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consensus : GTCAGAC-GC-TT--C--G-GCCCAA-AGA-CG----T--TTCG-GCCC-AT------GG-----------ACA-C-TTCGG-CC--C---AT-ACA-G---TT-----GGA-CAT--T----A-A----T--GG--C-AATA-TCAT--CC--C---TCAA-TATCTT-C-GACA--G-C--GC-C-TC----G-----GT----CTTCTCACG-CTACG----TT-A--CT--CGC-ACA---GC-G--CT--TG-TA---G---T-A-AG-ACCA--GCT-CAGC-GGA--T-TTTC-T-A-ATAT---TCA-AT--T--A-ACGT-GCTGG----AA--G-TGT-C--T--GGGCC-GAAG-T-G-TC------CAA-----C---T-GT-AT---G--GG-CCGA-A-G--TGT-----------CC-A-T-GGGC-CGAAACG---TC-TG--GCTACC
Reference ( gi|5 ) : GTCAGAC-AC-TT--C--G-GCCCAA-AGA-CG----T--TTCG-GCCC-AT------CA-----------ACA-C-TTCGG-CC--A---AT-ACA-G---TT-----GGA-CAT--T----A-A----T--GG--C-AATA-TCAT--CC--C---TCAA-TATTTT-T-GACA--G-C--GC-C-TC----G-----GT----CTTCTCACA-CTACG----TT-C--CT--CGC-ACA---GC-G--TT--TG-TA---G---T-A-AG-AATA--GCT-CAGC-GGA--T-TTTC-T-A-ATAT---TCA-AT--T--A-ACGT-GCTGG----AA--G-TGT-C--T--GGACC-GAAG-T-G-TC------CAA-----C---T-GT-AT---G--GG-CCGA-A-G--TGT-----------CC-A-T-GGAC-CGAAACG---TC-TG--GCTACC
gi|8 : GTCAGAC-AC-TT--C--G-GCCCAA-AGA-CG----T--TTCG-------------------------------------G-CC--A---AT-ACA-G---TT-----GGA-CAT--T----A-A----T--GG--C-------------C--C---TCAA-TATCTT-T-GACA--G-C--GC-C-TC----G-----GT----CTTCTCACA-CTACG----TT-A--CT--CGC-ACA---GC-G--CT--TG-TA---G---T-A-AG-AACA--GCT-CAGC-GGA--T-TTTC-T-A-ATAT---TCA-AT--T--A-ACGT-GCTGG----AA--G-TGT-C--T--GGGCC-GAAG-T-G-TCCATGTGCAA-----C---T-GT-AT---G--GG-CCGA-A-G--TGT-----------CC-A-T-GGGC-CTAAACG---TC-TG--GCTACC
gi|8 : tGCCAGAC-GT-TT--A--G-GCCCAT-GGA-CA----C--TTCG-GCCC-ATA-----CAGTTGCACATGGACA-C-TTCGG-CC--C---AG-ACA-C---TTCCA--GCA-CGT--T----A-A----T--TG----AATA-TTAg
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gi|16 : tatcatccctcaatatcttcaacaggcctcggtcttctcacactatatgaactcacacagcatagcggatttctatAGCC-GT-TT--C--G--CCCAT-GGA-C-----C--TTCG-GCCCCATA-----CAGTTGA------ACA-C-TTCGG-CC--C---AG-ACA-C---TTCCA--GCA-CGT--T----A-A----T--TG----AATA-TTAagctacc
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gi|8 : tcaaacacttcggtccaaAA-T-G-TC------CAA-----C---T-GT-AT---T--GG-CCGA-A-A--CGT-----------CT-T-T-GGGC-CGAAGTG---TC-TG--ACaaatgaccatatcattcctcaatatcttcgacaacgcctcggtcttctcacgctacgttactcgcacagcgcttgtagtaagaccagctcagcggattttctaatattcaattaacgtgcttgaggtgtctgggccgaagtgtccaactgtatgggccgaagtgtccatgggccgaaacgtcaggctac
gi|7 : tAA-T-G-TC------CAA-----CCCCT-GT-AT---T--GG-GCGA-A-G--TGT-----------CC-A-T-GGGC-CGGAAaatggccctcaatatctttgacagcgcctcggtcttctcacactacgttactcgcacagcgcttgtagtaagaacagctcagcggattttctaatattcaattaacgtgctggaagtgtctgggccgaagtgtccatgtgcaactgtatgggccgaagtgtccatgggcctaaacgtctggctaccg
gi|11 : tgtcagacacttctcgcccaaaacgcgtcAA-T-G-CC------CAA-----C---T-GT-AT---G--GG-CCGA-A-aatgccagtatcatccctcaatatcttatgacagcgctcggtcttccacactacttacttcgcacagcactggtgatagtaagaacagcgctcagcggatatttctaatattcagattagtgctggaagctgtctgggccgaagatggcgcaacgtatgggccgaaacgtcctggct
gi|9 : ccaaagaagtAA-T-G-CC------C-------C---T-GT-AT---G--GG-CCGA-A-A--CTT-----------CT-T-T-GGGC-CGAAGTG---TC-aattggccatatcatccctcaatatcttcgacagcgcctcggtcttctcacactacgttactcgcacagtgcttgtagtaagaccaattcagcgaattttctattattcaattaacgtgctggaagtgtttgggccgaagtgtccatggggcgaaacgtctggcta
gi|3 : cggAA-T-G-TC------CAACC---C---T-GTCAT---T--GG--CGA-A-G--TGTA----------CCAA-T-GGGC-CGAAaatggccatatcatccctcaatatcttcgacagcgcctcggtcttctcacactacgttactcgcacagtgctctgttagtaagaccaattcagcgaattttctattatcaattaacgtgctggaagtgttgggccgaagtgtccatggggcgaaacgtctggcta
gi|12 : cagacacattctgggccccaaagcttcgAG-T-G-TT------CAA-----C---T-GT-AT---G--GA-CCGA-A-G--TAT-----------CC-A-T-GGGC-CGAAACG---Taatggccagtatcatccctcaatatctttgacagccggccttcggtcttctcacactagtacttcgcgacacctggtgatagtcagaacaaggctcagctggattttcttatatattcaattacgtcgctggaagtgtcctgggccggaagatgtcgcaacgtagtgcgggccgaaaaccgtcctggtta
gi|15 : aatgtcagacacttcggcccaaatAA-T-G-TC------CAAA----C---T-GT-AT---G--GG-CCGaaatggccatatcatccctcattatcttcgacagcgcctcggcttcctcacactacggtacttgcacagactagctcagcggattttttaataactaataccggagtcgatgacggaag
gi|13 : AA-T-G-TC------CAAAAGAAC---T-GT-ATAATG--GG-CCGA-A-G--TGT-----------Caatgcgccatatcattaatgccaatatcatatccctcgatatcttcgacagcgcctcgtcttctcatgttatgttacatcgcacagcgcttgtagtaagaacagctcagcggatat
gi|19 : caG-T-G-TC------CAA-----C---T-GT-AT---G--GG-CCGA-A-A--CGT-----------CT-T-A-GGGC-CGAAGTG---TC-TG--ACaaaaaatgggcctttatcatccccccatttctttcgacagcgcctcccaaagtcccacttttcatgctatgggttttcactcccacacatgcgcttgttatcttaagaaacagctccagtggatttttt
gi|2 : at-G-TT------CAA-----C---T-G--AT---G--GGTCCGA-ATG--TGT-----------CC-A-G-AGGC-CGAAACG---TC-T
gi|4 : atgtccaactccacttgggtccaa-TC------CAA-----C---T-GT-AT---G--GG-CCGA-A-G--TGG-----------TC-A-T-GGGC-CG-AACGATCTT-TG--GCtaaatgatatcattcctcaaatatctttcgacacaacgctacggtactctcacgctacgttatactcgcacagcggcttgtataagtaagaccagctcagcggattttctaatatttatcaattaaacgtgcttgaggtgttgggccgaagtgatccaccatgtatggccgaagttccatgggccgaaacgatcagaagctacc
gi|20 : tgtcagacacttcg-TC------CAA-----C---T-GT-AT---G--GG-CCGA-A-G--TGT-----------CC-A-attaaatgggccatatcattcacctcaatatcttcgacagcgcctcggtcttctcacactacgttactcgcaccgcgcttgataagcaccagccgcaccggattttctaatattcaataaacgtctggaagtgtctgggccgaagtgtccaactgcatgggccgaagtgtccatggggccgaacatctggcttac
gi|17 : -TC------AAA-----C---T-GT-AT---G--G---CGAGA-G--TGT-----------CC-GTT-GGGCTCGAA--G---TC-Tatgaaatggccatatcatcca
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Alignments
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Reference ( family-2841 ) : GTCAGA-CGC-T--TC--G-GCCCAAAGA-CG----T--TTCG-GCCC-A-----------T-GG-ACAC-T-TCGG-C--CC---AT-ACAG-----TT-GGA---CA--TT----A----------------A-T-GG--C-AATA------------TCAT--CC--C---TCAA-TATC-TT-CGACA--GC--GC-C-TC----G-----GT----CTTCTCAC-GCTACG-----TTA--C-T--CGC-ACA---GC-G--CT--TG-TA---G---TA-AG-ACCA--GCT-CAGC-GGA--T-TTTC-TA-ATAT---TCA-A--TT-A-ACGT-GCTGGA--AG-TG-T-CTGGGCC-GAAG-TG-TC------CAA-C-T-GTAT-GGGCCGAAG--TGT-CCAT-GGGCCGAAACG-TC-TG--GCTACC
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Alignments
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Reference ( family-2841 ) : GTCAGA-CAC-T--TC--G-GCCCAAAGA-CG----T--TTCG-GCCC-A-----------T-GG-ACAC-T-TCGG-C--CC---AT-ACAG-----TT-GGA---CA--TT----A--A-T-G---------------G--CCA-TA------------TCAT--CC--C---TCAA-TATC-TT-CGACA--GC--GC-C-TC----G-----GT----CTTCTCAC-GCTACG-----TTA--C-T--CGC-ACA---GC-G--CT--TG-TA---G---TA-AG-ACCA--GCT-CAGC-GGA--T-TTTC-TA-ATAT---TCA-A--TT-A-ACGT-GCTGGA--AG-TG-T-CTGGGCC-GAAG-TG-TC------CAA-C-T-GTAT-GGGCCGAAG--TGT-CCAT-GGGCCGAAACG-TC-TG--GCTACC
gi|1 : GTCAGA-CAC-T--TC--G-GCCCAATGA-CG----T--TTCG-GCCC-ATGGTCCGCATGT-GG-ACAA-T-CCGG-CCTCC---AT-AAAG-----TT-GGA---CATCTT----AATA-T-G---------------G--CCA-TA------------T-ATG-TC--C---TCAA-TATC-TT-CGACAG-GC--GC-C-TC----G-----GT----CTTC-CACAGCT-CG-----TTA--C-TGGCGCGACA---GC-GGTCT--TG-TA---GT--TA-AG-ACCA-------AGC-GGGATT-TTTCTTA-ATATG--TCA-ATGTT-AGACGT-GCTGGGACAG-TGTT-CTGGGCCAGAAG-T--TC------CAAGC-T--TAT-GGG-CGAAG--TGTCCCAT-GGGCCGAAACG-AC-TG--GCTACC
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blockSeqs : . . . . . . . . . . T . . . G . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . G . G . . . . . . . . . TAG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . T . . . G . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . G . G . . . . . . . . . TAG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . T . . . G . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . G . A . . . . . . . . . TAG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . T . . . G . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . G . A . . . . . . . . . TAG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . T . . . C . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . G . A . . . . . . . . . TAG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . G . G . . . . . . . . . TAG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . G . A . . . . . . . . . TAG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . G . A . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqCons : T************ ** ** ** ** ** A* ** ** TAG******* ** *** ** **
originalCons : GTCAGA-CAC-T--TC--G-GCCCAAAGA-CG----T--TTCG-GCCC-A-----------T-GG-ACAC-T-TCGG-C--CC---AT-ACAG-----TT-GGA---CA--TT----A--A-T-G---------------G--CCA-TA------------TCAT--CC--C---TCAA-TATC-TT-CGACA--GC--GC-C-TC----G-----GT----CTTCTCAC-GCTACG-----TTA--C-T--CGC-ACA---GC-G--CT--TG-TA---G---TA-AG-ACCA--GCT-CAGC-GGA--T-TTTC-TA-ATAT---TCA-A--TT-A-ACGT-GCTGGA--AG-TG-T-CTGGGCC-GAAG-TG-TC------CAA-C-T-GTAT-GGGCCGAAG--TGT-CCAT-GGGCCGAAACG-TC-TG--GCTACC
finalCons : GTCAGA-CAC-T--TC--G-GCCCAAAGA-CG----T--TTCG-GCCC-AT------------GG-ACAC-T-TCGG-C--CC---AT-ACAG-----TT-GGA---CA--TT----A--A-T-G---------------G--CCA-TA------------TCAT--CC--C---TCAA-TATC-TT-CGACA--GC--GC-C-TC----G-----GT----CTTCTCACA-CTACG-----TTA--C-T--CGC-ACA---GC-G--CT--TGTAG-------TA-AG-ACCA--GCT-CAGC-GGA--T-TTTC-TA-ATAT---TCA-A--TT-A-ACGT-GCTGGA--AG-TG-T-CTGGGCC-GAAG-TG-TC------CAA-C-T-GTAT-GGGCCGAAG--TGT-CCAT-GGGCCGAAACG-TC-TG--GCTACC
Alignments
lowQualScore : 2222222222222 11111 1111 111111111111111111 111111111111 111111
lowQualScore : 3 3 44 44 3 3 7777 44 3 3 1111111111111 2 2 2 66 33 444 2 44444 2 444 33 5555 33 2 2 555555555555555555 7 444444444444 77 33 666 5 2 5 66 33 2 2 7777777777 5555 2 66666 66 8 33 5 444 2 55 55 8888888888 2 5 0 66 5 2 33 2 5 2 777 2 33 2 2 2 33 2 2 2 5 5 2 333333 2 666 2 55 2 2 2 2 33
lowQualScore : . . .. .. . . .... .. . . ............. . . . .. .. ... . ..... . ... .. .... .. . . .................. . ............ .. .. ... . . . .. .. . . .......... .... . ..... .. . .. . ... . .. .. .......... . . . .. . . .. . . . ... . .. . . . .. . . . . . . ...... . ... . .. . . . . ..
lowQualScore : 3 3 66 66 3 3 1111 66 1 1 9999999999999 7 5 7 66 44 444 5 11111 5 444 44 6666 44 5 5 777777777777777777 1 444444444444 99 22 999 0 5 0 33 77 7 7 8888888888 7777 7 77777 33 0 77 3 777 5 99 99 1111111111 5 0 9 99 0 5 22 4 0 7 333 7 77 7 7 7 77 7 7 7 3 3 7 999999 9 555 7 99 5 5 9 9 99
consensus : GTCAGA-CAC-T--TC--G-GCCCAAAGA-CG----T--TTCG-GCCC-A-----------T-GG-ACAC-T-TCGG-C--CC---AT-ACAG-----TT-GGA---CA--TT----A--A-T-G---------------G--CCA-TA------------TCAT--CC--C---TCAA-TATC-TT-CGACA--GC--GC-C-TC----G-----GT----CTTCTCACG-CTACG-----TTA--C-T--CGC-ACA---GC-G--CT--TG-TA---G---TA-AG-ACCA--GCT-CAGC-GGA--T-TTTC-TA-ATAT---TCA-A--TT-A-ACGT-GCTGGA--AG-TG-T-CTGGGCC-GAAG-TG-TC------CAA-C-T-GTAT-GGGCCGAAG--TGT-CCAT-GGGCCGAAACG-TC-TG--GCTACC
Reference ( family-2841 ) : GTCAGA-CAC-T--TC--G-GCCCAAAGA-CG----T--TTCG-GCCC-A-----------T-GG-ACAC-T-TCGG-C--CC---AT-ACAG-----TT-GGA---CA--TT----A--A-T-G---------------G--CCA-TA------------TCAT--CC--C---TCAA-TATC-TT-CGACA--GC--GC-C-TC----G-----GT----CTTCTCACA-CTACG-----TTA--C-T--CGC-ACA---GC-G--CT--TG-TA---G---TA-AG-ACCA--GCT-CAGC-GGA--T-TTTC-TA-ATAT---TCA-A--TT-A-ACGT-GCTGGA--AG-TG-T-CTGGGCC-GAAG-TG-TC------CAA-C-T-GTAT-GGGCCGAAG--TGT-CCAT-GGGCCGAAACG-TC-TG--GCTACC
gi|1 : GTCAGA-CAC-T--TC--G-GCCCAATGA-CG----T--TTCG-GCCC-ATGGTCCGCATGT-GG-ACAA-T-CCGG-CCTCC---AT-AAAG-----TT-GGA---CATCTT----AATA-T-G---------------G--CCA-TA------------T-ATG-TC--C---TCAA-TATC-TT-CGACAG-GC--GC-C-TC----G-----GT----CTTC-CACAGCT-CG-----TTA--C-TGGCGCGACA---GC-GGTCT--TG-TA---GT--TA-AG-ACCA-------AGC-GGGATT-TTTCTTA-ATATG--TCA-ATGTT-AGACGT-GCTGGGACAG-TGTT-CTGGGCCAGAAG-T--TC------CAAGC-T--TAT-GGG-CGAAG--TGTCCCAT-GGGCCGAAACG-AC-TG--GCTACC
gi|10 : aatTCG-GCCC-A----------------ACGT-T-TTG--C--CC---AT-A--------TT-AGATTACA--CC----A--A-A-T---------------G--CCA-TACATCCTATGAATTCAT--TC--CCTATCAA-TATC-TT-CAACA--GC--GCAC-TC----AATGCAGT----CTTCTCACA-TTACG-----TTA--A-T--CGC-ACA----C-G--CT--T--TA---G---TA-A--ACCA---CT-CA-C-GA-----TTTC-TA-AATT---TCA-A---T-A-ACGT--CTG----AG-T--T-C--AGCC--AAA-TG-TC--------A-C-T-TTAT-GGGCCGAA
gi|11 : caacac-T-TCGG-C--CC---AT-ACAG-----TT-GGG---CA--TT----A--A-TTG---------------G--CCA-TA------------TCAT--CC--C---TCAA-TATC-TT-CGACA--GC--GC-C-TC----G-----GT----CTTCTCACA-CTACG-----TTA--C-T--CGC-ACA---GT-G--CT--TG-TA---G---TA-AG-ACCA--ATT-CAGC-GAA--T-TTTC-TA-TTAT---TCA-A--TT-A-ACGT-GCTGGA--AG-TG-T-T----------------------------------T-GGGCCGAAG--TGT-CCAT-GGGGCGAAACG-TC-TG--GCTAtca
gi|12 : ccaaagaagtGTCAGA-CAC-T--TC--G-GCCCAAATA-CG----T--TTCG-GCCC-A-----------T-GG-ATAC-T-TCGG-T--CC---AT-ACAG-----TT-GAA---CA--CTA---A--A-T-G---------------G--CCA-TA------------TCAT--CC--C---TCAT-TATC-TT-CGACA--GC--GC-C-TC----G-----GC----TTCCTCACA-CTACG-----GTA--C-T--TGC-AC-----------------------------AG-ACTA--GCT-CAGC-GGA--T-TTTT-TA-ATA
gi|13 : aatG-ACAC-T-TCGG-C--CCATTAT-ACAGTTCTTTT-GGA---CA--TTAAAAA--A-T-G---------------GGCCTT-TA------------TCAT--CC--C---CCCA-TTTCTTT-CGACA--GC--GC-C-TCCCAAA-----GTCCCACTTTTCATG-CTATGGGTTTTCA--C-T--CCC-ACACATGC-G--CT--TG-TT---ATCTTA-AGAAACA--GCTCCAGT-GGA--T-TTTT-Tactaataccggagtcgatgacggaag
gi|14 : ca-TA------------TCAT--CC--C---TCAA-TATC-TT-CAACA--G---GC-C-TC----G-----GT----CTTCTCACA-CTATA-----TGAA-C-T--CAC-ACA---GC-A--T--------------------------------AGC-GGA--T-TT-C-TA-TTAT---TCA-A--TT-A-ACGC-CCTG----------T-CTGGGCC-GAAG-TG-TC------TAA-C-T-GCAT-GGGCCAAAG--TGT-CCAT--GGCTGAAACG-TC-TA--GCTACC
gi|15 : CGG-C--CC---AT-ACAG-----TTTGGA---CA--TT----A--A-T-GCGCCATATCATTAATG--CCAATA------------TCATATCC--C---TCGA-TATC-TT-CGACA--GC--GC-C-TC----------GT----CTTCTCATG-TTATG-----TTA--CAT--CGC-ACA---GC-G--CT--TG-TA---G---TA-AG-AACA--GCT-CAGC-GGA--T-
gi|16 : C-G--CG--TGATA---G---TATAG-ACCA--GCT-CAGC-GGA--T-TTTC-TA-ATAT---TCA-A--TT-A-ACGT-GCTGGA--AG-TG-T-CTGGGCC-GAAG-TG-TT------CAA-C-T-GTATGGGGCCGAAG---GT-CCAT-GGG-CGAAACG-GCTTG--GCTACCat
gi|17 : tGTCAGACCAC-TTATC--G----CAAAGA-C--------TTCGAGCCCAA-----------C-GG-ACAC-TCTCG-----CC---AT-ACAG-----TT-TGA---AA--TCTACAA--A-T-G---------------G--CCA-TAT-----------TCATG-CC--CA--TCAACCATC-TT-CGACat
gi|18 : atgaaaGA--T-TTTC-TA-ATAT---TCA-A--TT-A-ATGT-GCTTGA--AG-TG-T-TTGGGTC-AAAG-TG-TC------CAA-C-T-GTAT-GGGCCGAAG--TGT-CCAT-GGGCCGAAACG-TC-TG--GTTACC
gi|19 : GTCAGA-CAC-T--TC--G-GCCCTAAGA-CG----T--TTCG-GCCC-ATACAGT-----T-GG-ACAC-
gi|2 : at-CAC-T--TG--G-GTCCAAAGA-CG----T--TTCG-GCCT-C-----------T-GG-ACACAT-TCGGAC--CC---AT--CAG-----TT-GAA---C---TA----A--A-T-G--------------------A-TA------------TCAT--TC--C---TCAAATATC-TTTCGACACAAC--GC-T-AC----G-----GT----ACTCTCACG-CTACG-----TTATAC-T--CGC-ACA---GC-GG-CT--TG-TATAAG---TA-AG-ACCA--GCT-CAGC-GGA--T-TTTC-TA-ATATTTATCA-A--TTAA-ACGT-GCTTGA--GG-TG-T--TGGGCC-GAAG-TGATC------CAC-CAT-GTAT--GGCCGAAG--T-T-CCAT-GGGCCGAAACGATC-AGAAGCTACC
gi|20 : atgtccaactc-----------T-GG-ACAC-T-TCGG-C--CC---AT-ACAG-----TT-GGA----A--TGA---A--A-T-G---------------G--CCA-TA------------TCAT--CC--
gi|21 : TAT---TCA-A--TT-A-ACGT-GCTGGA--AG-TG-T-CTGGGCC-GAAG-TG-a
gi|22 : acT-GGGCCGAGGG-TGT-CCAT-GAGCCGAAACA-TC-TG--GCTACC
gi|23 : GAAA--TGT-CCAT-GGGCCAAAACG-TC-TG--GCTACCa
gi|24 : CCGNAG--TGT-CCAT-GGGCCGAAGTG-TC-TG--ACg
gi|3 : atCAGA-CACAT--TCTGG-GCCCCAAAG-CT----TCGTTCG-GCCC-A-----------TTGGTACAC-T-TCG--C--CA---ATGACAGGG---TT-GGA---CA--TT----A--A-T-G---------------G--CCAGTA------------TCAT--CC--C---TCAA-TATC-TT-TGACA--GCCGGC-CTTC----G-----GT----CTTCTCACA-CTA-G------TA--CTT--CGCGACA---CCTG--GT--GA-TA---G---TC-AG-AACAAGGCT-CAGCTGGA--T-TTTCTTATATAT---TCA-A--TT---ACGTCGCTGGA--AG-TG-TCCTGGGCCGGAAGATG-TCG-----CAA-CGTAGTGC-GGGCCGAAAACCGT-CC-T-GGg
gi|4 : GTCAGA-CAC-T--TC--G-GCC-AAAGATCG----T--T-CG-GCCC-A-----------T-GA-CCAC-T-TCGG-C--CC---AT-ACAG-----TT-GGA----A--TT----A--AAT-G---------------GG-CCA-TA------------TCAT--TCACC---TCAA-TATC-TT-CGACA--GC--GC-C-TC----G-----GT----CTTCTCACA-CTACG-----TTA--C-T--CGC-ACC---GC-G--CT--TG------A---TA-AGCACCA--GCCGCACC-GGA--T-TTTC-TA-ATAT---TCA-A--TA-A-ACGT--CTGGA--AG-TG-T-CTGGGCC-GAAG-TG-TC------CAA-C-T-GCAT-GGGCCGAAG--TGT-CCATGGGGCCG-AACA-TC-TG--GCTtta
gi|5 : tGTCAGA-CAC-T--TC--G-GCCCAAAGA-CG----T--TTCG-GCCC-A-----------T-CA-ACAC-T-TCGG-C--CA---AT-ACAG-----TT-GGA---CA--TT----A--A-T-G---------------G--CAA-TA------------TCAT--CC--C---TCAA-TATT-TT-TGACA--GC--GC-C-TC----G-----GT----CTTCTCACA-CTACG-----TTC--C-T--CGC-ACA---GC-G--TT--TG-TA---G---TA-AG-AATA--GCT-CAGC-GGA--T-TTTC-TA-ATAT---TCA-A--TT-A-ACGT-GCTGGA--AG-TG-T-CTGGACC-GAAG-TG-TC------CAA-C-T-GTAT-GGGCCGAAG--TGT-CCAT-GGACCGAAACG-TC-TG--GCTACCtac
gi|6 : TCAAA-CAC-T--TC--G-GTCCAAAGA-CG----T--TTCG-GCCC-C-----------T-GG-ACAC-T-TCGG-C--CC---AT-CAAG-----TT-GGA---AC--TA----A--A-T-G---------------A--CCA-TA------------TCAT--TC--C---TCAA-TATC-TT-CGACA--AC--GC-C-TC----G-----GT----CTTCTCACG-CTACG-----TTA--C-T--CGC-ACA---GC-G--CT--TG-TA---G---TA-AG-ACCA--GCT-CAGC-GGA--T-TTTC-TA-ATAT---TCA-A--TT-A-ACGT-GCTTGA--GG-TG-T-CTGGGCC-GAAG-TG-TC------CAA-C-T-GTAT-GGGCCGAAG--TGT-CCAT-GGGCCGAAACG-TC-AG--GCTAC
gi|7 : GTCAGA-CAC-T--TC--TCGCCCAAA-A-CGCGTCT--TCCG-GCCC-A-----------T-GG-ACAC-T-TCGC-C--CA---AT-ACAGGGG--TT-GGA---CA--TT----A--A-T-----------------G--CCAGTA------------TCAT--CC--C---TCAA-TATC-TTATGACA--GC--G--C-TC----G-----GT----CTTC-CACA-CTAC------TTA--CTT--CGC-ACA---GC-A--CTGGTGATA---G---TA-AG-AACAGCGCT-CAGC-GGA--TATTTC-TA-ATAT---TCAGA--TT-A---GT-GCTGGA--AGCTG-T-CTGGGCC-GAAGATG-GCG-----CAA-C---GTAT-GGGCCGAAA--CGT-CC-T-GG
gi|8 : tGTCAGA-CAC-T--TC--G-GCCCAAAGA-CG----T--TTCG-GCC---------------------A-----------------AT-ACAG-----TT-GGA---CA--TT----A--A-T-G---------------G--CC--------------------------C---TCAA-TATC-TT-TGACA--GC--GC-C-TC----G-----GT----CTTCTCACA-CTACG-----TTA--C-T--CGC-ACA---GC-G--CT--TG-TA---G---TA-AG-AACA--GCT-CAGC-GGA--T-TTTC-TA-ATAT---TCA-A--TT-A-ACGT-GCTGGA--AG-TG-T-CTGGGCC-GAAG-TG-TCCATGTGCAA-C-T-GTAT-GGGCCGAAG--TGT-CCAT-GGGCCTAAACG-TC-TG--GCTACCct
gi|9 : tGA-CAC-T--TC--G-GCCCAAAGA-AG----T--TTCG-GCCC-A-----------T---------------------------ACAG--------GGG---CA--TT----A--A-T-G---------------G--CCA-TA------------TCAT--CC--C---TCAA-TATC-TT-CGACA--GC--GC-C-TC----G-----GT----CTTCTCACA-CTACG-----TTA--C-T--CGC-ACA---GT-G--CTC-TGTTA---G---TA-AG-ACCA--ATT-CAGC-GAA--T-TTTC-TA-TTA----TCA-A--TT-A-ACGT-GCTGGA--AG-TG-T------------------------------------T-GGGCCGAAG--TGT-CCAT-GGGGCGAAACG-TC-TG--GCTAg