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gi|16 : ttT--GCCAA-GTAC------AT---TATTG-A-T--T-A--G---------GT-A--AAC--AGTC-AACT-T-ACA-GC--ATG-A-AAA---GTT--CATT--T--A-T--GT-ATTCA-AAATACAAA-TA-A-A--AG--AA------TAC-C-AC--AA--TA---T-ACT-------TCTGC---AC----CATAAA-----------GCTAAAGCT-CAT-G-AT-----A-----T-CGTA---------AA-------A-TA-A---TAT-------------------C---A-AT-GC-T--T-AG-T-GTGA-CAGTGCTA-----TGAAAGTTTTCG-AGA-TC--C-
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gi|24 : ttA-TA-A-A--AG--AA------CAC-G-AC--GA--TA---T-ACT-------T---CTCCAC----TATAAG-----------T--T----T-CAC-G-ATT--CTA-----T-TGTA-----------------------------------------------CAC---A-AT-GC-T--T-AG-T-GTTA-TTGTATT------TGAAAG--TTCG-ACA-CC--C-ATGT--AATTCC-TGCA-T-T--------------GGTT--GCA-CGT--GC-T
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3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-3362 ) : AGAACATC-TG-TTCGATCG--AANCA-TGC-CA-AGT-G---C-AA-GTA-------AT---TATTG-A-A--C-A--G---------GT-A---------A-AC--AGTC--A-CT-TAC-AG-C--A-TG-A-AAA---GTTT-CATT--N--A-T--GT-ATTCA-AAATA-CAAA--T-A-A-A--AG--AA-T-AC-G-AC--GA--TA---T-ACT-------T---C---AC----C-AT--------------AAAG--T--T-CAC-G---ATTGTA-----T-TGTA--------TAA--T--G-A-TA-ATGCTATGCTAAA--CTAT-----CAC---A-AT-GCT--T-AG-T-GTGA-CTGTAT----T-TTTGAAAG--TT-CG-A-GA-CC--CTT-GTAA--TTC-C-TGCA-T-T--------------GG-T--GCAC-G---TGC-TGG------T--ACAT-A--TC--G--------T--CCT-C-GGC-GACGAT-ATGCATGTACACC---T----AAT-GT-T----TCT-AACG-GC-AC-----G------TACTAGTG-T--CA--C--T-GAC-G-TT---A--AT-T------T-----GG--TTA----CTA--G--G--CAT-A---T--TT-TTGCAGG-AGGG-TTC-TTACT--G--TC-G-C---G----AAAACA-A---TA-A--TT--GTCC---TCG--CG--GA---AT-ATAATGT---CGCCG----G-CC-C-G---ATAGATGGGAAAAGG--G----------GG---GGGGGG-GGGG-------GT-AATA-TGA-C-TAT--A---GT-A-------TT--CC-AAAAAC------AAA-C-A-T-TTAGCTG-TGG-TTTGCTG-CTGANTT-TCTTTT-CA----T--GCG-AATACT-------TGGC--AAAAA-GGCT-AT-CAC-G-GCTTC-TGTC-AATA
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gi|15 : TATTG-T--CG--CGCT-GAC-G-TT---A--AT-G------T-----CG--ATA----CAA--G--G--CTT-A---TC-TT-TTGCAGG-ACGG-TTC-TTACT--G--TC-GTC---G----GAAACA-A---TA--------GTCCA--TCG------GA---AC-ACATTGT---TGCTG----G-CCGC-G---ATAAATGGAAAAGGGTTG----------GG---GTGGGGTGAGGTAAGATAGT-AAGA-TAA-C-TGG--AA--GT-A-------TT--TCTAAAAAC------AA--T-A-T-TTAGCTG-TGG-TTTGCTG-CTGA-TT-TCTT
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Reference ( family-3362 ) : AGAATATC-TG-TTCGATCGAAN--CA-TGC-CA-AGT-A---CAA-GTA-------AT---TATTGA-A--C-A--GGT---------A---------A-AC--AGT-CAACT-TAC-AGC-A--TGAAA-A---GTTT-C-ATTN--A--T--GT-ATTCA-AAATA-CAAA--T-A-A-A--AG-AA--T-ACG-AC--GA--TA---T-ACT-------T---C---AC----C-A----T--------------AAAG--T--T-CAC-G---ATTGTA-----T-TGTA--------TAA--T--G-A-TA-ATGCTATGCTAAA--CTAT-----CACA---AT-GCT--T-A-G-T-GTGAC-TGTAT----T-TTTGAAAG--TT-CGA-GACC--C-TTGT--AATTC-C-TGCA-T-TG-------------GTT-GCA-C-G---TGC-T-GG------T--ACAT-A--TC--G--------T--CCT-C-GGC-GACGAT-ATGCATGTACACC----AAT-GT-T----TCT-AA--CGGC-AC-----G------TACTAGTG-T--CA--C--T-GAC--------G----T-----TAAT------NT-GG--TT-A----CTA--G--G--CAT-A---T--TT-TTGCAGG-AGGG-TTC-TTACT--GTC-G-C---G----AAAACA-A---TA-A--TT--GTCC---TCG--CG--GA---AT-ATAATGT---CGCCG----G-CC-C-G---ATAGATGGGAAAAGG--G----------GG---GGGGGG-GGGG-------GT-AATA-TGA-C-TAT--A---GT-A-------TT--CC-AAAAAC------AAA-C-A-T-TTAGCTG-TGG-TTTGCTG-CTGAATT-TCTTTT-CA----T--GCG-AATACT-------TGGC--AAAAA-GGCT-AT-CAC-G-GCTTC-TGTC-AATA
gi|1 : AGAA-GTC-TG-TTTGATCGAAT--CA-TGC-CA-AGT-GG--CAA-GTA-------AT---TATTGA-A--C-A--GGT---------A---------A-AC--AGT-CA-CC-TAC-ATC-A--TGAAA-A---GTTT-C-ATTA--A--T--GT-ATTCA-AAATA-CACA--T-A-A-A--AG-AA--T-ACG-AC--GA--TA---T-ACT-------T---C---AC----C-A----T--------------AAAG--A--T-CAC-G---ATTGCA-----T-TGTA--------TAA--T--G-A-TA-ATGCTATGCTAAA--CTAT-----CACA---AT-GCT--T-A-G-T-GTGAC-TGTATTAAAT-TTTGAAAG--TT-CGA-GACC--C-TTGT--AATTC-CGTGCA-T-TG-------------G-T-GTA-C-G---AGC-T-GG------T--ACAT-A--TC--G--------T--CCT---AGC-GACGAT-ATACATGTACACCCTATATT-GTCT----TCT-AA--CGGC-AC-----A------TACTTGTG-T--CA--C--T-GAC--------G----T-----TAAT------TT-GG--TA-A----CTA--G--G--CAT-A---T--TT-TTGCAGG-AGTA-TTC-TTAAT--ATC-G-----A----AAAACA-A---TA-A--TT--GTTC---TCG--CG--GA---AT-ATAATGT---CGCCG----GCCC-C-G---ATAGATAGGAAAAAG--G----------GG---GGGGGG-GGGG-------GT-AATG-TGA-C-TAT--A---GTAA-------TT--CT-AAAAAC------AAA-C-A-T-TTAGCTG-TGGTTTTGCTG-CTTATTT-TCTTTT-CA----T--GCG-AATACT-------TGGC--AAAAA-GGCT-AT-TAC-G-GCTTC-TATC-AATA
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gi|29 : aGT---CGCCG----G-CC-CCG---ATAGATGGGAAA-----------------G---GGGGGG-GGGG-------GTAAATG-TGA-C-TAT--AG--GT-AT------TT--CT-AAAATC------AAA-C-A-T-TTAGCTG-TGG-TTTGCTG-CT-AATT-TC
gi|3 : ATC-AAT--CA-TGC-CA-AGT-A---CA-------------T---TATTGA-A--C-A--ATA---------A---------A-AC--CAT-CAACT-TAC-AGC-A--TGAAA-A---GTT--C-ATTA--A--T--CT-ATTCA-AAATA-CAAA--TTA-A-A--AG-AA--T-AC--AC--GA--TAACGT-GCT-------C---C---AC----T-A----T--------------AAAG--T--TTCAC-A---AT-GTA-----T--GTA--------CTA--T--GTA-TA--TA--ATGCTAAA--CTA------CACA---AT-GCT--TTA-G-T-GTGAC-T-TAT----T-TT--AAAT--TT-CGA-GACC----TTGT--CAATC-C-TGCA-T-TG--------------TT-GCA-CCG---TGC-T-GG------T--A-AT-A--TC--G--------T--CCC----GC-AAC-AT-A---AAATGCATC----AAT-GC-----------A--CAAC-AT-----G------TACTAGT--T--CA--C--T-GACC-------GC---T-----TAAT------TAAGG--TT-A----CTA--G-----CATTA---T--TT-TTGCAAG-AGGG-TTC-TTACT--ATC-G-CA--G----AAAAC--G---TA-A--T----------------------------TAATG---------------------------GAAGGGGGGAGG--G----------AG---GCG----------------T-AAT--TG--C-TAT--A---TT-AGGATT--TC--CC-AAAAAC------AAA-CAA-T-TTAACTG-TG---TTGC-G-CTGAATG-TCTTCT-------T--GCG-AATACT-------TGGC--AAAAA-AGCT-AT-TAT-G-GCTTCTTGTC-AATA
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gi|38 : tttgCA-T-TG-------------GTT-GCA-C-G---TGC-T-TG------T--ACAT-A--TC--G--------T--CCT-C-GGC-GACGAT-ATGC
gi|4 : -TGC-CA-AGTTA---CAA-TTT-------AT---TATTGA-AAGC-A--GGT---------A---------A-AC--AGT--AACT-TAC-AGC-A--TGAAA-A---AGTT-C-ATTACTA--T--CT-ATTCA-AAATA-CAAA--T-A-A-A--AG-AA--T-AAG-AC--AA--TA---T-ACT-------TCTCC---AC----T-A----T--------------AAAAGTT--T-CAC-G---ATTGTA-----T-TGTA--------C-A--T--G-T-TATATGTAATGCTAAA--CTATC----CACA---AT-GCT--T-A-G-T-GTGAC-TGTAA----T-TTTGAAAAGTTT-CGA-GACCGAG-GTGT--AATTCAC-TGCATT-TG-------------GTT-GCA-C-G---TGC-T-GG-----------------------------------T-T-GG-----AAT-AC-CATGTAC-TC----AGT-GT-C----ACT-GA--CG-------------------TTAAT------------------------------T-----TAAT------GTGGG--TT-A----CTA--G--GGCCAT-A---T--CT-TGGCAGG-AGGG-TTCTTTACT--ATC-G-CAG-A----AAAACA-A---TA-T--TT--ATTC---CC------------AT-------------CCG---------T-A---ATAGAACGGGAAAGG--G----------GG---GGGGGA-GGCG-------GT--ATA-TG----------------------------TC-AAAAAC------AAA-C-------------TGG-TTTGCTGACTGAATT---TTTT-CA----T--GTC-AATACT-------TGGC--AAAGATTGCT-AT-TAC-G-t
gi|40 : AGAAAATC-TG-TTCGAACGAAG--TA-TGC-CA-AGcc
gi|5 : acaTATC-TG-TTCT-TC--AT--CA-TGT-C----TCA---CAGCGTAC------AT---TATTGA-A--C-A--GTT---------A---------A-AC--AGT-CAAAT--AC-AGCCA--TGAAA-A---GTT-------C--A--T--GT-ATTCACGAATA-CAAA--T-A-A-A--AGTAA--T-ACC-AC--GA--TA---T-ACT-------T---C---TC----C-AGTCAT--------------AAAGA-T--T-CAT-G---AT-GTA-----T--GTA--------TAA--T--G-A-TA-ATGTTAA---AAA--TTAT-----CAAAT--AT-GCT--T-AAG-TAGTGACCTGTAT----T-T--GAAAG--T--CTA-GACC--T-TGGC--AATTC-C-TGCA-T-TAATTGCCCGATTAAGTT-GCA-C-GAGCTGCAT-GA------T--GCATCA--TCCAA--------TAACCT-C-GGC-GACGAT-ATGCAT-T--------------T-T----TCT-AA---GGC-AC-----A------TTCTAGTG-C--CA--C--TGGAC--------T----C-----TAGC------AT-----TT-A-----TA-------------------TT-TTGTAGG-A--G-TTC--TACTTAATC-G-T---ACCACAAAACA-A---TA-A--TA--TTCCA--T----CG--GA---ATAATAATGTACGCGCCG----C-CG-C-G---A
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-3362 ) : AGAATATC-TG-TTCGATCGAAN--C------A-TGC---CA-AGT-A-CA---G--TA-------AT---TATTGA-A--C-A--GGT---------A---------A-AC--AGT-CAACT-TAC-AGC-A--TGAAA-A---GTTT-C-ATTN--A--T--GT-ATTCA-AAATA-CAAA--T-A-A-A--AG-AA--T-ACG-AC--GA--TA---T-ACT-------T---C---AC----C-A----T--------------AAAG--T--T-CAC-G---ATTGTA-----T-TGTA--------TAA--T--G-A-TA-ATGCTATGCTAAA--CTAT-----CACA---AT-GCT--T-A-G-T-GTGAC-TGTAT----T-TTTGAAAG--TT-CGA-GACC--C-TTGT--AATTC-C-TGCA-T-TG-------------GTT-GCA-C-G---TGC-T-GG------T--ACAT-A--TC--G--------T--CCT-C-GGC-GACGAT-ATGCATGTACACC----AAT-GT-T----TCT-AA--CGGC-AC-----G------TACTAGTG-T--CA--C--T-GAC--------G----T-----TAAT------GT--GG--TT-A----C--TA--GG--CAT-A---T--TT-TTGCAGG-AGGG-TTC-TTACT--GTC-G-C---G----AAAACA-A---TA-A--TT--GTCC---TCG--CG--GA---AT-ATAATGT---CGCCG----G-CC-C-G---ATAGATGGGAAAAGG--G----------GG---GGGGGG-GGGG-------GT-AATA-TGA-C-TAT--A---GT-A-------TT--CC-AAAAAC------AAA-C-A-T-TTAGCTG-TGG-TTTGCTG-CTGAATT-TCTTTT-CA----T--GCG-AATACT-------TGGC--AAAAA-GGCT-AT-CAC-G-GCTTC-TGTC-AATA
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gi|10 : AAAATAGG-TT-TTCGATCGAAC--TTGAAGTA-TGC---CA-AG-------------A-------A--------GA-C--C-A--GGT---------AGA-------A-ATTAAGT-CAACT-GAC-TGC-G--TGAAA-----GTTT---ATTG--A--T--AT-ATTTG-AAAAA-CGA---T-G-A-----------T-ATG-ATCTAA--TA---T-GTT-------T-------AC----TGA----C--------------GAGA--T--T-C---------TGCA-----C-CATA--------AAT--T--G-A-TA-A-ACTTTAATAAG--TT-T-----CACG---AT-AAT--C-A-AAT-GTGA---ATAT----G-TGTGAAAG--TT-CAA-GATT--C-TTGT--AATTC-C-AGCG-T-TG-------------ATC-GCC-C-T---TGG-T-GG------T----AT-G--TT--G--------T--CCT-C-AGC-GACGAT-ATGCACATGCAat
gi|11 : cAAT--C------A-TGC---GA-AGT-A------G--CA--------T---TATTGA-A--C-A--GGT---------A------------C--AGT-CAACT-TAC--GC-AA-TGAAA-A---ATT----ATTA--A--T--CT-A--------------A--T-A-A-A--AG-AA--T-ACG-AC--GA--TA---TTACT-------T---CTCCAC----T-A----T--------------AAAG--T--TTCAC-G---ATTGTA-----T-TGCA--------CA---T--GTA-TA--TGTAATGCTAAA--CTAT-----CACA---AT-GCT--T-A-G-T-GTGAC-TA-AT----T-T--GAAAG--TT-CGAAGACC--C-TTGT--AATTC-C-TGCA-TATG-------------GTT-GCA-C-G---TGC-C-TG------T--ACAT-AATCC--G--------T--CCT-C--GC-AACAAT-A----------------AAT-GC-T----TCT-AA---GGCAAC-----ATACATCTACTAGTG-T--CA--C--T-GAC--------G----T-----TAAtgtcttactcttatggtatattg
gi|12 : AGAACATC-TG-TTCGATCGATA--C------A-TGT---CA-AGT-A-CA----------------T---TATTGA-A--C-A--GGT---------A---------A-AC--AGT-CAATT-TAC-AGC-A--TGAAA-T---GTT--C-ATTT--A--T--GT-ATTCA-AAATT-CAAA--T-A-A-A--AG-AA--T-ACG-AC--GA--TA---T-ACT-------TTTCC---AC----C-A----T--------------AAAGT-T--T-CAC-G---ATTG---------TGTAAGC-----TAA--T--G-A-TG-ATGC----------------------------T-GCT--T-A-G-T-GAGAC-TGTA-------TTTGAAAG--TT-CGA-GACC--C-TTGT--AATTC-C-TGCA-T-TG-------------GTT-GCA-C-G---TGG-T-GGTACATTT--ACAT-A--TT--G--------T--CCT-T-TGC-GACAAT-AT-CATG
gi|13 : -------AT---TATTGACA--C-A--AGT---------ATTCTGTTAAATAC--AGTTCAACTGTACCAGC-A--TGCAC-ATTGGTTTTC-ATTAT-A--TCCGTCATCAA-AAATAACAAAAAT-G-A-A--AGTAA--TTACGCAC--GA---A---T-ACTCTCTCGTT---C---AC----T-A----T--------------AAAG--T--TTCAC-AT--ATTGTA-----T-TGTACATGTGATTAA--TTAG-AGTA-ATGCTATCGTCAA--CCCTTGGTGCACA---GTTGCT--TTA-G-T-GTGAC-TGTA-----T-TTTGAAAGT-TT-CGG-CACC--T-CTGT--AATTT-T-CGCA-TATG-------------GTT-GCA-C-c
gi|14 : ----T-----TAAT------GT--GG--TT-A----C--TA--GGG-CAT-A---TA-TT-TTGCAAG-GAGG-TTC-TTACT--GTCCG-CAA-G----AAAACA-A---TA-T--TT-------------------A---AT-TCCAT-------CCG---------T-A---ATAGATGGGAAGGGG--GTGGGTTGGGTGG---GGGGGG-GGGGGGAGGC-GT-AATA-TGA-C-TAT--ATAGGT-A-------TTTCCC-AAAAAC------AAA-C-A-T-TTAGCTG-TGG-GTTAGTG-CTGAATT-TC-TTT-CA----T--GCG-AATACT-------TGGCCAAAAAA-GGCT-AT-TACGG-GCTTC-TATC-AATA
gi|15 : TATTG-T--CG--CGCT-GAC--------G----T-----TAAT------GT--CG--AT-A----C--AA--GG--CTT-A---TC-TT-TTGCAGG-ACGG-TTC-TTACT--GTC-GTC---G----GAAACA-A---TA--------GTCCA--TCG------GA---AC-ACATTGT---TGCTG----G-CCGC-G---ATAAATGGAAAAGGGTTG----------GG---GTGGGGTGAGGTAAGATAGT-AAGA-TAA-C-TGG--AA--GT-A-------TT--TCTAAAAAC------AA--T-A-T-TTAGCTG-TGG-TTTGCTG-CTG-ATT-TCTT
gi|16 : atata--C------A-TGC---CA-AGT-A-CA----------------T---TATTGA-T--T-A--GGT---------A---------A-AC--AGT-CAACT-TAC-AGC-A--TGAAA-A---GTT--C-ATTT--A--T--GT-ATTCA-AAATA-CAAA--T-A-A-A--AG-AA--T-ACC-AC--AA--TA---T-ACT-------TCTGC---AC----C-A----T--------------AAAG--C--T-AAA-GCTCATGATA-----T-CGTA---------AA-------A-TA-A---TAT-------------------CA---AT-GCT--T-A-G-T-GTGAC-AGTG-----C-TATGAAAGTTTT-CGA-GATC--C-cagagc
gi|17 : TGT---TGCTG----GGCC-C-TTC-ATAGATGAGATAAGG--G----------AACATGGGGAC-AGGT-------TT-AATAATGAAC-TATTTA---GT-AGGTTTATTT--CT-AAGAAC------AAA-C-G-C-TTAGCTGTTGG-TTTCCTT-CTGTATT-GTTTCT-CA----TTGACGAAATA---------TGGC--AAAAC-GGCT-TC-CAC-A-GC-TC-TGTC-
gi|18 : gtATATC-TGGTTCGATCGAAG--C------AATGT---CA-AG---------G--TA-------AT---TATCAA-T--T-A--GGTT--------A---------A-AC--AGT-CAACT-TAC-AGC-A--TGAA--------TT-C-ATTT--A--T--GT-ATTC--AATTA-CAAA--T-ATA-A--AGAAA--T-ACG-AC--GGATTA---T-ATT-------TCTGC---GC----C-A----T--------------AAAG--CGGT-CAC-G---ATTtgatatta
gi|19 : tacaatccatg---CA-AGT-A-CA----------------T---TATTGA-A--C-A--GGT---------A---------A-AC--AGT-CAACC-TAC-AAC-A--TGAGA-A---GTT--C-ATTA--A--T--GT-ATTCA-AAATA-CAAA--T-A-A-A--AG-AA--T-ACG-AC--GA--TA---T-ATT-------T---C---AC----C-A----T--------------AAAGT-T--T-CAC-G---ATTGTATCAATT-TGTA--------TAA--T--G-A-TA-ATGCTATGCTAAA--CTAT-----
gi|2 : gg-TGC---CG-AGT-A-TA----------------T---TAT-GACA--C-A--GGT---------A---------A-AC--AGT-CAA-T-TAC-AG--A--TGAGAGA---GCTT-C-TTTA--A--T--CT-ATTCA-AAAAT-CAAA--T-A-ACA--AG-AAAAT-ACGGAC--GA--TA---T-ACG-------T---C---ACTCTAC-T----T--------------AAAG--T--TTCAC-G---AT-GTA-----T-TGTA--------CA---T--G-A-TA--TGTAAT-TTAAA--CTAT-----CACACAAAT-GAT--T-A-G-T-TTGACCTCTAT----T-TTTGAAAA--GT-CGAAGACC--CCTTGT--AAT-C-C-T-CA-T-TG--------------TT-GCA-C-G---TGC-TTGG------T--ACAT-A--TC--G--------T--CCT-CAGGCAGACGAT-ATGC------------------T-T----TCTAAA--TGGC-ACTACATG------TACTAGTG-T--CAATC--T-GAC--------G----T-----TAATTCAATGAT--GGATTT-A----C--TAGCGG--CAT-AGTCT--TC-TTGCAGG-AGGG-TTC-TTACT--ATC-G-CAGAG----AAAACA-A---TG-ATCTT--ATTCCATCCA--CG--------T-GTAATA--------------------------GGATGGG-AAGGG--G----------GA---GGGGGG-GGGG-------GC-GGTA-C-----------------------------------AAC------AAA-C-ACT-TTAGCTG-TGG-TTAGCTG-CTGATTTATCTTTCACACCGCC--GCG--ATAC--------TGGCA-AAAAA-GGCTGAT-TAC-G-G-TTC-TAT
gi|20 : ttcccagATC-TG-TTCGATCGAAT--A------T-TGC---CA-TGT-A-CATGTG--TAC------AT---TATTGA-A--C-A--AGT---------A---------A-AC--AGT-CAACT-TAT-AGC-A--TGAAA-A---G-TT-C-ATTT--A--T--GT-ATT----AATA-CAAA--T-A-A-A--AG-AA--T-ACG-AC--GA--TA---T-ACT-------TCTCC---AC----C-A----T--------------AAAG--T--TCCAC-G---ATTGTA-----T-TGTA--------TAA--
gi|21 : AGAATATAATG-TTCGATCGAAAAGC------A-TGTGCACAGAGG-A--A---G--TAGCTCCCCATCAGTATTGA-AA-C-A--GGTTTTACATGTA---------A-AC--AGT-CA-CT-TAC-AGC-AAATGAAA-A---AGTT-CGATTT--AAAT--CT-ATTCA-AAATA-CAAA--T-A-A-A--
gi|22 : aT-A----C--GA--GG--CAC-A---TC-TT-TTGCAGG-AGGA-TTC-TTGCT--GTC-GTC---G----GAAATA-A---TA--------GTCCA--TCG---G--AATACAT-ATATTGT---TGCCC----G-CCGC-G---ATAGATGAGAAAGGG--G----------TT---AGGGGA-GG---------------A-TAA-C-TCT--AG--GT-A-------T------------------------A-T-ATAGCTG-TGG-Ttaagagat
gi|23 : -AT-----G------TACTAGTG-A--TA--C--T-GAT--------G----TGAATTTAAT------GT--GG--TT-ATATAC--TA--GG--GAA-A---TA-TT-TTGCAAG-AGGG-TTC-TTACT--NTT-G-A---G----A
gi|24 : tatgtgatnttcccattcttgatgtttgtaaacatcttacatatA--T-A-A-A--AG-AA--C-ACG-AC--GA--TA---T-ACT-------T---CTCCAC----T-A----T--------------AAGT--T--T-CAC-G---ATTCTA-----T-TGTA-----------------------------------------------CACA---AT-GCT--T-A-G-T-GTTAT-TGTAT----T-T--GAAAG--TT-CGA-CACC--C-ATGT--AATTC-C-TGCA-T-TG-------------GTT-GCA-C-G---TGC-T-
gi|25 : -TTGT--AATTC-C-TGCA-T-TG-------------ACT-GCA-C-G---T------------------AT-A--TC--C--------T--CCT-C-AGC-GACGAT-ATGCATGTAC--------AT-GTAC----CCT-CA--AGG-------------------TATTG-TCGCG--C--T-GAC--------G----T-----TAAT------GT--TG--AT-A----C--AA--GG--CAT-A---TC-TT-TTGCAGG-AG
gi|26 : TT--A--T--GT-ATTCA-AAATA-CAAA--T-A-A-A--AG-AA--C-ACG-AC--GA--TA---T---------------------------A----T--------------AAAT--T--T-CAC-G--------A-----T-TGTA--------TAAGCT--A-A-TA-AT----TGCTAAA--CTAC-----CATA---AT-GCTTGT-A-G-T-GAGAC-TGTA-------TTTGAAAG--T
gi|27 : TAGTG-T--CG--C--T-GAC--------A----T-----TAGT------GT--CG--AT-A-------TA--TGT-CGT-A---TC-TT-TTTCAGG-AGAT-TTC-TTACT--GTC-GTC---G----TAAAC-------A-A--TT--GTC--------------G---AC-A----GT---CG------------C-A---ATAGATGGG--AAGG--G----------AG---GGGG
gi|28 : cacaGGG-GGCG-------GT-AATA-TGA-C-TAT--ATAGGT-A-------TT-----------------------A-C-TTAGCTC-TGG-TTTGCTG-ATGAATT-C--TTT-CA----T--GCG-AATACTAATGACTTGGC--AAAAA-GGCT-AT-CAC-G-GCTTC-TATtg
gi|29 : aGT---CGCCG----G-CC-CCG---ATAGATGGGAAA-----------------G---GGGGGG-GGGG-------GTAAATG-TGA-C-TAT--AG--GT-AT------TT--CT-AAAATC------AAA-C-A-T-TTAGCTG-TGG-TTTGCTG-CT-AATT-TC
gi|3 : ATC-AAT--C------A-TGC---CA-AGT-A-CA----------------T---TATTGA-A--C-A--ATA---------A---------A-AC--CAT-CAACT-TAC-AGC-A--TGAAA-A---GTT--C-ATTA--A--T--CT-ATTCA-AAATA-CAAA--TTA-A-A--AG-AA--T-AC--AC--GA--TAACGT-GCT-------C---C---AC----T-A----T--------------AAAG--T--TTCAC-A---AT-GTA-----T--GTA--------CTA--T--GTA-TA--TA--ATGCTAAA--CTA------CACA---AT-GCT--TTA-G-T-GTGAC-T-TAT----T-TT--AAAT--TT-CGA-GACC----TTGT--CAATC-C-TGCA-T-TG--------------TT-GCA-CCG---TGC-T-GG------T--A-AT-A--TC--G--------T--CCC----GC-AAC-AT-A---AAATGCATC----AAT-GC-----------A--CAAC-AT-----G------TACTAGT--T--CA--C--T-GACC-------GC---T-----TAAT-------TAAGG--TT-A----C--TA--G---CATTA---T--TT-TTGCAAG-AGGG-TTC-TTACT--ATC-G-CA--G----AAAAC--G---TA-A--T----------------------------TAATG---------------------------GAAGGGGGGAGG--G----------AG---GCG----------------T-AAT--TG--C-TAT--A---TT-AGGATT--TC--CC-AAAAAC------AAA-CAA-T-TTAACTG-TG---TTGC-G-CTGAATG-TCTTCT-------T--GCG-AATACT-------TGGC--AAAAA-AGCT-AT-TAT-G-GCTTCTTGTC-AATA
gi|30 : ATAGC-TT-TCCGATCGAAG--C------A-TGC---CA-AGT-A-GA------TC-------AT---TAT--A-A--T-T--GGT---------A---------G-AA--AGT-CAACT-TAC-TGC-G--TGAAgata
gi|31 : tttaagaatcaggaccagact---ATAGATGGGAA-----------------GG---GGTGGT-GGTG-------GT-AATA-T-------------------------TT--CC-AAAAAC------AAA-C-A-T-TTAG-TG-TGG-TTTGCTG-CTGAATT---CTTT-CA----T--GCtgtttat
gi|32 : tttattccatccgta--C--T-GAC--------G----T-----TAAT------GT--GG--TT-A----A--TA--GG--AAT-A---TA-TT-TTGCAGG-AAGG-TTC-TTACT--GTC-G-TA--G----AAAGCA-ATATTA-A--TTTAGTCC---TT---CG--GA---AT-ATA
gi|33 : GCATGTATACCCTC-AAG-GT----------AA--TGGC-AC-----A------TATT---G-T--CG--C--T-GAT--------G----T-----TAAT------GT--GG--AT-A----CTATA--TG--CAT-A---T--CTATTGCAGGAAGGG-TTC-Ttt
gi|34 : AAAC------AAAAC-A-TCTTAGCTG-TGG-TTAGCTG-CTGAATT---CTTT-CAT---T--GCG-AAT-CT-------TGGC--AAAAA-GGCT-AT--AC-A-GCTTC-TATC-TATA
gi|35 : tAAAC------AA--T-A-T-TTAGCTG-TGG-TTTAATG-CTG-ATT-TC-ATC-CT----T--GCG-AATACT-------TGAC--AAAAATGGTT-AT-CTC-G-GCTTC-TGTT-AA
gi|37 : ---C---AC----C-A----T--------------A--G--T--TTCAC-G---ATGGTG-----T-CATA----------------------------ATGTTAAA--CTAT-----CAAG---AT-GTT--T-A-A-T-GTGAC-TG-----------TGAAAG--TT-C
gi|38 : tttgCA-T-TG-------------GTT-GCA-C-G---TGC-T-TG------T--ACAT-A--TC--G--------T--CCT-C-GGC-GACGAT-ATGC
gi|4 : -TGC---CA-AGTTA-CA---A--TTT------AT---TATTGA-AAGC-A--GGT---------A---------A-AC--AGT--AACT-TAC-AGC-A--TGAAA-A---AGTT-C-ATTACTA--T--CT-ATTCA-AAATA-CAAA--T-A-A-A--AG-AA--T-AAG-AC--AA--TA---T-ACT-------TCTCC---AC----T-A----T--------------AAAAGTT--T-CAC-G---ATTGTA-----T-TGTA--------C-A--T--G-T-TATATGTAATGCTAAA--CTATC----CACA---AT-GCT--T-A-G-T-GTGAC-TGTAA----T-TTTGAAAAGTTT-CGA-GACCGAG-GTGT--AATTCAC-TGCATT-TG-------------GTT-GCA-C-G---TGC-T-GG-----------------------------------T-T-GG-----AAT-AC-CATGTAC-TC----AGT-GT-C----ACT-GA--CG-------------------TTAAT------------------------------T-----TAAT------GTG-GG--TT-A----C--TA--GGGCCAT-A---T--CT-TGGCAGG-AGGG-TTCTTTACT--ATC-G-CAG-A----AAAACA-A---TA-T--TT--ATTC---CC------------AT-------------CCG---------T-A---ATAGAACGGGAAAGG--G----------GG---GGGGGA-GGCG-------GT--ATA-TG----------------------------TC-AAAAAC------AAA-C-------------TGG-TTTGCTGACTGAATT---TTTT-CA----T--GTC-AATACT-------TGGC--AAAGATTGCT-AT-TAC-G-t
gi|40 : AGAAAATC-TG-TTCGAACGAAG--T------A-TGC---CA-AGcc
gi|5 : acaTATC-TG-TTCT-TC--AT--C------A-TGT---C----TCA-CA---GCGTAC------AT---TATTGA-A--C-A--GTT---------A---------A-AC--AGT-CAAAT--AC-AGCCA--TGAAA-A---GTT-------C--A--T--GT-ATTCACGAATA-CAAA--T-A-A-A--AGTAA--T-ACC-AC--GA--TA---T-ACT-------T---C---TC----C-AGTCAT--------------AAAGA-T--T-CAT-G---AT-GTA-----T--GTA--------TAA--T--G-A-TA-ATGTTAA---AAA--TTAT-----CAAAT--AT-GCT--T-AAG-TAGTGACCTGTAT----T-T--GAAAG--T--CTA-GACC--T-TGGC--AATTC-C-TGCA-T-TAATTGCCCGATTAAGTT-GCA-C-GAGCTGCAT-GA------T--GCATCA--TCCAA--------TAACCT-C-GGC-GACGAT-ATGCAT-T--------------T-T----TCT-AA---GGC-AC-----A------TTCTAGTG-C--CA--C--TGGAC--------T----C-----TAGC------AT------TT-A-------TA-----------------TT-TTGTAGG-A--G-TTC--TACTTAATC-G-T---ACCACAAAACA-A---TA-A--TA--TTCCA--T----CG--GA---ATAATAATGTACGCGCCG----C-CG-C-G---A
gi|6 : acataaaatT---TATTCA-AATCGA--AGT---------A---------A-AA--AGT-CAGCG-TAC-AAC-A--TGAAG-------TT-C-ATTC--A--T--GT-ATTTA-AATTG-CAAA--G-A-A-A--GG-AA--T-GCA-AT--GG--TT---T-ACT-------T---CTGTAC----C-A----TTAATTAACTTTTACAAGT--T--T-CAC-G---AT---A-----C-TATAAGC-----TAA--T--A-A-TA-ATGCTAT--TAAATGTTAT-----CACA---AT-ACC--T-A-G-C-GTGAC-T---T----TGTTTGAAAG--TT-CAA-GA----T-TTAT--AATTC-T-GGCA-T-TG-------------ATC-GCA-C-A---TGA-T-GG------T--ACAT-A--C---------------------------------TGCATGTACA-------------T----TC---A--CAGA-A-------------TA-TAGTG-T--CA--C--C-GAC--------G----T-----TAAT------GT--TG--AT-A----C--AA--GG--TAT-A---TC-TT-TTGCAGG-AGGG-ATA-TCACT--GTC-GTC---G----A-----------A-A--CT--GTAG---TCAATCG--GA---AT-ATATTGatatgaaa
gi|7 : ttacatcatttttttcttcttatcaaaatgctcaagatacatgtagtccattgtattcatgcaccaatttGATCGA----T------A-TGC---CA-AGT-A-CA---G--T-------------TATTGA-A--C-ACGAGT---------A---------A-AC--AGT-CAACT-TAC-AG--A--TGAAA-G-----TT-C-ATAA--AA-T--CT-ATT---AAATA-CAAA--T-A-A-ATAAG-AAG-T-ACG-AC--GA--TA---T-ACT-------T---CTCTAC----T-C----T--------------GAAG--T--T-CACTG---TTTGTA-----CATGTA--------TTA--T--T-G-TA-----TATGCAACA--CTAT-----GACA---AT-GCT----A-G-T-G-GAC-TGTAT----T----GAA----TTACGA--ACC--C-TT-T--AAT-C-C-TGCA-T-TG-------------GTTCGCA-C-G---TGC-T-GT------T--ACAT-A--TC--G--------T--CCTCC-GGC-AACCAT-ATGC------------------T-T----TCT-AATGCGAC-ATGCATGG------TACTAGTG-T--CA--C--T-GACAGTTTACAA----T-----TAAT------AT--GG--TT-A----C--TA---G--CAT-A---TCCTT-GTGCAGGCAGGGTTTC-TTACT--ATC-G-C---A----GAAACATA---TATA--TT--
gi|8 : -TA-ATGCTA----AAA--TTAT-----CACA---AT--------------------CGT--------TTTGAAAG--TT-CGA-GCCC--CTTTGCAAAATT--C-TGCA-T-TG-------------GTT-GCACC-G---TGA-T-GG------TTAACAT-A--AC--G--------T--CC--C-GTC-GACGATGATGTATGTCCCTCAAA-AATAGT-TA---TAT-AA--TTGT--C------------TACAAATGAC--CA--C--T-G-------------------------------GC--GG--TTAA----C--TA--GG-----------------TGC--G-ATTA-TTT-TTAATGAGTC------------AAAAGATA---TA-A---T--G------TCG--AGTTGA---A--ATAA-------GGCGAAAAG-TC-T-GCTTATAGATGAGAAAA--------------------AGAGGG-GCGC-------GT--ACA-TGA-CTTAT--ATAGGT-T-------TT--CTGAAAGACCAAATGAAA-CGA-G-CGAGGTG--GG-TTTCCTT-CTGATTT-TC-TTT-CA----T--GCG-ATAACTG------TGGC--AAAAACGGCT-ACACAC-GTGCTTC--GTCTAATccatcccgtatagctggaggaggg
gi|9 : gT---------G---------A-AC--AGT-TAACT-TAC-AGC-A--TGAAA-A---GTT--C-ATTT--A--T--GT-ATTCA-AAATA-CAAA--T-A-A-A--TG-AA--T-ACG-AC--GA--TA---T-ATT-------T---C------------------------------------------C-T-G---ATTGTA-----T-TGTA--------TAA---------------------------CTAT-----CACA---AT-GCT--T-A-G-T-C--AC-CGTAT----T-T--GAAAG--TT-CGA-CACC--C-TTGT--AATTC-C-TGCA-T-TG-------------GTT-GCA-C-GTC-TGA-T-GG------T--ACAT-A--TC--GTCCTCGCCT--CCT-C-GGC-GACGAT-ATGCATGTAC-CCTT--AAT-AT-TGTCATCT-AA--TGGC-AC-----A------TACTAGTG-T--CA--C--T-GAC--------GTTAAT-----TAAT------GT--GG--TT---------TAAGGG--GAT-T---TA-TT-TTGCAGG-AGGG-TTC-TTACT--ATC-G-taata
blockSeqs : T A G CTTGAAGT A GCA G AAGTAGCTCCCCA CAG AAG G CG ATTCTGTTAA T TA T G C C AA ATTGGT TT G ACT AA CC C C A AA T T C TA T AA T C CT AT ACG T CTCTCGTTC TCTAC GTCA TAATTAACTTTTAC GT GG T T CTC T TCAAT A CATGTGATTAATTAGAGTAATGCTATCGT TG TGGTG CAA T TG T A A A T C TTGTTT TT A A GAG AA A . T A ATTGCCCGATTAA C C C AGC A T TACATTT C AT GTCCTCGCC AA CAG A G G A ACCCTTAATATTGTCATCTAATGGCACA A CG AT GC G AGTTTACAA GAATT TCAATG AA AT A TATAC GC GC T GTC CC A A T T TA C TACCAC AATAT ATATTCCATCGGAATAATAATGTACGCGCCGCCGCG A G GTGGGTTGGGTGG T GGGGAGGCGTAATATGACTATATAGGTATTTCCC CAAATG ACA C C T . A ATCT A CCGC TG A AATGACT CA T G AC G T T T
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blockSeqs : A . . TA . . . ACAGT . C . . A . . . . . . . AGT T . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . TCTCC C . . . . T . . T . . CATGTATATGTAATGCT . . . . . . . . . T . CTAT . . . C . . . . . . . . . . . . T . . G . CG . . G G TTTCTAAATGGCACTACATG . . . . . G . . . . . C . . . . C . . . . . . TCG AA TTTAATTCCATCCGTA G A GAG . CGGTAATATGACTATATAGGTATT . AC . . . . . TC . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : T . . TC . . . AGCA . A . . A . . . . . . . AAG T . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . TCTCC C . . . . . . . T . . TAAGCTAATAATTGCT . . . . . . . . . T . TTTT . . . T . . . . . . . . . . . . T . . C . TG . . G G GCATCAATGCACAACATG . . . . . G . . . . . C . . . . C . . . . . . TCG AA ATTGTCGACAGTCGCA A A GAG . TAATTGCTATATTAGGATTTCCC . AC . . . . . TC . . . . . . . . C . . .
blockSeqs : . . GC . . . GTAA . A . . A . . . . . . . AGT T . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . TCTCC C . . . . . . . T . . CTATGTATATAATGCT . . . . . . . . . A . TTT . . . C . . . . . . . . . . . . T . . G . CG . . G G ACTCAGTGTCACTGACG . . . . . G . . . . . C . . . . A . . . . . . CAG AA TTTATTCCCATCCGTA G A GGG . ATAACTCTAGGTAT . AC . . . . . C . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : GT . . . ACA . T . . A . . . . . . . AAG T . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . TCTGT C . . . . . . . T . . AGCTAATGATGATGC . . . . . . . . . T . TTT . . . C . . . . . . . . . . . . T . . G . CG . . G G ACATGTACCCTCAAGG . . . . . A . . . . . A . . . . C . . . . . . TAG AA ATTAATG A A GG . TGGTAATATTTCC . AC . . . . . C . . . . . . . . . . .
blockSeqs : TC . . . ACA . T . . A . . . . . . . AGT . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . TCTCT T . . . . . . . G . . CATGATATGTAATTT . . . . . . . . . T . TTT . . . T . . . . . . . . . . . . T . . G . CG . . G . TTTCTAAGGCACA . . . . . G . . . . . C . . . . A . . . . . . TCG G . . G . CGGTATATGTC . T . . . . . C . . .
blockSeqs : T . . . ACA . A . . A . . . . . . . AGT . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . TC T . . . . . . . T . . TAATGATAATGTTAA . . . . . . . . . T . TTT . . . T . . . . . . . . . . . . T . . G . C . . . . ACATTCACAGAA . . . . . G . . . . . C . . . . . . . . . . . AG . . . . . GGGCGGTAC . T . . . . . T
blockSeqs : . . . ATA . A . . A . . . . . . . GT . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . TC C . . . . . . . T . . TTATTGTATATGCA . . . . . . . . . T . TTT . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . C . . . . . . . . . . . CA . . . . . . . .
blockSeqs : . . . ACA . A . . A . . . . . . . AG . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . CC T . . . . . . . T . . AAATAATAT . . . . . . . . . T . TTT . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . AA . A . . A . . . . . . . G . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . TC C . . . . . . . . . . ATGTT . . . . . . . . . . . TTT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . A . . A . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . TC C . . . . . . . . . . TAA . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . A . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . T T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : G . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons : ACA****************** TCTCC********** TAATGATAATGCATGCT**************** TTT******* CG** NCTCTAAATGGCACTACACG**************************** C* CAG******* GGGTAAATGTACTATAGGTATTTCC************************* TC**
originalCons : AGAATATC-TG-TTCGATCGAAN--C------A-TGC---CA-AGT-A-CA---G--TA-------AT---TATTGA-A--C-A--GGT---------A---------A-AC--AGT-CAACT-TAC-AGC-A--TGAAA-A---GTTT-C-ATTN--A--T--GT-ATTCA-AAATA-CAAA--T-A-A-A--AG-AA--T-ACG-AC--GA--TA---T-ACT-------T---C---AC----C-A----T--------------AAAG--T--T-CAC-G---ATTGTA-----T-TGTA--------TAA--T--G-A-TA-ATGCTATGCTAAA--CTAT-----CACA---AT-GCT--T-A-G-T-GTGAC-TGTAT----T-TTTGAAAG--TT-CGA-GACC--C-TTGT--AATTC-C-TGCA-T-TG-------------GTT-GCA-C-G---TGC-T-GG------T--ACAT-A--TC--G--------T--CCT-C-GGC-GACGAT-ATGCATGTACACC----AAT-GT-T----TCT-AA--CGGC-AC-----G------TACTAGTG-T--CA--C--T-GAC--------G----T-----TAAT------GT--GG--TT-A----C--TA--GG--CAT-A---T--TT-TTGCAGG-AGGG-TTC-TTACT--GTC-G-C---G----AAAACA-A---TA-A--TT--GTCC---TCG--CG--GA---AT-ATAATGT---CGCCG----G-CC-C-G---ATAGATGGGAAAAGG--G----------GG---GGGGGG-GGGG-------GT-AATA-TGA-C-TAT--A---GT-A-------TT--CC-AAAAAC------AAA-C-A-T-TTAGCTG-TGG-TTTGCTG-CTGAATT-TCTTTT-CA----T--GCG-AATACT-------TGGC--AAAAA-GGCT-AT-CAC-G-GCTTC-TGTC-AATA
finalCons : AGAATATC-TG-TTCGATCGAAN--C------A-TGC---CA-AGTACA------------------T---TATTGA-A--C-A--GGT---------A---------A-AC--AGT-CAACT-TAC-AGC-A--TGAAA-A---GTTT-C-ATTN--A--T--GT-ATTCA-AAATA-CAAA--T-A-A-A--AG-AA--T-ACG-AC--GA--TA---T-ACTTCTCC----------AC----C-A----T--------------AAAG--T--T-CAC-G---ATTGTA-----T-TGTATAATGATAATGCATGCT----------------AAA--CTAT-----CACA---AT-GCT--T-A-G-T-GTGAC-TGTATTT-------GAAAG--TT-CGA-GACC--C-TTGT--AATTC-C-TGCA-T-TG-------------GTT-GCA-C-G---TGC-T-GG------T--ACAT-A--TC--G--------T--CCTCG--GC-GACGAT-ATGCATGTNCTCTAAATGGCACTACACG----------------------------TACTAGTG-T--CA--C--T-GAC--------G----T-----TAAT------GT--GG--TT-A----C--TA--GG--CAT-A---TC-TT-TTGCAGG-AGGG-TTC-TTACT--GTC-GCAG-------AAAACA-A---TA-A--TT--GTCC---TCG--CG--GA---AT-ATAATGT---CGCCG----G-CC-C-G---ATAGATGGGAAAAGG--G----------GG---GGGGGG-GGGGGTAAATGTACTATAGGTATTTCC-------------------------AAAAAC------AAA-C-A-T-TTAGCTG-TGG-TTTGCTG-CTGAATTTC--TTT-CA----T--GCG-AATACT-------TGGC--AAAAA-GGCT-AT-CAC-G-GCTTC-TGTC-AATA
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|36 ): TTCCATCATTTTTGAATCATCTTTTTTAAAAAAAAGACATGTACAAATGTACTGCAAGAAAAAAAAATTGA
Unaligned ( gi|39 ): TCTTTTTAAGAATCAGGACCAGACTATGTTCCCGAT
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lowQualScore : 1111111111 11111 1111111111111 1111111111111111111 1111111111 1111111 11111111111111 1111111 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1111111111111 11111111111 6666666666666666666666666666666666666666666666666 1111111111111111111 11111111 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1111111111111 66666666666666666666666666666666666666666666 111111 1111111 1
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lowQualScore : . . . .......... . ... .... ..... ... . . ............. ... . .... . .. ................... . .. . . . . .. .......... . ... .. .. . . . . .. .. . . .. .. .. . ....... .. . . . ....... . .............. ....... . ... . ..... . ........................................................ ... . . .. . . . . ... .. ...... .. . . . .. . . .. . . . . ............. . . . ... . . ......... . .. ........... .. .... . . ... ................................................. .. . . .. .. . ................... ...... .. ... .... .. ... .. .. . . . . . . . .. . ........ . ..... ............................................................. . . ............. ... . ...... ............................................ . ...... . . . . . . . . . . ...... .. . ....... .. . . .. . . . .
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consensus : AGAATATC-TG-TTCGATCGAAN--C------A-TGC---C----A-----A---G-T-A------CA-----T---TATTG-A-A--C-A--GGT---------A---------A-AC--AGT-CAACT-TAC-AGC-A--TGAAA-A---GTTT-C-ATTN--A--T--GT-ATTCA-AAATA-CAA--A--TA-A-A--AG--AA--T-ACG-------ACGA--TAT-AC-T-TC--TC---CA-CCAT--------------AAAG--T--T-CAC-G---ATTGTA-----T-TGTA---TA-A----TGAT-A-A--T----GC--A-TGCTA-----AA-C--TAT-----CACA---AT-GC-T--T-A-GT-GTGAC---TGTA--TT------TGAAAG--TT-CG-A-GACC--C-TT-GTAA--TTC-C-TGCA-T-TG-------------GTT-GCA-C-G---TGC-T-GG------T--ACAT-A--TC--G--------T--CCT-C-GGC-GACGAT---ATGCATGTNC--TCT---A---A-A---TG-GC------A-C-TA----CA--C-GT--ACTAGTG-TCA--C--TGA-C--------G----T-----TAAT------GT--GG--TTA----C--TA--GG--CA--TA-TCTT-T-TGCAGG-AGGG-TTC-TTACT--GTC-G---C--A-G-AAAACAA---TAA--TT--GTCC---TC---CG--GA---AT-ATAATGT---CGCCG----G-CC-C-G---ATAGATGGGAAAAGG--G----------GG---GGGGGGGGGG------GTAA--AT-GT------AC--T---AT-----A--GGT--ATTT-CCAAAA-AC------AAA-C-A-T-TTAGCTG-TGG-TTTGCTG-CTGAATT-TC-TTTCA------T--GCG-AATACT-------TGGC--AAAAA-GGCT-AT-CAC-G-GCTTC-TGTC-AATA
Reference ( family-3362 ) : AGAATATC-TG-TTCGATCGAAN--C------A-TGC---C----A-----A---G-T-A------CA-----T---TATTG-A-A--C-A--GGT---------A---------A-AC--AGT-CAACT-TAC-AGC-A--TGAAA-A---GTTT-C-ATTN--A--T--GT-ATTCA-AAATA-CAA--A--TA-A-A--AG--AA--T-ACG-------ACGA--TAT-AC-T-TC--TC---CA-CCAT--------------AAAG--T--T-CAC-G---ATTGTA-----T-TGTA---TA-A----TGAT-A-A--T----GC--A-TGCTA-----AA-C--TAT-----CACA---AT-GC-T--T-A-GT-GTGAC---TGTA--TT------TGAAAG--TT-CG-A-GACC--C-TT-GTAA--TTC-C-TGCA-T-TG-------------GTT-GCA-C-G---TGC-T-GG------T--ACAT-A--TC--G--------T--CCT-C-GGC-GACGAT---ATGCATGTNC--TCT---A---A-A---TG-GC------A-C-TA----CA--C-GT--ACTAGTG-TCA--C--TGA-C--------G----T-----TAAT------GT--GG--TTA----C--TA--GG--CA--TA-TCTT-T-TGCAGG-AGGG-TTC-TTACT--GTC-G---C--A-G-AAAACAA---TAA--TT--GTCC---TCG--CG--GA---AT-ATAATGT---CGCCG----G-CC-C-G---ATAGATGGGAAAAGG--G----------GG---GGGGGGGGGG------GTAA--AT-GT------AC--T---AT-----A--GGT--ATTT-CCAAAA-AC------AAA-C-A-T-TTAGCTG-TGG-TTTGCTG-CTGAATT-TC-TTTCA------T--GCG-AATACT-------TGGC--AAAAA-GGCT-AT-CAC-G-GCTTC-TGTC-AATA
gi|1 : AGAA-GTC-TG-TTTGATCGAAT--C------A-TGC---C----A-----A---G-T-GG-----CAAGTAAT---TATTG-A-A--C-A--GGT---------A---------A-AC--AGT-CA-CC-TAC-ATC-A--TGAAA-A---GTTT-C-ATTA--A--T--GT-ATTCA-AAATA-CAC--A--TA-A-A--AG--AA--T-ACG-------ACGA--TAT-AC-T-TC--------A-CCAT--------------AAAG--A--T-CAC-G---ATTGCA-----T-TGTA---TA-A----TGAT-A-A--T----GCT-A-TGCTA-----AA-C--TAT-----CACA---AT-GC-T--T-A-GT-GTGAC---TGTA--TTAAATTTTGAAAG--TT-CG-A-GACC--C-TT-GTAA--TTC-CGTGCA-T-TG-------------GT--GTA-C-G---AGC-T-GG------T--ACAT-A--TC--G--------T--CCT---AGC-GACGAT---ATACATGTACACCCT---A---T-A---TT-GTCTTCTAA-C-GG----CA--C-AT--ACTTGTG-TCA--C--TGA-C--------G----T-----TAAT------TT--GG--TAA----C--TA--GG--CA--TA-T-TT-T-TGCAGG-AGTA-TTC-TTAAT--ATC-G--------A-AAAACAA---TAA--TT--GTTC---TCG--CG--GA---AT-ATAATGT---CGCCG----GCCC-C-G---ATAGATAGGAAAAAG--G----------GG---GGGGGGGGGG------GT-A--AT-GTG-----AC--T---AT-----A---GT--AATT-CTAAAA-AC------AAA-C-A-T-TTAGCTG-TGGTTTTGCTG-CTTATTT-TCTTTTCA------T--GCG-AATACT-------TGGC--AAAAA-GGCT-AT-TAC-G-GCTTC-TATC-AATA
gi|10 : AAAATAGG-TT-TTCGATCGAAC--TTGAAGTA-TGC---C----A-----A---G-A-A---------------------G-A-C--C-A--GGT---------AGA-------A-ATTAAGT-CAACT-GAC-TGC-G--TGAAA-----GTTT---ATTG--A--T--AT-ATTTG-AAAAA-CGATGA--TA-T-G--ATCTAA--T-ATGTTTACTGACGA--GAT------TC--TG---CA-CCAT--------------AAA---------------------------T-TG-A---TA-AACTTTAAT-A-AGTT----TC--A-CGATA-----A-------T-----CA----------------A-AT-GTGAA---TATG--TG------TGAAAG--TT-CA-A-GATT--C-TT-GTAA--TTC-C-AGCG-T-TG-------------ATC-GCC-C-T---TGG-T-GG------T----AT-G--TT--G--------T--CCT-C-AGC-GACGAT---ATGCACATGC--at
gi|11 : cAAT--C------A-TGC---G----A-----A---G-T-AG-----CA-----T---TATTG-A-A--C-A--GGT---------A------------C--AGT-CAACT-TAC--GC-AA-TGAAA-A---ATT----ATTA--A--T--CT-A----------------A--TA-A-A--AG--AA--T-ACG-------ACGA--TATTAC-T-TC--TC---CA-CTAT--------------AAAG--T--TTCAC-G---ATTGTA-----T-TGCA---C--A----TG-T-ATA--T----GTA-A-TGCTA-----AA-C--TAT-----CACA---AT-GC-T--T-A-GT-GTGAC---TA-A--TT------TGAAAG--TT-CGAA-GACC--C-TT-GTAA--TTC-C-TGCA-TATG-------------GTT-GCA-C-G---TGC-C-TG------T--ACAT-AATCC--G--------T--CCT-C--GC-AACAAT---A--AATG-CT--TCT---A---A------G-GCA-----A-CATA----CA--T-CT--ACTAGTG-TCA--C--TGA-C--------G----T-----TAAatgtcttactcttatggtatattg
gi|12 : AGAACATC-TG-TTCGATCGATA--C------A-TGT---C----A-----A---G-T-A------CA-----T---TATTG-A-A--C-A--GGT---------A---------A-AC--AGT-CAATT-TAC-AGC-A--TGAAA-T---G-TT-C-ATTT--A--T--GT-ATTCA-AAATT-CAA--A--TA-A-A--AG--AA--T-ACG-------ACGA--TAT-AC-T-TT--TC---CA-CCAT--------------AAAGT-T--T-CAC-G---ATTG---------TGTAAGCTA-A----TGAT-G-A--T----GC------------------------------------T-GC-T--T-A-GT-GAGAC---TGTA--TT------TGAAAG--TT-CG-A-GACC--C-TT-GTAA--TTC-C-TGCA-T-TG-------------GTT-GCA-C-G---TGG-T-GGTACATTT--ACAT-A--TT--G--------T--CCT-T-TGC-GACAAT---AT-CATG
gi|13 : A-----T---TATTG-ACA--C-A--AGT---------ATTCTGTTAAATAC--AGTTCAACTGTACCAGC-A--TGCAC-ATTGGTTTTC-ATTAT-A--TCCGTCATCAA-AAATAACAA--AAATG-A-A--AGT-AA--TTACGC------ACGA---AT-AC-TCTC--TCGTTCA-CTAT--------------AAAG--T--TTCAC-AT--ATTGTA-----T-TGTA---CATG----TGATTA-A--TTAGAGT--AATGCTATCGTCAA-C--CCTTGGTGCACA---GTTGC-T--TTA-GT-GTGAC---TGTAT-TT------TGAAAGT-TT-CG-G-CACC--T-CT-GTAA--TTT-T-CGCA-TATG-------------GTT-GCA-C-c
gi|14 : ----T-----TAAT------GT--GG--TTA----C--TA--GGG-CA--TA-TATT-T-TGCAAG-GAGG-TTC-TTACT--GTCCG---C--AAG-AAAACAA---TAT--TT-------------------A---AT-TCCAT-------CCG---------T-A---ATAGATGGGAAGGGG--GTGGGTTGGGTGG---GGGGGGGGGGGGAGGCGTAAT-AT-G-------ACTAT---AT-----A--GGT--ATTTCCCAAAA-AC------AAA-C-A-T-TTAGCTG-TGG-GTTAGTG-CTGAATT-TC-TTTCA------T--GCG-AATACT-------TGGCCAAAAAA-GGCT-AT-TACGG-GCTTC-TATC-AATA
gi|15 : TATTG-TCG--CGCTGA-C--------G----T-----TAAT------GT--CG--ATA----C--AA--GG--CT--TA-TCTT-T-TGCAGG-ACGG-TTC-TTACT--GTC-G---T--C-G-GAAACAA---TA-------GTCCA--T----CG--GA---AC-ACATTGT---TGCTG----G-CCGC-G---ATAAATGGAAAAGGGTTG----------GG---GTGGGGTGAG------GTAAG-ATAGTAAGATAAC--T---GG-----A--AGT--ATTT-CTAAAA-AC-------AA-T-A-T-TTAGCTG-TGG-TTTGCTG-CTG-ATT-TC-TT
gi|16 : atata--C------A-TGC---C----A-----A---G-T-A------CA-----T---TATTG-A-T--T-A--GGT---------A---------A-AC--AGT-CAACT-TAC-AGC-A--TGAAA-A---GTT--C-ATTT--A--T--GT-ATTCA-AAATA-CAA--A--TA-A-A--AG--AA--T-ACC-------ACAA--TAT-AC-T-TC--TG---CA-CCAT--------------AAAG--C--T-AAA-GCTCATGATA-----T-CGTA----A-A------AT-A-A--T--------A-T-------------------------CA---AT-GC-T--T-A-GT-GTGAC---AGTG--CTA-----TGAAAGTTTT-CG-A-GATC--C-cagagc
gi|17 : TGT---TGCTG----GGCC-C-TTC-ATAGATGAGATAAGG--G----------AACATGGGGACAGGT------TTAATAAT-GA------AC--T---ATTTAGTA--GGTTTATTT-CTAAGA-AC------AAA-C-G-C-TTAGCTGTTGG-TTTCCTT-CTGTATTGTT-TCTCA------TTGACGAAATA---------TGGC--AAAAC-GGCT-TC-CAC-A-GC-TC-TGTC-
gi|18 : gtATATC-TGGTTCGATCGAAG--C------AATGT---C----A-----A---GGT-A-------A-----T---TATCA-A-T--T-A--GGTT--------A---------A-AC--AGT-CAACT-TAC-AGC-A--TGAA--------TT-C-ATTT--A--T--GT-ATTC--AATTA-CAA--A--TATA-A--AGA-AA--T-ACG-------ACGGATTAT-AT-T-TC--TG---CG-CCAT--------------AAAG--CGGT-CAC-G---ATTtgatatta
gi|19 : tacaatccatg---C----A-----A---G-T-A------CA-----T---TATTG-A-A--C-A--GGT---------A---------A-AC--AGT-CAACC-TAC-AAC-A--TGAGA-A---GTT--C-ATTA--A--T--GT-ATTCA-AAATA-CAA--A--TA-A-A--AG--AA--T-ACG-------ACGA--TAT-AT-T-T--------CA-CCAT--------------AAAGT-T--T-CAC-G---ATTGTATCAATT-TGTA---TA-A----TGAT-A-A--T----GCT-A-TGCTA-----AA-C--TAT-----
gi|2 : gg-TGC---C----G-----A---G-T-A------TA-----T---TAT-G-ACA--C-A--GGT---------A---------A-AC--AGT-CAA-T-TAC-AG--A--TGAGAGA---GCTT-C-TTTA--A--T--CT-ATTCA-AAAAT-CAA--A--TA-ACA--AG--AAAAT-ACGG------ACGA--TAT-AC-G-TCACTC---TA-CT-T--------------AAAG--T--TTCAC-G---AT-GTA-----T-TGTA---CA------TGAT-A----T----GT--A-ATTTA-----AA-C--TAT-----CACACAAAT-GA-T--T-A-GT-TTGACCTCTATT--TT------TGAAAA--GT-CG-AAGACC--CCTT-GTAA--T-C-C-T-CA-T-TG--------------TT-GCA-C-G---TGC-TTGG------T--ACAT-A--TC--G--------T--CCT-CAGGCAGACGAT---ATGC----TT--TCT---A---A-A---TG-GC------A-C-TA----CA--T-GT--ACTAGTG-TCAATC--TGA-C--------G----T-----TAATTCAATGAT--GGATTTA----C--TAGCGG--CA--TAGTCTTCT-TGCAGG-AGGG-TTC-TTACT--ATC-G---CAGA-G-AAAACAA---TGATCTT--ATTCCATCCA--CG--------T-GTAATA--------------------------GGATGGG-AAGGG--G----------GA---GGGGGGGGGG------GCG------GT------AC-------------------------------A-AC------AAA-C-ACT-TTAGCTG-TGG-TTAGCTG-CTGATTTATC-TTTCACACCGCC--GCG--ATAC--------TGGCA-AAAAA-GGCTGAT-TAC-G-G-TTC-TAT
gi|20 : ttcccagATC-TG-TTCGATCGAAT--A------T-TGC---C----ATGTACATGTG-T-A------CA-----T---TATTG-A-A--C-A--AGT---------A---------A-AC--AGT-CAACT-TAT-AGC-A--TGAAA-A---GTT--C-ATTT--A--T--GT-ATT----AATA-CAA--A--TA-A-A--AG--AA--T-ACG-------ACGA--TAT-AC-T-TC--TC---CA-CCAT--------------AAAG--T--TCCAC-G---ATTGTA-----T-TGTA---TA-A----
gi|21 : AGAATATAATG-TTCGATCGAAAAGC------A-TGTGCAC----AGAGGAA---G-T-AGCTCCCCA-----TCAGTATTG-A-AA-C-A--GGTTTTACATGTA---------A-AC--AGT-CA-CT-TAC-AGC-AAATGAAA-A---AGTT-CGATTT--AAAT--CT-ATTCA-AAATA-CAA--A--TA-A-A--
gi|22 : aTA----C--GA--GG--CA--CA-TCTT-T-TGCAGG-AGGA-TTC-TTGCT--GTC-G---T--C-G-GAAATAA---TA-------GTCCA--TCG---G--AATACAT-ATATTGT---TGCCC----G-CCGC-G---ATAGATGAGAAA--G--G----------GG---TTAGGGGAGG------ATA--------------AC--T---CT-----A--GGT--AT------------------------A-T-ATAGCTG-TGG-Ttaagagat
gi|23 : -TA----TA--T-GT--ACTAGTG-ATA--C--TGA-T--------G----TGAATTTAAT------GT--GG--TTATATAC--TA--GG--GA--AA-TATT-T-TGCAAG-AGGG-TTC-TTACT--NTT-G------A-G-A
gi|24 : tatgtgatnttcccattcttgatgtttgtaaacatcttaca--A--TA-A-A--AG--AA--C-ACG-------ACGA--TAT-AC-T-TC--TC---CA-CTAT--------------AAGT--T--T-CAC-G---ATTCTA-----T-TGTA--------------------------------------------------------CACA---AT-GC-T--T-A-GT-GTTAT---TGTA--TT------TGAAAG--TT-CG-A-CACC--C-AT-GTAA--TTC-C-TGCA-T-TG-------------GTT-GCA-C-G---TGC-T-
gi|25 : -TT-GTAA--TTC-C-TGCA-T-TG-------------ACT-GCA-C-G---T------------------AT-A--TC--C--------T--CCT-C-AGC-GACGAT---ATGCATGTAC--------------A---TGTAC------C-C-TC----AA--G-GT--ATT-GTC-GCG--C--TGA-C--------G----T-----TAAT------GT--TG--ATA----C--AA--GG--CA--TA-TCTT-T-TGCAGG-AG
gi|26 : TT--A--T--GT-ATTCA-AAATA-CAA--A--TA-A-A--AG--AA--C-ACG-------ACGA--TAT--------------------AT--------------AAAT--T--T-CAC-G--------A-----T-TGTA---TA-AGC--TAAT-A-A--T----------TGCTA-----AA-C--TAC-----CATA---AT-GC-TTGT-A-GT-GAGAC---TGTA--TT------TGAAAG--T
gi|27 : TAGTG-TCG--C--TGA-C--------A----T-----TAGT------GT--CG--ATA-------TA--TGT-CG--TA-TCTT-T-TTCAGG-AGAT-TTC-TTACT--GTC-G---T--C-G-TAAAC------AA--TT--GTC--------------G---AC-A----GT---CG------------C-A---ATAGATGGG--AAGG--G----------AG---GGGG
gi|28 : cacaGGGGGCG------GTAAT-AT-G-------AC--T---AT-----ATAGGT--ATT-----------------------A-C-TTAGCTC-TGG-TTTGCTG-ATGAATT--C-TTTCA------T--GCG-AATACTAATGACTTGGC--AAAAA-GGCT-AT-CAC-G-GCTTC-TATtg
gi|29 : aGT---CGCCG----G-CC-CCG---ATAGATGGGAAA----------------GG---GG-GGGGGGG------GTAA--AT-GTG-----AC--T---AT-----A--GGT--ATTT-CTAAAA-TC------AAA-C-A-T-TTAGCTG-TGG-TTTGCTG-CT-AATT-TC-
gi|3 : ATC-AAT--C------A-TGC---C----A-----A---G-T-A------CA-----T---TATTG-A-A--C-A--ATA---------A---------A-AC--CAT-CAACT-TAC-AGC-A--TGAAA-A---G-TT-C-ATTA--A--T--CT-ATTCA-AAATA-CAA--AT-TA-A-A--AG--AA--T-AC--------ACGA--TA--ACGT-GC--TC---CA-CTAT--------------AAAGT-T--T-CAC-A---A-TGTA-------TGTA---CT-A----TG-T-ATA--T----A---A-TGCTA-----AA-C--TA------CACA---AT-GCTT--T-A-GT-GTGAC---T-TA--TT------TTAAAT--TT-CG-A-GA-C--C-TT-GTCA--ATC-C-TGCA-T-T--------------GTT-GCACC-G---TGC-T-GG------T--A-AT-A--TC--G--------T--CCC----GC-AAC-ATAAAATGCAT---C------------A-A---T--GC------A-C-AA----CA--T-GT--ACTAGT--TCA--C--TGACC--------GC---T-----TAAT-------TAAGG--TTA----C--TA---G--CAT-TA-T-TT-T-TGCAAG-AGGG-TTC-TTACT--ATC-G---C--A-G-AAAAC-G---TAA--T----------------------------TAATG---------------------------GAAGGGGGGAGG--G----------AG---GCG--------------TAA--TT-G--------C--T---ATATT--A--GG---ATTTCCCAAAA-AC------AAA-CAA-T-TTAACTG-TG---TTGC-G-CTGAATG-TC--TTCT------T--GCG-AATACT-------TGGC--AAAAA-AGCT-AT-TAT-G-GCTTCTTGTC-AATA
gi|30 : ATAGC-TT-TCCGATCGAAG--C------A-TGC---C----A-----A---G-T-A------GA-----T---CATTATA-A--T-T--GGT---------A---------G-AA--AGT-CAACT-TAC-TGC-G--TGAAgata
gi|31 : tttaagaatcaggaccagact---ATAGATGGGAA-----------------GG---GGTGGTGGTG------GTAA---------------------------------T--ATTT-CCAAAA-AC------AAA-C-A-T-TTAG-TG-TGG-TTTGCTG-CTGAA-T-TC-TTTCA------T--GCtgtttat
gi|32 : tttattccatccgta--C--TGA-C--------G----T-----TAAT------GT--GG--TTA----A--TA--GG--AA--TA-TATT-T-TGCAGG-AAGG-TTC-TTACT--GTC-G---T--A-G-AAAGCAATATTAA--TTTAGTCC---TT---CG--GA---AT-ATA
gi|33 : ---ATGTATACCC--TCA---AGGTA-A---TG-GC------A-C-----------------A-TATTG-TCG--C--TGA-T--------G----T-----TAAT------GT--GG--ATA----CTATA--TG--CA--TA-TCTA-T-TGCAGGAAGGG-TTC-Ttt
gi|34 : gcAA-AC------AAAAC-A-TCTTAGCTG-TGG-TTAGCTG-CTGAA-T-TC-TTTCAT-----T--GCG-AAT-CT-------TGGC--AAAAA-GGCT-AT--AC-A-GCTTC-TATC-TATA
gi|35 : tAA-AC------AA--T-A-T-TTAGCTG-TGG-TTTAATG-CTG-ATT-TC-ATCCT------T--GCG-AATACT-------TGAC--AAAAATGGTT-AT-CTC-G-GCTTC-TGTT-AA
gi|37 : ---CA-CCAT--------------A--G--T--TTCAC-G---ATGGTG-----T-CATA------------------------------A-TGTTA-----AA-C--TAT-----CAAG---AT-GT-T--T-A-AT-GTGAC---TG------------TGAAAG--TT-C
gi|38 : tttgCA-T-TG-------------GTT-GCA-C-G---TGC-T-TG------T--ACAT-A--TC--G--------T--CCT-C-GGC-GACGAT---ATGC
gi|4 : -TGC---C----A-----A---G-TTA------CAATTTAT---TATTG-A-AAGC-A--GGT---------A---------A-AC--AGT--AACT-TAC-AGC-A--TGAAA-A---AGTT-C-ATTACTA--T--CT-ATTCA-AAATA-CAA--A--TA-A-A--AG--AA--T-AAG-------ACAA--TAT-AC-T-TC--TC---CA-CTAT--------------AAAAGTT--T-CAC-G---ATTGTA-----T-TGTA---C--A----TGTT-ATA--T----GTA-A-TGCTA-----AA-C--TATC----CACA---AT-GC-T--T-A-GT-GTGAC---TGTAATTT------TGAAAAGTTT-CG-A-GACCGAG-GT-GTAA--TTCAC-TGCATT-TG-------------GTT-GCA-C-G---TGC-T-GG-----------------------------------T-T-GG-----AAT---AC-CATGTAC--TC--------A-G---TG-TC------A-C-TG-----A--C-GT----TAAT----------------------------T-----TAAT------GTG-GG--TTA----C--TA--GGGCCA--TA-TC-T-T-GGCAGG-AGGG-TTCTTTACT--ATC-G---C--A-GAAAAACAA---TAT--TT--ATTC---CC------------AT-------------CCG---------T-A---ATAGAACGGGAAAGG--G----------GG---GGGGGAGGCG------GTAT--AT-GT-----------------------------------CAAAA-AC------AAA-C-------------TGG-TTTGCTGACTGAATT-T--TTTCA------T--GTC-AATACT-------TGGC--AAAGATTGCT-AT-TAC-G-t
gi|40 : AGAAAATC-TG-TTCGAACGAAG--T------A-TGC---C----A-----A---G-cc
gi|5 : acaTATC-TG-TTCT-TC--AT--C------A-TGT---CTCACA-----GC--G-T-A------CA-----T---TATTG-A-A--C-A--GTT---------A---------A-AC--AGT-CAAAT--AC-AGCCA--TGAAA-A---GTT-------C--A--T--GT-ATTCACGAATA-CAA--A--TA-A-A--AGT-AA--T-ACC-------ACGA--TAT-AC-T-TC--TC---CAGTCAT--------------AAAGA-T--T-CAT-G---AT-GTA-----T--GTA---TA-A----TGAT-A-A--T----GTTAA-----A-----AA-T--TAT-----CAAAT--AT-GC-T--T-AAGTAGTGACC--TGTA--TT------TGAAAG--T--CT-A-GACC--T-TG-GCAA--TTC-C-TGCA-T-TAATTGCCCGATTAAGTT-GCA-C-GAGCTGCAT-GA------T--GCATCA--TCCAA--------TAACCT-C-GGC-GACGAT---ATGCAT-TTT--TCT---A---A------G-G-----------------CA--C-AT--TCTAGTG-CCA--C--TG------------------------------------GA--CT-----C--TA---G--CATTTA-TATT-T-TGTAGG-A--G-TTC--TACTTAATC-GTACC--A-C-AAAACAA---TAA--TA--TTCCA--T----CG--GA---ATAATAATGTACGCGCCG----C-CG-C-G---A
gi|6 : acataaaat-----T---TATTC-A-AATCGA--AGT---------A---------A-AA--AGT-CAGCG-TAC-AAC-A--TGAAG-------TT-C-ATTC--A--T--GT-ATTTA-AATTG-CAA--A--GA-A-A--GG--AA--T-GCA-------ATGG--TTT-AC-T-TC--TG---TA-CCATTAATTAACTTTTACAAGT--T--T-CAC-G---AT---A-----C-TATAAGCTA-A----TAAT-A-A--T----GC----TATTA-----AA-TGTTAT-----CACA---AT-AC-C--T-A-GC-GTGAC---TTTG--TT------TGAAAG--TT-CA-A-GA----T-TT-ATAA--TTC-T-GGCA-T-TG-------------ATC-GCA-C-A---TGA-T-GG------T--ACAT-A--C-----------------------------------TGCATGTAC--ATT-----------------C------A-C--A----GA----AT--A-TAGTG-TCA--C--CGA-C--------G----T-----TAAT------GT--TG--ATA----C--AA--GG--TA--TA-TCTT-T-TGCAGG-AGGG-ATA-TCACT--GTC-G---T--C-G-A----------AA--CT--GTAG---TCAATCG--GA---AT-ATATTGatatgaaa
gi|7 : ttacatcatttttttcttcttatcaaaatgctcaagatacatgtagtccattgtattcatgcaccaatttGATCGA----T------A-TGC---C----A-----A---G-T-A------CAG----T---TATTG-A-A--C-ACGAGT---------A---------A-AC--AGT-CAACT-TAC-AG--A--TGAAA-G-----TT-C-ATAA--AA-T--CT-ATT---AAATA-CAA--A--TA-A-ATAAG--AAG-T-ACG-------ACGA--TAT-AC-T-TC--TC---TA-CTCT--------------GAAG--T--T-CACTG---TTTGTA-----CATGTA---TT-A----TTGT-ATA--T----GC--A-----A-----CA-C--TAT-----GACA---AT-GC----T-A-GT-G-GAC---TGTA---T------TGAA----TTACG-A--ACC--C-TT--TAA---TC-C-TGCA-T-TG-------------GTTCGCA-C-G---TGC-T-GT------T--ACAT-A--TC--G--------T--CCTCC-GGC-AACCAT---ATGC----TT--TCT---A---ATG---CG-AC------A---TG----CA--TGGT--ACTAGTG-TCA--C--TGA-CAGTTTACAA----T-----TAAT------AT--GG--TTA----C--TA---G--CA--TA-TCCT-TGTGCAGGCAGGGTTTC-TTACT--ATC-G---C--A-G-AAA
gi|8 : --A-TGCTA-----AAAT--TAT-----CACA---AT----------------------CGT---TT------TGAAAG--TT-CG-A-GCCC--C-TTTGCAAAATTC---TGCA-T-TG-------------GTT-GCA-CCG---TGA-T-GG------TTAACAT-A--AC--G--------T--CC--C-GTC-GACGATG--ATGTATGTCC---CTCAAA---A-A---TA-GT------T-A-TA----TAATT-GTCTACAAATGACCA--C--TGG-C--------G-------------------------G--TTAA---C--TA--GG----------------TGC--G-ATTA-TTT-TTAAT--GAG-T---C--A-A-AAGATA----TAA--T---GTC------G--AGTTGA---A--ATAAGG-------CGAAAAG-TC-T-GCTTATAGATGAGAAAAAG--A----------GG---GGCGCG-----------TAC--AT-G-------AC--TTATAT-----A--GGT---TTT-CTGAAAGACCAAATGAAA-CGA-G-CGAGGTG--GG-TTTCCTT-CTGATTT-TC-TTTCA------T--GCG-ATAACTG------TGGC--AAAAACGGCT-ACACAC-GTGCTTC--GTCTAATcatatatattccatcccgtatagctggaggaggg
gi|9 : gtaT---------G---------A-AC--AGT-TAACT-TAC-AGC-A--TGAAA-A---GTT--C-ATTT--A--T--GT-ATTCA-AAATA-CAA--A--TA-A-A--TG--AA--T-ACG-------ACGA--TAT-AT-T-TC--CT---------------------------------------G---ATTGTA-----T-TGTA---TA-A--------------------------------------C--TAT-----CACA---AT-GC-T--T-A-GT-C--AC---CGTA--TT------TGAAAG--TT-CG-A-CACC--C-TT-GTAA--TTC-C-TGCA-T-TG-------------GTT-GCA-C-GTC-TGA-T-GG------T--ACAT-A--TC--GTCCTCGCCT--CCT-C-GGC-GACGAT---ATGCATGTAC--CCT---T---A-ATATTG-TC------ATC-TAATGGCA--C-AT--ACTAGTG-TCA--C--TGA-C--------GTTAAT-----TAAT------GT--GG--TT--------TAAGGG--GA--TT-TATT-T-TGCAGG-AGGG-TTC-TTACT--ATC-G---T--A-G-Ataata
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