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Reference ( gi|2 ) : GGTGCTT-AGGACA-AGGAAAC----AG-C-AGCC---CC------------C---C-------C--CCCCC--------------C-CCGCA-CCGC-AA-TATTA-TCTCC---CCTAG--G-CTTC-T---T---GTGA--C-TT---T-C-G-TGTC-A-----CT--A--C-CCT-TTATGA-C---A--TA---T-T-CTGA--------A-TC-CA---TCC-T-AC---T-------------C---CA---AT--AATCT--CCGT----A--AATTA----AA-C-----TT-AAAGAA--T-C----------A-----T--T-TT-----T--A-----AAACAA------CA--------------CCGTAAACC-----CG-ACT--AGTAT---AAAC--ATA-GTTT---ATACT---A------AAGT-CGG-GTT-A-GGTG---TTTGTT---TTA-----AA-AA--AA---T--GTATTCTTT-AAGTT-C-ATA-ATTTTT-AACGG--AG-GTTTA-ATT----G-GGC-----------AATAA-------G-G-AT--GGA--T-CA---------GAAA--TAT---G-TCATAAAGGAGTTA-TTGACA-CGAA--AAG-TCAC-CAA--A-AG--A--CCT-GG-G---G--T---T-AATA-TT-CGG-G-GGGGGGGGGGGGGCACTTACGGGGAGGGGGGGGGT-GCT---GTTTTCCT--GTCCTCAGC
gi|1 : GGTGCTT-AGGACA-AGGAAAC----AG-C-AGCC---CC------------C---C-------C--CCCCC--------------C-CCGCA-CCGC-AA-TATTA-TCTCC---CCTAG--G-CTTC-T---T---GTGA--C-TT---T-C-G-TGTC-A-----CT--A--C-CCT-TTATGA-C---A--TA---T-T-CTGA--------A-TC-CA---TCC-T-AC---T-------------C---CA---AT--AATCT--CCGT----A--AATTA----AA-C-----TT-AAAGAA--T-C----------A-----T--T-TT-----T--A-----AAACAA------CA--------------CCGTAAACC-----CG-ACT--AGTAT---AAAC--ATA-GTTT---ATACT---A------AAGT-CGG-GTT-A-GGTG---TTTGTT---TTA-----AA-AA--AA---T--GTATTCTTTCAAGTTACAAAA-ATTTTTAAACGGAAAG-GTTTA-ATT----G-GCCAAAAAAAAAAAAATAA-------G-G-AT--GGA--T-CA---------GAAA--TAT---G-TCATAAAGGAGTTATTTGACA-CGAA--AAG-TCAC-CAA--A-AG--A--CCT-GG-G---G--T---T-AATA-TT-CGG-G-GGGGGGGGGGGGGCACTTA--GGGGGGGGGGGGGT-GCCTTGGTTTTCCT--GTCCTCAGC
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gi|4 : tgttctgttA-TGTTA-TC--C---CCTAG--A-CTTC-T---T---GTGA--CTTT---T-C-G-TGTC-A-----ATC-A--CTCCT-TTATGA-C---A--TGT--T-T-CTG---------A-TC-CA---TCC-T-A----T-------------G---CT---AT--AA-CT--CCGA----A--AATTA----AA-C-----TT-AAAGAT--T-C----------GT----T--T-TT-----T--A-----AAAGAA-------A--------------CC-T-AACC-----CG-ACTAGAGTAT---AAAC---T--GTTTATAATACT---ATTCGCCA--T-CGG-GTT-A-G--G---TTTCTT---TTA-----AAGAA--AA---T---TATTTTTT-AAGTT----TA-ATTT----ACGG--AG-TTATA-----------GC------------AT-A-------G-G-AT--GGA--C-CA---------GAAA------------------GATTGA-TTTACA-CGAA--AAG-TCAC-AAG--A-AG--T--CTA-GG-G---G--A---T-AATATTT-C-----GGATGGGCGGGGGC-----CGGGGGGG---------GCT---GTTTGCCT--GTCCTctcgtggt
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gi|17 : tcatttttatgaaaattacatatttcttA---TCC-T-AT---G-------------C---CA----T--AAT-T--CCGA----A--AATTA----AA-C-----TC-AAAGAA--T-C----------A-----TTTT-TT-----T--A-----AAAAAA------Cgtcacattctgatagacacgaaaagtcactagaagagtgatagacgcgaaaagtcactagaagcctggggggtcac
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gi|6 : AACC-----CG-ACT--AGTGT---AAAC---TG-GTCG---G-ATTTGGG------GGGG-GGG-GTT----GTG---TTTGTTGTTTTG-----GG-------------GTTTTTTTT-G-GTG-G-GT---TTTTT-AATGA--TT-GTTTA-ATTTGCAG-AGT-----------TATGAACTTATGG-G-AT--GGA--C-CA---------GAAG--TAT---G-TCATAAAAGAATGG-TTGACA-CCAA--AAG-TCA--CGA--G-AG--G--CCT-GGAG---G--T---T-AACA-TT-CGA-G-GGG--------------TATAG---------GGGT-GCT---G-TTTCCT--GTCCTCA
gi|9 : ataactccgcaaattaaacctaaacattctttcttttttttttcttctttttttttttaaact--AGTAT---AAAC--AGA---TT---ATACT---A--------GT-CGG-GTT-A-GGTG---TTT--T---TTA-----AA-GA--A----T--G-ATTCTTT-AAGTT----TA-ATTTT----CGG--AG---TTA-A--------GGC-----------A-TA--------G-G-AT--GAA--T-CA---------GAAA--TAT---G-TTATAAAGGAGTGA-TTGACA-CGAA--AAG-TCAC-AAG--A-AG-----CCTAGG-G---G--T---T-AATA-TT-CTC-G-GAGGGGGGGG----ACATAT--------GGGGGGT-GTT---G-TTTCCT--GTCCTCAagcacctg
gi|16 : -GTTT---ATACT---A--------GT-CGG-GTT-A-GG--------ATT---TCA-----AA-AA--AAAAAT---TATTCTTT-AAGTT----TA-ATTTT----CGG--A
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gi|13 : -GGTGAT-TTTTTT---TTA-----AA----------T--G-ATTCTT--AAGTT----TA-ATTTT----CGG--AG--------TT----A-TGC-----------A-TA--------G-G-AT--GGA--T-CA---------GAAA--TAT---G-TCATAAAGGAGTGA-TTGACA-TGAA--AAG-TCAC-AAG--A-AG-----CCT-GG-G---G--GA--T-AATA-TT-CGG-G-
gi|17 : G---TTT-TT---TTA-----AA-AA--AA---T--G-ATTCTTT-GAGTT----TA-ATTTT----CGG--A
gi|7 : cag---TTTATT---TTA-----AA----------C--G-GTTCTTT-AAGTT----TA-ATTTT----CGG--AG---TTA---T----G-G-C-----------A-TA--------G-G-AT--GGA--C-CA---------GA-------------C------GAGTGA-TAGACA-CGAA--AAG-TCAC-GAG--A-AG--AAGCCT-GG-G---G--attatggcataggat
gi|11 : tcatttttatgaaaattacatatttctTTTTT---TTA-----AA-A--------T--G-ATTCATT-AAGTT----TA-GTTTT-----GG--AG-TTATATAT-------GGC-----------A-TA--------G-G-AA--GGC--C-CA---------GAAA--TAT---G-TTATAAAGGAGTGA-TTGACA-CGAA--AAG-TCACACAAAGA-AG--C--CGT-GG-G---G------A-AACA-TT-CAA-G-GGGGGGGGGGGggtcacattctgatagacacgaaaagtcactagaagagtgatagacgcgaaaagtcactagaagcctggggggtcac
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gi|12 : tttT--GAA--C-GA---------GATA--TAT---G-TTA-AAAGGAGTGG-TTGACC-CAGA--AAG-TCAC--AA--G-AG--G--CTC-GG-G---G--T---TTAATA-TT-Cctagtgcgagttagaggtttttttaaaaaacgattctttaatttaattattgcggattatgcataagtgatggattcagaaaatcctgtcataaagaagtgaattgacacgaaaagatcacaagaagcctgggggttaactttcgggggggggggggggttggggg
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gi|7 : G--AA-TGTG-ACCC---CCC--A-G-GCTTCT-TCTCGTGAC-TT---TTC-G-TGTCTATCACTC-------G-------------T-CTGG---------TCC----ATCCTATG---CC----A-TA-A-CTCCGAAAATTAAA-C-----TTAAAGAA--CCG-------TTTA---AAATAAtg
gi|7 : tcatttttatgaaaattacatatttctt-ACCC---CCC--A-G-GCTTCT-A---GTGACTTT---T-C-G-CGTCTATCACTCTTCTAGTGAC----TT---T-T-CGTG---------TCT----ATCtgatagacacgaaaagtcactagaagagtgatagacgcgaaaagtcactagaagcctggggggtcac
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