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gi|10 : gtaacactgacgaaatcaacgaaaagatatgttttttgatacaaacttgaccatgcaatcatgggtatatcagtaatctatgctggaagacgggtagcatcaggaacggcgggaccaagtttatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGGTGT-A-CCTGTT-TTTA--GTGT-AGCAATGCGTAAC--TCAACA-GGCGGACCA--GTTT
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Reference ( family-3095 ) : AAACTGGTCC-GCCT-G--TT-GAGT--T-ACGC--A-TCGG---CT-AC-ACTAACAA---CAG-GTAC-GGCC-CAA-T--TCTCTG-TAAAATCCCGCGG--TCAACAT-GTT------GAC--CGCGGG-ATTTGGCAA-A-----GC---AGCG-AG-A-TTT-ACT--T-GAGGCATCA--TG--GGATTTGTTTA----CAA-CGGTGATGG-AAGT-AACACCGACG-AAA-TCAACGAA-GAG-AT-TGTTTGT--TG-TGTACAAATTTG-A-C-AT-GCAA-CA-T-G--GC-GT-TTCA-T-TAATTCTT--------ATGCATGGAAGA----C-G---GTAGCA-TC-AGGGAAACGGCG-GGAC-C-AG-TTTATAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTACGGCGT-A-CCCGTTGTTTGT-GCGT-AGCATCAA--TCAACG-GGATGCCA--GTTT
gi|1 : AAACTGGTCC-GCCT-G--TTCGAGT--T-ACGCC-A-TTCG---CTTACCACTAACAA---CAG--TACCGGCCGCAACT--TCTCTG-TAAAATCCCG--G--TCAAC-T-GTTCCGCTGGAC--CACGGGGATTTGGAAG-A-----GC---AGCA-AG-C-ATT-ACTGCT-CAGGC-TAAAGTG--AGGATTGTTTA----CAAACGGTGGTGG-AAGT-AACACCGACGAAAA-TCAATGAA-GAG-AT-TGTTTGT--TATTTTACAAATTTG-A-C-AT-GCAA-CA-T-GCTGC-GTGTTCA-T-TAATTCTTATTTATGAATG-ATGGAAG-----C-G---GTAGCA-TC-AGG--AACGGC--GGAC-C-AG-TT
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gi|5 : gtgactacgcgggattgggcaaagcagcggagatttacttgaggcatcattggattgtttaaccctaacggtgatgggaagtaacaccgacgaaattcaacgaatgagatgtttgttgtgacaatttgacatcccaccagagcgtttcattaattcttatgcatggaagacgtgtaccatcaaggaaaacggcgggacgcagttttatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnT------GACTACGCGGG-ATTGGGCAA-A-----GC---AGCGGAG-A-TTT-ACT--T-GAGGCATCA--TT--GGATT-GTTTAACCCTAA-CGGTGATGGGAAGT-AACACCGACG-AAATTCAACGAATGAG-A--TGTTTGT--TG-TG-AC-AATTTG-A-C-ATCCCAC-CA-G-A--GC-GT-TTCA-T-TAATTCTT--------ATGCATGGAAGA----C-GT--GTACCA-TCAAGGAAAACGGCG-GGACGC-AGTTTTATAG
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gi|1 : tTACGGCGT-AACCCGTTGTTTGT-GCGTAAGCATCAA---CATGG-GGATGCCA--GTTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacggcgtaacccgttgtttgtgcgtaagcatcaacatggggatgccagtttaggtacacactacta
gi|10 : taaactggtccgcctgttcgagttacgccattcgcttaccactaacaacagtaccggccgcaacttctctgtaaaatcccggtcaactgttccgctggaccacggggatttggaagagcagcaagcattactgctcaggctaaagtgaggattgtttacaaacggtggtggaagtaacaccgacgaaaatcaatgaagagattgtttgttattttacaaatttgacatgcaacatgctgcgtgttcattaattcttatttatgaatgatggaagcggtagcatcaggaacggcggaccagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAACTGGTCC-GCCT-G--TT-GAGT--T-ACGC--A-TT-G---CT-AC-ACTAAAAA---CAG-GTAC--ACC-CA---------TG-T------------------------T------GAC--CGCGGA---TTGGCAA-AGCCATGC---AGCG-AG-A-TTT-AC---T-GA-GCATC---T----GATTTGTTTA----CAA-CGGTGATGG-AAGTAAAAACCGATA-AAA-TCAACGAA-GAG-AT-T-TTTGT--TG-TAT-CAAAATTG-A-C-AT-GCAA-CA-T-G--GC-GT-TTCA-T-TAATTCCTG-------ATGTATGGAAGA----A-G---GTAG-A-TCAAGG---CACGGC---GAC-C-AG-TTaggtacacactacta
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gi|13 : AAACTGGTCC-GCCT-G--TT-GAGT--T-ACGC--A-TCGG---CT-AC-Aaa
gi|13 : gtTGT-GCGT-AGCATCAA--TCATCG-GGATACCA--GTTTtgtgcgtagcatcaatcatcgggataccagttt
gi|14 : gtaaactggtccgcctgttgagttacgcatcggctacaAAATTGGTCC-GTCT-G--TT-GAGC--T-ACGC--A-TCGG---CT-AC-ACT
gi|14 : tTGT-CTGT-AGCATCAA--TCAACG-GGATACCA--GTTgtctgtagcatcaatcaacgggataccagtt
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gi|15 : tTGT-GTGT-GGCATCAA--TCAACG-GGGTACCA--GTTTaatgtgtgtggcatcaatcaacggggtaccagttt
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gi|16 : GTTTGT-GTGT-AGCATCAA--TCAACG-GGATACtgtgtgtagcatcaatcaacgggatac
gi|17 : aaactggtccgcctgttgagttatacgcatcgGTTGTTTGT-GTTT-AGCATCAA--CCAATG-GAGTACCA--GTTT
gi|18 : GTTTGT-GTGT-AGCATCAA--TC-ACG-G--TACCA--GTTT
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gi|3 : gAAACTGGTCC-GCCT-G--TT-GAGT--T-ACGC--A-TCGG---CT-AC-ACTAACAA---CAG-GTAA-GGCC-CAA-T--TCTCTG-TAAAATCCCGCGA--TCAACAT-GTT------GAC--CGCGGC-ATTTGGCAA-A-----GC---AGCG-AG-A-TTT-ACT----GAGGCATCA--TG--GGATTTGTTTA----CAA-CGGTGATGG-AAGT-AACACCGACG-AAA-TCAACGAA-GAG-AT-TGTTTGC--TG-TGAACAACTTTG-C-C-AT-GCAA-CA-T-G--GC-GT-TTCA-T-TAATTCTT--------ATGCATGGAAGA----C-G---GTAGCA-TC-AGG---AACGGC--GGAC-C-AG-TTTATAGa
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gi|4 : gTACGGCGT-A-CCCGTTGTTTGTTGCGT-AGCATCAA--TCAACG-GAATGCCA--GTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacggcgtacccgttgtttgttgcgtagcatcaatcaacggaatgccagtt
gi|5 : gtgactacgcgggattgggcaaagcagcggagatttacttgaggcatcattggattgtttaaccctaacggtgatgggaagtaacaccgacgaaattcaacgaatgagatgtttgttgtgacaatttgacatcccaccagagcgtttcattaattcttatgcatggaagacgtgtaccatcaaggaaaacggcgggacgcagttttatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnT------GACTACGCGGG-ATTGGGCAA-A-----GC---AGCGGAG-A-TTT-ACT--T-GAGGCATCA--TT--GGATT-GTTTAACCCTAA-CGGTGATGGGAAGT-AACACCGACG-AAATTCAACGAATGAG-A--TGTTTGT--TG-TG-AC-AATTTG-A-C-ATCCCAC-CA-G-A--GC-GT-TTCA-T-TAATTCTT--------ATGCATGGAAGA----C-GT--GTACCA-TC-AAGGAAAACGGCG-GGACGC-AGTTTTATAG
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gi|7 : gtaacactgacgaaatcaacgaaaagatatgttttttgatacaaacttgaccatgcaatcatgggtatatcagtaatctatgctggaagacgggtagcatcaggaacggcgggaccaagtttatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAACTGGTCCCGCCTCGCTTT-GAGT--T-AGAC--AATCGGT--CT-AC-ACTA-CAA---CAG-GTAC-GGCC-TAA-CTATATCTG-TAA---TCCACGGACTCAACATAGTG------AAC--CGC-GG-AGTTGGCAA-A-----GC---A-C--AG-ACTTT-ACT--TCGAGG-ACCA--TGGCGGATTTG-TTA----CAA-CGGTGATG--------AC--------AGA-TCAACGAA-GAGAAT-TGTGTGTTGTG-TGTACAATTTTG-A-CAAT-GC-A-CAGT-G--GCGGT-TTCA-GATAATTCTTG-------ATGCAGGGAAAA------GTTCGTAGGACTA-AGGGA-AACGGCGCGGA--C-AG-ATTAT
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Alignments
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Reference ( family-3095 ) : AAACTGGTCC-GCCT-G--TT-GAGT--T-ACGC--A-TCGG---CT-AC-ACTAACAA---CAG-GTAC-GGCC-CAA-T--TCTCTG-TAAAATCCCGCGG--TCAACAT-GTT------GAC--CGCGGG-ATTTGGCAA-A-----GC---AGCG-AG-A-TTT-ACT--T-GAGGCATCA--TG--GGATTTGTTTA----CAA-CGGTGATGG-AAGT-AACACCGACG-AAA-TCAACGAA-GAG-AT-TGTTTGT--TG-TGTACAAATTTG-A-C-AT-GCAA-CA-T-G--GC-GT-TTCA-T-TAATTCTT--------ATGCATGGAAGA----C-G---GTAGCA-TC-AGG---AACGGCG-GGAC-C-AG-TTTATAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTACGGCGT-A-CCCGTTGTTTGT-GCGT-AGCATCAA--TCAACG-GGATACCA--GTTT
gi|1 : AAACTGGTCC-GCCT-G--TTCGAGT--T-ACGCC-A-TTCG---CTTACCACTAACAA---CAG--TACCGGCCGCAACT--TCTCTG-TAAAATCCCG--G--TCAAC-T-GTTCCGCTGGAC--CACGGGGATTTGGAAG-A-----GC---AGCA-AG-C-ATT-ACTGCT-CAGGC-TAAAGTG--AGGATTGTTTA----CAAACGGTGGTGG-AAGT-AACACCGACGAAAA-TCAATGAA-GAG-AT-TGTTTGT--TATTTTACAAATTTG-A-C-AT-GCAA-CA-T-GCTGC-GTGTTCA-T-TAATTCTTATTTATGAATG-ATGGAAG-----C-G---GTAGCA-TC-AGG---AACGGC--GGAC-C-AG-TT
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gi|7 : gtaacactgacgaaatcaacgaaaagatatgttttttgatacaaacttgaccatgcaatcatgggtatatcagtaatctatgctggaagacgggtagcatcaggaacggcgggaccaagtttatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAACTGGTCCCGCCTCGCTTT-GAGT--T-AGAC--AATCGGT--CT-AC-ACTA-CAA---CAG-GTAC-GGCC-TAA-CTATATCTG-TAA---TCCACGGACTCAACATAGTG------AAC--CGC-GG-AGTTGGCAA-A-----GC---A-C--AG-ACTTT-ACT--TCGAGG-ACCA--TGGCGGATTTG-TTA----CAA-CGGTGATG--------AC--------AGA-TCAACGAA-GAGAAT-TGTGTGTTGTG-TGTACAATTTTG-A-CAAT-GC-A-CAGT-G--GCGGT-TTCA-GATAATTCTTG-------ATGCAGGGAAAA------GTTCGTAGGACTA-AGGGA-AACGGCGCGGA--C-AG-ATTAT
gi|8 : AAACTGGTTG-GC-T-G--TT-GAGT--TTACGCCAA-T-GG----T-AC-ACTA-CAG---CAG--TAC-GGCC-AAA-T--TTT--G-TAAAATC----------AA-AT-GTT------GAA--CGCGGA-ATTTGG-AA-A-----GC---AGCG-AA-A-TTT-ACT--G-AAGGCATCA--TG--GGATTTGTTTA----CAA-CGGTGATGG-AAGT-AA-AGCG-----AA-T-A--GAA-GAG-AT-TGTGTGT--TG-TGTGCAAAATTGAA-A-AT-GCAA-CA-T-G--G--GT-TTTAGT-TAATTCTG--------ATGCA-GGAAGAAAGGC-----GTAG-A-TC-AGGC--AACG--G-GGA--C-AG-TTT
gi|9 : tAAACTGGTCC-GCCC-G--TT-GAGT--T-ACGC--A-TTGG---CT-AC-ACTAACAA---CAG-GTAC-GGCC-CAA-A--TCTCTG-TAAAATCCCGCGG--TCAACAT-GTT------GAC--CGCGGG-ATTTGGCAA-A-----GC---AGCG-AG-A-TTT-AC---T-GAGTCATCA--TG--GGATTTGTTTA----CAA-CGGTGATGG-AAGT-AACACCGACA-AAA-TCAACGAA-GAG-AT-TGTTTGT--TG-TGTGCAAAATTG-A-C-AT-GCAA-CA-T-G--AC-GT-TTCC-T-TAATTCTG--------ATGCATGGAAGA----A-G---GTAGCt
blockSeqs : C T CT . TA T CA A GCC . . A AAC TG . G ACTA A CCACGGAC CA A T TA G G GCCAT GGG G C C G TGCT . GGC T ACCC . G A . T T A A TG . T A C A C T G G . G . GA G AAGGC C C A GAA GC CG A T TA T . TC C AT
blockSeqs : . C . . . . . . T . . A . G . . CT . CCGCGA CA . . TA . . . . G . . . TTC . G T ACCC . G . . T T . . . . T . . A C . . . . . . GT G GTTC C . . GAA G CG . T A T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . A . G . . AT . CCGCGG CA . . . . . . . . . . . TT . G T . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . T . AGC C . . GA G C . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . A . G . . AT . CTCGG CA . . . . . . . . . . . TT . T T . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . G . CGT C . . C G C . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . A . G . . AT . . A . . . . . . . . . . . TG . T T . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . T . CGT C . . . G C . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . G . . AA . . . . . . . . . . . . . . T . G T . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . T . CGG C . . . . C . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . G . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . T . AG G . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . T . CG C . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . CG . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . AG . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons : ** G* AT*** CCCGG*** CA ****** TT*** ** ** ******** G*
originalCons : AAACTGGTCC-GCCT-G--TT-GAGT--T-ACGC--A-TCGG---CT-AC-ACTAACAA---CAG-GTAC-GGCC-CAA-T--TCTCTG-TAAAATCCCGCGG--TCAACAT-GTT------GAC--CGCGGG-ATTTGGCAA-A-----GC---AGCG-AG-A-TTT-ACT--T-GAGGCATCA--TG--GGATTTGTTTA----CAA-CGGTGATGG-AAGT-AACACCGACG-AAA-TCAACGAA-GAG-AT-TGTTTGT--TG-TGTACAAATTTG-A-C-AT-GCAA-CA-T-G--GC-GT-TTCA-T-TAATTCTT--------ATGCATGGAAGA----C-G---GTAGCA-TC-AGG---AACGGCG-GGAC-C-AG-TTTATAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTACGGCGT-A-CCCGTTGTTTGT-GCGT-AGCATCAA--TCAACG-GGATACCA--GTTT
finalCons : AAACTGGTCC-GCCT-G--TT-GAGT--T-ACGC--A-TCGG---CT-AC-ACTAACAA---CAGG-TAC-GGCC-CAAT---TCTCTG-TAAAATCCCCGG---TCAACAT-GTT------GAC--CGCGGG-ATTTGGCAA-A-----GC---AGCG-AG-A-TTT-ACTT---GAGGCATCA--TG--GGATTTGTTTA----CAA-CGGTGATGG-AAGT-AACACCGACG-AAA-TCAACGAA-GAG-AT-TGTTTGT--TG-TGTACAAATTTG-A-C-AT-GCAA-CA-T-G--GC-GT-TTCA-T-TAATTCTT--------ATGCATGGAAGA----C-G---GTAGCA-TC-AGG---AACGGCG-GGAC-C-AG-TTTATAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTACGGCGT-A-CCCGTTGTTTGT-GCGT-AGCATCAA--TCAACG-GGATACCA--GTTT
Alignments
lowQualScore : 1 11111 22222222 111111 11 11111 2222 1111 22222222 2222222222 222 11 11 111
lowQualScore : 3 6 44 3 44 3 77 3 999 3 4 3 888 77 5 0 11111 5 0 33333333 22 5 777777 22 8 4 11111 777 8 4 4 4 1111 66 777 1 8888 4 8 4 3 7 7 3 3 55 3 2 3 3 7 7 3 3 3 55 3 3 444 00000000 4444444444 1 4 4 666 66 00 4 8 111 6 3 44 3 55
lowQualScore : . . .. . .. . .. . ... . . . ... .. . . ..... . . ........ .. . ...... .. . . ..... ... . . . . .... .. ... . .... . . . . . . . . .. . . . . . . . . . .. . . ... ........ .......... . . . ... .. .. . . ... . . .. . ..
lowQualScore : 3 7 66 3 66 3 99 3 222 3 0 2 888 55 0 0 11111 0 1 99999999 11 7 222222 22 9 4 11111 888 9 4 4 4 2222 11 222 9 9999 4 9 0 6 3 3 6 6 00 6 3 6 6 3 3 6 6 6 00 6 6 888 55555555 5555555555 4 0 0 111 77 00 4 9 000 7 3 66 3 00
consensus : AAACTGGTCC-GCCT-G--TT-GAGT--T-ACGC--A-TCGG---CT-AC-ACTAACAA---CAG-GTAC-GGCC-CAA-T--TCTCTG-TAAAATCCC-CGG--TCAACAT-GTT------GAC--CGCGGG-ATTTGGCAA-A-----GC---AGCG-AG-A-TTT-ACT--T-GAGGCATCA--TG--GGATTTGTTTA----CAA-CGGTGATGG-AAGT-AACACCGACG-AAA-TCAACGAA-GAG-AT-TGTTTGT--TG-TGTACAAATTTG-A-C-AT-GCAA-CA-T-G--GC-GT-TTCA-T-TAATTCTT--------ATGCATGGAAGA----C-G---GTAGCA-TC-AGG---AACGGCG-GGAC-C-AG-TTTATAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTACGGCGT-A-CCCGTTGTTTGT-GCGT-AGCATCAA--TCAACG-GGATACCA--GTTT
Reference ( family-3095 ) : AAACTGGTCC-GCCT-G--TT-GAGT--T-ACGC--A-TCGG---CT-AC-ACTAACAA---CAG-GTAC-GGCC-CAA-T--TCTCTG-TAAAATCCC-CGG--TCAACAT-GTT------GAC--CGCGGG-ATTTGGCAA-A-----GC---AGCG-AG-A-TTT-ACT--T-GAGGCATCA--TG--GGATTTGTTTA----CAA-CGGTGATGG-AAGT-AACACCGACG-AAA-TCAACGAA-GAG-AT-TGTTTGT--TG-TGTACAAATTTG-A-C-AT-GCAA-CA-T-G--GC-GT-TTCA-T-TAATTCTT--------ATGCATGGAAGA----C-G---GTAGCA-TC-AGG---AACGGCG-GGAC-C-AG-TTTATAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTACGGCGT-A-CCCGTTGTTTGT-GCGT-AGCATCAA--TCAACG-GGATACCA--GTTT
gi|1 : AAACTGGTCC-GCCT-G--TTCGAGT--T-ACGCC-A-TTCG---CTTACCACTAACAA---CAG--TACCGGCCGCAACT--TCTCTG-TAAAATCCC--GG--TCAAC-T-GTTCCGCTGGAC--CACGGGGATTTGGAAG-A-----GC---AGCA-AG-C-ATT-ACTGCT-CAGGC-TAAAGTG--AGGATTGTTTA----CAAACGGTGGTGG-AAGT-AACACCGACGAAAA-TCAATGAA-GAG-AT-TGTTTGT--TATTTTACAAATTTG-A-C-AT-GCAA-CA-T-GCTGC-GTGTTCA-T-TAATTCTTATTTATGAATG-ATGGAAG-----C-G---GTAGCA-TC-AGG---AACGGC--GGAC-C-AG-TT
gi|1 : tTACGGCGT-AACCCGTTGTTTGT-GCGTAAGCATCAA---CATGG-GGATGCCA--GTTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacggcgtaacccgttgtttgtgcgtaagcatcaacatggggatgccagtttaggtacacactacta
gi|10 : taaactggtccgcctgttcgagttacgccattcgcttaccactaacaacagtaccggccgcaacttctctgtaaaatcccggtcaactgttccgctggaccacggggatttggaagagcagcaagcattactgctcaggctaaagtgaggattgtttacaaacggtggtggaagtaacaccgacgaaaatcaatgaagagattgtttgttattttacaaatttgacatgcaacatgctgcgtgttcattaattcttatttatgaatgatggaagcggtagcatcaggaacggcggaccagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAACTGGTCC-GCCT-G--TT-GAGT--T-ACGC--A-TT-G---CT-AC-ACTAAAAA---CAG-GTAC--ACC-CA---------------------------------T-GTT------GAC--CGCGGA---TTGGCAA-AGCCATGC---AGCG-AG-A-TTT-AC---T-GA-GCATC---T----GATTTGTTTA----CAA-CGGTGATGG-AAGTAAAAACCGATA-AAA-TCAACGAA-GAG-AT-T-TTTGT--TG-TAT-CAAAATTG-A-C-AT-GCAA-CA-T-G--GC-GT-TTCA-T-TAATTCCTG-------ATGTATGGAAGA----A-G---GTAG-A-TCAAGG---CACGGC---GAC-C-AG-TTaggtacacactacta
gi|11 : tG-AAG-TCAACGAA-GAG-AT-TGTGTGT--TG-TGTACAAATTTG-A-CAAT-GCTA-CA-T-G--GC-GT-TTCA-G-TAATTCTG--------ATGCAGGGAAGA----A-GC--GTAGCA-TC-a
gi|12 : AAACTG-TCC-GTCTTG--TT-GAGT--T-ACGC--A-TCGGGCCTT-AC-ACCAACAAAACCAGTGTAC-TGCC-CAC-T--TCACTGATAAAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnat
gi|13 : AAACTGGTCC-GCCT-G--TT-GAGT--T-ACGC--A-TCGG---CT-AC-Aaa
gi|13 : gtTGT-GCGT-AGCATCAA--TCATCG-GGATACCA--GTTTtgtgcgtagcatcaatcatcgggataccagttt
gi|14 : gtaaactggtccgcctgttgagttacgcatcggctacaAAATTGGTCC-GTCT-G--TT-GAGC--T-ACGC--A-TCGG---CT-AC-ACT
gi|14 : tTGT-CTGT-AGCATCAA--TCAACG-GGATACCA--GTTgtctgtagcatcaatcaacgggataccagtt
gi|15 : taaattggtccgtctgttgagctacgcatcggctacacAAACTGGTCC-GCCT-G--TT-GAGT--T-ACGC--A-TCGG---CT-A
gi|15 : tTGT-GTGT-GGCATCAA--TCAACG-GGGTACCA--GTTTaatgtgtgtggcatcaatcaacggggtaccagttt
gi|16 : taaactggtccgcctgttgagttacgcatcggctaaaAAACTGGTCC-GCCT-G--TT-GAGTTAT-ACGC--A-TCGG---TT-
gi|16 : GTTTGT-GTGT-AGCATCAA--TCAACG-GGATACtgtgtgtagcatcaatcaacgggatac
gi|17 : aaactggtccgcctgttgagttatacgcatcgGTTGTTTGT-GTTT-AGCATCAA--CCAATG-GAGTACCA--GTTT
gi|18 : GTTTGT-GTGT-AGCATCAA--TC-ACG-G--TACCA--GTTT
gi|19 : cgaTGT-GCGT-AGCATCAA--TCAACG-GGATGCCA--GTTTag
gi|2 : AAACTGGTCC-GCCT-G------AGT--T-ACGC--A-TCGG---CT-AC-ACTAACAA---CAG-GTAC-GGCCGCAA-T--TCTCTG-TAAAATCCT-CGG--TCAACAT-GTTT-----GAC--CACGGGGATTTGGCAAGA-----GCGGGAGCA-AGCA-TTTGACTGCT-CAGGCATAA--TG--GGATTTGTTTA----CAA-CGGTGATGG-AAGT-AACACCGACG-AAA-TCAATGAA-GAG-AT-TGTTTGT--TA-TGTACAAATTTG-A-C-AT-GCAA-CA-T-G--GC-GT-TTCA-T-TAATTCTT--------ATGCATGGAAGA----C-G---GTAGCA-TC-AGG---AACGGC--GGAC-C-AG-TTTATAG
gi|20 : tTGT-GTGT---CATCAA--TTAACG-GGGTACCA--GTTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacggcgtacccgttgtttgtgcgtagcatcaatcaatgggatgccagttt
gi|3 : gAAACTGGTCC-GCCT-G--TT-GAGT--T-ACGC--A-TCGG---CT-AC-ACTAACAA---CAG-GTAA-GGCC-CAA-T--TCTCTG-TAAAATCCCGCGA--TCAACAT-GTT------GAC--CGCGGC-ATTTGGCAA-A-----GC---AGCG-AG-A-TTT-ACT----GAGGCATCA--TG--GGATTTGTTTA----CAA-CGGTGATGG-AAGT-AACACCGACG-AAA-TCAACGAA-GAG-AT-TGTTTGC--TG-TGAACAACTTTG-C-C-AT-GCAA-CA-T-G--GC-GT-TTCA-T-TAATTCTT--------ATGCATGGAAGA----C-G---GTAGCA-TC-AGG---AACGGC--GGAC-C-AG-TTTATAGa
gi|4 : T------GACTACGCGGG-ATTGGGCAA-A-----GC---AGCGGAG-A-TTT-ACT--T-GAGGCATCA--TT--GGATT-GTTTAACCCTAA-CGGTGATGGGAAGT-AACACCGACG-AAATTCAACGAATGAG-A--TGTTTGT--TG-TG-AC-AATTTG-A-C-ATCCCAC-CA-G-A--GC-GT-TTCA-T-TAATTCTT--------ATGCATGGAAGA----C-GT--GTACCA-TC-AAGGAAAACGGCG-GGACGC-AGTTTTATAGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacggtgtacccgttgtttgtgcgtagcatcaatcaacgggatgccagttt
gi|4 : gTACGGCGT-A-CCCGTTGTTTGTTGCGT-AGCATCAA--TCAACG-GAATGCCA--GTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacggcgtacccgttgtttgttgcgtagcatcaatcaacggaatgccagtt
gi|5 : gtgactacgcgggattgggcaaagcagcggagatttacttgaggcatcattggattgtttaaccctaacggtgatgggaagtaacaccgacgaaattcaacgaatgagatgtttgttgtgacaatttgacatcccaccagagcgtttcattaattcttatgcatggaagacgtgtaccatcaaggaaaacggcgggacgcagttttatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnT------GACTACGCGGG-ATTGGGCAA-A-----GC---AGCGGAG-A-TTT-ACT--T-GAGGCATCA--TT--GGATT-GTTTAACCCTAA-CGGTGATGGGAAGT-AACACCGACG-AAATTCAACGAATGAG-A--TGTTTGT--TG-TG-AC-AATTTG-A-C-ATCCCAC-CA-G-A--GC-GT-TTCA-T-TAATTCTT--------ATGCATGGAAGA----C-GT--GTACCA-TC-AAGGAAAACGGCG-GGACGC-AGTTTTATAG
gi|5 : gTACGGCGT-A-CCCGTTGTTTGTTGCGT-AGCATCAA--TCAACG-GAATGCCA--GTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacggcgtacccgttgtttgttgcgtagcatcaatcaacggaatgccagtt
gi|6 : gtgactacgcgggattgggcaaagcagcggagatttacttgaggcatcattggattgtttaaccctaacggtgatgggaagtaacaccgacgaaattcaacgaatgagatgtttgttgtgacaatttgacatcccaccagagcgtttcattaattcttatgcatggaagacgtgtaccatcaaggaaaacggcgggacgcagttttatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGT-AACACTGACG-AAA-TCAACGAA-AAG-ATATGTTTTT--TG--ATACAAACTTG-ACC-AT-GCAATCA-TGG--GT-AT-ATCA-G-TAAT--CT--------ATGC-TGGAAGA----CGG---GTAGCA-TC-AGG---AACGGCG-GGAC-CAAG-TTTATAG
gi|6 : TACGGCGTTA-CCCGTTGTTT-T--CGT-AGCA-CAATCTCAACGCGGATGCCAATGTTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacggcgttacccgttgttttcgtagcacaatctcaacgcggatgccaatgttt
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gi|8 : AAACTGGTTG-GC-T-G--TT-GAGT--TTACGCCAA-T-GG----T-AC-ACTA-CAG---CAG--TAC-GGCC-AAA-T--TTT--G-TAAAATC----------AA-AT-GTT------GAA--CGCGGA-ATTTGG-AA-A-----GC---AGCG-AA-A-TTT-ACT--G-AAGGCATCA--TG--GGATTTGTTTA----CAA-CGGTGATGG-AAGT-AA-AGCG-----AA-T-A--GAA-GAG-AT-TGTGTGT--TG-TGTGCAAAATTGAA-A-AT-GCAA-CA-T-G--G--GT-TTTAGT-TAATTCTG--------ATGCA-GGAAGAAAGGC-----GTAG-A-TC-AGGC--AACG--G-GGA--C-AG-TTT
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