---CAA---TCAA---ATG----T-A-A--AA-T-GGAATGT------CA-T-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-GCAG-ACAGCT--ACATTTTC-TCTCAT-T--ACTTGTGTTTTTGTGTTAA--AC-GCCCGAGTTTCAATAGCC-AACAGA-ATGAGAACTAATTCT-AAAATTTG-----TAAAAACATTTT-CAAGAC-TTGAGGATT-AC-AATCT-----GAAAATATTTTT--CTCTACAGAATCTT--TTTTG-A-AC-----T-AATGGGAATAATGT-TC-GCA-GTGTTG---CCA----CATT----GGTT--TG-TCCTGCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---CCAGTGAA-ATT---------AAATCGCTC-AT---GCT-AACTT--T-ATA----GT-AACAA----TTT-GATTACGGA----AT------ATT-TTT--ATATC--ATG--TA--TAGAACATCTGT------ATAGT--CTAAGCTT-ATT---CAAAC--ATA--AATG-----AGA----GC--------TACT-A---GTTC-----AACTACT--T-TGTTTG-T------TA-TCGAA-TACAAT-ACAGTTG-TTTCATTA-T-AT-CAGCA--TAT-TCTT--AA-GAAT-GAAT-CTAC-AGGGGGCGAA----------ATCTA-AAATTC---TT-CGAAAAA-TATT-TA-AAAC---AG--CGTTTTTAT-AAACACAT--CAAAA--TACATA---GGAATCGACCA-AG---TTTCAC-CTACAATAGCT-TGA------TTT--GAG----CCTTTTTAGGTAC----------AGA----CCA-A---AATATAT--TTCAAGAATTTTAATG---TGGCAATTT-------TTTC------GCAGTAACATGTTTATTAA-AG-A----CGTTTT-CTAGT--ACAATAATCAGGGCGTTTTGACG-GAACTTGTA---TCTGTATTTATTGTTCCC-C--AAATTTCACATGCATA-AAAG-CAGTAACT----GTGT-------TTTA----ACTG-TATGATCATA----CA-----GTCGTATC--AG-GGTG-TGTA---TTTTTGGTTAT--AAT--TT-CCAAAAC-----ACTTTTGACTAGTT-TAAAATAAGGCCTTTAAGGCT---TTTGTAGAAGA-TCCAAATTG-AC----AACATGTGTA---AGGAGGCCTGATG--AGGTAAAAA-CAATTGCCCAGATATT---G--TACGATGAACACT---TGTTCTGA--ATT--TGATTT-TTA-TAGAAAAACTTT-------TT-ATC--TG-AT---------TTTT-T-------------ACAACGTTTTTTCTACAGAAATATT-GACAAT-TTT--T-GTCTTTCTGAGGTTGACCAGGA-TAGGCAAAATTTGA-TGA-CAATAGCATTCAAGCCTTTTTAATACAC---CGCTGTGAAGGCCCTCCCCTCGGTTT--AGAAATTAACACT---AAATCATCAGCAT-C----AACATAACA---TTAAGAGATGGTGTCACCT-ATTTTGC-CGGA-------TTATCAT--TATC-GTCGAAAA-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAATATTATTTTAA-AAAGGTTTGGACTTA-GG--------TTA--CCTCC----C-TGTCTTA-ACAC-------CCACACTTA-G-----TTCAAATG-AACTCGTAAGTTTGAT--------TTTGGAGTTT----TAGAG---T--ATTATGTTTT-GCCATGTACATAC-CTTGA-TTGACTTTATA-AAAGG-CCCTTTATGTCAAGTCTGTGTGCAGCCTTGTGTAGAAAGAGCTGAAATGT--AACGGTATCAAAGGCCTTAG-AAAATCAACACAAGC-AACATACAATTGCTGGAACTT--ATATTTGTATATTTTTTGAATAAGGGTTCTAAAGTATAAACATGTGGTCACTGGTTCT-GCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTTAT-ATATTGTTAGAGT-CAAGTAGTTTCGTACCTTTGTATTCAGTATGCTATTAA--ATACTTT-GGAAATAGCAAAGAAGTTGATTGTTAA-TCCTCTA---TA--ATTTTGAT-GGTCATA-AGGGCTATCATTTTTATGAAT-AGGTTTTAATAAAGCCTATTT-CCATTCCCTTTGGG-ATTCTGCCAACAGAAACAACGACAAG----AT-TAAACAATTTATAAGCATATGTGGTAAAAATATAT-GTACATCGG-TTTCA-ACATCTCATT-TTTAATGCCAT-CTAATCGCA-GCTTGATTTATTATCTTTCAGATGTTTTTATTGCATCAATGATTTTCTTTTCTTTAATTG-A-TAAATCTAAC-GAAGT-AATG--TTGATATTTCTGCTGACTTGGACAATAAATCTTCAAAATATTTAATTCTGGGTATCAAATTTACTAATCAATACTGAATAATGTTTGTAAAATGATTTACACCCATTGTTCACTAGATATCTT-ATCGGACT-ATCTTGCGGATTGCTGATTGATTCAAATTCTTTC-AAA---AGTTT-CAG-TATG
gi|10 : aaAAGTAA-AT--T--------TT-ATA-TCA--A-T-A--TT-T-GG-CC-C-AG------GCAT---------AACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--A-CA-ACAA-GA----AGA---AA---A------CC-ATT-C-ACCAAT-GA--T---AGATAA-CGT--AA-C-TAACA-AAGT---TAAT-GA---T-A-AATC---AA---AATT-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAGAGCAGCT-------TA-TATTAAT---GT-A-------G-TTGGACA-AA--TT---AG--T--AA-TC-GCTGTCA-CATGT-C-ATCTTTATACTGC--A-----T--AAAAG--C-AATTA-----AATTATTC-T-CT-AT-TAACATACCAAGT--T-T-A-T----------AA-GTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----T---CTA-TG---AAATG-G-T-T----------T--TCTTGATGTT----AGTAT-GCCATGT-AACACAA---TCAATG-ATG------A-A--AAAT-GGAAT-TAA----CA-TGCTTATC---AAAGCAC-AG-TACAG-A--CTT-GCAG-ACA-CTTAACATTTTC-TCACAT-TTA-CATGTGTTTTTGTGT--A--AC-GCC--A---TCAA-AGCC-AA-AGA-ATGAGAACTGGTTCTGAAATATGG-----TAAAA-CATTT--CAAGA-CTTGAGGATT-ATGAAgcat
gi|11 : taagctaATAGAGCATAA---TT-CCC-CCATAACTGTT-TGG------TTT--GAGG---TCTTCTTGTGTAT----------T------CCATATAGAGTATGTA-CTTGAGGGGTTTAATG---TG-AA-GTT-------TATC------AC--TA-AATA-TGATTCATGG-A----C-TTTT-CAA-C--ATTATAATTTGGGCTCTT-TACATCAGCAGGT----TTTGAATTTGTAGTT--T-CCCAAATT--------ACA-AA-A-CA----------G-GT-------TT-T----ACAG-TGTGATAAAA----AAAAAAGAT-GCAAC--AA-AATACTGGA---ATTTGGCCT-TGCAAT--TT-CAAAAAC-----ATTT--AATTAATT-TAAAGAAAG-CATTCAAACCAC-GCTTATA-CAGG-TCTTG-TTG-ACAATTAACATATA-ATCCAAAGG-CAT--TG--AA-T-ATAC-CA----CGTAAATATTAATGAATAAAA-GA-CAATGAATGTTC-TAT--TTCCTTATCT-TTA-TAAACAAATTTTAAGTTTCTT-ACCTTTGCAT---------TCTTGT-------------AAAA---------------AAAAT--G----T-TGTCCTTGTCTTTTTCAAATTAAC--AGA-GAGACAATGTTT-A-Taa
gi|12 : gTAAGTAA-GT--TA----T-TTT-ATT-TCC--AAT-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT--------------AA------------ATAT---------A--------------------CAT-AAA-C-CA-C--A-GA----AGA---G--G-A------CC-AT--CCA--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-A-TAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TTTC--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TAT-------GT-A---------TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T--AA-CA--CTGTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----ATATTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-T----------AAAGTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGA------TT--CTA-TG----A-TG-GTT-T----------T--CTTAGATG-T---TGGTA-TGC--TGT-A---CAA---CCAA---ATG----T---A--AAAT-GGTAT-T------CA-T-CTT--C---AA--CACAAG-TCCAG-A--CTT-GCAG-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCAC-TT-ACTTGTGTTTTTGTcata
gi|13 : -T--TT-G-GA-CC-C-AGAGT---GCAT----------ACAAAG------------A-AT---------A--------------------CAT-AG--TTCA-T--A--A----ATA---CA-C-A------TC-AT--A-A--AA---A--T----GATAA-AGT--AATA-TAACC-AGGT---TA-T-GA---T-A-AATC---TATTTT--T-TT-T--TCA---------------ATA-GT----------GAG--CAGC----------------------T-A-------A-TT-------A--TTGTCAA--T--AA-C--ACTGTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----ACTTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---TATGT--T-T-A-T----------AAAGTAATT----A-TAC-AAGGTGT-T-TA-T-------GAA------CT--CTA-TG---AA-TG-G-TGC----------C--CTTAGGTG-T---TGGTA-TGC--TAT-A---CAG---TCAA---ATA----T-ACA--AAAT-GGAAA-T------CA-T-CCT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-ATGCGT-GCGC-ACGCCT--GCAT
gi|14 : g--TA----A-TTT--TT-TCC--A-A-T--TT-T-TG-CC-C-AGAGG---GCAT----------ACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AAA-C-CA-C--A-GA----AGA---AA-G-A------CC-AT--CCA--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-AATAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TTTC--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TAATTTAT--GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T--AA-CA--CTGTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----AATTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T---C----------AAAG-TTTT----A-TACAAAAGTAT-T-CA-T-------GGATCTATATT--CTA-TG---AA-TG-GTT-T----------T--CTTAGATG-T---TGGT
gi|15 : aaggtagTAAGTAA-GT---A----A-TTT-----TCA--A-T-T--TT-G-GG-GT-G-AGAGG---GCAT---------CATACAA------------ATA-----------------------------------AA--T-CA-G--A-GTTCCTGTA---CA-T-G------TT-AT--CTA--AAA-GG--C---GTATAATATT--AA-A-TTACA-AGTT---TA-T-GA---T-ATAAT----AA---ACTT-TT-C--CCC---------------ATA-AT----------GAA--CAGCTCTAGAGATA-TA--------GGGA-------A-TTGGCAA-AA--TTTCCAT--T--AA-CA-TC-GTCA-CAT-g
gi|16 : aaA----G-TTT-ATT-CCA--A-T-T--TT-G-GGCCC-C-AAAGG---GCAT---------AATAGAA------------GTA----------A--------------------CA--GC--T-CA-T--A--A----AGA---AA-G-AAATGTCCC-AA--A-A--AAT-GAAGT---GGGAAA-AGTTAAA-A-TATCA-cacacaagtctatgtataactataaaatattcatggactct
gi|17 : aaagaaaataaatttgagaaaaaatatcaattttgaaataagaaaataaaatttggaaatattcattatgatatctataggtgtaaagataatataCCC-AGTTTAAATAGCC-AA-AAG-ATGAGAACTGATTATG-AAATTTA-----GAAAA-CATTG--CAAGAC---GAGGATT-GCGAA-TTAC-TGAAAAATG--TTTT-CTCTACAGA------------------------AATGC--A-A-TGT-TC-GCCAGT-TTGT--CCA-----ATT----G--T--TG-TCT-GCA-ATTGCCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------CCTTC--ATGAATATTTCTCTTTTTAAATCTATC-AG---A-T-AATTT--A-TTA----GT-AACAA----Ttggaatcacaacttacatgtatgtgg
gi|18 : tacA-AAGT---TA-TAGA---T-A-A-TC---AA---T--TGTT-C--TCA---------------TTT-GT----------GAG--CAG-T------ATA-TA---------T-A-------G-TTGGCAA------TTTCAA--T--AAGCA---T-TCA-CAT-TAC-AT-----TA-T-C--A-----CTAAA--G--CCAAATAC----AATTTCTT-TACT-AT-TA-CA---CAGGT--T-TTA-T----------AAATTTTTTGCCTA-TAC-AA-GTAT-TTCA-T-------GGAT-----TCTGCT--TG---AA-TG-G-T-T----------TTTCTTA-ATGTT----GGTATGGC--TGTTA---CA----TCAA---ATG----T-A-A--AAata
gi|19 : TGGCAACGA--TTTT-AA--T--AA-CA--CCGTCA-C-T-T-C-AT-----TGCTTC--A-----T--A---G--CCAGGTA-----AAGTT----------------------GTT--T-T-A-T----------CAAATTCTT----A-T-C-AATGTGT-T-CA-A-------GGA----------CTGGTG---AA-TG-G-T-T----------TT-CGTACA-GTTGAATGATAT-AC--AAT-A---CAG---TCAA---TT---------A--CAAT-GGAAT-T------CA-T-CTT-------A--CAA-AGTT-CAGCA--TTT-ACAG-ACA-GT--GCATTTTCTTTTCATATTACC---CGTTTTTG
gi|2 : acGGTAAGTAA-GT--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT---------TACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--C-CA-C--A-GA----AGA---AA-G-A------CC-AT--C-A--CAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-T-TAA-A-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TA--------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAAA-T--AA-CA-ACTGTCAGCAT---C-GT-----TACT-C--A-----T--AG------CAAA-A-----AATTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-T----------AAAGTTTTC----AATAA-CAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----TT--CTA-TG---A--TG-G-T-T----------T--CTTAGATGTT---TGGTATTGC--TGT-A---CAC---TCAG---ATG----T-A-A--AAAT-GGAAT-T------C--T-CTT------AA--CAC-AG-T--AG-A--CTT-GCAGGACA-CT--ACATTTTC-TCTCAT-TTAAATTGTGTTTTTGGTT--AGTAC-GCCCCAGTTTCAATAGCCCAA-AGATATG-GAACTGATTCTGAAAATTTG-----TAAAA-CATTT--CAAGACCTTCAGGATT-ACGAATTTACATGAAAAATATTTTTTTCTCTACAGAATTTTG-TTTTG-ATA------C-AATGA--ATA-TGT-TC-GCAAGT-TTG---CCA----CATT----G-TT--TG-TCT-TCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---C--ATGAATATTTA-------AAATCGTCC-AT-----T-AAACT--A-T-A----GT-AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------AAT-TTC--AT--C--ATG--TA--TAGAACAT-TGT------ATA-T--CTAA-CTT-ATT---CAAA---ATATTAATG-----AAT----GC--------TACT-A---GT-C-----AACTACT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACA-TTG-TTT---CA-T-ATACAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-GAAT-CTAC-AGGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TT-CGTAAA--TATT-TT-AAAC---AG--C-TTTTTAT-AA---CAT--CAAAA--TAC-TA-TGGGAATCGACCA-AG---TT-CAC-CTACAATAGCT-TGA------TTT--GAGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---AATATAT--TTCAAGAATTTTTATG---TG-CA-TTT-------TTTC------GCAGTA--GTATTTATTAA-AA-A----G-TTTTTCTA-T--ACAATAATCCAGGCGTTT-GACG-GAACTTGTA----CTGTATTTATTGTTCCCACCCAAATTTCACATGCATA-AA-G-CAGTA-CT----G-GT-------TT-A----GCTGCTATGATCATA----CAAA---GT-GTATC--AG-GGTG-TGTA---TTTTTGGTT-T--AATA-TT-CCGAAACCAAAAACTT--GACTAGTT-TAAAATAAG-CCTTTAAGGCTCTTTTTGTA-AAGA-TC-AA-TTG-AC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATG--AG-TAAA---CAATT-CCCAGATATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATT--TGAATT-GTA-TAGAAAAACTTT----------ATC--TG-AT---------TTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAAT-TTT--TTGTCTTTCTGGGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-A-TGA-CAATAGCATTCAAGCTTTTTTA-TACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCAGTTT-CGAAAATAAACACT---A--TT-TCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAG-GAT-GGTTCACCTAATTT-GT--GGA-------TTATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AATGGTCTG-ACTTA-GGT-------TTA--TCTCC----CGCGTCTAA-AC----------CACCTTTAGG-----TTCAAATGAAACTCGTAAGTTT-AT--------TTTGGAGCTT----TACAG--AT--ATTATG-TTT-GCCATGTACATACTCTTGG-ATGACTTTATAAAAAGGTCCCTTTATGTCAAGT-TG-GTGCAACC-TGTGTAG-AAGAGCTG-AATGTGAAACAGTATCAAAGGCCTTGGAAAAATTAATA-AAGCAAACATACAATT--TGG-ACTTAAATATTTGTATA-TTTTTGAATAAGGGTTCT-AAGTATAAACATGTGGTCACTGGTTCTGGCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTAATAATATTGTTAGAGTCCAAGTAGTTTTGTAACCTTGTATTCAGTATGCTATCAA--ATACTTT-GGATA-AGC-AAGAAGTT-ATTGTT-ATTCCTCTATACTAGTAGTTTGATGGGTCATA-TGGGCTATCGTTTTTATGAAT-AGG-TTTAATAAAGCCTATTTTCCA-TTCCTTTGGGTATT-TGCCAG-AA-GACAA-GACAAG----AT-TAAATAATTT-T-AGCATATGTGGT-AAAATATAT-G-AC-TTGGCTTTCA-ACATCTCATT-TTTAATGCCATCCTAATC-CA-GC-TGATTT-TTATTCTTTAGATG-TTTTATTGCATCAATGATTTTCTTTTTTTTAGTTGTACTAAATCTAAC-GAGGTAAATGTTTTGAT-TTTCT--T--CTTGG-CAAGTAAT-TTCAAAATATTT-ATTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAG-TATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGA------------CTTTC-AAACTGAGTTTCCAGTTATGATA
gi|20 : TTTTTGTAATCG-A-TA--TGTAGCTGTAGT-AAT---CTGA-ACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--AAAATATTTA-TTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAGATATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGA------------CTTTCAAAACCGAGTTTCCAG-TATGATA
gi|21 : T--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATT--TGAATT-GTA-TAGAAAAACTTT-------TT-ATC--TG-AT---------TTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAA--TTT--TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-A-TGA-CAATAGCATTCAAGCTTTTTT-ATACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCAGTTT-CAGAAATTAACACT---
gi|22 : --TA----A-TTT-ATT-TCA--AAT-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCATAACATGGAATACAGAGTTC---------ATAT---------G--------------------CATGAA--T-CA-T--G-AA----AG-----T-G-A------TCAAT--C-A--AAA-GA--T---CAATAA-AAT----------------T---TA-C-GA---T-A-AATC---AA---C--TCTT-C--TCT---------------ATA-AT----------GAG--CA-C------------------------------------------AA--TTTCCTG--T--AA-C--ACCGTCA-AAT-T-C-GT-----TACT-C--A-----T--A
gi|23 : gtacatgTCAGACAGGGCTATCATTCTTATGAATTA--CTTTGATAAAGCCTGTATCCCACTCC-TTTGAATATT-TGCCAG-AG-GACAA-GATAAATTACATGTAGATAATTT-C-AGCAAA--TGGT-ACAATATGTGGTACGGTGGCTAGTA-ACATTTCATT-TTCATTG
gi|25 : TAAATAA-GA--AA----AGTTT-ATT-CCA--A-T-T--TT-G-GG-CC-CAAGAGG---GCAT---------AATAGAA------------GTATTATTTAAAAA--------------------CAT-----T-CA-T----GA----AGA---AA-G-A------
gi|26 : agtttaTAA-GT--TA----A-TTC-ATT-TTC--A-A-AAATT-GCGG-CC-C-AGAGGAATGCAT---------TACAGAG------------ATAT---------AAGGTTCAAATA---------CAG-AA--T-AA-T--A-AA----AGA---AT-G-A------TT-TC--C-A--AAA-GA--T---AGATAA-AGT--AG-A-Taatgtccaaaaagaaggaagaaattattttttacaatattataacatacatggatgtgg
gi|27 : agaTT-ATT-TCCA-A-T-T--TT-G-GC-CC-C-A-AGG---GCAA---------TA-AAAGAATACCAGGTTCACAT---------A--------------------CATAAA--T-CA-T--A-AA----AGAGCTAA-C-A------TT-AT--CTA--AAT-GA--T---AGATAC-TATA-AA-A-TAACA-AGGT---TA-T-ggaatgtgatttggtcaatca
gi|28 : aagtagtattaaagtaAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA-------------------------A-G-A------CC-AT--CCA--AAT-GA--TTATAGATAA-AGT--AAGA-TTACA-AAGT---TA-T-GA---TTA-AATC---AA---A--T-TT-CC-TCA---------------ATTTGT----------GAG--CAGCT------ATA-c
gi|29 : TTTCAGACATTTCATTATTTTATCCCAC-CCAA--ACATGCTTGATTTATTATTTTTTAGCT-TTGTCACGGCAGAGATTATTTCCTTTTCTATATTT--------CCTAAC-Ggttgtgtgttaaattgg
gi|3 : cacaggTAAGTAA-GTAATATCTTA-TTT-ATT-TCC--AAT-T--TT-G-GG-CC-C-AG-GG---GCAT----------ACAA-G------------ATAT---------AAC------------------CAT-AAACT-CAAC--A-GA----AGA---AGTGCA------TC--T--C-A--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AACA-TAACATAAGT---TA-T-GGGACT-C-ACTCACAAA---A--T-TT----TCATGACACAGTACACTGATT-GTTACCTGATACGAG--CAGCT------GCA-TACACTCACTGT-A-------G-TTGGCAA-AATTTTTTCAA--TTAAA-CACACGTTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAACATCCACGATTTTCT-C-CT-AT-TA-AA---CAGGTGATAT-A-TACCTCCGATAAAAGTATTT----A-TAC--AAGTATAT-CA-TCATACAAGGA------TT--CTATTGTGTAA-TGTG-T-TTATAAAATTAT--CTTAAATG-T---TGGTA-TGC--TGT-A---CCGGCATCAATTCATGGCTAC-A-AACAAAT-GGAAC-TTGGAAACA-T-TCT--CCCAAA--CAG-CG-T-CAGTA--CTTAACCG-ATA-CTCGACACT
gi|3 : acccacgggtaATTCCAAAAACTTACTAAATGAAA-CAATTGCCAAGAC-TTGAGGATTCACGAATT-AC-TCGAAAATATTTTTC-CTCTACAGAATCTTG-TTTTGAA-A------TGAATGA--ATA-TGT-TC-GCAGTT-TTGCCACCA----CATTGGGGG-TTAATG-GTC-GCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACAAATGCCGCACC---T--GCGAATAATTA------TTAATCGCTC-ATAGCG-TGGACTTTAA-TTAAAAGATAAACAAGTTTTT--GAC-AC--A----ATTATTCCATT-GTTCAAT--C--ATGACTAATTAGAACAT-TGTA-----ATA-TC-CTAA-CTT-ATTTAACAAAAATATAT-AATG-----AATG---GCGGTAACTGTAGT-ATCTTT-CCACAAAATAACTAAT-TTGTTG-TTCACTATA-TCCTA-TACACT-CAA-TTGATTT--TCAGT-ATACAGCAGTT-C-TCTTGAAA-TAATCGAAT-CTACAAAGGGG---A----------ATCTA-AAATTCTCTTC-CGAAAA--TATTGTACGAACATAAGATC-TTTTTAT-AA---CAT--CAAAATTTACATAGTGGAATTCGACCA-AGTTTTT-CACGCTACAATAAATCTGAAGACCCTTTTGGAGGTATCCTTTTTATGTAC----------AAGTAACCTACA---AATAT-TATTTCAAGAGACTTTATGTTTTG-CA-TTTGGTTTAATCTTACAATAGCAGTA-CAT-TTTATTAA-AG-AAGACC-TTTT-CTA-TACACAATAAaccaatggtttaaacattcttttaaatctattttatctatctcaataatgtttccttgctgtaggacgcccggacgcagggaatttcaataaatgcctataagaaatgaaggctcttggatgatgagagagaactgattcatatttaccccacaacgattatttgtattccaaaaacttactaaatgaaacaattgccaagacttgaggattcacgaattactcgaaaatatttttcctctacagaatcttgttttgaaatgaatgaatatgttcgcagttttgccaccacattgggggttaatggtcgcaatgtctgaaagtgtactacaaatgccgcacctgcgaataattattaatcgctcatagcgtggactttaattaaaagataaacaagtttttgacacaattattccattgttcaatcatgactaattagaacattgtaatatcctaacttatttaacaaaaatatataatgaatggcggtaactgtagtatctttccacaaaataactaatttgttgttcactatatcctatacactcaattgattttcagtatacagcagttctcttgaaataatcgaatctacaaaggggaatctaaaattctcttccgaaaatattgtacgaacataagatctttttataacatcaaaatttacatagtggaattcgaccaagtttttcacgctacaataaatctgaagacccttttggaggtatcctttttatgtacaagtaacctacaaatattatttcaagagactttatgttttgcatttggtttaatcttacaatagcagtacattttattaaagaagaccttttctatacacaataaatggacaggggcccaaacgttgtatat
gi|30 : acccacgggtataagtaagtaatatcttatttatttccaattttgggcccaggggcatacaagatataaccataaactcaacagaagaagtgcatctcaaatgatagataaagtaacataacataagttatgggactcactcacaaaattttcatgacacagtacactgattgttacctgatacgagcagctgcatacactcactgtagttggcaaaattttttcaattaaacacacgttcacattcattactcataagccaaacatccacgattttctcctattaaacaggtgatatatacctccgataaaagtatttatacaagtatatcatcatacaaggattctattgtgtaatgtgtttataaaattatcttaaatgttggtatgctgtaccggcatcaattcatggctacaaacaaatggaacttggaaacattctcccaaacagcgtcagtacttaaccgatactcgacactaccaatggtttaaacattcttttaaatctattttatctatctcaataatgtttccttgctgtaggacgcccggacgcagggaatttcaataaatgcctataagaaatgaaggctcttggatgatgagagagaactgattcatatttaccccacaacgattatttgtTAAGTAA-GT---A----A-TTC-ATT-TTC--A-AAT--TT-G-GG-CC-C-AGAGA---GCATACAGAGAA-TACAGAGTTC---------ATAT---------A--------------------CATGAA--T-AA-T--A-AA----AGA---AT-G-A------TT-AT--C-C--AAA-GA--T---AGATAA-AGatggacaggggcccaaacgttgtatat
gi|31 : c-AA--T-CA-T--A-AA----AGA---GA-G-A------TT-ATCCC-A--AA--GA--T---AGGTAA-CGTG-AA-A-TAAC-----T--------------------------------T-TT-C--TCA---------------GTA-AT----------GAA--CAGCT------ATA-T-------------------------GCGT-AA--TTTTCAA--T--GA-CA-
gi|32 : attagatgGTAAGTAA-TT--TT----T-TTT--TT-TCA--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGGGG---GAATACAAAGAA-TACAGAGTTT---------ATCT---------A--------------------CATAAA--T-CA-T--A-GA----AGA---GA-G-A------TT-AT--C-C--AAttgt
gi|33 : aACTTGTA---TCTGTATTTATTGTTCCC-C--AAAT----------------G-CAGTA-CTTACCG-GT-------TG-A----CCTG-TATGATCATA----C-AA---GT-GTATC--A--GGTA-TGCA---TT
gi|34 : TCAGTATGCTATTAC---TCCTTT-GGATA-AGCAA-GAAGTT-ATAGTT----CTTCT------GTAATGTGATGGGTCAGA-AGGACTATCATT
gi|36 : -TTT-ATT-CCA--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---ACA----------TATAAAA------------GTA
gi|37 : acacgT------ATA-T--TTAA-CTT-ATT---CAAA---ATAT-AATG-----AATCAATGC--------TACT-A---CT-CC----AACTACT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACatgatagttttataaagttgaaaacatatct
gi|39 : TTTTT-CCCTTGAAAAGCTTC-TTTTG-A-ATAGGCCT-AATCC--ATA-TGT-TC-GTAA-C-TTG---CC
gi|4 : taGTAAGTAA-GT---A----A-TTT-ATT-TCC--AAT-T--TT-G-GG-TC-C-AGAGG---GCATACAAAGAA-TACAGAGTTC---------ATGT---------A--------------------CAT-AAG-T-CA-T--A-AA----A-A---GA-G-A------TT-AT--CCA--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-AATAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---CT-T-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------------------------------------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T--AA-C--ACTGTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----TTTTTTTC-T-CT-AT-TG-CA---TGGGT--T-T-A-T----------AAAGTTCTT----A-TAC-AAAGTGT-T-CA-T-------GGA------TT--CTA-TG---AA-TG-G-T-T----------TTCTTTAG-TG-T---TGGTA-TGC--TGT-A---CAG---TAAA---ATA----T---A--AAAT-GGAAT-T------CA-T-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-GCAG-ACA-CT--ACATTTT-------T-TTG---TGTG----TGTGT--A--AC-GCCC-AGTTTCCATAGCC-AA-AGA-ATGAGAACTG---------------------AAA-CATTA--CAAGA-CTTGAGGATT-ACGAA-TTAC-TGAAAAATA-CTTTT-CTCTTCAGAATCTTG-TTTTG-A-A------T-AATGC--ATA-TGT-TC-GC-AGT-TTG---CCA----CATT----G-TT--TG-TCT-GCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---C--ATGAATATT--------TAAATCGCTC-AT---G-T-AACTT--A-TTA----GT-AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------AGT-TTT--AT--C--ATG--TA--TAAAACAC-TGT------ATA-T--TTAA-CTT-ATT---CAAA---ATAT-AATG-----AAT----GC--------TACT-A---ATCC-----AAATGCT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACA-TTG-TTT--TCA-T-ATACAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-AATT-CTAC--AGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TT-CGTAAA--TAAT-TA-AAAC---AG--C-TCTTTAT-AA---CAT--CAAAA--TACATA--GGGAATCGACCA-AG---TT-CAC-CTACAATAGCT-TGA------ATT--GAGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---TATATAT--TTCAAGAATTTT-ATG---TG-CATTTT-------TTTT------GCAGTA-CAT-TTTATTAA-AGAA----G-TTTT-CTA-T--ACAATAATCAGGGCGTTT-GACG-AAACTTGTA---TCTGTATTTATTGTT-CC-CCCAAATTCCACATGCATA-AG-G-CAGTA-CT----G-GT-------TT-A----ACTG-TATGGTCATA----C-AA---GT-GTATC--AG-GATA-TGTA---TTTTAGGTT-T--AATATTT-CCAAAAC-----ACTT--GGCTAGTT-TAAAATAAG-CATTTAAGGCT-TTTTTGTA-AAGA-TCAAA--TG-AC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATG--AGATAAAAA-CAATC-CCCAGATATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATC--TGATTTGTTA-TAGAAATTTTTT-------TT-ATC--TG-ATTTTTTACCGTTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAA--TTT--TTGTCTTTTTGAGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-----A-CAATctt
gi|40 : AGCT------ATA-TAT-------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAG--T--AA-C--GCTGTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CC
gi|41 : TCACCTAATTTTGC-TGGA-------TCATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAGAA----TGGT---AGATT---AT
gi|42 : aT-TCC--AAT-T--TT-G-GGTCC-C-AGAGG---GCAT---------
gi|43 : -AT---G-T-AACTT--A-TTA----GT-AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------AAT-Taatatactcaa
gi|44 : ATAATCAGGGCGTTT-GACG-GAACTTGTA---TC
gi|5 : GGTAAGTAA--T--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TTCG-GG-CC----GAGG----CATA--------CACAAAG------------A-AT---------AAGAGTTGAGAAGTTCAATTTCAT-AAA-T-CA-T--AAGA----AGAG--AA-G-A------TT-AT--C-A--AATTGA------AGATAA-A-T--AA-A-TA-CA-AGGTCTATA-T-GAA--T-A-AATC---AA---C--T-CT-CCTTCATCC------------ATA-GT----------GAG--CAGCT------ATACTA--------GT-ATCAGTAAG-TTGGCAA-AA--TTTTAAA--T--AA-CA--CTGTCG-CAT-C-C-AT-----TGCT-C--AATATTT--AA--AGCCCAATTA-----AATTTTTCAT-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-CTAA-------AAAGTTCTT----A-TAC-A--GTGT-T-CA-T-------GGAT-----TT--G-A-TG---AA--G-G-T-T----------T---TTAG-TGTT---C--TAT-GC--TAT-AA--CAG---TCAA---ATA----TTA-A--CAATTAGAATGT------CAAT-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-ACAA-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCAT-TTAACT--TGTCTTTG-GT--A--ACAGCCC-AGTTTC-GTAGCC-AA-AGA-ATGACAACTGA-TCTG-AAATTTG-----TAAAA-CATTG--CCA-ACGTAGAGGTTT-ACGAA--TAC-GTGAAAATAATCTTT-CTCTACATAAACTTGATTTTG-A-ATAGCC-T-AATGC--ATA-TGTGTCGGC--GT-TTG-----A----AATT----GCTT--TGTTCT-GCA-A-TGGCGGA----TGTCCT-----A-A----------C---C--ATGAATAATT-------TAA--CATTCTATG--G-T-AACTTC-ATTTA----GT-AACAA----TT---ATAAC--ATTACAT------ACTGTTT--AT--CTAATG--TA--TAGCACATATGT------ATA-TACTTAA-CTT-ATT---CAAA---ATA--AATGAAATCAAT----TC--------TACT-A---TC-C-----CACTACT--TGTTGTTGAT------TATTC--ACTACAATGAGA-TTG-TTT--TCA-CAATACAGCA--T-TATCTC--AATTACT-GAAT-TCTC--AGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TTGTGTAAAATTATT-TA-AAACT--AG--C-TTTTAATAAA---CAT---AAAA--TA
gi|6 : aCATA-AA-GGCAGTA-CT----G-GTCCGTTCGTT-ACATTACTGATATGATCATAACACCAAG---TT-GTATCTCAGCGGTG-TGTACTTTTTTCG--C-T--AATA-TTTCCAAAAC------CTT--GACTAGCTCTAAAATAAG-CCTTTAAGGCTCTTTT-GTA-AAGAATCAAA-TTGGAC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATGCAGG-TAAAAAACAATT-CC-AGAGATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTCAGATGATT--TGATTT-TTAATAGAAAAACTTT-------TTTATC--TG-AT---------TTTT-CTTACCGTTTTTTTACAG---------------AATATATGACAATGTTT--TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGAATAGGCAATATTT-ACTGAACATCAGCATTCAAGCTTTTTTAATACATACCCGCTG---AGCCCCT-CCCTCGGTTTTCAGAA-TTAACACTGAAAAATCATCAGCATACCACGACTA-AACACATTTAAGCGAT-GTGTCACCTAATTTTGCGCGGGATAATATTTATCATTATATCAGTC-GGACAATAG-ATATCTGGTTCAGGATCCATGTCGAGTTTAT---TATTTTAACAAAGGTTT-GACTTACGGTACTTCTGTTACTCCTCCCGGGC-TGTTTAG-ACGACTCCACTCCACCGTTAAGGCCTTTCCACATGAAATTCG-AAGTTT-ATATCTGTTGTTCGGAGTTTGTGGTACAGTTATTAATTATG-TTTGGCCA-GTACATACTCTTGACATGACTTTATAGAgt
gi|7 : TTTTT-CCCTTGAAAAGCTTC-TTTTG-A-A------T-AATCC--GTA-TGT-TC-GTAA-C-TTG---TCCTTTTCATT------TT--TA-----GCACA-T-TCTGACAAAT-TACTTTGCCATA----------CA--T--GTACATATTAA------TAAATCTTTT--T---C-T-AAGTTC-A-TTA-------AACAC----TTTTGAT-T--------GT------AGA-TCTGAAA--C--TTG--AA--AAAGATGT-TATCGCAGGATA-TG-CCAA-GTTGATT---CAGT---AAAA-AATA-----AAC----AC--------TGCTCA---AC-C-----AACAATT--C-TTTTTG-T------TA-TC--A-TTCAAA-A------------TCA-T-AT--------T-T-TCTT--GA--AGT-GCACACT-C-AAGCAA---AGTATCATTTGATTTATGAATGT---GT-TGTAAA--TATT-TA-A--C---AG--T-ATTGGAT-AA---GGTTTCAATA--TATA-A-TGGATGCCTACCT-AA---TT-CCC-CCATAACTGCA-TAG------TTT--GAAG---CTTTCTTATGTACCCCCCGGTGTA------CCCCA---CATATGTA-CTTGAGAGTTTTAATG---TG-AA-GTT-------TATC------ACTATA-TATATTTTTCAT-TG-A----G-TTTT-CAA-T--ATTATAATTTGGTCTCTT-AAC---AA-TAGCAGATTCTGAATTTATAATT--C-CCCAAATTTCACTTCCATATAACA-CAATA-------G-GT-------TT-T----ATTG-TGTGATCAtgtaattcatcggccattcatcgtttcacttctagtcgaagttgtgtcgcaagccttgtg
gi|8 : aggta-TGA-TAGTAGCGTTCAAGCTTTTTT--------------G---AAGTCTT-CCTTCAGTTT-CAGAAATTAACACT---AAGTCATCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAA-GAT-GTGTCACCTAATTTTGC-TGGA-------TCATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TC--------TC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AAAGATTTGGACTTA-GGT-------C-G--TCTCC----C-TGTCTAACAC---------CCACC-TTAGG-----TTCAAAT--------------T-AT--------TTTGAAGTTT----TACAG--AC--AGTATG-TTT-GCCATGTACATACTTTTGA--TGACTTTATAGAAAGGCCCCTT-ATGTCAAGC-TG-ATGCAGCC-TGTGTAG-AAGATCTG-AATGTAAAACAGTGTCAAAAGCCTTAGAAAAATCAACA-AAGCAAACGTATAATT--TGGAA-TT-ATCATTTGTATA-TTTTTGAATAACGGTTCT-AAGTATAAAAATGTGGTCACTAGTTCTGGCTTTTGGTTGAAAACCAATTTGAACTTTATTTATAATGTTGTTCGAGTCCAAGTAGTTTTGTAACCTGGTATTCAGTATGCTATTAAATATACTTTGGGATA-aaaagatgcaacaaaatgccggcatt
gi|9 : caaaattaggAAGTAA-AT--T--------TT-ATA-TCA--A-T-A--TT-T-GG-CC-C-AG------GCAT---------AACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--A-CA-ACAA-GA----AGA---AA---A------CC-ATT-C-ACCAAT-GA--T---AGATAA-CGT--AA-C-TAACA-AAGT---TAAT-GA---T-A-AATC---AA---AATT-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAGAGCAGCT-------TA-TATTAAT---GT-A-------G-TTGGACA-AA--TT---AG--T--AA-TC-GCTGTCA-CATGT-C-ATCTTTATACTGC--A-----T--AAAAG--C-AATTA-----AATTATTC-T-CT-AT-TAACATACCAAGT--T-T-A-T----------AA-GTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----T---CTA-TG---AAATG-G-T-T----------T--TCTTGATGTT----AGTAT-GCCATGT-AACACAA---TCAATG-ATG------A-A--AAAT-GGAAT-TAA----CA-TGCTTATC---AAAGCAC-AG-TACAG-A--CTT-GCAG-ACA-CTTAACATTTTC-TCACAT-TTA-CATGTGTTTTTGTGT--A--AC-GCC--A---TCAA-AGCC-AA-AGA-ATGAGAACTGGTTCTGAAATATGG-----TAAAA-CATTT--CAAGA-CTTGAGGATT-ATGAAt
blockSeqs : . AATATCTTA . . CA A A AA C C C . A AAT ACACAAAGAATAAGAGTTGAGAAGTTCAATTT G ACT ACA AG TCCT GCT TGC AATGTC A CC C CC TT AG TAT T TA TA T CTA A A GAC T T ACA TTTT G T CT TGACACAGTACACTG T TACCTGATAC AG GCATACACTCACTGTAG C TT A TA G ACA G G A . CTTTA G . ATATT TA AA GC TCCAC A A A . . A TAC GA A T . ACCTCCGATA GCCT A A A T . CATACAA TCTATATT G TGT A T T G TATAAAATTAT TTGAAT TG CA T ACA GGCA TTC GCTACA AC T G TGGAAA A G CCCA AG A T A C TG A G C TA T A AAATT T AGT A CC G A T C . T GT GA TA CTAAA . TGC CC C T ATG T T T GA A T TAGGCCT . . G G CAG . CCA TTTTC GGGGG AA TTCT C T C TTGCC AATGCCGCACCT TCTCTTTTT T AGCG G TA T AAAG A GTTT TT ACAATTATTCC A G CA . TA AC AT A CGCAGG . AC . G TAA AAT TT AAATC GGCGGTAACTG C TCTTTCCACAA AA G A TCACTA T CT C G C . A . GT A GT TA GA TT C A A AA AGTATCATTTG T TCT G AT G C ATA AT . A . TT TT AT GT T TTT . G C AGACCC TG TAT CCCCCGGTGTA T TAG G AT A TTT . T GGTTTAA A ACAATA A A A T A AGACC T TAC T . ATC GAT C A C TCACATG T GG CTTACC . CCGTTCGTTACATT C ACACCAAG . TC GC C CTT G C . GC AT T CAAAAA . C . CTT . A T T G AATT . TCC . CA A AAA . T AA AA . GAA A G CC G A AAGTTTCTT TT C TTTTTACCG CTTACCGTTTTTTTACAG AT TG CC . A AC A AA ACC . . T GAA AA A A CACG . CA C . GC ATAATAT TA A . A A TATC TCA CAT GT . C GG C TACTTCTGTTACT CGGG G C GACTCCACT T G GCCTT GA T . ATCTGTTG GTGG TTATTA . G T T CA A T T . . . . . G A . A . A C AA . . G A C ATA G . A A . AT ATACTAG G G T C AGG T C C T . . . . TTAC G T T . G T G C G A C TC T T A G T G GTACTAAA T A GTT T NNNNN N GT TT A . . . A A . A . . A CT C T
blockSeqs : . AAAG . . A A . . . . T . . . AACATGGAATACAGAGTTCATATG A AC ACA G . G G . . T C CC T . . . A AA . . A . A . . . AAT C T C TCC . . AG ATACTAGTATCAGTAAG . . . . . CG . G . . CTTTA T . . . AA . C T . . . . A TAC . . . . TAA . . . . . . . TTCTG T . A . T . TTT TTT TT CA . ACA A TG TAC . . . AA . G ATC AG . . C T . . . . CG . . ACAT T A . C G A T . . . AT GA AT . . T CG . T TG T . T G . . TAGCCT . . . . AAG . T C GC . TCT . . . . CCTTC TAT . GG . C . . . . . AACATTACAT T . GA . . . . . A . C . . . . T . CAATGC . CTCC . . . . . . . . A . . . CA A . T . T . . A A A . . . . . . T . . . . . . AT T . . . . . . . . AAGTAAC C . A A T . . . . T . A C A . . C . C C . GG . C . C CCACATG . CA CT . TTT A AAAAAAG . . A . . T G . . A . A . . . CTT . . A T . . . . . . . AC . C . . . . . G . . . TTT . . . GTAAAA . T . . . A . A . . . . . AG A A . . A . . T . . . . . . . . . . . . G . TTTA . . . . G A . GA . . . . AT . . T T A G C . . . . . . A A . A . . . A . . G A C A . . . . . . G A G G . TAC C . . T . . . . . . C . . . . . C . . . A . . . T G A GATA . . . A T . NN NN A . . . . A . A . . . CC C .
blockSeqs : . TAT . . C A . . . . . . . . TACAGAGATATAAGGTTCAAATA G TT AC G . . C . . T T . T . . . G GA . . . . . . . . ACT . . . . . . . CTAGAGATATAGGGAA . . . . . AT . . . . . G . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTT . . . . . . TTC TTC T . . A A TG TTA . . . AA . . ATC . . . A . . . . . TA . . ACTT G A . C G A T . . . AT AA AT . . G C . . TC A . G G . . TG . . . . AGT . . C G . TCT . . . . CAT AAT . A . C . . . . . ACAAT G . . . . . . . . . G . . . . T . GC . ATCC . . . . . . . . C . . . T A . C . T . . A A A . . . . . . . . . . . . . T T . . . . . . . . T C . A A T . . . . C . A C A . . G . T A . GA . . . C TCACTTC . A CT . TTA . CAAA . . G . . A G . . A . A . . . CG . . A T . . . . . . . AA . C . . . . . G . . . TT . . . CACAA . T . . . A . A . . . . . . . A . . A . . T . . . . . . . . . . . . G . TCG . . . . . G . . . . . . AC . . . T . G . . . G . . . A T . .
blockSeqs : . TAA . . C A . . . . . . . . TAAAAGAATACCAGGTTCACATA A AC C G . . G . . . T . T . . . . CA . . . . . . . . AAT . . . . . . . ATATAATTTATGTAG . . . . . AA . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTT . . . . . . TT TT T . . . G . TA . . . . . . C . . . . . . . . . . . . AACT T A . C G C T . . . AT GA AC . . T C . . TG . . T C . . C . . . . AA . . C G . GTC . . . . CC TA . G . . . . . . . ACAAT A . . . . . . . . . . . . . . T . GC . GTC . . . . . . . . C . . . T A . T . T . . T . A . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . A C . G . A . . . . T . T T . . . G . T A . GG . . . C . . G CT . TGA . CAA . . G . . C . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . TT . . . CACAA . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . TAA . . A A . . . . . . . . ACAGAGAATACAGAGTTCATATA . GT T G . . T . . . C . A . . . . AA . . . . . . . . CT . . . . . . . TATATTAATGTAG . . . . . CG . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . T TT T . . . G . TA . . . . . . C . . . . . . . . . . . . ACAT T A . . . A . . . . GT G AT . . A C . . GT . . A G . . T . . . . AG . . A G . TCT . . . . CC TT . G . . . . . . . ACAAT C . . . . . . . . . . . . . . A . TC . TCC . . . . . . . . G . . . T . . T . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A C . . . . . . . . A . . . . . . G . T T . . . . . . . . G . . TTA . CAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . CACAA . . . . . . .
blockSeqs : . TAA . . A . . . . . . . . . ACAAAGAATACAGAGTTTATCTA . AT C G . . G . . . C . T . . . . C . . . . . . . . A . . . . . . . TATATTAATGTAG . . . . . A . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . T TT T . . . C . A . . . . . . C . . . . . . . . . . . . ACC . . . . . . . . A G TA . . G C . . G C . . T . . . . AA . . . . . . . . . . CC T . C . . . . . . . TGT G . . . . . . . . . . AC . ACC . . . . . . . . . . . G . . TTT .
blockSeqs : . TAA . . C . . . . . . . . . ACAAAGAATACAGAGTTCATGTA . A G A . . G . . . . . T . . . . A . . . . . . . . A . . . . . . . ATATATGTAG . . . . . A . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . CT . . . . . . C TT T . . . G . T . . . . . . C . . . . . . . . . . . . GT . . . . . T C . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . TTT . . A . . . . . . . . . AATAGAAGTATTATTTAAAAA . T T G . . G . . . . . A . . . . A . . . . . . . . T . . . . . . . ATATATGTA . . . . . A . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . T TT T . . . G . T . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . TAA . . A . . . . . . . . . AACAAAGATATA . T C A . . G . . . . . A . . . . A . . . . . . . . A . . . . . . . ATATAGTAG . . . . . A . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . T TT T . . . A . A . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . AA . . C . . . . . . . . . TACAAAGATATA . C T A . . G . . . . . T . . . . T . . . . . . . . C . . . . . . . ATATATAG . . . . . A . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . T TT T . . . . . . .
blockSeqs : . AA . . C . . . . . . . . . ACAAGATATAAC . T T G . . C . . . . . T . . . . A . . . . . . . . A . . . . . . . ATAT . . . . . A . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T TT
blockSeqs : . AA . . C . . . . . . . . . AACAAAGATATA . T T A . . G . . . . . T . . . . A . . . . . . . . A . . . . . . . GTAG . . . . . A . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . A . . . . . . . . . ACAAAGATATA . T T A . . G . . . . . A . . . . A . . . . . . . . C . . . . . . . TAA . . . . . G . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . A . . . . . . . . . AATAGAAGTAA . T T G . . G . . . . . T . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . .
blockSeqs : . . C . . . . . . . . . ACAAAGAATA . T T A . . G . . . . . T . . . . C . . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . . . . . . CATACAAATA . T T G . . G . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . . . . . . AAATATA . T T . . . G . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . A T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons : C** T*** *** *** ATATATGTAG*********************** ** A** ** **** T************ TT**** TA****** A**** C* GA N** TN* G* T******* ** AG* G***** TCT** CC*************** TAT****** G**** ** ACAAT************* ** *** T* TCC********* ** ** T** A************* ** *** AT T* A**************** A* C* G***** T*** G** CT***** TTA************ CAAA******* A* ** CTT T* CACAA***************************** ** T* ** A** A* ***
originalCons : GGTAAGTAA-GT--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT---------TACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--T-CA-T--A-GA----AGA---AA-G-A------TC-AT--C-A--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-A-TAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA-TA--------GT-A-------G-TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T--AA-CA-ACTGTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----AATTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-T----------AAAGTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----TT--CTA-TG---AA-TG-G-T-T----------T--CTTAGATGTT---TGGTATTGC--TGT-A---CAG---TCAA---ATG----T-A-A--AAAT-GGAAT-T------CA-T-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-GCAG-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCAT-TTAACTTGTGTTTTTGTGT--A--AC-GCCC-AGTTTCAATAGCC-AA-AGA-ATGAGAACTGATTCTGAAAATTTG-----TAAAA-CATTT--CAAGACCTTGAGGATT-ACGAATTTAC-TGGAAAATATTTTTT-CTCTACAGAATCTTG-TTTTG-A-A------T-AATGC--ATA-TGT-TC-GCAAGT-TTG---CCA----CATT----G-TT--TG-TCC-GCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---C--GTGAATATTTA------TAAATCGCTC-AT---G-T-AACTT--A-TTA----GT-AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------ANT-TTT--AT--C--ATG--TA--TAGAACAT-TGT------ATA-T--CTAA-CTT-ATT---CAAA---ATAT-AATG-----AAT----GC--------TACT-A---NT-C-----AACTACT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACA-TTG-TTT--TCA-T-ATACAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-GAAT-CTAC-AAGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TT-CGTAAA--TATT-TA-AAAC---AG--C-TTTTTAT-AA---CAT--CAAAA--TACATA-TGGGAATCGACCA-AG---TT-CAC-CTACAATAGCT-TGA------TTT--GAGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---AATATATA-TTCGAGAGTTTTAATG---TG-CA-TTT-------TNTC------GCAGTA-CATATTTATTAA-AG-A----N-TTTT-CTA-T--ACAATAATCNGGGCGTTT-GACG-GAACTTGTA---TCTGTATTTATTGTTCCC-CCCAAATTTCACATGCATA-AA-G-CAGTA-CT----G-GT-------TT-A----ACTG-TATGATCATA----CAAA---GT-GTATC--AG-GGTG-TGTA---TTTTNGGTT-T--AATA-TT-CCAAAAC-----ACTT--GACTAGTT-TAAAATAAG-CCTTTAAGGCTCTTTTTGTA-AAGA-TCNAA-TTG-AC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATG--AG-TAAAAA-CAATT-CCCAGATATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATT--TGATTT-TTA-TAGAAAAACTTT-------TT-ATC--TG-AT---------TTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAAT-TTT--TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-A-TGA-CAATAGCATTCAAGCTTTTTTAATACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCGGTTT-CAGAAATTAACACT---AAATCATCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAG-GAT-GTGTCACCTAATTTTGC-CGGA-------TTATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AAAGGTTTGGACTTA-GGT-------TTA--CCTCC----C-TGTCTAA-ACG--------CCACCNTTAGG-----TTCAAATGAAACTCGTAAGTTT-AT--------TTTGGAGTTT----TACAG--AT--ATTATG-TTT-GCCATGTACATACTCTTGA-ATGACTTTATAGAAAGGCCCCTTTATGTCAAGT-TG-GTGCAGCC-TGTGTAG-AAGAGCTG-AATGTGAAACGGTATCAAAGGCCTTAGAAAAATCAACA-AAGCAAACGTACAATT--TGGAACTT-AATATTTGTATA-TTTTTGAATAAGGGTTCT-AAGTATAAACATGTGGTCACTGGTTCTGGCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTTATAATATTGTTAGAGTCCAAGTAGTTTCGTAACCTTGTATTCAGTATGCTATTAA--ATACTTT-GGATA-AGCAAAGAAGTT-ATTGTT-A-TCCTCTA---TAGTANTTTGATGGGTCANA-AGGGCTATCATTTTTATGAAT-AGGCTTTAATAAAGCCTATTTCCCACTCCCTTTGGGTATT-TGCCAG-AG-GACAA-GACAAG----AT-TAAATAATTT-T-AGCATATGTGGT-AAAATATAT-GTACGTCGGCTTTCA-ACATCTCATT-TTTAATGCCAT-CTAATCGCA-GCTTGATTTATTATTTTTTAGATGTTTTTATTGCATCGATGATTTTCTTTTCTNTAATTG-A-TAAATCTAAC-GAAGT-AATG--TTGATATTTCTGCTGACTTGGACAANNAATCTTCAAAATATTTAATTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAGATATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGA------------CTTTC-AAACCGAGTTTCCAG-TATGATA
finalCons : GGTAAGTAA-GT--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT---------TACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AAT---CA-T--A-GA----AGA---AA-G-A------TC-AT--C-A--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-A-TAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCTATATATGTAG-----------------------TTGGCAA-AA--TTTTCAA--T--AA-CA--CTGTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----AATTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-T----------AAAGTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----TT--CTA-TG---AA-TG-G-T-TT------------CTTAGATGTT----GGTATTGC--TGT-A---CAG---TCAA---ATGTA------A--AAAT-GGAAT-T------CA-T-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-GCAG-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCAT-TTAACTTGTGTTTTTGTGTA----AC-GCCC-AGTTTCAATAGCC-AA-AGA-ATGAGAACTGATTCTGAAAATTTG-----TAAAA-CATTN--CAAGACCTTGAGGATT-ACGAATTTACTN-GAAAATATTTTTT-CTCTACAGAATCTTG-TTTTG-A-AT-------AATGC--ATA-TGT-TC-GCAG-T-TTG---CCA----CATTG-----TT--TGTCT--GCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACACC---------------GTGAATATTTAT------AAATCGCTC-ATG----T-AACTT--A-TTA----GT-AACAA----TT--GATACAAT-------------ANT-TTT--AT--C--ATG--TA--TAGAACAT-TGT------ATA-T--CTAA-CTT-ATT---CAAA---ATAT-AATG-----AAT----GC--------TACT-ATCC---------AACTACT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACA-TTG-TTT--TCA-T-ATACAGCA--TT--TCTT--AA-TAAT-GAAT-CTAC-AAGGGGA-------------ATCTA-AAATTC---TT-CGTAAA--TATT-TA-AAAC---AG--C-TTTTTAT-AA---CAT--CAAAA--TACATAT-GGGAATCGACCA-AG---TT-CAC-CTACAATAGCT-TGA------TTT--GAGG---CCTTTTTATGTACA----------------CCACA---AATATATA-TTCGAGAGTTTTAATG---TG-CA-TTT-------TNTC------GCAGTAC-ATATTTATTAA-AG-AG-----TTTT-CTAT---ACAATAATCNGGGCGTTT-GACG-GAACTTGTA---TCTGTATTTATTGTTCCC-CCCAAATTTCACATGCATA-AAG--CAGTACT-----G-GTTTA------------ACTG-TATGATCATACAAA-------GT-GTATC--AG-GGTG-TGTA---TTTTNGGTT-T--AATA-TT-CCAAAAC-----ACTT--GACTAGTT-TAAAATAAG-CCTTTAAGGCTCTTTTTGTA-AAGA-TCNAAT-TG-AC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATG--AG-TAAAAA-CAATT-CCCAGATATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATT--TGATTT-TTA-TAGAAAAACTTT-------TT-ATC--TG-AT---------TTTTCACAA-----------------------------AATAT--GACAAT-TTT--TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTTA--TGA-CAATAGCATTCAAGCTTTTTTA-TACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCGGTTT-CAGAAATTAACACT---AAATCATCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAG-GAT-GTGTCACCTAATTTTGC-CGGA-------TTATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AAAGGTTTGGACTTA-GGT-------TTA--CCTCC----C-TGTCTAA-ACG--------CCACCNTTAGG-----TTCAAATGAAACTCGTAAGTTT-AT--------TTTGGAGTTT----TACAG--AT--ATTATG-TTT-GCCATGTACATACTCTTGA-ATGACTTTATAGAAAGGCCCCTTTATGTCAAGT-TG-GTGCAGCC-TGTGTAG-AAGAGCTG-AATGTGAAACGGTATCAAAGGCCTTAGAAAAATCAACA-AAGCAAACGTACAATT--TGGAACTT-AATATTTGTATA-TTTTTGAATAAGGGTTCT-AAGTATAAACATGTGGTCACTGGTTCTGGCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTTATAATATTGTTAGAGTCCAAGTAGTTTCGTAACCTTGTATTCAGTATGCTATTAA--ATACTTT-GGATA-AGCAAAGAAGTT-ATTGTT-A-TCCTCTA---TAGTANTTTGATGGGTCANA-AGGGCTATCATTTTTATGAAT-AGGCTTTAATAAAGCCTATTTCCCACTCCCTTTGGGTATT-TGCCAG-AG-GACAA-GACAAG----AT-TAAATAATTT-T-AGCATATGTGGT-AAAATATAT-GTACGTCGGCTTTCA-ACATCTCATT-TTTAATGCCAT-CTAATCGCA-GCTTGATTTATTATTTTTTAGATGTTTTTATTGCATCGATGATTTTCTTTTCTNTAATTG-A-TAAATCTAAC-GAAGT-AATG--TTGATATTTCTGCTGACTTGGACAANNAATCTTCAAAATATTTAATTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAGATATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGA------------CTTTC-AAACCGAGTTTCCAG-TATGATA
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): TTCCAATTGGGTCGCTGTGCCCCAGAGCGCGCAAGAACTAATAGGAGAGACCGTACTTAACAGTTGAGAAAGAATGTCCCAAAAAAAAGAAGTGCGGAAAAGTGACTAAGATTTCAAGTACAGAGTGCGTAATCACAAACTCTAACAT
Unaligned ( gi|35 ): AAGGGTATTCAGAACAAGAATGACATGGGAACATAAAGAAATAAAGTAAAATAAACAGGGAAAAACATCCAGATG
Unaligned ( gi|38 ): AATAAATTTGGAAATAAAATATCAATTTTGAAATAAAGAAAATAAATTTGAAATATTCATTATGATA
Alignments
lowQualScore : 1111111111 1 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 1111 11 111 111111 222222222222222 1111111111 111111 222222222222222222 11111 11111 111 2222222222 1111 1111111 2222222222 2222222222222 22 11 111 111 22222222 222222 111111 11 1 11 11111 11 11111 22 1 1 11 22222222222222 1111 11111 222222 11111 33333333333333333 333333333 22222 11 1111 1111 11 111111111111111111 11 1 222222 11 111 111 11 11111 22222222222222 111 22222222 111111 11 11 33333333333333 111 11 111 111 11 111 111111 111 55555555555555555 111 22 111 1 2222222 111111 11 111111 111 1 111 1111111 222222222222222 1 22222222222 111 11 11 222222 11 111 1111 111 11 1 111 1 2222222222 222222222 5555555555555555555555555555555555 11 111 111 111 111 111 2222 1 11 2 1 11 2222222 11 1111 111 111 11 111 1 1 4444444444444 2222 1 1 666666666 1 22222 11 1 33333333 2222 222222 1 1 11 1 1 1 1 1 1 1 1 11 22 1 1 111 1 1 1 333 3333333 1 22222 1 1 1 1 1 1 2222 1 222 1 1 1 1 1 1 111 1 11 22222222 1 1 222 11 11111 1 111 11 1 1 7777777777777 1 1 666666666666 1 11 1
lowQualScore : 3 0000000000 2 2 555 0 2 22 2 2 4 2 2 333 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 8 3333 7777 33 4444 555 222 555555 2 4 77 55 44 33 666 2 77 888 2 444 5 2 000 2 2 444 888888 5 8888 111111111111111 2 1111111111 77 222222 888888888888888888 333 2 33 2 777 7 2 2 2 2 5 2 2 44444 8 33 77777 33 88 44 11111 1 3 3 3 3 6 111 44 3 3 3 0000000000 1111 3 3 0 0 3 3 3 0000000 5555555555 6 555 6 3 6 3 3333333333333 0 3 7777 44 00 3 666 9999 666 00000000 55 4 8 222222 4 8 888888 11 4 4 2 8 55 4 4 8 66 5 0 5 77777 1 99999 6 55 4 1 5 5 5 5 11 77 22 22222 5 5 66 5 00 5 5 999 1 5 0 3 00 5 5 33333333333333 66 5 5 5 5 5 0000 5 22222 000000 77 8888 5 5 5 44444 33333333333333333 444444444 0 5 00000 5 66 5 0000 5 0000 33 888888888888888888 1 5 88 99 99 99 99 3 222222 5 99 5 5 000 555 44 44444 44444444444444 333 00000000 77 5 5 666666 5 55 5 5 4 6 6 99 666 7 99 666 99 99 6 6 3 44 11111111111111 6 111 6 55 6 6 888 99 6 6 111 99 99 11 88 6 111 6 6 6 999999 99 111 22222222222222222 1 111 4 22 0 7 111 6 3 1111111 1 999999 3 11 9 6 6 777777 6 9999 1 6 888 000 5 6 6 6666666 5 111 6666666 5 000000000000000 1 44444444444 6 99 77 6 111 1 5 8 11 88 8 000000 11 8 8 666 0 8 8 8 88 8 7777 8 444 8 11 6 0 999 0 8 3 99 99 6 111 3 2 99 6 6 2222222222 99 6 666666666 0000000000000000000000000000000000 55 6 99 99 6 111 6 666 444 444 8 8 0 444 44 3 3 1111 0 33 0 0 0 0 44 6666666 11 8 8 8 8 7777 444 444 33 777 0 55 0 2222222222222 1111 0 0 555555555 0 6 55555 11 0 9 0 66666666 1111 555555 0 0 3 3 99 6 2 7 3 3 3 3 3 2 0 7 3 7 0 88 7 6 00 3 3 6 7 6 0 777 0 0 7 7 3 444 5555555 1 6 1 0 11111 2 2 6 7 3 3 3 3 8888 3 222 7 3 3 7 2 0 6 0 0 3 777 3 7 7 44 0 1 1 55555555 0 3 555 44 99999 0 22 222 44 3 3 3333333333333 7 7 3 7 3 888888888888 3 00 6 3
lowQualScore : . .......... . . ... . . .. . . . . . ... .............................................................. . .... .... .. .... ... ... ...... . . .. .. .. .. ... . .. ... . ... . . ... . . ... ...... . .... ............... . .......... .. ...... .................. ... . .. . ... . . . . . . . . ..... . .. ..... .. .. .. ..... . . . . . . ... .. . . . .......... .... . . . . . . . ....... .......... . ... . . . . ............. . . .... .. .. . ... .... ... ........ .. . . ...... . . ...... .. . . . . .. . . . .. . . . ..... . ..... . .. . . . . . . .. .. .. ..... . . .. . .. . . ... . . . . .. . . .............. .. . . . . . .... . ..... ...... .. .... . . . ..... ................. ......... . . ..... . .. . .... . .... .. .................. . . .. .. .. .. .. . ...... . .. . . ... ... .. ..... .............. ... ........ .. . . ...... . .. . . . . . .. ... . .. ... .. .. . . . .. .............. . ... . .. . . ... .. . . ... .. .. .. .. . ... . . . ...... .. ... ................. . ... . .. . . ... . . ....... . ...... . .. . . . ...... . .... . . ... ... . . . ....... . ... ....... . ............... . ........... . .. .. . ... . . . .. .. . ...... .. . . ... . . . . .. . .... . ... . .. . . ... . . . .. .. . ... . . .. . . .......... .. . ......... .................................. .. . .. .. . ... . ... ... ... . . . ... .. . . .... . .. . . . . .. ....... .. . . . . .... ... ... .. ... . .. . ............. .... . . ......... . . ..... .. . . . ........ .... ...... . . . . .. . . . . . . . . . . . . . . .. . . .. . . . . . . ... . . . . . ... ....... . . . . ..... . . . . . . . . .... . ... . . . . . . . . . . ... . . . .. . . . ........ . . ... .. ..... . .. ... .. . . ............. . . . . . ............ . .. . .
lowQualScore : 1 8888888888 2 1 555 5 0 88 0 0 0 0 0 555 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0 5555 2222 11 2222 555 888 888888 1 2 66 88 44 11 999 2 99 555 4 444 0 5 000 7 7 777 333333 3 7777 333333333333333 7 7777777777 33 222222 444444444444444444 222 4 22 5 888 5 5 5 5 7 3 9 9 33333 6 99 11111 99 55 22 77777 4 3 3 3 3 7 777 66 3 3 3 4444444444 7777 3 3 5 1 3 3 3 8888888 1111111111 7 888 7 3 7 3 9999999999999 4 3 1111 33 00 6 444 0000 444 55555555 00 0 0 555555 0 0 000000 00 0 0 0 0 55 0 0 0 55 0 5 0 44444 4 33333 7 77 3 4 0 7 7 7 00 66 99 55555 0 0 00 0 66 0 5 000 7 0 8 2 66 0 0 88888888888888 99 0 0 0 0 0 6666 0 99999 777777 99 7777 7 7 7 33333 11111111111111111 999999999 4 0 11111 0 99 0 6666 0 6666 66 333333333333333333 0 7 33 22 22 22 22 3 111111 7 33 7 7 000 777 44 33333 44444444444444 999 77777777 99 7 7 444444 7 77 7 7 3 7 7 22 888 3 22 888 22 88 7 7 5 00 88888888888888 7 777 7 88 7 7 333 22 7 7 777 22 22 66 66 7 777 7 7 7 222222 22 777 88888888888888888 0 777 2 22 7 8 777 7 3 7777777 0 222222 5 88 8 7 7 777777 7 3333 0 7 777 000 0 7 7 2222222 7 777 4444444 7 333333333333333 4 00000000000 7 22 77 7 777 0 0 0 00 66 0 888888 00 0 0 222 8 0 0 8 88 0 0000 0 000 0 00 0 8 444 8 0 2 22 22 7 777 3 5 22 7 7 5555555555 22 7 777777777 0000000000000000000000000000000000 88 7 22 22 7 555 7 888 000 000 0 0 8 000 00 2 2 2222 0 22 0 0 8 8 44 0000000 00 0 0 0 0 0000 000 000 88 555 0 00 0 2222222222222 2222 0 0 222222222 8 5 00000 88 2 2 0 22222222 2222 555555 0 0 2 2 88 5 0 3 3 3 3 3 3 0 7 3 3 3 7 33 3 7 77 3 3 7 3 7 7 000 0 0 3 3 3 000 3333333 0 7 0 0 33333 0 0 7 3 3 3 3 3 3333 3 777 3 3 3 3 0 7 7 0 0 3 777 3 3 3 00 7 0 2 88888888 0 3 000 77 33333 7 00 000 77 3 3 3333333333333 3 3 3 3 3 333333333333 3 33 7 3
consensus : GGTAAGTAA-GT--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT---------TACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--T-CA-T--A-GA----AGA---AA-G-A------TC-AT-CC-A--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-A-TAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA----T--A-------T--GTA-G-TTGGCAA-AA--TTTTCAA-T---AA-CA-C-TG-TCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----AATTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-T----------AAAGTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----TT--CTA-TG---AA-TG-G-T-T----------T--CTTAGATGTT-GG----TATTGC--TGT-A---CAG---TCAA---ATG----T-A-A--AAAT-GGAAT-T------CA-T-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-GCAG-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCAT-TTAACTTGTGTTTTTGTGT--A--AC-GCCC-AGTTTCAATAGCC-AA-AGA-ATGAGAACTGATTCTGAAAATTTG-----TAAAA-CA-TTN-C-AAGACCTTGAGGATT-ACGAATTTAC-TGGAAAATATTTTTT-CTCTACAGAATCTTG-TTTTG-A-A-----T-A------ATGC--ATA-TGT-TCG-CA-GT-TT----G-CCA----CATT----G-TT--TG-TC-TGCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---C--GTGAATATTTA------TAAATCGCTC-AT---G-T-AACTT--A-TTA----GT-AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------ANT-TTT--AT--C--ATG--TA--TAGAACAT-TGT------ATA-T--CTAA-CTT-ATT---CAAA---ATAT-AATG-----AAT----GC--------TACT-A-TCC--------AACTACT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACA-TTG-TTT--TCA-T-ATACAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-GAAT-CTAC-AAGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TT-CGTAAA--TATT-TA-AAAC---AG--C-TTTTTAT-AA---CAT--CAAAA--TACATA-TGGGAATCGACCA-AG---TT-CAC-CTACAATAGCT-TGA------TTT--GAGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---AATATATA-TTCGAGAGTTTTAATG---TG-CA-TTT-------TNTC------GCAGTA-CATATTTATTAA-AG-A-G----TTTT-CTA-T--ACAATAATCNGGGCGTTT-GACG-GAACTTGTA---TCTGTATTTATTGTTCCC-CCCAAATTTCACATGCATA-AA-G-CAGTA-CT----G-GT-------TT-A----ACTG-TATGATCATA----CAAA---GT-GTATC--AG-GGTG-TGTA---TTTTNGGTT-T--AATA-TT-CCAAAAC-----ACTT--GACTAGTT-TAAAATAAG-CCTTTAAGGCTCTTTTTGTA-AAGA-TCNAA-TTG-AC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATG--AG-TAAAAA-CAATT-CCCAGATATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATT--TGATTT-TTA-TAGAAAAACTTT-------TT-ATC--TG-AT---------TTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAAT-TTT--TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-A-TGA-CAATAGCATTCAAGCTTTTTT-A-TACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCGGTTT-CAGAAATTAACACT---AAATCATCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAG-GAT-GTGTCACCTAATTTTGC-CGGA-------TTATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AAAGGTTTGGACTTA-GGT-------TTA--CCTCC----C-TGTCTAA-ACG--------CCACCNTTAGG-----TTCAAATGAAACTCGTAAGTTT-AT--------TTTGGAGTTT----TACAG--AT--ATTATG-TTT-GCCATGTACATACTCTTGA-ATGACTTTATAGAAAGGCCCCTTTATGTCAAGT-TG-GTGCAGCC-TGTGTAG-AAGAGCTG-AATGTGAAACGGTATCAAAGGCCTTAGAAAAATCAACA-AAGCAAACGTACAATT--TGGAACTT-AATATTTGTATA-TTTTTGAATAAGGGTTCT-AAGTATAAACATGTGGTCACTGGTTCTGGCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTTATAATATTGTTAGAGTCCAAGTAGTTTCGTAACCTTGTATTCAGTATGCTATTAA--ATACTTT-GGATA-AGCAAAGAAGTT-ATTGTT-A-TCCTCTA---TAGTANTTTGATGGGTCANA-AGGGCTATCATTTTTATGAAT-AGGCTTTAATAAAGCCTATTTCCCACTCCCTTTGGGTATT-TGCCAG-AG-GACAA-GACAAG----AT-TAAATAATTT-T-AGCATATGTGGT-AAAATATAT-GTACGTCGGCTTTCA-ACATCTCATT-TTTAATGCCAT-CTAATCGCA-GCTTGATTTATTATTTTTTAGATGTTTTTATTGCATCGATGATTTTCTTTTCTNTAATTG-A-TAAATCTAAC-GAAGT-AATG--TTGATATTTCTGCTGACTTGGACAANNAATCTTCAAAATATTTAATTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAGATATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGA------------CTTTC-AAACCGAGTTTCCAG-TATGATA
Reference ( family-3541 ) : GGTAAGTAA-GT--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT---------TACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--T-CA-T--A-GA----AGA---AA-G-A------TC-AT-C--A--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-A-TAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA----T--A-------T--GTA-G-TTGGCAA-AA--TTTTCAA-T---AA-CA-C-TG-TCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----AATTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-T----------AAAGTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----TT--CTA-TG---AA-TG-G-T-T----------T--CTTAGATGTT-GG----TATTGC--TGT-A---CAG---TCAA---ATG----T-A-A--AAAT-GGAAT-T------CA-T-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-GCAG-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCAT-TTAACTTGTGTTTTTGTGT--A--AC-GCCC-AGTTTCAATAGCC-AA-AGA-ATGAGAACTGATTCTGAAAATTTG-----TAAAA-CA-TTN-C-AAGACCTTGAGGATT-ACGAATTTAC-TNGAAAATATTTTTT-CTCTACAGAATCTTG-TTTTG-A-A-----T-A------ATGC--ATA-TGT-TCG-CA-GT-TT----G-CCA----CATT----G-TT--TG-TC-TGCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---C--GTGAATATTTA------TAAATCGCTC-AT---G-T-AACTT--A-TTA----GT-AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------ANT-TTT--AT--C--ATG--TA--TAGAACAT-TGT------ATA-T--CTAA-CTT-ATT---CAAA---ATAT-AATG-----AAT----GC--------TACT-A-TCC--------AACTACT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACA-TTG-TTT--TCA-T-ATACAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-GAAT-CTAC-AAGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TT-CGTAAA--TATT-TA-AAAC---AG--C-TTTTTAT-AA---CAT--CAAAA--TACATA-TGGGAATCGACCA-AG---TT-CAC-CTACAATAGCT-TGA------TTT--GAGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---AATATATA-TTCGAGAGTTTTAATG---TG-CA-TTT-------TNTC------GCAGTA-CATATTTATTAA-AG-A-G----TTTT-CTA-T--ACAATAATCNGGGCGTTT-GACG-GAACTTGTA---TCTGTATTTATTGTTCCC-CCCAAATTTCACATGCATA-AA-G-CAGTA-CT----G-GT-------TT-A----ACTG-TATGATCATA----CAAA---GT-GTATC--AG-GGTG-TGTA---TTTTNGGTT-T--AATA-TT-CCAAAAC-----ACTT--GACTAGTT-TAAAATAAG-CCTTTAAGGCTCTTTTTGTA-AAGA-TCNAA-TTG-AC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATG--AG-TAAAAA-CAATT-CCCAGATATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATT--TGATTT-TTA-TAGAAAAACTTT-------TT-ATC--TG-AT---------TTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAAT-TTT--TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-A-TGA-CAATAGCATTCAAGCTTTTTT-A-TACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCGGTTT-CAGAAATTAACACT---AAATCATCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAG-GAT-GTGTCACCTAATTTTGC-CGGA-------TTATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AAAGGTTTGGACTTA-GGT-------TTA--CCTCC----C-TGTCTAA-ACG--------CCACCNTTAGG-----TTCAAATGAAACTCGTAAGTTT-AT--------TTTGGAGTTT----TACAG--AT--ATTATG-TTT-GCCATGTACATACTCTTGA-ATGACTTTATAGAAAGGCCCCTTTATGTCAAGT-TG-GTGCAGCC-TGTGTAG-AAGAGCTG-AATGTGAAACGGTATCAAAGGCCTTAGAAAAATCAACA-AAGCAAACGTACAATT--TGGAACTT-AATATTTGTATA-TTTTTGAATAAGGGTTCT-AAGTATAAACATGTGGTCACTGGTTCTGGCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTTATAATATTGTTAGAGTCCAAGTAGTTTCGTAACCTTGTATTCAGTATGCTATTAA--ATACTTT-GGATA-AGCAAAGAAGTT-ATTGTT-A-TCCTCTA---TAGTANTTTGATGGGTCANA-AGGGCTATCATTTTTATGAAT-AGGCTTTAATAAAGCCTATTTCCCACTCCCTTTGGGTATT-TGCCAG-AG-GACAA-GACAAG----AT-TAAATAATTT-T-AGCATATGTGGT-AAAATATAT-GTACGTCGGCTTTCA-ACATCTCATT-TTTAATGCCAT-CTAATCGCA-GCTTGATTTATTATTTTTTAGATGTTTTTATTGCATCGATGATTTTCTTTTCTNTAATTG-A-TAAATCTAAC-GAAGT-AATG--TTGATATTTCTGCTGACTTGGACAANNAATCTTCAAAATATTTAATTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAGATATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGA------------CTTTC-AAACCGAGTTTCCAG-TATGATA
gi|1 : GTAAGTAAAGT--TA----A-TTTTATTCTCCGAA-T-T--TT-G-GG-CCAC-GAAGG---GCAT----------ACAA-G------------ATAT---------A--------------------AAA-AA----CA-C--A-GA----AGA---AA-G-T------GC-AT-CC-A--AAT-GA--TGA-AGATAA-AGT--AA-A-TAACA-AAGT---TA-T-GAA--T-A-AATC---AA---T--T-TT-C--TCA---------------ATT-G-----------GAG--CAGCT------ATA----C--T-------T--GTA-GATTGGCAA-AT--TTCTCAA-CCTAAA-CA-C-TG-TCA-CAT-T-CGAT-----TACT-CCAA-----T--AA--G--CCAAATA-----A-TTTTTC-T-CTGATCTA-CA----AGGT--T-T-AAT----------AAAGTTTTTTA--A-AAC-AAAGT---T-CAAT-------GGAT-----T---CTA-TG---AA-TG-G-T-T----------TGTCTTAAATGTG-TG----TAT-GC--TGT-A---CAA---TCAA---ATG----T-A-A--AA-T-GGAATGT------CA-T-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-GCAG-ACAGCT--ACATTTTC-TCTCAT-T--ACTTGTGTTTTTGTGTTAA--AC-GCCCGAGTTTCAATAGCC-AACAGA-ATGAGAACTAATTCT-AAAATTTG-----TAAAAACA-TTTTC-AAGAC-TTGAGGATT-AC-AATCT-----GAAAATATTTTT--CTCTACAGAATCTT--TTTTG-A-AC----T-A------ATGGGAATAATGT-TCG-CA-GTGTT----G-CCA----CATT----GGTT--TG-TCCTGCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---CCAGTGAA-ATT---------AAATCGCTC-AT---GCT-AACTT--T-ATA----GT-AACAA----TTT-GATTACGGA----AT------ATT-TTT--ATATC--ATG--TA--TAGAACATCTGT------ATAGT--CTAAGCTT-ATT---CAAAC--ATA--AATG-----AGA----GC--------TACT-AGTTC--------AACTACT--T-TGTTTG-T------TA-TCGAA-TACAAT-ACAGTTG-TTTCATTA-T-AT-CAGCA--TAT-TCTT--AA-GAAT-GAAT-CTAC-AGGGGGCGAA----------ATCTA-AAATTC---TT-CGAAAAA-TATT-TA-AAAC---AG--CGTTTTTAT-AAACACAT--CAAAA--TACATA---GGAATCGACCA-AG---TTTCAC-CTACAATAGCT-TGA------TTT--GAG----CCTTTTTAGGTAC----------AGA----CCA-A---AATATAT--TTCAAGAATTTTAATG---TGGCAATTT-------TTTC------GCAGTAACATGTTTATTAA-AG-ACG----TTTT-CTAGT--ACAATAATCAGGGCGTTTTGACG-GAACTTGTA---TCTGTATTTATTGTTCCC-C--AAATTTCACATGCATA-AAAG-CAGTAACT----GTGT-------TTTA----ACTG-TATGATCATA----CA-----GTCGTATC--AG-GGTG-TGTA---TTTTTGGTTAT--AAT--TT-CCAAAAC-----ACTTTTGACTAGTT-TAAAATAAGGCCTTTAAGGCT---TTTGTAGAAGA-TCCAAATTG-AC----AACATGTGTA---AGGAGGCCTGATG--AGGTAAAAA-CAATTGCCCAGATATT---G--TACGATGAACACT---TGTTCTGA--ATT--TGATTT-TTA-TAGAAAAACTTT-------TT-ATC--TG-AT---------TTTT-T-------------ACAACGTTTTTTCTACAGAAATATT-GACAAT-TTT--T-GTCTTTCTGAGGTTGACCAGGA-TAGGCAAAATTTGA-TGA-CAATAGCATTCAAGCCTTTTTAA-TACAC---CGCTGTGAAGGCCCTCCCCTCGGTTT--AGAAATTAACACT---AAATCATCAGCAT-C----AACATAACA---TTAAGAGATGGTGTCACCT-ATTTTGC-CGGA-------TTATCAT--TATC-GTCGAAAA-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAATATTATTTTAA-AAAGGTTTGGACTTA-GG--------TTA--CCTCC----C-TGTCTTA-ACAC-------CCACACTTA-G-----TTCAAATG-AACTCGTAAGTTTGAT--------TTTGGAGTTT----TAGAG---T--ATTATGTTTT-GCCATGTACATAC-CTTGA-TTGACTTTATA-AAAGG-CCCTTTATGTCAAGTCTGTGTGCAGCCTTGTGTAGAAAGAGCTGAAATGT--AACGGTATCAAAGGCCTTAG-AAAATCAACACAAGC-AACATACAATTGCTGGAACTT--ATATTTGTATATTTTTTGAATAAGGGTTCTAAAGTATAAACATGTGGTCACTGGTTCT-GCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTTAT-ATATTGTTAGAGT-CAAGTAGTTTCGTACCTTTGTATTCAGTATGCTATTAA--ATACTTT-GGAAATAGCAAAGAAGTTGATTGTTAA-TCCTCTA---TA--ATTTTGAT-GGTCATA-AGGGCTATCATTTTTATGAAT-AGGTTTTAATAAAGCCTATTT-CCATTCCCTTTGGG-ATTCTGCCAACAGAAACAACGACAAG----AT-TAAACAATTTATAAGCATATGTGGTAAAAATATAT-GTACATCGG-TTTCA-ACATCTCATT-TTTAATGCCAT-CTAATCGCA-GCTTGATTTATTATCTTTCAGATGTTTTTATTGCATCAATGATTTTCTTTTCTTTAATTG-A-TAAATCTAAC-GAAGT-AATG--TTGATATTTCTGCTGACTTGGACAATAAATCTTCAAAATATTTAATTCTGGGTATCAAATTTACTAATCAATACTGAATAATGTTTGTAAAATGATTTACACCCATTGTTCACTAGATATCTT-ATCGGACT-ATCTTGCGGATTGCTGATTGATTCAAATTCTTTC-AAA---AGTTT-CAG-TATG
gi|10 : aaAAGTAA-AT--T--------TT-ATA-TCA--A-T-A--TT-T-GG-CC-C-AG------GCAT---------AACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--A-CA-ACAA-GA----AGA---AA---A------CC-ATTC--ACCAAT-GA--T---AGATAA-CGT--AA-C-TAACA-AAGT---TAAT-GA---T-A-AATC---AA---AATT-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAGAGCAGCTT-----ATA----TTAA-------T--GTA-G-TTGGACA-AA--TT---AG-T---AATCG-C-TG-TCA-CATGT-C-ATCTTTATACTGC--A-----T--AAAAG--C-AATTA-----AATTATTC-T-CT-AT-TAACATACCAAGT--T-T-A-T----------AA-GTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----T---CTA-TG---AAATG-G-T-T----------T--TCTTGATGTT-AG----TAT-GCCATGT-AACACAA---TCAATG-ATG------A-A--AAAT-GGAAT-TAA----CA-TGCTTATC---AAAGCAC-AG-TACAG-A--CTT-GCAG-ACA-CTTAACATTTTC-TCACAT-TTA-CATGTGTTTTTGTGT--A--AC-GCC--A---TCAA-AGCC-AA-AGA-ATGAGAACTGGTTCTGAAATATGG-----TAAAA-CA-TTT-C-AAGA-CTTGAGGATT-ATGAAgcat
gi|11 : taagctaATAGAGCATAA---TT-CCC-CCATAACTGTT-TGG------TTT--GAGG---TCTTCTTGTGTAT----------T------CCATATAGAGTATGTA-CTTGAGGGGTTTAATG---TG-AA-GTT-------TATC------AC--TA-AATA-TGATTCATGG-A-C----TTTT-CAA-C--ATTATAATTTGGGCTCTT-TACATCAGCAGGT----TTTGAATTTGTAGTT--T-CCCAAATT--------ACA-AA-A-CA----------G-GT-------TT-T----ACAG-TGTGATAAAA----AAAAAAGAT-GCAAC--AA-AATACTGGA---ATTTGGCCT-TGCAAT--TT-CAAAAAC-----ATTT--AATTAATT-TAAAGAAAG-CATTCAAACCAC-GCTTATA-CAGG-TCTTG-TTG-ACAATTAACATATA-ATCCAAAGG-CAT--TG--AA-T-ATAC-CA----CGTAAATATTAATGAATAAAA-GA-CAATGAATGTTC-TAT--TTCCTTATCT-TTA-TAAACAAATTTTAAGTTTCTT-ACCTTTGCAT---------TCTTGT-------------AAAA---------------AAAAT--G----T-TGTCCTTGTCTTTTTCAAATTAAC--AGA-GAGACAATGTTT-A-Taa
gi|12 : gTAAGTAA-GT--TA----T-TTT-ATT-TCC--AAT-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT--------------AA------------ATAT---------A--------------------CAT-AAA-C-CA-C--A-GA----AGA---G--G-A------CC-AT-CC-A--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-A-TAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TTTC--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA----T--A-------T--GTA---TTGGCAA-AA--TTTTCAA-T---AA-CA-C-TG-TCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----ATATTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-T----------AAAGTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGA------TT--CTA-TG----A-TG-GTT-T----------T--CTTAGATGTT-GG----TA-TGC--TGT-A---CAA---CCAA---ATG----T---A--AAAT-GGTAT-T------CA-T-CTT--C---AA--CACAAG-TCCAG-A--CTT-GCAG-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCAC-TT-ACTTGTGTTTTTGTcata
gi|13 : -T--TT-G-GA-CC-C-AGAGT---GCAT----------ACAAAG------------A-AT---------A--------------------CAT-AG--TTCA-T--A--A----ATA---CA-C-A------TC-AT-A--A--AA---A--T----GATAA-AGT--AATA-TAACC-AGGT---TA-T-GA---T-A-AATC---TATTTT--T-TT-T--TCA---------------ATA-GT----------GAG--CAGC-----------------------------TA-A-TT-------A--TTGTCAA-T---AA-CA-C-TG-TCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----ACTTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---TATGT--T-T-A-T----------AAAGTAATT----A-TAC-AAGGTGT-T-TA-T-------GAA------CT--CTA-TG---AA-TG-G-TGC----------C--CTTAGGTGTT-GG----TA-TGC--TAT-A---CAG---TCAA---ATA----T-ACA--AAAT-GGAAA-T------CA-T-CCT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-ATGCGT-GCGC-ACGCCT--GCAT
gi|14 : g--TA----A-TTT--TT-TCC--A-A-T--TT-T-TG-CC-C-AGAGG---GCAT----------ACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AAA-C-CA-C--A-GA----AGA---AA-G-A------CC-AT-CC-A--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-AATAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TTTC--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA----T--AATTTA--T--GTA-G-TTGGCAA-AA--TTTTCAA-T---AA-CA-C-TG-TCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----AATTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T---C----------AAAG-TTTT----A-TACAAAAGTAT-T-CA-T-------GGATCTATATT--CTA-TG---AA-TG-GTT-T----------T--CTTAGATGTT-GG----T
gi|15 : aaggtagTAAGTAA-GT---A----A-TTT-----TCA--A-T-T--TT-G-GG-GT-G-AGAGG---GCAT---------CATACAA------------ATA-----------------------------------AA--T-CA-G--A-GTTCCTGTA---CA-T-G------TT-AT-CT-A--AAA-GG--C---GTATAATATT--AA-A-TTACA-AGTT---TA-T-GA---T-ATAAT----AA---ACTT-TT-C--CCC---------------ATA-AT----------GAA--CAGCTCTAGAGATA----T--A-------G--GGA-A-TTGGCAA-AA--TTTCCAT-T---AA-CA-T-CG-TCA-CAT-g
gi|16 : aaA----G-TTT-ATT-CCA--A-T-T--TT-G-GGCCC-C-AAAGG---GCAT---------AATAGAA------------GTA----------A--------------------CA--GC--T-CA-T--A--A----AGA---AA-G-AAATGTCCC-AA-A--A--AAT-GAAGT---GGGAAA-AGTTAAA-A-TATCA-cacacaagtctatgtataactataaaatattcatggactct
gi|17 : aaagaaaataaatttgagaaaaaatatcaattttgaaataagaaaataaaatttggaaatattcattatgatatctataggtgtaaagataatataCCC-AGTTTAAATAGCC-AA-AAG-ATGAGAACTGATTATG-AAATTTA-----GAAAA-CA-TTG-C-AAGAC---GAGGATT-GCGAA-TTAC-TGAAAAATG--TTTT-CTCTACAGA-----------------------A------ATGC--A-A-TGT-TCGCCA-GT-TT----GTCCA-----ATT----G--T--TG-TC-TGCA-ATTGCCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------CCTTC--ATGAATATTTCTCTTTTTAAATCTATC-AG---A-T-AATTT--A-TTA----GT-AACAA----Ttggaatcacaacttacatgtatgtgg
gi|18 : tacA-AAGT---TA-TAGA---T-A-A-TC---AA---T--TGTT-C--TCA---------------TTT-GT----------GAG--CAG---------TA----T--A-------T--ATA-G-TTGGCAA------TTTCAA-T---AAGCA-T-T---CA-CAT-TAC-AT-----TA-T-C--A-----CTAAA--G--CCAAATAC----AATTTCTT-TACT-AT-TA-CA---CAGGT--T-TTA-T----------AAATTTTTTGCCTA-TAC-AA-GTAT-TTCA-T-------GGAT-----TCTGCT--TG---AA-TG-G-T-T----------TTTCTTA-ATGTT-GG----TATGGC--TGTTA---CA----TCAA---ATG----T-A-A--AAata
gi|19 : TGGCAACGA--TTTT-AA-T---AA-CA-C-CG-TCA-C-T-T-C-AT-----TGCTTC--A-----T--A---G--CCAGGTA-----AAGTT----------------------GTT--T-T-A-T----------CAAATTCTT----A-T-C-AATGTGT-T-CA-A-------GGA----------CTGGTG---AA-TG-G-T-T----------TT-CGTACA-GTT-GAATGATAT-AC--AAT-A---CAG---TCAA---TT---------A--CAAT-GGAAT-T------CA-T-CTT-------A--CAA-AGTT-CAGCA--TTT-ACAG-ACA-GT--GCATTTTCTTTTCATATTACC---CGTTTTTG
gi|2 : acGGTAAGTAA-GT--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCAT---------TACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--C-CA-C--A-GA----AGA---AA-G-A------CC-AT-C--A--CAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-T-TAA-A-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---A--T-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAG--CAGCT------ATA----T--A----------GTA-G-TTGGCAA-AA--TTTTCAAAT---AA-CAAC-TG-TCAGCAT---C-GT-----TACT-C--A-----T--AG------CAAA-A-----AATTTTTC-T-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-T----------AAAGTTTTC----AATAA-CAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----TT--CTA-TG---A--TG-G-T-T----------T--CTTAGATGTTTGG----TATTGC--TGT-A---CAC---TCAG---ATG----T-A-A--AAAT-GGAAT-T------C--T-CTT------AA--CAC-AG-T--AG-A--CTT-GCAGGACA-CT--ACATTTTC-TCTCAT-TTAAATTGTGTTTTTGGTT--AGTAC-GCCCCAGTTTCAATAGCCCAA-AGATATG-GAACTGATTCTGAAAATTTG-----TAAAA-CA-TTT-C-AAGACCTTCAGGATT-ACGAATTTACATGAAAAATATTTTTTTCTCTACAGAATTTTG-TTTTG-ATA-----C-A------ATGA--ATA-TGT-TCG-CAAGT-TT----G-CCA----CATT----G-TT--TG-TC-TTCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---C--ATGAATATTTA-------AAATCGTCC-AT-----T-AAACT--A-T-A----GT-AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------AAT-TTC--AT--C--ATG--TA--TAGAACAT-TGT------ATA-T--CTAA-CTT-ATT---CAAA---ATATTAATG-----AAT----GC--------TACT-A-GTC--------AACTACT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACA-TTG-TTT---CA-T-ATACAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-GAAT-CTAC-AGGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TT-CGTAAA--TATT-TT-AAAC---AG--C-TTTTTAT-AA---CAT--CAAAA--TAC-TA-TGGGAATCGACCA-AG---TT-CAC-CTACAATAGCT-TGA------TTT--GAGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---AATATAT--TTCAAGAATTTTTATG---TG-CA-TTT-------TTTC------GCAGTA--GTATTTATTAA-AA-A-G----TTTTTCTA-T--ACAATAATCCAGGCGTTT-GACG-GAACTTGTA----CTGTATTTATTGTTCCCACCCAAATTTCACATGCATA-AA-G-CAGTA-CT----G-GT-------TT-A----GCTGCTATGATCATA----CAAA---GT-GTATC--AG-GGTG-TGTA---TTTTTGGTT-T--AATA-TT-CCGAAACCAAAAACTT--GACTAGTT-TAAAATAAG-CCTTTAAGGCTCTTTTTGTA-AAGA-TC-AA-TTG-AC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATG--AG-TAAA---CAATT-CCCAGATATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATT--TGAATT-GTA-TAGAAAAACTTT----------ATC--TG-AT---------TTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAAT-TTT--TTGTCTTTCTGGGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-A-TGA-CAATAGCATTCAAGCTTTTTT-A-TACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCAGTTT-CGAAAATAAACACT---A--TT-TCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAG-GAT-GGTTCACCTAATTT-GT--GGA-------TTATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TGGT---AGATC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AATGGTCTG-ACTTA-GGT-------TTA--TCTCC----CGCGTCTAA-AC----------CACCTTTAGG-----TTCAAATGAAACTCGTAAGTTT-AT--------TTTGGAGCTT----TACAG--AT--ATTATG-TTT-GCCATGTACATACTCTTGG-ATGACTTTATAAAAAGGTCCCTTTATGTCAAGT-TG-GTGCAACC-TGTGTAG-AAGAGCTG-AATGTGAAACAGTATCAAAGGCCTTGGAAAAATTAATA-AAGCAAACATACAATT--TGG-ACTTAAATATTTGTATA-TTTTTGAATAAGGGTTCT-AAGTATAAACATGTGGTCACTGGTTCTGGCGTTTGGTTGAAAACCAATCTGAACTTTATTAATAATATTGTTAGAGTCCAAGTAGTTTTGTAACCTTGTATTCAGTATGCTATCAA--ATACTTT-GGATA-AGC-AAGAAGTT-ATTGTT-ATTCCTCTATACTAGTAGTTTGATGGGTCATA-TGGGCTATCGTTTTTATGAAT-AGG-TTTAATAAAGCCTATTTTCCA-TTCCTTTGGGTATT-TGCCAG-AA-GACAA-GACAAG----AT-TAAATAATTT-T-AGCATATGTGGT-AAAATATAT-G-AC-TTGGCTTTCA-ACATCTCATT-TTTAATGCCATCCTAATC-CA-GC-TGATTT-TTATTCTTTAGATG-TTTTATTGCATCAATGATTTTCTTTTTTTTAGTTGTACTAAATCTAAC-GAGGTAAATGTTTTGAT-TTTCT--T--CTTGG-CAAGTAAT-TTCAAAATATTT-ATTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAG-TATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGA------------CTTTC-AAACTGAGTTTCCAGTTATGATA
gi|20 : TTTTTGTAATCG-A-TA--TGTAGCTGTAGT-AAT---CTGA-ACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--AAAATATTTA-TTCTGGGTATCAAATTTACTAG-CAATACAGAACAATG-TTGTAAAATGATTT-------------ACTAGATATCTTAATC-GACTAATCTTGC-GATTGTTGA------------CTTTCAAAACCGAGTTTCCAG-TATGATA
gi|21 : T--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATT--TGAATT-GTA-TAGAAAAACTTT-------TT-ATC--TG-AT---------TTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAAT-TTT---TGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-A-TGA-CAATAGCATTCAAGCTTTTTT-A-TACAT---CGCTG---AAGCCCT-CCTTCAGTTT-CAGAAATTAACACT---
gi|22 : --TA----A-TTT-ATT-TCA--AAT-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---GCATAACATGGAATACAGAGTTC---------ATAT---------G--------------------CATGAA--T-CA-T--G-AA----AG-----T-G-A------TCAAT-C--A--AAA-GA--T---CAATAA-AAT----------------T---TA-C-GA---T-A-AATC---AA---C--TCTT-C--T-----------------------------------------CT------ATA-------A-------T--G-------AGCAC-AA--TTTCCTG-T---AA-CA-C-CG-TCA-AAT-T-C-GT-----TACT-C--A-----T--A
gi|23 : gtacatgTCAGACAGGGCTATCATTCTTATGAATTA--CTTTGATAAAGCCTGTATCCCACTCC-TTTGAATATT-TGCCAG-AG-GACAA-GATAAATTACATGTAGATAATTT-C-AGCAAA--TGGT-ACAATATGTGGTACGGTGGCTAGTA-ACATTTCATT-TTCATTG
gi|25 : TAAATAA-GA--AA----AGTTT-ATT-CCA--A-T-T--TT-G-GG-CC-CAAGAGG---GCAT---------AATAGAA------------GTATTATTTAAAAA--------------------CAT-----T-CA-T----GA----AGA---AA-G-A------
gi|26 : agtttaTAA-GT--TA----A-TTC-ATT-TTC--A-A-AAATT-GCGG-CC-C-AGAGGAATGCAT---------TACAGAG------------ATAT---------AAGGTTCAAATA---------CAG-AA--T-AA-T--A-AA----AGA---AT-G-A------TT-TC-C--A--AAA-GA--T---AGATAA-AGT--AG-A-Taatgtccaaaaagaaggaagaaattattttttacaatattataacatacatggatgtgg
gi|27 : agaTT-ATT-TCCA-A-T-T--TT-G-GC-CC-C-A-AGG---GCAA---------TA-AAAGAATACCAGGTTCACAT---------A--------------------CATAAA--T-CA-T--A-AA----AGAGCTAA-C-A------TT-AT-CT-A--AAT-GA--T---AGATAC-TATA-AA-A-TAACA-AGGT---TA-T-ggaatgtgatttggtcaatca
gi|28 : aagtagtattaaagtaAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA-------------------------A-G-A------CC-AT-CC-A--AAT-GA--TTATAGATAA-AGT--AAGA-TTACA-AAGT---TA-T-GA---TTA-AATC---AA---A--T-TT-CC-TCA---------------ATTTGT----------GAG--CAGCT------ATAGT--T--G-------T--GT--G-TT----A-AA--TTc
gi|29 : TTTCAGACATTTCATTATTTTATCCCAC-CCAA--ACATGCTTGATTTATTATTTTTTAGCT-TTGTCACGGCAGAGATTATTTCCTTTTCTATATTT--------CCTAAC-Ggg
gi|3 : cacaggTAAGTAA-GTAATATCTTA-TTT-ATT-TCC--AAT-T--TT-G-GG-CC-C-AG-GG---GCAT----------ACAA-G------------ATAT---------AAC------------------CAT-AAACT-CAAC--A-GA----AGA---AGTGCA------TC--T-C--A--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AACA-TAACATAAGT---TA-T-GGGACT-C-ACTCACAAA---A--T-TT----TCATGACACAGTACACTGATT-GTTACCTGATACGAG--CAGCT------GCA----T--ACACTCACT--GTA-G-TTGGCAA-AATTTTTTCAA-TTA-AA-CA-CACGTTCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAACATCCACGATTTTCT-C-CT-AT-TA-AA---CAGGTGATAT-A-TACCTCCGATAAAAGTATTT----A-TAC--AAGTATAT-CA-TCATACAAGGA------TT--CTATTGTGTAA-TGTG-T-TTATAAAATTAT--CTTAAATGTT-GG----TA-TGC--TGT-A---CCGGCATCAATTCATGGCTAC-A-AACAAAT-GGAAC-TTGGAAACA-T-TCT--CCCAAA--CAG-CG-T-CAGTA--CTTAACCG-ATA-CTCGACACT
gi|3 : acccacgggtaATTCCAAAAACTTACTAAATGAAA-CAATTG-CCAAGAC-TTGAGGATTCACGAATT-AC-TCGAAAATATTTTTC-CTCTACAGAATCTTG-TTTTGAA-A-----TGA------ATGA--ATA-TGT-TCG-CA-GT-TTTGCCA-CCA----CATTGGGGG-TTAATG-GT-CGCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACAAATGCCGCACC---T--GCGAATAATTA------TTAATCGCTC-ATAGCG-TGGACTTTAA-TTAAAAGATAAACAAGTTTTT--GAC-AC--A----ATTATTCCATT-GTTCAAT--C--ATGACTAATTAGAACAT-TGTA-----ATA-TC-CTAA-CTT-ATTTAACAAAAATATAT-AATG-----AATG---GCGGTAACTGTAGT-A-TCTTTCCACAAAATAACTAAT-TTGTTG-TTCACTATA-TCCTA-TACACT-CAA-TTGATTT--TCAGT-ATACAGCAGTT-C-TCTTGAAA-TAATCGAAT-CTACAAAGGGG---A----------ATCTA-AAATTCTCTTC-CGAAAA--TATTGTACGAACATAAGATC-TTTTTAT-AA---CAT--CAAAATTTACATAGTGGAATTCGACCA-AGTTTTT-CACGCTACAATAAATCTGAAGACCCTTTTGGAGGTATCCTTTTTATGTAC----------AAGTAACCTACA---AATAT-TATTTCAAGAGACTTTATGTTTTG-CA-TTTGGTTTAATCTTACAATAGCAGTA-CAT-TTTATTAA-AG-A-AGACCTTTT-CTA-TACACAATAAaccaatggtttaaacattcttttaaatctattttatctatctcaataatgtttccttgctgtaggacgcccggacgcagggaatttcaataaatgcctataagaaatgaaggctcttggatgatgagagagaactgattcatatttaccccacaacgattatttgtattccaaaaacttactaaatgaaacaattgccaagacttgaggattcacgaattactcgaaaatatttttcctctacagaatcttgttttgaaatgaatgaatatgttcgcagttttgccaccacattgggggttaatggtcgcaatgtctgaaagtgtactacaaatgccgcacctgcgaataattattaatcgctcatagcgtggactttaattaaaagataaacaagtttttgacacaattattccattgttcaatcatgactaattagaacattgtaatatcctaacttatttaacaaaaatatataatgaatggcggtaactgtagtatctttccacaaaataactaatttgttgttcactatatcctatacactcaattgattttcagtatacagcagttctcttgaaataatcgaatctacaaaggggaatctaaaattctcttccgaaaatattgtacgaacataagatctttttataacatcaaaatttacatagtggaattcgaccaagtttttcacgctacaataaatctgaagacccttttggaggtatcctttttatgtacaagtaacctacaaatattatttcaagagactttatgttttgcatttggtttaatcttacaatagcagtacattttattaaagaagaccttttctatacacaataaatggacaggggcccaaacgttgtatat
gi|30 : acccacgggtataagtaagtaatatcttatttatttccaattttgggcccaggggcatacaagatataaccataaactcaacagaagaagtgcatctcaaatgatagataaagtaacataacataagttatgggactcactcacaaaattttcatgacacagtacactgattgttacctgatacgagcagctgcatacactcactgtagttggcaaaattttttcaattaaacacacgttcacattcattactcataagccaaacatccacgattttctcctattaaacaggtgatatatacctccgataaaagtatttatacaagtatatcatcatacaaggattctattgtgtaatgtgtttataaaattatcttaaatgttggtatgctgtaccggcatcaattcatggctacaaacaaatggaacttggaaacattctcccaaacagcgtcagtacttaaccgatactcgacactaccaatggtttaaacattcttttaaatctattttatctatctcaataatgtttccttgctgtaggacgcccggacgcagggaatttcaataaatgcctataagaaatgaaggctcttggatgatgagagagaactgattcatatttaccccacaacgattatttgtTAAGTAA-GT---A----A-TTC-ATT-TTC--A-AAT--TT-G-GG-CC-C-AGAGA---GCATACAGAGAA-TACAGAGTTC---------ATAT---------A--------------------CATGAA--T-AA-T--A-AA----AGA---AT-G-A------TT-AT-C--C--AAA-GA--T---AGATAA-AGatggacaggggcccaaacgttgtatat
gi|31 : c-AA--T-CA-T--A-AA----AGA---GA-G-A------TT-AT-CCCA--AA--GA--T---AGGTAA-CGTG-AA-A-TAAC-------------------------T------------T-TT-C--TCA---------------GTA-AT----------GAA--CAGCT------ATA----T--G-------C--GT------------AA--TTTTCAA-T---GA-CA-T-TG-T
gi|32 : attagatgGTAAGTAA-TT--TT----T-TTT--TT-TCA--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGGGG---GAATACAAAGAA-TACAGAGTTT---------ATCT---------A--------------------CATAAA--T-CA-T--A-GA----AGA---GA-G-A------TT-AT-C--C--AA
gi|33 : aACTTGTA---TCTGTATTTATTGTTCCC-C--AAAT----------------G-CAGTA-CTTACCG-GT-------TG-A----CCTG-TATGATCATA----C-AA---GT-GTATC--A--GGTA-TGCA---TT
gi|34 : TCAGTATGCTATTAC---TCCTTT-GGATA-AGCAA-GAAGTT-ATAGTT----CTTCT------GTAATGTGATGGGTCAGA-AGGACTATCATT
gi|36 : -TTT-ATT-CCA--A-T-T--TT-G-GG-CC-C-AGAGG---ACA----------TATAAAA------------GTA
gi|37 : acacgT------ATA-T--TTAA-CTT-ATT---CAAA---ATAT-AATG-----AATCAATGC--------TACT-ACTCC--------AACTACT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACatgatagttttataaagttgaaaacatatct
gi|39 : TTTTT-CCCTTGAAAAGCTTC-TTTTG-A-A-----T-AGGCCTAATCC--ATA-TGT-TCG-TA-AC-TT----G-CC
gi|4 : taGTAAGTAA-GT---A----A-TTT-ATT-TCC--AAT-T--TT-G-GG-TC-C-AGAGG---GCATACAAAGAA-TACAGAGTTC---------ATGT---------A--------------------CAT-AAG-T-CA-T--A-AA----A-A---GA-G-A------TT-AT-CC-A--AAT-GA--T---AGATAA-AGT--AA-AATAACA-AAGT---TA-T-GA---T-A-AATC---AA---C--T-TTTC--TCA---------------ATT-GT----------G-------------------------------------TA-G-TTGGCAA-AA--TTTTCAA-T---AA-CA-C-TG-TCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CCAAATA-----TTTTTTTC-T-CT-AT-TG-CA---TGGGT--T-T-A-T----------AAAGTTCTT----A-TAC-AAAGTGT-T-CA-T-------GGA------TT--CTA-TG---AA-TG-G-T-T----------TTCTTTAG-TGTT-GG----TA-TGC--TGT-A---CAG---TAAA---ATA----T---A--AAAT-GGAAT-T------CA-T-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-GCAG-ACA-CT--ACATTTT-------T-TTG---TGTG----TGTGT--A--AC-GCCC-AGTTTCCATAGCC-AA-AGA-ATGAGAACTG---------------------AAA-CA-TTA-C-AAGA-CTTGAGGATT-ACGAA-TTAC-TGAAAAATA-CTTTT-CTCTTCAGAATCTTG-TTTTG-A-A-----T-A------ATGC--ATA-TGT-TCG-CA-GT-TT----G-CCA----CATT----G-TT--TG-TC-TGCA-A-TGTCTGA-AAGTGTACT-----ACA----------C---C--ATGAATATT--------TAAATCGCTC-AT---G-T-AACTT--A-TTA----GT-AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------AGT-TTT--AT--C--ATG--TA--TAAAACAC-TGT------ATA-T--TTAA-CTT-ATT---CAAA---ATAT-AATG-----AAT----GC--------TACTAA-TCC--------AAATGCT--T-TTGTTG-T------TA-TC--A-TACAAT-ACA-TTG-TTT--TCA-T-ATACAGCA--T-T-TCTT--AA-TAAT-AATT-CTAC--AGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TT-CGTAAA--TAAT-TA-AAAC---AG--C-TCTTTAT-AA---CAT--CAAAA--TACATA--GGGAATCGACCA-AG---TT-CAC-CTACAATAGCT-TGA------ATT--GAGG---CCTTTTTATGTAC----------A------CCACA---TATATAT--TTCAAGAATTTT-ATG---TG-CATTTT-------TTTT------GCAGTA-CAT-TTTATTAA-AGAA-G----TTTT-CTA-T--ACAATAATCAGGGCGTTT-GACG-AAACTTGTA---TCTGTATTTATTGTT-CC-CCCAAATTCCACATGCATA-AG-G-CAGTA-CT----G-GT-------TT-A----ACTG-TATGGTCATA----C-AA---GT-GTATC--AG-GATA-TGTA---TTTTAGGTT-T--AATATTT-CCAAAAC-----ACTT--GGCTAGTT-TAAAATAAG-CATTTAAGGCT-TTTTTGTA-AAGA-TCAAA--TG-AC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATG--AGATAAAAA-CAATC-CCCAGATATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTC-GATGATC--TGATTTGTTA-TAGAAATTTTTT-------TT-ATC--TG-ATTTTTTACCGTTTT-C-------------ACAA---------------AATAT--GACAA--TTT--TTGTCTTTTTGAGGTTGAC--AGA-TAGGCAATATTT-----A-CAATctt
gi|40 : AGCT------ATA----T--A-------T--GTA-G-TTGGCAA-AA--TTTTCAG-T---AA-CG-C-TG-TCA-CAT-T-C-AT-----TACT-C--A-----T--AA--G--CC
gi|41 : TCACCTAATTTTGC-TGGA-------TCATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAGAA----TGGT---AGATT---AT
gi|42 : aT-TCC--AAT-T--TT-G-GGTCC-C-AGAGG---GCAT---------
gi|43 : -AT---G-T-AACTT--A-TTA----GT-AACAA----TT--GAT-AC--A----AT------AAT-Taatatactcaa
gi|44 : ATAATCAGGGCGTTT-GACG-GAACTTGTA---TC
gi|5 : GGTAAGTAA--T--TA----A-TTT-ATT-TCC--A-T-T--TTCG-GG-CC----GAGG----CATA--------CACAAAG------------A-AT---------AAGAGTTGAGAAGTTCAATTTCAT-AAA-T-CA-T--AAGA----AGAG--AA-G-A------TT-AT-C--A--AATTGA------AGATAA-A-T--AA-A-TA-CA-AGGTCTATA-T-GAA--T-A-AATC---AA---C--T-CT-CCTTCATCC------------ATA-GT----------GAG--CAGCT------ATACTAGT--A-------TCAGTAAG-TTGGCAA-AA--TTTTAAA-T---AA-CA-C-TG-TCG-CAT-C-C-AT-----TGCT-C--AATATTT--AA--AGCCCAATTA-----AATTTTTCAT-CT-AT-TA-CA---CAGGT--T-T-A-CTAA-------AAAGTTCTT----A-TAC-A--GTGT-T-CA-T-------GGAT-----TT--G-A-TG---AA--G-G-T-T----------T---TTAG-TGTT-C-----TAT-GC--TAT-AA--CAG---TCAA---ATA----TTA-A--CAATTAGAATGT------CAAT-CTT--C---AA--CAC-AG-T-CAG-A--CTT-ACAA-ACA-CT--ACATTTTC-TCTCAT-TTAACT--TGTCTTTG-GT--A--ACAGCCC-AGTTTC-GTAGCC-AA-AGA-ATGACAACTGA-TCTG-AAATTTG-----TAAAA-CA-TTG-C-CA-ACGTAGAGGTTT-ACGAA--TAC-GTGAAAATAATCTTT-CTCTACATAAACTTGATTTTG-A-ATAGCCT-A------ATGC--ATA-TGTGTCG-GC-GT-TT----G---A----AATT----GCTT--TGTTC-TGCA-A-TGGCGGA----TGTCCT-----A-A----------C---C--ATGAATAATT-------TAA--CATTCTATG--G-T-AACTTC-ATTTA----GT-AACAA----TT---ATAAC--ATTACAT------ACTGTTT--AT--CTAATG--TA--TAGCACATATGT------ATA-TACTTAA-CTT-ATT---CAAA---ATA--AATGAAATCAAT----TC--------TACT-A-TCC--------CACTACT--TGTTGTTGAT------TATTC--ACTACAATGAGA-TTG-TTT--TCA-CAATACAGCA--T-TATCTC--AATTACT-GAAT-TCTC--AGGGG---A----------ATCTA-AAATTC---TTGTGTAAAATTATT-TA-AAACT--AG--C-TTTTAATAAA---CAT---AAAA--TA
gi|6 : aCATA-AA-GGCAGTA-CT----G-GTCCGTTCGTT-ACATTACTGATATGATCATAACACCAAG---TT-GTATCTCAGCGGTG-TGTACTTTTTTCG--C-T--AATA-TTTCCAAAAC------CTT--GACTAGCTCTAAAATAAG-CCTTTAAGGCTCTTTT-GTA-AAGAATCAAA-TTGGAC----AACATGTG-A---AGGAG-CCTGATGCAGG-TAAAAAACAATT-CC-AGAGATT--TG--TACGATGA-CACT---TGTTCAGATGATT--TGATTT-TTAATAGAAAAACTTT-------TTTATC--TG-AT---------TTTT-CTTACCGTTTTTTTACAG---------------AATATATGACAATGTTT--TTGTCTTTCTGAGGTTGAC--AGAATAGGCAATATTT-ACTGAACATCAGCATTCAAGCTTTTTT-AATACATACCCGCTG---AGCCCCT-CCCTCGGTTTTCAGAA-TTAACACTGAAAAATCATCAGCATACCACGACTA-AACACATTTAAGCGAT-GTGTCACCTAATTTTGCGCGGGATAATATTTATCATTATATCAGTC-GGACAATAG-ATATCTGGTTCAGGATCCATGTCGAGTTTAT---TATTTTAACAAAGGTTT-GACTTACGGTACTTCTGTTACTCCTCCCGGGC-TGTTTAG-ACGACTCCACTCCACCGTTAAGGCCTTTCCACATGAAATTCG-AAGTTT-ATATCTGTTGTTCGGAGTTTGTGGTACAGTTATTAATTATG-TTTGGCCA-GTACATACTCTTGACATGACTTTATAGAgt
gi|7 : TTTTT-CCCTTGAAAAGCTTC-TTTTG-A-A-----T-A------ATCC--GTA-TGT-TCG-TA-AC-TT----G-TCCTTTTCATT------TT--TA-----GCACA-T-TCTGACAAAT-TACTTTGCCATA----------CA--T--GTACATATTAA------TAAATCTTTT--T---C-T-AAGTTC-A-TTA-------AACAC----TTTTGAT-T--------GT------AGA-TCTGAAA--C--TTG--AA--AAAGATGT-TATCGCAGGATA-TG-CCAA-GTTGATT---CAGT---AAAA-AATA-----AAC----AC--------TGCTCA-ACC--------AACAATT--C-TTTTTG-T------TA-TC--A-TTCAAA-A------------TCA-T-AT--------T-T-TCTT--GA--AGT-GCACACT-C-AAGCAA---AGTATCATTTGATTTATGAATGT---GT-TGTAAA--TATT-TA-A--C---AG--T-ATTGGAT-AA---GGTTTCAATA--TATA-A-TGGATGCCTACCT-AA---TT-CCC-CCATAACTGCA-TAG------TTT--GAAG---CTTTCTTATGTACCCCCCGGTGTA------CCCCA---CATATGTA-CTTGAGAGTTTTAATG---TG-AA-GTT-------TATC------ACTATA-TATATTTTTCAT-TG-A-G----TTTT-CAA-T--ATTATAATTTGGTCTCTT-AAC---AA-TAGCAGATTCTGAATTTATAATT--C-CCCAAATTTCACTTCCATATAACA-CAATA-------G-GT-------TT-T----ATTG-TGTGATCAtgtaattcatcggccattcatcgtttcacttctagtcgaagttgtgtcgcaagccttgtg
gi|8 : aggta-TGA-TAGTAGCGTTCAAGCTTTTTT---------------G---AAGTCTT-CCTTCAGTTT-CAGAAATTAACACT---AAGTCATCAGCATAC----AATA-AACA-ATTTAAA-GAT-GTGTCACCTAATTTTGC-TGGA-------TCATCAT--TATC-GTC-AAAT-ATAG-A----TC--------TC---ATTGA--TTAA---TATTTTAA-AAAGATTTGGACTTA-GGT-------C-G--TCTCC----C-TGTCTAACAC---------CCACC-TTAGG-----TTCAAAT--------------T-AT--------TTTGAAGTTT----TACAG--AC--AGTATG-TTT-GCCATGTACATACTTTTGA--TGACTTTATAGAAAGGCCCCTT-ATGTCAAGC-TG-ATGCAGCC-TGTGTAG-AAGATCTG-AATGTAAAACAGTGTCAAAAGCCTTAGAAAAATCAACA-AAGCAAACGTATAATT--TGGAA-TT-ATCATTTGTATA-TTTTTGAATAACGGTTCT-AAGTATAAAAATGTGGTCACTAGTTCTGGCTTTTGGTTGAAAACCAATTTGAACTTTATTTATAATGTTGTTCGAGTCCAAGTAGTTTTGTAACCTGGTATTCAGTATGCTATTAAATATACTTTGGGATA-aaaagatgcaacaaaatgccggcatt
gi|9 : caaaattaggAAGTAA-AT--T--------TT-ATA-TCA--A-T-A--TT-T-GG-CC-C-AG------GCAT---------AACAAAG------------ATAT---------A--------------------CAT-AA--A-CA-ACAA-GA----AGA---AA---A------CC-ATTC--ACCAAT-GA--T---AGATAA-CGT--AA-C-TAACA-AAGT---TAAT-GA---T-A-AATC---AA---AATT-TT-C--TCA---------------ATT-GT----------GAGAGCAGCTT-----ATA----TTAA-------T--GTA-G-TTGGACA-AA--TT---AG-T---AATCG-C-TG-TCA-CATGT-C-ATCTTTATACTGC--A-----T--AAAAG--C-AATTA-----AATTATTC-T-CT-AT-TAACATACCAAGT--T-T-A-T----------AA-GTTTTT----A-TAC-AAAGTAT-T-CA-T-------GGAT-----T---CTA-TG---AAATG-G-T-T----------T--TCTTGATGTT-AG----TAT-GCCATGT-AACACAA---TCAATG-ATG------A-A--AAAT-GGAAT-TAA----CA-TGCTTATC---AAAGCAC-AG-TACAG-A--CTT-GCAG-ACA-CTTAACATTTTC-TCACAT-TTA-CATGTGTTTTTGTGT--A--AC-GCC--A---TCAA-AGCC-AA-AGA-ATGAGAACTGGTTCTGAAATATGG-----TAAAA-CA-TTT-C-AAGA-CTTGAGGATT-ATGAAt
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): TTCCAATTGGGTCGCTGTGCCCCAGAGCGCGCAAGAACTAATAGGAGAGACCGTACTTAACAGTTGAGAAAGAATGTCCCAAAAAAAAGAAGTGCGGAAAAGTGACTAAGATTTCAAGTACAGAGTGCGTAATCACAAACTCTAACAT
Unaligned ( gi|35 ): AAGGGTATTCAGAACAAGAATGACATGGGAACATAAAGAAATAAAGTAAAATAAACAGGGAAAAACATCCAGATG
Unaligned ( gi|38 ): AATAAATTTGGAAATAAAATATCAATTTTGAAATAAAGAAAATAAATTTGAAATATTCATTATGATA