lowQualScore : 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11111111 111 11111 4444444444444444 55555555555555555555555555555555555555555 11111 11111111111111111111 1111111 3333333333 111 111111 333 111111111 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 111111 22222222 3333333333333333333333333333333333333333 11 11111 22 1 11 111 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 111111 111 111 1111111111111 11111 2222222222222222 1111111 3333333333333333333333333333333333333 1111
lowQualScore : 3 3 44 3 2 2 2 3 3 7777 6 33333333 000 4 4 8 55 4 77777 9999 888 44 33 33 66 1111111111111111 2 2 2 4444 33 2 2 2 33 99999999999999999999999999999999999999999 2 444 33 55 33 33 2 33 33 2 11111 2 55 3 88888888888888888888 3 44 555 0000000 7777 2222222222 55 4 4 8888 4 000 444444 222 3 333333333 44 44 1 1 3 3 777 3 0 55 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 777777 00000000 3 9999999999999999999999999999999999999999 3 77 22 3 555 3 555 6 77 7777 3 44 3 11111 3 55 66 55 3 3 55 666 7777 77777 3 3 5 666 7 4 0 3 22 777 2 555 111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 888888 0 7777 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 3 1 88 222222 9999 4 666 5 2 33 666 2 2 2 5555555555555 66 00000 5 9999999999999999 33 33 2 2 33 8888888 4444444 2 2 5555555555555555555555555555555555555 0000 3 3 6 3
lowQualScore : . . .. . . . . . . .... . ........ ... . . . .. . ..... .... ... .. .. .. .. ................ . . . .... .. . . . .. ......................................... . ... .. .. .. .. . .. .. . ..... . .. . .................... . .. ... ....... .... .......... .. . . .... . ... ...... ... . ......... .. .. . . . . ... . . .. ............................................................................................................................................................................................... ...... ........ . ........................................ . .. .. . ... . ... . .. .... . .. . ..... . .. .. .. . . .. ... .... ..... . . . ... . . . . .. ... . ... ... .......................................................... ...... . .... ......................................................................... . . .. ...... .... . ... . . .. ... . . . ............. .. ..... . ................ .. .. . . .. ....... ....... . . ..................................... .... . . . .
lowQualScore : 6 6 66 1 9 9 9 3 3 1111 7 99999999 000 0 0 0 55 0 11111 6666 555 22 99 77 33 0000000000000000 5 5 4 7777 11 2 4 2 44 33333333333333333333333333333333333333333 5 777 44 99 44 44 5 77 44 5 22222 7 22 3 00000000000000000000 3 66 888 8888888 1111 0000000000 55 0 0 5555 0 000 111111 555 3 333333333 55 55 7 8 6 6 888 3 3 00 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 999999 33333333 3 6666666666666666666666666666666666666666 3 99 55 3 888 3 888 7 99 1111 3 66 3 88888 6 00 88 00 6 6 00 444 7777 99999 6 6 0 444 3 6 8 3 33 999 4 888 333 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 888888 8 1111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1 7 77 111111 3333 9 888 6 9 99 444 9 9 9 7777777777777 88 00000 7 4444444444444444 77 77 7 7 77 7777777 8888888 7 7 2222222222222222222222222222222222222 7777 3 3 7 3
consensus : GTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAACAA----A-TTTCTTTCA-----A--TG---TATT-AAG-TGGTT-AAT--AAGT-GAT-A-C-ATATATCAGACGA----TG---T--ACCC--TAC--ATA--AGTCGACTT---TTTTTTTT--ATA-GAGA-A-TTAT----A--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATTTC-ACTA--TTTT-AG-----GG--TGG--G---GG-G--GGTGGT---G-G-GT-TA--TTA--TT--AA--T--A-ACCA--AAG--A-A-----ATG-TTTA-CT-T--------AAT----T----CAT-T--T---GATT-------AATC----AAAT-----A----C--GC-C-T----CAGAA-GCATG--GGGAGGATGT------ATCAG-GA-AA---------AAAATC-AATT-AAATACGGCAA-GAA-AAAT--GTA-TAAAA--A-------------------TTC-------------A----------------T-----A---TG---GA---T----C------G---------TTCTAAAT-A-T-TGC---T--ATAGT---CTA-----GT--------------GT--------CAAGGATTATTCCATTTCAT------AAAGCC-ATTTT------CCGT-------TAGC-C--------AC------------------AAGC--------A-TA--TA--C-A---AT-T---A-T--ATA----TA-C--AT-TGT-A-A-TATA-TCAAC--AAAAA-CAA--CAT-AG-T--GGA---GAG----TG--A--G-T-AGTCTCC---ATTA-CAAAGATAGAGAGATA-TG-AT--TATTACA---AT--ATGT---TA----G--AA------TTACA----------ATGTA-----TGTATG-AG--A-TTGTTGCAC------ATTGT----AGA-----C---------------A---------------CAGTTCT-----C-GG-A---TT-------------GTATT-TGTAACGC-TAA------GTAATT----AAANAAG-TTTAAAAAC-AT--T---G-G-T-T-------------T--TTCT-----TCAT-ATAT------A---TA----TT--TCAAGT--CA-T-A--G-------T------NT-AG-ATGAC--------A--T---------------GG--------AACT---NA-TCCTC-T-A-TATCAT
Reference ( gi|5 ) : GTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAACAA----A-TTTCTTTCA-----A--TG---TATT-AAG-TGGTT-AAT--AAGT-GAT-A-C-ATATATCAGACGA----TG---T--ACCC--TAC--ATA--AGTCGATTT---TTTTTTTT--ATA-GAGA-A-TTAT----A--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATTTC-ACTA--TTTT-AG----TGG--TGG-TG---GT-G--GGTGGT---G-G-GT-TA--TTA--TT--AA--T--A-ACCA--AAG--A-A-----ATG-TTTA-CT-T--------AAT----T----CAT-T--T---GATT-------AATC----AAAT-----A----C--GC-C-T----CAGAA-GCATG--GGGAGGATGT------ATCAGGGA-AA---------AAAATC-AATT-AAATACGGCAA-GAA-AAAT--GTA-TAAAA--A-------------------T---------------A----------------T-----A---TG---GA---T----C------A---------TTCTAAAT-A-T-TGC---T--ATAGT---CTA-----GT--------------GT--------CAAGGATTAT--------AT------AAG--C-ATTTT------CCGT-------AAGC-C--------AC------------------ACGC--------A-TA--TA--C-A---AT-T---A-T--ATA----TA-C--AT-TGT-A-A-TATA-TCAAC--AAAA--CAA--CAT-AG-T--GGA---GAG----TG--A--G-T-ACTCTCC---ATTA-CAAAGATAGAGAGATA-TT-AT--TATTACA---AT--ATGT---T-----G--AA------TTACA----------ATGTAC---ATGTATG-AG--A-TTGTTGCAC------ATTGT----AGA-----C---------------A---------------CAGTTCT-----CAGG-A---TT-------------GTATT-TGTAACGC-CAA------GTAATT----AAAGAAG-TATAGAAAC-AT--T---G-G-T-T-------------T--TTCT-----TCAT-ATAT------A---TA----TT--TCAAGT--CA-T-A--G-------T------CT-AG-ATGAC--------A------------------GA--------AACT---AA-TCCTC-T-A-TATCAT
gi|15 : GTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAACAA----A-TTTCTTTCA-----A--TG---TATT-AAG-TGGTT-AAT--A-----------------TCAGATGA----TG---T--ACCC--TAC--ATA--AGTCGAATT---TTT-------ATA-GA---A-TTAT----A--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATTTC-ACTA--TTTT-AG----------GG-TG---GT-G--G-TGGT---G----T-TA--TTA--TT--AA--T--A-ACCA--AAG--A-A-----ATG-TTTA-CT-T--------AAT----T----CAT-T--T---GATT-------AATCAAATAAAT-----A----C--GC-C-T----CAGAA-GCATG--GGGAGGATGT------ATCAG----AA---------AAAATCAAATT-AAATACGGCAA-GAA-AAAT--GTA-TAAA
gi|2 : GTACA-TAGC--TTTCC-AAAAAGGCTTG-CCT-GAAC-TAAACAA----A-TT-CTTTCA-----AAATGA--TATT-AAG-TGGTTTAAT--AAGTTGAT-A-CGATATATCAGACGA----TGC--T--ATCCCGTAC--ATA--AGTCG---------TTTTTT--ATA-GAGATA-TTA-----A--AA-TGAT---TTCCTCAAATTTC-A-TA--TTTT-AGGGGGTGGGGTGG-CGTGGGT-G--GGTGGTTTGGTG-GTGTA--TTA--TG--AA--T--ATACCA--AAG--A-A-----ATG-TTTATCT-T--------AA-----T----CAT-T--T---GA-T-------AATC----AA
gi|18 : acaaGTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAACAA----A-TTTCTTTCA-----C--TG---TATT-ACG-TGGTT-AAT--AAGT-AAT-----ATATATCAGACGA----TGTACT--ACTC--TAC--ATA--AGTCGA--------CCTTTT--ATA-GAGA-A-TTAT----A--AA-TGAC-GTTT-CTCAAATTTC-TCTG--TTTA-AG---------------------G--GGGGGG---G-G-GG-TA--TTA--TT--AATTT--A-ACCA--AAG--A-A-----ATG-TTAT-CT-T--------AAT----T----CAT-T--T---GATT-------AAGC----AAAgatcagacgattattccattctcataaaagccattttccgttagccacaagcatataacagtctatatttaacattgtaaatatatcaacaaaaaacaaaacataggtggagagcgagtagtctccattaacaaagatgtagcgatatggattataaatatgttagaattacaatgtatgagaattgttgcacattgtagacacagttctcaagattgtatttgtaacgccagatgtaattaaagaagtttagaaacattgggtgttttcttcatatatatcataatattttaagtcatagtctagatgacacggaaactaaatcctcatagtatcgtgtagattccccggaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaataggtgcacaacggtgcaatcaattctctgttgctgtccatcgccaagtaagtgcaaaccgggtacgtcttgtacatg
gi|19 : caaGTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTGGCCT-GA-C-TAAACAA----ACTTTCTTTC------A--TG---TATTAAAG-TGGTT-AAT--AAGT-GAT-A-C---ATATTAGACGA----TG---T--A--T--TA---ATA--AGTCGA-------TTTTTTT--ATA-GAGA-A--TAT----A--AATTCATGGTTTCCTCACATTTC-ACTA--TTTTAAG----GGG--TGG--G---GTGG--GGTGGG---G-GTGT-TT--TTA--TTA-AA--T--A-ACCA--AAG--A-A-----ATG-T
gi|6 : caaGTA-AGTGGCGGTTTCC-AAA--G-CTTG-C----A-CATAAACAAGGGGA-TTTCTTTCA-----C--TGAGATGTT-AAC-TGTTTCAAT---AGT-GAT-G---ATAT-TTAGA-AA----TG---TTCACTC--TAC--AT---AGTCGACTT---T
gi|39 : aaGTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAACAA----A-TTTCTTTCA-----A--TG---TATcctcaaatttcaactgtttttaagtggggaatgcttattctgattgatattgattaatgcaatacatgcgctcagaagcattacgggaggatgtatcaagtaaatttaatgttaaaatctttaaaaaatcagtttcaaagtatcgataatggattgtcaattttctgaaatccttcaaggattattcgtttcaagctcattggataacatataatacgaattaattatataacgtatatacaaaaacagcatagtttgaagagtgcgttagtctcagaaattaacaaagatagagagttaattattacacaatataatacactacactagagactaatctatttaatatagacattttcctaaattagacagttctttgtatttgttaccttaagtaattaataagattagaacattgtggttttgttctgtcattatatatcattttcaagatatatggtatagaggaccctttagaaatcatcctctatat
gi|42 : caaGTA-A-CATC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-A-TAATCGA----A-TTTCTTa
gi|47 : ttaGTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTA-CCT-Gat
gi|46 : acaaGTA-A-TAGC--TTTCCAAAAAAG-CTTG-CCT-
gi|1 : catgacaaTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCTCGA-C--AAACAA----AATTTCTCT-A-----A--TG---GATT-AAGCTGGTT-AACTAAAGT-GATTA-C-ATATATCAGACGAATGTTG---T--GCC---TAC--ATA--AGTCGATTT---TTTT------ATA-GAGG-A-T-AT----AGCAA-TGAT-GTT-CCTCAA-TTTC-ACTA--TTTA-GG----CGG--TAA-AA---GG-A--GGTGTT---G----T-TG--TTAACTTCAAA--T--A-ATCAGAAAG--ACA-----ATG-TT-A-CT-T--------AATCAATT----AAT-T--T---GATT-------AATC----AAAT-----AAATAC--GC-C-T----TA-AA-GCATG--GGGAGGTTGTT-----ATCAAGAA-AA---------TAAA-C-A--T-AAATACGGCAATGAACAAAT--TTAATAAAA--A-------------------TTCATTTCAAAGGTATA----------------T-----A---TG---GGACGT----CCAAAAAA---------TTCTAAA--A-TATGC---T--ATAGT---CTATAGT-GTAAACCCC-------GT--------CAAGGATTATTCCATC--AT------AAAGCC-ATTTT------CCGTT------AGGC-C--------AC------------------AAGC--------AATA--CA--C-A---AT-T---A-T--ATA----TA-CTCAC-TGA-A-A-TATACTCAAC--AAAAA-CAA--CAT-AG----GGA---GAG----TGTGA--G-T-AGTCTCC---ATTA-AAAAGA-AGA-AGGGA-TG-AT---ATTACA---AT--ATGT---TT----G--TA------TT--------------TACAT---ATGTATG-AGGAA-TTGTTGCAC------ATTGT----AGA-----CGAT------------A---------------CAGTGTT-----C--------CT-------------GTATTGTGTAACGC-CAA------GTAATT----AAGAAGG-TTTAAAAAC-AT--T---G-G-T-T-------------T--TCTC-----TCATAATATC-----A---TA----TT--TCAAGT--CA-TAA--G-------T------CT-AG-ATGACCACTCTTTA------------------GATAAATGG-AACT---AACTCCTC-TAA-TATCA
gi|35 : TA-A-TAGC--TTTCC-AAAA-G-CTTT-CCT-GA-C-TAAA-AA----A-TTC--TTCA--------TG---TA---AAG-TG-TT-AAT--AAGT-GAT-A-C-ATATATC-GACGA----TG---T--ACCC--TAC--atgtagagaatccccggaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacgatctaggtacaaaagatgcacaaacgtgcaacaagtccttgctgcgtctatgcaagtaagtgccaaacccgggacgttgtacatg
gi|11 : C--TTTCC-AAAAAA-CTTG-CCT-GA-C-TAAACAA----A-TTTCTTTTA-----A--T----TATT-ACG-TAGTT-AAT--AAGT-GAT-----ATATATCAGACGA-----G---T--ACTC--TGCATATA--AGTCGA-------CTTTTTT--ATA-GAGA-A-TTAT----A--AT-TGAT-GTTTCCTTGAATTTC-TCTG---TTT-AG----CGG--GGG-GG---GG-GGCGGGGGT---G-G-GG-TA--TAA--T----G--T--A-ACCC--AAGGTA-AAACATATGTTTTA-CT-TTCAATATCAAT----TTTCGCAT-TTAT---AACT-------CGTC----AAATAAATGA----C--AC-CAT----CAGAA-GCATG--CGGTGGATTTTATGAGATCAGAAATAG---------AGAAT---ATTGAAACACG
gi|27 : ttccttgatcttaaaggcggatccaaaacttgtattaacacttttagac-AAAAAA-CTTG-CCA-GA-C-TAAGCAC----A-TATCTTTCACTCGTA--TG---TAAT-AGA-TACTA-AAT--GAGT-GAT-G-C-TTA-ATCAGAAGA----TG------ACCT--T-C--GTACCAGT---TTTACGTTTTTATTAAATA-ACG--A-TTAT----A--AA-
gi|26 : aAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAACAA----A-TTTCTTTCA-----A--TG---TATT-AAG-TGGTT-AAT--AAGT-GAT-A-C-ATATATCAGACGA----TG---T--ACCA--TAC--ACA--AGTCGA---------TTTTT--ATA-CAGA-A-TTAT----A--AA-TGAT-GTTTCCTTAAATTTC-Ag
gi|4 : AT-ATC-ATGTATCACACGAA---TG---T--ACTC--TAC--ATTT-AGGCGACTT---TTT-------ATA-AAGA-T-TTAT----A--AA-TGAT-TCTTCCTCAAA---C-ACAC--TTTT-AG----TGG--------------G--GGT----------GT-TA--TTA--TT--AA--T--A-ACCA--AAG--A-AG----AAA-TTTT-CT-----------AT----T----CAT-T--T---GATA-------AATC----AAATAA---A----C--GC-C-C----CAGAA-GCATG------GGATGT------ATCA--GA-AA---------AATTTC-AATT-AAAT-C-GCAA-GAA-AAA-----A--AAAA--A---------------------------------------------------------------G---GA---T----C------G---------TTCCAATA-A-T-TTC---TAAATAATG--CTA-----GTGGAAACCCCGTTACGT--------CAA-GATTGTTCCATTTCAT------AAAGCC-ATTTTCGAAA-CCAC-------AAGC-TCAACGG--AT------------------ACACA-------A-TA--TA--C-A---AT-T---A-T--ATA----TA-C--AT-TGT-A-A-AATA-TCAAC--AAA----AA--CATAAA-T--GGAAGGGAC----TG--T--A-T-AGTCTCC---ATTA-CAAAGAT-GAG-GAGA-TT-ATGATATTACA---ATACATGT---A-----G--AACAGAATTTACA----------ATGT--------TATG-AGAAA-CTGT--CAC------ATT-T----AGAATTTTCCTAAATTAG------A---------------CAGTTCT-----C--------TG-------------GTATT-TGT-ACGT-TAA------GTAATT----AA--AAG-TTTAAAAAA-AT--T---G-G-C-G-------------T--TTTC-----TCAT-ATATC-----A---T-----TT--TCAAGT--CA-T-A--G-------T------ATAAG-ATGACACTTT---A------------------GAATAAATG-AACC---AA-TCCTT-TCA-TATCAT
gi|12 : caagtaatagctttccaaaatttgtaataccgattGA----TG---T--ACTC--TAC--ATT--AGTCGACTT---TTT-------GTA-CAGA-A-TTAT----A--AA-TGAC-TTTTCCTCAAATTTC-ACTG--TTTT-A----------------------G--AGAGG------G-GT-T-----------------------------G--A-A-----ATG-TTTT-CT-T--------------------CAT-T------AATC-------AAAC----AAAT-----A----C--GC-C-T----CAGAA-GCATG--GGGA---TGT------ATCAG--A-AA---------AATTTC-AATT-AAATGCGGCAA-GAA-AAAT--TTA-TACAA--A-------------------TTCATTTCAAGGTATAA----------------T-----A---TG---GA---T----C------G---------TCC--AATAA-T-TTC---TAAATAATATACTG-----GTGTAACCCC------GT--------TAAGGATTATTCCATTTCAT------AAAGCC-ATTTT------TCGTTTGCCACAAGC-TCAATGAAAAC------------------ACAC--------A-TA--TA--C-A---AT-T---ATT--ATA----TA-C--AT-TGgttagatat
gi|17 : ----TG---T--ATCC--TAC--ATA--AGTCGATTT---TTTT------ATA-TA-A-A-TTAT----A--AA-TGAT-GTTTCTTCAAATTTC-ACCA--TTTT-AG----GGG--TGGGTG---GT-G--G-TGGT---G-G--------------T--A---T--A-AGCA--AAG--A-A-----ATG-TTTA-TT-T--------AAT----T----CAT-T--T---GATT-------AATC----AAATAAAT-A----C--GC-C-T----CAGAA-GCATA--GGGAGGATGT------ATCAGAAA-AA---------AAAAAC-AAC---AAT----------T-AAAT--GTG-TAAAA--A-------------------T----------------------------------------------------T----C------A---------TT-----------------------------------------------------T--------CAAGG--TAT--------A-------AAG--CTATTTT------CCGT-------TAGC-C--------AC------------------AAGC--------A-
gi|29 : CTC--TAC--ATA--AGTCGACTT---TT-----T--ATA-GAGG-A-TTAT----A--AA-TGAT-GTCTCCTCAAATTTC-ACTAGGTTTT-TT----TTT--TGG--G---GG-G--GGGGGT-------AT-CAATTTA--TT--AA--T--A-ACCA--AGG--A-A-----ATG-TTTT-CT-T--------
gi|3 : --ATA--AGTCGATTT---T-----TT--ATA-GATA-A-TTAT----A--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATTTC-ACTA--TTTT-CG----GGG--TGG-TG---GT----GGTGGT-------GT-TA--TTA--TT--AA--T--A-ACCA--AAN--N-NC----ATG-T
gi|33 : gggaggatgtatcacaaaaaaatcaattaaatacgacaagaaaaatgtataaaaattcatttcaaggtataacatgaatttctaaatattgctatagtctagtgtaactccgtcaaggattattccatttcataaagccattttccgttagccacaagcatatatacaattatatatacatcgtcaatatatcaacaaaaacaacatagtggaaagtgagtagtctctattacaaagatagggggatatgattattaaaatatgttagaattacaatgtatgagaattgna--AGTCGACTT---TTT-------ATA-AAGA-A-TTATTTATA--AA-TGAT-GTTTCCTCAAA-TTC-ACTG--TTTT-AG-----GG---GG--G---GG-G--GGTGTT-------GT-TA--TTA--TT--AA--T--A-ACCA--AAG--A-A-----ATatttcaagtcagtctagatgacactttagaataaatggaactaatcctctataccatgtagattccccggaaatggtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtatctaggtacaataggtgcacaacgtgcaacaattctcttgctgtccgtgcaagtaagtgcaaacccgggtacgttgtacatg
gi|16 : cTTTTT--ATATGAGA-AATTAT----A--AA-TGAT-GTTTCCTCCAACTTC-ACTA---TTT-A------GG--TGG-GG---GG-G--GGT----------CT-TA--TTA--TT--AA--T--A-A-CA--AAG--A-A-----ATG--TTA-CT-T--------AACTGA-T----TAT-T--T---GATTTTAATCAAATT----AAAT-----A----C--GC-C-T----CAGAAGGCATGT-TGGAGGATGT------ATTA--GA-AA---------AATTTC-AATT--AATACGGCAA-GAA-AGCT--GTA-TAAAATCATTTCAAGGTATATAATCATT---------------A----------------T-----A---TG---GA---T----C------GTCCAAAAT-TTCGAAAT-A-T-TGC---T--AT
gi|45 : --ATG-GAGA-A-TTAT----A--AA-TGAC-GTTTCCTCAAATTTT-Atgg
gi|37 : -TTAT----A--AA-TTAT-GTTTCCTCAAATTTC-ACTA--T-----G-----GA--TGG---------G--GGTGGT---G----------TTA--TT--AA-----A-ACCA--AAG--A-A-----ATG-TTT
gi|40 : ----A--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATTTT-ACTG--TTTT----------------TG---GG-G--GGTG-----G-G-GT-TA--TTA--CT--AA--T--A-
gi|6 : TTTCCTCAAATTTCAACTG--TTTT-
gi|24 : aagtaagtggcggtttccaaagcttgcacataaacaaggggatttctttcactgagatgttaactgtttcaatagtgatgatatttagaaatgttcactctacatagtcgacT-TT--TTA--TT--AA--TTTA-ACCA--AAG--A-A-----ATA-CTTT-CT-T--------ATT----T----CAT-T--TATCAATT-------AAAT----AAAT-----A----C--GC-C-TCATGCAGAA-GCATG--CGGGGGATAT------ATCA--GA-AC---------AATTTC-AATT-AAATGCAGCAA-AAT-ACAC--ATA-T-AAA--A-------------------T---------------A----------------T-----A---TA---AAAATT----C------A---------TTTCAAtaagtggggaatgcttattctgattgatattgattaatgcaatacatgcgctcagaagcattacgggaggatgtatcaagtaaatttaatgttaaaatctttaaaaaatcagtttcaaagtatcgataatggattgtcaattttctgaaatccttcaaggattattcgtttcaagctcattggataacatataatacgaattaattatataacgtatatacaaaaacagcatagtttgaagagtgcgttagtctcagaaattaacaaagatagagagttaattattacacaatataatacactacactagagactaatctatttaatatagacattttcctaaattagacagttctttgtatttgttaccttaagtaattaataagattagaacattgtggttttgttctgtcattatatatcattttcaagatatatggtatagaggaccctttagaaatcatcctctatat
gi|6 : gggggtaG--G-A-----ATG-CTTA-TTCT--------GAT----T----GATAT--T---GATT-------AATG----CAAT-----A----CATGCGC-T----CAGAA-GCATTACGGGAGGATGT------ATCAAGTA-AATTTAATGTTAAAATC---TT----TA--------AA-AAATCAGTT-TCAAA--G-------------------T---------------A----------------TCGATAA---TG---GA---T----T------G---------TC---AAT---T-TTC---T--GAAAT---CC-------T---------------T--------CAAGGATTAT---------T-----------C-GTTTC-----------------AAGCTC--------ATTGGATA------------ACAT--------A-TAA-TA--CGA---AT-T---A-A--TTA----TA-T--AA-CGT-A---TATA--CAA----AAA--CAG--CAT-AG-TTTGAA---GAG----TG--C--G-TTAGTCTCAGAAATTAACAAAGATAGAGAGTTAATT-AT--TAC-ACA---AT--ATAA---T-----A--CA------CTACACTAGAGACTAATCTATTTAATATA-G-AC--A-TTTTCCTAA------ATT------AGA-----C---------------A-----------------GTTCT--------------TT-------------GTATT-TGTTACCT-TAA------GTAATT----AATAAGA-T-TAG-AAC-ATTGT---G-G-T-T-------------TTGTTCTG----TCAT--TAT------A---TATCATTT--TCAAGA--TA-T-ATGG-------T------AT-AG-AGGACCCTTT---A------------------GA--------AA-T---CA-TCCTC-T-A-TATggta
gi|8 : aagtaagtggcggtttccaaagcttgcacataaacaaggggatttctttcactgagatgttaactgtttcaatagtgatgatatttagaaatgttcactctacatagtcgactttcctcaaatttcaactgtttttaagtggT----T----CAT-T--T---AATT-------AATC----AAAT-----AGATAC--CC-C-T----CAGAA-GCATG--GG---------------------A-GA---------AAAATT---TC-AAA-ACTGCAA-GAA-AAAT--CTA-CAAAA--A-------------------TTC-------------A----------------TTTCA-A---CGTCCAA---TA---C------T---------TTCTAAAT-A-A-TGCGAGT--ATAAC---CC-------C--------------GT--------CAAGGATTATTCTATTTCAT------AAA--CCATTTT------TCGT-------AAAC-C--------AC------------------AAGCTCA-----A-TG--GA--T-A---AT-TGTTA-T--ATA----TA-C--AT-TGT-A-AATATA-TCAAG--AAAAA-CAA--TAT-AG-T--TGA---GAGGAACTG--T--A-T-AGTCTCC---ATTA-CAAAGAT-GAGAGATA-TG-AT--TATTACA---ATACATGTATAC-----GAAAA------TCACA----------ATGTA-------TGCG-A---A-TTGTTGCAC------ATTGT----AGA-----C---------------A----------------ATTTCC-----TA-A-A---TTAGACACGTCTCTGGTATT-TGTAACTCTTAA------GTAATTTTAAAAAGAAGTTTTAAAAAC-AT--T---ATG-T-T-------------T--TTCT-----TCAT--TATC-----A---TA----TT--TCAAGT--CA-T-A--G-------T------AT-AG-ATGAC--------ACTTTAAATTAGAATAAATGG--------AACT---CA-TCCTC-T-A-TATCAT
gi|3 : --GGGAGGATGT------ATCAC--A-AA---------AAAATC-AATT-AAATACGACAA-GAA-AAAT--GTA-TAAAA--A-------------------TTCATTTCAAGGTATAA----------------C-----A---TG---AA---T---------------------TTCTAAAT-A-T-TGC---T--ATAGT---CTA-----GT--------------GTAACTCCGTCAAGGATTATTCCATTTCAT------AAAGCC-ATTTT------CCGT-------TAGC-C--------AC------------------AAGC--------A-TA--TATAC-A---AT-T---A-T--ATA----TA-C--AT-CGTCA-A-TATA-TCAAC--AAAAA-CAA--CAT-AG-T--GGA---AAG----TG--A--G-T-AGTCTCT---ATTA-CAAAGATAGGGGGATA-TG-AT--TATTAAA---AT--ATGT---TA----G--AA------TTACA----------ATGTAgt
gi|9 : -AA---------AAAATC-AATT-AAATACGGCAA-GAA-AAAT--CTA-TGAAA--A-------------------TTC-------------ATTTCAATGTATAATATT-----A---TG---GA---T----C------GACCAATAATTTCTAAAT-A-A-TGC---T---TAGTG--TTAACCCCGT--------------GC--------AAGGGATTATCTCC----ATTCATTAAAC--C-ACTTTCTCCAGCCTT-------TGGC-C--------ACAACAAGTCATTGGTATACACAC--------A-TA--TA--T-ACATAT-T---ATT--ATACTGTTA-C--AT-TGTAA-A-TATA-TCAACAAAAAA--CAA--CAT-AG-T--GGA---GAG----AG--ACTGTT-AGTCTCC---ATTA-AAAAGATAGAGAGATA-TG-AT--TATTGCAAGTAC--ATGTG--TACCCAG--AA------TTACA----------AT-------ATTTGAG-AA--A-TTGTTGCAC------ATTG-----AGA-----CATTTTCCTAAATTAGA---------------CAGTTCT-----CCG---------------------GTAAA-TGTAACGT--------------TT----AAAAAAA-T----------T--G---G-G-G-T-------------T--TTCT-----TCAT-ATAT------A---TAT---TT--TCAAGT--CA-T-A--G-------T------AA-TG-ATGAC--------A------------------tgagaattgnaataagtcgattttttatagataattataaatgatgtttcctcaaatttcactattttcggggtggtggtggtggtgttattattaataaccaaannncatgtatttcaagtcagtctagatgacactttagaataaatggaactaatcctctataccatgtagattccccggaaatggtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtatctaggtacaataggtgcacaacgtgcaacaattctcttgctgtccgtgcaagtaagtgcaaacccgggtacgttgtacatg
gi|10 : TA-TCAAA--G-------------------T---------------A----------------T-----AATATG---GA---TTGTCC------AATAAT----TTCTAAAC-AAT-GGT---T--ATA-----CCA-----TT------------------------------TCAT--------A-------AAG--CCACTTT------CCGT-------TAGC-C--------AC------------------AAGCTCATATACA-TAAATA--C-A---AT-T---A-TT-ATA----TA-C--AC-------G-TACA-TCAAC--AAAAA-CAA--CAT-AC-T--GGA---GAG----TG--A--G-T-AGTCTCC---ATTA-CAAAGATAGAGAGATA-TG-AT--AATCATA---A----------------G--A--------------------------------TGTATGAAA--A-TTGTTGAAC------ATTTTTCTAAGG---------------------A---------------CAGCTCT-------G---------------------GTATC-TGTAACGC-TAA------GTAATT----AAATAAG-TTTATAAGC-AC--T---G-G-G-T-------------TA-TCCT-----ACAT-ATATATC---A---TA----TT--TCAAGT--CA-T-A--G-------TATACTATT-AG-ATGGC--------AATTTAGAATAAAT-----GG--------AACT---CA-TCCTC-T-A-TATCATctttaaaatagatgactcattccttccttatatatcatgtcataatattt
gi|7 : a---------TTCTAAAT-A-T-TGC---T--ATAGT---CTA-----GT--------------GTAACCCCGTCAATGATTATTCCATTTCAT------AAAGCC-ATTTT------CCGT-------TAGC-C--------AC------------------AAGC--------A-TA--TATAC-A---AT-T---A-T--ATA----TA-C--AT-TGT-ACA-TATA-CCAAC--AAAAA-CAA--CAT-AG-T--GGA---GAG----TG--A--G-T-AGTCTCC---ATTA-CAAAGATAGAGGGATA-TG-AT--TATTACA---AT--ATGT---TA----G--AA------TTACA-------------------ATGTATG-AGA-A-TCATTGCACATACCAATTGT----AGA-----C---------------A---------------CAGTTCT-----C--------TT-------------GTATT-GGTAACGC-CAA------GTAATT----AAAGAAG-TTTAAAAAC-AT--TG--G-G-T-T-------------T--TTCT-----TCAT-ATATC-----A---TA----TT--TCAAGT--CA-T-A--G-------T------CT-AA-ATGAC--------ACTTTAGAATAAAT-----GG--------AACT---AA-TCCTC-T-A-TATCATgtaga
gi|36 : aaaaat--------------GT--------CAAGGATTATTCCATTTCAT------AAAGCC-ATTTT------CCGT-------TTGC-C--------AC------------------AAGC--------gtagattccccggaaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacatgtatccaggtacaatatgtgcacaacgtgcaacaattctcttgctgtccatgcaagtaagtgcaaaaccgggtacgttgtacatg
gi|2 : gcgagtgtaaccccTCAT--------AA------AAG--CCATTTT------CCGT-------TAGC-C--------AC------------------AAGC--------A-TA--TAA-C-A---GTCT---A-T--ATT----TAAC--AT-TGT-A-AATATA-TCAAC--AAAAAACAAAACAT-AGGT--GGA---GAG----CG--A--G-T-AGTCTCC---ATTAACAAAGATGTAGCGATA-TGGAT--TAT-A-A---AT--ATGT---TA----G--AA------TTACA----------ATGTA---------TG-AG--AATTGTTGCAC------ATTGT----AGA-----C---------------A---------------CAGTTCT-----CAAG-A---TT-------------GTATT-TGTAACGC-CAGAT----GTAATT----AAAGAAG-TTTAGAAAC-AT--TG--G-G-TGT-------------T--TTCT-----TCAT-ATATATCATAA---TA----TT--TTAAGT--CA-T-A--G-------T------CT-AG-ATGAC--------ACG----------------GA--------AACTA--AA-TCCTCAT-AGTATCGTtcaatggata
gi|31 : acaagtacatagctttccaaaaaggcttgcctgaactaaacaaattctttcaaaatgatattaagtggtttaataagttgatacgatatatcagacgatgctatcccgtacataagtcgttttttatagagatattaaaatgatttcctcaaatttcatattttagggggtggggtggcgtgggtgggtggtttggtggtgtattatgaatataccaaagaaatgtttatcttaatcatttgataatcaagatcagacgattattccattc--------AC------------------ACAT--------A-TA--TA--C-A---AT-T---G-T---TG----TA-A--ATATATCA-A-CA-A-TCAAC--AAAAG-CAA--CAT-AG-T--GGA---CAG----TG--A--G-T-AGTCTCC---ATTA-CAA--------AGATG-TG-AT--TATTACA---Agtagattccccggaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaataggtgcacaacggtgcaatcaattctctgttgctgtccatcgccaagtaagtgcaaaccgggtacgtcttgtacatg
gi|14 : caagctgattggatA--TA--C-A---AT-T---A-TTAATA----AA-C--A------A-A-CAAA-CAAAC--AAAC--GGA--CAT-TG-T--GGA---GGG----TG--A--G-T-GGACACC---AATG-CACAGTTTGAAA------T-A----A--ACA---A-----AT---T-----G--AG----------A----------ATTT------CGTA-----------GTTGCAT------ATTGT----AGA--------------------------------------AATTTC-----CAAA-A---TTAAACAGTTCGTTAGTATT-TTTGACAT-TGA------GTAATT----CAATCAG-TTTAAAAAC--T--C---A-A-T-G-------------T--TTGT-----ATAG-ATAC------AATTTG----TC--TCAAGT--CA-T-C--G-------T------AT-AG-AAAAG--------T------------------GA--------AACT---
gi|38 : cctaagtctcattggacgtacataaAAGATAGAGGGATA-TG-AT---ATTACA---AT--ATGT---TA----G--TA------TTACA----------ATGTA---------TG-AG--AATTGTTGCAC------ATTGttagatgaagtgcaccatttttt
gi|28 : -----G--AA------TTACA----------ATGTA-----TG-ATA-AA-----TGTTGCAC------ATAGT----AGA-----A---------------A---------------TTTTCCTAAATGCGGGCA---TTTCTCTG-------GTATT-TGTAGCGT-TAAGTACATGTAATT----AAATAAG-T
gi|22 : caattacgtgtacacgaTATG-AG--AATTGTTGCAC------ATTGT----AGA-----C---------------ATTTTCCTCAATTAGACAGTTCT-----CGGG---------------------TATT-TGTAACGC-GAA------GTAATT----AAAGAAG-TTTAAAAGCAAT--A---G-G-T-T-------------T--TTCT-----TCAT-ATAT----------TA----TT--TAAAAT--CA-T-A--G-------T------AT-AG-ATGAC-------------------------------------ACCTTAGAA-TCCTC-T-A-TATCATt
gi|20 : a-TTGTTGCAC------ATTAT----AGATTT--T---------------A---------------CTGATAT-----TAGACATTCTT-------------GTATT-TGT-ACGC-TAA------GTAATTTA--AAATAAG--ATTCAAAC-AT--TG--G-G-T-T-------------T--TTCTATGAATCATAATAT------A---CC----TT--TCAAGT--TGTT-A--GGGACGACT------TT-AGAATTAT--------AAAT---------------GG--------AACT---CA-TCCTC-T-A-TATgtagatt
gi|25 : tcatgttatgagattttccttaattAGTTCT-----CTGG-A--------------------ATT-TGTAACAC-TAA------GTAATT----TAATAAG-TTAAAAAAT-GC--TA--G-G-T-TTCACATAATAAAAT--TTCT-----TAAT-ATAT------C---TT----TTTCTCAAGT--TA-C-A--A-------T------AT-TG-GGGACACCTT---A------------------GAAAAAATGTAACT---GA-TCCTC-T-A-TATCA
gi|13 : tttcttaaattaggtA------GTAATT----AAAGACG-TTTTAAAAC-AT--TTTGG-G-T-T-------------T--TTCT-----TCAT-ATATC-----A---TA-----T--TCATGA--CA-T-A--G-------T------GT-AG-ATGAC--------ACTTTAGAATAAAT-----GG--------AACT---CA-TCCTT-T-A-
gi|32 : accgttaatgtcatacacaaagagagatgtgattattacaatacatgtatacgagnaaagacgatgtgaggaagttggagaggaactgctaaatctagcacaacagtctgtgcaatctgcattacaagaagaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAGTT----AAATAAG--ATTAAAAC-GT--T---G-GGT-T-------------T--TTCT-----TCAT-ATAT------A---T-----TT--TCAAGTTATA-T-A--G-------T------AT-GG-AGGAC--------A------------------
gi|3 : AT------G---TA----TT--TCAAGT--CA------G-------T------CT-AG-ATGAC--------ACTTTAGAATAAAT-----GG--------AACT---AA-TCCTC-T-A-TACCATcattagaatttataaatggaactcatcctcta
7 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|21 ): AGCCACAGTCTCATTGGATGTACAAAAGTACAATTATTAATTAATAAACAAACACGGCACTGTGGAGAGTGGGTAGACATCAATGCTACACTAATACACACTTAATTATCGCACCGTATGATAATTTTGTAGATTTAATTTGTTGCATATTGCAAAATTAAACAATTCGGTAGATTTTT
Unaligned ( gi|23 ): TCCGGAAAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAATAGGTGCACAACGTGCAACAATTCTCTTGCTGTCCATGCAAGTAAG
Unaligned ( gi|30 ): GAATTCCTGAAGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAATAAAGTAACTAATTTTCTATGCACAACAAATTTTTGCTCTTCAATATGAACAATAATTTTGTGCTCGTCAATAAAGACA
Unaligned ( gi|34 ): ACACGTGTACGAGAATTACAATATCAAGAGAATTGTTGCGCATGAACATTTTCCTAAAATGTTCAATGGTATATGTAACGTTTAAAAACATTGG
Unaligned ( gi|41 ): AGGATTATTCCGTTTCAAGCTCATTGGATAAACATATATACGATTATTACATG
Unaligned ( gi|43 ): TTTCGAATAAATGGAACTCATCCTCTATACCATGTAAATTCC
Unaligned ( gi|44 ): GAGTCCTTGTTAACATGAATAAAATTAAGTGTATCA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11111111 111111 222222222 111111111 33333333333333333333 11111 111111111111111 1111111 2222222222 111111 111 111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 55555555555555555555555555555555555555555 11111111 11111111111 111111111111111 111 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 111111 111 1111111111111 2222222222222222 1111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 3 3 44 2 2 2 2 3 3 6666 6 22222222 999 3 3 7 55 3 333333 8888 777 33 33 55 888888888 2 2 666 2 4444 22 2 2 2 7777777 444444444 55 7777 2 4 2 55555555555555555555 333 33 55 33 33 2 33 33 2 00000 2 44 3 444444444444444 6666 3 44 555 0000000 6666 8888888888 55 3 3 7777 3 888 222222 999 44 44 444 3 22 0 3 333333333 77 666 3 44 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 2 0 2 2 77777 2 888888 2 11111111111111111111111111111111111111111 2 555 33 2 77777777 22222222222 444 2 2 99 5555 2 33 111111111111111 77777 3 3 44 3 44 6 3 44 6666 66666 6 3 555 44 3 3 2 2 0 222 33 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 777777 6666 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 2 0 2 555555 8888 2 2 2 33 888 2 2 2 4444444444444 66 99999 5 5555555555555555 33 33 2 2 33 8888888 8888888 2 5555 7777777777777777777777777777777777777777777 2 33 44 5 88888 5 2
lowQualScore : . . .. . . . . . . .... . ........ ... . . . .. . ...... .... ... .. .. .. ......... . . ... . .... .. . . . ....... ......... .. .... . . . .................... ... .. .. .. .. . .. .. . ..... . .. . ............... .... . .. ... ....... .... .......... .. . . .... . ... ...... ... .. .. ... . .. . . ......... .. ... . .. ...................................................................................................................................... . . . . ..... . ...... . ......................................... . ... .. . ........ ........... ... . . .. .... . .. ............... ..... . . .. . .. . . .. .... ..... . . ... .. . . . . . ... .. ......................................................... ...... .... ....................................................................... . . . ...... .... . . . .. ... . . . ............. .. ..... . ................ .. .. . . .. ....... ....... . .... ........................................... . .. .. . ..... . .
lowQualScore : 3 3 22 9 7 7 7 1 1 5555 2 00000000 222 6 6 3 00 6 333333 9999 999 99 77 99 000000000 4 4 555 2 5555 99 1 2 1 6666666 888888888 66 4444 2 7 4 00000000000000000000 999 22 66 22 22 4 44 22 4 66666 5 11 1 333333333333333 5555 1 22 444 0000000 5555 3333333333 00 6 6 7777 6 333 999999 999 22 22 222 1 66 8 3 333333333 99 333 1 66 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 9 1 9 9 11111 9 222222 9 11111111111111111111111111111111111111111 9 000 77 7 00000000 77777777777 777 7 7 00 7777 7 77 555555555555555 77777 1 1 22 1 22 2 1 22 5555 55555 2 1 444 22 1 1 7 7 9 000 99 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 777777 1111 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 9 9 9 000000 8888 8 5 7 77 000 7 7 7 7777777777777 33 33333 3 9999999999999999 44 44 5 5 44 1111111 2222222 5 3333 4444444444444444444444444444444444444444444 4 22 22 0 88888 0 5
consensus : GTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAACAA----A-TTTCTTTCA-----A--TG---TATT-AAG-TGGTT-AAT--AAGT-GAT-A-C-ATATATCAGACGA----TG---T--ACCC--TACATA--AGTCGACTTTT--TTTTTTA-TA-GAGA---A-TTAT----A--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATTTC-ACTA-------TTT--T-A--G-GG--TGG----GG-GG-G-GTGG-TGG-GT------------TA--TTA--TT--AA--T--A-ACCA--AAG--A-A-----ATG-TTTA-CT-T--------AAT----T----CAT-T--T---GATT-------AATC----AAAT-----A----C--GC-C-T----CAGAA-GCATG--GGGAGGATGT------ATCA-GGA--AAAA--AATC-AATT-AAATACGGCAA-GA---------A--AAAT--GTA-TAAAA--AT-----------------TC-ATTTCA------------A-TG---GAT-CG---------T---------TCTAAA-TA-TTGC---T--A--TAGT---CTA-----GT--------------GT--------CA-AGGATTAT-TCCATT-TCA-----TAAA-GCCATTTTC------CGTTAG-CCACAA----------G---------------C--------------A-T---A--T-A--------CA-----------A---T-TA-T--ATA----T-AC--A----TTGT-A-A---TAT-----A-TCAAC-AAA--AA-C--A-ACATA-GT--GGAGAG----TG--A--GT-AGTC-TCC---AT--T-A-CAAAGATAGAGAGA-TAT-GATTATTACA---AT--ATGT-----T---AGA----A------TT-A-----CAATGT--AT---GTAT-GAG--A-TTGTTGCAC------ATTGT----AGA------C---------A---------------CAGTTCT-----C-GG--A-----TT-------------GTATT-TGTAACGC-TAA------GTAATT----AAANAAG-TTTAAAAAC-AT--T---G-G-T-T-------------T--TTCT-----TCAT-ATAT------A---TA----TT--TCAAGT--CA-T-A--G-------T------NT-AG----ATGACA--TTA-A---------A------------T----G-------G-A--ACT-CA-TCCTC-----T-A-TATCAT
Reference ( family-2690 ) : GTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAACAA----A-TTTCTTTCA-----A--TG---TATT-AAG-TGGTT-AAT--AAGT-GAT-A-C-ATATATCAGACGA----TG---T--ACCC--TACATA--AGTCGACTTTT--TTTTTTA-TA-GAGA---A-TTAT----A--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATTTC-ACTA-------TTT--T-A--G-GG--TGG----GG-GG-G-GTGG-TGG-GT------------TA--TTA--TT--AA--T--A-ACCA--AAG--A-A-----ATG-TTTA-CT-T--------AAT----T----CAT-T--T---GATT-------AATC----AAAT-----A----C--GC-C-T----CAGAA-GCATG--GGGAGGATGT------ATCA-GGA--AAAA--AATC-AATT-AAATACGGCAA-GA---------A--AAAT--GTA-TAAAA--AT-----------------TC-AT----------------A-TG---GAT-CG---------T---------TCTAAA-TA-TTGC---T--A--TAGT---CTA-----GT--------------GT--------CA-AGGATTAT-TCCATT-TCA-----TAAA-GCCATTTTC------CGTTAG-CCACAA----------G---------------C--------------A-T---A--T-A--------CA-----------A---T-TA-T--ATA----T-AC--A----TTGT-A-A---TAT-----A-TCAAC-AAA--AA-C--A-ACATA-GT--GGAGAG----TG--A--GT-AGTC-TCC---AT--T-A-CAAAGATAGAGAGA-TAT-GATTATTACA---AT--ATGT-----T---AGA----A------TT-A-----CAATGT--AT---GTAT-GAG--A-TTGTTGCAC------ATTGT----AGA------C---------A---------------CAGTTCT-----C-GG--A-----TT-------------GTATT-TGTAACGC-TAA------GTAATT----AAANAAG-TTTAAAAAC-AT--T---G-G-T-T-------------T--TTCT-----TCAT-ATAT------A---TA----TT--TCAAGT--CA-T-A--G-------T------NT-AG----ATGAC-----------------A------------T----G-------G-A--ACT-NA-TCCTC-----T-A-TATCAT
gi|1 : TA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCTCGA-C--AAACAA----AATTTCTCT-A-----A--TG---GATT-AAGCTGGTT-AACTAAAGT-GATTA-C-ATATATCAGACGAATGTTG---T--GCC---TACATA--AGTCGA----T--TTTTTTA-TA-GAGG---A-T-AT----AGCAA-TGAT-GTT-CCTCAA-TTTC-ACTA-------TTT-------A-GG--CGGTAAAAG-GA-G-GTGT-TG---T------------TG--TTAACTTCAAA--T--A-ATCAGAAAG--ACA-----ATG-TT-A-CT-T--------AATCAATT----AAT-T--T---GATT-------AATC----AAAT-----AAATAC--GC-C-T----TA-AA-GCATG--GGGAGGTTGTT-----ATCA-AGA--AAAT--AAAC-A--T-AAATACGGCAATGA---------AC-AAAT--TTAATAAAA--AT-----------------TC-ATTTCAAAGGTATAT---A-TG---GGA-CG---------TCCAAAAAATTCTAAAATA-T-GC---T--A--TAGT---CTATAGT-GTAAACCCC-------GT--------CA-AGGATTAT-TCCAT---CA-----TAAA-GCCATTTTC------CGTTAGGCCACAA----------G---------------C--------------AAT---A--C-A--------CA-----------A---T-TA-T--ATA----T-ACTCA----CTGA-A-A---TAT-----ACTCAAC-AAA--AA-C--A-ACATA-G---GGAGAG----TGTGA--GT-AGTC-TCC---AT--T-A-AAAAGA-AGA-AGG-GAT-GAT-ATTACA---AT--ATGT-----T---TGT----A------TTTA-----CA---T--AT---GTAT-GAGGAA-TTGTTGCAC------ATTGT----AGA------CGAT------A---------------CAGTGTT-----C-----------CT-------------GTATTGTGTAACGC-CAA------GTAATT----AAGAAGG-TTTAAAAAC-AT--T---G-G-T-T-------------T--TCTC-----TCATAATATC-----A---TA----TT--TCAAGT--CA-TAA--G-------T------CT-AG----ATGACCACTCTTTAGATAA---A------------T----G-------G-A--ACT-AACTCCTC-----TAA-TATCA
gi|10 : TA-TCAAA--GTA----------------TA-AT----------------A-TG---GAT-TG---------T---------CC--AA-TAATTTC---T--A--AA---------------------------------------CA-ATGGTTAT-ACCATT-TCA-----TAAA-GCCACTTTC------CGTTAG-CCACAA----------G---------------CTCATATAC------A-T---AAAT-A--------CA-----------A---T-TA-TT-ATA----T-AC--A----C------G---TAC-----A-TCAAC-AAA--AA-C--A-ACATA-CT--GGAGAG----TG--A--GT-AGTC-TCC---AT--T-A-CAAAGATAGAGAGA-TAT-GATAATCATA---A----------------------------------------GATGT--AT---G----AAA--A-TTGTTGAAC------ATTTTTCTAAGG----------------A---------------CAGCTCT-------G------------------------GTATC-TGTAACGC-TAA------GTAATT----AAATAAG-TTTATAAGC-AC--T---G-G-G-T-------------TA-TCCT-----ACAT-ATATATC---A---TA----TT--TCAAGT--CA-T-A--G-------TATACTATT-AG----ATGGCAATTTAGAATAA-----A------------T----G-------G-A--ACT-CA-TCCTC-----T-A-TATCATatgtagagaatccccggaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacgatctaggtacaaaagatgcacaaacgtgcaacaagtccttgctgcgtctatgcaagtaagtgccaaacccgggacgttgtacatg
gi|11 : aC--TTTCC-AAAAAA-CTTG-CCT-GA-C-TAAACAA----A-TTTCTTTTA-----A--T----TATT-ACG-TAGTT-AAT--AAGT-GAT-A----TATATCAGACGA-----G---T--ACTC--TGCATATAAGTCGACTTTT------TTA-TA-GAGA---A-TTAT----A--AT-TGAT-GTTTCCTTGAATTTC-TCTG-------TTTAGC-G--G-GG--GGG----GG-GGCG-GGGG-TGG-GG------------TA--TAA--T----G--T--A-ACCC--AAGGTA-AAACATATGTTTTA-CT-TTCAATATCAAT----TTTCGCAT-TTAT---AACT-------CGTC----AAATAAATGA----C--AC-CAT----CAGAA-GCATG--CGGTGGATTTTATGAGATCA-GAAATAGAG--AAT---ATTGAAACACGgtaga
gi|12 : ttccttgatcttaaaggcggatccaaaacttgtattaacacttttagacGA----TG---T--ACTC--TACATT--AGTCGACTTTT--T-----G-TA-CAGA---A-TTAT----A--AA-TGAC-TTTTCCTCAAATTTC-ACTG-------TTT--T-A--G-AG--AGG----G----------------GT------------T-----------------------------G--A-A-----ATG-TTTT-CT-T--------------------CAT-T------AATC-------AAAC----AAAT-----A----C--GC-C-T----CAGAA-GCATG--GGGA---TGT------ATCA-G-A--AAAA--TTTC-AATT-AAATGCGGCAA-GA---------A--AAAT--TTA-TACAA--AT-----------------TC-ATTTCAAGGTATAAT---A-TG---GAT-CG---------T---------CC--AA-TAATTTC---T--AAATAATATACTG-----GT--------------GTAACCCCGTTA-AGGATTAT-TCCATT-TCA-----TAAA-GCCATTTTT------CGTTTG-CCACAA----------GCTCAATGAAAACACAC--------------A-T---A--T-A--------CA-----------A---T-TATT--ATA----T-AC--A----TTG
gi|13 : AGAGAGA-TGT-GATTATTACA---AT--A
gi|13 : accgttaatgtcatacacaaA------GTAATT----AAAGACG-TTTTAAAAC-AT--TTTGG-G-T-T-------------T--TTCT-----TCAT-ATATC-----A---TA-----T--TCATGA--CA-T-A--G-------T------GT-AG----ATGACACTTTAGAATAA-----A------------T----G-------G-A--ACT-CA-TCCTT-----T-A-catgtatacgagnaaagacgatgtgaggaagttggagaggaactgctaaatctagcacaacagtctgtgcaatctgcattacaagaagaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaattaaagacgttttaaaacattttgggtttttcttcatatatcatattcatgacatagtgtagatgacactttagaataaatggaactcatcctttat
gi|14 : accgttaatgtcatacacaaagagagatgtgattattacaatacatgtatacgagnaaagacgatgtgaggaagttggagaggaactgctaaatctagcacaacagtctgtgcaatctgcattacaagaagaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn---A--T-A--------CA-----------A---T-TA-TTAATA----A-AC--A---------A-A---CA----------AAC-AAACAAA-C--GGACATT-GT--GGAGGG----TG--A--GT-GGAC-ACC---AA--T-G-CACAGTTTGAAA-----T-AA-----ACA---A---AT-T-----G---AGA----A------TT-T-----C------------GTA-----------GTTGCAT------ATTGT----AGAAATTTCC---------AAAATTAAA-------CAGTTC---------G--T-----TA-------------GTATT-TTTGACAT-TGA------GTAATT----CAATCAG-TTTAAAAAC--T--C---A-A-T-G-------------T--TTGT-----ATAG-ATAC------AATTTG----TC--TCAAGT--CA-T-C--G-------T------AT-AG----A-AAA-----------------G------------T----G-------A-A--ACT-
gi|15 : cctaagtctcattggacgtacataaGTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAACAA----A-TTTCTTTCA-----A--TG---TATT-AAG-TGGTT-AAT--A-----------------TCAGATGA----TG---T--ACCC--TACATA--AGTCGAATTTT--T-----A-TA-GA-----A-TTAT----A--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATTTC-ACTA-------TTT--T-A--G-GG--TGG-------------TGG-TGGTGT------------TA--TTA--TT--AA--T--A-ACCA--AAG--A-A-----ATG-TTTA-CT-T--------AAT----T----CAT-T--T---GATT-------AATCAAATAAAT-----A----C--GC-C-T----CAGAA-GCATG--GGGAGGATGT------ATCA-G----AAAA--AATCAAATT-AAATACGGCAA-GA---------A--AAAT--GTA-TAAAttagatgaagtgcaccatttttt
gi|16 : TTTTTA-TATGAGA---AATTAT----A--AA-TGAT-GTTTCCTCCAACTTC-ACTA-------TTT-------A-GG--TGG----GG-GG-G---GG-T---CT------------TA--TTA--TT--AA--T--A-A-CA--AAG--A-A-----ATG--TTA-CT-T--------AACTGA-T----TAT-T--T---GATTTTAATCAAATT----AAAT-----A----C--GC-C-T----CAGAAGGCATGT-TGGAGGATGT------ATTA--GA--AAAA--TTTC-AATT--AATACGGCAA-GA---------A--AGCT--GTA-TAAAATCATTTCAAGGTATATAATCATT-AT----------------A-TG---GAT-CGTCCAAAAT-T---------TCGAAA-TA-TTGC---T--A--T
gi|17 : ----TG---T--ATCC--TACATA--AGTCGA----T--TTTTTTA-TA-TA-A---A-TTAT----A--AA-TGAT-GTTTCTTCAAATTTC-ACCA-------TTT--T-A--G-GGG-TGG----GT-GGTG-GTGG-TGG-------------------------T--A---T--A-AGCA--AAG--A-A-----ATG-TTTA-TT-T--------AAT----T----CAT-T--T---GATT-------AATC----AAAT-----AAATAC--GC-C-T----CAGAA-GCATA--GGGAGGATGT------ATCA-GAA--AAAA--AA---------AA-----CAA-CA---------ATTAAAT--GTG-TAAAA--AT-----------------TC-AT----------------tgg
gi|17 : -----GT--------------GT---------A-AAAATT-----CATT-TCAAGGTATAAA-GCTATTTTC------CGTTAG-CCACAA----------G---------------C--------------A-ttcaaggtataaagctattttccgttagccacaagca
gi|18 : tgtatcctacataagtcgatttttttatataaattataaatgatgtttcttcaaatttcaccattttaggggtgggtggtggtggtggtataagcaaagaaatgtttatttaattcatttgattaatcaaataaatacgcctcagaagcatagggaggatgtatcagaaaaaaaaaacaacaattaaatGTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAACAA----A-TTTCTTTCA-----C--TG---TATT-ACG-TGGTT-AAT--AAGT-AAT-----ATATATCAGACGA----TGTACT--ACTC--TACATA--AGTCGAC-------CTTTTA-TA-GAGA---A-TTAT----A--AA-TGAC-GTTT-CTCAAATTTC-TCTG-------TTT--A-A--G-GG--GGG----GG-GG-G-G----------------------TA--TTA--TT--AATTT--A-ACCA--AAG--A-A-----ATG-TTAT-CT-T--------AAT----T----CAT-T--T---GATT-------AAGC----AAA
gi|19 : caaGTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTGGCCT-GA-C-TAAACAA----ACTTTCTTTC------A--TG---TATTAAAG-TGGTT-AAT--AAGT-GAT-A-C---ATATTAGACGA----TG---T--A--T--TA-ATA--AGTCGA----T--TTTTTTA-TA-GAGA---A--TAT----A--AATTCATGGTTTCCTCACATTTC-ACTA-------TTT--T-AAGG-GG--TGG----GGTGG-G-GTGG-GGGTGT------------TT--TTA--TTA-AA--T--A-ACCA--AAG--A-A-----ATG-T
gi|2 : caaGTACA-TAGC--TTTCC-AAAAAGGCTTG-CCT-GAAC-TAAACAA----A-TT-CTTTCA-----AAATGA--TATT-AAG-TGGTTTAAT--AAGTTGAT-A-CGATATATCAGACGA----TGC--T--ATCCCGTACATA--AGTCG--------TTTTTTA-TA-GAGAT--A-TTA-----A--AA-TGAT---TTCCTCAAATTTC-A-TA-------TTT--T-A--G-GGGGTGG----GG-TG-GCGTGGGTGG-GTGGTTTGGTGGTGTA--TTA--TG--AA--T--ATACCA--AAG--A-A-----ATG-TTTATCT-T--------AA-----T----CAT-T--T---GA-T-------AATC----AA
gi|2 : acaa--A--TAAT---CAA-----G---------------AT--------CAGACGATTAT-TCCATTCTCA-----TAAAAGCCATTTTC------CGTTAG-CCACAA----------G---------------C--------------A-T---A--TAA--------CA-----------G---TCTA-T--ATT----TAAC--A----TTGTAA-A---TAT-----A-TCAACAAAA--AA-CAAA-ACATAGGT--GGAGAG----CG--A--GT-AGTC-TCC---AT--TAA-CAAAGATGTAGCGA-TATGGATTA-TA-A---AT--ATGT-----T---AGA----A------TT-A-----CA------AT---GTAT-GAGA-A-TTGTTGCAC------ATTGT----AGA------C---------A---------------CAGTTCT-----CAAG--A-----TT-------------GTATT-TGTAACGC-CAGAT----GTAATT----AAAGAAG-TTTAGAAAC-AT--TG--G-G-TGT-------------T--TTCT-----TCAT-ATATATCATAA---TA----TT--TTAAGT--CA-T-A--G-------T------CT-AG----ATGAC-----------------A------------C----G-------GAA--ACTAAA-TCCTCA----T-AGTATCGTgatcagacgattattccattctcataaaagccattttccgttagccacaagcatataacagtctatatttaacattgtaaatatatcaacaaaaaacaaaacataggtggagagcgagtagtctccattaacaaagatgtagcgatatggattataaatatgttagaattacaatgtatgagaattgttgcacattgtagacacagttctcaagattgtatttgtaacgccagatgtaattaaagaagtttagaaacattgggtgttttcttcatatatatcataatattttaagtcatagtctagatgacacggaaactaaatcctcatagtatcgtgtagattccccggaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaataggtgcacaacggtgcaatcaattctctgttgctgtccatcgccaagtaagtgcaaaccgggtacgtcttgtacatg
gi|20 : acaagtacatagctttccaaaaaggcttgcctgaactaaacaaattctttcaaaatgatattaagtggtttaataagttgatacgatatatcagacgatgctatcccgtacataagtcgttttttatagagatattaaaatgatttcctcaaatttcatattttagggggtggggtggcgtgggtgggtggtttggtggtgtattatgaatataccaaagaaatgtttatcttaatcatttg-TTGTTGCAC------ATTAT----AGA------TTTT------A---------------CTGATAT-----T-AG--ACATTCTT-------------GTATT-TGTA-CGC-TAA------GTAATTTA--AAATAAG-ATT-CAAAC-AT--TG--G-G-T-T-------------T--TTCTATGAATCATAATAT------A---CC----TT--TCAAGT--TGTT-A--GGGACGACT------TT-AGAATTATAA------------------A------------T----G-------G-A--ACT-CA-TCCTC-----T-A-TATgtagattccccggaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaataggtgcacaacggtgcaatcaattctctgttgctgtccatcgccaagtaagtgcaaaccgggtacgtcttgtacatg
gi|21 : tcatgttatgagattttccttaatt--T-A--------CA-----------A---T-TA-T---------T-A---A----TT---A-A---TA----------AAC-AAA--CA-C--G-GCACT-GT--GGAGAG----TG--G--GT-AGACATCA---ATGCT-A-CACTAATACACACT-TA---ATTATCGCACC-GT--ATG----------ATA----A------TT---------TTGT--AG---AT-T-TAA--T-TTGTTGCAT------ATTGC----AAA------
gi|22 : agccacagtctcattggatgtacaaaagTAT-GAG--AATTGTTGCAC------ATTGT----AGA------C---------ATTTTCCTCAATTAGACAGTTCT-----C-GG-----------------------GTATT-TGTAACGC-GAA------GTAATT----AAAGAAG-TTTAAAAGCAAT--A---G-G-T-T-------------T--TTCT-----TCAT-ATAT----------TA----TT--TAAAAT--CA-T-A--G-------T------AT-AG----ATGAC-----------------ACCT---------T----A-------G-A-------A-TCCTC-----T-A-TATCATattaaacaattcggtagattttt
gi|24 : aG-GG-G-GTA-------T------------TT--TTA--TT--AA--TTTA-ACCA--AAG--A-A-----ATA-CTTT-CT-T--------ATT----T----CAT-T--TATCAATT-------AAAT----AAAT-----A----C--GC-C-TCATGCAGAA-GCATG--CGGGGGATAT------ATCA--GA--ACAA--TTTC-AATT-AAATGCAGCAA-AATACACATATA--AAAT--ATA-TAAAA--AT-----------------TC-AT----------------gtagatt
gi|25 : AGTTCT-----CTGG--A----------------------ATT-TGTAACAC-TAA------GTAATT----TAATAAG-TTAAAAAAT-GC--TA--G-G-T-TTCACATAATAAAAT--TTCT-----TAAT-ATAT------C---TT----TTTCTCAAGT--TA-C-A--A-------T------AT-TG----GGGACACCTTAGAAAAA-----A------------T----G-------T-A--ACT-GA-TCCTC-----T-A-TATCAttcaaggta
gi|26 : tttcttaaattaggtAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAACAA----A-TTTCTTTCA-----A--TG---TATT-AAG-TGGTT-AAT--AAGT-GAT-A-C-ATATATCAGACGA----TG---T--ACCA--TACACA--AGTCGA--------TTTTTA-TA-CAGA---A-TTAT----A--AA-TGAT-GTTTCCTTAAATTTC-A
gi|27 : -AAAAAA-CTTG-CCA-GA-C-TAAGCAC----A-TATCTTTCACTCGTA--TG---TAAT-AGA-TACTA-AAT--GAGT-GAT-G-C-TTA-ATCAGAAGA----TG------ACCT--T-CGTA-----CCAGTTTTACGTTTTTATTA-AATAACGA-TTAT----A--AA-
gi|28 : a---AGA----A------TT-A-----CAATGT--AT---G-AT-AAA-----TGTTGCAC------ATAGT----AGA------A---------A---------------TTTTCCTAAATGC-GGGCA-----TTTCTCTG-------GTATT-TGTAGCGT-TAAGTACATGTAATT----AAATAAG-TTg
gi|29 : caattacgtgtacacgCTC--TACATA--AGTCGACTTTT-------TA-TA-GAGG---A-TTAT----A--AA-TGAT-GTCTCCTCAAATTTC-ACTAGGTTTTTTTT--T----------TGG----GG-GG-G-GGGG-T---AT------------CAATTTA--TT--AA--T--A-ACCA--AGG--A-A-----ATG-TTTT-CT-T--------
gi|3 : --GGGAGGATGT------ATCA-C-A--AAAA--AATC-AATT-AAATACGACAA-GA---------A--AAAT--GTA-TAAAA--AT-----------------TC-ATTTCAAGGTATAAC---A-TG---AAT------------T---------TCTAAA-TA-TTGC---T--A--TAGT---CTA-----GT--------------GTAACTCCGTCA-AGGATTAT-TCCATT-TCA-----TAAA-GCCATTTTC------CGTTAG-CCACAA----------G---------------C--------------A-T---A--T-ATA------CA-----------A---T-TA-T--ATA----T-AC--A----TCGTCA-A---TAT-----A-TCAAC-AAA--AA-C--A-ACATA-GT--GGAAAG----TG--A--GT-AGTC-TCT---AT--T-A-CAAAGATAGGGGGA-TAT-GATTATTAAA---AT--ATGT-----T---AGA----A------TT-A-----CAATGT--AT---G
gi|3 : ATA--AGTCGA-------TTTTTTA-TA-GATA---A-TTAT----A--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATTTC-ACTA-------TTT--TCG--G-GG--TGG----TG-GT-G-GTGG-T---GT------------TA--TTA--TT--AA--T--A-ACCA--AAN--N-NC----ATG-Tagaattgnaataagtcgattttttatagataattataaatgatgtttcctcaaatttcactattttcggggtggtggtggtggtgttattattaataaccaaannncatgtatttcaagtcagtctagatgacactttagaataaatggaactaatcctctataccatgtagattccccggaaatggtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtatctaggtacaataggtgcacaacgtgcaacaattctcttgctgtccgtgcaagtaagtgcaaacccgggtacgttgtacatg
gi|3 : gggaggatgtatcacaaaaaaatcaattaaatacgacaagaaaaatgtataaaaattcatttcaaggtataacatgaatttctaaatattgctatagtctagtgtaactccgtcaaggattattccatttcataaagccattttccgttagccacaagcatatatacaattatatatacatcgtcaatatatcaacaaaaacaacatagtggaaagtgagtagtctctattacaaagatagggggatatgattattaaaatatgttagaattacaatgtatgagaattgnaAT------G---TA----TT--TCAAGT--CA------G-------T------CT-AG----ATGAC-----------------ACTTTAGAATAAAT----G-------G-A--ACT-AA-TCCTC-----T-A-TACCATatttcaagtcagtctagatgacactttagaataaatggaactaatcctctataccatgtagattccccggaaatggtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtatctaggtacaataggtgcacaacgtgcaacaattctcttgctgtccgtgcaagtaagtgcaaacccgggtacgttgtacatg
gi|31 : gggaggatgtatcacaaaaaaatcaattaaatacgacaagaaaaatgtataaaaattcatttcaaggtataacatgaatttctaaatattgctatagtctagtgtaactccgtcaaggattattccatttcataaagccattttccgttagccacaagcatatatacaattatatatacatcgtcaatatatcaacaaaaacaacatagtggaaagtgagtagtctctattacaaagatagggggatatgattattaaaatatgttagaattacaatgtatgagaattgnaataagtcgattttttatagataattataaatgatgtttcctcaaatttcactattttcggggtggtggtggtggtgttattattaataaccaaannncCAA----------G---------------CTG------------A-TTGGA--T-A--------CA-----------------CA-T--ATA----T-AC--AATTGTTGT-A-AATATATCAACAA-TCAAC-AAA--AG-C--A-ACATA-GT--GGACAG----TG--A--GT-AGTC-TCC---AT--T-A-CAA--------AGA-TGT-GATTATTACA---Agtagattccccggaaatggtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtatctaggtacaataggtgcacaacgtgcaacaattctcttgctgtccgtgcaagtaagtgcaaacccgggtacgttgtacatg
gi|32 : AGTT----AAATAAG-ATTAAAA-C-GT--T---G-GGT-T-------------T--TTCT-----TCAT-ATAT------A---T-----TT--TCAAGTTATA-T-A--G-------T------AT-GG----AGGACACATTAGAATTTATAA-A------------T----G-------G-A--ACT-CA-TCCTC-----T-A-
gi|33 : --AGTCGACTTTT--T-----A-TA-AAGA---A-TTATTTATA--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATT-C-ACTG-------TTT--T-A--G-GG---GG----GG-GG-G-GTGT-TG---T------------TA--TTA--TT--AA--T--A-ACCA--AAG--A-A-----AT
gi|35 : cTA-A-TAGC--TTTCC-AAAA-G-CTTT-CCT-GA-C-TAAA-AA----A-TTC--TTCA--------TG---TA---AAG-TG-TT-AAT--AAGT-GAT-A-C-ATATATC-GACGA----TG---T--ACCC--TAC
gi|36 : --------------GT--------CA-AGGATTAT-TCCATT-TCA-----TAAA-GCCATTTTC------CGTTTG-CCACAA----------G---------------C--------------
gi|37 : gcgagtgtaacccc-TTAT----A--AA-TTAT-GTTTCCTCAAATTTC-ACTA-------T---------G-GA--T-------G-GG-G-GTGG-TG--------------------TTA--TT--AA-----A-ACCA--AAG--A-A-----ATG-TTTtcaatggata
gi|38 : AAGATAGAGGGA-TAT-GAT-ATTACA---AT--ATGT-----T---AGT----A------TT-A-----CA------AT---GTAT-GAGA-A-TTGTTGCAC------ATTG
gi|39 : GTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAACAA----A-TTTCTTTCA-----A--TG---TAT
gi|4 : caaAT-ATC-ATGTATCACACGAA---TG---T--ACTC--TACATTT-AGGCGACTTTT--T-----A-TA-AAGA---T-TTAT----A--AA-TGAT-TCTTCCTCAAA---C-ACAC-------TTT--T-A-----G--T-------G-GG-G-GT-------GT------------TA--TTA--TT--AA--T--A-ACCA--AAG--A-AG----AAA-TTTT-CT-----------AT----T----CAT-T--T---GATA-------AATC----AAATAA---A----C--GC-C-C----CAGAA-GCATG------GGATGT------ATCA--GA--AAAA--TTTC-AATT-AAAT-C-GCAA-GA---------A--AAA-----A--AAAA--A------------------------------------------G---GAT-CG---------T---------TCCAAT-AA-TTTC---TAAA--TAATG--CTA-----GTGGAAACCCCGTTACGT--------CA-A-GATTGT-TCCATT-TCA-----TAAA-GCCATTTTC------GA--AA-CCACAA----------G---------------CTCAACGGATACACAA-T---A--T-A--------CA-----------A---T-TA-T--ATA----T-AC--A----TTGT-A-A---AAT-----A-TCAAC-AAA--AA-C--ATAAATG-GA--AGGGAC----TG--T--AT-AGTC-TCC---AT--T-A-CAAAGATGAGGAGATTAT-GA-TATTACA---AT--ACATG----T---AGA----ACAGAATTT-A-----CAATGT--------TAT-GAGAAA-CTGT--CAC------ATT-T----AGAATTTT-CCTAAATTAGA---------------CAGTTCT-----C-TG-----------------------GTATT-TGT-ACGT-TAA------GTAATT----AA--AAG-TTTAAAAAA-AT--T---G-G-C-G-------------T--TTTC-----TCAT-ATATC-----A---T-----TT--TCAAGT--CA-T-A--G-------T------ATAAG----ATGAC-----------------A------------CTTTAGAATAAATG-A--ACC-AA-TCCTT-----TCA-TATCATa
gi|40 : caagtaatagctttccaaaatttgtaataccgatt----A--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATTTT-ACTG-------TTT--T----------T------GG-GG-G-GTG---GG-GT------------TA--TTA--CT--AA--T--A-gttagatat
gi|41 : -AGGATTAT-TCCGTT-TC--------AA-GC------T------CATTGG---ATAA----------A---------------CAT------------A-T---A--T-A--------CG-----------A---T-TA-T---------T-AC--A----T
gi|42 : GTA-A-CATC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-A-TAATCGA----A-TTTCTTg
gi|43 : tta-----------------A------------T----G-------G-A--ACT-CA-TCCTC-----T-A-TACCATat
gi|45 : tttcgaataaA-TG-GAGA---A-TTAT----A--AA-TGAC-GTTTCCTCAAATTTT-Agtaaattcc
gi|46 : GTA-A-TAGC--TTTCCAAAAAAG-CTTG-CCT-
gi|47 : catgacaaGTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTA-CCT-G
gi|5 : acaaGTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAACAA----A-TTTCTTTCA-----A--TG---TATT-AAG-TGGTT-AAT--AAGT-GAT-A-C-ATATATCAGACGA----TG---T--ACCC--TACATA--AGTCGATTTTT--TTTTTTA-TA-GAGA---A-TTAT----A--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATTTC-ACTA-------TTT--T-A--GTGG--TGGT---GG-TG-G-GTGG-TGG-GT------------TA--TTA--TT--AA--T--A-ACCA--AAG--A-A-----ATG-TTTA-CT-T--------AAT----T----CAT-T--T---GATT-------AATC----AAAT-----A----C--GC-C-T----CAGAA-GCATG--GGGAGGATGT------ATCAGGGA--AAAA--AATC-AATT-AAATACGGCAA-GA---------A--AAAT--GTA-TAAAA--AT--------------------AT----------------A-TG---GAT-CA---------T---------TCTAAA-TA-TTGC---T--A--TAGT---CTA-----GT--------------GT--------CA-AGGATTAT----------A-----TAAG---CATTTTC------CGTAAG-CCACAC----------G---------------C--------------A-T---A--T-A--------CA-----------A---T-TA-T--ATA----T-AC--A----TTGT-A-A---TAT-----A-TCAAC--AA--AA-C--A-ACATA-GT--GGAGAG----TG--A--GT-ACTC-TCC---AT--T-A-CAAAGATAGAGAGA-TAT-TATTATTACA---AT--ATGT-----T----GA----A------TT-A-----CAATGTACAT---GTAT-GAG--A-TTGTTGCAC------ATTGT----AGA------C---------A---------------CAGTTCT-----CAGG--A-----TT-------------GTATT-TGTAACGC-CAA------GTAATT----AAAGAAG-TATAGAAAC-AT--T---G-G-T-T-------------T--TTCT-----TCAT-ATAT------A---TA----TT--TCAAGT--CA-T-A--G-------T------CT-AG----ATGAC-----------------A-----------------G-------A-A--ACT-AA-TCCTC-----T-A-TATCAT
gi|6 : GTA-AGTGGCGGTTTCC-AAA--G-CTTG-C----A-CATAAACAAGGGGA-TTTCTTTCA-----C--TGAGATGTT-AAC-TGTTTCAAT---AGT-GAT-G---ATAT-TTAGA-AA----TG---TTCACTC--TACAT---AGTCGACTTT
gi|6 : aaTTTCCTCAAATTTCAACTG-------TTT--T-T--A-AG--TGG----GG-cctcaaatttcaactgtttttaagtggggaatgcttattctgattgatattgattaatgcaatacatgcgctcagaagcattacgggaggatgtatcaagtaaatttaatgttaaaatctttaaaaaatcagtttcaaagtatcgataatggattgtcaattttctgaaatccttcaaggattattcgtttcaagctcattggataacatataatacgaattaattatataacgtatatacaaaaacagcatagtttgaagagtgcgttagtctcagaaattaacaaagatagagagttaattattacacaatataatacactacactagagactaatctatttaatatagacattttcctaaattagacagttctttgtatttgttaccttaagtaattaataagattagaacattgtggttttgttctgtcattatatatcattttcaagatatatggtatagaggaccctttagaaatcatcctctatat
gi|6 : aagtaagtggcggtttccaaagcttgcacataaacaaggggatttctttcactgagatgttaactgtttcaatagtgatgatatttagaaatgttcactctacatagtcgacG--G-A-----ATG-CTTA-TTCT--------GAT----T----GATAT--T---GATT-------AATG----CAAT-----A----CATGCGC-T----CAGAA-GCATTACGGGAGGATGT------ATCA-AGT--AAATTTAAT---GTT-AAAATCTTTAA------------A--AAATCAGTT-TCAAA--GTA----------------TCGAT----------------AATG---GAT-TG---------T---------C---AA-T--TTTC---T--G--AAAT---CC-------T---------------T--------CA-AGGATTAT-TC-GTT-TCA--------A-GCT------------CATTGG---ATAA--------------------------C--------------A-T---A--T-AATACGAATTA-----------A---T-TA-T--ATA------AC--G----T-----------AT-----A-T--AC-AAA--AA-C--A-GCATA-GTTTGAAGAG----TG--C--GTTAGTC-TCAGAAAT--T-AACAAAGATAGAGAGT-TA---ATTATTACACA-AT--ATAA-----T---ACACTACA------CT-AGAGACTAATCT--ATTTAATATAGAC--A-TTTTCCTAA------ATT------AGA------C---------A-----------------GTTCT-----------------TT-------------GTATT-TGTTACCT-TAA------GTAATT-----AATAAG-ATT-AGAAC-ATTGT---G-G-T-T-------------TTGTTCTG----TCAT--TAT------A---TATCATTT--TCAAGA--TA-T-ATGG-------T------AT-AG----AGGAC-----------------CCTT---------T----A-------G-A--AAT-CA-TCCTC-----T-A-TATaatgcttattctgattgatattgattaatgcaatacatgcgctcagaagcattacgggaggatgtatcaagtaaatttaatgttaaaatctttaaaaaatcagtttcaaagtatcgataatggattgtcaattttctgaaatccttcaaggattattcgtttcaagctcattggataacatataatacgaattaattatataacgtatatacaaaaacagcatagtttgaagagtgcgttagtctcagaaattaacaaagatagagagttaattattacacaatataatacactacactagagactaatctatttaatatagacattttcctaaattagacagttctttgtatttgttaccttaagtaattaataagattagaacattgtggttttgttctgtcattatatatcattttcaagatatatggtatagaggaccctttagaaatcatcctctatat
gi|7 : aagtaagtggcggtttccaaagcttgcacataaacaaggggatttctttcactgagatgttaactgtttcaatagtgatgatatttagaaatgttcactctacatagtcgactttcctcaaatttcaactgtttttaagtgg---------T---------TCTAAA-TA-TTGC---T--A--TAGT---CTA-----GT--------------GTAACCCCGTCA-ATGATTAT-TCCATT-TCA-----TAAA-GCCATTTTC------CGTTAG-CCACAA----------G---------------C--------------A-T---A--T-ATA------CA-----------A---T-TA-T--ATA----T-AC--A----TTGT-ACA---TAT-----A-CCAAC-AAA--AA-C--A-ACATA-GT--GGAGAG----TG--A--GT-AGTC-TCC---AT--T-A-CAAAGATAGAGGGA-TAT-GATTATTACA---AT--ATGT-----T---AGA----A------TT-A-----CA------AT---GTAT-GAGA-A-TCATTGCACATACCAATTGT----AGA------C---------A---------------CAGTTCT-----C-----------TT-------------GTATT-GGTAACGC-CAA------GTAATT----AAAGAAG-TTTAAAAAC-AT--TG--G-G-T-T-------------T--TTCT-----TCAT-ATATC-----A---TA----TT--TCAAGT--CA-T-A--G-------T------CT-AA----ATGACACTTTAGAATAA-----A------------T----G-------G-A--ACT-AA-TCCTC-----T-A-TATCAT
gi|8 : aaaaatT----T----CAT-T--T---AATT-------AATC----AAAT-----AGATAC--CC-C-T----CAGAA-GCATG--GG---------------------A--GAAA--AATT---TC-AAA-ACTGCAA-GA---------A--AAAT--CTA-CAAAA--AT-----------------TC-ATTTCA------------A-CGTCCAATACT---------T---------TCTAAA-TA-ATGCGAGT--A--TAAC---CC-------C--------------GT--------CA-AGGATTAT-TCTATT-TCA-----TAAA--CCATTTTT------CGTAAA-CCACAA----------G---------------CTCA-----------A-T---G--G-A--------TA-----------ATTGT-TA-T--ATA----T-AC--A----TTGTAA-A---TAT-----A-TCAAG-AAA--AA-C--A-ATATA-GT--TGAGAGGAACTG--T--AT-AGTC-TCC---AT--T-A-CAAAGAT-GAGAGA-TAT-GATTATTACA---ATACATGTA----TACGAAA----A------TC-A-----CAATGT--AT---G--C-GA---A-TTGTTGCAC------ATTGT----AGA------C---------A----------------ATTTCC-----T-AA--A-----TTAGACACGTCTCTGGTATT-TGTAACTCTTAA------GTAATTTTAAAAAGAAGTTTTAAAAAC-AT--T---ATG-T-T-------------T--TTCT-----TCAT--TATC-----A---TA----TT--TCAAGT--CA-T-A--G-------T------AT-AG----ATGACACTTTAAATTAGAATAAA------------T----G-------G-A--ACT-CA-TCCTC-----T-A-TATCATgtagattccccggaaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacatgtatccaggtacaatatgtgcacaacgtgcaacaattctcttgctgtccatgcaagtaagtgcaaaaccgggtacgttgtacatg
gi|9 : --AAAA--AATC-AATT-AAATACGGCAA-GA---------A--AAAT--CTA-TGAAA--AT-----------------TC-ATTTCAATGTATAATATTA-TG---GAT-CGACCAATAATT---------TCTAAA-TA-ATGC---T-----TAGTG--TTAACCCCGT--------------GC--------AA-GGGATTATCTCCATT--CA-----TTAA-ACCACTTTCTCCAGCCTTTGG-CCACAACAAGTCATTGG---------------T--------------A-T---A--C-A--------CACATATATACATA---T-TA-TT-ATACTGTT-AC--A----TTGT-A-AA--TAT-----A-TCAAC-AAA--AAAC--A-ACATA-GT--GGAGAG----AG--ACTGTTAGTC-TCC---AT--T-A-AAAAGATAGAGAGA-TAT-GATTATTGCAAGTAC--ATGTGTACCC---AGA----A------TT-A-----CAATAT--TT---G-A--GAA--A-TTGTTGCAC------ATTG-----AGA------C---------A---------------T-TTTCC-----T-AA--A-----TTAG-----------ACAGT-TCT-CCGG-TAAAT----GTAAC-----------G-TTTAAAAAA-AT--TG--G-G-G-T-------------T--TTCT-----TCAT-ATAT------A---TAT---TT--TCAAGT--CA-T-A--G-------T------AA-TG----ATGACACTTTAAA---------A------------T----A-------G-ATGACT-CATTCCTTCCTTAT-A-TATCATgt
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|23 ): TCCGGAAAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAATAGGTGCACAACGTGCAACAATTCTCTTGCTGTCCATGCAAGTAAG
Unaligned ( gi|30 ): GAATTCCTGAAGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAATAAAGTAACTAATTTTCTATGCACAACAAATTTTTGCTCTTCAATATGAACAATAATTTTGTGCTCGTCAATAAAGACA
Unaligned ( gi|34 ): ACACGTGTACGAGAATTACAATATCAAGAGAATTGTTGCGCATGAACATTTTCCTAAAATGTTCAATGGTATATGTAACGTTTAAAAACATTGG
Unaligned ( gi|44 ): GAGTCCTTGTTAACATGAATAAAATTAAGTGTATCA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11111111 1111 222222222 111111111 33333333333333333333 11111 11111111 1111111 1111 22222 222222 111111111 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000 6666666666666666666666666666666666666666666 55555555555555555555555555555555555555555 11111111 11111111111 111111111111111 111 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 111111 111 1111111111111 2222222222222222 999999999999999999999999999999
lowQualScore : 3 3 44 2 2 2 2 3 3 3 6666 3 22222222 999 3 3 7 55 3 3 0000 8888 777 33 33 55 888888888 2 2 666 2 4444 22 2 2 2 7777777 444444444 55 7777 2 4 2 55555555555555555555 333 33 55 33 33 2 33 33 2 00000 2 44 3 77777777 555 6666 3 44 555 0000000 3333 11111 7777 55 3 3 7777 3 888 3 999999 111111 11 3 3 0 0 3 333333333 77 3 3 55 3 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222 4 55 999 3 666 77 3333333333333333333333333333333333333333333 2 0 2 2 77777 2 888888 2 33333333333333333333333333333333333333333 555 33 2 77777777 22222222222 444 2 2 99 5555 2 33 111111111111111 77777 3 3 44 3 44 6 3 44 44 6666 44 6 3 555 44 3 3 2 2 0 222 33 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 777777 6666 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 2 0 2 555555 8888 2 2 2 33 555 2 5 2 4444444444444 66 99999 222 5555555555555555 33 33 2 33 8888888 2 5555 5 111111111111111111111111111111 33 2 33 55 5 88888 5 2
lowQualScore : . . .. . . . . . . . .... . ........ ... . . . .. . . .... .... ... .. .. .. ......... . . ... . .... .. . . . ....... ......... .. .... . . . .................... ... .. .. .. .. . .. .. . ..... . .. . ........ ... .... . .. ... ....... .... ..... .... .. . . .... . ... . ...... ...... .. . . . . . ......... .. . . .. . ........................................................ . .. ... . ... .. ........................................... . . . . ..... . ...... . ......................................... ... .. . ........ ........... ... . . .. .... . .. ............... ..... . . .. . .. . . .. .. .... .. . . ... .. . . . . . ... .. ......................................................... ...... .... ....................................................................... . . . ...... .... . . . .. ... . . . ............. .. ..... ... ................ .. .. . .. ....... . .... . .............................. .. . .. .. . ..... . .
lowQualScore : 3 3 22 9 7 7 7 1 1 1 5555 1 00000000 222 6 6 3 00 6 3 4444 9999 999 99 77 99 000000000 4 4 555 2 5555 99 1 2 1 6666666 888888888 66 4444 2 7 4 00000000000000000000 999 22 66 22 22 4 44 22 4 66666 5 11 1 77777777 444 5555 1 22 444 0000000 1111 88888 7777 00 6 6 7777 6 333 3 666666 222222 77 1 1 1 8 3 333333333 99 8 3 00 6 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333 3 00 000 6 444 99 3333333333333333333333333333333333333333333 9 1 9 9 11111 9 222222 9 88888888888888888888888888888888888888888 000 77 7 00000000 77777777777 777 7 7 00 7777 7 77 555555555555555 77777 1 1 22 1 22 2 1 22 22 5555 22 2 1 444 22 1 1 7 7 8 000 99 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 777777 1111 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 9 9 9 000000 8888 8 5 7 77 333 7 3 7 7777777777777 33 33333 999 9999999999999999 44 44 5 44 2222222 5 3333 0 666666666666666666666666666666 22 4 22 00 0 88888 0 5
consensus : GTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAAC-AA----A-TTTCTTTCA-----A--TG---TATT-AAG-TGGTT-AAT--AAGT-GA-TA-C-ATATATCAGACGA----TG---T--ACCC--TACATA--AGTCGACTTTT--TTTTTTA-TA-GAGA---A-TTAT----A--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATTTC-ACTA-------TTT--T-A--G-GG--TGG----GG-GG-G-GTGG-TGG-GT------------TA--TTA--TT--AA--T--A-ACC--AAAG--A-A-----ATG-TTTA-CT-T--------AAT---T----CAT-T--TG---ATT-------AATC----AAAT-----A----C--GC-C-TCA----GAA-GCATG--GGGAGGATG-T------ATCA-GGA--AAAAAATC-AATT-AAATACGGCAA-GA---------A--AAATNT-ATAAAAAT--TCA-TTTCA-----------------A---------TG------------GAT-CG---------TTCTAAAT--A-T-TG-C---TA--TAG---T---C--T--A-----GT---------G--T--------CA-AGGATTAT-TCCATT-TCA-----TAAA-GCCATTTTC------CGTTA-GCCACAA----------G---------------C--------------AT---A--T-A--------CA-----------A---T-TA-T--ATA----T-A--CA----TTGT-A-A---TAT-----A-TCAAC-AAA--AA-C--A-ACATA-GT--GGAGA--G----TGA--GT-AGTC-TCC---AT--T-A-CAAAGATAGAGAGA-TAT-GATTATTACA---AT--ATGT-----T---AG-A----A------TTA-----CAATGT--AT---GTAT-GAG--A-TTGTTGCAC------ATTGT----AGA------C---------A---------------CAGTTCT-----C-GG--A-----TT-------------GTATT-TGTAACGC-TAA------GTAATT----AAANAAG-TTTAAAAAC-AT--T---G-G-T-T-------------T--TTCT-----TCAT-A-TAT------A---TA----TT--TCAAGT--CAT-A--GT------AT-AGA----TGA-C------A--C-----A------T-------A--AATGG-A--ACT-CA-TCCTC-----T-A-TATCAT
Reference ( family-2690 ) : GTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAAC-AA----A-TTTCTTTCA-----A--TG---TATT-AAG-TGGTT-AAT--AAGT-GA-TA-C-ATATATCAGACGA----TG---T--ACCC--TACATA--AGTCGACTTTT--TTTTTTA-TA-GAGA---A-TTAT----A--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATTTC-ACTA-------TTT--T-A--G-GG--TGG----GG-GG-G-GTGG-TGG-GT------------TA--TTA--TT--AA--T--A-ACC--AAAG--A-A-----ATG-TTTA-CT-T--------AAT---T----CAT-T--TG---ATT-------AATC----AAAT-----A----C--GC-C-TCA----GAA-GCATG--GGGAGGATG-T------ATCA-GGA--AAAAAATC-AATT-AAATACGGCAA-GA---------A--AAATGT-ATAAAAAT--TCA-TTTCA-----------------A---------TG------------GAT-CG---------TTCTAAAT--A-T-TG-C---TA--TAG---T---C--T--A-----GT---------G--T--------CA-AGGATTAT-TCCATT-TCA-----TAAA-GCCATTTTC------CGTTA-GCCACAA----------G---------------C--------------AT---A--T-A--------CA-----------A---T-TA-T--ATA----T-A--CA----TTGT-A-A---TAT-----A-TCAAC-AAA--AA-C--A-ACATA-GT--GGAGA--G----TGA--GT-AGTC-TCC---AT--T-A-CAAAGATAGAGAGA-TAT-GATTATTACA---AT--ATGT-----T---AG-A----A------TTA-----CAATGT--AT---GTAT-GAG--A-TTGTTGCAC------ATTGT----AGA------C---------A---------------CAGTTCT-----C-GG--A-----TT-------------GTATT-TGTAACGC-TAA------GTAATT----AAANAAG-TTTAAAAAC-AT--T---G-G-T-T-------------T--TTCT-----TCAT-A-TAT------A---TA----TT--TCAAGT--CAT-A--GT------NT-AGA----TGA-C------A--T------------T-------A--AATGG-A--ACT-CA-TCCTC-----T-A-TATCAT
gi|1 : TA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCTCGA-C--AAACAAA----A-TTTCTCT-A-----A--TG---GATT-AAGCTGGTT-AACTAAAGT-GATTA-C-ATATATCAGACGAATGTTG---T--G-CC--TACATA--AGTCGA----T--TTTTTTA-TA-GAGG---A--TAT----AGCAA-TGAT-G-TTCCTC-AATTTC-ACTA-------TTT-------A-GG--CGGTAAAAG-GA-G-GTGT-T---GT------------TG--TTAACTTCAAA--T--A-ATCAGAAAG--ACA-----ATG--TTA-CT-TAATC----AAT---T----AAT-T--TG---ATT-------AATCAAATAAAT-----A----C--GC-C-TTA-----AA-GCATG--GGGAGGTTGTT------ATCA-AGA--AAATAAAC-A--T-AAATACGGCAATGA---------AC-AAATTTAATAAAAAT--TCA-TTTCAAAGGTATAT--------A---------TG------------GGA-CGTCCAAAAAATTCTAAA---A-TATG-C---TA--TAG---T---CTAT--A-----GTGTAAACCCCG--T--------CA-AGGATTAT-TCCA---TCA-----TAAA-GCCATTTTC------CGTTAGGCCACAA----------G---------------CA-------------AT---A--C-A--------CA-----------A---T-TA-T--ATA----T-ACTCA----CTGA-A-A---TAT-----ACTCAAC-AAA--AA-C--A-ACATA-G---GGAGAGTG----TGA--GT-AGTC-TCC---AT--T-A-AAAAGA-AGA-AGG-GAT-GA-TATTACA---AT--ATGT-----T---TGTA----T------TTA-----CA---T--AT---GTAT-GAGGAA-TTGTTGCAC------ATTGT----AGA------CGAT------A---------------CAGTGTT-----C-----------CT-------------GTATTGTGTAACGC-CAA------GTAATT----AAGAAGG-TTTAAAAAC-AT--T---G-G-T-T-------------T--TCTC-----TCATAA-TATC-----A---TA----TT--TCAAGT--CATAA--GT------CT-AGA----TGACC------A--CTCTTTAGA----T-------A--AATGG-A--ACT-AACTCCTC-----TAA-TATCA
gi|10 : -----------------A---------TG------------GAT-TG---------TCC--AAT--AAT-TT-C---TA--AA-------------------------------------------CA-ATGGTTAT-ACCATT-TCA-----TAAA-GCCACTTTC------CGTTA-GCCACAA----------G---------------CTCATATAC------AT---AAAT-A--------CA-----------A---T-TA-TT-ATA----T-A--CA----C------G---TAC-----A-TCAAC-AAA--AA-C--A-ACATA-CT--GGAGA--G----TGA--GT-AGTC-TCC---AT--T-A-CAAAGATAGAGAGA-TAT-GATAATCATA---A----------------------------------------GATGT--AT---G----AAA--A-TTGTTGAAC------ATTTTTCTAAGG----------------A---------------CAGCTCT-------G------------------------GTATC-TGTAACGC-TAA------GTAATT----AAATAAG-TTTATAAGC-AC--T---G-G-G-T-------------TA-TCCT-----ACAT-A-TATATC---A---TA----TT--TCAAGT--CAT-A--GTATACTATT-AGA----TGG-CA-----A--TTTAGAA------T-------A--AATGG-A--ACT-CA-TCCTC-----T-A-TATCATatgtagagaatccccggaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacgatctaggtacaaaagatgcacaaacgtgcaacaagtccttgctgcgtctatgcaagtaagtgccaaacccgggacgttgtacatg
gi|11 : atatcaaagtataatC--TTTCC-AAAAAA-CTTG-CCT-GA-C-TAAAC-AA----A-TTTCTTTTA-----A--T----TATT-ACG-TAGTT-AAT--AAGT-GA-TA----TATATCAGACGA-----G---T--ACTC--TGCATATAAGTCGACTTTT------TTA-TA-GAGA---A-TTAT----A--AT-TGAT-GTTTCCTTGAATTTC-TCTG-------TTTAGC-G--G-GG--GGG----GG-GGCG-GGGG-TGG-GG------------TA--TAA--T----G--T--A-ACC--CAAGGTA-AAACATATGTTTTA-CT-TTCAATATCAAT---TTTCGCAT-TTATA---ACT-------CGTC----AAATAAATGA----C--AC-CATCA----GAA-GCATG--CGGTGGATT-TTATGAGATCA-GAAATAGAGAAT---ATTGAAACACGgtaga
gi|12 : ttccttgatcttaaaggcggatccaaaacttgtattaacacttttagacGA----TG---T--ACTC--TACATT--AGTCGACTTTT--T-----G-TA-CAGA---A-TTAT----A--AA-TGAC-TTTTCCTCAAATTTC-ACTG-------TTT--T-A--G-AG--AGG----G----------------GT------------T-----------------------------G--A-A-----ATG-TTTT-CT-T-------------------CAT-T---A---ATC-------AAAC----AAAT-----A----C--GC-C-TCA----GAA-GCATG--GGGA---TG-T------ATCA-G-A--AAAATTTC-AATT-AAATGCGGCAA-GA---------A--AAATTT-ATACAAAT--TCA-TTTCA-----------------AGGTATAATATG------------GAT-CG---------TCC--AAT--AAT-TT-C---TAAATAA---TATAC--T--G-----GT---------G--TAACCCCGTTA-AGGATTAT-TCCATT-TCA-----TAAA-GCCATTTTT------CGTTT-GCCACAA----------GCTCAATGAAAACACAC--------------AT---A--T-A--------CA-----------A---T-TATT--ATA----T-A--CA----TTG
gi|13 : AGAGAGA-TGT-GATTATTACA---AT--A
gi|13 : accgttaatgtcatacacaaA------GTAATT----AAAGACG-TTTTAAAAC-AT--TTTGG-G-T-T-------------T--TTCT-----TCAT-A-TATC-----A---TA-----T--TCATGA--CAT-A--GT------GT-AGA----TGA-C------A--CTTTAGAA-----T-------A--AATGG-A--ACT-CA-TCCTT-----T-A-catgtatacgagnaaagacgatgtgaggaagttggagaggaactgctaaatctagcacaacagtctgtgcaatctgcattacaagaagaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaattaaagacgttttaaaacattttgggtttttcttcatatatcatattcatgacatagtgtagatgacactttagaataaatggaactcatcctttat
gi|14 : accgttaatgtcatacacaaagagagatgtgattattacaatacatgtatacgagnaaagacgatgtgaggaagttggagaggaactgctaaatctagcacaacagtctgtgcaatctgcattacaagaagaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn---A--T-A--------CA-----------A---T-TA-TTAATA----A-A--CA---------A-A---CA----------AAC-AAACAAA-C--GGACATT-GT--GGAGG--G----TGA--GT-GGAC-ACC---AA--T-G-CACAGTTTGAAA-----T-AA-----ACA---A---AT-T-----G---AG-A----A------TTT-----C------------GTA-----------GTTGCAT------ATTGT----AGAAATTTCC---------AAAATTAAA-------CAGTTC---------G--T-----TA-------------GTATT-TTTGACAT-TGA------GTAATT----CAATCAG-TTTAAAAAC--T--C---A-A-T-G-------------T--TTGT-----ATAG-A-TAC------AATTTG----TC--TCAAGT--CAT-C--GT------AT-AGAAAAGTGA-A------ACTT------------T-------A--GATGA-A--
gi|15 : cctaagtctcattggacgtacataaGTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAAC-AA----A-TTTCTTTCA-----A--TG---TATT-AAG-TGGTT-AAT--A-----------------TCAGATGA----TG---T--ACCC--TACATA--AGTCGAATTTT--T-----A-TA-GA-----A-TTAT----A--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATTTC-ACTA-------TTT--T-A--G-GG--TGG-------------TGG-TGGTGT------------TA--TTA--TT--AA--T--A-ACC--AAAG--A-A-----ATG-TTTA-CT-T--------AAT---T----CAT-T--TG---ATT-------AATCAAATAAAT-----A----C--GC-C-TCA----GAA-GCATG--GGGAGGATG-T------ATCA-G----AAAAAATCAAATT-AAATACGGCAA-GA---------A--AAATGT-ATAAAgtgcaccatttttt
gi|16 : TTTTTA-TATGAGA---AATTAT----A--AA-TGAT-GTTTCCTCCAACTTC-ACTA-------TTT-------A-GG--TGG----GG-GG-G---GG-T---CT------------TA--TTA--TT--AA--T--A-A-C--AAAG--A-A-----ATG--TTA-CT-T--------AACTGAT----TAT-T--TG---ATTTTAATCAAATT----AAAT-----A----C--GC-C-TCA----GAAGGCATGT-TGGAGGATG-T------ATTA--GA--AAAATTTC-AATT--AATACGGCAA-GA---------A--AGCTGT-ATAAAA----TCA-TTTCAAGGTATATAATCATTATA---------TG------------GAT-CGTCCAAAAT-TTCGAAAT--A-T-TG-C---TA--T
gi|17 : ----TG---T--ATCC--TACATA--AGTCGA----T--TTTTTTA-TA-TA-A---A-TTAT----A--AA-TGAT-GTTTCTTCAAATTTC-ACCA-------TTT--T-A--G-GGG-TGG----GT-GGTG-GTGG-TGG-------------------------T--A---T--A-AGC--AAAG--A-A-----ATG-TTTA-TT-T--------AAT---T----CAT-T--TG---ATT-------AATC----AAATAAAT-A----C--GC-C-TCA----GAA-GCATA--GGGAGGATG-T------ATCA-GAA--AAAAAA---AA-----------CAA-CA---------ATTAAATGT-GTAAAAAT--TCA-TTTCA-----------------A---------tgg
gi|17 : -----GT---------G--T---------A-AAAATT-----CATT-TCAAGGTATAAA-GCTATTTTC------CGTTA-GCCACAA----------G---------------C--------------Aggtataaagctattttccgttagccacaagca
gi|18 : tgtatcctacataagtcgatttttttatataaattataaatgatgtttcttcaaatttcaccattttaggggtgggtggtggtggtggtataagcaaagaaatgtttatttaattcatttgattaatcaaataaatacgcctcagaagcatagggaggatgtatcagaaaaaaaaaacaacaattaaatGTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAAC-AA----A-TTTCTTTCA-----C--TG---TATT-ACG-TGGTT-AAT--AAGT-AA-T----ATATATCAGACGA----TGTACT--ACTC--TACATA--AGTCGAC-------CTTTTA-TA-GAGA---A-TTAT----A--AA-TGAC-GTTT-CTCAAATTTC-TCTG-------TTT--A-A--G-GG--GGG----GG-GG-G-G----------------------TA--TTA--TT--AATTT--A-ACC--AAAG--A-A-----ATG-TTAT-CT-T--------AAT---T----CAT-T--TG---ATT-------AAGC----AAA
gi|19 : caaGTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTGGCCT-GA-C-TAAAC-AA----ACTTTCTTTC------A--TG---TATTAAAG-TGGTT-AAT--AAGT-GA-TA-C---ATATTAGACGA----TG---T--A--T--TA-ATA--AGTCGA----T--TTTTTTA-TA-GAGA---A--TAT----A--AATTCATGGTTTCCTCACATTTC-ACTA-------TTT--T-AAGG-GG--TGG----GGTGG-G-GTGG-GGGTGT------------TT--TTA--TTA-AA--T--A-ACC--AAAG--A-A-----ATG-T
gi|2 : caaGTACA-TAGC--TTTCC-AAAAAGGCTTG-CCT-GAAC-TAAAC-AA----A-TT-CTTTCA-----AAATGA--TATT-AAG-TGGTTTAAT--AAGTTGA-TA-CGATATATCAGACGA----TGC--T--ATCCCGTACATA--AGTCG--------TTTTTTA-TA-GAGAT--A-TTA-----A--AA-TGAT---TTCCTCAAATTTC-A-TA-------TTT--T-A--G-GGGGTGG----GG-TG-GCGTGGGTGG-GTGGTTTGGTGGTGTA--TTA--TG--AA--T--ATACC--AAAG--A-A-----ATG-TTTATCT-T--------AA----T----CAT-T--TG---A-T-------AATC----AA
gi|2 : acaaA--TAA---T---C--A--A-----G----------A--T--------CAGACGATTAT-TCCATTCTCA-----TAAAAGCCATTTTC------CGTTA-GCCACAA----------G---------------C--------------AT---A--TAA--------CA-----------G---TCTA-T--ATT----TAA--CA----TTGTAA-A---TAT-----A-TCAACAAAA--AA-CAAA-ACATAGGT--GGAGA--G----CGA--GT-AGTC-TCC---AT--TAA-CAAAGATGTAGCGA-TATGGATTA-TA-A---AT--ATGT-----T---AG-A----A------TTA-----CA------AT---GTAT-GAGA-A-TTGTTGCAC------ATTGT----AGA------C---------A---------------CAGTTCT-----CAAG--A-----TT-------------GTATT-TGTAACGC-CAGAT----GTAATT----AAAGAAG-TTTAGAAAC-AT--TG--G-G-TGT-------------T--TTCT-----TCAT-A-TATATCATAA---TA----TT--TTAAGT--CAT-A--GT------CT-AGA----TGA-C----------------------------------ACGGAA--ACTAAA-TCCTCA----T-AGTATCGTgatcagacgattattccattctcataaaagccattttccgttagccacaagcatataacagtctatatttaacattgtaaatatatcaacaaaaaacaaaacataggtggagagcgagtagtctccattaacaaagatgtagcgatatggattataaatatgttagaattacaatgtatgagaattgttgcacattgtagacacagttctcaagattgtatttgtaacgccagatgtaattaaagaagtttagaaacattgggtgttttcttcatatatatcataatattttaagtcatagtctagatgacacggaaactaaatcctcatagtatcgtgtagattccccggaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaataggtgcacaacggtgcaatcaattctctgttgctgtccatcgccaagtaagtgcaaaccgggtacgtcttgtacatg
gi|20 : acaagtacatagctttccaaaaaggcttgcctgaactaaacaaattctttcaaaatgatattaagtggtttaataagttgatacgatatatcagacgatgctatcccgtacataagtcgttttttatagagatattaaaatgatttcctcaaatttcatattttagggggtggggtggcgtgggtgggtggtttggtggtgtattatgaatataccaaagaaatgtttatcttaatcatttg-TTGTTGCAC------ATTAT----AGA------TTTT------A---------------CTGATAT-----T-AG--ACATTCTT-------------GTATT-TGTA-CGC-TAA------GTAATTTA--AAATAAG-ATTCAAA-C-AT--T---G-GGT-T-------------T--TTCTATGAATCAT-AATAT------A---CC----TT--TCAAGT--TGT-----T------AG-GGA----CGA-CTTTAGAA--T------------T-------ATAAATGG-A--ACT-CA-TCCTC-----T-A-TATgtagattccccggaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaataggtgcacaacggtgcaatcaattctctgttgctgtccatcgccaagtaagtgcaaaccgggtacgtcttgtacatg
gi|21 : tcatgttatgagattttccttaatt--T-A--------CA-----------A---T-TA-T---------T-A---A----TT---A-A---TA----------AAC-AAA--CA-C--G-GCACT-GT--GGAGA--G----TGG--GT-AGACATCA---ATGCT-A-CACTAATACACACT-TA---ATTATCGCACC-GT--ATG----------AT-A----A------TT--------TTGT--AG---AT-T-TAA--T-TTGTTGCAT------ATTGC----AAA------
gi|22 : agccacagtctcattggatgtacaaaagTAT-GAG--AATTGTTGCAC------ATTGT----AGA------C---------ATTTTCCTCAATTAGACAGTTCT-----C-GG-----------------------GTATT-TGTAACGC-GAA------GTAATT----AAAGAAG-TTTAAAAGCAAT--A---G-G-T-T-------------T--TTCT-----TCAT-A-TAT----------TA----TT--TAAAAT--CAT-A--GT------AT-AGA----TGA-C------ACCT------------T-------A--GA------------A-TCCTC-----T-A-TATCATattaaacaattcggtagattttt
gi|24 : aG-GG-G-GTA-------T------------TT--TTA--TT--AA--TTTA-ACC--AAAG--A-A-----ATA-CTTT-CT-T--------ATT---T----CAT-T--TATCAATT-------AAAT----AAAT-----A----C--GC-C-TCATGCAGAA-GCATG--CGGGGGATA-T------ATCA-G-A--ACAATTTC-AATT-AAATGCAGCAA-AATACACATATA--AAATAT-ATAAAAAT--TCA-TTTCA-----------------A---------gtagatt
gi|25 : AGTTCT-----CTGG--A----------------------ATT-TGTAACAC-TAA------GTAATT----TAATAAG-TTAAAAAAT-GC--TA--G-G-T-TTCACATAATAAAAT--TTCT-----TAAT-A-TAT------C---TT----TTTCTCAAGT--TAC-A--AT------AT-TGG----GGA-C------ACCT------------TAGAAA--A--AATGT-A--ACT-GA-TCCTC-----T-A-TATCAggta
gi|26 : tttcttaaattaggtAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAAC-AA----A-TTTCTTTCA-----A--TG---TATT-AAG-TGGTT-AAT--AAGT-GA-TA-C-ATATATCAGACGA----TG---T--ACCA--TACACA--AGTCGA--------TTTTTA-TA-CAGA---A-TTAT----A--AA-TGAT-GTTTCCTTAAATTTC-A
gi|27 : -AAAAAA-CTTG-CCA-GA-C-TAAGC-AC----A-TATCTTTCACTCGTA--TG---TAAT-AGA-TACTA-AAT--GAGT-GA-TG-C-TTA-ATCAGAAGA----TG------ACCT--T-CGTA-----CCAGTTTTACGTTTTTATTA-AATAACGA-TTAT----A--AA-
gi|28 : a---AG-A----A------TTA-----CAATGT--AT---G-AT-AAA-----TGTTGCAC------ATAGT----AGA------A---------A---------------TTTTCCTAAATGC-GGGCA-----TTTCTCTG-------GTATT-TGTAGCGT-TAAGTACATGTAATT----AAATAAG-TTg
gi|29 : caattacgtgtacacgCTC--TACATA--AGTCGACTTTT-------TA-TA-GAGG---A-TTAT----A--AA-TGAT-GTCTCCTCAAATTTC-ACTAGGTTTTTTTT--T----------TGG----GG-GG-G-GGGG-T---AT------------CAATTTA--TT--AA--T--A-ACC--AAGG--A-A-----ATG-TTTT-CT-T--------
gi|3 : --GGGAGGATG-T------ATCA-C-A--AAAAAATC-AATT-AAATACGACAA-GA---------A--AAATGT-ATAAAAAT--TCA-TTTCA-----------------AGGTATAACATG------------AAT------------TTCTAAAT--A-T-TG-C---TA--TAG---T---C--T--A-----GT---------G--TAACTCCGTCA-AGGATTAT-TCCATT-TCA-----TAAA-GCCATTTTC------CGTTA-GCCACAA----------G---------------C--------------AT---A--T-ATA------CA-----------A---T-TA-T--ATA----T-A--CA----TCGTCA-A---TAT-----A-TCAAC-AAA--AA-C--A-ACATA-GT--GGAAA--G----TGA--GT-AGTC-TCT---AT--T-A-CAAAGATAGGGGGA-TAT-GATTATTAAA---AT--ATGT-----T---AG-A----A------TTA-----CAATGT--AT---G
gi|3 : ATA--AGTCGA-------TTTTTTA-TA-GATA---A-TTAT----A--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATTTC-ACTA-------TTT--TCG--G-GG--TGG----TG-GT-G-GTGG-T---GT------------TA--TTA--TT--AA--T--A-ACC--AAAN--N-NC----ATG-Tagaattgnaataagtcgattttttatagataattataaatgatgtttcctcaaatttcactattttcggggtggtggtggtggtgttattattaataaccaaannncatgtatttcaagtcagtctagatgacactttagaataaatggaactaatcctctataccatgtagattccccggaaatggtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtatctaggtacaataggtgcacaacgtgcaacaattctcttgctgtccgtgcaagtaagtgcaaacccgggtacgttgtacatg
gi|3 : gggaggatgtatcacaaaaaaatcaattaaatacgacaagaaaaatgtataaaaattcatttcaaggtataacatgaatttctaaatattgctatagtctagtgtaactccgtcaaggattattccatttcataaagccattttccgttagccacaagcatatatacaattatatatacatcgtcaatatatcaacaaaaacaacatagtggaaagtgagtagtctctattacaaagatagggggatatgattattaaaatatgttagaattacaatgtatgagaattgnaAT------G---TA----TT--TCAAGT--CA-----GT------CT-AGA----TGA-C------A--C------------TTTAGAATA--AATGG-A--ACT-AA-TCCTC-----T-A-TACCATatttcaagtcagtctagatgacactttagaataaatggaactaatcctctataccatgtagattccccggaaatggtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtatctaggtacaataggtgcacaacgtgcaacaattctcttgctgtccgtgcaagtaagtgcaaacccgggtacgttgtacatg
gi|31 : gggaggatgtatcacaaaaaaatcaattaaatacgacaagaaaaatgtataaaaattcatttcaaggtataacatgaatttctaaatattgctatagtctagtgtaactccgtcaaggattattccatttcataaagccattttccgttagccacaagcatatatacaattatatatacatcgtcaatatatcaacaaaaacaacatagtggaaagtgagtagtctctattacaaagatagggggatatgattattaaaatatgttagaattacaatgtatgagaattgnaataagtcgattttttatagataattataaatgatgtttcctcaaatttcactattttcggggtggtggtggtggtgttattattaataaccaaannncCAA----------G---------------CTG------------ATTGGA--T-A--------CA-----------------CA-T--ATA----T-A--CAATTGTTGT-A-AATATATCAACAA-TCAAC-AAA--AG-C--A-ACATA-GT--GGACA--G----TGA--GT-AGTC-TCC---AT--T-A-CAA--------AGA-TGT-GATTATTACA---Agtagattccccggaaatggtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtatctaggtacaataggtgcacaacgtgcaacaattctcttgctgtccgtgcaagtaagtgcaaacccgggtacgttgtacatg
gi|32 : AGTT----AAATAAG-ATTAAAA-C-GT--T---G-GGT-T-------------T--TTCT-----TCAT-A-TAT------A---T-----TT--TCAAGTTATAT-A--GT------AT-GGA----GGA-C------A--CATTAGAATTTA-T-------A--AATGG-A--ACT-CA-TCCTC-----T-A-
gi|33 : --AGTCGACTTTT--T-----A-TA-AAGA---A-TTATTTATA--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATT-C-ACTG-------TTT--T-A--G-GG---GG----GG-GG-G-GTGT-TG---T------------TA--TTA--TT--AA--T--A-ACC--AAAG--A-A-----AT
gi|35 : cTA-A-TAGC--TTTCC-AAAA-G-CTTT-CCT-GA-C-TAAA--AA----A-TTC--TTCA--------TG---TA---AAG-TG-TT-AAT--AAGT-GA-TA-C-ATATATC-GACGA----TG---T--ACCC--TAC
gi|36 : ---------G--T--------CA-AGGATTAT-TCCATT-TCA-----TAAA-GCCATTTTC------CGTTT-GCCACAA----------G---------------C--------------
gi|37 : gcgagtgtaacccc-TTAT----A--AA-TTAT-GTTTCCTCAAATTTC-ACTA-------T---------G-GA--T-------G-GG-G-GTGG-TG--------------------TTA--TT--AA-----A-ACC--AAAG--A-A-----ATG-TTTtcaatggata
gi|38 : AAGATAGAGGGA-TAT-GAT-ATTACA---AT--ATGT-----T---AG-T----A------TTA-----CA------AT---GTAT-GAGA-A-TTGTTGCAC------ATTG
gi|39 : GTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAAC-AA----A-TTTCTTTCA-----A--TG---TAT
gi|4 : caaA-TATC-ATGTATCACACGAA---TG---T--ACTC--TACATTT-AGGCGACTTTT--T-----A-TA-AAGA---T-TTAT----A--AA-TGAT-TCTTCCTCAAA---C-ACAC-------TTT--T-A-----G--T-------G-GG-G-GT-------GT------------TA--TTA--TT--AA--T--A-ACC--AAAG--A-AG----AAA-TTTT-CT-----------AT---T----CAT-T--TG---ATA-------AATC----AAATAA---A----C--GC-C-CCA----GAA-GCATG------GGATG-T------ATCA--GA--AAAATTTC-AATT-AAAT-C-GCAA-GA---------A--AAA----A-AAAAAGGATCG-TTCCA-----------------A---------T-------------AAT------------TTCTAAAT--A-A-TG-C---TAG-TGGAAAC---C--C--C-----GTTAC------G--T--------CA-A-GATTGT-TCCATT-TCA-----TAAA-GCCATTTTC------GA--A-ACCACAA----------G---------------CTCAACGGATACACAAT---A--T-A--------CA-----------A---T-TA-T--ATA----T-A--CA----TTGT-A-A---AAT-----A-TCAAC-AAA--AA-C--ATAAATG-GA--AGGGA--C----TGT--AT-AGTC-TCC---AT--T-A-CAAAGATGAGGAGATTAT-GA-TATTACA---AT--ACATG----T---AG-A----ACAGAATTTA-----CAATGT--------TAT-GAGAAA-CTGT--CAC------ATT-T----AGAATTTT-CCTAAATTAGA---------------CAGTTCT-----C-TG-----------------------GTATT-TGT-ACGT-TAA------GTAATT----AA--AAG-TTTAAAAAA-AT--T---G-G-C-G-------------T--TTTC-----TCAT-A-TATC-----A---T-----TT--TCAAGT--CAT-A--GT------ATAAGA----TGA-C------A--CTTTAGAA-----T-------A--AAT-G-A--ACC-AA-TCCTT-----TCA-TATCATa
gi|40 : caagtaatagctttccaaaatttgtaataccgatt----A--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATTTT-ACTG-------TTT--T----------T------GG-GG-G-GTG---GG-GT------------TA--TTA--CT--AA--T--A-gttagatat
gi|41 : -AGGATTAT-TCCGTT-TC--------AA-GC------T------CATTG-G--ATAA----------A---------------CAT------------AT---A--T-A--------CG-----------A---T-TA-T---------T-A--CA----T
gi|42 : GTA-A-CATC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-A-TAATC-GA----A-TTTCTTg
gi|43 : tta------------T-------A--AATGG-A--ACT-CA-TCCTC-----T-A-TACCATat
gi|45 : tttcgaaA-TG-GAGA---A-TTAT----A--AA-TGAC-GTTTCCTCAAATTTT-Agtaaattcc
gi|46 : GTA-A-TAGC--TTTCCAAAAAAG-CTTG-CCT-
gi|47 : catgacaaGTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTA-CCT-G
gi|5 : acaaGTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAAC-AA----A-TTTCTTTCA-----A--TG---TATT-AAG-TGGTT-AAT--AAGT-GA-TA-C-ATATATCAGACGA----TG---T--ACCC--TACATA--AGTCGATTTTT--TTTTTTA-TA-GAGA---A-TTAT----A--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATTTC-ACTA-------TTT--T-A--GTGG--TGGT---GG-TG-G-GTGG-TGG-GT------------TA--TTA--TT--AA--T--A-ACC--AAAG--A-A-----ATG-TTTA-CT-T--------AAT---T----CAT-T--TG---ATT-------AATC----AAAT-----A----C--GC-C-TCA----GAA-GCATG--GGGAGGATG-T------ATCAGGGA--AAAAAATC-AATT-AAATACGGCAA-GA---------A--AAATGT-ATAAAAAT----A-T---------------------A---------TG------------GAT-CA---------TTCTAAAT--A-T-TG-C---TA--TAG---T---C--T--A-----GT---------G--T--------CA-AGGATTAT----------A-----TAAG---CATTTTC------CGTAA-GCCACAC----------G---------------C--------------AT---A--T-A--------CA-----------A---T-TA-T--ATA----T-A--CA----TTGT-A-A---TAT-----A-TCAAC--AA--AA-C--A-ACATA-GT--GGAGA--G----TGA--GT-ACTC-TCC---AT--T-A-CAAAGATAGAGAGA-TAT-TATTATTACA---AT--ATGT-----T----G-A----A------TTA-----CAATGTACAT---GTAT-GAG--A-TTGTTGCAC------ATTGT----AGA------C---------A---------------CAGTTCT-----CAGG--A-----TT-------------GTATT-TGTAACGC-CAA------GTAATT----AAAGAAG-TATAGAAAC-AT--T---G-G-T-T-------------T--TTCT-----TCAT-A-TAT------A---TA----TT--TCAAGT--CAT-A--GT------CT-AGA----TGA-C------A-----------------------------GA-A--ACT-AA-TCCTC-----T-A-TATCAT
gi|6 : GTA-AGTGGCGGTTTCC-AAA--G-CTTG-C----A-CATAAAC-AAGGGGA-TTTCTTTCA-----C--TGAGATGTT-AAC-TGTTTCAAT---AGT-GA-TG---ATAT-TTAGA-AA----TG---TTCACTC--TACAT---AGTCGACTTT
gi|6 : aaTTTCCTCAAATTTCAACTG-------TTT--T-T--A-AG--TGG----GG-cctcaaatttcaactgtttttaagtggggaatgcttattctgattgatattgattaatgcaatacatgcgctcagaagcattacgggaggatgtatcaagtaaatttaatgttaaaatctttaaaaaatcagtttcaaagtatcgataatggattgtcaattttctgaaatccttcaaggattattcgtttcaagctcattggataacatataatacgaattaattatataacgtatatacaaaaacagcatagtttgaagagtgcgttagtctcagaaattaacaaagatagagagttaattattacacaatataatacactacactagagactaatctatttaatatagacattttcctaaattagacagttctttgtatttgttaccttaagtaattaataagattagaacattgtggttttgttctgtcattatatatcattttcaagatatatggtatagaggaccctttagaaatcatcctctatat
gi|6 : aagtaagtggcggtttccaaagcttgcacataaacaaggggatttctttcactgagatgttaactgtttcaatagtgatgatatttagaaatgttcactctacatagtcgacG--G-A-----ATG-CTTA-TTCT--------GAT---T----GATAT--TG---ATT-------AATG----CAAT-----A----CATGCGC-TCA----GAA-GCATTACGGGAGGATG-T------ATCA-AG---------TA-AATT-TAATGTT----------------A--AAATCT-TTAAAAAA--TCAGTTTCA-----------------A---------AG------------TAT-CG---------AT---AATGGA-T-TGTC---AA--TTT---T---C--TGAA-----AT---------CCTT--------CA-AGGATTAT-TC-GTT-TCA--------A-GCT------------CATTG-G--ATAA--------------------------C--------------AT---A--T-AATACGAATTA-----------A---T-TA-T--ATA------A--CG----T-----------AT-----A-T--AC-AAA--AA-C--A-GCATA-GTTTGAAGA--G----TGC--GTTAGTC-TCAGAAAT--T-AACAAAGATAGAGAGT-TA---ATTATTACACA-AT--ATAA-----T---AC-ACTACA------CTAGAGACTAATCT--ATTTAATATAGAC--A-TTTTCCTAA------ATT------AGA------C---------A-----------------GTTCT-----------------TT-------------GTATT-TGTTACCT-TAA------GTAATT-----AATAAG-ATT-AGAAC-ATTGT---G-G-T-T-------------TTGTTCTG----TCAT---TAT------A---TATCATTT--TCAAGA--TAT-ATGGT------AT-AGA----GGACC------C--T------------T------------TAG-A--AAT-CA-TCCTC-----T-A-TATaatgcttattctgattgatattgattaatgcaatacatgcgctcagaagcattacgggaggatgtatcaagtaaatttaatgttaaaatctttaaaaaatcagtttcaaagtatcgataatggattgtcaattttctgaaatccttcaaggattattcgtttcaagctcattggataacatataatacgaattaattatataacgtatatacaaaaacagcatagtttgaagagtgcgttagtctcagaaattaacaaagatagagagttaattattacacaatataatacactacactagagactaatctatttaatatagacattttcctaaattagacagttctttgtatttgttaccttaagtaattaataagattagaacattgtggttttgttctgtcattatatatcattttcaagatatatggtatagaggaccctttagaaatcatcctctatat
gi|7 : aagtaagtggcggtttccaaagcttgcacataaacaaggggatttctttcactgagatgttaactgtttcaatagtgatgatatttagaaatgttcactctacatagtcgactttcctcaaatttcaactgtttttaagtgg---------TTCTAAAT--A-T-TG-C---TA--TAG---T---C--T--A-----GT---------G--TAACCCCGTCA-ATGATTAT-TCCATT-TCA-----TAAA-GCCATTTTC------CGTTA-GCCACAA----------G---------------C--------------AT---A--T-ATA------CA-----------A---T-TA-T--ATA----T-A--CA----TTGT-ACA---TAT-----A-CCAAC-AAA--AA-C--A-ACATA-GT--GGAGA--G----TGA--GT-AGTC-TCC---AT--T-A-CAAAGATAGAGGGA-TAT-GATTATTACA---AT--ATGT-----T---AG-A----A------TTA-----CA------AT---GTAT-GAGA-A-TCATTGCACATACCAATTGT----AGA------C---------A---------------CAGTTCT-----C-----------TT-------------GTATT-GGTAACGC-CAA------GTAATT----AAAGAAG-TTTAAAAAC-AT--TG--G-G-T-T-------------T--TTCT-----TCAT-A-TATC-----A---TA----TT--TCAAGT--CAT-A--GT------CT-AAA----TGA-C------A--CTTTAGAA-----T-------A--AATGG-A--ACT-AA-TCCTC-----T-A-TATCAT
gi|8 : aaaaatT---T----CAT-T--TA---ATT-------AATC----AAAT-----AGATAC--CC-C-TCA----GAA-GCATG--GG----------------------A--GAAAAATT---TC-AAA-ACTGCAA-GA---------A--AAATCT-ACAAAAAT--TCA-TTTCA-----------------A---------CGTCC---------AATACT---------TTCTAAAT--A-A-TG-CGAGTA--TAA---C---C--C---------C---------G--T--------CA-AGGATTAT-TCTATT-TCA-----TAAA--CCATTTTT------CGTAA-ACCACAA----------G---------------CTCA-----------AT---G--G-A--------TA-----------ATTGT-TA-T--ATA----T-A--CA----TTGTAA-A---TAT-----A-TCAAG-AAA--AA-C--A-ATATA-GT--TGAGA--GGAACTGT--AT-AGTC-TCC---AT--T-A-CAAAGAT-GAGAGA-TAT-GATTATTACA---ATACATGTA----TACGAA-A----A------TCA-----CAATGT--AT---G--C-GA---A-TTGTTGCAC------ATTGT----AGA------C---------A----------------ATTTCC-----T-AA--A-----TTAGACACGTCTCTGGTATT-TGTAACTCTTAA------GTAATTTTAAAAAGAAGTTTTAAAAAC-AT--T---ATG-T-T-------------T--TTCT-----TCAT---TATC-----A---TA----TT--TCAAGT--CAT-A--GT------AT-AGA----TGA-C------A--CTTTAAATTAGAAT-------A--AATGG-A--ACT-CA-TCCTC-----T-A-TATCATgtagattccccggaaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacatgtatccaggtacaatatgtgcacaacgtgcaacaattctcttgctgtccatgcaagtaagtgcaaaaccgggtacgttgtacatg
gi|9 : --AAAAAATC-AATT-AAATACGGCAA-GA---------A--AAATCT-ATGAAAAT--TCA-TTTCA-----------------A---------TGTATAATATTATGGAT-CGACCAATAATTTCTAAAT--A-A-TG-C---T---TAG---TG--T--T--AACCCCGT---------G--C--------AA-GGGATTATCTCCATT--CA-----TTAA-ACCACTTTCTCCAGCCTTTG-GCCACAACAAGTCATTGG---------------T--------------AT---A--C-A--------CACATATATACATA---T-TA-TT-ATACTGTT-A--CA----TTGT-A-AA--TAT-----A-TCAAC-AAA--AAAC--A-ACATA-GT--GGAGA--G----AGACTGTTAGTC-TCC---AT--T-A-AAAAGATAGAGAGA-TAT-GATTATTGCAAGTAC--ATGTGTACCC---AG-A----A------TTA-----CAATAT--TT---G-A--GAA--A-TTGTTGCAC------ATTG-----AGA------C---------A---------------T-TTTCC-----T-AA--A-----TTAG-----------ACAGT-TCT-CCGG-TAAAT----GTAAC-----------G-TTTAAAAAA-AT--TG--G-G-G-T-------------T--TTCT-----TCAT-A-TAT------A---TAT---TT--TCAAGT--CAT-A--GT------AA-TGA----TGA-C------A--C------------TTTA----A--AATAG-ATGACT-CATTCCTTCCTTAT-A-TATCATgt
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|23 ): TCCGGAAAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAATAGGTGCACAACGTGCAACAATTCTCTTGCTGTCCATGCAAGTAAG
Unaligned ( gi|30 ): GAATTCCTGAAGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAATAAAGTAACTAATTTTCTATGCACAACAAATTTTTGCTCTTCAATATGAACAATAATTTTGTGCTCGTCAATAAAGACA
Unaligned ( gi|34 ): ACACGTGTACGAGAATTACAATATCAAGAGAATTGTTGCGCATGAACATTTTCCTAAAATGTTCAATGGTATATGTAACGTTTAAAAACATTGG
Unaligned ( gi|44 ): GAGTCCTTGTTAACATGAATAAAATTAAGTGTATCA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11111111 1111 222222222 111111111 33333333333333333333 11111 11111111 1111111 1111 2222222222 222222 111111111 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000 6666666666666666666666666666666666666666666 55555555555555555555555555555555555555555 11111111 11111111111 111111111111111 111 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 111111 111 2222222222222 2222222222222222 7777777777777777777777777777777777
lowQualScore : 3 3 44 2 2 2 2 3 3 3 6666 3 22222222 999 3 3 7 55 3 3 0000 8888 777 33 33 55 888888888 2 2 666 2 4444 22 2 2 2 7777777 444444444 55 7777 2 4 2 55555555555555555555 333 33 55 33 33 2 33 33 2 00000 2 44 3 77777777 555 6666 3 44 555 0000000 3333 0000000000 55 3 3 7777 3 888 3 999999 111111 11 3 3 0 0 3 333333333 77 2 3 55 3 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222 4 55 999 3 666 77 3333333333333333333333333333333333333333333 2 0 2 2 77777 2 888888 2 33333333333333333333333333333333333333333 555 33 2 77777777 22222222222 444 2 2 99 5555 2 33 111111111111111 77777 3 3 44 3 44 6 3 44 44 6666 44 6 3 555 44 3 3 2 2 0 222 33 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 777777 6666 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 2 0 2 555555 8888 2 2 2 33 555 2 5 2 1111111111111 99999 222 5555555555555555 33 33 2 33 777777 2 2 2222222222222222222222222222222222 33 55 5 88888 5 2
lowQualScore : . . .. . . . . . . . .... . ........ ... . . . .. . . .... .... ... .. .. .. ......... . . ... . .... .. . . . ....... ......... .. .... . . . .................... ... .. .. .. .. . .. .. . ..... . .. . ........ ... .... . .. ... ....... .... .......... .. . . .... . ... . ...... ...... .. . . . . . ......... .. . . .. . ........................................................ . .. ... . ... .. ........................................... . . . . ..... . ...... . ......................................... ... .. . ........ ........... ... . . .. .... . .. ............... ..... . . .. . .. . . .. .. .... .. . . ... .. . . . . . ... .. ......................................................... ...... .... ....................................................................... . . . ...... .... . . . .. ... . . . ............. ..... ... ................ .. .. . .. ...... . . .................................. .. .. . ..... . .
lowQualScore : 3 3 22 9 7 7 7 1 1 1 5555 1 00000000 222 6 6 3 00 6 3 4444 9999 999 99 77 99 000000000 4 4 555 2 5555 99 1 2 1 6666666 888888888 66 4444 2 7 4 00000000000000000000 999 22 66 22 22 4 44 22 4 66666 5 11 1 77777777 444 5555 1 22 444 0000000 1111 5555555555 00 6 6 7777 6 333 3 666666 222222 77 1 1 1 8 3 333333333 99 2 3 00 6 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333 3 00 000 6 444 99 3333333333333333333333333333333333333333333 9 1 9 9 11111 9 222222 9 88888888888888888888888888888888888888888 000 77 7 00000000 77777777777 777 7 7 00 7777 7 77 555555555555555 77777 1 1 22 1 22 2 1 22 22 5555 22 2 1 444 22 1 1 7 7 8 000 99 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 777777 1111 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 9 9 9 000000 8888 8 5 7 77 333 7 3 7 0000000000000 33333 999 9999999999999999 44 44 5 44 222222 5 7 2222222222222222222222222222222222 44 00 0 88888 0 5
consensus : GTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAAC-AA----A-TTTCTTTCA-----A--TG---TATT-AAG-TGGTT-AAT--AAGT-GA-TA-C-ATATATCAGACGA----TG---T--ACCC--TACATA--AGTCGACTTTT--TTTTTTA-TA-GAGA---A-TTAT----A--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATTTC-ACTA-------TTT--T-A--G-GG--TGG----GG-GG-G-GTGG-TGG-GT------------TA--TTA--TT--AA--T--A-ACC--AAAG--A-A-----ATG-TTTA-CT-T--------AAT---T----CAT-T--T---GATT-------AATC----AAAT-----A----C--GC-C-T----CAGAA-GCATG--GGGAGGATG-T------ATCA-GGA--AAAAAATC-AATT-AAATACGGCAA-GA---------A--AAATNT-ATAAAAAT--TCA-TTTCA-----------------A---------TG------------GAT-CG---------TTCTAAAT--A-T-TG-C---TA--TAG---T---C--T--A-----GT---------G--T--------CA-AGGATTAT-TCCATT-TCA-----TAAA-GCCATTTTC------CGTTA-GCCACAA----------G---------------C--------------AT---A--T-A--------CA-----------A---T-TA-T--ATA----T-A--CA----TTGT-A-A---TAT-----A-TCAAC-AAA--AA-C--A-ACATA-GT--GGAGA--G----TGA--GT-AGTC-TCC---AT--T-A-CAAAGATAGAGAGA-TAT-GATTATTACA---AT--ATGT-----T---AG-A----A------TTA-----CAATGT--AT---GTAT-GAG--A-TTGTTGCAC------ATTGT----AGA------C---------A---------------CAGTTCT-----C-GG--A-----TT-------------GTATT-TGTAACGC-TAA------GTAATT----AAANAAG-TTTAAAAAC-AT--T---G-G-T-TT-------------TTCT-----TCAT-A-TAT------A---TA----TTTC--AAGT--CAT-A--GTA------T-AGATGA-C------A------CTTT--A-----AT------AAATGGA--ACT-CA-TCCTC-----T-A-TATCAT
Reference ( family-2690 ) : GTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAAC-AA----A-TTTCTTTCA-----A--TG---TATT-AAG-TGGTT-AAT--AAGT-GA-TA-C-ATATATCAGACGA----TG---T--ACCC--TACATA--AGTCGACTTTT--TTTTTTA-TA-GAGA---A-TTAT----A--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATTTC-ACTA-------TTT--T-A--G-GG--TGG----GG-GG-G-GTGG-TGG-GT------------TA--TTA--TT--AA--T--A-ACC--AAAG--A-A-----ATG-TTTA-CT-T--------AAT---T----CAT-T--T---GATT-------AATC----AAAT-----A----C--GC-C-T----CAGAA-GCATG--GGGAGGATG-T------ATCA-GGA--AAAAAATC-AATT-AAATACGGCAA-GA---------A--AAATNT-ATAAAAAT--TCA-TTTCA-----------------A---------TG------------GAT-CG---------TTCTAAAT--A-T-TG-C---TA--TAG---T---C--T--A-----GT---------G--T--------CA-AGGATTAT-TCCATT-TCA-----TAAA-GCCATTTTC------CGTTA-GCCACAA----------G---------------C--------------AT---A--T-A--------CA-----------A---T-TA-T--ATA----T-A--CA----TTGT-A-A---TAT-----A-TCAAC-AAA--AA-C--A-ACATA-GT--GGAGA--G----TGA--GT-AGTC-TCC---AT--T-A-CAAAGATAGAGAGA-TAT-GATTATTACA---AT--ATGT-----T---AG-A----A------TTA-----CAATGT--AT---GTAT-GAG--A-TTGTTGCAC------ATTGT----AGA------C---------A---------------CAGTTCT-----C-GG--A-----TT-------------GTATT-TGTAACGC-TAA------GTAATT----AAANAAG-TTTAAAAAC-AT--T---G-G-T-TT-------------TTCT-----TCAT-A-TAT------A---TA----TTTC--AAGT--CAT-A--GTA------T-AGATGA-C------A------C-----------AT------AAATGGA--ACT-CA-TCCTC-----T-A-TATCAT
gi|1 : TA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCTCGA-C--AAACAAA----A-TTTCTCT-A-----A--TG---GATT-AAGCTGGTT-AACTAAAGT-GATTA-C-ATATATCAGACGAATGTTG---T--G-CC--TACATA--AGTCGA----T--TTTTTTA-TA-GAGG---A--TAT----AGCAA-TGAT-G-TTCCTC-AATTTC-ACTA-------TTT-------A-GG--CGGTAAAAG-GA-G-GTGT-T---GT------------TG--TTAACTTCAAA--T--A-ATCAGAAAG--ACA-----ATG--TTA-CT-TAATC----AAT---T----AAT-T--T---GATT-------AATCAAATAAAT-----A----C--GC-C-T----TA-AA-GCATG--GGGAGGTTGTT------ATCA-AGA--AAATAAAC-A--T-AAATACGGCAATGA---------AC-AAATTTAATAAAAAT--TCA-TTTCAAAGGTATAT--------A---------TG------------GGA-CGTCCAAAAAATTCTAAA---A-TATG-C---TA--TAG---T---CTAT--A-----GTGTAAACCCCG--T--------CA-AGGATTAT-TCCA---TCA-----TAAA-GCCATTTTC------CGTTAGGCCACAA----------G---------------CA-------------AT---A--C-A--------CA-----------A---T-TA-T--ATA----T-ACTCA----CTGA-A-A---TAT-----ACTCAAC-AAA--AA-C--A-ACATA-G---GGAGAGTG----TGA--GT-AGTC-TCC---AT--T-A-AAAAGA-AGA-AGG-GAT-GA-TATTACA---AT--ATGT-----T---TGTA----T------TTA-----CA---T--AT---GTAT-GAGGAA-TTGTTGCAC------ATTGT----AGA------CGAT------A---------------CAGTGTT-----C-----------CT-------------GTATTGTGTAACGC-CAA------GTAATT----AAGAAGG-TTTAAAAAC-AT--T---G-G-T-TT-------------TCTC-----TCATAA-TATC-----A---TA----TTTC--AAGT--CATAA--GTC------T-AGATGACC------A------CTCTTTAG----AT------AAATGGA--ACT-AACTCCTC-----TAA-TATCA
gi|10 : -----------------A---------TG------------GAT-TG---------TCC--AAT--AAT-TT-C---TA--AA-------------------------------------------CA-ATGGTTAT-ACCATT-TCA-----TAAA-GCCACTTTC------CGTTA-GCCACAA----------G---------------CTCATATAC------AT---AAAT-A--------CA-----------A---T-TA-TT-ATA----T-A--CA----C------G---TAC-----A-TCAAC-AAA--AA-C--A-ACATA-CT--GGAGA--G----TGA--GT-AGTC-TCC---AT--T-A-CAAAGATAGAGAGA-TAT-GATAATCATA---A----------------------------------------GATGT--AT---G----AAA--A-TTGTTGAAC------ATTTTTCTAAGG----------------A---------------CAGCTCT-------G------------------------GTATC-TGTAACGC-TAA------GTAATT----AAATAAG-TTTATAAGC-AC--T---G-G-G-TTA------------TCCT-----ACAT-A-TATATC---A---TA----TTTC--AAGT--CAT-A--GTATACTATT-AGATGG-C------AATTTAGA-----------AT------AAATGGA--ACT-CA-TCCTC-----T-A-TATCATatgtagagaatccccggaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacgatctaggtacaaaagatgcacaaacgtgcaacaagtccttgctgcgtctatgcaagtaagtgccaaacccgggacgttgtacatg
gi|11 : atatcaaagtataatC--TTTCC-AAAAAA-CTTG-CCT-GA-C-TAAAC-AA----A-TTTCTTTTA-----A--T----TATT-ACG-TAGTT-AAT--AAGT-GA-TA----TATATCAGACGA-----G---T--ACTC--TGCATATAAGTCGACTTTT------TTA-TA-GAGA---A-TTAT----A--AT-TGAT-GTTTCCTTGAATTTC-TCTG-------TTTAGC-G--G-GG--GGG----GG-GGCG-GGGG-TGG-GG------------TA--TAA--T----G--T--A-ACC--CAAGGTA-AAACATATGTTTTA-CT-TTCAATATCAAT---TTTCGCAT-TTAT---AACT-------CGTC----AAATAAATGA----C--AC-CAT----CAGAA-GCATG--CGGTGGATT-TTATGAGATCA-GAAATAGAGAAT---ATTGAAACACGgtaga
gi|12 : ttccttgatcttaaaggcggatccaaaacttgtattaacacttttagacGA----TG---T--ACTC--TACATT--AGTCGACTTTT--T-----G-TA-CAGA---A-TTAT----A--AA-TGAC-TTTTCCTCAAATTTC-ACTG-------TTT--T-A--G-AG--AGG----G----------------GT------------T-----------------------------G--A-A-----ATG-TTTT-CT-T-------------------CAT-T------AATC-------AAAC----AAAT-----A----C--GC-C-T----CAGAA-GCATG--GGGA---TG-T------ATCA-G-A--AAAATTTC-AATT-AAATGCGGCAA-GA---------A--AAATTT-ATACAAAT--TCA-TTTCA-----------------AGGTATAATATG------------GAT-CG---------TCC--AAT--AAT-TT-C---TAAATAA---TATAC--T--G-----GT---------G--TAACCCCGTTA-AGGATTAT-TCCATT-TCA-----TAAA-GCCATTTTT------CGTTT-GCCACAA----------GCTCAATGAAAACACAC--------------AT---A--T-A--------CA-----------A---T-TATT--ATA----T-A--CA----TTG
gi|13 : AGAGAGA-TGT-GATTATTACA---AT--A
gi|13 : accgttaatgtcatacacaaA------GTAATT----AAAGACG-TTTTAAAAC-AT--TTTGG-G-T-TT-------------TTCT-----TCAT-A-TATC-----A---TA-----TTC--ATGA--CAT-A--GTG------T-AGATGA-C------A------CTTTAGA-----AT------AAATGGA--ACT-CA-TCCTT-----T-A-catgtatacgagnaaagacgatgtgaggaagttggagaggaactgctaaatctagcacaacagtctgtgcaatctgcattacaagaagaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaattaaagacgttttaaaacattttgggtttttcttcatatatcatattcatgacatagtgtagatgacactttagaataaatggaactcatcctttat
gi|14 : accgttaatgtcatacacaaagagagatgtgattattacaatacatgtatacgagnaaagacgatgtgaggaagttggagaggaactgctaaatctagcacaacagtctgtgcaatctgcattacaagaagaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn---A--T-A--------CA-----------A---T-TA-TTAATA----A-A--CA---------A-A---CA----------AAC-AAACAAA-C--GGACATT-GT--GGAGG--G----TGA--GT-GGAC-ACC---AA--T-G-CACAGTTTGAAA-----T-AA-----ACA---A---AT-T-----G---AG-A----A------TTT-----C------------GTA-----------GTTGCAT------ATTGT----AGAAATTTCC---------AAAATTAAA-------CAGTTC---------G--T-----TA-------------GTATT-TTTGACAT-TGA------GTAATT----CAATCAG-TTTAAAAAC--T--C---A-A-T-GT-------------TTGT-----ATAG-A-TAC------AATTTG----TCTC--AAGT--CAT-C--GTA------T-AGA
gi|15 : cctaagtctcattggacgtacataaGTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAAC-AA----A-TTTCTTTCA-----A--TG---TATT-AAG-TGGTT-AAT--A-----------------TCAGATGA----TG---T--ACCC--TACATA--AGTCGAATTTT--T-----A-TA-GA-----A-TTAT----A--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATTTC-ACTA-------TTT--T-A--G-GG--TGG-------------TGG-TGGTGT------------TA--TTA--TT--AA--T--A-ACC--AAAG--A-A-----ATG-TTTA-CT-T--------AAT---T----CAT-T--T---GATT-------AATCAAATAAAT-----A----C--GC-C-T----CAGAA-GCATG--GGGAGGATG-T------ATCA-G----AAAAAATCAAATT-AAATACGGCAA-GA---------A--AAATGT-ATAAAaaagtgaaactttagatgaagtgcaccatttttt
gi|16 : TTTTTA-TATGAGA---AATTAT----A--AA-TGAT-GTTTCCTCCAACTTC-ACTA-------TTT-------A-GG--TGG----GG-GG-G---GG-T---CT------------TA--TTA--TT--AA--T--A-A-C--AAAG--A-A-----ATG--TTA-CT-T--------AACTGAT----TAT-T--T---GATTTTAATCAAATT----AAAT-----A----C--GC-C-T----CAGAAGGCATGT-TGGAGGATG-T------ATTA--GA--AAAATTTC-AATT--AATACGGCAA-GA---------A--AGCTGT-ATAAAA----TCA-TTTCAAGGTATATAATCATTATA---------TG------------GAT-CGTCCAAAAT-TTCGAAAT--A-T-TG-C---TA--T
gi|17 : ----TG---T--ATCC--TACATA--AGTCGA----T--TTTTTTA-TA-TA-A---A-TTAT----A--AA-TGAT-GTTTCTTCAAATTTC-ACCA-------TTT--T-A--G-GGG-TGG----GT-GGTG-GTGG-TGG-------------------------T--A---T--A-AGC--AAAG--A-A-----ATG-TTTA-TT-T--------AAT---T----CAT-T--T---GATT-------AATC----AAAT-----AAATAC--GC-C-T----CAGAA-GCATA--GGGAGGATG-T------ATCA-GAA--AAAAAA---------AA-----CAA-CA---------ATTAAATGT-GTAAAAAT--TCA-TTTCA-----------------A---------tgg
gi|17 : -----GT---------G--T---------A-AAAATT-----CATT-TCAAGGTATAAA-GCTATTTTC------CGTTA-GCCACAA----------G---------------C--------------Aggtataaagctattttccgttagccacaagca
gi|18 : tgtatcctacataagtcgatttttttatataaattataaatgatgtttcttcaaatttcaccattttaggggtgggtggtggtggtggtataagcaaagaaatgtttatttaattcatttgattaatcaaataaatacgcctcagaagcatagggaggatgtatcagaaaaaaaaaacaacaattaaatGTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAAC-AA----A-TTTCTTTCA-----C--TG---TATT-ACG-TGGTT-AAT--AAGT-AA-T----ATATATCAGACGA----TGTACT--ACTC--TACATA--AGTCGAC-------CTTTTA-TA-GAGA---A-TTAT----A--AA-TGAC-GTTT-CTCAAATTTC-TCTG-------TTT--A-A--G-GG--GGG----GG-GG-G-G----------------------TA--TTA--TT--AATTT--A-ACC--AAAG--A-A-----ATG-TTAT-CT-T--------AAT---T----CAT-T--T---GATT-------AAGC----AAA
gi|19 : caaGTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTGGCCT-GA-C-TAAAC-AA----ACTTTCTTTC------A--TG---TATTAAAG-TGGTT-AAT--AAGT-GA-TA-C---ATATTAGACGA----TG---T--A--T--TA-ATA--AGTCGA----T--TTTTTTA-TA-GAGA---A--TAT----A--AATTCATGGTTTCCTCACATTTC-ACTA-------TTT--T-AAGG-GG--TGG----GGTGG-G-GTGG-GGGTGT------------TT--TTA--TTA-AA--T--A-ACC--AAAG--A-A-----ATG-T
gi|2 : caaGTACA-TAGC--TTTCC-AAAAAGGCTTG-CCT-GAAC-TAAAC-AA----A-TT-CTTTCA-----AAATGA--TATT-AAG-TGGTTTAAT--AAGTTGA-TA-CGATATATCAGACGA----TGC--T--ATCCCGTACATA--AGTCG--------TTTTTTA-TA-GAGAT--A-TTA-----A--AA-TGAT---TTCCTCAAATTTC-A-TA-------TTT--T-A--G-GGGGTGG----GG-TG-GCGTGGGTGG-GTGGTTTGGTGGTGTA--TTA--TG--AA--T--ATACC--AAAG--A-A-----ATG-TTTATCT-T--------AA----T----CAT-T--T---GA-T-------AATC----AA
gi|2 : acaaA--TAA---T---C--A--A-----G----------A--T--------CAGACGATTAT-TCCATTCTCA-----TAAAAGCCATTTTC------CGTTA-GCCACAA----------G---------------C--------------AT---A--TAA--------CA-----------G---TCTA-T--ATT----TAA--CA----TTGTAA-A---TAT-----A-TCAACAAAA--AA-CAAA-ACATAGGT--GGAGA--G----CGA--GT-AGTC-TCC---AT--TAA-CAAAGATGTAGCGA-TATGGATTA-TA-A---AT--ATGT-----T---AG-A----A------TTA-----CA------AT---GTAT-GAGA-A-TTGTTGCAC------ATTGT----AGA------C---------A---------------CAGTTCT-----CAAG--A-----TT-------------GTATT-TGTAACGC-CAGAT----GTAATT----AAAGAAG-TTTAGAAAC-AT--TG--G-G-TGTT-------------TTCT-----TCAT-A-TATATCATAA---TA----TTTT--AAGT--CAT-A--GTC------T-AGATGA-C------A------C-----------G-----------GAA--ACTAAA-TCCTCA----T-AGTATCGTgatcagacgattattccattctcataaaagccattttccgttagccacaagcatataacagtctatatttaacattgtaaatatatcaacaaaaaacaaaacataggtggagagcgagtagtctccattaacaaagatgtagcgatatggattataaatatgttagaattacaatgtatgagaattgttgcacattgtagacacagttctcaagattgtatttgtaacgccagatgtaattaaagaagtttagaaacattgggtgttttcttcatatatatcataatattttaagtcatagtctagatgacacggaaactaaatcctcatagtatcgtgtagattccccggaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaataggtgcacaacggtgcaatcaattctctgttgctgtccatcgccaagtaagtgcaaaccgggtacgtcttgtacatg
gi|20 : acaagtacatagctttccaaaaaggcttgcctgaactaaacaaattctttcaaaatgatattaagtggtttaataagttgatacgatatatcagacgatgctatcccgtacataagtcgttttttatagagatattaaaatgatttcctcaaatttcatattttagggggtggggtggcgtgggtgggtggtttggtggtgtattatgaatataccaaagaaatgtttatcttaatcatttg-TTGTTGCAC------ATTAT----AGA------TTTT------A---------------CTGATAT-----T-AG--ACATTCTT-------------GTATT-TGTA-CGC-TAA------GTAATTTA--AAATAAG-ATTCAAA-C-AT--T---G-GGT-TT-------------TTCTATGAATCAT-AATAT------A---CC----TTTC--AAGT--TGT-----TA------G-GGACGA-CTTTAGAA------TT----------AT------AAATGGA--ACT-CA-TCCTC-----T-A-TATgtagattccccggaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaataggtgcacaacggtgcaatcaattctctgttgctgtccatcgccaagtaagtgcaaaccgggtacgtcttgtacatg
gi|21 : tcatgttatgagattttccttaatt--T-A--------CA-----------A---T-TA-T---------T-A---A----TT---A-A---TA----------AAC-AAA--CA-C--G-GCACT-GT--GGAGA--G----TGG--GT-AGACATCA---ATGCT-A-CACTAATACACACT-TA---ATTATCGCACC-GT--ATG----------AT-A----A------TT--------TTGT--AG---AT-T-TAA--T-TTGTTGCAT------ATTGC----AAA------
gi|22 : agccacagtctcattggatgtacaaaagTAT-GAG--AATTGTTGCAC------ATTGT----AGA------C---------ATTTTCCTCAATTAGACAGTTCT-----C-GG-----------------------GTATT-TGTAACGC-GAA------GTAATT----AAAGAAG-TTTAAAAGCAAT--A---G-G-T-TT-------------TTCT-----TCAT-A-TAT----------TA----TTTA--AAAT--CAT-A--GTA------T-AGATGA-C------A------C-----------CT---------TAGA-------A-TCCTC-----T-A-TATCATattaaacaattcggtagattttt
gi|24 : aG-GG-G-GTA-------T------------TT--TTA--TT--AA--TTTA-ACC--AAAG--A-A-----ATA-CTTT-CT-T--------ATT---T----CAT-T--TATCAATT-------AAAT----AAAT-----A----C--GC-C-TCATGCAGAA-GCATG--CGGGGGATA-T------ATCA--GA--ACAATTTC-AATT-AAATGCAGCAA-AATACACATATA--AAATAT-ATAAAAAT--TCA-TTTCA-----------------A---------gtagatt
gi|25 : AGTTCT-----CTGG--A----------------------ATT-TGTAACAC-TAA------GTAATT----TAATAAG-TTAAAAAAT-GC--TA--G-G-T-TTCACATAATAAAATTTCT-----TAAT-A-TAT------C---TT----TTTCTCAAGT--TAC-A--ATA------T-TGGGGA-C------A------C-----------CTTAGAAAAAATGTA--ACT-GA-TCCTC-----T-A-TATCAggta
gi|26 : tttcttaaattaggtAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAAC-AA----A-TTTCTTTCA-----A--TG---TATT-AAG-TGGTT-AAT--AAGT-GA-TA-C-ATATATCAGACGA----TG---T--ACCA--TACACA--AGTCGA--------TTTTTA-TA-CAGA---A-TTAT----A--AA-TGAT-GTTTCCTTAAATTTC-A
gi|27 : -AAAAAA-CTTG-CCA-GA-C-TAAGC-AC----A-TATCTTTCACTCGTA--TG---TAAT-AGA-TACTA-AAT--GAGT-GA-TG-C-TTA-ATCAGAAGA----TG------ACCT--T-CGTA-----CCAGTTTTACGTTTTTATTA-AATAACGA-TTAT----A--AA-
gi|28 : a---AG-A----A------TTA-----CAATGT--AT---G-AT-AAA-----TGTTGCAC------ATAGT----AGA------A---------A---------------TTTTCCTAAATGC-GGGCA-----TTTCTCTG-------GTATT-TGTAGCGT-TAAGTACATGTAATT----AAATAAG-TTg
gi|29 : caattacgtgtacacgCTC--TACATA--AGTCGACTTTT-------TA-TA-GAGG---A-TTAT----A--AA-TGAT-GTCTCCTCAAATTTC-ACTAGGTTTTTTTT--T----------TGG----GG-GG-G-GGGG-T---AT------------CAATTTA--TT--AA--T--A-ACC--AAGG--A-A-----ATG-TTTT-CT-T--------
gi|3 : --GGGAGGATG-T------ATCA-C-A--AAAAAATC-AATT-AAATACGACAA-GA---------A--AAATGT-ATAAAAAT--TCA-TTTCA-----------------AGGTATAACATG------------AAT------------TTCTAAAT--A-T-TG-C---TA--TAG---T---C--T--A-----GT---------G--TAACTCCGTCA-AGGATTAT-TCCATT-TCA-----TAAA-GCCATTTTC------CGTTA-GCCACAA----------G---------------C--------------AT---A--T-ATA------CA-----------A---T-TA-T--ATA----T-A--CA----TCGTCA-A---TAT-----A-TCAAC-AAA--AA-C--A-ACATA-GT--GGAAA--G----TGA--GT-AGTC-TCT---AT--T-A-CAAAGATAGGGGGA-TAT-GATTATTAAA---AT--ATGT-----T---AG-A----A------TTA-----CAATGT--AT---G
gi|3 : ATA--AGTCGA-------TTTTTTA-TA-GATA---A-TTAT----A--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATTTC-ACTA-------TTT--TCG--G-GG--TGG----TG-GT-G-GTGG-T---GT------------TA--TTA--TT--AA--T--A-ACC--AAAN--N-NC----ATG-Tagaattgnaataagtcgattttttatagataattataaatgatgtttcctcaaatttcactattttcggggtggtggtggtggtgttattattaataaccaaannncatgtatttcaagtcagtctagatgacactttagaataaatggaactaatcctctataccatgtagattccccggaaatggtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtatctaggtacaataggtgcacaacgtgcaacaattctcttgctgtccgtgcaagtaagtgcaaacccgggtacgttgtacatg
gi|3 : gggaggatgtatcacaaaaaaatcaattaaatacgacaagaaaaatgtataaaaattcatttcaaggtataacatgaatttctaaatattgctatagtctagtgtaactccgtcaaggattattccatttcataaagccattttccgttagccacaagcatatatacaattatatatacatcgtcaatatatcaacaaaaacaacatagtggaaagtgagtagtctctattacaaagatagggggatatgattattaaaatatgttagaattacaatgtatgagaattgnaAT------G---TA----TTTC--AAGT--CA-----GTC------T-AGATGA-C------A------CTTTAGA-----AT------AAATGGA--ACT-AA-TCCTC-----T-A-TACCATatttcaagtcagtctagatgacactttagaataaatggaactaatcctctataccatgtagattccccggaaatggtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtatctaggtacaataggtgcacaacgtgcaacaattctcttgctgtccgtgcaagtaagtgcaaacccgggtacgttgtacatg
gi|31 : gggaggatgtatcacaaaaaaatcaattaaatacgacaagaaaaatgtataaaaattcatttcaaggtataacatgaatttctaaatattgctatagtctagtgtaactccgtcaaggattattccatttcataaagccattttccgttagccacaagcatatatacaattatatatacatcgtcaatatatcaacaaaaacaacatagtggaaagtgagtagtctctattacaaagatagggggatatgattattaaaatatgttagaattacaatgtatgagaattgnaataagtcgattttttatagataattataaatgatgtttcctcaaatttcactattttcggggtggtggtggtggtgttattattaataaccaaannncCAA----------G---------------CTG------------ATTGGA--T-A--------CA-----------------CA-T--ATA----T-A--CAATTGTTGT-A-AATATATCAACAA-TCAAC-AAA--AG-C--A-ACATA-GT--GGACA--G----TGA--GT-AGTC-TCC---AT--T-A-CAA--------AGA-TGT-GATTATTACA---Agtagattccccggaaatggtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtatctaggtacaataggtgcacaacgtgcaacaattctcttgctgtccgtgcaagtaagtgcaaacccgggtacgttgtacatg
gi|32 : AGTT----AAATAAG-ATTAAAA-C-GT--T---G-GGT-TT-------------TTCT-----TCAT-A-TAT------A---T-----TTTC--AAGTTATAT-A--GTA------T-GGAGGA-C------A------CATTAGAATTT-AT------AAATGGA--ACT-CA-TCCTC-----T-A-
gi|33 : --AGTCGACTTTT--T-----A-TA-AAGA---A-TTATTTATA--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATT-C-ACTG-------TTT--T-A--G-GG---GG----GG-GG-G-GTGT-TG---T------------TA--TTA--TT--AA--T--A-ACC--AAAG--A-A-----AT
gi|35 : cTA-A-TAGC--TTTCC-AAAA-G-CTTT-CCT-GA-C-TAAA--AA----A-TTC--TTCA--------TG---TA---AAG-TG-TT-AAT--AAGT-GA-TA-C-ATATATC-GACGA----TG---T--ACCC--TAC
gi|36 : ---------G--T--------CA-AGGATTAT-TCCATT-TCA-----TAAA-GCCATTTTC------CGTTT-GCCACAA----------G---------------C--------------
gi|37 : gcgagtgtaacccc-TTAT----A--AA-TTAT-GTTTCCTCAAATTTC-ACTA-------T---------G-GA--T-------G-GG-G-GTGG-TG--------------------TTA--TT--AA-----A-ACC--AAAG--A-A-----ATG-TTTtcaatggata
gi|38 : AAGATAGAGGGA-TAT-GAT-ATTACA---AT--ATGT-----T---AG-T----A------TTA-----CA------AT---GTAT-GAGA-A-TTGTTGCAC------ATTG
gi|39 : GTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAAC-AA----A-TTTCTTTCA-----A--TG---TAT
gi|4 : caaA-TATC-ATGTATCACACGAA---TG---T--ACTC--TACATTT-AGGCGACTTTT--T-----A-TA-AAGA---T-TTAT----A--AA-TGAT-TCTTCCTCAAA---C-ACAC-------TTT--T-A-----G--T-------G-GG-G-GT-------GT------------TA--TTA--TT--AA--T--A-ACC--AAAG--A-AG----AAA-TTTT-CT-----------AT---T----CAT-T--T---GATA-------AATC----AAATAA---A----C--GC-C-C----CAGAA-GCATG------GGATG-T------ATCA--GA--AAAATTTC-AATT-AAAT-C-GCAA-GA---------A--AAA----A-AAAAAGGATCG-TTCCA-----------------A---------T-------------AAT------------TTCTAAAT--A-A-TG-C---TAG-TGGAAAC---C--C--C-----GTTAC------G--T--------CA-A-GATTGT-TCCATT-TCA-----TAAA-GCCATTTTC------GA--A-ACCACAA----------G---------------CTCAACGGATACACAAT---A--T-A--------CA-----------A---T-TA-T--ATA----T-A--CA----TTGT-A-A---AAT-----A-TCAAC-AAA--AA-C--ATAAATG-GA--AGGGA--C----TGT--AT-AGTC-TCC---AT--T-A-CAAAGATGAGGAGATTAT-GA-TATTACA---AT--ACATG----T---AG-A----ACAGAATTTA-----CAATGT--------TAT-GAGAAA-CTGT--CAC------ATT-T----AGAATTTT-CCTAAATTAGA---------------CAGTTCT-----C-TG-----------------------GTATT-TGT-ACGT-TAA------GTAATT----AA--AAG-TTTAAAAAA-AT--T---G-G-C-GT-------------TTTC-----TCAT-A-TATC-----A---T-----TTTC--AAGT--CAT-A--GTA------TAAGATGA-C------A------CTTTAGA-----AT------AAAT-GA--ACC-AA-TCCTT-----TCA-TATCATa
gi|40 : caagtaatagctttccaaaatttgtaataccgatt----A--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATTTT-ACTG-------TTT--T----------T------GG-GG-G-GTG---GG-GT------------TA--TTA--CT--AA--T--A-gttagatat
gi|41 : -AGGATTAT-TCCGTT-TC--------AA-GC------T------CATTG-G--ATAA----------A---------------CAT------------AT---A--T-A--------CG-----------A---T-TA-T---------T-A--CA----T
gi|42 : GTA-A-CATC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-A-TAATC-GA----A-TTTCTTg
gi|43 : tta-----------AT------AAATGGA--ACT-CA-TCCTC-----T-A-TACCATat
gi|45 : tttcgaA-TG-GAGA---A-TTAT----A--AA-TGAC-GTTTCCTCAAATTTT-Agtaaattcc
gi|46 : GTA-A-TAGC--TTTCCAAAAAAG-CTTG-CCT-
gi|47 : catgacaaGTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTA-CCT-G
gi|5 : acaaGTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAAC-AA----A-TTTCTTTCA-----A--TG---TATT-AAG-TGGTT-AAT--AAGT-GA-TA-C-ATATATCAGACGA----TG---T--ACCC--TACATA--AGTCGATTTTT--TTTTTTA-TA-GAGA---A-TTAT----A--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATTTC-ACTA-------TTT--T-A--GTGG--TGGT---GG-TG-G-GTGG-TGG-GT------------TA--TTA--TT--AA--T--A-ACC--AAAG--A-A-----ATG-TTTA-CT-T--------AAT---T----CAT-T--T---GATT-------AATC----AAAT-----A----C--GC-C-T----CAGAA-GCATG--GGGAGGATG-T------ATCAGGGA--AAAAAATC-AATT-AAATACGGCAA-GA---------A--AAATGT-ATAAAAAT----A-T---------------------A---------TG------------GAT-CA---------TTCTAAAT--A-T-TG-C---TA--TAG---T---C--T--A-----GT---------G--T--------CA-AGGATTAT----------A-----TAAG---CATTTTC------CGTAA-GCCACAC----------G---------------C--------------AT---A--T-A--------CA-----------A---T-TA-T--ATA----T-A--CA----TTGT-A-A---TAT-----A-TCAAC--AA--AA-C--A-ACATA-GT--GGAGA--G----TGA--GT-ACTC-TCC---AT--T-A-CAAAGATAGAGAGA-TAT-TATTATTACA---AT--ATGT-----T----G-A----A------TTA-----CAATGTACAT---GTAT-GAG--A-TTGTTGCAC------ATTGT----AGA------C---------A---------------CAGTTCT-----CAGG--A-----TT-------------GTATT-TGTAACGC-CAA------GTAATT----AAAGAAG-TATAGAAAC-AT--T---G-G-T-TT-------------TTCT-----TCAT-A-TAT------A---TA----TTTC--AAGT--CAT-A--GTC------T-AGATGA-C------A------------------------------GAA--ACT-AA-TCCTC-----T-A-TATCAT
gi|6 : GTA-AGTGGCGGTTTCC-AAA--G-CTTG-C----A-CATAAAC-AAGGGGA-TTTCTTTCA-----C--TGAGATGTT-AAC-TGTTTCAAT---AGT-GA-TG---ATAT-TTAGA-AA----TG---TTCACTC--TACAT---AGTCGACTTT
gi|6 : aaTTTCCTCAAATTTCAACTG-------TTT--T-T--A-AG--TGG----GG-cctcaaatttcaactgtttttaagtggggaatgcttattctgattgatattgattaatgcaatacatgcgctcagaagcattacgggaggatgtatcaagtaaatttaatgttaaaatctttaaaaaatcagtttcaaagtatcgataatggattgtcaattttctgaaatccttcaaggattattcgtttcaagctcattggataacatataatacgaattaattatataacgtatatacaaaaacagcatagtttgaagagtgcgttagtctcagaaattaacaaagatagagagttaattattacacaatataatacactacactagagactaatctatttaatatagacattttcctaaattagacagttctttgtatttgttaccttaagtaattaataagattagaacattgtggttttgttctgtcattatatatcattttcaagatatatggtatagaggaccctttagaaatcatcctctatat
gi|6 : aagtaagtggcggtttccaaagcttgcacataaacaaggggatttctttcactgagatgttaactgtttcaatagtgatgatatttagaaatgttcactctacatagtcgacG--G-A-----ATG-CTTA-TTCT--------GAT---T----GATAT--T---GATT-------AATG----CAAT-----A----CATGCGC-T----CAGAA-GCATTACGGGAGGATG-T------ATCA-AG---------TA-AATT-TAATGTT----------------A--AAATCT-TTAAAAAA--TCAGTTTCA-----------------A---------AG------------TAT-CG---------AT---AATGGA-T-TGTC---AA--TTT---T---C--TGAA-----AT---------CCTT--------CA-AGGATTAT-TC-GTT-TCA--------A-GCT------------CATTG-G--ATAA--------------------------C--------------AT---A--T-AATACGAATTA-----------A---T-TA-T--ATA------A--CG----T-----------AT-----A-T--AC-AAA--AA-C--A-GCATA-GTTTGAAGA--G----TGC--GTTAGTC-TCAGAAAT--T-AACAAAGATAGAGAGT-TA---ATTATTACACA-AT--ATAA-----T---AC-ACTACA------CTAGAGACTAATCT--ATTTAATATAGAC--A-TTTTCCTAA------ATT------AGA------C---------A-----------------GTTCT-----------------TT-------------GTATT-TGTTACCT-TAA------GTAATT-----AATAAG-ATT-AGAAC-ATTGT---G-G-T-TTTG-----------TTCTG----TCAT---TAT------A---TATCATTTTC--AAGA--TAT-ATGGTA------T-AGAGGA-C------C------C-----------TT---------TAGA--AAT-CA-TCCTC-----T-A-TATaatgcttattctgattgatattgattaatgcaatacatgcgctcagaagcattacgggaggatgtatcaagtaaatttaatgttaaaatctttaaaaaatcagtttcaaagtatcgataatggattgtcaattttctgaaatccttcaaggattattcgtttcaagctcattggataacatataatacgaattaattatataacgtatatacaaaaacagcatagtttgaagagtgcgttagtctcagaaattaacaaagatagagagttaattattacacaatataatacactacactagagactaatctatttaatatagacattttcctaaattagacagttctttgtatttgttaccttaagtaattaataagattagaacattgtggttttgttctgtcattatatatcattttcaagatatatggtatagaggaccctttagaaatcatcctctatat
gi|7 : aagtaagtggcggtttccaaagcttgcacataaacaaggggatttctttcactgagatgttaactgtttcaatagtgatgatatttagaaatgttcactctacatagtcgactttcctcaaatttcaactgtttttaagtgg---------TTCTAAAT--A-T-TG-C---TA--TAG---T---C--T--A-----GT---------G--TAACCCCGTCA-ATGATTAT-TCCATT-TCA-----TAAA-GCCATTTTC------CGTTA-GCCACAA----------G---------------C--------------AT---A--T-ATA------CA-----------A---T-TA-T--ATA----T-A--CA----TTGT-ACA---TAT-----A-CCAAC-AAA--AA-C--A-ACATA-GT--GGAGA--G----TGA--GT-AGTC-TCC---AT--T-A-CAAAGATAGAGGGA-TAT-GATTATTACA---AT--ATGT-----T---AG-A----A------TTA-----CA------AT---GTAT-GAGA-A-TCATTGCACATACCAATTGT----AGA------C---------A---------------CAGTTCT-----C-----------TT-------------GTATT-GGTAACGC-CAA------GTAATT----AAAGAAG-TTTAAAAAC-AT--TG--G-G-T-TT-------------TTCT-----TCAT-A-TATC-----A---TA----TTTC--AAGT--CAT-A--GTC------T-AAATGA-C------A------CTTTAGA-----AT------AAATGGA--ACT-AA-TCCTC-----T-A-TATCAT
gi|8 : aaaaatT---T----CAT-T--T---AATT-------AATC----AAAT-----AGATAC--CC-C-T----CAGAA-GCATG--GG----------------------A--GAAAAATT---TC-AAA-ACTGCAA-GA---------A--AAATCT-ACAAAAAT--TCA-TTTCA-----------------A---------CGTCC---------AATACT---------TTCTAAAT--A-A-TG-CGAGTA--TAA---C---C--C---------C---------G--T--------CA-AGGATTAT-TCTATT-TCA-----TAAA--CCATTTTT------CGTAA-ACCACAA----------G---------------CTCA-----------AT---G--G-A--------TA-----------ATTGT-TA-T--ATA----T-A--CA----TTGTAA-A---TAT-----A-TCAAG-AAA--AA-C--A-ATATA-GT--TGAGA--GGAACTGT--AT-AGTC-TCC---AT--T-A-CAAAGAT-GAGAGA-TAT-GATTATTACA---ATACATGTA----TACGAA-A----A------TCA-----CAATGT--AT---G--C-GA---A-TTGTTGCAC------ATTGT----AGA------C---------A----------------ATTTCC-----T-AA--A-----TTAGACACGTCTCTGGTATT-TGTAACTCTTAA------GTAATTTTAAAAAGAAGTTTTAAAAAC-AT--T---ATG-T-TT-------------TTCT-----TCAT---TATC-----A---TA----TTTC--AAGT--CAT-A--GTA------T-AGATGA-C------A------CTTTAAATTAGAAT------AAATGGA--ACT-CA-TCCTC-----T-A-TATCATgtagattccccggaaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacatgtatccaggtacaatatgtgcacaacgtgcaacaattctcttgctgtccatgcaagtaagtgcaaaaccgggtacgttgtacatg
gi|9 : --AAAAAATC-AATT-AAATACGGCAA-GA---------A--AAATCT-ATGAAAAT--TCA-TTTCA-----------------A---------TGTATAATATTATGGAT-CGACCAATAATTTCTAAAT--A-A-TG-C---T---TAG---TG--T--T--AACCCCGT---------G--C--------AA-GGGATTATCTCCATT--CA-----TTAA-ACCACTTTCTCCAGCCTTTG-GCCACAACAAGTCATTGG---------------T--------------AT---A--C-A--------CACATATATACATA---T-TA-TT-ATACTGTT-A--CA----TTGT-A-AA--TAT-----A-TCAAC-AAA--AAAC--A-ACATA-GT--GGAGA--G----AGACTGTTAGTC-TCC---AT--T-A-AAAAGATAGAGAGA-TAT-GATTATTGCAAGTAC--ATGTGTACCC---AG-A----A------TTA-----CAATAT--TT---G-A--GAA--A-TTGTTGCAC------ATTG-----AGA------C---------A---------------T-TTTCC-----T-AA--A-----TTAG-----------ACAGT-TCT-CCGG-TAAAT----GTAAC-----------G-TTTAAAAAA-AT--TG--G-G-G-TT-------------TTCT-----TCAT-A-TAT------A---TAT---TTTC--AAGT--CAT-A--GTA------A-TGATGA-C------A------C-----------TTTA----AAATAGATGACT-CATTCCTTCCTTAT-A-TATCATgt
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|23 ): TCCGGAAAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAATAGGTGCACAACGTGCAACAATTCTCTTGCTGTCCATGCAAGTAAG
Unaligned ( gi|30 ): GAATTCCTGAAGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAATAAAGTAACTAATTTTCTATGCACAACAAATTTTTGCTCTTCAATATGAACAATAATTTTGTGCTCGTCAATAAAGACA
Unaligned ( gi|34 ): ACACGTGTACGAGAATTACAATATCAAGAGAATTGTTGCGCATGAACATTTTCCTAAAATGTTCAATGGTATATGTAACGTTTAAAAACATTGG
Unaligned ( gi|44 ): GAGTCCTTGTTAACATGAATAAAATTAAGTGTATCA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11111111 1111 222222222 111111111 33333333333333333333 11111 11111111 1111111 1111 2222222222 222222 111111111 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000 6666666666666666666666666666666666666666666 55555555555555555555555555555555555555555 11111111 11111111111 111111111111111 111 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 111111 111 2222222222222 2222222222222222 444444444444444
lowQualScore : 3 3 44 2 2 2 2 3 3 3 6666 3 22222222 999 3 3 7 55 3 3 0000 8888 777 33 33 55 888888888 2 2 666 2 4444 22 2 2 2 7777777 444444444 55 7777 2 4 2 55555555555555555555 333 33 55 33 33 2 33 33 2 00000 2 44 3 77777777 555 6666 3 44 555 0000000 3333 0000000000 55 3 3 7777 3 888 3 999999 111111 11 3 3 0 0 3 333333333 77 2 3 55 3 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222 4 55 999 3 666 77 3333333333333333333333333333333333333333333 2 0 2 2 77777 2 888888 2 33333333333333333333333333333333333333333 555 33 2 77777777 22222222222 444 2 2 99 5555 2 33 111111111111111 77777 3 3 44 3 44 6 3 44 44 6666 44 6 3 555 44 3 3 2 2 0 222 33 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 777777 6666 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 2 0 2 555555 8888 2 2 2 33 555 2 5 2 1111111111111 99999 222 5555555555555555 33 33 2 33 8888888 2 5555 2 2 33 111111111111111 33 1 5 66666 5
lowQualScore : . . .. . . . . . . . .... . ........ ... . . . .. . . .... .... ... .. .. .. ......... . . ... . .... .. . . . ....... ......... .. .... . . . .................... ... .. .. .. .. . .. .. . ..... . .. . ........ ... .... . .. ... ....... .... .......... .. . . .... . ... . ...... ...... .. . . . . . ......... .. . . .. . ........................................................ . .. ... . ... .. ........................................... . . . . ..... . ...... . ......................................... ... .. . ........ ........... ... . . .. .... . .. ............... ..... . . .. . .. . . .. .. .... .. . . ... .. . . . . . ... .. ......................................................... ...... .... ....................................................................... . . . ...... .... . . . .. ... . . . ............. ..... ... ................ .. .. . .. ....... . .... . . .. ............... .. . . ..... .
lowQualScore : 3 3 22 9 7 7 7 1 1 1 5555 1 00000000 222 6 6 3 00 6 3 4444 9999 999 99 77 99 000000000 4 4 555 2 5555 99 1 2 1 6666666 888888888 66 4444 2 7 4 00000000000000000000 999 22 66 22 22 4 44 22 4 66666 5 11 1 77777777 444 5555 1 22 444 0000000 1111 5555555555 00 6 6 7777 6 333 3 666666 222222 77 1 1 1 8 3 333333333 99 2 3 00 6 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333 3 00 000 6 444 99 3333333333333333333333333333333333333333333 9 1 9 9 11111 9 222222 9 88888888888888888888888888888888888888888 000 77 7 00000000 77777777777 777 7 7 00 7777 7 77 555555555555555 77777 1 1 22 1 22 2 1 22 22 5555 22 2 1 444 22 1 1 7 7 8 000 99 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 777777 1111 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 9 9 9 000000 8888 8 5 7 77 333 7 3 7 0000000000000 33333 999 9999999999999999 44 44 5 44 1111111 5 3333 5 5 44 444444444444444 77 7 3 77777 3
consensus : GTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAAC-AA----A-TTTCTTTCA-----A--TG---TATT-AAG-TGGTT-AAT--AAGT-GA-TA-C-ATATATCAGACGA----TG---T--ACCC--TACATA--AGTCGACTTTT--TTTTTTA-TA-GAGA---A-TTAT----A--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATTTC-ACTA-------TTT--T-A--G-GG--TGG----GG-GG-G-GTGG-TGG-GT------------TA--TTA--TT--AA--T--A-ACC--AAAG--A-A-----ATG-TTTA-CT-T--------AAT---T----CAT-T--TG---ATT-------AATC----AAAT-----A----C--GC-C-TCA----GAA-GCATG--GGGAGGATG-T------ATCA-GGA--AAAAAATC-AATT-AAATACGGCAA-GA---------A--AAATNT-ATAAAAAT--TCA-TTTCA-----------------A---------TG------------GAT-CG---------TTCTAAAT--A-T-TG-C---TA--TAG---T---C--T--A-----GT---------G--T--------CA-AGGATTAT-TCCATT-TCA-----TAAA-GCCATTTTC------CGTTA-GCCACAA----------G---------------C--------------AT---A--T-A--------CA-----------A---T-TA-T--ATA----T-A--CA----TTGT-A-A---TAT-----A-TCAAC-AAA--AA-C--A-ACATA-GT--GGAGA--G----TGA--GT-AGTC-TCC---AT--T-A-CAAAGATAGAGAGA-TAT-GATTATTACA---AT--ATGT-----T---AG-A----A------TTA-----CAATGT--AT---GTAT-GAG--A-TTGTTGCAC------ATTGT----AGA------C---------A---------------CAGTTCT-----C-GG--A-----TT-------------GTATT-TGTAACGC-TAA------GTAATT----AAANAAG-TTTAAAAAC-AT--T---G-G-T-TT-------------TTCT-----TCAT-A-TAT------A---TA----TTTC--AAGT--CAT-A--GTA------T-AGA----TGA-C-A--CTTTA------A------ATAAATGGA--ACTCA-TCCTC-----T-ATATCAT
Reference ( family-2690 ) : GTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAAC-AA----A-TTTCTTTCA-----A--TG---TATT-AAG-TGGTT-AAT--AAGT-GA-TA-C-ATATATCAGACGA----TG---T--ACCC--TACATA--AGTCGACTTTT--TTTTTTA-TA-GAGA---A-TTAT----A--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATTTC-ACTA-------TTT--T-A--G-GG--TGG----GG-GG-G-GTGG-TGG-GT------------TA--TTA--TT--AA--T--A-ACC--AAAG--A-A-----ATG-TTTA-CT-T--------AAT---T----CAT-T--TG---ATT-------AATC----AAAT-----A----C--GC-C-TCA----GAA-GCATG--GGGAGGATG-T------ATCA-GGA--AAAAAATC-AATT-AAATACGGCAA-GA---------A--AAATNT-ATAAAAAT--TCA-TTTCA-----------------A---------TG------------GAT-CG---------TTCTAAAT--A-T-TG-C---TA--TAG---T---C--T--A-----GT---------G--T--------CA-AGGATTAT-TCCATT-TCA-----TAAA-GCCATTTTC------CGTTA-GCCACAA----------G---------------C--------------AT---A--T-A--------CA-----------A---T-TA-T--ATA----T-A--CA----TTGT-A-A---TAT-----A-TCAAC-AAA--AA-C--A-ACATA-GT--GGAGA--G----TGA--GT-AGTC-TCC---AT--T-A-CAAAGATAGAGAGA-TAT-GATTATTACA---AT--ATGT-----T---AG-A----A------TTA-----CAATGT--AT---GTAT-GAG--A-TTGTTGCAC------ATTGT----AGA------C---------A---------------CAGTTCT-----C-GG--A-----TT-------------GTATT-TGTAACGC-TAA------GTAATT----AAANAAG-TTTAAAAAC-AT--T---G-G-T-TT-------------TTCT-----TCAT-A-TAT------A---TA----TTTC--AAGT--CAT-A--GTA------T-AGA----TGA-C-A--CTTT-------A------ATAAATGGA--ACTCA-TCCTC-----T-ATATCAT
gi|1 : TA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCTCGA-C--AAACAAA----A-TTTCTCT-A-----A--TG---GATT-AAGCTGGTT-AACTAAAGT-GATTA-C-ATATATCAGACGAATGTTG---T--G-CC--TACATA--AGTCGA----T--TTTTTTA-TA-GAGG---A--TAT----AGCAA-TGAT-G-TTCCTC-AATTTC-ACTA-------TTT-------A-GG--CGGTAAAAG-GA-G-GTGT-T---GT------------TG--TTAACTTCAAA--T--A-ATCAGAAAG--ACA-----ATG--TTA-CT-TAATC----AAT---T----AAT-T--TG---ATT-------AATCAAATAAAT-----A----C--GC-C-TTA-----AA-GCATG--GGGAGGTTGTT------ATCA-AGA--AAATAAAC-A--T-AAATACGGCAATGA---------AC-AAATTTAATAAAAAT--TCA-TTTCAAAGGTATAT--------A---------TG------------GGA-CGTCCAAAAAATTCTAAA---A-TATG-C---TA--TAG---T---CTAT--A-----GTGTAAACCCCG--T--------CA-AGGATTAT-TCCA---TCA-----TAAA-GCCATTTTC------CGTTAGGCCACAA----------G---------------CA-------------AT---A--C-A--------CA-----------A---T-TA-T--ATA----T-ACTCA----CTGA-A-A---TAT-----ACTCAAC-AAA--AA-C--A-ACATA-G---GGAGAGTG----TGA--GT-AGTC-TCC---AT--T-A-AAAAGA-AGA-AGG-GAT-GA-TATTACA---AT--ATGT-----T---TGTA----T------TTA-----CA---T--AT---GTAT-GAGGAA-TTGTTGCAC------ATTGT----AGA------CGAT------A---------------CAGTGTT-----C-----------CT-------------GTATTGTGTAACGC-CAA------GTAATT----AAGAAGG-TTTAAAAAC-AT--T---G-G-T-TT-------------TCTC-----TCATAA-TATC-----A---TA----TTTC--AAGT--CATAA--GTC------T-AGA----TGACC-ACTCTTT-------AG-----ATAAATGGA--ACTAACTCCTC-----TAATATCA
gi|10 : -----------------A---------TG------------GAT-TG---------TCC--AAT--AAT-TT-C---TA--AA-------------------------------------------CA-ATGGTTAT-ACCATT-TCA-----TAAA-GCCACTTTC------CGTTA-GCCACAA----------G---------------CTCATATAC------AT---AAAT-A--------CA-----------A---T-TA-TT-ATA----T-A--CA----C------G---TAC-----A-TCAAC-AAA--AA-C--A-ACATA-CT--GGAGA--G----TGA--GT-AGTC-TCC---AT--T-A-CAAAGATAGAGAGA-TAT-GATAATCATA---A----------------------------------------GATGT--AT---G----AAA--A-TTGTTGAAC------ATTTTTCTAAGG----------------A---------------CAGCTCT-------G------------------------GTATC-TGTAACGC-TAA------GTAATT----AAATAAG-TTTATAAGC-AC--T---G-G-G-TTA------------TCCT-----ACAT-A-TATATC---A---TA----TTTC--AAGT--CAT-A--GTATACTATT-AGA----TGG-C-A--ATTTAG-----A------ATAAATGGA--ACTCA-TCCTC-----T-ATATCATatgtagagaatccccggaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacgatctaggtacaaaagatgcacaaacgtgcaacaagtccttgctgcgtctatgcaagtaagtgccaaacccgggacgttgtacatg
gi|11 : atatcaaagtataatC--TTTCC-AAAAAA-CTTG-CCT-GA-C-TAAAC-AA----A-TTTCTTTTA-----A--T----TATT-ACG-TAGTT-AAT--AAGT-GA-TA----TATATCAGACGA-----G---T--ACTC--TGCATATAAGTCGACTTTT------TTA-TA-GAGA---A-TTAT----A--AT-TGAT-GTTTCCTTGAATTTC-TCTG-------TTTAGC-G--G-GG--GGG----GG-GGCG-GGGG-TGG-GG------------TA--TAA--T----G--T--A-ACC--CAAGGTA-AAACATATGTTTTA-CT-TTCAATATCAAT---TTTCGCAT-TTATA---ACT-------CGTC----AAATAAATGA----C--AC-CATCA----GAA-GCATG--CGGTGGATT-TTATGAGATCA-GAAATAGAGAAT---ATTGAAACACGgtaga
gi|12 : ttccttgatcttaaaggcggatccaaaacttgtattaacacttttagacGA----TG---T--ACTC--TACATT--AGTCGACTTTT--T-----G-TA-CAGA---A-TTAT----A--AA-TGAC-TTTTCCTCAAATTTC-ACTG-------TTT--T-A--G-AG--AGG----G----------------GT------------T-----------------------------G--A-A-----ATG-TTTT-CT-T-------------------CAT-T---A---ATC-------AAAC----AAAT-----A----C--GC-C-TCA----GAA-GCATG--GGGA---TG-T------ATCA-G-A--AAAATTTC-AATT-AAATGCGGCAA-GA---------A--AAATTT-ATACAAAT--TCA-TTTCA-----------------AGGTATAATATG------------GAT-CG---------TCC--AAT--AAT-TT-C---TAAATAA---TATAC--T--G-----GT---------G--TAACCCCGTTA-AGGATTAT-TCCATT-TCA-----TAAA-GCCATTTTT------CGTTT-GCCACAA----------GCTCAATGAAAACACAC--------------AT---A--T-A--------CA-----------A---T-TATT--ATA----T-A--CA----TTG
gi|13 : AGAGAGA-TGT-GATTATTACA---AT--A
gi|13 : accgttaatgtcatacacaaA------GTAATT----AAAGACG-TTTTAAAAC-AT--TTTGG-G-T-TT-------------TTCT-----TCAT-A-TATC-----A---TA-----TTC--ATGA--CAT-A--GTG------T-AGA----TGA-C-A--CTTTAG-----A------ATAAATGGA--ACTCA-TCCTT-----T-ATcatgtatacgagnaaagacgatgtgaggaagttggagaggaactgctaaatctagcacaacagtctgtgcaatctgcattacaagaagaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaattaaagacgttttaaaacattttgggtttttcttcatatatcatattcatgacatagtgtagatgacactttagaataaatggaactcatcctttat
gi|14 : accgttaatgtcatacacaaagagagatgtgattattacaatacatgtatacgagnaaagacgatgtgaggaagttggagaggaactgctaaatctagcacaacagtctgtgcaatctgcattacaagaagaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn---A--T-A--------CA-----------A---T-TA-TTAATA----A-A--CA---------A-A---CA----------AAC-AAACAAA-C--GGACATT-GT--GGAGG--G----TGA--GT-GGAC-ACC---AA--T-G-CACAGTTTGAAA-----T-AA-----ACA---A---AT-T-----G---AG-A----A------TTT-----C------------GTA-----------GTTGCAT------ATTGT----AGAAATTTCC---------AAAATTAAA-------CAGTTC---------G--T-----TA-------------GTATT-TTTGACAT-TGA------GTAATT----CAATCAG-TTTAAAAAC--T--C---A-A-T-GT-------------TTGT-----ATAG-A-TAC------AATTTG----TCTC--AAGT--CAT-C--GTA------T-AGAAAAGTGA-A-A--CTTT-------AG-----ATGAA
gi|15 : cctaagtctcattggacgtacataaGTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAAC-AA----A-TTTCTTTCA-----A--TG---TATT-AAG-TGGTT-AAT--A-----------------TCAGATGA----TG---T--ACCC--TACATA--AGTCGAATTTT--T-----A-TA-GA-----A-TTAT----A--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATTTC-ACTA-------TTT--T-A--G-GG--TGG-------------TGG-TGGTGT------------TA--TTA--TT--AA--T--A-ACC--AAAG--A-A-----ATG-TTTA-CT-T--------AAT---T----CAT-T--TG---ATT-------AATCAAATAAAT-----A----C--GC-C-TCA----GAA-GCATG--GGGAGGATG-T------ATCA-G----AAAAAATCAAATT-AAATACGGCAA-GA---------A--AAATGT-ATAAAgtgcaccatttttt
gi|16 : TTTTTA-TATGAGA---AATTAT----A--AA-TGAT-GTTTCCTCCAACTTC-ACTA-------TTT-------A-GG--TGG----GG-GG-G---GG-T---CT------------TA--TTA--TT--AA--T--A-A-C--AAAG--A-A-----ATG--TTA-CT-T--------AACTGAT----TAT-T--TG---ATTTTAATCAAATT----AAAT-----A----C--GC-C-TCA----GAAGGCATGT-TGGAGGATG-T------ATTA--GA--AAAATTTC-AATT--AATACGGCAA-GA---------A--AGCTGT-ATAAAA----TCA-TTTCAAGGTATATAATCATTATA---------TG------------GAT-CGTCCAAAAT-TTCGAAAT--A-T-TG-C---TA--T
gi|17 : ----TG---T--ATCC--TACATA--AGTCGA----T--TTTTTTA-TA-TA-A---A-TTAT----A--AA-TGAT-GTTTCTTCAAATTTC-ACCA-------TTT--T-A--G-GGG-TGG----GT-GGTG-GTGG-TGG-------------------------T--A---T--A-AGC--AAAG--A-A-----ATG-TTTA-TT-T--------AAT---T----CAT-T--TG---ATT-------AATC----AAAT-----AAATAC--GC-C-TCA----GAA-GCATA--GGGAGGATG-T------ATCA-GAA--AAAAAA---------AA-----CAA-CA---------ATTAAATGT-GTAAAAAT--TCA-TTTCA-----------------A---------tgg
gi|17 : -----GT---------G--T---------A-AAAATT-----CATT-TCAAGGTATAAA-GCTATTTTC------CGTTA-GCCACAA----------G---------------C--------------Aggtataaagctattttccgttagccacaagca
gi|18 : tgtatcctacataagtcgatttttttatataaattataaatgatgtttcttcaaatttcaccattttaggggtgggtggtggtggtggtataagcaaagaaatgtttatttaattcatttgattaatcaaataaatacgcctcagaagcatagggaggatgtatcagaaaaaaaaaacaacaattaaatGTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAAC-AA----A-TTTCTTTCA-----C--TG---TATT-ACG-TGGTT-AAT--AAGT-AA-T----ATATATCAGACGA----TGTACT--ACTC--TACATA--AGTCGAC-------CTTTTA-TA-GAGA---A-TTAT----A--AA-TGAC-GTTT-CTCAAATTTC-TCTG-------TTT--A-A--G-GG--GGG----GG-GG-G-G----------------------TA--TTA--TT--AATTT--A-ACC--AAAG--A-A-----ATG-TTAT-CT-T--------AAT---T----CAT-T--TG---ATT-------AAGC----AAA
gi|19 : caaGTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTGGCCT-GA-C-TAAAC-AA----ACTTTCTTTC------A--TG---TATTAAAG-TGGTT-AAT--AAGT-GA-TA-C---ATATTAGACGA----TG---T--A--T--TA-ATA--AGTCGA----T--TTTTTTA-TA-GAGA---A--TAT----A--AATTCATGGTTTCCTCACATTTC-ACTA-------TTT--T-AAGG-GG--TGG----GGTGG-G-GTGG-GGGTGT------------TT--TTA--TTA-AA--T--A-ACC--AAAG--A-A-----ATG-T
gi|2 : caaGTACA-TAGC--TTTCC-AAAAAGGCTTG-CCT-GAAC-TAAAC-AA----A-TT-CTTTCA-----AAATGA--TATT-AAG-TGGTTTAAT--AAGTTGA-TA-CGATATATCAGACGA----TGC--T--ATCCCGTACATA--AGTCG--------TTTTTTA-TA-GAGAT--A-TTA-----A--AA-TGAT---TTCCTCAAATTTC-A-TA-------TTT--T-A--G-GGGGTGG----GG-TG-GCGTGGGTGG-GTGGTTTGGTGGTGTA--TTA--TG--AA--T--ATACC--AAAG--A-A-----ATG-TTTATCT-T--------AA----T----CAT-T--TG---A-T-------AATC----AA
gi|2 : acaaA--TAA---T---C--A--A-----G----------A--T--------CAGACGATTAT-TCCATTCTCA-----TAAAAGCCATTTTC------CGTTA-GCCACAA----------G---------------C--------------AT---A--TAA--------CA-----------G---TCTA-T--ATT----TAA--CA----TTGTAA-A---TAT-----A-TCAACAAAA--AA-CAAA-ACATAGGT--GGAGA--G----CGA--GT-AGTC-TCC---AT--TAA-CAAAGATGTAGCGA-TATGGATTA-TA-A---AT--ATGT-----T---AG-A----A------TTA-----CA------AT---GTAT-GAGA-A-TTGTTGCAC------ATTGT----AGA------C---------A---------------CAGTTCT-----CAAG--A-----TT-------------GTATT-TGTAACGC-CAGAT----GTAATT----AAAGAAG-TTTAGAAAC-AT--TG--G-G-TGTT-------------TTCT-----TCAT-A-TATATCATAA---TA----TTTT--AAGT--CAT-A--GTC------T-AGA----TGA-C-A--Cgatcagacgattattccattctcataaaagccattttccgttagccacaagcatataacagtctatatttaacattgtaaatatatcaacaaaaaacaaaacataggtggagagcgagtagtctccattaacaaagatgtagcgatatggattataaatatgttagaattacaatgtatgagaattgttgcacattgtagacacagttctcaagattgtatttgtaacgccagatgtaattaaagaagtttagaaacattgggtgttttcttcatatatatcataatattttaagtcatagtctagatgacacggaaactaaatcctcatagtatcgtgtagattccccggaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaataggtgcacaacggtgcaatcaattctctgttgctgtccatcgccaagtaagtgcaaaccgggtacgtcttgtacatg
gi|20 : acaagtacatagctttccaaaaaggcttgcctgaactaaacaaattctttcaaaatgatattaagtggtttaataagttgatacgatatatcagacgatgctatcccgtacataagtcgttttttatagagatattaaaatgatttcctcaaatttcatattttagggggtggggtggcgtgggtgggtggtttggtggtgtattatgaatataccaaagaaatgtttatcttaatcatttg-TTGTTGCAC------ATTAT----AGA------TTTT------A---------------CTGATAT-----T-AG--ACATTCTT-------------GTATT-TGTA-CGC-TAA------GTAATTTA--AAATAAG-ATTCAAA-C-AT--T---G-GGT-TT-------------TTCTATGAATCAT-AATAT------A---CC----TTTC--AAGT--TGT-------------T-AGG-----GA-CGA--CTTT-------AGAATT-ATAAATGGA--ACTCA-TCCTC-----T-ATATggaaactaaatcctcatagtatcgtgtagattccccggaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaataggtgcacaacggtgcaatcaattctctgttgctgtccatcgccaagtaagtgcaaaccgggtacgtcttgtacatg
gi|21 : tcatgttatgagattttccttaatt--T-A--------CA-----------A---T-TA-T---------T-A---A----TT---A-A---TA----------AAC-AAA--CA-C--G-GCACT-GT--GGAGA--G----TGG--GT-AGACATCA---ATGCT-A-CACTAATACACACT-TA---ATTATCGCACC-GT--ATG----------AT-A----A------TT--------TTGT--AG---AT-T-TAA--T-TTGTTGCAT------ATTGC----AAA------
gi|22 : agccacagtctcattggatgtacaaaagTAT-GAG--AATTGTTGCAC------ATTGT----AGA------C---------ATTTTCCTCAATTAGACAGTTCT-----C-GG-----------------------GTATT-TGTAACGC-GAA------GTAATT----AAAGAAG-TTTAAAAGCAAT--A---G-G-T-TT-------------TTCT-----TCAT-A-TAT----------TA----TTTA--AAAT--CAT-A--GTA------T-AGA----TGA-C-A--CCTT-------A-------------GA------A-TCCTC-----T-ATATCATattaaacaattcggtagattttt
gi|24 : aG-GG-G-GTA-------T------------TT--TTA--TT--AA--TTTA-ACC--AAAG--A-A-----ATA-CTTT-CT-T--------ATT---T----CAT-T--TATCAATT-------AAAT----AAAT-----A----C--GC-C-TCATGCAGAA-GCATG--CGGGGGATA-T------ATCA-G-A--ACAATTTC-AATT-AAATGCAGCAA-AATACACATATA--AAATAT-ATAAAAAT--TCA-TTTCA-----------------A---------gtagatt
gi|25 : AGTTCT-----CTGG--A----------------------ATT-TGTAACAC-TAA------GTAATT----TAATAAG-TTAAAAAAT-GC--TA--G-G-T-TTCACATAATAAAATTTCT-----TAAT-A-TAT------C---TT----TTTCTCAAGT--TAC-A--ATA------T-TGG----GGA-C-A--CCTT-------AGA----AAAAATGTA--ACTGA-TCCTC-----T-ATATCAggta
gi|26 : tttcttaaattaggtAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAAC-AA----A-TTTCTTTCA-----A--TG---TATT-AAG-TGGTT-AAT--AAGT-GA-TA-C-ATATATCAGACGA----TG---T--ACCA--TACACA--AGTCGA--------TTTTTA-TA-CAGA---A-TTAT----A--AA-TGAT-GTTTCCTTAAATTTC-A
gi|27 : -AAAAAA-CTTG-CCA-GA-C-TAAGC-AC----A-TATCTTTCACTCGTA--TG---TAAT-AGA-TACTA-AAT--GAGT-GA-TG-C-TTA-ATCAGAAGA----TG------ACCT--T-CGTA-----CCAGTTTTACGTTTTTATTA-AATAACGA-TTAT----A--AA-
gi|28 : a---AG-A----A------TTA-----CAATGT--AT---G-AT-AAA-----TGTTGCAC------ATAGT----AGA------A---------A---------------TTTTCCTAAATGC-GGGCA-----TTTCTCTG-------GTATT-TGTAGCGT-TAAGTACATGTAATT----AAATAAG-TTg
gi|29 : caattacgtgtacacgCTC--TACATA--AGTCGACTTTT-------TA-TA-GAGG---A-TTAT----A--AA-TGAT-GTCTCCTCAAATTTC-ACTAGGTTTTTTTT--T----------TGG----GG-GG-G-GGGG-T---AT------------CAATTTA--TT--AA--T--A-ACC--AAGG--A-A-----ATG-TTTT-CT-T--------
gi|3 : --GGGAGGATG-T------ATCA-C-A--AAAAAATC-AATT-AAATACGACAA-GA---------A--AAATGT-ATAAAAAT--TCA-TTTCA-----------------AGGTATAACATG------------AAT------------TTCTAAAT--A-T-TG-C---TA--TAG---T---C--T--A-----GT---------G--TAACTCCGTCA-AGGATTAT-TCCATT-TCA-----TAAA-GCCATTTTC------CGTTA-GCCACAA----------G---------------C--------------AT---A--T-ATA------CA-----------A---T-TA-T--ATA----T-A--CA----TCGTCA-A---TAT-----A-TCAAC-AAA--AA-C--A-ACATA-GT--GGAAA--G----TGA--GT-AGTC-TCT---AT--T-A-CAAAGATAGGGGGA-TAT-GATTATTAAA---AT--ATGT-----T---AG-A----A------TTA-----CAATGT--AT---G
gi|3 : ATA--AGTCGA-------TTTTTTA-TA-GATA---A-TTAT----A--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATTTC-ACTA-------TTT--TCG--G-GG--TGG----TG-GT-G-GTGG-T---GT------------TA--TTA--TT--AA--T--A-ACC--AAAN--N-NC----ATG-Tagaattgnaataagtcgattttttatagataattataaatgatgtttcctcaaatttcactattttcggggtggtggtggtggtgttattattaataaccaaannncatgtatttcaagtcagtctagatgacactttagaataaatggaactaatcctctataccatgtagattccccggaaatggtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtatctaggtacaataggtgcacaacgtgcaacaattctcttgctgtccgtgcaagtaagtgcaaacccgggtacgttgtacatg
gi|3 : gggaggatgtatcacaaaaaaatcaattaaatacgacaagaaaaatgtataaaaattcatttcaaggtataacatgaatttctaaatattgctatagtctagtgtaactccgtcaaggattattccatttcataaagccattttccgttagccacaagcatatatacaattatatatacatcgtcaatatatcaacaaaaacaacatagtggaaagtgagtagtctctattacaaagatagggggatatgattattaaaatatgttagaattacaatgtatgagaattgnaAT------G---TA----TTTC--AAGT--C---A--GTC------T-AGA----TGA-C-A--CTTTAG-----A------ATAAATGGA--ACTAA-TCCTC-----T-ATACCATatttcaagtcagtctagatgacactttagaataaatggaactaatcctctataccatgtagattccccggaaatggtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtatctaggtacaataggtgcacaacgtgcaacaattctcttgctgtccgtgcaagtaagtgcaaacccgggtacgttgtacatg
gi|31 : gggaggatgtatcacaaaaaaatcaattaaatacgacaagaaaaatgtataaaaattcatttcaaggtataacatgaatttctaaatattgctatagtctagtgtaactccgtcaaggattattccatttcataaagccattttccgttagccacaagcatatatacaattatatatacatcgtcaatatatcaacaaaaacaacatagtggaaagtgagtagtctctattacaaagatagggggatatgattattaaaatatgttagaattacaatgtatgagaattgnaataagtcgattttttatagataattataaatgatgtttcctcaaatttcactattttcggggtggtggtggtggtgttattattaataaccaaannncCAA----------G---------------CTG------------ATTGGA--T-A--------CA-----------------CA-T--ATA----T-A--CAATTGTTGT-A-AATATATCAACAA-TCAAC-AAA--AG-C--A-ACATA-GT--GGACA--G----TGA--GT-AGTC-TCC---AT--T-A-CAA--------AGA-TGT-GATTATTACA---Agtagattccccggaaatggtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtatctaggtacaataggtgcacaacgtgcaacaattctcttgctgtccgtgcaagtaagtgcaaacccgggtacgttgtacatg
gi|32 : AGTT----AAATAAG-ATTAAAA-C-GT--T---G-GGT-TT-------------TTCT-----TCAT-A-TAT------A---T-----TTTC--AAGTTATAT-A--GTA------T-GGA----GGA-C-A--CATT-------AGAATTTATAAATGGA--ACTCA-TCCTC-----T-
gi|33 : --AGTCGACTTTT--T-----A-TA-AAGA---A-TTATTTATA--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATT-C-ACTG-------TTT--T-A--G-GG---GG----GG-GG-G-GTGT-TG---T------------TA--TTA--TT--AA--T--A-ACC--AAAG--A-A-----AT
gi|35 : cTA-A-TAGC--TTTCC-AAAA-G-CTTT-CCT-GA-C-TAAA--AA----A-TTC--TTCA--------TG---TA---AAG-TG-TT-AAT--AAGT-GA-TA-C-ATATATC-GACGA----TG---T--ACCC--TAC
gi|36 : ---------G--T--------CA-AGGATTAT-TCCATT-TCA-----TAAA-GCCATTTTC------CGTTT-GCCACAA----------G---------------C--------------
gi|37 : gcgagtgtaacccc-TTAT----A--AA-TTAT-GTTTCCTCAAATTTC-ACTA-------T---------G-GA--T-------G-GG-G-GTGG-TG--------------------TTA--TT--AA-----A-ACC--AAAG--A-A-----ATG-TTTtcaatggata
gi|38 : AAGATAGAGGGA-TAT-GAT-ATTACA---AT--ATGT-----T---AG-T----A------TTA-----CA------AT---GTAT-GAGA-A-TTGTTGCAC------ATTG
gi|39 : GTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAAC-AA----A-TTTCTTTCA-----A--TG---TAT
gi|4 : caaA-TATC-ATGTATCACACGAA---TG---T--ACTC--TACATTT-AGGCGACTTTT--T-----A-TA-AAGA---T-TTAT----A--AA-TGAT-TCTTCCTCAAA---C-ACAC-------TTT--T-A-----G--T-------G-GG-G-GT-------GT------------TA--TTA--TT--AA--T--A-ACC--AAAG--A-AG----AAA-TTTT-CT-----------AT---T----CAT-T--TG---ATA-------AATC----AAATAA---A----C--GC-C-CCA----GAA-GCATG------GGATG-T------ATCA--GA--AAAATTTC-AATT-AAAT-C-GCAA-GA---------A--AAA----A-AAAAAGGATCG-TTCCA-----------------A---------T-------------AAT------------TTCTAAAT--A-A-TG-C---TAG-TGGAAAC---C--C--C-----GTTAC------G--T--------CA-A-GATTGT-TCCATT-TCA-----TAAA-GCCATTTTC------GA--A-ACCACAA----------G---------------CTCAACGGATACACAAT---A--T-A--------CA-----------A---T-TA-T--ATA----T-A--CA----TTGT-A-A---AAT-----A-TCAAC-AAA--AA-C--ATAAATG-GA--AGGGA--C----TGT--AT-AGTC-TCC---AT--T-A-CAAAGATGAGGAGATTAT-GA-TATTACA---AT--ACATG----T---AG-A----ACAGAATTTA-----CAATGT--------TAT-GAGAAA-CTGT--CAC------ATT-T----AGAATTTT-CCTAAATTAGA---------------CAGTTCT-----C-TG-----------------------GTATT-TGT-ACGT-TAA------GTAATT----AA--AAG-TTTAAAAAA-AT--T---G-G-C-GT-------------TTTC-----TCAT-A-TATC-----A---T-----TTTC--AAGT--CAT-A--GTA------TAAGA----TGA-C-A--CTTTAG-----A------ATAAAT-GA--ACCAA-TCCTT-----TCATATCATa
gi|40 : caagtaatagctttccaaaatttgtaataccgatt----A--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATTTT-ACTG-------TTT--T----------T------GG-GG-G-GTG---GG-GT------------TA--TTA--CT--AA--T--A-gttagatat
gi|41 : -AGGATTAT-TCCGTT-TC--------AA-GC------T------CATTG-G--ATAA----------A---------------CAT------------AT---A--T-A--------CG-----------A---T-TA-T---------T-A--CA----T
gi|42 : GTA-A-CATC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-A-TAATC-GA----A-TTTCTTg
gi|43 : tta-------A------ATAAATGGA--ACTCA-TCCTC-----T-ATACCATat
gi|45 : tttcgA-TG-GAGA---A-TTAT----A--AA-TGAC-GTTTCCTCAAATTTT-Agtaaattcc
gi|46 : GTA-A-TAGC--TTTCCAAAAAAG-CTTG-CCT-
gi|47 : catgacaaGTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTA-CCT-G
gi|5 : acaaGTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAAC-AA----A-TTTCTTTCA-----A--TG---TATT-AAG-TGGTT-AAT--AAGT-GA-TA-C-ATATATCAGACGA----TG---T--ACCC--TACATA--AGTCGATTTTT--TTTTTTA-TA-GAGA---A-TTAT----A--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATTTC-ACTA-------TTT--T-A--GTGG--TGGT---GG-TG-G-GTGG-TGG-GT------------TA--TTA--TT--AA--T--A-ACC--AAAG--A-A-----ATG-TTTA-CT-T--------AAT---T----CAT-T--TG---ATT-------AATC----AAAT-----A----C--GC-C-TCA----GAA-GCATG--GGGAGGATG-T------ATCAGGGA--AAAAAATC-AATT-AAATACGGCAA-GA---------A--AAATGT-ATAAAAAT----A-T---------------------A---------TG------------GAT-CA---------TTCTAAAT--A-T-TG-C---TA--TAG---T---C--T--A-----GT---------G--T--------CA-AGGATTAT----------A-----TAAG---CATTTTC------CGTAA-GCCACAC----------G---------------C--------------AT---A--T-A--------CA-----------A---T-TA-T--ATA----T-A--CA----TTGT-A-A---TAT-----A-TCAAC--AA--AA-C--A-ACATA-GT--GGAGA--G----TGA--GT-ACTC-TCC---AT--T-A-CAAAGATAGAGAGA-TAT-TATTATTACA---AT--ATGT-----T----G-A----A------TTA-----CAATGTACAT---GTAT-GAG--A-TTGTTGCAC------ATTGT----AGA------C---------A---------------CAGTTCT-----CAGG--A-----TT-------------GTATT-TGTAACGC-CAA------GTAATT----AAAGAAG-TATAGAAAC-AT--T---G-G-T-TT-------------TTCT-----TCAT-A-TAT------A---TA----TTTC--AAGT--CAT-A--GTC------T-AGA----TGA-C-A--------------------------GAA--ACTAA-TCCTC-----T-ATATCAT
gi|6 : GTA-AGTGGCGGTTTCC-AAA--G-CTTG-C----A-CATAAAC-AAGGGGA-TTTCTTTCA-----C--TGAGATGTT-AAC-TGTTTCAAT---AGT-GA-TG---ATAT-TTAGA-AA----TG---TTCACTC--TACAT---AGTCGACTTT
gi|6 : aaTTTCCTCAAATTTCAACTG-------TTT--T-T--A-AG--TGG----GG-cctcaaatttcaactgtttttaagtggggaatgcttattctgattgatattgattaatgcaatacatgcgctcagaagcattacgggaggatgtatcaagtaaatttaatgttaaaatctttaaaaaatcagtttcaaagtatcgataatggattgtcaattttctgaaatccttcaaggattattcgtttcaagctcattggataacatataatacgaattaattatataacgtatatacaaaaacagcatagtttgaagagtgcgttagtctcagaaattaacaaagatagagagttaattattacacaatataatacactacactagagactaatctatttaatatagacattttcctaaattagacagttctttgtatttgttaccttaagtaattaataagattagaacattgtggttttgttctgtcattatatatcattttcaagatatatggtatagaggaccctttagaaatcatcctctatat
gi|6 : aagtaagtggcggtttccaaagcttgcacataaacaaggggatttctttcactgagatgttaactgtttcaatagtgatgatatttagaaatgttcactctacatagtcgacG--G-A-----ATG-CTTA-TTCT--------GAT---T----GATAT--TG---ATT-------AATG----CAAT-----A----CATGCGC-TCA----GAA-GCATTACGGGAGGATG-T------ATCA-AG---------TA-AATT-TAATGTT----------------A--AAATCT-TTAAAAAA--TCAGTTTCA-----------------A---------AG------------TAT-CG---------AT---AATGGA-T-TGTC---AA--TTT---T---C--TGAA-----AT---------CCTT--------CA-AGGATTAT-TC-GTT-TCA--------A-GCT------------CATTG-G--ATAA--------------------------C--------------AT---A--T-AATACGAATTA-----------A---T-TA-T--ATA------A--CG----T-----------AT-----A-T--AC-AAA--AA-C--A-GCATA-GTTTGAAGA--G----TGC--GTTAGTC-TCAGAAAT--T-AACAAAGATAGAGAGT-TA---ATTATTACACA-AT--ATAA-----T---AC-ACTACA------CTAGAGACTAATCT--ATTTAATATAGAC--A-TTTTCCTAA------ATT------AGA------C---------A-----------------GTTCT-----------------TT-------------GTATT-TGTTACCT-TAA------GTAATT-----AATAAG-ATT-AGAAC-ATTGT---G-G-T-TTTG-----------TTCTG----TCAT---TAT------A---TATCATTTTC--AAGA--TAT-ATGGTA------T-AGA----GGA-C-C--CTTT-------A-------------GA--AATCA-TCCTC-----T-ATATaatgcttattctgattgatattgattaatgcaatacatgcgctcagaagcattacgggaggatgtatcaagtaaatttaatgttaaaatctttaaaaaatcagtttcaaagtatcgataatggattgtcaattttctgaaatccttcaaggattattcgtttcaagctcattggataacatataatacgaattaattatataacgtatatacaaaaacagcatagtttgaagagtgcgttagtctcagaaattaacaaagatagagagttaattattacacaatataatacactacactagagactaatctatttaatatagacattttcctaaattagacagttctttgtatttgttaccttaagtaattaataagattagaacattgtggttttgttctgtcattatatatcattttcaagatatatggtatagaggaccctttagaaatcatcctctatat
gi|7 : aagtaagtggcggtttccaaagcttgcacataaacaaggggatttctttcactgagatgttaactgtttcaatagtgatgatatttagaaatgttcactctacatagtcgactttcctcaaatttcaactgtttttaagtgg---------TTCTAAAT--A-T-TG-C---TA--TAG---T---C--T--A-----GT---------G--TAACCCCGTCA-ATGATTAT-TCCATT-TCA-----TAAA-GCCATTTTC------CGTTA-GCCACAA----------G---------------C--------------AT---A--T-ATA------CA-----------A---T-TA-T--ATA----T-A--CA----TTGT-ACA---TAT-----A-CCAAC-AAA--AA-C--A-ACATA-GT--GGAGA--G----TGA--GT-AGTC-TCC---AT--T-A-CAAAGATAGAGGGA-TAT-GATTATTACA---AT--ATGT-----T---AG-A----A------TTA-----CA------AT---GTAT-GAGA-A-TCATTGCACATACCAATTGT----AGA------C---------A---------------CAGTTCT-----C-----------TT-------------GTATT-GGTAACGC-CAA------GTAATT----AAAGAAG-TTTAAAAAC-AT--TG--G-G-T-TT-------------TTCT-----TCAT-A-TATC-----A---TA----TTTC--AAGT--CAT-A--GTC------T-AAA----TGA-C-A--CTTTAG-----A------ATAAATGGA--ACTAA-TCCTC-----T-ATATCAT
gi|8 : aaaaatT---T----CAT-T--TA---ATT-------AATC----AAAT-----AGATAC--CC-C-TCA----GAA-GCATG--GG----------------------A--GAAAAATT---TC-AAA-ACTGCAA-GA---------A--AAATCT-ACAAAAAT--TCA-TTTCA-----------------A---------CGTCC---------AATACT---------TTCTAAAT--A-A-TG-CGAGTA--TAA---C---C--C---------C---------G--T--------CA-AGGATTAT-TCTATT-TCA-----TAAA--CCATTTTT------CGTAA-ACCACAA----------G---------------CTCA-----------AT---G--G-A--------TA-----------ATTGT-TA-T--ATA----T-A--CA----TTGTAA-A---TAT-----A-TCAAG-AAA--AA-C--A-ATATA-GT--TGAGA--GGAACTGT--AT-AGTC-TCC---AT--T-A-CAAAGAT-GAGAGA-TAT-GATTATTACA---ATACATGTA----TACGAA-A----A------TCA-----CAATGT--AT---G--C-GA---A-TTGTTGCAC------ATTGT----AGA------C---------A----------------ATTTCC-----T-AA--A-----TTAGACACGTCTCTGGTATT-TGTAACTCTTAA------GTAATTTTAAAAAGAAGTTTTAAAAAC-AT--T---ATG-T-TT-------------TTCT-----TCAT---TATC-----A---TA----TTTC--AAGT--CAT-A--GTA------T-AGA----TGA-C-A--CTTTAAATTAGA------ATAAATGGA--ACTCA-TCCTC-----T-ATATCATgtagattccccggaaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacatgtatccaggtacaatatgtgcacaacgtgcaacaattctcttgctgtccatgcaagtaagtgcaaaaccgggtacgttgtacatg
gi|9 : --AAAAAATC-AATT-AAATACGGCAA-GA---------A--AAATCT-ATGAAAAT--TCA-TTTCA-----------------A---------TGTATAATATTATGGAT-CGACCAATAATTTCTAAAT--A-A-TG-C---T---TAG---TG--T--T--AACCCCGT---------G--C--------AA-GGGATTATCTCCATT--CA-----TTAA-ACCACTTTCTCCAGCCTTTG-GCCACAACAAGTCATTGG---------------T--------------AT---A--C-A--------CACATATATACATA---T-TA-TT-ATACTGTT-A--CA----TTGT-A-AA--TAT-----A-TCAAC-AAA--AAAC--A-ACATA-GT--GGAGA--G----AGACTGTTAGTC-TCC---AT--T-A-AAAAGATAGAGAGA-TAT-GATTATTGCAAGTAC--ATGTGTACCC---AG-A----A------TTA-----CAATAT--TT---G-A--GAA--A-TTGTTGCAC------ATTG-----AGA------C---------A---------------T-TTTCC-----T-AA--A-----TTAG-----------ACAGT-TCT-CCGG-TAAAT----GTAAC-----------G-TTTAAAAAA-AT--TG--G-G-G-TT-------------TTCT-----TCAT-A-TAT------A---TAT---TTTC--AAGT--CAT-A--GTA------A-TGA----TGA-C-A--CTTT-------A--------AAATAGATGACTCATTCCTTCCTTAT-ATATCATgt
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|23 ): TCCGGAAAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAATAGGTGCACAACGTGCAACAATTCTCTTGCTGTCCATGCAAGTAAG
Unaligned ( gi|30 ): GAATTCCTGAAGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAATAAAGTAACTAATTTTCTATGCACAACAAATTTTTGCTCTTCAATATGAACAATAATTTTGTGCTCGTCAATAAAGACA
Unaligned ( gi|34 ): ACACGTGTACGAGAATTACAATATCAAGAGAATTGTTGCGCATGAACATTTTCCTAAAATGTTCAATGGTATATGTAACGTTTAAAAACATTGG
Unaligned ( gi|44 ): GAGTCCTTGTTAACATGAATAAAATTAAGTGTATCA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11111111 1111 222222222 111111111 33333333333333333333 11111 11111111 1111111 1111 2222222222 222222 111111111 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000 6666666666666666666666666666666666666666666 55555555555555555555555555555555555555555 11111111 11111111111 111111111111111 111 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 111111 111 1111111111111 2222222222 22222222222222222
lowQualScore : 3 3 44 2 2 2 2 3 3 3 6666 3 22222222 999 3 3 7 55 3 3 0000 8888 777 33 33 55 888888888 2 2 666 2 4444 22 2 2 2 7777777 444444444 55 7777 2 4 2 55555555555555555555 333 33 55 33 33 2 33 33 2 00000 2 44 3 77777777 555 6666 3 44 555 0000000 3333 0000000000 55 3 3 7777 3 888 3 999999 111111 11 3 3 0 0 3 333333333 77 2 3 55 3 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222 4 55 999 3 666 77 3333333333333333333333333333333333333333333 2 0 2 2 77777 2 888888 2 33333333333333333333333333333333333333333 555 33 2 77777777 22222222222 444 2 2 99 5555 2 33 111111111111111 77777 3 3 44 3 44 6 3 44 44 6666 44 6 3 555 44 3 3 2 2 0 222 33 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 777777 6666 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 2 0 2 555555 8888 2 2 2 2 555 66 5 2 7777777777777 33 99999 222 4444444444 33 5555 33 33 2 33 8888888 2 5555 2 2 33 2 66666666666666666 1 5 66666 5
lowQualScore : . . .. . . . . . . . .... . ........ ... . . . .. . . .... .... ... .. .. .. ......... . . ... . .... .. . . . ....... ......... .. .... . . . .................... ... .. .. .. .. . .. .. . ..... . .. . ........ ... .... . .. ... ....... .... .......... .. . . .... . ... . ...... ...... .. . . . . . ......... .. . . .. . ........................................................ . .. ... . ... .. ........................................... . . . . ..... . ...... . ......................................... ... .. . ........ ........... ... . . .. .... . .. ............... ..... . . .. . .. . . .. .. .... .. . . ... .. . . . . . ... .. ......................................................... ...... .... ....................................................................... . . . ...... .... . . . . ... .. . . ............. .. ..... ... .......... .. .... .. .. . .. ....... . .... . . .. . ................. . . ..... .
lowQualScore : 3 3 22 9 7 7 7 1 1 1 5555 1 00000000 222 6 6 3 00 6 3 4444 9999 999 99 77 99 000000000 4 4 555 2 5555 99 1 2 1 6666666 888888888 66 4444 2 7 4 00000000000000000000 999 22 66 22 22 4 44 22 4 66666 5 11 1 77777777 444 5555 1 22 444 0000000 1111 5555555555 00 6 6 7777 6 333 3 666666 222222 77 1 1 1 8 3 333333333 99 2 3 00 6 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333 3 00 000 6 444 99 3333333333333333333333333333333333333333333 9 1 9 9 11111 9 222222 9 88888888888888888888888888888888888888888 000 77 7 00000000 77777777777 777 7 7 00 7777 7 77 555555555555555 77777 1 1 22 1 22 2 1 22 22 5555 22 2 1 444 22 1 1 7 7 8 000 99 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 777777 1111 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 9 9 9 000000 8888 8 5 8 7 333 33 3 7 3333333333333 77 33333 999 9999999999 77 3333 44 44 5 44 1111111 5 3333 5 5 44 4 77777777777777777 7 3 77777 3
consensus : GTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAAC-AA----A-TTTCTTTCA-----A--TG---TATT-AAG-TGGTT-AAT--AAGT-GA-TA-C-ATATATCAGACGA----TG---T--ACCC--TACATA--AGTCGACTTTT--TTTTTTA-TA-GAGA---A-TTAT----A--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATTTC-ACTA-------TTT--T-A--G-GG--TGG----GG-GG-G-GTGG-TGG-GT------------TA--TTA--TT--AA--T--A-ACC--AAAG--A-A-----ATG-TTTA-CT-T--------AAT---T----CAT-T--TG---ATT-------AATC----AAAT-----A----C--GC-C-TCA----GAA-GCATG--GGGAGGATG-T------ATCA-GGA--AAAAAATC-AATT-AAATACGGCAA-GA---------A--AAATNT-ATAAAAAT--TCA-TTTCA-----------------A---------TG------------GAT-CG---------TTCTAAAT--A-T-TG-C---TA--TAG---T---C--T--A-----GT---------G--T--------CA-AGGATTAT-TCCATT-TCA-----TAAA-GCCATTTTC------CGTTA-GCCACAA----------G---------------C--------------AT---A--T-A--------CA-----------A---T-TA-T--ATA----T-A--CA----TTGT-A-A---TAT-----A-TCAAC-AAA--AA-C--A-ACATA-GT--GGAGA--G----TGA--GT-AGTC-TCC---AT--T-A-CAAAGATAGAGAGA-TAT-GATTATTACA---AT--ATGT-----T---AG-A----A------TTA-----CAATGT--AT---GTAT-GAG--A-TTGTTGCAC------ATTGT----AGA------C---------A---------------CAGTTCT-----C-GG--A-----TT-------------GTATT-TGTAACGC-TAA------GTAATT----AAANAAG-TTTAAAAAC-ATT---G--G-T-TT-------------T--TCT-----TCAT-A-TAT------A---TA-T----TTC--AAGT--CAT-A--GTA------T-AGA----TGA-C-A--CTTT-AG-----A-----A----TAAATGGAACTCA-TCCTC-----T-ATATCAT
Reference ( family-2690 ) : GTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAAC-AA----A-TTTCTTTCA-----A--TG---TATT-AAG-TGGTT-AAT--AAGT-GA-TA-C-ATATATCAGACGA----TG---T--ACCC--TACATA--AGTCGACTTTT--TTTTTTA-TA-GAGA---A-TTAT----A--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATTTC-ACTA-------TTT--T-A--G-GG--TGG----GG-GG-G-GTGG-TGG-GT------------TA--TTA--TT--AA--T--A-ACC--AAAG--A-A-----ATG-TTTA-CT-T--------AAT---T----CAT-T--TG---ATT-------AATC----AAAT-----A----C--GC-C-TCA----GAA-GCATG--GGGAGGATG-T------ATCA-GGA--AAAAAATC-AATT-AAATACGGCAA-GA---------A--AAATNT-ATAAAAAT--TCA-TTTCA-----------------A---------TG------------GAT-CG---------TTCTAAAT--A-T-TG-C---TA--TAG---T---C--T--A-----GT---------G--T--------CA-AGGATTAT-TCCATT-TCA-----TAAA-GCCATTTTC------CGTTA-GCCACAA----------G---------------C--------------AT---A--T-A--------CA-----------A---T-TA-T--ATA----T-A--CA----TTGT-A-A---TAT-----A-TCAAC-AAA--AA-C--A-ACATA-GT--GGAGA--G----TGA--GT-AGTC-TCC---AT--T-A-CAAAGATAGAGAGA-TAT-GATTATTACA---AT--ATGT-----T---AG-A----A------TTA-----CAATGT--AT---GTAT-GAG--A-TTGTTGCAC------ATTGT----AGA------C---------A---------------CAGTTCT-----C-GG--A-----TT-------------GTATT-TGTAACGC-TAA------GTAATT----AAANAAG-TTTAAAAAC-ATT---G--G-T-TT-------------T--TCT-----TCAT-A-TAT------A---TA-T----TTC--AAGT--CAT-A--GTA------T-AGA----TGA-C-A--CTTT-A------A-----A----TAAATGGAACTCA-TCCTC-----T-ATATCAT
gi|1 : TA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCTCGA-C--AAACAAA----A-TTTCTCT-A-----A--TG---GATT-AAGCTGGTT-AACTAAAGT-GATTA-C-ATATATCAGACGAATGTTG---T--G-CC--TACATA--AGTCGA----T--TTTTTTA-TA-GAGG---A--TAT----AGCAA-TGAT-G-TTCCTC-AATTTC-ACTA-------TTT-------A-GG--CGGTAAAAG-GA-G-GTGT-T---GT------------TG--TTAACTTCAAA--T--A-ATCAGAAAG--ACA-----ATG--TTA-CT-TAATC----AAT---T----AAT-T--TG---ATT-------AATCAAATAAAT-----A----C--GC-C-TTA-----AA-GCATG--GGGAGGTTGTT------ATCA-AGA--AAATAAAC-A--T-AAATACGGCAATGA---------AC-AAATTTAATAAAAAT--TCA-TTTCAAAGGTATAT--------A---------TG------------GGA-CGTCCAAAAAATTCTAAA---A-TATG-C---TA--TAG---T---CTAT--A-----GTGTAAACCCCG--T--------CA-AGGATTAT-TCCA---TCA-----TAAA-GCCATTTTC------CGTTAGGCCACAA----------G---------------CA-------------AT---A--C-A--------CA-----------A---T-TA-T--ATA----T-ACTCA----CTGA-A-A---TAT-----ACTCAAC-AAA--AA-C--A-ACATA-G---GGAGAGTG----TGA--GT-AGTC-TCC---AT--T-A-AAAAGA-AGA-AGG-GAT-GA-TATTACA---AT--ATGT-----T---TGTA----T------TTA-----CA---T--AT---GTAT-GAGGAA-TTGTTGCAC------ATTGT----AGA------CGAT------A---------------CAGTGTT-----C-----------CT-------------GTATTGTGTAACGC-CAA------GTAATT----AAGAAGG-TTTAAAAAC-ATT---G--G-T-TT-------------T--CTC-----TCATAA-TATC-----A---TA-T----TTC--AAGT--CATAA--GTC------T-AGA----TGACC-ACTCTTT-A------G-----A----TAAATGGAACTAACTCCTC-----TAATATCA
gi|10 : -----------------A---------TG------------GAT-TG---------TCC--AAT--AAT-TT-C---TA--AA-------------------------------------------CA-ATGGTTAT-ACCATT-TCA-----TAAA-GCCACTTTC------CGTTA-GCCACAA----------G---------------CTCATATAC------AT---AAAT-A--------CA-----------A---T-TA-TT-ATA----T-A--CA----C------G---TAC-----A-TCAAC-AAA--AA-C--A-ACATA-CT--GGAGA--G----TGA--GT-AGTC-TCC---AT--T-A-CAAAGATAGAGAGA-TAT-GATAATCATA---A----------------------------------------GATGT--AT---G----AAA--A-TTGTTGAAC------ATTTTTCTAAGG----------------A---------------CAGCTCT-------G------------------------GTATC-TGTAACGC-TAA------GTAATT----AAATAAG-TTTATAAGC-ACT---G--G-G-TTA------------T--CCT-----ACAT-A-TATATC---A---TA-T----TTC--AAGT--CAT-A--GTATACTATT-AGA----TGG-C-A--ATTT-AG-----A-----A----TAAATGGAACTCA-TCCTC-----T-ATATCATatgtagagaatccccggaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacgatctaggtacaaaagatgcacaaacgtgcaacaagtccttgctgcgtctatgcaagtaagtgccaaacccgggacgttgtacatg
gi|11 : atatcaaagtataatC--TTTCC-AAAAAA-CTTG-CCT-GA-C-TAAAC-AA----A-TTTCTTTTA-----A--T----TATT-ACG-TAGTT-AAT--AAGT-GA-TA----TATATCAGACGA-----G---T--ACTC--TGCATATAAGTCGACTTTT------TTA-TA-GAGA---A-TTAT----A--AT-TGAT-GTTTCCTTGAATTTC-TCTG-------TTTAGC-G--G-GG--GGG----GG-GGCG-GGGG-TGG-GG------------TA--TAA--T----G--T--A-ACC--CAAGGTA-AAACATATGTTTTA-CT-TTCAATATCAAT---TTTCGCAT-TTATA---ACT-------CGTC----AAATAAATGA----C--AC-CATCA----GAA-GCATG--CGGTGGATT-TTATGAGATCA-GAAATAGAGAAT---ATTGAAACACGgtaga
gi|12 : ttccttgatcttaaaggcggatccaaaacttgtattaacacttttagacGA----TG---T--ACTC--TACATT--AGTCGACTTTT--T-----G-TA-CAGA---A-TTAT----A--AA-TGAC-TTTTCCTCAAATTTC-ACTG-------TTT--T-A--G-AG--AGG----G----------------GT------------T-----------------------------G--A-A-----ATG-TTTT-CT-T-------------------CAT-T---A---ATC-------AAAC----AAAT-----A----C--GC-C-TCA----GAA-GCATG--GGGA---TG-T------ATCA-G-A--AAAATTTC-AATT-AAATGCGGCAA-GA---------A--AAATTT-ATACAAAT--TCA-TTTCA-----------------AGGTATAATATG------------GAT-CG---------TCC--AAT--AAT-TT-C---TAAATAA---TATAC--T--G-----GT---------G--TAACCCCGTTA-AGGATTAT-TCCATT-TCA-----TAAA-GCCATTTTT------CGTTT-GCCACAA----------GCTCAATGAAAACACAC--------------AT---A--T-A--------CA-----------A---T-TATT--ATA----T-A--CA----TTG
gi|13 : AGAGAGA-TGT-GATTATTACA---AT--A
gi|13 : accgttaatgtcatacacaaA------GTAATT----AAAGACG-TTTTAAAAC-ATTTTGG--G-T-TT-------------T--TCT-----TCAT-A-TATC-----A---TA------TTC--ATGA--CAT-A--GTG------T-AGA----TGA-C-A--CTTT-AG-----A-----A----TAAATGGAACTCA-TCCTT-----T-ATcatgtatacgagnaaagacgatgtgaggaagttggagaggaactgctaaatctagcacaacagtctgtgcaatctgcattacaagaagaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaattaaagacgttttaaaacattttgggtttttcttcatatatcatattcatgacatagtgtagatgacactttagaataaatggaactcatcctttat
gi|14 : accgttaatgtcatacacaaagagagatgtgattattacaatacatgtatacgagnaaagacgatgtgaggaagttggagaggaactgctaaatctagcacaacagtctgtgcaatctgcattacaagaagaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn---A--T-A--------CA-----------A---T-TA-TTAATA----A-A--CA---------A-A---CA----------AAC-AAACAAA-C--GGACATT-GT--GGAGG--G----TGA--GT-GGAC-ACC---AA--T-G-CACAGTTTGAAA-----T-AA-----ACA---A---AT-T-----G---AG-A----A------TTT-----C------------GTA-----------GTTGCAT------ATTGT----AGAAATTTCC---------AAAATTAAA-------CAGTTC---------G--T-----TA-------------GTATT-TTTGACAT-TGA------GTAATT----CAATCAG-TTTAAAAAC--TC---A--A-T-GT-------------T--TGT-----ATAG-A-TAC------AATTTG-T----CTC--AAGT--CAT-C--GTA------T-AGAAAAGTGA-A-A--CTTT-A------G-----A----TGAA
gi|15 : cctaagtctcattggacgtacataaGTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAAC-AA----A-TTTCTTTCA-----A--TG---TATT-AAG-TGGTT-AAT--A-----------------TCAGATGA----TG---T--ACCC--TACATA--AGTCGAATTTT--T-----A-TA-GA-----A-TTAT----A--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATTTC-ACTA-------TTT--T-A--G-GG--TGG-------------TGG-TGGTGT------------TA--TTA--TT--AA--T--A-ACC--AAAG--A-A-----ATG-TTTA-CT-T--------AAT---T----CAT-T--TG---ATT-------AATCAAATAAAT-----A----C--GC-C-TCA----GAA-GCATG--GGGAGGATG-T------ATCA-G----AAAAAATCAAATT-AAATACGGCAA-GA---------A--AAATGT-ATAAAgtgcaccatttttt
gi|16 : TTTTTA-TATGAGA---AATTAT----A--AA-TGAT-GTTTCCTCCAACTTC-ACTA-------TTT-------A-GG--TGG----GG-GG-G---GG-T---CT------------TA--TTA--TT--AA--T--A-A-C--AAAG--A-A-----ATG--TTA-CT-T--------AACTGAT----TAT-T--TG---ATTTTAATCAAATT----AAAT-----A----C--GC-C-TCA----GAAGGCATGT-TGGAGGATG-T------ATTA--GA--AAAATTTC-AATT--AATACGGCAA-GA---------A--AGCTGT-ATAAAA----TCA-TTTCAAGGTATATAATCATTATA---------TG------------GAT-CGTCCAAAAT-TTCGAAAT--A-T-TG-C---TA--T
gi|17 : ----TG---T--ATCC--TACATA--AGTCGA----T--TTTTTTA-TA-TA-A---A-TTAT----A--AA-TGAT-GTTTCTTCAAATTTC-ACCA-------TTT--T-A--G-GGG-TGG----GT-GGTG-GTGG-TGG-------------------------T--A---T--A-AGC--AAAG--A-A-----ATG-TTTA-TT-T--------AAT---T----CAT-T--TG---ATT-------AATC----AAAT-----AAATAC--GC-C-TCA----GAA-GCATA--GGGAGGATG-T------ATCA-GAA--AAAAAA---------AA-----CAA-CA---------ATTAAATGT-GTAAAAAT--TCA-TTTCA-----------------A---------tgg
gi|17 : -----GT---------G--T---------A-AAAATT-----CATT-TCAAGGTATAAA-GCTATTTTC------CGTTA-GCCACAA----------G---------------C--------------Aggtataaagctattttccgttagccacaagca
gi|18 : tgtatcctacataagtcgatttttttatataaattataaatgatgtttcttcaaatttcaccattttaggggtgggtggtggtggtggtataagcaaagaaatgtttatttaattcatttgattaatcaaataaatacgcctcagaagcatagggaggatgtatcagaaaaaaaaaacaacaattaaatGTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAAC-AA----A-TTTCTTTCA-----C--TG---TATT-ACG-TGGTT-AAT--AAGT-AA-T----ATATATCAGACGA----TGTACT--ACTC--TACATA--AGTCGAC-------CTTTTA-TA-GAGA---A-TTAT----A--AA-TGAC-GTTT-CTCAAATTTC-TCTG-------TTT--A-A--G-GG--GGG----GG-GG-G-G----------------------TA--TTA--TT--AATTT--A-ACC--AAAG--A-A-----ATG-TTAT-CT-T--------AAT---T----CAT-T--TG---ATT-------AAGC----AAA
gi|19 : caaGTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTGGCCT-GA-C-TAAAC-AA----ACTTTCTTTC------A--TG---TATTAAAG-TGGTT-AAT--AAGT-GA-TA-C---ATATTAGACGA----TG---T--A--T--TA-ATA--AGTCGA----T--TTTTTTA-TA-GAGA---A--TAT----A--AATTCATGGTTTCCTCACATTTC-ACTA-------TTT--T-AAGG-GG--TGG----GGTGG-G-GTGG-GGGTGT------------TT--TTA--TTA-AA--T--A-ACC--AAAG--A-A-----ATG-T
gi|2 : caaGTACA-TAGC--TTTCC-AAAAAGGCTTG-CCT-GAAC-TAAAC-AA----A-TT-CTTTCA-----AAATGA--TATT-AAG-TGGTTTAAT--AAGTTGA-TA-CGATATATCAGACGA----TGC--T--ATCCCGTACATA--AGTCG--------TTTTTTA-TA-GAGAT--A-TTA-----A--AA-TGAT---TTCCTCAAATTTC-A-TA-------TTT--T-A--G-GGGGTGG----GG-TG-GCGTGGGTGG-GTGGTTTGGTGGTGTA--TTA--TG--AA--T--ATACC--AAAG--A-A-----ATG-TTTATCT-T--------AA----T----CAT-T--TG---A-T-------AATC----AA
gi|2 : acaaA--TAA---T---C--A--A-----G----------A--T--------CAGACGATTAT-TCCATTCTCA-----TAAAAGCCATTTTC------CGTTA-GCCACAA----------G---------------C--------------AT---A--TAA--------CA-----------G---TCTA-T--ATT----TAA--CA----TTGTAA-A---TAT-----A-TCAACAAAA--AA-CAAA-ACATAGGT--GGAGA--G----CGA--GT-AGTC-TCC---AT--TAA-CAAAGATGTAGCGA-TATGGATTA-TA-A---AT--ATGT-----T---AG-A----A------TTA-----CA------AT---GTAT-GAGA-A-TTGTTGCAC------ATTGT----AGA------C---------A---------------CAGTTCT-----CAAG--A-----TT-------------GTATT-TGTAACGC-CAGAT----GTAATT----AAAGAAG-TTTAGAAAC-ATTG--G--G-TGTT-------------T--TCT-----TCAT-A-TATATCATAA---TA-T----TTT--AAGT--CAT-A--GTC------T-AGA----TGA-C-A--CGGA-A------A-----C----TAAATgatcagacgattattccattctcataaaagccattttccgttagccacaagcatataacagtctatatttaacattgtaaatatatcaacaaaaaacaaaacataggtggagagcgagtagtctccattaacaaagatgtagcgatatggattataaatatgttagaattacaatgtatgagaattgttgcacattgtagacacagttctcaagattgtatttgtaacgccagatgtaattaaagaagtttagaaacattgggtgttttcttcatatatatcataatattttaagtcatagtctagatgacacggaaactaaatcctcatagtatcgtgtagattccccggaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaataggtgcacaacggtgcaatcaattctctgttgctgtccatcgccaagtaagtgcaaaccgggtacgtcttgtacatg
gi|20 : acaagtacatagctttccaaaaaggcttgcctgaactaaacaaattctttcaaaatgatattaagtggtttaataagttgatacgatatatcagacgatgctatcccgtacataagtcgttttttatagagatattaaaatgatttcctcaaatttcatattttagggggtggggtggcgtgggtgggtggtttggtggtgtattatgaatataccaaagaaatgtttatcttaatcatttg-TTGTTGCAC------ATTAT----AGA------TTTT------A---------------CTGATAT-----T-AG--ACATTCTT-------------GTATT-TGTA-CGC-TAA------GTAATTTA--AAATAAG-ATTCAAA-C-ATT---G--GGT-TT-------------T--TCTATGAATCAT-AATAT------A---CC-T----TTC--AAGT--TGT-------------T-AGG-----GA-CGA--CTTT-A------G-----AATTATAAATGGAACTCA-TCCTC-----T-ATATcctcatagtatcgtgtagattccccggaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaataggtgcacaacggtgcaatcaattctctgttgctgtccatcgccaagtaagtgcaaaccgggtacgtcttgtacatg
gi|21 : tcatgttatgagattttccttaatt--T-A--------CA-----------A---T-TA-T---------T-A---A----TT---A-A---TA----------AAC-AAA--CA-C--G-GCACT-GT--GGAGA--G----TGG--GT-AGACATCA---ATGCT-A-CACTAATACACACT-TA---ATTATCGCACC-GT--ATG----------AT-A----A------TT--------TTGT--AG---AT-T-TAA--T-TTGTTGCAT------ATTGC----AAA------
gi|22 : agccacagtctcattggatgtacaaaagTAT-GAG--AATTGTTGCAC------ATTGT----AGA------C---------ATTTTCCTCAATTAGACAGTTCT-----C-GG-----------------------GTATT-TGTAACGC-GAA------GTAATT----AAAGAAG-TTTAAAAGCAATA---G--G-T-TT-------------T--TCT-----TCAT-A-TAT----------TA-T----TTA--AAAT--CAT-A--GTA------T-AGA----TGA-C-A--CCTT-A------G-----A----------------A-TCCTC-----T-ATATCATattaaacaattcggtagattttt
gi|24 : aG-GG-G-GTA-------T------------TT--TTA--TT--AA--TTTA-ACC--AAAG--A-A-----ATA-CTTT-CT-T--------ATT---T----CAT-T--TATCAATT-------AAAT----AAAT-----A----C--GC-C-TCATGCAGAA-GCATG--CGGGGGATA-T------ATCA-G-A--ACAATTTC-AATT-AAATGCAGCAA-AATACACATATA--AAATAT-ATAAAAAT--TCA-TTTCA-----------------A---------gtagatt
gi|25 : AGTTCT-----CTGG--A----------------------ATT-TGTAACAC-TAA------GTAATT----TAATAAG-TTAAAAAAT-GCTA--G--G-T-TTCACATAATAAAATT--TCT-----TAAT-A-TAT------C---TT-T----TTCTCAAGT--TAC-A--ATA------T-TGG----GGA-C-A--CCTT-AG-----A-----A----AAAATGTAACTGA-TCCTC-----T-ATATCAggta
gi|26 : tttcttaaattaggtAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAAC-AA----A-TTTCTTTCA-----A--TG---TATT-AAG-TGGTT-AAT--AAGT-GA-TA-C-ATATATCAGACGA----TG---T--ACCA--TACACA--AGTCGA--------TTTTTA-TA-CAGA---A-TTAT----A--AA-TGAT-GTTTCCTTAAATTTC-A
gi|27 : -AAAAAA-CTTG-CCA-GA-C-TAAGC-AC----A-TATCTTTCACTCGTA--TG---TAAT-AGA-TACTA-AAT--GAGT-GA-TG-C-TTA-ATCAGAAGA----TG------ACCT--T-CGTA-----CCAGTTTTACGTTTTTATTA-AATAACGA-TTAT----A--AA-
gi|28 : a---AG-A----A------TTA-----CAATGT--AT---G-AT-AAA-----TGTTGCAC------ATAGT----AGA------A---------A---------------TTTTCCTAAATGC-GGGCA-----TTTCTCTG-------GTATT-TGTAGCGT-TAAGTACATGTAATT----AAATAAG-TTg
gi|29 : caattacgtgtacacgCTC--TACATA--AGTCGACTTTT-------TA-TA-GAGG---A-TTAT----A--AA-TGAT-GTCTCCTCAAATTTC-ACTAGGTTTTTTTT--T----------TGG----GG-GG-G-GGGG-T---AT------------CAATTTA--TT--AA--T--A-ACC--AAGG--A-A-----ATG-TTTT-CT-T--------
gi|3 : --GGGAGGATG-T------ATCA-C-A--AAAAAATC-AATT-AAATACGACAA-GA---------A--AAATGT-ATAAAAAT--TCA-TTTCA-----------------AGGTATAACATG------------AAT------------TTCTAAAT--A-T-TG-C---TA--TAG---T---C--T--A-----GT---------G--TAACTCCGTCA-AGGATTAT-TCCATT-TCA-----TAAA-GCCATTTTC------CGTTA-GCCACAA----------G---------------C--------------AT---A--T-ATA------CA-----------A---T-TA-T--ATA----T-A--CA----TCGTCA-A---TAT-----A-TCAAC-AAA--AA-C--A-ACATA-GT--GGAAA--G----TGA--GT-AGTC-TCT---AT--T-A-CAAAGATAGGGGGA-TAT-GATTATTAAA---AT--ATGT-----T---AG-A----A------TTA-----CAATGT--AT---G
gi|3 : ATA--AGTCGA-------TTTTTTA-TA-GATA---A-TTAT----A--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATTTC-ACTA-------TTT--TCG--G-GG--TGG----TG-GT-G-GTGG-T---GT------------TA--TTA--TT--AA--T--A-ACC--AAAN--N-NC----ATG-Tagaattgnaataagtcgattttttatagataattataaatgatgtttcctcaaatttcactattttcggggtggtggtggtggtgttattattaataaccaaannncatgtatttcaagtcagtctagatgacactttagaataaatggaactaatcctctataccatgtagattccccggaaatggtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtatctaggtacaataggtgcacaacgtgcaacaattctcttgctgtccgtgcaagtaagtgcaaacccgggtacgttgtacatg
gi|3 : gggaggatgtatcacaaaaaaatcaattaaatacgacaagaaaaatgtataaaaattcatttcaaggtataacatgaatttctaaatattgctatagtctagtgtaactccgtcaaggattattccatttcataaagccattttccgttagccacaagcatatatacaattatatatacatcgtcaatatatcaacaaaaacaacatagtggaaagtgagtagtctctattacaaagatagggggatatgattattaaaatatgttagaattacaatgtatgagaattgnaAT------G---TA-T----TTC--AAGT--CA-----GTC------T-AGA----TGA-C-A--CTTT-AG-----A-----A----TAAATGGAACTAA-TCCTC-----T-ATACCATatttcaagtcagtctagatgacactttagaataaatggaactaatcctctataccatgtagattccccggaaatggtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtatctaggtacaataggtgcacaacgtgcaacaattctcttgctgtccgtgcaagtaagtgcaaacccgggtacgttgtacatg
gi|31 : gggaggatgtatcacaaaaaaatcaattaaatacgacaagaaaaatgtataaaaattcatttcaaggtataacatgaatttctaaatattgctatagtctagtgtaactccgtcaaggattattccatttcataaagccattttccgttagccacaagcatatatacaattatatatacatcgtcaatatatcaacaaaaacaacatagtggaaagtgagtagtctctattacaaagatagggggatatgattattaaaatatgttagaattacaatgtatgagaattgnaataagtcgattttttatagataattataaatgatgtttcctcaaatttcactattttcggggtggtggtggtggtgttattattaataaccaaannncCAA----------G---------------CTG------------ATTGGA--T-A--------CA-----------------CA-T--ATA----T-A--CAATTGTTGT-A-AATATATCAACAA-TCAAC-AAA--AG-C--A-ACATA-GT--GGACA--G----TGA--GT-AGTC-TCC---AT--T-A-CAA--------AGA-TGT-GATTATTACA---Agtagattccccggaaatggtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtatctaggtacaataggtgcacaacgtgcaacaattctcttgctgtccgtgcaagtaagtgcaaacccgggtacgttgtacatg
gi|32 : AGTT----AAATAAG-ATTAAAA-C-GTT---G--GGT-TT-------------T--TCT-----TCAT-A-TAT------A---T--T----TTC--AAGTTATAT-A--GTA------T-GGA----GGA-C-A--CATT-A------GAATTTA----TAAATGGAACTCA-TCCTC-----T-
gi|33 : --AGTCGACTTTT--T-----A-TA-AAGA---A-TTATTTATA--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATT-C-ACTG-------TTT--T-A--G-GG---GG----GG-GG-G-GTGT-TG---T------------TA--TTA--TT--AA--T--A-ACC--AAAG--A-A-----AT
gi|35 : cTA-A-TAGC--TTTCC-AAAA-G-CTTT-CCT-GA-C-TAAA--AA----A-TTC--TTCA--------TG---TA---AAG-TG-TT-AAT--AAGT-GA-TA-C-ATATATC-GACGA----TG---T--ACCC--TAC
gi|36 : ---------G--T--------CA-AGGATTAT-TCCATT-TCA-----TAAA-GCCATTTTC------CGTTT-GCCACAA----------G---------------C--------------
gi|37 : gcgagtgtaacccc-TTAT----A--AA-TTAT-GTTTCCTCAAATTTC-ACTA-------T---------G-GA--T-------G-GG-G-GTGG-TG--------------------TTA--TT--AA-----A-ACC--AAAG--A-A-----ATG-TTTtcaatggata
gi|38 : AAGATAGAGGGA-TAT-GAT-ATTACA---AT--ATGT-----T---AG-T----A------TTA-----CA------AT---GTAT-GAGA-A-TTGTTGCAC------ATTG
gi|39 : GTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAAC-AA----A-TTTCTTTCA-----A--TG---TAT
gi|4 : caaA-TATC-ATGTATCACACGAA---TG---T--ACTC--TACATTT-AGGCGACTTTT--T-----A-TA-AAGA---T-TTAT----A--AA-TGAT-TCTTCCTCAAA---C-ACAC-------TTT--T-A-----G--T-------G-GG-G-GT-------GT------------TA--TTA--TT--AA--T--A-ACC--AAAG--A-AG----AAA-TTTT-CT-----------AT---T----CAT-T--TG---ATA-------AATC----AAATAA---A----C--GC-C-CCA----GAA-GCATG------GGATG-T------ATCA--GA--AAAATTTC-AATT-AAAT-C-GCAA-GA---------A--AAA----A-AAAAAGGATCG-TTCCA-----------------A---------T-------------AAT------------TTCTAAAT--A-A-TG-C---TAG-TGGAAAC---C--C--C-----GTTAC------G--T--------CA-A-GATTGT-TCCATT-TCA-----TAAA-GCCATTTTC------GA--A-ACCACAA----------G---------------CTCAACGGATACACAAT---A--T-A--------CA-----------A---T-TA-T--ATA----T-A--CA----TTGT-A-A---AAT-----A-TCAAC-AAA--AA-C--ATAAATG-GA--AGGGA--C----TGT--AT-AGTC-TCC---AT--T-A-CAAAGATGAGGAGATTAT-GA-TATTACA---AT--ACATG----T---AG-A----ACAGAATTTA-----CAATGT--------TAT-GAGAAA-CTGT--CAC------ATT-T----AGAATTTT-CCTAAATTAGA---------------CAGTTCT-----C-TG-----------------------GTATT-TGT-ACGT-TAA------GTAATT----AA--AAG-TTTAAAAAA-ATT---G--G-C-GT-------------T--TTC-----TCAT-A-TATC-----A---T--T----TTC--AAGT--CAT-A--GTA------TAAGA----TGA-C-A--CTTT-AG-----A-----A----TAAAT-GAACCAA-TCCTT-----TCATATCATa
gi|40 : caagtaatagctttccaaaatttgtaataccgatt----A--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATTTT-ACTG-------TTT--T----------T------GG-GG-G-GTG---GG-GT------------TA--TTA--CT--AA--T--A-gttagatat
gi|41 : -AGGATTAT-TCCGTT-TC--------AA-GC------T------CATTG-G--ATAA----------A---------------CAT------------AT---A--T-A--------CG-----------A---T-TA-T---------T-A--CA----T
gi|42 : GTA-A-CATC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-A-TAATC-GA----A-TTTCTTg
gi|43 : ttaTTC-G------A-----A----TAAATGGAACTCA-TCCTC-----T-ATACCATat
gi|45 : tA-TG-GAGA---A-TTAT----A--AA-TGAC-GTTTCCTCAAATTTT-Agtaaattcc
gi|46 : GTA-A-TAGC--TTTCCAAAAAAG-CTTG-CCT-
gi|47 : catgacaaGTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTA-CCT-G
gi|5 : acaaGTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAAC-AA----A-TTTCTTTCA-----A--TG---TATT-AAG-TGGTT-AAT--AAGT-GA-TA-C-ATATATCAGACGA----TG---T--ACCC--TACATA--AGTCGATTTTT--TTTTTTA-TA-GAGA---A-TTAT----A--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATTTC-ACTA-------TTT--T-A--GTGG--TGGT---GG-TG-G-GTGG-TGG-GT------------TA--TTA--TT--AA--T--A-ACC--AAAG--A-A-----ATG-TTTA-CT-T--------AAT---T----CAT-T--TG---ATT-------AATC----AAAT-----A----C--GC-C-TCA----GAA-GCATG--GGGAGGATG-T------ATCAGGGA--AAAAAATC-AATT-AAATACGGCAA-GA---------A--AAATGT-ATAAAAAT----A-T---------------------A---------TG------------GAT-CA---------TTCTAAAT--A-T-TG-C---TA--TAG---T---C--T--A-----GT---------G--T--------CA-AGGATTAT----------A-----TAAG---CATTTTC------CGTAA-GCCACAC----------G---------------C--------------AT---A--T-A--------CA-----------A---T-TA-T--ATA----T-A--CA----TTGT-A-A---TAT-----A-TCAAC--AA--AA-C--A-ACATA-GT--GGAGA--G----TGA--GT-ACTC-TCC---AT--T-A-CAAAGATAGAGAGA-TAT-TATTATTACA---AT--ATGT-----T----G-A----A------TTA-----CAATGTACAT---GTAT-GAG--A-TTGTTGCAC------ATTGT----AGA------C---------A---------------CAGTTCT-----CAGG--A-----TT-------------GTATT-TGTAACGC-CAA------GTAATT----AAAGAAG-TATAGAAAC-ATT---G--G-T-TT-------------T--TCT-----TCAT-A-TAT------A---TA-T----TTC--AAGT--CAT-A--GTC------T-AGA----TGA-C-A------------------------------GAAACTAA-TCCTC-----T-ATATCAT
gi|6 : GTA-AGTGGCGGTTTCC-AAA--G-CTTG-C----A-CATAAAC-AAGGGGA-TTTCTTTCA-----C--TGAGATGTT-AAC-TGTTTCAAT---AGT-GA-TG---ATAT-TTAGA-AA----TG---TTCACTC--TACAT---AGTCGACTTT
gi|6 : aaTTTCCTCAAATTTCAACTG-------TTT--T-T--A-AG--TGG----GG-cctcaaatttcaactgtttttaagtggggaatgcttattctgattgatattgattaatgcaatacatgcgctcagaagcattacgggaggatgtatcaagtaaatttaatgttaaaatctttaaaaaatcagtttcaaagtatcgataatggattgtcaattttctgaaatccttcaaggattattcgtttcaagctcattggataacatataatacgaattaattatataacgtatatacaaaaacagcatagtttgaagagtgcgttagtctcagaaattaacaaagatagagagttaattattacacaatataatacactacactagagactaatctatttaatatagacattttcctaaattagacagttctttgtatttgttaccttaagtaattaataagattagaacattgtggttttgttctgtcattatatatcattttcaagatatatggtatagaggaccctttagaaatcatcctctatat
gi|6 : aagtaagtggcggtttccaaagcttgcacataaacaaggggatttctttcactgagatgttaactgtttcaatagtgatgatatttagaaatgttcactctacatagtcgacG--G-A-----ATG-CTTA-TTCT--------GAT---T----GATAT--TG---ATT-------AATG----CAAT-----A----CATGCGC-TCA----GAA-GCATTACGGGAGGATG-T------ATCA-AG---------TA-AATT-TAATGTT----------------A--AAATCT-TTAAAAAA--TCAGTTTCA-----------------A---------AG------------TAT-CG---------AT---AATGGA-T-TGTC---AA--TTT---T---C--TGAA-----AT---------CCTT--------CA-AGGATTAT-TC-GTT-TCA--------A-GCT------------CATTG-G--ATAA--------------------------C--------------AT---A--T-AATACGAATTA-----------A---T-TA-T--ATA------A--CG----T-----------AT-----A-T--AC-AAA--AA-C--A-GCATA-GTTTGAAGA--G----TGC--GTTAGTC-TCAGAAAT--T-AACAAAGATAGAGAGT-TA---ATTATTACACA-AT--ATAA-----T---AC-ACTACA------CTAGAGACTAATCT--ATTTAATATAGAC--A-TTTTCCTAA------ATT------AGA------C---------A-----------------GTTCT-----------------TT-------------GTATT-TGTTACCT-TAA------GTAATT----AA-TAAG-ATTAGAA-C-ATT---GTGG-T-TT-------------TGTTCTG----TCAT---TAT------A---TA-TCATTTTC--AAGA--TAT-ATGGTA------T-AGA----GGA-C-C--CTTT-A-----------------------GAAATCA-TCCTC-----T-ATATaatgcttattctgattgatattgattaatgcaatacatgcgctcagaagcattacgggaggatgtatcaagtaaatttaatgttaaaatctttaaaaaatcagtttcaaagtatcgataatggattgtcaattttctgaaatccttcaaggattattcgtttcaagctcattggataacatataatacgaattaattatataacgtatatacaaaaacagcatagtttgaagagtgcgttagtctcagaaattaacaaagatagagagttaattattacacaatataatacactacactagagactaatctatttaatatagacattttcctaaattagacagttctttgtatttgttaccttaagtaattaataagattagaacattgtggttttgttctgtcattatatatcattttcaagatatatggtatagaggaccctttagaaatcatcctctatat
gi|7 : aagtaagtggcggtttccaaagcttgcacataaacaaggggatttctttcactgagatgttaactgtttcaatagtgatgatatttagaaatgttcactctacatagtcgactttcctcaaatttcaactgtttttaagtgg---------TTCTAAAT--A-T-TG-C---TA--TAG---T---C--T--A-----GT---------G--TAACCCCGTCA-ATGATTAT-TCCATT-TCA-----TAAA-GCCATTTTC------CGTTA-GCCACAA----------G---------------C--------------AT---A--T-ATA------CA-----------A---T-TA-T--ATA----T-A--CA----TTGT-ACA---TAT-----A-CCAAC-AAA--AA-C--A-ACATA-GT--GGAGA--G----TGA--GT-AGTC-TCC---AT--T-A-CAAAGATAGAGGGA-TAT-GATTATTACA---AT--ATGT-----T---AG-A----A------TTA-----CA------AT---GTAT-GAGA-A-TCATTGCACATACCAATTGT----AGA------C---------A---------------CAGTTCT-----C-----------TT-------------GTATT-GGTAACGC-CAA------GTAATT----AAAGAAG-TTTAAAAAC-ATTG--G--G-T-TT-------------T--TCT-----TCAT-A-TATC-----A---TA-T----TTC--AAGT--CAT-A--GTC------T-AAA----TGA-C-A--CTTT-AG-----A-----A----TAAATGGAACTAA-TCCTC-----T-ATATCAT
gi|8 : aaaaatT---T----CAT-T--TA---ATT-------AATC----AAAT-----AGATAC--CC-C-TCA----GAA-GCATG--GG----------------------A--GAAAAATT---TC-AAA-ACTGCAA-GA---------A--AAATCT-ACAAAAAT--TCA-TTTCA-----------------A---------CGTCC---------AATACT---------TTCTAAAT--A-A-TG-CGAGTA--TAA---C---C--C---------C---------G--T--------CA-AGGATTAT-TCTATT-TCA-----TAAA--CCATTTTT------CGTAA-ACCACAA----------G---------------CTCA-----------AT---G--G-A--------TA-----------ATTGT-TA-T--ATA----T-A--CA----TTGTAA-A---TAT-----A-TCAAG-AAA--AA-C--A-ATATA-GT--TGAGA--GGAACTGT--AT-AGTC-TCC---AT--T-A-CAAAGAT-GAGAGA-TAT-GATTATTACA---ATACATGTA----TACGAA-A----A------TCA-----CAATGT--AT---G--C-GA---A-TTGTTGCAC------ATTGT----AGA------C---------A----------------ATTTCC-----T-AA--A-----TTAGACACGTCTCTGGTATT-TGTAACTCTTAA------GTAATTTTAAAAAGAAGTTTTAAAAAC-ATT---AT-G-T-TT-------------T--TCT-----TCAT---TATC-----A---TA-T----TTC--AAGT--CAT-A--GTA------T-AGA----TGA-C-A--CTTT-AAATTAGA-----A----TAAATGGAACTCA-TCCTC-----T-ATATCATgtagattccccggaaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacatgtatccaggtacaatatgtgcacaacgtgcaacaattctcttgctgtccatgcaagtaagtgcaaaaccgggtacgttgtacatg
gi|9 : --AAAAAATC-AATT-AAATACGGCAA-GA---------A--AAATCT-ATGAAAAT--TCA-TTTCA-----------------A---------TGTATAATATTATGGAT-CGACCAATAATTTCTAAAT--A-A-TG-C---T---TAG---TG--T--T--AACCCCGT---------G--C--------AA-GGGATTATCTCCATT--CA-----TTAA-ACCACTTTCTCCAGCCTTTG-GCCACAACAAGTCATTGG---------------T--------------AT---A--C-A--------CACATATATACATA---T-TA-TT-ATACTGTT-A--CA----TTGT-A-AA--TAT-----A-TCAAC-AAA--AAAC--A-ACATA-GT--GGAGA--G----AGACTGTTAGTC-TCC---AT--T-A-AAAAGATAGAGAGA-TAT-GATTATTGCAAGTAC--ATGTGTACCC---AG-A----A------TTA-----CAATAT--TT---G-A--GAA--A-TTGTTGCAC------ATTG-----AGA------C---------A---------------T-TTTCC-----T-AA--A-----TTAG-----------ACAGT-TCT-CCGG-TAAAT----GTAAC-----------G-TTTAAAAAA-ATTG--G--G-G-TT-------------T--TCT-----TCAT-A-TAT------A---TATT----TTC--AAGT--CAT-A--GTA------A-TGA----TGA-C-A--CTTTAA------A-----A----TAGATG--ACTCATTCCTTCCTTAT-ATATCATgt
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|23 ): TCCGGAAAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAATAGGTGCACAACGTGCAACAATTCTCTTGCTGTCCATGCAAGTAAG
Unaligned ( gi|30 ): GAATTCCTGAAGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAATAAAGTAACTAATTTTCTATGCACAACAAATTTTTGCTCTTCAATATGAACAATAATTTTGTGCTCGTCAATAAAGACA
Unaligned ( gi|34 ): ACACGTGTACGAGAATTACAATATCAAGAGAATTGTTGCGCATGAACATTTTCCTAAAATGTTCAATGGTATATGTAACGTTTAAAAACATTGG
Unaligned ( gi|44 ): GAGTCCTTGTTAACATGAATAAAATTAAGTGTATCA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11111111 1111 222222222 111111111 33333333333333333333 11111 11111111 1111111 1111 22222 222222 111111111 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000 6666666666666666666666666666666666666666666 55555555555555555555555555555555555555555 11111111 11111111111 111111111111111 111 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 111111 111 2222222222222 2222222222222222
lowQualScore : 3 3 44 2 2 2 2 3 3 3 6666 3 22222222 999 3 3 7 55 3 3 0000 8888 777 33 33 55 888888888 2 2 666 2 4444 22 2 2 2 7777777 444444444 55 7777 2 4 2 55555555555555555555 333 33 55 33 33 2 33 33 2 00000 2 44 3 77777777 555 6666 3 44 555 0000000 3333 11111 7777 55 3 3 7777 3 888 3 999999 111111 11 3 3 0 0 3 333333333 77 2 3 55 3 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222 4 55 999 3 666 77 3333333333333333333333333333333333333333333 2 0 2 2 77777 2 888888 2 33333333333333333333333333333333333333333 555 33 2 77777777 22222222222 444 2 2 99 5555 2 33 111111111111111 77777 3 3 44 3 44 6 3 44 44 6666 44 6 3 555 44 3 3 2 2 0 222 33 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 777777 6666 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 2 0 2 555555 8888 2 2 2 33 555 2 5 2 1111111111111 99999 222 5555555555555555 33 33 2 33 8888888 2 5555 2 2 33 55555 77777777777 1 5 66666 5
lowQualScore : . . .. . . . . . . . .... . ........ ... . . . .. . . .... .... ... .. .. .. ......... . . ... . .... .. . . . ....... ......... .. .... . . . .................... ... .. .. .. .. . .. .. . ..... . .. . ........ ... .... . .. ... ....... .... ..... .... .. . . .... . ... . ...... ...... .. . . . . . ......... .. . . .. . ........................................................ . .. ... . ... .. ........................................... . . . . ..... . ...... . ......................................... ... .. . ........ ........... ... . . .. .... . .. ............... ..... . . .. . .. . . .. .. .... .. . . ... .. . . . . . ... .. ......................................................... ...... .... ....................................................................... . . . ...... .... . . . .. ... . . . ............. ..... ... ................ .. .. . .. ....... . .... . . .. ..... ........... . . ..... .
lowQualScore : 3 3 22 9 7 7 7 1 1 1 5555 1 00000000 222 6 6 3 00 6 3 4444 9999 999 99 77 99 000000000 4 4 555 2 5555 99 1 2 1 6666666 888888888 66 4444 2 7 4 00000000000000000000 999 22 66 22 22 4 44 22 4 66666 5 11 1 77777777 444 5555 1 22 444 0000000 1111 88888 7777 00 6 6 7777 6 333 3 666666 222222 77 1 1 1 8 3 333333333 99 2 3 00 6 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333 3 00 000 6 444 99 3333333333333333333333333333333333333333333 9 1 9 9 11111 9 222222 9 88888888888888888888888888888888888888888 000 77 7 00000000 77777777777 777 7 7 00 7777 7 77 555555555555555 77777 1 1 22 1 22 2 1 22 22 5555 22 2 1 444 22 1 1 7 7 8 000 99 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 777777 1111 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 9 9 9 000000 8888 8 5 7 77 333 7 3 7 0000000000000 33333 999 9999999999999999 44 44 5 44 1111111 5 3333 5 5 44 99999 11111111111 7 3 77777 3
consensus : GTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAAC-AA----A-TTTCTTTCA-----A--TG---TATT-AAG-TGGTT-AAT--AAGT-GA-TA-C-ATATATCAGACGA----TG---T--ACCC--TACATA--AGTCGACTTTT--TTTTTTA-TA-GAGA---A-TTAT----A--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATTTC-ACTA-------TTT--T-A--G-GG--TGG----GG-GG-G-GTGG-TGG-GT------------TA--TTA--TT--AA--T--A-ACC--AAAG--A-A-----ATG-TTTA-CT-T--------AAT---T----CAT-T--TG---ATT-------AATC----AAAT-----A----C--GC-C-TCA----GAA-GCATG--GGGAGGATG-T------ATCA-GGA--AAAAAATC-AATT-AAATACGGCAA-GA---------A--AAATNT-ATAAAAAT--TCA-TTTCA-----------------A---------TG------------GAT-CG---------TTCTAAAT--A-T-TG-C---TA--TAG---T---C--T--A-----GT---------G--T--------CA-AGGATTAT-TCCATT-TCA-----TAAA-GCCATTTTC------CGTTA-GCCACAA----------G---------------C--------------AT---A--T-A--------CA-----------A---T-TA-T--ATA----T-A--CA----TTGT-A-A---TAT-----A-TCAAC-AAA--AA-C--A-ACATA-GT--GGAGA--G----TGA--GT-AGTC-TCC---AT--T-A-CAAAGATAGAGAGA-TAT-GATTATTACA---AT--ATGT-----T---AG-A----A------TTA-----CAATGT--AT---GTAT-GAG--A-TTGTTGCAC------ATTGT----AGA------C---------A---------------CAGTTCT-----C-GG--A-----TT-------------GTATT-TGTAACGC-TAA------GTAATT----AAANAAG-TTTAAAAAC-AT--T---G-G-T-TT-------------TTCT-----TCAT-A-TAT------A---TA----TTTC--AAGT--CAT-A--GTA------T-AGA----TGA-C-A--CT-----TTAGA----A--T---AAATGGAACTCA-TCCTC-----T-ATATCAT
Reference ( family-2690 ) : GTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAAC-AA----A-TTTCTTTCA-----A--TG---TATT-AAG-TGGTT-AAT--AAGT-GA-TA-C-ATATATCAGACGA----TG---T--ACCC--TACATA--AGTCGACTTTT--TTTTTTA-TA-GAGA---A-TTAT----A--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATTTC-ACTA-------TTT--T-A--G-GG--TGG----GG-GG-G-GTGG-TGG-GT------------TA--TTA--TT--AA--T--A-ACC--AAAG--A-A-----ATG-TTTA-CT-T--------AAT---T----CAT-T--TG---ATT-------AATC----AAAT-----A----C--GC-C-TCA----GAA-GCATG--GGGAGGATG-T------ATCA-GGA--AAAAAATC-AATT-AAATACGGCAA-GA---------A--AAATNT-ATAAAAAT--TCA-TTTCA-----------------A---------TG------------GAT-CG---------TTCTAAAT--A-T-TG-C---TA--TAG---T---C--T--A-----GT---------G--T--------CA-AGGATTAT-TCCATT-TCA-----TAAA-GCCATTTTC------CGTTA-GCCACAA----------G---------------C--------------AT---A--T-A--------CA-----------A---T-TA-T--ATA----T-A--CA----TTGT-A-A---TAT-----A-TCAAC-AAA--AA-C--A-ACATA-GT--GGAGA--G----TGA--GT-AGTC-TCC---AT--T-A-CAAAGATAGAGAGA-TAT-GATTATTACA---AT--ATGT-----T---AG-A----A------TTA-----CAATGT--AT---GTAT-GAG--A-TTGTTGCAC------ATTGT----AGA------C---------A---------------CAGTTCT-----C-GG--A-----TT-------------GTATT-TGTAACGC-TAA------GTAATT----AAANAAG-TTTAAAAAC-AT--T---G-G-T-TT-------------TTCT-----TCAT-A-TAT------A---TA----TTTC--AAGT--CAT-A--GTA------T-AGA----TGA-C-A--CT-----TTAGA----A--T---AAATGGAACTCA-TCCTC-----T-ATATCAT
gi|1 : TA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCTCGA-C--AAACAAA----A-TTTCTCT-A-----A--TG---GATT-AAGCTGGTT-AACTAAAGT-GATTA-C-ATATATCAGACGAATGTTG---T--G-CC--TACATA--AGTCGA----T--TTTTTTA-TA-GAGG---A--TAT----AGCAA-TGAT-G-TTCCTC-AATTTC-ACTA-------TTT-------A-GG--CGGTAAAAG-GA-G-GTGT-T---GT------------TG--TTAACTTCAAA--T--A-ATCAGAAAG--ACA-----ATG--TTA-CT-TAATC----AAT---T----AAT-T--TG---ATT-------AATCAAATAAAT-----A----C--GC-C-TTA-----AA-GCATG--GGGAGGTTGTT------ATCA-AGA--AAATAAAC-A--T-AAATACGGCAATGA---------AC-AAATTTAATAAAAAT--TCA-TTTCAAAGGTATAT--------A---------TG------------GGA-CGTCCAAAAAATTCTAAA---A-TATG-C---TA--TAG---T---CTAT--A-----GTGTAAACCCCG--T--------CA-AGGATTAT-TCCA---TCA-----TAAA-GCCATTTTC------CGTTAGGCCACAA----------G---------------CA-------------AT---A--C-A--------CA-----------A---T-TA-T--ATA----T-ACTCA----CTGA-A-A---TAT-----ACTCAAC-AAA--AA-C--A-ACATA-G---GGAGAGTG----TGA--GT-AGTC-TCC---AT--T-A-AAAAGA-AGA-AGG-GAT-GA-TATTACA---AT--ATGT-----T---TGTA----T------TTA-----CA---T--AT---GTAT-GAGGAA-TTGTTGCAC------ATTGT----AGA------CGAT------A---------------CAGTGTT-----C-----------CT-------------GTATTGTGTAACGC-CAA------GTAATT----AAGAAGG-TTTAAAAAC-AT--T---G-G-T-TT-------------TCTC-----TCATAA-TATC-----A---TA----TTTC--AAGT--CATAA--GTC------T-AGA----TGACC-ACTCT-----TTAG-----A--T---AAATGGAACTAACTCCTC-----TAATATCA
gi|10 : -----------------A---------TG------------GAT-TG---------TCC--AAT--AAT-TT-C---TA--AA-------------------------------------------CA-ATGGTTAT-ACCATT-TCA-----TAAA-GCCACTTTC------CGTTA-GCCACAA----------G---------------CTCATATAC------AT---AAAT-A--------CA-----------A---T-TA-TT-ATA----T-A--CA----C------G---TAC-----A-TCAAC-AAA--AA-C--A-ACATA-CT--GGAGA--G----TGA--GT-AGTC-TCC---AT--T-A-CAAAGATAGAGAGA-TAT-GATAATCATA---A----------------------------------------GATGT--AT---G----AAA--A-TTGTTGAAC------ATTTTTCTAAGG----------------A---------------CAGCTCT-------G------------------------GTATC-TGTAACGC-TAA------GTAATT----AAATAAG-TTTATAAGC-AC--T---G-G-G-TTA------------TCCT-----ACAT-A-TATATC---A---TA----TTTC--AAGT--CAT-A--GTATACTATT-AGA----TGG-C-A--AT-----TTAGA----A--T---AAATGGAACTCA-TCCTC-----T-ATATCATatgtagagaatccccggaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacgatctaggtacaaaagatgcacaaacgtgcaacaagtccttgctgcgtctatgcaagtaagtgccaaacccgggacgttgtacatg
gi|11 : atatcaaagtataatC--TTTCC-AAAAAA-CTTG-CCT-GA-C-TAAAC-AA----A-TTTCTTTTA-----A--T----TATT-ACG-TAGTT-AAT--AAGT-GA-TA----TATATCAGACGA-----G---T--ACTC--TGCATATAAGTCGACTTTT------TTA-TA-GAGA---A-TTAT----A--AT-TGAT-GTTTCCTTGAATTTC-TCTG-------TTTAGC-G--G-GG--GGG----GG-GGCG-GGGG-TGG-GG------------TA--TAA--T----G--T--A-ACC--CAAGGTA-AAACATATGTTTTA-CT-TTCAATATCAAT---TTTCGCAT-TTATA---ACT-------CGTC----AAATAAATGA----C--AC-CATCA----GAA-GCATG--CGGTGGATT-TTATGAGATCA-GAAATAGAGAAT---ATTGAAACACGgtaga
gi|12 : ttccttgatcttaaaggcggatccaaaacttgtattaacacttttagacGA----TG---T--ACTC--TACATT--AGTCGACTTTT--T-----G-TA-CAGA---A-TTAT----A--AA-TGAC-TTTTCCTCAAATTTC-ACTG-------TTT--T-A--G-AG--AGG----G----------------GT------------T-----------------------------G--A-A-----ATG-TTTT-CT-T-------------------CAT-T---A---ATC-------AAAC----AAAT-----A----C--GC-C-TCA----GAA-GCATG--GGGA---TG-T------ATCA-G-A--AAAATTTC-AATT-AAATGCGGCAA-GA---------A--AAATTT-ATACAAAT--TCA-TTTCA-----------------AGGTATAATATG------------GAT-CG---------TCC--AAT--AAT-TT-C---TAAATAA---TATAC--T--G-----GT---------G--TAACCCCGTTA-AGGATTAT-TCCATT-TCA-----TAAA-GCCATTTTT------CGTTT-GCCACAA----------GCTCAATGAAAACACAC--------------AT---A--T-A--------CA-----------A---T-TATT--ATA----T-A--CA----TTG
gi|13 : AGAGAGA-TGT-GATTATTACA---AT--A
gi|13 : accgttaatgtcatacacaaA------GTAATT----AAAGACG-TTTTAAAAC-AT--TTTGG-G-T-TT-------------TTCT-----TCAT-A-TATC-----A---TA-----TTC--ATGA--CAT-A--GTG------T-AGA----TGA-C-A--CT-----TTAGA----A--T---AAATGGAACTCA-TCCTT-----T-ATcatgtatacgagnaaagacgatgtgaggaagttggagaggaactgctaaatctagcacaacagtctgtgcaatctgcattacaagaagaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaattaaagacgttttaaaacattttgggtttttcttcatatatcatattcatgacatagtgtagatgacactttagaataaatggaactcatcctttat
gi|14 : accgttaatgtcatacacaaagagagatgtgattattacaatacatgtatacgagnaaagacgatgtgaggaagttggagaggaactgctaaatctagcacaacagtctgtgcaatctgcattacaagaagaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn---A--T-A--------CA-----------A---T-TA-TTAATA----A-A--CA---------A-A---CA----------AAC-AAACAAA-C--GGACATT-GT--GGAGG--G----TGA--GT-GGAC-ACC---AA--T-G-CACAGTTTGAAA-----T-AA-----ACA---A---AT-T-----G---AG-A----A------TTT-----C------------GTA-----------GTTGCAT------ATTGT----AGAAATTTCC---------AAAATTAAA-------CAGTTC---------G--T-----TA-------------GTATT-TTTGACAT-TGA------GTAATT----CAATCAG-TTTAAAAAC--T--C---A-A-T-GT-------------TTGT-----ATAG-A-TAC------AATTTG----TCTC--AAGT--CAT-C--GTA------T-AGAAAAGTGA-A-A--CT-----TTAGA----
gi|15 : cctaagtctcattggacgtacataaGTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAAC-AA----A-TTTCTTTCA-----A--TG---TATT-AAG-TGGTT-AAT--A-----------------TCAGATGA----TG---T--ACCC--TACATA--AGTCGAATTTT--T-----A-TA-GA-----A-TTAT----A--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATTTC-ACTA-------TTT--T-A--G-GG--TGG-------------TGG-TGGTGT------------TA--TTA--TT--AA--T--A-ACC--AAAG--A-A-----ATG-TTTA-CT-T--------AAT---T----CAT-T--TG---ATT-------AATCAAATAAAT-----A----C--GC-C-TCA----GAA-GCATG--GGGAGGATG-T------ATCA-G----AAAAAATCAAATT-AAATACGGCAA-GA---------A--AAATGT-ATAAAtgaagtgcaccatttttt
gi|16 : TTTTTA-TATGAGA---AATTAT----A--AA-TGAT-GTTTCCTCCAACTTC-ACTA-------TTT-------A-GG--TGG----GG-GG-G---GG-T---CT------------TA--TTA--TT--AA--T--A-A-C--AAAG--A-A-----ATG--TTA-CT-T--------AACTGAT----TAT-T--TG---ATTTTAATCAAATT----AAAT-----A----C--GC-C-TCA----GAAGGCATGT-TGGAGGATG-T------ATTA--GA--AAAATTTC-AATT--AATACGGCAA-GA---------A--AGCTGT-ATAAAA----TCA-TTTCAAGGTATATAATCATTATA---------TG------------GAT-CGTCCAAAAT-TTCGAAAT--A-T-TG-C---TA--T
gi|17 : ----TG---T--ATCC--TACATA--AGTCGA----T--TTTTTTA-TA-TA-A---A-TTAT----A--AA-TGAT-GTTTCTTCAAATTTC-ACCA-------TTT--T-A--G-GGG-TGG----GT-GGTG-GTGG-TGG-------------------------T--A---T--A-AGC--AAAG--A-A-----ATG-TTTA-TT-T--------AAT---T----CAT-T--TG---ATT-------AATC----AAATAAAT-A----C--GC-C-TCA----GAA-GCATA--GGGAGGATG-T------ATCA-GAA--AAAAAA---AA-----------CAA-CA---------ATTAAATGT-GTAAAAAT--TCA-TTTCA-----------------A---------tgg
gi|17 : -----GT---------G--T---------A-AAAATT-----CATT-TCAAGGTATAAA-GCTATTTTC------CGTTA-GCCACAA----------G---------------C--------------Aggtataaagctattttccgttagccacaagca
gi|18 : tgtatcctacataagtcgatttttttatataaattataaatgatgtttcttcaaatttcaccattttaggggtgggtggtggtggtggtataagcaaagaaatgtttatttaattcatttgattaatcaaataaatacgcctcagaagcatagggaggatgtatcagaaaaaaaaaacaacaattaaatGTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAAC-AA----A-TTTCTTTCA-----C--TG---TATT-ACG-TGGTT-AAT--AAGT-AA-T----ATATATCAGACGA----TGTACT--ACTC--TACATA--AGTCGAC-------CTTTTA-TA-GAGA---A-TTAT----A--AA-TGAC-GTTT-CTCAAATTTC-TCTG-------TTT--A-A--G-GG--GGG----GG-GG-G-G----------------------TA--TTA--TT--AATTT--A-ACC--AAAG--A-A-----ATG-TTAT-CT-T--------AAT---T----CAT-T--TG---ATT-------AAGC----AAA
gi|19 : caaGTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTGGCCT-GA-C-TAAAC-AA----ACTTTCTTTC------A--TG---TATTAAAG-TGGTT-AAT--AAGT-GA-TA-C---ATATTAGACGA----TG---T--A--T--TA-ATA--AGTCGA----T--TTTTTTA-TA-GAGA---A--TAT----A--AATTCATGGTTTCCTCACATTTC-ACTA-------TTT--T-AAGG-GG--TGG----GGTGG-G-GTGG-GGGTGT------------TT--TTA--TTA-AA--T--A-ACC--AAAG--A-A-----ATG-T
gi|2 : caaGTACA-TAGC--TTTCC-AAAAAGGCTTG-CCT-GAAC-TAAAC-AA----A-TT-CTTTCA-----AAATGA--TATT-AAG-TGGTTTAAT--AAGTTGA-TA-CGATATATCAGACGA----TGC--T--ATCCCGTACATA--AGTCG--------TTTTTTA-TA-GAGAT--A-TTA-----A--AA-TGAT---TTCCTCAAATTTC-A-TA-------TTT--T-A--G-GGGGTGG----GG-TG-GCGTGGGTGG-GTGGTTTGGTGGTGTA--TTA--TG--AA--T--ATACC--AAAG--A-A-----ATG-TTTATCT-T--------AA----T----CAT-T--TG---A-T-------AATC----AA
gi|2 : acaaA--TAA---T---C--A--A-----G----------A--T--------CAGACGATTAT-TCCATTCTCA-----TAAAAGCCATTTTC------CGTTA-GCCACAA----------G---------------C--------------AT---A--TAA--------CA-----------G---TCTA-T--ATT----TAA--CA----TTGTAA-A---TAT-----A-TCAACAAAA--AA-CAAA-ACATAGGT--GGAGA--G----CGA--GT-AGTC-TCC---AT--TAA-CAAAGATGTAGCGA-TATGGATTA-TA-A---AT--ATGT-----T---AG-A----A------TTA-----CA------AT---GTAT-GAGA-A-TTGTTGCAC------ATTGT----AGA------C---------A---------------CAGTTCT-----CAAG--A-----TT-------------GTATT-TGTAACGC-CAGAT----GTAATT----AAAGAAG-TTTAGAAAC-AT--TG--G-G-TGTT-------------TTCT-----TCAT-A-TATATCATAA---TA----TTTT--AAGT--CAT-A--GTC------T-AGA----TGA-C-A--C--------GGA----AACT---AAATgatcagacgattattccattctcataaaagccattttccgttagccacaagcatataacagtctatatttaacattgtaaatatatcaacaaaaaacaaaacataggtggagagcgagtagtctccattaacaaagatgtagcgatatggattataaatatgttagaattacaatgtatgagaattgttgcacattgtagacacagttctcaagattgtatttgtaacgccagatgtaattaaagaagtttagaaacattgggtgttttcttcatatatatcataatattttaagtcatagtctagatgacacggaaactaaatcctcatagtatcgtgtagattccccggaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaataggtgcacaacggtgcaatcaattctctgttgctgtccatcgccaagtaagtgcaaaccgggtacgtcttgtacatg
gi|20 : acaagtacatagctttccaaaaaggcttgcctgaactaaacaaattctttcaaaatgatattaagtggtttaataagttgatacgatatatcagacgatgctatcccgtacataagtcgttttttatagagatattaaaatgatttcctcaaatttcatattttagggggtggggtggcgtgggtgggtggtttggtggtgtattatgaatataccaaagaaatgtttatcttaatcatttg-TTGTTGCAC------ATTAT----AGA------TTTT------A---------------CTGATAT-----T-AG--ACATTCTT-------------GTATT-TGTA-CGC-TAA------GTAATTTA--AAATAAG-ATTCAAA-C-AT--T---G-GGT-TT-------------TTCTATGAATCAT-AATAT------A---CC----TTTC--AAGT--TGT-------------T-AGG-----GA-CGA--CT-----TTAGA----A--TTATAAATGGAACTCA-TCCTC-----T-ATATcctcatagtatcgtgtagattccccggaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaataggtgcacaacggtgcaatcaattctctgttgctgtccatcgccaagtaagtgcaaaccgggtacgtcttgtacatg
gi|21 : tcatgttatgagattttccttaatt--T-A--------CA-----------A---T-TA-T---------T-A---A----TT---A-A---TA----------AAC-AAA--CA-C--G-GCACT-GT--GGAGA--G----TGG--GT-AGACATCA---ATGCT-A-CACTAATACACACT-TA---ATTATCGCACC-GT--ATG----------AT-A----A------TT--------TTGT--AG---AT-T-TAA--T-TTGTTGCAT------ATTGC----AAA------
gi|22 : agccacagtctcattggatgtacaaaagTAT-GAG--AATTGTTGCAC------ATTGT----AGA------C---------ATTTTCCTCAATTAGACAGTTCT-----C-GG-----------------------GTATT-TGTAACGC-GAA------GTAATT----AAAGAAG-TTTAAAAGCAAT--A---G-G-T-TT-------------TTCT-----TCAT-A-TAT----------TA----TTTA--AAAT--CAT-A--GTA------T-AGA----TGA-C-A--CC-----TTAGA----------------------A-TCCTC-----T-ATATCATattaaacaattcggtagattttt
gi|24 : aG-GG-G-GTA-------T------------TT--TTA--TT--AA--TTTA-ACC--AAAG--A-A-----ATA-CTTT-CT-T--------ATT---T----CAT-T--TATCAATT-------AAAT----AAAT-----A----C--GC-C-TCATGCAGAA-GCATG--CGGGGGATA-T------ATCA-G-A--ACAATTTC-AATT-AAATGCAGCAA-AATACACATATA--AAATAT-ATAAAAAT--TCA-TTTCA-----------------A---------gtagatt
gi|25 : AGTTCT-----CTGG--A----------------------ATT-TGTAACAC-TAA------GTAATT----TAATAAG-TTAAAAAAT-GC--TA--G-G-T-TTCACATAATAAAATTTCT-----TAAT-A-TAT------C---TT----TTTCTCAAGT--TAC-A--ATA------T-TGG----GGA-C-A--CC-----TTAGA----A--A---AAATGTAACTGA-TCCTC-----T-ATATCAggta
gi|26 : tttcttaaattaggtAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAAC-AA----A-TTTCTTTCA-----A--TG---TATT-AAG-TGGTT-AAT--AAGT-GA-TA-C-ATATATCAGACGA----TG---T--ACCA--TACACA--AGTCGA--------TTTTTA-TA-CAGA---A-TTAT----A--AA-TGAT-GTTTCCTTAAATTTC-A
gi|27 : -AAAAAA-CTTG-CCA-GA-C-TAAGC-AC----A-TATCTTTCACTCGTA--TG---TAAT-AGA-TACTA-AAT--GAGT-GA-TG-C-TTA-ATCAGAAGA----TG------ACCT--T-CGTA-----CCAGTTTTACGTTTTTATTA-AATAACGA-TTAT----A--AA-
gi|28 : a---AG-A----A------TTA-----CAATGT--AT---G-AT-AAA-----TGTTGCAC------ATAGT----AGA------A---------A---------------TTTTCCTAAATGC-GGGCA-----TTTCTCTG-------GTATT-TGTAGCGT-TAAGTACATGTAATT----AAATAAG-TTg
gi|29 : caattacgtgtacacgCTC--TACATA--AGTCGACTTTT-------TA-TA-GAGG---A-TTAT----A--AA-TGAT-GTCTCCTCAAATTTC-ACTAGGTTTTTTTT--T----------TGG----GG-GG-G-GGGG-T---AT------------CAATTTA--TT--AA--T--A-ACC--AAGG--A-A-----ATG-TTTT-CT-T--------
gi|3 : --GGGAGGATG-T------ATCA-C-A--AAAAAATC-AATT-AAATACGACAA-GA---------A--AAATGT-ATAAAAAT--TCA-TTTCA-----------------AGGTATAACATG------------AAT------------TTCTAAAT--A-T-TG-C---TA--TAG---T---C--T--A-----GT---------G--TAACTCCGTCA-AGGATTAT-TCCATT-TCA-----TAAA-GCCATTTTC------CGTTA-GCCACAA----------G---------------C--------------AT---A--T-ATA------CA-----------A---T-TA-T--ATA----T-A--CA----TCGTCA-A---TAT-----A-TCAAC-AAA--AA-C--A-ACATA-GT--GGAAA--G----TGA--GT-AGTC-TCT---AT--T-A-CAAAGATAGGGGGA-TAT-GATTATTAAA---AT--ATGT-----T---AG-A----A------TTA-----CAATGT--AT---G
gi|3 : ATA--AGTCGA-------TTTTTTA-TA-GATA---A-TTAT----A--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATTTC-ACTA-------TTT--TCG--G-GG--TGG----TG-GT-G-GTGG-T---GT------------TA--TTA--TT--AA--T--A-ACC--AAAN--N-NC----ATG-Tagaattgnaataagtcgattttttatagataattataaatgatgtttcctcaaatttcactattttcggggtggtggtggtggtgttattattaataaccaaannncatgtatttcaagtcagtctagatgacactttagaataaatggaactaatcctctataccatgtagattccccggaaatggtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtatctaggtacaataggtgcacaacgtgcaacaattctcttgctgtccgtgcaagtaagtgcaaacccgggtacgttgtacatg
gi|3 : gggaggatgtatcacaaaaaaatcaattaaatacgacaagaaaaatgtataaaaattcatttcaaggtataacatgaatttctaaatattgctatagtctagtgtaactccgtcaaggattattccatttcataaagccattttccgttagccacaagcatatatacaattatatatacatcgtcaatatatcaacaaaaacaacatagtggaaagtgagtagtctctattacaaagatagggggatatgattattaaaatatgttagaattacaatgtatgagaattgnaAT------G---TA----TTTC--AAGT--CA-----GTC------T-AGA----TGA-C-A--CT-----TTAGA----A--T---AAATGGAACTAA-TCCTC-----T-ATACCATatttcaagtcagtctagatgacactttagaataaatggaactaatcctctataccatgtagattccccggaaatggtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtatctaggtacaataggtgcacaacgtgcaacaattctcttgctgtccgtgcaagtaagtgcaaacccgggtacgttgtacatg
gi|31 : gggaggatgtatcacaaaaaaatcaattaaatacgacaagaaaaatgtataaaaattcatttcaaggtataacatgaatttctaaatattgctatagtctagtgtaactccgtcaaggattattccatttcataaagccattttccgttagccacaagcatatatacaattatatatacatcgtcaatatatcaacaaaaacaacatagtggaaagtgagtagtctctattacaaagatagggggatatgattattaaaatatgttagaattacaatgtatgagaattgnaataagtcgattttttatagataattataaatgatgtttcctcaaatttcactattttcggggtggtggtggtggtgttattattaataaccaaannncCAA----------G---------------CTG------------ATTGGA--T-A--------CA-----------------CA-T--ATA----T-A--CAATTGTTGT-A-AATATATCAACAA-TCAAC-AAA--AG-C--A-ACATA-GT--GGACA--G----TGA--GT-AGTC-TCC---AT--T-A-CAA--------AGA-TGT-GATTATTACA---Agtagattccccggaaatggtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtatctaggtacaataggtgcacaacgtgcaacaattctcttgctgtccgtgcaagtaagtgcaaacccgggtacgttgtacatg
gi|32 : AGTT----AAATAAG-ATTAAAA-C-GT--T---G-GGT-TT-------------TTCT-----TCAT-A-TAT------A---T-----TTTC--AAGTTATAT-A--GTA------T-GGA----GGA-C-A--CA-----TTAGAATTTA--T---AAATGGAACTCA-TCCTC-----T-
gi|33 : --AGTCGACTTTT--T-----A-TA-AAGA---A-TTATTTATA--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATT-C-ACTG-------TTT--T-A--G-GG---GG----GG-GG-G-GTGT-TG---T------------TA--TTA--TT--AA--T--A-ACC--AAAG--A-A-----AT
gi|35 : cTA-A-TAGC--TTTCC-AAAA-G-CTTT-CCT-GA-C-TAAA--AA----A-TTC--TTCA--------TG---TA---AAG-TG-TT-AAT--AAGT-GA-TA-C-ATATATC-GACGA----TG---T--ACCC--TAC
gi|36 : ---------G--T--------CA-AGGATTAT-TCCATT-TCA-----TAAA-GCCATTTTC------CGTTT-GCCACAA----------G---------------C--------------
gi|37 : gcgagtgtaacccc-TTAT----A--AA-TTAT-GTTTCCTCAAATTTC-ACTA-------T---------G-GA--T-------G-GG-G-GTGG-TG--------------------TTA--TT--AA-----A-ACC--AAAG--A-A-----ATG-TTTtcaatggata
gi|38 : AAGATAGAGGGA-TAT-GAT-ATTACA---AT--ATGT-----T---AG-T----A------TTA-----CA------AT---GTAT-GAGA-A-TTGTTGCAC------ATTG
gi|39 : GTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAAC-AA----A-TTTCTTTCA-----A--TG---TAT
gi|4 : caaA-TATC-ATGTATCACACGAA---TG---T--ACTC--TACATTT-AGGCGACTTTT--T-----A-TA-AAGA---T-TTAT----A--AA-TGAT-TCTTCCTCAAA---C-ACAC-------TTT--T-A-----G--T-------G-GG-G-GT-------GT------------TA--TTA--TT--AA--T--A-ACC--AAAG--A-AG----AAA-TTTT-CT-----------AT---T----CAT-T--TG---ATA-------AATC----AAATAA---A----C--GC-C-CCA----GAA-GCATG------GGATG-T------ATCA--GA--AAAATTTC-AATT-AAAT-C-GCAA-GA---------A--AAA----A-AAAAAGGATCG-TTCCA-----------------A---------T-------------AAT------------TTCTAAAT--A-A-TG-C---TAG-TGGAAAC---C--C--C-----GTTAC------G--T--------CA-A-GATTGT-TCCATT-TCA-----TAAA-GCCATTTTC------GA--A-ACCACAA----------G---------------CTCAACGGATACACAAT---A--T-A--------CA-----------A---T-TA-T--ATA----T-A--CA----TTGT-A-A---AAT-----A-TCAAC-AAA--AA-C--ATAAATG-GA--AGGGA--C----TGT--AT-AGTC-TCC---AT--T-A-CAAAGATGAGGAGATTAT-GA-TATTACA---AT--ACATG----T---AG-A----ACAGAATTTA-----CAATGT--------TAT-GAGAAA-CTGT--CAC------ATT-T----AGAATTTT-CCTAAATTAGA---------------CAGTTCT-----C-TG-----------------------GTATT-TGT-ACGT-TAA------GTAATT----AA--AAG-TTTAAAAAA-AT--T---G-G-C-GT-------------TTTC-----TCAT-A-TATC-----A---T-----TTTC--AAGT--CAT-A--GTA------TAAGA----TGA-C-A--CT-----TTAGA----A--T---AAAT-GAACCAA-TCCTT-----TCATATCATa
gi|40 : caagtaatagctttccaaaatttgtaataccgatt----A--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATTTT-ACTG-------TTT--T----------T------GG-GG-G-GTG---GG-GT------------TA--TTA--CT--AA--T--A-gttagatat
gi|41 : -AGGATTAT-TCCGTT-TC--------AA-GC------T------CATTG-G--ATAA----------A---------------CAT------------AT---A--T-A--------CG-----------A---T-TA-T---------T-A--CA----T
gi|42 : GTA-A-CATC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-A-TAATC-GA----A-TTTCTTg
gi|43 : ttaT-----TTCGA----A--T---AAATGGAACTCA-TCCTC-----T-ATACCATat
gi|45 : A-TG-GAGA---A-TTAT----A--AA-TGAC-GTTTCCTCAAATTTT-Agtaaattcc
gi|46 : GTA-A-TAGC--TTTCCAAAAAAG-CTTG-CCT-
gi|47 : catgacaaGTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTA-CCT-G
gi|5 : acaaGTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAAC-AA----A-TTTCTTTCA-----A--TG---TATT-AAG-TGGTT-AAT--AAGT-GA-TA-C-ATATATCAGACGA----TG---T--ACCC--TACATA--AGTCGATTTTT--TTTTTTA-TA-GAGA---A-TTAT----A--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATTTC-ACTA-------TTT--T-A--GTGG--TGGT---GG-TG-G-GTGG-TGG-GT------------TA--TTA--TT--AA--T--A-ACC--AAAG--A-A-----ATG-TTTA-CT-T--------AAT---T----CAT-T--TG---ATT-------AATC----AAAT-----A----C--GC-C-TCA----GAA-GCATG--GGGAGGATG-T------ATCAGGGA--AAAAAATC-AATT-AAATACGGCAA-GA---------A--AAATGT-ATAAAAAT----A-T---------------------A---------TG------------GAT-CA---------TTCTAAAT--A-T-TG-C---TA--TAG---T---C--T--A-----GT---------G--T--------CA-AGGATTAT----------A-----TAAG---CATTTTC------CGTAA-GCCACAC----------G---------------C--------------AT---A--T-A--------CA-----------A---T-TA-T--ATA----T-A--CA----TTGT-A-A---TAT-----A-TCAAC--AA--AA-C--A-ACATA-GT--GGAGA--G----TGA--GT-ACTC-TCC---AT--T-A-CAAAGATAGAGAGA-TAT-TATTATTACA---AT--ATGT-----T----G-A----A------TTA-----CAATGTACAT---GTAT-GAG--A-TTGTTGCAC------ATTGT----AGA------C---------A---------------CAGTTCT-----CAGG--A-----TT-------------GTATT-TGTAACGC-CAA------GTAATT----AAAGAAG-TATAGAAAC-AT--T---G-G-T-TT-------------TTCT-----TCAT-A-TAT------A---TA----TTTC--AAGT--CAT-A--GTC------T-AGA----TGA-C-A-----------------------------GAAACTAA-TCCTC-----T-ATATCAT
gi|6 : GTA-AGTGGCGGTTTCC-AAA--G-CTTG-C----A-CATAAAC-AAGGGGA-TTTCTTTCA-----C--TGAGATGTT-AAC-TGTTTCAAT---AGT-GA-TG---ATAT-TTAGA-AA----TG---TTCACTC--TACAT---AGTCGACTTT
gi|6 : aaTTTCCTCAAATTTCAACTG-------TTT--T-T--A-AG--TGG----GG-cctcaaatttcaactgtttttaagtggggaatgcttattctgattgatattgattaatgcaatacatgcgctcagaagcattacgggaggatgtatcaagtaaatttaatgttaaaatctttaaaaaatcagtttcaaagtatcgataatggattgtcaattttctgaaatccttcaaggattattcgtttcaagctcattggataacatataatacgaattaattatataacgtatatacaaaaacagcatagtttgaagagtgcgttagtctcagaaattaacaaagatagagagttaattattacacaatataatacactacactagagactaatctatttaatatagacattttcctaaattagacagttctttgtatttgttaccttaagtaattaataagattagaacattgtggttttgttctgtcattatatatcattttcaagatatatggtatagaggaccctttagaaatcatcctctatat
gi|6 : aagtaagtggcggtttccaaagcttgcacataaacaaggggatttctttcactgagatgttaactgtttcaatagtgatgatatttagaaatgttcactctacatagtcgacG--G-A-----ATG-CTTA-TTCT--------GAT---T----GATAT--TG---ATT-------AATG----CAAT-----A----CATGCGC-TCA----GAA-GCATTACGGGAGGATG-T------ATCA-AG---------TA-AATT-TAATGTT----------------A--AAATCT-TTAAAAAA--TCAGTTTCA-----------------A---------AG------------TAT-CG---------AT---AATGGA-T-TGTC---AA--TTT---T---C--TGAA-----AT---------CCTT--------CA-AGGATTAT-TC-GTT-TCA--------A-GCT------------CATTG-G--ATAA--------------------------C--------------AT---A--T-AATACGAATTA-----------A---T-TA-T--ATA------A--CG----T-----------AT-----A-T--AC-AAA--AA-C--A-GCATA-GTTTGAAGA--G----TGC--GTTAGTC-TCAGAAAT--T-AACAAAGATAGAGAGT-TA---ATTATTACACA-AT--ATAA-----T---AC-ACTACA------CTAGAGACTAATCT--ATTTAATATAGAC--A-TTTTCCTAA------ATT------AGA------C---------A-----------------GTTCT-----------------TT-------------GTATT-TGTTACCT-TAA------GTAATT-----AATAAG-ATT-AGAAC-ATTGT---G-G-T-TTTG-----------TTCTG----TCAT---TAT------A---TATCATTTTC--AAGA--TAT-ATGGTA------T-AGA----GGA-C-C--CT-----TTAGA----A------A--------TCA-TCCTC-----T-ATATaatgcttattctgattgatattgattaatgcaatacatgcgctcagaagcattacgggaggatgtatcaagtaaatttaatgttaaaatctttaaaaaatcagtttcaaagtatcgataatggattgtcaattttctgaaatccttcaaggattattcgtttcaagctcattggataacatataatacgaattaattatataacgtatatacaaaaacagcatagtttgaagagtgcgttagtctcagaaattaacaaagatagagagttaattattacacaatataatacactacactagagactaatctatttaatatagacattttcctaaattagacagttctttgtatttgttaccttaagtaattaataagattagaacattgtggttttgttctgtcattatatatcattttcaagatatatggtatagaggaccctttagaaatcatcctctatat
gi|7 : aagtaagtggcggtttccaaagcttgcacataaacaaggggatttctttcactgagatgttaactgtttcaatagtgatgatatttagaaatgttcactctacatagtcgactttcctcaaatttcaactgtttttaagtgg---------TTCTAAAT--A-T-TG-C---TA--TAG---T---C--T--A-----GT---------G--TAACCCCGTCA-ATGATTAT-TCCATT-TCA-----TAAA-GCCATTTTC------CGTTA-GCCACAA----------G---------------C--------------AT---A--T-ATA------CA-----------A---T-TA-T--ATA----T-A--CA----TTGT-ACA---TAT-----A-CCAAC-AAA--AA-C--A-ACATA-GT--GGAGA--G----TGA--GT-AGTC-TCC---AT--T-A-CAAAGATAGAGGGA-TAT-GATTATTACA---AT--ATGT-----T---AG-A----A------TTA-----CA------AT---GTAT-GAGA-A-TCATTGCACATACCAATTGT----AGA------C---------A---------------CAGTTCT-----C-----------TT-------------GTATT-GGTAACGC-CAA------GTAATT----AAAGAAG-TTTAAAAAC-AT--TG--G-G-T-TT-------------TTCT-----TCAT-A-TATC-----A---TA----TTTC--AAGT--CAT-A--GTC------T-AAA----TGA-C-A--CT-----TTAGA----A--T---AAATGGAACTAA-TCCTC-----T-ATATCAT
gi|8 : aaaaatT---T----CAT-T--TA---ATT-------AATC----AAAT-----AGATAC--CC-C-TCA----GAA-GCATG--GG----------------------A--GAAAAATT---TC-AAA-ACTGCAA-GA---------A--AAATCT-ACAAAAAT--TCA-TTTCA-----------------A---------CGTCC---------AATACT---------TTCTAAAT--A-A-TG-CGAGTA--TAA---C---C--C---------C---------G--T--------CA-AGGATTAT-TCTATT-TCA-----TAAA--CCATTTTT------CGTAA-ACCACAA----------G---------------CTCA-----------AT---G--G-A--------TA-----------ATTGT-TA-T--ATA----T-A--CA----TTGTAA-A---TAT-----A-TCAAG-AAA--AA-C--A-ATATA-GT--TGAGA--GGAACTGT--AT-AGTC-TCC---AT--T-A-CAAAGAT-GAGAGA-TAT-GATTATTACA---ATACATGTA----TACGAA-A----A------TCA-----CAATGT--AT---G--C-GA---A-TTGTTGCAC------ATTGT----AGA------C---------A----------------ATTTCC-----T-AA--A-----TTAGACACGTCTCTGGTATT-TGTAACTCTTAA------GTAATTTTAAAAAGAAGTTTTAAAAAC-AT--T---ATG-T-TT-------------TTCT-----TCAT---TATC-----A---TA----TTTC--AAGT--CAT-A--GTA------T-AGA----TGA-C-A--CTTTAAATTAGA----A--T---AAATGGAACTCA-TCCTC-----T-ATATCATgtagattccccggaaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacatgtatccaggtacaatatgtgcacaacgtgcaacaattctcttgctgtccatgcaagtaagtgcaaaaccgggtacgttgtacatg
gi|9 : --AAAAAATC-AATT-AAATACGGCAA-GA---------A--AAATCT-ATGAAAAT--TCA-TTTCA-----------------A---------TGTATAATATTATGGAT-CGACCAATAATTTCTAAAT--A-A-TG-C---T---TAG---TG--T--T--AACCCCGT---------G--C--------AA-GGGATTATCTCCATT--CA-----TTAA-ACCACTTTCTCCAGCCTTTG-GCCACAACAAGTCATTGG---------------T--------------AT---A--C-A--------CACATATATACATA---T-TA-TT-ATACTGTT-A--CA----TTGT-A-AA--TAT-----A-TCAAC-AAA--AAAC--A-ACATA-GT--GGAGA--G----AGACTGTTAGTC-TCC---AT--T-A-AAAAGATAGAGAGA-TAT-GATTATTGCAAGTAC--ATGTGTACCC---AG-A----A------TTA-----CAATAT--TT---G-A--GAA--A-TTGTTGCAC------ATTG-----AGA------C---------A---------------T-TTTCC-----T-AA--A-----TTAG-----------ACAGT-TCT-CCGG-TAAAT----GTAAC-----------G-TTTAAAAAA-AT--TG--G-G-G-TT-------------TTCT-----TCAT-A-TAT------A---TAT---TTTC--AAGT--CAT-A--GTA------A-TGA----TGA-C-A--CT-----TTAAA----A--T---AGATG--ACTCATTCCTTCCTTAT-ATATCATgt
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|23 ): TCCGGAAAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAATAGGTGCACAACGTGCAACAATTCTCTTGCTGTCCATGCAAGTAAG
Unaligned ( gi|30 ): GAATTCCTGAAGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAATAAAGTAACTAATTTTCTATGCACAACAAATTTTTGCTCTTCAATATGAACAATAATTTTGTGCTCGTCAATAAAGACA
Unaligned ( gi|34 ): ACACGTGTACGAGAATTACAATATCAAGAGAATTGTTGCGCATGAACATTTTCCTAAAATGTTCAATGGTATATGTAACGTTTAAAAACATTGG
Unaligned ( gi|44 ): GAGTCCTTGTTAACATGAATAAAATTAAGTGTATCA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11111111 1111 222222222 111111111 33333333333333333333 11111 11111111 1111111 1111 22222 222222 111111111 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000 6666666666666666666666666666666666666666666 55555555555555555555555555555555555555555 11111111 11111111111 111111111111111 111 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 111111 111 2222222222222 2222222222222222
lowQualScore : 3 3 44 2 2 2 2 3 3 3 6666 3 22222222 999 3 3 7 55 3 3 0000 8888 777 33 33 55 888888888 2 2 666 2 4444 22 2 2 2 7777777 444444444 55 7777 2 4 2 55555555555555555555 333 33 55 33 33 2 33 33 2 00000 2 44 3 77777777 555 6666 3 44 555 0000000 3333 11111 7777 55 3 3 7777 3 888 3 999999 111111 11 3 3 0 0 3 333333333 77 2 3 55 3 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222 4 55 999 3 666 77 3333333333333333333333333333333333333333333 2 0 2 2 77777 2 888888 2 33333333333333333333333333333333333333333 555 33 2 77777777 22222222222 444 2 2 99 5555 2 33 111111111111111 77777 3 3 44 3 44 6 3 44 44 6666 44 6 3 555 44 3 3 2 2 0 222 33 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 777777 6666 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 2 0 2 555555 8888 2 2 2 33 555 2 5 2 1111111111111 99999 222 5555555555555555 33 33 2 33 8888888 2 5555 2 2 33 55555 77777777777 1 5 66666 5
lowQualScore : . . .. . . . . . . . .... . ........ ... . . . .. . . .... .... ... .. .. .. ......... . . ... . .... .. . . . ....... ......... .. .... . . . .................... ... .. .. .. .. . .. .. . ..... . .. . ........ ... .... . .. ... ....... .... ..... .... .. . . .... . ... . ...... ...... .. . . . . . ......... .. . . .. . ........................................................ . .. ... . ... .. ........................................... . . . . ..... . ...... . ......................................... ... .. . ........ ........... ... . . .. .... . .. ............... ..... . . .. . .. . . .. .. .... .. . . ... .. . . . . . ... .. ......................................................... ...... .... ....................................................................... . . . ...... .... . . . .. ... . . . ............. ..... ... ................ .. .. . .. ....... . .... . . .. ..... ........... . . ..... .
lowQualScore : 3 3 22 9 7 7 7 1 1 1 5555 1 00000000 222 6 6 3 00 6 3 4444 9999 999 99 77 99 000000000 4 4 555 2 5555 99 1 2 1 6666666 888888888 66 4444 2 7 4 00000000000000000000 999 22 66 22 22 4 44 22 4 66666 5 11 1 77777777 444 5555 1 22 444 0000000 1111 88888 7777 00 6 6 7777 6 333 3 666666 222222 77 1 1 1 8 3 333333333 99 2 3 00 6 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333 3 00 000 6 444 99 3333333333333333333333333333333333333333333 9 1 9 9 11111 9 222222 9 88888888888888888888888888888888888888888 000 77 7 00000000 77777777777 777 7 7 00 7777 7 77 555555555555555 77777 1 1 22 1 22 2 1 22 22 5555 22 2 1 444 22 1 1 7 7 8 000 99 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 777777 1111 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 9 9 9 000000 8888 8 5 7 77 333 7 3 7 0000000000000 33333 999 9999999999999999 44 44 5 44 1111111 5 3333 5 5 44 99999 11111111111 7 3 77777 3
consensus : GTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAAC-AA----A-TTTCTTTCA-----A--TG---TATT-AAG-TGGTT-AAT--AAGT-GA-TA-C-ATATATCAGACGA----TG---T--ACCC--TACATA--AGTCGACTTTT--TTTTTTA-TA-GAGA---A-TTAT----A--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATTTC-ACTA-------TTT--T-A--G-GG--TGG----GG-GG-G-GTGG-TGG-GT------------TA--TTA--TT--AA--T--A-ACC--AAAG--A-A-----ATG-TTTA-CT-T--------AAT---T----CAT-T--TG---ATT-------AATC----AAAT-----A----C--GC-C-TCA----GAA-GCATG--GGGAGGATG-T------ATCA-GGA--AAAAAATC-AATT-AAATACGGCAA-GA---------A--AAATNT-ATAAAAAT--TCA-TTTCA-----------------A---------TG------------GAT-CG---------TTCTAAAT--A-T-TG-C---TA--TAG---T---C--T--A-----GT---------G--T--------CA-AGGATTAT-TCCATT-TCA-----TAAA-GCCATTTTC------CGTTA-GCCACAA----------G---------------C--------------AT---A--T-A--------CA-----------A---T-TA-T--ATA----T-A--CA----TTGT-A-A---TAT-----A-TCAAC-AAA--AA-C--A-ACATA-GT--GGAGA--G----TGA--GT-AGTC-TCC---AT--T-A-CAAAGATAGAGAGA-TAT-GATTATTACA---AT--ATGT-----T---AG-A----A------TTA-----CAATGT--AT---GTAT-GAG--A-TTGTTGCAC------ATTGT----AGA------C---------A---------------CAGTTCT-----C-GG--A-----TT-------------GTATT-TGTAACGC-TAA------GTAATT----AAANAAG-TTTAAAAAC-AT--T---G-G-T-TT-------------TTCT-----TCAT-A-TAT------A---TA----TTTC--AAGT--CAT-A--GTA------T-AGA----TGA-C-A--CT-----TTAGA----A--T---AAATGGAACTCA-TCCTC-----T-ATATCAT
Reference ( family-2690 ) : GTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAAC-AA----A-TTTCTTTCA-----A--TG---TATT-AAG-TGGTT-AAT--AAGT-GA-TA-C-ATATATCAGACGA----TG---T--ACCC--TACATA--AGTCGACTTTT--TTTTTTA-TA-GAGA---A-TTAT----A--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATTTC-ACTA-------TTT--T-A--G-GG--TGG----GG-GG-G-GTGG-TGG-GT------------TA--TTA--TT--AA--T--A-ACC--AAAG--A-A-----ATG-TTTA-CT-T--------AAT---T----CAT-T--TG---ATT-------AATC----AAAT-----A----C--GC-C-TCA----GAA-GCATG--GGGAGGATG-T------ATCA-GGA--AAAAAATC-AATT-AAATACGGCAA-GA---------A--AAATNT-ATAAAAAT--TCA-TTTCA-----------------A---------TG------------GAT-CG---------TTCTAAAT--A-T-TG-C---TA--TAG---T---C--T--A-----GT---------G--T--------CA-AGGATTAT-TCCATT-TCA-----TAAA-GCCATTTTC------CGTTA-GCCACAA----------G---------------C--------------AT---A--T-A--------CA-----------A---T-TA-T--ATA----T-A--CA----TTGT-A-A---TAT-----A-TCAAC-AAA--AA-C--A-ACATA-GT--GGAGA--G----TGA--GT-AGTC-TCC---AT--T-A-CAAAGATAGAGAGA-TAT-GATTATTACA---AT--ATGT-----T---AG-A----A------TTA-----CAATGT--AT---GTAT-GAG--A-TTGTTGCAC------ATTGT----AGA------C---------A---------------CAGTTCT-----C-GG--A-----TT-------------GTATT-TGTAACGC-TAA------GTAATT----AAANAAG-TTTAAAAAC-AT--T---G-G-T-TT-------------TTCT-----TCAT-A-TAT------A---TA----TTTC--AAGT--CAT-A--GTA------T-AGA----TGA-C-A--CT-----TTAGA----A--T---AAATGGAACTCA-TCCTC-----T-ATATCAT
gi|1 : TA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCTCGA-C--AAACAAA----A-TTTCTCT-A-----A--TG---GATT-AAGCTGGTT-AACTAAAGT-GATTA-C-ATATATCAGACGAATGTTG---T--G-CC--TACATA--AGTCGA----T--TTTTTTA-TA-GAGG---A--TAT----AGCAA-TGAT-G-TTCCTC-AATTTC-ACTA-------TTT-------A-GG--CGGTAAAAG-GA-G-GTGT-T---GT------------TG--TTAACTTCAAA--T--A-ATCAGAAAG--ACA-----ATG--TTA-CT-TAATC----AAT---T----AAT-T--TG---ATT-------AATCAAATAAAT-----A----C--GC-C-TTA-----AA-GCATG--GGGAGGTTGTT------ATCA-AGA--AAATAAAC-A--T-AAATACGGCAATGA---------AC-AAATTTAATAAAAAT--TCA-TTTCAAAGGTATAT--------A---------TG------------GGA-CGTCCAAAAAATTCTAAA---A-TATG-C---TA--TAG---T---CTAT--A-----GTGTAAACCCCG--T--------CA-AGGATTAT-TCCA---TCA-----TAAA-GCCATTTTC------CGTTAGGCCACAA----------G---------------CA-------------AT---A--C-A--------CA-----------A---T-TA-T--ATA----T-ACTCA----CTGA-A-A---TAT-----ACTCAAC-AAA--AA-C--A-ACATA-G---GGAGAGTG----TGA--GT-AGTC-TCC---AT--T-A-AAAAGA-AGA-AGG-GAT-GA-TATTACA---AT--ATGT-----T---TGTA----T------TTA-----CA---T--AT---GTAT-GAGGAA-TTGTTGCAC------ATTGT----AGA------CGAT------A---------------CAGTGTT-----C-----------CT-------------GTATTGTGTAACGC-CAA------GTAATT----AAGAAGG-TTTAAAAAC-AT--T---G-G-T-TT-------------TCTC-----TCATAA-TATC-----A---TA----TTTC--AAGT--CATAA--GTC------T-AGA----TGACC-ACTCT-----TTAG-----A--T---AAATGGAACTAACTCCTC-----TAATATCA
gi|10 : -----------------A---------TG------------GAT-TG---------TCC--AAT--AAT-TT-C---TA--AA-------------------------------------------CA-ATGGTTAT-ACCATT-TCA-----TAAA-GCCACTTTC------CGTTA-GCCACAA----------G---------------CTCATATAC------AT---AAAT-A--------CA-----------A---T-TA-TT-ATA----T-A--CA----C------G---TAC-----A-TCAAC-AAA--AA-C--A-ACATA-CT--GGAGA--G----TGA--GT-AGTC-TCC---AT--T-A-CAAAGATAGAGAGA-TAT-GATAATCATA---A----------------------------------------GATGT--AT---G----AAA--A-TTGTTGAAC------ATTTTTCTAAGG----------------A---------------CAGCTCT-------G------------------------GTATC-TGTAACGC-TAA------GTAATT----AAATAAG-TTTATAAGC-AC--T---G-G-G-TTA------------TCCT-----ACAT-A-TATATC---A---TA----TTTC--AAGT--CAT-A--GTATACTATT-AGA----TGG-C-A--AT-----TTAGA----A--T---AAATGGAACTCA-TCCTC-----T-ATATCATatgtagagaatccccggaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacgatctaggtacaaaagatgcacaaacgtgcaacaagtccttgctgcgtctatgcaagtaagtgccaaacccgggacgttgtacatg
gi|11 : atatcaaagtataatC--TTTCC-AAAAAA-CTTG-CCT-GA-C-TAAAC-AA----A-TTTCTTTTA-----A--T----TATT-ACG-TAGTT-AAT--AAGT-GA-TA----TATATCAGACGA-----G---T--ACTC--TGCATATAAGTCGACTTTT------TTA-TA-GAGA---A-TTAT----A--AT-TGAT-GTTTCCTTGAATTTC-TCTG-------TTTAGC-G--G-GG--GGG----GG-GGCG-GGGG-TGG-GG------------TA--TAA--T----G--T--A-ACC--CAAGGTA-AAACATATGTTTTA-CT-TTCAATATCAAT---TTTCGCAT-TTATA---ACT-------CGTC----AAATAAATGA----C--AC-CATCA----GAA-GCATG--CGGTGGATT-TTATGAGATCA-GAAATAGAGAAT---ATTGAAACACGgtaga
gi|12 : ttccttgatcttaaaggcggatccaaaacttgtattaacacttttagacGA----TG---T--ACTC--TACATT--AGTCGACTTTT--T-----G-TA-CAGA---A-TTAT----A--AA-TGAC-TTTTCCTCAAATTTC-ACTG-------TTT--T-A--G-AG--AGG----G----------------GT------------T-----------------------------G--A-A-----ATG-TTTT-CT-T-------------------CAT-T---A---ATC-------AAAC----AAAT-----A----C--GC-C-TCA----GAA-GCATG--GGGA---TG-T------ATCA-G-A--AAAATTTC-AATT-AAATGCGGCAA-GA---------A--AAATTT-ATACAAAT--TCA-TTTCA-----------------AGGTATAATATG------------GAT-CG---------TCC--AAT--AAT-TT-C---TAAATAA---TATAC--T--G-----GT---------G--TAACCCCGTTA-AGGATTAT-TCCATT-TCA-----TAAA-GCCATTTTT------CGTTT-GCCACAA----------GCTCAATGAAAACACAC--------------AT---A--T-A--------CA-----------A---T-TATT--ATA----T-A--CA----TTG
gi|13 : AGAGAGA-TGT-GATTATTACA---AT--A
gi|13 : accgttaatgtcatacacaaA------GTAATT----AAAGACG-TTTTAAAAC-AT--TTTGG-G-T-TT-------------TTCT-----TCAT-A-TATC-----A---TA-----TTC--ATGA--CAT-A--GTG------T-AGA----TGA-C-A--CT-----TTAGA----A--T---AAATGGAACTCA-TCCTT-----T-ATcatgtatacgagnaaagacgatgtgaggaagttggagaggaactgctaaatctagcacaacagtctgtgcaatctgcattacaagaagaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaattaaagacgttttaaaacattttgggtttttcttcatatatcatattcatgacatagtgtagatgacactttagaataaatggaactcatcctttat
gi|14 : accgttaatgtcatacacaaagagagatgtgattattacaatacatgtatacgagnaaagacgatgtgaggaagttggagaggaactgctaaatctagcacaacagtctgtgcaatctgcattacaagaagaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn---A--T-A--------CA-----------A---T-TA-TTAATA----A-A--CA---------A-A---CA----------AAC-AAACAAA-C--GGACATT-GT--GGAGG--G----TGA--GT-GGAC-ACC---AA--T-G-CACAGTTTGAAA-----T-AA-----ACA---A---AT-T-----G---AG-A----A------TTT-----C------------GTA-----------GTTGCAT------ATTGT----AGAAATTTCC---------AAAATTAAA-------CAGTTC---------G--T-----TA-------------GTATT-TTTGACAT-TGA------GTAATT----CAATCAG-TTTAAAAAC--T--C---A-A-T-GT-------------TTGT-----ATAG-A-TAC------AATTTG----TCTC--AAGT--CAT-C--GTA------T-AGAAAAGTGA-A-A--CT-----TTAGA----
gi|15 : cctaagtctcattggacgtacataaGTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAAC-AA----A-TTTCTTTCA-----A--TG---TATT-AAG-TGGTT-AAT--A-----------------TCAGATGA----TG---T--ACCC--TACATA--AGTCGAATTTT--T-----A-TA-GA-----A-TTAT----A--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATTTC-ACTA-------TTT--T-A--G-GG--TGG-------------TGG-TGGTGT------------TA--TTA--TT--AA--T--A-ACC--AAAG--A-A-----ATG-TTTA-CT-T--------AAT---T----CAT-T--TG---ATT-------AATCAAATAAAT-----A----C--GC-C-TCA----GAA-GCATG--GGGAGGATG-T------ATCA-G----AAAAAATCAAATT-AAATACGGCAA-GA---------A--AAATGT-ATAAAtgaagtgcaccatttttt
gi|16 : TTTTTA-TATGAGA---AATTAT----A--AA-TGAT-GTTTCCTCCAACTTC-ACTA-------TTT-------A-GG--TGG----GG-GG-G---GG-T---CT------------TA--TTA--TT--AA--T--A-A-C--AAAG--A-A-----ATG--TTA-CT-T--------AACTGAT----TAT-T--TG---ATTTTAATCAAATT----AAAT-----A----C--GC-C-TCA----GAAGGCATGT-TGGAGGATG-T------ATTA--GA--AAAATTTC-AATT--AATACGGCAA-GA---------A--AGCTGT-ATAAAA----TCA-TTTCAAGGTATATAATCATTATA---------TG------------GAT-CGTCCAAAAT-TTCGAAAT--A-T-TG-C---TA--T
gi|17 : ----TG---T--ATCC--TACATA--AGTCGA----T--TTTTTTA-TA-TA-A---A-TTAT----A--AA-TGAT-GTTTCTTCAAATTTC-ACCA-------TTT--T-A--G-GGG-TGG----GT-GGTG-GTGG-TGG-------------------------T--A---T--A-AGC--AAAG--A-A-----ATG-TTTA-TT-T--------AAT---T----CAT-T--TG---ATT-------AATC----AAATAAAT-A----C--GC-C-TCA----GAA-GCATA--GGGAGGATG-T------ATCA-GAA--AAAAAA---AA-----------CAA-CA---------ATTAAATGT-GTAAAAAT--TCA-TTTCA-----------------A---------tgg
gi|17 : -----GT---------G--T---------A-AAAATT-----CATT-TCAAGGTATAAA-GCTATTTTC------CGTTA-GCCACAA----------G---------------C--------------Aggtataaagctattttccgttagccacaagca
gi|18 : tgtatcctacataagtcgatttttttatataaattataaatgatgtttcttcaaatttcaccattttaggggtgggtggtggtggtggtataagcaaagaaatgtttatttaattcatttgattaatcaaataaatacgcctcagaagcatagggaggatgtatcagaaaaaaaaaacaacaattaaatGTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAAC-AA----A-TTTCTTTCA-----C--TG---TATT-ACG-TGGTT-AAT--AAGT-AA-T----ATATATCAGACGA----TGTACT--ACTC--TACATA--AGTCGAC-------CTTTTA-TA-GAGA---A-TTAT----A--AA-TGAC-GTTT-CTCAAATTTC-TCTG-------TTT--A-A--G-GG--GGG----GG-GG-G-G----------------------TA--TTA--TT--AATTT--A-ACC--AAAG--A-A-----ATG-TTAT-CT-T--------AAT---T----CAT-T--TG---ATT-------AAGC----AAA
gi|19 : caaGTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTGGCCT-GA-C-TAAAC-AA----ACTTTCTTTC------A--TG---TATTAAAG-TGGTT-AAT--AAGT-GA-TA-C---ATATTAGACGA----TG---T--A--T--TA-ATA--AGTCGA----T--TTTTTTA-TA-GAGA---A--TAT----A--AATTCATGGTTTCCTCACATTTC-ACTA-------TTT--T-AAGG-GG--TGG----GGTGG-G-GTGG-GGGTGT------------TT--TTA--TTA-AA--T--A-ACC--AAAG--A-A-----ATG-T
gi|2 : caaGTACA-TAGC--TTTCC-AAAAAGGCTTG-CCT-GAAC-TAAAC-AA----A-TT-CTTTCA-----AAATGA--TATT-AAG-TGGTTTAAT--AAGTTGA-TA-CGATATATCAGACGA----TGC--T--ATCCCGTACATA--AGTCG--------TTTTTTA-TA-GAGAT--A-TTA-----A--AA-TGAT---TTCCTCAAATTTC-A-TA-------TTT--T-A--G-GGGGTGG----GG-TG-GCGTGGGTGG-GTGGTTTGGTGGTGTA--TTA--TG--AA--T--ATACC--AAAG--A-A-----ATG-TTTATCT-T--------AA----T----CAT-T--TG---A-T-------AATC----AA
gi|2 : acaaA--TAA---T---C--A--A-----G----------A--T--------CAGACGATTAT-TCCATTCTCA-----TAAAAGCCATTTTC------CGTTA-GCCACAA----------G---------------C--------------AT---A--TAA--------CA-----------G---TCTA-T--ATT----TAA--CA----TTGTAA-A---TAT-----A-TCAACAAAA--AA-CAAA-ACATAGGT--GGAGA--G----CGA--GT-AGTC-TCC---AT--TAA-CAAAGATGTAGCGA-TATGGATTA-TA-A---AT--ATGT-----T---AG-A----A------TTA-----CA------AT---GTAT-GAGA-A-TTGTTGCAC------ATTGT----AGA------C---------A---------------CAGTTCT-----CAAG--A-----TT-------------GTATT-TGTAACGC-CAGAT----GTAATT----AAAGAAG-TTTAGAAAC-AT--TG--G-G-TGTT-------------TTCT-----TCAT-A-TATATCATAA---TA----TTTT--AAGT--CAT-A--GTC------T-AGA----TGA-C-A--C--------GGA----AACT---AAATgatcagacgattattccattctcataaaagccattttccgttagccacaagcatataacagtctatatttaacattgtaaatatatcaacaaaaaacaaaacataggtggagagcgagtagtctccattaacaaagatgtagcgatatggattataaatatgttagaattacaatgtatgagaattgttgcacattgtagacacagttctcaagattgtatttgtaacgccagatgtaattaaagaagtttagaaacattgggtgttttcttcatatatatcataatattttaagtcatagtctagatgacacggaaactaaatcctcatagtatcgtgtagattccccggaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaataggtgcacaacggtgcaatcaattctctgttgctgtccatcgccaagtaagtgcaaaccgggtacgtcttgtacatg
gi|20 : acaagtacatagctttccaaaaaggcttgcctgaactaaacaaattctttcaaaatgatattaagtggtttaataagttgatacgatatatcagacgatgctatcccgtacataagtcgttttttatagagatattaaaatgatttcctcaaatttcatattttagggggtggggtggcgtgggtgggtggtttggtggtgtattatgaatataccaaagaaatgtttatcttaatcatttg-TTGTTGCAC------ATTAT----AGA------TTTT------A---------------CTGATAT-----T-AG--ACATTCTT-------------GTATT-TGTA-CGC-TAA------GTAATTTA--AAATAAG-ATTCAAA-C-AT--T---G-GGT-TT-------------TTCTATGAATCAT-AATAT------A---CC----TTTC--AAGT--TGT-------------T-AGG-----GA-CGA--CT-----TTAGA----A--TTATAAATGGAACTCA-TCCTC-----T-ATATcctcatagtatcgtgtagattccccggaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaataggtgcacaacggtgcaatcaattctctgttgctgtccatcgccaagtaagtgcaaaccgggtacgtcttgtacatg
gi|21 : tcatgttatgagattttccttaatt--T-A--------CA-----------A---T-TA-T---------T-A---A----TT---A-A---TA----------AAC-AAA--CA-C--G-GCACT-GT--GGAGA--G----TGG--GT-AGACATCA---ATGCT-A-CACTAATACACACT-TA---ATTATCGCACC-GT--ATG----------AT-A----A------TT--------TTGT--AG---AT-T-TAA--T-TTGTTGCAT------ATTGC----AAA------
gi|22 : agccacagtctcattggatgtacaaaagTAT-GAG--AATTGTTGCAC------ATTGT----AGA------C---------ATTTTCCTCAATTAGACAGTTCT-----C-GG-----------------------GTATT-TGTAACGC-GAA------GTAATT----AAAGAAG-TTTAAAAGCAAT--A---G-G-T-TT-------------TTCT-----TCAT-A-TAT----------TA----TTTA--AAAT--CAT-A--GTA------T-AGA----TGA-C-A--CC-----TTAGA----------------------A-TCCTC-----T-ATATCATattaaacaattcggtagattttt
gi|24 : aG-GG-G-GTA-------T------------TT--TTA--TT--AA--TTTA-ACC--AAAG--A-A-----ATA-CTTT-CT-T--------ATT---T----CAT-T--TATCAATT-------AAAT----AAAT-----A----C--GC-C-TCATGCAGAA-GCATG--CGGGGGATA-T------ATCA-G-A--ACAATTTC-AATT-AAATGCAGCAA-AATACACATATA--AAATAT-ATAAAAAT--TCA-TTTCA-----------------A---------gtagatt
gi|25 : AGTTCT-----CTGG--A----------------------ATT-TGTAACAC-TAA------GTAATT----TAATAAG-TTAAAAAAT-GC--TA--G-G-T-TTCACATAATAAAATTTCT-----TAAT-A-TAT------C---TT----TTTCTCAAGT--TAC-A--ATA------T-TGG----GGA-C-A--CC-----TTAGA----A--A---AAATGTAACTGA-TCCTC-----T-ATATCAggta
gi|26 : tttcttaaattaggtAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAAC-AA----A-TTTCTTTCA-----A--TG---TATT-AAG-TGGTT-AAT--AAGT-GA-TA-C-ATATATCAGACGA----TG---T--ACCA--TACACA--AGTCGA--------TTTTTA-TA-CAGA---A-TTAT----A--AA-TGAT-GTTTCCTTAAATTTC-A
gi|27 : -AAAAAA-CTTG-CCA-GA-C-TAAGC-AC----A-TATCTTTCACTCGTA--TG---TAAT-AGA-TACTA-AAT--GAGT-GA-TG-C-TTA-ATCAGAAGA----TG------ACCT--T-CGTA-----CCAGTTTTACGTTTTTATTA-AATAACGA-TTAT----A--AA-
gi|28 : a---AG-A----A------TTA-----CAATGT--AT---G-AT-AAA-----TGTTGCAC------ATAGT----AGA------A---------A---------------TTTTCCTAAATGC-GGGCA-----TTTCTCTG-------GTATT-TGTAGCGT-TAAGTACATGTAATT----AAATAAG-TTg
gi|29 : caattacgtgtacacgCTC--TACATA--AGTCGACTTTT-------TA-TA-GAGG---A-TTAT----A--AA-TGAT-GTCTCCTCAAATTTC-ACTAGGTTTTTTTT--T----------TGG----GG-GG-G-GGGG-T---AT------------CAATTTA--TT--AA--T--A-ACC--AAGG--A-A-----ATG-TTTT-CT-T--------
gi|3 : --GGGAGGATG-T------ATCA-C-A--AAAAAATC-AATT-AAATACGACAA-GA---------A--AAATGT-ATAAAAAT--TCA-TTTCA-----------------AGGTATAACATG------------AAT------------TTCTAAAT--A-T-TG-C---TA--TAG---T---C--T--A-----GT---------G--TAACTCCGTCA-AGGATTAT-TCCATT-TCA-----TAAA-GCCATTTTC------CGTTA-GCCACAA----------G---------------C--------------AT---A--T-ATA------CA-----------A---T-TA-T--ATA----T-A--CA----TCGTCA-A---TAT-----A-TCAAC-AAA--AA-C--A-ACATA-GT--GGAAA--G----TGA--GT-AGTC-TCT---AT--T-A-CAAAGATAGGGGGA-TAT-GATTATTAAA---AT--ATGT-----T---AG-A----A------TTA-----CAATGT--AT---G
gi|3 : ATA--AGTCGA-------TTTTTTA-TA-GATA---A-TTAT----A--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATTTC-ACTA-------TTT--TCG--G-GG--TGG----TG-GT-G-GTGG-T---GT------------TA--TTA--TT--AA--T--A-ACC--AAAN--N-NC----ATG-Tagaattgnaataagtcgattttttatagataattataaatgatgtttcctcaaatttcactattttcggggtggtggtggtggtgttattattaataaccaaannncatgtatttcaagtcagtctagatgacactttagaataaatggaactaatcctctataccatgtagattccccggaaatggtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtatctaggtacaataggtgcacaacgtgcaacaattctcttgctgtccgtgcaagtaagtgcaaacccgggtacgttgtacatg
gi|3 : gggaggatgtatcacaaaaaaatcaattaaatacgacaagaaaaatgtataaaaattcatttcaaggtataacatgaatttctaaatattgctatagtctagtgtaactccgtcaaggattattccatttcataaagccattttccgttagccacaagcatatatacaattatatatacatcgtcaatatatcaacaaaaacaacatagtggaaagtgagtagtctctattacaaagatagggggatatgattattaaaatatgttagaattacaatgtatgagaattgnaAT------G---TA----TTTC--AAGT--CA-----GTC------T-AGA----TGA-C-A--CT-----TTAGA----A--T---AAATGGAACTAA-TCCTC-----T-ATACCATatttcaagtcagtctagatgacactttagaataaatggaactaatcctctataccatgtagattccccggaaatggtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtatctaggtacaataggtgcacaacgtgcaacaattctcttgctgtccgtgcaagtaagtgcaaacccgggtacgttgtacatg
gi|31 : gggaggatgtatcacaaaaaaatcaattaaatacgacaagaaaaatgtataaaaattcatttcaaggtataacatgaatttctaaatattgctatagtctagtgtaactccgtcaaggattattccatttcataaagccattttccgttagccacaagcatatatacaattatatatacatcgtcaatatatcaacaaaaacaacatagtggaaagtgagtagtctctattacaaagatagggggatatgattattaaaatatgttagaattacaatgtatgagaattgnaataagtcgattttttatagataattataaatgatgtttcctcaaatttcactattttcggggtggtggtggtggtgttattattaataaccaaannncCAA----------G---------------CTG------------ATTGGA--T-A--------CA-----------------CA-T--ATA----T-A--CAATTGTTGT-A-AATATATCAACAA-TCAAC-AAA--AG-C--A-ACATA-GT--GGACA--G----TGA--GT-AGTC-TCC---AT--T-A-CAA--------AGA-TGT-GATTATTACA---Agtagattccccggaaatggtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtatctaggtacaataggtgcacaacgtgcaacaattctcttgctgtccgtgcaagtaagtgcaaacccgggtacgttgtacatg
gi|32 : AGTT----AAATAAG-ATTAAAA-C-GT--T---G-GGT-TT-------------TTCT-----TCAT-A-TAT------A---T-----TTTC--AAGTTATAT-A--GTA------T-GGA----GGA-C-A--CA-----TTAGAATTTA--T---AAATGGAACTCA-TCCTC-----T-
gi|33 : --AGTCGACTTTT--T-----A-TA-AAGA---A-TTATTTATA--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATT-C-ACTG-------TTT--T-A--G-GG---GG----GG-GG-G-GTGT-TG---T------------TA--TTA--TT--AA--T--A-ACC--AAAG--A-A-----AT
gi|35 : cTA-A-TAGC--TTTCC-AAAA-G-CTTT-CCT-GA-C-TAAA--AA----A-TTC--TTCA--------TG---TA---AAG-TG-TT-AAT--AAGT-GA-TA-C-ATATATC-GACGA----TG---T--ACCC--TAC
gi|36 : ---------G--T--------CA-AGGATTAT-TCCATT-TCA-----TAAA-GCCATTTTC------CGTTT-GCCACAA----------G---------------C--------------
gi|37 : gcgagtgtaacccc-TTAT----A--AA-TTAT-GTTTCCTCAAATTTC-ACTA-------T---------G-GA--T-------G-GG-G-GTGG-TG--------------------TTA--TT--AA-----A-ACC--AAAG--A-A-----ATG-TTTtcaatggata
gi|38 : AAGATAGAGGGA-TAT-GAT-ATTACA---AT--ATGT-----T---AG-T----A------TTA-----CA------AT---GTAT-GAGA-A-TTGTTGCAC------ATTG
gi|39 : GTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAAC-AA----A-TTTCTTTCA-----A--TG---TAT
gi|4 : caaA-TATC-ATGTATCACACGAA---TG---T--ACTC--TACATTT-AGGCGACTTTT--T-----A-TA-AAGA---T-TTAT----A--AA-TGAT-TCTTCCTCAAA---C-ACAC-------TTT--T-A-----G--T-------G-GG-G-GT-------GT------------TA--TTA--TT--AA--T--A-ACC--AAAG--A-AG----AAA-TTTT-CT-----------AT---T----CAT-T--TG---ATA-------AATC----AAATAA---A----C--GC-C-CCA----GAA-GCATG------GGATG-T------ATCA--GA--AAAATTTC-AATT-AAAT-C-GCAA-GA---------A--AAA----A-AAAAAGGATCG-TTCCA-----------------A---------T-------------AAT------------TTCTAAAT--A-A-TG-C---TAG-TGGAAAC---C--C--C-----GTTAC------G--T--------CA-A-GATTGT-TCCATT-TCA-----TAAA-GCCATTTTC------GA--A-ACCACAA----------G---------------CTCAACGGATACACAAT---A--T-A--------CA-----------A---T-TA-T--ATA----T-A--CA----TTGT-A-A---AAT-----A-TCAAC-AAA--AA-C--ATAAATG-GA--AGGGA--C----TGT--AT-AGTC-TCC---AT--T-A-CAAAGATGAGGAGATTAT-GA-TATTACA---AT--ACATG----T---AG-A----ACAGAATTTA-----CAATGT--------TAT-GAGAAA-CTGT--CAC------ATT-T----AGAATTTT-CCTAAATTAGA---------------CAGTTCT-----C-TG-----------------------GTATT-TGT-ACGT-TAA------GTAATT----AA--AAG-TTTAAAAAA-AT--T---G-G-C-GT-------------TTTC-----TCAT-A-TATC-----A---T-----TTTC--AAGT--CAT-A--GTA------TAAGA----TGA-C-A--CT-----TTAGA----A--T---AAAT-GAACCAA-TCCTT-----TCATATCATa
gi|40 : caagtaatagctttccaaaatttgtaataccgatt----A--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATTTT-ACTG-------TTT--T----------T------GG-GG-G-GTG---GG-GT------------TA--TTA--CT--AA--T--A-gttagatat
gi|41 : -AGGATTAT-TCCGTT-TC--------AA-GC------T------CATTG-G--ATAA----------A---------------CAT------------AT---A--T-A--------CG-----------A---T-TA-T---------T-A--CA----T
gi|42 : GTA-A-CATC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-A-TAATC-GA----A-TTTCTTg
gi|43 : ttaT-----TTCGA----A--T---AAATGGAACTCA-TCCTC-----T-ATACCATat
gi|45 : A-TG-GAGA---A-TTAT----A--AA-TGAC-GTTTCCTCAAATTTT-Agtaaattcc
gi|46 : GTA-A-TAGC--TTTCCAAAAAAG-CTTG-CCT-
gi|47 : catgacaaGTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTA-CCT-G
gi|5 : acaaGTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAAC-AA----A-TTTCTTTCA-----A--TG---TATT-AAG-TGGTT-AAT--AAGT-GA-TA-C-ATATATCAGACGA----TG---T--ACCC--TACATA--AGTCGATTTTT--TTTTTTA-TA-GAGA---A-TTAT----A--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATTTC-ACTA-------TTT--T-A--GTGG--TGGT---GG-TG-G-GTGG-TGG-GT------------TA--TTA--TT--AA--T--A-ACC--AAAG--A-A-----ATG-TTTA-CT-T--------AAT---T----CAT-T--TG---ATT-------AATC----AAAT-----A----C--GC-C-TCA----GAA-GCATG--GGGAGGATG-T------ATCAGGGA--AAAAAATC-AATT-AAATACGGCAA-GA---------A--AAATGT-ATAAAAAT----A-T---------------------A---------TG------------GAT-CA---------TTCTAAAT--A-T-TG-C---TA--TAG---T---C--T--A-----GT---------G--T--------CA-AGGATTAT----------A-----TAAG---CATTTTC------CGTAA-GCCACAC----------G---------------C--------------AT---A--T-A--------CA-----------A---T-TA-T--ATA----T-A--CA----TTGT-A-A---TAT-----A-TCAAC--AA--AA-C--A-ACATA-GT--GGAGA--G----TGA--GT-ACTC-TCC---AT--T-A-CAAAGATAGAGAGA-TAT-TATTATTACA---AT--ATGT-----T----G-A----A------TTA-----CAATGTACAT---GTAT-GAG--A-TTGTTGCAC------ATTGT----AGA------C---------A---------------CAGTTCT-----CAGG--A-----TT-------------GTATT-TGTAACGC-CAA------GTAATT----AAAGAAG-TATAGAAAC-AT--T---G-G-T-TT-------------TTCT-----TCAT-A-TAT------A---TA----TTTC--AAGT--CAT-A--GTC------T-AGA----TGA-C-A-----------------------------GAAACTAA-TCCTC-----T-ATATCAT
gi|6 : GTA-AGTGGCGGTTTCC-AAA--G-CTTG-C----A-CATAAAC-AAGGGGA-TTTCTTTCA-----C--TGAGATGTT-AAC-TGTTTCAAT---AGT-GA-TG---ATAT-TTAGA-AA----TG---TTCACTC--TACAT---AGTCGACTTT
gi|6 : aaTTTCCTCAAATTTCAACTG-------TTT--T-T--A-AG--TGG----GG-cctcaaatttcaactgtttttaagtggggaatgcttattctgattgatattgattaatgcaatacatgcgctcagaagcattacgggaggatgtatcaagtaaatttaatgttaaaatctttaaaaaatcagtttcaaagtatcgataatggattgtcaattttctgaaatccttcaaggattattcgtttcaagctcattggataacatataatacgaattaattatataacgtatatacaaaaacagcatagtttgaagagtgcgttagtctcagaaattaacaaagatagagagttaattattacacaatataatacactacactagagactaatctatttaatatagacattttcctaaattagacagttctttgtatttgttaccttaagtaattaataagattagaacattgtggttttgttctgtcattatatatcattttcaagatatatggtatagaggaccctttagaaatcatcctctatat
gi|6 : aagtaagtggcggtttccaaagcttgcacataaacaaggggatttctttcactgagatgttaactgtttcaatagtgatgatatttagaaatgttcactctacatagtcgacG--G-A-----ATG-CTTA-TTCT--------GAT---T----GATAT--TG---ATT-------AATG----CAAT-----A----CATGCGC-TCA----GAA-GCATTACGGGAGGATG-T------ATCA-AG---------TA-AATT-TAATGTT----------------A--AAATCT-TTAAAAAA--TCAGTTTCA-----------------A---------AG------------TAT-CG---------AT---AATGGA-T-TGTC---AA--TTT---T---C--TGAA-----AT---------CCTT--------CA-AGGATTAT-TC-GTT-TCA--------A-GCT------------CATTG-G--ATAA--------------------------C--------------AT---A--T-AATACGAATTA-----------A---T-TA-T--ATA------A--CG----T-----------AT-----A-T--AC-AAA--AA-C--A-GCATA-GTTTGAAGA--G----TGC--GTTAGTC-TCAGAAAT--T-AACAAAGATAGAGAGT-TA---ATTATTACACA-AT--ATAA-----T---AC-ACTACA------CTAGAGACTAATCT--ATTTAATATAGAC--A-TTTTCCTAA------ATT------AGA------C---------A-----------------GTTCT-----------------TT-------------GTATT-TGTTACCT-TAA------GTAATT-----AATAAG-ATT-AGAAC-ATTGT---G-G-T-TTTG-----------TTCTG----TCAT---TAT------A---TATCATTTTC--AAGA--TAT-ATGGTA------T-AGA----GGA-C-C--CT-----TTAGA----A------A--------TCA-TCCTC-----T-ATATaatgcttattctgattgatattgattaatgcaatacatgcgctcagaagcattacgggaggatgtatcaagtaaatttaatgttaaaatctttaaaaaatcagtttcaaagtatcgataatggattgtcaattttctgaaatccttcaaggattattcgtttcaagctcattggataacatataatacgaattaattatataacgtatatacaaaaacagcatagtttgaagagtgcgttagtctcagaaattaacaaagatagagagttaattattacacaatataatacactacactagagactaatctatttaatatagacattttcctaaattagacagttctttgtatttgttaccttaagtaattaataagattagaacattgtggttttgttctgtcattatatatcattttcaagatatatggtatagaggaccctttagaaatcatcctctatat
gi|7 : aagtaagtggcggtttccaaagcttgcacataaacaaggggatttctttcactgagatgttaactgtttcaatagtgatgatatttagaaatgttcactctacatagtcgactttcctcaaatttcaactgtttttaagtgg---------TTCTAAAT--A-T-TG-C---TA--TAG---T---C--T--A-----GT---------G--TAACCCCGTCA-ATGATTAT-TCCATT-TCA-----TAAA-GCCATTTTC------CGTTA-GCCACAA----------G---------------C--------------AT---A--T-ATA------CA-----------A---T-TA-T--ATA----T-A--CA----TTGT-ACA---TAT-----A-CCAAC-AAA--AA-C--A-ACATA-GT--GGAGA--G----TGA--GT-AGTC-TCC---AT--T-A-CAAAGATAGAGGGA-TAT-GATTATTACA---AT--ATGT-----T---AG-A----A------TTA-----CA------AT---GTAT-GAGA-A-TCATTGCACATACCAATTGT----AGA------C---------A---------------CAGTTCT-----C-----------TT-------------GTATT-GGTAACGC-CAA------GTAATT----AAAGAAG-TTTAAAAAC-AT--TG--G-G-T-TT-------------TTCT-----TCAT-A-TATC-----A---TA----TTTC--AAGT--CAT-A--GTC------T-AAA----TGA-C-A--CT-----TTAGA----A--T---AAATGGAACTAA-TCCTC-----T-ATATCAT
gi|8 : aaaaatT---T----CAT-T--TA---ATT-------AATC----AAAT-----AGATAC--CC-C-TCA----GAA-GCATG--GG----------------------A--GAAAAATT---TC-AAA-ACTGCAA-GA---------A--AAATCT-ACAAAAAT--TCA-TTTCA-----------------A---------CGTCC---------AATACT---------TTCTAAAT--A-A-TG-CGAGTA--TAA---C---C--C---------C---------G--T--------CA-AGGATTAT-TCTATT-TCA-----TAAA--CCATTTTT------CGTAA-ACCACAA----------G---------------CTCA-----------AT---G--G-A--------TA-----------ATTGT-TA-T--ATA----T-A--CA----TTGTAA-A---TAT-----A-TCAAG-AAA--AA-C--A-ATATA-GT--TGAGA--GGAACTGT--AT-AGTC-TCC---AT--T-A-CAAAGAT-GAGAGA-TAT-GATTATTACA---ATACATGTA----TACGAA-A----A------TCA-----CAATGT--AT---G--C-GA---A-TTGTTGCAC------ATTGT----AGA------C---------A----------------ATTTCC-----T-AA--A-----TTAGACACGTCTCTGGTATT-TGTAACTCTTAA------GTAATTTTAAAAAGAAGTTTTAAAAAC-AT--T---ATG-T-TT-------------TTCT-----TCAT---TATC-----A---TA----TTTC--AAGT--CAT-A--GTA------T-AGA----TGA-C-A--CTTTAAATTAGA----A--T---AAATGGAACTCA-TCCTC-----T-ATATCATgtagattccccggaaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacatgtatccaggtacaatatgtgcacaacgtgcaacaattctcttgctgtccatgcaagtaagtgcaaaaccgggtacgttgtacatg
gi|9 : --AAAAAATC-AATT-AAATACGGCAA-GA---------A--AAATCT-ATGAAAAT--TCA-TTTCA-----------------A---------TGTATAATATTATGGAT-CGACCAATAATTTCTAAAT--A-A-TG-C---T---TAG---TG--T--T--AACCCCGT---------G--C--------AA-GGGATTATCTCCATT--CA-----TTAA-ACCACTTTCTCCAGCCTTTG-GCCACAACAAGTCATTGG---------------T--------------AT---A--C-A--------CACATATATACATA---T-TA-TT-ATACTGTT-A--CA----TTGT-A-AA--TAT-----A-TCAAC-AAA--AAAC--A-ACATA-GT--GGAGA--G----AGACTGTTAGTC-TCC---AT--T-A-AAAAGATAGAGAGA-TAT-GATTATTGCAAGTAC--ATGTGTACCC---AG-A----A------TTA-----CAATAT--TT---G-A--GAA--A-TTGTTGCAC------ATTG-----AGA------C---------A---------------T-TTTCC-----T-AA--A-----TTAG-----------ACAGT-TCT-CCGG-TAAAT----GTAAC-----------G-TTTAAAAAA-AT--TG--G-G-G-TT-------------TTCT-----TCAT-A-TAT------A---TAT---TTTC--AAGT--CAT-A--GTA------A-TGA----TGA-C-A--CT-----TTAAA----A--T---AGATG--ACTCATTCCTTCCTTAT-ATATCATgt
blockSeqs : C G GG A G G . A A . GGGG C CTCGTA AGA A . T . T . CGA A TAC TC CG TA GTTTTACGT T T ACG A TTAT . T G A GGTTTTT AGCGG GG T T C C GGTGGGTGGTTTGGTGGTG AAT . A TT TT T . GT . AACAT T AT C TCAATATC TGA TTCG A TA TCA TTAATCA AAAT AAATG GATA AT G A TGCA G ACG . TATGAG GAAAT AA A G . TACACATAT TT T . GA G AGGTATATAATCATTATATGGATCGTCCAAAAT G GG AT T GAG AA ATATACTGGTGTAACCCCGT G C C AGGTA A TCCAGC . GCTCAATGAAAACACAC TGG AA A ATACGAAT CATATATACAT TTG C T TA CTGT A . ATTGTTGTAAATA CAACA . A CA A AA G G TT . GAAC CT T A GAA GC A A T G AGT AC TACACTACACTAGAGACTAATCTATTTAATATAGACA ATACCA TCTA AATTTTCCTAAATGCGGGCATTTCTCTG . T GTACAT TTAA T T A TG TTG T G G CACATAATAAAAT ATGAA AA ATCATAATA TC TA . TG ATACTAT A AAAG . G . TTAAA ATTTAT C T CCTTA C
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . AAA A . . C . . . TCA . C . . T TTTTTTT . . T . . . . . . . TAAGG G . . T . GTGGTGT A . . . . . . . . C . A . . . . . . . . . AAAT . . . . . . TT . . GGGA TT . . . . . G . . . ATGTATAATATTATGGATCGACCAATAAT T . AT . . G GTCTAGTGTAACTCCGT . . . . . . . GCTCAACGGATACACA . . . TA . . . . T . . . TTGTAAA . . . . . . T . . . . . T . . . . . . . CC . GTAGAACAGAATTTACAATGTTATGAGAAA . . CATTTTCCTCAATTAGACAGTTCTCGG . . AT TA G . . . G . G . TG G A ATATCAT . . . . G . . . . . . ATTAT C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . CA . . . . . CTTTTT . . . . . . . . . . TCGG . . . . . GGGGTGT A . . . . . . . . G . T . . . . . . . . . AA . . . . . . C . . GAA AA . . . . . G . . . AGGTATAATATGGATCG T . T . . . GTCTAGTGTAACCCCGT . . . . . . . CAAGTCATTGGT . . . TA . . . . T . . . TCGTCAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CA . GTACCCAGAATTACAATATTTGAGAAA . . CAATTTCCTAAATTAGACACGTCTCTG . . AT . T . . . A . . . A . A ATCATA . . . . A . . . . . . AACT C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . CT . . . . . ATTTTT . . . . . . . . . . TAGT . . . . . GTGGGG A . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . G . . GA TT . . . . . G . . . AGGTATAACATGAAT T . T . . . GAAACCCCGTTACGT . . . . . . . GCTCATATAC . . . . . . . . . . . . TTGTACA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TGAATTACAATGTACATGTATGAGA . . AATTTCCAAAATTAAACAGTTCGTTA . . . . G . . . G . . . . . A AATTTG . . . . C . . . . . . AT G . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . CA . . . . . CTTTTT . . . . . . . . . . TAG . . . . . GTGGGT A . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . G . . GA AA . . . . . A . . . ACGTCCAATACT T . A . . . GTGTTAACCCCGTGC . . . . . . . GCTCA . . . . . . . . . . . . TTGTAAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATACGAAAATCACAATGTATGCGAA . . ATTTTCCTAAATTAGACAGTTCTCTG . . . . T . . . G . . . . . A CATA . . . . A . . . . . . AT A . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . CA . . . . . CTTTTT . . . . . . . . . . TAG . . . . . GTCT T . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . G . . GA TT . . . . . G . . . ATGGATTG T . T . . . TTCTGAAATCCTT . . . . . . . GCTG . . . . . . . . . . . . TTGTAAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TAGAATTACAATGTATGAGAA . . TTTTACTGATATTAGACATTCTT . . . . G . . . . . . . . . A CATA . . . . A . . . . . . AA C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . A . . . . . CTTTT . . . . . . . . . . TAG . . . . . GTGG A . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . C . . CA AA . . . . . G . . . ATGGATCA T . T . . . GTCTAGTGT . . . . . . . ACAT . . . . . . . . . . . . TTGTAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TAGTATTACAATGTATGAGAA . . CACAGTTCTCAAGATT . . . . T . . . . . . . . . A CATA . . . . C . . . . . . AT A . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . C . . . . . CTTTT . . . . . . . . . . AAG . . . . . GTAT T . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . G . . GA TT . . . . . C . . . AAGTATCG . . T . . . ATCAAGAT . . . . . . . GC . . . . . . . . . . . . TTGTAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TAGAATTACAATGTATGAGAA . . CACAGTTCTCAGGATT . . . . T . . . . . . . . . A ATAT . . . . A . . . . . . AT C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . A . . . . . TTT . . . . . . . . . . TAG . . . . . GTGT A . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . G . . AG AA . . . . . C . . . ATAAT . . A . . . ACCCCGT . . . . . . . GC . . . . . . . . . . . . TTAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATAATTTTGTAGATTTAAT . . CATTTTCCTAAATTAG . . . . T . . . . . . . . . A ACC . . . . A . . . . . . AT A . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . TTT . . . . . . . . . . TAG . . . . . TTGT A . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . G . . G AA . . . . . C . . . . . A . . . . . . . . . . . GC . . . . . . . . . . . . CG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GATGTATGAAAA . . CACAGTTCTCTT . . . . G . . . . . . . . . A CTT . . . . C . . . . . . AT C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CC . . . . . . . . . . TTA . . . . . GGGT A . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . A AA . . . . . . . . . . . . . . . GC . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GAGAATTTCGTA . . ACAGCTCTG . . . . T . . . . . . . . . A GTA . . . . A . . . . . . AT A . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . TA . . . . . GTG A . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GC . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CAGTTCTTT . . . . G . . . . . . . . . A CAT . . . . C . . . . . . AT C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . A . . . . . GT A . . . . . . . . . . . . . . . . . GC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . ATA . . . . A . . . . . . A C . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . . . . . . T . . . . . GT . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TA . . . . A . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . G . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqCons : ** **** CTTTTT*** ** TAG****** **** ** ** ** ******** **** GA**** ** T** GTCTAGTAACCCCGT**************************** GC*************************************** ** TTGTAAA******** ** A** ATA************* **
originalCons : GTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAAC-AA----A-TTTCTTTCA-----A--TG---TATT-AAG-TGGTT-AAT--AAGT-GA-TA-C-ATATATCAGACGA----TG---T--ACCC--TACATA--AGTCGACTTTT--TTTTTTA-TA-GAGA---A-TTAT----A--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATTTC-ACTA-------TTT--T-A--G-GG--TGG----GG-GG-G-GTGG-TGG-GT------------TA--TTA--TT--AA--T--A-ACC--AAAG--A-A-----ATG-TTTA-CT-T--------AAT---T----CAT-T--TG---ATT-------AATC----AAAT-----A----C--GC-C-TCA----GAA-GCATG--GGGAGGATG-T------ATCA-GGA--AAAAAATC-AATT-AAATACGGCAA-GA---------A--AAATNT-ATAAAAAT--TCA-TTTCA-----------------A---------TG------------GAT-CG---------TTCTAAAT--A-T-TG-C---TA--TAG---T---C--T--A-----GT---------G--T--------CA-AGGATTAT-TCCATT-TCA-----TAAA-GCCATTTTC------CGTTA-GCCACAA----------G---------------C--------------AT---A--T-A--------CA-----------A---T-TA-T--ATA----T-A--CA----TTGT-A-A---TAT-----A-TCAAC-AAA--AA-C--A-ACATA-GT--GGAGA--G----TGA--GT-AGTC-TCC---AT--T-A-CAAAGATAGAGAGA-TAT-GATTATTACA---AT--ATGT-----T---AG-A----A------TTA-----CAATGT--AT---GTAT-GAG--A-TTGTTGCAC------ATTGT----AGA------C---------A---------------CAGTTCT-----C-GG--A-----TT-------------GTATT-TGTAACGC-TAA------GTAATT----AAANAAG-TTTAAAAAC-AT--T---G-G-T-TT-------------TTCT-----TCAT-A-TAT------A---TA----TTTC--AAGT--CAT-A--GTA------T-AGA----TGA-C-A--CT-----TTAGA----A--T---AAATGGAACTCA-TCCTC-----T-ATATCAT
finalCons : GTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAAC-AA----A-TTTCTTTCA-----A--TG---TATT-AAG-TGGTT-AAT--AAGT-GA-TA-C-ATATATCAGACGA----TG---T--ACCC--TACATA--AGTCGACTTTTT---TTTTA-TA-GAGA---A-TTAT----A--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATTTC-ACTA-------TTTTAG------GG--TGG----GG-GG-G-GTGG-TGG-GT------------TA--TTA--TT--AA--T--A-ACC--AAAG--A-A-----ATG-TTTA-CT-T--------AAT---T----CAT-T--TG---ATT-------AATC----AAAT-----A----C--GC-C-TCA----GAA-GCATG--GGGAGGATG-T------ATCAGA----AAAAAATC-AATT-AAATACGGCAA-GA---------A--AAATNT-ATAAAAAT--TCA-TTTCA-----------------A---------TG------------GAT-CG---------TTCTAAAT--AT--TG-C---TA--TAGTCTAGTAACCCCGT----------------------------CA-AGGATTAT-TCCATT-TCA-----TAAA-GCCATTTTC------CGTTA-GCCACAAGC---------------------------------------AT---A--T-A--------CA-----------A---T-TA-T--ATA----T-A--CATTGTAAA--------TAT-----A-TCAAC-AAA--AA-C--A-ACATA-GT--GGAGA--G----TGA--GT-AGTC-TCC---AT--T-A-CAAAGATAGAGAGA-TAT-GATTATTACA---AT--ATGT-----T---AG-A----A------TTA-----CAATGT--AT---GTAT-GAG--A-TTGTTGCAC------ATTGT----AGA------C---------A---------------CAGTTCT-----C-GG--A-----TT-------------GTATT-TGTAACGC-TAA------GTAATT----AAANAAG-TTTAAAAAC-AT--T---G-G-T-TT-------------TTCT-----TCATA--TATATA-------------TTTC--AAGT--CAT-A--GTA------T-AGA----TGA-C-A--CT-----TTAGA----A--T---AAATGGAACTCA-TCCTC-----T-ATATCAT
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|23 ): TCCGGAAAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAATAGGTGCACAACGTGCAACAATTCTCTTGCTGTCCATGCAAGTAAG
Unaligned ( gi|30 ): GAATTCCTGAAGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAATAAAGTAACTAATTTTCTATGCACAACAAATTTTTGCTCTTCAATATGAACAATAATTTTGTGCTCGTCAATAAAGACA
Unaligned ( gi|34 ): ACACGTGTACGAGAATTACAATATCAAGAGAATTGTTGCGCATGAACATTTTCCTAAAATGTTCAATGGTATATGTAACGTTTAAAAACATTGG
Unaligned ( gi|44 ): GAGTCCTTGTTAACATGAATAAAATTAAGTGTATCA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11111111 1111 2222 111111111 33333333333333333333 11111 11111111 1111111 22222 111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111 222222222222222 111 55555555555555555555555555555555555555555 11 11111111111 1111111 111 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 111111 111 2222222222222 2222222222222222
lowQualScore : 3 3 44 2 2 2 2 3 3 3 6666 3 22222222 999 3 3 7 55 3 3 0000 8888 777 33 33 55 2222 55555 2 2 666 6666 22 2 2 2 7777777 444444444 55 7777 2 4 2 55555555555555555555 333 33 55 33 33 2 33 33 2 00000 2 44 3 77777777 555 6666 3 44 555 0000000 6666 99999 7777 55 3 3 7777 3 888 3 999999 3 44 555 0 44 3 0 0 3 333333333 77 2 3 55 3 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0 55 555 3 9999 444444444444444 000 7777 3 2 2 77777 2 888888 2 33333333333333333333333333333333333333333 555 33 00 444 2 22222222222 444 2 66 66 5555 2 33 5555 00 3 3 0000000 44 3 44 6 3 44 44 6666 44 6 3 555 44 3 3 2 2 0 222 33 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 777777 6666 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 2 0 2 555555 8888 2 2 2 33 555 2 5 2 1111111111111 99999 222 5555555555555555 33 33 2 33 8888888 2 5555 2 2 33 55555 77777777777 1 5 66666 5
lowQualScore : . . .. . . . . . . . .... . ........ ... . . . .. . . .... .... ... .. .. .. .... ..... . . ... .... .. . . . ....... ......... .. .... . . . .................... ... .. .. .. .. . .. .. . ..... . .. . ........ ... .... . .. ... ....... .... ..... .... .. . . .... . ... . ...... . .. ... . .. . . . . ......... .. . . .. . ........................................................ . .. ... . .... ............... ... .... . . . ..... . ...... . ......................................... ... .. .. ... . ........... ... . .. .. .... . .. .... .. . . ....... .. . .. . . .. .. .... .. . . ... .. . . . . . ... .. ......................................................... ...... .... ....................................................................... . . . ...... .... . . . .. ... . . . ............. ..... ... ................ .. .. . .. ....... . .... . . .. ..... ........... . . ..... .
lowQualScore : 3 3 22 9 7 7 7 1 1 1 5555 1 00000000 222 6 6 3 00 6 3 4444 9999 999 99 77 99 9999 66666 4 4 555 9999 99 1 2 1 6666666 888888888 66 4444 2 7 4 00000000000000000000 999 22 66 22 22 4 44 22 4 66666 5 11 1 77777777 444 5555 1 22 444 0000000 5555 55555 7777 00 6 6 7777 6 333 3 666666 3 66 444 2 66 1 1 8 3 333333333 99 2 3 00 6 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666 7 00 444 6 3333 000000000000000 000 1111 1 9 9 11111 9 222222 9 88888888888888888888888888888888888888888 000 77 00 777 7 77777777777 777 7 33 11 7777 7 77 7777 66 1 1 0000000 22 1 22 2 1 22 22 5555 22 2 1 444 22 1 1 7 7 8 000 99 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 777777 1111 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 9 9 9 000000 8888 8 5 7 77 333 7 3 7 0000000000000 33333 999 9999999999999999 44 44 5 44 1111111 5 3333 5 5 44 99999 11111111111 7 3 77777 3
consensus : GTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAAC-AA----A-TTTCTTTCA-----A--TG---TATT-AAG-TGGTT-AAT--AAGT-GA-TA-C-ATATATCAGACGA----TG---T--ACCC--TACATA--AGTCGA-CTTTT---TTTTTA-TA-GAGA---A----TTATA--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATTTC-ACTA-------TTT--T-A--G-GG--TGG----GG-GG-G-GTGG-TGG-GT------------TA--TTA--TT--AA--T--A-ACC--AAAG--A-A-----ATG-TTTA-CT-T--------AAT---T----CAT-T--TG---ATT-------AATC----AAAT-----A----C--GC-C-TCA----GAA-GCATG--GGGAGGATG-T------ATC-A--GAAA---AAAATC-AATT-AAATACGGCAA-GA---------A--AAATNT-ATAAAAAT--TCA-TTTCA-----------------A---------TG------------GAT-CG---------TTCTAAAT--A-T-TG-CTA--TAGTC--TA-----GT---AACCCCGT---CA----AGG-ATTAT-TCCATT-TCA-----TAAA-GCCATTTTC------CGTTA-GCCACAA----------G---------------C--------------AT---A--T--A---C-A-----------A---T-TA--T-ATA----T-A--CA----TTGTAAATATA-TCAAC-AA-------A--AA-C--A-ACATA-GT--GGAGA--G----TGA--GT-AGTC-TCC---AT--T-A-CAAAGATAGAGAGA-TAT-GATTATTACA---AT--ATGT-----T---AG-A----A------TTA-----CAATGT--AT---GTAT-GAG--A-TTGTTGCAC------ATTGT----AGA------C---------A---------------CAGTTCT-----C-GG--A-----TT-------------GTATT-TGTAACGC-TAA------GTAATT----AAANAAG-TTTAAAAAC-AT--T---G-G-T-TT-------------TTCT-----TCAT-A-TAT------A---TA----TTTC--AAGT--CAT-A--GTA------T-AGA----TGA-C-A--CT-----TTAGA----A--T---AAATGGAACTCA-TCCTC-----T-ATATCAT
Reference ( family-2690 ) : GTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAAC-AA----A-TTTCTTTCA-----A--TG---TATT-AAG-TGGTT-AAT--AAGT-GA-TA-C-ATATATCAGACGA----TG---T--ACCC--TACATA--AGTCGA-CTTTT---TTTTTA-TA-GAGA---A----TTATA--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATTTC-ACTA-------TTT--T-A--G-GG--TGG----GG-GG-G-GTGG-TGG-GT------------TA--TTA--TT--AA--T--A-ACC--AAAG--A-A-----ATG-TTTA-CT-T--------AAT---T----CAT-T--TG---ATT-------AATC----AAAT-----A----C--GC-C-TCA----GAA-GCATG--GGGAGGATG-T------ATC-A--GAAA---AAAATC-AATT-AAATACGGCAA-GA---------A--AAATNT-ATAAAAAT--TCA-TTTCA-----------------A---------TG------------GAT-CG---------TTCTAAAT--A-T-TG-CTA--TAGTC--TA-----GT---AACCCCGT---CA----AGG-ATTAT-TCCATT-TCA-----TAAA-GCCATTTTC------CGTTA-GCCACAA----------G---------------C--------------AT---A--T--A---C-A-----------A---T-TA--T-ATA----T-A--CA----TTGTAAATATA-TCAAC-AA-------A--AA-C--A-ACATA-GT--GGAGA--G----TGA--GT-AGTC-TCC---AT--T-A-CAAAGATAGAGAGA-TAT-GATTATTACA---AT--ATGT-----T---AG-A----A------TTA-----CAATGT--AT---GTAT-GAG--A-TTGTTGCAC------ATTGT----AGA------C---------A---------------CAGTTCT-----C-GG--A-----TT-------------GTATT-TGTAACGC-TAA------GTAATT----AAANAAG-TTTAAAAAC-AT--T---G-G-T-TT-------------TTCT-----TCAT-A-TAT------A---TA----TTTC--AAGT--CAT-A--GTA------T-AGA----TGA-C-A--CT-----TTAGA----A--T---AAATGGAACTCA-TCCTC-----T-ATATCAT
gi|1 : TA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCTCGA-C--AAACAAA----A-TTTCTCT-A-----A--TG---GATT-AAGCTGGTT-AACTAAAGT-GATTA-C-ATATATCAGACGAATGTTG---T--G-CC--TACATA--AGTCGA----TT---TTTTTA-TA-GAGG---A-----TATAGCAA-TGAT-G-TTCCTC-AATTTC-ACTA-------TTT-------A-GG--CGGTAAAAG-GA-G-GTGT-T---GT------------TG--TTAACTTCAAA--T--A-ATCAGAAAG--ACA-----ATG--TTA-CT-TAATC----AAT---T----AAT-T--TG---ATT-------AATCAAATAAAT-----A----C--GC-C-TTA-----AA-GCATG--GGGAGGTTGTT------ATCAA--GAAA---ATAAAC-A--T-AAATACGGCAATGA---------AC-AAATTTAATAAAAAT--TCA-TTTCAAAGGTATAT--------A---------TG------------GGA-CGTCCAAAAAATTCTAAA---A-TATG-CTA--TAGTCTATA-----GTGTAAACCCCGT---CA----AGG-ATTAT-TCCA---TCA-----TAAA-GCCATTTTC------CGTTAGGCCACAA----------G---------------CA-------------AT---A--C--A---C-A-----------A---T-TA--T-ATA----T-ACTCA----CTG-AAATATACTCAAC-AA-------A--AA-C--A-ACATA-G---GGAGAGTG----TGA--GT-AGTC-TCC---AT--T-A-AAAAGA-AGA-AGG-GAT-GA-TATTACA---AT--ATGT-----T---TGTA----T------TTA-----CA---T--AT---GTAT-GAGGAA-TTGTTGCAC------ATTGT----AGA------CGAT------A---------------CAGTGTT-----C-----------CT-------------GTATTGTGTAACGC-CAA------GTAATT----AAGAAGG-TTTAAAAAC-AT--T---G-G-T-TT-------------TCTC-----TCATAA-TATC-----A---TA----TTTC--AAGT--CATAA--GTC------T-AGA----TGACC-ACTCT-----TTAG-----A--T---AAATGGAACTAACTCCTC-----TAATATCA
gi|10 : AAT--A-T-GG---A--TTGTC--CA-----AT---AATTTC-TAAACA----ATG-GTTAT-ACCATT-TCA-----TAAA-GCCACTTTC------CGTTA-GCCACAA----------G---------------CTCATATAC------AT---AAAT--A---C-A-----------A---T-TA--TTATA----T-A--CA----C-----GTACA-TCAAC-AA-------A--AA-C--A-ACATA-CT--GGAGA--G----TGA--GT-AGTC-TCC---AT--T-A-CAAAGATAGAGAGA-TAT-GATAATCATA---A----------------------------------------GATGT--AT---G----AAA--A-TTGTTGAAC------ATTTTTCTAAGG----------------A---------------CAGCTCT-------G------------------------GTATC-TGTAACGC-TAA------GTAATT----AAATAAG-TTTATAAGC-AC--T---G-G-G-TTA------------TCCT-----ACAT-A-TATATC---A---TA----TTTC--AAGT--CAT-A--GTATACTATT-AGA----TGG-C-A--AT-----TTAGA----A--T---AAATGGAACTCA-TCCTC-----T-ATATCATatgtagagaatccccggaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacgatctaggtacaaaagatgcacaaacgtgcaacaagtccttgctgcgtctatgcaagtaagtgccaaacccgggacgttgtacatg
gi|11 : atatcaaagtatC--TTTCC-AAAAAA-CTTG-CCT-GA-C-TAAAC-AA----A-TTTCTTTTA-----A--T----TATT-ACG-TAGTT-AAT--AAGT-GA-TA----TATATCAGACGA-----G---T--ACTC--TGCATATAAGTCGA-CTTTT------TTA-TA-GAGA---A----TTATA--AT-TGAT-GTTTCCTTGAATTTC-TCTG-------TTTAGC-G--G-GG--GGG----GG-GGCG-GGGG-TGG-GG------------TA--TAA--T----G--T--A-ACC--CAAGGTA-AAACATATGTTTTA-CT-TTCAATATCAAT---TTTCGCAT-TTATA---ACT-------CGTC----AAATAAATGA----C--AC-CATCA----GAA-GCATG--CGGTGGATT-TTATGAGATC-A--GAAATAGAGAAT---ATTGAAACACGgtaga
gi|12 : ttccttgatcttaaaggcggatccaaaacttgtattaacacttttagacGA----TG---T--ACTC--TACATT--AGTCGA-CTTTT---T----G-TA-CAGA---A----TTATA--AA-TGAC-TTTTCCTCAAATTTC-ACTG-------TTT--T-A--G-AG--AGG----G----------------GT------------T-----------------------------G--A-A-----ATG-TTTT-CT-T-------------------CAT-T---A---ATC-------AAAC----AAAT-----A----C--GC-C-TCA----GAA-GCATG--GGGA---TG-T------ATC-A--GAAA---AATTTC-AATT-AAATGCGGCAA-GA---------A--AAATTT-ATACAAAT--TCA-TTTCA-----------------AGGTATAATATG------------GAT-CG---------TCC--AAT--AAT-TT-CTAAATAATA--TACTGGTGT---AACCCCGT---TA----AGG-ATTAT-TCCATT-TCA-----TAAA-GCCATTTTT------CGTTT-GCCACAA----------GCTCAATGAAAACACAC--------------AT---A--T--A---C-A-----------A---T-TAT-T-ATA----T-A--CA----TTG
gi|13 : AGAGAGA-TGT-GATTATTACA---AT--A
gi|13 : accgttaatgtcatacacaaA------GTAATT----AAAGACG-TTTTAAAAC-AT--TTTGG-G-T-TT-------------TTCT-----TCAT-A-TATC-----A---TA-----TTC--ATGA--CAT-A--GTG------T-AGA----TGA-C-A--CT-----TTAGA----A--T---AAATGGAACTCA-TCCTT-----T-ATcatgtatacgagnaaagacgatgtgaggaagttggagaggaactgctaaatctagcacaacagtctgtgcaatctgcattacaagaagaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaattaaagacgttttaaaacattttgggtttttcttcatatatcatattcatgacatagtgtagatgacactttagaataaatggaactcatcctttat
gi|14 : accgttaatgtcatacacaaagagagatgtgattattacaatacatgtatacgagnaaagacgatgtgaggaagttggagaggaactgctaaatctagcacaacagtctgtgcaatctgcattacaagaagaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn---A--T--A---C-A-----------A---T-TA--T--------T-A----------ATAAACAAA-CAAAC-AA-------ACAAA-C--GGACATT-GT--GGAGG--G----TGA--GT-GGAC-ACC---AA--T-G-CACAGTTTGAAA-----T-AA-----ACA---A---AT-T-----G---AG-A----A------TTT-----C------------GTA-----------GTTGCAT------ATTGT----AGAAATTTCC---------AAAATTAAA-------CAGTTC---------G--T-----TA-------------GTATT-TTTGACAT-TGA------GTAATT----CAATCAG-TTTAAAAAC--T--C---A-A-T-GT-------------TTGT-----ATAG-A-TAC------AATTTG----TCTC--AAGT--CAT-C--GTA------T-AGAAAAGTGA-A-A--CT-----TTAGA----
gi|15 : cctaagtctcattggacgtacataaGTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAAC-AA----A-TTTCTTTCA-----A--TG---TATT-AAG-TGGTT-AAT--A-----------------TCAGATGA----TG---T--ACCC--TACATA--AGTCGA-ATTTT---T----A-TA-GA-----A----TTATA--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATTTC-ACTA-------TTT--T-A--G-GG--TGG-------------TGG-TGGTGT------------TA--TTA--TT--AA--T--A-ACC--AAAG--A-A-----ATG-TTTA-CT-T--------AAT---T----CAT-T--TG---ATT-------AATC----AAATAAAT-A----C--GC-C-TCA----GAA-GCATG--GGGAGGATG-T------ATC-A--G-AA---AAAATCAAATT-AAATACGGCAA-GA---------A--AAATGT-ATAAAtgaagtgcaccatttttt
gi|16 : ---TTTTTA-TATGAGA---AA---TTATA--AA-TGAT-GTTTCCTCCAACTTC-ACTA-------TTT-------A-GG--TGG----GG-GG-G---GG-T---CT------------TA--TTA--TT--AA--T--A-A-C--AAAG--A-A-----ATG--TTA-CT-T--------AACTGAT----TAT-T--TG---ATTTTAATCAAATT----AAAT-----A----C--GC-C-TCA----GAAGGCATGT-TGGAGGATG-T------ATT-A--GAAA---AATTTC-AATT--AATACGGCAA-GA---------A--AGCTGT-ATAAAA----TCA-TTTCAAGGTATATAATCATTATA---------TG------------GAT-CGTCCAAAAT-TTCGAAAT--A-T-TG-CTA--T
gi|17 : ----TG---T--ATCC--TACATA--AGTCGA----TT---TTTTTA-TA-TA-A---A----TTATA--AA-TGAT-GTTTCTTCAAATTTC-ACCA-------TTT--T-A--G-GGG-TGG----GT-GGTG-GTGG-TGG-------------------------T--A---T--A-AGC--AAAG--A-A-----ATG-TTTA-TT-T--------AAT---T----CAT-T--TG---ATT-------AATC----AAATAAAT-A----C--GC-C-TCA----GAA-GCATA--GGGAGGATG-T------ATC-A--GAAA---AAAA--------AAA-----CAA-CA---------ATTAAATGT-GTAAAAAT--TCA-TTTCA-----------------A---------tgg
gi|17 : -TTCATT-TCAAGGTATAAA-GCTATTTTC------CGTTA-GCCACAA----------G---------------C--------------Aggtataaagctattttccgttagccacaagca
gi|18 : tgtatcctacataagtcgatttttttatataaattataaatgatgtttcttcaaatttcaccattttaggggtgggtggtggtggtggtataagcaaagaaatgtttatttaattcatttgattaatcaaataaatacgcctcagaagcatagggaggatgtatcagaaaaaaaaaacaacaattaaatgtgtaaaaaGTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAAC-AA----A-TTTCTTTCA-----C--TG---TATT-ACG-TGGTT-AAT--AAGT-AA-T----ATATATCAGACGA----TGTACT--ACTC--TACATA--AGTCGA-C-------CTTTTA-TA-GAGA---A----TTATA--AA-TGAC-GTTT-CTCAAATTTC-TCTG-------TTT--A-A--G-GG--GGG----GG-GG-G-G----------------------TA--TTA--TT--AATTT--A-ACC--AAAG--A-A-----ATG-TTAT-CT-T--------AAT---T----CAT-T--TG---ATT-------AAGC----AAA
gi|19 : caaGTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTGGCCT-GA-C-TAAAC-AA----ACTTTCTTTC------A--TG---TATTAAAG-TGGTT-AAT--AAGT-GA-TA-C---ATATTAGACGA----TG---T--A--T--TA-ATA--AGTCGA----TT---TTTTTA-TA-GAGA---A-----TATA--AATTCATGGTTTCCTCACATTTC-ACTA-------TTT--T-AAGG-GG--TGG----GGTGG-G-GTGG-GGGTGT------------TT--TTA--TTA-AA--T--A-ACC--AAAG--A-A-----ATG-T
gi|2 : caaGTACA-TAGC--TTTCC-AAAAAGGCTTG-CCT-GAAC-TAAAC-AA----A-TT-CTTTCA-----AAATGA--TATT-AAG-TGGTTTAAT--AAGTTGA-TA-CGATATATCAGACGA----TGC--T--ATCCCGTACATA--AGTCG------T---TTTTTA-TA-GAGAT--A----TTA-A--AA-TGAT---TTCCTCAAATTTC-A-TA-------TTT--T-A--G-GGGGTGG----GG-TG-GCGTGGGTGG-GTGGTTTGGTGGTGTA--TTA--TG--AA--T--ATACC--AAAG--A-A-----ATG-TTTATCT-T--------AA----T----CAT-T--TG---A-T-------AATC----AA
gi|2 : acaaG-ATTAT-TCCATTCTCA-----TAAAAGCCATTTTC------CGTTA-GCCACAA----------G---------------C--------------AT---A--TA-A---C-A-----------G---TCTA--T-ATT----TAA--CA----TTGTAAATATA-TCAACAAA-------A--AA-CAAA-ACATAGGT--GGAGA--G----CGA--GT-AGTC-TCC---AT--TAA-CAAAGATGTAGCGA-TATGGATTA-TA-A---AT--ATGT-----T---AG-A----A------TTA-----CA------AT---GTAT-GAGA-A-TTGTTGCAC------ATTGT----AGA------C---------A---------------CAGTTCT-----CAAG--A-----TT-------------GTATT-TGTAACGC-CAGAT----GTAATT----AAAGAAG-TTTAGAAAC-AT--TG--G-G-TGTT-------------TTCT-----TCAT-A-TATATCATAA---TA----TTTT--AAGT--CAT-A--GTC------T-AGA----TGA-C-A--C--------GGA----AACT---AAATgatcagacgattattccattctcataaaagccattttccgttagccacaagcatataacagtctatatttaacattgtaaatatatcaacaaaaaacaaaacataggtggagagcgagtagtctccattaacaaagatgtagcgatatggattataaatatgttagaattacaatgtatgagaattgttgcacattgtagacacagttctcaagattgtatttgtaacgccagatgtaattaaagaagtttagaaacattgggtgttttcttcatatatatcataatattttaagtcatagtctagatgacacggaaactaaatcctcatagtatcgtgtagattccccggaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaataggtgcacaacggtgcaatcaattctctgttgctgtccatcgccaagtaagtgcaaaccgggtacgtcttgtacatg
gi|20 : acaagtacatagctttccaaaaaggcttgcctgaactaaacaaattctttcaaaatgatattaagtggtttaataagttgatacgatatatcagacgatgctatcccgtacataagtcgttttttatagagatattaaaatgatttcctcaaatttcatattttagggggtggggtggcgtgggtgggtggtttggtggtgtattatgaatataccaaagaaatgtttatcttaatcatttgataatcaagatcagac-TTGTTGCAC------ATTAT----AGA------TTTT------A---------------CTGATAT-----T-AG--ACATTCTT-------------GTATT-TGTA-CGC-TAA------GTAATTTA--AAATAAG-ATTCAAA-C-AT--T---G-GGT-TT-------------TTCTATGAATCAT-AATAT------A---CC----TTTC--AAGT--TGT-------------T-AGG-----GA-CGA--CT-----TTAGA----A--TTATAAATGGAACTCA-TCCTC-----T-ATATcctcatagtatcgtgtagattccccggaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaataggtgcacaacggtgcaatcaattctctgttgctgtccatcgccaagtaagtgcaaaccgggtacgtcttgtacatg
gi|21 : tcatgttatgagattttccttaatt--T--A---C-A-----------A---T-TA--T--------T-A---A----TT---AATA-----AAC-AA-------A--CA-C--G-GCACT-GT--GGAGA--G----TGG--GT-AGACATCA---ATGCT-A-CACTAATACACACT-TA---ATTATCGCACC-GT--ATG----------AT-A----A------TT--------TTGT--AG---AT-T-TAA--T-TTGTTGCAT------ATTGC----AAA------
gi|22 : agccacagtctcattggatgtacaaaagTAT-GAG--AATTGTTGCAC------ATTGT----AGA------C---------ATTTTCCTCAATTAGACAGTTCT-----C-GG-----------------------GTATT-TGTAACGC-GAA------GTAATT----AAAGAAG-TTTAAAAGCAAT--A---G-G-T-TT-------------TTCT-----TCAT-A-TAT----------TA----TTTA--AAAT--CAT-A--GTA------T-AGA----TGA-C-A--CC-----TTAGA----------------------A-TCCTC-----T-ATATCATattaaacaattcggtagattttt
gi|24 : aG-GG-G-GTA-------T------------TT--TTA--TT--AA--TTTA-ACC--AAAG--A-A-----ATA-CTTT-CT-T--------ATT---T----CAT-T--TATCAATT-------AAAT----AAAT-----A----C--GC-C-TCATGCAGAA-GCATG--CGGGGGATA-T------ATC-A--GAAC---AATTTC-AATT-AAATGCAGCAA-AATACACATATA--AAATAT-ATAAAAAT--TCA-TTTCA-----------------A---------gtagatt
gi|25 : AGTTCT-----CTGG--A----------------------ATT-TGTAACAC-TAA------GTAATT----TAATAAG-TTAAAAAAT-GC--TA--G-G-T-TTCACATAATAAAATTTCT-----TAAT-A-TAT------C---TT----TTTCTCAAGT--TAC-A--ATA------T-TGG----GGA-C-A--CC-----TTAGA----A--A---AAATGTAACTGA-TCCTC-----T-ATATCAggta
gi|26 : tttcttaaattaggtAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAAC-AA----A-TTTCTTTCA-----A--TG---TATT-AAG-TGGTT-AAT--AAGT-GA-TA-C-ATATATCAGACGA----TG---T--ACCA--TACACA--AGTCGA---------TTTTTA-TA-CAGA---A----TTATA--AA-TGAT-GTTTCCTTAAATTTC-A
gi|27 : -AAAAAA-CTTG-CCA-GA-C-TAAGC-AC----A-TATCTTTCACTCGTA--TG---TAAT-AGA-TACTA-AAT--GAGT-GA-TG-C-TTA-ATCAGAAGA----TG------ACCT--T-CGTA-----CCA-GTTTTACGTTTTTATTA-AATAACGA----TTATA--AA-
gi|28 : a---AG-A----A------TTA-----CAATGT--AT---G-AT-AAA-----TGTTGCAC------ATAGT----AGA------A---------A---------------TTTTCCTAAATGC-GGGCA-----TTTCTCTG-------GTATT-TGTAGCGT-TAAGTACATGTAATT----AAATAAG-TTg
gi|29 : caattacgtgtacacgCTC--TACATA--AGTCGA-CTTTT-------TA-TA-GAGG---A----TTATA--AA-TGAT-GTCTCCTCAAATTTC-ACTAGGTTTTTTTT--T----------TGG----GG-GG-G-GGGG-T---AT------------CAATTTA--TT--AA--T--A-ACC--AAGG--A-A-----ATG-TTTT-CT-T--------
gi|3 : --GGGAGGATG-T------ATC-A--CAAA---AAAATC-AATT-AAATACGACAA-GA---------A--AAATGT-ATAAAAAT--TCA-TTTCA-----------------AGGTATAACATG------------AAT------------TTCTAAAT--A-T-TG-CTA--TAGTC--TA-----GTGT-AACTCCGT---CA----AGG-ATTAT-TCCATT-TCA-----TAAA-GCCATTTTC------CGTTA-GCCACAA----------G---------------C--------------AT---A--TATA---C-A-----------A---T-TA--T-ATA----T-A--CA----TCGTCAATATA-TCAAC-AA-------A--AA-C--A-ACATA-GT--GGAAA--G----TGA--GT-AGTC-TCT---AT--T-A-CAAAGATAGGGGGA-TAT-GATTATTAAA---AT--ATGT-----T---AG-A----A------TTA-----CAATGT--AT---G
gi|3 : ATA--AGTCGA-----T---TTTTTA-TA-GATA---A----TTATA--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATTTC-ACTA-------TTT--TCG--G-GG--TGG----TG-GT-G-GTGG-T---GT------------TA--TTA--TT--AA--T--A-ACC--AAAN--N-NC----ATG-Tagaattgnaataagtcgattttttatagataattataaatgatgtttcctcaaatttcactattttcggggtggtggtggtggtgttattattaataaccaaannncatgtatttcaagtcagtctagatgacactttagaataaatggaactaatcctctataccatgtagattccccggaaatggtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtatctaggtacaataggtgcacaacgtgcaacaattctcttgctgtccgtgcaagtaagtgcaaacccgggtacgttgtacatg
gi|3 : gggaggatgtatcacaaaaaaatcaattaaatacgacaagaaaaatgtataaaaattcatttcaaggtataacatgaatttctaaatattgctatagtctagtgtaactccgtcaaggattattccatttcataaagccattttccgttagccacaagcatatatacaattatatatacatcgtcaatatatcaacaaaaacaacatagtggaaagtgagtagtctctattacaaagatagggggatatgattattaaaatatgttagaattacaatgtatgagaattgnaAT------G---TA----TTTC--AAGT--CA-----GTC------T-AGA----TGA-C-A--CT-----TTAGA----A--T---AAATGGAACTAA-TCCTC-----T-ATACCATatttcaagtcagtctagatgacactttagaataaatggaactaatcctctataccatgtagattccccggaaatggtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtatctaggtacaataggtgcacaacgtgcaacaattctcttgctgtccgtgcaagtaagtgcaaacccgggtacgttgtacatg
gi|31 : gggaggatgtatcacaaaaaaatcaattaaatacgacaagaaaaatgtataaaaattcatttcaaggtataacatgaatttctaaatattgctatagtctagtgtaactccgtcaaggattattccatttcataaagccattttccgttagccacaagcatatatacaattatatatacatcgtcaatatatcaacaaaaacaacatagtggaaagtgagtagtctctattacaaagatagggggatatgattattaaaatatgttagaattacaatgtatgagaattgnaataagtcgattttttatagataattataaatgatgtttcctcaaatttcactattttcggggtggtggtggtggtgttattattaataaccaaannncCAA----------G---------------CTG------------ATTGGA--T--A---C-A-----------------CA--T-ATA----T-A--CAATTGTTGTAAATATA-TCAAC-AATCAACAAA--AG-C--A-ACATA-GT--GGACA--G----TGA--GT-AGTC-TCC---AT--T-A-CAA--------AGA-TGT-GATTATTACA---Agtagattccccggaaatggtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgtatctaggtacaataggtgcacaacgtgcaacaattctcttgctgtccgtgcaagtaagtgcaaacccgggtacgttgtacatg
gi|32 : AGTT----AAATAAG-ATTAAAA-C-GT--T---G-GGT-TT-------------TTCT-----TCAT-A-TAT------A---T-----TTTC--AAGTTATAT-A--GTA------T-GGA----GGA-C-A--CA-----TTAGAATTTA--T---AAATGGAACTCA-TCCTC-----T-
gi|33 : --AGTCGA-C-------TTTTTA-TA-AAGA---ATTATTTATA--AA-TGAT-GTTTCCTCAAA-TTC-ACTG-------TTT--T-A--G-GG---GG----GG-GG-G-GTGT-T---GT------------TA--TTA--TT--AA--T--A-ACC--AAAG--A-A-----AT
gi|35 : cTA-A-TAGC--TTTCC-AAAA-G-CTTT-CCT-GA-C-TAAA--AA----A-TTC--TTCA--------TG---TA---AAG-TG-TT-AAT--AAGT-GA-TA-C-ATATATC-GACGA----TG---T--ACCC--TAC
gi|36 : -----GT---AACCCCGT---CA----AGG-ATTAT-TCCATT-TCA-----TAAA-GCCATTTTC------CGTTT-GCCACAA----------G---------------C--------------
gi|37 : gcgagt----TTATA--AA-TTAT-GTTTCCTCAAATTTC-ACTA-------T---------G-GA--T-------G-GG-G-GTGG-TG--------------------TTA--TT--AA-----A-ACC--AAAG--A-A-----ATG-TTTtcaatggata
gi|38 : AAGATAGAGGGA-TAT-GAT-ATTACA---AT--ATGT-----T---AG-T----A------TTA-----CA------AT---GTAT-GAGA-A-TTGTTGCAC------ATTG
gi|39 : GTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAAC-AA----A-TTTCTTTCA-----A--TG---TAT
gi|4 : caaA-TATC-ATGTATCACACGAA---TG---T--ACTC--TACATTT-AGGCGA-CTTTT---T----A-TA-AAGA---T----TTATA--AA-TGAT-TCTTCCTCAAA---C-ACAC-------TTT--T-A-----G--T-------G-GG-G-GT-------GT------------TA--TTA--TT--AA--T--A-ACC--AAAG--A-AG----AAA-TTTT-CT-----------AT---T----CAT-T--TG---ATA-------AATC----AAATAA---A----C--GC-C-CCA----GAA-GCATG------GGATG-T------ATC-A--GAAA---AATTTC-AATT-AAAT-C-GCAA-GA---------A--AAA----A-AAAAAGGATCG-TTCCA-----------------A---------T-------------AAT------------TTCTAAAT--A-A-TG-C----TAG----TG-----GA---AACCCCGT---TACGTCAAG-ATTGT-TCCATT-TCA-----TAAA-GCCATTTTC------GA--A-ACCACAA----------G---------------CTCAACGGATACACAAT---A--T--A---C-A-----------A---T-TA--T-ATA----T-A--CA----TTGTAAA-ATA-TCAAC-AA-------A--AA-C--ATAAATG-GA--AGGGA--C----TGT--AT-AGTC-TCC---AT--T-A-CAAAGATGAGGAGATTAT-GA-TATTACA---AT--ACATG----T---AG-A----ACAGAATTTA-----CAATGT--------TAT-GAGAAA-CTGT--CAC------ATT-T----AGAATTTT-CCTAAATTAGA---------------CAGTTCT-----C-TG-----------------------GTATT-TGT-ACGT-TAA------GTAATT----AA--AAG-TTTAAAAAA-AT--T---G-G-C-GT-------------TTTC-----TCAT-A-TATC-----A---T-----TTTC--AAGT--CAT-A--GTA------TAAGA----TGA-C-A--CT-----TTAGA----A--T---AAAT-GAACCAA-TCCTT-----TCATATCATa
gi|40 : caagtaatagctttccaaaatttgtaataccgattA--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATTTT-ACTG-------TTT--T----------T------GG-GG-G-GTG---GG-GT------------TA--TTA--CT--AA--T--A-gttagatat
gi|41 : ----AGG-ATTAT-TCCGTT-TC--------AA-GC------T------CATTG-G--ATAA----------A---------------CAT------------AT---A--T--A---C-G-----------A---T-TA--T--------T-A--CA----T
gi|42 : GTA-A-CATC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-A-TAATC-GA----A-TTTCTTg
gi|43 : ttaT-----TTCGA----A--T---AAATGGAACTCA-TCCTC-----T-ATACCATat
gi|45 : A-TG-GAGA---A----TTATA--AA-TGAC-GTTTCCTCAAATTTT-Agtaaattcc
gi|46 : GTA-A-TAGC--TTTCCAAAAAAG-CTTG-CCT-
gi|47 : catgacaaGTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTA-CCT-G
gi|5 : acaaGTA-A-TAGC--TTTCC-AAAAAG-CTTG-CCT-GA-C-TAAAC-AA----A-TTTCTTTCA-----A--TG---TATT-AAG-TGGTT-AAT--AAGT-GA-TA-C-ATATATCAGACGA----TG---T--ACCC--TACATA--AGTCGATTTTTT---TTTTTA-TA-GAGA---A----TTATA--AA-TGAT-GTTTCCTCAAATTTC-ACTA-------TTT--T-A--GTGG--TGGT---GG-TG-G-GTGG-TGG-GT------------TA--TTA--TT--AA--T--A-ACC--AAAG--A-A-----ATG-TTTA-CT-T--------AAT---T----CAT-T--TG---ATT-------AATC----AAAT-----A----C--GC-C-TCA----GAA-GCATG--GGGAGGATG-T------ATC-AGGGAAA---AAAATC-AATT-AAATACGGCAA-GA---------A--AAATGT-ATAAAAAT----A-T---------------------A---------TG------------GAT-CA---------TTCTAAAT--A-T-TG-CTA--TAGTC--TA-----GT---------GT---CA----AGG-ATTAT----------A-----TAAG---CATTTTC------CGTAA-GCCACAC----------G---------------C--------------AT---A--T--A---C-A-----------A---T-TA--T-ATA----T-A--CA----TTGT-AATATA-TCAAC--A-------A--AA-C--A-ACATA-GT--GGAGA--G----TGA--GT-ACTC-TCC---AT--T-A-CAAAGATAGAGAGA-TAT-TATTATTACA---AT--ATGT-----T----G-A----A------TTA-----CAATGTACAT---GTAT-GAG--A-TTGTTGCAC------ATTGT----AGA------C---------A---------------CAGTTCT-----CAGG--A-----TT-------------GTATT-TGTAACGC-CAA------GTAATT----AAAGAAG-TATAGAAAC-AT--T---G-G-T-TT-------------TTCT-----TCAT-A-TAT------A---TA----TTTC--AAGT--CAT-A--GTC------T-AGA----TGA-C-A-----------------------------GAAACTAA-TCCTC-----T-ATATCAT
gi|6 : GTA-AGTGGCGGTTTCC-AAA--G-CTTG-C----A-CATAAAC-AAGGGGA-TTTCTTTCA-----C--TGAGATGTT-AAC-TGTTTCAAT---AGT-GA-TG---ATAT-TTAGA-AA----TG---TTCACTC--TACAT---AGTCGA-CTTT
gi|6 : aaTTTCCTCAAATTTCAACTG-------TTT--T-T--A-AG--TGG----GG-cctcaaatttcaactgtttttaagtggggaatgcttattctgattgatattgattaatgcaatacatgcgctcagaagcattacgggaggatgtatcaagtaaatttaatgttaaaatctttaaaaaatcagtttcaaagtatcgataatggattgtcaattttctgaaatccttcaaggattattcgtttcaagctcattggataacatataatacgaattaattatataacgtatatacaaaaacagcatagtttgaagagtgcgttagtctcagaaattaacaaagatagagagttaattattacacaatataatacactacactagagactaatctatttaatatagacattttcctaaattagacagttctttgtatttgttaccttaagtaattaataagattagaacattgtggttttgttctgtcattatatatcattttcaagatatatggtatagaggaccctttagaaatcatcctctatat
gi|6 : aagtaagtggcggtttccaaagcttgcacataaacaaggggatttctttcactgagatgttaactgtttcaatagtgatgatatttagaaatgttcactctacatagtcgacG--G-A-----ATG-CTTA-TTCT--------GAT---T----GATAT--TG---ATT-------AATG----CAAT-----A----CATGCGC-TCA----GAA-GCATTACGGGAGGATG-T------ATC-A-----------AGTA-AATT-TAATGTT----------------A--AAATCT-TTAAAAAA--TCAGTTTCA-----------------A---------AG------------TAT-CG---------AT---AATGGA-T-TGTCAA--TTTTC--T------GA---AATCCT-T---CA----AGG-ATTAT-TC-GTT-TCA--------A-GCT------------CATTG-G--ATAA--------------------------C--------------AT---A--T--AATACGA-----------A---T-TAATT-ATA----T-A------------ACGTATA-T--AC-AA-------A--AA-C--A-GCATA-GTTTGAAGA--G----TGC--GTTAGTC-TCAGAAAT--T-AACAAAGATAGAGAGT-TA---ATTATTACACA-AT--ATAA-----T---AC-ACTACA------CTAGAGACTAATCT--ATTTAATATAGAC--A-TTTTCCTAA------ATT------AGA------C---------A-----------------GTTCT-----------------TT-------------GTATT-TGTTACCT-TAA------GTAATT-----AATAAG-ATT-AGAAC-ATTGT---G-G-T-TTTG-----------TTCTG----TCAT---TAT------A---TATCATTTTC--AAGA--TAT-ATGGTA------T-AGA----GGA-C-C--CT-----TTAGA----A------A--------TCA-TCCTC-----T-ATATaatgcttattctgattgatattgattaatgcaatacatgcgctcagaagcattacgggaggatgtatcaagtaaatttaatgttaaaatctttaaaaaatcagtttcaaagtatcgataatggattgtcaattttctgaaatccttcaaggattattcgtttcaagctcattggataacatataatacgaattaattatataacgtatatacaaaaacagcatagtttgaagagtgcgttagtctcagaaattaacaaagatagagagttaattattacacaatataatacactacactagagactaatctatttaatatagacattttcctaaattagacagttctttgtatttgttaccttaagtaattaataagattagaacattgtggttttgttctgtcattatatatcattttcaagatatatggtatagaggaccctttagaaatcatcctctatat
gi|7 : aagtaagtggcggtttccaaagcttgcacataaacaaggggatttctttcactgagatgttaactgtttcaatagtgatgatatttagaaatgttcactctacatagtcgactttcctcaaatttcaactgtttttaagtgg---------TTCTAAAT--A-T-TG-CTA--TAGTC--TA-----GTGT-AACCCCGT---CA----ATG-ATTAT-TCCATT-TCA-----TAAA-GCCATTTTC------CGTTA-GCCACAA----------G---------------C--------------AT---A--TATA---C-A-----------A---T-TA--T-ATA----T-A--CA----TTGTACATATA-CCAAC-AA-------A--AA-C--A-ACATA-GT--GGAGA--G----TGA--GT-AGTC-TCC---AT--T-A-CAAAGATAGAGGGA-TAT-GATTATTACA---AT--ATGT-----T---AG-A----A------TTA-----CA------AT---GTAT-GAGA-A-TCATTGCACATACCAATTGT----AGA------C---------A---------------CAGTTCT-----C-----------TT-------------GTATT-GGTAACGC-CAA------GTAATT----AAAGAAG-TTTAAAAAC-AT--TG--G-G-T-TT-------------TTCT-----TCAT-A-TATC-----A---TA----TTTC--AAGT--CAT-A--GTC------T-AAA----TGA-C-A--CT-----TTAGA----A--T---AAATGGAACTAA-TCCTC-----T-ATATCAT
gi|8 : aaaaatT---T----CAT-T--TA---ATT-------AATC----AAAT-----AGATAC--CC-C-TCA----GAA-GCATG--G-----------------------GAGA---AAAAT----TT-CAAAACTGCAA-GA---------A--AAATCT-ACAAAAAT--TCA-TTTCA-----------------A---------CGTCC---------AATACT---------TTCTAAAT--A-A-TG-C----GAGT----------AT---AACCCCGT---CA----AGG-ATTAT-TCTATT-TCA-----TAAA--CCATTTTT------CGTAA-ACCACAA----------G---------------CTCA-----------AT---G--G--A---T-A-----------ATTGT-TA--T-ATA----T-A--CA----TTGTAAATATA-TCAAG-AA-------A--AA-C--A-ATATA-GT--TGAGA--GGAACTGT--AT-AGTC-TCC---AT--T-A-CAAAGAT-GAGAGA-TAT-GATTATTACA---ATACATGTA----TACGAA-A----A------TCA-----CAATGT--AT---G--C-GA---A-TTGTTGCAC------ATTGT----AGA------C---------A----------------ATTTCC-----T-AA--A-----TTAGACACGTCTCTGGTATT-TGTAACTCTTAA------GTAATTTTAAAAAGAAGTTTTAAAAAC-AT--T---ATG-T-TT-------------TTCT-----TCAT---TATC-----A---TA----TTTC--AAGT--CAT-A--GTA------T-AGA----TGA-C-A--CTTTAAATTAGA----A--T---AAATGGAACTCA-TCCTC-----T-ATATCATgtagattccccggaaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacatgtatccaggtacaatatgtgcacaacgtgcaacaattctcttgctgtccatgcaagtaagtgcaaaaccgggtacgttgtacatg
gi|9 : AA---AAAATC-AATT-AAATACGGCAA-GA---------A--AAATCT-ATGAAAAT--TCA-TTTCA-----------------A---------TGTATAATATTATGGAT-CGACCAATAATTTCTAAAT--A-A-TG-CT---TAGTG--T-------T---AACCCCGTG--CA----AGGGATTATCTCCATT--CA-----TTAA-ACCACTTTCTCCAGCCTTTG-GCCACAACAAGTCATTGG---------------T--------------AT---A--C--A---C-ACATATATACATA---T-TA--TTATACTGTT-A--CA----TTGTAAATATA-TCAAC-AA-------A--AAAC--A-ACATA-GT--GGAGA--G----AGACTGTTAGTC-TCC---AT--T-A-AAAAGATAGAGAGA-TAT-GATTATTGCAAGTAC--ATGTGTACCC---AG-A----A------TTA-----CAATAT--TT---G-A--GAA--A-TTGTTGCAC------ATTG-----AGA------C---------A---------------T-TTTCC-----T-AA--A-----TTAG-----------ACAGT-TCT-CCGG-TAAAT----GTAAC-----------G-TTTAAAAAA-AT--TG--G-G-G-TT-------------TTCT-----TCAT-A-TAT------A---TAT---TTTC--AAGT--CAT-A--GTA------A-TGA----TGA-C-A--CT-----TTAAA----A--T---AGATG--ACTCATTCCTTCCTTAT-ATATCATgt
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|23 ): TCCGGAAAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAATAGGTGCACAACGTGCAACAATTCTCTTGCTGTCCATGCAAGTAAG
Unaligned ( gi|30 ): GAATTCCTGAAGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAATAAAGTAACTAATTTTCTATGCACAACAAATTTTTGCTCTTCAATATGAACAATAATTTTGTGCTCGTCAATAAAGACA
Unaligned ( gi|34 ): ACACGTGTACGAGAATTACAATATCAAGAGAATTGTTGCGCATGAACATTTTCCTAAAATGTTCAATGGTATATGTAACGTTTAAAAACATTGG
Unaligned ( gi|44 ): GAGTCCTTGTTAACATGAATAAAATTAAGTGTATCA