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Reference ( gi|1 ) : AGTCTTCA-----T--GAAAACTTTCA-AAACTTGCT-----GGCCAG--T-A----GGACCA-GTGAAC-TGCCAGAAT-T-------CAGTTAAACA-TTGCTTCC-------C----AT-------G--------T-----G------ATAA---ACG-----A-TG-TACTG-TG-AAATTTAGGGG-G-CC-AGTAAA---TGTC---AT---T-AGGGGCC---AG-T--AAATT-----AATTT--A-C---GGGCCCCT-A---AT---GACA-TTTACT-GG-CCCCTT--AATTT-TCA-TA---GTA-CA-T-----CGT---TTAT------CA-----C-------AT--------G-------GGATGCAAT-GTTTAACTGTA-CAGTTAA-TTTAGTGA-GAC------GTTGT--CTAAACACTTACT--TTACAT---ATA------TG----------C---TAT-TTACC--------AATTCACTT-TTAT-TTTGATT-GTA--AAATT--ATAC---AAATG---TCTA------TAT-GCATCTC--AACA-TTGTTTT---CA-ATGTGGCTT---------A---A---GTCTAC-A-ATCCCATTGGA-CTTCTTCATTTTCGACTTTCACGGACCC--GCGACCTT-TG-AA-TC--CAC-T-GCCCTCG-AT--CTTCAG-ACCA--C------------T-GAGTTTTC-GTGAAGAC
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Reference ( family-3101 ) : AGTCTTCAC--GAAAACTTTCAAAACTTGCT-----GGCCAG--TAGG----ACCAGTGGAC-TGTCTGAATTTA-------A---CT--GGCCCCCA-GTGA-----AATTTACTGCGAAAT-TT--GGGGCCAGTAAAT-TT-----ACTAG------G-GACCA-ATGAA---CTG----AATTTA-CTGGCCCCNA-GTGAA-ATTTACTG--G--CCCCCAAA------------TTTTCATAGT-A-CA--T--GT------TTA-----TCA-CAT--A--------C-ATT-ATGGGATGTAAT-GTTTAACTG--TA-CA--GTTAATTT-AGC---GA-GAC-------TT-GT--CT-A-ACATTTACT--TTATA-TC--ATA------T-G----------CCGT-TTGCC--------AATTCATTT-TTAT-TTTGAT-GGT---------AA--AATT--A---TACAANTAAAT-T----ATATCTA--CATC-CAACATTT-T----ATTTA-ATGTGACTT--------AA--A--GTCTAC-AAG-CCCGTCGGA-CTTCT-TG-------ATTTTCGAT-------GACC--CGACC-TTA-A-A-TC--CAC-TGG-CCTCG-GT--CTTCGG-ACC--AC------------CGAGTTTT-CGTGAAGAC
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