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gi|13 : AAAATCTTGAAAATTAAC-CGG-A------------------CCTA-AA-AA-TAAGCCTCCA-------ATTTCCTGC----ACCA-----------CAAT-TT-----TTTT-----G-A-AAATAAGCCCTATTT------GA-AA-GTT---AG-C-C-G---T-T-ATAGTCAGATATTCAG-CA-TT-------TG-AAGA--------T-------TT-------T-AT-------AA-CC-AA-ATACATGT-ATTT-----AATG-CAAA--------------------------------C--AT--GT-------TTT-GAT----ATC--ATACA---TAT-------TAATT-ATAT-T-AG----A--A---------------TTTT------A-GATTT-----------------TTT--------AA-TA-AT---TTAT--CAT-------TCAAAACATTTAAAA---A--TACT--G-GA-T--AT-T--TA--T-AAATAT--A---ATCCG--TTTAG---CCG--CT-AACAA-CAGAC-T---A-CCA-T-ATT--TTTGTTTTGATAAT-AAAACGG----CATT-TGAAAATAAGCCGGTTTTGAAAATAAGC-CC-CTACTTTCTT-A---CA--A--AA-A-CTT-A-AAATAA-GCTG-CGG-CTTA--TTTTCAA
gi|14 : cctT-----G-T-AAAGAAGGCTTATTTTCATGTGATAA-GTT---A--C-T-A---TATATTGATATGATATTCAAACA-TT-------TCCAAGA--------T-------TTATTGTTTT-AT-------AA-CC-AA-A------T-ATTT-----AATG-CCAA-A--T-TT-CA-T--TTTC--A--A---T---C--ATTGGT-------TTTTGATATC-ATT--ACACG---T-T-------TAATT-ATAT-TGAA----A--A---------------ATTT------A-GACATAA--GAT------A--ATCC-A-TG-CAAAGCA-ACCGACTGC--CATATTTTTGTTATGATA-AT-AAG---A--T-------GA-C--AT-T--TA--A-AANNNN--N---NNNNN--NNNNN---NNN--NN-NNNNN-NNNNN-N---N-NNN-N-NNN--NNNNNNNNNNNNNN-NAGCCGGT---CA---TGAAAATAAGC----CTT---------------CATTTTCCT-A---CC--A--AA-A-CTT-A-AAATAA-GCCG-TAG-CTTA--TTTTCAAGaat
gi|15 : aaAAACA--T-TT-CA-TCGT--C--A--AATTC-T-C--AT--ATATATTTATTT-AGCA---AT-----AC----TAA-------TAATT-ATAT-T-GA----A--A---------------TTTT------A-GACATAA--G------------------------A-TA-AT---C-----CAT-------GCAAGTAATTT-A----------TT--G-CA-C--TT-T--GT--A-TAGC---------TCTG--ATT-----------T-GACGA-CCAAC-T---A-CCA-T-ATT--TTTGTTACGATAAT-AAGACGA----CATT-TGAAAATAAGCCGGTCTTGAAAATAAGC-CC-CTATTTCCCT-A---CC--A--AA-A-CTT-A-AAATAA-GCCG-CGG-CGTA--TTTTCAAGatttt
gi|15 : aaatttatttacattagaaattccttttcttttagcatgaccatttcaatgttatgaaaaaaaaCCT-A-------A--AA-T-CTTGA-AAATAC-GCCG-CGG-CTTA--TTTT-AAGattttaggtgttccattatcactttcata
gi|16 : aaatttatttacattagaaattccttttcttttagcatgaccatttcaatgttatgaaaaaaaaaaacatttcatcgtcaaattctcatatatatttatttagcaatactaataattatattgaaattttagacataagataatccatgcaagtaatttattgcactttgtatagctctgatttgacgaccaactaccatatttttgttacgataataagacgacatttgaaaataagccggtcttgaaaataagcccctatttccctaccaaaaTT------GA-AA-GTT---AG-C-C-G---T-T-TTAATAAGATATTAAG-CA-CT-------TC-AAGA--------T-------TT-------T-AT-------AA-CC-AC-A------T-ATTT-----AATG-CAAACA--T-TTCCA-T--T--CCAA--G---T-A-C--AT--GT-------TTT-GAT----ATCCAACACA---TAT-------GAATA-ATAT-T-AA----A--A---------------TTTT------A-GACATAC--AAT------AT-ATCC-A-AG-CAAA-TA-AT---TTAT--CAT-------TCAAAA---TT-AAA---A--TACT----GA-T--AT-T--TTA-A-AAACAT------ATCCGCCCTTAA---CCG--C--AACAA-CCGAC-T---ACCCA-T-ATT--TCTGTTTT--TAAT-AA----------ATA-TGA--------CGGCTTTGAAAATAAGC-CC-CTATTTTCCT-A---CC--A--AA-A-CTT-A-AAATAA-GACGCCGG-TTTA--TTTTtgttccattatcactttcata
gi|17 : AAATCTTGAAAATTAGC-CGG-AATTGATAATAA-GCTGGTCTTG-AA-AA-TAAGCCTCCA-------ATTTCCTGT----ACCA-----------CAGA-AT-----TTTT-----G-A-AAATAGGCCCTATTT------GA-AA-GCT---AG-C-T-G---T-T-TTAATAAGATATACCA-CA-TT-------TG-ACGATTTTATTGT-------TT-------T-AT-------AA-CC-AT-A------T-ATTT-----AATG-CAAACA--T-----------------------T-T-C--AT--GT-------TTT-GAT----ATC--ACACA---TGT-------TAATC-ATAT-T-AA----A--A---------------TTTT------A-GACAGGA--GAT------A--ATCC-A-TG-CAAA-----------AT--CGC-------T---AACA--------------ACC--G-AC-T--AC-T--ATGCA-AAAC------------------------CA--TT-AACAA-CCAAC-T---A-CCA-T-ATT--TTTGTTTTG
gi|18 : -ATTT-----AATG-CAAACA--T-TT-CA-T--T--C--A--A---T-A-C--GT--GT-------TTT-AATA----TC--ACACA---TAT-------TAATT-ATAT-C-AA----A--A---------------TTTT------A-GACATAA--TAT------A--ATCC-A-AG-CAAA-TA-AT---TTAT--CAT-------TCAAAACATTT-AAA---A--TACT--G-GA-C--AT-TTCTT--AGAAACAA--AT--ATCAGC-TTTAG---CAGGAAT-AACCA-CGGACTT---A-CCA-TCATG--TAT-TTTGGATAAT-AAGACGG----TATT-TTGAAATAAG-CGGCTTAGAAAAT-AGC-CT-CTATTTTCCT-AATCCT--A--AC-A-ATT-A-AAATAAGGCCG-AGGAATTAATTTTTC
gi|19 : GTAAGATATTCAA-TA-TC-------TG-AAGA--------TGTTATGGTT-------T-AT-------AA-AC-AA-A------T-A-------------CAAACA--T-TC-CA-T--T--C--A--A---T-T-C--AT--GT-------TTT-GATA----TC--ACACA---TAT-------CAACC-ATAT-C-AACTATATTACTT------------TTTT------T-TACATAA--GAT------A--ATCT-A-TG-TAAA-TA-AT---TTAT--CAG-------TCGAAACATTT-AAA---A--TACT--G-GA-T--AT-T--TT--A-TAATGT--A---ATCCG--TTTAgcaatttt
gi|2 : attcccttaatataatctgtaatcttgacaatttgcccAAAATCTTGAAAATTAGC-CGG-ATTTGATAATAA-GCCAGTCTTG-AA-AA-TAAGCCTCCA-------ATTTTCTGC----ACCA-----------CAGA-AT-----TTTT-----G-A-AAATAAGCTCTATTT------GA-AA-GTT---AG-C----------------------------CA-TT-------T-----------------------T-------T-GT-------AA-CC-AA-A------T-ATTT-----AATG-CAAACA--T-TT-CA-T--T--C--A--A---T-A-C--AT--GT-------CTT-GATA----TC--ACACG---TAT-------TAATT-ATAT-T-AA----A--A---------------TTTT------A-AAAATAA--TAT------A--ATCC-A-AG-CAAA-TG-AT---TTAT--CAT-------TCAAAACATTT-AAA---A--TACT--G-GA-T--AT-T--TT--A-AA-CAT--A----TCCC--TTTAG---CCG--CT-AACAA-CCGAC-T---A-CCA-T-ATT--TTTGATTTGATAAT-AAGACGG----CATT-TGAAAATAAGCCAGTCTTGAAAGTAAGC-CC-CTATTTTCCT-A---CC--A--AA-A-CTT-A-AAATAA-GCCA-CAG-CTTA--TTTTCAAGcggtcgaggtttgtaacaaca
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gi|20 : taaaatcttgaaaattagccggatttgataataagccagtcttgaaaataagcctccaattttctgcaccacagaatttttgaaaataagctctatttgaaagttagccatttttgtaaccaaatatttaatgcaaacatttcattcaatacatgtcttgatatcacacgtattaattatattaaaattttaaaaataatataatccaagcaaatgatttatcattcaaaacatttaaaatactggatattttaaacatatccctttagccgctaacaaccgactaccatatttttgatttgataataagacggcatttgaaaataagccagtcttgaaagtaagcccctattttcctaccaaaa------T-ATCA-----AATC-CAAACAAATATT-CA-T--T--T--ATAA---T-T-CCAAT--CG-------TTT-GACACCCACT--ACACACTATATGAAGCTATAAAT-ACATAT-AAC---AT-A---------------TTTC------A-AACATAA--GATCAGACAA--ATCCCA-AG-CAAA-TA-------TAT--AATAAAT---CCAAAACATTT-GAA---A--TACTCAG-GA-TAAATAT--TT--A-AAA-AC--A---ACCCG--TGTGGTCCCTG--CTCAACAAGAGGAC-TATAA-CCA-T-ATT--TCTtgtgactattttggacccgccctagcgtcagaatcctgagtagtgaaattcataattttggtttatccctg
gi|22 : T--CAT--------CAAAACATTT-AAA---A--TACT--G-GA-T--AT-T--TT--A-AAACAT--ATGGA-CCG--TG-AG---CCG--AT-AACAG-CCGAC-T---A-CCA-T-ACT--TTTGTTTTGATAAT-AAGATG
gi|23 : -CA-TT-------TG-AAGA--------T-------TT-------T-AT-------AA-CC-AA-A------T-ATTT-----TATG-CAAACAT-T-TT-CA-T--T--C--A--A---T-T-C--AT--GC-------TTT-GA-A---ATC--ACATA---TAT-------TAATT-ACAT-T-AA----A--A---------------TTTT------A-GACATAagagag
gi|24 : aTTGAAAATAA-GCCTGTCTTG-AA-AA-TAAACCTCCA-------ATTTCCTGT----ACCT-----------CAGA----------TTAAAAAA-A-AAATAAGCCTTATTT------GA-AA-GTT---AG-C-C-
gi|25 : cctaaaatcAGACGGTCTTGAATAAAAGC-CC-CTATTTTTTT-A---CC--A--AC-A-CTT-T-AAAGAA-GCCG-CGA-CTTA--TTTTCAAG
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gi|26 : agacggtcttgaataaaagcccctatttttttaccaacactttAAATAAGCCGGTCTTGAAAATAAAC-CC-CTTTTCTCCT-A---CC--A--AA-A-Ctactttag
gi|26 : AATAA-GCCGGTCTTG-AA-AA-TAAACCCCTT-------TTCTCCTAC-------------------CAAA-ACCCTTATTTT-----C-A-AAATccttattttcaaaattttagggtattcgcttacttcgata
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gi|28 : ---CC--A--AA-T-CTT-A-AAAAAA-GCCG-TGG-CTTA---TTTCAAGatttgggggtacttattcattca
gi|3 : aaataagcccctattttcctaacaaaaAAAATCTTGAAAATCAGCGCGG-ATTCGATAATGA-GCCGGTCTTG-AA-AA-TAAGCCTCCA-------ATTTCCTGC----ACCA-----------CAGA-AT-----TTTT-----TTA-AAATAAGCCATATT-------AA-AA-GTT---AG-C-C-GA--T-T-TTAGTAAGATATTCAG--A-TT-------TC-AAGA--------T-------TT-------TTAT-------AA-CC-AACA------T-ATTTCGCCTAATG-CAAACA--T-TT-CA-T--T--C--A--G---T-A-C--AT--GT-------TTT-GATA----TC--ACACA---TAT-------TAATT-ATAT-T-AA----A--A---------------TTTT------A-GACATAA--TAA------A--ATCC-A-AG-CAAA-TC-AT---TTAT--CAT-------TCAAAACATTT-AAA---A--TACT--G-GA-T--AT-T--TT--A-AAACAT------ATCCG--TTTAG---CCG--CT-AACAA-CAGAC-T---T-CCA-T-ATT--TTTGTTTTGATAAT-AAGACAGT---CTTT-TAAAAATAAGCCGGTCTTGAAAATAAGCAAC-TTATTTTCCT-A---CC--A--AA-A-CTT-A-GAATTA-GCTG-CGG-CTTA--TTTTCAAGgggtacttattcattca
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Reference ( family-3230 ) : AAAATCTTGAAAATTAGC-CGG-ATTTGATAATAA-GCCGGTCTTG-AA-AA-TAAGCCTCCA-------ATTTCCTGC----ACCG-----------CAGA-AT-----TTTT-----G-A-AAATAAGCCCTATTT------GA-AA-GTT---AG-C-C-G---T-T-TTAGTAAGATATTCAG-CA-TT-------TG-AAGA--------T-------TT-------T-AT-------AA-CC-AA-A------T-ATTT-----AATG-CAAACA--T-TT-CA-T--T--C--A--A---T-T-C--AT--GT-------TTT-GATA---ATC--ACACA---TAT-------TAATT-ATAT-T-AA----A--A---------------TTTT------A-GACATAA--GAT------A--ATCC-A-NG-CAAA-TA-AT---TTAT--CAT-------TCAAAACATTT-AAA---A--TACT--G-GA-T--AT-T--TT--A-AAACAT--A---ATCCG--TTTAG---CCG--CT-AACAA-CCGAC-T---A-CCA-T-ATT--TTTGTTTTGATAAT-AAGACGG----CATT-TGAAAATAAGCCGGTCTTGAAAATAAGC-CC-CTATTTTCCT-A---CC--A--AA-A-CTT-A-AAATAA-GCCG-CGG-CTTA--TTTTCAAG
gi|1 : AAAATCTTGACAATTAGC-CGT-ATTTGATAATAA--CCGATCTTC-AA-AA-TAAGC-TCCA-------ATT-CCGCC----ACCG-----------CAAACGT-----ATTT-----G-A-AAATAGCCCCTATT-------GA-AA-TTTTAAAG-C-C-A---T-T-TTAGTAAGATATTCAA-CA-TT-------TG-ACA-----------------TT-------T-A--------AA-C---A-A------T-ATCC-----AATG-CAAACA--TATT-CA-T--T--C--A--A---T-T-C--AT--GT-------TT--GA-----ATC--ACACA---TCT---------ATTGAAAT-T-AA----T--A---------------TTTT------A-AACACAA--GAT------A--ATCC-A-TG-CAAA-TA-AT---GTAT--CAT-------TCAAAACATTT-AAG---A--TACT--G-GA-T--AT-T--TT--A-AAACAT--A---ATCCG--TTTAG---CCG--CT-AGCAA-CCGAC-T---A-CCA-T-ATT--TTTGTTTTGATAAT-AAGACGG----AATT-TGAAAATAAACCAGTCTTGATAATAAAC-CC-CTATTTT-CT-A---CC--A--AA-A-CTT-T-GAATAA-GCTG-CGG-TTTA--TTTTCAAG
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gi|16 : aaatttatttacattagaaattccttttcttttagcatgaccatttcaatgttatgaaaaaaaaaaacatttcatcgtcaaattctcatatatatttatttagcaatactaataattatattgaaattttagacataagataatccatgcaagtaatttattgcactttgtatagctctgatttgacgaccaactaccatatttttgttacgataataagacgacatttgaaaataagccggtcttgaaaataagcccctatttccctaccaaaaTT------GA-AA-GTT---AG-C-C-G---T-T-TTAATAAGATATTAAG-CA-CT-------TC-AAGA--------T-------TT-------T-AT-------AA-CC-AC-A------T-ATTT-----AATG-CAAACA--T-TTCCA-T--T--CCAA--G---T-A-C--AT--GT-------TTT-GAT----ATCCAACACA---TAT-------GAATA-ATAT-T-AA----A--A---------------TTTT------A-GACATAC--AAT------AT-ATCC-A-AG-CAAA-TA-AT---TTAT--CAT-------TCAAAA---TT-AAA---A--TACT----GA-T--AT-T--TTA-A-AAACAT------ATCCGCCCTTAA---CCG--C--AACAA-CCGAC-T---ACCCA-T-ATT--TCTGTTTT--TAAT-AA----------ATA-TGA--------CGGCTTTGAAAATAAGC-CC-CTATTTTCCT-A---CC--A--AA-A-CTT-A-AAATAA-GACGCCGG-TTTA--TTTTtgttccattatcactttcata
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gi|26 : agacggtcttgaataaaagcccctatttttttaccaacactttAAATAAGCCGGTCTTGAAAATAAAC-CC-CTTTTCTCCT-A---CC--A--AA-A-Ctactttag
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gi|28 : ---CC--A--AA-T-CTT-A-AAAAAA-GCCG-TGG-CTTA---TTTCAAGatttgggggtacttattcattca
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