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Reference ( gi|1 )            :                        ACATTT--TTTATTA--C---ATTGT-CCTTCATA--AT-AAATATAAGAGAA----ATGA-AC--TATTTTGG--AAACT--TGAAA-TATGTAA-TGCTTC-AAC---CTCACTCTTGATTGATAATCTTGTTTAA---AAATCTTATTGT--AACATTA--T-CCTAGAAAAGTG-------GC---------AAA-T-TC----ATTT--AC-CA---GGCATA--CAAAAT---TG-A-----GA-C-A-TCCAATATTCGCGAAAA-CATT-TT---AAATC-CACTT-CT--TTG--CTG--C-GTA--TT--TA--TG--TATAT--ATTTTATTGT-ATA-ATATG-AAAAGT----GACAT---A-------TAG--GTCCGCTGGGCCGGG----TGTA--TTC---A-C----CA--T----GT-GTATCTACT-ATTG-AAATTGTT--AAAACT-AT--CAGATATGTTGTT-ATA------T-ACAC--ATGTCA----CTATA-ATAAATGATTTAC-TTACTTAT
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2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-2725 )     :                                                                                ACATTT--TTTATTA--CG---TTGT-TCTT--TA-A-AT--AAATATAAGAGAA--T-ATGACANC--GTTT-GG-AAAACT--TGAAA-TACGCAA-TGCTTC-AA---A-CTCACTCTTGATTGATAATCTTGTTTAA---AAATCGTA-TTGTA-A-ATTAT----CCTAGAAAAGTG-------GC--------AAA-T-TTATTT--AC-CA---GGCATA--CAAAAT---TGA-----GA-C-A-TCCAATATTCG-AAAAA--CATTCT---AAATC-CACTT-CT--TTG--CTG--C-GTA--TT--TA--TG--TATAT--ATTTTATTGT-ATA-ATATG-AAAAGT----GACAT---A-------TAG--GTCCGCTGGGCCGGG----TGT----A--TTC--AAC----CA-TGT-GTATCTACT-ATTG-AAATTGTT--AAAATT-AT--CATAT-TGTTGTT-AT--A------T-AC--ACAT-GTCACTATA-AT-AAATGATTTAC-TTACTTAT
gi|1                          :                                                                                ACATTT--TTTATTA--CA---TTGT-CCTT--CATA-AT--AAATATAAGAGAA----ATGA-ACT--ATTT-TG-GAAACT--TGAAA-TATGTAA-TGCTTC-AA---C-CTCACTCTTGATTGATAATCTTGTTTAA---AAATCTTA-TTGTA-ACATTAT----CCTAGAAAAGTG-------GC--------AAA-T-TCATTT--AC-CA---GGCATA--CAAAAT---TGA-----GA-C-A-TCCAATATTCGCGAAAA--CATTTT---AAATC-CACTT-CT--TTG--CTG--C-GTA--TT--TA--TG--TATAT--ATTTTATTGT-ATA-ATATG-AAAAGT----GACAT---A-------TAG--GTCCGCTGGGCCGGG----TGT----A--TTC---AC----CA-TGT-GTATCTACT-ATTG-AAATTGTT--AAAACT-AT--CAGATATGTTGTT-AT--A------T-AC--ACAT-GTCACTATA-AT-AAATGATTTAC-TTACTTAT
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                  AGTG-------GC--------AAT-T-TTTTTTTTAC-CA---GGCATA--CAAAA----TGA-----GACC-A-TC---TAT-------------TTC----AAATC-CACTT-CT--TTG--CTG--G-GT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 T-AT--G------T-AC--ACAT-GCCACTATAGAT-AGATAAATTAC-TTACTTATgatcacatacac
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              taA-----GA-C-AATCTAATATTCG-AAAAT--CATTCT---AAATC-CACTT-CT--gagattattgta
gi|2                          :                                                                                ACATTTCCTTTATTAAACGAAATTGTGTCTT--TA-G-ATTGAAATATAAGAGAAGATGATGATATCTTGTTTTGGTAAAACT--TGAAAATACGCAAAGGCTTC-AAGTAA-CTCACTCTTGAT-GATAAT-TTGTTTAA---AAATCGTA-TTGTACA-ACTCTACGCCCTAGGAAACTGGTATTCCGT--------AAA-CATTATTT--ATACAACTGGCATAACCACAAT---TA-------------------ATTCG-AAAAA--CATCGT----AATC-CACTTAAT--TTG--CTG--CGGTA--TT--TAT-TGATTATAG--ATT
gi|3                          :                                                                              cctaaaaT--TTAATTG--CT---TTTT-CCCTCTTA-GTAT--AAATATAAGAACACCT-ATGACAGC--GTTT-GG-AAAAGCGGTGAAA-TACGCAA-TGCTTC-AA---AACTCACTCTTGATTAGTAATTTTGTTTAATATAA---GTATTTGTA-A-ATGATA---CCTAGAATA-TG-------G----------GG-T-TTAT--------------CGTA---AAAATTCATGAACCCTGG-C-A-TACAATTATCG--CAAA--CACTTTAG-AAATC-CAA---CT--TTGAACTGTCT-TTAT-TT--TACTTG--TATAC---TCTTATTG
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                 tgagctgaatatgctccTTAT----CCTAGAAAAGTG-------GC--------AAAAT-TCATTT--AC-CA---GGCATA--CAAAAT----GA-----GA-C-AATCCAATATTCG-AAAAA--CATTCT---AAATC-CACTT-TT--TTG--CTG--C-GTA--T--------A--AATAT--ATCTTATTGT-ATA-ATATG-AAAAGT----GACAT---A-------TAG--GTCTGCTGGGACGGG----TGT----A--TTC--AAC----CA-TGT-GTATCTACT-ATTG-AAATTGTT--AAAATT-AC--CATAT-TGTTGTT-AT--A------T-AC--ACAT-GTCACTATA-AT-AAAAGATTTAC-TTACTTAc
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gi|6                          : tcatagtaaaccggcaaacttcttgtatttatcatatatatacttacagacagtctattgtatatactattaaacatcaACATTT--CTTATTA--CG---TTGT-TCTT--TA-G-AT--AAATATAAGAGAA----ATGA-ACT--GTTT-GG-AAAACT--TGAAA-TACGCAA-TGCTTCAAA---A-CTCACTCTTGA-TGATAAT-TTGTTTAA---AAATCGTA-TTGTA-A-ATTAC----CCTAGGAAAGTG-------GTATACCGTAAAA-A-TTATTT--AC-CCT--GGCATA--C--AAT-----------------------TATTCG-AAAAA--CAT--T---AAATC-CACTT-CT--TTG--CTG--C-GTAATTT--TA--Tatgtactt
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-2725 )     :                                                                                ACATTT--TTTATTA--CG---TTGT-CCTT--TA-G-AT--AAATATAAGAGAA--T-ATGACACC--GTTT-GG-AAAACT--TGAAA-TACGCAA-TGCTTC-AA---A-CTCACTCTTGATTGATAATCTTGTTTAA---AAATCGTA-TTGTA-A-ATTAT----CCTAGAAAAGTG-------GC--------AAA-T-TTATTT--AC-CA---GGCATA--CAAAAT---TGA-----GA-C-A-TCCAATATTCG-AAAAA--CATTCT---AAATC-CACTT-CT--TTG--CTG--C-GTA--TT--TA--TG--TATAT--ATTTTATTGT-ATA-ATATG-AAAAGT----GACAT---A-------TAG--GTCCGCTGGGCCGGG----TGT----A--TTC--AAC----CA-TGT-GTATCTACT-ATTG-AAATTGTT--AAAATT-AT--CATAT-TGTTGTT-AT--A------T-AC--ACAT-GTCACTATA-AT-AAATGATTTAC-TTACTTAT
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gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 T-AT--G------T-AC--ACAT-GCCACTATAGAT-AGATAAATTAC-TTACTTATgatcacatacac
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              taA-----GA-C-AATCTAATATTCG-AAAAT--CATTCT---AAATC-CACTT-CT--gagattattgta
gi|2                          :                                                                                ACATTTCCTTTATTAAACGAAATTGTGTCTT--TA-G-ATTGAAATATAAGAGAAGATGATGATATCTTGTTTTGGTAAAACT--TGAAAATACGCAAAGGCTTC-AAGTAA-CTCACTCTTGAT-GATAAT-TTGTTTAA---AAATCGTA-TTGTACA-ACTCTACGCCCTAGGAAACTGGTATTCCGT--------AAA-CATTATTT--ATACAACTGGCATAACCACAAT---TA-------------------ATTCG-AAAAA--CATCGT----AATC-CACTTAAT--TTG--CTG--CGGTA--TT--TAT-TGATTATAG--ATT
gi|3                          :                                                                              cctaaaaT--TTAATTG--CT---TTTT-CCCTCTTA-GTAT--AAATATAAGAACACCT-ATGACAGC--GTTT-GG-AAAAGCGGTGAAA-TACGCAA-TGCTTC-AA---AACTCACTCTTGATTAGTAATTTTGTTTAATATAA---GTATTTGTA-A-ATGATA---CCTAGAATA-TG-------G----------GG-T-TTAT--------------CGTA---AAAATTCATGAACCCTGG-C-A-TACAATTATCG--CAAA--CACTTTAG-AAATC-CAA---CT--TTGAACTGTCT-TTAT-TT--TACTTG--TATAC---TCTTATTG
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                 tgagctgaatatgctccTTAT----CCTAGAAAAGTG-------GC--------AAAAT-TCATTT--AC-CA---GGCATA--CAAAAT----GA-----GA-C-AATCCAATATTCG-AAAAA--CATTCT---AAATC-CACTT-TT--TTG--CTG--C-GTA--T--------A--AATAT--ATCTTATTGT-ATA-ATATG-AAAAGT----GACAT---A-------TAG--GTCTGCTGGGACGGG----TGT----A--TTC--AAC----CA-TGT-GTATCTACT-ATTG-AAATTGTT--AAAATT-AC--CATAT-TGTTGTT-AT--A------T-AC--ACAT-GTCACTATA-AT-AAAAGATTTAC-TTACTTAc
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TG--C-GTA--TTGCCAG-TG--TATCTTTATTTCATTGTTATA-CTGTT-AAAAGTAAGTGACAT---ACTAAGTATAT--GTCCGATGGGCCGGG----CGT--------TT--AA------A-TGC-TTAT-TA-T-ATTA-CA--TGT------ACT-A----------GTTAGT-AT--A------TGAC--ACAT-GTCACTGTA-AT-AAACAATTTAC-GTACc
gi|6                          : tcatagtaaaccggcaaacttcttgtatttatcatatatatacttacagacagtctattgtatatactattaaacatcaACATTT--CTTATTA--CG---TTGT-TCTT--TA-G-AT--AAATATAAGAGAA----ATGA-ACT--GTTT-GG-AAAACT--TGAAA-TACGCAA-TGCTTCAAA---A-CTCACTCTTGA-TGATAAT-TTGTTTAA---AAATCGTA-TTGTA-A-ATTAC----CCTAGGAAAGTG-------GTATACCGTAAAA-A-TTATTT--AC-CCT--GGCATA--C--AAT-----------------------TATTCG-AAAAA--CAT--T---AAATC-CACTT-CT--TTG--CTG--C-GTAATTT--TA--Tatgtactt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                        ccttcggttcaggtgagctaaaaATAATCT-GTTTAA---AAATCTTA-TTGTA-A-ATTAT----CCTAGAAAAGTG-------GCA-------AAA-T-TTATTT--CC-CA---GGCACA--CAGAATGA-TGA-----GA-CAA-TCTAATATTCG-AAAAA--CATTCT---AAATC-CACTT-C-----------------A--TT-------------------------GT-ATA-ATATG-AAAAGT----GACAT---A-------TAG--GTCCACTGGGCCAGG----TGT----AATTTC--AAC----CA-TGT-GTATC-AAT-ATTG-AAATTGTT--GAAATT-AT--CATAT-TGTT
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AATAT-CG-AAAAAAACATCTTTAGAAATCGCACT--CT--TTG--CTG--C--TA--TT---A--TG---------ATTTTTTTAG-ATACATATG-AAAAGT----GACAT---A-------TAA--GTCCGCTGTGCC--G----CGT----A--TTC--AAC----CA-TGT-AT-TCTACT-ATT--AAATGTTT--ATAAAT-ATTCTATATATGTTGTTGATCAG------C-ACTAACATCAACACT-TA-TTAAAATGA-TTACTTTACTa
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                AAAGTG-------GC--------AAAAT-TTATTT--AC-CA---GGTATA--CATAA----TGA-----GA-CAA-TCTAATATTCG-AAAAA--CAaag
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -ACA-ATATG-AA--GT----GATAT---A-------TAG--GTCCACTGGGCCAGA----TGT----A--TTC--AAA----AA-TGT-GTATCTAAT-ATTG-AAATTGTT--AAGATT-AT--CATGT-TATTATT-AC--ATGTACGT-AC--ACAT-GCCACTATA-AT-AGATGATTTAC-TTAATTGTatatgaagtgatatataggtccactgggccagatgtattcaaaaatgtgtatctaatattgaaattgttaagattatcatgttattattacatgtacgtacacatgccactataatagatgatttacttaattgttagc


blockSeqs                     :                                                                                      CC       AACGAAA    G    CT  GT   TG             GATG    TATCTT    T  T      GG     A       A      A  GTAA            TT      C T      TAT        T     C .     ACGC            GTATACCGTA          G A      TT  A  ACT      AC     TTCATGAACCCTGGCA     T     T  .     AA      TAG     G     A  CT   AA   TC G   TTGCCAGTGTATCTTT               T   C     G      AAGT     GAT CTAAGTA   AG               CCGT   CGTAA     TG  CCATG  T   A    CT C A    A        GA      A  TC  TATA       G  ATGTACG   G  TA    C         G  A           T
blockSeqs                     :                                                                                      .        CT         .    .   G    .              CCT     CAGC      .  .      .      .       .      .  AA              T       T T      .          .     . .     A               GTATTCCGT           A .      .   .  T        .      TGATGAGACAA          C     T  .     A       AG      .     .  .    .    .  .   TTTATTGATTATAG                 .   .     .      .        .   .         .                .      AAT       .   C      .   .    CT C .    .        .       .  .   TAT        .  CAG       .  .     .         .  .           .
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                    . .      .          .     . .     .               GC                  . .      .   .  .        .      TGAGACAA             C     T  .     .       .       .     .  .    .    .  .   TTTATGTAT                      .   .     .      .        .   .         .                .      A         .   C      .   .    CT C .    .        .       .  .   TAT        .  A         .  .     .         .  .           .
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                      .               GC                  . .      .   .  .        .      TGAGACAA             C     T  .     .       .       .     .  .    .    .  .   TTATG                          .   .     .      .        .   .         .                .      A         .   C      .   .    T  C .    .        .       .  .   GT         .  G         .  .     .         .  .           .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                      GC                  . .      .   .  .        .      TGAGACAA             C     T  .     .       .       .     .  .    .    .  .   ATAT                           .   .     .      .        .   .         .                .      A         .   A      .   .    C  A .    .        .       .  .   TA         .  G         .  .     .         .  .           .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                      G                   . .      .   .  .        .      TTA                  T     T  .     .       .       .     .  .    .    .  .   TT                             .   .     .      .        .   .         .                .      A         .   .      .   .    .  . .    .        .       .  .   T          .  A         .                                  
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-2725 )     :                                                                                ACATTT--TTTATTA--CG---TTGT-CCTT--TA-G-AT--AAATATAAGAGAA--T-ATGACACC--GTTT-GG-AAAACT--TGAAA-TACGCAA-TGCTTC-AA---A-CTCACTCTTGATTGATAATCTTGTTTAA---AAATCGTA-TTGTA-A-ATTAT----CCTAGAAAAGTG-------GC--------AAA-T-TTATTT--AC-CA---GGCATA--CAAAAT---TGA-----GA-C-A-TCCAATATTCG-AAAAA--CATTCT---AAATC-CACTT-CT--TTG--CTG--C-GTA--TT-------TA--TG--TATA-TTTTATTGT-ATA-ATATG-AAAAGT----GACAT---A-------TAG--GTCCGCTGGGCCGGG----TGT----A--TTC--AAC----CA-TGT-GTATCTACT-ATTG-AAATTGTT--AAAATT-AT--CATAT-TGTTGTT-AT--A------T-AC--ACAT-GTCACTATA-AT-AAATGATTTAC-TTACTTAT
gi|1                          :                                                                                ACATTT--TTTATTA--CA---TTGT-CCTT--CATA-AT--AAATATAAGAGAA----ATGA-ACT--ATTT-TG-GAAACT--TGAAA-TATGTAA-TGCTTC-AA---C-CTCACTCTTGATTGATAATCTTGTTTAA---AAATCTTA-TTGTA-ACATTAT----CCTAGAAAAGTG-------GC--------AAA-T-TCATTT--AC-CA---GGCATA--CAAAAT---TGA-----GA-C-A-TCCAATATTCGCGAAAA--CATTTT---AAATC-CACTT-CT--TTG--CTG--C-GTA--TT-------TA--TGTATATA-TTTTATTGT-ATA-ATATG-AAAAGT----GACAT---A-------TAG--GTCCGCTGGGCCGGG----TGT----A--TTC---AC----CA-TGT-GTATCTACT-ATTG-AAATTGTT--AAAACT-AT--CAGATATGTTGTT-AT--A------T-AC--ACAT-GTCACTATA-AT-AAATGATTTAC-TTACTTAT
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -A-TCTAATAT-CG-AAAAA--CATTCT---AAATC-CACTT-CTCTTTG--CTG--C-GTA----------------------A-TTTTATTGC-AAA-ATATC-AAAAGT----GACATGATA-------TAG--TTCCGCTGGGCCGGGCCGTTGT----A--TTC--AGC----CA-TAT-GAGT--ACA-AT-G-AAATTGTT--AAAATT-AT--CAT----GTTGTT-AC--A------T-AC--AC---GTCACTATA-AT-AAATGATGTAC-TTACTTA
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ta---GGCATA--CAAAAT----GA-----GA-C-AATCCAATATTCG-AAAAA--CATTCT---AAATT-CACTT-CT--TTG--ATG--C-ATA----------------A--TATA-TTTTATTGT-ATA-ATATG-AAAAGT----GACAT---A-------AAG--GTCCGCTGGGCCGGG----TGT----A--TTCTGAACCATGCA-TGT-GTATCTACT-ATTG-AAATTGTT--AAAATT-AT--CATAT-TGTTGTT-AC--A------cttata
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -ATA-AT-TA-GAAATT----GATGG---A-------TAG--GTCCGTAGGGCTGGA----TGTCGTAA--TTG--GA---------GT-GTA-------AGTG-----TGTT--A---TT-AC--TA-GT-TTTTGAT-AT--A------T-GT--ACAT-ATAACTATG-AC-AAATAATTTAC-TTACTTA
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  attttctttaagtTATGGAAAAGT----GACAT---A-------TAGAGGTG-GCTGGGCGGGG----TGT----A--TTC--AAC----AATTGTAGTATCTACTAATTGAAAATTGTTGAAAAATTAAT--CATA---ATTGTT-AT--G------T-
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                              GATAATCT-GTTTAA---AAATCGTA-TTGTA-A-A-----------------GTG-------GC--------AAAGT-TCATTT--TC-CA---GGCTTA--CAAAGT----GA-----GA-C-AATCCAATATTCG-AAAAA--t
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                  AGTG-------GC--------AAT-T-TTTTTTTTAC-CA---GGCATA--CAAAA----TGA-----GACC-A-TC---TAT-------------TTC----AAATC-CACTT-CT--TTG--CTG--G-GT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   T-AT--G------T-AC--ACAT-GCCACTATAGAT-AGATAAATTAC-TTACTTATgatcacatacac
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              taA-----GA-C-AATCTAATATTCG-AAAAT--CATTCT---AAATC-CACTT-CT--gagattattgta
gi|2                          :                                                                                ACATTTCCTTTATTAAACGAAATTGTGTCTT--TA-G-ATTGAAATATAAGAGAAGATGATGATATCTTGTTTTGGTAAAACT--TGAAAATACGCAAAGGCTTC-AAGTAA-CTCACTCTTGAT-GATAAT-TTGTTTAA---AAATCGTA-TTGTACA-ACTCTACGCCCTAGGAAACTGGTATTCCGT--------AAA-CATTATTT--ATACAACTGGCATAACCACAAT---TA-------------------ATTCG-AAAAA--CATCGT----AATC-CACTTAAT--TTG--CTG--CGGTA--TT-------TA--T
gi|3                          :                                                                              cctaaaaT--TTAATTG--CT---TTTT-CCCTCTTA-GTAT--AAATATAAGAACACCT-ATGACAGC--GTTT-GG-AAAAGCGGTGAAA-TACGCAA-TGCTTC-AA---AACTCACTCTTGATTAGTAATTTTGTTTAATATAA---GTATTTGTA-A-ATGATA---CCTAGAATA-TG-------G----------GG-T-TTAT--------------CGTA---AAAATTCATGAACCCTGG-C-A-TACAATTATCG--CAAA--CACTTTAG-AAATC-CAA---CT--TTGAACTGTCT-TTAT-TT-------TACTTG--TATACTCTTATTGtgattatagatt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                 tgagctgaatatgctccTTAT----CCTAGAAAAGTG-------GC--------AAAAT-TCATTT--AC-CA---GGCATA--CAAAAT----GA-----GA-C-AATCCAATATTCG-AAAAA--CATTCT---AAATC-CACTT-TT--TTG--CTG--C-GTA--T---------A--AA--TATA-TCTTATTGT-ATA-ATATG-AAAAGT----GACAT---A-------TAG--GTCTGCTGGGACGGG----TGT----A--TTC--AAC----CA-TGT-GTATCTACT-ATTG-AAATTGTT--AAAATT-AC--CATAT-TGTTGTT-AT--A------T-AC--ACAT-GTCACTATA-AT-AAAAGATTTAC-TTACTTAc
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TG--C-GTA--TTGCCAGTGTA--TC--TTTA-TTTCATTGTTATA-CTGTT-AAAAGTAAGTGACAT---ACTAAGTATAT--GTCCGATGGGCCGGG----CGT--------TT--AA------A-TGC-TTAT-TA-T-ATTA-CA--TGT------ACT-A----------GTTAGT-AT--A------TGAC--ACAT-GTCACTGTA-AT-AAACAATTTAC-GTACc
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                        ccttcggttcaggtgagctaaaaATAATCT-GTTTAA---AAATCTTA-TTGTA-A-ATTAT----CCTAGAAAAGTG-------GCA-------AAA-T-TTATTT--CC-CA---GGCACA--CAGAATGA-TGA-----GA-CAA-TCTAATATTCG-AAAAA--CATTCT---AAATC-CACTT-C----------------------------------------------ATTGT-ATA-ATATG-AAAAGT----GACAT---A-------TAG--GTCCACTGGGCCAGG----TGT----AATTTC--AAC----CA-TGT-GTATC-AAT-ATTG-AAATTGTT--GAAATT-AT--CATAT-TGTT
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                AAAGTG-------GC--------AAAAT-TTATTT--AC-CA---GGTATA--CATAA----TGA-----GA-CAA-TCTAATATTCG-AAAAA--CAaag
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -ACA-ATATG-AA--GT----GATAT---A-------TAG--GTCCACTGGGCCAGA----TGT----A--TTC--AAA----AA-TGT-GTATCTAAT-ATTG-AAATTGTT--AAGATT-AT--CATGT-TATTATT-AC--ATGTACGT-AC--ACAT-GCCACTATA-AT-AGATGATTTAC-TTAATTGTatatgaagtgatatataggtccactgggccagatgtattcaaaaatgtgtatctaatattgaaattgttaagattatcatgttattattacatgtacgtacacatgccactataatagatgatttacttaattgttagc
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Unaligned ( gi|19 ): ACCTTCGGTTCAGGTGAGCTAAAAAGTCATTGATTT
Unaligned ( gi|20 ): CCTTCGGTTCAGGTGAGCTAAAAACATTTGAC