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Reference ( gi|1 )            :   TTCAGCTGAAATAG--TC-AGAT----A-GT--ACTTCAA-GA-TA-CAATGTTCAAT-TC-GTTTATTGACC-AATTATTTTTTTCCAATAAAATAGGGCAATAAAGAAGG-GTTG-TACA-AT--GG-TATA----A-CATCC------CGTGTTGC-AC-G--TGCGAGGACAATTGTG-AAT-AA--CACAG-GTGTTTCG-T-C-GGCAATTTGATGAGC-TCTAAAAA-GGT-GTG-AAA-GTCA------------------G-------------GC------------TGC-TA--C-G--G--ATATA------TGTTTA-TAGG-GAT---A---GT--A-TGGCA-T-AAA---CC-CAAGTA-TT-GC-A-GTT--A-A-AATTGGTTTT-AACAG--T-T--AGG--CC-T---AAATATTTT--AATCTG-T-TGT-CAA---ATTAA-------TAATTA---AT-TCA-TCATCGGAAAC--C-CAAGGTATTT-T-TTCCA-AA-TACC-------------CT-ATTTTAA-TTG-AA-CGCCCTTTTAATTT-TACCTGT--AT-A-----GTCAG-A---TA--G----------TGA--TTAA--G-GGT-A-CGCCG---C--CTGCC-----ATAAAACAAATTGGA-T--ACACAA--T-GG-ATTGTCACCTA-A--TA-A-CACAGA---CC-CAAGTCGGATGATTTGA---C--TCACG-AATG-ATTGAAGAATTCGA------AGA-TGA-CCCGTGCAT-TTTG-CG-AC-GA-TGAATTC---CACAG-CGCC-----C-TACACC------TAT-CT-------G-T-G-TT-T--CCA----AGCG------ATG----TTGTT--CAGG---T---T-CAGT-A-----TTTTCCCCAT-TT--GATTCATTCAGAA----TC-CG-TTG-C--TGCTGG--------CT----CAAATC-T---AC---G-G-ACAATATCCC----A-TGCGTC-CTC-GGTA-G--AT------ATCTTC---AAAG---G-A-AGA-C-GCTTCAA--ACAA-CAC-C--TGAAGG-TCGATTTC--TCTG-AGGAAG---C-G-AGA-TATC---G-CT-CGCACTC-G---CCATAAT------ACCCTGTT--CAAAAC-AGC-TGT--GTT-GTGA-CGTC--ACAGG--CATTTCGGC-AAA-AT-A--TAG-AAAAACC-GG-AAG-TTAAG----TTG-AT--TAGTT-TTAA----GC-----AGG-TGCC-AA-----AATAG-CAACCTT--TGACGGGAAAT---AT-CTCGGTATTTAACGCACGC-ACGATTATA----TTTTTACC--C-TCATA-TTTT-TAAAGGTATTTTTTCAA-C--AATTT-ACCAT-TATT-TATACCCATGACTTCCGGGGCACT
gi|2                          :   TTC-GCTGAA-TAG--TCCAGAT----A-GT---CTTCAA-GA-TAACAAT--CCAAT--C-GTTTATTGACC-GAT----------------------GCAATAA-GAAGGTGTTA-T-CA-AT--GG-TATA----AACATCC------TGTGCTGC-ACCG--TGCGAGGACAATTGTG-AAT-AAACCACAG--TGTT-CG-TTC-GGCAAATT--TGAGC-TCTAAAAAAGGT-GTG-AAA-GTCA------------------GTGTGGGTGGAAG-GC------------TGCATA--C-G-----ATATA------TGTTTA------------A---GT--AATGGCAAT-AAA---CC-AATGTA-TTTGC-A-GTT--A-A-AAT-GGTTTT-AAC--------------------------TTTA--AATCTA-T-TGT-CCA---ATAAA-------TAATTA---AT-TCA-TCATCGGAAAC--C-CAA-GTA----T-TTCCA-AA-TACCT------------CT-ATTTTAATTTG-AA-CGCCCCTT--ATTTGTACCTGT--AT-A-----GTCAGTA---TA--GATGAATTAACTGA--TT-A--G-GGTAA-CGCCG------CTGCC-----AT-AAAC-AATTAGA-T--ACACAA--TAGG-ATTGTGTCCTATATTTA-T-CACAGA---CCTCAAGTCGGATGATTTGA---CCATCACA-AATG-CATGAAGAATGCCG------AGATTGA--CCGTG-AC-TTTG-CG-AG-AG-TGAATTC---CACAG-CGCC-----C-TA---C------CAT-CT-------G-T-GTTT-T--CCA----AGCGA-----ATT----TTGTT--CAGG---T---T-CAGT-A-----TTTTCCCCAT-TT--GATTCA-TCAGAA----TT-CT-GTG-CCTTG--GG--------CT----CAAATC--------------------TCCC----A-TGCGTC-CTC-GGTAGG--AA------ATCTTCATAAAAG---GAA-AGAGC-GCTTCAA--A-AA-CAC-G--TGGAGG-TCGATTTTCGTCTG-AGGAAG---CGG-AGATTATC---GCCT-CGCACTC-A---TCATAAT------ACCT--TT--CAAAAC-AG--TGT---TT-GTGA-CGTC--ACAGGT-CATTT-GGC-TAA-AT-A--TAG-TAAAA-C-GG-AAG-TT-AG----TTG-AT--TA-TT-TTGAGCATGC-----AGG-TGCCAAA-----AATAG-CCAACTT--TGACGGGAAAT---ATCCTCGGTATTTAACGCACAC-ACGATTATAT---TTTTTACC--C-TC-TA-TTTT-TAAAGGTTATTTTTCAA-CCAAGTTTAACCAT-TA-T-TATACCCATAACTTCCGGG
gi|11                         : ttTTC-GCTGAACTAG--TC-AGAT----A-GT--ACCTCAA-GA-TA-CAAT--TCAAT-TCCGTTTATTGACC-AATG---TGCCCCCAA-------AGGCAATAA-GAAGG---TG-TACAGAT--G--TATA----AACATCC------CGT-TTGCGAC-G--TGCGGAGACAATTGTG-AATCAA--CACAG-GTGGTTCG-T-C-GGCAATT---TGAGC-TCTA
gi|12                         : ttTTCGACTGAA-TAGATCC-AGACTAAAA-GTTTACTTCAATGAGTAGCAAT---CAAT-GC-GTTTTATGACC-AG--------------------AGGGCAATTAAGAAAG-GTTGTTACA-AT--GGATATAAAATA-CATCCTCTCTGTGTGTTGC-AC-G--T
gi|10                         :      cGCTGGATAAG--TC-AGAT----AAGT--ACTTCAA-GA--A-CAAT--TCAAGGTC-GTTTATTGACC-AATTAAGTG---CCACCCAAA---GGCAATAA-GAAGG--TTG-TACA-ATTTGG-TATA----AACATCC-------GTGTTGC-AC-GCGTGCGAGGACAATTGTGCAAT-AAC-CACAGTGTG
gi|4                          :                                                            T-TT-GTTTTTTTACTGAATTATGTTTTTCCA-TAAAATAGGGCAATGA-----G-GTTG--ACA-AT--GG--ATG----G--AT-C------CGTGTTGC-AA-G--TG-GAGGAAAGTTGTG-AA--A------AG-GTGTTACG-T---GG-AATTTGAggttttttttggtttttttttttttttattttcccagttttgtaagatctttat
gi|7                          :                                                                                                                                                                             tagtatttcgatttAC-AA--CACAG-GTCGTTCGAT-CAGGCAATTTGA-GATC--CTAAAAA-AGTAGTG-ACACGTCATTTGTTGGGGTAGCGGAAG-------------GC------------TGC-AA--CTG--G--ATATA------TGTGTAGTATG-GAT---AAAAGTTAG-TGGCA-T-AAA---CC-CAAGTA-TT-GCAA-GTTAAA-A-AAATGGTTGT-AACAG--T-GGAGGG--CC-TAAAAAATCTTTTTAAATCTATT-TGTACAC---GATAAGCCCTCCCAAATATGTAT-TC---TATCGGACCC--CACAGAGTGCTTAT-CACCACAA-TACC-------------CT-A-TTTAA-TTG-AATCGCCCCTTgatataagaaatgtcccaagttggagttaattgtttttaagaaactataggctattttaaattattgtcaatattaattttcatatggacaggtattctaactatgtaattgagccttaattttactgcgttagattgtggcttaggggtagtgctgataaacattagactacacatggattgtacctatatacacagagcaaagtggatgatttgaataggaatgcattgaagattcgagattgaagatgactttggcgatgaattcacaggctacttctgttgttttccaagcgtgttgttcaggttagatattttccccattttgaattttaagaagtccgttgctttaacgagacaattctattgcgatctcaggtaggaaaatcttaaagaagcgaagtacaacacacgatgaagggtagatttcgtctgaggaaggggggtatagtcgactggcataattctgttcaaaaagagctgtgttgtgcgtcaaggttttcggtaaatacgtagtaaaaccggaagttgttgattatttttgagccgtgcctaatgcaagtttgggggattccggtttacgacgatttagttttttttacccctcataattgtttaaggtatttttttaccaatttaatctattatacctgattcgggggcacttta
gi|8                          :                                                                                                                                                                                            ttgttgcatAG-GTGTGTCG-T-C-GGAAATT--ATGAGAATCTAAAAA-GGT-GTGCAAA-GTCATTGT--------------G-------------GCGGTAGGAAGGATTGC-AAATC-G--GTGATATAAAATAATGTT-A-TAGGTGAT---AAG-GT--A-TGGCA-TGAAA---CC-AAAGTA--T-GCAA-GTT--ACACAATTGCTTTTGAACAA--G-T--AGGGACC-T---AAATCTTCTTAAATCTA-TCTGT-CAATAGATGGA--------AATTA---ATATCAGTCATCGAACACCAC-CAAGCGGTCT-TACTCCA-AA-TACCACATCAGATTAAGCTAATTTTAA-TTGAAA-CGCCCGCTTACTTT-TACact
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                            TTCG-T-C-GGCAATTTGA---GC-TCTAAAAA-GGT-GTG-AAA-GTCA------------------GTGGGAGTAGGAAGGC------------TGCATA--C-G--G--ATATA------TGTTTA---GG-GATTTTA---GT--A-TGGCA-T-AAAA--CC-CAAGTA-TT-GC-A-GTT--A-A-AATTGGTTTT-AACAG----T--ATG--CCTT---AAATCTTTA--AATATA-T-TGT-CAA---A-TAA-------TAATTA---AT-TCA-TCATCGGAAAC--C-CAAGGTA--C-T-TCCCA-AA-TACC-------------CT-ATTTTAA-TTG-AA-CGCCC--CTAATTT-TACCTGG--ATAA-----GTCAT-A---TA--G----------TGA--TTAA--GCGGT-A-CG-CG---C--CTGCC-----ATAAAAC-AATTAGA-T--ACACAA--T-GG-TTTGTCACCTATA--T--A-CACAGA---CC-CAACTCGGATGATTTGA---CA-TCACG-AATGCATT-AAGAATGCGA------GAT-TGA--CCGTG-A--CTTG-CG-AC-GATTGAATTC---CACAG-CGCC-----C-TA-ACC------ATT-CT-------GTT-G-TTGT--CCA----AGCG------ATG----TTGTT--CAGGTATT---T-CAGTGA-----TTTTCCCCGA-TT--GATTCA-TCAGAA----TC-CGCTTG-C--TGCTGG--------CT----CAAATCTT---ACG--G-G-ACAATATCCC----ATTGCGTCGCTC-GGTA-GGAAA------ATC-TC---AAAGGGAG-A-AGA-C-GCTTCAA--ACAACCAC-TG-TGGAGG-TCAATTTCG-TCTG-AGGAAG---CGG-AGA-TATC---G-CT-CGCAC-C-G---CCATTAT------ACCCTGTTTCCAAAAC-AGC-TGT---TT-GTGA-CGTCAAAAAGT--CATTTCAGC-TAA-AT-A--TAGTAAAAGCC-GGAAAG-TTAAG----TTGAAT--TAGTT-TTGA----GC-----AGGTTGAC-AA-----AAT--------T------CGG---AT---A--------ATTTAACGCACGC-ACAATTATAT---TTTTTACC--C-TCATA-TTTTATAAA----------C---C--AATTT-ACCAT-TA-T-TATACCCATGACTCCGGGAGCA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                        tgAAA-GTT-GTG-AAA----A------------------G-------------G-------------TGT-TA--C-GTGG--A-----------ATTT----GA-GAT---A----T--A-----A-G-AAATGTCC-CAAGT---T-GG-A-GTT--A-A---TTGTTTTT-AAGAAACTAT--AGG--C---------TATTTT--AAATTA-T-TGT-CAA-----TAT-------TAATT-----T-TCA-T-AT-GGA-------CA-GGTATT------CTA-A-------------------CT-ATGT-AA-TTG-A---GCC---TTAATTT-TAC-TGC-----------GTTAG-A---TT--G----------TGGC-TTAG--G-GGT-AGTGCTG----------------ATAAA-CA--TTAGACT--ACACA---T-GG-ATTGT-ACCTA----TATA-CACAGA---GC-AAAGT-GGATGATTTGA---A--T-AGG-AATGCATTGAAGA-TTCGAGATTGAAGA-TGA-C---------TTTG----GC-GA-TGAATTC----ACAG--GC--------TACTTC------TGT--T-------G-T---TT-T--CCA----AGCG-------TG----TTGTT--CAGG---T---T-AGAT-A-----TTTTCCCCAT-TTTGAATT--TTAAGAAG---TC-CG-TTG-C--T--------------T----TAA---------C---GAG-ACAAT-TCTA----T-TGCGAT-CTCAGGTA-GGAAA------ATCTT-----AAA---G-A-AG--C-G----AAGTACAA-CACACGATGAAGGGTAGATTTCG-TCTG-AGGAAG---G-G-GGG-TATA---G--T-CG-ACTG-G---C-ATAAT--------TCTGTT--CAAAAAGAGC-TGT--GTT-GTG--CGTC--A-AGG--T-TTTCGGT-AAATAC-G--TAG-TAAAACC-GG-AAG-TT--G----TTG-AT--TATTT-TTGA----GC-----CG--TGCC-TA-----A-T-G-CAAGTTT------GGGGGAT----T-C-CGGT--TTA-----CG--ACGATT-TAGTTTTTTTTACC--CCTCATAATTGT-TTAAGGTATTTTTTTAC-C--AATTT-A--ATCTA-T-TATACC--TGA-TTCGGGGGCACT
gi|15                         :                                                                                                                                                             tagtatttcgattttttgtttttttactgaattatgtttttccataaaatagggcaatgaggttgacaatggatggatccgtgttgcaagtggaggA------------------G-------------GC------------TGC-AAA-C-G--G--ATATA------TGTTTA-TAGG-GAT---A---GT--A-TGGCtta
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tgggggtaggaGCA-T-AAA---CCACAAGTAGTT-GC-AAGTT--A-A-A-TTGGTTTT-A-CAG--T----AGG--CC-T---A-------T--AATCTT-T-T----AA---ATC---------TAATTA---AT-TCA-TCATCGGAAACA-C-CAAGGTACTT-----CCA-AAATACC-------------CT-ATCTTAA-TTG-AA-CCCCCTTT--ATTT-T-CCTGT--AT-A-----GT------------------------GA--TTA---G-TGT-A-CGCC--------TGC------ATAAAACAA-TTAGA-TTAAC-CAA--T-GG-ATTGTCACCTATA--T--A-CACAGA---CC-CAAGTCGGATGATTTGA---CA-TCACGAAATGCATTGAGAAAT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ttTAA-TTG-AA-CGCCCCTT-AATTT-TACCTGC-----------GTCAG-A---TATAG----------TGC--TTAA--G-GGT-A-CGCCG---C--CTGCC-----ATAAagaaagtaaacgagacttt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tgTTT-AACCTGTTGAT-GAGAATGTCAA-AGAGTA--G----------TGAGTTTAATAG-GGT-A-CGACGGAGCGACTGCTCAGTAAGAAAACTAATCAAAAT--ACACAAACT-GGTATTGTCACATATA--TA-TTCACAGAACTCC-AAAGTTCGAGGAGCTGAACAT--TCACG-A-TGCATTGAAGAATTCGA------TGA-TTAGCCCA--CATCTTTGACG-AC-GA-TGCATCCAAACAGAG-CGCCGTAACCATACAAT------TAG-CT-------G-TAG-TTGC--CCACAATAGCGGAGTACATAGCAATTGTTTGCAGG---TGTTT-CA-T-AAGAAGTTTTCCCCATCTT--GATTCATTCAGAAAAAATCACGATTGTC--AGCTGGGCATAGAGCTAAGTCAAATC-TCTTAC---G-GGACAATATGCCTCTGA-CGC-TC-TTG-GGTA-A--AGGAAAAAATC--C---AAAG---G-A-GAA-CCGCTTCAA--ACAA-CAC-G--TGAAGG-TCGATTTCAGTCTGTAGGAAGAGACGG-AGA--ATCTGAG-CT-CGCACTCTGAGCCCATAATATATTGACCGTGTT--CATACG-AGCATGTGAGAT-GTGACCGTC--ACAGGGTCACTTCGGCTAAA-AT-AGGTAG-TAAAACCGGG-AAGTTTGAGAGGTTTG-ATTCTAGTTGTTGA----GCAAGGAAGG--ACC-GAAAAGTAATAGCCAACCTTAGCGA-GGGAAGT---AT-C
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Reference ( family-3382 )     :   TTC-G-CTGAACTAG--TC-AGAT----A-GT--ACTTCAA-GA-TAGCAAT--TCAAT-T-C---GTTTATTGACC-AATTA-GTG-----CCA---A---AA-AGGGCAAT-AA-GAAGG-GTTGT-ACA-AT--GG-TATAAA---CATCCC------GTGTTGC-AC-G--TGCGAGGACAATTGTG-AAT-AA--CACAG-GTGTTTCG-T-C-GGCAATTTGATGAGC-TCTAAAAA-GGT-GTG-AAA-GTCA------------------G-------------GC------------TGCN-A--C-G--G--ATATA------TGTTTA-TAGG-GAT---A---GT--ATGGC-AT-AAA---CC-CAAGTA-TTGC-A-GTT--A-A-AATTGGTTTT-AACAG--T-T--AGG--CC-T---A-AATCTTTT--AATCTA-T-TGT-CA-AATNAA------T---AATTA---AT-TCA-TCATCGGAAAC--C-CAA--GGTA-CTT-TC-CCA-AATACC-------------CT-ATTTTAA-TTG-AA-CGCCCCTTTAATTT-TACCTGT--AT-A-----GTCAG-A---TA--G----------TGA--TTAA--G-GGT-A-CGCCG---C--CTGCC-----ATAAAACAAATTAGA-T--ACACAA--T-GG-ATTGTCACCTATA--TAA-CACAGA---CC-CAAGTCGGATGATTTGA-CAT-CACG-AATGCATTGAAGAATG-CGA-GGNTGACCCG-TG-ACTTTG-CG-AC-GA-TGAATTC---CACAG-CGCCCTA-ACC-------TAT-CT-------G-T-G-TT-T--CCA----AGCG------ATG----TTGTT--CAGG---T---T-CAGT-A-----TTTTCCCCAT-TT--GATTCATTCAG----AA-TC-CG-TTG-CTGCT--GGC-----------TCAAATC---TAC---G-GACAATAT-CCCA-TG-CG-TC-CTC-GGT--AGGAAAATCTTC---AAAG---G-A-AGA-CGCTTCAA--ACAA-CAC--GGTGGAGG-TCGATTTCGGTCTG-AGGAAG---CGGAGA-TATC---G-CT-CGCACTC-G---CCATAAT------ACCCTGTT--CAAAAC-AGC-TGT--G-TTGTGA-CGTC-ACA-GGTCATTTCGGCT-AAA-TA--TAGTAAAA-CC-GG-AAG-TTAAG----TTG-AT--TAGTT-TTGA----GC-----AGG-TGCC-AA-----AATAGCNAACTT---CGACGGGAAAT---AT-CTCGGTATTTAACGCACGC-ACGATTATA--TTTTTTTA-CC--CTCAT-ATTTT-TAAAGG-TA-TTTTTCAA-C--AATTT-ACCAT-TA-TT--ATACCCATGACTTCNGGGGCACT
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gi|12                         : ttTTC-GACTGAA-TAGATCC-AGACTAAAA-GTTTACTTCAATGAGTAGCAAT---CAAT-G-C---GTTTTATGACC-AG-------------------------AGGGCAATTAA-GAAAG-GTTGTTACA-AT--GGATATAAAATACATCCTCTCTGTGTGTTGC-AC-G--T
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            agaTAA-TTG-AA-CGCCCCTT-AATTT-TACCTGC-----------GTCAG-A---TATAG----------TGC--TTAA--G-GGT-A-CGCCG---C--CTGCC-----ATAAttaaaagtgatttc
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                    tgA------------------G-------------GC------------TGCA-AA-C-G--G--ATATA------TGTTTA-TAGG-GAT---A---GT--ATGGC-
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tgggggtaggaTTCCCCAT-TT--GATTCAT-CAG----AA-TC-TG-TTG-CTGCT--GGC-----------TCAA
gi|2                          :   TTC-G-CTGAA-TAG--TCCAGAT----A-GT---CTTCAA-GA-TAACAAT--CCAAT---C---GTTTATTGACC-GAT---------------------------GCAAT-AA-GAAGGTGTTAT--CA-AT--GG-TATAAA---CATCCT------GTGCTGC-ACCG--TGCGAGGACAATTGTG-AAT-AAACCACAG--TGTT-CG-TTC-GGCAAATT--TGAGC-TCTAAAAAAGGT-GTG-AAA-GTCA------------------GTGTGGGTGGAAG-GC------------TGCATA--C-G-----ATATA------TGTTTA------------A---GTA-ATGGCAAT-AAA---CC-AATGTATTTGC-A-GTT--A-A-AA-TGGTTTT-AA---------------------------CTTTA--AATCTA-T-TGT-CC-AATAAA------T---AATTA---AT-TCA-TCATCGGAAAC--C-CAA---GTA---T-TT-CCA-AATACCT------------CT-ATTTTAATTTG-AA-CGCCCCTT--ATTTGTACCTGT--AT-A-----GTCAGTA---TA--GATGAATTAACTGA--TT-A--G-GGTAA-CGCCG------CTGCC-----AT-AAAC-AATTAGA-T--ACACAA--TAGG-ATTGTGTCCTATATTTAT-CACAGA---CCTCAAGTCGGATGATTTGACCAT-CACA-AATGCA-TGAAGAATGCCGA-GATTGA-CCG-TG-ACTTTG-CG-AG-AG-TGAATTC---CACAG-CGCCCTA---C-------CAT-CT-------G-T-GTTT-T--CCA----AGCGA-----ATT----TTGTT--CAGG---T---T-CAGT-A-----TTTTCCCCAT-TT--GATTCA-TCAG----AA-TT-CT-GTG-C--CTTGGGC-----------TCAAATC------------------T-CCCA-TG-CG-TC-CTC-GGT--AGG-AAATCTTCATAAAAG---GAA-AGAGCGCTTCAA--A-AA-CAC---GTGGAGG-TCGATTTTCGTCTG-AGGAAG---CGGAGATTATC---GCCT-CGCACTC-A---TCATAAT------ACCT--TT--CAAAAC-AG--TGT----TTGTGA-CGTC-ACA-GGTCATTT-GGCT-AAA-TA--TAGTAAAA--C-GG-AAG-TT-AG----TTG-AT--TA-TT-TTGAGCATGC-----AGG-TGCCAAA-----AATAGCCAACTT---TGACGGGAAAT---ATCCTCGGTATTTAACGCACAC-ACGATTATA---TTTTTTA-CC--CTC-T-ATTTT-TAAAGGTTA-TTTTTCAA-CCAAGTTTAACCAT-TA-TT--ATACCCATAACTTCCGGG
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                   ttTTCG-T-C-GGCAATTTGA---GC-TCTAAAAA-GGT-GTG-AAA-GTCA------------------GTGGGAGTAGGAAGGC------------TGCATA--C-G--G--ATATA------TGTTTA---GG-GATTTTA---GT--ATGGC-AT-AAAA--CC-CAAGTA-TTGC-A-GTT--A-A-AATTGGTTTT-AACAG----T--ATG--CCTT---A-AATCTTTA--AATATA-T-TGT-CA-AAT-AA------T---AATTA---AT-TCA-TCATCGGAAAC--C-CAA--GGTA-C-T-TC-CCA-AATACC-------------CT-ATTTTAA-TTG-AA-CGCCCC--TAATTT-TACCTGG--ATAA-----GTCAT-A---TA--G----------TGA--TTAA--GCGGT-A-CG-CG---C--CTGCC-----ATAAAAC-AATTAGA-T--ACACAA--T-GG-TTTGTCACCTATA--T-A-CACAGA---CC-CAACTCGGATGATTTGA-CAT-CACG-AATGCATT-AAGAATG-CGA-GATTGA-CCG-TG-AC-TTG-CG-AC-GATTGAATTC---CACAG-CGCCCTA-ACC-------ATT-CT-------GTT-G-TTGT--CCA----AGCG------ATG----TTGTT--CAGGTATT---T-CAGTGA-----TTTTCCCCGA-TT--GATTCA-TCAG----AA-TC-CGCTTG-CTGCT--GGC-----------TCAAATCT--TACG--G-GACAATAT-CCCATTG-CG-TCGCTC-GGT--AGGAAAATC-TC---AAAGGGAG-A-AGA-CGCTTCAA--ACAACCAC--TGTGGAGG-TCAATTTC-GTCTG-AGGAAG---CGGAGA-TATC---G-CT-CGCAC-C-G---CCATTAT------ACCCTGTTTCCAAAAC-AGC-TGT----TTGTGA-CGTCAAAA-AGTCATTTCAGCT-AAA-TA--TAGTAAAAGCC-GGAAAG-TTAAG----TTGAAT--TAGTT-TTGA----GC-----AGGTTGAC-AA-----AA--------TT---CG------GAT---A--------ATTTAACGCACGC-ACAATTATA---TTTTTTA-CC--CTCAT-ATTTTATAAA-----------C---C--AATTT-ACCAT-TA-TT--ATACCCATGACTCCGGGAGCA
gi|4                          :                                             tg-TAGTATT--TCGAT-T-TTTTGTTTTTTTACTGAATTA--TGTTTTTCCATA-A---AATAGGGCAAT-GA-G-----GTTG--ACA-AT--GG--ATGGA---T---CC------GTGTTGC-AA-G--TG-GAGGAAAGTTGTG-AA--A------AG-GTGTTACG-T---GG-AATTTGA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                   AAA-GTT-GTG-AAA----A------------------G-------------G-------------TGTT-A--C-GTGG--A-----------ATTT----GA-GAT---A----T--A-----AG-AAATGTCC-CAAGT---TGG-A-GTT--A-A---TTGTTTTT-AAGAAACTAT--AGG--C--T---A-----TTTT--AAATTA-T-TGT-CA-A--TAT------T---AATT-----T-TCA-T-AT-GGA-------CA---GGTA-TT-----CTA-A------------------CT-ATGT-AA-TTG-A---GCC---TTAATTT-TAC-TGC-----------GTTAG-A---TT--G----------TGGC-TTAG--G-GGT-AGTGCTG----------------ATAAA-CA--TTAGACT--ACACA---T-GG-ATTGT-ACCTATA--TA--CACAGA---GC-AAAGT-GGATGATTTGA--AT--AGG-AATGCATTGAAGA-TT-CGA-GATTGAA--GATG-ACTTTG----GC-GA-TGAATTC----ACAG--GC--TA---C-------T-T-CT-------G-TTG-TT-TT-CCA----AGCG-------TG----TTGTT--CAGG---T---T-AGAT-A-----TTTTCCCCAT-TTTGAATT--TTAAG----AAGTC-CG-TTG-CT-------------------TTAA--------C---GAGACAAT-T-CTAT-TG-CG-AT-CTCAGGT--AGGAAAATCTT-----AAA---G-A-AG--CG----AAGTACAA-CACACGATGAAGGGTAGATTTCG-TCTG-AGGAAG----GGGGG-TATA---G--T-CG-ACTG-G---C-ATAAT--------TCTGTT--CAAAAAGAGC-TGT--G-TTGTG--CGTC-A-A-GGT--TTTCGG-T-AAA-TACGTAGTAAAA-CC-GG-AAG-TT--G----TTG-AT--TATTT-TTGA----GC------CG-TGCC--T-----AAT-GCAAGTTT-------GGGGGAT----T-C-CGGT-TT--ACG------ACGATT-TAGTTTTTTTTACCC--CTCATAATTGT-TTAAGG-TATTTTTTTAC-C--AATTT-A--ATCTA-TT--ATACC--TGA-TTCGGGGGCACTgatataagaaatgtcccaagttggagttaattgtttttaagaaactataggctattttaaattattgtcaatattaattttcatatggacaggtattctaactatgtaattgagccttaattttactgcgttagattgtggcttaggggtagtgctgataaacattagactacacatggattgtacctatatacacagagcaaagtggatgatttgaataggaatgcattgaagattcgagattgaagatgactttggcgatgaattcacaggctacttctgttgttttccaagcgtgttgttcaggttagatattttccccattttgaattttaagaagtccgttgctttaacgagacaattctattgcgatctcaggtaggaaaatcttaaagaagcgaagtacaacacacgatgaagggtagatttcgtctgaggaaggggggtatagtcgactggcataattctgttcaaaaagagctgtgttgtgcgtcaaggttttcggtaaatacgtagtaaaaccggaagttgttgattatttttgagccgtgcctaatgcaagtttgggggattccggtttacgacgatttagttttttttacccctcataattgtttaaggtatttttttaccaatttaatctattatacctgattcgggggcacttta
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tagtatttcgattttttgtttttttactgaattatgtttttccataaaatagggcaatgaggttgacaatggatggatccgtgttgcaagtggaggTTT-AACCTGTTGAT-GAGAATGTCAA-AGAGTA--G----------TGAGTTTAATAG-GGT-A-CGACGGAGCGACTGCTCAGTAAGAAAACTAATCAAAAT--ACACAAACT-GGTATTGTCACATATA--TATTCACAGAACTCC-AAAGTTCGAGGAGCTGAACATTCACG-A-TGCATTGAAGAATT-CGATGATTAGCCCA-CA-TCTTTGACG-AC-GA-TGCATCCAAACAGAG-CGCCGTA-ACCATACAATTAG-CT-------G-TAG-TTGC--CCACAATAGCGGAGTACATAGCAATTGTTTGCAGG---TGTTT-CA-T-AAGAAGTTTTCCCCATCTT--GATTCATTCAGAAAAAA-TCACGATTGTCAGCTG-GGCATAGAGCTAAGTCAAATCTCTTACG--G-GACAATATGCCTC-TGACGCTC-TTG-GGTAAAGGAAAAAATCC---AAAG---G-A-GAACCGCTTCAA--ACAA-CAC---GTGAAGG-TCGATTTCAGTCTGTAGGAAGAGACGGAGA--ATCTGAG-CT-CGCACTCTGAGCCCATAATATATTGACCGTGTT--CATACG-AGCATGTGAG-ATGTGACCGTC-ACAGGGTCACTTCGGCTAAAA-TAGGTAGTAAAA-CCGGG-AAGTTTGAGAGGTTTG-ATTCTAGTTGTTGA----GCAAGGAAGG--ACC-GAAAAGTAATAGCCAACCTTAGCGA-GGGAAGT---AT-Ctta
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CCTATA--TA--CATAGA---CC-CAAGTCGGATGATTTGA-CAT-CACG-AATGCATTGAAGAATG-CGA-GATTGACC-G-TG-ACTTTG-CG-AC-GA-TGAATTC---CACAG-CGCCCTA-ACT-------CATTCT-------G-T-G-TT-TTTCCA----AGCG------ATG----TTGTT--CAGG---T---TTCAGTTA-----TTTTCCCCAT-T---GATTCAT-CAG----AA-TC-CG-TTG-CTGCT--GG------------TCAAATC---TTTCCGG-GACAATAT-CCCA-TG-CG-TC-CTT-GGT--AGGAAAATCTTC---AAAG---A-AGAAA-CGCTTCAA--ACAA-CAC--G-TGGAGG-TCGATTTCG-TCTG-AG-AAG---CGGAGA-TATC---G-CTTCGCACTC-A---CCATAAT------ACCCTGTT--CAAAAC-AGC-T-T--GTTTGTGA-CGTC-ACA-GGTCATTTCGGCT-AAATTA--TAGTAAAA-CT--G-AAG-TTAAG----TTG-AT--TAGTT-TTGA----GC-----AGG-TGCC-AA-----AATGCCCAACTT---TGACGGGAAATCAAAT-CTCGGTATTTAACGCACGTAACGATTATA--TTTTTTTA-CCCTCTCAT-ATTTT-TAAAGG-TA-TTTTTCAACC--AATTT-ACCAT-TA-TTAGATACCCATGACTTCCGGGGCACTagatttggat
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                    AC-AA--CACAG-GTCGTTCGAT-CAGGCAATTTGA-GATC--CTAAAAA-AGTAGTG-ACACGTCATTTGTTGGGGTAGCGGAAG-------------GC------------TGCA-A--CTG--G--ATATA------TGTGTAGTATG-GAT---AAAAGTTAGTGGC-AT-AAA---CC-CAAGTA-TTGCAA-GTTAAA-A-AAATGGTTGT-AACAG--T-GGAGGG--CC-TAAAA-AATCTTTTTAAATCTATT-TGTACACGATAAGCCCTCCC---AAATATGTAT-TC---TATCGGACCC--CACAG--AGTG-CTTATCACCACAATACC-------------CT-A-TTTAA-TTG-AATCGCCCCTT
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                     ttgttgcatAG-GTGTGTCG-T-C-GGAAATT--ATGAGAATCTAAAAA-GGT-GTGCAAA-GTCATTGT--------------G-------------GCGGTAGGAAGGATTGCA-AATC-G--GTGATATAAAATAATGTT-A-TAGGTGAT---AAG-GT--ATGGC-ATGAAA---CC-AAAGTA--TGCAA-GTT--ACACAATTGCTTTTGAACAA--G-T--AGGGACC-T---A-AATCTTCTTAAATCTA-TCTGT-C--AATAGA------TGGAAATTA---ATATCAGTCATCGAACACCAC-CAAGCGGT--CTT-ACTCCA-AATACCACATCAGATTAAGCTAATTTTAA-TTGAAA-CGCCCGCTTACTTT-TACact
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GC-AT-AAA---CCACAAGTAGTTGC-AAGTT--A-A-A-TTGGTTTT-A-CAG--T----AGG--CC-T---ATAATCTTTT--AA---------------ATC--------T---AATTA---AT-TCA-TCATCGGAAACA-C-CAA--GGTA-C-T-TC-CAA-AATACC-------------CT-ATCTTAA-TTG-AA-C-CCCCTTT-ATTT-T-CCTGT-----------------A---TA--G----------TGA--TT-A--G-TGT-A----CG---C--CTG-C-----ATAAAAC-AATTAGA-TTAAC-CAA--T-GG-ATTGTCACCTATA--T-A-CACAGA---CC-CAAGTCGGATGATTTGA-CAT-CACGAAATGCATTGAGAAATA--GA-AAGTAA-ACG-AG-ACTTT

Unaligned ( gi|16 ): TAAAAAGGTGTGATAGTCCGTGGGGTAGGAAAGCTGCACACGGGTAT

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Reference ( family-3382 )     :   TTC-G-CTGAA-TA-G--TC-AGAT----A-GT--ACTTCAA-GA-TAGCAAT--TCAAT-TC---GTTTATTGACC-AATTA--TG-----CCA---A---AA-AGGGCAAT-AA-GAAGG-GTTGT-ACA-AT--GG-TATAAA---CATCCC------GTGTTGC-AC-G--TGCGAGGACAATTGTG-AAT-AA--CACAG-GTGTTTCG-T-C-GGCAATTTGATGAGC-TCTAAAAA-GGT-GTG-AAA-GTCA------------------G-------------GC------------TGCA-A--C-GG--ATATA------TGTTTA-TAGG-GAT---A---GT--ATGGC-AT-AAA-CC-CAAGTA-TTGC-A-GTT--A-A-AATTGGTTTT-AACAG--T-T--AGG--CC-T---A-AATCTTTT--AATCTA-T-TGT-CA-AATNAA------T---AATTA---AT-TCA-TCATCGGAAAC--C-CAA--GGTA-CTT-TC-CCA-AATACC-------------CT-ATTTTAA-TTG-AA-CGCCCCTTTAATTT-TACCTGT--AT-A-----GTCAG-A---TA--G----------TGA--TTAA--G-GGT-A-CGCCG---C--CTGCC-----ATAAAAC-AATTAGA-T--ACACAA--T-GG-ATTGTCACCTATA--TAA-CACAGA---CC-CAAGTCGGATGATTTGA-CAT-CACG-AATGCATTGAAGAATG-CGA-GATTGACCCG-TG-ACTTTG-CG-AC-GA-TGAATTC---CACAG-CGCCCTA-ACC-------TAT-CT-------G-T-GTTTT-CCA----AGCG------ATG----TTGTT--CAGG---T---T-CAGT-A-----TTTTCCCCAT-TT--GATTCATTCAG----AA-TC-CG-TTG-CTGCT--GGC-----------TCAAATC---TAC---G-GACAATAT-CCCA-TG-CG-TC-CTC-GGT--AGGAAAATCTTC---AAAG---G-A-AGA-CGCTTCAA--ACAA-CAC-GTG--GA--GGTCGATTTCGGTCTG-AGGAAG---CGGAGA-TATC---G-C-TCGCACTC-G---CCATAAT------ACCCTGTT--CAAAAC-AGC-TGT--G-TTGTGA-CGTC-ACA-GGTCATTTCGGCT-AAA-TA--TAGTAAAA-CC-GG-AAG-TTAAG----TTG-AT--TAGTT-TTGA----GC-----AGG-TGCC-AA-----AATAGCCAACTT---CGACGGGAAAT---AT-CTCGGTATTTAACGCACGC-ACGATTATA--TTTTTTTACC--C-TCATA-TTTT-TAAAGGTATTTTTTCAA-C--AATTT-ACCAT-TA-TT--ATACCCATGACTTCCGGGGCACT
gi|1                          :   TTCAG-CTGAAATA-G--TC-AGAT----A-GT--ACTTCAA-GA-TA-CAATGTTCAAT-TC---GTTTATTGACC-AATTA--TTTTTTTCCA---ATAAAATAGGGCAAT-AAAGAAGG-GTTGT-ACA-AT--GG-TATAA----CATCCC------GTGTTGC-AC-G--TGCGAGGACAATTGTG-AAT-AA--CACAG-GTGTTTCG-T-C-GGCAATTTGATGAGC-TCTAAAAA-GGT-GTG-AAA-GTCA------------------G-------------GC------------TGCT-A--C-GG--ATATA------TGTTTA-TAGG-GAT---A---GT--ATGGC-AT-AAA-CC-CAAGTA-TTGC-A-GTT--A-A-AATTGGTTTT-AACAG--T-T--AGG--CC-T---A-AATATTTT--AATCTG-T-TGT-CA-AATTAA------T---AATTA---AT-TCA-TCATCGGAAAC--C-CAA--GGTATTTT-TT-CCA-AATACC-------------CT-ATTTTAA-TTG-AA-CGCCCTTTTAATTT-TACCTGT--AT-A-----GTCAG-A---TA--G----------TGA--TTAA--G-GGT-A-CGCCG---C--CTGCC-----ATAAAACAAATTGGA-T--ACACAA--T-GG-ATTGTCACCTA-A--TAA-CACAGA---CC-CAAGTCGGATGATTTGA-C-T-CACG-AATG-ATTGAAGAATT-CGA-AGATGACCCG-TGCATTTTG-CG-AC-GA-TGAATTC---CACAG-CGCCCTACACC-------TAT-CT-------G-T-G-TTT-CCA----AGCG------ATG----TTGTT--CAGG---T---T-CAGT-A-----TTTTCCCCAT-TT--GATTCATTCAG----AA-TC-CG-TTG-CTGCT--GGC-----------TCAAATC---TAC---G-GACAATAT-CCCA-TG-CG-TC-CTC-GGT--AG--ATATCTTC---AAAG---G-A-AGA-CGCTTCAA--ACAA-CAC-CTG--AA--GGTCGATTTC--TCTG-AGGAAG---C-GAGA-TATC---G-C-TCGCACTC-G---CCATAAT------ACCCTGTT--CAAAAC-AGC-TGT--G-TTGTGA-CGTC-ACA-GG-CATTTCGGCA-AAA-TA--TAGAAAAA-CC-GG-AAG-TTAAG----TTG-AT--TAGTT-TTAA----GC-----AGG-TGCC-AA-----AATAGCAACCTT---TGACGGGAAAT---AT-CTCGGTATTTAACGCACGC-ACGATTATA----TTTTTACC--C-TCATA-TTTT-TAAAGGTATTTTTTCAA-C--AATTT-ACCAT-TATTT--ATACCCATGACTTCCGGGGCACT
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gi|11                         :   TTC-G-CTGAACTA-G--TC-AGAT----A-GT--ACCTCAA-GA-TA-CAAT--TCAAT-TCC--GTTTATTGACC-AAT-G--TG-----CCC---C---CA-AAGGCAAT-AA-GAAGG---TGT-ACAGAT--G--TATAAA---CATCCC------GT-TTGCGAC-G--TGCGGAGACAATTGTG-AATCAA--CACAG-GTGGTTCG-T-C-GGCAATT---TGAGC-TCTAggttttttttggtttttttttttttttattttcccagttttgtaagatctttat
gi|12                         : ttTTC-GACTGAA-TA-GATCC-AGACTAAAA-GTTTACTTCAATGAGTAGCAAT---CAAT-GC---GTTTTATGACC-AG-------------------------AGGGCAATTAA-GAAAG-GTTGTTACA-AT--GGATATAAAATACATCCTCTCTGTGTGTTGC-AC-G--T
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             cAATG-CGA-GATTGACC-G-TG-ACTT-G-CGGACTAA-TGAATTC---CACAGGCGCCCTA-ACCATTCTG-TAT-TTCCCCGAGG-T-GTTTT-CCA----AGCG------ATG----TTGTT--
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        agaTAA-TTG-AA-CGCCCCTT-AATTT-TACCTGC-----------GTCAG-A---TATAG----------TGC--TTAA--G-GGT-A-CGCCG---C--CTGCC-----ATAAttaaaagtgatttc
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                    tgA------------------G-------------GC------------TGCA-AA-C-GG--ATATA------TGTTTA-TAGG-GAT---A---GT--ATGGC-
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tgggggtaggaTTCCCCAT-TT--GATTCAT-CAG----AA-TC-TG-TTG-CTGCT--GGC-----------TCAA
gi|2                          :   TTC-G-CTGAA-TA-G--TCCAGAT----A-GT---CTTCAA-GA-TAACAAT--CCAAT--C---GTTTATTGACC-GAT---------------------------GCAAT-AA-GAAGGTGTTAT--CA-AT--GG-TATAAA---CATCCT------GTGCTGC-ACCG--TGCGAGGACAATTGTG-AAT-AAACCACAG--TGTT-CG-TTC-GGCAAATT--TGAGC-TCTAAAAAAGGT-GTG-AAA-GTCA------------------GTGTGGGTGGAAG-GC------------TGCATA--C-G---ATATA------TGTTTA------------A---GTA-ATGGCAAT-AAA-CC-AATGTATTTGC-A-GTT--A-A-AA-TGGTTTT-AA---------------------------CTTTA--AATCTA-T-TGT-CC-AATAAA------T---AATTA---AT-TCA-TCATCGGAAAC--C-CAA---GTA---T-TT-CCA-AATACCT------------CT-ATTTTAATTTG-AA-CGCCCCTT--ATTTGTACCTGT--AT-A-----GTCAGTA---TA--GATGAATTAACTGA--TT-A--G-GGTAA-CGCCG------CTGCC-----AT-AAAC-AATTAGA-T--ACACAA--TAGG-ATTGTGTCCTATATTTAT-CACAGA---CCTCAAGTCGGATGATTTGACCAT-CACA-AATGCA-TGAAGAATGCCGA-GATTGA-CCG-TG-ACTTTG-CG-AG-AG-TGAATTC---CACAG-CGCCCTA---C-------CAT-CT-------G-T-GTTTT-CCA----AGCGA-----ATT----TTGTT--CAGG---T---T-CAGT-A-----TTTTCCCCAT-TT--GATTCA-TCAG----AA-TT-CT-GTG-C--CTTGGGC-----------TCAAATC------------------T-CCCA-TG-CG-TC-CTC-GGT--AGG-AAATCTTCATAAAAG---GAA-AGAGCGCTTCAA--A-AA-CAC-GTG--GA--GGTCGATTTTCGTCTG-AGGAAG---CGGAGATTATC---GCC-TCGCACTC-A---TCATAAT------ACCT--TT--CAAAAC-AG--TGT----TTGTGA-CGTC-ACA-GGTCATTT-GGCT-AAA-TA--TAGTAAAA--C-GG-AAG-TT-AG----TTG-AT--TA-TT-TTGAGCATGC-----AGG-TGCCAAA-----AATAGCCAACTT---TGACGGGAAAT---ATCCTCGGTATTTAACGCACAC-ACGATTATA---TTTTTTACC--C-TC-TA-TTTT-TAAAGGTTATTTTTCAA-CCAAGTTTAACCAT-TA-TT--ATACCCATAACTTCCGGG
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gi|4                          :                                              tg-TAGTATT--TCGAT-TTTTTGTTTTTTTACTGAATTA--TGTTTTTCCATA-A---AATAGGGCAAT-GA-G-----GTTG--ACA-AT--GG--ATGGA---T---CC------GTGTTGC-AA-G--TG-GAGGAAAGTTGTG-AA--A------AG-GTGTTACG-T---GG-AATTTGA
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                    AC-AA--CACAG-GTCGTTCGAT-CAGGCAATTTGA-GATC--CTAAAAA-AGTAGTG-ACACGTCATTTGTTGGGGTAGCGGAAG-------------GC------------TGCA-A--CTGG--ATATA------TGTGTAGTATG-GAT---AAAAGTTAGTGGC-AT-AAA-CC-CAAGTA-TTGCAA-GTTAAA-A-AAATGGTTGT-AACAG--T-GGAGGG--CC-TAAAA-AATCTTTTTAAATCTATT-TGTACACGATAAGCCCTCCC---AAATATGTAT-TC---TATCGGACCC--CACAG--AGTG-CTTATCACCACAATACC-------------CT-A-TTTAA-TTG-AATCGCCCCTT
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GC-AT-AAA-CCACAAGTAGTTGC-AAGTT--A-A-A-TTGGTTTT-A-CAG--T----AGG--CC-T---ATAATCTTTT--AA---------------ATC--------T---AATTA---AT-TCA-TCATCGGAAACA-C-CAA--GGTA-C-T-TC-CAA-AATACC-------------CT-ATCTTAA-TTG-AA-C-CCCCTTT-ATTT-T-CCTGT-----------------A---TA--G----------TGA--TT-A--G-TGT-A----CG---C--CTG-C-----ATAAAAC-AATTAGA-TTAAC-CAA--T-GG-ATTGTCACCTATA--T-A-CACAGA---CC-CAAGTCGGATGATTTGA-CAT-CACGAAATGCATTGAGAAATA--GA-AAGTAA-ACG-AG-ACTTT