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Reference ( family-2761 ) : CTATTT-TCTGT-A-GTA-----AGAT---TAGAC-GA-CT-TCCCG-GG-GC-GC-CCAC---AGGC--TGTT---------TAC-A--AACAC-G-TGGAAAA-CAC-GTGG--T-T-TT--GAGGG-TAG--TGCT---GTTT----GC------GG---A--A-------------AAA-ANT------TGA---GAA--AA-TGCCGTGTANGGT----G---TCG--T---TTTTCC-GA-T-GTCG-GCA-G-ACGA----GACAG-GT--AAC-G-TAT-A-A-C-A-----C-TGTTC--G-A--TGA-A-T-TATT--TN-GCA-TGAGTTGTA-T-AAAC-TG-A-T---TTTTC--GCG-A-TTTTTT-TCCC-T-AC--GT--AG--A--A--AC--A--T----AGTG-------------AAAAT-A-ATT-A-CC--GGTGTGATAT
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blockSeqs : . A A T . . . T . G . . . . T . . . . . . G . . . . . . GACAACAAACAACATATGA A . . C G GTT . T . . C . . . . . ATTATAAAACTGCTTGA A . . TC . G T CA . . . CT AAG . . . . . . . CTA ATAT A . . . . .
blockSeqs : . A A A . . . T . C . . . . T . . . . . . T . . . . . . ACACATGTAAAAAAAATGG A . . G G GT . T . . G . . . . . AATAAACGCTGTTTGTA C . . TG . T A TG . . . AT AAT . . . . . . . T ATAT A . . . . .
blockSeqs : . A A T . . . C . G . . . . T . . . . . . T . . . . . . GGGGGAGAAAAATTGA A . . G G G . C . . G . . . . . ATATAAACATGTTTTGA A . . CT . C A GT . . . AT AAT . . . . . . . G ATAT C . . . . .
blockSeqs : . A A T . . . C . A . . . . T . . . . . . T . . . . . . GGACAAAAATTTGAA A . . G A A . T . . G . . . . . AAGTAACATTGTTACC C . . CG . C A GT . . . AT CGG . . . . . . . A ATAT A . . . . .
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blockSeqs : . . T . A . . . . T . . . . . . T . . . . . . GGCAAAAAAAATGC A . . C A G . C . . A . . . . . GTAGAACATTTCTGTC A . . CG . G G GT . . . AC AAG . . . . . . . G AT A . . . . .
blockSeqs : T . G . . . . T . . . . . . A . . . . . . GGGGGGAACTTGA G . . A A A . T . . G . . . . . ATATAACACTGTTTAA A . . TT . A G GT . . . AT CGG . . . . . . . A AT A . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . A . . . . . . GGGAT . . . T A G . T . . A . . . . . GTAGATCATTTCCCTC C . . CG . C A CA . . . AA CGC . . . . . . . A CT A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . GGATT . . . G G A . T . . G . . . . . GTAGAACATTTCTGTT A . . TA . G G G . . . AA CAG . . . . . . . A AT G . . . . .
blockSeqs : . . GG . . . A G A . T . . G . . . . . ATAACATTCCCAAC C . . TT . G G T . . . AT AAT . . . . . . . A AT A . . . .
blockSeqs : G A G . T . . G . . . . . ATATACACATGTTA . . . TT . G G T . . . A AAT . . . . . . . C AA . . .
blockSeqs : . G A . T . . G . . . . . TTTCTATTTTAAA . . . CA . G C T . . . . CCC . . . . . . . G AT . . .
blockSeqs : . . . C . . T . . . . . CTGTCTGTACG . . . TT . C A
blockSeqs : C . . T . . . . . TGTCTGTACG . . . CG . T T
blockSeqs : A . . . . . . . . T . C A
blockSeqs : . . .
blockSeqCons : A***** G* ** T********* ** T*** ** *** GGAAAAAATTGA************************************* ** G*** **** ** ATAGAACATTTCTGTC*************** A** ** AT***** ** A**** ATAT****** **
originalCons : CTATTT-TCTGT-A-GTA-----AGAT---TAGAC-GA-CT-TCCCG-GG-GC-GC-CCAC---AGGC--TGTT---------TAC-A--AACAC-G-TGGAAAA-CAC-GTGG--T-T-TT--GAGGG-TAG--TGCT---GTTT----GC------GG---A--A-------------AAA-AAT------T--GA---GAA--AA-TGCCGTGTA-GGGT----G---TCG--T---TTTTCC-GA-T-GTC--G-GCA-G-ACGA----GACAG-GT--AACG-TAT-AAC-A-----C-TG-TTC--G-A--TG-A-AT-TA--TT--C-GGC-ATNAGTTGTA-T-AAAC-TG-A-T---TTTTC--GCG-A-TTTTTT-TCCC-T-AC--AT--AG--A--AAC--A--T----AGTG-------------AAAAT-A-ATT-A-CC--GGTGTGATAT
finalCons : CTATTT-TCTGT-A-GTAA-----GAT---TAGAC-GA-CT-TCCCG-GGG-C-GC-CCAC---AGGC--TGTTT---------AC-A--AACAC-G-TGGAAAA-CAC-GTGGT---T-TT--GAGGG-TAG--TGCT---GTTT----GCGGAAAAAATTGA-------------------------------------GAA--AA-TGCCGTGTA-GGGT----G---TCG--T---TTTTCC-GA-T-GTCG---GCA-G-ACGA----GACAG-GT--AACATAGAACATTTCTGTC---------------TGA--AT-TA--TT--C-GGC-ATNAGTTGTA-T-AAAC-TGAT-----TTTTC--GCG-A-TTTTTT-TCCC-T-AC--AT--AGA----AACATAT------AGTG-------------AAAAT-A-ATT-A-CC--GGTGTGATAT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|20 ): GTTTACAAAAGAAACTATTTGATATTGTTTTCTGAGGCTAATCACTGAAGGTGCACTAATGTTAATTACAAACATATATGA
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Reference ( family-2761 ) : CTATTT-TCTGT-A-GTA-----AGAT---TAGAC-GA-CT-TCCCG-GG-GC-GC-CCAC---AGGC--TGTT---------TAC-A--AACAC-G-TGGAAAA-CAC-GTGG--T-T-TT--GAGGG-TAG--TGCT---GTTT----GC-----G-------G--A--------------AAA---AA-T------T--GA---GAA--AA-TGCCGTGTAGGG-T----G---TCG--T---TTTT--CC-GA-T-GTCG-G--CA-G-ACG-A----GACAG-GT--AAC-A-TA-G-A-ACAT--T-TCTGTC-----TGA----A--T-TA--TT--C-G-GC-ATNAGTTGTA-T-AAAC-TG-A-T---TTTTCGCG--A-TTTTTT-TCCC-T-AC--AT-AGA--AACA--TAT-AGTG-------------AAAAT-A-ATT-A-CC--GGTGTGATAT
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gi|19 : -----TGA----A--T-TA--TT--T-T-AC-ATGAGTGGTA-T-AAAC-AG-A-T---TTT-CGGG--A-ATTTTT-TTCC-T-AC--AT-AGA--AACA--TAT-AGTG-------------AAAAT-A-ATT-A-CC--GGTG
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|20 ): GTTTACAAAAGAAACTATTTGATATTGTTTTCTGAGGCTAATCACTGAAGGTGCACTAATGTTAATTACAAACATATATGA