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Reference ( gi|3 )            : CTCGTAGGTTACTAGTCCCAAGGGATCTTAGGTCCAAGATCATGCACCTATGTC------ATGACAT-CCC-GTCATCTGGTCACCAGGGGATTCTGAGAACTAAG--GAACGACT---GAAGCAGCAGTTTTACTGGTGGCGGATGGTTAAGGACATTA-AGTT-AT--ATG-TCATGA-CATGTGACA--T---TTGTGCT-TTA-AACAA---GAGG-GGTTCC---TTG-CCG-AACAA-ATCGGAATTTAAGGGCTATCAGGCCGG-AAGCCCGATGGAGAGAGTACACCTGG---AT-TTCCTC--GG-CCC-CTTACCC---CGCAC------------TG---AA--------TG----TA-------------TATAC--TCAT---G---A-TGGTC--GA-CAACTT--CA--C-AAAA-----TGGG-TCGAAT-GTATTCCGCTCCCATCC-CAGAAAGCGGAA---A--TTACTGC--AAGGGCAGCCGTCAACGATTTTTTTCTC-TA-GATTTGGCTATCCGT---ACCAGATGTTTATGGATCAAGG--GCGCAATGTTGAAAGCGAGCTGTT----CCGGAAGATCTGT----ACCATG---CT-TG---GAATACATAAATATAGG------ACAACGCCA-TACAGACCTTCTGGCAAC--GA-ACAGGTCGAACG-GTACAACTGCAC-CTTAATGGA-CGCGGTCCCTTGCT-ATATTGAT--GG-TTA-GCCCAAG-AC--ATGA-----GACAAGTACTTAGGTCCAT--TGGCCGGAG-------GGTTGCGCTCGGTGGTAAATCGTCATACGGGCT-ACACACCAAATCG----GCTAATGCT-------GGGT-AGCAACCTTG--------ATGTTTGTCCCACCTCCTTCG-G--AGTCTATTCAAAATGGGGAGGATGGTGAGTTAGACAG-ATATGTGAGATATCTTGAGCAGAA----------AGTGCACATGGCACTGCTCGTAAAATATTAAAGACGT----CTCAGAAGGCGATGA-AATGAGCTCACGATCTGAAGATTCGCACATGTAAGT-TCAAGGTAGGGGAT-------TTGGT---TTACTGGCGACTCAATGCAGGAAATAAAGTATAA-TCGGTATGGAAGGGTCCTGTCATCACAA--TAGAAGTCACATCCGACACAGTATTTGCAGTT---A-----AGTCGCAGAGGGAGATCAGAGTCATGCACCATGACAAACTCAAAAGATGCGAATCTAGACAACTTCCGAAATGG-TTA
gi|1                          :             TAGTCCCCAAGGGTCTGCGTGCGGAGGTT------CTATGTCTGGTACATGACATACCCAGT--TCTGGCCATCAGGGG-TTCAGCGAACGAAGCTGAG-GGCTCGCGAA--AAC--TTTTATTGGCGGAAAATGTCTGATGATATTA-AGCG-GC--ATG-TCCTCA-CGTGTGACA--C---CTG--CTGTCG-AACAA---ACGG-GGTACT---TTA-CCT-GCTAG-GTCTGGGTTGAAAAGTTATCAGGCAGG-TAGTCCGATGGA-AAAGTCCACATAG---AT-TTTTGG--GG-CCC-CT--CCT---CGCACGGAGGCGGGGAACG---AA--------TA-----A-------------TATCC--TTAT---G---A-TGGTG--GA-CAGCTT---A--CTACAG-----TGGG-TAGAGT-GCGGGCCACT-CCATCG-CAGACAGCAGAA---G---CACTGC--AAGAGCAATGATCGAGGA-GTTTTTCGC-GG-CGTTTGGTTACCCCT---TCC-GAGGTTTACGGATCAGGGTAGCGTAAT-TCGAAAGTGAGCTGTT-----CGAAAGG-GTGTGGCGACT-TG---CT-CA---AAATACATAAGTCGCGT------ACTACTCCG-TATAGGCCTTCGGGAAAT--GGTCCAAGTCGAGCG-ATATAACCGTAC-TCTCATGGA-TGCTGTTCGATGCT-TCATAGAC--AA-CCAGGCCAAAA-AC--TTGG-----AACAGGCAATT-GGT--ATTCTAGCTGGAG-------CGTTGCGCTCCTCGG-AAACAGACAAACGGGGT-ACAC-CCCTACCG----GTTAATGCTAGTAGGAGAGTCAACAGCCCTGCCACACTCATGTACAGACCGCC-CCATAGTA--AGCCTTTTCAAAATGAGG-GGA-GGGGATACAGATAATATATGTGGCAGGTCTGGA--AGAATCCCTTTATCA--GCCCACGAAATCGCGCGCGAAAAGTT----GCGTGTGGCGCAGAAAGTCATGAGAACGAGATTACGACCTCCGTATGCGCGAACGCAAGT-ATAAAGTGGGGGATCTTGTTATTGGCGCGTTATTGGAGCCT-AATGT-GGAAAAAAGGTAGAGTTCAGTCTGTTAGG--CCCGCCGTGGTAAACT-GAGGTGAAATCGGATACCATCTATGCAATTCGGA-----A--CGCGTCGTGACATCATAATTATGCATCATGACAAGTTGAAGGTCTGCGAGTCCCGGCAGCTGCCGAAATGGATTA
gi|2                          :                                                                                                                        tcccgacagcttttACTGG----GGATAGTT-------TTAGAGTT-A---GT--TCCTTA-CCTGTGACA--CCGGTTGTCGT-CGA-AATAA---ACGC-GGACCC---ATA-CCC-CCTAA-AGCAGGACTTAAGAGCTACCAAGCTGGTAAGTCCCATGGAGAAA-TCCATTTG----AC-TTCTTG--GG-CCC-TCT-CCCTTTCGCAC------------TG---AAGCAGGAAATG----AAA------------TATAC---CATTTGA---A-TGGTGAAGA-TAAGTTTCCA--C-CCAA-----TGG--TTGAGT-GT-TGCCCCTCCCATCC-CAGACCGCAGAACAGA--T-ACGGC--GCGTGCTGCTATCAAGAATTTTT----CGTACGGTTCGGATACCCGTTTGA--AGAT-TTCACTGA-CAAGT---CGGAAT--TGAGAGCGAACTGTT----CCAAAAG-TTTGC----GATTTA---CTGTC---AGATCCACA---ATCGC------GTACCACCAGTATAGGCCTTCAGGAAAT--G--CCAGGTGGAAGC-GTATAAC-GCAC-TTTGAT-GA-TGCAG----TTGCG-TTGTTTCT--GG-ACA-ACACAAGTAA--ATAACCGTGGTAAAGCACCTGGGCCTCC--TACGCGGTG-------AA-TGCGCTCAGCTGTCAATAGACAGACAG--T-ACACCCCTAAT-A----AATGATGCT-------GGG------GCCGTG--------ATGaggattttaaggcccgatcggaaaatcggacgagttcgagagtgccccaccaactcctgtcagcttaccatctgcgactgtcaagcaaaagggtaggggatggcccatatctaggtactcggataaatccgggagcatcgaggcaaggccgcccggtttgttgatccggaaaaaccgagacgtgggggtaaaacggaaagaaatatcttactgcctgtgcaaggcgactaaccccacgggccttatggtgcagtgtgacacttgcagggattggttccaccctttaatgcgtaggggagactgaagacatgtaaaaacagtgtccacctattattgctccgaattgtactctagtatatgggtttggg
gi|14                         :                                                                                                                tcaaagaactaaattaagggtaggaaggagatttctttggtgagaggTA-AGTT-AT--ATG-TCAGGA-CATGTGATA--T---TTGTGCT-ATA-AACAA---GAGG-GGTTCC---TTG-TCG-AACAA-ATCTGAATGTAAGAGCTATCAGGCCGG-AAGCCCGATGgtaaataaccctgcactccttaggtttaaaccccccagggaaggtttcaagctggggtgaggggcgtagcattgcatacgtagctgggcttgtaacaagacgctcagtgggcgcaccgagtagcaagagaaaaagttgcgtgactgctcaaaggtcgatgagaaaaggactattgaccttcacatgcgagctagggagtattaaggtggcgatttgttattggcgccgcatgccggtaaaagtgcaatcatttggttggcccgggatagcattcaagtcaagtccgacactgtgtatgcatatccgcacccgccgagacatttaaaatcatgcattacgacaaactgaaggccctgtatgctcgcggagcttcctaagtggattcgagcaaccaagctgcattcttccgaccagctgcgtgccagataacaaactcgcaatcaccaccgcccgctaagctggcaattataatcgcagatagtcgagatgcaatcccgtatcttcgggacacgcagccgtacggggcactaaatcctggacaaaaccgatcggcgattcaggcttccagggcagaaaaacgatctgccagcggtcgaagttacagtattgcctgtgcaagtcgacaagccagctggtctatggtacgtgtgataccttgcaaggactggtttccccaaaatgttgtgagaccgggaacattcaaaaacatcccacttacaatgtccgactgtcactctgtagttgcgtttaggg
gi|11                         :                                                                                                                                                               TA-AGTTTACTAATGATCAGGATCATTGGACAACT---CTGTCCT-ATATAACAATGAGAAGTGGCTCTAATTCGTCCGCAACAAGATCGGAATTTAAAA-CTATCAGACCGG-AAG-CTGATG
gi|15                         :                                                                                                                                                                             G-TCAGGA-CATGTGACA--T---TTGTGCT-ATA-AACAA---GAGG-GGTTCC---TTG-CCG-AACAA-ATCTGAAGTTAAAAGCTATCAGGCCGG-AAGcga
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                  CC---TTA-CCC-CATAA-AGCAGGATTCG-GAGCTACAAAGCTAT-AGTCCC-ATGGAGA-AGTCCATGTGGTAGATCTTCTTCTGGG-CCCTCTTCCTT---CGCAC------------TG---AA---------G----TAGGAAATGGGGTAATATAC--TCAT---G---ATTGGTG--GAGTAGGTT--CAGCC-GAGAGAGCGTAGGCTTGAGT-ATGTGCCCCTCCCCT-C-CAGA
gi|9                          :                                                                                                                                                                 tcaaagaactcaaattaagccgctagtcgaacatttctattggtgagaatggattgatagtttaggagctaaattgtcctataacttgatcgctgtgtagcgtcgaaataaaacacgacATGGAAAAAGTCCACTTCG---AT-TTTTTG--GG-GCC-CCTCCCT---CGCACGGAGG-------TGGGGAA--------CGAA--TA-------------TATCC--TTAT---G---A-CGGTG--GA-CAGTTT--TA--C-TAAG-----TGGG-TAGAGT-GCATGCCACTCCCATCG-CAGACAGCAGAA---G--TGACTGC--AAGAGCAATGATCGAGGAGTTTTTcctcagaacaaaccgcgcgtgctgcaatcaaaacggtgagttttcgttcgttgatacccgtttaaga
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                            AGAGGGTG-ATTTGG---AT-TTCCTG--GGCCCC-CCTGCCC---AGGAC------------CGCCAAA--------TGGCAACG-------------AATACCGTCCT---GGTTA-TGGTG--GACCAAGTT--CAC-C-CAAG-----TGGG-T-GAGTAGTGTGCCGCTCCCCTTCGCAGACTGCGGAA---AAGTGACAGCCTAGCGGCGG--GTGGACCAGTTCTTCCTC-TC-G-TTCGGCTGCCCCT---TCCAGATCTTCACCGATCAGGG--CCGCAATTTCGAAAGTAAGCTTTTTGAGCTGG------TGT----GCGGTGGCTCT-TGAAAGAATCCATA-----AGGCCCCGCACTAC-CCG-TACCGACC-TCGGCCAATTGGG-GCAGGTAGAGCGCATGCAATCGGACACT--ATGGATCGCCGTCCGGTGTTAATATTGACAAGGCTTA-----AGG-ACTGCTGG-----GACCAACATTTA-GCCCAG--TCGCTGGAGCTCTCCCGGT--CGCTCCGTG---AACCGCAGCACGGGTTCAC-CGCCAAACAGTGTAGCTGATGCT-------GGGc
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CCGCAC-CTTAATGGA-AGCGGTCCGTTGCT-ATATTGAgtcgagagaacctaactcccagccggacttattgtacccagttcccggcccgggggaggaccggaatctcgtcaggagtaacgtggcggggctggagaaatctatcctagttggcccacgagaaaggccccggtcccgctcaagaccacggaggaagagccctgaaaacgggattatgagc
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CTT---------ATGTTCAGACC-CCTCCCTGG-GGGAGCTTTTTCAAAAT-GGGAGAA-GGGGATTCTGATAA-ATATGTG
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        caacagtcccactacaTGCACATGACACTGCTCGTACAAAGTTAAAAACGG----CTCGGAAGGCAATGA-AAAGAGCTCACGATCTGGAGgcagggatggacgagtctctaatcaatccacaaaattgcgcatgaaaagttagattacgatctccacctgtgtgagcgaaagtataacgtgggagatctagtttacttgcg
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATGACACTGCTCGTAAAAAATTAAAGACGG----ATCAGAAGGCGATGA-AA-AAGCTCACGATCTGCAGAGACGCATTTATAAGT-TCAAGGTAGGGGAT-------TTGAC---TTACTGGCGACGCAATGCGGGGAAGAAAGTAGAA-TCGGTATGGAAGGGTCCTGGCATCATAA--TAGAAGTCAAATCCGTCACAGCATTTGCAGTT---A-----AGTCGCGGAGGGAGATC--AGTCATGCACCA
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CGGCCCTT--------AG-GTTTA-AAAC--TC-CCCCA---GAGGAAGG-T-----------TTACAAAGTGGGGGTGA-GGGGGATAACA-AT-GTATACGTAGC-TGGGCTTGA--AAAcga
gi|14                         :                                                                                                                                                      gtaaataaccctgTA--AGTT-AT--AT-G-TC--AGGA-CATG-TGATA--T---TTGTGCTAT--A-AACAA---GAGG-GGTTCC---TTGTCG--AACAA-ATCTGAATGTAAGAGCTATCAGGCCGG-AAGCCCGATGgacgct
gi|15                         :                                                                                                                                                                                  -G-TC--AGGA-CATG-TGACA--T---TTGTGCTAT--A-AACAA---GAGG-GGTTCC---TTGCCG--AACAA-ATCTGAAGTTAAAAGCTATCAGGCCGG-AAG
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TGCACA-TGA-CACTGCTCGTACAAAGTTAAA-AACGGCTCGGAAGGCAATGA--AAA--GAGCTCACGATCTG
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CCGCAC-CTTAATGGA-AGCGGTC-CGTTGCT-ATATTGAgag
gi|2                          :                                                                                              TCAAAGAACTAAATTAAG-GG-TAG-GAAGGAGA--TTTCTTTGGTGAGAGGA---CTGGGGATAGTTTTAG-AGTT-A---GT---TC--CTTA-CCTG-TGACA--CCGGTTGTCGTCG--A-AATAA---ACGC-GGACCC---ATACCC--CCTAA-AGCAGGACTTAAGAGCTACCAAGCTGGTAAGTCCCATGGAGAAA-TCCATTTG----AC-TTCTT--GGGCCCTCT--CCC----TTTCGCACTGA-AGC---AGGAAATG---A-AATATAC-CATTTGA---A-TGGTGAAGA-T-AAGTTTCCA-CC-C-A------ATGG--TTGAGT-GT-TGCCCCTCCCATCC-CAGACCGCAGAACA--GATACGGCGCGTGCTGCTA-TC-AA-----GA-ATTTTTCGTACGGTTCG--GATACCCGTTTGA-AGAT-TTCACTGA-C-AAG---T-CGGAA-T-T-GAGAGCGAACTGTTCCAAAA----GTT-TGCGA---TT-TACT---GTCA---GATCCACAATCG--CGTACCAC-CAGTATAGGCCTTCAGGAAAT---G-CCAGGTGGAAGCG--TATAA-CGCAC-TTTGAT-GA-TGCAGTTGCGTTG-T-TTCTGGAC-AACA----C---AAGTAAATAACC--GTGGTA-AAGCACCTGGGCCTC--CTACGCGGTG-------AA-TGCGCTCAGCTGTCAATAGACAGAC--AG-TACACC--CCTAA-T-----AAATGATGCT-------GGG------GCCGTG--------ATGGTAAATAACCCTGCACTCCTTAGGTTTAAACCCCCCAGGGAAGGTTTCAAGCTGGGG-TGA-GGGG--CGTAGCATTGCATACGTAGCTGGGCTTGTA--ACAAGACGCTCAGTGGGCGCACCGAGTAGCAAGAG-AAAAAGTTGCGTGACTGCTCAAAGGTCGATGAGAAAA--GGACTATTGACCTTCACATGCGAGCTAGGGAGTATTAAGGT-GGCGAT-------TTG-----TTATTGGCGCCGC-ATGCC-GGTA--AAAGTGCAA-TCATT-TGGTTGG--CCCGGGATAGCAT--T-CAAGTCAAGTCCGACACTGTGTATGCA--T--AT-CCGCACCCGCCGAGACATTTAA-AATCATGCATTACGACAAACTGAAGGCCCTGTATGCTCGCGG-AGCTTCCTAAGTGGATT
gi|3                          :             TAGTCCCAAGGGATCTTAGGTCCAAGATCATGCACCTATGTC------ATGACAT-CCC-GTCATCTGGTCACCAGGGGATTCTGAGAACTAAG--GAACGACT---GAAGCAGCAGTTTTACTGGTG-GCGGATGGTTAAGGACA---TTA--AGTT-AT--AT-G-TC--ATGA-CATG-TGACA--T---TTGTGCTTT--A-AACAA---GAGG-GGTTCC---TTGCCG--AACAA-ATCGGAATTTAAGGGCTATCAGGCCGG-AAGCCCGATGGAGAGAGTACACCTGG---AT-TTCCT--CGGCCCCTT--ACC----C--CGCAC------T---G---AATG---T-A-TATACTCAT---G---A-TGGTC--GA-C-AACTT--CA-CA-A-A------ATGGG-TCGAAT-GTATTCCGCTCCCATCC-CAGAAAGCGGA--A--ATTACTGCAAGGGCAGCCG-TCAAC-----GATTTTTTTCTCTAGATTTG--GCTATCC-GTACC-AGATGTTTATGGATCAAGG---G-CGCAA-TGTTGAAAGCGAGCTGTTCCGGAA----GATCTGTA----CCATGCTT--G--G---AATACATAAATAT-AGGACAACGCCATACAGACCTTCTGGCAAC--GA-ACAGGTCG-AACG-GTACAACTGCAC-CTTAATGGA-CGCGGTC-CCTTGCT-ATATTGATGGTTA-GCCC---AAG-A------C--ATGAGACAAGTACTTAGGTCCA--TTGGCCGGAG-------GGTTGCGCTCGGTGGTAAATCGTCATAC-GGGCTACA-CA-CCAAATC-----GGCTAATGCT-------GGGT-AGCAACCTTG--------AT-GTTTG-TCCC--AC-CTCCT----TCGGAGTCT-----------ATTCAAAATGGGGAGGATGGTG-AGTTAG-ACAG-ATATGTGAG-ATATCTTGAGCAGAA-------A--GTGCACA-TGG-CACTGCTCGTAAAATATTAAA-GACGTCTCAGAAGGCGATG---AAAT-GAGCTCACGATCTGAAGATTCGCACATGTAAGT-TCAAGGTAGGGGAT-------TTGGT---TTACTGGCGACTCAATG-CAGGAAATAAAGTATAA-TCGGTATGGAAGGGTCCTGTCATCACAA--TAGAAGTCACATCCGACACAGTATTTGCAGTT--AAGTCG----CAGAGGGAGATC--AGAGTCATGCACCATGACAAACTCAAAA-GATGCGAA-TCTAGACAACTTCCGAAATGG-TTAcgagcaaccaagctgcattcttccgaccagctgcgtgccagataacaaactcgcaatcaccaccgcccgctaagctggcaattataatcgcagatagtcgagatgcaatcccgtatcttcgggacacgcagccgtacggggcactaaatcctggacaaaaccgatcggcgattcaggcttccagggcagaaaaacgatctgccagcggtcgaagttacagtattgcctgtgcaagtcgacaagccagctggtctatggtacgtgtgataccttgcaaggactggtttccccaaaatgttgtgagaccgggaacattcaaaaacatcccacttacaatgtccgactgtcactctgtagttgcgtttaggg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ctcgtaggttacATTTGG---AT-TTCCT--GGGCCCCCCTGCCCAGGAC--CGC-CAAATGGC-------AACG---A-A-TACCGTCCT---GGTTA-TGGTG--GA-CCAAGTT--CA-CCCA-A------GTGGG-T-GAGTAGTGTGCCGCTCCCCTTCGCAGACTGCGGA--AAAGTGACAGCC-TAGCGGCGGGTGGAC-----CA-GTTCTTCCTCTCGTTCG--GCTGCCC-CTTCC-AGATCTTCACCGATC-AGG---GCCGCAATT-TCGAAAGTAAGCT-TTTTGAGCTGGTG---TGCG----GT-GGCTCTTG--AAAGAATCCATAAGGCCCCGCACTAC-CCGTACCGACC-TCGGCCAATTGGG-GCAGGTAG-AGCGCATGCAATCGGACACT--ATGGATCGCCGTC-CGGTGTTAATATTGACAAG---G--CTTAAGG-A------CTGCTGGGACCAACATTT-AGCCCA--GTCGCTGGAGCTCTCCCGGT--CGCTCCGT-G--AACCGCAGCAC-GGG-TTCA-CCGCCAAA-CAGTGTAGCTGATGCTG------GGGTCGAGAG
gi|5                          :                                                                                                               agagggtgCGAA--CAT--TTCTATTGGTG--AGAATGGAT--TGATAGT-TTAGGAGCT-AA--ATTG-TCCTATAA-CTTGATCGC---T---GTGTAGCGTCGA-AATAA---AACA-CGACCC---TTACCC--CATAA-AGCAGGATTCG-GAGCTACAAAGCTAT-AGTCCC-ATGGAGAA-GTCCATGTGGTAGATCTTCTTCTGGGCCCTCT--TCC----TT-CGCACTGA-AGT---AGGAAATGGGGT-AATATACTCAT---G---ATTGGTG--GAGT-AGGTT--CAGCC-G-AGAGAGCGTAGGCTTGAGT-ATGTGCCCCTCCCCT-C-CAGACCTCAGA--A--CAAACCGCGCGTGCTGCAA-TCAAAACGGTGA-GTTTTC------GTTCGTTGATACCC-GTTTA-AGAaacctaactcccagccggacttattgtacccagttcccggcccgggggaggaccggaatctcgtcaggagtaacgtggcggggctggagaaatctatcctagttggcccacgagaaaggccccggtcccgctcaagaccacggaggaagagccctgaaaacgggattatgagc
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tcaaagaactcaaattaagccgctagtA-TGA-CACTGCTCGTAAAAAATTAAA-GACGGATCAGAAGGCGATG---AAA--AAGCTCACGATCTGCAGAGACGCATTTATAAGT-TCAAGGTAGGGGAT-------TTGAC---TTACTGGCGACGCAATG-CGGGGAAGAAAGTAGAA-TCGGTATGGAAGGGTCCTGGCATCATAA--TAGAAGTCAAATCCGTCACAGCATTTGCAGTT--AAGTCG----CGGAGGGAGATC----AGTCATGCACCA
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Unaligned ( gi|10 ): ATATCTAGGCACGCGGAGTAAATCTGGGAGCATCGAGGCAAGGCCGGCCCGGGTTGCTTTTGTCCCAGAAAAAACGAGACGTGGGGGGAAATATCCCTACTGCCTGTGCAATGCGACTAAC
Unaligned ( gi|12 ): CAGATCGCCGGTGCCCTCAGGTCTTCCGTACGCCGCATTACCGGGTTCACGGCCAACAAATTGATGCTAGAGAGGGAAACTAAATCCCCGGCGGATTTGTTGTACCCCTTTCTC

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gi|14                         :                                                                                                                                                         gtaaataaccctgT--A--AGTT-AT--AT-G-TC--AGGA-CATG-TGATA--T---TTGT-GC-TAT-A-AACAA---GAGG-GGTTCC---TTGTCG--AACAA-ATCTGAATGTAAGAGCTATCAGGCCGG-AAGCCCGATGgacgct
gi|15                         :                                                                                                                                                                                       -G-TC--AGGA-CATG-TGACA--T---TTGT-GC-TAT-A-AACAA---GAGG-GGTTCC---TTGCCG--AACAA-ATCTGAAGTTAAAAGCTATCAGGCCGG-AAG
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TGCACA-TGACA--CTGCTCG-TACAAAGTTAAA--AACG-GCT----CGGAAGG--CAATGA--AAA--GAG---CTCACGATCT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CCGCAC-CTTAATGGA-AGCGGTC-CGTTGCT-ATATTGAggag
gi|2                          :                                                                                              TCAAAGAACT-AAATTAAG-G-GTA-G--GAAGG-AGA--TTTCTTTGGTGAGAGGA---CTGGGGATAGTTTTAG--AGTT-A---GT---TC--CTTA-CCTG-TGACA--CCGGTTGT-CG-TCG-A-AATAA---ACGC-GGACCC---ATACCC--CCTAA-AGCAGGACTTAAGAGCTACCAAGCTGGTAAGTCCCATGGAGAAA-TCCATTTG----AC-TTCTT--GGGCCCTCTCCCTTTCGCACTGAAGCA------GGAAATG----AA-A-T-ATAC-CATTTGAAT-GGTGAAGA-T-AAGTTTCCA-CC-C-AA------TGG--TTGAGT-GT-TGCCCCTCCCATCC-CAGACCGCAGAACA--GATACGGCGCGTGCTGCTA-T-----C-AAGA-ATTTTTCGTACGGTTCG--GATACCCGTTTGA-AGAT-TTCACTGA-C-AAGT---CGGAA-T-T-GAGAGCGAACTGTTCCAAAA-GTT-TGCGAT---TTACT---GTCA---GATCCACAA--TCGCGTACCAC-CAGTATAGGCCTTCAGGAAAT---GCC-AGGTGGAAGCG--TATAA-CGCAC-TTTGAT-GA-TGCAGTTGCGTTGTT--TCTGGAC-AACA---C--AAGTAAATAACC--GTGGTA-AAGCACCTGGGCCTC--CTACGCGGTG-------AA-TGCGCTCAGCTGTCAATAGACAGAC--AG-TACACC-CCTAA-T-----AAATGATG---CTG---G------GGCCGTGATGGTAAATAA-CCC--------T-GCACTCCTTAG-----GTTTAAAC--CCCCCA-GG--GAAG--GTTTCAAGCT---GGGG-TGA-GGG--G--C----G-TAGCA------TTGC-----ATACGTAGC-TGGGCTTGTA--ACAA---GA--CGCTCA--GTGGGCGCACCGA-G--TAGCAAGAGAAAAAGTTGCGT-GACT-GCT----CAAAGGT--CGATGAGAAAA--GGA---CTATTGACCTTCACATGCGAGCTAGGGAGTATTAAGGT-G---G---CGAT-------TTG-------TTATTGGCGCCGC-ATGCCGGTA--AAAGTGCAAT-CATT-TGGTTGG--CCCGGGATAGC-A--TTCAAGTCAAGTCCGACACTGTGTATGCA-T-----ATCCGCACCCGCCGAGACATTTAA-AATCATGCATTACGACAAACTGAAGGCCCTGTATGCTCGCGG-AGCTTCCTAAGTGGATT
gi|3                          :             TAGTCCCAAGGGATCTTAGGTCCAAGATCATGCACCTATGTC------ATGACAT-CCC-GTCATCTGGTCACCAGGGGATTCTGAGAACT-AAG--GAACG-ACT-G----AAGCAGCAGTTTTACTGGTG-GCGGATGGTTAAGGACA--TT--A--AGTT-AT--AT-G-TC--ATGA-CATG-TGACA--T---TTGT-GC-TTT-A-AACAA---GAGG-GGTTCC---TTGCCG--AACAA-ATCGGAATTTAAGGGCTATCAGGCCGG-AAGCCCGATGGAGAGAGTACACCTGG---AT-TTCCT--CGGCCCCTTACCC--CGCACTG--------------AATG------TA-T-ATACTCAT---GAT-GGTC--GA-C-AACTT--CA-CA-A-AA------TGGG-TCGAAT-GTATTCCGCTCCCATCC-CAGAAAGCGGA--A--ATTACTGCAAGGGCAGCCG-T-----CAACGATTTTTTTCTCTAGATTTG--GCTATCCGTAC-C-AGATGTTTATGGATCAAGGG---CGCAA-TGTTGAAAGCGAGCTGTTCCGGAA-GATCTGTACC---ATGCTT--G--G---AATACATAA-ATATAGGACAACGCCATACAGACCTTCTGGCAAC--GAAC-AGGTCG-AACG-GTACAACTGCAC-CTTAATGGA-CGCGGTC-CCTTGCT-ATATTGATGGTTAGCCC--AAG-A------C--ATGAGACAAGTACTTAGGTCCA--TTGGCCGGAG-------GGTTGCGCTCGGTGGTAAATCGTCATAC-GGGCTACACA-CCAAATC-----GGCTAATG---CTG---G------G--T---------AGCAA-CCT--------T-G--------AT-----GTTTGTCCCACCTCCT---TCGGAGTCTATTCAAAAT---GGGGAGGATGGT--G-AG----T-TAG-A------CAG------ATATGTGAG-ATATC-TTGAGCAGAA------------A----GTGCACA-TGGCA--CTGCTCG-TAAAATATTAAA--GACG-TCT----CAGAAGG--CGATG---AAAT-GAG---CTCACGATCTGAAGATTCGCACATGTAAGT-TCAAGGTAG---G---GGAT-------TTGG--T---TTACTGGCGACTCAATGCAGGAAATAAAGTATAAT-CGGTATGGAAGGGTCCTGTCATCACAA--TAGAAGTCACATCCGACACAGTATTTGCAGTT---AAGTCG----CAGAGGGAGATC--AGAGTCATGCACCATGACAAACTCAAAA-GATGCGAA-TCTAGACAACTTCCGAAATGG-TTAcgagcaaccaagctgcattcttccgaccagctgcgtgccagataacaaactcgcaatcaccaccgcccgctaagctggcaattataatcgcagatagtcgagatgcaatcccgtatcttcgggacacgcagccgtacggggcactaaatcctggacaaaaccgatcggcgattcaggcttccagggcagaaaaacgatctgccagcggtcgaagttacagtattgcctgtgcaagtcgacaagccagctggtctatggtacgtgtgataccttgcaaggactggtttccccaaaatgttgtgagaccgggaacattcaaaaacatcccacttacaatgtccgactgtcactctgtagttgcgtttaggg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ctcgtaggttacATTTGG---AT-TTCCT--GGGCCCCC---CT---GCCCAGGACCGCCAAATGGCAACG----AATA-CCGTCCTGGT---TAT-GGTG--GA-CCAAGTT--CA-CCCA-AG------TGGG-T-GAGTAGTGTGCCGCTCCCCTTCGCAGACTGCGGA--AAAGTGACAGCC-TAGCGGCGGGT-----GGACCA-GTTCTTCCTCTCGTTCG--GCTGCCCCTTC-C-AGATCTTCACCGATC-AGGGC--CGCAATT-TCGAAAGTAAGCT-TTTTGAGCTGGTGTGCGG----TGGCTCTTG--AAAGAATCCATAAGGCCCCGCACTAC-CCGTACCGACC-TCGGCCAATTGGGGC-AGGTAG-AGCGCATGCAATCGGACACT--ATGGATCGCCGTC-CGGTGTTAATATTGACAAG--G-CTTAAGG-A------CTGCTGGGACCAACATTT-AGCCCA--GTCGCTGGAGCTCTCCCGGT--CGCTCCGTG---AACCGCAGCAC-GGG-TTCACCGCCAAA-CAGTGTAGCTGATG---CTG---G------GGTC---------GAGAGAACC--------T-A--------AC-----TCCCAGCCGGACTT----ATTGTACCCAGTTCCCGGCCCGGGGGAGGACCGG--A-ATCTCGT-CAG-G-------AGT-----A-ACGTGGC-GGGGC-TGGA--GAAA---TCTATCCTAG--TTG-GCCCA-CGA
gi|5                          :                                                                                      agagggtgTCAAAGAACTCAAATTAAG-CCGCT-AGTCGAAC-A-T--TTCTATTGGTG--AGAATGGAT--TGATAGTTT--AGGAGCT-AA--ATTG-TCCTATAA-CTTGATCGC---T---GTGTAGCGTCG-A-AATAA---AACA-CGACCC---TTACCC--CATAA-AGCAGGATTCG-GAGCTACAAAGCTAT-AGTCCC-ATGGAGAA-GTCCATGTGGTAGATCTTCTTCTGGGCCCTCTTCCTT-CGCACTGAAGTA------GGAAATGGGGTAATA-T-A--CTCAT---GATTGGTG--GAGT-AGGTT--CAGCC-G-AGAGAGCGTAGGCTTGAGT-ATGTGCCCCTCCCCTCC--AGACCTCAGA--A--CAAACCGCGCGTGCTGCAA-TCAAAACGGTGA-GTTTT------CGTTCGTTGATACCCGTTT-A-AGAgaaaggccccggtcccgctcaagaccacggaggaagagccctgaaaacgggattatgagc
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AAACAGGG-TACACC-CTTAA-T-----AA-TGATGTGGCCGTGAG------GGTA---------AATAA-CCC--------TCG--------ACCATAGGTTTA-ACCTTCCCCAGGGCC-AAGAGTTTACGAAAT---GGGGGTGA-GGGCCA-AT----A-AAA-AGTCGCGTAGCGCATAATACGTAGCTTGGCT-TTGA--AAAAAAGAC--ACTTCAGGTGGCGCGGA-TGATAGGTAGCAAG-AGAAAA---AAATTGCCGTGCTGTTCCAAAAAGTCCGATG---AAA--AAGGGACT-ATGACCTTCACATGCA-GCTAGGAG----TAAAGCGGTTAGGCCGGAC-------TTGAGTC---TT-TTGGCGCCGCA
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             C---------AACAG-TCCCACTACACT-T--------AT-----GTTCAGACC-CCTCCCTGG-GGGAGCTTTTTCAAAAT---GGG-AGAA-GGG--G-AT----T-CTG-A------TAA------ATATGTGGC-AGGGA-TGGA--CGAG---T---CTCTAA--TCAATC-CA-CAAAA--TTGCGCA-TGAAAAGTTAGA-------------------------------------------TTACGATCTCCACCTGTGTGAGCGAAAGT-ATAACGTGG---G---AGAT-------CTAG--T---TTACTTGCG
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Unaligned ( gi|12 ): CAGATCGCCGGTGCCCTCAGGTCTTCCGTACGCCGCATTACCGGGTTCACGGCCAACAAATTGATGCTAGAGAGGGAAACTAAATCCCCGGCGGATTTGTTGTACCCCTTTCTC

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Reference ( family-2782 )     : NNNNNNNNNNNNTAGTCCCNAGGGGTCTNNGNNCCGAGGTCATGCACCTATGTCTGGTACATGACATACCCAGTCATCTGGCCACCAGGGGATTCAGAGAACT-AAGTTGAG-G-GCT-G--CGAAG-AGC--TTTTATTGGTG-GAGGATGGCTGANGATAGTTT--A--AGTT-AC--AT-G-TC--ATGA-CATG-TGACA--T---TTGT-GC-TNT-A-AACAA---GAGG-GGTTCC---TTGCCN--AACAA-ATCNGGATTTAAGAGCTATCAGGCCGG-A-AGCCCGATGGAGAAAGTCCACNTG---GAT-TTCT--TGGGCCC-CC-TCCCT--CGCACNG--AAGCGGGGAACG----AA-TA-T-ATCCTCATGA-TGGTG--GA-C-AGNTT--CA-CC-A-A------GTGGG-TNGAGT-GCGTGCCGCTCCCATCC-CAGACNGCGGAA--GNNACNGCGAGNGCNGCGA-T-----CGANGA-GTTTTTCNCNNCGTTCG--GNTACCCGTTCC-A-GAT-TTCACGGATCAGGGC--CGCAA-T-TCGAAAGCGAGCTGTTCCGAAA-G---GT-TGCGGCTTGCT--C--GA---AATNCATAA-GTCNCGTACTAC-CCGTACAGGCCTTCGGGNAAT--GG-NCAGGTNG-AGCG-ATACAACCGCAC-CTTAATGGA-CGCGGTC-CGTTGCT-ATATTGACGANCA-GC-CAAG-AA-----C--NTGGGACAAGCACTTGGGCCCA--CTAGCCGGAG-------GGTTGCGCTCNGCGGT-AACNGNCANAC-GGG-TACACC-CCTAA-C-----GGCTGATG---CT------G---GGGTC---------AACAG-CCC--------T-G--------AC-------GTTCAG--------ACCGCCCCCAG-GTCGAAGCCTTTTCAAAATGGGGAGGA-GGG--G-AT----N-CAG-A------TAGT-----ATACGTGGCNGGGC--TGGA--AGAA--TC--CCCTNA--TCGNGCGCA-CGA-CA--CTGCNCGTG-AAAAGTTAAA--GACG-GCT----CAGAAGG--CGATG---AAA--GAG---CTCACGACCTNCACATGCGCGCNCGNAAGT-TTAAGGTGG---G---GGAT-------TTGG--C---TTACTGGCGCCGCAATGCGGGAAANAAAGTANAA-TCGGTATGGNAGGGTCCCGNCATCGCAATA--GAAGTCAAATCCGACACNGTATNTGCAGTT---AAGTCG----CGNNGGGANATC--A-AGTCATGCACCACGACAAACTGAAGG-NCTGCGAG-TCNCGGCAGCTTCCGAAATGGATTA
gi|1                          :             TAGTCCCCAAGGGTCTGCGTGCGGAGGTT------CTATGTCTGGTACATGACATACCCAGT--TCTGGCCATCAGGGG-TTCAGCGAACG-AAGCTGAG-G-GCTCG--CGAAA-A-C--TTTTATTGGCG-GAAAATGTCTGATGATA--TT--A--AGCG-GC--AT-G-TC--CTCA-CGTG-TGACA--C---CTG---C-TGTCG-AACAA---ACGG-GGTACT---TTACCT--GCTAG-GTCTGGGTTGAAAAGTTATCAGGCAGG-T-AGTCCGATGGA-AAAGTCCACATA---GAT-TT-T--TGGGGCC-CC-TCC-T--CGCACGG--AGGCGGGGAACG----AA-TAAT-ATCCTTATGA-TGGTG--GA-C-AGCTT---A-CT-ACA------GTGGG-TAGAGT-GCGGGCCACTCC-ATCG-CAGACAGCAGAA--GC-ACTGCAAGAGCAATGA-T-----CGAGGA-GTTTTTCGCGGCGTTTG--GTTACCCCTTCCGA-GGT-TT-ACGGATCAGGGTAGCGTAA-T-TCGAAAGTGAGCTGTT-CGAAA-GGGTGT-GGCGACTTGCT--C--AA---AATACATAA-GTCGCGTACTACTCCGTATAGGCCTTCGGGAAAT--GGTCCAAGTCG-AGCG-ATATAACCGTAC-TCTCATGGA-TGCTGTT-CGATGCT-TCATAGACAACCAGGC-CAAA-AA-----C--TTGGAACAGGCAATTGG---TATTCTAGCTGGAG-------CGTTGCGCTCCTCGGA-AACAGACAAACGGGG-TACACC-CCTAC-C-----GGTTAATG---CTAGTAGGA---GAGTC---------AACAG-CCC--------T-GCCACACTCAT-------GTACAG--------ACCGCCCCATA-GT--AAGCCTTTTCAAAATGAGG-GGA-GGG--G-AT----A-CAG-A------TAAT-----ATATGTGGCAGGTC--TGGA--AGAA--TC--CCTTTA--TC-AGCCCA-CGA-AA--TCGCGCGCG-AAAAGTTGCG--TGTG-GCG----CAGAAAG--TCATG---AGAACGAG---ATTACGACCTCCGTATGCGCGAACGCAAGT-ATAAAGTGG---G---GGATCTTGTTATTGG--CGCGTTATTGGAGCC-TAATGT-GGAAAAAAGGTAGAGTTCAGTCTGTTAGG--CCCGCCGTGGTAA-ACTGAGGTGAAATCGGATACCATCTATGCAATTCGGAA--CG----CGTCGTGACATC--ATAATTATGCATCATGACAAGTTGAAGG-TCTGCGAG-TCCCGGCAGCTGCCGAAATGGATTA
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                       -G-TC--AGGA-CATG-TGACA--T---TTGT-GC-TAT-A-AACAA---GAGG-GGTTCC---TTGCCG--AACAA-ATCTGAAGTTAAAAGCTATCAGGCCGG-A-AG
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GCACA-TGA-CA--CTGCTCGTA-CAAAGTTAAA--AACG-GCT----CGGAAGG--CAATGA--AAA--GAG---CTCACGATCT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tCCGCAC-CTTAATGGA-AGCGGTC-CGTTGCT-ATATTGAggag
gi|2                          :                                                                                              TCAAAGAACT-AAATTAAG-G-GTA-G--GAAGG-AGA--TTTCTTTGGTGAGAGGA---CTGGGGATAGTTTTAG--AGTT-A---GT---TC--CTTA-CCTG-TGACA--CCGGTTGT-CG-TCG-A-AATAA---ACGC-GGACCC---ATACCC--CCTAA-AGCAGGACTTAAGAGCTACCAAGCTGGTA-AGTCCCATGGAGAAA-TCCATTTG----AC-TTCT--TGGGCCC-TC-TCCCTTTCGCACTG--AAGCAGGAAATG----AAATA-T-ACCATT-TGAATGGTGAAGA-T-AAGTTTCCA-CC-C-A------ATGG--TTGAGT-GT-TGCCCCTCCCATCC-CAGACCGCAGAACAGATACGGCGCGTGCTGCTA-T-----C-AAGA-ATTTTTCGTACGGTTCG--GATACCCGTTTG-AAGAT-TTCACTGA-CAAG-T--CGGAA-T-T-GAGAGCGAACTGTTCCAAAA-G---TT-TGCGATTTACTGTC---A---GATCCACAA--TCGCGTACCAC-CAGTATAGGCCTTCAGGAAAT---G-CCAGGTGGAAGCG--TATAA-CGCAC-TTTGAT-GA-TGCAGTTGCGTTGTT--TCTGGAC-AACA----CAAGTAAATAACC--GTGGTA-AAGCACCTGGGCCTC--CTACGCGGTG-------AA-TGCGCTCAGCTGTCAATAGACAGAC--AG-TACACC-CCTAA-T-----AAATGATG---CT------G---GGGCCGTGATGGTAAATAA-CCC--------T-GC-------ACTCCTTAGGTTTAA--------AC--CCCCCAG-G--GAAG--GTTTCAAGCTGGGG-TGA-GGG--G--C----G-TAGCA------TTGC-----ATACGTAGCTGGGCT-TGTA--ACAA--GA--CGCTCA--GTGGGCGCACCGAGTA----GCAAGAGAAAAAGTTGCGT-GACT-GCT----CAAAGGT--CGATGAGAAAA--GGA---CTATTGACCTTCACATGCGAGCTAGGGAGTATTAAGGT-G---G---CGAT-------TTG-------TTATTGGCGCCGC-ATGCCGGTA--AAAGTGCAA-TCATT-TGGTTGG--CCCGGGATAGC-ATT--CAAGTCAAGTCCGACACTGTGTATGCA-T-----ATCCGCACCCGCCGAGACATTTAA-AATCATGCATTACGACAAACTGAAGGCCCTGTATGCTCGCGG-AGCTTCCTAAGTGGATT
gi|3                          :             TAGTCCCAAGGGATCTTAGGTCCAAGATCATGCACCTATGTC------ATGACAT-CCC-GTCATCTGGTCACCAGGGGATTCTGAGAACT-AAG--GAACG-ACT-G----AAGCAGCAGTTTTACTGGTG-GCGGATGGTTAAGGACA--TT--A--AGTT-AT--AT-G-TC--ATGA-CATG-TGACA--T---TTGT-GC-TTT-A-AACAA---GAGG-GGTTCC---TTGCCG--AACAA-ATCGGAATTTAAGGGCTATCAGGCCGG-A-AGCCCGATGGAGAGAGTACACCTG---GAT-TTCC--TCGGCCC-CT-TACCC--CGCACTG--AA-TG--------------TA-T-ATACTCATGA-TGGTC--GA-C-AACTT--CA-CA-A-A------ATGGG-TCGAAT-GTATTCCGCTCCCATCC-CAGAAAGCGGAA--ATTACTGCAAGGGCAGCCG-T-----CAACGATTTTTTTCTCTAGATTTG--GCTATCCGTACC-A-GATGTTTATGGATCAAGGG--CGCAA-TGTTGAAAGCGAGCTGTTCCGGAA-G---ATCTGTACCATGCT--T--GG---AATACATAA-ATATAGGACAACGCCATACAGACCTTCTGGCAAC--GA-ACAGGTCG-AACG-GTACAACTGCAC-CTTAATGGA-CGCGGTC-CCTTGCT-ATATTGATGGTTA-GC-CCAA-GA-----C--ATGAGACAAGTACTTAGGTCCA--TTGGCCGGAG-------GGTTGCGCTCGGTGGTAAATCGTCATAC-GGGCTACACA-CCAAATC-----GGCTAATG---CT------G---GG--T---------AGCAA-CCT--------T-G--------AT-------GTTTGT--------CCCACCTCC---TTCGGAGTCTATTCAAAATGGGGAGGATGGT--G-AG----T-TAG-A------CAG------ATATGTGAGATATC--TTGAGCAGAA-----------A----GTGCACA-TGG-CA--CTGCTCGTA-AAATATTAAA--GACG-TCT----CAGAAGG--CGATG---AAAT-GAG---CTCACGATCTGAAGATTCGCACATGTAAGT-TCAAGGTAG---G---GGAT-------TTGG--T---TTACTGGCGACTCAATGCAGGAAATAAAGTATAA-TCGGTATGGAAGGGTCCTGTCATCACAATA--GAAGTCACATCCGACACAGTATTTGCAGTT---AAGTCG----CAGAGGGAGATC--AGAGTCATGCACCATGACAAACTCAAAA-GATGCGAA-TCTAGACAACTTCCGAAATGG-TTAcgagcaaccaagctgcattcttccgaccagctgcgtgccagataacaaactcgcaatcaccaccgcccgctaagctggcaattataatcgcagatagtcgagatgcaatcccgtatcttcgggacacgcagccgtacggggcactaaatcctggacaaaaccgatcggcgattcaggcttccagggcagaaaaacgatctgccagcggtcgaagttacagtattgcctgtgcaagtcgacaagccagctggtctatggtacgtgtgataccttgcaaggactggtttccccaaaatgttgtgagaccgggaacattcaaaaacatcccacttacaatgtccgactgtcactctgtagttgcgtttaggg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ctcgtaggttacATTTG---GAT-TTCC--TGGGCCC-CCCTGCCC--AGGACCGCCAAATGGC-AACG----AA-TA-CCGTCCTGGTTA-TGGTG--GA-CCAAGTT--CA-CCCA-A------GTGGG-T-GAGTAGTGTGCCGCTCCCCTTCGCAGACTGCGGAAAAGTGACAGCC-TAGCGGCGGGT-----GGACCA-GTTCTTCCTCTCGTTCG--GCTGCCCCTTCC-A-GATCTTCACCGATCAGGGC--CGCAATT-TCGAAAGTAAGCT-TTTTGAGCTG---GTGTGCGG-TGGCT--CTTGAAAGAATCCATAAGGCCCCGCACTAC-CCGTACCGACC-TCGGCCAATTGGG-GCAGGTAG-AGCGCATGCAATCGGACACT--ATGGATCGCCGTC-CGGTGTTAATATTGACAAG---GCTTAAG-GA-----CTGCTGGGACCAACATTT-AGCCCA--GTCGCTGGAGCTCTCCCGGT--CGCTCCGTG---AACCGCAGCAC-GGG-TTCACCGCCAAA-CAGTGTAGCTGATG---CT------G---GGGTC---------GAGAGAACC--------T-A--------AC-------TCCCAGCCGGACTTATTGTACCCAG-TTCCCGGCC----CG----GGGGAGGACCGG--A-ATCTCGT-CAG-G-------AGT-----A-ACGTGGCGGGGC--TGGA--GAAA--TCTATCCTAG--TTG-GCCCA-CGA-
gi|5                          :                                                                                      agagggtgTCAAAGAACTCAAATTAAG-CCGCT-AGTCGAAC-A-T--TTCTATTGGTG--AGAATGGAT--TGATAGTTT--AGGAGCT-AA--ATTG-TCCTATAA-CTTGATCGC---T---GTGTAGCGTCG-A-AATAA---AACA-CGACCC---TTACCC--CATAA-AGCAGGATTC-GGAGCTACAAAGCT---ATAGTCCCATGGAG-AAGTCCATGTGGTAGATCTTCTTCTGGGCCCTCT-TCCTT--CGCACTG--AAGTAGGAAATGGGGTAA-TA-T-A--CTCATGATTGGTG--GAGT-AGGTT--CAGCC-G-AGAGAGCGTAGGCTTGAGT-ATGTGCCCCTCCCCT-C-CAGACCTCAGAA--CAAACCGCGCGTGCTGCAA-TCAAAACGGTGA-GTTTT------CGTTCGTTGATACCCGTTTA-A-GAgaaaggccccggtcccgctcaagaccacggaggaagagccctgaaaacgggattatgagc
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAACAGGG-TACACC-CTTAA-T-----AA-TGATGTGGCC------GTGAGGGTA---------AATAA-CCC--------TCG--------ACCATAG--GTTTA---------ACCTTCCCCAG-GGCCAAGAGTTTACGAAATGGGGGTGA-GGGCCA-AT----A-AAA-AGTCGCGTAGCGCATAATACGTAGCTTGGCTTTGAA--AAAAAGAC--ACTTCAGGTGGCGCGGA-TGA-TAGGTAGCAAGAG-AAAA---AAATTGCCGTGCTGTTCCAAAAAGTCCGATG---AAA--AAGGGACT-ATGACCTTCACATGCA-GCTAGGAG----TAAAGCGGTTAGGCCGGAC-------TTGAGTC---TT-TTGGCGCCGCA
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          atagA-TGA-CA--CTGCTCGTA-AAAAATTAAA--GACG-GAT----CAGAAGG--CGATG---AAA--AAG---CTCACGATCTGCAGAGACGCATTTATAAGT-TCAAGGTAG---G---GGAT-------TTGA--C---TTACTGGCGACGCAATGCGGGGAAGAAAGTAGAA-TCGGTATGGAAGGGTCCTGGCATCATAATA--GAAGTCAAATCCGTCACAGCATTTGCAGTT---AAGTCG----CGGAGGGAGATC----AGTCATGCACCAt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      C---------AACAG-TCCCACTACACT-T--------AT-------GTTCAG--------ACCCCTCCCTG-GG-GGAGCTTTTTCAAAATGGG-AGAA-GGG--G-AT----T-CTG-A------TAA------ATATGTGGCAGGGA--TGGA--CGAG--TC--TC-TAA--TCAATC-CA-CAA-AA--TTGCGCATG-AAAAGTTAGA-------------------------------------------TTACGATCTCCACCTGTGTGAGCGAAAGT-ATAACGTGG---G---AGAT-------CTAG--T---TTACTTGCG
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ATGGAAAAAGTCCACTTC---GAT-TTTT--TGGGGCC-CC-TCCCT--CGCACGG--AGGTGGGGAACG----AA-TA-T-ATCCTTATGA-CGGTG--GA-C-AGTTT--TA-CT-A-A------GTGGG-TAGAGT-GCATGCCACTCCCATCG-CAGACAGCAGAA--GTGACTGCAAGAGCAATGA-T-----CGAGGA-GTTTTTC

Unaligned ( gi|10 ): ATATCTAGGCACGCGGAGTAAATCTGGGAGCATCGAGGCAAGGCCGGCCCGGGTTGCTTTTGTCCCAGAAAAAACGAGACGTGGGGGGAAATATCCCTACTGCCTGTGCAATGCGACTAAC
Unaligned ( gi|12 ): CAGATCGCCGGTGCCCTCAGGTCTTCCGTACGCCGCATTACCGGGTTCACGGCCAACAAATTGATGCTAGAGAGGGAAACTAAATCCCCGGCGGATTTGTTGTACCCCTTTCTC

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Reference ( family-2782 )     : NNNNNNNNNNNNTAGTCCCNAGGGGTCTNNGNNCCGAGGTCATGCACCTATGTCTGGTACATGACATACCCAGTCATCTGGCCACCAGGGGATTCAGAGAACT-AAGTTGAG-G-GCT-G--CGAAG-AGC--TTTTATTGGTG-GAGGATGGCTGANGATAGTTT--A--AGTT-AC--AT-G-TC--ATGA-CATG-TGACA--T---TTGT-GC-TNT-A-AACAA---GAGG-GGTTCC---TTGCCN--AACAA-ATCNGGATTTAAGAGCTATCAGGCCGG-AAGTCCGATGGAGAAAGTCCACNTGG---AT-TTCTT--GGGCCCCC-TCCCT--CGCACTG--AAGCGGGGAACG----AA-TA-T-ATCCTTATGA-TGGTG--GA-C-AGNTT--CA-CC-A-A------GTGGG-TNGAGT-GCGTGCCGCTCCCATCC-CAGACNGCGGAA--GNNACNGCGAGNGCNGCGA-T-----CGANGA-GTTTTTCNCNNCGTTCG--GNTACCCGTTCC-A-GAT-TTCACGGATCAGGGT--CGCAA-T-TCGAAAGCGAGCTGTTCCGAAA-GGT-TG---CGACTTGCT--C--GA---AATNCATAA-GTCNCGTACTAC-CCGTACAGGCCTTCGGGNAAT--GGNC-AGGTNG-AGCG-ATACAACCGCAC-CTTAATGGA-CGCGGTC-CGTTGCT-ATATTGACGANCAG-C-CAAGGA------C--NTGGGACAAGCACTTGGGCCCA--CTAGCCGGAG-------GGTTGCGCTCNGCGGT-AACNGNCANAC-GGG-TACACC-CCTAA-C-----GGCTGATG---CTG---G------GGTC---------AACAG-CCC--------T-G--------AC-------GTTCAG--------ACCNCCCCCAG-GTCGAAGCCTTTTCGAAATGGGGAGGA-GGG--G-AT----N-CAG-A------TAGT-----ATACGTGGCNGGGC--TGGA--AGAA--TC--CCCTNA--TCGNGCGCA-CGA-CA--CTGCNCGTG-AAAAGTTAAA--GACG-GCT----CAGAAGG--CGATG---AAA--GAG---CTCACGACCTNCACATGCGCGCNCGNAAGT-TTAAGGTGG---G---GGAT-------TTGG--C---TTACTGGCGCCGCAATGCGGGAAANAAAGTANAAT-CGGTATGGNAGGGTCCCGNCATCGCAA--TAGAAGTCAAATCCGACACNGTATNTGCAGTT---AAGTCG----CGNNGGGANATC--A-AGTCATGCACCACGACAAACTGAAGG-NCTGCGAG-TCNCGGCAGCTTCCGAAATGGATTA
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gi|11                         :                                                                                                                                                        tcccgacagcttttT--A--AGTTTACTAAT-GATC--AGGATCATT-GGACAACT---CTGT-CC-TAT-ATAACAATGAGAAGTGGCTCTAATTCGTCCGCAACAAGATCGGAATTTAAAA-CTATCAGACCGG-AAG-CTGATGaggattttaaggcccgatcggaaaatcggacgagttcgagagtgccccaccaactcctgtcagcttaccatctgcgactgtcaagcaaaagggtaggggatggcccatatctaggtactcggataaatccgggagcatcgaggcaaggccgcccggtttgttgatccggaaaaaccgagacgtgggggtaaaacggaaagaaatatcttactgcctgtgcaaggcgactaaccccacgggccttatggtgcagtgtgacacttgcagggattggttccaccctttaatgcgtaggggagactgaagacatgtaaaaacagtgtccacctattattgctccgaattgtactctagtatatgggtttggg
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CGG-CCC--------T-T--------AG-------GTTTAA--------AACTCCCCCAGAG--GAAGG-TTTACAAAGTGGGGGTGA-GGG--GGAT----AACA--A------T-GT-----ATACGTAGCTGGGC--TTGA--AAAcga
gi|14                         :                                                                                                                                                         gtaaataaccctgT--A--AGTT-AT--AT-G-TC--AGGA-CATG-TGATA--T---TTGT-GC-TAT-A-AACAA---GAGG-GGTTCC---TTGTCG--AACAA-ATCTGAATGTAAGAGCTATCAGGCCGG-AAGCCCGATGgacgct
gi|15                         :                                                                                                                                                                                       -G-TC--AGGA-CATG-TGACA--T---TTGT-GC-TAT-A-AACAA---GAGG-GGTTCC---TTGCCG--AACAA-ATCTGAAGTTAAAAGCTATCAGGCCGG-AAG
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GCACA-TGA-CA--CTGCTCGTA-CAAAGTTAAA--AACG-GCT----CGGAAGG--CAATGA--AAA--GAG---CTCACGATCT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tCCGCAC-CTTAATGGA-AGCGGTC-CGTTGCT-ATATTGAggag
gi|2                          :                                                                                              TCAAAGAACT-AAATTAAG-G-GTA-G--GAAGG-AGA--TTTCTTTGGTGAGAGGA---CTGGGGATAGTTTTAG--AGTT-A---GT---TC--CTTA-CCTG-TGACA--CCGGTTGT-CG-TCG-A-AATAA---ACGC-GGACCC---ATACCC--CCTAA-AGCAGGACTTAAGAGCTACCAAGCTGGTAAGTCCCATGGAGAAA-TCCATTTG----AC-TTCTT--GGGCCCTC-TCCCTTTCGCACTG--AAGCAGGAAATG----AAATA-T-ACCATT-TGAATGGTGAAGA-T-AAGTTTCCA-CC-C-A------ATGG--TTGAGT-GT-TGCCCCTCCCATCC-CAGACCGCAGAACAGATACGGCGCGTGCTGCTA-T-----C-AAGA-ATTTTTCGTACGGTTCG--GATACCCGTTTG-AAGAT-TTCACTGA-CAAG-T--CGGAA-T-T-GAGAGCGAACTGTTCCAAAA-GTT-TG---CGATTTACTGTC---A---GATCCACAA--TCGCGTACCAC-CAGTATAGGCCTTCAGGAAAT---GCC-AGGTGGAAGCG--TATAA-CGCAC-TTTGAT-GA-TGCAGTTGCGTTGTT--TCTGGAC-AACA----CAAGTAAATAACC--GTGGTA-AAGCACCTGGGCCTC--CTACGCGGTG-------AA-TGCGCTCAGCTGTCAATAGACAGAC--AG-TACACC-CCTAA-T-----AAATGATG---CTG---G------GGCCGTGATGGTAAATAA-CCC--------T-GC-------ACTCCTTAGGTTTAA--------AC--CCCCCAG-G--GAAG--GTTTCAAGCTGGGG-TGA-GGG--G--C----G-TAGCA------TTGC-----ATACGTAGCTGGGCT-TGTA--ACAA--GA--CGCTCA--GTGGGCGCACCGAGTA----GCAAGAGAAAAAGTTGCGT-GACT-GCT----CAAAGGT--CGATGAGAAAA--GGA---CTATTGACCTTCACATGCGAGCTAGGGAGTATTAAGGT-G---G---CGAT-------TTG-------TTATTGGCGCCGC-ATGCCGGTA--AAAGTGCAAT-CATT-TGGTTGG--CCCGGGATAGC-A--TTCAAGTCAAGTCCGACACTGTGTATGCA-T-----ATCCGCACCCGCCGAGACATTTAA-AATCATGCATTACGACAAACTGAAGGCCCTGTATGCTCGCGG-AGCTTCCTAAGTGGATT
gi|3                          :             TAGTCCCAAGGGATCTTAGGTCCAAGATCATGCACCTATGTC------ATGACAT-CCC-GTCATCTGGTCACCAGGGGATTCTGAGAACT-AAG--GAACG-ACT-G----AAGCAGCAGTTTTACTGGTG-GCGGATGGTTAAGGACA--TT--A--AGTT-AT--AT-G-TC--ATGA-CATG-TGACA--T---TTGT-GC-TTT-A-AACAA---GAGG-GGTTCC---TTGCCG--AACAA-ATCGGAATTTAAGGGCTATCAGGCCGG-AAGCCCGATGGAGAGAGTACACCTGG---AT-TTCCT--CGGCCCCT-TACCC--CGCACTG--AA-TG--------------TA-T-ATACTCATGA-TGGTC--GA-C-AACTT--CA-CA-A-A------ATGGG-TCGAAT-GTATTCCGCTCCCATCC-CAGAAAGCGGAA--ATTACTGCAAGGGCAGCCG-T-----CAACGATTTTTTTCTCTAGATTTG--GCTATCCGTACC-A-GATGTTTATGGATCAAGGG--CGCAA-TGTTGAAAGCGAGCTGTTCCGGAA-GATCTG---TACCATGCT--T--GG---AATACATAA-ATATAGGACAACGCCATACAGACCTTCTGGCAAC--GAAC-AGGTCG-AACG-GTACAACTGCAC-CTTAATGGA-CGCGGTC-CCTTGCT-ATATTGATGGTTAG-C-CCAAGA------C--ATGAGACAAGTACTTAGGTCCA--TTGGCCGGAG-------GGTTGCGCTCGGTGGTAAATCGTCATAC-GGGCTACACA-CCAAATC-----GGCTAATG---CTG---G------G--T---------AGCAA-CCT--------T-G--------AT-------GTTTGT--------CCCACCTCC---TTCGGAGTCTATTCAAAATGGGGAGGATGGT--G-AG----T-TAG-A------CAG------ATATGTGAGATATC--TTGAGCAGAA-----------A----GTGCACA-TGG-CA--CTGCTCGTA-AAATATTAAA--GACG-TCT----CAGAAGG--CGATG---AAAT-GAG---CTCACGATCTGAAGATTCGCACATGTAAGT-TCAAGGTAG---G---GGAT-------TTGG--T---TTACTGGCGACTCAATGCAGGAAATAAAGTATAAT-CGGTATGGAAGGGTCCTGTCATCACAA--TAGAAGTCACATCCGACACAGTATTTGCAGTT---AAGTCG----CAGAGGGAGATC--AGAGTCATGCACCATGACAAACTCAAAA-GATGCGAA-TCTAGACAACTTCCGAAATGG-TTAcgagcaaccaagctgcattcttccgaccagctgcgtgccagataacaaactcgcaatcaccaccgcccgctaagctggcaattataatcgcagatagtcgagatgcaatcccgtatcttcgggacacgcagccgtacggggcactaaatcctggacaaaaccgatcggcgattcaggcttccagggcagaaaaacgatctgccagcggtcgaagttacagtattgcctgtgcaagtcgacaagccagctggtctatggtacgtgtgataccttgcaaggactggtttccccaaaatgttgtgagaccgggaacattcaaaaacatcccacttacaatgtccgactgtcactctgtagttgcgtttaggg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ctcgtaggttacATTTGG---AT-TTCCT--GGGCCCCCCTGCCC--AGGACCGCCAAATGGC-AACG----AA-TA-CCGTCCTGGTTA-TGGTG--GA-CCAAGTT--CA-CCCA-A------GTGGG-T-GAGTAGTGTGCCGCTCCCCTTCGCAGACTGCGGAAAAGTGACAGCC-TAGCGGCGGGT-----GGACCA-GTTCTTCCTCTCGTTCG--GCTGCCCCTTCC-A-GATCTTCACCGATCAGGGC--CGCAATT-TCGAAAGTAAGCT-TTTTGAGCTGGTGTG---CGG-TGGCT--CTTGAAAGAATCCATAAGGCCCCGCACTAC-CCGTACCGACC-TCGGCCAATTGGGGC-AGGTAG-AGCGCATGCAATCGGACACT--ATGGATCGCCGTC-CGGTGTTAATATTGACAAG--G-CTTAAGGA------CTGCTGGGACCAACATTT-AGCCCA--GTCGCTGGAGCTCTCCCGGT--CGCTCCGTG---AACCGCAGCAC-GGG-TTCACCGCCAAA-CAGTGTAGCTGATG---CTG---G------GGTC---------GAGAGAACC--------T-A--------AC-------TCCCAGCCGGACTTATTGTACCCAG-TTCCCGGCC----CG----GGGGAGGACCGG--A-ATCTCGT-CAG-G-------AGT-----A-ACGTGGCGGGGC--TGGA--GAAA--TCTATCCTAG--TTG-GCCCA-CGA-
gi|5                          :                                                                                      agagggtgTCAAAGAACTCAAATTAAG-CCGCT-AGTCGAAC-A-T--TTCTATTGGTG--AGAATGGAT--TGATAGTTT--AGGAGCT-AA--ATTG-TCCTATAA-CTTGATCGC---T---GTGTAGCGTCG-A-AATAA---AACA-CGACCC---TTACCC--CATAA-AGCAGGATTCG-GAGCTACAAAGCTAT-A-GTCCCATGGAGAA-GTCCATGTGGTAGATCTTCTTCTGGGCCCTC-TTCCTT-CGCACTG--AAGTAGGAAATGGGGTAA-TA-T-A--CTCATGATTGGTG--GAGT-AGGTT--CAGCC-G-AGAGAGCGTAGGCTTGAGT-ATGTGCCCCTCCCCT-C-CAGACCTCAGAA--CAAACCGCGCGTGCTGCAA-TCAAAACGGTGA-GTTTT------CGTTCGTTGATACCCGTTTA-A-GAgaaaggccccggtcccgctcaagaccacggaggaagagccctgaaaacgggattatgagc
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AAACAGGG-TACACC-CTTAA-T-----AA-TGATGTGGCCGTGAG------GGTA---------AATAA-CCC--------TCG--------ACCATAG--GTTTA---------ACCTTCCCCAG-GGCCAAGAGTTTACGAAATGGGGGTGA-GGGCCA-AT----A-AAA-AGTCGCGTAGCGCATAATACGTAGCTTGGCTTTGAA--AAAAAGAC--ACTTCAGGTGGCGCGGA-TGA-TAGGTAGCAAGAG-AAAA---AAATTGCCGTGCTGTTCCAAAAAGTCCGATG---AAA--AAGGGACT-ATGACCTTCACATGCA-GCTAGGAG----TAAAGCGGTTAGGCCGGAC-------TTGAGTC---TT-TTGGCGCCGCA
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        atagA-TGA-CA--CTGCTCGTA-AAAAATTAAA--GACG-GAT----CAGAAGG--CGATG---AAA--AAG---CTCACGATCTGCAGAGACGCATTTATAAGT-TCAAGGTAG---G---GGAT-------TTGA--C---TTACTGGCGACGCAATGCGGGGAAGAAAGTAGAAT-CGGTATGGAAGGGTCCTGGCATCATAA--TAGAAGTCAAATCCGTCACAGCATTTGCAGTT---AAGTCG----CGGAGGGAGATC----AGTCATGCACCAt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    C---------AACAG-TCCCACTACACT-T--------AT-------GTTCAG--------ACCCCTCCCTG-GG-GGAGCTTTTTCAAAATGGG-AGAA-GGG--G-AT----T-CTG-A------TAA------ATATGTGGCAGGGA--TGGA--CGAG--TC--TC-TAA--TCAATC-CA-CAA-AA--TTGCGCATG-AAAAGTTAGA-------------------------------------------TTACGATCTCCACCTGTGTGAGCGAAAGT-ATAACGTGG---G---AGAT-------CTAG--T---TTACTTGCG
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATGGAAAAAGTCCACTTCG---AT-TTTTT--GGGGCCCC-TCCCT--CGCACGG--AGGTGGGGAACG----AA-TA-T-ATCCTTATGA-CGGTG--GA-C-AGTTT--TA-CT-A-A------GTGGG-TAGAGT-GCATGCCACTCCCATCG-CAGACAGCAGAA--GTGACTGCAAGAGCAATGA-T-----CGAGGA-GTTTTTC