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Reference ( gi|6 ) : TAAGGGTAA--A--AT--TA-AA--CCCT-CC--A---TTT--A--ATTTCC--GGAAAA------------GTT---TGA--A--TTT--GATGC-TAG--T---CATTTA-G-TT-GC--------------T-CGGTT-G-TACT-TTATAGCT--GAGTCGACGTAA-CA--T-G-C-TTAA--TGTAA-TT-GT---TC-AT--A-T--C-CTCACCGC--ATCT----A---T----T-C-A-GAT-GTAGT-GT-TGAGTTTTCA--T--GG-T--TT-GATC--AT-TA-CG---TT-T--TT-A-TT-TTTCTC-ATGT-AACTG-T-TTT-A------C----------------A---------TT-----G--------TA--------------A----T------A-------------------T--------------A------C-T-C-----------CCAT-CAT-A--TCC-G---TAG--T-GTAGAT--TT-AG-T--------G-T--TT--AG-ATTCTTTGGTGTTTTTT--TTT--G-----T--TT--GT-TTT-T---TTCAT-TTCTCATGTA-TTTCTTAT---AACCATA-ATT-C-GTC---CTG-A-AG--A-GG-G-A-CA--GGT-C-GTCC-C---G-A-A-AAT--------TT---G------------A-------------T----------TG---GTCG--TG--T------CG-TTG-G-TCA---TT-C-----T---AG-----TGC--TT---TATAT-G--ATTT-C-A--TAT---T-CTG--ATCT--T---G-CA-TC--TA-TTCAATAGATCCGACACT-A-TG--AGTCATAG---AGTGTT--GTT--GGTATTA
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Reference ( family-329 ) : TAAGGGTAA---AT-GCTAAAA-C-CTCCCA---T-TTN--ATTTCC--GGAA--------AA---------GT-------------T---TGA--A--TTT-GANGC-TAG--T---CATTGA-G-TT-GC--------------T-CG-GTTG-TACT-TTATAGCT--GAGTCGACGTAAC--ATTGCA-TAATGTAA-TT-GT---TT-AT--ACT-CTCACCGC--ATCT----A---T----T-C-AGAT-GTAG-TGT-TGAGTTGTCA-----T--GG-T--TTGATC--A--T-TG-CG---TT-T--TTACT-T-TT-CTC-ATGT-AACTG-T-TTT-A------C----------------A---------TT-----G--------TA--------------A-----------T--------------A-------------------T-------------A-C-TC-----------CCAT-CAC-A-TCCG---TAG--T-GTAGAT--TT-AGT--------G-T--TT--AG-----ATTCTTTGGTGT--T-TT-TTTTG-T--TT---GTT--TT-T--TTCAT-TTCTCATGT-A-TTT-CTTAT---AACCAT-AC-CCCG---TCCTG-A-AG--A-GG-G-A-CA--GGT-CGTCC-C---G-A-A-AA-T--------TTG------------A-------------T----------TG-----TTCG---TG--T------CG-TT-G-GTCA---TT-C-----T---AG-----TGC--TT---TATATG-ATTT---C-G-TAT---TCTG--ATCT---T---GCA-TC--TA-TTCGATAGATCCGACACTNTG--AGT-CATNG---AGTGTT--GTT--GGTATTA
gi|1 : TAAGGTTAA---AT-GCTAAAAAC-CACCCA---T-TTT--ATTTCC--GGAA--------AA---------GT-------------T---GGA--ATTTTT-GAAGCTTAG--T----A-TGA-G-TT--C--------------T-CG-GTTG--ACG-TTGTAGCT--GAGTCGAC--AATCAATTGCA-TAATGTAA-CT-G----TT-ATA-ACT-CTCA-CGC--ATCT----A---T----T-C-AGAT-GTAG-TGT-TGAG--GTCAGT---T--GG----TTGAT---A--T-TA-CG---TT-TAACTATG-T-TT-CTC-ATGTAAACTG-T-TTC-A------C----------------A---------TT-----G--------TA--------------T-----------A--------------A-------------------T-------------G-C-TCGACAGTATTCTCCAT-CGT-T-TCCG---TAG--T-GTAGA---AT-AGT--------G-TTCTC--AG-----ATTTTTTGTTGT--T-TT-TTTCT-T--TTTGCGTT--TT-CTGTTCAT-CTC-CATGC-A--TT-CTTGT---AACCAT-ACATTCG---T-CTG-A-CGGAA-GG-G-A-CA--GGT-CG-CC-C---G-A-A-AT-C--------TTGACAATTAC----A-------------T----------TGC----TTCGCC-TG--T------CG-AT-G-GTCA---GT-CTAGCAT---AG-----TGCTATC---TATATG-ATTT---C-ACTATTC-TCTG--ATCTCC-T---GCACTC--T
gi|10 : cattttgatttccgtttactttttaatttatatttgatttttgaatcattcagtccgtgaaacttttattcgggtatttgaaacaattatattgggatttataaattttgtggtcgttgaaaaagattatttcgttaggtacgactaccggataacgaacgagtactttactgtgaattAAGGGTAATAAGT-GCTACAA-CTCTGCCAATTT-TTAGCATTTCCCCGAAA--------AC---------TT-------------T---TGACAA--TTTCGAAGC-TAGCTT---CATTGACA-TTAGC--------------T-CC-GTTG--A---TTCTAGCC--GACTCAA----AT--ATTGCAGTAATGCTA-TT-GT---TC-ATCGACC-TTCACCGG--ATCT----A---T----T-CTAGCTTGTAG-TGT-TGAACTGTAA-----T--TG-TGCTTGA-C--A--T-TAACG---TTGT--TTACT-T-TTTCTC-ATGT-AAG-G-TCTTT-A------CGAGTCAT---------A---------TTAGACAG--------TA--------------A-----------T--------------A-----------------------------------C-TC-----------CGATTCA--A-TCCG---TAG--T-GTAAATCATT-AGTTC------G-T--TTA-AG-----ATTCT----TGT--T-TC-TTTT-----------TCAATT-T--TTCATATTCTCGTG--A-TTT-CTTAT---AACCA
gi|11 : aacgagttaccttacttgtgaactttaTAAC--ATTGCA-TAATGTAA-TT-TT---AT-AT--ACT-CTCACCAC--ATCT----A---TAA--TGC-AGAT-GTAG-TGT-TGAGTTGTTA-----TT-GG-T--TTGATC--A--T-TG-CG---TT-T--TT-CT-T-TT-CTC-ATGT-AACAG-T-TTT-AA-----C----------------A---------TT-----G--------TA--------------A-----------T--------------A-------------------TGTAGCCTGTATATA-C-TC-----------CCAT-CAT-T-TCCG---TAG--T-GTAGAT--TT-AAT--------G-T--TT--AG-----TTTCATTG--------------------TT---ATT--TT-T--TTC-------CATTT-A-T-------C---AATCAT-AC-CCCG---TCCTG-A-AGA-A-GG-G-A-C-----------------------AA-T--------TTA------------A-------------T----------TG-----TTCG---TG--T------TG-TC-T-GTCA---TT-C-----T---AG-----TGC--TT---TAT---------------------------ATCT---T---GCA-TC--TA-TTTAATAGATCCGACATCCTG--AGT-CATAGTGTTGTGTT--GTT--GGTATCAata
gi|12 : aaaattacatatagcattTAAGGGTAA---AT-ACTAAAA-C-CTCCCA---T-TTT--ATTTCC--GGAA--------AA---------GT-------------T---TGA--A--TTTTGTTGC-CAG--T---CATTGA-G-TT-GC--------------T-CG-GTTG-TACT-TTATAGCT--GAGTCGACGTAAC--ATTGCA-AAATGTAA-TT-GT---TC-AT--ACT-CTCACCGC--ATCT----A---T----T-C-AGAT-GTAG-TGT-AGAGTTGTCAT----T--GG-T--TTGATC--A--T-TA-CG---TT-T--TTATT-T-TT-CTC-ATGT-AACTG-T-TTT-A------C----------------A---------TT-----G--------T---------------A-----------T--------------A-------------------T-------------A-C-TC-----------CCAT-CAT-A-TCTG---TAG--T-GTAGAT--TT-AGT--------G-T--TT--AG-----ATTC---------------------T--TT---GTT--TT-T--TTCAT-TTCTCATGT-tagttcta
gi|13 : gaacgactactaggacgaacgagttactttacttatgaatt--TTGATC--A--A-TA-CA---TT-T--TTA-T-T-TT-CTC-ATGT-AACTG-T-TTT-A------C----------------A---------TT-----G--------TA--------------A-----------T--------------A-------------------TGTAGACAGTATATA-C-TC-----------CCAT-CAT-A-TCCG---TAG--T-GTAGAT--TT-AGT--------G-T--TT--GG-----ATTCTTTGG--------------A-T--TT-----T--TT-T--TTCAT-TTCTCATGT-A-TTT-CTTAT---AACCAT-AC-TCCG---TCCTG-A-AG--AAGG-G-A-CA--GGT-CGTCC-C---G-A-A-AA-T--------TTG------------ACAATTTAA-----T----------TG-----TTCG---TG--T------CG-TT-G-GTCA---TT-C-----T---AA-----TGC--TT---TATATG-ATTT---C-A-TAT---TCTG--ATCT---T---GAA-TC--TC-TGAGATAGATCCGACACCATG--AGT-CATAG---AGTGTT--GTT--GGCATTA
gi|14 : GGTAA---AT-GTTAAAA-C-CTCCCT---T-TTC--ATCTCC--GGAA--------AA---------tagtgcgct
gi|15 : tgccagaatggagtgagctaagccctattggactttcttttcacgacctatgctcacagtaaattcaattaattttcagctaaatttctaatttatttaagttatgatttattcagtcgttagacattttcattcgggttatttagactttttattcggttagtaatctttaattcgtaatgaatatgtctttttaaggaacgactactatgacgaatgagttactttactaatgatttttacTT-A-----------------------A---------TT-----GAT------TA--------------A-----------T--------------A-------------------T-------------AAT-TT-----------CCAT--AG-T-TCCC---T-T--T-GTAGTT--TT-AGTTGTACATAG-TG-CT--AG------TTCTT----GT--T-TT-TTTTG-G--G----GTT--TT-T--TTCAC-T--TGGTGTAA-TTTATTTGT---GTCCAG-AC------------G-A-----A-GG-A-A-CT--GGC-TGTTC-C---G-A-A-AA-T--------TT-------------A-------------T----------TA-----CACA---T---T------AA-TT-G-GCCA---TT-TG----T---AG-----TGC--TT---TATATG---TT---C-GTTTT---TCTG--GCCTACAT---GTA-TG--TA-T----CAGATCCGACAATTTG--AGA-TGTCT---AGTGAT--GTT--GATTTTAa
gi|16 : a---------TT-----G--------TAT-------------A-----------T--------------A-------------------CG------------A-C-TC-----------TCAT-CAC-ACTCTGCCCTAA--A-GTTAAT--TC-AGT--------G-TC-TT--AG-----TTTCATTG---------------------T---GTT--TT------------CTCATGT---------TAT---AATC-T-AC-CCCG---TCCTG-A-AG--A-AG-A-A-CA--GGTCCGTCC-C---G-A-A-AA-T--------TTGACATTTTAT---A-------------T----------TG-----TTCG---TGT-T------CG-TCGG-GTCT---TT-C-----TA--AA-----TGC--TT---CATATG-ATCTA--C-A-TAT---TCTG--ATCC---CA--ATA-TC--TA-TTTAATAGATCCGACACCATGATAG--CATTG---AGTGTTC-GTT--tt
gi|17 : tagcTAA---AT-GTCAAAA-G-CTCCCA---A-TTT--ATTTCT--GGAATAATGTTCAATGTCATCCCGT-------------T---TGA--A--TTT-GACGC-AAG--T---CATTGA-G-AT-GTGTGTTCTTATGACAT-CG-GTTG-TGCT-TTAC--CTACGAGCTGTCCTAAC--ATTGCA-AGTTGTAGCTT-GTATATT-AT--ACTACTCATCAC--ATCTTGTAG---T----G-C-AGAT-TTAGTTGT-TTAGTGGTCG-----TTGGG-T--CT-CTC--T--T-CG-TG---TT-T-----CT-T-TT-CTC-ATGT-AAa
gi|18 : TAAGGGTAA---AT-GCTAAAA-C-CTCCCA---T-TTT--ATTTCC--ATAA--------AA---------GT-------------T---TGA--A--TTTCGAAGC-TAG--T---CAATGA-G-TT-GC--------------T-CG-GTTG-TGCT-TTATAACT--AAGTCGACGTAAT--ATTGCA-TAATGTAA-TT-GT---TC-AT--ACT-CTCACCAC--ATCT----A---T----T-C-AGAT-GTAG-TGT-TGAGTTGTCAT----T--GG-T--TTGATCAAA--T-TA-CG---TT-T--TTATT-T-TT-CTC-ATGT-AACTG-A-TTT-A------C----------------A---------TT-----G--------TA--------------A-----------T--------------A-------------------
gi|19 : --T-GTAGTT--TT-AGT----------T--GT--AC-----AT-----AGTGC--TAGT-TCTTG-T--TTT--GTT--TTCT--TTCAC-TTT--ATGT-AATTT-ATT-T---GTTTGT-------G---TACAG-A-CG--A-AG-G-A--ATTGGC-TGTTC-C---A-A-A-TA-T--------TTG------------ACAATATCAACTAAT----------TG-----TTCG---TG--T------CA-TT-G-GCCAT--TT-T-----T---AG-----TGC--TT---TATATA---TT---C-GTTTT---TCTG--GTCT---A---ATA-TC--TA-AGCATTAGATCCGACACTTTG--AGcgtaaggaca
gi|2 : tagtagttattctccatagttcccttTAAGGGTAA---ATGGCTAAAA---CTTCCA---T-TTT---TTTCC---GAA--------AA---------GT-------------T---TGA--ATTTTT-GAAGC-TAG--T---CATTGG-T-TT-GC--------------TGCGTTTTG-TACT-TTGTAGCT--GAGTCGA-GTAAC--ATTGCA-T-ATGTAA-CT-GT---TT-AT--ACT-CTCA-CGC--ATCT----A---T----T-CAAGAT-GAAG-TGTATGAGTTGTAT-----T--GGTT--TTGATC--A--T-TG-------T-T--AAACTATGTT-CTC-ATGT-AA-TG-T-TTC-A------C----------------A---------TTG----G--------TA--------------A-----------TATGTAGACAGTATAA-------------------T-------------A-C-T------------CCAT-CGT---TTCG---TAG--T-GTACAA--TT-AGT--------G-T--TTTAAG-----ATTTTTTG-------------TTG-T--------TT--TT-T--TTCAT-CT-TCATGT---TAT-CTTGT---AA-CATAAT-TCCG---TCCTG-A-AGA-A-GG-G-A-CA--TGT-CGT-C-C---G-A-A-AATT--------TTGACAATCT-----A-------------T----------TG-----TTCG---TG--T------CG-TT-G-GTCAT--TT-C-----T---AG-----a
gi|21 : attcattttgatttccagtttattttaattttttatttgatttatgaatcatcagtcttaaaacattttattcgggtattgaaacactttttatttgggattttaatcttgtggtcgtgaaaaatatatttcgttaggtacgactctatgacgaacgagttactttacttgtgaattTGCCA-----TT-GG-T--TTGACC--A--T-CG-TG---TT-T--TT-CT-T-TT-CTC-GTGT-AACTT-T-TTTAA------C----------------A---------TT-----T--------AA--------------A-----------T--------------A-------------------T-------------attatgc
gi|21 : agtatatacaggctac--TTT-GTTGC-TAG--T---GACTGA-G-T--------------------CG-GTTG-TACT-TCTTTGCT--GAATCCTTGTAAC--AT---A-GAAT-----------------T--ACT-CTTACCGC--ATCT----G---TAG--TGC-AGAT-GTAG-TGT-TGAGTTGTCAT----T--AG-T--TTGACA--A--T-Ttttttgttgctagtgactgagtcggttgtacttctttgctgaatccttgtaacatagaattactcttaccgcatctgtagtgcagatgtagtgttgagttgtcattagtttgacaatt
gi|22 : agtatatacaggctacatatttaaatgttaaaaaagttacacgagaaaagaaaaacacgatggtcaaaccaatggcattT--TG-T--TTCCT-TTCTAAGGC-A-TTT-CATGT---AATCAT-AC-CCCG---TCCTA-AGAA--A-GG-G-A-CA--GAT-CGTCT-C---G-A-A-AA-T--------TTG------------A-------------C----------AA-----TT-----TG--T------CG-TA-G-GGTA---TT-C-----T---AG-----TAT--TT---TATATATATTT---
gi|23 : tcgtgtttcacaaacacatcT-----G--------TA--------------T-----------T--------------A-------------------T-------------A-C-TC-----------TCAT-CAC-A-TTT----TGG--TTGTAGAT--TT-AAT--------G-T--TT--AG---------------------------TG-TCATT---GTG--TT-T--TTCCT-TTCTCAT--------------------CAT----CCCG---TCC-G-A-GG--A-AG-G-A-CA--GGT-CGTTCAC---G-A-ATAA-TAAAAAAA-GTA------------A-------------T----------TG-----TCTG---TG--T------CG-TT-A-GTCA---CT-C-----T---AG-----TGC--TT---TGTATA-ATTA---CAG-CTT---TCTG--Agacacacacacacacacacacacgcacgcacgcacgcacgcacgcacagacacacagtac
gi|24 : cta-----T--GG-T--TTGATC--A--T-TG-TG---TT-T--TT-CT-T-TT-CTC-ATGT-AATTG-T-TTT-AA-----C----------------A---------TT-----GCAGTACTTTA--------------A-----------TGTATGT--------A-------------------T-------------A-C-TC-----------TCAT-CAC-A-CCTG---TGG--T-GTAGAT--TT-AGT--------G-T--TT--AG-----TTTCATTG---------------------T---GTT--TT-----TCAT-TTCTCATGT-A-TTT-CTTAT---AATCAT-AC-CCAG---TCCTG-A-AG--A-AG-
gi|25 : atTG-AGAA--A-GG-G-A-CG--GGT-CGTCC-C---A-A-G-GA-T--------CTATCGA--------A-------------T----------TG-----TTTG---TG--TGACTGTCG-TT-G-GTCA---AA-T-----T---TG-----TGT--TT---TTTGTA-ATTTT--C-G-TATAAATTTG--ACCT---T---GCA-TC--TG-CTATGTAGATCCGACATTTCT--AGG-TATCG---GATGTT--GTT--GG-ATT
gi|26 : -----T--GG-T--TCGATC--A--T-TG-TG---TT-T--TT-CT-T-TT-CTC-ATGC-AACTG-T-TCT-A------TCACTTGCGAAATATAGA---------TT-----G--------T---------------A-----------T--------------A-------------------T-------------A-C-TC-----------TCAT-CAC-A-TCTG---TAG--T-GTATAT--TT-AGT--------G-T--TT--Attagtgttatatat
gi|27 : t--------------A-----------T--------------A-------------------T-------------A-C-TC-----------CCTT-CAT-A-TACG---TAG--T-GTAGAT--TT-AGT--------G-T--TT--AG-----ATTCTTGGGGGG--T-TT-AT--A-T--TT----TT--TT-T--TTCAT-TTCTCATGT-A-TTT-CTTAT---AACCAT-AA-TTCG---TCCTG-A-AGA-A-GG-G-A-CA--GGT-CGTCC-C---G-A-A-AA-T--------TTG------------A-------------C----------Ttcattcccttcacgatctatgtttaaattatttccctcgttgttgatcatat
gi|28 : TTTG-T--TTTT-GTT--TT-T--TTAAT-T-CTCATGT-T-TTT-CTAAT---AATCAT-AT-CCTG---TCCTG-A-AGA-A-GG-G-A-AA--GGT-TGTCT-C---G-A-A-AA-T--------TTG------------ACT-----------T----------TATAATTTTTG---GG--T------CG-TT-G-ATAA------------T---AA-----T-C--TT---T---CG-GTTT---T-G-T------------CCT---T---GCA-TT--T--TTCATTAGATCCGACAttatcacttttgtgt
gi|29 : aGGTAA---AT-GCCAAAA-C-CTCCTA---A-TTT--ATTTCC--GGAA--------AA---------GT-------------T---TGA--AT-TTT-GTTGC-TAG--T---CACTGA-G--------------------T-CG-GTTG-TATT-TCATTGCT--GAA---------------GCA-TGATGTAA-TT-TC---AT-AT--ACT-CTCACCGC--ATCT----G---TAGA-G-C-AGAT-GTAG-TGT-TGAGTT
gi|3 : aGGTAA---AT-ATCAAAA-C-CTCCCA---A-TTT--ATTTTA--TGAA--------AA---------GTCACGTGATCCGGTT---TGA--A--TTTCGACGG-TAG--T---CATTGA-G-TC-GA--------------T-CG-GTGGGTACTCTTCTTACT--GAATCGTTCTAGC--ATTGCA-TAATGTAG-CT--T---TT-AT--ATA-CTCATTG-----------G---T----G-C-AGAT-TTAG-TGT-ATAGTTGTCA-----TT-GG-T--TCGATC--A--T-TG-TG---TT-T--TT-CT-T-TT-CTC-ATGT-AACTG-T-TCT-AA-----C----------------A---------TT-----G--------CA--------------AAATGTAGCTTGT--------------A-------------------TTT-----------A-C-TA-----------TCAT-CAA-A-TATG---TAG--T-GTAGAT--TT-AG--------------TT--CG-----ATT-----GTG---------------------------TT-T--TTCAT-TTCTCTTGT-A-TTT-CATAT---AA
gi|30 : tcagaatgaacgtgagcgctaagccctaacagactttacttctcgtctctcctcacgacgtatacccatagtgattttcattgattttcagttaattttaaatttattgggttattatttattcagtattagacgttttttatttgggttattgaaacaattttattcgggttattaatcattagttcgtgaggagtatattttgtaaggaacgactactatgacgaacgagttactttacttagttattttac-GTAG-TGT-TG----------------------TTGATC--A--T-TG-CGGGGTT-T--TT--T-T-TT-CTC-ATGT-AACTG-T-TTTAA------C----------------A---------TT-----G--------TA--------------A-----------T--------------A-------------------T--------------------------------------------G---TAGACT-GTATA----A-AAT--------G-C--CA--TC-----ATTCATTGG-GT--T-TT-TT--------------------------AT-TTCTCATGT-A-TTT-CTTAT---AATCAT-TC-CCt
gi|32 : gaCCCG-C-AG--A-AG-G-AACA--GGT-CGTCC-C-------A-AA-T--------TT---------------------------------------------TTCAA--TC--T------CA-AT-T-GTCA---AT-T-----T---AG-----TGC--TT---CTCATA-ATT------G-T------TTG--ATCT---T---GTT-TC--CA-TTTGGTGCATCCGACACTa
gi|33 : ttttatttattccgtgcatatctgtaaa---G-A-C-AA-T--------TTA------------A-------------T----------TG-----TTCG---TG--T------CG-TT-G-GTCA---TT-C-----T---AGGATAGTGC--TT---TATATG-ATTT---C-A-TAGG--TCGGGGATCT---T---GCA-TC--TA-T-CAATAGATCCGACACTTTG--CAT-AATTG---AGTGTT--GTT--GGTATTAga
gi|34 : aatttTG-A-AG--A-AAAG-A-CA--GGT-TTTCC-C---G-A-A-AA-T--------TTG------------ACACTTTATTA---T----------TC-----TTCG---TG--T------CG-TT-G-GTCA---TTAT-----T---AA-----TGC--TT---TTTATA---TC---C-T-TATTTATTTG--ACAT---T---GCA-TC--TA--CCATTAGATCTGACAATATG--ttat
gi|36 : --------TTA------------A-------------T----------TG-----TTC----TG--T------CG-TT-G-GTCA---TT-C-----TGATAG-----TGC--TTA--TAT-TG-ATTTT--C-A-TAT---TCTG--ATCT---TAGGGCA-TC---A-TTCAATAGATC-GACACTTTG--AGT-AATTA---CGTGTT--GTT---GTATTAgatg
gi|37 : a-G-A-CG--GGT-CGTCT-G---G-A-A-AA-A--------TTGACGATTA-----A-------------T----------TG-----TT-A---TG--T------CG-CT-G-GTTA---TT-T-----A---AG-----TG---TT---TA---G-GTCT---T-G-TGT---T-TG--ACCT---T---GCA-TCAGTA-CTT-ACAGAT------------------ATCG---GGTGTT--GTT--GGAATTttat
gi|39 : ------------A-------------T----------TG-----TTCA---TG--T------TA-TT-G-GTTG---TT-T-----T---AG-----TGC--TT---TATATA-A-----------------------------T---GCA-TC--TG-TTTTGTAGAT-AGACACTGAT--AGG-TATCG---GGTA-C--GTT--GGAATTtag
gi|4 : aTAAGGGTAA---AT-GCTAAAA-C-CTCCCA---T-TTTTAATTTCC--GGAA--------AA---------GT-------------T---TGA--A--TTT-GATGC-TAG--T---CATTGA-GTTT-GC--------------T-TG-GTTG-TACT-TTATA-CT--GAGTCGACGTAAC--ATTGCATTAATGTAA-TT-GT---TTAATG-ACT-CTCACCACTAATCT----A---T----T-C-AGAT-G-AG-TGT-TGAGTTGTCAT----T--GGTT--TTGACC--A--TCTA-CG---TT-T--TTATT-T-TT-CTCAATGTAAACTGTT-TTT-A------CTTGTA-----------A---------TT-----G--------TAGCAGT---------A-----------T--------------A-------------------T-------------A-CTTC-----------CCAT-CATAA-TCCG---TAA------AGAG--TTAAGT--------GTT--TT--AG-----ATTCTT--GT------------------------TT--TT-T--TTCAT-TTCTCATGT-A-TTT-CTTAT---AACCAT-Atcatgctgttatgtattc
gi|40 : gctatacgtagtaaatttcattaatttcatttataattttatttgggttatgatcattcagttgtgagacattttatttgggtattgaacatttttattcgattataataatcatttagcgtgaagagtatataagtatattttaggaaacgatacatggagacgagttactttaagcttgtgaatt---TG--C------CG-TT-G-GTCA---TT-C-----T---CT-----TGC--TC---TATATATAGTTACAC-G-GA-----CTG--ATCT---T---GCA-TT--TA-TTTGATAGATCTGATACTATT---GTGCAATG---AGTG-T--GTTTCGGTTTTAa
gi|41 : gtaGTTA---AT-ACCAAAA-C-CTCCG------TTT--ATTTTC--GGAA--------AA---------GT-------------CACGTGA------TC-GACG---AA--TCCCCATTGA-T-TC-AA--------------T-CG-GCTG-TGCT-TT
gi|42 : ttaccC-CTTG---TCCCCCA-AA--A-TG-G-A-TG--GAT-CGTCC-C---G------A-T--------TTG------------A-------------A----------CC-----TCAA---T---T------CG-TT-G-GTCAT--TT-C-----T---AG-----TGC--TTATATATATT-TTTT---T-G-CAT---TTTG--ACCT---T---Gtcctactgaactgtttt
gi|43 : tcTGTCA-----TT-GG-T--TCGATC--A--T-TG-TG---TG-T--TTTGT-T-TT-CTC-GTGT-AACTG-T-TCTAA------C----------------A---------TT-----G--------AAAAAATGAAGCTTGTA-----------T--------------A-------------------T-------------A-C-TC-----------CCAC-CAC-A-TCTG---TA
gi|44 : CATGT-A-ATT-CTTTT---AATCTT-AC-CCCGTCATCCTG-A-AGA-A-GG-G-A-CA--GAT-TAGCC-C---G-A-A-AA-A--------TCG------------A-------------CAATTTTTTTATG-----TTTG---TG--C------CT-TT-G-GTC
gi|45 : -CA--GGT-CTTCC-C---G-A-A-AA-T--------TTGACAATCTA----A-------------T----------TG-----TTCG---TGATT------CGATT-GCGTCA---TT-TAGA--TA--AG-----TGC--TT---CATAT--AT-------A-TAT---T-----ATCT---T----CA-T
gi|46 : G-----TGC--TT---TACGTA-ATTT---TTG-TAT---T-TG--ACAT---T---GTA-TC--TACTTCGA-AGATCCGACATTTCT--AGA-TATAT---A-TGTTGGGTT--GGta
gi|47 : att-AC-CCTGC--TCCTG-A-AG--A-AG-G-A-CA--AGG-TATCC-C---A-A-A-AA-T--------TTGACCAATCGTTATA-------------T----------TGT----TTCG---TT--T------CG-TC-G-GTCA---TT-T-----T---actt
gi|5 : taccT-TTAAAGCT--GAATCGATGCAAC--ATTGCA-TAATGTAA-TTTGT---TT-AT--ACT-CTCACCTT--ATCT----A---TATAGTGC-GGAT-GTAG-CAT-TGAGTTGTCA-----TT-GG-T--TTGATC--A--T-TG-CG---GT-T--TT--T-T-TC-CTC-ATGT-AACTG-T-TTT-AA-----C----------------A---------TT-----G--------TA--------------A-----------T--------------ACCGGTATGTAGACTGTTTAT-------------A-C-TA-----------CCAT-CAT-A-TCCA---TAC--T-GTAGAT--TT-AGT--------G-T------AA-----GTTGTTTTGGGT--T-TT-TTTT----------------------TTAA-CTCGCATGC-A-TTT-CTTAT---AATCAT-AC-CCCG---TCCTG-A-AA--AAGG-G-A-CA--GGT-CGTCC-C---G-A-A-AA-T--------TTG------------A-------------TAATTTCAT--TG-----TTCA---TG--T------CG-CT-G-GTCG---TT-C-----T---AG-----TGC--TT---TATATG-ATTT---C-A-TAT---TATG--ATCT---T---GCA-TC--TA-TTTAATATATCCGACACCATT--AAT-CATAT---AGTGTT--GTT--GGTATTttgg
gi|52 : ---TCCTGCG-AA--A-GG-G-A-CG--GGTTCGTCC-C---T-A-G-GA-TCA------TCG------------AA------------T----------TG-----TTTG---TG--T------CG-TT-G-GTCA---Tttatttcatctattgcattgattagctcttgcaaatcatattaatttttcacctcttgaatttgtaacatt
gi|53 : cgttta--A-GG-G-A-CA--GGT-TGTCA-T---GAA-A-AA-T--------TTG------------A-------------CAA--------T------TTCATACTG--T------CA-AT-GTGTGA---TT-T-----T---AG-----TGC--TT---TATAatca
gi|54 : TTT---T-G-TAT---T-TG--ACCT---T---GTA-TT--TA-CTATGTAGATCCGACATTCT
gi|55 : aacCCTG-A-GG--A-AGAG-A-CA--TGT-CGTTT-CTCTG-ATC-AA-T--------CTA------------A-------------T----------TG-----TTCG---TG--T------CG-TT-G-TTCA---Ttgttcttggatttcagta
gi|56 : g--ATCT---T---GCA-TC--TA-TTCAATAG-TCCGAGACTTTG--AGT-CATTG---AGTGTT--GTT--GG-ATTAa
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gi|21 : attcattttgatttccagtttattttaattttttatttgatttatgaatcatcagtcttaaaacattttattcgggtattgaaacactttttatttgggattttaatcttgtggtcgtgaaaaatatatttcgttaggtacgactctatgacgaacgagttactttacttgtgaattTGCCA-----TT-GG-T--TT-GACC--A--T-CG-TG---TT-T--TT-CT-T-TT-CTC-GTGT-AACTT-T-TTTAA------C----------------A---------TT-----T--------AA--------------A----T------A-------------------T--------------attatgc
gi|21 : agtatatacaggctac--TTT--GTTGC-TAG--T---GACTGA-G-T--------------------CGGT-T-GTACT-TCTTTGCT--GAATCCTTGTAAC--AT---A-GAAT-----------------T--ACT-CTTACCGC--ATCT----G---TAG--TGC-A-GAT-GTAG-TGT-TGAGTTGTCAT----T--AG-T--TT-GACA--A--T-Ttttttgttgctagtgactgagtcggttgtacttctttgctgaatccttgtaacatagaattactcttaccgcatctgtagtgcagatgtagtgttgagttgtcattagtttgacaatt
gi|22 : agtatatacaggctacatatttaaatgttaaaaaagttacacgagaaaagaaaaacacgatggtcaaaccaatggcattTTG-T--TTCCT-TTCTAAGGC-A-TTT-CATGT---AATCATA-C-CCCG---TCCTA-AGAA--A-GG-G-A-CA--GAT-CGTCT-C---G-A-A-AAT--------TT-G------------A-------------C----------AA-----TT-----TG--T------CG-TA-G-GGTA---TT-C-----T-AGTAT--TT---TATA-TATA-TTT---
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gi|24 : cta-----T--GG-T--TT-GATC--A--T-TG-TG---TT-T--TT-CT-T-TT-CTC-ATGT-AATTG-T-TTT-AA-----C----------------A---------TT-----GCAGTACTTTA--------------A----TGTATGTA-------------------T--------------A-C-TC-----------TCAT-CAC-A--CCTG---TGG--T-GTAGAT--TT-AGT--------G-T--TT--A-G-----TTTCATT-GTG---------------------------TT-T--TTCAT-TTCTCATGT-A-TTT-CTTAT---AATCATA-C-CCAG---TCCTG-A-AG--A-AG-
gi|25 : atTG-AGAA--A-GG-G-A-CG--GGT-CGTCC-C---A-A-G-GAT--------CT-ATCGA--------A-------------T----------TG-----TTTG---TG--TGACTGTCG-TT-G-GTCA---AA-T-----T-TGTGT--TT---TTTG-TA-A-TTTT--C-G-TA-TAAATT--TGACCT---T---GCA-TC--TG-CTATGTAGATCCGACATTTCT--AGG-TATCG---GATGTT--GTT--GG-ATT
gi|26 : -----T--GG-T--TC-GATC--A--T-TG-TG---TT-T--TT-CT-T-TT-CTC-ATGC-AACTG-T-TCT-A------TCACTTGCGAAATATAGA---------TT-----G--------T---------------A----T------A-------------------T--------------A-C-TC-----------TCAT-CAC-A--TCTG---TAG--T-GTATAT--TT-AGT--------G-T--TT--A-ttagtgttatatat
gi|27 : t--------------A----T------A-------------------T--------------A-C-TC-----------CCTT-CAT-A--TACG---TAG--T-GTAGAT--TT-AGT--------G-T--TT--A-G-----ATTCTTGGGGGGT---TT---ATA-T--TT------TTTT-T--TTCAT-TTCTCATGT-A-TTT-CTTAT---AACCATA-A-TTCG---TCCTG-A-AGA-A-GG-G-A-CA--GGT-CGTCC-C---G-A-A-AAT--------TT-G------------A-------------C----------Ttcattcccttcacgatctatgtttaaattatttccctcgttgttgatcatat
gi|28 : T---TTG-T--TTTT---GTTTT-T--TTAAT-T-CTCATGT-T-TTT-CTAAT---AATCATA-T-CCTG---TCCTG-A-AGA-A-GG-G-A-AA--GGT-TGTCT-C---G-A-A-AAT--------TT-G------------ACT-----------T----------TATAATTTTTG---GG--T------CG-TT-G-ATAA------------T-AAT-C--TT---T----CG-G-TTT---T-G-T-------------CCT---T---GCA-TT--T--TTCATTAGATCCGACAttatcacttttgtgt
gi|29 : aGGTAA---ATG-CCAAAA-C-CTCCTA--A-TTT--A----TTTCCGGAA--------AA-------------GTT---T-GA--AT-TTT--GTTGC-TAG--T---CACTGA-G--------------------T-CGGT-T-GTATT-TCATTGCT--GAA---------------GCA-TGATGTAA-TT-TC---AT-AT--ACT-CTCACCGC--ATCT----G---TAGA-G-C-A-GAT-GTAG-TGT-TGAGTT
gi|3 : aGGTAA---ATA-TCAAAA-C-CTCCCA--A-TTT--A----TTTTATGAA--------AAGTCACGTGATCCGGTT---T-GA--A--TTTC-GACGG-TAG--T---CATTGA-G-TC-GA--------------T-CGGTGG-GTACTCTTCTTACT--GAATCGTTCTAGC--ATTGCA-TAATGTAG-CT--T---TT-AT--ATA-CTCATTG-----------G---T----G-C-A-GAT-TTAG-TGT-ATAGTTGTCAT----T--GG-T--TC-GATC--A--T-TG-TG---TT-T--TT-CT-T-TT-CTC-ATGT-AACTG-T-TCTAA------C----------------A---------TT-----G--------CA--------------AAATGT------AGCTTGTATT----------T--------------A-C-TA-----------TCAT-CAA-A--TATG---TAG--T-GTAGAT--TT-AG--------------TT--C-G-----ATT-----GTG---------------------------TT-T--TTCAT-TTCTCTTGT-A-TTT-CATAT---AA
gi|30 : tcagaatgaacgtgagcgctaagccctaacagactttacttctcgtctctcctcacgacgtatacccatagtgattttcattgattttcagttaattttaaatttattgggttattatttattcagtattagacgttttttatttgggttattgaaacaattttattcgggttattaatcattagttcgtgaggagtatattttgtaaggaacgactactatgacgaacgagttactttacttagttattttac-GTAG-TGT-TG----------------------TT-GATC--A--T-TG-CGGGGTT-T--TT--T-T-TT-CTC-ATGT-AACTG-T-TTTAA------C----------------A---------TT-----G--------TA--------------A----T------A-------------------T----------------------------------------------G---TAGACT-GTATA----A-AAT--------G-C--CA--T-C-----ATTCATTGG-GTT---TT---TT------------------------AT-TTCTCATGT-A-TTT-CTTAT---AATCATT-C-CCt
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gi|37 : a-G-A-CG--GGT-CGTCT-G---G-A-A-AAA--------TT-GACGATTA-----A-------------T----------TG-----TT-A---TG--T------CG-CT-G-GTTA---TT-T-----A-AGTG---TT---TA----G-G-TCT---T-G-TG-T---T---TGACCT---T---GCA-TCAGTA-CTT-ACAGAT------------------ATCG---GGTGTT--GTT--GGAATTttat
gi|39 : ------------A-------------T----------TG-----TTCA---TG--T------TA-TT-G-GTTG---TT-T-----T-AGTGC--TT---TATA-TA-A-------------------------------T---GCA-TC--TG-TTTTGTAGAT-AGACACTGAT--AGG-TATCG---GGTA-C--GTT--GGAATTtag
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gi|40 : gctatacgtagtaaatttcattaatttcatttataattttatttgggttatgatcattcagttgtgagacattttatttgggtattgaacatttttattcgattataataatcatttagcgtgaagagtatataagtatattttaggaaacgatacatggagacgagttactttaagcttgtgaatt---TG--C------CG-TT-G-GTCA---TT-C-----T-CTTGC--TC---TATA-TATA-GTTACAC-G-GA------C--TGATCT---T---GCA-TT--TA-TTTGATAGATCTGATACTATT---GTGCAATG---AGTG-T--GTTTCGGTTTTAa
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gi|42 : ttacc-C-CTTG---TCCCCCA-AA--A-TG-G-A-TG--GAT-CGTCC-C---G------AT--------TT-G------------A-------------A----------CC-----TCAA---T---T------CG-TT-G-GTCAT--TT-C-----T-AGTGC--TTATATATA-TT-T-TTT---T-G-CA-T---TT--TGACCT---T---Gtcctactgaactgtttt
gi|43 : tcTGTCA-----TT-GG-T--TC-GATC--A--T-TG-TG---TG-T--TTTGT-T-TT-CTC-GTGT-AACTG-T-TCTAA------C----------------A---------TT-----G--------AAAAAATGAAGCTTGTA----T------A-------------------T--------------A-C-TC-----------CCAC-CAC-A--TCTG---TA
gi|44 : CATGT-A-ATT-CTTTT---AATCTTA-C-CCCGTCATCCTG-A-AGA-A-GG-G-A-CA--GAT-TAGCC-C---G-A-A-AAA--------TC-G------------A-------------CAATTTTTTTATG-----TTTG---TG--C------CT-TT-G-GTC
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gi|5 : taccT-TTAAAGCT--GAATCGATGCAAC--ATTGCA-TAATGTAA-TTTGT---TT-AT--ACT-CTCACCTT--ATCT----A---TATAGTGC-G-GAT-GTAG-CAT-TGAGTTGTCA-----TT-GG-T--TT-GATC--A--T-TG-CG---GT-T--TT--T-T-TC-CTC-ATGT-AACTG-T-TTT-AA-----C----------------A---------TT-----G--------TA--------------A----T------ACCGGTATGTAGACTGTTTAT--------------A-C-TA-----------CCAT-CAT-A--TCCA---TAC--T-GTAGAT--TT-AGT--------G-T------A-A-----GTT-------GTT---TT---GGG-T--TT-------TTT-T--TTTAA-CTCGCATGC-A-TTT-CTTAT---AATCATA-C-CCCG---TCCTG-A-AA--AAGG-G-A-CA--GGT-CGTCC-C---G-A-A-AAT--------TT-G------------A-------------TAATTTCAT--TG-----TTCA---TG--T------CG-CT-G-GTCG---TT-C-----T-AGTGC--TT---TATA-TG-A-TTT---C-A-TA-T---TA--TGATCT---T---GCA-TC--TA-TTTAATATATCCGACACCATT--AAT-CATAT---AGTGTT--GTT--GGTATTttgg
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gi|53 : cgttta--A-GG-G-A-CA--GGT-TGTCA-T---GAA-A-AAT--------TT-G------------A-------------CAA--------T------TTCATACTG--T------CA-AT-GTGTGA---TT-T-----T-AGTGC--TT---TATA-atca
gi|54 : -TTT---T-G-TA-T---T---TGACCT---T---GTA-TT--TA-CTATGTAGATCCGACATTCT
gi|55 : aacCCTG-A-GG--A-AGAG-A-CA--TGT-CGTTT-CTCTG-ATC-AAT--------CT-A------------A-------------T----------TG-----TTCG---TG--T------CG-TT-G-TTCA---Ttgttcttggatttcagta
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16 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-329 ) : TAAGGGTAA---ATG-CTAAAA-C-CTCCCA--T-TTT--A----TTTCCGGAA--------AA-------------GTT---T-GA--A--TTT--GANGC-TAG--T---CATTGA-G-TT-GC--------------T-CGGT-T-GTACT-TTATAGCT--GAGTCGACGTAAC--ATTGCA-TAATGTAA-TT-GT---TT-AT--ACT-CTCACCGC--ATCT----A---T----T-C-A-GAT-GTAG-TGT-TGAGTTGTCA-----T--GG-T--TT-GATC--A--T-TG-CG---TT-T--TTACT-T-TT-CTC-ATGT-AACTG-T-TTT-A------C----------------A---------TT-----G--------TA--------------A----T------A-------------------T--------------A-C-TC-----------CCAT-CAT-A--TCCG---TAG--T-GTAGAT--TT-AGT--------G-T--TT--AG-----ATTCTTTGGTG----TTTT----TG-TTT------G---TTTT-T--TTCAT-TTCTCATGT-A-TTT-CTTAT---AACCATA-C-CCCG---TCCTG-A-AG--A-GG-G-A-CA--GGT-CGTCC-C---G-A-A-AAT--------TT-G------------A-------------T----------TG-----TTCG---TG--T------CG-TT-G-GTCA---TT-C-----T---AG-----TGC--TT---TATATG-ATTT---C-G-TAT---TCTG--ATCT---T---GCA-TC--TA-TTCGATAGATCCGACACTNTG--AGT-CATNG---AGTGTT--GTT--GGTATTA
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gi|10 : cattttgatttccgtttactttttaatttatatttgatttttgaatcattcagtccgtgaaacttttattcgggtatttgaaacaattatattgggatttataaattttgtggtcgttgaaaaagattatttcgttaggtacgactaccggataacgaacgagtactttactgtgaattAAGGGTAATAAGTG-CTACAA-CTCTGCCAATT-TTT--AGCATTTCCCCGAA--------AA-------------CTT---TTGACAA--TTTC-GAAGC-TAGCTT---CATTGACA-TTAGC--------------T-CCGT-T-G-A---TTCTAGCC--GACTCAA----AT--ATTGCAGTAATGCTA-TT-GT---TC-ATCGACC-TTCACCGG--ATCT----A---T----T-CTA-GCTTGTAG-TGT-TGAACTGTAA-----T--TG-TGCTT-GA-C--A--T-TAACG---TTGT--TTACT-T-TTTCTC-ATGT-AAG-G-TCTTT-A------CGAGTCAT---------A---------TTAGACAG--------TA--------------A----T------A------------------------------------C-TC-----------CGATTCA--A--TCCG---TAG--T-GTAAATCATT-AGTTC------G-T--TTA-AG-----ATTCT----TG----TTTC----TT-TTT------C---AATT-T--TTCATATTCTCGTG--A-TTT-CTTAT---AACCA
gi|11 : aacgagttaccttacttgtgaactttaTAAC--ATTGCA-TAATGTAA-TT-TT---AT-AT--ACT-CTCACCAC--ATCT----A---TAA--TGC-A-GAT-GTAG-TGT-TGAGTTGTTA-----TT-GG-T--TT-GATC--A--T-TG-CG---TT-T--TT-CT-T-TT-CTC-ATGT-AACAG-T-TTT-AA-----C----------------A---------TT-----G--------TA--------------A----T------A-------------------TGTAGCCTGTATAT-A-C-TC-----------CCAT-CAT-T--TCCG---TAG--T-GTAGAT--TT-AAT--------G-T--TT--AG-----TTTCATTG-------------------TT------A---TTTT-T--TTC-------CATTT-A-T-------C---AATCATA-C-CCCG---TCCTG-A-AGA-A-GG-G-A-C-----------------------AAT--------TT-A------------A-------------T----------TG-----TTCG---TG--T------TG-TC-T-GTCA---TT-C-----T---AG-----TGC--TT---TAT---------------------------ATCT---T---GCA-TC--TA-TTTAATAGATCCGACATCCTG--AGT-CATAGTGTTGTGTT--GTT--GGTATCAata
gi|12 : aaaattacatatagcattTAAGGGTAA---ATA-CTAAAA-C-CTCCCA--T-TTT--A----TTTCCGGAA--------AA-------------GTT---T-GA--A--TTTT-GTTGC-CAG--T---CATTGA-G-TT-GC--------------T-CGGT-T-GTACT-TTATAGCT--GAGTCGACGTAAC--ATTGCA-AAATGTAA-TT-GT---TC-AT--ACT-CTCACCGC--ATCT----A---T----T-C-A-GAT-GTAG-TGT-AGAGTTGTCA-----TT-GG-T--TT-GATC--A--T-TA-CG---TT-T--TTATT-T-TT-CTC-ATGT-AACTG-T-TTT-A------C----------------A---------TT-----G--------TA-------------------T------A-------------------T--------------A-C-TC-----------CCAT-CAT-A--TCTG---TAG--T-GTAGAT--TT-AGT--------G-T--TT--AG-----ATTCTTTG------------------T-------------TTT-T--TTCAT-TTCTCATGT-tagttcta
gi|13 : gaacgactactaggacgaacgagttactttacttatgaatt--TT-GATC--A--A-TA-CA---TT-T--TTA-T-T-TT-CTC-ATGT-AACTG-T-TTT-A------C----------------A---------TT-----G--------TA--------------A----T------A-------------------TGTAGACAGTATAT-A-C-TC-----------CCAT-CAT-A--TCCG---TAG--T-GTAGAT--TT-AGT--------G-T--TT--GG-----ATTCTTTGG---------------A-TTT-----------TTT-T--TTCAT-TTCTCATGT-A-TTT-CTTAT---AACCATA-C-TCCG---TCCTG-A-AG--AAGG-G-A-CA--GGT-CGTCC-C---G-A-A-AAT--------TT-G------------ACAATTTAA-----T----------TG-----TTCG---TG--T------CG-TT-G-GTCA---TT-C-----T---AA-----TGC--TT---TATATG-ATTT---C-A-TAT---TCTG--ATCT---T---GAA-TC--TC-TGAGATAGATCCGACACCATG--AGT-CATAG---AGTGTT--GTT--GGCATTA
gi|14 : GGTAA---ATG-TTAAAA-C-CTCCCT--T-TTC--A----TCTCCGGAA--------AA-------------tagtgcgct
gi|15 : tgccagaatggagtgagctaagccctattggactttcttttcacgacctatgctcacagtaaattcaattaattttcagctaaatttctaatttatttaagttatgatttattcagtcgttagacattttcattcgggttatttagactttttattcggttagtaatctttaattcgtaatgaatatgtctttttaaggaacgactactatgacgaatgagttactttactaatgatttttacTT-A-----------------------A---------TT-----GAT------TA--------------A----T------A-------------------T--------------AAT-TT-----------CCAT-AGT-T--CCCT---T----T-GTAGTT--TT-AGTTGTACATAG-TG-CT--AG------TTCTT----G----TTTT----T--TTT------GGGGTTTT-T--TTCAC-T--TGGTGTAA-TTTATTTGT---GTCCAGA-C------------G-A-----A-GG-A-A-CT--GGC-TGTTC-C---G-A-A-AAT--------TT--------------A-------------T----------TA-----CACA---T---T------AA-TT-G-GCCA---TT-TG----T---AG-----TGC--TT---TATATG---TT---C-GTTTT---TCTG--GCCTACAT---GTA-TG--TA-T----CAGATCCGACAATTTG--AGA-TGTCT---AGTGAT--GTT--GATTTTAa
gi|16 : a---------TT-----G--------TAT-------------A----T------A-------------------CG-------------A-C-TC-----------TCAT-CAC-AC-TCTGCCCTAA--A-GTTAAT--TC-AGT--------G-TC-TT--AG-----TTTCATTG--------------------T------G---TTTT------------CTCATGT---------TAT---AATC-TA-C-CCCG---TCCTG-A-AG--A-AG-A-A-CA--GGTCCGTCC-C---G-A-A-AAT--------TT-GACATTTTAT---A-------------T----------TG-----TTCG---TGT-T------CG-TCGG-GTCT---TT-C-----TA--AA-----TGC--TT---CATATG-ATCTA--C-A-TAT---TCTG--ATCC---CA--ATA-TC--TA-TTTAATAGATCCGACACCATGATAG--CATTG---AGTGTTC-GTT--tt
gi|17 : tagcTAA---ATG-TCAAAA-G-CTCCCA--A-TTT--A----TTTCTGGAATAATGTTCAATGTCATCCC----GTT---T-GA--A--TTT--GACGC-AAG--T---CATTGA-G-AT-GTGTGTTCTTATGACAT-CGGT-T-GTGCT-TTAC--CTACGAGCTGTCCTAAC--ATTGCA-AGTTGTAGCTT-GTATATT-AT--ACTACTCATCAC--ATCTTGTAG---T----G-C-A-GAT-TTAGTTGT-TTAGTGGTCG-----TTGGG-T--CT--CTC--T--T-CG-TG---TT-T-----CT-T-TT-CTC-ATGT-AAa
gi|18 : TAAGGGTAA---ATG-CTAAAA-C-CTCCCA--T-TTT--A----TTTCCATAA--------AA-------------GTT---T-GA--A--TTTC-GAAGC-TAG--T---CAATGA-G-TT-GC--------------T-CGGT-T-GTGCT-TTATAACT--AAGTCGACGTAAT--ATTGCA-TAATGTAA-TT-GT---TC-AT--ACT-CTCACCAC--ATCT----A---T----T-C-A-GAT-GTAG-TGT-TGAGTTGTCAT----T--GG-T--TT-GATCAAA--T-TA-CG---TT-T--TTATT-T-TT-CTC-ATGT-AACTG-A-TTT-A------C----------------A---------TT-----G--------TA--------------A----T------A-------------------
gi|19 : -----G--------TA--------------G----T--------------------------T--------------A-T-TC-----------TC---CAT-AGTTCCC---T-T--T-GTAGTT--TT-AGT----------T--GT--AC-----AT-----AGTGCTAGTTCT----TG-TTTT-----G---TTTTCT--TTCAC-TTT--ATGT-AATTT-ATT-T---GTTTGT-------G---TACAG-A-CG--A-AG-G-A--ATTGGC-TGTTC-C---A-A-A-TAT--------TT-G------------ACAATATCAACTAAT----------TG-----TTCG---TG--T------CA-TT-G-GCCAT--TT-T-----T---AG-----TGC--TT---TATATA---TT---C-GTTTT---TCTG--GTCT---A---ATA-TC--TA-AGCATTAGATCCGACACTTTG--AGcgtaaggaca
gi|2 : taTAAGGGTAA---ATGGCTAAAA-C-TTCC-A--T-TTT-------TTTCCG-AA--------AA-------------GTT---T-GA--A--TTTTTGAAGC-TAG--T---CATTGG-T-TT-GC--------------TGCGTT-TTGTACT-TTGTAGCT--GAGTCGA-GTAAC--ATTGCA-TA-TGTAA-CT-GT---TT-AT--ACT-CTCAC-GC--ATCT----A---T----T-C-AAGAT-GAAG-TGTATGAGTTGTAT-----T--GG-T--TTTGATC--A--T-TG-------T-T--AAACTATGTT-CTC-ATGT-AA-TG-T-TTC-A------C----------------A---------TT-----GG-------TA--------------A----T------A-------------------TGTAGACAGTATAATA-C-TC-----------C-AT-CGT----TTCG---TAG--T-GTACAA--TT-AGT--------G-T--TTTAAG-----ATTTTTTG----------T----TG-TTT------------TT-T--TTCAT-CT-TCATGT---TAT-CTTGT---AAC-ATAAT-TCCG---TCCTG-A-AG--AAGG-G-A-CA--TGT-CGTCC-----G-A-A-AAT--------TTTG------------ACAATCTA------T----------TG-----TTCG---TG--T------CG-TT-G-GTCAT--TT-C-----T---AG-----a
gi|21 : attcattttgatttccagtttattttaattttttatttgatttatgaatcatcagtcttaaaacattttattcgggtattgaaacactttttatttgggattttaatcttgtggtcgtgaaaaatatatttcgttaggtacgactctatgacgaacgagttactttacttgtgaattTGCCA-----TT-GG-T--TT-GACC--A--T-CG-TG---TT-T--TT-CT-T-TT-CTC-GTGT-AACTT-T-TTTAA------C----------------A---------TT-----T--------AA--------------A----T------A-------------------T--------------attatgc
gi|21 : agtatatacaggctac--TTT--GTTGC-TAG--T---GACTGA-G-T--------------------CGGT-T-GTACT-TCTTTGCT--GAATCCTTGTAAC--AT---A-GAAT-----------------T--ACT-CTTACCGC--ATCT----G---TAG--TGC-A-GAT-GTAG-TGT-TGAGTTGTCAT----T--AG-T--TT-GACA--A--T-Ttttttgttgctagtgactgagtcggttgtacttctttgctgaatccttgtaacatagaattactcttaccgcatctgtagtgcagatgtagtgttgagttgtcattagtttgacaatt
gi|22 : agtatatacaggctacatatttaaatgttaaaaaagttacacgagaaaagaaaaacacgatggtcaaaccaatggcattTTG-T--TTCCT-TTCTAAGGC-A-TTT-CATGT---AATCATA-C-CCCG---TCCTA-AGAA--A-GG-G-A-CA--GAT-CGTCT-C---G-A-A-AAT--------TT-G------------A-------------C----------AA-----TT-----TG--T------CG-TA-G-GGTA---TT-C-----T---AG-----TAT--TT---TATATATATTT---
gi|23 : tcgtgtttcacaaacacatcT-----G--------TA--------------T----T------A-------------------T--------------A-C-TC-----------TCAT-CAC-A--TTT----TGG--TTGTAGAT--TT-AAT--------G-T--TT--AG--------------TG----TCAT----TG-T--------G---TTTT-T----CCT-TTCTCAT--------------------CAT----CCCG---TCC-G-A-GG--A-AG-G-A-CA--GGT-CGTTCAC---G-A-ATAATAAAAAAA-GT-A------------A-------------T----------TG-----TCTG---TG--T------CG-TT-A-GTCA---CT-C-----T---AG-----TGC--TT---TGTATA-ATTA---CAG-CTT---TCTG--Agacacacacacacacacacacacgcacgcacgcacgcacgcacgcacagacacacagtac
gi|24 : cta-----T--GG-T--TT-GATC--A--T-TG-TG---TT-T--TT-CT-T-TT-CTC-ATGT-AATTG-T-TTT-AA-----C----------------A---------TT-----GCAGTACTTTA--------------A----TGTATGTA-------------------T--------------A-C-TC-----------TCAT-CAC-A--CCTG---TGG--T-GTAGAT--TT-AGT--------G-T--TT--AG-----TTTCATT-GTG------------------------------TT-T--TTCAT-TTCTCATGT-A-TTT-CTTAT---AATCATA-C-CCAG---TCCTG-A-AG--A-AG-
gi|25 : atTG-AGAA--A-GG-G-A-CG--GGT-CGTCC-C---A-A-G-GAT--------CT-ATCGA--------A-------------T----------TG-----TTTG---TG--TGACTGTCG-TT-G-GTCA---AA-T-----T---TG-----TGT--TT---TTTGTA-ATTTT--C-G-TATAAATTTG--ACCT---T---GCA-TC--TG-CTATGTAGATCCGACATTTCT--AGG-TATCG---GATGTT--GTT--GG-ATT
gi|26 : -----T--GG-T--TC-GATC--A--T-TG-TG---TT-T--TT-CT-T-TT-CTC-ATGC-AACTG-T-TCT-A------TCACTTGCGAAATATAGA---------TT-----G--------T---------------A----T------A-------------------T--------------A-C-TC-----------TCAT-CAC-A--TCTG---TAG--T-GTATAT--TT-AGT--------G-T--TT--Attagtgttatatat
gi|27 : t--------------A----T------A-------------------T--------------A-C-TC-----------CCTT-CAT-A--TACG---TAG--T-GTAGAT--TT-AGT--------G-T--TT--AG-----ATTCTTGGGGG----GTTTA---TA-TTT----------TTTT-T--TTCAT-TTCTCATGT-A-TTT-CTTAT---AACCATA-A-TTCG---TCCTG-A-AGA-A-GG-G-A-CA--GGT-CGTCC-C---G-A-A-AAT--------TT-G------------A-------------C----------Ttcattcccttcacgatctatgtttaaattatttccctcgttgttgatcatat
gi|28 : TT----TG-TTTTT----G---TTTT-T--TTAAT-T-CTCATGT-T-TTT-CTAAT---AATCATA-T-CCTG---TCCTG-A-AGA-A-GG-G-A-AA--GGT-TGTCT-C---G-A-A-AAT--------TT-G------------ACT-----------T----------TATAATTTTTG---GG--T------CG-TT-G-ATAA------------T---AA-----T-C--TT---T---CG-GTTT---T-G-T------------CCT---T---GCA-TT--T--TTCATTAGATCCGACAttatcacttttgtgt
gi|29 : aGGTAA---ATG-CCAAAA-C-CTCCTA--A-TTT--A----TTTCCGGAA--------AA-------------GTT---T-GA--AT-TTT--GTTGC-TAG--T---CACTGA-G--------------------T-CGGT-T-GTATT-TCATTGCT--GAA---------------GCA-TGATGTAA-TT-TC---AT-AT--ACT-CTCACCGC--ATCT----G---TAGA-G-C-A-GAT-GTAG-TGT-TGAGTT
gi|3 : aGGTAA---ATA-TCAAAA-C-CTCCCA--A-TTT--A----TTTTATGAA--------AAGTCACGTGATCCGGTT---T-GA--A--TTTC-GACGG-TAG--T---CATTGA-G-TC-GA--------------T-CGGTGG-GTACTCTTCTTACT--GAATCGTTCTAGC--ATTGCA-TAATGTAG-CT--T---TT-AT--ATA-CTCATTG-----------G---T----G-C-A-GAT-TTAG-TGT-ATAGTTGTCAT----T--GG-T--TC-GATC--A--T-TG-TG---TT-T--TT-CT-T-TT-CTC-ATGT-AACTG-T-TCTAA------C----------------A---------TT-----G--------CA--------------AAATGT------AGCTTGTATT----------T--------------A-C-TA-----------TCAT-CAA-A--TATG---TAG--T-GTAGAT--TT-AG--------------TT--CG-----ATT-----GTG------------------------------TT-T--TTCAT-TTCTCTTGT-A-TTT-CATAT---AA
gi|30 : tcagaatgaacgtgagcgctaagccctaacagactttacttctcgtctctcctcacgacgtatacccatagtgattttcattgattttcagttaattttaaatttattgggttattatttattcagtattagacgttttttatttgggttattgaaacaattttattcgggttattaatcattagttcgtgaggagtatattttgtaaggaacgactactatgacgaacgagttactttacttagttattttac-GTAG-TGT-TG----------------------TT-GATC--A--T-TG-CGGGGTT-T--TT--T-T-TT-CTC-ATGT-AACTG-T-TTTAA------C----------------A---------TT-----G--------TA--------------A----T------A-------------------T----------------------------------------------G---TAGACT-GTATA----A-AAT--------G-C--CA--TC-----ATTCATTGG-G----TTTT-----------------------------TTAT-TTCTCATGT-A-TTT-CTTAT---AATCATT-C-CCt
gi|32 : gaCCCG-C-AG--A-AG-G-AACA--GGT-CGTCC-C-------A-AAT--------TT----------------------------------------------TTCAA--TC--T------CA-AT-T-GTCA---AT-T-----T---AG-----TGC--TT---CTCATA-ATT------G-T------TTG--ATCT---T---GTT-TC--CA-TTTGGTGCATCCGACACTa
gi|33 : ttttatttattccgtgcatatctgtaaa---G-A-C-AAT--------TT-A------------A-------------T----------TG-----TTCG---TG--T------CG-TT-G-GTCA---TT-C-----T---AGGATAGTGC--TT---TATATG-ATTT---C-A-TAGG--TCGGGGATCT---T---GCA-TC--TA-T-CAATAGATCCGACACTTTG--CAT-AATTG---AGTGTT--GTT--GGTATTAga
gi|34 : aatttTG-A-AG--A-AAAG-A-CA--GGT-TTTCC-C---G-A-A-AAT--------TT-G------------ACACTTTATTA---T----------TC-----TTCG---TG--T------CG-TT-G-GTCA---TTAT-----T---AA-----TGC--TT---TTTATA---TC---C-T-TATTTATTTG--ACAT---T---GCA-TC--TA--CCATTAGATCTGACAATATG--ttat
gi|36 : --------TT-A------------A-------------T----------TG-----TTC----TG--T------CG-TT-G-GTCA---TT-C-----TGATAG-----TGC--TTA--TAT-TG-ATTTT--C-A-TAT---TCTG--ATCT---TAGGGCA-TC---A-TTCAATAGATC-GACACTTTG--AGT-AATTA---CGTGTT--GTT---GTATTAgatg
gi|37 : a-G-A-CG--GGT-CGTCT-G---G-A-A-AAA--------TT-GACGATTA-----A-------------T----------TG-----TT-A---TG--T------CG-CT-G-GTTA---TT-T-----A---AG-----TG---TT---TA---G-GTCT---T-G-TGT---T-TG--ACCT---T---GCA-TCAGTA-CTT-ACAGAT------------------ATCG---GGTGTT--GTT--GGAATTttat
gi|39 : ------------A-------------T----------TG-----TTCA---TG--T------TA-TT-G-GTTG---TT-T-----T---AG-----TGC--TT---TATATA-A-----------------------------T---GCA-TC--TG-TTTTGTAGAT-AGACACTGAT--AGG-TATCG---GGTA-C--GTT--GGAATTtag
gi|4 : aTAAGGGTAA---ATG-CTAAAA-C-CTCCCA--T-TTTTAA----TTTCCGGAA--------AA-------------GTT---T-GA--A--TTT--GATGC-TAG--T---CATTGA-GTTT-GC--------------T-TGGT-T-GTACT-TTATA-CT--GAGTCGACGTAAC--ATTGCATTAATGTAA-TT-GT---TTAATG-ACT-CTCACCACTAATCT----A---T----T-C-A-GAT-G-AG-TGT-TGAGTTGTCAT----T--GGTT--TT-GACC--A--TCTA-CG---TT-T--TTATT-T-TT-CTCAATGTAAACTGTT-TTT-A------CTTGTA-----------A---------TT-----G--------TAGCAGT---------A----T------A-------------------T--------------A-CTTC-----------CCAT-CATAA--TCCG---TAA------AGAG--TTAAGT--------GTT--TT--AG-----ATTCTT--GT-----------------------------TTTT-T--TTCAT-TTCTCATGT-A-TTT-CTTAT---AACCATA-tcatgctgttatgtattc
gi|40 : gctatacgtagtaaatttcattaatttcatttataattttatttgggttatgatcattcagttgtgagacattttatttgggtattgaacatttttattcgattataataatcatttagcgtgaagagtatataagtatattttaggaaacgatacatggagacgagttactttaagcttgtgaatt---TG--C------CG-TT-G-GTCA---TT-C-----T---CT-----TGC--TC---TATATATAGTTACAC-G-GA-----CTG--ATCT---T---GCA-TT--TA-TTTGATAGATCTGATACTATT---GTGCAATG---AGTG-T--GTTTCGGTTTTAa
gi|41 : gtaGTTA---ATA-CCAAAA-C-CTCCG-----TTT--A----TTTTCGGAA--------AA-------------GTCACGT-GA------TC--GACG---AA--TCCCCATTGA-T-TC-AA--------------T-CGGC-T-GTGCT-TT
gi|42 : ttacc-C-CTTG---TCCCCCA-AA--A-TG-G-A-TG--GAT-CGTCC-C---G------AT--------TT-G------------A-------------A----------CC-----TCAA---T---T------CG-TT-G-GTCAT--TT-C-----T---AG-----TGC--TTATATATATT-TTTT---T-G-CAT---TTTG--ACCT---T---Gtcctactgaactgtttt
gi|43 : tcTGTCA-----TT-GG-T--TC-GATC--A--T-TG-TG---TG-T--TTTGT-T-TT-CTC-GTGT-AACTG-T-TCTAA------C----------------A---------TT-----G--------AAAAAATGAAGCTTGTA----T------A-------------------T--------------A-C-TC-----------CCAC-CAC-A--TCTG---TA
gi|44 : CATGT-A-ATT-CTTTT---AATCTTA-C-CCCGTCATCCTG-A-AGA-A-GG-G-A-CA--GAT-TAGCC-C---G-A-A-AAA--------TC-G------------A-------------CAATTTTTTTATG-----TTTG---TG--C------CT-TT-G-GTC
gi|45 : -CA--GGT-CTTCC-C---G-A-A-AAT--------TT-GACAATCTA----A-------------T----------TG-----TTCG---TGATT------CGATT-GCGTCA---TT-TAGA--TA--AG-----TGC--TT---CATAT--AT-------A-TAT---T-----ATCT---T----CA-T
gi|46 : G-----TGC--TT---TACGTA-ATTT---TTG-TAT---T-TG--ACAT---T---GTA-TC--TACTTCGA-AGATCCGACATTTCT--AGA-TATAT---A-TGTTGGGTT--GGta
gi|47 : attA-C-CCTGC--TCCTG-A-AG--A-AG-G-A-CA--AGG-TATCC-C---A-A-A-AAT--------TT-GACCAATCGTTATA-------------T----------TGT----TTCG---TT--T------CG-TC-G-GTCA---TT-T-----T---actt
gi|5 : taccT-TTAAAGCT--GAATCGATGCAAC--ATTGCA-TAATGTAA-TTTGT---TT-AT--ACT-CTCACCTT--ATCT----A---TATAGTGC-G-GAT-GTAG-CAT-TGAGTTGTCA-----TT-GG-T--TT-GATC--A--T-TG-CG---GT-T--TT--T-T-TC-CTC-ATGT-AACTG-T-TTT-AA-----C----------------A---------TT-----G--------TA--------------A----T------ACCGGTATGTAGACTGTTTAT--------------A-C-TA-----------CCAT-CAT-A--TCCA---TAC--T-GTAGAT--TT-AGT--------G-T------AA-----GTT-------G----TTTT----GG-GTT----------TTTT-T--TTTAA-CTCGCATGC-A-TTT-CTTAT---AATCATA-C-CCCG---TCCTG-A-AA--AAGG-G-A-CA--GGT-CGTCC-C---G-A-A-AAT--------TT-G------------A-------------TAATTTCAT--TG-----TTCA---TG--T------CG-CT-G-GTCG---TT-C-----T---AG-----TGC--TT---TATATG-ATTT---C-A-TAT---TATG--ATCT---T---GCA-TC--TA-TTTAATATATCCGACACCATT--AAT-CATAT---AGTGTT--GTT--GGTATTttgg
gi|52 : ---TCCTGCG-AA--A-GG-G-A-CG--GGTTCGTCC-C---T-A-G-GATCA------TC-G------------AA------------T----------TG-----TTTG---TG--T------CG-TT-G-GTCA---Tttatttcatctattgcattgattagctcttgcaaatcatattaatttttcacctcttgaatttgtaacatt
gi|53 : cgttta--A-GG-G-A-CA--GGT-TGTCA-T---GAA-A-AAT--------TT-G------------A-------------CAA--------T------TTCATACTG--T------CA-AT-GTGTGA---TT-T-----T---AG-----TGC--TT---TATAatca
gi|54 : TTT---T-G-TAT---T-TG--ACCT---T---GTA-TT--TA-CTATGTAGATCCGACATTCT
gi|55 : aacCCTG-A-GG--A-AGAG-A-CA--TGT-CGTTT-CTCTG-ATC-AAT--------CT-A------------A-------------T----------TG-----TTCG---TG--T------CG-TT-G-TTCA---Ttgttcttggatttcagta
gi|56 : g--ATCT---T---GCA-TC--TA-TTCAATAG-TCCGAGACTTTG--AGT-CATTG---AGTGTT--GTT--GG-ATTAa
gi|58 : aCCTG-AGAA--A-GG-G-A-CG--GGT-CATCC-C---T-A-G-AGT--------CT-ATCGAAT------A-------------T----------TG-----TTCG---TG--T------Ctagt
gi|59 : aa-A-CG--GGT-CGTCC-T---G-A-A-AATTAGATGACTT-A------------A-------------T----------TT-----TTCG---TG--T------TA-TT-G-ATCAATTTT-C-----T---tagg
gi|6 : TAAGGGTAA---A-A-TTAAAC-C-CTCC-A--T-TTA--A----TTTCCGGAA--------AA-------------GTT---T-GA--A--TTT--GATGC-TAG--T---CATTTA-G-TT-GC--------------T-CGGT-T-GTACT-TTATAGCT--GAGTCGACGTAAC--AT-GCT-TAATGTAA-TT-GT---TC-AT--ATC-CTCACCGC--ATCT----A---T----T-C-A-GAT-GTAG-TGT-TGAGTTTTCA-----T--GG-T--TT-GATC--A--T-TA-CG---TT-T--TTATT-T-TT-CTC-ATGT-AACTG-T-TTT-A------C----------------A---------TT-----G--------TA--------------A----T------A-------------------T--------------A-C-TC-----------CCAT-CAT-A--TCCG---TAG--T-GTAGAT--TT-AGT--------G-T--TT--AG-----ATTCTTTGGTG----TTTTTTTTTG-TTT------G---TTTT-T--TTCAT-TTCTCATGT-A-TTT-CTTAT---AACCATA-A-TTCG---TCCTG-A-AG--A-GG-G-A-CA--GGT-CGTCC-C---G-A-A-AAT--------TT-G------------A-------------T----------TG-----GTCG---TG--T------CG-TT-G-GTCA---TT-C-----T---AG-----TGC--TT---TATATG-ATTT---C-A-TAT---TCTG--ATCT---T---GCA-TC--TA-TTCAATAGATCCGACACTATG--AGT-CATAG---AGTGTT--GTT--GGTATTA
gi|60 : G--ATCT---T---GCA-TC--TA-GTTAATAGATCCGACATCACG--AGT-CGTAG---ATTGTT--GT
gi|66 : G---TCCTG-A-AG--A-AG-GCA-CA--GGT-CGTCC-C---T-A-A-AAT--------TT-
gi|7 : tagcatatAAGGGTAA---ATG-CTATAA-C-CTCCCA--T-TTT--A----TTTCTGGAA--------AA-------------GTT---T-GA--A--TTTT-GAAGC-TAG--T---CATCGA-G-TT-GC--------------T-CGGT-T-GTACT-TTATAACC--GAGTCGACGTAAT--ATTTCA-TAATGTAA-TT-GT---TC-AT--ACT-CTCACCGC--ATCT----A---T----T-A-A-GAT-GTAG-TGT-TGAGTTGTCA-----T--TGCT--TT-GATC--A--T-TA-CG---TT-T--TTATT-T-TT-CTC-ATAT-AACTG-T-TTT-A------C----------------A---------TT-----G--------TA--------------A----T------A-------------------TGTAGACAGTATAT-A-C-TC-----------CCAT-TAT-A--TCCG---TAG--T-GTAGAT--TT-AGT--------G-T--TT--AG-----ATTC--TAGT-----------------------------TTTT-T--TTCAC-ATCTCATGT-A-TTT-CTTAT---AACCATA-A-TTGG---TCCTG-A-GGA-A-GG-G-A-CA--GGT-CGTCC-C---G-A-A-AGA--------TT-G------------ACT-----------T----------TATAACTTTTG---TG--T------CG-TT-G-GTCA---TT-T-----T---AG-----
gi|8 : tactacgacgaacgagttaccttacttgtgaattaTAATGTTAG---ATA-TTGGAA-C-GTCCAA--TGCTC--A----TT----AAA--------GA-------------ATA---T--A--T--TTT--GATGC-TAG--T---CATCGA-G-TT-GG--------------T-CAGT-T-GTACT-TTATGGCA--AAATCGTTGTAAC--ATTGCA-TTATGTAA-TT-TT---AT-AT--GCT-CTCACCGC--ATCT----AAAGT----G-A-A-GAT-GTAG-TGT-TGAGTTGTCA-----TT-GG-T--TT-GATC--A--A-TG-CA---TT-T--TT-CT-T-TT-CTC-GTGT-AAATG-T-TTT-AA-----C----------------A---------TT-----G--------TA--------------A----T------A-------------------TGTAGCTTGTATAT-A-C-TA-----------CCAT-CAT-A--TCCG---TAG--T-GTAGAT--TT-AGT--------G-T--TT--GG-----TTTCATTG--------TTT----TGCTTT------G---TTTA-T--TT-AT-TTCTCATGT-A-TTT-TTTTTGTAAATCATA-C-CCCG---TCCTG-A-AG--ACGG-G-A-CA--GGT-CGTCC-C---G-A-A-AAT--------TT-G------------A-------------
gi|9 : taaatatctatgtaatagctacaagagaaaaaaatcaC--------------T-CGGT-C-ATTCT-TTCCTGCG--GAACTGTTTTAAC--TTTGCA-AAATGTAGCTT-GT---AT-AT--ACT-CTCATCAC--ATCT----G---TAG--TGT-A-GTT-ATAG-TGC-GTAGTTTTTATTTATT--GG-T--CT-GATC--ATTT-TG-TG---TT-T--TT-CT-T-TT-CT--ATGC-A-----T-TT---------C----------------A---------TT--------------TA--------------AC---C------A-------------------T--------------A-C-T------------------AT-G--CCCT---GAG--G-ATAAAC--TT-----------------------------TTCTTT-------------------------------------N--TTCTT-TTCT-ATGC-A-TTT-CATTT---AACCATA-C-TCCG---CCCTG-A-ca
gi|9 : aactgttaacgatagtcggattcatgtggatagttgatgatctcactatcaaagtataagacacgttcacccaaaggttctatagtctcgtactaatgtaaacgagtatgactgagctgtgtcaaaacaggctaagtttcgaaaaggacagtctgcctgaaacc-T-TT-CCT-GCGG-AACTG-T-TTT-AACTTTGC----------------AAAATGTAGCTT-----G--------TA-------------------T------A-------------------T--------------A-C-TC-----------TCAT-CAC-A--TCTG---TAG--T-GTAGTT--AT-AGT--------G-C--GT--AGTTTTTATTTATTGGTC----TGAT----CATTTT------G---TGTT-T--TTCTT-TTCT-ATGC-A-TTT-CATTT---AACCATA-C-TATG---CCCTG-A-GG--A-g
blockSeqs : TAA G . T C ATT TA GCAT TAATGTTC GTCACGTGATCCG ACG T CAA TT A . CT CCC C T GTGTGTTCTTATGACA G G T C A AC ACG . G C T ATA A CG A TA TGTAG ATAGTG T A T T A TTTATT T GC T AA TT C A GGG G . AC A G T A A T C A ACATTGTAATACCGGTATGTAGACTGTTTAT A T . T A GT CCC AC T CA A TGTACATA T G TA TTTTTA TTTGGTGTTTTTTTTTGTTTG C . A A A A A GTA A . TCA C G A A A C A TT C A TCT A T T TAGATGAC T ACAATATCAACTAATTG TAC AT GACTGT A G C ATT A AGA GAT GATAG . ATA ATA TCGTATAAATT GG ACA AGG . AG C AG A AT TG A . GG TC C
blockSeqs : . . . . C TG . . . TGTCATCCC . . AT C T . . . . . AGC . . . . A . TCC . T C . . . G . . AAAG AATG . . . . . TTG C . . . . . . . . . AT . . . . . . . A CATTGGTAATATGTAGACAGTATAAT . . . . . C . . . . . TC . C A A AGTGCTAGTTCTTGTTTTG . . . . . . A . . . C C G A A A . . . T . . . . . AAAAAAA . ACCAATCGTTATATTGT A T . . . T T . G A . . A ATA CTTATTTATT . . A . . . TA T . T C . C . T
blockSeqs : . . . . C T . . . . . . A T C . . . . . GC . . . . A . ACG . . . . . . . . . A AGTG . . . . . TT . . . . . . . . . . AT . . . . . . . A ACATTGCAGTACTTTAATGTATGTAT . . . . . . . . . . . . . . . T ATTGGTCTGATCATTTTG . . . . . . G . . . . . G A A . . . . . . . . . . CA . ACACTTTATTATTC . . . . . . T . . A . . . GA CGTTTTTC . . . . . . CA A . A T . . . T
blockSeqs : . . . . C T . . . . . . A C A . . . . . GC . . . . A . TTG . . . . . . . . . A AGAG . . . . . TT . . . . . . . . . . AC . . . . . . . A TCACTTGCGAAATATAGATTGTATAT . . . . . . . . . . . . . . . A TTGGGGGGTTTATATTT . . . . . . A . . . . . . A C . . . . . . . . . . . . ACAATTTTTTTATG . . . . . . T . . . . . . GA ACATATTC . . . . . . AT T . G C . . . T
blockSeqs : . . . . C A . . . . . . A C A . . . . . GC . . . . T . TTC . . . . . . . . . A AGTG . . . . . TT . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . ACATTGTAATATGTAGCCTGTATAT . . . . . . . . . . . . . . . A TTGTTTTTTTTGGGG . . . . . . G . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . ACATTTTATATTG . . . . . . . . . . . . . AA CGTTTTTC . . . . . . CA T . T T . . . A
blockSeqs : . . . . T T . . . . . . A T T . . . . . GA . . . . T . ACG . . . . . . . . . A T . . . . . TT . . . . . . . . . . TG . . . . . . . . CATTGAAAAAATGAAGCTTGTATAT . . . . . . . . . . . . . . . T ATTGTTTTGCTTTG . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ACAATTTAATTG . . . . . . . . . . . . . AA CAGCTTTC . . . . . . TG T . T T . . . A
blockSeqs : . . . . C T . . . . . . A . T . . . . . GC . . . . T . ATG . . . . . . . . . A T . . . . . TT . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . ACATTGTAATATGTAGCTTGTATAT . . . . . . . . . . . . . . . A TTGTTTCTTTTTC . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ACAATCTAATTG . . . . . . . . . . . . . GG CATAGGTC . . . . . . CA A . G C . . . T
blockSeqs : . . . . C A . . . . . . A . C . . . . . AA . . . . A . ACG . . . . . . . . . G G . . . . . TT . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . ACTTTGCAAAATGTAGCTTGTATAT . . . . . . . . . . . . . . . A TTTGTTGTTT . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATAATTTCATTG . . . . . . . . . . . . . AA TCATATTC . . . . . . CA T . A C . . . T
blockSeqs : . . . . G A . . . . . . A . T . . . . . GC . . . . A . ACG . . . . . . . . . G T . . . . . TT . . . . . . . . . . C . . . . . . . . CATTGTAATATGTAGACAGTATAT . . . . . . . . . . . . . . . T TGTCATTGTG . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ACAATCTATTG . . . . . . . . . . . . . GA ACACGGAC . . . . . . CA G . T T . . . T
blockSeqs : . . . . C T . . . . . . A . C . . . . . GC . . . . A . TTG . . . . . . . . . G T . . . . . TT . . . . . . . . . . A . . . . . . . . CATTGCAAAATGTAGCTTGTATTT . . . . . . . . . . . . . . . A ATTGGGTTTT . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ACTTTATAATT . . . . . . . . . . . . . GA CATATTC . . . . . . TT A . T A . . . .
blockSeqs : . . . . A T . . . . . . T . T . . . . . GG . . . . A . TTT . . . . . . . . . A G . . . . . TT . . . . . . . . . . C . . . . . . . . CATTGTAATATGTAGACAGTATAT . . . . . . . . . . . . . . . A GTTTTGGGTT . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ACGATTAATTG . . . . . . . . . . . . . GG TGCATTT . . . . . . TG T . T A . . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . . . . A . . . . . . . . . . G . AG . . . . . . . . . A T . . . . . TT . . . . . . . . . . C . . . . . . . . CGAGTCATATTAGACAGTAATA . . . . . . . . . . . . . . . A TTTGGATTT . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ACTTTATAACT . . . . . . . . . . . . . AA TTGTATT . . . . . . CG A . T T . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . T . A . . . . . . . . . A T . . . . . T . . . . . . . . . . C . . . . . . . . CTTGTAATTGTAGCAGTATAT . . . . . . . . . . . . . . . A ATTGTTA . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TCGAATATTG . . . . . . . . . . . . . TT CATATTA . . . . . . TA C . . A . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . A T . . . . . T . . . . . . . . . . C . . . . . . . . ATTGATTAATAT . . . . . . . . . . . . . . . G ATTGTG . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TCGAATTG . . . . . . . . . . . . . AA CATATTC . . . . . . AT T . . A . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . G G . . . . . T . . . . . . . . . . C . . . . . . . . CATTTAAATAT . . . . . . . . . . . . . . . A ATTGTG . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AATTG . . . . . . . . . . . . . GA TGTGTT . . . . . . CA A .
blockSeqs : . . . T . . . . . . . . . . C . . . . . . . . CATTGTAATAT . . . . . . . . . . . . . . . A TTTGT . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ACAAT . . . . . . . . . . . . . GA TGTATT . . . . . . CA A .
blockSeqs : T . . . . . . . . . . C . . . . . . . . CATTGTAATAT . . . . . . . . . . . . . . . T TTGT . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATTG . . . . . . . . . . . . . G ATATT . . . . . . TA .
blockSeqs : T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CATTTAACCAT . . . . . . . . . . . . . . . . TAGT . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATTA . . . . . . . . . . . . . A TGT . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CATTGTATAT . . . . . . . . . . . . . . . . GTG . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ACAA . . . . . . . . . . . . . A GTT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATTG . . . . . . . . . . . . . A . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATTG . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATTG . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . ATTG . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . AACC . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . ATTG . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . ATTT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . ATTG . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . .
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originalCons : TAAGGGTAA---ATG-CTAAAA-C-CTCCCA--T-TTT--A----TTTCCGGAA--------AA-------------GTT---T-GA--A--TTT--GANGC-TAG--T---CATTGA-G-TT-GC--------------T-CGGT-T-GTACT-TTATAGCT--GAGTCGACGTAAC--ATTGCA-TAATGTAA-TT-GT---TT-AT--ACT-CTCACCGC--ATCT----A---T----T-C-A-GAT-GTAG-TGT-TGAGTTGTCA-----T--GG-T--TT-GATC--A--T-TG-CG---TT-T--TTACT-T-TT-CTC-ATGT-AACTG-T-TTT-A------C----------------A---------TT-----G--------TA--------------A----T------A-------------------T--------------A-C-TC-----------CCAT-CAT-A--TCCG---TAG--T-GTAGAT--TT-AGT--------G-T--TT--AG-----ATTCTTTGGTG----TTTT----TG-TTT------G---TTTT-T--TTCAT-TTCTCATGT-A-TTT-CTTAT---AACCATA-C-CCCG---TCCTG-A-AG--A-GG-G-A-CA--GGT-CGTCC-C---G-A-A-AAT--------TT-G------------A-------------T----------TG-----TTCG---TG--T------CG-TT-G-GTCA---TT-C-----T---AG-----TGC--TT---TATATG-ATTT---C-G-TAT---TCTG--ATCT---T---GCA-TC--TA-TTCGATAGATCCGACACTNTG--AGT-CATNG---AGTGTT--GTT--GGTATTA
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16 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-329 ) : TAAGGGTAA---ATG-CTAAAA-C-CTCCCA--T-TTT--A----TTTCCGGAA--------AA-------------GTT---T-GA--A-TTT--GANGCT-AG--T---CATTGA-G-TT-GC--------------T-CGGT-T-GTACT-TTATAGCT--GAGTCGNCGTAAC--ATTGCA-TAATGTA-A-TT-GT---T-T-AT--ACT-CTCACCGC--ATCT----A---T----T-C-A-GAT-GTAG-TGT-TGAG---TT----GTCA-TTG-G-TTT---GATC--A--T-TG-CG---TT-T---TTACT-T-TT-CTC-ATGT-AA-CTG-T-TTT-A-C----------------ATT-----G--------TA--------------A----T------A-------------------T--------------A-C-TC-----------CCAT-CAT-A-TCCG---TAGT-GTAGAT--TT-AGT--------G-T-TT--AGATTC-TT-----GT--TT-T-----G-T--TT---GTT---TTT----------TTCAT-TTCTCATGT-A-TTT-CTTAT---AACCATA-C-CCCG---TCCTG-A-AG--A-GG-G-A-CA--GGT-CGTCC-CGAA-AA-T--T---T---G-AC--A-------TT----T--A-T--TG---TTCG--TG--TCG-TT-G-GTCA---TT-C-----T---AG-----TGC--TT---TATATG-ATTT---C-G-TAT---TCTG--ATCT---T---GCA-TC--TA-TTCGATAGATCCGACACTNTG--AGT-CATNG---AGTGTT--GTT--GGTATTA
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gi|21 : agtatatacaggctac-TTT--GTTGCT-AG--T---GACTGA-G-T--------------------CGGT-T-GTACT-TCTTTGCT--GAATCCTTGTAAC--AT---A-GAAT-------------------T--ACT-CTTACCGC--ATCT----G---TAG--TGC-A-GAT-GTAG-TGT-TGAG---TT----GTCA-TTA-G-TTT---GACA--A--T-Ttttttgttgctagtgactgagtcggttgtacttctttgctgaatccttgtaacatagaattactcttaccgcatctgtagtgcagatgtagtgttgagttgtcattagtttgacaatt
gi|22 : agtatatacaggctacatatttaaatgttaaaaaagttacacgagaaaagaaaaacacgatggtcaaaccaatggcattT---TGT----------TTCCT-TTCTAAGGC-A-TTT-CATGT---AATCATA-C-CCCG---TCCTA-AGAA--A-GG-G-A-CA--GAT-CGTCT-CGAA-AA-T--T---T---G-AC--A----------------A-T--T----------TG--TCG-TA-G-GGTA---TT-C-----T---AG-----TAT--TT---TATATATATTT---
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gi|26 : TTGCG-AAATATAGA-TT-GT---A-T-AT--ACT-CTCATCAC--ATCT----G---T--------A-G-T-GTA--TAT-TTAGTGTTT----ATCA-TTC-C-CTTCACGATC-------TA-TG---TT-TAAATTATT-T-CC-CTC-GTtcattcccttcacgatctatgtttaaattatttccctcgttgttgatcatat
gi|27 : ttggttcgatcattgtgtttttcttttctcatgcaactgttctatcac--------------A----T------A-------------------T--------------A-C-TC-----------CCTT-CAT-A-TACG---TAGT-GTAGAT--TT-AGT--------G-T-TT--AGATTC-TTGGGGGGT--TTAT-----A-T--TT----TT---TTT----------TTCAT-TTCTCATGT-A-TTT-CTTAT---AACCATA-A-TTCG---TCCTG-A-AGA-A-GG-G-A-CA--GGT-CGTCC-CGAA-AA-T--T---T---G-AC----------TT----T--A-T--CACT-TTTG--TG--Ttgttgatcatat
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gi|39 : --A-T--TG---TTCA--TG--TTA-TT-G-GTTG---TT-T-----T---AG-----TGC--TT---TATATA-A-----------------------------T---GCA-TC--TG-TTTTGTAGAT-AGACACTGAT--AGG-TATCG---GGTA-C--GTT--GGAATTtag
gi|4 : aTAAGGGTAA---ATG-CTAAAA-C-CTCCCA--T-TTTTAA----TTTCCGGAA--------AA-------------GTT---T-GA--A-TTT--GATGCT-AG--T---CATTGA-GTTT-GC--------------T-TGGT-T-GTACT-TTATA-CT--GAGTCGACGTAAC--ATTGCATTAATGTA-A-TT-GT---T-TAATG-ACT-CTCACCACTAATCT----A---T----T-C-A-GAT-G-AG-TGT-TGAG---TT----GTCA-TTG-GTTTT---GACC--A--TCTA-CG---TT-T---TTATT-T-TT-CTCAATGTAAA-CTGTT-TTT-A-CTTGTA-----------ATT-----G--------TAGCAGT---------A----T------A-------------------T--------------A-CTTC-----------CCAT-CATAA-TCCG---TAA----AGAG--TTAAGT--------GTT-TT--AGATTC-TT-----GT----------------------TT---TTT----------TTCAT-TTCTCATGT-A-TTT-CTTAT---AACCATA-tcatgctgttatgtattc
gi|40 : gctatacgtagtaaatttcattaatttcatttataattttatttgggttatgatcattcagttgtgagacattttatttgggtattgaacatttttattcgattataataatcatttagcgtgaagagtatataagtatattttaggaaacgatacatggagacgagttactttaagcttgtgaatt--TG--CCG-TT-G-GTCA---TT-C-----T---CT-----TGC--TC---TATATATAGTTACAC-G-GA-----CTG--ATCT---T---GCA-TT--TA-TTTGATAGATCTGATACTATT---GTGCAATG---AGTG-T--GTTTCGGTTTTAa
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gi|42 : ttacc-C-CTTG---TCCCCCA-AA--A-TG-G-A-TG--GAT-CGTCC-CG----A-T--T---T---GAAC--C-------TC----A--A-T-----------------TCG-TT-G-GTCAT--TT-C-----T---AG-----TGC--TTATATATATT-TTTT---T-G-CAT---TTTG--ACCT---T---Gtcctactgaactgtttt
gi|43 : tcT----GTCA-TTG-G-TTC---GATC--A--T-TG-TG---TG-T---TTTGT-T-TT-CTC-GTGT-AA-CTG-T-TCTAA-C----------------ATT-----G--------AAAAAATGAAGCTTGTA----T------A-------------------T--------------A-C-TC-----------CCAC-CAC-A-TCTG---TA
gi|44 : CATGT-A-ATT-CTTTT---AATCTTA-C-CCCGTCATCCTG-A-AGA-A-GG-G-A-CA--GAT-TAGCC-CGAA-AA-A--T---C---G-AC--AATTTT--TT----T--A----TG---TTTG--TG--CCT-TT-G-GTC
gi|45 : -CA--GGT-CTTCC-CGAA-AA-T--T---T---G-ACA-A-------TC----TA-A-T--TG---TTCG--TGATTCGATT-GCGTCA---TT-TAGA--TA--AG-----TGC--TT---CATAT--AT-------A-TAT---T-----ATCT---T----CA-T
gi|46 : G-----TGC--TT---TACGTA-ATTT---TTG-TAT---T-TG--ACAT---T---GTA-TC--TACTTCGA-AGATCCGACATTTCT--AGA-TATAT---A-TGTTGGGTT--GGta
gi|47 : attA-C-CCTGC--TCCTG-A-AG--A-AG-G-A-CA--AGG-TATCC-CAAA-AA-T--T---T---G-ACCAA-------TCGTTAT--A-T--TGT--TTCG--TT--TCG-TC-G-GTCA---TT-T-----T---actt
gi|5 : taccT-TTAAAGCT--GAATCGATGCAAC--ATTGCA-TAATGTA-A-TTTGT---T-T-AT--ACT-CTCACCTT--ATCT----A---TATAGTGC-G-GAT-GTAG-CAT-TGAG---TT----GTCA-TTG-G-TTT---GATC--A--T-TG-CG---GT-T---TT--T-T-TC-CTC-ATGT-AA-CTG-T-TTT-AAC----------------ATT-----G--------TA--------------A----T------ACCGGTATGTAGACTGTTTAT--------------A-C-TA-----------CCAT-CAT-A-TCCA---TACT-GTAGAT--TT-AGT--------G-T-A---AG-----TT-----GT--TT-T-----G-G--GT---TTT---TTT----------TTTAA-CTCGCATGC-A-TTT-CTTAT---AATCATA-C-CCCG---TCCTG-A-AA--AAGG-G-A-CA--GGT-CGTCC-CGAA-AA-T--T---T---G-AT--AAT-----TT----C--A-T--TG---TTCA--TG--TCG-CT-G-GTCG---TT-C-----T---AG-----TGC--TT---TATATG-ATTT---C-A-TAT---TATG--ATCT---T---GCA-TC--TA-TTTAATATATCCGACACCATT--AAT-CATAT---AGTGTT--GTT--GGTATTttgg
gi|52 : ---TCCTGCG-AA--A-GG-G-A-CG--GGTTCGTCC-CTAG-GA-TCAT---C---G-A--------------------A-T--TG---TTTG--TG--TCG-TT-G-GTCA---Tttatttcatctattgcattgattagctcttgcaaatcatattaatttttcacctcttgaatttgtaacatt
gi|53 : cgttta--A-GG-G-A-CA--GGT-TGTCA-TGAA-AAAT--T---T---G-AC--A-------AT----T----T--CA---TAC---TG--TCA-AT-GTGTGA---TT-T-----T---AG-----TGC--TT---TATAatca
gi|54 : TTT---T-G-TAT---T-TG--ACCT---T---GTA-TT--TA-CTATGTAGATCCGACATTCT
gi|55 : aacCCTG-A-GG--A-AGAG-A-CA--TGT-CGTTT-C-------T--C---T---G-ATCAA-------TC----T--AAT--TG---TTCG--TG--TCG-TT-G-TTCA---Ttgttcttggatttcagta
gi|56 : g--ATCT---T---GCA-TC--TA-TTCAATAG-TCCGAGACTTTG--AGT-CATTG---AGTGTT--GTT--GG-ATTAa
gi|58 : aCCTG-AGAA--A-GG-G-A-CG--GGT-CATCC-CTAG-AG-T--C---T---A-TC--G-------AA----T--A-T--TG---TTCG--TG--TCtagt
gi|59 : aa-A-CG--GGT-CGTCC-TGAA-AA-T--TAGAT---G-AC----------TT----A--A-T--TT---TTCG--TG--TTA-TT-G-ATCAATTTT-C-----T---tagg
gi|6 : TAAGGGTAA---A-A-TTAAAC-C-CTCC-A--T-TTA--A----TTTCCGGAA--------AA-------------GTT---T-GA--A-TTT--GATGCT-AG--T---CATTTA-G-TT-GC--------------T-CGGT-T-GTACT-TTATAGCT--GAGTCGACGTAAC--AT-GCT-TAATGTA-A-TT-GT---T-C-AT--ATC-CTCACCGC--ATCT----A---T----T-C-A-GAT-GTAG-TGT-TGAG---TT----TTCA-T-G-G-TTT---GATC--A--T-TA-CG---TT-T---TTATT-T-TT-CTC-ATGT-AA-CTG-T-TTT-A-C----------------ATT-----G--------TA--------------A----T------A-------------------T--------------A-C-TC-----------CCAT-CAT-A-TCCG---TAGT-GTAGAT--TT-AGT--------G-T-TT--AGATTC-TTTGGT-GT--TT-TTTTTTG-T--TT---GTT---TTT----------TTCAT-TTCTCATGT-A-TTT-CTTAT---AACCATA-A-TTCG---TCCTG-A-AG--A-GG-G-A-CA--GGT-CGTCC-CGAA-AA-T--T---T---G-A----------------------T--TG---GTCG--TG--TCG-TT-G-GTCA---TT-C-----T---AG-----TGC--TT---TATATG-ATTT---C-A-TAT---TCTG--ATCT---T---GCA-TC--TA-TTCAATAGATCCGACACTATG--AGT-CATAG---AGTGTT--GTT--GGTATTA
gi|60 : G--ATCT---T---GCA-TC--TA-GTTAATAGATCCGACATCACG--AGT-CGTAG---ATTGTT--GT
gi|62 : CC-CAAA-AA-T--T---T---G-ACA-A-------TC----TA-A-T--TG---TTTA--TG--TCA-TT-A-GTAA---TT-A-----T---A
gi|66 : G---TCCTG-A-AG--A-AG-GCA-CA--GGT-CGTCC-CTAA-AA-T--T---T---
gi|7 : tagcatatAAGGGTAA---ATG-CTATAA-C-CTCCCA--T-TTT--A----TTTCTGGAA--------AA-------------GTT---T-GA--A-TTTT-GAAGCT-AG--T---CATCGA-G-TT-GC--------------T-CGGT-T-GTACT-TTATAACC--GAGTCGACGTAAT--ATTTCA-TAATGTA-A-TT-GT---T-C-AT--ACT-CTCACCGC--ATCT----A---T----T-A-A-GAT-GTAG-TGT-TGAG---TT----GTCA-TTG-C-TTT---GATC--A--T-TA-CG---TT-T---TTATT-T-TT-CTC-ATAT-AA-CTG-T-TTT-A-C----------------ATT-----G--------TA--------------A----T------A-------------------TGTAGACAGTATAT-A-C-TC-----------CCAT-TAT-A-TCCG---TAGT-GTAGAT--TT-AGT--------G-T-TT--AGATTC-TA-----GT----------------------TT---TTT----------TTCAC-ATCTCATGT-A-TTT-CTTAT---AACCATA-A-TTGG---TCCTG-A-GGA-A-GG-G-A-CA--GGT-CGTCC-CGAA-AG-A--T---T---G-AC----------TT----T--A-TAACT---TTTG--TG--TCG-TT-G-GTCA---TT-T-----T---AG-----
gi|8 : tactacgacgaacgagttaccttacttgtgaattaTAATGTTAG---ATA-TTGGAA-C-GTCCAA--TGCTC--A----TT----AAA--------GA-------------ATA---T--A--T-TTT--GATGCT-AG--T---CATCGA-G-TT-GG--------------T-CAGT-T-GTACT-TTATGGCA--AAATCGTTGTAAC--ATTGCA-TTATGTA-A-TT-TT---A-T-AT--GCT-CTCACCGC--ATCT----AAAGT----G-A-A-GAT-GTAG-TGT-TGAG---TT----GTCA-TTG-G-TTT---GATC--A--A-TG-CA---TT-T---TT-CT-T-TT-CTC-GTGT-AA-ATG-T-TTT-AAC----------------ATT-----G--------TA--------------A----T------A-------------------TGTAGCTTGTATAT-A-C-TA-----------CCAT-CAT-A-TCCG---TAGT-GTAGAT--TT-AGT--------G-T-TT--GGTTTCATT-----GT--TT-T-----GCT--TT---GTT---TAT----------TT-AT-TTCTCATGT-A-TTT-TTTTTGTAAATCATA-C-CCCG---TCCTG-A-AG--ACGG-G-A-CA--GGT-CGTCC-CGAA-AA-T--T---T---G-AC--A-------
gi|9 : taaatatctatgtaatagctacaagagaaaaaaatcaC--------------T-CGGT-C-ATTCT-TTCCTGCG--GAACTGTTTTAAC--TTTGCA-AAATGTA-GCTT-GT---A-T-AT--ACT-CTCATCAC--ATCT----G---TAG--TGT-A-GTT-ATAG-TGC-GTAG---TTTTTATTTA-TTG-G-TCT---GATC--ATTT-TG-TG---TT-T---TT-CT-T-TT-CT--ATGC-A------T-TT----C----------------ATT--------------TA--------------AC---C------A-------------------T--------------A-C-T------------------AT-G-CCCT---GAGG-ATAAAC--TT-----------------------TTC---------------------------------T---TTN----------TTCTT-TTCT-ATGC-A-TTT-CATTT---AACCATA-C-TCCG---CCCTG-A-
15 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|20 ): TGCTAGAATGAACTTGAGCTAAGCCCCACCAGACTTTACACCTTGCCTCTCTTCACGACCTATACTCGTAGTGAATTCCATTGATTTTCAGTTTAATTTTAATTTTATTTGGGTTATGATTTTTTTCAGTCGTTAGACATTTTATTTGGGTATTGAAACAATATTCGGATTATTAATCATTAGGTCGTGAAGAGTATATATATTCTTCGACATTTGCCGAATCAAG
Unaligned ( gi|31 ): AATCAATTTCATTTTGCAATTTCGAGTTTACATTTTAATTCTTCGGGTCATGAATCTTCAGCTGGTGAGACGATTTCTTTCGAGATTACACTTGTATTCGATTTTTAATCATTAGCGGTCGTGAAGAGTAATA
Unaligned ( gi|35 ): ATCGACTTTGTACTGTAAATATCACGATGCAGTAGTTATTTTCCATAGCTCCCTTTGTAGTTTTAGTTGTACATAGGTCTAGTTCTTTCACATTATGTCATTTATTTCTTTTGTGTCCAGAC
Unaligned ( gi|38 ): GACTGAGCTGTGTCAAAACAGGCTAAGTTTCCAAAAGGACAGTCTGTCTGAAACCCTCTGTCGTTCTTTCCTGCGGAACTGTTTTAACCTTGCAAAATGTAGCTTGTAT
Unaligned ( gi|48 ): CCAGTATTCACCCTATACATGATATTGGCTATTGTCAACACACACACACACACGCACACGCACACGCACGCACGCGCGCTTT
Unaligned ( gi|49 ): TATACACAGCAGGGTTTGTTGGGGATAAAGTATTAAAACGTAAACCTTTAAACCTCTTGAAATATCTGTAGATACATTT
Unaligned ( gi|50 ): TTCACGCACACGCGCACACACACGCACGCACCGTCACGCACACACGCATGAACGCACAGTATTTATATATGTATAT
Unaligned ( gi|51 ): GATTTTAAGATTATATGAACGTGAGCTAAGCCCTACCAGACTTTACTTCTCGCCTCTCTTCACGACCTATA
Unaligned ( gi|57 ): GTACACACACACACACACACTCGTACGCATGCACACACTCGCAAGCACACACGCATAC
Unaligned ( gi|61 ): TACTATGACGAACGAGTTACTTTACTGTGATTTTAAGGGTAAATGCTA
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Unaligned ( gi|64 ): ACACACACACACATACACACACGCACGCACGCGCGCCTCTTT
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