lowQualScore : 11 11 1 111 1 11111111 1111 66666666666666666666666666666 1111 2222222222222222222222222222222 111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2222222222 333333333333333333 3333333333 111111111111111 11111111111 11111111 222222222 1111 11111 1111111111 1111 111111 11111111111111111 444444444444444444444444444444444444444444444444444 111111 1111 222222222222 2 1111 11111 11111 222 111 11111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111 111 1111111 111111
lowQualScore : 7 4 888 1 33 0 666 888 8 4 00 3 6 4 99 2 4 2 0 66 0 33 222 77 5 77777 6666 0 5 66 66666666 1111 2 22222222222222222222222222222 33 444 88 99 3 1 9999999999 333 55555 33 1111 33 0 7777 1 33 99999999999 2 0 5555555555555555555555555555555 444 3 999999999999999999999999999999999999999999999999999999 6666 333 1 1 222 1 2 222 0000000000 2 1 1 1 22 1 3333 22 1 1 444444444444444444 1 11 9999999999 1 333333 44 1 1 1 222222222222222 1 11111111111 1 55555 11 99999999 4 999999999 1 1 22 1 88888888888 1 1 44 1 1 2222 5 666 1 777777 1 8888888 222 1 1 1 11 66666 9999999999 1 1 44444 1 1 1 222 1 11 2 3333 1 3 0 2222 111111 222 3 2 1 1 333 222 444 2222 1 1 6666666 1 4444444 22222222222222222 555555555555555555555555555555555555555555555555555 44 0 111111 55 0000 000000000000 0 5 1 0000 5 5 2 66 66 11111 99999 4 00000 7777 0 55555 3 1 22 4444 22 1 1 22 1 55555555 222 000 1 000 1 3 3333 88888888888888888888888 6666666666666666666666666666666666 4 2 55 000 1 1 4 3 3 1 444 0 1 5 4 4 4 4 3333333 3 555 3 3 3 777 3 0 000000
lowQualScore : . . ... . .. . ... ... . . .. . . . .. . . . . .. . .. ... .. . ..... .... . . .. ........ .... . ............................. .. ... .. .. . . .......... ... ..... .. .... .. . .... . .. ........... . . ............................... ... . ...................................................... .... ... . . ... . . ... .......... . . . . .. . .... .. . . .................. . .. .......... . ...... .. . . . ............... . ........... . ..... .. ........ . ......... . . .. . ........... . . .. . . .... . ... . ...... . ....... ... . . . .. ..... .......... . . ..... . . . ... . .. . .... . . . .... ...... ... . . . . ... ... ... .... . . ....... . ....... ................. ................................................... .. . ...... .. .... ............ . . . .... . . . .. .. ..... ..... . ..... .... . ..... . . .. .... .. . . .. . ........ ... ... . ... . . .... ....................... .................................. . . .. ... . . . . . . ... . . . . . . . ....... . ... . . . ... . . ......
lowQualScore : 3 0 777 9 11 8 555 111 0 4 66 3 7 8 22 0 7 5 5 66 3 33 111 00 0 22222 9999 0 0 99 22222222 5555 1 11111111111111111111111111111 22 111 33 00 8 8 5555555555 999 66666 11 5555 22 3 9999 6 44 88888888888 9 2 9999999999999999999999999999999 555 1 444444444444444444444444444444444444444444444444444444 7777 000 1 1 888 0 1 888 5555555555 0 0 0 0 33 0 0000 77 0 0 888888888888888888 0 33 0000000000 0 888888 22 1 1 1 111111111111111 1 99999999999 1 00000 99 11111111 4 444444444 5 5 00 5 55555555555 5 4 88 4 4 6666 5 666 4 333333 3 8888888 222 2 2 2 77 99999 6666666666 2 2 44444 2 2 2 111 2 77 4 9999 3 1 9 3333 222222 888 3 3 0 0 777 999 222 2222 1 1 4444444 1 6666666 22222222222222222 555555555555555555555555555555555555555555555555555 66 5 555555 55 6666 444444444444 4 0 1 6666 7 7 3 99 99 55555 00000 0 11111 9999 8 99999 8 6 00 6666 00 5 5 11 5 66666666 777 888 5 000 5 1 4444 66666666666666666666666 5555555555555555555555555555555555 0 8 33 888 7 7 4 4 8 7 666 9 0 0 4 4 4 4 1111111 3 222 3 3 3 777 3 5 555555
consensus : CTCAGTGAGATTGGT-AG--AGGC-TAAAT-A-TTTGGA--CTG-GT-C--GC-TC-TACCAATCTCAGACCAATGTAACA--ACCTTATTNGGGAAAGTT-TGCCTCAA--CTNCCGCCG-CCTG--T--TG-CG-AT-TAA-AA--TG-G--CT--TAAACTG--A-ACATCT-TGCC-CA-----------GNA-A---TT--C---A-GATTTTC-ACCTTAGACATC--------C-T---ACT-----AA--CTCCC----TA--TCACAAT---GAAACTTGCATTTC--TTACCT-TTN-C-AT--GGT-GTT---------AAATCTC------NAN-----ATCAAGTT-G-GTTATTTTG---AC---GC-NCN-----TTT-AGCG-----------C--------------T----G---AA-G-A---G-TTC-CA---A--------A-TT-GAT-AG-T-T--T-G----T--ACT-A-T---G-AANT---T-----AGTCTT-G--AGGT----ACA--GA-A------CN-G-T-T-T--A-AAA---T----TGTT-TTCAGATA----------GAC-TG--T--T--T-GA--NA-TTTACGTA-GTTT-T-------C-T-A--TT-T-----------G-TT-AA--TTT-T-G----TT-TT---CA-TGA-----TT-T-----TTGA---A-A-T-GCTT--T---G-TGAT---AAA---GT-AAA-GT-----C-A-TTTA-A---A-A--GT-A---AAG-A-TAG-AC--A-GG-----TCTGT---ACCTCAA-GAC-T---AGT---T-G-A----TA-G-TA-------C-A-------A-----------------ACT-------------------A-------------------G-----------T--GTTGAGAA------A--GCAC----AAAA----T-------GGAC-GTGAA-AATA----ACCA-CTTGATTT-AAATT--GA--GATTT----AACAC--T--AT-G-NAA-AGGTAAGAAATGCAAGTTT---CATTGTG--A--TAGG-GA-GT--T----A--GTAG-GA-T-GTC-T--------A---A-G-TG-AAAATT--TG-AA-G----CGG-----GC-A-AG--ATGTT--C-AGTTT--AA-GT-CA-T-TTN-TA-AT-CG-CA--A--CAGG-CGGCGGAAG--TTGGGGCA-AACTTTCCCNAATAAGGTTGCGTTACATTGGTCTGAG-ATTGGT-A-GA-G-C--GA-C-CA-G--TCC-AAATA-TTT-AGCCT--CT-ACC------AATCTCACTGAGATTA
Reference ( gi|2 ) : CTCAGTGAGATTGGT-AG--AAGC-GAAAT-A-TTTGGA--CTG-AT-C--GC-TC-TACCAATCTCAGACCAATGTAACA--ACCTTATTCGGGAAAGTT-TGCCTCAA--CTTCCGCCG-CCTG--T--TG-CG-AT-TAA-AA--TG-G--CT--TAAACTG--A-ACATCT-TGTT-CA-----------GAAAA---TT--C---A-GATTTTT-ATCTTAGGTATC--------C-T---ACT-----AA--CTCCC----TA--TCACAAT---GAAACTTGCATTTC--TTACCT-TTT-C-AT--GGT-GTT---------AAATCCC------TAT-----ATCAAGTT-G-GTTATTTTG---AC---GC-TCC-----TTT-AGTG-----------C--------------T----G---AA-G-A---G-TTC-CA---A--------AATT-GAT-AG-T-T--T-G----T--ACT-A-T---G-GATT---T-----AGTCTT-G--AGG-----ACAC-GA-A------CG-G-T-T-T--A-AAA---T----TGTT-TTCAGATA----------GAC-TG--T--T--T-AG--TA-TTTACGTA-GTTT-A-------C-T-A--TT-T-----------G-TT-AA--TTT-T-G----TT-TT---CA-TGA-----TT-T-----TTGA---A-A-T-GCTT--T---T-TGAC---AAA---GT-AAA-GT-----C-A-TTTA-A---A-A--GT-A---CAG-A-TAA-AC--A-GA-----TCTGT---ATCTTAA-GAC-T---AGT---T-G-A----TA-G-TA-------C-A-------A-----------------ACT-------------------A-------------------G-----------T--GTTGAGAA------A--GCAC----AAAA----T-------GGAC-GTGAATAATA----ACCA-CTTGATTT-AAATT--GA--GATTT----AACAC--T--AT-G-AAA-AGGTAAGAAATGCAAGTTT---TATTGTG--A--TAGG-GA-GT--T----A--GTAG-GA-T-ATC-T--------A---A-G-TG-AAAATC--TG-AA-G----CGG-----GA-A-AG--ATGTT--C-AGTTT--AA-GT-CA-T-TTA-TA-AT-CG-CA--A--CAGG-CGGTGGAAG--TTGGGGCA-AACTTTCCCTAATAAGGTTGTGTTACATTGGTTTGAG-ATTGGT-A-GA-G-C--GA-T-CA-G--TCC-AAATA-TTT-AGCTT--CT-ACC------AATCTCACTGAGATTA
gi|3 : CTCAGTGAGATTGGTTAG--AAGC-TAAAT-T-ATTGGA--CTG-AT----GC-TC-TACCAATCTCAAACCAATGTAACACAACCTTATTAGGGAAAGTTGTGCC-CAA--CTTCCACCGGCCTAGTT--TG-CGTAT-TAA-AA--TG-A--CT--TAAACTG--A-ACATCT-TGCC-CG-----------C-------TT--C---A-GATTTTC-ACCTTAGATATC--------C-T---ACT-----A---CTCCC----TA--TCACAAT---AAAACTTGCATTTC--TTACCT-TTT-C--T--AGT-GTT---------AAATCTCAATT--TAA-----ATCAAG-G-G-GTTATTTTC---AC---GT-CCA-----TTT-TGTG-----------C--------------T-------------------TTCTCA---A--------CAC----T-AG-T-T--T-G----T--ACT-A-T---C-AA-C---T-----AGTCTT-A--AGAT----ACA--GA-T------CT-G-T-T-T------A---TC---TGTT-ATTAAAT-----------GAC-T
gi|7 : agtgagattggtagaagcgaaatattttggactggtcgctctaccaatctcagaccaatgtaacaaccttattcgggaaagtttgcctcaccttccgccgcctgttgcgattaaatggctttaactgaacatcttgttcagaaaatttcagatttttatcttaggtatcctactaacccctatcacaatgaaacttgcatttcttaccttttcatggtgttaaatccctatatcaagttggttattttgacgtccatttagtgctgaagagtttccaaaattgatagtttgtactatggattagtcttgaggcacagaacggtttaaaatgttttcagatagactgtttgatattttacgtagtttaactatttgttaattttgttttcatgattttgaaatgctttttgacaaagtaaCTCAGTGAGAT-GGT-AA--AGGC-TAA-T-A-TTTGG---CTG-GTTC--GCCTT-TACCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNN--NNNNNNNNN-NNNN--N--NN-NN-NN-NNN-NN--NN-N--NN--NNNNNNN--N-NNNNNN-NNNC-CC-----------GC------TT--C---A-AATTTTC-ACCTTAGACATC----------T---ACT-----AATCNNNNN----NN--NNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNN--NNNNNN-NNN-N-NN--NNN-NNN---------NNNNNNN------NNN-----NNNNNNNN-N-NNNNNNNNN---NN---NN-NNN-----NNN-NNNN-----------N--------------N----G---AA-G-A---G-TTC-CA---A--------A-TT-GAT-AG-T-T--T-G----T--ACT-A-T---G-GAAA---T-----AGTCTT-G--AGGT----AGA--GA-A------CG-G-T-T-T--A-AAA---T-----GTT-TTCAGA------------GAC-TG--T--T--T-GA--AA-TTTACGTA-GTTT-T-------C-T-A--TT-T-----------G-TT-AA--TAT-T-G----TT-TTT--CA-TGA-----TT-T-----T-GA---A-A-T-GCTT--T---TGTGAC---AA----GT-AAA-GT-----C-A-TTTA-A---A-A--GT-A---AAG-A-TAA-AC--A-GG-----TCTGT---A-CTTAA-GAC-T---AGT---T-G-A----TA-G-TA-------C-A-------A-----------------ACT-------------------A-------------------atta
gi|4 : taatCTCAGTG-GAT-GGT-A---AGGC-TAAAT---TTTGGA--CTG-tcaatttggaactcttcagtgttg
gi|46 : agcttcaaatttcaccttagacattactaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagagttccaaatttgataggttttactcatggaatagtcttgaggtaagagaacggttttaaaaatgttttcagatagactgttgaaatttacgtagttctatttgttaatatgttacatgaattttgaaaggcctaatgttgactaagtaaagtatttaaaagtaaagataatacaggtctgtaccttaagactagtttgtagtagcaaactatcaattttggaactcttcagtgttagaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagttgtaggatgtctaggtgaaaatttgaagcggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtattaacaggcaccCTCAGTGAGAT-GGT-AG--AAGC-TAAA--A-TTTGGA--CTGCAT-C--att
gi|48 : agactttgttggctCTCAGTGAGATTGGT-AGATAAGCTAAAAT-A-TTTGAT--CTGCAT-C--atta
gi|52 : ggactCTCAGCAAGATTGAC-AG--AGGC-TAGAT-A-TTTGGT--CTT-AT-C--atta
gi|8 : atTCAGTGAGATTGGT-AG--A-GC-GAAATTA-TTTGGA--CTG-GT-CA-GC-TCATACCANNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNN--NNNNNNNNN-NNNN--N--NN-NN-NN-NNN-NN--NN-N--NN--NNNNNNN--N-NNNNNN-TGTTGCA-----------GAAGAGATTT--C---A-GATTT---ATCTTAGGTATC--------C-T---AC------AA--CTCCCGNN-NN--NNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNN--NNNNNN-NNN-N-NN--NNN-NNN---------NNNNNNN------NNN-----NNNNNNNN-N-NNNNNNNNN---NN---NN-NNN-----NNN-AGTG-----------CA-------------T----G---AAAG-A---G-TTC-CA---A--------A-TT-GAT-AG-T-T--T-G----T--ACT-A-T---G-GATT---------AGTCTG-G--AGG------CACAGA-A------CG---T-T-T--A-AAA---T----GTTT-TTCAGATA----------GAC-TGA-T--T--TGAG--TA-TTTACGTA-GTTT-A-------C-TTA--TT-TT----------G-TT-AA--TTT-T-G----TT-TT---CA-TGA-----TT----------G---A-A-T-GCTT--T---T--GAC---A-----GT-AAA-GT-----C-A-TT-A-A---A-A--GT-A---CAG-A-TAA-AC--A-GA-----TCTGT---ATCTTAA-GAC-T---AGTA--T-G-A----TA-GTTA-------C-A-------A-----------------A
gi|3 : ctaatAGTGAGATTGGT-AG--AAGC-GAAAT-ATTTTGGA--CTG-GT-C--GC-TC-TACCAATCTCAGACCAATGTAACA--ACCTTATTCGGGAAAGTT-TGCCTCAC--CTTCCGCCG-CCTG--T--TG-CG-AT-T-A-AA--TG-G--CT--TTAACTG--A-ACATCT-TGTT-CA-----------GAAAAT--TT--C---A-GATTTTT-ATCTTAGGTATC--------C-T---ACT-----AA--C-CCC----TA--TCACAAT---GAAACTTGCATTTC--TTACCT-TTT-C-AT--GGT-GTT---------AAATCCC------TAT-----ATCAAGTT-G-GTTATTTTG---AC---GT-CCA-----TTT-AGTG-----------C--------------T----G---AA-G-A---GTTTC-CA---A--------AATT-GAT-AG-T-T--T-G----T--ACT-A-T---G-GA-T---T-----AGTCTT-G--AGG------CACAGA-A------CG-G-T-T-T--A-AAA--------TGTT-TTCAGATA----------GAC-TG--T--T--T-GA--TATTTTACGTA-GTTTAA-------C-T-A--TT-T-----------G-TT-AA--TTT-T-G----TT-TT---CA-TGA------T-T-----TTGA---A-A-T-GCTT--T---T-TGAC---AAA---GT-AAA-GT-----C-A-TTTA-A---T-A-----A---CAG-A-TAA-AC--A-GA-----TCTGT---ATCTTAA-GAC-T---AGT---T-G-A----TA-G-TA-------C-A-------A-----------------ACT-------------------A-------------------G-----------T--GTTGAGAA------A--GCAC----AAAA----T-------GGAC-GTGAA-AATA----ACCC-CTTGATTT-AAATT--GA--GATTT----AACAC--T--A--G-AAA-AGGTAAGAAATGCAAGTTT---TATTGTG--A--TAGG-GA-G---T----A--GTAG-GA-T-ATC-T--------A---AGG-TG-AAAATC--TG-AA-G----CGG-----GC-A-AG--ATGTT--C-AGTTT--AA-GT-CA-T-TT--TA-ATACG-CA--AACTAGGCCGGTGGAAG--TT-GGGCACAACTTTCCCTAATAAGGTTGTGTTACATTGGTTTGAG-ATTGGT-A-GA-G-C---A-T-CA-G--TCC-AATAA-TTT-AGCTT--CTAACC------AATCTCACTGAGATTAact
gi|1 : GTGAGATTG-T-A---AAGC-TAA-T-A-TTTGGA---TG-AT-CCAAC-TC-TACCAATCTCAGAACAATGT--CA--AG--TATTGGAGAAAAT---GAAT-AA--TTACTGTGG-GTAG--T--TG-AG-ATCTAA-AA--TG-C--CTC-TATATTG--ACAAAT-T-GGCC-CA-----------GGACC---TT--TTTTA-ATTTTCT-AAATTGGGTATA--------T-T-----T-----AA--TTTTCAGAATA--TCAAAGTTA-GAGAGT-GT-TTTCAATTAATT-TTA-T-AA--GGTTGTTTATCAATAAAAATTTA------AAT------TTAAGTTTG-GTTATTATG---AC---GT-ATA-----TTA-ATTG-----------T--------------TATGTG---AA-T-A---G-TTCACACCCA--------ACTT-CAT-AG-G-T--T-A----TCTGCT-A-TATCG-GATT---------ATTTTT-GTAAGATAATAACAC-GA-C------AG-G-T-TAT--C-AAA---TGA--TGTT-T--AGATA----------GAA-TG--T--T--G-AT--TAATTTA-GTA--TTT---------C-T-AAATT-T-----------GATT-AAGCTTTAT-G----TA-TTA--TA-TAA-----TA-T-----TTGA---A-A-TTGATT--TA--G-TGATGCAAAA---AT-ATATGT-----C-C-ATTA-A---ATA--GT-A---CCG-AATAA-ACCAG-GA-----TCTGTCAAAT-TTAA--AC-T---AGT-------A----TA-G-AA-------C-AGTCGATAA-----------------ACT-------------------ATCAATATTGGA--------GCTTCTTACAATT--GTTGAGAA------AAAGTGC----CAAACAACT-------GGACCGTGAACAATATAATGCAA-AATGATTT-AAACTCGGA--GATTTGAAAAACAC--TTAATAG-AGAGAGGTAAGAA-TGCAAGTTT---TA-TGTGGTA--TAGGCGA-GTACG----A--ATAG-AA---ATA-A--------A---A-G-AG-TCAATTTGTG-AA-G----CGGTGGGTAA-ATAGT-ATGTTTAT-AGTTT--AA-GGACA-TATTG-TACAT--G--A--A--CAGG-GAGAGCGAG---TGGGG-A-AA---TATCAGATAAGGTTGCGCTA
gi|32 : T-AA--AGGC-TAAAT-A-TTTGGGACCTG-GT-C--GCTTT-TACC
gi|1 : gttagtaggacgtctaatgtgaaaatttaaagcgaagacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCA--ACCTTATCTGATA---TT-T-CCCCA---CTCGCTCTC-CCTG--T--T--C--ATGTAC-AA--TATGTCCT--TAAACTATAA-ACATAC-TATT-TACCCACCGCTTCACAAA---TT--G---A-CTCTTTT-ATTTC---TATT--------CGT---ACT---------CGCCTA---TA--CCACA-T---AAAACTTGCA-TTC--TTACCTCTCT-CTATTAAGT-GTTTTTC-----AAATCTCCGAGTTTAA-----ATCATTTT-GCATTATATTGTTCAC---GG-TCCAGTTGTTT-GGCA-----------CTTTTTCTCAACAATT----GT--AA-GAA---G-CTC-CA---A--------TATT-GAT-AG-T-T--T-A----TCGACT-G-T---
gi|31 : gtgagattgtaaagctaatatttggatgatccaactctaccaatctcagaacaatgtcaagtattggagaaaatgaataattactgtgggtagttgagatctaaaatgcctctatattgacaaattggcccaggaccttttttaattttctaaattgggtatatttaattttcagaatatcaaagttagagagtgttttcaattaattttataaggttgtttatcaataaaaatttaaatttaagtttggttattatgacgtatattaattgttatgtgaatagttcacacccaacttcataggttatctgctatatcggattatttttgtaagataataacacgacaggttatcaaatgatgtttagatagaatgttgattaatttagtatttctaaatttgattaagctttatgtattatataatatttgaaattgatttagtgatgcaaaaatatatgtccattaaatagtaccgaataaaccaggatctgtcaaatttaaactagtatagaT-TGTCTCAAAACT--CGGCG-CTTG--TCCTG-CG-AT-TAATAA--TT-G--GTAGTAAATTG----ACACC---ACT-CA-----------GCCCG---CTTAC---A-AATTTTTCACCTTGGACATC--------C-A---CCT-----AA---TCCT----TA--GAACAATAGCAAAACTT-CTTTAT--TCACCT-CTTAC-AT--AGT-G-T---------AAATTTC------AATTTGAAATCAAGcgcta
gi|6 : CCG-CCTG--T--TGATG-AT-TAA-AAAATG-A--CA---AAACTG--A-A-ATATACGCC-CG-----------C-------TT--C---A-AATTTTC-ACCTTAGACATC--------C-T---ACT-----AA--CTCNN----NN--NNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNN--NNNNNN-NNN-N-NN--NNN-NNN---------NNNNNNN------NNN-----NNNNNNNN-N-NNNNNNNNN---NN---NN-NNN-----NNN-NNNN-----------N--------------NNNN-G---AA-G-A---G-TTC-CA---A----------TT--AT-AG-T-TGTT-T----T--ACT-A-TT--G-GAAT---T-----AGTCTTTG--AGGT----ACA--GA-A------CG-G-T-T-TTTA-AAA---A----TGTTCTTCAGATA----------GAC-TG--T--T--T-TG--AAATTTACGTA-GTTT---------C-T-A--TT-------------G-TT-AA--TTT-G-T----TT-TT---CA-TGA-----TT-T-----TTGA---A-A-T-GCTT--T---G-TGAC----AA---GT-AAA-GT-----CGA-TTTA-A---A-A--GT-A---AAG-A-TAA-A---A-GG-----TCTTT---ACCTTAA-GAC-T---AGT---T-G-A----TA-G-TA-------C-A-------A-----------------ACTATCAATTGTGGAACTCTTCA-------------------G-----------T--GTTGGGAA------A--GCAC----AAAA----TCTTATGNNNNN-NNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNN-NNNNN--NN--NNNNN----NNNNN--N--NN-N-NNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNN--N--NNNG-GACGT--TATTAA--GTAG-G--T-TTC-T--------A---AGG-TG-AAAA----TG-AA-G----CGG-----
gi|4 : ---TT--C---A-AATTTC--ACCTTAGACAT-----------T---ACT-----AA--CTCNN----NN--NNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNN--NNNNNN-NNN-N-NN--NNN-NNN---------NNNNNNN------NNN-----NNNNNNNN-N-NNNNNNNNN---NN---NN-NNN-----NNN-NNNN-----------N--------------N----NNNNAA-G-A---G-TTC-CA---A--------ATTT-GAT-AG-G-T--T-T----T--ACTCA-T---G-GAAT---------AGTCTT-G--AGGTA---AGA--GA-A------CG-G-T-T-TT-A-AAA---A----TGTT-TTCAGATA----------GAC-TG--T--T--G-AA---A-TTTACGTA-GTT----------C-T-A--TT-T-----------G-TT-AA--TAT---G----TT-A----CA-TGA-----AT-T-----TTGA---A-A-G-GCCTAATG--T-TGAC---TAA---GT-AAA-GT-------A-TTTA-A---A-A--GT-A---AAG-A-TAATAC--A-GG-----TCTGT---ACCTTAA-GAC-T---AGTTTGT-A-G----TA-G-CAAACTAT-C-A-------ATTTTGGA----------ACTCTTC---------------A-------------------G-----------T--GTT-AGAA------N--NNNN----NNNN----N-------NNNN-NNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNN-NNNNN--NN--NNNNN----NNNNN--N--NN-N-NNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNN--N--NNNG--A-GT--T-------GTAG-GA-T-GTC-T--------A---G-G-TG-AAAATT--TG-AA-G----CGGNNNN-NN-N-NN--NNNNN--N-NNNNN--NN-NN-NN-N-NNN-NN-NN-NN-NN--N--NNNN-NNNNNNNNN--NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTATTAAC-A-G--G-C--AC-C-CA-G--TCC-AAA-A-TTT-AGCCT---T-ACC-------ATC-CACTGAGATT
gi|14 : agc---TT--C---A--ATGTTC-ACCTTAGATATC--------A-T---ACT-----AA--CTCNN----NN--NNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNN--NNNNNN-NNN-N-NN--NNN-NNN---------NNNNNNN------NNN-----NNNNNNNN-N-NNNNNNNNN---NN---NN-NNN-----NNN-NNNN-----------N--------------N----N---NN-G-AAACG-TTC-CA---A--------A-TT-GAT-AG-T-T--T-G----T--ACT-C-T---G-AA-C---T-----AGTCTT-G--AGG-----TCCA-GA-C------CT-G-T-C-T--A-TCT---T----TACT-TTTAAAT-----------GAC-T
gi|12 : cactgaagattcccaattgatagtttgtaccatcaactagtcttgacatacagaacggttttcaaatgtctagagatggactatttgaaatttacatatgtttccatttgttatttgttttttcatgattttgaaatgctttgtgataggtaa---TT--C---A--ATGTTC-ACCTTAGATATC--------A-T---ACT-----AA--CTCNN----NN--NNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNN--NNNNNN-NNN-N-NN--NNN-NNN---------NNNNNNN------NNN-----NNNNNNNN-N-NNNNNNNNN---NN---NN-NNN-----NNN-NNNN-----------N--------------NNNNNG---AA-A-C---G-TTC-CA---A--------A-TT-GAT-AG-T-T--T-G----T--ACT-C-T---G-AA-C---T-----AGTCTT-G--AGG-----TCCA-GA-C------CT-G-T-C-T--A-TCT---T----TACT-TTTAAAT-----------GAC-Tgcag
gi|10 : cactgaagatttcccaattgatagtttgtaccatcaactagtcttgacatacagaacggttttcaaatgtctagagatggacctatttgaaatttacatatgtttccatttgttatttgttttttcatgattttgaaatgctttgtgataggtaa---TT--C---A-TATTTC--ACCTTGGACATC--------C-T---ACT-----AA--CTCgcag
gi|5 : aatctcagtgagattatttggacctgcgcctcttccgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncccgc---TT--C---ACAATTTTC-AACTTAGGTATC--------C-TCTAACTCNNNNNN--NNNNN----NN--NNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNN--NNNNNN-NNN-N-NN--NNN-NNN---------NNNNNNN------NNN-----NNNNNNNN-N-NNNNNNNNN---NN---NN-NNN-----NNN-NNNN-----------N--------------N----N---AA-G-A-----TTC-CA---G--------AATT-GATTAG-T-T----G-------ACT-ACT---G-GATT---------AGTCTT-G--AGGT----ACAG-AA-A------CG-GGT-T-T--C-ATA---T-----GTT-TTCAGATA----------GAC-TGTTT--T--T-GA--TA-TTTACGTA-GTTT---------C-T-A--GT-TGATCGGTGTAGG-TC-AAT-TTT-T-GGTGTTT-TT---CATTGACCGAGTTAT-----TTGA---A-A-G-CCTT--T---G-TG-C----AA---GT-AAC-GTACATGC-A-CTTA-A---A-ATCG--A---CAGCA-GTA-AC--ACGG-----TCTGTAA-ACCTTAA-GA--T---AGT-------A----TA-G-TA-------C-A-------AG----------------ACT-------------------A-------------------nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttcaacactgaagagttccaaattttgatagttttgtactatcaaccagtttgaggtacaaaacggttttaaaatgtcttcagatatatgtagatagactattcgcaatttatcattttctatttgttaatttgttattcgtgatttgagatgttttgtgataagtaaagtcatttaaaagtaaagattagacaggtatgtacctc
gi|13 : c---TT--C---A-GCTTTTG-ACTTTAGACATCGGATGATCC-T---ACT-----AA--CTCCC----TA--TCACTAT---GCAACTTGCATTTC--TTACCT-AAA-C-ATACGGT-GTT---------AAATCCtcaatttgaacttctctacagtttgagtggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggttagtagaagtatctagagggtgagaaatgaaggcgggcaaggaatgttcgagctttgaaatc
gi|25 : c---TT--G---A-GATTTTT-ATCTTAGACAAC--------C-T---ATT-----AA--CTCCC----TA--TCATTAT---CAAACTTGTATTTC--TTACCT-TCA-C-AT--accaatcgcattccgccaaccatctcatcaacggcagttgggattcaataattaacgcatcgctgccagatttatttttatgctttctcaacactgaagagttccaactgtaagtaatttagttcgtacgattctttcaaacacactggttaaaatttaaatagatctagttttctttttgctaatttttattttcatgtttatggaatattgtgtggtaagtaaagttatgtaatagtagacagttccgtacctttagacaaat
gi|50 : atctcagcgagattcgtcgaggctggacctgttccgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctgc---TT--C---A-GATTTTC-ACCTAAGGCATC--------C-T---ACT-----AA--CTCCA----TA--TCACAA
gi|9 : T--C---A-TATTATC-ACCTTAGACATC--------A-T---ACT-----AA--CTCNN----NN--NNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNN--NNNNNN-NNN-N-NN--NNN-NNN---------NNNNNNN------NNN-----NNNNNNNN-N-NNNNNNNNN---NN---NN-NNT-----TCTCAACA-----------C--------------T----G---AA-G-A---G-TTC-CA---A--------A-TC-GAT-AG-T-T--T-G----C--ACT-A-T-----GATT---T-----AGTCTT-G--AGG------TAC-AA-A------Cgcgg
gi|43 : taatctcaacgagatattcgtcgaggctggaacctcttccgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncccgcaATA--------C-T---TCT-----AA--CTCTC----TAAATCACTAT---GAAACTTGCGTTTC--TTACCT-ATA-C-AT--ctgactatctttacttttaaatgaatttgctttttaacaaagcattttgaaatgatgaaaatcaaaattaacacatagaaaactatgtaaaattcaaccagtctgtctaaagacattttagatagttcagtacctcaaaactagttgatagtacaatatggaactcttcagtgtt
gi|21 : tc-G-GTTATTTTC---AC---AT-ACA-----TTT-TGTGCTTTCTCGACAC--------------T----G---AA-G-A---G-TTC-C----A--------AATT-GAT-AG-T-T--T-G----T--ACT-A-T-----GATT---T-----AGTCTT-A--AAGT----ACA--GG-C------CG-G-T-C-T--A-tacggt
gi|13 : tacgaatgtgtcttaaagtaaaatgtcgtcagacagactggttgatatttatgtagttttctatttgttaattttgattttcataattttgaaatgctttgtgataaagaaaatcatttaaatgtaaagaTTATTTTT---AT---GC-TTT-----CTC-AACA-----------C--------------T----G---AA-G-A---G-TTC-CA---ACTGTAAGTAATT---T-AG-T-T--C-G----T--AC----------GAT------------TCTT-T--CAA-----ACAC----A------CT-G-G-T-T--A-AAA-------------TTTAAATA----------GA------T--C--T-AG--T--TTT-------------------C-T-T--TT-T-----------G-CT-AAT-TTT-T-A----TT-TT---CA-TG------TT-T-----ATGG---A-A-T-ATTG--T---G-TGGT----AA---GT-AAA-GT-----T-A-TGTA-A---T-A--G------------TAG-AC--A-GT-----TCCGT---ACCTTTA-GAC-
gi|24 : cttcagcttttgactttagacatcggatgatcctactaactccctatcactatgcaacttgcatttcttacctaaacatacggtgttaaatccaccaatcgcattccgccaaccatctcatcaacggcagttgggattcaataattaacgcatcgctgccagatTATTTTA---ATTGTGCCTTC-----TCT-A-CA-----------C--------------C----A---AA-G-A---G-TTC-TA---A--------ATTT-GAT-AG-T-T--T-G----T--ACC-A-T---C-AACT---------AGTCGA-G--AGGT----ACA--GA-A------CT-G-T-C-C--A-AAA---T----TGTC-CTCAGACA----------GAC-TG--G--T--G-AA--T--TCTATGTA-GTTT-T-------C-T-A--TT-T-----------G-TTGAA--TTT-G-A----TT-TT---CA-GGA-----TT-T-----TGTA---A-A---GCTT--T---G-TGAT---AAG---Gaaat
gi|6 : acattaattttttgtagATTTTG----T---GC-TTT-----CCC-AACA-----------C--------------T----G---AA-G-A---G-TTC-CA---C--------AATT-GAT-AG-T-T--T-G----T--ACT-A-T---C-AA-C---T-----AGTCTT-A--AGG-----tatgtgaaaataacctac
gi|4 : ccgcctgttgatgattaaaaaatgacaaaactgaaatatacgcccgcttcaaattttcaccttagacatcctactaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaagagttccaattatagttgttttactattggaattagtctttgaggtacagaacggtttttaaaaatgttcttcagatagactgttttgaaatttacgtagtttctattgttaatttgtttttcatgatttttgaaatgctttgtgacaagtaaagtcgatttaaaagtaaagataaaaggtcttta-----TCT-AACA-----------C--------------T----G---AA-G-A---G-TTC-CA---A--------AATT-GAT-AG-T-T--T-GC---T--ACT-A-C---A-AA-C---T-----AGTCTT-A--AGGT----ACA--GA-C------CT-G-T----------A---T----TATC-TTT----------------AC-TT--T--T--A-AA--TACTTTACTTA-GTcttatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggacgttattaagtaggtttctaaggtgaaaatgaagcgg
gi|11 : agcttcaaatttcaccttagacattactaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagagttccaaatttgataggttttactcatggaatagtcttgaggtaagagaacggttttaaaaatgttttcagatagactgttgaaatttacgtagttctatttgttaatatgttacatgaattttgaaaggcctaatgttg-----TTC-AACA-----------C--------------T----G---AA-G-A---G-TTC-CA---A--------ATTT-GAT-AGTT-T--T-G----T--ACT-A-T---C-AA-C---C-----AGTCTT-G--AGG------TAC-AA-A------CG-G-T-T-T--T-AAA---A----TGTC-TTCAGATA----------TA--TG--TAGA--T-AGACTA-TT--CGCA-ATTT-ATCATTTTC-T-A--TT-T-----------G-TT-AA---TT-T-G----TTATT---CG-TGA------T-T-----TTGA---G-A-T-GTTT--T---G-TGGA---TAA---GT--AA-GT-----C-ATTTTA-A---A-A--GT-A---AAG-AGTAG-AC--A-GG-----TATGT---ACCTannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagttgtaggatgtctaggtgaaaatttgaagcggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtattaacaggcacccagtccaaaatttagccttaccatccactgagatt
gi|10 : aatctcaagtgagattatttggacctgcgcctcttcgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncccgcttcatatttcaccttggacatcctacaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntt-----TTC-AACA-----------C--------------T----G---AA-G-A---G-TTC-CA---A--------ATTTTGAT-AG-T-T--TTG----T--ACT-A-T---C-AACC---------AGT-TT-G--AGGT----ACA--AA-A------CG-G-T-T-T--T-AAA---A----TGTC-TTCAGATA----------TA--TG--T--AGAT-AGACTA-TT--CGCA-ATTT-ATCATTTTC-T-A--TT-T-----------G-TT-AA--TTT---G----TTATT---CG-TGA-----TT-T-------GA---G-A-T-GTTT--T---G-TGAT---AA----GT-AAA-GT-----C-A-TTTA-A---A-A--GT-A---AAG-ATTAG-AC--A-GG-----TATGT---ACCTc
gi|28 : aatctcagtgagattatttggacctgcgcctcttccgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncccgcttcatatttcaccttggacatcctactaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttG-----------C--------------T----G---AA-G-A---G-TGC-CA---A--------T-TT-GAT-AG-T-T--T-G----T--ACT-A-----G-CAAT---T-----AGTCTT-G--AGGT----ACA--GA-A------CG-G-T-T-T--A-AAA---A----TGTC-TTCAGATA----------GAA-TA--T--T--T-GA--AA-TTTACGTA-GTTT-T-------C-T-A--TT-T-----------G-TT-AA--TTT-T-G----TTATT---CG-TGA------T-T-----TTGA----------------------------GAA---GT-AAA-G--------A-TT---------------------------G-AC--A-GG-----TATGT---ACTTCAA-GAC-T---AGT---T-A-A----TA-G-TA-------C-c
gi|7 : ac-----------C--------------T----G---AA-G-A---G-TTC-CA---A--------A-TT-GAT-AG-T-T--T-G----T--ACT-A-T---C-AA-C---T-----AGTCTT-A--AGT-----ACA--GA-C------CT-G-T-T-T--A-TCT---T----TACT-TTTAAAT-----------GAC-Tgg
gi|20 : taatctcagtgagatggtaaaggctaatatttggctggttcgcctttaccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncccgcttcaaattttcaccttagacatctactaatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaagagttccaaattgatagtttgtactatggaaatagtcttgaggtagagaacggtttaaaatgttttcagagactgtttgaaatttacgtagttttctatttgttaatattgtttttcatgattttgaaatgcttttgtgacaagtaa-----------C--------------T----G---AA-G-A---G-TTC-CA---A--------A-TT-GAT-AG-T-T--T-GAATGT--ACT-A-C---G-TATCAACT-----AGTCTT-G--AGGT----ACA--GA-A------CG-G-T-T-T--ACAAA---T----T-----TCAGATA----------GAC-TG--T--T--T-GA--AA-TTTACGTA-GTTT-C-------C-T-A--TT-T-----------G-TT-AA--TTT-T-G-----------------------------------A---A-A-T-GCTT--T---G-TGAT---AA----GT-A---GT-----C-A-TTTA-A---A-A--GT-A---AAG-A-TAG-AC--A-GGTTTGCTTTGT---ATCTCCA-GAC-T---AGT---T-G------TA-G-TA-------C-AC------A-----------------ACT-------------------A-------------------tgttg
gi|16 : a-----------C--------------T----G---AA-G-A---G-TTC-CAC--C--------AATT-GAT-AA-T-G--T-G----T--ACT-A-T---T-AA-C---T-----AGTCTT-G--AGGT----ACA--GA-A------CT-G-T-C-T--A-CAA---A----TGTT-TTCAGACA----------GAC-TG--G--T--T-GA--AA-TTTATGCA-TTTT-T-------C-T-A--TT-T-----------G-TT-AA--TTT-T-GA---TT-TT---CA-TGA------T-T-----TTGA---A-A-T-GCTT--C---G-TGAT---AAA---G--AAA-GT-----C-A-TTTA-A---A-A--GTAA---AAG-A-TAG-AG--C-GG-----TTTGT---ATCTCAA-GAA-TATGAAT---T-ACA----TA-G-TA-------C-A-------G-----------------ACT-------------------A-------------------tcaatttggaacttcttc
gi|16 : aca-----------C--------------T----G---AA-G-A---G-TTC-CA---A--------A-TT-GAT-AG-T-C--T-G----T--ACT-A-T---GTAATTCA-T-----ATTCTT-G--A-G-----ATAC-AA-A------Ctcaatttggaactcttcagtg
gi|14 : acactgaagagttccaccaattgataatgtgtactattaactagtcttgaggtacagaactgtctacaaatgttttcagacagactggttgaaatttatgcatttttctatttgttaattttgattttcatgattttgaaatgcttcgtgataaagaaagtcatttaaaagtaaaagatagagcg-----------C--------------T----G---AA-G-A---T-TCC-CA---A----------TT-GAT-AG-T-T--T-G----T--ACC-A-T---C-AACT---------AGTCTT-G--ACAT----ACA--GA-A------CG-G-T-T-T--T-CAA---A----TGTC-TAGAGATG----------GAC-TA--T--T--T-GA--AA-TTTACATATGTTT---------C-C-A--TT-T-----------G-TT-AT--TTG-T-T----TT-TT---CA-TGA-----TT-T-----T-GA---A-A-T-GCTT--T---G-TGAT---AG----GT-AAA-GT-----C-A-TTTA-A---A-A--GT-A---AAG-A-TAG-AC--A-GG-----TCTGG---ACCTCAA-GAC-T---AGT---T-C-A----GA-G-TA-------C-A-------A-----------------ACT-------------------A-------------------tg
gi|19 : ca-----------C--------------T----G---AA-G-A---G-TTC-CC---A--------A-TT-GAT-AG-T-T--T-G----T--ACC-A-T---C-AACT---------AGTCTT-G--ACAT----ACA--GA-A------CG-G-T-T-T--T-CAA---A----TGTC-TAGAGATG----------GAC-TA--T--T--T-GA--AA-TTTACATATGTTT---------C-C-A--TT-T-----------G-TT-AT--TTG-T-T----TT-TT---CA-TGA-----TT-T-----T-GA---A-A-T-GCTT--T---G-TGAT---AG----GT-AA--GT-----C-A-TTTA-A---A-A--GT-A---AAG-A-TAG-AC--A-GG-----TCTGG---ACCTCAA-GAC-T---AGT---T-C-A----GA-G-TA-------C-A-------A-----------------ACT-------------------A-------------------tcaatttggaacgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagttagtatgatatctaaggtgaacattgaagcag
gi|12 : ca-----------C--------------T----G---AA-G-A---T-TTC-CC---A--------A-TT-GAT-AG-T-T--T-G----T--ACC-A-T---C-AACT---------AGTCTT-G--ACAT----ACA--GA-A------CG-G-T-T-T--T-CAA---A----TGTC-TAGAGATG----------GACCTA--T--T--T-GA--AA-TTTACATATGTTT---------C-C-A--TT-T-----------G-TT-AT--TTG-T-T----TT-TT---CA-TGA-----TT-T-----T-GA---A-A-T-GCTT--T---G-TGAT---AG----GT-AAA-GT-----C-A-TTTA-A---A-A--GT-A---AAG-A-TAG-AC--A-GG-----TCTGG---ACCTCAA-GAC-T---AGT---T-C-A----GA-G-TA-------C-A-------A-----------------ACT-------------------A-------------------tcaatttggaacgt
gi|17 : ca-----------C--------------T----A---AA-G-A---G-TTC-CA---A--------A-TT-GAT-AG-T-T--T-G----T--ACT-A-C------ATG---TCAACGAGTCTT-G--AGGT----ACA--GA-A------CT-G-T-C-A--A-GAA---A----CGTC-TTCATACA----------GAC-TG--G--T--T-GA--AA-TTCACGTA-GTTT-T-------C-T-A--CT-T-----------C-TT-CA--TTT-T-GA---TT-TT---CA-TGA-----TT-T-----T-GA---A-A-T-GCTT--T---G-TGA-----------T-ACA-GT-----C-A-TTTA-A---A-A--GT-A---AAG-T-TAA-AC--A-GG-----TCTGT---ACCTCAA-GGC-A---AAT---T-C-A----TA-G-TA-------C-A-------A-----------------ACT-------------------A-------------------tcaatttggaacgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagttagtatgatatctaaggtgaacattgaagcag
gi|9 : aca-----------C--------------T----G---AA-G-A---G-TTC-CA-------------------T-A----T--T-G----T--ACT-A-T---C-AACT---------AGTTTT-G--AGG------TACTGA-A------CT-A-T-C-T--A-AAA---T-----GTC-TTTAGACA----------GAC-TG--G--T--TGAA--T--TTTACATA-GTTT-T-------C-T-A--TG-T-----------G-TT-AA--TTT-T-GA---TT-TT---CA-TCA-----TT-T-----C-AA---A-A-T-GCTT--T---G-TTAA---AAA---GC-AAA-TT-----C-A-TTTA-A---A-A--GT-A---AAG-A-TAG-TC--A-GG-----TTTGT---ACCTCAA-GAC-T---AAA---T-C-A----TA-G-TG-------C-A-------A-----------------ACT-------------------A-------------------tcaaattggaactct
gi|26 : taatctcaacgagatattcgtcgaggctggaacctcttccgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncccgcatcatattatcaccttagacatcatactaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttctcaacactgaagagttccaaatcga-----------C--------------T----G---AA-G-A---G-TTC-CA---A--------ATTTTGAT-AG-T-T--T-G----T--ACT-A-T---C-AACC---------AGTCTT-G--AGGT----ACA--AA-A------CG-G-T-T-T--T-AAA---A----TGTC-TTCAGATATATGTAGATAGAC-TA--T--T--C-GC--AA-TTTATGCA-TTTT-T-------C-T-A--TT-T-----------G-TT-AA--TTT---G----TTATT---CG-TGA-----TT-T-----T-GA---G-A-T-GTTT--T---G-TGAT---AA----GT-AAA-GT-----C-A-TTTA-A---A-A--GT-A---AAG-A-TAG-AC--A-GG-----TATGT---ACCTCAtgtt
gi|29 : a-----------C--------------T----G---AA-G-A---T-TTC-CA---A--------A-TT-AAT-AG-T-T--T-G----T--ACT-A-T---G-AATTAG-T-----AG--TT-G--AGGT----ACA--GA-C------CT-G-T-C-T--A-TCT---T----TACT-TTTAAATG----------G
gi|18 : gaggtacagaactgtccaaaaatgttttcagacagattggttgaaatttgcgtgaattttgattttcatgattttgaaatgttttgtgataagtaaag-----------C--------------T----G---AA-G-A---T-TTC-C----A--------AATC-GAC-AG-T-T--T-T----G--ACT-A-T---C-AA-C---T-----AGTCTT-G--AGAT----ACA--GA-C------CT-G-T-C-------AATCTT----TACT-TTTAAAT-----------GAC-TA--C--T--T-AT--TA-tgt
gi|39 : agaatcttcaaatattttagggatttcattgacatacatgaagaacaatgaggtacagaacggtttaagacttttttaaatttacgtaattacatatttgttgattttgttttacatgcttttgagattctttg-----------C--------------T----G---AA-G-A---G-TTC-CA---A--------A-TT-GAT-AG-T-T--T-G----T--TTT-A-T-----GAGT---T-----AATCTT-G--AGG------TAC-AA-AT-----CG-G-T-A-T--A-TCC---T----TACT-TTCAAAT-----------GAC-Ttgttgag
gi|22 : tgaaatgctttgtgataaagaa-----------C--------------T----G---AA-G-A---G-TTC-CA---A--------A-TT-GAT-AG-T-C--T-G----T--ACT-A-T---GTAATTCA-T-----ATTCTT-G--A-G-----ATAC-AA-A------Ct
gi|20 : caccttagatatcctactacatgtaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttctgaaca----G---AA-G-AA--G-TTC-CA---A--------A-TT-GAT-AG-T-TG-T-G----T--ACT-A-C------AAC---T-----AGTCTG-G--A-G-----ATAC-AA-AGCAAACCT-G-T-C-T--A-TCT---T----TACT-TTTAAAT-----------GAC-TA--C--T--T-Acgctctatcttttacttttaaatgactttctttatc
gi|5 : actgaagagttccaaattgatagtttgaatgtactacgtatcaactagtcttgaggtacagaacggtttacaaatttcagatagactgtttgaaatttacgtagtttcctatttgttaattttgaaatgctttgtga----G---AG-A-A---G-TTC------A--------AATT-GAT-AG-TCT--T-G----T--ACT-A-T------ACT----------ATCTT-A--AGG-----
gi|27 : cttcacaattttcaacttaggtatcctctaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagattccagaattgattagttgactactggattagtcttgaggtacagaaacgggtttcatatgttttcagatagactgtttttgatatttacgtagtttctagttgatcggtgtaggtcaatttttggtgtttttcattgaccgagttatttgaaagcctttgtgcaagtaacgtacatgcacttaaaatcgacagcagtaacacggtctgtaaa---AA-A-A---G-TTC-CA---T--------A-TT-GAT-AA-T-T--T-G----T--GCT-A-T---T-AACT---------AGTCTT-G--TGGT----ACA--GA-A------AT-G-T-C-T--A-AAA---A----TGTC-TTCAGA------------GAC-TG--G--T--T-AA--AA----ACATA-TTTT---------C-T-G--TT-T-----------G-TT-AA--TTC-T-GA---TT-TT---CA-TGA------T-T-----TTGA---A-A-A-GCTT--T---G-TGAT---AAGTTTAT-TAA-GT-----A-A-TTTA-A---A-A--GT-A---GAG-A-TGG-AC--A-TA-----TCtacagtttgagtggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggttagtagaagtatctagagggtgagaaatgaaggcgggcaaggaatgttcgagctttgaaatc
gi|17 : ctcaacgctgttcaA-G-A---G-TTC-CA---A--------T-TT-GAT-AG-T-T--T-G----T--ACT-A-T---G-AATT---T------GCCTT-G--AGGT----ACA--GA-C------CT-G-T-T-T--A-ACT---T----TACT-TTTAAAT-----------GAC-TG--T--c
gi|19 : acactaaagagttccaaattgatagtttgtactacatgtcaacgagtcttgaggtacagaactgtcaagaaacgtcttcatacagactggttgaaattcacgtagttttctacttcttcattttgattttcatgattttgaaatgctttgtgat---G-TTC-CA---A--------A-TT-GAT-AG-T-T--T-G----T--ACT-C-T---G-AA-C---T-----AGTCTT-G--AGG-----TCCA-GA-C------CT-G-T-C-T--A-TCT---T----TACT-TTTAAAT-----------GAC-T
gi|33 : cactgaagagttcccaattgatagtttgtaccatcaactagtcttgacatacagaacggttttcaaatgtctagagatggactatttgaaatttacatatgtttccatttgttatttgttttttcatgattttgaaatgctttgtgataggta---A--------GATT-GAT-AG-T-T--T-G----T--ACT-A-T---G-AAGT---------AATCTA-G--AGG------TAG-GA-A------C----------------------------------ATA------------C-TG--G--T--T-AA--AA-TTTACATA-ATTT-T-------C-T-A--TT-T-----------G-TT-GA--TTT-T-GA---TT-TT---CA-TGA-----TA-T-----T-GA---A-A-T-GCTT--T---G-TGAT----AA---GT-AAA-AT-----C-A-TTTA-A---A-A--GT-A---AAG-G-TAG-AC--A-GT-----TCTGT---ACCTTgt
gi|23 : c-T-T--T-G----T--AGT-A-T---C-AATT---T------GTCTG-G--AGG------TAC-GGCA------CT-G-C-T-G--A-AAA---T----TGCC-TTCAAAGA----------GAA-TG--G--T--T-AA--GA-TTTACATA-GTTT-T-------C-------T-T-----------G-TT--A--TCT-T-A----AT-TT---CA-TG------CT-T-----TTAA---A-A-T-GCTT--TGCGT-T-------AG---GT-AAA-AT-----C-A-TGTATA---A-A--GT-G---------------------------TTGT---ACTTCAA-GATAC---AG----A-G-A----TA-G-TA-------C-A-------A-----------------GCT-------------------A-------------------A-----------T--AT---GAA------A--tga
gi|18 : tgtT-G--AGGT----ACA--GA-A------CG-G-T-T-T--A-AGA---C----TTTT-TTAA-----------------------------------A-TTTACGTA-A-TT-A-------CAT-A--TT-T-----------G-TT-GA--TTT-T-G----TT-TTA--CA-TG------CT-T-----TTGA---G-A-T-TCTT--T---G-TAAT----AA---GT---A-GT-----C-A-TTTA-A---A-A--GT-A---AAG-A-TTG-AC--A-GG-----TCTGT---ATCTCAA-GAC-T---AGT---T-G-A----TA-G-T--------C-A-------A-----------------A---------------------A-------------------C-----------T--GTCGAtagattgttggaactcttcagtgttg
gi|29 : agaatcttcaaatattttagggatttcattgacatacatgaagaacaa-G--AGGT----ACA--GA-A------CT-G-T-C-C--A-AAA---A----TGTT-TTCAGACA----------GAT-TG--G--T--T-GA--AA-TTTGCGTG-----------------------------------------AA--TTT-T-GA---TT-TT---CA-TGA-----TT-T-----T-GA---A-A-T-GTTT--T---G-TGAT---AA----GT-AAA-GC-----C-A-TTTA-A---A-A--GT-A---AAG-A-TAG-AC--A-GG-----TCTGT---ACCTCAACTAC-T---AAT---T-C-A----TA-G-TA-------C-A-------A-----------------ACT-------------------A-------------------tttggaaatcttcagtgttgag
gi|21 : AC-GA-A------TGTG-TCT-T--A-AAG---TAAAATGTC-GTCAGACA----------GAC-TG--G--T--T-GA--TA-TTTATGTA-GTTT-T-------C-T-A--TT-T-----------G-TT-AA--TTT-T-GA---TT-TT---CA-TAA------T-T-----TTGA---A-A-T-GCTT--T---G-TGAT---AAA---G--AAA-AT-----C-A-TTTA-A---A-T--GT-A---AAG-A-TAG-AC--C-GG-----CCTGT---ACTTTAA-GAC-T---AAA---T-C-A----TA-G-TA-------C-A-------A-----------------ACTATCAATTTGGAACTCTTC-A-------------------G-----------T--GTCGAGAA------A--GCAC----AAAA----T-------GTAT-GTGAA-AATA----ACCttaatttggaaatcttcagtgt
gi|41 : t-T-A--TTCT-----------G-TT-AA--TTT-C-G----TT-TT----A-TGA-----TT-TCAAGCTTG----A-A-T-AC-T--T---C-TGAC---A--------AGA-GG-----C-A-TTGA-AATGA-A--AT-A---TAG-A-TAA-AT--A-GA-----
gi|38 : T-AA--TTT-TTG----TT-TTTTCCA-TGA-----TT-T-------GA---A-AAT-GCTT--T---G-TGAT----AA---GT-AAA-GTC----C-A-TTTG-A---A-A--GT-T---AAA-G-TAA-Ac
gi|42 : catttgaccaaatcttcgttaagttccaacccgttgcc----TT-TT---CA-CG------TT-T-----TTGA---A-A-T-GCTT--T---G-TGAT----AA---GTGAAA-GT-----C-A-TTT--A---A-A--GT-A---
gi|45 : atttaaaT-T-----TTGACGCATA-N-GTTT--T---G-TGAT---AA----GT-AAA-GT-----C-A-TTTA-A---A-A--GT-A---TAgaactacttgaagtagacc
gi|44 : -T-----TTGA---G-A-T-GCTT--T---G-TGT-----AA---GT-AAA-GT-----A-A-TTGA-A---A-A--GT-AACTTAG-A-TAG-AC--A-GG-----TCTGT---Atacctcaagact
gi|39 : TGA---A-A-T-GCTT--T---G-TGAT---AAA---G--AAA-GT-----C-A-TTTG-A---A-A--GT-A---AGG-A-TAT-AC--C-GA-----TTTGT---ACCTCAA-GAT-T---AAC---T-C-A----TA-A-AA-------C-A-------A-----------------ACT-------------------A-------------------
gi|22 : GAT---AAA---G--AAA-GT-----C-A-TTTA-A---A-A--GTAA---AAG-A-TAG-AG--C-GG-----TTTGT---ATCTCAA-GAA-TATGAAT---T-ACA----TA-G-TA-------C-A-------G-----------------ACT-------------------A-------------------tcaatttggaactcttcagt
gi|53 : caccttagatatcctactacatgtaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttctgaacactgaagagttccaaattgaTA-A---A-A--GT-A---AAG-A-TAA-AC--A-GG-----TCTGT---ACCTCAG-G
gi|3 : -TAA-AC--C-GT-----TCTGT---GCCTCAA-GAC-T---AAT---C-C-A----TA-G-TA-------C-A-------A-----------------ACT-------------------ATCA----------------A-----------T--TTTGGAAACTCTTCA--GCAC----TAAA----T-------GGAC-GTCAA-AATA----ACCAACTTGATAT-A------GG--GATTT----AACAC--C--AT-G-AAA-AGGTAAGAAATGCAAGTTT---CATTGTG--A--TAGG-G--GT--T----A--GTAG-GA-T-ACC-T--------A---A-GATA-AAAATC--TG-AA-ATTTTCTG-----AACA-AG--ATGTT--C-AGTTA--AA-GC-CA-T-TTA----AT-CG-CA--A--CAGG-CGGCGGAAG--GTGAGGCA-AACTTTCCCGAATAAGGT--TGTTACATTGGTCTGAG-ATTGGT-A-GA-G-C--GA-C-CA-G--TCCAAAATA-TTT-CGCTT--CT-ACC------AATCTCACT
gi|8 : -TAA-AC----GT-----TCTGT---GCCTCCA-GAC-T---AAT---C-C-A----TA-G-TA-------C-A-------A-----------------ACT-------------------A-------------------aaatgttttcagatagactgtttgatattttacgtagtttaactatttgttaattttgttttcatgattttgaaatgctttttgacaaagtaaagtcatttaataacagataaacagatctgtatcttaagactagttgatagtacaaactagtgttgagaaagcacaaaatggacgtgaaaataaccccttgatttaaattgagatttaacactagaaaaggtaagaaatgcaagttttattgtgatagggagtagtaggatatctaaggtgaaaatctgaagcgggcaagatgttcagtttaagtcattttaatacgcaaactaggccggtggaagttgggcacaactttccctaataaggttgtgttacattggtttgagattggtagagcatcagtccaataatttagcttctaaccaatctcactgagatta
gi|7 : ctaattcagtgagattggtagagcgaaattatttggactggtcagctcataccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttgcagaagagatttcagatttatcttaggtatcctacaactcccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgcatgaaagagttccaaattga-TAA-AC--C-GT-----TCTCT---ACCTCAA-GAC-T---ATT---TCC-A----TA-G-TA-------C-A-------A-----------------ACT-------------------A-------------------aaatgtttttcagatagactgatttgagtatttacgtagtttacttattttgttaattttgttttcatgattgaatgcttttgacagtaaagtcattaaaagtacagataaacagatctgtatcttaagactagtatgatagttacaaaact
gi|20 : taatctcagtgagatggtaaaggctaatatttggctggttcgcctttaccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncccgcttcaaattttcaccttagacatctactaatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaagagttccaaattga-TAA-AC--C-GT-----TCTGT---ACCTCAA-GAC-T---AGT---T-G-A----TACG-TAGTACATTC-A-------A-----------------ACT-------------------A-------------------aaatgttttcagagactgtttgaaatttacgtagttttctatttgttaatattgtttttcatgattttgaaatgcttttgtgacaagtaaagtcatttaaaagtaaagataaacaggtctgtacttaagactagttgatagtacaaactatcaatttggaactcttcagtgttg
gi|16 : actgaagagttccaaattga-TAG-AC--A-GT-----TCTGT---ACCTCAA-GAC-T---AGT---T-A-A----TA-G-TA-------C-A-------C-----------------ATT-------------------A-------------------caaatttcagatagactgtttgaaatttacgtagtttcctatttgttaattttgaaatgctttgtgataagtagtcatttaaaagtaaagatagacaggtttgctttgtatctccagactagttgtagtacacaactatcaatttggaacttcttc
gi|9 : acactgaagagttccaccaattga-TAG-AT--A-GT-----TCAGT---ACCTCAA-AAC-T---AGT---T-G-A----TA-G-TA-------C-A-------A-----------------caaatgttttcagacagactggttgaaatttatgcatttttctatttgttaattttgattttcatgattttgaaatgcttcgtgataaagaaagtcatttaaaagtaaaagatagagcggtttgtatctcaagaatatgaattacatagtacagactatcaatttggaactcttcagtg
gi|28 : taatctcaacgagatattcgtcgaggctggaacctcttccgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncccgcatcatattatcaccttagacatcatactaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttctcaacactgaagagttccaaatcgatagtttgcactatgatttagtcttgaggtacaaacctgactatctttacttttaaatgaatttgctttttaacaaagcattttgaaatgatgaaaatcaaaattaacacatagaaaactatgtaaaattcaaccagtctgtctaaagacattt-TAA-AC--C-GT-----TCTGT---ACCTCAA-GAC-T---AAT---T-G-C----TA-G-TA-------C-A-------A-----------------ACT-------------------A-------------------tatggaactcttcagtgtt
gi|27 : acgctgaagagtgccaatttga-TAG-AC--A-TT-----TCTGT---ACCACAA-GAC-T---AGT---T-A-A----TA-G-CA-------C-A-------A-----------------ATT-------------------A-------------------aaaatgtcttcagatagaatatttgaaatttacgtagttttctatttgttaattttgttattcgtgattttgagaagtaaagattgacaggtatgtacttcaagactagttaatagtacgg
gi|14 : ctcaacgctgttcaaaaagttccatattgaAA-AC--C-GT-----TCTGT---ATGTCAA-GAC-T---AGT---T-G-A----TG-G-TA-------C-A-------A-----------------ACT-------------------A-------------------aaaatgtcttcagagactggttaaaaacatattttctgtttgttaattctgattttcatgattttgaaaagctttgtgataagtttattaagtaatttaaaagtagagatggacatatcc
gi|19 : cactgaagattcccaattgaAA-AC--C-GT-----TCTGT---ATGTCAA-GAC-T---AGT---T-G-A----TG-G-TA-------C-A-------A-----------------ACT-------------------A-------------------tcaaatgtctagagatggactatttgaaatttacatatgtttccatttgttatttgttttttcatgattttgaaatgctttgtgataggtaaagtcatttaaaagtaaagatagacaggtctggacctcaagactagttcagagtacaaactatcaatttggaacgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagttagtatgatatctaaggtgaacattgaagcag
gi|12 : cactgaagagttcccaattgaAA-AC--C-GT-----TCTGT---ATGTCAA-GAC-T---AGT---T-G-A----TG-G-TA-------C-A-------A-----------------ACT-------------------A-------------------------------TCAATTGGGAA------A--tcaaatgtctagagatggactatttgaaatttacatatgtttccatttgttatttgttttttcatgattttgaaatgctttgtgataggtaagtcatttaaaagtaaagatagacaggtctggacctcaagactagttcagagtacaaactatcaatttggaacgt
gi|26 : cactgaagaAA-AC--C-GT-----TTTGT---ACCTCAA-GAC-T---GGT---T-G-A----TA-G-TA-------C-A-------A-----------------ACT-------------------A-------------------tcaaatgtctagagatggacctatttgaaatttacatatgtttccatttgttatttgttttttcatgattttgaaatgctttgtgataggtaaagtcatttaaaagtaaagatagacaggtctggacctcaagactagttcagagtacaaactatcaatttggaacgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagttagtatgatatctaaggtgaacattgaagcag
gi|11 : actgaagagttccaaattttgaAA-AC--C-G------TTTGT---ACCTCAA-GAC-T---GGT---T-G-A----TA-G-TA-------CAA-------A-----------------ACT-------------------A-------------------taaaatgtcttcagatatatgtagatagactattcgcaatttatgcatttttctatttgttaatttgttattcgtgattttgagatgttttgtgataagtaaagtcatttaaaagtaaagatagacaggtatgtacctca
gi|10 : aatctcaagtgagattatttggacctgcgcctcttcgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncccgcttcatatttcaccttggacatcctacaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttcaacactgaagagttccaaatttgaAA-AC--C-GT-----TTTGT---ACCTCAA--AC-T---GGT---T-G-A----TA-G-TA-------C-A-------AAACTATCAAAATTTGGAACTCTTC---------------A-------------------G-----------T--GTTGAAAA------N--NNNN----NNNN----N-------NNNN-NNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNN-NNNNN--NN--NNNNN----NNNNN--N--NN-N-NNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNN--N--NNNNNGA-GT--T----A--GTAG-GA-T-GTC-C--------A---AGG-TG--AAATA--TG-AA-G----CGG-----GN-N-NN--NNNNN--N-NNNNN--NN-NN-NN-N-NNN-NN-NN-NN-NN--N--NNNN-NNNNNNNNN--NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NTCGGA-A-GAGG-C--G----CAGG--TCC-AAAT-------------------------AATCTCACTGAGATTtaaaatgtcttcagatatatgtagatagactattcgcaatttatcattttctatttgttaatttgttattcgtgattttgagatgttttgtggataagtaagtcattttaaaagtaaagagtagacaggtatgtacctc
gi|17 : -AC--A-GT-----TCTGT---ACCTCAA-GAC-T---CGT---T-G-ACATGTA-G-TA-------C-A-------A-----------------ACT-------------------A-------------------taaaatgtcttcagatatatgtagatagactattcgcaatttatcattttctatttgttaatttgttattcgtgatttgagatgttttgtgataagtaaagtcatttaaaagtaaagattagacaggtatgtacctc
gi|24 : acactaaagagttccaaattga-AC--A-GT-----TCTGT---ACCTCTC-GAC-T---AGT---T-G-A----TG-G-TA-------C-A-------A-----------------ACT-------------------ATCAAATTTAGAACTCTTTGG-----------T--GTAGAGAA------G--GCACAATTAAAA----T-------ATAT-GTGAA-AATA----ACCcaagaaacgtcttcatacagactggttgaaattcacgtagttttctacttcttcattttgattttcatgattttgaaatgctttgtgatacagtcatttaaaagtaaagttaaacaggtctgtacctcaaggcaaattcatagtacaaactatcaaattggaactct
gi|40 : acattaattttttgtagccttatcacaaagctttacaaaatcctgaaaatcaaattcaacaaatagaaaactacatagaattcaccagtctgtctgaggacaattttggA-GAC-A---AAT---T-G-A----TA-G-TA-------C-A-------A-----------------ACT-------------------A-------------------A-----------T--tac
gi|31 : t-CTTGATTTCAAATT--GA--AATTT-----ACAC--T--AT-GTAAG-AGGTGAATAAAG-AAGTTTTGCTATTGTT--C--TAAG-GA--T--T----A--GGTG-GA-T-GTC-C--------A---AGG-TGAAAAATT--TGTAA-G----CGGGCT--GA-G-TG--GTG-T--C-AATTT--ACTAC-CA-A-TTATTA-AT-CG-CAGGA--CAAG-CGCCG--AGTTTTGAGACA-Aacgaagtagcctgttggaactttttagtgttgagaggcatatcaatattcacagcatgcagc
gi|13 : ATT--GGTGGATTT----AACACCGT--AT-G-TTT-AGGTAAGAAATGCAAGTTG---CATAGTG--A--TAGG-GA-GT--T----A--GTAG-GA-TCATC-CGATGTCTAA---A-G-TC-AAAAGC--TG-AA-G----
gi|25 : --AT-G-TGA-AGGTAAGAAATACAAGTTT---GATAATG--A--TAGG-GA-GT--T----A--ATAG-GT-T-GTC-T--------A---A-GATA-AAAATC--TC-AA-G----CAG-----Gcgcattccgccaaccatctcatcaacggcagttgggattcaataattaacgcatcgctgccagatttatttttatgctttctcaacactgaagagttccaactgtaagtaatttagttcgtacgattctttcaaacacactggttaaaatttaaatagatctagttttctttttgctaatttttattttcatgtttatggaatattgtgtggtaagtaaagttatgtaatagtagacagttccgtacctttagacaaat
gi|43 : atctcagcgagattcgtcgaggctggacctgttccgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--AT-G-TAT-AGGTAAGAAACGCAAGTTT---CATAGTG--ATTTAGA-GA-GT--T----A--GAAG-TA-T-
gi|50 : tcTTGTG--A--TATG-GA-GT--T----A--GTAG-GA-T-GCCTT--------A---G-G-TG-AAAATC--TG-AA-G----CGG-----tacggt
gi|8 : GG-GA-GT--T-------GTAG-GA-T-ACC-T--------A---A-GAT---AAATC--TG-AA-
gi|15 : ctaattcagtgagattggtagagcgaaattatttggactggtcagctcataccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttgcagaagagatG-GG-GT--T----A--GTGG-GA-T-GTC-T--------A---ATG-TG-AAAATA--TG-AA-G----CGG-----gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgcatgaaagagttccaaattgatagtttgtactatggattagtctggaggcacagaacgtttaaaatgtttttcagatagactgatttgagtatttacgtagtttacttattttgttaattttgttttcatgattgaatgcttttgacagtaaagtcattaaaagtacagataaacagatctgtatcttaagactagtatgatagttacaaaact
gi|6 : -GA-GT--T----A--GTAG-GA-T-GTC-T--------A---A-GGTG-AAAATT--TG-AA-G----CGG-----GC-GTAT--AT-TT--C-AGTTT---T-GT-CATT-TTT-TA-AT-CATCA--A--CAGG-CGGannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactttctaacactggagagttccccgaatgattgggacgaactgcctaaaaacgccgacagacagactggctaacatgattttgacttcttttttttatgaaatgctttgtgataattaaagttattgaaaagtaagcctagaa
gi|4 : -GA-GT--T----A--GTA---A-T-GTC-T--------A---AGG-TG--AAATT--TG-AA-G----Cnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaagagttccaattatagttgttttactattggaattagtctttgaggtacagaacggtttttaaaaatgttcttcagatagactgttttgaaatttacgtagtttctattgttaatttgtttttcatgatttttgaaatgctttgtgacaagtaaagtcgatttaaaagtaaagataaaaggtctttaccttaagactagttgatagtacaaactatcaattgtggaactcttcagtgttgggaaagcacaaaatcttatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggacgttattaagtaggtttctaaggtgaaaatgaagcgg
gi|14 : a-GA-GT--T----A--GTAT-GA-T-ATC-T--------A---AGG-TG-AACAT---TG-AA-G----CAG-----nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagagttccaaatttgataggttttactcatggaatagtcttgaggtaagagaacggttttaaaaatgttttcagatagactgttgaaatttacgtagttctatttgttaatatgttacatgaattttgaaaggcctaatgttgactaagtaaagtatttaaaagtaaagataatacaggtctgtaccttaagactagtttgtagtagcaaactatcaattttggaactcttcagtgttagaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagttgtaggatgtctaggtgaaaatttgaagcggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtattaacaggcacccagtccaaaatttagccttaccatccactgagatt
gi|12 : cactgaagattcccaattgatagtttgtaccatcaactagtcttgacatacagaacggttttcaaatgtctagagatggactatttgaaatttacatatgtttccatttgttatttgttttttcatgattttgaaatgctttgtgataggtaaagtcatttaaaagtaaagatagacaggtctggacctcaagactagttcagagtacaaactatcaatttggaacgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-GA-GT--T----A--GTAT-GA-T-ATC-T--------A---AGG-TG-AACAT---TG-AA-G----CAG-----
gi|9 : cactgaagatttcccaattgatagtttgtaccatcaactagtcttgacatacagaacggttttcaaatgtctagagatggacctatttgaaatttacatatgtttccatttgttatttgttttttcatgattttgaaatgctttgtgataggtaaagtcatttaaaagtaaagatagacaggtctggacctcaagactagttcagagtacaaactatcaatttggaacgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-GA-GT--T----A--GTAT-GA-T-GTC-T--------A---AGG-TG-ATAATA--TG-AT-G----CGG-----G
gi|11 : taatctcaacgagatattcgtcgaggctggaacctcttccgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-GA-GT--T-------GTAG-GA-T-GTC-C--------A---A-GGTG-AAA-TA--TG-AA-G----CGG-----Gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttctcaacactgaagagttccaaatcgatagtttgcactatgatttagtcttgaggtacaaacctgactatctttacttttaaatgaatttgctttttaacaaagcattttgaaatgatgaaaatcaaaattaacacatagaaaactatgtaaaattcaaccagtctgtctaaagacattttagatagttcagtacctcaaaactagttgatagtacaatatggaactcttcagtgtt
gi|34 : aatctcaagtgagattatttggacctgcgcctcttcgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-GA-GT--TT---ATTGTAG-GA-T-GTC-T--------A---A-GGTG-AAAATT--TG-AA-G----CGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttcaacactgaagagttccaaatttgatagttttgtactatcaaccagtcttgaggtacaaacggttttaaaatgtcttcagatatatgtagatagactattcgcaatttatcattttctatttgttaatttgttattcgtgattttgagatgttttgtggataagtaagtcattttaaaagtaaagagtagacaggtatgtacctc
gi|35 : aactctacagtgttgagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-GA-GT--T----A--GTAGTGA-T-ATC----------A---A-G-GG-AAAATCA-TG-AAGG----CGG-----G
gi|30 : gttgagaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnA-GT--T----A--GTAG-AA-T-GTC-T--------A---A-GGTG-AAAAAT--TG-AA-G----CGG-----GC-A-AG--A--------AATT----N-NN-NN-N-NNN-NN-NN-NN-NN--N--NNNN-NNNNNNNNN--NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-ATCGGG-A-AA-G-G--CA-C-CA-G--TCC-A---A-TTT-TGACG--CT-AGCGAGGATAATCTCACTGAGATTA
gi|51 : A-GT--T----A--GTAG-GA-T-GTC-C--------G---A-GGTG-AAAAGT--TG-AA-G----CGG-----GC-A-AG--A
gi|5 : -GT--T----A--GTAG-AAGT-ATC-T--------AGAGG-G-TG-AGAA-A--TG-AAGG----CGG-----GC-A-AGGAATGTT--CGAGCTTTGAA-AT-C
gi|32 : cttcacaattttcaacttaggtatcctctaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagattccagaattgattagttgactactggattagtcttgaggtacagaaacgggtttcatatgttttcagatagactgtttttgatatttacgtagtttctagttgatcggtgtaggtcaatttttggtgtttttcattgaccgagttatttgaaagcctttgtgcaagtaacgtacatgcacttaaaatcgacagcagtaacacggtctgtaaaccttaagatagtatagtacaagactatcaatttgaacttctctacagtttgagtggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnag-GT--T----A--GTAG-GA-C-GTC-T--------A---ATG-TG-AAAATT--TA-AA-G----CG---------A-AG--A--CN--N-NNNNN--NN-NN-NN-N-NNN-NN-NN-NN-NN--N--NNNN-NNNNNNNNN--NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNGGTAA-AA-G-C--GA-C-CA-GGTCCC-AAATA-TTT-AGCCT--TT-A
gi|7 : T--T----A--GTAG--A-T-GTC-T--------A---A-GGTG-AAAATT--TG-AA-G----CGG-----GN-N-NN--NNNNN--N-NNNNN--NN-NN-NN-N-NNN-NN-NN-NN-NN--N--NNNN-NNNNNNNNN--NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-N--GGT-A-AA-GGC--GAAC-CA-G---CC-AAATA-TT--AGCCT--TT-ACC------A-TCTCACTGAGATTA
gi|49 : --T----A--GTAG-GA-T-ATC-T--------A---AGG-TG-ACCATT--TG-AA-G----CAG-----GC-A-AG--AAATG--C-AGTtcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaagagttccaaattgatagtttgtactatggaaatagtcttgaggtagagaacggtttaaaatgttttcagagactgtttgaaatttacgtagttttctatttgttaatattgtttttcatgattttgaaatgcttttgtgacaagtaaagtcatttaaaagtaaagataaacaggtctgtacttaagactagttgatagtacaaactatcaatttggaactcttcagtgttg
gi|1 : aaATTTTCTCCAATAC--TTG----ACATTGTTCTGAG-ATTGGT-A-GA-G-TTGGA-T-CA----TCC-AAATA--TT-AGCTT---T-A-C------AATCTCAC
gi|8 : TGGT-ATGA-G-CT-GA-C-CA-G--TCC-AAATAATTT-CGCT---CT-ACC------AATCTCACTGA-ATTAgaataattactgtgggtagttgagatctaaaatgcctctatattgacaaattggcccaggaccttttttaattttctaaattgggtatatttaattttcagaatatcaaagttagagagtgttttcaattaattttataaggttgtttatcaataaaaatttaaatttaagtttggttattatgacgtatattaattgttatgtgaatagttcacacccaacttcataggttatctgctatatcggattatttttgtaagataataacacgacaggttatcaaatgatgtttagatagaatgttgattaatttagtatttctaaatttgattaagctttatgtattatataatatttgaaattgatttagtgatgcaaaaatatatgtccattaaatagtaccgaataaaccaggatctgtcaaatttaaactagtatagaacagtcgataaactatcaatattggagcttcttacaattgttgagaaaaagtgccaaacaactggaccgtgaacaatataatgcaaaatgatttaaactcggagatttgaaaaacacttaatagagagaggtaagaatgcaagttttatgtggtataggcgagtacgaatagaaataaaagagtcaatttgtgaagcggtgggtaaatagtatgtttatagtttaaggacatattgtacatgaacagggagagcgagtggggaaatatcagataaggttgcgcta
gi|46 : c--GA-TGCA-G--TCC-AAAT--TTT-AGCTT--CT-ACC------A-TCTCACTGAGATTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttgcagaagagatttcagatttatcttaggtatcctacaactcccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgcatgaaagagttccaaattgatagtttgtactatggattagtctggaggcacagaacgtttaaaatgtttttcagatagactgatttgagtatttacgtagtttacttattttgttaattttgttttcatgattgaatgcttttgacagtaaagtcattaaaagtacagataaacagatctgtatcttaagactagtatgatagttacaaaact
gi|48 : agactttgttggct--GA-TGCA-G--ATC-AAATA-TTTTAGCTTATCT-ACC------AATCTCACTGAGATTA
gi|52 : ggact--GA-T-AA-G--ACC-AAATA-TCT-AGCCT--CT-GTC------AATCTTGCTGAGAT
3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|36 ): GGTACAGAAAACTAAATTTTTCAGCATTTTAGAATGACAATTACTGAACACAAGTCATTTTAAAAGCACGAAAAAAGGAAACTAGATGTAAATTTTAACCAGTCTGTTTGAAGACATCTTTAAATAGTTC
Unaligned ( gi|37 ): TTCTCAATACTGACTAATTTCATCGTAATTGTACTATCATTTACGGAGGTACATAACTGTCTAAAGATGCCTTCAGACTGGTTACATGTAAGTTTACATATTTTCTTTTTTA
Unaligned ( gi|47 ): TTCTCGATGTACAGAGATGTCTAGAAATGTCTACAGACAGACTGGTTGAAATTTA
Alignments
lowQualScore : 1 1 11 111 3333333 11 111111111 1111 111111111 2222222222222222 11111111111 11111111111 1111 111111 111111111 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 2222222222222 11111 1111 111 22222 22222222222222 111111
lowQualScore : 0 0 5 0 8 8 0 8 99 8 8 4 4 1 4 4 1 77 6 111 0 99 777 777 6 3 7777777 33 3 333333333 0 44 2222 44 1 44 0 2 44 1 1 44 3 444444444 444444 4 3 1111 77777 4 1 4444 4444 4444 1 333 22222 11 44 1 66 44444444 1 1 22 2 3333 1 22 4444444444444444 1 1 1 11 11 2222 1 0 33333 3 0 1 22 33 6666666 1 4444444444 22222222222 1 555 1 1 4444 1 4444444 11 3 1 33 00000000000 1 44444 44 11 1 1 3333 1 5 333 2 222222 44444 2 222 1 2 1 11 1 2 333333333 1 1 44444 1 1 1 1 1 2 333 1 2 22 1 1 44444 33 1 1 555 1 66 1 1 5555555 1 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 55 1111111111111 4 8 9999 0 4 66 11111 777777 1 4 3 0 1111 55 333 2 33 7777 33 2 2 33333 2 33 333 2 444 5555 3 11111111111111 99999 4 6666 5 66 1 99999 5 2 55 999 1 1 5 333 1 0 2 6 88 6 88 66 33 4 55 4 222222
lowQualScore : . . . . . . . . .. . . . . . . . . .. . ... . .. ... ... . . ....... .. . ......... . .. .... .. . .. . . .. . . .. . ......... ...... . . .... ..... . . .... .... .... . ... ..... .. .. . .. ........ . . .. . .... . .. ................ . . . .. .. .... . . ..... . . . .. .. ....... . .......... ........... . ... . . .... . ....... .. . . .. ........... . ..... .. .. . . .... . . ... . ...... ..... . ... . . . .. . . ......... . . ..... . . . . . . ... . . .. . . ..... .. . . ... . .. . . ....... . ............................................................... .. ............. . . .... . . .. ..... ...... . . . . .... .. ... . .. .... .. . . ..... . .. ... . ... .... . .............. ..... . .... . .. . ..... . . .. ... . . . ... . . . . .. . .. .. .. . .. . ......
lowQualScore : 8 0 4 6 0 0 8 0 00 0 0 8 4 0 8 4 0 22 7 777 5 22 222 222 7 2 9999999 22 3 999999999 5 22 9999 66 2 66 9 2 66 2 0 66 6 555555555 111111 0 3 5555 44444 5 7 0000 7777 6666 1 111 99999 55 22 1 44 00000000 1 1 55 1 7777 1 55 3333333333333333 1 0 0 33 33 1111 0 9 33333 1 9 0 33 33 7777777 0 5555555555 88888888888 1 777 2 3 1111 3 2222222 88 0 3 22 55555555555 4 77777 55 88 3 3 1111 3 2 555 6 666666 22222 9 111 2 4 2 77 2 4 333333333 2 2 11111 2 2 1 1 1 3 111 2 4 99 2 2 44444 44 5 5 666 7 88 7 7 4444444 7 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 55 0000000000000 4 9 4444 2 4 11 44444 999999 0 0 5 5 4444 00 888 5 22 4444 22 4 4 33333 4 22 888 4 111 3333 6 11111111111111 22222 4 1111 0 88 8 88888 0 6 88 000 8 8 0 777 0 9 7 7 55 7 33 11 99 0 55 0 888888
consensus : CTCAGTGAGATTGGTAGAGGCGAAAT-ATTT-GGACTGGT-C--GC-TC-TACCAATCTCAGACCAATGTAACAACCTTATTCGGGAAAGTTTGCCTCAACTTCCGCCGCCTGTTG-CGAT-TAAAA--TGGCT-TAAACTGA-ACATCT-TGTC-CAGAAA----TTCA-GATTTTC-ACCTTAGACATC--------CTACTAA--CTCCC----TA--TCACNAT--GAAACTTGCATTTC--TTACCTNTNCAT--GGT-GTT---------AAATCCCNATATCAAGTT-GGTTATTTTGAC-GTNCNTT---C-AACGC----T----G----AA-GA---GTT-----CC--A--AA-TT--GA--------T-AGT-T--T-G----TACT-A--T---G--A--ACT---TA-GT-CTT-G--AGG--T----AC-A-GAA-----CNG-T-TT--A--AAA---N--TGTC-TTC----------AGATA----------GAC-TG--NTT-G-A--A-ATTT-A-------CGT--AGTTTT-CT--ATTT-----------G-TT-----AA--T--TT-T-G----T-T-TT---CA-TGA-----TT-----TTTGA---A-A-TGC-TT--T-GT-GAT---AAA---GT-A-AAGT-----C-A-TTTA-AA-AG-T-AA---AG-A-TAG--A-CA-GG-----TCTGT--ACCTCAA-GAC-T---AGT-TG-ATAG-TA-C-------A-A-----------------ACT-------------------A--------G--------------TGTTGAG--AAAGCACAAAA----T--------GGA-CGTGAA-AATA----ACCACTTGATTT-AAATT--GAGATTT----AACACT--AT--GNAA-AGGTAAGAAATGCAAGTTT---TATTGTG--ATAGG---GA-GT--T----A--GTAGGA-TGTC-TAA---G-TG-AA--AATT--TG-AAGC---GG----GC-AAG----ATGT-T--C-AGTTT--A--AGT-CAT-TTNTA-AT-CGCA--A--CAGG-CGGCGGAAG--TTGGGGCA-AACTTTCCCTAATAAGGTTGCGTTACATTGGTTTGAG-ATCGGN-AGA-GCGACCAG--TCCAAATATTT-AGCCT--CT-ACC------AATCTCACTGAGATTA
Reference ( family-297 ) : CTCAGTGAGATTGGTAGAGGCTAAAT-ATTT-GGACTGGT-C--GC-TC-TACCAATCTCAGACCAATGTAACAACCTTATTNGGGAAAGTTTGCCTCAACTNCCGCCGCCTGTTG-CGAT-TAAAA--TGGCT-TAAACTGA-ACATCT-TGCC-CAGNAA----TTCA-GATTTTC-ACCTTAGACATC--------CTACTAA--CTCCC----TA--TCACAAT--GAAACTTGCATTTC--TTACCTTTNCAT--GGT-GTT---------AAATCTCNANATCAAGTT-GGTTATTTTGAC-GCNCNTT---T-AGCGC----T----G----AA-GA---GTT-----CC--A--AA-TT--GA--------T-AGT-T--T-G----TACT-A--T---G--A--ANT---TA-GT-CTT-G--AGG--T----AC-A-GAA-----CNG-T-TT--A--AAA---T--TGTT-TTC----------AGATA----------GAC-TG--TTT-G-A--N-ATTT-A-------CGT--AGTTTT-CT--ATTT-----------G-TT-----AA--T--TT-T-G----T-T-TT---CA-TGA-----TT-----TTTGA---A-A-TGC-TT--T-GT-GAT---AAA---GT-A-AAGT-----C-A-TTTA-AA-AG-T-AA---AG-A-TAG--A-CA-GG-----TCTGT--ACCTCAA-GAC-T---AGT-TG-ATAG-TA-C-------A-A-----------------ACT-------------------A--------G--------------TGTTGAG--AAAGCACAAAA----T--------GGA-CGTGAA-AATA----ACCACTTGATTT-AAATT--GAGATTT----AACACT--AT--GNAA-AGGTAAGAAATGCAAGTTT---CATTGTG--ATAGG---GA-GT--T----A--GTAGGA-TGTC-TAA---G-TG-AA--AATT--TG-AAGC---GG----GC-AAG----ATGT-T--C-AGTTT--A--AGT-CAT-TTNTA-AT-CGCA--A--CAGG-CGGCGGAAG--TTGGGGCA-AACTTTCCCNAATAAGGTTGCGTTACATTGGTCTGAG-ATTGGT-AGA-GCGACCAG--TCCAAATATTT-AGCCT--CT-ACC------AATCTCACTGAGATTA
gi|1 : GTGAGATTG-TAAAG-CTAA-T-ATTT-GGA-TGAT-CCAAC-TC-TACCAATCTCAGAACAATGT--CAAG--TATTGGAGAAAAT--GAAT-AATTACTGTGGGTAGTTG-AGATCTAAAA--TGCCTCTATATTGACAAAT-T-GGCC-CAGGACCTTTTTTA--ATTTTCTAAATTGGGTATA--------TT--TAA--TTTTCAGAATA--TCAAAGTTAGAGAGT-GT-TTTCAATTAATTTTATAA--GGTTGTTTATCAATAAAAATTTAAAT-TTAAGTTTGGTTATTATGAC-GTATATT---A-ATTGTTATGT----G----AA-TA---GTTCACACCC--A--AC-TT--CA--------T-AGG-T--T-ATC--TGCT-A--TATCG--G--A-T---TA-TT-TTT-GTAAGA--TAATAAC-A-CGA-----CAG-G-TT--ATCAAA---TGATGTT-T------------AGATA----------GAA-TG---TT-G-ATTA-ATTT-A--------GT--A--TTT-CTAAATTT-----------GATT-----AAGCT--TTAT-G----TAT-TA---TA-TAA-----TA-----TTTGA---A-ATTGA-TT--TAGT-GATGCAAAA---AT-ATATGT-----C-C-ATTA-AATAG-T-AC---CGAA-TAA--ACCA-GGA----TCTGTCAAATTTAA--AC-T---AGT----ATAG-AA-CAGTCGATA-A-----------------ACT-------------------ATCAATATTGGAGCTTCTTACAATTGTTGAGAAAAAGTGCCAAACAACT--------GGACCGTGAACAATATAATGCAAAATGATTT-AAACTCGGAGATTTGAAAAACACTTAATAGAGAG-AGGTAAG-AATGCAAGTTT---TA-TGTGGTATAGGC--GA-GTACG----A--ATAGAA----A-TAA---A-AG-AGTCAATTTGTG-AAGCGGTGG----GT-AAATAGTATGT-TTAT-AGTTT--A--AGGACATATTGTACAT--G-A--A--CAGG-GAGAGCGAG---TGGGG-A-AA---TATCAGATAAGGTTGCGCTA
gi|10 : T-G-AAGA-----C-A-TTT--------T-AA---A---------A-CC-GT-----TTTGT--ACCTCAA--AC-T---GGT-TG-ATAG-TA-C-------A-AAACTATCAAAATTTGGAACTCTTC---------------A--------G--------------TGTTGAA--AANNNNNNNNN----N--------NNN-NNNNNN-NNNN----NNNNNNNNNNNN-NNNNN--NNNNNNN----NNNNNN--NN--NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNN--NNNNNNN-GA-GT--T----A--GTAGGA-TGTC-CAAG--G-TG--A--AATA--TG-AAGC---GG----GN-NNN----NNNN-N--N-NNNNN--N--NNN-NNN-NNNNN-NN-NNNN--N--NNNN-NNNNNNNNN--NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NTCGGA-AGAGGCG-CAGG--TCCAAAT------------------------AATCTCACTGAGATT
gi|10 : TT---C-AACAC----T----G----AA-GA---GTT-----CC--A--AA-TTTTGA--------T-AGT-T--TTG----TACT-A--T---C--A--ACC----A-GT--TT-G--AGG--T----AC-A-AAA-----CGG-T-TT--T--AAA---A--TGTC-TTCAGATATATGTAGATA----------GAC-TA--TTC-G-C--A-ATTT-A---------T--CATTTT-CT--ATTT-----------G-TT-----AA-----TT-T-G----T-TATT---CG-TGA------------TTTGA---G-A-TGT-TT--T-GT-GAT----AA---GT-A-AAGT-----C-A-TTTA-AA-AG-T-AA---AG-ATTAG--A-CA-GG-----TATGT--ACCTCgatatatgtagatagactattcgcaatttatcattttctatttgttaatttgttattcgtgatttgagatgttttgtgataagtaaagtcatttaaaagtaaagattagacaggtatgtacctc
gi|11 : aatctcagtgagattatttggacctgcgcctcttccgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncccgcttcatatttcaccttggacatcctactaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttG-----TTTGT--ACCTCAA-GAC-T---GGT-TG-ATAG-TA-C-------A-AAACTATCAAATTTGGA-ACTCTTC---------------A--------G--------------TGTTGAA--AANNNNNNNNN----N--------NNN-NNNNNN-NNNN----NNNNNNNNNNNN-NNNNN--NNNNNNN----NNNNNN--NN--NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNN--NNNNNNNNGA-GT--T-------GTAGGA-TGTC-CAAG--G-TG--A--AATA--TG-AAGC---GG----G
gi|11 : aatctcaagtgagattatttggacctgcgcctcttcgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTT---C-AACAC----T----G----AA-GA---GTT-----CC--A--AA-TTT-GA--------T-AGT-T--TTG----TACT-A--T---C--A--ACC----A-GT-CTT-G--AGG--T----AC-A--AA-----CGG-T-TT--T--AAA---A--TGTC-TTC----------AGATATATGTAGATAGAC-TA--TTC-G-C--A-ATTT-A---------T--CATTTT-CT--ATTT-----------G-TT-----AA-----TT-T-G----T-TATT---CG-TGA------T-----TTTGA---G-A-TGT-TT--T-GTGGAT----AA---GT---AAGT-----C-ATTTTA-AA-AG-T-AA---AG-AGTAG--A-CA-GG-----TATGT--ACCTCggttttaaaatgtcttcagatatatgtagatagactattcgcaatttatcattttctatttgttaatttgttattcgtgattttgagatgttttgtggataagtaagtcattttaaaagtaaagagtagacaggtatgtacctc
gi|12 : aatctcaagtgagattatttggacctgcgcctcttcgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncccgcttcatatttcaccttggacatcctacaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttCAC----T----G----AA-GA---TTT-----CC--C--AA-TT--GA--------T-AGT-T--T-G----TACC-A--T---C--A--ACT----A-GT-CTT-G--ACA--T----AC-A-GAA-----CGG-T-TT--T--CAA---A--TGTC-TAG----------AGATG----------GACCTA--TTT-G-A--A-ATTT-A-------CAT--ATGTTT-CC--ATTT-----------G-TT-----AT--T--TG-T-T----T-T-TT---CA-TGA-----TT-----TT-GA---A-A-TGC-TT--T-GT-GAT---AG----GT-A-AAGT-----C-A-TTTA-AA-AG-T-AA---AG-A-TAG--A-CA-GG-----TCTGG--ACCTCAA-GAC-T---AGT-TC-AGAG-TA-C-------A-A-----------------ACT-------------------A--------
gi|12 : ----TTCA--ATGTTC-ACCTTAGATATC--------ATACTAA--CTCNN----NN--NNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNN--NNN-NNN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-NNNNNNN---N-NNNNN----NNNNNG----AA-AC---GTT-----CC--A--AA-TT--GA--------T-AGT-T--T-G----TACT-C--T---G--A--AC----TA-GT-CTT-G--AGG--T----CC-A-GAC-----CTG-T-CT--A--TCT---T--TACT-TTT----------AAAT-----------GAC-Ttcaatttggaacgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagttagtatgatatctaaggtgaacattgaagcag
gi|13 : cactgaagatttcccaattgatagtttgtaccatcaactagtcttgacatacagaacggttttcaaatgtctagagatggacctatttgaaatttacatatgtttccatttgttatttgttttttcatgattttgaaatgctttgtgataggtaa----TTCA-GCTTTTG-ACTTTAGACATCGGATGATCCTACTAA--CTCCC----TA--TCACTAT--GCAACTTGCATTTC--TTACCTAAACATACGGT-GTT---------AAATCgcag
gi|13 : cTTATTTTTAT-GCTTTCT---C-AACAC----T----G----AA-GA---GTT-----CC--A--A----------------------C--T-G----TA---A--G---T--A--ATT---TA-GT-TC-------G--T----AC-G------------------------A---T--T-CT-TTC----------AAACA----------CAC-TG--GTT-A-A--A-ATTT-AAATAGATC-T--AGTTTT-CT--TTTT-----------G-CT-----AAT-T--TT-T-A----T-T-TT---CA-TG------TT-----TATGG---A-A-TAT-TG--T-GT-GGT----AA---GT-A-AAGT-----T-A-TGTA-AT-AG-------------TAG--A-CA-GT-----TCCGT--ACCTTTA-GAC-caccaatcgcattccgccaaccatctcatcaacggcagttgggattcaataattaacgcatcgctgccagatttatttttatgctttctcaacactgaagagttccaactgtaagtaatttagttcgtacgattctttcaaacacactggttaaaatttaaatagatctagttttctttttgctaatttttattttcatgtttatggaatattgtgtggtaagtaaagttatgtaatagtagacagttccgtacctttagacaaat
gi|14 : cttcagcttttgactttagacatcggatgatcctactaactccctatcactatgcaacttgcatttcttacctaaacatacggtgttaaatccaccaatcgcattccgccaaccatctcatcaacggcagttgggattcaataattaacgcatcgctgccagatCAC----T----G----AA-GA----TT-----CC--C--AA-TT--GA--------T-AGT-T--T-G----TACC-A--T---C--A--ACT----A-GT-CTT-G--ACA--T----AC-A-GAA-----CGG-T-TT--T--CAA---A--TGTC-TAG----------AGATG----------GAC-TA--TTT-G-A--A-ATTT-A-------CAT--ATGTTT-CC--ATTT-----------G-TT-----AT--T--TG-T-T----T-T-TT---CA-TGA------T-----TTTGA---A-A-TGC-TT--T-GT-GAT----AG---GT-A-AAGT-----C-A-TTTA-AA-AG-T-AA---AG-A-TAG--A-CA-GG-----TCTGG--ACCTCAA-GAC-T---AGT-TC-AGAG-TA-C-------A-A-----------------ACT-------------------A--------aaat
gi|14 : ----TTCA--ATGTTC-ACCTTAGATATC--------ATACTAA--CTCNN----NN--NNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNN--NNN-NNN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-NNNNNNN---N-NNNNN----N----N----NN-GAAACGTT-----CC--A--AA-TT--GA--------T-AGT-T--T-G----TACT-C--T---G--A--AC----TA-GT-CTT-G--AGG--T----CC-A-GAC-----CTG-T-CT--A--TCT---T--TACT-TTT----------AAAT-----------GAC-Ttcaatttggaacgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagttagtatgatatctaaggtgaacattgaagcag
gi|15 : cactgaagattcccaattgatagtttgtaccatcaactagtcttgacatacagaacggttttcaaatgtctagagatggactatttgaaatttacatatgtttccatttgttatttgttttttcatgattttgaaatgctttgtgataggtaaG---GG-GT--T----A--GTGGGA-TGTC-TAAT--G-TG-AA--AATA--TG-AAGC---GG----gcag
gi|15 : -GAA-----CTG-C-CT--A--AAA---A--CGCC-GAC----------AGACA----------GAC-TG--GCT-A-A--C-AT-----------------G---------ATTT--------------T-----GA--C--TT-C-T----T-T-TT--------------TT-----TATGA---A-A-TGC-TT--T-GT-GAT----AA---TT-A-AAGT-----T-A-TTGA-AA-AG-T-AA---GC-C-TAG--A-annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactttctaacactggagagttccccgaatgattgggacgaactgcctaaaaacgccgacagacagactggctaacatgattttgacttcttttttttatgaaatgctttgtgataattaaagttattgaaaagtaagcctagaa
gi|16 : ccgcttcatattttcacattagacatcccactaaccccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactttctaacactggagagttccccgaatgattgggacCAC----T----G----AA-GA---GTT-----CC--ACCAA-TT--GA--------T-AAT-G--T-G----TACT-A--T---T--A--ACT----A-GT-CTT-G--AGG--T----AC-A-GAA-----CTG-T-CT--A--CAA---A--TGTT-TTC----------AGACA----------GAC-TG--GTT-G-A--A-ATTT-A-------TGC--ATTTTT-CT--ATTT-----------G-TT-----AA--T--TT-T-GA---T-T-TT---CA-TGA------T-----TTTGA---A-A-TGC-TT--C-GT-GAT---AAA---G--A-AAGT-----C-A-TTTA-AA-AG-TAAA---AG-A-TAG--A-GC-GG-----TTTGT--ATCTCAA-GAA-TATGAAT-TACATAG-TA-C-------A-G-----------------ACT-------------------A--------a
gi|16 : aCAC----T----G----AA-GA---GTT-----CC--A--AA-TT--GA--------T-AGT-C--T-G----TACT-A--T---GT-A--ATTCA-TA-TT-CTT-G--AGA--T----AC-A--AA-----CCG-C-Ttcaatttggaactcttcagtg
gi|17 : acactgaagagttccaccaattgataatgtgtactattaactagtcttgaggtacagaactgtctacaaatgttttcagacagactggttgaaatttatgcatttttctatttgttaattttgattttcatgattttgaaatgcttcgtgataaagaaagtcatttaaaagtaaaagatagCAC----T----A----AA-GA---GTT-----CC--A--AA-TT--GA--------T-AGT-T--T-G----TACT-ACAT---GTCA--ACG----A-GT-CTT-G--AGG--T----AC-A-GAA-----CTG-T-CA--A--GAA---A--CGTC-TTC----------ATACA----------GAC-TG--GTT-G-A--A-ATTC-A-------CGT--AGTTTT-CT--ACTT-----------C-TT-----CA--T--TT-T-GA---T-T-TT---CA-TGA------T-----TTTGA---A-A-TGC-TT--T-GT-GA-----------T-A-CAGT-----C-A-TTTA-AA-AG-T-AA---AG-T-TAA--A-CA-GG-----TCTGT--ACCTCAA-GGC-A---AAT-TC-ATAG-TA-C-------A-A-----------------ACT-------------------A--------
gi|17 : aA-GA---GTT-----CC--A--AT-TT--GA--------T-AGT-T--T-G----TACT-A--T---G--A--ATT---T--GC-CTT-G--AGG--T----AC-A-GAC-----CTG-T-TT--A--ACT---T--TACT-TTT----------AAAT-----------GAC-TG--Ttcaaattggaactct
gi|18 : acactaaagagttccaaattgatagtttgtactacatgtcaacgagtcttgaggtacagaactgtcaagaaacgtcttcatacagactggttgaaattcacgtagttttctacttcttcattttgattttcatgattttgaaatgctttgtgatT-G--AGG--T----AC-A-GAA-----CGG-T-TT--A--A-----------------------------------------GAC-TT--TTT-T-A--A-ATTT-A-------CGT--AATTAC-AT--ATTT-----------G-TT-----GA--T--TT-T-G----T-T-TTA--CA-TG------CT-----TTTGA---G-A-TTC-TT--T-GT-AAT---AA----GT-A---GT-----C-A-TTTA-AA-AG-T-AA---AG-A-TTG--A-CA-GG-----TCTGT--ATCTCAA-GAC-T---AGT-TG-ATAG-T--C-------A-A-----------------A---------------------A--------C--------------TGTCGA
gi|18 : agaatcttcaaatattttagggatttcattgacatacatgaagaacaaT---C-AACAC----T----G----AA-GA---TTT-----CC--A--AA-TC--GA--------C-AGT-T--T-T----GACT-A--T---C--A--AC----TA-GT-CTT-G--AGA--T----AC-A-GAC-----CTG-T-C-------AATCTT--TACT-TTT----------AAAT-----------GAC-TA--CTT-tttggaaatcttcagtgttgag
gi|19 : agaatcttcaaatattttagggatttcattgacatacatgaagaacaatgaggtacagaacggtttaagacttttttaaatttacgtaattacatatttgttgattttgttttacatgcttttgagattctttgtaatCAC----T----G----AA-GA---GTT-----CC--C--AA-TT--GA--------T-AGT-T--T-G----TACC-A--T---C--A--ACT----A-GT-CTT-G--ACA--T----AC-A-GAA-----CGG-T-TT--T--CAA---A--TGTC-TAG----------AGATG----------GAC-TA--TTT-G-A--A-ATTT-A-------CAT--ATGTTT-CC--ATTT-----------G-TT-----AT--T--TG-T-T----T-T-TT---CA-TGA-----TT-----TT-GA---A-A-TGC-TT--T-GT-GAT---AG----GT-A-A-GT-----C-A-TTTA-AA-AG-T-AA---AG-A-TAG--A-CA-GG-----TCTGG--ACCTCAA-GAC-T---AGT-TC-AGAG-TA-C-------A-A-----------------ACT-------------------A--------g
gi|2 : CTCAGTGAGATTGGTAGAAGCGAAAT-ATTT-GGACTGAT-C--GC-TC-TACCAATCTCAGACCAATGTAACAACCTTATTCGGGAAAGTTTGCCTCAACTTCCGCCGCCTGTTG-CGAT-TAAAA--TGGCT-TAAACTGA-ACATCT-TGTT-CAGAAAA---TTCA-GATTTTT-ATCTTAGGTATC--------CTACTAA--CTCCC----TA--TCACAAT--GAAACTTGCATTTC--TTACCTTTTCAT--GGT-GTT---------AAATCCCTATATCAAGTT-GGTTATTTTGAC-GCTCCTT---T-AGTGC----T----G----AA-GA---GTT-----CC--A--AAATT--GA--------T-AGT-T--T-G----TACT-A--T---G--G--ATT---TA-GT-CTT-G--AGG-------AC-ACGAA-----CGG-T-TT--A--AAA---T--TGTT-TTC----------AGATA----------GAC-TG--TTT-A-G--T-ATTT-A-------CGT--AGTTTA-CT--ATTT-----------G-TT-----AA--T--TT-T-G----T-T-TT---CA-TGA-----TT-----TTTGA---A-A-TGC-TT--T-TT-GAC---AAA---GT-A-AAGT-----C-A-TTTA-AA-AG-T-AC---AG-A-TAA--A-CA-GA-----TCTGT--ATCTTAA-GAC-T---AGT-TG-ATAG-TA-C-------A-A-----------------ACT-------------------A--------G--------------TGTTGAG--AAAGCACAAAA----T--------GGA-CGTGAATAATA----ACCACTTGATTT-AAATT--GAGATTT----AACACT--AT--GAAA-AGGTAAGAAATGCAAGTTT---TATTGTG--ATAGG---GA-GT--T----A--GTAGGA-TATC-TAA---G-TG-AA--AATC--TG-AAGC---GG----GA-AAG----ATGT-T--C-AGTTT--A--AGT-CAT-TTATA-AT-CGCA--A--CAGG-CGGTGGAAG--TTGGGGCA-AACTTTCCCTAATAAGGTTGTGTTACATTGGTTTGAG-ATTGGT-AGA-GCGATCAG--TCCAAATATTT-AGCTT--CT-ACC------AATCTCACTGAGATTAtcaatttggaacgt
gi|20 : C----T----G----AA-GA---GTT-----CC--A--AA-TT--GA--------T-AGT-T--T-GAATGTACT-A--C---GT-ATCAAC---TA-GT-CTT-G--AGG--T----AC-A-GAA-----CGG-T-TT--AC-AAA---T--T-----TC----------AGATA----------GAC-TG--TTT-G-A--A-ATTT-A-------CGT--AGTTTC-CT--ATTT-----------G-TT-----AA--T--TT-T-G-----------------------------------A---A-A-TGC-TT--T-GT-GAT---AA----GT-A---GT-----C-A-TTTA-AA-AG-T-AA---AG-A-TAG--A-CA-GGTTTGCTTTGT--ATCTCCA-GAC-T---AGT-TG--TAG-TA-C-------ACA-----------------ACT-------------------A--------
gi|20 : a----G----AA-GAA--GTT-----CC--A--AA-TT--GA--------T-AGT-TG-T-G----TACT-A--C---------AAC---TA-GT-CTG-G--AGA--T----AC-A-AAGCAAACCTG-T-CT--A--TCT---T--TACT-TTT----------AAAT-----------GAC-TA--CTT-tcaatttggaacttcttc
gi|21 : actgaagagttccaaattgatagtttgaatgtactacgtatcaactagtcttgaggtacagaacggtttacaaatttcagatagactgtttgaaatttacgtagtttcctatttgttaattttgaaatgctttgtgatT--A--AAA---T---GTC-GTC----------AGACA----------GAC-TG--GTT-G-A--T-ATTT-A-------TGT--AGTTTT-CT--ATTT-----------G-TT-----AA--T--TT-T-GA---T-T-TT---CA-TAA------T-----TTTGA---A-A-TGC-TT--T-GT-GAT---AAA---G--A-AAAT-----C-A-TTTA-AA-TG-T-AA---AG-A-TAG--A-CC-GG-----CCTGT--ACTTTAA-GAC-T---AAA-TC-ATAG-TA-C-------A-A-----------------ACTATCAATTTGGAACTCTTC-A--------G--------------TGTCGAG--AAAGCACAAAA----T--------GTA-TGTGAA-AATA----ACC
gi|22 : tacgaatgtgtcttaaag-AACAC----T----G----AA-GA---GTT-----CC--A--AA-TT--GA--------T-AGT-C--T-G----TACT-A--T---GT-A--ATTCA-TA-TT-CTT-G--AGA--T----AC-A--AA-----CCG-C-T
gi|22 : caccttagatatcctactacatgtaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttctg-GAT---AAA---G--A-AAGT-----C-A-TTTA-AA-AG-TAAA---AG-A-TAG--A-GC-GG-----TTTGT--ATCTCAA-GAA-TATGAAT-TACATAG-TA-C-------A-G-----------------ACT-------------------A--------ctatcttttacttttaaatgactttctttatc
gi|23 : caccttagatatcctactacatgtaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttctgaacactgaagagttccaaattgaT-T--T-G----TAGT-A--T---C--A--ATT---T--GT-CTG-G--AGG--T----AC-G-GCA-----CTG-C-TG--A--AAA---T--TGCC-TTC----------AAAGA----------GAA-TG--GTT-A-A--G-ATTT-A-------CAT--AGTTTT-CT-----T-----------G-TT-----A---T--CT-T-A----A-T-TT---CA-TG------CT-----TTTAA---A-A-TGC-TT--T-GC-GTT---AG----GT-A-AAAT-----C-A-TGTATAA-AG-T----------------------G-----T-TGT--ACTTCAA-GATAC---AGA--G-ATAG-TA-C-------A-A-----------------GCT-------------------A--------A--------------TAT---G--AAA
gi|23 : tgt-AACAC----T----G----AA-GA---GTT-----CC--AACAA-TC--TATTTCATATT-AGC-T--T-G----TACT-A--T----------CTCTGTA--T-CTT-G--AAG--T----AC----AA-----CAC-T-TT--AT-ACA---T--GATT-TTtagattgttggaactcttcagtgttg
gi|24 : tgttttgtagtatcaatttgtctggaggtacggcactgctgaaaattgccttcaaagagaatggttaagatttacatagttttcttgttatcttaatttcatgcttttaaaatgctttgcgttaggtTATTTTAATTGTGCCTTCTCT-A-CAC----C----A----AA-GA---GTT-----CT--A--AA-TTT-GA--------T-AGT-T--T-G----TACC-A--T---C--A--ACT----A-GT-CGA-G--AGG--T----AC-A-GAA-----CTG-T-CC--A--AAA---T--TGTC-CTC----------AGACA----------GAC-TG--GT--G-A--A-TTCT-A-------TGT--AGTTTT-CT--ATTT-----------G-TTG----AA--T--TT-G-A----T-T-TT---CA-GGA-----TT-----TTGTA---A-A--GC-TT--T-GT-GAT---AAG---Gg
gi|25 : acattaattttttgtag-AGCCT--CG-ACG------AATCTCGCTGAGATtatgtgaaaataacctac
gi|25 : --AT--GTGA-AGGTAAGAAATACAAGTTT---GATAATG--ATAGG---GA-GT--T----A--ATAGGT-TGTC-TAA---GATA-AA--AATC--TC-AAGC---AG----Gggacctgttccgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctgcttgagatttttatcttagacaacctattaactccctatcattatcaaacttgtatttcttaccttcacat
gi|26 : atctcagcgagattcgtcgaggctggacctgttccgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnC----T----G----AA-GA---GTT-----CC--A--AA-TTTTGA--------T-AGT-T--T-G----TACT-A--T---C--A--ACC----A-GT-CTT-G--AGG--T----AC-A-AAA-----CGG-T-TT--T--AAA---A--TGTC-TTC----------AGATATATGTAGATAGAC-TA--TTC-G-C--A-ATTT-A-------TGC--ATTTTT-CT--ATTT-----------G-TT-----AA--T--TT---G----T-TATT---CG-TGA-----TT-----TT-GA---G-A-TGT-TT--T-GT-GAT---AA----GT-A-AAGT-----C-A-TTTA-AA-AG-T-AA---AG-A-TAG--A-CA-GG-----TATGT--ACCTCA
gi|27 : aT---C-AACGC----T----GTTCAAA-AA---GTT-----CC--A--TA-TT--GA--------T-AAT-T--T-G----TGCT-A--T---T--A--ACT----A-GT-CTT-G--TGG--T----AC-A-GAA-----ATG-T-CT--A--AAA---A--TGTC-TTC----------AGA------------GAC-TG--GTT-A-A--A-A----A-------CAT--A-TTTT-CT--GTTT-----------G-TT-----AA--T--TC-T-GA---T-T-TT---CA-TGA-----TT-----TT-GA---A-A-AGC-TT--T-GT-GAT---AAGTTTAT-T-AAGT-----A-A-TTTA-AA-AG-T-AG---AG-A-TGG--A-CA-
gi|28 : cCGC----T----G----AA-GA---GTG-----CC--A--AT-TT--GA--------T-AGT-T--T-G----TACT-A------G--C--AAT---TA-GT-CTT-G--AGG--T----AC-A-GAA-----CGG-T-TT--A--AAA---A--TGTC-TTC----------AGATA----------GAA-TA--TTT-G-A--A-ATTT-A-------CGT--AGTTTT-CT--ATTT-----------G-TT-----AA--T--TT-T-G----T-TATT---CG-TGA------T-----TTTGA--------------------------GAA---GT-A-AAG--------A-TT-----------------------G--A-CA-GG-----TATGT--ACTTCAA-GAC-T---AGT-TA-ATAG-TA-C-------tatcc
gi|29 : a-G--AGG--T----AC-A-GAA-----CTG-T-CC--A--AAA---A--TGTT-TTC----------AGACA----------GAT-TG--GTT-G-A--A-ATTT-G-------CGT--G----------------------------------AA--T--TT-T-GA---T-T-TT---CA-TGA-----TT-----TT-GA---A-A-TGT-TT--T-GT-GAT---AA----GT-A-AAGC-----C-A-TTTA-AA-AG-T-AA---AG-A-TAG--A-CA-GG-----TCTGT--ACCTCAACTAC-T---AAT-TC-ATAG-TA-C-------A-A-----------------ACT-------------------A--------gg
gi|29 : CAC----T----G----AA-GA---TTT-----CC--A--AA-TT--AA--------T-AGT-T--T-G----TACT-A--T---G--A--A-T---TA-GTAGTT-G--AGG--T----AC-A-GAC-----CTG-T-CT--A--TCT---T--TACT-TTT----------AAATG----------Gttaatttggaaatcttcagtgt
gi|3 : gaggtacagaactgtccaaaaatgttttcagacagattggttgaaatttgcgtgaattttgattttcatgattttgaaatgttttgtgataagtaaagAGTGAGATTGGTAGAAGCGAAAT-ATTTTGGACTGGT-C--GC-TC-TACCAATCTCAGACCAATGTAACAACCTTATTCGGGAAAGTTTGCCTCACCTTCCGCCGCCTGTTG-CGAT-TAAA---TGGCT-TTAACTGA-ACATCT-TGTT-CAGAAAAT--TTCA-GATTTTT-ATCTTAGGTATC--------CTACTAA--C-CCC----TA--TCACAAT--GAAACTTGCATTTC--TTACCTTTTCAT--GGT-GTT---------AAATCCCTATATCAAGTT-GGTTATTTTGAC-GTCCATT---T-AGTGC----T----G----AA-GA---GTT-----TCCAA--AA-TT--GA--------T-AGT-T--T-G----TACT-A--T---G--G--A-T---TA-GT-CTT-G--AGG--C----AC-A-GAA-----CGG-T-TT--A--AAA---T---GTT-TTC----------AGATA----------GAC-TG--TTT-G-A--T-ATTTTA-------CGT--AGTTTAACT--ATTT-----------G-TT-----AA--T--TT-T-G----T-T-TT---CA-TGA-----TT-----TT-GA---A-A-TGC-TT--T-TT-GAC---AAA---GT-A-AAGT-----C-A-TTTA-A-----T-AAC--AG-A-TAA--A-CA-GA-----TCTGT--ATCTTAA-GAC-T---AGT-TG-ATAG-TA-C-------A-A-----------------ACT-------------------A--------G--------------TGTTGAG--AAAGCACAAAA----T--------GGA-CGTGAA-AATA----ACCCCTTGATTT-AAATT--GAGATTT----AACACT--A---GAAA-AGGTAAGAAATGCAAGTTT---TATTGTG--ATAGG---GA-G---T----A--GTAGGA-TATC-TAAG--G-TG-AA--AATC--TG-AAGC---GG----GC-AAG----ATGT-T--C-AGTTT--A--AGT-CAT-TT-TA-ATACGCA--AACTAGGCCGGTGGAAG--TT-GGGCACAACTTTCCCTAATAAGGTTGTGTTACATTGGTTTGAG-ATTGGT-AGA-GC-ATCAG--TCCAATAATTT-AGCTT--CTAACC------AATCTCACTGAGATTAt
gi|30 : A-GT--T----A--GTAGAA-TGTC-TAA---GGTG-AA--AAAT--TG-AAGC---GG----GC-AAG----A---------AATT------NNN-NNN-NNNNN-NN-NNNN--N--NNNN-NNNNNNNNN--NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-ATCGGG-AAA-GGCACCAG--TCCA---ATTT-TGACG--CT-AGCGAGGATAATCTCACTGAGATTA
gi|31 : CTTGATTTCAAATT--GAAATTT-----ACACT--AT--GTAAGAGGTGAATAAAG-AAGTTTTGCTATTGTT--CTAAG---GA--T--T----A--GGTGGA-TGTC-CAAG--G-TGAAA--AATT--TGTAAGC---GG----GCTGAG----TGGTGT--C-AATTT--ACTACC-AAT-TATTA-AT-CGCAGGA--CAAG-CGCCG--AGTTTTGAGACA-A
gi|32 : -GT--T----A--GTAGGA-CGTC-TAAT--G-TG-AA--AATT--TA-AAGC---G--------AAG----A--C-N--N-NNNNN--N--NNN-NNN-NNNNN-NN-NNNN--N--NNNN-NNNNNNNNN--NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNGGTAAAA-GCGACCAGGTCCCAAATATTT-AGCCT--TT-A
gi|33 : C--A--GA-TT--GA--------T-AGT-T--T-G----TACT-A--T---G--A--AGT----A-AT-CTA-G--AGG--T----A--G-GAA-----C-----------------------------------------ATA------------C-TG--GTT-A-A--A-ATTT-A-------CAT--AATTTT-CT--ATTT-----------G-TT-----GA--T--TT-T-GA---T-T-TT---CA-TGA------T-----ATTGA---A-A-TGC-TT--T-GT-GAT----AA---GT-A-AAAT-----C-A-TTTA-AA-AG-T-AA---AG-G-TAG--A-CA-GT-----TCTGT--ACCT
gi|34 : -------------------A--------G--------------TGTTGAG--ANNNNNNNNNN----N--------NNN-NNNNNN-NNNN----NNNNNNNNNNNN-NNNNN--NNNNNNN----NNNNNN--NN--NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNN--NNNNN---GA-GT--TT---ATTGTAGGA-TGTC-TAA---GGTG-AA--AATT--TG-AAGC---Gttga
gi|36 : aactctac-GAA-----CTA-T-TT--A--AAG---A--TGTC-TTC----------AAACA----------GAC-TG--GTT-A-A--A-ATTT-A-------CATCTAGTTTC-CT--TTTTTCGT-------G-CTTTTAAAA--TGACT-T-G----T-G-TT---CAGTAA-----TTGTCATTCTAA---A-A-TGC-T
gi|37 : ggtacagaaaactaaatttttc-T--T-G----TACT-A--T---C--A---TT---TACG------G--AGG--T----AC-A-TAA-----CTG-T-CT--A--AAG---A--TGCC-TTC----------AGACT----------GGT-TA--CAT-GTA--A-GTTT-A-------CAT--A-TTTT-CT--TTTT-----------
gi|38 : ttctcaatactgactaatttcatcgtaaT-----AA--T--TT-TTG----T-T-TTTTCCA-TGA-----TT-----T--GA---A-AATGC-TT--T-GT-GAT----AA---GT-A-AAGTC----C-A-TTTG-AA-AGTT-AA---AG-ta
gi|39 : catttgaccaaatcttcgttaagttccaacccgttgccTGA---A-A-TGC-TT--T-GT-GAT---AAA---G--A-AAGT-----C-A-TTTG-AA-AG-T-AA---GG-A-TAT--A-CC-GA-----TTTGT--ACCTCAA-GAT-T---AAC-TC-ATAA-AA-C-------A-A-----------------ACT-------------------A--------taaa
gi|39 : C----T----G----AA-GA---GTT-----CC--A--AA-TT--GA--------T-AGT-T--T-G----TTTT-A--T---G-----AGT---TA-AT-CTT-G--AGG--T----AC-A-AAT-----CGG-T-AT--A--TCC---T--TACT-TTC----------AAAT-----------GAC-Ttcaatttggaactcttcagt
gi|4 : tgaaatgctttgtgataaagaa----TTCA-AATTT-C-ACCTTAGACAT----------TACTAA--CTCNN----NN--NNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNN--NNN-NNN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-NNNNNNN---N-NNNNN----N----NNNN-AA-GA---GTT-----CC--A--AA-TTT-GA--------T-AGG-T--T-T----TACTCA--T---G--G--AAT----A-GT-CTT-G--AGG--T----AAGA-GAA-----CGG-T-TTT-A--AAA---A--TGTT-TTC----------AGATA----------GAC-TG--TT--G-A--A-ATTT-A-------CGT--AGTT---CT--ATTT-----------G-TT-----AA--T--AT---G----T-T-A----CA-TGA-----AT-----TTTGA---A-A-GGC-CTAAT-GTTGAC---TAA---GT-A-AAGT-------A-TTTA-AA-AG-T-AA---AG-A-TAAT-A-CA-GG-----TCTGT--ACCTTAA-GAC-T---AGT-TT-GTAG-TAGC-------A-A-----------------ACTATCAATTTTGGAACTCTTCA--------G--------------TGTT-AG--AANNNNNNNNN----N--------NNN-NNNNNN-NNNN----NNNNNNNNNNNN-NNNNN--NNNNNNN----NNNNNN--NN--NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNN--NNNNN---GA-GT--T-------GTAGGA-TGTC-TAG---G-TG-AA--AATT--TG-AAGC---GGNNNNNN-NNN----NNNN-N--N-NNNNN--N--NNN-NNN-NNNNN-NN-NNNN--N--NNNN-NNNNNNNNN--NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTATTAAC-AG--GCACCCAG--TCCAAA-ATTT-AGCCT---T-ACC-------ATC-CACTGAGATTt
gi|42 : agc----T-T-TT---CA-CG------TT-----TTTGA---A-A-TGC-TT--T-GT-GAT----AA---GTGA-AAGT-----C-A-TTT--AA-AG-T-AG---A
gi|43 : atttaaaCATA--------CTTCTAA--CTCTC----TAAATCACTAT--GAAACTTGCGTTTC--TTACCTATACAT--actacttgaagtagacc
gi|44 : t-----TTTGA---G-A-TGC-TT--T-GT-G-T---AA----GT-A-AAGT-----A-A-TTGA-AA-AG-T-AACTTAG-A-TAG--A-CA-GG-----TCTGT--Atacggt
gi|45 : T-----TTTGACGCATA-NGT-TT--T-GT-GAT---AA----GT-A-AAGT-----C-A-TTTA-AA-AG-T-A----------------------------TAT--ACCTCAA-GAC-T---
gi|46 : CAG--TCCAAAT-TTT-AGCTT--CT-ACC------A-TCTCACTGAGATTA
gi|47 : agactttgttggctgatgT-CTC-G--ATG--T----AC-A-GAG-----ATG-T-CT--A--GAA---A--TGTC-TAC----------AGACA----------GAC-TG--GTT-G-A--A-ATTT-A-------
gi|48 : tCAG--ATCAAATATTTTAGCTTATCT-ACC------AATCTCACTGAGATTA
gi|49 : ggactgatg--T----A--GTAGGA-TATC-TAA---GGTG-AC--CATT--TG-AAGC---AG----GC-AAG----AAAT-G--C-AGT
gi|5 : aa----TTCACAATTTTC-AACTTAGGTATC--------CT-CTAA--CTC
gi|5 : c----AA-GA----TT-----CC--AG-AA-TT--GA--------TTAGT-T----G-----ACT-AC-T---G--G--A-T---TA-GT-CTT-G--AGG--T----AC-A-GAAA----CGGGT-TT--C--ATA---T---GTT-TTC----------AGATA----------GAC-TGTTTTT-G-A--T-ATTT-A-------CGT--AG-TTT-CT--AGTTGATCGGTGTAGG-TC-----AAT-T--TT-T-GGTGTT-T-TT---CATTGACCGAGTTA----TTTGA---A-A-GCC-TT--T-GT-G-----CAA---GT-A-ACGTACATGC-A-CTTA-AA-AT-C-GA---CA-G-CAGTAA-CACGG-----TCTGTAAACCTTAA-GA--T---AGT----ATAG-TA-C-------A-AG----------------ACT-------------------A--------nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagattccagaattgattagttgactactggattagtcttgaggtacagaaacgggtttcatatgttttcagatagactgtttttgatatttacgtagtttctagttgatcggtgtaggtcaatttttggtgtttttcattgaccgagttatttgaaagcctttgtgcaagtaacgtacatgcacttaaaatcgacagcagtaacacggtctgtaaaccttaagatagtatagtacaagactatcaatttgaacttctctacagtttgagtggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggttagtagaagtatctagagggtgagaaatgaaggcgggcaaggaatgttcgagctttgaaatc
gi|5 : cttcacaattttcaacttaggtatcctctaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn----G----AG-AA---GTT-----C---A--AA-TT--GA--------T-AGTCT--T-G----TACT-A--T---------ACT------AT-CTT-A--AGGTTT----AC-A-G-A-----CCG-TGTT--A--tcaatttgaacttctctacagtttgagtggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggttagtagaagtatctagagggtgagaaatgaaggcgggcaaggaatgttcgagctttgaaatc
gi|5 : cttcacaattttcaacttaggtatcctctaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagattccagaattgattagttgactactggattagtcttgaggtacagaaacgggtttcatatgttttcagatagactgtttttgatatttacgtagtttctagttgatcggtgtaggtcaatttttggtgtttttcattgaccgagttatttgaaagcctttgtgcaagtaacgtacatgcacttaaaatcgacagcag-GT--T----A--GTAGAAGTATC-TAGAGGG-TG-AG--AAAT--GA-AGGC---GG----GC-AAGGA--ATGT-T--CGAGCTTTGA--AAT-Ctacagtttgagtggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggttagtagaagtatctagagggtgagaaatgaaggcgggcaaggaatgttcgagctttgaaatc
gi|50 : cttcacaattttcaacttaggtatcctctaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagattccagaattgattagttgactactggattagtcttgaggtacagaaacgggtttcatatgttttcagatagactgtttttgatatttacgtagtttctagttgatcggtgtaggtcaatttttggtgtttttcattgaccgagttatttgaaagcctttgtgcaagtaacgtacatgcacttaaaatcgacagcagtaacacggtctgtaaaccttaagatagtatagtacaagactatcaatttgaacttctctacagtttgagtggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagTTGTG--ATATG---GA-GT--T----A--GTAGGA-TGCCTTAG---G-TG-AA--AATC--TG-AAGC---GG----
gi|51 : A-GT--T----A--GTAGGA-TGTC-CGA---GGTG-AA--AAGT--TG-AAGC---GG----GC-AAG----A
gi|52 : AG--ACCAAATATCT-AGCCT--CT-GTC------AATCTTGCTGAGAT
gi|53 : TA-AA-AG-T-AA---AG-A-TAA--A-CA-GG-----TCTGT--ACCTCAG-Gtatc
gi|6 : CCGCCTGTTGATGAT-TAAAAAATGACA--AAACTGA-A-ATATACGCC-C-GC------TTCA-AATTTTC-ACCTTAGACATC--------CTACTAA--CTCNN----NN--NNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNN--NNN-NNN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-NNNNNNN---N-NNNNN----NNNN-G----AA-GA---GTT-----CC--A--A--TT---A--------T-AGT-TGTT-T----TACT-A--TT--G--G--AAT---TA-GT-CTTTG--AGG--T----AC-A-GAA-----CGG-T-TTTTA--AAA---A--TGTTCTTC----------AGATA----------GAC-TG--TTTTG-A--A-ATTT-A-------CGT--AGTTT--CT--ATT------------G-TT-----AA--T--TT-G-T----T-T-TT---CA-TGA-----TT-----TTTGA---A-A-TGC-TT--T-GT-GAC----AA---GT-A-AAGT-----CGA-TTTA-AA-AG-T-AA---AG-A-TAA--A--A-GG-----TCTTT--ACCTTAA-GAC-T---AGT-TG-ATAG-TA-C-------A-A-----------------ACTATCAATTGTGGAACTCTTCA--------G--------------TGTTGGG--AAAGCACAAAA----TCTTATGNNNNN-NNNNNN-NNNN----NNNNNNNNNNNN-NNNNN--NNNNNNN----NNNNNN--NN--NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNN--NNNNG---GACGT--TATTAA--GTAGG--TTTC-TAAG--G-TG-AA--AA----TG-AAGC---GG----
gi|7 : CTCAGTGAGAT-GGTAAAGGCTAA-T-ATTT-GG-CTGGTTC--GCCTT-TACCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNN-NNNNN--NNNNN-NNNNNNNN-NNNNNN-NNNC-CCGC------TTCA-AATTTTC-ACCTTAGACATC---------TACTAATCNNNNN----NN--NNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNN--NNN-NNN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-NNNNNNN---N-NNNNN----N----G----AA-GA---GTT-----CC--A--AA-TT--GA--------T-AGT-T--T-G----TACT-A--T---G--G--AAA---TA-GT-CTT-G--AGG--T----AG-A-GAA-----CGG-T-TT--A--AAA---T---GTT-TTC----------AGA------------GAC-TG--TTT-G-A--A-ATTT-A-------CGT--AGTTTT-CT--ATTT-----------G-TT-----AA--T--AT-T-GT---T-T-TT---CA-TGA------T-----TTTGA---A-A-TGCTTT--T-GT-GAC----AA---GT-A-AAGT-----C-A-TTTA-AA-AG-T-AA---AG-A-TAA--A-CA-GG-----TCTGT--A-CTTAA-GAC-T---AGT-TG-ATAG-TA-C-------A-A-----------------ACT-------------------A--------
gi|7 : taat-AACAC----T----G----AA-GA---GTT-----CC--A--AA-TT--GA--------T-AGT-T--T-G----TACT-A--T---C--A--AC----TA-GT-CTT----AAG--T----AC-A-GAC-----CTG-T-TT--A--TCT---T--TACT-TTT----------AAAT-----------GAC-Ttcaatttggaactcttcagtgttg
gi|8 : taatctcagtgagatggtaaaggctaatatttggctggttcgcctttaccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncccgcttcaaattttcaccttagacatctactaatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaagagttccaaattgatagtttgtactatggaaatagtcttgaggtagagaacggtttaaaatgttttcagagactgtttgaaatttacgtagttttctatttgttaatattgtttttcatgattttgaaatgcttttgtgacaagtaaTCAGTGAGATTGGTAGAG-CGAAATTATTT-GGACTGGT-CA-GC-TCATACCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNN-NNNNN--NNNNN-NNNNNNNN-NNNNNN-TGTTGCAGAAGAGATTTCA-GATTT---ATCTTAGGTATC--------CTAC-AA--CTCCCGNN-NN--NNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNN--NNN-NNN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-NNNNNNN---N-AGTGCA---T----G----AAAGA---GTT-----CC--A--AA-TT--GA--------T-AGT-T--T-G----TACT-A--T---G--G--A-T---TA-GT-CTG-G--AGG--C----AC-A-GAA-----C-G-T-TT--A--AAA---T--GTTT-TTC----------AGATA----------GAC-TGA-TTT-G-A--GTATTT-A-------CGT--AGTTTA-CTT-ATTTT----------G-TT-----AA--T--TT-T-G----T-T-TT---CA-TGA-----TT---------G---A-A-TGC-TT--T--T-GAC---A-----GT-A-AAGT-----C-A-TT-A-AA-AG-T-AC---AG-A-TAA--A-CA-GA-----TCTGT--ATCTTAA-GAC-T---AGTATG-ATAGTTA-C-------A-A-----------------Ag
gi|9 : ctaatTCA-TATTATC-ACCTTAGACATC--------ATACTAA--CTCNN----NN--NNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNN--NNN-NNN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-NNNNTTC---TCAACAC----T----G----AA-GA---GTT-----CC--A--AA-TC--GA--------T-AGT-T--T-G----CACT-A--T---G-----ATT---TA-GT-CTT-G--AGG--T----AC-A-AAC-----CTG-act
gi|9 : taatctcaacgagatattcgtcgaggctggaacctcttccgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncccgca-AACAC----T----G----AA-GA---GTT-----CC--A-------------------T-A---T--T-G----TACT-A--T---C--A--ACT----A-GT-TTT-G--AGG--T----AC-T-GAA-----CTA-T-CT--A--AAA---T---GTC-TTT----------AGACA----------GAC-TG--GTT-G-A--A-TTTT-A-------CAT--AGTTTT-CT--ATGT-----------G-TT-----AA--T--TT-T-GA---T-T-TT---CA-TCA------T-----TTCAA---A-A-TGC-TT--T-GT-TAA---AAA---GC-A-AATT-----C-A-TTTA-AA-AG-T-AA---AG-A-TAG--T-CA-GG-----TTTGT--ACCTCAA-GAC-T---AAA-TC-ATAG-TG-C-------A-A-----------------ACT-------------------A--------actatctttacttttaaatgaatttgctttttaacaaagcattttgaaatgatgaaaatcaaaattaacacatagaaaactatgtaaaattcaaccagtctgtctaaagacattttagatagttcagtacctcaaaactagttgatagtacaatatggaactcttcagtgtt
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|35 ): GTTGAGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAGTTAGTAGTGATATCAAGGGAAAATCATGAAGGCGGG
Unaligned ( gi|40 ): TAGACAAATTGATAGTACAAACTAATACGAAGTAGCCTGTTGGAACTTTTTAGTGTTGAGAGGCATATCAATATTCACAGCATGCAGC
Unaligned ( gi|41 ): TATTCTGTTAATTTCGTTTTATGATTTCAAGCTTGAATACTTCTGACAAGAGGCATTGAAATGAAATATAGATAAATAGAC
Alignments
lowQualScore : 11 3333333 11 111111111 1111 111111111 2222222222222222 1111111111 11111111111 1111 111111 111111111 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1111111111111 11111 111 22222 11111111111111 1111 111111111
lowQualScore : 0 5 5 0 8 8 0 8 99 8 8 4 4 4 4 0 77 6 2 99 0 99 777 777 6 8888888 33 3 333333333 0 44 2222 44 1 44 0 2 44 1 1 44 3 444444444 11 2 4 3 1 1 2 1 55555 2 1 4444 4444 1 222 111 22222 11 33 1 55 33333333 1 22 22 2 2222 11 1 22 3333333333333333 1 1 0 11 11 2222 0 0 0 44 0 22 11 6 1 5555555555 0 0000000000 1 555 2 33333 33 1 4444444 11 3 1 1 11 00000000000 1 44444 44 11 1 1 2222 5 444 2 444444 44444 0 222 1 1 1 1 11 1 2 222222222 1 1 66666 1 1 1 1 2222 1 2 333 3 22 1 1 44444 33 1 66666666 555 1 88 1 1 3333 7777777 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 55 8888888888888 4 8 9999 0 4 66 11111 55 0 1 4 55 0 0 777 55 222 2 33 6666 33 2 2 33333 2 33 444 2 333 5555 77 88888888888888 77777 3 5555 4 8888888888 4 2 55 777 1 1 4 333 0 0 0 5 66 5 9999 55 88 3 55 3 222222222
lowQualScore : . . . . . . . . .. . . . . . . . .. . . .. . .. ... ... . ....... .. . ......... . .. .... .. . .. . . .. . . .. . ......... .. . . . . . . . ..... . . .... .... . ... ... ..... .. .. . .. ........ . .. .. . .... .. . .. ................ . . . .. .. .... . . . .. . .. .. . . .......... . .......... . ... . ..... .. . ....... .. . . . .. ........... . ..... .. .. . . .... . ... . ...... ..... . ... . . . . .. . . ......... . . ..... . . . . .... . . ... . .. . . ..... .. . ........ ... . .. . . .... ....... ............................................................... .. ............. . . .... . . .. ..... .. . . . .. . . ... .. ... . .. .... .. . . ..... . .. ... . ... .... .. .............. ..... . .... . .......... . . .. ... . . . ... . . . . .. . .... .. .. . .. . .........
lowQualScore : 8 0 0 8 0 0 8 0 00 0 0 8 4 8 4 2 22 7 5 22 5 22 222 222 7 4444444 22 3 999999999 5 22 9999 66 0 66 9 2 66 0 0 66 6 555555555 22 9 0 3 0 0 1 7 77777 1 2 4444 3333 1 999 888 66666 44 88 0 99 77777777 0 44 44 0 1111 44 0 44 7777777777777777 0 0 9 33 33 0000 9 9 9 99 9 33 33 3 1 1111111111 4 3333333333 2 555 5 11111 00 2 1111111 88 1 3 3 88 22222222222 3 55555 44 88 3 3 7777 0 777 5 222222 11111 7 000 1 1 1 1 66 2 3 222222222 1 1 99999 1 1 1 1 4444 1 2 111 5 88 2 2 22222 33 4 99999999 444 6 11 6 6 4444 1111111 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 00 0000000000000 4 9 4444 2 4 11 44444 55 9 0 0 55 9 5 000 00 777 4 11 9999 11 2 2 77777 2 11 555 2 999 0000 55 77777777777777 77777 6 5555 0 8888888888 0 3 00 444 6 6 0 666 1 6 9 0 00 0 6666 00 66 6 00 6 999999999
consensus : CTCAGTGAGATTGGTAGAGGCGAAAT-ATTT-GGACTGGT-C--GC-TC-TACCAATCTCAGACCAATGTAACAACCTTATTCGGGAAAGTTTGCCTCAACTTCCGCCGCCTGTTG-CGAT-TAAAA--TGGCT-TAAACTGA-ACATCT-TGTC-CAGAAA----TTCA-GATTTTC-ACCTTAGACATC--------CTACTAA--CTCCC----TA--TCACNAT--GAAACTTGCATTTC--TTACCTNTNCAT--GGT-GTT---------AAATCCCNATATCAAGTT-GGTTATTTTGAC-GTNCNT-TC-A-----ACAC-T----G----AA-GA---G---TTC-----C--A--AA-TT--GA--------T-AGT--T--T-G----T--ACT-A--T---G----AACT---TA-GT-CTT-G--AGG--TA----C-A-G-AAC-NGT-TT--A--AAAATGT-CTTC----------AGATA----------GAC-TG--NTT-G-----A--A-ATTTA-------CGT--AGTTT-TCT-A--TTT-----------G-TT-----AA--T--TT-T-G----TT-TT---CA-TGA-----TT-----TTTGA---A-A-T-GC-TT--T-GT-GAT---AAA---GT-AAA-GT-----C-A-TTTA-AA-A----G-T-AA---AGA-TAG--AC-A-GG-----TCTGT--ACCTCAA-GAC--------T---AGT-TG-ATAG-TA-C----A-------A-----------------ACT-------------------A-----------G-----------TGTTGAGAAA--GCACAAAA----T--------GGAC-GTGAA-AATA----ACCACTTGATTT-AAATT--GAGATTT----AACACT--ATGNAA-AG--GTAAGAAATGCAAGTTT---TATTGTG--ATAGG---GA-GT--T----A--GTAGGA-TGTC-TAA---G-TG-AA--AATT--TG-AAGC---GG----GC-AAG----ATGT-T--C-AGTTT--A--AGT-CAT-TTNTA-AT-CGCA--A--CAGG-CGGCGGAAG--TTGGGGCA-AACTTTCCCTAATAAGGTTGCGTTACATTGGTTTGAG-ATCGG-NAGA-GCGACCAG--TCCAAATATTT-AGCCT--CT-ACC------A--ATCTCGCTGAGATTA
Reference ( family-297 ) : CTCAGTGAGATTGGTAGAGGCGAAAT-ATTT-GGACTGGT-C--GC-TC-TACCAATCTCAGACCAATGTAACAACCTTATTCGGGAAAGTTTGCCTCAACTTCCGCCGCCTGTTG-CGAT-TAAAA--TGGCT-TAAACTGA-ACATCT-TGTC-CAGAAA----TTCA-GATTTTC-ACCTTAGACATC--------CTACTAA--CTCCC----TA--TCACNAT--GAAACTTGCATTTC--TTACCTNTNCAT--GGT-GTT---------AAATCCCNATATCAAGTT-GGTTATTTTGAC-GTNCNT-TC-A-----ACGC-T----G----AA-GA---G---TTC-----C--A--AA-TT--GA--------T-AGT--T--T-G----T--ACT-A--T---G----AACT---TA-GT-CTT-G--AGG--TA----C-A-G-AAC-NGT-TT--A--AAANTGT-CTTC----------AGATA----------GAC-TG--NTT-G-----A--A-ATTTA-------CGT--AGTTT-TCT-A--TTT-----------G-TT-----AA--T--TT-T-G----TT-TT---CA-TGA-----TT-----TTTGA---A-A-T-GC-TT--T-GT-GAT---AAA---GT-AAA-GT-----C-A-TTTA-AA-A----G-T-AA---AGA-TAG--AC-A-GG-----TCTGT--ACCTCAA-GAC--------T---AGT-TG-ATAG-TA-C----A-------A-----------------ACT-------------------A-----------G-----------TGTTGAGAAA--GCACAAAA----T--------GGAC-GTGAA-AATA----ACCACTTGATTT-AAATT--GAGATTT----AACACT--ATGNAA-AG--GTAAGAAATGCAAGTTT---TATTGTG--ATAGG---GA-GT--T----A--GTAGGA-TGTC-TAA---G-TG-AA--AATT--TG-AAGC---GG----GC-AAG----ATGT-T--C-AGTTT--A--AGT-CAT-TTNTA-AT-CGCA--A--CAGG-CGGCGGAAG--TTGGGGCA-AACTTTCCCTAATAAGGTTGCGTTACATTGGTTTGAG-ATCGG-NAGA-GCGACCAG--TCCAAATATTT-AGCCT--CT-ACC------A--ATCTCACTGAGATTA
gi|1 : GTGAGATTG-TAAAGCT--AAT-ATTT-GGA-TGAT-CCAAC-TC-TACCAATCTCAGAACAATGT--CAAG--TATTGGAGAAAAT--GAAT-AATTACTGTGGGTAGTTG-AGATCTAAAA--TGCCTCTATATTGACAAAT-T-GGCC-CAGGACCTTTTTTA--ATTTTCTAAATTGGGTATA--------TT--TAA--TTTTCAGAATA--TCAAAGTTAGAGAGT-GT-TTTCAATTAATTTTATAA--GGTTGTTTATCAATAAAAATTTAAAT-TTAAGTTTGGTTATTATGAC-GTATAT-TA-ATTGTTATG--T----G----AA-TA---G---TTCACACCC--A--AC-TT--CA--------T-AGG--T--T-A----TCTGCT-A--TATCG----GA-T---TA-TT-TTT-GTAAGA--TAATAAC-A-C-GAC-AGG-TT--ATCAAATGAT-GTTT----------AGATA----------GAA-TG---TT-G-----ATTA-ATTTA--------GT--A--TT-TCT-AAATTT-----------GATT-----AAGCT--TTAT-G----TA-TTA--TA-TAA-----TA-----TTTGA---A-A-TTGA-TT--TAGT-GATGCAAAA---AT-ATATGT-----C-C-ATTA-AATA----G-T-AC---CGAATAA--ACCA-GGA----TCTGTCAAATTTAA--AC--------T---AGT----ATAG-AA-C----AGTCGATAA-----------------ACT-------------------ATCAATATTGGAGCTTCTTACAATTGTTGAGAAAAAGTGCCAAACAACT--------GGACCGTGAACAATATAATGCAAAATGATTT-AAACTCGGAGATTTGAAAAACACTTAATAGAG-AGAGGTAAGAA-TGCAAGTTT---TA-TGTGGTATAGGC--GA-GTACG----A--ATAGAA----A-TAA---A-AG-AGTCAATTTGTG-AAGCGGTGG----GT-AAATAGTATGT-TTAT-AGTTT--A--AGGACATATTGTACAT--G-A--A--CAGG-GAGAGCGAG---TGGGG-A-AA---TATCAGATAAGGTTGCGCTA
gi|10 : T-GAA-GA-----C-A-TTT------------T-AA---A--------AC-C-GT-----TTTGT--ACCTCAA--AC--------T---GGT-TG-ATAG-TA-C----A-------AAACTATCAAAATTTGGAACTCTTC---------------A-----------G-----------TGTTGAAAAN--NNNNNNNN----N--------NNNN-NNNNN-NNNN----NNNNNNNNNNNN-NNNNN--NNNNNNN----NNNNNN--NNNNNN-NN--NNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNN--NNNNNNN-GA-GT--T----A--GTAGGA-TGTC-CAAG--G-TG--A--AATA--TG-AAGC---GG----GN-NNN----NNNN-N--N-NNNNN--N--NNN-NNN-NNNNN-NN-NNNN--N--NNNN-NNNNNNNNN--NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NTCGG-AAGAGGCG-CAGG--TCCAAAT------------------------A--ATCTCACTGAGATT
gi|10 : T-TC-A-----ACAC-T----G----AA-GA---G---TTC-----C--A--AA-TTTTGA--------T-AGT--T--TTG----T--ACT-A--T---C----AACC----A-GT--TT-G--AGG--TA----C-A-A-AAC-GGT-TT--T--AAAATGT-CTTCAGATATATGTAGATA----------GAC-TA--TTC-G-----C--A-ATTTA---------T--CATTT-TCT-A--TTT-----------G-TT-----AA-----TT-T-G----TTATT---CG-TGA------------TTTGA---G-A-T-GT-TT--T-GT-GAT----AA---GT-AAA-GT-----C-A-TTTA-AA-A----G-T-AA---AGATTAG--AC-A-GG-----TATGT--ACCTCgatatatgtagatagactattcgcaatttatcattttctatttgttaatttgttattcgtgatttgagatgttttgtgataagtaaagtcatttaaaagtaaagattagacaggtatgtacctc
gi|11 : aatctcagtgagattatttggacctgcgcctcttccgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncccgcttcatatttcaccttggacatcctactaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttG-----TTTGT--ACCTCAA-GAC--------T---GGT-TG-ATAG-TA-C----A-------AAACTATCAAATTTGGA-ACTCTTC---------------A-----------G-----------TGTTGAAAAN--NNNNNNNN----N--------NNNN-NNNNN-NNNN----NNNNNNNNNNNN-NNNNN--NNNNNNN----NNNNNN--NNNNNN-NN--NNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNN--NNNNNNNNGA-GT--T-------GTAGGA-TGTC-CAAG--G-TG--A--AATA--TG-AAGC---GG----G
gi|11 : aatctcaagtgagattatttggacctgcgcctcttcgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnT-TC-A-----ACAC-T----G----AA-GA---G---TTC-----C--A--AA-TTT-GA--------T-AGT--T--TTG----T--ACT-A--T---C----AACC----A-GT-CTT-G--AGG--TA----C-A---AAC-GGT-TT--T--AAAATGT-CTTC----------AGATATATGTAGATAGAC-TA--TTC-G-----C--A-ATTTA---------T--CATTT-TCT-A--TTT-----------G-TT-----AA-----TT-T-G----TTATT---CG-TGA------T-----TTTGA---G-A-T-GT-TT--T-GTGGAT----AA---GT--AA-GT-----C-ATTTTA-AA-A----G-T-AA---AGAGTAG--AC-A-GG-----TATGT--ACCTCggttttaaaatgtcttcagatatatgtagatagactattcgcaatttatcattttctatttgttaatttgttattcgtgattttgagatgttttgtggataagtaagtcattttaaaagtaaagagtagacaggtatgtacctc
gi|12 : aatctcaagtgagattatttggacctgcgcctcttcgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncccgcttcatatttcaccttggacatcctacaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttCAC-T----G----AA-GA---T---TTC-----C--C--AA-TT--GA--------T-AGT--T--T-G----T--ACC-A--T---C----AACT----A-GT-CTT-G--ACA--TA----C-A-G-AAC-GGT-TT--T--CAAATGT-CTAG----------AGATG----------GACCTA--TTT-G-----A--A-ATTTA-------CAT--ATGTT-TCC-A--TTT-----------G-TT-----AT--T--TG-T-T----TT-TT---CA-TGA-----TT-----TT-GA---A-A-T-GC-TT--T-GT-GAT---AG----GT-AAA-GT-----C-A-TTTA-AA-A----G-T-AA---AGA-TAG--AC-A-GG-----TCTGG--ACCTCAA-GAC--------T---AGT-TC-AGAG-TA-C----A-------A-----------------ACT-------------------A-----------
gi|12 : ----TTCA--ATGTTC-ACCTTAGATATC--------ATACTAA--CTCNN----NN--NNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNN--NNN-NNN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NN-N-----NNNN-NNNNNG----AA-AC---G---TTC-----C--A--AA-TT--GA--------T-AGT--T--T-G----T--ACT-C--T---G----AAC----TA-GT-CTT-G--AGG--TC----C-A-G-ACC-TGT-CT--A--tcaatttggaacgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagttagtatgatatctaaggtgaacattgaagcag
gi|13 : cactgaagatttcccaattgatagtttgtaccatcaactagtcttgacatacagaacggttttcaaatgtctagagatggacctatttgaaatttacatatgtttccatttgttatttgttttttcatgattttgaaatgctttgtgataggtaaagtcatttaaaagtaaaga----TTCA-GCTTTTG-ACTTTAGACATCGGATGATCCTACTAA--CTCCC----TA--TCACTAT--GCAACTTGCATTTC--TTACCTAAACATACGGT-GTT---------AAATCCgcag
gi|13 : cTTATTTTTAT-GCTTTC-TC-A-----ACAC-T----G----AA-GA---G---TTC-----C--A--A-----------------------C--T-G----T--A---A--G---T----AATT---TA-GT-TC-------G--TA----C-G--------------------ATTCT--TTC----------AAACA----------CAC-TG--GTT-A-----A--A-ATTTAAATAGATC-T--AGTTT-TCT-T--TTT-----------G-CT-----AAT-T--TT-T-A----TT-TT---CA-TG------TT-----TATGG---A-A-T-AT-TG--T-GT-GGT----AA---GT-AAA-GT-----T-A-TGTA-AT-A----G------------TAG--AC-A-GT-----TCCGT--ACCTTTA-GAC--------accaatcgcattccgccaaccatctcatcaacggcagttgggattcaataattaacgcatcgctgccagatttatttttatgctttctcaacactgaagagttccaactgtaagtaatttagttcgtacgattctttcaaacacactggttaaaatttaaatagatctagttttctttttgctaatttttattttcatgtttatggaatattgtgtggtaagtaaagttatgtaatagtagacagttccgtacctttagacaaat
gi|14 : cttcagcttttgactttagacatcggatgatcctactaactccctatcactatgcaacttgcatttcttacctaaacatacggtgttaaatccaccaatcgcattccgccaaccatctcatcaacggcagttgggattcaataattaacgcatcgctgccagatCAC-T----G----AA-GA-------TTC-----C--C--AA-TT--GA--------T-AGT--T--T-G----T--ACC-A--T---C----AACT----A-GT-CTT-G--ACA--TA----C-A-G-AAC-GGT-TT--T--CAAATGT-CTAG----------AGATG----------GAC-TA--TTT-G-----A--A-ATTTA-------CAT--ATGTT-TCC-A--TTT-----------G-TT-----AT--T--TG-T-T----TT-TT---CA-TGA------T-----TTTGA---A-A-T-GC-TT--T-GT-GAT----AG---GT-AAA-GT-----C-A-TTTA-AA-A----G-T-AA---AGA-TAG--AC-A-GG-----TCTGG--ACCTCAA-GAC--------T---AGT-TC-AGAG-TA-C----A-------A-----------------ACT-------------------A-----------aaat
gi|14 : ----TTCA--ATGTTC-ACCTTAGATATC--------ATACTAA--CTCNN----NN--NNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNN--NNN-NNN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NN-N-----NNNN-N----N----NN-GAAACG---TTC-----C--A--AA-TT--GA--------T-AGT--T--T-G----T--ACT-C--T---G----AAC----TA-GT-CTT-G--AGG--TC----C-A-G-ACC-TGT-CT--A--tcaatttggaacgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagttagtatgatatctaaggtgaacattgaagcag
gi|15 : cactgaagattcccaattgatagtttgtaccatcaactagtcttgacatacagaacggttttcaaatgtctagagatggactatttgaaatttacatatgtttccatttgttatttgttttttcatgattttgaaatgctttgtgataggtaaagtcatttaaaagtaaagaG---GG-GT--T----A--GTGGGA-TGTC-TAAT--G-TG-AA--AATA--TG-AAGC---GG----gcag
gi|15 : CTT-TCTA-----ACAC-T----G----GA-GA---G---TTC-----C--------CC--GA--------------------------------A--T---G----A-------------TT-G--GG----A----C---G-AAC-TGC-CT--A--AAAACGC-CGAC----------AGACA----------GAC-TG--GCT-A-----A--C-AT----------------G--------A--TTT--------------T-----GA--C--TT-C-T----TT-TT--------------TT-----TATGA---A-A-T-GC-TT--T-GT-GAT----AA---TT-AAA-GT-----T-A-TTGA-AA-A----G-T-AA---GCC-TAG--Aannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactttctaacactggagagttccccgaatgattgggacgaactgcctaaaaacgccgacagacagactggctaacatgattttgacttcttttttttatgaaatgctttgtgataattaaagttattgaaaagtaagcctagaa
gi|16 : ccgcttcatattttcacattagacatcccactaaccccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaa-----ACAC-T----G----AA-GA---G---TTC-----C--ACCAA-TT--GA--------T-AAT--G--T-G----T--ACT-A--T---T----AACT----A-GT-CTT-G--AGG--TA----C-A-G-AAC-TGT-CT--A--CAAATGT-TTTC----------AGACA----------GAC-TG--GTT-G-----A--A-ATTTA-------TGC--ATTTT-TCT-A--TTT-----------G-TT-----AA--T--TT-T-GA---TT-TT---CA-TGA------T-----TTTGA---A-A-T-GC-TT--C-GT-GAT---AAA---G--AAA-GT-----C-A-TTTA-AA-A----G-TAAA---AGA-TAG--AG-C-GG-----TTTGT--ATCTCAA-GAA--------TATGAAT-TACATAG-TA-C----A-------G-----------------ACT-------------------A-----------a
gi|16 : CAC-T----G----AA-GA---G---TTC-----C--A--AA-TT--GA--------T-AGT--C--T-G----T--ACT-A--T---GT---AATTCA-TA-TT-CTT-G--AGA--TA----C-A---AAC-CGC-Ttcaatttggaactcttcagtg
gi|17 : acactgaagagttccaccaattgataatgtgtactattaactagtcttgaggtacagaactgtctacaaatgttttcagacagactggttgaaatttatgcatttttctatttgttaattttgattttcatgattttgaaatgcttcgtgataaagaaagtcatttaaaagtaaaagatag-----ACAC-T----A----AA-GA---G---TTC-----C--A--AA-TT--GA--------T-AGT--T--T-G----T--ACT-ACAT---GTC--AACG----A-GT-CTT-G--AGG--TA----C-A-G-AAC-TGT-CA--A--GAAACGT-CTTC----------ATACA----------GAC-TG--GTT-G-----A--A-ATTCA-------CGT--AGTTT-TCT-A--CTT-----------C-TT-----CA--T--TT-T-GA---TT-TT---CA-TGA------T-----TTTGA---A-A-T-GC-TT--T-GT-GA-----------T-ACA-GT-----C-A-TTTA-AA-A----G-T-AA---AGT-TAA--AC-A-GG-----TCTGT--ACCTCAA-GGC--------A---AAT-TC-ATAG-TA-C----A-------A-----------------ACT-------------------A-----------
gi|17 : A-GA---G---TTC-----C--A--AT-TT--GA--------T-AGT--T--T-G----T--ACT-A--T---G----AATT---T--GC-CTT-G--AGG--TA----C-A-G-ACC-TGT-TT--A--ACTTTAC-TTTT----------AAAT-----------GAC-TG--tcaaattggaactct
gi|18 : acactaaagagttccaaattgatagtttgtactacatgtcaacgagtcttgaggtacagaactgtcaagaaacgtcttcatacagactggttgaaattcacgtagttttctacttcttcattttgattttcatgattttgaaatgctttgtgataT-G--AGG--TA----C-A-G-AAC-GGT-TT--A--A------------------------------------GAC-TT--TTT-T-----A--A-ATTTA-------CGT--AATTA-CAT-A--TTT-----------G-TT-----GA--T--TT-T-G----TT-TTA--CA-TG------CT-----TTTGA---G-A-T-TC-TT--T-GT-AAT---AA----GT-A---GT-----C-A-TTTA-AA-A----G-T-AA---AGA-TTG--AC-A-GG-----TCTGT--ATCTCAA-GAC--------T---AGT-TG-ATAG-T--C----A-------A-----------------A---------------------A-----------C-----------TGTCGA
gi|18 : agaatcttcaaatattttagggatttcattgacatacatgaagaacaa-TC-A-----ACAC-T----G----AA-GA---T---TTC-----C--A--AA-TC--GA--------C-AGT--T--T-T----G--ACT-A--T---C----AAC----TA-GT-CTT-G--AGA--TA----C-A-G-ACC-TGT-tttggaaatcttcagtgttgag
gi|19 : agaatcttcaaatattttagggatttcattgacatacatgaagaacaatgaggtacagaacggtttaagacttttttaaatttacgtaattacatatttgttgattttgttttacatgcttttgagattctttgtaataagtagtcatttaaaagtaaagattgCAC-T----G----AA-GA---G---TTC-----C--C--AA-TT--GA--------T-AGT--T--T-G----T--ACC-A--T---C----AACT----A-GT-CTT-G--ACA--TA----C-A-G-AAC-GGT-TT--T--CAAATGT-CTAG----------AGATG----------GAC-TA--TTT-G-----A--A-ATTTA-------CAT--ATGTT-TCC-A--TTT-----------G-TT-----AT--T--TG-T-T----TT-TT---CA-TGA------T-----TTTGA---A-A-T-GC-TT--T-GT-GAT----AG---GT--AA-GT-----C-A-TTTA-AA-A----G-T-AA---AGA-TAG--AC-A-GG-----TCTGG--ACCTCAA-GAC--------T---AGT-TC-AGAG-TA-C----A-------A-----------------ACT-------------------A-----------g
gi|19 : ---G---TTC-----C--A--AA-TT--GA--------T-AGT--T--T-G----T--ACT-C--T---G----AAC----TA-GT-CTT-G--AGG--TC----C-A-G-ACC-TGT-CT--A--tcaatttggaacgt
gi|2 : cactgaagagttcccaattgatagtttgtaccatcaactagtcttgacatacagaacggttttcaaatgtctagagatggactatttgaaatttacatatgtttccatttgttatttgttttttcatgattttgaaatgctttgtgataggtaagtcatttaaaagtaaagaCTCAGTGAGATTGGTAGAAGCGAAAT-ATTT-GGACTGAT-C--GC-TC-TACCAATCTCAGACCAATGTAACAACCTTATTCGGGAAAGTTTGCCTCAACTTCCGCCGCCTGTTG-CGAT-TAAAA--TGGCT-TAAACTGA-ACATCT-TGTT-CAGAAAA---TTCA-GATTTTT-ATCTTAGGTATC--------CTACTAA--CTCCC----TA--TCACAAT--GAAACTTGCATTTC--TTACCTTTTCAT--GGT-GTT---------AAATCCCTATATCAAGTT-GGTTATTTTGAC-GCTCCT-TT-A-----GTGC-T----G----AA-GA---G---TTC-----C--A--AAATT--GA--------T-AGT--T--T-G----T--ACT-A--T---G----GATT---TA-GT-CTT-G--AGG---A----C-ACG-AAC-GGT-TT--A--AAATTGT-TTTC----------AGATA----------GAC-TG--TTT-A-----G--T-ATTTA-------CGT--AGTTT-ACT-A--TTT-----------G-TT-----AA--T--TT-T-G----TT-TT---CA-TGA-----TT-----TTTGA---A-A-T-GC-TT--T-TT-GAC---AAA---GT-AAA-GT-----C-A-TTTA-AA-A----G-T-AC---AGA-TAA--AC-A-GA-----TCTGT--ATCTTAA-GAC--------T---AGT-TG-ATAG-TA-C----A-------A-----------------ACT-------------------A-----------G-----------TGTTGAGAAA--GCACAAAA----T--------GGAC-GTGAATAATA----ACCACTTGATTT-AAATT--GAGATTT----AACACT--ATGAAA-AG--GTAAGAAATGCAAGTTT---TATTGTG--ATAGG---GA-GT--T----A--GTAGGA-TATC-TAA---G-TG-AA--AATC--TG-AAGC---GG----GA-AAG----ATGT-T--C-AGTTT--A--AGT-CAT-TTATA-AT-CGCA--A--CAGG-CGGTGGAAG--TTGGGGCA-AACTTTCCCTAATAAGGTTGTGTTACATTGGTTTGAG-ATTGG-TAGA-GCGATCAG--TCCAAATATTT-AGCTT--CT-ACC------A--ATCTCACTGAGATTAgt
gi|20 : C-T----G----AA-GA---G---TTC-----C--A--AA-TT--GA--------T-AGT--T--T-GAATGT--ACT-A--C---GTATCAACT----A-GT-CTT-G--AGG--TA----C-A-G-AAC-GGT-TT--A--CAAAT----TTC----------AGATA----------GAC-TG--TTT-G-----A--A-ATTTA-------CGT--AGTTT-CCT-A--TTT-----------G-TT-----AA--T--TT-T-G----------------------------------A---A-A-T-GC-TT--T-GT-GAT---AA----GT-A---GT-----C-A-TTTA-AA-A----G-T-AA---AGA-TAG--AC-A-GGTTTGCTTTGT--ATCTCCA-GAC--------T---AGT-TG--TAG-TA-C----AC------A-----------------ACT-------------------A-----------
gi|20 : a----G----AA-GAA--G---TTC-----C--A--AA-TT--GA--------T-AGT--TG-T-G----T--ACT-A--C--------AAC----TA-GT-CTG-G--AGA--TA----C-A-A-AGC---------A--AACCTGT-CTtcaatttggaacttcttc
gi|21 : actgaagagttccaaattgatagtttgaatgtactacgtatcaactagtcttgaggtacagaacggtttacaaatttcagatagactgtttgaaatttacgtagtttcctatttgttaattttgaaatgctttgtgataagtagtcatttaaaagtaaagat--AAAATGT-CGTC----------AGACA----------GAC-TG--GTT-G-----A--T-ATTTA-------TGT--AGTTT-TCT-A--TTT-----------G-TT-----AA--T--TT-T-GA---TT-TT---CA-TAA------T-----TTTGA---A-A-T-GC-TT--T-GT-GAT---AAA---G--AAA-AT-----C-A-TTTA-AA-T----G-T-AA---AGA-TAG--AC-C-GG-----CCTGT--ACTTTAA-GAC--------T---AAA-TC-ATAG-TA-C----A-------A-----------------ACTATCAATTTGGAACTCTTC-A-----------G-----------TGTCGAGAAA--GCACAAAA----T--------GTAT-GTGAA-AATA----ACC
gi|22 : tacgaatgtgtcttaaagt-A-----ACAC-T----G----AA-GA---G---TTC-----C--A--AA-TT--GA--------T-AGT--C--T-G----T--ACT-A--T---GT---AATTCA-TA-TT-CTT-G--AGA--TA----C-A---AAC-CGC-T
gi|22 : caccttagatatcctactacatgtaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttctg-GAT---AAA---G--AAA-GT-----C-A-TTTA-AA-A----G-TAAA---AGA-TAG--AG-C-GG-----TTTGT--ATCTCAA-GAA--------TATGAAT-TACATAG-TA-C----A-------G-----------------ACT-------------------A-----------ctatcttttacttttaaatgactttctttatc
gi|23 : caccttagatatcctactacatgtaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttctgaacactgaagagttccaaattgaT--T--T-G----T--AGT-A--T---C----AATT---T--GT-CTG-G--AGG--TA----C-G-G-CAC-TGC-TG--A--AAATTGC-CTTC----------AAAGA----------GAA-TG--GTT-A-----A--G-ATTTA-------CAT--AGTTT-TCT------T-----------G-TT-----A---T--CT-T-A----AT-TT---CA-TG------CT-----TTTAA---A-A-T-GC-TT--T-GC-GTT---AG----GT-AAA-AT-----C-A-TGTATAA-A----G-T---------------------G-----T-TGT--ACTTCAA-GATA-------C---AGA--G-ATAG-TA-C----A-------A-----------------GCT-------------------A-----------A-----------TAT---GAAA--
gi|23 : tgtC-A-----ACAC-T----G----AA-GA---G---TTC-----C--AACAA-TC--TATTTCATATT-AGC--T--T-G----T--ACT-A--T----------CTCTGTA--T-CTT-G--AAG--TA----C-----AAC-ACT-TT--A--tagattgttggaactcttcagtgttg
gi|24 : tgttttgtagtatcaatttgtctggaggtacggcactgctgaaaattgccttcaaagagaatggttaagatttacatagttttcttgttatcttaatttcatgcttttaaaatgctttgcgttaggtaaaatcatgtaTATTTTAATTGTGCCT-TC-TCT---ACAC-C----A----AA-GA---G---TTC-----T--A--AA-TTT-GA--------T-AGT--T--T-G----T--ACC-A--T---C----AACT----A-GT-CGA-G--AGG--TA----C-A-G-AAC-TGT-CC--A--AAATTGT-CCTC----------AGACA----------GAC-TG--GT--G-----A--A-TTCTA-------TGT--AGTTT-TCT-A--TTT-----------G-TTG----AA--T--TT-G-A----TT-TT---CA-GGA-----TT-----TTGTA---A-A---GC-TT--T-GT-GAT---AAG---G
gi|25 : acattaattttttgtag--ATGTGA-AG--GTAAGAAATACAAGTTT---GATAATG--ATAGG---GA-GT--T----A--ATAGGT-TGTC-TAA---GATA-AA--AATC--TC-AAGC---AG----G--NNN----NNNN-N--N-NNNNN--N--NNN-NNN-NNNNN-NN-NNNN--N--NNNN-NNNNNNNNN--NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NTCGG-AACA-G------G--TCC---------AGCCT--CG-ACG------A--ATCTCGCTGAGATtatgtgaaaataacctac
gi|26 : C-T----G----AA-GA---G---TTC-----C--A--AA-TTTTGA--------T-AGT--T--T-G----T--ACT-A--T---C----AACC----A-GT-CTT-G--AGG--TA----C-A-A-AAC-GGT-TT--T--AAAATGT-CTTC----------AGATATATGTAGATAGAC-TA--TTC-G-----C--A-ATTTA-------TGC--ATTTT-TCT-A--TTT-----------G-TT-----AA--T--TT---G----TTATT---CG-TGA-----TT-----TT-GA---G-A-T-GT-TT--T-GT-GAT---AA----GT-AAA-GT-----C-A-TTTA-AA-A----G-T-AA---AGA-TAG--AC-A-GG-----TATGT--ACCTCA
gi|27 : a-TC-A-----ACGC-T----GTTCAAA-AA---G---TTC-----C--A--TA-TT--GA--------T-AAT--T--T-G----T--GCT-A--T---T----AACT----A-GT-CTT-G--TGG--TA----C-A-G-AAA-TGT-CT--A--AAAATGT-CTTC----------AG--A----------GAC-TG--GTT-A-----A--A-A---A-------CAT--A-TTT-TCT-G--TTT-----------G-TT-----AA--T--TC-T-GA---TT-TT---CA-TGA------T-----TTTGA---A-A-A-GC-TT--T-GT-GAT---AAGTTTAT-TAA-GT-----A-A-TTTA-AA-A----G-T-AG---AGA-TGG--AC-A-
gi|28 : c-----ACGC-T----G----AA-GA---G---TGC-----C--A--AT-TT--GA--------T-AGT--T--T-G----T--ACT-A------G----CAAT---TA-GT-CTT-G--AGG--TA----C-A-G-AAC-GGT-TT--A--AAAATGT-CTTC----------AGATA----------GAA-TA--TTT-G-----A--A-ATTTA-------CGT--AGTTT-TCT-A--TTT-----------G-TT-----AA--T--TT-T-G----TTATT---CG-TGA------T-----TTTGA---------------------------GAA---GT-AAA-G--------A-TT--------------------------G--AC-A-GG-----TATGT--ACTTCAA-GAC--------T---AGT-TA-ATAG-TA-C----tatcc
gi|29 : -G--AGG--TA----C-A-G-AAC-TGT-CC--A--AAAATGT-TTTC----------AGACA----------GAT-TG--GTT-G-----A--A-ATTTG-------CGT--G-----------------------------------AA--T--TT-T-GA---TT-TT---CA-TGA-----TT-----TT-GA---A-A-T-GT-TT--T-GT-GAT---AA----GT-AAA-GC-----C-A-TTTA-AA-A----G-T-AA---AGA-TAG--AC-A-GG-----TCTGT--ACCTCAACTAC--------T---AAT-TC-ATAG-TA-C----A-------A-----------------ACT-------------------A-----------gg
gi|29 : -----ACAC-T----G----AA-GA---T---TTC-----C--A--AA-TT--AA--------T-AGT--T--T-G----T--ACT-A--T---G----AA-T---TA-GTAGTT-G--AGG--TA----C-A-G-ACC-TGT-CT--A--ttaatttggaaatcttcagtgt
gi|3 : gaggtacagaactgtccaaaaatgttttcagacagattggttgaaatttgcgtgaattttgattttcatgattttgaaatgttttgtgataagtaaagccatttaaaagtaaagaAGTGAGATTGGTAGAAGCGAAAT-ATTTTGGACTGGT-C--GC-TC-TACCAATCTCAGACCAATGTAACAACCTTATTCGGGAAAGTTTGCCTCACCTTCCGCCGCCTGTTG-CGAT-T-AAA--TGGCT-TTAACTGA-ACATCT-TGTT-CAGAAAAT--TTCA-GATTTTT-ATCTTAGGTATC--------CTACTAA--C-CCC----TA--TCACAAT--GAAACTTGCATTTC--TTACCTTTTCAT--GGT-GTT---------AAATCCCTATATCAAGTT-GGTTATTTTGAC-GTCCAT-TT-A-----GTGC-T----G----AA-GA---G---TTT-----CCAA--AA-TT--GA--------T-AGT--T--T-G----T--ACT-A--T---G----GA-T---TA-GT-CTT-G--AGG--CA----C-A-G-AAC-GGT-TT--A--AAA-TGT-TTTC----------AGATA----------GAC-TG--TTT-G-----AT-A-TTTTA-------CGT--AGTTTAACT-A--TTT-----------G-TT-----AA--T--TT-T-G----TT-TT---CA-TGA------T-----TTTGA---A-A-T-GC-TT--T-TT-GAC---AAA---GT-AAA-GT-----C-A-TTTA-A---------T-AAC--AGA-TAA--AC-A-GA-----TCTGT--ATCTTAA-GAC--------T---AGT-TG-ATAG-TA-C----A-------A-----------------ACT-------------------A-----------G-----------TGTTGAGAAA--GCACAAAA----T--------GGAC-GTGAA-AATA----ACCCCTTGATTT-AAATT--GAGATTT----AACACT--A-GAAA-AG--GTAAGAAATGCAAGTTT---TATTGTG--ATAGG---GA-G---T----A--GTAGGA-TATC-TAAG--G-TG-AA--AATC--TG-AAGC---GG----GC-AAG----ATGT-T--C-AGTTT--A--AGT-CAT-TT-TA-ATACGCA--AACTAGGCCGGTGGAAG--TT-GGGCACAACTTTCCCTAATAAGGTTGTGTTACATTGGTTTGAG-ATTGG-TAGA-GC-ATCAG--TCCAATAATTT-AGCTT--CTAACC------A--ATCTCACTGAGATTA
gi|30 : A-GT--T----A--GTAGAA-TGTC-TAA---GGTG-AA--AAAT--TG-AAGC---GG----GC-AAG----A---------AATT------NNN-NNN-NNNNN-NN-NNNN--N--NNNN-NNNNNNNNN--NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-ATCGG-GAAA-GGCACCAG--TCCA---ATTT-TGACG--CT-AGCGAGGATA--ATCTCACTGAGATTA
gi|31 : CTTGATTTCAAATT--GAAATTT-----ACACT--ATGTAAGAG--GTGAATAAAG-AAGTTTTGCTATTGTT--CTAAG---GA--T--T----A--GGTGGA-TGTC-CAAG--G-TGAAA--AATT--TGTAAGC---GG----GCTGAG----TGGTGT--C-AATTT--ACTACC-AAT-TATTA-AT-CGCAGGA--CAAG-CGCCG--AGTTTTGAGACA-A
gi|32 : -GT--T----A--GTAGGA-CGTC-TAAT--G-TG-AA--AATT--TA-AAGC---G--------AAG----A--C-N--N-NNNNN--N--NNN-NNN-NNNNN-NN-NNNN--N--NNNN-NNNNNNNNN--NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNGGTAAAA-GCGACCAGGTCCCAAATATTT-AGCCT--TT-A
gi|33 : -----C--A--GA-TT--GA--------T-AGT--T--T-G----T--ACT-A--T---G----AAGT----A-AT-CTA-G--AGG--TA------G-G-AAC------------------------------------ATA------------C-TG--GTT-A-----A--A-ATTTA-------CAT--AATTT-TCT-A--TTT-----------G-TT-----GA--T--TT-T-GA---TT-TT---CA-TGA-----TA-----TT-GA---A-A-T-GC-TT--T-GT-GAT----AA---GT-AAA-AT-----C-A-TTTA-AA-A----G-T-AA---AGG-TAG--AC-A-GT-----TCTGT--ACCT
gi|34 : -------------------A-----------G-----------TGTTGAGANN--NNNNNNNN----N--------NNNN-NNNNN-NNNN----NNNNNNNNNNNN-NNNNN--NNNNNNN----NNNNNN--NNNNNN-NN--NNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNN--NNNNN---GA-GT--TT---ATTGTAGGA-TGTC-TAA---GGTG-AA--AATT--TG-AAGC---Gttga
gi|36 : aactctac-G-AAC-TAT-TT--A--AAGATGT-CTTC----------AAACA----------GAC-TG--GTT-A-----A--A-ATTTA-------CATCTAGTTT-CCT-T--TTTTCGT-------G-CTTTTAAAA--TGACT-T-G----TG-TT---CAGTAA-----TTGTCATTCTAA---A-A-T-GC-T
gi|37 : ggtacagaaaactaaatttttc-TC-A-----ATAC-T----G----A-------------C-----T--A--AT-TT--CA--------T-CGTAAT--T-G----T--ACT-A--T---C----A-TT---TACG------G--AGG--TA----C-A-T-AAC-TGT-CT--A--AAGATGC-CTTC--------------A----------GAC-TG--GTT-ACATGTA--A-GTTTA-------CAT--A-TTT-TCT-T--TTT-----------
gi|38 : ttcT-----AA--T--TT-TTG----TT-TTTTCCA-TGA-----TT-----T--GA---A-AAT-GC-TT--T-GT-GAT----AA---GT-AAA-GTC----C-A-TTTG-AA-A----GTT-AA---AGta
gi|39 : catttgaccaaatcttcgttaagttccaacccgttgccTGA---A-A-T-GC-TT--T-GT-GAT---AAA---G--AAA-GT-----C-A-TTTG-AA-A----G-T-AA---GGA-TAT--AC-C-GA-----TTTGT--ACCTCAA-GAT--------T---AAC-TC-ATAA-AA-C----A-------A-----------------ACT-------------------A-----------taaa
gi|39 : C-T----G----AA-GA---G---TTC-----C--A--AA-TT--GA--------T-AGT--T--T-G----T--TTT-A--T---G----AG-T---TA-AT-CTT-G--AGG--TA----C-A-A-ATC-GGT-AT--A--TCCTTAC-TTTC----------AAAT-----------GAC-Ttcaatttggaactcttcagt
gi|4 : tgaaatgctttgtgataaagaa----TTCA-AATTT-C-ACCTTAGACAT----------TACTAA--CTCNN----NN--NNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNN--NNN-NNN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NN-N-----NNNN-N----NNNN-AA-GA---G---TTC-----C--A--AA-TTT-GA--------T-AGG--T--T-T----T--ACTCA--T---G----GAAT----A-GT-CTT-G--AGG--TA----AGA-G-AAC-GGT-TTT-A--AAAATGT-TTTC----------AGATA----------GAC-TG---TT-G-----A--A-ATTTA-------CGT--AGTT---CT-A--TTT-----------G-TT-----AA--T--AT---G----TT-A----CA-TGA-----AT-----TTTGA---A-A-G-GC-CTAAT-GTTGAC---TAA---GT-AAA-GT-------A-TTTA-AA-A----G-T-AA---AGA-TAAT-AC-A-GG-----TCTGT--ACCTTAA-GAC--------T---AGT-TT-GTAG-TAGC----A-------A-----------------ACTATCAATTTTGGAACTCTTCA-----------G-----------TGTT-AGAAN--NNNNNNNN----N--------NNNN-NNNNN-NNNN----NNNNNNNNNNNN-NNNNN--NNNNNNN----NNNNNN--NNNNNN-NN--NNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNN--NNNNN---GA-GT--T-------GTAGGA-TGTC-TAG---G-TG-AA--AATT--TG-AAGC---GGNNNNNN-NNN----NNNN-N--N-NNNNN--N--NNN-NNN-NNNNN-NN-NNNN--N--NNNN-NNNNNNNNN--NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTATTAA-CAG--GCACCCAG--TCCAAA-ATTT-AGCCT---T-ACC---------ATC-CACTGAGATTt
gi|42 : agc----TT-TT---CA-CG------TT-----TTTGA---A-A-T-GC-TT--T-GT-GAT----AA---GTGAAA-GT-----C-A-TTT--AA-A----G-T-AG---A
gi|43 : atttaaaCATA--------CTTCTAA--CTCTC----TAAATCACTAT--GAAACTTGCGTTTC--TTACCTATACAT--actacttgaagtagacc
gi|44 : t-----TTTGA---G-A-T-GC-TT--T-GT-G-T---AA----GT-AAA-GT-----A-A-TTGA-AA-A----G-T-AACTTAGA-TAG--AC-A-GG-----TCTGT--Atacggt
gi|45 : T-----TTTGACGCATA-N-GT-TT--T-GT-GAT---AA----GT-AAA-GT-----C-A-TTTA-AA-A----G-T-A---------------------------TAT--ACCTCAA-GAC--------T---
gi|46 : CAG--TCCAAAT-TTT-AGCTT--CT-ACC------A---TCTCACTGAGATTA
gi|47 : agactttgttggctgatgT-CTC-G--ATG--TA----C-A-G-AGA-TGT-CT--A--GAAATGT-CTAC----------AGACA----------GAC-TG--GTT-G-----A--A-ATTTA-------
gi|48 : tCAG--ATCAAATATTTTAGCTTATCT-ACC------A--ATCTCACTGAGATTA
gi|49 : ggactgatg--T----A--GTAGGA-TATC-TAA---GGTG-AC--CATT--TG-AAGC---AG----GC-AAG----AAAT-G--C-AGT
gi|5 : aa----TTCACAATTTTC-AACTTAGGTATC--------CT-CTAA--CTC
gi|5 : c----AA-GA-------TTC-----C--AG-AA-TT--GA--------TTAGT--T----G-------ACT-AC-T---G----GA-T---TA-GT-CTT-G--AGG--TA----C-A-GAAACGGGT-TT--C--ATA-TGT-TTTC----------AGATA----------GAC-TGTTTTT-G-----A--T-ATTTA-------CGT--AG-TT-TCT-A--GTTGATCGGTGTAGG-TC-----AAT-T--TT-T-GGTGTTT-TT---CATTGACCGAGTTA----TTTGA---A-A-G-CC-TT--T-GT-G-----CAA---GT-AAC-GTACATGC-A-CTTA-AA-A----T-C-GA---CAG-CAGTAAC-ACGG-----TCTGTAAACCTTAA-GA---------T---AGT----ATAG-TA-C----A-------AG----------------ACT-------------------A-----------nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagattccagaattgattagttgactactggattagtcttgaggtacagaaacgggtttcatatgttttcagatagactgtttttgatatttacgtagtttctagttgatcggtgtaggtcaatttttggtgtttttcattgaccgagttatttgaaagcctttgtgcaagtaacgtacatgcacttaaaatcgacagcagtaacacggtctgtaaaccttaagatagtatagtacaagactatcaatttgaacttctctacagtttgagtggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggttagtagaagtatctagagggtgagaaatgaaggcgggcaaggaatgttcgagctttgaaatc
gi|5 : cttcacaattttcaacttaggtatcctctaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTCCAC-TC-A-----A-AC-T----G----TA-GA---GAAGTTC--------A--AA-TT--GA--------T-AGTC-T--T-G----T--ACT-A--T---------ACT------AT-CTT-A--AGGTTTA----C-A-G--AC-CGTGTT--A--tcaatttgaacttctctacagtttgagtggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggttagtagaagtatctagagggtgagaaatgaaggcgggcaaggaatgttcgagctttgaaatc
gi|5 : cttcacaattttcaacttaggtatcctctaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagattccagaattgattagttgactactggattagtcttgaggtacagaaacgggtttcatatgttttcagatagactgtttttgatatttacgtagtttctagttgatcggtgtaggtcaatttttggtgtttttcattgaccgagttatttgaaagcctttgtgcaagtaacgtacatgcacttaaaatcgacagcag-GT--T----A--GTAGAAGTATC-TAGAGGG-TG-AG--AAAT--GA-AGGC---GG----GC-AAGGA--ATGT-T--CGAGCTTTGA--AAT-Cannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggttagtagaagtatctagagggtgagaaatgaaggcgggcaaggaatgttcgagctttgaaatc
gi|50 : cttcacaattttcaacttaggtatcctctaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagattccagaattgattagttgactactggattagtcttgaggtacagaaacgggtttcatatgttttcagatagactgtttttgatatttacgtagtttctagttgatcggtgtaggtcaatttttggtgtttttcattgaccgagttatttgaaagcctttgtgcaagtaacgtacatgcacttaaaatcgacagcagtaacacggtctgtaaaccttaagatagtatagtacaagactatcaatttgaacttctctacagtttgagtggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagTTGTG--ATATG---GA-GT--T----A--GTAGGA-TGCCTTAG---G-TG-AA--AATC--TG-AAGC---GG----
gi|51 : A-GT--T----A--GTAGGA-TGTC-CGA---GGTG-AA--AAGT--TG-AAGC---GG----GC-AAG----A
gi|52 : AG--ACCAAATATCT-AGCCT--CT-GTC------A--ATCTTGCTGAGAT
gi|53 : TA-AA-A----G-T-AA---AGA-TAA--AC-A-GG-----TCTGT--ACCTCAG-Gtatc
gi|6 : CCGCCTGTTGATGAT-TAAAAAATGACA--AAACTGA-A-ATATACGCC-CGC-------TTCA-AATTTTC-ACCTTAGACATC--------CTACTAA--CTCNN----NN--NNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNN--NNN-NNN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NN-N-----NNNN-NNNN-G----AA-GA---G---TTC-----C--A--A--TT---A--------T-AGT--TGTT-T----T--ACT-A--TTG-G----AA-T---TA-GT-CTTTG--AGG--TA----C-A-G-AAC-GGT-TTTTA--AAAATGTTCTTC----------AGATA----------GAC-TG--TTTTG-----A--A-ATTTA-------CGT--AGTTT--CT-A--TT------------G-TT-----AA--T--TT-G-T----TT-TT---CA-TGA-----TT-----TTTGA---A-A-T-GC-TT--T-GT-GAC----AA---GT-AAA-GT-----CGA-TTTA-AA-A----G-T-AA---AGA-TAA--A--A-GG-----TCTTT--ACCTTAA-GAC--------T---AGT-TG-ATAG-TA-C----A-------A-----------------ACTATCAATTGTGGAACTCTTCA-----------G-----------TGTTGGGAAA--GCACAAAA----TCTTATGNNNNNN-NNNNN-NNNN----NNNNNNNNNNNN-NNNNN--NNNNNNN----NNNNNN--NNNNNN-NN--NNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNN--NNNNG---GACGT--TATTAA--GTAGG--TTTC-TAAG--G-TG-AA--AA----TG-AAGC---GG----
gi|7 : CTCAGTGAGAT-GGTAAAGGCTAA-T-ATTT-GG-CTGGTTC--GCCTT-TACCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNN-NNNNN--NNNNN-NNNNNNNN-NNNNNN-NNNC-CCGC------TTCA-AATTTTC-ACCTTAGACATC---------TACTAATCNNNNN----NN--NNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNN--NNN-NNN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NN-N-----NNNN-N----G----AA-GA---G---TTC-----C--A--AA-TT--GA--------T-AGT--T--T-G----T--ACT-A--T---G----GAAA---TA-GT-CTT-G--AGG--TA----G-A-G-AAC-GGT-TT--A--AAA-TGT-TTTC----------AGA------------GAC-TG--TTT-G-----A--A-ATTTA-------CGT--AGTTT-TCT-A--TTT-----------G-TT-----AA--T--AT-T-GT---TT-TT---CA-TGA------T-----TTTGA---A-A-T-GCTTT--T-GT-GAC----AA---GT-AAA-GT-----C-A-TTTA-AA-A----G-T-AA---AGA-TAA--AC-A-GG-----TCTGT--A-CTTAA-GAC--------T---AGT-TG-ATAG-TA-C----A-------A-----------------ACT-------------------A-----------
gi|7 : taatC-A-----ACAC-T----G----AA-GA---G---TTC-----C--A--AA-TT--GA--------T-AGT--T--T-G----T--ACT-A--T---C----AAC----TA-GT-CTT----AAG--TA----C-A-G-ACC-TGT-TT--A--tcaatttggaactcttcagtgttg
gi|8 : taatctcagtgagatggtaaaggctaatatttggctggttcgcctttaccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncccgcttcaaattttcaccttagacatctactaatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaagagttccaaattgatagtttgtactatggaaatagtcttgaggtagagaacggtttaaaatgttttcagagactgtttgaaatttacgtagttttctatttgttaatattgtttttcatgattttgaaatgcttttgtgacaagtaaagtcatttaaaagtaaagaTCAGTGAGATTGGTAGAG-CGAAATTATTT-GGACTGGT-CA-GC-TCATACCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNN-NNNNN--NNNNN-NNNNNNNN-NNNNNN-TGTTGCAGAAGAGATTTCA-GATTT---ATCTTAGGTATC--------CTAC-AA--CTCCCGNN-NN--NNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNN--NNN-NNN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NN-A-----GTGCAT----G----AAAGA---G---TTC-----C--A--AA-TT--GA--------T-AGT--T--T-G----T--ACT-A--T---G----GA-T---TA-GT-CTG-G--AGG--CA----C-A-G-AAC--GT-TT--A--AAATGTT-TTTC----------AGATA----------GAC-TG--ATTTG-----A--GTATTTA-------CGT--AGTTT-ACTTA--TTTT----------G-TT-----AA--T--TT-T-G----TT-TT---CA-TGA-----TT---------G---A-A-T-GC-TT--T--T-GAC---A-----GT-AAA-GT-----C-A-TT-A-AA-A----G-T-AC---AGA-TAA--AC-A-GA-----TCTGT--ATCTTAA-GAC--------T---AGTATG-ATAGTTA-C----A-------A-----------------A
gi|9 : ctaat---GA-GT--T----A--GTATGA-TGTC-TAAG--G-TG-AT--AATA--TG-ATGC---GG----G--NNN----NNNN-N--N-NNNNN--N--NNN-NNN-NNNNN-NN-NNNN--N--NNNN-NNNNNNNNN--NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NTCGG-AAGA-G------G--TTC-------C-AGCCT--CG-ACG------AATATCTCGTTGAGATTAact
gi|9 : TCA-TATTATC-ACCTTAGACATC--------ATACTAA--CTCNN----NN--NNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNN--NNN-NNN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-NNNNTTCTC-A-----ACAC-T----G----AA-GA---G---TTC-----C--A--AA-TC--GA--------T-AGT--T--T-G----C--ACT-A--T---G-----ATT---TA-GT-CTT-G--AGG--TA----C-A-A-ACC-TG-----------ACTAT-CTTT--------------------------AC-T----TT-T-----A--A-AT-----------G---AATTT-GCT-T--TTT-----------A-AC-----AA--------A-G------------CA----------T-----TTTGA---A-A-T-G--------AT-GA----AAA---TC-AAA-ATTAACAC-A-TAGA-AA-ACTATG-T-AA---AAT-TCA--AC-C-AG-----TCTGT----CTAAA-GACATTTTAGAT---AGT-T---CAG-TA-CCTCAA-------A-----------------ACT-------------------A------------------------GTTGAT--A--GTACAATA----T--------GGAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttctcaacactgaagagttccaaatcgatagtttgcactatgatttagtcttgaggtacaaacctgactatctttacttttaaatgaatttgctttttaacaaagcattttgaaatgatgaaaatcaaaattaacacatagaaaactatgtaaaattcaaccagtctgtctaaagacattttagatagttcagtacctcaaaactagttgatagtacaatatggaactcttcagtgtt
gi|9 : taatctcaacgagatattcgtcgaggctggaacctcttccgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncccgca-A-----ACAC-T----G----AA-GA---G---TTC-----C--A-------------------T-A----T--T-G----T--ACT-A--T---C----AACT----A-GT-TTT-G--AGG--TA----C-T-G-AAC-TAT-CT--A--AAA-TGT-CTTT----------AGACA----------GAC-TG--GTT-G-----A--A-TTTTA-------CAT--AGTTT-TCT-A--TGT-----------G-TT-----AA--T--TT-T-GA---TT-TT---CA-TCA-----TT-----TC-AA---A-A-T-GC-TT--T-GT-TAA---AAA---GC-AAA-TT-----C-A-TTTA-AA-A----G-T-AA---AGA-TAG--TC-A-GG-----TTTGT--ACCTCAA-GAC--------T---AAA-TC-ATAG-TG-C----A-------A-----------------ACT-------------------A-----------actcttcagtgtt
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|35 ): GTTGAGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAGTTAGTAGTGATATCAAGGGAAAATCATGAAGGCGGG
Unaligned ( gi|40 ): TAGACAAATTGATAGTACAAACTAATACGAAGTAGCCTGTTGGAACTTTTTAGTGTTGAGAGGCATATCAATATTCACAGCATGCAGC
Unaligned ( gi|41 ): TATTCTGTTAATTTCGTTTTATGATTTCAAGCTTGAATACTTCTGACAAGAGGCATTGAAATGAAATATAGATAAATAGAC
Alignments
lowQualScore : 11 3333333 11 111111111 111111111 2222222222222222 1111111111 11111111111 1111 111111 111111111 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1111111111111 11111 111 22222 11111111111111 1111 111111111
lowQualScore : 0 5 5 0 8 8 0 8 99 8 8 4 4 4 4 0 77 6 2 99 0 99 777 777 6 8888888 33 3 333333333 0 44 7777 44 1 44 0 2 44 1 1 44 3 444444444 11 2 4 3 1 1 4 1 22 2222 1 4444 66666 222 111 22222 11 33 1 5555555 44 1 44444444 1 1 22 22 1 2222 11 1 22 2222222222222222 1 1 0 11 11 2222 0 0 0 3 0 22 1 2 1 0000000000 1 5555555555 1 666 1 33333 33 1 4444444 11 3 1 1 11 00000000000 1 44444 44 11 1 1 2222 5 444 2 333333 44444 0 222 1 1 1 1 11 1 2 222222222 1 1 66666 1 1 1 1 2222 1 2 333 3 22 1 1 44444 33 1 66666666 555 1 88 1 1 3333 7777777 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 55 8888888888888 4 8 9999 0 4 66 11111 55 0 1 4 55 0 0 777 55 222 2 33 6666 33 2 2 33333 2 33 444 2 333 5555 77 88888888888888 77777 3 5555 4 8888888888 4 2 55 777 1 1 4 333 0 0 0 5 66 5 9999 55 88 3 55 3 222222222 1
lowQualScore : . . . . . . . . .. . . . . . . . .. . . .. . .. ... ... . ....... .. . ......... . .. .... .. . .. . . .. . . .. . ......... .. . . . . . . . .. .... . .... ..... ... ... ..... .. .. . ....... .. . ........ . . .. .. . .... .. . .. ................ . . . .. .. .... . . . . . .. . . . .......... . .......... . ... . ..... .. . ....... .. . . . .. ........... . ..... .. .. . . .... . ... . ...... ..... . ... . . . . .. . . ......... . . ..... . . . . .... . . ... . .. . . ..... .. . ........ ... . .. . . .... ....... ............................................................... .. ............. . . .... . . .. ..... .. . . . .. . . ... .. ... . .. .... .. . . ..... . .. ... . ... .... .. .............. ..... . .... . .......... . . .. ... . . . ... . . . . .. . .... .. .. . .. . ......... .
lowQualScore : 8 0 0 8 0 0 8 0 00 0 0 8 4 8 4 2 22 7 5 22 5 22 222 222 7 4444444 22 3 999999999 5 22 1111 66 0 66 9 2 66 0 0 66 6 555555555 22 9 0 1 0 0 0 7 00 4444 1 3333 99999 888 888 55555 44 88 0 2222222 88 0 66666666 0 0 33 33 0 1111 33 0 33 8888888888888888 0 0 9 33 33 0000 9 9 9 1 9 44 0 4 2 9999999999 0 5555555555 2 888 2 11111 00 2 1111111 88 1 3 3 88 22222222222 3 55555 44 88 3 3 7777 0 777 5 555555 11111 7 000 1 1 1 1 66 2 3 222222222 1 1 99999 1 1 1 1 4444 1 2 111 5 88 2 2 22222 33 4 99999999 444 6 11 6 6 4444 1111111 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 00 0000000000000 4 9 4444 2 4 11 44444 55 9 0 0 55 9 5 000 00 777 4 11 9999 11 2 2 77777 2 11 555 2 999 0000 55 77777777777777 77777 6 5555 0 8888888888 0 3 00 444 6 6 0 666 1 6 9 0 00 0 6666 00 66 6 00 6 999999999 2
consensus : CTCAGTGAGATTGGTAGAGGCGAAAT-ATTT-GGACTGGT-C--GC-TC-TACCAATCTCAGACCAATGTAACAACCTTATTCGGGAAAGTTTGCCTCAACTTCCGCCGCCTGTTG-CGAT-TAAAA--TGGCT-TAAACTGA-ACATCT-TGTC-CAGAAA----TTCA-GATTTTC-ACCTTAGACATC--------CTACTAA--CTCCC----TA--TCACNAT--GAAACTTGCATTTC--TTACCTNTNCAT--GGT-GTT---------AAATCCCNATATCAAGTT-GGTTATTTTGAC-GTNCNT-TC-A--AC----AC-T----G-----AAGA---G---TTC-----C--A--A-A-------TT--G-A--------T-AG-T--T--T-G----T--ACT-A--T---G----AACT---TA-GT-CTT-G--AGG--TA----C-A-G-AACNGT-TT--A-AAAATG-TCTT-C----------AGATA----------GAC-TG--NTT-G-----A--A-ATTTA-------CGT--AGTTT-TCT-A--TTT-----------G-TT-----AA--T--TT-T-G----TT-TT---CA-TGA-----TT-----TTTGA---A-A-T-GC-TT--T-GT-GAT---AAA---GT-AAA-GT-----C-A-TTTA-AA-A----G-T-AA---AGA-TAG--AC-A-GG-----TCTGT--ACCTCAA-GAC--------T---AGT-TG-ATAG-TA-C----A-------A-----------------ACT-------------------A-----------G-----------TGTTGAGAAA--GCACAAAA----T--------GGAC-GTGAA-AATA----ACCACTTGATTT-AAATT--GAGATTT----AACACT--ATGNAA-AG--GTAAGAAATGCAAGTTT---TATTGTG--ATAGG---GA-GT--T----A--GTAGGA-TGTC-TAA---G-TG-AA--AATT--TG-AAGC---GG----GC-AAG----ATGT-T--C-AGTTT--A--AGT-CAT-TTNTA-AT-CGCA--A--CAGG-CGGCGGAAG--TTGGGGCA-AACTTTCCCTAATAAGGTTGCGTTACATTGGTTTGAG-ATCGG-NAGA-GCGACCAG--TCCAAATATTT-AGCCT--CT-ACC------A--ATCTCGCTGAGATTA
Reference ( family-297 ) : CTCAGTGAGATTGGTAGAGGCGAAAT-ATTT-GGACTGGT-C--GC-TC-TACCAATCTCAGACCAATGTAACAACCTTATTCGGGAAAGTTTGCCTCAACTTCCGCCGCCTGTTG-CGAT-TAAAA--TGGCT-TAAACTGA-ACATCT-TGTC-CAGAAA----TTCA-GATTTTC-ACCTTAGACATC--------CTACTAA--CTCCC----TA--TCACNAT--GAAACTTGCATTTC--TTACCTNTNCAT--GGT-GTT---------AAATCCCNATATCAAGTT-GGTTATTTTGAC-GTNCNT-TC-A--AC----AC-T----G-----AAGA---G---TTC-----C--A--A-A-------TT--G-A--------T-AG-T--T--T-G----T--ACT-A--T---G----AACT---TA-GT-CTT-G--AGG--TA----C-A-G-AACNGT-TT--A-AAAATG-TCTT-C----------AGATA----------GAC-TG--NTT-G-----A--A-ATTTA-------CGT--AGTTT-TCT-A--TTT-----------G-TT-----AA--T--TT-T-G----TT-TT---CA-TGA-----TT-----TTTGA---A-A-T-GC-TT--T-GT-GAT---AAA---GT-AAA-GT-----C-A-TTTA-AA-A----G-T-AA---AGA-TAG--AC-A-GG-----TCTGT--ACCTCAA-GAC--------T---AGT-TG-ATAG-TA-C----A-------A-----------------ACT-------------------A-----------G-----------TGTTGAGAAA--GCACAAAA----T--------GGAC-GTGAA-AATA----ACCACTTGATTT-AAATT--GAGATTT----AACACT--ATGNAA-AG--GTAAGAAATGCAAGTTT---TATTGTG--ATAGG---GA-GT--T----A--GTAGGA-TGTC-TAA---G-TG-AA--AATT--TG-AAGC---GG----GC-AAG----ATGT-T--C-AGTTT--A--AGT-CAT-TTNTA-AT-CGCA--A--CAGG-CGGCGGAAG--TTGGGGCA-AACTTTCCCTAATAAGGTTGCGTTACATTGGTTTGAG-ATCGG-NAGA-GCGACCAG--TCCAAATATTT-AGCCT--CT-ACC------A--ATCTCGCTGAGATTA
gi|1 : GTGAGATTG-TAAAGCT--AAT-ATTT-GGA-TGAT-CCAAC-TC-TACCAATCTCAGAACAATGT--CAAG--TATTGGAGAAAAT--GAAT-AATTACTGTGGGTAGTTG-AGATCTAAAA--TGCCTCTATATTGACAAAT-T-GGCC-CAGGACCTTTTTTA--ATTTTCTAAATTGGGTATA--------TT--TAA--TTTTCAGAATA--TCAAAGTTAGAGAGT-GT-TTTCAATTAATTTTATAA--GGTTGTTTATCAATAAAAATTTAAAT-TTAAGTTTGGTTATTATGAC-GTATAT-T--A--ATTGTTATGT----G-----AATA---G---TTCACACCC--A--A-C-------TT--C-A--------T-AG-G--T--T-A----TCTGCT-A--TATCG----GA-T---TA-TT-TTT-GTAAGA--TAATAAC-A-C-GACAGG-TT--ATCAAATGATGTT-T----------AGATA----------GAA-TG---TT-G-----ATTA-ATTTA--------GT--A--TT-TCT-AAATTT-----------GATT-----AAGCT--TTAT-G----TA-TTA--TA-TAA-----TA-----TTTGA---A-A-TTGA-TT--TAGT-GATGCAAAA---AT-ATATGT-----C-C-ATTA-AATA----G-T-AC---CGAATAA--ACCA-GGA----TCTGTCAAATTTAA--AC--------T---AGT----ATAG-AA-C----AGTCGATAA-----------------ACT-------------------ATCAATATTGGAGCTTCTTACAATTGTTGAGAAAAAGTGCCAAACAACT--------GGACCGTGAACAATATAATGCAAAATGATTT-AAACTCGGAGATTTGAAAAACACTTAATAGAG-AGAGGTAAGAA-TGCAAGTTT---TA-TGTGGTATAGGC--GA-GTACG----A--ATAGAA----A-TAA---A-AG-AGTCAATTTGTG-AAGCGGTGG----GT-AAATAGTATGT-TTAT-AGTTT--A--AGGACATATTGTACAT--G-A--A--CAGG-GAGAGCGAG---TGGGG-A-AA---TATCAGATAAGGTTGCGCTA
gi|10 : T-GAA-GA-----C-A-TTT------------T-AA---A--------AC-C-GT-----TTTGT--ACCTCAA--AC--------T---GGT-TG-ATAG-TA-C----A-------AAACTATCAAAATTTGGAACTCTTC---------------A-----------G-----------TGTTGAAAAN--NNNNNNNN----N--------NNNN-NNNNN-NNNN----NNNNNNNNNNNN-NNNNN--NNNNNNN----NNNNNN--NNNNNN-NN--NNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNN--NNNNNNN-GA-GT--T----A--GTAGGA-TGTC-CAAG--G-TG--A--AATA--TG-AAGC---GG----GN-NNN----NNNN-N--N-NNNNN--N--NNN-NNN-NNNNN-NN-NNNN--N--NNNN-NNNNNNNNN--NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NTCGG-AAGAGGCG-CAGG--TCCAAAT------------------------A--ATCTCACTGAGATT
gi|10 : T-TC-A--AC----AC-T----G-----AAGA---G---TTC-----C--A--A-A-------TTTTG-A--------T-AG-T--T--TTG----T--ACT-A--T---C----AACC----A-GT--TT-G--AGG--TA----C-A-A-AACGGT-TT--T-AAAATG-TCTT-CAGATATATGTAGATA----------GAC-TA--TTC-G-----C--A-ATTTA---------T--CATTT-TCT-A--TTT-----------G-TT-----AA-----TT-T-G----TTATT---CG-TGA------------TTTGA---G-A-T-GT-TT--T-GT-GAT----AA---GT-AAA-GT-----C-A-TTTA-AA-A----G-T-AA---AGATTAG--AC-A-GG-----TATGT--ACCTCgatatatgtagatagactattcgcaatttatcattttctatttgttaatttgttattcgtgatttgagatgttttgtgataagtaaagtcatttaaaagtaaagattagacaggtatgtacctc
gi|11 : aatctcagtgagattatttggacctgcgcctcttccgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncccgcttcatatttcaccttggacatcctactaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttG-----TTTGT--ACCTCAA-GAC--------T---GGT-TG-ATAG-TA-C----A-------AAACTATCAAATTTGGA-ACTCTTC---------------A-----------G-----------TGTTGAAAAN--NNNNNNNN----N--------NNNN-NNNNN-NNNN----NNNNNNNNNNNN-NNNNN--NNNNNNN----NNNNNN--NNNNNN-NN--NNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNN--NNNNNNNNGA-GT--T-------GTAGGA-TGTC-CAAG--G-TG--A--AATA--TG-AAGC---GG----G
gi|11 : aatctcaagtgagattatttggacctgcgcctcttcgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnT-TC-A--AC----AC-T----G-----AAGA---G---TTC-----C--A--A-AT------TT--G-A--------T-AGTT--T--T-G----T--ACT-A--T---C----AAC----CA-GT-CTT-G--AGG--TA----C-A---AACGGT-TT--T-AAAATG-TCTT-CAGATATATGTAGATA----------GAC-TA--TTC-G-----C--A-ATTTA---------T--CATTT-TCT-A--TTT-----------G-TT-----AA-----TT-T-G----TTATT---CG-TGA------T-----TTTGA---G-A-T-GT-TT--T-GTGGAT----AA---GT--AA-GT-----C-ATTTTA-AA-A----G-T-AA---AGAGTAG--AC-A-GG-----TATGT--ACCTCggttttaaaatgtcttcagatatatgtagatagactattcgcaatttatcattttctatttgttaatttgttattcgtgattttgagatgttttgtggataagtaagtcattttaaaagtaaagagtagacaggtatgtacctc
gi|12 : aatctcaagtgagattatttggacctgcgcctcttcgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncccgcttcatatttcaccttggacatcctacaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttC----AC-T----G-----AAGA---T---TTC-----C--C--A-A-------TT--G-A--------T-AG-T--T--T-G----T--ACC-A--T---C----AACT----A-GT-CTT-G--ACA--TA----C-A-G-AACGGT-TT--T-CAAATG-TCTA-G----------AGATG----------GACCTA--TTT-G-----A--A-ATTTA-------CAT--ATGTT-TCC-A--TTT-----------G-TT-----AT--T--TG-T-T----TT-TT---CA-TGA-----TT-----TT-GA---A-A-T-GC-TT--T-GT-GAT---AG----GT-AAA-GT-----C-A-TTTA-AA-A----G-T-AA---AGA-TAG--AC-A-GG-----TCTGG--ACCTCAA-GAC--------T---AGT-TC-AGAG-TA-C----A-------A-----------------ACT-------------------A-----------
gi|12 : ----TTCA--ATGTTC-ACCTTAGATATC--------ATACTAA--CTCNN----NN--NNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNN--NNN-NNN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NN-N--NN----NN-NNNNNG-----AAAC---G---TTC-----C--A--A-A-------TT--G-A--------T-AG-T--T--T-G----T--ACT-C--T---G----AAC----TA-GT-CTT-G--AGG--TC----C-A-G-ACCTGT-CT--A-tcaatttggaacgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagttagtatgatatctaaggtgaacattgaagcag
gi|13 : cactgaagatttcccaattgatagtttgtaccatcaactagtcttgacatacagaacggttttcaaatgtctagagatggacctatttgaaatttacatatgtttccatttgttatttgttttttcatgattttgaaatgctttgtgataggtaaagtcatttaaaagtaaaga----TTCA-GCTTTTG-ACTTTAGACATCGGATGATCCTACTAA--CTCCC----TA--TCACTAT--GCAACTTGCATTTC--TTACCTAAACATACGGT-GTT---------AAATCCgcag
gi|13 : cTTATTTTTAT-GCTTTC-TC-A--AC----AC-T----G-----AAGA---G---TTC-----C--A--A--------------------------------C--T-G----T--A---A--G---T----AATT---TA-GT-TC-------G--TA----C-G-------------------ATT-CTTT-C----------AAACA----------CAC-TG--GTT-A-----A--A-ATTTAAATAGATC-T--AGTTT-TCT-T--TTT-----------G-CT-----AAT-T--TT-T-A----TT-TT---CA-TG------TT-----TATGG---A-A-T-AT-TG--T-GT-GGT----AA---GT-AAA-GT-----T-A-TGTA-AT-A----G------------TAG--AC-A-GT-----TCCGT--ACCTTTA-GAC--------accaatcgcattccgccaaccatctcatcaacggcagttgggattcaataattaacgcatcgctgccagatttatttttatgctttctcaacactgaagagttccaactgtaagtaatttagttcgtacgattctttcaaacacactggttaaaatttaaatagatctagttttctttttgctaatttttattttcatgtttatggaatattgtgtggtaagtaaagttatgtaatagtagacagttccgtacctttagacaaat
gi|14 : cttcagcttttgactttagacatcggatgatcctactaactccctatcactatgcaacttgcatttcttacctaaacatacggtgttaaatccaccaatcgcattccgccaaccatctcatcaacggcagttgggattcaataattaacgcatcgctgccagatC----AC-T----G-----AAGA-------TTC-----C--C--A-A-------TT--G-A--------T-AG-T--T--T-G----T--ACC-A--T---C----AACT----A-GT-CTT-G--ACA--TA----C-A-G-AACGGT-TT--T-CAAATG-TCTA-G----------AGATG----------GAC-TA--TTT-G-----A--A-ATTTA-------CAT--ATGTT-TCC-A--TTT-----------G-TT-----AT--T--TG-T-T----TT-TT---CA-TGA------T-----TTTGA---A-A-T-GC-TT--T-GT-GAT----AG---GT-AAA-GT-----C-A-TTTA-AA-A----G-T-AA---AGA-TAG--AC-A-GG-----TCTGG--ACCTCAA-GAC--------T---AGT-TC-AGAG-TA-C----A-------A-----------------ACT-------------------A-----------aaat
gi|14 : ----TTCA--ATGTTC-ACCTTAGATATC--------ATACTAA--CTCNN----NN--NNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNN--NNN-NNN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NN-N--NN----NN-N----N-----NNGAAACG---TTC-----C--A--A-A-------TT--G-A--------T-AG-T--T--T-G----T--ACT-C--T---G----AAC----TA-GT-CTT-G--AGG--TC----C-A-G-ACCTGT-CT--A-tcaatttggaacgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagttagtatgatatctaaggtgaacattgaagcag
gi|15 : cactgaagattcccaattgatagtttgtaccatcaactagtcttgacatacagaacggttttcaaatgtctagagatggactatttgaaatttacatatgtttccatttgttatttgttttttcatgattttgaaatgctttgtgataggtaaagtcatttaaaagtaaagaG---GG-GT--T----A--GTGGGA-TGTC-TAAT--G-TG-AA--AATA--TG-AAGC---GG----gcag
gi|15 : CTT-TCTA--AC----AC-T----G-----GAGA---G---TTC-----C---------------CC--G-A---------------------------------A--T---G----A-------------TT-G--GG----A----C---G-AACTGC-CT--A-AAAACG-CCGA-C----------AGACA----------GAC-TG--GCT-A-----A--C-AT----------------G--------A--TTT--------------T-----GA--C--TT-C-T----TT-TT--------------TT-----TATGA---A-A-T-GC-TT--T-GT-GAT----AA---TT-AAA-GT-----T-A-TTGA-AA-A----G-T-AA---GCC-TAG--Aannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactttctaacactggagagttccccgaatgattgggacgaactgcctaaaaacgccgacagacagactggctaacatgattttgacttcttttttttatgaaatgctttgtgataattaaagttattgaaaagtaagcctagaa
gi|16 : ccgcttcatattttcacattagacatcccactaaccccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaa--AC----AC-T----G-----AAGA---G---TTC-----C--ACCA-A-------TT--G-A--------T-AA-T--G--T-G----T--ACT-A--T---T----AACT----A-GT-CTT-G--AGG--TA----C-A-G-AACTGT-CT--A-CAAATG-TTTT-C----------AGACA----------GAC-TG--GTT-G-----A--A-ATTTA-------TGC--ATTTT-TCT-A--TTT-----------G-TT-----AA--T--TT-T-GA---TT-TT---CA-TGA------T-----TTTGA---A-A-T-GC-TT--C-GT-GAT---AAA---G--AAA-GT-----C-A-TTTA-AA-A----G-TAAA---AGA-TAG--AG-C-GG-----TTTGT--ATCTCAA-GAA--------TATGAAT-TACATAG-TA-C----A-------G-----------------ACT-------------------A-----------a
gi|16 : C----AC-T----G-----AAGA---G---TTC-----C--A--A-A-------TT--G-A--------T-AG-T--C--T-G----T--ACT-A--T---GT---AATTCA-TA-TT-CTT-G--AGA--TA----C-A---AACCGC-Ttcaatttggaactcttcagtg
gi|17 : acactgaagagttccaccaattgataatgtgtactattaactagtcttgaggtacagaactgtctacaaatgttttcagacagactggttgaaatttatgcatttttctatttgttaattttgattttcatgattttgaaatgcttcgtgataaagaaagtcatttaaaagtaaaagatag--AC----AC-T----A-----AAGA---G---TTC-----C--A--A-A-------TT--G-A--------T-AG-T--T--T-G----T--ACT-ACAT---GTC--AACG----A-GT-CTT-G--AGG--TA----C-A-G-AACTGT-CA--A-GAAACG-TCTT-C----------ATACA----------GAC-TG--GTT-G-----A--A-ATTCA-------CGT--AGTTT-TCT-A--CTT-----------C-TT-----CA--T--TT-T-GA---TT-TT---CA-TGA------T-----TTTGA---A-A-T-GC-TT--T-GT-GA-----------T-ACA-GT-----C-A-TTTA-AA-A----G-T-AA---AGT-TAA--AC-A-GG-----TCTGT--ACCTCAA-GGC--------A---AAT-TC-ATAG-TA-C----A-------A-----------------ACT-------------------A-----------
gi|17 : AGA---G---TTC-----C--A--A-T-------TT--G-A--------T-AG-T--T--T-G----T--ACT-A--T---G----AATT---T--GC-CTT-G--AGG--TA----C-A-G-ACCTGT-TT--A-Atcaaattggaactct
gi|18 : acactaaagagttccaaattgatagtttgtactacatgtcaacgagtcttgaggtacagaactgtcaagaaacgtcttcatacagactggttgaaattcacgtagttttctacttcttcattttgattttcatgattttgaaatgctttgtgatacagtcatttaaaagtaaagT-G--AGG--TA----C-A-G-AACGGT-TT--A-A-------------------------------------GAC-TT--TTT-T-----A--A-ATTTA-------CGT--AATTA-CAT-A--TTT-----------G-TT-----GA--T--TT-T-G----TT-TTA--CA-TG------CT-----TTTGA---G-A-T-TC-TT--T-GT-AAT---AA----GT-A---GT-----C-A-TTTA-AA-A----G-T-AA---AGA-TTG--AC-A-GG-----TCTGT--ATCTCAA-GAC--------T---AGT-TG-ATAG-T--C----A-------A-----------------A---------------------A-----------C-----------TGTCGA
gi|18 : agaatcttcaaatattttagggatttcattgacatacatgaagaacaa-TC-A--AC----AC-T----G-----AAGA---T---TTC-----C--A--A-A-------TC--G-A--------C-AG-T--T--T-T----G--ACT-A--T---C----AAC----TA-GT-CTT-G--AGA--TA----C-A-G-ACCTGT-tttggaaatcttcagtgttgag
gi|19 : agaatcttcaaatattttagggatttcattgacatacatgaagaacaatgaggtacagaacggtttaagacttttttaaatttacgtaattacatatttgttgattttgttttacatgcttttgagattctttgtaataagtagtcatttaaaagtaaagattgC----AC-T----G-----AAGA---G---TTC-----C--C--A-A-------TT--G-A--------T-AG-T--T--T-G----T--ACC-A--T---C----AACT----A-GT-CTT-G--ACA--TA----C-A-G-AACGGT-TT--T-CAAATG-TCTA-G----------AGATG----------GAC-TA--TTT-G-----A--A-ATTTA-------CAT--ATGTT-TCC-A--TTT-----------G-TT-----AT--T--TG-T-T----TT-TT---CA-TGA------T-----TTTGA---A-A-T-GC-TT--T-GT-GAT----AG---GT--AA-GT-----C-A-TTTA-AA-A----G-T-AA---AGA-TAG--AC-A-GG-----TCTGG--ACCTCAA-GAC--------T---AGT-TC-AGAG-TA-C----A-------A-----------------ACT-------------------A-----------g
gi|19 : ---G---TTC-----C--A--A-A-------TT--G-A--------T-AG-T--T--T-G----T--ACT-C--T---G----AAC----TA-GT-CTT-G--AGG--TC----C-A-G-ACCTGT-CT--A-tcaatttggaacgt
gi|2 : cactgaagagttcccaattgatagtttgtaccatcaactagtcttgacatacagaacggttttcaaatgtctagagatggactatttgaaatttacatatgtttccatttgttatttgttttttcatgattttgaaatgctttgtgataggtaagtcatttaaaagtaaagaCTCAGTGAGATTGGTAGAAGCGAAAT-ATTT-GGACTGAT-C--GC-TC-TACCAATCTCAGACCAATGTAACAACCTTATTCGGGAAAGTTTGCCTCAACTTCCGCCGCCTGTTG-CGAT-TAAAA--TGGCT-TAAACTGA-ACATCT-TGTT-CAGAAAA---TTCA-GATTTTT-ATCTTAGGTATC--------CTACTAA--CTCCC----TA--TCACAAT--GAAACTTGCATTTC--TTACCTTTTCAT--GGT-GTT---------AAATCCCTATATCAAGTT-GGTTATTTTGAC-GCTCCT-TT-A--GT----GC-T----G-----AAGA---G---TTC-----C--A--A-AA------TT--G-A--------T-AG-T--T--T-G----T--ACT-A--T---G----GATT---TA-GT-CTT-G--AGG---A----C-ACG-AACGGT-TT--A-AAATTG-TTTT-C----------AGATA----------GAC-TG--TTT-A-----G--T-ATTTA-------CGT--AGTTT-ACT-A--TTT-----------G-TT-----AA--T--TT-T-G----TT-TT---CA-TGA-----TT-----TTTGA---A-A-T-GC-TT--T-TT-GAC---AAA---GT-AAA-GT-----C-A-TTTA-AA-A----G-T-AC---AGA-TAA--AC-A-GA-----TCTGT--ATCTTAA-GAC--------T---AGT-TG-ATAG-TA-C----A-------A-----------------ACT-------------------A-----------G-----------TGTTGAGAAA--GCACAAAA----T--------GGAC-GTGAATAATA----ACCACTTGATTT-AAATT--GAGATTT----AACACT--ATGAAA-AG--GTAAGAAATGCAAGTTT---TATTGTG--ATAGG---GA-GT--T----A--GTAGGA-TATC-TAA---G-TG-AA--AATC--TG-AAGC---GG----GA-AAG----ATGT-T--C-AGTTT--A--AGT-CAT-TTATA-AT-CGCA--A--CAGG-CGGTGGAAG--TTGGGGCA-AACTTTCCCTAATAAGGTTGTGTTACATTGGTTTGAG-ATTGG-TAGA-GCGATCAG--TCCAAATATTT-AGCTT--CT-ACC------A--ATCTCACTGAGATTAgt
gi|20 : ----AC-T----G-----AAGA---G---TTC-----C--A--A-A-------TT--G-A--------T-AG-T--T--T-GAATGT--ACT-A--C---GTATCAACT----A-GT-CTT-G--AGG--TA----C-A-G-AACGGT-TT--A-CAAAT----TT-C----------AGATA----------GAC-TG--TTT-G-----A--A-ATTTA-------CGT--AGTTT-CCT-A--TTT-----------G-TT-----AA--T--TT-T-G----------------------------------A---A-A-T-GC-TT--T-GT-GAT---AA----GT-A---GT-----C-A-TTTA-AA-A----G-T-AA---AGA-TAG--AC-A-GGTTTGCTTTGT--ATCTCCA-GAC--------T---AGT-TG--TAG-TA-C----AC------A-----------------ACT-------------------A-----------
gi|20 : ----G-----AAGAA--G---TTC-----C--A--A-A-------TT--G-A--------T-AG-T--TG-T-G----T--ACT-A--C--------AAC----TA-GT-CTG-G--AGA--TA----C-A-A-AGCtcaatttggaacttcttc
gi|21 : actgaagagttccaaattgatagtttgaatgtactacgtatcaactagtcttgaggtacagaacggtttacaaatttcagatagactgtttgaaatttacgtagtttcctatttgttaattttgaaatgctttgtgataagtagtcatttaaaagtaaagatagacaggttt-AAAATG-TCGT-C----------AGACA----------GAC-TG--GTT-G-----A--T-ATTTA-------TGT--AGTTT-TCT-A--TTT-----------G-TT-----AA--T--TT-T-GA---TT-TT---CA-TAA------T-----TTTGA---A-A-T-GC-TT--T-GT-GAT---AAA---G--AAA-AT-----C-A-TTTA-AA-T----G-T-AA---AGA-TAG--AC-C-GG-----CCTGT--ACTTTAA-GAC--------T---AAA-TC-ATAG-TA-C----A-------A-----------------ACTATCAATTTGGAACTCTTC-A-----------G-----------TGTCGAGAAA--GCACAAAA----T--------GTAT-GTGAA-AATA----ACC
gi|22 : tacgaatgtgtcttaaagt-A--AC----AC-T----G-----AAGA---G---TTC-----C--A--A-A-------TT--G-A--------T-AG-T--C--T-G----T--ACT-A--T---GT---AATTCA-TA-TT-CTT-G--AGA--TA----C-A---AACCGC-T
gi|22 : caccttagatatcctactacatgtaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttctg-GAT---AAA---G--AAA-GT-----C-A-TTTA-AA-A----G-TAAA---AGA-TAG--AG-C-GG-----TTTGT--ATCTCAA-GAA--------TATGAAT-TACATAG-TA-C----A-------G-----------------ACT-------------------A-----------ctatcttttacttttaaatgactttctttatc
gi|23 : caccttagatatcctactacatgtaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttctgaacactgaagagttccaaattga-T--T--T-G----T--AGT-A--T---C----AATT---T--GT-CTG-G--AGG--TA----C-G-G-CACTGC-TG--A-AAATTG-CCTT-C----------AAAGA----------GAA-TG--GTT-A-----A--G-ATTTA-------CAT--AGTTT-TCT------T-----------G-TT-----A---T--CT-T-A----AT-TT---CA-TG------CT-----TTTAA---A-A-T-GC-TT--T-GC-GTT---AG----GT-AAA-AT-----C-A-TGTATAA-A----G-T---------------------G-----T-TGT--ACTTCAA-GATA-------C---AGA--G-ATAG-TA-C----A-------A-----------------GCT-------------------A-----------A-----------TAT---GAAA--
gi|23 : tgtC-A--AC----AC-T----G-----AAGA---G---TTC-----C--AACA-A-------TC--T-ATTTCATATT-AG-C--T--T-G----T--ACT-A--T----------CTCTGTA--T-CTT-G--AAG--TA----C-----AACACT-TT--A-TACATG-tagattgttggaactcttcagtgttg
gi|24 : tgttttgtagtatcaatttgtctggaggtacggcactgctgaaaattgccttcaaagagaatggttaagatttacatagttttcttgttatcttaatttcatgcttttaaaatgctttgcgttaggtaaaatTATTTTAATTGTGCCT-TC-TCTAC----AC-C----A-----AAGA---G---TTC-----T--A--A-A-------TTT-G-A--------T-AG-T--T--T-G----T--ACC-A--T---C----AACT----A-GT-CGA-G--AGG--TA----C-A-G-AACTGT-CC--A-AAATTG-TCCT-C----------AGACA----------GAC-TG--GT--G-----A--A-TTCTA-------TGT--AGTTT-TCT-A--TTT-----------G-TTG----AA--T--TT-G-A----TT-TT---CA-GGA-----TT-----TTGTA---A-A---GC-TT--T-GT-GAT---AAG---G
gi|25 : acattaattttttgtag--ATGTGA-AG--GTAAGAAATACAAGTTT---GATAATG--ATAGG---GA-GT--T----A--ATAGGT-TGTC-TAA---GATA-AA--AATC--TC-AAGC---AG----G--NNN----NNNN-N--N-NNNNN--N--NNN-NNN-NNNNN-NN-NNNN--N--NNNN-NNNNNNNNN--NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NTCGG-AACA-G------G--TCC---------AGCCT--CG-ACG------A--ATCTCGCTGAGATtatgtgaaaataacctac
gi|26 : ----AC-T----G-----AAGA---G---TTC-----C--A--A-A-------TTTTG-A--------T-AG-T--T--T-G----T--ACT-A--T---C----AACC----A-GT-CTT-G--AGG--TA----C-A-A-AACGGT-TT--T-AAAATG-TCTT-C----------AGATATATGTAGATAGAC-TA--TTC-G-----C--A-ATTTA-------TGC--ATTTT-TCT-A--TTT-----------G-TT-----AA--T--TT---G----TTATT---CG-TGA-----TT-----TT-GA---G-A-T-GT-TT--T-GT-GAT---AA----GT-AAA-GT-----C-A-TTTA-AA-A----G-T-AA---AGA-TAG--AC-A-GG-----TATGT--ACCTCA
gi|27 : -TC-A--AC----GC-T----GTTCA-AAAA---G---TTC-----C--A--T-A-------TT--G-A--------T-AA-T--T--T-G----T--GCT-A--T---T----AACT----A-GT-CTT-G--TGG--TA----C-A-G-AAATGT-CT--A-AAAATG-TCTT-C----------AG--A----------GAC-TG--GTT-A-----A--A-A---A-------CAT--A-TTT-TCT-G--TTT-----------G-TT-----AA--T--TC-T-GA---TT-TT---CA-TGA------T-----TTTGA---A-A-A-GC-TT--T-GT-GAT---AAGTTTAT-TAA-GT-----A-A-TTTA-AA-A----G-T-AG---AGA-TGG--AC-A-
gi|28 : c--AC----GC-T----G-----AAGA---G---TGC-----C--A--A-T-------TT--G-A--------T-AG-T--T--T-G----T--ACT-A------G----CAAT---TA-GT-CTT-G--AGG--TA----C-A-G-AACGGT-TT--A-AAAATG-TCTT-C----------AGATA----------GAA-TA--TTT-G-----A--A-ATTTA-------CGT--AGTTT-TCT-A--TTT-----------G-TT-----AA--T--TT-T-G----TTATT---CG-TGA------T-----TTTGA---------------------------GAA---GT-AAA-G--------A-TT--------------------------G--AC-A-GG-----TATGT--ACTTCAA-GAC--------T---AGT-TA-ATAG-TA-C----tatcc
gi|29 : -G--AGG--TA----C-A-G-AACTGT-CC--A-AAAATG-TTTT-C----------AGACA----------GAT-TG--GTT-G-----A--A-ATTTG-------CGT--G-----------------------------------AA--T--TT-T-GA---TT-TT---CA-TGA-----TT-----TT-GA---A-A-T-GT-TT--T-GT-GAT---AA----GT-AAA-GC-----C-A-TTTA-AA-A----G-T-AA---AGA-TAG--AC-A-GG-----TCTGT--ACCTCAACTAC--------T---AAT-TC-ATAG-TA-C----A-------A-----------------ACT-------------------A-----------gg
gi|29 : --AC----AC-T----G-----AAGA---T---TTC-----C--A--A-A-------TT--A-A--------T-AG-T--T--T-G----T--ACT-A--T---G----AA-T---TA-GTAGTT-G--AGG--TA----C-A-G-ACCTGT-CT--A-ttaatttggaaatcttcagtgt
gi|3 : gaggtacagaactgtccaaaaatgttttcagacagattggttgaaatttgcgtgaattttgattttcatgattttgaaatgttttgtgataagtaaagccatttaaaagtaaagaAGTGAGATTGGTAGAAGCGAAAT-ATTTTGGACTGGT-C--GC-TC-TACCAATCTCAGACCAATGTAACAACCTTATTCGGGAAAGTTTGCCTCACCTTCCGCCGCCTGTTG-CGAT-T-AAA--TGGCT-TTAACTGA-ACATCT-TGTT-CAGAAAAT--TTCA-GATTTTT-ATCTTAGGTATC--------CTACTAA--C-CCC----TA--TCACAAT--GAAACTTGCATTTC--TTACCTTTTCAT--GGT-GTT---------AAATCCCTATATCAAGTT-GGTTATTTTGAC-GTCCAT-TT-A--GT----GC-T----G-----AAGA---G---TTT-----CCAA--A-A-------TT--G-A--------T-AG-T--T--T-G----T--ACT-A--T---G----GA-T---TA-GT-CTT-G--AGG--CA----C-A-G-AACGGT-TT----AAAATG-TTTT-C----------AGATA----------GAC-TG--TTT-G-----AT-A-TTTTA-------CGT--AGTTTAACT-A--TTT-----------G-TT-----AA--T--TT-T-G----TT-TT---CA-TGA------T-----TTTGA---A-A-T-GC-TT--T-TT-GAC---AAA---GT-AAA-GT-----C-A-TTTA-A---------T-AAC--AGA-TAA--AC-A-GA-----TCTGT--ATCTTAA-GAC--------T---AGT-TG-ATAG-TA-C----A-------A-----------------ACT-------------------A-----------G-----------TGTTGAGAAA--GCACAAAA----T--------GGAC-GTGAA-AATA----ACCCCTTGATTT-AAATT--GAGATTT----AACACT--A-GAAA-AG--GTAAGAAATGCAAGTTT---TATTGTG--ATAGG---GA-G---T----A--GTAGGA-TATC-TAAG--G-TG-AA--AATC--TG-AAGC---GG----GC-AAG----ATGT-T--C-AGTTT--A--AGT-CAT-TT-TA-ATACGCA--AACTAGGCCGGTGGAAG--TT-GGGCACAACTTTCCCTAATAAGGTTGTGTTACATTGGTTTGAG-ATTGG-TAGA-GC-ATCAG--TCCAATAATTT-AGCTT--CTAACC------A--ATCTCACTGAGATTA
gi|30 : A-GT--T----A--GTAGAA-TGTC-TAA---GGTG-AA--AAAT--TG-AAGC---GG----GC-AAG----A---------AATT------NNN-NNN-NNNNN-NN-NNNN--N--NNNN-NNNNNNNNN--NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-ATCGG-GAAA-GGCACCAG--TCCA---ATTT-TGACG--CT-AGCGAGGATA--ATCTCACTGAGATTA
gi|31 : CTTGATTTCAAATT--GAAATTT-----ACACT--ATGTAAGAG--GTGAATAAAG-AAGTTTTGCTATTGTT--CTAAG---GA--T--T----A--GGTGGA-TGTC-CAAG--G-TGAAA--AATT--TGTAAGC---GG----GCTGAG----TGGTGT--C-AATTT--ACTACC-AAT-TATTA-AT-CGCAGGA--CAAG-CGCCG--AGTTTTGAGACA-A
gi|32 : -GT--T----A--GTAGGA-CGTC-TAAT--G-TG-AA--AATT--TA-AAGC---G--------AAG----A--C-N--N-NNNNN--N--NNN-NNN-NNNNN-NN-NNNN--N--NNNN-NNNNNNNNN--NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNGGTAAAA-GCGACCAGGTCCCAAATATTT-AGCCT--TT-A
gi|33 : -----C--A--G-A-------TT--G-A--------T-AG-T--T--T-G----T--ACT-A--T---G----AAGT----A-AT-CTA-G--AGG--TA------G-G-AAC-----------------------------------ATA------------C-TG--GTT-A-----A--A-ATTTA-------CAT--AATTT-TCT-A--TTT-----------G-TT-----GA--T--TT-T-GA---TT-TT---CA-TGA-----TA-----TT-GA---A-A-T-GC-TT--T-GT-GAT----AA---GT-AAA-AT-----C-A-TTTA-AA-A----G-T-AA---AGG-TAG--AC-A-GT-----TCTGT--ACCT
gi|34 : -------------------A-----------G-----------TGTTGAGANN--NNNNNNNN----N--------NNNN-NNNNN-NNNN----NNNNNNNNNNNN-NNNNN--NNNNNNN----NNNNNN--NNNNNN-NN--NNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNN--NNNNN---GA-GT--TT---ATTGTAGGA-TGTC-TAA---GGTG-AA--AATT--TG-AAGC---Gttga
gi|36 : aactctac-G-AACTAT-TT--A-AAGATG-TCTT-C----------AAACA----------GAC-TG--GTT-A-----A--A-ATTTA-------CATCTAGTTT-CCT-T--TTTTCGT-------G-CTTTTAAAA--TGACT-T-G----TG-TT---CAGTAA-----TTGTCATTCTAA---A-A-T-GC-T
gi|37 : ggtacagaaaactaaatttttc-TC-A--AT----AC-T----G-----A------------C-----T--A--A-T-------TT--C-A--------T-CG-TAAT--T-G----T--ACT-A--T---C----A-TT---TACG------G--AGG--TA----C-A-T-AACTGT-CT--A-AAGATG-CCTT-C--------------A----------GAC-TG--GTT-ACATGTA--A-GTTTA-------CAT--A-TTT-TCT-T--TTT-----------
gi|38 : ttcT-----AA--T--TT-TTG----TT-TTTTCCA-TGA-----TT-----T--GA---A-AAT-GC-TT--T-GT-GAT----AA---GT-AAA-GTC----C-A-TTTG-AA-A----GTT-AA---AGta
gi|39 : catttgaccaaatcttcgttaagttccaacccgttgccTGA---A-A-T-GC-TT--T-GT-GAT---AAA---G--AAA-GT-----C-A-TTTG-AA-A----G-T-AA---GGA-TAT--AC-C-GA-----TTTGT--ACCTCAA-GAT--------T---AAC-TC-ATAA-AA-C----A-------A-----------------ACT-------------------A-----------taaa
gi|39 : ----AC-T----G-----AAGA---G---TTC-----C--A--A-A-------TT--G-A--------T-AG-T--T--T-G----T--TTT-A--T---G----AG-T---TA-AT-CTT-G--AGG--TA----C-A-A-ATCGGT-AT--A-tcaatttggaactcttcagt
gi|4 : tgaaatgctttgtgataaagaaagtcatttgaaagtaagga----TTCA-AATTT-C-ACCTTAGACAT----------TACTAA--CTCNN----NN--NNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNN--NNN-NNN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NN-N--NN----NN-N----NNNN--AAGA---G---TTC-----C--A--A-A-------TTT-G-A--------T-AG-G--T--T-T----T--ACTCA--T---G----GAAT----A-GT-CTT-G--AGG--TA----AGA-G-AACGGT-TTT-A-AAAATG-TTTT-C----------AGATA----------GAC-TG---TT-G-----A--A-ATTTA-------CGT--AGTT---CT-A--TTT-----------G-TT-----AA--T--AT---G----TT-A----CA-TGA-----AT-----TTTGA---A-A-G-GC-CTAAT-GTTGAC---TAA---GT-AAA-GT-------A-TTTA-AA-A----G-T-AA---AGA-TAAT-AC-A-GG-----TCTGT--ACCTTAA-GAC--------T---AGT-TT-GTAG-TAGC----A-------A-----------------ACTATCAATTTTGGAACTCTTCA-----------G-----------TGTT-AGAAN--NNNNNNNN----N--------NNNN-NNNNN-NNNN----NNNNNNNNNNNN-NNNNN--NNNNNNN----NNNNNN--NNNNNN-NN--NNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNN--NNNNN---GA-GT--T-------GTAGGA-TGTC-TAG---G-TG-AA--AATT--TG-AAGC---GGNNNNNN-NNN----NNNN-N--N-NNNNN--N--NNN-NNN-NNNNN-NN-NNNN--N--NNNN-NNNNNNNNN--NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTATTAA-CAG--GCACCCAG--TCCAAA-ATTT-AGCCT---T-ACC---------ATC-CACTGAGATT
gi|40 : agcATATTGAT-ATGCCTCTC-A--AC----AC-T----A-----AAAA---G---TTC-----C--A--ACAGGCTACTTC--GTAT-------T-AG-T--T--T-G----T--ACT-A--T---C----AATT---T--GT-CT
gi|42 : t----TT-TT---CA-CG------TT-----TTTGA---A-A-T-GC-TT--T-GT-GAT----AA---GTGAAA-GT-----C-A-TTT--AA-A----G-T-AG---Atcacagcatgcagc
gi|43 : atttaaaCATA--------CTTCTAA--CTCTC----TAAATCACTAT--GAAACTTGCGTTTC--TTACCTATACAT--actacttgaagtagacc
gi|44 : t-----TTTGA---G-A-T-GC-TT--T-GT-G-T---AA----GT-AAA-GT-----A-A-TTGA-AA-A----G-T-AACTTAGA-TAG--AC-A-GG-----TCTGT--Atacggt
gi|45 : T-----TTTGACGCATA-N-GT-TT--T-GT-GAT---AA----GT-AAA-GT-----C-A-TTTA-AA-A----G-T-A---------------------------TAT--ACCTCAA-GAC--------T---
gi|46 : CAG--TCCAAAT-TTT-AGCTT--CT-ACC------A---TCTCACTGAGATTA
gi|47 : agactttgttggctgatgT-CTC-G--ATG--TA----C-A-G-AGATGT-CT--A-GAAATG-TCTA-C----------AGACA----------GAC-TG--GTT-G-----A--A-ATTTA-------
gi|48 : tCAG--ATCAAATATTTTAGCTTATCT-ACC------A--ATCTCACTGAGATTA
gi|49 : ggactgatg--T----A--GTAGGA-TATC-TAA---GGTG-AC--CATT--TG-AAGC---AG----GC-AAG----AAAT-G--C-AGT
gi|5 : aa----TTCACAATTTTC-AACTTAGGTATC--------CT-CTAA--CTC
gi|5 : c-----AAGA-------TTC-----C--AG-A-A-------TT--G-A--------TTAG-T--T----G-------ACT-AC-T---G----GA-T---TA-GT-CTT-G--AGG--TA----C-A-GAAACGGG-TT--T-CATATG-TTTT-C----------AGATA----------GAC-TGTTTTT-G-----A--T-ATTTA-------CGT--AG-TT-TCT-A--GTTGATCGGTGTAGG-TC-----AAT-T--TT-T-GGTGTTT-TT---CATTGACCGAGTTA----TTTGA---A-A-G-CC-TT--T-GT-G-----CAA---GT-AAC-GTACATGC-A-CTTA-AA-A----T-C-GA---CAG-CAGTAAC-ACGG-----TCTGTAAACCTTAA-GA---------T---AGT----ATAG-TA-C----A-------AG----------------ACT-------------------A-----------nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagattccagaattgattagttgactactggattagtcttgaggtacagaaacgggtttcatatgttttcagatagactgtttttgatatttacgtagtttctagttgatcggtgtaggtcaatttttggtgtttttcattgaccgagttatttgaaagcctttgtgcaagtaacgtacatgcacttaaaatcgacagcagtaacacggtctgtaaaccttaagatagtatagtacaagactatcaatttgaacttctctacagtttgagtggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggttagtagaagtatctagagggtgagaaatgaaggcgggcaaggaatgttcgagctttgaaatc
gi|5 : cttcacaattttcaacttaggtatcctctaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTCCAC-TC-A--A-----AC-T----G-----TAGA---GAAGTTC--------A--A-A-------TT--G-A--------T-AG-TC-T--T-G----T--ACT-A--T---------ACT------AT-CTT-A--AGGTTTA----C-A-G--ACCGTGTT--A-tcaatttgaacttctctacagtttgagtggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggttagtagaagtatctagagggtgagaaatgaaggcgggcaaggaatgttcgagctttgaaatc
gi|5 : cttcacaattttcaacttaggtatcctctaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagattccagaattgattagttgactactggattagtcttgaggtacagaaacgggtttcatatgttttcagatagactgtttttgatatttacgtagtttctagttgatcggtgtaggtcaatttttggtgtttttcattgaccgagttatttgaaagcctttgtgcaagtaacgtacatgcacttaaaatcgacagcag-GT--T----A--GTAGAAGTATC-TAGAGGG-TG-AG--AAAT--GA-AGGC---GG----GC-AAGGA--ATGT-T--CGAGCTTTGA--AAT-Cannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggttagtagaagtatctagagggtgagaaatgaaggcgggcaaggaatgttcgagctttgaaatc
gi|50 : cttcacaattttcaacttaggtatcctctaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagattccagaattgattagttgactactggattagtcttgaggtacagaaacgggtttcatatgttttcagatagactgtttttgatatttacgtagtttctagttgatcggtgtaggtcaatttttggtgtttttcattgaccgagttatttgaaagcctttgtgcaagtaacgtacatgcacttaaaatcgacagcagtaacacggtctgtaaaccttaagatagtatagtacaagactatcaatttgaacttctctacagtttgagtggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagTTGTG--ATATG---GA-GT--T----A--GTAGGA-TGCCTTAG---G-TG-AA--AATC--TG-AAGC---GG----
gi|51 : A-GT--T----A--GTAGGA-TGTC-CGA---GGTG-AA--AAGT--TG-AAGC---GG----GC-AAG----A
gi|52 : AG--ACCAAATATCT-AGCCT--CT-GTC------A--ATCTTGCTGAGAT
gi|53 : TA-AA-A----G-T-AA---AGA-TAA--AC-A-GG-----TCTGT--ACCTCAG-Gtatc
gi|6 : CCGCCTGTTGATGAT-TAAAAAATGACA--AAACTGA-A-ATATACGCC-CGC-------TTCA-AATTTTC-ACCTTAGACATC--------CTACTAA--CTCNN----NN--NNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNN--NNN-NNN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NN-N--NN----NN-NNNN-G-----AAGA---G---TTC-----C--A--A---------TT----A--------T-AG-T--TGTT-T----T--ACT-A--TTG-G----AA-T---TA-GT-CTTTG--AGG--TA----C-A-G-AACGGT-TTTTA-AAAATGTTCTT-C----------AGATA----------GAC-TGT-TTT-G-----A--A-ATTTA-------CGT--AG-TT-TCT-A---TT-----------G-TT-----AA--T--TT-G-T----TT-TT---CA-TGA-----TT-----TTTGA---A-A-T-GC-TT--T-GT-GAC----AA---GT-AAA-GT-----CGA-TTTA-AA-A----G-T-AA---AGA-TAA--A--A-GG-----TCTTT--ACCTTAA-GAC--------T---AGT-TG-ATAG-TA-C----A-------A-----------------ACTATCAATTGTGGAACTCTTCA-----------G-----------TGTTGGGAAA--GCACAAAA----TCTTATGNNNNNN-NNNNN-NNNN----NNNNNNNNNNNN-NNNNN--NNNNNNN----NNNNNN--NNNNNN-NN--NNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNN--NNNNG---GACGT--TATTAA--GTAGG--TTTC-TAAG--G-TG-AA--AA----TG-AAGC---GG----
gi|7 : CTCAGTGAGAT-GGTAAAGGCTAA-T-ATTT-GG-CTGGTTC--GCCTT-TACCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNN-NNNNN--NNNNN-NNNNNNNN-NNNNNN-NNNC-CCGC------TTCA-AATTTTC-ACCTTAGACATC---------TACTAATCNNNNN----NN--NNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNN--NNN-NNN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NN-N--NN----NN-N----G-----AAGA---G---TTC-----C--A--A-A-------TT--G-A--------T-AG-T--T--T-G----T--ACT-A--T---G----GAAA---TA-GT-CTT-G--AGG--TA----G-A-G-AACGGT-TT--A-AAA-TG-TTTT-C----------AGA------------GAC-TG--TTT-G-----A--A-ATTTA-------CGT--AGTTT-TCT-A--TTT-----------G-TT-----AA--T--AT-T-GT---TT-TT---CA-TGA------T-----TTTGA---A-A-T-GCTTT--T-GT-GAC----AA---GT-AAA-GT-----C-A-TTTA-AA-A----G-T-AA---AGA-TAA--AC-A-GG-----TCTGT--A-CTTAA-GAC--------T---AGT-TG-ATAG-TA-C----A-------A-----------------ACT-------------------A-----------
gi|7 : taatC-A--AC----AC-T----G-----AAGA---G---TTC-----C--A--A-A-------TT--G-A--------T-AG-T--T--T-G----T--ACT-A--T---C----AAC----TA-GT-CTT----AAG--TA----C-A-G-ACCTGT-TT--A-tcaatttggaactcttcagtgttg
gi|8 : taatctcagtgagatggtaaaggctaatatttggctggttcgcctttaccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncccgcttcaaattttcaccttagacatctactaatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaagagttccaaattgatagtttgtactatggaaatagtcttgaggtagagaacggtttaaaatgttttcagagactgtttgaaatttacgtagttttctatttgttaatattgtttttcatgattttgaaatgcttttgtgacaagtaaagtcatttaaaagtaaagaTCAGTGAGATTGGTAGAG-CGAAATTATTT-GGACTGGT-CA-GC-TCATACCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNN-NNNNN--NNNNN-NNNNNNNN-NNNNNN-TGTTGCAGAAGAGATTTCA-GATTT---ATCTTAGGTATC--------CTAC-AA--CTCCC----GN--NNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNN--NNN-NNN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NN-N--NN----AG-T----GCATGAAAGA---G---TTC-----C--A--A-A-------TT--G-A--------T-AG-T--T--T-G----T--ACT-A--T---G----GA-T---TA-GT-CTG-G--AGG--CA----C-A-G-AAC-GT-TT--A-AAA-TG-TTTTTC----------AGATA----------GAC-TG--ATTTG-----A--GTATTTA-------CGT--AGTTT-ACTTA--TTTT----------G-TT-----AA--T--TT-T-G----TT-TT---CA-TGA-----TT---------G---A-A-T-GC-TT--T--T-GAC---A-----GT-AAA-GT-----C-A-TT-A-AA-A----G-T-AC---AGA-TAA--AC-A-GA-----TCTGT--ATCTTAA-GAC--------T---AGTATG-ATAGTTA-C----A-------A-----------------A
gi|9 : ctaat---GA-GT--T----A--GTATGA-TGTC-TAAG--G-TG-AT--AATA--TG-ATGC---GG----G--NNN----NNNN-N--N-NNNNN--N--NNN-NNN-NNNNN-NN-NNNN--N--NNNN-NNNNNNNNN--NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NTCGG-AAGA-G------G--TTC-------C-AGCCT--CG-ACG------AATATCTCGTTGAGATTAact
gi|9 : TCA-TATTATC-ACCTTAGACATC--------ATACTAA--CTCNN----NN--NNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNN--NNN-NNN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-NNNNTTCTC-A--AC----AC-T----G-----AAGA---G---TTC-----C--A--A-A-------TC--G-A--------T-AG-T--T--T-G----C--ACT-A--T---G-----ATT---TA-GT-CTT-G--AGG--TA----C-A-A-ACCTG----------ACTA-TCTT-T--------------------------AC-T----TT-T-----A--A-AT-----------G---AATTT-GCT-T--TTT-----------A-AC-----AA------------------------A-GCA-----TT------TTGA---A-A-T-G--------AT-GA----AAA---TC-AAA-ATTAACAC-A-TAGA-AA-ACTATG-T-AA---AAT-TCA--AC-C-AG-----TCTGT----CTAAA-GACATTTTAGAT---AGT-T---CAG-TA-CCTCAA-------A-----------------ACT-------------------A------------------------GTTGAT--A--GTACAATA----T--------GGAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttctcaacactgaagagttccaaatcgatagtttgcactatgatttagtcttgaggtacaaacctgactatctttacttttaaatgaatttgctttttaacaaagcattttgaaatgatgaaaatcaaaattaacacatagaaaactatgtaaaattcaaccagtctgtctaaagacattttagatagttcagtacctcaaaactagttgatagtacaatatggaactcttcagtgtt
gi|9 : taatctcaacgagatattcgtcgaggctggaacctcttccgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncccgca-A--AC----AC-T----G-----AAGA---G---TTC-----C--A---------------------------T-A-----T--T-G----T--ACT-A--T---C----AACT----A-GT-TTT-G--AGG--TA----C-T-G-AACTAT-CT--A-AAA-TG-TCTT-T----------AGACA----------GAC-TG--GTT-G-----A--A-TTTTA-------CAT--AGTTT-TCT-A--TGT-----------G-TT-----AA--T--TT-T-GA---TT-TT---CA-TCA-----TT-----TC-AA---A-A-T-GC-TT--T-GT-TAA---AAA---GC-AAA-TT-----C-A-TTTA-AA-A----G-T-AA---AGA-TAG--TC-A-GG-----TTTGT--ACCTCAA-GAC--------T---AAA-TC-ATAG-TG-C----A-------A-----------------ACT-------------------A-----------actcttcagtgtt
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|35 ): GTTGAGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAGTTAGTAGTGATATCAAGGGAAAATCATGAAGGCGGG
Unaligned ( gi|41 ): TATTCTGTTAATTTCGTTTTATGATTTCAAGCTTGAATACTTCTGACAAGAGGCATTGAAATGAAATATAGATAAATAGAC
Alignments
lowQualScore : 11 3333333 11 111111111 111111111 2222222222222222 1111111111 11111111111 1111 111111 111111111 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1111111111111 11111 111 22222 11111111111111 1111 111111111
lowQualScore : 0 5 5 0 8 8 0 8 99 8 8 4 4 4 4 0 77 6 2 99 0 99 777 777 6 8888888 33 3 333333333 0 44 7777 44 1 44 0 2 44 1 1 44 3 444444444 11 2 4 3 1 1 4 1 22 2222 1 4444 66666 222 111 22222 11 33 1 5555555 44 1 44444444 1 1 22 22 1 2222 11 1 22 2222222222222222 1 1 0 11 11 2222 0 0 0 3 0 22 1 2 1 0000000000 1 5555555555 1 666 1 33333 33 1 4444444 11 3 1 1 11 00000000000 1 44444 44 11 1 1 2222 5 444 2 333333 44444 0 222 1 1 1 1 11 1 2 222222222 1 1 66666 1 1 1 1 2222 1 2 333 3 22 1 1 44444 33 1 66666666 555 1 88 1 1 3333 7777777 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 55 8888888888888 4 8 9999 0 4 66 11111 55 0 1 4 55 0 0 777 55 222 2 33 6666 33 2 2 33333 2 33 444 2 333 5555 77 88888888888888 77777 3 5555 4 8888888888 4 2 55 777 1 1 4 333 0 0 0 5 66 5 9999 55 88 3 55 3 222222222 1
lowQualScore : . . . . . . . . .. . . . . . . . .. . . .. . .. ... ... . ....... .. . ......... . .. .... .. . .. . . .. . . .. . ......... .. . . . . . . . .. .... . .... ..... ... ... ..... .. .. . ....... .. . ........ . . .. .. . .... .. . .. ................ . . . .. .. .... . . . . . .. . . . .......... . .......... . ... . ..... .. . ....... .. . . . .. ........... . ..... .. .. . . .... . ... . ...... ..... . ... . . . . .. . . ......... . . ..... . . . . .... . . ... . .. . . ..... .. . ........ ... . .. . . .... ....... ............................................................... .. ............. . . .... . . .. ..... .. . . . .. . . ... .. ... . .. .... .. . . ..... . .. ... . ... .... .. .............. ..... . .... . .......... . . .. ... . . . ... . . . . .. . .... .. .. . .. . ......... .
lowQualScore : 8 0 0 8 0 0 8 0 00 0 0 8 4 8 4 2 22 7 5 22 5 22 222 222 7 4444444 22 3 999999999 5 22 1111 66 0 66 9 2 66 0 0 66 6 555555555 22 9 0 1 0 0 0 7 00 4444 1 3333 99999 888 888 55555 44 88 0 2222222 88 0 66666666 0 0 33 33 0 1111 33 0 33 8888888888888888 0 0 9 33 33 0000 9 9 9 1 9 44 0 4 2 9999999999 0 5555555555 2 888 2 11111 00 2 1111111 88 1 3 3 88 22222222222 3 55555 44 88 3 3 7777 0 777 5 555555 11111 7 000 1 1 1 1 66 2 3 222222222 1 1 99999 1 1 1 1 4444 1 2 111 5 88 2 2 22222 33 4 99999999 444 6 11 6 6 4444 1111111 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 00 0000000000000 4 9 4444 2 4 11 44444 55 9 0 0 55 9 5 000 00 777 4 11 9999 11 2 2 77777 2 11 555 2 999 0000 55 77777777777777 77777 6 5555 0 8888888888 0 3 00 444 6 6 0 666 1 6 9 0 00 0 6666 00 66 6 00 6 999999999 2
consensus : CTCAGTGAGATTGGTAGAGGCGAAAT-ATTT-GGACTGGT-C--GC-TC-TACCAATCTCAGACCAATGTAACAACCTTATTCGGGAAAGTTTGCCTCAACTTCCGCCGCCTGTTG-CGAT-TAAAA--TGGCT-TAAACTGA-ACATCT-TGTC-CAGAAA----TTCA-GATTTTC-ACCTTAGACATC--------CTACTAA--CTCCC----TA--TCACNAT--GAAACTTGCATTTC--TTACCTNTNCAT--GGT-GTT---------AAATCCCNATATCAAGTT-GGTTATTTTGAC-GTNCNT-TC-A--AC----AC-T----G-----AAGA---G---TTC-----C--A--A-A-------TT--G-A--------T-AG-T--T--T-G----T--ACT-A--T---G----AACT---TA-GT-CTT-G--AGG--TA----C-A-G-AACNGT-TT--A-AAAATG-TCTT-C----------AGATA----------GAC-TG--NTT-G-----A--A-ATTTA-------CGT--AGTTT-TCT-A--TTT-----------G-TT-----AA--T--TT-T-G----TT-TT---CA-TGA-----TT-----TTTGA---A-A-T-GC-TT--T-GT-GAT---AAA---GT-AAA-GT-----C-A-TTTA-AA-A----G-T-AA---AGA-TAG--AC-A-GG-----TCTGT--ACCTCAA-GAC--------T---AGT-TG-ATAG-TA-C----A-------A-----------------ACT-------------------A-----------G-----------TGTTGAGAAA--GCACAAAA----T--------GGAC-GTGAA-AATA----ACCACTTGATTT-AAATT--GAGATTT----AACACT--ATGNAA-AG--GTAAGAAATGCAAGTTT---TATTGTG--ATAGG---GA-GT--T----A--GTAGGA-TGTC-TAA---G-TG-AA--AATT--TG-AAGC---GG----GC-AAG----ATGT-T--C-AGTTT--A--AGT-CAT-TTNTA-AT-CGCA--A--CAGG-CGGCGGAAG--TTGGGGCA-AACTTTCCCTAATAAGGTTGCGTTACATTGGTTTGAG-ATCGG-NAGA-GCGACCAG--TCCAAATATTT-AGCCT--CT-ACC------A--ATCTCGCTGAGATTA
Reference ( family-297 ) : CTCAGTGAGATTGGTAGAGGCGAAAT-ATTT-GGACTGGT-C--GC-TC-TACCAATCTCAGACCAATGTAACAACCTTATTCGGGAAAGTTTGCCTCAACTTCCGCCGCCTGTTG-CGAT-TAAAA--TGGCT-TAAACTGA-ACATCT-TGTC-CAGAAA----TTCA-GATTTTC-ACCTTAGACATC--------CTACTAA--CTCCC----TA--TCACNAT--GAAACTTGCATTTC--TTACCTNTNCAT--GGT-GTT---------AAATCCCNATATCAAGTT-GGTTATTTTGAC-GTNCNT-TC-A--AC----AC-T----G-----AAGA---G---TTC-----C--A--A-A-------TT--G-A--------T-AG-T--T--T-G----T--ACT-A--T---G----AACT---TA-GT-CTT-G--AGG--TA----C-A-G-AACNGT-TT--A-AAAATG-TCTT-C----------AGATA----------GAC-TG--NTT-G-----A--A-ATTTA-------CGT--AGTTT-TCT-A--TTT-----------G-TT-----AA--T--TT-T-G----TT-TT---CA-TGA-----TT-----TTTGA---A-A-T-GC-TT--T-GT-GAT---AAA---GT-AAA-GT-----C-A-TTTA-AA-A----G-T-AA---AGA-TAG--AC-A-GG-----TCTGT--ACCTCAA-GAC--------T---AGT-TG-ATAG-TA-C----A-------A-----------------ACT-------------------A-----------G-----------TGTTGAGAAA--GCACAAAA----T--------GGAC-GTGAA-AATA----ACCACTTGATTT-AAATT--GAGATTT----AACACT--ATGNAA-AG--GTAAGAAATGCAAGTTT---TATTGTG--ATAGG---GA-GT--T----A--GTAGGA-TGTC-TAA---G-TG-AA--AATT--TG-AAGC---GG----GC-AAG----ATGT-T--C-AGTTT--A--AGT-CAT-TTNTA-AT-CGCA--A--CAGG-CGGCGGAAG--TTGGGGCA-AACTTTCCCTAATAAGGTTGCGTTACATTGGTTTGAG-ATCGG-NAGA-GCGACCAG--TCCAAATATTT-AGCCT--CT-ACC------A--ATCTCGCTGAGATTA
gi|1 : GTGAGATTG-TAAAGCT--AAT-ATTT-GGA-TGAT-CCAAC-TC-TACCAATCTCAGAACAATGT--CAAG--TATTGGAGAAAAT--GAAT-AATTACTGTGGGTAGTTG-AGATCTAAAA--TGCCTCTATATTGACAAAT-T-GGCC-CAGGACCTTTTTTA--ATTTTCTAAATTGGGTATA--------TT--TAA--TTTTCAGAATA--TCAAAGTTAGAGAGT-GT-TTTCAATTAATTTTATAA--GGTTGTTTATCAATAAAAATTTAAAT-TTAAGTTTGGTTATTATGAC-GTATAT-T--A--ATTGTTATGT----G-----AATA---G---TTCACACCC--A--A-C-------TT--C-A--------T-AG-G--T--T-A----TCTGCT-A--TATCG----GA-T---TA-TT-TTT-GTAAGA--TAATAAC-A-C-GACAGG-TT--ATCAAATGATGTT-T----------AGATA----------GAA-TG---TT-G-----ATTA-ATTTA--------GT--A--TT-TCT-AAATTT-----------GATT-----AAGCT--TTAT-G----TA-TTA--TA-TAA-----TA-----TTTGA---A-A-TTGA-TT--TAGT-GATGCAAAA---AT-ATATGT-----C-C-ATTA-AATA----G-T-AC---CGAATAA--ACCA-GGA----TCTGTCAAATTTAA--AC--------T---AGT----ATAG-AA-C----AGTCGATAA-----------------ACT-------------------ATCAATATTGGAGCTTCTTACAATTGTTGAGAAAAAGTGCCAAACAACT--------GGACCGTGAACAATATAATGCAAAATGATTT-AAACTCGGAGATTTGAAAAACACTTAATAGAG-AGAGGTAAGAA-TGCAAGTTT---TA-TGTGGTATAGGC--GA-GTACG----A--ATAGAA----A-TAA---A-AG-AGTCAATTTGTG-AAGCGGTGG----GT-AAATAGTATGT-TTAT-AGTTT--A--AGGACATATTGTACAT--G-A--A--CAGG-GAGAGCGAG---TGGGG-A-AA---TATCAGATAAGGTTGCGCTA
gi|10 : T-GAA-GA-----C-A-TTT------------T-AA---A--------AC-C-GT-----TTTGT--ACCTCAA--AC--------T---GGT-TG-ATAG-TA-C----A-------AAACTATCAAAATTTGGAACTCTTC---------------A-----------G-----------TGTTGAAAAN--NNNNNNNN----N--------NNNN-NNNNN-NNNN----NNNNNNNNNNNN-NNNNN--NNNNNNN----NNNNNN--NNNNNN-NN--NNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNN--NNNNNNN-GA-GT--T----A--GTAGGA-TGTC-CAAG--G-TG--A--AATA--TG-AAGC---GG----GN-NNN----NNNN-N--N-NNNNN--N--NNN-NNN-NNNNN-NN-NNNN--N--NNNN-NNNNNNNNN--NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NTCGG-AAGAGGCG-CAGG--TCCAAAT------------------------A--ATCTCACTGAGATT
gi|10 : T-TC-A--AC----AC-T----G-----AAGA---G---TTC-----C--A--A-A-------TTTTG-A--------T-AG-T--T--TTG----T--ACT-A--T---C----AACC----A-GT--TT-G--AGG--TA----C-A-A-AACGGT-TT--T-AAAATG-TCTT-CAGATATATGTAGATA----------GAC-TA--TTC-G-----C--A-ATTTA---------T--CATTT-TCT-A--TTT-----------G-TT-----AA-----TT-T-G----TTATT---CG-TGA------------TTTGA---G-A-T-GT-TT--T-GT-GAT----AA---GT-AAA-GT-----C-A-TTTA-AA-A----G-T-AA---AGATTAG--AC-A-GG-----TATGT--ACCTCgatatatgtagatagactattcgcaatttatcattttctatttgttaatttgttattcgtgatttgagatgttttgtgataagtaaagtcatttaaaagtaaagattagacaggtatgtacctc
gi|11 : aatctcagtgagattatttggacctgcgcctcttccgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncccgcttcatatttcaccttggacatcctactaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttG-----TTTGT--ACCTCAA-GAC--------T---GGT-TG-ATAG-TA-C----A-------AAACTATCAAATTTGGA-ACTCTTC---------------A-----------G-----------TGTTGAAAAN--NNNNNNNN----N--------NNNN-NNNNN-NNNN----NNNNNNNNNNNN-NNNNN--NNNNNNN----NNNNNN--NNNNNN-NN--NNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNN--NNNNNNNNGA-GT--T-------GTAGGA-TGTC-CAAG--G-TG--A--AATA--TG-AAGC---GG----G
gi|11 : aatctcaagtgagattatttggacctgcgcctcttcgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnT-TC-A--AC----AC-T----G-----AAGA---G---TTC-----C--A--A-AT------TT--G-A--------T-AGTT--T--T-G----T--ACT-A--T---C----AAC----CA-GT-CTT-G--AGG--TA----C-A---AACGGT-TT--T-AAAATG-TCTT-CAGATATATGTAGATA----------GAC-TA--TTC-G-----C--A-ATTTA---------T--CATTT-TCT-A--TTT-----------G-TT-----AA-----TT-T-G----TTATT---CG-TGA------T-----TTTGA---G-A-T-GT-TT--T-GTGGAT----AA---GT--AA-GT-----C-ATTTTA-AA-A----G-T-AA---AGAGTAG--AC-A-GG-----TATGT--ACCTCggttttaaaatgtcttcagatatatgtagatagactattcgcaatttatcattttctatttgttaatttgttattcgtgattttgagatgttttgtggataagtaagtcattttaaaagtaaagagtagacaggtatgtacctc
gi|12 : aatctcaagtgagattatttggacctgcgcctcttcgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncccgcttcatatttcaccttggacatcctacaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttC----AC-T----G-----AAGA---T---TTC-----C--C--A-A-------TT--G-A--------T-AG-T--T--T-G----T--ACC-A--T---C----AACT----A-GT-CTT-G--ACA--TA----C-A-G-AACGGT-TT--T-CAAATG-TCTA-G----------AGATG----------GACCTA--TTT-G-----A--A-ATTTA-------CAT--ATGTT-TCC-A--TTT-----------G-TT-----AT--T--TG-T-T----TT-TT---CA-TGA-----TT-----TT-GA---A-A-T-GC-TT--T-GT-GAT---AG----GT-AAA-GT-----C-A-TTTA-AA-A----G-T-AA---AGA-TAG--AC-A-GG-----TCTGG--ACCTCAA-GAC--------T---AGT-TC-AGAG-TA-C----A-------A-----------------ACT-------------------A-----------
gi|12 : ----TTCA--ATGTTC-ACCTTAGATATC--------ATACTAA--CTCNN----NN--NNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNN--NNN-NNN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NN-N--NN----NN-NNNNNG-----AAAC---G---TTC-----C--A--A-A-------TT--G-A--------T-AG-T--T--T-G----T--ACT-C--T---G----AAC----TA-GT-CTT-G--AGG--TC----C-A-G-ACCTGT-CT--A-tcaatttggaacgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagttagtatgatatctaaggtgaacattgaagcag
gi|13 : cactgaagatttcccaattgatagtttgtaccatcaactagtcttgacatacagaacggttttcaaatgtctagagatggacctatttgaaatttacatatgtttccatttgttatttgttttttcatgattttgaaatgctttgtgataggtaaagtcatttaaaagtaaaga----TTCA-GCTTTTG-ACTTTAGACATCGGATGATCCTACTAA--CTCCC----TA--TCACTAT--GCAACTTGCATTTC--TTACCTAAACATACGGT-GTT---------AAATCCgcag
gi|13 : cTTATTTTTAT-GCTTTC-TC-A--AC----AC-T----G-----AAGA---G---TTC-----C--A--A--------------------------------C--T-G----T--A---A--G---T----AATT---TA-GT-TC-------G--TA----C-G-------------------ATT-CTTT-C----------AAACA----------CAC-TG--GTT-A-----A--A-ATTTAAATAGATC-T--AGTTT-TCT-T--TTT-----------G-CT-----AAT-T--TT-T-A----TT-TT---CA-TG------TT-----TATGG---A-A-T-AT-TG--T-GT-GGT----AA---GT-AAA-GT-----T-A-TGTA-AT-A----G------------TAG--AC-A-GT-----TCCGT--ACCTTTA-GAC--------accaatcgcattccgccaaccatctcatcaacggcagttgggattcaataattaacgcatcgctgccagatttatttttatgctttctcaacactgaagagttccaactgtaagtaatttagttcgtacgattctttcaaacacactggttaaaatttaaatagatctagttttctttttgctaatttttattttcatgtttatggaatattgtgtggtaagtaaagttatgtaatagtagacagttccgtacctttagacaaat
gi|14 : cttcagcttttgactttagacatcggatgatcctactaactccctatcactatgcaacttgcatttcttacctaaacatacggtgttaaatccaccaatcgcattccgccaaccatctcatcaacggcagttgggattcaataattaacgcatcgctgccagatC----AC-T----G-----AAGA-------TTC-----C--C--A-A-------TT--G-A--------T-AG-T--T--T-G----T--ACC-A--T---C----AACT----A-GT-CTT-G--ACA--TA----C-A-G-AACGGT-TT--T-CAAATG-TCTA-G----------AGATG----------GAC-TA--TTT-G-----A--A-ATTTA-------CAT--ATGTT-TCC-A--TTT-----------G-TT-----AT--T--TG-T-T----TT-TT---CA-TGA------T-----TTTGA---A-A-T-GC-TT--T-GT-GAT----AG---GT-AAA-GT-----C-A-TTTA-AA-A----G-T-AA---AGA-TAG--AC-A-GG-----TCTGG--ACCTCAA-GAC--------T---AGT-TC-AGAG-TA-C----A-------A-----------------ACT-------------------A-----------aaat
gi|14 : ----TTCA--ATGTTC-ACCTTAGATATC--------ATACTAA--CTCNN----NN--NNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNN--NNN-NNN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NN-N--NN----NN-N----N-----NNGAAACG---TTC-----C--A--A-A-------TT--G-A--------T-AG-T--T--T-G----T--ACT-C--T---G----AAC----TA-GT-CTT-G--AGG--TC----C-A-G-ACCTGT-CT--A-tcaatttggaacgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagttagtatgatatctaaggtgaacattgaagcag
gi|15 : cactgaagattcccaattgatagtttgtaccatcaactagtcttgacatacagaacggttttcaaatgtctagagatggactatttgaaatttacatatgtttccatttgttatttgttttttcatgattttgaaatgctttgtgataggtaaagtcatttaaaagtaaagaG---GG-GT--T----A--GTGGGA-TGTC-TAAT--G-TG-AA--AATA--TG-AAGC---GG----gcag
gi|15 : CTT-TCTA--AC----AC-T----G-----GAGA---G---TTC-----C---------------CC--G-A---------------------------------A--T---G----A-------------TT-G--GG----A----C---G-AACTGC-CT--A-AAAACG-CCGA-C----------AGACA----------GAC-TG--GCT-A-----A--C-AT----------------G--------A--TTT--------------T-----GA--C--TT-C-T----TT-TT--------------TT-----TATGA---A-A-T-GC-TT--T-GT-GAT----AA---TT-AAA-GT-----T-A-TTGA-AA-A----G-T-AA---GCC-TAG--Aannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactttctaacactggagagttccccgaatgattgggacgaactgcctaaaaacgccgacagacagactggctaacatgattttgacttcttttttttatgaaatgctttgtgataattaaagttattgaaaagtaagcctagaa
gi|16 : ccgcttcatattttcacattagacatcccactaaccccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaa--AC----AC-T----G-----AAGA---G---TTC-----C--ACCA-A-------TT--G-A--------T-AA-T--G--T-G----T--ACT-A--T---T----AACT----A-GT-CTT-G--AGG--TA----C-A-G-AACTGT-CT--A-CAAATG-TTTT-C----------AGACA----------GAC-TG--GTT-G-----A--A-ATTTA-------TGC--ATTTT-TCT-A--TTT-----------G-TT-----AA--T--TT-T-GA---TT-TT---CA-TGA------T-----TTTGA---A-A-T-GC-TT--C-GT-GAT---AAA---G--AAA-GT-----C-A-TTTA-AA-A----G-TAAA---AGA-TAG--AG-C-GG-----TTTGT--ATCTCAA-GAA--------TATGAAT-TACATAG-TA-C----A-------G-----------------ACT-------------------A-----------a
gi|16 : C----AC-T----G-----AAGA---G---TTC-----C--A--A-A-------TT--G-A--------T-AG-T--C--T-G----T--ACT-A--T---GT---AATTCA-TA-TT-CTT-G--AGA--TA----C-A---AACCGC-Ttcaatttggaactcttcagtg
gi|17 : acactgaagagttccaccaattgataatgtgtactattaactagtcttgaggtacagaactgtctacaaatgttttcagacagactggttgaaatttatgcatttttctatttgttaattttgattttcatgattttgaaatgcttcgtgataaagaaagtcatttaaaagtaaaagatag--AC----AC-T----A-----AAGA---G---TTC-----C--A--A-A-------TT--G-A--------T-AG-T--T--T-G----T--ACT-ACAT---GTC--AACG----A-GT-CTT-G--AGG--TA----C-A-G-AACTGT-CA--A-GAAACG-TCTT-C----------ATACA----------GAC-TG--GTT-G-----A--A-ATTCA-------CGT--AGTTT-TCT-A--CTT-----------C-TT-----CA--T--TT-T-GA---TT-TT---CA-TGA------T-----TTTGA---A-A-T-GC-TT--T-GT-GA-----------T-ACA-GT-----C-A-TTTA-AA-A----G-T-AA---AGT-TAA--AC-A-GG-----TCTGT--ACCTCAA-GGC--------A---AAT-TC-ATAG-TA-C----A-------A-----------------ACT-------------------A-----------
gi|17 : AGA---G---TTC-----C--A--A-T-------TT--G-A--------T-AG-T--T--T-G----T--ACT-A--T---G----AATT---T--GC-CTT-G--AGG--TA----C-A-G-ACCTGT-TT--A-Atcaaattggaactct
gi|18 : acactaaagagttccaaattgatagtttgtactacatgtcaacgagtcttgaggtacagaactgtcaagaaacgtcttcatacagactggttgaaattcacgtagttttctacttcttcattttgattttcatgattttgaaatgctttgtgatacagtcatttaaaagtaaagT-G--AGG--TA----C-A-G-AACGGT-TT--A-A-------------------------------------GAC-TT--TTT-T-----A--A-ATTTA-------CGT--AATTA-CAT-A--TTT-----------G-TT-----GA--T--TT-T-G----TT-TTA--CA-TG------CT-----TTTGA---G-A-T-TC-TT--T-GT-AAT---AA----GT-A---GT-----C-A-TTTA-AA-A----G-T-AA---AGA-TTG--AC-A-GG-----TCTGT--ATCTCAA-GAC--------T---AGT-TG-ATAG-T--C----A-------A-----------------A---------------------A-----------C-----------TGTCGA
gi|18 : agaatcttcaaatattttagggatttcattgacatacatgaagaacaa-TC-A--AC----AC-T----G-----AAGA---T---TTC-----C--A--A-A-------TC--G-A--------C-AG-T--T--T-T----G--ACT-A--T---C----AAC----TA-GT-CTT-G--AGA--TA----C-A-G-ACCTGT-tttggaaatcttcagtgttgag
gi|19 : agaatcttcaaatattttagggatttcattgacatacatgaagaacaatgaggtacagaacggtttaagacttttttaaatttacgtaattacatatttgttgattttgttttacatgcttttgagattctttgtaataagtagtcatttaaaagtaaagattgC----AC-T----G-----AAGA---G---TTC-----C--C--A-A-------TT--G-A--------T-AG-T--T--T-G----T--ACC-A--T---C----AACT----A-GT-CTT-G--ACA--TA----C-A-G-AACGGT-TT--T-CAAATG-TCTA-G----------AGATG----------GAC-TA--TTT-G-----A--A-ATTTA-------CAT--ATGTT-TCC-A--TTT-----------G-TT-----AT--T--TG-T-T----TT-TT---CA-TGA------T-----TTTGA---A-A-T-GC-TT--T-GT-GAT----AG---GT--AA-GT-----C-A-TTTA-AA-A----G-T-AA---AGA-TAG--AC-A-GG-----TCTGG--ACCTCAA-GAC--------T---AGT-TC-AGAG-TA-C----A-------A-----------------ACT-------------------A-----------g
gi|19 : ---G---TTC-----C--A--A-A-------TT--G-A--------T-AG-T--T--T-G----T--ACT-C--T---G----AAC----TA-GT-CTT-G--AGG--TC----C-A-G-ACCTGT-CT--A-tcaatttggaacgt
gi|2 : cactgaagagttcccaattgatagtttgtaccatcaactagtcttgacatacagaacggttttcaaatgtctagagatggactatttgaaatttacatatgtttccatttgttatttgttttttcatgattttgaaatgctttgtgataggtaagtcatttaaaagtaaagaCTCAGTGAGATTGGTAGAAGCGAAAT-ATTT-GGACTGAT-C--GC-TC-TACCAATCTCAGACCAATGTAACAACCTTATTCGGGAAAGTTTGCCTCAACTTCCGCCGCCTGTTG-CGAT-TAAAA--TGGCT-TAAACTGA-ACATCT-TGTT-CAGAAAA---TTCA-GATTTTT-ATCTTAGGTATC--------CTACTAA--CTCCC----TA--TCACAAT--GAAACTTGCATTTC--TTACCTTTTCAT--GGT-GTT---------AAATCCCTATATCAAGTT-GGTTATTTTGAC-GCTCCT-TT-A--GT----GC-T----G-----AAGA---G---TTC-----C--A--A-AA------TT--G-A--------T-AG-T--T--T-G----T--ACT-A--T---G----GATT---TA-GT-CTT-G--AGG---A----C-ACG-AACGGT-TT--A-AAATTG-TTTT-C----------AGATA----------GAC-TG--TTT-A-----G--T-ATTTA-------CGT--AGTTT-ACT-A--TTT-----------G-TT-----AA--T--TT-T-G----TT-TT---CA-TGA-----TT-----TTTGA---A-A-T-GC-TT--T-TT-GAC---AAA---GT-AAA-GT-----C-A-TTTA-AA-A----G-T-AC---AGA-TAA--AC-A-GA-----TCTGT--ATCTTAA-GAC--------T---AGT-TG-ATAG-TA-C----A-------A-----------------ACT-------------------A-----------G-----------TGTTGAGAAA--GCACAAAA----T--------GGAC-GTGAATAATA----ACCACTTGATTT-AAATT--GAGATTT----AACACT--ATGAAA-AG--GTAAGAAATGCAAGTTT---TATTGTG--ATAGG---GA-GT--T----A--GTAGGA-TATC-TAA---G-TG-AA--AATC--TG-AAGC---GG----GA-AAG----ATGT-T--C-AGTTT--A--AGT-CAT-TTATA-AT-CGCA--A--CAGG-CGGTGGAAG--TTGGGGCA-AACTTTCCCTAATAAGGTTGTGTTACATTGGTTTGAG-ATTGG-TAGA-GCGATCAG--TCCAAATATTT-AGCTT--CT-ACC------A--ATCTCACTGAGATTAgt
gi|20 : ----AC-T----G-----AAGA---G---TTC-----C--A--A-A-------TT--G-A--------T-AG-T--T--T-GAATGT--ACT-A--C---GTATCAACT----A-GT-CTT-G--AGG--TA----C-A-G-AACGGT-TT--A-CAAAT----TT-C----------AGATA----------GAC-TG--TTT-G-----A--A-ATTTA-------CGT--AGTTT-CCT-A--TTT-----------G-TT-----AA--T--TT-T-G----------------------------------A---A-A-T-GC-TT--T-GT-GAT---AA----GT-A---GT-----C-A-TTTA-AA-A----G-T-AA---AGA-TAG--AC-A-GGTTTGCTTTGT--ATCTCCA-GAC--------T---AGT-TG--TAG-TA-C----AC------A-----------------ACT-------------------A-----------
gi|20 : ----G-----AAGAA--G---TTC-----C--A--A-A-------TT--G-A--------T-AG-T--TG-T-G----T--ACT-A--C--------AAC----TA-GT-CTG-G--AGA--TA----C-A-A-AGCtcaatttggaacttcttc
gi|21 : actgaagagttccaaattgatagtttgaatgtactacgtatcaactagtcttgaggtacagaacggtttacaaatttcagatagactgtttgaaatttacgtagtttcctatttgttaattttgaaatgctttgtgataagtagtcatttaaaagtaaagatagacaggttt-AAAATG-TCGT-C----------AGACA----------GAC-TG--GTT-G-----A--T-ATTTA-------TGT--AGTTT-TCT-A--TTT-----------G-TT-----AA--T--TT-T-GA---TT-TT---CA-TAA------T-----TTTGA---A-A-T-GC-TT--T-GT-GAT---AAA---G--AAA-AT-----C-A-TTTA-AA-T----G-T-AA---AGA-TAG--AC-C-GG-----CCTGT--ACTTTAA-GAC--------T---AAA-TC-ATAG-TA-C----A-------A-----------------ACTATCAATTTGGAACTCTTC-A-----------G-----------TGTCGAGAAA--GCACAAAA----T--------GTAT-GTGAA-AATA----ACC
gi|22 : tacgaatgtgtcttaaagt-A--AC----AC-T----G-----AAGA---G---TTC-----C--A--A-A-------TT--G-A--------T-AG-T--C--T-G----T--ACT-A--T---GT---AATTCA-TA-TT-CTT-G--AGA--TA----C-A---AACCGC-T
gi|22 : caccttagatatcctactacatgtaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttctg-GAT---AAA---G--AAA-GT-----C-A-TTTA-AA-A----G-TAAA---AGA-TAG--AG-C-GG-----TTTGT--ATCTCAA-GAA--------TATGAAT-TACATAG-TA-C----A-------G-----------------ACT-------------------A-----------ctatcttttacttttaaatgactttctttatc
gi|23 : caccttagatatcctactacatgtaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttctgaacactgaagagttccaaattga-T--T--T-G----T--AGT-A--T---C----AATT---T--GT-CTG-G--AGG--TA----C-G-G-CACTGC-TG--A-AAATTG-CCTT-C----------AAAGA----------GAA-TG--GTT-A-----A--G-ATTTA-------CAT--AGTTT-TCT------T-----------G-TT-----A---T--CT-T-A----AT-TT---CA-TG------CT-----TTTAA---A-A-T-GC-TT--T-GC-GTT---AG----GT-AAA-AT-----C-A-TGTATAA-A----G-T---------------------G-----T-TGT--ACTTCAA-GATA-------C---AGA--G-ATAG-TA-C----A-------A-----------------GCT-------------------A-----------A-----------TAT---GAAA--
gi|23 : tgtC-A--AC----AC-T----G-----AAGA---G---TTC-----C--AACA-A-------TC--T-ATTTCATATT-AG-C--T--T-G----T--ACT-A--T----------CTCTGTA--T-CTT-G--AAG--TA----C-----AACACT-TT--A-TACATG-tagattgttggaactcttcagtgttg
gi|24 : tgttttgtagtatcaatttgtctggaggtacggcactgctgaaaattgccttcaaagagaatggttaagatttacatagttttcttgttatcttaatttcatgcttttaaaatgctttgcgttaggtaaaatTATTTTAATTGTGCCT-TC-TCTAC----AC-C----A-----AAGA---G---TTC-----T--A--A-A-------TTT-G-A--------T-AG-T--T--T-G----T--ACC-A--T---C----AACT----A-GT-CGA-G--AGG--TA----C-A-G-AACTGT-CC--A-AAATTG-TCCT-C----------AGACA----------GAC-TG--GT--G-----A--A-TTCTA-------TGT--AGTTT-TCT-A--TTT-----------G-TTG----AA--T--TT-G-A----TT-TT---CA-GGA-----TT-----TTGTA---A-A---GC-TT--T-GT-GAT---AAG---G
gi|25 : acattaattttttgtag--ATGTGA-AG--GTAAGAAATACAAGTTT---GATAATG--ATAGG---GA-GT--T----A--ATAGGT-TGTC-TAA---GATA-AA--AATC--TC-AAGC---AG----G--NNN----NNNN-N--N-NNNNN--N--NNN-NNN-NNNNN-NN-NNNN--N--NNNN-NNNNNNNNN--NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NTCGG-AACA-G------G--TCC---------AGCCT--CG-ACG------A--ATCTCGCTGAGATtatgtgaaaataacctac
gi|26 : ----AC-T----G-----AAGA---G---TTC-----C--A--A-A-------TTTTG-A--------T-AG-T--T--T-G----T--ACT-A--T---C----AACC----A-GT-CTT-G--AGG--TA----C-A-A-AACGGT-TT--T-AAAATG-TCTT-C----------AGATATATGTAGATAGAC-TA--TTC-G-----C--A-ATTTA-------TGC--ATTTT-TCT-A--TTT-----------G-TT-----AA--T--TT---G----TTATT---CG-TGA-----TT-----TT-GA---G-A-T-GT-TT--T-GT-GAT---AA----GT-AAA-GT-----C-A-TTTA-AA-A----G-T-AA---AGA-TAG--AC-A-GG-----TATGT--ACCTCA
gi|27 : -TC-A--AC----GC-T----GTTCA-AAAA---G---TTC-----C--A--T-A-------TT--G-A--------T-AA-T--T--T-G----T--GCT-A--T---T----AACT----A-GT-CTT-G--TGG--TA----C-A-G-AAATGT-CT--A-AAAATG-TCTT-C----------AG--A----------GAC-TG--GTT-A-----A--A-A---A-------CAT--A-TTT-TCT-G--TTT-----------G-TT-----AA--T--TC-T-GA---TT-TT---CA-TGA------T-----TTTGA---A-A-A-GC-TT--T-GT-GAT---AAGTTTAT-TAA-GT-----A-A-TTTA-AA-A----G-T-AG---AGA-TGG--AC-A-
gi|28 : c--AC----GC-T----G-----AAGA---G---TGC-----C--A--A-T-------TT--G-A--------T-AG-T--T--T-G----T--ACT-A------G----CAAT---TA-GT-CTT-G--AGG--TA----C-A-G-AACGGT-TT--A-AAAATG-TCTT-C----------AGATA----------GAA-TA--TTT-G-----A--A-ATTTA-------CGT--AGTTT-TCT-A--TTT-----------G-TT-----AA--T--TT-T-G----TTATT---CG-TGA------T-----TTTGA---------------------------GAA---GT-AAA-G--------A-TT--------------------------G--AC-A-GG-----TATGT--ACTTCAA-GAC--------T---AGT-TA-ATAG-TA-C----tatcc
gi|29 : -G--AGG--TA----C-A-G-AACTGT-CC--A-AAAATG-TTTT-C----------AGACA----------GAT-TG--GTT-G-----A--A-ATTTG-------CGT--G-----------------------------------AA--T--TT-T-GA---TT-TT---CA-TGA-----TT-----TT-GA---A-A-T-GT-TT--T-GT-GAT---AA----GT-AAA-GC-----C-A-TTTA-AA-A----G-T-AA---AGA-TAG--AC-A-GG-----TCTGT--ACCTCAACTAC--------T---AAT-TC-ATAG-TA-C----A-------A-----------------ACT-------------------A-----------gg
gi|29 : --AC----AC-T----G-----AAGA---T---TTC-----C--A--A-A-------TT--A-A--------T-AG-T--T--T-G----T--ACT-A--T---G----AA-T---TA-GTAGTT-G--AGG--TA----C-A-G-ACCTGT-CT--A-ttaatttggaaatcttcagtgt
gi|3 : gaggtacagaactgtccaaaaatgttttcagacagattggttgaaatttgcgtgaattttgattttcatgattttgaaatgttttgtgataagtaaagccatttaaaagtaaagaAGTGAGATTGGTAGAAGCGAAAT-ATTTTGGACTGGT-C--GC-TC-TACCAATCTCAGACCAATGTAACAACCTTATTCGGGAAAGTTTGCCTCACCTTCCGCCGCCTGTTG-CGAT-T-AAA--TGGCT-TTAACTGA-ACATCT-TGTT-CAGAAAAT--TTCA-GATTTTT-ATCTTAGGTATC--------CTACTAA--C-CCC----TA--TCACAAT--GAAACTTGCATTTC--TTACCTTTTCAT--GGT-GTT---------AAATCCCTATATCAAGTT-GGTTATTTTGAC-GTCCAT-TT-A--GT----GC-T----G-----AAGA---G---TTT-----CCAA--A-A-------TT--G-A--------T-AG-T--T--T-G----T--ACT-A--T---G----GA-T---TA-GT-CTT-G--AGG--CA----C-A-G-AACGGT-TT----AAAATG-TTTT-C----------AGATA----------GAC-TG--TTT-G-----AT-A-TTTTA-------CGT--AGTTTAACT-A--TTT-----------G-TT-----AA--T--TT-T-G----TT-TT---CA-TGA------T-----TTTGA---A-A-T-GC-TT--T-TT-GAC---AAA---GT-AAA-GT-----C-A-TTTA-A---------T-AAC--AGA-TAA--AC-A-GA-----TCTGT--ATCTTAA-GAC--------T---AGT-TG-ATAG-TA-C----A-------A-----------------ACT-------------------A-----------G-----------TGTTGAGAAA--GCACAAAA----T--------GGAC-GTGAA-AATA----ACCCCTTGATTT-AAATT--GAGATTT----AACACT--A-GAAA-AG--GTAAGAAATGCAAGTTT---TATTGTG--ATAGG---GA-G---T----A--GTAGGA-TATC-TAAG--G-TG-AA--AATC--TG-AAGC---GG----GC-AAG----ATGT-T--C-AGTTT--A--AGT-CAT-TT-TA-ATACGCA--AACTAGGCCGGTGGAAG--TT-GGGCACAACTTTCCCTAATAAGGTTGTGTTACATTGGTTTGAG-ATTGG-TAGA-GC-ATCAG--TCCAATAATTT-AGCTT--CTAACC------A--ATCTCACTGAGATTA
gi|30 : A-GT--T----A--GTAGAA-TGTC-TAA---GGTG-AA--AAAT--TG-AAGC---GG----GC-AAG----A---------AATT------NNN-NNN-NNNNN-NN-NNNN--N--NNNN-NNNNNNNNN--NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-ATCGG-GAAA-GGCACCAG--TCCA---ATTT-TGACG--CT-AGCGAGGATA--ATCTCACTGAGATTA
gi|31 : CTTGATTTCAAATT--GAAATTT-----ACACT--ATGTAAGAG--GTGAATAAAG-AAGTTTTGCTATTGTT--CTAAG---GA--T--T----A--GGTGGA-TGTC-CAAG--G-TGAAA--AATT--TGTAAGC---GG----GCTGAG----TGGTGT--C-AATTT--ACTACC-AAT-TATTA-AT-CGCAGGA--CAAG-CGCCG--AGTTTTGAGACA-A
gi|32 : -GT--T----A--GTAGGA-CGTC-TAAT--G-TG-AA--AATT--TA-AAGC---G--------AAG----A--C-N--N-NNNNN--N--NNN-NNN-NNNNN-NN-NNNN--N--NNNN-NNNNNNNNN--NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNGGTAAAA-GCGACCAGGTCCCAAATATTT-AGCCT--TT-A
gi|33 : -----C--A--G-A-------TT--G-A--------T-AG-T--T--T-G----T--ACT-A--T---G----AAGT----A-AT-CTA-G--AGG--TA------G-G-AAC-----------------------------------ATA------------C-TG--GTT-A-----A--A-ATTTA-------CAT--AATTT-TCT-A--TTT-----------G-TT-----GA--T--TT-T-GA---TT-TT---CA-TGA-----TA-----TT-GA---A-A-T-GC-TT--T-GT-GAT----AA---GT-AAA-AT-----C-A-TTTA-AA-A----G-T-AA---AGG-TAG--AC-A-GT-----TCTGT--ACCT
gi|34 : -------------------A-----------G-----------TGTTGAGANN--NNNNNNNN----N--------NNNN-NNNNN-NNNN----NNNNNNNNNNNN-NNNNN--NNNNNNN----NNNNNN--NNNNNN-NN--NNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNN--NNNNN---GA-GT--TT---ATTGTAGGA-TGTC-TAA---GGTG-AA--AATT--TG-AAGC---Gttga
gi|36 : aactctac-G-AACTAT-TT--A-AAGATG-TCTT-C----------AAACA----------GAC-TG--GTT-A-----A--A-ATTTA-------CATCTAGTTT-CCT-T--TTTTCGT-------G-CTTTTAAAA--TGACT-T-G----TG-TT---CAGTAA-----TTGTCATTCTAA---A-A-T-GC-T
gi|37 : ggtacagaaaactaaatttttc-TC-A--AT----AC-T----G-----A------------C-----T--A--A-T-------TT--C-A--------T-CG-TAAT--T-G----T--ACT-A--T---C----A-TT---TACG------G--AGG--TA----C-A-T-AACTGT-CT--A-AAGATG-CCTT-C--------------A----------GAC-TG--GTT-ACATGTA--A-GTTTA-------CAT--A-TTT-TCT-T--TTT-----------
gi|38 : ttcT-----AA--T--TT-TTG----TT-TTTTCCA-TGA-----TT-----T--GA---A-AAT-GC-TT--T-GT-GAT----AA---GT-AAA-GTC----C-A-TTTG-AA-A----GTT-AA---AGta
gi|39 : catttgaccaaatcttcgttaagttccaacccgttgccTGA---A-A-T-GC-TT--T-GT-GAT---AAA---G--AAA-GT-----C-A-TTTG-AA-A----G-T-AA---GGA-TAT--AC-C-GA-----TTTGT--ACCTCAA-GAT--------T---AAC-TC-ATAA-AA-C----A-------A-----------------ACT-------------------A-----------taaa
gi|39 : ----AC-T----G-----AAGA---G---TTC-----C--A--A-A-------TT--G-A--------T-AG-T--T--T-G----T--TTT-A--T---G----AG-T---TA-AT-CTT-G--AGG--TA----C-A-A-ATCGGT-AT--A-tcaatttggaactcttcagt
gi|4 : tgaaatgctttgtgataaagaaagtcatttgaaagtaagga----TTCA-AATTT-C-ACCTTAGACAT----------TACTAA--CTCNN----NN--NNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNN--NNN-NNN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NN-N--NN----NN-N----NNNN--AAGA---G---TTC-----C--A--A-A-------TTT-G-A--------T-AG-G--T--T-T----T--ACTCA--T---G----GAAT----A-GT-CTT-G--AGG--TA----AGA-G-AACGGT-TTT-A-AAAATG-TTTT-C----------AGATA----------GAC-TG---TT-G-----A--A-ATTTA-------CGT--AGTT---CT-A--TTT-----------G-TT-----AA--T--AT---G----TT-A----CA-TGA-----AT-----TTTGA---A-A-G-GC-CTAAT-GTTGAC---TAA---GT-AAA-GT-------A-TTTA-AA-A----G-T-AA---AGA-TAAT-AC-A-GG-----TCTGT--ACCTTAA-GAC--------T---AGT-TT-GTAG-TAGC----A-------A-----------------ACTATCAATTTTGGAACTCTTCA-----------G-----------TGTT-AGAAN--NNNNNNNN----N--------NNNN-NNNNN-NNNN----NNNNNNNNNNNN-NNNNN--NNNNNNN----NNNNNN--NNNNNN-NN--NNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNN--NNNNN---GA-GT--T-------GTAGGA-TGTC-TAG---G-TG-AA--AATT--TG-AAGC---GGNNNNNN-NNN----NNNN-N--N-NNNNN--N--NNN-NNN-NNNNN-NN-NNNN--N--NNNN-NNNNNNNNN--NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTATTAA-CAG--GCACCCAG--TCCAAA-ATTT-AGCCT---T-ACC---------ATC-CACTGAGATT
gi|40 : agcATATTGAT-ATGCCTCTC-A--AC----AC-T----A-----AAAA---G---TTC-----C--A--ACAGGCTACTTC--GTAT-------T-AG-T--T--T-G----T--ACT-A--T---C----AATT---T--GT-CT
gi|42 : t----TT-TT---CA-CG------TT-----TTTGA---A-A-T-GC-TT--T-GT-GAT----AA---GTGAAA-GT-----C-A-TTT--AA-A----G-T-AG---Atcacagcatgcagc
gi|43 : atttaaaCATA--------CTTCTAA--CTCTC----TAAATCACTAT--GAAACTTGCGTTTC--TTACCTATACAT--actacttgaagtagacc
gi|44 : t-----TTTGA---G-A-T-GC-TT--T-GT-G-T---AA----GT-AAA-GT-----A-A-TTGA-AA-A----G-T-AACTTAGA-TAG--AC-A-GG-----TCTGT--Atacggt
gi|45 : T-----TTTGACGCATA-N-GT-TT--T-GT-GAT---AA----GT-AAA-GT-----C-A-TTTA-AA-A----G-T-A---------------------------TAT--ACCTCAA-GAC--------T---
gi|46 : CAG--TCCAAAT-TTT-AGCTT--CT-ACC------A---TCTCACTGAGATTA
gi|47 : agactttgttggctgatgT-CTC-G--ATG--TA----C-A-G-AGATGT-CT--A-GAAATG-TCTA-C----------AGACA----------GAC-TG--GTT-G-----A--A-ATTTA-------
gi|48 : tCAG--ATCAAATATTTTAGCTTATCT-ACC------A--ATCTCACTGAGATTA
gi|49 : ggactgatg--T----A--GTAGGA-TATC-TAA---GGTG-AC--CATT--TG-AAGC---AG----GC-AAG----AAAT-G--C-AGT
gi|5 : aa----TTCACAATTTTC-AACTTAGGTATC--------CT-CTAA--CTC
gi|5 : c-----AAGA-------TTC-----C--AG-A-A-------TT--G-A--------TTAG-T--T----G-------ACT-AC-T---G----GA-T---TA-GT-CTT-G--AGG--TA----C-A-GAAACGGG-TT--T-CATATG-TTTT-C----------AGATA----------GAC-TGTTTTT-G-----A--T-ATTTA-------CGT--AG-TT-TCT-A--GTTGATCGGTGTAGG-TC-----AAT-T--TT-T-GGTGTTT-TT---CATTGACCGAGTTA----TTTGA---A-A-G-CC-TT--T-GT-G-----CAA---GT-AAC-GTACATGC-A-CTTA-AA-A----T-C-GA---CAG-CAGTAAC-ACGG-----TCTGTAAACCTTAA-GA---------T---AGT----ATAG-TA-C----A-------AG----------------ACT-------------------A-----------nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagattccagaattgattagttgactactggattagtcttgaggtacagaaacgggtttcatatgttttcagatagactgtttttgatatttacgtagtttctagttgatcggtgtaggtcaatttttggtgtttttcattgaccgagttatttgaaagcctttgtgcaagtaacgtacatgcacttaaaatcgacagcagtaacacggtctgtaaaccttaagatagtatagtacaagactatcaatttgaacttctctacagtttgagtggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggttagtagaagtatctagagggtgagaaatgaaggcgggcaaggaatgttcgagctttgaaatc
gi|5 : cttcacaattttcaacttaggtatcctctaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTCCAC-TC-A--A-----AC-T----G-----TAGA---GAAGTTC--------A--A-A-------TT--G-A--------T-AG-TC-T--T-G----T--ACT-A--T---------ACT------AT-CTT-A--AGGTTTA----C-A-G--ACCGTGTT--A-tcaatttgaacttctctacagtttgagtggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggttagtagaagtatctagagggtgagaaatgaaggcgggcaaggaatgttcgagctttgaaatc
gi|5 : cttcacaattttcaacttaggtatcctctaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagattccagaattgattagttgactactggattagtcttgaggtacagaaacgggtttcatatgttttcagatagactgtttttgatatttacgtagtttctagttgatcggtgtaggtcaatttttggtgtttttcattgaccgagttatttgaaagcctttgtgcaagtaacgtacatgcacttaaaatcgacagcag-GT--T----A--GTAGAAGTATC-TAGAGGG-TG-AG--AAAT--GA-AGGC---GG----GC-AAGGA--ATGT-T--CGAGCTTTGA--AAT-Cannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggttagtagaagtatctagagggtgagaaatgaaggcgggcaaggaatgttcgagctttgaaatc
gi|50 : cttcacaattttcaacttaggtatcctctaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagattccagaattgattagttgactactggattagtcttgaggtacagaaacgggtttcatatgttttcagatagactgtttttgatatttacgtagtttctagttgatcggtgtaggtcaatttttggtgtttttcattgaccgagttatttgaaagcctttgtgcaagtaacgtacatgcacttaaaatcgacagcagtaacacggtctgtaaaccttaagatagtatagtacaagactatcaatttgaacttctctacagtttgagtggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagTTGTG--ATATG---GA-GT--T----A--GTAGGA-TGCCTTAG---G-TG-AA--AATC--TG-AAGC---GG----
gi|51 : A-GT--T----A--GTAGGA-TGTC-CGA---GGTG-AA--AAGT--TG-AAGC---GG----GC-AAG----A
gi|52 : AG--ACCAAATATCT-AGCCT--CT-GTC------A--ATCTTGCTGAGAT
gi|53 : TA-AA-A----G-T-AA---AGA-TAA--AC-A-GG-----TCTGT--ACCTCAG-Gtatc
gi|6 : CCGCCTGTTGATGAT-TAAAAAATGACA--AAACTGA-A-ATATACGCC-CGC-------TTCA-AATTTTC-ACCTTAGACATC--------CTACTAA--CTCNN----NN--NNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNN--NNN-NNN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NN-N--NN----NN-NNNN-G-----AAGA---G---TTC-----C--A--A---------TT----A--------T-AG-T--TGTT-T----T--ACT-A--TTG-G----AA-T---TA-GT-CTTTG--AGG--TA----C-A-G-AACGGT-TTTTA-AAAATGTTCTT-C----------AGATA----------GAC-TGT-TTT-G-----A--A-ATTTA-------CGT--AG-TT-TCT-A---TT-----------G-TT-----AA--T--TT-G-T----TT-TT---CA-TGA-----TT-----TTTGA---A-A-T-GC-TT--T-GT-GAC----AA---GT-AAA-GT-----CGA-TTTA-AA-A----G-T-AA---AGA-TAA--A--A-GG-----TCTTT--ACCTTAA-GAC--------T---AGT-TG-ATAG-TA-C----A-------A-----------------ACTATCAATTGTGGAACTCTTCA-----------G-----------TGTTGGGAAA--GCACAAAA----TCTTATGNNNNNN-NNNNN-NNNN----NNNNNNNNNNNN-NNNNN--NNNNNNN----NNNNNN--NNNNNN-NN--NNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNN--NNNNG---GACGT--TATTAA--GTAGG--TTTC-TAAG--G-TG-AA--AA----TG-AAGC---GG----
gi|7 : CTCAGTGAGAT-GGTAAAGGCTAA-T-ATTT-GG-CTGGTTC--GCCTT-TACCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNN-NNNNN--NNNNN-NNNNNNNN-NNNNNN-NNNC-CCGC------TTCA-AATTTTC-ACCTTAGACATC---------TACTAATCNNNNN----NN--NNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNN--NNN-NNN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NN-N--NN----NN-N----G-----AAGA---G---TTC-----C--A--A-A-------TT--G-A--------T-AG-T--T--T-G----T--ACT-A--T---G----GAAA---TA-GT-CTT-G--AGG--TA----G-A-G-AACGGT-TT--A-AAA-TG-TTTT-C----------AGA------------GAC-TG--TTT-G-----A--A-ATTTA-------CGT--AGTTT-TCT-A--TTT-----------G-TT-----AA--T--AT-T-GT---TT-TT---CA-TGA------T-----TTTGA---A-A-T-GCTTT--T-GT-GAC----AA---GT-AAA-GT-----C-A-TTTA-AA-A----G-T-AA---AGA-TAA--AC-A-GG-----TCTGT--A-CTTAA-GAC--------T---AGT-TG-ATAG-TA-C----A-------A-----------------ACT-------------------A-----------
gi|7 : taatC-A--AC----AC-T----G-----AAGA---G---TTC-----C--A--A-A-------TT--G-A--------T-AG-T--T--T-G----T--ACT-A--T---C----AAC----TA-GT-CTT----AAG--TA----C-A-G-ACCTGT-TT--A-tcaatttggaactcttcagtgttg
gi|8 : taatctcagtgagatggtaaaggctaatatttggctggttcgcctttaccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncccgcttcaaattttcaccttagacatctactaatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaagagttccaaattgatagtttgtactatggaaatagtcttgaggtagagaacggtttaaaatgttttcagagactgtttgaaatttacgtagttttctatttgttaatattgtttttcatgattttgaaatgcttttgtgacaagtaaagtcatttaaaagtaaagaTCAGTGAGATTGGTAGAG-CGAAATTATTT-GGACTGGT-CA-GC-TCATACCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNN-NNNNN--NNNNN-NNNNNNNN-NNNNNN-TGTTGCAGAAGAGATTTCA-GATTT---ATCTTAGGTATC--------CTAC-AA--CTCCC----GN--NNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNN--NNN-NNN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NN-N--NN----AG-T----GCATGAAAGA---G---TTC-----C--A--A-A-------TT--G-A--------T-AG-T--T--T-G----T--ACT-A--T---G----GA-T---TA-GT-CTG-G--AGG--CA----C-A-G-AAC-GT-TT--A-AAA-TG-TTTTTC----------AGATA----------GAC-TG--ATTTG-----A--GTATTTA-------CGT--AGTTT-ACTTA--TTTT----------G-TT-----AA--T--TT-T-G----TT-TT---CA-TGA-----TT---------G---A-A-T-GC-TT--T--T-GAC---A-----GT-AAA-GT-----C-A-TT-A-AA-A----G-T-AC---AGA-TAA--AC-A-GA-----TCTGT--ATCTTAA-GAC--------T---AGTATG-ATAGTTA-C----A-------A-----------------A
gi|9 : ctaat---GA-GT--T----A--GTATGA-TGTC-TAAG--G-TG-AT--AATA--TG-ATGC---GG----G--NNN----NNNN-N--N-NNNNN--N--NNN-NNN-NNNNN-NN-NNNN--N--NNNN-NNNNNNNNN--NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NTCGG-AAGA-G------G--TTC-------C-AGCCT--CG-ACG------AATATCTCGTTGAGATTAact
gi|9 : TCA-TATTATC-ACCTTAGACATC--------ATACTAA--CTCNN----NN--NNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNN--NNN-NNN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-NNNNTTCTC-A--AC----AC-T----G-----AAGA---G---TTC-----C--A--A-A-------TC--G-A--------T-AG-T--T--T-G----C--ACT-A--T---G-----ATT---TA-GT-CTT-G--AGG--TA----C-A-A-ACCTG----------ACTA-TCTT-T--------------------------AC-T----TT-T-----A--A-AT-----------G---AATTT-GCT-T--TTT-----------A-AC-----AA------------------------A-GCA-----TT------TTGA---A-A-T-G--------AT-GA----AAA---TC-AAA-ATTAACAC-A-TAGA-AA-ACTATG-T-AA---AAT-TCA--AC-C-AG-----TCTGT----CTAAA-GACATTTTAGAT---AGT-T---CAG-TA-CCTCAA-------A-----------------ACT-------------------A------------------------GTTGAT--A--GTACAATA----T--------GGAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttctcaacactgaagagttccaaatcgatagtttgcactatgatttagtcttgaggtacaaacctgactatctttacttttaaatgaatttgctttttaacaaagcattttgaaatgatgaaaatcaaaattaacacatagaaaactatgtaaaattcaaccagtctgtctaaagacattttagatagttcagtacctcaaaactagttgatagtacaatatggaactcttcagtgtt
gi|9 : taatctcaacgagatattcgtcgaggctggaacctcttccgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncccgca-A--AC----AC-T----G-----AAGA---G---TTC-----C--A---------------------------T-A-----T--T-G----T--ACT-A--T---C----AACT----A-GT-TTT-G--AGG--TA----C-T-G-AACTAT-CT--A-AAA-TG-TCTT-T----------AGACA----------GAC-TG--GTT-G-----A--A-TTTTA-------CAT--AGTTT-TCT-A--TGT-----------G-TT-----AA--T--TT-T-GA---TT-TT---CA-TCA-----TT-----TC-AA---A-A-T-GC-TT--T-GT-TAA---AAA---GC-AAA-TT-----C-A-TTTA-AA-A----G-T-AA---AGA-TAG--TC-A-GG-----TTTGT--ACCTCAA-GAC--------T---AAA-TC-ATAG-TG-C----A-------A-----------------ACT-------------------A-----------actcttcagtgtt
blockSeqs : G G T T T A C A A C T C AT . A AA T AC ATA G AAGAGAT CA . GGATGATCC TC . AA N . N . N N AC . . NN N . T N N C T CT . . NNNN CATGA AAC AAG . CA CC C GGCTACT TT T TTTCATAT T AA GT AATG . CA GTAATTCAT . TT . G TT T T AGATATATGT TATGTAGATA C TTT T CATGT T T AATAGAT CT A A T . GATCGGTGTAG . TTTAA T GA . T GTGT A TTC G CCGAGT GTCAT CGC T A . T AA . G AAGTTT G . ACATG G T T . CTAT T A CTT T TA . C TTTGC AA C ATTTTAGA ATG A AC T G CTCA C AACTATCAAAATTTGGAACTCTTCAG . TCTTATGNN . T . C . N . N G . TGC . NNN C . ATTA TT G T AGGG A . A T . NNNN CT GAATGTTCG ACT . NNN . ACGCAAAC C N NN TTT N N C NNN T TA . CGAT GT TA T AT A GAGGATA A
blockSeqs : G G . . . . . . A C T C C . A . T AC CT . AAAAT G . A . . . T . A . A A . . . NN N . . T T C . . . . NNN TTCA A . . . AC . T TT . T . C G . . C GTATCAACT . . . G T . . AGATATATGT . . TT . . . . . . A . . . TCGT . G T . . . A A A T T A . . . . . . . T AAA . . TAACA . . . . . . A C G T . . . . . A ATG . AC . . . . AACTATCAAATTTGGAACTCTTCAG . N . . . . . N . N . . . . NN . . T . . . GG . . A . . . N TGGTGTC TGA . TTA . CGCAGGA . T GA N G C . CTT . T . GCAC . AA . . . AAT G
blockSeqs : G T . . . . . . N N N N C . N . N NN CT . AAAA G . A . . . N . N . N N . . . CT A . . N N . . . . . . NNN . . . . G . A T . . . . . . . . GTAATTCAT . . . G . . . . . . T . . . . . . T . . . T . . . . . . A A . . T . . . . . . . . . AAA . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . ACTATCAATTTTGGAACTCTTCAG . N . . . . . A . A . . . . . . . . . . . GG . . A . . . A NNNNNN N . NNN . NNNNN . N NN T N N . NNN . A . CGAC . TA . . . A A
blockSeqs : . G . . . . . . N N N N N . N . N NN NN . C G . C . . . A . A . T T . . . CT A . . T T . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . GTCAACG . . . T . . . . . . T . . . . . . G . . . . . . . . . . A A . . T . . . . . . . . . AAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . ACTATCAATTGTGGAACTCTTCAG . T . . . . . A . T . . . . . . . . . . . TG . . C . . . C ATGTTC A . NNN . CGCAA . T GA N N C . CTT . T . CACC . TA . . . A A
blockSeqs : N . . . . A NN . . A . C . . . A . A . T T . . . NN N . . G C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TGGAATT . . . G . . . . . . T . . . . . . T . . . . . . . . . . A . . . C . . . . . . . . . AAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . ACTATCAATTTGGAACTCTTCAG . T . . . . . N . A . . . . . . . . . . . GA . . C . . . C NNNNNN N . TAT . NNNNN . N NN T G N . NNN . G . CAT . TA . . . A A
blockSeqs : A . C . . . N . N . N N . . . NN N . . C C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TAATTT . . . T . . . . . . G . . . . . . G . . . . . . . . . . A . . . T . . . . . . . . . AAG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . ACTAG . T . . . . . N . T . . . . . . . . . . . GG . . C . . . N ATGTTC A . NNN . NNNNN . C NN N N C . NNN . C . . . A . . . A A
blockSeqs : A . C . . . T . G . A A . . . NN N . . N A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GAATTT . . . T . . . . . . T . . . . . . T . . . . . . . . . . A . . . C . . . . . . . . . GAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . GCTAA . N . . . . . N . N . . . . . . . . . . . GG . . T . . . C NNNNNN N . NNN . NNNNN . N NN N N N . NNN . A . . . A . . . A A
blockSeqs : G . C . . . N . N . N N . . . NN N . . G N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GGATTT . . . T . . . . . . G . . . . . . G . . . . . . . . . . T . . . T . . . . . . . . . AAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . ACTAG . N . . . . . . . N . . . . . . . . . . . GG . . T . . . C AAATGC N . NNN . NNNNN . N NN N N N . NNN . T . . . A G
blockSeqs : T . C . . . N . N . N N . . . NN N . . C C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CAATTT . . . C . . . . . . G . . . . . . A . . . . . . . . . . A . . . T . . . . . . . . . AAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . ACTA . T . N . . . . . . . . . . . TG . . T . . . C NNNNNN N . TT . NNNNN . N . N . N . . . . . . . G
blockSeqs : . . A . . . N . N . N N . . . . N A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CTCTGT . . . T . . . . . . G . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . TAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . AAC . . . . . . . . . GG . . T . . . . ACNN . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . N . N . N N . . N N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GCAATT . . . T . . . . . . T . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . CAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . GG . . T . . . . A
blockSeqs : . . . N N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CAATTT . . . G . . . . . . T . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . AAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . GG . . T . . . .
blockSeqs : N N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GGAAAT . . . T . . . . . . T . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . AAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . GG . . T . . .
blockSeqs : T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CAACC . . . G . . . . . . T . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . GG . . C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CAACC . . . T . . . . . . G . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . G . . T . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CAACT . . . G . . . . . . G . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . AG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . G . . A . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GAACT . . . G . . . . . . G . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . G . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CAACT . . . C . . . . . . T . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . AG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GAACT . . . T . . . . . . G . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TAACT . . . A . . . . . . T . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CAACT . . . T . . . . . . G . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CAACT . . . G . . . . . . T . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GAACT . . . T . . . . . . G . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CAACT . . . G . . . . . . G . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CAACC . . . T . . . . . . G . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TAACT . . . T . . . . . . G . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GAATT . . . G . . . . . . T . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GGATT . . . T . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GAAGT . . . T . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CATTT . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GAGTT . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GGAAT . . . T . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GGATT . . . G . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CAACT . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . GGATT . . . G . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . GATTT . . . G .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . CAACT . . . T .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . AACT . . . T .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . ACT . . . T .
blockSeqs : . . . . . GA . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqCons : ** T* AC* CT* AAGAC** G* **** ** ** ********* **** ***** ** NAACT*********** ** **** G** ** ** ** *** AA******* ***** ** G* ******* ** T************ **** ** A**** ** ** ** *** ** GG*** ** T** *** ATGTTC******** TNN* CGCAA***** T** CTT CGAC TA
originalCons : CTCAGTGAGATTGGTAGAGGCGAAAT-ATTT-GGACTGGT-C--GC-TC-TACCAATCTCAGACCAATGTAACAACCTTATTCGGGAAAGTTTGCCTCAACTTCCGCCGCCTGTTG-CGAT-TAAAA--TGGCT-TAAACTGA-ACATCT-TGTC-CAGAAA----TTCA-GATTTTC-ACCTTAGACATC--------CTACTAA--CTCCC----TA--TCACNAT--GAAACTTGCATTTC--TTACCTNTNCAT--GGT-GTT---------AAATCCCNATATCAAGTT-GGTTATTTTGAC-GTNCNT-TC-A--AC----AC-T----G-----AAGA---G---TTC-----C--A--A-A-------TT--G-A--------T-AG-T--T--T-G----T--ACT-A--T---G----AACT---TA-GT-CTT-G--AGG--TA----C-A-G-AACNGT-TT--A-AAAATG-TCTT-C----------AGATA----------GAC-TG--NTT-G-----A--A-ATTTA-------CGT--AGTTT-TCT-A--TTT-----------G-TT-----AA--T--TT-T-G----TT-TT---CA-TGA-----TT-----TTTGA---A-A-T-GC-TT--T-GT-GAT---AAA---GT-AAA-GT-----C-A-TTTA-AA-A----G-T-AA---AGA-TAG--AC-A-GG-----TCTGT--ACCTCAA-GAC--------T---AGT-TG-ATAG-TA-C----A-------A-----------------ACT-------------------A-----------G-----------TGTTGAGAAA--GCACAAAA----T--------GGAC-GTGAA-AATA----ACCACTTGATTT-AAATT--GAGATTT----AACACT--ATGNAA-AG--GTAAGAAATGCAAGTTT---TATTGTG--ATAGG---GA-GT--T----A--GTAGGA-TGTC-TAA---G-TG-AA--AATT--TG-AAGC---GG----GC-AAG----ATGT-T--C-AGTTT--A--AGT-CAT-TTNTA-AT-CGCA--A--CAGG-CGGCGGAAG--TTGGGGCA-AACTTTCCCTAATAAGGTTGCGTTACATTGGTTTGAG-ATCGG-NAGA-GCGACCAG--TCCAAATATTT-AGCCT--CT-ACC------A--ATCTCGCTGAGATTA
finalCons : CTCAGTGAGATTGGTAGAGGCGAAAT-ATTT-GGACTGGT-C--GC-TC-TACCAATCTCAGACCAATGTAACAACCTTATTCGGGAAAGTTTGCCTCAACTTCCGCCGCCTGTTG-CGAT-TAAAA--TGGCTT-AAACTGAAC-ATCT-TGTC-CAGAAGAC--TTCAG-ATTTTC-ACCTTAGACATC--------CTACTAA--CTCCC----TA--TCACNAT--GAAACTTGCATTTC--TTACCTNTNCAT--GGT-GTT---------AAATCCCNATATCAAGTT-GGTTATTTTGAC-GTNCNT-TC-A--AC----AC-T----G-----AAGA---G---TTC-----C--A--A-A-------TT--G-A--------T-AG-T--T--T-G----T--ACT-A--TNAACT-----------A-GT-CTT-G--AGG--TA----C-A-G-AACNGT-TT--A-AAAATG-TCTT-C----------AGATA----------GAC-TGG--TT-G-----A--A-ATTTA-------CGT--AGTTT-TCT-A--TTT-----------G-TT-----AA--T--TT-T-G----TT-TT---CA-TGA-----TT-----TTTGA---A-A-T-GC-TT--T-GT-GATAA-------GT-AAA-GT-----C-A-TTTA-AA-A----G-T-AA---AGA-TAG--AC-A-GG-----TCTGT--ACCTCAA-GAC--------T---AGT-TG-ATAG-TA-C----A-------A-----------------ACT-------------------A-----------G-----------TGTTGAGAAA--GCACAAAAT------------GGAC-GTGAA-AATA----ACCACTTGATTT-AAATT--GAGATTTA----ACACT--ATGNAA-AG--GTAAGAAATGCAAGTTT---TATTGTG--ATAGG---GA-GT--T----A--GTAGGA-TGTC-TAAGG---TG-AA--AATT--TG-AAGC---GG----GC-AAGATGTTC--------AGTTT--A--AGT-CATTNN-TA-ATCGCAA-----CAGG-CGGCGGAAGT--TGGGGCA-AACTTTCCCTAATAAGGTTGCGTTACATTGGTTTGAG-ATCGG-NAGA-GCGACCAG--TCCAAATATTT-AGCCT--CT-ACC------A--ATCTCGCTGAGATTA
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|35 ): GTTGAGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAGTTAGTAGTGATATCAAGGGAAAATCATGAAGGCGGG
Unaligned ( gi|41 ): TATTCTGTTAATTTCGTTTTATGATTTCAAGCTTGAATACTTCTGACAAGAGGCATTGAAATGAAATATAGATAAATAGAC
Alignments
lowQualScore : 11 111 22222222222 11 111111111 111111111 1111111111 1111 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1111111111111 111 11111111111 11111111111111 1111 111111111
lowQualScore : 0 5 5 0 8 8 0 8 99 8 8 4 4 4 4 0 77 6 111 0 99 777 777 6 55555555555 44 3 555555555 555 77777 33 6666 44 1 44 0 2 44 111 44 3 333333333 11 2 3 2 1 1 3 1 11 2222 1 4444 66666 222 111 22222 11 33 1 4444444 55 1 44444444 1 22 22 2 3333333 11 1 1 3333 77777 333 1 2 1 0 11 11 2222 0 0 0 3 0 22 1 3 1 6666666666 1 9999 33333 11 1 1 4444444 11 44 1 1 33 1 88888888888 1 44444 33 11 1 2 1111 4 555 2 999999 44444 3333333 111 1 1 1 1 11 1 2 1 1 2222 2 11 1 11 1 66666 1 1 1 111 1 2222 1 2 333 3 22 1 1 44444 33 1 66666666 555 1 88 1 1 3333 7777777 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 55 8888888888888 4 8 9999 0 4 66 9999 2 55 0 1 4 55 0 0 777 55 111 2 22 11111111111 2 2 22 2 444 2 333 5555 77 88888888888888 77777 3 6666 4 8888888888 4 2 55 777 1 1 4 333 0 0 0 5 66 5 9999 55 88 3 55 3 222222222 1
lowQualScore : . . . . . . . . .. . . . . . . . .. . ... . .. ... ... . ........... .. . ......... ... ..... .. .... .. . .. . . .. ... .. . ......... .. . . . . . . . .. .... . .... ..... ... ... ..... .. .. . ....... .. . ........ . .. .. . ....... .. . . .... ..... ... . . . . .. .. .... . . . . . .. . . . .......... . .... ..... .. . . ....... .. .. . . .. . ........... . ..... .. .. . . .... . ... . ...... ..... ....... ... . . . . .. . . . . .... . .. . .. . ..... . . . ... . .... . . ... . .. . . ..... .. . ........ ... . .. . . .... ....... ............................................................... .. ............. . . .... . . .. .... . .. . . . .. . . ... .. ... . .. ........... . . .. . ... . ... .... .. .............. ..... . .... . .......... . . .. ... . . . ... . . . . .. . .... .. .. . .. . ......... .
lowQualScore : 8 0 0 8 0 0 8 0 00 0 0 8 4 8 4 2 22 7 777 5 22 222 222 7 55555555555 55 1 111111111 000 11111 99 5555 22 0 22 9 1 22 222 22 3 333333333 33 7 6 9 0 0 8 6 99 4444 1 2222 99999 888 888 55555 44 88 0 2222222 88 0 66666666 0 33 33 0 2222222 33 0 0 0000 99999 444 0 0 0 9 33 33 0000 9 9 9 1 9 44 0 6 0 4444444444 2 6666 11111 77 2 2 1111111 88 33 3 2 00 2 66666666666 3 44444 00 77 2 5 1111 8 888 4 888888 00000 6666666 999 1 1 1 1 66 1 3 1 1 4444 2 55 1 55 1 77777 1 1 1 999 1 3333 1 2 000 4 77 2 2 22222 33 4 99999999 444 6 11 6 6 4444 1111111 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 00 0000000000000 4 9 4444 2 4 11 4444 0 55 9 0 0 55 9 5 000 00 888 2 99 77777777777 1 1 99 1 555 2 999 0000 55 77777777777777 77777 6 9999 0 8888888888 0 3 00 444 6 6 0 666 1 6 9 0 00 0 6666 00 66 6 00 6 999999999 2
consensus : CTCAGTGAGATTGGTAGAGGCGAAAT-ATTT-GGACTGGT-C--GC-TC-TACCAATCTCAGACCAATGTAACAACCTTATTCGGGAAAGTTTGCCTCAACTTCCGCCGCCTGTTG-CGAT-TAAAA--TGGCT-TAAACTGA-ACATCT-TGTC-CAGAAGA--C----TTCA-GATTTTC-ACCTTAGACATC--------CT---ACT-----AA--CTCCC----TA--TCACNAT--GAAACTTGCATTTC--TTACCTNTNCAT--GGT-GTT---------AAATCCCNATATCAAGTT-GGTTATTTTGAC-GTNCNT-TC-A--AC----AC-T----G-----AAGA---G---TTC-----C--A--A-A-------TT--G-A--------T-AGT--T--T-G-------T--AC-T-A----T-C---AAC---T-A-GT-CTT-G--AGG--TA----C-A-G-AACNGT-TT--A-AAAATG-TCTTCAGATA----------GA-CTG--N-TTG-----A--A-ATTT-A-------CGT--AGTTTT-C-TA--TT-T-----------G-TT-----AA--T--TT-T-G----TT-TT---CA-TGA-----TT-----T-----TTGA---A-A-T-GC-TT--T-G-T-GA-T----AA-G--T-A--AA-GT-----C-A-TTTA-A---A-A----G-T-AA---AGA-TAG--AC-A-GG-----TCTGT--ACCTCAA-GAC--------T---AGT-TG-ATAG-TA-C----A-------A-----------------ACT-------------------A-----------G-----------TGTTGAGAAA--GCACAAAA----T--------GGAC-GTGAA-AATA----ACCACTTGATTT-AAATT--GAGATTT----AACACT--ATGNAA-AG--GTAAGAAATGCAAGTTTT---ATTGTG--ATAGG---GA-GT--T----A------GTAG-GA-TGTCTAA--GGTG-AAAATT--TG-AAGC---GG----GC-AAG----ATGT-T--C-AGTTT--A--AGT-CAT-TTNTA-AT-CGCA--A--CAGG-CGGCGGAAG--TTGGGGCA-AACTTTCCCTAATAAGGTTGCGTTACATTGGTTTGAG-ATCGG-NAGA-GCGACCAG--TCCAAATATTT-AGCCT--CT-ACC------A--ATCTCGCTGAGATTA
Reference ( family-297 ) : CTCAGTGAGATTGGTAGAGGCGAAAT-ATTT-GGACTGGT-C--GC-TC-TACCAATCTCAGACCAATGTAACAACCTTATTCGGGAAAGTTTGCCTCAACTTCCGCCGCCTGTTG-CGAT-TAAAA--TGGCT-TAAACTGA-ACATCT-TGTC-CAGAAGA--C----TTCA-GATTTTC-ACCTTAGACATC--------CT---ACT-----AA--CTCCC----TA--TCACNAT--GAAACTTGCATTTC--TTACCTNTNCAT--GGT-GTT---------AAATCCCNATATCAAGTT-GGTTATTTTGAC-GTNCNT-TC-A--AC----AC-T----G-----AAGA---G---TTC-----C--A--A-A-------TT--G-A--------T-AGT--T--T-G-------T--AC-T-A----T-N---AAC---T-A-GT-CTT-G--AGG--TA----C-A-G-AACNGT-TT--A-AAAATG-TCTTCAGATA----------GA-CTG--G-TTG-----A--A-ATTT-A-------CGT--AGTTTT-C-TA--TT-T-----------G-TT-----AA--T--TT-T-G----TT-TT---CA-TGA-----TT-----T-----TTGA---A-A-T-GC-TT--T-G-T-GA-T----AA-G--T-A--AA-GT-----C-A-TTTA-A---A-A----G-T-AA---AGA-TAG--AC-A-GG-----TCTGT--ACCTCAA-GAC--------T---AGT-TG-ATAG-TA-C----A-------A-----------------ACT-------------------A-----------G-----------TGTTGAGAAA--GCACAAAA----T--------GGAC-GTGAA-AATA----ACCACTTGATTT-AAATT--GAGATTT----AACACT--ATGNAA-AG--GTAAGAAATGCAAGTTTT---ATTGTG--ATAGG---GA-GT--T----A------GTAG-GA-TGTCTAA--GGTG-AAAATT--TG-AAGC---GG----GC-AAG----ATGT-T--C-AGTTT--A--AGT-CAT-TNNTA-AT-CGCA--A--CAGG-CGGCGGAAG--TTGGGGCA-AACTTTCCCTAATAAGGTTGCGTTACATTGGTTTGAG-ATCGG-NAGA-GCGACCAG--TCCAAATATTT-AGCCT--CT-ACC------A--ATCTCGCTGAGATTA
gi|1 : GTGAGATTG-TAAAGCT--AAT-ATTT-GGA-TGAT-CCAAC-TC-TACCAATCTCAGAACAATGT--CAAG--TATTGGAGAAAAT--GAAT-AATTACTGTGGGTAGTTG-AGATCTAAAA--TGCCTCTATATTGACAAAT-T-GGCC-CAG--GA--CCTTTTTTA--ATTTTCTAAATTGGGTATA--------TT-----T-----AA--TTTTCAGAATA--TCAAAGTTAGAGAGT-GT-TTTCAATTAATTTTATAA--GGTTGTTTATCAATAAAAATTTAAAT-TTAAGTTTGGTTATTATGAC-GTATAT-T--A--ATTGTTATGT----G-----AATA---G---TTCACACCC--A--A-C-------TT--C-A--------T-AGG--T--T-A-------TCTGC-T-A----T-ATCGGAT---T-A-TT-TTT-GTAAGA--TAATAAC-A-C-GACAGG-TT--ATCAAATGATGTTTAGATA----------GA-ATG----TTG-----ATTA-ATTT-A--------GT--A--TTT-C-TAAATT-T-----------GATT-----AAGCT--TTAT-G----TA-TTA--TA-TAA-----TA-----T-----TTGA---A-A-TTGA-TT--TAG-T-GA-TGCAAAA-A--T-A--TATGT-----C-C-ATTA-A---ATA----G-T-AC---CGAATAA--ACCA-GGA----TCTGTCAAATTTAA--AC--------T---AGT----ATAG-AA-C----AGTCGATAA-----------------ACT-------------------ATCAATATTGGAGCTTCTTACAATTGTTGAGAAAAAGTGCCAAACAACT--------GGACCGTGAACAATATAATGCAAAATGATTT-AAACTCGGAGATTTGAAAAACACTTAATAGAG-AGAGGTAAGAA-TGCAAGTTTT---A-TGTGGTATAGGC--GA-GTACG----A------ATAGAAA-TA---AA--AGAG-TCAATTTGTG-AAGCGGTGG----GT-AAATAGTATGT-TTAT-AGTTT--A--AGGACATATTGTACAT--G-A--A--CAGG-GAGAGCGAG---TGGGG-A-AA---TATCAGATAAGGTTGCGCTA
gi|10 : --T-G--AA-GA-----C-A-TTT---------------T-AA---A--------AC-C-GT-----TTTGT--ACCTCAA--AC--------T---GGT-TG-ATAG-TA-C----A-------AAACTATCAAAATTTGGAACTCTTC---------------A-----------G-----------TGTTGAAAAN--NNNNNNNN----N--------NNNN-NNNNN-NNNN----NNNNNNNNNNNN-NNNNN--NNNNNNN----NNNNNN--NNNNNN-NN--NNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNN--NNNNNNN-GA-GT--T----A------GTAG-GA-TGTCCAA--GGTG--AAATA--TG-AAGC---GG----GN-NNN----NNNN-N--N-NNNNN--N--NNN-NNN-NNNNN-NN-NNNN--N--NNNN-NNNNNNNNN--NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NTCGG-AAGAGGCG-CAGG--TCCAAAT------------------------A--ATCTCACTGAGATT
gi|10 : T-TC-A--AC----AC-T----G-----AAGA---G---TTC-----C--A--A-A-------TTTTG-A--------T-AGT--T--TTG-------T--AC-T-A----T-C---AAC---C-A-GT--TT-G--AGG--TA----C-A-A-AACGGT-TT--T-AAAATG-TCTTCAGATATATGTAGATAGA-CTA--T-TCG-----C--A-ATTT-A---------T--CATTTT-C-TA--TT-T-----------G-TT-----AA--T--TT---G----TTATT---CG-TGA-----TT-----T-------GA---G-A-T-GT-TT--T-G-T-GA-T----AA-G--T-A--AA-GT-----C-A-TTTA-A---A-A----G-T-AA---AGATTAG--AC-A-GG-----TATGT--ACCTCgatatatgtagatagactattcgcaatttatcattttctatttgttaatttgttattcgtgatttgagatgttttgtgataagtaaagtcatttaaaagtaaagattagacaggtatgtacctc
gi|11 : aatctcagtgagattatttggacctgcgcctcttccgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncccgcttcatatttcaccttggacatcctactaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttG-----TTTGT--ACCTCAA-GAC--------T---GGT-TG-ATAG-TA-C----A-------AAACTATCAAATTTGGA-ACTCTTC---------------A-----------G-----------TGTTGAAAAN--NNNNNNNN----N--------NNNN-NNNNN-NNNN----NNNNNNNNNNNN-NNNNN--NNNNNNN----NNNNNN--NNNNNN-NN--NNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNN--NNNNNNNNGA-GT--T-----------GTAG-GA-TGTCCAA--GGTG--AAATA--TG-AAGC---GG----G
gi|11 : aatctcaagtgagattatttggacctgcgcctcttcgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnT-TC-A--AC----AC-T----G-----AAGA---G---TTC-----C--A--A-A-------TTT-G-A--------T-AGT--T--TTG-------T--AC-T-A----T-C---AAC---C-A-GT-CTT-G--AGG--TA----C-A---AACGGT-TT--T-AAAATG-TCTTCAGATATATGTAGATAGA-CTA--T-TCG-----C--A-ATTT-A---------T--CATTTT-C-TA--TT-T-----------G-TT-----AA-----TT-T-G----TTATT---CG-TGA------T-----T-----TTGA---G-A-T-GT-TT--T-G-TGGA-T----AA-G--T----AA-GT-----C-ATTTTA-A---A-A----G-T-AA---AGAGTAG--AC-A-GG-----TATGT--ACCTCggttttaaaatgtcttcagatatatgtagatagactattcgcaatttatcattttctatttgttaatttgttattcgtgattttgagatgttttgtggataagtaagtcattttaaaagtaaagagtagacaggtatgtacctc
gi|12 : aatctcaagtgagattatttggacctgcgcctcttcgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncccgcttcatatttcaccttggacatcctacaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttC----AC-T----G-----AAGA---T---TTC-----C--C--A-A-------TT--G-A--------T-AGT--T--T-G-------T--AC-C-A----T-C---AAC---T-A-GT-CTT-G--ACA--TA----C-A-G-AACGGT-TT--T-CAAATG-TCTAGAGATG----------GACCTA--T-TTG-----A--A-ATTT-A-------CAT--ATGTTT-C-CA--TT-T-----------G-TT-----AT--T--TG-T-T----TT-TT---CA-TGA------T-----T-----TTGA---A-A-T-GC-TT--T-G-T-GA-T----AG-G--T-A--AA-GT-----C-A-TTTA-A---A-A----G-T-AA---AGA-TAG--AC-A-GG-----TCTGG--ACCTCAA-GAC--------T---AGT-TC-AGAG-TA-C----A-------A-----------------ACT-------------------A-----------
gi|12 : --C----TTCA--ATGTTC-ACCTTAGATATC--------AT---ACT-----AA--CTCNN----NN--NNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNN--NNN-NNN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NN-N--NN----NN-NNNNNG-----AAAC---G---TTC-----C--A--A-A-------TT--G-A--------T-AGT--T--T-G-------T--AC-T-C----T-G---AAC---T-A-GT-CTT-G--AGG--TC----C-A-G-ACCTGT-CT--A-tcaatttggaacgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagttagtatgatatctaaggtgaacattgaagcag
gi|13 : cactgaagatttcccaattgatagtttgtaccatcaactagtcttgacatacagaacggttttcaaatgtctagagatggacctatttgaaatttacatatgtttccatttgttatttgttttttcatgattttgaaatgctttgtgataggtaaagtcatttaaaagtaaaga--C----TTCA-GCTTTTG-ACTTTAGACATCGGATGATCCT---ACT-----AA--CTCCC----TA--TCACTAT--GCAACTTGCATTTC--TTACCTAAACATACGGT-GTT---------AAATCCcag
gi|13 : TTATTTTTAT-GCTTTC-TC-A--AC----AC-T----G-----AAGA---G---TTC-----C--A----A-------CT--G----------T-AA--------G-------T--A----A----T-T---------T-A-GT-TC-------G--TA----C-G-------------------ATT-CTTTCAAACA----------CA-CTG--G-TTA-----A--A-ATTT-AAATAGATC-T--AGTTTT-C-TT--TT-T-----------G-CT-----AA--T--TT-TTA----TT-TT---CA-TG------TT-----T-----ATGG---A-A-T-AT-TG--T-G-T-GG-T----AA-G--T-A--AA-GT-----T-A-TGTA-A---T-A----G------------TAG--AC-A-GT-----TCCGT--ACCTTTA-GAC--------accaatcgcattccgccaaccatctcatcaacggcagttgggattcaataattaacgcatcgctgccagatttatttttatgctttctcaacactgaagagttccaactgtaagtaatttagttcgtacgattctttcaaacacactggttaaaatttaaatagatctagttttctttttgctaatttttattttcatgtttatggaatattgtgtggtaagtaaagttatgtaatagtagacagttccgtacctttagacaaat
gi|14 : cttcagcttttgactttagacatcggatgatcctactaactccctatcactatgcaacttgcatttcttacctaaacatacggtgttaaatccaccaatcgcattccgccaaccatctcatcaacggcagttgggattcaataattaacgcatcgctgccagatC----AC-T----G-----AAGA-------TTC-----C--C--A-A-------TT--G-A--------T-AGT--T--T-G-------T--AC-C-A----T-C---AAC---T-A-GT-CTT-G--ACA--TA----C-A-G-AACGGT-TT--T-CAAATG-TCTAGAGATG----------GA-CTA--T-TTG-----A--A-ATTT-A-------CAT--ATGTTT-C-CA--TT-T-----------G-TT-----AT--T--TG-T-T----TT-TT---CA-TGA-----TT-----T-----T-GA---A-A-T-GC-TT--T-G-T-GA-T----AG-G--T-A--AA-GT-----C-A-TTTA-A---A-A----G-T-AA---AGA-TAG--AC-A-GG-----TCTGG--ACCTCAA-GAC--------T---AGT-TC-AGAG-TA-C----A-------A-----------------ACT-------------------A-----------aaat
gi|14 : --C----TTCA--ATGTTC-ACCTTAGATATC--------AT---ACT-----AA--CTCNN----NN--NNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNN--NNN-NNN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NN-N--NN----NN-N----N-----NNGAAACG---TTC-----C--A--A-A-------TT--G-A--------T-AGT--T--T-G-------T--AC-T-C----T-G---AAC---T-A-GT-CTT-G--AGG--TC----C-A-G-ACCTGT-CT--A-tcaatttggaacgtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagttagtatgatatctaaggtgaacattgaagcag
gi|15 : cactgaagattcccaattgatagtttgtaccatcaactagtcttgacatacagaacggttttcaaatgtctagagatggactatttgaaatttacatatgtttccatttgttatttgttttttcatgattttgaaatgctttgtgataggtaaagtcatttaaaagtaaagaG---GG-GT--T----A------GTGG-GA-TGTCTAA--TGTG-AAAATA--TG-AAGC---GG----cag
gi|15 : CTT-TCTA--AC----AC-T----G-----GAGA---G---TTC-----C---------------CC--G-A------------------------------------A----T-G---A-------------TT-G--GG----A----C---G-AACTGC-CT--A-AAAACG-CCGACAGACA----------GA-CTG--G-CTA-----A--C-AT-----------------G--------A--TT-T--------------T-----GA--C--TT-C-T----TT-TT--------------TT-----T-----ATGA---A-A-T-GC-TT--T-G-T-GA-T----AA-T--T-A--AA-GT-----T-A-TTGA-A---A-A----G-T-AA---GCC-TAG--Aannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactttctaacactggagagttccccgaatgattgggacgaactgcctaaaaacgccgacagacagactggctaacatgattttgacttcttttttttatgaaatgctttgtgataattaaagttattgaaaagtaagcctagaa
gi|16 : ccgcttcatattttcacattagacatcccactaaccccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaa--AC----AC-T----G-----AAGA---G---TTC-----C--ACCA-A-------TT--G-A--------T-AAT--G--T-G-------T--AC-T-A----T-T---AAC---T-A-GT-CTT-G--AGG--TA----C-A-G-AACTGT-CT--A-CAAATG-TTTTCAGACA----------GA-CTG--G-TTG-----A--A-ATTT-A-------TGC--ATTTTT-C-TA--TT-T-----------G-TT-----AA--T--TT-T-GA---TT-TT---CA-TGA------T-----T-----TTGA---A-A-T-GC-TT--C-G-T-GA-T----AA-A--G-A--AA-GT-----C-A-TTTA-A---A-A----G-TAAA---AGA-TAG--AG-C-GG-----TTTGT--ATCTCAA-GAA--------TATGAAT-TACATAG-TA-C----A-------G-----------------ACT-------------------A-----------a
gi|16 : C----AC-T----G-----AAGA---G---TTC-----C--A--A-A-------TT--G-A--------T-AGT--C--T-G-------T--AC-T-A----TGT---AATTCAT-A-TT-CTT-G--AGA--TA----C-A---AACCGC-Ttcaatttggaactcttcagtg
gi|17 : acactgaagagttccaccaattgataatgtgtactattaactagtcttgaggtacagaactgtctacaaatgttttcagacagactggttgaaatttatgcatttttctatttgttaattttgattttcatgattttgaaatgcttcgtgataaagaaagtcatttaaaagtaaaagatag--AC----AC-T----A-----AAGA---G---TTC-----C--A--A-A-------TT--G-A--------T-AGT--T--T-G-------T--AC-T-ACATGT-C---AAC---G-A-GT-CTT-G--AGG--TA----C-A-G-AACTGT-CA--A-GAAACG-TCTTCATACA----------GA-CTG--G-TTG-----A--A-ATTC-A-------CGT--AGTTTT-C-TA--CT-T-----------C-TT-----CA--T--TT-T-GA---TT-TT---CA-TGA------T-----T-----TTGA---A-A-T-GC-TT--T-G-T-GA------------T-A--CA-GT-----C-A-TTTA-A---A-A----G-T-AA---AGT-TAA--AC-A-GG-----TCTGT--ACCTCAA-GGC--------A---AAT-TC-ATAG-TA-C----A-------A-----------------ACT-------------------A-----------
gi|17 : AGA---G---TTC-----C--A--A-T-------TT--G-A--------T-AGT--T--T-G-------T--AC-T-A----T-G---AAT---T-T-GC-CTT-G--AGG--TA----C-A-G-ACCTGT-TT--A-Atcaaattggaactct
gi|18 : acactaaagagttccaaattgatagtttgtactacatgtcaacgagtcttgaggtacagaactgtcaagaaacgtcttcatacagactggttgaaattcacgtagttttctacttcttcattttgattttcatgattttgaaatgctttgtgatacagtcatttaaaagtaaagT-G--AGG--TA----C-A-G-AACGGT-TT--A-A--------------------------GA-CTT--T-TTT-----A--A-ATTT-A-------CGT--AATTAC-A-TA--TT-T-----------G-TT-----GA--T--TT-T-G----TT-TTA--CA-TG------CT-----T-----TTGA---G-A-T-TC-TT--T-G-T-AA-T----AA-G--T-A-----GT-----C-A-TTTA-A---A-A----G-T-AA---AGA-TTG--AC-A-GG-----TCTGT--ATCTCAA-GAC--------T---AGT-TG-ATAG-T--C----A-------A-----------------A---------------------A-----------C-----------TGTCGA
gi|18 : agaatcttcaaatattttagggatttcattgacatacatgaagaacaa-TC-A--AC----AC-T----G-----AAGA---T---TTC-----C--A--A-A-------TC--G-A--------C-AGT--T--T-T-------G--AC-T-A----T-C---AAC---T-A-GT-CTT-G--AGA--TA----C-A-G-ACCTGT-tttggaaatcttcagtgttgag
gi|19 : agaatcttcaaatattttagggatttcattgacatacatgaagaacaatgaggtacagaacggtttaagacttttttaaatttacgtaattacatatttgttgattttgttttacatgcttttgagattctttgtaataagtagtcatttaaaagtaaagattgC----AC-T----G-----AAGA---G---TTC-----C--C--A-A-------TT--G-A--------T-AGT--T--T-G-------T--AC-C-A----T-C---AAC---T-A-GT-CTT-G--ACA--TA----C-A-G-AACGGT-TT--T-CAAATG-TCTAGAGATG----------GA-CTA--T-TTG-----A--A-ATTT-A-------CAT--ATGTTT-C-CA--TT-T-----------G-TT-----AT--T--TG-T-T----TT-TT---CA-TGA------T-----T-----TTGA---A-A-T-GC-TT--T-G-T-GA-T----AG-G--T----AA-GT-----C-A-TTTA-A---A-A----G-T-AA---AGA-TAG--AC-A-GG-----TCTGG--ACCTCAA-GAC--------T---AGT-TC-AGAG-TA-C----A-------A-----------------ACT-------------------A-----------g
gi|19 : ---G---TTC-----C--A--A-A-------TT--G-A--------T-AGT--T--T-G-------T--AC-T-C----T-G---AAC---T-A-GT-CTT-G--AGG--TC----C-A-G-ACCTGT-CT--A-tcaatttggaacgt
gi|2 : cactgaagagttcccaattgatagtttgtaccatcaactagtcttgacatacagaacggttttcaaatgtctagagatggactatttgaaatttacatatgtttccatttgttatttgttttttcatgattttgaaatgctttgtgataggtaagtcatttaaaagtaaagaCTCAGTGAGATTGGTAGAAGCGAAAT-ATTT-GGACTGAT-C--GC-TC-TACCAATCTCAGACCAATGTAACAACCTTATTCGGGAAAGTTTGCCTCAACTTCCGCCGCCTGTTG-CGAT-TAAAA--TGGCT-TAAACTGA-ACATCT-TGTT-CAGAAAA-------TTCA-GATTTTT-ATCTTAGGTATC--------CT---ACT-----AA--CTCCC----TA--TCACAAT--GAAACTTGCATTTC--TTACCTTTTCAT--GGT-GTT---------AAATCCCTATATCAAGTT-GGTTATTTTGAC-GCTCCT-TT-A--GT----GC-T----G-----AAGA---G---TTC-----C--A--A-AA------TT--G-A--------T-AGT--T--T-G-------T--AC-T-A----T-G---GAT---TTA-GT-CTT-G--AGG---A----C-ACG-AACGGT-TT--A-AAATTG-TTTTCAGATA----------GA-CTG--T-TTA-----G--T-ATTT-A-------CGT--AGTTTA-C-TA--TT-T-----------G-TT-----AA--T--TT-T-G----TT-TT---CA-TGA-----TT-----T-----TTGA---A-A-T-GC-TT--T-T-T-GA-C----AAAG--T-A--AA-GT-----C-A-TTTA-A---A-A----G-T-AC---AGA-TAA--AC-A-GA-----TCTGT--ATCTTAA-GAC--------T---AGT-TG-ATAG-TA-C----A-------A-----------------ACT-------------------A-----------G-----------TGTTGAGAAA--GCACAAAA----T--------GGAC-GTGAATAATA----ACCACTTGATTT-AAATT--GAGATTT----AACACT--ATGAAA-AG--GTAAGAAATGCAAGTTTT---ATTGTG--ATAGG---GA-GT--T----A------GTAG-GA-TATCTAA---GTG-AAAATC--TG-AAGC---GG----GA-AAG----ATGT-T--C-AGTTT--A--AGT-CAT-TTATA-AT-CGCA--A--CAGG-CGGTGGAAG--TTGGGGCA-AACTTTCCCTAATAAGGTTGTGTTACATTGGTTTGAG-ATTGG-TAGA-GCGATCAG--TCCAAATATTT-AGCTT--CT-ACC------A--ATCTCACTGAGATTAgt
gi|20 : ----AC-T----G-----AAGA---G---TTC-----C--A--A-A-------TT--G-A--------T-AGT--T--T-GAATGTACT--ACGT-A----T-C---AAC---T-A-GT-CTT-G--AGG--TA----C-A-G-AACGGT-TT--A-CAAAT----TTCAGATA----------GA-CTG--T-TTG-----A--A-ATTT-A-------CGT--AGTTTC-C-TA--TT-T-----------G-TT-----AA--T--TT-T-G---------------------------------------A---A-A-T-GC-TT--T-G-T-GA-T----AA-G--T-A-----GT-----C-A-TTTA-A---A-A----G-T-AA---AGA-TAG--AC-A-GGTTTGCTTTGT--ATCTCCA-GAC--------T---AGT-TG--TAG-TA-C----AC------A-----------------ACT-------------------A-----------
gi|20 : ----G-----AAGAA--G---TTC-----C--A--A-A-------TT--G-A--------T-AGT--TG-T-G-------T--AC-T-A------C---AAC---T-A-GT-CTG-G--AGA--TA----C-A-A-AGCtcaatttggaacttcttc
gi|21 : actgaagagttccaaattgatagtttgaatgtactacgtatcaactagtcttgaggtacagaacggtttacaaatttcagatagactgtttgaaatttacgtagtttcctatttgttaattttgaaatgctttgtgataagtagtcatttaaaagtaaagatagacaggttt-AAAATG-TCGTCAGACA----------GA-CTG--G-TTG-----A--T-ATTT-A-------TGT--AGTTTT-C-TA--TT-T-----------G-TT-----AA--T--TT-T-GA---TT-TT---CA-TAA------T-----T-----TTGA---A-A-T-GC-TT--T-G-T-GA-T----AA-A--G-A--AA-AT-----C-A-TTTA-A---A-T----G-T-AA---AGA-TAG--AC-C-GG-----CCTGT--ACTTTAA-GAC--------T---AAA-TC-ATAG-TA-C----A-------A-----------------ACTATCAATTTGGAACTCTTC-A-----------G-----------TGTCGAGAAA--GCACAAAA----T--------GTAT-GTGAA-AATA----ACC
gi|22 : tacgaatgtgtcttaaagt---GA-GT--T----ACATGTAGTAG-GA-TATCTAA--GGTG-
gi|22 : -A--AC----AC-T----G-----AAGA---G---TTC-----C--A--A-A-------TT--G-A--------T-AGT--C--T-G-------T--AC-T-A----TGT---AATTCAT-A-TT-CTT-G--AGA--TA----C-A---AACCGC-Tnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttctgaacactgaagagttccaaattgatagtctgtactatgtaattcatattcttgagatacaaaccgctctatcttttacttttaaatgactttctttatc
gi|22 : caccttagatatcctactacatgtaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttctg-GA-T----AA-A--G-A--AA-GT-----C-A-TTTA-A---A-A----G-TAAA---AGA-TAG--AG-C-GG-----TTTGT--ATCTCAA-GAA--------TATGAAT-TACATAG-TA-C----A-------G-----------------ACT-------------------A-----------ctatcttttacttttaaatgactttctttatc
gi|23 : caccttagatatcctactacatgtaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttctgaacactgaagagttccaaattgaT--T--T-G-------T--AG-T-A----T-C---AAT---T-T-GT-CTG-G--AGG--TA----C-G-G-CACTGC-TG--A-AAATTG-CCTTCAAAGA----------GA-ATG--G-TTA-----A--G-ATTT-A-------CAT--AGTTTT-C-T------T-----------G-TT-----A---T--CT-T-A----AT-TT---CA-TG------CT-----T-----TTAA---A-A-T-GC-TT--T-G-C-GT-T----AG-G--T-A--AA-AT-----C-A-TGTATA---A-A----G-T---------------------G-----T-TGT--ACTTCAA-GATA-------C---AGA--G-ATAG-TA-C----A-------A-----------------GCT-------------------A-----------A-----------TAT---GAAA--
gi|23 : tgtC-A--AC----AC-T----G-----AAGA---G---TTC-----C--AACA-A-------TC--T-ATTTCATATT-AGC--T--T-G-------T--AC-T-A----T-C----TC---T-GTAT-CTT-G--AAG--TA----C-----AACACT-TT--A-TACATG-tagattgttggaactcttcagtgttg
gi|24 : tgttttgtagtatcaatttgtctggaggtacggcactgctgaaaattgccttcaaagagaatggttaagatttacatagttttcttgttatcttaatttcatgcttttaaaatgctttgcgttaggtaaaatTATTTTAATTGTGCCT-TC-TCTAC----AC-C----A-----AAGA---G---TTC-----T--A--A-A-------TTT-G-A--------T-AGT--T--T-G-------T--AC-C-A----T-C---AAC---T-A-GT-CGA-G--AGG--TA----C-A-G-AACTGT-CC--A-AAATTG-TCCTCAGACA----------GA-CTG--G--TG-----A--A-TTCT-A-------TGT--AGTTTT-C-TA--TT-T-----------G-TTG----AA--T--TT-G-A----TT-TT---CA-GGA-----TT-----T-----TGTA---A-A---GC-TT--T-G-T-GA-T----AA-G--
gi|25 : acattaattttttgtagc--ATGTGA-AG--GTAAGAAATACAAGTTTG---ATAATG--ATAGG---GA-GT--T----A------ATAG-GT-TGTCTAA--GATA-AAAATC--TC-AAGC---AG----G--NNN----NNNN-N--N-NNNNN--N--NNN-NNN-NNNNN-NN-NNNN--N--NNNN-NNNNNNNNN--NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NTCGG-AACA-G------G--TCC---------AGCCT--CG-ACG------A--ATCTCGCTGAGATtatgtgaaaataacctac
gi|26 : ----AC-T----G-----AAGA---G---TTC-----C--A--A-A-------TTTTG-A--------T-AGT--T--T-G-------T--AC-T-A----T-C---AAC---C-A-GT-CTT-G--AGG--TA----C-A-A-AACGGT-TT--T-AAAATG-TCTTCAGATATATGTAGATAGA-CTA--T-TCG-----C--A-ATTT-A-------TGC--ATTTTT-C-TA--TT-T-----------G-TT-----AA--T--TT---G----TTATT---CG-TGA-----TT-----T-----T-GA---G-A-T-GT-TT--T-G-T-GA-T----AA-G--T-A--AA-GT-----C-A-TTTA-A---A-A----G-T-AA---AGA-TAG--AC-A-GG-----TATGT--ACCTCA
gi|27 : -TC-A--AC----GC-T----GTTCA-AAAA---G---TTC-----C--A--T-A-------TT--G-A--------T-AAT--T--T-G-------T--GC-T-A----T-T---AAC---T-A-GT-CTT-G--TGG--TA----C-A-G-AAATGT-CT--A-AAAATG-TCTTCAG--A----------GA-CTG--G-TTA-----A--A-A----A-------CAT--A-TTTT-C-TG--TT-T-----------G-TT-----AA--T--TC-T-GA---TT-TT---CA-TGA------T-----T-----TTGA---A-A-A-GC-TT--T-G-T-GA-T----AA-GTTT-ATTAA-GT-----A-A-TTTA-A---A-A----G-T-AG---AGA-TGG--AC-A-
gi|28 : c--AC----GC-T----G-----AAGA---G---TGC-----C--A--A-T-------TT--G-A--------T-AGT--T--T-G-------T--AC-T-A----G-C---AAT---T-A-GT-CTT-G--AGG--TA----C-A-G-AACGGT-TT--A-AAAATG-TCTTCAGATA----------GA-ATA--T-TTG-----A--A-ATTT-A-------CGT--AGTTTT-C-TA--TT-T-----------G-TT-----AA--T--TT-T-G----TTATT---CG-TGA-----TT-----T-----------------------------T-GA-G----AA-G--T-A--AA-G--------A-TT-----------------------------G--AC-A-GG-----TATGT--ACTTCAA-GAC--------T---AGT-TA-ATAG-TA-C----tatcc
gi|29 : -G--AGG--TA----C-A-G-AACTGT-CC--A-AAAATG-TTTTCAGACA----------GA-TTG--G-TTG-----A--A-ATTT-G-------CGT--G------------------------------------AA--T--TT-T-GA---TT-TT---CA-TGA-----TT-----T-----T-GA---A-A-T-GT-TT--T-G-T-GA-T----AA-G--T-A--AA-GC-----C-A-TTTA-A---A-A----G-T-AA---AGA-TAG--AC-A-GG-----TCTGT--ACCTCAACTAC--------T---AAT-TC-ATAG-TA-C----A-------A-----------------ACT-------------------A-----------gg
gi|29 : --AC----AC-T----G-----AAGA---T---TTC-----C--A--A-A-------TT--A-A--------T-AGT--T--T-G-------T--AC-T-A----T-G---AAT---T-A-GTAGTT-G--AGG--TA----C-A-G-ACCTGT-CT--A-ttaatttggaaatcttcagtgt
gi|3 : gaggtacagaactgtccaaaaatgttttcagacagattggttgaaatttgcgtgaattttgattttcatgattttgaaatgttttgtgataagtaaagccatttaaaagtaaagaAGTGAGATTGGTAGAAGCGAAAT-ATTTTGGACTGGT-C--GC-TC-TACCAATCTCAGACCAATGTAACAACCTTATTCGGGAAAGTTTGCCTCACCTTCCGCCGCCTGTTG-CGAT-TAAA---TGGCT-TTAACTGA-ACATCT-TGTT-CAGAAAA--T----TTCA-GATTTTT-ATCTTAGGTATC--------CT---ACT-----AA--C-CCC----TA--TCACAAT--GAAACTTGCATTTC--TTACCTTTTCAT--GGT-GTT---------AAATCCCTATATCAAGTT-GGTTATTTTGAC-GTCCAT-TT-A--GT----GC-T----G-----AAGA---G---TTT-----CCAA--A-A-------TT--G-A--------T-AGT--T--T-G-------T--AC-T-A----T-G---GAT---T-A-GT-CTT-G--AGG--CA----C-A-G-AACGGT-TT--A-AAA-TG-TTTTCAGATA----------GA-CTG--T-TTG-----A--T-ATTTTA-------CGT--AGTTTAAC-TA--TT-T-----------G-TT-----AA--T--TT-T-G----TT-TT---CA-TGA-----TT-----T-----T-GA---A-A-T-GC-TT--T-T-T-GA-C----AAAG--T-A--AA-GT-----C-A-TTTA-A------------T-AAC--AGA-TAA--AC-A-GA-----TCTGT--ATCTTAA-GAC--------T---AGT-TG-ATAG-TA-C----A-------A-----------------ACT-------------------A-----------G-----------TGTTGAGAAA--GCACAAAA----T--------GGAC-GTGAA-AATA----ACCCCTTGATTT-AAATT--GAGATTT----AACACT--A-GAAA-AG--GTAAGAAATGCAAGTTTT---ATTGTG--ATAGG---GA-G---T----A------GTAG-GA-TATCTAA--GGTG-AAAATC--TG-AAGC---GG----GC-AAG----ATGT-T--C-AGTTT--A--AGT-CAT-T-TTA-ATACGCA--AACTAGGCCGGTGGAAG--TT-GGGCACAACTTTCCCTAATAAGGTTGTGTTACATTGGTTTGAG-ATTGG-TAGA-GC-ATCAG--TCCAATAATTT-AGCTT--CTAACC------A--ATCTCACTGAGATTA
gi|30 : A-GT--T----A------GTAG-AA-TGTCTAA--GGTG-AAAAAT--TG-AAGC---GG----GC-AAG----A---------AATT------NNN-NNN-NNNNN-NN-NNNN--N--NNNN-NNNNNNNNN--NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-ATCGG-GAAA-GGCACCAG--TCCA---ATTT-TGACG--CT-AGCGAGGATA--ATCTCACTGAGATTA
gi|31 : CTTGATTTCAAATT--GAAATTT----A-CACT--ATGTAAGAG--GTGAATAAAG-AAGTTTTGCTATTGTT--CTAAG---GA--T--T----A------GGTG-GA-TGTCCAA--GGTGAAAAATT--TGTAAGC---GG----GCTGAG----TGGTGT--C-AATTT--ACTACC-AAT-TATTA-AT-CGCAGGA--CAAG-CGCCG--AGTTTTGAGACA-A
gi|32 : -GT--T----A------GTAG-GA-CGTCTAA--TGTG-AAAATT--TA-AAGC---G--------AAG----A--C-N--N-NNNNN--N--NNN-NNN-NNNNN-NN-NNNN--N--NNNN-NNNNNNNNN--NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNGGTAAAA-GCGACCAGGTCCCAAATATTT-AGCCT--TT-A
gi|33 : -----C--A--G-A-------TT--G-A--------T-AGT--T--T-G-------T--AC-T-A----T-G---AAG---T-A-AT-CTA-G--AGG--TA------G-G-AAC------------------------ATA-------------CTG--G-TTA-----A--A-ATTT-A-------CAT--AATTTT-C-TA--TT-T-----------G-TT-----GA--T--TT-T-GA---TT-TT---CA-TGA-----TA-----T-----T-GA---A-A-T-GC-TT--T-G-T-GA-T----AA-G--T-A--AA-AT-----C-A-TTTA-A---A-A----G-T-AA---AGG-TAG--AC-A-GT-----TCTGT--ACCT
gi|34 : -------------------A-----------G-----------TGTTGAGANN--NNNNNNNN----N--------NNNN-NNNNN-NNNN----NNNNNNNNNNNN-NNNNN--NNNNNNN----NNNNNN--NNNNNN-NN--NNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNN--NNNNN---GA-GT--TT---ATT----GTAG-GA-TGTCTAA--GGTG-AAAATT--TG-AAGC---Gttga
gi|35 : aactctac--C----TTCATGATTTTC--CCTT-GATATCA-------CT---ACT-----AA--CTC
gi|36 : gttgagaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-G-AACTAT-TT--A-AAGATG-TCTTCAAACA----------GA-CTG--G-TTA-----A--A-ATTT-A-------CATCTAGTTTC-C-TT--TT-TTCGT-------G-CTTTTAAAA--TGACT-T-G----TG-TT---CAGTAA-----TTGTCATT-----CTAA---A-A-T-GC-Tgcggg
gi|37 : ggtacagaaaactaaatttttc-TC-A--AT----AC-T----G-----A------------C-----T--A--A-T-------TT--C-A--------T-CGTAAT--T-G-------T--AC-T-A----T-C---ATT---T-ACG------G--AGG--TA----C-A-T-AACTGT-CT--A-AAGATG-CCTTC----A----------GA-CTG--G-TTACATGTA--A-GTTT-A-------CAT--A-TTTT-C-TT--TT-T-----------
gi|38 : ttcT-----AA--T--TT-TTG----TT-TTTTCCA-TGA-----TT-----T-------GA---A-AAT-GC-TT--T-G-T-GA-T----AA-G--T-A--AA-GTC----C-A-TTTG-A---A-A----GTT-AA---AGta
gi|39 : catttgaccaaatcttcgttaagttccaacccgttgccTGA---A-A-T-GC-TT--T-G-T-GA-T----AA-A--G-A--AA-GT-----C-A-TTTG-A---A-A----G-T-AA---GGA-TAT--AC-C-GA-----TTTGT--ACCTCAA-GAT--------T---AAC-TC-ATAA-AA-C----A-------A-----------------ACT-------------------A-----------taaa
gi|39 : ----AC-T----G-----AAGA---G---TTC-----C--A--A-A-------TT--G-A--------T-AGT--T--T-G-------T--TT-T-A----T-G---AGT---T-A-AT-CTT-G--AGG--TA----C-A-A-ATCGGT-AT--A-tcaatttggaactcttcagt
gi|4 : tgaaatgctttgtgataaagaaagtcatttgaaagtaagga--C----TTCA-AATTT-C-ACCTTAGACAT----------T---ACT-----AA--CTCNN----NN--NNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNN--NNN-NNN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NN-N--NN----NN-N----NNNN--AAGA---G---TTC-----C--A--A-A-------TTT-G-A--------T-AGG--T--T-T-------T--AC-TCA----T-G---GAA---T-A-GT-CTT-G--AGG--TA----AGA-G-AACGGT-TTT-A-AAAATG-TTTTCAGATA----------GA-CTG----TTG-----A--A-ATTT-A-------CGT--AG--TT-C-TA--TT-T-----------G-TT-----AA-----TA-T-G-----T-TA---CA-TGA-----AT-----T-----TTGA---A-A-G-GC-CTAAT-GTT-GACT----AA-G--T-A--AA-GT-------A-TTTA-A---A-A----G-T-AA---AGA-TAAT-AC-A-GG-----TCTGT--ACCTTAA-GAC--------T---AGT-TT-GTAG-TAGC----A-------A-----------------ACTATCAATTTTGGAACTCTTCA-----------G-----------TGTT-AGAAN--NNNNNNNN----N--------NNNN-NNNNN-NNNN----NNNNNNNNNNNN-NNNNN--NNNNNNN----NNNNNN--NNNNNN-NN--NNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNN--NNNNN---GA-GT--T-----------GTAG-GA-TGTCT-A--GGTG-AAAATT--TG-AAGC---GGNNNNNN-NNN----NNNN-N--N-NNNNN--N--NNN-NNN-NNNNN-NN-NNNN--N--NNNN-NNNNNNNNN--NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTATTAA-CAG--GCACCCAG--TCCAAA-ATTT-AGCCT---T-ACC---------ATC-CACTGAGATT
gi|40 : agATATTGAT-ATGCCTCTC-A--AC----AC-T----A-----AAAA---G---TTC-----C--A--ACAGGCTACTTC--GTAT-------T-AGT--T--T-G-------T--AC-T-A----T-C---AAT---T-T-GT-CT
gi|41 : t-TA--TTCT-----------G-TT-----AA--T--TT-C-G----TT-TT----A-TGA-----TT-----TCAAGCTTG----A-A-T-AC-TT--C---T-GA-C----AA-G--------A-GG-----C-A-TTGA-AATGA-A----A-T-AT---AGA-TAA--AT-A-Gtcacagcatgcagc
gi|42 : ----TT-TT---CA-CG------TT-----T-----TTGA---A-A-T-GC-TT--T-G-T-GA-T----AA-G--TGA--AA-GT-----C-A-TTT--A---A-A----G-T-AG---Aac
gi|43 : atttaaaCATA--------CT---TCT-----AA--CTCTC----TAAATCACTAT--GAAACTTGCGTTTC--TTACCTATACAT--actacttgaagtagacc
gi|44 : t-----T-----TTGA---G-A-T-GC-TT--T-G-T-G--T----AA-G--T-A--AA-GT-----A-A-TTGA-A---A-A----G-T-AACTTAGA-TAG--AC-A-GG-----TCTGT--Atacggt
gi|45 : T-----T-----TTGACGCATA-N-GT-TT--T-G-T-GA-T----AA-G--T-A--AA-GT-----C-A-TTTA-A---A-A----G-T-A---------------------------TAT--ACCTCAA-GAC--------T---
gi|46 : CAG--TCCAAAT-TTT-AGCTT--CT-ACC------A---TCTCACTGAGATTA
gi|47 : agactttgttggctgatgT-CTC-G--ATG--TA----C-A-G-AGATGT-CT--A-GAAATG-TCTACAGACA----------GA-CTG--G-TTG-----A--A-ATTT-A-------
gi|48 : tCAG--ATCAAATATTTTAGCTTATCT-ACC------A--ATCTCACTGAGATTA
gi|49 : ggactgatg--T----A------GTAG-GA-TATCTAA--GGTG-ACCATT--TG-AAGC---AG----GC-AAG----AAAT-G--C-AGT
gi|5 : aa--C----TTCACAATTTTC-AACTTAGGTATC--------CTCTAACTCNNNNNN--NNNNN----NN--NNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNN--NNN-NNN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NN-N--NN----NN-N----N-----AAGA-------TTC-----C--AG-A-A-------TT--G-A--------TTAGT--T----G----------AC-T-AC---T-G---GAT---T-A-GT-CTT-G--AGG--TA----C-A-GAAACGGG-TT--T-CATATG-TTTTCAGATA----------GA-CTGTTT-TTG-----A--T-ATTT-A-------CGT--AG-TTT-C-TA--GT-TGATCGGTGTAGG-TC-----AAT-T--TT-T-GGTGTTT-TT---CATTGACCGAGTTA----T-----TTGA---A-A-G-CC-TT--T-G-T-G--C----AA-G--T-A--AC-GTACATGC-A-CTTA-A---A-A----T-C-GA---CAG-CAGTAAC-ACGG-----TCTGTAAACCTTAA-GA---------T---AGT----ATAG-TA-C----A-------AG----------------ACT-------------------A-----------
gi|5 : TCCAC-TC-A--A-----AC-T----G-----TAGA---GAAGTTC--------A--A-A-------TT--G-A--------T-AGTC-T--T-G-------T--AC-T-A----T------AC---T-A--T-CTT-A--AGGTTTA----C-A-G--ACCGTGTT--A-tcaatttgaacttctctacagtttgagtggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggttagtagaagtatctagagggtgagaaatgaaggcgggcaaggaatgttcgagctttgaaatc
gi|5 : cttcacaattttcaacttaggtatcctctaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagattccagaattgattagttgactactggattagtcttgaggtacagaaacgggtttcatatgttttcagatagactgtttttgatatttacgtagtttctagttgatcggtgtaggtcaatttttggtgtttttcattgaccgagttatttgaaagcctttgtgcaagtaacgtacatgcacttaaaatcgacagcag-GT--T----A------GTAG-AAGTATCTAGAGGGTG-AGAAAT--GA-AGGC---GG----GC-AAGGA--ATGT-T--CGAGCTTTGA--AAT-Cannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggttagtagaagtatctagagggtgagaaatgaaggcgggcaaggaatgttcgagctttgaaatc
gi|50 : cttcacaattttcaacttaggtatcctctaactcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagattccagaattgattagttgactactggattagtcttgaggtacagaaacgggtttcatatgttttcagatagactgtttttgatatttacgtagtttctagttgatcggtgtaggtcaatttttggtgtttttcattgaccgagttatttgaaagcctttgtgcaagtaacgtacatgcacttaaaatcgacagcagtaacacggtctgtaaaccttaagatagtatagtacaagactatcaatttgaacttctctacagtttgagtggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagTTGTG--ATATG---GA-GT--T----A------GTAG-GA-TGCCTTA--GGTG-AAAATC--TG-AAGC---GG----
gi|51 : A-GT--T----A------GTAG-GA-TGTCCGA--GGTG-AAAAGT--TG-AAGC---GG----GC-AAG----A
gi|52 : AG--ACCAAATATCT-AGCCT--CT-GTC------A--ATCTTGCTGAGAT
gi|53 : TA-A---A-A----G-T-AA---AGA-TAA--AC-A-GG-----TCTGT--ACCTCAG-Gtatc
gi|6 : CCGCCTGTTGATGAT-TAAAAAATGACA--AAACTGA-A-ATATACGCC-CG-------C----TTCA-AATTTTC-ACCTTAGACATC--------CT---ACT-----AA--CTCNN----NN--NNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNN--NNN-NNN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NN-N--NN----NN-NNNN-G-----AAGA---G---TTC-----C--A--A---------TT----A--------T-AGT--TGTT-T-------T--AC-T-A----T-TGG-AAT---T-A-GT-CTTTG--AGG--TA----C-A-G-AACGGT-TTTTA-AAAATGTTCTTCAGATA----------GA-CTGT-T-TTG-----A--A-ATTT-A-------CGT--AG-TTT-C-TA---T-T-----------G-TT-----AA--T--TT-G-T----TT-TT---CA-TGA-----TT-----T-----TTGA---A-A-T-GC-TT--T-G-T-GA-C----AA-G--T-A--AA-GT-----CGA-TTTA-A---A-A----G-T-AA---AGA-TAA--A--A-GG-----TCTTT--ACCTTAA-GAC--------T---AGT-TG-ATAG-TA-C----A-------A-----------------ACTATCAATTGTGGAACTCTTCA-----------G-----------TGTTGGGAAA--GCACAAAA----TCTTATGNNNNNN-NNNNN-NNNN----NNNNNNNNNNNN-NNNNN--NNNNNNN----NNNNNN--NNNNNN-NN--NNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNN--NNNNG---GACGT--TATTAA------GTAG-G--TTTCTAA--GGTG-AAAA----TG-AAGC---GG----
gi|7 : CTCAGTGAGAT-GGTAAAGGCTAA-T-ATTT-GG-CTGGTTC--GCCTT-TACCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNN-NNNNN--NNNNN-NNNNNNNN-NNNNNN-NNNC-CCG------C----TTCA-AATTTTC-ACCTTAGACATC---------T---ACT-----AATCNNNNN----NN--NNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNN--NNN-NNN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NN-N--NN----NN-N----G-----AAGA---G---TTC-----C--A--A-A-------TT--G-A--------T-AGT--T--T-G-------T--AC-T-A----T-GG--AAA---T-A-GT-CTT-G--AGG--TA----G-A-G-AACGGT-TT--A-AAA-TG-TTTTCAGA------------GA-CTG--T-TTG-----A--A-ATTT-A-------CGT--AGTTTT-C-TA--TT-T-----------G-TT-----AA--T--AT-T-G----TT-TTT--CA-TGA------T-----T-----TTGA---A-A-T-GCTTT--T-G-T-GA-C----AA-G--T-A--AA-GT-----C-A-TTTA-A---A-A----G-T-AA---AGA-TAA--AC-A-GG-----TCTGT--A-CTTAA-GAC--------T---AGT-TG-ATAG-TA-C----A-------A-----------------ACT-------------------A-----------
gi|7 : taatC-A--AC----AC-T----G-----AAGA---G---TTC-----C--A--A-A-------TT--G-A--------T-AGT--T--T-G-------T--AC-T-A----T-C---AAC---T-A-GT-CTT----AAG--TA----C-A-G-ACCTGT-TT--A-tcaatttggaactcttcagtgttg
gi|8 : taatctcagtgagatggtaaaggctaatatttggctggttcgcctttaccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncccgcttcaaattttcaccttagacatctactaatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaagagttccaaattgatagtttgtactatggaaatagtcttgaggtagagaacggtttaaaatgttttcagagactgtttgaaatttacgtagttttctatttgttaatattgtttttcatgattttgaaatgcttttgtgacaagtaaagtcatttaaaagtaaagaTCAGTGAGATTGGTAGAG-CGAAATTATTT-GGACTGGT-CA-GC-TCATACCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNN-NNNNN--NNNNN-NNNNNNNN-NNNNNN-TGTTGCAGAAGAGAT----TTCA-GATTT---ATCTTAGGTATC--------CT---AC------AA--CTCCC----GN--NNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNN--NNN-NNN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NN-N--NN----AG-T----GCATGAAAGA---G---TTC-----C--A--A-A-------TT--G-A--------T-AGT--T--T-G-------T--AC-T-A----T-G---GAT---T-A-GT-CTG-G--AGG--CA----C-A-G-AAC-GT-TT----AAAATGTTTTTCAGATA----------GA-CTG--ATTTG-----A--GTATTT-A-------CGT--AGTTTA-CTTAT-TT-T-----------G-TT-----AA--T--TT-T-G----TT-TT---CA-TGA-----TT--------------G---A-A-T-GC-TT--T---T-GA-C-----A-G--T-A--AA-GT-----C-A--TTA-A---A-A----G-T-AC---AGA-TAA--AC-A-GA-----TCTGT--ATCTTAA-GAC--------T---AGTATG-ATAGTTA-C----A-------A-----------------A
gi|9 : ctaat---GA-GT--T----A------GTAT-GA-TGTCTAA--GGTG-ATAATA--TG-ATGC---GG----G--NNN----NNNN-N--N-NNNNN--N--NNN-NNN-NNNNN-NN-NNNN--N--NNNN-NNNNNNNNN--NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NTCGG-AAGA-G------G--TTC-------C-AGCCT--CG-ACG------AATATCTCGTTGAGATTAact
gi|9 : TCA-TATTATC-ACCTTAGACATC--------AT---ACT-----AA--CTCNN----NN--NNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNN--NNN-NNN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-NNNNTTCTC-A--AC----AC-T----G-----AAGA---G---TTC-----C--A--A-A-------TC--G-A--------T-AGT--T--T-G-------C--AC-T-A----T-G---ATT---T-A-GT-CTT-G--AGG--TA----C-A-A-ACCTG----------ACTA-TCTTT----------------A-CT-----TTT-----A--A-AT------------G---AATTTG-C-TT--TT-T-----------A-AC-----AA------------------------A-GCA-----TT-----------TTGA---A-A-T-G--------A-T-GA-A----AA-T--C-A--AA-ATTAACAC-A-TAGA-A---A-ACTATG-T-AA---AAT-TCA--AC-C-AG-----TCTGT----CTAAA-GACATTTTAGAT---AGT-T---CAG-TA-CCTCAA-------A-----------------ACT-------------------A------------------------GTTGAT--A--GTACAATA----T--------GGAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttctcaacactgaagagttccaaatcgatagtttgcactatgatttagtcttgaggtacaaacctgactatctttacttttaaatgaatttgctttttaacaaagcattttgaaatgatgaaaatcaaaattaacacatagaaaactatgtaaaattcaaccagtctgtctaaagacattttagatagttcagtacctcaaaactagttgatagtacaatatggaactcttcagtgtt
gi|9 : taatctcaacgagatattcgtcgaggctggaacctcttccgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncccgca-A--AC----AC-T----G-----AAGA---G---TTC-----C--A---------------------------T-A----T--T-G-------T--AC-T-A----T-C---AAC---T-A-GT-TTT-G--AGG--TA----C-T-G-AACTAT-CT--A-AAA-TG-TCTTTAGACA----------GA-CTG--G-TTG-----A--A-TTTT-A-------CAT--AGTTTT-C-TA--TG-T-----------G-TT-----AA--T--TT-T-GA---TT-TT---CA-TCA------T-----T-----TCAA---A-A-T-GC-TT--T-GTT-AA-A----AA-G--C-A--AA-TT-----C-A-TTTA-A---A-A----G-T-AA---AGA-TAG--TC-A-GG-----TTTGT--ACCTCAA-GAC--------T---AAA-TC-ATAG-TG-C----A-------A-----------------ACT-------------------A-----------actcttcagtgtt