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lowQualScore : . .. . . . .. . . .. . . . . . . . ..................... .. .... . ............... . .. . . . . .... ... . ......................... .. ...... ...... . . ... . . ........ .. . ......... . .... . . ........................... ... ... ... . .. .. ......... . . . .
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Reference ( gi|5 ) : GTTGTCGAGATTACGATCAATACAGATTA-CAGCATAATGAAATATTTA-ATTG--TGAATGCTATATGAAAGAAAACCCAATATT--GGA-AATTGTTAACCC-CTAGAATATAAGAATTGCTCGGAAATGAAT-GTA--TTT-TTAATGGAGTGTTTT---TAATACCA-GA-CA--G-AAAC----CTCCAAAATATTAA-TGTA--TAAA-CTAATGTACGATTACCA----TG--TGTATGTGTG-TACATAATATAT-TAT-ATATAT--TATGTATAGAT--AT-T---CATAC------TTGTGTATATGT---TACTCCAACCCAACAAAAATGAACATACATGTGGAG-AG-TATTTAATT-------T-AATTT-GATACC-C--TGT-GTT------GT---------T---------A--CTGTG---TTT---ATGACTACA-TG--CC--AATGT---ATG-AATGGT-G-C-TGTCAATAAA-TAAA
gi|4 : GTTGTCGAGATTACGATCAATATAGATTA-CAGCATAATGAAATATTTA-ATTG--TGAATGCTATATGAAAGAAAACC-AATATT--GGA-AATTGT-AACCC-CTAGAATATAAGAATTGCTCGGAAAT--AT-GTAACTTT-TTAAATGAGTTGTTT---TAATACCA-GAACA--G-AAAA----CTCCAAAATATTAA-TGTA--TAAA-C-AATGTACGATTACCA----TG--TGTATGTGTG-TACATAA-ATAT-TAT-ATATATATTATGTATAGAT--AT-TT--CATAC------TTGTGTATATGT---TACTCCAACCCAACAAAAATGAACATACATGTGGAG-AG-TATTTAATT-------TAAATTT-GATACC-C--TGT-GTT------G----------T---------A--CTGTG---TTT---ATGACTACAGTG---C--AATGT---ATG-AATGGT-G-C-TGTCAATAAA-TAAA
gi|3 : GTTGTCGA-ATTACGATCAAATTAGATTAACAGCATAAT-AAATATTTATATTGGGTGAATGCTATATGAAAGAAAACC-AATATTTTGGA-AAT-GTCA-CCC-CTAGAATATAAGAATTGCTCG-AAATTTATAGTAACTTTATTAAATGAGTGTTTT---AATTACCA-GAACA--GGAAAA----CTCCAAAATATTAAATGTA--TAAAACTAATGTACGATTACCA----TG--TGTATGTGTGTTACATAA-ATAT-TATAATATAT--TATGTATAGATTAAT-T---CATAC------TTGT-TA-ATGT---TACTCCAACCCAACAAAAATGAACATAC-TGTGGAGAAG-TATTT-ATT-------T-AATTT-GATACC-C--TGT-GTT------GT---------T---------A--CTGTG---TAT---ATGACTACA--G--CTCAAATGT---ATG-AATGGT-G-C-TGTCAATAAA-TAAA
gi|1 : ttTTGTCCAATTTATTACCGATGCAGTTTA-CAGCATAATGAAATATTTA-ATTG--TAAATGCTATATGAAAGAAAACCCAGTATT--GGA-AATTGTTAACCC-CCAAAATATAACAATTGCTTGAAAAt
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gi|19 : tAATG-AGTGTTTT----AATACCA-GA-AAA-G-AAAATTTACTCCAAAATATTAA-TGCA--TAAA-CTAATGCAAGATTACCATAATTA--TGTATGTGTG-T--ATAATGTGTGTAC-ATAT
gi|11 : aGAGTGTTTTAATTAATACCA-GA-AAATG-AAAC-----TCCAAAATATTAG-TGTAATTAGA-TTAATGAAAATTTACCA----TAATTATATGTGTG-TACA---------------------TATGGATAGAT--AT-T-----TAC------TTGTATATATG
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gi|23 : TTAA-TGTA--TAGA-TTAATGAAAGTTTACCG----TA--TGTATGTGTG-T--ATAATGTGTGTAT-ACATA---TATATATAGAT--ATATATATATAT------TTGTGTATATGT---TACTCAAAtgaattgtg
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gi|14 : --TGTATGTGTG-TA--TAATGTGT-----GTACAT---ATGTATAGAT--AT-T---TATAC------TTGTGTATATGT---TACTCCAACCCAAC-----T--ACATACATGTGGAC-AG-TATTTAATT-------T-AATTT-GATACC-C--TTT-GTT------GT---------TTTTCTAGTTA--CTGTG---TTT---ATGACTACA-TG--CC--TGTGT---ATG-AATGGT-G-C-TGTCAATAAA-tgaattga
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gi|9 : caactagtacaatacagacttcgaaatttctTT-------T-AATTTTGTTATCAT--TGT-ACT------AT---------C---------A--AT-TG---TTT---ATGACTGTA-TG--CC--AACAT----TGTAAT--------TGTCA--AAA-TAAAtt
gi|25 : aactgcaagaaggccctgttgtttattgaaaacctgcgttgatataagaaaagaaagtctgcaatgaatatacatgtgtacatgaatatatacatgttcattgcattatttttggattctgcatatactttgtgtttagtatgcattgatctgTT------GT---------T---------AAATTGCG---TTT---ATGACTACA-TG--CC--AATGTATAATG-AATGGT-G-C-TGTCTGTCAA-TAAAag
gi|7 : aagaaccctttgttgtcattcTT------GT---------T---------A--CTGTACTTTTC---ATGACTGTA-TG--CT--AAC----------ATGGTAA-T-TGTCAATAAA-ttgaat
gi|2 : tgttcaaattaggatgtaaattaggatgtattatttatttaatgttaacacatatacttgtgatgacccaataaggaaaattgttaatcctacaaatattacaaatgcaagaagaacatgttgttacttgaaaacttgctttaaattaagaaaagaaaatcaagagtaaatgttaaaagatatatttgtacatcttcagtgattttatatatctacattgatctgtttaattTT------GT---------T---------A--CTGTACTTTTC---ATGACTGTA-TG--CT--AAC----------ATGGTAA-T-TGTCAATAAA-g
gi|17 : atgagaatgtatgagaatttttcaaaacatttagtacaaagtttgccgaagaacggaattttacgtttttcgaattttaaaaatgaatattaaatataagtaaaatcaagaactgtggaaaattagctttttatagcaaaatcgtaaatcaaaatgaatataacttgcacaatttatttgaggcacctttaaagaaatgtgataggtctgtacttaacaaaattaagaataagctgcgccatcattgtatattgaaacgggtagataattctaaacccccactcccaaagaaaaacgtctttgctgttcatgtagattcgttttaaaattgaagatgaaaaacatttttgtattatattgttcaacgtatgagcaatgcagatgcagtataatgatttatttaatgttaacacatatacttgtgatgacccaataaggaaaattgttaatcctacgaatattacaatgcaagaagaacatgttgttacttgaaaacttgctttaaattaagaaaagaaaatcaagagtaaatgttaaaagatatatttgtacatcttcagtgatttatattttatatatctacattgatctgtttaattTT------GT---------T---------A--TTGTA---CTTTTCATGACTGTA-TG--CT--AAC----------ATGGT-AAT-TGTCAATAAA-gttat
gi|28 : tttaaaaaaaatgaatcattatttgtacatcttcagtgattttatatatctacattgatctgtttaattTT------GT---------T---------A--TTGTACTATTC---ATGACTGTA-TG--CC--AAC----------ATGGTAA-T-TGTCAATgtta
gi|16 : attTT------GT---------T---------A--TTGTACTATTC---ATGACTGTA-TG--CC--AAC----------ATGGTAA-T-TGTCAA
gi|26 : gttaaaagatatgaacatacataaatgtttgtacattttcaatgtagtacattattttgactttgtatatctacattgatctgtttaatt---TTT---TTGACTACA-TG--TC--AAT-T---AC----TGGT-G-C-TGTCCATAAA-agtt
gi|32 : cgttgttattttgtagtaagttgtatttaaaGATTACA-TGTACC--A---T---ATG-AATGGT-G-C-TGTCAATAGA-tgaactgaaa
gi|30 : TAAA-TG------AATGT---ATG-AATGGT-G-CTTGTCAATAAATTAAAtga
10 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Unaligned ( gi|13 ): CAAAACGTGGTTTGCGACGATCTGAAAACTTGCTTTGATATAAGAAGAAAGTCTACAATTAATTTAAAAAGATATTGACTATACAATTCCATGAACATTTTTCAATGTAGTATTCTACATTGATCTGTTTTAAATTTTGTTGTTGTATCTATTATGAACCGTATGCCAAACATGGTAATTGTCAAAAAGTTCAT
Unaligned ( gi|15 ): TTGAAAACTTGCTTTGATATAAGAAAAGAAAGTCTACAATAAATGTTAAAAGATATGAACATACAATTCATGAACATTTTCAATGTAGTATTCTACATTGATCTGTTTAATTTTGTTGTTGTACTATTTATGACTGTATGCCAACAT
Unaligned ( gi|20 ): AAGAAGGATCTGCATGTTGCTTAATGTAGGTACATGTACACGTATGTTCATTGCAAATATTTTTGGATTTTGTCAAATTTGCGTTTAGTATACGTTAGTTTGCGTTT
Unaligned ( gi|22 ): ACTTATACATGGATATCATAATCTGTCATAATCATTGATCTGTTTAATTTTGTTATTGTACTAAGCTATTCAATGACTGTATGCCAACGTGGTAATGTCATAGA
Unaligned ( gi|24 ): AACATTATTTGAGGCTACCTTTAAAAAAAATGTGATAGAATTTAGAATAAGTGCCCATCCATTATATATCGAAAAGGGTAGATATTCTACCCCCCCCCCCC
Unaligned ( gi|27 ): TTTTGGGATTCTGTATACATTGTGTTTAGTATACATTAATTAATCTGTGTTAATTTTGTTATCAATGTTCATGACTGTGT
Unaligned ( gi|29 ): TAGACATTAATTGCGAGTTGTGAAAATTGGGAGTTTCTATCCCTGAT
Unaligned ( gi|31 ): TGTTCATGACTGTATGCCGACATCGTAATTGTCAATAAGAATT
Alignments
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lowQualScore : . . . . . . . .. . .. . . .. . . . . . . ....... . ...... . .... . .... . .. . . . .... .. ... .......... . . .. .. . ..... ...... . .. ... . . ........... ... . . . ....... . ........ .. ........ ...... ................... .. ... ... . .. ...... . . .
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Reference ( family-3171 ) : GTTGTCGAGATTACGATCGATNTAGATTA-CAGCATAATGAAATATTTA-ATTG--TGAATGC-TATA--TGAAAGAAAACCCAATATT--GGA-AATTGTTAACCC-CCAGAATATAAGAATTGCTCG-GA-A---AT--ATGTAACTTT-TTAAATGAGTGTTTT---TAATACCAGAAAAAGAAA---ACTCCAAAATATTAA-TGTA--TAAA-CTAATGNAAGNTTACCA----TA--TGTATGTGTGT-ACATAA-T--GTGT-TATA-TATATTA--TGTATAGAT--AT-T---T-ATAC------TTGTGTA--TATGT---TACTCCAACCCAACAAAA---ATGAACATACA---TGTGGACA-G-TATTTAATT-------T-AAT--------TTGATACCC--TG-----T-GTT------GT---------T---------A--CTG---TG---TTTATGACTACA-TGCC--AACGT---ATGAATGGT-GC-TGTCAATAAA-TAAA
gi|1 : TTGTCCAATTTATTACCGATGCAGTTTA-CAGCATAATGAAATATTTA-ATTG--TAAATGC-TATA--TGAAAGAAAACCCAGTATT--GGA-AATTGTTAACCC-CCAAAATATAACAATTGCTTGAAA-A---AT--ATGTAACT
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gi|16 : ttgaaaacttgctttgatataagaaaagaaagtctacaataaatgttTT------GT---------T---------A--TTG---TACTATTCATGACTGTA-TGCC--AAC---------ATGGTAAT-TGTCAA
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Reference ( family-3171 ) : GTTGTCGAGATTACGATCAATGCAGATTA-CAGCATAATGAAATATTTA-ATTG--TGAATGC-TATA--TGAAAGAAAACCCAATATT--GGA-AATTGTTAACCC-CTA-GAATATAAGAATTGCTCG-GA-A---AT--ATGTAACTTT-TTAAATGAGTGTTTT---TAATACCAGAAAAGGAAA---ACTCCAAAATATTAA-TGTA--TAAA-CTAATGNAAGATTACCA----TA--TGTATGTGTGT-ACATAA-T--GTGT-TATA-TATATTA--TGTATAGAT--AT-T---T-A------TACTTGTGTA--TATGT---TACTCCAACCCAACAAAA---ATGAACATACA---TGTGGACA-G-TATTTAATT-------T-AAT--------TT-GATACC-C--TG-----T-GTT------GT---------T---------A--CTG---TG---TTTATGACTACA-TGCC--AACGT---ATG-AATGGT-GC-TGTCAATAAA-TAAA
gi|1 : TTGTCCAATTTATTACCGATGCAGTTTA-CAGCATAATGAAATATTTA-ATTG--TAAATGC-TATA--TGAAAGAAAACCCAGTATT--GGA-AATTGTTAACCC-CCA-AAATATAACAATTGCTTGAAA-A---AT--ATGTAACT
gi|10 : tgcacagttttccccatctcgttccatctgtgtcaaagctatcgctgtatcaataaggtaataagacgcatgacctcaatatccatatctgaagcctttaagatctgaaatcttcgatgtgacgtcagatctattatcaaaagcaaacagatctttttggttttagattccatgcaataatctcccattctgtttctaaacaagcataaatggtatactgtgaggtttataattgctctacctcttcaaaatgtgtcatgctttggtttaccaaaagaaaatgctcataaaaaatatggattcattattgtcaaaggacgaattgtgttgtgacaagcataggaagagttttcccaagtcagacattcattcagattatctgaacttgggtacacaaatgaccgtgctcagataaaagagctgatgcatgctgtgcctaatgtaccatatgggtaactaacaatgatagtacaaacgtttaccaataaaaatattgtcatcatgtggagagcatacagaaaaagacgaatgttagaggtaattacatgtatattaaacatacatgttattttcatatagaacaagatatattaaaaaatattttccaaaatgtacgttaaagtttgcattttttaaatatttaattctgtatgatttattgcttaaattgccagaagtgaatgacacactatactgaaaataaatctacaaatatggctgagattatcattcaattaaaatcataatatctaataataatgtggtaaaaattgcaagactacttacattttccatttaaaaagtcacaaagatcaatcttaaccaaattaagaattagtgccgatacgttacatattgaagaagggagatattcttaggccttttcctaaagaaaacgtacttgtcatacatgctgattattcattgaaaacgaaatacacattgttctttaAAA---ACTCCAAAATATTAG-TGTA--TAGA-TTAATGAAAGTTTACCA----TA--TG-ATGTGTGT-ATATG----------TATA-AATAT-----------AT--AC-A---T-G------TACTTGT--A--CATGTACGTACTG-AACT---------------ACATACA---TGTGGGCA-G-TATTTAATT-------T-AAT------------ACACT-T--TG-----TTGTTATTCTTGT---------T---------A--TTG---TG---TTTATGACTACA-TGCC--AATGT---ATG-AGTGGT-GA-TGTCAATAAA-caaat
gi|11 : GAGTGTTTTAATTAATACCAGAAAATGAAA----CTCCAAAATATTAG-TGTAATTAGA-TTAATGAAAATTTACCA----TAATTATATGTGTGT-ACAT-A-T--G-GA-TAGA-TAT-TTACTTGTATATATGAAT-T---TAA------TACCTGT-TG--T-TGT---TATTCtgaattgtg
gi|11 : TACA---TATGGATA-GATATTTACTTGTATATATGAAT--------TT-AATACC-TGTTG-----TTGTTATTCGTGT---------T---------A--TTG---CG---TTTATGACTTCA-TACC--AATGT---AGG-AATGGT-GC-TGTCAATAAA-gtgttattgcgtttatgacttcataccaatgtaggaatggtgctgtcaataaatggatttaatt
gi|12 : gagtgttttaattaataccagaaaatgaaactccaaaatattagtgtaattagattaatgaaaatttaccataattatatgtgtgAA-TGTA--TAAA-CTAATGCAATATTACCA----TA--TGTATGTGTGT---ATAA-T--GTG--TGTA-CA---TA--TGTATAGAT--AT-T---T-ATACATGTACTTGTGTA--TATGT---TACTCAAACCGAAC--------T--ACATACA---TGTGGACA-G-TATTTAATT-------T-GAT--------TT-GATTCC-C--T------T-GTT-------------------------------TG---TG---TTGATGACTACA-TGCC--AATGT---ATG-AATGGT-GC-TGTCAATAAA-ggatttaatt
gi|14 : A----CA--TGTATGTGTGT-A--TAA-T--GTGT----G-TACAT-A--TGTATAGAT--AT-T---T-A------TACTTGTGTA--TATGT---TACTCCAACCCAAC--------T--ACATACA---TGTGGACA-G-TATTTAATT-------T-AAT--------TT-GATACC-C--TT-----T-GTT------GT---------TTTTCTAGTTA--CTG---TG---TTTATGACTACA-TGCC--TGTGT---ATG-AATGGT-GC-TGTCAATAAA-tgaattga
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gi|2 : atgagaatgtatgagaatttttcaaaacatttagtacaaagtttgccgaagaacggaattttacgtttttcgaattttaaaaatgaatattaaatataagtaaaatcaagaactgtggaaaattagctttttatagcaaaatcgtaaatcaaaatgaatataacttgcacaatttatttgaggcacctttaaagaaatgtgataggtctgtacttaacaaaattaagaataagctgcgccatcattgtatattgaaacgggtagataattctaaacccccactcccaaagaaaaacgtctttgctgttcatgtagattcgttttaaaattgaagatgaaaaacatttttgtattatattgttcaacgTT------GT---------T---------A--CTG---TACTTTTCATGACTGTA-TGCT--AAC----------ATGGTAAT-TGTCAATAAA-gtacttttcatgactgtatgctaacatggtaattgtcaataaagttat
gi|21 : atgagaatgtatgagaatttttcaaaacatttagtacaaagtttgccgaagaacggaattttacgtttttcgaattttaaaaatgaatattaaatataagtaaaatcaagaactgtggaaaattagctttttatagcaaaatcgtaaatcaaaatgaatataacttgcacaatttatttgaggcacctttaaagaaatgtgataggtctgtacttaacaaaattaagaataagctgcgccatcattgtatattgaaacgggtagataattctaaacccccactcccaaagaaaaacgtctttgctgttcatgtagattcgttttaaaattgaagatgaaaaacatttttgtattatattgttcaacgtatgagcaatgcagatgcagtataatgatttatttaatgttaacacatatacttgtgatgacccaataaggaaaattgttaatcctacgaatattacaatgcaagaagaacatgttgttacttgaaaacttgctttaaattaagaaaagaaaatcaagagtaaatgttaaaagatatatttgtacatcttcagtgatttatattttatatatctacattgatctgtttaattAAAACCAAT-TT--AGTTAATTGTTAACACGCCA-GAATATAAGAATTGCTCG-GA-A-------------------TAAATGAGT---TT---TAATACCACAAAAGAAAA---ACTCCAAAATATTAA-TGTA--TAAgttat
gi|23 : tTTAA-TGTA--TAGA-TTAATGAAAGTTTACCG----TA--TGTATGTGTGT---ATAA-T--GTGTGTATA-CATA-TA--TATATAGAT--ATATATAT-A------TATTTGTGTA--TATGT---TACTCAAA
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gi|26 : aagaaccctttgttgtcattc---TTTTTGACTACA-TGTC--AA-------TT-ACTGGT-GC-TGTCCATAAA-ttgaat
gi|28 : cgttgttattttgtagtaagttgtatttaaaTT------GT---------T---------A--TTG---TACTATTCATGACTGTA-TGCC--AAC----------ATGGTAAT-TGTCAATtgaactgaaa
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gi|30 : ttTAAA-TG----AATGT---ATG-AATGGT-GCTTGTCAATAAATTAAAt
gi|31 : ---TG---TTCATGACTGTA-TGCC--GACAT---CGT-AAT-------TGTCAATAAtgaatt
gi|32 : GATTACA-TGT---ACCAT---ATG-AATGGT-GC-TGTCAATAGA-gaatt
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gi|7 : TT------GT---------T---------A--CTG---TACTTTTCATGACTGTA-TGCT--AAC----------ATGGTAAT-TGTCAATAAA-
gi|9 : tgttcaaattaggatgtaaattaggatgtattatttatttaatgttaacacatatacttgtgatgacccaataaggaaaattgttaatcctacaaatattacaaatgcaagaagaacatgttgttacttgaaaacttgctttaaattaagaaaagaaaatcaagagtaaatgttaaaagatatatttgtacatcttcagtgattttatatatctacattgatctgtttaattTT-------T-AAT--------TTTGTTATCAT--TG-----T-ACT------AT---------C---------A--AT----TG---TTTATGACTGTA-TGCC--AACAT----TGTAAT-------TGTCA--AAA-TAAAg
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blockSeqs : . A . . . . . C . . C . . . . AC T TTT A A A . . . C . . AC TGTGTG . ATT . . . TAA T . . A C AAAAATGA . C . . . . . . . . . . ATTCGTGTT . . CTA . . TGTA . A . .
blockSeqs : A . . . . . . . . T . . . . AT . . T G A . . . A . . AC ATATTA . ATT . . . TCA G . . C C AAAAATGA . C . . . . . . . . . . GTT . . CTT . . TGTA . A . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . T G C . . . T . . AC TGTGT . TT . . . TA G . . C C T . G . . . . . . . . . . GTT . . . . . TGTA . . . .
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blockSeqs : . . . . . . C . . . .
blockSeqs : . . . . C . . .
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blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . .
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9 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|29 ): TAGACATTAATTGCGAGTTGTGAAAATTGGGAGTTTCTATCCCTGAT
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consensus : GTTGTCGAGATTACGATCAATGCAGATTA-CAGCATAATGAAATATTTA-ATTG--TGAATGC-TATA--TGAAAGAAAACCCAATATT--GGA-AATTGTTAACCC-CTA-GAATATAAGAATTGCTCG-GA-A---AT--ATGTAACTTT-TTAAATGAGTGTTTT---TAATACCAGAAAAGGAAA---ACTCCAAAATATTAA-TGTA--TAAA-CTAATGNAAGATTACCA----TA--TGTATGTGTGT-ACATAA-T--GTG-NTATA-TATATTA--TGTATAGAT--AT-T---T-ATAC------TTGTGTA--TATGT---TACTCCAACCCAACAAAA---ATGAACATACA---TGTGGACA-G-TATTTAATT-------T-AAT--------TT-GATACC-C--TG-----T-GTT------GT---------T---------A--CTG---TG---TTTATGACTACA-TGCC--AACGT---ATG-AATGGT-GC-TGTCAATAAA-TAAA
Reference ( family-3171 ) : GTTGTCGAGATTACGATCAATGCAGATTA-CAGCATAATGAAATATTTA-ATTG--TGAATGC-TATA--TGAAAGAAAACCCAATATT--GGA-AATTGTTAACCC-CTA-GAATATAAGAATTGCTCG-GA-A---AT--ATGTAACTTT-TTAAATGAGTGTTTT---TAATACCAGAAAAGGAAA---ACTCCAAAATATTAA-TGTA--TAAA-CTAATGNAAGATTACCA----TA--TGTATGTGTGT-ACATAA-T--GTG-NTATA-TATATTA--TGTATAGAT--AT-T---T-ATAC------TTGTGTA--TATGT---TACTCCAACCCAACAAAA---ATGAACATACA---TGTGGACA-G-TATTTAATT-------T-AAT--------TT-GATACC-C--TG-----T-GTT------GT---------T---------A--CTG---TG---TTTATGACTACA-TGCC--AACGT---ATG-AATGGT-GC-TGTCAATAAA-TAAA
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gi|12 : gagtgttttaattaataccagaaaatgaaactccaaaatattagtgtaattagattaatgaaaatttaccataattatatgtgtgAA-TGTA--TAAA-CTAATGCAATATTACCA----TA--TGTATGTGTGT-A--TAA-T--GTG----TG-TACAT-A--TGTATAGAT--AT-T---T-ATACATGTACTTGTGTA--TATGT---TACTCAAACCGAAC--------T--ACATACA---TGTGGACA-G-TATTTAATT-------T-GAT--------TT-GATTCC-C--T----------T------GT---------T-------------TG---TG---TTGATGACTACA-TGCC--AATGT---ATG-AATGGT-GC-TGTCAATAAA-ggatttaatt
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