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Reference ( family-334 ) : NAATTTCTT--G-C-G-CACA-TG-CG-C-A--GA-G-AGG-T-T--G-T-A-T--GGA--TTT-CCCC--T-TCA---T-A-C-A-T-A-TTCACG
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originalCons : NAATTTCTT--G-C-G-CACA-TG-CG-C-A--GA-G-AGG-T-T--G-T-A-T--GGA--TTT-CCCC--T-TCA---T-A-C-A-T-A-TTCACG
finalCons : NAATTTCTT--G-C-G-CACA-TG-CG-C-A--GA-G-AGG-T-T--G-T-A-T--GGA--TTT-CCCC--T-TCA---T-A-C-A-T-A-TTCACG
Alignments
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lowQualScore : .. . . . . . . . .. . . . . .. . . . .. .. . .. . ... . . . . . .
lowQualScore : 88 4 4 8 6 6 2 2 99 2 2 6 2 77 2 2 2 88 66 2 77 2 999 5 2 2 2 2 2
consensus : NAATTTCTT--G-C-G-CACA-TG-CG-C-A--GA-G-AGG-T-T--G-T-A-T--GGA--TTT-CCCC--T-TCA---T-A-C-A-T-A-TTCACG
Reference ( family-334 ) : NAATTTCTT--G-C-G-CACA-TG-CG-C-A--GA-G-AGG-T-T--G-T-A-T--GGA--TTT-CCCC--T-TCA---T-A-C-A-T-A-TTCACG
gi|1 : AATTTCTCTGG-C-G-CAAA-TG-CA-C-A--GAAG-AGG-CCT--G-T-A-TC-GGA--TTT-TCCCCTT-TCA---T-A-C-A-T-A-TTAACG
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gi|20 : gggtaattttttttTCTT--G-C-G-CACA-TG-CG-C-A--GA-C-TGG-T-T--G-T-A-T--GGA--TTT-CCCC--T-TCA---T-A-C-A-T-A-TTTACG
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gi|23 : ATTTCTT--G-C-GGCACA-TG-CG-T-AA-GA-T-AGG-T-T--G-T-A-T--GG---TTT-CCCC--T-TCA---T-A-C---T-A-TT
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gi|25 : TTCTT--G-C-G-CACA-TG-CG-C-A--GA---AGG-T-T--G-T-A-T--GGA--TTT--CCC--T-TCA---T-A-C-A-TGA-TTTA
gi|26 : TTTTT--G-C-G-CACA-TG-TG-C-A--GA-G-AGG-T-T--T-T-A-T--GGA--TTC-CCTC--T-TCA---T-G-C-A-T-A-TT
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gi|28 : T--G-C-G-CAGT-GG-CG-C-A--GA-G-AGGGT-T--G-T-A-T--GGA--TTT-CCCCG-T-TCA---T-A-C-A-T-A-TT
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gi|9 : TTTCTT--G-C-G-CTCAATG-CG-CCA--GA-G-AGG-T-TTTG-T-A-T--GGA--ATT-CCCT--T-TCA---T-A-C-A-T-A-TTCa