lowQualScore : 7777777777 4 111 22222 3333 1 1 1 4 22222 66666666666666666666666666 22 444 11 1 33333 11 2222222 22 33 1 1 3333 1 22 11 11 222 11111 1 222 2 1 1 1 444444444 22 111 11 11 1 33333333333 4444444444444444 1111111 1 11 1111 1111 111 111 1111 1111111 11111 111111 1 222222222222222222222 11111 111 33333333333 111 1111111 1 2222 222222 1 1111111 11 1111 111111111 333333333333333333333 11111 22222222222 11111 11 111 22222 33333333333333333333333333 22222 1111 1 1 11 1 11111 333333333333333333333333333333333333333333 1111111111 111111 1111111 111111 111 77777777777777777777777777777 333333333 111111111111111 22222222222222222 111111 1111
lowQualScore : 6 1111111111 0 777 0 33333 1111 3 3 3 0 33333 88888888888888888888888888 00 6 222 00 3 55555 7 88 88 6 1111111 00 00 6 3 3 7 7 0000 3 00 7 3 3 22 33 555 44444 0 0 55 888 2 0 3 9 0 2 2 0 2 222222222 2 00 666 22 1 33 0 3 99999999999 9999999999999999 5 6 888 77 5 66 8 6666666 2 7 77 4 1 1 77 22 7777 77 2222 5 5 77 999 5 3 555 5 5 5 5 66 5 0 5 0 9999 5 0 5 6666666 5 5 33333 333333 3 444444444444444444444 77 77 77777 5 5 5 5 6 5 555 22222222222 999 5555555 77 1 5 6 2222 3 5 77 5 77 5 5 66 1 888888 5 7 5 5 6666666 5 5 77 1 33 2222 5 5 66 5 4 777777777 777 66 66 8 444444444444444444444 66 5 9999 22222 22222222222 77777 5 44 11 000 66 5 5 888 22222 88888888888888888888888888 6 22222 5 5 5 6 888 0000 4 1 5 7 55 5 4 2 44444 4 88888888888 4 666666666666666666666666666666666666666666 9999999999 4 222222 4 9999 66 4 9999 66 3333333 4 000000 55 55 111 4 4 8 9 7 777 4 55 88888888888888888888888888888 3 000000000 7 999999999999999 3 3 55 88888888888888888 1 777 111111 777 2 99 99 2222 6
lowQualScore : . .......... . ... . ..... .... . . . . ..... .......................... .. . ... .. . ..... . .. .. . ....... .. .. . . . . . .... . .. . . . .. .. ... ..... . . .. ... . . . . . . . . . ......... . .. ... .. . .. . . ........... ................ . . ... .. . .. . ....... . . .. . . . .. .. .... .. .... . . .. ... . . ... . . . . .. . . . . .... . . . ....... . . ..... ...... . ..................... .. .. ..... . . . . . . ... ........... ... ....... .. . . . .... . . .. . .. . . .. . ...... . . . . ....... . . .. . .. .... . . .. . . ......... ... .. .. . ..................... .. . .... ..... ........... ..... . .. .. ... .. . . ... ..... .......................... . ..... . . . . ... .... . . . . .. . . . ..... . ........... . .......................................... .......... . ...... . .... .. . .... .. ....... . ...... .. .. ... . . . . . ... . .. ............................. . ......... . ............... . . .. ................. . ... ...... ... . .. .. .... .
lowQualScore : 0 0000000000 0 777 7 77777 7777 3 3 3 0 33333 77777777777777777777777777 00 7 000 33 3 33333 3 33 33 7 7777777 00 33 0 3 3 3 3 3333 3 00 3 2 2 55 88 888 22222 2 0 88 888 5 0 2 0 0 5 5 0 2 888888888 5 55 555 22 2 22 0 2 88888888888 2222222222222222 7 6 999 99 7 99 4 2222222 7 6 99 3 7 4 99 66 9999 99 1111 7 7 99 666 7 9 777 7 7 7 7 99 0 4 0 4 5555 0 1 0 2222222 0 0 99999 888888 8 000000000000000000000 99 99 44444 7 7 7 7 0 7 777 99999999999 333 1111111 99 4 7 0 2222 6 7 99 7 99 6 7 66 4 777777 7 1 7 7 6666666 7 7 99 4 66 1111 7 7 99 0 4 888888888 888 11 11 9 444444444444444444444 11 0 0000 55555 00000000000 33333 7 99 66 000 99 0 0 888 00000 22222222222222222222222222 0 55555 0 0 0 0 888 6666 0 9 0 1 88 2 4 1 44444 0 99999999999 4 999999999999999999999999999999999999999999 2222222222 4 888888 4 4444 11 4 4444 11 9999999 4 777777 55 55 000 0 0 0 4 9 000 0 55 55555555555555555555555555555 6 555555555 2 999999999999999 6 6 00 44444444444444444 6 888 444444 888 7 22 22 7777 0
consensus : NNNNNNNNCATAGT-TACTTACTAAGATTTT-AAATA-A-AAATTC-A-A-AAGTNAT-AA-CC-ATT-GTA-ATTCTTTCAT--TA-CAGT-----AC-G---ANAA-GTT-TGC-GATGGC-AACATCAGATCC---CTGGCCAGAGCG-CAA--AACGTGAAAC--GCTGTCAGTTA-TGTCC-GGCAAA-CACAGAA--TCTGCA-GCAGA-GACCGTGTGTAACACATGTC-ANGTCAA-CCT-CTGTAAGGATTGTGTAG-GACATCAC--ATGACCT-CAAATCCCACCAT--ACGCCAT-GATGTTG-TCACTTATTCAATTCAAAAAAC-TAGAAATCGTTCCA-CCCCAGTG--TAAAC--TACATA-AACAACAGA-AATGT-GAAACAT-TCTGTGAACAAT-GTGATTCTCCAATTTGT-CT--------GAAATGTC------TTG-----CCTCTGGATCTCATGAAA-AACACGACG-TG--TCAC-AGATT--TCAGAAATCCAC-------AGTTCTAG--AAAACAGCTG-ATAGA--AAGC-GA----TACACAA--GA----A-CTT-GAA--AGGAA-C-ATTGC-ACCTGTG---TT-T-G-AAT-CAATTCTCTCTGAAA--T-AGAAGAAATG-TTGTCAAATGTTC-TCCA-AAAACAC-GG-------AGA-AAG-ACAACA----AACCATT-----ACTGAATT-C---GG---C----------AAAAGA--TG--TCATGCACGTGT-AGAC-A-T-TGTCATC-AACA--GA-----------TATC-T-GAGTG-AT-T-CAA--AGAAG-ATGGAAAAACAAGAT-GGTGACTC---AATCAAAACCC-T--GAA-AT--CNG-AGTT-CGAT-----AAAT-TACA-ATC-ATCAA-TAC------AATC-AA-CT--ATAAAT--GAA----AAT-C-ATTCTAT--CC-TTGCTTCCA-AC---------G---AT--T--T-CT-----------------CC--AA--AT-T--T-A-----CCAGTT-A-----TG--CTTCG----AGGA-ACGAGGAATTAAGAAAT---GTTCCC--TC-TAG-ATTTGAA---TTAACA---NTTCCA--------------CCATTNG--AC-CTCAGAGAAC--TAACAGA-AC-AA-GCGTTGAAG---GA----ATTCATGTGGAGTCATTCCTA-CCTCCAT-AAAAACC----GACA-TT----C-CA--GGGCAAGTCT-TGCAA--------GTC---ACT------CA---TC----------C-AGTC-T-----C--CAG-TGT------CAAC-GA----AC--CAAA-TA----AAAAA--TTAT------CAGG-AAAG---C--CTG--AAGT--ATT---A-G-CAGCT-CTCAAAACCGG---CT-A--T---A---A-NN----CA--C--TN---G-CAGAG-TN--------TGCTG-----TAT----T--CCT-A-ACACA--G--------A-T--C---AATTCT---ATGTCAG--T--GGTGA---CAATAAN-ATCA--TCAGACG-C--ATGAACACT
Reference ( gi|3 ) : AATATTCACATAATGTATTTA---AGATTTTGAAATA-A-AAATCC-AGA-AAGTTGTTAA-CC-ATT-GTACATTCTTTCAT--TG-CAGT-----ACAG---AGAA-GCT-TGC-TATGGC-AACATCAGATCC--ACTGGCCAGAGCA-CAA--GGCGTGAAAC--GTTGTCAGTTA-TGTCCCGGCAAA-CACAGAAAGTCTGTA-GCAGA-GACCGTGTGTAACACATGTC-TTATCAA-CCT-CTGTAAGGATTGTGTAG-GACATCAC--ATGACCT-CAAATCCCACCAT--ACGCCAT-GATGTAG-TCACTT-TTCAATTCAAAAAAC-TAGAAATCATTCCA-CCCCAATG--TACAA--TACATG-AACAACAGA-AATGT-AAAACAT-TCTGTGAACAAT-GTGATTCTCCAATTTGT-CT--------GAAATGTC------TTG-----CCTCTGGATCTCATGAAA-AACACAACA-TG--TCAC-AGATT--TCAGAAATTCAC-------AGCTTTAG--AAAACAGTTG-ATAGA--AAGA-GA----TACACAA--GA----A-CTT-GAA--AGGAA-A-ATTGC-ACCTATG---TT-T-G-AAT-CAATTCTCTCTGAAA--T-AGAAAAAATG-TTGTCAAATGTTC-TACA-AAAACAC-GG-------AGA-AAG-ACAACA----AACCATT-----ACTGATTT-T---GG---C----------AAAAGA--TG--TCATATACTTGT-AGAC-A-T-TATCATC-AACC--GA-----------TATC-G-GAGTA-AT-T-CAA--AGAAG-ATGGAAAAACAAGAT-GGCGACTC---TATCAAAACCC-T--GAA-AT--CAG-AGTT-TGGT-----AAAT-TACA-ATC-ATCAA-TAC------AATC-AA-CT--ATAAAT--GAA----AAT-C-ATTCTAT--CC-TTGCTTCCA-AC---------G---AT--T--T-CT-----------------CC--AA--AT-T--T-A-----CCAGTT-A-----TG--CTTCA----AGGA-ATGAAGAATTAAGAAAT---GTTCCC--TC-TAG-ATTTGAA---TTAACC---CTTCCA--------------CCAATGG--AA-CTCAAAGGGC--TAACAGA-AC-AA-GTATTGAAG---GA----ACTCCTG-GGAGTCATCCCTA-GCTCAAT-AAGAACT----GACA-TT----C-CA--GGGCAAGTCT-TGCAA--------GTC---ACT------CA---TC----------C-AGTC-T-----C--CAG-TGT------CAAC-GA----AC--CAAA-TA----AAAAA--TTAT------CAGG-AAAG---C--CTG--AAGT--ATT---A-G-CAGCT-TTCAGAACTAG---TT-A--T---A---ATCT----CA--C--TA---G-CAGAG-TC--------TGTTG-----TAT----T--CCT-A-ACACA--G--------A-T--A---AATTCT---ATGTCAG--T--GGTGA---CAATGAG-ATCA--TCAGACA-C--ATAAACACT
gi|1 : CATAGT-TACTTACTAAGATTTT-AAATA-ATAAATCCCAGATAAGTGATTAAACC-ATG-GTA-ATTCTTTCAT--TG-CAGTTCGTCAC-G---ACAA-GTT-TGCAGATGGCTAACATCAGATCC---CTGGCCAGAGAG-CAACAAACGTGAAACCCGCTGTCAGTTAATGTCCCGGCAAAACACAGAAACTCTGCA-GCAGA-GACAGTGTGTAACACATGTC-ATGTCAACCCT-CTGTAAGGATTGTGT-G-GACATCAC--ATGACCTGCAAAACCCACCATAGACGGCATGGATGTTGTTCACTTATTCAAATTAATAAATAGAGAAATCGTTCCACCCCCAGTG---AAAC--TACATGAAACAACAGAGAATGTGAAGACAT-TCTGTGAACAAT-GTGATTCTCCAATTTGTGCTTTGAAGAAAAAATGTCCCCTTTTTGCCTCCCCTCTGGATCTCATGAAA-AACACAATG-TG--TCACAAGATT--TCAG-AATCCACAGTGTCTAGCTATAG--AAA--AGTTGAATAGA--AAGC-GAT---TACACAA--GA----A-CTT-GGA--AGGAACA-GTTGCAACCTGTGA--TT-T-G-AAT-CAATTCCTTCTAAAA--T-AGAGAAAATG-TTGTC-AATGTTTGTCCATTAAACAT-GG-------AGA-AAGAACAAC------ACCTAC-----ACAGAATT-TCGGGG---C----------GAAAGA--TG--TCATGCACGTGTAAGACAA-T-TGTCATC-AACCAGGA-----------TATC-T-GAGTG-ATAT-CAACCAGAAGCATGGAAAAACAAGAT-GGTGACTC---AATCAAAACCC-TAGAAA-AT--CAG-AATT-CGGGGAGGAAAATCTACACATCAATCAC-TACACCAGGAATCAAA-CT--ATCAATCAGAAGGACAAT-CAATTCTACTACCATTGCTTCCACAC---------GCTCAT--T--TACT-----------------GCGGAA--AT-TAGT-AGTGCTCGAATTGA-----TGACCTTCG----AGAA---GACGAATTGCGACATGGGGTTCCTCATCATA----CTGAATAGTTAACA---GTTCCA--------------CCATTGG--ACTCTCAGGAAAA--CAAGAGA-ACAAA-GCATTGAAGATTGAGAGTACTCATGTGGAGTCATTCCTA-CCTCCATAAAAAACTTTTCGACA-TA----CACA---GGCAAATCT-TGCAATTTCCTGGATCTAAACT------CACAGTC----------C-CGTCAT-----G--CAGTTGT------C-AC-GAGAATAA--CAAA-TA----AAAAA--TTAT------CAGG-AAAA---G--CTG--AAAT--ATT---A-GCCAGATACTCAAAGCTAGACTTT-A--T---A-----CTTAA-CA--CGTTA-----CAGAG-TCA-------TGCTG-----TACGGGGTGGCCT-ACATACA--G--------A-TCCA---AATTCT---ATGTCA---C--AGTGA---TAATG
gi|4 : cattggtaacaatcgtcatatccttaccgggtatttacaatcaaatgaggaaaaatgatataactgttcatctgttagaaattgtatattacactgttgtttatatcctataaaatttgcacAATAGA-AAATTC-A-A-AAGTAATAAA-CTTATTAGTA-ATTATTTCTT--TA-CAGT-----A------AGACTGTT-TGC-CATGG--AA-ATCAGATCC----TGG--AGAGCAACAA--ATTGTGAA-C--GCTGT-AGTTA--GT---GGCAAA-CACAGAA-GTCTGCAAGCAGA-G--CGTGTGTAACAC--GTC-AAGTCAA-CTT---G-AAGG-TTGTGTAGAGACATCACTGATGAC------ATCCCAT-------GCCAT-GA-GTA---TA--T-TTCA-TT---AAAAT-TA-AAATCATTC-A-CCGCAGTGGGTAAAC--TA-AT--AACAACAGA-A-TGT-GAAACATATCTGTGAACAATTGTGATTCTCCAATTTGT-CT--------GAAATGT-------TTG------CTCTGGTACTC-TGAAACAACG-AATG-TG--T-A--AGATT--TCAGAA--TTAC-------AATTCTAG--AAAAAAGCTGAATAG----ATG-GA----TACACAA--GA----AGATT-GAA--GAGAA-C-ATTGC-AACCATGTGATT-T-G--AT-CAATTCACTCTGAAAAGTGAGAAATATTGTTTGTCAAAT-TTC------AAACCACTGG-------AGA-AAG-ACAAC-----AACTATT------CTGAATT-C---GG---C----------AAACGAATTG--T-ATGCAAGTGT-AGAA-G-TATGTCATC-AACA--GA-----------TATC-T-GAGTG-AT-G-CAA--AGAAGAATGGAAAAACAAGAT-GGTGATTC---AATC-AAACCC-T--GAC-CT--CAGAAGTT-TGAT------AAT-TACA---T-ATC-A-TAC-------AT-----CT--AT--AT--GAA----AAT-C-ATTCTGA--TC-TTGCTT-CA-AC---------G---AT--T--TGGT----------------------A--AT-T--TAA-----CCTGTT-A-----TGC-CTTCG----AGGCTATG-CGGATTAAGAAAT---GTTC-----C-TAG-AATTGAA---TTAAACTATCTTTCACTGGTCTGATTACTCCACTTG---A-CTCAGAGAA---TAACAGATAC-AAGGCGTTGAAA---GA----ATTCATATGGAGTAATGTCTACATCCTAT----AACC----GAC--TT----C-----GGGC-AGTC--TGCAA--------AAT---ACT------C----TC-------------GTC-T--------CAG-TGT------CAAC-GA----AA--CAAATTA----AAAAA--ATAT-------AGG-AAG-------CTG--AAGT--ATT---A-G-CAGCT-TTCA-AACCGG---CT-A--TATAA---A-------CA--T--T------CAGAG-TTAA------TGCTG-----T---------------ACACA--G--------A-T--------TTAT---CTACCA---TAAGGTGA---AAA--AGTATAA--TCAGACA-A--GTGAACACTtaagagagaaacaaatatatacatcagatgagcaacgagggggctactacactgtagggagatcaccacaagtcaggatatactctcaacagaatgctgacaggtgcaccttagggcgaaggagagatatactggtgtatcaactagcacaatgggatgga
gi|2 : ttaag-A-AAATTC-ACA-TAGTT---AA-CC-ACT-GTA-ATTCTTTCATATTATCAGT-----ACAGGCGAAAA-GTTCTGT-AATGGC-AACATCAGATCCCCACTGGCTAGAGCA-CA---GACCTGAAAC--GT-GTCAGTTA-TGTCC--GCAAA--ACAAAA--TCTGCA-GCAGAAGACCGTGTGTAACACATGCCATGATCAA-CCTACTGTAAGGATTGTGTAG--ACATCAC--ATGACCTTCAAATCCCATTAT--ACGCCAT-GAT-T-G-TCACTTATTCAATT-AAAAAAC-TAGAAATTGTTCCA-CCCCAGTG--T-CAAACTACATA-AACAACAGA-A-TGT-GAAACAT--CTGTGAACAAT-GTGATTCTCCA-TATGT--T--------GAAATGTC------T-------CCTCTGGATTTCATGAAA-AGCA--ACAATGGCTCAC-AGATTCATCAGAAATCCAC-------AGTTCTAAGAAAAACAGCTG-ATAGA--AAGATGA----TACACAA--GA----A-CTTAGAA--AAGCG-ACATTGC-ACCTGTG---TT-T-GGAAT-CAATTCTCTC-GAAA--T-AGAAGAAATG-TTGCAAAATGTTG-TCCA-AAA-CAT-GG-------CGA-A-G-ACAACA----AACCATT-----ACTGAATC------G---C----------AAAAA----G--TCATACA--TGT--GAC-A-T-TGTCATCGAACA--GA-----------TATC-T-GAGTG-AT---CAA--AGAAG-ATG-AAAAACAAGAT-GGTGACTCGAGTAGCGAGAGAA-T--GAA-ATATCTG-ACTTATTGA-----AAAG-TGCATATC-ATCAA-TAC------AATC-AAACT--ATAAAT--GAA----AATTC-ATTCTAT--CC-TTGTATCCA-AC---------G---AT--T--T-CT-----------------CC--AA--AT-T----A-----CCAGTT-A-----TG--CTGCATCGTGAGA-ACGAGGAGTTACGAAAT---GTTCCC--TC-TAG-ATTTGAA---TTAACA---CTTCCA--------------CCATTTG--GA-CCCAGAGAAC--TAACAGA-AC-AA-GCATTGAAG---GA----ATGCATG-GGAGTCATTCCTA-CCTCCAT-AAAAACC----GACA-TT----C-CA---GGCAAGTCT-TGCCA--------GTC---ACT------CA---TC----------CAAGTC-T-----C--CAG-TGT------CAAC-GA----AC--CAAA-TA----AAAAAACTTAT------CAGG--AAG---C--CTG--AAGT--ATT---A-G-CAGCT-CTCAAAACTGG---TT-AACT---A---A-------CA--CT-TA------AGAGCTCA-------TGCTG-----TAT----T--CCT-A-ACACA--G--------A-T--C---AGTTCT---ATGTCAG--T--GGTAA---CAATAAG-ATCA--TCAGACA-CCTATGAACACTtgaggg
gi|7 : catttgtactgtgcatacccccttaccgggttatttacaaatatcaaaataaatacagttgatttgtttactgtgtttcagccaaatgtagttaaactatgcatacacctgtttatataccGGATTGTGTAG-GACATCAC--ATGACAT-CAAATCCCACCAT--ACGTCAT-GATGTTG-TCACTT-TTCAATACAAAAAAC-TAGAAATCATTCCA-CCCCAATG--TAAAC--TACATA-AAAAACAGA-AATGT-GATACAT-TCTGTGAACAAT-GTGATTCTCCAATTTGT-CT--------GAAATGCC------TTG-----CCTCTGGATCTCATGAAA-ATCACGATA-TG--TCGC-AGATT--TCAGAAATCCAC-------AGCTCTAG--AAAACTGTTG-ATAGA--AAGA-GA----TACACAA--GA----A-CTT-GAA--AGAAA-C-ATTGC-ACCTGCG---TT-T-G-AAT-CAATTCTCTCTGAGA--T-AGAAGATATG-TTGTCAAATGTTC-TACA-GAAACAC-AG-------AGA-AAG-ACAACA----AACCATT-----ACTGAATT-C---GG---C----------AAAAGA--TG--TCATACACTTGT-AGAC-A-T-TGTCATC-AACA--GA-----------TATC-T-GAGTG-AT-T-CAA--AGAAG-ATGGAAAAACAAGAT-GGTGACTC---AATCAAAACCC-T--GAA-AT--CTG-AGTT-CGAT-----GAAT-TACA-ATC-ATCAT-TAC------GATC-AA-CT--ATAAAC--GAA----AAT-C-ATTCTAT--CC-TAGCTTCCA-AC---------G---AT--T--T-CT-----------------CC--AA--AT-T--T-A-----Cgaggcggactactactggggag
gi|10 : gCTCTGGGTCTCATGAAA-AACACAACG-TG--TCAC-AGATT--TCAGAAATCCAC-------AGGTCTAG--AAAACAGCTG-ATAAA--AAGC-GA----TACACAA--GA----A-CTT-GAA--AGAAA-C-ATTGC-ACCTGTG---TT-T-G-AAT-CAATTCTCTCTGAAA--T-AGAAGAAATG-TTGTCAAATGTTT-TACA-AAAACAC-AG-------AGA-AAG-ACAACA----AACCATA-----GCTGAATT-C---GG---C----------AAAAGA--TG--TCATTCACGTGT-AGAT-A-T-TGTCATC-AACA--GA-----------TATA-T-GAGTG-AA-T-CAA--ACAAG-ATGGAAAAACAAGAT-GGTGACTC---AATC
gi|6 : GGATCTCATGAAA-AACATGATG-TG--TCAC-ATATT--TCAGAAATCCA---------GTTCTAG--AAAACAGCTG-ATAGA--AAGC-GA----TAAAAAAAAGA----A-ATT-GAA--AGTAA-C-ATTGC-ACCTGTG---TT-TTG-AATTCAATTCTCTCT-AAA--T-AGAAGAAA-G-TTGTCTAATGTTG-TCCA-AAAACAT-GG-------AGA-AAG-ACAACA----AACCATA-----ACTGAATT-C---GG---C----------AAAAGA--TG--TCATGCACGTGT-AGAC-A-T-TGTCATC-AACA--GAA----------TATC-GTGAGTA--T-T-CAG--AGAAG-ATGGAAAAGCAAGAT-GGTGACTC---AATCAAAACCCCT--AAA-AT--CCG-AGTA-CGAT-----AAAT-TACA-ATC-ATCAA-TAC------AATC-AA-CT--ATAAAT--GAA----AAT-C-ATTCTAT--CC-TTGCTTCCA-AT---------G---AC--T--T-CT-----------------CC--AA--AT-T--T-A-----CCAGTT-A-----TG--CTTCG----AGGA-ACGAGGAATTCCGAAAT---GTTCCC--TC-TAA-ATTTGAA---TTGACA---GTTCCA--------------CCATTGG--AC-CTCAGAGAAC--TAACAGA-AC-AA-GCATTGAAG---GA----ATTCATG-GGAGTCATTCCTA-CCTCCAT-AAAAACC----GACA-TT----C-CA--GGGCAAGTCT-TGCAA--------GTC---ACT------CA---CC----------C-AGTC-T-----C--CAG-TGT------CAAC-GA----CC--CAAA-TA----AACAA--TTAT------CAGG-AAAT---C--CTG--AAGT--ATTTAAA-A-CAGCT-CT-AAAAATGG---CT-A--T----------------A--C--TA---A-CAGAG-TA--------TGCTG-----TAT----T--CCT-A-ACACA--G--------A-T--C---AATTCT---AGATCAG--T--GGTTT---CTATATC-ATCA--TCAAACG-T--ATGAGCACT
gi|19 : CATGAAA-AACACAATG-TG--TCAC-AGATT--TCAAAAATCCAC-------
gi|5 : GATT--T-AGAAAT--AC-------AATTCTAG--AAAA--GCTG-A-AGATGAGGC-GAGTAGTACGAAA--GATGAAA-CT--GAATGAGGCA-C-ATTGA-AC-TGTG---TTAT-G-AAC-TAATTCTTCATGAAA--T-ATGGAAGATG-TTGTCAAATGTTT----A-AAAACAT-GGGAAAGAGAGACAAG-ACAATATTATAAATGTCGGACGACGGATTCAT---GGATTCGGAGAAAAGGAGAAGA--TGGGTCAT-CACGTGT-AG-C-AGT-TGT-ATC-GGTC--GAGTACAGATTAATATTTG-GAGTGGAT-TGCAA--AGAAG-ATTGGAAAACAGAGTAGGTGATT------TCAAA---C-T--GAAGAT--TAG--GTT-GGATGTTG-AAAT-TACAGAGT-ATCAAGTAC------A-TC-AA-CCTAATACATT-GAA----TAT-T-CCCCT-T--CC-TTGTT--CA-ACATGGCGAGGG---ATGAT--T-CTAAGGGAGGTAGGAGGAGCC--AA---T-T--T-A-----ACTGTT-A-----T---CTTAG----AGGA-ATGCGGAGTTAAGAA-T---GTTAAC--TC-TAGGATTTGAA---TTAAAC---TTTCCA--------------CAATTTG-----CTCAGAGAAC--TAACAGA-A--AA-GCGT-GAAA---GA----ATTCATGTGGGATCATTTCT-----CCAT-AAAG-------GACA-TT----C--A--GGG-AAGTCT-TGCAA---------TC----TT------C-----C----------C-AGTC-----------AG-TGT--------AC-GA----AC---AAA-TA----AAAAA--ATAT-------AGG-AAAG---C--CTG--AAGT--ATT---A-G--AGAT-TTCAAAACCGG---CT-A--T---A---CTAA----CA--T--T------CAGAG-TA--------TG-CG-----T---------------ACACA--G-------------A---AATT-T---ACATAAG-----GGTGA---CA
gi|16 : gGAAA--T-AGAAGAAATG-TTGTCAAATGTTC-TCAA-AAAACAT-GG-------AGA-AAG-ACAACA----AACTATT-----ACTGAATT-C---GG---C----------AAtagttaaatagaaaatgaactgagcgggccactacctgggggagatc
gi|14 : GACTC---AATCCAAACCC-T--AAA-AT--CTG-AGTT-TGAT-----GAAT-TACA-ATC-ATCAA-TAA------AAAC-AA-CT--ATAAAT--GAA----AAT-C-ATTTTAT--CC-TTGCTTCCA-AT---------G---AT--T--T-CT-----------------CC--AA--A
gi|9 : tTAT--CC-TTGCTTCCA-AC---------G---AT--T--T-CT-----------------CC--AA--AT-A--T-A-----CCAGTT-A-----TC--CTTCC----AGGA-ATGAGGAATTAAGAAAT---GTTCCC--TC-TAG-ATTTGAA---TTAACA---GTTCCA--------------ACATTGA--AC-CTCAGAGAAC--TAACAGA-AC-AA-GCATTGAAG---GA----ATTCCTG-GGAGTCATTCCTA-GCTCCAT-AAGAACT----GACA-TT----C-CA--GGGAAAGT
gi|8 : -AC---------G---AC--TGTT-CT-----------------CCCGAACGATGT--T-A-----CCAGTTCAGCGTTTG--CTTCG----AGGA-ATGA-GAATTTAGAAAT---ATTCCC--TC-TAG-ATTTGAA---TTAACA---GT--CA--------------CCA-TGGTGGG-CTCAGAGA-CAATAACAGA-AC-AA-GCATTGAAG----A----ATTCATG-GGAGTCATTCCTA-CCTCCAT-AAAACCG----GACA-CT----C-CACAGGGCAAGCTT-TGCAA--------GTCC--ACTT-----CA---TC----------C-AGTC-T-----C--CAA-GGG------CAAC-GA----AC--CAAA-TA----AAAAA--TTAT------CA-G-AAAG---C--CTG--AAAT--ATT---ACG-CAGCTCTCCAAAACT-G---TTGA--T---ATACAACA----CAT-C--CA---GTCCGGG-TCGTACAGCTTGGTA-----TGT----T--CCTGA-ACACATCG--------AGC--ATCCATTTCTATAATGTCAGTCT--GGTGA---C-ATAAT-ATCATGTCAGACACC--ATGAACACTtgntgaagtattagcagatctcaaaactggctatgccatcacttacagagtatgctgtattcccaacacagatcagttctatatcagtggtaacaataacatcatcaaacgcatgaacact
gi|12 : TCCC--TC-TAG-ATTTGAA---TTAACA---CTTCCA--------------CCACTTG--AC-CTCAGAGAAC--TAACAGA-AC-AA-GCGTTGAAA---GA----ATTCATT-GGAGTCATTCCTA-CCTCCAT-AAAAACC----GACA-TT----C-CA--GGGCAAGTCT-TGCAA--------ATC---ACT------CA---TC----------C-AGTC-T-----C--CAG-TGT------CAAC-GA----AC--CAAA-TA----AAAAA--ATAT------CAGG-AAAG---C--CTG--AAGT--ATT---A-G-CAGCT-TTCAAAACCGG---CT-A--T---A---CTAA----CA--C--TT---T-CAGAG-TA--------TGCTG-----------------T-A-ACACA--G--------A-T--C---AAGTCaaggggc
gi|11 : AT-ACGAACC----GACAGCTGAGAC-CA--CGGCAAGTCTGTGCAATAA-----GTC---ACCTCACACCA---TCATTACCAAGGC-AGTC-TGCGCGCAACAA-TGTGGTATCCAACTGA----ACTCCAAA-CATAATAAAAA--TTATATATCACAAG-AAAGACAC--CTGAAAAGTAAATTA--A-G-CAAGT-CTCAAAACTGG---T-----T---A---ATCTAAAACAAGC--CATATG-TAAAC-GC--------TGTTACCACTTGC----T--CCT-A-AC-CA--GTCTAGTACA-T--A---ATTTCT---ATGTCAG--T--GGTGAACCCAAT
gi|9 : AGAACA----AGCA-TT----G-AA--GG--AATTCC-TGGGA--------GTC---ATT------C-----C----------T-AG-C-T-----C--CA-----------TAA--GA----AC--TGAC-----------A--TT-C------CAGGGAAAG---TTGNTG--AAGT--ATT---A-G-CAGAT-CTCAAAACTGG---CT-A--T---G---CCAT----CA--C--TT---A-CAGAG-TA--------TGCTG-----TAT----T--CCC-A-ACACA--G--------A-T--C---AGTTCT---ATATCAG--T--GGTAA---CAATAAC-ATCA--TCAAACG-C--ATGAACACTa
gi|13 : tatccttgcttccaacgatttctccaaatataccagttatccttccaggaatgaggaattaagaaatgttccctctagatttgaattaacagttccaacattgaacctcagagaactaacAAG---T--CTG--AAGT--ATT---A-G-CAGCC-CTAAAAACAGG---CT-A--T---A---AAGA----GA--C--TT---G-CAGAG-TA--------TGCTG-----TAT----T--CCT-A-ACACA--G--------A-T--C---AATTCT---ATGTCAG--T--GGTAA---CAATGAG-ATCA--TCAGACA-C--ATGAACACT
gi|20 : ----CA--C--TT---A-CAGAG-TA--------TGTTG-----TAT----T--CCT-A-ACACA--G--------gaggggacactactgggggagatc
3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|15 ): ATGGGGGGATACAACGTCAGGAATCTCCAGAGAGATTGACGGTGACAGGGAGGGAGATTGGTGTACTGATGGGATGATAGAGATATCAACAGACAAAAGAATAGA
Unaligned ( gi|17 ): ACCAAGTAGGAATCTCAGAAATTGACGGTGAAAGGGAGGAGAGATTTGGTGTACTGGACATGGAATGCAT
Unaligned ( gi|18 ): CATCATCAGACACATGGACACTGAGGGAACACTACTGGGGGAGATCGC
Alignments
lowQualScore : 2 222 1 2222 2222222 22222 11 1 1 11 1 44444444444 1 11 11 33333 11 1111 11 11 2 11 33 1 1 1 1 11 11 111 11 1 1 1111 1 22222222 22222222222222 1111 1111 1111 1 1111 333333333333333333333 1111111 1111111 1111 111 1 2222222 1 111111 11 1111 111111111 222222222222222222222 11111 11111111111 111111111 111111 1 22222222 111 2222222222222222222222222 11111111 111111 111111 111 444444444444444444444444444 111 111111111111111111 11111111
lowQualScore : 0 111 3 4444 5555555 66666 33 0 0 33 0 33333333333 1 3 0 66 22 2 00000 22 22 5555 2 3 33 6 2 33 2 0 2 22 77 0 0 3 3 1 0 0 22 3 0 0 8 11 666 3 11 8 7777 8 0 3 8 8 9999 8 0 8 0 8 88 8 0 8 99999999 99999999999999 5 77 5 66 2 5 7777 2 5 5 66 99 5555 66 0000 5 5 66 5 5 5 5 5 0 5 5 5 5 66 4 9999 1111 4 4 777 4 777777777777777777777 777 6666666 66 66 5 5 5 5 5 5 6666666 66 5 0000 5 5 5 000 66 0 5 4 66 2 5 66 5 66 1 5 888 4444444 5 5 5 5 444444 5 5 66 0 11 0000 5 5 66 4 4 666666666 777 55 55 8 999999999999999999999 55 4 7777 11111 55555555555 888 5 555 888 66 4 4 777 777777777 1 66 222222 66 1 88 4 1 4 4 4 0 777 9999 8 4 99999 3 888888 666 4 11111111 111 3333333333333333333333333 4 55555555 4 111111 4 8888 55 4 8888 55 111111 4 888888 55 55 666 7 3 3 3 2 55 666 111 888888888888888888888888888 3 44 333 999999999999999999 3 3 44 22222222 77777777 777 88888 777 1 66 99999
lowQualScore : . ... . .... ....... ..... .. . . .. . ........... . . . .. .. . ..... .. .. .... . . .. . . .. . . . .. .. . . . . . . . .. . . . . .. ... . .. . .... . . . . . .... . . . . . .. . . . ........ .............. . .. . .. . . .... . . . .. .. .... .. .... . . .. . . . . . . . . . . .. . .... .... . . ... . ..................... ... ....... .. .. . . . . . . ....... .. . .... . . . ... .. . . . .. . . .. . .. . . ... ....... . . . . ...... . . .. . .. .... . . .. . . ......... ... .. .. . ..................... .. . .... ..... ........... ... . ... ... .. . . ... ......... . .. ...... .. . .. . . . . . . ... .... . . ..... . ...... ... . ........ ... ......................... . ........ . ...... . .... .. . .... .. ...... . ...... .. .. ... . . . . . .. ... ... ........................... . .. ... .................. . . .. ........ ........ ... ..... ... . .. .....
lowQualScore : 0 000 3 8888 5555555 22222 88 0 0 88 0 55555555555 0 2 0 55 55 5 00000 88 00 8888 5 2 88 5 5 22 5 0 5 55 55 0 0 2 2 0 0 0 55 2 8 8 0 00 888 2 00 0 4444 0 6 2 0 0 8888 0 8 0 6 0 88 0 8 0 00000000 88888888888888 0 00 0 11 9 0 5555 5 0 0 99 55 6666 99 6666 0 0 99 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11 4 4444 1111 4 4 888 4 888888888888888888888 888 2222222 99 99 4 0 0 0 0 0 2222222 99 0 6666 0 0 0 111 99 0 0 4 11 0 0 99 0 99 0 0 000 1111111 0 0 0 0 444444 0 0 99 1 99 6666 0 0 11 4 0 000000000 000 55 55 0 000000000000000000000 55 4 0000 11111 88888888888 888 0 222 888 11 4 4 888 888888888 0 11 888888 11 0 33 4 1 4 4 4 7 888 4444 2 0 11111 6 222222 444 0 55555555 000 6666666666666666666666666 0 55555555 0 555555 0 5555 55 0 5555 55 555555 0 888888 00 00 444 3 6 6 6 5 00 444 444 888888888888888888888888888 3 66 555 000000000000000000 3 3 66 11111111 88888888 000 44444 000 0 99 00000
consensus : NNNNNNNNCATAGTGTACTTACTAAGATTTT-AAATA--A-AAATCCA-A---A-AGTNATT-AACC--ATT-GTA-ATTCTTTCAT--TG-CAGT-----ACA---GANAAGTT-TGC-NATGGC-AACATCAGATCC-C---TGGCCAGAGCA-CAA--ANCGTGAAAC--GCTGTCAGTTA-TGTCCCGGCAAA-CACAGAAA-TCTGCA-GCAGA-GACCGTGTGTAACACATGTCATG-TCAA-CCT-CTGTAAGGATTGTGTAG-GACATCAC--ATGACCT-CAAATCCCACCAT--ACGCCAT-GATGTTG-TCACTTATTCAATTCAAAAAAC-TAGAAATCGTTCCA-CCCCAGTG--T-AAACTACAT-AAACAACAGA-AATGTGAA-ACAT-TCTGTGAACAAT-GTGATTCTCCAATTTGT-CT--------GAAATGTC------TTG-----CCTCTGGATCTCATGAAAAACA-CGA-TGTGTCAC-AGATT--TCAGAAATCCACAGT-TCTAG----AAAACAGCTG-A-TAGA--AAG-CGA----TACACAA--GA----AC-TT-GAA--AGG-AACA-TTGC-A-CC-TGTG-TT-T-G-AAT-CAATTCTCTCTGAAATA--G-AAGAAATGTTGT----CAAATGTTC-TCCA-AAAACAC-GG---AGAAAG-ACAACAAACCATTAC---------------------TGAATTC---GGCAAAA-------GA--TG--TCATGCACGTGT-AGAC-A-T-TGTCATC-A-------AC--AGA-T----ATC-TG-AGTG-AT-T-CAA--AGAAG-ATGGAAAAACAAGAT-GGTGACTCAA-T--CAAAACCC-T--GAA-AT--CNG-AGTT--CGAT-----AAAT-TACA-ATC-ATCAA-TAC------AATC-AA-CT--ATAAAT--GAA----AAT-C-ATTCTAT--CC-TTGCTTCCA-AC---------G---AT--T--T-CT-----------------CC--AA--AT-T--T-A-----CCAGTT-A-----TG--CT---TCGAG-GA-ACGAGGAATTAAGAAAT---GTTCCC--TCTAG-AT-TTGAA---TTAA---------CANT--TC------CACCAT--TGGAC-CTCAGAGA-ACTAACAGA-AC-AA-GCGTTGAAG---GA----ATTCATGTGGAGTCATTCCTACCTCC-ATAAAAA-----CCGACA-TT----C-CA--GGGCAAGTCT-TGCAA--------GTC---ACT------CA---TC----------C-AGTC-T-----C--CAG-TGT------CAAC-GA----AC--CAAA-TA----AAAAA--TTAT------CAGG-AAAG---C--CTGAA--GTA--TT---A-G-CAGCT-CT-CAAAACCG--G---CTA---TA-N--AA-C-AC------------TTG-CAGA-G--T--ATGCTG--------TAT----T--CCT-A-ACACA--G--------A----TC--AATTCT---ATGTCAG--T--GGTGA---CAATAANATCA--TCAGACA-C--ATGAACACT
Reference ( family-3067 ) : NNNNNNNNCATAGT-TACTTACTAAGATTTT-AAATA--A-AAATTCA-A---A-AGTNAT--AACC--ATT-GTA-ATTCTTTCAT--TA-CAGT-----AC----GANAAGTT-TGC-GATGGC-AACATCAGATCC-C---TGGCCAGAGCG-CAA--AACGTGAAAC--GCTGTCAGTTA-TGTCC-GGCAAA-CACAGAA--TCTGCA-GCAGA-GACCGTGTGTAACACATGTCANG-TCAA-CCT-CTGTAAGGATTGTGTAG-GACATCAC--ATGACCT-CAAATCCCACCAT--ACGCCAT-GATGTTG-TCACTTATTCAATTCAAAAAAC-TAGAAATCGTTCCA-CCCCAGTG--T-AAACTACAT-AAACAACAGA-AATGTGAA-ACAT-TCTGTGAACAAT-GTGATTCTCCAATTTGT-CT--------GAAATGTC------TTG-----CCTCTGGATCTCATGAAAAACA-CGA-CGTGTCAC-AGATT--TCAGAAATCCACAGT-TCTAG----AAAACAGCTG-A-TAGA--AAG-CGA----TACACAA--GA----AC-TT-GAA--AGG-AACA-TTGC-A-CC-TGTG-TT-T-G-AAT-CAATTCTCTCTGAAATA--G-AAGAAATGTTGT----CAAATGTTC-TCCA-AAAACAC-GG---AGAAAG-ACAACAAACCATTAC---------------------TGAATTC---GGCAAAA-------GA--TG--TCATGCACGTGT-AGAC-A-T-TGTCATC-A-------AC--AGA-T----ATC-TG-AGTG-AT-T-CAA--AGAAG-ATGGAAAAACAAGAT-GGTGACTCAA-T--CAAAACCC-T--GAA-AT--CNG-AGTT--CGAT-----AAAT-TACA-ATC-ATCAA-TAC------AATC-AA-CT--ATAAAT--GAA----AAT-C-ATTCTAT--CC-TTGCTTCCA-AC---------G---AT--T--T-CT-----------------CC--AA--AT-T--T-A-----CCAGTT-A-----TG--CT---TCGAG-GA-ACGAGGAATTAAGAAAT---GTTCCC--TCTAG-AT-TTGAA---TTAA---------CANT--TC------CACCAT--TNGAC-CTCAGAGA-ACTAACAGA-AC-AA-GCGTTGAAG---GA----ATTCATGTGGAGTCATTCCTACCTCC-ATAAAAA-----CCGACA-TT----C-CA--GGGCAAGTCT-TGCAA--------GTC---ACT------CA---TC----------C-AGTC-T-----C--CAG-TGT------CAAC-GA----AC--CAAA-TA----AAAAA--TTAT------CAGG-AAAG---C--CTGAA--GTA--TT---A-G-CAGCT-CT-CAAAACCG--G---CTA---TA-A--NN-C-AC------------TNG-CAGA-G--T--NTGCTG--------TAT----T--CCT-A-ACACA--G--------A----TC--AATTCT---ATGTCAG--T--GGTGA---CAATAANATCA--TCAGACG-C--ATGAACACT
gi|1 : CATAGT-TACTTACTAAGATTTT-AAATA--ATAAATCCC-AGATA-AGTGATTAAACC--ATG-GTA-ATTCTTTCAT--TG-CAGTTCGTCAC----GACAAGTT-TGCAGATGGCTAACATCAGATCC-C---TGGCCAGAGAG-CAACAAACGTGAAACCCGCTGTCAGTTAATGTCCCGGCAAAACACAGAAACTCTGCA-GCAGA-GACAGTGTGTAACACATGTCATG-TCAACCCT-CTGTAAGGATTGTGT-G-GACATCAC--ATGACCTGCAAAACCCACCATAGACGGCATGGATGTTGTTCACTTATTCAAATTAATAAATAGAGAAATCGTTCCACCCCCAGTG----AAACTACATGAAACAACAGAGAATGTGAAGACAT-TCTGTGAACAAT-GTGATTCTCCAATTTGTGCTTTGAAGAAAAAATGTCCCCTTTTTGCCTCCCCTCTGGATCTCATGAAAAACA-CAA-TGTGTCACAAGATT--TCAG-AATCCACAGTGTCTAGCTATAGAAAAGTTGAA-TAGA--AAG-CGAT---TACACAA--GA----AC-TT-GGA--AGG-AACAGTTGCAA-CC-TGTGATT-T-G-AAT-CAATTCCTTCTAAAATA--G-AGAAAATGTTGT----C-AATGTTTGTCCATTAAACAT-GG---AGAAAGAACAAC--ACCTACAC---------------------AGAATTTCGGGGCGAAA-------GA--TG--TCATGCACGTGTAAGACAA-T-TGTCATC-A-------ACCAGGA-T----ATC-TG-AGTG-ATAT-CAACCAGAAGCATGGAAAAACAAGAT-GGTGACTCAA-T--CAAAACCC-TAGAAA-AT--CAG-AATT--CGGGGAGGAAAATCTACACATCAATCAC-TACACCAGGAATCAAA-CT--ATCAATCAGAAGGACAAT-CAATTCTACTACCATTGCTTCCACAC---------GCTCAT--T--TACT-----------------GCGGAA--AT-TAGT-AGTGCTCGAATTGA-----TGACCT---TCGAG-AA---GACGAATTGCGACATGGGGTTCCTCATC----ATACTGAATAGTTAA---------CAGT--TC------CACCAT--TGGACTCTCAGGAA-AACAAGAGA-ACAAA-GCATTGAAGATTGAGAGTACTCATGTGGAGTCATTCCTACCTCC-ATAAAAAACTTTTCGACA-TA----CACA---GGCAAATCT-TGCAATTTCCTGGATCTAAACT------CACAGTC----------C-CGTCAT-----G--CAGTTGT------C-AC-GAGAATAA--CAAA-TA----AAAAA--TTAT------CAGG-AAAA---G--CTGAA--ATA--TT---A-GCCAGATACT-CAAAGCTA--GACTTTA---TA-CTTAA-C-ACG-----------TTA-CAGA-G--TC-ATGCTG--------TACGGGGTGGCCT-ACATACA--G--------A----TCCAAATTCT---ATGTCA---C--AGTGA---TAAT
gi|10 : cattggtaacaatcgtcatatccttaccgggtatttacaatcaaatgaggaaaaatgatataactgttcatctgttagaaattgtatattacactgttgtttatatcctataaaatttgcacCTCTGGGTCTCATGAAAAACA-CAA-CGTGTCAC-AGATT--TCAGAAATCCACAGG-TCTAG----AAAACAGCTG-A-TAAA--AAG-CGA----TACACAA--GA----AC-TT-GAA--AGA-AACA-TTGC-A-CC-TGTG-TT-T-G-AAT-CAATTCTCTCTGAAATA--G-AAGAAATGTTGT----CAAATGTTT-TACA-AAAACAC-AG---AGAAAG-ACAACAAACCATAGC---------------------TGAATTC---GGCAAAA-------GA--TG--TCATTCACGTGT-AGAT-A-T-TGTCATC-A-------AC--AGA-T----ATA-TG-AGTG-AA-T-CAA--ACAAG-ATGGAAAAACAAGAT-GGTGACTCAA-T--Cgtaagagagaaacaaatatatacatcagatgagcaacgagggggctactacactgtagggagatcaccacaagtcaggatatactctcaacagaatgctgacaggtgcaccttagggcgaaggagagatatactggtgtatcaactagcacaatgggatgga
gi|11 : -ATACGAA-----CCGACAGCTGAGAC-CA--CGGCAAGTCTGTGCAATAA-----GTC---ACCTCACACCA---TCATTACCAAGGC-AGTC-TGCGCGCAACAA-TGTGGTATCCAACTGA----ACTCCAAA-CATAATAAAAA--TTATATATCACAAG-AAAGACAC--CTGAAAAGTAAATT---AAG-CAAGT-CT-CAAAACTG--G---TTAATCTA-A--AA-C-A--------------AGCCATATG--TAAACGCTGTTACCACTTGC----T--CCT-A-AC-CA--GTCTAGTACA----TA--ATTTCT---ATGTCAG--T--GGTGAACCCAATA
gi|12 : TCCC--TCTAG-AT-TTGAA---TTAA---------CACT--TC------CACCAC--TTGAC-CTCAGAGA-ACTAACAGA-AC-AA-GCGTTGAAA---GA----ATTCAT-TGGAGTCATTCCTACCTCC-ATAAAAA-----CCGACA-TT----C-CA--GGGCAAGTCT-TGCAA--------ATC---ACT------CA---TC----------C-AGTC-T-----C--CAG-TGT------CAAC-GA----AC--CAAA-TA----AAAAA--ATAT------CAGG-AAAG---C--CTGAA--GTA--TT---A-G-CAGCT-TT-CAAAACCG--G---CTA---TA-CT-AA-C-AC------------TTT-CAGA-G--T--ATGCTG--------------------T-A-ACACA--G--------A----TC--AAGTC
gi|13 : AAG---T--CTGAA--GTA--TT---A-G-CAGCC-CT-AAAAACAG--G---CTA---TA-A--AG-AGAC------------TTG-CAGA-G--T--ATGCTG--------TAT----T--CCT-A-ACACA--G--------A----TC--AATTCT---ATGTCAG--T--GGTAA---CAATGAGATCA--TCAGACA-C--ATGAACACT
gi|14 : TGACTCAA-T--CCAAACCC-T--AAA-AT--CTG-AGTT--TGAT-----GAAT-TACA-ATC-ATCAA-TAA------AAAC-AA-CT--ATAAAT--GAA----AAT-C-ATTTTAT--CC-TTGCTTCCA-AT---------G---AT--T--T-CT-----------------CC--AA--Agaggggacactactgggggagatc
gi|16 : GAAATA--G-AAGAAATGTTGT----CAAATGTTC-TCAA-AAAACAT-GG---AGAAAG-ACAACAAACTATTAC---------------------TGAATTC---GGCAA
gi|18 : ATCA--TCAGACA-C--ATGGACACT
gi|19 : cCATGAAAAACA-CAA-TGTGTCAC-AGATT--TCAAAAATCCACgagggaacactactgggggagatcgc
gi|2 : TTT-ATATACCA-AAATTCA-C---ATAGT--T--AACC--ACT-GTA-ATTCTTTCATATTATCAGT-----ACAGGCGAAAAGTTCTGT-AATGGC-AACATCAGATCC-CCACTGGCTAGAGCA-CAG--ACC-TGAAAC--G-TGTCAGTTA-TGTCC-G-CAAA--ACAAAA--TCTGCA-GCAGAAGACCGTGTGTAACACATGCCATGATCAA-CCTACTGTAAGGATTGTGTAG--ACATCAC--ATGACCTTCAAATCCCATTAT--ACGCCAT-GAT--TG-TCACTTATTCAATT-AAAAAAC-TAGAAATTGTTCCA-CCCCAGTG--TCAAACTACAT-AAACAACAGA-A-TGTGAA-ACAT--CTGTGAACAAT-GTGATTCTCCA-TATGT--T--------GAAATGTC------T-------CCTCTGGATTTCATGAAAAGCAACAA-TGGCTCAC-AGATTCATCAGAAATCCACAGT-TCTAAGA--AAAACAGCTG-A-TAGA--AAGATGA----TACACAA--GA----AC-TTAGAA--AAGCGACA-TTGC-A-CC-TGTG-TT-T-GGAAT-CAATTCTCTC-GAAATA--G-AAGAAATGTTGC----AAAATGTTG-TCCA-AAA-CAT-GG---CGAA-G-ACAACAAACCATTAC---------------------TGAATC-----GCAAAA-------A----G--TCATACATGTG----AC-A-T-TGTCATCGA-------AC--AGA-T----ATC-TG-AGTG-AT---CAA--AGAAG-ATG-AAAAACAAGAT-GGTGACTCGAGTAGCGAGAGAA-T--GAA-ATATCTG-ACTTATTGA------AAAG-TGCATATC-ATCAA-TAC------AATC-AAACT--ATAAAT--GAA----AATTC-ATTCTAT--CC-TTGTATCCA-AC---------G---AT--T--T-CT-----------------CC--AA--AT-T----A-----CCAGTT-A-----TG--CTGCATCGTGAGA-ACGAGGAGTTACGAAAT---GTTCCC--TCTAG-AT-TTGAA---TTAA---------CACT--TC------CACCAT--TTGGA-CCCAGAGA-ACTAACAGA-AC-AA-GCATTGAAG---GA----ATGCATG-GGAGTCATTCCTACCTCC-ATAAAAA-----CCGACA-TT----C-CA---GGCAAGTCT-TGCCA--------GTC---ACT------CA---TC----------CAAGTC-T-----C--CAG-TGT------CAAC-GA----AC--CAAA-TA----AAAAAACTTAT------CAGG--AAG---C--CTGAA--GTA--TT---A-G-CAGCT-CT-CAAAACTG--G---TTAAC-TA-A-----C-AC------------TTA--AGA-GCTC--ATGCTG--------TAT----T--CCT-A-ACACA--G--------A----TC--AGTTCT---ATGTCAG--T--GGTAA---CAATAAGATCA--TCAGACA-CCTATGAACACT
gi|20 : catttgtactgtgcatacccccttaccgggttatttacaaatatcaaaataaatacagttgatttgtttactgtgtttcagccaaatgtagttaaactatgcatacacctg-C-AC------------TTA-CAGA-G--T--ATGTTG--------TAT----T--CCT-A-ACACA--G--------gaggcggactactactggggag
gi|3 : CATAATGTATTTA---AGATTTTGAAATA--A-AAATCCAGA---A-AGTTGTT-AACC--ATT-GTACATTCTTTCAT--TG-CAGT-----ACA---GAGAAGCT-TGC-TATGGC-AACATCAGATCCAC---TGGCCAGAGCA-CAA--GGCGTGAAAC--GTTGTCAGTTA-TGTCCCGGCAAA-CACAGAAAGTCTGTA-GCAGA-GACCGTGTGTAACACATGTCTTA-TCAA-CCT-CTGTAAGGATTGTGTAG-GACATCAC--ATGACCT-CAAATCCCACCAT--ACGCCAT-GATGTAG-TCACTT-TTCAATTCAAAAAAC-TAGAAATCATTCCA-CCCCAATG--T-ACAATACAT-GAACAACAGA-AATGTAAA-ACAT-TCTGTGAACAAT-GTGATTCTCCAATTTGT-CT--------GAAATGTC------TTG-----CCTCTGGATCTCATGAAAAACA-CAA-CATGTCAC-AGATT--TCAGAAATTCACAGC-TTTAG----AAAACAGTTG-A-TAGA--AAG-AGA----TACACAA--GA----AC-TT-GAA--AGG-AAAA-TTGC-A-CC-TATG-TT-T-G-AAT-CAATTCTCTCTGAAATA--G-AAAAAATGTTGT----CAAATGTTC-TACA-AAAACAC-GG---AGAAAG-ACAACAAACCATTAC---------------------TGATTTT---GGCAAAA-------GA--TG--TCATATACTTGT-AGAC-A-T-TATCATC-A-------AC--CGA-T----ATC-GG-AGTA-AT-T-CAA--AGAAG-ATGGAAAAACAAGAT-GGCGACTCTA-T--CAAAACCC-T--GAA-AT--CAG-AGTT--TGGT-----AAAT-TACA-ATC-ATCAA-TAC------AATC-AA-CT--ATAAAT--GAA----AAT-C-ATTCTAT--CC-TTGCTTCCA-AC---------G---AT--T--T-CT-----------------CC--AA--AT-T--T-A-----CCAGTT-A-----TG--CT---TCAAG-GA-ATGAAGAATTAAGAAAT---GTTCCC--TCTAG-AT-TTGAA---TTAA---------CCCT--TC------CACCAA--TGGAA-CTCAAAGG-GCTAACAGA-AC-AA-GTATTGAAG---GA----ACTCCTG-GGAGTCATCCCTAGCTCA-ATAAGAA-----CTGACA-TT----C-CA--GGGCAAGTCT-TGCAA--------GTC---ACT------CA---TC----------C-AGTC-T-----C--CAG-TGT------CAAC-GA----AC--CAAA-TA----AAAAA--TTAT------CAGG-AAAG---C--CTGAA--GTA--TT---A-G-CAGCT-TT-CAGAACTA--G---TTA---TA-AT-CT-C-AC------------TAG-CAGA-G--T--CTGTTG--------TAT----T--CCT-A-ACACA--G--------A----TA--AATTCT---ATGTCAG--T--GGTGA---CAATGAGATCA--TCAGACA-C--ATAAACACT
gi|4 : aatattcaAATAG-A-AAATTCA-A---A-AGTAAT--AAACTTATTAGTA-ATTATTTCTT--TA-CAGT-----AA----GACT-GTT-TGC-CATGG--AA-ATCAGATCC-----TGG--AGAGCAACAA--ATTGTGAA-C--GCTGT-AGTTA--GT---GGCAAA-CACAGAAG-TCTGCAAGCAGA-G--CGTGTGTAACAC--GTCAAG-TCAA-CTT---G-AAGG-TTGTGTAGAGACATCACTGATGAC------ATCCCAT-------GCCAT-GA----G-T-A--TATTTCATT---AAAAT-TA-AAATCATTC-A-CCGCAGTGGGT-AAACTA-AT-AA-CAACAGA-A-TGTGAA-ACATATCTGTGAACAATTGTGATTCTCCAATTTGT-CT--------GAAATGT-------TTG-----C-TCTGGTACTC-TGAAACA-A-CGAATGTGT-A--AGATT--TCAGAATT--ACAAT-TCTAG----AAAAAAGCTG-AATAGA--TGG---A----TACACAA--GA----AGATT-GAA--GAG-AACA-TTGC-AACCATGTGATT-T-G-A-T-CAATTCACTCTGAAA-A--GTGAGAAATATTGTTTGTCAAAT-TTC------AAACCACTGG---AGAAAG-ACAACAA-CTATT-C---------------------TGAATTC---GGCAAAC-------GAATTG--T-ATGCAAGTGT-AGAA-G-TATGTCATC-A-------AC--AGA-T----ATC-TG-AGTG-AT-G-CAA--AGAAGAATGGAAAAACAAGAT-GGTGATTCAA-T--C-AAACCC-T--GAC-CT--CAGAAGTT--TGAT------AAT-TACA---T-ATC-A-TAC-------AT-----CT--AT--AT--GAA----AAT-C-ATTCTGA--TC-TTGCTT-CA-AC---------G---AT--T--TGGT----------------------A--AT-T--TAA-----CCTGTT-A-----TGC-CT---TCGAG-GCTATGCGG-ATTAAGAAAT---GTTC-----CTAG-AA-TTGAA---TTAAACTATCTTTCACTGGTCTGATTACTCCAC--TTGA--CTCAGAGA-A-TAACAGATAC-AAGGCGTTGAAA---GA----ATTCATATGGAGTAATGTCTACATCCTAT---AA-----CCGAC--TT----C-----GGGC-AGTC--TGCAA--------AAT---ACT------C----TC-------------GTC-T--------CAG-TGT------CAAC-GA----AA--CAAATTA----AAAAA--ATAT-------AGG-AAG-------CTGAA--GTA--TT---A-G-CAGCT-TT-C-AAACCG--G---CTA---TATA--AA-C-AT------------T---CAGA-G--TTAATGCTG--------T---------------ACACA--G--------A----TT--TA-TCT---A--CCA---TAAGGTGA---AAA-AGTATAA--TCAGACA-A--GTGAACACT
gi|5 : ttaagGATT--T-AGAAAT--ACAAT-TCTAG----AAAA--GCTG-A--AGATGAGG-CGAGTAGTACGAAA--GATGAAAC-T--GAATGAGG-CACA-TTGA-A-C--TGTG-TTAT-G-AAC-TAATTCTTCATGAAATATGG-AAGA--TGTTGT----CAAATGTTT----A-AAAACAT-GGGAAAGAGAG-ACAAGACAATATTATAAATGTCGGACGACGGATTCATGGATTC---GGAGAAAAGGAGAAGA--TGGGTCAT-CACGTGT-AG-C-AGT-TGT-ATC-GGTCGAGTAC--AGA-TTAATATT-TGGAGTGGAT-TGCAA--AGAAG-ATTGGAAAACAGAGTAGGTGATT----T--CAAA---C-T--GAAGAT--TAG--GTT--GGATGTTG-AAAT-TACAGAGT-ATCAAGTAC------A-TC-AA-CCTAATACATT-GAA----TAT-T-CCCCT-T--CC-TTGTT--CA-ACATGGCGAGGG---ATGAT--T-CTAAGGGAGGTAGGAGGAGCC--AA---T-T--T-A-----ACTGTT-A-----T---CT---TAGAG-GA-ATGCGGAGTTAAGAA-T---GTTAAC--TCTAGGAT-TTGAA---TTAA---------ACTT--TC------CACAAT--TTG---CTCAGAGA-ACTAACAGA-A--AA-GCG-TGAAA---GA----ATTCATGTGGGATCATT----TCTCC-ATAAAG--------GACA-TT------CA--GGG-AAGTCT-TGCAA---------TC----TT------C-----C----------C-AGT-----------CAG-TGT--------AC-GA----A---CAAA-TA----AAAAA--ATAT-------AGG-AAAG---C--CTGAA--GTA--TT---A-G--AGAT-TT-CAAAACCG--G---CTA---TA-CT-AA-C-AT------------T---CAGA-G--T--ATGC-G--------T---------------ACACA--G--------A--------AATT-T---ACATAAG-----GGTGA---CAtgaggg
gi|6 : gGGATCTCATGAAAAACA-TGA-TGTGTCAC-ATATT--TCAGAAATCCA--GT-TCTAG----AAAACAGCTG-A-TAGA--AAG-CGA----TAAAAAAAAGA----AA-TT-GAA--AGT-AACA-TTGC-A-CC-TGTG-TT-TTG-AATTCAATTCTCTCT-AAATA--G-AAGAAA-GTTGT----CTAATGTTG-TCCA-AAAACAT-GG---AGAAAG-ACAACAAACCATAAC---------------------TGAATTC---GGCAAAA-------GA--TG--TCATGCACGTGT-AGAC-A-T-TGTCATC-A-------AC--AGAAT----ATCGTG-AGT--AT-T-CAG--AGAAG-ATGGAAAAGCAAGAT-GGTGACTCAA-T--CAAAACCCCT--AAA-AT--CCG-AGTA--CGAT-----AAAT-TACA-ATC-ATCAA-TAC------AATC-AA-CT--ATAAAT--GAA----AAT-C-ATTCTAT--CC-TTGCTTCCA-AT---------G---AC--T--T-CT-----------------CC--AA--AT-T--T-A-----CCAGTT-A-----TG--CT---TCGAG-GA-ACGAGGAATTCCGAAAT---GTTCCC--TCTAA-AT-TTGAA---TTGA---------CAGT--TC------CACCAT--TGGAC-CTCAGAGA-ACTAACAGA-AC-AA-GCATTGAAG---GA----ATTCATG-GGAGTCATTCCTACCTCC-ATAAAAA-----CCGACA-TT----C-CA--GGGCAAGTCT-TGCAA--------GTC---ACT------CA---CC----------C-AGTC-T-----C--CAG-TGT------CAAC-GA----CC--CAAA-TA----AACAA--TTAT------CAGG-AAAT---C--CTGAA--GTA--TTTAAA-A-CAGCT-CT--AAAAATG--G---CTA---T----------AC------------TAA-CAGA-G--T--ATGCTG--------TAT----T--CCT-A-ACACA--G--------A----TC--AATTCT---AGATCAG--T--GGTTT---CTATATCATCA--TCAAACG-T--ATGAGCACTtagttaaatagaaaatgaactgagcgggccactacctgggggagatc
gi|7 : GGATTGTGTAG-GACATCAC--ATGACAT-CAAATCCCACCAT--ACGTCAT-GATGTTG-TCACTT-TTCAATACAAAAAAC-TAGAAATCATTCCA-CCCCAATG--T-AAACTACAT-AAAAAACAGA-AATGTGAT-ACAT-TCTGTGAACAAT-GTGATTCTCCAATTTGT-CT--------GAAATGCC------TTG-----CCTCTGGATCTCATGAAAATCA-CGA-TATGTCGC-AGATT--TCAGAAATCCACAGC-TCTAG----AAAACTGTTG-A-TAGA--AAG-AGA----TACACAA--GA----AC-TT-GAA--AGA-AACA-TTGC-A-CC-TGCG-TT-T-G-AAT-CAATTCTCTCTGAGATA--G-AAGATATGTTGT----CAAATGTTC-TACA-GAAACAC-AG---AGAAAG-ACAACAAACCATTAC---------------------TGAATTC---GGCAAAA-------GA--TG--TCATACACTTGT-AGAC-A-T-TGTCATC-A-------AC--AGA-T----ATC-TG-AGTG-AT-T-CAA--AGAAG-ATGGAAAAACAAGAT-GGTGACTCAA-T--CAAAACCC-T--GAA-AT--CTG-AGTT--CGAT-----GAAT-TACA-ATC-ATCAT-TAC------GATC-AA-CT--ATAAAC--GAA----AAT-C-ATTCTAT--CC-TAGCTTCCA-AC---------G---AT--T--T-CT-----------------CC--AA--AT-T--T-A-----C
gi|8 : g-AC---------G---AC--TGTT-CT-----------------CCCGAACGATGT--T-A-----CCAGTTCAGCGTTTG--CT---TCGAG-GA-ATGAG-AATTTAGAAAT---ATTCCC--TCTAG-AT-TTGAA---TTAA---------CAGT----------CACCATGGTGGGC--TCAGAGACAATAACAGA-AC-AA-GCATTGAAG----A----ATTCATG-GGAGTCATTCCTACCTCC-ATAAAAC-----CGGACA-CT----C-CACAGGGCAAGCTT-TGCAA--------GTCC--ACTT-----CA---TC----------C-AGTC-T-----C--CAA-GGG------CAAC-GA----AC--CAAA-TA----AAAAA--TTAT------CA-G-AAAG---C--CTGAA--ATA--TT---ACG-CAGCT-CTCCAAAACTGTTG---ATA---TA-C--AA-C-ACATCCAGTCCGGGTCG-TACA-G--C--TTGGTA--------TGT----T--CCTGA-ACACATCG--------AGCATCC--ATTTCTATAATGTCAGTCT--GGTGA---C-ATAATATCATGTCAGACACC--ATGAACACT
gi|9 : TAT--CC-TTGCTTCCA-AC---------G---AT--T--T-CT-----------------CC--AA--AT-A--T-A-----CCAGTT-A-----TC--CT---TCCAG-GA-ATGAGGAATTAAGAAAT---GTTCCC--TCTAG-AT-TTGAA---TTAA---------CAGT--TC------CAACAT--TGAAC-CTCAGAGA-ACTAACAGA-AC-AA-GCATTGAAG---GA----ATTCCTG-GGAGTCATTCCTAGCTCC-ATAAGAA-----CTGACA-TT----C-CA--GGGAAAGTaaggggc
gi|9 : AGAA-----CAAGCA-TT----G-AA--GG--AATTCC-TGGGA--------GTC---ATT------C-----C----------T-AG-C-T-----C--CA-----------TAA--GA----AC--TGAC-----------A--TT-C------CAGGGAAAG---TTGNTGAA--GTA--TT---A-G-CAGAT-CT-CAAAACTG--G---CTA---TG-C--CATC-AC------------TTA-CAGA-G--T--ATGCTG--------TAT----T--CCC-A-ACACA--G--------A----TC--AGTTCT---ATATCAG--T--GGTAA---CAATAACATCA--TCAAACG-C--ATGAACACTtgntgaagtattagcagatctcaaaactggctatgccatcacttacagagtatgctgtattcccaacacagatcagttctatatcagtggtaacaataacatcatcaaacgcatgaacact
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|15 ): ATGGGGGGATACAACGTCAGGAATCTCCAGAGAGATTGACGGTGACAGGGAGGGAGATTGGTGTACTGATGGGATGATAGAGATATCAACAGACAAAAGAATAGA
Unaligned ( gi|17 ): ACCAAGTAGGAATCTCAGAAATTGACGGTGAAAGGGAGGAGAGATTTGGTGTACTGGACATGGAATGCAT
Alignments
lowQualScore : 1 222 1 2222 22222 1 1 1 1 11 1 222222222222 1 11 11 33333 1 11 11 11 11 2 1 1 1 1 11 11 111 11 1 1 1111 1 22222222 22222222222222 1111 1111 1111 1 1111 333333333333333333333 1111111 1111111 1111 111 1 2222222 1 111111 11 1111 111111111 222222222222222222222 11111 11111111111 111111111 111111 1 22222222 111 2222222222222222222222222 11111111 111111 111111 2222222222 1111 111111111111 11 111111111111111111 11111111
lowQualScore : 5 111 3 4444 44444 3 1 0 0 0 0 33 0 999999999999 1 3 0 11 22 2 00000 22 0 33 1 2 3 33 6 2 33 2 8 22 2 0 0 0 3 3 0 0 22 3 0 0 8 11 666 3 11 8 7777 8 0 3 8 8 9999 8 0 8 0 8 88 8 0 8 99999999 99999999999999 5 5 5 66 2 5 7777 2 5 5 66 99 5555 66 0000 5 5 66 5 5 5 5 5 0 5 5 5 5 66 4 9999 1111 4 4 777 4 777777777777777777777 777 6666666 66 66 5 5 5 5 5 5 6666666 66 5 0000 5 5 5 000 66 0 5 4 66 2 5 66 5 66 1 5 888 4444444 5 5 5 5 444444 5 5 66 0 11 0000 5 5 66 4 4 666666666 777 55 55 8 999999999999999999999 55 4 7777 11111 55555555555 888 5 555 888 66 4 4 777 777777777 1 66 222222 7777 55 4 1 4 4 4 0 777 9999 8 4 99999 3 888888 666 4 11111111 111 3333333333333333333333333 4 55555555 4 111111 4 8888 55 4 8888 55 111111 4 888888 55 55 666 7 3 3 3 2 55 666 666 0000000000 44 1111 777777777777 3 44 22 999999999999999999 3 3 44 22222222 77777777 777 88888 777 1 66 7777
lowQualScore : . ... . .... ..... . . . . . . .. . ............ . . . .. .. . ..... .. . .. . . . .. . . .. . . .. . . . . . . . . .. . . . . .. ... . .. . .... . . . . . .... . . . . . .. . . . ........ .............. . . . .. . . .... . . . .. .. .... .. .... . . .. . . . . . . . . . . .. . .... .... . . ... . ..................... ... ....... .. .. . . . . . . ....... .. . .... . . . ... .. . . . .. . . .. . .. . . ... ....... . . . . ...... . . .. . .. .... . . .. . . ......... ... .. .. . ..................... .. . .... ..... ........... ... . ... ... .. . . ... ......... . .. ...... .... .. . . . . . . ... .... . . ..... . ...... ... . ........ ... ......................... . ........ . ...... . .... .. . .... .. ...... . ...... .. .. ... . . . . . .. ... ... .......... .. .... ............ . .. .. .................. . . .. ........ ........ ... ..... ... . .. ....
lowQualScore : 0 000 3 8888 55555 2 0 0 0 0 0 88 0 222222222222 0 2 0 00 55 5 00000 88 0 88 0 5 2 88 5 5 22 5 8 55 5 0 0 0 2 2 0 0 55 2 8 8 0 00 888 2 00 0 4444 0 6 2 0 0 8888 0 8 0 6 0 88 0 8 0 00000000 88888888888888 0 0 0 11 9 0 5555 5 0 0 99 55 6666 99 6666 0 0 99 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11 4 4444 1111 4 4 888 4 888888888888888888888 888 2222222 99 99 4 0 0 0 0 0 2222222 99 0 6666 0 0 0 111 99 0 0 4 11 0 0 99 0 99 0 0 000 1111111 0 0 0 0 444444 0 0 99 1 99 6666 0 0 11 4 0 000000000 000 55 55 0 000000000000000000000 55 4 0000 11111 88888888888 888 0 222 888 11 4 4 888 888888888 0 11 888888 8888 66 4 1 4 4 4 7 888 4444 2 0 11111 6 222222 444 0 55555555 000 6666666666666666666666666 0 55555555 0 555555 0 5555 55 0 5555 55 555555 0 888888 00 00 444 3 6 6 6 5 00 444 444 6666666666 66 2222 111111111111 3 66 55 000000000000000000 3 3 66 11111111 88888888 000 44444 000 0 99 0000
consensus : NNNNNNNNCATAGTGTACTTACTAAGATTTT-AAATA--A-AAATCCA-A---AAGTAGTTAA-CC-ATT-GTA-ATTCTTTCAT--TG-CAGT-----ACAG---ANAAGTT-TGCN-ATGGC-AACATCAGATCC-C---TGGCCAGAGCA-CAA--ANCGTGAAAC--GCTGTCAGTTA-TGTCCCGGCAAA-CACAGAAA-TCTGCA-GCAGA-GACCGTGTGTAACACATGTCATG-TCAA-CCT-CTGTAAGGATTGTGTAG-GACATCAC--ATGACCT-CAAATCCCACCAT--ACGCCAT-GATGTTG-TCACTTATTCAATTCAAAAAAC-TAGAAATCGTTCCA-CCCCAGTG--T-AAACTACAT-AAACAACAGA-AATGTGAA-ACAT-TCTGTGAACAAT-GTGATTCTCCAATTTGT-CT--------GAAATGTC------TTG-----CCTCTGGATCTCATGAAAAACA-CGA-TGTGTCAC-AGATT--TCAGAAATCCACAGT-TCTAG----AAAACAGCTG-A-TAGA--AAG-CGA----TACACAA--GA----AC-TT-GAA--AGG-AACA-TTGC-A-CC-TGTG-TT-T-G-AAT-CAATTCTCTCTGAAATA--G-AAGAAATGTTGT----CAAATGTTC-TCCA-AAAACAC-GG---AGAAAG-ACAACAAACCATTAC---------------------TGAATTC---GGCAAAA-------GA--TG--TCATGCACGTGT-AGAC-A-T-TGTCATC-A-------AC--AGA-T----ATC-TG-AGTG-AT-T-CAA--AGAAG-ATGGAAAAACAAGAT-GGTGACTCAA-T--CAAAACCC-T--GAA-AT--CNG-AGTT--CGAT-----AAAT-TACA-ATC-ATCAA-TAC------AATC-AA-CT--ATAAAT--GAA----AAT-C-ATTCTAT--CC-TTGCTTCCA-AC---------G---AT--T--T-CT-----------------CC--AA--AT-T--T-A-----CCAGTT-A-----TG--CT---TCGAG-GA-ACGAGGAATTAAGAAAT---GTTCCC--TCTAG-AT-TTGAA---TTAA---------CANT--TC------CACCA-T--TGGAC-CTCAGAGA-ACTAACAGA-AC-AA-GCGTTGAAG---GA----ATTCATGTGGAGTCATTCCTACCTCC-ATAAAAA-----CCGACA-TT----C-CA--GGGCAAGTCT-TGCAA--------GTC---ACT------CA---TC----------C-AGTC-T-----C--CAG-TGT------CAAC-GA----AC--CAAA-TA----AAAAA--TTAT------CAGG-AAAG---C--CTGAA--GTA--TT---A-G-CAGCT-CT-CAAAACCG--G---CTA---TA--TA-A---CA--C-TTNCAG------------A-G--T--ATGCTG--------TAT----T--CCT-A-ACACA--G--------A----TC--AATTCT---ATGTCAG--T--GGTGA---CAATAANATCA--TCAGACA-C--ATGAACACT
Reference ( family-3067 ) : NNNNNNNNCATAGTGTACTTACTAAGATTTT-AAATA--A-AAATCCA-A---AAGTNATTAA-CC-ATT-GTA-ATTCTTTCAT--TG-CAGT-----ACAG---ANAAGTT-TGCN-ATGGC-AACATCAGATCC-C---TGGCCAGAGCA-CAA--ANCGTGAAAC--GCTGTCAGTTA-TGTCCCGGCAAA-CACAGAAA-TCTGCA-GCAGA-GACCGTGTGTAACACATGTCATG-TCAA-CCT-CTGTAAGGATTGTGTAG-GACATCAC--ATGACCT-CAAATCCCACCAT--ACGCCAT-GATGTTG-TCACTTATTCAATTCAAAAAAC-TAGAAATCGTTCCA-CCCCAGTG--T-AAACTACAT-AAACAACAGA-AATGTGAA-ACAT-TCTGTGAACAAT-GTGATTCTCCAATTTGT-CT--------GAAATGTC------TTG-----CCTCTGGATCTCATGAAAAACA-CGA-TGTGTCAC-AGATT--TCAGAAATCCACAGT-TCTAG----AAAACAGCTG-A-TAGA--AAG-CGA----TACACAA--GA----AC-TT-GAA--AGG-AACA-TTGC-A-CC-TGTG-TT-T-G-AAT-CAATTCTCTCTGAAATA--G-AAGAAATGTTGT----CAAATGTTC-TCCA-AAAACAC-GG---AGAAAG-ACAACAAACCATTAC---------------------TGAATTC---GGCAAAA-------GA--TG--TCATGCACGTGT-AGAC-A-T-TGTCATC-A-------AC--AGA-T----ATC-TG-AGTG-AT-T-CAA--AGAAG-ATGGAAAAACAAGAT-GGTGACTCAA-T--CAAAACCC-T--GAA-AT--CNG-AGTT--CGAT-----AAAT-TACA-ATC-ATCAA-TAC------AATC-AA-CT--ATAAAT--GAA----AAT-C-ATTCTAT--CC-TTGCTTCCA-AC---------G---AT--T--T-CT-----------------CC--AA--AT-T--T-A-----CCAGTT-A-----TG--CT---TCGAG-GA-ACGAGGAATTAAGAAAT---GTTCCC--TCTAG-AT-TTGAA---TTAA---------CANT--TC------CACCA-T--TGGAC-CTCAGAGA-ACTAACAGA-AC-AA-GCGTTGAAG---GA----ATTCATGTGGAGTCATTCCTACCTCC-ATAAAAA-----CCGACA-TT----C-CA--GGGCAAGTCT-TGCAA--------GTC---ACT------CA---TC----------C-AGTC-T-----C--CAG-TGT------CAAC-GA----AC--CAAA-TA----AAAAA--TTAT------CAGG-AAAG---C--CTGAA--GTA--TT---A-G-CAGCT-CT-CAAAACCG--G---CTA---TA--NA-A---CA--C-TTGCAG------------A-G--T--ATGCTG--------TAT----T--CCT-A-ACACA--G--------A----TC--AATTCT---ATGTCAG--T--GGTGA---CAATAANATCA--TCAGACA-C--ATGAACACT
gi|1 : CATAGT-TACTTACTAAGATTTT-AAATA--ATAAATCCC-AGATAAGTGATTAAACC-ATG-GTA-ATTCTTTCAT--TG-CAGTTCGTCAC-G---ACAAGTT-TGCAGATGGCTAACATCAGATCC-C---TGGCCAGAGAG-CAACAAACGTGAAACCCGCTGTCAGTTAATGTCCCGGCAAAACACAGAAACTCTGCA-GCAGA-GACAGTGTGTAACACATGTCATG-TCAACCCT-CTGTAAGGATTGTGT-G-GACATCAC--ATGACCTGCAAAACCCACCATAGACGGCATGGATGTTGTTCACTTATTCAAATTAATAAATAGAGAAATCGTTCCACCCCCAGTG----AAACTACATGAAACAACAGAGAATGTGAAGACAT-TCTGTGAACAAT-GTGATTCTCCAATTTGTGCTTTGAAGAAAAAATGTCCCCTTTTTGCCTCCCCTCTGGATCTCATGAAAAACA-CAA-TGTGTCACAAGATT--TCAG-AATCCACAGTGTCTAGCTATAGAAAAGTTGAA-TAGA--AAG-CGAT---TACACAA--GA----AC-TT-GGA--AGG-AACAGTTGCAA-CC-TGTGATT-T-G-AAT-CAATTCCTTCTAAAATA--G-AGAAAATGTTGT----C-AATGTTTGTCCATTAAACAT-GG---AGAAAGAACAAC--ACCTACAC---------------------AGAATTTCGGGGCGAAA-------GA--TG--TCATGCACGTGTAAGACAA-T-TGTCATC-A-------ACCAGGA-T----ATC-TG-AGTG-ATAT-CAACCAGAAGCATGGAAAAACAAGAT-GGTGACTCAA-T--CAAAACCC-TAGAAA-AT--CAG-AATT--CGGGGAGGAAAATCTACACATCAATCAC-TACACCAGGAATCAAA-CT--ATCAATCAGAAGGACAAT-CAATTCTACTACCATTGCTTCCACAC---------GCTCAT--T--TACT-----------------GCGGAA--AT-TAGT-AGTGCTCGAATTGA-----TGACCT---TCGAG-AA---GACGAATTGCGACATGGGGTTCCTCATC----ATACTGAATAGTTAA---------CAGT--TC------CACCA-T--TGGACTCTCAGGAA-AACAAGAGA-ACAAA-GCATTGAAGATTGAGAGTACTCATGTGGAGTCATTCCTACCTCC-ATAAAAAACTTTTCGACA-TA----CACA---GGCAAATCT-TGCAATTTCCTGGATCTAAACT------CACAGTC----------C-CGTCAT-----G--CAGTTGT------C-AC-GAGAATAA--CAAA-TA----AAAAA--TTAT------CAGG-AAAA---G--CTGAA--ATA--TT---A-GCCAGATACT-CAAAGCTA--GACTTTA---TACTTA-A---CA--CGTTACAG------------A-G--TC-ATGCTG--------TACGGGGTGGCCT-ACATACA--G--------A----TCCAAATTCT---ATGTCA---C--AGTGA---TAAT
gi|10 : cattggtaacaatcgtcatatccttaccgggtatttacaatcaaatgaggaaaaatgatataactgttcatctgttagaaattgtatattacactgttgtttatatcctataaaatttgcacCTCTGGGTCTCATGAAAAACA-CAA-CGTGTCAC-AGATT--TCAGAAATCCACAGG-TCTAG----AAAACAGCTG-A-TAAA--AAG-CGA----TACACAA--GA----AC-TT-GAA--AGA-AACA-TTGC-A-CC-TGTG-TT-T-G-AAT-CAATTCTCTCTGAAATA--G-AAGAAATGTTGT----CAAATGTTT-TACA-AAAACAC-AG---AGAAAG-ACAACAAACCATAGC---------------------TGAATTC---GGCAAAA-------GA--TG--TCATTCACGTGT-AGAT-A-T-TGTCATC-A-------AC--AGA-T----ATA-TG-AGTG-AA-T-CAA--ACAAG-ATGGAAAAACAAGAT-GGTGACTCAA-T--Cgtaagagagaaacaaatatatacatcagatgagcaacgagggggctactacactgtagggagatcaccacaagtcaggatatactctcaacagaatgctgacaggtgcaccttagggcgaaggagagatatactggtgtatcaactagcacaatgggatgga
gi|11 : -ATACGAA-----CCGACAGCTGAGAC-CA--CGGCAAGTCTGTGCAATAA-----GTC---ACCTCACACCA---TCATTACCAAGGC-AGTC-TGCGCGCAACAA-TGTGGTATCCAACTGA----ACTCCAAA-CATAATAAAAA--TTATATATCACAAG-AAAGACAC--CTGAAAAGTAAATT---AAG-CAAGT-CT-CAAAACTG--G---TTAATCTA--AA-A---CAAGC----CAT------------ATG--TAAACGCTGTTACCACTTGC----T--CCT-A-AC-CA--GTCTAGTACA----TA--ATTTCT---ATGTCAG--T--GGTGAACCCAATA
gi|12 : TCCC--TCTAG-AT-TTGAA---TTAA---------CACT--TC------CACCA-C--TTGAC-CTCAGAGA-ACTAACAGA-AC-AA-GCGTTGAAA---GA----ATTCAT-TGGAGTCATTCCTACCTCC-ATAAAAA-----CCGACA-TT----C-CA--GGGCAAGTCT-TGCAA--------ATC---ACT------CA---TC----------C-AGTC-T-----C--CAG-TGT------CAAC-GA----AC--CAAA-TA----AAAAA--ATAT------CAGG-AAAG---C--CTGAA--GTA--TT---A-G-CAGCT-TT-CAAAACCG--G---CTA---TAC-TA-A---CA--C-TTTCAG------------A-G--T--ATGCTG--------------------T-A-ACACA--G--------A----TC--AAGTC
gi|13 : AAG---T--CTGAA--GTA--TT---A-G-CAGCC-CT-AAAAACAG--G---CTA---TA--AAGA---GA--C-TTGCAG------------A-G--T--ATGCTG--------TAT----T--CCT-A-ACACA--G--------A----TC--AATTCT---ATGTCAG--T--GGTAA---CAATGAGATCA--TCAGACA-C--ATGAACACT
gi|14 : TGACTCAA-T--CCAAACCC-T--AAA-AT--CTG-AGTT--TGAT-----GAAT-TACA-ATC-ATCAA-TAA------AAAC-AA-CT--ATAAAT--GAA----AAT-C-ATTTTAT--CC-TTGCTTCCA-AT---------G---AT--T--T-CT-----------------CC--AA--Agaggggacactactgggggagatc
gi|16 : GAAATA--G-AAGAAATGTTGT----CAAATGTTC-TCAA-AAAACAT-GG---AGAAAG-ACAACAAACTATTAC---------------------TGAATTC---GGCAA
gi|18 : ATCA--TCAGACA-C--ATGGACACT
gi|19 : cCATGAAAAACA-CAA-TGTGTCAC-AGATT--TCAAAAATCCACgagggaacactactgggggagatcgc
gi|2 : TTT-ATATACCA-AAATTCA-C---A--TAGTTAA-CC-ACT-GTA-ATTCTTTCATATTATCAGT-----ACAGGCGAAAAGTTCTGTA-ATGGC-AACATCAGATCC-CCACTGGCTAGAGCA-CAG--ACC-TGAAAC--G-TGTCAGTTA-TGTCC--GCAAA--ACA-AAA-TCTGCA-GCAGAAGACCGTGTGTAACACATGCCATGATCAA-CCTACTGTAAGGATTGTGTAG--ACATCAC--ATGACCTTCAAATCCCATTAT--ACGCCAT-GAT--TG-TCACTTATTCAATT-AAAAAAC-TAGAAATTGTTCCA-CCCCAGTG--TCAAACTACAT-AAACAACAGA-A-TGTGAA-ACAT--CTGTGAACAAT-GTGATTCTCCA-TATGT--T--------GAAATGTC------T-------CCTCTGGATTTCATGAAAAGCAACAA-TGGCTCAC-AGATTCATCAGAAATCCACAGT-TCTAAGA--AAAACAGCTG-A-TAGA--AAGATGA----TACACAA--GA----AC-TTAGAA--AAGCGACA-TTGC-A-CC-TGTG-TT-T-GGAAT-CAATTCTCTC-GAAATA--G-AAGAAATGTTGC----AAAATGTTG-TCCA-AAA-CAT-GG---CGAA-G-ACAACAAACCATTAC---------------------TGAATC-----GCAAAA-------A----G--TCATACATGTG----AC-A-T-TGTCATCGA-------AC--AGA-T----ATC-TG-AGTG-AT---CAA--AGAAG-ATG-AAAAACAAGAT-GGTGACTCGAGTAGCGAGAGAA-T--GAA-ATATCTG-ACTTATTGA------AAAG-TGCATATC-ATCAA-TAC------AATC-AAACT--ATAAAT--GAA----AATTC-ATTCTAT--CC-TTGTATCCA-AC---------G---AT--T--T-CT-----------------CC--AA--AT-T----A-----CCAGTT-A-----TG--CTGCATCGTGAGA-ACGAGGAGTTACGAAAT---GTTCCC--TCTAG-AT-TTGAA---TTAA---------CACT--TC------CACCATT--TGGAC-C-CAGAGA-ACTAACAGA-AC-AA-GCATTGAAG---GA----ATGCATG-GGAGTCATTCCTACCTCC-ATAAAAA-----CCGACA-TT----C-CA---GGCAAGTCT-TGCCA--------GTC---ACT------CA---TC----------CAAGTC-T-----C--CAG-TGT------CAAC-GA----AC--CAAA-TA----AAAAAACTTAT------CAGG--AAG---C--CTGAA--GTA--TT---A-G-CAGCT-CT-CAAAACTG--G---TTA---AC--TA-A---CA--C-TTA-AG------------A-GCTC--ATGCTG--------TAT----T--CCT-A-ACACA--G--------A----TC--AGTTCT---ATGTCAG--T--GGTAA---CAATAAGATCA--TCAGACA-CCTATGAACACT
gi|20 : catttgtactgtgcatacccccttaccgggttatttacaaatatcaaaataaatacagttgatttgtttactgtgtttcagccaaatgtagttaaactatgcatacacctg---CA--C-TTACAG------------A-G--T--ATGTTG--------TAT----T--CCT-A-ACACA--G--------gaggcggactactactggggag
gi|3 : CATAATGTATTTA---AGATTTTGAAATA--A-AAATCCAGA---AAGTTGTTAA-CC-ATT-GTACATTCTTTCAT--TG-CAGT-----ACAG---AGAAGCT-TGCT-ATGGC-AACATCAGATCCAC---TGGCCAGAGCA-CAA--GGCGTGAAAC--GTTGTCAGTTA-TGTCCCGGCAAA-CACAGAAAGTCTGTA-GCAGA-GACCGTGTGTAACACATGTCTTA-TCAA-CCT-CTGTAAGGATTGTGTAG-GACATCAC--ATGACCT-CAAATCCCACCAT--ACGCCAT-GATGTAG-TCACTT-TTCAATTCAAAAAAC-TAGAAATCATTCCA-CCCCAATG--T-ACAATACAT-GAACAACAGA-AATGTAAA-ACAT-TCTGTGAACAAT-GTGATTCTCCAATTTGT-CT--------GAAATGTC------TTG-----CCTCTGGATCTCATGAAAAACA-CAA-CATGTCAC-AGATT--TCAGAAATTCACAGC-TTTAG----AAAACAGTTG-A-TAGA--AAG-AGA----TACACAA--GA----AC-TT-GAA--AGG-AAAA-TTGC-A-CC-TATG-TT-T-G-AAT-CAATTCTCTCTGAAATA--G-AAAAAATGTTGT----CAAATGTTC-TACA-AAAACAC-GG---AGAAAG-ACAACAAACCATTAC---------------------TGATTTT---GGCAAAA-------GA--TG--TCATATACTTGT-AGAC-A-T-TATCATC-A-------AC--CGA-T----ATC-GG-AGTA-AT-T-CAA--AGAAG-ATGGAAAAACAAGAT-GGCGACTCTA-T--CAAAACCC-T--GAA-AT--CAG-AGTT--TGGT-----AAAT-TACA-ATC-ATCAA-TAC------AATC-AA-CT--ATAAAT--GAA----AAT-C-ATTCTAT--CC-TTGCTTCCA-AC---------G---AT--T--T-CT-----------------CC--AA--AT-T--T-A-----CCAGTT-A-----TG--CT---TCAAG-GA-ATGAAGAATTAAGAAAT---GTTCCC--TCTAG-AT-TTGAA---TTAA---------CCCT--TC------CACCA-A--TGGAA-CTCAAAGG-GCTAACAGA-AC-AA-GTATTGAAG---GA----ACTCCTG-GGAGTCATCCCTAGCTCA-ATAAGAA-----CTGACA-TT----C-CA--GGGCAAGTCT-TGCAA--------GTC---ACT------CA---TC----------C-AGTC-T-----C--CAG-TGT------CAAC-GA----AC--CAAA-TA----AAAAA--TTAT------CAGG-AAAG---C--CTGAA--GTA--TT---A-G-CAGCT-TT-CAGAACTA--G---TTA---T----A-ATCTCA--C-TAGCAG------------A-G--T--CTGTTG--------TAT----T--CCT-A-ACACA--G--------A----TA--AATTCT---ATGTCAG--T--GGTGA---CAATGAGATCA--TCAGACA-C--ATAAACACT
gi|4 : aatattcaAATAG-A-AAATTCA-A---AAGTAATAAA-CTTATTAGTA-ATTATTTCTT--TA-CAGT-----A-AG---ACT-GTT-TGCC-ATGG--AA-ATCAGATCC-----TGG--AGAGCAACAA--ATTGTGAA-C--GCTGT-AGTTA--GT---GGCAAA-CACAGAAG-TCTGCAAGCAGA-G--CGTGTGTAACAC--GTCAAG-TCAA-CTT---G-AAGG-TTGTGTAGAGACATCACTGATGAC------ATCCCAT-------GCCAT-GA----G-T-A--TATTTCATT---AAAAT-TA-AAATCATTC-A-CCGCAGTGGGT-AAACTA-AT-AA-CAACAGA-A-TGTGAA-ACATATCTGTGAACAATTGTGATTCTCCAATTTGT-CT--------GAAATGT-------TTG-----C-TCTGGTACTC-TGAAACA-A-CGAATGTGT-A--AGATT--TCAGAATT--ACAAT-TCTAG----AAAAAAGCTG-AATAGA--TGG---A----TACACAA--GA----AGATT-GAA--GAG-AACA-TTGC-AACCATGTGATT-T-G-A-T-CAATTCACTCTGAAA-A--GTGAGAAATATTGTTTGTCAAAT-TTC------AAACCACTGG---AGAAAG-ACAACAA-CTATT-C---------------------TGAATTC---GGCAAAC-------GAATTG--T-ATGCAAGTGT-AGAA-G-TATGTCATC-A-------AC--AGA-T----ATC-TG-AGTG-AT-G-CAA--AGAAGAATGGAAAAACAAGAT-GGTGATTCAA-T--C-AAACCC-T--GAC-CT--CAGAAGTT--TGAT------AAT-TACA---T-ATC-A-TAC-------AT-----CT--AT--AT--GAA----AAT-C-ATTCTGA--TC-TTGCTT-CA-AC---------G---AT--T--TGGT----------------------A--AT-T--TAA-----CCTGTT-A-----TGC-CT---TCGAG-GCTATGCGG-ATTAAGAAAT---GTTC-----CTAG-AA-TTGAA---TTAAACTATCTTTCACTGGTCTGATTACTCCA-C--TTGA--CTCAGAGA-A-TAACAGATAC-AAGGCGTTGAAA---GA----ATTCATATGGAGTAATGTCTACATCCTAT---AA-----CCGAC--TT----C-----GGGC-AGTC--TGCAA--------AAT---ACT------C----TC-------------GTC-T--------CAG-TGT------CAAC-GA----AA--CAAATTA----AAAAA--ATAT-------AGG-AAG-------CTGAA--GTA--TT---A-G-CAGCT-TT-C-AAACCG--G---CTA---TA--TA-A----A--C-ATTCAG------------A-G--TTAATGCTG--------T---------------ACACA--G--------A----TT--TA-TCT---A--CCA---TAAGGTGA---AAA-AGTATAA--TCAGACA-A--GTGAACACT
gi|5 : ttaagGATT--T-AGAAAT--ACAAT-TCTAG----AAAA--GCTG-A--AGATGAGG-CGAGTAGTACGAAA--GATGAAAC-T--GAATGAGG-CACA-TTGA-A-C--TGTG-TTAT-G-AAC-TAATTCTTCATGAAATATGG-AAGA--TGTTGT----CAAATGTTT----A-AAAACAT-GGGAAAGAGAG-ACAAGACAATATTATAAATGTCGGACGACGGATTCATGGATTC---GGAGAAAAGGAGAAGA--TGGGTCAT-CACGTGT-AG-C-AGT-TGT-ATC-GGTCGAGTAC--AGA-TTAATATT-TGGAGTGGAT-TGCAA--AGAAG-ATTGGAAAACAGAGTAGGTGATT----T--CAAA---C-T--GAAGAT--TAG--GTT--GGATGTTG-AAAT-TACAGAGT-ATCAAGTAC------A-TC-AA-CCTAATACATT-GAA----TAT-T-CCCCT-T--CC-TTGTT--CA-ACATGGCGAGGG---ATGAT--T-CTAAGGGAGGTAGGAGGAGCC--AA---T-T--T-A-----ACTGTT-A-----T---CT---TAGAG-GA-ATGCGGAGTTAAGAA-T---GTTAAC--TCTAGGAT-TTGAA---TTAA---------ACTT--TC------CACAA-T--TTG---CTCAGAGA-ACTAACAGA-A--AA-GCGT-GAAA---GA----ATTCATGTGGGATCATT----TCTCC-ATAAAG--------GACA-TT------CA--GGG-AAGTCT-TGCAA---------TC----TT------C-----C----------C-AGT-----------CAG-TGT--------AC-GA----A---CAAA-TA----AAAAA--ATAT-------AGG-AAAG---C--CTGAA--GTA--TT---A-G--AGAT-TT-CAAAACCG--G---CTA---TAC-TA-A---CA--T-T--CAG------------A-G--T--ATGC-G--------T---------------ACACA--G--------A--------AATT-T---ACATAAG-----GGTGA---CAtgaggg
gi|6 : gGGATCTCATGAAAAACA-TGA-TGTGTCAC-ATATT--TCAGAAATCCA--GT-TCTAG----AAAACAGCTG-A-TAGA--AAG-CGA----TAAAAAAAAGA----AA-TT-GAA--AGT-AACA-TTGC-A-CC-TGTG-TT-TTG-AATTCAATTCTCTCT-AAATA--G-AAGAAA-GTTGT----CTAATGTTG-TCCA-AAAACAT-GG---AGAAAG-ACAACAAACCATAAC---------------------TGAATTC---GGCAAAA-------GA--TG--TCATGCACGTGT-AGAC-A-T-TGTCATC-A-------AC--AGAAT----ATCGTG-AGT--AT-T-CAG--AGAAG-ATGGAAAAGCAAGAT-GGTGACTCAA-T--CAAAACCCCT--AAA-AT--CCG-AGTA--CGAT-----AAAT-TACA-ATC-ATCAA-TAC------AATC-AA-CT--ATAAAT--GAA----AAT-C-ATTCTAT--CC-TTGCTTCCA-AT---------G---AC--T--T-CT-----------------CC--AA--AT-T--T-A-----CCAGTT-A-----TG--CT---TCGAG-GA-ACGAGGAATTCCGAAAT---GTTCCC--TCTAA-AT-TTGAA---TTGA---------CAGT--TC------CACCA-T--TGGAC-CTCAGAGA-ACTAACAGA-AC-AA-GCATTGAAG---GA----ATTCATG-GGAGTCATTCCTACCTCC-ATAAAAA-----CCGACA-TT----C-CA--GGGCAAGTCT-TGCAA--------GTC---ACT------CA---CC----------C-AGTC-T-----C--CAG-TGT------CAAC-GA----CC--CAAA-TA----AACAA--TTAT------CAGG-AAAT---C--CTGAA--GTA--TTTAAA-A-CAGCT-CT--AAAAATG--G---CTA---T-----------A--C-TAACAG------------A-G--T--ATGCTG--------TAT----T--CCT-A-ACACA--G--------A----TC--AATTCT---AGATCAG--T--GGTTT---CTATATCATCA--TCAAACG-T--ATGAGCACTtagttaaatagaaaatgaactgagcgggccactacctgggggagatc
gi|7 : GGATTGTGTAG-GACATCAC--ATGACAT-CAAATCCCACCAT--ACGTCAT-GATGTTG-TCACTT-TTCAATACAAAAAAC-TAGAAATCATTCCA-CCCCAATG--T-AAACTACAT-AAAAAACAGA-AATGTGAT-ACAT-TCTGTGAACAAT-GTGATTCTCCAATTTGT-CT--------GAAATGCC------TTG-----CCTCTGGATCTCATGAAAATCA-CGA-TATGTCGC-AGATT--TCAGAAATCCACAGC-TCTAG----AAAACTGTTG-A-TAGA--AAG-AGA----TACACAA--GA----AC-TT-GAA--AGA-AACA-TTGC-A-CC-TGCG-TT-T-G-AAT-CAATTCTCTCTGAGATA--G-AAGATATGTTGT----CAAATGTTC-TACA-GAAACAC-AG---AGAAAG-ACAACAAACCATTAC---------------------TGAATTC---GGCAAAA-------GA--TG--TCATACACTTGT-AGAC-A-T-TGTCATC-A-------AC--AGA-T----ATC-TG-AGTG-AT-T-CAA--AGAAG-ATGGAAAAACAAGAT-GGTGACTCAA-T--CAAAACCC-T--GAA-AT--CTG-AGTT--CGAT-----GAAT-TACA-ATC-ATCAT-TAC------GATC-AA-CT--ATAAAC--GAA----AAT-C-ATTCTAT--CC-TAGCTTCCA-AC---------G---AT--T--T-CT-----------------CC--AA--AT-T--T-A-----C
gi|8 : g-AC---------G---AC--TGTT-CT-----------------CCCGAACGATGT--T-A-----CCAGTTCAGCGTTTG--CT---TCGAG-GA-ATGAG-AATTTAGAAAT---ATTCCC--TCTAG-AT-TTGAA---TTAA---------CAGT----------CACCA-TGGTGGGC--TCAGAGACAATAACAGA-AC-AA-GCATTGAAG----A----ATTCATG-GGAGTCATTCCTACCTCC-ATAAAAC-----CGGACA-CT----C-CACAGGGCAAGCTT-TGCAA--------GTCC--ACTT-----CA---TC----------C-AGTC-T-----C--CAA-GGG------CAAC-GA----AC--CAAA-TA----AAAAA--TTAT------CA-G-AAAG---C--CTGAA--ATA--TT---ACG-CAGCT-CTCCAAAACTGTTG---ATA---TA--CA-A---CA--C-ATCCAGTCCGGGTCGTACA-G--C--TTGGTA--------TGT----T--CCTGA-ACACATCG--------AGCATCC--ATTTCTATAATGTCAGTCT--GGTGA---C-ATAATATCATGTCAGACACC--ATGAACACT
gi|9 : TAT--CC-TTGCTTCCA-AC---------G---AT--T--T-CT-----------------CC--AA--AT-A--T-A-----CCAGTT-A-----TC--CT---TCCAG-GA-ATGAGGAATTAAGAAAT---GTTCCC--TCTAG-AT-TTGAA---TTAA---------CAGT--TC------CAACA-T--TGAAC-CTCAGAGA-ACTAACAGA-AC-AA-GCATTGAAG---GA----ATTCCTG-GGAGTCATTCCTAGCTCC-ATAAGAA-----CTGACA-TT----C-CA--GGGAAAGTaaggggc
gi|9 : AGAA-----CAAGCA-TT----G-AA--GG--AATTCC-TGGGA--------GTC---ATT------C-----C----------T-AG-C-T-----C--CA-----------TAA--GA----AC--TGAC-----------A--TT-C------CAGGGAAAG---TTGNTGAA--GTA--TT---A-G-CAGAT-CT-CAAAACTG--G---CTA---TG--CC-AT--CA--C-TTACAG------------A-G--T--ATGCTG--------TAT----T--CCC-A-ACACA--G--------A----TC--AGTTCT---ATATCAG--T--GGTAA---CAATAACATCA--TCAAACG-C--ATGAACACTtgntgaagtattagcagatctcaaaactggctatgccatcacttacagagtatgctgtattcccaacacagatcagttctatatcagtggtaacaataacatcatcaaacgcatgaacact
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|15 ): ATGGGGGGATACAACGTCAGGAATCTCCAGAGAGATTGACGGTGACAGGGAGGGAGATTGGTGTACTGATGGGATGATAGAGATATCAACAGACAAAAGAATAGA
Unaligned ( gi|17 ): ACCAAGTAGGAATCTCAGAAATTGACGGTGAAAGGGAGGAGAGATTTGGTGTACTGGACATGGAATGCAT
Alignments
lowQualScore : 1 222 1 2222 22222 1 1 1 1 11 1 222222222222 1 11 11 33333 1 11 11 11 11 2 1 1 1 1 11 11 111 11 1 1 1111 1 22222222 22222222222222 1111 1111 1111 1 1111 333333333333333333333 1111111 1111111 1111 111 1 2222222 1 111111 11 1111 111111111 222222222222222222222 11111 11111111111 111111111 111111 1 22222222 111 2222222222222222222222222 11111111 111111 111111 1111111 111111111111 11 111111111111111111 11111111
lowQualScore : 5 111 3 4444 44444 3 1 0 0 0 0 33 0 999999999999 1 3 0 11 22 2 00000 22 0 33 1 2 3 33 6 2 33 2 8 22 2 0 0 0 3 3 0 0 22 3 0 0 8 11 666 3 11 8 7777 8 0 3 8 8 9999 8 0 8 0 8 88 8 0 8 99999999 99999999999999 5 5 5 66 2 5 7777 2 5 5 66 99 5555 66 0000 5 5 66 5 5 5 5 5 0 5 5 5 5 66 4 9999 1111 4 4 777 4 777777777777777777777 777 6666666 66 66 5 5 5 5 5 5 6666666 66 5 0000 5 5 5 000 66 0 5 4 66 2 5 66 5 66 1 5 888 4444444 5 5 5 5 444444 5 5 66 0 11 0000 5 5 66 4 4 666666666 777 55 55 8 999999999999999999999 55 4 7777 11111 55555555555 888 5 555 888 66 4 4 777 777777777 1 66 222222 7777 55 4 1 4 4 4 0 777 9999 8 4 99999 3 888888 666 4 11111111 111 3333333333333333333333333 4 55555555 4 111111 4 8888 55 4 8888 55 111111 4 888888 55 55 666 7 3 3 3 2 55 666 666 6666666 3 44 44 2 777777777777 3 44 22 999999999999999999 3 3 44 22222222 77777777 777 88888 777 1 66 7777
lowQualScore : . ... . .... ..... . . . . . . .. . ............ . . . .. .. . ..... .. . .. . . . .. . . .. . . .. . . . . . . . . .. . . . . .. ... . .. . .... . . . . . .... . . . . . .. . . . ........ .............. . . . .. . . .... . . . .. .. .... .. .... . . .. . . . . . . . . . . .. . .... .... . . ... . ..................... ... ....... .. .. . . . . . . ....... .. . .... . . . ... .. . . . .. . . .. . .. . . ... ....... . . . . ...... . . .. . .. .... . . .. . . ......... ... .. .. . ..................... .. . .... ..... ........... ... . ... ... .. . . ... ......... . .. ...... .... .. . . . . . . ... .... . . ..... . ...... ... . ........ ... ......................... . ........ . ...... . .... .. . .... .. ...... . ...... .. .. ... . . . . . .. ... ... ....... . .. .. . ............ . .. .. .................. . . .. ........ ........ ... ..... ... . .. ....
lowQualScore : 0 000 3 8888 55555 2 2 0 0 0 0 88 0 222222222222 0 2 0 00 55 5 00000 88 0 88 0 5 2 88 5 5 22 5 8 55 5 0 0 0 2 2 0 0 55 2 8 8 0 00 888 2 00 0 4444 0 6 2 0 0 8888 0 8 0 6 0 88 0 8 0 00000000 88888888888888 0 0 0 11 9 0 5555 5 0 0 99 55 6666 99 6666 0 0 99 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11 4 4444 1111 4 4 888 4 888888888888888888888 888 2222222 99 99 4 0 0 0 0 0 2222222 99 0 6666 0 0 0 111 99 0 0 4 11 0 0 99 0 99 0 0 000 1111111 0 0 0 0 444444 0 0 99 1 99 6666 0 0 11 4 0 000000000 000 55 55 0 000000000000000000000 55 4 0000 11111 88888888888 888 0 222 888 11 4 4 888 888888888 0 11 888888 8888 66 4 1 4 4 4 7 888 4444 2 0 11111 6 222222 444 0 55555555 000 6666666666666666666666666 0 55555555 0 555555 0 5555 55 0 5555 55 555555 0 888888 00 00 444 3 6 6 6 5 00 444 444 7777777 3 66 88 2 111111111111 3 66 55 000000000000000000 3 3 66 11111111 88888888 000 44444 000 0 99 0000
consensus : NNNNNNNNCATAGTGTACTTACTAAGATTTT-AAATA--A-AAATCCA-A---AAGTAGTTAA-CC-ATT-GTA-ATTCTTTCAT--TG-CAGT-----ACAG---ANAAGTT-TGCN-ATGGC-AACATCAGATCC-C---TGGCCAGAGCA-CAA--ANCGTGAAAC--GCTGTCAGTTA-TGTCCCGGCAAA-CACAGAAA-TCTGCA-GCAGA-GACCGTGTGTAACACATGTCATG-TCAA-CCT-CTGTAAGGATTGTGTAG-GACATCAC--ATGACCT-CAAATCCCACCAT--ACGCCAT-GATGTTG-TCACTTATTCAATTCAAAAAAC-TAGAAATCGTTCCA-CCCCAGTG--T-AAACTACAT-AAACAACAGA-AATGTGAA-ACAT-TCTGTGAACAAT-GTGATTCTCCAATTTGT-CT--------GAAATGTC------TTG-----CCTCTGGATCTCATGAAAAACA-CGA-TGTGTCAC-AGATT--TCAGAAATCCACAGT-TCTAG----AAAACAGCTG-A-TAGA--AAG-CGA----TACACAA--GA----AC-TT-GAA--AGG-AACA-TTGC-A-CC-TGTG-TT-T-G-AAT-CAATTCTCTCTGAAATA--G-AAGAAATGTTGT----CAAATGTTC-TCCA-AAAACAC-GG---AGAAAG-ACAACAAACCATTAC---------------------TGAATTC---GGCAAAA-------GA--TG--TCATGCACGTGT-AGAC-A-T-TGTCATC-A-------AC--AGA-T----ATC-TG-AGTG-AT-T-CAA--AGAAG-ATGGAAAAACAAGAT-GGTGACTCAA-T--CAAAACCC-T--GAA-AT--CNG-AGTT--CGAT-----AAAT-TACA-ATC-ATCAA-TAC------AATC-AA-CT--ATAAAT--GAA----AAT-C-ATTCTAT--CC-TTGCTTCCA-AC---------G---AT--T--T-CT-----------------CC--AA--AT-T--T-A-----CCAGTT-A-----TG--CT---TCGAG-GA-ACGAGGAATTAAGAAAT---GTTCCC--TCTAG-AT-TTGAA---TTAA---------CANT--TC------CACCA-T--TGGAC-CTCAGAGA-ACTAACAGA-AC-AA-GCGTTGAAG---GA----ATTCATGTGGAGTCATTCCTACCTCC-ATAAAAA-----CCGACA-TT----C-CA--GGGCAAGTCT-TGCAA--------GTC---ACT------CA---TC----------C-AGTC-T-----C--CAG-TGT------CAAC-GA----AC--CAAA-TA----AAAAA--TTAT------CAGG-AAAG---C--CTGAA--GTA--TT---A-G-CAGCT-CT-CAAAACCG--G---CTA---T-A--TA-A-CA--C-TTNCAG------------A-G--T--ATGCTG--------TAT----T--CCT-A-ACACA--G--------A----TC--AATTCT---ATGTCAG--T--GGTGA---CAATAANATCA--TCAGACA-C--ATGAACACT
Reference ( family-3067 ) : NNNNNNNNCATAGTGTACTTACTAAGATTTT-AAATA--A-AAATCCA-A---AAGTAGTTAA-CC-ATT-GTA-ATTCTTTCAT--TG-CAGT-----ACAG---ANAAGTT-TGCN-ATGGC-AACATCAGATCC-C---TGGCCAGAGCA-CAA--ANCGTGAAAC--GCTGTCAGTTA-TGTCCCGGCAAA-CACAGAAA-TCTGCA-GCAGA-GACCGTGTGTAACACATGTCATG-TCAA-CCT-CTGTAAGGATTGTGTAG-GACATCAC--ATGACCT-CAAATCCCACCAT--ACGCCAT-GATGTTG-TCACTTATTCAATTCAAAAAAC-TAGAAATCGTTCCA-CCCCAGTG--T-AAACTACAT-AAACAACAGA-AATGTGAA-ACAT-TCTGTGAACAAT-GTGATTCTCCAATTTGT-CT--------GAAATGTC------TTG-----CCTCTGGATCTCATGAAAAACA-CGA-TGTGTCAC-AGATT--TCAGAAATCCACAGT-TCTAG----AAAACAGCTG-A-TAGA--AAG-CGA----TACACAA--GA----AC-TT-GAA--AGG-AACA-TTGC-A-CC-TGTG-TT-T-G-AAT-CAATTCTCTCTGAAATA--G-AAGAAATGTTGT----CAAATGTTC-TCCA-AAAACAC-GG---AGAAAG-ACAACAAACCATTAC---------------------TGAATTC---GGCAAAA-------GA--TG--TCATGCACGTGT-AGAC-A-T-TGTCATC-A-------AC--AGA-T----ATC-TG-AGTG-AT-T-CAA--AGAAG-ATGGAAAAACAAGAT-GGTGACTCAA-T--CAAAACCC-T--GAA-AT--CNG-AGTT--CGAT-----AAAT-TACA-ATC-ATCAA-TAC------AATC-AA-CT--ATAAAT--GAA----AAT-C-ATTCTAT--CC-TTGCTTCCA-AC---------G---AT--T--T-CT-----------------CC--AA--AT-T--T-A-----CCAGTT-A-----TG--CT---TCGAG-GA-ACGAGGAATTAAGAAAT---GTTCCC--TCTAG-AT-TTGAA---TTAA---------CANT--TC------CACCA-T--TGGAC-CTCAGAGA-ACTAACAGA-AC-AA-GCGTTGAAG---GA----ATTCATGTGGAGTCATTCCTACCTCC-ATAAAAA-----CCGACA-TT----C-CA--GGGCAAGTCT-TGCAA--------GTC---ACT------CA---TC----------C-AGTC-T-----C--CAG-TGT------CAAC-GA----AC--CAAA-TA----AAAAA--TTAT------CAGG-AAAG---C--CTGAA--GTA--TT---A-G-CAGCT-CT-CAAAACCG--G---CTA---T-A--TA-A-CA--C-TTNCAG------------A-G--T--ATGCTG--------TAT----T--CCT-A-ACACA--G--------A----TC--AATTCT---ATGTCAG--T--GGTGA---CAATAANATCA--TCAGACA-C--ATGAACACT
gi|1 : CATAGT-TACTTACTAAGATTTT-AAATA--ATAAATCCC-AGATAAGTGATTAAACC-ATG-GTA-ATTCTTTCAT--TG-CAGTTCGTCAC-G---ACAAGTT-TGCAGATGGCTAACATCAGATCC-C---TGGCCAGAGAG-CAACAAACGTGAAACCCGCTGTCAGTTAATGTCCCGGCAAAACACAGAAACTCTGCA-GCAGA-GACAGTGTGTAACACATGTCATG-TCAACCCT-CTGTAAGGATTGTGT-G-GACATCAC--ATGACCTGCAAAACCCACCATAGACGGCATGGATGTTGTTCACTTATTCAAATTAATAAATAGAGAAATCGTTCCACCCCCAGTG----AAACTACATGAAACAACAGAGAATGTGAAGACAT-TCTGTGAACAAT-GTGATTCTCCAATTTGTGCTTTGAAGAAAAAATGTCCCCTTTTTGCCTCCCCTCTGGATCTCATGAAAAACA-CAA-TGTGTCACAAGATT--TCAG-AATCCACAGTGTCTAGCTATAGAAAAGTTGAA-TAGA--AAG-CGAT---TACACAA--GA----AC-TT-GGA--AGG-AACAGTTGCAA-CC-TGTGATT-T-G-AAT-CAATTCCTTCTAAAATA--G-AGAAAATGTTGT----C-AATGTTTGTCCATTAAACAT-GG---AGAAAGAACAAC--ACCTACAC---------------------AGAATTTCGGGGCGAAA-------GA--TG--TCATGCACGTGTAAGACAA-T-TGTCATC-A-------ACCAGGA-T----ATC-TG-AGTG-ATAT-CAACCAGAAGCATGGAAAAACAAGAT-GGTGACTCAA-T--CAAAACCC-TAGAAA-AT--CAG-AATT--CGGGGAGGAAAATCTACACATCAATCAC-TACACCAGGAATCAAA-CT--ATCAATCAGAAGGACAAT-CAATTCTACTACCATTGCTTCCACAC---------GCTCAT--T--TACT-----------------GCGGAA--AT-TAGT-AGTGCTCGAATTGA-----TGACCT---TCGAG-AA---GACGAATTGCGACATGGGGTTCCTCATC----ATACTGAATAGTTAA---------CAGT--TC------CACCA-T--TGGACTCTCAGGAA-AACAAGAGA-ACAAA-GCATTGAAGATTGAGAGTACTCATGTGGAGTCATTCCTACCTCC-ATAAAAAACTTTTCGACA-TA----CACA---GGCAAATCT-TGCAATTTCCTGGATCTAAACT------CACAGTC----------C-CGTCAT-----G--CAGTTGT------C-AC-GAGAATAA--CAAA-TA----AAAAA--TTAT------CAGG-AAAA---G--CTGAA--ATA--TT---A-GCCAGATACT-CAAAGCTA--GACTTTA---T-ACTTA-A-CA--CGTTACAG------------A-G--TC-ATGCTG--------TACGGGGTGGCCT-ACATACA--G--------A----TCCAAATTCT---ATGTCA---C--AGTGA---TAAT
gi|10 : cattggtaacaatcgtcatatccttaccgggtatttacaatcaaatgaggaaaaatgatataactgttcatctgttagaaattgtatattacactgttgtttatatcctataaaatttgcacCTCTGGGTCTCATGAAAAACA-CAA-CGTGTCAC-AGATT--TCAGAAATCCACAGG-TCTAG----AAAACAGCTG-A-TAAA--AAG-CGA----TACACAA--GA----AC-TT-GAA--AGA-AACA-TTGC-A-CC-TGTG-TT-T-G-AAT-CAATTCTCTCTGAAATA--G-AAGAAATGTTGT----CAAATGTTT-TACA-AAAACAC-AG---AGAAAG-ACAACAAACCATAGC---------------------TGAATTC---GGCAAAA-------GA--TG--TCATTCACGTGT-AGAT-A-T-TGTCATC-A-------AC--AGA-T----ATA-TG-AGTG-AA-T-CAA--ACAAG-ATGGAAAAACAAGAT-GGTGACTCAA-T--Cgtaagagagaaacaaatatatacatcagatgagcaacgagggggctactacactgtagggagatcaccacaagtcaggatatactctcaacagaatgctgacaggtgcaccttagggcgaaggagagatatactggtgtatcaactagcacaatgggatgga
gi|11 : -ATACGAA-----CCGACAGCTGAGAC-CA--CGGCAAGTCTGTGCAATAA-----GTC---ACCTCACACCA---TCATTACCAAGGC-AGTC-TGCGCGCAACAA-TGTGGTATCCAACTGA----ACTCCAAA-CATAATAAAAA--TTATATATCACAAG-AAAGACAC--CTGAAAAGTAAATT---AAG-CAAGT-CT-CAAAACTG--G---TTAATCT-A--AA-A-CAAGC----CAT------------ATG--TAAACGCTGTTACCACTTGC----T--CCT-A-AC-CA--GTCTAGTACA----TA--ATTTCT---ATGTCAG--T--GGTGAACCCAATA
gi|12 : TCCC--TCTAG-AT-TTGAA---TTAA---------CACT--TC------CACCA-C--TTGAC-CTCAGAGA-ACTAACAGA-AC-AA-GCGTTGAAA---GA----ATTCAT-TGGAGTCATTCCTACCTCC-ATAAAAA-----CCGACA-TT----C-CA--GGGCAAGTCT-TGCAA--------ATC---ACT------CA---TC----------C-AGTC-T-----C--CAG-TGT------CAAC-GA----AC--CAAA-TA----AAAAA--ATAT------CAGG-AAAG---C--CTGAA--GTA--TT---A-G-CAGCT-TT-CAAAACCG--G---CTA---T-AC-TA-A-CA--C-TTTCAG------------A-G--T--ATGCTG--------------------T-A-ACACA--G--------A----TC--AAGTC
gi|13 : AAG---T--CTGAA--GTA--TT---A-G-CAGCC-CT-AAAAACAG--G---CTA---T-A--AAGA-GA--C-TTGCAG------------A-G--T--ATGCTG--------TAT----T--CCT-A-ACACA--G--------A----TC--AATTCT---ATGTCAG--T--GGTAA---CAATGAGATCA--TCAGACA-C--ATGAACACT
gi|14 : TGACTCAA-T--CCAAACCC-T--AAA-AT--CTG-AGTT--TGAT-----GAAT-TACA-ATC-ATCAA-TAA------AAAC-AA-CT--ATAAAT--GAA----AAT-C-ATTTTAT--CC-TTGCTTCCA-AT---------G---AT--T--T-CT-----------------CC--AA--Agaggggacactactgggggagatc
gi|16 : GAAATA--G-AAGAAATGTTGT----CAAATGTTC-TCAA-AAAACAT-GG---AGAAAG-ACAACAAACTATTAC---------------------TGAATTC---GGCAA
gi|18 : ATCA--TCAGACA-C--ATGGACACT
gi|19 : cCATGAAAAACA-CAA-TGTGTCAC-AGATT--TCAAAAATCCACgagggaacactactgggggagatcgc
gi|2 : TTT-ATATACCA-AAATTCA-C---A--TAGTTAA-CC-ACT-GTA-ATTCTTTCATATTATCAGT-----ACAGGCGAAAAGTTCTGTA-ATGGC-AACATCAGATCC-CCACTGGCTAGAGCA-CAG--ACC-TGAAAC--G-TGTCAGTTA-TGTCC--GCAAA--ACA-AAA-TCTGCA-GCAGAAGACCGTGTGTAACACATGCCATGATCAA-CCTACTGTAAGGATTGTGTAG--ACATCAC--ATGACCTTCAAATCCCATTAT--ACGCCAT-GAT--TG-TCACTTATTCAATT-AAAAAAC-TAGAAATTGTTCCA-CCCCAGTG--TCAAACTACAT-AAACAACAGA-A-TGTGAA-ACAT--CTGTGAACAAT-GTGATTCTCCA-TATGT--T--------GAAATGTC------T-------CCTCTGGATTTCATGAAAAGCAACAA-TGGCTCAC-AGATTCATCAGAAATCCACAGT-TCTAAGA--AAAACAGCTG-A-TAGA--AAGATGA----TACACAA--GA----AC-TTAGAA--AAGCGACA-TTGC-A-CC-TGTG-TT-T-GGAAT-CAATTCTCTC-GAAATA--G-AAGAAATGTTGC----AAAATGTTG-TCCA-AAA-CAT-GG---CGAA-G-ACAACAAACCATTAC---------------------TGAATC-----GCAAAA-------A----G--TCATACATGTG----AC-A-T-TGTCATCGA-------AC--AGA-T----ATC-TG-AGTG-AT---CAA--AGAAG-ATG-AAAAACAAGAT-GGTGACTCGAGTAGCGAGAGAA-T--GAA-ATATCTG-ACTTATTGA------AAAG-TGCATATC-ATCAA-TAC------AATC-AAACT--ATAAAT--GAA----AATTC-ATTCTAT--CC-TTGTATCCA-AC---------G---AT--T--T-CT-----------------CC--AA--AT-T----A-----CCAGTT-A-----TG--CTGCATCGTGAGA-ACGAGGAGTTACGAAAT---GTTCCC--TCTAG-AT-TTGAA---TTAA---------CACT--TC------CACCATT--TGGAC-C-CAGAGA-ACTAACAGA-AC-AA-GCATTGAAG---GA----ATGCATG-GGAGTCATTCCTACCTCC-ATAAAAA-----CCGACA-TT----C-CA---GGCAAGTCT-TGCCA--------GTC---ACT------CA---TC----------CAAGTC-T-----C--CAG-TGT------CAAC-GA----AC--CAAA-TA----AAAAAACTTAT------CAGG--AAG---C--CTGAA--GTA--TT---A-G-CAGCT-CT-CAAAACTG--G---TTA---A-C--TA-A-CA--C-TTA-AG------------A-GCTC--ATGCTG--------TAT----T--CCT-A-ACACA--G--------A----TC--AGTTCT---ATGTCAG--T--GGTAA---CAATAAGATCA--TCAGACA-CCTATGAACACT
gi|20 : catttgtactgtgcatacccccttaccgggttatttacaaatatcaaaataaatacagttgatttgtttactgtgtttcagccaaatgtagttaaactatgcatacacctg-CA--C-TTACAG------------A-G--T--ATGTTG--------TAT----T--CCT-A-ACACA--G--------gaggcggactactactggggag
gi|3 : CATAATGTATTTA---AGATTTTGAAATA--A-AAATCCAGA---AAGTTGTTAA-CC-ATT-GTACATTCTTTCAT--TG-CAGT-----ACAG---AGAAGCT-TGCT-ATGGC-AACATCAGATCCAC---TGGCCAGAGCA-CAA--GGCGTGAAAC--GTTGTCAGTTA-TGTCCCGGCAAA-CACAGAAAGTCTGTA-GCAGA-GACCGTGTGTAACACATGTCTTA-TCAA-CCT-CTGTAAGGATTGTGTAG-GACATCAC--ATGACCT-CAAATCCCACCAT--ACGCCAT-GATGTAG-TCACTT-TTCAATTCAAAAAAC-TAGAAATCATTCCA-CCCCAATG--T-ACAATACAT-GAACAACAGA-AATGTAAA-ACAT-TCTGTGAACAAT-GTGATTCTCCAATTTGT-CT--------GAAATGTC------TTG-----CCTCTGGATCTCATGAAAAACA-CAA-CATGTCAC-AGATT--TCAGAAATTCACAGC-TTTAG----AAAACAGTTG-A-TAGA--AAG-AGA----TACACAA--GA----AC-TT-GAA--AGG-AAAA-TTGC-A-CC-TATG-TT-T-G-AAT-CAATTCTCTCTGAAATA--G-AAAAAATGTTGT----CAAATGTTC-TACA-AAAACAC-GG---AGAAAG-ACAACAAACCATTAC---------------------TGATTTT---GGCAAAA-------GA--TG--TCATATACTTGT-AGAC-A-T-TATCATC-A-------AC--CGA-T----ATC-GG-AGTA-AT-T-CAA--AGAAG-ATGGAAAAACAAGAT-GGCGACTCTA-T--CAAAACCC-T--GAA-AT--CAG-AGTT--TGGT-----AAAT-TACA-ATC-ATCAA-TAC------AATC-AA-CT--ATAAAT--GAA----AAT-C-ATTCTAT--CC-TTGCTTCCA-AC---------G---AT--T--T-CT-----------------CC--AA--AT-T--T-A-----CCAGTT-A-----TG--CT---TCAAG-GA-ATGAAGAATTAAGAAAT---GTTCCC--TCTAG-AT-TTGAA---TTAA---------CCCT--TC------CACCA-A--TGGAA-CTCAAAGG-GCTAACAGA-AC-AA-GTATTGAAG---GA----ACTCCTG-GGAGTCATCCCTAGCTCA-ATAAGAA-----CTGACA-TT----C-CA--GGGCAAGTCT-TGCAA--------GTC---ACT------CA---TC----------C-AGTC-T-----C--CAG-TGT------CAAC-GA----AC--CAAA-TA----AAAAA--TTAT------CAGG-AAAG---C--CTGAA--GTA--TT---A-G-CAGCT-TT-CAGAACTA--G---TTA---TAA--TC-T-CA--C-TAGCAG------------A-G--T--CTGTTG--------TAT----T--CCT-A-ACACA--G--------A----TA--AATTCT---ATGTCAG--T--GGTGA---CAATGAGATCA--TCAGACA-C--ATAAACACT
gi|4 : aatattcaAATAG-A-AAATTCA-A---AAGTAATAAA-CTTATTAGTA-ATTATTTCTT--TA-CAGT-----A-AG---ACT-GTT-TGCC-ATGG--AA-ATCAGATCC-----TGG--AGAGCAACAA--ATTGTGAA-C--GCTGT-AGTTA--GT---GGCAAA-CACAGAAG-TCTGCAAGCAGA-G--CGTGTGTAACAC--GTCAAG-TCAA-CTT---G-AAGG-TTGTGTAGAGACATCACTGATGAC------ATCCCAT-------GCCAT-GA----G-T-A--TATTTCATT---AAAAT-TA-AAATCATTC-A-CCGCAGTGGGT-AAACTA-AT-AA-CAACAGA-A-TGTGAA-ACATATCTGTGAACAATTGTGATTCTCCAATTTGT-CT--------GAAATGT-------TTG-----C-TCTGGTACTC-TGAAACA-A-CGAATGTGT-A--AGATT--TCAGAATT--ACAAT-TCTAG----AAAAAAGCTG-AATAGA--TGG---A----TACACAA--GA----AGATT-GAA--GAG-AACA-TTGC-AACCATGTGATT-T-G-A-T-CAATTCACTCTGAAA-A--GTGAGAAATATTGTTTGTCAAAT-TTC------AAACCACTGG---AGAAAG-ACAACAA-CTATT-C---------------------TGAATTC---GGCAAAC-------GAATTG--T-ATGCAAGTGT-AGAA-G-TATGTCATC-A-------AC--AGA-T----ATC-TG-AGTG-AT-G-CAA--AGAAGAATGGAAAAACAAGAT-GGTGATTCAA-T--C-AAACCC-T--GAC-CT--CAGAAGTT--TGAT------AAT-TACA---T-ATC-A-TAC-------AT-----CT--AT--AT--GAA----AAT-C-ATTCTGA--TC-TTGCTT-CA-AC---------G---AT--T--TGGT----------------------A--AT-T--TAA-----CCTGTT-A-----TGC-CT---TCGAG-GCTATGCGG-ATTAAGAAAT---GTTC-----CTAG-AA-TTGAA---TTAAACTATCTTTCACTGGTCTGATTACTCCA-C--TTGA--CTCAGAGA-A-TAACAGATAC-AAGGCGTTGAAA---GA----ATTCATATGGAGTAATGTCTACATCCTAT---AA-----CCGAC--TT----C-----GGGC-AGTC--TGCAA--------AAT---ACT------C----TC-------------GTC-T--------CAG-TGT------CAAC-GA----AA--CAAATTA----AAAAA--ATAT-------AGG-AAG-------CTGAA--GTA--TT---A-G-CAGCT-TT-C-AAACCG--G---CTA---T-A--TA-A--A--C-ATTCAG------------A-G--TTAATGCTG--------T---------------ACACA--G--------A----TT--TA-TCT---A--CCA---TAAGGTGA---AAA-AGTATAA--TCAGACA-A--GTGAACACT
gi|5 : ttaagGATT--T-AGAAAT--ACAAT-TCTAG----AAAA--GCTG-A--AGATGAGG-CGAGTAGTACGAAA--GATGAAAC-T--GAATGAGG-CACA-TTGA-A-C--TGTG-TTAT-G-AAC-TAATTCTTCATGAAATATGG-AAGA--TGTTGT----CAAATGTTT----A-AAAACAT-GGGAAAGAGAG-ACAAGACAATATTATAAATGTCGGACGACGGATTCATGGATTC---GGAGAAAAGGAGAAGA--TGGGTCAT-CACGTGT-AG-C-AGT-TGT-ATC-GGTCGAGTAC--AGA-TTAATATT-TGGAGTGGAT-TGCAA--AGAAG-ATTGGAAAACAGAGTAGGTGATT----T--CAAA---C-T--GAAGAT--TAG--GTT--GGATGTTG-AAAT-TACAGAGT-ATCAAGTAC------A-TC-AA-CCTAATACATT-GAA----TAT-T-CCCCT-T--CC-TTGTT--CA-ACATGGCGAGGG---ATGAT--T-CTAAGGGAGGTAGGAGGAGCC--AA---T-T--T-A-----ACTGTT-A-----T---CT---TAGAG-GA-ATGCGGAGTTAAGAA-T---GTTAAC--TCTAGGAT-TTGAA---TTAA---------ACTT--TC------CACAA-T--TTG---CTCAGAGA-ACTAACAGA-A--AA-GCGT-GAAA---GA----ATTCATGTGGGATCATT----TCTCC-ATAAAG--------GACA-TT------CA--GGG-AAGTCT-TGCAA---------TC----TT------C-----C----------C-AGT-----------CAG-TGT--------AC-GA----A---CAAA-TA----AAAAA--ATAT-------AGG-AAAG---C--CTGAA--GTA--TT---A-G--AGAT-TT-CAAAACCG--G---CTA---T-AC-TA-A-CA-----TTCAG------------A-G--T--ATGC-G--------T---------------ACACA--G--------A--------AATT-T---ACATAAG-----GGTGA---CAtgaggg
gi|6 : gGGATCTCATGAAAAACA-TGA-TGTGTCAC-ATATT--TCAGAAATCCA--GT-TCTAG----AAAACAGCTG-A-TAGA--AAG-CGA----TAAAAAAAAGA----AA-TT-GAA--AGT-AACA-TTGC-A-CC-TGTG-TT-TTG-AATTCAATTCTCTCT-AAATA--G-AAGAAA-GTTGT----CTAATGTTG-TCCA-AAAACAT-GG---AGAAAG-ACAACAAACCATAAC---------------------TGAATTC---GGCAAAA-------GA--TG--TCATGCACGTGT-AGAC-A-T-TGTCATC-A-------AC--AGAAT----ATCGTG-AGT--AT-T-CAG--AGAAG-ATGGAAAAGCAAGAT-GGTGACTCAA-T--CAAAACCCCT--AAA-AT--CCG-AGTA--CGAT-----AAAT-TACA-ATC-ATCAA-TAC------AATC-AA-CT--ATAAAT--GAA----AAT-C-ATTCTAT--CC-TTGCTTCCA-AT---------G---AC--T--T-CT-----------------CC--AA--AT-T--T-A-----CCAGTT-A-----TG--CT---TCGAG-GA-ACGAGGAATTCCGAAAT---GTTCCC--TCTAA-AT-TTGAA---TTGA---------CAGT--TC------CACCA-T--TGGAC-CTCAGAGA-ACTAACAGA-AC-AA-GCATTGAAG---GA----ATTCATG-GGAGTCATTCCTACCTCC-ATAAAAA-----CCGACA-TT----C-CA--GGGCAAGTCT-TGCAA--------GTC---ACT------CA---CC----------C-AGTC-T-----C--CAG-TGT------CAAC-GA----CC--CAAA-TA----AACAA--TTAT------CAGG-AAAT---C--CTGAA--GTA--TTTAAA-A-CAGCT-CT--AAAAATG--G---CTA---T----------A--C-TAACAG------------A-G--T--ATGCTG--------TAT----T--CCT-A-ACACA--G--------A----TC--AATTCT---AGATCAG--T--GGTTT---CTATATCATCA--TCAAACG-T--ATGAGCACTtagttaaatagaaaatgaactgagcgggccactacctgggggagatc
gi|7 : GGATTGTGTAG-GACATCAC--ATGACAT-CAAATCCCACCAT--ACGTCAT-GATGTTG-TCACTT-TTCAATACAAAAAAC-TAGAAATCATTCCA-CCCCAATG--T-AAACTACAT-AAAAAACAGA-AATGTGAT-ACAT-TCTGTGAACAAT-GTGATTCTCCAATTTGT-CT--------GAAATGCC------TTG-----CCTCTGGATCTCATGAAAATCA-CGA-TATGTCGC-AGATT--TCAGAAATCCACAGC-TCTAG----AAAACTGTTG-A-TAGA--AAG-AGA----TACACAA--GA----AC-TT-GAA--AGA-AACA-TTGC-A-CC-TGCG-TT-T-G-AAT-CAATTCTCTCTGAGATA--G-AAGATATGTTGT----CAAATGTTC-TACA-GAAACAC-AG---AGAAAG-ACAACAAACCATTAC---------------------TGAATTC---GGCAAAA-------GA--TG--TCATACACTTGT-AGAC-A-T-TGTCATC-A-------AC--AGA-T----ATC-TG-AGTG-AT-T-CAA--AGAAG-ATGGAAAAACAAGAT-GGTGACTCAA-T--CAAAACCC-T--GAA-AT--CTG-AGTT--CGAT-----GAAT-TACA-ATC-ATCAT-TAC------GATC-AA-CT--ATAAAC--GAA----AAT-C-ATTCTAT--CC-TAGCTTCCA-AC---------G---AT--T--T-CT-----------------CC--AA--AT-T--T-A-----C
gi|8 : g-AC---------G---AC--TGTT-CT-----------------CCCGAACGATGT--T-A-----CCAGTTCAGCGTTTG--CT---TCGAG-GA-ATGAG-AATTTAGAAAT---ATTCCC--TCTAG-AT-TTGAA---TTAA---------CAGT----------CACCA-TGGTGGGC--TCAGAGACAATAACAGA-AC-AA-GCATTGAAG----A----ATTCATG-GGAGTCATTCCTACCTCC-ATAAAAC-----CGGACA-CT----C-CACAGGGCAAGCTT-TGCAA--------GTCC--ACTT-----CA---TC----------C-AGTC-T-----C--CAA-GGG------CAAC-GA----AC--CAAA-TA----AAAAA--TTAT------CA-G-AAAG---C--CTGAA--ATA--TT---ACG-CAGCT-CTCCAAAACTGTTG---ATA---T-A--CA-A-CA--C-ATCCAGTCCGGGTCGTACA-G--C--TTGGTA--------TGT----T--CCTGA-ACACATCG--------AGCATCC--ATTTCTATAATGTCAGTCT--GGTGA---C-ATAATATCATGTCAGACACC--ATGAACACT
gi|9 : TAT--CC-TTGCTTCCA-AC---------G---AT--T--T-CT-----------------CC--AA--AT-A--T-A-----CCAGTT-A-----TC--CT---TCCAG-GA-ATGAGGAATTAAGAAAT---GTTCCC--TCTAG-AT-TTGAA---TTAA---------CAGT--TC------CAACA-T--TGAAC-CTCAGAGA-ACTAACAGA-AC-AA-GCATTGAAG---GA----ATTCCTG-GGAGTCATTCCTAGCTCC-ATAAGAA-----CTGACA-TT----C-CA--GGGAAAGTaaggggc
gi|9 : AGAA-----CAAGCA-TT----G-AA--GG--AATTCC-TGGGA--------GTC---ATT------C-----C----------T-AG-C-T-----C--CA-----------TAA--GA----AC--TGAC-----------A--TT-C------CAGGGAAAG---TTGNTGAA--GTA--TT---A-G-CAGAT-CT-CAAAACTG--G---CTA---T-G--CC-ATCA--C-TTACAG------------A-G--T--ATGCTG--------TAT----T--CCC-A-ACACA--G--------A----TC--AGTTCT---ATATCAG--T--GGTAA---CAATAACATCA--TCAAACG-C--ATGAACACTtgntgaagtattagcagatctcaaaactggctatgccatcacttacagagtatgctgtattcccaacacagatcagttctatatcagtggtaacaataacatcatcaaacgcatgaacact
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|15 ): ATGGGGGGATACAACGTCAGGAATCTCCAGAGAGATTGACGGTGACAGGGAGGGAGATTGGTGTACTGATGGGATGATAGAGATATCAACAGACAAAAGAATAGA
Unaligned ( gi|17 ): ACCAAGTAGGAATCTCAGAAATTGACGGTGAAAGGGAGGAGAGATTTGGTGTACTGGACATGGAATGCAT
Alignments
lowQualScore : 1 222 1 2222 22222 1 1 1 1 11 1 222222222222 1 11 11 33333 1 11 11 11 11 2 1 1 1 1 11 11 111 11 1 1 1111 1 22222222 22222222222222 1111 1111 1111 1 1111 333333333333333333333 1111111 1111111 1111 111 1 2222222 1 111111 11 1111 111111111 222222222222222222222 11111 11111111111 111111111 111111 1 22222222 111 2222222222222222222222222 11111111 111111 111111 1111111 111111111111 11 111111111111111111 11111111
lowQualScore : 5 111 3 4444 44444 3 1 0 0 0 0 33 0 999999999999 1 3 0 11 22 2 00000 22 0 33 1 2 3 33 6 2 33 2 8 22 2 0 0 0 3 3 0 0 22 3 0 0 8 11 666 3 11 8 7777 8 0 3 8 8 9999 8 0 8 0 8 88 8 0 8 99999999 99999999999999 5 5 5 66 2 5 7777 2 5 5 66 99 5555 66 0000 5 5 66 5 5 5 5 5 0 5 5 5 5 66 4 9999 1111 4 4 777 4 777777777777777777777 777 6666666 66 66 5 5 5 5 5 5 6666666 66 5 0000 5 5 5 000 66 0 5 4 66 2 5 66 5 66 1 5 888 4444444 5 5 5 5 444444 5 5 66 0 11 0000 5 5 66 4 4 666666666 777 55 55 8 999999999999999999999 55 4 7777 11111 55555555555 888 5 555 888 66 4 4 777 777777777 1 66 222222 7777 55 4 1 4 4 4 0 777 9999 8 4 99999 3 888888 666 4 11111111 111 3333333333333333333333333 4 55555555 4 111111 4 8888 55 4 8888 55 111111 4 888888 55 55 666 7 3 3 3 2 55 666 666 6666666 3 44 44 2 777777777777 3 44 22 999999999999999999 3 3 44 22222222 77777777 777 88888 777 1 66 7777
lowQualScore : . ... . .... ..... . . . . . . .. . ............ . . . .. .. . ..... .. . .. . . . .. . . .. . . .. . . . . . . . . .. . . . . .. ... . .. . .... . . . . . .... . . . . . .. . . . ........ .............. . . . .. . . .... . . . .. .. .... .. .... . . .. . . . . . . . . . . .. . .... .... . . ... . ..................... ... ....... .. .. . . . . . . ....... .. . .... . . . ... .. . . . .. . . .. . .. . . ... ....... . . . . ...... . . .. . .. .... . . .. . . ......... ... .. .. . ..................... .. . .... ..... ........... ... . ... ... .. . . ... ......... . .. ...... .... .. . . . . . . ... .... . . ..... . ...... ... . ........ ... ......................... . ........ . ...... . .... .. . .... .. ...... . ...... .. .. ... . . . . . .. ... ... ....... . .. .. . ............ . .. .. .................. . . .. ........ ........ ... ..... ... . .. ....
lowQualScore : 0 000 3 8888 55555 2 2 0 0 0 0 88 0 222222222222 0 2 0 00 55 5 00000 88 0 88 0 5 2 88 5 5 22 5 8 55 5 0 0 0 2 2 0 0 55 2 8 8 0 00 888 2 00 0 4444 0 6 2 0 0 8888 0 8 0 6 0 88 0 8 0 00000000 88888888888888 0 0 0 11 9 0 5555 5 0 0 99 55 6666 99 6666 0 0 99 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11 4 4444 1111 4 4 888 4 888888888888888888888 888 2222222 99 99 4 0 0 0 0 0 2222222 99 0 6666 0 0 0 111 99 0 0 4 11 0 0 99 0 99 0 0 000 1111111 0 0 0 0 444444 0 0 99 1 99 6666 0 0 11 4 0 000000000 000 55 55 0 000000000000000000000 55 4 0000 11111 88888888888 888 0 222 888 11 4 4 888 888888888 0 11 888888 8888 66 4 1 4 4 4 7 888 4444 2 0 11111 6 222222 444 0 55555555 000 6666666666666666666666666 0 55555555 0 555555 0 5555 55 0 5555 55 555555 0 888888 00 00 444 3 6 6 6 5 00 444 444 7777777 3 66 88 2 111111111111 3 66 55 000000000000000000 3 3 66 11111111 88888888 000 44444 000 0 99 0000
consensus : NNNNNNNNCATAGTGTACTTACTAAGATTTT-AAATA--A-AAATCCA-A---AAGTAGTTAA-CC-ATT-GTA-ATTCTTTCAT--TG-CAGT-----ACAG---ANAAGTT-TGCN-ATGGC-AACATCAGATCC-C---TGGCCAGAGCA-CAA--ANCGTGAAAC--GCTGTCAGTTA-TGTCCCGGCAAA-CACAGAAA-TCTGCA-GCAGA-GACCGTGTGTAACACATGTCATG-TCAA-CCT-CTGTAAGGATTGTGTAG-GACATCAC--ATGACCT-CAAATCCCACCAT--ACGCCAT-GATGTTG-TCACTTATTCAATTCAAAAAAC-TAGAAATCGTTCCA-CCCCAGTG--T-AAACTACAT-AAACAACAGA-AATGTGAA-ACAT-TCTGTGAACAAT-GTGATTCTCCAATTTGT-CT--------GAAATGTC------TTG-----CCTCTGGATCTCATGAAAAACA-CGA-TGTGTCAC-AGATT--TCAGAAATCCACAGT-TCTAG----AAAACAGCTG-A-TAGA--AAG-CGA----TACACAA--GA----AC-TT-GAA--AGG-AACA-TTGC-A-CC-TGTG-TT-T-G-AAT-CAATTCTCTCTGAAATA--G-AAGAAATGTTGT----CAAATGTTC-TCCA-AAAACAC-GG---AGAAAG-ACAACAAACCATTAC---------------------TGAATTC---GGCAAAA-------GA--TG--TCATGCACGTGT-AGAC-A-T-TGTCATC-A-------AC--AGA-T----ATC-TG-AGTG-AT-T-CAA--AGAAG-ATGGAAAAACAAGAT-GGTGACTCAA-T--CAAAACCC-T--GAA-AT--CNG-AGTT--CGAT-----AAAT-TACA-ATC-ATCAA-TAC------AATC-AA-CT--ATAAAT--GAA----AAT-C-ATTCTAT--CC-TTGCTTCCA-AC---------G---AT--T--T-CT-----------------CC--AA--AT-T--T-A-----CCAGTT-A-----TG--CT---TCGAG-GA-ACGAGGAATTAAGAAAT---GTTCCC--TCTAG-AT-TTGAA---TTAA---------CANT--TC------CACCA-T--TGGAC-CTCAGAGA-ACTAACAGA-AC-AA-GCGTTGAAG---GA----ATTCATGTGGAGTCATTCCTACCTCC-ATAAAAA-----CCGACA-TT----C-CA--GGGCAAGTCT-TGCAA--------GTC---ACT------CA---TC----------C-AGTC-T-----C--CAG-TGT------CAAC-GA----AC--CAAA-TA----AAAAA--TTAT------CAGG-AAAG---C--CTGAA--GTA--TT---A-G-CAGCT-CT-CAAAACCG--G---CTA---T-A--TA-A-CA--C-TTNCAG------------A-G--T--ATGCTG--------TAT----T--CCT-A-ACACA--G--------A----TC--AATTCT---ATGTCAG--T--GGTGA---CAATAANATCA--TCAGACA-C--ATGAACACT
Reference ( family-3067 ) : NNNNNNNNCATAGTGTACTTACTAAGATTTT-AAATA--A-AAATCCA-A---AAGTAGTTAA-CC-ATT-GTA-ATTCTTTCAT--TG-CAGT-----ACAG---ANAAGTT-TGCN-ATGGC-AACATCAGATCC-C---TGGCCAGAGCA-CAA--ANCGTGAAAC--GCTGTCAGTTA-TGTCCCGGCAAA-CACAGAAA-TCTGCA-GCAGA-GACCGTGTGTAACACATGTCATG-TCAA-CCT-CTGTAAGGATTGTGTAG-GACATCAC--ATGACCT-CAAATCCCACCAT--ACGCCAT-GATGTTG-TCACTTATTCAATTCAAAAAAC-TAGAAATCGTTCCA-CCCCAGTG--T-AAACTACAT-AAACAACAGA-AATGTGAA-ACAT-TCTGTGAACAAT-GTGATTCTCCAATTTGT-CT--------GAAATGTC------TTG-----CCTCTGGATCTCATGAAAAACA-CGA-TGTGTCAC-AGATT--TCAGAAATCCACAGT-TCTAG----AAAACAGCTG-A-TAGA--AAG-CGA----TACACAA--GA----AC-TT-GAA--AGG-AACA-TTGC-A-CC-TGTG-TT-T-G-AAT-CAATTCTCTCTGAAATA--G-AAGAAATGTTGT----CAAATGTTC-TCCA-AAAACAC-GG---AGAAAG-ACAACAAACCATTAC---------------------TGAATTC---GGCAAAA-------GA--TG--TCATGCACGTGT-AGAC-A-T-TGTCATC-A-------AC--AGA-T----ATC-TG-AGTG-AT-T-CAA--AGAAG-ATGGAAAAACAAGAT-GGTGACTCAA-T--CAAAACCC-T--GAA-AT--CNG-AGTT--CGAT-----AAAT-TACA-ATC-ATCAA-TAC------AATC-AA-CT--ATAAAT--GAA----AAT-C-ATTCTAT--CC-TTGCTTCCA-AC---------G---AT--T--T-CT-----------------CC--AA--AT-T--T-A-----CCAGTT-A-----TG--CT---TCGAG-GA-ACGAGGAATTAAGAAAT---GTTCCC--TCTAG-AT-TTGAA---TTAA---------CANT--TC------CACCA-T--TGGAC-CTCAGAGA-ACTAACAGA-AC-AA-GCGTTGAAG---GA----ATTCATGTGGAGTCATTCCTACCTCC-ATAAAAA-----CCGACA-TT----C-CA--GGGCAAGTCT-TGCAA--------GTC---ACT------CA---TC----------C-AGTC-T-----C--CAG-TGT------CAAC-GA----AC--CAAA-TA----AAAAA--TTAT------CAGG-AAAG---C--CTGAA--GTA--TT---A-G-CAGCT-CT-CAAAACCG--G---CTA---T-A--TA-A-CA--C-TTNCAG------------A-G--T--ATGCTG--------TAT----T--CCT-A-ACACA--G--------A----TC--AATTCT---ATGTCAG--T--GGTGA---CAATAANATCA--TCAGACA-C--ATGAACACT
gi|1 : CATAGT-TACTTACTAAGATTTT-AAATA--ATAAATCCC-AGATAAGTGATTAAACC-ATG-GTA-ATTCTTTCAT--TG-CAGTTCGTCAC-G---ACAAGTT-TGCAGATGGCTAACATCAGATCC-C---TGGCCAGAGAG-CAACAAACGTGAAACCCGCTGTCAGTTAATGTCCCGGCAAAACACAGAAACTCTGCA-GCAGA-GACAGTGTGTAACACATGTCATG-TCAACCCT-CTGTAAGGATTGTGT-G-GACATCAC--ATGACCTGCAAAACCCACCATAGACGGCATGGATGTTGTTCACTTATTCAAATTAATAAATAGAGAAATCGTTCCACCCCCAGTG----AAACTACATGAAACAACAGAGAATGTGAAGACAT-TCTGTGAACAAT-GTGATTCTCCAATTTGTGCTTTGAAGAAAAAATGTCCCCTTTTTGCCTCCCCTCTGGATCTCATGAAAAACA-CAA-TGTGTCACAAGATT--TCAG-AATCCACAGTGTCTAGCTATAGAAAAGTTGAA-TAGA--AAG-CGAT---TACACAA--GA----AC-TT-GGA--AGG-AACAGTTGCAA-CC-TGTGATT-T-G-AAT-CAATTCCTTCTAAAATA--G-AGAAAATGTTGT----C-AATGTTTGTCCATTAAACAT-GG---AGAAAGAACAAC--ACCTACAC---------------------AGAATTTCGGGGCGAAA-------GA--TG--TCATGCACGTGTAAGACAA-T-TGTCATC-A-------ACCAGGA-T----ATC-TG-AGTG-ATAT-CAACCAGAAGCATGGAAAAACAAGAT-GGTGACTCAA-T--CAAAACCC-TAGAAA-AT--CAG-AATT--CGGGGAGGAAAATCTACACATCAATCAC-TACACCAGGAATCAAA-CT--ATCAATCAGAAGGACAAT-CAATTCTACTACCATTGCTTCCACAC---------GCTCAT--T--TACT-----------------GCGGAA--AT-TAGT-AGTGCTCGAATTGA-----TGACCT---TCGAG-AA---GACGAATTGCGACATGGGGTTCCTCATC----ATACTGAATAGTTAA---------CAGT--TC------CACCA-T--TGGACTCTCAGGAA-AACAAGAGA-ACAAA-GCATTGAAGATTGAGAGTACTCATGTGGAGTCATTCCTACCTCC-ATAAAAAACTTTTCGACA-TA----CACA---GGCAAATCT-TGCAATTTCCTGGATCTAAACT------CACAGTC----------C-CGTCAT-----G--CAGTTGT------C-AC-GAGAATAA--CAAA-TA----AAAAA--TTAT------CAGG-AAAA---G--CTGAA--ATA--TT---A-GCCAGATACT-CAAAGCTA--GACTTTA---T-ACTTA-A-CA--CGTTACAG------------A-G--TC-ATGCTG--------TACGGGGTGGCCT-ACATACA--G--------A----TCCAAATTCT---ATGTCA---C--AGTGA---TAAT
gi|10 : cattggtaacaatcgtcatatccttaccgggtatttacaatcaaatgaggaaaaatgatataactgttcatctgttagaaattgtatattacactgttgtttatatcctataaaatttgcacCTCTGGGTCTCATGAAAAACA-CAA-CGTGTCAC-AGATT--TCAGAAATCCACAGG-TCTAG----AAAACAGCTG-A-TAAA--AAG-CGA----TACACAA--GA----AC-TT-GAA--AGA-AACA-TTGC-A-CC-TGTG-TT-T-G-AAT-CAATTCTCTCTGAAATA--G-AAGAAATGTTGT----CAAATGTTT-TACA-AAAACAC-AG---AGAAAG-ACAACAAACCATAGC---------------------TGAATTC---GGCAAAA-------GA--TG--TCATTCACGTGT-AGAT-A-T-TGTCATC-A-------AC--AGA-T----ATA-TG-AGTG-AA-T-CAA--ACAAG-ATGGAAAAACAAGAT-GGTGACTCAA-T--Cgtaagagagaaacaaatatatacatcagatgagcaacgagggggctactacactgtagggagatcaccacaagtcaggatatactctcaacagaatgctgacaggtgcaccttagggcgaaggagagatatactggtgtatcaactagcacaatgggatgga
gi|11 : -ATACGAA-----CCGACAGCTGAGAC-CA--CGGCAAGTCTGTGCAATAA-----GTC---ACCTCACACCA---TCATTACCAAGGC-AGTC-TGCGCGCAACAA-TGTGGTATCCAACTGA----ACTCCAAA-CATAATAAAAA--TTATATATCACAAG-AAAGACAC--CTGAAAAGTAAATT---AAG-CAAGT-CT-CAAAACTG--G---TTAATCT-A--AA-A-CAAGC----CAT------------ATG--TAAACGCTGTTACCACTTGC----T--CCT-A-AC-CA--GTCTAGTACA----TA--ATTTCT---ATGTCAG--T--GGTGAACCCAATA
gi|12 : TCCC--TCTAG-AT-TTGAA---TTAA---------CACT--TC------CACCA-C--TTGAC-CTCAGAGA-ACTAACAGA-AC-AA-GCGTTGAAA---GA----ATTCAT-TGGAGTCATTCCTACCTCC-ATAAAAA-----CCGACA-TT----C-CA--GGGCAAGTCT-TGCAA--------ATC---ACT------CA---TC----------C-AGTC-T-----C--CAG-TGT------CAAC-GA----AC--CAAA-TA----AAAAA--ATAT------CAGG-AAAG---C--CTGAA--GTA--TT---A-G-CAGCT-TT-CAAAACCG--G---CTA---T-AC-TA-A-CA--C-TTTCAG------------A-G--T--ATGCTG--------------------T-A-ACACA--G--------A----TC--AAGTC
gi|13 : AAG---T--CTGAA--GTA--TT---A-G-CAGCC-CT-AAAAACAG--G---CTA---T-A--AAGA-GA--C-TTGCAG------------A-G--T--ATGCTG--------TAT----T--CCT-A-ACACA--G--------A----TC--AATTCT---ATGTCAG--T--GGTAA---CAATGAGATCA--TCAGACA-C--ATGAACACT
gi|14 : TGACTCAA-T--CCAAACCC-T--AAA-AT--CTG-AGTT--TGAT-----GAAT-TACA-ATC-ATCAA-TAA------AAAC-AA-CT--ATAAAT--GAA----AAT-C-ATTTTAT--CC-TTGCTTCCA-AT---------G---AT--T--T-CT-----------------CC--AA--Agaggggacactactgggggagatc
gi|16 : GAAATA--G-AAGAAATGTTGT----CAAATGTTC-TCAA-AAAACAT-GG---AGAAAG-ACAACAAACTATTAC---------------------TGAATTC---GGCAA
gi|18 : ATCA--TCAGACA-C--ATGGACACT
gi|19 : cCATGAAAAACA-CAA-TGTGTCAC-AGATT--TCAAAAATCCACgagggaacactactgggggagatcgc
gi|2 : TTT-ATATACCA-AAATTCA-C---A--TAGTTAA-CC-ACT-GTA-ATTCTTTCATATTATCAGT-----ACAGGCGAAAAGTTCTGTA-ATGGC-AACATCAGATCC-CCACTGGCTAGAGCA-CAG--ACC-TGAAAC--G-TGTCAGTTA-TGTCC--GCAAA--ACA-AAA-TCTGCA-GCAGAAGACCGTGTGTAACACATGCCATGATCAA-CCTACTGTAAGGATTGTGTAG--ACATCAC--ATGACCTTCAAATCCCATTAT--ACGCCAT-GAT--TG-TCACTTATTCAATT-AAAAAAC-TAGAAATTGTTCCA-CCCCAGTG--TCAAACTACAT-AAACAACAGA-A-TGTGAA-ACAT--CTGTGAACAAT-GTGATTCTCCA-TATGT--T--------GAAATGTC------T-------CCTCTGGATTTCATGAAAAGCAACAA-TGGCTCAC-AGATTCATCAGAAATCCACAGT-TCTAAGA--AAAACAGCTG-A-TAGA--AAGATGA----TACACAA--GA----AC-TTAGAA--AAGCGACA-TTGC-A-CC-TGTG-TT-T-GGAAT-CAATTCTCTC-GAAATA--G-AAGAAATGTTGC----AAAATGTTG-TCCA-AAA-CAT-GG---CGAA-G-ACAACAAACCATTAC---------------------TGAATC-----GCAAAA-------A----G--TCATACATGTG----AC-A-T-TGTCATCGA-------AC--AGA-T----ATC-TG-AGTG-AT---CAA--AGAAG-ATG-AAAAACAAGAT-GGTGACTCGAGTAGCGAGAGAA-T--GAA-ATATCTG-ACTTATTGA------AAAG-TGCATATC-ATCAA-TAC------AATC-AAACT--ATAAAT--GAA----AATTC-ATTCTAT--CC-TTGTATCCA-AC---------G---AT--T--T-CT-----------------CC--AA--AT-T----A-----CCAGTT-A-----TG--CTGCATCGTGAGA-ACGAGGAGTTACGAAAT---GTTCCC--TCTAG-AT-TTGAA---TTAA---------CACT--TC------CACCATT--TGGAC-C-CAGAGA-ACTAACAGA-AC-AA-GCATTGAAG---GA----ATGCATG-GGAGTCATTCCTACCTCC-ATAAAAA-----CCGACA-TT----C-CA---GGCAAGTCT-TGCCA--------GTC---ACT------CA---TC----------CAAGTC-T-----C--CAG-TGT------CAAC-GA----AC--CAAA-TA----AAAAAACTTAT------CAGG--AAG---C--CTGAA--GTA--TT---A-G-CAGCT-CT-CAAAACTG--G---TTA---A-C--TA-A-CA--C-TTA-AG------------A-GCTC--ATGCTG--------TAT----T--CCT-A-ACACA--G--------A----TC--AGTTCT---ATGTCAG--T--GGTAA---CAATAAGATCA--TCAGACA-CCTATGAACACT
gi|20 : catttgtactgtgcatacccccttaccgggttatttacaaatatcaaaataaatacagttgatttgtttactgtgtttcagccaaatgtagttaaactatgcatacacctg-CA--C-TTACAG------------A-G--T--ATGTTG--------TAT----T--CCT-A-ACACA--G--------gaggcggactactactggggag
gi|3 : CATAATGTATTTA---AGATTTTGAAATA--A-AAATCCAGA---AAGTTGTTAA-CC-ATT-GTACATTCTTTCAT--TG-CAGT-----ACAG---AGAAGCT-TGCT-ATGGC-AACATCAGATCCAC---TGGCCAGAGCA-CAA--GGCGTGAAAC--GTTGTCAGTTA-TGTCCCGGCAAA-CACAGAAAGTCTGTA-GCAGA-GACCGTGTGTAACACATGTCTTA-TCAA-CCT-CTGTAAGGATTGTGTAG-GACATCAC--ATGACCT-CAAATCCCACCAT--ACGCCAT-GATGTAG-TCACTT-TTCAATTCAAAAAAC-TAGAAATCATTCCA-CCCCAATG--T-ACAATACAT-GAACAACAGA-AATGTAAA-ACAT-TCTGTGAACAAT-GTGATTCTCCAATTTGT-CT--------GAAATGTC------TTG-----CCTCTGGATCTCATGAAAAACA-CAA-CATGTCAC-AGATT--TCAGAAATTCACAGC-TTTAG----AAAACAGTTG-A-TAGA--AAG-AGA----TACACAA--GA----AC-TT-GAA--AGG-AAAA-TTGC-A-CC-TATG-TT-T-G-AAT-CAATTCTCTCTGAAATA--G-AAAAAATGTTGT----CAAATGTTC-TACA-AAAACAC-GG---AGAAAG-ACAACAAACCATTAC---------------------TGATTTT---GGCAAAA-------GA--TG--TCATATACTTGT-AGAC-A-T-TATCATC-A-------AC--CGA-T----ATC-GG-AGTA-AT-T-CAA--AGAAG-ATGGAAAAACAAGAT-GGCGACTCTA-T--CAAAACCC-T--GAA-AT--CAG-AGTT--TGGT-----AAAT-TACA-ATC-ATCAA-TAC------AATC-AA-CT--ATAAAT--GAA----AAT-C-ATTCTAT--CC-TTGCTTCCA-AC---------G---AT--T--T-CT-----------------CC--AA--AT-T--T-A-----CCAGTT-A-----TG--CT---TCAAG-GA-ATGAAGAATTAAGAAAT---GTTCCC--TCTAG-AT-TTGAA---TTAA---------CCCT--TC------CACCA-A--TGGAA-CTCAAAGG-GCTAACAGA-AC-AA-GTATTGAAG---GA----ACTCCTG-GGAGTCATCCCTAGCTCA-ATAAGAA-----CTGACA-TT----C-CA--GGGCAAGTCT-TGCAA--------GTC---ACT------CA---TC----------C-AGTC-T-----C--CAG-TGT------CAAC-GA----AC--CAAA-TA----AAAAA--TTAT------CAGG-AAAG---C--CTGAA--GTA--TT---A-G-CAGCT-TT-CAGAACTA--G---TTA---TAA--TC-T-CA--C-TAGCAG------------A-G--T--CTGTTG--------TAT----T--CCT-A-ACACA--G--------A----TA--AATTCT---ATGTCAG--T--GGTGA---CAATGAGATCA--TCAGACA-C--ATAAACACT
gi|4 : aatattcaAATAG-A-AAATTCA-A---AAGTAATAAA-CTTATTAGTA-ATTATTTCTT--TA-CAGT-----A-AG---ACT-GTT-TGCC-ATGG--AA-ATCAGATCC-----TGG--AGAGCAACAA--ATTGTGAA-C--GCTGT-AGTTA--GT---GGCAAA-CACAGAAG-TCTGCAAGCAGA-G--CGTGTGTAACAC--GTCAAG-TCAA-CTT---G-AAGG-TTGTGTAGAGACATCACTGATGAC------ATCCCAT-------GCCAT-GA----G-T-A--TATTTCATT---AAAAT-TA-AAATCATTC-A-CCGCAGTGGGT-AAACTA-AT-AA-CAACAGA-A-TGTGAA-ACATATCTGTGAACAATTGTGATTCTCCAATTTGT-CT--------GAAATGT-------TTG-----C-TCTGGTACTC-TGAAACA-A-CGAATGTGT-A--AGATT--TCAGAATT--ACAAT-TCTAG----AAAAAAGCTG-AATAGA--TGG---A----TACACAA--GA----AGATT-GAA--GAG-AACA-TTGC-AACCATGTGATT-T-G-A-T-CAATTCACTCTGAAA-A--GTGAGAAATATTGTTTGTCAAAT-TTC------AAACCACTGG---AGAAAG-ACAACAA-CTATT-C---------------------TGAATTC---GGCAAAC-------GAATTG--T-ATGCAAGTGT-AGAA-G-TATGTCATC-A-------AC--AGA-T----ATC-TG-AGTG-AT-G-CAA--AGAAGAATGGAAAAACAAGAT-GGTGATTCAA-T--C-AAACCC-T--GAC-CT--CAGAAGTT--TGAT------AAT-TACA---T-ATC-A-TAC-------AT-----CT--AT--AT--GAA----AAT-C-ATTCTGA--TC-TTGCTT-CA-AC---------G---AT--T--TGGT----------------------A--AT-T--TAA-----CCTGTT-A-----TGC-CT---TCGAG-GCTATGCGG-ATTAAGAAAT---GTTC-----CTAG-AA-TTGAA---TTAAACTATCTTTCACTGGTCTGATTACTCCA-C--TTGA--CTCAGAGA-A-TAACAGATAC-AAGGCGTTGAAA---GA----ATTCATATGGAGTAATGTCTACATCCTAT---AA-----CCGAC--TT----C-----GGGC-AGTC--TGCAA--------AAT---ACT------C----TC-------------GTC-T--------CAG-TGT------CAAC-GA----AA--CAAATTA----AAAAA--ATAT-------AGG-AAG-------CTGAA--GTA--TT---A-G-CAGCT-TT-C-AAACCG--G---CTA---T-A--TA-A--A--C-ATTCAG------------A-G--TTAATGCTG--------T---------------ACACA--G--------A----TT--TA-TCT---A--CCA---TAAGGTGA---AAA-AGTATAA--TCAGACA-A--GTGAACACT
gi|5 : ttaagGATT--T-AGAAAT--ACAAT-TCTAG----AAAA--GCTG-A--AGATGAGG-CGAGTAGTACGAAA--GATGAAAC-T--GAATGAGG-CACA-TTGA-A-C--TGTG-TTAT-G-AAC-TAATTCTTCATGAAATATGG-AAGA--TGTTGT----CAAATGTTT----A-AAAACAT-GGGAAAGAGAG-ACAAGACAATATTATAAATGTCGGACGACGGATTCATGGATTC---GGAGAAAAGGAGAAGA--TGGGTCAT-CACGTGT-AG-C-AGT-TGT-ATC-GGTCGAGTAC--AGA-TTAATATT-TGGAGTGGAT-TGCAA--AGAAG-ATTGGAAAACAGAGTAGGTGATT----T--CAAA---C-T--GAAGAT--TAG--GTT--GGATGTTG-AAAT-TACAGAGT-ATCAAGTAC------A-TC-AA-CCTAATACATT-GAA----TAT-T-CCCCT-T--CC-TTGTT--CA-ACATGGCGAGGG---ATGAT--T-CTAAGGGAGGTAGGAGGAGCC--AA---T-T--T-A-----ACTGTT-A-----T---CT---TAGAG-GA-ATGCGGAGTTAAGAA-T---GTTAAC--TCTAGGAT-TTGAA---TTAA---------ACTT--TC------CACAA-T--TTG---CTCAGAGA-ACTAACAGA-A--AA-GCGT-GAAA---GA----ATTCATGTGGGATCATT----TCTCC-ATAAAG--------GACA-TT------CA--GGG-AAGTCT-TGCAA---------TC----TT------C-----C----------C-AGT-----------CAG-TGT--------AC-GA----A---CAAA-TA----AAAAA--ATAT-------AGG-AAAG---C--CTGAA--GTA--TT---A-G--AGAT-TT-CAAAACCG--G---CTA---T-AC-TA-A-CA-----TTCAG------------A-G--T--ATGC-G--------T---------------ACACA--G--------A--------AATT-T---ACATAAG-----GGTGA---CAtgaggg
gi|6 : gGGATCTCATGAAAAACA-TGA-TGTGTCAC-ATATT--TCAGAAATCCA--GT-TCTAG----AAAACAGCTG-A-TAGA--AAG-CGA----TAAAAAAAAGA----AA-TT-GAA--AGT-AACA-TTGC-A-CC-TGTG-TT-TTG-AATTCAATTCTCTCT-AAATA--G-AAGAAA-GTTGT----CTAATGTTG-TCCA-AAAACAT-GG---AGAAAG-ACAACAAACCATAAC---------------------TGAATTC---GGCAAAA-------GA--TG--TCATGCACGTGT-AGAC-A-T-TGTCATC-A-------AC--AGAAT----ATCGTG-AGT--AT-T-CAG--AGAAG-ATGGAAAAGCAAGAT-GGTGACTCAA-T--CAAAACCCCT--AAA-AT--CCG-AGTA--CGAT-----AAAT-TACA-ATC-ATCAA-TAC------AATC-AA-CT--ATAAAT--GAA----AAT-C-ATTCTAT--CC-TTGCTTCCA-AT---------G---AC--T--T-CT-----------------CC--AA--AT-T--T-A-----CCAGTT-A-----TG--CT---TCGAG-GA-ACGAGGAATTCCGAAAT---GTTCCC--TCTAA-AT-TTGAA---TTGA---------CAGT--TC------CACCA-T--TGGAC-CTCAGAGA-ACTAACAGA-AC-AA-GCATTGAAG---GA----ATTCATG-GGAGTCATTCCTACCTCC-ATAAAAA-----CCGACA-TT----C-CA--GGGCAAGTCT-TGCAA--------GTC---ACT------CA---CC----------C-AGTC-T-----C--CAG-TGT------CAAC-GA----CC--CAAA-TA----AACAA--TTAT------CAGG-AAAT---C--CTGAA--GTA--TTTAAA-A-CAGCT-CT--AAAAATG--G---CTA---T----------A--C-TAACAG------------A-G--T--ATGCTG--------TAT----T--CCT-A-ACACA--G--------A----TC--AATTCT---AGATCAG--T--GGTTT---CTATATCATCA--TCAAACG-T--ATGAGCACTtagttaaatagaaaatgaactgagcgggccactacctgggggagatc
gi|7 : GGATTGTGTAG-GACATCAC--ATGACAT-CAAATCCCACCAT--ACGTCAT-GATGTTG-TCACTT-TTCAATACAAAAAAC-TAGAAATCATTCCA-CCCCAATG--T-AAACTACAT-AAAAAACAGA-AATGTGAT-ACAT-TCTGTGAACAAT-GTGATTCTCCAATTTGT-CT--------GAAATGCC------TTG-----CCTCTGGATCTCATGAAAATCA-CGA-TATGTCGC-AGATT--TCAGAAATCCACAGC-TCTAG----AAAACTGTTG-A-TAGA--AAG-AGA----TACACAA--GA----AC-TT-GAA--AGA-AACA-TTGC-A-CC-TGCG-TT-T-G-AAT-CAATTCTCTCTGAGATA--G-AAGATATGTTGT----CAAATGTTC-TACA-GAAACAC-AG---AGAAAG-ACAACAAACCATTAC---------------------TGAATTC---GGCAAAA-------GA--TG--TCATACACTTGT-AGAC-A-T-TGTCATC-A-------AC--AGA-T----ATC-TG-AGTG-AT-T-CAA--AGAAG-ATGGAAAAACAAGAT-GGTGACTCAA-T--CAAAACCC-T--GAA-AT--CTG-AGTT--CGAT-----GAAT-TACA-ATC-ATCAT-TAC------GATC-AA-CT--ATAAAC--GAA----AAT-C-ATTCTAT--CC-TAGCTTCCA-AC---------G---AT--T--T-CT-----------------CC--AA--AT-T--T-A-----C
gi|8 : g-AC---------G---AC--TGTT-CT-----------------CCCGAACGATGT--T-A-----CCAGTTCAGCGTTTG--CT---TCGAG-GA-ATGAG-AATTTAGAAAT---ATTCCC--TCTAG-AT-TTGAA---TTAA---------CAGT----------CACCA-TGGTGGGC--TCAGAGACAATAACAGA-AC-AA-GCATTGAAG----A----ATTCATG-GGAGTCATTCCTACCTCC-ATAAAAC-----CGGACA-CT----C-CACAGGGCAAGCTT-TGCAA--------GTCC--ACTT-----CA---TC----------C-AGTC-T-----C--CAA-GGG------CAAC-GA----AC--CAAA-TA----AAAAA--TTAT------CA-G-AAAG---C--CTGAA--ATA--TT---ACG-CAGCT-CTCCAAAACTGTTG---ATA---T-A--CA-A-CA--C-ATCCAGTCCGGGTCGTACA-G--C--TTGGTA--------TGT----T--CCTGA-ACACATCG--------AGCATCC--ATTTCTATAATGTCAGTCT--GGTGA---C-ATAATATCATGTCAGACACC--ATGAACACT
gi|9 : TAT--CC-TTGCTTCCA-AC---------G---AT--T--T-CT-----------------CC--AA--AT-A--T-A-----CCAGTT-A-----TC--CT---TCCAG-GA-ATGAGGAATTAAGAAAT---GTTCCC--TCTAG-AT-TTGAA---TTAA---------CAGT--TC------CAACA-T--TGAAC-CTCAGAGA-ACTAACAGA-AC-AA-GCATTGAAG---GA----ATTCCTG-GGAGTCATTCCTAGCTCC-ATAAGAA-----CTGACA-TT----C-CA--GGGAAAGTaaggggc
gi|9 : AGAA-----CAAGCA-TT----G-AA--GG--AATTCC-TGGGA--------GTC---ATT------C-----C----------T-AG-C-T-----C--CA-----------TAA--GA----AC--TGAC-----------A--TT-C------CAGGGAAAG---TTGNTGAA--GTA--TT---A-G-CAGAT-CT-CAAAACTG--G---CTA---T-G--CC-ATCA--C-TTACAG------------A-G--T--ATGCTG--------TAT----T--CCC-A-ACACA--G--------A----TC--AGTTCT---ATATCAG--T--GGTAA---CAATAACATCA--TCAAACG-C--ATGAACACTtgntgaagtattagcagatctcaaaactggctatgccatcacttacagagtatgctgtattcccaacacagatcagttctatatcagtggtaacaataacatcatcaaacgcatgaacact
blockSeqs : G . G CCA GA A A . T A C AT T ACAGGCG A A C A C C CCAC CT A . C G A . T C T C C C G G A A A A A . AC T A TG CTT T . . TGTA . A C . . GGT . . A . AT T . . TTG A A . CA C . GA C . A TG AT GTAG AA TGAA A A TG C . . A A A A T G T TG T TTGT TTA . T GAA . AAATGTCGGACGACGGATTCA . AGGAGAA AT GG T . . G A G GTCGAGT . A TAAT G G G TG . A A G AG C C . G AT T A ATT TGTTGA . T . G . . A TA T . T . . . . ATGGCGAGG . GA GT G AAGGGAGGTAGGAGGAGCC CG G TA . CAGCGTTTG GCA A TAT . . G . . ACTATCTTT C GG TGATTA TGG C C C T . G . . T T . G GAGAC CAG G TAA C TCACACCATCATTACCAAGGC . GCGCGCAA . GGTATC T . TC T TAAT AC ATATCA G ACAC AA AA TAA A . . C T TT . ATC ACTA T AG T T TCCGGGTCGTAC T CT AA TTACCACTTGCT G . TC TCTAGTAC GCATCC ATA TAA ACC G TG CCT
blockSeqs : . GA C A T . . . . . . ACAG G A . T C C AC CC . . G G A . C C T C . C G . . . A A . . C T . . CT C . . TGTT . A C . . TC . . A . T . . . TTG . . . . C . . C . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CTC . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . T . . . . . G . . . . T . T TG . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . CCCG . . T . ATGC . . AC . . . . . . C . . TT C . C . . . . . T . . . C C . . . CATCCA . C . . . . . . . . . . TTG . . . C . . . C . . . AAAG . . T G . . . TA TATT . . . . TA . TCT . G . CC
blockSeqs : A A . A . . . . . . AAG C . . C . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT C . . TT . . . . . T . . . . T . . . TTG . . . . C . . C . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GTC . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . T . . . . . A . . . . A . T TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CC . . T . ATG . . AT . . . . . . C . . C A . C . . . . . T . . . C G . . . TCATCC . C . . . . . . . . . . C . . . . . . . A . . . AATC . . T A . . . . TATT . . . . TC . T . T . C
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . T . . . . T . . A . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CTA . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . G . . . . . A . . . . A . T TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CC . . T . ATG . . AT . . . . . . C . . A C . C . . . . . . . . . C G . . . CATCC . C . . . . . . . . . . T . . . . . . . T . . . ACTA . . T A . . . . TATT . . . . TC . T . C . C
blockSeqs : . . . . C . . C . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GTC . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . T . . . . . A . . . . A . G TG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CC . . T . ATG . . AC . . . . . . T . . C C . C . . . . . . . . . C G . . . CATCC . C . . . . . . . . . . C . . . . . . . T . . . AAA . . T G . . . . TATT . . . . TC . T . T . A
blockSeqs : . . . . C . . C . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CTA . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . T . . . . . A . . . . C . C A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CC . . T . ATC . . AT . . . . . . G . . T C . A . . . . . . . . . C G . . . CACCC . C . . . . . . . . . . C . . . . . . . C . . . CTA . . A T . . . . TATT . . . . TA . T . C . T
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . C T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CC . . T . AT . . AT . . . . . . G . . T . . C . . . . . . . . . C G . . . CTC . C . . . . . . . . . . C . . . . . . . C . . . ATA . . T T . . . . TGTT . . . . TT . T . . C
blockSeqs : . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . CC . . . . . . . . . G . . T . . . . . . . . . . . . C G . . . CCC . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . T . . . ACA . . A A . . . . TATT . . . . TC . T .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . G G . . . CCT . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . T . . . GCC . . T C . . . . T . . . . TC . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . A . . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons : T** ** T*** ******** TTG*********** **** **** CTN* *** ** T** ** ** TG***** ****** ** **** ** *** CC******************* T*** ***** ATG******** AT* *** ** *** C* *** **** ***** C***** G** ******** *** CATCC******************** **** *** ACTA*** T* ** TATT************** TC******
originalCons : NNNNNNNNCATAGTGTACTTACTAAGATTTT-AAATA--A-AAATCCA-A---AAGTAGTTAA-CC-ATT-GTA-ATTCTTTCAT--TG-CAGT-----ACAG---ANAAGTT-TGCN-ATGGC-AACATCAGATCC-C---TGGCCAGAGCA-CAA--ANCGTGAAAC--GCTGTCAGTTA-TGTCCCGGCAAA-CACAGAAA-TCTGCA-GCAGA-GACCGTGTGTAACACATGTCATG-TCAA-CCT-CTGTAAGGATTGTGTAG-GACATCAC--ATGACCT-CAAATCCCACCAT--ACGCCAT-GATGTTG-TCACTTATTCAATTCAAAAAAC-TAGAAATCGTTCCA-CCCCAGTG--T-AAACTACAT-AAACAACAGA-AATGTGAA-ACAT-TCTGTGAACAAT-GTGATTCTCCAATTTGT-CT--------GAAATGTC------TTG-----CCTCTGGATCTCATGAAAAACA-CGA-TGTGTCAC-AGATT--TCAGAAATCCACAGT-TCTAG----AAAACAGCTG-A-TAGA--AAG-CGA----TACACAA--GA----AC-TT-GAA--AGG-AACA-TTGC-A-CC-TGTG-TT-T-G-AAT-CAATTCTCTCTGAAATA--G-AAGAAATGTTGT----CAAATGTTC-TCCA-AAAACAC-GG---AGAAAG-ACAACAAACCATTAC---------------------TGAATTC---GGCAAAA-------GA--TG--TCATGCACGTGT-AGAC-A-T-TGTCATC-A-------AC--AGA-T----ATC-TG-AGTG-AT-T-CAA--AGAAG-ATGGAAAAACAAGAT-GGTGACTCAA-T--CAAAACCC-T--GAA-AT--CNG-AGTT--CGAT-----AAAT-TACA-ATC-ATCAA-TAC------AATC-AA-CT--ATAAAT--GAA----AAT-C-ATTCTAT--CC-TTGCTTCCA-AC---------G---AT--T--T-CT-----------------CC--AA--AT-T--T-A-----CCAGTT-A-----TG--CT---TCGAG-GA-ACGAGGAATTAAGAAAT---GTTCCC--TCTAG-AT-TTGAA---TTAA---------CANT--TC------CACCA-T--TGGAC-CTCAGAGA-ACTAACAGA-AC-AA-GCGTTGAAG---GA----ATTCATGTGGAGTCATTCCTACCTCC-ATAAAAA-----CCGACA-TT----C-CA--GGGCAAGTCT-TGCAA--------GTC---ACT------CA---TC----------C-AGTC-T-----C--CAG-TGT------CAAC-GA----AC--CAAA-TA----AAAAA--TTAT------CAGG-AAAG---C--CTGAA--GTA--TT---A-G-CAGCT-CT-CAAAACCG--G---CTA---T-A--TA-A-CA--C-TTNCAG------------A-G--T--ATGCTG--------TAT----T--CCT-A-ACACA--G--------A----TC--AATTCT---ATGTCAG--T--GGTGA---CAATAANATCA--TCAGACA-C--ATGAACACT
finalCons : NNNNNNNNCATAGTGTACTTACTAAGATTTT-AAATA--A-AAATCCA-A---AAGTAGTTAA-CC-ATT-GTA-ATTCTTTCAT--TG-CAGT-----ACAG---ANAAGTT-TGCN-ATGGC-AACATCAGATCC-C---TGGCCAGAGCA-CAA--ANCGTGAAAC--GCTGTCAGTTA-TGTCCCGGCAAA-CACAGAAA-TCTGCA-GCAGA-GACCGTGTGTAACACATGTCATG-TCAA-CCT-CTGTAAGGATTGTGTAG-GACATCAC--ATGACT--CAAATCCCACCAT--ACGCCAT-GATGTTG-TCACTTATTCAATTCAAAAAAC-TAGAAATCGTTCCA-CCCCAGTGT---AAACTACAT-AAACAACAGA-AATGTGAA-ACAT-TCTGTGAACAAT-GTGATTCTCCAATTTGT-CT--------GAAATGTCTTG-----------CCTCTGGATCTCATGAAAAACA-CGA-TGTGTCAC-AGATT--TCAGAAATCCACAGT-TCTAG----AAAACAGCTG-A-TAGA--AAG-CGA----TACACAA--GA----AC-TT-GAA--AGG-AACA-TTGC-A-CC-TGTG-TT-T-G-AAT-CAATTCTCTCTGAAATA--G-AAGAAATGTTGT----CAAATGTTCTN-CA-AAAACAC-GG---AGAAAG-ACAACAAACCATTAC---------------------TGAATTC---GGCAAAA-------GA--TG--TCATGCACGTGT-AGAC-A-T-TGTCATC-A-------AC--AGA-T----ATC-TG-AGTG-ATT--CAA--AGAAG-ATGGAAAAACAAGAT-GGTGACTCAA-T--CAAAACCC-T--GAA-AT--CNG-AGTT--CGATG-----AAT-TACA-ATC-ATCAA-TAC------AATC-AA-CT--ATAAAT--GAA----AAT-C-ATTCTAT--CC-TTGCTTCCA-AC---------G---AT--T--T-CTCC-------------------AA--AT-TT---A-----CCAGTTATG--------CT---TCGAG-GAAT-GAGGAATTAAGAAAT---GTTCCC--TCTAG-AT-TTGAA---TTAA---------CANT--TC------CACCA-T--TGGAC-CTCAGAGA-ACTAACAGA-AC-AA-GCGTTGAAG---GA----ATTCATGTGGAGTCATTCCTACCTCC-ATAAAAA-----CCGACA-TTC-----CAG--GGCAAGTCT-TGCAA--------GTC---ACTCATCC--------------------AGTC-T-----C--CAG-TGT------CAAC-GA----AC--CAAA-TA----AAAAA--TTAT------CAGG-AAAG---C--CTGAA--GTA--TT---A-G-CAGCT-CT-CAAAACCG--G---CTA---TACTA---A-CA--CT-TNCAG------------A-G--T--ATGCTGTATT--------------CCT-A-ACACA--G--------ATC------AATTCT---ATGTCAG--T--GGTGA---CAATAANATCA--TCAGACA-C--ATGAACACT
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|15 ): ATGGGGGGATACAACGTCAGGAATCTCCAGAGAGATTGACGGTGACAGGGAGGGAGATTGGTGTACTGATGGGATGATAGAGATATCAACAGACAAAAGAATAGA
Unaligned ( gi|17 ): ACCAAGTAGGAATCTCAGAAATTGACGGTGAAAGGGAGGAGAGATTTGGTGTACTGGACATGGAATGCAT
Alignments
lowQualScore : 1 222 1 2222 22222 1 1 1 1 11 1 222222222222 1 11 11 33333 1 11 11 11 11 2 1 1 1 1 11 11 33333 11 1 1 1111 1 22222222 22222222222222 1111 1111 1111 1 1111 333333333333333333333 1111111 1111111 1111 111 1 111111 111111 1 111111 11 1111 111111111 222222222222222222222 11111 11111111111 111111111 111111 1 22222222 111 2222222222222222222222222 11111111 111111 111111 111111111111 11 111111111111111111 11111111
lowQualScore : 5 111 3 4444 44444 3 1 0 0 0 0 33 0 999999999999 1 3 0 11 22 2 00000 22 0 33 1 2 3 33 6 2 33 2 8 22 2 0 0 0 3 3 0 0 22 3 0 0 8 11 8 33333 3 11 8 7777 8 0 3 8 8 9999 8 0 8 0 8 88 8 0 8 99999999 99999999999999 5 5 5 66 2 5 7777 2 5 5 66 99 5555 66 0000 5 5 66 5 5 5 5 5 0 5 5 5 5 66 4 9999 1111 4 4 777 4 777777777777777777777 777 6666666 66 66 5 5 5 5 5 5 6666666 66 5 0000 5 5 5 000 66 0 5 4 66 2 5 66 5 66 1 5 666666 333333 888 5 5 5 444444 5 5 66 0 11 0000 5 5 66 4 4 666666666 777 55 55 8 999999999999999999999 55 4 7777 11111 55555555555 888 5 5 888 66 4 4 777 777777777 1 66 222222 7777 55 4 1 4 4 4 0 777 9999 8 4 99999 3 7777 55 666 4 11111111 111 3333333333333333333333333 4 55555555 4 111111 4 8888 55 4 8888 55 111111 4 888888 55 55 666 7 3 3 3 2 55 666 55 888 2 777777777777 3 44 22 999999999999999999 3 3 44 22222222 77777777 777 88888 777 1 66 7777
lowQualScore : . ... . .... ..... . . . . . . .. . ............ . . . .. .. . ..... .. . .. . . . .. . . .. . . .. . . . . . . . . .. . . . . .. . ..... . .. . .... . . . . . .... . . . . . .. . . . ........ .............. . . . .. . . .... . . . .. .. .... .. .... . . .. . . . . . . . . . . .. . .... .... . . ... . ..................... ... ....... .. .. . . . . . . ....... .. . .... . . . ... .. . . . .. . . .. . .. . . ...... ...... ... . . . ...... . . .. . .. .... . . .. . . ......... ... .. .. . ..................... .. . .... ..... ........... ... . . ... .. . . ... ......... . .. ...... .... .. . . . . . . ... .... . . ..... . .... .. ... . ........ ... ......................... . ........ . ...... . .... .. . .... .. ...... . ...... .. .. ... . . . . . .. ... .. ... . ............ . .. .. .................. . . .. ........ ........ ... ..... ... . .. ....
lowQualScore : 0 000 3 8888 55555 2 2 0 0 0 0 88 0 222222222222 0 2 0 00 55 5 00000 88 0 88 0 5 2 88 5 5 22 5 8 55 5 0 0 0 2 2 0 0 55 2 8 8 0 00 0 88888 2 00 0 4444 0 6 2 0 0 8888 0 8 0 6 0 88 0 8 0 00000000 88888888888888 0 0 0 11 9 0 5555 5 0 0 99 55 6666 99 6666 0 0 99 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11 4 4444 3333 4 4 888 4 888888888888888888888 888 2222222 99 99 4 0 0 0 0 0 2222222 99 0 6666 0 0 0 111 99 0 0 4 11 0 0 99 0 99 0 0 888888 000000 888 0 0 0 444444 0 0 99 1 99 6666 0 0 11 4 0 000000000 000 55 55 0 000000000000000000000 55 4 0000 11111 88888888888 888 0 0 888 11 4 4 888 888888888 0 11 888888 8888 66 4 1 4 4 4 7 888 4444 2 0 11111 6 7777 00 444 0 55555555 000 6666666666666666666666666 0 55555555 0 555555 0 5555 55 0 5555 55 555555 0 888888 00 00 444 3 6 6 6 5 00 444 22 444 2 111111111111 3 66 55 000000000000000000 3 3 66 11111111 88888888 000 44444 000 0 99 0000
consensus : NNNNNNNNCATAGTGTACTTACTAAGATTTT-AAATA--A-AAATCCA-A---AAGTAGTTAA-CC-ATT-GTA-ATTCTTTCAT--TG-CAGT-----ACAG---ANAAGTT-TGCN-ATGGC-AACATCAGATCC-C---TGGCCAGAGCA-CAA--ANCGTGAAAC--GCTGTCAGTTA-TGTCCCGGCAAA-CACAGAAA-TCTGCA-GCAGA-GACCGTGTGTAACACATGTCATG-TCAA-CCT-CTGTAAGGATTGTGTAG-GACATCAC--ATGA-C--T--CAAATCCCACCAT--ACGCCAT-GATGTTG-TCACTTATTCAATTCAAAAAAC-TAGAAATCGTTCCA-CCCCAGTG--T-AAACTACAT-AAACAACAGA-AATGTGAA-ACAT-TCTGTGAACAAT-GTGATTCTCCAATTTGT-CT--------GAAATGTC------TTG-----CCTCTGGATCTCATGAAAAACA-CGA-TGTGTCAC-AGATT--TCAGAAATCCACAGT-TCTAG----AAAACAGCTG-A-TAGA--AAG-CGA----TACACAA--GA----AC-TT-GAA--AGG-AACA-TTGC-A-CC-TGTG-TT-T-G-AAT-CAATTCTCTCTGAAATA--G-AAGAAATGTTGT----CAAATGTTC-TCCA-AAAACAC-GG---AGAAAG-ACAACAAACCATTAC---------------------TGAATTC---GGCAAAA-------GA--TG--TCATGCACGTGT-AGAC-A-T-TGTCATC-A-------AC--AGA-T----ATC-TG-AGTG-AT-T-CAA--AGAAG-ATGGAAAAACAAGAT-GGTGACTCAA-T--CAAAACCC-T--GAA-AT--CNG-AGTT--C---GATG----AA---TTACA-ATC-ATCAA-TAC------AATC-AA-CT--ATAAAT--GAA----AAT-C-ATTCTAT--CC-TTGCTTCCA-AC---------G---AT--T--T-CT-----------------CC--AA--AT-T--T-A-----CCAGTT-A-----TG--CT---TCGAG-GA-ACGAGGAATTAAGAAAT---GTTCCC--TCTAG-AT-TTGAA---TTAA---------CANT--TC------CACCA-T--TGGAC-CTCAGAGA-ACTAACAGA-AC-AA-GCGTTGAAG---GA----ATTCATGTGGAGTCATTCCTACCTCC-ATAAAAA-----CCGACA-TT----C-CA--GGGCAAGTCT-TGCAA--------GTC---ACT------CA---TC----------C-AGTC-T-----C--CAG-TGT------CAAC-GA----AC--CAAA-TA----AAAAA--TTAT------CAGG-AAAG---C--CTGAA--GTA--TT---A-G-CAGCT-CT-CAAAACCG--G---CTATAC-TAACAC-TTNCAG------------A-G--T--ATGCTG--------TAT----T--CCT-A-ACACA--G--------A----TC--AATTCT---ATGTCAG--T--GGTGA---CAATAANATCA--TCAGACA-C--ATGAACACT
Reference ( family-3067 ) : NNNNNNNNCATAGTGTACTTACTAAGATTTT-AAATA--A-AAATCCA-A---AAGTAGTTAA-CC-ATT-GTA-ATTCTTTCAT--TG-CAGT-----ACAG---ANAAGTT-TGCN-ATGGC-AACATCAGATCC-C---TGGCCAGAGCA-CAA--ANCGTGAAAC--GCTGTCAGTTA-TGTCCCGGCAAA-CACAGAAA-TCTGCA-GCAGA-GACCGTGTGTAACACATGTCATG-TCAA-CCT-CTGTAAGGATTGTGTAG-GACATCAC--ATGA-C--T--CAAATCCCACCAT--ACGCCAT-GATGTTG-TCACTTATTCAATTCAAAAAAC-TAGAAATCGTTCCA-CCCCAGTG--T-AAACTACAT-AAACAACAGA-AATGTGAA-ACAT-TCTGTGAACAAT-GTGATTCTCCAATTTGT-CT--------GAAATGTC------TTG-----CCTCTGGATCTCATGAAAAACA-CGA-TGTGTCAC-AGATT--TCAGAAATCCACAGT-TCTAG----AAAACAGCTG-A-TAGA--AAG-CGA----TACACAA--GA----AC-TT-GAA--AGG-AACA-TTGC-A-CC-TGTG-TT-T-G-AAT-CAATTCTCTCTGAAATA--G-AAGAAATGTTGT----CAAATGTTC-TNCA-AAAACAC-GG---AGAAAG-ACAACAAACCATTAC---------------------TGAATTC---GGCAAAA-------GA--TG--TCATGCACGTGT-AGAC-A-T-TGTCATC-A-------AC--AGA-T----ATC-TG-AGTG-AT-T-CAA--AGAAG-ATGGAAAAACAAGAT-GGTGACTCAA-T--CAAAACCC-T--GAA-AT--CNG-AGTT--C---GATG----AA---TTACA-ATC-ATCAA-TAC------AATC-AA-CT--ATAAAT--GAA----AAT-C-ATTCTAT--CC-TTGCTTCCA-AC---------G---AT--T--T-CT-----------------CC--AA--AT-T--T-A-----CCAGTT-A-----TG--CT---TCGAG-GA-ATGAGGAATTAAGAAAT---GTTCCC--TCTAG-AT-TTGAA---TTAA---------CANT--TC------CACCA-T--TGGAC-CTCAGAGA-ACTAACAGA-AC-AA-GCGTTGAAG---GA----ATTCATGTGGAGTCATTCCTACCTCC-ATAAAAA-----CCGACA-TT----C-CA--GGGCAAGTCT-TGCAA--------GTC---ACT------CA---TC----------C-AGTC-T-----C--CAG-TGT------CAAC-GA----AC--CAAA-TA----AAAAA--TTAT------CAGG-AAAG---C--CTGAA--GTA--TT---A-G-CAGCT-CT-CAAAACCG--G---CTATAC-TAACAC-TTNCAG------------A-G--T--ATGCTG--------TAT----T--CCT-A-ACACA--G--------A----TC--AATTCT---ATGTCAG--T--GGTGA---CAATAANATCA--TCAGACA-C--ATGAACACT
gi|1 : CATAGT-TACTTACTAAGATTTT-AAATA--ATAAATCCC-AGATAAGTGATTAAACC-ATG-GTA-ATTCTTTCAT--TG-CAGTTCGTCAC-G---ACAAGTT-TGCAGATGGCTAACATCAGATCC-C---TGGCCAGAGAG-CAACAAACGTGAAACCCGCTGTCAGTTAATGTCCCGGCAAAACACAGAAACTCTGCA-GCAGA-GACAGTGTGTAACACATGTCATG-TCAACCCT-CTGTAAGGATTGTGT-G-GACATCAC--ATGA-C--CTGCAAAACCCACCATAGACGGCATGGATGTTGTTCACTTATTCAAATTAATAAATAGAGAAATCGTTCCACCCCCAGTG----AAACTACATGAAACAACAGAGAATGTGAAGACAT-TCTGTGAACAAT-GTGATTCTCCAATTTGTGCTTTGAAGAAAAAATGTCCCCTTTTTGCCTCCCCTCTGGATCTCATGAAAAACA-CAA-TGTGTCACAAGATT--TCAG-AATCCACAGTGTCTAGCTATAGAAAAGTTGAA-TAGA--AAG-CGAT---TACACAA--GA----AC-TT-GGA--AGG-AACAGTTGCAA-CC-TGTGATT-T-G-AAT-CAATTCCTTCTAAAATA--G-AGAAAATGTTGT----C-AATGTTTGTCCATTAAACAT-GG---AGAAAGAACAAC--ACCTACAC---------------------AGAATTTCGGGGCGAAA-------GA--TG--TCATGCACGTGTAAGACAA-T-TGTCATC-A-------ACCAGGA-T----ATC-TG-AGTG-ATAT-CAACCAGAAGCATGGAAAAACAAGAT-GGTGACTCAA-T--CAAAACCC-TAGAAA-AT--CAG-AATT--CGGGGAGG----AAAATCTACACATCAATCAC-TACACCAGGAATCAAA-CT--ATCAATCAGAAGGACAAT-CAATTCTACTACCATTGCTTCCACAC---------GCTCAT--T--TACT-----------------GCGGAA--AT-TAGT-AGTGCTCGAATTGA-----TGACCT---TCGAG-AA---GACGAATTGCGACATGGGGTTCCTCATC----ATACTGAATAGTTAA---------CAGT--TC------CACCA-T--TGGACTCTCAGGAA-AACAAGAGA-ACAAA-GCATTGAAGATTGAGAGTACTCATGTGGAGTCATTCCTACCTCC-ATAAAAAACTTTTCGACA-TA----CACA---GGCAAATCT-TGCAATTTCCTGGATCTAAACT------CACAGTC----------C-CGTCAT-----G--CAGTTGT------C-AC-GAGAATAA--CAAA-TA----AAAAA--TTAT------CAGG-AAAA---G--CTGAA--ATA--TT---A-GCCAGATACT-CAAAGCTA--GACTTTATACTTAACACGTTACAG------------A-G--TC-ATGCTG--------TACGGGGTGGCCT-ACATACA--G--------A----TCCAAATTCT---ATGTCA---C--AGTGA---TAAT
gi|10 : cattggtaacaatcgtcatatccttaccgggtatttacaatcaaatgaggaaaaatgatataactgttcatctgttagaaattgtatattacactgttgtttatatcctataaaatttgcacCTCTGGGTCTCATGAAAAACA-CAA-CGTGTCAC-AGATT--TCAGAAATCCACAGG-TCTAG----AAAACAGCTG-A-TAAA--AAG-CGA----TACACAA--GA----AC-TT-GAA--AGA-AACA-TTGC-A-CC-TGTG-TT-T-G-AAT-CAATTCTCTCTGAAATA--G-AAGAAATGTTGT----CAAATGTTT-TACA-AAAACAC-AG---AGAAAG-ACAACAAACCATAGC---------------------TGAATTC---GGCAAAA-------GA--TG--TCATTCACGTGT-AGAT-A-T-TGTCATC-A-------AC--AGA-T----ATA-TG-AGTG-AA-T-CAA--ACAAG-ATGGAAAAACAAGAT-GGTGACTCAA-T--Cgtaagagagaaacaaatatatacatcagatgagcaacgagggggctactacactgtagggagatcaccacaagtcaggatatactctcaacagaatgctgacaggtgcaccttagggcgaaggagagatatactggtgtatcaactagcacaatgggatgga
gi|11 : -ATACGAA-----CCGACAGCTGAGAC-CA--CGGCAAGTCTGTGCAATAA-----GTC---ACCTCACACCA---TCATTACCAAGGC-AGTC-TGCGCGCAACAA-TGTGGTATCCAACTGA----ACTCCAAA-CATAATAAAAA--TTATATATCACAAG-AAAGACAC--CTGAAAAGTAAATT---AAG-CAAGT-CT-CAAAACTG--G---TTAATC-TAAAACAAGCCAT------------ATG--TAAACGCTGTTACCACTTGC----T--CCT-A-AC-CA--GTCTAGTACA----TA--ATTTCT---ATGTCAG--T--GGTGAACCCAATA
gi|12 : TCCC--TCTAG-AT-TTGAA---TTAA---------CACT--TC------CACCA-C--TTGAC-CTCAGAGA-ACTAACAGA-AC-AA-GCGTTGAAA---GA----ATTCAT-TGGAGTCATTCCTACCTCC-ATAAAAA-----CCGACA-TT----C-CA--GGGCAAGTCT-TGCAA--------ATC---ACT------CA---TC----------C-AGTC-T-----C--CAG-TGT------CAAC-GA----AC--CAAA-TA----AAAAA--ATAT------CAGG-AAAG---C--CTGAA--GTA--TT---A-G-CAGCT-TT-CAAAACCG--G---CTATAC-TAACAC-TTTCAG------------A-G--T--ATGCTG--------------------T-A-ACACA--G--------A----TC--AAGTC
gi|13 : AAG---T--CTGAA--GTA--TT---A-G-CAGCC-CT-AAAAACAG--G---CTATAA-AGAGAC-TTGCAG------------A-G--T--ATGCTG--------TAT----T--CCT-A-ACACA--G--------A----TC--AATTCT---ATGTCAG--T--GGTAA---CAATGAGATCA--TCAGACA-C--ATGAACACT
gi|14 : TGACTCAA-T--CCAAACCC-T--AAA-AT--CTG-AGTT--T---GATG----AA---TTACA-ATC-ATCAA-TAA------AAAC-AA-CT--ATAAAT--GAA----AAT-C-ATTTTAT--CC-TTGCTTCCA-AT---------G---AT--T--T-CT-----------------CC--AA--Agaggggacactactgggggagatc
gi|16 : GAAATA--G-AAGAAATGTTGT----CAAATGTTC-TCAA-AAAACAT-GG---AGAAAG-ACAACAAACTATTAC---------------------TGAATTC---GGCAA
gi|18 : ATCA--TCAGACA-C--ATGGACACT
gi|19 : cCATGAAAAACA-CAA-TGTGTCAC-AGATT--TCAAAAATCCACgagggaacactactgggggagatcgc
gi|2 : TTT-ATATACCA-AAATTCA-C---A--TAGTTAA-CC-ACT-GTA-ATTCTTTCATATTATCAGT-----ACAGGCGAAAAGTTCTGTA-ATGGC-AACATCAGATCC-CCACTGGCTAGAGCA-CAG--ACC-TGAAAC--G-TGTCAGTTA-TGTCC--GCAAA--ACA-AAA-TCTGCA-GCAGAAGACCGTGTGTAACACATGCCATGATCAA-CCTACTGTAAGGATTGTGTAG--ACATCAC--ATGA-CCTT--CAAATCCCATTAT--ACGCCAT-GAT--TG-TCACTTATTCAATT-AAAAAAC-TAGAAATTGTTCCA-CCCCAGTG--TCAAACTACAT-AAACAACAGA-A-TGTGAA-ACAT--CTGTGAACAAT-GTGATTCTCCA-TATGT--T--------GAAATGTC------T-------CCTCTGGATTTCATGAAAAGCAACAA-TGGCTCAC-AGATTCATCAGAAATCCACAGT-TCTAAGA--AAAACAGCTG-A-TAGA--AAGATGA----TACACAA--GA----AC-TTAGAA--AAGCGACA-TTGC-A-CC-TGTG-TT-T-GGAAT-CAATTCTCTC-GAAATA--G-AAGAAATGTTGC----AAAATGTTG-TCCA-AAA-CAT-GG---CGAA-G-ACAACAAACCATTAC---------------------TGAATC-----GCAAAA-------A----G--TCATACATGTG----AC-A-T-TGTCATCGA-------AC--AGA-T----ATC-TG-AGTG-AT---CAA--AGAAG-ATG-AAAAACAAGAT-GGTGACTCGAGTAGCGAGAGAA-T--GAA-ATATCTG-ACTTATT---GA-A----AA---GTGCATATC-ATCAA-TAC------AATC-AAACT--ATAAAT--GAA----AATTC-ATTCTAT--CC-TTGTATCCA-AC---------G---AT--T--T-CT-----------------CC--AA--AT-T----A-----CCAGTT-A-----TG--CTGCATCGTGAGA-ACGAGGAGTTACGAAAT---GTTCCC--TCTAG-AT-TTGAA---TTAA---------CACT--TC------CACCATT--TGGAC-C-CAGAGA-ACTAACAGA-AC-AA-GCATTGAAG---GA----ATGCATG-GGAGTCATTCCTACCTCC-ATAAAAA-----CCGACA-TT----C-CA---GGCAAGTCT-TGCCA--------GTC---ACT------CA---TC----------CAAGTC-T-----C--CAG-TGT------CAAC-GA----AC--CAAA-TA----AAAAAACTTAT------CAGG--AAG---C--CTGAA--GTA--TT---A-G-CAGCT-CT-CAAAACTG--G---TTA-AC-TAACAC-TTA-AG------------A-GCTC--ATGCTG--------TAT----T--CCT-A-ACACA--G--------A----TC--AGTTCT---ATGTCAG--T--GGTAA---CAATAAGATCA--TCAGACA-CCTATGAACACT
gi|20 : catttgtactgtgcatacccccttaccgggttatttacaaatatcaaaataaatacagttgatttgtttactgtgtttcagccaaatgtagttaaactatgcatacacctgCAC-TTACAG------------A-G--T--ATGTTG--------TAT----T--CCT-A-ACACA--G--------gaggcggactactactggggag
gi|3 : CATAATGTATTTA---AGATTTTGAAATA--A-AAATCCAGA---AAGTTGTTAA-CC-ATT-GTACATTCTTTCAT--TG-CAGT-----ACAG---AGAAGCT-TGCT-ATGGC-AACATCAGATCCAC---TGGCCAGAGCA-CAA--GGCGTGAAAC--GTTGTCAGTTA-TGTCCCGGCAAA-CACAGAAAGTCTGTA-GCAGA-GACCGTGTGTAACACATGTCTTA-TCAA-CCT-CTGTAAGGATTGTGTAG-GACATCAC--ATGACC--T--CAAATCCCACCAT--ACGCCAT-GATGTAG-TCACTT-TTCAATTCAAAAAAC-TAGAAATCATTCCA-CCCCAATG--T-ACAATACAT-GAACAACAGA-AATGTAAA-ACAT-TCTGTGAACAAT-GTGATTCTCCAATTTGT-CT--------GAAATGTC------TTG-----CCTCTGGATCTCATGAAAAACA-CAA-CATGTCAC-AGATT--TCAGAAATTCACAGC-TTTAG----AAAACAGTTG-A-TAGA--AAG-AGA----TACACAA--GA----AC-TT-GAA--AGG-AAAA-TTGC-A-CC-TATG-TT-T-G-AAT-CAATTCTCTCTGAAATA--G-AAAAAATGTTGT----CAAATGTTC-TACA-AAAACAC-GG---AGAAAG-ACAACAAACCATTAC---------------------TGATTTT---GGCAAAA-------GA--TG--TCATATACTTGT-AGAC-A-T-TATCATC-A-------AC--CGA-T----ATC-GG-AGTA-AT-T-CAA--AGAAG-ATGGAAAAACAAGAT-GGCGACTCTA-T--CAAAACCC-T--GAA-AT--CAG-AGTT--T---GGTA----AA---TTACA-ATC-ATCAA-TAC------AATC-AA-CT--ATAAAT--GAA----AAT-C-ATTCTAT--CC-TTGCTTCCA-AC---------G---AT--T--T-CT-----------------CC--AA--AT-T--T-A-----CCAGTT-A-----TG--CT---TCAAG-GA-ATGAAGAATTAAGAAAT---GTTCCC--TCTAG-AT-TTGAA---TTAA---------CCCT--TC------CACCA-A--TGGAA-CTCAAAGG-GCTAACAGA-AC-AA-GTATTGAAG---GA----ACTCCTG-GGAGTCATCCCTAGCTCA-ATAAGAA-----CTGACA-TT----C-CA--GGGCAAGTCT-TGCAA--------GTC---ACT------CA---TC----------C-AGTC-T-----C--CAG-TGT------CAAC-GA----AC--CAAA-TA----AAAAA--TTAT------CAGG-AAAG---C--CTGAA--GTA--TT---A-G-CAGCT-TT-CAGAACTA--G---TTATAA-TCTCAC-TAGCAG------------A-G--T--CTGTTG--------TAT----T--CCT-A-ACACA--G--------A----TA--AATTCT---ATGTCAG--T--GGTGA---CAATGAGATCA--TCAGACA-C--ATAAACACT
gi|4 : aatattcaAATAG-A-AAATTCA-A---AAGTAATAAA-CTTATTAGTA-ATTATTTCTT--TA-CAGT-----A-AG---ACT-GTT-TGCC-ATGG--AA-ATCAGATCC-----TGG--AGAGCAACAA--ATTGTGAA-C--GCTGT-AGTTA--GT---GGCAAA-CACAGAAG-TCTGCAAGCAGA-G--CGTGTGTAACAC--GTCAAG-TCAA-CTT---G-AAGG-TTGTGTAGAGACATCACTGATGA-C--------ATCCCAT-------GCCAT-GA----G-T-A--TATTTCATT---AAAAT-TA-AAATCATTC-A-CCGCAGTGGGT-AAACTA-AT-AA-CAACAGA-A-TGTGAA-ACATATCTGTGAACAATTGTGATTCTCCAATTTGT-CT--------GAAATGT-------TTG-----C-TCTGGTACTC-TGAAACA-A-CGAATGTGT-A--AGATT--TCAGAATT--ACAAT-TCTAG----AAAAAAGCTG-AATAGA--TGG---A----TACACAA--GA----AGATT-GAA--GAG-AACA-TTGC-AACCATGTGATT-T-G-A-T-CAATTCACTCTGAAA-A--GTGAGAAATATTGTTTGTCAAAT-TTC------AAACCACTGG---AGAAAG-ACAACAA-CTATT-C---------------------TGAATTC---GGCAAAC-------GAATTG--T-ATGCAAGTGT-AGAA-G-TATGTCATC-A-------AC--AGA-T----ATC-TG-AGTG-AT-G-CAA--AGAAGAATGGAAAAACAAGAT-GGTGATTCAA-T--C-AAACCC-T--GAC-CT--CAGAAGTT--T---GAT-----AA---TTACA---T-ATC-A-TAC-------AT-----CT--AT--AT--GAA----AAT-C-ATTCTGA--TC-TTGCTT-CA-AC---------G---AT--T--TGGT----------------------A--AT-T--TAA-----CCTGTT-A-----TGC-CT---TCGAG-GCTATGCGG-ATTAAGAAAT---GTTC-----CTAG-AA-TTGAA---TTAAACTATCTTTCACTGGTCTGATTACTCCA-C--TTGA--CTCAGAGA-A-TAACAGATAC-AAGGCGTTGAAA---GA----ATTCATATGGAGTAATGTCTACATCCTAT---AA-----CCGAC--TT----C-----GGGC-AGTC--TGCAA--------AAT---ACT------C----TC-------------GTC-T--------CAG-TGT------CAAC-GA----AA--CAAATTA----AAAAA--ATAT-------AGG-AAG-------CTGAA--GTA--TT---A-G-CAGCT-TT-C-AAACCG--G---CTATAT-AAACA---TTCAG------------A-G--TTAATGCTG--------T---------------ACACA--G--------A----TT--TA-TCT---A--CCA---TAAGGTGA---AAA-AGTATAA--TCAGACA-A--GTGAACACT
gi|5 : ttaagGATT--T-AGAAAT--ACAAT-TCTAG----AAAA--GCTG-A--AGATGAGG-CGAGTAGTACGAAA--GATGAAAC-T--GAATGAGG-CACA-TTGA-A-C--TGTG-TTAT-G-AAC-TAATTCTTCATGAAATATGG-AAGA--TGTTGT----CAAATGTTT----A-AAAACAT-GGGAAAGAGAG-ACAAGACAATATTATAAATGTCGGACGACGGATTCATGGATTC---GGAGAAAAGGAGAAGA--TGGGTCAT-CACGTGT-AG-C-AGT-TGT-ATC-GGTCGAGTAC--AGA-TTAATATT-TGGAGTGGAT-TGCAA--AGAAG-ATTGGAAAACAGAGTAGGTGATT----T--CAAA---C-T--GAAGAT--TAG--GTT--G---GATGTTGAAA---TTACAGAGT-ATCAAGTAC------A-TC-AA-CCTAATACATT-GAA----TAT-T-CCCCT-T--CC-TTGTT--CA-ACATGGCGAGGG---ATGAT--T-CTAAGGGAGGTAGGAGGAGCC--AA---T-T--T-A-----ACTGTT-A-----T---CT---TAGAG-GA-ATGCGGAGTTAAGAA-T---GTTAAC--TCTAGGAT-TTGAA---TTAA---------ACTT--TC------CACAA-T--TTG---CTCAGAGA-ACTAACAGA-A--AA-GCGT-GAAA---GA----ATTCATGTGGGATCATTTCT----CC-ATAAAG--------GACA-TT----C--A--GGG-AAGTCT-TGCAA---------TC----TT------C-----C----------C-AGTC-----------AG-TGT--------AC-GA----AC---AAA-TA----AAAAA--ATAT-------AGG-AAAG---C--CTGAA--GTA--TT---A-G--AGAT-TT-CAAAACCG--G---CTATAC-TAACA---TTCAG------------A-G--T--ATGC-G--------T---------------ACACA--G--------A--------AATT-T---ACATAAG-----GGTGA---CAtgaggg
gi|6 : gGGATCTCATGAAAAACA-TGA-TGTGTCAC-ATATT--TCAGAAATCCA--GT-TCTAG----AAAACAGCTG-A-TAGA--AAG-CGA----TAAAAAAAAGA----AA-TT-GAA--AGT-AACA-TTGC-A-CC-TGTG-TT-TTG-AATTCAATTCTCTCT-AAATA--G-AAGAAA-GTTGT----CTAATGTTG-TCCA-AAAACAT-GG---AGAAAG-ACAACAAACCATAAC---------------------TGAATTC---GGCAAAA-------GA--TG--TCATGCACGTGT-AGAC-A-T-TGTCATC-A-------AC--AGAAT----ATCGTG-AGT--AT-T-CAG--AGAAG-ATGGAAAAGCAAGAT-GGTGACTCAA-T--CAAAACCCCT--AAA-AT--CCG-AGTA--C---GATA----AA---TTACA-ATC-ATCAA-TAC------AATC-AA-CT--ATAAAT--GAA----AAT-C-ATTCTAT--CC-TTGCTTCCA-AT---------G---AC--T--T-CT-----------------CC--AA--AT-T--T-A-----CCAGTT-A-----TG--CT---TCGAG-GA-ACGAGGAATTCCGAAAT---GTTCCC--TCTAA-AT-TTGAA---TTGA---------CAGT--TC------CACCA-T--TGGAC-CTCAGAGA-ACTAACAGA-AC-AA-GCATTGAAG---GA----ATTCATG-GGAGTCATTCCTACCTCC-ATAAAAA-----CCGACA-TT----C-CA--GGGCAAGTCT-TGCAA--------GTC---ACT------CA---CC----------C-AGTC-T-----C--CAG-TGT------CAAC-GA----CC--CAAA-TA----AACAA--TTAT------CAGG-AAAT---C--CTGAA--GTA--TTTAAA-A-CAGCT-CT--AAAAATG--G---CTATAC-TAA-------CAG------------A-G--T--ATGCTG--------TAT----T--CCT-A-ACACA--G--------A----TC--AATTCT---AGATCAG--T--GGTTT---CTATATCATCA--TCAAACG-T--ATGAGCACTtagttaaatagaaaatgaactgagcgggccactacctgggggagatc
gi|7 : GGATTGTGTAG-GACATCAC--ATGA-CA-T--CAAATCCCACCAT--ACGTCAT-GATGTTG-TCACTT-TTCAATACAAAAAAC-TAGAAATCATTCCA-CCCCAATG--T-AAACTACAT-AAAAAACAGA-AATGTGAT-ACAT-TCTGTGAACAAT-GTGATTCTCCAATTTGT-CT--------GAAATGCC------TTG-----CCTCTGGATCTCATGAAAATCA-CGA-TATGTCGC-AGATT--TCAGAAATCCACAGC-TCTAG----AAAACTGTTG-A-TAGA--AAG-AGA----TACACAA--GA----AC-TT-GAA--AGA-AACA-TTGC-A-CC-TGCG-TT-T-G-AAT-CAATTCTCTCTGAGATA--G-AAGATATGTTGT----CAAATGTTC-TACA-GAAACAC-AG---AGAAAG-ACAACAAACCATTAC---------------------TGAATTC---GGCAAAA-------GA--TG--TCATACACTTGT-AGAC-A-T-TGTCATC-A-------AC--AGA-T----ATC-TG-AGTG-AT-T-CAA--AGAAG-ATGGAAAAACAAGAT-GGTGACTCAA-T--CAAAACCC-T--GAA-AT--CTG-AGTT--C---GATG----AA---TTACA-ATC-ATCAT-TAC------GATC-AA-CT--ATAAAC--GAA----AAT-C-ATTCTAT--CC-TAGCTTCCA-AC---------G---AT--T--T-CT-----------------CC--AA--AT-T--T-A-----C
gi|8 : g-AC---------G---AC--TGTT-CT-----------------CCCGAACGATGT--T-A-----CCAGTTCAGCGTTTG--CT---TCGAG-GA-ATGAG-AATTTAGAAAT---ATTCCC--TCTAG-AT-TTGAA---TTAA---------CAGT----------CACCA-TGGTGGGC--TCAGAGACAATAACAGA-AC-AA-GCATTGAAG----A----ATTCATG-GGAGTCATTCCTACCTCC-ATAAAAC-----CGGACA-CT----C-CACAGGGCAAGCTT-TGCAA--------GTCC--ACTT-----CA---TC----------C-AGTC-T-----C--CAA-GGG------CAAC-GA----AC--CAAA-TA----AAAAA--TTAT------CA-G-AAAG---C--CTGAA--ATA--TT---ACG-CAGCT-CTCCAAAACTGTTG---ATATAC--AACAC-ATCCAGTCCGGGTCGTACA-G--C--TTGGTA--------TGT----T--CCTGA-ACACATCG--------AGCATCC--ATTTCTATAATGTCAGTCT--GGTGA---C-ATAATATCATGTCAGACACC--ATGAACACT
gi|9 : TAT--CC-TTGCTTCCA-AC---------G---AT--T--T-CT-----------------CC--AA--AT-A--T-A-----CCAGTT-A-----TC--CT---TCCAG-GA-ATGAGGAATTAAGAAAT---GTTCCC--TCTAG-AT-TTGAA---TTAA---------CAGT--TC------CAACA-T--TGAAC-CTCAGAGA-ACTAACAGA-AC-AA-GCATTGAAG---GA----ATTCCTG-GGAGTCATTCCTAGCTCC-ATAAGAA-----CTGACA-TT----C-CA--GGGAAAGTaaggggc
gi|9 : AGAA-----CAAGCA-TT----G-AA--GG--AATTCC-TGGGA--------GTC---ATT------C-----C----------T-AG-C-T-----C--CA-----------TAA--GA----AC--TGAC-----------A--TT-C------CAGGGAAAG---TTGNTGAA--GTA--TT---A-G-CAGAT-CT-CAAAACTG--G---CTATGC-CATCAC-TTACAG------------A-G--T--ATGCTG--------TAT----T--CCC-A-ACACA--G--------A----TC--AGTTCT---ATATCAG--T--GGTAA---CAATAACATCA--TCAAACG-C--ATGAACACTtgntgaagtattagcagatctcaaaactggctatgccatcacttacagagtatgctgtattcccaacacagatcagttctatatcagtggtaacaataacatcatcaaacgcatgaacact
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|15 ): ATGGGGGGATACAACGTCAGGAATCTCCAGAGAGATTGACGGTGACAGGGAGGGAGATTGGTGTACTGATGGGATGATAGAGATATCAACAGACAAAAGAATAGA
Unaligned ( gi|17 ): ACCAAGTAGGAATCTCAGAAATTGACGGTGAAAGGGAGGAGAGATTTGGTGTACTGGACATGGAATGCAT