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Reference ( gi|1 ) : CCTTC-GA--CA-TCACATGCA-T-GGAAA-----------CAT-----TTTAAAA-AA--AG---A-ATTA-GA-T-GCAAAA--TTGTAAAATGC-CAAGTTT-GACT---TTGATCAGCGGAA-TT-G-AC-G-TA---------TACT--TG-----T--G---GTAC----------CTC-AAAT--AT-----G-T--TTGC----ACA-TCTAA-------AG-----GCAAA-GC-AT-C-T-T-------A--GC-AT-A-------TAG-TT-C--AA-A---T-T--C-------G---G--GAAATG-CA-----TTC-C-GT-C-G--A-TG-A----C--AT----C-GT-----T----------T-------GTAT-C-CCC-TAG-AATTCGAAGACT---T-----------TCC-------GGTGTC-C------G----A-C---C--TGA----------GAC-TG-AG---AACC--AAGCCAA--CAAA----ACCG----AAAATT---C-GCCTATTCTCA-GC--TG--A--T-GT-T-GA-GCAAAT-A--T---T----TTT-T---------GGG--AAAT-AAATATG-GCAAATT---AT----ATA----T------A----T-ATTA--G--CTC-T-GACG-A-T-GGTGA-A-AGTAGATATTAAAAGAATAA
gi|9 : CCTTC-AA--CA-TCACACGCA-T-GGAAA-----------TAT-----TTTAAAA-AA--C----A-ATTA-GA-T-GCAGAAAGTTTTAA----------TTC-AA-----TTGATCATCGGAA-TT-G-AT-G-TA---------CACT--------------------------------C-AAAT--AT-----G-T--TTGC----ACA-TCTAA-------AG-----GCAAA-GC-AT-C-C-T-------A--GC-AC-A---------A-TT-C--AA-AC--T-T--C-------G---G--AAAAAA-CA-----CTC-C-AT-C-A--A-TG-A----C--AT----C-GT-----T----------T-------GTAT-A-CCC-TAT-AATTCGAAGACT---T-----------TCC-------GGTGTC-C------A----A-T---C--TGA----------GAT-TG-AG---TACA--AAGCCAA--GAAA----ATTG----AAAATT---C-GCCTATTCTCA-GC--TG--A--T-AT-T-GA-GCAAAT-A--T---T----TTC-T---------GGG----AT-AAAAATG-GCAAAT-----T----ATA----T------A----T-ATCA--G--TTC-T-TACG-A-C-GGTGA-A-AGTAAA
gi|5 : CCTTC-GA--CA-TCACACATA-T-GGAAA-----------CAT-----TCTAAAA-GA-----------T-----T-GCAAAA--TTGGAAAATGC-CAA-------CT---TTGTTCGGCGGAA-TT-G-AC-G-TA---------CATT--GG-----T--A---GTTC----------CTC-AAAT--AT-----G-C--TTGC----ACT-TCTAA-------AG-----GCAAA-GC-TT-C-C-T-------ACTGA-A--A-------CAG-------AA-AACTT-C--C-------A---A--AAAAAA-CAA----CTC-C-AT-C-A--G-TG-A----C--AG----C-GT-----T----------G-------GTAT-C-CCC-TAG-ATTTCAAAGACT---T-----------TCC-------GGTG---------------------C--TCA----------GCC-TG-AG---AACA--AAGCCAA--CAAA----ACTA----AAAAGT---C-GCCTTTTCTCG-GT--TG--A--T-CT-T-GA-TCAAAT-AATT---T----TTT-T---------GG-----AC-AAA-ATG-GCAAATT---GT----ATAGCC-T------A----T-ATTA--G--TTC-T-GACA-A-T-AGTGA-A-AGCAgccg
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gi|48 : ccCCTTC-GA--CA-TCACATGCA-T-GGAAA-----------CAT-----TTTAAAA-AA--AA---C-ATTA-GA-T-GCAAAA--Tc
gi|49 : cCCTTC-GA--CA-TCACATTCA-C-GGAAA-----------TAT-----TTC-ATA-AA--AG---A-ATTA-G
gi|10 : tccCTTC-AA--CA-TCATAC-CA-T-GGAAA-----------TAT-----TTTAAAA-AA--C----A-ATTA-GA-T-GCAGAA----------------AGTTT-TATTCAATTGATCATCGGAA-TT-G-AT-G-TA---------CACT--------------------------------C-AAAT--AT-----G-T--TTGC----ACA-TCTAA-------AG-----GCAA--GC-AT-C-C-T-------A--GC-AC-A---------A-TT-C--AA-A---T-T--C-------G---G--AAAAAAACA-----CTC-C-ATGC-ATCA-TG-A----C--AT----C-GT-----T----------T-------GTAT-A-CCC-AAT-AATTCGAAGACT---T-----------TCC-------GGTGTCTC------C----A-T---C--TGT----------GAT-TG-AG---TACA--AAGC-AA---GAA----TTTG----AAAATT---C-GCCTATTCTCA-GC--TG--A--T-AT-T-GA-GCAAAT-A--T---T----TTC-T---------GGG----AT-AAAAATG-GCA-------AT----ATA----T------A----T-ATCA--GT-TTC-T-TACG-A-C-GGTGA-A-AGTAAA
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gi|11 : ccaTTC-GA--CA-TCACATGCA-T-GGAA------------CAC-----TTCAAAA-GA---G---A-ATAA-GA-T-G---------GCAAAATGT-CAACTTT-G--T---TTG----GTGGAA-TT-G-AC-A-TA---------CATT--GG-----T--A---ATAC----------CTT-TAAT--AT-----G-C--TTGC----GCA-TCTAA-------AG-----GCAAA-GC-AT-C-C-T-------A--GC-AA-A-------AGG-TT-A--AA-A---C-T--CCAGG---G---G--GAAA----A-----CTC-C-GT-C-G--A-TGTATTCCC--AT----C-AA-----T----------T-------GCA------------AA-TCAAAGACTCAGC-----------TCC-------GTTGCC-A------G----G-CAGTC--TGA----------GAT-TG-AG---AACA--AAGCCAA--CAAA----ACGG----AGAAGG---C-GCATATTCTCA-GC--TT--T--T-GT-T-AA-TGAAATAA--T---T----TTT-T---------GGG-----TCAAAAATG-ACAAAT-----------TA----T------A----T-ATTA--G--TTC-T-GACA-A-T-gaat
gi|19 : ctcaTTC-GA--CA-ATACGTGCT-T-GGAAA-----------CAC-----TTCAAAA-GA--AA---A-GTAG-GT-T-GCAAAA--TTGTAAAATGA-CAA-------CT---TTATTCGGTGCAA-TT-G-GC-G-TA---------CATT--GG-----T--A---GTAA----------TTG-AACT--AT-----G-G--TTGC----ACA-TCTCA-------AA-----GCAAA-----T-C-----------------------------AG-TT-A--AA-AC--T-T--C-------A---G--AAGAAG-C-------TC-A-GT-C-A--A-TG-A----A--AT----T-GT-----T----------T-------GTAT-C-C
gi|8 : gcccca--CA-TCACACACA-T-GGAAAATACATGTGTGTAT-----TTCGAAA-AG--GA---A-AATA-CA-A-GTAAAC--TTGTAAAATGC-CACGTTT-G--T---TTG----GAAGAA-TT-G--T-G-TA---------CACT--TG-----TC-G---GTAC----------TCCGAAAG--AT-----G-T--TTGTGCTGGCA-TCTAA-------A------GCAAA-GC-ATCC-C-T-------A--GC-AA-AC------CAGTTT-C--AACA---T-T--TTTGGGGGG---G--GGAACG---------TCGC-AT-T-G--ATTG-A----C--ATGTCAN-NN-----N----------N-------NNNN-N-NNN-NNN-NNNNNNNNNACT---CCATTGATGGTATCCCTAGAACAGTGTC-C------A----G-T---C--TGA----------GAT-TG-AG---AACG--AAGCCCA--CAAA----ATTG----TAAAGT---T-GCCTATTTTCA-GC--TG--T--T-TT-T-GA-TCTAAT-A--A---T----T
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gi|42 : -----------CAT-----TTCAAAA-----AG---A-ATTA-GA-T-GCAAAA--TTGTATGATGC-CAAGTTT-GACT---TTGACCAG
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gi|14 : -AAAT--AT-----GAT--TTGC----AAACTCT----------T-----GCAAA----------------------------A-------TTG-TTGC--AA-A---C-TTGC-------G---G--AAAAAG-CGAGCACCTC-C-GT-CCG--A-TG-A----CC-AT----C-GT-----T----------TTGTATAAGCAT-CGCCC-TAGGAATGACACGAGT---C-----------TCG-------GGTGTC-------------A-C---A--TCA----------GATATGTAGTATAATCTTAAGTCACGTCAAG----AGCGTTGCAGGAAT---G-GCCTATTCTCA-GC--TG--ACCT-GCGT-GACGCAAAT----T---T----TTT-T---------CTC--CAAT-AAAAAAGAGCAAAT-----------TA----T------A----T-ATTA--GT-TTC-TGGACGAA-T-GGTGATA-AGTAG-------AAGAATAAtaa
gi|15 : --AA-A---C-T--T-------T---G--GAAAAA-AA-----CTC-C-GT-C-A--A-TC-A----C--AT----C-GT-----T----------T-------ACA----------G-AATTCAAAGACT---T-----------TCT-------GGTGCC-C------A----G-C---C--CGA----------GAT-TG-AA---AACA--AAGCCAA--CAAA----ACTG----AAAAGT---C-GCCTATCATTG-GT--TGTTAT-T-GT-T-GA-TCAAAT-AATT---T----TTT-T---------GG-----AC-AAAAATG-GTAAATT---AT----ATA----T-----------T-ATT-------TC-T-GA
gi|24 : gtttacaccccctatccagaaacaaacaaacgatcaaaacagttttaaCT---T-----------TCC-------AGTGCC-C------ATGCAG-C---C--TGA----------GAT-TG-AG---AACA--AAGCCAA--CAAA----ACTG----AAAAGT---C-GCCAATTCTCA-GC--TG--A--T-GT-T-GA-TCAAAT-A--TA--T----TTT-T---------GG-----AT-AAAAATG-GCAAATT---AT----ACA-----------A--------TA--G--TTC-T-GATC-A-T-GGTGA-A-AGT--------AAAGAATAaag
gi|50 : cAA--CAAC----ACTG----AAAAGT---C-GCCTATTCTCG-GT---------T-GT-T-GA-TCAAAT-
gi|26 : TT---C-ACCTATTCTCA-GC--TG--G--T-AT-T-GA-GCAATT-T--T---T----TTT-T---------CGT--CGAT-AAAAATG-GCAAATTGCGAT----ATACATGT------G----T-ATTA--G--TTC-T-GAAA-A-T-GGTGA-A-AGTtt
gi|27 : ccTT---C-ACCTATTCTCA-GC--TG--A--T-GT-T-GA-GGAATT-T--T---T----TTT-C---------GTG--GATT-AAA-ATT-ACAAATTTA-ATTACGATA----T------A----T-ATTA--G--TTC-T-GAAA-A-T-TGTGA-A-AGT--------AAAGAATAAcaagaataa
gi|32 : cccTT---C-ATCTGTTCTCA-GC--CG--A--T-AT-T-GA-GC-AAT-T--T---T----TTT-T---------CGT--GGAT-AAAAATG-ACAAATT---AC----G-A----T------A----T-ATTA--A--TTCTT-GA-A-A-T-GGTGA-C-AGTAAAGAATAAA
gi|31 : cTT---C-ACCTATTCTCA-GC--TG--A--T-AT-T-GA-GC--CT-T--T---T----TTT-C---------GTC--GATT-AAAAATG-GTAAATT---G-----GGA----T------A----T-AATA--G--TTC-T-GGAA-A-T-GGTGA-A-AGT
gi|25 : cccTT---CAGTCTATTCTCA-GC--TG--A--T-AT-T-AA-GC-ATT-T--T---T----TTT-T---------GTG--CTAT-GAAT-TG-GCAAATT---GT----CTG----T------C----TAATTGATG--TTC-T-GAAGAA-T-GGTGA-A-AGTCGAcaagaaataa
gi|34 : ccTT---C-ACCTATTCTCA-GCTTTG--A--T-AT-T-GA-G------G--T---T----TTTAT---------CGT--CAAT-ATAAATG-GCAAATTGCAAT----AAA----T------A------AATA--G--TTT-T-GAAA-A-T-GGTGC-A-AGTacagaaataa
gi|29 : tcccTT---C-ACATATTCTCA-GC--TA--A--C-GT-T-GA-GCAA-----------------T-TGGGGGGG--GGG--GGAT-AAA-ATG-GTAAATT---AC----G-A----T------A----T-A-CA--G--TTC-T-AA-A-A-T--GTGA-A-AGTAAAcaa
gi|52 : cgcccTT---C-ACATATTCTCA-GC--TA--A--C-GT-T-GT-GCA-----------------TT-T---------GGG--gaatgaac
gi|35 : ccT---C-ACATATTCTCA-GC--TG--A--C-GT-T-GA-GCATAT-T--T---C----TTT-T---------CGT--GGAT-AAAAATG-GCAAATT---AC----G-A----T------A----T-ATCA--G---TC-T-GAAA-A-T-GGTGA-A-AGTAAAgg
gi|37 : ---C-GCCCATCACTA-GC--TC--A--T-GT-T-GA-GCA--T-G--T---T----TTT-T---------CGT--GGAG-AAAAATG-GCAAATT---AC----A-A----T------A----T-ATTA--G--TTC-T-GAAA-A-T-GGTAA-A-AGTAAAGAATAAAgaaaa
gi|38 : ---C-GCCT---CTTA-GC--TG--A--T-GT-T-GA-GAAAAA-A--A---AAA--TTT-C---------GAG--GA-T-AAAAATG-GCAA-TT---AC----G-A----T------A----T-ATTA--G--TTC-T-GCAA-A-T-GGTGA-A-AATAAAGAATAAA
gi|39 : CTATTCTCA-GC--TG-----C-GT-T-GA-GCATAT-T--C---T----TTT-C---------TGT--GGAT-AAAAATG-GCAAAAT----T----ACA----T------A----T-ATCA--G---TC-T-GAAA-A-T--GTGA-ACAGTAAA
gi|33 : tctaCTATTCTCA-GC--TG--A--T-AT-T-GA-GC--CT-T--T---T----TTT-C---------GTC--GATT-AAAAATG-GTAATTG---GC----A-A----T------A----T-AATA--G--TTT-G-AAAA-A-T-GGTGA-A-AGTgac
gi|36 : ccttcaTCCTCA-GC--TG--A--T-GT-TTGA-GC---T-T--T---T----TTT-TTTTTCCTTCG-----AAT-AAAAATG-GCAAATT---A--------------------------ATTA--GT-TTC-T-GAAA-ATT-GGTGA-A------ATAT--AAAGAATAAcaaagaaata
gi|40 : catG--A--TCGT-T-CA-GCATAT-G--TGTTT----TTT-C---------GGGTGAAGC-GAAAATG-GCAAAAT---AT----ATA----TCGGCATA----T-ATTA--G--TTC-T-GAAA-A-T-GTTAA-A-AGTAa
gi|41 : cCAAAC-A--T---TGGGATTT-T---------GGT--ATAA-AAA-ATG-GCAAATT---AT----ATA----T------AAGTTT-ATTA--G--TCT-T-GACG-A-T-GGTAA-A-AGT--------AAAGAATAcaag
gi|45 : tAT-T--T---T----TTT-T---------CGT--AGAT-AAA-ATG-GCAAATT---ACG---ATA----C------A----T-A--A--G--TTT-T-GAAA-A-T-GCTGA-A-AGTA
gi|46 : gcT-AAAAATG-GCAA-------T-----TA----T------G----T-ATTA--G--TTC-T-GACG-A-TGGGTGA-A-AGT--------AAAGAATAAa
gi|47 : ttttttcgtT-AAAT-TG-GTAAATT---ATT---ATA----T------A----G-ATCA--G--TTC-T-GAAA-A-A-GGTGA-A-AGTAAA
2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|43 ): ATTGTTTTTGTCGATAAAAATGACAAATGGCAATATATTAGTTCTGAATGATACGTCACTATAATAAATTA
Unaligned ( gi|51 ): TACATACTTTAGTTCTGAAAATGTTGAAAGTCAAGAATAA
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consensus : CCTTC-GA--CATCA-CACGCA-T-GGAAA-----------CA--------TTTCAAAA-AA--AG---A-ATTA-GA-T-GCAAAA--TTGTAAAATGC-CAAGTTT-GACT---TTGNTCGGCGGAA-TT-GA-C-G-TA-CACT-----G--GT--G------------GTAC----------CTC-AAAT--AT-----GT--TTG-C----GCATCTAA-------AG-----GCAAA-GCA-T-CCT--------AGC--A-AA-------TA-GTT-C---AAA--C-T--C----GG-GAAAAGC-A-----CTC-C-GT-C-G--ATG-A----C--ATC-GT-----T----------T-------GTAT-C-CCC-TAG-AATTCGAAGACT---T---TCCGGTG-C-C---CA--------------------GCCTGA-GAT-TG-AG-AACAA-----AGCCAA--CAAAA---CT----G-AAAA---GTCGCCTATTCTC-AGC--TG--A--T-GT-T-GA-GCAAAT--N----T--T----TTT-T-------CGT------GGA-TA-AAAATG-GCAAATT---AT----ATA----T------A----T-ATTA--G-T--TC-T-GACG-A-T-GGTGA-A-AGTAAA----GAAAGAATAA
Reference ( family-276 ) : CCTTC-GA--CATCA-CACGCA-T-GGAAA-----------CA--------TTTCAAAA-AA--AG---A-ATTA-GA-T-GCAAAA--TTGTAAAATGC-CAAGTTT-GACT---TTGATCGGCGGAA-TT-GA-C-G-TA-CACT-----G--GT--G------------GTAC----------CTC-AAAT--AT-----GT--TTG-C----GCATCTAA-------AG-----GCAAA-GCA-T-CCT--------AGC--A-NA-------TA-GTT-C---AAA--C-T--C----GG-GAAAAGC-A-----CTC-C-GT-C-G--ATG-A----C--ATC-GT-----T----------T-------GTAT-C-CCC-TAG-AATTCGAAGACT---T---TCCGGTG-C-C---CA--------------------GCCTGA-GAT-TG-AG-AACAA-----AGCCAA--CAAAA---CT----G-AAAA---NTCGCCTATTCTC-AGC--TG--A--T-GT-T-GA-GCAAAT--N----T--T----TTT-T-------GGN------GGA-TA-AAAATG-GCAAATT---AT----ATA----T------A----T-ATTA--G-T--TC-T-GACG-A-T-GGTGA-A-AGTAAA----AAAAGAATAA
gi|1 : CCTTC-GA--CATCA-CATGCA-T-GGAAA-----------CA--------TTTTAAAA-AA--AG---A-ATTA-GA-T-GCAAAA--TTGTAAAATGC-CAAGTTT-GACT---TTGATCAGCGGAA-TT-GA-C-G-TA-TACT-----T--GT--G------------GTAC----------CTC-AAAT--AT-----GT--TTG-C----ACATCTAA-------AG-----GCAAA-GCA-T-CTT--------AGC--A-TA-------TA-GTT-C---AAA--T-T--C----GG-GAAATGC-A-----TTC-C-GT-C-G--ATG-A----C--ATC-GT-----T----------T-------GTAT-C-CCC-TAG-AATTCGAAGACT---T---TCCGGTG-T-C---CG--------------------ACCTGA-GAC-TG-AG-AACCA-----AGCCAA--CAAAA---CC----G-AAAA---TTCGCCTATTCTC-AGC--TG--A--T-GT-T-GA-GCAAAT--A----T--T----TTT-T-------GGG------AAA-TA-AATATG-GCAAATT---AT----ATA----T------A----T-ATTA--G-C--TC-T-GACG-A-T-GGTGA-A-AGTAGATATTAAAAGAATAA
gi|10 : CTTC-AA--CATCA-TAC-CA-T-GGAAA-----------TA--------TTTT-AAA-AA--AC---A-ATTA-GA-T-GCAGA----------------AAGTTT-TATTCAATTGATCATCGGAA-TT-GA-T-G-TA-CA-----------------------------------------CTC-AAAT--AT-----GT--TTG-C----ACATCTAA-------AG-----GC-AA-GCA-T-CCT--------AGC--A-C---------A-ATT-C---AAA--T-T--C----GGAAAAAAAC-A-----CTC-C-ATGC-ATCATG-A----C--ATC-GT-----T----------T-------GTAT-A-CCC-AAT-AATTCGAAGACT---T---TCCGGTGTC-T---CC--------------------ATCTGT-GAT-TG-AG-TACAA-----AG-CAA---GAAT---TT----G-AAAA---TTCGCCTATTCTC-AGC--TG--A--T-AT-T-GA-GCAAAT--A----T--T----TTC-T-------G--------GGA-TA-AAAATG-GCA-------AT----ATA----T------A----T-ATCA--GTT--TC-T-TACG-A-C-GGTGA-A-AGTAAA----
gi|11 : TTC-GA--CATCA-CATGCA-T-GGAA------------CA--------CTTCAAAA-GA---G---A-ATAA-GA-T-G---------GCAAAATGT-CAA-------CT---TTGTTTGGTGGAA-TT-GA-C-A-TA-CATT-----G--GT--A------------ATAC----------CTT-TAAT--AT-----GC--TTG-C----GCATCTAA-------AG-----GCAAA-GCA-T-CCT--------AGC--A-AA-------AG-GTT-A---AAA--C-T--CCAG-GG-GGAAA---A-----CTC-C-GT-C-G--ATGTATTCCC--ATC-AA-----T----------T-------GCA------------AA-TCAAAGACTCAGC---TCCGTTG-C-CAGGCA--------------------GTCTGA-GAT-TG-AG-AACAA-----AGCCAA--CAAAA---CG----G-AGAA---GGCGCATATTCTC-AGC--TT--T--T-GT-T-AA-TGAAATA-A----T--T----TTT-T-------G--------GGT-CA-AAAATG-ACAAAT-----------TA----T------A----T-ATTA--G-T--TC-T-GACA-A-T-gcga
gi|12 : ctcaCTTC-AA--CATCA-CAC-CA-TAGGAAA-----------TA--------TTTT-AAA-AA--AC---A-ATTA-GA-T-GCAGA----------------AAGTTT-TATTCAATTGATCATCGGAA-TT-GA-T-G-TA-CA-----------------------------------------CTC-AAAT--AT-----GT--TTG-C----ACATCTAA-------AG-----GCAAA-GCA-T-CCT--------AGC--A-C---------A-ATT-C---AAA--CTT--C----GGAAAAAAAC-A-----CTC-CAAT-C----ATG------C--ATC-GT-----T----------T-------GTATAC-CCG-TAT-AATTCGAAGACT---T---TCCGGTG-T-C---TC--------------------CTCTGATGAT-TG-AG-TACAA-----AG-CAA---GAAT---TT----G-AAAA---TTCGCCTATTCTC--GC--TG--A--T-AT-T-GA-GAAAA--------T--T----TTC-T-------G--------GGA-TA-AAAATG-GCAAAT-----T----ATA----T------A----T-ATCA--G-T--TC-T--ACG-A-C-GGTGA-A-AGTAAA----
gi|13 : CCTTT-GAATCACCA-CA-GCA-T-GGAAA-----------TACATGTGTATTTCAAAA-GA---G---A-ATTA-CA---GTAAAA--TTGTAAAATGCGCAA-CTT-G--T---TTGA-----AGAA-TTTGA-----TA-CACT-----G---T--G------------GTAC----------TTC-AAAT--AT-----GT--TTG-T----GCATCTAA-------A------GCAAA-GCA-T-CC---------AGC--A-AAC------CA-GTT-C---AAA--T-T--TTG--GG-GGAGGGA-A-----CTC-C-AT-T-G--A-G-A----C--ATCAAA-----T----------G-------GTA----CCC-TAG-A--------------------CAGTG-C-C---CA--------------------GGCTGA-GA--TG-AGAAACAA-------CCCA--C-AAA---TT----G-TAAA---GTTGCCTATTCTC-AGC--TG--T--T-TT-T-GA-TCTAAT--A----A--T----TTT-C-------GCA--------A-AA-AAAATG-G-AAAT-----------TA----T------G----C-ATTA--G-T--TC-T-GACG-A-T-GGTAA-A-AGTgcg
gi|14 : --A-AA-------TT-GTTGC---AAA--C-TTGC----GG-AAAAAGC-GAGCACCTC-C-GT-CCG--ATG-A----CC-ATC-GT-----T----------TTGTATAAGCAT-CGCCC-TAGGAATGACACGAGT---C---TCGGGTG-T-CA--CA--------------------TC---A-GATATGTAG-TATAATCTTAAGTCACGTCAAGAGCGTT----GCAGGA---ATGGCCTATTCTC-AGC--TG--ACCT-GCGT-GACGCAAAT-------T--T----TTT-T-------CTC------CAA-TA-AAAAAGAGCAAAT-----------TA----T------A----T-ATTA--GTT--TC-TGGACGAA-T-GGTGATA-AGT-------AGAAGAATAA
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gi|16 : gtttacaccccctatccagaaacaaacaaacgatca-AG--AG---A-ATAA-AA-TAGCAAAA--TTATAAAATGT-CAA-------CT---TTGCTGCACGAAA-TT-GA-T-G-CA-CACT-----G--AT--G------------TTAA----------CTC-A-----------------TG-C----GCATCTAA-------AG-----ACAAA-GCT-T-TCTTGCAAAAAAAC--A-TA-------AA-GGT-A---AAA--C-A--T----GG-GGAAA-T-G-----CTT-T-GT-C-A--ATG-C----C--AAC-GT-----T----------T-------TTAT-C-CAC-TAT-CATTTCAAGAC----T---TCCGGTG-C-C---AA--------------------GACAGA-GAT-CG-TT-AATAA-----AACCAaag
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gi|2 : gccccaCCTTC-GA--CATCA-CACGCA-T-GGAA------------CG--------TTTCAAAA-GA---G---A-ATAT-GA-TTGCAAAA--TTGTAAAATTT-CAACTTT---------TGTTTAGCGGAA-TT-GA-C-A-TG-CATT-----G--GT--G------------GTAC----------CTC-AAAT--AT-----GC--TTG-C----ACATCTAC-------AG-----GCAAA-ATA-T-CCT--------AGC--A-AA-------CA-GTT-A---AAA--C-T--CTG--GG-GAAAAAC-------CTC-C-GT-C-T--ATG-A----C--ATC-GT-----TTTTATTCCCAT-------GTAT-T-CCCATAA-AA-TCAAAGATT---C---TCCGATT-C-C---CATGGAGAACAATGGCGAATTTGCC----GAT-TG-AG-AACAA-----AGCCAA--CAAAA---CG----G-AGAG---GGCACCTATT------C--TG--T--T-GT-T-TA-TGAAAT--A----A--T----TTT----------GG------GGG-CC-AAAATG-GCAAATT---AT----A----------------------TA--G-T--TC-T-GACG-A-T-GGTGA-A-ATTAA
gi|20 : ccCGAAT-TT-GA-T-A-CA-CACT-----G--CT--G------------ACAT----------TTT-AAAT--ATACATTGTACTTG-C----ACATTTAA-------AA-----GCAAA-ATA-T-CATTAG-----AGG--A-AA-------T--GTT-A---CAA--C-T--C----CA-ATAAAAC-------CTC-C-GT-C-A--GTG-G----T--ATT-GTAAAACT----------C-------ATGT-C-CTA-TAG-AATGTGAAAACT---T---CCCGGTG-C-C---GA--------------------GTCTGA-GAT-TG-
gi|21 : CCTTCCGA--CATCA-CACGCAAT-GGGAC-----------TA--------TTT-AAAA-AA--AG---A-ATTA-GA-T----------TGCA-------CAAA-----------------GGCTGAA-TT-GA-C-AATAGCACT-----G--GT--GA-----------GTAC-----------TC-AG-T--AT-----AT--TTG-C----ACATCTAA-------CGCAAATGC-AA-GCA-T-CCT--------AGC--A-CAATT----TA-ATT-C---AAATCC-T--T----AG-AAAAGGC-A-----CTC-C-Gtaa
gi|22 : cc-GA--CATCGTCACGCA-G-AGAAA-----------TA----------------------G---A-ATTA-GA---GCACAA--TTGCAAAATGC-CAAGTTTTGAAT---TTGATCGGCCGAA-TT-GA-T-G-TA-CAAT-----AACGTTAG------------GTAC----------CTCCAAATTTAT-----GT--TTG-C----ACACCCAA-------AG-----GCAAA-GCATT-TCT--------AGCA-A-AA-------TA--TT-C---AAA--C-c
gi|23 : tcctaatCCTTC-GA--CATCA-CACGCA-T-GGGAC-----------TA--------TT-AAAAA-AA--AG---A-ATTA-GA-T-GC----------AAAA-------------------------GGCTGAA-TT-GA-C-A-TA-CACT-----G--GT--A------------GTAC-----------TC-AAGT--AT-----AT--TTG-C----ACATCTAA-------AC-----GCAAA-GCA-T-CCT--------AGC--A-CAATT----TA-ATT-C---AAAC-C-T--T----AG-AAAAAGC-A-----CTC-C-GT-C-G--ATG-G----C--at
gi|24 : ccCT---T---TCCAGTG-C-C---CATGCA----------------GCCTGA-GAT-TG-AG-AACAA-----AGCCAA--CAAAA---CT----G-AAAA---GTCGCCAATTCTC-AGC--TG--A--T-GT-T-GA-TCAAAT--A----T--A----TTT-T---------T------GGA-TA-AAAATG-GCAAATT---AT----ACA-----------A--------TA--G-T--TC-T-GATC-A-T-GGTGA-A-AGTAAA----GAA
gi|25 : cGTCTATTCTC-AGC--TG--A--T-AT-T-AA-GC--AT--T----T--T----TTT-T-------TGT-------GC-TATGAATTG-GCAAATT---GT----CTG----T------C----TAATTGATG-T--TC-T-GAAGAA-T-GGTGA-A-AGTCGA----ACAGAAATAAta
gi|26 : ccttcaTCACCTATTCTC-AGC--TG--G--T-AT-T-GA-GCAATT--T----T--T----TTT-T-------CGT------CGA-TA-AAAATG-GCAAATTGCGAT----ATACATGT------G----T-ATTA--G-T--TC-T-GAAA-A-T-GGTGA-A-AGT--------CAAGAATAA
gi|27 : cctTCACCTATTCTC-AGC--TG--A--T-GT-T-GA-G-GAAT--T----T--T----TTT-T-------CGT------GGA-TT-AAAATT-ACAAATTTA-ATTACGATA----T------A----T-ATTA--G-T--TC-T-GAAA-A-T-TGTGA-A-AGT--------AAAGAATAA
gi|28 : ccctACGCA-T-GGAAA-----------CA--------TTCCAAAA-GA---G---A-AT------------------GTAAAATGC-CAA-------CT---TTGTTTGGCGGAA-TT-GA-C-G-TA-CATT-----G--AT--G------------GTTC----------CTC-AAAT--AT-----GC--TTG-C----GCATGTAA-------AG-----GCAAA-
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gi|3 : cgccctTTC-GA--CATCA-CACGCA-T-GGAAA-----------TA--------T----AAA-AA--AA---A-AT-A-GA-T-GCAAAA----------------AGTTT-TACT---TTTATCGACGGAA-TT-GA-C-G-CA-CACT-----G--GT--ATA----------GTAC----------CTC-AAAT--AT-----GT--TTG-C----ACATCTAA-------AG-----ACAAA-ATA-T-CCT--------AGC--A-CAATACATCTA-ATT-C---AAA--C-TT-C----GG-AAAAAAC-A-----CTT-C-AT-T-G--ATG-A----C--ATC-GT-----T----------T-------ATAT-C-CCC-TAG-AATTTGAAGACT---T---TCTGGTG-C-T---CA--------------------ATTTGA-GAT-TG-AG-AACAT-----AACCAA--CAAAA---CC----G-AAAA---TTAATCTATTCTC-ATT--AG--A--T-GT-T-TA-GCAAAT--A----T--G----TTT-----------G------AGA-TA-AAAATG-GGAAAT-----------TA----T------A----T-ATTA--G-T--TC-T-GACG-A-T-GATGA-A-AGTAAA----GAAc
gi|30 : ccaCTTTC-AA--TATTA-CATGCA-T-GGAAA-----------CA--------TATTAAAA-GA--GGATTA-AGTA-GATT-GCAAAA--TTGTAAAATGC-CA-------ACT---TAGTTCGGCGGAA-TT-GA-C-G-TA-CATT-----T--GT--t
gi|31 : cTCACCTATTCTC-AGC--TG--A--T-AT-T-GA-GC---C--T----T--T----TTT-T-------CGT------CGATTA-AAAATG-GTAAATT---G-----GGA----T------A----T-AATA--G-T--TC-T-GGAA-A-T-GGTGA-A-AGTCAA----GAAATAAa
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gi|33 : ctCTATTCTC-AGC--TG--A--T-AT-T-GA-GC---C--T----T--T----TTT-T-------CGT------CGATTA-AAAATG-GTAATTG---GC----A-A----T------A----T-AATA--G-T--TT-G-AAAA-A-T-GGTGA-A-AGTCAA----AGAAa
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gi|35 : tccctTCACATATTCTC-AGC--TG--A--C-GT-T-GA-GCATAT--T----T--C----TTT-T-------CGT------GGA-TA-AAAATG-GCAAATT---AC----G-A----T------A----T-ATCA--G----TC-T-GAAA-A-T-GGTGA-A-AGTAAA----GAAA
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gi|4 : tctaCCTTC-GA--CATCA-AATGCA-T-GGGAA-----------CA--------TTTCAAAA-GAGAAG---A-ATT---------------TTGCAAA-----CA--------CT---GTGTTAGGCGGAT-TT-GA-C-G-TA-CATTCGAACG--GT--A------------GTAC----------CTG-ACCT--AT-----GG--CTG-C----GTATCTAA-------AT-----ACAAA-ACA-T-CCC--------ACCG-A-AA-------GA-GTT-TTA-AAA--C-T--C----GGAGGGAA---A-----CTC-T-GT-C-A--GTG-A----C--ATC-GT-----T----------T-------ATAT-C-CCT-TAT-AATTCAAAGACT---C---TCCTGTG-C-C---CA--------------------GCCCGA-GAT-TG-AT-AACAC-----GGTCAA--CAAAG---CT----G-AAAA---GTCACCTATTCCC-AGG--TG--T--C-GG-T-GA-TCACAT--A----A--T----TTT-T---------T------AGA-CA-AAAATA-GCAAGTTAC-AT----GTA----T------A----T-ATTA--G-T--TC-T-AACG-A-T-GGTGC-A-AGc
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gi|9 : gcttgaccatcacacacatggaaaatacatgtgtgtatttcgaaaaggaaaatacaagtaaacttgtaaaatgccacgtttgtttggaagaattgtgtacacttgtcggtactccgaaagatgtttgtgctggcatctaaagcaaagcatccctagcaaaccagtttcaacatttttgggggggggaacgtcgcattgattgacatgtcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCCTTC-AA--CATCA-CACGCA-T-GGAAA-----------TA--------TTTTAAAA-AA--C----A-ATTA-GA-T-GCAGAAAGTTTTAA----------TTC-AA-----TTGATCATCGGAA-TT-GA-T-G-TA-CACT-----------------------------------------C-AAAT--AT-----GT--TTG-C----ACATCTAA-------AG-----GCAAA-GCA-T-CCT--------AGC--A-CA----------ATT-C---AAA--C-TT-C----GG-AAAAAAC-A-----CTC-C-AT-C-A--ATG-A----C--ATC-GT-----T----------T-------GTAT-A-CCC-TAT-AATTCGAAGACT---T---TCCGGTG-T-C---CA--------------------ATCTGA-GAT-TG-AG-TACAA-----AGCCAA--GAAAA---TT----G-AAAA---TTCGCCTATTCTC-AGC--TG--A--T-AT-T-GA-GCAAAT--A----T--T----TTC-T-------G--------GGA-TA-AAAATG-GCAAAT-----T----ATA----T------A----T-ATCA--G-T--TC-T-TACG-A-C-GGTGA-A-AGTAAA----aatt
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gi|16 : gtttacaccccctatccagaaacaaacaaacgatca-AG--AGA---ATAA-AATAGC--AAAATTATAAAATGT-CAA-------CT---TTGCTGCACGAAA-TT-GA-T-G-CA-CACT-----G--AT--G------------TTAA----------CTC-A-----------------TG-C----GCATCTAA-------AG-----ACAAA-GCT-T-TCT---TGC--A-AAAAAACA--TAAA------GGT-A---AAA--C-A--T----GG-GGAAA--T-G-----CTT-T-GT-C-A--ATG-C----C--AAC-GT-----T----------T-------TTAT-C-CAC-TAT-CATTTCAAGAC----T---TCCGGTGC-C---AA--------------------GACAGA-GAT-CG-TT-AATAA-----AACCAaag
gi|17 : tgaattgtttcattCCTTT-GA--CA-CT-CACTCA-T-GGAAA-----------TA--------TTTCAAAA-GA--GAAT--ATTAAGAT-GC--AGAATTGCAAAATGC-CAAGTTT-GACT---TTGATCAGCAGAG-CT-GA-T-G-TA-CAAT-----G--GT--GGTACATGTACATGTAC----------CTC-AAAT--GC-----AT--TTG-C----ACATCTAATTAAATTAG-----GCAAA-TCA-T-CCT---AGT--ATA------A--T--A------GTT-C---AAA----------------A--------------TC-C-GT-C-A--ATG-A----CATATC-AT-----T----------T-------Gtag
gi|18 : gccCCTTT-GA--CA-CT-CACTCA-T-GGAAA-----------TA--------TTTCAAAA-GA--GAAT--ATTAAGAT-GC--AGAATTGCAAATTGC-CAAGTTT-GACT---TTGATCAGAAGAAGCT-GAAT-G-TA-CAAT-----G--GT--G------------GTACATGTACATTACTC-AAAT--GC-----AT--TTG-C----ACATCTAATTAAATTAG-----GCAAA-TCA-T-C-T---AGT--A-T------A--T--A------GTT-C---AAA------------------------A------TC-C-GT-C-A--ATG-A----CATATC-AT-----T----------T-------G
gi|19 : cgccTTC-GA--CAATA-CGTGCT-T-GGAAA-----------CA--------CTTCAAAA-GA--AAA---GTAG-GTT-GC--AAAATTGTAAAATGA-CA-------ACT---TTATTCGGTGCAA-TT-GG-C-G-TA-CATT-----G--GT--A------------GTAA----------TTG-AACT--AT-----GG--TTG-C----ACATCT-----------------CAA--------------AGC--A-A------A--TC-A------GTT-A---AAA--CTT--C----AG-AAGAAG---------CTC-A-GT-C-A--ATG-A----A--ATT-GT-----T----------T-------GTAT-C-C
gi|2 : gccccaCCTTC-GA--CATCA-CACGCA-T-GGAA------------CG--------TTTCAAAA-GA---GA---ATAT-GATTGC--AAAATTGTAAAATTT-CAACTTT---------TGTTTAGCGGAA-TT-GA-C-A-TG-CATT-----G--GT--G------------GTAC----------CTC-AAAT--AT-----GC--TTG-C----ACATCTAC-------AG-----GCAAA-ATA-T-CCT---AGC--A-A------A--C--A------GTT-A---AAA--C-T--CTG--GG-GAAAAA-C-------CTC-C-GT-C-T--ATG-A----C--ATC-GT-----TTTTATTCCCAT-------GTAT-T-CCCATAA-AA-TCAAAGATT---C---TCCGATTC-C---CATGGAGAACAATGGCGAATTTGCC----GAT-TG-AG-AACAA-----AGCCAA--CAAAA---CG----G-AGAG---GGCACCTATT------CT--G--T--T-G-T-TTA-TGAAAT-A----A--T----TTT---G--G------GG-------G-C-C-AAAATG-GCAAATT---AT----A----------------------TA--G-T--TC-T-GACG-A-T-GGTGA-A-A-TT--A-A-
gi|20 : ccCGAAT-TT-GA-T-A-CA-CACT-----G--CT--G------------ACAT----------TTT-AAAT--ATACATTGTACTTG-C----ACATTTAA-------AA-----GCAAA-ATA-T-CATTAGAGG--A-A------A--T---------GTT-A---CAA--C-T--C----CA-ATAAAA-C-------CTC-C-GT-C-A--GTG-G----T--ATT-GTAAAACT----------C-------ATGT-C-CTA-TAG-AATGTGAAAACT---T---CCCGGTGC-C---GA--------------------GTCTGA-GAT-TG-
gi|21 : CCTTCCGA--CATCA-CACGCAAT-GGGAC-----------TA--------TTT-AAAA-AA--AGA---ATTA-GAT----------TGCA-------CAAA-----------------GGCTGAA-TT-GA-C-AATAGCACT-----G--GT--GA-----------GTAC-----------TC-AG-T--AT-----AT--TTG-C----ACATCTAA-------CGCAAATGC-AA-GCA-T-CCT---AGC--ACA------ATTT--A------ATT-C---AAATCC-T--T----AG-AAAAGG-C-A-----CTC-C-Gtaa
gi|22 : cc-GA--CATCGTCACGCA-G-AGAAA-----------TA----------------------GA---ATTA-GA--GC--ACAATTGCAAAATGC-CAAGTTTTGAAT---TTGATCGGCCGAA-TT-GA-T-G-TA-CAAT-----AACGTTAG------------GTAC----------CTCCAAATTTAT-----GT--TTG-C----ACACCCAA-------AG-----GCAAA-GCATT-TCT---AGCA-A-A------A--T--A-------TT-C---AAA--C-c
gi|23 : tcctaatCCTTC-GA--CATCA-CACGCA-T-GGGAC-----------TA--------TT-AAAAA-AA--AGA---ATTA-GAT-GC----------AAAA-------------------------GGCTGAA-TT-GA-C-A-TA-CACT-----G--GT--A------------GTAC-----------TC-AAGT--AT-----AT--TTG-C----ACATCTAA-------AC-----GCAAA-GCA-T-CCT---AGC--ACA------ATTT--A------ATT-C---AAAC-C-T--T----AG-AAAAAG-C-A-----CTC-C-GT-C-G--ATG-G----C--at
gi|24 : ccCT---T---TCCAGTGC-C---CATGCA----------------GCCTGA-GAT-TG-AG-AACAA-----AGCCAA--CAAAA---CT----G-AAAA---GTCGCCAATTCTC-AGCT--G--A--T-G-T-TGA-TCAAAT-A----T--A----TTT-T----T------GG-------A-T-A-AAAATG-GCAAATT---AT----ACA-----------A--------TA--G-T--TC-T-GATC-A-T-GGTGA-A-A-GT--A-A-A----GAA
gi|25 : cGTCTATTCTC-AGCT--G--A--T-A-T-TAA-GC--AT-T----T--T----TTT-TTG--T-------G-------C-T-ATGAATTG-GCAAATT---GT----CTG----T------C----TAATTGATG-T--TC-T-GAAGAA-T-GGTGA-A-A-GTCGA-ACA----GAAATAAta
gi|26 : ccttcaTCACCTATTCTC-AGCT--G--G--T-A-T-TGA-GCAATT-T----T--T----TTT-TCG--T------CG-------A-T-A-AAAATG-GCAAATTGCGAT----ATACATGT------G----T-ATTA--G-T--TC-T-GAAA-A-T-GGTGA-A-A-GT--C-A-A----GAA
gi|27 : cctTCACCTATTCTC-AGCT--G--A--T-G-T-TGA-G-GAAT-T----T--T----TTT-TCG--T------GG-------A-T-T-AAAATT-ACAAATTTA-ATTACGATA----T------A----T-ATTA--G-T--TC-T-GAAA-A-T-TGTGA-A-A-GT--A-A-A----GAAtaa
gi|28 : ccctACGCA-T-GGAAA-----------CA--------TTCCAAAA-GA---GA---AT-----------------GTAAAATGC-CAA-------CT---TTGTTTGGCGGAA-TT-GA-C-G-TA-CATT-----G--AT--G------------GTTC----------CTC-AAAT--AT-----GC--TTG-C----GCATGTAA-------AG-----GCAAA-taa
gi|29 : TCACATATTCTC-AGCT--A--A--C-G-T-TGA-GCAA------------------T-TGG--G------GGGGGGGGGA-T-A--AAATG-GTAAATT---AC----G-A----T------A----T-A-CA--G-T--TC-T-AA-A-A-T--GTGA-A-A-GT--A-A-A----GAATGAA
gi|3 : cgccctTTC-GA--CATCA-CACGCA-T-GGAAA-----------TA--------T----AAA-AA--AAA---AT-A-GAT-GC--AAAA--------------AGTTT-TACT---TTTATCGACGGAA-TT-GA-C-G-CA-CACT-----G--GT--ATA----------GTAC----------CTC-AAAT--AT-----GT--TTG-C----ACATCTAA-------AG-----ACAAA-ATA-T-CCT---AGC--ACA------A--T--ACATCTAATT-C---AAA--C-TT-C----GG-AAAAAA-C-A-----CTT-C-AT-T-G--ATG-A----C--ATC-GT-----T----------T-------ATAT-C-CCC-TAG-AATTTGAAGACT---T---TCTGGTGC-T---CA--------------------ATTTGA-GAT-TG-AG-AACAT-----AACCAA--CAAAA---CC----G-AAAA---TTAATCTATTCTC-ATTA--G--A--T-G-T-TTA-GCAAAT-A----T--G----TTT---G---------AG-------A-T-A-AAAATG-GGAAAT-----------TA----T------A----T-ATTA--G-T--TC-T-GACG-A-T-GATGA-A-A-GT--A-A-A----GAAc
gi|30 : ccaCTTTC-AA--TATTA-CATGCA-T-GGAAA-----------CA--------TATTAAAA-GA--GGATTAAGTA-GATTGC--AAAATTGTAAAATGC-CAA-------CT---TAGTTCGGCGGAA-TT-GA-C-G-TA-CATT-----T--GT--t
gi|31 : cTCACCTATTCTC-AGCT--G--A--T-A-T-TGA-GC---C-T----T--T----TTT-TCG--T------CG-------A-TTA-AAAATG-GTAAATT---GG----G-A----T------A----T-AATA--G-T--TC-T-GGAA-A-T-GGTGA-A-A-GT--C-A-A----GAAATAAa
gi|32 : ccctTCATCTGTTCTC-AGCC--G--A--T-A-T-TGA-GCAA-T-T----T--T----TTT-TCG--T------GG-------A-T-A-AAAATG-ACAAATT---AC----G-A----T------A----T-ATTA--A-T--TCTT-GA-A-A-T-GGTGA-C-A-GT--A-A-A----GAA
gi|33 : ctCTATTCTC-AGCT--G--A--T-A-T-TGA-GC---C-T----T--T----TTT-TCG--T------CG-------ATT-A-AAAATG-GTAATTG---GC----A-A----T------A----T-AATA--G-T--TT-G-AAAA-A-T-GGTGA-A-A-GTC-A-A-A----GAAAtaaa
gi|34 : ccttcaTCACCTATTCTC-AGCTTTG--A--T-A-T-TGA-G------G----T--T----TTTATCG--T------CA-------A-T-A-TAAATG-GCAAATTGCAAT----AAA----T------A------AATA--G-T--TT-T-GAAA-A-T-GGTGC-A-A-GT--C-A-A----ta
gi|35 : tccctTCACATATTCTC-AGCT--G--A--C-G-T-TGA-GCATAT-T----T--C----TTT-TCG--T------GG-------A-T-A-AAAATG-GCAAATT---AC----G-A----T------A----T-ATCA--G----TC-T-GAAA-A-T-GGTGA-A-A-GT--A-A-A----GAAA
gi|36 : TCCTC-AGCT--G--A--T-GTT-TGA-GC---T-T----T--T----TTT-TTT--TTCCTTCGA-------A-T-A-AAAATG-GCAAATT---A--------------------------ATTA--GTT--TC-T-GAAA-ATT-GGTGA-A-ATAT--A-A-A----GAAa
gi|37 : catCGCCCATCACT-AGCT--C--A--T-G-T-TGA-GCA--T-G----T--T----TTT-TCG--T------GG-------A-G-A-AAAATG-GCAAATT---AC----A-A----T------A----T-ATTA--G-T--TC-T-GAAA-A-T-GGTAA-A-A-GT--A-A-A----GAAtaaa
gi|38 : CGCCT---CTT-AGCT--G--A--T-G-T-TGA-GAAAAA-AAAAAT--T----T----CG--A------GG-------A-T-A-AAAATG-GCAA-TT---AC----G-A----T------A----T-ATTA--G-T--TC-T-GCAA-A-T-GGTGA-A-A-AT--A-A-A----GAAtaaa
gi|39 : CTATTCTC-AGCT--G-----C-G-T-TGA-GCATAT-T----C--T----TTT-CTG--T------GG-------A-T-A-AAAATG-GCAAAAT----T----ACA----T------A----T-ATCA--G----TC-T-GAAA-A-T--GTGA-ACA-GT--A-A-A----GAtaaa
gi|4 : tctaCCTTC-GA--CATCA-AATGCA-T-GGGAA-----------CA--------TTTCAAAA-GAGAAGA---ATT--------------TTGCAAA-----CA--------CT---GTGTTAGGCGGAT-TT-GA-C-G-TA-CATTCGAACG--GT--A------------GTAC----------CTG-ACCT--AT-----GG--CTG-C----GTATCTAA-------AT-----ACAAA-ACA-T-CCC---ACCG-A-A------A--G--A------GTT-TTA-AAA--C-T--C----GGAGGGAA----A-----CTC-T-GT-C-A--GTG-A----C--ATC-GT-----T----------T-------ATAT-C-CCT-TAT-AATTCAAAGACT---C---TCCTGTGC-C---CA--------------------GCCCGA-GAT-TG-AT-AACAC-----GGTCAA--CAAAG---CT----G-AAAA---GTCACCTATTCCC-AGGT--G--T--C-G-G-TGA-TCACAT-A----A--T----TTT-T----T------AG-------A-C-A-AAAATA-GCAAGTTAC-AT----GTA----T------A----T-ATTA--G-T--TC-T-AACG-A-T-GGTGC-A-A-Gc
gi|40 : --G--A--TCG-T-TCA-GCATAT-G----TGTT----TTT-TCGGGT------GA-------AGC-G-AAAATG-GCAAAAT---AT----ATA----TCGGCATA----T-ATTA--G-T--TC-T-GAAA-A-T-GTTAA-A-A-GT--ACA-A----c
gi|41 : cCAAAC-A----T--TGGGATTT-TGG--T------AT-------A---A-AAAATG-GCAAATT---AT----ATA----T------AAGTTT-ATTA--G-T--CT-T-GACG-A-T-GGTAA-A-A-GT--A-A-A----GAA
gi|42 : t-----------CA--------TTTCAAAA-----AGA---ATTA-GAT-GC--AAAATTGTATGATGC-CAAGTTT-GACT---TTGACCAGta
gi|43 : ctccctttgacat----TTT-TTG--T------CG-------A-T-A-AAAATG-ACAAATG---GC----A-A----T------A----T-ATTA--G-T--TC-T-GA---A-T-GATtattaa
gi|44 : attgA-CACGCA-T-GGAAA-----------TA--------TTAAAAAAAAA--AGA---ATTA-GAT-GC--AAAATTGCAAAATGC-CAAGTTT-GACT---TTGATCacgtcactataataaatta
gi|45 : AT-T----T--T----TTT-TCG--T------AG-------A-T---AAAATG-GCAAATT---ACG---ATA----C------A----T-A--A--G-T--TT-T-GAAA-A-T-GCTGA-A-A-GT--A-A-
gi|46 : gc----T--T----TTT-TCG--T-----------------T-A-AAAATG-GCAA-------T-----TA----T------G----T-ATTA--G-T--TC-T-GACG-A-TGGGTGA-A-A-GT--A-A-A----GAA
gi|47 : -AAATTG-GTAAATT---ATT---ATA----T------A----G-ATCA--G-T--TC-T-GAAA-A-A-GGTGA-A-A-GT--A-A-A----GAATGAAtaa
gi|48 : tttCCTTC-GA--CATCA-CATGCA-T-GGAAA-----------CA--------TTTTAAAA-AA--AAC---ATTA-GAT-GC--AAAATc
gi|49 : cCCTTC-GA--CATCA-CATTCA-C-GGAAA-----------TA--------TTTC-ATA-AA--AGA---ATTA-G
gi|5 : tccCCTTC-GA--CATCA-CACATA-T-GGAAA-----------CA--------TTCTAAAA-GA----------T----T-GC--AAAATTGGAAAATGC-CAA-------CT---TTGTTCGGCGGAA-TT-GA-C-G-TA-CATT-----G--GT--A------------GTTC----------CTC-AAAT--AT-----GC--TTG-C----ACTTCTAA-------AG-----GCAAA-GCT-T-CCT---A-CTGA-A------A--C--A------G---A---AAA--C-TTCC----AA-AAAAAA-CAA-----CTC-C-AT-C-A--GTG-A----C--AGC-GT-----T----------G-------GTAT-C-CCC-TAG-ATTTCAAAGACT---T---TCCGGTGC-T---CA--------------------GCC--------TG-AG-AACAA-----AGCCAA--CAAAA---CT----A-AAAA---GTCGCCTTTTCTC-GGTT--G--A--T-C-T-TGA-TCAAATAA----T--T----TTT-T----T------GG-------A-C---AAAATG-GCAAATT---GT----ATAGCC-T------A----T-ATTA--G-T--TC-T-GACA-A-T-AGTGA-A-A-GC--A-A-
gi|50 : gccAA--CAACA---CT----G-AAAA---GTCGCCTATTCTC-GGT---------T-G-T-TGA-TCAAAT-T----T--
gi|51 : T----ACA----T------A----C-TTTA--G-T--TC-T-GAAA-A-T-GTTGA-A-A-GT--C-A-A----GAA
gi|52 : TCACATATTCTC-AGCT--A--A--C-G-T-TGT-GCAtaa
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gi|7 : agtATCA-CACGTA-T-GGGGA-----------TA--------TTT--AAA-AA--AAA---AT-A-GAT-GT--AAAATTCTAAAATGC-CAAATTT-GACT---TTGATCGACGGAA-TT-GA-C-G-TA-CACT-----G--GC--G------------GTAA----------CTC-AAAC--AA-----AC--------------TCTAA-------AG-----GCAAA-ACA-T-GCT---ATCA-A-A------A--T--A------ATT-C---AAA--C-TG-C----GG-AAAAAG-C-A-----CCC-C-AT-T-G--ATG-A----C--ACT-G------T----------T-------GAAT-T-CCC-TTT-AATTCAAA---T---TATGTCTGGTGC-C---CA--------------------ACGTTA-GAT-TG-AG-AACAA-----AGCCAA--CAAAA---CTTACCA-AAAA---ATCGC---TTTAC-AGCT--G--A--T-A-T-TGA--CCAAT-G----T--T----TTT-T-G--T-------A-------A-T-A-TAAATG-GCAACT-----------TA----T------A----C-ATTA--C-T--TT-T-GACG-A-T-GGTGA-A-A-GT--G-A-G----GAA
gi|8 : aa--CATCA-CACACA-T-GGAAAATACATGTGTGTA--------TTTCGAAA-AG--GAA---AATA-CAA-GT--AAACTTGTAAAATGC-CACGTTT-G--T---TT----GGAAGAA-TT-G--T-G-TA-CACT-----T--GTC-G------------GTAC----------TCCGAAAG--AT-----GT--TTG-TGCTGGCATCTAA-------A------GCAAA-GCA-TCCCT---AGC--A-A------AC-C--A------GTT-T---CAA--C-
gi|8 : gcttgac-A-----CTC-C-AT-T-G--ATG---------------------------------------GTAT-C-CC--TAG-AA-------------------CAGTGT-C---CA--------------------GTCTGA-GAT-TG-AG-AACGA-----AGCCCA--CAAAA---TT----G-TAAA---GTTGCCTATTTTC-AGCT--G--T--T-T-T-TGA-TCTAAT-atttttgggggggggaacgtcgcattgattgacatgtcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactccattgatggtatccctagaacagtgtccagtctgagattgagaacgaagcccacaaaattgtaaagttgcctattttcagctgtttttgatctaataatt
gi|9 : gcttgaccatcacacacatggaaaatacatgtgtgtatttcgaaaaggaaaatacaagtaaacttgtaaaatgccacgtttgtttggaagaattgtgtacacttgtcggtactccgaaagatgtttgtgctggcatctaaagcaaagcatccctagcaaaccagtttcaacatttttgggggggggaacgtcgcattgattgacatgtcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCCTTC-AA--CATCA-CACGCA-T-GGAAA-----------TA--------TTTT-AAA-AA--ACA---ATTA-GAT-GCAGAAAGTTTTAA----------TTC-AA-----TTGATCATCGGAA-TT-GA-T-G-TA-CA-----------------------------------------CTC-AAAT--AT-----GT--TTG-C----ACATCTAA-------AG-----GCAAA-GCA-T-CCT---AGC-----------A--C--A------ATT-C---AAA--CTT--C----GG-AAAAAA-C-A-----CTC-C-AT-C-A--ATG-A----C--ATC-GT-----T----------T-------GTAT-A-CCC-TAT-AATTCGAAGACT---T---TCCGGTGT-C---CA--------------------ATCTGA-GAT-TG-AG-TACAA-----AGCCAA--GAAAA---TT----G-AAAA---TTCGCCTATTCTC-AGCT--G--A--T-A-T-TGA-GCAAAT-A----T--T----TTC-T-G---------GG-------A-T-A-AAAATG-GCAAAT-----T----ATA----T------A----T-ATCA--G-T--TC-T-TACG-A-C-GGTGA-A-A-GT--A-A-A----aatt
Alignments
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consensus : CCTTC-GA--CATCA-CACGCA-T-GGAAA-----------CA--------TTTCAAAA-AA--AGA---ATTA-GAT-GC--AAAATTGTAAAATGC-CAAGTTT-GACT---TTGNTCGGCGGAA-TT-GA-C-G-TA-CACT-----G--GT--G------------GTAC----------CTC-AAAT--AT-----GT--TTG-C----GCATCTAA-------AG-----GCAAA-GCA-T-CCT---AGC----A-AA--C----A------GTT-C---AAA--C-T--C----GG-GAAAAG-C-A-----CTC-C-GT-C-G--ATG-A----C--ATC-GT-----T----------T-------GTAT-C-CCC-TAG-AATTCGAAGACT---T---TCCGGTGC-C---CA--------------------GCCTGA-GAT-TG-AG-AACAA-----AGCCAA--CAAAA---CT----G-AAAA---GTCGCCTATTCTC-AGCT--G--A--T-G-T-TGA-GCAAAT-N----T--T----TTT-TCG--T------GG-------A-T-A-AAAATG-GCAAATT---AT----ATA----T------A----T-ATTA--G-T--TC-T-GACG-A-T-GGTGA-A-A-GT--A-A-A----GAAAGAATAA
Reference ( family-276 ) : CCTTC-GA--CATCA-CACGCA-T-GGAAA-----------CA--------TTTCAAAA-AA--AGA---ATTA-GAT-GC--AAAATTGTAAAATGC-CAAGTTT-GACT---TTGNTCGGCGGAA-TT-GA-C-G-TA-CACT-----G--GT--G------------GTAC----------CTC-AAAT--AT-----GT--TTG-C----GCATCTAA-------AG-----GCAAA-GCA-T-CCT---AGC----A-AA--C----A------GTT-C---AAA--C-T--C----GG-GAAAAG-C-A-----CTC-C-GT-C-G--ATG-A----C--ATC-GT-----T----------T-------GTAT-C-CCC-TAG-AATTCGAAGACT---T---TCCGGTGC-C---CA--------------------GCCTGA-GAT-TG-AG-AACAA-----AGCCAA--CAAAA---CT----G-AAAA---GTCGCCTATTCTC-AGCT--G--A--T-G-T-TGA-GCAAAT-N----T--T----TTT-TCG--T------GG-------A-T-A-AAAATG-GCAAATT---AT----ATA----T------A----T-ATTA--G-T--TC-T-GACG-A-T-GGTGA-A-A-GT--A-A-A----GAAAGAATAA
gi|1 : CCTTC-GA--CATCA-CATGCA-T-GGAAA-----------CA--------TTTTAAAA-AA--AGA---ATTA-GAT-GC--AAAATTGTAAAATGC-CAAGTTT-GACT---TTGATCAGCGGAA-TT-GA-C-G-TA-TACT-----T--GT--G------------GTAC----------CTC-AAAT--AT-----GT--TTG-C----ACATCTAA-------AG-----GCAAA-GCA-T-CTT---AGC----A-TA--T----A------GTT-C---AAA--T-T--C----GG-GAAATG-C-A-----TTC-C-GT-C-G--ATG-A----C--ATC-GT-----T----------T-------GTAT-C-CCC-TAG-AATTCGAAGACT---T---TCCGGTGT-C---CG--------------------ACCTGA-GAC-TG-AG-AACCA-----AGCCAA--CAAAA---CC----G-AAAA---TTCGCCTATTCTC-AGCT--G--A--T-G-T-TGA-GCAAAT-A----T--T----TTT-TGG--G------AA-------A-T-A-AATATG-GCAAATT---AT----ATA----T------A----T-ATTA--G-C--TC-T-GACG-A-T-GGTGA-A-A-GT--A-G-ATATTAAAAGAATAA
gi|10 : CTTC-AA--CATCA-TAC-CA-T-GGAAA-----------TA--------TTTTAAAA-AA--C-A---ATTA-GAT-GC--AGAA--------------AGTTT-TATTCAATTGATCATCGGAA-TT-GA-T-G-TA-CACT-----------------------------------------C-AAAT--AT-----GT--TTG-C----ACATCTAA-------AG-----GCAA--GCA-T-CCT---AGC----A-----C----A------ATT-C---AAA--T-T--C----GG-AAAAAAAC-A-----CTC-C-ATGC-ATCATG-A----C--ATC-GT-----T----------T-------GTAT-A-CCC-AAT-AATTCGAAGACT---T---TCCGGTGT-CTC-CA---------------------TCTGT-GAT-TG-AG-TACAA-----AGC-AA---GAAT---TT----G-AAAA---TTCGCCTATTCTC-AGCT--G--A--T-A-T-TGA-GCAAAT-A----T--T----TTC-T-G---------GG-------A-T-A-AAAATG-GCA-------AT----ATA----T------A----T-ATCA--GTT--TC-T-TACG-A-C-GGTGA-A-A-GT--A-A-A----
gi|11 : TTC-GA--CATCA-CATGCA-T-GGAA------------CA--------CTTCAAAA-GA---GA---ATAA-GAT-G---------GCAAAATGT-CAA-------CT---TTGTTTGGTGGAA-TT-GA-C-A-TA-CATT-----G--GT--A------------ATAC----------CTT-TAAT--AT-----GC--TTG-C----GCATCTAA-------AG-----GCAAA-GCA-T-CCT---AGC----A-AA--A----G------GTT-A---AAA--C-T--CCAG-GG-GGAAA----A-----CTC-C-GT-C-G--ATGTATTCCC--ATC-AA-----T----------T-------GCA------------AA-TCAAAGACTCAGC---TCCGTTGC-CAGGCA--------------------GTCTGA-GAT-TG-AG-AACAA-----AGCCAA--CAAAA---CG----G-AGAA---GGCGCATATTCTC-AGCT--T--T--T-G-T-TAA-TGAAAT-A----A--T----TTT-T----T------GG-------G-TCA-AAAATG-ACAAAT-----------TA----T------A----T-ATTA--G-T--TC-T-GACA-A-T-cga
gi|12 : ctcaCTTC-AA--CATCA-CAC-CA-TAGGAAA-----------TA--------TTTTAAAA-AA--C-A---ATTA-GAT-GC--AGAA--------------AGTTT-TATTCAATTGATCATCGGAA-TT-GA-T-G-TA-CACT-----------------------------------------C-AAAT--AT-----GT--TTG-C----ACATCTAA-------AG-----GCAAA-GCA-T-CCT---AGC-------A--C----A------ATT-C---AAA--CTT--C----GGAAAAAAA-C-A-----CTC-CAAT-C----ATG------C--ATC-GT-----T----------T-------GTATAC-CCG-TAT-AATTCGAAGACT---T---TCCGGTGT-C---TC--------------------CTCTGATGAT-TG-AG-TACAA-----AG-CAA---GAAT---TT----G-AAAA---TTCGCCTATTCTC--GCT--G--A--T-A-T-TGA-GAAAAT-T----T--T----CT----G---------GG-------A-T-A-AAAATG-GCAAAT-----T----ATA----T------A----T-ATCA--G-T--TC-T--ACG-A-C-GGTGA-A-A-GT--A-A-A----
gi|13 : CCTTT-GAATCACCA-CA-GCA-T-GGAAA-----------TACATGTGTATTTCAAAA-GA---GA---ATTA-CA--GT--AAAATTGTAAAATGCGCAA-CTT-G--T---TTGA-----AGAA-TTTGA-----TA-CACT-----G---T--G------------GTAC----------TTC-AAAT--AT-----GT--TTG-T----GCATCTAA-------A------GCAAA-GCA-T-CC----AGC----A-AAC-C----A------GTT-C---AAA--T-T--TTG--GG-GGAGGG-A-A-----CTC-C-AT-T-G--A-G-A----C--ATCAAA-----T----------G-------GTA----CCC-TAG-A--------------------CAGTGC-C---CA--------------------GGCTGA-GA--TG-AGAAACAA-------CCCA--C-AAA---TT----G-TAAA---GTTGCCTATTCTC-AGCT--G--T--T-T-T-TGA-TCTAAT-A-------A----TTT-TCG--C------AA-------A---A-AAAATG-G-AAAT-----------TA----T------G----C-ATTA--G-T--TC-T-GACG-A-T-GGTAA-A-A-GT--cg
gi|14 : -----GCAAA--C--T-CTT----GC----A-AA-------ATT----GTTGC---AAA--C-TTGC----GG-AAAAAG-C-GAGCACCTC-C-GT-CCG--ATG-A----CC-ATC-GT-----T----------TTGTATAAGCAT-CGCCC-TAGGAATGACACGAGT---C---TCGGGTGT-CA--CA--------------------TC---A-GATATGTAG-TATAATCTTAAGTCACGTCAAGAGCGTT----GCAGGA---ATGGCCTATTCTC-AGCT--G--ACCT-G-CGTGACGCAAAT------T--T----TTT-TCT--C------CA-------A-T-A-AAAAAGAGCAAAT-----------TA----T------A----T-ATTA--GTT--TC-TGGACGAA-T-GGTGATA-A-GT--A---------GAAGAATAA
gi|15 : aaatatgattt----A-AA--C----A------GTT-TTAAAAA--C-T--T----TG-GAAAAA-A-A-----CTC-C-GT-C-A--ATC-A----C--ATC-GT-----T----------T-------ACA----------G-AATTCAAAGACT---T---TCTGGTGC-C---CA--------------------GCCCGA-GAT-TG-AA-AACAA-----AGCCAA--CAAAA---CT----G-AAAA---GTCGCCTATCATT-GGTT--GTTAT-T-G-T-TGA-TCAAATAA----T--T----TTT-T----T------GG-------A-C-A-AAAATG-GTAAATT---AT----ATA----T-----------T-AT------T--TC-T-GA
gi|16 : gtttacaccccctatccagaaacaaacaaacgatca-AG--AGA---ATAA-AATAGC--AAAATTATAAAATGT-CAA-------CT---TTGCTGCACGAAA-TT-GA-T-G-CA-CACT-----G--AT--G------------TTAA----------CTC-A-----------------TG-C----GCATCTAA-------AG-----ACAAA-GCT-T-TCT---TGCAAAAA-AA--CATAAA------GGT-A---AAA--C-A--T----GG-GGAAA--T-G-----CTT-T-GT-C-A--ATG-C----C--AAC-GT-----T----------T-------TTAT-C-CAC-TAT-CATTTCAAGAC----T---TCCGGTGC-C---AA--------------------GACAGA-GAT-CG-TT-AATAA-----AACCAaag
gi|17 : tgaattgtttcattCCTTT-GA--CA-CT-CACTCA-T-GGAAA-----------TA--------TTTCAAAA-GA--GAAT--ATTAAGAT-GC--AGAATTGCAAAATGC-CAAGTTT-GACT---TTGATCAGCAGAG-CT-GA-T-G-TA-CAAT-----G--GT--GGTACATGTACATGTAC----------CTC-AAAT--GC-----AT--TTG-C----ACATCTAATTAAATTAG-----GCAAA-TCA-T-CCT---AGT----ATAA--T----A------GTT-C---AAA----------------A--------------TC-C-GT-C-A--ATG-A----CATATC-AT-----T----------T-------Gtag
gi|18 : gccCCTTT-GA--CA-CT-CACTCA-T-GGAAA-----------TA--------TTTCAAAA-GA--GAAT--ATTAAGAT-GC--AGAATTGCAAATTGC-CAAGTTT-GACT---TTGATCAGAAGAAGCT-GAAT-G-TA-CAAT-----G--GT--G------------GTACATGTACATTACTC-AAAT--GC-----AT--TTG-C----ACATCTAATTAAATTAG-----GCAAA-TCA-T-C-T---AGT----A-TA--T----A------GTT-C---AAA------------------------A------TC-C-GT-C-A--ATG-A----CATATC-AT-----T----------T-------G
gi|19 : cgccTTC-GA--CAATA-CGTGCT-T-GGAAA-----------CA--------CTTCAAAA-GA--AAA---GTAG-GTT-GC--AAAATTGTAAAATGA-CA-------ACT---TTATTCGGTGCAA-TT-GG-C-G-TA-CATT-----G--GT--A------------GTAA----------TTG-AACT--AT-----GG--TTG-C----ACATCT-----------------CAAA-GCA----------------A-AT--C----A------GTT-A---AAA--CTT--C----AG-AAGAAG---------CTC-A-GT-C-A--ATG-A----A--ATT-GT-----T----------T-------GTAT-C-C
gi|2 : gccccaCCTTC-GA--CATCA-CACGCA-T-GGAA------------CG--------TTTCAAAA-GA---GA---ATAT-GATTGC--AAAATTGTAAAATTT-CAACTTT---------TGTTTAGCGGAA-TT-GA-C-A-TG-CATT-----G--GT--G------------GTAC----------CTC-AAAT--AT-----GC--TTG-C----ACATCTAC-------AG-----GCAAA-ATA-T-CCT---AGC----A-AA--C----A------GTT-A---AAA--C-T--CTG--GG-GAAAAA-C-------CTC-C-GT-C-T--ATG-A----C--ATC-GT-----TTTTATTCCCAT-------GTAT-T-CCCATAA-AA-TCAAAGATT---C---TCCGATTC-C---CATGGAGAACAATGGCGAATTTGCC----GAT-TG-AG-AACAA-----AGCCAA--CAAAA---CG----G-AGAG---GGCACCTATT------CT--G--T--T-G-T-TTA-TGAAAT-A----A--T----TTT---G--G------GG-------G-C-C-AAAATG-GCAAATT---AT----A----------------------TA--G-T--TC-T-GACG-A-T-GGTGA-A-A-TT--A-A-
gi|20 : ccCGAAT-TT-GA-T-A-CA-CACT-----G--CT--G------------ACAT----------TTT-AAAT--ATACATTGTACTTG-C----ACATTTAA-------AA-----GCAAA-ATA-T-CATTAGAGG----A-AA--T-----------GTT-A---CAA--C-T--C----CA-ATAAAA-C-------CTC-C-GT-C-A--GTG-G----T--ATT-GTAAAACT----------C-------ATGT-C-CTA-TAG-AATGTGAAAACT---T---CCCGGTGC-C---GA--------------------GTCTGA-GAT-TG-
gi|21 : CCTTCCGA--CATCA-CACGCAAT-GGGAC-----------TA--------TTT-AAAA-AA--AGA---ATTA-GAT----------TGCA-------CAAA-----------------GGCTGAA-TT-GA-C-AATAGCACT-----G--GT--GA-----------GTAC-----------TC-AG-T--AT-----AT--TTG-C----ACATCTAA-------CGCAAATGC-AA-GCA-T-CCT---AGC----ACAATTT----A------ATT-C---AAATCC-T--T----AG-AAAAGG-C-A-----CTC-C-Gtaa
gi|22 : cc-GA--CATCGTCACGCA-G-AGAAA-----------TA----------------------GA---ATTA-GA--GC--ACAATTGCAAAATGC-CAAGTTTTGAAT---TTGATCGGCCGAA-TT-GA-T-G-TA-CAAT-----AACGTTAG------------GTAC----------CTCCAAATTTAT-----GT--TTG-C----ACACCCAA-------AG-----GCAAA-GCATT-TCT---AGC----A-AA--A----T------ATT-C---AAA--C-c
gi|23 : tcctaatCCTTC-GA--CATCA-CACGCA-T-GGGAC-----------TA--------TT-AAAAA-AA--AGA---ATTA-GAT-GC----------AAAA-------------------------GGCTGAA-TT-GA-C-A-TA-CACT-----G--GT--A------------GTAC-----------TC-AAGT--AT-----AT--TTG-C----ACATCTAA-------AC-----GCAAA-GCA-T-CCT---AGC----ACAATTT----A------ATT-C---AAAC-C-T--T----AG-AAAAAG-C-A-----CTC-C-GT-C-G--ATG-G----C--at
gi|24 : ccCT---T---TCCAGTGC-C---CATGCA----------------GCCTGA-GAT-TG-AG-AACAA-----AGCCAA--CAAAA---CT----G-AAAA---GTCGCCAATTCTC-AGCT--G--A--T-G-T-TGA-TCAAAT-A----T--A----TTT-T----T------GG-------A-T-A-AAAATG-GCAAATT---AT----ACA-----------A--------TA--G-T--TC-T-GATC-A-T-GGTGA-A-A-GT--A-A-A----GAA
gi|25 : cGTCTATTCTC-AGCT--G--A--T-A-T-TAA-GC--AT-T----T--T----TTT-TTG--T-------G-------C-T-ATGAATTG-GCAAATT---GT----CTG----T------C----TAATTGATG-T--TC-T-GAAGAA-T-GGTGA-A-A-GTCGA-ACA----GAAATAAta
gi|26 : ccttcaTCACCTATTCTC-AGCT--G--G--T-A-T-TGA-GCAATT-T----T--T----TTT-TCG--T------CG-------A-T-A-AAAATG-GCAAATTGCGAT----ATACATGT------G----T-ATTA--G-T--TC-T-GAAA-A-T-GGTGA-A-A-GT--C-A-A----GAA
gi|27 : cctTCACCTATTCTC-AGCT--G--A--T-G-T-TGA-G-GAAT-T----T--T----TTT-TCG--T------GG-------A-T-T-AAAATT-ACAAATTTA-ATTACGATA----T------A----T-ATTA--G-T--TC-T-GAAA-A-T-TGTGA-A-A-GT--A-A-A----GAAtaa
gi|28 : ccctACGCA-T-GGAAA-----------CA--------TTCCAAAA-GA---GA---AT-----------------GTAAAATGC-CAA-------CT---TTGTTTGGCGGAA-TT-GA-C-G-TA-CATT-----G--AT--G------------GTTC----------CTC-AAAT--AT-----GC--TTG-C----GCATGTAA-------AG-----GCAAA-taa
gi|29 : TCACATATTCTC-AGCT--A--A--C-G-T-TGA-GCAA------------------T-TGG--G------GGGGGGGGGA-T-A--AAATG-GTAAATT---AC----G-A----T------A----T-A-CA--G-T--TC-T-AA-A-A-T--GTGA-A-A-GT--A-A-A----GAATGAA
gi|3 : cgccctTTC-GA--CATCA-CACGCA-T-GGAAA-----------TA--------T----AAA-AA--AAA---AT-A-GAT-GC--AAAA--------------AGTTT-TACT---TTTATCGACGGAA-TT-GA-C-G-CA-CACT-----G--GT--ATA----------GTAC----------CTC-AAAT--AT-----GT--TTG-C----ACATCTAA-------AG-----ACAAA-ATA-T-CCT---AGC----ACAA--T----ACATCTAATT-C---AAA--C-TT-C----GG-AAAAAA-C-A-----CTT-C-AT-T-G--ATG-A----C--ATC-GT-----T----------T-------ATAT-C-CCC-TAG-AATTTGAAGACT---T---TCTGGTGC-T---CA--------------------ATTTGA-GAT-TG-AG-AACAT-----AACCAA--CAAAA---CC----G-AAAA---TTAATCTATTCTC-ATTA--G--A--T-G-T-TTA-GCAAAT-A----T--G----TTT---G---------AG-------A-T-A-AAAATG-GGAAAT-----------TA----T------A----T-ATTA--G-T--TC-T-GACG-A-T-GATGA-A-A-GT--A-A-A----GAAc
gi|30 : ccaCTTTC-AA--TATTA-CATGCA-T-GGAAA-----------CA--------TATTAAAA-GA--GGATTAAGTA-GATTGC--AAAATTGTAAAATGC-CAA-------CT---TAGTTCGGCGGAA-TT-GA-C-G-TA-CATT-----T--GT--t
gi|31 : cTCACCTATTCTC-AGCT--G--A--T-A-T-TGA-GC---C-T----T--T----TTT-TCG--T------CG-------A-TTA-AAAATG-GTAAATT---GG----G-A----T------A----T-AATA--G-T--TC-T-GGAA-A-T-GGTGA-A-A-GT--C-A-A----GAAATAAa
gi|32 : ccctTCATCTGTTCTC-AGCC--G--A--T-A-T-TGA-GCAA-T-T----T--T----TTT-TCG--T------GG-------A-T-A-AAAATG-ACAAATT---AC----G-A----T------A----T-ATTA--A-T--TCTT-GA-A-A-T-GGTGA-C-A-GT--A-A-A----GAA
gi|33 : ctCTATTCTC-AGCT--G--A--T-A-T-TGA-GC---C-T----T--T----TTT-TCG--T------CG-------ATT-A-AAAATG-GTAATTG---GC----A-A----T------A----T-AATA--G-T--TT-G-AAAA-A-T-GGTGA-A-A-GTC-A-A-A----GAAAtaaa
gi|34 : ccttcaTCACCTATTCTC-AGCTTTG--A--T-A-T-TGA-G------G----T--T----TTTATCG--T------CA-------A-T-A-TAAATG-GCAAATTGCAAT----AAA----T------A------AATA--G-T--TT-T-GAAA-A-T-GGTGC-A-A-GT--C-A-A----ta
gi|35 : tccctTCACATATTCTC-AGCT--G--A--C-G-T-TGA-GCATAT-T----T--C----TTT-TCG--T------GG-------A-T-A-AAAATG-GCAAATT---AC----G-A----T------A----T-ATCA--G----TC-T-GAAA-A-T-GGTGA-A-A-GT--A-A-A----GAAA
gi|36 : TCCTC-AGCT--G--A--T-GTT-TGA-GC---T-T----T--T----TTT-TTT--TTCCTTCGA-------A-T-A-AAAATG-GCAAATT---A--------------------------ATTA--GTT--TC-T-GAAA-ATT-GGTGA-A-ATAT--A-A-A----GAAa
gi|37 : catCGCCCATCACT-AGCT--C--A--T-G-T-TGA-GCA--T-G----T--T----TTT-TCG--T------GG-------A-G-A-AAAATG-GCAAATT---AC----A-A----T------A----T-ATTA--G-T--TC-T-GAAA-A-T-GGTAA-A-A-GT--A-A-A----GAAtaaa
gi|38 : CGCCT---CTT-AGCT--G--A--T-G-T-TGA-GAAAAA-AAAAAT--T----T----CG--A------GG-------A-T-A-AAAATG-GCAA-TT---AC----G-A----T------A----T-ATTA--G-T--TC-T-GCAA-A-T-GGTGA-A-A-AT--A-A-A----GAAtaaa
gi|39 : CTATTCTC-AGCT--G-----C-G-T-TGA-GCATAT-T----C--T----TTT-CTG--T------GG-------A-T-A-AAAATG-GCAAAAT----T----ACA----T------A----T-ATCA--G----TC-T-GAAA-A-T--GTGA-ACA-GT--A-A-A----GAtaaa
gi|4 : tctaCCTTC-GA--CATCA-AATGCA-T-GGGAA-----------CA--------TTTCAAAA-GAGAAGA---ATT--------------TTGCAAA-----CA--------CT---GTGTTAGGCGGAT-TT-GA-C-G-TA-CATTCGAACG--GT--A------------GTAC----------CTG-ACCT--AT-----GG--CTG-C----GTATCTAA-------AT-----ACAAA-ACA-T-CCC---ACCG---A-AA--G----A------GTT-TTA-AAA--C-T--C----GGAGGGAA----A-----CTC-T-GT-C-A--GTG-A----C--ATC-GT-----T----------T-------ATAT-C-CCT-TAT-AATTCAAAGACT---C---TCCTGTGC-C---CA--------------------GCCCGA-GAT-TG-AT-AACAC-----GGTCAA--CAAAG---CT----G-AAAA---GTCACCTATTCCC-AGGT--G--T--C-G-G-TGA-TCACAT-A----A--T----TTT-T----T------AG-------A-C-A-AAAATA-GCAAGTTAC-AT----GTA----T------A----T-ATTA--G-T--TC-T-AACG-A-T-GGTGC-A-A-Gc
gi|40 : --G--A--TCG-T-TCA-GCATAT-G----TGTT----TTT-TCGGGT------GA-------AGC-G-AAAATG-GCAAAAT---AT----ATA----TCGGCATA----T-ATTA--G-T--TC-T-GAAA-A-T-GTTAA-A-A-GT--ACA-A----c
gi|41 : cCAAAC-A----T--TGGGATTT-TGG--T------AT-------A---A-AAAATG-GCAAATT---AT----ATA----T------AAGTTT-ATTA--G-T--CT-T-GACG-A-T-GGTAA-A-A-GT--A-A-A----GAA
gi|42 : t-----------CA--------TTTCAAAA-----AGA---ATTA-GAT-GC--AAAATTGTATGATGC-CAAGTTT-GACT---TTGACCAGta
gi|43 : ctccctttgacat----TTT-TTG--T------CG-------A-T-A-AAAATG-ACAAATG---GC----A-A----T------A----T-ATTA--G-T--TC-T-GA---A-T-GATtattaa
gi|44 : attgA-CACGCA-T-GGAAA-----------TA--------TTAAAAAAAAA--AGA---ATTA-GAT-GC--AAAATTGCAAAATGC-CAAGTTT-GACT---TTGATCacgtcactataataaatta
gi|45 : AT-T----T--T----TTT-TCG--T------AG-------A-T---AAAATG-GCAAATT---ACG---ATA----C------A----T-A--A--G-T--TT-T-GAAA-A-T-GCTGA-A-A-GT--A-A-
gi|46 : gc----T--T----TTT-TCG--T-----------------T-A-AAAATG-GCAA-------T-----TA----T------G----T-ATTA--G-T--TC-T-GACG-A-TGGGTGA-A-A-GT--A-A-A----GAA
gi|47 : -AAATTG-GTAAATT---ATT---ATA----T------A----G-ATCA--G-T--TC-T-GAAA-A-A-GGTGA-A-A-GT--A-A-A----GAATGAAtaa
gi|48 : tttCCTTC-GA--CATCA-CATGCA-T-GGAAA-----------CA--------TTTTAAAA-AA--AAC---ATTA-GAT-GC--AAAATc
gi|49 : cCCTTC-GA--CATCA-CATTCA-C-GGAAA-----------TA--------TTTC-ATA-AA--AGA---ATTA-G
gi|5 : tccCCTTC-GA--CATCA-CACATA-T-GGAAA-----------CA--------TTCTAAAA-GA----------T----T-GC--AAAATTGGAAAATGC-CAA-------CT---TTGTTCGGCGGAA-TT-GA-C-G-TA-CATT-----G--GT--A------------GTTC----------CTC-AAAT--AT-----GC--TTG-C----ACTTCTAA-------AG-----GCAAA-GCT-T-CCT---A-CTG--A-AA--C----A------G---A---AAA--C-TTCC----AA-AAAAAA-CAA-----CTC-C-AT-C-A--GTG-A----C--AGC-GT-----T----------G-------GTAT-C-CCC-TAG-ATTTCAAAGACT---T---TCCGGTGC-T---CA--------------------GCC--------TG-AG-AACAA-----AGCCAA--CAAAA---CT----A-AAAA---GTCGCCTTTTCTC-GGTT--G--A--T-C-T-TGA-TCAAATAA----T--T----TTT-T----T------GG-------A-C---AAAATG-GCAAATT---GT----ATAGCC-T------A----T-ATTA--G-T--TC-T-GACA-A-T-AGTGA-A-A-GC--A-A-
gi|50 : gccAA--CAACA---CT----G-AAAA---GTCGCCTATTCTC-GGT---------T-G-T-TGA-TCAAAT-T----T--
gi|51 : T----ACA----T------A----C-TTTA--G-T--TC-T-GAAA-A-T-GTTGA-A-A-GT--C-A-A----GAA
gi|52 : TCACATATTCTC-AGCT--A--A--C-G-T-TGT-GCAtaa
gi|6 : cctTCA-CACGCA-T-GGAAA-----------CA--------TTCC-AAA-AG--AGA---AT---G------------TATAAAATGC-CA-------ACT---TTGTTCGGCGGAT-TT-GA-CTG-TA-CATT-----G--GC--GA-----------GTTC----------CTC-AAAT--AT-----GC--TTGCC----GCATCTAA-------AG-----GCAAATGCA-T-ACT---AACA---A-AA--C----AG-----GTT-A---AAA--C-T--TCGAAGG-GAAAAA-A-A-----CTCTC-CT-C-A--ATG-A----C--ATT-G------T----------T-------GTAT-C-CCC-TAG-TATCGAAAGACT---T---TCCAATCCAC---AA--------------------GCTTGA-GAT-TG-AG-AACAA-----GGTCAA--CAAAA---CT----G-AAAAAAGAACG-CTATTCTCAAGCT--G--T--T-G-T-TGA-TCAAAT-A----A--A----TTT-TC---T------GA-------A-C---AAAATG-GCAAATT---AT----AT-----------------T-ATTA--G-TTCTC-T-GACG-A-T-GGTGA-A-A-GC--A-tttggggg
gi|7 : agtATCA-CACGTA-T-GGGGA-----------TA--------TTT--AAA-AA--AAA---AT-A-GAT-GT--AAAATTCTAAAATGC-CAAATTT-GACT---TTGATCGACGGAA-TT-GA-C-G-TA-CACT-----G--GC--G------------GTAA----------CTC-AAAC--AA-----AC--------------TCTAA-------AG-----GCAAA-ACA-T-GCT---ATCA---A-AA--T----A------ATT-C---AAA--C-TG-C----GG-AAAAAG-C-A-----CCC-C-AT-T-G--ATG-A----C--ACT-G------T----------T-------GAAT-T-CCC-TTT-AATTCAAA---T---TATGTCTGGTGC-C---CA--------------------ACGTTA-GAT-TG-AG-AACAA-----AGCCAA--CAAAA---CTTACCA-AAAA---ATCGC---TTTAC-AGCT--G--A--T-A-T-TGA--CCAAT-G----T--T----TTT-T-G--T-------A-------A-T-A-TAAATG-GCAACT-----------TA----T------A----C-ATTA--C-T--TT-T-GACG-A-T-GGTGA-A-A-GT--G-A-G----GAA
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gi|9 : gcttgaccatcacacacatggaaaatacatgtgtgtatttcgaaaaggaaaatacaagtaaacttgtaaaatgccacgtttgtttggaagaattgtgtacacttgtcggtactccgaaagatgtttgtgctggcatctaaagcaaagcatccctagcaaaccagtttcaacatttttgggggggggaacgtcgcattgattgacatgtcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCCTTC-AA--CATCA-CACGCA-T-GGAAA-----------TA--------TTTT-AAA-AA--ACA---ATTA-GAT-GCAGAAAGTTTTAA----------TTC-AA-----TTGATCATCGGAA-TT-GA-T-G-TA-CA-----------------------------------------CTC-AAAT--AT-----GT--TTG-C----ACATCTAA-------AG-----GCAAA-GCA-T-CCT---AGC-------A--C----A------ATT-C---AAA--CTT--C----GG-AAAAAA-C-A-----CTC-C-AT-C-A--ATG-A----C--ATC-GT-----T----------T-------GTAT-A-CCC-TAT-AATTCGAAGACT---T---TCCGGTGT-C---CA--------------------ATCTGA-GAT-TG-AG-TACAA-----AGCCAA--GAAAA---TT----G-AAAA---TTCGCCTATTCTC-AGCT--G--A--T-A-T-TGA-GCAAAT-A----T--T----TTC-T-G---------GG-------A-T-A-AAAATG-GCAAAT-----T----ATA----T------A----T-ATCA--G-T--TC-T-TACG-A-C-GGTGA-A-A-GT--A-A-A----aatt
Alignments
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Reference ( family-276 ) : CCTTC-GA--CATCA-CACGCA-T-GGAAA-----------CA--------TTTCAAAA-AA--AGA---ATTA-GAT-GC--AAAATTGTAAAATGC-CAAGTTT-GACT---TTGNTCGGCGGAA-TT-GA-C-G-TA-CACT-----G--GT--G------------GTAC----------CTC-AAAT--AT-----GT--TTG-C----GCATCTAA-------AG-----GCAAA-GCA-T-CCT---AGC----A-AA--C----A------GTT-C---AAA--C-T--C----GG-GAAAAG-C-A-----CTC-C-GT-C-G--ATG-A----C--ATC-GT-----T----------T-------GTAT-C-CCC-TAG-AATTCGAAGACT---T---TCCGGTGC-C---CA--------------------GCCTGA-GAT-TG-AG-AACAA-----AGCCAA--CAAAA---CT----G-AAAA---GTCGCCTATTCTC-AGCT--G--A--T-G-T-TGA-GCAAAT-N----T--T----TTT-TCG--T------GG-------A-T-A-AAAATG-GCAAATT---AT----ATA----T------A----T-ATTA--G-T--TC-T-GACG-A-T-GGTGA-A-A-GT--A-A-A----GAAAGAATAA
gi|1 : CCTTC-GA--CATCA-CATGCA-T-GGAAA-----------CA--------TTTTAAAA-AA--AGA---ATTA-GAT-GC--AAAATTGTAAAATGC-CAAGTTT-GACT---TTGATCAGCGGAA-TT-GA-C-G-TA-TACT-----T--GT--G------------GTAC----------CTC-AAAT--AT-----GT--TTG-C----ACATCTAA-------AG-----GCAAA-GCA-T-CTT---AGC----A-TA--T----A------GTT-C---AAA--T-T--C----GG-GAAATG-C-A-----TTC-C-GT-C-G--ATG-A----C--ATC-GT-----T----------T-------GTAT-C-CCC-TAG-AATTCGAAGACT---T---TCCGGTGT-C---CG--------------------ACCTGA-GAC-TG-AG-AACCA-----AGCCAA--CAAAA---CC----G-AAAA---TTCGCCTATTCTC-AGCT--G--A--T-G-T-TGA-GCAAAT-A----T--T----TTT-TGG--G------AA-------A-T-A-AATATG-GCAAATT---AT----ATA----T------A----T-ATTA--G-C--TC-T-GACG-A-T-GGTGA-A-A-GT--A-G-ATATTAAAAGAATAA
gi|10 : CTTC-AA--CATCA-TAC-CA-T-GGAAA-----------TA--------TTTTAAAA-AA--C-A---ATTA-GAT-GC--AGAA--------------AGTTT-TATTCAATTGATCATCGGAA-TT-GA-T-G-TA-CACT-----------------------------------------C-AAAT--AT-----GT--TTG-C----ACATCTAA-------AG-----GCAA--GCA-T-CCT---AGC----A-----C----A------ATT-C---AAA--T-T--C----GG-AAAAAAAC-A-----CTC-C-ATGC-ATCATG-A----C--ATC-GT-----T----------T-------GTAT-A-CCC-AAT-AATTCGAAGACT---T---TCCGGTGT-CTC-CA---------------------TCTGT-GAT-TG-AG-TACAA-----AGC-AA---GAAT---TT----G-AAAA---TTCGCCTATTCTC-AGCT--G--A--T-A-T-TGA-GCAAAT-A----T--T----TTC-T-G---------GG-------A-T-A-AAAATG-GCA-------AT----ATA----T------A----T-ATCA--GTT--TC-T-TACG-A-C-GGTGA-A-A-GT--A-A-A----
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gi|30 : ccaCTTTC-AA--TATTA-CATGCA-T-GGAAA-----------CA--------TATTAAAA-GA--GGATTAAGTA-GATTGC--AAAATTGTAAAATGC-CAA-------CT---TAGTTCGGCGGAA-TT-GA-C-G-TA-CATT-----T--GT--t
gi|31 : cTCACCTATTCTC-AGCT--G--A--T-A-T-TGA-GC---C-T----T--T----TTT-TCG--T------CG-------A-TTA-AAAATG-GTAAATT---GG----G-A----T------A----T-AATA--G-T--TC-T-GGAA-A-T-GGTGA-A-A-GT--C-A-A----GAAATAAa
gi|32 : ccctTCATCTGTTCTC-AGCC--G--A--T-A-T-TGA-GCAA-T-T----T--T----TTT-TCG--T------GG-------A-T-A-AAAATG-ACAAATT---AC----G-A----T------A----T-ATTA--A-T--TCTT-GA-A-A-T-GGTGA-C-A-GT--A-A-A----GAA
gi|33 : ctCTATTCTC-AGCT--G--A--T-A-T-TGA-GC---C-T----T--T----TTT-TCG--T------CG-------ATT-A-AAAATG-GTAATTG---GC----A-A----T------A----T-AATA--G-T--TT-G-AAAA-A-T-GGTGA-A-A-GTC-A-A-A----GAAAtaaa
gi|34 : ccttcaTCACCTATTCTC-AGCTTTG--A--T-A-T-TGA-G------G----T--T----TTTATCG--T------CA-------A-T-A-TAAATG-GCAAATTGCAAT----AAA----T------A------AATA--G-T--TT-T-GAAA-A-T-GGTGC-A-A-GT--C-A-A----ta
gi|35 : tccctTCACATATTCTC-AGCT--G--A--C-G-T-TGA-GCATAT-T----T--C----TTT-TCG--T------GG-------A-T-A-AAAATG-GCAAATT---AC----G-A----T------A----T-ATCA--G----TC-T-GAAA-A-T-GGTGA-A-A-GT--A-A-A----GAAA
gi|36 : TCCTC-AGCT--G--A--T-GTT-TGA-GC---T-T----T--T----TTT-TTT--TTCCTTCGA-------A-T-A-AAAATG-GCAAATT---A--------------------------ATTA--GTT--TC-T-GAAA-ATT-GGTGA-A-ATAT--A-A-A----GAAa
gi|37 : catCGCCCATCACT-AGCT--C--A--T-G-T-TGA-GCA--T-G----T--T----TTT-TCG--T------GG-------A-G-A-AAAATG-GCAAATT---AC----A-A----T------A----T-ATTA--G-T--TC-T-GAAA-A-T-GGTAA-A-A-GT--A-A-A----GAAtaaa
gi|38 : CGCCT---CTT-AGCT--G--A--T-G-T-TGA-GAAAAA-AAAAAT--T----T----CG--A------GG-------A-T-A-AAAATG-GCAA-TT---AC----G-A----T------A----T-ATTA--G-T--TC-T-GCAA-A-T-GGTGA-A-A-AT--A-A-A----GAAtaaa
gi|39 : CTATTCTC-AGCT--G-----C-G-T-TGA-GCATAT-T----C--T----TTT-CTG--T------GG-------A-T-A-AAAATG-GCAAAAT----T----ACA----T------A----T-ATCA--G----TC-T-GAAA-A-T--GTGA-ACA-GT--A-A-A----GAtaaa
gi|4 : tctaCCTTC-GA--CATCA-AATGCA-T-GGGAA-----------CA--------TTTCAAAA-GAGAAGA---ATT--------------TTGCAAA-----CA--------CT---GTGTTAGGCGGAT-TT-GA-C-G-TA-CATTCGAACG--GT--A------------GTAC----------CTG-ACCT--AT-----GG--CTG-C----GTATCTAA-------AT-----ACAAA-ACA-T-CCC---ACCG---A-AA--G----A------GTT-TTA-AAA--C-T--C----GGAGGGAA----A-----CTC-T-GT-C-A--GTG-A----C--ATC-GT-----T----------T-------ATAT-C-CCT-TAT-AATTCAAAGACT---C---TCCTGTGC-C---CA--------------------GCCCGA-GAT-TG-AT-AACAC-----GGTCAA--CAAAG---CT----G-AAAA---GTCACCTATTCCC-AGGT--G--T--C-G-G-TGA-TCACAT-A----A--T----TTT-T----T------AG-------A-C-A-AAAATA-GCAAGTTAC-AT----GTA----T------A----T-ATTA--G-T--TC-T-AACG-A-T-GGTGC-A-A-Gc
gi|40 : --G--A--TCG-T-TCA-GCATAT-G----TGTT----TTT-TCGGGT------GA-------AGC-G-AAAATG-GCAAAAT---AT----ATA----TCGGCATA----T-ATTA--G-T--TC-T-GAAA-A-T-GTTAA-A-A-GT--ACA-A----c
gi|41 : cCAAAC-A----T--TGGGATTT-TGG--T------AT-------A---A-AAAATG-GCAAATT---AT----ATA----T------AAGTTT-ATTA--G-T--CT-T-GACG-A-T-GGTAA-A-A-GT--A-A-A----GAA
gi|42 : t-----------CA--------TTTCAAAA-----AGA---ATTA-GAT-GC--AAAATTGTATGATGC-CAAGTTT-GACT---TTGACCAGta
gi|43 : ctccctttgacat----TTT-TTG--T------CG-------A-T-A-AAAATG-ACAAATG---GC----A-A----T------A----T-ATTA--G-T--TC-T-GA---A-T-GATtattaa
gi|44 : attgA-CACGCA-T-GGAAA-----------TA--------TTAAAAAAAAA--AGA---ATTA-GAT-GC--AAAATTGCAAAATGC-CAAGTTT-GACT---TTGATCacgtcactataataaatta
gi|45 : AT-T----T--T----TTT-TCG--T------AG-------A-T---AAAATG-GCAAATT---ACG---ATA----C------A----T-A--A--G-T--TT-T-GAAA-A-T-GCTGA-A-A-GT--A-A-
gi|46 : gc----T--T----TTT-TCG--T-----------------T-A-AAAATG-GCAA-------T-----TA----T------G----T-ATTA--G-T--TC-T-GACG-A-TGGGTGA-A-A-GT--A-A-A----GAA
gi|47 : -AAATTG-GTAAATT---ATT---ATA----T------A----G-ATCA--G-T--TC-T-GAAA-A-A-GGTGA-A-A-GT--A-A-A----GAATGAAtaa
gi|48 : tttCCTTC-GA--CATCA-CATGCA-T-GGAAA-----------CA--------TTTTAAAA-AA--AAC---ATTA-GAT-GC--AAAATc
gi|49 : cCCTTC-GA--CATCA-CATTCA-C-GGAAA-----------TA--------TTTC-ATA-AA--AGA---ATTA-G
gi|5 : tccCCTTC-GA--CATCA-CACATA-T-GGAAA-----------CA--------TTCTAAAA-GA----------T----T-GC--AAAATTGGAAAATGC-CAA-------CT---TTGTTCGGCGGAA-TT-GA-C-G-TA-CATT-----G--GT--A------------GTTC----------CTC-AAAT--AT-----GC--TTG-C----ACTTCTAA-------AG-----GCAAA-GCT-T-CCT---A-CTG--A-AA--C----A------G---A---AAA--C-TTCC----AA-AAAAAA-CAA-----CTC-C-AT-C-A--GTG-A----C--AGC-GT-----T----------G-------GTAT-C-CCC-TAG-ATTTCAAAGACT---T---TCCGGTGC-T---CA--------------------GCC--------TG-AG-AACAA-----AGCCAA--CAAAA---CT----A-AAAA---GTCGCCTTTTCTC-GGTT--G--A--T-C-T-TGA-TCAAATAA----T--T----TTT-T----T------GG-------A-C---AAAATG-GCAAATT---GT----ATAGCC-T------A----T-ATTA--G-T--TC-T-GACA-A-T-AGTGA-A-A-GC--A-A-
gi|50 : gccAA--CAACA---CT----G-AAAA---GTCGCCTATTCTC-GGT---------T-G-T-TGA-TCAAAT-T----T--
gi|51 : T----ACA----T------A----C-TTTA--G-T--TC-T-GAAA-A-T-GTTGA-A-A-GT--C-A-A----GAA
gi|52 : TCACATATTCTC-AGCT--A--A--C-G-T-TGT-GCAtaa
gi|6 : cctTCA-CACGCA-T-GGAAA-----------CA--------TTCC-AAA-AG--AGA---AT---G------------TATAAAATGC-CA-------ACT---TTGTTCGGCGGAT-TT-GA-CTG-TA-CATT-----G--GC--GA-----------GTTC----------CTC-AAAT--AT-----GC--TTGCC----GCATCTAA-------AG-----GCAAATGCA-T-ACT---AACA---A-AA--C----AG-----GTT-A---AAA--C-T--TCGAAGG-GAAAAA-A-A-----CTCTC-CT-C-A--ATG-A----C--ATT-G------T----------T-------GTAT-C-CCC-TAG-TATCGAAAGACT---T---TCCAATCCAC---AA--------------------GCTTGA-GAT-TG-AG-AACAA-----GGTCAA--CAAAA---CT----G-AAAAAAGAACG-CTATTCTCAAGCT--G--T--T-G-T-TGA-TCAAAT-A----A--A----TTT-TC---T------GA-------A-C---AAAATG-GCAAATT---AT----AT-----------------T-ATTA--G-TTCTC-T-GACG-A-T-GGTGA-A-A-GC--A-tttggggg
gi|7 : agtATCA-CACGTA-T-GGGGA-----------TA--------TTT--AAA-AA--AAA---AT-A-GAT-GT--AAAATTCTAAAATGC-CAAATTT-GACT---TTGATCGACGGAA-TT-GA-C-G-TA-CACT-----G--GC--G------------GTAA----------CTC-AAAC--AA-----AC--------------TCTAA-------AG-----GCAAA-ACA-T-GCT---ATCA---A-AA--T----A------ATT-C---AAA--C-TG-C----GG-AAAAAG-C-A-----CCC-C-AT-T-G--ATG-A----C--ACT-G------T----------T-------GAAT-T-CCC-TTT-AATTCAAA---T---TATGTCTGGTGC-C---CA--------------------ACGTTA-GAT-TG-AG-AACAA-----AGCCAA--CAAAA---CTTACCA-AAAA---ATCGC---TTTAC-AGCT--G--A--T-A-T-TGA--CCAAT-G----T--T----TTT-T-G--T-------A-------A-T-A-TAAATG-GCAACT-----------TA----T------A----C-ATTA--C-T--TT-T-GACG-A-T-GGTGA-A-A-GT--G-A-G----GAA
gi|8 : aa--CATCA-CACACA-T-GGAAAATACATGTGTGTA--------TTTCGAAA-AG--GAA---AATA-CAA-GT--AAACTTGTAAAATGC-CACGTTT-G--T---TT----GGAAGAA-TT-G--T-G-TA-CACT-----T--GTC-G------------GTAC----------TCCGAAAG--AT-----GT--TTG-TGCTGGCATCTAA-------A------GCAAA-GCA-TCCCT---AGC----A-AAC-C----A------GTT-T---CAA--C-
gi|8 : gcttgac-A-----CTC-C-AT-T-G--ATG---------------------------------------GTAT-C-CC--TAG-AA-------------------CAGTGT-C---CA--------------------GTCTGA-GAT-TG-AG-AACGA-----AGCCCA--CAAAA---TT----G-TAAA---GTTGCCTATTTTC-AGCT--G--T--T-T-T-TGA-TCTAAT-atttttgggggggggaacgtcgcattgattgacatgtcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactccattgatggtatccctagaacagtgtccagtctgagattgagaacgaagcccacaaaattgtaaagttgcctattttcagctgtttttgatctaataatt
gi|9 : gcttgaccatcacacacatggaaaatacatgtgtgtatttcgaaaaggaaaatacaagtaaacttgtaaaatgccacgtttgtttggaagaattgtgtacacttgtcggtactccgaaagatgtttgtgctggcatctaaagcaaagcatccctagcaaaccagtttcaacatttttgggggggggaacgtcgcattgattgacatgtcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCCTTC-AA--CATCA-CACGCA-T-GGAAA-----------TA--------TTTT-AAA-AA--ACA---ATTA-GAT-GCAGAAAGTTTTAA----------TTC-AA-----TTGATCATCGGAA-TT-GA-T-G-TA-CA-----------------------------------------CTC-AAAT--AT-----GT--TTG-C----ACATCTAA-------AG-----GCAAA-GCA-T-CCT---AGC-------A--C----A------ATT-C---AAA--CTT--C----GG-AAAAAA-C-A-----CTC-C-AT-C-A--ATG-A----C--ATC-GT-----T----------T-------GTAT-A-CCC-TAT-AATTCGAAGACT---T---TCCGGTGT-C---CA--------------------ATCTGA-GAT-TG-AG-TACAA-----AGCCAA--GAAAA---TT----G-AAAA---TTCGCCTATTCTC-AGCT--G--A--T-A-T-TGA-GCAAAT-A----T--T----TTC-T-G---------GG-------A-T-A-AAAATG-GCAAAT-----T----ATA----T------A----T-ATCA--G-T--TC-T-TACG-A-C-GGTGA-A-A-GT--A-A-A----aatt
blockSeqs : C AT T A A ATACATGTGTG CATGTGTA TA A GAAG TTA TAA A AG T CG AGTTTTATTCAA A G T AT A G C CGAACG GGTACATGTACAT ATGTACATTA C TT ACATT AC C GCTGG TTAAATT CAAAT T T C TAG AAAAAAACATAAA TTAA CTTCGAA AA GCGAGCAC T A G ATC TATTCC AT A AAAAC TTTATTCCCAT AC A GG T G CAGC A AGG TGGAGAACAATGGCGAATTT T A T A TCTTA GT GCG TACC C AAGA A TT TTAT C T G C AAAAA GT GGGA A TTTTCCTTCG GGGGGGG T C T A TTAATTACGAT CATG CGGCAT AGTT A AT T TC T G CGA T G T C T CG C C .
blockSeqs : . . . . . . . CA . AG T TAA T . T T AGTTTTATTCAA T . . CT . . T AAC TAG . G . . . . A TTAAATT . . . . . ACAATACATCTA TTA CTCCAG AG AACA . . . CG A AT . . TTGTATAA CG . T T A TATG . TC TGCA . . . . . . . . . T . . ACC . . . . AA . . . CGGGTG . G T . . TGCGATAT GCC . . . . T . . . AGA . . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . . . TA . GA T TA T . T T AGTTTTGAAT A . . T . . C G ATA . . . . . . G . . . . . . ACAATTTA GC TTTTG A ACAA . . . G A C . . T A . T T G T . A . . . . . . . . . . G . . A . . . . AA . . . CGCA . . . . . TGCAATAA . . . . . T . . . CG . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . CA . GA . AA . . T C AGTTTGACT A . . C . . C G GA . . . . . . A . . . . . . ACAATTTA C CTTGC G ACA . . . G A . . . T C . G T C T . . . . . . . . . . . . T . . T . . . . A . . . CTCC . . . . . TACATGT . . . . . . . . . CA . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . CA . AA . TA . . T C AGTTTGACT C . . T . . C G GA . . . . . . G . . . . . . TGAAACA A CTCTG G GAA . . . A A . . . T C . G T A C . . . . . . . . . . . . G . . A . . . . A . . . CGTC . . . . . TACGAT . . . . . . . . . CG . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . CA . AG . TA . . T A AGTTTTACT A . . T . . A G CG . . . . . . G . . . . . . AAAACAG C TCCTT A AAA . . . A C . . . G T . T T C T . . . . . . . . . . . . A . . T . . . . T . . . CGTG . . . . . TATTAT . . . . . . . . . CG . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . CA . AG . AA . . T T AGTTTGACT A . . T . . A G A . . . . . . A . . . . . . AAACCA C CTTCC G GCA . . . A A . . . T C . A T A T . . . . . . . . . . . . G . . T . . . . A . . . GGGG . . . . . TATAT . . . . . . . . . CG . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . CA . AA . AG . . T C AGTTTGACT T . . C . . T G G . . . . . . A . . . . . . AAAATT A CTTC G GCA . . . A A . . . T C . G T G C . . . . . . . . . . . . G . . A . . . . A . . . CGTC . . . . . TATAC . . . . . . . . . TC . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . AA . GG . AT . . T C AATTTGACT T . . C . . T G G . . . . . . A . . . . . . ATAATA C CTTC A ACA . . . A A . . . T C . G T G T . . . . . . . . . . . . G . . A . . . . A . . . CGTG . . . . . TGTCT . . . . . . . . . AA . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . CA . AG . TA . . T C CGTTTGT A . . T . . C G G . . . . . . A . . . . . . GAAAGA C CCTT G AAA . . . T A . . . T C . T T A T . . . . . . . . . . . . T . . G . . . . T . . . CGTC . . . . . TATAT . . . . . . . . . AA . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . TA . AG . TA . . T C ACTTGT T . . C . . C G A . . . . . . A . . . . . . AAAATA A CTTC A GCA . . . A G . . . T C . G T A T . . . . . . . . . . . . G . . A . . . . T . . . CGTC . . . . . TATAT . . . . . . . . . CG . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . CA . AA . TA . . T C ACTTT A . . T . . A G G . . . . . . A . . . . . . AAACCA A CTGC A ACA . . . G G . . . C T . G T A C . . . . . . . . . . . . G . . A . . . . T . . . CGTG . . . . . TGTAT . . . . . . . . . AA . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . CA . AG . TA . . T C TTCAA T . . C . . C G G . . . . . . A . . . . . . AAAAG A CTTC A TG . . . G A . . . T C . T . A T . . . . . . . . . . . . G . . A . . . . A . . . CGTG . . . . . TATAT . . . . . . . . . AA . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . AA . AG . TA . . T C ACT T . . C . . T G A . . . . . . A . . . . . . AAACA C TTC A AC . . . A A . . . T A . G . G T . . . . . . . . . . . . A . . A . . . . T . . . CGAG . . . . . ATAT . . . . . . . . . AA . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . TA . AA . TA . . T C ACT A . . C . . C T G . . . . . . G . . . . . . ATATA C CTT A AC . . . A A . . . G . . T . . T . . . . . . . . . . . . G . . A . . . . T . . . TGTG . . . . . TATA . . . . . . . . . AA . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . TA . GA . TA . . T C ACT A . . C . . T G A . . . . . . A . . . . . . AATCA C CAT G A . . . A A . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . A . . . . T . . . GGTA . . . . . TACG . . . . . . . . . AA . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . CG . AC . TA . . . . ACT T . . C . . T G A . . . . . . G . . . . . . AAACA C CTC A A . . . G A . . . T . . . . . . . . . . A . . . . G . . . TGTC . . . . . TGGG . . . . . . . . . AA . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . C . TA . . . . ACT T . . C . . T G G . . . . . . A . . . . . . AAAAT A CTC A G . . . G A . . . T . . A . . . . T . . . CGTA . . . . . TACG . . . . . . . . . AA . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . C . G . TA . . . . ACT A . . C . . T T . . . . . . . G . . . . . . AAAT A . . A . . . A . . . . . . . A . . . . T . . . GGG . . . . . GGCA . . . . . . . . . AA . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . C . A . . . . ACT A . . T . . C . . . . . . . . A . . . . . . ACA C . . . . . . . . . . . A . . . . G . . . TGT . . . . . TACG . . . . . . . . . CG . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T . G . T . . . . AA . . . T . . C . . . . . . . . . . . . . . . ACA T . . . . A . . . . T . . . CGT . . . . . TACA . . . . . . . . . AA . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . G . T . . . . CT . . . . . . . . . . ACA C . . T . . . . A . . . CTG . . . . . TACG . . . . . . . . . CG . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . G . A . . . . . . . . A . . . . G . . . GG . . . . . TTAC . . . . . . . . . AA . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . G . . . . . . . A . . . . A . . . TG . . . . . GGCA . . . . . . . . . CG . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . A . . . . T . . . GG . . . . . TAT . . . . . . . . . AA . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . T . . . TG . . . . . TAT . . . . . . . . . CA . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . A . . . TG . . . . . TA . . . . . . . . . AA . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . G . . . GA . . . . . TT . . . . . . . . . CG . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . A . . . TA . . . . . T . . . . . . . . . CG . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . TG . . . . . T . . . . . . . . . CG . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . GT . . . . . T . . . . . . . . . A . . . . .
blockSeqs : . . . GG . . . . . T . . . . . . . . . A . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqCons : AGTTTACT***** AAAACA**************** CTTC******** TATAT******* ****
originalCons : CCTTC-GA--CATCA-CACGCA-T-GGAAA-----------CA--------TTTCAAAA-AA--AGA---ATTA-GAT-GC--AAAATTGTAAAATGC-CAAGTTT-GACT---TTGNTCGGCGGAA-TT-GA-C-G-TA-CACT-----G--GT--G------------GTAC----------CTC-AAAT--AT-----GT--TTG-C----GCATCTAA-------AG-----GCAAA-GCA-T-CCT---AGC----A-AA--C----A------GTT-C---AAA--C-T--C----GG-GAAAAG-C-A-----CTC-C-GT-C-G--ATG-A----C--ATC-GT-----T----------T-------GTAT-C-CCC-TAG-AATTCGAAGACT---T---TCCGGTGC-C---CA--------------------GCCTGA-GAT-TG-AG-AACAA-----AGCCAA--CAAAA---CT----G-AAAA---GTCGCCTATTCTC-AGCT--G--A--T-G-T-TGA-GCAAAT-N----T--T----TTT-TCG--T------GG-------A-T-A-AAAATG-GCAAATT---AT----ATA----T------A----T-ATTA--G-T--TC-T-GACG-A-T-GGTGA-A-A-GT--A-A-A----GAAAGAATAA
finalCons : CCTTC-GA--CATCA-CACGCA-T-GGAAA-----------CA--------TTTCAAAA-AA--AGA---ATTA-GAT-GC--AAAATTGTAAAATGC-CAAGTTTACT-----TTGNTCGGCGGAA-TT-GA-C-G-TA-CACT-----G--GT--G------------GTAC----------CTC-AAAT--AT-----GT--TTG-C----GCATCTAA-------AG-----GCAAA-GCA-T-CCT---AGCAAAACA----------------GTT-C---AAACTTC--------GG-GAAAAG-C-A-----CTC-C-GT-C-G--ATG-A----C--ATC-GT-----T----------T-------GTAT-C-CCC-TAG-AATTCGAAGACT---T---TCCGGTGC-C---CA--------------------GCCTGA-GAT-TG-AG-AACAA-----AGCCAA--CAAAA---CT----G-AAAA---GTCGCCTATTCTC-AGCT--G--A--T-G-T-TGA-GCAAAT-N----T--T----TTT-TCG--T------GG-------A-T-A-AAAATG-GCAAATTATAT-------A----T------A----T-ATTA--G-T--TC-T-GACG-A-T-GGTGA-A-A-GT--A-A-A----GAAAGAATAA
Alignments
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lowQualScore : 1 88 7 7 7 66666666666 88888888 88 5 7777 888 888 8 22 1 7 4 111 5555555555555 2 7 999 7 7 0 11111111 444444444444444 0000000000 6 55 55555 55 8 22222 3333333 22222 88 7 7 7 88888 77777777777777 99999 888888 8 99999 22 3333333333 8 6 8 9 5555 9 9 0000 11 2222 0 00000 999999999999999999 888 4 22 6 888888888888888 2222222 2 2 111 88888888888888888888 9 2 2 2 4 99999 22 111 0000 4 3333 3 77 33333 2 2 2 2 4 777777 77 6666 2 444444444444 9999999 4 4 2 2 33333333333333 4444 333333 4444 1 66 4 66 1 1 222 2 2 2 2 2 11 3 4 3333
consensus : CCTTC-GA--CATCA-CACGCA-T-GGAAA-----------CA--------TTTCAAAA-AA--AGA---ATTA-GAT-GC--AAAATTGTAAAATGC-CAA-TTT--ACT---TTGNTCGGCGGAA-TTGA-C-G-TA-CACT-----G--GT--G------------GTAC----------CTC-AAAT--AT-----GT--TTG-C----GCATCTAA-------AG-----GCAAA-GCA-T-C-CTAGC---AAAA--C----A------GTT-C---AAA-C----T-T-C---GG-GAAAAG-C-A-----C-TC-C-GT-C-G--A-TG-A----C--AT----C-GT-----T----------T-------GTAT-C-CCC-TAG-AATTCGAAGACT---T-----------TCC-------GGTG-C-C---CA--------------------GCCTGA-GAT-TG-AG-AACAA-----AGCCAA--CAAAA---CT----G-AAAA---GTCGCCTATTCTC-AGCT--G--A--T-GT-T-GA-GCAAAT-N----T--T----TTT-TCG--T------GG-------A-T-A-AAAATG-GCAAATT---AT----AT--A----T------A----T-ATTA--G-T--TC-T-GACG-A-T-GGTGA-A-A-GT--A-A-A----GAAAGAATAA
Reference ( family-276 ) : CCTTC-GA--CATCA-CACGCA-T-GGAAA-----------CA--------TTTCAAAA-AA--AGA---ATTA-GAT-GC--AAAATTGTAAAATGC-CAAGTTT--ACT---TTGNTCGGCGGAA-TTGA-C-G-TA-CACT-----G--GT--G------------GTAC----------CTC-AAAT--AT-----GT--TTG-C----GCATCTAA-------AG-----GCAAA-GCA-T-C-CTAGC---AAAA--C----A------GTT-C---AAA-C----T-T-C---GG-GAAAAG-C-A-----C-TC-C-GT-C-G--A-TG-A----C--AT----C-GT-----T----------T-------GTAT-C-CCC-TAG-AATTCGAAGACT---T-----------TCC-------GGTG-C-C---CA--------------------GCCTGA-GAT-TG-AG-AACAA-----AGCCAA--CAAAA---CT----G-AAAA---GTCGCCTATTCTC-AGCT--G--A--T-GT-T-GA-GCAAAT-N----T--T----TTT-TCG--T------GG-------A-T-A-AAAATG-GCAAATT---AT----AT--A----T------A----T-ATTA--G-T--TC-T-GACG-A-T-GGTGA-A-A-GT--A-A-A----GAAAGAATAA
gi|1 : CCTTC-GA--CATCA-CATGCA-T-GGAAA-----------CA--------TTTTAAAA-AA--AGA---ATTA-GAT-GC--AAAATTGTAAAATGC-CAAGTTTG-ACT---TTGATCAGCGGAA-TTGA-C-G-TA-TACT-----T--GT--G------------GTAC----------CTC-AAAT--AT-----GT--TTG-C----ACATCTAA-------AG-----GCAAA-GCA-T-C-TTAGC---ATA---T----A------GTT-C---AAA------T-T-C---GG-GAAATG-C-A-----T-TC-C-GT-C-G--A-TG-A----C--AT----C-GT-----T----------T-------GTAT-C-CCC-TAG-AATTCGAAGACT---T-----------TCC-------GGTG-T-C---CG--------------------ACCTGA-GAC-TG-AG-AACCA-----AGCCAA--CAAAA---CC----G-AAAA---TTCGCCTATTCTC-AGCT--G--A--T-GT-T-GA-GCAAAT-A----T--T----TTT-TGG--G------AA-------A-T-A-AATATG-GCAAATT---AT----AT--A----T------A----T-ATTA--G-C--TC-T-GACG-A-T-GGTGA-A-A-GT--A-G-ATATTAAAAGAATAA
gi|10 : CTTC-AA--CATCA-TAC-CA-T-GGAAA-----------TA--------TTTTAAAA-AA--C-A---ATTA-GAT-GC--AGAA------AGT-------TTT--ATTCAATTGATCATCGGAA-TTGA-T-G-TA-CACT-----------------------------------------C-AAAT--AT-----GT--TTG-C----ACATCTAA-------AG-----GCAA--GCA-T-C-CTAGC---A-----C----A------ATT-C---AAA------T-T-C---GG-AAAAAAAC-A-----C-TC-C-ATGC-ATCA-TG-A----C--AT----C-GT-----T----------T-------GTAT-A-CCC-AAT-AATTCGAAGACT---T-----------TCC-------GGTGTC-T---CC--------------------ATCTGT-GAT-TG-AG-TACAA-----AG-CAA---GAAT---TT----G-AAAA---TTCGCCTATTCTC-AGCT--G--A--T-AT-T-GA-GCAAAT-A----T--T----TTC-T-G---------GG-------A-T-A-AAAATG-GCA-------AT----AT--A----T------A----T-ATCA--GTT--TC-T-TACG-A-C-GGTGA-A-A-GT--A-A-A----
gi|11 : TTC-GA--CATCA-CATGCA-T-GGAA------------CA--------CTTCAAAA-GA---GA---ATAA-GAT-G---------GCAAAATGT-CAA-------CT---TTGTTTGGTGGAA-TTGA-C-A-TA-CATT-----G--GT--A------------ATAC----------CTT-TAAT--AT-----GC--TTG-C----GCATCTAA-------AG-----GCAAA-GCA-T-C-CTAGC---AAAA-------G------GTT-A---AAA-C----T-C-CAG-GG-GGAAA----A-----C-TC-C-GT-C-G--A-TGTATTCCC--AT----C-AA-----T----------T-------GCA------------AA-TCAAAGACTCAGC-----------TCC-------GTTG-C-CAGGCA--------------------GTCTGA-GAT-TG-AG-AACAA-----AGCCAA--CAAAA---CG----G-AGAA---GGCGCATATTCTC-AGCT--T--T--T-GT-T-AA-TGAAAT-A----A--T----TTT-T----T------GG-------G-TCA-AAAATG-ACAAAT-----------T--A----T------A----T-ATTA--G-T--TC-T-GACA-A-T-cga
gi|12 : ctcaCTTC-AA--CATCA-CAC-CA-TAGGAAA-----------TA--------TTTTAAAA-AA--C-A---ATTA-GAT-GC--AGAA------AGT-------TTT--ATTCAATTGATCATCGGAA-TTGA-T-G-TA-CACT-----------------------------------------C-AAAT--AT-----GT--TTG-C----ACATCTAA-------AG-----GCAAA-GCA-T-C-CTAGC------A--C----A------ATT-C---AAA-C----T-T-C---GGAAAAAAA-C-A-----C-TC-CAAT-C----A-TG------C--AT----C-GT-----T----------T-------GTATAC-CCG-TAT-AATTCGAAGACT---T-----------TCC-------GGTG-T-C---TC--------------------CTCTGATGAT-TG-AG-TACAA-----AG-CAA---GAAT---TT----G-AAAA---TTCGCCTATTCTC--GCT--G--A--T-AT-T-GA-GAAAAT-T----T--T----CT----G---------GG-------A-T-A-AAAATG-GCAAAT-----T----AT--A----T------A----T-ATCA--G-T--TC-T--ACG-A-C-GGTGA-A-A-GT--A-A-A----
gi|13 : CCTTT-GAATCACCA-CA-GCA-T-GGAAA-----------TACATGTGTATTTCAAAA-GA---GA---ATTA-CA--GT--AAAATTGTAAAATGCGCAA--------C---TTGTTTGAAGAAT-TTGA-----TA-CACT-----G---T--G------------GTAC----------TTC-AAAT--AT-----GT--TTG-T----GCATCTAA-------A------GCAAA-GCA-T-C-C-AGC---AAAC--C----A------GTT-C---AAA-T----T-T-TG--GG-GGAGGG-A-A-----C-TC-C-AT-T-G--A--G-A----C--AT----CAAA-----T----------G-------GTA----CCC-TAG-A----------------------------C-------AGTG-C-C---CA--------------------GGCTGA-GA--TG-AGAAACAA-------CCCA--C-AAA---TT----G-TAAA---GTTGCCTATTCTC-AGCT--G--T--T-TT-T-GA-TCTAAT-A-------A----TTT-TCG--C------AA-------A---A-AAAATG-G-AAAT-----------T--A----T------G----C-ATTA--G-T--TC-T-GACG-A-T-GGTAA-A-A-GT--cg
gi|14 : -----GCAAA--C--T-C-TT-GC---AAAA--T----T------GTTGC---AAA-C----T-TGC---GG-AAAAAG-C-GAGCACC-TC-C-GT-CCG--A-TG-A----CC-AT----C-GT-----T----------TTGTATAAGCAT-CGCCC-TAGGAATGACACGAGT---C-----------TCG-------GGTG-T-CA--CA--------------------TC---A-GATATGTAG-TATAATCTTAAGTCACGTCAAGAGCGTT----GCAGGA---ATGGCCTATTCTC-AGCT--G--ACCT-GCGT-GACGCAAAT------T--T----TTT-TCT--C------CA-------A-T-A-AAAAAGAGCAAAT-----------T--A----T------A----T-ATTA--GTT--TC-TGGACGAA-T-GGTGATA-A-GT--A---------GAAGAATAA
gi|15 : aaatatgatttATCCAG-------AA-----ACAAA--CA-A-A-CGATC---AAAA--C----A------GTT-TTAAAAA-C----T-T-T---GG-AAAAAA---A-----C-TC-C-GT-C-A--A-TC-A----C--AT----C-GT-----T----------T-------ACA----------G-AATTCAAAGACT---T-----------TCT-------GGTG-C-C---CA--------------------GCCCGA-GAT-TG-AA-AACAA-----AGCCAA--CAAAA---CT----G-AAAA---GTCGCCTATCATT-GGTT--GTTAT-T-GT-T-GA-TCAAATAA----T--T----TTT-T----T------GG-------A-C-A-AAAATG-GTAAATT---AT----AT--A----T-----------T-AT------T--TC-T-GA
gi|16 : gtttacaccccct-AG--AGA---ATAA-AATAGC--AAAATTATAAAATGT-CAA-------CT---TTGCTGCACGAAA-TTGA-T-G-CA-CACT-----G--AT--G------------TTAA----------CTC-A-----------------TG-C----GCATCTAA-------AG-----ACAAA-GCT-T-T-CTTGCAAAAAAA--CATAAA------GGT-A---AAA-C----A-T-G---GG-GAAATG---------C-TT-T-GT-C-A--A-TG-C----C--AA----C-GT-----T----------T-------TTAT-C-CAC-TAT-CATTTCAAGAC----T-----------TCC-------GGTG-C-C---AA--------------------GACAGA-GAT-CG-TT-AATAA-----AACCAaag
gi|17 : tgaattgtttcattCCTTT-GA--CA-CT-CACTCA-T-GGAAA-----------TA--------TTTCAAAA-GA--GAAT--ATTAAGAT-GC--AGAATTGCAAAATGC-CAAGTTTG-ACT---TTGATCAGCAGAG-CTGA-T-G-TA-CAAT-----G--GT--GGTACATGTACATGTAC----------CTC-AAAT--GC-----AT--TTG-C----ACATCTAATTAAATTAG-----GCAAA-TCA-T-C-CTAGT---ATAA--T----A------GTT-C---AAA------------------A---------------TC-C-GT-C-A--A-TG-A----CATAT----C-AT-----T----------T-------Gtag
gi|18 : gccCCTTT-GA--CA-CT-CACTCA-T-GGAAA-----------TA--------TTTCAAAA-GA--GAAT--ATTAAGAT-GC--AGAATTGCAAATTGC-CAAGTTTG-ACT---TTGATCAGAAGAAGCTGAAT-G-TA-CAAT-----G--GT--G------------GTACATGTACATTACTC-AAAT--GC-----AT--TTG-C----ACATCTAATTAAATTAG-----GCAAA-TCA-T-C--TAGT---ATA---T----A------GTT-C---AAA--------------------------A-------TC-C-GT-C-A--A-TG-A----CATAT----C-AT-----T----------T-------G
gi|19 : cgccTTC-GA--CAATA-CGTGCT-T-GGAAA-----------CA--------CTTCAAAA-GA--AAA---GTAG-GTT-GC--AAAATTGTAAAATGA-CA-------ACT---TTATTCGGTGCAA-TTGG-C-G-TA-CATT-----G--GT--A------------GTAA----------TTG-AACT--AT-----GG--TTG-C----ACATCT-----------------CAA------------AGC---AAAT--C----A------GTT-A---AAA-C----T-T-C---AG-AAGAAG---------C-TC-A-GT-C-A--A-TG-A----A--AT----T-GT-----T----------T-------GTAT-C-C
gi|2 : gccccaCCTTC-GA--CATCA-CACGCA-T-GGAA------------CG--------TTTCAAAA-GA---GA---ATAT-GATTGC--AAAATTGTAAAATTT-CAACTTT---------TGTTTAGCGGAA-TTGA-C-A-TG-CATT-----G--GT--G------------GTAC----------CTC-AAAT--AT-----GC--TTG-C----ACATCTAC-------AG-----GCAAA-ATA-T-C-CTAGC----AAA--C----A------GTT-A---AAA-C----TCT-G---GG-GAAAAA-C-------C-TC-C-GT-C-T--A-TG-A----C--AT----C-GT-----TTTTATTCCCAT-------GTAT-T-CCCATAA-AA-TCAAAGATT---C-----------TCC-------GATT-C-C---CATGGAGAACAATGGCGAATTTGCC----GAT-TG-AG-AACAA-----AGCCAA--CAAAA---CG----G-AGAG---GGCACCTATT------CT--G--T--T-GT-T-TA-TGAAAT-A----A--T----TTT---G--G------GG-------G-C-C-AAAATG-GCAAATT---AT----A------------------------TA--G-T--TC-T-GACG-A-T-GGTGA-A-A-TT--A-A-
gi|20 : ccCGAAT-TTGA-T-A-CA-CACT-----G--CT--G------------ACAT----------TTT-AAAT--ATACATTGTACTTG-C----ACATTTAA-------AA-----GCAAA-ATA-T-CATTAGA---GGAA--A----T------GTT-A---CAA-C----T-C-C---AA-TAAAA--C-------C-TC-C-GT-C-A--G-TG-G----T--AT----T-GTAAAACT----------C-------ATGT-C-CTA-TAG-AATGTGAAAACT---T-----------CCC-------GGTG-C-C---GA--------------------GTCTGA-GAT-TG-
gi|21 : CCTTCCGA--CATCA-CACGCAAT-GGGAC-----------TA--------TTT-AAAA-AA--AGA---ATTA-GAT----------TGCA-------CAAA-----------------GGCTGAA-TTGA-C-AATAGCACT-----G--GT--GA-----------GTAC-----------TC-AG-T--AT-----AT--TTG-C----ACATCTAA-------CGCAAATGC-AA-GCA-T-C-CTAGC---ACAATTT----A------ATT-C---AAATC----C-T-T---AG-AAAAGG-C-A-----C-TC-C-Gtaa
gi|22 : cc-GA--CATCGTCACGCA-G-AGAAA-----------TA----------------------GA---ATTA-GA--GC--ACAATTGCAAAATGC-CAAGTTTTGAAT---TTGATCGGCCGAA-TTGA-T-G-TA-CAAT-----AACGTTAG------------GTAC----------CTCCAAATTTAT-----GT--TTG-C----ACACCCAA-------AG-----GCAAA-GCATT-T-CTAGC---AAAA--T----A-------TT-C---AAA-C----c
gi|23 : tcctaatCCTTC-GA--CATCA-CACGCA-T-GGGAC-----------TA--------TT-AAAAA-AA--AGA---ATTA-GAT-GC--A--------AAA-------------------------GGCTGAA-TTGA-C-A-TA-CACT-----G--GT--A------------GTAC-----------TC-AAGT--AT-----AT--TTG-C----ACATCTAA-------AC-----GCAAA-GCA-T-C-CTAGC---ACAATTT----A------ATT-C---AAA-C----C-T-T---AG-AAAAAG-C-A-----C-TC-C-GT-C-G--A-TG-G----C--at
gi|24 : ccCT---T-----------TCC-------AGTG-C-C---CATGCA----------------GCCTGA-GAT-TG-AG-AACAA-----AGCCAA--CAAAA---CT----G-AAAA---GTCGCCAATTCTC-AGCT--G--A--T-GT-T-GA-TCAAAT-A----T--A----TTT-T----T------GG-------A-T-A-AAAATG-GCAAATT---AT----AC--A-----------A--------TA--G-T--TC-T-GATC-A-T-GGTGA-A-A-GT--A-A-A----GAA
gi|25 : cGTCTATTCTC-AGCT--G--A--T-AT-T-AA-GC--AT-T----T--T----TTT-TTG--T-------G-------C-T-ATGAATTG-GCAAATT---GT----CT--G----T------C----TAATTGATG-T--TC-T-GAAGAA-T-GGTGA-A-A-GTCGA-ACA----GAAATAAta
gi|26 : ccttcaTCACCTATTCTC-AGCT--G--G--T-AT-T-GA-GCAATT-T----T--T----TTT-TCG--T------CG-------A-T-A-AAAATG-GCAAATTGCGAT----AT--ACATGT------G----T-ATTA--G-T--TC-T-GAAA-A-T-GGTGA-A-A-GT--C-A-A----GAA
gi|27 : cctTCACCTATTCTC-AGCT--G--A--T-GT-T-GA-G-GAAT-T----T--T----TTT-TCG--T------GG-------A-T-T-AAAATT-ACAAATTTA-ATTACGAT--A----T------A----T-ATTA--G-T--TC-T-GAAA-A-T-TGTGA-A-A-GT--A-A-A----GAAtaa
gi|28 : ccctACGCA-T-GGAAA-----------CA--------TTCCAAAA-GA---GA---AT-----------------GTAAAATGC-CAA-------CT---TTGTTTGGCGGAA-TTGA-C-G-TA-CATT-----G--AT--G------------GTTC----------CTC-AAAT--AT-----GC--TTG-C----GCATGTAA-------AG-----GCAAA-taa
gi|29 : TCACATATTCTC-AGCT--A--A--C-GT-T-GA-GCAA------------------T-TGG--G------GGGGGGGGGA-T-A-AAA-TG-GTAAATT---AC----G---A----T------A----T-AC-A--G-T--TC-T-AA-A-A-T-G-TGA-A-A-GT--A-A-A----GAATGAA
gi|3 : cgccctTTC-GA--CATCA-CACGCA-T-GGAAA-----------TA--------T----AAA-AA--AAA---AT-A-GAT-GC--AAAA------AGT-------TTT--ACT---TTTATCGACGGAA-TTGA-C-G-CA-CACT-----G--GT--ATA----------GTAC----------CTC-AAAT--AT-----GT--TTG-C----ACATCTAA-------AG-----ACAAA-ATA-T-C-CTAGC---ACAA--T----ACATCTAATT-C---AAA-C----T-T-C---GG-AAAAAA-C-A-----C-TT-C-AT-T-G--A-TG-A----C--AT----C-GT-----T----------T-------ATAT-C-CCC-TAG-AATTTGAAGACT---T-----------TCT-------GGTG-C-T---CA--------------------ATTTGA-GAT-TG-AG-AACAT-----AACCAA--CAAAA---CC----G-AAAA---TTAATCTATTCTC-ATTA--G--A--T-GT-T-TA-GCAAAT-A----T--G----TTT---G---------AG-------A-T-A-AAAATG-GGAAAT-----------T--A----T------A----T-ATTA--G-T--TC-T-GACG-A-T-GATGA-A-A-GT--A-A-A----GAAc
gi|30 : ccaCTTTC-AA--TATTA-CATGCA-T-GGAAA-----------CA--------TATTAAAA-GA--GGATTAAGTA-GATTGC--AAAATTGTAAAATGC-CAA-------CT---TAGTTCGGCGGAA-TTGA-C-G-TA-CATT-----T--GT--t
gi|31 : cTCACCTATTCTC-AGCT--G--A--T-AT-T-GA-GC---C-T----T--T----TTT-TCG--T------CG-------A-TTA-AAAATG-GTAAATT---GG----G---A----T------A----T-AATA--G-T--TC-T-GGAA-A-T-GGTGA-A-A-GT--C-A-A----GAAATAAa
gi|32 : ccctTCATCTGTTCTC-AGCC--G--A--T-AT-T-GA-GCAA-T-T----T--T----TTT-TCG--T------GG-------A-T-A-AAAATG-ACAAATT---AC----G---A----T------A----T-ATTA--A-T--TCTT-GA-A-A-T-GGTGA-C-A-GT--A-A-A----GAA
gi|33 : ctCTATTCTC-AGCT--G--A--T-AT-T-GA-GC---C-T----T--T----TTT-TCG--T------CG-------ATT-A-AAAATG-GTAATTG---GC----A---A----T------A----T-AATA--G-T--TT-G-AAAA-A-T-GGTGA-A-A-GTC-A-A-A----GAAAtaaa
gi|34 : ccttcaTCACCTATTCTC-AGCTTTG--A--T-AT-T-GA-G------G----T--T----TTTATCG--T------CA-------A-T-A-TAAATG-GCAAATTGCAAT----AA--A----T------A------AATA--G-T--TT-T-GAAA-A-T-GGTGC-A-A-GT--C-A-A----ta
gi|35 : tccctTCACATATTCTC-AGCT--G--A--C-GT-T-GA-GCATAT-T----T--C----TTT-TCG--T------GG-------A-T-A-AAAATG-GCAAATT---AC----G---A----T------A----T-ATCA--G----TC-T-GAAA-A-T-GGTGA-A-A-GT--A-A-A----GAAA
gi|36 : TCCTC-AGCT--G--A--T-GT-TTGA-GC---T-T----T--T----TTT-TTT--TTCCTTCGA-------A-T-A-AAAATG-GCAAATT---A----------------------------ATTA--GTT--TC-T-GAAA-ATT-GGTGA-A-ATAT--A-A-A----GAAa
gi|37 : catCGCCCATCACT-AGCT--C--A--T-GT-T-GA-GCA--T-G----T--T----TTT-TCG--T------GG-------A-G-A-AAAATG-GCAAATT---AC----A---A----T------A----T-ATTA--G-T--TC-T-GAAA-A-T-GGTAA-A-A-GT--A-A-A----GAAtaaa
gi|38 : CGCCT---CTT-AGCT--G--A--T-GT-T-GA-GAAAAA-AAAAAT--T----T----CG--A------GG-------A-T-A-AAAATG-GCAA-TT---AC----G---A----T------A----T-ATTA--G-T--TC-T-GCAA-A-T-GGTGA-A-A-AT--A-A-A----GAAtaaa
gi|39 : CTATTCTC-AGCT--G-----C-GT-T-GA-GCATAT-T----C--T----TTT-CTG--T------GG-------A-T-A-AAAATG-GCAAAAT----T----AC--A----T------A----T-ATCA--G----TC-T-GAAA-A-T--GTGA-ACA-GT--A-A-A----GAtaaa
gi|4 : tctaCCTTC-GA--CATCA-AATGCA-T-GGGAA-----------CA--------TTTCAAAA-GAGAAGA---ATT--------------TTGCAAA-----------C--ACT---GTGTTAGGCGGAT-TTGA-C-G-TA-CATTCGAACG--GT--A------------GTAC----------CTG-ACCT--AT-----GG--CTG-C----GTATCTAA-------AT-----ACAAA-ACA-T-C-CCACC---GAAA--G----A------GTT-TTA-AAA-C----T-C-G---GA-GGGAA----A-----C-TC-T-GT-C-A--G-TG-A----C--AT----C-GT-----T----------T-------ATAT-C-CCT-TAT-AATTCAAAGACT---C-----------TCC-------TGTG-C-C---CA--------------------GCCCGA-GAT-TG-AT-AACAC-----GGTCAA--CAAAG---CT----G-AAAA---GTCACCTATTCCC-AGGT--G--T--C-GG-T-GA-TCACAT-A----A--T----TTT-T----T------AG-------A-C-A-AAAATA-GCAAGTT---AC----ATGTA----T------A----T-ATTA--G-T--TC-T-AACG-A-T-GGTGC-A-A-Gc
gi|40 : --G--A--TCGT-T-CA-GCATAT-G----TGTT----TTT-TCGGGT------GA-------AGC-G-AAAATG-GCAAAAT---AT----AT--A----TCGGCATA----T-ATTA--G-T--TC-T-GAAA-A-T-GTTAA-A-A-GT--ACA-A----c
gi|41 : cCAAAC-A----T--TGGGATTT-TGG--T------AT-------A---A-AAAATG-GCAAATT---AT----AT--A----T------AAGTTT-ATTA--G-T--CT-T-GACG-A-T-GGTAA-A-A-GT--A-A-A----GAA
gi|42 : t-----------CA--------TTTCAAAA-----AGA---ATTA-GAT-GC--AAAATTGTATGATGC-CAAGTTTG-ACT---TTGACCAGta
gi|43 : ctccctttgacat----TTT-TTG--T------CG-------A-T-A-AAAATG-ACAAATG---GC----A---A----T------A----T-ATTA--G-T--TC-T-GA---A-T-GATtattaa
gi|44 : attgA-CACGCA-T-GGAAA-----------TA--------TTAAAAAAAAA--AGA---ATTA-GAT-GC--AAAATTGCAAAATGC-CAAGTTTG-ACT---TTGATCacgtcactataataaatta
gi|45 : AT-T----T--T----TTT-TCG--T------AG-------A-T-A-AAA-TG-GCAAATT---ACG---AT--A----C------A----T-A--A--G-T--TT-T-GAAA-A-T-GCTGA-A-A-GT--A-A-
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