lowQualScore : 11111111111111
lowQualScore : 22222 222222 111 222 1 11 1 11 222 1 1 1 22222222 11 11 1 222222 2222222222 11 111111 444444444444 1111 2222222 222 333333333333 11 1111 55555555555555555555555 22 11 111 1 3333 1 2222 1 111111 111 444 11 1 333333 111 1 111 44444444444 111 3 1 6666666666 1 44444 2 1 222 3333 22 333 111 2 1111 4444444444444444444 1 111 22 11 1 2222222222 44444 1111 1111 1 111 111 22222222222 11 222 888888 1111 6666666666 111 22222 111 1 1 33333333333333 00000000000000 11
lowQualScore : 8 66666 2 888888 999 333 3 44 3 7 55 333 7 0 0 4 0 9 3 44444444 33 33 5 8 8 0 111111 7777777777 33 666666 4 33 0 888888888888 88 8 7777 8 0 0 6 2 0 6666666 888 8 888888888888 0 8 5 11 7777 88888888888888888888888 3 33 00 6 88 111 6 6 6 6 3 888 6 2222 3 3333 1 999999 444 3 111 5 5 88 3 9 000000 111 6 3 999 3 6 1 6 44444444444 6 777 5 0 0 6 6 2222222222 5 8 6 1 6 55555 6 0 2 6 0 3 333 2222 9 6 99 3 000 6 111 0 9999 5 5 3333333333333333333 5 0 222 44 66 22 0 4 777 66 4 8888888888 4 4 4 66 3 0 5 5 55 66 8 00000 5 0 5 2222 5 2222 5 5 77 9 000 000 6 8 0 44444444444 7 9 6 4 00 8 444 5 444444 0 66 1111 1 4 4 8888888888 6 66 444 55555 444 4 4 1 2 77777777777777 777 5 99999999999999 3 77 7 55 55 4 99
lowQualScore : . ..... . ...... ... ... . .. . . .. ... . . . . . . . ........ .. .. . . . . ...... .......... .. ...... . .. . ............ .. . .... . . . . . . ....... ... . ............ . . . .. .... ....................... . .. .. . .. ... . . . . . ... . .... . .... . ...... ... . ... . . .. . . ...... ... . . ... . . . . ........... . ... . . . . . .......... . . . . . ..... . . . . . . ... .... . . .. . ... . ... . .... . . ................... . . ... .. .. .. . . ... .. . .......... . . . .. . . . . .. .. . ..... . . . .... . .... . . .. . ... ... . . . ........... . . . . .. . ... . ...... . .. .... . . . .......... . .. ... ..... ... . . . . .............. ... . .............. . .. . .. .. . ..
lowQualScore : 8 00000 0 000000 000 777 3 00 3 3 00 333 3 0 0 0 0 8 2 55555555 88 88 5 0 0 8 000000 8888888888 22 000000 0 55 8 000000000000 88 0 0000 0 8 8 7 5 8 0000000 444 0 444444444444 6 0 0 00 0000 00000000000000000000000 3 22 55 7 77 777 7 7 7 7 3 222 7 5555 3 8888 4 000000 111 6 444 7 7 55 3 2 222222 777 7 3 222 0 7 7 7 22222222222 7 666 0 8 0 6 0 0000000000 6 0 7 7 7 33333 7 7 5 7 0 3 333 5555 0 7 22 7 000 7 777 0 2222 0 0 5555555555555555555 7 0 555 88 99 44 2 0 000 11 4 2222222222 4 4 4 11 2 5 0 0 44 99 8 22222 0 1 6 1111 7 1111 7 7 99 6 000 000 6 7 7 99999999999 1 4 2 4 66 1 888 0 555555 1 11 7777 1 4 6 3333333333 8 11 222 00000 111 4 4 9 7 55555555555555 000 0 99999999999999 6 99 3 00 00 0 00
consensus : TAAAATGCCTCGCATAGCCAGT-AC-ATTTTGTG-AATA-TATTGCTT--CAAATG--TCT-AAATGCTTAT-TAGAAAATA-ATC---TTAAAATGTATT-TAAAG-CAANC-ATATTTTGCATTCA-AAAATANTTA--ACAGTAGGGA--GGTAAT-TTGG-TTACGGGACACTACG--AATAT---TT----GTA-ACTA--CTAAANGAAAACAAAAAATACTG-----------GACA-TCAA-TATCAGA----AC-AAATAGTGTATATC-TAACTGTGTAAAAATAAAAG-------GTATGCTTCACAAT-CATAAA-AA-----CAA----CTTGAATT-AAGGAAA--AAGC----TTACG-TC--TTACGTTTT--CTAG--TTTCATACATATATATTGAAAGCTTTGACA-AGTTGT---TCT-G-C-AAA-TA-AATCTTTTTTG-CTTGA-AT-A--TGTCAAA-TTT---CGTGCACTT----TTGT--TTTCAAT-TATCA-TTT-GC-ATCTGATT-TCTA--AC--GTTC---A-GA-AGTTTAA-GGAATGNT-TTTTTTTTCCACAA-CC-----A-----AGCCAAT-CTCAAATATCTTTAATTTTGGTAGTGTC-CGTAACTAAATAAGGCTATGTT-AAC-ATTATTTCA-GAAAGTTTATGAAA-ATGAAAATTT-C----TTATCT-TAATGGAANTA-TTTTTGTTTCAA-CAAAGGCAT---AAAAA--TGTTGTTTGTAAATGAAATTTCC-TTC-ATCAAAATTGGTATT--AA-GTGTTCATGTAATTTG---AAATACTGTC--N-TTTTTAA-C-AAAA---T--AC----C--A-G-GTAA-G-AAATGTGTT-C-ATTTTA-AA--GTGTTACAAAACCTTTTCTAGT-C---AAAATTATGTCCA--TA-TTA-T--TG----T-AC-T-TT--CAATATGTTGTTTA-CTTTTGAA-CA-GTT--GAAAAANAAAT--A-GT-TTATTAACAGC----TT-T----CGAT-ATT-TA--TTTCAAAGAAAGA---AAC---ACTTGTAGTGT-C-G-C-----GTAACCTGTGAAAAATGAG-C--TTATTATCA-AGCAT-GC------AAAAATATAAAGTTT--T--TAATCTGAAT-ATCATAAAACCACTTA--TTATGTTCTGGTTCC--TTTAGG--TACT-----CT--ACTCTTTAGAAAAAA-AATATTTTTTTGGGCAA----A----A--TA---AAGACATCAATT--A---------TTTTC-ACC-TC-AAGT--GCAACACTA--CT-GTTCCC-TTTATTGT
Reference ( gi|3 ) : TAAAATGCCTCGCAGAGCCAGTAAT-ATCTTGTG-AATG-TATTGCTC--CAAATACATCT-AACTGCTTAT-TAGAAAATAAATC---TTAAAATGTATT-TAAAG-CAAAC-ATATTTTGCATTCA-AAAATGTTTA--ACAGTAGGGA--GGTAAT-TTGG-TTACGGGACACTACA--AATAT---TT----GTA-ACTA--TTAAAAGAAAACAAAAAATACTG-----------GACA-TCAA-TATCAGA----AC-AAATAGTGTATATC-TAACTGTGTAAAGATAAAAG-------GTATGCTTCACAAT-TATAAA-AA-----CAA----CTTGAATT-AAGGAAA--AAGC----TTACG-----TAACGTTTTGGCTAACCTTTCATACATATATATCGAAGGCAATGACA-AGTTGT---TCT-G-C-AAA-TA-AATCTTTTTTG-CTTGA-AT----TGTCAAA-TTT---AATGCATTT----TTGT--TTTCA---TATCA-TTT-GCAATCTGGTTCTCTA--A---GTTC---A-GA-AGTTTAA-AGAATGTT-TTTTTTTTCCACAA-CC-----A-----AGCCAAT-CTCAAATATTTTTAATTTTGGTAGTGTCGCGTAACTATA-AAGGCTATATTAAACTATTATTTCA-GAAAATTTATGAAA-ATGAAAATTT-C--ATTTATCT-TAGTGGAAGTA-TTTT-GTTTCAA-CAAAGGCAT---AAA----TGTTGTTTGTAAATGAAGTTTCC-TT--ATCAAAATTGGTATT--AA-GTGTTCATGTAATTTG---AAATAC-GTC--A-TTTTTAA-C-AAAA---T--AT----C--A-G-GTAA-G-AAATGTGTT-C-ATTTTATAA--GTGTTAAAAAACCTTTTCTAGT-C---AAAATTATGTCCA--TA-TTA-T--TG----T-AC-T-TT--CAATATGTTGTTTA-CTTTTGAA-CA-ATT--GAAAAATAAAT----GT-TTATTAACAGC----TT-T----CAAT-ATT-TA--TTTCATAGAAAGA---AAC---ACTTGTAGTGT-C-G-C-----GTAACCTGTGAAAAATGAG-C--TAATTATCAAAGCAT-GCCCAAAAAAAAATATAAAGTTT--T--TAATCTGAAT-ATCATAAAACCATTTACTTTATGTTTTGGTTCC--TTTAGG--AACT-----CT--ACTCTTTAGAAAAAA-AATATTTTTTTGGGC------A----A--TA---AAGACATCAATT--ATTTCCACA-TTTTC-ACC-TC-AAGT--GCAACACTA--CT-GTTCCC-GTTATTGT
gi|4 : TAAAATGCCTCGCAGAGCCAGTAAT-ATCTTGTG-AATG-TATTGCTC--CAAATACATCT-AACTGCTTAT-TAGAAAATAAATC---TTAAAATGTATT-TAAAG-CAAAC-ATATTTTGCATTCA-AAAATGTTTA--ACAGTAGGGA--GGTAAT-TTGG-TTACGGGACACTACA--AATAT---TT----GTA-ACTA--TTAAAAGAAAACAAAAAATACTG-----------GACA-TCAA-TATCAGA----AC-AAATAGTGTATATC-TAACTGTGTAAAGATAAAAG-------GTATGCTTCACAAT-TATAAA-AA-----CAA----CTTGAATT-AAGGAAA--AAGC----TTACG-----TAACGTTTTGGCTAACCTTTCATACATATATATCGAAGGCAATGACA-AGTTGT---TCT-G-C-AAA-TA-AATCTTTTTTG-CTTGA-AT----TGTCAAA-TTT---AATGCATTT----TTGT--TTTCA---TATCA-TTT-GCAATCTGGTTCTCTA--A---GTTC---A-GA-AGTTTAA-AGAATGTT-TTTTTTTTCCACAA-CC-----A-----AGCCAAT-CTCAAATATTTTTAATTTTGGTAGTGTCGCGTAACTATA-AAGGCTATATTAAACTATTATTTCA-GAAAATTTATGAAA-ATGAAAATTT-C--ATTTATCT-TAGTGGAAGTA-TTTT-GTTTCAA-CAAAGGCAT---AAA----TGTTGTTTGTAAATGAAGTTTCC-TT--ATCAAAATTGGTATT--AA-GTGTTCATGTAATTTG---AAATAC-GTC--A-TTTTTAA-C-AAAA---T--AT----C--A-G-GTAA-G-AAATGTGTT-C-ATTTTATAA--GTGTTAAAAAACCTTTTCTAGT-C---AAAATTATGTCCA--TA-TTA-T--TG----T-AC-T-TT--CAATATGTTGTTTA-CTTTTGAA-CA-ATT--GAAAAATAAAT----GT-TTATTAACAGC----TT-T----CAAT-ATT-TA--TTTCATAGAAAGA---AAC---ACTTGTAGTGT-C-G-C-----GTAACCTGTGAAAAATGAG-C--TAATTATCAAAGCAT-GCCCAAAAAAAAATATAAAGTTT--T--TAATCTGAAT-ATCATAAAACCATTTACTTTATGTTTTGGTTCC--TTTAGG--AACT-----CT--ACTCTTTAGAAAAAA-AATATTTTTTTGGGC------A----A--TA---AAGACATCAATT--ATTTCCACA---------C-TC-AAGT--GCAACACTATCCT-GTT-CC-GTTATT
gi|2 : TAAAATGTCTTACATAGCCAG--GTCATTTTGTATAAT---ATGGCTTGTCAAATG--TCT-AAA-GCTTATGTAGAAA-TATCTC---TTAAA-TGTATTCTAAAG-GCAAT-TCAATTTGCATTCA-A------TTATTACAGTAGTGGTTGG--AT-TTGACTTACGAGCCAC-------ATAT---TCTTCGGTACACTA--C---AGAAAAATGTAAAATACTAATGTTAATTATGACACTCAAGTATCAGA----ATTAAATAGTGTATATCCTAACTGTTTGAGAAAAAAAG-------TTATGCTTCACAAC--ATAGA-AA-----AAAACCCCTTGCATTTAAGAAAAGCAAGG----CTACCATCTCTTACGATTTCCCTAG--TTTCA-ACATATATCTTGAAATCT-TGACA-AGT-GTACGTAT-G-C-AAAATAGAATCTTTTT-G-CT-GA-AT----AATCGTC-TTTTC-AGTG-ACTT----A-GTA-TTGCAAGTTATCA-TTTTGC--TCTGATTCT--A--A---AGTC---A-GATAGTTTGA-----TGGT-TTTTTTTTCCACAA--------------GGCCAATTCTCAAATTTTTTT-------GTAGTGTC-CGTAACTAAA-ATGGCTAGG---AAC-ATTATT-CATGAAAGTTTATGATC--TGAAA-TTT-CCCATGCAT---TAATGAAATTA-TTTT-TGTTCAAGCAGAGGCAT---AAAAAAGTGTTGTCTTCTAATAAA-TTTCC-TTC-ATTAGAAATAGTAT---AA-GAGTATATGTAATT-G---AGATCT-GTC--C-TTTTTAA-C-AAAA---TG-AC----C--T-TTGTAA-GTAAATATTGT-A-ATTTT-TAAAGGTGTTACAATACTTTTT--AGTTC---AAA--TATGTC-A--TAATTA-T---G----T-CA-T-TT--CAATGCGTTA---A-CTTT-GAA-CAGATT--GAAAAATAAAA----GT-T-ATTAACAGG----TTAT----CGATTATT-TA--TTC---AGAAAGAGAAAAC---A-TTG-AGTGT-C-GGC-----GTAACCTGTCAAA---GAG-C--TTACTAT--AAGCA--GC----AAAATAGTATAG----T--T--TAAT--GAAT-ATCATAA--CCA----CCTTA-GTTC-GGTTCC--TTTGGT--ACCT-----CT---CTTGTTAGAAAAAA---TATTTGT--GGGC------A----AAATA---AA-ACATCAATT-----TTCAC---------CC-TC-A-GT--GCAGCACTA--CT-GTTCGC-CTTTTTGT
gi|15 : gataagattctgagtgtccggtaacttatttggactcagtttgaaacgcagctgttttatataacactaagctttacattaaggtcattgtggtttattctacaatttatatactttatttttcacctctattttgagtgatgcataattgaagagccacgcacattcatactaactcatatatgctttacatcaagccatgacatagagtttgcatgacatggcttaaactatgaccatattatttcatattaagtgttattatcatcttgttacgtaattcaccaataagttccatcccttataaatcgtttaaatgttagttcacgtataccaaaggttaaaataaaatcttattttttctccaaggaaaattcaaatgtgttattgaattgatgtatgtagtgatatatcattaaattgcttagatttgtgtggggtttttttcttattgacaatagaaataaaattttacttaaaacctacaaatacatagatgtgggggaaattatAAAATGCTTCGCATAGCCAGT-AC-ATTTTGTG--ATA-TATgt
gi|1 : agaaattcttatagattaaggggtgtttttttcaccgcaagatataaaaaatattacttaaaaatataaagatacatagaatgtgtgggaatattatcCATAGCCAGCTAC-ATTCTGTG-A-TACTATTGCTT--CAAATGATTCTTAAATGCTTAT-TAGAAAAT--ATCTTATTAAAATGTATT-TAAAGACAATCAATA-TTTGCTATCATCAAATAGTTA--ACAGTTAGGA--GG-AACATTAG-TT-CGGGACACTACGACAATA----TT----ATA-ACAACTCTATACGAAA--AAAAAATAT-------------GACA--CAA-TATCAGATTTGAT-AA--AG-GTATATC-TAAC-GT-TGAGAAT-------------TATGCTTCACAA--CATAAA-AAAAAACCCA----CTTGCATT-AA-GAAA--AAGCCAAGCTACATTC--TTACGTTTT-ACTAG--TTTCATAC-TACAGATTGAAAGCTTGGACATAG-TGT---ACT-GCC-AAA-TATAATTTTTTT----CTGA-ATTAAATGTCAAA-TTT---CA-GCACTTAGTATTGCAACTT-A----ATCATTTT-GCCATCTCACTATCTA--ACTTATTC---A-GACAGTT
gi|22 : tcatggtaagatacgcagaatatgtggttttccctgatcatcaccaactgttgcttcaaggtatcaatcacaaacgtggttacgacactacaaaattccttgtagatgtccgctaacctgtatttcatatcacgtttgaacgcagcctgtttttaaaaccactaactgctgaattattcttaccaaaggttcagggtttttctcacaagttaaatcaatcatggtctttattttttcacctcattttgatgatgcaacctaattgaaagcccaaatcgcatgcattaccatatacagcaatcaaactgttcacatcagccaatgactaagcaatgttattgcacccatgggcatctaaggacagagatggcccacagcatattttttcatatgaaagtccaacgttgttacacagtcgtaacaaaatctgtgcacgaaattttccaactaatttaagactaatttctccagtcccgtttaatatacaagacatgctgatagtgtctcgtaaccaaagttcgaaaactttaaaactttatttttttctccaagaaagttccagaacaaagttcaaagcatgtttgtctattgacagattatggatggtatacgtgattattgccaaatcttttagatactactgtggttttgtttttcatatcgcagaataaagaaaaaaatatacttacacctacaacaatacatagaatggtgtcggggaaatttattaaggatcttcTAGT-TAAAG-CAATC-ATATTT-GCATTCA-AAA-TACTTA--ACAGTAGGGA--GGTAGT-TTGG-TTACGGatcgcggacgatgttagtattcaattatcatttgtatctgatttctaataattttaaagaagtttatggaatgttttttttccacaacccaaagccaatctcaaatatcttaattttgtagtgttcgtaactaaataaggctcagaaagtttatgaatataaaatttgctatcttaatggaattatttttgtttcaacagaggcataaaaatgttgtttctaaataaaatttccttcaataaaattggtataaaagtatttatgtaatttgaaatactgtcctatttttacaaaaatgcacctggtaagaaatttgttaattttaaggtgttacaaccttttctagtcaaaattatgtccatattatgtactttcatatgttgttaacttttggacagttgaaaaaaaaagtttattaacagctttcaattttagttcaaagaaagaaacacttgtagtgtccgtaacctgtgaaaatgaacttattatcagcatgcaaaatataaagttctaatctgaatatcataaaaccacttatgttctggttcctttaggtactctactctttagaaaaaataattttggggcaaaataaagacatcaatttttcacctcaagtgcaacactactgttctctttattgtgt
gi|1 : T-TTGG-TTACGAGACACTATC--AGCATGTCTT----GTA---TA--TTAAA
gi|16 : tcatggtaagatacgcagaatatgtggttttccctgatcatcaccaactgttgcttcaaggtatcaatcacaaacgtggttacgacactacaaaattccttgtagatgtccgctaacctgtatttcatatcacgtttgaacgcagcctgtttttaaaaccactaactgctgaattattcttaccaaaggttcagggtttttctcacaagttaaatcaatcatggtctttattttttcacctcattttgatgatgcaacctaattgaaagcccaaatcgcatgcattaccatatacagcaatcaaactgttcacatcagccaatgactaagcaatgttattgcacccatgggcatctaaggacagagatggcccacagcatattttttcatatgaaagtccaacgttgttacacagtcgtaacaaaatctgtgcacgaaattttccaactaatttaagactaatttctccagtcccgGAAAACAAAAAATACTG------------ACA-TCAA-TATCTGA----AC-AAATAGTGTATATC-TAACTGTGTAAAAATAAAAG-------GTATGCTTCACAATGCAAAAA-AA-----C-A----CTTGAATT-AAGGAAA--AAGC----Tgttcgaaaactttaaaactttatttttttctccaagaaagttccagaacaaagttcaaagcatgtttgtctattgacagattatggatggtatacgtgattattgccaaatcttttagatactactgtggttttgtttttcatatcgcagaataaagaaaaaaatatacttacacctacaacaatacatagaatggtgtcggggaaatttattaaggatcttccatagccagctacattctgtgatactattgcttcaaatgattcttaaatgcttattagaaaatatcttattaaaatgtatttaaagacaatcaatatttgctatcatcaaatagttaacagttaggaggaacattagttcgggacactacgacaatattataacaactctatacgaaaaaaaaatatgacacaatatcagatttgataaaggtatatctaacgttgagaattatgcttcacaacataaaaaaaaacccacttgcattaagaaaaagccaagctacattcttacgttttactagtttcatactacagattgaaagcttggacatagtgtactgccaaatataatttttttctgaattaaatgtcaaatttcagcacttagtattgcaacttaatcattttgccatctcactatctaacttattcagacagttatcgcggacgatgttagtattcaattatcatttgtatctgatttctaataattttaaagaagtttatggaatgttttttttccacaacccaaagccaatctcaaatatcttaattttgtagtgttcgtaactaaataaggctcagaaagtttatgaatataaaatttgctatcttaatggaattatttttgtttcaacagaggcataaaaatgttgtttctaaataaaatttccttcaataaaattggtataaaagtatttatgtaatttgaaatactgtcctatttttacaaaaatgcacctggtaagaaatttgttaattttaaggtgttacaaccttttctagtcaaaattatgtccatattatgtactttcatatgttgttaacttttggacagttgaaaaaaaaagtttattaacagctttcaattttagttcaaagaaagaaacacttgtagtgtccgtaacctgtgaaaatgaacttattatcagcatgcaaaatataaagttctaatctgaatatcataaaaccacttatgttctggttcctttaggtactctactctttagaaaaaataattttggggcaaaataaagacatcaatttttcacctcaagtgcaacactactgttctctttattgtgt
gi|23 : AAAAATACTG------------ACA-TCAA-TATCAGA----AC-AAACAGTGTATATC-TGACTGTGTA
gi|18 : GTATATC-TAACTGTGTAAAGATAAAAGGTACATTGTATGCTTCACAA--TATAAACAA-----C-A----TTTGAATT-ATTGAAA--AGGC----TTACG-----T----TTT---CTAG--TTTCATACAT
gi|5 : ACGTTTT--CTAG--TTTCATACATAT----TGAAAGCAATGACA-AGT-GT---TCT-G-C-AAA-TA-AATCTTTTTTG-CTTGA-ATAA--TGTCAAATTTT---CATGCA-CT----TTGT--TTTCAAT-TATCA-ATT-GC-ATCTGATT-TCTAATA---GTTA---A-GA-AATTTAT-GGAATGTTGTTTTTTTTCCACAACCC-----ATGCATAGCCAAT-
gi|17 : atttttTTTTATACACTTATATTGAAAGCTTTGA-A-ATGTGT---TCT-G-T-AAA-TA-AATCCATTTTG-CTTGATAA----TGTCAACTTTT---CATGCA-TT----TTGT--ATCCAAG-TATCA-TTT-natatggaatgggttttttttccacaacccatgcatagccaatctcaaatatcttaattttgttgtgtccttaacaaaataaggctatttgacattatttcagaaaatttatgaaaatgaaatttccttaatggaagtatttttgtttcaacaaaggcataaaaaatgttgtttgtaaatgaaatttcctttatcaaaattggtattaaagtgttcatgtaatttgaaatactgtcttttttaacaaaaatgtaccaggtaagaaatgtgttaaaacattttctagtcaaaattatatccatattatgtactttcatatgttgtttacttttgaacagttgaaaaaaaaataaagtttattaacacctttcaatatttatttcaaagaaagaaacgcttgtagtgtccgttattagtaacctgtgaaaatgagcttattctcatctgaatattataaaaccacttaagttttggttcctttaggtactctactctttagaaaaaatattttttgggcaaaatataaagacatcaatttttcaccccaagtgcaacactactgttccctttattg
gi|6 : ATATATTGAAG-CTTTAACA-AGT-GT---ACTCG-CTAAA-TA-AATCTTTTTTGGCTTGA-ATAG--TGTCAAA-TTTTCCAGTGCACTT------GT--TT-CAAT-TATCA-TTT-GCCATCTGATT-TCTA--ATA-GTTC---AAGA-AGTTTTATGGAATGGT-TTTTTTCGCCAACC-CC-----A-----AGCCA-T-CTCAAATGTCTTAATTTTTTGTAGTGTC-CGTAACTATA-TAGGTTATG---AAC-ATTATTTCA-GAAAGTTTATGAAATATGAAATTTT-C----CTATCTGTAATGGAATTC-TTTTTGTTTCAAACAAAGCAAT---AAAAA--TGTTGTT-GTAATAAAAATGTCC-TTC-ATTAAAATTG-TATTCAAA-GTGTTCATGTAATTTGGAAAAATCT-GTC--C-TTTTTAAAC-AAAAA--T--GC----C--ACA-GTAA-GCAAATGTGTTTC-ATTTTA-AA--GAGTTTAACAACCTTTTCTCGT-CTCCCAGATTATGTATA--TA-GTA-T--AG----T-ACGTGTT--CAA-ATGTTGTTTA-CTTTTGAA-CA-GTT--GAAAAA--AATTTAAGT-TTATTAACAGC----TT-T----CAAT-ATT-TA--CTTCA-AGAAAGA---AAC---AC-TGTAGTGT-CAG-T-----G-AACCTGTG-AAAATGAG-CATTAA-TATC--AGCAT-GC------AACAATATAAAGTTT--T--TAATCTGAATAATCATAAAACCA---AC-TTATGTCTTGGTTCCCTTTTAGGTAAACTG----CT--ACTCTTTAG--AAGA-AATATTTTTTTGGGCAA----A----A--TA---AAGACATCAA----AT--------TTTTC-ACTGCC-AAGT--GCAAAAATA--CTAGTTCCCTTTTATTGT
gi|1 : aATGT----TAGT--ATTCAAT-TATCA-TTT-GTA-TCTGATT-TCTA--ATA-ATTTTAAA-GA-AGTTTAT-GGAATGTT-TTTTTT--CCACAA-CCCA---A-----AGCCAAT-CTCAAATATCTT-AATTTTG-TAGTGTT-CGTAACTAAATAAGGCT-----------------CA-GAAAGTTTATGAAT-AT-AAAATTTGC-----TATCT-TAATGGAATTA-TTTTTGTTTCAA-CAGAGGCAT---AAAAA--TGTTGTTTCTAAATAAAATTTCC-TTCAAT-AAAATTGGTATA--AAAGTATTTATGTAATTTG---AAATACTGTCCTA-TTTTTAC-A-AAAA---TGCAC----C--T-G-GTAA-G-AAATTTGTT-A-ATTTTA-AG--GTGTTACAA--CCTTTTCTAGT-C---AAAATTATGTCCA--TA-TTA-T---G----T-AC-T-TT--CA-TATGTTGTTAA-CTTTTGGA-CA-GTT--GAAAAAAAAA-----GT-TTATTAACAGC----TT-T----CAAT--TT-TA--GTTCAAAGAAAGA---AAC---ACTTGTAGTGT-C---C-----GTAACCTGTGAAAA-TGAA-C--TTATTATCA--GCAT-GC-------AAAATATAAAGTTC--T---AATCTGAAT-ATCATAAAACCACTTA-----TGTTCTGGTTCC--TTTAGG--TACT-----CT--ACTCTTTAGAAAAAATAA----TTTTGGGGCAA----A----A--TA---AAGACATCAAT-------------TTTTC-ACC-TC-AAGT--GCAACACTA--CT-GTTCTC-TTTATTGT
gi|5 : tcatggtaagatacgcagaatatgtggttttccctgatcatcaccaactgttgcttcaaggtatcaatcacaaacgtggttacgacactacaaaattccttgtagatgtccgctaacctgtatttcatatcacgtttgaacgcagcctgtttttaaaaccactaactgctgaattattcttaccaaaggttcagggtttttctcacaagttaaatcaatcatggtctttattttttcacctcattttgatgatgcaacctaattgaaagcccaaatcgcatgcattaccatatacagcaatcaaactgttcacatcagccaatgactaagcaatgttattgcacccatgggcatctaaggacagagatggcccacagcatattttttcatatgaaagtccaacgttgttacacagtcgtaacaaaatctgtgcacgaaattttccaactaatttaagactaatttctccagtcccgtttaatatacaagacatgctgatagtgtctcgtaaccaaagttcgaaaactttaaaactttatttttttctccaagaaagttccagaacaaagttcaaagcatgtttgtctattgacagattatggatggtatacgtgattattgccaaatcttttagatactactgtggttttgtttttcatatcgcagaataaagaaaaaaatatacttacacctacaacaatacatagaatggtgtcggggaaatttattaaggatcttccatagccagctacattctgtgatactattgcttcaaatgattcttaaatgcttattagaaaatatcttattaaaatgtatttaaagacaatcaatatttgctatcatcaaatagttaacagttaggaggaacattagttcgggacactacgacaatattataacaactctatacgaaaaaaaaatatgacacaatatcagatttgataaaggtatatctaacgttgagaattatgcttcacaacataaaaaaaaacccacttgcattaagaaaaagccaagctacattcttacgttttactagtttcatactacagattgaaagcttggacatagtgtactgccaaatataatttttttctgaattaaatgtcaaatttcagcacttagtattgcaacttaatcattttgccatctcactatctaacttattcagacagttatcgcggacgGAATGGG-TTTTTTTTCCACAA-CCCATGCAT----AGCCAAT-CTCAAATATCTT-AATTTTGTT-GTGTC-CTTAACAAAATAAGGCTAT-TTGA--CATTATTTCA-GAAAATTTATGAAA-ATG-AAATTT-C--------CT-TAATGGAAGTATTTTT-GTTTCAA-CAAAGGCATAAAAAA----TGTTGTTTGTAAATGAAATTTCCTTT--ATCAAAATTGGTATTA-AA-GTGTTCATGTAATTTG---AAATACTGTC--T-TTTTTAA-C-AAAAATGT--AC----C--A-G-GTAA-G-AAATGTGTT---------------------AAAACATTTTCTAGT-C---AAAATTATATCCA--TA-TTA----TG----T-AC-T-TT--C-ATATGTTGTTTA-CTTTTGAA-CA-GTT--GAAAAAAAAATAAA-GT-TTATTAACACC----TT-T----CAAT-ATT-TA--TTTCAAAGAAAGA---AAC---GCTTGTAGTGTCC-G-TTATTAGTAACCTGTG-AAAATGAG-C--TTATTCTCAgt
gi|13 : atttttacgttttctagtttcatacatattgaaagcaatgacaagtgttctgcaaataaatcttttttgcttgaataatgtcaaattttcatgcactttgttttcaattatcaattgcatctgatttctaatagttaagaaatttatggaatgttgttttttttccacaacccatgcatagccaatnatatgAA-ATGAAA-TTT-C----TTATCC-TAGTGGAGGTA-TTTTTGTTTCAA-CAAAGGCATAAAAAA----TG-TGTTTGTAAATGAAATTTCC-TTA-ATCAAAATTGGTATGA-AA-GTGTTCATGTAATTTG---AAGTACTGTC--ATTTTTTAA-CAAAAA---T--AT----tctgaatattataaaaccacttaagttttggttcctttaggtactctactctttagaaaaaatattttttgggcaaaatataaagacatcaatttttcaccccaagtgcaacactactgttccctttattg
gi|7 : TTAA-C-AAAAG--T--ATACAGCTGA-G-GTAA-G-AAATGTGTT-C-ATTTTA-AA--GTGTTACAA---CCTTGCTAGT-C---AATATTATGTCCA--TA-TTAGTA-TG----T-AC-T-TT--CA-TATGTTGCTTA-CTTTTGAA-CA-GTT--TAAAAAAAAATCAA-GT-TTATGAACA-CTCTATT-T----CGAT-ATTAAA--TTTCAAAGAAAGA---AGC---A-TTA-AAT-T-T-G-A-----A-AACCAGTG-AAAATGAG-CT-TAATTATC--AGCAT-GC-------AAAATATAAAGTTC--TAGTTATCTGGAT-ATCATAAA------------------TGGTTCC--TTTAGG--TACTGTGA-CTTAACTCTTTAG-AAAAA-AATA-TTTTTTGGGCAATTAGA----A--TA---AAGACAT--ATA--AATT------TTTTC-ACC-ACTAAGT--GGAACACT----T-ACTCCC-TTTATTGat
gi|8 : -C-AAAG---T--ATACAGCG-A-G-GTAAAG-AAATGTGTT-CCATTTTA-AA--GTGTTACAA---CCTTGCTAGT-----AAACTTATGTCCA---A-TTA-G--TA----TGAC-T-TT----ATATGTTCTTAA-CTTTTGAAACA-GTTTAAAAAAATAA------GT-TTAG-AACA-C----TC-TATTGTGAT-ATT-AAAATTTCA-AGACAGA---CATTAAATTTGAAA------A-C-----GCA----GTGACAAATGAGGC--TTATTATCACGCCAT-GC------AAAAATATAAAGTCTAGT--T-ATCTGGAT-AGCATAAA------------------TGGTTCC--TTTAGG--TACTTGTGACTTAACTCTTTTAGAAAAA-AATATTCTTTTGGGC------A----AT-TAGATAAGACAT-AATTAAATT-------TTTTCAACC-ACTAAGTTGGAAACACTA--
gi|25 : -AAATGTGTC-C-ATTTTA-AA--GTGTT--ACAACCTTTTCTAGT-C---tcctttacgtgttt
gi|24 : AACCTTTTCTAGT-C---AAAATTATGTCCA--TA-TGA----TG----T-AT-T-TT--CA
gi|11 : -C---AAAATTATGTCCACATA-TTA-GGATGAAACT-AC-T-TTTCCAATATGTTGTTTAACTTTTGAA-CA-ATT--GAATAACAAATCAC-GTATTATTGAAAG
gi|10 : gaCCTGTGAAAA-TGAG-C--TCATTATCA--GCAT-G-------AAAAATATAAAGTTC--T---AATCTGAAT-ATCATAAAACCACTTA-----TGTTCTGGTTCC--TTTAGG--TACT-----CT--ATTCTTTAGAAAAAA-AA-----TTTTGGGCAA----A----A--TA---AAGACAT-------------ACATTTTTT-ACC-CC-AAGT--GCAACACTG--CT-GTTCCC-tgtttatggtaatcctaacattcaatctattgaaataattaagcttcaagaaagtggaattttctatgagctt
gi|12 : GAG-C--TTATTATCA--GCATAGC-------AAAATATA---CTT--T--TGAT-TGAAT-ATCATAAAACAATGTAATTTG-GTT---GTT----TTTAGG--CACT-----CT------TTTAG--AAAA-AGTA-TTTTTTGGACA-----A----A--TA---AA-ACATCAA------------A-TTTTC-ACC--C-GA-T--ACA--ACCA--CT-GTTCCT--TTATTGtt
gi|5 : TT--C--TCATCTGAAT-ATTATAAAACCACTTA----A-GTTTTGGTTCC--TTTAGG--TACT-----CT--ACTCTTTAG--AAAA-AATA-TTTTTTGGGC------AAAATA--TA---AAGACATCAAT-------------TTTTC-ACC-CC-AAGT--GCAACACTA--CT-GTTCCC-TTTATTGgtt
gi|20 : atttttacgttttctagtttcatacatattgaaagcaatgacaagtgttctgcaaataaatcttttttgcttgaataatgtcaaattttcatgcactttgttttcaattatcaattgcatctgatttctaatagttaagaaatttatggaatgttgttttttttccacaacccatgcatagccaatnatatggaatgggttttttttccacaacccatgcatagccaatctcaaatatcttaattttgttgtgtccttaacaaaataaggctatttgacattatttcagaaaatttatgaaaatgaaatttccttaatggaagtatttttgtttcaacaaaggcataaaaaatgttgtttgtaaatgaaatttcctttatcaaaattggtattaaagtgttcatgtaatttgaaatactgtcttttttaacaaaaatgtaccaggtaagaaatgtgttaaaacattttctagtcaaaattatatccatattatgtactttcatatgttgtttacttttgaacagttgaaaaaaaaataaagtttattaacacctttcaatatttatttcaaagaaagaaacgcttgtagtgtccgttattagtaacctgtgaaaatgagcttaTTTTTGGGC------A----AAATA---AAGACATCAATT-------------TTTC-ACC-TC-AAGT--GCAACACTA--CT-GTTCCC-TTTAT
gi|21 : aataaA-TTTTC-ACC-TC-AAGT--GCAACACTA--CT-GTTCCC-TTTATTGT
4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|9 ): AAACACTAATGCTGATAATTTTTACAAAGGTCAGAGGTTTGTTCTACAAGTTAATCAATCTACTTTATTTTTCACCCTCGTTTTGATGATGCAACTAATTTGGAAAGCCCAAATCGCATCATTTCCCTATACAGCATCATAGTTACATCTACATGACATAAGCTATGCTATTGAAATGGGCATCAAGACAG
Unaligned ( gi|14 ): TACAAAGGTCAAAGGTTTGTTCTACAAGTTACCAGGTAATCAATCTACTTTATTTTTCACCCACATTGTGATGATGCAACTAATTTGGAAAGCCCAAATCGCATCATTTCCATATGCAGCATCGTTGCTGTAACAGCATGACATA
Unaligned ( gi|19 ): TATGGTGTTTTTTCCCTGGTCATCACCACTGTGTTTCAGGTATCATCACAAATGTGGTTTAGGTTACGGACACTACAAAATCCTGTAGTGTC
Unaligned ( gi|26 ): GTTAAAAGTAAGACAATTTAAAGACACCAATTTT
Alignments
lowQualScore : 1 1 11 44 1 1 1 333 111 1 11 1 111 1111 1111 1111 333333333333 1111 2222222 111 222222222222 2222222222222222 22 11 11 111 1 333333 1 1111 1 111 1 1 333333 11 1 111 33333333333 1 1 1 1 3333333 222 11 1 2222 111 333 1111 111 2222 333333 1111 1111 11 222222222222 222 3333333 55555555555 22222 111 1 1 111111111 444444444444444
lowQualScore : 0 8 6 66 6 33 11 0 66 0 0 222 777 3 8 6 1 44 8 0 8 66 1 0 11 0 6 6 0 777 4444 7777 88 1111 1 1 0 888888888888 6 6 4444 6 5 0 1111111 777 6 777777777777 6 2 99 8888888888888888 55 99 55 2 555 5 33 000 5 5 5 5 1 5 5 444444 1 7777 66 77 0 5 000 66 5 5 5 7 7 666666 33 1 999 000 5 66666666666 5 1 1 5 1 5 2 5 3 3333333 3 6 5 8 000 5 5 5 1 5 5 00 5 77 1 0 3333 000 5 5 66 5 5 111 5 77 4444 5 8 000 66 8 5555 4 666 55 4 8888 8888 4 4 4 8888 4 4 4 5 555555 4 3 0000 5 0000 5 11 2 888 5 6 333333333333 4 7 4 4 4 4 444 4 4 1111111 4 0 4 6666666 4 0 55555555555 5555 4 55 55 22222 111 55 2 3 5 111111111 44 0 44 0 000000000000000 3 3 77 6 44 44 3 3 3
lowQualScore : . . . .. . .. .. . .. . . ... ... . . . . .. . . . .. . . .. . . . . ... .... .... .. .... . . . ............ . . .... . . . ....... ... . ............ . . .. ................ .. .. .. . ... . .. ... . . . . . . . ...... . .... .. .. . . ... .. . . . . . ...... .. . ... ... . ........... . . . . . . . . . ....... . . . . ... . . . . . . .. . .. . . .... ... . . .. . . ... . .. .... . . ... .. . .... . ... .. . .... .... . . . .... . . . . ...... . . .... . .... . .. . ... . . ............ . . . . . . ... . . ....... . . . ....... . . ........... .... . .. .. ..... ... .. . . . ......... .. . .. . ............... . . .. . .. .. . . .
lowQualScore : 6 0 0 44 0 88 22 0 22 0 0 555 555 2 0 0 0 66 0 8 0 44 0 8 00 6 7 7 8 444 8888 0000 88 4444 0 0 8 333333333333 7 7 2222 7 7 7 7777777 777 7 333333333333 7 5 22 1111111111111111 00 22 77 3 777 7 44 000 7 7 7 7 4 0 7 333333 4 1111 77 00 0 0 111 99 0 0 7 1 1 444444 66 4 666 111 7 66666666666 7 7 7 0 4 7 1 5 5 0000000 2 7 7 7 111 7 7 7 0 0 7 77 7 99 7 1 1111 000 0 0 77 7 0 222 7 99 4444 0 9 000 11 9 4444 0 444 55 0 9999 5555 0 0 0 6666 4 4 4 3 333333 4 9 6666 0 6666 0 99 0 888 0 5 666666666666 4 3 6 0 0 0 222 0 0 1111111 0 9 7 6666666 0 8 88888888888 8888 0 55 55 55555 888 55 1 6 5 222222222 66 4 66 4 999999999999999 3 3 88 7 66 66 3 3 3
consensus : TAAAATGCCTCGCATAGCCAG-TAACATTTTGTGAATA-TATTGCTC--CAAATGCATCT-AANTGCTTAT-TAGAAA-ATAAATC---TTAAAATGTATT-TAAAG-CAATCATAT-TTTGCATTCA-AAAATATTTAACAGTAGGGA--GGTAAT-TTGG-TTACGGGACACTACG--AATAT---TT----GTA-ACTA--TTAAANGAAAACAAAAAATACTG-----------GACA-TCAA-TATCAGA----AC-AAATAGTGTATATC-TAACTGTGTAAAGATAAAAG-------GTATGCTTCACAAT-CATAAA-AA-----CAA----CTTGAATT-AAGGAAA--AAGC----TTACG---TCTTACGTTTTG-C--TAG--TTTCATACATATATATCGAAAGCNNTGACA-AGTTGT---TCT-G-C-AAA-TA-AATCTTTTTTG-CTTGAAT---A--TGTCAAA-TTTC---GTGCACTTTTGT-TTTCAA-TT--ATCA-TTT-G-C-ATCTGATT-TCTAAC--G--TTCA--GA-AGTTTAN-GGAATGNT-TTTTTTTTCCACAA-CC-----A-----AGCCAAT-CTCAAATATCTTTAATTTTGGTAGTGTC-CGTAA-CTANATAAGGCTATGTTAA--CATTATTTCA-GAAAGTTTATGAAA-ATGAAAATTTC--CTAT-C-T-TAGTGGAAGTATTTTTGTTTCAA-CAAAGGCAT-AAAA-A--TGTTGTTTGTAAATGAAATTTCCTTCATCAAAATTGGTAT-T--AAGTGTTCATGTAATTTG---AAATACTGTC-CT-TTTTAA-CAAAAAT-T-AC--C--A-GGTAA-G-AAATGTGTT-C-ATTTT--A-AAGTGTTACAAAACCTTTTCTAG-TC---AAAATTATGTCCA--T-ATTA-T--TG----T-AC-T-TT--CAATATGTTGTTTA-CTTTTG-AACAG-TTGAAAAANAAAT---A-GT-TTATTAACAGC----TT-T----CGA-TATT--TATTTCAAAGAAAGAAAC---AC-TTGTAGTGT-C-GC-----GTAAC-CTGTGAAAAATGA-GC-TT-ATTATC-AAG-CAT-GC------AAAAATA-TAAAGTTT--T--TAATCTGAATA-TCATAAAACCA-CTTA--TTATGT--TTTGGTT-CC--TTTAGGTA--CT-----CT--ACTCT--TTAGAAAAAA-AATA-TTTTTTGGGCA---A----A--ATAAAGAC--ATCAATT--------A----TTTTC-AC-C-CC-AAGT--GCAACACTA--CT-GTTC-CC-TTTATTGT
Reference ( family-3356 ) : TAAAATGCCTCGCATAGCCAG-TA-CATTTTGTGAATA-TATTGCTT--CAAATG--TCT-AAATGCTTAT-TAGAAA-ATAA-TC---TTAAAATGTATT-TAAAG-CAANCATAT-TTTGCATTCA-AAAATANTTAACAGTAGGGA--GGTAAT-TTGG-TTACGGGACACTACG--AATAT---TT----GTA-ACTA--CTAAANGAAAACAAAAAATACTG-----------GACA-TCAA-TATCAGA----AC-AAATAGTGTATATC-TAACTGTGTAAAAATAAAAG-------GTATGCTTCACAAT-CATAAA-AA-----CAA----CTTGAATT-AAGGAAA--AAGC----TTACG---TCTTACGTTTT--C--TAG--TTTCATACATATATATTGAAAGCTTTGACA-AGTTGT---TCT-G-C-AAA-TA-AATCTTTTTTG-CTTGAAT---A--TGTCAAA-TTTC---GTGCACTTTTGT-TTTCAA-TT--ATCA-TTT-G-C-ATCTGATT-TCTAAC--G--TTCA--GA-AGTTTAA-GGAATGNT-TTTTTTTTCCACAA-CC-----A-----AGCCAAT-CTCAAATATCTTTAATTTTGGTAGTGTC-CGTAA-CTAAATAAGGCTATGTTAA--CATTATTTCA-GAAAGTTTATGAAA-ATGAAAATTTC--TTAT-C-T-TAATGGAANTATTTTTGTTTCAA-CAAAGGCAT-AAAA-A--TGTTGTTTGTAAATGAAATTTCCTTCATCAAAATTGGTAT-T--AAGTGTTCATGTAATTTG---AAATACTGTC-NT-TTTTAA-CAAAA---T-AC--C--A-GGTAA-G-AAATGTGTT-C-ATTTT--A-AAGTGTTACAAAACCTTTTCTAG-TC---AAAATTATGTCCA--T-ATTA-T--TG----T-AC-T-TT--CAATATGTTGTTTA-CTTTTG-AACAG-TTGAAAAANAAAT---A-GT-TTATTAACAGC----TT-T----CGA-TATT--TATTTCAAAGAAAGAAAC---AC-TTGTAGTGT-C-GC-----GTAAC-CTGTGAAAAATGA-GC-TT-ATTATC-AAG-CAT-GC------AAAAATA-TAAAGTTT--T--TAATCTGAATA-TCATAAAACCA-CTTA--TTATGT--TCTGGTT-CC--TTTAGGTA--CT-----CT--ACTCT--TTAGAAAAAA-AATATTTTTTTGGGCA---A----A--ATAAAGAC--ATCAATT--------A----TTTTC-AC-C-TC-AAGT--GCAACACTA--CT-GTTC-CC-TTTATTGT
gi|1 : T-TTGG-TTACGAGACACTATC--AGCATGTCTT----GTA---TA--TTAAACG
gi|1 : tcatggtaagatacgcagaatatgtggttttccctgatcatcaccaactgttgcttcaaggtatcaatcacaaacgtggttacgacactacaaaattccttgtagatgtccgctaacctgtatttcatatcacgtttgaacgcagcctgtttttaaaaccactaactgctgaattattcttaccaaaggttcagggtttttctcacaagttaaatcaatcatggtctttattttttcacctcattttgatgatgcaacctaattgaaagcccaaatcgcatgcattaccatatacagcaatcaaactgttcacatcagccaatgactaagcaatgttattgcacccatgggcatctaaggacagagatggcccacagcatattttttcatatgaaagtccaacgttgttacacagtcgtaacaaaatctgtgcacgaaattttccaactaatttaagactaatttctccagtccCATAGCCAGCTA-CATTCTGTGA-TACTATTGCTT--CAAATGATTCTTAAATGCTTAT-TAGAAA-AT-A-TCTTATTAAAATGTATT-TAAAGACAATCA-ATATTTGCTATCATCAAATAGTTAACAGTTAGGA--GG-AACATTAG-TT-CGGGACACTACGACAATA----TT----ATA-ACAACTCTATACGAAA--AAAAAATAT-------------GACA--CAA-TATCAGATTTGAT-AA--AG-GTATATC-TAAC-GT-TGAGAAT-------------TATGCTTCACAA--CATAAA-AAAAAACCCA----CTTGCATT-AA-GAAA--AAGCCAAGCTACAT--TCTTACGTTTTA-C--TAG--TTTCATAC-TACAGATTGAAAGCTTGGACATAG-TGT---ACT-GCC-AAA-TATAATTTTTTT----CTGAATTAAA--TGTCAAA-TTTC---A-GCAC-TTAGTATTGCAA-CTTAATCATTTT-GCC-ATCTCACTATCTAACTTA--TTCA--GACAGTTgttcgaaaactttaaaactttatttttttctccaagaaagttccagaacaaagttcaaagcatgtttgtctattgacagattatggatggtatacgtgattattgccaaatcttttagatactactgtggttttgtttttcatatcgcagaataaagaaaaaaatatacttacacctacaacaatacatagaatggtgtcggggaaatttattaaggatcttccatagccagctacattctgtgatactattgcttcaaatgattcttaaatgcttattagaaaatatcttattaaaatgtatttaaagacaatcaatatttgctatcatcaaatagttaacagttaggaggaacattagttcgggacactacgacaatattataacaactctatacgaaaaaaaaatatgacacaatatcagatttgataaaggtatatctaacgttgagaattatgcttcacaacataaaaaaaaacccacttgcattaagaaaaagccaagctacattcttacgttttactagtttcatactacagattgaaagcttggacatagtgtactgccaaatataatttttttctgaattaaatgtcaaatttcagcacttagtattgcaacttaatcattttgccatctcactatctaacttattcagacagttatcgcggacgatgttagtattcaattatcatttgtatctgatttctaataattttaaagaagtttatggaatgttttttttccacaacccaaagccaatctcaaatatcttaattttgtagtgttcgtaactaaataaggctcagaaagtttatgaatataaaatttgctatcttaatggaattatttttgtttcaacagaggcataaaaatgttgtttctaaataaaatttccttcaataaaattggtataaaagtatttatgtaatttgaaatactgtcctatttttacaaaaatgcacctggtaagaaatttgttaattttaaggtgttacaaccttttctagtcaaaattatgtccatattatgtactttcatatgttgttaacttttggacagttgaaaaaaaaagtttattaacagctttcaattttagttcaaagaaagaaacacttgtagtgtccgtaacctgtgaaaatgaacttattatcagcatgcaaaatataaagttctaatctgaatatcataaaaccacttatgttctggttcctttaggtactctactctttagaaaaaataattttggggcaaaataaagacatcaatttttcacctcaagtgcaacactactgttctctttattgtgt
gi|1 : tcatggtaagatacgcagaatatgtggttttccctgatcatcaccaactgttgcttcaaggtatcaatcacaaacgtggttacgacactacaaaattccttgtagatgtccgctaacctgtatttcatatcacgtttgaacgcagcctgtttttaaaaccactaactgctgaattattcttaccaaaggttcagggtttttctcacaagttaaatcaatcatggtctttattttttcacctcattttgatgatgcaacctaattgaaagcccaaatcgcatgcattaccatatacagcaatcaaactgttcacatcagccaatgactaagcaatgttattgcacccatgggcatctaaggacagagatggcccacagcatattttttcatatgaaagtccaacgttgttacacagtcgtaacaaaatctgtgcacgaaattttccaactaatttaagactaatttctccagtcccgtttaatatacaagacatgctgatagtgtctcgtaaccaaagttcgaaaactttaaaactttatttttttctccaagaaagttccagaacaaagttcaaagcatgtttgtctattgacagattatggatggtatacgtgattattgccaaatcttttagatactactgtggttttgtttttcatatcgcagaataaagaaaaaaatatacttacacctacaacaatacatagaatggtgtcggggaaatttattaaggatcttcTTAGT-ATTCAA-TT--ATCA-TTT-G-T-ATCTGATT-TCTAAT--AATTTTAAAGA-AGTTTAT-GGAATG---TTTTTTTTCCACAA-CCCA---A-----AGCCAAT-CTCAAATATCTT-AATTTTG-TAGTGTT-CGTAA-CTAAATAAGGCT-----------------CA-GAAAGTTTATGAAT-AT-AAAATTTG--CTAT-C-T-TAATGGAATTATTTTTGTTTCAA-CAGAGGCAT-AAAA-A--TGTTGTTTCTAAATAAAATTTCCTTCAATAAAATTGGTATAA--AAGTATTTATGTAATTTG---AAATACTGTC-CTATTTTTA-CAAAAATGC-AC--C--T-GGTAA-G-AAATTTGTT-A-ATTTT--A-AGGTGTTAC--AACCTTTTCTAG-TC---AAAATTATGTCCA--T-ATTA----TG----T-AC-T-TT--C-ATATGTTGTTAA-CTTTTG-GACAG-TTGAAAAAAAA-----A-GT-TTATTAACAGC----TT-T----CAA-T-TT--TAGTTCAAAGAAAGAAAC---AC-TTGTAGTGT-C--C-----GTAAC-CTGTG-AAAATGA-AC-TT-ATTATC--AG-CAT-GC-------AAAATA-TAAAG-TT--C--TAATCTGAATA-TCATAAAACCA-C-----TTATGT--TCTGGTT-CC--TTTAGGTA--CT-----CT--ACTCT--TTAGAAAAAATAA----TTTTGGGGCA---A----A--ATAAAGAC--ATCAAT--------------TTTTC-AC-C-TC-AAGT--GCAACACTA--CT-GTTC-TC-TTTATTGTatcgcggacgatgttagtattcaattatcatttgtatctgatttctaataattttaaagaagtttatggaatgttttttttccacaacccaaagccaatctcaaatatcttaattttgtagtgttcgtaactaaataaggctcagaaagtttatgaatataaaatttgctatcttaatggaattatttttgtttcaacagaggcataaaaatgttgtttctaaataaaatttccttcaataaaattggtataaaagtatttatgtaatttgaaatactgtcctatttttacaaaaatgcacctggtaagaaatttgttaattttaaggtgttacaaccttttctagtcaaaattatgtccatattatgtactttcatatgttgttaacttttggacagttgaaaaaaaaagtttattaacagctttcaattttagttcaaagaaagaaacacttgtagtgtccgtaacctgtgaaaatgaacttattatcagcatgcaaaatataaagttctaatctgaatatcataaaaccacttatgttctggttcctttaggtactctactctttagaaaaaataattttggggcaaaataaagacatcaatttttcacctcaagtgcaacactactgttctctttattgtgt
gi|10 : tcatggtaagatacgcagaatatgtggttttccctgatcatcaccaactgttgcttcaaggtatcaatcacaaacgtggttacgacactacaaaattccttgtagatgtccgctaacctgtatttcatatcacgtttgaacgcagcctgtttttaaaaccactaactgctgaattattcttaccaaaggttcagggtttttctcacaagttaaatcaatcatggtctttattttttcacctcattttgatgatgcaacctaattgaaagcccaaatcgcatgcattaccatatacagcaatcaaactgttcacatcagccaatgactaagcaatgttattgcacccatgggcatctaaggacagagatggcccacagcatattttttcatatgaaagtccaacgttgttacacagtcgtaacaaaatctgtgcacgaaattttccaactaatttaagactaatttctccagtcccgtttaatatacaagacatgctgatagtgtctcgtaaccaaagttcgaaaactttaaaactttatttttttctccaagaaagttccagaacaaagttcaaagcatgtttgtctattgacagattatggatggtatacgtgattattgccaaatcttttagatactactgtggttttgtttttcatatcgcagaataaagaaaaaaatatacttacacctacaacaatacatagaatggtgtcggggaaatttattaaggatcttccatagccagctacattctgtgatactattgcttcaaatgattcttaaatgcttattagaaaatatcttattaaaatgtatttaaagacaatcaatatttgctatcatcaaatagttaacagttaggaggaacattagttcgggacactacgacaatattataacaactctatacgaaaaaaaaatatgacacaatatcagatttgataaaggtatatctaacgttgagaattatgcttcacaacataaaaaaaaacccacttgcattaagaaaaagccaagctacattcttacgttttactagtttcatactacagattgaaagcttggacatagtgtactgccaaatataatttttttctgaattaaatgtcaaatttcagcacttagtattgcaacttaatcattttgccatctcactatctaacttattcagacagttatcgcggacgatgC-CTGTGAAAA-TGA-GC-TC-ATTATC-A-G-CAT-G-------AAAAATA-TAAAGTTC--T---AATCTGAATA-TCATAAAACCA-CTTA--T---GT--TCTGGTT-CC--TTTAGGTA--CT-----CT--ATTCT--TTAGAAAAAA-AA-----TTTTGGGCA---A----A--ATAAAGAC--ATACAT--------------TTTTT-AC-C-CC-AAGT--GCAACACTG--CT-GTTC-CC-TTgt
gi|11 : C---AAAATTATGTCCACAT-ATTA-GGATGAAACT-AC-T-TTTCCAATATGTTGTTTAACTTTTG-AACAA-TTGAATAACAAATC--ACGTATTATTGAAAG
gi|12 : gaGA-GC-TT-ATTATC-A-G-CATAGC------AAAA-TA-TA---CTT--T--TGAT-TGAATA-TCATAAAA-CA---------ATGTAATTTGGTTGTT--TTTAGGCA--CT-----CT------T--TTAG--AAAA-AGTA-TTTTTTGGAC----A----A--ATAAA-AC--ATCAA----------A----TTTTC-AC-C--C-GA-T--ACA--ACCA--CT-GTT--CC-TTTATTGtgtttatggtaatcctaacattcaatctattgaaataattaagcttcaagaaagtggaattttctatgagctt
gi|13 : AA-ATGAAA-TTTC--TTAT-C-C-TAGTGGAGGTATTTTTGTTTCAA-CAAAGGCATAAAAA-A--TG-TGTTTGTAAATGAAATTTCCTTAATCAAAATTGGTAT-GA-AAGTGTTCATGTAATTTG---AAGTACTGTCATT-TTTTAA-CAAAA---gtt
gi|15 : AAAATGCTTCGCATAGCCAG-TA-CATTTTGTG-ATA-TATatatat
gi|16 : agaaattcttatagattaaggggtgtttttttcaccgcaagatataaaaaatattacttaaaaatataaagatacatagaatgtgtgggaatattatcGAAAACAAAAAATACTG------------ACA-TCAA-TATCTGA----AC-AAATAGTGTATATC-TAACTGTGTAAAAATAAAAG-------GTATGCTTCACAATGCAAAAA-AA-----C-A----CTTGAATT-AAGGAAA--AAGC----T
gi|17 : --TTTTATACACTTATATTGAAAGCTTTGA-A-ATGTGT---TCT-G-T-AAA-TA-AATCCATTTTG-CTTGATA---A--TGTCAACTTTTC---ATGCA-TTTTGT-ATCCAA-GT--ATCA-TTT-
gi|18 : GTATATC-TAACTGTGTAAAGATAAAAGGTACATTGTATGCTTCACAAT--ATAAACAA-----C-A----TTTGAATT-ATTGAAA--AGG--------------CTTACGTTTT--C--TAG--TTTCATACAT
gi|19 : ATTTTG-TAGTGTC-CGTAACCTAAA
gi|2 : tatggtgttttttccctggtcatcaccactgtgtttcaggtatcatcacaaatgtggTAAAATGTCTTACATAGCCAG-GT-CATTTTGT--ATAATATGGCTTGTCAAATG--TCT-AAA-GCTTATGTAGAAATATC--TC---TTAAA-TGTATTCTAAAGGCAATT-CAA-TTTGCATTCA-AT--TATT--ACAGTAGTGGTTGG--AT-TTGACTTACGAGCCAC-------ATAT---TCTTCGGTACACTA--C---AGAAAAATGTAAAATACTAATGTTAATTATGACACTCAAGTATCAGA----ATTAAATAGTGTATATCCTAACTGTTTGAGAAAAAAAG-------TTATGCTTCACAA--CATAGA-AA-----AAAACCCCTTGCATTTAAGAAAAGCAAGG----CTACCATCTCTTACGATTT--CCCTAG--TTTCA-ACATATATCTTGAAATCTT-GACA-AGT-GTACGTAT-G-C-AAAATAGAATCTTTTT-G-CT-GAAT---AATCGTCT---TTTCA--GTG-ACTTA-GTATTGCAAGTT--ATCA-TTTTG-C--TCTGATT--CTAAA--G--T-CA--GATAGTTTGA-----TGGT-TTTTTTTTCCACAA--------------GGCCAATTCTCAAAT----TT--TTTTG-TAGTGTC-CGTAA-CTAAA-ATGGCTAGG--AA--CATTATT-CATGAAAGTTTATG-AT-CTG-AAATTTC--CCATGCAT-TAATGAAATTATTTTTGTTCAAG-CAGAGGCAT-AAAA-AAGTGTTGTCTTCTAAT-AAATTTCCTTCATTAGAAATAGTA--T--AAGAGTATATGTAA-TTG---AGAT-CTGTC-CT-TTTTAA-CAAAA---TGAC--CT-T-TGTAA-GTAAATATTGT-A-ATTTTTAA-AGGTGTTACAATAC--TTTTTAGTTC---AAA--TATGT-CA--TAATTA----TG----T-CA-T-TT--CAATGCGTTA---A-C-TTTG-AACAGATTGAAAAATAAA----A-G--TTATTAACAGG----TTAT----CGATTATT--TA-TTCAGAAAGAGAAA----ACATTG-AGTGT-CGGC-----GTAAC-CTGTCAAA---GA-GC-TT-ACTAT--AAG-CA--GC-------AAAATAGTATAG--T--T--TAA--TGAATA-TCAT--AACCA-CC----TTA-GT--TC-GGTT-CC--TTT-GGTA--C------CT---CTCTTGTTAG--AAAA-AATA--TTTGTGGGCA---A----A--ATAAA-AC--ATCA-----------A----TTTTC-AC-C-CT-CAGT--GCAGCACTA--CT-GTTCGCC-TTT-TTGTcctgtagtgtc
gi|20 : gataagattctgagtgtccggtaacttatttggactcagtttgaaacgcagctgttttatataacactaagctttacattaaggtcattgtggtttattctacaatttatatactttatttttcacctctattttgagtgatgcataattgaagagccacgcacattcatactaactcatatatgctttacatcaagccatgacatagagtttgcatgacatggcttaaactatgaccatattatttcatattaagtgttattatcatcttgttacgtaattcaccaataagttccatcccttataaatcgtttaaatgttagttcacgtataccaaaggttaaaataaaatcttattttttctccaaggaaaattcaaatgtgttattgaattgatgtatgtagtgatatatcattaaattgcttagatttgtgtggggtttttttcttattgacaatagaaataaaattttacttaaaacctacaaatacatagatgtgggggaaattatTTTTTGGGCA---A----A--ATAAAGAC--ATCAATT--------------TTTC-AC-C-TC-AAGT--GCAACACTA--CT-GTTC-CC-TTTATgt
gi|21 : aataaAAAA-AATAATTTTT-GGGCA---A----A--AT-----------------------------TTTC-AC-C-TC-AAGT--GCAACACTA--CT-GTTC-CC-TTTATTGT
gi|22 : TAGT-TAAAG-CAATCATAT-TT-GCATTCA-AAA-TACTTAACAGTAGGGA--GGTAGT-TTGG-TTACGGgtt
gi|23 : AAAAATACTG------------ACA-TCAA-TATCAGA----AC-AAACAGTGTATATC-TGACTGTGTA
gi|24 : AACCTTTTCTAG-TC---AAAATTATGTCCA--T-ATGA----TG----T-AT-T-TT--CA
gi|25 : -AAATGTGTC-C-ATTTT--A-AAGTGTTAC--AACCTTTTCTAG-TC---
gi|3 : TAAAATGCCTCGCAGAGCCAG-TAATATCTTGTGAATG-TATTGCTC--CAAATACATCT-AACTGCTTAT-TAGAAA-ATAAATC---TTAAAATGTATT-TAAAG-CAAACATAT-TTTGCATTCA-AAAATGTTTAACAGTAGGGA--GGTAAT-TTGG-TTACGGGACACTACA--AATAT---TT----GTA-ACTA--TTAAAAGAAAACAAAAAATACTG-----------GACA-TCAA-TATCAGA----AC-AAATAGTGTATATC-TAACTGTGTAAAGATAAAAG-------GTATGCTTCACAAT-TATAAA-AA-----CAA----CTTGAATT-AAGGAAA--AAGC----TTACG---TA--ACGTTTTGGC--TAACCTTTCATACATATATATCGAAGGCAATGACA-AGTTGT---TCT-G-C-AAA-TA-AATCTTTTTTG-CTTGAAT------TGTCAAA-TTTA---ATGCATTTTTGT-TTTCA---T--ATCA-TTT-G-CAATCTGGTTCTCTAA---G--TTCA--GA-AGTTTAA-AGAATGTT-TTTTTTTTCCACAA-CC-----A-----AGCCAAT-CTCAAATATTTTTAATTTTGGTAGTGTCGCGTAA-CTATA-AAGGCTATATTAAACTATTATTTCA-GAAAATTTATGAAA-ATGAAAATTTCATTTAT-C-T-TAGTGGAAGTA-TTTTGTTTCAA-CAAAGGCAT---AA-A--TGTTGTTTGTAAATGAAGTTTCCTT-ATCAAAATTGGTAT-T--AAGTGTTCATGTAATTTG---AAATAC-GTC-AT-TTTTAA-CAAAA---T-AT--C--A-GGTAA-G-AAATGTGTT-C-ATTTT--ATAAGTGTTAAAAAACCTTTTCTAG-TC---AAAATTATGTCCA--T-ATTA-T--TG----T-AC-T-TT--CAATATGTTGTTTA-CTTTTG-AACAA-TTGAAAAATAAAT-----GT-TTATTAACAGC----TT-T----CAA-TATT--TATTTCATAGAAAGAAAC---AC-TTGTAGTGT-C-GC-----GTAAC-CTGTGAAAAATGA-GC-TA-ATTATCAAAG-CAT-GCCCAAAAAAAAATA-TAAAGTTT--T--TAATCTGAATA-TCATAAAACCA-TTTACTTTATGT--TTTGGTT-CC--TTTAGGAA--CT-----CT--ACTCT--TTAGAAAAAA-AATATTTTTTTGGGC---------A--ATAAAGAC--ATCAATTATTTCCACA----TTTTC-AC-C-TC-AAGT--GCAACACTA--CT-GTTC-CC-GTTATTGT
gi|4 : TAAAATGCCTCGCAGAGCCAG-TAATATCTTGTGAATG-TATTGCTC--CAAATACATCT-AACTGCTTAT-TAGAAA-ATAAATC---TTAAAATGTATT-TAAAG-CAAACATAT-TTTGCATTCA-AAAATGTTTAACAGTAGGGA--GGTAAT-TTGG-TTACGGGACACTACA--AATAT---TT----GTA-ACTA--TTAAAAGAAAACAAAAAATACTG-----------GACA-TCAA-TATCAGA----AC-AAATAGTGTATATC-TAACTGTGTAAAGATAAAAG-------GTATGCTTCACAAT-TATAAA-AA-----CAA----CTTGAATT-AAGGAAA--AAGC----TTACG---TA--ACGTTTTGGC--TAACCTTTCATACATATATATCGAAGGCAATGACA-AGTTGT---TCT-G-C-AAA-TA-AATCTTTTTTG-CTTGAAT------TGTCAAA-TTTA---ATGCATTTTTGT-TTTCA---T--ATCA-TTT-G-CAATCTGGTTCTCTAA---G--TTCA--GA-AGTTTAA-AGAATGTT-TTTTTTTTCCACAA-CC-----A-----AGCCAAT-CTCAAATATTTTTAATTTTGGTAGTGTCGCGTAA-CTATA-AAGGCTATATTAAACTATTATTTCA-GAAAATTTATGAAA-ATGAAAATTTCATTTAT-C-T-TAGTGGAAGTA-TTTTGTTTCAA-CAAAGGCAT---AA-A--TGTTGTTTGTAAATGAAGTTTCCTT-ATCAAAATTGGTAT-T--AAGTGTTCATGTAATTTG---AAATAC-GTC-AT-TTTTAA-CAAAA---T-AT--C--A-GGTAA-G-AAATGTGTT-C-ATTTT--ATAAGTGTTAAAAAACCTTTTCTAG-TC---AAAATTATGTCCA--T-ATTA-T--TG----T-AC-T-TT--CAATATGTTGTTTA-CTTTTG-AACAA-TTGAAAAATAAAT-----GT-TTATTAACAGC----TT-T----CAA-TATT--TATTTCATAGAAAGAAAC---AC-TTGTAGTGT-C-GC-----GTAAC-CTGTGAAAAATGA-GC-TA-ATTATCAAAG-CAT-GCCCAAAAAAAAATA-TAAAGTTT--T--TAATCTGAATA-TCATAAAACCA-TTTACTTTATGT--TTTGGTT-CC--TTTAGGAA--CT-----CT--ACTCT--TTAGAAAAAA-AATATTTTTTTGGGC---------A--ATAAAGAC--ATCAATT--------A----TTTCC-ACAC-TC-AAGT--GCAACACTATCCT-GTT--CC-GTTATT
gi|5 : ---TTTTACGTTTT--C--TAG--TTTCATACATAT----TGAAAGCAATGACA-AG-TGT---TCT-G-C-AAA-TA-AATCTTTTTTG-CTTGAATA--A--TGTCAAATTTTC---ATGCAC-TTTGT-TTTCAA-TT--ATCA-ATT-G-C-ATCTGATT-TCTAATA-G--TTAA--GA-AATTTAT-GGAATGTTGTTTTTTTTCCACAACCC-----ATGCATAGCCAAT-
gi|5 : atTAT-GGAATGGG-TTTTTTTTCCACAA-CCCATGCAT----AGCCAAT-CTCAAATATCTT-AATTTTGTT-GTGTC-CTTAA-CAAAATAAGGCTAT-TTGA--CATTATTTCA-GAAAATTTATGAAA-ATGAAA-TTTC-------C-T-TAATGGAAGTATTTTTGTTTCAA-CAAAGGCAT-AAAAAA--TGTTGTTTGTAAATGAAATTTCCTTTATCAAAATTGGTAT-TA-AAGTGTTCATGTAATTTG---AAATACTGTC-TT-TTTTAA-CAAAAATGT-AC--C--A-GGTAA-G-AAATGTGTT---------------------AAAACATTTTCTAG-TC---AAAATTATATCCA--T-ATTA----TG----T-AC-T-TT--C-ATATGTTGTTTA-CTTTTG-AACAG-TTGAAAAAAAAATAA-A-GT-TTATTAACACC----TT-T----CAA-TATT--TATTTCAAAGAAAGAAAC---GC-TTGTAGTGTCC-GTTATTAGTAAC-CTGTG-AAAATGA-GC-TT-ATTCTC----------------------------------------ATCTGAATA-TTATAAAACCA-CTTA----A-GT--TTTGGTT-CC--TTTAGGTA--CT-----CT--ACTCT--TTAG--AAAA-AATA-TTTTTTGGGCA---A----AATATAAAGAC--ATCAAT--------------TTTTC-AC-C-CC-AAGT--GCAACACTA--CT-GTTC-CC-TTTATTGnatatggaatgggttttttttccacaacccatgcatagccaatctcaaatatcttaattttgttgtgtccttaacaaaataaggctatttgacattatttcagaaaatttatgaaaatgaaatttccttaatggaagtatttttgtttcaacaaaggcataaaaaatgttgtttgtaaatgaaatttcctttatcaaaattggtattaaagtgttcatgtaatttgaaatactgtcttttttaacaaaaatgtaccaggtaagaaatgtgttaaaacattttctagtcaaaattatatccatattatgtactttcatatgttgtttacttttgaacagttgaaaaaaaaataaagtttattaacacctttcaatatttatttcaaagaaagaaacgcttgtagtgtccgttattagtaacctgtgaaaatgagcttattctcatctgaatattataaaaccacttaagttttggttcctttaggtactctactctttagaaaaaatattttttgggcaaaatataaagacatcaatttttcaccccaagtgcaacactactgttccctttattg
gi|6 : atttttacgttttctagtttcatacatattgaaagcaatgacaagtgttctgcaaataaatcttttttgcttgaataatgtcaaattttcatgcactttgttttcaattatcaattgcatctgatttctaatagttaagaaatttatggaatgttgttttttttccacaacccatgcatagccaatnaATATATTGAA-GCTTTAACA-AGT-GT---ACTCG-CTAAA-TA-AATCTTTTTTGGCTTGAAT---AG-TGTCAAA-TTTTCCAGTGCACTT--GT-TT-CAA-TT--ATCA-TTT-G-CCATCTGATT-TCTAATA-G--TTCAA-GA-AGTTTTATGGAATGGT-TTTTTTCGCCAACC-CC-----A-----AGCCA-T-CTCAAATGTCTTAATTTTTTGTAGTGTC-CGTAA-CTATATA-GGTTATG--AA--CATTATTTCA-GAAAGTTTATGAAATATGAAATTTTC--CTAT-C-TGTAATGGAATTCTTTTTGTTTCAAACAAAGCAAT-AAAA-A--TGTTGTT-GTAATAAAAATGTCCTTCATTAAAATTG-TAT-TCAAAGTGTTCATGTAATTTGGAAAAAT-CTGTC-CT-TTTTAAACAAAAA--T-GC--C--ACAGTAA-GCAAATGTGTTTC-ATTTT--A-AAGAGTTTAACAACCTTTTCTCG-TCTCCCAGATTATGTATA--T-AGTA-T--AG----T-ACGTGTT--CAA-ATGTTGTTTA-CTTTTG-AACAG-TTGAAAAA--AATTTAA-GT-TTATTAACAGC----TT-T----CAA-TATT--TACTTCAA-GAAAGAAAC---AC-T-GTAGTGT-CAGT-----G-AAC-CTGTGAAAA-TGA-GCATT-AATATC-A-G-CAT-GC------AACAATA-TAAAGTTT--T--TAATCTGAATAATCATAAAACCAACTTA--T---GT--CTTGGTT-CCCTTTTAGGTAAACTG----CT--ACTCT--TTAGAAGAAA---TATTTTTTTGGGCA---A----A--ATAAAGAC--ATCAAAT-------------TTTTC-AC-TGCC-AAGT--GCAAAAATA--CTAGTTC-CCTTTTATTGT
gi|7 : aTTAA-CAAAAGTAT-ACAGCTGA-GGTAA-G-AAATGTGTT-C-ATTTT--A-AAGTGTTACAA---CCTTGCTAG-TC---AATATTATGTCCA--T-ATTAGTA-TG----T-AC-T-TT--C-ATATGTTGCTTA-CTTTTG-AACAG-TTTAAAAAAAAATCA-A-GT-TTATGAACA-CTCTATT-T----CGA-TATTA-AATTTCAAAGAAAGAAGC---A--TTA-AAT-T-T-GA-----A-AAC-CAGTG-AAAATGA-GC-TTAATTATC--AG-CAT-GC-------AAAATA-TAAAGTTC--TAGTTATCTGGATA-TCATAAA---------------------TGGTT-CC--TTTAGGTA--CTGTGA-CTTAACTCT--TTAG-AAAAA-AATA-TTTTTTGGGCA---ATTAGA--ATAAAGACATATAAATT-------------TTTTC-AC-C-ACTAAGT--GGAACACT----T-ACTC-CC-TTTATTG
gi|8 : --A-GGTAAAG-AAATGTGTT-CCATTTT--A-AAGTGTTACAA---CCTTGCTAG-T----AAACTTATGTCCA----ATTA-G--TA----TGAC-T-TT----ATATGTTCTTAA-CTTTTGAAACAG-TTTAAAAAAATA----A-GT-TTA-GAACA-C----TC-TATTGTGA-TATTAAAATTTC-AAGACAGACATTAAAT-TTGAA----------------AACGCAGTGACAAATGAGGC-TT-ATTATC-ACGCCAT-GC------AAAAATA-TAAAGTCTAGT--T-ATCTGGATA-GCATAAA---------------------TGGTT-CC--TTTAGGTA--CTTGTGACTTAACTCT--TTTAGAAAAA-AATATTCTTTTGGGCAATTA----G--AT-AAGAC--AT-AATT--------AAATTTTTTCAAC-C-ACTAAGTTGGAAACACTA--------T-CC-TTTA
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|9 ): AAACACTAATGCTGATAATTTTTACAAAGGTCAGAGGTTTGTTCTACAAGTTAATCAATCTACTTTATTTTTCACCCTCGTTTTGATGATGCAACTAATTTGGAAAGCCCAAATCGCATCATTTCCCTATACAGCATCATAGTTACATCTACATGACATAAGCTATGCTATTGAAATGGGCATCAAGACAG
Unaligned ( gi|14 ): TACAAAGGTCAAAGGTTTGTTCTACAAGTTACCAGGTAATCAATCTACTTTATTTTTCACCCACATTGTGATGATGCAACTAATTTGGAAAGCCCAAATCGCATCATTTCCATATGCAGCATCGTTGCTGTAACAGCATGACATA
Unaligned ( gi|26 ): GTTAAAAGTAAGACAATTTAAAGACACCAATTTT
Alignments
lowQualScore : 111 1 1 11 11 1 1 111 1 11 1 111 1111 1111 11 333333333333 1111 2222222 111 222222222222 1111 222222 22 11 11 111 1 333333 222222 11 1 111 1 1 333333 11 1 111 33333333333 1 1 1 1 3333333 11 11 1 2222 111 2222 1111 111 2222 333333 1111 1111 11 222222222222 222 3333333 555555555555555 22222 111 1 11 111111111 444444444444444 1
lowQualScore : 0 777 5 6 33 22 0 44 0 3 66 777 3 8 6 1 44 8 0 8 66 0 11 0 6 6 0 777 4444 7777 88 11 0 1 1 0 888888888888 6 6 4444 6 5 0 1111111 777 6 777777777777 6 2 99 4444 000000 6 22 55 1 2 77 5 33 000 5 5 5 5 1 5 5 444444 5 222222 1 33 0 5 000 66 5 5 5 7 7 666666 33 1 5 6 000 5 66666666666 5 1 1 0 3 1 5 3 3333333 3 6 5 8 55 5 888 0 5 5 00 5 77 1 0 3333 000 5 5 77 5 5 0000 77 4444 5 8 000 66 8 5555 4 666 55 4 8888 8888 4 4 4 8888 4 4 4 5 555555 4 3 0000 5 0000 5 11 2 888 5 6 333333333333 4 7 4 4 4 4 444 4 4 1111111 4 0 4 6666666 4 0 333333333333333 4 55 55 22222 111 55 2 00 3 111111111 44 0 44 0 000000000000000 3 3 0 44 44 3 3 3
lowQualScore : . ... . . .. .. . .. . . .. ... . . . . .. . . . .. . .. . . . . ... .... .... .. .. . . . . ............ . . .... . . . ....... ... . ............ . . .. .... ...... . .. .. . . .. . .. ... . . . . . . . ...... . ...... . .. . . ... .. . . . . . ...... .. . . . ... . ........... . . . . . . . . ....... . . . . .. . ... . . . .. . .. . . .... ... . . .. . . .... .. .... . . ... .. . .... . ... .. . .... .... . . . .... . . . . ...... . . .... . .... . .. . ... . . ............ . . . . . . ... . . ....... . . . ....... . . ............... . .. .. ..... ... .. . .. . ......... .. . .. . ............... . . . .. .. . . .
lowQualScore : 6 888 4 0 88 22 0 22 0 2 88 555 2 0 0 4 66 0 8 0 44 8 00 6 7 7 8 444 8888 0000 88 00 8 0 0 8 333333333333 7 7 2222 7 7 7 7777777 777 7 333333333333 7 5 22 2222 333333 7 77 77 4 3 66 7 44 000 7 7 7 7 4 0 7 333333 7 333333 7 11 0 0 111 99 0 0 7 1 1 444444 66 4 7 6 111 7 66666666666 7 7 7 8 3 0 5 5 0000000 2 7 7 7 77 7 000 7 0 7 77 7 99 7 1 1111 000 0 0 44 7 0 7777 99 4444 0 9 000 11 9 4444 0 444 55 0 9999 5555 0 0 0 6666 4 4 4 3 333333 4 9 6666 0 6666 0 99 0 888 0 5 666666666666 4 3 6 0 0 0 222 0 0 1111111 0 9 7 6666666 0 8 666666666666666 0 55 55 55555 888 55 1 22 3 222222222 66 4 66 4 999999999999999 3 3 0 66 66 3 3 3
consensus : TAAAATGCCTCGCATAGCCAG-TAACATTTTGTGAATA-TATTGCTC--CAAATGCATC-TAANTGCTTAT-TAGAAAATAAATC---TTAAAATGTATT-TAAAG-CAATCATAT-TTTGCATTCA-AAAATATTTAACAGTAGGGA--GGTAAT-TTGG-TTACGGGACACTACG--AATAT---TT----GTA-ACTA--TTAAANGAAAACAAAAAATACTG-----------GACA-TCAA-TATCAGA----AC-AAATAGTGTATATC-TAACTGTGTAAAGATAAAAG-------GTATGCTTCACAAT-CATAAA-AA-----CAA----CTTGAATT-AAGGAAA--AAGC----TTACG---TNTTACG-TTTT-GCTAG--TTTCATACATATATATCGAAAGCNNTGACA-AGTTGT---TCT-G-C-AAA-TA-AATCTTTTTTG-CTTGAAT---A--TGTCAAA-TTT-C---GTGCACTTT-GT-TTTCAA-TT--ATCA-TTT-G-C-ATCTGATT-TCTAAC--G--TTCA--GA-AGTTT-ATGGAATGNT-TTTTTTTTCCACAA-CC-----A-----AGCCAAT-CTCAAATATCTTTAATTTTGGTAGTGTC-CGTAACTANATAAGGCTATGTTAA--CATTATTTCA-GAAAGTTTATGAAA-ATGAAAATTTC--CTAT-C-T-TAGTGGAAGTATTTTTGTTTCAA-CAAAGGCAT-AAAA-A--TGTTGTTTGTAAATGAAATTTCCTTCATCAAAATTGGTAT-T--AAGTGTTCATGTAATTTG---AAATACTGTC-CT-TTTTAA-CAAAAAT-TAC--C--A-GGTAA-G-AAATGTGTT-C-ATTTT--A-AAGTGTTACAAAACCTTTTCTAG-TC---AAAATTATGTCCA--T-ATTA-T--TG----T-AC-T-TT--CAATATGTTGTTTA-CTTTTG-AACAG-TTGAAAAANAAAT---A-GT-TTATTAACAGC----TT-T----CGA-TATT--TATTTCAAAGAAAGAAAC---AC-TTGTAGTGT-C-GC-----GTAAC-CTGTGAAAAATGA-GC-TT-ATTATC-AAG-CAT-GC------AAAAATA-TAAAGTTT--T--TAATCTGAATA-TCATAAAACCA-CTTA--T-ATGT--TTTGGTT-CC--TTTAGGTA--CT-----CT--ACTCT--TTAGAAAAAAAATA-TT-TTTTGGGCA---A----A--ATAAAGAC--ATCAATT--------A----TTTTC-AC-C-CCAAGT--GCAACACTA--CT-GTTC-CC-TTTATTGT
Reference ( family-3356 ) : TAAAATGCCTCGCATAGCCAG-TAACATTTTGTGAATA-TATTGCTC--CAAATGCATC-TAANTGCTTAT-TAGAAAATAAATC---TTAAAATGTATT-TAAAG-CAATCATAT-TTTGCATTCA-AAAATATTTAACAGTAGGGA--GGTAAT-TTGG-TTACGGGACACTACG--AATAT---TT----GTA-ACTA--TTAAANGAAAACAAAAAATACTG-----------GACA-TCAA-TATCAGA----AC-AAATAGTGTATATC-TAACTGTGTAAAGATAAAAG-------GTATGCTTCACAAT-CATAAA-AA-----CAA----CTTGAATT-AAGGAAA--AAGC----TTACG---TCTTACG-TTTT-GCTAG--TTTCATACATATATATCGAAAGCNNTGACA-AGTTGT---TCT-G-C-AAA-TA-AATCTTTTTTG-CTTGAAT---A--TGTCAAA-TTT-C---GTGCACTTTTGT-TTTCAA-TT--ATCA-TTT-G-C-ATCTGATT-TCTAAC--G--TTCA--GA-AGTTT-ANGGAATGNT-TTTTTTTTCCACAA-CC-----A-----AGCCAAT-CTCAAATATCTTTAATTTTGGTAGTGTC-CGTAACTANATAAGGCTATGTTAA--CATTATTTCA-GAAAGTTTATGAAA-ATGAAAATTTC--CTAT-C-T-TAGTGGAAGTATTTTTGTTTCAA-CAAAGGCAT-AAAA-A--TGTTGTTTGTAAATGAAATTTCCTTCATCAAAATTGGTAT-T--AAGTGTTCATGTAATTTG---AAATACTGTC-CT-TTTTAA-CAAAAAT-TAC--C--A-GGTAA-G-AAATGTGTT-C-ATTTT--A-AAGTGTTACAAAACCTTTTCTAG-TC---AAAATTATGTCCA--T-ATTA-T--TG----T-AC-T-TT--CAATATGTTGTTTA-CTTTTG-AACAG-TTGAAAAANAAAT---A-GT-TTATTAACAGC----TT-T----CGA-TATT--TATTTCAAAGAAAGAAAC---AC-TTGTAGTGT-C-GC-----GTAAC-CTGTGAAAAATGA-GC-TT-ATTATC-AAG-CAT-GC------AAAAATA-TAAAGTTT--T--TAATCTGAATA-TCATAAAACCA-CTTA--TTATGT--TTTGGTT-CC--TTTAGGTA--CT-----CT--ACTCT--TTAGAAAAAAAATA-TT-TTTTGGGCA---A----A--ATAAAGAC--ATCAATT--------A----TTTTC-AC-C-CCAAGT--GCAACACTA--CT-GTTC-CC-TTTATTGT
gi|1 : T-TTGG-TTACGAGACACTATC--AGCATGTCTT----GTA---TA--TTAAACG
gi|1 : tcatggtaagatacgcagaatatgtggttttccctgatcatcaccaactgttgcttcaaggtatcaatcacaaacgtggttacgacactacaaaattccttgtagatgtccgctaacctgtatttcatatcacgtttgaacgcagcctgtttttaaaaccactaactgctgaattattcttaccaaaggttcagggtttttctcacaagttaaatcaatcatggtctttattttttcacctcattttgatgatgcaacctaattgaaagcccaaatcgcatgcattaccatatacagcaatcaaactgttcacatcagccaatgactaagcaatgttattgcacccatgggcatctaaggacagagatggcccacagcatattttttcatatgaaagtccaacgttgttacacagtcgtaacaaaatctgtgcacgaaattttccaactaatttaagactaatttctccagtccCATAGCCAG-CTACATTCTGTG-ATACTATTGCTT--CAAATGATTCTTAAATGCTTAT-TAGAAAAT--ATCTTATTAAAATGTATT-TAAAGACAATCA-ATATTTGCTATCATCAAATAGTTAACAGTTAGGA--GG-AACATTAG-TT-CGGGACACTACGACAATA----TT----ATA-ACAACTCTATACGAAA--AAAAAATAT-------------GACA--CAA-TATCAGATTTGAT-AA--AG-GTATATC-TAAC-GT-TGAGAAT-------------TATGCTTCACAA--CATAAA-AAAAAACCCA----CTTGCATT-AA-GAAA--AAGCCAAGCTACAT--TCTTACG-TTTT-ACTAG--TTTCATAC-TACAGATTGAAAGCTTGGACATAG-TGT---ACT-GCC-AAA-TATAATTTTTTT----CTGAATTAAA--TGTCAAA-TTT-C---A-GCAC-TTAGTATTGCAA-CTTAATCATTTT-GCC-ATCTCACTATCTAACTTA--TTCA--GACAGTTgttcgaaaactttaaaactttatttttttctccaagaaagttccagaacaaagttcaaagcatgtttgtctattgacagattatggatggtatacgtgattattgccaaatcttttagatactactgtggttttgtttttcatatcgcagaataaagaaaaaaatatacttacacctacaacaatacatagaatggtgtcggggaaatttattaaggatcttccatagccagctacattctgtgatactattgcttcaaatgattcttaaatgcttattagaaaatatcttattaaaatgtatttaaagacaatcaatatttgctatcatcaaatagttaacagttaggaggaacattagttcgggacactacgacaatattataacaactctatacgaaaaaaaaatatgacacaatatcagatttgataaaggtatatctaacgttgagaattatgcttcacaacataaaaaaaaacccacttgcattaagaaaaagccaagctacattcttacgttttactagtttcatactacagattgaaagcttggacatagtgtactgccaaatataatttttttctgaattaaatgtcaaatttcagcacttagtattgcaacttaatcattttgccatctcactatctaacttattcagacagttatcgcggacgatgttagtattcaattatcatttgtatctgatttctaataattttaaagaagtttatggaatgttttttttccacaacccaaagccaatctcaaatatcttaattttgtagtgttcgtaactaaataaggctcagaaagtttatgaatataaaatttgctatcttaatggaattatttttgtttcaacagaggcataaaaatgttgtttctaaataaaatttccttcaataaaattggtataaaagtatttatgtaatttgaaatactgtcctatttttacaaaaatgcacctggtaagaaatttgttaattttaaggtgttacaaccttttctagtcaaaattatgtccatattatgtactttcatatgttgttaacttttggacagttgaaaaaaaaagtttattaacagctttcaattttagttcaaagaaagaaacacttgtagtgtccgtaacctgtgaaaatgaacttattatcagcatgcaaaatataaagttctaatctgaatatcataaaaccacttatgttctggttcctttaggtactctactctttagaaaaaataattttggggcaaaataaagacatcaatttttcacctcaagtgcaacactactgttctctttattgtgt
gi|1 : tcatggtaagatacgcagaatatgtggttttccctgatcatcaccaactgttgcttcaaggtatcaatcacaaacgtggttacgacactacaaaattccttgtagatgtccgctaacctgtatttcatatcacgtttgaacgcagcctgtttttaaaaccactaactgctgaattattcttaccaaaggttcagggtttttctcacaagttaaatcaatcatggtctttattttttcacctcattttgatgatgcaacctaattgaaagcccaaatcgcatgcattaccatatacagcaatcaaactgttcacatcagccaatgactaagcaatgttattgcacccatgggcatctaaggacagagatggcccacagcatattttttcatatgaaagtccaacgttgttacacagtcgtaacaaaatctgtgcacgaaattttccaactaatttaagactaatttctccagtcccgtttaatatacaagacatgctgatagtgtctcgtaaccaaagttcgaaaactttaaaactttatttttttctccaagaaagttccagaacaaagttcaaagcatgtttgtctattgacagattatggatggtatacgtgattattgccaaatcttttagatactactgtggttttgtttttcatatcgcagaataaagaaaaaaatatacttacacctacaacaatacatagaatggtgtcggggaaatttattaaggatcttcTTAGT-ATTCAA-TT--ATCA-TTT-G-T-ATCTGATT-TCTAAT--AATTTTAAAGA-AGTTT-ATGGAATG---TTTTTTTTCCACAA-CCCA---A-----AGCCAAT-CTCAAATATCTT-AATTTTG-TAGTGTT-CGTAACTAAATAAGGCT-----------------CA-GAAAGTTTATGAAT-AT-AAAATTTG--CTAT-C-T-TAATGGAATTATTTTTGTTTCAA-CAGAGGCAT-AAAA-A--TGTTGTTTCTAAATAAAATTTCCTTCAATAAAATTGGTATAA--AAGTATTTATGTAATTTG---AAATACTGTC-CTATTTTTA-CAAAAATGCAC--C--T-GGTAA-G-AAATTTGTT-A-ATTTT--A-AGGTGTTAC--AACCTTTTCTAG-TC---AAAATTATGTCCA--T-ATTA----TG----T-AC-T-TT--C-ATATGTTGTTAA-CTTTTG-GACAG-TTGAAAAAAAA-----A-GT-TTATTAACAGC----TT-T----CAA-T-TT--TAGTTCAAAGAAAGAAAC---AC-TTGTAGTGT-C--C-----GTAAC-CTGTG-AAAATGA-AC-TT-ATTATC--AG-CAT-GC-------AAAATA-TAAAG-TT--C--TAATCTGAATA-TCATAAAACCA-C-----TTATGT--TCTGGTT-CC--TTTAGGTA--CT-----CT--ACTCT--TTAG--AAAAAATA-AT-TTTGGGGCA---A----A--ATAAAGAC--ATCAAT--------------TTTTC-AC-C-TCAAGT--GCAACACTA--CT-GTTC-TC-TTTATTGTatcgcggacgatgttagtattcaattatcatttgtatctgatttctaataattttaaagaagtttatggaatgttttttttccacaacccaaagccaatctcaaatatcttaattttgtagtgttcgtaactaaataaggctcagaaagtttatgaatataaaatttgctatcttaatggaattatttttgtttcaacagaggcataaaaatgttgtttctaaataaaatttccttcaataaaattggtataaaagtatttatgtaatttgaaatactgtcctatttttacaaaaatgcacctggtaagaaatttgttaattttaaggtgttacaaccttttctagtcaaaattatgtccatattatgtactttcatatgttgttaacttttggacagttgaaaaaaaaagtttattaacagctttcaattttagttcaaagaaagaaacacttgtagtgtccgtaacctgtgaaaatgaacttattatcagcatgcaaaatataaagttctaatctgaatatcataaaaccacttatgttctggttcctttaggtactctactctttagaaaaaataattttggggcaaaataaagacatcaatttttcacctcaagtgcaacactactgttctctttattgtgt
gi|10 : tcatggtaagatacgcagaatatgtggttttccctgatcatcaccaactgttgcttcaaggtatcaatcacaaacgtggttacgacactacaaaattccttgtagatgtccgctaacctgtatttcatatcacgtttgaacgcagcctgtttttaaaaccactaactgctgaattattcttaccaaaggttcagggtttttctcacaagttaaatcaatcatggtctttattttttcacctcattttgatgatgcaacctaattgaaagcccaaatcgcatgcattaccatatacagcaatcaaactgttcacatcagccaatgactaagcaatgttattgcacccatgggcatctaaggacagagatggcccacagcatattttttcatatgaaagtccaacgttgttacacagtcgtaacaaaatctgtgcacgaaattttccaactaatttaagactaatttctccagtcccgtttaatatacaagacatgctgatagtgtctcgtaaccaaagttcgaaaactttaaaactttatttttttctccaagaaagttccagaacaaagttcaaagcatgtttgtctattgacagattatggatggtatacgtgattattgccaaatcttttagatactactgtggttttgtttttcatatcgcagaataaagaaaaaaatatacttacacctacaacaatacatagaatggtgtcggggaaatttattaaggatcttccatagccagctacattctgtgatactattgcttcaaatgattcttaaatgcttattagaaaatatcttattaaaatgtatttaaagacaatcaatatttgctatcatcaaatagttaacagttaggaggaacattagttcgggacactacgacaatattataacaactctatacgaaaaaaaaatatgacacaatatcagatttgataaaggtatatctaacgttgagaattatgcttcacaacataaaaaaaaacccacttgcattaagaaaaagccaagctacattcttacgttttactagtttcatactacagattgaaagcttggacatagtgtactgccaaatataatttttttctgaattaaatgtcaaatttcagcacttagtattgcaacttaatcattttgccatctcactatctaacttattcagacagttatcgcggacgatgC-CTGTGAAAA-TGA-GC-TC-ATTATC-A-G-CAT-G-------AAAAATA-TAAAGTTC--T---AATCTGAATA-TCATAAAACCA-CTTA--T---GT--TCTGGTT-CC--TTTAGGTA--CT-----CT--ATTCT--TTAGAAAAAAAA------TTTTGGGCA---A----A--ATAAAGAC--ATACAT--------------TTTTT-AC-C-CCAAGT--GCAACACTG--CT-GTTC-CC-TTgt
gi|11 : C---AAAATTATGTCCACAT-ATTA-GGATGAAACT-AC-T-TTTCCAATATGTTGTTTAACTTTTG-AACAA-TTGAATAACAAATC--ACGTATTATTGAAAG
gi|12 : gaGA-GC-TT-ATTATC-A-G-CATAGC------AAAA-TA-TA---CTT--T--TGAT-TGAATA-TCATAAAAC------A----ATGTAATTTGGTTGTT--TTTAGGCA--CT-----CT------T--TTAGAAAAAG--TA-TT-TTTTGGAC----A----A--ATAAA-AC--ATCAA----------A----TTTTC-AC-C-CGA--T--ACA--ACCA--CT-GTT--CC-TTTATTGtgtttatggtaatcctaacattcaatctattgaaataattaagcttcaagaaagtggaattttctatgagctt
gi|13 : AA-ATGAAA-TTTC--TTAT-C-C-TAGTGGAGGTATTTTTGTTTCAA-CAAAGGCATAAAAA-A--TG-TGTTTGTAAATGAAATTTCCTTAATCAAAATTGGTAT-GA-AAGTGTTCATGTAATTTG---AAGTACTGTCATT-TTTTAA-CAAAAAT-gtt
gi|15 : AAAATGCTTCGCATAGCCAG-T-ACATTTTGTG-ATA-TATatat
gi|16 : agaaattcttatagattaaggggtgtttttttcaccgcaagatataaaaaatattacttaaaaatataaagatacatagaatgtgtgggaatattatcGAAAACAAAAAATACTG------------ACA-TCAA-TATCTGA----AC-AAATAGTGTATATC-TAACTGTGTAAAAATAAAAG-------GTATGCTTCACAATGCAAAAA-AA-----C-A----CTTGAATT-AAGGAAA--AAGC----T
gi|17 : --TTTTATACACTTATATTGAAAGCTTTGA-A-ATGTGT---TCT-G-T-AAA-TA-AATCCATTTTG-CTTGATA---A--TGTCAACTTTT-C---ATGCA-TTTTGT-ATCCAA-GT--ATCA-TTT-
gi|18 : GTATATC-TAACTGTGTAAAGATAAAAGGTACATTGTATGCTTCACAAT--ATAAACAA-----C-A----TTTGAATT-ATTGAAA--AGGC----TTACG---TTTT----------CTAG--TTTCATACAT
gi|2 : TAAAATGTCTTACATAGCCAGGT--CATTTTGT--ATAATATGGCTTGTCAAATG--TC-TAAA-GCTTATGTAGAAA-TATCTC---TTAAA-TGTATTCTAAAGGCAATT-CAA-TTTGCATTCA-AT--TATT--ACAGTAGTGGTTGG--AT-TTGACTTACGAGCCAC-------ATAT---TCTTCGGTACACTA--C---AGAAAAATGTAAAATACTAATGTTAATTATGACACTCAAGTATCAGA----ATTAAATAGTGTATATCCTAACTGTTTGAGAAAAAAAG-------TTATGCTTCACAA--CATAGA-AA-----AAAACCCCTTGCATTTAAGAAAAGCAAGG----CTACCATCTCTTACGATTTC-CCTAG--TTTCA-ACATATATCTTGAAATCT-TGACA-AGT-GTACGTAT-G-C-AAAATAGAATCTTTTT-G-CT-GAAT---AATCGTCT---TTT-CA--GTG-ACTTA-GTATTGCAAGTT--ATCA-TTTTG-C--TCTGATT--CTAAA--G--T-CA--GATAGTTT-G----ATGGT-TTTTTTTTCCACAA--------------GGCCAATTCTCAAAT----TT--TTTTG-TAGTGTC-CGTAACTAAA-ATGGCTAGG--AA--CATTATT-CATGAAAGTTTATG-AT-CTG-AAATTTC--CCATGCAT-TAATGAAATTATTTTTGTTCAAG-CAGAGGCAT-AAAA-AAGTGTTGTCTTCTAAT-AAATTTCCTTCATTAGAAATAGTA--T--AAGAGTATATGTAA-TTG---AGAT-CTGTC-CT-TTTTAA-C-AAAAT-GAC--CT-T-TGTAA-GTAAATATTGT-A-ATTTTTAA-AGGTGTTACAATAC--TTTTTAGTTC---AAA--TATGT-CA--TAATTA----TG----T-CA-T-TT--CAATGCGTTA---A-C-TTTG-AACAGATTGAAAAATAAA----A-G--TTATTAACAGG----TTAT----CGATTATT--TA-TTCAGAAAGAGAAA----ACATTG-AGTGT-CGGC-----GTAAC-CTGTCAAA---GA-GC-TT-ACTAT--AAG-CA--GC-------AAAATAGTATAG--T--T--TAA--TGAATA-TCAT--AACCA-CCT------TAG--TTCGGTT-CC--TTT-GGTA--C------CT---CTCTTGTTAG--AAAAAATA--T-TTGTGGGCA---A----A--ATAAA-AC--ATCA-----------A----TTTTC-AC-C-CTCAGT--GCAGCACTA--CT-GTTCGCC-TTT-TTGT
gi|20 : gataagattctgagtgtccggtaacttatttggactcagtttgaaacgcagctgttttatataacactaagctttacattaaggtcattgtggtttattctacaatttatatactttatttttcacctctattttgagtgatgcataattgaagagccacgcacattcatactaactcatatatgctttacatcaagccatgacatagagtttgcatgacatggcttaaactatgaccatattatttcatattaagtgttattatcatcttgttacgtaattcaccaataagttccatcccttataaatcgtttaaatgttagttcacgtataccaaaggttaaaataaaatcttattttttctccaaggaaaattcaaatgtgttattgaattgatgtatgtagtgatatatcattaaattgcttagatttgtgtggggtttttttcttattgacaatagaaataaaattttacttaaaacctacaaatacatagatgtgggggaaattatAATA-AT-TTTTGGGCA---A----A--ATAAAGAC--ATCAATT--------------TTTC-AC-C-TCAAGT--GCAACACTA--CT-GTTC-CC-TTTATgt
gi|21 : AAAAAATA-AT-TTTTGGGCA---A----A--AT-----------------------------TTTC-AC-C-TCAAGT--GCAACACTA--CT-GTTC-CC-TTTATTGT
gi|22 : TAGT-TAAAG-CAATCATAT-TT-GCATTCA-AAA-TACTTAACAGTAGGGA--GGTAGT-TTGG-TTACGGgtt
gi|23 : AAAAATACTG------------ACA-TCAA-TATCAGA----AC-AAACAGTGTATATC-TGACTGTGTA
gi|24 : AACCTTTTCTAG-TC---AAAATTATGTCCA--T-ATGA----TG----T-AT-T-TT--CA
gi|25 : -AAATGTGTC-C-ATTTT--A-AAGTGTTAC--AACCTTTTCTAG-TC---
gi|3 : TAAAATGCCTCGCAGAGCCAG-TAATATCTTGTGAATG-TATTGCTC--CAAATACATC-TAACTGCTTAT-TAGAAAATAAATC---TTAAAATGTATT-TAAAG-CAAACATAT-TTTGCATTCA-AAAATGTTTAACAGTAGGGA--GGTAAT-TTGG-TTACGGGACACTACA--AATAT---TT----GTA-ACTA--TTAAAAGAAAACAAAAAATACTG-----------GACA-TCAA-TATCAGA----AC-AAATAGTGTATATC-TAACTGTGTAAAGATAAAAG-------GTATGCTTCACAAT-TATAAA-AA-----CAA----CTTGAATT-AAGGAAA--AAGC----TTACG---TA--ACG-TTTTGGCTAACCTTTCATACATATATATCGAAGGCAATGACA-AGTTGT---TCT-G-C-AAA-TA-AATCTTTTTTG-CTTGAAT------TGTCAAA-TTT-A---ATGCATTTTTGT-TTTCA---T--ATCA-TTT-G-CAATCTGGTTCTCTAA---G--TTCA--GA-AGTTT-AAAGAATGTT-TTTTTTTTCCACAA-CC-----A-----AGCCAAT-CTCAAATATTTTTAATTTTGGTAGTGTCGCGTAACTATA-AAGGCTATATTAAACTATTATTTCA-GAAAATTTATGAAA-ATGAAAATTTCATTTAT-C-T-TAGTGGAAGTA-TTTTGTTTCAA-CAAAGGCAT---AA-A--TGTTGTTTGTAAATGAAGTTTCCTT-ATCAAAATTGGTAT-T--AAGTGTTCATGTAATTTG---AAATAC-GTC-AT-TTTTAA-CAAAA---TAT--C--A-GGTAA-G-AAATGTGTT-C-ATTTT--ATAAGTGTTAAAAAACCTTTTCTAG-TC---AAAATTATGTCCA--T-ATTA-T--TG----T-AC-T-TT--CAATATGTTGTTTA-CTTTTG-AACAA-TTGAAAAATAAAT-----GT-TTATTAACAGC----TT-T----CAA-TATT--TATTTCATAGAAAGAAAC---AC-TTGTAGTGT-C-GC-----GTAAC-CTGTGAAAAATGA-GC-TA-ATTATCAAAG-CAT-GCCCAAAAAAAAATA-TAAAGTTT--T--TAATCTGAATA-TCATAAAACCA-TTTACTTTATGT--TTTGGTT-CC--TTTAGGAA--CT-----CT--ACTCT--TTAGAAAAAAAATATTT-TTTTGGGC---------A--ATAAAGAC--ATCAATTATTTCCACA----TTTTC-AC-C-TCAAGT--GCAACACTA--CT-GTTC-CC-GTTATTGT
gi|4 : TAAAATGCCTCGCAGAGCCAG-TAATATCTTGTGAATG-TATTGCTC--CAAATACATC-TAACTGCTTAT-TAGAAAATAAATC---TTAAAATGTATT-TAAAG-CAAACATAT-TTTGCATTCA-AAAATGTTTAACAGTAGGGA--GGTAAT-TTGG-TTACGGGACACTACA--AATAT---TT----GTA-ACTA--TTAAAAGAAAACAAAAAATACTG-----------GACA-TCAA-TATCAGA----AC-AAATAGTGTATATC-TAACTGTGTAAAGATAAAAG-------GTATGCTTCACAAT-TATAAA-AA-----CAA----CTTGAATT-AAGGAAA--AAGC----TTACG---TA--ACG-TTTTGGCTAACCTTTCATACATATATATCGAAGGCAATGACA-AGTTGT---TCT-G-C-AAA-TA-AATCTTTTTTG-CTTGAAT------TGTCAAA-TTT-A---ATGCATTTTTGT-TTTCA---T--ATCA-TTT-G-CAATCTGGTTCTCTAA---G--TTCA--GA-AGTTT-AAAGAATGTT-TTTTTTTTCCACAA-CC-----A-----AGCCAAT-CTCAAATATTTTTAATTTTGGTAGTGTCGCGTAACTATA-AAGGCTATATTAAACTATTATTTCA-GAAAATTTATGAAA-ATGAAAATTTCATTTAT-C-T-TAGTGGAAGTA-TTTTGTTTCAA-CAAAGGCAT---AA-A--TGTTGTTTGTAAATGAAGTTTCCTT-ATCAAAATTGGTAT-T--AAGTGTTCATGTAATTTG---AAATAC-GTC-AT-TTTTAA-CAAAA---TAT--C--A-GGTAA-G-AAATGTGTT-C-ATTTT--ATAAGTGTTAAAAAACCTTTTCTAG-TC---AAAATTATGTCCA--T-ATTA-T--TG----T-AC-T-TT--CAATATGTTGTTTA-CTTTTG-AACAA-TTGAAAAATAAAT-----GT-TTATTAACAGC----TT-T----CAA-TATT--TATTTCATAGAAAGAAAC---AC-TTGTAGTGT-C-GC-----GTAAC-CTGTGAAAAATGA-GC-TA-ATTATCAAAG-CAT-GCCCAAAAAAAAATA-TAAAGTTT--T--TAATCTGAATA-TCATAAAACCA-TTTACTTTATGT--TTTGGTT-CC--TTTAGGAA--CT-----CT--ACTCT--TTAGAAAAAAAATATTT-TTTTGGGC---------A--ATAAAGAC--ATCAATT--------A----TTTCC-ACAC-TCAAGT--GCAACACTATCCT-GTT--CC-GTTATT
gi|5 : ---TTTTACG-TTTT--CTAG--TTTCATACATAT----TGAAAGCAATGACA-AGT-GT---TCT-G-C-AAA-TA-AATCTTTTTTG-CTTGAAT---AA-TGTCAAA-TTTTC---ATGCACTTT-GT-TTTCAA-TT--ATCA-ATT-G-C-ATCTGATT-TCTAATA-G--TTAA--GA-AATTT-ATGGAATGTTGTTTTTTTTCCACAACCC-----ATGCATAGCCAAT-
gi|5 : atT-ATGGAATGGG-TTTTTTTTCCACAA-CCCATGCAT----AGCCAAT-CTCAAATATCTT-AATTTTGTT-GTGTC-CTTAACAAAATAAGGCTAT-TTGA--CATTATTTCA-GAAAATTTATGAAA-ATGAAA-TTTC--CT-------TAATGGAAGTATTTTTGTTTCAA-CAAAGGCAT-AAAAAA--TGTTGTTTGTAAATGAAATTTCCTTTATCAAAATTGGTAT-TA-AAGTGTTCATGTAATTTG---AAATACTGTC-TT-TTTTAA-CAAAAATGTAC--C--A-GGTAA-G-AAATGTGTT---------------------AAAACATTTTCTAG-TC---AAAATTATATCCA--T-ATTA----TG----T-AC-T-TT--C-ATATGTTGTTTA-CTTTTG-AACAG-TTGAAAAAAAAATAA-A-GT-TTATTAACACC----TT-T----CAA-TATT--TATTTCAAAGAAAGAAAC---GC-TTGTAGTGTCC-GTTATTAGTAAC-CTGTG-AAAATGA-GC-TT-ATTCTC----------------------------------------ATCTGAATA-TTATAAAACCA-CTTA----A-GT--TTTGGTT-CC--TTTAGGTA--CT-----CT--ACTCT--TTAG--AAAAAATA-TT-TTTTGGGCA---A----AATATAAAGAC--ATCAAT--------------TTTTC-AC-C-CCAAGT--GCAACACTA--CT-GTTC-CC-TTTATTGnatatggaatgggttttttttccacaacccatgcatagccaatctcaaatatcttaattttgttgtgtccttaacaaaataaggctatttgacattatttcagaaaatttatgaaaatgaaatttccttaatggaagtatttttgtttcaacaaaggcataaaaaatgttgtttgtaaatgaaatttcctttatcaaaattggtattaaagtgttcatgtaatttgaaatactgtcttttttaacaaaaatgtaccaggtaagaaatgtgttaaaacattttctagtcaaaattatatccatattatgtactttcatatgttgtttacttttgaacagttgaaaaaaaaataaagtttattaacacctttcaatatttatttcaaagaaagaaacgcttgtagtgtccgttattagtaacctgtgaaaatgagcttattctcatctgaatattataaaaccacttaagttttggttcctttaggtactctactctttagaaaaaatattttttgggcaaaatataaagacatcaatttttcaccccaagtgcaacactactgttccctttattg
gi|6 : atttttacgttttctagtttcatacatattgaaagcaatgacaagtgttctgcaaataaatcttttttgcttgaataatgtcaaattttcatgcactttgttttcaattatcaattgcatctgatttctaatagttaagaaatttatggaatgttgttttttttccacaacccatgcatagccaatnaATATATTGAA-GCTTTAACA-AGT-GT---ACTCG-CTAAA-TA-AATCTTTTTTGGCTTGAAT---AG-TGTCAAA-TTT-TCCAGTGCACTT--GT-TT-CAA-TT--ATCA-TTT-G-CCATCTGATT-TCTAATA-G--TTCAA-GA-AGTTTTATGGAATGGT-TTTTTTCGCCAACC-CC-----A-----AGCCA-T-CTCAAATGTCTTAATTTTTTGTAGTGTC-CGTAACTATATA-GGTTATG--AA--CATTATTTCA-GAAAGTTTATGAAATATGAAATTTTC--CTAT-C-TGTAATGGAATTCTTTTTGTTTCAAACAAAGCAAT-AAAA-A--TGTTGTT-GTAATAAAAATGTCCTTCATTAAAATTG-TAT-TCAAAGTGTTCATGTAATTTGGAAAAAT-CTGTC-CT-TTTTAAACAAAAAT--GC--C--ACAGTAA-GCAAATGTGTTTC-ATTTT--A-AAGAGTTTAACAACCTTTTCTCG-TCTCCCAGATTATGTATA--T-AGTA-T--AG----T-ACGTGTT--CAA-ATGTTGTTTA-CTTTTG-AACAG-TTGAAAAA--AATTTAA-GT-TTATTAACAGC----TT-T----CAA-TATT--TACTTCAA-GAAAGAAAC---AC-T-GTAGTGT-CAGT-----G-AAC-CTGTGAAAA-TGA-GCATT-AATATC-A-G-CAT-GC------AACAATA-TAAAGTTT--T--TAATCTGAATAATCATAAAACCAACTTA--T---GT--CTTGGTT-CCCTTTTAGGTAAACTG----CT--ACTCT--TTAGAAGAAATAT--TT-TTTTGGGCA---A----A--ATAAAGAC--ATCAAAT-------------TTTTC-AC-TGCCAAGT--GCAAAAATA--CTAGTTC-CCTTTTATTGT
gi|7 : aTTAA-CAAAAGTATACAGCTGA-GGTAA-G-AAATGTGTT-C-ATTTT--A-AAGTGTTACAA---CCTTGCTAG-TC---AATATTATGTCCA--T-ATTAGTA-TG----T-AC-T-TT--C-ATATGTTGCTTA-CTTTTG-AACAG-TTTAAAAAAAAATCA-A-GT-TTATGAACA-CTCTATT-T----CGA-TATTA-AATTTCAAAGAAAGAAGC---A--TTA-AAT-T-T-GA-----A-AAC-CAGTG-AAAATGA-GC-TTAATTATC--AG-CAT-GC-------AAAATA-TAAAGTTC--TAGTTATCTGGATA-TCATAAA---------------------TGGTT-CC--TTTAGGTA--CTGTGA-CTTAACTCT--TTAG-AAAAAAATA-TT-TTTTGGGCA---ATTAGA--ATAAAGACATATAAATT-------------TTTTC-AC-CACTAAGT--GGAACACT----T-ACTC-CC-TTTATTG
gi|8 : --A-GGTAAAG-AAATGTGTT-CCATTTT--A-AAGTGTTACAA---CCTTGCTAG-T----AAACTTATGTCCA----ATTA-G--TA----TGAC-T-TT----ATATGTTCTTAA-CTTTTGAAACAG-TTTAAAAAAATA----A-GT-TTA-GAACA-C----TC-TATTGTGA-TATTAAAATTTC-AAGACAGACATTAAAT-TTGAA----------------AACGCAGTGACAAATGAGGC-TT-ATTATC-ACGCCAT-GC------AAAAATA-TAAAGTCTAGT--T-ATCTGGATA-GCATAAA---------------------TGGTT-CC--TTTAGGTA--CTTGTGACTTAACTCT--TTTAGAAAAAAATA-TTCTTTTGGGCAATTA----G--AT-AAGAC--AT-AATT--------AAATTTTTTCAAC-CACTAAGTTGGAAACACTA--------T-CC-TTTA
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|9 ): AAACACTAATGCTGATAATTTTTACAAAGGTCAGAGGTTTGTTCTACAAGTTAATCAATCTACTTTATTTTTCACCCTCGTTTTGATGATGCAACTAATTTGGAAAGCCCAAATCGCATCATTTCCCTATACAGCATCATAGTTACATCTACATGACATAAGCTATGCTATTGAAATGGGCATCAAGACAG
Unaligned ( gi|14 ): TACAAAGGTCAAAGGTTTGTTCTACAAGTTACCAGGTAATCAATCTACTTTATTTTTCACCCACATTGTGATGATGCAACTAATTTGGAAAGCCCAAATCGCATCATTTCCATATGCAGCATCGTTGCTGTAACAGCATGACATA
Unaligned ( gi|19 ): TATGGTGTTTTTTCCCTGGTCATCACCACTGTGTTTCAGGTATCATCACAAATGTGGTTTAGGTTACGGACACTACAAAATCCTGTAGTGTC
Unaligned ( gi|26 ): GTTAAAAGTAAGACAATTTAAAGACACCAATTTT
Alignments
lowQualScore : 111 1 1 11 11 1 1 111 1 11 1 111 1111 1111 11 333333333333 1111 2222222 111 222222222222 1111 111 22 11 11 111 1 333333 222222 1 1 111 1 1 333333 11 1 111 33333333333 1 1 1 1 3333333 11 11 1 2222 111 2222 1111 111 2222 333333 1111 1111 11 222222222222 222 3333333 44444444444 22222 111 1 11 111111111 444444444444444 1
lowQualScore : 0 777 5 6 33 22 0 44 0 3 66 777 3 8 6 1 44 8 0 8 66 0 11 0 6 6 0 777 4444 7777 88 11 0 1 1 0 888888888888 6 6 4444 6 5 0 1111111 777 6 777777777777 6 2 99 4444 888 88 6 22 55 1 2 77 5 33 000 5 5 5 5 1 5 5 444444 5 222222 1 6 0 5 000 66 5 5 5 7 7 666666 33 1 5 5 000 5 66666666666 5 1 1 0 3 1 5 3 3333333 3 6 5 8 55 5 888 0 5 5 00 5 77 1 0 3333 000 5 5 77 5 5 0000 77 4444 5 8 000 66 8 5555 4 666 55 4 8888 8888 4 4 4 8888 4 4 4 5 555555 4 3 0000 5 0000 5 11 2 888 5 6 333333333333 4 7 4 4 4 4 444 4 4 1111111 4 0 4 6666666 4 0 55555555555 0 4 55 55 22222 111 55 2 00 3 111111111 44 0 44 0 000000000000000 3 3 0 44 44 3 3 3
lowQualScore : . ... . . .. .. . .. . . .. ... . . . . .. . . . .. . .. . . . . ... .... .... .. .. . . . . ............ . . .... . . . ....... ... . ............ . . .. .... ... .. . .. .. . . .. . .. ... . . . . . . . ...... . ...... . . . . ... .. . . . . . ...... .. . . . ... . ........... . . . . . . . . ....... . . . . .. . ... . . . .. . .. . . .... ... . . .. . . .... .. .... . . ... .. . .... . ... .. . .... .... . . . .... . . . . ...... . . .... . .... . .. . ... . . ............ . . . . . . ... . . ....... . . . ....... . . ........... . . .. .. ..... ... .. . .. . ......... .. . .. . ............... . . . .. .. . . .
lowQualScore : 6 888 4 0 88 22 0 22 0 2 88 555 2 0 0 4 66 0 8 0 44 8 00 6 7 7 8 444 8888 0000 88 00 8 0 0 8 333333333333 7 7 2222 7 7 7 7777777 777 7 333333333333 7 5 22 2222 333 33 7 77 77 4 3 66 7 44 000 7 7 7 7 4 0 7 333333 7 333333 4 9 0 0 111 99 0 0 7 1 1 444444 66 4 7 4 111 7 66666666666 7 7 7 8 3 0 5 5 0000000 2 7 7 7 77 7 000 7 0 7 77 7 99 7 1 1111 000 0 0 44 7 0 7777 99 4444 0 9 000 11 9 4444 0 444 55 0 9999 5555 0 0 0 6666 4 4 4 3 333333 4 9 6666 0 6666 0 99 0 888 0 5 666666666666 4 3 6 0 0 0 222 0 0 1111111 0 9 7 6666666 0 8 22222222222 8 0 55 55 55555 888 55 1 22 3 222222222 66 4 66 4 999999999999999 3 3 0 66 66 3 3 3
consensus : TAAAATGCCTCGCATAGCCAG-TAACATTTTGTGAATA-TATTGCTC--CAAATGCATC-TAANTGCTTAT-TAGAAAATAAATC---TTAAAATGTATT-TAAAG-CAATCATAT-TTTGCATTCA-AAAATATTTAACAGTAGGGA--GGTAAT-TTGG-TTACGGGACACTACG--AATAT---TT----GTA-ACTA--TTAAANGAAAACAAAAAATACTG-----------GACA-TCAA-TATCAGA----AC-AAATAGTGTATATC-TAACTGTGTAAAGATAAAAG-------GTATGCTTCACAAT-CATAAA-AA-----CAA----CTTGAATT-AAGGAAA--AAGC----TTACG---TNTTACG-TTTT-GCTAG--TTTCATACATATATATCGAAAGCNNTGACA-AGTTGT---TCT-G-C-AAA-TA-AATCTTTTTTG-CTTGAAT---A--TGTCAAA-TTT-C---GTGCA-CTTNGT-TTTCAA-TT--ATCA-TTT-G-C-ATCTGATT-TCTAAC--G--TTCA--GA-AGTTT-ATGGAATGNT-TTTTTTTTCCACAA-CC-----A-----AGCCAAT-CTCAAATATCTTTAATTTTGGTAGTGTC-CGTAACTANATAAGGCTATGTTAA--CATTATTTCA-GAAAGTTTATGAAA-ATGAAAATTTC--CTAT-C-T-TAGTGGAAGTATTTTTGTTTCAA-CAAAGGCAT-AAAA-A--TGTTGTTTGTAAATGAAATTTCCTTCATCAAAATTGGTAT-T--AAGTGTTCATGTAATTTG---AAATACTGTC-CT-TTTTAA-CAAAAAT-TAC--C--A-GGTAA-G-AAATGTGTT-C-ATTTT--A-AAGTGTTACAAAACCTTTTCTAG-TC---AAAATTATGTCCA--T-ATTA-T--TG----T-AC-T-TT--CAATATGTTGTTTA-CTTTTG-AACAG-TTGAAAAANAAAT---A-GT-TTATTAACAGC----TT-T----CGA-TATT--TATTTCAAAGAAAGAAAC---AC-TTGTAGTGT-C-GC-----GTAAC-CTGTGAAAAATGA-GC-TT-ATTATC-AAG-CAT-GC------AAAAATA-TAAAGTTT--T--TAATCTGAATA-TCATAAAACCA-CTTA---TATGTTTTGGTT-CC--TTTAGGTA--CT-----CT--ACTCT--TTAGAAAAAAAATA-TT-TTTTGGGCA---A----A--ATAAAGAC--ATCAATT--------A----TTTTC-AC-C-CCAAGT--GCAACACTA--CT-GTTC-CC-TTTATTGT
Reference ( family-3356 ) : TAAAATGCCTCGCATAGCCAG-TAACATTTTGTGAATA-TATTGCTC--CAAATGCATC-TAANTGCTTAT-TAGAAAATAAATC---TTAAAATGTATT-TAAAG-CAATCATAT-TTTGCATTCA-AAAATATTTAACAGTAGGGA--GGTAAT-TTGG-TTACGGGACACTACG--AATAT---TT----GTA-ACTA--TTAAANGAAAACAAAAAATACTG-----------GACA-TCAA-TATCAGA----AC-AAATAGTGTATATC-TAACTGTGTAAAGATAAAAG-------GTATGCTTCACAAT-CATAAA-AA-----CAA----CTTGAATT-AAGGAAA--AAGC----TTACG---TNTTACG-TTTT-GCTAG--TTTCATACATATATATCGAAAGCNNTGACA-AGTTGT---TCT-G-C-AAA-TA-AATCTTTTTTG-CTTGAAT---A--TGTCAAA-TTT-C---GTGCA-CTTTGT-TTTCAA-TT--ATCA-TTT-G-C-ATCTGATT-TCTAAC--G--TTCA--GA-AGTTT-ATGGAATGNT-TTTTTTTTCCACAA-CC-----A-----AGCCAAT-CTCAAATATCTTTAATTTTGGTAGTGTC-CGTAACTANATAAGGCTATGTTAA--CATTATTTCA-GAAAGTTTATGAAA-ATGAAAATTTC--CTAT-C-T-TAGTGGAAGTATTTTTGTTTCAA-CAAAGGCAT-AAAA-A--TGTTGTTTGTAAATGAAATTTCCTTCATCAAAATTGGTAT-T--AAGTGTTCATGTAATTTG---AAATACTGTC-CT-TTTTAA-CAAAAAT-TAC--C--A-GGTAA-G-AAATGTGTT-C-ATTTT--A-AAGTGTTACAAAACCTTTTCTAG-TC---AAAATTATGTCCA--T-ATTA-T--TG----T-AC-T-TT--CAATATGTTGTTTA-CTTTTG-AACAG-TTGAAAAANAAAT---A-GT-TTATTAACAGC----TT-T----CGA-TATT--TATTTCAAAGAAAGAAAC---AC-TTGTAGTGT-C-GC-----GTAAC-CTGTGAAAAATGA-GC-TT-ATTATC-AAG-CAT-GC------AAAAATA-TAAAGTTT--T--TAATCTGAATA-TCATAAAACCA-CTTA---TATGTTTTGGTT-CC--TTTAGGTA--CT-----CT--ACTCT--TTAGAAAAAAAATA-TT-TTTTGGGCA---A----A--ATAAAGAC--ATCAATT--------A----TTTTC-AC-C-CCAAGT--GCAACACTA--CT-GTTC-CC-TTTATTGT
gi|1 : T-TTGG-TTACGAGACACTATC--AGCATGTCTT----GTA---TA--TTAAACG
gi|1 : tcatggtaagatacgcagaatatgtggttttccctgatcatcaccaactgttgcttcaaggtatcaatcacaaacgtggttacgacactacaaaattccttgtagatgtccgctaacctgtatttcatatcacgtttgaacgcagcctgtttttaaaaccactaactgctgaattattcttaccaaaggttcagggtttttctcacaagttaaatcaatcatggtctttattttttcacctcattttgatgatgcaacctaattgaaagcccaaatcgcatgcattaccatatacagcaatcaaactgttcacatcagccaatgactaagcaatgttattgcacccatgggcatctaaggacagagatggcccacagcatattttttcatatgaaagtccaacgttgttacacagtcgtaacaaaatctgtgcacgaaattttccaactaatttaagactaatttctccagtccCATAGCCAG-CTACATTCTGTG-ATACTATTGCTT--CAAATGATTCTTAAATGCTTAT-TAGAAAAT--ATCTTATTAAAATGTATT-TAAAGACAATCA-ATATTTGCTATCATCAAATAGTTAACAGTTAGGA--GG-AACATTAG-TT-CGGGACACTACGACAATA----TT----ATA-ACAACTCTATACGAAA--AAAAAATAT-------------GACA--CAA-TATCAGATTTGAT-AA--AG-GTATATC-TAAC-GT-TGAGAAT-------------TATGCTTCACAA--CATAAA-AAAAAACCCA----CTTGCATT-AA-GAAA--AAGCCAAGCTACAT--TCTTACG-TTTT-ACTAG--TTTCATAC-TACAGATTGAAAGCTTGGACATAG-TGT---ACT-GCC-AAA-TATAATTTTTTT----CTGAATTAAA--TGTCAAA-TTT-C---A-GCA-CTTAGTATTGCAA-CTTAATCATTTT-GCC-ATCTCACTATCTAACTTA--TTCA--GACAGTTgttcgaaaactttaaaactttatttttttctccaagaaagttccagaacaaagttcaaagcatgtttgtctattgacagattatggatggtatacgtgattattgccaaatcttttagatactactgtggttttgtttttcatatcgcagaataaagaaaaaaatatacttacacctacaacaatacatagaatggtgtcggggaaatttattaaggatcttccatagccagctacattctgtgatactattgcttcaaatgattcttaaatgcttattagaaaatatcttattaaaatgtatttaaagacaatcaatatttgctatcatcaaatagttaacagttaggaggaacattagttcgggacactacgacaatattataacaactctatacgaaaaaaaaatatgacacaatatcagatttgataaaggtatatctaacgttgagaattatgcttcacaacataaaaaaaaacccacttgcattaagaaaaagccaagctacattcttacgttttactagtttcatactacagattgaaagcttggacatagtgtactgccaaatataatttttttctgaattaaatgtcaaatttcagcacttagtattgcaacttaatcattttgccatctcactatctaacttattcagacagttatcgcggacgatgttagtattcaattatcatttgtatctgatttctaataattttaaagaagtttatggaatgttttttttccacaacccaaagccaatctcaaatatcttaattttgtagtgttcgtaactaaataaggctcagaaagtttatgaatataaaatttgctatcttaatggaattatttttgtttcaacagaggcataaaaatgttgtttctaaataaaatttccttcaataaaattggtataaaagtatttatgtaatttgaaatactgtcctatttttacaaaaatgcacctggtaagaaatttgttaattttaaggtgttacaaccttttctagtcaaaattatgtccatattatgtactttcatatgttgttaacttttggacagttgaaaaaaaaagtttattaacagctttcaattttagttcaaagaaagaaacacttgtagtgtccgtaacctgtgaaaatgaacttattatcagcatgcaaaatataaagttctaatctgaatatcataaaaccacttatgttctggttcctttaggtactctactctttagaaaaaataattttggggcaaaataaagacatcaatttttcacctcaagtgcaacactactgttctctttattgtgt
gi|1 : tcatggtaagatacgcagaatatgtggttttccctgatcatcaccaactgttgcttcaaggtatcaatcacaaacgtggttacgacactacaaaattccttgtagatgtccgctaacctgtatttcatatcacgtttgaacgcagcctgtttttaaaaccactaactgctgaattattcttaccaaaggttcagggtttttctcacaagttaaatcaatcatggtctttattttttcacctcattttgatgatgcaacctaattgaaagcccaaatcgcatgcattaccatatacagcaatcaaactgttcacatcagccaatgactaagcaatgttattgcacccatgggcatctaaggacagagatggcccacagcatattttttcatatgaaagtccaacgttgttacacagtcgtaacaaaatctgtgcacgaaattttccaactaatttaagactaatttctccagtcccgtttaatatacaagacatgctgatagtgtctcgtaaccaaagttcgaaaactttaaaactttatttttttctccaagaaagttccagaacaaagttcaaagcatgtttgtctattgacagattatggatggtatacgtgattattgccaaatcttttagatactactgtggttttgtttttcatatcgcagaataaagaaaaaaatatacttacacctacaacaatacatagaatggtgtcggggaaatttattaaggatcttcTTAGT-ATTCAA-TT--ATCA-TTT-G-T-ATCTGATT-TCTAAT--AATTTTAAAGA-AGTTT-ATGGAATG---TTTTTTTTCCACAA-CCCA---A-----AGCCAAT-CTCAAATATCTT-AATTTTG-TAGTGTT-CGTAACTAAATAAGGCT-----------------CA-GAAAGTTTATGAAT-AT-AAAATTTG--CTAT-C-T-TAATGGAATTATTTTTGTTTCAA-CAGAGGCAT-AAAA-A--TGTTGTTTCTAAATAAAATTTCCTTCAATAAAATTGGTATAA--AAGTATTTATGTAATTTG---AAATACTGTC-CTATTTTTA-CAAAAATGCAC--C--T-GGTAA-G-AAATTTGTT-A-ATTTT--A-AGGTGTTAC--AACCTTTTCTAG-TC---AAAATTATGTCCA--T-ATTA----TG----T-AC-T-TT--C-ATATGTTGTTAA-CTTTTG-GACAG-TTGAAAAAAAA-----A-GT-TTATTAACAGC----TT-T----CAA-T-TT--TAGTTCAAAGAAAGAAAC---AC-TTGTAGTGT-C--C-----GTAAC-CTGTG-AAAATGA-AC-TT-ATTATC--AG-CAT-GC-------AAAATA-TAAAG-TT--C--TAATCTGAATA-TCATAAAACCA-CT-----TATGTTCTGGTT-CC--TTTAGGTA--CT-----CT--ACTCT--TTAG--AAAAAATA-AT-TTTGGGGCA---A----A--ATAAAGAC--ATCAAT--------------TTTTC-AC-C-TCAAGT--GCAACACTA--CT-GTTC-TC-TTTATTGTatcgcggacgatgttagtattcaattatcatttgtatctgatttctaataattttaaagaagtttatggaatgttttttttccacaacccaaagccaatctcaaatatcttaattttgtagtgttcgtaactaaataaggctcagaaagtttatgaatataaaatttgctatcttaatggaattatttttgtttcaacagaggcataaaaatgttgtttctaaataaaatttccttcaataaaattggtataaaagtatttatgtaatttgaaatactgtcctatttttacaaaaatgcacctggtaagaaatttgttaattttaaggtgttacaaccttttctagtcaaaattatgtccatattatgtactttcatatgttgttaacttttggacagttgaaaaaaaaagtttattaacagctttcaattttagttcaaagaaagaaacacttgtagtgtccgtaacctgtgaaaatgaacttattatcagcatgcaaaatataaagttctaatctgaatatcataaaaccacttatgttctggttcctttaggtactctactctttagaaaaaataattttggggcaaaataaagacatcaatttttcacctcaagtgcaacactactgttctctttattgtgt
gi|10 : tcatggtaagatacgcagaatatgtggttttccctgatcatcaccaactgttgcttcaaggtatcaatcacaaacgtggttacgacactacaaaattccttgtagatgtccgctaacctgtatttcatatcacgtttgaacgcagcctgtttttaaaaccactaactgctgaattattcttaccaaaggttcagggtttttctcacaagttaaatcaatcatggtctttattttttcacctcattttgatgatgcaacctaattgaaagcccaaatcgcatgcattaccatatacagcaatcaaactgttcacatcagccaatgactaagcaatgttattgcacccatgggcatctaaggacagagatggcccacagcatattttttcatatgaaagtccaacgttgttacacagtcgtaacaaaatctgtgcacgaaattttccaactaatttaagactaatttctccagtcccgtttaatatacaagacatgctgatagtgtctcgtaaccaaagttcgaaaactttaaaactttatttttttctccaagaaagttccagaacaaagttcaaagcatgtttgtctattgacagattatggatggtatacgtgattattgccaaatcttttagatactactgtggttttgtttttcatatcgcagaataaagaaaaaaatatacttacacctacaacaatacatagaatggtgtcggggaaatttattaaggatcttccatagccagctacattctgtgatactattgcttcaaatgattcttaaatgcttattagaaaatatcttattaaaatgtatttaaagacaatcaatatttgctatcatcaaatagttaacagttaggaggaacattagttcgggacactacgacaatattataacaactctatacgaaaaaaaaatatgacacaatatcagatttgataaaggtatatctaacgttgagaattatgcttcacaacataaaaaaaaacccacttgcattaagaaaaagccaagctacattcttacgttttactagtttcatactacagattgaaagcttggacatagtgtactgccaaatataatttttttctgaattaaatgtcaaatttcagcacttagtattgcaacttaatcattttgccatctcactatctaacttattcagacagttatcgcggacgatgC-CTGTGAAAA-TGA-GC-TC-ATTATC-A-G-CAT-G-------AAAAATA-TAAAGTTC--T---AATCTGAATA-TCATAAAACCA-CTTA---T--GTTCTGGTT-CC--TTTAGGTA--CT-----CT--ATTCT--TTAGAAAAAAAA------TTTTGGGCA---A----A--ATAAAGAC--ATACAT--------------TTTTT-AC-C-CCAAGT--GCAACACTG--CT-GTTC-CC-TTgt
gi|11 : C---AAAATTATGTCCACAT-ATTA-GGATGAAACT-AC-T-TTTCCAATATGTTGTTTAACTTTTG-AACAA-TTGAATAACAAATC--ACGTATTATTGAAAG
gi|12 : gaGA-GC-TT-ATTATC-A-G-CATAGC------AAAA-TA-TA---CTT--T--TGAT-TGAATA-TCATAAAAC-A----A---TGTAATTTGGTTGTT--TTTAGGCA--CT-----CT------T--TTAGAAAAAG--TA-TT-TTTTGGAC----A----A--ATAAA-AC--ATCAA----------A----TTTTC-AC-C-CGA--T--ACA--ACCA--CT-GTT--CC-TTTATTGtgtttatggtaatcctaacattcaatctattgaaataattaagcttcaagaaagtggaattttctatgagctt
gi|13 : AA-ATGAAA-TTTC--TTAT-C-C-TAGTGGAGGTATTTTTGTTTCAA-CAAAGGCATAAAAA-A--TG-TGTTTGTAAATGAAATTTCCTTAATCAAAATTGGTAT-GA-AAGTGTTCATGTAATTTG---AAGTACTGTCATT-TTTTAA-CAAAAAT-gtt
gi|15 : AAAATGCTTCGCATAGCCAG-T-ACATTTTGTG-ATA-TATatat
gi|16 : agaaattcttatagattaaggggtgtttttttcaccgcaagatataaaaaatattacttaaaaatataaagatacatagaatgtgtgggaatattatcGAAAACAAAAAATACTG------------ACA-TCAA-TATCTGA----AC-AAATAGTGTATATC-TAACTGTGTAAAAATAAAAG-------GTATGCTTCACAATGCAAAAA-AA-----C-A----CTTGAATT-AAGGAAA--AAGC----T
gi|17 : --TTTTATACACTTATATTGAAAGCTTTGA-A-ATGTGT---TCT-G-T-AAA-TA-AATCCATTTTG-CTTGATA---A--TGTCAACTTTT-C---ATGCA-TTTTGT-ATCCAA-GT--ATCA-TTT-
gi|18 : GTATATC-TAACTGTGTAAAGATAAAAGGTACATTGTATGCTTCACAAT--ATAAACAA-----C-A----TTTGAATT-ATTGAAA--AGGC----TTACG---TTTT----------CTAG--TTTCATACAT
gi|2 : TAAAATGTCTTACATAGCCAGGT--CATTTTGT--ATAATATGGCTTGTCAAATG--TC-TAAA-GCTTATGTAGAAA-TATCTC---TTAAA-TGTATTCTAAAGGCAATT-CAA-TTTGCATTCA-AT--TATT--ACAGTAGTGGTTGG--AT-TTGACTTACGAGCCAC-------ATAT---TCTTCGGTACACTA--C---AGAAAAATGTAAAATACTAATGTTAATTATGACACTCAAGTATCAGA----ATTAAATAGTGTATATCCTAACTGTTTGAGAAAAAAAG-------TTATGCTTCACAA--CATAGA-AA-----AAAACCCCTTGCATTTAAGAAAAGCAAGG----CTACCATCTCTTACGATTTC-CCTAG--TTTCA-ACATATATCTTGAAATCT-TGACA-AGT-GTACGTAT-G-C-AAAATAGAATCTTTTT-G-CT-GAAT---AATCGTCT---TTT-CA--GTG-A-CTTAGTATTGCAAGTT--ATCA-TTTTG-C--TCTGATT--CTAAA--G--T-CA--GATAGTTT-G----ATGGT-TTTTTTTTCCACAA--------------GGCCAATTCTCAAAT----TT--TTTTG-TAGTGTC-CGTAACTAAA-ATGGCTAGG--AA--CATTATT-CATGAAAGTTTATG-AT-CTG-AAATTTC--CCATGCAT-TAATGAAATTATTTTTGTTCAAG-CAGAGGCAT-AAAA-AAGTGTTGTCTTCTAAT-AAATTTCCTTCATTAGAAATAGTA--T--AAGAGTATATGTAA-TTG---AGAT-CTGTC-CT-TTTTAA-C-AAAAT-GAC--CT-T-TGTAA-GTAAATATTGT-A-ATTTTTAA-AGGTGTTACAATAC--TTTTTAGTTC---AAA--TATGT-CA--TAATTA----TG----T-CA-T-TT--CAATGCGTTA---A-C-TTTG-AACAGATTGAAAAATAAA----A-G--TTATTAACAGG----TTAT----CGATTATT--TA-TTCAGAAAGAGAAA----ACATTG-AGTGT-CGGC-----GTAAC-CTGTCAAA---GA-GC-TT-ACTAT--AAG-CA--GC-------AAAATAGTATAG--T--T--TAA--TGAATA-TCAT--AACCA-CCT------TAGTTCGGTT-CC--TTT-GGTA--C------CT---CTCTTGTTAG--AAAAAATA--T-TTGTGGGCA---A----A--ATAAA-AC--ATCA-----------A----TTTTC-AC-C-CTCAGT--GCAGCACTA--CT-GTTCGCC-TTT-TTGT
gi|20 : gataagattctgagtgtccggtaacttatttggactcagtttgaaacgcagctgttttatataacactaagctttacattaaggtcattgtggtttattctacaatttatatactttatttttcacctctattttgagtgatgcataattgaagagccacgcacattcatactaactcatatatgctttacatcaagccatgacatagagtttgcatgacatggcttaaactatgaccatattatttcatattaagtgttattatcatcttgttacgtaattcaccaataagttccatcccttataaatcgtttaaatgttagttcacgtataccaaaggttaaaataaaatcttattttttctccaaggaaaattcaaatgtgttattgaattgatgtatgtagtgatatatcattaaattgcttagatttgtgtggggtttttttcttattgacaatagaaataaaattttacttaaaacctacaaatacatagatgtgggggaaattatAATA-AT-TTTTGGGCA---A----A--ATAAAGAC--ATCAATT--------------TTTC-AC-C-TCAAGT--GCAACACTA--CT-GTTC-CC-TTTATgt
gi|21 : AAAAAATA-AT-TTTTGGGCA---A----A--AT-----------------------------TTTC-AC-C-TCAAGT--GCAACACTA--CT-GTTC-CC-TTTATTGT
gi|22 : TAGT-TAAAG-CAATCATAT-TT-GCATTCA-AAA-TACTTAACAGTAGGGA--GGTAGT-TTGG-TTACGGgtt
gi|23 : AAAAATACTG------------ACA-TCAA-TATCAGA----AC-AAACAGTGTATATC-TGACTGTGTA
gi|24 : AACCTTTTCTAG-TC---AAAATTATGTCCA--T-ATGA----TG----T-AT-T-TT--CA
gi|25 : -AAATGTGTC-C-ATTTT--A-AAGTGTTAC--AACCTTTTCTAG-TC---
gi|3 : TAAAATGCCTCGCAGAGCCAG-TAATATCTTGTGAATG-TATTGCTC--CAAATACATC-TAACTGCTTAT-TAGAAAATAAATC---TTAAAATGTATT-TAAAG-CAAACATAT-TTTGCATTCA-AAAATGTTTAACAGTAGGGA--GGTAAT-TTGG-TTACGGGACACTACA--AATAT---TT----GTA-ACTA--TTAAAAGAAAACAAAAAATACTG-----------GACA-TCAA-TATCAGA----AC-AAATAGTGTATATC-TAACTGTGTAAAGATAAAAG-------GTATGCTTCACAAT-TATAAA-AA-----CAA----CTTGAATT-AAGGAAA--AAGC----TTACG---TA--ACG-TTTTGGCTAACCTTTCATACATATATATCGAAGGCAATGACA-AGTTGT---TCT-G-C-AAA-TA-AATCTTTTTTG-CTTGAAT------TGTCAAA-TTT-A---ATGCATTTTTGT-TTTCA---T--ATCA-TTT-G-CAATCTGGTTCTCTAA---G--TTCA--GA-AGTTT-AAAGAATGTT-TTTTTTTTCCACAA-CC-----A-----AGCCAAT-CTCAAATATTTTTAATTTTGGTAGTGTCGCGTAACTATA-AAGGCTATATTAAACTATTATTTCA-GAAAATTTATGAAA-ATGAAAATTTCATTTAT-C-T-TAGTGGAAGTA-TTTTGTTTCAA-CAAAGGCAT---AA-A--TGTTGTTTGTAAATGAAGTTTCCTT-ATCAAAATTGGTAT-T--AAGTGTTCATGTAATTTG---AAATAC-GTC-AT-TTTTAA-CAAAA---TAT--C--A-GGTAA-G-AAATGTGTT-C-ATTTT--ATAAGTGTTAAAAAACCTTTTCTAG-TC---AAAATTATGTCCA--T-ATTA-T--TG----T-AC-T-TT--CAATATGTTGTTTA-CTTTTG-AACAA-TTGAAAAATAAAT-----GT-TTATTAACAGC----TT-T----CAA-TATT--TATTTCATAGAAAGAAAC---AC-TTGTAGTGT-C-GC-----GTAAC-CTGTGAAAAATGA-GC-TA-ATTATCAAAG-CAT-GCCCAAAAAAAAATA-TAAAGTTT--T--TAATCTGAATA-TCATAAAACCA-TTTACTTTATGTTTTGGTT-CC--TTTAGGAA--CT-----CT--ACTCT--TTAGAAAAAAAATATTT-TTTTGGGC---------A--ATAAAGAC--ATCAATTATTTCCACA----TTTTC-AC-C-TCAAGT--GCAACACTA--CT-GTTC-CC-GTTATTGT
gi|4 : TAAAATGCCTCGCAGAGCCAG-TAATATCTTGTGAATG-TATTGCTC--CAAATACATC-TAACTGCTTAT-TAGAAAATAAATC---TTAAAATGTATT-TAAAG-CAAACATAT-TTTGCATTCA-AAAATGTTTAACAGTAGGGA--GGTAAT-TTGG-TTACGGGACACTACA--AATAT---TT----GTA-ACTA--TTAAAAGAAAACAAAAAATACTG-----------GACA-TCAA-TATCAGA----AC-AAATAGTGTATATC-TAACTGTGTAAAGATAAAAG-------GTATGCTTCACAAT-TATAAA-AA-----CAA----CTTGAATT-AAGGAAA--AAGC----TTACG---TA--ACG-TTTTGGCTAACCTTTCATACATATATATCGAAGGCAATGACA-AGTTGT---TCT-G-C-AAA-TA-AATCTTTTTTG-CTTGAAT------TGTCAAA-TTT-A---ATGCATTTTTGT-TTTCA---T--ATCA-TTT-G-CAATCTGGTTCTCTAA---G--TTCA--GA-AGTTT-AAAGAATGTT-TTTTTTTTCCACAA-CC-----A-----AGCCAAT-CTCAAATATTTTTAATTTTGGTAGTGTCGCGTAACTATA-AAGGCTATATTAAACTATTATTTCA-GAAAATTTATGAAA-ATGAAAATTTCATTTAT-C-T-TAGTGGAAGTA-TTTTGTTTCAA-CAAAGGCAT---AA-A--TGTTGTTTGTAAATGAAGTTTCCTT-ATCAAAATTGGTAT-T--AAGTGTTCATGTAATTTG---AAATAC-GTC-AT-TTTTAA-CAAAA---TAT--C--A-GGTAA-G-AAATGTGTT-C-ATTTT--ATAAGTGTTAAAAAACCTTTTCTAG-TC---AAAATTATGTCCA--T-ATTA-T--TG----T-AC-T-TT--CAATATGTTGTTTA-CTTTTG-AACAA-TTGAAAAATAAAT-----GT-TTATTAACAGC----TT-T----CAA-TATT--TATTTCATAGAAAGAAAC---AC-TTGTAGTGT-C-GC-----GTAAC-CTGTGAAAAATGA-GC-TA-ATTATCAAAG-CAT-GCCCAAAAAAAAATA-TAAAGTTT--T--TAATCTGAATA-TCATAAAACCA-TTTACTTTATGTTTTGGTT-CC--TTTAGGAA--CT-----CT--ACTCT--TTAGAAAAAAAATATTT-TTTTGGGC---------A--ATAAAGAC--ATCAATT--------A----TTTCC-ACAC-TCAAGT--GCAACACTATCCT-GTT--CC-GTTATT
gi|5 : ---TTTTACG-TTTT--CTAG--TTTCATACATAT----TGAAAGCAATGACA-AGT-GT---TCT-G-C-AAA-TA-AATCTTTTTTG-CTTGAAT---AA-TGTCAAA-TTTTC---ATGCA-CTTTGT-TTTCAA-TT--ATCA-ATT-G-C-ATCTGATT-TCTAATA-G--TTAA--GA-AATTT-ATGGAATGTTGTTTTTTTTCCACAACCC-----ATGCATAGCCAAT-
gi|5 : atT-ATGGAATGGG-TTTTTTTTCCACAA-CCCATGCAT----AGCCAAT-CTCAAATATCTT-AATTTTGTT-GTGTC-CTTAACAAAATAAGGCTAT-TTGA--CATTATTTCA-GAAAATTTATGAAA-ATGAAA-TTTC--CT-------TAATGGAAGTATTTTTGTTTCAA-CAAAGGCAT-AAAAAA--TGTTGTTTGTAAATGAAATTTCCTTTATCAAAATTGGTAT-TA-AAGTGTTCATGTAATTTG---AAATACTGTC-TT-TTTTAA-CAAAAATGTAC--C--A-GGTAA-G-AAATGTGTT---------------------AAAACATTTTCTAG-TC---AAAATTATATCCA--T-ATTA----TG----T-AC-T-TT--C-ATATGTTGTTTA-CTTTTG-AACAG-TTGAAAAAAAAATAA-A-GT-TTATTAACACC----TT-T----CAA-TATT--TATTTCAAAGAAAGAAAC---GC-TTGTAGTGTCC-GTTATTAGTAAC-CTGTG-AAAATGA-GC-TT-ATTCTC----------------------------------------ATCTGAATA-TTATAAAACCA-CTTA----A-GTTTTGGTT-CC--TTTAGGTA--CT-----CT--ACTCT--TTAG--AAAAAATA-TT-TTTTGGGCA---A----AATATAAAGAC--ATCAAT--------------TTTTC-AC-C-CCAAGT--GCAACACTA--CT-GTTC-CC-TTTATTGnatatggaatgggttttttttccacaacccatgcatagccaatctcaaatatcttaattttgttgtgtccttaacaaaataaggctatttgacattatttcagaaaatttatgaaaatgaaatttccttaatggaagtatttttgtttcaacaaaggcataaaaaatgttgtttgtaaatgaaatttcctttatcaaaattggtattaaagtgttcatgtaatttgaaatactgtcttttttaacaaaaatgtaccaggtaagaaatgtgttaaaacattttctagtcaaaattatatccatattatgtactttcatatgttgtttacttttgaacagttgaaaaaaaaataaagtttattaacacctttcaatatttatttcaaagaaagaaacgcttgtagtgtccgttattagtaacctgtgaaaatgagcttattctcatctgaatattataaaaccacttaagttttggttcctttaggtactctactctttagaaaaaatattttttgggcaaaatataaagacatcaatttttcaccccaagtgcaacactactgttccctttattg
gi|6 : atttttacgttttctagtttcatacatattgaaagcaatgacaagtgttctgcaaataaatcttttttgcttgaataatgtcaaattttcatgcactttgttttcaattatcaattgcatctgatttctaatagttaagaaatttatggaatgttgttttttttccacaacccatgcatagccaatnaATATATTGAA-GCTTTAACA-AGT-GT---ACTCG-CTAAA-TA-AATCTTTTTTGGCTTGAAT---AG-TGTCAAA-TTT-TCCAGTGCA-CTT-GT-TT-CAA-TT--ATCA-TTT-G-CCATCTGATT-TCTAATA-G--TTCAA-GA-AGTTTTATGGAATGGT-TTTTTTCGCCAACC-CC-----A-----AGCCA-T-CTCAAATGTCTTAATTTTTTGTAGTGTC-CGTAACTATATA-GGTTATG--AA--CATTATTTCA-GAAAGTTTATGAAATATGAAATTTTC--CTAT-C-TGTAATGGAATTCTTTTTGTTTCAAACAAAGCAAT-AAAA-A--TGTTGTT-GTAATAAAAATGTCCTTCATTAAAATTG-TAT-TCAAAGTGTTCATGTAATTTGGAAAAAT-CTGTC-CT-TTTTAAACAAAAAT--GC--C--ACAGTAA-GCAAATGTGTTTC-ATTTT--A-AAGAGTTTAACAACCTTTTCTCG-TCTCCCAGATTATGTATA--T-AGTA-T--AG----T-ACGTGTT--CAA-ATGTTGTTTA-CTTTTG-AACAG-TTGAAAAA--AATTTAA-GT-TTATTAACAGC----TT-T----CAA-TATT--TACTTCAA-GAAAGAAAC---AC-T-GTAGTGT-CAGT-----G-AAC-CTGTGAAAA-TGA-GCATT-AATATC-A-G-CAT-GC------AACAATA-TAAAGTTT--T--TAATCTGAATAATCATAAAACCAACTTA---T--GTCTTGGTT-CCCTTTTAGGTAAACTG----CT--ACTCT--TTAGAAGAAATAT--TT-TTTTGGGCA---A----A--ATAAAGAC--ATCAAAT-------------TTTTC-AC-TGCCAAGT--GCAAAAATA--CTAGTTC-CCTTTTATTGT
gi|7 : aTTAA-CAAAAGTATACAGCTGA-GGTAA-G-AAATGTGTT-C-ATTTT--A-AAGTGTTACAA---CCTTGCTAG-TC---AATATTATGTCCA--T-ATTAGTA-TG----T-AC-T-TT--C-ATATGTTGCTTA-CTTTTG-AACAG-TTTAAAAAAAAATCA-A-GT-TTATGAACA-CTCTATT-T----CGA-TATTA-AATTTCAAAGAAAGAAGC---A--TTA-AAT-T-T-GA-----A-AAC-CAGTG-AAAATGA-GC-TTAATTATC--AG-CAT-GC-------AAAATA-TAAAGTTC--TAGTTATCTGGATA-TCATAAA-------------------TGGTT-CC--TTTAGGTA--CTGTGA-CTTAACTCT--TTAG-AAAAAAATA-TT-TTTTGGGCA---ATTAGA--ATAAAGACATATAAATT-------------TTTTC-AC-CACTAAGT--GGAACACT----T-ACTC-CC-TTTATTG
gi|8 : --A-GGTAAAG-AAATGTGTT-CCATTTT--A-AAGTGTTACAA---CCTTGCTAG-T----AAACTTATGTCCA----ATTA-G--TA----TGAC-T-TT----ATATGTTCTTAA-CTTTTGAAACAG-TTTAAAAAAATA----A-GT-TTA-GAACA-C----TC-TATTGTGA-TATTAAAATTTC-AAGACAGACATTAAAT-TTGAA----------------AACGCAGTGACAAATGAGGC-TT-ATTATC-ACGCCAT-GC------AAAAATA-TAAAGTCTAGT--T-ATCTGGATA-GCATAAA-------------------TGGTT-CC--TTTAGGTA--CTTGTGACTTAACTCT--TTTAGAAAAAAATA-TTCTTTTGGGCAATTA----G--AT-AAGAC--AT-AATT--------AAATTTTTTCAAC-CACTAAGTTGGAAACACTA--------T-CC-TTTA
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|9 ): AAACACTAATGCTGATAATTTTTACAAAGGTCAGAGGTTTGTTCTACAAGTTAATCAATCTACTTTATTTTTCACCCTCGTTTTGATGATGCAACTAATTTGGAAAGCCCAAATCGCATCATTTCCCTATACAGCATCATAGTTACATCTACATGACATAAGCTATGCTATTGAAATGGGCATCAAGACAG
Unaligned ( gi|14 ): TACAAAGGTCAAAGGTTTGTTCTACAAGTTACCAGGTAATCAATCTACTTTATTTTTCACCCACATTGTGATGATGCAACTAATTTGGAAAGCCCAAATCGCATCATTTCCATATGCAGCATCGTTGCTGTAACAGCATGACATA
Unaligned ( gi|19 ): TATGGTGTTTTTTCCCTGGTCATCACCACTGTGTTTCAGGTATCATCACAAATGTGGTTTAGGTTACGGACACTACAAAATCCTGTAGTGTC
Unaligned ( gi|26 ): GTTAAAAGTAAGACAATTTAAAGACACCAATTTT
Alignments
lowQualScore : 111 1 1 11 11 1 1 111 1 11 1 111 1111 1111 11 333333333333 1111 2222222 111 222222222222 1111 111 22 11 11 111 1 333333 222222 1 1 111 1 1 333333 11 1 111 33333333333 1 1 1 1 3333333 11 11 1 2222 111 2222 1111 111 2222 333333 1111 1111 11 222222222222 222 3333333 44444444444 22222 111 1 11 111111111 444444444444444 1
lowQualScore : 0 777 5 6 33 22 0 44 0 3 66 777 3 8 6 1 44 8 0 8 66 0 11 0 6 6 0 777 4444 7777 88 11 0 1 1 0 888888888888 6 6 4444 6 5 0 1111111 777 6 777777777777 6 2 99 4444 888 88 6 22 55 1 2 77 5 33 000 5 5 5 5 1 5 5 444444 5 222222 1 1 0 000 66 5 5 5 7 7 666666 33 1 5 5 000 5 66666666666 5 1 1 0 3 1 5 3 3333333 3 6 5 8 55 5 888 0 5 5 00 5 77 1 0 3333 000 5 5 77 5 5 0000 77 4444 5 8 000 66 8 5555 4 666 55 4 8888 8888 4 4 4 8888 4 4 4 5 555555 4 3 0000 5 0000 5 11 2 888 5 6 333333333333 4 7 4 4 4 4 444 4 4 1111111 4 0 4 6666666 4 0 55555555555 0 4 55 55 22222 111 55 2 00 3 111111111 44 0 44 0 000000000000000 3 3 0 44 44 3 3 3
lowQualScore : . ... . . .. .. . .. . . .. ... . . . . .. . . . .. . .. . . . . ... .... .... .. .. . . . . ............ . . .... . . . ....... ... . ............ . . .. .... ... .. . .. .. . . .. . .. ... . . . . . . . ...... . ...... . . . ... .. . . . . . ...... .. . . . ... . ........... . . . . . . . . ....... . . . . .. . ... . . . .. . .. . . .... ... . . .. . . .... .. .... . . ... .. . .... . ... .. . .... .... . . . .... . . . . ...... . . .... . .... . .. . ... . . ............ . . . . . . ... . . ....... . . . ....... . . ........... . . .. .. ..... ... .. . .. . ......... .. . .. . ............... . . . .. .. . . .
lowQualScore : 6 888 4 0 88 22 0 22 0 2 88 555 2 0 0 4 66 0 8 0 44 8 00 6 7 7 8 444 8888 0000 88 00 8 0 0 8 333333333333 7 7 2222 7 7 7 7777777 777 7 333333333333 7 5 22 2222 333 33 7 77 77 4 3 66 7 44 000 7 7 7 7 4 0 7 333333 7 333333 4 0 0 111 99 0 0 7 1 1 444444 66 4 7 4 111 7 66666666666 7 7 7 8 3 0 5 5 0000000 2 7 7 7 77 7 000 7 0 7 77 7 99 7 1 1111 000 0 0 44 7 0 7777 99 4444 0 9 000 11 9 4444 0 444 55 0 9999 5555 0 0 0 6666 4 4 4 3 333333 4 9 6666 0 6666 0 99 0 888 0 5 666666666666 4 3 6 0 0 0 222 0 0 1111111 0 9 7 6666666 0 8 22222222222 8 0 55 55 55555 888 55 1 22 3 222222222 66 4 66 4 999999999999999 3 3 0 66 66 3 3 3
consensus : TAAAATGCCTCGCATAGCCAG-TAACATTTTGTGAATA-TATTGCTC--CAAATGCATC-TAANTGCTTAT-TAGAAAATAAATC---TTAAAATGTATT-TAAAG-CAATCATAT-TTTGCATTCA-AAAATATTTAACAGTAGGGA--GGTAAT-TTGG-TTACGGGACACTACG--AATAT---TT----GTA-ACTA--TTAAANGAAAACAAAAAATACTG-----------GACA-TCAA-TATCAGA----AC-AAATAGTGTATATC-TAACTGTGTAAAGATAAAAG-------GTATGCTTCACAAT-CATAAA-AA-----CAA----CTTGAATT-AAGGAAA--AAGC----TTACG---TNTTACG-TTTT-GCTAG--TTTCATACATATATATCGAAAGCNNTGACA-AGTTGT---TCT-G-C-AAA-TA-AATCTTTTTTG-CTTGAAT---A--TGTCAAA-TTT-C---GTGCA-CTTNGT-TTTCAA-TT--ATCA-TTT-G-C-ATCTGATT-TCTAAC--G--TTCA--GA-AGTTT-ATGGAATGNT-TTTTTTTTCCACAA-CC-----A-----AGCCAAT-CTCAAATATCTTTAATTTTGGTAGTGTC-CGTAACTANATAAGGCTATGTTAA--CATTATTTCA-GAAAGTTTATGAAA-ATGAAAATTTC--CTAT-C-T-TAGTGGAAGTATTTTTGTTTCAA-CAAAGGCAT-AAAA-A--TGTTGTTTGTAAATGAAATTTCCTTCATCAAAATTGGTAT-T--AAGTGTTCATGTAATTTG---AAATACTGTC-CT-TTTTAA-CAAAAAT-TAC--C--A-GGTAA-G-AAATGTGTT-C-ATTTT--A-AAGTGTTACAAAACCTTTTCTAG-TC---AAAATTATGTCCA--T-ATTA-T--TG----T-AC-T-TT--CAATATGTTGTTTA-CTTTTG-AACAG-TTGAAAAANAAAT---A-GT-TTATTAACAGC----TT-T----CGA-TATT--TATTTCAAAGAAAGAAAC---AC-TTGTAGTGT-C-GC-----GTAAC-CTGTGAAAAATGA-GC-TT-ATTATC-AAG-CAT-GC------AAAAATA-TAAAGTTT--T--TAATCTGAATA-TCATAAAACCA-CTTA---TATGTTTTGGTT-CC--TTTAGGTA--CT-----CT--ACTCT--TTAGAAAAAAAATA-TT-TTTTGGGCA---A----A--ATAAAGAC--ATCAATT--------A----TTTTC-AC-C-CCAAGT--GCAACACTA--CT-GTTC-CC-TTTATTGT
Reference ( family-3356 ) : TAAAATGCCTCGCATAGCCAG-TAACATTTTGTGAATA-TATTGCTC--CAAATGCATC-TAANTGCTTAT-TAGAAAATAAATC---TTAAAATGTATT-TAAAG-CAATCATAT-TTTGCATTCA-AAAATATTTAACAGTAGGGA--GGTAAT-TTGG-TTACGGGACACTACG--AATAT---TT----GTA-ACTA--TTAAANGAAAACAAAAAATACTG-----------GACA-TCAA-TATCAGA----AC-AAATAGTGTATATC-TAACTGTGTAAAGATAAAAG-------GTATGCTTCACAAT-CATAAA-AA-----CAA----CTTGAATT-AAGGAAA--AAGC----TTACG---TNTTACG-TTTT-GCTAG--TTTCATACATATATATCGAAAGCNNTGACA-AGTTGT---TCT-G-C-AAA-TA-AATCTTTTTTG-CTTGAAT---A--TGTCAAA-TTT-C---GTGCA-CTTNGT-TTTCAA-TT--ATCA-TTT-G-C-ATCTGATT-TCTAAC--G--TTCA--GA-AGTTT-ATGGAATGNT-TTTTTTTTCCACAA-CC-----A-----AGCCAAT-CTCAAATATCTTTAATTTTGGTAGTGTC-CGTAACTANATAAGGCTATGTTAA--CATTATTTCA-GAAAGTTTATGAAA-ATGAAAATTTC--CTAT-C-T-TAGTGGAAGTATTTTTGTTTCAA-CAAAGGCAT-AAAA-A--TGTTGTTTGTAAATGAAATTTCCTTCATCAAAATTGGTAT-T--AAGTGTTCATGTAATTTG---AAATACTGTC-CT-TTTTAA-CAAAAAT-TAC--C--A-GGTAA-G-AAATGTGTT-C-ATTTT--A-AAGTGTTACAAAACCTTTTCTAG-TC---AAAATTATGTCCA--T-ATTA-T--TG----T-AC-T-TT--CAATATGTTGTTTA-CTTTTG-AACAG-TTGAAAAANAAAT---A-GT-TTATTAACAGC----TT-T----CGA-TATT--TATTTCAAAGAAAGAAAC---AC-TTGTAGTGT-C-GC-----GTAAC-CTGTGAAAAATGA-GC-TT-ATTATC-AAG-CAT-GC------AAAAATA-TAAAGTTT--T--TAATCTGAATA-TCATAAAACCA-CTTA---TATGTTTTGGTT-CC--TTTAGGTA--CT-----CT--ACTCT--TTAGAAAAAAAATA-TT-TTTTGGGCA---A----A--ATAAAGAC--ATCAATT--------A----TTTTC-AC-C-CCAAGT--GCAACACTA--CT-GTTC-CC-TTTATTGT
gi|1 : T-TTGG-TTACGAGACACTATC--AGCATGTCTT----GTA---TA--TTAAACG
gi|1 : tcatggtaagatacgcagaatatgtggttttccctgatcatcaccaactgttgcttcaaggtatcaatcacaaacgtggttacgacactacaaaattccttgtagatgtccgctaacctgtatttcatatcacgtttgaacgcagcctgtttttaaaaccactaactgctgaattattcttaccaaaggttcagggtttttctcacaagttaaatcaatcatggtctttattttttcacctcattttgatgatgcaacctaattgaaagcccaaatcgcatgcattaccatatacagcaatcaaactgttcacatcagccaatgactaagcaatgttattgcacccatgggcatctaaggacagagatggcccacagcatattttttcatatgaaagtccaacgttgttacacagtcgtaacaaaatctgtgcacgaaattttccaactaatttaagactaatttctccagtccCATAGCCAG-CTACATTCTGTG-ATACTATTGCTT--CAAATGATTCTTAAATGCTTAT-TAGAAAAT--ATCTTATTAAAATGTATT-TAAAGACAATCA-ATATTTGCTATCATCAAATAGTTAACAGTTAGGA--GG-AACATTAG-TT-CGGGACACTACGACAATA----TT----ATA-ACAACTCTATACGAAA--AAAAAATAT-------------GACA--CAA-TATCAGATTTGAT-AA--AG-GTATATC-TAAC-GT-TGAGAAT-------------TATGCTTCACAA--CATAAA-AAAAAACCCA----CTTGCATT-AA-GAAA--AAGCCAAGCTACAT--TCTTACG-TTTT-ACTAG--TTTCATAC-TACAGATTGAAAGCTTGGACATAG-TGT---ACT-GCC-AAA-TATAATTTTTTT----CTGAATTAAA--TGTCAAA-TTT-C---A-GCA-CTTAGTATTGCAA-CTTAATCATTTT-GCC-ATCTCACTATCTAACTTA--TTCA--GACAGTTgttcgaaaactttaaaactttatttttttctccaagaaagttccagaacaaagttcaaagcatgtttgtctattgacagattatggatggtatacgtgattattgccaaatcttttagatactactgtggttttgtttttcatatcgcagaataaagaaaaaaatatacttacacctacaacaatacatagaatggtgtcggggaaatttattaaggatcttccatagccagctacattctgtgatactattgcttcaaatgattcttaaatgcttattagaaaatatcttattaaaatgtatttaaagacaatcaatatttgctatcatcaaatagttaacagttaggaggaacattagttcgggacactacgacaatattataacaactctatacgaaaaaaaaatatgacacaatatcagatttgataaaggtatatctaacgttgagaattatgcttcacaacataaaaaaaaacccacttgcattaagaaaaagccaagctacattcttacgttttactagtttcatactacagattgaaagcttggacatagtgtactgccaaatataatttttttctgaattaaatgtcaaatttcagcacttagtattgcaacttaatcattttgccatctcactatctaacttattcagacagttatcgcggacgatgttagtattcaattatcatttgtatctgatttctaataattttaaagaagtttatggaatgttttttttccacaacccaaagccaatctcaaatatcttaattttgtagtgttcgtaactaaataaggctcagaaagtttatgaatataaaatttgctatcttaatggaattatttttgtttcaacagaggcataaaaatgttgtttctaaataaaatttccttcaataaaattggtataaaagtatttatgtaatttgaaatactgtcctatttttacaaaaatgcacctggtaagaaatttgttaattttaaggtgttacaaccttttctagtcaaaattatgtccatattatgtactttcatatgttgttaacttttggacagttgaaaaaaaaagtttattaacagctttcaattttagttcaaagaaagaaacacttgtagtgtccgtaacctgtgaaaatgaacttattatcagcatgcaaaatataaagttctaatctgaatatcataaaaccacttatgttctggttcctttaggtactctactctttagaaaaaataattttggggcaaaataaagacatcaatttttcacctcaagtgcaacactactgttctctttattgtgt
gi|1 : tcatggtaagatacgcagaatatgtggttttccctgatcatcaccaactgttgcttcaaggtatcaatcacaaacgtggttacgacactacaaaattccttgtagatgtccgctaacctgtatttcatatcacgtttgaacgcagcctgtttttaaaaccactaactgctgaattattcttaccaaaggttcagggtttttctcacaagttaaatcaatcatggtctttattttttcacctcattttgatgatgcaacctaattgaaagcccaaatcgcatgcattaccatatacagcaatcaaactgttcacatcagccaatgactaagcaatgttattgcacccatgggcatctaaggacagagatggcccacagcatattttttcatatgaaagtccaacgttgttacacagtcgtaacaaaatctgtgcacgaaattttccaactaatttaagactaatttctccagtcccgtttaatatacaagacatgctgatagtgtctcgtaaccaaagttcgaaaactttaaaactttatttttttctccaagaaagttccagaacaaagttcaaagcatgtttgtctattgacagattatggatggtatacgtgattattgccaaatcttttagatactactgtggttttgtttttcatatcgcagaataaagaaaaaaatatacttacacctacaacaatacatagaatggtgtcggggaaatttattaaggatcttcTTAGT-ATTCAA-TT--ATCA-TTT-G-T-ATCTGATT-TCTAAT--AATTTTAAAGA-AGTTT-ATGGAATG---TTTTTTTTCCACAA-CCCA---A-----AGCCAAT-CTCAAATATCTT-AATTTTG-TAGTGTT-CGTAACTAAATAAGGCT-----------------CA-GAAAGTTTATGAAT-AT-AAAATTTG--CTAT-C-T-TAATGGAATTATTTTTGTTTCAA-CAGAGGCAT-AAAA-A--TGTTGTTTCTAAATAAAATTTCCTTCAATAAAATTGGTATAA--AAGTATTTATGTAATTTG---AAATACTGTC-CTATTTTTA-CAAAAATGCAC--C--T-GGTAA-G-AAATTTGTT-A-ATTTT--A-AGGTGTTAC--AACCTTTTCTAG-TC---AAAATTATGTCCA--T-ATTA----TG----T-AC-T-TT--C-ATATGTTGTTAA-CTTTTG-GACAG-TTGAAAAAAAA-----A-GT-TTATTAACAGC----TT-T----CAA-T-TT--TAGTTCAAAGAAAGAAAC---AC-TTGTAGTGT-C--C-----GTAAC-CTGTG-AAAATGA-AC-TT-ATTATC--AG-CAT-GC-------AAAATA-TAAAG-TT--C--TAATCTGAATA-TCATAAAACCA-CT-----TATGTTCTGGTT-CC--TTTAGGTA--CT-----CT--ACTCT--TTAG--AAAAAATA-AT-TTTGGGGCA---A----A--ATAAAGAC--ATCAAT--------------TTTTC-AC-C-TCAAGT--GCAACACTA--CT-GTTC-TC-TTTATTGTatcgcggacgatgttagtattcaattatcatttgtatctgatttctaataattttaaagaagtttatggaatgttttttttccacaacccaaagccaatctcaaatatcttaattttgtagtgttcgtaactaaataaggctcagaaagtttatgaatataaaatttgctatcttaatggaattatttttgtttcaacagaggcataaaaatgttgtttctaaataaaatttccttcaataaaattggtataaaagtatttatgtaatttgaaatactgtcctatttttacaaaaatgcacctggtaagaaatttgttaattttaaggtgttacaaccttttctagtcaaaattatgtccatattatgtactttcatatgttgttaacttttggacagttgaaaaaaaaagtttattaacagctttcaattttagttcaaagaaagaaacacttgtagtgtccgtaacctgtgaaaatgaacttattatcagcatgcaaaatataaagttctaatctgaatatcataaaaccacttatgttctggttcctttaggtactctactctttagaaaaaataattttggggcaaaataaagacatcaatttttcacctcaagtgcaacactactgttctctttattgtgt
gi|10 : tcatggtaagatacgcagaatatgtggttttccctgatcatcaccaactgttgcttcaaggtatcaatcacaaacgtggttacgacactacaaaattccttgtagatgtccgctaacctgtatttcatatcacgtttgaacgcagcctgtttttaaaaccactaactgctgaattattcttaccaaaggttcagggtttttctcacaagttaaatcaatcatggtctttattttttcacctcattttgatgatgcaacctaattgaaagcccaaatcgcatgcattaccatatacagcaatcaaactgttcacatcagccaatgactaagcaatgttattgcacccatgggcatctaaggacagagatggcccacagcatattttttcatatgaaagtccaacgttgttacacagtcgtaacaaaatctgtgcacgaaattttccaactaatttaagactaatttctccagtcccgtttaatatacaagacatgctgatagtgtctcgtaaccaaagttcgaaaactttaaaactttatttttttctccaagaaagttccagaacaaagttcaaagcatgtttgtctattgacagattatggatggtatacgtgattattgccaaatcttttagatactactgtggttttgtttttcatatcgcagaataaagaaaaaaatatacttacacctacaacaatacatagaatggtgtcggggaaatttattaaggatcttccatagccagctacattctgtgatactattgcttcaaatgattcttaaatgcttattagaaaatatcttattaaaatgtatttaaagacaatcaatatttgctatcatcaaatagttaacagttaggaggaacattagttcgggacactacgacaatattataacaactctatacgaaaaaaaaatatgacacaatatcagatttgataaaggtatatctaacgttgagaattatgcttcacaacataaaaaaaaacccacttgcattaagaaaaagccaagctacattcttacgttttactagtttcatactacagattgaaagcttggacatagtgtactgccaaatataatttttttctgaattaaatgtcaaatttcagcacttagtattgcaacttaatcattttgccatctcactatctaacttattcagacagttatcgcggacgatgC-CTGTGAAAA-TGA-GC-TC-ATTATC-A-G-CAT-G-------AAAAATA-TAAAGTTC--T---AATCTGAATA-TCATAAAACCA-CTTA---T--GTTCTGGTT-CC--TTTAGGTA--CT-----CT--ATTCT--TTAGAAAAAAAA------TTTTGGGCA---A----A--ATAAAGAC--ATACAT--------------TTTTT-AC-C-CCAAGT--GCAACACTG--CT-GTTC-CC-TTgt
gi|11 : C---AAAATTATGTCCACAT-ATTA-GGATGAAACT-AC-T-TTTCCAATATGTTGTTTAACTTTTG-AACAA-TTGAATAACAAATC--ACGTATTATTGAAAG
gi|12 : gaGA-GC-TT-ATTATC-A-G-CATAGC------AAAA-TA-TA---CTT--T--TGAT-TGAATA-TCATAAAAC-A----A---TGTAATTTGGTTGTT--TTTAGGCA--CT-----CT------T--TTAGAAAAAG--TA-TT-TTTTGGAC----A----A--ATAAA-AC--ATCAA----------A----TTTTC-AC-C-CGA--T--ACA--ACCA--CT-GTT--CC-TTTATTGtgtttatggtaatcctaacattcaatctattgaaataattaagcttcaagaaagtggaattttctatgagctt
gi|13 : AA-ATGAAA-TTTC--TTAT-C-C-TAGTGGAGGTATTTTTGTTTCAA-CAAAGGCATAAAAA-A--TG-TGTTTGTAAATGAAATTTCCTTAATCAAAATTGGTAT-GA-AAGTGTTCATGTAATTTG---AAGTACTGTCATT-TTTTAA-CAAAAAT-gtt
gi|15 : AAAATGCTTCGCATAGCCAG-T-ACATTTTGTG-ATA-TATatat
gi|16 : agaaattcttatagattaaggggtgtttttttcaccgcaagatataaaaaatattacttaaaaatataaagatacatagaatgtgtgggaatattatcGAAAACAAAAAATACTG------------ACA-TCAA-TATCTGA----AC-AAATAGTGTATATC-TAACTGTGTAAAAATAAAAG-------GTATGCTTCACAATGCAAAAA-AA-----C-A----CTTGAATT-AAGGAAA--AAGC----T
gi|17 : --TTTTATACACTTATATTGAAAGCTTTGA-A-ATGTGT---TCT-G-T-AAA-TA-AATCCATTTTG-CTTGATA---A--TGTCAACTTTT-C---ATGCA-TTTTGT-ATCCAA-GT--ATCA-TTT-
gi|18 : GTATATC-TAACTGTGTAAAGATAAAAGGTACATTGTATGCTTCACAAT--ATAAACAA-----C-A----TTTGAATT-ATTGAAA--AGGC----TTACG---TTTT----------CTAG--TTTCATACAT
gi|2 : TAAAATGTCTTACATAGCCAGGT--CATTTTGT--ATAATATGGCTTGTCAAATG--TC-TAAA-GCTTATGTAGAAA-TATCTC---TTAAA-TGTATTCTAAAGGCAATT-CAA-TTTGCATTCA-AT--TATT--ACAGTAGTGGTTGG--AT-TTGACTTACGAGCCAC-------ATAT---TCTTCGGTACACTA--C---AGAAAAATGTAAAATACTAATGTTAATTATGACACTCAAGTATCAGA----ATTAAATAGTGTATATCCTAACTGTTTGAGAAAAAAAG-------TTATGCTTCACAA--CATAGA-AA-----AAAACCCCTTGCATTTAAGAAAAGCAAGG----CTACCATCTCTTACGATTTC-CCTAG--TTTCA-ACATATATCTTGAAATCT-TGACA-AGT-GTACGTAT-G-C-AAAATAGAATCTTTTT-G-CT-GAAT---AATCGTCT---TTT-CA--GTG-A-CTTAGTATTGCAAGTT--ATCA-TTTTG-C--TCTGATT--CTAAA--G--T-CA--GATAGTTT-G----ATGGT-TTTTTTTTCCACAA--------------GGCCAATTCTCAAAT----TT--TTTTG-TAGTGTC-CGTAACTAAA-ATGGCTAGG--AA--CATTATT-CATGAAAGTTTATG-AT-CTG-AAATTTC--CCATGCAT-TAATGAAATTATTTTTGTTCAAG-CAGAGGCAT-AAAA-AAGTGTTGTCTTCTAAT-AAATTTCCTTCATTAGAAATAGTA--T--AAGAGTATATGTAA-TTG---AGAT-CTGTC-CT-TTTTAA-C-AAAAT-GAC--CT-T-TGTAA-GTAAATATTGT-A-ATTTTTAA-AGGTGTTACAATAC--TTTTTAGTTC---AAA--TATGT-CA--TAATTA----TG----T-CA-T-TT--CAATGCGTTA---A-C-TTTG-AACAGATTGAAAAATAAA----A-G--TTATTAACAGG----TTAT----CGATTATT--TA-TTCAGAAAGAGAAA----ACATTG-AGTGT-CGGC-----GTAAC-CTGTCAAA---GA-GC-TT-ACTAT--AAG-CA--GC-------AAAATAGTATAG--T--T--TAA--TGAATA-TCAT--AACCA-CCT------TAGTTCGGTT-CC--TTT-GGTA--C------CT---CTCTTGTTAG--AAAAAATA--T-TTGTGGGCA---A----A--ATAAA-AC--ATCA-----------A----TTTTC-AC-C-CTCAGT--GCAGCACTA--CT-GTTCGCC-TTT-TTGT
gi|20 : gataagattctgagtgtccggtaacttatttggactcagtttgaaacgcagctgttttatataacactaagctttacattaaggtcattgtggtttattctacaatttatatactttatttttcacctctattttgagtgatgcataattgaagagccacgcacattcatactaactcatatatgctttacatcaagccatgacatagagtttgcatgacatggcttaaactatgaccatattatttcatattaagtgttattatcatcttgttacgtaattcaccaataagttccatcccttataaatcgtttaaatgttagttcacgtataccaaaggttaaaataaaatcttattttttctccaaggaaaattcaaatgtgttattgaattgatgtatgtagtgatatatcattaaattgcttagatttgtgtggggtttttttcttattgacaatagaaataaaattttacttaaaacctacaaatacatagatgtgggggaaattatAATA-AT-TTTTGGGCA---A----A--ATAAAGAC--ATCAATT--------------TTTC-AC-C-TCAAGT--GCAACACTA--CT-GTTC-CC-TTTATgt
gi|21 : AAAAAATA-AT-TTTTGGGCA---A----A--AT-----------------------------TTTC-AC-C-TCAAGT--GCAACACTA--CT-GTTC-CC-TTTATTGT
gi|22 : TAGT-TAAAG-CAATCATAT-TT-GCATTCA-AAA-TACTTAACAGTAGGGA--GGTAGT-TTGG-TTACGGgtt
gi|23 : AAAAATACTG------------ACA-TCAA-TATCAGA----AC-AAACAGTGTATATC-TGACTGTGTA
gi|24 : AACCTTTTCTAG-TC---AAAATTATGTCCA--T-ATGA----TG----T-AT-T-TT--CA
gi|25 : -AAATGTGTC-C-ATTTT--A-AAGTGTTAC--AACCTTTTCTAG-TC---
gi|3 : TAAAATGCCTCGCAGAGCCAG-TAATATCTTGTGAATG-TATTGCTC--CAAATACATC-TAACTGCTTAT-TAGAAAATAAATC---TTAAAATGTATT-TAAAG-CAAACATAT-TTTGCATTCA-AAAATGTTTAACAGTAGGGA--GGTAAT-TTGG-TTACGGGACACTACA--AATAT---TT----GTA-ACTA--TTAAAAGAAAACAAAAAATACTG-----------GACA-TCAA-TATCAGA----AC-AAATAGTGTATATC-TAACTGTGTAAAGATAAAAG-------GTATGCTTCACAAT-TATAAA-AA-----CAA----CTTGAATT-AAGGAAA--AAGC----TTACG---TA--ACG-TTTTGGCTAACCTTTCATACATATATATCGAAGGCAATGACA-AGTTGT---TCT-G-C-AAA-TA-AATCTTTTTTG-CTTGAAT------TGTCAAA-TTT-A---ATGCATTTTTGT-TTTCA---T--ATCA-TTT-G-CAATCTGGTTCTCTAA---G--TTCA--GA-AGTTT-AAAGAATGTT-TTTTTTTTCCACAA-CC-----A-----AGCCAAT-CTCAAATATTTTTAATTTTGGTAGTGTCGCGTAACTATA-AAGGCTATATTAAACTATTATTTCA-GAAAATTTATGAAA-ATGAAAATTTCATTTAT-C-T-TAGTGGAAGTA-TTTTGTTTCAA-CAAAGGCAT---AA-A--TGTTGTTTGTAAATGAAGTTTCCTT-ATCAAAATTGGTAT-T--AAGTGTTCATGTAATTTG---AAATAC-GTC-AT-TTTTAA-CAAAA---TAT--C--A-GGTAA-G-AAATGTGTT-C-ATTTT--ATAAGTGTTAAAAAACCTTTTCTAG-TC---AAAATTATGTCCA--T-ATTA-T--TG----T-AC-T-TT--CAATATGTTGTTTA-CTTTTG-AACAA-TTGAAAAATAAAT-----GT-TTATTAACAGC----TT-T----CAA-TATT--TATTTCATAGAAAGAAAC---AC-TTGTAGTGT-C-GC-----GTAAC-CTGTGAAAAATGA-GC-TA-ATTATCAAAG-CAT-GCCCAAAAAAAAATA-TAAAGTTT--T--TAATCTGAATA-TCATAAAACCA-TTTACTTTATGTTTTGGTT-CC--TTTAGGAA--CT-----CT--ACTCT--TTAGAAAAAAAATATTT-TTTTGGGC---------A--ATAAAGAC--ATCAATTATTTCCACA----TTTTC-AC-C-TCAAGT--GCAACACTA--CT-GTTC-CC-GTTATTGT
gi|4 : TAAAATGCCTCGCAGAGCCAG-TAATATCTTGTGAATG-TATTGCTC--CAAATACATC-TAACTGCTTAT-TAGAAAATAAATC---TTAAAATGTATT-TAAAG-CAAACATAT-TTTGCATTCA-AAAATGTTTAACAGTAGGGA--GGTAAT-TTGG-TTACGGGACACTACA--AATAT---TT----GTA-ACTA--TTAAAAGAAAACAAAAAATACTG-----------GACA-TCAA-TATCAGA----AC-AAATAGTGTATATC-TAACTGTGTAAAGATAAAAG-------GTATGCTTCACAAT-TATAAA-AA-----CAA----CTTGAATT-AAGGAAA--AAGC----TTACG---TA--ACG-TTTTGGCTAACCTTTCATACATATATATCGAAGGCAATGACA-AGTTGT---TCT-G-C-AAA-TA-AATCTTTTTTG-CTTGAAT------TGTCAAA-TTT-A---ATGCATTTTTGT-TTTCA---T--ATCA-TTT-G-CAATCTGGTTCTCTAA---G--TTCA--GA-AGTTT-AAAGAATGTT-TTTTTTTTCCACAA-CC-----A-----AGCCAAT-CTCAAATATTTTTAATTTTGGTAGTGTCGCGTAACTATA-AAGGCTATATTAAACTATTATTTCA-GAAAATTTATGAAA-ATGAAAATTTCATTTAT-C-T-TAGTGGAAGTA-TTTTGTTTCAA-CAAAGGCAT---AA-A--TGTTGTTTGTAAATGAAGTTTCCTT-ATCAAAATTGGTAT-T--AAGTGTTCATGTAATTTG---AAATAC-GTC-AT-TTTTAA-CAAAA---TAT--C--A-GGTAA-G-AAATGTGTT-C-ATTTT--ATAAGTGTTAAAAAACCTTTTCTAG-TC---AAAATTATGTCCA--T-ATTA-T--TG----T-AC-T-TT--CAATATGTTGTTTA-CTTTTG-AACAA-TTGAAAAATAAAT-----GT-TTATTAACAGC----TT-T----CAA-TATT--TATTTCATAGAAAGAAAC---AC-TTGTAGTGT-C-GC-----GTAAC-CTGTGAAAAATGA-GC-TA-ATTATCAAAG-CAT-GCCCAAAAAAAAATA-TAAAGTTT--T--TAATCTGAATA-TCATAAAACCA-TTTACTTTATGTTTTGGTT-CC--TTTAGGAA--CT-----CT--ACTCT--TTAGAAAAAAAATATTT-TTTTGGGC---------A--ATAAAGAC--ATCAATT--------A----TTTCC-ACAC-TCAAGT--GCAACACTATCCT-GTT--CC-GTTATT
gi|5 : ---TTTTACG-TTTT--CTAG--TTTCATACATAT----TGAAAGCAATGACA-AGT-GT---TCT-G-C-AAA-TA-AATCTTTTTTG-CTTGAAT---AA-TGTCAAA-TTTTC---ATGCA-CTTTGT-TTTCAA-TT--ATCA-ATT-G-C-ATCTGATT-TCTAATA-G--TTAA--GA-AATTT-ATGGAATGTTGTTTTTTTTCCACAACCC-----ATGCATAGCCAAT-
gi|5 : atT-ATGGAATGGG-TTTTTTTTCCACAA-CCCATGCAT----AGCCAAT-CTCAAATATCTT-AATTTTGTT-GTGTC-CTTAACAAAATAAGGCTAT-TTGA--CATTATTTCA-GAAAATTTATGAAA-ATGAAA-TTTC--CT-------TAATGGAAGTATTTTTGTTTCAA-CAAAGGCAT-AAAAAA--TGTTGTTTGTAAATGAAATTTCCTTTATCAAAATTGGTAT-TA-AAGTGTTCATGTAATTTG---AAATACTGTC-TT-TTTTAA-CAAAAATGTAC--C--A-GGTAA-G-AAATGTGTT---------------------AAAACATTTTCTAG-TC---AAAATTATATCCA--T-ATTA----TG----T-AC-T-TT--C-ATATGTTGTTTA-CTTTTG-AACAG-TTGAAAAAAAAATAA-A-GT-TTATTAACACC----TT-T----CAA-TATT--TATTTCAAAGAAAGAAAC---GC-TTGTAGTGTCC-GTTATTAGTAAC-CTGTG-AAAATGA-GC-TT-ATTCTC----------------------------------------ATCTGAATA-TTATAAAACCA-CTTA----A-GTTTTGGTT-CC--TTTAGGTA--CT-----CT--ACTCT--TTAG--AAAAAATA-TT-TTTTGGGCA---A----AATATAAAGAC--ATCAAT--------------TTTTC-AC-C-CCAAGT--GCAACACTA--CT-GTTC-CC-TTTATTGnatatggaatgggttttttttccacaacccatgcatagccaatctcaaatatcttaattttgttgtgtccttaacaaaataaggctatttgacattatttcagaaaatttatgaaaatgaaatttccttaatggaagtatttttgtttcaacaaaggcataaaaaatgttgtttgtaaatgaaatttcctttatcaaaattggtattaaagtgttcatgtaatttgaaatactgtcttttttaacaaaaatgtaccaggtaagaaatgtgttaaaacattttctagtcaaaattatatccatattatgtactttcatatgttgtttacttttgaacagttgaaaaaaaaataaagtttattaacacctttcaatatttatttcaaagaaagaaacgcttgtagtgtccgttattagtaacctgtgaaaatgagcttattctcatctgaatattataaaaccacttaagttttggttcctttaggtactctactctttagaaaaaatattttttgggcaaaatataaagacatcaatttttcaccccaagtgcaacactactgttccctttattg
gi|6 : atttttacgttttctagtttcatacatattgaaagcaatgacaagtgttctgcaaataaatcttttttgcttgaataatgtcaaattttcatgcactttgttttcaattatcaattgcatctgatttctaatagttaagaaatttatggaatgttgttttttttccacaacccatgcatagccaatnaATATATTGAA-GCTTTAACA-AGT-GT---ACTCG-CTAAA-TA-AATCTTTTTTGGCTTGAAT---AG-TGTCAAA-TTT-TCCAGTGCA-CTTG---TTTCAA-TT--ATCA-TTT-G-CCATCTGATT-TCTAATA-G--TTCAA-GA-AGTTTTATGGAATGGT-TTTTTTCGCCAACC-CC-----A-----AGCCA-T-CTCAAATGTCTTAATTTTTTGTAGTGTC-CGTAACTATATA-GGTTATG--AA--CATTATTTCA-GAAAGTTTATGAAATATGAAATTTTC--CTAT-C-TGTAATGGAATTCTTTTTGTTTCAAACAAAGCAAT-AAAA-A--TGTTGTT-GTAATAAAAATGTCCTTCATTAAAATTG-TAT-TCAAAGTGTTCATGTAATTTGGAAAAAT-CTGTC-CT-TTTTAAACAAAAAT--GC--C--ACAGTAA-GCAAATGTGTTTC-ATTTT--A-AAGAGTTTAACAACCTTTTCTCG-TCTCCCAGATTATGTATA--T-AGTA-T--AG----T-ACGTGTT--CAA-ATGTTGTTTA-CTTTTG-AACAG-TTGAAAAA--AATTTAA-GT-TTATTAACAGC----TT-T----CAA-TATT--TACTTCAA-GAAAGAAAC---AC-T-GTAGTGT-CAGT-----G-AAC-CTGTGAAAA-TGA-GCATT-AATATC-A-G-CAT-GC------AACAATA-TAAAGTTT--T--TAATCTGAATAATCATAAAACCAACTTA---T--GTCTTGGTT-CCCTTTTAGGTAAACTG----CT--ACTCT--TTAGAAGAAATAT--TT-TTTTGGGCA---A----A--ATAAAGAC--ATCAAAT-------------TTTTC-AC-TGCCAAGT--GCAAAAATA--CTAGTTC-CCTTTTATTGT
gi|7 : aTTAA-CAAAAGTATACAGCTGA-GGTAA-G-AAATGTGTT-C-ATTTT--A-AAGTGTTACAA---CCTTGCTAG-TC---AATATTATGTCCA--T-ATTAGTA-TG----T-AC-T-TT--C-ATATGTTGCTTA-CTTTTG-AACAG-TTTAAAAAAAAATCA-A-GT-TTATGAACA-CTCTATT-T----CGA-TATTA-AATTTCAAAGAAAGAAGC---A--TTA-AAT-T-T-GA-----A-AAC-CAGTG-AAAATGA-GC-TTAATTATC--AG-CAT-GC-------AAAATA-TAAAGTTC--TAGTTATCTGGATA-TCATAAA-------------------TGGTT-CC--TTTAGGTA--CTGTGA-CTTAACTCT--TTAG-AAAAAAATA-TT-TTTTGGGCA---ATTAGA--ATAAAGACATATAAATT-------------TTTTC-AC-CACTAAGT--GGAACACT----T-ACTC-CC-TTTATTG
gi|8 : --A-GGTAAAG-AAATGTGTT-CCATTTT--A-AAGTGTTACAA---CCTTGCTAG-T----AAACTTATGTCCA----ATTA-G--TA----TGAC-T-TT----ATATGTTCTTAA-CTTTTGAAACAG-TTTAAAAAAATA----A-GT-TTA-GAACA-C----TC-TATTGTGA-TATTAAAATTTC-AAGACAGACATTAAAT-TTGAA----------------AACGCAGTGACAAATGAGGC-TT-ATTATC-ACGCCAT-GC------AAAAATA-TAAAGTCTAGT--T-ATCTGGATA-GCATAAA-------------------TGGTT-CC--TTTAGGTA--CTTGTGACTTAACTCT--TTTAGAAAAAAATA-TTCTTTTGGGCAATTA----G--AT-AAGAC--AT-AATT--------AAATTTTTTCAAC-CACTAAGTTGGAAACACTA--------T-CC-TTTA
blockSeqs : GT A A GT CA . CT G A AT . A C G T AT . . AA TT T A C GAC T TTCG CA CT T C ATGTTAATTATG C G . T C GTACATT TGC C AAAACCC T G GC . ATC TT A GG CC T A TT . GT ACG C . T A G T G AAT T TCCAG T A A AGT . . T . A C TAAT AA T T A TTG C CATGCAT T A T G G A T T ATTAAAC T T T A AT G AT T A AA A AG G A TCA GAA A T AT . A ATGT AG TGA A T TC TA T CAAT T TCC CA A GGA AAAC G G G TCCA A A A C TTTAA A G TCTA A ATTG T AA T TAA A T CCGTTATTAGT G A A G A A AAA C A CCAAAAA G T TAGTT A TTTACTTTAT G CT AA TGTGA TAA TG A TT C AATTAG AT AT TTATTTCCACA A A G TG TC A G T
blockSeqs : TA A . . CA . CT . A AA . A . . T AT . . AA . T . . A T . A . A G G . . . . . . TT . CAA . T . . . CT . GG CC T A AA . TT . . . . . . T . AA . CAG T T . AT . . . . A C TAG A . . A GT . ATGCAT . A T G G T T A ATTAAAC T . . A AT . TG T . A . . G C GA . A T C . . GTAT . TT . C CC . T AAAA . . . . GTA . . . . CA . . . T TCAC . G . . . . A T . . T CGGCGT . A A . . . AAA . . CCAAAAA . C AGTT . TTTACTTTAT . . . GTGA TAA . A TT . AATTA . . TTAAATT . . A . . . . .
blockSeqs : TA . . . . . A . . AA . . . . A AT . . A . T . . A T . A . A A G . . . . . . TT . CAA . G . . . TT . C . C G AA . TT . . . . . . T . AG . TCA . A . AG . . . . C . TAG . . . T TT . A . A T T . T . A TTGA T . . A . . C T . A . . G T TA . A T A . . ATG . AC . . A . . AAAA . . . . T . . . . CA . . . T TAAA . G . . . . . T . . T CGCGT . A A . . . AA . . A . T TTG . ACTTAT . . . G A . A T . AA . . TTA . . A . . . . .
blockSeqs : T . . . . A C . . . . . . . . . . A . . A . . . . . . . T . CA . G . . . A . . . C G AA . T . . . . . . T . A . CA . T . AT . . . . . . AG . . . T TT . A . G A G . A . A GAA T . . T . . T T . A . . G C T . A T A . . AT . A . . C . . AACA . . . . T . . . . CA . . . T TCAA . G . . . . . C . . T CGCGT . A A . . . AC . . A . T TTA . CTTAT . . . . A . A A . AA . . TT . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . C . CA . G . . . A . . . T A TT . T . . . . . . T . . . AA . T . AT . . . . . . G . . . T GG . A . . . . . T . . GAA . . . . . . T . . . . . A . T . . . T . . T . A . . C . . AAA . . . . T . . . . CA . . . A A . C . . . . . T . . A CAGTG . A A . . . A . . A . T TTA . CTTAA . . . . A . A A . AA . . AT . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . T . T . . . . . . . . . . AA . T . . . . . . . . G . . . . GT . . . . . . . . . . . . . . . T . . . C . . T . A . . C . . CAA . . . . G . . . . CA . . . A T . G . . . . . T . . . TGAA . A . . . . A . . A . T TTA . ATGT . . . . A . G T . AA . . TT . . . . . . . .
blockSeqs : G . . . . . . A . . C . . CAA . . . . . . . . . C . . . A T . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . T TTA . CCTT . . . . A . . T . AA . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . CA . . . . . . . . . C . . . . A . . . . . . . . A . . . . . TA . . . . . . . . . T . AA . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . A . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons : AT T*** A* **** TC* CAA********* **** *** ** AA**** ** TAG*** GT* AT********* GTTGAA* TA** ATT* AAA* T*** CA** CGCGT******* A****** CTTAT******
originalCons : TAAAATGCCTCGCATAGCCAG-TAACATTTTGTGAATA-TATTGCTC--CAAATGCATC-TAANTGCTTAT-TAGAAAATAAATC---TTAAAATGTATT-TAAAG-CAATCATAT-TTTGCATTCA-AAAATATTTAACAGTAGGGA--GGTAAT-TTGG-TTACGGGACACTACG--AATAT---TT----GTA-ACTA--TTAAANGAAAACAAAAAATACTG-----------GACA-TCAA-TATCAGA----AC-AAATAGTGTATATC-TAACTGTGTAAAGATAAAAG-------GTATGCTTCACAAT-CATAAA-AA-----CAA----CTTGAATT-AAGGAAA--AAGC----TTACG---TNTTACG-TTTT-GCTAG--TTTCATACATATATATCGAAAGCNNTGACA-AGTTGT---TCT-G-C-AAA-TA-AATCTTTTTTG-CTTGAAT---A--TGTCAAA-TTT-C---GTGCA-CTTNGT-TTTCAA-TT--ATCA-TTT-G-C-ATCTGATT-TCTAAC--G--TTCA--GA-AGTTT-ATGGAATGNT-TTTTTTTTCCACAA-CC-----A-----AGCCAAT-CTCAAATATCTTTAATTTTGGTAGTGTC-CGTAACTANATAAGGCTATGTTAA--CATTATTTCA-GAAAGTTTATGAAA-ATGAAAATTTC--CTAT-C-T-TAGTGGAAGTATTTTTGTTTCAA-CAAAGGCAT-AAAA-A--TGTTGTTTGTAAATGAAATTTCCTTCATCAAAATTGGTAT-T--AAGTGTTCATGTAATTTG---AAATACTGTC-CT-TTTTAA-CAAAAAT-TAC--C--A-GGTAA-G-AAATGTGTT-C-ATTTT--A-AAGTGTTACAAAACCTTTTCTAG-TC---AAAATTATGTCCA--T-ATTA-T--TG----T-AC-T-TT--CAATATGTTGTTTA-CTTTTG-AACAG-TTGAAAAANAAAT---A-GT-TTATTAACAGC----TT-T----CGA-TATT--TATTTCAAAGAAAGAAAC---AC-TTGTAGTGT-C-GC-----GTAAC-CTGTGAAAAATGA-GC-TT-ATTATC-AAG-CAT-GC------AAAAATA-TAAAGTTT--T--TAATCTGAATA-TCATAAAACCA-CTTA---TATGTTTTGGTT-CC--TTTAGGTA--CT-----CT--ACTCT--TTAGAAAAAAAATA-TT-TTTTGGGCA---A----A--ATAAAGAC--ATCAATT--------A----TTTTC-AC-C-CCAAGT--GCAACACTA--CT-GTTC-CC-TTTATTGT
finalCons : TAAAATGCCTCGCATAGCCAG-TAACATTTTGTGAATA-TATTGCTC--CAAATGCATC-TAANTGCTTAT-TAGAAAATAAATC---TTAAAATGTATT-TAAAG-CAATCATAT-TTTGCATTCA-AAAATATTTAACAGTAGGGA--GGTAAT-TTGG-TTACGGGACACTACG--AATAT---TT----GTAA-CTA--TTAAANGAAAACAAAAAATACTG-----------GACA-TCAA-TATCAGA----AC-AAATAGTGTATATC-TAACTGTGTAAAGATAAAAG-------GTATGCTTCACAATC-ATAAA-AACAA---------CTTGAATT-AAGGAAA--AAGC----TTACG---TNTTACG-TTTT--CTAG--TTTCATACATATATATCGAAAGCNNTGACA-AGTTGT---TCT-G-C-AAA-TA-AATCTTTTTTG-CTTGAATAA----TGTCAAA-TTT-C---GTGCA-CTTNGT-TTTCAA-TT--ATCA-TTT-G-C-ATCTGATT-TCTAATAG---TTCA--GA-AGTTT-ATGGAATGGT-TTTTTTTTCCACAA-CCAT---------AGCCAAT-CTCAAATATCTTTAATTTTGGTAGTGTC-CGTAACTANATAAGGCTATGTTGAA-CATTATTTCA-GAAAGTTTATGAAA-ATGAAAATTTC--CTAT-C-T-TAGTGGAAGTATTTTTGTTTCAA-CAAAGGCAT-AAAA-A--TGTTGTTTGTAAATGAAATTTCCTTCATCAAAATTGGTATTA--AAGTGTTCATGTAATTTG---AAATACTGTC-CT-TTTTAA-CAAAAATT-AC--C--A-GGTAA-G-AAATGTGTT-C-ATTTT--A-AAGTGTTAAAA-ACCTTTTCTAG-TC---AAAATTATGTCCA--T-ATTAT---TG----T-AC-T-TTCA--ATATGTTGTTTA-CTTTTG-AACAG-TTGAAAAANAAAT---A-GT-TTATTAACAGC----TT-T----CGA-TATT--TATTTCAAAGAAAGAAAC---AC-TTGTAGTGTCGCGT-------AAC-CTGTGAAAAATGA-GC-TT-ATTATC-AAG-CAT-GCA------AAAATA-TAAAGTTT--T--TAATCTGAATA-TCATAAAACCACTTAT------GTTTTGGTT-CC--TTTAGGTA--CT-----CT--ACTCT--TTAGAAAAAAAATA-TT-TTTTGGGCA---A----A--ATAAAGAC--ATCAATT--------A----TTTTC-AC-C-CCAAGT--GCAACACTA--CT-GTTC-CC-TTTATTGT
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|9 ): AAACACTAATGCTGATAATTTTTACAAAGGTCAGAGGTTTGTTCTACAAGTTAATCAATCTACTTTATTTTTCACCCTCGTTTTGATGATGCAACTAATTTGGAAAGCCCAAATCGCATCATTTCCCTATACAGCATCATAGTTACATCTACATGACATAAGCTATGCTATTGAAATGGGCATCAAGACAG
Unaligned ( gi|14 ): TACAAAGGTCAAAGGTTTGTTCTACAAGTTACCAGGTAATCAATCTACTTTATTTTTCACCCACATTGTGATGATGCAACTAATTTGGAAAGCCCAAATCGCATCATTTCCATATGCAGCATCGTTGCTGTAACAGCATGACATA
Unaligned ( gi|19 ): TATGGTGTTTTTTCCCTGGTCATCACCACTGTGTTTCAGGTATCATCACAAATGTGGTTTAGGTTACGGACACTACAAAATCCTGTAGTGTC
Unaligned ( gi|26 ): GTTAAAAGTAAGACAATTTAAAGACACCAATTTT
Alignments
lowQualScore : 111 1 1 11 11 1 1 111 1 11 1 111 1111 1111 11 333333333333 1111 2222222 111 222222222222 333333333333333 22 11 11 111 1 111 222222 1 1 111 1 1 1111 111 1 111 4444444444444 1 1 1 1 333333333 11 11 1 111 111 222 1111 11 2222 333333 1111 1111 11 222222222222 1 222 3333333 222222 22222 111 1 11 111111111 444444444444444 1
lowQualScore : 0 777 5 6 33 22 0 44 0 3 66 777 3 8 6 1 44 8 0 8 66 0 11 0 6 6 0 777 4444 7777 88 11 0 1 1 0 888888888888 6 6 4444 6 5 0 1111111 777 6 777777777777 6 2 99 222222222222222 55 99 55 1 2 77 5 33 000 5 5 5 5 1 5 5 222 5 5 222222 1 1 0 000 66 5 5 5 7 7 7777 555 1 5 5 111 1111111111111 5 1 1 0 3 1 5 444444444 3 6 5 8 55 5 888 0 5 5 00 5 77 1 0 222 000 5 5 77 5 5 333 77 4444 5 8 4 55 66 8 4 33 3 4 666 55 4 8888 8888 4 4 4 55 3 4 4 4 2 555555 4 3 0000 5 0000 5 11 2 3 888 5 6 333333333333 4 2 4 4 4 444 4 4 1111111 4 0 4 6666666 4 0 4 333333 0 55 4 55 55 22222 111 55 2 00 3 111111111 44 0 44 0 000000000000000 3 3 0 44 44 3 3 3
lowQualScore : . ... . . .. .. . .. . . .. ... . . . . .. . . . .. . .. . . . . ... .... .... .. .. . . . . ............ . . .... . . . ....... ... . ............ . . .. ............... .. .. .. . . .. . .. ... . . . . . . . ... . . ...... . . . ... .. . . . . . .... ... . . . ... ............. . . . . . . . ......... . . . . .. . ... . . . .. . .. . . ... ... . . .. . . ... .. .... . . . .. .. . . .. . . ... .. . .... .... . . . .. . . . . . ...... . . .... . .... . .. . . ... . . ............ . . . . . ... . . ....... . . . ....... . . . ...... . .. . .. .. ..... ... .. . .. . ......... .. . .. . ............... . . . .. .. . . .
lowQualScore : 6 888 4 0 88 22 0 22 0 2 88 555 2 0 0 4 66 0 8 0 44 8 00 6 7 7 8 444 8888 0000 88 00 8 0 0 8 333333333333 7 7 2222 7 7 7 7777777 777 7 333333333333 7 5 22 111111111111111 00 22 77 4 3 66 7 44 000 7 7 7 7 4 0 7 999 7 7 333333 4 0 0 111 99 0 0 7 1 1 7777 777 4 7 4 444 4444444444444 7 7 7 8 3 0 5 777777777 2 7 7 7 77 7 000 7 0 7 77 7 99 7 1 666 000 0 0 44 7 0 222 99 4444 0 9 4 66 11 9 4 44 4 0 444 55 0 9999 5555 0 0 0 55 2 4 4 4 6 333333 4 9 6666 0 6666 0 99 0 2 888 0 5 666666666666 4 8 0 0 0 222 0 0 1111111 0 9 7 6666666 0 8 0 222222 7 55 0 55 55 55555 888 55 1 22 3 222222222 66 4 66 4 999999999999999 3 3 0 66 66 3 3 3
consensus : TAAAATGCCTCGCATAGCCAG-TAACATTTTGTGAATA-TATTGCTC--CAAATGCATC-TAANTGCTTAT-TAGAAAATAAATC---TTAAAATGTATT-TAAAG-CAATCATAT-TTTGCATTCA-AAAATATTTAACAGTAGGGA--GGTAAT-TTGG-TTACGGGACACTACG--AATAT---TT----GTA-ACTA--TTAAANGAAAACAAAAAATACTG-----------GACA-TCAA-TATCAGA----AC-AAATAGTGTATATC-TAACTGTGTAAAGATAAAAG-------GTATGCTTCACAAT-CATAAA-AA-----CAA----CTTGAATT-AAGGAAA--AAGC----TTACG---TNTTACGTTTTG-C--TAG--TTTCATACATATATATCGAAAGCNNTGACA-AGTTGT---TCT-G-C-AAA-TA-AATCTTTTTTG-CTTGAAT--AAT-GTCAAA-TTT-C---GTGCA-CTTNGT-TTTCAA-TT--ATCA-TTT-G-C-ATCTGATT-TCTAA--TAGTTC---AGA-AG-TTTATGGAATGNT-TTTTTTTTCCACAAC-----C-----A-AGCCAAT-CTCAAATATCTTTAATTTTGGTAGTGTC-CGTAACTANATAAGGCTATATTGAAC-ATTATTTCA-GAAAGTTTATGAAA-ATGAAAATTTC--CTAT-C-T-TAGTGGAAGTATTTTTGTTTC-AACAAAGGCAT-AAAA-A--TGTTGTTTGTAAATGAAATTTCCTTCATCAAAATTGGTATT-AAAGTGTTCATGTAATTTG---AAATACTGTC-CT-TTTT-AACAAAAAT-TAC--C--A-GGTAA-G-AAATGTG-TTC-ATTTT--A-AAGTG-TT-AAAAACCTTTTCTAG-T---CAAAATTATGTCCA--T-ATTA-T--TG----T-AC-T-TT--CAATATGTTGTTTA-CTTTTG-AACAG-TTGAAAAANAAAT---A-GT-TTATTAACAGC----TT-T----CGA-TATT--TATTTCAAAGAAAGAAAC---AC-TTGTAGTGT-C-GC-----GTAAC-CTGTGAAAAATGA-GC-TT-ATTATC-AAG-CAT-GC------AAAAATA-TAAAGTTT--T--TAATCTGAAT-ATCATAAAACC-A-----CTTATGT--TTTGGTT-CC--TTTAGGT--ACT-----CT--ACTCT--TTAGAAAAAAAATA-TT-TTTTGGGCA---A----A--ATAAAGAC--ATCAATT--------A----TTTTC-AC-C-CCAAGT--GCAACACTA--CT-GTTC-CC-TTTATTGT
Reference ( family-3356 ) : TAAAATGCCTCGCATAGCCAG-TAACATTTTGTGAATA-TATTGCTC--CAAATGCATC-TAANTGCTTAT-TAGAAAATAAATC---TTAAAATGTATT-TAAAG-CAATCATAT-TTTGCATTCA-AAAATATTTAACAGTAGGGA--GGTAAT-TTGG-TTACGGGACACTACG--AATAT---TT----GTA-ACTA--TTAAANGAAAACAAAAAATACTG-----------GACA-TCAA-TATCAGA----AC-AAATAGTGTATATC-TAACTGTGTAAAGATAAAAG-------GTATGCTTCACAAT-CATAAA-AA-----CAA----CTTGAATT-AAGGAAA--AAGC----TTACG---TNTTACGTTTT--C--TAG--TTTCATACATATATATCGAAAGCNNTGACA-AGTTGT---TCT-G-C-AAA-TA-AATCTTTTTTG-CTTGAAT--AAT-GTCAAA-TTT-C---GTGCA-CTTNGT-TTTCAA-TT--ATCA-TTT-G-C-ATCTGATT-TCTAA--TAGTTC---AGA-AG-TTTATGGAATGGT-TTTTTTTTCCACAAC-----C-----ATAGCCAAT-CTCAAATATCTTTAATTTTGGTAGTGTC-CGTAACTANATAAGGCTATGTTGAAC-ATTATTTCA-GAAAGTTTATGAAA-ATGAAAATTTC--CTAT-C-T-TAGTGGAAGTATTTTTGTTTC-AACAAAGGCAT-AAAA-A--TGTTGTTTGTAAATGAAATTTCCTTCATCAAAATTGGTATT-AAAGTGTTCATGTAATTTG---AAATACTGTC-CT-TTTT-AACAAAAAT-TAC--C--A-GGTAA-G-AAATGTG-TTC-ATTTT--A-AAGTG-TT-AAAAACCTTTTCTAG-T---CAAAATTATGTCCA--T-ATTA-T--TG----T-AC-T-TT--CAATATGTTGTTTA-CTTTTG-AACAG-TTGAAAAANAAAT---A-GT-TTATTAACAGC----TT-T----CGA-TATT--TATTTCAAAGAAAGAAAC---AC-TTGTAGTGT-C-GC-----GTAAC-CTGTGAAAAATGA-GC-TT-ATTATC-AAG-CAT-GC------AAAAATA-TAAAGTTT--T--TAATCTGAAT-ATCATAAAACC-A-----CTTATGT--TTTGGTT-CC--TTTAGGT--ACT-----CT--ACTCT--TTAGAAAAAAAATA-TT-TTTTGGGCA---A----A--ATAAAGAC--ATCAATT--------A----TTTTC-AC-C-CCAAGT--GCAACACTA--CT-GTTC-CC-TTTATTGT
gi|1 : T-TTGG-TTACGAGACACTATC--AGCATGTCTT----GTA---TA--TTAAACG
gi|1 : tcatggtaagatacgcagaatatgtggttttccctgatcatcaccaactgttgcttcaaggtatcaatcacaaacgtggttacgacactacaaaattccttgtagatgtccgctaacctgtatttcatatcacgtttgaacgcagcctgtttttaaaaccactaactgctgaattattcttaccaaaggttcagggtttttctcacaagttaaatcaatcatggtctttattttttcacctcattttgatgatgcaacctaattgaaagcccaaatcgcatgcattaccatatacagcaatcaaactgttcacatcagccaatgactaagcaatgttattgcacccatgggcatctaaggacagagatggcccacagcatattttttcatatgaaagtccaacgttgttacacagtcgtaacaaaatctgtgcacgaaattttccaactaatttaagactaatttctccagtccCATAGCCAG-CTACATTCTGTG-ATACTATTGCTT--CAAATGATTCTTAAATGCTTAT-TAGAAAAT--ATCTTATTAAAATGTATT-TAAAGACAATCA-ATATTTGCTATCATCAAATAGTTAACAGTTAGGA--GG-AACATTAG-TT-CGGGACACTACGACAATA----TT----ATA-ACAACTCTATACGAAA--AAAAAATAT-------------GACA--CAA-TATCAGATTTGAT-AA--AG-GTATATC-TAAC-GT-TGAGAAT-------------TATGCTTCACAA--CATAAA-AAAAAACCCA----CTTGCATT-AA-GAAA--AAGCCAAGCTACAT--TCTTACGTTTTA-C--TAG--TTTCATAC-TACAGATTGAAAGCTTGGACATAG-TGT---ACT-GCC-AAA-TATAATTTTTTT----CTGAATTAAAT-GTCAAA-TTT-C---A-GCA-CTTAGTATTGCAA-CTTAATCATTTT-GCC-ATCTCACTATCTAACTTA-TTC---AGACAG-TTgttcgaaaactttaaaactttatttttttctccaagaaagttccagaacaaagttcaaagcatgtttgtctattgacagattatggatggtatacgtgattattgccaaatcttttagatactactgtggttttgtttttcatatcgcagaataaagaaaaaaatatacttacacctacaacaatacatagaatggtgtcggggaaatttattaaggatcttccatagccagctacattctgtgatactattgcttcaaatgattcttaaatgcttattagaaaatatcttattaaaatgtatttaaagacaatcaatatttgctatcatcaaatagttaacagttaggaggaacattagttcgggacactacgacaatattataacaactctatacgaaaaaaaaatatgacacaatatcagatttgataaaggtatatctaacgttgagaattatgcttcacaacataaaaaaaaacccacttgcattaagaaaaagccaagctacattcttacgttttactagtttcatactacagattgaaagcttggacatagtgtactgccaaatataatttttttctgaattaaatgtcaaatttcagcacttagtattgcaacttaatcattttgccatctcactatctaacttattcagacagttatcgcggacgatgttagtattcaattatcatttgtatctgatttctaataattttaaagaagtttatggaatgttttttttccacaacccaaagccaatctcaaatatcttaattttgtagtgttcgtaactaaataaggctcagaaagtttatgaatataaaatttgctatcttaatggaattatttttgtttcaacagaggcataaaaatgttgtttctaaataaaatttccttcaataaaattggtataaaagtatttatgtaatttgaaatactgtcctatttttacaaaaatgcacctggtaagaaatttgttaattttaaggtgttacaaccttttctagtcaaaattatgtccatattatgtactttcatatgttgttaacttttggacagttgaaaaaaaaagtttattaacagctttcaattttagttcaaagaaagaaacacttgtagtgtccgtaacctgtgaaaatgaacttattatcagcatgcaaaatataaagttctaatctgaatatcataaaaccacttatgttctggttcctttaggtactctactctttagaaaaaataattttggggcaaaataaagacatcaatttttcacctcaagtgcaacactactgttctctttattgtgt
gi|1 : tcatggtaagatacgcagaatatgtggttttccctgatcatcaccaactgttgcttcaaggtatcaatcacaaacgtggttacgacactacaaaattccttgtagatgtccgctaacctgtatttcatatcacgtttgaacgcagcctgtttttaaaaccactaactgctgaattattcttaccaaaggttcagggtttttctcacaagttaaatcaatcatggtctttattttttcacctcattttgatgatgcaacctaattgaaagcccaaatcgcatgcattaccatatacagcaatcaaactgttcacatcagccaatgactaagcaatgttattgcacccatgggcatctaaggacagagatggcccacagcatattttttcatatgaaagtccaacgttgttacacagtcgtaacaaaatctgtgcacgaaattttccaactaatttaagactaatttctccagtcccgtttaatatacaagacatgctgatagtgtctcgtaaccaaagttcgaaaactttaaaactttatttttttctccaagaaagttccagaacaaagttcaaagcatgtttgtctattgacagattatggatggtatacgtgattattgccaaatcttttagatactactgtggttttgtttttcatatcgcagaataaagaaaaaaatatacttacacctacaacaatacatagaatggtgtcggggaaatttattaaggatcttcTTAGT-ATTCAA-TT--ATCA-TTT-G-T-ATCTGATT-TCTAA--TAATTTTAAAGA-AG-TTTATGGAATG---TTTTTTTTCCACAAC-----CC----AAAGCCAAT-CTCAAATATCTT-AATTTTG-TAGTGTT-CGTAACTAAATAAGGCT-----------------CA-GAAAGTTTATGAAT-AT-AAAATTTG--CTAT-C-T-TAATGGAATTATTTTTGTTTC-AACAGAGGCAT-AAAA-A--TGTTGTTTCTAAATAAAATTTCCTTCAATAAAATTGGTATA-AAAGTATTTATGTAATTTG---AAATACTGTC-CTATTTT-TACAAAAATGCAC--C--T-GGTAA-G-AAATTTG-TTA-ATTTT--A-AGGTG-TT--ACAACCTTTTCTAG-T---CAAAATTATGTCCA--T-ATTA----TG----T-AC-T-TT--C-ATATGTTGTTAA-CTTTTG-GACAG-TTGAAAAAAAA-----A-GT-TTATTAACAGC----TT-T----CAA-T-TT--TAGTTCAAAGAAAGAAAC---AC-TTGTAGTGT-C--C-----GTAAC-CTGTG-AAAATGA-AC-TT-ATTATC--AG-CAT-GC-------AAAATA-TAAAG-TT--C--TAATCTGAAT-ATCATAAAACC-A-----CTTATGT--TCTGGTT-CC--TTTAGGT--ACT-----CT--ACTCT--TTAG--AAAAAATA-AT-TTTGGGGCA---A----A--ATAAAGAC--ATCAAT--------------TTTTC-AC-C-TCAAGT--GCAACACTA--CT-GTTC-TC-TTTATTGTatcgcggacgatgttagtattcaattatcatttgtatctgatttctaataattttaaagaagtttatggaatgttttttttccacaacccaaagccaatctcaaatatcttaattttgtagtgttcgtaactaaataaggctcagaaagtttatgaatataaaatttgctatcttaatggaattatttttgtttcaacagaggcataaaaatgttgtttctaaataaaatttccttcaataaaattggtataaaagtatttatgtaatttgaaatactgtcctatttttacaaaaatgcacctggtaagaaatttgttaattttaaggtgttacaaccttttctagtcaaaattatgtccatattatgtactttcatatgttgttaacttttggacagttgaaaaaaaaagtttattaacagctttcaattttagttcaaagaaagaaacacttgtagtgtccgtaacctgtgaaaatgaacttattatcagcatgcaaaatataaagttctaatctgaatatcataaaaccacttatgttctggttcctttaggtactctactctttagaaaaaataattttggggcaaaataaagacatcaatttttcacctcaagtgcaacactactgttctctttattgtgt
gi|10 : tcatggtaagatacgcagaatatgtggttttccctgatcatcaccaactgttgcttcaaggtatcaatcacaaacgtggttacgacactacaaaattccttgtagatgtccgctaacctgtatttcatatcacgtttgaacgcagcctgtttttaaaaccactaactgctgaattattcttaccaaaggttcagggtttttctcacaagttaaatcaatcatggtctttattttttcacctcattttgatgatgcaacctaattgaaagcccaaatcgcatgcattaccatatacagcaatcaaactgttcacatcagccaatgactaagcaatgttattgcacccatgggcatctaaggacagagatggcccacagcatattttttcatatgaaagtccaacgttgttacacagtcgtaacaaaatctgtgcacgaaattttccaactaatttaagactaatttctccagtcccgtttaatatacaagacatgctgatagtgtctcgtaaccaaagttcgaaaactttaaaactttatttttttctccaagaaagttccagaacaaagttcaaagcatgtttgtctattgacagattatggatggtatacgtgattattgccaaatcttttagatactactgtggttttgtttttcatatcgcagaataaagaaaaaaatatacttacacctacaacaatacatagaatggtgtcggggaaatttattaaggatcttccatagccagctacattctgtgatactattgcttcaaatgattcttaaatgcttattagaaaatatcttattaaaatgtatttaaagacaatcaatatttgctatcatcaaatagttaacagttaggaggaacattagttcgggacactacgacaatattataacaactctatacgaaaaaaaaatatgacacaatatcagatttgataaaggtatatctaacgttgagaattatgcttcacaacataaaaaaaaacccacttgcattaagaaaaagccaagctacattcttacgttttactagtttcatactacagattgaaagcttggacatagtgtactgccaaatataatttttttctgaattaaatgtcaaatttcagcacttagtattgcaacttaatcattttgccatctcactatctaacttattcagacagttatcgcggacgatgC-CTGTGAAAA-TGA-GC-TC-ATTATC-A-G-CAT-G-------AAAAATA-TAAAGTTC--T---AATCTGAAT-ATCATAAAACC-A-----CTTATGT--TCTGGTT-CC--TTTAGGT--ACT-----CT--ATTCT--TTAGAAAAAAAA------TTTTGGGCA---A----A--ATAAAGAC--ATACAT--------------TTTTT-AC-C-CCAAGT--GCAACACTG--CT-GTTC-CC-TTgt
gi|11 : ---CAAAATTATGTCCACAT-ATTA-GGATGAAACT-AC-T-TTTCCAATATGTTGTTTAACTTTTG-AACAA-TTGAATAACAAATC--ACGTATTATTGAAAG
gi|12 : gaGA-GC-TT-ATTATC-A-G-CATAGC------AAAA-TA-TA---CTT--T--TGAT-TGAAT-ATCATAAAAC--A--------ATGTAATTTGGTTGTT--TTTAGGC--ACT-----CT------T--TTAGAAAAAG--TA-TT-TTTTGGAC----A----A--ATAAA-AC--ATCAA----------A----TTTTC-AC-C-CGA--T--ACA--ACCA--CT-GTT--CC-TTTATTGtgtttatggtaatcctaacattcaatctattgaaataattaagcttcaagaaagtggaattttctatgagctt
gi|13 : AA-ATGAAA-TTTC--TTAT-C-C-TAGTGGAGGTATTTTTGTTTC-AACAAAGGCATAAAAA-A--TG-TGTTTGTAAATGAAATTTCCTTAATCAAAATTGGTATG-AAAGTGTTCATGTAATTTG---AAGTACTGTCATT-TTTT-AACAAAAAT-gtt
gi|15 : AAAATGCTTCGCATAGCCAG-T-ACATTTTGTG-ATA-TATatat
gi|16 : agaaattcttatagattaaggggtgtttttttcaccgcaagatataaaaaatattacttaaaaatataaagatacatagaatgtgtgggaatattatcGAAAACAAAAAATACTG------------ACA-TCAA-TATCTGA----AC-AAATAGTGTATATC-TAACTGTGTAAAAATAAAAG-------GTATGCTTCACAATGCAAAAA-AA-----C-A----CTTGAATT-AAGGAAA--AAGC----T
gi|17 : --TTTTATACACTTATATTGAAAGCTTTGA-A-ATGTGT---TCT-G-T-AAA-TA-AATCCATTTTG-CTTG-AT--AAT-GTCAACTTTT-C---ATGCA-TTTTGT-ATCCAA-GT--ATCA-TTT-
gi|18 : GTATATC-TAACTGTGTAAAGATAAAAGGTACATTGTATGCTTCACAAT--ATAAACAA-----C-A----TTTGAATT-ATTGAAA--AGGC--------------TTACGTTTT--C--TAG--TTTCATACAT
gi|2 : TAAAATGTCTTACATAGCCAGGT--CATTTTGT--ATAATATGGCTTGTCAAATG--TC-TAAA-GCTTATGTAGAAA-TATCTC---TTAAA-TGTATTCTAAAGGCAATT-CAA-TTTGCATTCA-AT--TATT--ACAGTAGTGGTTGG--AT-TTGACTTACGAGCCAC-------ATAT---TCTTCGGTACACTA--C---AGAAAAATGTAAAATACTAATGTTAATTATGACACTCAAGTATCAGA----ATTAAATAGTGTATATCCTAACTGTTTGAGAAAAAAAG-------TTATGCTTCACAA--CATAGA-AA-----AAAACCCCTTGCATTTAAGAAAAGCAAGG----CTACCATCTCTTACGATTT--CCCTAG--TTTCA-ACATATATCTTGAAATCT-TGACA-AGT-GTACGTAT-G-C-AAAATAGAATCTTTTT-G-CT-GAAT--AATCGTCT---TTT-CA--GTG-A-CTTAGTATTGCAAGTT--ATCA-TTTTG-C--TCTGATT--CTAA---AGT-C---AGATAG-TTTG----ATGGT-TTTTTTTTCCACAA--------------GGCCAATTCTCAAAT----TT--TTTTG-TAGTGTC-CGTAACTAAA-ATGGCTA-G--GAAC-ATTATT-CATGAAAGTTTATG-AT-CTG-AAATTTC--CCATGCAT-TAATGAAATTATTTTTGTTCA-AGCAGAGGCAT-AAAA-AAGTGTTGTCTTCTAAT-AAATTTCCTTCATTAGAAATAGTATA-AGAGTAT--ATGTAA-TTG---AGAT-CTGTC-CT-TTTT-AAC-AAAAT-GAC--CT-T-TGTAA-GTAAATATT-GTA-ATTTTTAA-AGGTG-TT-ACAATACTTTT-TAGTT---CAAA--TATGT-CA--TAATTA----TG----T-CA-T-TT--CAATGCGTTA---A-C-TTTG-AACAGATTGAAAAATAAA----A-G--TTATTAACAGG----TTAT----CGATTATT--TA-TTCAGAAAGAGAAA----ACATTG-AGTGT-CGGC-----GTAAC-CTGTCAAA---GA-GC-TT-ACTAT--AAG-CA--GC-------AAAATAGTATAG--T--T--TAA--TGAAT-ATCAT--AACC-A-----CCT-TAG--TTCGGTT-CC--TTT-GGT--AC------CT---CTCTTGTTAG--AAAAAATA--T-TTGTGGGCA---A----A--ATAAA-AC--ATCA-----------A----TTTTC-AC-C-CTCAGT--GCAGCACTA--CT-GTTCGCC-TTT-TTGT
gi|20 : gataagattctgagtgtccggtaacttatttggactcagtttgaaacgcagctgttttatataacactaagctttacattaaggtcattgtggtttattctacaatttatatactttatttttcacctctattttgagtgatgcataattgaagagccacgcacattcatactaactcatatatgctttacatcaagccatgacatagagtttgcatgacatggcttaaactatgaccatattatttcatattaagtgttattatcatcttgttacgtaattcaccaataagttccatcccttataaatcgtttaaatgttagttcacgtataccaaaggttaaaataaaatcttattttttctccaaggaaaattcaaatgtgttattgaattgatgtatgtagtgatatatcattaaattgcttagatttgtgtggggtttttttcttattgacaatagaaataaaattttacttaaaacctacaaatacatagatgtgggggaaattatAATA-AT-TTTTGGGCA---A----A--ATAAAGAC--ATCAATT--------------TTTC-AC-C-TCAAGT--GCAACACTA--CT-GTTC-CC-TTTATgt
gi|21 : AAAAAATA-AT-TTTTGGGCA---A----A--AT-----------------------------TTTC-AC-C-TCAAGT--GCAACACTA--CT-GTTC-CC-TTTATTGT
gi|22 : TAGT-TAAAG-CAATCATAT-TT-GCATTCA-AAA-TACTTAACAGTAGGGA--GGTAGT-TTGG-TTACGGgtt
gi|23 : AAAAATACTG------------ACA-TCAA-TATCAGA----AC-AAACAGTGTATATC-TGACTGTGTA
gi|24 : AACCTTTTCTAG-T---CAAAATTATGTCCA--T-ATGA----TG----T-AT-T-TT--CA
gi|25 : -AAATGTG-TCC-ATTTT--A-AAGTG-TT--ACAACCTTTTCTAG-T---C
gi|3 : TAAAATGCCTCGCAGAGCCAG-TAATATCTTGTGAATG-TATTGCTC--CAAATACATC-TAACTGCTTAT-TAGAAAATAAATC---TTAAAATGTATT-TAAAG-CAAACATAT-TTTGCATTCA-AAAATGTTTAACAGTAGGGA--GGTAAT-TTGG-TTACGGGACACTACA--AATAT---TT----GTA-ACTA--TTAAAAGAAAACAAAAAATACTG-----------GACA-TCAA-TATCAGA----AC-AAATAGTGTATATC-TAACTGTGTAAAGATAAAAG-------GTATGCTTCACAAT-TATAAA-AA-----CAA----CTTGAATT-AAGGAAA--AAGC----TTACG---TA--ACGTTTTGGC--TAACCTTTCATACATATATATCGAAGGCAATGACA-AGTTGT---TCT-G-C-AAA-TA-AATCTTTTTTG-CTTGAAT----T-GTCAAA-TTT-A---ATGCATTTTTGT-TTTCA---T--ATCA-TTT-G-CAATCTGGTTCTCTA----AGTTC---AGA-AG-TTTAAAGAATGTT-TTTTTTTTCCACAAC-----C-----A-AGCCAAT-CTCAAATATTTTTAATTTTGGTAGTGTCGCGTAACTATA-AAGGCTATATTAAACTATTATTTCA-GAAAATTTATGAAA-ATGAAAATTTCATTTAT-C-T-TAGTGGAAGTA-TTTTGTTTC-AACAAAGGCAT---AA-A--TGTTGTTTGTAAATGAAGTTTCCTT-ATCAAAATTGGTATT--AAGTGTTCATGTAATTTG---AAATAC-GTC-AT-TTTT-AACAAAA---TAT--C--A-GGTAA-G-AAATGTG-TTC-ATTTT--ATAAGTG-TTAAAAAACCTTTTCTAG-T---CAAAATTATGTCCA--T-ATTA-T--TG----T-AC-T-TT--CAATATGTTGTTTA-CTTTTG-AACAA-TTGAAAAATAAAT-----GT-TTATTAACAGC----TT-T----CAA-TATT--TATTTCATAGAAAGAAAC---AC-TTGTAGTGT-C-GC-----GTAAC-CTGTGAAAAATGA-GC-TA-ATTATCAAAG-CAT-GCCCAAAAAAAAATA-TAAAGTTT--T--TAATCTGAAT-ATCATAAAACC-ATTTACTTTATGT--TTTGGTT-CC--TTTAGGA--ACT-----CT--ACTCT--TTAGAAAAAAAATATTT-TTTTGGGC---------A--ATAAAGAC--ATCAATTATTTCCACA----TTTTC-AC-C-TCAAGT--GCAACACTA--CT-GTTC-CC-GTTATTGT
gi|4 : TAAAATGCCTCGCAGAGCCAG-TAATATCTTGTGAATG-TATTGCTC--CAAATACATC-TAACTGCTTAT-TAGAAAATAAATC---TTAAAATGTATT-TAAAG-CAAACATAT-TTTGCATTCA-AAAATGTTTAACAGTAGGGA--GGTAAT-TTGG-TTACGGGACACTACA--AATAT---TT----GTA-ACTA--TTAAAAGAAAACAAAAAATACTG-----------GACA-TCAA-TATCAGA----AC-AAATAGTGTATATC-TAACTGTGTAAAGATAAAAG-------GTATGCTTCACAAT-TATAAA-AA-----CAA----CTTGAATT-AAGGAAA--AAGC----TTACG---TA--ACGTTTTGGC--TAACCTTTCATACATATATATCGAAGGCAATGACA-AGTTGT---TCT-G-C-AAA-TA-AATCTTTTTTG-CTTGAAT----T-GTCAAA-TTT-A---ATGCATTTTTGT-TTTCA---T--ATCA-TTT-G-CAATCTGGTTCTCTA----AGTTC---AGA-AG-TTTAAAGAATGTT-TTTTTTTTCCACAAC-----C-----A-AGCCAAT-CTCAAATATTTTTAATTTTGGTAGTGTCGCGTAACTATA-AAGGCTATATTAAACTATTATTTCA-GAAAATTTATGAAA-ATGAAAATTTCATTTAT-C-T-TAGTGGAAGTA-TTTTGTTTC-AACAAAGGCAT---AA-A--TGTTGTTTGTAAATGAAGTTTCCTT-ATCAAAATTGGTATT--AAGTGTTCATGTAATTTG---AAATAC-GTC-AT-TTTT-AACAAAA---TAT--C--A-GGTAA-G-AAATGTG-TTC-ATTTT--ATAAGTG-TTAAAAAACCTTTTCTAG-T---CAAAATTATGTCCA--T-ATTA-T--TG----T-AC-T-TT--CAATATGTTGTTTA-CTTTTG-AACAA-TTGAAAAATAAAT-----GT-TTATTAACAGC----TT-T----CAA-TATT--TATTTCATAGAAAGAAAC---AC-TTGTAGTGT-C-GC-----GTAAC-CTGTGAAAAATGA-GC-TA-ATTATCAAAG-CAT-GCCCAAAAAAAAATA-TAAAGTTT--T--TAATCTGAAT-ATCATAAAACC-ATTTACTTTATGT--TTTGGTT-CC--TTTAGGA--ACT-----CT--ACTCT--TTAGAAAAAAAATATTT-TTTTGGGC---------A--ATAAAGAC--ATCAATT--------A----TTTCC-ACAC-TCAAGT--GCAACACTATCCT-GTT--CC-GTTATT
gi|5 : ---TTTTACGTTTT--C--TAG--TTTCATACATAT----TGAAAGCAATGACA-AGT-GT---TCT-G-C-AAA-TA-AATCTTTTTTG-CTTGAAT--AAT-GTCAAA-TTTTC---ATGCA-CTTTGT-TTTCAA-TT--ATCA-ATT-G-C-ATCTGATT-TCTAA--TAGTTA---AGA-AA-TTTATGGAATGTTGTTTTTTTTCCACAACCCATGC-----ATAGCCAAT-
gi|5 : atTATGGAATGGG-TTTTTTTTCCACAAC-----CCATGCATAGCCAAT-CTCAAATATCTT-AATTTTGTT-GTGTC-CTTAACAAAATAAGGCTAT-TTGA-C-ATTATTTCA-GAAAATTTATGAAA-ATGAAA-TTTC--CT-------TAATGGAAGTATTTTTGTTTC-AACAAAGGCAT-AAAAAA--TGTTGTTTGTAAATGAAATTTCCTTTATCAAAATTGGTATT-AAAGTGTTCATGTAATTTG---AAATACTGTC-TT-TTTT-AACAAAAATGTAC--C--A-GGTAA-G-AAATGTG-TT---------------------AAAACATTTTCTAG-T---CAAAATTATATCCA--T-ATTA----TG----T-AC-T-TT--C-ATATGTTGTTTA-CTTTTG-AACAG-TTGAAAAAAAAATAA-A-GT-TTATTAACACC----TT-T----CAA-TATT--TATTTCAAAGAAAGAAAC---GC-TTGTAGTGTCC-GTTATTAGTAAC-CTGTG-AAAATGA-GC-TT-ATTCTC----------------------------------------ATCTGAAT-ATTATAAAACC-A-----CTTAAGT--TTTGGTT-CC--TTTAGGT--ACT-----CT--ACTCT--TTAG--AAAAAATA-TT-TTTTGGGCA---A----AATATAAAGAC--ATCAAT--------------TTTTC-AC-C-CCAAGT--GCAACACTA--CT-GTTC-CC-TTTATTGnatatggaatgggttttttttccacaacccatgcatagccaatctcaaatatcttaattttgttgtgtccttaacaaaataaggctatttgacattatttcagaaaatttatgaaaatgaaatttccttaatggaagtatttttgtttcaacaaaggcataaaaaatgttgtttgtaaatgaaatttcctttatcaaaattggtattaaagtgttcatgtaatttgaaatactgtcttttttaacaaaaatgtaccaggtaagaaatgtgttaaaacattttctagtcaaaattatatccatattatgtactttcatatgttgtttacttttgaacagttgaaaaaaaaataaagtttattaacacctttcaatatttatttcaaagaaagaaacgcttgtagtgtccgttattagtaacctgtgaaaatgagcttattctcatctgaatattataaaaccacttaagttttggttcctttaggtactctactctttagaaaaaatattttttgggcaaaatataaagacatcaatttttcaccccaagtgcaacactactgttccctttattg
gi|6 : atttttacgttttctagtttcatacatattgaaagcaatgacaagtgttctgcaaataaatcttttttgcttgaataatgtcaaattttcatgcactttgttttcaattatcaattgcatctgatttctaatagttaagaaatttatggaatgttgttttttttccacaacccatgcatagccaatnaATATATTGAA-GCTTTAACA-AGT-GT---ACTCG-CTAAA-TA-AATCTTTTTTGGCTTGAAT--AGT-GTCAAA-TTT-TCCAGTGCA-CTTG---TTTCAA-TT--ATCA-TTT-G-CCATCTGATT-TCTAA--TAGTTCA--AGA-AGTTTTATGGAATGGT-TTTTTTCGCCAACCC-----C-----A-AGCC-AT-CTCAAATGTCTTAATTTTTTGTAGTGTC-CGTAACTATAT-AGGTTA---TGAAC-ATTATTTCA-GAAAGTTTATGAAATATGAAATTTTC--CTAT-C-TGTAATGGAATTCTTTTTGTTTCAAACAAAGCAAT-AAAA-A--TGTTG-TTGTAATAAAAATGTCCTTCATTAAAATT-GTATTCAAAGTGTTCATGTAATTTGGAAAAAT-CTGTC-CT-TTTTAAACAAAAA--TGC--C--ACAGTAA-GCAAATGTGTTTC-ATTTT--A-AAGAGTTT-AACAACCTTTTCTCG-TCTCCCAGATTATGTATA--T-AGTA-T--AG----T-ACGTGTT--CAA-ATGTTGTTTA-CTTTTG-AACAG-TTGAAAA--AAATTTAA-GT-TTATTAACAGC----TT-T----CAA-TATT--TACTTC-AAGAAAGAAAC---AC--TGTAGTGT-CAGT-----G-AAC-CTGTG-AAAATGA-GCATT-AATATC--AG-CAT-GC------AACAATA-TAAAGTTT--T--TAATCTGAATAATCATAAAACCAA-----CTTATGT--CTTGGTT-CCCTTTTAGGTAAACTG----CT--ACTCT--TTAGAAGAAATAT--TT-TTTTGGGCA---A----A--ATAAAGAC--ATCAAAT-------------TTTTC-AC-TGCCAAGT--GCAAAAATA--CTAGTTC-CCTTTTATTGT
gi|7 : aTT-AACAAAAGTATACAGCTGA-GGTAA-G-AAATGTG-TTC-ATTTT--A-AAGTG-TT-ACAA--CCTTGCTAG-T---CAATATTATGTCCA--T-ATTAGTA-TG----T-AC-T-TT--CA-TATGTTGCTTA-CTTTTG-AACAG-TTTAAAAAAAAATCA-A-GT-TTATGAACA-CTCTATT-T----CGA-TATTA-AATTTCAAAGAAAGAAGC---A--TTA-AAT-T-T-GA-----A-AAC-CAGTG-AAAATGA-GC-TTAATTATC--AG-CAT-GC-------AAAATA-TAAAGTTC--TAGTTATCTGGAT-ATCATAAA---------------------TGGTT-CC--TTTAGGT--ACTGTGA-CTTAACTCT--TTAG-AAAAAAATA-TT-TTTTGGGCA---ATTAGA--ATAAAGACATATAAATT-------------TTTTC-AC-CACTAAGT--GGAACACT----T-ACTC-CC-TTTATTG
gi|8 : --A-GGTAAAG-AAATGTG-TTCCATTTT--A-AAGTG-TT-ACAA--CCTTGCTAG-T----AAACTTATGTCCA----ATTA-G--TA----TGAC-T-TT----ATATGTTCTTAA-CTTTTGAAACAG-TTTAAAAAAATA----A-GT-TTA-GAACA-C----TC-TATTGTGA-TATTAAAATTTC-AAGACAGACATTAAAT-TTGAA----------------AACGCAGTGACAAATGAGGC-TT-ATTATC-ACGCCAT-GC------AAAAATA-TAAAGTCTAGT--T-ATCTGGAT-AGCATAAA---------------------TGGTT-CC--TTTAGGT--ACTTGTGACTTAACTCT--TTTAGAAAAAAATA-TTCTTTTGGGCAATTA----G--AT-AAGAC--AT-AATT--------AAATTTTTTCAAC-CACTAAGTTGGAAACACTA--------T-CC-TTTA
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|9 ): AAACACTAATGCTGATAATTTTTACAAAGGTCAGAGGTTTGTTCTACAAGTTAATCAATCTACTTTATTTTTCACCCTCGTTTTGATGATGCAACTAATTTGGAAAGCCCAAATCGCATCATTTCCCTATACAGCATCATAGTTACATCTACATGACATAAGCTATGCTATTGAAATGGGCATCAAGACAG
Unaligned ( gi|14 ): TACAAAGGTCAAAGGTTTGTTCTACAAGTTACCAGGTAATCAATCTACTTTATTTTTCACCCACATTGTGATGATGCAACTAATTTGGAAAGCCCAAATCGCATCATTTCCATATGCAGCATCGTTGCTGTAACAGCATGACATA
Unaligned ( gi|19 ): TATGGTGTTTTTTCCCTGGTCATCACCACTGTGTTTCAGGTATCATCACAAATGTGGTTTAGGTTACGGACACTACAAAATCCTGTAGTGTC
Unaligned ( gi|26 ): GTTAAAAGTAAGACAATTTAAAGACACCAATTTT