lowQualScore : 1111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 2222 0000000 11 22 1 111 333333 1 11 222 77777777777777777777 1 222 4444444444 7777777777777 2 55555 22222 4 2 2 1 1 555555555 1 4 4 1 11 4444 222 3333333333 4444444 11111 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 11 6666666666666666666666666666666666 33333333 77777777777777777777777777777777777777777777777777 1111111111111 222222222222222222 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 222222222 111 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 3333333333333333333 1111111 111111 1111111 1 33 555555555555555555555555555555 11111111 222222 22222222 11111111111 1111111 333 111 111111 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 1111111111111111 333 1111111 222222222222222 222 111 22222222222222222222222222222222222222222 1111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 444444444444 1111111 2222222222222222222222222222222222222222 22222 44444 11111111111111111 1111 11111111111111 444444444444444444444444444444444444444444444444444 333333333333333333 2222222222 22222 1111111111 2222222 1111 11111111111111 11111111111111111 33333333 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1111111111 111 555555555 333333333333333333333333333333333 11111 333 11 22
lowQualScore : 88 6 8888 7777777 44 11 1 3 6 777 888888 0 11 2 555 44444444444444444444 3 999 1111111111 6 4 4444444444444 3 00000 77777 6 0 4 0 8 5 6 6 5 999999999 5 6 0 0 5 33 0 11 3333 55 222 8 2222222222 1 99 5555555 6 6 6 66666 6 6 6 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 11 2 2 2 0000000000000000000000000000000000 2 22 33 5555 2 77777777 33 333 33 2 66666 66666666666666666666666666666666666666666666666666 7 5 1111111111111 9999 4 222222222222222222 2 4 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 2 0 6 2 444 2 22 3 555555555 33 33 2 2 33 111 2 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 3 9999 44 1111111111111111111 3 555 77777 7777777 22 111111 4 2222222 0 2 2 77 2 222222222222222222222222222222 8888888 2 66666666 333333 33 2 5555 22222222 222 33 9999 77777777777 5555 88 1111111 2 33 222 2 111 9999 333333 3 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 22 3333 3 0 1111111111111111 55 888 22 6 1111111 3 1 6666 555555555555555 33 1 55555555 444 444444 444444 66 1 3 22 99999999 444444 444 44 3 33 444 333 55555555 555555 1 222 999 55 22 444 666 99999999999999999999999999999999999999999 5555555555 88 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 44444 22 111111111111 22 0000000 444 1 1 0000000000000000000000000000000000000000 222 55555 4444 44444 1 22222 1 1 0 222 22 4444444 1 777777 22 222 1 22 222 66666 4444444 888 444 1 222 444444 5555 1 2 1 33333333333333333 1 0 0000 1 55555555555555 55555555 3 1 9 8 444444 999999 444444 666666666666666666666666666666666666666666666666666 1 1 66 222222222222222222 1 22 6666 33333 22 1 33333 0 55555555 8888888888 1 44444 4444 666666 88888 8 44 3 6666666666 1 3 4444 1 333 22 8888888 333 0000 55555555555555 1 55555555555555555 2 666 2 666666 11111111 33 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 8888888888 777 2 2 99999999 888 000000000 33 2 2 2 66666 99 2 8888888 2 2 222222222222222222222222222222222 77 0 9 44 44 00000 555 4 333 99 8 0 3 77 6
lowQualScore : .. . .... ....... .. .. . . . ... ...... . .. . ... .................... . ... .......... . . ............. . ..... ..... . . . . . . . . . ......... . . . . . .. . .. .... .. ... . .......... . .. ....... . . . ..... . . . .................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... .. . . . .................................. . .. .. .... . ........ .. ... .. . ..... .................................................. . . ............. .... . .................. . . ......................................................... . . . . ... . .. . ......... .. .. . . .. ... . .......................................................................................................... . .... .. ................... . ... ..... ....... .. ...... . ....... . . . .. . .............................. ....... . ........ ...... .. . .... ........ ... .. .... ........... .... .. ....... . .. ... . ... .... ...... . ............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... .. .... . . ................ .. ... .. . ....... . . .... ............... .. . ........ ... ...... ...... .. . . .. ........ ...... ... .. . .. ... ... ........ ...... . ... ... .. .. ... ... ......................................... .......... .. ............................................................................... ..... .. ............ .. ....... ... . . ........................................ ... ..... .... ..... . ..... . . . ... .. ....... . ...... .. ... . .. ... ..... ....... ... ... . ... ...... .... . . . ................. . . .... . .............. ........ . . . . ...... ...... ...... ................................................... . . .. .................. . .. .... ..... .. . ..... . ........ .......... . ..... .... ...... ..... . .. . .......... . . .... . ... .. ....... ... .... .............. . ................. . ... . ...... ........ .. ........................................................... .......... ... . . ........ ... ......... .. . . . ..... .. . ....... . . ................................. .. . . .. .. ..... ... . ... .. . . . .. .
lowQualScore : 33 7 3333 0000000 33 77 0 3 0 555 888888 0 22 5 000 77777777777777777777 3 777 3333333333 0 7 0000000000000 7 00000 00000 0 0 0 0 5 0 0 0 0 000000000 0 0 0 0 0 22 8 88 5555 22 666 0 7777777777 0 22 7777777 7 7 7 77777 7 7 7 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 22 7 5 5 8888888888888888888888888888888888 5 88 22 0000 2 77777777 11 999 44 5 22222 99999999999999999999999999999999999999999999999999 3 4 2222222222222 1111 1 222222222222222222 2 2 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1 1 3 1 333 1 99 1 444444444 44 44 5 5 77 444 9 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 2 7777 22 8888888888888888888 1 444 11111 7777777 99 111111 4 8888888 9 5 6 99 4 333333333333333333333333333333 1111111 5 66666666 111111 22 4 6666 22222222 777 99 3333 11111111111 3333 44 2222222 4 22 111 4 111 8888 999999 1 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 33 4444 2 4 0000000000000000 99 888 55 3 2222222 3 7 6666 888888888888888 77 3 66666666 888 333333 111111 55 5 1 00 22222222 444444 222 22 1 44 222 444 99999999 888888 5 666 444 66 33 444 999 77777777777777777777777777777777777777777 1111111111 99 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 00000 22 111111111111 11 8888888 888 5 6 3333333333333333333333333333333333333333 666 11111 8888 00000 5 11111 5 6 8 666 00 8888888 5 111111 00 555 4 22 555 33333 3333333 333 111 4 555 333333 0000 4 8 4 00000000000000000 4 5 2222 4 99999999999999 22222222 1 5 9 8 777777 999999 444444 444444444444444444444444444444444444444444444444444 5 4 66 000000000000000000 5 00 1111 77777 00 5 88888 3 55555555 0000000000 6 00000 8888 555555 33333 3 00 5 5555555555 9 8 0000 9 222 55 0000000 555 5555 44444444444444 9 00000000000000000 0 777 2 444444 88888888 11 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 5555555555 777 7 7 77777777 555 222222222 22 4 5 5 22222 88 5 1111111 5 5 999999999999999999999999999999999 11 9 9 22 22 88888 444 4 333 00 0 6 2 00 0
consensus : ATTTCGTTTGGATATACTG--AAAAAAGCG----TTCGACTAAACC---AACCGTACC-TCT-TGGG-CAGGATGGTTATCT---ACAA--CCGCACCTG-ATGGAAGAAGTNA-TTTGCTCGACTG---TTGATTA--TAT--GGTTCC-AATCACCTGCCCTATTAC-A-GAAAT--G-CACTA-TTCAGCANGTTATTC-AGCT--------ATCAC-AAGAAGGGGTTCTGTCAAAATGTAACTATCCTTGCNTGTGATATTTTGCAGTGGCTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATTTGGCAAAATACTGAGAAATACAGCGA-TGTTCAC-TTAGGAGTTTTCGATTCACTATCCTCTG-CACTGGAAACAATT--GGG-GAAA-T---AATG-AGCG--CGAG-------TGGACT-TTC-AC-AC-----GT-GA-T-TATTGA-GTCTGGA-AATATATATA----GTACGA-T-A--TATCG-----GATAAATGTTATTAAACTCCAAACTTTAT-NAA--TGTACC--TAGCCTTGATATCAAACAAC--NTGAT--ATACATAAG---------C-T---T-AGGTT--TAGTTCTTTAAA-GCAAAA---TGCATGCNTGC-----AA-ATTGT---C-AT-----T-ATG----ACT-TT-GGAA---T------TT-------TTCT-----C-A---TT-C---AAC-AGTG-CTGTTTTAATGAC-AATTT--CA-----TACATGTA-TTTTG-CCC-CAA-AACTCGAA-A--G-----ACG-T-CCC-------AAA-T-ATCA--AT----GTCAGA-CAAGTCT-TG--AT---TT--ACAA-T-----TAAAG---------------G-GT-T-------GCAT-----AC----T-AATGATACTTTCAGAA---------A---AT----ANTTGTTT---------T--------C-AA-AGGT---T---A-T-GAT--ATT------T--ATAT--A---G----GA-TTCT-TG----A-GAAG-T-T--TT-CC--ATTTTTT--CAGTTGA--T--T-T-TTA--AAGTTA-AA---AA-N-ATG-CTG----T--AAC-C-TC--AAA-CCTCATAA--------A---CA-T-----T-C------------ATA---CA-A---------TTT-ATGTCAAA---ACAA--C-----------TAAAT---AT-AT---A-----ATCAAGGG----GTTA-CA------TATAT--TC---ACAAA-ANACTTG-TTTGCAAA--T-G--A--A-TAAC-G---------A--TCTA-------T-AT------CGGATCT-G---GAAA--A-GTTTT--T-C----AATTTTCG-G-CGA-T----TAT--------T-TT----TTCA--CAAATTT-CA---AGTT-T--TT---CCCCA-AAA-C-TC---GAAAAAG----GT-CC------C-C-GN------G-----C---A----------A--CA--A----T-----CT---N--AT-----------------T---TTAT----AA--TCAAAGG-GTTA-C--G-T-ACT---------T-T-CAGAGA-AAACANTTGT--TTTT--C--ATC----AGT--C-AA--T--A--------TC--AT--CT--A--T-NG---AG--AGN--T-TGAAGGA-G--TT------T----C-C--A--T-T-TTT----C---G------A---T--T-A-T--T-T--NTAA-----AGAA--A--AAATTC---N-----T-GT-TTTA-GCCCC-----AAAA---------TC-G------TCA----NAA----C--G--TCC---C---CA--------AA------TA-----T---C-----------T-TA------G-----T--CAAA----CAA-CCTG----------------ATA-TA---TAA--TCGAA----G--GGTTA-C-A---TACT--------G----T--TCACAA--------A---ATAC------TTGTTTGC------AAA--AGT-CA-ATGACA--TCTAT-------AT------CGG---A--TCTG-A-GGA---G-T-TTTC-------C-----AATTT-T---C-G-G--TG--ATTATT---TT---CA--C-----C-----AAT----TT----T-CATG-------TTTTT--------TTGCCCC--AA----CT---AA---A---A-----A------AAC-GCC-CC-CAC--G--AA--GG----A---ATGT---T-------CA-----AA--CAACC---TGA---T--A--TA-------AT-C-A-AG-GG-------A-CT---A-T-G-T--------A-CTT-T----C---AAA---NNA----TA-----CTTGT-T-TGCCAAAAGT-CA-ATGACA---T--CTA-------T-AT------CGGA--TCT---GA-A-GA---G----TTTTT-------CCAA-TTTTCG-G-C---GA------T----TATT-T-T-CA------C----A-----A-ATT----T-CAT----G--------TTTT--------TTGC-CCCAAAA-----ACTC----G-AAA------A--C--G--C-----C-C--C--AC-----G-T----AG-G--------N--A-TGTCAA-AC--A------------AC-C--G-AT--T----TATA-----A--T-C-----AAGGG-------GCT--A--C-G--T-AC-----TTT----CA------AA-----ATACTTGTTTGC-A--A-A-------G--T-CA-A----TGA-CA---TCTAT--AT-----TCGG---A----TCTG--AG-GA-G-----TTT-T--------C-C--AA--TTT-C-G-G-CGAT------TA--T-----TTTT--CA---C--A--A-TT-TC----ATGT--T---------T----TTT--------TTGCCCCCAAAACT-----TC-GAAAACG-CCC-C-CAC--------GTA-G-GAAT-GT------CAAA--C-AACCTGA-T-T-----TA-T-AA-------T-CA-A------G-GG--------CT--AAT-GT-----A-GTTTCAAAAA--A--AT-----ACTTGTTT---GCAAAAGTCCCCAGGG-GGGTC-C-CCCATTACCTTTAC-TGGCCCATGG
Reference ( gi|1 ) : ATTTTGTTTGGATATACTG--AAAAAAGCG----TTCAACTAAACCTTGAA--GTACT-TCT-AGAG-CAGGATGGTTATTT---ACAA--C---ACCTG-ATGGAAGAAGTTA-TTTGCTCGACTGAT-TTG--TA--TATT-GGTTCC-AATCACCTGCCCTATTACAAGGAAATTGGCCACTATTTCAACAAGTTATTCAAGCT-------CATCACAAAGAAG-----CTGTCAAAATGCAACTATCC-TGCATGTGAT-TTTAGCAGTTGCTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAACTTAGCCAAA-ATCGA---ATACCGTGAATGTTCATATTAGCAGTTTTCATTTCACTATCCTCTTTCACTGGAAACAGTT--AGG-GAAA-T---AAT--AGTG--CGAG-----A-TGGACT-TTC-AC-AC-----GT-GA-T-TATTGACGTCTGGAGAATATATATACATGGTACGA-TTA--TATCG-----GATAAATGTTATTAAACTCCAAACTTTCT-TAAGCTGTAC---TAGCCTAGATATCAAA-AAC--TTGAT--ATAAATAAGG--------CTT---TGGGGTT--TAATTCTTTAAA-GCAAAA---T---TGCATGC-----AA-GTTAT---T-AT-----T-ATA----ACT-TT-GGAA---T------TT-------TTCT-----C-A---TT-C---AAC-AGTAACTGTTTTAATGAC-AATTC--CA-----TGCATGTA-TTTTG-TCC-CAA-AACTTGGA-AG-G-----ACG-T-CTC-------AAA-T-ATCA--AT----GTCAGA-CGAGTCT-TG--AT---TT--ACAA-T-----TAAAG---------------G-GT-T-------GCAT-----AC----TAAATGATATTTTAAGAA---------A---AT----AATTGTTT---------T--------C-AA-AGGT---T---A-T-GAT--ATT------T--ATAT--A---G----GA-TTCT-TG----A-GAAG-T-T--CT-CC--ATTTTTT--CAGTTGA--T--T-T-TTA--AAGTTA-AA---AA-G-ATG-CTG----G--AAG-C-TC--AAA-CGTCATAA--------A---CA-T-----T-C------------ATA---TA-A---------TTT-ATTTCAAA---ACAA--C-----------TAAA----AT-AT---A-----ATCAAAAG----GTTA-CA------TATAT--TT---ACATA-AGA--TG-TTTGCAAA--T-G--A--A-TAAT-A---------A--TCTA-------T-AT------CTGATCT-G---GAAA--A-GTTTT--T-C----AATGTTCG-G-CGA-T----TAT--------T-TT----TTCA--CAAATTT-CA---AGTT-T--TT---CCCCA-AAA-T-TC---GAAAAAG----GT-TC------T-T-GG------G-----T---A----------A--CA--G----T--T--CT---T--AT-----------------T---TTAT----AA--TCAAAGG-GTTA-C--A-T-ACT---------T-T-CAGAGA-AAACAGTTAT--TTTT--C--ATC----AGT--C-AA--T--A--------TC--AT--CT--A--T-TG---AG--AGG--T-TGAAGGA-A--TT------T----C-C--A--T-T-TTT----C---G------A---T--T-A-T--T-T--ATAA-----AGAA--A--AAATTC---C-----T-GT-TTTA-GCCCC-----AAAA---------TC-G------TCC----CAA----T--G--TCC---C---CA--------AA------TA-----T---C-----------T-TA------G-----T--CAAA----CAA-CTTG----------------ATA-TAC-TTAA--TTGAA----T--GGTTA-C-A---CACT--------G----T--TCACAA--------A---ATAC------TTGTTTGC------AAA--AGT-CA-ATGACA--TTTAC-------AT------CGG---A--TCTG-A-GGA---G-TATTTT-------C-----AATTT-T---C-T-G--TG--ATTATT---TT---CA--C-----C-----AAT----TT----T-TATG-------TTTTT--------TTGCCCC--AA----CT---AA---A---A-----A------AAC-GCC-CC-CAC--CCTAA--AG----A---ATGT---T-------CA-----AA--CAACC--GTGA---T--A--TA-------AT-T-A-AG-GG-------A-CT---A-T-G-T--------G-CTC-T----C---AAA---TTA----TA-----CTTGT-TCTGCCAAAAGT-CA-ATGACA---T--CTA-------T-AT------CGGA--TCT---GA-A-AA---G----TTTTT-------CCGA-TTTTCG-G-C---GA------T----TATT-T-T-CA------C----A-----A-ATT----T-CAT----G--------TTTT--------TTGC-CTCAAAA-----ACTC----A-AAA------A--C--A--C-----C-C--C--AC-----G-T----AG-G--------T--A-TGTCAA-AC--A------------TC-C--G-AT--T----TATA-----A--T-C-----AAGGG-------ACT--A--T-GT-T-AC-----TTT----CA------AA---TTATACTTGTTTGC-A--A-A-------G--T-CA-A----TGA-CA---TCTAT--AT-----TCGG---A----TCTG--GG-GA-G-----TTT-T--------C-C--AA--TTT-C-G-G-CGAT------TA-AT-----TTTT--CA---C--A--A-TT-TC----GTGT--T---------T----TTT--------TTGCCTTCAAAACT-----TC-AAAAACG-ACC-C-CAC--------GTA-G-GAAT-TT-TA---CAAA--C-AACCTGA-T-T-----TT-T-AA-------T-CA-A------G-GG--------CT--AAT-GT-----A-GTTTCAAAAA--A--AT-----ACTTGTTT---GCAAAAATCCCTAGAGCGGGT--C-CCCATTACCTTTAC-AGGCCCACGGC
gi|12 : ATTTCTTGTGGACATACTG--TAGGATGCG----TTCGAGTGAACC---AACCGTACCGCCT-TGGG-CAGGATGGTTATCT---TCAA--CTGCACCAG-ACG-AAGAAGTGC-TTTGCTCGACTG---TTGATTA--TAT--GGTTCC-AATCAACTGTCCTATCAC-AGAAAAT--GCCAC-AGTTCAGCAAGTCATCC-AGCT--------ATCACAA
gi|2 : tacaactcatactgctcacggtattgtgaaacaagaagtatatgtgcgtgatgaggataaccaaggccctctagacaaatcttgctagataggaataaatctaggacaagtttcagaaaaatcagaagaactagccccatgtttcgtgaagaccaaaacatcgccagctgtccgaactacttgcatgtcccctttgcataccaacaatgataagagagacatgactcTTTTGATTGGATATCCTG--AAAAAAA-G----TTCAACTAAACC---AACCATACT-TCT-TGAGGCAGGATGGTTATCT---ACAA--CCACACCTA-ATGGAGGAA--CACTTTGTTGGATTG---TTGATTA--TAT--GGTTCC-AATCACCTGCCCTATTGCAA-GAAAT--GACACTA-TTCAGCATGCTATTC-AGCTAGATTAATATCAC-AAGAAG-----CTGTCAAAATGTAACTATCCTTGCATGTGAT-TTT-GCAGTGGCTAg
gi|25 : TTTGTTTGGATGTACTGAAAAAAAAGCGTCGATCCAACTAAACC---AACCGTACC-TCTAAGGA-CAGGATGATTATCTACAACAA--C---ACCTG-AT-GAAGAAGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttggcaaaatccagagaagcacagcaatgtattgttcatttaggagttttccattcactatcctctgaactggaaaccactggggaaaatagtgagcgtgagtggacttttacacatgattattgagtctggaatatatgtacgatatgtcagaaaatgttataaacttcaaactttataaatgtacctaaccttgatatcaagcaacgtaatatacataagcgtttagttctttaagcaatgcatgcttgcaaaatgcccattatgttttctatttcaacaatcgtataatgacaattttatacatgtattttgtccaaaactcgaagacgtctccaaatatcaatgtcagacagtctgatttcaataaggataaaactgttcgtttcctttgattttacatacagaattaatgatacgttaagaaaataattattttcattggttcatatgatttatatattcatttccaataaatttgaaaagtaaaaatcatgttgtaacctaaaaattcataaacattcatacatatttattttcacacaactaaatatataaacaaggggttacacatatttacaaaagacttgtatgcaaataataaggacatcaatatcggtatgtgaaattttccccccaactttgagtgattattatttttacacatttcaagtttttgcccaaaaactcgaaaaggtctccatgcaaacaatcttatttataatcaaaggtacatacattcagaaaacaatgattttcatcagtaaatattatctattgagagttgaaggagatttccatttttcgattatttttagagaaaaaatcccgttttagccccaaaactcgtcgatgcccccaactatctatgccagacattggatggctacatatgttcacaaaatatttgtttgcaaaattcagtgatatctatatcggatctgaggagcttgtccaatttttggtgattatttttaccaattttatgttttttcctccaaaactcaataacatcccacgtaagaatgtcaaacaacctgatttataattagggggctatgtacttgcaaattatacctgtttgcaaaagtcaatgacatttatatcggatctgaggaattttttccaatttttggtgattattttcaccaattttatgtttttccccaaaaactcaaaaacgcccccacgtaggaatgttaaacaacctgatttataatcaggggaacattaccttt
gi|3 : ---ACAAACC---ACCTGCATCGAAGAAGTAA-TTTGCTCGA--AATGTTA--TAATTATTCGGTTCCCAATCACCTGCCCTATTACCA-GAAATTGG-CACTG-TACAGCAGGTTATTC-AGCT--------ATCAC-AAGAAGGGGTTTTGT-----TGTAACTATCCTTGCTTGTGATATTTTGCAGa
gi|29 : caaAATTTGGCAAAATACTGAGAAATACAGCGA-TGTTCAC-TTAGGAATTTTCCATTCACTATCCTCTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntataattggcaaaatacagagaaatacagcgatgtccatttaggagttttcgattcacttccctgcactggaaacagttcgggaaaataatgagcgcgagtggactttcacacgttgattattgagtctgaaatatatgtacgatatactcaggtatcagataatgttataagctccaaacttagccttgatatcaaacaaataatacacataagtatgaggttgttctttctttaaagcaaaatgcatgcttgcaaaatgtccatatatgactgttgaaaattttctctatttcaacagtactgtataatgacaatttttcatacatgtattttgtcccaaaactcgaagatgtccccaaatattaatgtcagacagtctgatttacaattaaagggttacatactattgataatttaagaaaataattgtttcagaggtcaatatgatttgaataagatctgaagaagttctccatttttcagtgtttttttaagtaaaaatcatgttgtagcctcaaaccttataaacatatacatacatacaaatacaggtttttatgccaaacaactagatatataatcaaggggttacataaattacaaaagacttgcttgcaaataataatgacatctaccaggtatattggatctgaaaagttttccaattttcagctattattattttcacaaatttctagtttttgccccaaaactcgaaaaggtctccgggtaaacattgtaaccttattataaacaaagggttactaatttcagaaaacatttattttcatcagtcaatattatctatagagagtatgaataagttttccatttttcgattatttattaagaaaaaatcctgttttagtccaaagactcgtcaatgttataatatctatgttaaacaaacttgatatatcattgaatggttacatacgttcacaaatacttgtttgcaaaagtcaacgacatttatatcg
gi|3 : A---ATACAGCGA-TGTCCAT-TTAGGAGTTTTCGATTCACT-TCCC--TGCACTGGAAACAGTT--CGG-GAAAAT---AATG-AGCG--CGAG-------TGGACT-TTC-AC-AC-----GTTGA-T-TATTGA-GTCTGAA--ATATATGTAC--GATATAC-TCAGGTATCA-----GATAA-TGTTAT-AAGCTCCAAACTT------------------AGCCTTGATATCAAA-CAA--ATAAT--ACACATAAG----------TA---TGAGGTTGTTCTTTCTTTAAA-GCAAAA---TGCATGCTTGC-----AA-AATGT---CCATA----T-ATG----ACTGTT-GAAA---A------TT-------TTCT-----CTA---TTTC---AAC-AGTA-CTGTAT-AATGAC-AATTTTTCA-----TACATGTA-TTTTG-TCC-CAA-AACTCGAA----G-----ATG-T-CCCC------AAA-T-ATTA--AT----GTCAGA-C-AGTCT--G--AT---TT--ACAA-T-----TAAAG---------------G-GT-T-------ACAT-----AC----TAT-TGATAATTTAAGAA---------A---AT----AATTGTTT------------------C-AG-AGGTCAAT---A-T-GAT----T------T--GAAT--A---A----GA-T-CT-GA----A-GAAG-T-T--CT-CC--ATTTTT---CAGT-GT--T--T-T-TTT--AAGTAA-AA---AT-C-ATG-TTG----T--AGC-C-TC--AAA-CCTTATAA--------A---CA-TATACATAC------------ATA---CA-AATACAGGTTTTT-ATGCCAAA----CAA--C-----------TAGAT---AT-AT---A-----ATCAAGGG----GTTA-CA------TAAAT--T----ACAAA-AGACTTG-CTTGCAAA--T----A--A-TAAT-G---------ACATCTACCAGGTAT-AT------TGGATCT-G----AAA--A-GTTTT--C-C----AATTTTCA-G-CTA-T----TAT--------TATT----TTCA--CAAATTT-CT---AGTT-T--TTG--CCCCA-AAA-C-TC---GAAAA-G----GT-CT------C-C-GG------G-----T---A----------AA-CATTG----TAAC--CT---T--AT-----------------T-----AT----AA--ACAAAGG-GTTA-C----T-AAT---------T-T-CAGA---AAACATTTAT--TTT---C--ATC----AGT--C-AA--T--A--------TT--AT--CT--A--T-AG---AG--AGT--A-TGAATAA-G--TT------TT---C-C--A--T-T-TTT----C---G------A---T--T-A-T--T-T--ATTA-----AGAA--A--AAAT-C---C-----T-GT-TTTA-GTCCA-----AAGAC--------TC-G------TC------AA----T--G--TTA---T-------------AA------TA-----T---C-----------T-AT------G-----T--TAAA----CAAACTTG----------------ATA-TA---TCA--TTGAA----T--GGTTA-C-A---TAC---------G----T--TCACAA--------A----TAC------TTGTTTGC------AAA--AGT-CA-ACGACA--TTTAT-------AT------CGgca
gi|2 : caaacaaaccacctgcatcgaagaagtaatttgctcgaaatgttataattattcggttcccaatcacctgccctattaccagaaattggcactgtacagcaggttattcagctatcacaagaaggggttttgttgtaactatccttgcttgtgatattttgcagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntataattggcaaaatacagagaTGTTCAT-TTAGGAGTTTTCCATTCACTATCCTCTG-AACTGGAAACCACT--GGG-GAAA------AT--AGTGAGCGTG-----AGTGGACT-TTT-AC-AC-----AT-GA-T-TATTGA-GTCTGGA----ATATAT-----GTACGA-T-A--TGTCA-----GA-AAATGTTAT-AAACTTCAAACTTTAT-AAA--TGTACC--TAACCTTGATATCAAGCAAC--GTAAT--ATACATAAG---------C---------GTT--TAGTTCTTTAA--GCAA---------TGCATGCTTGCAAA-ATGCC---C-AT-----T-ATG-------------------------TT-------TTCT-----A-T---TT-C---AAC-AAT---CGTAT-AATGAC-AATTT--TA-----TACATGTA-TTTTG-TCC--AA-AACTCGAA----G-----ACG-T-CTCC------AAA-T-ATCA--AT----GTCAGA-C-AGTCT--G--AT---TT---CAA-TAAGGATAAAACTGTTCGTTTCCTTTG-AT-TTT-----ACAT-----ACAGAATTAATGATACGTTAAGAA---------A---AT----AATTATTT---------T--------C-AT-TGGT---TCATA-T-GAT----T------T--ATAT--A-----------------------------------T-TC--ATTTC----CAATAAA--T--T-T-GAA--AAGTAA-AA---AT-C-ATG-TTG----T--AAC-C-TA--AAA-ATTCATAA--------A---CA-T-----T-C------------ATA---CATA---------TTT-ATTTTCAC---ACAA--C-----------TAAAT---AT-AT---A-----AACAAGGG----GTTA-CA------CATAT--TT---ACAAA-AGACTTG-TATGCAAA--T----A--A-TAAG-G---------ACATCAA-------T-AT------C-GGTAT-GT--GAAA-----TTTT--C-CCCCCAACTTTGA-G-TGA-T----TAT--------TATT----TTTA--CACATTT-CA---AGTT-T--TT---GCCCA-AAAAC-TC---GAAAAGG----TC-TC------CAT-GC------A---------A----------A--CA--A----T-----CT---T--AT-----------------T---T-AT----AA--TCAAAGG---TA-C--A-T-ACA---------T-T-CAGA---AAACAATGAT--TTT---C--ATC----AGT--A-AA--T--A--------TT--AT--CT--A--T-TG---AG--AG---T-TGAAGGAGA--TT------T----C-C--A--T-T-TTT----C---G------A---T--T-A-T--T-T--TTAG-----AGAA--A--AAATCC---C-------GT-TTTA-GCCCC-----AAAAC--------TC-G------TC------GA----T--G--CCC---C---CA--------AC------TA-----T---C-----------T-AT------G-----C--CAGA----CA------------------------------------TTGGA----T--GGCTA-C-A---TA-T--------G----T--TCACAA--------A---ATAT------TTGTTTGC------AAA--ATT-CA-GTGATA--TCTAT-------AT------CGG---A--TCTG-A-GGA---G-CTTGTC-------C-----AATTT-T---T-G-G--TG--ATTATT---TT---TA--C-----C-----AA-----TT----T-TATG-------TTTTT--------TC-CTCC--AA---------AACTCA---A-----T------AAC-A-T-CC-CAC--GT--A--AG----A---ATG----T-------CA-----AA--CAACC---TGATT-T--A--TA-------AT-T-A-GG-GG-------G-CT---A-T-G-T--------A-CTT-G----C---AAA---TTA----TA-----CCTGT-T-TG-CAAAAGT-CA-ATGACA---T--TTA-------T-AT------CGGA--TCT---GAGG-AA---T----TTTTT-------CCAA-TTTTTG-G-T---GA------T----TATT-T-T-CA------C----C-----A-ATT----T-TAT----G--------TTTT--------T--C-CCCAAAA-----ACTC----A-AAA------A--C--GC-C-----C-C--C--AC-----G-T----AG-G--------A--A-TGTTAA-AC--A------------AC-CT-G-AT--T----TATA-----A--T-C-----AGGGG-------A----A--C-AT-T-AC-----CTT----
gi|13 : ttttgattggatatcctgaaaaaaagttcaactaaaccaaccatacttcttgaggcaggatggttatctacaaccacacctaatggaggaacactttgttggattgttgattatatggttccaatcacctgccctattgcaagaaatgacactattcagcatgctattcagctagattaatatcacaagaagctgtcaaaatgtaactatccttgcatgtgattttgcagtggctannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttggcaaaatccagagaagcacagcaatgtatTGTTCAC-TGAGGAGTTTCCATT-CGCTAAGCTATG-CATTGGAAAGAATT--GGG-TAAA-G---AGT--AATG--GGAGTACTAG-TGGACT-TTC-AC-ATCACATGT-GA-T-TATTGAGG-CTGG----CATATAT-----GTATGA-------------------AAATTTT-CTGAACTCAAAACTTTAT-AAA--TGTACC--TAGCCTTGATGTCAAACAAC-----------AAAT---------------------GGTA--TAGTTCTTCAAA-GCAAA----T---TACATGCTTGCGAATGTCTT---T-AT-----T-GTG----ATT-GTAGGAA---TCGAAAATT-------TTC------C-A---TT-TTTTAAC-AATA----TTATATTGAC-AAAT----------TTCATATA-TTGCG-CGCATAACAACTCGAAGAG-GT----ACA-T-GT----------A-T-ATTA--AT----ATCAGA-T-AGTCT--G--AC---TT--ACGA-T-----TAAAG---------------G-GC-T-------GCAT-----AC----T-AATGATt
gi|4 : tgcgaaatctagagaagtacagcgatgtcatTTTCGTTTTAGGAGCCTCT-------GCAGCACTT----G-TAAA-TCGCAATGGAGCG--CGAG-----T-CGAACTGTTCTACCAT-----GT-GA-T-TATT--CGT----AGA-----TAT-----GTAAGA-------------------AAATGTTAT-AAACTCCAAACTTCATATA---TGTACC--TAGCCTTGATATCAAACAAC--TTGA------------------------------GGAT--TAGTTCTTTAAA-GCAAAA---TGCATGCTTGC-----AA-AATGCCCAT-AA-----T-ATG----ACTGTT-GGAAA--T------TT-------TTCT-----CTA---TTTC---AAC-AATA-CTGT-------AC-AAT--------------ATGTA-TTTTG-CCC-CAA-AACTCGAA----G-----ACG-T-TCCCATGC--AAA-T-ATCA--AT----GCCAGA-C-AGTCT--G--AT---TT--ACAA-T-----TAAAG---------------G-GT-T-------ACAC-----AC----TAA-TGATACGTTAAGAA---------A---AT----TATCATTT---------T--------C-AA-AGGT---TT--A-TCGAT----T------T--ATAT--A---A----GA-T-AT-GA----A-GAGG-T-T--CT-CC--ATTTTT---CAGT-GA--T--T-A-TTA--AAAGTA-AA---AA-TCATG-TCG----T--AGC-C-TCC-AAA-C-TCATAT--------A---CA-T-----T-C------------ATA---CATA---------TTT-ATGTCAAA----CAA--C-----------TAAAT---AT-AT---A-----ATCAAGGG----GTTA-CA------TA----------------AGACTTG-TTTGCAAA--T-G--A----TAAT-G---------ACATCTA-------C-AT------CGGATCT-G---AAAA--A-GTTTT--T-CCA--AAT-TTCG-G-CGA-T----TAT--------TATT----TTCA--CAAATTT-----------T--TG---CCCCA-AAA-C-TC----AGATAG----AT-TT------C-T-AT------G-----C---A----------AA-CA--A----T--T--TTATTT--ATAATCAAAGGGTCACATAT---TTATTTAAAA--TCAAAGG-GTCA-C--A-T-ATT---------T-T-CAGA---AAACAATT-C--TTTT--C--ATC----CGT--C-AA--T--A--------TT--AT--CT--A--T-GG---AA--AG---C-TGAAGGA-G--TT------TT---C-C--A--T-T-TTT----C---G------A---T--T-A-T--T-T--TTAA-----AGAA--A--AAAT-C---C-----T-GT-TTTA-GACCC-----AAAA---------TTTG------TC------AA----T--G--TCC---C---CA--------AA------TA-----T---C-----------TATA------A--------CTGA----CAA-CTTG----------------ATA-TA---TAA--TTGAA----TATGTTTA-C-A---TAC---------G----T--TCACAA--------A---ATAC------TTGTTTGC------AAA--AGT-CA-ATGACA--TTTAT-------AT------CGG---A--TCTG-A-GGA---G-TTTTTC-------C-----AATTT-T---C-G-G--TG--ATTATT---GT---CA--C-----C-----GA-----TT----T-CATGT------TTTTT--------TTGCCCCAAAA----CT----A---A---A-----A------AAC-GCC-CC-CAC--GT--A--GG----A---ATG----T-------CA-----AA--CAACC---TGATT-T--A--TA-------AT-C-G-AG-TG-------A-CT---A-T-G-T--------A-CTT-T----A---AAA---TTA----TA-----CTTGT-T-TG-CAAAAGT-C---TGACA---T--TTA-------T-AT------CGGA--TCT---GA-G-GG---T----TTTTT-------CCAA-TTTTCG-G-T---GA------T----TATT-G-T-CA------C----C-----G-ATT----T-CAT----GTT------TTTT--------TTGC-CCC-AAA-----ACTA----A-AAA------A--C--GC-C-----C-C--C--AT-----G-T----AG-G--------A--A-TGTCAA-AC--A------------AC-CT-G-AT--T----TATA-----A--T-CAATTTAAGGG-------ACT--A--T-A--T-AC-----TTT----CA------AA---Tg
gi|5 : atggcaaaattcattagaaacactaacagctgatgtaattgCACTGTAAACCACTGGAGGAGAGA-T---AATGGAGCG--CGAG-------TGGACT-TTC-AC-AT-----GC-GAGTGTGTTGA-GTCTGCTTAATCTA-ATAAGT--TACGATTTG--CATTGTCAAAGATAAATGTT
gi|32 : atttggcaacattatcagtacgacataacaccagcatcgcatattgtgtcggtttaggaagcactctgAAA-T---AATG-AGCG--CGAG-------TGGACT-TTC-AC-AC-----AT-CA-T-TATTGA-ATCTG--GAATATAgaaatgacacagagaaactccatcaggtcactactgttcaacactaagcaccttaaggatagtcaaagcaactatgaggatagtaatttctttcaaaagcgagaaaaatgcaccattaacacaatatgcccattaatattggatctgtcatgcaaataatttattctactatatatctaatcaattactgttacaatagctcttaagtatagcccacaaaacgtcgaagacgtccccatgcagagatatcacaatgccagaacggtctgacttgtacaaattaaagtgagttactggaagcatcttacatgatcatctaagaatctctataagatgagaattgtctcaattatggtcaatagtttttcatcattttcatagaagagacccatgtatcagaggtgtctccattttcagtgtattattaaaagtaacaatctgtcgtagcctccaaatttcataaacagttcatacatatttatttcaaagtgaaaattcttaagtatgataatcaaggtgttaataagacttgttggcaaatgaaatgacatctaccatcgatctgaaaacaagtttttccaaattcgccgaatagtattattttcagcaaatttcaagtttttgccccagaaaatcagagaaaaaggttctccgtgcaaacaatatttttttactccattataaattcaaagggtcacagtgattttcagaaaacaatttctttttgcatcagctaaattattatctatgaagagttctgaaggaatttttaccatttttttcgattaatattgtgaaagacagaaaaaatcactattctcacccctctataaaaagataaatttctttttcaaaggttccccaaattatcttatgtcagacaactttg
gi|11 : TAAGCTCCAAACTT-AT-TAA-CTGTACCTATAACCTTTATATCAAACAAC--TTGAT--ATACACAAG---------CATACATGGGGTT--TAGTTCTTTAAA-GCAAAA---TGCATGCTTGC-----AA-AATGTCCAT-AT-----C-ATG----ACTGTT-GGAA---A------TT-------TTCT-----CTA---TTTC---AAC-AGTA-CTGTAT-AATGAC-AATTTT-CA-----TACATGTA-TTTTG-TCC-CAA-AACTCGAA-A--------ATG-TCCCC-------AAA-T-ATCA--AT----GTCAAA-C-AGTCT-
gi|34 : taTGTACC--TAGCCTTGATATCAAGCAAC--TTGAT--ATAgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatttttaagtacaaatcatgttgtagcctcaaacatacatatataaaggtatttatgccaaacaactagatatataa
gi|10 : cttcatataATGTCAAACAAC--CAGATTTATAATCAAGGACAATGTACTT---TCAAATTA-TACTTGTTT----GCAAAA---G---TCAATGA-----CA-TTTAT-----AT-----C-GGA----TCT-GA-GGAG---T------TT-------TTCC-----A-A---TT-T-----C-GGTGATTATTTTCAC--C-TATTT--C----------TGTT-TTTTG-CCC-CAA-AACTC--A-AA-A-----ACC-C-CCC-------ACG-T-AGGA--AT----GTCAAA-CAA--CC-TG--AT---T
gi|6 : caattcggatgagtattatcactaagatgttatagcgatcgtctcgttagtttttttgccccaaaactaaaaacacgccccatgaaggaatgtcaaacaatctgattataattgtgtgactatgtactttcaaattatactttttggaaaagtcaaacatttatatcggatctgaggagttttccaatttcgtgattattttcaccaattcatgtttttgccccaaaactcaaaacgccccacgcagaAA-AACAACTAAT--ATA--TAA------------T---CAAGGGT--TAAT-----AAATACAAAAGACT---TGCTTGC-----AA-AT-ACA--C-ATGGCTCT-ATATCGGATC-TT-GAAAAAGT------TT-------TCTT-----C-AATTTT-C---AAC-A-TA--TATTTTCA---C-AAAT----A-----TAC---TAGTTTTG-CCC-CAA-AACCTCGA-AA-G-------T-T-CTC---------------CG--G-----GTAAGA-CA---CT-TA--ACCTATT--ATAA-T-----CAAAG---------------G-GT-T-------A-AT-----AC----T---------TTTCAGAA---------A---AC----ATTTATTT---------TTCATCAGTC-AA-TTAT---T---A-T-CAT--AGA------G--ATATGAA---G----GAGTTGT-T------------T-T--TT-CC--ATTTT----CGATT-A--T--T-T-ATA--AAG--A-AA---AA-A-TTC-CTG----TTTAAT-C-CA--AAA-C-TCACAA------------TG-T-----T-C------------TCA---AA-A---------TCTCATGT-AAA---ACAA--CTTATATATCATTGAATGGTAT-AT---ACGTTCACCAAAATACTTGTTC-CAATGCATTATATCGNN---NNNNN-NNN--NN-NNNNNNNN--N-N--N--N-NNNN-N---------N--NNNN-------N-NN------NNNNTCT-G----AGG--A-GTTTT--C-C----AATTTTCG---TGA-T----TAT--------T-TT------CA--CCAATTT--A---TGTT-T--TTG--CCCCA-AAAAC-TC---AAAAAAACGCCGT-TCACG---T-A-GGAAT---G-----TCAAA----------A--CA--A----C-----CT---G--AT-----------------T-----AT----AA--GCAA-GG-ACTA-T--G-T-ACT---------CGT-CA------AATA---AC--CTTG--T--ATCCAAAAGT--C-CA--T--A--------AC--AT--CTTTA--T-CG--------GA--T-TTGAGGA-G--TT------T----TTC--A--A-T-TTTGG--C---G------A---T--T-A-T--T-T--TCAC-----C--------AATTTC---A-----T-GT-TTTTTGCCCC-----AGAA---------AC--------TCAAAAACAA----C------CC---C---CA--------CG------TA-----G---G-----------A--A------G-----T--CAAA----CAAACCCG----------------ATT-TA---TAA--TCAAG----G--GACTA-T-G---TACT-------------T--TCAAAT--------T---ATAC------TTGTTTGC------AAT--AGT-CATAAGACA--TCTAT-------AT------TGG---A--T-TG-A--GA---G-TTTTGC-------C-------TAT-T---C-A-G--CG--ATTATT---TT---CA--CAATTTC-----AATTAA-TT----T-CAAG--------TTTT--------TTGCCCC--AAAAACCT---CA---A---A-----A------AAC-GCC-CC-CA---CGTAA--CG----A---A--T---T-------CA-----AAGGCAACC---TGATT-T--T--TA-------AT-C-A-A---G-------A-CT---A-T---T--------A-GTT-T----C---AAA---AAAT---TA-----CTTGT-T-TG-CAAAAAT-Catattcagggactagactttcaaaaaaactgttgcaaatccccggggt
gi|14 : tgcTTCTTTAGA-AGGAAA---T-----AATGA-----AA-TTAAT---G-AC-----A-GTA----GGA-TT-GGATCT-T------TT-------TTCTACTATC-T---TT-T---AACCAGTG-CTGT---AATGACTAACTT--TC-----TACATGTA-CTTTACTAC-TCA-AACTCGAA------------------C-------AA--T-CCCA--AT----GCCAGA-C-AGT---TGGAAT---TT--ACAA-T--------AG---------------GCGT-A-------GTATCGCCAAT----AAAATGATCCTTTAAGGA---------A---ATGCTAAATTGTTT---------C--------C--A-AGGT---TG--G-T-AATCGACT------TTAACAT--A--------AA-TTCTCTG----A-GAGGAT-T--TT-CC--ACTTGT----AG-TGA--T--C-TGTTT--AAGTTA-AA---GACC-ATGTCTC----G--TAGCC-TC--AAA-ctgagggggtcccccattacctttactggcccatggtc
gi|17 : ttagtTAT---T-AT-----TTATA---------T-AGAA---T------TCGAAGAGGTTCT-----CCA---TT-T---TTA-GGTGATTTTTTTAAGTAA-AAT-------------CATGTA-----G-CCT-CAA-AACTCGTA-AATGTTCCCACA-T-CCT-------AAAGT-ATAA--ATTTATGTCAAA-CAA--CT-TA--GT---AT--ATGA-T-----CAAGG---------------G-GT-T-------GCAT-----------------GTATTC--ACAA---------A---AT----ACTTGTTT---------G--------C-AA-ATGT---CA--A-T-GAC--ATC------T--ACAT--C---G----GA-T--C-TA----A-AACG-T-T--TT-CC--A-ATTTT--CAG
gi|10 : aggttca-GGAG---T------TT-------TCCA-----A-T---TT-C--------GTGATTATTTTCAC--C-AATTC------------ATGT--TTTTG-CCC-CAA-AACTCAAA-A---------CG-C-CCC-------ACG-C-AG-A--AT----GTCAAA-CAA--CC-AG--AT---TT--ATAA-T-----CAAGG-------------------------------------AC------AATG-TACTTTCAAAT---------T---AT----ACTTGTTT---------G--------C-AA-AAGT---C---AAT-GAC--ATT------T--ATAT--C---G----GA-T--C-TG----A-GGAGTT-T--TT-CC--A--ATTT--CGG-TGA--T--TAT-TTc
gi|28 : caattcggatgagtattatcactaagatgttatagcgatcgtctcgttagtttttttgccccaaaactaaaaacacgccccatgaaggaatgtcaaacaatctgattataattgtgtgactatgtactttcaaattatactttttggaaaagtcaaacatttatatcggatctgaTTTACTTAT-ACCTC--CA-----TGC------------TCG-CAA-AACTCGAA-A--------ACG-TTCCC-------AAT-T-ATCA--AT----GTCAGA-C-AGTC--TG--AT---Ttcacctatttctgttttttgccccaaaactcaaaaaccccccacgtaggaatgtcaaacaacctgattatattcagggactagactttcaaaaaaactgttgcaaatccccggggt
gi|16 : gacga-AATTC--CACAAATTTCAAGT--TTTTG-CCC-CAA-AA-TTCAA-A------------------------AAA-T-ATCC--AT----G-CAAA-CAA---TATG--AT---TT--ATAA-T-----CAAAG---------------G-GT-T--------CA------------------ATAGTTTCAGAG---------ACCCAC----ATTTGTTT---------T--------CAAA-AGGC---A---A-T-ATT--ATC------T--GTG---A---A----GA-GTCT-GA----A-GGAG-T-T--TT-CC--ATTTGTC--GA--TGA--T--T-T-TTA--AAGAAACAA---AA-G-AGC-CCA----A--AAG-C-TCGAAAA-TGTCCTAA--------A----A-T-----------------------------A---------CTT-ATGTC-AA---ACAA--C-----------T
gi|7 : CATGT--TTTAG-CCC-CAA-AACTCGAA-A--------ATG-T-CCCA------AAA-T-ACTT--AT----GTCAAA-CAA--CT-TG--AT---AT--ATAA-T-----TTAAT---------------T-GT-T-------ACAT-----AC---------G-----TTCACAA---------A---AT----ACTTGTTT---------A--------C-AA-AAGT---CA--A-T-GAC--ATC------T--ATAT--C---G----GA-T--C-TG----A-GGAG-T-T--TT-CCCAATTTTtgatatat
gi|9 : attaagaatttgatctcatagaccatgggccagtaataatgtcatatagtctgatttacaattaaagagctttgaaaggtctatatgatttatatagaatctgaacttttttattttttggtgatctttttaaaagtaaaatcatgttgtagcccgaaatctcgtaattgttcacacatatcatagtataaatttatgtcaaataaattaatatatgattaaaggcttgcatatattcacaaaatacttgtttccaaatgtcagtgacatctgtatcggatgtaaaatgtttttctactttttggcgattattttcacaattaaatttcaaattcttaccccaaaacccagaaaggtctccatgcaaacaatataatttataatcaaagggttgaatagtttcagaaaatatttttttcattttccatttttcgatgatttctaaagaaaataaaatATGT--TGTTT-TCC-CAA-AACCCAAA-AA-------ACGCT-CCC-------ACG-TTAGGA--AT----GTCA-A-CAAACCT--G--AT---T---ATAA-T-----CAAGG---------------G---------------------AC----TA--TTGTACTTTCAATA---------T---AT----ACTTGTTT---------G--------C-AATAGCC---A---A-T-GA---ATC------T--ATAT--C---G----GA-TC---TG----A-TGAG-T-T--TTTCC--AATTTT---CAGCCGA--T--T-A-TTA--cggtgactatttccaccaatttcatgtttttg
gi|10 : atgttaaaaacttgataatcataggaatggttacatatttcacaaaatacttgtttgcaaagttcaatgacatttatatccggatacgaaaacgtcgatcaatctcgtaagtccaaattagggatctgaagaggtatccaatttcgagtgttattttcacagatttt-TTTTG-CCC-CAA-AACT-AAA-AA-C-----ACG-C-CCC-------ATG-A-AGGA--AT----GTCAAA-CAA-TCT--G--AT---T---ATAA-T-----T---------------------GTGT-------G--------AC----TA--TG-TACTTTCAAAT---------T---AT----ACTT-TTT---------G--------G-AA-AAGT---C---A---AAC--ATT------T--ATAT--C---G----GA-TC---TG----A-GGAG-T-T--TT-CC--AATTTCG--TGATT-A--T--T-T-TCACCAATTCA-T-------G-TTT-TTGCCCCA--AAA-C-TC--AAAACGCCC---------------CA-C-----G-C------------AGA--------------------ATGTCAAA----CAA--C-----------CAGA----TTTAT---A-----ATCAA--G----G--A-CAA-----TGTAC--TTTC-AAATT-ATACTTG-TTTGCAAAAGT-C--A--A-TGAC-----------A--TTTA-------T-AT------CGGATCT-----GAGG--A-GTTTT--TCC----AAT-TTCG-G-TGA-T----TA-----------TT----TTCA--CCTATTT-C----TGTT-T--TTTG-CCCCA-AAA-C-TC---AAAAAttcaccaaatttccagtttttttgccccaaaactcaaaacgccccacacgtagggaatgtcaacaacctgatctttaatcaagggactactgtagtttcaaaaatacttgttgcaaaaatctaggggggtccccccattacctttactggcatagtctagggattcaatt
gi|5 : caattcggatgagtattatcactaagatgttatagcgatcgtctcgttagttt-CAA-AACGTCGA-AG-------ACG-T-CCCCATGCAGAGA-T-ATCACAAT----GCCAGAACG-GTCT--G--AC---TTGTACAAAT-----TAAAGTG-------------A-GT-TACTGGAAGCAT-----CT----TACATGATCATCTAAGAATCTCTATAAG---ATGAG-AATTGTCTCAATTATGGT--------C-AATAGTT---T---T-T-CATC-ATT------T--TCAT--A---GAAGAGA-CCCA-TGTATCA-GAGG-TGT--CT-CC--ATTTT----CAGTGTA--T--T-A-TTA--AAAGTA-AC---AA-T-CTG-TCG----T--AGC-C-TCC-AAA-TTTCATAA--------A---CAGT-----T-C------------ATA---CATA---------TTT-ATTTCAAAGTGAAAATTC-----------TTAA----GT-ATGATA-----ATCAAGGT----GTTA-----------------------ATA-AGACTTG-TTGGCAAA--T-G--A--AATGAC-A------------TCTA-------CCAT------C-GATCT-G---AAAACAA-GTTTT--T-C----CAAATTCG-C-CGAATAG--TAT--------TATT----TTCAG-CAAATTT-CA---AGTT-T--TTG--CCCCAGAAA-A-TCAGAGAAAAAG----GT-TC------TCC-GT------G-----CA--A----------A--CA--ATATTT--T--TT---T--AC-----------------TCCATTAT----AAATTCAAAGG-GTCA-C--AGTGATT---------T-T-C--AGA-AAACAATTTC--TTTTTGC--ATC----AGC--T-AAATT--A--------TT--AT--CT--A--T-GA---AG--AGT--TCTGAAGGA-A--TT------TTTA-C-C--ATTT-T-TTT----C---G------A---T--TAA-TA-T-T--GTGAAAGACAGAA--A--AAATCA---C-----T-AT-TCTC-ACCCCTCTATAAAAAGATAAATTTCTT------TTT----CAA----A--GGTTCC---C---CA--------AAT-----TA-----T---C-----------T-TAT-----G-----T--CAGA----CAA-CTTccccccacgtaggaatgtcaaacaacctgattatattcagggactagactttcaaaaaaactgttgcaaatccccggggt
gi|7 : atttggcaacattatcagtacgacataacaccagcatcgcatattgtgtcggtttaggaagcactctgcactgtaaaccactggaggagagataatggagcgcgagtggactttcacatgcgagtgtgttgagtctgcttaatctaataagttacgatttgcattgtcaaagataaatgttgaaatgacacagagaaactccatcaggtcactactgttcaacactaagcaccttaaggatagtcaaagcaactatgaggatagtaatttctttcaaaagcgagaaaaatgcaccattaacacaatatgcccattaatattggatctgtcatgcaaataatttattctactatatatctaatcaattactgttacaatagctcttaagtatagccca--AT----GTCAAA-TAAAT---TA--AT---AT--ATGA-T-----TAAAG---------------G-CT-T-------GCAT-----------------ATATTC--ACAA---------A---AT----ACTTGTTT---------C--------C-AA-ATGT---C---AGT-GAC--ATC------T--GTAT--C---G----GA-T--G-TA----A-AATGTT-T--TT-CT--ACTTTTTGGCGATT-A--T--T-T-TCA--CAATTA-AATTTCA-A-ATT-CTT--------AC-C-CC--AAA-ACCCAGAA--------AGGTC--T-----C-C------------ATG---CA-A-------------A---CAAT---ATAA--T-----------T--------T-AT---A-----ATCAAAGG----GTTG-AA------TA-GT--TT----CAGA-AAA--TA-TTTtg
gi|20 : attaagaatttgatctcatagaccatgggccagtaataatgtcatatagtctgatttacaattaaagagctttgaaaggtctatatgatttatatagaatctgaacttttttattttttggtgatctttttaaaagtaaaatcatgttgtagcccgaaatctcgtaattgttcacacatatcatagtataaatttCAGA-C-AGTCT--G--AT---TT--ACAA-T-----TAAAG---------------G-GT-T-------CCAT-----AC----T-AATGGTACGTTAAGAA---------A---AT----AATCATTT---------T--------C-AA-AAGTTCAT---A-T-G----ATT------T--ACAT--A---G----GA--TCT-GA----A-GAGG-T-T--CT-CC--ATTTTTttttcattttccatttttcgatgatttctaaagaaaataaaatcatgttttagccccaaaactcgaaaatgtcccaaaatacttatgtcaaacaacttgatatataatttaattgttacatacgttcacaaaatacttgtttacaaaagtcaatgacatctatatcggatctgaggagttttcccaattttcggtgactatttccaccaatttcatgtttttg
gi|8 : -TG--AT---TT--ATAA-T-----CAAAG---------------GAGT-T------------------------AA--ATACTTTCAGAA---------A---GT----ATTTGTTT---------TTT------C-AA-AAGT---T---G---AAT--ATTGGTTCTT--GTG---A---A----GA-GTCT-GG----A-AGAG-T-T--TT-CC--ATTATTT--CA----------------A--AA---A-AA---AA-A-AT--CAC----G--A---T-TT--A----GTC-CAA--------A---AA-C-----T-C------------GAA----A-A---------TGT----TCCAA---ACAA--C-----------TTGAT---AT-AT---A-----TTTAA--T----GTTAGCA------TACGT--TC---ACAAA-ATA--TTCTTTGCAAA-------A--A-TAAA-AGTCAATGACA--TCTT-------T-AT------TCGGCAT-GTCTGAGG--A-GTTTT--T-T--------CTCA-A-TGA-T----TAT--------T-TT----CACA--CCAATGT-CA---TGTT-T--TTTG-CCCCA-AAC-T-TG---GAAca
gi|22 : atattcacaaaatactgtttgcaaatcggtcatgacaactacatcggatctacgaaaatgtcggcggatattttgcagttcaattaagattggtgccccaaaatcaaaacagtatccatgcaacaataGAA---------A---AT----AATTGTTT---------T--------C-AA-AGTC---C---A-T--AT--A-T------T--ATAT--AAACG----GA-------A----A-GAAC-T-TTCTT-CC--ATTTTTT--CAG-TGA--T--T-T-TTT--AAGTAA-AA---AATC-ATG-TTG----T--AGC-C-TC--AAA-Ccgcccaggtagaatgtcaaaacaggctgactttataaatgcagtggactattgactgtcgaaaaagtatactttttcaagagccttcaggagtctccctt
gi|26 : ----AATTGTTT---------T--------C-AA-AGGTCCAT---A-T-G----ATT------T--AAAT--A---G----GA--TCT-GA----A-AAAG-T-T--CT-CT--A-TTTTT--CAG-TGATTT--T-T-TTA--AAG-TA-AA---AT-GCATG--TG----G--TAG-CATC--Att
gi|7 : GCTT---------T--------G-AA-AGGTCTAT---A-T-GAT----T------T--ATAT--A---G----AA-T-CT---------GAAC-T-T--TT-TT--ATTTTTT----GGTGA--TCTT-T-TTA--AAAGTA-AA---AT-C-ATG-TTG----T--A-G-C-CCG-AAA-TCTCGTAATTGTTCACA---CA-TA----T-C------------ATAGTATA-AA--------TTT-ATGTCAAA---TAAA--T-----------TAAT----AT-AT---G-----ATTAAAGG----CTTG-CA------TATAT--TC---ACAAA-ATACTTG-TTTCCAAA--T-GTCA--G-TGAC-----------A--TCTG-------T-AT------CGGA--T-G---TAAA--ATGTTTT--T-CT---ACTTTTTG-G-CGA-T----TAT--------T-TT----CACAATTAAATTT-CA---AATT-C--TTA--CCCCA-AAA-C-CC----AGAAAG----GTCTC------CAT-GC------A---------A----------A--CA--A----T------A---T--AA-----------------T---TTAT----AA--TCAAAGG-GTTG-A--A-T-AGT---------T-T-CAGAAA-A------TAT--TTTT--T---TC----ATT--T----------------------T--CC--A--T-T--------------------------TT------T----C-G--A--T--------------G------A---T--T--------T--CTAA-----AGAA--AATAAAATC---A-----T-GT-TTTA-GCCCC-----AAAAC--------TC-G--------A----AAA----T--G--TCC---C---AA--------AA------TA---------C-----------T-TAT-----G-----T--CAAA----CAA-CTTG----------------ATA-TA---TAA--TTTAA----T--TGTTA-C-A---TAC---------G----T--TCACAA--------A---ATAC------TTGTTTAC------AAA--AGT-CA-ATGACA--TCTAT-------AT------CGG---A--TCTG-A-GGA---G-TTTTCC-------C-----AATTT-T---C-G-G--TG--ACTATT---TC---CA--C-----C-----AA-----TT----T-CATG-------TTTTT--------
gi|17 : attaagaatttgatctcatagaccatgggccagtaataatgtcatatagtctgatttacaattaaaga-AGGT---TC--A-T-ATT--ATT------T--ATAT--A---G----AA-TTC---G----AAGAGG-T-T--CT-CC--ATTTTT----AGGTGA--T--T-T-TT------TTA-AGT--AA-A-ATC-ATG----T--AGC-C-TC--AAA-ACTCGTAA--------A---TG-T-----T-CCCACATCCTAAAGTA---TA-AA--------TTT-ATGTC-AA---ACAA--CT----------TAGT----AT-AT---G-----ATCAAGGG----GTTG-CA------TGTAT--TC---ACAAA-ATACTTG-TTTGCAAA--T-GTCA--A-TGAC-----------A--TCTA-------C-AT------CGGATCT-----AAAA--C-GTTTT--C-C----AATTTTCA-G-Cg
gi|6 : CAAA---ACAA--C-----------TAAT----AT-AT---A-----ATCAAG-G----GTTA--A------TAAAT-------ACAAA-AGACTTG-CTTGCAAA--T-A--C--A-CATG-G---------C--TCTA-------T-AT------CGGATCTTG---AAAA--A-GTTTTCTT-C----AATTTTCA-A-CA-------TAT--------A-TT----TTCA--CAAATATACT---AGTT-T--TG---CCCCA-AAA-CCTC---GAAA-------GT-TC------T-CCGG------G-----T---A----------AGACA--C----T--TAACC---T--AT-----------------T-----AT----AA--TCAAAGG-GTTA----A-T-ACT---------T-TTCAGA---AAACATTTAT--TTTT--C--ATC----AGT--C-AA--TT-A--------TT--AT--C---A--T------AG--AGA--TATGAAGGA-G--TTGTTTTTT----C-C--A--T-T-TT-----C---G------A---T--T-A-T--T-T--ATAA-----AGAA--A--AAATTC---C-----T-GT-TTAA---TCC-----AAAA---------C---------TCA----CAA----T--G--TTC---T---CA--------AA-------A-----T---C-----------T-CAT-----G-----T--AAAA----CAA-CTTATATATCATTGAATGGTATA-TACGTTCA--CCAAAATACT--TGTTC-C-AATGCATT--------A----TA-TCGNNN--------N---NNNN------NNNNNNNN------NNN--NNN-NN-NNNNNN--NNNNN-------NN------NNN---N--TCTG-A-GGA---G-T-TTTC-------C-----AATTT-T---C---G--TG--ATTATT---TT---CA--C-----C-----AAT----TT-------ATG-------TTTTT----------GCCCC--AAAAA-CTC--AA---A---A-----A------AAC-GCCGTT-CAC--GT--A--GG----A---ATGT---C-------AA-----AA--CAACC---TGA---TT-A--TA-------AG-C-A-AG-G--------A-CT---A-T-G-T--------A-CTCGT----C---AAA---TAA----C------CTTGTATC---CAAAAGT-CC-ATAACA---T--CTT-------T-AT------CGGA--TTT---GA-G-GA---G----TTTTT-------C-AA-TTTT-G-G-C---GA------T----TATT-T-T-CA------C----C-----A-ATT----T-CAT----G--------TTTT--------TTGC-CCCAGAA-----ACTC----A-AAA------A--C--AACC-----C-C--C--AC-----G-T----AG-G-----------A-AGTCAA-ACAAA------------CC-C--G-AT--T----TATA-----A--T-C-----AAGGG-------ACT--A--T-G--T-AC-----TTT----CA------AA---TTATACTTGTTTGC-A--ATA-------G--T-CATA----AGA-CA---TCTAT--AT-----T-GG---A----TT----GA-GA-G-----TTT-TG-------C-C--TA---TT-C-A-G-CGAT------TA--------TTTT--CA---C--A--A-TT-TC----A-AT--TAATTTCAAGT----TTT--------TTGCCCCAAAAACC-----TCAAAAAACG-CCC-C-CAC--------GTA-ACGAAT-T-------CAAAGGC-AACCTGA-T-T-----TT-T-AA-------T-CA-A--------GA--------CT---AT--T-----A-GTTTCAAAAA--A--TT-----ACTTGTTT---GCAAAAATCCT--GAGGGGGTC-C-CCCATTACCTTTAC-TGGCCCATGG
gi|24 : tgAA---ACAA--C-----------TAAAT---AT-AT---A-----TTCAAGGG----GTTT-CA------TATAG--TT---ACAAA-TGACTTG-TTTGCAAA--T-G-----A-TAAT-GAC-------A--TTT--------T-AT------CGGATCT-G---AAAA--G-GTTTT--T-tc
gi|9 : tcT-AT---A-----ATCAAGGG----ACTA-T-------TGTAC--TTTCAATATATACT--TG-TTTGCAA---T-A--G--C-CAATGA---------A--TCTA-------T-AT------CGGATCT-----GATG--A-GTTTT--TCC----AATTTTCA-GCCGA-T----TA---------T-TA----TTCAC-CAAATTT-CC---AGTT-T--TTTTGCCCCA-AAA-C-TC-----AAAAC----GC-CCCACACGT-A-GG------GAATGTC---A----------A--CA--A-------C--CT---G--AT-----------------C---TT-T----AA--TCAAGGG-ACTA-CT-G-T-AGT---------T-T-CA---A-AAATACTTGT--Ttttccaat
gi|31 : atgttaaaaacttgataatcataggaatggttacatatttcacaaaatacttgtttgcaaagttcaatgacatttatatccggatacgaaaacgtcgatcaatctcgtaagtccaaattagggatctgaagaggtatccaatttcgagtgttattttcacagattttatgttgttttcccaaaacccaaaaaacgctcccacgttaggaatgtcaacaaacctgat-----ACCAAGGG----GTTA-CA------TAAAT--TT---ACGAA-AGACTTG-CTTGCAAA--T----A--A-TAAT-G---------A--gcaaaaatctaggggggtccccccattacctttactggcatagtctagggattcaatt
gi|8 : ATAT--TC---ACAAA-ATAC-TG-TTTGCAAA--TCG--GTCA-TGAC-A---------A---CTA-------C-AT------CGGATCT-AC--GAAA--A-----------------TGT-CG-G-CGG-A----TAT--------T-TTGCAGTTCA-----ATT---A---AGAT-TGGTG---CCCCA-AAA-T--C---AAAACAGT---AT-CC------A-T-G-------------C---A----------A--CA--A----T-------------ATGA---------------T---TTAT----AA--TCAAAGGAGTTA-A--A-T-ACT---------T-T-CAGA---AAGTATTTGT--TTTTT-C--AAA----AGT--TGAA--T--A--------TT--GG--TT--C--T-TGTGAAG--AGT--C-TGGAAGA-G--TT------T------------------T----C---C------A---T--T-A-T--T-T---CAA-----AAAA--A--AAAATC---A-----C-GA-TTTA-GTCCA-----AAAA-----------------------------------------C---T---CG--------AA------AA-----T---G-----------T-T-------------C--CAAA----CAA-CTTG----------------ATA-TAT----A--TTTAA----T---GTTAGC-A---TAC---------G----T--TCACAA--------A---ATA-------TTCTTTGCAAAAATAAA--AGT-CA-ATGACATCTTTAT--------T------CGGCATG--TCTG-A-GGA---G-TTTTTT-------C-----------T---C-A-A--TG--ATTATT---TTCA-CA--C-----C-----AA-----TG----T-CATG--------TTTT--------TTGCCCCA-AA----CT--------T---G-----G------AAC-GCC-C----------AGGTAG----A---ATGT---C-------AA-----AA--CAGGC---TGACTTT--A--TA-------AA-T-GCAGTGG-------A-CT---A-T---T--------GACTG-T----CGAAAAA---GTA----TA-----CTTTT-TCcatt
gi|21 : ATAT--TC---ACAAA-ATACTTG-TTTGCAAA--T-GCCA--G-TGGC-A------------TCAA-------T-AT------CGGACCT-G---AAAG--G-CTTTT--C-C----AATTTTCA-G-CGA-T----TA------------T----TTCA--CAAATTT-CA---AGTT-T--TTG--CCCCA-AAA-aagagccttcaggagtctccctt
gi|3 : A--TG-CTTGCAAA--------------AT-G------------TCCA-------T-AT------ATGA-CT-GTT-GAAA--A-TTTTC--T-C----TAT-TTCA-A-CAG-TACTGTATAATGACAAT-TT----TTCA--TACATGT-------ATT-T--TG---TCCCA-AAA-C-TC---GAAGA-T----GT-CC------C-C-AA------A-----T---ATTAATGTCAGA--CA--G----T-----CT---G--AT-----------------T---T-AC----AA--TTAAAGG-GTTA-C--A-T-ACTATTGATAA-T-T-TA-AGA-AAATAATTGT--TT----C--AGA----GGT--C-AA--T--A--------TG--AT---------T-TG---AATAAGA--TCTGAAGAA-G--TTC-----T----C-C--A--T-T-TTT----C---A------G---T--G-T-T--T-T--TTTA-----AGTA--A--AAAT-C---A-----T-GT-TGTA-GCCTC-----AAA-----------C-C------TTA----TAAACA-T--A--TACATACATACA--------AA------TACAGGTT---T-----------T-TAT-----G-----C--CAAA----CAA-CTAG----------------ATA-TA---TAA--TCAAG----G--GGTTA-C-A---TA----------A----A--TTACAA--------A---AGAC------TTGCTTGC------AAAT-AAT--A-ATGACA--TCTACCAGGTATAT------TGG---A--TCTG-A-AAA---G-T-TTTC-------C-----AATTT-TCAGC-T-A--TT--ATTATT---TT---CA--C-----A-----AAT----TT----C-TA-G---------TTT--------TTGCCCCAAAA----CT---CG---A---A-----A------AG--GTC-TC-CG---GGTAA--AC----A---TTGT-----------------------AACC--TTAT---T--A--TA-------AA-C-A-AA-GG-------G-TT---A-C---T--------A-ATT-T----C---AGA---AAA----CA-----TTTAT-TTT--CATCAGT-CA-ATATTA---T--CTA-------T-AG------AGAG--TAT---GA-ATAA---G----TTTTC-------C--A-TTTTT----C---GA------T----TATT-TAT-TAAG----A----A-----A-AAA----T-CCT----G---------TTT--------TAGT-C-CAAAG-----ACTC----G-TCA------A--T--G--T-----T-A--T--A------A-T----AT-C--------T--A-TGTTAA-ACAAA------------CT-T--G-AT--A----TATC-----A--T-T-----GAATG-------GTT--A--C-A--T-AC-----GTT----CAC-----AA-----ATACTTGTTTGCAA--A-A-------G--T-CA-A----CGA-CA---TTTAT--AT-----
gi|18 : caaacaaaccacctgcatcgaagaagtaatttgctcgaaatgttataattattcggttcccaatcacctgccctattaccagaaattggcactgtacagcaggttattcagctatcacaagaaggggttttgttgtaactatccttgcttgtgatattttgcagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntataattggcaaaatacagagaaatacagcgatgtccatttaggagttttcgattcacttccctgcactggaaacagttcgggaaaataatgagcgcgagtggactttcacacgttgattattgagtctgaaatatatgtacgatatactcaggtatcagataatgttataagctccaaacttagccttgatatcaaacaaataatacacataagtatgaggttgttctttctttaaagcaaaatgcTTGCAAAACT-T--T--A-TAAT-A------------TCTA-------T-ATGTATTTCGGATCT-G----AAG--A-GTTTT--T-CC---AAAGTTTG-G-CGT-T----TAT--------T-------TTCA--CCAGTTG-CATGGGGTT-T--TTTG-CCCCC-AAA-C-TC---GACAAcg
gi|9 : GATCT-G----AAG--A-GGTAT--C-C----AAT-TTCGAG-TG--T----TAT--------T-TT------CA--CAGATTT-TA---TGTTGT--TT---TCCCA-AAA-C-CC---AAAAAAC----GC-TCCCACG-T-T-AG------GAATGTC---A----------A--CA--A----A--C--CT---G--A----------------------TTAT----AA--TCAAGGG-ACTATT--G-T-ACT---------T-T-CA---ATATATACTTGT--TTGC--A--AT-----AGC--C-AA--TGAA--------TC---T--AT--A--T-CG--------GA--T-CTGATGA-GTTTT------T----C-C--A--A-T-TTTCAGCC---G------A---T--T-A----T-T--ATTC-----A-CC--A--AATTTC---CAG---T-TT-TTTT-GCCCC-----AAAA---------C---------TCA----AAA----C--G---CC---C---CA--------CA-----------------C-----------G-TAGGGAATG-----T--C-AA----CAA-CCTG----------------ATC-T---TTAA--TC-AA----G--GG--A-C-----TACT--------GTAGTT--TCA-AA--------A---ATAC------TTG-TTGC------AAA--AAT-Ccaccaccaccaaggaatgtcaaacaaccttatttagaatctagggacaatgtagtttcaaaatat
gi|16 : atgttaaaaacttgataatcataggaatggttacatatttcacaaaatacttgtttgcaaagttcaatgacatttatatccggatacgaaaacgtcgatcaatctcgtaagtccaaattaggT----TCCA--CAAATTT-CA---AGTT-T--TTG--CCCCA-AAA-T-TC---AAAAAAT----AT-CC------A-T-GC------A---------A----------A--CA--A----T-------------ATGA---------------T---TTAT----AA--TCAAAGG-GTTC-A--A-T-AGT---------T-T-CAGAGACCCACATTTG---TTTT--C--AAA----AGG--C-AA--T--A--------TT--AT--CT--G--T-GA---AG--AGT--C-TGAAGGA-GT-TT------T----C-C--A--T-T-TGT----C---G------A---T--G-A-T--T-T--TTAA-----AGAAACA--AAA--------------G-----A-G-CCC-----AAAAGC-------TC-G--------A----AAA----T--G--TCC---T---AA--------AA------TA---------C-----------T-TAT-----G-----T--CAAA----CAA-CTTG----------------ATA-TAtaggggggtccccccattacctttactggcatagtctagggattcaatt
gi|10 : aa---AGTT-T--TTTTGCCCCA-AAA-C-TA---AAAACAC----GC-CC------CAT-GAAGGAATG-----TCA-A----------A--CA--A----T-----CT---G--AT-----------------T-----AT----AA--TTGTGTG-ACTA-T--G-T-ACT---------T-T-CAAA---------TTATACTTTT--TGGAAA----AGT--C-AA-----A---------C--AT--TT--A--TATC---GG--A----T-CTGAGGA-G--TT------T----T-CCAA--T-T-TCG----T---G------A---T--T-A-T--T-T--TC----------A--C--CAATTC---A-----T-GT-TTTT-GCCCC-----AAAA---------C---------TCA----AAA----C--G--CCC---CACGCA--------GA-------A-----T-------------------------G-----T--CAAA----CAA-CCAG----------------ATT-TA---TAA--TCAA--------GG------A---CAAT--------G----TACTTTCAA--------ATT-ATAC------TTGTTTGC------AAA--AGT-CA-ATGACA--TTTAT-------AT------CGG---A--TCTG-A-GGA---G-TTTTTC-------C-----AA-TT-T---C-G-G--TG--ATTATT---TT---CA--C-----C-----TAT----TT----C-TG----------TTTT--------TTGCCCC--AA---------AACTCA---A-----A------AAC--CC-CC-CAC--GT--A--GG----A---ATG----T-------CA-----AA--CAACC---TGAT--T--A--T--------AT-T-C-AG-GG-------A-CT---A---G----------A-CTT-T----C---AAA---t
gi|20 : caattcggatgagtattatcactaagatgttatagcgatcgtctcgtt----------A--CA--G----T-----CT---G--AT-----------------T---T-AC----AA--TTAAAGG-GTTC-C--A-T-ACTAATGGTACGT-T---AAGA-AAATAATCA---TTTT--C--AAA----AGT--T-CA--T--A--------TG--AT--TT--A--C------AT--AGGATC-TGAAGAG-G--TTC-----T----C-C--A--T-T-TTT----C---aaaactgttgcaaatccccggggt
gi|2 : cag----T--C--CT---TTGAT-----------------T---TTAC----A----TACAGA-ATTA-ATGA-T-ACG---------T-T---AAGA-AAATAATTAT--TTT---C--ATT----GGT--T-CA--T--A--------TG--AT--TT--A--T-------------------------A--TA------T----T-C--A--T-T-TC-----C---A------A---T--A-AAT--T-T--GAAA-----AGTA--A--AAAT-C---A-----T-GT-TGTA-ACCTA-----AAAA---------T---------TCA----TAAA---C--A--TTC---A---TA--------CA------TA-----T---------------T-TA------T-----TTTCACA----CAA-CTAA----------------ATA-TA---TAA--ACAAG----G--GGTTA-C-A---CA-T--------A----T--TTACAA--------A---AGAC------TTGTATGC------AAAT-AAT--A-AGGACA--TCAAT-------AT------CGGT--A--TGTG-A-A--------ATTTT-------CCCCCCAACTT-T---G-A-G--TG--ATTATTATTTT---TA--CA----C-----A------TT----T-CAAG-------TTTTT----------GCCCA--AAAA--CT---CG---A---A-----A------AG--GTC-TC-CA---------------------TG------------CA-----AA--CAATC--TT-A---TTTA--TA-------AT-C-A-AA-GG----------T---A-C-A-T--------A-CAT-T----C---AGA---AAA----CA-----ATGAT-TTT--CATCAGT-AA-ATATTA---T--CTA-------T--T------GAGA--GTT---GA-A-GG---A----GATTT-------CC-A-TTTTT----C---GA------T----TATT-T-T-TA------G----AGAAAAA-ATC----C-CGT---------------TT--------TAGC-CCCAAAA------CTC----G-TCG------A--T--G--C-----C-C--CCAAC-------T----AT-C--------T--A-TGCCAG-AC--A------------TT-G--G-ATGGC----TACA------------------------------T--A--T-GT-TCAC-------------A------AA-----ATATTTGTTTGC-A--A-A-------A--TTCA-G----TGA-TA---TCTAT--AT------CGG---A----TCTG--AG-GA-G-----CTTGT--------C-C--AA--TTT-TTG-G-TGAT------TA--T-----TTTT--AC---C--A--A-TT-TT----ATGT--T---------T----TTT-----------CCTCCAAAACT------C-AATAAC--ATC-C-CAC--------GTA-A-GAAT-GT------CAAA--C-AACCTGA-T-T-----TA-T-AA-------T-TAGG------G-GG--------CT---AT-GT-----A-CTTGC-AAAT--T--AT-----ACCTGTTT---GCAAAAGTCa
gi|4 : ttttgattggatatcctgaaaaaaagttcaactaaaccaaccatacttcttgaggcaggatggttatctacaaccacacctaatggaggaacactttgttggattgttgattatatggttccaatcacctgccctattgcaagaaatgacactattcagcatgctattcagctagattaatatcacaagaagctgtcaaaatgtaactatccttgcatgtgattttgcagtggctannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttggcaaaatccagagaagcacagcaatgtattgttcatttaggagttttccattcactatcctctgaactggaaaccactggggaaaatagtgagcgtgagtggacttttacacatgattattgagtctggaatatatgtacgatatgtcagaaaatgttataaacttcaaactttataaatgtacctaaccttgatatcaagcaacgtaatatacataagcgtttagttctttaagcaatgcatgcttgcaaaatgcccattatgttttctatttcaacaatcgtataatgacaattttatacatgtattttgtccaaaactcgaagacgtctccaaatatcaatgtcagacagtctgatttcaataaggataaaactgttcgttTAT----AA--TCAAGGG-GTTA-C--A-T-A----------------------AGAC--TTGT--TTG---C--A------AATGAT-AA--T--G--------AC--AT--CT--ACAT-CG--------GA--TCTGAAAAA-G--TT------TTT--C-C--A--A-A-TTT----C---GGCGATTA---T--T-A-T--T-TTCACAA-----A--------------------------T-TTTT-GCCCC-----AAAAC--------TC-AGATAGATTT----CTA----T--G------------CA--------AACAATTTTA-----T---T-----------TATA------A-----T--CAAAGGGTCA--CAT-----------------ATT-TAT-TTAAAATCAAA----G--GGTCA-C-A---TATT-------------T--TCAGAA--------A---ACAA------TTCTTTTC------ATC--CGT-CA-ATATTA--TCTAT----------------GG---AAAGCTG-AAGGA---G-T-TTTC-------C-----ATTTT-T---C-------G--ATTATT---TT---TA--A-----AGAAAAAAT----CC----T----G-------TTTTA----------GACCC--AA------------------A-----ATTTGTCAAT-GTC-CC-CA----------------A---ATAT---C-------TATAACTGA--CAACT---TGA---T--A--TA----------T-A-AT-TG-------A-AT---A-T-G-TTTACATACG-TTC-A----C---AAA-----A----TA-----CTTGT-T-TGC-AAAAGT-CA-ATGACA---T--TTA-------T-AT------CGGA--TCT---GA-G-GA---G----TTTTT-------CCAA-TTTTCG-G-T---GA------T----TATT-G-T-CA------C----C-----G-ATT----T-CAT----GTT------TTTT--------TTGC-CCC-AAA-----ACTA----A-AAA------A--C--GC-C-----C-C--C--AC-----G-T----AG-G--------A--A-TGTCAA-AC--A------------AC-CT-G-AT--T----TATA-----A--T-C-----GAGTG-------ACT--A--T-G--T-AC-----TTT----AA------AA---TTATACTTGTTTGCAA--A-A-------G--T-C-------TGA-CA---TTTAT--A------TCGG---A----TCTGA-GG-GT-T-----TTT-T--------C-C--AAT-TTT-C-G-G-TGAT------TA--------TTGT--CAC--C--G--A-TT-TC----ATGT--T---------T----TTT--------TTGCC-CCAAAAC------TA-AAAAACG-CCC-C-CAT--------GTA-G-GAAT-GT------CAAA--C-AACCTGA-T-T-----TA-T-AA-------T-CA-ATTTAAGG-GA--------CT---AT-AT-----A-CTTTCAAAaatgacatttatatcggatctgaggaattttttccaatttttggtgattattttcaccaattttatgtttttccccaaaaactcaaaaacgcccccacgtaggaatgttaaacaacctgatttataatcaggggaacattaccttt
gi|22 : atggcaaaattcattagaaacactaacagctgatgtaattgtttcgttttaggagcctctgcagcacttgtaaatcgcaatggagcgcgagtcgaactgttctaccatgtgattattcgtagatatgtaagaaaatgttataaactccaaacttcatatatgtacctagccttgatatcaaacaacttgaggattagttctttaaagcaaaatgcatgcttgcaaaatgcccataatatgactgttggaaatttttctctatttcaacaatactgtacaatatgtattttgccccaaaactcgaagacgttcccatgcaaatatcaatgccagacagtctgatttacaattaaagggttacacactaatgatacgttaagaaaattatcattttcaaaggtttatcgatttatataagatatgaagaggttctccatttttcagtgattattaaaagtaaaaatcatgtcgtagcctccaaactcatatacattcatacatatttatgtcaaacaactaaataGA-AAATAATTGT--TTTC--A--A------AGT--C-CA--T--A--------T---AT---T--A--T-AT---AA--ACG-----GAAAGA-A--CT------TTCTTC-C--A--TTT-TTT----C---A------G---T--G-A-T--T-T--TTTA-----AGTA--A--AAAATC---A-----T-GT-TGTA-GCCTC-----AAAt
gi|5 : T--TTTT--C--ATC----ATTTTC-A---T--AGAAGAGACCC--AT--GT--A--T-C----AG--AGG--T---------G--TC------T----C-C--A--T-T-TTC----A---GTGT---A---T--T-A-T--T----A-AA-----AGTA--A--CAAT-----C-----T-GT-CGTA-GCCTC-----CAAA---------TT--------TCA----TAA----ACAG--TTC---A---TA--------CA------TA-----T---------------T-TA------T-----T--T-------CAA-AGTG----------------AAAATTC-TTAA--GT--A----T--GATAATC-A---AGGT--------G----T--TAATAA--------G---A--C------TTGTTGGC------AAA--TG--AA-ATGACA--TCTACC------AT------CG----A--TCTG-A-AAACAAG-T-TTTT-------CCA---AATTC-G---C-C-GAATAGTATTATT---TT---CA--G-----C-----AAA----TT----T-CAAG---------TTT--------TTGCCCC--Actt
gi|7 : atttggcaacattatcagtacgacataacaccagcatcgcatattgtgtcggtttaggaagcactctgcactgtaaaccactggaggagagataatggagcgcgagtggactttcacatgcgagtgtgttgagtctgcttaatctaataagttacgatttgcattgtcaaagataaatgttgaaatgacacagagaaactccatcaggtcactactgttcaacactaagcaccttaaggatagtcaaagcaactatgaggatagtaatttctttcaaaagcgagaaaaatgcaccattaacacaatatgcccattaatattggatctgtcatgcaaataatttattctactatatatctaatcaattactgttacaatagctcttaagtatagcccacaaaacgtcgaagacgtccccatgcagagatatcacaatgccagaacggtctgacttgtacaaattaaagtgagttactggaagcatcttacatgatcatctaagaatctctataagatgagaattgtctcaattatggtcaatagGT--C-TA--T--A--------TG--AT--TT--A--T-AT---AG--AAT--C-TGAACT-----TT------T----T-T--A--T-T-TTT----T---G------G---T--G-A-TCTT-T--TTAA-----AAGT--A--AAAT-C---A-----T-GT-TGTA-GCCC------GAAA---------TC--------TCG----TAA----TT-G--TTC---A---CA--------CA------TA-----T---CATAGTATAAATT-TAT-----G-----T--CAAA----TAA-ATTA----------------ATA-TA---TGA--TTAAA----G--GCTTG-C-A---TA-T--------A----T--TCACAA--------A---ATAC------TTGTTTCC------AAA--TGT-CA-GTGACA--TCTGT-------AT------CGG---A--TGTA-A-AAT---G-T-TTTT-------C-----TACTT-T---T-TGG--CG--ATTATT---TT---CA--------C-----AATTAAATT----T-CAAA---------TTC--------TTACCCC--AA---------AACCCA---G-----A------AAG-GTC-TC-C---------------------ATG------------CA-----AA--CAA-T--ATAATT-T--A--TA-------AT-C-A-AA-GG-------gaaaatcagagaaaaaggttctccgtgcaaacaatatttttttactccattataaattcaaagggtcacagtgattttcagaaaacaatttctttttgcatcagctaaattattatctatgaagagttctgaaggaatttttaccatttttttcgattaatattgtgaaagacagaaaaaatcactattctcacccctctataaaaagataaatttctttttcaaaggttccccaaattatcttatgtcagacaactttg
gi|11 : attaagaatttgatctcatagaccatgggccagtaataatgtcatatagtctgatttacaattaaagagctttgaaagGT--C-CA--T--A--------TC--ATGACT--G--T-TG------------------GAA-A--TT------T----T-C--T--C-TATTT----C---A------A---CAGT-A-C--TGT--ATAA-----TGAC--A--ATTTTCATACA----T-GTATTTT-GTCCC-----AAAAC--------TC-G--------A----AAA----T--G--TCC---C---CA--------AA------TA-----T---C-----------A-AT------G-----T--CAAA----CAG-TCTG----------------gttgaatagtttcagaaaatatttttttcattttccatttttcgatgatttctaaagaaaataaaatcatgttttagccccaaaactcgaaaatgtcccaaaatacttatgtcaaacaacttgatatataatttaattgttacatacgttcacaaaatacttgtttacaaaagtcaatgacatctatatcggatctgaggagttttcccaattttcggtgactatttccaccaatttcatgtttttg
gi|21 : tataagctccaaacttattaactgtacctataacctttatatcaaacaacttgatatacacaagcatacatggggtttagttctttaaagcaaaatgcatgcttgcaaaatT--C-AA--T--A--------TCGGAC--CT--------G---AA--AGG--C-T----------TT------T----C-C--A--A-T-TTT----CAGCG------A---T--T-A-T--T-T--C----------AC--A--AATTTC---A-----A-GT-TTTT-GCCCC-----AAAA---------nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatttttaagtacaaatcatgttgtagcctcaaacatacatatataaaggtatttatgccaaacaactagatatataa
gi|17 : atattcacaaaatacttgtttgcaaatgccagtggcaA--T--A--------TT--AT--TT--A--T-AT---AG--AAT--T-CGAAGAG-G--TTC-----T----C-C--A--T-T-TTTAGG-T---G------A---T--T-T-T--T-T---TAA-----GTAA--A--A---TC---A-----T-GT----A-GCCTC-----AAAAC--------TC-G------TA------AA----T--G--TTC---C---CACATCCTAAAG------TA-----TAAAT-----------T-TAT-----G-----T--CAAA----CAA-CTTA----------------GTA-TA---TGA--TCAAG----G--GGTTG-C-A---TG-T--------A----T--TCACAA--------A---ATAC------TTGTTTGC------AAA--TGT-CA-ATGACA--TCTAC-------AT------CGG---A--TCTA-A-AAC---G-T-TTTC-------C-----AATTT-T---C-
gi|9 : aggttc--A--T-T----AG--GGA--TCTGAAGAG-G--TA------T----C-C--A--A-T-TT-----C---G------AGTGT--T-A-T--T-T--TCAC-----AGA---------TTT---TATGT-T-GT-TTT----CCC-----AAAA--------------------CC----CAAAAAAC--G--CTC---C---CA---------------------------CG----------T-TA------GGAATGT--CAAC----AAA-CCTG----------------AT--TA---TAA--TCAAG----G--GACTA-TTG---TACT-------------T--TCAATA--------T---ATAC------TTGTTTGC------AAT--AGC-CA-ATGA-A--TCTAT-------AT------CGG---A--TCTG-A-TGA---G-TTTTTC-------C-----AATTT-T---C-A-GC-CG--ATTATTA--TT---CA--C-----CA----AAT----TT----C-CA-G-------TTTTT--------TTGCCCC--A----------AA---ACTCA-----A------AAC-GCC-CCACA---CGTAG--GG----A---ATGT---C--------------AA--CAACC---TGA---T--CTTTA-------AT-C-A-AG-GG-------A-CT---ACT-G-T--------A-GTT-T----C---AAA----AA----TA-----CTTGT---TG-CAAAAAT-Cagc
gi|3 : atgttaaaaacttgataatcataggaatggttacatatttcacaaaatacttgtttgcaaagttcaatgacatttatatccggatacgaaaacgtcgatcaatctcgtaagtccaaG--T-TGAA--A-A--TT------T----T-C--T--C-TATTT----C---A------A---CAGT-A-C--TGT--ATAA-----TGAC--A--ATTTTT---CATACAT-GTATTTT-GTCCC-----AAAAC--------TC-G--------------AAGA--T--G--TCC---C---CA--------AA------TA-----T-----------------TAAT----G-----T--CAGA----CAG-TCTG----------------ATT-TAC---AA--TTAAA----G--GGTTA-C-A---TACT--------A----T--TGATAATTTAAGAAA---ATAA------TTGTTT-C------AGA--GGT-CA-ATATGA--TTTGA-------AT------AAG---A--TCTG-A-AGAA--G-T-TCTC-------C-----ATTTT-T---C-A-G--TG--TTT-TT---TT---AA--G-----T-----AAA----AA----T-CATG-------TTGTA----------GCCTC--AAAC--CTTATAA---A---C-----A------TAT-ACA-TA-CAT--AC-AA--AT----AC--AGGT---TTTTATGCCA-----AA--CAACTA-GATA---T--A--TA-------AT-C-A-AG-GG-------G-TT---A-C-A-T-----------------------AAA---TTA----CAAAAGACTTGC-T-TGCAAATAAT--A-ATGACA---T--CTACCAGGTAT-AT------TGGA--TCT---GA-A-AA---G-----TTTT-------CCAA-TTTTCA-G-CTATTA------T----TATT-T-T-CA------C----A-----A-ATT----T-C-T----A--------GTTT--------TTGC-CCC-AAA-----ACTC----G-AAA------A--G--GT-C-----T-C--C--GG-----G-T----AA-A--------C--ATTGT--A-AC----------------C-T--T-A---T----TATA-----A--A-C-----AAAGG-------GTT--A-----C-T-AA-----TTT----CA------GA---AAACATTTATTTTC-AT-C-A-------G--T-CA-A----TAT-TA---TCTAT--A---------G---AGAG-TATG--AATAA-G-----TTT-T--------C-C--AT--TTT-T-----CGAT------TA-TT-----TATTAAGA---A--A--A-AA-TC----CTGT--T---------T----T---------------------AGT-----CC-AAAGACT-CGT-C-AAT--------GTT-A-TAATATC-TATGTTAAA--CAAACTTGA-TAT-----AT-C-AT-------T-GA-A------T-GG--------TT---AC-AT-----A-CGTTC--ACA--A--AT-----ACTTGTTT---GCAAAAGTCtaggggggtccccccattacctttactggcatagtctagggattcaatt
gi|16 : caaacaaaccacctgcatcgaagaagtaatttgctcgaaatgttataattattcggttcccaatcacctgccctattaccagaaattggcactgtacagcaggttattcagctatcacaagaaggggttttgttgtaactatccttgcttgtgatattttgcagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntataattggcaaaatacagagaaatacagcgatgtccatttaggagttttcgattcacttccctgcactggaaacagttcgggaaaataatgagcgcgagtggactttcacacgttgattattgagtctgaaatatatgtacgatatactcaggtatcagataatgttataagctccaaacttagccttgatatcaaacaaataatacacataagtatgaggttgttctttctttaaagcaaaatgcatgcttgcaaaatgtccatatatgact--AAATTT---C-----AAGT-TTTT-GCCCC-----AAAA---------TT---------------CAA--------------------AA--------AA------TA-----T---C-----------C--A------T-----G--CAAA----CAA-TATG----------------ATT-TA---TAA--TCAAA----G--GGTTC-A-A---TAGT-------------T--TCAGAG--------ACCCACAT------TTGTTTTC------AAA--AGG-CA-ATATTA--TCTGT-------GA------AGA---G--TCTGAA-GGA---G---TTTT-------C-----CATTTGT---C-G-A--TG--ATT-TT---Taacgacatttatatcg
gi|10 : aattccac------G-----T--CAAA----CAA-TCTG----------------AT--TA---TAA--TTGTG----T--GACTA-T-G---TACT-------------T--TCAAAT--------T---ATAC------TT-TTTGG------AAA--AGT-CA-A--ACA--TTTAT-------AT------CGG---A--TCTG-A-GGA---G-T-TTTC-------C-----AATTT-C-------G--TG--ATTATT---TT---CA--C-----C-----AAT----TC-------ATG-------TTTTT----------GCCCC--AA----------A---ACTCA-----A------AAC-GCC-CC--AC--GC-----AG----A---ATGT-----------CA-----AA--CAACC--A-GA---TTTA--TA-------AT-C-A-AG-G--------A-CA---A-T-G-T--------A-CTT-T----C---AAA---TTA----TA-----CTTGT-T-TGC-AAAAGT-CA-ATGACA---T--TTA-------T-AT------CGGA--TCT---GA-G-GA---G----TTTTT-------CCAA--TTTCG-G-T---GA------T----TATT-T-T-CA------C----C-----T-ATT----T-C-T----G--------TTTT--------TTGC-CCC-AAA-----ACTC----A-AAA------A--C--C--C-----C-C--C--AC-----G-T----AG-G--------A--A-TGTCAA-AC--A------------AC-CT-G-A---T----TATA-----T--T-C------AGGG-------ACT--A----G----AC-----TTT----CA------AA-----AAAACTG-TTGC-A--A-A-------aaagaaacaaaagagcccaaaagctcgaaaatgtcctaaaatacttatgtcaaacaacttgatatat
gi|24 : caattcggatgagtattatcactaagatgttatagcgatcgtctcgttagtttttttgccccaaaactaaaaacacgccccatgaaggaat-----T--CAAA----CAA-CTAA----------------ATA-TA---TAT--TCAAG----G--GGTTT-C-A---TATA--------G----T--T-ACAA--------A---TGAC------TTGTTTGC------AAA--TGA-TA-ATGACA--TTT-T-------AT------CGG---A--TCTG-A-AAA---G--GTTTT---------------TTT-T---C-tccccggggt
gi|20 : --CAGA----CAG-TCTG----------------ATT-TAC---AA--TTAAA----G--GGTTC-C-A---TACTAATGGTACG----T--TAAGAA--------A---ATAA------TCATTTTC------AAA--AGTTCATATGA----TTTAC-------AT------AGG---A--TCTG-A-AGA---G--GTTCT-------C-----CATTT-T---caat
gi|19 : AAA----CAA-CC------------------ACA-TTT-TTAA--TCAAA----C--GACTG-T-G---CACT--------T----T--CCA-AA--------A---GTAC------TTGTTTAC------Atca
gi|30 : gagtttctttttccgctagcatatttctcacagcatgctttttgttcaaaactggtattcaccccctggcccacatagaaatttgTGAA----T--GGTTA-C-A---TAC---------G----T--TCACAA--------A---ATACCGGTACTTGTTTGC------AAA--AGT-CA-AAGACA--TTTAT-------A
gi|31 : --GGTTA-C-A---TAA---------A----T--TTACGA--------A---AGAC------TTGCTTGC------AAAT-AAT--A-ATGACA--TT
gi|8 : accaaggT--------A----T--TCACAA--------A---ATAC------T-GTTTGC------AAATCGGT-CA--TGACA--ACTAC-------AT------CGG---A--TCT--A-CGA------------------------AAATG-T---C-G-G--CG--GATATT---TTG--CAGTT-----C-----AAT----T--------AAG-------ATTGG--------T-GCCCC--AA----------A---ATC-A-----A------AACAGT------AT--CC---------------ATGC------------------AA--CAAT---ATGA---TTTA--TA-------AT-C-A-AA-GG-------AGTT---A-A-A-T--------A-CTT-T----C---AGA---AAG----TA-----TTTGT-TTTTTCAAAAGT-----TGA----------A-------T-AT------TGGT--TCTTGTGA-A-GA---G----TCTGG-------AAGAGTTTTC----C----A------T----TATT-T---CA------A----A-----A-AAAAAAAT-CAC----G--------ATTT--------A-GT-C-CAAAA-----ACTC----G-AAA------A------------------------------------------------T--G-TTCCAA-AC--A------------AC-TT-G-AT--A----TATA-----T--T-T-----AATG---------TT--A----GCAT-AC-----GTT----CA------CA---AAATA-TTCTTTGC-A--A-AAATAAAAG--T-CA-A----TGA-CA---TCTTT--AT-----TCGGCATG----TCTG--AG-GA-G-----TTT-T--------T--------TCT-C-A-A-TGAT------TA--------TTTT--CACACC--A--A-TG-TC----ATG-------------T----TTT--------TTGCC--CCAAACT-----T---GGAACG---C-C-CAG--------GTA---GAAT-GT-CA----AAA--C-AGGCTGA-C-T-----TTATAAA-------TGCA-GT-----G-GA--------CT--ATT-G------A-CTGTCGAAAA--AGTAT-----ACTT-TTT----CAAGAGCCTTCAG---GAGT--C-TCCCTT
gi|21 : aT--------A----T--TCACAA--------A---ATAC------TTGTTTGC------AAA--TGC-CA-GTGGCA--TCAAT-------AT------CGG---A--CCTG-A-AAG---G-CTTTTC-------C-----AATTT-T---C-A-G--CG--ATTA-T---TT---CA--C-----A-----AA-----TT----T-CAAG---------TTT--------TTGCCCC--AA----
gi|26 : a------TTGTTTTC------AAA--GGT-CC-ATATGA--TTTAA-------AT------AGG---A--TCTGAA-AAA---G-T-TCTC-------T-----ATTTT-T---C-A-G--TG--ATTTTT---TT---aa
gi|18 : aaTTGC------AAA--ACT-TT-ATAATA--TCTAT-------ATGTATTTCGG---A--TCTG-A-AGA---G-TTTTTC-------C-----AAAGT-T---T-G-G--CG--TTTATT---TT---CA--C-----C-----AGT----TG----CATGGG-------GTTTT--------TTGCCCCCAAA----CT----C---G---A-----C------AAC-ACC-AC-CAC--C--AA--GG----A---ATG----T-------CA-----AA--CAACC---TTATT-T--A--GA-------AT-C-T-AG-GG-------A-CA---A-T-G-T--------A-GTT-T----C---AAA---ATA----Taaagtaaaatgcatgtggtagcatca
gi|17 : A--TTTAT-------AT------AGA---A--TTCG-A-AGA---G--GTTCT-------C-----CATTT-T---TAG-G--TG--ATTTTT---TT---AA--G-----T-----AAA----AT----C--ATG-------TA-------------GCCTC--AA--------------A---ACTCGTA------AAT-GTT-CC-CACATCCTAA--AGTATAA---ATTTATGT-------CA-----AA--CAACTTAGT-A---T--A--TG-------AT-C-A-AG-GG-------G-TTGC-A-T-G-T--------A-TTC-A----C---AAA-----A----TA-----CTTGT-T-TGC-AAATGT-CA-ATGACA---T--CTA-------C-AT------CGGA--TCT---AA-A-AC---G-----TTTT-------CCAA-TTTTCA-G-C---
gi|15 : aggttcatattA--TATAC--------T------CGG---AAATCTG-A-G-A---G-TCTTTTATCTCCCC-----AATTT-T---CGC-G--TG--AT-ATT---TTGCACA--C-----C-----A-T----TA----T-TATGGGTGTACCTTTTGGTAGGGGTTGCATC--AA---------AATC-G---A-----A------AAC-GTAACC-CAC--G-TAG--AA----A---ATGC-----------CA-----AA--CAACC---TG-----------A-------AT-T-A-A
gi|9 : atatagttacaatatctgcaaattagagggttgacaaattctGG---A--TCTG-A-AGA---GGTATC---------C-----AATTT-C---G-A-G--TG---TTATT---TT---CA--C-----A-----GAT----TT----T--ATG-------TTGTT--------TTCCCAA--AA----CC---CA---A---A-----A------AAC-GCT-CC-CAC--GTTAG---G----A---ATGT---C--------------AA--CAAAC--CTGA---TT-A--TA-------AT-C-A-AG-GG-------A-CT---A-TTG-T--------A-CTT-T----C---AAT---ATA----TA-----CTTGT-T-TGC-AATAGC-CA-ATGA-A---T--CTA-------T-AT------CGGA--TCT---GA-T-GA---G----TTTTT-------CCAA-TTTTCA-GCC---GA------T----TATTAT-T-CAC-----C----A-----A-ATT----TCCAG----T--------TTTT--------TTGC-CCC-AAA-----ACTC------AAA------A--C--G--C-----C-CCAC--AC-----G-T----AG-G--------GA-A-TGTCAA-CA--A------------CC-T--G-AT--C----TTTA-----A--T-C-----AAGGG-------ACT--AC-T-G--T-AG-----TTT----CA------AA----AATACTTG-TTGC-A--A-A-------atatttgaaaaggtttcagtaggataaaatcaataaactacaaaaaaacccacaatttgttttgagaaaaatccccatgggggtcgcccattacctttacttggcccatgtc
gi|7 : atgttaaaaacttgataatcataggaatggttacatatttcacaaaatacttgtttgcaaagttcaatgacatttatatccggatacgaaaacgtcgatcaatctcgtaagtccaaattagATTTT-------C-----CATTT-T---T-C-GA-TG--ATT--T---CT---AA--A-----G-----AAA----ATAAAAT-CATG-------TTTTA----------GCCCC--AA---------AACTCG---A-----A------AAT-GTC-CC--A------AA--AT----ACTTATGT-----------CA-----AA--CAACT---TGA---T--A--TATA-----AT-TTA-AT-TGTT-----A-C----A-T-A-C--------G-TTC-A----C---AAA-----A----TA-----CTTGT-T-TAC-AAAAGT-CA-ATGACA---T--CTA-------T-AT------CGGA--TCT---GA-G-GA---G----TTTTC-------CCAA-TTTTCG-G-T---GA------C----TATT-T-C-CA------C----C-----A-ATT----T-CAT----G--------TTTT--------Taatctaggggggtccccccattacctttactggcatagtctagggattcaatt
gi|16 : attaagaatttgatctcatagaccatgggccagtaataatgtcatatagtctgatttacaattaaagagctttgaaaggtctatatgatttatatagaatctgaacttttttattttttggtgatctttttaaaagtaaaatcatgttgtagcccgaaatctcgtaattgttcacacatatcatagtataaatttatgtcaaataaattaatatatgattaaaggcttgcatatattcacaaaatacttgtttccaaatgtcagtgacatctgtatcggatgtaaaatgtttttctactttttggcgattattttcacaattaaatttcaaattcttaccccaaaacccagaaaggtctccatgcaaacaatataatttataatcaaagggttgaatagtttcagaaaatatttttttcT---TC---CA--C-----A-----AAT----TT----C-AA-G-------TTTTT----------GCCCC--AAAA--TT---CA---A---A-----A------AAT-ATC-C------------------------ATG------------CA-----AA--CAAT---ATGA---TTTA--TA-------AT-C-A-AA-GG-------G-TT---C-A-A-T--------A-GTT-T----C---AGAGACCCA----CA-----TTTGT-TTT--CAAAAGG-CA-ATATTA---T--CTG-------T-GA------AGAG--TCT---GA-A-GG---A----GTTTT-------CC-A-TTT--G-T-C---GA------T----GATT-T-T-TAAAGAAAC----A-----A-A---------AG----A----------------------GC-C-CAAAA-----GCTC----G-AAA------A--T--G--T-----C-C--T--AA-----AAT----AC-T--------T--A-TGTCAA-AC--A------------g
gi|10 : aa----T-TA-G-------TTTTT--------TTGCCCC--AAAA--CT---AA---A---A-----A------CAC-GCC-CC--AT--G--AA--GG----A---ATGT-----------CA-----AA--CAATC---TGA---TT-A--TA-------AT-T-G-TG-TG-------A-CT---A-T-G-T--------A-CTT-T----C---AAA---TTA----TA-----CT--T-TTTG-GAAAAGT-CA-A--ACA---T--TTA-------T-AT------CGGA--TCT---GA-G-GA---G-----TTTT-------CCAA-TTTC---G-T---GA------T----TATT-T-T-CA------C----C-----A-A-T----T-CAT----G---------TTT--------TTGC-CCC-AAA-----ACTC------AAA------A--C--G--C-----C-C--C--AC-----G-C----AG-A-----------A-TGTCAA-AC--A------------AC-CA-G-AT--T----TATA-----A--T-C-----AA-GG-------ACA--A--T-G--T-AC-----TTT----CA------AA---TTATACTTGTTTGCAA--A-A-------G--T-CA-A----TGA-CA---TTTAT--A------TCGG---A----TCTG--AG-GA-GT----TTT-T--------C-C--AA--TTT-C-G-G-TGAT------TA--------TTTT--CA---C--CT-A-TT-TC-----TG-------------T----TTT--------TTGCC-CCAAAAC------TC-AAAAAC--CCC-C-CAC--------GTA-G-GAAT-GT------CAAA--C-AACCTGA---T-----TA-T-AT-------T-CA-G------G-GA--------CT--AG---------A-CTTTCAAAAA--A--A--------CTG-TT---GC--AAATCCCCGGGGacttgatatat
gi|7 : caattcggatgagtattatcactaagatgttatagcgatcgtctcg---ATGT-----------CA-----AA--TAAAT---TAA---T--A--TATG-----AT-T-A-AA-GG---------CTTGCA-T-A-T--------A-TTC-A----C---AAA-----A----TA-----CTTGT-TT--CCAAATGT-CA-GTGACA---T--CTG-------T-AT------CGGA--TGT---AA-A-AT---G----TTTTT-------CTAC-TTTTTG-G-C---GA------T----TATT-T-T-CA------CAATTA-----A-ATT----T-CA-----A--------ATTC--------TTAC-CCC-AAA-----ACCC----A-GAA------A--G--G--T-----C-T--C----------------------------C--A-TG-CAA-ACA-A------------TA-T--A-AT--T----TATA-----A--T-C-----AAAGG-------GTT--G----AA-T-AG-----TTT----CA------GA---AAATATTTTTTTt
gi|11 : attaagaatttgatctcatagaccatgggccagtaataatgtcatatagtctgatttacaattaaagagctttgaaaggtctatatgatttatatagaatctgaacttttttattttttggtgatctttttaaaagtaaaatcatgttgtagcccgaaatctcgtaattgttcacacatatcatagtataaattt---T-------CA-----AA--CAACT---TGA---T--A--TACACAAGCATAC-A-TG-GG-------G-TT---T-A-G-T--------T-CTT-TAAAGC---AAA-----A----TG-----CATGC-T-TGCAAAATGT-CC-ATATCA---TGACTG-------T-----------------T---GG-A-AA---T----TTTCT-------CTA---TTTCA-A-C---AG------TACTGTATA-A-T-GA------C----A-----A-TTT----T-CATACATG--------TATT--------TTGT-CCCAAAA------CTC----G-AAA------A--T--GT-C-----C-C--C--AA-----A-T----AT-C--------A--A-TGTCAA-AC--A------------cattttccatttttcgatgatttctaaagaaaataaaatcatgttttagccccaaaactcgaaaatgtcccaaaatacttatgtcaaacaacttgatatataatttaattgttacatacgttcacaaaatacttgtttacaaaagtcaatgacatctatatcggatctgaggagttttcccaattttcggtgactatttccaccaatttcatgtttttg
gi|24 : tataagctccaaacttattaactgtacctataacctttata---T-------CA-----AA--CAACT--A-AA---T--A--TAT------AT-TCA-AG-GG-------G-TTTC-A-T-A-T--------A-GTT-A----C---AAA---TGA-----------CTTGT-T-TGC-AAATGA-TA-ATGACA---T--TT--------T-AT------CGGA--TCT---GA-A-AA---GGTTTTTTTT-------CCAA-Tgtctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatttttaagtacaaatcatgttgtagcctcaaacatacatatataaaggtatttatgccaaacaactagatatataa
gi|20 : -------CA-----GA--CAGTC---TGA---TTTA--CA-------AT-T-A-AA-GGGTTCCATA-CT---AAT-GGT--------A-CGT-T----A---AGA---AAA----TA-----ATCAT-TTT--CAAAAGTTCATATGA-----T--TTA-------C-AT------AGGA--TCT---GA-A-GA---G----GTTCT-------CCAT-TTTTC
gi|5 : --A--TA-------AT-C-A-AG-G---------------------T--------G-TT------------AA---TAA----GA-----CTTGT-T--GGCAAATG--AA-ATGACA---T--CTA-------CCAT------CG-A--TCT---GA-A-AACAAG----TTTTT-------CCAA-ATT-CG-C-C---GAATAGTAT----TATT-T-T-CAG-----C----A-----A-ATT----T-CAA----G---------TTT--------TTGC-CCCAGAA-----AATCAGAGA-AAA------A--G--G--T-----T-C--T--CC-----G-T----G-------------------CAA-AC--AATATTTTTTTACTC-C--A-----T----TATA-----AATT-C-----AAAGG-------GTC--A--CAGT-G-AT-----TTT----CAGAAAACAA---TT-T-CTT-TTTGC-ATCA-G-------C--T-AA-A----TTATTA---TCTAT-----------GA---AGAGTTCTGA-AG-GA-A-----TTT-TTA------C-C--AT--TTT-T-T-T-CGAT------TA-AT-----ATTa
gi|2 : atttggcaacattatcagtacgacataacaccagcatcgcatattgtgtcggtttaggaagcactctgcactgtaaaccactggaggagagataatggagcgcgagtggactttcacatgcgagtgtgttgagtctgcttaatctaataagttacgatttgcattgtcaaagataaatgttgaaatgacacagagaaactccatcaggtcactactgttcaacactaagcaccttaaggatagtcaaagcaactatgaggatagtaatttctttcaaaagcgagaaaaatgcaccattaacacaatatgcccattaatattggatctgtcatgcaaataatttattctactatatatctaatcaattactgttacaatagctcttaagtatagcccacaaaacgtcgaagacgtccccatgcagagatatcacaatgccagaacggtctgacttgtacaaattaaagtgagttactggaagcatcttacatgatcatctaagaatctctataagatgagaattgtctcaattatggtcaatagtttttcatcattttcatagaagagacccatgtatcagaggtgtctccattttcagtgtattattaaaagtaacaatctgtcgtagcctccaaatttcataaacagttcatacatatttatttcaaagtgaaaattcttaagtatg---A-T-A-T--------G-TTC-A----C---AAA-----A----TA-----TTTGT-T-TGC-AAAATT-CA-GTGATA---T--CTA-------T-AT------CGGA--TCT---GA-G-GA---G----CTTGT-------CCAA-TTTTTG-G-T---GA------T----TATT-T-T-TA------C----C-----A-ATT----T-TAT----G--------TTTT--------TT-C-CTCCAAA-----ACTC----A-ATA------A--C--A--T-----C-C--C--AC-----G-T----AA-G--------A--A-TGTCAA-AC--A------------AC-CT-G-AT--T----TATA-----A--T-T-----AGGGG-------GCT--A--T-G--T-AC-----TTG----CA------AA---TTATACCTGTTTGCAA--A-A-------G--T-CA-A----TGA-CA---TTTAT--A------TCGG---A----TCTG--AG-GA-ATT---TTT-T--------C-C--AAT-TTT-T-G-G-TGAT------TA--------TTTT--CAC--C--A--A-TT-TT----ATGT--T---------T----TT-------------CCCCAAAAAC-----TC-AAAAACG-CCC-C-CAC--------GTA-G-GAAT-GT-T-----AAA--C-AACCTGA-T-T-----TA-T-AA-------T-CA-G------G-GG--------gtgaaagacagaaaaaatcactattctcacccctctataaaaagataaatttctttttcaaaggttccccaaattatcttatgtcagacaactttg
gi|30 : ttttgattggatatcctgaaaaaaagttcaactaaaccaaccatacttcttgaggcaggatggttatctacaaccacacctaatggaggaacactttgttggattgttgattatatggttccaatcacctgccctattgcaagaaatgacactattcagcatgctattcagctagattaatatcacaagaagctgtcaaaatgtaactatccttgcatgtgattttgcagtggctannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttggcaaaatccagagaagcacagcaatgtattgttcatttaggagttttccattcactatcctctgaactggaaaccactggggaaaatagtgagcgtgagtggacttttacacatgattattgagtctggaatatatgtacgatatgtcagaaaatgttataaacttcaaactttataaatgtacctaaccttgatatcaagcaacgtaatatacataagcgtttagttctttaagcaatgcatgcttgcaaaatgcccattatgttttctatttcaacaatcgtataatgacaattttatacatgtattttgtccaaaactcgaagacgtctccaaatatcaatgtcagacagtctgatttcaataaggataaaactgttcgtttcctttgattttacatacagaattaatgatacgttaagaaaataattattttcattggttcatatgatttatatattcatttccaataaatttgaaaagtaaaaatcatgttgtaacctaaaaattcataaacattcatacatatttattttcacacaactaaatatataaacaaggggttacacatatttacaaaagacttgtatgcaaataataaggacatcaatatcggtatgtgaaattttccccccaactttgagtgattattatttttacacatttcaagtttttgcccaaaaactcgaaaaggtctccatgcaaacaatcttatttataatcaaaggtacatacattcagaaaacaatgattttcatcagtaaatattatctattgagagttgaaggagatttccatttttcgattatttttagagaaaaaatcccgttttagccccaaaactcgtcgatgcccccaactatctatgccagacattggatggctac---A-T-A-C--------G-TTC-A----C---AAA---ATACCGGTA-----CTTGT-T-TGC-AAAAGT-CA-AAGACA---T--TTA-------T-Aaacattaccttt
gi|21 : tgaatggttacTC-A----C---AAA-----A----TA-----CTTGT-T-TGC-AAATGC-CA-GTGGCA---T--CAA-------T-AT------CGGA--CCT---GA-A-AG---G----CTTTT-------CCAA-TTTTCA-G-C---GA------T----TA-T-T-T-CA------C----A-----A-ATT----T-CAA----G---------TTT--------TTGC-CCCAAAA-----
gi|26 : atatTTGT-TTT--CAAAGGT-CC-ATATGA---T--TTA-------A-AT------AGGA--TCT---GA-A-AA---A----GTTCT-------CTAT-TTTTCA-G-T---GA------T----TTTT-T-T-AAAG----T----A-----A-AAT----G-CAT----G--------T
gi|18 : aaCAAAACT-TT-ATAATA---T--CTA-------T-ATGTATTTCGGA--TCT---GA-A-GA---G----TTTTT-------CCAA-AGTTTG-G-C---GT------T----TATT-T-T-CA------C----C-----A-GTT----G-CATGGG-G--------TTTT--------TTGC-CCC-CAA-----ACTC----G-ACA------A--C--A--C-----CAC--C--AC-----C-A----AG-G--------A--A-TGTCAA-AC--A------------AC-CT-T-AT--T----TAGA-----A--T-C-----TAGGG-------ACA--A--T-G--T-AG-----TTT----CA------AA---ATATggtagcatca
gi|7 : ttgAAAGGT-CT-ATATGA---T--TTA-------T-AT------AGAA--TCT---GA-A-----------CTTTT-------TTAT-TTTTTG-G-T---GA------T----C-TT-T-T-TA-----------A-----A-AGTAAAAT-CAT----G--------TTGT--------A-GC-C-CGAAA-----TCTC----G-TAATTGTTCA--C--A--C-----A-T--A--TC-----A-T----AG-TATAAATT-T--A-TGTCAA-AT--A------------------A-AT--TAATATATG-----A--T-T-----AAAGG-------CTT--G--C-ATAT-AT-----TCA----CA------AA-----ATACTTGTTTCC-A--A-AT------G--T-CA-G----TGA-CA---TCTGT--AT------CGG---A----TGTA--AA-AT-G-----TTT-T--------T-C--TACTTTT-T-G-G-CGAT------TA--------TTTT--CA---C--A--A-TT-------AAAT--T---------TCAAATTC--------TTACCC-CAAAACC------C-AGAAAGG-TCT-C-CAT--------G------------------CAAA--C-AATATAA-T-T-----TA-T-AA-------T-CA-AA-----G-GG--------TT--GA--AT-----A-GTTTC-AGAA--A--AT-----ATTTTTTT---
gi|15 : attaagaatttgatctcatagaccatgggccagtaataatgtcatatagtctgatttacaattaaagagctttgTGACAAATT--CTA-------T-ATACT---CGGAAATCT---GA-G-A----G----TCTTTTATCTCCCCAA-TTTTCGCG-T---GA------T-----ATT-T-TGCA------C----A-----CCATTA---T-TAT----GGGTGTACCTTTTGGTAGGGGTTGC-ATCAAAA-------TC----G-AAA------A--CGTA--A-----C-C--C--AC-----G-T----AGAA--------A--A-TGCCAA-AC--A------------AC-CT-G-AA--T----TA-A-----A--T-cattttccatttttcgatgatttctaaagaaaataaaatcatgttttagccccaaaactcgaaaatgtcccaaaatacttatgtcaaacaacttgatatataatttaattgttacatacgttcacaaaatacttgtttacaaaagtcaatgacatctatatcggatctgaggagttttcccaattttcggtgactatttccaccaatttcatgtttttg
gi|17 : atatagttacaatatctgcaaattagagggtA---T--TTA-------T-AT------AGAA--TTC---GA-A-GA---G----GTTCT-------CCAT-TTTTAG-G-T---GA------T----TTTT-T-T-AAG-----T----A-----A-AAT------CAT----G--------TA------------GC-CTCA-AA-----ACTC----G-TAA------A--T--GT-T-----C-C--C--AC-----A-TCCTAAA-GTATAAATTT--A-TGTCAA-AC--A------------AC-T--T-AG--TA---TATG-----A--T-C-----AAGGG-------GTTGCA--T-G--T-AT-----TCA----CA------AA-----ATACTTGTTTGC-A--A-AT------G--T-CA-A----TGA-CA---TCTAC--A------TCGG---A----TCTA--AA-AC-G-----TTT-T--------C-C--AA--TTT-atttgaaaaggtttcagtaggataaaatcaataaactacaaaaaaacccacaatttgttttgagaaaaatccccatgggggtcgcccattacctttacttggcccatgtc
gi|9 : aggttcatattGGA--TCT---GA-A-GA---G----GTAT--------CCAA-TTTCGA-G-T---G-------T----TATT-T-T-CA------C----A-----G-ATT----T-TAT----G--------TTGT--------TTTC-C-CAAAA-----CCCA----A-AAA------A--C--G--CT----C-C--C--AC-----G-TT---AG-G--------A--A-TGTCAACAA--A------------CC-T--G-AT--T-----ATA-----A--T-C-----AAGGG-------ACT--A--T-TG-T-AC-----TTT----CA------AT---ATATACTTGTTTGC-A--ATA-------G--C-CA-A----TGA--A---TCTAT--A------TCGG---A----TCTG--AT-GA-GT----TTT-T--------C-C--AAT-TTT-C-A-GCCGAT------T--AT-----TATT--CA---CCAA--A-TT-TC----CAG---T---------T----TTT--------TTGCC-CCAAAACT-----C---AAAACG-CCC-CACAC--------GTAGG-GAAT-GT-C------AA--C-AACCTGA-T-C-----TT-T-AA-------T-CA-A------G-GGA-------CT--ACT-GT-----A-GTTTC--AAA--A--AT-----ACTTG-TT---GCAAAAAT--CTAGGG-GGGTCCC-CCCATTACCTTTAC-TGGCtcagc
gi|13 : atgttaaaaacttgataatcataggaatggttacatatttcacaaaatacttgtttgcaaagttcaatgacatttatatccggatacgaaaacgtcgatcaatctcgtaagtccaaattagGAA--TC----GA-A-AA---------TTTT-------CCAT-TTTTTA-A-C---AA------TAT--TATA-T-T-GA------C----A-----A-ATT----T-CAT----A--------TATT--------GCGCGCATAACA-----ACTC----G-AAG------AGGT--A-------------C--AT-----G-T----AT-A--------TTAA-TATCAG-AT--AG-----------TC-T--G-AC--T----TACG-----A--T-T-----AAAGG-------GCT--atagtctagggattcaatt
gi|19 : tgcgaaatctagagaagtacagcgatgtcattgttcactgaggagtttccattcgctaagctatgcattggaaagaattgggtaaagagtaatgggagtactagtggactttcacatcacatgtgattattgaggctggcatatatgtatgaaaattttctgaactcaaaactttataaatgtacctagccttgatgtcaaacaacaaatggtatagttcttcaaagcaaattacatgcttgcgaatgtctttattgtgattgtag----TTTTT-------CCGC-T----A-G-C---A------------TATT-TCT-CA------C----A-----G----------CAT----G--------CTTT--------TTG--TTCAAAACTGGTATTC---------------A--C--C--CCCTGGC-C--C--AC-----A-T----AG-A--------A--A-TTTGAA-AC--A------------AC-C--ACAT--T----TTTA-----A--T-C-----AAACG-------ACT--G--T-G--C-AC-----TTT----CC------AA---AAGTACTTGTTTAC-A--gcatactaatgatg
gi|7 : gagtttcTTTT-------CCAT-TTTTCG-A-T---GA------T----T-TC-T-A-AA------G----A-----A-AATAAAAT-CAT----G--------TTTT--------A-GC-CCCAAAA------CTC----G-AAA------A--T--G--T-----C-C--C--AA-----AAT----AC-T--------T--A-TGTCAA-AC--A------------AC-TT-G-AT--A----TATA-----A--T-T-------------------T--AATT-GT-T-ACATACGTTCA---CA------AA-----ATACTTGTTTAC-A--A-AA------G--T-CA-A----TGA-CA---TCTAT--A------TCGG---A----TCTG--AG-GA-G-----TTT-TC-------C-C--AAT-TTT-C-G-G-TGAC------TA--------TTTC--CAC--C--A--A-TT-TC----ATGT--T---------T----TT
gi|23 : attaagaatttgatctcatagaccatgggccagtaataatgtcatatagtctgatttacaattaaagagctttgaaaggtctatatgatttatatagaatctgaacttttttattttttggtgatctttttaaaagtaaaatcatgttgtagcccgaaatctcgtaattgttcacacatatcatagtataaatttatgtcaaataaattaatatatgattaaaggcttgcatatattcacaaaatacttgtttccaaatgtcagtgacatctgtatcggatgtaaaatgtttttctactttttggcgattattttcacaattaaatttcaaattcttaccccaaaacccagaaaggtctccatgcaaacaatataatttataatcaaagggttgaatagtttcagaaaatatttttttca----TATA-T-T-TA------C----A-----A-ATA----T-TAT----GAG------TATT--------TCCC-CTCAAAT-----ATTC----ATAAA------A--T-----C-----C-C--T--ATATTCTG-T----AA-------------A-TGTTAA-AC--A------------AC-CTCG--T--T----TATA-----A--T-C-----AAGAG-------ACT--A--T-AT----C-----TTT----Cg
gi|16 : cT-T-C-CA------C----A-----A-ATT----T-CAA----G---------TTT--------TTGC-CCC-AAA-----ATTCA---A-AAA------A--T--A--T-----C-C----------------------------------A-TG-CAA-ACA-A------------TA-T--G-AT--T----TATA-----A--T-C-----AAAGG-------GTT-----C-AA-T-AG-----TTT----CA------GAGACCCACATTTGTTTTCAA--A-A-------G--G-CA-A----TAT-TA---TCTGTGAA--------GA---G----TCTGA-AG-GA-G-----TTT-T--------C-C--A----TT-T-G-T-CGA-------TG-AT-----TTTT--
gi|11 : aa--------T--A-TATCAA-AC--A------------ACTT--G-AT--A----TACACAAGCA--TAC-----ATGGG-------GTT--T--A-GT-T--C-----TTTAAAGCA------AA-----ATGCATGCTTGC-A--A---------------A-A----TG-------TCCAT--AT-----CATG---A-----CTGTTGG-AA-A-----TTT-T--------CTC--TA--TTT-C-A-A-CAGTACTGTATA-ATGACAATTTT--CA---T--A--------C----ATGT--A---------T----TTT--------GT-CC--CAAAAC------TC-GAAAATG-TCC-C-CAA--------ATA-T-CAAT-GT------CAAA--C-AGTCTGaaagaaacaaaagagcccaaaagctcgaaaatgtcctaaaatacttatgtcaaacaacttgatatat
gi|24 : tataagctccaaacttattaactgtacctataaccttTCAA-AC--A------------AC-T--A-AA--TA---TATA-----T--T-C-----AAGGG-------GTTTCA--T-AT---AG-----TTA----CA------AA---TGA--CTTGTTTGC-A--A-AT------G--A-TA-A----TGA-CA---TTT-T--A------TCGG---A----TCTG--AA-AA-GGTTTTTTT-T--------C-C--AA--Tnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatttttaagtacaaatcatgttgtagcctcaaacatacatatataaaggtatttatgccaaacaactagatatataa
gi|20 : CAG-AC--AG-----------TC-T--G-AT--T----TACA-----A--T-T-----AAAGGGTTCCATACT--AA-T-GG-T-AC-----GTT----AA------GA---AAATAATCATTTTC-A--A-A-------AGTT-CATA----TGA------TTTAC--AT------AGG---A----TCTG--AA-GAGG-----TTC-T--------C-C--AT--TTT-
gi|21 : ----CA------AA-----ATACTTGTTTGC-A--A-AT------G--C-CA-G----TGG-CA---TCAAT--A------TCGG---A----CCTG--AA-AG-GC----TTT-T--------C-C--AAT-TTT-C-A-G-CGAT------TA---------TTT--CA---CA-A--A-TT-TC----AAG------------------TTT--------TTGCC-CCAAAAtca
gi|30 : atattcaTACTTGTTTGC-A--A-AA------G--T-CA-A----AGA-CA---TTTAT--A
gi|15 : tgaatggttacatacgttcacaaaataccggTATCTGC-A--A-A-------T--T-AG-AGGGTTGA-CAAATTCTAT--ATAC---TCGG---AAA--TCTG--AG--A-G-----TCT-TTTATCTCCC-C--AA--TTTTC-GCG-TGAT---------AT-----TTTG--CA---C--ACCA-TTATTATGGGTGTACC---------T----TTTGGTAGGGGTTGCAT-CAAAA-------TC-GAAAACGTAAC-C-CAC--------GTA-G-AAAA-TG-C----CAAA--C-AACCTGAAT-TAAATATT-T-GAAAAGGTTT-CA-GT-----A-GG--------AT--AAA-ATCAATAA-ACTACAAAAA--A--ACCCACAATTTGTTTTGAG-AAAAATCCCCATGG-GGGT--CGCCCATTACCTTTACTTGGCCCAT
gi|18 : atatagttacaaTTGC-A--A-A-------AC-T-TT-A----TAA-TA---TCTAT--ATGTATTTCGG---A----TCTG--AA-GA-G-----TTT-T--------T-CCAAA--GTT-T-G-G-CGTT------TA--------TTTT--CA---CC-A--G-TT-GC----ATGG--GG--------T----TTT--------TTGCCCCCAAA--C-----TC-GACAAC--ACCAC-CAC--------CAA-G-GAAT-GT------CAAA--C-AACCTTA-T-T-----TA-G-AA-------T-CT-A------G-GG--------AC--AAT-GT-----A-GTTTCAAAAtc
gi|17 : A---TTTAT--AT------AGA---A----TTCG--AA-GA-GG----TTC-T--------C-C--AT--TTT-TAG-G-TGAT------T---T-----TTTT--AAG--T--A--A-AA-TC----ATGT--A---------------------------GCCT-CAAAACT------C-GTAAATG-TTC-C-CACATCCTAAAGTA-T-AAAT-TTATGT--CAAA--C-AACTTAG-T-A-----TA-T-GA-------T-CA-A------G-GG--------GTTGCAT-GT-----A---TTCACAAA--A---T-----ACTTGTTT---GCAAAtat
gi|19 : aggttcatatt-GA-G-----TTT-C--------T-T------TTT-C-C-G-CTAG------CATAT-----TTCT--CA---C--A--G-----C----ATGC--T---------T----TTT----------G--TTCAAAACTGGTATTC-ACCCCCT-GGC-C-CAC--------ATA-G-AAAT-TT-GA-----AA--C-AACCACA-T-T-----TT-T-AA-------T-CA-A------ACGA--------CT---GT-GC-----A-CTTTC-CAAA--A--GT-----ACTTGTTT---ACAtgtcaatgacatctacatcggatctaaaacgttttccaattttcagc
gi|16 : TTC--CA---C--A--AATT-TC----AAGT--T---------T----TT-----------GCCC-CAAAA-T-----TC-AAAAAAT-ATC-C--AT--------G------------------CAAA--C-AATATGA-T-T-----TA-T-AA-------T-CA-AA-----G-GG--------TT--CA--AT-----A-GTTTCAGAGACCC--AC-----ATTTGTTT---TCAAAA
gi|20 : aa---CAGA--C-AGTCTGA-T-T-----TA-C-AA-------T-TA-A------A-GGGTTCCATACT--AATGGT-----ACGTT--AAGAA--A--AT-----AATCATTT---TCAAAAGTTCATAggcaatattatctgtgaagagtctgaaggagttttccatttgtcgatgatttttaaagaaacaaaagagcccaaaagctcgaaaatgtcctaaaatacttatgtcaaacaacttgatatat
gi|24 : ---CAAA--C-AACTAAA-T-A-----TA-T-AT-------T-CA-A------G-GGGT------TT--CAT-AT-----A-GTT----ACA--A--ATG----ACTTGTTT---GCAAAtgatttacataggatctgaagaggttctccatttttca
gi|35 : tTCCCTAGGG--GGT--C-CCCCTTACC-TTAC-TGGCCCATGGtgataatgacattttatcggatctgaaaaggttttttttccaat
2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|27 ): AANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACAGGTATT
Unaligned ( gi|33 ): GTGAAGAGTCTGAAAGAGTTTTCCATTATTCAAAAAAAAAAATCA
Alignments
lowQualScore : 11 2222 111 1 1 1 111 11 11 111 1 1 2222 1 3333333 1 1 3333333333 1 55555 111 11111 1111 3333333 11111111111 11 11111 666666666666666666666666666666666666666666666666666 333333333333333 11111111 111111 5555555555555 1111 555555555555555555555555555555555555555555555555555555 444444444444 1 111 222 1111 111 111 222222222222 22 11 11111 333333333333333 1111111 1111 11111 11111111 11 1111 111111111 4444444444444 444444444444444444444 11 1111 11111111 1111111 6666666666666666666666666666 1111 3333333333333333 1111111 1111 1111 2 11 2 11111 1 222222 66666666666666666666666666 111 111111 11 11 1111 1 1111111111 11111 11 11111 55555555555555555555 222222 222 2222222222222222 222222222222222 1111111 111111 111 222222 11 44444444444 111 333333 222 111111 11 11 1111111 11111 2222 11111 22 1 1111 111 111 44444444 1 22222 55555555555555555555 2222222222 1 111 11111 1111 1111 44444444444444444444444 222222 1 111
lowQualScore : 2 33 2 1111 2 777 2 0 4 0 0 999 8 5 44 00 33 777 0 0 4444 0 8888888 0 1 0 7777777777 0 00000 6 7 1 333 2 55555 4444 6 6 7777777 88 9 5 1 6 22 77777777777 99 5 5 5 5 5 44444 5 5 5 5 555555555555555555555555555555555555555555555555555 333333333333333 5 33333333 888 5 111111 888 5 5 999999999 3 7777777777777 66 5 66 0000 0 2 66 5 888888888888888888888888888888888888888888888888888888 5 333333333333 5 5 5 999 777 8 4444 1 777 111 8 4 4 9 111 1 4 777777777777 55 33 99 55 66 4 11111 333333333333333 4 66 4444444 0000 22222 66 5 5 88888888 1 77 7777 1 666666666 3 3333333333333 55 666666666666666666666 3 3 3 777 5 9 66 55 55 3 2 2 3 3333 77 3 3 3 88 88888888 5 9999999 3333333333333333333333333333 4 0000 777 3 4 4 99 1 3333333333333333 3333333 4 4 5555 55 4 4444 8 1 9999 0 9999 00 4 66 2 4 66 44444 2 66 2 1 3 111111 77 1 55555555555555555555555555 0 8888 55 4 444 4 2 4 888888 1 11 99 4 66 4 2 66 00 1 1111 2 3333333333 55 777 4 4 1 00000 55 55 33 2 3 00000 44444444444444444444 7 4 1 6666666 111111 4 7 0 66 44 000 777 4 5555555555555555 777777777777777 6666666 222222 0 4 000 5 5 5 5 1 77 8 000000 5 5 33 55555555555 888 4 99999 4 888 222 5 000000 5 66 5 1 4 777 22 2 4 111 3 444444 4 2 5 55 3 4 666 00 2 5 6 4 55 4 4 4444444 11111 4 11 55 6666 00000 4 777 8 88 4 4 66 5 55 3 777 6 4444 111 999 99 2 66 6 44444444 3 6 8 88 0 5 55555 8 00000000000000000000 6666666666 9 2 1 888 8888 6 66666 1111 6 2 99 99 3 4 6 4444 6 44444444444444444444444 0 333333 0 444 88 2 2 6 8 0 0 8
lowQualScore : . .. . .... . ... . . . . . ... . . .. .. .. ... . . .... . ....... . . . .......... . ..... . . . ... . ..... .... . . ....... .. . . . . .. ........... .. . . . . . ..... . . . . ................................................... ............... . ........ ... . ...... ... . . ......... . ............. .. . .. .... . . .. . ...................................................... . ............ . . . ... ... . .... . ... ... . . . . ... . . ............ .. .. .. .. .. . ..... ............... . .. ....... .... ..... .. . . ........ . .. .... . ......... . ............. .. ..................... . . . ... . . .. .. .. . . . . .... .. . . . .. ........ . ....... ............................ . .... ... . . . .. . ................ ....... . . .... .. . .... . . .... . .... .. . .. . . .. ..... . .. . . . ...... .. . .......................... . .... .. . ... . . . ...... . .. .. . .. . . .. .. . .... . .......... .. ... . . . ..... .. .. .. . . ..... .................... . . . ....... ...... . . . .. .. ... ... . ................ ............... ....... ...... . . ... . . . . . .. . ...... . . .. ........... ... . ..... . ... ... . ...... . .. . . . ... .. . . ... . ...... . . . .. . . ... .. . . . . .. . . ....... ..... . .. .. .... ..... . ... . .. . . .. . .. . ... . .... ... ... .. . .. . ........ . . . .. . . ..... . .................... .......... . . . ... .... . ..... .... . . .. .. . . . .... . ....................... . ...... . ... .. . . . . . . .
lowQualScore : 0 88 5 2222 0 555 5 0 0 0 0 666 0 0 00 22 88 000 0 0 8888 0 5555555 0 0 0 2222222222 0 77777 7 3 0 777 5 77777 2222 7 7 5555555 88 3 7 0 7 00 77777777777 33 7 7 7 7 7 33333 7 7 7 7 444444444444444444444444444444444444444444444444444 666666666666666 7 99999999 888 0 666666 888 0 0 555555555 6 0000000000000 99 0 99 6666 2 8 99 0 222222222222222222222222222222222222222222222222222222 0 222222222222 0 0 0 444 666 9 3333 1 888 444 9 4 4 0 999 9 4 000000000000 55 99 44 55 11 4 11111 999999999999999 4 11 4444444 6666 55555 99 0 0 11111111 3 11 2222 0 000000000 6 7777777777777 00 888888888888888888888 6 6 6 777 7 6 33 00 00 6 5 8 6 7777 55 6 3 6 33 11111111 0 6666666 9999999999999999999999999999 6 4444 000 8 0 7 33 0 7777777777777777 0000000 0 0 1111 55 0 0000 9 1 1111 0 4444 66 4 11 2 4 33 33333 0 33 4 0 3 777777 33 0 66666666666666666666666666 8 5555 55 0 333 0 3 0 777777 0 22 55 4 11 4 4 11 66 0 8888 0 5555555555 55 000 0 0 0 00000 55 55 00 4 2 00000 77777777777777777777 8 0 6 6666666 555555 0 8 1 11 11 111 888 4 8888888888888888 888888888888888 9999999 888888 1 4 000 7 7 7 7 7 99 7 111111 0 0 66 11111111111 111 3 00000 0 888 888 0 444444 0 99 0 4 4 888 00 5 4 888 4 444444 0 3 7 00 6 1 444 00 3 6 2 4 00 4 4 4444444 11111 4 11 55 1111 00000 0 000 0 77 4 4 11 0 66 3 555 7 2222 777 000 22 5 22 7 22222222 3 7 0 88 8 6 88888 0 88888888888888888888 5555555555 2 5 7 222 5555 7 77777 2222 7 5 22 22 5 0 7 2222 7 55555555555555555555555 8 888888 6 000 66 2 5 7 0 8 8 0
consensus : ATTTTGTTTGGATATACTGAAAAAA--GCGTT----CAACTAAACC---AACCGTACC-TCTNG-GG-CAGGATGGTTATCTACAACCGCACCTG-ATGGAAGAAGTANTTTGCTCGAC-TG--TTG--ATTATA-TGGTTCC-AATCACCTGCCCTATTAC-A--G-AAA-T--GN-CACTG-TTCAGCAAGTTATTC-AGC--------T-ATCAC-AAGAAG-----CTGTCAAAATGTAACTATCCTTGCATGTGATATTTTGCAGTNGCTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATTTGGCAAAATAC-N-GAGAAATAC----AGC-GA-TGT------TCAT-TTAGGAGTTTTCGATTCACTATCCTCTG-CACTGGAAACAATT-GGGGAA---A---T---AATGG-AGCGCGAG-T-GGACT-TTC-AC-AC-----GT-GA-T-TATTGA-GTCTGGA-AATATATAT-----G--TACGAT-AT--A-TCG-----GATA------AATGTT---ATTA--------AACTCCA-AACTTCATNAA--TGT---AC-CTA--G---CCTT---GATA-TCAAA-CAACTTGATATACATAAG-C--T--A-----GGTT--TAGTT-CTTT--AAAGC----AAAATGCATGCTT--GCA-AAN-T---G-CCC--AT--TA----TGACTGTT-G----G-----AA--T------TT-TTCT------CTA---TTTCAA-C-AGT-A-CTGTTNTAATGAC-AATTT--CATACATGTATTT---TGC--CC-CAA-AAC-TCGAAAG-ACG-T-C-CC-------AAATATCA--ATGTCAGACAAGTCTTG--ATTT--ACAA-T-----TAAAG---------------G-G--TT-------GCAT----AC-----T--A-A-TGAT--------ACTTTA-AGAAAAT----AATTGTTT---------TCAA-AGGT--AT-AT-GAT--ATTT--ATATA---G----GATTCT-GG----A-GAGG-T-TC--TCCATTTTTTCAGTTGA--T--TT-TTAAAGTNAAA-AN-C-ATG-TT-GTAGCCTC-AAANCTCATAA--------ACA-T-T-----CATAC----AT------------A---------TTTATGTCAAA---ACAACT---AAATAT-ATAATCAAGGGGTTACATATATTCACAAAAGACTTGTTTGCAAAT-G--A--A-TGACG--ATC-------TAT-ATCGG-ATCT-G-AAAA--A-GTTTT----TC-AATTTTCGGCGA-T--TATTATT----TTCA--CAAATTT-CAAGTTT--TTGCCCCA-AAAC-TC---GAAAAAGG-TCTCCGTGC-AA------CAAT-NTTA---TT---------------------TTAT----AA--TCAAAGG-GTTAC-AT-ACTTT-CAGAGA-AAACANTTGTTTTT--CATCAGTC-AA--T-ATTA--TCT--ATGGAGAGNT-TGAAGGAG-TT------T---CCA--TTTTT---CGATT-AT-TTNTAA-----AGAA--AA--AATTCCTGTTTTAGCCCC-----AAAAC-----------TC-GTCAAAATG-TCCCCA-AA-TATCT-TATGTCAAAC-AACTTGATATA--TAATTGAAT--GGT---TA-C----------ATAC--GTTCACAA---------------AATAC------TTGTTTGCAAAA------GTCAATGACATTTATA-TCGG---ATCTGAGGAG-T-TT-TCC-AATTTTCGGTGATTATTTT--CACCAATTT----TCATG-TTTTTTTGCCCC--AA---CT-AA---AAAAACGCC-CCCA--CGNAGGA---ATGTTCAAACAACC-TGA-T-TT-AT-A--AT-CGAGGGACTATGTACTT-TC---AAATTATACTTGTT-TGCCAAAAGTCAATGACATCTATAT------CGGATCTGAGGAG-TTTTTCCAATTTTCGGCGAT--TATTT-TCACCAATTTCAT---G--TTTTTTGCCCCAAAAACTCAAAAA-CG--C-C-CC-------AC-----GT-AGGAATGTCAAACAA--CCT-G-ATTTATAATC-----A-AGG---GACTAT-G-TACTTT-C--AA-ATTATACTTGTTTGCAA-A-G-TCA-A----TGACA---TCTATAT--TCGGA--TCTGAGGA-GTTTTT-------CCAATTT-CG-GC-GATT-ATTTTTCAC--A--ATT-TCGTG------TT---------TTTT--------TTGCCCC-AAAACTTC-A-AAAACGCC-CC-CAC-----GTAG-G-AA-TGT--CAAA--CAACCTGATTTNTA-ATC----AAG-G---------G-CTAATGT-----AGTTTCAAAAAAAT-----ACTTGTTT---GCAAAAATCCCTAGGG-GGGT-CCCCCATTACCTTTAC-TGGCCCATGG
Reference ( family-3276 ) : ATTTCGTTTGGATATACTGAAAAAA--GCGTT----CGACTAAACC---AACCGTACC-TCTTG-GG-CAGGATGGTTATCTACAACCGCACCTG-ATGGAAGAAGTNATTTGCTCGAC-TG--TTG--ATTATA-TGGTTCC-AATCACCTGCCCTATTAC-A--G-AAA-T--G--CACTA-TTCAGCANGTTATTC-AGC--------T-ATCAC-AAGAAGGGGTTCTGTCAAAATGTAACTATCCTTGCNTGTGATATTTTGCAGTGGCTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATTTGGCAAAATAC-T-GAGAAATAC----AGC-GA-TGT------TCAC-TTAGGAGTTTTCGATTCACTATCCTCTG-CACTGGAAACAATT-GGGGAA---A---T---AATG--AGCGCGAG-T-GGACT-TTC-AC-AC-----GT-GA-T-TATTGA-GTCTGGA-AATATATATA----G--TACGAT-AT--A-TCG-----GATA------AATGTT---ATTA--------AACTCCA-AACTTTATNAA--TGT---AC-CTA--G---CCTT---GATA-TCAAA-CAACNTGATATACATAAG-C-TT--A-----GGTT--TAGTT-CTTT--AAAGC----AAAATGCATGCNT--GCA-AAT-T---G-TC---AT--TA----TGACT-TT-G----G-----AA--T------TT-TTCT------C-A---TT-CAA-C-AGT-G-CTGTTTTAATGAC-AATTT--CATACATGTATTT---TGC--CC-CAA-AAC-TCGAAAG-ACG-T-C-CC-------AAATATCA--ATGTCAGACAAGTCTTG--ATTT--ACAA-T-----TAAAG---------------G-G--TT-------GCAT----AC-----T--A-A-TGAT--------ACTTTC-AGAAAAT----ANTTGTTT---------TCAA-AGGT---T-AT-GAT--ATTT--ATATA---G----GATTCT-TG----A-GAAG-T-TT--TCCATTTTTTCAGTTGA--T--TT-TTAAAGTTAAA-AA-N-ATG-CT-GTAACCTC-AAACCTCATAA--------ACA-T-T-----CATAC----A-------------A---------TTTATGTCAAA---ACAACT---AAATAT-ATAATCAAGGGGTTACATATATTCACAAAANACTTGTTTGCAAAT-G--A--A-TAACG--ATC-------TAT-ATCGG-ATCT-G-GAAA--A-GTTTT----TC-AATTTTCGGCGA-T--TATT-TT----TTCA--CAAATTT-CAAGTTT--TT-CCCCA-AAAC-TC---GAAAAAGG-TCCCCGNGC-AA------CAAT-CTNA---TT---------------------TTAT----AA--TCAAAGG-GTTAC-GT-ACTTT-CAGAGA-AAACANTTGTTTTT--CATCAGTC-AA--T-ATCA--TCT--ATNGAGAGNT-TGAAGGAG-TT------T---CCA--TTTTT---CGATT-AT-TTNTAA-----AGAA--AA--AATTCNTGTTTTAGCCCC-----AAAA------------TC-GTCANAACG-TCCCCA-AA-TATCT-TA-GTCAAAC-AACCTGATATA--TAATCGAAG--GGT---TA-C----------ATACT-GTTCACAA---------------AATAC------TTGTTTGCAAAA------GTCAATGACATCTATA-TCGG---ATCTGAGGAG-T-TT-TCC-AATTTTCGGTGATTATTTT--CACCAATTT----TCATG-TTTTTTTGCCCC--AA---CT-AA---AAAAACGCC-CCCA--CGAAGGA---ATGTTCAAACAACC-TGA---T--AT-A--AT-CAAGGGACTATGTACTT-TC---AAANNATACTTGTT-TGCCAAAAGTCAATGACATCTATAT------CGGATCTGAAGAG-TTTTTCCAATTTTCGGCGAT--TATTT-TCACAAATTTCAT---G--TTTTTTGCCCCAAAAACTCGAAAA-CG--C-C-CC-------AC-----GT-AGGNATGTCAAACAA--CC--G-ATTTATAATC-----A-AGG---GGCTAC-G-TACTTT-C--AA-A--ATACTTGTTTGCAA-A-G-TCA-A----TGACA---TCTATAT--TCGGA--TCTGAGGA-GTTTT--------CCAATTT-CG-GC-GATT-ATTTTTCAC--A--ATT-TCATG------TT---------TTTT--------TTGCCCCCAAAACTTC-G-AAAACGCC-CC-CAC-----GTAG-G-AA-TGT--CAAA--CAACCTGATTTATA-ATC----AAG-G---------G-CTAATGT-----AGTTTCAAAAAAAT-----ACTTGTTT---GCAAAAGTCCCCAGGG-GGGT-CCCCCATTACCTTTAC-TGGCCCATGG
gi|1 : ATTTTGTTTGGATATACTGAAAAAA--GCGTT----CAACTAAACCTTGAA--GTACT-TCTAG-AG-CAGGATGGTTATTTACAA---CACCTG-ATGGAAGAAGTTATTTGCTCGAC-TGATTTG----TATATTGGTTCC-AATCACCTGCCCTATTAC-AAGG-AAATT--GGCCACTATTTCAACAAGTTATTCAAGC--------TCATCACAAAGAAG-----CTGTCAAAATGCAACTATCC-TGCATGTGAT-TTTAGCAGTTGCTA
gi|1 : AACTTAGCCAAA-AT-C-GA---ATAC----CGT-GAATGT------TCATATTAGCAGTTTTCATTTCACTATCCTCTTTCACTGGAAACAGTT-AGGGAA---A---T---AAT---AGTGCGAGAT-GGACT-TTC-AC-AC-----GT-GA-T-TATTGACGTCTGGAGAATATATATACATGG--TACGATTAT--A-TCG-----GATA------AATGTT---ATTA--------AACTCCA-AACTTTCTTAAGCTGT---AC--TA--G---CCTA---GATA-TCAAA--AACTTGATATAAATAAGGC-TTTGG-----GGTT--TAATT-CTTT--AAAGC----AAAAT---TGCAT--GCA-AGT-T---A-TT---AT--TA----TAACT-TT-G----G-----AA--T------TT-TTCT------C-A---TT-CAA-C-AGT-AACTGTTTTAATGAC-AATTC--CATGCATGTATTT---TGT--CC-CAA-AAC-TTGGAAGGACG-T-C-TC-------AAATATCA--ATGTCAGACGAGTCTTG--ATTT--ACAA-T-----TAAAG---------------G-G--TT-------GCAT----AC-----T--A-AATGAT--------ATTTTA-AGAAAAT----AATTGTTT---------TCAA-AGGT---T-AT-GAT--ATTT--ATATA---G----GATTCT-TG----A-GAAG-T-TC--TCCATTTTTTCAGTTGA--T--TT-TTAAAGTTAAA-AA-G-ATG-CT-GGAAGCTC-AAACGTCATAA--------ACA-T-T-----CATAT----A-------------A---------TTTATTTCAAA---ACAACT---AAA-AT-ATAATCAAAAGGTTACATATATTTACATAAGA--TGTTTGCAAAT-G--A--A-TAATA--ATC-------TAT-ATCTG-ATCT-G-GAAA--A-GTTTT----TC-AATGTTCGGCGA-T--TATT-TT----TTCA--CAAATTT-CAAGTTT--TT-CCCCA-AAAT-TC---GAAAAAGG-TTCTTGGGT-AA------CAGTTCTTA---TT---------------------TTAT----AA--TCAAAGG-GTTAC-AT-ACTTT-CAGAGA-AAACAGTTATTTTT--CATCAGTC-AA--T-ATCA--TCT--ATTGAGAGGT-TGAAGGAA-TT------T---CCA--TTTTT---CGATT-AT-TTATAA-----AGAA--AA--AATTCCTGTTTTAGCCCC-----AAAA------------TC-GTCCCAATG-TCCCCA-AA-TATCT-TA-GTCAAAC-AACTTGATATACTTAATTGAAT--GGT---TA-C----------ACACT-GTTCACAA---------------AATAC------TTGTTTGCAAAA------GTCAATGACATTTACA-TCGG---ATCTGAGGAG-TATT-TTC-AATTTTCTGTGATTATTTT--CACCAATTT----TTATG-TTTTTTTGCCCC--AA---CT-AA---AAAAACGCC-CCCACCCTAAAGA---ATGTTCAAACAACCGTGA---T--AT-A--AT-TAAGGGACTATGTGCTC-TC---AAATTATACTTGTTCTGCCAAAAGTCAATGACATCTATAT------CGGATCTGAAAAG-TTTTTCCGATTTTCGGCGAT--TATTT-TCACAAATTTCAT---G--TTTTTTGCCTCAAAAACTCAAAAA-CA--C-C-CC-------AC-----GT-AGGTATGTCAAACAT--CC--G-ATTTATAATC-----A-AGG---GACTAT-GTTACTTT-C--AA-ATTATACTTGTTTGCAA-A-G-TCA-A----TGACA---TCTATAT--TCGGA--TCTGGGGA-GTTTT--------CCAATTT-CG-GC-GATTAATTTTTCAC--A--ATT-TCGTG------TT---------TTTT--------TTGCCTTCAAAACTTC-A-AAAACGAC-CC-CAC-----GTAG-G-AA-TTTTACAAA--CAACCTGATTTTTA-ATC----AAG-G---------G-CTAATGT-----AGTTTCAAAAAAAT-----ACTTGTTT---GCAAAAATCCCTAGAGCGGGT--CCCCATTACCTTTAC-AGGCCCACGGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacttagccaaaatcgaataccgtgaatgttcatattagcagttttcatttcactatcctctttcactggaaacagttagggaaataatagtgcgagatggactttcacacgtgattattgacgtctggagaatatatatacatggtacgattatatcggataaatgttattaaactccaaactttcttaagctgtactagcctagatatcaaaaacttgatataaataaggctttggggtttaattctttaaagcaaaattgcatgcaagttattattataactttggaatttttctcattcaacagtaactgttttaatgacaattccatgcatgtattttgtcccaaaacttggaaggacgtctcaaatatcaatgtcagacgagtcttgatttacaattaaagggttgcatactaaatgatattttaagaaaataattgttttcaaaggttatgatatttatataggattcttgagaagttctccattttttcagttgatttttaaagttaaaaagatgctggaagctcaaacgtcataaacattcatataatttatttcaaaacaactaaaatataatcaaaaggttacatatatttacataagatgtttgcaaatgaataataatctatatctgatctggaaaagtttttcaatgttcggcgattattttttcacaaatttcaagtttttccccaaaattcgaaaaaggttcttgggtaacagttcttattttataatcaaagggttacatactttcagagaaaacagttatttttcatcagtcaatatcatctattgagaggttgaaggaatttccatttttcgattatttataaagaaaaaattcctgttttagccccaaaatcgtcccaatgtccccaaatatcttagtcaaacaacttgatatacttaattgaatggttacacactgttcacaaaatacttgtttgcaaaagtcaatgacatttacatcggatctgaggagtattttcaattttctgtgattattttcaccaatttttatgtttttttgccccaactaaaaaaacgcccccaccctaaagaatgttcaaacaaccgtgatataattaagggactatgtgctctcaaattatacttgttctgccaaaagtcaatgacatctatatcggatctgaaaagtttttccgattttcggcgattattttcacaaatttcatgttttttgcctcaaaaactcaaaaacaccccacgtaggtatgtcaaacatccgatttataatcaagggactatgttactttcaaattatacttgtttgcaaagtcaatgacatctatattcggatctggggagttttccaatttcggcgattaatttttcacaatttcgtgttttttttgccttcaaaacttcaaaaacgaccccacgtaggaattttacaaacaacctgatttttaatcaagggctaatgtagtttcaaaaaaatacttgtttgcaaaaatccctagagcgggtccccattacctttacaggcccacggc
gi|10 : attttgtttggatatactgaaaaaagcgttcaactaaaccttgaagtacttctagagcaggatggttatttacaacacctgatggaagaagttatttgctcgactgatttgtatattggttccaatcacctgccctattacaaggaaattggccactatttcaacaagttattcaagctcatcacaaagaagctgtcaaaatgcaactatcctgcatgtgattttagcagttgctannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntG-TTTTTTTGCCCC--AAAA-CT-AA---AAACACGCC-CC-A--TGAAGGA---ATGT-CAAACAATC-TGA---TT-AT-A--AT-TGTGTGACTATGTACTT-TC---AAATTATACTT-TT-TGG-AAAAGTCAA--ACATTTATAT------CGGATCTGAGGAG-TTTT-CCAATTTC--GTGAT--TATTT-TCACCAATT-CAT---G--TTTTT-GCCCCAAAA-CTC-AAAA-CG--C-C-CC-------AC-----GC-AG-AATGTCAAACAA--CCA-G-ATTTATAATC-----A-AGG---A-CAAT-G-TACTTT-C--AA-ATTATACTTGTTTGCAA-AAG-TCA-A----TGACA---TTTATAT---CGGA--TCTGAGGA-GTTTTT-------CCAATTT-CG-GT-GATT-ATTTT-CAC--CT-ATT-TC-TG------TT---------TTTT----------GCCCC-AAAACT-C-A-AAAAC-CC-CC-CAC-----GTAG-G-AA-TGT--CAAA--CAACCTGA-TTATA-TTC----AGG-G---------A-CTAG--------ACTTTCAAAAAAA--------CTG-TT---GCAAA--TCCCCGGGG-c
gi|11 : caattcggatgagtattatcactaagatgttatagcgatcgtctcgttaTA--------AGCTCCA-AACTT-ATTAAC-TGT---AC-CTATAA---CCTT---TATA-TCAAA-CAACTTGATATACACAAG-C-AT--ACATGGGGTT--TAGTT-CTTT--AAAGC----AAAATGCATGCTT--GCA-AAA-T---G-TCCATAT--CA----TGACTGTT-G----G-----AA--A------TT-TTCT------CTA---TTTCAA-C-AGT-A-CTGTAT-AATGAC-AATTTT-CATACATGTATTT---TGT--CC-CAA-AAC-TCGAAA--ATG-TCC-CC-------AAATATCA--ATGTCAAAC-AGTCTt
gi|11 : taA--T--TT-TTAA-GTACAA-AT-C-ATG-TT-GTAGCCTC-AAA---CATAC--------ATA-T--------ATAA----AGGT----------A---------TTTATGCC-AA---ACAACT---AGATAT-ATAAgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatttttaagtacaaatcatgttgtagcctcaaacatacatatataaaggtatttatgccaaacaactagatatataa
gi|12 : tataagctccaaacttattaactgtacctataacctttatatcaaacaacttgatatacacaagcatacatggggtttagttctttaaagcaaaatgcatgcttgcaaaatgtccatatcatgactgttggaaattttctctatttcaacagtactgtataatgacaattttcatacatgtattttgtcccaaaactcgaaaatgtccccaaatatcaatgtcaaacagtctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaATTTCTTGTGGACATACTGTAGGAT--GCGTT----CGAGTGAACC---AACCGTACCGCCTTG-GG-CAGGATGGTTATCTTCAACTGCACCAG-ACG-AAGAAGTGCTTTGCTCGAC-TG--TTG--ATTATA-TGGTTCC-AATCAACTGTCCTATCAC-A--GAAAA-T--GC-CACAG-TTCAGCAAGTCATCC-AGC--------T-ATCAC-AAG
gi|13 : tacaactcatactgctcacggtattgtgaaacaagaagtatatgtgcgtgatgaggataaccaaggccctctagacaaatcttgctagataggaataaatctaggacaagtttcagaaaaatcagaagaactagccccatgtttcgtgaagaccaaaacatcgccagctgtccgaactacttgcatgtcccctttgcataccaacaatgataagagagacatgactcGCGAAAT-C-TAGAGAAGTAC----AGC-GA-TGTCATTGTTCAC-TGAGGAGTTTCC-ATTCGCTAAGCTATG-CATTGGAAAGAATT-GGGTAA---AGAGT---AATGGGAGTACTAG-T-GGACT-TTC-AC-ATCACATGT-GA-T-TATTGA-GGCTGG----CATATAT-----G--TATGA-------------------A------AATTTT----CTG--------AACTCAA-AACTTTATAAA--TGT---AC-CTA--G---CCTT---GATG-TCAAA-CAAC-------AAAT----------------GGTA--TAGTT-CTTC--AAAGC----AAATTACATGCTT--GCG-AA--T---G-TCTTTAT--TG----TGATT-GTAG----G-----AA--TCGAAAATT-TTC-------C-ATTTTT-TAA-C-AA-----TATTATATTGACAAATTT--CATA----TATTG---CGCG-CA-TAACAAC-TCG-AAG-AGG-TAC-AT-------GTATATTA--ATATCAGAT-AGTC-TG--ACTT--ACGA-T-----TAAAG---------------G-G--CT-------GCAT----AC-----T--A-A-TGAT--------
gi|14 : tT--TAGTTTCTTT--AGAAG----GAAATA-ATG-------A-AAT-TAATG-AC---AG--TA----GGA---TT-G----G-----ATCTT------TT-TTCTACTAT-C-T---TT-TAA-CCAGT-G-CTGT---AATGACTAACTT--TCTACATGTACTT---TACTACT-C-A-AAC-TCGAACA-A---T-C-C--------------CA--ATGCCAGACAG---TTGGAATTT--ACAA-T--------AG---------------GCG--TA-------GTATCGCCAA-----TAAA-A-TGAT--------CCTTTA-AGGAAATGCTAAATTGTTT---------CC-A-AGGT---TGGT-AATCGACTTTAACATA--------AATTCTCTG----A-GAGGAT-TT--TCCACTTGT--AG-TGA--T--CTGTTTAAGTTAAA-GACC-ATGTCTCGTAGCCTC-AAAg
gi|15 : TATCTGCAA-A-T-TAG-AGGGTTGACAAATTCTATATACTCGGAAATCTGAG-A-GTCTTTTATCTCCCCAATTTTCGCGT-GAT--ATTTTGCAC--ACCATTATTATGGGTGTACC---------TTTTGGTAGGGGTTGCATC-AAAA--TC-G-AAAACGTAACC-CAC-----GTAG-A-AAATGC--CAAA--CAACCTGAATTAAATATTTGAAAAG-GTTTCAGTAGG-ATAAAATCAATAAACTACAAAAAAACCCACAATTTGTTTTGAG-AAAAATCCCCATGG-GGGT-CGCCCATTACCTTTACTTGGCCCATG
gi|16 : atatagttacaaT----TCCA--CAAATTT-CAAGTTT--TTGCCCCA-AAAT-TC---AAAAAATA-TCC--ATGC-AAA-----CAAT-ATGA---TT---------------------T-AT----AA--TCAAAGG-GTTCA-AT-AGTTT-CAGAGACCCACATTTG-TTTT--CAAAAGGC-AA--T-ATTA--TCT--GTGAAGAGTC-TGAAGGAGTTT------T---CCA--TTTGT---CGATG-AT-TTTTAA-----AGAAACAA--AA-----G----AG-CCC-----AAAAGC----------TC-G--AAAATG-TCCTAA-AA-TA-CT-TATGTCAAAC-AACTTGATATA--Ttc
gi|17 : aa-AGGT---TCAT-ATT--ATTT--ATATA---G----AATTC---G----AAGAGG-T-TC--TCCATTTTT--AGGTGA--T--TT-TT----TTAAGTAA-A-ATC-AT-GTAGCCTC-AAAACTCGTAA--------ATG-T-T-----CCCAC----ATCCTAAAGTATAAA---------TTTATGTCAAA----CAACT---TAGTAT-ATGATCAAGGGGTTGCATGTATTCACAAAATACTTGTTTGCAAAT-GTCA--A-TGAC---ATC-------TAC-ATCGG-ATCT---AAAA--C-GTTTT----CC-AATTTTCAGC
gi|18 : T-TGC-AAAACTTTATAATATCTATATGTATTTCGGATCTGAAGAG-TTTTTCCAAAGTTTGGCGTT--TATTT-TCACCAGTTGCATGGGG--TTTTTTGCCCC-CAAACTCGACAA-CA--C-CACC-------AC-----CA-AGGAATGTCAAACAA--CCT-T-ATTTAGAATC-----T-AGG---GACAAT-G-TAGTTT-C--AA-A--ATA
gi|19 : GAG-TTTCT----TTTTCCGCTAGCATATTTCTCACAG----CAT---G--CTTTTTGTTC--AAAACTGGTATT-CA--C-C-CCCTGGCCCAC-----AT-AGAAATTTGAAACAA--CC--ACATTTTTAATC-----A-AAC---GACTGT-G-CACTTT-CCAAA-A--GTACTTGTTTACAt
gi|2 : TTTTGATTGGATATCCTGAAAAAA--A-GTT----CAACTAAACC---AACCATACT-TCTTGAGG-CAGGATGGTTATCTACAACCACACCTA-ATGGAGGAA-CACTTTGTTGGAT-TG--TTG--ATTATA-TGGTTCC-AATCACCTGCCCTATTGCAA--G-AAA-T--GA-CACTA-TTCAGCATGCTATTC-AGCTAGATTAAT-ATCAC-AAGAAG-----CTGTCAAAATGTAACTATCCTTGCATGTG--ATTTTGCAGTGGCTA
gi|2 : TTTGGCAAAATCC-A-GAGAAGCAC----AGC-AA-TGTATTGT-TCAT-TTAGGAGTTTTCCATTCACTATCCTCTG-AACTGGAAACCACT-GGGGAA---AA--T---AGTG--AGCGTGAG-T-GGACT-TTT-AC-AC-----AT-GA-T-TATTGA-GTCTGGA-A---TATAT-----G--TACGAT-AT--G-TCA-----GA-A------AATGTT---AT-A--------AACTTCA-AACTTTATAAA--TGT---AC-CTA--A---CCTT---GATA-TCAAG-CAACGTAATATACATAAG-C------------GTT--TAGTT-CTTT---AAGC------AATGCATGCTT--GCA-AAA-T---GCCC---AT--TA----TG-----------------------------TT-TTCT------A-T---TT-CAA-C-AAT----CG-TATAATGAC-AATTT--TATACATGTATTT---TG---TC-CAA-AAC-TCG-AAG-ACG-T-CTCC-------AAATATCA--ATGTCAGAC-AGTC-TG--ATTT---CAA-TAAGGATAAAACTGTTCGTTTCCTTTG-ATTTT-------ACAT----ACAGAATT--A-A-TGAT--------ACGTTA-AGAAAAT----AATTATTT---------TCAT-TGGTTCAT-AT-G----ATTT--ATATA----------------------------------TTCA--TTTCCAATAAA--T--TT-GAAAAGTAAAA-AT-C-ATG-TT-GTAACCTA-AAAATTCATAA--------ACA-T-T-----CATAC----AT------------A---------TTTATTTTCAC---ACAACT---AAATAT-ATAAACAAGGGGTTACACATATTTACAAAAGACTTGTATGCAAAT----A--A-TAAGGACATC-------AAT-ATCGGTATGT-G----A--A-ATTTTCCCCCC-AACTTTGAGTGA-T--TATTATT----TTTA--CACATTT-CAAGTTT--TTGCCCAA-AAAC-TC---G-AAAAGG-TCTCCATGCAAA------CAAT-CTTA----T---------------------TTAT----AA--TCAAAGG---TAC-AT-ACATT-C--AGA-AAACAA-TGATTTT--CATCAGTA-AA--T-ATTA--TCT--ATTGAGAG-T-TGAAGGAGATT------T---CCA--TTTTT---CGATT-AT-TTTTAG-----AGAA--AA--AA-TCCCGTTTTAGCCCC-----AAAAC-----------TC-GTC--GATG-CCCCCA-AC-TATCT-AT-GCCAGAC----------------ATTGGAT--GGC---TA-C----------ATA-T-GTTCACAA---------------AATAT------TTGTTTGCAAAA------TTCAGTGATATCTATA-TCGG---ATCTGAGGAG-C-TTGTCC-AATTTTTGGTGATTATTTT--TACCAATTT----T-ATG-TTTTTTC-CTCC--AA------AACTCAATAACA-T-CCCA--CGTAAGA---ATG-TCAAACAACC-TGATT-T--AT-A--AT-TAGGGGGCTATGTACTT-GC---AAATTATACCTGTT-TG-CAAAAGTCAATGACATTTATAT------CGGATCTGAGGAATTTTTTCCAATTTTTGGTGAT--TATTT-TCACCAATTTTAT---G--TTTTT--CCCCAAAAACTCAAAAA-CGC-C-C-CC-------AC-----GT-AGGAATGTTAAACAA--CCT-G-ATTTATAATC-----A-GGG---Gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttggcaaaatccagagaagcacagcaatgtattgttcatttaggagttttccattcactatcctctgaactggaaaccactggggaaaatagtgagcgtgagtggacttttacacatgattattgagtctggaatatatgtacgatatgtcagaaaatgttataaacttcaaactttataaatgtacctaaccttgatatcaagcaacgtaatatacataagcgtttagttctttaagcaatgcatgcttgcaaaatgcccattatgttttctatttcaacaatcgtataatgacaattttatacatgtattttgtccaaaactcgaagacgtctccaaatatcaatgtcagacagtctgatttcaataaggataaaactgttcgtttcctttgattttacatacagaattaatgatacgttaagaaaataattattttcattggttcatatgatttatatattcatttccaataaatttgaaaagtaaaaatcatgttgtaacctaaaaattcataaacattcatacatatttattttcacacaactaaatatataaacaaggggttacacatatttacaaaagacttgtatgcaaataataaggacatcaatatcggtatgtgaaattttccccccaactttgagtgattattatttttacacatttcaagtttttgcccaaaaactcgaaaaggtctccatgcaaacaatcttatttataatcaaaggtacatacattcagaaaacaatgattttcatcagtaaatattatctattgagagttgaaggagatttccatttttcgattatttttagagaaaaaatcccgttttagccccaaaactcgtcgatgcccccaactatctatgccagacattggatggctacatatgttcacaaaatatttgtttgcaaaattcagtgatatctatatcggatctgaggagcttgtccaatttttggtgattatttttaccaattttatgttttttcctccaaaactcaataacatcccacgtaagaatgtcaaacaacctgatttataattagggggctatgtacttgcaaattatacctgtttgcaaaagtcaatgacatttatatcggatctgaggaattttttccaatttttggtgattattttcaccaattttatgtttttccccaaaaactcaaaaacgcccccacgtaggaatgttaaacaacctgatttataatcaggggaacattaccttt
gi|20 : ttttgattggatatcctgaaaaaaagttcaactaaaccaaccatacttcttgaggcaggatggttatctacaaccacacctaatggaggaacactttgttggattgttgattatatggttccaatcacctgccctattgcaagaaatgacactattcagcatgctattcagctagattaatatcacaagaagctgtcaaaatgtaactatccttgcatgtgattttgcagtggctannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAGACA-GTCT-G--ATTT--ACAA-T-----TAAAG---------------G-G--TT-------CCAT----AC-----T--A-A-TGGT--------ACGTTA-AGAAAAT----AATCATTT---------TCAA-AAGTTCAT-AT-G----ATTT--ACATA---G----GA-TCT-GA----A-GAGG-T-TC--TCCATTTTTaacattaccttt
gi|21 : T-TC---ACAAAATACTTGTT-TGC-AAATGCCAGTGGCATCAATAT------CGGACCTGAAAGG-CTTTTCCAATTTTCAGCGAT--TA-TT-TCACAAATTTCAA---G---TTTTTGCCCCAAAAca
gi|22 : ataGAAAAT----AATTGTTT---------TCAA-AGTC---C-AT--AT--ATT---ATATAAACG----GA------A----A-GAAC-T-TTCTTCCATTTTTTCAG-TGA--T--TT-TTTAAGTAAAA-AATC-ATG-TT-GTAGCCTC-AAACTT
gi|23 : --TATAT-TTACAAATATTAT---GAGTATTTCCCCTCAAATATTCATAAA-AT--C-C-CT-------ATATTCTGT-A--AATGTTAAACAA--CCTCG--TTTATAATC-----A-AGA---GACTAT-A-T-CTTT-C--
gi|23 : cT--------TTCCCCTCAAATATTC-ATAAAAT--C-CC-TATATTCTGTA----AA-TGT--TAAA--CAACCTCGTTTATA-ATC----AAGAG---------A-CTA
gi|23 : ctatatttacaaatattatgagtaA---ATGTT-AAACAACC-TCG---TTTAT-A--AT-CAAGAGACTATAT-CTT-TC---tatctttc
gi|24 : ctatatttacaaatattatgagtatttcccctcaaatattcataaaatccctatattctgtaAA---ACAACT---AAATAT-ATATTCAAGGGGTTTCATATAGTTACAAATGACTTGTTTGCAAAT-G-----A-TAATGACATT-------T-T-ATCGG-ATCT-G-AAAA--G-GTTTT----T
gi|25 : tcTTTGTTTGGATGTACTGAAAAAAAAGCGTCGATCCAACTAAACC---AACCGTACC-TCTAA-GGACAGGATGATTATCTACAACAACACCTG-AT-GAAGAAGTtttccaat
gi|26 : ----AATTGTTT---------TCAA-AGGTCCAT-AT-G----ATTT--AAATA---G----GA-TCT-GA----A-AAAG-T-TC--TCTA-TTTTTCAG-TGATTT--TT-TTAAAGTAAAA-TG-C-ATG-TG-GTAGCATC-Aa
gi|28 : GAC-GATTT-----ACTTATACCTCCATGC--TCGCAA-AAC-TCGAAA--ACGTT-C-CC-------AATTATCA--ATGTCAGAC-AGTC-TG--ATT
gi|29 : AATTTGGCAAAATAC-T-GAGAAATAC----AGC-GA-TGT------TCAC-TTAGGAATTTTCCATTCACTATCCTCTG-CA
gi|3 : ACAAAC-CACCTGCATCGAAGAAGTAATTTGCTCGAAATG--TTATAATTATT-CGGTTCCCAATCACCTGCCCTATTACCA--G-AAA-TTGG--CACTG-TACAGCAGGTTATTC-AGC--------T-ATCAC-AAGAAGGGGTTTTGT-----TGTAACTATCCTTGCTTGTGATATTTTGCAG
gi|3 : caaTTGGCAAAATAC-A-GAGAAATAC----AGC-GA-TGT------CCAT-TTAGGAGTTTTCGATTCACT-TCC-CTG-CACTGGAAACAGTTCGGGAAA---A---T---AATG--AGCGCGAG-T-GGACT-TTC-AC-AC-----GTTGA-T-TATTGA-GTCTG-A-AATATAT-------G--TACGAT-AT--ACTCA-----GGTATCAGATAATGTT---AT-A--------AGCTCCA-AACTT-------------------A--G---CCTT---GATA-TCAAA-CAA-ATAATACACATAAG-TATG--A-----GGTTGTTCTTT-CTTT--AAAGC----AAAATGCATGCTT--GCA-AAA-T---G-TCC--ATA-TA----TGACTGTT-G----A-----AA--A------TT-TTCT------CTA---TTTCAA-C-AGT-A-CTGTAT-AATGAC-AATTTTTCATACATGTATTT---TGT--CC-CAA-AAC-TCG-AAG-ATG-TCC-CC-------AAATATTA--ATGTCAGAC-AGTC-TG--ATTT--ACAA-T-----TAAAG---------------G-G--TT-------ACAT----AC-----T--A-T-TGAT--------AATTTA-AGAAAAT----AATTG-TT---------TCAG-AGGTCAAT-AT-G----ATTT--GAATA---A----GA-TCT-GA----A-GAAG-T-TC--TCCA-TTTTTCAG-TGT--T--TT-TTTAAGTAAAA-AT-C-ATG-TT-GTAGCCTC-AAACCTTATAA--------ACA-TATACATACATAC----A-------------AATACAGGTTTTTATGCC-AA---ACAACT---AGATAT-ATAATCAAGGGGTTACATAAATT-ACAAAAGACTTGCTTGCAAAT----A--A-TAATGACATCTACCAGGTAT-ATTGG-ATCT---GAAA--A-GTTTT----CC-AATTTTCAGCTA-T--TATTATT----TTCA--CAAATTT-CTAGTTT--TTGCCCCA-AAAC-TC---G-AAAAGG-TCTCCGGGT-AAACATTGTAAC-CTTA--------------------------TTAT----AA--ACAAAGG-GTTAC--T-AATTT-C--AGA-AAACATTTA-TTTT--CATCAGTC-AA--T-ATTA--TCT--ATAGAGAGTA-TGAATAAGTTT------T---CCA--TTTTT---CGATT-AT-TTATTA-----AGAA--AA--AA-TCCTGTTTTAGTCCA-----AAGAC-----------TC-GTC--AATG-T---TATAA-TATCT-AT-GTTAAACAAACTTGATATA--TCATTGAAT--GGT---TA-C----------ATAC--GTTCAC-A---------------AATAC------TTGTTTGCAAAA------GTCAACGACATTTATA-TCGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntataattggcaaaatacagagaaatacagcgatgtccatttaggagttttcgattcacttccctgcactggaaacagttcgggaaaataatgagcgcgagtggactttcacacgttgattattgagtctgaaatatatgtacgatatactcaggtatcagataatgttataagctccaaacttagccttgatatcaaacaaataatacacataagtatgaggttgttctttctttaaagcaaaatgcatgcttgcaaaatgtccatatatgactgttgaaaattttctctatttcaacagtactgtataatgacaatttttcatacatgtattttgtcccaaaactcgaagatgtccccaaatattaatgtcagacagtctgatttacaattaaagggttacatactattgataatttaagaaaataattgtttcagaggtcaatatgatttgaataagatctgaagaagttctccatttttcagtgtttttttaagtaaaaatcatgttgtagcctcaaaccttataaacatatacatacatacaaatacaggtttttatgccaaacaactagatatataatcaaggggttacataaattacaaaagacttgcttgcaaataataatgacatctaccaggtatattggatctgaaaagttttccaattttcagctattattattttcacaaatttctagtttttgccccaaaactcgaaaaggtctccgggtaaacattgtaaccttattataaacaaagggttactaatttcagaaaacatttattttcatcagtcaatattatctatagagagtatgaataagttttccatttttcgattatttattaagaaaaaatcctgttttagtccaaagactcgtcaatgttataatatctatgttaaacaaacttgatatatcattgaatggttacatacgttcacaaatacttgtttgcaaaagtcaacgacatttatatcg
gi|30 : caaacaaaccacctgcatcgaagaagtaatttgctcgaaatgttataattattcggttcccaatcacctgccctattaccagaaattggcactgtacagcaggttattcagctatcacaagaaggggttttgttgtaactatccttgcttgtgatattttgcagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntataaGAAT--GGT---TA-C----------ATAC--GTTCACAA---------------AATACCGGTACTTGTTTGCAAAA------GTCAAAGACATTTATA-
gi|31 : tACCAAGGGGTTACATAAATTTACGAAAGACTTGCTTGCAAAT----A--A-TAATG--A
gi|32 : AA---A---T---AATG--AGCGCGAG-T-GGACT-TTC-AC-AC-----AT-CA-T-TATTGA-ATCTGG--AATATAcatt
gi|34 : CTTCATATA--TGT---AC-CTA--G---CCTT---GATA-TCAAG-CAACTTGATATA
gi|35 : TCCCTAGGG-GG-T-CCCCC-TTACCTT-AC-TGGCCCATGG
gi|4 : TGGCAAAATTCAT-TAGAAACACTAACAGCTGA-TGT--------AA-TTG-----TTTCGTTTTAGGAGCCTCTG-CA------GCACTT-GT--AA---A---TCGCAATGG-AGCGCGAG-TCGAACTGTTCTACCAT-----GT-GA-T-TATT-----C-------------------G--TA-GAT-AT--G-TAA-----GA-A------AATGTT---AT-A--------AACTCCA-AACTTCATATA--TGT---AC-CTA--G---CCTT---GATA-TCAAA-CAACTTGA-----------------------GGAT--TAGTT-CTTT--AAAGC----AAAATGCATGCTT--GCA-AAA-T---G-CCC--ATAATA----TGACTGTT-G----G-----AAA-T------TT-TTCT------CTA---TTTCAA-C-AAT-A-CTGT-------AC-AAT---------ATGTATTT---TGC--CC-CAA-AAC-TCGAA-G-ACG-T-T-CCCATGC--AAATATCA--ATGCCAGACA-GTCT-G--ATTT--ACAA-T-----TAAAG---------------G-G--TT-------ACAC----AC-----T--A-A-TGAT--------ACGTTA-AGAAAAT----TATCATTT---------TCAA-AGGT---TTATCGAT----TT--ATATA---A----GAT-AT-GA----A-GAGG-T-TC--TCCATTTTT-CAGT-GA--T--TA-TTAAAAGTAAA-AA-TCATG-TC-GTAGCCTC-CAAACTCATAT--------ACA-T-T-----CATAC----AT------------A---------TTTATGTCAAA----CAACT---AAATAT-ATAATCAAGGGGTTACATA----------AGACTTGTTTGCAAAT-G--ATAA-TGAC---ATC-------TAC-ATCGG-ATCT-G-AAAA--A-GTTTT----TCCAAATTTCGGCGA-T--TATTATT----TTCA--CAAATTT-------T--TG-CCCCA-AAAC-TC----AGATAGA-TTTCTATGC-AAA-----CAAT-TTTA---TTTATAATCAAAGGGTCACATATTTATTTAAAA--TCAAAGG-GTCAC-AT-ATTTT-CAGA---AAACAATT-CTTTT--CATCCGTC-AA--T-ATTA--TCT--ATGGAAAGCT--GAAGGAG-TT------TT--CCA--TTTTT---CGATT-AT-TTTTAA-----AGAA--AA--AAT-CCTGTTTTAGACCC-----AAAA------------TTTGTCA--ATG-TCCCCA-AA-TATCTATA-A-CTGAC-AACTTGATATA--TAATTGAATATGTT---TA-C----------ATAC--GTTCACAA---------------AATAC------TTGTTTGCAAAA------GTCAATGACATTTATA-TCGG---ATCTGAGGAGTT-TT-TCC-AATTTTCGGTGATTATTGT--CACCGA-TT----TCATGTTTTTTTTGCCCCAAAA---CT--A---AAAAACGCC-CCCA--CGTAGGA---ATG-TCAAACAACC-TGATT-T--AT-A--AT-CGAGTGACTATGTACTT-TA---AAATTATACTTGTT-TG-CAAAAGTC--TGACATTTATAT------CGGATCTGAGGGT-TTTTTCCAATTTTCGGTGAT--TATTG-TCACCGATTTCAT---GTTTTTTTTGCCCC-AAAACTAAAAAA-CGC-C-C-CC-------AT-----GT-AGGAATGTCAAACAA--CCT-G-ATTTATAATCAATTTA-AGG---GACTAT-A-TACTTT-C--AA-A--tct
gi|5 : aCTCTG-CACTGTAAACCACT-GGAGGAGAGA---T---AATGG-AGCGCGAG-T-GGACT-TTC-AC-AT-----GC-GAGTGTGTTGA-GTCTGCTTAATCTA-ATA----AGTTACGAT-TTGCA-TTGTCAAAGATA------AATGTTGAAATGACACAGAGAAACTCCATCAGGTCACTAC--TGTTCAACACTA--AGCACCTTAAGGATAGTCAAAGCAACT--------ATGAG-G-AT--A-----G--T--AATTT-CTTTCAAAAGCGAGAAAAATGCAC-CATTAACACAATAT---G-CCC--AT--TAATATTGGAT-CT-GTCATGCAAATAA--T------TTATTCTACTATAT-A---TC-TAATC-AATTA-CTGTTACAATAGC-----T--CTTAAGTATA-------GC--CCACAA-AACGTCGAA-G-ACG-T-C-CCCATGCAGAGATATCACAATGCCAGAACGGTCT-G--ACTTGTACAAAT-----TAAAGTG-------------A-G--TTACTGGAAGCAT----CT-----T--ACA-TGATCATCTAAGAATCTCTATAAGATGAG-AATTGTCTCAATTATGGTCAATAGTT---T-TT-CATC-ATTT--TCATA---GAAGAGACCCA-TGTATCA-GAGG-TGTC--TCCATTTT--CAGTGTA--T--TA-TTAAAAGTAAC-AA-T-CTG-TC-GTAGCCTCCAAATTTCATAA--------ACAGT-T-----CATAC----AT------------A---------TTTATTTCAAAGTGAAAATTCTTAAGTATGATAATCAAGGTGTTA-----AT------AAGACTTGTTGGCAAAT-G--A--AATGAC---ATC-------TACCATCG--ATCT-G-AAAACAA-GTTTT----TC-CAAATTCGCCGAATAGTATTATT----TTCAG-CAAATTT-CAAGTTT--TTGCCCCAGAAAA-TCAGAGAAAAAGGTTCTCCGTGCAAA------CAAT-ATTT---TTTTACTCCA-------------TTAT----AAATTCAAAGG-GTCACAGTGATTTT-C--AGA-AAACAATTTCTTTTTGCATCAGCT-AAATT-ATTA--TCT--ATGAAGAGTTCTGAAGGAA-TT------TTTACCATTTTTTT---CGATTAATATTGTGAAAGACAGAA--AA--AATCACTATTCTCACCCCTCTATAAAAAGATAAATTTCTTT-TTCAAAGGT-TCCCCA-AATTATCT-TATGTCAGAC-AACTTt
gi|6 : atttggcaacattatcagtacgacataacaccagcatcgcatattgtgtcggtttaggaagcaCAAA---ACAACT---AA-TAT-ATAATCAAGGG-TTA-ATAAAT--ACAAAAGACTTGCTTGCAAAT-A--C--A-CATGG--CTC-------TAT-ATCGG-ATCTTG-AAAA--A-GTTTTCT--TC-AATTTTCAACA-----TATA-TT----TTCA--CAAATATACTAGTTT--TG-CCCCA-AAACCTC---GAAA--GT-TCTCCGGGT-AA------GACA-CTTAACCTA---------------------TTAT----AA--TCAAAGG-GTTA--AT-ACTTTTCAGA---AAACATTTATTTTT--CATCAGTC-AA--TTATTA--TC---ATAGAGATAT--GAAGGAG-TTGTTTTTT---CCA--TTTT----CGATT-AT-TTATAA-----AGAA--AA--AATTCCTGTTTAA--TCC-----AAAA------------C---TCACAATG-TTCTCA-AA--ATCT-CATGTAAAAC-AACTT-ATATA--TCATTGAAT--GGTATATA-CGTTCACCAAAATACTTGTTC-CAATGCATTATATCGNNNNNNNN------NNNNNNNNNNNN------NNNNNNNNNNNNNNNN-NNNN---NTCTGAGGAG-T-TT-TCC-AATTTTCG-TGATTATTTT--CACCAATTT------ATG-TTTTT--GCCCC--AAAAACTCAA---AAAAACGCCGTTCA--CGTAGGA---ATGTCAAAACAACC-TGA---TT-AT-A--AG-CAAGG-ACTATGTACTCGTC---AAATAAC-CTTGTA-T-CCAAAAGTCCATAACATCTTTAT------CGGATTTGAGGAG-TTTTTC-AATTTT-GGCGAT--TATTT-TCACCAATTTCAT---G--TTTTTTGCCCCAGAAACTCAAAAA-CAACC-C-CC-------AC-----GT-AGGAA-GTCAAACAAACCC--G-ATTTATAATC-----A-AGG---GACTAT-G-TACTTT-C--AA-ATTATACTTGTTTGCAATA-G-TCATA----AGACA---TCTATAT--T-GGA--T-TGA-GA-GTTTTG-------CCTA-TT-CA-GC-GATT-A-TTTTCAC--A--ATT-TCA-A------TTAATTTCAAGTTTT--------TTGCCCCAAAAACCTCAA-AAAACGCC-CC-CAC-----GTAACG-AA-T-T--CAAAGGCAACCTGATTTTTA-ATC----AA--G---------A-CT-AT-T-----AGTTTCAAAAAATT-----ACTTGTTT---GCAAAAATCCTGA-GG-GGGT-CCCCCATTACCTTTAC-TGGCCCATGGtg
gi|7 : tgA--ATGTCATATA-GTCT-G--ATTT--ACAA-T-----TAAAG---------------A-G--CT-------tc
gi|7 : attaagaatttgatctcatagaccatgggccagtaatGCTT---------TGAA-AGGTCTAT-AT-GAT----TT--ATATA---G----AAT-CT---------GAAC-T-TT--TTTATTTTTT--GGTGA--TCTTT-TTAAAAGTAAA-AT-C-ATG-TT-GTAGCCCG-AAATCTCGTAATTGTTCACACA-TAT-----CATAGTATAA-------------A---------TTTATGTCAAA---TAAATT---AA-TAT-ATGATTAAAGGCTTGCATATATTCACAAAATACTTGTTTCCAAAT-GTCA--G-TGAC---ATC-------TGT-ATCGG-A--T-G-TAAA--ATGTTTT----TCTACTTTTTGGCGA-T--TATT-TT----CACAATTAAATTT-CAAATTC--TTACCCCA-AAAC-CC----AGAAAGG-TCTCCATGCAAA------CAAT-ATAA----T---------------------TTAT----AA--TCAAAGG-GTTGA-AT-AGTTT-C--AGA-AAATATT--TTTTT--CATttgaaaggtctatatgatttatatagaatctgaacttttttattttttggtgatctttttaaaagtaaaatcatgttgtagcccgaaatctcgtaattgttcacacatatcatagtataaatttatgtcaaataaattaatatatgattaaaggcttgcatatattcacaaaatacttgtttccaaatgtcagtgacatctgtatcggatgtaaaatgtttttctactttttggcgattattttcacaattaaatttcaaattcttaccccaaaacccagaaaggtctccatgcaaacaatataatttataatcaaagggttgaatagtttcagaaaatatttttttcattttccatttttcgatgatttctaaagaaaataaaatcatgttttagccccaaaactcgaaaatgtcccaaaatacttatgtcaaacaacttgatatataatttaattgttacatacgttcacaaaatacttgtttacaaaagtcaatgacatctatatcggatctgaggagttttcccaattttcggtgactatttccaccaatttcatgtttttg
gi|7 : attaagaatttgatctcatagaccatgggccagtaataatgtcatatagtctgatttacaattaaagaTAT----GA--TTAAAGG-CTTGC-AT-ATATT-CACA---AAATACTTGTTTC---CAAATGTC-AG--T-GACA--TCTGTATCG-GATGT-AAAATGTT-TT------T---CTA--CTTTTTGGCGATT-AT-TTTCAC-----AATT--AA--ATTTCAAATTCTTACCCC-----AAAA------------CC---CAGAAAGGTCTCCA----------TG---CAAAC-AATATAATTTA--TAATC-AAA--GG------------------------GTT----G---------------AATA---------GTTT-CAGAA---------AAT---ATTTTTT-TCA---------------T-TT-TCC-ATTTTTCGATGATT--TCT--AAAGAAAATAAAATCATG-TTTTA--GCCCC--AA------AACTCGAAAATGTC-CC-----AAAATACTTATGT-CAAACAACT-TGA---T--AT-ATAAT-TTAATTGTTACATACGT-TC---ACAAAATACTTGTT-TAC-AAAAGTCAATGACATCTATAT------CGGATCTGAGGAG-TTTTCCCAATTTTCGGTGAC--TATTT-CCACCAATTTCAT---G--TTTTTtttccatttttcgatgatttctaaagaaaataaaatcatgttttagccccaaaactcgaaaatgtcccaaaatacttatgtcaaacaacttgatatataatttaattgttacatacgttcacaaaatacttgtttacaaaagtcaatgacatctatatcggatctgaggagttttcccaattttcggtgactatttccaccaatttcatgtttttg
gi|7 : attaagaatttgatctcatagaccatgggccagtaataatgtcatatagtctgatttacaattaaagagctttgaaaggtctatatgatttatatagaatctgaacttttttattttttggtgatctttttaaaagtaaaatcatgttgtagcccgaaatctcgtaattgttcacacatatcatagtataaatttatgtcaaataaattaata-TT------T---CCA--TTTTT---CGATG-AT-TTCTAA-----AGAA--AATAAAATCATGTTTTAGCCCC-----AAAAC-----------TC-G--AAAATG-TCCCAA-AA-TA-CT-TATGTCAAAC-AACTTGATATA--TAATTTAAT--TGT---TA-C----------ATAC--GTTCACAA---------------AATAC------TTGTTTACAAAA------GTCAATGACATCTATA-TCGG---ATCTGAGGAG-T-TT-TCCCAATTTTCGGTGACTATTTC--CACCAATTT-----CATG-TTTTTg
gi|8 : attaagaatttgatctcatagaccatgggccagtaataatgtcatatagtctgatttacaattaaagagctttgaaaggtctatatgatttatatagaatctgaacttttttattttttggtgatctttttaaaagtaaaatcatgttgtagcccgaaatctcgtaattgttcacacatatcatagtataaatttatgtcaaataaattaatatatgattaaaggcttgcatatattcacaaaatacttgtttccaaatgtcagtgacatctgtatcggatgtaaaatgtttttctactttttggcgattattttcacaattaaatttcaaattcttaccccaaaacccagaaaggtctccatgcaaacaatataatttataatcaaagggttgaatagtttcagaaaatatttttttcatATATTCACAAAATACT-GTTTGCAAATCG--GTCA-TGACA--A-C-------TAC-ATCGG-ATCT-ACGAAA--A----------------TGTCGGCGG-A--TATT-TTGCAGTTCA-----ATT---AAGATTGGTG-CCCCA-AAA--TC---AAAACAG--TATCCATGC-AA------CAAT-ATGA---TT---------------------T-AT----AA--TCAAAGGAGTTAA-AT-ACTTT-CAGA---AAGTATTTGTTTTTT-CAAAAGTTGAA--T-ATTGGTTCTT-GTGAAGAGTC-TGGAAGAG-TT------T------------T---CCATT-AT-TTCAAA-----AAAA--AA--AAT-CACGATTTAGTCCA-----AAAAC-----------TC-G--AAAATG-TTCC------------------AAAC-AACTTGATATA--TATTTAA----TGT---TAGC----------ATAC--GTTCACAA---------------AATA-------TTCTTTGCAAAAATAAAAGTCAATGACATCTTTATTCGGCATGTCTGAGGAG-T-TT-T-----TTCTCAATGATTATTTTCACACCAA-TG----TCATG--TTTTTTGCCCCA-AA---CT------TGGAACG---CCCA--GGTA-GA---ATGTCAAAACAGGC-TGACTTT--ATAA--ATGCAGTGGACTATTGACTG-TCGAAAAAGTATACTT-TT-T--CAAGAGCCg
gi|9 : ATGTTAAA-AA--C------TTGATAATC-----ATAGGAATGGTTAC-A-TATTTCAC--AA-A--ATACTTGTTTGCAA-A-GTTCA-A----TGACA---TTTATAT--CCGGA--TACGAAAACGTCGA--------TCAATCT-CG-ttcaggagtctccctt
gi|9 : GGATCTGAAGAG-GTAT-CCAATTTCGAGTG-T--TATTT-TCACAGATTTTAT---G--TTGTTTTCCC--AAAACCCAAAAAACG--CTC-CC-------AC-----GTTAGGAATGTCAACAAA--CCT-G-ATT-ATAATC-----A-AGG---GACTATTG-TACTTT-C--AATAT-ATACTTGTTTGCAATA-G-CCA-A----TGA-A---TCTATAT---CGGA--TCTGATGA-GTTTTT-------CCAATTTTCA-GCCGATT-ATTATTCACCAA--ATT-TCCAG------TT---------TTTT--------T-GCCCC-AAAACTC----AAAACGCC-CCACAC-----GTAG-GGAA-TGT--CAA---CAACCTGATCTTTA-ATC----AAG-G---------GACTACTGT-----AGTTTC--AAAAAT-----ACTTG-TT---GCAAAAAT--CTAGGG-GGGTCCCCCCATTACCTTTAC-TGGCtaagtccaaattagggatctgaagaggtatccaatttcgagtgttattttcacagattttatgttgttttcccaaaacccaaaaaacgctcccacgttaggaatgtcaacaaacctgattataatcaagggactattgtactttcaatatatacttgtttgcaatagccaatgaatctatatcggatctgatgagtttttccaattttcagccgattattattcaccaaatttccagtttttttgccccaaaactcaaaacgccccacacgtagggaatgtcaacaacctgatctttaatcaagggactactgtagtttcaaaaatacttgttgcaaaaatctaggggggtccccccattacctttactggcatagtctagggattcaatt
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|27 ): AANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACAGGTATT
Unaligned ( gi|33 ): GTGAAGAGTCTGAAAGAGTTTTCCATTATTCAAAAAAAAAAATCA
Alignments
lowQualScore : 11 2222 111 1 1 1 111 1 11 11 111 1 1 2222 1 22 1 1 3333333333 1 33333 111 1111 3333333 11111111111 22 11111 3333333 11111 77777777777777777777777777 333333333333333 11111111 111111 6666666666666666666 1111 11 1111 11111 33333333333 11111 22 11 222 3333333 2222222 11111 333333333333333333333333333 1111 11111 11 222222222 1111 111111111 3333333333333 222222222222222 111 222222 66666666666666666666666666666666666666666 1111 44444 3 1111111 1111 1111 11 111 1111 333333 66666666666666666666666666 11 22222222 1111 3333333333333 1111111111 11 11111 22222222222222222222 11 22222222222222 11111 11111 111111 111111 111111 111 11 1 11 33333333333 111 1 1 111 222 111111 222 11 1111111 11111 11111 1 1111 111 222 11 2222222 1 22222 77777777777777777777 22222222 1111 11 11 222222222 22222 11 33333333 222222 1 111
lowQualScore : 33 2 1111 777 2 0 1 0 0 999 8 5 1 00 33 777 0 0 4444 0 33 1 0 1 0 7777777777 0 33333 6 7 333 1 3 1 6 4444 6 6 7777777 77 9 5 1 6 22 77777777777 00 5 5 5 5 5 44444 5 5 5 5 7777777 5 66666 6 11111111111111111111111111 333333333333333 5 33333333 888 5 111111 888 5 5 66666 2222222222222222222 66 5 66 0000 0 888 5 4 888 88 0000 66 99999 22222222222 5 5 22222 888 5 5 999 00 8 4 9999 1 777 00 8 4 4 222 1 4 8 4 0000000 55 4444444 55 66 4 11111 333333333333333333333333333 0000 22222 5 11 1 000000000 7777 666666666 666 5555555555555 555555555555555 666 000 3 3 111111 55 3 9999 7 4 3 44 55 1 3 66 5 777 22222222222222222222222222222222222222222 5555 777 3 4 3 5 3 33333 3 5555555 3 88 1111 55 6666 0 4 66 11 111 8888 4 4 4 66 6666 1 4 4 000000 55 00000000000000000000000000 7 9999 66 4 444 4 1 4 33 6 4 1 33333333 66 4 66 8 66 4 1 1111 0000000000000 66 1 4 4 1 1111111111 66 22 0 22 11111 88888888888888888888 444 4 55 2 00 0 4 33333333333333 1 33333 4 11111 444444 4 4 4 9999 222222 222222 66 5 000 6 6 44 1 99 5 5 5 55 44444444444 1 6 6 000 3 2 6 6 1 0 6 6 6 111 6 5 000 7 999999 5 3 9 0 66 4 3 1 000 3 88 4 55 4 4 4444444 11111 4 0 4 3 11111 4 4 2 6 6 8 7777 444 111 11 5 0 6666666 88 8 8 8 88 0 55555 8 66666666666666666666 99999999 8 8 0000 8 8 999 8 5 11 0 11 999999999 1 00000 11 8 0 00000000 0 333333 0 444 0 6 6 8 0 0 8
lowQualScore : .. . .... ... . . . . . ... . . . .. .. ... . . .... . .. . . . . .......... . ..... . . ... . . . . .... . . ....... .. . . . . .. ........... .. . . . . . ..... . . . . ....... . ..... . .......................... ............... . ........ ... . ...... ... . . ..... ................... .. . .. .... . ... . . ... .. .... .. ..... ........... . . ..... ... . . ... .. . . .... . ... .. . . . ... . . . . ....... .. ....... .. .. . ..... ........................... .... ..... . .. . ......... .... ......... ... ............. ............... ... ... . . ...... .. . .... . . . .. .. . . .. . ... ......................................... .... ... . . . . . ..... . ....... . .. .... .. .... . . .. .. ... .... . . . .. .... . . . ...... .. .......................... . .... .. . ... . . . .. . . . ........ .. . .. . .. . . .... ............. .. . . . . .......... .. .. . .. ..... .................... ... . .. . .. . . .............. . ..... . ..... ...... . . . .... ...... ...... .. . ... . . .. . .. . . . .. ........... . . . ... . . . . . . . . . ... . . ... . ...... . . . . .. . . . ... . .. . .. . . ....... ..... . . . . ..... . . . . . . .... ... ... .. . . ....... .. . . . .. . ..... . .................... ........ . . .... . . ... . . .. . .. ......... . ..... .. . . ........ . ...... . ... . . . . . . .
lowQualScore : 88 5 2222 555 5 0 0 0 0 666 0 0 0 22 88 000 0 0 8888 0 88 0 0 2 0 2222222222 0 33333 7 3 777 0 3 0 7 2222 7 7 5555555 00 3 7 0 7 00 77777777777 77 7 7 7 7 7 33333 7 7 7 7 6666666 7 77777 7 22222222222222222222222222 666666666666666 7 55555555 888 0 666666 888 0 0 88888 7777777777777777777 99 0 99 6666 2 888 9 2 222 88 6666 99 44444 44444444444 0 0 55555 888 0 0 000 00 9 4 9999 1 888 66 9 4 4 888 9 4 9 4 0000000 55 2222222 55 11 4 11111 999999999999999999999999999 6666 55555 0 99 3 000000000 2222 000000000 444 5555555555555 888888888888888 444 000 6 6 666666 00 6 1111 3 5 6 66 00 7 6 22 0 111 99999999999999999999999999999999999999999 3333 000 8 0 6 8 3 55555 8 5555555 6 66 2222 00 5555 1 4 11 88 000 5555 0 0 0 33 2222 8 4 4 666666 44 11111111111111111111111111 3 4444 11 4 888 4 9 4 99 7 4 0 77777777 11 4 11 9 11 4 9 8888 1111111111111 11 9 4 4 0 6666666666 11 66 8 00 11111 77777777777777777777 999 4 22 0 22 7 0 55555555555555 8 66666 4 11111 000000 4 4 4 4444 888888 888888 11 0 000 7 7 33 0 22 5 2 7 88 88888888888 0 7 7 222 7 3 7 7 3 7 7 7 7 777 7 7 000 5 222222 0 2 6 4 11 4 9 8 000 6 33 4 00 4 4 4444444 11111 4 1 4 9 11111 4 4 1 7 0 0 0000 000 666 00 0 8 0000000 88 0 0 0 88 6 88888 0 88888888888888888888 00000000 0 0 6666 0 0 222 0 0 00 8 00 888888888 0 00000 22 0 8 00000000 8 888888 6 000 8 7 7 0 8 8 0
consensus : ATTTTGTTTGGATATACTGAAAAAA--GCGTT----CAACTAAACC---AACCGTACC-TCTNG-GG-CAGGATGGTTATCTACAACCGCACCTG-ATGGAAGAAGTANTTTGCTCGAC-TG--TTG--ATTATA-TGGTTCC-AATCACCTGCCCTATTAC-AA-G-AAATT-GNCACTG-TTCAGCAAGTTATTC-AGCT-A--------TCAC-AAGAAG-----CTGTCAAAATGTAACTATCCTTGCATGTGATATTTTGCAGTNGCTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATTTGGCAAAATNCAG-AGAAATAC----AGC-GA-TGT------TCAT-TTAGGAGTTTTCGATTCACTATCCTCTG-CACTGGAAACAATT-GGGGAA---A---T---AATGG-AGCGCGAG-T-GGACT-TTC-AC-AC-----GT-GA-T-TATTGA-GTCTGGA-AATATA-TAT-----GT-ACGAT-AT--A-TCG-----GATA------AATGTT---ATTA--------AACTCCA-AACTTCATNAA--TGT---AC-CTA--G---CCTT---GATA-TCAAA-CAACTTGATATACATAAG-C-T---A-----GGTT--TAGTT-CTTT--AAAGC----AAAATGCATGCTTG---CAAAATGCC--CATA-TA----TGA--CTGT-----TGGAA----T------TT-TTCT-CTA-----T---TTCAA-C-AGT-A-CTGTTATAATGAC-AA-TTT--CATACATGTATTT---TGC--CC-CAA-AAC-TCGAAAG-ACG-T-C-CC-------AAATATCA--ATGTCAGACAAGTCTTG--ATTT--ACAA-T-----TAAAG---------------G-GTT-------GCAT----AC-----TA-A--TGATACTTTAAGAA---------AAT----AATTGTTT---------TCAAA---GGTCCATAT-GAT-ATTTATATAG----GATTC-T-GAA---GAGG---T-TCT-CCATTTTT-CAGTTGAT--TT-TT--A-AA-GTAAAA-AT-CATG--TCGTAGCCTC-AAANCTCATAAACG-T-T-CATACA--T------------A------------T------------TTATGTCAAA---ACAA---CTAAATAT-ATAATCAAGGGGTTACATATATTCACAAAAGACTTGTTTGCAAAT-G--A--ATGAC-ATCTA-------TATCGG-ATCT--GAAA--AAGTTTT--TC----AATTTTCGGCG-AT--TATTATTTTCA---CAA----ATTT-CAAG-TTTTTGCCCCA-AAAC-TC---GAAAAAGG-TCTCCGTGC-AAA-----CAATN-TTA---TT---------------------TTAT----AA--TCAAAGG-GTTACA-T-ACTTT-CAGAGAAA-ACANTT-----G-TTTTT--CATCAGTC-AA--T-ATTA--TC-TATGGAGAGNT-TGAAGGAG-TT------T---CCA--TTTTTCGATT-AT-TTNTAA-----A----GAAA--AAATTCCTGTTTTAGCCCC-----AAAA-----------CTCGTCAAAATGTCCCCA-AA-TATCTT-ATGTCAAAC-AACT--------------TGATATA--TA-AT-T-----GAAT--G---GTTA-CA-TAC-GTT----CACAAAA------TACTTGTTTGC------AAAAGTCAATGACA--TTTATAT-CGG---ATCTGAGGAGT-TT-T-CCAATTTTCGGTGATTATTTT--CACCAATTTTCATG-TTTTTTTGCCCC--AA---CT-AA---AAAAACGCC-CCCACGT--AGGAATGTCCAAACAACC-TGA-TTTATAATCG-AG-GGACTATGTACTT-TC---AAATTATACTTGTT-TGCCAAAAGTCAATGACATCTATAT------CGGATCTGAGGAG-TTTTTCCAATTTTCGGCGAT--TATTT-TCACCAATTTCATG---TTTTTTGCCCCAAAAACTCAAAAA-CG--C-C-CC-------AC-----GT-AGGAATGTCAAACAA-CCTGATTTATAATC-----AAGGGACTA-TG-TACTTTCAAANTATACTTGTTTGC-AATAGTCA-A----TGACA---TCTATAT--TCGGA--TCTGAGGAGTTTTT-------CCAA-TTT-CG-G-CGATT-ATTTTTCAC--A--ATT-TC----GTGT--T---------TTTT--------TTGCC-CC-AAAACTTC-AAAAACGCC-CC-CACGTA-G-GAA-TGT--CAAA--CAACCTGA--------TTTTTAA-----TCAA-GGG-CTAATGT-----AGTTTCAAAAAAAT-----ACTTGTTT---GCAAAAATCCCTAGGG-GGGT-CCCCCATTACCTTTAC-TGGCCCATGG
Reference ( family-3276 ) : ATTTTGTTTGGATATACTGAAAAAA--GCGTT----CAACTAAACC---AACCGTACC-TCTNG-GG-CAGGATGGTTATCTACAACCGCACCTG-ATGGAAGAAGTANTTTGCTCGAC-TG--TTG--ATTATA-TGGTTCC-AATCACCTGCCCTATTAC-A--G-AAAT--GNCACTG-TTCAGCAAGTTATTC-AGCT-A--------TCAC-AAGAAG-----CTGTCAAAATGTAACTATCCTTGCATGTGATATTTTGCAGTNGCTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATTTGGCAAAATACNG-AGAAATAC----AGC-GA-TGT------TCAT-TTAGGAGTTTTCGATTCACTATCCTCTG-CACTGGAAACAATT-GGGGAA---A---T---AATGG-AGCGCGAG-T-GGACT-TTC-AC-AC-----GT-GA-T-TATTGA-GTCTGGA-AATATA-TAT-----GT-ACGAT-AT--A-TCG-----GATA------AATGTT---ATTA--------AACTCCA-AACTTCATNAA--TGT---AC-CTA--G---CCTT---GATA-TCAAA-CAACTTGATATACATAAG-C-T---A-----GGTT--TAGTT-CTTT--AAAGC----AAAATGCATGCTTG---CAAANTGCC--CAT--TA----TGA--CTGT-----TGGAA----T------TT-TTCT-CTA-----T---TTCAA-C-AGT-A-CTGTTNTAATGAC-AA-TTT--CATACATGTATTT---TGC--CC-CAA-AAC-TCGAAAG-ACG-T-C-CC-------AAATATCA--ATGTCAGACAAGTCTTG--ATTT--ACAA-T-----TAAAG---------------G-GTT-------GCAT----AC-----TA-A--TGATACTTTAAGAA---------AAT----AATTGTTT---------TCAAA---GGT--ATAT-GAT-ATTTATATAG----GATTC-T-GGA---GAGG---T-TCT-CCATTTTTTCAGTTGAT--TT-TT--A-AA-GTNAAA-AN-CATG--TTGTAGCCTC-AAANCTCATAAACA-T-T-CATACA--T------------A------------T------------TTATGTCAAA---ACAA---CTAAATAT-ATAATCAAGGGGTTACATATATTCACAAAAGACTTGTTTGCAAAT-G--A--ATGACGATCTA-------TATCGG-ATCT--GAAA--AAGTTTT--TC----AATTTTCGGCG-AT--TATTATTTTCA---CAA----ATTT-CAAG-TTTTTGCCCCA-AAAC-TC---GAAAAAGG-TCTCCGTGC-AA------CAATN-TTA---TT---------------------TTAT----AA--TCAAAGG-GTTACA-T-ACTTT-CAGAGAAA-ACANTT-----G-TTTTT--CATCAGTC-AA--T-ATTA--TC-TATGGAGAGNT-TGAAGGAG-TT------T---CCA--TTTTTCGATT-AT-TTNTAA-----A----GAAA--AAATTCCTGTTTTAGCCCC-----AAAA-----------CTCGTCAAAATGTCCCCA-AA-TATCTT-ATGTCAAAC-AACT--------------TGATATA--TA-AT-T-----GAAT--G---GTTA-CA-TAC-GTT----CACAAAA------TACTTGTTTGC------AAAAGTCAATGACA--TTTATAT-CGG---ATCTGAGGAGT-TT-T-CCAATTTTCGGTGATTATTTT--CACCAATTTTCATG-TTTTTTTGCCCC--AA---CT-AA---AAAAACGCC-CCCACGN--AGGAATGTTCAAACAACC-TGA-TTTATAATCG-AG-GGACTATGTACTT-TC---AAATTATACTTGTT-TGCCAAAAGTCAATGACATCTATAT------CGGATCTGAGGAG-TTTTTCCAATTTTCGGCGAT--TATTT-TCACCAATTTCATG---TTTTTTGCCCCAAAAACTCAAAAA-CG--C-C-CC-------AC-----GT-AGGAATGTCAAACAA-CCTGATTTATAATC-----AAGGGACTA-TG-TACTTTCAAATTATACTTGTTTGC-AA-AGTCA-A----TGACA---TCTATAT--TCGGA--TCTGAGGAGTTTTT-------CCAA-TTT-CG-G-CGATT-ATTTTTCAC--A--ATT-TC----GTGT--T---------TTTT--------TTGCC-CC-AAAACTTC-AAAAACGCC-CC-CACGTA-G-GAA-TGT--CAAA--CAACCTGA--------TTTNTAA-----TCAA-GGG-CTAATGT-----AGTTTCAAAAAAAT-----ACTTGTTT---GCAAAAATCCCTAGGG-GGGT-CCCCCATTACCTTTAC-TGGCCCATGG
gi|1 : ATTTTGTTTGGATATACTGAAAAAA--GCGTT----CAACTAAACCTTGAA--GTACT-TCTAG-AG-CAGGATGGTTATTTACAA---CACCTG-ATGGAAGAAGTTATTTGCTCGAC-TGATTTG----TATATTGGTTCC-AATCACCTGCCCTATTAC-AAGG-AAATTGGCCACTATTTCAACAAGTTATTCAAGCTCA--------TCACAAAGAAG-----CTGTCAAAATGCAACTATCC-TGCATGTGAT-TTTAGCAGTTGCTA
gi|1 : AACTTAGCCAAA-ATCG-A---ATAC----CGT-GAATGT------TCATATTAGCAGTTTTCATTTCACTATCCTCTTTCACTGGAAACAGTT-AGGGAA---A---T---AAT---AGTGCGAGAT-GGACT-TTC-AC-AC-----GT-GA-T-TATTGACGTCTGGAGAATATA-TATACATGGT-ACGATTAT--A-TCG-----GATA------AATGTT---ATTA--------AACTCCA-AACTTTCTTAAGCTGT---AC--TA--G---CCTA---GATA-TCAAA--AACTTGATATAAATAAGGC-TTTGG-----GGTT--TAATT-CTTT--AAAGC----AAAAT---TGCATG---CAAGTTATT---AT--TA----TAA--CT-T-----TGGAA----T------TT-TTCT-C-A-----T---T-CAA-C-AGT-AACTGTTTTAATGAC-AA-TTC--CATGCATGTATTT---TGT--CC-CAA-AAC-TTGGAAGGACG-T-C-TC-------AAATATCA--ATGTCAGACGAGTCTTG--ATTT--ACAA-T-----TAAAG---------------G-GTT-------GCAT----AC-----TA-AA-TGATATTTTAAGAA---------AAT----AATTGTTT---------TCAAA---GGT---TAT-GAT-ATTTATATAG----GATTC-T-TGA---GAAG---T-TCT-CCATTTTTTCAGTTGAT--TT-TT--A-AA-GTTAAA-AA-GATG--CTGGAAGCTC-AAACGTCATAAACA-T-T-CATATA---------------A------------T------------TTATTTCAAA---ACAA---CTAAA-AT-ATAATCAAAAGGTTACATATATTTACATAAGA--TGTTTGCAAAT-G--A--ATAATAATCTA-------TATCTG-ATCT--GGAA--AAGTTTT--TC----AATGTTCGGCG-AT--TATT-TTTTCA---CAA----ATTT-CAAG-TTTTT-CCCCA-AAAT-TC---GAAAAAGG-TTCTTGGGT-AA------CAGTTCTTA---TT---------------------TTAT----AA--TCAAAGG-GTTACA-T-ACTTT-CAGAGAAA-ACAGTT-----A-TTTTT--CATCAGTC-AA--T-ATCA--TC-TATTGAGAGGT-TGAAGGAA-TT------T---CCA--TTTTTCGATT-AT-TTATAA-----A----GAAA--AAATTCCTGTTTTAGCCCC-----AAAA------------TCGTCCCAATGTCCCCA-AA-TATCTT-A-GTCAAAC-AACT--------------TGATATACTTA-AT-T-----GAAT--G---GTTA-CA-CACTGTT----CACAAAA------TACTTGTTTGC------AAAAGTCAATGACA--TTTACAT-CGG---ATCTGAGGAGTATT-T-TCAATTTTCTGTGATTATTTT--CACCAATTTTTATG-TTTTTTTGCCCC--AA---CT-AA---AAAAACGCC-CCCACCCTAAAGAATGTTCAAACAACCGTGA-T--ATAATTA-AG-GGACTATGTGCTC-TC---AAATTATACTTGTTCTGCCAAAAGTCAATGACATCTATAT------CGGATCTGAAAAG-TTTTTCCGATTTTCGGCGAT--TATTT-TCACAAATTTCATG---TTTTTTGCCTCAAAAACTCAAAAA-CA--C-C-CC-------AC-----GT-AGGTATGTCAAACAT-CC-GATTTATAATC-----AAGGGACTA-TGTTACTTTCAAATTATACTTGTTTGC-AA-AGTCA-A----TGACA---TCTATAT--TCGGA--TCTGGGGAG-TTTT-------CCAA-TTT-CG-G-CGATTAATTTTTCAC--A--ATT-TC----GTGT--T---------TTTT--------TTGCCTTC-AAAACTTC-AAAAACGAC-CC-CACGTA-G-GAA-TTTTACAAA--CAACCTGA--------TTTTTAA-----TCAA-GGG-CTAATGT-----AGTTTCAAAAAAAT-----ACTTGTTT---GCAAAAATCCCTAGAGCGGGT--CCCCATTACCTTTAC-AGGCCCACGGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacttagccaaaatcgaataccgtgaatgttcatattagcagttttcatttcactatcctctttcactggaaacagttagggaaataatagtgcgagatggactttcacacgtgattattgacgtctggagaatatatatacatggtacgattatatcggataaatgttattaaactccaaactttcttaagctgtactagcctagatatcaaaaacttgatataaataaggctttggggtttaattctttaaagcaaaattgcatgcaagttattattataactttggaatttttctcattcaacagtaactgttttaatgacaattccatgcatgtattttgtcccaaaacttggaaggacgtctcaaatatcaatgtcagacgagtcttgatttacaattaaagggttgcatactaaatgatattttaagaaaataattgttttcaaaggttatgatatttatataggattcttgagaagttctccattttttcagttgatttttaaagttaaaaagatgctggaagctcaaacgtcataaacattcatataatttatttcaaaacaactaaaatataatcaaaaggttacatatatttacataagatgtttgcaaatgaataataatctatatctgatctggaaaagtttttcaatgttcggcgattattttttcacaaatttcaagtttttccccaaaattcgaaaaaggttcttgggtaacagttcttattttataatcaaagggttacatactttcagagaaaacagttatttttcatcagtcaatatcatctattgagaggttgaaggaatttccatttttcgattatttataaagaaaaaattcctgttttagccccaaaatcgtcccaatgtccccaaatatcttagtcaaacaacttgatatacttaattgaatggttacacactgttcacaaaatacttgtttgcaaaagtcaatgacatttacatcggatctgaggagtattttcaattttctgtgattattttcaccaatttttatgtttttttgccccaactaaaaaaacgcccccaccctaaagaatgttcaaacaaccgtgatataattaagggactatgtgctctcaaattatacttgttctgccaaaagtcaatgacatctatatcggatctgaaaagtttttccgattttcggcgattattttcacaaatttcatgttttttgcctcaaaaactcaaaaacaccccacgtaggtatgtcaaacatccgatttataatcaagggactatgttactttcaaattatacttgtttgcaaagtcaatgacatctatattcggatctggggagttttccaatttcggcgattaatttttcacaatttcgtgttttttttgccttcaaaacttcaaaaacgaccccacgtaggaattttacaaacaacctgatttttaatcaagggctaatgtagtttcaaaaaaatacttgtttgcaaaaatccctagagcgggtccccattacctttacaggcccacggc
gi|10 : attttgtttggatatactgaaaaaagcgttcaactaaaccttgaagtacttctagagcaggatggttatttacaacacctgatggaagaagttatttgctcgactgatttgtatattggttccaatcacctgccctattacaaggaaattggccactatttcaacaagttattcaagctcatcacaaagaagctgtcaaaatgcaactatcctgcatgtgattttagcagttgctannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntG-TTTTTTTGCCCC--AAAA-CT-AA---AAACACGCC-CC-ATGA--AGGAATGT-CAAACAATC-TGA-TT-ATAATTG-TG-TGACTATGTACTT-TC---AAATTATACTT-TT-TGG-AAAAGTCAA--ACATTTATAT------CGGATCTGAGGAG-TTTT-CCAATTTC--GTGAT--TATTT-TCACCAATT-CATG---TTTTT-GCCCCAAAA-CTCAAAA--CG--C-C-CC-------AC-----GC-AG-AATGTCAAACAA-CCAGATTTATAATC-----AAGG-ACAA-TG-TACTTTCAAATTATACTTGTTTGCAAA-AGTCA-A----TGACA---TTTATA---TCGGA--TCTGAGGAGTTTTT-------CCAA-TTT-CG-G-TGATT-A-TTTTCAC--CT-ATT-TC-----TG-------------TTTT--------TTGCC-CC-AAAAC-TC-AAAAAC-CC-CC-CACGTA-G-GAA-TGT--CAAA--CAACCTGA---------TTATAT-----TCAG-GGA-CTAG--------ACTTTCAAAAAAA--------CTG-TT---GC--AAATCCCCGGGG-c
gi|11 : caattcggatgagtattatcactaagatgttatagcgatcgtctcgttaTA--------AGCTCCA-AACTT-ATTAAC-TGT---AC-CTATAA---CCTT---TATA-TCAAA-CAACTTGATATACACAAG-CAT---ACATGGGGTT--TAGTT-CTTT--AAAGC----AAAATGCATGCTTG---CAAAATGTC--CATATCA----TGA--CTGT-----TGGAA----A------TT-TTCT-CTA-----T---TTCAA-C-AGT-A-CTG-TATAATGAC-AATTTT--CATACATGTATTT---TGT--CC-CAA-AAC-TCGAAA--ATG-TCC-CC-------AAATATCA--ATGTCAAAC-AGTCTt
gi|11 : taAT--TT-TT--A-A--GTACAA-AT-CATG--TTGTAGCCTC-AAA---CATACATA-T----ATAAAGGT------------A------------T------------TTATGCC-AA---ACAA---CTAGATAT-ATAAgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatttttaagtacaaatcatgttgtagcctcaaacatacatatataaaggtatttatgccaaacaactagatatataa
gi|12 : tataagctccaaacttattaactgtacctataacctttatatcaaacaacttgatatacacaagcatacatggggtttagttctttaaagcaaaatgcatgcttgcaaaatgtccatatcatgactgttggaaattttctctatttcaacagtactgtataatgacaattttcatacatgtattttgtcccaaaactcgaaaatgtccccaaatatcaatgtcaaacagtctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaATTTCTTGTGGACATACTGTAGGAT--GCGTT----CGAGTGAACC---AACCGTACCGCCTTG-GG-CAGGATGGTTATCTTCAACTGCACCAG-AC-GAAGAAGTGCTTTGCTCGAC-TG--TTG--ATTATA-TGGTTCC-AATCAACTGTCCTATCAC-A--GAAAAT--GCCACAG-TTCAGCAAGTCATCC-AGCT-A--------TCAC-AAG
gi|13 : tacaactcatactgctcacggtattgtgaaacaagaagtatatgtgcgtgatgaggataaccaaggccctctagacaaatcttgctagataggaataaatctaggacaagtttcagaaaaatcagaagaactagccccatgtttcgtgaagaccaaaacatcgccagctgtccgaactacttgcatgtcccctttgcataccaacaatgataagagagacatgactcGCGAAATCTAG-AGAAGTAC----AGC-GA-TGTCATTGTTCAC-TGAGGAGTTTCC-ATTCGCTAAGCTATG-CATTGGAAAGAATT-GGGTAA---AGAGT---AATGGGAGTACTAG-T-GGACT-TTC-AC-ATCACATGT-GA-T-TATTGA-GGCTGG----CATA-TAT-----GT-ATGA-------------------A------AATTTT----CTG--------AACTCAA-AACTTTATAAA--TGT---AC-CTA--G---CCTT---GATG-TCAAA-CAAC-------AAAT----------------GGTA--TAGTT-CTTC--AAAGC----AAATTACATGCTTG---CGAA-TGTCTTTAT--TG----TGA--TTGT-----AGGAA----TCGAAAATT-TTCC-ATT-----T---TTTAA-C-AAT-A----TTATATTGACAAA-TTT--CATA----TATTG---CGCG-CA-TAACAAC-TCG-AAG-AGG-TAC-AT-------GTATATTA--ATATCAGAT-AGTC-TG--ACTT--ACGA-T-----TAAAG---------------G-GCT-------GCAT----AC-----TA-A--TGAT
gi|14 : tT--TAGTTTCTTT--AGAAG----GAAATA-ATG--------AAATTA----------A----TGA--CAGTAGGATTGGAT----C------TT-TTTT-CTACTATCT---TTTAA-CCAGT-G-CTGT---AATGACTAA-CTT--TCTACATGTACTT---TACTACT-CAA-A-C-TCGAACA-A---T-C-CC-------AA---------TGCCAGACAG---TTGGAATTT--ACAA-T--------AG---------------GCGTA-------GTATCGCCAA-----TA-AAATGATCCTTTAAGGA---------AATGCTAAATTGTTT---------CCAAGGTTGGT--A-ATCGAC-TTTAACATA-----AATTC-TCTGA---GAGGA--T-TTT-CCACTTGT--AG-TGAT--CTGTT--T-AA-GTTAAAGAC-CATGTCTCGTAGCCTC-AAAg
gi|15 : TATCTGC-AA-ATTAG-AGGGTTGACAAATTCTATATACTCGGAAATCTGAG-AGTCTTTTATCTCCCCAA-TTTTCGCG-TGAT--ATTTTGCAC--ACCATTATTATGGGTGTACC---------TTTTGGTAGGGGTTGCA-TC-AAAA--TC-GAAAACGTAACC-CACGTA-G-AAAATGC--CAAA--CAACCTGAATTAAATATTTGAAAAGGTTTCAGTAGG-ATAAAATCAATAAACTACAAAAAAACCCACAATTTGTTTTGAG-AAAAATCCCCATGG-GGGT-CGCCCATTACCTTTACTTGGCCCATG
gi|16 : atatagttacaaTTCCA---CAA----ATTT-CAAG-TTTTTGCCCCA-AAAT-TC---AAAAAA---TATCCATGC-AAA-----CAATA-TGA---TT---------------------T-AT----AA--TCAAAGG-GTTCAA-T-AGTTT-CAGAGACCCACATTT-----G-TTTT---CAAAAGGC-AA--T-ATTA--TC-TGTGAAGAGTC-TGAAGGAG-TT------TT--CCA--TTTGTCGATG-AT-TTTTAA-----A----GAAACAAAA-----G----AGCCCA-----AAAG-----------CTCG--AAAATGTCCTAA-AA-TA-CTT-ATGTCAAAC-AACT--------------TGATATA--Ttc
gi|17 : aaA---GGTTCATAT---T-ATTTATATAG----AATTC---GAA---GAGG---T-TCT-CCATTTTT--AGGTGAT--TT-TT--TTAA-GT-AAA-AT-CATG--T---AGCCTC-AAAACTCGTAAATG-T-T-CCCACA--TCCTAAAGTATAAA------------T------------TTATGTCAAA----CAA---CTTAGTAT-ATGATCAAGGGGTTGCATGTATTCACAAAATACTTGTTTGCAAAT-GTCA--ATGAC-ATCTA-------CATCGG-ATCT---AAA--ACGTTTT--CC----AATTTTCAGC
gi|18 : T-TGC-AAAACTTTATAATATCTATATGTATTTCGGATCTGAAGAG-TTTTTCCAAAGTTTGGCGTT--TATTT-TCACCAGTTGCATGGGGTTTTTTGCCCC-CAAACTCGACAA-CA--C-CACC-------AC-----CA-AGGAATGTCAAACAA-CCTTATTTAGAATC-----TAGGGACAA-TG-TAGTTTCAAAATAT
gi|19 : GAG-TTTCT----TTTTCCGCTAGCATATTTCTCAC-AG---CATG---CTTTTTGTTC--AAAACTGGTATT-CA--C-C-CCCTGGCCCAC-----AT-AGAAATTTGAAACAA-CCACATTTTTAATC-----AAACGACTG-TG-CACTTTCCAAAAGTACTTGTTTAC-A
gi|2 : TTTTGATTGGATATCCTGAAAAAA--A-GTT----CAACTAAACC---AACCATACT-TCTTGAGG-CAGGATGGTTATCTACAACCACACCTA-ATGGAGGAA-CACTTTGTTGGAT-TG--TTG--ATTATA-TGGTTCC-AATCACCTGCCCTATTGC-AA-G-AAAT--GACACTA-TTCAGCATGCTATTC-AGCT-AGATTAATATCAC-AAGAAG-----CTGTCAAAATGTAACTATCCTTGCATGTG--ATTTTGCAGTGGCTA
gi|2 : TTTGGCAAAATCCAG-AGAAGCAC----AGC-AA-TGTATTGT-TCAT-TTAGGAGTTTTCCATTCACTATCCTCTG-AACTGGAAACCACT-GGGGAA---AA--T---AGTG--AGCGTGAG-T-GGACT-TTT-AC-AC-----AT-GA-T-TATTGA-GTCTGGA-A---TA-TAT-----GT-ACGAT-AT--G-TCA-----GA-A------AATGTT---AT-A--------AACTTCA-AACTTTATAAA--TGT---AC-CTA--A---CCTT---GATA-TCAAG-CAACGTAATATACATAAG-C------------GTT--TAGTT-CTTT--AA-GC----AA--TGCATGCTTG---CAAAATGCC--CAT--TA----TG-------------------------------TTTT-CTA-----T---TTCAA-C-AAT----CGT-ATAATGAC-AA-TTT--TATACATGTATTT---TGT--CC--AA-AAC-TCGAA-G-ACG-T-CTCC-------AAATATCA--ATGTCAGACA-GTCT-G--ATTT---CAA-TAAGGATAAAACTGTTCGTTTCCTTTG-ATTTT-----ACAT----ACAGAATTA-A--TGATACGTTAAGAA---------AAT----AATTATTT---------TCATT---GGTTCATAT-GAT---TTATATA------------------------------T-TCATTTC--CAATAAAT--TT-GA--A-AA-GTAAAA-AT-CATG--TTGTAACCTA-AAAATTCATAAACA-T-T-CATACA--T------------A------------T------------TTATTTTCAC---ACAA---CTAAATAT-ATAAACAAGGGGTTACACATATTTACAAAAGACTTGTATGCAAAT-A--ATAAGGAC-ATCAA-------TATCGGTATGT--GAAA-----TTTT--CCCCCCAACTTTGAGTG-AT--TATTATTTTTA---CAC----ATTT-CAAG-TTTTTGCCCAA-AAAC-TC---GAAAA-GG-TCTCCATGC-AAA-----CAATC-TTA---TT---------------------T-AT----AA--TCAAAGG---TACA-T-ACATT-CAGA--AA-ACAAT------G-ATTTT--CATCAGTA-AA--T-ATTA--TC-TATTGAGAG-T-TGAAGGAGATT------T---CCA--TTTTTCGATT-AT-TTTTAG-----A----GAAA--AAATCCC-GTTTTAGCCCC-----AAAA-----------CTCGTCGA--TGCCCCCA-AC-TATCT--ATGCCAGAC-A------------------------------T-T-----GGAT--G---GCTA-CA-TAT-GTT----CACAAAA------TATTTGTTTGC------AAAATTCAGTGATA--TCTATAT-CGG---ATCTGAGGAGC-TTGT-CCAATTTTTGGTGATTATTTT--TACCAATTTT-ATG-TTTTTTC-CTCC--AA------AACTCAATAACATC-CC-ACGT--AAGAATGT-CAAACAACC-TGA-TTTATAATTA-GG-GGGCTATGTACTT-GC---AAATTATACCTGTT-TGC-AAAAGTCAATGACATTTATAT------CGGATCTGAGGAATTTTTTCCAATTTTTGGTGAT--TATTT-TCACCAATTTTATG---TTTTT--CCCCAAAAACTCAAAAA-CGC-C-C-CC-------AC-----GT-AGGAATGTTAAACAA-CCTGATTTATAATC-----AGGGGAACA-T--TACCTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttggcaaaatccagagaagcacagcaatgtattgttcatttaggagttttccattcactatcctctgaactggaaaccactggggaaaatagtgagcgtgagtggacttttacacatgattattgagtctggaatatatgtacgatatgtcagaaaatgttataaacttcaaactttataaatgtacctaaccttgatatcaagcaacgtaatatacataagcgtttagttctttaagcaatgcatgcttgcaaaatgcccattatgttttctatttcaacaatcgtataatgacaattttatacatgtattttgtccaaaactcgaagacgtctccaaatatcaatgtcagacagtctgatttcaataaggataaaactgttcgtttcctttgattttacatacagaattaatgatacgttaagaaaataattattttcattggttcatatgatttatatattcatttccaataaatttgaaaagtaaaaatcatgttgtaacctaaaaattcataaacattcatacatatttattttcacacaactaaatatataaacaaggggttacacatatttacaaaagacttgtatgcaaataataaggacatcaatatcggtatgtgaaattttccccccaactttgagtgattattatttttacacatttcaagtttttgcccaaaaactcgaaaaggtctccatgcaaacaatcttatttataatcaaaggtacatacattcagaaaacaatgattttcatcagtaaatattatctattgagagttgaaggagatttccatttttcgattatttttagagaaaaaatcccgttttagccccaaaactcgtcgatgcccccaactatctatgccagacattggatggctacatatgttcacaaaatatttgtttgcaaaattcagtgatatctatatcggatctgaggagcttgtccaatttttggtgattatttttaccaattttatgttttttcctccaaaactcaataacatcccacgtaagaatgtcaaacaacctgatttataattagggggctatgtacttgcaaattatacctgtttgcaaaagtcaatgacatttatatcggatctgaggaattttttccaatttttggtgattattttcaccaattttatgtttttccccaaaaactcaaaaacgcccccacgtaggaatgttaaacaacctgatttataatcaggggaacattaccttt
gi|20 : ttttgattggatatcctgaaaaaaagttcaactaaaccaaccatacttcttgaggcaggatggttatctacaaccacacctaatggaggaacactttgttggattgttgattatatggttccaatcacctgccctattgcaagaaatgacactattcagcatgctattcagctagattaatatcacaagaagctgtcaaaatgtaactatccttgcatgtgattttgcagtggctannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAGACA-GTCT-G--ATTT--ACAA-T-----TAAAG---------------G-GTT-------CCAT----AC-----TA-A--TGGTACGTTAAGAA---------AAT----AATCATTT---------TCAAA---AGTTCATAT-G---ATTTACATAG----GA-TC-T-GAA---GAGG---T-TCT-CCATTTTTt
gi|21 : ATATTCACAAAATACTTGTTTGCAAAT-GCCA--GTGGC-ATCAA-------TATCGG-ACCT--GAAA--GGCTTTT--CC----AATTTTCAGCG-AT--TA----TTTCA---CAA----ATTT-CAAG-TTTTTGCCCCA-AAAca
gi|22 : GAA---------AAT----AATTGTTT---------TCAAA---G-T--CCAT--AT-ATT-ATATAA----A-----C-GGA---AAGAACTT-TCTTCCATTTTTTCAGT-GAT--TT-TT--T-AA-GTAAAA-AATCATG--TTGTAGCCTC-AAACTT
gi|23 : --TATAT-TTACAAATATTATGAG-TATTTCCCCTCAAATATTCATAAA-AT--C-C-CT-------ATATTCTGT-A--AATGTTAAACAA-CCTCGTTTATAATC-----AAGAGACTA-TA-T-CTTTC
gi|24 : cAA---ACAA---CTAAATAT-ATATTCAAGGGGTTTCATATAGTTACAAATGACTTGTTTGCAAAT-GATA--ATGAC-ATTT--------TATCGG-ATCT--GAAA--AGGTTTT--T
gi|25 : tcTTTGTTTGGATGTACTGAAAAAAAAGCGTCGATCCAACTAAACC---AACCGTACC-TCTAA-GGACAGGATGATTATCTACAACAACACCTG-AT-GAAGAAGTAtttccaat
gi|26 : ----AATTGTTT---------TCAAA---GGTCCATAT-GAT---TTAAATAG----GAT-C-T-GAA---AAAG---T-TCT-CTATTTTT-CAGT-GAT--TT-TTTTA-AA-GTAAAA-TG-CATG--TGGTAGCATC-A
gi|28 : GAC-GA-TTT-----ACTTATACCTCCATGC--TCGCAA-AAC-TCGAAA--ACGTT-C-CC-------AATTATCA--ATGTCAGAC-AGTC-TG--ATT
gi|29 : AATTTGGCAAAATACTG-AGAAATAC----AGC-GA-TGT------TCAC-TTAGGAATTTTCCATTCACTATCCTCTG-CA
gi|3 : ACAAAC-CACCTGCATCGAAGAAGTAATTTGCTCGAAATG--TTATAATTATT-CGGTTCCCAATCACCTGCCCTATTACCA--G-AAATT-GGCACTG-TACAGCAGGTTATTC-AGCT-A--------TCAC-AAGAAGGGGTTTTGT-----TGTAACTATCCTTGCTTGTGATATTTTGCAG
gi|3 : caaTTGGCAAAATACAG-AGAAATAC----AGC-GA-TGT------CCAT-TTAGGAGTTTTCGATTCACT-TCC-CTG-CACTGGAAACAGTTCGGGAAA---A---T---AATG--AGCGCGAG-T-GGACT-TTC-AC-AC-----GTTGA-T-TATTGA-GTCTGAA-A---TA-TAT-----GT-ACGAT-AT--ACTCA-----GGTATCAGATAATGTT---AT-A--------AGCTCCA-AACTT-------------------A--G---CCTT---GATA-TCAAA-CAAAT-AATACACATAAG-TATG--A-----GGTTGTTCTTT-CTTT--AAAGC----AAAATGCATGCTTG---CAAAATGTC--CATA-TA----TGA--CTGT-----TGAAA----A------TT-TTCT-CTA-----T---TTCAA-C-AGT-A-CTGT-ATAATGAC-AA-TTTTTCATACATGTATTT---TGT--CC-CAA-AAC-TCGAA-G-ATG-T-C-CCC------AAATATTA--ATGTCAGACA-GTCT-G--ATTT--ACAA-T-----TAAAG---------------G-GTT-------ACAT----AC-----TA-T--TGATAATTTAAGAA---------AAT----AATTGTTT----------CAGA---GGTCAATAT-GAT---TTGAATAA----GAT-C-T-GAA---GAAG---T-TCT-CCATTTTT-CAGT-GTT--TT-TT--T-AA-GTAAAA-AT-CATG--TTGTAGCCTC-AAACCTTATAAACA-TATACATACA--T------------ACAAATACAGGTTT------------TTATGCCAAA----CAA---CTAGATAT-ATAATCAAGGGGTTACATAAATT-ACAAAAGACTTGCTTGCAAAT-A--ATAATGAC-ATCTACCAGGTATATTGG-ATCT--GAAA--A-GTTTT--CC----AATTTTCAGCT-AT--TATTATTTTCA---CAA----ATTT-CTAG-TTTTTGCCCCA-AAAC-TC---G-AAAAGG-TCTCCGGGT-AAACATTGTAACC-TTA--------------------------TTAT----AA--ACAAAGG-GTTAC--T-AATTT-C--AGAAA-ACATTT-----A--TTTT--CATCAGTC-AA--T-ATTA--TC-TATAGAGAGTA-TGAATAAGTTT------T---CCA--TTTTTCGATT-AT-TTATTA-----A----GAAA--AAA-TCCTGTTTTAGTCCA-----AAGA-----------CTCGTC--AATGT---TATAA-TATC-T-ATGTTAAACAAACT--------------TGATATA--TC-AT-T-----GAAT--G---GTTA-CA-TAC-GTT----CAC-AAA------TACTTGTTTGC------AAAAGTCAACGACA--TTTATAT-CGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntataattggcaaaatacagagaaatacagcgatgtccatttaggagttttcgattcacttccctgcactggaaacagttcgggaaaataatgagcgcgagtggactttcacacgttgattattgagtctgaaatatatgtacgatatactcaggtatcagataatgttataagctccaaacttagccttgatatcaaacaaataatacacataagtatgaggttgttctttctttaaagcaaaatgcatgcttgcaaaatgtccatatatgactgttgaaaattttctctatttcaacagtactgtataatgacaatttttcatacatgtattttgtcccaaaactcgaagatgtccccaaatattaatgtcagacagtctgatttacaattaaagggttacatactattgataatttaagaaaataattgtttcagaggtcaatatgatttgaataagatctgaagaagttctccatttttcagtgtttttttaagtaaaaatcatgttgtagcctcaaaccttataaacatatacatacatacaaatacaggtttttatgccaaacaactagatatataatcaaggggttacataaattacaaaagacttgcttgcaaataataatgacatctaccaggtatattggatctgaaaagttttccaattttcagctattattattttcacaaatttctagtttttgccccaaaactcgaaaaggtctccgggtaaacattgtaaccttattataaacaaagggttactaatttcagaaaacatttattttcatcagtcaatattatctatagagagtatgaataagttttccatttttcgattatttattaagaaaaaatcctgttttagtccaaagactcgtcaatgttataatatctatgttaaacaaacttgatatatcattgaatggttacatacgttcacaaatacttgtttgcaaaagtcaacgacatttatatcg
gi|30 : caaacaaaccacctgcatcgaagaagtaatttgctcgaaatgttataattattcggttcccaatcacctgccctattaccagaaattggcactgtacagcaggttattcagctatcacaagaaggggttttgttgtaactatccttgcttgtgatattttgcagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntataa-T-----GAAT--G---GTTA-CA-TAC-GTT----CACAAAATACCGGTACTTGTTTGC------AAAAGTCAAAGACA--TTTATA
gi|31 : ACCAAGGGGTTACATAAATTTACGAAAGACTTGCTTGCAAAT-AATA--ATGAC
gi|32 : AA---A---T---AATG--AGCGCGAG-T-GGACT-TTC-AC-AC-----AT-CA-T-TATTGA-ATCTGG--AATATA-att
gi|34 : CTTCATATA--TGT---AC-CTA--G---CCTT---GATA-TCAAG-CAACTTGATATA
gi|35 : TCCCTAGGG-GG-T-CCCCC-TTACCTT-AC-TGGCCCATGG
gi|4 : TGGCAAAATTCATTAGAAACACTAACAGCTGA-TGT--------AA-TTG-----TTTCGTTTTAGGAGCCTCTG-CA------GCACTT-GT--AA---A---TCGCAATGG-AGCGCGAG-TCGAACTGTTCTACCAT-----GT-GA-T-TATT------CG-----TAGA-TAT-----GT-AAGA-------------------A------AATGTT---AT-A--------AACTCCA-AACTTCATATA--TGT---AC-CTA--G---CCTT---GATA-TCAAA-CAACTTGA-----------------------GGAT--TAGTT-CTTT--AAAGC----AAAATGCATGCTTG---CAAAATGCC--CATAATA----TGA--CTGT-----TGGAAA---T------TT-TTCT-CTA-----T---TTCAA-C-AAT-A-CTGT-------AC-AA-T---------ATGTATTT---TGC--CC-CAA-AAC-TCGAA-G-ACG-T-T-CCCATGC--AAATATCA--ATGCCAGACA-GTCT-G--ATTT--ACAA-T-----TAAAG---------------G-GTT-------ACAC----AC-----TA-A--TGATACGTTAAGAA---------AAT----TATCATTT---------TCAAA---GGT--TTATCGAT---TTATATAA----GAT-A-T-GAA---GAGG---T-TCT-CCATTTTT-CAGT-GAT--TA-TT--A-AAAGTAAAA-AT-CATG--TCGTAGCCTC-CAAACTCATATACA-T-T-CATACA--T------------A------------T------------TTATGTCAAA----CAA---CTAAATAT-ATAATCAAGGGGTTACATA----------AGACTTGTTTGCAAAT-G--ATAATGAC-ATCTA-------CATCGG-ATCT--GAAA--AAGTTTT--TCC---AAATTTCGGCG-AT--TATTATTTTCA---CAA----ATTT---------TTGCCCCA-AAAC-TC----AGATAGA-TTTCTATGC-AAA-----CAATT-TTA---TTTATAATCAAAGGGTCACATATTTATTTAAAA--TCAAAGG-GTCACA-T-ATTTT-CAGA--AA-ACAATT-------CTTTT--CATCCGTC-AA--T-ATTA--TC-TATGGAAAGCT--GAAGGAG-TT------TT--CCA--TTTTTCGATT-AT-TTTTAA-----A----GAAA--AAAT-CCTGTTTTAGACCC-----AAAA-----------TTTGTCAA--TGTCCCCA-AA-TATCT--ATAACTGAC-AACT--------------TGATATA--TA-AT-T-----GAATATG---TTTA-CA-TAC-GTT----CACAAAA------TACTTGTTTGC------AAAAGTCAATGACA--TTTATAT-CGG---ATCTGAGGAGT-TT-TTCCAATTTTCGGTGATTATTGT--CACCGA-TTTCATGTTTTTTTTGCCCCAAAA---CT--A---AAAAACGCC-CCCACGT--AGGAATG-TCAAACAACC-TGA-TTTATAATCG-AG-TGACTATGTACTT-TA---AAATTATACTTGTT-TG-CAAAAGTC--TGACATTTATAT------CGGATCTGAGGGT-TTTTTCCAATTTTCGGTGAT--TATTG-TCACCGATTTCATGTT-TTTTTTGCCCC-AAAACTAAAAAA-CGC-C-C-CC-------AT-----GT-AGGAATGTCAAACAA-CCTGATTTATAATCAATTTAAGGGACTA-TA-TACTTTCAAATtct
gi|5 : aCTCTG-CACTGTAAACCACT-GGAGGAGAGA---T---AATGG-AGCGCGAG-T-GGACT-TTC-AC-AT-----GC-GAGTGTGTTGA-GTCTGCTTAATCTAATAA-----GTTACGAT-TTGCA-TTGTCAAAGATA------AATGTTGAAATGACACAGAGAAACTCCATCAGGTCACTAC--TGTTCAACACTA--AGCACCTTAAGGATAGTCAAAGCAACT----ATG---AGG-A-T---A-----G--T--AATTT-CTTTCAAAAGCGAGAAAAATGCACCATTAACACAATATGCC--CAT--TAATATTGGATCTGTCA---TGCAAATAAT------TTATTCTACTA-----TATATCTAATC-AATTA-CTGTTACAATAGC------T--CTTAAGTATA-------GC--CCACAA-AACGTCGAA-G-ACG-T-C-CCCATGCAGAGATATCACAATGCCAGAACGGTCT-G--ACTTGTACAAAT-----TAAAGTG-------------A-GTTACTGGAAGCAT----CT-----TACA--TGATCATCTAAGAATCTCTATAAGATGAG-AATTGTCTCAATTATGGTCAAT---AGT--TTTT-CATCATTTTCATAGAAGAGACCCAT-GTATCAGAGG---TGTCT-CCATTTT--CAGTGTAT--TA-TT--A-AAAGTAACA-AT-C-TG--TCGTAGCCTCCAAATTTCATAAACAGT-T-CATACA--T------------A------------T------------TTATTTCAAAGTGAAAATTCTTAAGTATGATAATCAAGGTGTTA-AT----------AAGACTTGTTGGCAAAT-GA-A--ATGAC-ATCTAC------CATC-G-ATCT--GAAAACAAGTTTT--TC----CAAATTCGCCGAATAGTATTATTTTCAG--CAA----ATTT-CAAG-TTTTTGCCCCAGAAAA-TCAGAGAAAAAGGTTCTCCGTGCAAA------CAATA-TTT---TTTTACTCCA-------------TTAT----AAATTCAAAGG-GTCACAGTGATTTT-C--AGAAA-ACAATT-----T-CTTTTTGCATCAGCT-AAATT-ATTA--TC-TATGAAGAGTTCTGAAGGAA-TT------TTTACCATTTTTTTCGATTAATATTGTGAAAGACA----GAAA--AAATCACTATTCTCACCCCTCTATAAAAAGATAAATTTCTTTTTCAAAGGTTCCCCA-AATTATCTT-ATGTCAGAC-AACT--------------T
gi|6 : atttggcaacattatcagtacgacataacaccagcatcgcatattgtgtcggtttaggaagcaCAAA---ACAA---CTAA-TAT-ATAATCAAGGG-TTA-ATAAAT--ACAAAAGACTTGCTTGCAAAT-AC-AC-ATGGC--TCTA-------TATCGG-ATCTT-GAAA--AAGTTTTCTTC----AATTTTCAACA-----TAT-ATTTTCA---CAA----ATATACTAG-TTTT-GCCCCA-AAACCTC---GAAA--GT-TCTCCGGGT-AA------GACAC-TTAACCTA---------------------TTAT----AA--TCAAAGG-GTTA-A-T-ACTTTTCAGA--AA-ACATTT-----A-TTTTT--CATCAGTC-AA--TTATTA--TC--ATAGAGATAT--GAAGGAG-TTGTTTTTT---CCA--TTTT-CGATT-AT-TTATAA-----A----GAAA--AAATTCCTGTTTAA--TCC-----AAAA-----------CTC---ACAATGTTCTCA-AA--ATCTC-ATGTAAAAC-AACTTATATATCATTGAATGGTATA--TACGT-TCACCAAAAT--ACTTGTTC-CAATGC-ATTATATCGNNNNN------NNNNNNNNNNN------NNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN-NNN---NTCTGAGGAGT-TT-T-CCAATTTTCG-TGATTATTTT--CACCAATTT--ATG-TTTTT--GCCCC--AAAAACTCAA---AAAAACGCCGTTCACGT--AGGAATGTCAAAACAACC-TGA-TT-ATAAGCA-AG-G-ACTATGTACTCGTC---AAATAAC-CTTGTA-T-CCAAAAGTCCATAACATCTTTAT------CGGATTTGAGGAG-TTTTTC-AATTTT-GGCGAT--TATTT-TCACCAATTTCATG---TTTTTTGCCCCAGAAACTCAAAAA-CAACC-C-CC-------AC-----GT-AGGAA-GTCAAACAAACCCGATTTATAATC-----AAGGGACTA-TG-TACTTTCAAATTATACTTGTTTGC-AATAGTCATA----AGACA---TCTATAT--T-GGA--T-TGA-GAGTTTTG-------CCTA--TT-CA-G-CGATT-A-TTTTCAC--A--ATT-TC----A-AT--TAATTTCAAGTTTT--------TTGCC-CCAAAAACCTCAAAAAACGCC-CC-CACGTA-ACGAA-T-T--CAAAGGCAACCTGA--------TTTTTAA-----TCAA--GA-CT-AT-T-----AGTTTCAAAAAATT-----ACTTGTTT---GCAAAAAT-CCTGAGG-GGGT-CCCCCATTACCTTTAC-TGGCCCATGGtg
gi|7 : tgA--ATGTCATATA-GTCT-G--ATTT--ACAA-T-----TAAAG---------------A-Gtc
gi|7 : attaagaatttgatctcatagaccatgggccagtaatGCTT---------TGAAA---GGTCTATAT-GAT---TTATATAG----AAT-C-T-GAA---C------T-TTT-TTATTTTTT--GGTGATCTTT-TT--A-AA-AGTAAA-AT-CATG--TTGTAGCCCG-AAATCTCGTAATTG-T-T-CACACA--T------------A------------TCATAGTATAAATTTATGTCAAA---TAAA---TTAA-TAT-ATGATTAAAGGCTTGCATATATTCACAAAATACTTGTTTCCAAAT-GTCA--GTGAC-ATCTG-------TATCGG-ATGT---AAA--ATGTTTT--TCT---ACTTTTTGGCG-AT--TATT---TTCA---CAATTAAATTT-CAAA-TTCTTACCCCA-AAAC-CC----AGAAAGG-TCTCCATGC-AAA-----CAATA-TAA---TT---------------------T-AT----AA--TCAAAGG-GTTGAA-T-AGTTT-C--AGAAA-ATATTTTTTTCA-TTTTC--CATTTTTC-GA--TGATT---TC-TA--AAGAAAA-TAAAA----------------TCA--TGTT----TT-AG-CCCCAA-----AACTCGAAA--A------TGT------CCC-----AAAA-----------TACTT----ATGT---CA-AA-CAACTTGATAT---AT-AATT--------------T---------A-AT-T-----G----------TTA-CA-TAC-GTT----CACAAAA------TACTTGTTTAC------AAAAGTCAATGACA--TCTATAT-CGG---ATCTGAGGAGT-TT-TCCCAATTTTCGGTGACTATTTC--CACCAA-TTTCATG-TTTTTctttgaaaggtctatatgatttatatagaatctgaacttttttattttttggtgatctttttaaaagtaaaatcatgttgtagcccgaaatctcgtaattgttcacacatatcatagtataaatttatgtcaaataaattaatatatgattaaaggcttgcatatattcacaaaatacttgtttccaaatgtcagtgacatctgtatcggatgtaaaatgtttttctactttttggcgattattttcacaattaaatttcaaattcttaccccaaaacccagaaaggtctccatgcaaacaatataatttataatcaaagggttgaatagtttcagaaaatatttttttcattttccatttttcgatgatttctaaagaaaataaaatcatgttttagccccaaaactcgaaaatgtcccaaaatacttatgtcaaacaacttgatatataatttaattgttacatacgttcacaaaatacttgtttacaaaagtcaatgacatctatatcggatctgaggagttttcccaattttcggtgactatttccaccaatttcatgtttttg
gi|8 : attaagaatttgatctcatagaccatgggccagtaataatgtcatatagtctgatttacaattaaagaATATTCACAAAATAC-TGTTTGCAAATCG--GTCATGACAA-CTA-------CATCGG-ATCTACGAAA--A-----------------TGTCGGCG-GA--TAT--TTTGCAGTTCAA-------T-TAAGATTGGTGCCCCA-AAA--TC----AAAACAG-TATCCATGC-AA------CAATA-TGA----T---------------------TTAT----AA--TCAAAGGAGTTAAA-T-ACTTT-C--AGAAA-GTATTT-----GTTTTTT--CAAAAGTTGAA--T-ATTGGTTCTTGTGAAGAGTC-TGGAAGAG-------------------TTTTCCATT-AT-TTC-AA-----A----AAAA--AAAATCACGATTTAGTCCA-----AAAA-----------CTCG--AAAATGTTC------------------CAAAC-AACT--------------TGATATA--T--AT-T-----TAAT------GTTAGCA-TAC-GTT----CACAAAA------TA-TTCTTTGCAAAAATAAAAGTCAATGACATCTTTAT-T-CGGCATGTCTGAGGAGT-TT-T-----TTCTCAATGATTATTTTCACACCAA-TGTCATG--TTTTTTGCCCCA-AA---CT------TGGAACG---CCCAGGT--A-GAATGTCAAAACAGGC-TGACTTTATAAATGCAGTGGACTATTGACTG-TCGAAAAAGTATACTT-TT-T--CAAGAGCCg
gi|9 : -ATGTTAAA--AACT--------------TGATA-A--TC-ATAG-----GAAT--G---GTTA-CA-TAT--TT----CACAAAA------TACTTGTTTGC------AAAGTTCAATGACA--TTTATATCCGG---ATttcaggagtctccctt
gi|9 : GGATCTGAAGAG-GTAT-CCAATTTCGAGTG-T--TATTT-TCACAGATTTTATG---TTGTTTTCCC--AAAACCCAAAAAACG--CTC-CC-------AC-----GTTAGGAATGTCAACAAA-CCTGATT-ATAATC-----AAGGGACTATTG-TACTTTCAATATATACTTGTTTGC-AATAGCCA-A----TGA-A---TCTATA---TCGGA--TCTGATGAGTTTTT-------CCAATTTT-CA-GCCGATT-ATTATTCACCAA--ATT-TC----CAG---T---------TTTT--------TTGCC-CC-AAAACTC---AAAACGCC-CCACACGTAGG-GAA-TGT--C-AA--CAACCTGA--------TCTTTAA-----TCAA-GGGACTACTGT-----AGTTTC--AAAAAT-----ACTTG-TT---GCAAAAAT--CTAGGG-GGGTCCCCCCATTACCTTTAC-TGGCacgaaaacgtcgatcaatctcgtaagtccaaattagggatctgaagaggtatccaatttcgagtgttattttcacagattttatgttgttttcccaaaacccaaaaaacgctcccacgttaggaatgtcaacaaacctgattataatcaagggactattgtactttcaatatatacttgtttgcaatagccaatgaatctatatcggatctgatgagtttttccaattttcagccgattattattcaccaaatttccagtttttttgccccaaaactcaaaacgccccacacgtagggaatgtcaacaacctgatctttaatcaagggactactgtagtttcaaaaatacttgttgcaaaaatctaggggggtccccccattacctttactggcatagtctagggattcaatt
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|27 ): AANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACAGGTATT
Unaligned ( gi|33 ): GTGAAGAGTCTGAAAGAGTTTTCCATTATTCAAAAAAAAAAATCA
Alignments
lowQualScore : 11 2222 111 1 1 1 111 1 11 11 111 1 1 111 111 1 1 3333333333 1 33333 111 1111 3333333 11111111111 22 11111 3333333 11111 77777777777777777777777777 333333333333333 11111111 111111 6666666666666666666 1111 222222 11111 33333333333 111111111 1 111 11111 11 11 1 2222222 22 11 11111 333333333333333 2222222 1111 11111 222222222 1111 33333333333 3333333333333333333333 11 66666666666666666666666666666666666666666 1111 44444444 1111111 1111 2222222222222 111 11111 66666666666666666666666666 11 1111111 11 1111 2222222222 1111111111 111 11111 33333333333333333333 22222222222222 11111 111111 111111 111 11 1 11 33333333333 111 11 111 222 111111 222 11 1111111 11111 11111 1 111 222 11 2222222 1 22222 77777777777777777777 22222222 1111 11 11 22222222 2222222 11 33333333 222222 1 111
lowQualScore : 33 2 1111 777 2 0 1 0 0 999 8 5 1 00 33 777 0 0 000 000 1 0 1 0 7777777777 0 33333 6 7 333 1 6 22 6 4444 6 6 7777777 77 9 5 1 6 22 77777777777 00 5 5 5 5 5 44444 5 5 5 5 7777777 5 66666 6 11111111111111111111111111 333333333333333 5 33333333 888 5 111111 888 5 5 66666 2222222222222222222 66 5 66 0000 5 0 888 3 2 222222 66 5 99999 22222222222 5 5 888888888 5 5 0 222 11111 33 1 777 00 8 4 4 4 1 44 1 4 3 4 5555555 55 33 99 55 66 4 11111 333333333333333 4 0000000 0000 22222 5 5 66 1 000000000 7777 55 3 33 00000000000 3333333333333333333333 0 3 3 55 3 44 88 55 55 88888 7 55 55 5 3 66 5 777 22222222222222222222222222222222222222222 4 0000 777 3 4 2 5 11111111 555 3 555 0000000 3 555 3 44 77 0000 1111111111111 7 3 77777 0 3 3 000 7777 4 4 4 66 44444 2 77 4 55 1 55555555555555555555555555 1 9999 66 4 444 4 1 4 33 6 4 1 9999999 00 4 66 8 66 4 1 1111 8 3333333333 66 1 4 4 1 1111111111 66 666 0 22 11111 11111111111111111111 4 0 4 55 2 999 3 4 33333333333333 1 77777 4 11111 9999999 4 4 4 9999 222222 222222 66 5 000 6 6 44 1 99 5 5 5 55 44444444444 000 99 3 66 6 8888 0 6 6 6 111 6 5 000 7 999999 5 3 9 0 66 4 3 1 000 3 88 4 55 4 4 4444444 11111 4 0 4 3 11111 888 1 9 0 444 111 11 5 0 6666666 88 8 8 8 88 0 55555 8 66666666666666666666 99999999 8 8 0000 8 8 999 8 5 11 0 11 22222222 6666666 11 8 0 00000000 0 333333 0 444 0 6 6 8 0 0 8
lowQualScore : .. . .... ... . . . . . ... . . . .. .. ... . . ... ... . . . . .......... . ..... . . ... . . .. . .... . . ....... .. . . . . .. ........... .. . . . . . ..... . . . . ....... . ..... . .......................... ............... . ........ ... . ...... ... . . ..... ................... .. . .. .... . . ... . . ...... .. . ..... ........... . . ......... . . . ... ..... .. . ... .. . . . . . .. . . . . ....... .. .. .. .. .. . ..... ............... . ....... .... ..... . . .. . ......... .... .. . .. ........... ...................... . . . .. . .. .. .. .. ..... . .. .. . . .. . ... ......................................... . .... ... . . . . ........ ... . ... ....... . ... . .. .. .... ............. . . ..... . . . ... .... . . . .. ..... . .. . .. . .......................... . .... .. . ... . . . .. . . . ....... .. . .. . .. . . .... . .......... .. . . . . .......... .. ... . .. ..... .................... . . . .. . ... . . .............. . ..... . ..... ....... . . . .... ...... ...... .. . ... . . .. . .. . . . .. ........... ... .. . .. . .... . . . . ... . . ... . ...... . . . . .. . . . ... . .. . .. . . ....... ..... . . . . ..... ... . . . ... ... .. . . ....... .. . . . .. . ..... . .................... ........ . . .... . . ... . . .. . .. ........ ....... .. . . ........ . ...... . ... . . . . . . .
lowQualScore : 88 5 2222 555 5 0 0 0 0 666 0 0 0 22 88 000 0 0 222 888 0 0 2 0 2222222222 0 33333 7 3 777 0 7 00 7 2222 7 7 5555555 00 3 7 0 7 00 77777777777 77 7 7 7 7 7 33333 7 7 7 7 6666666 7 77777 7 22222222222222222222222222 666666666666666 7 55555555 888 0 666666 888 0 0 88888 7777777777777777777 99 0 99 6666 0 1 888 1 2 222222 99 0 44444 44444444444 0 0 444444444 0 0 0 999 22222 88 1 888 66 9 4 4 4 9 66 9 4 3 4 6666666 55 99 99 55 11 4 11111 999999999999999 4 6666666 6666 55555 0 0 99 3 000000000 2222 00 6 88 77777777777 6666666666666666666666 4 6 6 00 6 22 88 00 00 11111 3 99 00 5 6 22 0 111 99999999999999999999999999999999999999999 6 4444 000 8 0 6 8 77777777 444 1 444 8888888 3 888 3 66 99 8888 8888888888888 3 6 88888 7 2 6 000 7777 0 0 0 33 33333 0 33 4 44 0 44444444444444444444444444 9 4444 11 4 888 4 9 4 99 7 4 0 2222222 66 4 11 9 11 4 9 8888 9 1111111111 11 9 4 4 0 6666666666 11 222 8 00 11111 33333333333333333333 7 1 4 22 0 333 2 0 55555555555555 8 44444 4 11111 6666666 4 4 4 4444 888888 888888 11 0 000 7 7 33 0 22 5 2 7 88 88888888888 222 22 7 00 7 2222 7 7 7 7 777 7 7 000 5 222222 0 2 6 4 11 4 9 8 000 6 33 4 00 4 4 4444444 11111 4 1 4 9 11111 000 0 8 0 000 666 00 0 8 0000000 88 0 0 0 88 6 88888 0 88888888888888888888 00000000 0 0 6666 0 0 222 0 0 00 8 00 88888888 0000000 22 0 8 00000000 8 888888 6 000 8 7 7 0 8 8 0
consensus : ATTTTGTTTGGATATACTGAAAAAA--GCGTT----CAACTAAACC---AACCGTACC-TCTNG-GG-CAGGATGGTTATCTACAACCGCACCTG-ATGGAAGAAGTANTTTGCTCGAC-TG--TTG--ATTATA-TGGTTCC-AATCACCTGCCCTATTACAA-GAAATT-GNCACTG-TTCAGCAAGTTATTC-AGC--------T-ATCAC-AAGAAG-----CTGTCAAAATGTAACTATCCTTGCATGTGATATTTTGCAGTNGCTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATTTGGC-AAAATCCAG-AGAAATAC----AGC-GA-TGT------TCAT-TTAGGAGTTTTCGATTCACTATCCTCTG-CACTGGAAACAATT-GGGGAA---A---T---AATGG-AGCGCGAG-T-GGACT-TTC-AC-AC-----GT-GA-T-TATTGA-GTCTGGA-AATATA-TAT-----GT-ACGA-TAT--A-TCG-----GATA------AATGTT---ATTA--------AACTCCA-AACTTCATNAA--TGT---AC-CTA--G---CCTT---GATA-TCAAA-CAACTTGATATACATAA-GC-T---A-----GGTT--TAGTT-CTTT--AAAGC----AAAA-TGCATGCTTG---CAAAATGCCCAT--A-T-AT--GA-CTGT-----TGGAA----T------TT-TTCT-CTA-----T---TTCAA-C-AGT-ACTGTTATAATGAC-AA--TTTCATACATGTATTT---TGC--CC-CAA-AAC-TC-GAAAGACG-T-C-CC-------AAATATCA--ATGTCAGACAAGTCTTG--ATTT--ACAA-T-----TAAAG---------------G-GTT-------GCAT----AC-----T-A-A--TGATACTTTAAGAA---------AAT----AATTGTTTTCAA--A-GGTCCATA-----TGAT-ATTTATATA---G----GAT--TC-TG-A--AGAGG-T-TC--TCCA-TTTTT-CAGTTGA--TT--TTT---A-AA-GTAAAAA-TCATG--TCGTAGCCTC-AAANCTCATAAAC-GT-T-CATACA--T------------A------------T------------TTATGTCAAA---ACAA---CTAAATAT-ATAATCAAGGGGTTACATATATTCACAAAAGACTTGTTTGCAAAT--GNCA--A---TGAC-A---TC-------TA-TAT---CGG-A--TCT--GAAA--AAGTTTT----T--------C-AATTTTCG-GCG-AT--TATTATTTT-CA---C----AAATTT-CAAG-TTTTTGCCCCA-AAAC-TC---GAAAAAGG-TCTCCGTGCAA-ACAA-TNTTA---TT---------------------TTAT----AA--TCAAAGG-GTTACA-T-ACTTT-CAGAGAAA-ACANTT-----GTTTTT--CATCAGTC-AA--T-ATTA--TCT-ATGGAGAGNT-TGAAGGAG-TT------T---CCA--TTTTTCGATT-AT-TTNTAA-----A----GAAA--AAATTCCTGTTTTAGCCCC-----AAAA-----------CTCGTCAAAATGTCCCCA-AA-TATCTT-ATGTCAAAC-AACT--------------TGATATA--TA-AT-T-----GAAT--G---GTTA-CA-TAC-GTT----CACAAAA------TACTTGTTTGC------AAAAGTCAATGACA--TTTATAT-CGG---ATCTGAGGAGT-TT-T-CCAATTTTCGGTGATTATTTT--CACCAATTTTCATG-TTTTTTTGCCCC--AA---CT-AA---AAAAACGCC-CCCACGT--AGGAATGTCCAAACAACC-TGA-TTTATAATCG-AG-GGACTATGTACTT-TC---AAATTATACTTGTT-TGCCAAAAGTCAATGACATCTATAT------CGGATCTGAGGAG-TTTTTCCAATTTTCGGCGAT--TATTT-TCACCAATTTCATG---TTTTTTGCCCCAAAAACTCAAAAA-CG--C-C-CC-------AC-----GT-AGGAATGTCAAACAA-CCTGATTTATAATC-----AAGGGACTAT-G-TACTTTCAAANTATACTTGTTTGCAATAGTCA-ATGACA---TCTATAT--TCGGA--TCTGAGGAGTTTTT-------CCAA-TTT-CG-G-CGATT-ATTTTTCAC--A--ATT-TC----GTGT--T---------TTTT--------TTGCC-CC-AAAACTTC-AAAAACGCC-CC-CACGTA-G-GAA-TGT--CAAA--CAACCTGA-TT-----TTTAA-------TCAA-GGG-CTAATGT-----AGTTTCAAAAAAAT-----ACTTGTTT---GCAAAAATCCCTAGGG-GGGT-CCCCCATTACCTTTAC-TGGCCCATGG
Reference ( family-3276 ) : ATTTTGTTTGGATATACTGAAAAAA--GCGTT----CAACTAAACC---AACCGTACC-TCTNG-GG-CAGGATGGTTATCTACAACCGCACCTG-ATGGAAGAAGTANTTTGCTCGAC-TG--TTG--ATTATA-TGGTTCC-AATCACCTGCCCTATTACAA-GAAATT-GNCACTG-TTCAGCAAGTTATTC-AGC--------T-ATCAC-AAGAAG-----CTGTCAAAATGTAACTATCCTTGCATGTGATATTTTGCAGTNGCTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATTTGGC-AAAATNCAG-AGAAATAC----AGC-GA-TGT------TCAT-TTAGGAGTTTTCGATTCACTATCCTCTG-CACTGGAAACAATT-GGGGAA---A---T---AATGG-AGCGCGAG-T-GGACT-TTC-AC-AC-----GT-GA-T-TATTGA-GTCTGGA-AATATA-TAT-----GT-ACGA-TAT--A-TCG-----GATA------AATGTT---ATTA--------AACTCCA-AACTTCATNAA--TGT---AC-CTA--G---CCTT---GATA-TCAAA-CAACTTGATATACATAA-GC-T---A-----GGTT--TAGTT-CTTT--AAAGC----AAAA-TGCATGCTTG---CAAAATGCCCAT--A-T-AT--GA-CTGT-----TGGAA----T------TT-TTCT-CTA-----T---TTCAA-C-AGT-ACTGTTATAATGAC-AA--TTTCATACATGTATTT---TGC--CC-CAA-AAC-TC-GAAAGACG-T-C-CC-------AAATATCA--ATGTCAGACAAGTCTTG--ATTT--ACAA-T-----TAAAG---------------G-GTT-------GCAT----AC-----T-A-A--TGATACTTTAAGAA---------AAT----AATTGTTTTCAA--A-GGTCCATA-----TGAT-ATTTATATA---G----GAT--TC-TG-A--AGAGG-T-TC--TCCA-TTTTT-CAGTTGA--TT--TTT---A-AA-GTAAAAA-TCATG--TCGTAGCCTC-AAANCTCATAAAC-GT-T-CATACA--T------------A------------T------------TTATGTCAAA---ACAA---CTAAATAT-ATAATCAAGGGGTTACATATATTCACAAAAGACTTGTTTGCAAAT--G--A--A---TGAC-A---TC-------TA-TAT---CGG-A--TCT--GAAA--AAGTTTT----T--------C-AATTTTCG-GCG-AT--TATTATTTT-CA---C----AAATTT-CAAG-TTTTTGCCCCA-AAAC-TC---GAAAAAGG-TCTCCGTGCAA-ACAA-TNTTA---TT---------------------TTAT----AA--TCAAAGG-GTTACA-T-ACTTT-CAGAGAAA-ACANTT-----GTTTTT--CATCAGTC-AA--T-ATTA--TCT-ATGGAGAGNT-TGAAGGAG-TT------T---CCA--TTTTTCGATT-AT-TTNTAA-----A----GAAA--AAATTCCTGTTTTAGCCCC-----AAAA-----------CTCGTCAAAATGTCCCCA-AA-TATCTT-ATGTCAAAC-AACT--------------TGATATA--TA-AT-T-----GAAT--G---GTTA-CA-TAC-GTT----CACAAAA------TACTTGTTTGC------AAAAGTCAATGACA--TTTATAT-CGG---ATCTGAGGAGT-TT-T-CCAATTTTCGGTGATTATTTT--CACCAATTTTCATG-TTTTTTTGCCCC--AA---CT-AA---AAAAACGCC-CCCACGT--AGGAATGTCCAAACAACC-TGA-TTTATAATCG-AG-GGACTATGTACTT-TC---AAATTATACTTGTT-TGCCAAAAGTCAATGACATCTATAT------CGGATCTGAGGAG-TTTTTCCAATTTTCGGCGAT--TATTT-TCACCAATTTCATG---TTTTTTGCCCCAAAAACTCAAAAA-CG--C-C-CC-------AC-----GT-AGGAATGTCAAACAA-CCTGATTTATAATC-----AAGGGACTAT-G-TACTTTCAAANTATACTTGTTTGCAATAGTCA-ATGACA---TCTATAT--TCGGA--TCTGAGGAGTTTTT-------CCAA-TTT-CG-G-CGATT-ATTTTTCAC--A--ATT-TC----GTGT--T---------TTTT--------TTGCC-CC-AAAACTTC-AAAAACGCC-CC-CACGTA-G-GAA-TGT--CAAA--CAACCTGA-TT-----TTTAA-------TCAA-GGG-CTAATGT-----AGTTTCAAAAAAAT-----ACTTGTTT---GCAAAAATCCCTAGGG-GGGT-CCCCCATTACCTTTAC-TGGCCCATGG
gi|1 : ATTTTGTTTGGATATACTGAAAAAA--GCGTT----CAACTAAACCTTGAA--GTACT-TCTAG-AG-CAGGATGGTTATTTACAA---CACCTG-ATGGAAGAAGTTATTTGCTCGAC-TGATTTG----TATATTGGTTCC-AATCACCTGCCCTATTACAAGGAAATTGGCCACTATTTCAACAAGTTATTCAAGC--------TCATCACAAAGAAG-----CTGTCAAAATGCAACTATCC-TGCATGTGAT-TTTAGCAGTTGCTA
gi|1 : AACTTAGCCAAAATC------GAATAC----CGT-GAATGT------TCATATTAGCAGTTTTCATTTCACTATCCTCTTTCACTGGAAACAGTT-AGGGAA---A---T---AAT---AGTGCGAGAT-GGACT-TTC-AC-AC-----GT-GA-T-TATTGACGTCTGGAGAATATA-TATACATGGT-ACGATTAT--A-TCG-----GATA------AATGTT---ATTA--------AACTCCA-AACTTTCTTAAGCTGT---A--CTA--G---CCTA---GATA-TCAAA--AACTTGATATAAATAAGGC-TTTGG-----GGTT--TAATT-CTTT--AAAGC----AAAATTGCATGC--------AAGTTATTAT----T-AT--AA-CT-T-----TGGAA----T------TT-TTCT-C-A---------TTCAA-C-AGTAACTGTTTTAATGAC-AA--TTCCATGCATGTATTT---TGT--CC-CAA-AAC-TTGGAAGGACG-T-C-TC-------AAATATCA--ATGTCAGACGAGTCTTG--ATTT--ACAA-T-----TAAAG---------------G-GTT-------GCAT----AC-----TAA-A--TGATATTTTAAGAA---------AAT----AATTGTTTTCAA--A-GGT---TA-----TGAT-ATTTATATA---G----GAT--TC-TT-G--AGAAG-T-TC--TCCATTTTTT-CAGTTGA--TT--TTT---A-AA-GTTAAAA-AGATG--CTGGAAGCTC-AAACGTCATAAAC-AT-T-CATATA---------------A------------T------------TTATTTCAAA---ACAA---CTAAA-AT-ATAATCAAAAGGTTACATATATTTACATAAGA--TGTTTGCAAAT--G--A--A---TAATAA---TC-------TA-TAT---CTG-A--TCT--GGAA--AAGTTTT----T--------C-AATGTTCG-GCG-AT--TATT-TTTT-CA---C----AAATTT-CAAG-TTTTT-CCCCA-AAAT-TC---GAAAAAGG-TTCTTGGGT-A-ACAGTTCTTA---TT---------------------TTAT----AA--TCAAAGG-GTTACA-T-ACTTT-CAGAGAAA-ACAGTT-----ATTTTT--CATCAGTC-AA--T-ATCA--TCT-ATTGAGAGGT-TGAAGGAA-TT------T---CCA--TTTTTCGATT-AT-TTATAA-----A----GAAA--AAATTCCTGTTTTAGCCCC-----AAAA------------TCGTCCCAATGTCCCCA-AA-TATCTT-A-GTCAAAC-AACT--------------TGATATACTTA-AT-T-----GAAT--G---GTTA-CA-CACTGTT----CACAAAA------TACTTGTTTGC------AAAAGTCAATGACA--TTTACAT-CGG---ATCTGAGGAGTATT-T-TCAATTTTCTGTGATTATTTT--CACCAATTTTTATG-TTTTTTTGCCCC--AA---CT-AA---AAAAACGCC-CCCACCCTAAAGAATGTTCAAACAACCGTGA---TATAATTA-AG-GGACTATGTGCTC-TC---AAATTATACTTGTTCTGCCAAAAGTCAATGACATCTATAT------CGGATCTGAAAAG-TTTTTCCGATTTTCGGCGAT--TATTT-TCACAAATTTCATG---TTTTTTGCCTCAAAAACTCAAAAA-CA--C-C-CC-------AC-----GT-AGGTATGTCAAACAT-CC-GATTTATAATC-----AAGGGACTAT-GTTACTTTCAAATTATACTTGTTTGCAA-AGTCA-ATGACA---TCTATAT--TCGGA--TCTGGGGAG-TTTT-------CCAA-TTT-CG-G-CGATTAATTTTTCAC--A--ATT-TC----GTGT--T---------TTTT--------TTGCCTTC-AAAACTTC-AAAAACGAC-CC-CACGTA-G-GAA-TTTTACAAA--CAACCTGA-TT-----TTTAA-------TCAA-GGG-CTAATGT-----AGTTTCAAAAAAAT-----ACTTGTTT---GCAAAAATCCCTAGAGCGGGT--CCCCATTACCTTTAC-AGGCCCACGGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacttagccaaaatcgaataccgtgaatgttcatattagcagttttcatttcactatcctctttcactggaaacagttagggaaataatagtgcgagatggactttcacacgtgattattgacgtctggagaatatatatacatggtacgattatatcggataaatgttattaaactccaaactttcttaagctgtactagcctagatatcaaaaacttgatataaataaggctttggggtttaattctttaaagcaaaattgcatgcaagttattattataactttggaatttttctcattcaacagtaactgttttaatgacaattccatgcatgtattttgtcccaaaacttggaaggacgtctcaaatatcaatgtcagacgagtcttgatttacaattaaagggttgcatactaaatgatattttaagaaaataattgttttcaaaggttatgatatttatataggattcttgagaagttctccattttttcagttgatttttaaagttaaaaagatgctggaagctcaaacgtcataaacattcatataatttatttcaaaacaactaaaatataatcaaaaggttacatatatttacataagatgtttgcaaatgaataataatctatatctgatctggaaaagtttttcaatgttcggcgattattttttcacaaatttcaagtttttccccaaaattcgaaaaaggttcttgggtaacagttcttattttataatcaaagggttacatactttcagagaaaacagttatttttcatcagtcaatatcatctattgagaggttgaaggaatttccatttttcgattatttataaagaaaaaattcctgttttagccccaaaatcgtcccaatgtccccaaatatcttagtcaaacaacttgatatacttaattgaatggttacacactgttcacaaaatacttgtttgcaaaagtcaatgacatttacatcggatctgaggagtattttcaattttctgtgattattttcaccaatttttatgtttttttgccccaactaaaaaaacgcccccaccctaaagaatgttcaaacaaccgtgatataattaagggactatgtgctctcaaattatacttgttctgccaaaagtcaatgacatctatatcggatctgaaaagtttttccgattttcggcgattattttcacaaatttcatgttttttgcctcaaaaactcaaaaacaccccacgtaggtatgtcaaacatccgatttataatcaagggactatgttactttcaaattatacttgtttgcaaagtcaatgacatctatattcggatctggggagttttccaatttcggcgattaatttttcacaatttcgtgttttttttgccttcaaaacttcaaaaacgaccccacgtaggaattttacaaacaacctgatttttaatcaagggctaatgtagtttcaaaaaaatacttgtttgcaaaaatccctagagcgggtccccattacctttacaggcccacggc
gi|10 : attttgtttggatatactgaaaaaagcgttcaactaaaccttgaagtacttctagagcaggatggttatttacaacacctgatggaagaagttatttgctcgactgatttgtatattggttccaatcacctgccctattacaaggaaattggccactatttcaacaagttattcaagctcatcacaaagaagctgtcaaaatgcaactatcctgcatgtgattttagcagttgctannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntG-TTTTTTTGCCCC--AAAA-CT-AA---AAACACGCC-CC-ATGA--AGGAATGTC-AAACAATC-TGA-TT-ATAATTG-TG-TGACTATGTACTT-TC---AAATTATACTT-TT-TGG-AAAAGTCAA--ACATTTATAT------CGGATCTGAGGAG-TTTT-CCAATTTC--GTGAT--TATTT-TCACCAATT-CATG---TTTTT-GCCCCAAAA-CTCAAAA--CG--C-C-CC-------AC-----GC-AG-AATGTCAAACAA-CCAGATTTATAATC-----AAGG-ACAAT-G-TACTTTCAAATTATACTTGTTTGCAAAAGTCA-ATGACA---TTTATA---TCGGA--TCTGAGGAGTTTTT-------CCAA-TTT-CG-G-TGATT-A-TTTTCAC--CT-ATT-TC-----TG-------------TTTT--------TTGCC-CC-AAAAC-TC-AAAAAC-CC-CC-CACGTA-G-GAA-TGT--CAAA--CAACCTGA--T-----TATAT-------TCAG-GGA-CTAG--------ACTTTCAAAAAAA--------CTG-TT---GC--AAATCCCCGGGG-c
gi|11 : caattcggatgagtattatcactaagatgttatagcgatcgtctcgttaTA--------AGCTCCA-AACTT-ATTAAC-TGT---AC-CTATAA---CCTT---TATA-TCAAA-CAACTTGATATACACAA-GCAT---ACATGGGGTT--TAGTT-CTTT--AAAGC----AAAA-TGCATGCTTG---CAAAATGTCCAT--A-TCAT--GA-CTGT-----TGGAA----A------TT-TTCT-CTA-----T---TTCAA-C-AGT-ACTG-TATAATGAC-AAT-TTTCATACATGTATTT---TGT--CC-CAA-AAC-TC-GAAA-ATG-TCC-CC-------AAATATCA--ATGTCAAAC-AGTCTt
gi|11 : taA--TT--TTT---A-A--GTACAAA-TCATG--TTGTAGCCTC-AAA---CATACAT-AT----ATAAAGGT------------A------------T------------TTATGCC-AA---ACAA---CTAGATAT-ATAAgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatttttaagtacaaatcatgttgtagcctcaaacatacatatataaaggtatttatgccaaacaactagatatataa
gi|12 : tataagctccaaacttattaactgtacctataacctttatatcaaacaacttgatatacacaagcatacatggggtttagttctttaaagcaaaatgcatgcttgcaaaatgtccatatcatgactgttggaaattttctctatttcaacagtactgtataatgacaattttcatacatgtattttgtcccaaaactcgaaaatgtccccaaatatcaatgtcaaacagtctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaATTTCTTGTGGACATACTGTAGGAT--GCGTT----CGAGTGAACC---AACCGTACCGCCTTG-GG-CAGGATGGTTATCTTCAACTGCACCAG-AC-GAAGAAGTGCTTTGCTCGAC-TG--TTG--ATTATA-TGGTTCC-AATCAACTGTCCTATCAC-A-GAAAAT-GCCACAG-TTCAGCAAGTCATCC-AGC--------T-ATCAC-AAG
gi|13 : tacaactcatactgctcacggtattgtgaaacaagaagtatatgtgcgtgatgaggataaccaaggccctctagacaaatcttgctagataggaataaatctaggacaagtttcagaaaaatcagaagaactagccccatgtttcgtgaagaccaaaacatcgccagctgtccgaactacttgcatgtcccctttgcataccaacaatgataagagagacatgactcGC-GAAATCTAG-AGAAGTAC----AGC-GA-TGTCATTGTTCAC-TGAGGAGTTTCC-ATTCGCTAAGCTATG-CATTGGAAAGAATT-GGGTAA---AGAGT---AATGGGAGTACTAG-T-GGACT-TTC-AC-ATCACATGT-GA-T-TATTGA-GGCTGG----CATA-TAT-----GT-ATGA-------------------A------AATTTT----CTG--------AACTCAA-AACTTTATAAA--TGT---AC-CTA--G---CCTT---GATG-TCAAA-CAAC-------AAAT----------------GGTA--TAGTT-CTTC--AAAGC----AAAT-TACATGCTTG---C-GAATGTCTTT--ATT-GT--GA-TTGT-----AGGAA----TCGAAAATT-TTCC-ATT-----T---TTTAA-C-AAT-A---TTATATTGACAAA--TTTCATA----TATTG---CGCG-CA-TAACAAC-TC-G-AAGAGG-TAC-AT-------GTATATTA--ATATCAGAT-AGTC-TG--ACTT--ACGA-T-----TAAAG---------------G-GCT-------GCAT----AC-----T-A-A--TGAT
gi|14 : tT--TAGTTTCTTT--AGAAG----GAAA-TA-ATG---------AAAT-----T--A---AT--GA-CAGTAGGATTGGAT----C------TT-TTTT-CTACTATCT---TTTAA-CCAGT-GCTGT---AATGACTAA--CTTTCTACATGTACTT---TACTACT-CAA-A-C-TC-GAACAA---T-C-CC-------AA---------TGCCAGACAG---TTGGAATTT--ACAA-T--------AG---------------GCGTA-------GTATCGCCAA-----T-A-AAATGATCCTTTAAGGA---------AATGCTAAATTGTTTCC-A--A-GGTTGGTAAT---CGAC-TTTAACATA--------AATTCTC-TG----AGAGGAT-TT--TCCA-CTTGT--AG-TGA--TCTGTTT---A-AG-TTAAAGA-CCATGTCTCGTAGCCTC-AAAg
gi|15 : ATATAGTTACAA------TATCTGCAAATTAG--A--GGGTTGAC-AAATTC-------TA-TATACTCGG-AAATCT--GAGA----GTCTT----TTATCTCCCC-AATTTTCGCGTG-A------TATTTTGCA---C----A
gi|15 : TGACAAATTCTATATACTCGGAAATCTGAG-AGTCTTTTATCTCCCCAA-TTTTCGCG-TGAT--ATTTTGCAC--ACCATTATTATGGGTGTACC---------TTTTGGTAGGGGTTGCA-TC-AAAA--TC-GAAAACGTAACC-CACGTA-G-AAAATGC--CAAA--CAACCTGAATTAAATATTTGAAAAGGTTTCAGTAGG-ATAAAATCAATAAACTACAAAAAAACCCACAATTTGTTTTGAG-AAAAATCCCCATGG-GGGT-CGCCCATTACCTTTACTTGGCCCATGccattattatgggtgtaccttttggtaggggttgcatcaaaatcgaaaacgtaacccacgtagaaaatgccaaacaacctgaattaaatatttgaaaaggtttcagtaggataaaatcaataaactacaaaaaaacccacaatttgttttgagaaaaatccccatgggggtcgcccattacctttacttggcccatgtc
gi|16 : atatagttacaatatctgcaaattagagggtTTC-CA---C----AAATTT-CAAG-TTTTTGCCCCA-AAAT-TC---AAAAAA---TATCCATGCAA-ACAA-TATGA---TT---------------------T-AT----AA--TCAAAGG-GTTCAA-T-AGTTT-CAGAGACCCACATTT-----GTTTT---CAAAAGGC-AA--T-ATTA--TCT-GTGAAGAGTC-TGAAGGAG-TT------TT--CCA--TTTGTCGATG-AT-TTTTAA-----A----GAAACAAAA-----G----AGCCCA-----AAAG-----------CTCG--AAAATGTCCTAA-AA-TA-CTT-ATGTCAAAC-AACT--------------TGATATA--Ttc
gi|17 : aa--A-GGTTCATA-----T--T-ATTTATATA---G----AAT--TC--G-A--AGAGG-T-TC--TCCA-TTTTT--AGGTGA--TT--TTT---TTAA-GTAAAA--TCATG--T---AGCCTC-AAAACTCGTAAAT-GT-T-CCCACA--TCCTAAAGTATAAA------------T------------TTATGTCAAA----CAA---CTTAGTAT-ATGATCAAGGGGTTGCATGTATTCACAAAATACTTGTTTGCAAAT--GTCA--A---TGAC-A---TC-------TA-CAT---CGG-A--TCT---AAA--ACGTTTT----C--------C-AATTTTCA-GC
gi|18 : T-TGC-AAAACTTTATAATATCTATATGTATTTCGGATCTGAAGAG-TTTTTCCAAAGTTTGGCGTT--TATTT-TCACCAGTTGCATGGGGTTTTTTGCCCC-CAAACTCGACAA-CA--C-CACC-------AC-----CA-AGGAATGTCAAACAA-CCTTATTTAGAATC-----TAGGGACAAT-G-TAGTTTCAAAATAT
gi|19 : GAG-TTTCT----TTTTCCGCTAGCATATTTCTCAC-AG---CATG---CTTTTTGTTC--AAAACTGGTATT-CA--C-C-CCCTGGCCCAC-----AT-AGAAATTTGAAACAA-CCACATTTTTAATC-----AAACGACTGT-G-CACTTTCCAAAAGTACTTGTTTACA
gi|2 : TTTTGATTGGATATCCTGAAAAAA--A-GTT----CAACTAAACC---AACCATACT-TCTTGAGG-CAGGATGGTTATCTACAACCACACCTA-ATGGAGGAA-CACTTTGTTGGAT-TG--TTG--ATTATA-TGGTTCC-AATCACCTGCCCTATTGCAA-GAAA-T-GACACTA-TTCAGCATGCTATTC-AGCTAGATTAAT-ATCAC-AAGAAG-----CTGTCAAAATGTAACTATCCTTGCATGTG--ATTTTGCAGTGGCTA
gi|2 : TTTGGC-AAAATCCAG-AGAAGCAC----AGC-AA-TGTATTGT-TCAT-TTAGGAGTTTTCCATTCACTATCCTCTG-AACTGGAAACCACT-GGGGAA---AA--T---AGTG--AGCGTGAG-T-GGACT-TTT-AC-AC-----AT-GA-T-TATTGA-GTCTGGA-A---TA-TAT-----GT-ACGA-TAT--G-TCA-----GA-A------AATGTT---AT-A--------AACTTCA-AACTTTATAAA--TGT---AC-CTA--A---CCTT---GATA-TCAAG-CAACGTAATATACATAA-GC------------GTT--TAGTT-CTTT--AA-GC----AA---TGCATGCTTG---CAAAATGCCCAT----T-AT--G------------------------------TTTT-CTA-----T---TTCAA-C-AAT---CGT-ATAATGAC-AA--TTTTATACATGTATTT---TGT--CC--AA-AAC-TC-GAA-GACG-T-CTCC-------AAATATCA--ATGTCAGACA-GTCT-G--ATTT---CAA-TAAGGATAAAACTGTTCGTTTCCTTTG-ATTTT-----ACAT----ACAGAATT-A-A--TGATACGTTAAGAA---------AAT----AATTATTTTCAT--T-GGTTCATA-----TGAT---TTATATA----------------------------------TTCA-TTTC--CAATAAA--TT--TGA---A-AA-GTAAAAA-TCATG--TTGTAACCTA-AAAATTCATAAAC-AT-T-CATACA--T------------A------------T------------TTATTTTCAC---ACAA---CTAAATAT-ATAAACAAGGGGTTACACATATTTACAAAAGACTTGTATGCAAAT--AATA--A---GGAC-A---TC-------AA-TAT---CGGTA--TGT--GAAA-----TTTTCCCCC--------C-AACTTTGA-GTG-AT--TATTATTTT-TA---C----ACATTT-CAAG-TTTTTGCCCAA-AAAC-TC---G-AAAAGG-TCTCCATGCAA-ACAA-TCTTA----T---------------------TTAT----AA--TCAAAGG---TACA-T-ACATT-C--AGAAA-ACAA-T-----GATTTT--CATCAGTA-AA--T-ATTA--TCT-ATTGAGAG-T-TGAAGGAGATT------T---CCA--TTTTTCGATT-AT-TTTTAG-----A----GAAA--AAA-TCCCGTTTTAGCCCC-----AAAA-----------CTCGTC--GATGCCCCCA-AC-TATC-T-ATGCCAGAC-------------------------------AT-T-----GGAT--G---GCTA-CA-TAT-GTT----CACAAAA------TATTTGTTTGC------AAAATTCAGTGATA--TCTATAT-CGG---ATCTGAGGAGC-TTGT-CCAATTTTTGGTGATTATTTT--TACCAATTTT-ATG-TTTTTTC-CTCC--AA------AACTCAATAACA-T-CCCACGT--AAGAATGT-CAAACAACC-TGA-TTTATAATTA-GG-GGGCTATGTACTT-GC---AAATTATACCTGTT-TG-CAAAAGTCAATGACATTTATAT------CGGATCTGAGGAATTTTTTCCAATTTTTGGTGAT--TATTT-TCACCAATTTTATG---TTTTT--CCCCAAAAACTCAAAAA-CGC-C-C-CC-------AC-----GT-AGGAATGTTAAACAA-CCTGATTTATAATC-----AGGGGAACAT---TACCTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttggcaaaatccagagaagcacagcaatgtattgttcatttaggagttttccattcactatcctctgaactggaaaccactggggaaaatagtgagcgtgagtggacttttacacatgattattgagtctggaatatatgtacgatatgtcagaaaatgttataaacttcaaactttataaatgtacctaaccttgatatcaagcaacgtaatatacataagcgtttagttctttaagcaatgcatgcttgcaaaatgcccattatgttttctatttcaacaatcgtataatgacaattttatacatgtattttgtccaaaactcgaagacgtctccaaatatcaatgtcagacagtctgatttcaataaggataaaactgttcgtttcctttgattttacatacagaattaatgatacgttaagaaaataattattttcattggttcatatgatttatatattcatttccaataaatttgaaaagtaaaaatcatgttgtaacctaaaaattcataaacattcatacatatttattttcacacaactaaatatataaacaaggggttacacatatttacaaaagacttgtatgcaaataataaggacatcaatatcggtatgtgaaattttccccccaactttgagtgattattatttttacacatttcaagtttttgcccaaaaactcgaaaaggtctccatgcaaacaatcttatttataatcaaaggtacatacattcagaaaacaatgattttcatcagtaaatattatctattgagagttgaaggagatttccatttttcgattatttttagagaaaaaatcccgttttagccccaaaactcgtcgatgcccccaactatctatgccagacattggatggctacatatgttcacaaaatatttgtttgcaaaattcagtgatatctatatcggatctgaggagcttgtccaatttttggtgattatttttaccaattttatgttttttcctccaaaactcaataacatcccacgtaagaatgtcaaacaacctgatttataattagggggctatgtacttgcaaattatacctgtttgcaaaagtcaatgacatttatatcggatctgaggaattttttccaatttttggtgattattttcaccaattttatgtttttccccaaaaactcaaaaacgcccccacgtaggaatgttaaacaacctgatttataatcaggggaacattaccttt
gi|20 : ttttgattggatatcctgaaaaaaagttcaactaaaccaaccatacttcttgaggcaggatggttatctacaaccacacctaatggaggaacactttgttggattgttgattatatggttccaatcacctgccctattgcaagaaatgacactattcagcatgctattcagctagattaatatcacaagaagctgtcaaaatgtaactatccttgcatgtgattttgcagtggctannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAGACA-GTCT-G--ATTT--ACAA-T-----TAAAG---------------G-GTT-------CCAT----AC-----T-A-A--TGGTACGTTAAGAA---------AAT----AATCATTTTCAA--A-AGTTCATA-----TG---ATTTACATA---G----GA---TC-TG-A--AGAGG-T-TC--TCCA-TTTTT-CAt
gi|21 : ATATTCACAAAATACTTGTTTGCAAAT--GCCA--G---TGGC-A---TC-------AA-TAT---CGG-A--CCT--GAAA--GGCTTTT----C--------C-AATTTTCA-GCG-AT--TA----TTT-CA---C----AAATTT-CAAG-TTTTTGCCCCA-AAA
gi|22 : GAA---------AAT----AATTGTTTTCAA--A-G-TCCATA-----TA-----TTATATAAACG----GA---------A--AGAAC-T-TTCTTCCA-TTTTTTCAGT-GA--TT--TTT---T-AA-GTAAAAAATCATG--TTGTAGCCTC-AAACTT
gi|23 : --TATAT-TTACAAATATTATGAG-TATTTCCCCTCAAATATTCATAAA-AT--C-C-CT-------ATATTCTGT-A--AATGTTAAACAA-CCTCGTTTATAATC-----AAGAGACTAT-A-T-CTTTC
gi|24 : cAA---ACAA---CTAAATAT-ATATTCAAGGGGTTTCATATAGTTACAAATGACTTGTTTGCAAAT--GATA--A---TGAC-A---TT-------T--TAT---CGG-A--TCT--GAAA--AGGTTTT----T--------
gi|25 : tcTTTGTTTGGATGTACTGAAAAAAAAGCGTCGATCCAACTAAACC---AACCGTACC-TCTAA-GGACAGGATGATTATCTACAACAACACCTG-AT-GAAGAAGTAtttccaat
gi|26 : ----AATTGTTTTCAA--A-GGTCCATA-----TG---ATTTAAATA---G----GA---TC-TG-A--AAAAG-T-TC--TCTA-TTTTT-CAG-TGATTTT--TTT---A-AA-GTAAAAT-GCATG--TGGTAGCATC-A
gi|28 : GAC-GA--TTT---ACTTATACCTCCATGC--TCGCAA-AAC-TC-GAAA-ACGTT-C-CC-------AATTATCA--ATGTCAGAC-AGTC-TG--ATT
gi|29 : AATTTGGC-AAAATACTG-AGAAATAC----AGC-GA-TGT------TCAC-TTAGGAATTTTCCATTCACTATCCTCTG-CA
gi|3 : ACAAAC-CACCTGCATCGAAGAAGTAATTTGCTCGAAATG--TTATAATTATT-CGGTTCCCAATCACCTGCCCTATTACCA-GAAATT-GGCACTG-TACAGCAGGTTATTC-AGC--------T-ATCAC-AAGAAGGGGTTTTGT-----TGTAACTATCCTTGCTTGTGATATTTTGCAG
gi|3 : caaTTGGC-AAAATACAG-AGAAATAC----AGC-GA-TGT------CCAT-TTAGGAGTTTTCGATTCACT-TCC-CTG-CACTGGAAACAGTTCGGGAAA---A---T---AATG--AGCGCGAG-T-GGACT-TTC-AC-AC-----GTTGA-T-TATTGA-GTCTGAA-A---TA-TAT-----GT-ACGA-TAT--ACTCA-----GGTATCAGATAATGTT---AT-A--------AGCTCCA-AACTT-------------------A--G---CCTT---GATA-TCAAA-CAAAT-AATACACATAA-GTATG--A-----GGTTGTTCTTT-CTTT--AAAGC----AAAA-TGCATGCTTG---CAAAATGTCCAT--A-T-AT--GA-CTGT-----TGAAA----A------TT-TTCT-CTA-----T---TTCAA-C-AGT-ACTG-TATAATGAC-AATTTTTCATACATGTATTT---TGT--CC-CAA-AAC-TC-G-AAGATG-TCC-CC-------AAATATTA--ATGTCAGAC-AGTC-TG--ATTT--ACAA-T-----TAAAG---------------G-GTT-------ACAT----AC-----T-A-T--TGATAATTTAAGAA---------AAT----AATTG-TTTCAG--A-GGTCAATA-----TG---ATTTGAATA---A----GA---TC-TG-A--AGAAG-T-TC--TCCA-TTTTT-CAG-TGT--TT--TTT---T-AA-GTAAAAA-TCATG--TTGTAGCCTC-AAACCTTATAAAC-ATATACATACA--T------------ACAAATACAGGTTT------------TTATGCC-AA---ACAA---CTAGATAT-ATAATCAAGGGGTTACATAAATT-ACAAAAGACTTGCTTGCAAAT--AATA--A---TGAC-A---TCTACCAGGTA-TAT---TGG-A--TCT--G-AA--AAGTTTT----C--------C-AATTTTCA-GCT-AT--TATTATTTT-CA---C----AAATTT-CTAG-TTTTTGCCCCA-AAAC-TC---G-AAAAGG-TCTCCGGGTAA-ACAT-TGTAACC-TTA--------------------TTAT----AA--ACAAAGG-GTTAC--T-AATTT-C--AGAAA-ACATTT-----A-TTTT--CATCAGTC-AA--T-ATTA--TCT-ATAGAGAGTA-TGAATAAGTTT------T---CCA--TTTTTCGATT-AT-TTATTA-----A----GAAA--AAA-TCCTGTTTTAGTCCA-----AAGA-----------CTCGTC--AATGT---TATAA-TATC-T-ATGTTAAACAAACT--------------TGATATA--TC-AT-T-----GAAT--G---GTTA-CA-TAC-GTT----CAC-AAA------TACTTGTTTGC------AAAAGTCAACGACA--TTTATAT-CGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntataattggcaaaatacagagaaatacagcgatgtccatttaggagttttcgattcacttccctgcactggaaacagttcgggaaaataatgagcgcgagtggactttcacacgttgattattgagtctgaaatatatgtacgatatactcaggtatcagataatgttataagctccaaacttagccttgatatcaaacaaataatacacataagtatgaggttgttctttctttaaagcaaaatgcatgcttgcaaaatgtccatatatgactgttgaaaattttctctatttcaacagtactgtataatgacaatttttcatacatgtattttgtcccaaaactcgaagatgtccccaaatattaatgtcagacagtctgatttacaattaaagggttacatactattgataatttaagaaaataattgtttcagaggtcaatatgatttgaataagatctgaagaagttctccatttttcagtgtttttttaagtaaaaatcatgttgtagcctcaaaccttataaacatatacatacatacaaatacaggtttttatgccaaacaactagatatataatcaaggggttacataaattacaaaagacttgcttgcaaataataatgacatctaccaggtatattggatctgaaaagttttccaattttcagctattattattttcacaaatttctagtttttgccccaaaactcgaaaaggtctccgggtaaacattgtaaccttattataaacaaagggttactaatttcagaaaacatttattttcatcagtcaatattatctatagagagtatgaataagttttccatttttcgattatttattaagaaaaaatcctgttttagtccaaagactcgtcaatgttataatatctatgttaaacaaacttgatatatcattgaatggttacatacgttcacaaatacttgtttgcaaaagtcaacgacatttatatcg
gi|30 : caaacaaaccacctgcatcgaagaagtaatttgctcgaaatgttataattattcggttcccaatcacctgccctattaccagaaattggcactgtacagcaggttattcagctatcacaagaaggggttttgttgtaactatccttgcttgtgatattttgcagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntataa-T-----GAAT--G---GTTA-CA-TAC-GTT----CACAAAATACCGGTACTTGTTTGC------AAAAGTCAAAGACA--TTTATA
gi|31 : ACCAAGGGGTTACATAAATTTACGAAAGACTTGCTTGCAAAT--AATA--A---TGAC-A---T
gi|32 : AA---A---T---AATG--AGCGCGAG-T-GGACT-TTC-AC-AC-----AT-CA-T-TATTGA-ATCTGG--AATATA-t
gi|34 : CTTCATATA--TGT---AC-CTA--G---CCTT---GATA-TCAAG-CAACTTGATATA
gi|35 : TCCCTAGGG-GG-T-CCCCC-TTACCTT-AC-TGGCCCATGG
gi|4 : TGGC-AAAATTCATTAGAAACACTAACAGCTGA-TGT--------AA-TTG-----TTTCGTTTTAGGAGCCTCTG-CA------GCACTT-GT--AA---A---TCGCAATGG-AGCGCGAG-TCGAACTGTTCTACCAT-----GT-GA-T-TATT------CG-----TAGA-TAT-----GT-AAGA-------------------A------AATGTT---AT-A--------AACTCCA-AACTTCATATA--TGT---AC-CTA--G---CCTT---GATA-TCAAA-CAACTTGA-----------------------GGAT--TAGTT-CTTT--AAAGC----AAAA-TGCATGCTTG---CAAAATGCCCAT--AAT-AT--GA-CTGT-----TGGAAA---T------TT-TTCT-CTA-----T---TTCAA-C-AAT-ACTGT-------AC-AA--T-------ATGTATTT---TGC--CC-CAA-AAC-TC-GAA-GACG-T-T-CCCATGC--AAATATCA--ATGCCAGACA-GTCT-G--ATTT--ACAA-T-----TAAAG---------------G-GTT-------ACAC----AC-----T-A-A--TGATACGTTAAGAA---------AAT----TATCATTTTCAA--A-GGTTTAT------CGAT---TTATATA---A----GAT---A-TG-A--AGAGG-T-TC--TCCA-TTTTT-CAGT-GA--TT--ATT---A-AAAGTAAAAA-TCATG--TCGTAGCCTC-CAAACTCATATAC-AT-T-CATACA--T------------A------------T------------TTATGTCAAA----CAA---CTAAATAT-ATAATCAAGGGGTTACATA----------AGACTTGTTTGCAAAT--G--ATAA---TGAC-A---TC-------TA-CAT---CGG-A--TCT--GAAA--AAGTTTT----T--------CCAAATTTCG-GCG-AT--TATTATTTT-CA---C----AAATTT---------TTGCCCCA-AAAC-TC----AGATAGA-TTTCTATGCAA-ACAA-TTTTA---TTTATAATCAAAGGGTCACATATTTATTTAAAA--TCAAAGG-GTCACA-T-ATTTT-CAGA--AA-ACAATT------CTTTT--CATCCGTC-AA--T-ATTA--TCT-ATGGAAAGCT--GAAGGAG-TT------TT--CCA--TTTTTCGATT-AT-TTTTAA-----A----GAAA--AAAT-CCTGTTTTAGACCC-----AAAA-----------TTTGTCAA--TGTCCCCA-AA-TATCT--ATAACTGAC-AACT--------------TGATATA--TA-AT-T-----GAATATG---TTTA-CA-TAC-GTT----CACAAAA------TACTTGTTTGC------AAAAGTCAATGACA--TTTATAT-CGG---ATCTGAGGAGT-TT-TTCCAATTTTCGGTGATTATTGT--CACCGA-TTTCATGTTTTTTTTGCCCCAAAA---CT--A---AAAAACGCC-CCCACGT--AGGAATGT-CAAACAACC-TGA-TTTATAATCG-AG-TGACTATGTACTT-TA---AAATTATACTTGTT-TG-CAAAAGTC--TGACATTTATAT------CGGATCTGAGGGT-TTTTTCCAATTTTCGGTGAT--TATTG-TCACCGATTTCATGTT-TTTTTTGCCCC-AAAACTAAAAAA-CGC-C-C-CC-------AT-----GT-AGGAATGTCAAACAA-CCTGATTTATAATCAATTTAAGGGACTAT-A-TACTTTCAAAtct
gi|5 : aCTCTG-CACTGTAAACCACT-GGAGGAGAGA---T---AATGG-AGCGCGAG-T-GGACT-TTC-AC-AT-----GC-GAGTGTGTTGA-GTCTGCTTAATCTAATAA-----GTTACGA-TTTGCA-TTGTCAAAGATA------AATGTTGAAATGACACAGAGAAACTCCATCAGGTCACTAC--TGTTCAACACTA--AGCACCTTAAGGATAGTCAAAGCAACT----ATG---AG-GA-T---A-----G--T--AATTT-CTTTCAAAAGCGAGAAAAA-TGCACCATTAACACAATATGCCCATTAA-T-ATTGGATCTGTCA---TGCAAATAAT------TTATTCTACTA-----TATATCTAATC-AATTACTGTTACAATAGC-------TCTTAAGTATA-------GC--CCACAA-AACGTC-GAA-GACG-T-C-CCCATGCAGAGATATCACAATGCCAGAACGGTCT-G--ACTTGTACAAAT-----TAAAGTG-------------A-GTTACTGGAAGCAT----CT-----T-ACA--TGATCATCTAAGAATCTCTATAAGATGAG-AATTGTCT-CAATTATGGTCAATAGTTTTTCATCATTTTCATA---GAAGAGAC--CCATGTATCAGAGG-TGTC--TCCA-TTTT--CAGTGTA--TT--ATT---A-AAAGTAACAA-TC-TG--TCGTAGCCTCCAAATTTCATAAACAGT-T-CATACA--T------------A------------T------------TTATTTCAAAGTGAAAATTCTTAAGTATGATAATCAAGGTGTTA-AT----------AAGACTTGTTGGCAAAT--GA-A--A---TGAC-A---TC-------TACCAT---C-G-A--TCT--GAAAACAAGTTTT----T--------C-CAAATTCG-CCGAATAGTATTATTTT-CAG--C----AAATTT-CAAG-TTTTTGCCCCAGAAAA-TCAGAGAAAAAGGTTCTCCGTGCAA-ACAA-TATTT---TTTTACTCCA-------------TTAT----AAATTCAAAGG-GTCACAGTGATTTT-C--AGAAA-ACAATT-----TCTTTTTGCATCAGCT-AAATT-ATTA--TCT-ATGAAGAGTTCTGAAGGAA-TT------TTTACCATTTTTTTCGATTAATATTGTGAAAGACA----GAAA--AAATCACTATTCTCACCCCTCTATAAAAAGATAAATTTCTTTTTCAAAGGTTCCCCA-AATTATCTT-ATGTCAGAC-AACT--------------Tt
gi|6 : atttggcaacattatcagtacgacataacaccagcatcgcatattgtgtcggtttaggaagcaCAAA---ACAA---CTAA-TAT-ATAATCAAGGG-TTA-ATAAAT--ACAAAAGACTTGCTTGCAAAT--AC-AC-A---TGGC-----TC-------TA-TAT---CGG-A--TCTT-GAAA--AAGTTTTCT--T--------C-AATTTTCA-ACA-----TAT-ATTTT-CA---C----AAATATACTAG-TTTT-GCCCCA-AAACCTC---GAAA--GT-TCTCCGGGTAAGACA---CTTAACCTA---------------------TTAT----AA--TCAAAGG-GTTA-A-T-ACTTTTCAGA--AA-ACATTT-----ATTTTT--CATCAGTC-AA--TTATTA--TC--ATAGAGATAT--GAAGGAG-TTGTTTTTT---CCA--TTTT-CGATT-AT-TTATAA-----A----GAAA--AAATTCCTGTTTAA--TCC-----AAAA-----------CTC---ACAATGTTCTCA-AA--ATCTC-ATGTAAAAC-AACTTATATATCATTGAATGGTATA--TACGT-TCACCAAAAT--ACTTGTTC-CAATGC-ATTATATCGNNNNN------NNNNNNNNNNN------NNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN-NNN---NTCTGAGGAGT-TT-T-CCAATTTTCG-TGATTATTTT--CACCAATTT--ATG-TTTTT--GCCCC--AAAAACTCAA---AAAAACGCCGTTCACGT--AGGAATGTCAAAACAACC-TGA-TT-ATAAGCA-AG-G-ACTATGTACTCGTC---AAATAAC-CTTGTA-T-CCAAAAGTCCATAACATCTTTAT------CGGATTTGAGGAG-TTTTTC-AATTTT-GGCGAT--TATTT-TCACCAATTTCATG---TTTTTTGCCCCAGAAACTCAAAAA-CAACC-C-CC-------AC-----GT-AGGAA-GTCAAACAAACCCGATTTATAATC-----AAGGGACTAT-G-TACTTTCAAATTATACTTGTTTGCAATAGTCATAAGACA---TCTATAT--T-GGA--T-TGA-GAGTTTTG-------CCTA--TT-CA-G-CGATT-A-TTTTCAC--A--ATT-TC----A-AT--TAATTTCAAGTTTT--------TTGCC-CCAAAAACCTCAAAAAACGCC-CC-CACGTA-ACGAA-T-T--CAAAGGCAACCTGA-TT-----TTTAA-------TCAA--GA-CT-AT-T-----AGTTTCAAAAAATT-----ACTTGTTT---GCAAAAAT-CCTGAGG-GGGT-CCCCCATTACCTTTAC-TGGCCCATGGtg
gi|7 : tgA--ATGTCATATA-GTCT-G--ATTT--ACAA-T-----TAAAG---------------A-GCT-------tc
gi|7 : attaagaatttgatctcatagaccatgggccagtaatGCTTTGAA--A-GGTCTATA-----TGAT---TTATATA---G----AAT---C-TG-A--AC----T-TT--TTTA-TTTTT-TGGT-GA--TC--TTTTTAA-AA-GTAAAA--TCATG--TTGTAGCCCG-AAATCTCGTAATT-GT-T-CACACA--T------------A------------TCATAGTATAAATTTATGTCAAA---TAAA---TTAA-TAT-ATGATTAAAGGCTTGCATATATTCACAAAATACTTGTTTCCAAAT--GTCA--G---TGAC-A---TC-------TG-TAT---CGG-A--TGT---AAA--ATGTTTT----T--------CTACTTTTTG-GCG-AT-----TATTTT-CA---CAATTAAATTT-CAAA-TTCTTACCCCA-AAAC-CC----AGAAAGG-TCTCCATGCAA-ACAA-TA-TA---AT---------------------TTAT----AA--TCAAAGG-GTTGAA-T-AGTTT-C--AGAAA-ATATTTTTTTCATTTTC--CATTTTTC-GA--TGATT---TCT-A--AAGAAAA-TAAAA----------------TCA--TGTT----TT-AG-CCCCAA-----AACTCGAAA--A------TGT------CCC-----AAAA-----------TACTT----ATGT---CA-AA-CAACTTGATAT---AT-AATT--------------T---------A-AT-T-----G----------TTA-CA-TAC-GTT----CACAAAA------TACTTGTTTAC------AAAAGTCAATGACA--TCTATAT-CGG---ATCTGAGGAGT-TT-TCCCAATTTTCGGTGACTATTTC--CACCAA-TTTCATG-TTTTTttgaaaggtctatatgatttatatagaatctgaacttttttattttttggtgatctttttaaaagtaaaatcatgttgtagcccgaaatctcgtaattgttcacacatatcatagtataaatttatgtcaaataaattaatatatgattaaaggcttgcatatattcacaaaatacttgtttccaaatgtcagtgacatctgtatcggatgtaaaatgtttttctactttttggcgattattttcacaattaaatttcaaattcttaccccaaaacccagaaaggtctccatgcaaacaatataatttataatcaaagggttgaatagtttcagaaaatatttttttcattttccatttttcgatgatttctaaagaaaataaaatcatgttttagccccaaaactcgaaaatgtcccaaaatacttatgtcaaacaacttgatatataatttaattgttacatacgttcacaaaatacttgtttacaaaagtcaatgacatctatatcggatctgaggagttttcccaattttcggtgactatttccaccaatttcatgtttttg
gi|8 : attaagaatttgatctcatagaccatgggccagtaataatgtcatatagtctgatttacaattaaagaATATTCACAAAATACT-GTTTGCAAATC-G--GTCA---TGAC-A---AC-------TA-CAT---CGG-A--TCTACGAAA--A------------------------TGTCG-GCG-GA--TATT--TTG-CAGTTC----AA---T-TAAGATTGGTGCCCCA-AAA--TC---AAAACAG--TATCCATGCAA--CAA-TATGA---TT---------------------T-AT----AA--TCAAAGGAGTTAAA-T-ACTTT-CAGA--AA-GTATTT-----GTTTTTT-CAAAAGTTGAA--T-ATTGGTTCTTGTGAAGAGTC-TGGAAGAG-TT------T------------TCCATT-AT-TTCAAA-----A----AAAA--AAATCAC-GATTTAGTCCA-----AAAA-----------CTCG--AAAATGTTCC------------------AAAC-AACT--------------TGATATA--TA--T-T-----TAAT--G----TTAGCA-TAC-GTT----CACAAAA------TA-TTCTTTGCAAAAATAAAAGTCAATGACATCTTTAT-T-CGGCATGTCTGAGGAGT-TT-T-----TTCTCAATGATTATTTTCACACCAA-TGTCATG--TTTTTTGCCCCA-AA---CT------TGGAACG---CCCAGGT--A-GAATGTCAAAACAGGC-TGACTTTATAAATGCAGTGGACTATTGACTG-TCGAAAAAGTATACTT-TT-T--CAAGAGCCg
gi|9 : -ATGTTAAA--AACT--------------TGATA-A--TC-ATAG-----GAAT--G---GTTA-CA-TAT--TT----CACAAAA------TACTTGTTTGC------AAAGTTCAATGACA--TTTATATCCGG---ATttcaggagtctccctt
gi|9 : GGATCTGAAGAG-GTAT-CCAATTTCGAGTG-T--TATTT-TCACAGATTTTATG---TTGTTTTCCC--AAAACCCAAAAAACG--CTC-CC-------AC-----GTTAGGAATGTCAACAAA-CCTGATT-ATAATC-----AAGGGACTATTG-TACTTTCAATATATACTTGTTTGCAATAGCCA-ATGA-A---TCTATA---TCGGA--TCTGATGAGTTTTT-------CCAATTTT-CA-GCCGATT-ATTATTCACCAA--ATT-TC----CAG---T---------TTTT--------TTGCC-CC-AAAACTC---AAAACGCC-CCACACGTAGG-GAA-TGT--C-AA--CAACCTGA-TC-----TTTAA-------TCAA-GGGACTACTGT-----AGTTTC--AAAAAT-----ACTTG-TT---GCAAAAAT--CTAGGG-GGGTCCCCCCATTACCTTTAC-TGGCacgaaaacgtcgatcaatctcgtaagtccaaattagggatctgaagaggtatccaatttcgagtgttattttcacagattttatgttgttttcccaaaacccaaaaaacgctcccacgttaggaatgtcaacaaacctgattataatcaagggactattgtactttcaatatatacttgtttgcaatagccaatgaatctatatcggatctgatgagtttttccaattttcagccgattattattcaccaaatttccagtttttttgccccaaaactcaaaacgccccacacgtagggaatgtcaacaacctgatctttaatcaagggactactgtagtttcaaaaatacttgttgcaaaaatctaggggggtccccccattacctttactggcatagtctagggattcaatt
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|27 ): AANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACAGGTATT
Unaligned ( gi|33 ): GTGAAGAGTCTGAAAGAGTTTTCCATTATTCAAAAAAAAAAATCA
Alignments
lowQualScore : 11 2222 111 1 1 1 111 1 11 11 111 1 1 111 111 1 1 3333333333 1 33333 111 1111 3333333 11111111111 22 11111 3333333 11111 77777777777777777777777777 333333333333333 11111111 111111 6666666666666666666 1111 222222 11111 33333333333 11111 111 11111 11 111 1 2222222 22 11 11111 333333333333333 2222222 1111 11111 11 222222222 1111 33333333333 3333333333333333333333 11 66666666666666666666666666666666666666666 1111 11111 1111111 1111 2222222222222 11111 111 11111 66666666666666666666666666 11 1111111 11 1111 2222222222 1111111111 111 11111 33333333333333333333 22222222222222 11111 111111 111111 111 11 1 11 33333333333 111 11 111 222 111111 222 11 1111111 11111 11111 1 111 222 11 2222222 1 22222 77777777777777777777 22222222 1111 11 11 22222222 2222222 11 33333333 222222 1 111
lowQualScore : 33 2 1111 777 2 0 1 0 0 999 8 5 1 00 33 777 0 0 000 000 1 0 1 0 7777777777 0 33333 6 7 333 1 6 22 6 4444 6 6 7777777 77 9 5 1 6 22 77777777777 00 5 5 5 5 5 44444 5 5 5 5 7777777 5 66666 6 11111111111111111111111111 333333333333333 5 33333333 888 5 111111 888 5 5 66666 2222222222222222222 66 5 66 0000 5 0 888 3 2 222222 66 5 99999 22222222222 5 5 22222 888 5 5 999 222 11111 33 1 777 00 8 4 4 3 777 1 4 3 4 5555555 55 33 99 55 66 4 11111 333333333333333 4 0000000 0000 22222 5 11 1 000000000 7777 55 3 33 00000000000 3333333333333333333333 0 3 3 55 77 88 55 55 88888 7 55 55 5 3 66 5 777 22222222222222222222222222222222222222222 4 0000 777 3 4 2 5 11111 66666 888 0000000 3 555 3 44 77 0000 1111111111111 7 3 55555 3 3 000 7777 4 4 4 66 44444 2 77 66 1 55 55555555555555555555555555 1 9999 66 4 444 4 1 4 33 6 4 1 9999999 00 4 66 8 66 4 1 1111 8 3333333333 66 1 4 4 1 1111111111 66 666 0 22 11111 11111111111111111111 4 0 4 55 2 999 3 4 33333333333333 1 77777 4 11111 9999999 4 4 4 9999 222222 222222 66 5 000 6 6 44 1 99 5 5 5 55 44444444444 000 99 3 66 6 8888 0 6 6 6 111 6 5 000 7 999999 5 3 9 0 66 4 3 1 000 3 88 4 55 4 4 4444444 11111 4 0 4 3 11111 888 1 9 0 444 111 11 5 0 6666666 88 8 8 8 88 0 55555 8 66666666666666666666 99999999 8 8 0000 8 8 999 8 5 11 0 11 22222222 6666666 11 8 0 00000000 0 333333 0 444 0 6 6 8 0 0 8
lowQualScore : .. . .... ... . . . . . ... . . . .. .. ... . . ... ... . . . . .......... . ..... . . ... . . .. . .... . . ....... .. . . . . .. ........... .. . . . . . ..... . . . . ....... . ..... . .......................... ............... . ........ ... . ...... ... . . ..... ................... .. . .. .... . . ... . . ...... .. . ..... ........... . . ..... ... . . ... ... ..... .. . ... .. . . . . ... . . . . ....... .. .. .. .. .. . ..... ............... . ....... .... ..... . .. . ......... .... .. . .. ........... ...................... . . . .. .. .. .. .. ..... . .. .. . . .. . ... ......................................... . .... ... . . . . ..... ..... ... ....... . ... . .. .. .... ............. . . ..... . . ... .... . . . .. ..... . .. .. . .. .......................... . .... .. . ... . . . .. . . . ....... .. . .. . .. . . .... . .......... .. . . . . .......... .. ... . .. ..... .................... . . . .. . ... . . .............. . ..... . ..... ....... . . . .... ...... ...... .. . ... . . .. . .. . . . .. ........... ... .. . .. . .... . . . . ... . . ... . ...... . . . . .. . . . ... . .. . .. . . ....... ..... . . . . ..... ... . . . ... ... .. . . ....... .. . . . .. . ..... . .................... ........ . . .... . . ... . . .. . .. ........ ....... .. . . ........ . ...... . ... . . . . . . .
lowQualScore : 88 5 2222 555 5 0 0 0 0 666 0 0 0 22 88 000 0 0 222 888 0 0 2 0 2222222222 0 33333 7 3 777 0 7 00 7 2222 7 7 5555555 00 3 7 0 7 00 77777777777 77 7 7 7 7 7 33333 7 7 7 7 6666666 7 77777 7 22222222222222222222222222 666666666666666 7 55555555 888 0 666666 888 0 0 88888 7777777777777777777 99 0 99 6666 0 1 888 1 2 222222 99 0 44444 44444444444 0 0 55555 888 0 0 000 999 22222 88 1 888 66 9 4 4 6 333 9 4 3 4 6666666 55 99 99 55 11 4 11111 999999999999999 4 6666666 6666 55555 0 99 3 000000000 2222 00 6 88 77777777777 6666666666666666666666 4 6 6 00 88 88 00 00 11111 3 99 00 5 6 22 0 111 99999999999999999999999999999999999999999 6 4444 000 8 0 6 8 55555 77777 555 8888888 3 888 3 66 99 8888 8888888888888 3 6 11111 2 6 000 7777 0 0 0 33 33333 0 33 33 0 44 44444444444444444444444444 9 4444 11 4 888 4 9 4 99 7 4 0 2222222 66 4 11 9 11 4 9 8888 9 1111111111 11 9 4 4 0 6666666666 11 222 8 00 11111 33333333333333333333 7 1 4 22 0 333 2 0 55555555555555 8 44444 4 11111 6666666 4 4 4 4444 888888 888888 11 0 000 7 7 33 0 22 5 2 7 88 88888888888 222 22 7 00 7 2222 7 7 7 7 777 7 7 000 5 222222 0 2 6 4 11 4 9 8 000 6 33 4 00 4 4 4444444 11111 4 1 4 9 11111 000 0 8 0 000 666 00 0 8 0000000 88 0 0 0 88 6 88888 0 88888888888888888888 00000000 0 0 6666 0 0 222 0 0 00 8 00 88888888 0000000 22 0 8 00000000 8 888888 6 000 8 7 7 0 8 8 0
consensus : ATTTTGTTTGGATATACTGAAAAAA--GCGTT----CAACTAAACC---AACCGTACC-TCTNG-GG-CAGGATGGTTATCTACAACCGCACCTG-ATGGAAGAAGTANTTTGCTCGAC-TG--TTG--ATTATA-TGGTTCC-AATCACCTGCCCTATTACAA-GAAATT-GNCACTG-TTCAGCAAGTTATTC-AGC--------T-ATCAC-AAGAAG-----CTGTCAAAATGTAACTATCCTTGCATGTGATATTTTGCAGTNGCTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATTTGGC-AAAATCCAG-AGAAATAC----AGC-GA-TGT------TCAT-TTAGGAGTTTTCGATTCACTATCCTCTG-CACTGGAAACAATT-GGGGAA---A---T---AATGG-AGCGCGAG-T-GGACT-TTC-AC-AC-----GT-GA-T-TATTGA-GTCTGGA-AATATA-TAT-----GT-ACGAT-AT--A-TCG-----GATA------AATGTT---ATTA--------AACTCCA-AACTTCATNAA--TGT---AC-CTA--G---CCTT---GATA-TCAAA-CAACTTGATATACATAAG-C-T---A-----GGTT--TAGTT-CTTT--AAAGC----AAAAT-GCATGCTTG---CAAAATGCCCAT--A-T-AT--GA-CTGT-----TGGAA----T------TT-TTCT-CTA-----T---TTCAA-C-AGT-A-CTGTTATAATGAC-AA--TTTCATACATGTATTT---TGC--CC-CAA-AAC-TCGAAAG-ACG-T-C-CC-------AAATATCA--ATGTCAGACAAGTCTTG--ATTT--ACAA-T-----TAAAG---------------G-GTT-------GCAT----AC-----TA-A--TGATACTTTAAGAA---------AAT----AATTGTTTTCAA--A-GGTCCATA-----TGAT-ATTTATATA---G----GAT--TC-TG-A--AGAGG-T-TC--TCCATTTTT-CAGTTGA--TT--TTT---A-AA-GTAAAAA-TCATG--TCGTAGCCTC-AAANCTCATAAAC-GT-T-CATACA--T------------A------------T------------TTATGTCAAA---ACAA---CTAAATAT-ATAATCAAGGGGTTACATATATTCACAAAAGACTTGTTTGCAAAT--GACA-A---TGACA---TC-------TA-TAT---CGG-A--TCT--GAAA--AAGTTTT----T--------C-AATTTTCG-GCG-AT--TATTATTTT-CA---C----AAATTT-CAAG-TTTTTGCCCCA-AAAC-TC---GAAAAAGG-TCTCCGTGCAA-ACAATN-TTA---TT---------------------TTAT----AA--TCAAAGG-GTTACA-T-ACTTT-CAGAGAAA-ACANTT-----GTTTTT--CATCAGTC-AA--T-ATTA--TCT-ATGGAGAGNT-TGAAGGAG-TT------T---CCA--TTTTTCGATT-AT-TTNTAA-----A----GAAA--AAATTCCTGTTTTAGCCCC-----AAAA-----------CTCGTCAAAATGTCCCCA-AA-TATCTT-ATGTCAAAC-AACT--------------TGATATA--TA-AT-T-----GAAT--G---GTTA-CA-TAC-GTT----CACAAAA------TACTTGTTTGC------AAAAGTCAATGACA--TTTATAT-CGG---ATCTGAGGAGT-TT-T-CCAATTTTCGGTGATTATTTT--CACCAATTTTCATG-TTTTTTTGCCCC--AA---CT-AA---AAAAACGCC-CCCACGT--AGGAATGTCCAAACAACC-TGA-TTTATAATCG-AG-GGACTATGTACTT-TC---AAATTATACTTGTT-TGCCAAAAGTCAATGACATCTATAT------CGGATCTGAGGAG-TTTTTCCAATTTTCGGCGAT--TATTT-TCACCAATTTCATG---TTTTTTGCCCCAAAAACTCAAAAA-CG--C-C-CC-------AC-----GT-AGGAATGTCAAACAA-CCTGATTTATAATC-----AAGGGACTAT-G-TACTTTCAAANTATACTTGTTTGCAATAGTCA-ATGACA---TCTATAT--TCGGA--TCTGAGGAGTTTTT-------CCAA-TTT-CG-G-CGATT-ATTTTTCAC--A--ATT-TC----GTGT--T---------TTTT--------TTGCC-CC-AAAACTTC-AAAAACGCC-CC-CACGTA-G-GAA-TGT--CAAA--CAACCTGA-TT-----TTTAA-------TCAA-GGG-CTAATGT-----AGTTTCAAAAAAAT-----ACTTGTTT---GCAAAAATCCCTAGGG-GGGT-CCCCCATTACCTTTAC-TGGCCCATGG
Reference ( family-3276 ) : ATTTTGTTTGGATATACTGAAAAAA--GCGTT----CAACTAAACC---AACCGTACC-TCTNG-GG-CAGGATGGTTATCTACAACCGCACCTG-ATGGAAGAAGTANTTTGCTCGAC-TG--TTG--ATTATA-TGGTTCC-AATCACCTGCCCTATTACAA-GAAATT-GNCACTG-TTCAGCAAGTTATTC-AGC--------T-ATCAC-AAGAAG-----CTGTCAAAATGTAACTATCCTTGCATGTGATATTTTGCAGTNGCTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATTTGGC-AAAATCCAG-AGAAATAC----AGC-GA-TGT------TCAT-TTAGGAGTTTTCGATTCACTATCCTCTG-CACTGGAAACAATT-GGGGAA---A---T---AATGG-AGCGCGAG-T-GGACT-TTC-AC-AC-----GT-GA-T-TATTGA-GTCTGGA-AATATA-TAT-----GT-ACGAT-AT--A-TCG-----GATA------AATGTT---ATTA--------AACTCCA-AACTTCATNAA--TGT---AC-CTA--G---CCTT---GATA-TCAAA-CAACTTGATATACATAAG-C-T---A-----GGTT--TAGTT-CTTT--AAAGC----AAAAT-GCATGCTTG---CAAAATGCCCAT--A-T-AT--GA-CTGT-----TGGAA----T------TT-TTCT-CTA-----T---TTCAA-C-AGT-A-CTGTTATAATGAC-AA--TTTCATACATGTATTT---TGC--CC-CAA-AAC-TCGAAAG-ACG-T-C-CC-------AAATATCA--ATGTCAGACAAGTCTTG--ATTT--ACAA-T-----TAAAG---------------G-GTT-------GCAT----AC-----TA-A--TGATACTTTAAGAA---------AAT----AATTGTTTTCAA--A-GGTCCATA-----TGAT-ATTTATATA---G----GAT--TC-TG-A--AGAGG-T-TC--TCCATTTTT-CAGTTGA--TT--TTT---A-AA-GTAAAAA-TCATG--TCGTAGCCTC-AAANCTCATAAAC-GT-T-CATACA--T------------A------------T------------TTATGTCAAA---ACAA---CTAAATAT-ATAATCAAGGGGTTACATATATTCACAAAAGACTTGTTTGCAAAT--GNCA-A---TGACA---TC-------TA-TAT---CGG-A--TCT--GAAA--AAGTTTT----T--------C-AATTTTCG-GCG-AT--TATTATTTT-CA---C----AAATTT-CAAG-TTTTTGCCCCA-AAAC-TC---GAAAAAGG-TCTCCGTGCAA-ACAATN-TTA---TT---------------------TTAT----AA--TCAAAGG-GTTACA-T-ACTTT-CAGAGAAA-ACANTT-----GTTTTT--CATCAGTC-AA--T-ATTA--TCT-ATGGAGAGNT-TGAAGGAG-TT------T---CCA--TTTTTCGATT-AT-TTNTAA-----A----GAAA--AAATTCCTGTTTTAGCCCC-----AAAA-----------CTCGTCAAAATGTCCCCA-AA-TATCTT-ATGTCAAAC-AACT--------------TGATATA--TA-AT-T-----GAAT--G---GTTA-CA-TAC-GTT----CACAAAA------TACTTGTTTGC------AAAAGTCAATGACA--TTTATAT-CGG---ATCTGAGGAGT-TT-T-CCAATTTTCGGTGATTATTTT--CACCAATTTTCATG-TTTTTTTGCCCC--AA---CT-AA---AAAAACGCC-CCCACGT--AGGAATGTCCAAACAACC-TGA-TTTATAATCG-AG-GGACTATGTACTT-TC---AAATTATACTTGTT-TGCCAAAAGTCAATGACATCTATAT------CGGATCTGAGGAG-TTTTTCCAATTTTCGGCGAT--TATTT-TCACCAATTTCATG---TTTTTTGCCCCAAAAACTCAAAAA-CG--C-C-CC-------AC-----GT-AGGAATGTCAAACAA-CCTGATTTATAATC-----AAGGGACTAT-G-TACTTTCAAANTATACTTGTTTGCAATAGTCA-ATGACA---TCTATAT--TCGGA--TCTGAGGAGTTTTT-------CCAA-TTT-CG-G-CGATT-ATTTTTCAC--A--ATT-TC----GTGT--T---------TTTT--------TTGCC-CC-AAAACTTC-AAAAACGCC-CC-CACGTA-G-GAA-TGT--CAAA--CAACCTGA-TT-----TTTAA-------TCAA-GGG-CTAATGT-----AGTTTCAAAAAAAT-----ACTTGTTT---GCAAAAATCCCTAGGG-GGGT-CCCCCATTACCTTTAC-TGGCCCATGG
gi|1 : ATTTTGTTTGGATATACTGAAAAAA--GCGTT----CAACTAAACCTTGAA--GTACT-TCTAG-AG-CAGGATGGTTATTTACAA---CACCTG-ATGGAAGAAGTTATTTGCTCGAC-TGATTTG----TATATTGGTTCC-AATCACCTGCCCTATTACAAGGAAATTGGCCACTATTTCAACAAGTTATTCAAGC--------TCATCACAAAGAAG-----CTGTCAAAATGCAACTATCC-TGCATGTGAT-TTTAGCAGTTGCTA
gi|1 : AACTTAGCCAAAATC------GAATAC----CGT-GAATGT------TCATATTAGCAGTTTTCATTTCACTATCCTCTTTCACTGGAAACAGTT-AGGGAA---A---T---AAT---AGTGCGAGAT-GGACT-TTC-AC-AC-----GT-GA-T-TATTGACGTCTGGAGAATATA-TATACATGGT-ACGATTAT--A-TCG-----GATA------AATGTT---ATTA--------AACTCCA-AACTTTCTTAAGCTGT---AC--TA--G---CCTA---GATA-TCAAA--AACTTGATATAAATAAGGC-TTTGG-----GGTT--TAATT-CTTT--AAAGC----AAAATTGCATGC--------AAGTTATTAT----T-AT--AA-CT-T-----TGGAA----T------TT-TTCT-C-A-----T---T-CAA-C-AGT-AACTGTTTTAATGAC-AA--TTCCATGCATGTATTT---TGT--CC-CAA-AAC-TTGGAAGGACG-T-C-TC-------AAATATCA--ATGTCAGACGAGTCTTG--ATTT--ACAA-T-----TAAAG---------------G-GTT-------GCAT----AC-----TA-AA-TGATATTTTAAGAA---------AAT----AATTGTTTTCAA--A-GGT---TA-----TGAT-ATTTATATA---G----GAT--TC-TT-G--AGAAG-T-TC--TCCATTTTTTCAGTTGA--TT--TTT---A-AA-GTTAAAA-AGATG--CTGGAAGCTC-AAACGTCATAAAC-AT-T-CATATA---------------A------------T------------TTATTTCAAA---ACAA---CTAAA-AT-ATAATCAAAAGGTTACATATATTTACATAAGA--TGTTTGCAAAT--G--A-A---TAATAA--TC-------TA-TAT---CTG-A--TCT--GGAA--AAGTTTT----T--------C-AATGTTCG-GCG-AT--TATT-TTTT-CA---C----AAATTT-CAAG-TTTTT-CCCCA-AAAT-TC---GAAAAAGG-TTCTTGGGTAA--CAGTTCTTA---TT---------------------TTAT----AA--TCAAAGG-GTTACA-T-ACTTT-CAGAGAAA-ACAGTT-----ATTTTT--CATCAGTC-AA--T-ATCA--TCT-ATTGAGAGGT-TGAAGGAA-TT------T---CCA--TTTTTCGATT-AT-TTATAA-----A----GAAA--AAATTCCTGTTTTAGCCCC-----AAAA------------TCGTCCCAATGTCCCCA-AA-TATCTT-A-GTCAAAC-AACT--------------TGATATACTTA-AT-T-----GAAT--G---GTTA-CA-CACTGTT----CACAAAA------TACTTGTTTGC------AAAAGTCAATGACA--TTTACAT-CGG---ATCTGAGGAGTATT-T-TCAATTTTCTGTGATTATTTT--CACCAATTTTTATG-TTTTTTTGCCCC--AA---CT-AA---AAAAACGCC-CCCACCCTAAAGAATGTTCAAACAACCGTGA---TATAATTA-AG-GGACTATGTGCTC-TC---AAATTATACTTGTTCTGCCAAAAGTCAATGACATCTATAT------CGGATCTGAAAAG-TTTTTCCGATTTTCGGCGAT--TATTT-TCACAAATTTCATG---TTTTTTGCCTCAAAAACTCAAAAA-CA--C-C-CC-------AC-----GT-AGGTATGTCAAACAT-CC-GATTTATAATC-----AAGGGACTAT-GTTACTTTCAAATTATACTTGTTTGCAA-AGTCA-ATGACA---TCTATAT--TCGGA--TCTGGGGAG-TTTT-------CCAA-TTT-CG-G-CGATTAATTTTTCAC--A--ATT-TC----GTGT--T---------TTTT--------TTGCCTTC-AAAACTTC-AAAAACGAC-CC-CACGTA-G-GAA-TTTTACAAA--CAACCTGA-TT-----TTTAA-------TCAA-GGG-CTAATGT-----AGTTTCAAAAAAAT-----ACTTGTTT---GCAAAAATCCCTAGAGCGGGT--CCCCATTACCTTTAC-AGGCCCACGGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacttagccaaaatcgaataccgtgaatgttcatattagcagttttcatttcactatcctctttcactggaaacagttagggaaataatagtgcgagatggactttcacacgtgattattgacgtctggagaatatatatacatggtacgattatatcggataaatgttattaaactccaaactttcttaagctgtactagcctagatatcaaaaacttgatataaataaggctttggggtttaattctttaaagcaaaattgcatgcaagttattattataactttggaatttttctcattcaacagtaactgttttaatgacaattccatgcatgtattttgtcccaaaacttggaaggacgtctcaaatatcaatgtcagacgagtcttgatttacaattaaagggttgcatactaaatgatattttaagaaaataattgttttcaaaggttatgatatttatataggattcttgagaagttctccattttttcagttgatttttaaagttaaaaagatgctggaagctcaaacgtcataaacattcatataatttatttcaaaacaactaaaatataatcaaaaggttacatatatttacataagatgtttgcaaatgaataataatctatatctgatctggaaaagtttttcaatgttcggcgattattttttcacaaatttcaagtttttccccaaaattcgaaaaaggttcttgggtaacagttcttattttataatcaaagggttacatactttcagagaaaacagttatttttcatcagtcaatatcatctattgagaggttgaaggaatttccatttttcgattatttataaagaaaaaattcctgttttagccccaaaatcgtcccaatgtccccaaatatcttagtcaaacaacttgatatacttaattgaatggttacacactgttcacaaaatacttgtttgcaaaagtcaatgacatttacatcggatctgaggagtattttcaattttctgtgattattttcaccaatttttatgtttttttgccccaactaaaaaaacgcccccaccctaaagaatgttcaaacaaccgtgatataattaagggactatgtgctctcaaattatacttgttctgccaaaagtcaatgacatctatatcggatctgaaaagtttttccgattttcggcgattattttcacaaatttcatgttttttgcctcaaaaactcaaaaacaccccacgtaggtatgtcaaacatccgatttataatcaagggactatgttactttcaaattatacttgtttgcaaagtcaatgacatctatattcggatctggggagttttccaatttcggcgattaatttttcacaatttcgtgttttttttgccttcaaaacttcaaaaacgaccccacgtaggaattttacaaacaacctgatttttaatcaagggctaatgtagtttcaaaaaaatacttgtttgcaaaaatccctagagcgggtccccattacctttacaggcccacggc
gi|10 : attttgtttggatatactgaaaaaagcgttcaactaaaccttgaagtacttctagagcaggatggttatttacaacacctgatggaagaagttatttgctcgactgatttgtatattggttccaatcacctgccctattacaaggaaattggccactatttcaacaagttattcaagctcatcacaaagaagctgtcaaaatgcaactatcctgcatgtgattttagcagttgctannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntG-TTTTTTTGCCCC--AAAA-CT-AA---AAACACGCC-CC-ATGA--AGGAATGTC-AAACAATC-TGA-TT-ATAATTG-TG-TGACTATGTACTT-TC---AAATTATACTT-TT-TGG-AAAAGTCAA--ACATTTATAT------CGGATCTGAGGAG-TTTT-CCAATTTC--GTGAT--TATTT-TCACCAATT-CATG---TTTTT-GCCCCAAAA-CTCAAAA--CG--C-C-CC-------AC-----GC-AG-AATGTCAAACAA-CCAGATTTATAATC-----AAGG-ACAAT-G-TACTTTCAAATTATACTTGTTTGCAAAAGTCA-ATGACA---TTTATA---TCGGA--TCTGAGGAGTTTTT-------CCAA-TTT-CG-G-TGATT-A-TTTTCAC--CT-ATT-TC-----TG-------------TTTT--------TTGCC-CC-AAAAC-TC-AAAAAC-CC-CC-CACGTA-G-GAA-TGT--CAAA--CAACCTGA--T-----TATAT-------TCAG-GGA-CTAG--------ACTTTCAAAAAAA--------CTG-TT---GC--AAATCCCCGGGG-c
gi|11 : caattcggatgagtattatcactaagatgttatagcgatcgtctcgttaTA--------AGCTCCA-AACTT-ATTAAC-TGT---AC-CTATAA---CCTT---TATA-TCAAA-CAACTTGATATACACAAG-CAT---ACATGGGGTT--TAGTT-CTTT--AAAGC----AAAAT-GCATGCTTG---CAAAATGTCCAT--A-TCAT--GA-CTGT-----TGGAA----A------TT-TTCT-CTA-----T---TTCAA-C-AGT-A-CTG-TATAATGAC-AAT-TTTCATACATGTATTT---TGT--CC-CAA-AAC-TCGAAA--ATG-TCC-CC-------AAATATCA--ATGTCAAAC-AGTCTt
gi|11 : taA--TT--TTT---A-A--GTACAAA-TCATG--TTGTAGCCTC-AAA---CATACAT-AT----ATAAAGGT------------A------------T------------TTATGCC-AA---ACAA---CTAGATAT-ATAAgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatttttaagtacaaatcatgttgtagcctcaaacatacatatataaaggtatttatgccaaacaactagatatataa
gi|12 : tataagctccaaacttattaactgtacctataacctttatatcaaacaacttgatatacacaagcatacatggggtttagttctttaaagcaaaatgcatgcttgcaaaatgtccatatcatgactgttggaaattttctctatttcaacagtactgtataatgacaattttcatacatgtattttgtcccaaaactcgaaaatgtccccaaatatcaatgtcaaacagtctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaATTTCTTGTGGACATACTGTAGGAT--GCGTT----CGAGTGAACC---AACCGTACCGCCTTG-GG-CAGGATGGTTATCTTCAACTGCACCAG-AC-GAAGAAGTGCTTTGCTCGAC-TG--TTG--ATTATA-TGGTTCC-AATCAACTGTCCTATCAC-A-GAAAAT-GCCACAG-TTCAGCAAGTCATCC-AGC--------T-ATCAC-AAG
gi|13 : tacaactcatactgctcacggtattgtgaaacaagaagtatatgtgcgtgatgaggataaccaaggccctctagacaaatcttgctagataggaataaatctaggacaagtttcagaaaaatcagaagaactagccccatgtttcgtgaagaccaaaacatcgccagctgtccgaactacttgcatgtcccctttgcataccaacaatgataagagagacatgactcGC-GAAATCTAG-AGAAGTAC----AGC-GA-TGTCATTGTTCAC-TGAGGAGTTTCC-ATTCGCTAAGCTATG-CATTGGAAAGAATT-GGGTAA---AGAGT---AATGGGAGTACTAG-T-GGACT-TTC-AC-ATCACATGT-GA-T-TATTGA-GGCTGG----CATA-TAT-----GT-ATGA-------------------A------AATTTT----CTG--------AACTCAA-AACTTTATAAA--TGT---AC-CTA--G---CCTT---GATG-TCAAA-CAAC-------AAAT----------------GGTA--TAGTT-CTTC--AAAGC----AAATT-ACATGCTTG---C-GAATGTCTTT--ATT-GT--GA-TTGT-----AGGAA----TCGAAAATT-TTCC-ATT-----T---TTTAA-C-AAT-A----TTATATTGACAAA--TTTCATA----TATTG---CGCG-CA-TAACAAC-TCG-AAG-AGG-TAC-AT-------GTATATTA--ATATCAGAT-AGTC-TG--ACTT--ACGA-T-----TAAAG---------------G-GCT-------GCAT----AC-----TA-A--TGAT
gi|14 : tT--TAGTTTCTTT--AGAAG----GAAAT-A-ATG---------AAAT-----T--A---AT--GA-CAGTAGGATTGGAT----C------TT-TTTT-CTACTATCT---TTTAA-CCAGT-G-CTGT---AATGACTAA--CTTTCTACATGTACTT---TACTACT-CAA-A-C-TCGAACA-A---T-C-CC-------AA---------TGCCAGACAG---TTGGAATTT--ACAA-T--------AG---------------GCGTA-------GTATCGCCAA-----TA-AAATGATCCTTTAAGGA---------AATGCTAAATTGTTTCC-A--A-GGTTGGTAAT---CGAC-TTTAACATA--------AATTCTC-TG----AGAGGAT-TT--TCCACTTGT--AG-TGA--TCTGTTT---A-AG-TTAAAGA-CCATGTCTCGTAGCCTC-AAAg
gi|15 : ATATAGTTACAA------TATCTGCAAAT--TAGA-GGGTTGACAAATTC-------TA-TATACTCGG-AAATCT--GAGA----GTCTT----TTATCTCCCC-AATTTTCGCGTG-A------TATTTTGCA---C----A
gi|15 : TGACAAATTCTATATACTCGGAAATCTGAG-AGTCTTTTATCTCCCCAA-TTTTCGCG-TGAT--ATTTTGCAC--ACCATTATTATGGGTGTACC---------TTTTGGTAGGGGTTGCA-TC-AAAA--TC-GAAAACGTAACC-CACGTA-G-AAAATGC--CAAA--CAACCTGAATTAAATATTTGAAAAGGTTTCAGTAGG-ATAAAATCAATAAACTACAAAAAAACCCACAATTTGTTTTGAG-AAAAATCCCCATGG-GGGT-CGCCCATTACCTTTACTTGGCCCATGccattattatgggtgtaccttttggtaggggttgcatcaaaatcgaaaacgtaacccacgtagaaaatgccaaacaacctgaattaaatatttgaaaaggtttcagtaggataaaatcaataaactacaaaaaaacccacaatttgttttgagaaaaatccccatgggggtcgcccattacctttacttggcccatgtc
gi|16 : atatagttacaatatctgcaaattagagggtTTC-CA---C----AAATTT-CAAG-TTTTTGCCCCA-AAAT-TC---AAAAAA---TATCCATGCAA-ACAATA-TGA---TT---------------------T-AT----AA--TCAAAGG-GTTCAA-T-AGTTT-CAGAGACCCACATTT-----GTTTT---CAAAAGGC-AA--T-ATTA--TCT-GTGAAGAGTC-TGAAGGAG-TT------TT--CCA--TTTGTCGATG-AT-TTTTAA-----A----GAAACAAAA-----G----AGCCCA-----AAAG-----------CTCG--AAAATGTCCTAA-AA-TA-CTT-ATGTCAAAC-AACT--------------TGATATA--Ttc
gi|17 : aa--A-GGTTCATA-----T--T-ATTTATATA---G----AAT--TC--G-A--AGAGG-T-TC--TCCATTTTT--AGGTGA--TT--TTT---TTAA-GTAAAA--TCATG--T---AGCCTC-AAAACTCGTAAAT-GT-T-CCCACA--TCCTAAAGTATAAA------------T------------TTATGTCAAA----CAA---CTTAGTAT-ATGATCAAGGGGTTGCATGTATTCACAAAATACTTGTTTGCAAAT--GTCA-A---TGACA---TC-------TA-CAT---CGG-A--TCT---AAA--ACGTTTT----C--------C-AATTTTCA-GC
gi|18 : T-TGC-AAAACTTTATAATATCTATATGTATTTCGGATCTGAAGAG-TTTTTCCAAAGTTTGGCGTT--TATTT-TCACCAGTTGCATGGGGTTTTTTGCCCC-CAAACTCGACAA-CA--C-CACC-------AC-----CA-AGGAATGTCAAACAA-CCTTATTTAGAATC-----TAGGGACAAT-G-TAGTTTCAAAATAT
gi|19 : GAG-TTTCT----TTTTCCGCTAGCATATTTCTCAC-AG---CATG---CTTTTTGTTC--AAAACTGGTATT-CA--C-C-CCCTGGCCCAC-----AT-AGAAATTTGAAACAA-CCACATTTTTAATC-----AAACGACTGT-G-CACTTTCCAAAAGTACTTGTTTACA
gi|2 : TTTTGATTGGATATCCTGAAAAAA--A-GTT----CAACTAAACC---AACCATACT-TCTTGAGG-CAGGATGGTTATCTACAACCACACCTA-ATGGAGGAA-CACTTTGTTGGAT-TG--TTG--ATTATA-TGGTTCC-AATCACCTGCCCTATTGCAA-GAAA-T-GACACTA-TTCAGCATGCTATTC-AGCTAGATTAAT-ATCAC-AAGAAG-----CTGTCAAAATGTAACTATCCTTGCATGTG--ATTTTGCAGTGGCTA
gi|2 : TTTGGC-AAAATCCAG-AGAAGCAC----AGC-AA-TGTATTGT-TCAT-TTAGGAGTTTTCCATTCACTATCCTCTG-AACTGGAAACCACT-GGGGAA---AA--T---AGTG--AGCGTGAG-T-GGACT-TTT-AC-AC-----AT-GA-T-TATTGA-GTCTGGA-A---TA-TAT-----GT-ACGAT-AT--G-TCA-----GA-A------AATGTT---AT-A--------AACTTCA-AACTTTATAAA--TGT---AC-CTA--A---CCTT---GATA-TCAAG-CAACGTAATATACATAAG-C------------GTT--TAGTT-CTTT--AA-GC----AA--T-GCATGCTTG---CAAAATGCCCAT----T-AT--G------------------------------TTTT-CTA-----T---TTCAA-C-AAT----CGT-ATAATGAC-AA--TTTTATACATGTATTT---TGT--CC--AA-AAC-TCGAA-G-ACG-T-CTCC-------AAATATCA--ATGTCAGACA-GTCT-G--ATTT---CAA-TAAGGATAAAACTGTTCGTTTCCTTTG-ATTTT-----ACAT----ACAGAATTA-A--TGATACGTTAAGAA---------AAT----AATTATTTTCAT--T-GGTTCATA-----TGAT---TTATATA----------------------------------TTCATTTC--CAATAAA--TT--TGA---A-AA-GTAAAAA-TCATG--TTGTAACCTA-AAAATTCATAAAC-AT-T-CATACA--T------------A------------T------------TTATTTTCAC---ACAA---CTAAATAT-ATAAACAAGGGGTTACACATATTTACAAAAGACTTGTATGCAAAT--AATA-A---GGACA---TC-------AA-TAT---CGGTA--TGT--GAAA-----TTTTCCCCC--------C-AACTTTGA-GTG-AT--TATTATTTT-TA---C----ACATTT-CAAG-TTTTTGCCCAA-AAAC-TC---G-AAAAGG-TCTCCATGCAA-ACAATC-TTA----T---------------------TTAT----AA--TCAAAGG---TACA-T-ACATT-C--AGAAA-ACAA-T-----GATTTT--CATCAGTA-AA--T-ATTA--TCT-ATTGAGAG-T-TGAAGGAGATT------T---CCA--TTTTTCGATT-AT-TTTTAG-----A----GAAA--AAA-TCCCGTTTTAGCCCC-----AAAA-----------CTCGTC--GATGCCCCCA-AC-TATC-T-ATGCCAGAC-------------------------------AT-T-----GGAT--G---GCTA-CA-TAT-GTT----CACAAAA------TATTTGTTTGC------AAAATTCAGTGATA--TCTATAT-CGG---ATCTGAGGAGC-TTGT-CCAATTTTTGGTGATTATTTT--TACCAATTTT-ATG-TTTTTTC-CTCC--AA------AACTCAATAACA-T-CCCACGT--AAGAATGT-CAAACAACC-TGA-TTTATAATTA-GG-GGGCTATGTACTT-GC---AAATTATACCTGTT-TG-CAAAAGTCAATGACATTTATAT------CGGATCTGAGGAATTTTTTCCAATTTTTGGTGAT--TATTT-TCACCAATTTTATG---TTTTT--CCCCAAAAACTCAAAAA-CGC-C-C-CC-------AC-----GT-AGGAATGTTAAACAA-CCTGATTTATAATC-----AGGGGAACAT---TACCTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttggcaaaatccagagaagcacagcaatgtattgttcatttaggagttttccattcactatcctctgaactggaaaccactggggaaaatagtgagcgtgagtggacttttacacatgattattgagtctggaatatatgtacgatatgtcagaaaatgttataaacttcaaactttataaatgtacctaaccttgatatcaagcaacgtaatatacataagcgtttagttctttaagcaatgcatgcttgcaaaatgcccattatgttttctatttcaacaatcgtataatgacaattttatacatgtattttgtccaaaactcgaagacgtctccaaatatcaatgtcagacagtctgatttcaataaggataaaactgttcgtttcctttgattttacatacagaattaatgatacgttaagaaaataattattttcattggttcatatgatttatatattcatttccaataaatttgaaaagtaaaaatcatgttgtaacctaaaaattcataaacattcatacatatttattttcacacaactaaatatataaacaaggggttacacatatttacaaaagacttgtatgcaaataataaggacatcaatatcggtatgtgaaattttccccccaactttgagtgattattatttttacacatttcaagtttttgcccaaaaactcgaaaaggtctccatgcaaacaatcttatttataatcaaaggtacatacattcagaaaacaatgattttcatcagtaaatattatctattgagagttgaaggagatttccatttttcgattatttttagagaaaaaatcccgttttagccccaaaactcgtcgatgcccccaactatctatgccagacattggatggctacatatgttcacaaaatatttgtttgcaaaattcagtgatatctatatcggatctgaggagcttgtccaatttttggtgattatttttaccaattttatgttttttcctccaaaactcaataacatcccacgtaagaatgtcaaacaacctgatttataattagggggctatgtacttgcaaattatacctgtttgcaaaagtcaatgacatttatatcggatctgaggaattttttccaatttttggtgattattttcaccaattttatgtttttccccaaaaactcaaaaacgcccccacgtaggaatgttaaacaacctgatttataatcaggggaacattaccttt
gi|20 : ttttgattggatatcctgaaaaaaagttcaactaaaccaaccatacttcttgaggcaggatggttatctacaaccacacctaatggaggaacactttgttggattgttgattatatggttccaatcacctgccctattgcaagaaatgacactattcagcatgctattcagctagattaatatcacaagaagctgtcaaaatgtaactatccttgcatgtgattttgcagtggctannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAGACA-GTCT-G--ATTT--ACAA-T-----TAAAG---------------G-GTT-------CCAT----AC-----TA-A--TGGTACGTTAAGAA---------AAT----AATCATTTTCAA--A-AGTTCATA-----TG---ATTTACATA---G----GA---TC-TG-A--AGAGG-T-TC--TCCATTTTT-CAt
gi|21 : ATATTCACAAAATACTTGTTTGCAAAT--GCCA-G---TGGCA---TC-------AA-TAT---CGG-A--CCT--GAAA--GGCTTTT----C--------C-AATTTTCA-GCG-AT--TA----TTT-CA---C----AAATTT-CAAG-TTTTTGCCCCA-AAA
gi|22 : GAA---------AAT----AATTGTTTTCAA--A-G-TCCATA-----TA-----TTATATAAACG----GA---------A--AGAAC-T-TTCTTCCATTTTTTCAGT-GA--TT--TTT---T-AA-GTAAAAAATCATG--TTGTAGCCTC-AAACTT
gi|23 : --TATAT-TTACAAATATTATGAG-TATTTCCCCTCAAATATTCATAAA-AT--C-C-CT-------ATATTCTGT-A--AATGTTAAACAA-CCTCGTTTATAATC-----AAGAGACTAT-A-T-CTTTC
gi|24 : cAA---ACAA---CTAAATAT-ATATTCAAGGGGTTTCATATAGTTACAAATGACTTGTTTGCAAAT--GATA-A---TGACA---TT-------T--TAT---CGG-A--TCT--GAAA--AGGTTTT----T--------
gi|25 : tcTTTGTTTGGATGTACTGAAAAAAAAGCGTCGATCCAACTAAACC---AACCGTACC-TCTAA-GGACAGGATGATTATCTACAACAACACCTG-AT-GAAGAAGTAtttccaat
gi|26 : ----AATTGTTTTCAA--A-GGTCCATA-----TG---ATTTAAATA---G----GA---TC-TG-A--AAAAG-T-TC--TCTATTTTT-CAG-TGATTTT--TTT---A-AA-GTAAAAT-GCATG--TGGTAGCATC-A
gi|28 : GAC-GA--TTT---ACTTATACCTCCATGC--TCGCAA-AAC-TCGAAA--ACGTT-C-CC-------AATTATCA--ATGTCAGAC-AGTC-TG--ATT
gi|29 : AATTTGGC-AAAATACTG-AGAAATAC----AGC-GA-TGT------TCAC-TTAGGAATTTTCCATTCACTATCCTCTG-CA
gi|3 : ACAAAC-CACCTGCATCGAAGAAGTAATTTGCTCGAAATG--TTATAATTATT-CGGTTCCCAATCACCTGCCCTATTACCA-GAAATT-GGCACTG-TACAGCAGGTTATTC-AGC--------T-ATCAC-AAGAAGGGGTTTTGT-----TGTAACTATCCTTGCTTGTGATATTTTGCAG
gi|3 : caaTTGGC-AAAATACAG-AGAAATAC----AGC-GA-TGT------CCAT-TTAGGAGTTTTCGATTCACT-TCC-CTG-CACTGGAAACAGTTCGGGAAA---A---T---AATG--AGCGCGAG-T-GGACT-TTC-AC-AC-----GTTGA-T-TATTGA-GTCTGAA-A---TA-TAT-----GT-ACGAT-AT--ACTCA-----GGTATCAGATAATGTT---AT-A--------AGCTCCA-AACTT-------------------A--G---CCTT---GATA-TCAAA-CAAAT-AATACACATAAG-TATG--A-----GGTTGTTCTTT-CTTT--AAAGC----AAAAT-GCATGCTTG---CAAAATGTCCAT--A-T-AT--GA-CTGT-----TGAAA----A------TT-TTCT-CTA-----T---TTCAA-C-AGT-A-CTG-TATAATGAC-AATTTTTCATACATGTATTT---TGT--CC-CAA-AAC-TCG-AAG-ATG-TCC-CC-------AAATATTA--ATGTCAGAC-AGTC-TG--ATTT--ACAA-T-----TAAAG---------------G-GTT-------ACAT----AC-----TA-T--TGATAATTTAAGAA---------AAT----AATTG-TTTCAG--A-GGTCAATA-----TG---ATTTGAATA---A----GA---TC-TG-A--AGAAG-T-TC--TCCATTTTT-CAG-TGT--TT--TTT---T-AA-GTAAAAA-TCATG--TTGTAGCCTC-AAACCTTATAAAC-ATATACATACA--T------------ACAAATACAGGTTT------------TTATGCC-AA---ACAA---CTAGATAT-ATAATCAAGGGGTTACATAAATT-ACAAAAGACTTGCTTGCAAAT--AATA-A---TGACA---TCTACCAGGTA-TAT---TGG-A--TCT--G-AA--AAGTTTT----C--------C-AATTTTCA-GCT-AT--TATTATTTT-CA---C----AAATTT-CTAG-TTTTTGCCCCA-AAAC-TC---G-AAAAGG-TCTCCGGGTAA-ACATTG-TAACC-TTA--------------------TTAT----AA--ACAAAGG-GTTAC--T-AATTT-C--AGAAA-ACATTT-----A-TTTT--CATCAGTC-AA--T-ATTA--TCT-ATAGAGAGTA-TGAATAAGTTT------T---CCA--TTTTTCGATT-AT-TTATTA-----A----GAAA--AAA-TCCTGTTTTAGTCCA-----AAGA-----------CTCGTC--AATGT---TATAA-TATC-T-ATGTTAAACAAACT--------------TGATATA--TC-AT-T-----GAAT--G---GTTA-CA-TAC-GTT----CAC-AAA------TACTTGTTTGC------AAAAGTCAACGACA--TTTATAT-CGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntataattggcaaaatacagagaaatacagcgatgtccatttaggagttttcgattcacttccctgcactggaaacagttcgggaaaataatgagcgcgagtggactttcacacgttgattattgagtctgaaatatatgtacgatatactcaggtatcagataatgttataagctccaaacttagccttgatatcaaacaaataatacacataagtatgaggttgttctttctttaaagcaaaatgcatgcttgcaaaatgtccatatatgactgttgaaaattttctctatttcaacagtactgtataatgacaatttttcatacatgtattttgtcccaaaactcgaagatgtccccaaatattaatgtcagacagtctgatttacaattaaagggttacatactattgataatttaagaaaataattgtttcagaggtcaatatgatttgaataagatctgaagaagttctccatttttcagtgtttttttaagtaaaaatcatgttgtagcctcaaaccttataaacatatacatacatacaaatacaggtttttatgccaaacaactagatatataatcaaggggttacataaattacaaaagacttgcttgcaaataataatgacatctaccaggtatattggatctgaaaagttttccaattttcagctattattattttcacaaatttctagtttttgccccaaaactcgaaaaggtctccgggtaaacattgtaaccttattataaacaaagggttactaatttcagaaaacatttattttcatcagtcaatattatctatagagagtatgaataagttttccatttttcgattatttattaagaaaaaatcctgttttagtccaaagactcgtcaatgttataatatctatgttaaacaaacttgatatatcattgaatggttacatacgttcacaaatacttgtttgcaaaagtcaacgacatttatatcg
gi|30 : caaacaaaccacctgcatcgaagaagtaatttgctcgaaatgttataattattcggttcccaatcacctgccctattaccagaaattggcactgtacagcaggttattcagctatcacaagaaggggttttgttgtaactatccttgcttgtgatattttgcagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntataa-T-----GAAT--G---GTTA-CA-TAC-GTT----CACAAAATACCGGTACTTGTTTGC------AAAAGTCAAAGACA--TTTATA
gi|31 : ACCAAGGGGTTACATAAATTTACGAAAGACTTGCTTGCAAAT--AATA-A---TGACA---T
gi|32 : AA---A---T---AATG--AGCGCGAG-T-GGACT-TTC-AC-AC-----AT-CA-T-TATTGA-ATCTGG--AATATA-t
gi|34 : CTTCATATA--TGT---AC-CTA--G---CCTT---GATA-TCAAG-CAACTTGATATA
gi|35 : TCCCTAGGG-GG-T-CCCCC-TTACCTT-AC-TGGCCCATGG
gi|4 : TGGC-AAAATTCATTAGAAACACTAACAGCTGA-TGT--------AA-TTG-----TTTCGTTTTAGGAGCCTCTG-CA------GCACTT-GT--AA---A---TCGCAATGG-AGCGCGAG-TCGAACTGTTCTACCAT-----GT-GA-T-TATT------CG-----TAGA-TAT-----GT-AAGA-------------------A------AATGTT---AT-A--------AACTCCA-AACTTCATATA--TGT---AC-CTA--G---CCTT---GATA-TCAAA-CAACTTGA-----------------------GGAT--TAGTT-CTTT--AAAGC----AAAAT-GCATGCTTG---CAAAATGCCCAT--AAT-AT--GA-CTGT-----TGGAAA---T------TT-TTCT-CTA-----T---TTCAA-C-AAT-A-CTGT-------AC-AA--T-------ATGTATTT---TGC--CC-CAA-AAC-TCGAA-G-ACG-T-T-CCCATGC--AAATATCA--ATGCCAGACA-GTCT-G--ATTT--ACAA-T-----TAAAG---------------G-GTT-------ACAC----AC-----TA-A--TGATACGTTAAGAA---------AAT----TATCATTTTCAA--A-GGTTTAT------CGAT---TTATATA---A----GAT---A-TG-A--AGAGG-T-TC--TCCATTTTT-CAGT-GA--TT--ATT---A-AAAGTAAAAA-TCATG--TCGTAGCCTC-CAAACTCATATAC-AT-T-CATACA--T------------A------------T------------TTATGTCAAA----CAA---CTAAATAT-ATAATCAAGGGGTTACATA----------AGACTTGTTTGCAAAT--GATA-A---TGACA---TC-------TA-CAT---CGG-A--TCT--GAAA--AAGTTTT----T--------CCAAATTTCG-GCG-AT--TATTATTTT-CA---C----AAATTT---------TTGCCCCA-AAAC-TC----AGATAGA-TTTCTATGCAA-ACAATT-TTA---TTTATAATCAAAGGGTCACATATTTATTTAAAA--TCAAAGG-GTCACA-T-ATTTT-CAGA--AA-ACAATT------CTTTT--CATCCGTC-AA--T-ATTA--TCT-ATGGAAAGCT--GAAGGAG-TT------TT--CCA--TTTTTCGATT-AT-TTTTAA-----A----GAAA--AAAT-CCTGTTTTAGACCC-----AAAA-----------TTTGTCAA--TGTCCCCA-AA-TATCT--ATAACTGAC-AACT--------------TGATATA--TA-AT-T-----GAATATG---TTTA-CA-TAC-GTT----CACAAAA------TACTTGTTTGC------AAAAGTCAATGACA--TTTATAT-CGG---ATCTGAGGAGT-TT-TTCCAATTTTCGGTGATTATTGT--CACCGA-TTTCATGTTTTTTTTGCCCCAAAA---CT--A---AAAAACGCC-CCCACGT--AGGAATGT-CAAACAACC-TGA-TTTATAATCG-AG-TGACTATGTACTT-TA---AAATTATACTTGTT-TG-CAAAAGTC--TGACATTTATAT------CGGATCTGAGGGT-TTTTTCCAATTTTCGGTGAT--TATTG-TCACCGATTTCATGTT-TTTTTTGCCCC-AAAACTAAAAAA-CGC-C-C-CC-------AT-----GT-AGGAATGTCAAACAA-CCTGATTTATAATCAATTTAAGGGACTAT-A-TACTTTCAAAtct
gi|5 : aCTCTG-CACTGTAAACCACT-GGAGGAGAGA---T---AATGG-AGCGCGAG-T-GGACT-TTC-AC-AT-----GC-GAGTGTGTTGA-GTCTGCTTAATCTAATAA-----GTTACGAT-TTGCA-TTGTCAAAGATA------AATGTTGAAATGACACAGAGAAACTCCATCAGGTCACTAC--TGTTCAACACTA--AGCACCTTAAGGATAGTCAAAGCAACT----ATG---AGG-A-T---A-----G--T--AATTT-CTTTCAAAAGCGAGAAAAAT-GCACCATTAACACAATATGCCCATTAA-T-ATTGGATCTGTCA---TGCAAATAAT------TTATTCTACTA-----TATATCTAATC-AATTA-CTGTTACAATAGC-------TCTTAAGTATA-------GC--CCACAA-AACGTCGAA-G-ACG-T-C-CCCATGCAGAGATATCACAATGCCAGAACGGTCT-G--ACTTGTACAAAT-----TAAAGTG-------------A-GTTACTGGAAGCAT----CT-----TACA--TGATCATCTAAGAATCTCTATAAGATGAG-AATTGTCT-CAATTATGGTCAATAGTTTTTCATCATTTTCATA---GAAGAGAC--CCATGTATCAGAGG-TGTC--TCCATTTT--CAGTGTA--TT--ATT---A-AAAGTAACAA-TC-TG--TCGTAGCCTCCAAATTTCATAAACAGT-T-CATACA--T------------A------------T------------TTATTTCAAAGTGAAAATTCTTAAGTATGATAATCAAGGTGTTA-AT----------AAGACTTGTTGGCAAAT--GA-A-A---TGACA---TC-------TACCAT---C-G-A--TCT--GAAAACAAGTTTT----T--------C-CAAATTCG-CCGAATAGTATTATTTT-CAG--C----AAATTT-CAAG-TTTTTGCCCCAGAAAA-TCAGAGAAAAAGGTTCTCCGTGCAA-ACAATA-TTT---TTTTACTCCA-------------TTAT----AAATTCAAAGG-GTCACAGTGATTTT-C--AGAAA-ACAATT-----TCTTTTTGCATCAGCT-AAATT-ATTA--TCT-ATGAAGAGTTCTGAAGGAA-TT------TTTACCATTTTTTTCGATTAATATTGTGAAAGACA----GAAA--AAATCACTATTCTCACCCCTCTATAAAAAGATAAATTTCTTTTTCAAAGGTTCCCCA-AATTATCTT-ATGTCAGAC-AACT--------------Tt
gi|6 : atttggcaacattatcagtacgacataacaccagcatcgcatattgtgtcggtttaggaagcaCAAA---ACAA---CTAA-TAT-ATAATCAAGGG-TTA-ATAAAT--ACAAAAGACTTGCTTGCAAAT---ACACA---TGGC----TC-------TA-TAT---CGG-A--TCTT-GAAA--AAGTTTTCT--T--------C-AATTTTCA-ACA-----TAT-ATTTT-CA---C----AAATATACTAG-TTTT-GCCCCA-AAACCTC---GAAA--GT-TCTCCGGGTAAGACA--C-TTAACCTA---------------------TTAT----AA--TCAAAGG-GTTA-A-T-ACTTTTCAGA--AA-ACATTT-----ATTTTT--CATCAGTC-AA--TTATTA--TC--ATAGAGATAT--GAAGGAG-TTGTTTTTT---CCA--TTTT-CGATT-AT-TTATAA-----A----GAAA--AAATTCCTGTTTAA--TCC-----AAAA-----------CTC---ACAATGTTCTCA-AA--ATCTC-ATGTAAAAC-AACTTATATATCATTGAATGGTATA--TACGT-TCACCAAAAT--ACTTGTTC-CAATGC-ATTATATCGNNNNN------NNNNNNNNNNN------NNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN-NNN---NTCTGAGGAGT-TT-T-CCAATTTTCG-TGATTATTTT--CACCAATTT--ATG-TTTTT--GCCCC--AAAAACTCAA---AAAAACGCCGTTCACGT--AGGAATGTCAAAACAACC-TGA-TT-ATAAGCA-AG-G-ACTATGTACTCGTC---AAATAAC-CTTGTA-T-CCAAAAGTCCATAACATCTTTAT------CGGATTTGAGGAG-TTTTTC-AATTTT-GGCGAT--TATTT-TCACCAATTTCATG---TTTTTTGCCCCAGAAACTCAAAAA-CAACC-C-CC-------AC-----GT-AGGAA-GTCAAACAAACCCGATTTATAATC-----AAGGGACTAT-G-TACTTTCAAATTATACTTGTTTGCAATAGTCATAAGACA---TCTATAT--T-GGA--T-TGA-GAGTTTTG-------CCTA--TT-CA-G-CGATT-A-TTTTCAC--A--ATT-TC----A-AT--TAATTTCAAGTTTT--------TTGCC-CCAAAAACCTCAAAAAACGCC-CC-CACGTA-ACGAA-T-T--CAAAGGCAACCTGA-TT-----TTTAA-------TCAA--GA-CT-AT-T-----AGTTTCAAAAAATT-----ACTTGTTT---GCAAAAAT-CCTGAGG-GGGT-CCCCCATTACCTTTAC-TGGCCCATGGtg
gi|7 : tgA--ATGTCATATA-GTCT-G--ATTT--ACAA-T-----TAAAG---------------A-GCT-------tc
gi|7 : attaagaatttgatctcatagaccatgggccagtaatGCTTTGAA--A-GGTCTATA-----TGAT---TTATATA---G----AAT---C-TG-A--AC----T-TT--TTTATTTTT-TGGT-GA--TC--TTTTTAA-AA-GTAAAA--TCATG--TTGTAGCCCG-AAATCTCGTAATT-GT-T-CACACA--T------------A------------TCATAGTATAAATTTATGTCAAA---TAAA---TTAA-TAT-ATGATTAAAGGCTTGCATATATTCACAAAATACTTGTTTCCAAAT--GTCA-G---TGACA---TC-------TG-TAT---CGG-A--TGT---AAA--ATGTTTT----T--------CTACTTTTTG-GCG------ATTATTTT-CA---CAATTAAATTT-CAAA-TTCTTACCCCA-AAAC-CC----AGAAAGG-TCTCCATGCAA-ACAATA--TA---AT---------------------TTAT----AA--TCAAAGG-GTTGAA-T-AGTTT-C--AGAAA-ATATTTTTTTCATTTTC--CATTTTTC-GA--TGATT---TCT-A--AAGAAAA-TAAAA----------------TCA--TGTT----TT-AG-CCCCAA-----AACTCGAAA--A------TGT------CCC-----AAAA-----------TACTT----ATGT---CA-AA-CAACTTGATAT---AT-AATT--------------T---------A-AT-T-----G----------TTA-CA-TAC-GTT----CACAAAA------TACTTGTTTAC------AAAAGTCAATGACA--TCTATAT-CGG---ATCTGAGGAGT-TT-TCCCAATTTTCGGTGACTATTTC--CACCAA-TTTCATG-TTTTTttgaaaggtctatatgatttatatagaatctgaacttttttattttttggtgatctttttaaaagtaaaatcatgttgtagcccgaaatctcgtaattgttcacacatatcatagtataaatttatgtcaaataaattaatatatgattaaaggcttgcatatattcacaaaatacttgtttccaaatgtcagtgacatctgtatcggatgtaaaatgtttttctactttttggcgattattttcacaattaaatttcaaattcttaccccaaaacccagaaaggtctccatgcaaacaatataatttataatcaaagggttgaatagtttcagaaaatatttttttcattttccatttttcgatgatttctaaagaaaataaaatcatgttttagccccaaaactcgaaaatgtcccaaaatacttatgtcaaacaacttgatatataatttaattgttacatacgttcacaaaatacttgtttacaaaagtcaatgacatctatatcggatctgaggagttttcccaattttcggtgactatttccaccaatttcatgtttttg
gi|8 : attaagaatttgatctcatagaccatgggccagtaataatgtcatatagtctgatttacaattaaagaATATTCACAAAATACT-GTTTGCAAATCGGTCA-----TGACA---AC-------TA-CAT---CGG-A--TCTACGAAA--A------------------------TGTCG-GCG-GA--TATT--TTG-CAGTTC----AA---T-TAAGATTGGTGCCCCA-AAA--TC---AAAACAG--TATCCATGCAA--CAATA-TGA---TT---------------------T-AT----AA--TCAAAGGAGTTAAA-T-ACTTT-CAGA--AA-GTATTT-----GTTTTTT-CAAAAGTTGAA--T-ATTGGTTCTTGTGAAGAGTC-TGGAAGAG-TT------T------------TCCATT-AT-TTCAAA-----A----AAAA--AAATCAC-GATTTAGTCCA-----AAAA-----------CTCG--AAAATGTTCC------------------AAAC-AACT--------------TGATATA--TA--T-T-----TAAT--G----TTAGCA-TAC-GTT----CACAAAA------TA-TTCTTTGCAAAAATAAAAGTCAATGACATCTTTAT-T-CGGCATGTCTGAGGAGT-TT-T-----TTCTCAATGATTATTTTCACACCAA-TGTCATG--TTTTTTGCCCCA-AA---CT------TGGAACG---CCCAGGT--A-GAATGTCAAAACAGGC-TGACTTTATAAATGCAGTGGACTATTGACTG-TCGAAAAAGTATACTT-TT-T--CAAGAGCCg
gi|9 : -ATGTTAAA--AACT--------------TGATA-A--TC-ATAG-----GAAT--G---GTTA-CA-TAT--TT----CACAAAA------TACTTGTTTGC------AAAGTTCAATGACA--TTTATATCCGG---ATttcaggagtctccctt
gi|9 : GGATCTGAAGAG-GTAT-CCAATTTCGAGTG-T--TATTT-TCACAGATTTTATG---TTGTTTTCCC--AAAACCCAAAAAACG--CTC-CC-------AC-----GTTAGGAATGTCAACAAA-CCTGATT-ATAATC-----AAGGGACTATTG-TACTTTCAATATATACTTGTTTGCAATAGCCA-ATGA-A---TCTATA---TCGGA--TCTGATGAGTTTTT-------CCAATTTT-CA-GCCGATT-ATTATTCACCAA--ATT-TC----CAG---T---------TTTT--------TTGCC-CC-AAAACTC---AAAACGCC-CCACACGTAGG-GAA-TGT--C-AA--CAACCTGA-TC-----TTTAA-------TCAA-GGGACTACTGT-----AGTTTC--AAAAAT-----ACTTG-TT---GCAAAAAT--CTAGGG-GGGTCCCCCCATTACCTTTAC-TGGCacgaaaacgtcgatcaatctcgtaagtccaaattagggatctgaagaggtatccaatttcgagtgttattttcacagattttatgttgttttcccaaaacccaaaaaacgctcccacgttaggaatgtcaacaaacctgattataatcaagggactattgtactttcaatatatacttgtttgcaatagccaatgaatctatatcggatctgatgagtttttccaattttcagccgattattattcaccaaatttccagtttttttgccccaaaactcaaaacgccccacacgtagggaatgtcaacaacctgatctttaatcaagggactactgtagtttcaaaaatacttgttgcaaaaatctaggggggtccccccattacctttactggcatagtctagggattcaatt
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|27 ): AANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACAGGTATT
Unaligned ( gi|33 ): GTGAAGAGTCTGAAAGAGTTTTCCATTATTCAAAAAAAAAAATCA
Alignments
lowQualScore : 11 2222 111 1 1 1 111 1 11 11 111 1 1 111 111 1 1 3333333333 1 33333 111 1111 3333333 11111111111 22 11111 3333333 11111 77777777777777777777777777 333333333333333 11111111 111111 6666666666666666666 1111 222222 11111 33333333333 11111 111 11111 11 111 1 2222222 22 11 11111 333333333333333 2222222 1111 11111 11 222222222 1111 33333333333 3333333333333333333333 11 66666666666666666666666666666666666666666 1111 1111111 1111 2222222222222 11111 111 11111 77777777777777777777777777 22 22222222 1111 3333333333333 1111111111 11 11111 33333333333333333333 22222222222222 11111 11111 111111 111111 111111 111 11 1 11 33333333333 111 11 111 222 111111 222 11 1111111 11111 11111 1 111 222 11 2222222 1 22222 77777777777777777777 22222222 1111 11 11 22222222 2222222 11 33333333 222222 1 111
lowQualScore : 33 2 1111 777 2 0 1 0 0 999 8 5 1 00 33 777 0 0 000 000 1 0 1 0 7777777777 0 33333 6 7 333 1 6 22 6 4444 6 6 7777777 77 9 5 1 6 22 77777777777 00 5 5 5 5 5 44444 5 5 5 5 7777777 5 66666 6 11111111111111111111111111 333333333333333 5 33333333 888 5 111111 888 5 5 66666 2222222222222222222 66 5 66 0000 5 0 888 3 2 222222 66 5 99999 22222222222 5 5 22222 888 5 5 999 222 11111 33 1 777 00 8 4 4 3 777 1 4 3 4 5555555 55 33 99 55 66 4 11111 333333333333333 4 0000000 0000 22222 5 11 1 000000000 7777 55 3 33 00000000000 3333333333333333333333 0 3 3 55 77 88 55 55 88888 7 55 55 5 3 66 5 777 22222222222222222222222222222222222222222 4 0000 777 3 4 2 5 88888 3 555 555 0000000 3 555 3 44 77 0000 1111111111111 7 3 55555 33 3 000 7777 4 4 4 66 88888 4 4 1 55 00000000000000000000000000 9999 66 4 444 4 1 4 22 1 4 1 33333333 66 4 66 8 66 4 1 1111 0000000000000 66 1 4 4 1 1111111111 66 66 22 11111 11111111111111111111 444 4 55 2 999 0 4 33333333333333 1 33333 4 11111 444444 4 4 4 9999 222222 222222 66 5 000 6 6 44 1 99 5 5 5 55 44444444444 000 99 3 66 6 8888 0 6 6 6 111 6 5 000 7 999999 5 3 9 0 66 4 3 1 000 3 88 4 55 4 4 4444444 11111 4 0 4 3 11111 888 1 9 0 444 111 11 5 0 6666666 88 8 8 8 88 0 55555 8 66666666666666666666 99999999 8 8 0000 8 8 999 8 5 11 0 11 22222222 6666666 11 8 0 00000000 0 333333 0 444 0 6 6 8 0 0 8
lowQualScore : .. . .... ... . . . . . ... . . . .. .. ... . . ... ... . . . . .......... . ..... . . ... . . .. . .... . . ....... .. . . . . .. ........... .. . . . . . ..... . . . . ....... . ..... . .......................... ............... . ........ ... . ...... ... . . ..... ................... .. . .. .... . . ... . . ...... .. . ..... ........... . . ..... ... . . ... ... ..... .. . ... .. . . . . ... . . . . ....... .. .. .. .. .. . ..... ............... . ....... .... ..... . .. . ......... .... .. . .. ........... ...................... . . . .. .. .. .. .. ..... . .. .. . . .. . ... ......................................... . .... ... . . . . ..... . ... ... ....... . ... . .. .. .... ............. . . ..... .. . ... .... . . . .. ..... . . . .. .......................... .... .. . ... . . . .. . . . ........ .. . .. . .. . . .... ............. .. . . . . .......... .. .. .. ..... .................... ... . .. . ... . . .............. . ..... . ..... ...... . . . .... ...... ...... .. . ... . . .. . .. . . . .. ........... ... .. . .. . .... . . . . ... . . ... . ...... . . . . .. . . . ... . .. . .. . . ....... ..... . . . . ..... ... . . . ... ... .. . . ....... .. . . . .. . ..... . .................... ........ . . .... . . ... . . .. . .. ........ ....... .. . . ........ . ...... . ... . . . . . . .
lowQualScore : 88 5 2222 555 5 0 0 0 0 666 0 0 0 22 88 000 0 0 222 888 0 0 2 0 2222222222 0 33333 7 3 777 0 7 00 7 2222 7 7 5555555 00 3 7 0 7 00 77777777777 77 7 7 7 7 7 33333 7 7 7 7 6666666 7 77777 7 22222222222222222222222222 666666666666666 7 55555555 888 0 666666 888 0 0 88888 7777777777777777777 99 0 99 6666 0 1 888 1 2 222222 99 0 44444 44444444444 0 0 55555 888 0 0 000 999 22222 88 1 888 66 9 4 4 6 333 9 4 3 4 6666666 55 99 99 55 11 4 11111 999999999999999 4 6666666 6666 55555 0 99 3 000000000 2222 00 6 88 77777777777 6666666666666666666666 4 6 6 00 88 88 00 00 11111 3 99 00 5 6 22 0 111 99999999999999999999999999999999999999999 6 4444 000 8 0 6 8 00000 1 444 444 8888888 3 888 3 66 99 8888 8888888888888 3 6 11111 99 6 000 7777 0 0 0 33 11111 4 4 0 44 99999999999999999999999999 4444 11 4 888 4 9 4 11 1 4 0 77777777 11 4 11 9 11 4 9 8888 1111111111111 11 9 4 4 0 6666666666 11 33 00 11111 33333333333333333333 999 4 22 0 333 7 0 55555555555555 8 66666 4 11111 000000 4 4 4 4444 888888 888888 11 0 000 7 7 33 0 22 5 2 7 88 88888888888 222 22 7 00 7 2222 7 7 7 7 777 7 7 000 5 222222 0 2 6 4 11 4 9 8 000 6 33 4 00 4 4 4444444 11111 4 1 4 9 11111 000 0 8 0 000 666 00 0 8 0000000 88 0 0 0 88 6 88888 0 88888888888888888888 00000000 0 0 6666 0 0 222 0 0 00 8 00 88888888 0000000 22 0 8 00000000 8 888888 6 000 8 7 7 0 8 8 0
consensus : ATTTTGTTTGGATATACTGAAAAAA--GCGTT----CAACTAAACC---AACCGTACC-TCTNG-GG-CAGGATGGTTATCTACAACCGCACCTG-ATGGAAGAAGTANTTTGCTCGAC-TG--TTG--ATTATA-TGGTTCC-AATCACCTGCCCTATTACAA-GAAATT-GNCACTG-TTCAGCAAGTTATTC-AGC--------T-ATCAC-AAGAAG-----CTGTCAAAATGTAACTATCCTTGCATGTGATATTTTGCAGTNGCTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATTTGGC-AAAATCCAG-AGAAATAC----AGC-GA-TGT------TCAT-TTAGGAGTTTTCGATTCACTATCCTCTG-CACTGGAAACAATT-GGGGAA---A---T---AATGG-AGCGCGAG-T-GGACT-TTC-AC-AC-----GT-GA-T-TATTGA-GTCTGGA-AATATA-TAT-----GT-ACGAT-AT--A-TCG-----GATA------AATGTT---ATTA--------AACTCCA-AACTTCATNAA--TGT---AC-CTA--G---CCTT---GATA-TCAAA-CAACTTGATATACATAAG-C-T---A-----GGTT--TAGTT-CTTT--AAAGC----AAAAT-GCATGCTTG---CAAAATGCCCAT--A-T-AT--GA-CTGT-----TGGAA----T------TT-TTCT-CTA-----T---TTCAA-C-AGT-A-CTGTTATAATGAC-AA--TTTCATACATGTATTT---TGC--CC-CAA-AAC-TCGAAAG-ACG-T-C-CC-------AAATATCA--ATGTCAGACAAGTCTTG--ATTT--ACAA-T-----TAAAG---------------G-GTT-------GCAT----AC-----TA-A--TGATACTTTAAGAA---------AAT----AATTGTTTTCAA--A-GGTCCATA-----TGAT-ATTTATATA---G----GAT--TC-TG-A--AGAGG-T-TC--TCCATTTTT-CAGTTGA--TT--TTT---A-AA-GTAAAAA-TCATG--TCGTAGCCTC-AAANCTCATAAAC-GT-T-CATACA--T------------A------------T------------TTATGTCAAA---ACAA---CTAAATAT-ATAATCAAGGGGTTACATATATTCACAAAAGACTTGTTTGCAAAT-GA-TA-A---TGACA---TC-------TA-TAT---CGG-A--TCT--GAAA--AAGTTTT----T--------C-AATTTTCG-GCG-AT--TATTATTTT-CA---C----AAATTT-CAAG-TTTTTGCCCCA-AAAC-TC---GAAAAAGG-TCTCCGTGCAA-ACAATN-TTA---TT---------------------TTAT----AA--TCAAAGG-GTTACA-T-ACTTT-CAGAGAAA-ACANTT-----G-TTTTT--CATCAGTC-AA--T-ATTA--TC-TATGGAGAGNT-TGAAGGAG-TT------T---CCA--TTTTTCGATT-AT-TTNTAA-----A----GAAA--AAATTCCTGTTTTAGCCCC-----AAAA-----------CTCGTCAAAATGTCCCCA-AA-TATCTT-ATGTCAAAC-AACT--------------TGATATA--TA-AT-T-----GAAT--G---GTTA-CA-TAC-GTT----CACAAAA------TACTTGTTTGC------AAAAGTCAATGACA--TTTATAT-CGG---ATCTGAGGAGT-TT-T-CCAATTTTCGGTGATTATTTT--CACCAATTTTCATG-TTTTTTTGCCCC--AA---CT-AA---AAAAACGCC-CCCACGT--AGGAATGTCCAAACAACC-TGA-TTTATAATCG-AG-GGACTATGTACTT-TC---AAATTATACTTGTT-TGCCAAAAGTCAATGACATCTATAT------CGGATCTGAGGAG-TTTTTCCAATTTTCGGCGAT--TATTT-TCACCAATTTCATG---TTTTTTGCCCCAAAAACTCAAAAA-CG--C-C-CC-------AC-----GT-AGGAATGTCAAACAA-CCTGATTTATAATC-----AAGGGACTAT-G-TACTTTCAAANTATACTTGTTTGCAATAGTCA-ATGACA---TCTATAT--TCGGA--TCTGAGGAGTTTTT-------CCAA-TTT-CG-G-CGATT-ATTTTTCAC--A--ATT-TC----GTGT--T---------TTTT--------TTGCC-CC-AAAACTTC-AAAAACGCC-CC-CACGTA-G-GAA-TGT--CAAA--CAACCTGA-TT-----TTTAA-------TCAA-GGG-CTAATGT-----AGTTTCAAAAAAAT-----ACTTGTTT---GCAAAAATCCCTAGGG-GGGT-CCCCCATTACCTTTAC-TGGCCCATGG
Reference ( family-3276 ) : ATTTTGTTTGGATATACTGAAAAAA--GCGTT----CAACTAAACC---AACCGTACC-TCTNG-GG-CAGGATGGTTATCTACAACCGCACCTG-ATGGAAGAAGTANTTTGCTCGAC-TG--TTG--ATTATA-TGGTTCC-AATCACCTGCCCTATTACAA-GAAATT-GNCACTG-TTCAGCAAGTTATTC-AGC--------T-ATCAC-AAGAAG-----CTGTCAAAATGTAACTATCCTTGCATGTGATATTTTGCAGTNGCTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATTTGGC-AAAATCCAG-AGAAATAC----AGC-GA-TGT------TCAT-TTAGGAGTTTTCGATTCACTATCCTCTG-CACTGGAAACAATT-GGGGAA---A---T---AATGG-AGCGCGAG-T-GGACT-TTC-AC-AC-----GT-GA-T-TATTGA-GTCTGGA-AATATA-TAT-----GT-ACGAT-AT--A-TCG-----GATA------AATGTT---ATTA--------AACTCCA-AACTTCATNAA--TGT---AC-CTA--G---CCTT---GATA-TCAAA-CAACTTGATATACATAAG-C-T---A-----GGTT--TAGTT-CTTT--AAAGC----AAAAT-GCATGCTTG---CAAAATGCCCAT--A-T-AT--GA-CTGT-----TGGAA----T------TT-TTCT-CTA-----T---TTCAA-C-AGT-A-CTGTTATAATGAC-AA--TTTCATACATGTATTT---TGC--CC-CAA-AAC-TCGAAAG-ACG-T-C-CC-------AAATATCA--ATGTCAGACAAGTCTTG--ATTT--ACAA-T-----TAAAG---------------G-GTT-------GCAT----AC-----TA-A--TGATACTTTAAGAA---------AAT----AATTGTTTTCAA--A-GGTCCATA-----TGAT-ATTTATATA---G----GAT--TC-TG-A--AGAGG-T-TC--TCCATTTTT-CAGTTGA--TT--TTT---A-AA-GTAAAAA-TCATG--TCGTAGCCTC-AAANCTCATAAAC-GT-T-CATACA--T------------A------------T------------TTATGTCAAA---ACAA---CTAAATAT-ATAATCAAGGGGTTACATATATTCACAAAAGACTTGTTTGCAAAT-GA-CA-A---TGACA---TC-------TA-TAT---CGG-A--TCT--GAAA--AAGTTTT----T--------C-AATTTTCG-GCG-AT--TATTATTTT-CA---C----AAATTT-CAAG-TTTTTGCCCCA-AAAC-TC---GAAAAAGG-TCTCCGTGCAA-ACAATN-TTA---TT---------------------TTAT----AA--TCAAAGG-GTTACA-T-ACTTT-CAGAGAAA-ACANTT-----G-TTTTT--CATCAGTC-AA--T-ATTA--TC-TATGGAGAGNT-TGAAGGAG-TT------T---CCA--TTTTTCGATT-AT-TTNTAA-----A----GAAA--AAATTCCTGTTTTAGCCCC-----AAAA-----------CTCGTCAAAATGTCCCCA-AA-TATCTT-ATGTCAAAC-AACT--------------TGATATA--TA-AT-T-----GAAT--G---GTTA-CA-TAC-GTT----CACAAAA------TACTTGTTTGC------AAAAGTCAATGACA--TTTATAT-CGG---ATCTGAGGAGT-TT-T-CCAATTTTCGGTGATTATTTT--CACCAATTTTCATG-TTTTTTTGCCCC--AA---CT-AA---AAAAACGCC-CCCACGT--AGGAATGTCCAAACAACC-TGA-TTTATAATCG-AG-GGACTATGTACTT-TC---AAATTATACTTGTT-TGCCAAAAGTCAATGACATCTATAT------CGGATCTGAGGAG-TTTTTCCAATTTTCGGCGAT--TATTT-TCACCAATTTCATG---TTTTTTGCCCCAAAAACTCAAAAA-CG--C-C-CC-------AC-----GT-AGGAATGTCAAACAA-CCTGATTTATAATC-----AAGGGACTAT-G-TACTTTCAAANTATACTTGTTTGCAATAGTCA-ATGACA---TCTATAT--TCGGA--TCTGAGGAGTTTTT-------CCAA-TTT-CG-G-CGATT-ATTTTTCAC--A--ATT-TC----GTGT--T---------TTTT--------TTGCC-CC-AAAACTTC-AAAAACGCC-CC-CACGTA-G-GAA-TGT--CAAA--CAACCTGA-TT-----TTTAA-------TCAA-GGG-CTAATGT-----AGTTTCAAAAAAAT-----ACTTGTTT---GCAAAAATCCCTAGGG-GGGT-CCCCCATTACCTTTAC-TGGCCCATGG
gi|1 : ATTTTGTTTGGATATACTGAAAAAA--GCGTT----CAACTAAACCTTGAA--GTACT-TCTAG-AG-CAGGATGGTTATTTACAA---CACCTG-ATGGAAGAAGTTATTTGCTCGAC-TGATTTG----TATATTGGTTCC-AATCACCTGCCCTATTACAAGGAAATTGGCCACTATTTCAACAAGTTATTCAAGC--------TCATCACAAAGAAG-----CTGTCAAAATGCAACTATCC-TGCATGTGAT-TTTAGCAGTTGCTA
gi|1 : AACTTAGCCAAAATC------GAATAC----CGT-GAATGT------TCATATTAGCAGTTTTCATTTCACTATCCTCTTTCACTGGAAACAGTT-AGGGAA---A---T---AAT---AGTGCGAGAT-GGACT-TTC-AC-AC-----GT-GA-T-TATTGACGTCTGGAGAATATA-TATACATGGT-ACGATTAT--A-TCG-----GATA------AATGTT---ATTA--------AACTCCA-AACTTTCTTAAGCTGT---AC--TA--G---CCTA---GATA-TCAAA--AACTTGATATAAATAAGGC-TTTGG-----GGTT--TAATT-CTTT--AAAGC----AAAATTGCATGC--------AAGTTATTAT----T-AT--AA-CT-T-----TGGAA----T------TT-TTCT-C-A-----T---T-CAA-C-AGT-AACTGTTTTAATGAC-AA--TTCCATGCATGTATTT---TGT--CC-CAA-AAC-TTGGAAGGACG-T-C-TC-------AAATATCA--ATGTCAGACGAGTCTTG--ATTT--ACAA-T-----TAAAG---------------G-GTT-------GCAT----AC-----TA-AA-TGATATTTTAAGAA---------AAT----AATTGTTTTCAA--A-GGT---TA-----TGAT-ATTTATATA---G----GAT--TC-TT-G--AGAAG-T-TC--TCCATTTTTTCAGTTGA--TT--TTT---A-AA-GTTAAAA-AGATG--CTGGAAGCTC-AAACGTCATAAAC-AT-T-CATATA---------------A------------T------------TTATTTCAAA---ACAA---CTAAA-AT-ATAATCAAAAGGTTACATATATTTACATAAGA--TGTTTGCAAAT-GAATA-A---TAA-----TC-------TA-TAT---CTG-A--TCT--GGAA--AAGTTTT----T--------C-AATGTTCG-GCG-AT--TATT-TTTT-CA---C----AAATTT-CAAG-TTTTT-CCCCA-AAAT-TC---GAAAAAGG-TTCTTGGGTAA--CAGTTCTTA---TT---------------------TTAT----AA--TCAAAGG-GTTACA-T-ACTTT-CAGAGAAA-ACAGTT-----A-TTTTT--CATCAGTC-AA--T-ATCA--TC-TATTGAGAGGT-TGAAGGAA-TT------T---CCA--TTTTTCGATT-AT-TTATAA-----A----GAAA--AAATTCCTGTTTTAGCCCC-----AAAA------------TCGTCCCAATGTCCCCA-AA-TATCTT-A-GTCAAAC-AACT--------------TGATATACTTA-AT-T-----GAAT--G---GTTA-CA-CACTGTT----CACAAAA------TACTTGTTTGC------AAAAGTCAATGACA--TTTACAT-CGG---ATCTGAGGAGTATT-T-TCAATTTTCTGTGATTATTTT--CACCAATTTTTATG-TTTTTTTGCCCC--AA---CT-AA---AAAAACGCC-CCCACCCTAAAGAATGTTCAAACAACCGTGA---TATAATTA-AG-GGACTATGTGCTC-TC---AAATTATACTTGTTCTGCCAAAAGTCAATGACATCTATAT------CGGATCTGAAAAG-TTTTTCCGATTTTCGGCGAT--TATTT-TCACAAATTTCATG---TTTTTTGCCTCAAAAACTCAAAAA-CA--C-C-CC-------AC-----GT-AGGTATGTCAAACAT-CC-GATTTATAATC-----AAGGGACTAT-GTTACTTTCAAATTATACTTGTTTGCAA-AGTCA-ATGACA---TCTATAT--TCGGA--TCTGGGGAG-TTTT-------CCAA-TTT-CG-G-CGATTAATTTTTCAC--A--ATT-TC----GTGT--T---------TTTT--------TTGCCTTC-AAAACTTC-AAAAACGAC-CC-CACGTA-G-GAA-TTTTACAAA--CAACCTGA-TT-----TTTAA-------TCAA-GGG-CTAATGT-----AGTTTCAAAAAAAT-----ACTTGTTT---GCAAAAATCCCTAGAGCGGGT--CCCCATTACCTTTAC-AGGCCCACGGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacttagccaaaatcgaataccgtgaatgttcatattagcagttttcatttcactatcctctttcactggaaacagttagggaaataatagtgcgagatggactttcacacgtgattattgacgtctggagaatatatatacatggtacgattatatcggataaatgttattaaactccaaactttcttaagctgtactagcctagatatcaaaaacttgatataaataaggctttggggtttaattctttaaagcaaaattgcatgcaagttattattataactttggaatttttctcattcaacagtaactgttttaatgacaattccatgcatgtattttgtcccaaaacttggaaggacgtctcaaatatcaatgtcagacgagtcttgatttacaattaaagggttgcatactaaatgatattttaagaaaataattgttttcaaaggttatgatatttatataggattcttgagaagttctccattttttcagttgatttttaaagttaaaaagatgctggaagctcaaacgtcataaacattcatataatttatttcaaaacaactaaaatataatcaaaaggttacatatatttacataagatgtttgcaaatgaataataatctatatctgatctggaaaagtttttcaatgttcggcgattattttttcacaaatttcaagtttttccccaaaattcgaaaaaggttcttgggtaacagttcttattttataatcaaagggttacatactttcagagaaaacagttatttttcatcagtcaatatcatctattgagaggttgaaggaatttccatttttcgattatttataaagaaaaaattcctgttttagccccaaaatcgtcccaatgtccccaaatatcttagtcaaacaacttgatatacttaattgaatggttacacactgttcacaaaatacttgtttgcaaaagtcaatgacatttacatcggatctgaggagtattttcaattttctgtgattattttcaccaatttttatgtttttttgccccaactaaaaaaacgcccccaccctaaagaatgttcaaacaaccgtgatataattaagggactatgtgctctcaaattatacttgttctgccaaaagtcaatgacatctatatcggatctgaaaagtttttccgattttcggcgattattttcacaaatttcatgttttttgcctcaaaaactcaaaaacaccccacgtaggtatgtcaaacatccgatttataatcaagggactatgttactttcaaattatacttgtttgcaaagtcaatgacatctatattcggatctggggagttttccaatttcggcgattaatttttcacaatttcgtgttttttttgccttcaaaacttcaaaaacgaccccacgtaggaattttacaaacaacctgatttttaatcaagggctaatgtagtttcaaaaaaatacttgtttgcaaaaatccctagagcgggtccccattacctttacaggcccacggc
gi|10 : attttgtttggatatactgaaaaaagcgttcaactaaaccttgaagtacttctagagcaggatggttatttacaacacctgatggaagaagttatttgctcgactgatttgtatattggttccaatcacctgccctattacaaggaaattggccactatttcaacaagttattcaagctcatcacaaagaagctgtcaaaatgcaactatcctgcatgtgattttagcagttgctannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntG-TTTTTTTGCCCC--AAAA-CT-AA---AAACACGCC-CC-ATGA--AGGAATGTC-AAACAATC-TGA-TT-ATAATTG-TG-TGACTATGTACTT-TC---AAATTATACTT-TT-TGG-AAAAGTCAA--ACATTTATAT------CGGATCTGAGGAG-TTTT-CCAATTTC--GTGAT--TATTT-TCACCAATT-CATG---TTTTT-GCCCCAAAA-CTCAAAA--CG--C-C-CC-------AC-----GC-AG-AATGTCAAACAA-CCAGATTTATAATC-----AAGG-ACAAT-G-TACTTTCAAATTATACTTGTTTGCAAAAGTCA-ATGACA---TTTATA---TCGGA--TCTGAGGAGTTTTT-------CCAA-TTT-CG-G-TGATT-A-TTTTCAC--CT-ATT-TC-----TG-------------TTTT--------TTGCC-CC-AAAAC-TC-AAAAAC-CC-CC-CACGTA-G-GAA-TGT--CAAA--CAACCTGA--T-----TATAT-------TCAG-GGA-CTAG--------ACTTTCAAAAAAA--------CTG-TT---GC--AAATCCCCGGGG-c
gi|11 : caattcggatgagtattatcactaagatgttatagcgatcgtctcgttaTA--------AGCTCCA-AACTT-ATTAAC-TGT---AC-CTATAA---CCTT---TATA-TCAAA-CAACTTGATATACACAAG-CAT---ACATGGGGTT--TAGTT-CTTT--AAAGC----AAAAT-GCATGCTTG---CAAAATGTCCAT--A-TCAT--GA-CTGT-----TGGAA----A------TT-TTCT-CTA-----T---TTCAA-C-AGT-A-CTG-TATAATGAC-AAT-TTTCATACATGTATTT---TGT--CC-CAA-AAC-TCGAAA--ATG-TCC-CC-------AAATATCA--ATGTCAAAC-AGTCTt
gi|11 : taA--TT--TTT---A-A--GTACAAA-TCATG--TTGTAGCCTC-AAA---CATACAT-AT----ATAAAGGT------------A------------T------------TTATGCC-AA---ACAA---CTAGATAT-ATAAgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatttttaagtacaaatcatgttgtagcctcaaacatacatatataaaggtatttatgccaaacaactagatatataa
gi|12 : tataagctccaaacttattaactgtacctataacctttatatcaaacaacttgatatacacaagcatacatggggtttagttctttaaagcaaaatgcatgcttgcaaaatgtccatatcatgactgttggaaattttctctatttcaacagtactgtataatgacaattttcatacatgtattttgtcccaaaactcgaaaatgtccccaaatatcaatgtcaaacagtctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaATTTCTTGTGGACATACTGTAGGAT--GCGTT----CGAGTGAACC---AACCGTACCGCCTTG-GG-CAGGATGGTTATCTTCAACTGCACCAG-AC-GAAGAAGTGCTTTGCTCGAC-TG--TTG--ATTATA-TGGTTCC-AATCAACTGTCCTATCAC-A-GAAAAT-GCCACAG-TTCAGCAAGTCATCC-AGC--------T-ATCAC-AAG
gi|13 : tacaactcatactgctcacggtattgtgaaacaagaagtatatgtgcgtgatgaggataaccaaggccctctagacaaatcttgctagataggaataaatctaggacaagtttcagaaaaatcagaagaactagccccatgtttcgtgaagaccaaaacatcgccagctgtccgaactacttgcatgtcccctttgcataccaacaatgataagagagacatgactcGC-GAAATCTAG-AGAAGTAC----AGC-GA-TGTCATTGTTCAC-TGAGGAGTTTCC-ATTCGCTAAGCTATG-CATTGGAAAGAATT-GGGTAA---AGAGT---AATGGGAGTACTAG-T-GGACT-TTC-AC-ATCACATGT-GA-T-TATTGA-GGCTGG----CATA-TAT-----GT-ATGA-------------------A------AATTTT----CTG--------AACTCAA-AACTTTATAAA--TGT---AC-CTA--G---CCTT---GATG-TCAAA-CAAC-------AAAT----------------GGTA--TAGTT-CTTC--AAAGC----AAATT-ACATGCTTG---C-GAATGTCTTT--ATT-GT--GA-TTGT-----AGGAA----TCGAAAATT-TTCC-ATT-----T---TTTAA-C-AAT-A----TTATATTGACAAA--TTTCATA----TATTG---CGCG-CA-TAACAAC-TCG-AAG-AGG-TAC-AT-------GTATATTA--ATATCAGAT-AGTC-TG--ACTT--ACGA-T-----TAAAG---------------G-GCT-------GCAT----AC-----TA-A--TGAT
gi|14 : tT--TAGTTTCTTT--AGAAG----GAAAT-A-ATG---------AAAT-----T--A---AT--GA-CAGTAGGATTGGAT----C------TT-TTTT-CTACTATCT---TTTAA-CCAGT-G-CTGT---AATGACTAA--CTTTCTACATGTACTT---TACTACT-CAA-A-C-TCGAACA-A---T-C-CC-------AA---------TGCCAGACAG---TTGGAATTT--ACAA-T--------AG---------------GCGTA-------GTATCGCCAA-----TA-AAATGATCCTTTAAGGA---------AATGCTAAATTGTTTCC-A--A-GGTTGGTAAT---CGAC-TTTAACATA--------AATTCTC-TG----AGAGGAT-TT--TCCACTTGT--AG-TGA--TCTGTTT---A-AG-TTAAAGA-CCATGTCTCGTAGCCTC-AAAg
gi|15 : ATATAGTTACAA------TATCTGCAAAT-TA-GA-GGGTTGACAAATTC-------TA-TATACTCGG-AAATCT--GAGA----GTCTT----TTATCTCCCC-AATTTTCGCGTG-A------TATTTTGCA---C----A
gi|15 : TGACAAATTCTATATACTCGGAAATCTGAG-AGTCTTTTATCTCCCCAA-TTTTCGCG-TGAT--ATTTTGCAC--ACCATTATTATGGGTGTACC---------TTTTGGTAGGGGTTGCA-TC-AAAA--TC-GAAAACGTAACC-CACGTA-G-AAAATGC--CAAA--CAACCTGAATTAAATATTTGAAAAGGTTTCAGTAGG-ATAAAATCAATAAACTACAAAAAAACCCACAATTTGTTTTGAG-AAAAATCCCCATGG-GGGT-CGCCCATTACCTTTACTTGGCCCATGccattattatgggtgtaccttttggtaggggttgcatcaaaatcgaaaacgtaacccacgtagaaaatgccaaacaacctgaattaaatatttgaaaaggtttcagtaggataaaatcaataaactacaaaaaaacccacaatttgttttgagaaaaatccccatgggggtcgcccattacctttacttggcccatgtc
gi|16 : atatagttacaatatctgcaaattagagggtTTC-CA---C----AAATTT-CAAG-TTTTTGCCCCA-AAAT-TC---AAAAAA---TATCCATGCAA-ACAATA-TGA---TT---------------------T-AT----AA--TCAAAGG-GTTCAA-T-AGTTT-CAGAGACCCACATTT-----G-TTTT---CAAAAGGC-AA--T-ATTA--TC-TGTGAAGAGTC-TGAAGGAG-TT------TT--CCA--TTTGTCGATG-AT-TTTTAA-----A----GAAACAAAA-----G----AGCCCA-----AAAG-----------CTCG--AAAATGTCCTAA-AA-TA-CTT-ATGTCAAAC-AACT--------------TGATATA--Ttc
gi|17 : aa--A-GGTTCATA-----T--T-ATTTATATA---G----AAT--TC--G-A--AGAGG-T-TC--TCCATTTTT--AGGTGA--TT--TTT---TTAA-GTAAAA--TCATG--T---AGCCTC-AAAACTCGTAAAT-GT-T-CCCACA--TCCTAAAGTATAAA------------T------------TTATGTCAAA----CAA---CTTAGTAT-ATGATCAAGGGGTTGCATGTATTCACAAAATACTTGTTTGCAAAT-GT-CA-A---TGACA---TC-------TA-CAT---CGG-A--TCT---AAA--ACGTTTT----C--------C-AATTTTCA-GC
gi|18 : T-TGC-AAAACTTTATAATATCTATATGTATTTCGGATCTGAAGAG-TTTTTCCAAAGTTTGGCGTT--TATTT-TCACCAGTTGCATGGGGTTTTTTGCCCC-CAAACTCGACAA-CA--C-CACC-------AC-----CA-AGGAATGTCAAACAA-CCTTATTTAGAATC-----TAGGGACAAT-G-TAGTTTCAAAATAT
gi|19 : GAG-TTTCT----TTTTCCGCTAGCATATTTCTCAC-AG---CATG---CTTTTTGTTC--AAAACTGGTATT-CA--C-C-CCCTGGCCCAC-----AT-AGAAATTTGAAACAA-CCACATTTTTAATC-----AAACGACTGT-G-CACTTTCCAAAAGTACTTGTTTACA
gi|2 : TTTTGATTGGATATCCTGAAAAAA--A-GTT----CAACTAAACC---AACCATACT-TCTTGAGG-CAGGATGGTTATCTACAACCACACCTA-ATGGAGGAA-CACTTTGTTGGAT-TG--TTG--ATTATA-TGGTTCC-AATCACCTGCCCTATTGCAA-GAAA-T-GACACTA-TTCAGCATGCTATTC-AGCTAGATTAAT-ATCAC-AAGAAG-----CTGTCAAAATGTAACTATCCTTGCATGTG--ATTTTGCAGTGGCTA
gi|2 : TTTGGC-AAAATCCAG-AGAAGCAC----AGC-AA-TGTATTGT-TCAT-TTAGGAGTTTTCCATTCACTATCCTCTG-AACTGGAAACCACT-GGGGAA---AA--T---AGTG--AGCGTGAG-T-GGACT-TTT-AC-AC-----AT-GA-T-TATTGA-GTCTGGA-A---TA-TAT-----GT-ACGAT-AT--G-TCA-----GA-A------AATGTT---AT-A--------AACTTCA-AACTTTATAAA--TGT---AC-CTA--A---CCTT---GATA-TCAAG-CAACGTAATATACATAAG-C------------GTT--TAGTT-CTTT--AA-GC----AA--T-GCATGCTTG---CAAAATGCCCAT----T-AT--G------------------------------TTTT-CTA-----T---TTCAA-C-AAT----CGT-ATAATGAC-AA--TTTTATACATGTATTT---TGT--CC--AA-AAC-TCGAA-G-ACG-T-CTCC-------AAATATCA--ATGTCAGACA-GTCT-G--ATTT---CAA-TAAGGATAAAACTGTTCGTTTCCTTTG-ATTTT-----ACAT----ACAGAATTA-A--TGATACGTTAAGAA---------AAT----AATTATTTTCAT--T-GGTTCATA-----TGAT---TTATATA----------------------------------TTCATTTC--CAATAAA--TT--TGA---A-AA-GTAAAAA-TCATG--TTGTAACCTA-AAAATTCATAAAC-AT-T-CATACA--T------------A------------T------------TTATTTTCAC---ACAA---CTAAATAT-ATAAACAAGGGGTTACACATATTTACAAAAGACTTGTATGCAAAT-AA-TA-A---GGACA---TC-------AA-TAT---CGGTA--TGT--GAAA-----TTTTCCCCC--------C-AACTTTGA-GTG-AT--TATTATTTT-TA---C----ACATTT-CAAG-TTTTTGCCCAA-AAAC-TC---G-AAAAGG-TCTCCATGCAA-ACAATC-TTA----T---------------------TTAT----AA--TCAAAGG---TACA-T-ACATT-C--AGAAA-ACAA-T-----G-ATTTT--CATCAGTA-AA--T-ATTA--TC-TATTGAGAG-T-TGAAGGAGATT------T---CCA--TTTTTCGATT-AT-TTTTAG-----A----GAAA--AAA-TCCCGTTTTAGCCCC-----AAAA-----------CTCGTC--GATGCCCCCA-AC-TATC-T-ATGCCAGAC-------------------------------AT-T-----GGAT--G---GCTA-CA-TAT-GTT----CACAAAA------TATTTGTTTGC------AAAATTCAGTGATA--TCTATAT-CGG---ATCTGAGGAGC-TTGT-CCAATTTTTGGTGATTATTTT--TACCAATTTT-ATG-TTTTTTC-CTCC--AA------AACTCAATAACA-T-CCCACGT--AAGAATGT-CAAACAACC-TGA-TTTATAATTA-GG-GGGCTATGTACTT-GC---AAATTATACCTGTT-TG-CAAAAGTCAATGACATTTATAT------CGGATCTGAGGAATTTTTTCCAATTTTTGGTGAT--TATTT-TCACCAATTTTATG---TTTTT--CCCCAAAAACTCAAAAA-CGC-C-C-CC-------AC-----GT-AGGAATGTTAAACAA-CCTGATTTATAATC-----AGGGGAACAT---TACCTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttggcaaaatccagagaagcacagcaatgtattgttcatttaggagttttccattcactatcctctgaactggaaaccactggggaaaatagtgagcgtgagtggacttttacacatgattattgagtctggaatatatgtacgatatgtcagaaaatgttataaacttcaaactttataaatgtacctaaccttgatatcaagcaacgtaatatacataagcgtttagttctttaagcaatgcatgcttgcaaaatgcccattatgttttctatttcaacaatcgtataatgacaattttatacatgtattttgtccaaaactcgaagacgtctccaaatatcaatgtcagacagtctgatttcaataaggataaaactgttcgtttcctttgattttacatacagaattaatgatacgttaagaaaataattattttcattggttcatatgatttatatattcatttccaataaatttgaaaagtaaaaatcatgttgtaacctaaaaattcataaacattcatacatatttattttcacacaactaaatatataaacaaggggttacacatatttacaaaagacttgtatgcaaataataaggacatcaatatcggtatgtgaaattttccccccaactttgagtgattattatttttacacatttcaagtttttgcccaaaaactcgaaaaggtctccatgcaaacaatcttatttataatcaaaggtacatacattcagaaaacaatgattttcatcagtaaatattatctattgagagttgaaggagatttccatttttcgattatttttagagaaaaaatcccgttttagccccaaaactcgtcgatgcccccaactatctatgccagacattggatggctacatatgttcacaaaatatttgtttgcaaaattcagtgatatctatatcggatctgaggagcttgtccaatttttggtgattatttttaccaattttatgttttttcctccaaaactcaataacatcccacgtaagaatgtcaaacaacctgatttataattagggggctatgtacttgcaaattatacctgtttgcaaaagtcaatgacatttatatcggatctgaggaattttttccaatttttggtgattattttcaccaattttatgtttttccccaaaaactcaaaaacgcccccacgtaggaatgttaaacaacctgatttataatcaggggaacattaccttt
gi|20 : ttttgattggatatcctgaaaaaaagttcaactaaaccaaccatacttcttgaggcaggatggttatctacaaccacacctaatggaggaacactttgttggattgttgattatatggttccaatcacctgccctattgcaagaaatgacactattcagcatgctattcagctagattaatatcacaagaagctgtcaaaatgtaactatccttgcatgtgattttgcagtggctannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAGACA-GTCT-G--ATTT--ACAA-T-----TAAAG---------------G-GTT-------CCAT----AC-----TA-A--TGGTACGTTAAGAA---------AAT----AATCATTTTCAA--A-AGTTCATA-----TG---ATTTACATA---G----GA---TC-TG-A--AGAGG-T-TC--TCCATTTTT-CAt
gi|21 : ATATTCACAAAATACTTGTTTGCAAAT-GC-CA-G---TGGCA---TC-------AA-TAT---CGG-A--CCT--GAAA--GGCTTTT----C--------C-AATTTTCA-GCG-AT--TA----TTT-CA---C----AAATTT-CAAG-TTTTTGCCCCA-AAA
gi|22 : GAA---------AAT----AATTGTTTTCAA--A-G-TCCATA-----TA-----TTATATAAACG----GA---------A--AGAAC-T-TTCTTCCATTTTTTCAGT-GA--TT--TTT---T-AA-GTAAAAAATCATG--TTGTAGCCTC-AAACTT
gi|23 : --TATAT-TTACAAATATTATGAG-TATTTCCCCTCAAATATTCATAAA-AT--C-C-CT-------ATATTCTGT-A--AATGTTAAACAA-CCTCGTTTATAATC-----AAGAGACTAT-A-T-CTTTC
gi|24 : cAA---ACAA---CTAAATAT-ATATTCAAGGGGTTTCATATAGTTACAAATGACTTGTTTGCAAAT-GA-TA-A---TGACA---TT-------T--TAT---CGG-A--TCT--GAAA--AGGTTTT----T--------
gi|25 : tcTTTGTTTGGATGTACTGAAAAAAAAGCGTCGATCCAACTAAACC---AACCGTACC-TCTAA-GGACAGGATGATTATCTACAACAACACCTG-AT-GAAGAAGTAtttccaat
gi|26 : ----AATTGTTTTCAA--A-GGTCCATA-----TG---ATTTAAATA---G----GA---TC-TG-A--AAAAG-T-TC--TCTATTTTT-CAG-TGATTTT--TTT---A-AA-GTAAAAT-GCATG--TGGTAGCATC-A
gi|28 : GAC-GA--TTT---ACTTATACCTCCATGC--TCGCAA-AAC-TCGAAA--ACGTT-C-CC-------AATTATCA--ATGTCAGAC-AGTC-TG--ATT
gi|29 : AATTTGGC-AAAATACTG-AGAAATAC----AGC-GA-TGT------TCAC-TTAGGAATTTTCCATTCACTATCCTCTG-CA
gi|3 : ACAAAC-CACCTGCATCGAAGAAGTAATTTGCTCGAAATG--TTATAATTATT-CGGTTCCCAATCACCTGCCCTATTACCA-GAAATT-GGCACTG-TACAGCAGGTTATTC-AGC--------T-ATCAC-AAGAAGGGGTTTTGT-----TGTAACTATCCTTGCTTGTGATATTTTGCAG
gi|3 : caaTTGGC-AAAATACAG-AGAAATAC----AGC-GA-TGT------CCAT-TTAGGAGTTTTCGATTCACT-TCC-CTG-CACTGGAAACAGTTCGGGAAA---A---T---AATG--AGCGCGAG-T-GGACT-TTC-AC-AC-----GTTGA-T-TATTGA-GTCTGAA-A---TA-TAT-----GT-ACGAT-AT--ACTCA-----GGTATCAGATAATGTT---AT-A--------AGCTCCA-AACTT-------------------A--G---CCTT---GATA-TCAAA-CAAAT-AATACACATAAG-TATG--A-----GGTTGTTCTTT-CTTT--AAAGC----AAAAT-GCATGCTTG---CAAAATGTCCAT--A-T-AT--GA-CTGT-----TGAAA----A------TT-TTCT-CTA-----T---TTCAA-C-AGT-A-CTG-TATAATGAC-AATTTTTCATACATGTATTT---TGT--CC-CAA-AAC-TCG-AAG-ATG-TCC-CC-------AAATATTA--ATGTCAGAC-AGTC-TG--ATTT--ACAA-T-----TAAAG---------------G-GTT-------ACAT----AC-----TA-T--TGATAATTTAAGAA---------AAT----AATTG-TTTCAG--A-GGTCAATA-----TG---ATTTGAATA---A----GA---TC-TG-A--AGAAG-T-TC--TCCATTTTT-CAG-TGT--TT--TTT---T-AA-GTAAAAA-TCATG--TTGTAGCCTC-AAACCTTATAAAC-ATATACATACA--T------------ACAAATACAGGTTT------------TTATGCC-AA---ACAA---CTAGATAT-ATAATCAAGGGGTTACATAAATT-ACAAAAGACTTGCTTGCAAAT-AA-TA-A---TGACA---TCTACCAGGTA-TAT---TGG-A--TCT--G-AA--AAGTTTT----C--------C-AATTTTCA-GCT-AT--TATTATTTT-CA---C----AAATTT-CTAG-TTTTTGCCCCA-AAAC-TC---G-AAAAGG-TCTCCGGGTAA-ACATTG-TAACC-TTA--------------------TTAT----AA--ACAAAGG-GTTAC--T-AATTT-C--AGAAA-ACATTT-----A--TTTT--CATCAGTC-AA--T-ATTA--TC-TATAGAGAGTA-TGAATAAGTTT------T---CCA--TTTTTCGATT-AT-TTATTA-----A----GAAA--AAA-TCCTGTTTTAGTCCA-----AAGA-----------CTCGTC--AATGT---TATAA-TATC-T-ATGTTAAACAAACT--------------TGATATA--TC-AT-T-----GAAT--G---GTTA-CA-TAC-GTT----CAC-AAA------TACTTGTTTGC------AAAAGTCAACGACA--TTTATAT-CGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntataattggcaaaatacagagaaatacagcgatgtccatttaggagttttcgattcacttccctgcactggaaacagttcgggaaaataatgagcgcgagtggactttcacacgttgattattgagtctgaaatatatgtacgatatactcaggtatcagataatgttataagctccaaacttagccttgatatcaaacaaataatacacataagtatgaggttgttctttctttaaagcaaaatgcatgcttgcaaaatgtccatatatgactgttgaaaattttctctatttcaacagtactgtataatgacaatttttcatacatgtattttgtcccaaaactcgaagatgtccccaaatattaatgtcagacagtctgatttacaattaaagggttacatactattgataatttaagaaaataattgtttcagaggtcaatatgatttgaataagatctgaagaagttctccatttttcagtgtttttttaagtaaaaatcatgttgtagcctcaaaccttataaacatatacatacatacaaatacaggtttttatgccaaacaactagatatataatcaaggggttacataaattacaaaagacttgcttgcaaataataatgacatctaccaggtatattggatctgaaaagttttccaattttcagctattattattttcacaaatttctagtttttgccccaaaactcgaaaaggtctccgggtaaacattgtaaccttattataaacaaagggttactaatttcagaaaacatttattttcatcagtcaatattatctatagagagtatgaataagttttccatttttcgattatttattaagaaaaaatcctgttttagtccaaagactcgtcaatgttataatatctatgttaaacaaacttgatatatcattgaatggttacatacgttcacaaatacttgtttgcaaaagtcaacgacatttatatcg
gi|30 : caaacaaaccacctgcatcgaagaagtaatttgctcgaaatgttataattattcggttcccaatcacctgccctattaccagaaattggcactgtacagcaggttattcagctatcacaagaaggggttttgttgtaactatccttgcttgtgatattttgcagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntataa-T-----GAAT--G---GTTA-CA-TAC-GTT----CACAAAATACCGGTACTTGTTTGC------AAAAGTCAAAGACA--TTTATA
gi|31 : ACCAAGGGGTTACATAAATTTACGAAAGACTTGCTTGCAAAT-AA-TA-A---TGACA---T
gi|32 : AA---A---T---AATG--AGCGCGAG-T-GGACT-TTC-AC-AC-----AT-CA-T-TATTGA-ATCTGG--AATATA-t
gi|34 : CTTCATATA--TGT---AC-CTA--G---CCTT---GATA-TCAAG-CAACTTGATATA
gi|35 : TCCCTAGGG-GG-T-CCCCC-TTACCTT-AC-TGGCCCATGG
gi|4 : TGGC-AAAATTCATTAGAAACACTAACAGCTGA-TGT--------AA-TTG-----TTTCGTTTTAGGAGCCTCTG-CA------GCACTT-GT--AA---A---TCGCAATGG-AGCGCGAG-TCGAACTGTTCTACCAT-----GT-GA-T-TATT------CG-----TAGA-TAT-----GT-AAGA-------------------A------AATGTT---AT-A--------AACTCCA-AACTTCATATA--TGT---AC-CTA--G---CCTT---GATA-TCAAA-CAACTTGA-----------------------GGAT--TAGTT-CTTT--AAAGC----AAAAT-GCATGCTTG---CAAAATGCCCAT--AAT-AT--GA-CTGT-----TGGAAA---T------TT-TTCT-CTA-----T---TTCAA-C-AAT-A-CTGT-------AC-AA--T-------ATGTATTT---TGC--CC-CAA-AAC-TCGAA-G-ACG-T-T-CCCATGC--AAATATCA--ATGCCAGACA-GTCT-G--ATTT--ACAA-T-----TAAAG---------------G-GTT-------ACAC----AC-----TA-A--TGATACGTTAAGAA---------AAT----TATCATTTTCAA--A-GGTTTAT------CGAT---TTATATA---A----GAT---A-TG-A--AGAGG-T-TC--TCCATTTTT-CAGT-GA--TT--ATT---A-AAAGTAAAAA-TCATG--TCGTAGCCTC-CAAACTCATATAC-AT-T-CATACA--T------------A------------T------------TTATGTCAAA----CAA---CTAAATAT-ATAATCAAGGGGTTACATA----------AGACTTGTTTGCAAAT-GA-TA-A---TGACA---TC-------TA-CAT---CGG-A--TCT--GAAA--AAGTTTT----T--------CCAAATTTCG-GCG-AT--TATTATTTT-CA---C----AAATTT---------TTGCCCCA-AAAC-TC----AGATAGA-TTTCTATGCAA-ACAATT-TTA---TTTATAATCAAAGGGTCACATATTTATTTAAAA--TCAAAGG-GTCACA-T-ATTTT-CAGA--AA-ACAATT-------CTTTT--CATCCGTC-AA--T-ATTA--TC-TATGGAAAGCT--GAAGGAG-TT------TT--CCA--TTTTTCGATT-AT-TTTTAA-----A----GAAA--AAAT-CCTGTTTTAGACCC-----AAAA-----------TTTGTCAA--TGTCCCCA-AA-TATCT--ATAACTGAC-AACT--------------TGATATA--TA-AT-T-----GAATATG---TTTA-CA-TAC-GTT----CACAAAA------TACTTGTTTGC------AAAAGTCAATGACA--TTTATAT-CGG---ATCTGAGGAGT-TT-TTCCAATTTTCGGTGATTATTGT--CACCGA-TTTCATGTTTTTTTTGCCCCAAAA---CT--A---AAAAACGCC-CCCACGT--AGGAATGT-CAAACAACC-TGA-TTTATAATCG-AG-TGACTATGTACTT-TA---AAATTATACTTGTT-TG-CAAAAGTC--TGACATTTATAT------CGGATCTGAGGGT-TTTTTCCAATTTTCGGTGAT--TATTG-TCACCGATTTCATGTT-TTTTTTGCCCC-AAAACTAAAAAA-CGC-C-C-CC-------AT-----GT-AGGAATGTCAAACAA-CCTGATTTATAATCAATTTAAGGGACTAT-A-TACTTTCAAAtct
gi|5 : aCTCTG-CACTGTAAACCACT-GGAGGAGAGA---T---AATGG-AGCGCGAG-T-GGACT-TTC-AC-AT-----GC-GAGTGTGTTGA-GTCTGCTTAATCTAATAA-----GTTACGAT-TTGCA-TTGTCAAAGATA------AATGTTGAAATGACACAGAGAAACTCCATCAGGTCACTAC--TGTTCAACACTA--AGCACCTTAAGGATAGTCAAAGCAACT----ATG---AGG-A-T---A-----G--T--AATTT-CTTTCAAAAGCGAGAAAAAT-GCACCATTAACACAATATGCCCATTAA-T-ATTGGATCTGTCA---TGCAAATAAT------TTATTCTACTA-----TATATCTAATC-AATTA-CTGTTACAATAGC-------TCTTAAGTATA-------GC--CCACAA-AACGTCGAA-G-ACG-T-C-CCCATGCAGAGATATCACAATGCCAGAACGGTCT-G--ACTTGTACAAAT-----TAAAGTG-------------A-GTTACTGGAAGCAT----CT-----TACA--TGATCATCTAAGAATCTCTATAAGATGAG-AATTGTCT-CAATTATGGTCAATAGTTTTTCATCATTTTCATA---GAAGAGAC--CCATGTATCAGAGG-TGTC--TCCATTTT--CAGTGTA--TT--ATT---A-AAAGTAACAA-TC-TG--TCGTAGCCTCCAAATTTCATAAACAGT-T-CATACA--T------------A------------T------------TTATTTCAAAGTGAAAATTCTTAAGTATGATAATCAAGGTGTTA-AT----------AAGACTTGTTGGCAAAT-GA--A-A---TGACA---TC-------TACCAT---C-G-A--TCT--GAAAACAAGTTTT----T--------C-CAAATTCG-CCGAATAGTATTATTTT-CAG--C----AAATTT-CAAG-TTTTTGCCCCAGAAAA-TCAGAGAAAAAGGTTCTCCGTGCAA-ACAATA-TTT---TTTTACTCCA-------------TTAT----AAATTCAAAGG-GTCACAGTGATTTT-C--AGAAA-ACAATT-----T-CTTTTTGCATCAGCT-AAATT-ATTA--TC-TATGAAGAGTTCTGAAGGAA-TT------TTTACCATTTTTTTCGATTAATATTGTGAAAGACA----GAAA--AAATCACTATTCTCACCCCTCTATAAAAAGATAAATTTCTTTTTCAAAGGTTCCCCA-AATTATCTT-ATGTCAGAC-AACT--------------Tt
gi|6 : atttggcaacattatcagtacgacataacaccagcatcgcatattgtgtcggtttaggaagcaCAAA---ACAA---CTAA-TAT-ATAATCAAGGG-TTA-ATAAAT--ACAAAAGACTTGCTTGCAAAT--A-CACA---TGGC----TC-------TA-TAT---CGG-A--TCTT-GAAA--AAGTTTTCT--T--------C-AATTTTCA-ACA-----TAT-ATTTT-CA---C----AAATATACTAG-TTTT-GCCCCA-AAACCTC---GAAA--GT-TCTCCGGGTAAGACA--C-TTAACCTA---------------------TTAT----AA--TCAAAGG-GTTA-A-T-ACTTTTCAGA--AA-ACATTT-----A-TTTTT--CATCAGTC-AA--TTATTA--TC--ATAGAGATAT--GAAGGAG-TTGTTTTTT---CCA--TTTT-CGATT-AT-TTATAA-----A----GAAA--AAATTCCTGTTTAA--TCC-----AAAA-----------CTC---ACAATGTTCTCA-AA--ATCTC-ATGTAAAAC-AACTTATATATCATTGAATGGTATA--TACGT-TCACCAAAAT--ACTTGTTC-CAATGC-ATTATATCGNNNNN------NNNNNNNNNNN------NNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN-NNN---NTCTGAGGAGT-TT-T-CCAATTTTCG-TGATTATTTT--CACCAATTT--ATG-TTTTT--GCCCC--AAAAACTCAA---AAAAACGCCGTTCACGT--AGGAATGTCAAAACAACC-TGA-TT-ATAAGCA-AG-G-ACTATGTACTCGTC---AAATAAC-CTTGTA-T-CCAAAAGTCCATAACATCTTTAT------CGGATTTGAGGAG-TTTTTC-AATTTT-GGCGAT--TATTT-TCACCAATTTCATG---TTTTTTGCCCCAGAAACTCAAAAA-CAACC-C-CC-------AC-----GT-AGGAA-GTCAAACAAACCCGATTTATAATC-----AAGGGACTAT-G-TACTTTCAAATTATACTTGTTTGCAATAGTCATAAGACA---TCTATAT--T-GGA--T-TGA-GAGTTTTG-------CCTA--TT-CA-G-CGATT-A-TTTTCAC--A--ATT-TC----A-AT--TAATTTCAAGTTTT--------TTGCC-CCAAAAACCTCAAAAAACGCC-CC-CACGTA-ACGAA-T-T--CAAAGGCAACCTGA-TT-----TTTAA-------TCAA--GA-CT-AT-T-----AGTTTCAAAAAATT-----ACTTGTTT---GCAAAAAT-CCTGAGG-GGGT-CCCCCATTACCTTTAC-TGGCCCATGGtg
gi|7 : tgA--ATGTCATATA-GTCT-G--ATTT--ACAA-T-----TAAAG---------------A-GCT-------tc
gi|7 : attaagaatttgatctcatagaccatgggccagtaatGCTTTGAA--A-GGTCTATA-----TGAT---TTATATA---G----AAT---C-TG-A--AC----T-TT--TTTATTTTT-TGGT-GA--TC--TTTTTAA-AA-GTAAAA--TCATG--TTGTAGCCCG-AAATCTCGTAATT-GT-T-CACACA--T------------A------------TCATAGTATAAATTTATGTCAAA---TAAA---TTAA-TAT-ATGATTAAAGGCTTGCATATATTCACAAAATACTTGTTTCCAAAT-GT-CA-G---TGACA---TC-------TG-TAT---CGG-A--TGT---AAA--ATGTTTT----T--------CTACTTTTTG-GCG------ATTATTTT-CA---CAATTAAATTT-CAAA-TTCTTACCCCA-AAAC-CC----AGAAAGG-TCTCCATGCAA-ACAATA--TA---AT---------------------TTAT----AA--TCAAAGG-GTTGAA-T-AGTTT-C--AGAAA-ATATTTTTTTCA-TTTTC--CATTTTTC-GA--TGATT---TC-TA--AAGAAAA-TAAAA----------------TCA--TGTT----TT-AG-CCCCAA-----AACTCGAAA--A------TGT------CCC-----AAAA-----------TACTT----ATGT---CA-AA-CAACTTGATAT---AT-AATT--------------T---------A-AT-T-----G----------TTA-CA-TAC-GTT----CACAAAA------TACTTGTTTAC------AAAAGTCAATGACA--TCTATAT-CGG---ATCTGAGGAGT-TT-TCCCAATTTTCGGTGACTATTTC--CACCAA-TTTCATG-TTTTTttgaaaggtctatatgatttatatagaatctgaacttttttattttttggtgatctttttaaaagtaaaatcatgttgtagcccgaaatctcgtaattgttcacacatatcatagtataaatttatgtcaaataaattaatatatgattaaaggcttgcatatattcacaaaatacttgtttccaaatgtcagtgacatctgtatcggatgtaaaatgtttttctactttttggcgattattttcacaattaaatttcaaattcttaccccaaaacccagaaaggtctccatgcaaacaatataatttataatcaaagggttgaatagtttcagaaaatatttttttcattttccatttttcgatgatttctaaagaaaataaaatcatgttttagccccaaaactcgaaaatgtcccaaaatacttatgtcaaacaacttgatatataatttaattgttacatacgttcacaaaatacttgtttacaaaagtcaatgacatctatatcggatctgaggagttttcccaattttcggtgactatttccaccaatttcatgtttttg
gi|8 : attaagaatttgatctcatagaccatgggccagtaataatgtcatatagtctgatttacaattaaagaATATTCACAAAATAC-TGTTTGCAAATCGG-TC-A---TGACA---AC-------TA-CAT---CGG-A--TCTACGAAA--A------------------------TGTCG-GCG-GA--TAT--TTTG-CAGTTC----AA---T-TAAGATTGGTGCCCCA-AAA--TC----AAAACAG-TATCCATGC-A-ACAATA-TGA----T---------------------TTAT----AA--TCAAAGGAGTTAAA-T-ACTTT-C--AGAAA-GTATTT-----GTTTTTT--CAAAAGTTGAA--T-ATTGGTTCTTGTGAAGAGTC-TGGAAGAG-------------------TTTTCCATT-AT-TTC-AA-----A----AAAA--AAAATCACGATTTAGTCCA-----AAAA-----------CTCG--AAAATGTTC------------------CAAAC-AACT--------------TGATATA--T--AT-T-----TAAT------GTTAGCA-TAC-GTT----CACAAAA------TA-TTCTTTGCAAAAATAAAAGTCAATGACATCTTTAT-T-CGGCATGTCTGAGGAGT-TT-T-----TTCTCAATGATTATTTTCACACCAA-TGTCATG--TTTTTTGCCCCA-AA---CT------TGGAACG---CCCAGGT--A-GAATGTCAAAACAGGC-TGACTTTATAAATGCAGTGGACTATTGACTG-TCGAAAAAGTATACTT-TT-T--CAAGAGCCg
gi|9 : -ATGTTAAA--AACT--------------TGATA-A--TC-ATAG-----GAAT--G---GTTA-CA-TAT--TT----CACAAAA------TACTTGTTTGC------AAAGTTCAATGACA--TTTATATCCGG---ATttcaggagtctccctt
gi|9 : GGATCTGAAGAG-GTAT-CCAATTTCGAGTG-T--TATTT-TCACAGATTTTATG---TTGTTTTCCC--AAAACCCAAAAAACG--CTC-CC-------AC-----GTTAGGAATGTCAACAAA-CCTGATT-ATAATC-----AAGGGACTATTG-TACTTTCAATATATACTTGTTTGCAATAGCCA-ATGA-A---TCTATA---TCGGA--TCTGATGAGTTTTT-------CCAATTTT-CA-GCCGATT-ATTATTCACCAA--ATT-TC----CAG---T---------TTTT--------TTGCC-CC-AAAACTC---AAAACGCC-CCACACGTAGG-GAA-TGT--C-AA--CAACCTGA-TC-----TTTAA-------TCAA-GGGACTACTGT-----AGTTTC--AAAAAT-----ACTTG-TT---GCAAAAAT--CTAGGG-GGGTCCCCCCATTACCTTTAC-TGGCacgaaaacgtcgatcaatctcgtaagtccaaattagggatctgaagaggtatccaatttcgagtgttattttcacagattttatgttgttttcccaaaacccaaaaaacgctcccacgttaggaatgtcaacaaacctgattataatcaagggactattgtactttcaatatatacttgtttgcaatagccaatgaatctatatcggatctgatgagtttttccaattttcagccgattattattcaccaaatttccagtttttttgccccaaaactcaaaacgccccacacgtagggaatgtcaacaacctgatctttaatcaagggactactgtagtttcaaaaatacttgttgcaaaaatctaggggggtccccccattacctttactggcatagtctagggattcaatt
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|27 ): AANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACAGGTATT
Unaligned ( gi|33 ): GTGAAGAGTCTGAAAGAGTTTTCCATTATTCAAAAAAAAAAATCA
Alignments
lowQualScore : 11 2222 111 1 1 1 111 1 11 11 111 1 1 111 111 1 1 3333333333 1 33333 111 1111 3333333 11111111111 22 11111 3333333 11111 77777777777777777777777777 333333333333333 11111111 111111 6666666666666666666 1111 222222 11111 33333333333 11111 111 11111 11 111 1 2222222 22 11 11111 333333333333333 2222222 1111 11111 11 222222222 1111 33333333333 3333333333333333333333 11 66666666666666666666666666666666666666666 1111 1111111 1111 2222222222222 11111 111 11111 77777777777777777777777777 22 22222222 1111 3333333333333 1111111111 11 11111 33333333333333333333 22222222222222 11111 11111 111111 111111 111111 111 11 1 11 33333333333 111 11 111 222 111111 222 11 1111111 11111 11111 1 111 222 11 2222222 1 22222 77777777777777777777 22222222 1111 11 11 22222222 2222222 11 33333333 222222 1 111
lowQualScore : 33 2 1111 777 2 0 1 0 0 999 8 5 1 00 33 777 0 0 000 000 1 0 1 0 7777777777 0 33333 6 7 333 1 6 22 6 4444 6 6 7777777 77 9 5 1 6 22 77777777777 00 5 5 5 5 5 44444 5 5 5 5 7777777 5 66666 6 11111111111111111111111111 333333333333333 5 33333333 888 5 111111 888 5 5 66666 2222222222222222222 66 5 66 0000 5 0 888 3 2 222222 66 5 99999 22222222222 5 5 22222 888 5 5 999 222 11111 33 1 777 00 8 4 4 3 777 1 4 3 4 5555555 55 33 99 55 66 4 11111 333333333333333 4 0000000 0000 22222 5 11 1 000000000 7777 55 3 33 00000000000 3333333333333333333333 0 3 3 55 77 88 55 55 88888 7 55 55 5 3 66 5 777 22222222222222222222222222222222222222222 4 0000 777 3 4 2 5 44444 3 555 555 0000000 3 555 3 44 77 0000 1111111111111 7 3 55555 33 3 000 7777 4 4 4 66 88888 4 4 1 55 00000000000000000000000000 9999 66 4 444 4 1 4 22 1 4 1 33333333 66 4 66 8 66 4 1 1111 0000000000000 66 1 4 4 1 1111111111 66 66 22 11111 11111111111111111111 444 4 55 2 999 0 4 33333333333333 1 33333 4 11111 444444 4 4 4 9999 222222 222222 66 5 000 6 6 44 1 99 5 5 5 55 44444444444 000 99 3 66 6 8888 0 6 6 6 111 6 5 000 7 999999 5 3 9 0 66 4 3 1 000 3 88 4 55 4 4 4444444 11111 4 0 4 3 11111 888 1 9 0 444 111 11 5 0 6666666 88 8 8 8 88 0 55555 8 66666666666666666666 99999999 8 8 0000 8 8 999 8 5 11 0 11 22222222 6666666 11 8 0 00000000 0 333333 0 444 0 6 6 8 0 0 8
lowQualScore : .. . .... ... . . . . . ... . . . .. .. ... . . ... ... . . . . .......... . ..... . . ... . . .. . .... . . ....... .. . . . . .. ........... .. . . . . . ..... . . . . ....... . ..... . .......................... ............... . ........ ... . ...... ... . . ..... ................... .. . .. .... . . ... . . ...... .. . ..... ........... . . ..... ... . . ... ... ..... .. . ... .. . . . . ... . . . . ....... .. .. .. .. .. . ..... ............... . ....... .... ..... . .. . ......... .... .. . .. ........... ...................... . . . .. .. .. .. .. ..... . .. .. . . .. . ... ......................................... . .... ... . . . . ..... . ... ... ....... . ... . .. .. .... ............. . . ..... .. . ... .... . . . .. ..... . . . .. .......................... .... .. . ... . . . .. . . . ........ .. . .. . .. . . .... ............. .. . . . . .......... .. .. .. ..... .................... ... . .. . ... . . .............. . ..... . ..... ...... . . . .... ...... ...... .. . ... . . .. . .. . . . .. ........... ... .. . .. . .... . . . . ... . . ... . ...... . . . . .. . . . ... . .. . .. . . ....... ..... . . . . ..... ... . . . ... ... .. . . ....... .. . . . .. . ..... . .................... ........ . . .... . . ... . . .. . .. ........ ....... .. . . ........ . ...... . ... . . . . . . .
lowQualScore : 88 5 2222 555 5 0 0 0 0 666 0 0 0 22 88 000 0 0 222 888 0 0 2 0 2222222222 0 33333 7 3 777 0 7 00 7 2222 7 7 5555555 00 3 7 0 7 00 77777777777 77 7 7 7 7 7 33333 7 7 7 7 6666666 7 77777 7 22222222222222222222222222 666666666666666 7 55555555 888 0 666666 888 0 0 88888 7777777777777777777 99 0 99 6666 0 1 888 1 2 222222 99 0 44444 44444444444 0 0 55555 888 0 0 000 999 22222 88 1 888 66 9 4 4 6 333 9 4 3 4 6666666 55 99 99 55 11 4 11111 999999999999999 4 6666666 6666 55555 0 99 3 000000000 2222 00 6 88 77777777777 6666666666666666666666 4 6 6 00 88 88 00 00 11111 3 99 00 5 6 22 0 111 99999999999999999999999999999999999999999 6 4444 000 8 0 6 8 88888 1 444 444 8888888 3 888 3 66 99 8888 8888888888888 3 6 11111 99 6 000 7777 0 0 0 33 11111 4 4 0 44 99999999999999999999999999 4444 11 4 888 4 9 4 11 1 4 0 77777777 11 4 11 9 11 4 9 8888 1111111111111 11 9 4 4 0 6666666666 11 33 00 11111 33333333333333333333 999 4 22 0 333 7 0 55555555555555 8 66666 4 11111 000000 4 4 4 4444 888888 888888 11 0 000 7 7 33 0 22 5 2 7 88 88888888888 222 22 7 00 7 2222 7 7 7 7 777 7 7 000 5 222222 0 2 6 4 11 4 9 8 000 6 33 4 00 4 4 4444444 11111 4 1 4 9 11111 000 0 8 0 000 666 00 0 8 0000000 88 0 0 0 88 6 88888 0 88888888888888888888 00000000 0 0 6666 0 0 222 0 0 00 8 00 88888888 0000000 22 0 8 00000000 8 888888 6 000 8 7 7 0 8 8 0
consensus : ATTTTGTTTGGATATACTGAAAAAA--GCGTT----CAACTAAACC---AACCGTACC-TCTNG-GG-CAGGATGGTTATCTACAACCGCACCTG-ATGGAAGAAGTANTTTGCTCGAC-TG--TTG--ATTATA-TGGTTCC-AATCACCTGCCCTATTACAA-GAAATT-GNCACTG-TTCAGCAAGTTATTC-AGC--------T-ATCAC-AAGAAG-----CTGTCAAAATGTAACTATCCTTGCATGTGATATTTTGCAGTNGCTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATTTGGC-AAAATCCAG-AGAAATAC----AGC-GA-TGT------TCAT-TTAGGAGTTTTCGATTCACTATCCTCTG-CACTGGAAACAATT-GGGGAA---A---T---AATGG-AGCGCGAG-T-GGACT-TTC-AC-AC-----GT-GA-T-TATTGA-GTCTGGA-AATATA-TAT-----GT-ACGAT-AT--A-TCG-----GATA------AATGTT---ATTA--------AACTCCA-AACTTCATNAA--TGT---AC-CTA--G---CCTT---GATA-TCAAA-CAACTTGATATACATAAG-C-T---A-----GGTT--TAGTT-CTTT--AAAGC----AAAAT-GCATGCTTG---CAAAATGCCCAT--A-T-AT--GA-CTGT-----TGGAA----T------TT-TTCT-CTA-----T---TTCAA-C-AGT-A-CTGTTATAATGAC-AA--TTTCATACATGTATTT---TGC--CC-CAA-AAC-TCGAAAG-ACG-T-C-CC-------AAATATCA--ATGTCAGACAAGTCTTG--ATTT--ACAA-T-----TAAAG---------------G-GTT-------GCAT----AC-----TA-A--TGATACTTTAAGAA---------AAT----AATTGTTTTCAA--A-GGTCCATA-----TGAT-ATTTATATA---G----GAT--TC-TG-A--AGAGG-T-TC--TCCATTTTT-CAGTTGA--TT--TTT---A-AA-GTAAAAA-TCATG--TCGTAGCCTC-AAANCTCATAAAC-GT-T-CATACA--T------------A------------T------------TTATGTCAAA---ACAA---CTAAATAT-ATAATCAAGGGGTTACATATATTCACAAAAGACTTGTTTGCAAAT-GA-TA-A---TGACA---TC-------TA-TAT---CGG-A--TCT--GAAA--AAGTTTT----T--------C-AATTTTCG-GCG-AT--TATTATTTT-CA---C----AAATTT-CAAG-TTTTTGCCCCA-AAAC-TC---GAAAAAGG-TCTCCGTGCAA-ACAATN-TTA---TT---------------------TTAT----AA--TCAAAGG-GTTACA-T-ACTTT-CAGAGAAA-ACANTT-----G-TTTTT--CATCAGTC-AA--T-ATTA--TC-TATGGAGAGNT-TGAAGGAG-TT------T---CCA--TTTTTCGATT-AT-TTNTAA-----A----GAAA--AAATTCCTGTTTTAGCCCC-----AAAA-----------CTCGTCAAAATGTCCCCA-AA-TATCTT-ATGTCAAAC-AACT--------------TGATATA--TA-AT-T-----GAAT--G---GTTA-CA-TAC-GTT----CACAAAA------TACTTGTTTGC------AAAAGTCAATGACA--TTTATAT-CGG---ATCTGAGGAGT-TT-T-CCAATTTTCGGTGATTATTTT--CACCAATTTTCATG-TTTTTTTGCCCC--AA---CT-AA---AAAAACGCC-CCCACGT--AGGAATGTCCAAACAACC-TGA-TTTATAATCG-AG-GGACTATGTACTT-TC---AAATTATACTTGTT-TGCCAAAAGTCAATGACATCTATAT------CGGATCTGAGGAG-TTTTTCCAATTTTCGGCGAT--TATTT-TCACCAATTTCATG---TTTTTTGCCCCAAAAACTCAAAAA-CG--C-C-CC-------AC-----GT-AGGAATGTCAAACAA-CCTGATTTATAATC-----AAGGGACTAT-G-TACTTTCAAANTATACTTGTTTGCAATAGTCA-ATGACA---TCTATAT--TCGGA--TCTGAGGAGTTTTT-------CCAA-TTT-CG-G-CGATT-ATTTTTCAC--A--ATT-TC----GTGT--T---------TTTT--------TTGCC-CC-AAAACTTC-AAAAACGCC-CC-CACGTA-G-GAA-TGT--CAAA--CAACCTGA-TT-----TTTAA-------TCAA-GGG-CTAATGT-----AGTTTCAAAAAAAT-----ACTTGTTT---GCAAAAATCCCTAGGG-GGGT-CCCCCATTACCTTTAC-TGGCCCATGG
Reference ( family-3276 ) : ATTTTGTTTGGATATACTGAAAAAA--GCGTT----CAACTAAACC---AACCGTACC-TCTNG-GG-CAGGATGGTTATCTACAACCGCACCTG-ATGGAAGAAGTANTTTGCTCGAC-TG--TTG--ATTATA-TGGTTCC-AATCACCTGCCCTATTACAA-GAAATT-GNCACTG-TTCAGCAAGTTATTC-AGC--------T-ATCAC-AAGAAG-----CTGTCAAAATGTAACTATCCTTGCATGTGATATTTTGCAGTNGCTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATTTGGC-AAAATCCAG-AGAAATAC----AGC-GA-TGT------TCAT-TTAGGAGTTTTCGATTCACTATCCTCTG-CACTGGAAACAATT-GGGGAA---A---T---AATGG-AGCGCGAG-T-GGACT-TTC-AC-AC-----GT-GA-T-TATTGA-GTCTGGA-AATATA-TAT-----GT-ACGAT-AT--A-TCG-----GATA------AATGTT---ATTA--------AACTCCA-AACTTCATNAA--TGT---AC-CTA--G---CCTT---GATA-TCAAA-CAACTTGATATACATAAG-C-T---A-----GGTT--TAGTT-CTTT--AAAGC----AAAAT-GCATGCTTG---CAAAATGCCCAT--A-T-AT--GA-CTGT-----TGGAA----T------TT-TTCT-CTA-----T---TTCAA-C-AGT-A-CTGTTATAATGAC-AA--TTTCATACATGTATTT---TGC--CC-CAA-AAC-TCGAAAG-ACG-T-C-CC-------AAATATCA--ATGTCAGACAAGTCTTG--ATTT--ACAA-T-----TAAAG---------------G-GTT-------GCAT----AC-----TA-A--TGATACTTTAAGAA---------AAT----AATTGTTTTCAA--A-GGTCCATA-----TGAT-ATTTATATA---G----GAT--TC-TG-A--AGAGG-T-TC--TCCATTTTT-CAGTTGA--TT--TTT---A-AA-GTAAAAA-TCATG--TCGTAGCCTC-AAANCTCATAAAC-GT-T-CATACA--T------------A------------T------------TTATGTCAAA---ACAA---CTAAATAT-ATAATCAAGGGGTTACATATATTCACAAAAGACTTGTTTGCAAAT-GA-TA-A---TGACA---TC-------TA-TAT---CGG-A--TCT--GAAA--AAGTTTT----T--------C-AATTTTCG-GCG-AT--TATTATTTT-CA---C----AAATTT-CAAG-TTTTTGCCCCA-AAAC-TC---GAAAAAGG-TCTCCGTGCAA-ACAATN-TTA---TT---------------------TTAT----AA--TCAAAGG-GTTACA-T-ACTTT-CAGAGAAA-ACANTT-----G-TTTTT--CATCAGTC-AA--T-ATTA--TC-TATGGAGAGNT-TGAAGGAG-TT------T---CCA--TTTTTCGATT-AT-TTNTAA-----A----GAAA--AAATTCCTGTTTTAGCCCC-----AAAA-----------CTCGTCAAAATGTCCCCA-AA-TATCTT-ATGTCAAAC-AACT--------------TGATATA--TA-AT-T-----GAAT--G---GTTA-CA-TAC-GTT----CACAAAA------TACTTGTTTGC------AAAAGTCAATGACA--TTTATAT-CGG---ATCTGAGGAGT-TT-T-CCAATTTTCGGTGATTATTTT--CACCAATTTTCATG-TTTTTTTGCCCC--AA---CT-AA---AAAAACGCC-CCCACGT--AGGAATGTCCAAACAACC-TGA-TTTATAATCG-AG-GGACTATGTACTT-TC---AAATTATACTTGTT-TGCCAAAAGTCAATGACATCTATAT------CGGATCTGAGGAG-TTTTTCCAATTTTCGGCGAT--TATTT-TCACCAATTTCATG---TTTTTTGCCCCAAAAACTCAAAAA-CG--C-C-CC-------AC-----GT-AGGAATGTCAAACAA-CCTGATTTATAATC-----AAGGGACTAT-G-TACTTTCAAANTATACTTGTTTGCAATAGTCA-ATGACA---TCTATAT--TCGGA--TCTGAGGAGTTTTT-------CCAA-TTT-CG-G-CGATT-ATTTTTCAC--A--ATT-TC----GTGT--T---------TTTT--------TTGCC-CC-AAAACTTC-AAAAACGCC-CC-CACGTA-G-GAA-TGT--CAAA--CAACCTGA-TT-----TTTAA-------TCAA-GGG-CTAATGT-----AGTTTCAAAAAAAT-----ACTTGTTT---GCAAAAATCCCTAGGG-GGGT-CCCCCATTACCTTTAC-TGGCCCATGG
gi|1 : ATTTTGTTTGGATATACTGAAAAAA--GCGTT----CAACTAAACCTTGAA--GTACT-TCTAG-AG-CAGGATGGTTATTTACAA---CACCTG-ATGGAAGAAGTTATTTGCTCGAC-TGATTTG----TATATTGGTTCC-AATCACCTGCCCTATTACAAGGAAATTGGCCACTATTTCAACAAGTTATTCAAGC--------TCATCACAAAGAAG-----CTGTCAAAATGCAACTATCC-TGCATGTGAT-TTTAGCAGTTGCTA
gi|1 : AACTTAGCCAAAATC------GAATAC----CGT-GAATGT------TCATATTAGCAGTTTTCATTTCACTATCCTCTTTCACTGGAAACAGTT-AGGGAA---A---T---AAT---AGTGCGAGAT-GGACT-TTC-AC-AC-----GT-GA-T-TATTGACGTCTGGAGAATATA-TATACATGGT-ACGATTAT--A-TCG-----GATA------AATGTT---ATTA--------AACTCCA-AACTTTCTTAAGCTGT---AC--TA--G---CCTA---GATA-TCAAA--AACTTGATATAAATAAGGC-TTTGG-----GGTT--TAATT-CTTT--AAAGC----AAAATTGCATGC--------AAGTTATTAT----T-AT--AA-CT-T-----TGGAA----T------TT-TTCT-C-A-----T---T-CAA-C-AGT-AACTGTTTTAATGAC-AA--TTCCATGCATGTATTT---TGT--CC-CAA-AAC-TTGGAAGGACG-T-C-TC-------AAATATCA--ATGTCAGACGAGTCTTG--ATTT--ACAA-T-----TAAAG---------------G-GTT-------GCAT----AC-----TA-AA-TGATATTTTAAGAA---------AAT----AATTGTTTTCAA--A-GGT---TA-----TGAT-ATTTATATA---G----GAT--TC-TT-G--AGAAG-T-TC--TCCATTTTTTCAGTTGA--TT--TTT---A-AA-GTTAAAA-AGATG--CTGGAAGCTC-AAACGTCATAAAC-AT-T-CATATA---------------A------------T------------TTATTTCAAA---ACAA---CTAAA-AT-ATAATCAAAAGGTTACATATATTTACATAAGA--TGTTTGCAAAT-GAATA-A---TAA-----TC-------TA-TAT---CTG-A--TCT--GGAA--AAGTTTT----T--------C-AATGTTCG-GCG-AT--TATT-TTTT-CA---C----AAATTT-CAAG-TTTTT-CCCCA-AAAT-TC---GAAAAAGG-TTCTTGGGTAA--CAGTTCTTA---TT---------------------TTAT----AA--TCAAAGG-GTTACA-T-ACTTT-CAGAGAAA-ACAGTT-----A-TTTTT--CATCAGTC-AA--T-ATCA--TC-TATTGAGAGGT-TGAAGGAA-TT------T---CCA--TTTTTCGATT-AT-TTATAA-----A----GAAA--AAATTCCTGTTTTAGCCCC-----AAAA------------TCGTCCCAATGTCCCCA-AA-TATCTT-A-GTCAAAC-AACT--------------TGATATACTTA-AT-T-----GAAT--G---GTTA-CA-CACTGTT----CACAAAA------TACTTGTTTGC------AAAAGTCAATGACA--TTTACAT-CGG---ATCTGAGGAGTATT-T-TCAATTTTCTGTGATTATTTT--CACCAATTTTTATG-TTTTTTTGCCCC--AA---CT-AA---AAAAACGCC-CCCACCCTAAAGAATGTTCAAACAACCGTGA---TATAATTA-AG-GGACTATGTGCTC-TC---AAATTATACTTGTTCTGCCAAAAGTCAATGACATCTATAT------CGGATCTGAAAAG-TTTTTCCGATTTTCGGCGAT--TATTT-TCACAAATTTCATG---TTTTTTGCCTCAAAAACTCAAAAA-CA--C-C-CC-------AC-----GT-AGGTATGTCAAACAT-CC-GATTTATAATC-----AAGGGACTAT-GTTACTTTCAAATTATACTTGTTTGCAA-AGTCA-ATGACA---TCTATAT--TCGGA--TCTGGGGAG-TTTT-------CCAA-TTT-CG-G-CGATTAATTTTTCAC--A--ATT-TC----GTGT--T---------TTTT--------TTGCCTTC-AAAACTTC-AAAAACGAC-CC-CACGTA-G-GAA-TTTTACAAA--CAACCTGA-TT-----TTTAA-------TCAA-GGG-CTAATGT-----AGTTTCAAAAAAAT-----ACTTGTTT---GCAAAAATCCCTAGAGCGGGT--CCCCATTACCTTTAC-AGGCCCACGGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacttagccaaaatcgaataccgtgaatgttcatattagcagttttcatttcactatcctctttcactggaaacagttagggaaataatagtgcgagatggactttcacacgtgattattgacgtctggagaatatatatacatggtacgattatatcggataaatgttattaaactccaaactttcttaagctgtactagcctagatatcaaaaacttgatataaataaggctttggggtttaattctttaaagcaaaattgcatgcaagttattattataactttggaatttttctcattcaacagtaactgttttaatgacaattccatgcatgtattttgtcccaaaacttggaaggacgtctcaaatatcaatgtcagacgagtcttgatttacaattaaagggttgcatactaaatgatattttaagaaaataattgttttcaaaggttatgatatttatataggattcttgagaagttctccattttttcagttgatttttaaagttaaaaagatgctggaagctcaaacgtcataaacattcatataatttatttcaaaacaactaaaatataatcaaaaggttacatatatttacataagatgtttgcaaatgaataataatctatatctgatctggaaaagtttttcaatgttcggcgattattttttcacaaatttcaagtttttccccaaaattcgaaaaaggttcttgggtaacagttcttattttataatcaaagggttacatactttcagagaaaacagttatttttcatcagtcaatatcatctattgagaggttgaaggaatttccatttttcgattatttataaagaaaaaattcctgttttagccccaaaatcgtcccaatgtccccaaatatcttagtcaaacaacttgatatacttaattgaatggttacacactgttcacaaaatacttgtttgcaaaagtcaatgacatttacatcggatctgaggagtattttcaattttctgtgattattttcaccaatttttatgtttttttgccccaactaaaaaaacgcccccaccctaaagaatgttcaaacaaccgtgatataattaagggactatgtgctctcaaattatacttgttctgccaaaagtcaatgacatctatatcggatctgaaaagtttttccgattttcggcgattattttcacaaatttcatgttttttgcctcaaaaactcaaaaacaccccacgtaggtatgtcaaacatccgatttataatcaagggactatgttactttcaaattatacttgtttgcaaagtcaatgacatctatattcggatctggggagttttccaatttcggcgattaatttttcacaatttcgtgttttttttgccttcaaaacttcaaaaacgaccccacgtaggaattttacaaacaacctgatttttaatcaagggctaatgtagtttcaaaaaaatacttgtttgcaaaaatccctagagcgggtccccattacctttacaggcccacggc
gi|10 : attttgtttggatatactgaaaaaagcgttcaactaaaccttgaagtacttctagagcaggatggttatttacaacacctgatggaagaagttatttgctcgactgatttgtatattggttccaatcacctgccctattacaaggaaattggccactatttcaacaagttattcaagctcatcacaaagaagctgtcaaaatgcaactatcctgcatgtgattttagcagttgctannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntG-TTTTTTTGCCCC--AAAA-CT-AA---AAACACGCC-CC-ATGA--AGGAATGTC-AAACAATC-TGA-TT-ATAATTG-TG-TGACTATGTACTT-TC---AAATTATACTT-TT-TGG-AAAAGTCAA--ACATTTATAT------CGGATCTGAGGAG-TTTT-CCAATTTC--GTGAT--TATTT-TCACCAATT-CATG---TTTTT-GCCCCAAAA-CTCAAAA--CG--C-C-CC-------AC-----GC-AG-AATGTCAAACAA-CCAGATTTATAATC-----AAGG-ACAAT-G-TACTTTCAAATTATACTTGTTTGCAAAAGTCA-ATGACA---TTTATA---TCGGA--TCTGAGGAGTTTTT-------CCAA-TTT-CG-G-TGATT-A-TTTTCAC--CT-ATT-TC-----TG-------------TTTT--------TTGCC-CC-AAAAC-TC-AAAAAC-CC-CC-CACGTA-G-GAA-TGT--CAAA--CAACCTGA--T-----TATAT-------TCAG-GGA-CTAG--------ACTTTCAAAAAAA--------CTG-TT---GC--AAATCCCCGGGG-c
gi|11 : caattcggatgagtattatcactaagatgttatagcgatcgtctcgttaTA--------AGCTCCA-AACTT-ATTAAC-TGT---AC-CTATAA---CCTT---TATA-TCAAA-CAACTTGATATACACAAG-CAT---ACATGGGGTT--TAGTT-CTTT--AAAGC----AAAAT-GCATGCTTG---CAAAATGTCCAT--A-TCAT--GA-CTGT-----TGGAA----A------TT-TTCT-CTA-----T---TTCAA-C-AGT-A-CTG-TATAATGAC-AAT-TTTCATACATGTATTT---TGT--CC-CAA-AAC-TCGAAA--ATG-TCC-CC-------AAATATCA--ATGTCAAAC-AGTCTt
gi|11 : taA--TT--TTT---A-A--GTACAAA-TCATG--TTGTAGCCTC-AAA---CATACAT-AT----ATAAAGGT------------A------------T------------TTATGCC-AA---ACAA---CTAGATAT-ATAAgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatttttaagtacaaatcatgttgtagcctcaaacatacatatataaaggtatttatgccaaacaactagatatataa
gi|12 : tataagctccaaacttattaactgtacctataacctttatatcaaacaacttgatatacacaagcatacatggggtttagttctttaaagcaaaatgcatgcttgcaaaatgtccatatcatgactgttggaaattttctctatttcaacagtactgtataatgacaattttcatacatgtattttgtcccaaaactcgaaaatgtccccaaatatcaatgtcaaacagtctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaATTTCTTGTGGACATACTGTAGGAT--GCGTT----CGAGTGAACC---AACCGTACCGCCTTG-GG-CAGGATGGTTATCTTCAACTGCACCAG-AC-GAAGAAGTGCTTTGCTCGAC-TG--TTG--ATTATA-TGGTTCC-AATCAACTGTCCTATCAC-A-GAAAAT-GCCACAG-TTCAGCAAGTCATCC-AGC--------T-ATCAC-AAG
gi|13 : tacaactcatactgctcacggtattgtgaaacaagaagtatatgtgcgtgatgaggataaccaaggccctctagacaaatcttgctagataggaataaatctaggacaagtttcagaaaaatcagaagaactagccccatgtttcgtgaagaccaaaacatcgccagctgtccgaactacttgcatgtcccctttgcataccaacaatgataagagagacatgactcGC-GAAATCTAG-AGAAGTAC----AGC-GA-TGTCATTGTTCAC-TGAGGAGTTTCC-ATTCGCTAAGCTATG-CATTGGAAAGAATT-GGGTAA---AGAGT---AATGGGAGTACTAG-T-GGACT-TTC-AC-ATCACATGT-GA-T-TATTGA-GGCTGG----CATA-TAT-----GT-ATGA-------------------A------AATTTT----CTG--------AACTCAA-AACTTTATAAA--TGT---AC-CTA--G---CCTT---GATG-TCAAA-CAAC-------AAAT----------------GGTA--TAGTT-CTTC--AAAGC----AAATT-ACATGCTTG---C-GAATGTCTTT--ATT-GT--GA-TTGT-----AGGAA----TCGAAAATT-TTCC-ATT-----T---TTTAA-C-AAT-A----TTATATTGACAAA--TTTCATA----TATTG---CGCG-CA-TAACAAC-TCG-AAG-AGG-TAC-AT-------GTATATTA--ATATCAGAT-AGTC-TG--ACTT--ACGA-T-----TAAAG---------------G-GCT-------GCAT----AC-----TA-A--TGAT
gi|14 : tT--TAGTTTCTTT--AGAAG----GAAAT-A-ATG---------AAAT-----T--A---AT--GA-CAGTAGGATTGGAT----C------TT-TTTT-CTACTATCT---TTTAA-CCAGT-G-CTGT---AATGACTAA--CTTTCTACATGTACTT---TACTACT-CAA-A-C-TCGAACA-A---T-C-CC-------AA---------TGCCAGACAG---TTGGAATTT--ACAA-T--------AG---------------GCGTA-------GTATCGCCAA-----TA-AAATGATCCTTTAAGGA---------AATGCTAAATTGTTTCC-A--A-GGTTGGTAAT---CGAC-TTTAACATA--------AATTCTC-TG----AGAGGAT-TT--TCCACTTGT--AG-TGA--TCTGTTT---A-AG-TTAAAGA-CCATGTCTCGTAGCCTC-AAAg
gi|15 : ATATAGTTACAA------TATCTGCAAAT-TA-GA-GGGTTGACAAATTC-------TA-TATACTCGG-AAATCT--GAGA----GTCTT----TTATCTCCCC-AATTTTCGCGTG-A------TATTTTGCA---C----A
gi|15 : TGACAAATTCTATATACTCGGAAATCTGAG-AGTCTTTTATCTCCCCAA-TTTTCGCG-TGAT--ATTTTGCAC--ACCATTATTATGGGTGTACC---------TTTTGGTAGGGGTTGCA-TC-AAAA--TC-GAAAACGTAACC-CACGTA-G-AAAATGC--CAAA--CAACCTGAATTAAATATTTGAAAAGGTTTCAGTAGG-ATAAAATCAATAAACTACAAAAAAACCCACAATTTGTTTTGAG-AAAAATCCCCATGG-GGGT-CGCCCATTACCTTTACTTGGCCCATGccattattatgggtgtaccttttggtaggggttgcatcaaaatcgaaaacgtaacccacgtagaaaatgccaaacaacctgaattaaatatttgaaaaggtttcagtaggataaaatcaataaactacaaaaaaacccacaatttgttttgagaaaaatccccatgggggtcgcccattacctttacttggcccatgtc
gi|16 : atatagttacaatatctgcaaattagagggtTTC-CA---C----AAATTT-CAAG-TTTTTGCCCCA-AAAT-TC---AAAAAA---TATCCATGCAA-ACAATA-TGA---TT---------------------T-AT----AA--TCAAAGG-GTTCAA-T-AGTTT-CAGAGACCCACATTT-----G-TTTT---CAAAAGGC-AA--T-ATTA--TC-TGTGAAGAGTC-TGAAGGAG-TT------TT--CCA--TTTGTCGATG-AT-TTTTAA-----A----GAAACAAAA-----G----AGCCCA-----AAAG-----------CTCG--AAAATGTCCTAA-AA-TA-CTT-ATGTCAAAC-AACT--------------TGATATA--Ttc
gi|17 : aa--A-GGTTCATA-----T--T-ATTTATATA---G----AAT--TC--G-A--AGAGG-T-TC--TCCATTTTT--AGGTGA--TT--TTT---TTAA-GTAAAA--TCATG--T---AGCCTC-AAAACTCGTAAAT-GT-T-CCCACA--TCCTAAAGTATAAA------------T------------TTATGTCAAA----CAA---CTTAGTAT-ATGATCAAGGGGTTGCATGTATTCACAAAATACTTGTTTGCAAAT-GT-CA-A---TGACA---TC-------TA-CAT---CGG-A--TCT---AAA--ACGTTTT----C--------C-AATTTTCA-GC
gi|18 : T-TGC-AAAACTTTATAATATCTATATGTATTTCGGATCTGAAGAG-TTTTTCCAAAGTTTGGCGTT--TATTT-TCACCAGTTGCATGGGGTTTTTTGCCCC-CAAACTCGACAA-CA--C-CACC-------AC-----CA-AGGAATGTCAAACAA-CCTTATTTAGAATC-----TAGGGACAAT-G-TAGTTTCAAAATAT
gi|19 : GAG-TTTCT----TTTTCCGCTAGCATATTTCTCAC-AG---CATG---CTTTTTGTTC--AAAACTGGTATT-CA--C-C-CCCTGGCCCAC-----AT-AGAAATTTGAAACAA-CCACATTTTTAATC-----AAACGACTGT-G-CACTTTCCAAAAGTACTTGTTTACA
gi|2 : TTTTGATTGGATATCCTGAAAAAA--A-GTT----CAACTAAACC---AACCATACT-TCTTGAGG-CAGGATGGTTATCTACAACCACACCTA-ATGGAGGAA-CACTTTGTTGGAT-TG--TTG--ATTATA-TGGTTCC-AATCACCTGCCCTATTGCAA-GAAA-T-GACACTA-TTCAGCATGCTATTC-AGCTAGATTAAT-ATCAC-AAGAAG-----CTGTCAAAATGTAACTATCCTTGCATGTG--ATTTTGCAGTGGCTA
gi|2 : TTTGGC-AAAATCCAG-AGAAGCAC----AGC-AA-TGTATTGT-TCAT-TTAGGAGTTTTCCATTCACTATCCTCTG-AACTGGAAACCACT-GGGGAA---AA--T---AGTG--AGCGTGAG-T-GGACT-TTT-AC-AC-----AT-GA-T-TATTGA-GTCTGGA-A---TA-TAT-----GT-ACGAT-AT--G-TCA-----GA-A------AATGTT---AT-A--------AACTTCA-AACTTTATAAA--TGT---AC-CTA--A---CCTT---GATA-TCAAG-CAACGTAATATACATAAG-C------------GTT--TAGTT-CTTT--AA-GC----AA--T-GCATGCTTG---CAAAATGCCCAT----T-AT--G------------------------------TTTT-CTA-----T---TTCAA-C-AAT----CGT-ATAATGAC-AA--TTTTATACATGTATTT---TGT--CC--AA-AAC-TCGAA-G-ACG-T-CTCC-------AAATATCA--ATGTCAGACA-GTCT-G--ATTT---CAA-TAAGGATAAAACTGTTCGTTTCCTTTG-ATTTT-----ACAT----ACAGAATTA-A--TGATACGTTAAGAA---------AAT----AATTATTTTCAT--T-GGTTCATA-----TGAT---TTATATA----------------------------------TTCATTTC--CAATAAA--TT--TGA---A-AA-GTAAAAA-TCATG--TTGTAACCTA-AAAATTCATAAAC-AT-T-CATACA--T------------A------------T------------TTATTTTCAC---ACAA---CTAAATAT-ATAAACAAGGGGTTACACATATTTACAAAAGACTTGTATGCAAAT-AA-TA-A---GGACA---TC-------AA-TAT---CGGTA--TGT--GAAA-----TTTTCCCCC--------C-AACTTTGA-GTG-AT--TATTATTTT-TA---C----ACATTT-CAAG-TTTTTGCCCAA-AAAC-TC---G-AAAAGG-TCTCCATGCAA-ACAATC-TTA----T---------------------TTAT----AA--TCAAAGG---TACA-T-ACATT-C--AGAAA-ACAA-T-----G-ATTTT--CATCAGTA-AA--T-ATTA--TC-TATTGAGAG-T-TGAAGGAGATT------T---CCA--TTTTTCGATT-AT-TTTTAG-----A----GAAA--AAA-TCCCGTTTTAGCCCC-----AAAA-----------CTCGTC--GATGCCCCCA-AC-TATC-T-ATGCCAGAC-------------------------------AT-T-----GGAT--G---GCTA-CA-TAT-GTT----CACAAAA------TATTTGTTTGC------AAAATTCAGTGATA--TCTATAT-CGG---ATCTGAGGAGC-TTGT-CCAATTTTTGGTGATTATTTT--TACCAATTTT-ATG-TTTTTTC-CTCC--AA------AACTCAATAACA-T-CCCACGT--AAGAATGT-CAAACAACC-TGA-TTTATAATTA-GG-GGGCTATGTACTT-GC---AAATTATACCTGTT-TG-CAAAAGTCAATGACATTTATAT------CGGATCTGAGGAATTTTTTCCAATTTTTGGTGAT--TATTT-TCACCAATTTTATG---TTTTT--CCCCAAAAACTCAAAAA-CGC-C-C-CC-------AC-----GT-AGGAATGTTAAACAA-CCTGATTTATAATC-----AGGGGAACAT---TACCTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttggcaaaatccagagaagcacagcaatgtattgttcatttaggagttttccattcactatcctctgaactggaaaccactggggaaaatagtgagcgtgagtggacttttacacatgattattgagtctggaatatatgtacgatatgtcagaaaatgttataaacttcaaactttataaatgtacctaaccttgatatcaagcaacgtaatatacataagcgtttagttctttaagcaatgcatgcttgcaaaatgcccattatgttttctatttcaacaatcgtataatgacaattttatacatgtattttgtccaaaactcgaagacgtctccaaatatcaatgtcagacagtctgatttcaataaggataaaactgttcgtttcctttgattttacatacagaattaatgatacgttaagaaaataattattttcattggttcatatgatttatatattcatttccaataaatttgaaaagtaaaaatcatgttgtaacctaaaaattcataaacattcatacatatttattttcacacaactaaatatataaacaaggggttacacatatttacaaaagacttgtatgcaaataataaggacatcaatatcggtatgtgaaattttccccccaactttgagtgattattatttttacacatttcaagtttttgcccaaaaactcgaaaaggtctccatgcaaacaatcttatttataatcaaaggtacatacattcagaaaacaatgattttcatcagtaaatattatctattgagagttgaaggagatttccatttttcgattatttttagagaaaaaatcccgttttagccccaaaactcgtcgatgcccccaactatctatgccagacattggatggctacatatgttcacaaaatatttgtttgcaaaattcagtgatatctatatcggatctgaggagcttgtccaatttttggtgattatttttaccaattttatgttttttcctccaaaactcaataacatcccacgtaagaatgtcaaacaacctgatttataattagggggctatgtacttgcaaattatacctgtttgcaaaagtcaatgacatttatatcggatctgaggaattttttccaatttttggtgattattttcaccaattttatgtttttccccaaaaactcaaaaacgcccccacgtaggaatgttaaacaacctgatttataatcaggggaacattaccttt
gi|20 : ttttgattggatatcctgaaaaaaagttcaactaaaccaaccatacttcttgaggcaggatggttatctacaaccacacctaatggaggaacactttgttggattgttgattatatggttccaatcacctgccctattgcaagaaatgacactattcagcatgctattcagctagattaatatcacaagaagctgtcaaaatgtaactatccttgcatgtgattttgcagtggctannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAGACA-GTCT-G--ATTT--ACAA-T-----TAAAG---------------G-GTT-------CCAT----AC-----TA-A--TGGTACGTTAAGAA---------AAT----AATCATTTTCAA--A-AGTTCATA-----TG---ATTTACATA---G----GA---TC-TG-A--AGAGG-T-TC--TCCATTTTT-CAt
gi|21 : ATATTCACAAAATACTTGTTTGCAAAT-GC-CA-G---TGGCA---TC-------AA-TAT---CGG-A--CCT--GAAA--GGCTTTT----C--------C-AATTTTCA-GCG-AT--TA----TTT-CA---C----AAATTT-CAAG-TTTTTGCCCCA-AAA
gi|22 : GAA---------AAT----AATTGTTTTCAA--A-G-TCCATA-----TA-----TTATATAAACG----GA---------A--AGAAC-T-TTCTTCCATTTTTTCAGT-GA--TT--TTT---T-AA-GTAAAAAATCATG--TTGTAGCCTC-AAACTT
gi|23 : --TATAT-TTACAAATATTATGAG-TATTTCCCCTCAAATATTCATAAA-AT--C-C-CT-------ATATTCTGT-A--AATGTTAAACAA-CCTCGTTTATAATC-----AAGAGACTAT-A-T-CTTTC
gi|24 : cAA---ACAA---CTAAATAT-ATATTCAAGGGGTTTCATATAGTTACAAATGACTTGTTTGCAAAT-GA-TA-A---TGACA---TT-------T--TAT---CGG-A--TCT--GAAA--AGGTTTT----T--------
gi|25 : tcTTTGTTTGGATGTACTGAAAAAAAAGCGTCGATCCAACTAAACC---AACCGTACC-TCTAA-GGACAGGATGATTATCTACAACAACACCTG-AT-GAAGAAGTAtttccaat
gi|26 : ----AATTGTTTTCAA--A-GGTCCATA-----TG---ATTTAAATA---G----GA---TC-TG-A--AAAAG-T-TC--TCTATTTTT-CAG-TGATTTT--TTT---A-AA-GTAAAAT-GCATG--TGGTAGCATC-A
gi|28 : GAC-GA--TTT---ACTTATACCTCCATGC--TCGCAA-AAC-TCGAAA--ACGTT-C-CC-------AATTATCA--ATGTCAGAC-AGTC-TG--ATT
gi|29 : AATTTGGC-AAAATACTG-AGAAATAC----AGC-GA-TGT------TCAC-TTAGGAATTTTCCATTCACTATCCTCTG-CA
gi|3 : ACAAAC-CACCTGCATCGAAGAAGTAATTTGCTCGAAATG--TTATAATTATT-CGGTTCCCAATCACCTGCCCTATTACCA-GAAATT-GGCACTG-TACAGCAGGTTATTC-AGC--------T-ATCAC-AAGAAGGGGTTTTGT-----TGTAACTATCCTTGCTTGTGATATTTTGCAG
gi|3 : caaTTGGC-AAAATACAG-AGAAATAC----AGC-GA-TGT------CCAT-TTAGGAGTTTTCGATTCACT-TCC-CTG-CACTGGAAACAGTTCGGGAAA---A---T---AATG--AGCGCGAG-T-GGACT-TTC-AC-AC-----GTTGA-T-TATTGA-GTCTGAA-A---TA-TAT-----GT-ACGAT-AT--ACTCA-----GGTATCAGATAATGTT---AT-A--------AGCTCCA-AACTT-------------------A--G---CCTT---GATA-TCAAA-CAAAT-AATACACATAAG-TATG--A-----GGTTGTTCTTT-CTTT--AAAGC----AAAAT-GCATGCTTG---CAAAATGTCCAT--A-T-AT--GA-CTGT-----TGAAA----A------TT-TTCT-CTA-----T---TTCAA-C-AGT-A-CTG-TATAATGAC-AATTTTTCATACATGTATTT---TGT--CC-CAA-AAC-TCG-AAG-ATG-TCC-CC-------AAATATTA--ATGTCAGAC-AGTC-TG--ATTT--ACAA-T-----TAAAG---------------G-GTT-------ACAT----AC-----TA-T--TGATAATTTAAGAA---------AAT----AATTG-TTTCAG--A-GGTCAATA-----TG---ATTTGAATA---A----GA---TC-TG-A--AGAAG-T-TC--TCCATTTTT-CAG-TGT--TT--TTT---T-AA-GTAAAAA-TCATG--TTGTAGCCTC-AAACCTTATAAAC-ATATACATACA--T------------ACAAATACAGGTTT------------TTATGCC-AA---ACAA---CTAGATAT-ATAATCAAGGGGTTACATAAATT-ACAAAAGACTTGCTTGCAAAT-AA-TA-A---TGACA---TCTACCAGGTA-TAT---TGG-A--TCT--G-AA--AAGTTTT----C--------C-AATTTTCA-GCT-AT--TATTATTTT-CA---C----AAATTT-CTAG-TTTTTGCCCCA-AAAC-TC---G-AAAAGG-TCTCCGGGTAA-ACATTG-TAACC-TTA--------------------TTAT----AA--ACAAAGG-GTTAC--T-AATTT-C--AGAAA-ACATTT-----A--TTTT--CATCAGTC-AA--T-ATTA--TC-TATAGAGAGTA-TGAATAAGTTT------T---CCA--TTTTTCGATT-AT-TTATTA-----A----GAAA--AAA-TCCTGTTTTAGTCCA-----AAGA-----------CTCGTC--AATGT---TATAA-TATC-T-ATGTTAAACAAACT--------------TGATATA--TC-AT-T-----GAAT--G---GTTA-CA-TAC-GTT----CAC-AAA------TACTTGTTTGC------AAAAGTCAACGACA--TTTATAT-CGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntataattggcaaaatacagagaaatacagcgatgtccatttaggagttttcgattcacttccctgcactggaaacagttcgggaaaataatgagcgcgagtggactttcacacgttgattattgagtctgaaatatatgtacgatatactcaggtatcagataatgttataagctccaaacttagccttgatatcaaacaaataatacacataagtatgaggttgttctttctttaaagcaaaatgcatgcttgcaaaatgtccatatatgactgttgaaaattttctctatttcaacagtactgtataatgacaatttttcatacatgtattttgtcccaaaactcgaagatgtccccaaatattaatgtcagacagtctgatttacaattaaagggttacatactattgataatttaagaaaataattgtttcagaggtcaatatgatttgaataagatctgaagaagttctccatttttcagtgtttttttaagtaaaaatcatgttgtagcctcaaaccttataaacatatacatacatacaaatacaggtttttatgccaaacaactagatatataatcaaggggttacataaattacaaaagacttgcttgcaaataataatgacatctaccaggtatattggatctgaaaagttttccaattttcagctattattattttcacaaatttctagtttttgccccaaaactcgaaaaggtctccgggtaaacattgtaaccttattataaacaaagggttactaatttcagaaaacatttattttcatcagtcaatattatctatagagagtatgaataagttttccatttttcgattatttattaagaaaaaatcctgttttagtccaaagactcgtcaatgttataatatctatgttaaacaaacttgatatatcattgaatggttacatacgttcacaaatacttgtttgcaaaagtcaacgacatttatatcg
gi|30 : caaacaaaccacctgcatcgaagaagtaatttgctcgaaatgttataattattcggttcccaatcacctgccctattaccagaaattggcactgtacagcaggttattcagctatcacaagaaggggttttgttgtaactatccttgcttgtgatattttgcagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntataa-T-----GAAT--G---GTTA-CA-TAC-GTT----CACAAAATACCGGTACTTGTTTGC------AAAAGTCAAAGACA--TTTATA
gi|31 : ACCAAGGGGTTACATAAATTTACGAAAGACTTGCTTGCAAAT-AA-TA-A---TGACA---T
gi|32 : AA---A---T---AATG--AGCGCGAG-T-GGACT-TTC-AC-AC-----AT-CA-T-TATTGA-ATCTGG--AATATA-t
gi|34 : CTTCATATA--TGT---AC-CTA--G---CCTT---GATA-TCAAG-CAACTTGATATA
gi|35 : TCCCTAGGG-GG-T-CCCCC-TTACCTT-AC-TGGCCCATGG
gi|4 : TGGC-AAAATTCATTAGAAACACTAACAGCTGA-TGT--------AA-TTG-----TTTCGTTTTAGGAGCCTCTG-CA------GCACTT-GT--AA---A---TCGCAATGG-AGCGCGAG-TCGAACTGTTCTACCAT-----GT-GA-T-TATT------CG-----TAGA-TAT-----GT-AAGA-------------------A------AATGTT---AT-A--------AACTCCA-AACTTCATATA--TGT---AC-CTA--G---CCTT---GATA-TCAAA-CAACTTGA-----------------------GGAT--TAGTT-CTTT--AAAGC----AAAAT-GCATGCTTG---CAAAATGCCCAT--AAT-AT--GA-CTGT-----TGGAAA---T------TT-TTCT-CTA-----T---TTCAA-C-AAT-A-CTGT-------AC-AA--T-------ATGTATTT---TGC--CC-CAA-AAC-TCGAA-G-ACG-T-T-CCCATGC--AAATATCA--ATGCCAGACA-GTCT-G--ATTT--ACAA-T-----TAAAG---------------G-GTT-------ACAC----AC-----TA-A--TGATACGTTAAGAA---------AAT----TATCATTTTCAA--A-GGTTTAT------CGAT---TTATATA---A----GAT---A-TG-A--AGAGG-T-TC--TCCATTTTT-CAGT-GA--TT--ATT---A-AAAGTAAAAA-TCATG--TCGTAGCCTC-CAAACTCATATAC-AT-T-CATACA--T------------A------------T------------TTATGTCAAA----CAA---CTAAATAT-ATAATCAAGGGGTTACATA----------AGACTTGTTTGCAAAT-GA-TA-A---TGACA---TC-------TA-CAT---CGG-A--TCT--GAAA--AAGTTTT----T--------CCAAATTTCG-GCG-AT--TATTATTTT-CA---C----AAATTT---------TTGCCCCA-AAAC-TC----AGATAGA-TTTCTATGCAA-ACAATT-TTA---TTTATAATCAAAGGGTCACATATTTATTTAAAA--TCAAAGG-GTCACA-T-ATTTT-CAGA--AA-ACAATT-------CTTTT--CATCCGTC-AA--T-ATTA--TC-TATGGAAAGCT--GAAGGAG-TT------TT--CCA--TTTTTCGATT-AT-TTTTAA-----A----GAAA--AAAT-CCTGTTTTAGACCC-----AAAA-----------TTTGTCAA--TGTCCCCA-AA-TATCT--ATAACTGAC-AACT--------------TGATATA--TA-AT-T-----GAATATG---TTTA-CA-TAC-GTT----CACAAAA------TACTTGTTTGC------AAAAGTCAATGACA--TTTATAT-CGG---ATCTGAGGAGT-TT-TTCCAATTTTCGGTGATTATTGT--CACCGA-TTTCATGTTTTTTTTGCCCCAAAA---CT--A---AAAAACGCC-CCCACGT--AGGAATGT-CAAACAACC-TGA-TTTATAATCG-AG-TGACTATGTACTT-TA---AAATTATACTTGTT-TG-CAAAAGTC--TGACATTTATAT------CGGATCTGAGGGT-TTTTTCCAATTTTCGGTGAT--TATTG-TCACCGATTTCATGTT-TTTTTTGCCCC-AAAACTAAAAAA-CGC-C-C-CC-------AT-----GT-AGGAATGTCAAACAA-CCTGATTTATAATCAATTTAAGGGACTAT-A-TACTTTCAAAtct
gi|5 : aCTCTG-CACTGTAAACCACT-GGAGGAGAGA---T---AATGG-AGCGCGAG-T-GGACT-TTC-AC-AT-----GC-GAGTGTGTTGA-GTCTGCTTAATCTAATAA-----GTTACGAT-TTGCA-TTGTCAAAGATA------AATGTTGAAATGACACAGAGAAACTCCATCAGGTCACTAC--TGTTCAACACTA--AGCACCTTAAGGATAGTCAAAGCAACT----ATG---AGG-A-T---A-----G--T--AATTT-CTTTCAAAAGCGAGAAAAAT-GCACCATTAACACAATATGCCCATTAA-T-ATTGGATCTGTCA---TGCAAATAAT------TTATTCTACTA-----TATATCTAATC-AATTA-CTGTTACAATAGC-------TCTTAAGTATA-------GC--CCACAA-AACGTCGAA-G-ACG-T-C-CCCATGCAGAGATATCACAATGCCAGAACGGTCT-G--ACTTGTACAAAT-----TAAAGTG-------------A-GTTACTGGAAGCAT----CT-----TACA--TGATCATCTAAGAATCTCTATAAGATGAG-AATTGTCT-CAATTATGGTCAATAGTTTTTCATCATTTTCATA---GAAGAGAC--CCATGTATCAGAGG-TGTC--TCCATTTT--CAGTGTA--TT--ATT---A-AAAGTAACAA-TC-TG--TCGTAGCCTCCAAATTTCATAAACAGT-T-CATACA--T------------A------------T------------TTATTTCAAAGTGAAAATTCTTAAGTATGATAATCAAGGTGTTA-AT----------AAGACTTGTTGGCAAAT-GA--A-A---TGACA---TC-------TACCAT---C-G-A--TCT--GAAAACAAGTTTT----T--------C-CAAATTCG-CCGAATAGTATTATTTT-CAG--C----AAATTT-CAAG-TTTTTGCCCCAGAAAA-TCAGAGAAAAAGGTTCTCCGTGCAA-ACAATA-TTT---TTTTACTCCA-------------TTAT----AAATTCAAAGG-GTCACAGTGATTTT-C--AGAAA-ACAATT-----T-CTTTTTGCATCAGCT-AAATT-ATTA--TC-TATGAAGAGTTCTGAAGGAA-TT------TTTACCATTTTTTTCGATTAATATTGTGAAAGACA----GAAA--AAATCACTATTCTCACCCCTCTATAAAAAGATAAATTTCTTTTTCAAAGGTTCCCCA-AATTATCTT-ATGTCAGAC-AACT--------------Tt
gi|6 : atttggcaacattatcagtacgacataacaccagcatcgcatattgtgtcggtttaggaagcaCAAA---ACAA---CTAA-TAT-ATAATCAAGGG-TTA-ATAAAT--ACAAAAGACTTGCTTGCAAAT--A-CACA---TGGC----TC-------TA-TAT---CGG-A--TCTT-GAAA--AAGTTTTCT--T--------C-AATTTTCA-ACA-----TAT-ATTTT-CA---C----AAATATACTAG-TTTT-GCCCCA-AAACCTC---GAAA--GT-TCTCCGGGTAAGACA--C-TTAACCTA---------------------TTAT----AA--TCAAAGG-GTTA-A-T-ACTTTTCAGA--AA-ACATTT-----A-TTTTT--CATCAGTC-AA--TTATTA--TC--ATAGAGATAT--GAAGGAG-TTGTTTTTT---CCA--TTTT-CGATT-AT-TTATAA-----A----GAAA--AAATTCCTGTTTAA--TCC-----AAAA-----------CTC---ACAATGTTCTCA-AA--ATCTC-ATGTAAAAC-AACTTATATATCATTGAATGGTATA--TACGT-TCACCAAAAT--ACTTGTTC-CAATGC-ATTATATCGNNNNN------NNNNNNNNNNN------NNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN-NNN---NTCTGAGGAGT-TT-T-CCAATTTTCG-TGATTATTTT--CACCAATTT--ATG-TTTTT--GCCCC--AAAAACTCAA---AAAAACGCCGTTCACGT--AGGAATGTCAAAACAACC-TGA-TT-ATAAGCA-AG-G-ACTATGTACTCGTC---AAATAAC-CTTGTA-T-CCAAAAGTCCATAACATCTTTAT------CGGATTTGAGGAG-TTTTTC-AATTTT-GGCGAT--TATTT-TCACCAATTTCATG---TTTTTTGCCCCAGAAACTCAAAAA-CAACC-C-CC-------AC-----GT-AGGAA-GTCAAACAAACCCGATTTATAATC-----AAGGGACTAT-G-TACTTTCAAATTATACTTGTTTGCAATAGTCATAAGACA---TCTATAT--T-GGA--T-TGA-GAGTTTTG-------CCTA--TT-CA-G-CGATT-A-TTTTCAC--A--ATT-TC----A-AT--TAATTTCAAGTTTT--------TTGCC-CCAAAAACCTCAAAAAACGCC-CC-CACGTA-ACGAA-T-T--CAAAGGCAACCTGA-TT-----TTTAA-------TCAA--GA-CT-AT-T-----AGTTTCAAAAAATT-----ACTTGTTT---GCAAAAAT-CCTGAGG-GGGT-CCCCCATTACCTTTAC-TGGCCCATGGtg
gi|7 : tgA--ATGTCATATA-GTCT-G--ATTT--ACAA-T-----TAAAG---------------A-GCT-------tc
gi|7 : attaagaatttgatctcatagaccatgggccagtaatGCTTTGAA--A-GGTCTATA-----TGAT---TTATATA---G----AAT---C-TG-A--AC----T-TT--TTTATTTTT-TGGT-GA--TC--TTTTTAA-AA-GTAAAA--TCATG--TTGTAGCCCG-AAATCTCGTAATT-GT-T-CACACA--T------------A------------TCATAGTATAAATTTATGTCAAA---TAAA---TTAA-TAT-ATGATTAAAGGCTTGCATATATTCACAAAATACTTGTTTCCAAAT-GT-CA-G---TGACA---TC-------TG-TAT---CGG-A--TGT---AAA--ATGTTTT----T--------CTACTTTTTG-GCG------ATTATTTT-CA---CAATTAAATTT-CAAA-TTCTTACCCCA-AAAC-CC----AGAAAGG-TCTCCATGCAA-ACAATA--TA---AT---------------------TTAT----AA--TCAAAGG-GTTGAA-T-AGTTT-C--AGAAA-ATATTTTTTTCA-TTTTC--CATTTTTC-GA--TGATT---TC-TA--AAGAAAA-TAAAA----------------TCA--TGTT----TT-AG-CCCCAA-----AACTCGAAA--A------TGT------CCC-----AAAA-----------TACTT----ATGT---CA-AA-CAACTTGATAT---AT-AATT--------------T---------A-AT-T-----G----------TTA-CA-TAC-GTT----CACAAAA------TACTTGTTTAC------AAAAGTCAATGACA--TCTATAT-CGG---ATCTGAGGAGT-TT-TCCCAATTTTCGGTGACTATTTC--CACCAA-TTTCATG-TTTTTttgaaaggtctatatgatttatatagaatctgaacttttttattttttggtgatctttttaaaagtaaaatcatgttgtagcccgaaatctcgtaattgttcacacatatcatagtataaatttatgtcaaataaattaatatatgattaaaggcttgcatatattcacaaaatacttgtttccaaatgtcagtgacatctgtatcggatgtaaaatgtttttctactttttggcgattattttcacaattaaatttcaaattcttaccccaaaacccagaaaggtctccatgcaaacaatataatttataatcaaagggttgaatagtttcagaaaatatttttttcattttccatttttcgatgatttctaaagaaaataaaatcatgttttagccccaaaactcgaaaatgtcccaaaatacttatgtcaaacaacttgatatataatttaattgttacatacgttcacaaaatacttgtttacaaaagtcaatgacatctatatcggatctgaggagttttcccaattttcggtgactatttccaccaatttcatgtttttg
gi|8 : attaagaatttgatctcatagaccatgggccagtaataatgtcatatagtctgatttacaattaaagaATATTCACAAAATAC-TGTTTGCAAATCGG-TC-A---TGACA---AC-------TA-CAT---CGG-A--TCTACGAAA--A------------------------TGTCG-GCG-GA--TAT--TTTG-CAGTTC----AA---T-TAAGATTGGTGCCCCA-AAA--TC----AAAACAG-TATCCATGC-A-ACAATA-TGA----T---------------------TTAT----AA--TCAAAGGAGTTAAA-T-ACTTT-C--AGAAA-GTATTT-----GTTTTTT--CAAAAGTTGAA--T-ATTGGTTCTTGTGAAGAGTC-TGGAAGAG-------------------TTTTCCATT-AT-TTC-AA-----A----AAAA--AAAATCACGATTTAGTCCA-----AAAA-----------CTCG--AAAATGTTC------------------CAAAC-AACT--------------TGATATA--T--AT-T-----TAAT------GTTAGCA-TAC-GTT----CACAAAA------TA-TTCTTTGCAAAAATAAAAGTCAATGACATCTTTAT-T-CGGCATGTCTGAGGAGT-TT-T-----TTCTCAATGATTATTTTCACACCAA-TGTCATG--TTTTTTGCCCCA-AA---CT------TGGAACG---CCCAGGT--A-GAATGTCAAAACAGGC-TGACTTTATAAATGCAGTGGACTATTGACTG-TCGAAAAAGTATACTT-TT-T--CAAGAGCCg
gi|9 : -ATGTTAAA--AACT--------------TGATA-A--TC-ATAG-----GAAT--G---GTTA-CA-TAT--TT----CACAAAA------TACTTGTTTGC------AAAGTTCAATGACA--TTTATATCCGG---ATttcaggagtctccctt
gi|9 : GGATCTGAAGAG-GTAT-CCAATTTCGAGTG-T--TATTT-TCACAGATTTTATG---TTGTTTTCCC--AAAACCCAAAAAACG--CTC-CC-------AC-----GTTAGGAATGTCAACAAA-CCTGATT-ATAATC-----AAGGGACTATTG-TACTTTCAATATATACTTGTTTGCAATAGCCA-ATGA-A---TCTATA---TCGGA--TCTGATGAGTTTTT-------CCAATTTT-CA-GCCGATT-ATTATTCACCAA--ATT-TC----CAG---T---------TTTT--------TTGCC-CC-AAAACTC---AAAACGCC-CCACACGTAGG-GAA-TGT--C-AA--CAACCTGA-TC-----TTTAA-------TCAA-GGGACTACTGT-----AGTTTC--AAAAAT-----ACTTG-TT---GCAAAAAT--CTAGGG-GGGTCCCCCCATTACCTTTAC-TGGCacgaaaacgtcgatcaatctcgtaagtccaaattagggatctgaagaggtatccaatttcgagtgttattttcacagattttatgttgttttcccaaaacccaaaaaacgctcccacgttaggaatgtcaacaaacctgattataatcaagggactattgtactttcaatatatacttgtttgcaatagccaatgaatctatatcggatctgatgagtttttccaattttcagccgattattattcaccaaatttccagtttttttgccccaaaactcaaaacgccccacacgtagggaatgtcaacaacctgatctttaatcaagggactactgtagtttcaaaaatacttgttgcaaaaatctaggggggtccccccattacctttactggcatagtctagggattcaatt
blockSeqs : AA C GATC . C G T A A CTG C G C AA . TAA . C AA AT C . A . TAGATTAAT . GGGTT C T ATA G . CT T TAAC T . CATTGTT C C . T C GT AGAGT GG . C G T C CACAT T G G . CTTAATC A . T TATACTCAGGTATCAGAT GAAATGACACAGAGA T ATTAAC TCA A AGCA AAG G G TTGAT CACAAGCATACATGG GT T CA GAGA . ACA A T TAAT TG T AGGAT TCGAAAA A A CTATC ATA T C TA TTA AATT CA C CCA TA G C G A AG T T C T CATGCAG CA AG TT GA GT A AAGGA CTGTTCGTTTCCTTT C ACTGGAA CGCC AGAAT C AA T TCTCTATAA GCTA TT T TG GTTTTTCATCA GAAGAGACCCATGTATC A G CT TC GT TT TG TTAA A AA TC T C AC A ATA TCCTAAAGTATAAAT A GTGA TTC A G T T CGGT C GGT AAT TACCAGG C ACT T AA AC ACAA TTATCTCCC C C AATAG TA G GTT AATT A A G CC AGAGA T G A A TTTATAATCAAAGGGTCACATAT TTAA AT A CAG G G T AG G C T TTTTCAT TG G AT T GT T G TTCT TTGTTTTTT TT T A A T AAGACA CA TC GC TCTAT AGATAAATTTCTTTTTCAAA CCT T TT T TTG A TATATATCATTGAA T TAC A CACCA ACTT G A . ATAT TACCGG AAAAAT TC C CAT . G TC G CA T C T AA AAACTCAA CCG . G CA . CTTT C T G GAA G . GG A GTATTT T T T CA C C G GGG T CA A AC T A CTGGCCC ATTCT T A A AATTT TG T A T AAT TAC AA G TATCTCC TT T C C T T ACC A AATTAATTTCAAG GGTAGGGG . A CTCA A A AC A G . GG ATTAAATA AAAGGTT TA A AATCAATA CCCACA T TGA C . C T
blockSeqs : . C . . C . T . . CCA . C C C . A . . CA TT A . T . T . . . T A . CC . . . . ATTGTT T C . C . GG ATCGC G . . . . . . . . . . GAATA . . . TTTGCATTGTCAAAGATA CTG . TATAAA . . TAA . . . GTAAT CATAAGTATGA . . . . . . A T ATC . . CA ATAAT . . . . . . A TTA AAT CA C . G A . . A CA G . A . CATGC . CG T . . . . TG . TT . . . . G . GAG . . TC ATCGACT AATTCTCTG . . . C TA . . TT A A . C . AT . T TACAAATACAGGTTT C A . G . T C TAG . . . . . . . . T AC CCCCC T . AT TA . G . . . . T AA . . A C TTTTACTCCA . . . AA . C . AG G . A GTT . . . G . . T TCT TTTTTA . T . . T AACTC . TT GC . TTTGTCAA CCC . T T TT . . T TC . . ATG . . . . . . . . . . . CC G . T C . A AACTAA CC . A CA . TTT . . . . G . GC T . . T C . . C T AG T CA . C . . . . . . T . G A T . . T . G . T . . . T T CAA . ATGGGTGTACC . . . TC . . GG . G . . TT . G . TGT T T . C . . .
blockSeqs : . . . . C . A . . CAA . . A T . A . . A T G . G . T . . AC . . . . T C G . C . GA GAGAT G . . . . . . . . . . GCA . . . TATGTCAGAA ATA . TATAAA . . G . . . TTGAT CATAAGC . . . . . . A C ATT . . . AT . . . . . . A TA AAA TC C . . . . . A AG C . C . . . A T . . . . . . . . . . . G . . . . TC TGAT GAATTCGA . . . C TG . . A . A . T . CT . T TATCATAGTATAAAT A A . A . T T GTC . . . . . . . . . GG CTT . . AT TA . . . . . . C GA . . T G CCTTA . . . CA . A . AG G . T GT . . . . . . A TAT TTTT . T . . A A . AT GT . CTCGAAA CCC . T T TT . . T TA . . G . . . . . . . . . . . C G . . C . . AACTC CC . G C . TTT . . . . G . GC A . . T T . . C T TT C CA . C . . . . . . A . G A T . . . . T . T . . . T . CT . CAGT . . . TC . . G . G . . TC . G . TT T . . C . . .
blockSeqs : AC . . . AC . . . . C T G . C . AG AAT . . . . . . . . . . . GAA . . . A ATA . CATATA . . A . . . TAAT AGGATA . . . . . . A T AAT . . . A . . . . . . G TA TAA TA C . . . . . A A C . . . . . A T . . . . . . . . . . . T . . . . TC CGAT GGATCTGA . . . C T . . A . A . T . CC . T GGTAT A A . A . T C AAT . . . . . . . . . AG C . . AT TA . . . . . . C G . . A T ACCTA . . . CA . T . . G . A GA . . . . . . G AAT ATTT . T . . T A . T GA . CTCGTCG CCC . T T TC . . T TC . . G . . . . . . . . . . . C A . . . . . CTA T . G C . TT . . . . . . GC C . . T C . . A T . T CA . . . . . . . . T . G T . . . . . . . . . . . A . TG . . . TC . . G . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . TC . . . . . A . . . . . AT . . . . . . . . . . . AAA . . . A ATA . CATATA . . G . . . TTGA AAT . . . . . . A C AT . . . C . . . . . . A TA AA CA C . . . . . A G T . . . . . A T . . . . . . . . . . . G . . . . CC TGAT GGATCTGA . . . C T . . A . T . G . AC . T TAT A A . A . T T GCC . . . . . . . . . AA C . . AT TA . . . . . . C G . . A A TT . . . AA . T . . G . A TC . . . . . . G TCT TTTT . T . . G A . T AC . CTCGTCA TCT . T T T . . T A . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . CT . . . C . TT . . . . . . CC . . . T G . . C T . T C . . . . . . . . T . A A . .
blockSeqs : . AT . . . . . . . . . . . TA . . CACTAC . . G . . . T . . . . . . . . C A . . . A . . . . . . A T GA CT A . . . . . A A C . . . . . A T . . . . . . . . . . . T . . . . CC TTA AGATCTGA . . . C T . . T . A . T . TT . T TAT A A . A . A T GAT . . . . . . . . . AA T . . GA TA . . . . . . A A . . A C AT . . . AA . C . . G . T AT . . . . . . A TT TTTT . T . . A A . T GT . CTCGAAA TC . C A T . . . T . . G . . . . . . . . . . . C . . . . . C T . T C . . . . . . . . T . A
blockSeqs : . . . G . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . T AA . . . . . . . . G C . . . . . A T . . . . . . . . . . . . . . . CA TGA AGATATGA . . . C T . . A . A . C . TC . . TAT . T . G . A C AAT . . . . . . . . . AA C . . A A . . . . . . C A . . A A T . . . C . G . . . . T A . . . . . . G CT . . . . . C A . . . . CTCACA . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . C . G
blockSeqs : . . . . . . . . . G . . . . . . A T . . . . . . . . . . TT TGA GAATCTGA . . . T T . . T . A . C . . . . . . . A C AAT . . . . . . . . . AT T . . . . . . . . . . . A . . . A T . . . A . C . . . . T C . . . . . . . AT . . . . . C A . . . . TACTT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . A T . . . CA TGA AACGGAA . . . . T . . A . . . T . . . . . T . GAT . . . . . . . . . A T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : A . . CT TA . . . . . . . A . . . . . T . GTC . . . . . . . . . . T . . . . .
blockSeqs : . . GA . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . AC . . .
blockSeqCons : CCG NC C* AT********* NAA**** ***** TATGTCAGAA**************** ATA************ CATAAA** CATAAGCAT********** AT**** A** TA* AA*** G** A* T* ** CC TGA******** GGATCTGA************** C* T* TAT************************************** GAT** TA A**** N* TT************************ ** TTTT********* T* CTCGTCA************* T**** CC AACTA****** ** C* TTT* GC* G** T** T* AC*** AGTA**************** TC** G** **
originalCons : ATTTTGTTTGGATATACTGAAAAAA--GCGTT----CAACTAAACC---AACCGTACC-TCTNG-GG-CAGGATGGTTATCTACAACCGCACCTG-ATGGAAGAAGTANTTTGCTCGAC-TG--TTG--ATTATA-TGGTTCC-AATCACCTGCCCTATTACAA-GAAATT-GNCACTG-TTCAGCAAGTTATTC-AGC--------T-ATCAC-AAGAAG-----CTGTCAAAATGTAACTATCCTTGCATGTGATATTTTGCAGTNGCTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATTTGGC-AAAATCCAG-AGAAATAC----AGC-GA-TGT------TCAT-TTAGGAGTTTTCGATTCACTATCCTCTG-CACTGGAAACAATT-GGGGAA---A---T---AATGG-AGCGCGAG-T-GGACT-TTC-AC-AC-----GT-GA-T-TATTGA-GTCTGGA-AATATA-TAT-----GT-ACGAT-AT--A-TCG-----GATA------AATGTT---ATTA--------AACTCCA-AACTTCATNAA--TGT---AC-CTA--G---CCTT---GATA-TCAAA-CAACTTGATATACATAAG-C-T---A-----GGTT--TAGTT-CTTT--AAAGC----AAAAT-GCATGCTTG---CAAAATGCCCAT--A-T-AT--GA-CTGT-----TGGAA----T------TT-TTCT-CTA-----T---TTCAA-C-AGT-A-CTGTTATAATGAC-AA--TTTCATACATGTATTT---TGC--CC-CAA-AAC-TCGAAAG-ACG-T-C-CC-------AAATATCA--ATGTCAGACAAGTCTTG--ATTT--ACAA-T-----TAAAG---------------G-GTT-------GCAT----AC-----TA-A--TGATACTTTAAGAA---------AAT----AATTGTTTTCAA--A-GGTCCATA-----TGAT-ATTTATATA---G----GAT--TC-TG-A--AGAGG-T-TC--TCCATTTTT-CAGTTGA--TT--TTT---A-AA-GTAAAAA-TCATG--TCGTAGCCTC-AAANCTCATAAAC-GT-T-CATACA--T------------A------------T------------TTATGTCAAA---ACAA---CTAAATAT-ATAATCAAGGGGTTACATATATTCACAAAAGACTTGTTTGCAAAT-GA-TA-A---TGACA---TC-------TA-TAT---CGG-A--TCT--GAAA--AAGTTTT----T--------C-AATTTTCG-GCG-AT--TATTATTTT-CA---C----AAATTT-CAAG-TTTTTGCCCCA-AAAC-TC---GAAAAAGG-TCTCCGTGCAA-ACAATN-TTA---TT---------------------TTAT----AA--TCAAAGG-GTTACA-T-ACTTT-CAGAGAAA-ACANTT-----G-TTTTT--CATCAGTC-AA--T-ATTA--TC-TATGGAGAGNT-TGAAGGAG-TT------T---CCA--TTTTTCGATT-AT-TTNTAA-----A----GAAA--AAATTCCTGTTTTAGCCCC-----AAAA-----------CTCGTCAAAATGTCCCCA-AA-TATCTT-ATGTCAAAC-AACT--------------TGATATA--TA-AT-T-----GAAT--G---GTTA-CA-TAC-GTT----CACAAAA------TACTTGTTTGC------AAAAGTCAATGACA--TTTATAT-CGG---ATCTGAGGAGT-TT-T-CCAATTTTCGGTGATTATTTT--CACCAATTTTCATG-TTTTTTTGCCCC--AA---CT-AA---AAAAACGCC-CCCACGT--AGGAATGTCCAAACAACC-TGA-TTTATAATCG-AG-GGACTATGTACTT-TC---AAATTATACTTGTT-TGCCAAAAGTCAATGACATCTATAT------CGGATCTGAGGAG-TTTTTCCAATTTTCGGCGAT--TATTT-TCACCAATTTCATG---TTTTTTGCCCCAAAAACTCAAAAA-CG--C-C-CC-------AC-----GT-AGGAATGTCAAACAA-CCTGATTTATAATC-----AAGGGACTAT-G-TACTTTCAAANTATACTTGTTTGCAATAGTCA-ATGACA---TCTATAT--TCGGA--TCTGAGGAGTTTTT-------CCAA-TTT-CG-G-CGATT-ATTTTTCAC--A--ATT-TC----GTGT--T---------TTTT--------TTGCC-CC-AAAACTTC-AAAAACGCC-CC-CACGTA-G-GAA-TGT--CAAA--CAACCTGA-TT-----TTTAA-------TCAA-GGG-CTAATGT-----AGTTTCAAAAAAAT-----ACTTGTTT---GCAAAAATCCCTAGGG-GGGT-CCCCCATTACCTTTAC-TGGCCCATGG
finalCons : ATTTTGTTTGGATATACTGAAAAAA--GCGTT----CAACTAAACC---AACCGTACC-TCTNG-GG-CAGGATGGTTATCTACAACCGCACCTG-ATGGAAGAAGTANTTTGCTCGAC-TG--TTG--ATTATA-TGGTTCC-AATCACCTGCCCTATTACAA-GAAATT-GNCACTG-TTCAGCAAGTTATTC-AGC--------T-ATCAC-AAGAAG-----CTGTCAAAATGTAACTATCCTTGCATGTGATATTTTGCAGTNGCTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATTTGGC-AAAATNCAG-AGAAATAC----AGC-GA-TGT------TCAC-TTAGGAGTTTTCGATTCACTATCCTCTG-CACTGGAAACAATT-GGGGAAAT---------AATGG-AGCGCGAG-T-GGACT-TTC-AC-AC-----GT-GA-T-TATTGA-GTCTGNAA----TA-TAT-----GT-ACGATATGTCAGAA----------------AATGTTATA------------AACTCCA-AACTTCATAAA--TGT---AC-CTA--G---CCTT---GATA-TCAAA-CAACTTGATATACATAAGCAT----------GGTT--TAGTT-CTTT--AAAGC----AAAAT-GCATGCTTG---CAAAATGCCCATAT----AT--GA-CTGT-----TGGAA----T------TT-TTCT-CTA-----T---TTCAA-C-AGTA--CTGTA-TAATGACAA---TTTCATACATGTATTT---TGC--CC-CAA-AAC-TCGAAG--ACG-T-C-CC-------AAATATCA--ATGTCAGACA-GTCT-G--ATTT--ACAA-T-----TAAAG---------------G-GTT-------GCAT----AC-----TA-A--TGATACTTTAAGAA---------AAT----AATTGTTTTCAA--A-GGTCCATATGA--------TTTATATAGGATCTGA--------------AGAGG-T-TC--TCCATTTTTC-AGT-GA--TT--TTT---A-AA-GTAAAAA-TCATG--TCGTAGCCTC-AAANCTCATAAAC-GT-T-CATACATAT--------------------------------------TTATGTCAAA---ACAA---CTAAATAT-ATAATCAAGGGGTTACATATATTCACAAAAGACTTGTTTGCAAATGAT--A-A---TGACA---TC-------TA-TAT---CGG-A--TCT--GAAA--AAGTTTT----T--------C-AATTTTCG-GCG-AT--TATTATTTT-CA---C----AAATTT-CAAG-TTTTTGCCCCA-AAAC-TCA----AAAAGG-TCTCCGTGCAA-ACAATN-TTATT------------------------TTAT----AA--TCAAAGG-GTTACA-T-ACTTT-C--AGAAA-ACANTT-----G-TTTTT--CATCAGTC-AA--T-ATTA--TC-TATGGAGAGNT-TGAAGGAGTTTT---------CCA--TTTTTCGATT-AT-TTNTAA-----A----GAAA--AAAT-CCTGTTTTAGCCCC-----AAAACTCGTCA-------------ATGTCCCCA-AA-TATCTT-ATGTCAAAC-AACT--------------TGATATAT----AT-T-----GAAT--G---GTTA-CA-TAC-GTT----CACAAAA------TACTTGTTTGC------AAAAGTCAATGACA--TTTATAT-CGG---ATCTGAGGAGT-TT-TCCCAATTTTCGGTGATTATTTT--CACCAATTTTCATG-TTTTTTTGCCCC--AAAACTA------AAAAACGCC-CCCACGT--AGGAATGTC-AAACAACC-TGATTT-ATAATCG-AG-GGACTATGTACTT-TC---AAATTATACTTGTT-TGC-AAAAGTCAATGACATCTATAT------CGGATCTGAGGAG-TTTTTCCAATTTTCGGCGAT--TATTT-TCACCAATTTCATG---TTTTTTGCCCCAAAAACTCAAAAA-CG--C-C-CC-------AC-----GT-AGGAATGTCAAACAA-CCTGATTTATAATC-----AAGGGACTATG--TACTTTCAAANTATACTTGTTTGCAATAGTCA-ATGACA---TCTATAT--TCGGA--TCTGAGGAGTTTTT-------CCAA-TTT-CG-G-CGATT-ATTTTTCACAC---ATT-TCAGTA----------------TTTT--------TTGCC-CC-AAAACTC--AAAAACGCC-CC-CACGTAG--GAA-TGT--CAAA--CAACCTGA-TT-----TTTAA-------TCAA-GGG-CTAATGT-----AGTTTCAAAAAAAT-----ACTTGTTT---GCAAAAATCCCTAGGG-GGGT-CCCCCATTACCTTTAC-TGGCCCATGG
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|27 ): AANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACAGGTATT
Unaligned ( gi|33 ): GTGAAGAGTCTGAAAGAGTTTTCCATTATTCAAAAAAAAAAATCA
Alignments
lowQualScore : 11 2222 111 1 1 1 111 1 11 11 111 1 1 111 111 1 1 3333333333 1 33333 111 1111 3333333 11111111111 22 11111 22222222 111 11111 444444444444444444444444 111 222222222 111111 444444444444444444444444444 1111 222222 11111 33333333333 11111 11111 11 222222222222 11111 333333333333333 2222222 1111 11111 11 222222222 1111 11111111 11111111111111111111111 1 66666666666666666666666666666666666666666 1111 1111111 1111 2222222222222 111 1111 66666666666666666666666666 111 1111 11111 11111 11111 22222222222 22222222222222 2222222222222 111111 111111 111111 111 1 111 111 1 111 111111 222 11 1111111 11111 11111 1 111 1111 11 2222222 1 1 3333 888888888888888888888 22222222 1111 11 11 11 22222222 2222222 11 33333333 222222 1 111
lowQualScore : 33 2 1111 777 2 0 1 0 0 999 8 5 1 00 33 777 0 0 000 000 1 0 1 0 7777777777 0 33333 6 7 333 1 6 22 6 4444 6 6 7777777 88 9 5 1 6 22 77777777777 00 5 5 5 5 5 44444 5 5 5 5 00000000 000 66666 6 1 222222222222222222222222 000 888888888 5 99999999 888 5 111111 888 5 5 444444444444444444444444444 66 5 66 0000 5 0 888 3 2 222222 66 5 99999 22222222222 5 5 22222 888 5 5 999 5 666 66666 33 1 777 00 8 4 4 66 1 555555555555 55 3 3 3 4 66 4 11111 333333333333333 4 0000000 0000 22222 5 11 1 000000000 7777 55 3 33 88888888 55 55 77777777777777777777777 0 3 3 55 3 3 4 3 55 55 88888 0 3 2 55 5 3 66 5 777 22222222222222222222222222222222222222222 4 0000 777 3 4 2 5 44444 3 555 555 0000000 3 555 3 44 77 0000 1111111111111 7 3 77777 88 3 000 8888 4 4 4 1 3333 44 4 1 55 2 88888888888888888888888888 1 9999 66 4 444 4 1 4 66 777 1 333 66 1 4 66 4 66 4 3 4444 00000 55 55 0 44 4 2 00000 777 55 8 4 11111 11111111111 9999 66 22 4 4 4 55 4 33333333333333 66 1111111111111 444444 4 4 4 9999 222222 222222 66 5 000 6 2 1 99 5 5 5 6 222 6 6 000 99 3 6 6 6 6 6 1 0 6 6 6 111 6 5 0 5 7 999999 5 55 9 0 66 4 3 1 000 3 88 4 55 4 4 4444444 11111 4 0 4 3 11111 888 1 9 0 444 2222 11 5 0 6666666 0 6 8 8 88 0 0000 8 444444444444444444444 99999999 8 9999 11 8 8 999 8 5 11 0 11 22222222 6666666 11 8 0 00000000 0 333333 0 444 0 6 6 8 0 0 8
lowQualScore : .. . .... ... . . . . . ... . . . .. .. ... . . ... ... . . . . .......... . ..... . . ... . . .. . .... . . ....... .. . . . . .. ........... .. . . . . . ..... . . . . ........ ... ..... . . ........................ ... ......... . ........ ... . ...... ... . . ........................... .. . .. .... . . ... . . ...... .. . ..... ........... . . ..... ... . . ... . ... ..... .. . ... .. . . . .. . ............ .. . . . . .. . ..... ............... . ....... .... ..... . .. . ......... .... .. . .. ........ .. .. ....................... . . . .. . . . . .. .. ..... . . . .. . . .. . ... ......................................... . .... ... . . . . ..... . ... ... ....... . ... . .. .. .... ............. . . ..... .. . ... .... . . . . .... .. . . .. . .......................... . .... .. . ... . . . .. ... . ... .. . . .. . .. . . .... ..... .. .. . .. . . ..... ... .. . . ..... ........... .... .. .. . . . .. . .............. .. ............. ...... . . . .... ...... ...... .. . ... . . . .. . . . . ... . . ... .. . . . . . . . . . . . ... . . . . . ...... . .. . . .. . . . ... . .. . .. . . ....... ..... . . . . ..... ... . . . ... .... .. . . ....... . . . . .. . .... . ..................... ........ . .... .. . . ... . . .. . .. ........ ....... .. . . ........ . ...... . ... . . . . . . .
lowQualScore : 88 5 2222 555 5 0 0 0 0 666 0 0 0 22 88 000 0 0 222 888 0 0 2 0 2222222222 0 33333 7 3 777 0 7 00 7 2222 7 7 5555555 88 3 7 0 7 00 77777777777 77 7 7 7 7 7 33333 7 7 7 7 99999999 000 77777 7 0 222222222222222222222222 000 666666666 7 44444444 888 0 666666 888 0 0 333333333333333333333333333 99 0 99 6666 0 1 888 1 2 222222 99 0 44444 44444444444 0 0 55555 888 0 0 000 0 000 66666 88 1 888 66 9 4 4 11 9 999999999999 55 6 6 6 0 11 4 11111 999999999999999 4 6666666 6666 55555 0 99 3 000000000 2222 00 6 88 22222222 00 00 11111111111111111111111 4 6 6 00 6 6 0 6 00 00 11111 9 6 3 00 5 6 22 0 111 99999999999999999999999999999999999999999 6 4444 000 8 0 6 8 88888 1 444 444 8888888 3 888 3 66 99 8888 8888888888888 3 6 88888 88 6 000 5555 0 0 0 9 9999 66 4 0 44 1 00000000000000000000000000 9 4444 11 4 888 4 9 4 11 888 0 666 11 1 4 11 4 11 4 2 0000 00000 55 55 7 77 0 4 00000 000 55 0 0 11111 11111111111 6666 11 00 4 4 6 33 0 55555555555555 11 1111111111111 000000 4 4 4 4444 888888 888888 11 0 000 3 5 0 22 5 2 7 7 333 7 7 222 22 7 7 7 7 7 7 3 7 7 7 7 777 7 7 7 7 5 222222 0 88 6 4 11 4 9 8 000 6 33 4 00 4 4 4444444 11111 4 1 4 9 11111 000 0 8 0 000 6666 00 0 8 0000000 8 0 0 0 88 6 0000 0 000000000000000000000 00000000 0 0000 88 0 0 222 0 0 00 8 00 88888888 0000000 22 0 8 00000000 8 888888 6 000 8 7 7 0 8 8 0
consensus : ATTTTGTTTGGATATACTGAAAAAA--GCGTT----CAACTAAACC---AACCGTACC-TCTNG-GG-CAGGATGGTTATCTACAACCGCACCTG-ATGGAAGAAGTANTTTGCTCGAC-TG--TTG--ATTATA-TGGTTCC-AATCACCTGCCCTATTACAA-GAAATT-GNCACTG-TTCAGCAAGTTATTC-AGC--------T-ATCAC-AAGAAG-----CTGTCAAAATGTAACTATCCTTGCATGTGATATTTTGCAGTNGCTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATTTGGC-AAAATCCAG-AGAAATAC----AGC-GA-TGT------TCAT-TTAGGAGTTTTCGATTCACTATCCTCTG-CACTGGAAACAATT-GGGGAA---A---T---AATGG-AGCGCGAG-T-GGACT-TTC-AC-AC-----GT-GA-T-TATTGA-GTCTGG--A----AT---ATAT-----GT-ACGAT----AT-G--------TCAGA---AAATGTT---AT---------AAACTCCA-AACTT-CATAAA-TGT---AC-CTA--G---CCTT---GATA-TCAAA-CAACTTGATATACATAAG-CAT------G--GTT--TAGTT-CTTT--AAAGC----AAAAT-GCATGCTTG---CAAAATGCCCAT--A-T-AT--GA-CTGT-----TGGAA----T------TT-TTCT-CTA-----T---TTCAA-C-AGT-A-CTGT-AT-AATGAC-AA--TTTCATACATGTATTT---TGC--CC-CAA-AAC-TCGAA--GACGT-C-CC-------AAATATCA--ATGTCAGA-C-AGTCT-GA-TTT--ACAA-T-----TAAAG---------------G-GTT-------GCAT----AC-----TA-A--TGATACTTTAAGAA---------AAT----AATTGTTTTCAA--A-GGTCCATA--------TGAT--TT--ATATA---G----G--AT-C--TG-A--AGAGG-T-T--CTCCA-TTTTT-CAGT-G-A--TT--TTT---A-AA-GT-AAAAATCATG--TCGTAGCCTC-AAANCTCATAAAC-GT-T-CATACA--T------------A------------T------------TTATGTCAAA---ACAA---CTAAATAT-ATAATCAAGGGGTTACATATATTCACAAAAGACTTGTTTGCAAAT-GA-TA-A---TGACA---TC-------TA-TAT---CGG-A--TCT--GAAA--AAGTTTT----T--------C-AATTTTCG-GCG-AT--TATTATTTT-CA---CAA----ATTT-CAAG-TTTTTGCCCCA-AAACTC----GAAAAGG-TCTCCGTGCAA-ACAATN-TNA---TT---------------------TTAT----AA--TCAAAGG-GTTACA-T-ACTTT-CAGA--AA---ACANTTG-TTTTT--CATCAGTC-AA--T-ATTA--TC-TATGGAGAGTT-TGAAGGAGTT-----TT--CCA--TTTTTCGATT-AT-TTNTAA-----AGAA---A--AAAT-C-CTGTTTTAGCCCC-----AAAA-----------CTCGTC--AATG--TCCCCA-AA-TATCTTATGTCAAAC-AACT--------------TGATA--TAT---A--TT-----GAAT--G---GTTA-CA-TAC-GTT----CACAAAA------TACTTGTTTGC------AAAAGTCAATGACA--TTTATAT-CGG---ATCTGAGGAGTTTTTCCAATTTTCGGTGATTATTTT--CACCAATTTTCATG-TTTTTTTGCCCCAAAA-CT--AAAAA-A-CGCC-CCCACGT--AGGAATGT-C-AAA-CAACC-TGA-TTTATAATCG-AG-GGACTATGTACTT-TC---AAATTATACTTGTT-TGC-AAAAGTCAATGACATCTATAT------CGGATCTGAGGAG-TTTTTCCAATTTTCGGCGAT--TATTT-TCACCAATTTCATG---TTTTTTGCCCCAAAAACTCAAAAA-CG--C-C-CC-------AC-----GT-AGGAATGTCAAAC-AACCTGATTTATAATC-----AAGGGACTAT-G-TACTTTCAAANTATACTTGTTTGCAATAGTCA-ATGACA---TCTATAT--TCGGA--TCTGAGGAGTTTTT-------CCAATTTTCG-GC-GATT-ATTTTTCAC-A--ATT-TC-AT----GT---------G--TTTT--------TTGCC-CCAAAA--C-TC-AAAAACGCC-CC-CACGTA-G-GAA-TGT--CAAA--CAACCTGA-TT-----TTTAA-------TCAA-GGG-CTAATGT-----AGTTTCAAAAAAAT-----ACTTGTTT---GCAAAAATCCCTAGGG-GGGT-CCCCCATTACCTTTAC-TGGCCCATGG
Reference ( family-3276 ) : ATTTTGTTTGGATATACTGAAAAAA--GCGTT----CAACTAAACC---AACCGTACC-TCTNG-GG-CAGGATGGTTATCTACAACCGCACCTG-ATGGAAGAAGTANTTTGCTCGAC-TG--TTG--ATTATA-TGGTTCC-AATCACCTGCCCTATTACAA-GAAATT-GNCACTG-TTCAGCAAGTTATTC-AGC--------T-ATCAC-AAGAAG-----CTGTCAAAATGTAACTATCCTTGCATGTGATATTTTGCAGTNGCTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATTTGGC-AAAATNCAG-AGAAATAC----AGC-GA-TGT------TCAC-TTAGGAGTTTTCGATTCACTATCCTCTG-CACTGGAAACAATT-GGGGAA---A---T---AATGG-AGCGCGAG-T-GGACT-TTC-AC-AC-----GT-GA-T-TATTGA-GTCTGN--A----AT---ATAT-----GT-ACGAT----AT-G--------TCAGA---AAATGTT---AT---------AAACTCCA-AACTT-CATAAA-TGT---AC-CTA--G---CCTT---GATA-TCAAA-CAACTTGATATACATAAG-CAT------G--GTT--TAGTT-CTTT--AAAGC----AAAAT-GCATGCTTG---CAAAATGCCCAT--A-T-AT--GA-CTGT-----TGGAA----T------TT-TTCT-CTA-----T---TTCAA-C-AGT-A-CTGT-AT-AATGAC-AA--TTTCATACATGTATTT---TGC--CC-CAA-AAC-TCGAA--GACGT-C-CC-------AAATATCA--ATGTCAGA-C-AGTCT-GA-TTT--ACAA-T-----TAAAG---------------G-GTT-------GCAT----AC-----TA-A--TGATACTTTAAGAA---------AAT----AATTGTTTTCAA--A-GGTCCATA--------TGAT--TT--ATATA---G----G--AT-C--TG-A--AGAGG-T-T--CTCCA-TTTTT-CAGT-G-A--TT--TTT---A-AA-GT-AAAAATCATG--TCGTAGCCTC-AAANCTCATAAAC-GT-T-CATACA--T------------A------------T------------TTATGTCAAA---ACAA---CTAAATAT-ATAATCAAGGGGTTACATATATTCACAAAAGACTTGTTTGCAAAT-GA-TA-A---TGACA---TC-------TA-TAT---CGG-A--TCT--GAAA--AAGTTTT----T--------C-AATTTTCG-GCG-AT--TATTATTTT-CA---CAA----ATTT-CAAG-TTTTTGCCCCA-AAACTC----AAAAAGG-TCTCCGTGCAA-ACAATN-TTA---TT---------------------TTAT----AA--TCAAAGG-GTTACA-T-ACTTT-CAGA--AA---ACANTTG-TTTTT--CATCAGTC-AA--T-ATTA--TC-TATGGAGAGNT-TGAAGGAGTT-----TT--CCA--TTTTTCGATT-AT-TTNTAA-----AGAA---A--AAAT-C-CTGTTTTAGCCCC-----AAAA-----------CTCGTC--AATG--TCCCCA-AA-TATCTTATGTCAAAC-AACT--------------TGATA--TAT---A--TT-----GAAT--G---GTTA-CA-TAC-GTT----CACAAAA------TACTTGTTTGC------AAAAGTCAATGACA--TTTATAT-CGG---ATCTGAGGAGTTTTCCCAATTTTCGGTGATTATTTT--CACCAATTTTCATG-TTTTTTTGCCCCAAAA-CT--AAAAA-A-CGCC-CCCACGT--AGGAATGT-C-AAA-CAACC-TGA-TTTATAATCG-AG-GGACTATGTACTT-TC---AAATTATACTTGTT-TGC-AAAAGTCAATGACATCTATAT------CGGATCTGAGGAG-TTTTTCCAATTTTCGGCGAT--TATTT-TCACCAATTTCATG---TTTTTTGCCCCAAAAACTCAAAAA-CG--C-C-CC-------AC-----GT-AGGAATGTCAAAC-AACCTGATTTATAATC-----AAGGGACTAT-G-TACTTTCAAANTATACTTGTTTGCAATAGTCA-ATGACA---TCTATAT--TCGGA--TCTGAGGAGTTTTT-------CCAATTT-CG-GC-GATT-ATTTTTCAC-AC-ATT-TC-A-----GT---------A--TTTT--------TTGCC-CCAAAA--C-TC-AAAAACGCC-CC-CACGTA-G-GAA-TGT--CAAA--CAACCTGA-TT-----TTTAA-------TCAA-GGG-CTAATGT-----AGTTTCAAAAAAAT-----ACTTGTTT---GCAAAAATCCCTAGGG-GGGT-CCCCCATTACCTTTAC-TGGCCCATGG
gi|1 : ATTTTGTTTGGATATACTGAAAAAA--GCGTT----CAACTAAACCTTGAA--GTACT-TCTAG-AG-CAGGATGGTTATTTACAA---CACCTG-ATGGAAGAAGTTATTTGCTCGAC-TGATTTG----TATATTGGTTCC-AATCACCTGCCCTATTACAAGGAAATTGGCCACTATTTCAACAAGTTATTCAAGC--------TCATCACAAAGAAG-----CTGTCAAAATGCAACTATCC-TGCATGTGAT-TTTAGCAGTTGCTA
gi|1 : AACTTAGCCAAAATC------GAATAC----CGT-GAATGT------TCATATTAGCAGTTTTCATTTCACTATCCTCTTTCACTGGAAACAGTT-AGGGAA---A---T---AAT---AGTGCGAGAT-GGACT-TTC-AC-AC-----GT-GA-T-TATTGACGTCTGG--AGAATAT---ATATACATGGT-ACGATT---AT-A--------TCGGAT--AAATGTT---ATT--------AAACTCCA-AACTTTCTTAAGCTGT---AC--TA--G---CCTA---GATA-TCAAA--AACTTGATATAAATAAGGCTTTGG---G--GTT--TAATT-CTTT--AAAGC----AAAATTGCATGC--------AAGTTATTAT----T-AT--AA-CT-T-----TGGAA----T------TT-TTCT-C-A-----T---T-CAA-C-AGT-AACTGT-TTTAATGAC-AA--TTCCATGCATGTATTT---TGT--CC-CAA-AAC-TTGGAAGGACGT-C-TC-------AAATATCA--ATGTCAGA-CGAGTCTTGA-TTT--ACAA-T-----TAAAG---------------G-GTT-------GCAT----AC-----TA-AA-TGATATTTTAAGAA---------AAT----AATTGTTTTCAA--A-GGT---TA--------TGATATTT--ATATA---G----G--ATTC--TT-G--AGAAG-T-T--CTCCA-TTTTTTCAGTTG-A--TT--TTT---A-AA-GT-TAAAAAGATG--CTGGAAGCTC-AAACGTCATAAAC-AT-T-CATATA---------------A------------T------------TTATTTCAAA---ACAA---CTAAA-AT-ATAATCAAAAGGTTACATATATTTACATAAGA--TGTTTGCAAAT-GAATA-A---TAA-----TC-------TA-TAT---CTG-A--TCT--GGAA--AAGTTTT----T--------C-AATGTTCG-GCG-AT--TATT-TTTT-CA---CAA----ATTT-CAAG-TTTTT-CCCCA-AAATTCG---AAAAAGG-TTCTTGGGTAA--CAGTTCTTA---TT---------------------TTAT----AA--TCAAAGG-GTTACA-T-ACTTT-CAGAGAAA---ACAGTTA-TTTTT--CATCAGTC-AA--T-ATCA--TC-TATTGAGAGGT-TGAAGGAATT-----T---CCA--TTTTTCGATT-AT-TTATAA-----AGAA---A--AAATTC-CTGTTTTAGCCCC-----AAAA------------TCGTCCCAATG--TCCCCA-AA-TATCTTA-GTCAAAC-AACT--------------TGATA--TACTTAA--TT-----GAAT--G---GTTA-CA-CACTGTT----CACAAAA------TACTTGTTTGC------AAAAGTCAATGACA--TTTACAT-CGG---ATCTGAGGAGTATTTTCAATTTTCTGTGATTATTTT--CACCAATTTTTATG-TTTTTTTGCCCCAA---CT--AAAAA-AACGCC-CCCACCCTAAAGAATGTTC-AAA-CAACCGTGA-T--ATAATTA-AG-GGACTATGTGCTC-TC---AAATTATACTTGTTCTGCCAAAAGTCAATGACATCTATAT------CGGATCTGAAAAG-TTTTTCCGATTTTCGGCGAT--TATTT-TCACAAATTTCATG---TTTTTTGCCTCAAAAACTCAAAAA-CA--C-C-CC-------AC-----GT-AGGTATGTCAAAC-ATCC-GATTTATAATC-----AAGGGACTAT-GTTACTTTCAAATTATACTTGTTTGCAA-AGTCA-ATGACA---TCTATAT--TCGGA--TCTGGGGAG-TTTT-------CCAATTT-CG-GC-GATTAATTTTTCAC-A--ATT-TC-GT----GT---------T--TTTT--------TTGCCTTCAAAA--CTTC-AAAAACGAC-CC-CACGTA-G-GAA-TTTTACAAA--CAACCTGA-TT-----TTTAA-------TCAA-GGG-CTAATGT-----AGTTTCAAAAAAAT-----ACTTGTTT---GCAAAAATCCCTAGAGCGGGT--CCCCATTACCTTTAC-AGGCCCACGGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacttagccaaaatcgaataccgtgaatgttcatattagcagttttcatttcactatcctctttcactggaaacagttagggaaataatagtgcgagatggactttcacacgtgattattgacgtctggagaatatatatacatggtacgattatatcggataaatgttattaaactccaaactttcttaagctgtactagcctagatatcaaaaacttgatataaataaggctttggggtttaattctttaaagcaaaattgcatgcaagttattattataactttggaatttttctcattcaacagtaactgttttaatgacaattccatgcatgtattttgtcccaaaacttggaaggacgtctcaaatatcaatgtcagacgagtcttgatttacaattaaagggttgcatactaaatgatattttaagaaaataattgttttcaaaggttatgatatttatataggattcttgagaagttctccattttttcagttgatttttaaagttaaaaagatgctggaagctcaaacgtcataaacattcatataatttatttcaaaacaactaaaatataatcaaaaggttacatatatttacataagatgtttgcaaatgaataataatctatatctgatctggaaaagtttttcaatgttcggcgattattttttcacaaatttcaagtttttccccaaaattcgaaaaaggttcttgggtaacagttcttattttataatcaaagggttacatactttcagagaaaacagttatttttcatcagtcaatatcatctattgagaggttgaaggaatttccatttttcgattatttataaagaaaaaattcctgttttagccccaaaatcgtcccaatgtccccaaatatcttagtcaaacaacttgatatacttaattgaatggttacacactgttcacaaaatacttgtttgcaaaagtcaatgacatttacatcggatctgaggagtattttcaattttctgtgattattttcaccaatttttatgtttttttgccccaactaaaaaaacgcccccaccctaaagaatgttcaaacaaccgtgatataattaagggactatgtgctctcaaattatacttgttctgccaaaagtcaatgacatctatatcggatctgaaaagtttttccgattttcggcgattattttcacaaatttcatgttttttgcctcaaaaactcaaaaacaccccacgtaggtatgtcaaacatccgatttataatcaagggactatgttactttcaaattatacttgtttgcaaagtcaatgacatctatattcggatctggggagttttccaatttcggcgattaatttttcacaatttcgtgttttttttgccttcaaaacttcaaaaacgaccccacgtaggaattttacaaacaacctgatttttaatcaagggctaatgtagtttcaaaaaaatacttgtttgcaaaaatccctagagcgggtccccattacctttacaggcccacggc
gi|10 : attttgtttggatatactgaaaaaagcgttcaactaaaccttgaagtacttctagagcaggatggttatttacaacacctgatggaagaagttatttgctcgactgatttgtatattggttccaatcacctgccctattacaaggaaattggccactatttcaacaagttattcaagctcatcacaaagaagctgtcaaaatgcaactatcctgcatgtgattttagcagttgctannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntG-TTTTTTTGCCCCAAAA-CT--AAAAACA-CGCC-CC-ATGA--AGGAATGT-C-AAA-CAATC-TGA-TT-ATAATTG-TG-TGACTATGTACTT-TC---AAATTATACTT-TT-TGG-AAAAGTCAA--ACATTTATAT------CGGATCTGAGGAG-TTTT-CCAATTTC--GTGAT--TATTT-TCACCAATT-CATG---TTTTT-GCCCCAAAA-CTCAAAA--CG--C-C-CC-------AC-----GC-AG-AATGTCAAAC-AACCAGATTTATAATC-----AAGG-ACAAT-G-TACTTTCAAATTATACTTGTTTGCAAAAGTCA-ATGACA---TTTATA---TCGGA--TCTGAGGAGTTTTT-------CCAATTT-CG-GT-GATT-A-TTTTCAC-CT-ATT-TC--------T---------G--TTTT--------TTGCC-CCAAAA--C-TC-AAAAAC-CC-CC-CACGTA-G-GAA-TGT--CAAA--CAACCTGA--T-----TATAT-------TCAG-GGA-CTAG--------ACTTTCAAAAAAA--------CTG-TT---GC--AAATCCCCGGGG-c
gi|11 : caattcggatgagtattatcactaagatgttatagcgatcgtctcgttaT---AT---------AAGCTCCA-AACTT-ATTAAC-TGT---AC-CTATAA---CCTT---TATA-TCAAA-CAACTTGATATACACAAG-CATACATGGG--GTT--TAGTT-CTTT--AAAGC----AAAAT-GCATGCTTG---CAAAATGTCCAT--A-TCAT--GA-CTGT-----TGGAA----A------TT-TTCT-CTA-----T---TTCAA-C-AGT-A-CTGT-AT-AATGAC-AAT-TTTCATACATGTATTT---TGT--CC-CAA-AAC-TCGAA--AATGTCC-CC-------AAATATCA--ATGTCAAA-C-AGTCT-Gt
gi|11 : -A--TT--TTT---A-A--GT-ACAAATCATG--TTGTAGCCTC-AAA---CATACAT-AT----ATAAAGGT------------A------------T------------TTATGCC-AA---ACAA---CTAGATAT-ATAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatttttaagtacaaatcatgttgtagcctcaaacatacatatataaaggtatttatgccaaacaactagatatataa
gi|12 : tataagctccaaacttattaactgtacctataacctttatatcaaacaacttgatatacacaagcatacatggggtttagttctttaaagcaaaatgcatgcttgcaaaatgtccatatcatgactgttggaaattttctctatttcaacagtactgtataatgacaattttcatacatgtattttgtcccaaaactcgaaaatgtccccaaatatcaatgtcaaacagtctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaATTTCTTGTGGACATACTGTAGGAT--GCGTT----CGAGTGAACC---AACCGTACCGCCTTG-GG-CAGGATGGTTATCTTCAACTGCACCAG-AC-GAAGAAGTGCTTTGCTCGAC-TG--TTG--ATTATA-TGGTTCC-AATCAACTGTCCTATCAC-A-GAAAAT-GCCACAG-TTCAGCAAGTCATCC-AGC--------T-ATCAC-AAG
gi|13 : tacaactcatactgctcacggtattgtgaaacaagaagtatatgtgcgtgatgaggataaccaaggccctctagacaaatcttgctagataggaataaatctaggacaagtttcagaaaaatcagaagaactagccccatgtttcgtgaagaccaaaacatcgccagctgtccgaactacttgcatgtcccctttgcataccaacaatgataagagagacatgactcGC-GAAATCTAG-AGAAGTAC----AGC-GA-TGTCATTGTTCAC-TGAGGAGTTTCC-ATTCGCTAAGCTATG-CATTGGAAAGAATT-GGGTAA---AGAGT---AATGGGAGTACTAG-T-GGACT-TTC-AC-ATCACATGT-GA-T-TATTGA-GGCTGG--C----AT---ATAT-----GT-ATGA-------------------------AAATTTT---CT---------GAACTCAA-AACTT-TATAAA-TGT---AC-CTA--G---CCTT---GATG-TCAAA-CAAC-----------AA---AT------G--GTA--TAGTT-CTTC--AAAGC----AAATT-ACATGCTTG---C-GAATGTCTTT--ATT-GT--GA-TTGT-----AGGAA----TCGAAAATT-TTCC-ATT-----T---TTTAA-C-AAT-A-TTAT-AT---TGACAAA--TTTCATA----TATTG---CGCG-CA-TAACAAC-TCGAA--GAGGTAC-AT-------GTATATTA--ATATCAGA-T-AGTCT-GA-CTT--ACGA-T-----TAAAG---------------G-GCT-------GCAT----AC-----TA-A--TGAT
gi|14 : tT--TAGTTTCTTT--AGAAG----GAAAT-A-ATG---------AAAT-----T--A---AT--GA-CAGTAGGATTGGAT----C------TT-TTTT-CTACTATCT---TTTAA-CCAGT-G-CTGT-A---ATGACTAA--CTTTCTACATGTACTT---TACTACT-CAA-A-C-TCGAA--CA-AT-C-CC-------AA---------TGCCAGA-C-AGTTG-GAATTT--ACAA-T--------AG---------------GCGTA-------GTATCGCCAA-----TA-AAATGATCCTTTAAGGA---------AATGCTAAATTGTTTCC-A--A-GGTTGGTAAT------CGAC--TTTAACATA---A----ATTCT-C--TG----AGAGGAT-T--TTCCA-CTTGT--AGT-G-A--TCTGTTT---A-AG-TT-AAAGACCATGTCTCGTAGCCTC-AAAg
gi|15 : ATATAGTTACAA------TATCTGCAAAT-TA-GA-GGGTTGACAAATTC-------TA-TATACTCGG-AAATCT--GAGA----GTCTT----TTATCTCCCC-AATTTTCGCGTG-A------TATTTTGCA---CA
gi|15 : TGACAAATTCTATATACTCGGAAATCTGAG-AGTCTTTTATCTCCCCAATTTTCGCGT-GAT--ATTTTGCAC-ACCATTATT-ATGGGTGT---------ACCTTTTGGTAGGGGTTGCA-TCAAAA----TC-GAAAACGTAACC-CACGTA-G-AAAATGC--CAAA--CAACCTGAATTAAATATTTGAAAAGGTTTCAGTAGG-ATAAAATCAATAAACTACAAAAAAACCCACAATTTGTTTTGAG-AAAAATCCCCATGG-GGGT-CGCCCATTACCTTTACTTGGCCCATGccattattatgggtgtaccttttggtaggggttgcatcaaaatcgaaaacgtaacccacgtagaaaatgccaaacaacctgaattaaatatttgaaaaggtttcagtaggataaaatcaataaactacaaaaaaacccacaatttgttttgagaaaaatccccatgggggtcgcccattacctttacttggcccatgtc
gi|16 : atatagttacaatatctgcaaattagagggtTTC-CA---CAA----ATTT-CAAG-TTTTTGCCCCA-AAATTC----AAAAAA--TATCCATGCAA-ACAATA-TGA---TT---------------------T-AT----AA--TCAAAGG-GTTCAA-T-AGTTT-CAGA--GACCCACATTTG-TTTT---CAAAAGGC-AA--T-ATTA--TC-TGTGAAGAGTC-TGAAGGAGTT-----TT--CCA--TTTGTCGATG-AT-TTTTAA-----AGAA---ACAAAA------G----AGCCCA-----AAAG-----------CTCGAA--AATG--TCCTAA-AA-TA-CTTATGTCAAAC-AACT--------------TGATA--TAT---tc
gi|17 : aa--A-GGTTCATA--------TTAT--TT--ATATA---G----A--AT-T--CG-A--AGAGG-T-T--CTCCA-TTTTT-AGGT-G-A--TT--TTT---TTAA-GT-AAAA-TCATG--T---AGCCTC-AAAACTCGTAAAT-GT-T-CCCACA--TCCTAAAGTATAAA------------T------------TTATGTCAAA----CAA---CTTAGTAT-ATGATCAAGGGGTTGCATGTATTCACAAAATACTTGTTTGCAAAT-GT-CA-A---TGACA---TC-------TA-CAT---CGG-A--TCT---AAA--ACGTTTT----C--------C-AATTTTCA-GC
gi|18 : T-TGC-AAAACTTTATAATATCTATATGTATTTCGGATCTGAAGAG-TTTTTCCAAAGTTTGGCGTT--TATTT-TCACCAGTTGCATGGGGTTTTTTGCCCC-CAAACTCGACAA-CA--C-CACC-------AC-----CA-AGGAATGTCAAAC-AACCTTATTTAGAATC-----TAGGGACAAT-G-TAGTTTCAAAATAT
gi|19 : GAG-TTTCT----TTTTCCGCTAGCATATTTCTCAC-AG---CATG---CTTTTTGTTC--AAAACTGGTATT-CA--C-C-CCCTGGCCCAC-----AT-AGAAATTTGAAAC-AACCACATTTTTAATC-----AAACGACTGT-G-CACTTTCCAAAAGTACTTGTTTACA
gi|2 : TTTTGATTGGATATCCTGAAAAAA--A-GTT----CAACTAAACC---AACCATACT-TCTTGAGG-CAGGATGGTTATCTACAACCACACCTA-ATGGAGGAA-CACTTTGTTGGAT-TG--TTG--ATTATA-TGGTTCC-AATCACCTGCCCTATTGCAA-GAAA-T-GACACTA-TTCAGCATGCTATTC-AGCTAGATTAAT-ATCAC-AAGAAG-----CTGTCAAAATGTAACTATCCTTGCATGTG--ATTTTGCAGTGGCTA
gi|2 : TTTGGC-AAAATCCAG-AGAAGCAC----AGC-AA-TGTATTGT-TCAT-TTAGGAGTTTTCCATTCACTATCCTCTG-AACTGGAAACCACT-GGGGAA---AA--T---AGTG--AGCGTGAG-T-GGACT-TTT-AC-AC-----AT-GA-T-TATTGA-GTCTGG--A----AT---ATAT-----GT-ACGAT----AT-G--------TCAGA---AAATGTT---AT---------AAACTTCA-AACTT-TATAAA-TGT---AC-CTA--A---CCTT---GATA-TCAAG-CAACGTAATATACATAAG-C-----------GTT--TAGTT-CTTT--AA-GC----AA--T-GCATGCTTG---CAAAATGCCCAT----T-AT--G------------------------------TTTT-CTA-----T---TTCAA-C-AAT----CGT-AT-AATGAC-AA--TTTTATACATGTATTT---TGT--CC--AA-AAC-TCGAA--GACGT-CTCC-------AAATATCA--ATGTCAGA-C-AGTCT-GA-TTT---CAA-TAAGGATAAAACTGTTCGTTTCCTTTG-ATTTT-----ACAT----ACAGAATTA-A--TGATACGTTAAGAA---------AAT----AATTATTTTCAT--T-GGTTCATA--------TGAT--TT--ATATA-----------------------------------TTCA-TTTC--CAAT-A-A--AT--TTG---A-AAAGT-AAAAATCATG--TTGTAACCTA-AAAATTCATAAAC-AT-T-CATACA--T------------A------------T------------TTATTTTCAC---ACAA---CTAAATAT-ATAAACAAGGGGTTACACATATTTACAAAAGACTTGTATGCAAAT-AA-TA-A---GGACA---TC-------AA-TAT---CGGTA--TGT--GAAA-----TTTTCCCCC--------C-AACTTTGA-GTG-AT--TATTATTTT-TA---CAC----ATTT-CAAG-TTTTTGCCCAA-AAACTC----GAAAAGG-TCTCCATGCAA-ACAATC-TTA----T---------------------TTAT----AA--TCAAAGG---TACA-T-ACATT-CAGA--AA---ACAA-TG-ATTTT--CATCAGTA-AA--T-ATTA--TC-TATTGAGAG-T-TGAAGGAGAT-----TT--CCA--TTTTTCGATT-AT-TTTTAG-----AGAA---A--AAAT-C-CCGTTTTAGCCCC-----AAAA-----------CTCGTC--GATG--CCCCCA-AC-TATC-TATGCCAGAC--------------------------------A--TT-----GGAT--G---GCTA-CA-TAT-GTT----CACAAAA------TATTTGTTTGC------AAAATTCAGTGATA--TCTATAT-CGG---ATCTGAGGAGCTTGTCCAATTTTTGGTGATTATTTT--TACCAATTTT-ATG-TTTTTTC-CTCCAAAA-CT--CAATA-A-CA-T-CCCACGT--AAGAATGT-C-AAA-CAACC-TGA-TTTATAATTA-GG-GGGCTATGTACTT-GC---AAATTATACCTGTT-TGC-AAAAGTCAATGACATTTATAT------CGGATCTGAGGAATTTTTTCCAATTTTTGGTGAT--TATTT-TCACCAATTTTATG---TTTTT--CCCCAAAAACTCAAAAA-CGC-C-C-CC-------AC-----GT-AGGAATGTTAAAC-AACCTGATTTATAATC-----AGGGGAACAT---TACCTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttggcaaaatccagagaagcacagcaatgtattgttcatttaggagttttccattcactatcctctgaactggaaaccactggggaaaatagtgagcgtgagtggacttttacacatgattattgagtctggaatatatgtacgatatgtcagaaaatgttataaacttcaaactttataaatgtacctaaccttgatatcaagcaacgtaatatacataagcgtttagttctttaagcaatgcatgcttgcaaaatgcccattatgttttctatttcaacaatcgtataatgacaattttatacatgtattttgtccaaaactcgaagacgtctccaaatatcaatgtcagacagtctgatttcaataaggataaaactgttcgtttcctttgattttacatacagaattaatgatacgttaagaaaataattattttcattggttcatatgatttatatattcatttccaataaatttgaaaagtaaaaatcatgttgtaacctaaaaattcataaacattcatacatatttattttcacacaactaaatatataaacaaggggttacacatatttacaaaagacttgtatgcaaataataaggacatcaatatcggtatgtgaaattttccccccaactttgagtgattattatttttacacatttcaagtttttgcccaaaaactcgaaaaggtctccatgcaaacaatcttatttataatcaaaggtacatacattcagaaaacaatgattttcatcagtaaatattatctattgagagttgaaggagatttccatttttcgattatttttagagaaaaaatcccgttttagccccaaaactcgtcgatgcccccaactatctatgccagacattggatggctacatatgttcacaaaatatttgtttgcaaaattcagtgatatctatatcggatctgaggagcttgtccaatttttggtgattatttttaccaattttatgttttttcctccaaaactcaataacatcccacgtaagaatgtcaaacaacctgatttataattagggggctatgtacttgcaaattatacctgtttgcaaaagtcaatgacatttatatcggatctgaggaattttttccaatttttggtgattattttcaccaattttatgtttttccccaaaaactcaaaaacgcccccacgtaggaatgttaaacaacctgatttataatcaggggaacattaccttt
gi|20 : ttttgattggatatcctgaaaaaaagttcaactaaaccaaccatacttcttgaggcaggatggttatctacaaccacacctaatggaggaacactttgttggattgttgattatatggttccaatcacctgccctattgcaagaaatgacactattcagcatgctattcagctagattaatatcacaagaagctgtcaaaatgtaactatccttgcatgtgattttgcagtggctannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAGA-C-AGTCT-GA-TTT--ACAA-T-----TAAAG---------------G-GTT-------CCAT----AC-----TA-A--TGGTACGTTAAGAA---------AAT----AATCATTTTCAA--A-AGTTCATA--------TGAT--TT--ACATA---G----G--AT-C--TG-A--AGAGG-T-T--CTCCA-TTTTT-CAt
gi|21 : ATATTCACAAAATACTTGTTTGCAAAT-GC-CA-G---TGGCA---TC-------AA-TAT---CGG-A--CCT--GAAA--GGCTTTT----C--------C-AATTTTCA-GCG-AT--TA----TTT-CA---CAA----ATTT-CAAG-TTTTTGCCCCA-AAA
gi|22 : GAA---------AAT----AATTGTTTTCAA--A--GTCCATA--------TA----TT--ATATAAACG----G--A--------A--AGAAC-T-TTCTTCCATTTTTT-CAGT-G-A--TT--TTT---T-AA-GTAAAAAATCATG--TTGTAGCCTC-AAACTT
gi|23 : --TATAT-TTACAAATATTATGAG-TATTTCCCCTCAAATATTCATAAA-AT--C-C-CT-------ATATTCTGT-A--AATGTTAAAC-AACCTCGTTTATAATC-----AAGAGACTAT-A-T-CTTTC
gi|24 : cAA---ACAA---CTAAATAT-ATATTCAAGGGGTTTCATATAGTTACAAATGACTTGTTTGCAAAT-GA-TA-A---TGACA---TT-------T--TAT---CGG-A--TCT--GAAA--AGGTTTT----T--------
gi|25 : tcTTTGTTTGGATGTACTGAAAAAAAAGCGTCGATCCAACTAAACC---AACCGTACC-TCTAA-GGACAGGATGATTATCTACAACAACACCTG-AT-GAAGAAGTAtttccaat
gi|26 : ----AATTGTTTTCAA--A-GGTCCATA--------TGAT--TT--AAATA---G----G--AT-C--TG-A--AAAAG-T-T--CTCTA-TTTTT-CAGT-G-ATTTT--TTT---A-AA-GT-AAAATGCATG--TGGTAGCATC-A
gi|28 : GAC-GA--TTT---ACTTATACCTCCATGC--TCGCAA-AAC-TCGAA--AACGTTC-CC-------AATTATCA--ATGTCAGA-C-AGTCT-GA-TT
gi|29 : AATTTGGC-AAAATACTG-AGAAATAC----AGC-GA-TGT------TCAC-TTAGGAATTTTCCATTCACTATCCTCTG-CA
gi|3 : ACAAAC-CACCTGCATCGAAGAAGTAATTTGCTCGAAATG--TTATAATTATT-CGGTTCCCAATCACCTGCCCTATTACCA-GAAATT-GGCACTG-TACAGCAGGTTATTC-AGC--------T-ATCAC-AAGAAGGGGTTTTGT-----TGTAACTATCCTTGCTTGTGATATTTTGCAG
gi|3 : caaTTGGC-AAAATACAG-AGAAATAC----AGC-GA-TGT------CCAT-TTAGGAGTTTTCGATTCACT-TCC-CTG-CACTGGAAACAGTTCGGGAAA---A---T---AATG--AGCGCGAG-T-GGACT-TTC-AC-AC-----GTTGA-T-TATTGA-GTCTGA--A----AT---ATAT-----GT-ACGAT----AT-ACTCAGGTATCAGA---TAATGTT---AT---------AAGCTCCA-AACTT-------------------A--G---CCTT---GATA-TCAAA-CAAAT-AATACACATAAG-TAT------GAGGTTGTTCTTT-CTTT--AAAGC----AAAAT-GCATGCTTG---CAAAATGTCCAT--A-T-AT--GA-CTGT-----TGAAA----A------TT-TTCT-CTA-----T---TTCAA-C-AGT-A-CTGT-AT-AATGAC-AATTTTTCATACATGTATTT---TGT--CC-CAA-AAC-TCGAA--GATGTCC-CC-------AAATATTA--ATGTCAGA-C-AGTCT-GA-TTT--ACAA-T-----TAAAG---------------G-GTT-------ACAT----AC-----TA-T--TGATAATTTAAGAA---------AAT----AATTG-TTTCAG--A-GGTCAATA--------TGAT--TT--GAATA---A----G--AT-C--TG-A--AGAAG-T-T--CTCCA-TTTTT-CAGT-G-T--TT--TTT---T-AA-GT-AAAAATCATG--TTGTAGCCTC-AAACCTTATAAAC-ATATACATACA--T------------ACAAATACAGGTTT------------TTATGCC-AA---ACAA---CTAGATAT-ATAATCAAGGGGTTACATAAATT-ACAAAAGACTTGCTTGCAAAT-AA-TA-A---TGACA---TCTACCAGGTA-TAT---TGG-A--TCT--G-AA--AAGTTTT----C--------C-AATTTTCA-GCT-AT--TATTATTTT-CA---CAA----ATTT-CTAG-TTTTTGCCCCA-AAACTC----GAAAAGG-TCTCCGGGTAA-ACATTG-TAACC-TTA--------------------TTAT----AA--ACAAAGG-GTTAC--T-AATTT-CAGA--AA---ACATTTA--TTTT--CATCAGTC-AA--T-ATTA--TC-TATAGAGAGTA-TGAATAAGTT-----TT--CCA--TTTTTCGATT-AT-TTATTA-----AGAA---A--AAAT-C-CTGTTTTAGTCCA-----AAGA-----------CTCGTC--AATG--T---TATAA-TATC-TATGTTAAACAAACT--------------TGATA--TATC--A--TT-----GAAT--G---GTTA-CA-TAC-GTT----CAC-AAA------TACTTGTTTGC------AAAAGTCAACGACA--TTTATAT-CGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntataattggcaaaatacagagaaatacagcgatgtccatttaggagttttcgattcacttccctgcactggaaacagttcgggaaaataatgagcgcgagtggactttcacacgttgattattgagtctgaaatatatgtacgatatactcaggtatcagataatgttataagctccaaacttagccttgatatcaaacaaataatacacataagtatgaggttgttctttctttaaagcaaaatgcatgcttgcaaaatgtccatatatgactgttgaaaattttctctatttcaacagtactgtataatgacaatttttcatacatgtattttgtcccaaaactcgaagatgtccccaaatattaatgtcagacagtctgatttacaattaaagggttacatactattgataatttaagaaaataattgtttcagaggtcaatatgatttgaataagatctgaagaagttctccatttttcagtgtttttttaagtaaaaatcatgttgtagcctcaaaccttataaacatatacatacatacaaatacaggtttttatgccaaacaactagatatataatcaaggggttacataaattacaaaagacttgcttgcaaataataatgacatctaccaggtatattggatctgaaaagttttccaattttcagctattattattttcacaaatttctagtttttgccccaaaactcgaaaaggtctccgggtaaacattgtaaccttattataaacaaagggttactaatttcagaaaacatttattttcatcagtcaatattatctatagagagtatgaataagttttccatttttcgattatttattaagaaaaaatcctgttttagtccaaagactcgtcaatgttataatatctatgttaaacaaacttgatatatcattgaatggttacatacgttcacaaatacttgtttgcaaaagtcaacgacatttatatcg
gi|30 : caaacaaaccacctgcatcgaagaagtaatttgctcgaaatgttataattattcggttcccaatcacctgccctattaccagaaattggcactgtacagcaggttattcagctatcacaagaaggggttttgttgtaactatccttgcttgtgatattttgcagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntataaT-----GAAT--G---GTTA-CA-TAC-GTT----CACAAAATACCGGTACTTGTTTGC------AAAAGTCAAAGACA--TTTATA
gi|31 : ACCAAGGGGTTACATAAATTTACGAAAGACTTGCTTGCAAAT-AA-TA-A---TGACA---T
gi|32 : AA---A---T---AATG--AGCGCGAG-T-GGACT-TTC-AC-AC-----AT-CA-T-TATTGA-ATCTGG--A----AT---ATAt
gi|33 : TGAAGAGTC-TGAAAGAGTT-----TT--CCA--TTATTCA-----------AA-----AAAA---A--AAAT-C-
gi|34 : gCTT-CATATA-TGT---AC-CTA--G---CCTT---GATA-TCAAG-CAACTTGATATAa
gi|35 : TCCCTAGGG-GG-T-CCCCC-TTACCTT-AC-TGGCCCATGG
gi|4 : TGGC-AAAATTCATTAGAAACACTAACAGCTGA-TGT--------AA-TTG-----TTTCGTTTTAGGAGCCTCTG-CA------GCACTT-GT--AA---A---TCGCAATGG-AGCGCGAG-TCGAACTGTTCTACCAT-----GT-GA-T-TATT------------------------C-----GT-A-GAT----AT-G--------TAAGA---AAATGTT---AT---------AAACTCCA-AACTT-CATATA-TGT---AC-CTA--G---CCTT---GATA-TCAAA-CAACTTGA--------------------G--GAT--TAGTT-CTTT--AAAGC----AAAAT-GCATGCTTG---CAAAATGCCCAT--AAT-AT--GA-CTGT-----TGGAAA---T------TT-TTCT-CTA-----T---TTCAA-C-AAT-A-CTGT-AC-AAT----------------ATGTATTT---TGC--CC-CAA-AAC-TCGAA--GACGT-T-CCCATGC--AAATATCA--ATGCCAGA-C-AGTCT-GA-TTT--ACAA-T-----TAAAG---------------G-GTT-------ACAC----AC-----TA-A--TGATACGTTAAGAA---------AAT----TATCATTTTCAA--A-GGTTTAT---------CGAT--TT--ATATA---A----G--AT-A--TG-A--AGAGG-T-T--CTCCA-TTTTT-CAGT-G-A--TT--ATT---A-AAAGT-AAAAATCATG--TCGTAGCCTC-CAAACTCATATAC-AT-T-CATACA--T------------A------------T------------TTATGTCAAA----CAA---CTAAATAT-ATAATCAAGGGGTTACATA----------AGACTTGTTTGCAAAT-GA-TA-A---TGACA---TC-------TA-CAT---CGG-A--TCT--GAAA--AAGTTTT----T--------CCAAATTTCG-GCG-AT--TATTATTTT-CA---CAA----ATTT---------TTGCCCCA-AAACTC----AGATAGA-TTTCTATGCAA-ACAATT-TTA---TTTATAATCAAAGGGTCACATATTTATTTAAAA--TCAAAGG-GTCACA-T-ATTTT-CAGA--AA---ACAATT--CTTTT--CATCCGTC-AA--T-ATTA--TC-TATGGAAAGCT--GAAGGAGTT-----TT--CCA--TTTTTCGATT-AT-TTTTAA-----AGAA---A--AAAT-C-CTGTTTTAGACCC-----AAAA-----------TTTGTC--AATG--TCCCCA-AA-TATCT-ATAACTGAC-AACT--------------TGATA--TAT---AA-TT-----GAATATG---TTTA-CA-TAC-GTT----CACAAAA------TACTTGTTTGC------AAAAGTCAATGACA--TTTATAT-CGG---ATCTGAGGAGTTTTTCCAATTTTCGGTGATTATTGT--CACCGA-TTTCATGTTTTTTTTGCCCCAAAA-CT--AAAAA-A-CGCC-CCCACGT--AGGAATGT-C-AAA-CAACC-TGA-TTTATAATCG-AG-TGACTATGTACTT-TA---AAATTATACTTGTT-TGC-AAAAGTC--TGACATTTATAT------CGGATCTGAGGGT-TTTTTCCAATTTTCGGTGAT--TATTG-TCACCGATTTCATGTT-TTTTTTGCCCC-AAAACTAAAAAA-CGC-C-C-CC-------AT-----GT-AGGAATGTCAAAC-AACCTGATTTATAATCAATTTAAGGGACTAT-A-TACTTTCAAAtct
gi|5 : aCTCTG-CACTGTAAACCACT-GGAGGAGAGA---T---AATGG-AGCGCGAG-T-GGACT-TTC-AC-AT-----GC-GAGTGTGTTGA-GTCTGCTTA----ATCTAATAA-----GTTACGATTTGCATTG--------TCAAAGATAAATGTTGAAATGACACAGAGAAACTCCATCAGGT-CACTAC-TGTTCAACACTA--AGCACCTTAAGGATAGTCAAAGCAACT--------ATGAG-GAT------A--GTA---ATTT-CTTTCAAAAGCGAGAAAAAT-GCACCATTAACACAATATGCCCATTAA-T-ATTGGATCTGTCA---TGCAAATAAT------TTATTCTACTA-----TATATCTAATC-AATTA-CTGTTAC-AATAGC-------TCTTAAGTATA-------GC--CCACAA-AACGTCGAA--GACGT-C-CCCATGCAGAGATATCACAATGCCAGAAC-GGTCT-GA-CTTGTACAAAT-----TAAAGTG-------------A-GTTACTGGAAGCAT----CT-----TACA--TGATCATCTAAGAATCTCTATAAGATGAG-AATTGTCT-CAATTATGGTCAATAGTTTTTCATCAT--TT--TCATA---GAAGAG--AC-CCATGTATCAGAGG-TGT--CTCCA-TTTT--CAGT-GTA--TT--ATT---A-AAAGT-AACAATC-TG--TCGTAGCCTCCAAATTTCATAAACAGT-T-CATACA--T------------A------------T------------TTATTTCAAAGTGAAAATTCTTAAGTATGATAATCAAGGTGTTA-AT----------AAGACTTGTTGGCAAAT-GA--A-A---TGACA---TC-------TACCAT---C-G-A--TCT--GAAAACAAGTTTT----T--------C-CAAATTCG-CCGAATAGTATTATTTT-CAG--CAA----ATTT-CAAG-TTTTTGCCCCAGAAAATCAGAGAAAAAGGTTCTCCGTGCAA-ACAATA-TTT---TTTTACTCCA-------------TTAT----AAATTCAAAGG-GTCACAGTGATTTT-CAGA--AA---ACAATTT-CTTTTTGCATCAGCT-AAATT-ATTA--TC-TATGAAGAGTTCTGAAGGAATT-----TTTACCATTTTTTTCGATTAATATTGTGAAAGACAGAA---A--AAAT-CACTATTCTCACCCCTCTATAAAAAGATAAATTTCTTTTTC--AAAGGTTCCCCA-AATTATCTTATGTCAGAC-AACT--------------Tt
gi|6 : atttggcaacattatcagtacgacataacaccagcatcgcatattgtgtcggtttaggaagcaCAAA---ACAA---CTAA-TAT-ATAATCAAGGG-TTA-ATAAAT--ACAAAAGACTTGCTTGCAAAT--A-CACA---TGGC----TC-------TA-TAT---CGG-A--TCTT-GAAA--AAGTTTTCT--T--------C-AATTTTCA-ACA-----TAT-ATTTT-CA---CAA----ATATACTAG-TTTT-GCCCCA-AAACCT----CGAAAGT-TCTCCGGGTAAGACA--C-TTAACCTA---------------------TTAT----AA--TCAAAGG-GTTA-A-T-ACTTTTCAGA--AA---ACATTTA-TTTTT--CATCAGTC-AA--TTATTA--TC--ATAGAGATAT--GAAGGAGTTGTTTTTT--CCA--TTTT-CGATT-AT-TTATAA-----AGAA---A--AAATTC-CTGTTTAA--TCC-----AAAA-----------CTCA-C--AATG--TTCTCA-AA--ATCTCATGTAAAAC-AACTTATATATCATTGAATGGTA--TAT---ACGTTCACCAAAAT--ACTTGTTC-CAATGC-ATTATATCGNNNNN------NNNNNNNNNNN------NNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN-NNN---NTCTGAGGAGTTTTCC-AATTTTCG-TGATTATTTT--CACCAATTT--ATG-TTTTT--GCCCCAAAAACTCAAAAAA-A-CGCCGTTCACGT--AGGAATGT-C-AAAACAACC-TGA-TT-ATAAGCA-AG-G-ACTATGTACTCGTC---AAATAAC-CTTGTA-TCC-AAAAGTCCATAACATCTTTAT------CGGATTTGAGGAG-TTTTT-CAATTTT-GGCGAT--TATTT-TCACCAATTTCATG---TTTTTTGCCCCAGAAACTCAAAAA-CAACC-C-CC-------AC-----GT-AGGAA-GTCAAACAAACCCGATTTATAATC-----AAGGGACTAT-G-TACTTTCAAATTATACTTGTTTGCAATAGTCATAAGACA---TCTATAT--T-GGA--T-TGA-GAGTTTTG-------CCTA-TT-CA-GC-GATT-A-TTTTCAC-A--ATT-TC-A-----ATTAATTTCAAG--TTTT--------TTGCC-CCAAAAACC-TCAAAAAACGCC-CC-CACGTA-ACGAA-T-T--CAAAGGCAACCTGA-TT-----TTTAA-------TCAA--GA-CT-AT-T-----AGTTTCAAAAAATT-----ACTTGTTT---GCAAAAAT-CCTGAGG-GGGT-CCCCCATTACCTTTAC-TGGCCCATGGtg
gi|7 : tgA--ATGTCATA-T-AGTCT-GA-TTT--ACAA-T-----TAAAG---------------A-GCT-------tc
gi|7 : attaagaatttgatctcatagaccatgggccagtaatGCTTTGAA--A-GGTCTATA--------TGAT--TT--ATATA---G----A--AT-C--TG-A--AC----T-T--TTTTA-TTTTT-TGGT-G-A--TC--TTTTTAA-AA-GT-AAAA-TCATG--TTGTAGCCCG-AAATCTCGTAATT-GT-T-CACACA--T------------A------------TCATAGTATAAATTTATGTCAAA---TAAA---TTAA-TAT-ATGATTAAAGGCTTGCATATATTCACAAAATACTTGTTTCCAAAT-GT-CA-G---TGACA---TC-------TG-TAT---CGG-A--TGT---AAA--ATGTTTT----T--------CTACTTTTTG-GCG-AT--TATT---TT-CA---CAATTAAATTT-CAAA-TTCTTACCCCA-AAACCC----AGAAAGG-TCTCCATGCAA-ACAATA-TAA---TT---------------------T-AT----AA--TCAAAGG-GTTGAA-T-AGTTT-CAGA--AA---ATATT---TTTTT--CAT-------------TT---TC-CAT-----------------TT-----TT--CGA--T-----GAT-----TTCTAA-----AGAAAATA--AAAT-C-ATGTTTTAGCCCC-----AAAA-----------CTCGAA--AATG--TCCCAA-AA-TA-CTTATGTCAAAC-AACT--------------TGATA--TATA--A--TT-----TAAT--T---GTTA-CA-TAC-GTT----CACAAAA------TACTTGTTTAC------AAAAGTCAATGACA--TCTATAT-CGG---ATCTGAGGAGTTTTCCCAATTTTCGGTGACTATTTC--CACCAA-TTTCATG-TTTTTttgaaaggtctatatgatttatatagaatctgaacttttttattttttggtgatctttttaaaagtaaaatcatgttgtagcccgaaatctcgtaattgttcacacatatcatagtataaatttatgtcaaataaattaatatatgattaaaggcttgcatatattcacaaaatacttgtttccaaatgtcagtgacatctgtatcggatgtaaaatgtttttctactttttggcgattattttcacaattaaatttcaaattcttaccccaaaacccagaaaggtctccatgcaaacaatataatttataatcaaagggttgaatagtttcagaaaatatttttttcattttccatttttcgatgatttctaaagaaaataaaatcatgttttagccccaaaactcgaaaatgtcccaaaatacttatgtcaaacaacttgatatataatttaattgttacatacgttcacaaaatacttgtttacaaaagtcaatgacatctatatcggatctgaggagttttcccaattttcggtgactatttccaccaatttcatgtttttg
gi|8 : attaagaatttgatctcatagaccatgggccagtaataatgtcatatagtctgatttacaattaaagaATATTCACAAAATAC-TGTTTGCAAATCGG-TC-A---TGACA---AC-------TA-CAT---CGG-A--TCTACGAAA--A------------------------TGTCG-GCG-GA--TAT--TTTG-CAGTTCAA-------T-TAAGATTGGTGCCCCA-AAA-TC----AAAACAG-TATCCATGC-A-ACAATA-TGA----T---------------------TTAT----AA--TCAAAGGAGTTAAA-T-ACTTT-CAGA--AA---GTATTTGTTTTTT--CAAAAGTTGAA--T-ATTGGTTCTTGTGAAGAGTC-TGGAAGAGTT-----TT--CC----------ATT-AT-TTCAAA-----AAAA---A--AAAT-C-ACGATTTAGTCCA-----AAAA-----------CTCGAA--AATG--TTC-----------------CAAAC-AACT--------------TGATA--TAT---A--TT-----TAAT------GTTAGCA-TAC-GTT----CACAAAA------TA-TTCTTTGCAAAAATAAAAGTCAATGACATCTTTAT-T-CGGCATGTCTGAGGAGTTTT-----TTCTCAATGATTATTTTCACACCAA-TGTCATG--TTTTTTGCCCCAAAC-TT----GGA-A-CG---CCCAGGT--A-GAATGT-CAAAA-CAGGC-TGACTTTATAAATGCAGTGGACTATTGACTG-TCGAAAAAGTATACTT-TT-T-C-AAGAGCCg
gi|9 : ATGTTAAA--AACT--------------TGATAATCAT---A--G------GAAT--G---GTTA-CA-TAT--TT----CACAAAA------TACTTGTTTGC------AAAGTTCAATGACA--TTTATATCCGG---ATttcaggagtctccctt
gi|9 : GGATCTGAAGAG-GTAT-CCAATTTCGAGTG-T--TATTT-TCACAGATTTTATG---TTGTTTTCCC--AAAACCCAAAAAACG--CTC-CC-------AC-----GTTAGGAATGTCAACA-AACCTGATT-ATAATC-----AAGGGACTATTG-TACTTTCAATATATACTTGTTTGCAATAGCCA-ATGA-A---TCTATAT---CGGA--TCTGATGAGTTTTT-------CCAATTTTCA-GCCGATT-ATTATTCACCAA-ATT-TCCA-----GT------------TTTT--------TTGCC-CCAAAA--C-TC--AAAACGCC-CCACACGTAGG-GAA-TGT--C-AA--CAACCTGA-TC-----TTTAA-------TCAA-GGGACTACTGT-----AGTTTC--AAAAAT-----ACTTG-TT---GCAAAAAT--CTAGGG-GGGTCCCCCCATTACCTTTAC-TGGCacgaaaacgtcgatcaatctcgtaagtccaaattagggatctgaagaggtatccaatttcgagtgttattttcacagattttatgttgttttcccaaaacccaaaaaacgctcccacgttaggaatgtcaacaaacctgattataatcaagggactattgtactttcaatatatacttgtttgcaatagccaatgaatctatatcggatctgatgagtttttccaattttcagccgattattattcaccaaatttccagtttttttgccccaaaactcaaaacgccccacacgtagggaatgtcaacaacctgatctttaatcaagggactactgtagtttcaaaaatacttgttgcaaaaatctaggggggtccccccattacctttactggcatagtctagggattcaatt
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|27 ): AANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACAGGTATT